CN101347094A - 一种聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻品种的选育方法 - Google Patents

一种聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻品种的选育方法 Download PDF

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Abstract

本发明为一种聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻品种的选育方法,属于水稻育种领域。以W3660为母本、镇稻88为父本杂交,F2代开始,选择植株主穗12粒稻米中全蛋白的SDS-PAGE蛋白带型与W3660全蛋白带型一致的单株种植;用WW1标记、R15标记辅助选择,结合抗条纹叶枯病的田间接种和人工接种鉴定,选出抗条纹叶枯病,SSR指纹图谱具有WW1标记的低谷蛋白特征谱带237bp,R15标记的抗条纹叶枯病特征谱带363bp,生育期、株高、株叶形态性状与镇稻88一致的株系,定名W1721。经测定,育成的水稻新品种W1721品种谷蛋白含量低,可吸收蛋白(包含清—球蛋白和谷蛋白)含量小于4%,且抗条纹叶枯病。

Description

一种聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻品种的选育方法
一、技术领域
本发明为一种聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻品种的选育方法,属于低谷蛋白和抗条纹叶枯病水稻新品种的聚合育种方法,专用于适合肾脏病及糖尿病人食用稻米且抗条纹叶枯病品种的选育。
二、背景技术
近年来由于我国城乡居民生活习惯和生态环境等的改变,我国肾脏病和糖尿病患者的人数在不断增加,据统计,近年来全国糖尿病患者总人数超过1亿人,其中有近600万人因糖尿病并发肾脏病而接受住院治疗。肾脏病及糖尿病(并发肾脏病)患者的蛋白质代谢机能障碍,在治疗期间不能食用可吸收蛋白含量超过4%的大米,因此采用低蛋白的饮食配合治疗是一种有效的措施,而目前我国尚无专用的低蛋白质大米品种,而以代用品进行饮食配合治疗,这无疑增加了患者的经济和精神负担,降低了医疗效果。
众所周知,通常稻米中的全蛋白根据其在不同溶剂中的溶解性可以分为清蛋白、球蛋白、谷蛋白和醇溶蛋白四大类,其中谷蛋白占全蛋白含量的60%以上,是稻米中可为人体吸收蛋白的主要成分;醇溶蛋白则不能被人体所吸收。因此,对于肾脏病和糖尿病患者来讲,所需要的是低谷蛋白(即低可吸收蛋白)含量的大米。目前本实验室已选育出低谷蛋白水稻品种W3660,单粒稻米中可吸收蛋白(包含清-球蛋白和谷蛋白)含量3.35%,谷蛋白含量低,为1.82%(表2),并进行了示范试种,但该品种存在产量低、不抗条纹叶枯病等缺点,因此,需要进一步提高产量和品种抗性。
三、发明内容
技术问题  本发明的目的是提供一种聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻品种的选育方法,培育出产量与目前主栽品种相当,而可吸收蛋白(包含清-球蛋白和谷蛋白)在4%以下且抗条纹叶枯病的功能保健水稻新品种,解决我国低谷蛋白大米品种产量低、抗性差的问题,培育优质高产多抗的适合肾脏病、糖尿病人食用的水稻品种。
技术方案
一种聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻品种的选育方法,包括:
1)以W3660(品种权号CNA20020113.1)为母本、镇稻88(1997年苏种审字第265号)为父本进行杂交,从杂种F2代开始,在杂交后代群体中,选择12粒稻米中全蛋白的SDS-PAGE蛋白带型与W3660全蛋白带型(江绍玫等,水稻谷蛋白突变体的筛选与遗传分析,遗传学报,2003,30(7):641-645))一致,同时,在植株农艺性状上,选择生育期、株高、株叶形态等性状与镇稻88(参照文献盛生兰等,水稻中粳新品种——镇稻88.江苏农业学报,1998,14(3):148)一致的单株种植。
