CN101475536A - 多取代s-daco类衍生物及其合成方法及用途 - Google Patents
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Abstract
本发明属药物技术领域。具体公开了如I式所示的一种多取代6-环己甲基嘧啶酮类(Dihydro-Alkylsulfanyl-Cyclohexylmethyl-Oxopyrimidines,S-DACO)化合物、其N-氧化物、立体异构体形式、立体异构体混合物和药学上可接受的盐、其水合物和溶剂化物,其多晶和共晶,其同样生物学功能的前体和衍生物。本发明的衍生物具有明显的抑制HIV的活性及抗耐药性,可在治疗艾滋病等相关药物中应用。
Description
技术领域
本发明涉及一种多取代S-DACO类化合物,作非核苷类抗HIV病毒制剂的合成方法及其用途,属抗HIV药物技术领域。
背景技术
面对艾滋病治疗的世纪技术难题,目前虽然有28种HIV疫苗正在临床试验阶段,但尚无一种HIV疫苗取得效果。因此,抗HIV药物的研究就显得特别重要,抗病毒药物治疗成为目前防治AIDS的焦点。
抗HIV病毒药物研发主要基于HIV生命周期的认识,通过阻断该循环的各个环节以抑制HIV病毒的复制。目前临床使用的33种抗HIV药物大都是基于病毒本身的蛋白为靶标,药物主要分为3大类:抑制病毒RNA逆转录的核苷类逆转酶抑制剂、非核苷类逆转录酶抑制剂,以及抑制病毒在宿主细胞装配、成熟、释放的蛋白酶抑制剂、整合酶抑制剂等。
非核苷类抑制剂(Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors,NNRTIs)是逆转录酶抑制剂中的一类,它能结合到病毒逆转录酶(Reverse Transcriptase,RT)的活性位点,通过抑制RT酶,阻止病毒的复制。非核苷类抑制剂一般对细胞的毒性较小,且在较低的EC50值下就可以抑制病毒的复制,易于与其他药物联合发挥作用,加之RT酶的结构已被解析清楚,药物作用位点明确,因此一直以来NNRTIs都是研发新的抗HIV-1药物的重要靶点。目前已有30多类结构各异的NNRTIs,除奈伟拉平(Nevirapine)、地拉韦定(Delavirdine)、依非韦伦(Efavirenz)外,2008年又有一种新的NNRTIs—TMC125被FDA批准上市。除此以外,还有多种NNRTIs处于临床试验阶段,有望成为新的抗HIV-1药物。
二氢烷氧苄基嘧啶酮类化合物(Dihydro-Alkoxy-Benzyl-Oxopyrimidines,DABOs)是NNRTIs中较具代表性的一类,由于其具高效低毒、合成便利等特点,自1992发现以来就成为抗HIV药物研究的热点。经多年结构修饰已合成出大量高活性化合物。构效关系研究表明,DABO类衍生物嘧啶环的C-2侧链及C-6位取代基对该类化合物的抗HIV活性有着重要的影响作用,S-DABO类化合物是DABOs的C-2侧链氧原子被硫原子取代后得到的化合物((Mai,A.et.al.J.Med.Chem.1995,38,3258-3263),其活性较DABOs先导物有了明显的改进。随后Mai,A.等又在S-DABOs的C-6位苄基的亚甲基上引入甲基,对其构象进行限制,同时在苯环上引入各取代基得到了系列2,6-F2-S-DABOs类化合物,使其抗HIV活性及抗耐药性都有了十分显著的提高(Mai,A.et.al.J.Med.Chem.2001,44,2544-2554.)。最近,我们以柔性较大的环己甲基取代C-6位苄基,设计合成了系列二氢硫烃基环己甲基嘧啶酮类化合物(Dihydro-Alkylsulfanyl-Cyclohexylmethyl-Oxopyrimidines,S-DACOs),体外细胞水平及酶水平抗HIV试验表明,该类化合物具有极高的抗HIV活性,且细胞毒性较小,具有一定的抗耐药性(何严萍等,中国专利文件CN 101177413A)。
