CA2692633A1 - Procede de detection simultanee de multiples sequences d'acides nucleiques dans un echantillon - Google Patents

Procede de detection simultanee de multiples sequences d'acides nucleiques dans un echantillon Download PDF

Info

Publication number
CA2692633A1
CA2692633A1 CA 2692633 CA2692633A CA2692633A1 CA 2692633 A1 CA2692633 A1 CA 2692633A1 CA 2692633 CA2692633 CA 2692633 CA 2692633 A CA2692633 A CA 2692633A CA 2692633 A1 CA2692633 A1 CA 2692633A1
Authority
CA
Canada
Prior art keywords
detection
target
nucleic acid
tag
region
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CA 2692633
Other languages
English (en)
Other versions
CA2692633C (fr
Inventor
Martinus Gerardus Cecilia Maria Reijans
Gijs Josephus Henricus Dingemans
Augustinus Franciscus Maria Simons
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Pathofinder Holding BV
Original Assignee
Individual
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Individual filed Critical Individual
Publication of CA2692633A1 publication Critical patent/CA2692633A1/fr
Application granted granted Critical
Publication of CA2692633C publication Critical patent/CA2692633C/fr
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C12Q1/6818—Hybridisation assays characterised by the detection means involving interaction of two or more labels, e.g. resonant energy transfer
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]

Abstract

La présente invention concerne la détection de séquences d'acides nucléiques dans un échantillon, et notamment la détection d'organismes pathogènes dans des échantillons cliniques. L'invention concerne plus particulièrement la détection d'une infection causée par un organisme pathogène tel qu'un virus ou une bactérie dans un spécimen clinique au moyen de l'amplification et de la détection de séquences d'acides nucléiques spécifiques dudit organisme pathogène. L'invention concerne un test multiplex avec la possibilité de déterminer environ 30 séquences d'acides nucléiques cibles différentes dans un test mono-tube unique combiné avec une détection par sonde en temps réel. Le procédé utilise l'amplification multiplex de sonde nucléique dépendant des ligatures (MLPA) utilisant des amorces marquées en association avec des sondes marquées et la détection de la fluorescence.
CA2692633A 2007-07-11 2008-07-10 Procede de detection simultanee de multiples sequences d'acides nucleiques dans un echantillon Active CA2692633C (fr)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP07112219.6 2007-07-11
EP07112219A EP2014774A1 (fr) 2007-07-11 2007-07-11 Analyse pour la détection simultanée de plusieurs séquences d'acides nucléiques dans un échantillon
PCT/EP2008/059050 WO2009007438A1 (fr) 2007-07-11 2008-07-10 Procédé de détection simultanée de multiples séquences d'acides nucléiques dans un échantillon

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CA2692633A1 true CA2692633A1 (fr) 2009-01-15
CA2692633C CA2692633C (fr) 2017-06-20

Family

ID=38685434

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CA2692633A Active CA2692633C (fr) 2007-07-11 2008-07-10 Procede de detection simultanee de multiples sequences d'acides nucleiques dans un echantillon

Country Status (4)

Country Link
US (1) US9222124B2 (fr)
EP (2) EP2014774A1 (fr)
CA (1) CA2692633C (fr)
WO (1) WO2009007438A1 (fr)

Families Citing this family (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102876660A (zh) * 2011-07-11 2013-01-16 三星电子株式会社 扩增靶核酸的方法和测定样品中的靶核酸的相对量的方法
KR101922126B1 (ko) * 2011-07-11 2019-02-20 삼성전자주식회사 바이어스가 감소된 표적 핵산을 증폭하는 방법 및 시료 중 표적 핵산의 상대적인 양을 결정하는 방법
GB201116131D0 (en) * 2011-09-19 2011-11-02 Epistem Ltd Probe
ES2662386T3 (es) * 2011-10-04 2018-04-06 Genera Biosystems Limited Composiciones y métodos para la detección patógenos respiratorios usando sondas de ácido nucleico y subconjuntos de gránulos
JP6234463B2 (ja) 2012-09-10 2017-11-22 ジーンスカイ ダイアグノスティクス（スーツォウ） インコーポレーテッドＧｅｎｅｓｋｙ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ （Ｓｕｚｈｏｕ） Ｉｎｃ． 核酸の多重分析の方法
KR101572041B1 (ko) 2013-09-12 2015-11-27 대한민국 식중독균 검출용 프로브 조성물
KR101830700B1 (ko) * 2013-11-11 2018-02-21 주식회사 파나진 클램핑 프로브 및 검출 프로브를 이용한 다중 표적핵산 검출방법
ES2572031B1 (es) * 2014-10-27 2017-07-03 Servicio Andaluz De Salud Método de detección del virus sincitial respiratorio humano tipo A, del virus sincitial respiratorio humano tipo B y del metapneumovirus humano
CA2970966A1 (fr) 2014-12-22 2016-06-30 Anapa Biotech A/S Dosage par double extinction pour la detection multiplexe d'acides nucleiques cibles
EP3286329B1 (fr) * 2015-04-23 2019-10-30 PathoFinder B.V. Procédé de détection simultanée de multiples séquences d'acide nucléique dans un échantillon
CN106893771B (zh) * 2017-01-09 2020-10-16 广东华美众源生物科技有限公司 一种人果糖二磷酸醛缩酶b基因检测试剂盒及其检测方法
EP3774641A4 (fr) * 2018-04-11 2021-05-12 The Regents of the University of California Dispositifs et procédés de détection/discrimination d'acides nucléiques complémentaires et non appariés à l'aide de transistors à effet de champ à film ultramince
CN110184363B (zh) * 2018-11-13 2020-07-24 深圳市疾病预防控制中心 检测沙门菌的引物组和试剂盒
CN111187847A (zh) * 2018-11-15 2020-05-22 蔡慧娜 分枝杆菌鉴定用的探针系统、试剂盒及鉴定方法
CN109355437A (zh) * 2018-12-11 2019-02-19 上海捷诺生物科技有限公司 一种呼吸道病原体多重检测试剂盒

