本申请要求2008年2月21日提交的标题为“Macrocyclic Prodrug Compounds Useful as Therapeutics”的美国临时专利申请61/030,446的优先权,其内容为了所有目的整体援引加入本文。本申请还与2007年8月10日提交的标题为“Macrocyclic Compounds Useful as Inhibitors of Kinase and HSP90”的国际申请PCT/US2007/017754和美国序列号11/891,652,和2007年8月10日提交的标题为“Treatment of Neurofibromatosis with Radicicol and its Derivatives”的国际申请PCT/US2007/075739,以及2009年1月15日提交的标题为“Synthesis of Resorcylic Acid Lactones Useful as Therapeutic Agents”的国际申请PCT/US2009/031149相关,其内容为了所有目的整体援引加入本文。
发明背景
在20世纪50年代中期,已发现磷酸化可以通过催化磷酸化的蛋白激酶或通过涉及脱磷酸化步骤的蛋白磷酸酶可逆地改变酶的功能。这些反应在调节许多细胞过程(特别是信号转导途径)中起重要作用。在20世纪70年代后期,发现劳氏肉瘤病毒(v-Src)转化因子是蛋白激酶,而且也发现肿瘤促进佛波醇酯是蛋白激酶C的有效激活剂,这揭示了首次了解的疾病和异常蛋白质磷酸化之间的联系。从那以后,已经发现转导机理的缺陷引起许多致癌过程并且在糖尿病、炎性病症和心血管疾病中起作用(T.Hunter,Cell,100:113-127(2000);P.Cohen,Nat.Rev.Drug Discov.,1:309(2002))。因此,选择性的激酶和磷酸酶抑制剂已呈现为重要的药物靶,并且抑制激酶磷酸化活性是化学疗法的最有希望的策略之一。已经批准了三种激酶抑制 剂药物:Gleevec(其抑制Ab1)以及Iressa和Tarceva(后两者均抑制EGFR)。
通过丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸残基的激酶介导的磷酸化或磷酸酶介导的去磷酸化来调节蛋白质活性是大多数信号转导机理的核心。(T.Hunter,Cell,100:113(2000))。小分子抑制剂(例如6-二甲基氨基嘌呤和星状孢子素)有助于阐明这样的磷酸化机理的重要性,并且阐明激酶的生物功能。激酶以0.1-10μM的Km结合于ATP,并将γ-磷酸酯基团选择性地转移至给定蛋白质的特定残基。激酶的核心结构域由所述ATP结合位点和涉及磷酸转移反应的残基组成,在整个激酶组中高度保守。(G.Manning等人,Science,298:1912(2002))。这导致了以下推测:针对该高度保守的ATP结合袋的抑制剂不仅必须与以高浓度(mM)存在的ATP竞争,而且必将缺乏选择性。修饰的嘌呤(例如(R)-细胞周期蛋白依赖激酶)是强效并具有相当选择性的抑制剂的发现(L.Meijer和E.Raymond,Acc.Chem.Res.,36:417(2003))驳斥了那种观点并且激发了合成围绕嘌呤骨架的组合库(Y.T.Chang等人,Chem.Biol.,6:361(1999);S.Ding等人,J.Am.Chem.Soc.,124:1594(2002)),获得了重要的先导物(lead)(N.S.Gray等人,Sciences,281:533(1998);M.Knockaert等人,Chem.Biol.,7:411(2000))。
在这方面也已研究了大环二羟基苯甲酸内酯。这类化合物的原型是根赤壳菌素和相关的pochonin,它们是从麦角菌目丝孢菌普可尼亚属(clavicipitaceous hyphomycete Pochonia genus),例如厚垣孢普可尼亚菌(Pochonia chlamydosporia)变异链状菌株P0297的培养物中分离的次级代谢物的结构相关的组。参见例如V.Hellwig等人,J.Natural Prod.,66(6):829-837(2003)。制备根赤壳菌素的卤代醇和肟衍生物并评估它们的v-src酪氨酸激酶抑制、抗增殖和抗肿瘤的体外活性(T.Agatsuma等人,Bioorg.& Med.Chem.,10(11):3445-3454(2002)。
像激酶一样,热激蛋白质(HSP)与ATP相互作用,并且是控制疾病的重要靶,然而它们具有不同的机理效应。接触应激(例如热、缺氧或酸中毒)后,大多数组织中的细胞立即迅速增加HSP的产生速率。目前认为热HSP是分子伴侣,即它们防止不合适的缔合并且帮助正确地折叠统称为客户(client)和底物的其它分子蛋白质。还发现HSP与肿瘤和其它病理生理学状态有关。事实上,伴侣蛋白通过促进对细胞内部变化的耐受性进而促进肿瘤细胞在应激环境中的存活。HSP是普遍存在的,在物种中高度保守,并且通常按照分子量分为以下主要的家族:HSP100、HSP90、HSP70、HSP60和小HSP。这些家族具有结构和功能差异,但是它们在蛋白质折叠的不同阶段协同工作。HSP90受到了特别的关注,因为它与许多类型的信号分子(例如v-Src和Raf)有关,所述信号分子在恶性转化和转移发展中起重要作用。因此,期望HSP90抑制剂用于设计化学治疗,并且还用于阐述复杂信号网络中的相互作用。
热激蛋白质90(Hsp90)是普遍存在的伴侣蛋白,其维持许多“客户”蛋白的合适的构象(参见Kamal等人,Trends Mol.Med.2004,10,283-290;Dymock等人,Expert Opin.Ther.Patents 2004,14,837-847;Isaacs等人,Cancer Cell,2003,3,213;Maloney等人,Expert Opin.Biol.Ther.2002,2,3-24 和Richter等人,J.Cell.Physiol.2001,188,281-290)并且参与折叠、活化和装配大范围的蛋白质,包括涉及信号转导、细胞周期控制和转录调节的关键蛋白质。研究人员已经报道了HSP90伴侣蛋白与重要的信号蛋白有关,所述重要的信号蛋白诸如类固醇激素受体和蛋白激酶,包括例如Raf-1、EGFR、v-Src家族激酶、Cdk4和ErbB-2(Buchner,TIBS,1999,24,136-141;Stepanova等人,Genes Dev.1996,10,1491-502;Dai等人,J.Biol.Chem.1996,271,22030-4)。研究进一步指示某些辅陪伴蛋白(co-chaperone)(例如Hsp70、p60/Hop/Stil、Hip、Bag1、HSP40/Hdj2/Hsj1、抑免蛋白、p23和p50)可促进HSP90的功能(参见例如Caplan,Trends in Cell Biol.,1999,9,262-268)。抑制Hsp90引起这些客户蛋白质采用异常构象,并且这些异常折叠的蛋白质由细胞经泛素化(ubiquitinylation)和蛋白酶体降解迅速消除。有趣的是,Hsp90客户蛋白的列表包括一系列众人皆知的致癌基因。它们中的四种是临床验证的癌症靶:HER-2/neu( (曲妥著单抗))、Bcr-Abl( (甲磺酸伊马替尼))、雌激素受体(他莫昔芬)和雄激素受体( (比卡鲁胺)),而其它基因在癌症的产生中起重要的作用。一些最敏感的Hsp90客户涉及生长信号(Raf-1、Akt、cdk4、Src、Bcr-Abl等)。相比之下,似乎很少有肿瘤抑制基因(如果有)是Hsp90的客户(客户蛋白的列表参见Pratt等人,Exp.Biol.Med.2003,228,111-133;Workman等人Cancer Lett.2004,206,149-157和Zhang等人,J.Mol.Med.2004,82,488-499),因此抑制Hsp90具有全面的抗增殖效应。此外,一些客户蛋白涉及肿瘤发生的其它基本过程,即凋亡逃逸(apoptosis evasion)(例如Apaf-1、RIP、Akt)、永生性(immortality)(例如hTert)、血管发生(例如VEGFR、Flt-3、FAK、HIF-1)和转移(c-Met)。
然而,药用的HSP抑制剂必须是选择性的,因为HSP还起到构造(constructive)作用。在非应激条件下,HSP90是存在于真核细胞中的最大量的蛋白质之一,代表总细胞蛋白质含量的1-2%,并且当细胞受到应激时仅增加约两倍。当与天然客户结合时,HSP90主管例如折叠新生多肽、跨膜转运蛋白质以及正常的蛋白质周转。此外,HSP90在翻译后调节信号分子中起关键作用,导致它们的活化。HSP90很少单独起作用,而是与伴侣蛋白HSP70、辅陪伴蛋白(HSP40、CDC37/p50、AHA1、p23)和辅助蛋白一起工作。
HSP90的许多客户蛋白在生长控制、细胞存活和发育过程中起关键作用,且已知那些客户包括受体酪氨酸激酶、丝氨酸/苏氨酸激酶、类固醇激 素受体、转录因子和端粒末端转移酶。客户的致癌突变体也是客户自身,只是对HSP90的功能具有更高的需求,例如突变体v-SRC酪氨酸激酶需要从蛋白质的HSP90协同装配中得到更强的蛋白质折叠能力(Y.Xu等人,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,96:109(1999);H.Oppermann等人,同上,78:1067(1981);L.Whitesell等人,同上,91:8324(1994)。同样,肿瘤抑制蛋白p53的突变导致发现于人类癌症中的最普遍的分子遗传缺陷,并且大多数p53突变表现出与HSP90的扩大的相互作用(可能由于异常构象),这防止了它们通常的泛素化和随后被蛋白酶体降解(M.V.Blagosklonny等人,同上,93:8379(1996))。然而,尽管有HSP90客户的普遍参与,但是它们大多数是前生长信号蛋白(pro-growth signaling protein),并且其伴侣蛋白功能在肿瘤发生期间被破坏,这导致恶性转化的产生以及所转化表型的维持。
除了抗癌和抗肿瘤形成(antitumorgenic)活性外,HSP90抑制剂还涉及许多其它应用,包括用作抗炎剂、抗传染病剂、治疗自身免疫的药剂、治疗缺血的药剂和用于促进神经再生的药剂(参见例如Rosen等人,WO02/09696;PCT/US01/23640;Degranco等人,WO 99/51223;PCT/US99/07242;Gold,美国专利第6,210,974B1号)。文献报道了纤维形成病症(包括但不限于硬皮病、多肌炎、全身性狼疮(systemic lupus)、类风湿关节炎、肝硬化、瘢痕形成、间质性肾炎和肺纤维化)是可治疗的(Strehlow,WO 02/02123;PCT/US01/20578)。
因此,安沙霉素类和其它HSP90抑制剂对治疗和/或预防许多类型的病症是很有前途的。然而,许多天然产物衍生的Hsp90抑制剂表现出药学上的缺陷;它们的相对不溶性使它们难以配制和给药,并且它们不容易合成,而且目前必须(至少部分地)通过发酵生产。此外,安沙霉素的剂量限制毒性为肝毒性。例如半合成抑制剂17-烯丙基氨基,17-去甲氧基-格尔德霉素(17-AAG),目前在II期临床试验中,其造价昂贵,配制困难(NCI临床方案由注射17-AAG的DMSO溶液组成),且目前只能肠胃外给药。尽管17-二甲基氨基乙基氨基类似物(17-DMAG)更加易溶,但它表现出所有17-AAG的副作用,并且在临床前毒性研究中出现胃肠出血(Glaze等人,Proc.Am.Assoc.Cancer.Res.2003,44,162-162和Eiseman等人,Cancer Chemother.Pharmacol.2005,55,21-32)。另一种天然产物Hsp90抑制剂——根赤壳菌素(RC)的水溶性差,并且在肿瘤异种移植中没有活性。根赤壳菌素的半合成肟衍生物提供较好的溶解性并且大大改善了鼠科模型中的药理学特征,但是仍然仅限于静脉内给药(Ikuina等人,J.Med.Chem.2003,46,2534-2541)。 此外,根赤壳菌素和其肟含有被视为对稳定性和毒性负责的环氧乙烷环,这促进了环丙根赤壳菌素(cycloproparadicicol)的合成:Yang等人,J.Am.Chem.Soc.2004,126,7881和2003,125,9602-9603)。尽管安沙霉素类具有潜力,但因此需要替代的HSP90抑制剂。
已经寻找Hsp90的全合成口服活性抑制剂,以便提供更加灵活的给药方案选择,并且可能避免天然产物抑制剂的副反应。Chiosis等人描述了嘌呤类似物的设计和合成,所述嘌呤类似物模拟格尔德霉素和其它安沙霉素类结合HSP90的ATP结合袋并因此抑制HSP90的能力。参见国际专利申请PCT/US01/46303(WO 02/36075;Chemistry & Biology 8:289-299(2001))。Chiosis等人描述的具体化合物包括在3、4和5位取代的三甲氧苄基实体。使用凝胶结合测定,证明这些化合物结合HSP90比17-AAG低近20倍。
