WO2021070934A1 - がんの検査方法 - Google Patents
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- G01N2400/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates
- G01N2400/02—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates involving antibodies to sugar part of glycoproteins
Definitions
- the present invention relates to a cancer test method and a test kit for that purpose.
- BC2LCN is a glycoprotein, a type of lectin, and has previously reported affinity for glycoprotein sugar chains H-type1 (Fuc ⁇ 1-2Gal ⁇ 1-3GlcNAc) and H-type3 (Fuc ⁇ 1-2Gal ⁇ 1-3GalNAc). It has been clarified that it can be used as a probe for detecting an undifferentiated marker of human ES cells and iPS cells expressing podocalyxin having a property and having an H-type3 sugar chain (Patent Document 1). Further, according to a previous report, it has been clarified that BC2LCN strongly binds to cancer tissues and can be used as a cancer marker detection probe (Patent Document 2).
- Patent Document 2 a sandwich assay of BC2LCN and an antibody that binds to keratan sulfate has confirmed the presence of a protein recognized by BC2LCN and keratan sulfate in the blood components of some cancer patients.
- Serpin A3 is also called ⁇ 1-antichymotrypsin and is known to be associated with diseases such as some tumors. Serpin A3 has been developed as a blood test marker (Non-Patent Document 1).
- Gal3BP also called LGAL3SBP or MAC-2-BP
- LGAL3SBP MAC-2-BP
- the present invention relates to a cancer test method and a test kit for that purpose.
- a method of analyzing a blood sample obtained from a subject Blood samples by sandwich assay or immunochromatography assay performed with a first molecule selected from the group consisting of antibodies that bind BC2LCN, Serpin A3, and antibodies that bind Gal3BP, and a second molecule that is BC2LCN.
- a method comprising analyzing the blood components contained therein.
- a kit for sandwich assays or immunochromatography assays that can be used to measure the amount of glycoprotein in a blood sample of interest.
- (11) Labeled selected from the group consisting of a second molecule that is immobilized BC2LCN, labeled BC2LCN, an antibody that binds to labeled Serpin A3, and an antibody that binds to labeled Gal3BP.
- the kit according to (12) above, wherein the cancer is a cancer selected from the group consisting of pancreatic cancer and colon cancer.
- the kit according to (13) above, wherein the cancer is stage 1 or 2 pancreatic cancer.
- a method for predicting whether or not a subject has cancer which comprises carrying out the method according to any one of (1) to (7) above.
- (1A) A method for analyzing a biological sample obtained from a subject. It is carried out using a first molecule selected from the group consisting of a molecule that binds to a BC2LCN-binding sugar chain, a molecule that binds to SerpinA3, and a molecule that binds to Gal3BP, and a second molecule that is BC2LCN.
- a method comprising analyzing components contained in a biological sample by an assay.
- (2A) The method according to (1A) above, wherein the first molecule is an antibody that binds to Serpin A3.
- (3A) The method according to (1A) above, wherein the first molecule is an antibody that binds to Gal3BP.
- (4A) The method according to (1A) above, wherein the first molecule is BC2LCN.
- (5A) The method according to any one of (1A) to (4A) above, wherein the subject has or has the possibility of cancer.
- (6A) The method according to (5A) above, wherein the subject has or has the possibility of pancreatic cancer.
- (7A) The method of (6A) above, wherein the subject has or is likely to have stage 1 or 2 pancreatic cancer.
- (8A) A first molecule selected from the group consisting of a molecule that binds to BC2LCN, SerpinA3, and a molecule that binds to Gal3BP, and a second molecule that is a molecule that binds to a BC2LCN-binding sugar chain.
- kits for sandwich assay a kit for immunochromatography assay, a kit for lectin electrophoresis, and mass, which can measure the amount of glycoprotein in a biological sample of interest using a first molecule and a second molecule.
- Kits for analysis kits for lectin affinity chromatography or kits for ⁇ TAS.
- 10A The kit according to (8A) above, wherein the first molecule is an antibody that binds to Gal3BP, and the protein portion of the glycoprotein is Gal3BP.
- (11A) Labeled selected from the group consisting of a second molecule that is immobilized BC2LCN and a labeled BC2LCN, an antibody that binds to labeled Serpin A3, and an antibody that binds to labeled Gal3BP.
- the kit according to (8A) above which comprises a first molecule.
- (12A) The kit according to any one of (8A) to (11A) above, which is used for detecting cancer.
- (13A) The kit according to (12A) above, wherein the cancer is pancreatic cancer.
- (14A) The kit according to (13A) above, wherein the cancer is stage 1 or 2 pancreatic cancer.
- FIG. 1 shows the results of a sandwich assay in which the concentrations of blood factors that can be simultaneously recognized by two molecules of BC2LCN were measured in blood samples of patients with various cancers and healthy subjects.
- FIG. 2 shows the results of precipitating blood components that bind to BC2LCN using BC2LCN from a blood sample, and then performing gel electrophoresis and Western blotting using BC2LCN (left) and silver staining (right). ..
- FIG. 3 shows the results of Western blotting of blood components that bind to BC2LCN from a blood sample using BC2LCN, which were then subjected to gel electrophoresis and then antibody against Seprin A3 (left) and antibody against Gal3BP (right), respectively. Shown.
- FIG. 1 shows the results of a sandwich assay in which the concentrations of blood factors that can be simultaneously recognized by two molecules of BC2LCN were measured in blood samples of patients with various cancers and healthy subjects.
- FIG. 2 shows the results of precipitating blood components that bind to BC
- FIG. 4 shows the results of a sandwich assay using an antibody that binds BC2LCN and SerpinA3 in blood samples of patients with various cancers and healthy subjects.
- FIG. 5 shows the results of a sandwich assay using an antibody that binds to BC2LCN and Gal3BP in blood samples of patients with various cancers and healthy subjects.
- FIG. 6 shows the concentration of blood factors that can be simultaneously recognized by two molecules of BC2LCN, the concentration of BC2LCN-binding SerpinA3, the concentration of BC2LCN-binding Gal3BP, and two types of blood samples of pancreatic cancer patients and healthy subjects. The results of the concentration of Serpin A3 measured using different anti-Serpin A3 antibodies are shown.
- FIG. 7 shows the concentration of blood factors that can be simultaneously recognized by two molecules of BC2LCN, the concentration of BC2LCN-binding SerpinA3, the concentration of BC2LCN-binding Gal3BP, and two types of blood samples of pancreatic cancer patients and healthy subjects.
- FIG. 5 is an ROC curve showing the relationship between sensitivity and specificity in an evaluation system for detecting pancreatic cancer using the concentration of Serpin A3 measured using different anti-Serpin A3 antibodies as an index.
- FIG. 8A shows the results of measuring the concentrations of blood factors that can be simultaneously recognized by two molecules of BC2LCN in a blood sample of a pancreatic cancer patient for each stage in the UICC TMN classification.
- FIG. 8B shows the results of measuring the concentration of BC2LCN-binding Serpin A3 in a blood sample of a pancreatic cancer patient for each stage in the UICC TMN classification.
- FIG. 8C shows the results of measuring the concentration of BC2LCN-binding Gal3BP in a blood sample of a pancreatic cancer patient for each stage in the UICC TMN classification.
- FIG. 8D shows the results of measuring the concentration of Serpin A3 in a blood sample of a pancreatic cancer patient measured using two different anti-Serpin A3 antibodies for each stage in the UICC TMN classification.
