WO2024123139A1 - 타겟 세포 내로 올리고뉴클레오티드를 전달하기 위한 펩타이드 기반 결합체를 포함하는 나노입자 및 이를 포함하는 약학적 조성물 - Google Patents

타겟 세포 내로 올리고뉴클레오티드를 전달하기 위한 펩타이드 기반 결합체를 포함하는 나노입자 및 이를 포함하는 약학적 조성물 Download PDF

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WO2024123139A1
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peptide
conjugate
nanoparticle
sirna
oligonucleotide
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박윤정
정종평
이주연
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주식회사 나이벡
서울대학교산학협력단
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Definitions

  • the present invention relates to nanoparticles containing a peptide-based conjugate loaded with oligonucleotides for inhibiting target proteins or promoting the expression of target proteins in cells, and pharmaceutical compositions containing the same.
  • Oligonucleotides are being developed as therapeutic agents to control genes that cause cancer and infectious diseases. Recently, the application of mRNA is attracting attention as the mRNA vaccine, which induces an immune response by injecting the gene encoding the spike protein of the COVID-19 virus in mRNA form, was approved by the FDA. mRNA is not toxic because it is used by artificially synthesizing mRNA within the body. However, siRNA and mRNA are quickly degraded by nuclease in vivo, have a negative charge, and cannot be targeted to specific lesions. In addition, it must act within the cytoplasm to be effective, but due to its negative charge and large size, it cannot penetrate the cell membrane on its own. Therefore, to overcome these limitations, a delivery vehicle that can stably deliver oligonucleotides into cells is needed.
  • lipid nanoparticles The most widely used carrier is lipid nanoparticles, and oligonucleotide carriers using various cationic lipids are known (US 2006/0083780, US 2006/0240554, US 2008/0020058, US 2009/0263407 and US 2009/0285881 and WO 2009/086558, WO 2009/127060, WO 2009/132131, WO 2010/042877, WO 2010/054384, WO 2010/054401, WO 2010/054405, WO 2010/054406 and WO 2010/105209).
  • Traditional cationic lipids such as CLinDMA and DLinDMA have been used for oligonucleotide delivery to the liver, but are known to suffer from non-optimal delivery efficiency along with liver toxicity at high doses.
  • Lipid Nanoparticles are manufactured using cationic lipids, cholesterol, and polyethylene glycol (PEG).
  • the cationic lipids allow the oligonucleotide to pass through the cell membrane, and the cholesterol maintains the shape of the oligonucleotide.
  • PEG allows lipid nanoparticles to have long circulation in vivo.
  • PEG induces an anaphylactic reaction by generating antibodies against PEG. Therefore, there is a need for new oligonucleotide delivery technology that can safely and efficiently deliver oligonucleotides into cells.
  • the present inventors used a sequence for target cell surface recognition, cell penetration functionality, acceleration of escape from endosomes, and a sequence that can bind to oligonucleotides.
  • a peptide-based conjugate was prepared using a lipid capable of protecting the peptide and oligonucleotide, and when nanoparticles composed of the peptide-based conjugate were used, it was confirmed that the oligonucleotide was effectively delivered into the cell, and the loaded oligonucleotide As a result, it was confirmed that the expression of cancer-causing proteins was reduced and that it exhibited anti-cancer effects in animal models that caused cancer, and the present invention was completed.
  • the purpose of the present invention is to provide a peptide-based conjugate that can safely and effectively deliver oligonucleotides into cells.
  • Another object of the present invention is to provide nanoparticles for intracellular delivery of oligonucleotides combined with the peptide-based conjugate and oligonucleotides, and compositions for intracellular delivery of oligonucleotides containing the nanoparticles.
  • Another object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition for preventing or treating diseases containing the nanoparticles.
  • Another object of the present invention is to provide a method for preventing or treating disease comprising administering the nanoparticles.
  • Another object of the present invention is to provide a use of the nanoparticles for preventing or treating diseases.
  • Another object of the present invention is to provide the use of the nanoparticles for manufacturing drugs for preventing or treating diseases.
  • the present invention provides a peptide-based conjugate having the following structural formula 1 as a basic unit:
  • A is an RNA-binding peptide
  • B is a fatty acid with 12 to 20 carbon atoms; cationic lipids; amphipathic polypeptide;
  • D is a peptide with a cell-penetrating function
  • E is a peptide that recognizes the target cell surface.
  • the present invention also provides nanoparticles in which the peptide-based conjugate and oligonucleotide are combined.
  • the present invention also provides a composition for intracellular delivery of oligonucleotides, including nanoparticles in which the peptide-based conjugate and oligonucleotide are combined.
  • the present invention also provides a pharmaceutical composition for disease prevention or treatment comprising nanoparticles in which the peptide-based conjugate and oligonucleotide are combined.
  • the present invention also provides a method for preventing or treating disease comprising administering the nanoparticles.
  • the present invention also provides the use of the nanoparticles for the prevention or treatment of diseases.
  • the present invention also provides the use of the nanoparticles for the production of medicaments for the prevention or treatment of diseases.
  • Figure 1 shows that the oligonucleotide is first bound to the RNA-binding peptide of the conjugate consisting of RNA-binding peptide, lipid, endosome escape-promoting peptide, cell-penetrating function peptide, and target recognition peptide, and then nanoparticles are formed by self-assembly.
  • This is a schematic diagram showing the formation process.
  • Figure 2A is a photograph of nanoparticles of a conjugate of mRNA and peptide observed by TEM
  • Figure 2B is a photograph of nanoparticles of a conjugate of siRNA and peptide observed by TEM.
  • Figure 3 shows the results of treating cells with nanoparticles formed by a peptide conjugate and mRNA encoding a KRAS-degraded protein, and confirming the expression of the KRAS-degraded protein within the cell by Western blot.
  • Figure 4 shows the results of confirming the expression of Firefly luciferase in vivo using IVIS after injecting nanoparticles formed by the mRNA and peptide conjugate encoding Firefly luciferase into mice.
  • nanoparticles composed of peptide conjugates that can safely and efficiently deliver functional oligonucleotides into cells were prepared.
  • a peptide-based conjugate was prepared using a peptide composed of a sequence for target cell surface recognition, cell penetration functionality, acceleration of escape from endosomes, and a sequence that can bind to an oligonucleotide, and a lipid that can protect the oligonucleotide.
  • nanoparticles were prepared by combining oligonucleotides with the peptide-based conjugate.
  • oligonucleotides are effectively delivered into cells, expression of cancer-causing proteins is reduced by the loaded oligonucleotides, and anti-cancer effects are shown in animal models that cause cancer. Confirmed.
  • the present invention relates to a peptide-based conjugate having the following structural formula 1 as a basic unit:
  • A is an RNA binding peptide
  • B is a fatty acid with 12 to 20 carbon atoms; cationic lipids; amphipathic polypeptide; or amphiphilic polymers,
  • D is a peptide with cell-penetrating function
  • E is characterized as a peptide that recognizes the target cell surface.
  • A may be characterized as comprising a peptide sequence to which RNA binds.
  • the A may be characterized as a peptide represented by any one of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 15, but is not limited thereto.
  • SEQ ID NO: 1 LKKLLKLLKKLLKLAG
  • SEQ ID NO: 2 IKKLIKIIKKLIKLAG
  • SEQ ID NO: 7 LKKLLKLL Orn KLLKLAG
  • SEQ ID NO: 8 WKKLLKLLKKLLKLAG
  • SEQ ID NO: 10 WRKLLLRLLKKLLKLAG
  • SEQ ID NO: 12 LRRLL Dbu LLRRLLRWAG
  • Orn Ornithine
  • Dbu 2,4-diaminobutyric acid
  • Dpr 2,3-diaminopropionic acid.
  • the A can be used without limitation as long as it is a peptide capable of binding RNA.
  • the nucleic acid binding peptide disclosed in US 2020/0207834 A1, etc. can be used, but is not limited thereto.
  • B may be a fatty acid having 12 to 20 carbon atoms, a cationic lipid, an amphipathic polypeptide, or an amphipathic polymer.
  • the fatty acid may be a saturated fatty acid or an unsaturated fatty acid having 12 to 20 carbon atoms.
  • the cationic lipid is 3 ⁇ -[N-(N′,N′-dimethylaminoethane carbamoyl cholesterol (DC-Chol); 1,2-dioleoyl-3-trimethylammonium-propane (DOTAP) ); 1,2-dioleoyl-3-dimethylammonium-propane (DODAP); 1,2-dilauroyl-sn-glycero-3-ethylphospho; Choline chloride (DL-EPC); N-[1-(2,3-dioleyloxy)propyl]-N-N-N-trimethylammonium chloride (DOTMA); N-[1-(2,3-dioleyloxy)propyl] -N-N-N-dimethylammonium chloride (DODMA); 1,2-dilauroyl-sn-glycero-3-ethylphosphocholine chloride (DOTMA); (DODAC); N-(1-(2,3-dimethylamino
  • amphipathic means comprising hydrophilic and hydrophobic domains.