最近,已经报道了其它新的非天然产物Hsp90抑制剂(例如PU3和CCT018159;参见Chiosis等人,Bioorg.Med.Chem.Lett.2002,10,3555-3564;Vilenchik等人,Chem.Biol.2004,11,787-797;Chiosis等人,WO 0236075,2002;Drysdale等人,WO 03/055860A1,2003;Wright等人,Chem.Biol.2004,11,775-785;Dymock等人,Bioorg.Med.Chem.Lett.2004,14,325-328;Dymock等人,J.Med.Chem.2005,48,4212-4215。Structure of Hsp90 in complex with PU3 pdb code 1UY6,and with PU24FCl:pdb code 1UYF和Clevenger等人,Org.Lett.2004,6,4459-4462)。使用与ATP、格尔德霉素或根赤壳菌素复合的Hsp90的晶体结构设计这些抑制剂的结构。将8-苄基腺嘌呤(例如PU3)设计成采取与格尔德霉素相同的C型构象(Chiosis等人,Current Cancer Drug Targets,2003,3,371-376),其具有指向腺嘌呤结合位点(铰链区)的腺嘌呤环,以及模拟格尔德霉素醌环的H键接受性质的三甲氧基苯环。(PU3的苯环没有设计成具有与格尔德霉素的醌环完全相同的方向。而是将所述三甲氧基苯基团设计成指向相同的一般方向,并且与Lys 112(与格尔德霉素的醌环形成氢键的氨基酸)形成氢键。)最近获得的与PU3复合的Hsp90的晶体结构确认了嘌呤环占据一般由ADP/ATP占据的位置,但是苯环指向与预期方向相反的方向,以形成与Phe138的r-堆积相互作用(r-stacking interaction)。然而,PU3抑制Hsp90(HER-2降解测定,HER-2IC50=40μM)并提供用于进一步优化的有价值的起始点。基于PU3的结构活性研究导致更具活性的PU24FCl(HER-2IC50=1.7μM),其随后还与Hsp90共结晶。当PU24FCl在DMSO/EtOH/磷酸盐缓冲盐水1∶1∶1中配制并向荷有(bearing)MCF-7异种移植肿瘤的小鼠腹膜内给药时,它在100-300mg/kg 时诱导HER-2和Raf-1的下调(一种与Hsp90抑制一致的药效学应答),并且在200mg/kg时它显著抑制了肿瘤生长。当口服给药时,需要非常高剂量(500-1000mg/kg)的PU24FCl才能观察到类似的药效学应答,并且未报道8-苄基腺嘌呤通过口服途径抑制肿瘤生长。在我们手中,证实了PU24FCl过于难溶以至于不能有效地配制和口服递送。目前为止,尽管大量的SAR研究改善了效力和药学性质,但是还未证明当口服给药时,Hsp90抑制剂在人类癌症的动物模型(异种移植物)中具有活性。
8-苄基腺嘌呤的发现导致8-硫烷基腺嘌呤的设计(Kasibhatla等人,WO3037860,2003和Llauger等人,J.Med.Chem.2005,48,2892-2905),以8-(2-碘-5-甲氧基-苯基硫烷基)-9-戊-4-炔基-9H-嘌呤-6-基胺为例,其在几种基于细胞的测定中显示出优异的效能,但是在水中溶解性差,并且在临床可接受的制剂中没有足够的口服生物利用度。
当抑制HSP90时,其客户被降解,即未折叠的蛋白质被泛素化,随后是蛋白酶体介导的水解。到目前为止,大多数报道的抑制剂结合于N端的结构域(见下文),但是报道了一些抑制剂与C端结构域相互作用;HSP90在两个部位都具有ATP结合位点。不完全清楚HSP90的C端功能,但是化合物在该结构域相互作用明显地损害了HSP90功能并且具有抗癌效应。已发现一些二羟基苯甲酸内酯抑制HSP90,因此天然产物根赤壳菌素和格尔德霉素(分别见P.Delmotte和J.Delmotte-Plaquee,Nature(London),171:344(1953);和C.DeBoer等人,J Antibiot(Tokyo),23:442(1970))被证明抑制表达活化的Src的细胞的转化表型(H.J.Kwon等人,Cancer Research,52:6926(1992);Y.Uehara等人,Virology,164:294(1988))。已报道相关的化合物(例如除莠霉素)具有类似的效应(S.Omura等人,J Antibiot(Tokyo),32:255(1979)。
在这方面研究的其它二羟基苯甲酸内酯(RAL)包括17-烯丙基氨基-17- 去甲氧基格尔德霉素(17AAG)(D.B.Solit等人,Clin.Cancer Res.,8:986(2002);L.R.Kelland等人,J.Natl.Cancer Inst.,91:1940(1999));17DMAG(J.L.Eiseman等人,Cancer Chemother.Pharmacol.,55:21-32(2005));IPI-504(J.Ge等人,J.Med.Chem.,49:4606(2006);肟衍生物例如KF25706(S.Soga等人,Cancer Res.,59:2931(1999))和KF55823(S.Soga等人,Cancer Chemotherapy and Pharmacology,48:435(2001));以及Danishefsky等人的环丙根赤壳菌素(A.Rivkin等人,同上,44:2838(2005))。结构相关的变体包括具有根赤壳菌素的羧基间苯二酚和格尔德霉素的苯醌的嵌合抑制剂(chimeric inhibitor)(R.C.Clevenger和B.S.Blagg,Org.Lett.,6:4459(2004);G.Shen和B.S.Blagg,同上,7:2157(2004);G.Shen等人,J.Org.Chem.,71:7618(2006))。
基于根赤壳菌素的HSP90抑制剂
HSP90的嵌合抑制剂
已经研究嘌呤(例如PU3),以便设计适合HSP90的ATP结合位点的小分子(G.Chiosis等人,Chem Biol 8,289-299(2001);G.Chiosis等人,Bioorg.Med.Chem.,10:3555(2002);L.LLauger等人,J.Med.Chem.,48:2892(2005);H.He等人,同上,49:381(2006);M.A.Biamonte等人,同上,49:817(2006))。
基于嘌呤设计的HSP90抑制剂
最近还报道了吡唑(1-35)(M.G.Rowlands等人,Anal.Biochem.,327:176(2004);B.W.Dymock等人,J.Med.Chem.,48:4212(2005))和苯并噻唑硫-嘌呤(1-36)(L.Zhang等人,J.Med.Chem.,49:5352(2006)作为这些酶的小分子抑制剂。
其它类HSP90抑制剂
根赤壳菌素已具有特别意义。根赤壳菌素(一种14元大环内酯,并且也称作单孢菌素)是HSP90的ATP结合袋的有效的、高竞争性和高选择性的配体。HSP90是ATP酶而不是激酶,并且它的ATP结合袋具有Bergerat折叠(A.Bergerat等人,Nature,386:414(1997);R.Dutta和M.Inouye,Trends Biochem.Sci.,25:24(2000)),其与激酶的ATP结合袋不同(S.M.Roe等人,J.Med.Chem.,42:260(1999))。在最初发现后,出现对根赤壳菌素的药物应用的极大关注。(参见美国专利6,946,456和美国专利申请公布2003-0211469、2004-0102458、2005-0074457、2005-0261263、2005-0267087、2006-0073151、2006-0251574、2006-0269618、2007-0004674和2007-0010432)。
引人注目地,已知一些二羟基苯甲酸(resorcylic)大环内酯类(其为根赤壳菌素的相近类似物)抑制激酶,但不抑制HSP90。确实,发现LL-Z1640-2是TAK1激酶的有效和选择性的抑制剂,而根赤壳菌素和其它二羟基苯甲酸酯(resorcylides)对所述TAK1激酶没有活性(J.Ninomiya-Tsuji等人,J.Biol.Chem.,278:18485(2003);P.Rawlins等人,Int.J.Immunopharma.,21:799(1999);K.Takehana等人,Biochem.Biophys.Res.Comm.,257:19(1999);A.Zhao等人,J.Antibiotics,52:1086(1999))。密切相关的LL-783,227(其中一个烯烃被还原)是MEK激酶的有效抑制剂(A.Zhao等人,J.Antibiotics,52:1086(1999))。发现化合物F87-2509.04诱导含有AU富集元素(ARE)的mRNA的降解(T.Kastelic等人,Cytokine,8:751(1996)),并且发现寄端霉素抑制Ras介导的细胞信号(H.Tanaka等人,Jap.J.Cancer Res.,90:1139(1999))。我们已经证明aigialomycin D是CDK抑制剂(S.Barluenga等人,Angew.Chem.,Int.Ed.,46(24):3951(2006))。
根赤壳菌素的其它相近类似物确实抑制HSP90。Pochonin D是HSP90的有效抑制剂。(E.Moulin等人,J.Am.Chem.Soc.,127(19):6999(2005))。并且,已报道pochonin A是HSP90的90nM抑制剂。据发现Pochonin C是疱疹的解旋酶-引发酶的抑制剂,所述解旋酶-引发酶是ATP酶而不是激酶(V.Hellwig等人,J.Nat.Prod.,66:829(2003))。虽然根赤壳菌素和pochonin C在结构上非常相似,但它们在溶液中具有非常不同的构象,并且具有不同 的生物活性(S.Barluenga等人,Chem.Eur.J.,11:4935(2005)。因此,看来所述大环的“松弛(floppiness)”可能在二羟基苯甲酸大环内酯间的抑制差异中起到重要的作用,并且在任何情况下使得那些效应难以通过理论方法进行预测。
已知一些二羟基苯甲酸大环内酯是激酶或磷酸酶的抑制剂(美国专利5,674,892、5,728,726、5,731,343和5,795,910),或抑制其它的酶(美国专利5,710,174,抑制纤维蛋白交联的FXIIIa催化)。二羟基苯甲酸大环内酯还用于其它医学适应症(美国专利3,453,367、3,965,275、4,035,504、4,670,249、4,778,821、4,902,711和6,635,671)。
根赤壳菌素和pochonin是天然产物;用于合成它们的一些类似物的中间体可通过发酵获得,然而仅仅依靠那些天然产物或它们的发酵衍生物严重限制了化合物的范围。因此,已经合成了许多新的二羟基苯甲酸大环内酯。这些中的许多是玉米赤霉烷和相关化合物,其中所述大环除了苯环的几个碳之间外,不含有碳-碳双键。(美国专利序列号3,373,038、3,586,701、3,621,036、3,631,179、3,687,982、3,704,249、3,751,431、3,764,614、3,810,918、3,836,544、3,852,307、3,860,616、3,901,921、3,901,922、3,903,115、3,957,825、4,042,602、4,751,239、4,849,447;和2005-0256183)。还报道了具有以下特征的二羟基苯甲酸大环内酯的合成:苯环外的环上的碳之间存在一个双键(美国专利序列号3,196,019;3,551,454;3,758,511;3,887,583;3,925,423;3,954,805;和4,088,658)。那些二羟基苯甲酸大环内酯中的大部分是14元大环,但是还报道了12元大环类似物的合成(美国专利序列号5,710,174;6,617,348;和2004-0063778,以及PCT公布WO 02/48135)。
还报道了根赤壳菌素相关化合物的合成,所述化合物在大环上具有两个非芳族双键和卤化物或1,2-桥氧基(即环氧化物)。(美国专利序列号4,228,079;5,597,846;5,650,430;5,977,165;7,115,651以及日本专利文件号JP 6-279279A、JP 6-298764A、JP 9-202781A、JP 10-265381A2和JP2000-236984)。根赤壳菌素相关化合物的肟的合成公开于美国专利序列号5,977,165;6,239,168;6,316,491;6,635,662;2001-0027208;2004-0053990;日本专利文件号JP 2003-113183A2;和PCT公布WO 99/55689中。根赤壳菌素的环丙类似物的合成公开于美国专利7,115,651和PCT公布WO05/061481中。一些其它二羟基苯甲酸大环内酯类似物的合成公开于美国专利公布2006-0247448和PCT公布WO 02/48135中。还合成了根赤壳菌素以及Pochonin A和C(S.Barluenga等人,Angew.Chemie,43(26):3467-3470 (2004);S.Barluenga等人,Chemistry-A European Journal,11(17):4935-4952(2005年8月19日);E.Moulin等人,Organic Letters,7(25):5637-5639(2005年12月8日)。
尽管有上述进展,但化学生物学家仍然受到敲除特定激酶活性的有限能力的困扰,其中敲除特定激酶活性是为了揭示(deconvolute)特定激酶在复杂信号网络中的作用。可渗入细胞的小分子有望解决该问题。而且越来越明显的是:激酶的生物功能通常受它们的构象调节,所述构象转而由它们的磷酸化水平并且由分子内和分子间的缔合指示。小分子抑制剂还具有辨别给定激酶的不同构象的潜力,因此小分子提供了详细分析那些构象的各自功能的方法。不幸的是,已知激酶抑制剂的资料(portfolio)还不能支持在分析激酶组(kinome)的不同成员的作用中所要做的全部工作。这不仅是学术研究,因为直到了解激酶的机理和它们的选择性为止,药物设计的合理性会继续受到困扰。
因此对不仅具有改善的效能和选择性,而且具有改善的溶解性和生物利用度的激酶抑制剂和HSP90抑制剂有持续需求。
附图简述
图1A和1B显示磷酸酯前药1a和1b在肝匀浆和肠匀浆中体外水解为它们的母体化合物。
图2A和2B显示磷酸酯前药1a和1b在血浆和人工胃液中体外水解为它们的母体化合物。
发明详述
本发明提供用作激酶抑制剂和HSP90抑制剂的基于二羟基苯甲酸内酯的新化合物。还提供包含所述化合物的组合物和制备所述化合物的方法。本发明提供所述化合物在抑制激酶和HSP-90中的用途,以及治疗激酶介导或HSP90介导的疾病的方法,所述方法包括向患有激酶介导或HSP90介导的疾病的患者给药有效激酶抑制量或有效HSP90抑制量的式I、II、III、IV或V的化合物。