- FIG. 9 shows histological staining of normal and pancreatic tissue sections containing pancreatic cancer with rBC2LCN (sometimes referred to simply as “rBC2” in the figure), and immunohistochemistry against Serpin A3 and Gal3BP. The results of academic staining are shown.
- FIG. 10 shows a sandwich assay using two molecules of BC2LCN, a sandwich assay using BC2LCN and an anti-Serpin A3 antibody, a sandwich assay using BC2LCN and an anti-Gal3BP antibody, an ELISA using an anti-Serpin A3 antibody, and an anti-Gal3BP antibody.
- FIG. 10 shows a sandwich assay using two molecules of BC2LCN, a sandwich assay using BC2LCN and an anti-Serpin A3 antibody, a sandwich assay using BC2LCN and an anti-Gal3BP antibody, an ELISA using an anti-Serpin A3 antibody, and an anti-Gal3BP antibody.
- FIG. 10 shows a sandwich as
- FIG. 11 shows a sandwich assay using two molecules of BC2LCN, a sandwich assay using BC2LCN and an anti-Serpin A3 antibody, a sandwich assay using BC2LCN and an anti-Gal3BP antibody, an ELISA using an anti-Serpin A3 antibody, and an anti-Gal3BP antibody.
- the ROC curve for detecting pancreatic cancer patients in healthy subjects and patients with chronic pancreatitis in the ELISA system is shown. The analysis was performed using blood samples.
- FIG. 12 shows a sandwich assay using two molecules of BC2LCN, a sandwich assay using BC2LCN and an anti-Serpin A3 antibody, a sandwich assay using BC2LCN and an anti-Gal3BP antibody, an ELISA using an anti-Serpin A3 antibody, and an anti-Gal3BP antibody.
- the ROC curve for detecting a stage I pancreatic cancer patient in a healthy subject in the ELISA system is shown. The analysis was performed using blood samples.
- FIG. 13 shows a sandwich assay using two molecules of BC2LCN, a sandwich assay using BC2LCN and an anti-Serpin A3 antibody, a sandwich assay using BC2LCN and an anti-Gal3BP antibody, an ELISA using an anti-Serpin A3 antibody, and an anti-Gal3BP antibody.
- the ROC curve for detecting stage II pancreatic cancer patients in a healthy subject in the ELISA system is shown. The analysis was performed using blood samples.
- FIG. 14 shows stage III pancreatic cancer in a healthy subject in a sandwich assay with two molecules of BC2LCN, a sandwich assay with BC2LCN and an anti-Serpin A3 antibody, and a sandwich assay with BC2LCN and an anti-Gal3BP antibody.
- FIG. 15 shows stage IV pancreatic cancer in a healthy subject in a sandwich assay with two molecules of BC2LCN, a sandwich assay with BC2LCN and an anti-Serpin A3 antibody, and a sandwich assay with BC2LCN and an anti-Gal3BP antibody.
- the ROC curve for detecting a patient is shown. The analysis was performed using blood samples.
- FIG. 16 shows blood samples of patients before, 30 days after, and 3 months (3 m) after surgery to remove pancreatic cancer, analyzed by sandwich assay using BC2LCN and anti-Serpin A3 antibody. The result is shown.
- FIG. 16 shows blood samples of patients before, 30 days after, and 3 months (3 m) after surgery to remove pancreatic cancer, analyzed by sandwich assay using BC2LCN and anti-Serpin A3 antibody. The result is shown.
- FIG. 17 shows blood samples of patients before, 30 days after, and 3 months (3 m) after surgery to remove pancreatic cancer, analyzed by a sandwich assay using BC2LCN and anti-Gal3BP antibody. The result is shown.
- FIG. 18 shows the results of analysis of blood samples of patients before, 30 days after the surgery (30 POD), and 3 months after the surgery (3 m) by ELISAA using CA19-9. Shown.
- FIG. 19 shows a patient (patient A) before, 1 day after the surgery (1 POD), 7 days after the surgery (7 POD), and 30 days after the surgery (30 POD), and after recurrence. The results of analysis of blood samples in a sandwich assay using BC2LCN and anti-Serpin A3 antibody are shown.
- the term "subject” means mammals, especially mammals including humans.
- a “subject” can be a healthy person, a patient with cancer, or a patient with the potential to have cancer.
- tumor means a cell population that exhibits self-sustaining growth. Independent proliferation means the property of cells that escape the normal control of cell proliferation in the body and continue to proliferate autonomously. Tumors are roughly classified into benign tumors and malignant tumors (cancers). Benign tumors are tumors that grow autonomously but do not metastasize, infiltrate, or cause cachexia. In addition to autonomous growth, malignant tumors cause one or more of infiltration, metastasis, and cachexia into normal tissue.
- biological sample means a sample obtained from a subject (eg, tissue, cells, extracellular fluid, and body fluid).
- Body fluids include blood, urine, ascites, pleural effusion, and secretions (eg, endocrine and exocrine fluids, such as digestive juices such as pancreatic juice).
- a "blood sample” is blood obtained from a subject (eg, peripheral blood) or a sample derived from blood (eg, serum and plasma).
- the "blood component” is a component contained in blood, particularly a liquid component contained in blood. In the present specification, when the biological sample is a blood sample, the component is a blood component, as will be described later.
- antibody means immunoglobulin.
- An antibody is a biomolecule that has the property of binding to an antigen.
- Antibodies can have specificity for the antigen.
- the antibody may be a monoclonal antibody or a polyclonal antibody.
- Antibodies can include bispecific antibodies.
- the antibody can be a full-length antibody and a fragment thereof that has binding to the antigen.
- BC2LCN is the N-terminal domain of BC2LC, which is a lectin derived from Burkholderia cenocepacia (Sulak, O., et al., Structure, 18 (1): 59-72, 2010). .. According to previous reports, BC2LCN has been shown to have an affinity for glycoprotein sugar chains H-type1 (Fuc ⁇ 1-2Gal ⁇ 1-3GlcNAc) and H-type3 (Fuc ⁇ 1-2Gal ⁇ 1-3GalNAc), and It has been clarified that BC2LCN can be used as an undifferentiated marker of human ES cells and iPS cells expressing podocalyxin having an H-type3 sugar chain (WO2014 / 1236146).
- BC2LCN is specifically expressed in cancer tissues and can be used to detect cancer (WO2017 / 061449).
- a sandwich assay of BC2LCN and an antibody that binds to keratan sulfate confirms the presence of a protein recognized by BC2LCN and keratan sulfate in the blood components of some cancer patients.
- BC2LCN produced using a host other than cenocepacia may be referred to as recombinant BC2LCN or rBC2LCN.
- BC2LCN-binding sugar chain or protein a sugar chain or protein to which BC2LCN binds
- BC2LCN-binding proteins are modified with BC2LCN-binding sugar chains.
- the BC2LCN-binding sugar chain can be an H-type1 sugar chain and / or an H-type3 sugar chain.
- BC2LCN includes, for example, lectins registered as YP_002232818 at the National Center for Biotechnology Information (NCBI).
- NCBI National Center for Biotechnology Information
- BC2LCN it can be used as long as it has a binding ability to a sugar chain, but as BC2LCN, one having a modified (for example, improved) binding ability to a sugar chain as disclosed in JP2020-146027 can also be used.
- BC2LCN a protein having an amino acid sequence of 90% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more or 100% identical to the amino acid sequence of the lectin registered as YP_002232818 (BC2LCN). Can be mentioned. BC2LCN binds to at least one selected from the group consisting of H-type3 sugar chains and H-type1 sugar chains.