  • the amphipathic polypeptide includes polar amino acids and non-polar amino acids, and refers to a polypeptide in which the polar amino acids and non-polar amino acids are partially crowded together to form a polar portion and a non-polar portion.
  • the polar amino acids include cysteine, glutamine, threonine, tyrosine, serine, or asparagine
  • the non-polar amino acids include phenylalanine, tryptophan, methionine, proline, valine, isoleucine, leucine, glycine, or alanine. It is not limited to this.
  • the amphipathic polypeptide may be in a form in which polar amino acids and nonpolar amino acids are crowded together in the amino acid sequence, and polar amino acids and nonpolar amino acids are not crowded together in the amino acid sequence, but the peptide containing the amino acids has a three-dimensional structure.
  • polar amino acids and non-polar amino acids may be crowded together due to the three-dimensional structure, but it is not limited thereto.
  • an amphipathic polypeptide may be a combination of a plurality of identical or non-identical polar amino acids and a plurality of identical or non-identical non-polar amino acids.
  • the amphipathic polypeptide may be a peptide represented by the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16, but is not limited thereto.
  • the amphiphilic polymer is a combination of a hydrophobic polymer and a hydrophilic polymer, and is a polymer already known to those skilled in the art.
  • the amphiphilic polymer may include any one of poloxamer and poly(ethylene oxide) (PEO)-polylactic acid (PLA) copolymer, which are bonded in a hydrophilic-hydrophobic form, and are preferably poly(ethylene oxide).
  • PEO poly(ethylene oxide)-polylactic acid (PLA) copolymer, but is not limited thereto, and can be selected and used according to the use and purpose of the amphiphilic polymer with self-association.
  • the amphiphilic polymer may be a poloxamer, but is not limited thereto.
  • D may be characterized as comprising a peptide sequence with a cell-penetrating function.
  • the peptide having the cell-penetrating function is not particularly limited as long as it has the characteristic of entering the cell through a cell internalization (endocytosis) mechanism, but is preferably composed of the cell-penetrating peptide disclosed in Korean Patent No. 10-0951719 or a variant thereof. You can select from the group and use it.
  • D may be characterized as a peptide selected from the group consisting of 4 to 12 arginines, 4 to 12 lysines, and 2 cysteines, or a combination thereof, but is limited thereto. No, peptides or peptide analogs other than the above-mentioned peptides can also be used as long as they can penetrate the cell membrane.
  • E may be characterized as comprising a peptide sequence that recognizes the target cell surface.
  • the target cell refers to a cell targeted by an oligonucleotide to be delivered into a cell by binding to the RNA-binding peptide.
  • the oligonucleotide is mRNA
  • the E may be a peptide that recognizes the surface of an immune cell
  • the immune cell may be a B cell or a T cell, but is not limited thereto.
  • E is a sequence that binds to the surface of an existing target cell, and can be newly discovered and applied through phage display technology.
  • the E may use a peptide represented by the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17 that targets cancer cells, but is not limited thereto.
  • SEQ ID NO: 17 CAIYPRH
  • C a peptide that promotes endosome escape between B and D.
  • the C may be characterized as comprising a peptide sequence that promotes endosomal escape, and is not particularly limited as long as it promotes endosomal escape of the conjugate, but is preferably an endosomal decomposition peptide disclosed in US 2020/0207834 A1 Alternatively, it can be selected and used from the group consisting of variants thereof.
  • C may be characterized as a peptide composed of 4 to 12 histidines, but is not limited thereto.
  • A-B or B-C of Structural Formula 1 may be linked through an amide bond, and the amide bond of A-B or B-C may be linked by chemical synthesis.
  • the C-D-E may be produced by chemical synthesis or recombinant expression.
  • a and C-D-E can be synthesized by a solid-phase peptide synthesis method and then chemically form an amide bond with B.
  • the present invention relates to nanoparticles in which the peptide-based conjugate and oligonucleotide are combined.
  • the oligonucleotide may be DNA, siRNA, miRNA, or mRNA, and preferably has the function of suppressing or increasing the expression of the target gene, but is not limited thereto.
  • the siRNA may have a complementary base sequence to a base sequence encoding a tumor-causing protein or a disease-causing protein, but is not limited thereto.
  • mRNA for mutant KRAS was used to suppress the expression of mutant KRAS.
  • the mRNA sequence encoding the protein that decomposes KRAS may be mRNA having the base sequences of SEQ ID NO: 18 and SEQ ID NO: 19, but is not limited thereto.
  • the expression of KRAS was suppressed using siRNA, and the siRNA may be characterized as having the base sequences of SEQ ID NO: 20 and SEQ ID NO: 21, but is not limited thereto.
  • SEQ ID NO: 20 and SEQ ID NO: 21 siRNA sequence that inhibits the expression of KRAS
  • the siRNA is a natural or chemically modified form of siRNA, or siRNA substituted at the 5' end with a sulfhydryl group or amine group is used to penetrate cells and chemically interact with the sulfhydryl group of cysteine in the target recognition peptide. They can be combined using a cross-linking agent.
  • the mRNA may be characterized as encoding a target protein, recombinant protein, or viral antigen whose expression is to be increased. It is an mRNA with a natural structure with a 3' cap and a 5' poly A tail, or it can be combined with a sulfhydryl group or amine group at the 5' end and then combined with the sulfhydryl group of cysteine in the cell-penetrating and target recognition peptide using a chemical cross-linker. You can.
  • an oligonucleotide is bound to Structural Formula 1, specifically A of Structural Formula 1, and when left for a certain period of time, nanoparticles are formed through self-assembly. You can do this.
  • the nanoparticles may be characterized as having a size of 10 to 200 nm, but are not limited thereto.
  • the molecular weight ratio of the siRNA or mRNA and the complex may be 1:1 to 1:100.
  • the siRNA and mRNA may be used as anticancer agents, but are not limited thereto.
  • the present invention relates to a composition for intracellular delivery of oligonucleotides, including nanoparticles in which the peptide-based conjugate and oligonucleotide are combined.
  • the present invention relates to a pharmaceutical composition for disease prevention or treatment comprising nanoparticles in which the peptide-based conjugate and oligonucleotide are combined.
  • the disease may be characterized as cancer, an inflammatory disease, or a viral infection, but is not limited thereto.
  • the above cancers include squamous cell carcinoma, basal cell carcinoma, adenocarcinoma, hepatocellular carcinoma, renal cell carcinoma, bladder cancer, intestinal cancer, breast cancer, cervical cancer, uterine cancer, colon cancer, esophagus cancer, head cancer, kidney cancer, liver cancer, lung cancer, ovarian cancer, pancreatic cancer, and prostate cancer.
  • Cancer gastric cancer, leukemia, benign and malignant lymphomas, especially Bukit's lymphoma and non-Hodgkin's lymphoma, benign and malignant melanoma, myeloproliferative diseases, Ewing's sarcoma, angiosarcoma, Kaposi's sarcoma, liposarcoma, myoma, neuroepithelial sarcoma , including synovial sarcoma, neurosarcoma, astrocytoma, oligodendroglioma, encephalocytosis, glioblastoma, neuroblastoma, gangliocytoma, ganglioglioma, medulloblastoma, pinocytoma, meningioma, meningosarcoma, neurofibroma, and schwannoma. It may be sarcoma, testicular cancer, thyroid cancer, carcinosarcoma, Hodgin's
  • the inflammatory diseases include atopy, psoriasis, arthritis, dermatitis, allergy, osteoarthritis, rhinitis, otitis media, pharyngitis, tonsillitis, periodontitis, gingivitis, inflammatory eye disease, cystitis, nephritis, rheumatoid arthritis, spondylitis, inflammatory bowel disease, hepatitis, sepsis, and alcohol. It may be, but is not limited to, sexual liver disease, non-alcoholic fatty liver disease, epilepsy, or intervertebral disc degeneration.
  • the viral infection may be, but is limited to, cold, flu (influenza), infectious mononucleosis, cytomegalovirus infection, measles, polio, yellow fever, dengue fever, hepatitis B, hepatitis C, AIDS, or COVID-19. It doesn't work.
  • the pharmaceutical composition is used to treat asthma, autoimmune disease, multiple sclerosis, ciliary disease, cleft palate, diabetes, heart disease, high blood pressure, mental retardation, mood disorder, obesity, and refractive error in addition to cancer, inflammatory disease, or viral infection.