化合物
在一实施方案中,本发明提供式I的化合物,或其药学可接受的盐、溶剂合物和/或酯:
其中:
R1、R2、R3和R4各自独立地为氢、卤素、硝基、氰基、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、芳基、杂烷基、烷基杂芳基、杂环基、杂芳基、OR、NR2、SR、S(O)R、S(O)2R、-SO2N(R)2、-N(R)SO2R、-N(CO)R、-N(CO)NR2、-N(CO)OR、-O(CO)R、-(CO)R、-(CO)OR、-(CO)NR2、-O(CO)OR、-O(CO)NR2,或选自以下的结构式:
条件是R1、R2、R3和R4中的至少一个具有选自(Ia)、(Ib)、(Ic)、(Id)、(Ie)和(If)的结构式;
L1和L2各自独立地为共价键、-O-或-NR3a-;
p是0、1或2;
R1a和R2a各自独立地为氢、烷基、杂烷基、杂芳基、杂环基、烯基、炔基、芳基烷基、杂芳基烷基、杂环基烷基、-亚烷基-C(O)-O-R4a或-亚烷基-O-C(O)-O-R4a;并且
R3a和R4a各自独立地为氢、烷基、杂烷基、环烷基、杂环基、芳基、杂芳基、烯基、炔基、芳基烷基、杂环基烷基或杂芳基烷基;
L3和L4各自独立地为氢、卤素、硝基、氰基、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、芳基、杂烷基、杂环基、杂芳基、杂环基烷基、杂芳基烷基、OR、NR2或SR;
R5a、R6a和R7a各自独立地为氢、烷基、烯基、炔基、烷基芳基、芳基烷基、芳基、杂烷基、烷基杂芳基、杂环基或杂芳基;
R5是氢、卤素、硝基、氰基、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、芳基、杂烷基、烷基杂芳基、杂环基、杂芳基、OR、NR2、SR、S(O)R、S(O)2R、-SO2N(R)2、-N(R)SO2R、-N(CO)R、-N(CO)NR2、-N(CO)OR、-O(CO)R、-(CO)R、-(CO)OR、-(CO)NR2、-O(CO)OR或-O(CO)NR2;
Z具有选自(Ia)、(Ib)、(Ic)、(Id)和(Ie)的结构式;
A1与A2一起为-CH2-CH2-、-CH=CH-、-CH(OH)-CH(OH)-、-CH(OH)-CH(卤素)-、-CH(卤素)-CH(OH)-、1,2-环丙二基或1,2-环氧乙烷;
B1与B2一起为-CH2-CH2-,或B1和B2一起表示共价键;
X1是氢、卤素、OR、NR2、NH-OR、SR、S(O)R、S(O)2R、-N-O-(CH2)n-CO2-R;或者X1与X2或X3一起表示共价键;
X2和X3均为氢,或X2和X3中的一个是氢且另一个与X1一起表示共 价键;
X4与X5一起为=O、=S、=N-OR、=N-O-(CH2)nCOOR、=N-O-(CH2)nCONR2、=N-NR2、=N-N-SOR或=N-N-SO2R;或者X4和X5中的一个是氢,且另外一个是OH、OR、O(CO)R、O(CO)OR、O(CO)NR2、-(CH2)n-O(CO)OR、-(CH2)n-O(CO)NR2;或者X4和X5中的一个与X6一起表示共价键,且X4和X5中的另外一个是OH、OR、O(CO)R、O(CO)OR或O(CO)NR2;
X6是氢,或者X6与X4和X5中的一个一起表示共价键;并且
每一个R独立地为氢、烷基、酰基、芳基、烷芳基、芳基烷基、杂烷基、杂芳基、杂环基、保护基;或者当两个R基团与同一个氮键合时,所述两个R基团与所述氮一起形成5-8元杂环或杂芳基环;并且
n是1、2或3。
在另一实施方案中,本发明提供式II的化合物:
其中,R7是=O、=S、=N-OR、=N-O-(CH2)nCOOR、=N-O-(CH2)nCONR2、=N-NR2、=N-N-SOR或=N-N-SO2R。
在式II化合物的一实施方案中,R1是H、卤素或杂环基。
在式II化合物的一实施方案中,R5是氢、烷基、芳基、杂芳基或芳基烷基。
在式II化合物的一实施方案中,A1与A2一起为-CH=CH-。
在式II化合物的一实施方案中,A1与A2一起为-CH(OH)-CH(OH)-、-CH(OH)-CH(卤素)-或-CH(卤素)-CH(OH)-。
在式II化合物的一实施方案中,A1与A2一起为1,2-环氧乙烷。
在式II化合物的一实施方案中,R1是H、Cl或杂环基;R5是氢、烷基、芳基或芳基烷基;A1与A2一起为-CH=CH-或-C(OH)-C(OH)-;X1是氢、卤素或NH-OR;并且R7是=O、=S、=N-OR、=N-O-(CH2)nCOOR、 =N-O-(CH2)nCONR2、=N-NR2、=N-N-SOR、=N-N-SO2R。优选地,R7是=O。还优选R7为=N-OR、=N-O-(CH2)nCOOR或=N-O-(CH2)nCONR2。
在式II化合物的一实施方案中,R1是H、Cl或杂环基;R5是氢、烷基、芳基或芳基烷基;A1与A2一起为1,2-环氧乙烷;X1是氢、卤素或NH-OR;并且R7是=O、=S、=N-OR、=N-O-(CH2)nCOOR、=N-O-(CH2)nCONR2、=N-NR2、=N-N-SOR、=N-N-SO2R。
在式II化合物的一实施方案中,R1是H、Cl或杂环基;R5是氢、烷基、低级烷基、芳基或芳基烷基;A1与A2一起为-CH=CH-或-C(OH)-C(OH)-;X1与X2一起表示键;并且R7是=O、=S、=N-OR、=N-O-(CH2)nCOOR、=N-O-(CH2)nCONR2、=N-NR2、=N-N-SOR、=N-N-SO2R。优选地,R1是H或Cl;R5是氢、甲基、丙基、异丙基或苯基;并且R7是=N-OR、=N-O-(CH2)nCOOR或=N-O-(CH2)nCONR2。还优选R1是Cl且R5是氢。还优选n为1。还优选R5是氢且R7是=N-O-(CH2)nCOOR或=N-O-(CH2)nCONR2。还优选R5是氢且R7是=N-OR。
在式II化合物的一实施方案中,R1是H、Cl或杂环基;R5是氢、烷基、低级烷基、芳基或芳基烷基;A1与A2一起为1,2-环氧乙烷;X1与X2一起表示键;并且R7是=O、=S、=N-OR、=N-O-(CH2)nCOOR、=N-O-(CH2)nCONR2、=N-NR2、=N-N-SOR、=N-N-SO2R。优选地,R7是=O。还优选R7是=N-OR、=N-O-(CH2)nCOOR或=N-O-(CH2)nCONR2。
在另一实施方案中,本发明提供式III的化合物:
其中R是氢、烷基、芳基烷基、酰基或保护基。
在式III化合物的一实施方案中,R是氢或酰基;并且R1是H、卤素或杂环基。
在式III化合物的一实施方案中,R5是氢、烷基、芳基、杂芳基或芳基烷基。
在式III化合物的一实施方案中,X1与X2一起表示共价键。
在式III化合物的一实施方案中,X1是氢、卤素、NH-OR、NH-O-(CH2)nCOOR或NH-O-(CH2)nCONR2。
在式III化合物的一实施方案中,A1与A2一起为-CH=CH-。
在式III化合物的一实施方案中,A1与A2一起为-CH(OH)-CH(OH)-、-CH(OH)-CH(卤素)-或-CH(卤素)-CH(OH)-。
在式III化合物的一实施方案中,A1与A2一起为1,2-环氧乙烷。
在另一实施方案中,本发明提供式IV的化合物:
其中R6是氢、OR或NR2。
在式IV化合物的一实施方案中,R是氢或酰基。
在式IV化合物的一实施方案中,R1是H、卤素或杂环基。
在式IV化合物的一实施方案中,R5是氢、烷基、芳基、杂芳基或芳基烷基。
在式IV化合物的一实施方案中,A1与A2一起为-CH=CH-。
在式IV化合物的一实施方案中,A1与A2一起为-CH(OH)-CH(OH)-、-CH(OH)-CH(卤素)-或-CH(卤素)-CH(OH)-。
在式IV化合物的一实施方案中,A1与A2一起为1,2-环氧乙烷。
在另一实施方案中,本发明提供式V的化合物:
其中R6是(CH2)nC(O)OR或-(CH2)nC(O)NR2;并且n是1、2或3。
在式V化合物的一实施方案中,R6是-CH2C(O)N(Me)OMe。
在式V化合物的一实施方案中,R1是H、卤素或杂环基。
在式V化合物的一实施方案中,R5是氢、烷基、芳基、杂芳基或芳基烷基。
在式V化合物的一实施方案中,A1与A2一起为-CH=CH-。
在式V化合物的一实施方案中,A1与A2一起为-CH(OH)-CH(OH)-、-CH(OH)-CH(卤素)-或-CH(卤素)-CH(OH)-。
在式V化合物的一实施方案中,A1与A2一起为1,2-环氧乙烷。
在本发明的某些实施方案中,任意一个以上式结构中的R2和R4独立地为OR或选自(Ia)、(Ib)、(Ic)、(Id)、(Ie)和(If)的结构式;R独立地为烷基、酰基、芳基、烷芳基、芳基烷基、杂烷基、杂芳基、杂环基、保护基;条件是R2和R4中的至少一个为选自(Ia)、(Ib)、(Ic)、(Id)、(Ie)和(If)的结构式。
在某些实施方案中,本发明提供具有选自以下结构式的化合物:
或其药学可接受的盐、溶剂合物或酯。
在一实施方案中,本发明提供化合物,其中R2和R4中的一个具有结 构式(Ia),L1和L2中的至少一个是-O-,并且p是0或1。优选地,L1和L2均为-O-。
在一实施方案中,本发明提供化合物,其中R2和R4中的一个具有结构式(Ib),并且R5a和R6a独立地为氢或低级烷基。
在一实施方案中,本发明提供化合物,其中R2和R4中的一个具有结构式(Ic),并且R5a、R6a和R7a独立地为氢或低级烷基。
在一实施方案中,本发明提供化合物,其中R2和R4中的一个具有结构式(Id),并且L1为-O-。
在一实施方案中,本发明提供化合物,其中R2和R4中的一个具有结构式(Ie),并且L1为-O-。
在一实施方案中,本发明提供化合物,其中R2和R4中的一个具有结构式(If),并且R5a和R6a独立地为氢或低级烷基。
在一些具体实施方案中,本发明提供具有选自以下结构式的化合物:
或其药学可接受的盐、溶剂合物或酯。
其它具体化合物
一方面,本发明还提供具有选自以下结构式的具体化合物:
或其药学可接受的盐、溶剂合物或酯。
这些具体化合物可以配制于本文所述的药物组合物中,并且可用于治疗本文所述的各种疾病。
立体异构和同质多晶
具有手性中心的本发明的化合物可以以旋光和外消旋形式存在并分离。本发明涵盖了本发明化合物的任何外消旋、旋光、非对映异构、多晶型或立体异构形式,或其混合物,其具有本文所述的有用性质。
在一实施方案中,通过不对称合成,使用本文所述的方法或本领域技术人员已知的合成转化来制备旋光形式的化合物。
获得旋光物质的方法的实例为本领域所已知,并且至少包括下述方法:
i)晶体的物理分离——手工分离单个对映异构体的宏观晶体的技术。如果存在不同对映异构体的晶体,即所述物质是混合体(conglomerate)并且所述晶体在视觉上不同,可使用这一技术;
ii)同时结晶——将单个对映异构体从外消旋物的溶液中分别结晶的技术,该技术只有在外消旋物是固态的混合体时才可使用;
iii)酶法拆分——根据多种对映异构体与酶的不同反应速率来部分或完全分离外消旋物的技术;
iv)酶促不对称合成——合成的至少一个步骤使用酶促反应以获得期望的对映异构体的对映异构纯的或富集的合成前体的合成技术;
v)化学不对称合成——在产生产品的不对称性(即手性)的条件下从非 手性前体合成期望的对映异构体的合成技术,其可通过使用手性催化剂或手性助剂来实现;
vi)非对映异构体分离——使外消旋化合物与对映异构纯的试剂(手性助剂)反应的技术,所述对映异构纯的试剂将单个对映异构体转化为非对映异构体。然后根据它们目前更加不同的结构差异,通过色谱或结晶来分离得到的非对映异构体,并随后除去所述手性助剂以获得期望的对映异构体;
vii)一级和二级不对称转化——使其中非对映异构体从外消旋物平衡中产生非对映异构体相对于期望的对映异构体在溶液中的优势,或使其中非对映异构体相对于期望的对映异构体的优先结晶破坏所述平衡,以致最终基本上将所有物质从期望的对映异构体转化为结晶非对映异构体的技术。然后从所述非对映异构体中释放期望的对映异构体;
viii)动力学拆分——该技术是指在动力学条件下根据所述对映异构体与手性非外消旋的试剂或催化剂的不同反应速率来实现对外消旋物的部分或完全拆分(或对被部分拆分的化合物的进一步拆分);
ix)从非外消旋前体的对映特异性(enantiospecific)合成——从非手性原料获得期望的对映异构体并在所述合成过程中没有或仅很少地危及立体化学完整性的合成技术;
x)手性液相色谱法——由于不同对映异构体与固定相的不同相互作用,在液体流动相中分离外消旋物中的对映异构体的技术。所述固定相可由手性材料制成,或者所述流动相可含有其它手性材料以引起不同的相互作用;
xi)手性气相色谱法——挥发外消旋物,并由于不同对映异构体在气体流动相中与含有不挥发的非外消旋手性吸附相的柱的不同相互作用来分离对映异构体的技术;
xii)用手性溶剂萃取——根据一种对映异构体在特定手性溶剂中的优先溶解来分离所述对映异构体的技术;或者
xiii)跨手性膜转运——将外消旋物与薄膜屏障接触的技术。所述屏障通常分离两种混溶液体,一种含有外消旋物,并且驱动力(例如浓度或压力差)引起跨膜屏障的优先转运。发生分离是由于所述膜只允许外消旋物中的一种对映异构体通过的非外消旋手性性质。
定义
无论何时本说明书中的术语被确定为一个范围(即C1-4烷基),所述范围 独立地指所述范围的每个要素。作为非限定性实例,C1-4烷基独立地指C1、C2、C3或C4烷基。类似地,当一个或多个取代基被称为“独立地选自”某组时,这是指每个取代基可以是该组的任何要素,并且这些组的任何组合可以从所述组分离。例如,如果R1和R2可独自地选自X、Y和Z,这分别包括以下组:R1是X且R2是X;R1是X且R2是Y;R1是X且R2是Z;R1是Y且R2是X;R1是Y且R2是Y;R1是Y且R2是Z;R1是Z且R2是X;R1是Z且R2是Y;以及R1是Z且R2是Z。