- Serpin A3 is a serine protease inhibitor (serpin) also known as ⁇ 1 antichymotrypsin (AACT).
- serpin serine protease inhibitor
- AACT ⁇ 1 antichymotrypsin
- the Serpin A3 protein can be produced by cleaving a signal peptide consisting of the 1st to 23rd amino acid sequences from a 423 amino acid long precursor (eg, NCBI reference number: NP_001076.2).
- Gal3BP is a galectin-3-binding protein.
- Gal3BP can be a protein obtained by translating from mRNA having a base sequence registered as National Center for Biotechnology Information (NCBI) reference number NM_0055677.4.
- NCBI National Center for Biotechnology Information
- the Gal3BP protein is cleaved, for example, from a 585 amino acid long precursor (eg, having an amino acid sequence registered as NCBI reference number: NP_005558.1) with a signal peptide consisting of the 1st to 18th amino acid sequences. Can occur.
- Gal3BP has a molecular weight of 90 kDa in serum and is found in high concentrations in the serum of patients with breast cancer, lung cancer, rectal colon cancer, ovarian cancer, and endometrial cancer (Koths, K. etal., J. Biol. Chem. 268: 14245-14249, 1993).
- the "sandwich assay” is an assay used to detect a target component contained in a sample. Sandwich assays can be performed by one of ordinary skill in the art.
- the target component is typically contacted with a capture molecule A that binds to the target component immobilized on a support (eg, substrate and beads) to capture the target component on the support and then.
- the capture molecule B that binds to the labeled target component is brought into contact with the target component, and the target component captured on the support is detected using the label as an index. It is an assay.
- any support used in ordinary immunological measurement methods can be used, and for example, polystyrene, polyacrylic acid, etc.
- Organic substances such as acid copolymers; inorganic substances such as glass, silicon oxide, silica, porous glass, suri glass, alumina, silica gel, metal oxides; magnetic substances such as iron, cobalt, nickel, magnetite, chromate, etc.; and these.
- Examples thereof include those prepared using the above magnetic alloy as a material. Immobilization can be done on a solid phase (eg, any surface such as beads, magnetic beads, membranes, plates, etc.). As the magnetic beads, various commercially available ones can be used. As the magnetic beads, for example, the beads disclosed in WO2012 / 173002A may be used. In a sandwich assay, the captive molecule A to be immobilized and the captive molecule B labeled are usually required to bind to the target component at the same time without competing with each other for binding to the target component.
- the capture molecule A can be the first molecule described below and the capture molecule B can be the second molecule.
- the capture molecule A can be the second molecule described below, and the capture molecule B can be the first molecule.
- the sandwich assay can also be performed with a microfluidic chip (micro-total analysis systems; ⁇ TAS).
- the microfluidic chip comprises a flow path, the flow path having a sample inlet, for example, at the sample inlet, the capture molecule X to which a polycation or polyanion (eg, DNA) is bound and the sample are brought into contact with each other for capture.
- a polycation or polyanion eg, DNA
- a complex of the molecule X and the target component is formed, an electric field is applied to move the complex, and when the labeled capture molecule Y existing in the middle of the flow path and the complex come into contact with each other, the target component and the target component X
- a complex of trapping molecules Y is formed, and the electric field allows the complex to travel through the flow path and reach the detection section on the flow path, where it can be detected by a label bound to the trapping molecule Y.
- the detection can be carried out optically, for example, by a laser or the like.
- the capture molecule X can be the first molecule described below and the capture molecule Y can be the second molecule.
- the capture molecule X can be the second molecule described below, and the capture molecule Y can be the first molecule.
- the presence of multiple biomarkers can also be detected in parallel using ⁇ TAS.
- the supplementary molecule N and the supplementary molecule M are immobilized on separate beads A and B, respectively, and when the target molecule is present, the target molecule, the supplementary molecule N and the beads A, and the supplementary molecule M and the beads are present.
- a complex is formed by irradiating a bead A containing a photosensitizer containing a photosensitizer that forms a complex with B and releases single-term oxygen by excitation to form a complex (beads A and B are in close proximity to each other).
- an assay eg, AlphaLISA
- an assay that detects the presence of a target molecule by detecting the light from the bead B so that the monomorphic oxygen reaches the bead B only (when it is), thereby causing the bead B to chemiluminescent.
- the present invention may provide an AlphaLISA assay kit comprising beads on which BC2LCN is immobilized and beads on which an antibody that binds Serpin A3 or Gal3BP is immobilized.
- FRET fluorescence resonance energy transfer
- BRET bioluminescence resonance energy transfer
- Etc. can also be used to detect the presence of the target molecule.
- beads or supports for immobilization are not required.
- the present invention may provide kits for such assays.
- the "immunochromatometric assay” is an assay used to detect a target component contained in a sample, and is usually contained in a capture molecule C labeled with a label such as gold colloid and a liquid sample.
- the target component is contacted to form a complex of the label-capturing molecule C and the target component, and then the complex is transferred onto the chromatomembrane and brought into contact with the supplementary molecule D immobilized on the test line.
- An assay in which a complex of a label capture molecule C and a target component is captured on a test line and the label on the test line is detected as an index.
- the labeled capture molecule C and the capture molecule D immobilized on the test line do not usually compete with each other for binding to the target component and must bind to the target component at the same time.
- a control line is provided in addition to the test line, and the control line contains a molecule that binds to the capture molecule C (an antibody or the like, and if the capture molecule C is an IgG antibody, it can be an anti-IgG antibody). It is possible to capture the label-capturing component C that has been immobilized and has not bound to the target component.
- a sample pad containing the sample containing the sample, a conjugate pad in which the labeled capture molecule C is present, a membrane which is a moving layer to which the complex of the target component and the capture molecule C in the sample moves, and a membrane in the sample.
- a strip containing an absorption pad that absorbs water is provided in this order, and on the membrane there is a test line on which the capture molecule D is immobilized and a control line in which the antibody against the capture molecule C is immobilized. ..
- the labeled capture molecule C and the target component form a complex, and the complex is captured by the capture molecule D immobilized on the test line and also captured by the control line. .. If the sample does not contain the component of interest, the sample moves towards the absorption pad and the labeled capture molecule C does not form a complex, is not captured on the test line, but is captured only on the control line. It will be. As a result, if the control line develops color and the test line develops color, it indicates that the sample contains the target component, and if the control line develops color and the test line does not develop color, the sample contains the target component. Is shown not to be included.
- the capture molecule C can be the first molecule described below and the capture molecule D can be the second molecule.
- the capture molecule C can be the second molecule described below, and the capture molecule D can be the first molecule.
- lectin electrophoresis is electrophoresis using a gel containing a lectin, which means that molecules that interact with lectins during electrophoresis have a slower migration rate than molecules that do not interact with each other. This is a method for separating lectin-binding molecules.
- the lectin is either free in the gel or immobilized on the gel. Since lectins hardly move by electrophoresis, the migration rate of glycoproteins can be reduced by simply mixing with the gel material to prepare a gel. Alternatively, the lectin is non-covalently or covalently linked to the gel.
- the biological sample can be separated by lectin electrophoresis using BC2LCN as the lectin.
- Molecules with BC2LCN-binding sugar chains repeatedly interact with lectins immobilized on the gel during electrophoresis, which delays electrophoresis.
- BC2LCN non-bonding molecules do not interact with lectins immobilized on the gel and migrate quickly.
- Lectin electrophoresis can be appropriately carried out by those skilled in the art.
