CN101865798A - 一种聚丙烯酰胺凝胶电泳中的dna银染方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳中的DNA银染方法,先用0.1%AgNO3浸泡聚丙烯酰胺凝胶10–15min,用蒸馏水清洗2次,其次用0.04%的Na2CO3、2mL的37%HCOH/L、2%的NaOH混合溶液显色5–6min,蒸馏水冲洗2次即可完成全部染色过程。传统的DNA银染方法需要5-6种化学试剂,配制4中溶液,花费40-60min才能完成染色步骤,而本方法只需要4种化学试剂,配制2种溶液,花费20min就可以达到与传统染色方法相同的结果,而且在变性聚丙烯酰胺电泳(PAGE)中,本染色方法可以将DNA的量降低到0.44ng;在非变性聚丙烯酰胺电泳(PAGE)中可以将DNA的量降低到3.5ng。本方法与传统染色方法相比,不仅节约了时间,降低额成本,而且提高了检测的灵敏度。
Description
技术领域
本发明属于分子遗传学领域的电泳染色方法,具体涉及一种聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)中的DNA银染方法。
背景技术
聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳是分析蛋白质和核酸样品的一种常用的方法,在分子生物学及相关学科的基础和临床研究中得以广泛的应用。电泳后对样品的显示有许多的方法,银染法因具有灵敏度高、无毒无害且显色结果可以随干胶直接保存等优点而得以广泛应用,特别是近几年在SSCP、DDPCR和DNA测序等实验中更显示出其优越性。传统的银染方法主要包含下面几个步骤:(1)预处理与固定,(2)染色,(3)显色,(4)终止反应。整个过程比较繁琐,要用到蒸馏水或去离子水、乙醇、硝酸、硝酸银、碳酸钠、甲醛、硫代硫酸钠、乙酸等多种化学试剂。近年来,许多研究人员对PAGE胶中蛋白质和DNA的银染和显色的过程优化进行了探索,以求得到简便、快速、灵敏度高且消耗低的银染显色方法,但改良后的方法,染色与显色的整个过程仍然至少需要40~50min。
发明内容
针对上述现有技术存在的缺陷或不足,本发明的目的在于,提供一种快速、灵敏和有效的聚丙烯酰胺(PAGE)电泳中的DNA银染方法。
为了实现上述任务,本发明采取如下的技术解决方案:
一种聚丙烯酰胺(PAGE)电泳中的DNA银染方法,其特征在于,该方法先用质量浓度0.1%的AgNO3浸泡聚丙烯酰胺凝胶10min–15min,然后对用浸泡后的聚丙烯酰胺凝胶蒸馏水清洗凝胶2次,再用质量分数0.04%的Na2CO3、每升含有质量浓度37%的HCOH,2mL、质量分数2%的NaOH的混合溶液显色5min–6min,显色后用蒸馏水冲洗聚丙烯酰胺凝胶2次。
所述的聚丙烯酰胺凝胶的质量浓度为8%或12%,交联度为29:1。
本发明与现有技术相比,具有以下有益的技术效果:
传统的DNA银染方法需要5-6种化学试剂,配制4种溶液,花费40-60min才能完成染色步骤,而本方法只需要4种化学试剂,即硝酸银(AgNO3)、氢氧化钠(NaOH)、碳酸钠(Na2CO3)和甲醛(HCOH),配制2种溶液,花费20min就可以达到与传统染色方法相同的结果,而且在变性聚丙烯酰胺电泳(PAGE)中,该方法可以将DNA的用量降低到0.44ng;在非变性聚丙烯酰胺电泳(PAGE)中可以将DNA的用量降低到3.5ng。本方法与传统染色方法相比,不仅节约了时间,降低了成本,而且提高了检测的灵敏度。
附图说明
图1是采用本发明对GDF9基因外显子1的PCR产物的变性聚丙烯酰胺凝胶(浓度12%)电泳检测对比图,图中,A表示本发明的DNA银染方法;B表示采用传统方法1;C表示采用传统方法2;D表示采用传统方法3;
图2是采用本发明对微卫星BM1329PCR产物的非变性聚丙烯酰胺凝胶(浓度8%)电泳检测图,图中,1、2、3和8表示:关中奶山羊;4和5表示:济宁青山羊;6和7表示:布尔山羊;9和10表示:西农萨能奶山羊,M表示pBR322DNA/MspI;
图3是采用本发明对GDF9基因外显子2PCR产物的变性聚丙烯酰胺凝胶(浓度12%)电泳检测图,图中,1、2和3表示:关中奶山羊;4、5和7表示:济宁青山羊;6和8表示:布尔山羊;9、10和11表示:西农萨能奶山羊;
以下通过对3种传统的DNA银染方法与本发明的DNA银染方法的实施例进行比较分析,对本发明作进一步的详细说明。
具体实施方式
1、3种传统的DNA银染方法与本发明的DNA银染方法的比较
按照表1的操作步骤对3种传统的DNA银染方法(图中的方法1、方法2和方法3)与本发明的DNA银染方法进行比较,电泳检测结果如图1所示,从图1可知,本发明的染色方法明显优于3种传统的染色方法。
用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测400头山羊的微卫星BM1329,使用本发明的DNA银染方法染色,检测结果如图2所示;
用12%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测400头山羊GDF9基因外显子2的多态性,使用本发明的DNA银染方法染色,试验结果如图3所示。
从图2和图3可知,使用优化后的DNA银染方法染色能够获得良好的试验结果。
表1:3种传统的DNA银染方法与本发明的DNA银染方法操作步骤的比较
注:表中所用试剂为质量浓度。
表2:3种传统的DNA银染方法与本发明的DNA银染方法效果的比较
Claims (2)
1.一种聚丙烯酰胺(PAGE)电泳中的DNA银染方法,其特征在于,该方法先用质量浓度0.1%的AgNO3浸泡聚丙烯酰胺凝胶10min–15min,然后对用浸泡后的聚丙烯酰胺凝胶蒸馏水清洗凝胶2次,再用质量分数0.04%的Na2CO3、每升含有质量浓度37%的HCOH,2mL、质量分数2%的NaOH所构成的混合溶液显色5min–6min,显色后用蒸馏水冲洗聚丙烯酰胺凝胶2次。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的聚丙烯酰胺凝胶的浓度为8%或12%,交联度为29:1。
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