  • infertility infertility, Engelmann syndrome, Canavan disease, chronic digestive disorder, Charcot-Maritoud disease, cystic fibrosis, Duquessian muscular dystrophy, hemochromatosis, hemophilia, Klinefelter syndrome, neurofibromatosis, phenylketonuria, autosomal dominant polycystic nephroma (PKD1 or It may be for the prevention or treatment of PKD2), Prader-Willi syndrome, sickle cell anemia, Tay-Sachs disease, Turner syndrome, etc., but is not limited thereto.
  • prevention refers to all actions that suppress or delay a disease by administering the composition
  • treatment refers to all actions that improve or completely cure disease symptoms by administering the composition. do.
  • the pharmaceutical composition is any one selected from the group consisting of injections, preparations for oral administration, patches, solutions, capsules, granules, tablets, powders, sprays, ointments, gels, mucosal administration preparations, and suppositories. It may be characterized as being formulated in a dosage form, but is not limited thereto. These preparations can be manufactured by conventional methods used for formulation in the art or by methods disclosed in Remington's Pharmaceutical Science (latest edition), Mack Publishing Company, Easton PA, and can be formulated into various preparations depending on each disease or ingredient. You can. However, the above description is illustrative, and the preparations to which the present invention can be applied are not limited to the above description.
  • the pharmaceutical composition may further include an acceptable adjuvant, and the adjuvant may be, for example, a carrier.
  • Pharmaceutically acceptable carriers can be saline solution, sterile water, Ringer's solution, buffered saline solution, dextrose solution, maltodextrin solution, glycerol, ethanol, and a mixture of one or more of these ingredients, and if necessary, antioxidants and buffer solutions.
  • Other common additives such as bacteriostatic agents can be added.
  • diluents can be additionally added to formulate injectable formulations such as aqueous solutions, suspensions, emulsions, etc., pills, capsules, granules, or tablets.
  • injectable formulations such as aqueous solutions, suspensions, emulsions, etc., pills, capsules, granules, or tablets.
  • auxiliaries or carriers usable in the present invention are not limited to the above description.
  • the present invention relates to a method for preventing or treating a disease comprising administering the nanoparticles.
  • the present invention relates to the use of the nanoparticles for the prevention or treatment of diseases.
  • the present invention relates to the use of the nanoparticles for the manufacture of drugs for the prevention or treatment of diseases.
  • the method, use and use include nanoparticles according to the present invention, and relate to a pharmaceutical composition containing the nanoparticles, and any content that overlaps with the nanoparticles and pharmaceutical compositions described above is included in the description. omit.
  • Amino acids and reagents necessary for synthesis were purchased from GL biochem and Sigma-Aldirich.
  • Peptides were synthesized from the C terminus using the F-moc solid phase chemical synthesis method using a peptide synthesis device. In other words, it was synthesized using a link resin with 2-chlorotrityl chloride bound as a blocking group and the necessary amino acids attached. After putting 50 mg of link resin into the synthesizer, the resin was swelled with DMF. After swelling, a 20% piperidine/DMF solution was used to remove the Fmoc-group.
  • 0.5M amino acid solution (solvent: dimethylformamide, DMF), 1.0M DIPEA (solvent: dimethylformamide&enmethylpyrrolidone, DMF&NMP), 0.5M HBTU (solvent: dimethylformamide, DMF) 5, 10, and 5 equivalents, respectively, were added and reacted for 1 to 2 hours under a nitrogen stream. After each deprotection and coupling step, washing was performed twice with DMF and isopropanol. Even after coupling the last amino acid, deprotection was performed to remove the Fmoc-group. The reaction was conducted using Kaiser test solution until a negative result was obtained. After the reaction was completed, the resin was washed with DMF and MeOH and dried in a vacuum oven.
  • Acetic acid (AcOH) cleavage cocktail was added at a rate of 15 ml per 1 g of resin and mixed for 1 hour, and then the cocktail containing the dissolved resin and peptide was separated through filtering. After partially removing the filtered solution using a rotary evaporator, cold ether was added, or an excessive amount of cold ether was added directly to the AcOH cocktail solution in which the peptide was dissolved, crystallizing the peptide into a solid phase and centrifuging it. It was separated and separated. At this time, the AcOH cocktail was completely removed through several washings with ether and centrifugation. The peptide obtained in this way was dried in a vacuum oven at room temperature.
  • lipid pentadecanedioic acid 5 equivalents
  • DIPEA DIPEA
  • EDC EDC
  • DMAP DMAP
  • pentadecanedioic acid pentadecanedioic acid
  • lipids with carboxyl groups (-COOH) present on both sides such as hexadecanedioic acid, heptadecanedioic acid, octadecanedioic acid, and nonadecanedioic acid, can be used.
  • the solution was washed several times with water and DCM using a separatory funnel to obtain an organic layer.
  • the peptide-lipid-peptide obtained in this way was dried using a rotary evaporator, and trifluoroacetic acid (TFA) cleavage cocktail was added at a ratio of 20 ml per 1 g of resin and mixed (shaking) for 3 hours. to remove the remaining protecting groups of each amino acid in the peptide.
  • TFA trifluoroacetic acid
  • the peptide-lipid-peptide conjugate obtained in this way was dissolved in distilled water, freeze-dried, and then separated and purified by high-performance liquid chromatography (Shimadzu, Japan). Analysis was performed using a C18 column with a diameter of 4.6 mm, flowing 0.1% TFA/H2O and 0.092% TFA/acetonitrile for 30 minutes at a flow rate of 1 ml/min while varying it from 0 to 60%. At this time, ultraviolet rays were used. The wavelength of the detector was set to 220 nm. Purification was performed using a column with a diameter of 2.2 cm at a flow rate of 20 ml/min and under the same solvent and detection wavelength conditions. The molecular weight of the purified peptide was confirmed through mass spectrometry.
  • Example 2 Preparation of nanoparticles through combination of peptide-lipid-peptide conjugate and mRNA
  • the peptide-lipid-peptide conjugate prepared in Example 1 contains mRNA (SEQ ID NO: 18 or SEQ ID NO: 19) of a gene encoding a protein that degrades mutant KRAS and siRNA (SEQ ID NO: 20 and SEQ ID NO: 21) that inhibits KRAS expression. were combined to prepare nanoparticles. 5 mg of peptide-lipid-peptide conjugate was mixed and dissolved in 1 ml of nuclease-free water (Invitrogen, AM9938). mRNA or siRNA was mixed with peptide-lipid-peptide conjugate at a weight ratio of 1:10 and reacted at room temperature for 30 minutes. The formed nanoparticles were observed using a transmission electron microscope (TEM, JEM-1230, JEOL) ( Figure 2). Both mRNA and siRNA formed particles with a diameter of 100 to 120 nm.
  • TEM transmission electron microscope
  • Cells were treated with nanoparticles formed by combining the mRNA encoding the KRAS degradation protein prepared in Example 2 with a peptide-lipid-peptide conjugate to confirm the intracellular expression of the KRAS degradation protein.
  • H358 cells (ATCC, CRL-5807) were seeded at a density of 70% in a 6-well plate, and 16 hours later, cells were starved overnight with serum-free DMEM medium. Nanoparticles formed by mRNA and peptide-lipid-peptide conjugates were treated with medium and cells were harvested every hour. Active KRAS was precipitated by immunoprecipitation using the Active Ras Detection Kit (CST, #8821). Proteins were lysed using lysis/binding/wash buffer containing protease inhibitor and phosphatase inhibitor.
  • Proteins were quantified through BCA protein assay (23227, Thermo scientific), and the expression levels of His tag and GAPDH, isolated by immunoprecipitation, and Active KRAS proteins were confirmed by western blot.
  • Western blot an equal amount of sample was loaded along with a size marker on a 12% SDS PAGE gel, electrophoresed for about 2 hours, and then transferred to a nitrocellulose membrane. The transferred membrane was blocked with 5% skim milk for 30 minutes, and 1st antibody (GST, abcam, ab19256; KRAS, abcam, ab275876; GAPDH, Santa Cruz, sc-32233; His tag, abcam, ab18184) was added at a ratio of 1:1000. It was reacted overnight.
  • the membrane was washed with TBST containing 0.1% tween-20, and incubated with HRP-attached 2nd antibody (anti-Rabbit, A90-116P, BETHYL Lab.; anti-Mouse, A120-101P, BETHYL Lab.) for 1 hour. After reaction, chemiluminescence was confirmed using ECL substrate.
  • HRP-attached 2nd antibody anti-Rabbit, A90-116P, BETHYL Lab.; anti-Mouse, A120-101P, BETHYL Lab.
  • KRAS decomposition protein was expressed by mRNA delivered into cells starting 4 hours after nanoparticle treatment, and the expression of active KRAS was confirmed to be suppressed by expression of KRAS decomposition protein. .
  • Nanoparticles formed by mRNA and peptide-lipid-peptide conjugates were processed in vivo to confirm the in vivo delivery and expression of mRNA.