- lectin affinity chromatography is chromatography utilizing the fact that lectins have a property of specifically binding to a sugar chain.
- affinity chromatography for example, affinity chromatography is performed on a sample using a column containing an insoluble support on which a lectin is immobilized. If a component in the sample has an affinity for lectins, the component will be separated from the other components.
- BC2LCN can be used as the lectin.
- a blood component capable of simultaneously binding two BC2LCNs was found in a sandwich assay using immobilized BC2LCN and labeled BC2LCN. It has been found that it is present and that the serum content of the blood component in patients with cancer tends to be higher than in healthy individuals.
- BC2LCN-binding SerpinA3 was present as a blood component in a sandwich assay using BC2LCN and an antibody that binds to SerpinA3, and We have found that the serum levels of BC2LCN-binding Serpin A3 in patients with cancer tend to be higher than in healthy individuals.
- BC2LCN-binding Gal3BP was present as a blood component in a sandwich assay using BC2LCN and an antibody that binds to Gal3BP.
- serum levels of BC2LCN-binding Gal3BP in patients with cancer tend to be higher than in healthy individuals.
- a method of analyzing a biological sample obtained from a subject One or more components (sometimes referred to as "target components") selected from the group consisting of Serpin A3 (eg, BC2LCN-binding Serpin A3) and Gal3BP (eg, BC2LCN-binding Gal3BP) in a biological sample obtained from a subject. ), Including The method is provided.
- the method of the present invention may include preparing a biological sample.
- the method of the present invention may further include measuring the amount of the above components.
- one or more components selected from the group consisting of Serpin A3 (for example, BC2LCN-binding Serpin A3) and Gal3BP (for example, BC2LCN-binding Gal3BP) are detected using a molecule that binds to the component. can do.
- the one or more components can be separated from the other components before the one or more components can be detected.
- SerpinA3 can be detected using a molecule that binds to SerpinA3. Two different molecules that can simultaneously bind to Serpin A3 can also be used. Using two different molecules that can bind to SerpinA3 at the same time, SerpinA3 can be detected by immunochromatography and sandwich assays.
- Serpin A3 can also be detected by mass spectrometry. In either case, a calibration curve can be obtained using the standard substance of Serpin A3. Further, the measured value for SerpinA3 can be applied to the obtained verification line to quantify SerpinA3. Further, BC2LCN-binding SerpinA3 can be detected by using a molecule that binds to a BC2LCN-binding sugar chain and a molecule that binds to SerpinA3. The molecule that binds to the BC2LCN-binding sugar chain may include separating the BC2LCN-binding molecule from the others by using the molecule that binds to the BC2LCN-binding sugar chain, or the BC2LCN-binding molecule.
- the molecule bound to the sugar chain may include separating the BC2LCN-binding molecule from the others by using lectin affinity chromatography or lectin electrophoresis. It may also include separating Serpin A3 from other components. Either of the separation of Serpin A3 and the separation of the BC2LCN-binding component may be carried out first.
- Gal3BP can be detected using a molecule that binds to Gal3BP. Two different molecules that can simultaneously bind to Gal3BP can also be used. Using two different molecules that can simultaneously bind to Gal3BP, Gal3BP can be detected by immunochromatography and sandwich assays. Gal3BP can also be detected by mass spectrometry.
- a calibration curve can be obtained using the standard substance of Gal3BP.
- Gal3BP can be quantified by applying the measured value for Gal3BP to the obtained verification line.
- BC2LCN-binding Gal3BP can be detected by using a molecule that binds to a BC2LCN-binding sugar chain and a molecule that binds to Gal3BP.
- the molecule that binds to the BC2LCN-binding sugar chain may include separating the BC2LCN-binding molecule from the others by using the molecule that binds to the BC2LCN-binding sugar chain, or the BC2LCN-binding molecule.
- the molecule bound to the sugar chain may include separating the BC2LCN-binding molecule from the others by using lectin electrophoresis. It may also include separating Gal3BP from other components. Either Gal3BP separation or BC2LCN-binding component separation may be performed first.
- a method of analyzing a biological sample obtained from a subject It is carried out using a first molecule selected from the group consisting of a molecule that binds to a BC2LCN-binding sugar chain, a molecule that binds to SerpinA3, and a molecule that binds to Gal3BP, and a second molecule that is BC2LCN.
- the assay provides a method comprising analyzing a component (sometimes referred to as a "target component") contained in a biological sample.
- the biological sample is a biological sample obtained from the above-mentioned subject.
- the subject can be a subject who has or may have cancer.
- the cancer can be, for example, pancreatic cancer.
- Pancreatic cancer can be, for example, stage pancreatic cancer selected from the group consisting of stages I, II, III, and IV, eg, stage I pancreatic cancer, eg, stage II pancreatic cancer. possible.
- Biological samples include, for example, tissues, cells, and body fluids. Body fluids include blood (eg, plasma and serum), sweat, saliva, urine, ascites, pleural effusion, and secretions (eg, endocrine and exocrine fluids, eg, digestive juices such as pancreatic fluid).
- Tissues and cells can be, for example, cancer or suspected cancer, respectively. Each tissue and cell contains, for example, cancer or a suspected cancer.
- Examples of the molecule that binds to the BC2LCN-binding sugar chain include an antibody that binds to the BC2LCN-binding sugar chain or an antigen-binding fragment thereof. Molecules that bind to BC2LCN-binding sugar chains also include aptamers that bind to BC2LCN-binding sugar chains (eg, nucleic acid aptamers selected from the group consisting of DNA and RNA). Further, examples of the molecule that binds to the BC2LCN-binding sugar chain include a medium molecule such as a cyclic peptide. Molecules that bind to these BC2LCN-binding sugar chains can be obtained by methods well known to those skilled in the art.
- an antibody that binds to a BC2LCN-binding sugar chain can be obtained from a non-human mammal immunized with the BC2LCN-binding sugar chain.
- Aptamers that bind to BC2LCN-binding sugar chains can be obtained from the nucleic acid pool by utilizing the affinity for BC2LCN-binding sugar chains.
- the cyclic peptide that binds to the BC2LCN-binding sugar chain can be obtained from the cyclic peptide pool by utilizing the affinity for the BC2LCN-binding sugar chain.
- the molecule that binds to the BC2LCN-binding sugar chain can be, for example, BC2LCN.
- Examples of the molecule that binds to SerpinA3 include an antibody that binds to SerpinA3 or an antigen-binding fragment thereof. Molecules that bind to SerpinA3 also include aptamers that bind to SerpinA3 (eg, nucleic acid aptamers selected from the group consisting of DNA and RNA). Further, examples of the molecule that binds to Serpin A3 include a medium molecule such as a cyclic peptide. Molecules that bind to Serpin A3 can be obtained by methods well known to those skilled in the art. For example, an antibody that binds to Serpin A3 can be obtained from a non-human mammal immunized with Serpin A3.
- Aptamers that bind to Serpin A3 can be obtained from the nucleic acid pool by utilizing their affinity for Serpin A3.
- the cyclic peptide that binds to Serpin A3 can be obtained from the cyclic peptide pool by utilizing its affinity for Serpin A3.
- Serpin A3 may form a complex with other components in a biological sample. In the present invention, such a complex may be detected.
- PSA is another component that forms a complex with Serpin A3. Therefore, SerpinA3 can also be detected using a molecule that binds to PSA and a molecule that binds to SerpinA3.
- labeled recombinant PSA can be used to detect SerpinA3 by taking advantage of the binding property of SerpinA3 to PSA.
