CN103695455A - 利用原生质体转化构建黑根霉cpr基因工程菌的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种利用原生质体转化技术对黑根霉(Rhizopus nigericans)进行外源基因的遗传转化方法:利用真菌细胞壁降解酶对黑根霉(Rhizopus nigericans)的细胞壁进行处理,得到原生质体并进行纯化,以潮霉素B作为选择标记,首次将来自米根霉NADPH-细胞色素P450还原酶CYPOR(缩写:CPR基因)基因采用原生质体转化方法导入黑根霉中,获得工程菌。本发明的有益效果体现在:可以用于黑根霉的分子生物学研究,如研究该菌P450酶系基因对甾体化合物羟化作用的分子机制等;可以用来对黑根霉实施基因工程从而进行遗传改良育种,提高黑根霉对甾体底物羟化转化率。
Description
(一)技术领域
本发明涉及一种利用原生质体转化构建黑根霉CPR基因工程菌的方法。
(二)背景技术
黑根霉(Rhizopus nigricans)对甾体具有C11α-羟基化反应能力。羟基化生物转化反应通常是P450酶系介导的,细胞色素P450氧化还原酶(NADPH-cytochrome P450reductase,CPR,E.C.1.6.2.4)能将电子从NADPH传递到细胞色素P450、细胞色素c、细胞色素b5以及血红素氧化酶等血红素蛋白。
目前,改进生物转化体系的方法大体可归纳为三类:增加底物溶解性,解除底物(产物)抑制,改变细胞膜(细胞壁)通透性,已遇到一程度上的瓶颈。随着分子技术水平的发展,将P450单加氧酶(CYP)和P450还原酶(CPR)基因在酵母或大肠杆菌等模式菌株中进行克隆表达,在转录水平调控、酶活分析、药物代谢等方面不断迈向新的领域。但关于构建黑根霉CPR基因工程菌并应用于甾体羟化转化上的应用未见报道。
自1973年首先在粗糙脉胞菌建立DNA转化系统,1983年建立构巢曲霉DNA转化系统以来,迄今已在30多种丝状真菌中建立了DNA转化系统。丝状真菌遗传转化方法包括电击转化法、基因枪转化法、农杆菌介导转化法、原生质体转化法、醋酸锂转化法等。并已成功应用于赤霉菌、毛霉、绿色木霉等丝状真菌中。但尚未有采用原生质体转化法应用于黑根霉的报道。
(三)发明内容
本发明目的是提供一种利用PEG-CaCl2介导原生质体转化技术构建黑根霉CPR基因工程菌的遗传转化方法,并找到转化效率高的转化参数组合,可用于黑根霉工程菌育种以及分子生物学研究等领域,并为其他丝状真菌遗传转化提供借鉴。
本发明采用的技术方案是:
一种利用原生质体转化构建黑根霉CPR基因工程菌的方法,所述方法包括:
(1)从米根霉克隆得到其CPR基因,克隆至质粒pCB1004-pgpd,得
到表达质粒pCB1004-pgpd-CPR;
具体步骤如下:根据NCBI数据库上所报道的米根霉CPR基因序列设计引物,并根据pCB1004-pgpd质粒上的MCS序列选出适合的酶切位点,然后提取米根霉总RNA,利用RT-PCR扩增得到CPR目的基因片段;经过T-A克隆,得到重组子经测序正确后,用限制性内切酶酶切得到目的片段并将其克隆至pCB1004-pgpd上MCS上相应的酶切位点,转化至大肠杆菌得到重组子并测序;测序正确后,从大肠杆菌中提取pCB1004-pgpd-CPR质粒,备用。
目前真菌绝大多数用潮霉素筛选,所述的pCB1004-pgpd质粒上的潮霉素(hygromycin)抗性基因(hph)由Aspergillus nidulans的ptrpC启动子调控,MCS序列上游由强启动子pgpd A调控;
(2)将黑根霉孢子原生质体用1mol/L的山梨醇溶液悬浮,调节原生
质体浓度为107~108个/mL,得到原生质体溶液;所述山梨醇溶 液组成如下:1mol/L山梨醇,10mmol/L Tris-Cl,CaCl250mmol/L,溶剂为水,pH7.0;所述米根霉和黑根霉采用常规市购菌株即可;
(3)将构建的表达质粒pCB1004-pgpd-CPR经限制性内切酶酶切,酶切产物纯化后溶于无菌去离子水至浓度为10~15μg/mL,得到线性化质粒溶液;