除非另有说明,本文所用的术语“烷基”指饱和直链、支链或环状的伯、仲或叔烃,包括但不限于具有C1至C10的基团。该术语“烷基”也包括“低级烷基”。
术语“低级烷基”指饱和直链、支链或环状的伯、仲或叔烃,包括具有C1至C4的基团,并且如果适宜则包括环状烷基(例如环丙基)。
烷基的说明性实例是甲基、乙基、丙基、异丙基、环丙基、丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基、环丁基、1-甲基丁基、1,1-二甲基丙基、戊基、环戊基、异戊基、新戊基、环戊基、己基、异己基和环己基。除非另有说明,所述烷基可以是未取代的,或被一个或多个选自以下的基团所取代,如本领域技术人员所知,所述基团包括视需要未被保护或被保护的烷基、卤代、卤代烷基、羟基、羧基、酰基、酰氧基、氨基、酰氨基、羧基衍生物、烷基氨基、二烷基氨基、芳基氨基、烷氧基、芳氧基、硝基、氰基、硫醇、亚胺、磺酸、硫酸酯、磺酰基、硫烷基、亚硫酰基、氨磺酰基(sulfamonyl)、酯、羧酸、酰胺、膦酰基、氧膦基、磷酰基、膦、硫代酸酯、硫醚、卤化酰基、酐、肟、肼(hydrozine)、氨基甲酸酯、膦酸、磷酸酯、膦酸酯,或任何不抑制所述化合物的药理学活性的其它可行的官能团,例如Greene等人在Protective Groups in Organic Synthesis,John Wiley and Sons,第二版,1991中所教导的。
如本文所用,术语“卤代”或“卤素”包括氯代、溴代、碘代和氟代。
如本文所用,术语“手性”包括具有与其镜像不可重叠的性质的化合物。
术语“烷硫基”是指具有特定碳原子数量的直链或支链烷基硫化物,例如C1-4烷硫基、乙硫基、-S-烷基、-S-烯基、-S-炔基等等。
术语“烷基氨基”或“芳基氨基”是指分别具有一个或两个烷基或芳基取代基的氨基。除非在本申请中另有具体陈述,当烷基为合适基团时,则它是低级烷基(无论是取代的还是未取代的)。
术语“烷基磺酰基”是指具有特定碳原子数量的直链或支链烷基砜 (alkylsulfone),例如C1-6烷基磺酰基或甲基磺酰基。
术语“烷氧羰基”是指具有特定碳原子数量的羧酸衍生物的直链或支链酯,例如甲氧羰基(MeOCO-)。
如本文所用,术语“硝基”意指-NO2;术语“巯基”意指-SH;且术语“磺酰基”意指-SO2。
术语“烯基”和“炔基”是指其中至少一个饱和C-C键被双键或三键替代的烷基基团,包括取代和未取代的形式。因此C2-6烯基可以是乙烯基、烯丙基、1-丙烯基、2-丙烯基、1-丁烯基、2-丁烯基、3-丁烯基、1-戊烯基、2-戊烯基、3-戊烯基、4-戊烯基、1-己烯基、2-己烯基、3-己烯基、4-己烯基或5-己烯基。类似地,C2-6炔基可以是乙炔基、1-丙炔基、2-丙炔基、1-丁炔基、2-丁炔基、3-丁炔基、1-戊炔基、2-戊炔基、3-戊炔基、4-戊炔基、1-己炔基、2-己炔基、3-己炔基、4-己炔基或5-己炔基。
术语“亚烷基”包括具有式-(CH2)n-的饱和直链的二价烷基,其中“n”可以是1至10的任意整数。
“烷基”、“烷氧基”、“烯基”、“炔基”等包括直链和支链的基团。然而,提及个别基团例如“丙基”时,仅包括直链基团,而对支链异构体进行特别定义,如“异丙基”。
如本文所用且除非另外指定,术语“芳基”是指每个环中至多为8元的任何稳定的单环、二环或三环碳环,其中至少一个环是如休克尔4n+2法则所定义的芳环,并特别是苯基、联苯基或萘基。该术语包括取代和未取代的基团。所述芳基可被任意所述基团取代,如本领域技术人员所知,所述基团包括但不限于视需要被保护或未被保护的选自以下基团的一个或多个基团:卤素(氟、氯、溴或碘)、羟基、氨基、叠氮基、烷基氨基、芳基氨基、烷氧基、芳氧基、硝基、氰基、磺酸、硫酸酯、膦酸、磷酸酯或膦酸酯,例如Greene等人在Protective Groups in Organic Synthesis,John Wiley &Sons,第三版,1999中所教导的。
术语“烷芳基”或“烷基芳基”是指具有芳基取代基的烷基或通过如本文所定义的芳基连接到分子上的烷基。术语“芳烷基”或“芳基烷基”是指被烷基取代基取代的芳基或通过以上定义的烷基连接到分子上的芳基。
术语“环烷基”包括C3-8的环,包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基和环辛基。
术语“烷氧基”是指具有连接的氧基团的直链或支链烷基,所述烷基具有特定数量或在该范围内的任意数量的碳原子。例如“-O-烷基”、C1-4烷氧 基、甲氧基等。
术语“酰基”或“O-链接的酯”包括式C(O)R’的基团,其中R’是直链、支链或环状烷基(包括低级烷基),氨基酸的羧酸残基(carboxylate residue)、芳基(包括苯基)、杂芳基、烷芳基、芳烷基(包括苄基)、烷氧基烷基(包括甲氧基甲基)、芳氧基烷基(例如苯氧基甲基);或取代的烷基(包括低级烷基)、芳基(包括被氯、溴、氟、碘、C1至C4烷基或C1至C4烷氧基任选取代的苯基)、磺酸酯(例如烷基或芳烷基磺酰基,包括甲磺酰基)、单磷酸酯、二磷酸酯或三磷酸酯、三苯甲基或单甲氧基-三苯甲基、取代苄基、烷芳基、芳烷基(包括苄基)、烷氧基烷基(包括甲氧基甲基)、芳氧基烷基(例如苯氧基甲基)。所述酯中的芳基最佳包括苯基。在非限定性实施方案中,酰基包括乙酰基、三氟乙酰基、甲基乙酰基、环丙基乙酰基、环丙基-羧基、丙酰基、丁酰基、异丁酰基、己酰基、庚酰基、辛酰基、新庚酰基、苯乙酰基、2-乙酰氧基-2-苯基乙酰基、二苯基乙酰基、α-甲氧基-α-三氟甲基-苯基乙酰基、溴乙酰基、2-硝基-苯乙酰基、4-溴-苯乙酰基、2-氯-2,2-二苯基乙酰基、2-氯-2-苯乙酰基、三甲基乙酰基、氯二氟乙酰基、全氟乙酰基、氟乙酰基、溴二氟乙酰基、甲氧基乙酰基、2-噻吩乙酰基、氯磺酰基乙酰基、3-甲氧基苯基乙酰基、苯氧基乙酰基、叔丁基乙酰基、三氯乙酰基、单氯-乙酰基、二氯乙酰基、7H-十二氟-庚酰基(7H-dodecafluoro-heptanoyl)、全氟-庚酰基、7H-十二-氟庚酰基(7H-dodeca-fluoroheptanoyl)、7-氯十二氟-庚酰基(7-chlorododecafluoro-heptanoyl)、7-氯-十二氟-庚酰基(7-chloro-dodecafluoro-heptanoyl)、7H-十二氟庚酰基(7H-dodecafluoroheptanoyl)、7H-十二-氟庚酰基(7H-dodeca-fluoro-heptanoyl)、九-氟-3,6-二氧杂-庚酰基(nona-fluoro-3,6-dioxa-heptanoyl)、九氟-3,6-二氧杂庚酰基(nonafluoro-3,6-dioxaheptanoyl)、全氟庚酰基、甲氧基苯甲酰基、甲基3-氨基-5-苯基噻吩-2-羧基、3,6-二氯-2-甲氧基-苯甲酰基、4-(1,1,2,2-四氟-乙氧基)-苯甲酰基、2-溴-丙酰基、ω-氨基辛酰基、癸酰基、正十五酰基、硬脂酰基、3-环戊基-丙酰基、1-苯-羧基、O-乙酰基扁桃酰基(O-acetylmandelyl)、特戊酰基乙酰基、1-金刚烷-羧基、环己烷-羧基、2,6-吡啶二羧基、环丙烷-羧基、环丁烷-羧基、全氟环己基羧基、4-甲基苯甲酰基、氯甲基异噁唑基羰基、全氟环己基羧基、丁烯酰基、1-甲基-1H-吲唑-3-羰基、2-丙烯基、异戊酰基、1-吡咯烷羰基、4-苯基苯甲酰基。
术语“酰氨基”包括具有“-N(R’)-C(=O)-R’”结构的基团,其中每个R’独 立地如上文定义。
术语“羰基”包括结构为“-C(=O)-X-R’”或“X-C(=O)-R’”的基团,其中X是O、S或键,并且每个R独立地如上文所定义。
术语“杂原子”包括在杂环化合物的结构中除碳或氢以外的原子,其非限制性实例是氮、氧、硫、磷或硼。
如本文所用,术语“杂环”、“杂环基”或“杂环的”包括具有四至十四元(优选五至十元)的非芳香性环体系,其中一个或多个环碳(优选一至四个)各自被杂原子替代。杂环的实例包括3-1H-苯并咪唑-2-酮、(1-取代的)-2-氧代-苯并咪唑-3-基、2-四氢-呋喃基、3-四氢呋喃基、2-四氢吡喃基、3-四氢吡喃基、4-四氢吡喃基、[1,3]-二氧杂环戊烷基([1,3]-dioxalanyl)、[1,3]-二硫环戊烷基([1,3]-dithiolanyl)、[1,3]-二噁烷基、2-四氢-噻吩基、3-四氢噻吩基、2-吗啉基、3-吗啉基、4-吗啉基、2-硫吗啉基、3-硫吗啉基、4-硫吗啉基、1-吡咯烷基、2-吡咯烷基、3-吡咯烷基、1-哌嗪基、2-哌嗪基、1-哌啶基、2-哌啶基、3-哌啶基、4-哌啶基、4-噻唑烷基、diazolonyl、N-取代diazolonyl、1-酞酰亚胺基(1-phthalimidinyl)、苯并噁烷基(benzoxanyl)、苯并吡咯烷基、苯并哌啶基、苯并氧戊环烷基(benzoxolanyl)、苯并硫戊环烷基和苯并噻烷基(benzothianyl)。如本文所用,术语“杂环基”或“杂环的”的范围还包括其中含有杂原子的非芳族环稠合到一个或多个芳族或非芳族环上的基团,例如二氢吲哚基、苯并二氢吡喃基、菲啶基或四氢喹啉基,其中连接基团或连接点在含有杂原子的非芳族环上。术语“杂环”、“杂环基”或“杂环的”(不论是饱和的还是部分不饱和的)还指被任选取代的环。
单独使用或作为如“杂芳烷基”或“杂芳基烷氧基”中的较大基团的部分使用的术语“杂芳基”是指具有五至十四元的杂芳族环基团。杂芳基环的实例包括2-呋喃基、3-呋喃基、3-呋吖基(3-furazanyl)、N-咪唑基、2-咪唑基、4-咪唑基、5-咪唑基、3-异噁唑基、4-异噁唑基、5-异噁唑基、2-噁二唑基、5-噁二唑基、2-噁唑基、4-噁唑基、5-噁唑基、1-吡咯基、2-吡咯基、3-吡咯基、1-吡唑基、2-吡唑基、3-吡唑基、2-吡啶基、3-吡啶基、4-吡啶基、2-嘧啶基、4-嘧啶基、5-嘧啶基、3-哒嗪基、2-噻唑基、4-噻唑基、5-噻唑基、5-四唑基、2-三唑基、5-三唑基、2-噻吩基、3-噻吩基、咔唑基、苯并咪唑基、苯并噻吩基、苯并呋喃基、吲哚基、喹啉基、苯并三唑基、苯并噻唑基、苯并噁唑基、苯并咪唑基、异喹啉基、吲唑基、异吲哚基、吖啶基和苯并异噁唑基。如本文所用,术语“杂芳基”的范围内还包括其中杂环稠合到一个或多个芳族或非芳族环的基团,其中连接基团或连接点在杂芳 环上。实例包括四氢喹啉基、四氢异喹啉基和吡啶并[3,4-d]嘧啶基。术语“杂芳基”还指被任选取代的环。术语“杂芳基”与术语“杂芳基环”或术语“杂芳族的(heteroaromatic)”可以互换使用。
除非另有说明,如本文所用的术语“氨基”包括由结构“-N(R)2”所表示的基团,并包括被烷基、芳基、杂环基和/或磺酰基任选取代的伯、仲和叔胺。因此(R)2可代表两个氢原子、两个烷基基团,或一个氢原子和一个烷基基团。
如本文所用,术语“酰氨基”包括氨基取代的羰基,而术语“脒基”意指具有结构“-C(=NH)-NH2”的基团。
如本文所用,术语“季胺”包括具有正电荷的氮的季铵盐。它们是通过所关注的化合物中的碱性氮原子与合适的季铵化剂(例如碘甲烷或苄基碘)之间的反应而形成的。伴随着季胺的合适的抗衡离子包括乙酸根、三氟乙酸根、氯离子、溴离子和碘离子。
应当理解,上述的官能团(例如烷基,烯基、炔基、杂烷基、芳基、杂芳基、芳基烷基、烷基芳基等)包括那些官能团的取代形式(即取代烷基、取代烯基、取代炔基、取代杂烷基、取代芳基、取代杂芳基、取代芳基烷基、取代烷基芳基等)。术语“取代的”包括被一种或多种指定的取代基的多种程度的取代,所述取代基例如卤代、羟基、硫代、烷基、烯基、炔基、硝基、氰基、叠氮基、氨基、甲酰胺基(carboxamido)等。在存在多种取代可能性的情况下,所述化合物可以被一个或多个公开的或要求保护的取代基所取代,所述取代基相互独立,并且采用一次或多次。
如本文所用且除非另外定义,术语“保护的”是指加到氧、氮或磷原子上以防止其进一步反应或为了其它目的的基团。许多氧和氮的保护基为有机合成领域的技术人员所知。
如本文所用,术语“保护基”是指可以连接到反应基团(包括杂原子,例如氧或氮)上从而防止所述反应基团参与反应的基团。可使用Greene等人, Protective Groups in Organic Synthesis,John Wiley and Sons,第二版,1991中教导的任何保护基。合适的保护基的实例包括但不限于烷氧基烷基,如乙氧基甲基和甲氧基甲基;甲硅烷基保护基,如叔丁基二甲基甲硅烷基(TBS)、苯基二甲基甲硅烷基、三甲基甲硅烷基(TMS)、2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基(SEM)和2-三甲基甲硅烷基乙基;以及苄基和取代苄基。
应当理解,除非另外指定,上述的和本文中提及的基团的各种可能的立体异构体在单个术语和实例的含义的范围内。作为说明性实例,“1-甲基 -丁基”以(R)和(S)二者的形式存在,因此除非另外指定,(R)-1-甲基-丁基和(S)-1-甲基-丁基被术语“1-甲基-丁基”所涵盖。
术语“其盐”是指本发明的化合物的任何酸加成盐和/或碱加成盐。术语“其盐”包括但不限于其药学可接受的盐。
术语“其溶剂合物”是指通过溶剂化作用(溶剂分子与溶质分子或离子的结合)形成的本发明的化合物,或由溶质离子或分子与一种或多种溶剂分子组成的集合体(aggregate)。溶剂合物的一个实例是水合物。术语“其溶剂合物”包括但不限于其药学可接受的溶剂合物。
术语“其酯”是指本发明的化合物的任意酯,其中该分子中的任意-COOH官能团被-COOR官能团取代,在所述-COOR官能团中,所述酯的R基团是形成稳定酯基团的任何含有碳的基团,所述R基团包括但不限于烷基、烯基、炔基、环烷基、环烷基烷基、芳基、芳基烷基、杂环基、杂环基烷基,及其取代衍生物。术语“其酯”包括但不限于其药学可接受的酯。
术语“药学可接受的”是指这样的本发明的化合物的盐、溶剂合物和/或酯:其在合理的医学判断的范围内,适合用于与人或低级动物的组织接触,而没有过度的毒性、刺激、过敏反应等,符合合理的收益/风险率,通常为水溶性的或油溶性的或者可分散的,并且对预期用途有效。