- Examples of the molecule that binds to Gal3BP include an antibody that binds to Gal3BP or an antigen-binding fragment thereof. Molecules that bind to Gal3BP also include aptamers that bind to Gal3BP (eg, nucleic acid aptamers selected from the group consisting of DNA and RNA). Further, examples of the molecule that binds to Gal3BP include a medium molecule such as a cyclic peptide. Molecules that bind to these Gal3BPs can be obtained by methods well known to those skilled in the art. For example, an antibody that binds to Gal3BP can be obtained from a non-human mammal immunized with Gal3BP.
- Aptamers that bind to Gal3BP can be obtained from the nucleic acid pool using their affinity for Gal3BP.
- the cyclic peptide that binds to Gal3BP can be obtained from the cyclic peptide pool by utilizing the affinity for Gal3BP.
- Gal3BP may form a complex with other components in a biological sample. In the present invention, such a complex may be detected.
- other components that form a complex with Gal3BP include galectin (particularly galectin-3). Therefore, Gal3BP can also be detected using a molecule that binds to galectin (particularly galectin 3) and a molecule that binds to Gal3BP.
- labeled recombinant galectin (particularly galectin 3) can be used to detect Gal3BP by taking advantage of the binding property of Gal3BP to galectin (particularly galectin 3).
- a biological sample for example, a blood sample obtained from a subject.
- the component eg, blood component
- a component (sometimes referred to as a target component (eg, a target blood component)) selected from the group consisting of a component, Serpin A3 (eg, BC2LCN-binding Serpin A3), and Gal3BP (eg, BC2LCN-binding Gal3BP).
- Serpin A3 eg, BC2LCN-binding Serpin A3
- Gal3BP eg, BC2LCN-binding Gal3BP
- the subject when one, two or all of the above components are detected, it indicates that the subject may be cancer.
- the concentration of one of the above components when the concentration of one of the above components is larger than the cutoff value, it indicates that the subject may be cancer.
- the subject can be a human, for example, a healthy person, a patient with cancer, and a patient who has the possibility of having cancer.
- the cancers are pancreatic cancer, colon cancer, rectal adenocarcinoma, bladder cancer, breast cancer, non-small cell lung cancer, gastric cancer, cervical cancer, uterine body cancer, hepatocellular carcinoma, It can be one or more cancers selected from the group consisting of thyroid cancer, prostate cancer, melanoma, esophageal cancer, ovarian cancer, bile duct cancer, non-hodgkin lymphoma, and chronic myeloid leukemia.
- the cancer can be pancreatic cancer.
- the pancreatic cancer can be a stage pancreatic cancer selected from the group consisting of stages I and II.
- the pancreatic cancer can be stage I.
- the pancreatic cancer can be stage II.
- the target component or target blood component is a component capable of simultaneously binding two BC2LCNs.
- the target component or target blood component is BC2LCN-binding Serpin A3.
- the target component or target blood component is BC2LCN-binding Gal3BP.
- the cancer can be as described above, such as pancreatic cancer, colon cancer, rectal adenocarcinoma, bladder cancer, breast cancer, uterine body cancer, hepatocellular carcinoma, thyroid cancer.
- the cancer can be pancreatic cancer.
- the pancreatic cancer can be a stage pancreatic cancer selected from the group consisting of stages I and II. In some embodiments, the pancreatic cancer can be stage I. In some embodiments, the pancreatic cancer can be stage II.
- the cutoff value is, for example, 0, the 1st quartile, the mean, the 3rd quartile, or the maximum, or the concentration of the target component (eg, the target blood component) of the healthy subject group. It can be a value between any two of these (eg, the third quartile or the maximum value or a value in between). In some embodiments, the cutoff value is, for example, 0, the first quartile, average, third quartile, or maximum of the target component (eg, target blood component) concentration of the cancer patient group. Or it can be a value between any two of these.
- the cutoff value is a cutoff value at the point closest to the points of sensitivity 1 and specificity 1 on the ROC curve, a value greater than the cutoff value, or a value less than the cutoff value. Can be. In some embodiments, the cutoff value can also be a cutoff value at the point where the Youden Index is maximal, a value greater than the cutoff value, or a value smaller than the cutoff value.
- the cutoff value can be determined by the balance between sensitivity and false positive rate.
- the cutoff value can be set low if you want to detect as many cancer patients as possible even if there are many false positives (if you want to increase the sensitivity), and you want to reduce the false positives (instead, even if the sensitivity decreases). If it is good), it can be set high, and a person skilled in the art can set it appropriately according to the purpose of the inspection.
- the concentration of the target component (for example, the target blood component) in the biological sample (for example, blood sample) obtained from the subject is larger than the cutoff value
- the subject is cancerous. You can get information that you may have. Therefore, in the analysis method of the present invention, when the concentration of the target component (for example, the target blood component) in the biological sample (for example, blood sample) obtained from the target is larger than the cutoff value, the target is. May include providing information indicating that the patient may have cancer.
- the subject when the concentration of the target component (for example, the target blood component) in the biological sample (for example, blood sample) obtained from the subject is larger than the cutoff value, the subject is pancreatic cancer. You can get information that you may have pancreatic cancer. Therefore, in the analysis method of the present invention, when the concentration of the target component (for example, the target blood component) in the biological sample (for example, blood sample) obtained from the subject is larger than the cutoff value, the subject is pancreatic. It may include providing information indicating that you may have cancer.
- a target component for example, a target blood component
- a biological sample for example, a blood sample
- a biological sample for example, a blood sample
- the concentration of the target component (for example, the target blood component) in the biological sample (for example, blood sample) obtained from the target is larger than the cutoff value
- the target is early. It may include providing information indicating that you may have cancer.
- Early cancer can be early pancreatic cancer.
- the stage classification of pancreatic cancer can be determined by a doctor based on the UICC TNM classification (UICC: TNM Classification of Malignant Tumors, 8th Edn. Willey-Blackwell; 2017.94-95).
- Stage I includes stages 1A and 1B
- stage II includes stages 2A and 2B.
- Stages III and IV are synonymous with stages 3 and 4, respectively.
- Information can be provided by sending or outputting information.
- the output of information can be on a display or printed matter.
- the analytical method of the present invention may further include determining that the subject has the potential to have cancer.
- cancer therapies include one or more selected from the group consisting of radiation therapy, chemotherapy, and surgical therapies.
- Cancer therapy can be standard therapy.
- Radiation therapy may include irradiating the cancer with radiation.
- Chemotherapy may include administering an anticancer drug to a subject.
- Surgical treatment may include removing the cancer.
- Chemotherapy for cancer includes, for example, forfilinox therapy, gemcitabine / nabpaclitaxel therapy (GnP therapy), gemcitabine / S1 therapy (GS therapy), liposomal irinotecan / 5FU / LV therapy. (Nal-IRI / FL therapy), gemcitabine therapy, S1 therapy and the like, and the subject can be treated by any one or more of these therapies.
- the anticancer agent is selected from the group consisting of, for example, platinum preparations such as oxaliplatin, irinotecan, liposome-type irinotecan, levofolinate, gemcitabine, nab-paclitaxel, 5-fluorouracil (5-FU), and S-1.
- platinum preparations such as oxaliplatin, irinotecan, liposome-type irinotecan, levofolinate, gemcitabine, nab-paclitaxel, 5-fluorouracil (5-FU), and S-1.