(4)每100μL原生质体溶液加入10μL线性化质粒溶液,并加入1~2μL步骤(3)所述限制性内切酶,混匀,冰浴30min后,加入20~50μL的PEG4000-CaCl2溶液,冰浴10~20min;再加入400~800μL的PEG4000-CaCl2溶液,室温静置10~15min;所述PEG4000-CaCl2溶液终浓度组成如下:PEG400060%,CaCl250mmol/L,1mol/L山梨醇,Tris-Cl10mmol/L,pH7.0,溶剂为水;
(5)步骤(4)转化液转移至10mL MYG液体再生培养基,28℃、80rpm,培养12h后,离心,用无菌去离子水洗涤,获得菌悬液涂布于含有150μg/mL潮霉素B的MYG固体平板,28℃培养;
(6)待固体平板上长出菌丝后,转接到含有150μg/mL潮霉素B的MYG固体平板上;转化子在潮霉素B浓度200μg/mL的MYG固体平板上继代培养,提取转化子基因组,进行PCR确定目的基因片段是否整合到黑根霉基因组中,鉴定正确后保存。
所述MYG液体再生培养基组成如下:麦芽糖5g/L,酵母粉5g/L,葡萄糖10g/L溶剂为水;所述MYG固体平板组成如下:麦芽糖5g/L, 酵母粉5g/L,葡萄糖10g/L,琼脂15g/L,溶剂为水。
用于潮霉素B对黑根霉最小抑制浓度测试方法如下:
将潮霉素B溶液(50mg/mL)加入MYG液体培养基,使终浓度分别为50,100,150,200,250μg/mL,并倒平板。取长有黑根霉菌丝的琼脂块接种于抗性平板上,于30℃恒温培养,观察其生长情况,确定潮霉素B的最低抑制浓度。所述MYG液体培养基终浓度为:麦芽糖5g/L,酵母粉5g/L,葡萄糖10g/L,溶剂为水;
所述黑根霉孢子原生质体溶液可按如下方法制得:
(1)收集黑根霉菌丝,用无菌去离子水洗涤2次后,再用酶解液洗涤2次,得湿菌体;所述酶解液组成如下:0.5mol/L MgSO4,50mmol/L DL-Maleate aicd(CP),溶剂为水;
(2)每1ml细胞壁降解酶液加入0.5~1.0g湿菌体,置30℃水浴锅,每20min轻轻摇匀,酶解游离原生质体3~4h,得到原生质体酶解液;细胞壁降解酶液按如下组成配制:lywallzyme(广东微生物研究所)和Yatalase(Takara)质量比为5:7的混合酶溶解于无菌的0.5mol/L MgSO4、50mmol/L DL-Maleate aicd溶液中,制成终浓度为50mg/mL的细胞壁降解酶液;
(3)将原生质体酶解液用1mol/L山梨醇溶液稀释,过滤除去菌丝残片,5000r/min离心10min,得原生质体沉淀,用1mol/L山梨醇溶液悬浮,调节原生质体浓度为107~108个/mL,得原生质体溶液。
本发明中,所述CPR基因序列如下:
ATGACTCGAAACAACTCTCATCATCTGCTTGACACAGTCGATTTGATACTGCTAGGTACCATTGGCCTTGGTACAGTTGCTTGGTTTGCTA GACATCAAATAGCCAATCGACTTTTCAAATCTGATTCTACCAATAAATCTGAAGTTAAGGATGAGGCAAAGACCCCTAAACAAGAACGTAACTTTGTTAAAGTGATGCAGCAACAGGGTCGTCGAGTCATCTTCTTTTATGGTTCTCAGACAGGTACAGCCGAAGACTTTGCTTCTCGTCTTGCAAAAGAATGTACACAAAAATATGGTGTGAGCGCAATGACTGCTGATATTGAACAATATGATTTGAGCTACCTTGATTCAGTTCCCGAAGACTCTTTGGTGTTCTTTATTATGGCAACCTATGGTGAAGGTGAACCTACTGATAACGCTGTTGATTTTTGGGACTTGTTAGCAGAAGAGGTACCTGAGTTCTCTAATGATGATGGTGAGGGAAAGCCATTGCAAAAACTTCGTTATGTAGCCTTTGGTCTTGGTAACAAAACTTATGAGCATTACAATGAGGTCATTAGAAAAGTAGATAACCGTTTACTTTCTTTGGGTGCAAAGAGAATCGGCGAAAGAGGAGAAGGTGATGATGATGGTACACTTGAAGAAGATTTCTTGGCTTGGCAAGAAGAGATGTGGCCTGCTTTTTGTGAAGCTCTTGGTGTAGATGAAAGCAATGCTCACTCTGGACCACGCCAAGCTATTTTCAAAATCGAAGAACTGACTGCATATGACCAAGCAAAGGTCTACCTTGGTGAAATAGGAGAATGGCTTAAGGAAGGAGCCTCTATTGTTTATGATGCTAAACGTCCTTACAATGCACCTATTACTTCAAAGGACATTTTCAAAGCAGGCGATAGACATTGTCTTCATCTTGAAATTGATATTTCTAATACAAACTTGTCTTATCAAACTGGTGACCATGTTGCTATTTGGCCAACAAACAATGAAGTCGAAGTCAACCGTCTTGCTAAACTTCTTGGATTACAAAATAAGTTGGATACAGTCATTCACGTACAATCACTTGACCCTGCTGCTTCCAAAAAATATCCTTTCCCAGTTCCTACAACCTATCGAGCTGTATTCCGTCATTACCTTGACATTTGTTCTGCAGTTCCCCGTCAAGTC TTGATGTCATTGATTGAATATGCTCCTACTGAAGCCTCCAAAGAAGCTCTTAGAAAACTTGCTACTGATAAAGATGAATATCGTGTTCATGTAGGTGATGTCACTCGTAACTTGGGTGAGGTATTACAAATGTTGGCAGAGAGTGAATCTTTGGAGTTAGATGGTGCATTTTCCTCAGTTCCTTTCGATTTAGTTATTGAAAGCATCTCACGTCTTCAACCTCGCTACTACTCCATTTCTTCATCATCAAAAGAAAATCCCAAAAAGATTGCCGTTACTGCAGTCACTCTTCAATACACTCCAGAGCACGGATCTCCTCGTACAGTCTATGGTGTTAATACCAACTATCTTTGGCGTGTTCATGAAGCAGTCAATAACTTAACTCCTAATAGTGTGATCCCTGAATATAACTTGACAGGACCACGTGATTCATTGTTTAGCCAGCAAGGCAAAGTTGCTCGTATTCCTGTTCATGTCCGTCGTTCTCAATTCAAATTGCCTAGAAATCCTACTGTGCCTGTTATCATGATCGGTCCTGGTACTGGTGTTGCACCATTCCGTGGATTTGTTAGAGAACGCGCACTTCAAAAGAAGGAAAATAAACCAGTGGGGCCTACTATCCTCTTCTTTGGTTGTCGTAATAGAGCAGAAGATTTCCTTTATGAAGAAGAATGGCCAGAGTTATTTGAAGTCTTGGGAGGTGATTCTCGTATCATCACAGCATTTTCACGTGAAACTGAAAAAAAGGTTTATGTACAACACCGCTTAATGGAAAATGGCCAAGAGATGTGGAATTTATTGGAAAAGGGCGCTTACGTTTATGTTTGTGGAGATGCAAAGAACATGGCTCGTGATGTTAATCAAACATTTGTACGCTTTGCACAACAGTTTGGCGGAATGGACGAAAATCGATCTCAGGATTACGTGAAGAATTTGAGAAATACGGGTAGATACCAAGAAGATGTTTGGAGTTAA
所述黑根霉菌丝获得方法如下:
a.在PDA培养基平板上对黑根霉进行菌种活化,培养温度28~30℃,所 述的PDA培养基终浓度为:马铃薯200g/L,葡萄糖20g/L,琼脂粉15g/L,溶剂为水,pH自然;
b.在PDA斜面上培养3~5天后,用无菌水洗下黑根霉孢子,玻璃珠打散并用无菌纱布过滤制成孢子悬液后接种至MYG液体培养基,至于28~30℃下静置培养14~16h,收集得到黑根霉菌丝。
本发明的有益效果主要体现在:本发明首次利用原生质体转化法将构建好的含有米根霉CPR基因的pCB1004-pgpd质粒转化至黑根霉,找到了合适的转化参数并优化了参数组合,构建了适用于黑根霉遗传转化系统,可以用于黑根霉的分子生物学研究,如研究该菌对甾体化合物代谢的分子机制以及该菌的生长发育机制等;可以用来对黑根霉实施其他基因工程从而进行遗传改良育种。
(四)具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明进行进一步描述,但本发明的保护范围并不仅限于此:
实施例1:利用原生质体转化法对黑根霉进行外源基因pCB1004-pgpd-CPR的遗传转化