2)进行分子标记WW1的辅助选择,苗期各单株取叶片提取DNA,用WW1标记引物:
左端引物序列5′TTGGTGTGCCATTGTTTTTT 3′
右端引物序列5′AACTGTTGAGACCTGCTTTT3′
扩增上述各单株DNA,选择仅得到扩增片段长度237bp的条带、没有扩增片段长度222bp的条带的纯合W3660基因型的植株;
对获得的植株再进行SDS-PAGE蛋白带型的验证,选择植株全蛋白带型与W3660带型一致,生育期、株高、株叶形态性状与镇稻88一致的单株种植;选择2代后,获得谷蛋白含量与W3660一致的株系;
3)对获选的株系开展抗条纹叶枯病分子标记R15的辅助选择,提取各植株叶片的DNA,用R15标记引物:
左端引物序列5′GGGCTTTCAACTCGTACTCTG3′
右端引物序列5′ATGAACTGCGGGTCCAATAA3′
选择仅得到扩增片段长度363bp的条带、没有得到扩增片段长度357bp的条带的纯合镇稻88基因型的植株,对获得的植株再进行抗条纹叶枯病的田间接种(丁秀兰等.利用回交重组自交群体检测水稻条纹叶枯病抗性位点.作物学报,2005,31(8):1041-1046)和人工接种(丁秀兰等,利用回交重组自交群体检测水稻条纹叶枯病抗性位点.作物学报,2005,31(8):1041-1046)鉴定,选出抗性与镇稻88一致;且生育期、株高和株叶形态性状与镇稻88一致的单株种植,获得株系,定名W1721。
以上述方法育成的水稻新品种W1721品种谷蛋白含量与W3660一致,可吸收蛋白(包含清-球蛋白和谷蛋白)含量小于4%,抗条纹叶枯病,简单重复序列(SSR)指纹图谱具有WW1标记的低谷蛋白特征谱带237bp,R15标记的抗条纹叶枯病特征谱带363bp。
有益效果  与现有技术相比,本发明所提供的一种聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻品种的选育方法,具有如下优点:
1、本发明提供的方法选育了产量与镇稻88持平,抗条纹叶枯病,品质优良,特别是可吸收蛋白(包含清-球蛋白和谷蛋白)含量小于4%的低谷蛋白水稻新品种W1721。与传统育种方法相比,利用本方法培育聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻品种的年限缩短,从而提高了育种效率。
2、选育的新品种W1721与低谷蛋白品种W3660相比,农艺性状有较大的改善,与镇稻88相似。(见表1)
3、育成品种W1721的主要优点:
生育期短、早熟:W1721属中熟中粳,在南京地区于5月15日左右播种,6月15日左右移栽,8月19日左右齐穗,9月底10月初成熟。
综合性状好:全生育期130天左右。株高87cm,主茎总叶片16张,地上伸长5节。株型紧凑,叶略短,叶色绿,熟相好,穗颈节稍长,每亩成穗21万以上,每穗实粒数110粒,结实率91.8%,千粒重26.2g,亩产500kg以上。可留种繁殖。田间感纹枯病,苗稻瘟0~2级、穗颈瘟0~2级,接种鉴定免疫6个稻瘟病生理小种,中抗白叶枯病,抗条纹叶枯病,抗倒伏。米质优,理化分51,出糙率84.8%,精米率71.1%,整精米率69.1%,垩白粒率20%,垩白度2%,直链淀粉含量15.11%,胶稠度82mm,粒长7.0mm,长宽比3.0,透明度1级,碱消值7级,含水量12.4%。
谷蛋白含量低:该品系稻米的谷蛋白含量低,为1.84%,可吸收蛋白(包含清-球蛋白和谷蛋白)含量小于4%,适合肾脏病病人食用(表2)。
抗条纹叶枯病:W1721经条纹叶枯病田间接种和人工接种鉴定分别表现为抗病、中抗,与镇稻88相当(表3)。
四、附图说明
图1W1721及其亲本的与低谷蛋白性状紧密连锁的简单重复序列(SSR)指纹图谱
亲本1:W3660;亲本2:镇稻88;