  • Nanoparticles prepared as in Example 2 using firefly luciferase mRNA were injected into the thigh muscle of C57BL/6 mice. Expression of firefly luciferase was confirmed using an IVIS instrument (PerkinElmer, IVIS SPECTRUM) at 5 hours, 24 hours, 48 hours, and 72 hours. Substrate solution (VivoGloTM Luciferin, In Vivo Grade, Promega, P1041) was intravenously injected into mice at 1.5 mg/kg, and measured with IVIS 5 minutes later.
  • Nanoparticles composed of a peptide-based conjugate with oligonucleotides according to the present invention effectively deliver therapeutic oligonucleotides into cells, and can be used as a therapeutic agent by reducing or increasing the expression of target proteins by the oligonucleotides.

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Abstract

본 발명은 치료용으로 사용하려는 올리고뉴클레오티드를 세포 내로 전달하기 위한 전달체에 관한 것으로 세포 내에서 타겟 단백질의 억제하거나, 타겟 단백질의 발현을 촉진시키기 위해, 펩타이드 기반 결합체를 제조하고, 올리고뉴클레오티드를 포함한 펩타이드 기반 결합체로 구성된 나노입자 및 이를 포함하는 약학적 조성물에 관한 것이다. 본 발명에 따른 펩타이드 기반 결합체로 구성된 나노입자를 이용하여 세포 내로 올리고뉴클레오티드가 효과적으로 전달된 것을 확인하였다. 또한, 올리고뉴클레오티드에 의해 암을 유발하는 단백질의 발현을 감소시켰고, 암을 발생시킨 동물 모델에서 항암 효과가 있음을 확인함으로써, 상기 펩타이드 기반 결합체로 구성된 나노입자가 올리고뉴클레오티드의 전달에 효과적임을 확인할 수 있었다.

Description

타겟 세포 내로 올리고뉴클레오티드를 전달하기 위한 펩타이드 기반 결합체를 포함하는 나노입자 및 이를 포함하는 약학적 조성물
본 발명은 세포 내에서 타겟 단백질을 억제하거나, 타겟 단백질의 발현을 촉진시키기 위한 올리고뉴클레오티드가 탑재된 펩타이드 기반 결합체를 포함하는 나노입자 및 이를 포함하는 약학적 조성물에 관한 것이다.
올리고뉴클레오티드는 특히 siRNA, mRNA 등의 형태로 암, 감염성 질환을 유발하는 유전자를 제어하기 위한 치료제로서 많이 개발하고 있다. 최근에는 코로나19 바이러스의 스파이크 단백질을 코딩하는 유전자를 mRNA 형태로 주입하여 면역반응을 일으키는 mRNA 백신이 FDA의 승인을 받으면서, mRNA의 응용이 주목을 받고 있다. mRNA는 체내의 mRNA를 인공적으로 합성하여 사용하기 때문에 독성이 없다. 그러나, siRNA, mRNA는 생체 내에서 뉴클레아제(nuclease)에 의해 빠르게 분해되며, 음전하를 띄고 있고, 특정 병소로의 타겟팅이 불가능하다. 또한, 세포질 내에서 작용해야 그 효과가 나타나나, 음전하 및 사이즈가 크기 때문에 그 자체로 세포막을 투과할 수 없다. 따라서 이런 한계점을 극복하기 위해, 세포 내로 안정하게 올리고뉴클레오티드를 전달할 수 있는 전달체가 필요하다.
가장 많이 사용되고 있는 전달체는 지질나노입자이며, 다양한 양이온성 지질을 사용하여 올리고뉴클레오티드 전달체가 알려져 있다(US 2006/0083780, US 2006/0240554, US 2008/0020058, US 2009/0263407 및 US 2009/0285881 및 WO 2009/086558, WO 2009/127060, WO 2009/132131, WO 2010/042877, WO 2010/054384, WO 2010/054401, WO 2010/054405, WO 2010/054406 및 WO 2010/105209). CLinDMA 및 DLinDMA와 같은 전통적인 양이온성 지질은 간으로 올리고뉴클레오티드 전달을 위해 이용되어 왔으나, 고용량에서 간 독성과 함께 비-최적 전달 효율을 겪는 것으로 알려져 있다.
지질나노입자(Lipid Nanoparticle, LNP)는 양이온성 지질, 콜레스테롤, 폴리에틸렌글리콜(PEG)을 사용하여 제조하고 있으며, 양이온성 지질은 올리고뉴클레오티드가 세포막을 통과하도록 하고, 콜레스테롤은 올리고뉴클레오티드의 형태를 유지하도록 하며, PEG는 생체 내에서 지질나노입자가 long circulation을 할 수 있도록 한다. 그러나, PEG가 PEG에 대한 항체를 생성시켜 아나필락시스 반응을 유도한다는 보고들이 나오고 있다. 따라서, 세포 내로 올리고뉴클레오티드를 안전하고 효율적으로 전달할 수 있는 새로운 올리고뉴클레오티드 전달체 기술이 요구되고 있다.
이에, 본 발명자들은 안전하면서도 효과적으로 세포 내로 올리고뉴클레오티드를 전달할 수 있는 나노입자를 제조하기 위하여, 타겟 세포 표면 인식을 위한 서열과 세포투과 기능성, 엔도좀에서의 탈출 촉진, 올리고뉴클레오티드와 결합할 수 있는 서열로 구성된 펩타이드와 올리고뉴클레오티드를 보호할 수 있는 지질을 이용하여 펩타이드 기반 결합체를 제조하고, 상기 펩타이드 기반 결합체로 구성된 나노입자를 이용하는 경우, 세포 내로 올리고뉴클레오티드가 효과적으로 전달되는 것을 확인하였으며, 탑재된 올리고뉴클레오티드에 의해 암을 유발하는 단백질의 발현이 감소되고, 암을 발생시킨 동물 모델에서 항암 효과를 나타내는 것을 확인하고, 본 발명을 완성하게 되었다.
본 배경기술 부분에 기재된 상기 정보는 오직 본 발명의 배경에 대한 이해를 향상시키기 위한 것이며, 이에 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가지는 자에게 있어 이미 알려진 선행기술을 형성하는 정보를 포함하지 않을 수 있다.
발명의 요약
본 발명의 목적은 안전하면서도 효과적으로 세포 내로 올리고뉴클레오티드를 전달할 수 있는 펩타이드 기반 결합체를 제공하는 데 있다.
본 발명의 다른 목적은 상기 펩타이드 기반 결합체와 올리고뉴클레오티드가 결합된 올리고뉴클레오티드의 세포 내 전달용 나노입자 및 상기 나노입자를 포함하는 올리고뉴클레오티드의 세포 내 전달용 조성물을 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 나노입자를 포함하는 질병 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 나노입자를 투여하는 단계를 포함하는 질병의 예방 또는 치료방법을 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 질병의 예방 또는 치료를 위한 상기 나노입자의 용도를 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 질병의 예방 또는 치료용 약제 제조를 위한 상기 나노입자의 사용을 제공하는 데 있다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 하기 구조식 1을 기본단위로 하는 펩타이드 기반 결합체를 제공한다:
[구조식 1]
A-B-D-E
여기서, A는 RNA 결합 펩타이드, B는 탄소수가 12~20개인 지방산; 양이온성 지질; 양친매성 폴리펩타이드; 또는 양친매성 고분자, D는 세포 투과 기능을 가진 펩타이드, E는 타겟 세포 표면을 인식하는 펩타이드인 것을 특징으로 한다.
본 발명은 또한, 상기 펩타이드 기반 결합체와 올리고뉴클레오티드가 결합된 나노입자를 제공한다.
본 발명은 또한, 상기 펩타이드 기반 결합체와 올리고뉴클레오티드가 결합된 나노입자를 포함하는 올리고뉴클레오티드의 세포 내 전달용 조성물을 제공한다.
본 발명은 또한, 상기 펩타이드 기반 결합체와 올리고뉴클레오티드가 결합된 나노입자를 포함하는 질병 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명은 또한, 상기 나노입자를 투여하는 단계를 포함하는 질병의 예방 또는 치료방법을 제공한다.
본 발명은 또한, 질병의 예방 또는 치료를 위한 상기 나노입자의 용도를 제공한다.
본 발명은 또한, 질병의 예방 또는 치료용 약제 제조를 위한 상기 나노입자의 사용을 제공한다.
도 1은 올리고뉴클레오티드가 RNA 결합 펩타이드, 지질, 엔도좀 탈출 촉진 펩타이드, 세포투과기능 펩타이드 및 타겟인식 펩타이드로 구성된 결합체의 RNA 결합 펩타이드에 먼저 결합한 후에, 자기조립(self-assembly)에 의해서 나노입자를 형성하는 과정을 나타낸 모식도이다.