利用发明内容中所述的方法,将含有CPR目的基因的外源质粒pCB1004-pgpd-CPR导入了黑根霉,通过潮霉素筛选得到稳定转化的工程菌并应用于甾体化合物的羟化转化。具体方法如下:
1、真菌表达质粒构建
1)根据geneBank上的黑根霉CPR基因序列设计引物:
CPR-F:5’-GGATCCATGACTCGAAACAACTCTCATC-3’(下划线为 BamH I酶切位点);
CPR-R:5’-AAGCTTTTAACTCCAAACATCTTCTTGG-3’(下划线为Hind III酶切位点)
按照Takara RNAiso Plus试剂盒说明书提取米根霉(CICC40467)总RNA,然后用PrimeScript RT-PCR Kit反转录得到cDNA。以反转录扩增出的cDNA为模板,CPR-F/CPR-R为引物PCR扩增CPR基因。
PCR体系:10×PCR buffer(Takara)5.0μL,d NTPs2.0μL(10mM),CPR-F1.0μL(100mM),CPR-R1.0μL(100mM),cDNA模板5.0μL,TaKaRa Ex Taq HS0.25μL(5u/μL),RNase Free dH2O补充至25μL。
PCR程序:94℃预变性2min;94℃变性40s,60℃退火30s,55℃退火30s70℃延伸2min(35次循环);72℃延伸5min。经T-A克隆得到重组载体pMD19-T-CPR,转化E.coli DH5α。
2)分别用BamH I和Hind III对pMD19-T-CPR和质粒pCB1004-pgpd(质粒由浙江工业大学朱廷恒博士惠赠)双酶切,将获得纯化后的目的基因CPR与质粒pCB1004-pgpd大片段连接,连接产物转化E.coli至DH5α,涂布于含50μg/mL氯霉素抗性的LB平板,筛选含表达质粒pCB1004-pgpd-CPR的转化子。以特异性引物CPR-F/CPR-R进行菌落PCR鉴定后提取质粒,在分别以BamH I和Hind III进行酶切鉴定得到正确结果后,测序。
测序结果如下:
真菌表达质粒目的条带CPR测序结果比对:
自带引物测序结果:
CPR引物:
上游(5’-3’):GGATCCATGACTCGAAACAACTCTCATC
Bam HI
下游(5’-3’):AAGCTTTTAACTCCAAACATCTTCTTGG
Hind III
686bp
AGGGTCGTCGAGTCATCTTCTTTTATGGTTCTCAGACAGGTACAGCCGAAGACTTTGCTT
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ACAACAGTTTGGCGGAATGGACGAAAATCGATCTCAGGATTACGTGAAGAATT
测交接触序列:
CPR测序引物(5’-3’):GAGGTGATTCTCGTATCATCAC
Pgpd A测序引物(5’-3’):GGTTGACAAGGTCGTTGCGTCA
271bp
ATGACTCGAAACAACTCTCATCATCTGCTTGACACAGTCGATTTGATACTGCTAGGTACC
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ATGACTCGAAACAACTCTCATCATCTGCTTGACACAGTCGATTTGATACTGCTAGGTACC
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由以上测序结果可见:序列完全正确。
2、黑根霉原生质体的制备
1)在PDA培养基平板上对黑根霉(台州仙琚药业HG09-11-03)进行菌种活化,培养温度28~30℃;PDA培养基终浓度组成为:马铃薯200g/L,葡萄糖20g/L,琼脂粉15g/L,pH自然;
2)在PDA斜面上培养3~5天后,用无菌水洗下黑根霉孢子,玻璃珠打散并用无菌纱布过滤制成孢子悬液后接种至MYG液体培养基,至于28~30℃下静置培养14~16h;所述的MYG液体培养基终浓度为:麦芽糖5g/L,酵母粉5g/L,葡萄糖10g/L;
3)收集步骤2)所得的菌丝,用无菌去离子水洗涤2次后,再用酶解液(0.5mol/L MgSO4,50mmol/L DL-Maleate aicd,溶剂为水)洗涤2次即可;