- platinum preparations such as oxaliplatin, irinotecan, liposome-type irinotecan, levofolinate, gemcitabine, nab-paclitaxel, 5-fluorouracil (5-FU), and S-1.
- oxaliplatin irinotecan, liposome-type irinotecan, levofolinate, gemcitabine,
- a method of analyzing the inside of a biological sample obtained from a subject.
- a biological sample by a sandwich assay or immunochromatography assay performed using a first molecule selected from the group consisting of an antibody that binds to BC2LCN, SerpinA3, and an antibody that binds to Gal3BP, and a second molecule that is BC2LCN.
- Methods are provided that include analyzing components (eg, blood components) contained in (eg, blood samples).
- the first molecule is immobilized on a support (eg, substrate) and the second molecule can be labeled. In some embodiments, the first molecule can be labeled and the second molecule can be immobilized on the support.
- Immobilization can be performed by, for example, a direct method, a polystyrene tag method (WO2018 / 190357), a biotin-streptavidin method, a HaloTag method, a method using a chemical bond such as an amine coupling method, and a known solidification such as a V5 tag method.
- a phase conversion method can be used.
- the direct method the captive molecule to be immobilized is directly contacted with the support, thereby immobilizing on the support.
- the polystyrene tag method the polystyrene plate is immobilized on the polystyrene plate via the polystyrene tag fused to the trapping molecule.
- the capture molecule is immobilized on the support by binding the capture molecule modified with biotin to the support coated with streptavidin.
- the capture molecule is immobilized on the support coated with HaloTag via the HaloTag protein fused to the capture molecule.
- the amine coupling method a carboxyl group formed on the surface of a solid phase can be activated esterified, and a protein or the like can be immobilized by a chemical bond via an amino group.
- the capture molecule is immobilized on the support by binding the capture molecule to which the V5 tag is linked to the support coated with the anti-V5 tag antibody.
- substrates color-developing substrate, fluorescent substrate, and luminescent substrate
- enzymes used in the enzyme antibody method for example, peroxidase, glucose oxidase, and alkaline phosphatase
- Labeling can be performed by those skilled in the art using a conventional method. Labeling can be done, for example, in a covalent bond. Labeling may be performed by reacting, for example, a biotin-linked antibody with an avidin-linked label. Examples of the substrate include a fluorescent substrate.
- the peroxidase for example, horseradish peroxidase can be used.
- Horseradish peroxidase produces color, fluorescence or chemiluminescence by adding a chromogenic, fluorescent or chemiluminescent substrate. Therefore, the presence of a trapped molecule labeled with color development, fluorescence or chemiluminescence as an index can be detected.
- Coloring substrates for horseradish peroxidase include, for example, tetramethylbenzidine (TMB), o-phenylenediamine (OPD), 2,2-azinobis [3-ethylbenzo-thiazolin-6-sulfonic acid (ABTS), and Amplex ( Trademark) Red can be used to detect labeled molecules in the presence of hydrogen peroxide.
- Luminescent substrates for alkaline phosphatase include p-nitrophenyl phosphate (pNPP), 4-methylumbelliferyl phosphate (4-MUP), and AttoPhos TM, which can be used to detect trapping molecules.
- pNPP p-nitrophenyl phosphate
- 4-MUP 4-methylumbelliferyl phosphate
- AttoPhos TM which can be used to detect trapping molecules.
- Glucose oxidase oxidizes glucose to generate gluconic acid and hydrogen peroxide.
- Hydrogen peroxide can be easily detected using, for example, a colorimetric probe for detecting hydrogen peroxide (for example, peroxidase). Hydrogen peroxide can develop color, for example, in the presence of peroxidase and its chromogenic substrate.
- a dye for example, a colorant, for example, colloidal gold
- a colorant for example, colloidal gold
- the first molecule is BC2LCN.
- recombinant BC2LCN can be used as BC2LCN.
- BC2LCN may be directly immobilized or, for example, immobilized on a streptavidin (or neutralvidin) -coated support that is biotin-labeled.
- BC2LCN may be fused with the HaloTag protein and then immobilized on a support coated with the HaloTag ligand.
- BC2LCN may be fused with a polystyrene tag and then directly immobilized on a polystyrene plate.
- the target component detected by the sandwich assay and the immunochromatographic assay in which the first molecule is BC2LCN is a component that can bind to a plurality of BC2LCNs at the same time.
- an antibody against BC2LCN and a sugar chain antigen that binds to BC2LCN such as H-type1 sugar chain antigen and H-type3 sugar chain antigen can be immobilized on the control line.
- the first molecule is an antibody that binds to Serpin A3.
- Serpin A3 having a BC2LCN-binding sugar chain has been detected.
- the antibody that binds to Serpin A3 can be prepared by a conventional method using the binding property to Serpin A3 as an index.
- the antibody that binds to SerpinA3 may be further confirmed by having binding to SerpinA3 having a BC2LCN-binding sugar chain.
- Serpin A3 having a BC2LCN-binding sugar chain can be purified as a component that reacts with the immobilized BC2LCN and the antibody that binds to Serpin A3, as used in the examples.
- the antibody that binds to Serpin A3 may be selected based on whether or not it binds to the purified component.
- the first molecule is an antibody that binds to Serpin A3
- the first molecule is immobilized on a support (eg, substrate or beads) and the second molecule can be labeled; or the first.
- the molecule is labeled and the second molecule can be immobilized on the support.
- the first molecule is an antibody that binds to Gal3BP.
- Gal3BP having a BC2LCN-binding sugar chain has been detected.
- the antibody that binds to Gal3BP can be prepared by a conventional method using the binding property to Gal3BP as an index.
- the antibody that binds to Gal3BP may be further confirmed by having binding to Gal3BP having a BC2LCN-binding sugar chain.
- Gal3BP having a BC2LCN-binding sugar chain can be purified as a component that reacts with the immobilized BC2LCN and an antibody that binds to Gal3BP, as used in the examples.
- the antibody that binds to Gal3BP may be selected using whether or not it binds to the purified component as an index.
- the first molecule is an antibody that binds to Gal3BP
- the first molecule can be immobilized on a support (eg, substrate or beads) and the second molecule can be labeled; or the first.
- the molecule is labeled and the second molecule can be immobilized on the support.
- a method of predicting whether or not a subject has cancer a method of obtaining preliminary information on whether or not the subject has cancer, a method of determining whether or not the subject has cancer, and a method of determining whether or not the subject has cancer.
- a method or preliminary method for predicting whether or not cancer is present, a method for detecting cancer in a subject, a method for detecting cancer cells in a subject, a method for detecting a biomarker for cancer in a subject (biomarker).
- biomarker Is a component selected from the group consisting of a component capable of simultaneously binding two BC2LCNs, a BC2LCN-binding SerpinA3, and a BC2LCN-binding Gal3BP), or whether or not the subject has cancer.
- the method is Including analyzing the presence or concentration of a component (eg, a blood component) in a biological sample (eg, a blood sample), the component (eg, a blood component) is a component capable of simultaneously binding two BC2LCNs, BC2LCN.
- a component selected from the group consisting of binding Serpin A3 and BC2LCN binding Gal3BP; or with a first molecule selected from the group consisting of BC2LCN, an antibody that binds Serpin A3, and an antibody that binds Gal3BP.
- a method for detecting a component (for example, a blood component) in a target biological sample for example, a blood sample
- the component for example, a blood component
- a method is provided which is a component selected from the group consisting of possible components, BC2LCN-binding Serpin A3, and BC2LCN-binding Gal3BP.