3~16为F2群体,其中3为低谷蛋白纯合基因型的F2个体(进一步选育成W1721),13为高谷蛋白的纯合基因型的F2个体,其他为低谷蛋白杂合基因型的F2个体。
图2W3660、镇稻88及其F1种子SDS-PAGE分析
图3F2种子全蛋白SDS-PAGE分析
7,13,14,17,20,22为正常蛋白型;其它为低谷蛋白型
图4F3家系种子全蛋白SDS-PAGE分析
图5亲本及W1721株系抗条纹叶枯病人工接种鉴定结果
左为未接种的对照,右为接种后的发病情况
图6W1721及其亲本的与抗条纹叶枯病性状紧密连锁的简单重复序列(SSR)指纹图谱
1分子量标记,2镇稻88,3W3660,4W1721,5~16为F2群体,其中6,13,14为纯合抗条纹叶枯病基因型的F2个体,5,7~10,12,16为杂合抗条纹叶枯病基因型的F2个体,11,15为纯合感条纹叶枯病基因型的F2个体
图7聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻新品系W1721的选育过程
五、具体实施方式
1、以低谷蛋白的水稻品种W3660为母本,以镇稻88为父本,杂交,杂种后代自交,从F1开始,后代种子全蛋白进行十二烷基磺酸钠变性-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析显示,发现低谷蛋白和高醇溶蛋白性状总是相伴出现;F1种子全部呈现低谷蛋白含量和高醇溶蛋白含量特性(图2);F2种子中呈现低谷蛋白和正常蛋白性状的比例约为3∶1(图3);测定F3种子蛋白,其低谷蛋白纯合型,杂合型和正常型的分离比例符合F2植株基因型1∶2∶1(图4)。表明低谷蛋白和高醇溶蛋白性状是由单显性基因控制(图3),而且能稳定地遗传给后代。
2、以W3660为母本、镇稻88为父本进行杂交,从杂种F2代开始,在杂交后代群体中,用SDS-PAGE法测定各植株主穗12粒稻米中全蛋白组分含量,选择12粒稻米中全蛋白的SDS-PAGE蛋白带型均为W3660蛋白带型(江绍玫等,水稻谷蛋白突变体的筛选与遗传分析,遗传学报,2003,30(7):641-645)的植株;此外,在植株农艺性状上,选择生育期、株高、株叶形态等性状与镇稻88(盛生兰等,水稻中粳新品种——镇稻88.江苏农业学报,1998,14(3):148)一致的单株种植。
3、进行分子标记WW1的辅助选择,苗期各单株取叶片提取DNA,用WW1标记引物:
左端引物序列5′TTGGTGTGCCATTGTTTTTT 3′
右端引物序列5′AACTGTTGAGACCTGCTTTT3′
扩增上述各单株DNA,选择仅得到扩增片段长度237bp的条带、没有扩增片段长度222bp的条带的纯合W3660基因型的植株;
对获得的植株再进行SDS-PAGE蛋白带型的验证,选择植株主穗12粒稻米中全蛋白的SDS-PAGE蛋白带型均为W3660蛋白带型,在植株农艺性状上,生育期、株高和株叶形态性状与镇稻88一致的单株种植。经测定,选择2代后,获得谷蛋白含量与W3660一致的株系;
4、对获选的株系开展抗条纹叶枯病分子标记R15的辅助选择,提取各植株叶片的DNA,用R15标记引物:
左端引物序列5′GGGCTTTCAACTCGTACTCTG3′
右端引物序列5′ATGAACTGCGGGTCCAATAA3′
选择仅得到扩增片段长度363bp的条带、没有得到扩增片段长度357bp的条带的纯合镇稻88基因型的植株,对获得的植株再进行抗条纹叶枯病的田间接种(丁秀兰等,利用回交重组自交群体检测水稻条纹叶枯病抗性位点.作物学报,2005,31(8):1041-1046)和人工接种(丁秀兰等,利用回交重组自交群体检测水稻条纹叶枯病抗性位点.作物学报,2005,31(8):1041-1046)鉴定,选出抗性与镇稻88一致;且生育期、株高和株叶形态性状与镇稻88一致的单株种植,获得株系,定名W1721。其选育过程详见图7。
具体方法如下
(一)蛋白含量及组分的测定方法(江绍玫等,水稻谷蛋白突变体的筛选与遗传分析,遗传学报,2003,30(7):641-645):