도 2A는 mRNA와 펩타이드 결합체의 나노입자를 TEM으로 관찰한 사진이고, 도 2B는 siRNA와 펩타이드 결합체의 나노입자를 TEM으로 관찰한 사진이다.
도 3은 KRAS 분해 단백질을 코딩하는 mRNA와 펩타이드 결합체에 의해 형성된 나노입자를 세포에 처리하고, 세포내 KRAS 분해 단백질의 발현을 웨스턴 블랏으로 확인한 결과이다.
도 4는 Firefly luciferase를 코딩하는 mRNA와 펩타이드 결합체에 의해 형성된 나노입자를 마우스에 주사한 후, 생체 내 Firefly luciferase의 발현을 IVIS로 확인한 결과이다.
발명의 상세한 설명 및 바람직한 구현예
다른 식으로 정의되지 않는 한, 본 명세서에서 사용된 모든 기술적 및 과학적 용어들은 본 발명이 속하는 기술분야에서 숙련된 전문가에 의해서 통상적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다. 일반적으로, 본 명세서에서 사용된 명명법 및 이하에 기술하는 실험 방법은 본 기술분야에서 잘 알려져 있고 통상적으로 사용되는 것이다.
본 발명에서는 세포 내로 기능성 올리고뉴클레오티드를 안전하고, 효율적으로 전달할 수 있는 펩타이드 결합체로 구성된 나노입자를 제조하였다. 먼저, 타겟 세포 표면 인식을 위한 서열과 세포투과 기능성, 엔도좀에서의 탈출 촉진, 올리고뉴클레오티드와 결합할 수 있는 서열로 구성된 펩타이드와 올리고뉴클레오티드를 보호할 수 있는 지질을 이용하여, 펩타이드 기반 결합체를 제조하고, 상기 펩타이드 기반 결합체에 올리고뉴클레오티드를 결합시킨 나노입자를 제조하였다. 상기 펩타이드 기반 결합체로 구성된 나노입자를 이용하는 경우, 세포 내로 올리고뉴클레오티드가 효과적으로 전달되며, 탑재된 올리고뉴클레오티드에 의해 암을 유발하는 단백질의 발현이 감소되고, 암을 발생시킨 동물 모델에서 항암 효과를 나타내는 것을 확인하였다.
따라서, 본 발명은 일 관점에서, 하기 구조식 1을 기본단위로 하는 펩타이드 기반 결합체에 관한 것이다:
[구조식 1]
A-B-D-E
여기서, A는 RNA 결합 펩타이드,
B는 탄소수가 12~20개인 지방산; 양이온성 지질; 양친매성 폴리펩타이드; 또는 양친매성 고분자,
D는 세포 투과 기능을 가진 펩타이드,
E는 타겟 세포 표면을 인식하는 펩타이드인 것을 특징으로 한다.
본 발명에 있어서, 상기 A는 RNA가 결합하는 펩타이드 서열을 포함하는 것을 특징으로 할 수 있다. 상기 A는 서열번호 1 내지 서열번호 15 중 어느 하나의 아미노산 서열로 표시되는 펩타이드인 것을 특징으로 할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
서열번호 1: LKKLLKLLKKLLKLAG
서열번호 2: IKKLIKIIKKLIKLAG
서열번호 3: LRRLLRLLRRLLRLAG
서열번호 4: LKKLLKLLOrnKLLDprLAG
서열번호 5: LRRLLRLLOrnRLLDprLAG
서열번호 6: LRKIIRLIOrnKLLDprLAG
서열번호 7: LKKLLKLLOrnKLLKLAG
서열번호 8: WKKLLKLLKKLLKLAG
서열번호 9: WRRLLRLLRRLLRLAG
서열번호 10: WRKLLRLLKKLLKLAG
서열번호 11: LKKLLDbuLLKKLLKWAG
서열번호 12: LRRLLDbuLLRRLLRWAG
서열번호 13: LKRLIDbuIIKKLIKWAG
서열번호 14: LKKLLKWLOrnKLLDprLAG
서열번호 15: LRRLLRWLOrnRLLDbuLAG
Orn = Ornithine, Dbu = 2,4-diaminobutyric acid, Dpr = 2,3-diaminopropionic acid.
본 발명에 있어서, 상기 A는 RNA가 결합할 수 있는 펩타이드라면 제한 없이 이용할 수 있으며, 예를 들어, US 2020/0207834 A1 등에 개시된 핵산 결합 펩타이드를 이용할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 B는 탄소수가 12~20개인 지방산, 양이온성 지질, 양친매성 폴리펩타이드 또는 양친매성 고분자인 것을 특징으로 할 수 있다.
상기 지방산은 탄소수가 12에서 20개인 포화지방산 또는 불포화지방산일 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 양이온성 지질은 3β-[N-(N′,N′-디메틸아미노에탄 카바모일 콜레스테롤(DC-Chol); 1,2-디올레오일-3-트리메틸암모늄-프로판(DOTAP); 1,2-디올레오일-3-디메틸암모늄-프로판(DODAP); 디메틸디옥타데실암모늄 브로마이드 염(DDAB); 1,2-디라우로일-sn-글리세로-3-에틸포스포콜린 클로라이드(DL-EPC); N-[1-(2,3-디올레일옥시)프로필]-N-N-N-트리메틸암모늄 클로라이드(DOTMA); N-[1-(2,3-디올레일옥시)프로필]-N-N-N-디메틸암모늄 클로라이드(DODMA); 1,2-디라우로일-sn-글리세로-3-에틸포스포콜린 클로라이드(DOTMA); N,N-디옥타데실-N,N-디메틸암모늄 클로라이드(DODAC); N-(1-(2,3-디올레일옥시)프로필)-N-2-(스페르민카르복스아미도)에틸)-N,N-디메틸암모늄 트리플루오르아세테이트(DOSPA); 1,2-디미리스틸 옥시프로필-3-디메틸히드록시에틸암모늄 브로마이드(DMRIE); 디옥타데실아미도글리실스페르민(DOGS); 양이온성 개질기에 접합된 중성 지질; 및 이들의 조합을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 추가로, 예컨대 리포펙틴(LIPOFECTIN, GIBCO), 리포펙타민(LIPOFECTAMINE, GIBCO), 트랜스펙탐(TRANSFECTAM, Promega)과 같이, 상업적으로 이용가능한 제제에서 다수의 양이온성 지질을 사용할 수 있다.
본 발명에 있어서, 용어 “양친매성(amphipathic)”이란 친수성 및 소수성 도메인을 포함하는 것을 의미한다.
상기 양친매성 폴리펩타이드는 극성 아미노산과 비극성 아미노산을 포함하고, 상기 극성 아미노산과 비극성 아미노산이 부분적으로 서로 밀집되어 극성 부분과 비극성 부분을 나타내는 폴리펩타이드를 의미한다. 상기 극성 아미노산으로는 시스테인, 글루타민, 트레오닌, 타이로신, 세린 또는 아스파라긴 등을 들 수 있고, 상기 비극성 아미노산으로는 페닐알라닌, 트립토판, 메티오닌, 프롤린, 발린, 이소류신, 류신, 글리신 또는 알라닌 등을 들 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 양친매성 폴리펩타이드는 아미노산 서열상 극성 아미노산과 비극성 아미노산이 서로 밀집된 형태일 수 있고, 아미노산 서열상 극성 아미노산과 비극성 아미노산이 서로 밀집되어 있지는 않으나, 상기 아미노산을 포함하는 펩타이드가 3차원 구조를 형성할 때, 상기 3차원 구조에 의하여 극성 아미노산과 비극성 아미노산이 서로 밀집되는 형태일 수도 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 예컨대, 양친매성 폴리펩타이드는 다수의 동일 또는 비동일 극성 아미노산과 다수의 동일 또는 비동일 비극성 아미노산이 결합된 형태일 수 있다.
본 발명의 일 실시예에서, 상기 양친매성 폴리펩타이드는 서열번호 16의 아미노산 서열로 표시되는 펩타이드를 사용할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
서열번호 16: MMIVRSQN
상기 양친매성 고분자는 소수성 고분자와 친수성 고분자가 결합된 것으로, 이 기술분야의 통상의 기술자들에게 이미 알려진 고분자이다. 상기 양친매성 고분자는 친수성-소수성의 형태로 결합되어 있는 폴록사머, 폴리(에틸렌옥사이드)(PEO)-폴리락트산(PLA) 공중합체 중 어느 하나를 포함할 수 있고, 바람직하게는 폴리(에틸렌옥사이드)(PEO)-폴리락트산(PLA) 공중합체이나, 이에 한정되는 것은 아니며, 자기회합성을 갖는 양친매성 고분자의 용도 및 목적에 맞게 선정하여 사용할 수 있다. 본 발명의 일 실시예에서, 상기 양친매성 고분자는 폴록사머인 것을 특징으로 할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 D는 세포 투과 기능을 가진 펩타이드 서열을 포함하는 것을 특징으로 할 수 있다. 상기 세포 투과 기능을 가진 펩타이드는 세포 내재화(endocytosis) 기전에 의해 세포 내로 들어가는 특징을 가지고 있는 것이라면 특별히 제한되지 않으나, 바람직하게는 한국등록특허 제10-0951719호에 개시된 세포투과성 펩타이드 또는 이의 변이체로 구성된 군에서 선택하여 사용할 수 있다.