- a first molecule selected from the group consisting of an antibody that binds to BC2LCN, SerpinA3, and an antibody that binds to Gal3BP and a second molecule that is BC2LCN are contacted with a biological sample (for example, a blood sample).
- This method is a sandwich assay or immunochromatography assay performed using a first molecule selected from the group consisting of an antibody that binds to BC2LCN, SerpinA3, and an antibody that binds to Gal3BP, and a second molecule that is BC2LCN.
- a first molecule selected from the group consisting of an antibody that binds to BC2LCN, an antibody that binds to Serpin A3, and an antibody that binds to Gal3BP, and a second molecule that is BC2LCN are included, and the first molecule and the first molecule.
- Kits for sandwich assays or immunochromatographic assays are provided that can measure the amount of glycoprotein in a biological sample of interest (eg, a blood sample) using two molecules.
- the first molecule is immobilized on a substrate or strip and the second molecule is labeled.
- the first molecule is labeled and the second molecule is immobilized on a substrate or strip.
- the first molecule is labeled and the second molecule is contained in or immobilized on the gel.
- the kit of the present invention may further contain a chromogenic substrate when the label is an enzyme used in an enzyme antibody method. If the biological sample is a blood sample, the component is a blood component.
- the first molecule is BC2LCN. In some aspects of the invention, the first molecule is an antibody that binds to Serpin A3. In some aspects of the invention, the first molecule is an antibody that binds to Gal3BP.
- the kit of the present invention can be used for detection of a target molecule, or for detection, determination, prediction, or diagnosis of cancer.
- a combination of a first molecule selected from the group consisting of an antibody that binds to BC2LCN, SerpinA3, and an antibody that binds to Gal3BP and a second molecule that is BC2LCN is provided.
- a component selected from the group consisting of a component capable of simultaneously binding two BC2LCNs, a BC2LCN-binding SerpinA3, and a BC2LCN-binding Gal3BP is sampled (for example, a biological sample or a biological sample (for example, a biological sample or a biological sample (for example). For example, it can be used for detection in blood samples)).
- one of the first molecule and the second molecule may be immobilized on the support and the other may be labeled for detection.
- the above combination can be used to diagnose cancer using a biological sample (eg, a blood sample).
- a kit including the above combination used for diagnosing cancer using a biological sample is provided.
- the combination may be a kit for a sandwich assay, a kit for an immunochromatography assay, a kit for lectin electrophoresis, a kit for mass spectrometry, a kit for lectin affinity chromatography or a kit for ⁇ TAS.
- Kits for lectin electrophoresis can include gels containing lectins.
- Kits for lectin affinity chromatography can include a column containing a support on which the lectin is immobilized. These kits may further include purified Serpin A3, purified BC2LCN binding Serpin A3, purified Gal3BP, purified BC2LCN binding Gal3BP, and the like as reference materials.
- the kit for ⁇ TAS may include a microfluidic chip.
- the microfluidic chip has a detection unit, and the detection unit includes one or more selected from the group consisting of SerpinA3, BC2LCN-binding SerpinA3, Gal3BP, and BC2LCN-binding Gal3BP, and a protein complex containing these.
- the molecule to be bound can be immobilized.
- a method for analyzing a biological sample obtained from a subject in the present invention is carried out using a first molecule selected from the group consisting of a molecule that binds to a BC2LCN-binding sugar chain, a molecule that binds to SerpinA3, and a molecule that binds to Gal3BP, and a second molecule that is BC2LCN.
- the signal obtained by the assay reduces cancer in the body (eg, cancer). Can be reduced by removal). Therefore, in the methods of the invention, the assay signal can indicate the amount of cancer in the body.
- the signal obtained by the assay can be increased by recurrence. Therefore, in the method of the invention, an increased signal may indicate a recurrence of the cancer.
- a method comprising separating from a biological sample obtained from a subject one or more components selected from the group consisting of two BC2LCNs capable of binding simultaneously, Serpin A3 and Gal3BP. ..
- the present invention also provides a method comprising detecting from a biological sample obtained from a subject one or more components selected from the group consisting of two BC2LCNs capable of binding simultaneously, Serpin A3 and Gal3BP.
- a method of analyzing a biological sample obtained from a subject Containing the separation of one or more components selected from the group consisting of Serpin A3 and Gal3BP, components capable of simultaneously binding to two BC2LCNs in a biological sample obtained from the subject. The method is provided.
- Separation means separating the target component from at least one or more of the other components. Separation can include enrichment, enrichment, and purification of the component of interest. Concentration means increasing the concentration. Enrichment and purification means selectively increasing the abundance ratio of the desired component to other components. Enrichment and purification may involve enrichment of the components of interest. Separation can also include binding to immobilized molecules. In this case, by binding to the immobilized molecule, it is separated from other components that do not bind. Separation may include removing non-adsorbed components in addition to adsorbing the components of interest on the immobilized surface. The non-adsorbed components can be removed by cleaning the surface.
- Removal of non-adsorbed components can also be performed by removal of the liquid phase. Removal of the non-adsorbed component may also be performed by recovering the beads if a solid phase is present on the surface of the beads.
- the invention may further comprise measuring the amount of separated components. Measurements can be performed by assays well known to those of skill in the art, which can give assay signals. The measured amount can be compared with other indicators (eg, cutoff values). The cutoff value can be as described above.
- the method of the present invention when the measured amount is larger than the other amount as an index, it can be indicated that the target from which the biological sample is derived may be cancer. Therefore, the method of the present invention is a method for detecting cancer, a method for detecting cancer cells, a method for diagnosing cancer, a non-diagnostic method for diagnosing cancer, and a method for diagnosing cancer. It can be a method of obtaining preliminary information for predicting cancer, a method of predicting cancer, or a non-diagnostic method for predicting cancer.
- the signal obtained by the assay can be reduced by reducing the cancer in the body (eg, removing the cancer). Therefore, in the methods of the invention, the assay signal can indicate the amount of cancer in the body.
- the signal obtained by the assay can be increased by recurrence. Therefore, in the method of the invention, an increased signal may indicate a recurrence of the cancer.
- the method of the present invention can be performed on two or more biological samples collected at different time points.
- the biological sample can be two or more biological samples recovered at different time points.
- the method of the invention further comprises comparing the signal obtained by the assay (corresponding to the measured amount) with the signal obtained in another sample that could be recovered at that different time point. You may. In this way, the present invention can be used to monitor a patient's cancer treatment process and / or recurrence process.
- the method of the present invention may be carried out in combination with an existing method.
- an existing method a method including measuring the amount of CA19-9 in a body fluid sample is known.
- CA19-9 is increasing in concentration in body fluid samples with cancer. Also, as the amount of cancer increases, its concentration increases, and as the amount of cancer decreases, its concentration decreases.
- the combination of CA19-9 and the method of the invention can enhance the accuracy and / or specificity of cancer detection by analysis of body fluid samples.
- CA19-9 can be an indicator of pancreatic cancer, especially pancreatic cancer such as stage III and IV. Therefore, the present invention may further include measuring the concentration of CA19-9 in a biological sample.
- One or more components selected from the group consisting of Serpin A3 and Gal3BP to be measured may be further analyzed using BC2LCN-binding sugar chain modification as an index. Whether or not one or more components selected from the group consisting of Serpin A3 and Gal3BP has a BC2LCN-binding sugar chain modification is determined by using a factor that binds to the sugar modification (sugar chain) as described above. can do. Alternatively, one or more components selected from the group consisting of Serpin A3 and Gal3BP may be detected after separation using a factor that binds to the sugar modification (sugar chain). One or more components selected from the group consisting of Serpin A3 and Gal3BP may be detected after separation using a molecule that binds to Serpin A3 and a molecule that binds to Gal3BP.