适用的且与本发明的化合物的化学性质相容的“药学可接受的盐”包括药学可接受的酸加成盐和药学可接受的碱加成盐。合适的盐的列表见于例如S.M.Birge等人,J.Pharm.Sci,1977,66,pp.1-19。
在其中化合物具有足够的碱性或酸性以形成稳定的无毒性的酸或碱的盐的情况下,给药作为盐的化合物可能是合适的。术语药学可接受的盐或复合物是指保持本发明的化合物的期望生物活性并表现出最小的非期望的毒理学效应的盐或复合物。
此类盐的非限定性实例是(a)与无机酸(例如,盐酸、氢溴酸、硫酸、磷酸、硝酸等)形成的酸加成盐,例如硫酸盐、硝酸盐、碳酸氢盐和碳酸盐,和与有机酸形成的盐,包括甲苯磺酸盐、甲磺酸盐、乙酸盐、柠檬酸盐、丙二酸盐、酒石酸盐、琥珀酸盐、苯甲酸盐、抗坏血酸盐、α-酮戊二酸盐和α-甘油磷酸盐,所述有机酸例如乙酸、草酸、酒石酸、琥珀酸、苹果酸、抗坏血酸、苯甲酸、鞣酸、扑酸、海藻酸、聚谷氨酸、萘磺酸、萘二磺酸(naphthalenedisulfonic acid)和聚半乳糖醛酸(polygalcturonic acid);(b)与金属阳离子(例如锌、钙、铋、钡、镁、铝、铜、钴、镍、镉、钠、钾、锂等)形成的碱加成盐,或与由氨、N,N-二苄基乙二胺、D-葡糖胺、四乙胺或乙 二胺形成的阳离子所形成的碱加成盐;或者(c)(a)和(b)的组合;例如鞣酸锌盐等等。该定义还包括本领域技术人员已知的药学可接受的季盐,其具体包括式-NR+A-的季铵盐,其中R如上定义,并且A是抗衡离子,包括氯离子(chloride)、溴离子(bromide)、碘离子(iodide)、-O-烷基、甲苯磺酸根、甲基磺酸根、磺酸根、磷酸根、或羧酸根(例如苯甲酸根、琥珀酸根、乙酸根、乙醇酸根、马来酸根、苹果酸根、柠檬酸根、酒石酸根、抗坏血酸根、苯甲酸根、肉桂酸根(cinnamoate)、扁桃酸根(mandeloate)、苄酸根(benzyloate)和二苯基乙酸根。
可以使用本领域公知的标准操作来获得药学可接受的盐,例如通过使具有足够碱性的化合物(例如胺)与提供生理学可接受的阴离子的合适的酸反应。
如本文所用,“前药”是指在宿主中代谢(例如水解或氧化)以形成活性化合物的化合物。前药的代表性实例包括在所述活性化合物的官能团(functional moiety)上具有生物学不稳定的保护基的化合物。前药包括可以被氧化、还原、氨化、脱氨基化、羟基化、脱羟基化、水解、脱水、烷基化、脱烷基化、酰基化、脱酰基化、磷酸化、脱磷酸化以产生所述活性化合物的化合物。
术语“患者”包括人类和兽医学的个体。
如本文所用,术语“生物样品”包括但不限于细胞培养物或其提取物;适于体外测定的酶制品;获自哺乳动物的活组织检查材料或其提取物;以及血液、唾液、尿液、粪便、精液、泪液或其它体液,或它们的提取物。
术语“癌症”包括但不限于实体瘤和血源性肿瘤,并且包括但不限于下列癌症:乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、前列腺癌、睾丸癌、泌尿生殖道癌、食道癌、喉癌、胶质母细胞瘤、胃癌、皮肤癌、角化棘皮瘤、肺癌、表皮样癌、大细胞癌、小细胞癌、肺腺癌、骨癌、结肠癌、腺瘤、胰腺癌、腺癌、甲状腺癌、滤泡癌、未分化癌、乳头状癌、精原细胞瘤、黑素瘤、肉瘤、膀胱癌、肝癌和胆道癌、肾癌、髓性病症、淋巴病症、霍奇金病、毛细胞癌、口腔癌和咽(口)癌、唇癌、舌癌、口癌、咽癌、小肠癌、结肠-直肠癌、大肠癌、直肠癌、脑癌和中枢神经系统癌症,以及白血病。术语“癌症”包括原发性癌症、治疗继发性癌症和转移癌症。
术语“药学可接受的载体”是指可与本发明的化合物共同向患者给药并且不破坏其药理学活性的无毒载体、辅剂或媒介物。
如本文所用,术语“GSK-3介导的疾病”或“GSK-3介导的病状”意指其 中已知GSK-3起作用的任何疾病或其它有害的病状或状态。此类疾病或病状包括但不限于糖尿病、阿尔茨海默病、亨延顿病、帕金森病、AIDS-相关的痴呆、肌萎缩侧索硬化(AML)、多发性硬化(MS)、精神分裂症、心肌细胞肥大(cardiomycete hypertrophy)、再灌注/缺血和脱发。
如本文所用,术语“CDK-2介导的疾病”或“CDK-2介导的病状”是指其中已知CDK-2起作用的任何疾病或其它有害的病状。术语“CDK-2介导的疾病”或“CDK-2介导的病状”还指通过用CDK-2抑制剂治疗而缓解的那些疾病或病状。此类病状包括但不限于癌症、阿尔茨海默病、再狭窄、血管发生、肾小球性肾炎、巨细胞病毒、HIV、疱疹、银屑病、动脉粥样硬化、脱发和自身免疫疾病如类风湿性关节炎,例如在Fischer,P.M.和Lane,D.P.,Current Medicinal Chemistry,7,1213-1245(2000);Mani,S.,Wang,C.,Wu,K.,Francis,R.和Pestell,R.,Exp.Opin.Invest.Drugs,9,1849(2000);Fry,D.W.和Garrett,M.D.,Current Opinion in Oncologic,Endocrine & Metabolic Investigational Drugs,2,40-59(2000)中所记载的病状。
如本文所用,术语“ERK介导的疾病”或“ERK介导的病状”是指其中ERK可能起作用的任何疾病或其它有害的病状。术语“ERK介导的疾病”或“ERK介导的病状”还指通过用ERK-2抑制剂治疗而缓解的那些疾病或病状。此类病状包括但不限于癌症、中风、糖尿病、肝肿大、心血管疾病(包括心脏扩大)、阿尔茨海默病、囊性纤维化、病毒病、自身免疫疾病、动脉粥样硬化、再狭窄、银屑病、过敏性病症(包括哮喘)、炎症、神经学病症和与激素相关的疾病。ERK-2蛋白激酶及其在多种疾病中的作用已记载于例如Bokemeyer等人,1996,Kidney Int.49,1187;Anderson等人,1990,Nature 343,651;Crews等人,1992,Science 258,478;Bjorbaek等人,1995,J.Biol.Chem.270,18848;Rouse等人,1994,Cell 78,1027;Raingeaud等人,1996,Mol.Cell Biol.16,1247;Raingeaud等人,1996;Chen等人,1993Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90,10952;Oliver等人,1995,Proc.Soc.Exp.Biol.Med.210,162;Moodie等人,1993,Science 260,1658;Frey和Mulder,1997,Cancer Res.57,628;Sivaraman等人,1997,J Clin.Invest.99,1478;Whelchel等人,1997,Am.J.Respir.Cell Mol.Biol.16,589中。
如本文所用,术语“AKT介导的疾病”或“AKT介导的病状”是指其中已知AKT起作用的任何疾病或其它有害的病状。术语“AKT介导的疾病”或“AKT介导的病状”还指通过用AKT抑制剂治疗而缓解的那些疾病或病状。AKT介导的疾病或病状包括但不限于增殖性病症、癌症和神经变性病症。 AKT(也称为蛋白激酶B)与多种疾病的关联已记载于例如Khwaja,A.,Nature,pp.33-34,1990;Zang,Q.Y.等人,Oncogene,192000;Kazuhiko,N.等人,The Journal of Neuroscience,202000中。
如本文所用,术语“Src介导的疾病”或“Src介导的病状”是指其中已知Src起作用的任何疾病或其它有害的病状。术语“Src介导的疾病”或“Src介导的病状”还指通过用Src抑制剂治疗而缓解的那些疾病或病状。此类病状包括但不限于高钙血症、骨质疏松症、骨关节炎、癌症、骨转移的对症治疗和佩吉特病。Src蛋白激酶及其在多种疾病中的作用已记载于例如Soriano,Cell,69,551(1992);Soriano等人,Cell,64,693(1991);Takayanagi,J.Clin.Invest.,104,137(1999);Boschelli,Drugs of the Future 2000,25(7),717,(2000);Talamonti,J.Clin.Invest.,91,53(1993);Lutz,Biochem.Biophys.Res.243,503(1998);Rosen,J.Biol.Chem.,261,13754(1986);Bolen,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,84,2251(1987);Masaki,Hepatology,27,1257(1998);Biscardi,Adv.Cancer Res.,76,61(1999);Lynch,Leukemia,7,1416(1993);Wiener,Clin.Cancer Res.,5,2164(1999);Staley,Cell Growth Diff.,8,269(1997)中。
如本文所用,术语“Lck介导的疾病”或“Lck介导的病状”是指其中已知Lck起作用的任何疾病状态或其它有害的病状。术语“Lck介导的疾病”或“Lck介导的病状”还指通过用Lck抑制剂治疗而缓解的那些疾病或病状。Lck介导的疾病或病状包括但不限于自身免疫疾病,如移植排斥、变态反应、类风湿性关节炎和白血病。Lck与多种疾病的关联已记载于例如Molina等人,Nature,357,161(1992)中。
如本文所用,术语“Abl介导的疾病”或“Abl介导的病状”是指其中已知Abl起作用的任何疾病状态或其它有害的病状。术语“Abl介导的疾病”或“Abl介导的病状”还指通过用Abl抑制剂治疗而缓解的那些疾病或病状。Abl介导的疾病或病状包括但不限于白血病,特别是慢性髓样白血病。Abl与多种疾病的关联已记载于例如Druker等人,N.Engl.J.Med.2001,344,1038-1042中。
如本文所用,术语“cKit介导的疾病”或“cKit介导的病状”是指其中已知cKit起作用的任何疾病状态或其它有害的病状。术语“cKit介导的疾病”或“cKit介导的病状”还指通过用cKit抑制剂治疗而缓解的那些疾病或病状。cKit介导的疾病或病状包括但不限于肥大细胞增多症/肥大细胞白血病、胃肠道间质瘤、鼻窦自然杀伤(sinonasal natural killer)/T细胞淋巴瘤、精原细 胞瘤/无性细胞瘤、甲状腺癌(throid carcinoma)、小细胞肺癌、恶性黑素瘤、腺样囊性癌、卵巢癌、急性髓性白血病、退行性大细胞淋巴瘤、血管肉瘤、子宫内膜癌、小儿T细胞急性淋巴细胞白血病/淋巴瘤、乳腺癌和前列腺癌。cKit与多种疾病的关联已记载于例如Heinrich等人,J Clinical Oncology2002,20,1692-1703中。
如本文所用,术语“Flt3介导的疾病”或“Flt3介导的病状”是指其中已知Flt3起作用的任何疾病状态或其它有害的病状。术语“Flt3介导的疾病”或“Flt3介导的病状”还指通过用Flt3抑制剂治疗而缓解的那些疾病或病状。Flt3介导的疾病或病状包括但不限于急性髓性白血病、混合性白血病和急性淋巴细胞性白血病。Flt3与多种疾病的关联已记载于例如Sternberg和Licht,Curr.Opin Hematol.2004,12,7-13中。
如本文所用,术语“KDR介导的疾病”或“KDR介导的病状”是指其中已知KDR起作用的任何疾病状态或其它有害的病状。术语“KDR介导的疾病”或“KDR介导的病状”还指通过用KDR抑制剂治疗而缓解的那些疾病或病状。KDR介导的疾病或病状包括但不限于肺癌、乳腺癌、胃肠道癌、肾癌、膀胱癌、卵巢癌和子宫内膜癌、颅内肿瘤(包括多形性胶质母细胞瘤(glioblatoma multiforme))、散发性毛细血管血管母细胞瘤(sporadic capillary hemangioblastoma)、骨髓恶性肿瘤(包括T细胞淋巴瘤、急性成淋巴细胞性白血病、Burkitt淋巴瘤和前髓细胞性白血病)、老年性黄斑变性、疱疹性眼病、类风湿性关节炎、脑缺血和子宫内膜异位。KDR与多种疾病的关联已记载于Ferrara,Endocrine Reviews 2004,25,581-611中。
如本文所用,术语“HSP90介导的疾病”或“HSP90介导的病状”是指其中已知HSP90起作用的病状。所述病状包括但不限于炎性病症、异常细胞增殖、自身免疫病症、缺血,纤维发生(fibrogenetic)病症(包括但不限于硬皮症、多肌炎、全身性狼疮、类风湿性关节炎、肝硬化、瘢痕形成、间质性肾炎和肺纤维化)。(Strehlow,WO 02/02123;PCT/US01/20578)。
治疗方法
本文所述的化合物特别用于治疗或预防由激酶或HSP90介导的病症。在一实施方案中,本文所述的化合物用于治疗或预防增殖性病症,包括癌症转移。在另一实施方案中,本文所述的化合物用于治疗或预防与激酶或HSP90有关的炎性病症。