본 발명의 일 실시예에서, 상기 D는 알지닌 4~12개, 라이신 4~12개, 시스테인 2개로 구성되는 군에서 선택되는 펩타이드 또는 이들의 조합인 것을 특징으로 할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니며, 세포막을 투과할 수 있다면 전술한 펩타이드 이외의 다른 펩타이드 또는 펩타이드 유사체도 사용할 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 E는 타겟 세포 표면을 인식하는 펩타이드 서열을 포함하는 것을 특징으로 할 수 있다.
상기 타겟 세포는 상기 RNA 결합 펩타이드에 결합하여 세포 내로 전달시키고자 하는 올리고뉴클레오티드가 타겟하는 세포를 의미한다. 예를 들어, 올리고뉴클레오타이드가 mRNA인 경우, 상기 E는 면역세포 표면을 인식하는 펩타이드일 수 있고, 상기 면역세포는 B 세포 또는 T 세포일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 E는 기존의 타겟 세포 표면에 결합하는 서열이며, 파지 디스플레이 기법을 통해, 신규로 발굴하여 적용이 가능하다.
본 발명의 일 실시예에서, 상기 E는 암세포를 타겟하는 서열번호 17의 아미노산 서열로 표시되는 펩타이드를 사용할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
서열번호 17: CAIYPRH
본 발명에 있어서, 상기 B와 D 사이에 엔도좀 탈출을 촉진하는 펩타이드인 C를 추가로 포함하는 것을 특징으로 할 수 있다.
상기 C는 엔도좀 탈출을 촉진하는 펩타이드 서열을 포함하는 것을 특징으로 할 수 있으며, 상기 결합체의 엔도좀 탈출을 촉진하는 것이라면 특별히 제한되지 않으나, 바람직하게는 US 2020/0207834 A1에 개시된 엔도좀 분해 펩타이드 또는 이의 변이체로 구성된 군에서 선택하여 사용할 수 있다.
본 발명의 일 실시예에서, 상기 C는 히스티딘 4~12개로 구성된 펩타이드인 것을 특징으로 할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 구조식 1의 A-B 또는 상기 B-C는 아마이드 결합을 통해 연결되어 있는 것을 특징으로 할 수 있으며, 상기 A-B 또는 B-C의 아마이드 결합은 화학적 합성방법으로 결합되는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 C-D-E는 화학적 합성기법 또는 재조합 발현기법으로 제조하는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 일 실시예에서, 상기 A와 C-D-E는 고체상 펩타이드 합성방법에 의해 합성한 후, B를 화학적으로 아미이드 결합을 형성시킬 수 있다.
본 발명은 다른 관점에서, 상기 펩타이드 기반 결합체와 올리고뉴클레오티드가 결합된 나노입자에 관한 것이다.
본 발명에 있어서, 상기 올리고뉴클레오티드는 DNA, siRNA, miRNA 또는 mRNA일 수 있으며, 타겟 유전자의 발현을 억제시키거나 증가시키는 기능을 가지는 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 siRNA는 종양유발 단백질, 질병을 유발하는 단백질을 코딩하는 염기서열에 대한 상보적인 염기서열을 가질 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 일 실시예에서, 돌연변이 KRAS에 대한 mRNA를 사용하여, 돌연변이 KRAS의 발현을 억제하였다. KRAS를 분해하는 단백질을 코딩하는 mRNA 서열은 서열번호 18 및 서열번호 19의 염기서열을 가지는 mRNA를 사용할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
Figure PCTKR2023020217-appb-img-000001
Figure PCTKR2023020217-appb-img-000002
Figure PCTKR2023020217-appb-img-000003
본 발명의 일 실시예에서, siRNA를 사용하여 KRAS의 발현을 억제하였으며, 상기 siRNA는 서열번호 20 및 서열번호 21의 염기서열을 갖는 것을 특징으로 할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
서열번호 20 및 서열번호 21: KRAS의 발현을 저해하는 siRNA 서열
서열번호 20(Sense): CAGCUAAUUCAGAAUCAUU
서열번호 21(AntiSense): AAUGAUUCUGAAUUAGCUG
본 발명에 있어서, 상기 siRNA는 천연 형태 또는 화학적으로 변형된 형태의 siRNA이거나, 5' 말단에 sulfhydryl group 또는 amine group으로 치환된 siRNA를 사용하여 세포투과 및 타겟 인식 펩타이드에 있는 시스테인의 sulfhydryl group과 화학적 가교제를 사용하여 결합할 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 mRNA는 발현을 증가시키려는 타겟 단백질, 재조합 단백질, 바이러스 항원을 코딩하는 것을 특징으로 할 수 있다. 3' cap과 5' poly A tail을 가진 천연 구조의 mRNA이거나, 5' 말단에 sulfhydryl group 또는 amine group을 결합시킨 후에 세포투과 및 타겟 인식 펩타이드에 있는 시스테인의 sulfhydryl group과 화학적 가교제를 사용하여 결합시킬 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 구조식 1을 제조한 이후, 올리고뉴클레오티드를 구조식 1, 구체적으로는 구조식 1의 A에 결합시키고, 일정 시간 방치하면 자기조립(self-assembly)에 의해 나노입자를 형성하는 것을 특징으로 할 수 있다.
상기 나노입자는 10~200nm의 크기인 것을 특징으로 할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 siRNA 또는 mRNA와 결합체의 분자량 비율은 1:1~1:100인 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 siRNA, mRNA는 항암제로 사용하는 것을 특징으로 할 수 있으나, 이에 한정되지는 않는다.
본 발명은 또 다른 관점에서, 상기 펩타이드 기반 결합체와 올리고뉴클레오티드가 결합된 나노입자를 포함하는 올리고뉴클레오티드의 세포 내 전달용 조성물에 관한 것이다.
본 발명은 또 다른 관점에서, 상기 펩타이드 기반 결합체와 올리고뉴클레오티드가 결합된 나노입자를 포함하는 질병 예방 또는 치료용 약학적 조성물에 관한 것이다.
본 발명에 있어서, 상기 질병은 암, 염증성 질환 또는 바이러스 감염증인 것을 특징으로 할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 암은 편평상피암, 기저세포암, 선암, 간세포암, 신세포암, 방광암, 장암, 유방암, 자궁경부암, 자궁암, 결장암, 식도암, 두부암, 신장암, 간암, 폐암, 난소암, 췌장암, 전립선암, 위암, 백혈병, 양성 및 악성 림프종, 특히 부키트 림프종 및 비-호지킨 림프종, 양성 및 악성 흑색종, 골수증식성 질환, 에윙육종, 혈관육종, 카포시 육종, 지방육종, 근육종, 신경상피육종, 활막육종, 신경육종, 성상세포종, 희소돌기아교세포종, 뇌질피복세포증, 교아세포종, 신경아세포종, 신경절세포종, 신경절교세포종, 수아종, 송과세포종, 수막종, 뇌막육종, 신경섬유종 및 신경초종을 포함하는 육종, 고환암, 갑상선암, 암육종, 호긴스병, 윌름 종양 또는 테라토칼시노마스일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 염증성 질환은 아토피, 건선, 관절염, 피부염, 알레르기, 골관절염, 비염, 중이염, 인후염, 편도염, 치주염, 치은염, 염증성 안질환, 방광염, 신장염, 류마티스 관절염, 척추염, 염증성 장질환, 간염, 패혈증, 알콜성 간질환, 비-알콜성 지방간, 간질 또는 추간판 퇴행일 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 바이러스 감염증은 감기, 독감(인플루엔자), 감염성 단핵구증, 거대세포바이러스감염, 홍역, 소아마비(폴리오), 황열, 뎅기열, B형 간염, C형 간염, 에이즈 또는 코비드-19일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 약학적 조성물은 상기 암, 염증성 질환 또는 바이러스 감염증 외에도 천식, 자가면역 질환, 다발성 경화증, 섬모질환, 구개열, 당뇨병, 심장 질환, 고혈압, 정신 지체, 기분 장애, 비만, 굴절 이상, 불임, 앵겔만 증후군, 카나반병, 만성 소화 장애증, 샤르코마리투드병, 낭포성 섬유증, 듀켄시근이영양증, 혈색소증, 혈우병, 클리네펠터 증후군, 신경섬유종증, 페닐케톤뇨증, 상염색체 우성 다낭성 신종(PKD1 또는 PKD2), 프라더-윌리 증후군, 겸상적혈구빈혈증, 테이삭스병, 터너증후군 등의 예방 또는 치료용일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명에서, 용어 “예방”은, 상기 조성물의 투여로 질병을 억제 또는 지연시키는 모든 행위를 의미하며, 용어 “치료”는, 상기 조성물의 투여로 질병의 증세가 호전되거나 완치되는 모든 행위를 의미한다.