①单粒糙米全蛋白的提取:每粒米(糙米)加0.5ml试剂A,研磨匀浆,在冰浴上,超声波处理数分钟,离心,15000rpm(或7000g),5min,上清10ul用于SDS-PAGE,胶浓度为15%。然后用光密度仪检测各色带的密度(Beckman DU-8 Spectrimetre)。算出稻米中全蛋白质含量。
②各蛋白组分的分离:100mg精米粉,加1.0ml试剂B离心管,超声波处理数分钟(冰浴),微型匀浆机匀浆1min,离心(10000g,15min,4℃)重复三次,每次隔6h,上清置一试管中(清-球蛋白组分),沉淀加1.0ml试剂C,超声波处理数分钟(冰浴),离心(10000g,15min,4℃)重复三次,每次隔6h,上清置一试管中(醇溶蛋白组分),沉淀加1.0ml试剂D,超声波处理数分钟(冰浴),离心(10000g,15min,4℃)重复三次,每次隔6h,上清置一试管中(谷蛋白组分),弃沉淀。
③用SDS-PAGE法测定各蛋白组分含量(以牛血清白蛋白为标准):300ul清-球蛋白组,300ul谷蛋白组,各加1.0ml 10%TCA(三氯乙酸);300ul醇溶蛋白组,80℃干燥至100ul,加1.0ml 10%TCA,上述成分分别离心,10000g,15min,去上清,沉淀加100ul SDS-尿素,进行SDS-PAGE,然后用光密度仪检测535nm下各色带的密度(Beckman DU-8 Spectrimetre)。算出稻米中清-球蛋白、醇溶蛋白、谷蛋白分别占全蛋白的百分比。
④用Bradford法测定各蛋白组分含量(以牛血清白蛋白为标准):
清-球蛋白组分,谷蛋白组分;醇溶蛋白组分(80℃干燥),上述成分分别加蒸馏水定容至4.0ml,各加33ul 2%脱氧胆酸,作用15min,各加1.3ml24%TCA,4℃过夜,离心3000rpm,15min,2℃,弃上清,沉淀,1.0ml 1NaOH(溶解各蛋白),用Bradford法测蛋白含量(以牛血清白蛋白为标准)。
⑤各试剂的配方:
试剂A:50mM KH2PO4-NaOH pH 6.8(或50mM Tris-HCl pH 6.8)+8M尿素+4%SDS+20%甘油+5%β-巯基乙醇
试剂B:50mM KH2PO4-NaOH pH 6.8(或50mM Tris-HCl pH 6.8)+0.5MNaCl
试剂C:60%正丙醇+1mM EDTA-2Na
试剂D:1%乳酸+1mM EDTA-2Na
(二)低谷蛋白DNA指纹图谱、抗条纹叶枯病DNA指纹图谱的建立
可作为低谷蛋白含量、抗条纹叶枯病的鉴定标准。
1、水稻基因组DNA的分离采用微量法,具体步骤如下:
在分蘖期取亲本及各待测植株的新鲜叶片1张,在-20℃预冷研钵中用液氮研磨成粉末。然后转移到-20℃预冷的1.5ml离心管中,放入-20℃冰箱保存待用(过夜)。加入600ul SDS提取液摇匀,65℃,温浴30min。间或振荡3-4次。温浴至样液变墨绿色;加入1/4体积(约100ul)5M KAC、摇匀,冰浴30min。加入1/2体积(约300-400ul)的氯仿∶异戊醇(体积比:24∶1),振荡器上充分摇匀(120rpm、30min)。离心:6000-8000rpm、15min,取上清。加入等体积(400ul左右)氯仿∶异戊醇(体积比:24∶1),80-90rpm振荡30min。室温下6000-8000rpm离心15min。取上清。加入2倍体积(700ul左右)-20℃预冷的无水乙醇、摇匀。-20℃冰箱自由沉降20min。室温下12000rpm离心6min。弃上清,沉淀用等体积(400ul左右)70%乙醇洗涤10min。弃70%乙醇,DNA沉淀风干后,溶解于200ul TE(1/10),4℃保存备用。用Perkin Elmer MBA 2000DNA浓度测定仪测定,并平衡各个样品的DNA浓度为10-20ng/ul。用于PCR扩增。
2、微卫星的PCR扩增:PCR反应用10μl反应体系,包括:10mMTris-HCl pH 8.3,50mM KCl,1.5mM MgCl2,50μM dNTPs,0.2μM引物,0.5U Taq polymerase(TaKaRa,大连)和20ng DNA模板,扩增反应在PTC-200(MJ Research Inc.)PCR仪上进行:94℃4min;94℃1min,55℃1min,72℃1.5min,35个循环;72℃7min。