NF2和NF1患者中的肿瘤的特别之处在于它们是生长缓慢的肿瘤。NF2 和NF1肿瘤在肿瘤抑制基因中均具有杂合性的突变或缺失,但所述肿瘤抑制基因是不同的,即分别为NF2基因和NF1基因。本发明的发明人已发现HSP90抑制剂有效地阻碍了缺乏NF2的和缺乏NF1的肿瘤细胞的增殖,并且还延迟了小鼠中的缺乏NF2的和缺乏NF1的肿瘤的生长。Merlin调节多种细胞表面受体的多度和周转,并且与多种途径相互作用。这些蛋白质中的许多是HSP90的客户蛋白。例如,ErbB2和其它受体酪氨酸激酶、AKT和Raf是公认的HSP90的客户蛋白。此外,已在NF2患者的人神经鞘瘤(与正常的神经相比)中,缺乏NF2的人肿瘤异种移植物(例如脑膜瘤和间皮瘤)中,和缺乏Nf-2的小鼠许旺细胞(Schwann cell)肿瘤中发现了PI3K/AKT途径的异常活化(参考2007年6月4日提交的标题为“Treatment of Neurofibromatosis with Inhibitors of a Signal Transduction Pathway”的PCT/US2007/70366,其整体援引加入)。Neurofibromin是Ras的负调节物。Ras的直接下游效应物Raf是公知的HSP90的客户蛋白。还证明Neurofibromin对AKT的调节。因此抑制HSP90的化合物很可能能够降低缺乏NF2的细胞或缺乏NF1的细胞中的AKT和其它HSP90客户蛋白(例如ErbB2、IGF-IR和Raf)的量。这些蛋白质的量或活性的降低可以用于降低或稳定缺乏NF2的细胞或缺乏NF1的细胞的增殖,或者引起缺乏NF2的细胞或缺乏NF1的细胞的凋亡。抑制HSP90的活性的化合物是这样的化合物,其与HSP90蛋白直接结合,或翻译后地修饰HSP90蛋白,或调节HSP蛋白(例如HSP70和HSP27)的转录(Zaarur等人,2006,Cancer Res.66(3):1783-1791)。例如,可以通过组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂将HSP90乙酰化及灭活(Kovacs等人,2005,Mol.Cell 18(5):601-607;Fuino等人,2003,Mol.Cancer Ther.2:971-984;Aoyagi和Archer,2005,Trends Cell.Biol.15(11):565-567)。因此,确定HSP90抑制化合物用于可能对传统化疗和其它针对快速生长的异质癌症细胞的癌症疗法没有很好的应答的治疗缺乏NF2的肿瘤和缺乏NF1的肿瘤。
NF-2相关肿瘤
患有II型神经纤维瘤病的患者患有缺乏NF2的肿瘤。该基因特征(即NF2基因的失活)将在NF2患者中发现的肿瘤与基因异质性肿瘤(如乳腺癌肿瘤和结肠癌肿瘤)区分开来。例如,NF2患者患有缺乏NF2的脑膜瘤,而一些非缺乏NF2的脑膜瘤患者可能在许多不同的致癌基因或肿瘤抑制基因中含有突变。
如本文所用,“缺乏NF2的肿瘤”是指含有非功能性NF2基因的肿瘤。 非功能性NF2基因可以是NF2基因内的一个或多个插入突变或缺失突变(例如误义突变或无义突变、导致无/低NF2基因表达的启动子或增强子或内含子中的突变,或整个NF2基因的缺失)所导致的。在间皮瘤和患有NF2的患者中发现缺乏NF2的肿瘤,所述缺乏NF2的肿瘤包括神经鞘瘤、脑膜瘤和其它与神经系统相关的肿瘤。还在所有患有散发性神经鞘瘤(sporadic schwannomas)的患者和50%-70%的患有脑膜瘤的患者中发现缺乏NF2的肿瘤。
存在缺乏NF2的双侧前庭神经鞘瘤(即许旺细胞肿瘤)是NF2的标志。本发明的方法可以用于抑制缺乏NF2的神经鞘瘤细胞的生长和/或将其杀死,所述缺乏NF2的神经鞘瘤细胞包括与前庭神经鞘瘤、脊髓和其它外周神经鞘瘤以及散发性神经鞘瘤相关的那些神经鞘瘤细胞。
Merlin以及信号蛋白和途径
如本文所用,“缺乏NF2的肿瘤”是指含有非功能性NF2基因的肿瘤。Merlin与蛋白质和途径相互作用或对其进行调节,但不限于此,所述蛋白质和途径例如Paxillin/Integrin-β1/ErbB2、EGFR、Patched/Smoothened、HRS、CD44、E-Cadherin、Fat、EBP50/NHE-RF/PDGFR、Wingless、Notch、Rac-PAK、PI3K-AKT、Ras-Raf-Mek-Erk2、Hippo途径,以及它们的下游蛋白质(downstream proteins)。图1是Merlin与多种细胞表面蛋白质和信号途径的相互关系的示意图。治疗NF2可能需要针对多种蛋白质和途径。
NF1相关肿瘤
患有I型神经纤维瘤病的患者患有缺乏NF1的肿瘤。该基因特征(即NF1基因的失活)将在NF1患者中发现的肿瘤与基因异质性肿瘤(如乳腺癌肿瘤和结肠癌肿瘤)区分开来。例如,所有在NF1患者中发现的肿瘤都具有NF1基因突变,而患有其它癌症的患者则具有不同基因中的突变或不同基因的过度表达。
如本文所用,“缺乏NF1的肿瘤”是指含有非功能性NF1基因的肿瘤。非功能性NF1基因可以是NF1基因内的一个或多个插入突变或缺失突变(例如误义突变或无义突变、导致无/低NF1基因表达的启动子或增强子或内含子中的突变,或整个NF1基因的缺失)所导致的。在患有NF1的患者中发现缺乏NF1的肿瘤,所述缺乏NF1的肿瘤包括皮肤神经纤维瘤、皮下神经纤维瘤、丛状神经纤维瘤,以及MPNST和其它与神经系统相关的肿瘤。缺乏NF1还使个体易患白血病的罕见形式JMML。
NF1的诊断通过执行NIH临床标准或通过用突变分析发现NF1突变得 以证实。本发明的方法可以用于抑制缺乏NF1的肿瘤的生长或将其杀死,所述缺乏NF1的肿瘤包括皮肤神经纤维瘤、皮下神经纤维瘤、丛状神经纤维瘤、MPNST、神经胶质瘤、星状细胞瘤、嗜铬细胞瘤和JMML。
本发明提供式I、II、III、IV或V的化合物作为HSP90抑制剂用于治疗、预防或改善由神经纤维瘤病导致的肿瘤或症状的用途。还提供包含所述化合物的组合物以及制备所述化合物的方法。
本发明包括通过使缺乏NF2的或缺乏NF1的肿瘤细胞接触根赤壳菌素及其衍生物(即用根赤壳菌素及其衍生物治疗缺乏NF2的或缺乏NF1的肿瘤细胞)来抑制所述细胞的生长的方法,所述根赤壳菌素及其衍生物例如一种或多种上述的式I、II、III、IV或V的化合物。本发明还包括通过使缺乏NF2的或缺乏NF1的肿瘤细胞接触根赤壳菌素及其衍生物来降低所述细胞的增殖的方法,所述根赤壳菌素及其衍生物例如一种或多种上述的式I、II、III、IV或V的化合物。
在一实施方案中,通过将用本发明的化合物治疗的缺乏NF2的或缺乏NF1的肿瘤细胞的样品与对照(例如未治疗的缺乏NF2的或缺乏NF1的肿瘤细胞的样品,或用已知的惰性化合物治疗的细胞样品)相比较,以确定对NF2或NF1细胞生长的抑制。在使细胞接触本发明的化合物之前,缺乏NF2的细胞样品或缺乏NF1的细胞样品(经治疗的和对照)均应由大约相同数量的细胞构成,并具有相同的细胞类型(例如缺乏NF2的神经鞘瘤或缺乏NF1的MPNST细胞)。与对照相比,用根赤壳菌素及其衍生物治疗的缺乏NF2的肿瘤细胞或缺乏NF1的肿瘤细胞在经化合物治疗后可能在数量上下降至少约10%、至少约20%、至少约30%、至少约40%、至少约50%、至少约60%、至少约70%、至少约80%、至少约90%或约100%。
在本发明的一实施方案中,将所述药物组合物直接施用于缺乏NF2的肿瘤或缺乏NF1的肿瘤的位点。例如,可以通过局部治疗(包括局部治疗和病灶内(intralesional)或皮内治疗)将所述HSP90抑制剂施用于肿瘤位点。因此,可以将所述抑制剂注射到缺乏NF2的肿瘤或缺乏NF1的肿瘤中、局部施用到其上或附近。在本发明的一实施方案中,通过本领域已知的方法将所述抑制剂病灶内施用到缺乏NF2的肿瘤或缺乏NF1的肿瘤上。
本发明包括治疗、预防或改善个体中的由神经纤维瘤病导致的肿瘤或症状的方法,其包括向患有II型神经纤维瘤病(NF2)或与NF2功能丧失相关的病状、或者患有I型神经纤维瘤病(NF1)或与NF1功能丧失相关的病状的所述个体给药治疗有效量的至少一种包含至少一种本发明化合物的组合 物,为了确定治疗效用,其与作为对照水平的未用所述组合物治疗的情形相比较,抑制或减缓一种或多种缺乏NF2的肿瘤或缺乏NF1的肿瘤的生长,减少所述肿瘤的数量或抑制和/或减少相关的症状。本发明特别涉及给药至少一种包含本发明化合物的组合物,其引起一种或多种缺乏NF2的肿瘤或一种或多种缺乏NF1的肿瘤的大小和/或数量的下降。
本发明的方法包括给药抑制或降低HSP90复合物的功能的本发明的化合物。更具体地,本发明的化合物与HSP90蛋白结合并对其进行抑制、翻译后地修饰HSP90蛋白,和/或从HSP70或其它HSP蛋白的正常水平开始增加在它们缺乏NF2的或缺乏NF1的肿瘤中的水平。给药本发明的化合物引起所述个体中的HSP70的上调或增加。此外,所述方法包括给药降解或减少一种或多种HSP90客户蛋白以及所述客户蛋白的磷酸化形式的本发明的化合物。此外,所述方法包括给药抑制或降低与一种或多种HSP90客户蛋白缔合的信号途径蛋白质的活性或磷酸化的本发明的化合物。所述一种或多种客户蛋白选自ErbB2、AKT和Raf。所述HSP90抑制剂抑制或降低信号途径蛋白质(如PI3K、mTOR、GSK3、4E-BP1、Bad、FKHR、HSP90、S6K、S6、Mek和Erk1/2)的活性或磷酸化。
本发明的方法治疗、预防或改善由II型神经纤维瘤病(NF2)或与NF2功能丧失相关的病状引起的肿瘤或症状。更具体地,所述一种或多种缺乏NF2的肿瘤包括前庭神经鞘瘤,并且更具体地,包括单侧前庭神经鞘瘤或双侧前庭神经鞘瘤。此外,所述待治疗的一种或多种缺乏NF2的肿瘤包括脊髓神经鞘瘤、散发性神经鞘瘤、外周神经鞘瘤、神经鞘瘤、脑膜瘤、间皮瘤、室管膜瘤、神经胶质瘤和星形细胞瘤。
所述方法包括给药本发明的化合物以获得以下结果:所述个体的听力、平衡和视力中的至少一项的改善;肌肉质量(muscle mass)的增加;所述个体中的肿瘤负荷的减少,其中使用MRI或CAT扫描来确认后者。
本发明的方法治疗、预防或改善由I型神经纤维瘤病(NF1)或与NF1功能丧失相关的病状引起的肿瘤或症状。更具体地,所述一种或多种缺乏NF1的肿瘤包括皮肤神经纤维瘤和丛状神经纤维瘤、视神经星形细胞瘤(optic pathway astrocytoma)、视神经瘤、视神经胶质瘤、脑星形细胞瘤、脑神经胶质瘤、室管膜瘤、嗜铬细胞瘤和神经节瘤、横纹肌肉瘤、神经纤维肉瘤、恶性周围神经鞘瘤(MPNST)、恶性神经鞘瘤和JMML。
本发明还包括抑制或减少缺乏NF2的肿瘤细胞或缺乏NF1的肿瘤细胞的生长或数量的方法,其包括使缺乏NF2的肿瘤细胞或缺乏NF1的肿瘤细 胞与至少一种包含至少一种本发明化合物的组合物相接触,其抑制或减缓一种或多种缺乏NF2的肿瘤或缺乏NF1的肿瘤的生长和/或降低其数量。所述方法包括使所述缺乏NF2的肿瘤细胞或缺乏NF1的肿瘤细胞与所述化合物在体外或离体相接触。所述缺乏NF2的肿瘤细胞是缺乏Nf2的小鼠许旺细胞,并且所述缺乏NF1的肿瘤细胞是缺乏Nf1的小鼠许旺细胞。或者所述缺乏NF2的肿瘤细胞是缺乏NF2的人神经鞘瘤细胞,并且所述缺乏NF1的肿瘤细胞是缺乏NF1的人许旺细胞。所述缺乏NF2的肿瘤细胞选自缺乏NF2的神经鞘瘤细胞系细胞、缺乏NF2的脑膜瘤细胞系细胞和缺乏NF2的间皮瘤细胞系细胞。所述缺乏NF2的肿瘤细胞选自HEI193细胞、SF1335细胞、BAR细胞和RAV细胞。所述缺乏NF1的肿瘤细胞选自人MPNST细胞、源自NF1患者的原发性神经纤维瘤细胞、由cisNf1;p53小鼠建立的缺乏Nf1;p53的小鼠MPNST细胞系,以及Nf1-/-小鼠细胞,例如许旺细胞、小鼠胚胎细胞和白血病细胞。更具体地,所述缺乏NF1的肿瘤细胞选自ST88-14、88-3、90-8和sNF96.2。与所述HSP90抑制剂接触的缺乏NF2的肿瘤细胞或缺乏NF1的肿瘤细胞可以存在于体内。所述缺乏NF2的肿瘤细胞或所述缺乏NF1的肿瘤细胞来自于人类、犬、大鼠或小鼠。
本发明的方法包括使缺乏NF2的肿瘤细胞或缺乏NF1的肿瘤细胞与本发明的抑制HSP90功能的化合物相接触。本发明进一步包括使所述缺乏NF2的肿瘤细胞或所述缺乏NF1的肿瘤细胞与引起HSP70上调的本发明的化合物相接触。进一步地,所述缺乏NF2的肿瘤细胞或所述缺乏NF1的肿瘤细胞与本发明的化合物的接触引起ErbB2和/或磷酸化ErbB2的降解、Akt和/或磷酸化Akt的降解,或者Raf和/或磷酸化Raf的降解。更具体地,所述缺乏NF2的肿瘤细胞或所述缺乏NF1的肿瘤细胞与本发明的化合物的接触引起ErbB2、Akt或Raf信号途径的下游蛋白质的磷酸化的下降。用抗体检测所述蛋白质的降解或上调,或者磷酸化蛋白质的下降。
在另一实施方案中,本发明包括筛选用于治疗NF-2或NF-1的测试化合物的方法,其包括将缺乏NF-2的细胞或缺乏NF-1的细胞用所述测试化合物治疗或者与其接触,其中一种或多种HSP90客户蛋白的降解、或与一种或多种HSP90客户蛋白相关的信号途径的活性降低、或HSP70的增加表明了对NF-2或NF-1的有效治疗。所述方法进一步包括评价对HSP90功能的抑制。对HSP90功能的抑制引起HSP70的上调。所述一种或多种HSP90客户蛋白选自ErbB2、AKT和Raf。此外,所述与一种或多种HSP90客户蛋白相关的信号途径是ErbB2途径、AKT途径或Raf途径,其包含至少一 种选自ErbB2、AKT、Raf、mTOR、GSK3、4E-BP1、Bad、FKHR、S6K、S6、Mek和Erk1/2的蛋白质。具体地,所述一种或多种客户蛋白是AKT,所述AKT被所述测试化合物降解,引起AKT的磷酸化的下降。所述治疗引起S6、GSK3、FKHR、Mek或Erk1/2的磷酸化的下降。用抗体检测磷酸化的下降。
本发明的方法进一步包括测量用所述测试化合物治疗后的缺乏NF-2的细胞或缺乏NF-1的细胞,其中用所述测试化合物治疗后的缺乏NF-2的细胞或缺乏NF-1的细胞数量的下降或者用所述测试化合物治疗后的缺乏NF-2的细胞或缺乏NF-1的细胞增殖的下降表明了有效的治疗。此外,所述方法进一步包括将治疗后的缺乏NF2的细胞或缺乏NF-1的细胞与未治疗的缺乏NF2的细胞或缺乏NF-1的细胞相比较,其中与未治疗的缺乏NF2的细胞或缺乏NF-1的细胞相比,用所述测试化合物治疗后的一种或多种HSP90客户蛋白的下降表明了有效的治疗。此外,所述方法进一步包括将治疗后的缺乏NF2的细胞或缺乏NF-1的细胞与未治疗的缺乏NF2的细胞或缺乏NF-1的细胞相比较,其中与未治疗的缺乏NF2的细胞或缺乏NF-1的细胞相比,用所述测试化合物治疗后的缺乏NF2的细胞或缺乏NF-1的细胞的数量的下降,或者用所述测试化合物治疗后的缺乏NF2的细胞或缺乏NF-1的细胞增殖的下降表明了有效的治疗。用所述测试化合物对所述缺乏NF2的细胞或缺乏NF1的细胞的治疗发生在体外或离体。所述缺乏NF2的肿瘤细胞是缺乏Nf2的小鼠许旺细胞,并且所述缺乏NF1的肿瘤细胞是缺乏Nf1的小鼠许旺细胞。同样,所述缺乏NF2的肿瘤细胞是缺乏NF2的人神经鞘瘤细胞,并且所述缺乏NF1的肿瘤细胞是缺乏NF1的人许旺细胞。