4)lywallzyme(购自广东微生物研究所)和Yatalase(购自Takara)质量比为5:7的混合酶溶解于无菌的0.5mol/L MgSO4,50mmol/L DL-Maleate aicd溶液中,制成终浓度为50mg/mL的细胞壁降解酶液;每1ml细胞壁降解酶液加入约1.0g湿菌体,置30℃水浴锅,每20min轻轻摇匀,酶解游离原生质体3~4h,得到原生质体酶解液
5)将原生质体酶解液用1mol/L山梨醇溶液稀释,然后用双层无菌擦镜纸过滤除去菌丝残片,5000r/min离心10min,的原生质体沉淀,并用1mol/L山梨醇溶液悬浮调节原生质体浓度为107~108个/mL;所述山梨醇溶液组成如下:1mol/L山梨醇,10mmol/L Tris-Cl,50mmol/L CaCl2,溶剂为水,pH7.0;
3、确定黑根霉对潮霉素B的最小抑制浓度
潮霉素B(Hygromycin B)通过抑制蛋白质的合成阻碍原核生物、真核生物和哺乳动物细胞的生长,属于氨基糖苷类抗生素。真菌类一般对潮 霉素B的敏感性较低。将制备好的黑根霉孢子悬液(1×107个/mL),涂布于含不同浓度潮霉素B的MYG培养基平板,不含抗性的MYG培养基作为空白对照。30℃下培养4d。空白组黑根霉长势十分旺盛,菌丝周围已出现大量浓密孢子;潮霉素B为150μg/mL的平板上有菌丝停止匍匐生长,少数盖顶生长,但长势很弱,孢子出现时间较晚,且数量较少;潮霉素B为200μg/mL的平板则完全不能生长。则确定潮霉素B浓度为200μg/mL作为最小抑制浓度。
4、PEG-CaCl2介导原生质体进行外源DNA转化
1)线性化外源基因pCB1004-pgpd-CPR制备。用Hind III对pCB1004-pgpd-CPR质粒进行线性化酶切,纯化后溶于无菌去离子水,浓度为10μg/mL,用于转化。
2)100μL原生质体中加入10μL线性化pCB1004-pgpd-CPR质粒和1μL Hind III,混匀,冰浴30min
3)缓慢加入25μL PEG-4000-CaCl2溶液,混匀,冰浴10min;
4)加入500μL PEG-4000-CaCl2溶液,混匀,室温静置10min;所述PEG4000-CaCl2溶液终浓度组成如下:PEG400060%,CaCl250mmol/L,山梨醇1mol/L,Tris-Cl10mmol/L,溶剂为水,pH7.0;
5)上述转化液转移至10mL MYG液体再生培养基,28℃,80rpm,培养12h;所述MYG液体再生培养基组成如下:麦芽糖5g/L,酵母粉5g/L,葡萄糖10g/L,溶剂为水;
6)带原生质体细胞壁再生后,将上述培养液8000r/min离心5min,再用无菌去离子水洗涤2次。将菌悬液涂布于含有150μg/mL潮霉素B的 MYG固体平板,28℃培养;所述MYG固体平板组成如下:麦芽糖5g/L,酵母粉5g/L,葡萄糖10g/L,琼脂15g/L,溶剂为水,按上述组成配制,高温灭菌后倒平板;
7)待抗性平板上长出菌丝后,打下琼脂块转接到抗性平板上;转化子在潮霉素浓度200μg/mL的MYG固体培养基上继代培养,考察遗传稳定性;
8)提取转化子基因组,用潮霉素抗性基因和CPR目的基因进行PCR,确定目的基因片段是否整合到黑根霉基因组中。鉴定正确后保存。
9)黑根霉转化子对甾体底物羟化作用
将黑根霉转化子应用于甾体底物的羟化转化发酵实验,经多次重复实验后,转化子相比出发菌株对甾体的羟化转化率提高约4%左右。
发酵实验条件如下:发酵培养基组成:葡萄糖30g/L,玉米浆25g/L,硫酸铵1.6g/L,蚕蛹粉g/L,溶剂为水,pH自然,0.1MPa、120℃灭菌10min;500mL三角瓶装液量100mL,接0.5mL黑根霉(转化子或出发菌株)孢子悬液(浓度约108个/mL),往复式摇床,100r/min、28℃震荡培养22h,投入2mL沃氏物底物(沃氏物:乙醇:水按体积比2:1.8:4.3混合,90℃回流45min后的混合物),转化43h,终止发酵。
结果:
成功构建了黑根霉CPR基因工程菌,建立了采用原生质体转化法黑根霉遗传转化体系,并应于与黑根霉甾体化合物羟化反应。
Claims (3)
1.一种利用原生质体转化构建黑根霉CPR基因工程菌的方法,所述方法包括:
(1)从米根霉克隆得到其CPR基因,克隆至质粒pCB1004-pgpd,得到表达质粒pCB1004-pgpd-CPR;