S-DACOs的C-6环己甲基的成功引入为NNRTIs的研究引导了又一个新方向,基于S-DACOs与S-DABOs结构的相似性,我们进一步借鉴S-DABOs构效关系研究结果,通过分子模拟实验对S-DACOs嘧啶环的C-2、C-5及C-6各取代位进行结构修饰,以开发新一代S-DACOs类NNRTIs。
发明内容
本发明的目的在于为制备抗HIV病毒的药物提供一类新的化合物,即提供多取代S-DACO类衍生物。
本发明的目的还在于获得上述化合物的制备方法。
本发明的目的也在于获得上述化合物的用途。
本发明以前期工作设计合成的S-DACO类化合物为先导,基于S-DACOs与S-DABOs结构的相似性,在保留了C-6位环己甲基的柔性结构的基础上,借鉴S-DABO类化合物构效关系的研究成果,在C-6位亚甲基上引入构象限制因素,以增加其与RT酶结合腔穴中周围氨基酸残基间的范德华力;同时在嘧啶环C-5位及C-6位环己基上引入各取代基,以加强和环己基的协同作用,干扰氨基酸残基Asp的催化作用;结合活性敏感部位-嘧啶环C-2侧链的结构修饰,设计了系列多取代S-DACO类衍生物。最后通过分子对接的方法对所设计分子与RT酶的相互作用进行了分析,从中筛选具有较适宜的体积与柔性的分子,它们能够较好地适配于RT酶的结合腔穴,与RT的结合自由能较低,往往具有较高抗HIV活性。
本发明涉及了如通式I所示的一种多取代二氢硫烃基环己甲基嘧啶酮类化合物(Dihydro-Alkylsulfanyl-Cyclohexylmethyl-Oxopyrimidines,S-DACOs)、以及其N-氧化物、和/或立体异构体形式、和/或立体异构体混合物、和/或药学上可接受的盐:
其中:
Y为:-H、卤素、氰基、羟基、氨基、三氟甲基、-C1-6的烷基、-C3-6的环烷基;
R为:-H;被一个或多个卤素原子、氰基、硝基、羧基、三氟甲基、-C1-4的烷基、-C1-4的烷氧基取代或未取代的-C1-12的烷基、-C3-6的环烷基、-C3-6的环烯基、-C3-12的杂环、芳基、芳烷基、五元或六元芳杂环;或-CH2COL(其中,L是被一个或多个卤素原子、氰基、硝基、羧基、三氟甲基、-C1-4的烷基,-C1-4的烷氧基取代或未取代的-C1-12的烷基、-C3-6的环烷基、-C3-6的环烯基、-C3-12的杂环、芳基、五元或六元芳杂环);
Z为:-H、-C1-3烷基、-卤素、-CN;
R’为:-H、卤素、氰基、硝基、羟基、氨基、三氟甲基、-C1-6的烷基;
m为0,1或2;
本发明的优选化合物为Ia:
其中:
Y为:-H、-Br、-F、-C1-4的烷基;
Z为:-H、-CH3;
R为:单取代或双取代苄基(其中,苯环上的取代基为-H,-OCH3,-F,-OH,-CN,取代位为邻位和/或对位);或-CH2COL(其中,L为呋喃环或单取代或双取代的苯环,苯环上的取代基为-H,-OCH3,-F,-OH,-CN,取代位为邻位和/或对位)。
药学上可接受的盐可以为盐酸盐、或硫酸盐、或酒石酸盐、或柠檬酸盐。
本发明所述具有通式I的S-DACO类衍生物合成方法如下:
以取代的环己基乙酰乙酸乙酯(简称β-酮酯)(3)为原料,与硫脲在醇钠催化下缩合关环制得关键中间体取代的6-环己甲基硫尿嘧啶(2),最后与各卤代物(RX)反应引入C-2侧链制备目标分子(1),其反应式如下所示:
其中,
(1)β-酮酯(3)可参照文献(M.Artico,J Med Chem,1997,42,619)方法制备,以取代的环己基乙酸(4)为原料与N,N-羰基二咪唑(CDI)反应制备取代的环己基乙酰咪唑(5),进而与取代的丙二酸单钾盐(7)反应制备β-酮酯(3),其反应式如下所示:
(2)取代基Y为:-H、卤素、氰基、羟基、氨基、三氟甲基、-C1-6的烷基、-C3-6的环烷基;R为:-H,被一个或多个卤素原子、氰基、硝基、羧基、三氟甲基、-C1-4的烷基、-C1-4的烷氧基取代或未取代的-C1-12的烷基、-C3-6的环烷基、-C3-6的环烯基、-C3-12的杂环、芳基、芳烷基、五元或六元芳杂环;或-CH2COL(其中,L是被一个或多个卤素原子、氰基、硝基、羧基、三氟甲基、-C1-4的烷基,-C1-4的烷氧基取代或未取代的-C1-12的烷基、-C3-6的环烷基、-C3-6的环烯基、-C3-12的杂环、芳基、五元或六元芳杂环);Z为:-H、-C1-3烷基、-卤素、-CN;R’为:-H、卤素、氰基、硝基、羟基、氨基、三氟甲基、-C1-6的烷基;m为0,1或2;