所述缺乏NF2的肿瘤细胞选自缺乏NF2的神经鞘瘤细胞系细胞、缺乏NF2的脑膜瘤细胞系细胞和缺乏NF2的间皮瘤细胞系细胞。所述缺乏NF2的肿瘤细胞选自HEI193细胞、SF1335细胞、BAR细胞和RAV细胞。所述缺乏NF1的肿瘤细胞选自人MPNST细胞、源自NF1患者的原发性神经纤维瘤细胞、由cisNf1;p53小鼠建立的缺乏Nf1;p53的小鼠MPNST细胞系,以及Nf1-/-小鼠细胞,例如许旺细胞、小鼠胚胎细胞和白血病细胞。更具体地,所述缺乏NF1的肿瘤细胞选自ST88-14、88-3、90-8和sNF96.2。与所述HSP90抑制剂接触的缺乏NF2的肿瘤细胞或缺乏NF1的肿瘤细胞可以存在于体内。所述缺乏NF2的肿瘤细胞或所述缺乏NF1的肿瘤细胞来自于人类、犬、大鼠或小鼠。
本发明的一方面涉及用于治疗癌症的化合物和组合物。
本发明的另一方面涉及以下癌症的治疗:乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、前列腺癌、睾丸癌、泌尿生殖道癌、食道癌、喉癌、胶质母细胞瘤、胃癌、皮肤癌、角化棘皮瘤、肺癌、表皮样癌、大细胞癌、小细胞癌、肺腺癌、骨癌、结肠癌、腺瘤、胰腺癌、腺癌、甲状腺癌、滤泡癌、未分化癌、乳头状癌、精原细胞瘤、黑素瘤、肉瘤、膀胱癌、肝癌和胆道癌、肾癌、髓性病症、淋巴病症、霍奇金病、毛细胞癌、口腔癌和咽(口)癌、唇癌、舌癌、口癌、咽癌、小肠癌、结肠-直肠癌、大肠癌、直肠癌、脑癌和中枢神经系统癌症,以及白血病。
本发明的另一方面是治疗癌症的方法,其包括向患有癌症的患者给药有效量的本文所述的式I、II、III、IV或V的化合物。
血管发生的特征为内皮细胞增殖从而形成新血管(通常称为新生血管形成)。对内皮细胞有丝分裂的抑制导致对血管发生的抑制。因此本发明的另一方面涉及对包括不期望的血管发生在内的不期望的有丝分裂的抑制。如本文所定义,以不期望的细胞有丝分裂为特征的哺乳动物疾病包括但不限于内皮细胞的过度或异常刺激(例如动脉粥样硬化)、实体瘤和肿瘤转移、良性肿瘤(例如血管瘤、听神经瘤、沙眼和化脓性肉芽肿)、血管功能障碍、伤口愈合异常、炎性和免疫病症、白塞病、痛风或痛风性关节炎、伴随血管发生异常的类风湿性关节炎、皮肤疾病(例如银屑病)、糖尿病性视网膜病变和其它眼部血管发生疾病,例如早产儿视网膜病(晶体后纤维增生症)、黄斑变性、角膜移植片排斥、新生血管性青光眼和Osler Weber综合征(Osler-Weber-Rendu病)。
其它不期望的血管发生包括包含排卵和囊胚植入的正常过程。上述组合物可通过减少或防止胚胎植入所需的子宫血管形成而用作节育剂。因此,上述组合物可用于阻断排卵和囊胚植入或阻断月经(诱发闭经)。
根据本发明,可治疗包括新生血管形成在内的与不期望的有丝分裂相关的疾病。这样的疾病包括但不限于眼新生血管性疾病、糖尿病性视网膜病变、早产儿视网膜病、角膜移植片排斥、新生血管性青光眼和晶体后纤维增生症、流行性角膜结膜炎、维生素A缺乏病、接触镜超戴症、异位性角膜炎、上角膜缘角膜炎、翼状胬肉干燥性角膜炎、干燥综合征( syndrome)、红斑痤疮、小水疱病(phylectenulosis)、梅毒、分枝杆菌(Mycobacteria)感染、脂质变性、化学烧伤、细菌性溃疡、真菌性溃疡、单纯疱疹(Herpes simplex)感染、带状疱疹(Herpes zoster)感染、原虫感染、卡波西肉瘤、莫伦溃疡、角膜Terrien边缘性变性、边缘性角质层分离、创伤、 类风湿性关节炎、全身性狼疮、多动脉炎、韦格内结节病、巩膜炎、斯-琼二氏病、类天疱疮、放射状角膜切开术和角膜移植片排斥。
根据本发明,可治疗包括新生血管形成在内的与不期望的有丝分裂相关的其它疾病。这样的疾病包括但不限于镰状细胞性贫血、结节病、弹性假黄色瘤、佩吉特病、静脉阻塞、动脉阻塞、颈动脉阻塞性疾病、慢性葡萄膜炎/玻璃体炎、Lyme′s病、全身性红斑狼疮、伊尔斯病、白塞病、引起视网膜炎或脉络膜炎的感染、眼假组织胞浆菌病、贝斯特病、近视、视窝、Stargart病、睫状体扁平部炎、慢性视网膜脱离、高粘滞综合征、弓形体病和激光治疗后并发症。其它疾病包括但不限于与发红相关的疾病(虹膜和角的新生血管形成)和由纤维血管或纤维组织的异常增生引起的疾病,包括所有形式的增生性玻璃体视网膜病变(无论是否与糖尿病相关)。
本发明的另一方面涉及炎性疾病的治疗,所述炎性疾病包括但不限于内皮细胞的过度或异常刺激(例如动脉粥样硬化)、实体瘤和肿瘤转移、良性肿瘤(例如血管瘤、听神经瘤、沙眼和化脓性肉芽肿)、血管功能障碍、伤口愈合异常、炎性和免疫病症、白塞病、痛风或痛风性关节炎、伴随血管发生异常的类风湿性关节炎、皮肤疾病(例如银屑病)、糖尿病性视网膜病变和其它眼部血管发生疾病,例如早产儿视网膜病(晶体后纤维增生症)、黄斑变性、角膜移植片排斥、新生血管性青光眼或Osler Weber综合征(Osler-Weber-Rendu病)。其它不期望的血管发生包括包含排卵和囊胚植入的正常过程。因此,上述组合物可用于阻断排卵和囊胚植入或阻断月经(诱发闭经)。
本发明的另一方面涉及在患者中抑制HSP90活性的方法,其包括向患者给药有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药学可接受的盐或前药。本发明还提供治疗由HSP90介导的疾病的方法。
本发明的另一方面涉及在患者中抑制AuroraA活性的方法,其包括向患者给药有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药学可接受的盐或前药。
本发明的另一方面涉及用GSK-3抑制剂治疗或预防GSK-3介导的疾病的方法,其包括向患者给药有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药学可接受的盐或前药。
本发明的一方面涉及在有此需要的患者中增强糖原合成和/或降低葡萄糖的血液水平的方法,所述方法包括向所述患者给药治疗有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药物组合物。此方法特别用于糖尿病患者。 另一方法涉及抑制高度磷酸化的Tau蛋白的产生,其用于中止或延缓阿尔茨海默病的进展。另一方法涉及抑制β-连环蛋白的磷酸化,其用于治疗精神分裂症。
本发明的另一方面涉及在生物样品中抑制GSK-3的活性,该方法包括使所述生物样品接触式I、II、III、IV或V的GSK-3抑制剂。
本方面的另一方面涉及在患者中抑制GSK-3活性的方法,其包括向所述患者给药式I、II、III、IV或V的化合物或包含所述化合物的组合物。
本发明的另一方面涉及治疗或预防CDK-2介导的疾病的方法,其包括向需要此类治疗的患者给药治疗有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药物组合物。
本发明的另一方面涉及在生物样品或患者中抑制CDK-2活性,该方法包括向所述患者给药式I、II、III、IV或V的化合物或包含所述化合物的组合物。
本发明的另一方面涉及治疗或预防ERK-2介导的疾病的方法,其包括向需要此类治疗的患者给药治疗有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药物组合物。
本发明的另一方面涉及在生物样品或患者中抑制ERK-2活性,该方法包括向所述患者给药式I、II、III、IV或V的化合物或包含所述化合物的组合物。
本发明的另一方面涉及治疗或预防AKT介导的疾病的方法,其包括向需要此类治疗的患者给药治疗有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药物组合物。
本发明的另一方面涉及在生物样品或患者中抑制AKT活性,该方法包括向所述患者给药式I、II、III、IV或V的化合物或包含所述化合物的组合物。
本发明的另一方面涉及治疗或预防Src介导的疾病的方法,其包括向需要此类治疗的患者给药治疗有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药物组合物。
本发明的另一方面涉及在生物样品或患者中抑制Src活性,该方法包括向所述患者给药式I、II、III、IV或V的化合物或包含所述化合物的组合物。
本发明的另一方面涉及用Lck抑制剂治疗或预防Lck介导的疾病的方法,其包括向需要此类治疗的患者给药治疗有效量的式I、II、III、IV或V 的化合物或其药物组合物。
本发明的另一方面涉及在生物样品或患者中抑制Lck活性,该方法包括向所述患者给药式I、II、III、IV或V的化合物或包含所述化合物的组合物。
本发明的另一方面涉及用Abl抑制剂治疗或预防Abl介导的疾病的方法,该方法包括向需要此类治疗的患者给药治疗有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药物组合物。
本发明的另一方面涉及在生物样品或患者中抑制Abl活性,该方法包括向所述患者给药式I、II、III、IV或V的化合物或包含所述化合物的组合物。
本发明的另一方面涉及治疗或预防cKit介导的疾病的方法,其包括向需要此类治疗的患者给药治疗有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药物组合物。
本发明的另一方面涉及在生物样品或患者中抑制cKit活性,该方法包括向所述患者给药式I、II、III、IV或V的化合物或包含所述化合物的组合物。
本发明的另一方面涉及治疗或预防Flt3介导的疾病的方法,其包括向需要此类治疗的患者给药治疗有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药物组合物。
本发明的另一方面涉及在生物样品或患者中抑制Flt3活性,该方法包括向所述患者给药式I、II、III、IV或V的化合物或包含所述化合物的组合物。
本发明的另一方面涉及治疗或预防KDR介导的疾病的方法,其包括向需要此类治疗的患者给药治疗有效量的式I、II、III、IV或V的化合物或其药物组合物。
本发明的另一方面涉及在生物样品或患者中抑制KDR活性,该方法包括向所述患者给药式I、II、III、IV或V的化合物或包含所述化合物的组合物。
有效抑制蛋白激酶的量是:当与不存在抑制剂时的酶活性比较时,引起对所述激酶活性的可测量的抑制量。任何方法均可用于测定抑制,例如下文所述的生物测试实施例。
药物组合物
通过吸入、全身、口服、局部或经皮给药(任选地在药学可接受的载体或稀释剂中的)含有有效量的本文所述的化合物或其药学可接受的盐、酯或前药的组合物,可治疗患有呼吸病症的哺乳动物,特别是人类。
所述化合物或组合物通常通过口服或吸入给药来给药。或者,可经皮下、静脉内、腹膜内、肌内、肠胃外、口服、粘膜下、通过吸入、经由缓释贴剂经皮,或局部给药有效剂量范围的化合物来治疗目标病状。
通过使用常规技术并通过观察在类似情况下获得的结果,可以容易地测定有效剂量。在测定有效剂量时,考虑了许多因素,包括但不限于:患者的物种;其大小、年龄和一般健康;涉及的具体疾病;所述疾病的涉及程度或其严重性;单个患者的反应;所给药的特定化合物;给药方式;所给药的制剂的生物利用度特征;所选的剂量方案;和伴随药物(concomitant medication)的使用。
在一单独的实施方案中,本发明的化合物是吸入剂量形式。在该实施方案中,所述化合物可以是气溶胶混悬液(aerosol suspension)、干粉或液体颗粒的形式。可以将所述化合物制备成鼻腔喷雾剂或将其制备于吸入器(例如计量吸入器)中用于递送。加压计量吸入器(“MDI”)通常递送雾化(aerosolized)的颗粒,所述颗粒与或不与表面活性剂和合适的架桥剂(bridging agent)一同悬浮于含氯氟烃抛射剂(例如CFC-11、CFC-12)或非含氯氟烃或替代的抛射剂(例如氟碳化合物、HFC-134A或HFC-227)中。还可使用于粉吸入器(不论是呼吸启动的或通过空气或气体压力递送的),例如于1993年1月7日公布的Schering公司的国际专利申请PCT/US92/05225中所公开的干粉吸入器,以及可用于单独地或与某些药学可接受的载体(例如乳糖)组合地递送作为大聚集体(aggregates)中细粉的雾化颗粒的TurbuhalerTM(获自Astra Pharmaceutical Products,Inc.)或RotahalerTM(获自Allen & Hanburys);以及雾化器。
通过使用泵式喷瓶,还可以按具体测量量以水混悬液的形式给药本发明的化合物。本发明的水混悬液组合物可通过将所述化合物与水和其它药物可接受的赋形剂混合来制备。本发明的水混悬液组合物还可含有水、辅料和/或一种或多种赋形剂,例如:助悬剂,例如微晶纤维素、羧甲基纤维素钠、羟丙基(hydroxpropyl)-甲基纤维素;湿润剂,例如甘油和丙二醇;用于调节pH的酸、碱或缓冲物质,例如柠檬酸、柠檬酸钠、磷酸、磷酸钠以及柠檬酸盐和磷酸盐缓冲剂的混合物;表面活性剂,例如聚山梨酯80;和 抗微生物防腐剂,例如苯扎氯胺、苯乙基醇和山梨酸钾。
对于本文描述的所有情况,通常全身剂量为每天0.01mg/kg体重至1500mg/kg体重,其作为单次日剂量或分开的日剂量。对于所述情况,优选的剂量为每天0.5-1500mg。对于期望的情况,更特别优选的剂量为每天5-750mg。代表性剂量还可以为0.01-1500mg/kg/天、0.02-1000mg/kg/天、0.2-500mg/kg/天、0.02-200mg/kg/天、0.05-100mg/kg/天、0.05-50mg/kg/天、0.075-50mg/kg/天、0.1-50mg/kg/天、0.5-50mg/kg/天、1-50mg/kg/天、2-50mg/kg/天、5-50mg/kg/天、10-50mg/kg/天、25-50mg/kg/天、25-75mg/kg/天、25-100mg/kg/天、100-150mg/kg/天、或150mg/kg/天或更多,其作为单次日剂量或分开的日剂量。在一实施方案中,以约1mg/kg至约5mg/kg、约5mg/kg至约10mg/kg、约10mg/kg至约25mg/kg、或约25mg/kg至约50mg/kg的剂量提供所述化合物。用于局部施用的一般剂量为活性化合物重量的0.001-100%。