(2)将黑根霉孢子原生质体用1mol/L的山梨醇溶液悬浮,调节原生质体浓度为107~108个/mL,得到原生质体溶液;所述山梨醇溶液组成如下:1mol/L山梨醇,10mmol/L Tris-Cl,50mmol/L CaCl2,溶剂为水,pH7.0;
(3)将构建的表达质粒pCB1004-pgpd-CPR经限制性内切酶酶切,酶切产物纯化后溶于无菌去离子水至浓度为10~15μg/mL,得到线性化质粒溶液;
(4)每100μL原生质体溶液加入10μL线性化质粒溶液,并加入1~2μL步骤(3)所述限制性内切酶,混匀,冰浴30min后,加入20~50μL的PEG4000-CaCl2溶液,冰浴10~20min;再加入400~800μL的PEG4000-CaCl2溶液,室温静置10~15min;所述PEG4000-CaCl2溶液组成如下:PEG400060%,CaCl250mmol/L,山梨醇1mol/L,Tris-Cl10mmol/L,溶剂为水,pH7.0;
(5)步骤(4)转化液转移至10mL MYG液体再生培养基,28℃、80rpm,培养12h后,离心,用无菌去离子水洗涤,获得菌悬液涂布于含有150μg/mL潮霉素B的MYG固体平板,28℃培养;
(6)待平板上长出菌丝后,转接到含有150μg/mL潮霉素B的MYG固体平板上;转化子在潮霉素B浓度200μg/mL的MYG固体平板上继代培养,提取转化子基因组,进行PCR确定目的基因片段是否整合到黑根霉基因组中,鉴定正确后保存。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于所述黑根霉孢子原生质体溶液按如下方法制得:
(1)收集黑根霉菌丝,用无菌去离子水洗涤2次后,再用酶解液洗涤2次,得湿菌体;所述酶解液组成如下:0.5mol/L MgSO4,50mmol/L DL-Maleate aicd,溶剂为水;
(2)每1ml细胞壁降解酶液加入0.5~1.0g湿菌体,置30℃水浴锅,每20min轻轻摇匀,酶解游离原生质体3~4h,得到原生质体酶解液;细胞壁降解酶液按如下组成配制:lywallzyme和Yatalase质量比为5:7的混合酶溶解于无菌的0.5mol/L MgSO4、50mmol/LDL-Maleate aicd溶液中,制成终浓度为50mg/mL的细胞壁降解酶液;
(3)将原生质体酶解液用1mol/L山梨醇溶液稀释,过滤除去菌丝残片,5000r/min离心10min,得原生质体沉淀,用1mol/L山梨醇溶液悬浮,调节原生质体浓度为107~108个/mL,得原生质体溶液。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于所述CPR基因序列如下:
ATGACTCGAAACAACTCTCATCATCTGCTTGACACAGTCGATTTGATACTGCTAGGTACCATTGGCCTTGGTACAGTTGCTTGGTTTGCTAGACATCAAATAGCCAATCGACTTTTCAAATCTGATTCTACCAATAAATCTGAAGTTAAGGATGAGGCAAAGACCCCTAAACAAGAACGTAACTTTGTTAAAGTGATGCAGCAACAGGGTCGTCGAGTCATCTTCTTTTATGGTTCTCAGACAGGTACAGCCGAAGACTTTGCTTCTCGTCTTGCAAAAGAATGTACACAAAAATATGGTGTGAGCGCAATGACTGCTGATATTGAACAATATGATTTGAGCTACCTTGATTCAGTTCCCGAAGACTCTTTGGTGTTCTTTATTATGGCAACCTATGGTGAAGGTGAACCTACTGATAACGCTGTTGATTTTTGGGACTTGTTAGCAGAAGAGGTACCTGAGTTCTCTAATGATGATGGTGAGGGAAAGCCATTGCAAAAACTTCGTTATGTAGCCTTTGGTCTTGGTAACAAAACTTATGAGCATTACAATGAGGTCATTAGAAAAGTAGATAACCGTTTACTTTCTTTGGGTGCAAAGAGAATCGGCGAAAGAGGAGAAGGTGATGATGATGGTACACTTGAAGAAGATTTCTTGGCTTGGCAAGAAGAGATGTGGCCTGCTTTTTGTGAAGCTCTTGGTGTAGATGAAAGCAATGCTCACTCTGGACCACGCCAAGCTATTTTCAAAATCGAAGAACTGACTGCATATGACCAAGCAAAGGTCTACCTTGGTGAAATAGGAGAATGGCTTAAGGAAGGAGCCTCTATTGTTTATGATGCTAAACGTCCTTACAATGCACCTATTACTTCAAAGGACATTTTCAAAGCAGGCGATAGACATTGTCTTCATCTTGAAATTGATATTTCTAATACAAACTTGTCTTATCAAACTGGTGACCATGTTGCTATTTGGCCAACAAACAATGAAGTCGAAGTCAACCGTCTTGCTAAACTTCTTGGATTACAAAATAAGTTGGATACAGTCATTCACGTACAATCACTTGACCCTGCTGCTTCCAAAAAATATCCTTTCCCAGTTCCTACAACCTATCGAGCTGTATTCCGTCATTACCTTGACATTTGTTCTGCAGTTCCCCGTCAAGTCTTGATGTCATTGATTGAATATGCTCCTACTGAAGCCTCCAAAGAAGCTCTTAGAAAACTTGCTACTGATAAAGATGAATATCGTGTTCATGTAGGTGATGTCACTCGTAACTTGGGTGAGGTATTACAAATGTTGGCAGAGAGTGAATCTTTGGAGTTAGATGGTGCATTTTCCTCAGTTCCTTTCGATTTAGTTATTGAAAGCATCTCACGTCTTCAACCTCGCTACTACTCCATTTCTTCATCATCAAAAGAAAATCCCAAAAAGATTGCCGTTACTGCAGTCACTCTTCAATACACTCCAGAGCACGGATCTCCTCGTACAGTCTATGGTGTTAATACCAACTATCTTTGGCGTGTTCATGAAGCAGTCAATAACTTAACTCCTAATAGTGTGATCCCTGAATATAACTTGACAGGACCACGTGATTCATTGTTTAGCCAGCAAGGCAAAGTTGCTCGTATTCCTGTTCATGTCCGTCGTTCTCAATTCAAATTGCCTAGAAATCCTACTGTGCCTGTTATCATGATCGGTCCTGGTACTGGTGTTGCACCATTCCGTGGATTTGTTAGAGAACGCGCACTTCAAAAGAAGGAAAATAAACCAGTGGGGCCTACTATCCTCTTCTTTGGTTGTCGTAATAGAGCAGAAGATTTCCTTTATGAAGAAGAATGGCCAGAGTTATTTGAAGTCTTGGGAGGTGATTCTCGTATCATCACAGCATTTTCACGTGAAACTGAAAAAAAGGTTTATGTACAACACCGCTTAATGGAAAATGGCCAAGAGATGTGGAATTTATTGGAAAAGGGCGCTTACGTTTATGTTTGTGGAGATGCAAAGAACATGGCTCGTGATGTTAATCAAACATTTGTACGCTTTGCACAACAGTTTGGCGGAATGGACGAAAATCGATCTCAGGATTACGTGAAGAATTTGAGAAATACGGGTAGATACCAAGAAGATGTTTGGAGTTAA。
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Cited By (1)
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---|---|---|---|---|
CN106591361A (zh) * | 2015-10-20 | 2017-04-26 | 钱文斌 | 一种重组痘溶瘤病毒及其构建方法和应用 |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101532028A (zh) * | 2009-04-21 | 2009-09-16 | 江南大学 | 一种高产糖化酶工业生产菌株的选育方法 |