(3)取代的6-环己甲基硫尿嘧啶(2)与各种卤代物(RX)反应的的摩尔比为1:1~1:1.5,反应温度控制在为20~150℃之间,反应时间为8-36小时;
(4)所用的溶剂1是甲苯、和/或二氯甲烷、和/或N,N-二甲基甲酰胺中的一种或它们的混合物。碱是醇钠或碳酸钾或三乙胺。
经Johns Hopkin大学病理系体外抗HIV活性实验证明,由本发明提出的化学结构通式I所包含的化合物,普遍具有较强的抗HIV-1病毒活性及较低的细胞毒性和较高选择指数。其中优选化合物多数对临床突变株Y181C及K103N有明显的抗突变作用。
发明产品的用途是作为制备抗艾滋病药物的候选物。
具体实施方式
通过下述实施例将有助于理解本发明,但是不能限制本发明的内容。
实施例一 β-酮酯(3)的制备
取代的丙二酸单钾盐(7)的制备:在圆底烧瓶中加入100ml绝对甲醇和0.15mol KOH,搅拌溶解后,滴加入0.15mol的取代的丙二酸二乙酯(6),然后在适宜温度下搅拌反应4小时,冷却,过滤,减压蒸溜,得到取代的丙二酸单钾盐(7)的白色固体,产率为90-95%。
β-酮酯(3)的制备:把50ml无水乙腈加入盛有26mmol取代的环己基乙酸(4)和26mmol的N,N-羰基二咪唑(CDI)的100ml烧杯中,室温或40℃下搅拌反应1小时即得取代环己基乙酰咪唑(5)的乙腈溶液。
在溶有取代的丙二酸单钾盐(7)的100ml无水乙腈中,加入三乙胺(83.2mmol)和MgCl2(66.5mmol),搅拌反应2小时后,滴加取代的环己基乙酰咪唑(5)的乙腈溶液(50ml),室温搅拌过夜,继续回流2-4小时,至原料点消失,冷却后,向体系中加入100ml稀盐酸,搅拌一定时间后静置分层,分取有机层减压蒸干,用100ml乙酸乙酯溶解,依次用饱和NaHCO3溶液、食盐水洗涤,无水NaSO4干燥,减压浓缩得β-酮酯(3)粗品。该产品可不经纯化直接用于下一步合成。
实施例二 取代6-环己甲基硫尿嘧啶(2)的合成
反应的一般操作:在装有50ml绝对乙醇的圆底烧瓶中,加入金属钠(26.2mmol),搅拌使钠溶解,加入硫脲(18.2mmol)和上述β-酮酯(3)(13.1mmol),回流搅拌反应约6小时,TLC跟踪原料点消失后冷却,减压蒸出乙醇,用20ml水溶解剩余物,HCl酸化后析出沉淀,抽滤,分别用水和乙醚洗涤沉淀物,真空干燥,用适当溶剂重结晶得取代的6-环己甲基硫尿嘧啶(2)。
以4-环己基-2-甲基-3-氧代-戊酸乙酯及硫脲为原料,如上操作,得6-(1-环己基-乙基)-5-甲基-2-硫代-嘧啶-4-酮(2a,收率85%;1H NMR(CDCl3)δ(ppm):1.15-1.69(m,11H,cyclohexyl),1.17(d,3H,CHCH 3 ),1.95(s,3H,CH 3 ),2.66(m,1H,CH),9.05(d,1H,NH),9.92(d,1H,NH)
实施例三 取代的5-烷基-6-(环己甲基)-4(3H)-嘧啶酮(1)的合成
反应的一般操作:将取代的5-烷基-6-(环己甲基)-2-硫脲嘧啶(2)(3mmol)和K2CO3(3.3mmol)溶于10ml无水DMF,于室温下搅拌30min后,加入卤化物(3.3mmol),在25-80℃继续搅拌反应,TLC跟踪,至原料点消失(12-24h),停止反应,过滤,减压蒸去溶剂,残余物用30ml二氯甲烷溶解,饱和食盐水洗涤,无水Na2SO4干燥,减压蒸去溶剂,得油状或固体粗品,经柱层析纯化得各种取代的5-烷基-6-(环己甲基)-4(3H)-嘧啶酮(1)纯品化合物。
操作如上,柱层析分离得白色粉末1a,产率:56%;熔点:159-160℃,
1H NMR(CDCl3)δ(ppm):1.09-1.64(m,11H,cyclohexyl),1.21(d,6H,2CH3),2.41(d,2H,-CH 2 cyclohexyl),4.41(s,2H,CH 2 -S),7.01-8.03(m,4H,Ph-H),12.25(s,brs,1H,NH);