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6140054A (en) * 1998-09-30 2000-10-31 University Of Utah Research Foundation Multiplex genotyping using fluorescent hybridization probes
EP1130113A1 (fr) * 2000-02-15 2001-09-05 Johannes Petrus Schouten Méthode d'amplification dépendant de ligatures multiples
GB0303497D0 (en) * 2003-02-15 2003-03-19 Univ Liverpool Immuno PCR method
WO2005059178A1 (fr) * 2003-12-10 2005-06-30 Bio Trove, Inc. Ligature selective amelioree et essai d'amplification
US20060281099A1 (en) * 2005-06-14 2006-12-14 Bio-Rad Laboratories, Inc. Q-melt for polymorphism detection

Also Published As

Publication number Publication date
WO2009007438A1 (fr) 2009-01-15
US9222124B2 (en) 2015-12-29
EP2167691B1 (fr) 2016-07-13
CA2692633C (fr) 2017-06-20
EP2167691A1 (fr) 2010-03-31
US20100297630A1 (en) 2010-11-25
EP2014774A1 (fr) 2009-01-14

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CA2692633A1 (fr) Procede de detection simultanee de multiples sequences d'acides nucleiques dans un echantillon
CA2884246C (fr) Pyrosequencage multiplexe a l'aide d'etiquettes d'identification de polynucleotide anti-bruit, non interferentes
EP1716257B8 (fr) Nouvelles amorces et sondes pour la détection du parvovirus b19
EP3063292B1 (fr) Sonde nucléique
US9809846B2 (en) Compositions, kits, uses and methods for amplified detection of an analyte
US9845495B2 (en) Method and kit for detecting target nucleic acid
WO2014173963A1 (fr) Procédé d'amplification d'adn fondée sur l'invasion de brins
KR20140071968A (ko) Ｐｃｒ에 의한 미생물 ｄｎａ 검출 방법, 이를 위한 시스템 및 조성물
JP2014501494A (ja) 核酸標的の定量的多重同定
WO2016203740A1 (fr) Procédé d'étude de microorganismes, kit d'étude de microorganismes, micropuce pour l'étude de microorganismes, support pour détection de moisissures, procédé de détection de moisissures et kit de détection de moisissures
KR102435116B1 (ko) CRISPR-Cas 시스템과 멀티플렉스 LAMP 프라이머 세트를 이용한 인플루엔자 바이러스의 검출 방법
EP3156501A1 (fr) Procédé de détection de colibacilles, et support pour détection de colibacilles
Mulvaney et al. Direct detection of genomic DNA with fluidic force discrimination assays
JP6880554B2 (ja) カビ検出用担体、カビの検出方法、及びカビ検出用キット
JP2008072951A (ja) Ｌａｍｐ法を用いたサルモネラｏ４群の血清型迅速検出法
JP6728657B2 (ja) 核酸増幅法
WO2016129249A1 (fr) Procédé pour détecter des bactéries d'acide lactique, kit de détection de bactéries d'acide lactique et instrument de détection de bactéries d'acide lactique
JP5697881B2 (ja) パエシロマイセスサトゥラタス及びパエシロマイセスディバリカタスの検出方法
US7749696B2 (en) Method and kit for the specific detection of M. tuberculosis
JP5873356B2 (ja) モニリエラ属真菌の検出方法
JP4576489B2 (ja) 新規ポリヌクレオチド、それを用いた深在性輸入真菌症原因菌ペニシリウム・マルネッフェイ（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍｍａｒｎｅｆｆｅｉ）の検出用マーカ、プローブ、プライマー、検出方法およびキット
Tsui et al. Rapid identification and detection of pathogenic fungi by padlock probes
JP5799139B2 (ja) パエシロマイセスサトゥラタス及びパエシロマイセスディバリカタスの検出方法
JP2017521083A (ja) リステリア・モノサイトゲネス（Ｌｉｓｔｅｒｉａ ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ）を検出するための配列およびこの配列の使用
KR20170092216A (ko) hsp65 유전자 증폭에 기반한 마이코박테리움 압세수스 균종 동정용 키트 및 방법

Legal Events

Date Code Title Description
EEER Examination request

Effective date: 20130419