EP2308983A1 (en) * | 2009-10-05 | 2011-04-13 | Univerza v Ljubljani | Cytochrome P450 from Rhizopus oryzae and uses thereof |
CN102978233A (zh) * | 2012-11-16 | 2013-03-20 | 河南农业大学 | 一种黑根霉菌丝脂质体直接转化方法 |
CN103088013A (zh) * | 2012-11-06 | 2013-05-08 | 湖南科源生物制品有限公司 | 一种黑根霉及其催化甾体羟基化反应的微生物转化方法 |
CN103966056A (zh) * | 2014-06-03 | 2014-08-06 | 四川理工学院 | 一种白酒籼米散曲的制备方法 |
-
2013
- 2013-07-24 CN CN201310316876.2A patent/CN103695455B/zh active Active
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101532028A (zh) * | 2009-04-21 | 2009-09-16 | 江南大学 | 一种高产糖化酶工业生产菌株的选育方法 |
EP2308983A1 (en) * | 2009-10-05 | 2011-04-13 | Univerza v Ljubljani | Cytochrome P450 from Rhizopus oryzae and uses thereof |
CN103088013A (zh) * | 2012-11-06 | 2013-05-08 | 湖南科源生物制品有限公司 | 一种黑根霉及其催化甾体羟基化反应的微生物转化方法 |
CN102978233A (zh) * | 2012-11-16 | 2013-03-20 | 河南农业大学 | 一种黑根霉菌丝脂质体直接转化方法 |
CN103966056A (zh) * | 2014-06-03 | 2014-08-06 | 四川理工学院 | 一种白酒籼米散曲的制备方法 |
Non-Patent Citations (4)
Title |
---|
S. PETRI ET AL.: "Discovery of a steroid 11α-hydroxylase from Rhizopus oryzae and its biotechnological application", 《JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY》 * |
TOMAZ MAKOVEC AND KATJA BRESKVAR: "Purification and Characterization of NADPH–Cytochrome P450 Reductase from Filamentous Fungus Rhizopus nigricans", 《ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS》 * |
XIAOLONG CHEN ET AL.: "Molecular cloning, expression of CPR gene from Rhizopus oryzae into Rhizopus nigericans and its application in the 11α-hydroxylation of 16α,17-epoxy-progesterone", 《ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY》 * |
王森: "固定化黑根霉进行甾体C11α羟基化的研究", 《中国优秀硕士学位论文全文数据库工程科技I辑》 * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN106591361A (zh) * | 2015-10-20 | 2017-04-26 | 钱文斌 | 一种重组痘溶瘤病毒及其构建方法和应用 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
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