3、扩增产物的PAGE和银染检测:扩增产物经非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,凝胶浓度为8%,凝胶大小180×120×2mm,电泳缓冲液为0.5×TBE,以50bp的DNALadder为对照比较扩增产物的分子量大小,200V恒压电泳。电泳结束后,凝胶用蒸馏水稍微冲洗。银染方法如下:含10%酒精,0.5%冰乙酸固定液固定2次,6分钟/次,然后0.2%AgNO3溶液渗透10~12分钟,ddH2O清洗2次,0.002%硫代硫酸钠溶液置代30s,用含NaOH1.5%、甲醛0.4%的溶液染色,最后用0.75%Na2CO3溶液终止显色反应。
4、低谷蛋白水稻的SSR指纹图谱:W1721及其亲本的SSR指纹图谱见图1,对苗期各单株取叶片提DNA,用分子标记WW1的引物进行扩增,扩增片段仅有长度为237的植株,即为低谷蛋白纯合基因型,扩增片段仅有长度为222的植株,即为高谷蛋白纯合基因型,若同时存在237和222两个条带,则为杂合基因型,因而该标记可用于低谷蛋白纯合基因型水稻品种的选育。这是低谷蛋白水稻特有的分子检测特征,可作为低谷蛋白水稻的鉴定标准。
5、抗条纹叶枯病水稻的SSR指纹图谱:W1721及其亲本的SSR指纹图谱见图6,对苗期各单株取叶片提DNA,用分子标记R15的引物进行扩增,扩增片段仅有长度为363的植株,即为抗条纹叶枯病纯合基因型,扩增片段仅有长度为357的植株,即为感条纹叶枯病纯合基因型,若同时存在357和363两个条带,则为杂合基因型,因而该标记可用于抗条纹叶枯病基因型水稻品种的选育。这是抗条纹叶枯病基因型水稻特有的分子检测特征,可作为抗条纹叶枯病基因型水稻的鉴定标准。
(三)选育品种W1721的主要特点:
全生育期130天左右。株高87cm,主茎总叶片16张,地上伸长5节。株型紧凑,叶略短,约20cm,叶色绿,熟相好,穗颈节稍长,约2cm,每亩成穗21万以上,每穗实粒数110粒,结实率91.8%,千粒重26.2g,亩产500kg以上。可留种繁殖。田间感纹枯病,苗稻瘟0~2级、穗颈瘟0~2级,接种鉴定免疫6个稻瘟病生理小种,中抗白叶枯病,抗条纹叶枯病,抗倒伏。米质优,理化分51,出糙率84.8%,精米率71.1%,整精米率69.1%,垩白粒率20%,垩白度2%,直链淀粉含量15.11%,胶稠度82mm,粒长7.0mm,长宽比3.0,透明度1级,碱消值7级,含水量12.4%。
谷蛋白含量低:该品系稻米的谷蛋白含量低,为1.84%,可吸收蛋白(包含清-球蛋白和谷蛋白)含量小于4%,适合肾脏病病人食用(表2)。
抗条纹叶枯病:W1721经条纹叶枯病田间接种和人工接种鉴定分别表现为抗病、中抗,与镇稻88相当(表3)。
表1.W1721与镇稻88、W3360农艺性状比较(2006-2007年平均)
  品种名称   全生育期(天)   有效穗数(万/亩)   株高(cm)   穗长(cm)   总粒数   实粒数   结实率(%)   千粒重(g)   米质   小区产量(kg/亩)
  W1721   131   21.4   87.1   15.1   119.9   110.1   91.8   26.2   良   515.9
  镇稻88   135   19.3   90.4   17.4   132.8   120.7   90.9   27   中   542.6
  W3660   126   22.4   78.6   17.9   68.5   65.9   96.2   25.9   良   335.3
谷蛋白含量低:该品系稻米的谷蛋白低于4%,适合肾脏病病人食用(表2)。
表2低谷蛋白水稻品种W1721的蛋白质测定结果(2006~2007年)
  品系   全蛋白含量(%)   清-球蛋白(%)   醇溶蛋白(%)   谷蛋白(%)