所述化合物可以任何合适的剂型单位方便地给药,包括但不限于每单位剂型含有约7-3000mg、约70-1400mg或约25-1000mg的活性成分的剂型单位。例如,约50-1000mg的口服剂量通常是方便的,包括50mg、100mg、200mg、250mg、300mg、400mg、500mg、600mg、700mg、800mg、900mg或1000mg的一种或多种剂型。优选较低的剂量,例如约10-100mg或1-50mg。还包括0.1-50mg、0.1-20mg或0.1-10mg的剂量。此外,在通过非口服途径(例如通过注射或吸入)给药的情况下,可应用较低的剂量。
将所述化合物给药足够的时间周期,以改善与所治疗的病状相关的不期望的症状和临床体征。
以在没有严重毒性效应的情况下足以将治疗量的化合物向患者体内递送的量将活性化合物包含于药学可接受的载体或稀释剂中。可用于这些药物组合物的药学可接受的载体通常为本领域所知。它们包括但不限于离子交换剂、氧化铝、硬脂酸铝、卵磷脂、血清蛋白(例如人血清白蛋白)、缓冲物质(例如磷酸盐)、甘氨酸、山梨酸、山梨酸钾、饱和植物脂肪酸的部分甘油酯混合物、水、溶剂、盐或电解质,例如硫酸鱼精蛋白、磷酸氢二钠、磷酸氢钾、氯化钠、锌盐、硅酸盐、胶体二氧化硅、三硅酸镁、聚乙烯吡咯烷酮、纤维素系物质、聚乙二醇、羧甲基纤维素钠、聚丙烯酸酯、蜡、油、聚乙烯-聚氧丙烯-嵌段共聚物、聚乙二醇和羊毛脂。药学可接受的媒介物可包含多于一种赋形剂的混合物,其中可选择组分和比率从而优化制剂的期望特征,包括但不限于储存期、稳定性、载药量、递送部位、溶出速 率、自乳化、释放速率和释放部位的控制以及代谢。
通过本领域已知的多种技术可以制备制剂。制剂技术的实例可参见文献出版物和教科书,例如“Water-insoluble drug formulation”,Rong Liu编辑,2000,Interpharm Press。
如果静脉内给药,载体可以是生理盐水、抑菌水、Cremophor ELTM(BASF,Parsippany,NJ)或磷酸盐缓冲盐水(PBS)。本发明组合物的无菌注射形式可以是水混悬液或油混悬液。根据本领域已知的技术,可使用合适的分散剂或润湿剂和助悬剂来配制这些混悬液。所述无菌注射制剂还可以是在无毒的肠胃外可接受的稀释剂或溶剂中的无菌注射溶液或混悬液,例如在1,3-丁二醇中的溶液。可使用的可接受的媒介物和溶剂是水、林格溶液和等渗氯化钠溶液。此外,无菌不挥发油方便地用作溶剂或助悬介质。为此目的,可使用任何温和的不挥发油,包括合成的甘油单酯或甘油二酯。脂肪酸(例如油酸)及其甘油酯衍生物用于制备注射剂,也可使用天然药学可接受的油(例如橄榄油或蓖麻油),特别是其聚氧乙烯化的形式。这些油溶液或混悬液还可包含长链醇稀释剂或分散剂(例如羧甲基纤维素或类似分散剂),其通常用于配制药学可接受的剂型(包括乳剂和混悬剂)。还可以为了配制目的而使用其它常用表面活性剂(例如Tween、Span和其它表面活性乳化剂)或常用于制备药学可接受的固体、液体或其它剂型的生物利用度增强剂。
药物组合物中活性化合物的浓度取决于药物的吸收、失活和排泄速率以及本领域技术人员所知的其它因素。应注意,剂量值还会随待改善的病状的严重性而变化。还应理解,对于任何特定的个体,应根据个体需要以及管理或监督组合物给药的人的专业判断而随时调整具体剂量方案,并且本文所述的剂量范围仅为示例,并且并非意图限制要求保护的组合物的范围或实践。所述活性成分可一次给药,或可分为多个较小给药剂量在不同时间间隔给药。
口服是用于全身递送所述活性化合物的一种给药方式。口服组合物通常会包括惰性稀释剂或可食用载体。它们可包封于明胶胶囊中或压制成片剂。为了口服治疗性给药的目的,可将所述活性化合物与赋形剂掺在一起,并以片剂、锭剂或胶囊剂的形式使用。可包含药学相容的粘合剂和/或佐剂物质作为组合物的部分。
片剂、丸剂、胶囊剂、锭剂等可含有任何以下成分或具有相似性质的化合物:粘合剂,例如微晶纤维素、黄耆树胶或明胶;赋形剂,例如淀粉 或乳糖;崩解剂,例如海藻酸、Primogel或玉米淀粉;润滑剂,例如硬脂酸镁或Sterotes;助流剂,例如胶体二氧化硅;甜味剂,例如蔗糖或糖精;或者矫味剂,例如薄荷、水杨酸甲酯或橘子香料(organge flavoring)。
当剂量单位形式是胶囊剂时,除了以上类型的物质,其还可含有液体载体,例如脂肪油。此外,剂量单位形式可含有改良剂量单位的物理形式的多种其它物质,例如糖包衣、紫胶或其它肠溶剂(enteric agent)。
所述化合物或其盐可作为酏剂、混悬剂、糖浆剂、糯米纸囊剂(wafer)、咀嚼胶(chewing gum)等等给药。除所述活性化合物以外,糖浆还可含有作为甜味剂的蔗糖和某些防腐剂、染料和着色剂及矫味剂。
在优选实施方案中,所述活性化合物与会保护所述化合物免于从体内迅速清除的载体一同制备,例如控释制剂,包括植入剂和微胶囊化递送体系。可使用可生物降解的、生物相容的聚合物,例如乙烯乙酸乙烯酯、聚酐、聚乙醇酸、胶原、聚原酸酯(polyorthoester)和聚乳酸。本领域技术人员清楚制备此类制剂的方法。所述物质还可商购自Alza Corporation和Nova Pharmaceuticals,Inc.。还优选脂质体混悬液(包括针对病毒抗原的单克隆抗体感染的细胞的脂质体)作为药学可接受的载体。这些可根据本领域技术人员已知的方法进行制备,例如美国专利4,522,811(其整体援引加入本文)中所记载的方法。例如,可如下制备脂质体制剂:将合适的脂质(例如硬脂酰磷脂酰乙醇胺、硬脂酰磷脂酰胆碱、花生四烯酰磷脂酰胆碱(arachadoyl phosphatidyl choline)和胆固醇)溶解于无机溶剂,然后蒸发所述无机溶剂,在容器表面上留下干燥脂质薄膜。然后将所述化合物的水溶液引入容器中。然后手动旋转所述容器从而使脂质物质离开所述容器的边缘并分散脂质聚集体(lipid aggregates),由此形成脂质体混悬液。
用于局部施用的合适的媒介物或载体可通过常规技术制备,例如施用于直肠、阴道、鼻腔或口腔粘膜的洗剂、混悬剂、软膏剂、乳膏剂、凝胶剂、酊剂、喷雾剂、散剂、糊剂、缓释透皮贴剂、栓剂。除了以上列举的用于全身给药的其它物质外,还可使用增稠剂、软化剂和稳定剂来制备局部用组合物。增稠剂的实例包括凡士林、蜂蜡、黄原胶或聚乙烯,湿润剂例如山梨醇,软化剂例如矿物油、羊毛脂及其衍生物,或角鲨烯。
组合治疗
所述化合物还可与不损害期望作用的其它活性物质或与补充期望作用的物质混合。所述活性化合物可与用于治疗呼吸病症的其它药物联合(即组 合或交替)给药。
所述化合物可与通常用于治疗或预防哮喘的药物(例如某些抗炎药物和支气管扩张剂)组合或交替给药。皮质类固醇(吸入的和口服的)、肥大细胞稳定剂和白三烯调节药物通常是对患有哮喘的人有用的抗炎药物。这些药物减少气道的肿胀和粘液产生。支气管扩张剂通常通过松弛紧环气道的肌肉带(muscle band)来缓解哮喘的症状。该作用迅速打开气道,使更多的空气进入和离开肺部。支气管扩张剂还有助于从肺中清除粘液。
常用的化合物包括预防而非缓解症状的吸入皮质类固醇。吸入皮质类固醇包括:氟替卡松和沙美特罗吸入剂(Advair,包含皮质类固醇(氟替卡松)加上长期作用的支气管扩张药物(在该情况下是β-2肾上腺素能受体激动剂沙美特罗)的组合药物)、氟尼缩松气雾吸入剂(aerobid,氟尼缩松)、曲安奈德气雾剂(azmacort,曲安西龙),flovent(氟替卡松)、甲泼尼龙、泼尼松、普米克(pulmicort)或施立稳(serevent)干粉吸入器(沙美特罗散剂)、茶碱、qvar和xopenex(左旋沙丁胺醇)。吸入皮质类固醇以三种形式进入:计量吸入器(MDI)、干粉吸入器(DPI)和喷雾器溶液。全身性类固醇包括:甲泼尼龙(Medrol、Methylpred、Solu-Medrol)、泼尼松(Deltasone)和泼尼松龙(Prelone、Prediapred、Orapred)。肥大细胞稳定剂包括色甘酸钠(Intal)和尼多米钠(Tilade),其通过防止刺激性和炎性物质从肥大细胞中释放而起作用。白三烯调节剂包括安可来(accolate)和顺尔宁(singular),以及安可来(扎鲁司特)、顺尔宁(孟鲁司特)和zyflo(齐留通)。
所述化合物可以与非甾体抗炎剂(例如布洛芬、吲哚美辛、非诺洛芬、甲芬那酸、氟芬那酸、舒林酸)组合给药。所述化合物还可以与皮质类固醇一起给药。用于组合或交替治疗的本文所述的任意化合物均可作为任意前药给药,当向接受者给药时,所述前药能够直接或间接提供所述母体化合物。非限定性实例是药学可接受的盐(或称为“生理学可接受的盐”)和已在合适位置上烷基化或酰基化的化合物。该修饰可以实现所述化合物的生物活性,在某些情况下增强所述活性使之超越母体化合物。
化合物的制备方法
可以使用模块化合成方法来制备非前药形式(例如活性形式或带有保护基团的活性形式)的大环化合物。用于制备非前药形式的大环化合物的方法和步骤详细记载于2007年8月10日提交的标题为“Macrocyclic Compounds Useful as Inhibitors of Kinase and HSP90”的国际申请 PCT/US2007/017754和美国序列号11/891,652中,其内容整体援引加入本文。可以通过本领域技术人员已知的制备前药的方法由活性大环化合物合成各种前药。例如,可以通过使羟基与磷酸化试剂(例如磷酰氯类似物)反应来制备所述羟基的磷酸酯。可以通过用碱性离子树脂(如Dowex 550a)处理最终化合物得到所有膦酸酯的钠盐。
以下路线1、2和3阐明了合成二磷酸酯前药、其中磷酸酯在羰基的对位的单磷酸酯前药以及其中磷酸酯在羰基的邻位的单磷酸酯前药的一般合成策略。
路线1:用于合成二磷酸酯前药的一般合成策略
路线2:用于合成对-单磷酸酯前药的一般合成策略
路线3:用于合成邻-单磷酸酯前药的一般合成策略
本文使用以下缩写:
Ac 乙酰基(CH3C=O)
ADP 二磷酸腺甘
AIBN 偶氮二(异丁腈)
All 烯丙基
ATP 三磷酸腺苷
BER 硼氢化物交换树脂
BBN 硼杂双环壬烷(Borabicyclononane)
Bn 苄基
Bz 苯甲酰基
CAN 硝酸高铈铵
CSA 樟脑磺酸
δ 化学位移(NMR)
dba 二亚苄基丙酮
DBU 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯
DDQ 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌
DEAD 偶氮二羧酸二乙酯
DIAD 偶氮二羧酸二异丙酯
d.e. 非对映异构体过量
DET 酒石酸二乙酯
DHP 二氢吡喃
DIBAL或Dibal-H 二异丁基氢化铝
DIC N,N’-二异丙基碳二亚胺
DMAP 4-二甲基氨基吡啶
DMDO 二甲基二环氧乙烷
DMF 二甲基甲酰胺
DMPI 戴斯-马丁试剂(Dess-Martin periodinane)
DMSO 二甲基亚砜
DNA 脱氧核糖核酸
dppe 1,2-双(二苯基膦基)乙烷
EC50 获得50%体内最大效应所需的血浆浓度
EDC 盐酸1-乙基-3-[3-二甲基氨基丙基]碳二亚胺
EDTA 乙二胺四乙酸
e.e. 对映异构体过量
EOM 乙氧甲基(CH3CH2OCH2-)
FDA 食品与药品管理局
Fmoc 9-芴基甲氧羰基
GI50 50%抑制细胞生长所需浓度
Grubbs’II Grubbs’第二代催化剂:(钌[1,3-双(2,4,6-三甲基苯
基)-2-咪唑烷亚基)二氯(苯基亚甲基)(三环己基膦)
HFIP 六氟异丙醇
HMDS 六甲基二硅胺(hexamethyldisilazide)
HMPA 六甲基磷酸三酰胺
HOBT N-羟基苯并三唑
HPLC 高效液相色谱(High performance chromatography)
HRMS 高分辨质谱
HSP90 热激蛋白质90
Hunig碱 二异丙基乙胺
IC50 体外50%抑制所需的药物浓度
imid. 咪唑
Ipc2BH 二异松蒎基硼烷(bis-isopinocamphorylborane)
J 偶合常数
KHMDS 六甲基二硅基氨基钾(Potassium
hexamethyldisilyamide)
L.C. 液相色谱
LDA 异丙基氨基锂(Lithium diisopropylamide)
LiHMDS 六甲基二硅基氨基锂(LiN(SiMe3)2)
μM 微摩尔浓度(μmol.l-1)
MAP 促分裂原活化蛋白
mCPBA 间氯过氧苯甲酸
MOM 甲氧甲基(CH3OCH2-)
mRNA 信使核糖核酸
M.S. 质谱
NaHMDS 六甲基二硅基氨基钠
NMR 核磁共振
NMM N-甲基吗啉
NMO N-甲基吗啉-N-氧化物
NOE(SY) 核奥弗豪泽效应
PCC 氯铬酸吡啶鎓盐
PDC 重铬酸吡啶鎓盐
PG 保护基
PMB 对甲氧基苄基
PNA 肽核酸
Piv 特戊酰基
PS- 聚合物载体
PS-TBD (1,5,7)-三氮杂-二环并[4.4.0]十二-5-烯-7-甲基苯乙
烯
Pyr或Py 吡啶
rac 外消旋
RAL 二羟基苯甲酸内酯
RCM 闭环复分解(Ring-closing metathesis)
RedAl 双(甲氧乙氧基)氢化铝钠
Rf 保留因子
RNA 核糖核酸
RT 室温
SAE 夏普勒斯不对称环氧化
SAR 构效关系
SEM 2-三甲基甲硅烷基乙氧甲氧基
TBAF 氟化四正丁基铵
TBAI 碘化四正丁基铵
TBDPS 叔丁基二苯基甲硅烷基
TBHP 叔丁基过氧化氢
TBS 叔丁基二甲基甲硅烷基
Teoc 2-(三甲基甲硅烷基)乙氧羰基
Tf 三氟甲基磺酸酯(CF3SO3)(triflate)
TFA 三氟乙酸
TFAA 三氟乙酸乙酸酐
THF 四氢呋喃
THP 四氢吡喃
TLC 薄层色谱
TMS 三甲基甲硅烷基
Ts 甲苯磺酰基(p-CH3C6H4SO2)
p-TSOH 对甲苯磺酸