操作如上,柱层析分离得白色粉末1b,产率:42%;熔点:183-185℃1HNMR,(CDCl3,500MHz):δ(ppm)=1.02-1.57(m,11H,cyclohexyl),1.07(t,3H,CH2CH 3 ),2.22(d,2H,-CH 2 cyclohexyl),2.33(q,2H,CH 3 CH 2 CH3),2.43(s,3H,CH3),4.55(s,2H,CH 2 -S),7.18-7.95(q,4H,Ph-H),12.08(s,brs,1H,NH);
操作如上,柱层析分离得淡黄色油状物1c,产率:43%。1HNMR,(CDCl3,500MHz):δ(ppm)=1.03-1.78(m,11H,cyclohexyl),1.17(d,3H,CHCH 3 ),1.95(s,3H,CH3),2.45(d,H,CHCH3),5.31(s,2H,CH 2 S),7.28-7.92(m,4H,Ph-H),12.05(s,brs,1H,NH);
操作如上,柱层析分离得白色粉末1d,产率:51%;熔点:53-54℃;1HNMR,(CDCl3,500MHz):δ(ppm)=1.04-1.76(m,11H,cyclohexyl),1.20(d,3H,CHCH 3 ),1.89(s,3H,CH3),2.45(m,1H,CHCH3),3.85(s,3H,OCH 3 ),5.28(s,2H,CH 2 S),7.92(d,2H,Ph-H),7.88(d,2H,Ph-H),12.05(s,brs,1H,NH)。
操作如上,柱层析分离得白色粉末1e,产率:49%;1H NMR(CDCl3)δ(ppm):1.09-1.72(m,11H,cyclohexyl),1.93(s,3H,CH3),2.41(d,2H,-CH2cyclohexyl),4.49(s,2H,CH 2 -S),6.70-7.21(m,3H,Ar-H),12.05(s,brs,1H,NH);
操作如上,柱层析分离得白色粉末1f,产率:56%;1HNMR,(CDCl3,500MHz):δ(ppm)=1.02(d,6H,2CH3),1.19(m,3H,CHCH 3 ),1.45-1.82(m,11H,cyclohexyl),1.88(s,3H,CH3),2.41(m,1H,CHMe2),2.45(m,1H,CHCH3),3.84(d,2H,SCH 2 ),12.5(s,brs,1H,NH);
操作如上,柱层析分离得淡黄色粉末1g,产率:52%;1HNMR,δ(ppm):0.86-1.76(m,11H,cyclohexyl),2.43(d,2H,CH 2 cyclohexyl),3.85-3.89(s,2H,SCH 2 ),7.26-7.61(m,5H,Ph),12.35(s,brs,1H,NH);;
操作如上,柱层析分离得白色粉末1h,产率:45%;1HNMR,(CDCl3,500MHz):δ(ppm)=1.07(d,3H,CH 3 ),0.84-1.68(m,10H,cyclohexyl),1.95(s,3H,CH3),3.86(s,2H,CH 2 S),7.28-7.92(m,5H,Ph-H),12.75(s,brs,1H,NH);
实施例四 目标化合物体外抗HIV活性实验
体外细胞水平的抗HIV病毒活性由Johns Hopkin大学病理系测定。包括对HIV感染的MT-4及C8166细胞抑制活性,细胞毒性两方面。
材料与方法:
各化合物的抗HIV活性由药物对细胞中引起的细胞病变的抑制作用效率来监控。采用MT-4及C8166细胞进行细胞培养。采用的病毒株有:HIV-1IIIB病毒株,HIV-2病毒株ROD和典型的NNRTIs选择性变异株RES056(变异部位和变异类型为:K103N和Y181C)。具体操作如下:
