CN101354348A - 一种甘蔗分子标记page凝胶超快速银染检测方法 - Google Patents
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Abstract
一种甘蔗分子标记PAGE凝胶超快速银染检测方法,该方法包括以下步骤:用5%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测SSR标记和AFLP标记的PCR扩增物;将电泳好的凝胶放入染色液染色;将凝胶从染色液中取出,快速冲洗,放入显影液里显影;显影好的凝胶用蒸馏水清洗两次,晾干读带;本发明将传统的固定、染色、显影和定影四个步骤合成两个最简单的步骤,同时减少了洗涤次数和时间,减少了固定液、定影液及乙酸、无水乙醇、碳酸钠、硫代硫酸钠的使用,不仅大大减少了银染时间、试剂成本,同时也保证了高质量的银染效果,相比较其他传统或改良银染和同位素方法具有较大的时间成本优势。
Description
技术领域:
本发明涉及一种甘蔗分子标记PAGE凝胶的超快速银染检测方法。
背景技术:
甘蔗的分子标记技术近年来得到快速发展,目前针对甘蔗种质资源研究最有效的分子标记技术为AFLP和SSR标记,对两种标记的扩增片段多用聚丙烯酰胺凝胶,凝胶的显影有两种方式:银染显影和放射性显影,放射性显影虽能较清晰的显示扩增片段,但由于其实验成本过高及对从业人员身体危害比较大,因此较少采用;银染方法通过甲醛将银离子还原出来,银离子与核酸结合从而显出扩增带,达到显影的目的,其分辨率能够满足检测要求。
目前,所报道的银染方法多为常规银染方法和经过改良的方法,但依然存在步骤多,所用试剂强碱强酸有毒,不仅耗时耗力,对人体也有一定的伤害,而且显影的质量也有好有坏。
发明内容:
本发明的目的是提出一种甘蔗分子标记PAGE凝胶的超快速银染检测方法,该方法能有效提高银染的速度,同时减少一些有害试剂的使用。
本发明的目的通过以下步骤实现:
1、用5%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测SSR标记和AFLP标记的PCR扩增物。
2、将电泳好的凝胶放入染色液染色。
3、将凝胶从染色液中取出,快速冲洗,放入显影液里显影。
4、显影好的凝胶用蒸馏水清洗两次,晾干读带。
本发明将传统的固定、染色、显影和定影四个步骤合成两个最简单的步骤,同时减少了洗涤次数和时间,减少了固定液、定影液及乙酸、无水乙醇、碳酸钠、硫代硫酸钠的使用,不仅大大减少了银染时间、试剂成本,同时也保证了高质量的银染效果,相比较其他传统或改良银染和同位素方法具有较大的时间成本优势。整个过程只需要10分钟时间,在保证快速少害的同时,又能进一步提高银染显影质量,提高分子标记扩增带的检出率。
具体实施方式:
本发明的方法步骤是:
a、用5%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测SSR标记和AFLP标记的PCR扩增物。
1、采用常规SSR标记和AFLP标记方法对甘蔗基因组DNA进行PCR扩增,获得扩增产物;
2、取3.8ul产物进行凝胶电泳检测。
b、将电泳好的凝胶放入染色液染色。
1、染色液的配置:称2g硝酸银加入2L去离子水中配成0.1%的染色液;
2、将电泳好的凝胶放入染色液中染色5分钟。
c、将凝胶从染色液中取出,快速冲洗,放入显影液里显影。
1、显影液的配置:30gNaOH,15ml 37%甲醛加入到2L去离子水中;
2、将染色好的凝胶用去离子水清洗5秒,放入显影液里显影4分钟左右。
D、显影好的凝胶用蒸馏水清洗两次,晾干读带。
1、显影完全后用清水清洗两次,晾干;
2、胶片晾干后即可读带。
Claims (3)
1、一种甘蔗分子标记PAGE凝胶超快速银染检测方法,步骤如下:
1)、用5%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测SSR标记和AFLP标记的PCR扩增产物;
2)、将电泳好的凝胶放入染色液染色5分钟;
3)、将凝胶从染色液中取出,用去离子水快速冲洗5秒,放入显影液里显影4分钟;
4)、显影好的凝胶用蒸馏水清洗两次,晾干读带。
2、根据权利要求1所述的一种甘蔗分子标记PAGE凝胶超快速银染检测方法,其特征是:染色液为0.1%的硝酸银溶液。
3、根据权利要求1所述的一种甘蔗分子标记PAGE凝胶超快速银染检测方法,其特征是:显影液为含有1.5%的氢氧化钠和0.5%甲醛的溶液。
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