본 발명에 있어서, 상기 약학적 조성물은 주사제, 경구투여용 제제, 패치제, 액제, 캡술, 과립, 정제, 산제, 분무제, 연고제, 겔제, 점막투여제제 및 좌제로 구성된 군에서 선택되는 어느 하나의 제형으로 제제화되는 것을 특징으로 할 수 있으나, 이에 한정되지는 않는다. 이들 제제는 당분야에서 제제화에 사용되는 통상의 방법 또는 Remington's Pharmaceutical Science(최신판), Mack Publishing Company, Easton PA에 개시되어 있는 방법으로 제조될 수 있으며 각 질환에 따라 또는 성분에 따라 다양한 제제로 제제화될 수 있다. 그러나, 상기 기재는 예시적인 것으로, 본 발명이 적용 가능한 제제는 상기 기재에 한정되지는 않는다.
본 발명에 있어서, 상기 약학적 조성물은 허용가능한 보조제를 추가로 포함하는 것을 특징으로 할 수 있으며, 상기 보조제는 예컨대 담체일 수 있다. 약제학적으로 허용 가능한 담체는 식염수, 멸균수, 링거액, 완충 식염수, 덱스트로즈 용액, 말토 덱스트린 용액, 글리세롤, 에탄올 및 이들 성분 중 1 성분 이상을 혼합하여 사용할 수 있으며, 필요에 따라 항산화제, 완충액, 정균제 등 다른 통상의 첨가제를 첨가할 수 있다. 또한 희석제, 분산제, 계면활성제, 결합제 및 윤활제를 부가적으로 첨가하여 수용액, 현탁액, 유탁액 등과 같은 주사용 제형, 환약, 캡슐, 과립 또는 정제로 제제화할 수 있다. 그러나, 상기 기재는 예시적인 것으로, 본 발명에서 사용 가능한 보조제나 담체는 상기 기재에 한정되지는 않는다.
본 발명은 또 다른 관점에서, 상기 나노입자를 투여하는 단계를 포함하는 질병의 예방 또는 치료방법에 관한 것이다.
본 발명은 또 다른 관점에서, 질병의 예방 또는 치료를 위한 상기 나노입자의 용도에 관한 것이다.
본 발명은 또 다른 관점에서, 질병의 예방 또는 치료용 약제 제조를 위한 상기 나노입자의 사용에 관한 것이다.
본 발명에 있어서, 상기 방법, 용도 및 사용은 본 발명에 따른 나노입자를 포함하며, 상기 나노입자를 포함하는 약학적 조성물에 관한 것으로, 상술한 나노입자 및 약학적 조성물과 중복된 내용은 그 기재를 생략한다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지는 않는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
실시예 1: 펩타이드 및 펩타이드-지질-펩타이드 결합체의 합성
아미노산 및 합성에 필요한 시약은 GL biochem과 Sigma-Aldirich에서 구입하였다. 펩타이드 합성장치를 이용하여 C 말단으로부터 F-moc 고체상 화학합성방법으로 펩타이드를 합성하였다. 즉, 블로킹 그룹(Blocking group)으로 2-chlorotrityl chloride가 결합된 링크 레진(Rink resin)에 필요한 아미노산이 붙어 있는 것을 사용하여 합성하였으며, 합성기에 50mg의 링크 레진을 넣은 뒤 DMF로 레진을 스웰링(swelling) 시킨 후 Fmoc-group의 제거를 위해 20% piperidine/DMF 용액을 사용하였다. C 말단부터 서열대로 0.5M 아미노산 용액(용매: 디메틸포름아마이드, DMF), 1.0M DIPEA(용매: 디메틸포름아마이드&엔메틸피롤리돈, DMF&NMP), 0.5M HBTU(용매: 디메틸포름아마이드, DMF)를 각각 5, 10, 5 당량씩 넣어 질소 기류하에서 1~2시간 동안 반응시켰다. 상기 디프로텍션(deprotection)과 커플링(coupling) 단계가 끝날 때마다 DMF와 이소프로판올(Isopropanol)로 두 번씩 세척하는 과정을 거쳤다. 마지막 아미노산을 커플링(coupling) 시킨 후에도 디프로텍션(deprotection)을 해주어 Fmoc-group을 제거하였다. 반응 시간은 Kaiser test solution을 사용하여 음성의 결과가 나올 때까지 반응을 진행하였으며, 반응 종결 후 DMF 및 MeOH로 resin을 세척하고 진공오븐에 건조하였다. 아세트산(AcOH) 절단 칵테일(cleavage cocktail)을 레진 1g 당 15ml의 비율로 넣어 1시간 혼합(shaking) 시킨 후 필터링을 통해 레진과 펩타이드가 녹아 있는 칵테일을 분리하였다. 필터로 걸러진 용액을 진공증발농축기(rotary evaporator)를 이용하여 일부 제거한 후 콜드 에테르(cold ether)를 넣어주거나 펩타이드가 녹아있는 AcOH 칵테일 용액에 직접 콜드 에테르를 과량 넣어주어 펩타이드를 고체상으로 결정화시키고 이를 원심분리하여 분리해 내었다. 이때 에테르로 여러 번 세척과 원심분리 과정을 거쳐 AcOH 칵테일을 완전히 제거하였다. 이렇게 해서 얻어진 펩타이드를 실온에서 진공오븐으로 건조하였다. 건조 완료 후 DCM 존재하에 DIPEA(5 당량), EDC(5 당량), DMAP(1 당량) 그리고 pentadecanedioic acid(5 당량)를 첨가하여 합성을 진행하였다. 이때 지질인 pentadecanedioic acid 대신, hexadecanedioic acid, heptadecanedioic acid, octadecanedioic acid, nonadecanedioic acid 등 카복실기(-COOH)가 각각 양쪽에 존재하는 지질을 사용할 수 있다.
합성 완료 후 분별 깔때기를 사용하여 물과 DCM으로 용액을 여러 번 세척해주고 유기층을 얻었다. 이렇게 해서 얻어진 펩타이드-지질-펩타이드를 진공증발농축기(rotary evaporator)를 이용하여 건조하고, 트리플루오로아세트산(TFA) 절단 칵테일(cleavage cocktail)을 레진 1g 당 20ml의 비율로 넣어 3시간 혼합(shaking) 시켜 펩타이드 각 아미노산의 남아있는 보호기를 제거하였다. 용액을 진공증발농축기(rotary evaporator)를 이용하여 제거한 후 콜드 에테르(cold ether)를 넣어주거나 펩타이드-지질의 결합체가 녹아있는 TFA 칵테일 용액에 직접 콜드 에테르를 과량 넣어주어 펩타이드-지질의 결합체를 고체상으로 결정화시키고 이를 원심분리하여 분리해 내었다. 이때 에테르로 여러 번 세척과 원심분리 과정을 거쳐 TFA 칵테일을 완전히 제거하였다. 이렇게 해서 얻어진 펩타이드-지질-펩타이드의 결합체는 증류수에 녹여 동결건조 후, 고성능 액체크로마토그래피(Shimadzu, Japan)에 의해 분리, 정제하였다. 직경 4.6mm의 C18 컬럼을 이용하여 유속 1ml/min으로 0.1% TFA/H2O와 0.092% TFA/아세토나이트릴(acetonitrile)을 0~60%의 변화를 주면서 30분간 흘려주는 방법으로 분석하였으며, 이때 자외선 검출기의 파장은 220nm로 하였다. 정제는 직경 2.2cm의 컬럼을 이용하여 유속 20ml/min으로 용매와 검출파장을 같은 조건으로 실시하였다. 정제된 펩타이드의 분자량을 질량분석법(Mass spectrometry)을 통해 확인하였다.