将待测化合物用DMSO溶解后用磷酸盐缓冲食盐水溶液稀释成不同浓度溶液。由于HIV感染的MT-4及C8166细胞往往在5-7天内发生病变,因此向HIV-1感染细胞悬浊液中加入不同浓度的待测化合物溶液,在5% CO2氛围于37℃经过一段时间(5-7天)的培养后,使用MTT法测定存活细胞数,得保护50%细胞免于细胞病变的药物浓度(EC50)即可得化合物的抗HIV的活性。毒性测定与抗HIV活性实验平行操作,也在MT-4或C8166细胞培养中,用MTT法测定化合物使50%未感染细胞发生细胞病变的浓度(CC50),并计算选择指数SI=CC50/EC50。
本发明以AZT、NVP为对照,经Johns Hopkin大学病理系对合成的32个多取代S-DACO类化合物进行了抗HIV-1活性筛选。实验结果表明,所测化合物普遍对野生型HIV-1有明显的抑制活性,尤其是其中所含的优选化合物可在低于1μM范围内抑制HIV的复制,且细胞毒性较小,对择性变异株RES056的保留了较好抑制活性,更多的活性评价及药理、毒理实验正在进行之中。
Claims (5)
1、一种的多取代二氢硫烃基环己甲基嘧啶酮类(Dihydro-Alkylsulfanyl-Cyclohexylmethyl-Oxopyrimidines,S-DACOs)化合物、其结构通式I,以及其N-氧化物、其立体异构体形式、其立体异构体混合物或药学上可接受的盐,其药学上可接受的前体药物和衍生物:
其中:
Y为:-H、卤素、氰基、羟基、氨基、三氟甲基、-C1-6的烷基、-C3-6的环烷基;
R为:-H;被一个或多个卤素原子、氰基、硝基、羧基、三氟甲基、-C1-4的烷基、-C1-4的烷氧基取代或未取代的-C1-12的烷基、-C3-6的环烷基、-C3-6的环烯基、-C3-12的杂环、芳基、芳烷基、五元或六元芳杂环;或-CH2COL(其中,L是被一个或多个卤素原子、氰基、硝基、羧基、三氟甲基、-C1-4的烷基,-C1-4的烷氧基取代或未取代的-C1-12的烷基、-C3-6的环烷基、-C3-6的环烯基、-C3-12的杂环、芳基、五元或六元芳杂环);
Z为:-H、-C1-3烷基、-卤素、-CN;
R’为:-H、卤素、氰基、硝基、羟基、氨基、三氟甲基、-C1-6的烷基;
m为0,1或2。
3、一种如权利要求1所述化合物的制备方法,其特征在于:以取代的环己基乙酰乙酸乙酯(简称β-酮酯)(3)为原料,与硫脲在醇钠催化下缩合关环制得关键中间体取代的6-环己甲基硫尿嘧啶(2),最后与各卤代物反应引入C-2位侧链制备目标分子,其反应式为:
其中:
(1)β-酮酯(3)是以取代的环己基乙酸(4)为原料与N,N-羰基二咪唑(CDI)反应制备各取代环己甲基羰基咪唑(5),进而与各烷基丙二酸单钾盐(7)反应制备β-酮酯(3),其反应式为:
(2)取代基Y为:-H、卤素、氰基、羟基、氨基、三氟甲基、-C1-6的烷基、-C3-6的环烷基;R为:-H,被一个或多个卤素原子、氰基、硝基、羧基、三氟甲基、-C1-4的烷基、-C1-4的烷氧基取代或未取代的-C1-12的烷基、-C3-6的环烷基、-C3-6的环烯基、-C3-12的杂环、芳基、芳烷基、五元或六元芳杂环;或-CH2COL(其中,L是被一个或多个卤素原子、氰基、硝基、羧基、三氟甲基、-C1-4的烷基,-C1-4的烷氧基取代或未取代的-C1-12的烷基、-C3-6的环烷基、-C3-6的环烯基、-C3-12的杂环、芳基、五元或六元芳杂环);Z为:-H、-C1-3烷基、-卤素、-CN;R’为:-H、卤素、氰基、硝基、羟基、氨基、三氟甲基、-C1-6的烷基;m为0,1或2;
(3)取代的6-环己甲基硫尿嘧啶(2)与各种卤代物(RX)反应的的摩尔比为1:1~1:1.5,反应温度控制在为20~150℃之间,反应时间为8-36小时;
(4)所用的溶剂1是甲苯、和/或二氯甲烷、和/或N,N-二甲基甲酰胺中的一种或它们的混合物。碱是醇钠或碳酸钾或三乙胺。
4、如权利要求1所述化合物的药学上可接受的盐,其特征在于为盐酸盐、或硫酸盐、或酒石酸盐、或柠檬酸盐。
5、如权利要求1、2、4所述的任一化合物在制备用于治疗与HIV感染疾病状或疾病有关药物上的用途。
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