  W1721   8.80   18   61   21
  镇稻88   9.99   16.8   31.4   52
  W3660   8.99   17   62.7   20.3
注:全蛋白含量指蛋白质总量占整粒稻米总量的百分比。
以蛋白质含量为100%,其中清-球蛋白、醇溶蛋白、谷蛋白分别占全蛋白中的百分比。
单粒稻米中可吸收蛋白(包含清-球蛋白和谷蛋白)含量的计算:
W3660:(17+20.3)%*8.99%=3.35%
W1721:(18+21)%*8.8%=3.43%
表3低谷蛋白水稻品种W1721的抗条纹叶枯病测定结果(2006~2007年)
品系   田间接种病情指数比率(%) 抗病级别   人工接种病情指数比率(%) 抗病级别
  W1721   25   抗   50   中抗
  镇稻88   20   抗   58   中抗
  W3660   84   感   97   感病
序列表
<110>南京农业大学
<120>一种聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻品种的选育方法
<130>说明书
<140>00
<141>2008-08-08
<160>4
<170>PatentIn version 3.1
<210>1
<211>20
<212>DNA
<213>人工合成
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<221>WW1标记引物左端
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<223>
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<400>4
atgaactgcg ggtccaataa                                            20

Claims (2)

1、一种聚合低谷蛋白和抗条纹叶枯病的水稻品种的选育方法,包括:
1)以W3660为母本、镇稻88为父本进行杂交,从杂种F2代开始,在杂交后代群体中,选择植株主穗12粒稻米中全蛋白的SDS-PAGE蛋白带型与W3660全蛋白带型一致,生育期、株高、株叶形态性状与镇稻88一致的单株种植;
2)上述单株种植后进行分子标记WW1的辅助选择,苗期各单株取叶片提取DNA,用WW1标记引物:
左端引物序列5′TTGGTGTGCCATTGTTTTTT3′
右端引物序列5′AACTGTTGAGACCTGCTTTT3′
扩增上述各单株DNA,选择仅得到扩增片段长度237bp的条带、没有扩增片段长度222bp条带的纯合W3660基因型的植株;
对获得的植株再进行全蛋白SDS-PAGE蛋白带型的验证,选择植株全蛋白带型与W3660带型一致,生育期、株高和株叶形态性状与镇稻88一致的单株种植;选择2代后,获得谷蛋白含量与W3660一致的株系;
3)对获选的株系开展抗条纹叶枯病分子标记R15的辅助选择,提取各植株叶片的DNA,用R15标记引物:
左端引物序列5′GGGCTTTCAACTCGTACTCTG3′
右端引物序列5′ATGAACTGCGGGTCCAATAA3′
选择仅得到扩增片段长度363bp的条带、没有得到扩增片段长度357bp的条带的纯合镇稻88基因型的植株,对获得的植株再进行抗条纹叶枯病的田间接种和人工接种鉴定,选出抗性与镇稻88一致,生育期、株高和株叶形态性状与镇稻88一致的单株种植,获得株系,定名W1721。
2、据权利要求1所述的一种聚合和抗条纹叶枯病的水稻品种的选育方法,其特征在于,以上述方法育成的水稻新品种W1721品种可吸收蛋白即清-球蛋白和谷蛋白含量小于4%,抗条纹叶枯病,简单重复序列SSR指纹图谱具有WW1标记的低谷蛋白特征谱带237bp,R15标记的抗条纹叶枯病特征谱带363bp。
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