실시예 2: 펩타이드-지질-펩타이드 결합체와 mRNA의 결합을 통한 나노입자 제조
실시예 1에서 제조된 펩타이드-지질-펩타이드 결합체에 돌연변이 KRAS를 분해하는 단백질을 코딩하는 유전자의 mRNA(서열번호 18 또는 서열번호 19)와 KRAS 발현을 저해하는 siRNA(서열번호 20 및 서열번호 21)를 각각 결합시켜 나노입자를 제조하였다. 펩타이드-지질-펩타이드 결합체 5mg을 nuclease-free water(Invitrogen, AM9938) 1ml에 혼합하여 용해하였다. mRNA 또는 siRNA는 펩타이드-지질-펩타이드 결합체와 중량비 1:10으로 혼합하고 실온에서 30분 동안 반응시켰다. 형성된 나노입자를 투과전자현미경(transmission, electron microscope, TEM, JEM-1230, JEOL)으로 관찰하였다(도 2). mRNA 또는 siRNA 모두 100~120nm의 직경을 가지는 입자를 형성하였다.
실시예 3: 세포 내로 전달된 mRNA에 의한 KRAS의 감소 확인
실시예 2에서 제조된, KRAS 분해 단백질을 코딩하는 mRNA와 펩타이드-지질-펩타이드 결합체의 결합을 통해 형성된 나노입자를 세포에 처리하여 KRAS 분해 단백질의 세포내 발현을 확인하고자 하였다.
6-well plate에 70%의 밀도로 H358 cells(ATCC, CRL-5807)을 분주한 후, 16시간 뒤에 serum free DMEM 배지로 overnight 동안 cell starvation 하였다. mRNA와 펩타이드-지질-펩타이드 결합체에 의해 형성된 나노입자를 배지에 처리하고 시간마다 세포를 harvest하였다. Active KRAS는 Active Ras Detection Kit(CST, #8821)를 사용하여 면역침전법으로 침전시켰다. Protease inhibitor와 phosphatase inhibitor를 포함한 Lysis/binding/wash buffer를 사용하여 단백질을 융해(lysis)하였다. BCA protein assay(23227, Thermo scientific)를 통해 단백질을 정량하고, western blot으로 His tag과 GAPDH, 면역침전으로 분리된 GST와 Active KRAS 단백질의 발현량을 확인하였다. Western blot의 경우, 12% SDS PAGE gel에 size marker와 함께 샘플을 동량 로딩하여 약 2시간 전기영동한 후, nitrocellulose membrane에 transfer하였다. Transfer한 membrane은 5% skim milk로 30분 블로킹하고, 1st antibody(GST, abcam, ab19256; KRAS, abcam, ab275876; GAPDH, Santa Cruz, sc-32233; His tag, abcam, ab18184)를 1:1000 비율로 하룻밤 동안 반응시켰다. 이 후 membrane을 0.1% tween-20을 포함한 TBST로 세척하고, HRP가 부착된 2nd antibody(anti-Rabbit, A90-116P, BETHYL Lab.; anti-Mouse, A120-101P, BETHYL Lab.)로 1시간 반응시킨 후, ECL substrate로 화학발광을 확인하였다.
그 결과, 도 3에 나타난 바와 같이, 나노입자 처리 후 4시간부터 세포내에 전달된 mRNA에 의해 KRAS 분해 단백질이 발현되는 것이 확인되었으며, KRAS 분해 단백질이 발현됨으로써 active KRAS의 발현이 억제되는 것이 확인되었다.
실시예 4: 생체 내 발현 확인
mRNA와 펩타이드-지질-펩타이드 결합체에 의해 형성된 나노입자를 생체 내 처리하여, mRNA의 생체 내 전달 및 발현을 확인하고자 하였다.
Firefly luciferase mRNA(FLuc mRNA, Messenger Bio, FLUC500P)를 이용하여 실시예 2와 같이 제작한 나노입자를 C57BL/6 마우스의 대퇴부 근육주사 하였다. 5시간, 24시간, 48시간, 72시간에 IVIS 기기(퍼킨엘머, IVIS SPECTRUM)를 이용하여 발현하는 firefly luciferase를 확인하였다. Substrate solution(VivoGlo™ Luciferin, In Vivo Grade, Promega, P1041)을 1.5mg/kg로 마우스에 intravenous injection하고, 5분 후에 IVIS로 측정하였다.
그 결과, 도 4에 나타난 바와 같이, 5시간부터 72시간까지 생체 내에서 firefly luciferase가 발현되는 것을 확인할 수 있었다.
본 발명에 따른 올리고뉴클레오티드가 결합된 펩타이드 기반 결합체로 구성된 나노입자는 치료용 올리고뉴클레오티드를 세포 내로 효과적으로 전달하며, 올리고뉴클레오티드에 의해 타겟 단백질의 발현이 감소하거나, 발현을 증가시켜 치료제로 사용할 수 있다.
이상으로 본 발명 내용의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적 기술은 단지 바람직한 실시 양태일 뿐이며, 이에 의해 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백할 것이다. 따라서, 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항들과 그것들의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
전자파일 첨부하였음.

Claims (21)

  1. 하기 구조식 1을 기본단위로 하는 펩타이드 기반 결합체:
    [구조식 1]
    A-B-D-E
    여기서, A는 RNA 결합 펩타이드,
    B는 탄소수가 12~20개인 지방산; 양이온성 지질; 양친매성 폴리펩타이드; 또는 양친매성 고분자,
    D는 세포 투과 기능을 가진 펩타이드,
    E는 타겟 세포 표면을 인식하는 펩타이드인 것을 특징으로 함.
  2. 제1항에 있어서, 상기 A는 서열번호 1 내지 서열번호 15 중 어느 하나의 아미노산 서열로 표시되는 펩타이드인 것을 특징으로 하는 결합체.
  3. 제1항에 있어서, 상기 D는 4~12개 알지닌, 4~12개 라이신 및 2개의 시스테인으로 구성되는 군에서 선택되는 펩타이드 또는 이들의 조합인 것을 특징으로 하는 결합체.
  4. 제1항에 있어서, 상기 E는 서열번호 17의 아미노산 서열로 표시되는 펩타이드인 것을 특징으로 하는 결합체.
  5. 제1항에 있어서, 상기 B와 D 사이에 엔도좀 탈출을 촉진하는 펩타이드인 C를 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 결합체.
  6. 제5항에 있어서, 상기 C는 4~12개의 히스티딘으로 구성된 펩타이드인 것을 특징으로 하는 결합체.
  7. 제5항에 있어서, 상기 A-B 또는 B-C는 아마이드 결합을 통해 연결되어 있는 것을 특징으로 하는 결합체.
  8. 제7항에 있어서, 상기 A-B 또는 B-C의 아마이드 결합은 화학적 합성방법으로 결합되는 것을 특징으로 하는 결합체.
  9. 제5항에 있어서, 상기 C-D-E는 화학적 합성기법 또는 재조합 발현기법으로 제조하는 것을 특징으로 하는 결합체.
  10. 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항의 펩타이드 기반 결합체와 올리고뉴클레오티드가 결합된 나노입자.
  11. 제10항에 있어서, 상기 올리고뉴클레오티드는 DNA, siRNA, miRNA 및 mRNA로 구성되는 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 나노입자.
  12. 제10항에 있어서, 상기 올리고뉴클레오티드는 타겟 유전자의 발현을 억제시키거나 증가시키는 것을 특징으로 하는 나노입자.
  13. 제11항에 있어서, 상기 siRNA는 종양유발 단백질, 질병을 유발하는 단백질을 코딩하는 염기서열에 대한 상보적인 염기서열을 가지는 siRNA인 것을 특징으로 하는 나노입자.
  14. 제13항에 있어서, 상기 siRNA는 천연 형태 또는 화학적으로 변형된 형태의 siRNA이거나, 5' 말단에 sulfhydryl group 또는 amine group으로 치환된 siRNA를 사용하여 세포투과 및 타겟 인식 펩타이드에 있는 시스테인의 sulfhydryl group과 화학적 가교제를 사용하여 결합한 것을 특징으로 하는 나노입자.
  15. 제11항에 있어서, 상기 mRNA는 발현을 증가시키려는 타겟 단백질, 재조합 단백질 또는 바이러스 항원을 코딩하는 것을 특징으로 하는 나노입자.
  16. 제10항에 있어서, 상기 올리고뉴클레오티드가 구조식 1의 A에 결합한 후, 펩타이드 기반 결합체의 자기조립을 통해 형성되는 것을 특징으로 하는 나노입자.
  17. 제16항에 있어서, 10~200nm의 크기를 가지는 것을 특징으로 하는 나노입자.
  18. 제11항에 있어서, 상기 올리고뉴클레오티드가 siRNA 또는 mRNA이고, 상기 siRNA 또는 mRNA와 결합체의 분자량 비가 1:1~1:100인 것을 특징으로 하는 나노입자.
  19. 제10항의 나노입자를 포함하는 올리고뉴클레오티드의 세포 내 전달용 조성물.
  20. 제10항의 나노입자를 포함하는 질병 예방 또는 치료용 약학적 조성물.
  21. 제20항에 있어서, 상기 질병은 암, 염증성 질환 또는 바이러스 감염증인 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
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