- Example 1 Detection of Glycoprotein in Serum of Cancer Patients Using rBC2LCN Glycoprotein in serum of patients with various cancers was detected by a sandwich assay using rBC2LCN.
- biotinylated rBC2LCN was diluted with PBS to 0.3 ⁇ g / mL, added to an avidin plate (blockingless type) (Sumitomo Bakelite, BS-X7603) at 50 ⁇ L / well, and incubated at room temperature for 1 hour.
- the glycoproteins detected by the sandwich assay with rBC2LCN are pancreatic cancer patients, colon cancer patients, bladder cancer patients, breast cancer patients, non-Hodgkin's lymphoma patients, uterine body cancer patients, and ovarian cancer. It was revealed that the concentration was higher than the maximum value observed in the healthy group in cancer patients and patients with chronic myelogenous leukemia.
- the detected glycoprotein must be able to bind at the same time as two molecules, the immobilized rBC2LCN and the detection rBC2LCN.
- the components that can bind simultaneously with the two molecules of rBC2LCN eg, blood components
- the components eg, blood. It became clear that it is useful for the analysis of components).
- Example 2 Identification of glycoprotein recognized by rBC2LCN
- glycoproteins in the sera of pancreatic cancer patients and healthy subjects were precipitated with rBC2LCN-binding beads, and the precipitated glycoproteins were eluted with rBC2LCN.
- the obtained eluate was electrophoresed, and glycoproteins specific to pancreatic cancer were identified by mass analysis.
- Biotinylated rBC2LCN was bound to Dynabeads M280 Streptavidin (Invitrogen). Then, the glycoprotein bound to rBC2LCN was eluted by incubating with pancreatic cancer and healthy person's serum overnight at 4 ° C., washing, adding 0.2 M fucose, and incubating at room temperature for 1 hour. The obtained eluate was electrophoresed, transferred to a PVDF membrane, and then blotted with HRP-labeled rBC2LCN. As a result, although no reactivity was observed in the rBC2LCN blot in the serum of healthy subjects, the reactivity was observed in the vicinity of 75-150 kDa in the pancreatic cancer serum.
- glycoprotein showing binding to rBC2LCN-immobilized beads was electrophoresed from pancreatic cancer and healthy person's serum, and Western blot was performed using an antibody against Serpin A3, an antibody against Gal3BP, and an HRP-labeled secondary antibody.
- SerpinA3 and Gal3BP were detected significantly more strongly in the sera of pancreatic cancer patients than in healthy subjects.
- Serpin A3 and Gal3BP were obtained as proteins adsorbed on beads by rBC2LCN, and therefore these glycoproteins were found to be reactive to rBC2LCN.
- biotinylated anti-mouse IgG manufactured by Nichirei Bioscience, product number: 424021, dilution ratio: stock solution
- biotinylated anti-goat IgG manufactured by Nichirei Bioscience, product number: 414011, respectively.
- Dilution ratio undiluted solution
- Serpin A3 and Gal3BP detected in blood are derived from the pancreatic duct of pancreatic cancer tissue.
- Example 3 Analysis of sera of cancer patients in a sandwich assay using rBC2LCN and SerpinA3 antibody or Gal3BP antibody Therefore, a sandwich assay of rBC2LCN and SerpinA3 antibody was constructed in healthy subjects and various cancers including pancreatic cancer. The patient's serum was analyzed. Biotinylated rBC2LCN was diluted with PBS to 0.3 ⁇ g / mL, added to an avidin plate (blockingless type) (Sumitomo Bakelite, BS-X7603) at 50 ⁇ L / well, and incubated at room temperature for 1 hour.
- an avidin plate blockingless type
- the glycoprotein detected by the sandwich assay of rBC2LCN and SerpinA3 antibody can hardly be detected in healthy subjects.
- colon cancer, pancreatic cancer, bladder cancer, gastric cancer, small cell lung cancer, breast cancer, non-hodgkin lymphoma, cervical cancer, rectal adenocarcinoma, stem cell cancer, thyroid cancer, prostate cancer was strongly detected in all of uterine body cancer, melanoma, esophageal cancer, ovarian cancer, bile duct cancer, and chronic myeloid leukemia (all of the cancers examined).
- rBC2LCN and Gal3BP antibody were constructed, and sera of healthy subjects and various cancer patients including pancreatic cancer were analyzed.
- Biotinylated rBC2LCN was diluted with PBS to 0.3 ⁇ g / mL, added to an avidin plate (blockingless type) (Sumitomo Bakelite, BS-X7603) at 50 ⁇ L / well, and incubated at room temperature for 1 hour.
- the glycoprotein detected by the sandwich assay of rBC2LCN and Gal3BP antibody (that is, Gal3BP having a specific sugar chain that binds to BC2LCN lectin) can hardly be detected in healthy subjects.
- colon cancer, pancreatic cancer, bladder cancer, gastric cancer, small cell lung cancer, breast cancer, non-hodgkin lymphoma, cervical cancer, rectal adenocarcinoma, stem cell cancer, thyroid cancer, prostate cancer was strongly detected in all of uterine body cancer, melanoma, esophageal cancer, ovarian cancer, bile duct cancer, and chronic myeloid leukemia (all of the cancers examined).
- FIG. 10 a comparison was made by dividing into healthy subjects, pancreatitis patients, and pancreatic cancer patients.
- the sandwich assay of rBC2LCN and rBC2LCN the sandwich assay of rBC2LCN and anti-SerpinA3 antibody
- the sandwich assay of rBC2LCN and anti-Gal3BP antibody the sandwich assay of anti-SerpinA3 antibody and anti-SerpinA3 antibody
- stronger signals were detected in patients and patients with pancreatitis. This suggests that these assays can distinguish pancreatic cancer patients from healthy individuals and pancreatitis patients.
- a sandwich assay with rBC2LCN and rBC2LCN using serum specimens from other healthy individuals and serum specimens from pancreatic cancer patients, a sandwich assay with rBC2LCN and rBC2LCN, a sandwich assay with rBC2LCN and anti-Serpin A3 antibody, rBC2LCN and anti-virus, as described above.
- a sandwich assay with Gal3BP antibody and a sandwich assay with anti-Serum A3 antibody (R & D Systems, Cat #: AF1295) and anti-Serum A3 antibody were performed.
- the ROC curved point at the shortest distance from the specificity 1) was 0.01, the specificity at that time was 0.900, and the sensitivity was 0.575. Further, as shown in the lower right panel of FIG. 7, in the sandwich assay (SerpinA3-SerpinA3) using the anti-Serpin A3 antibody and the anti-Serpin A3 antibody, the area under the ROC curve (AUC) was 0.718, and the cut in the ROC curve was obtained.
- Off sensitivity 1, determined from the ROC curved point at the shortest distance from specificity 1) was 1.056, the specificity at that time was 0.8, and the sensitivity was 0.65. ..
- the sandwich assay with rBC2LCN and anti-SerpinA3 antibody has the best accuracy, and the sandwich assay with rBC2LCN and anti-Gal3BP antibody (rBC2-Gal3BP) shows the best specificity. It became clear. In addition, it was revealed that the sandwich assay using rBC2LCN and rBC2LCN (rBC2-rBC2) and the sandwich assay using anti-SerpinA3 antibody and anti-SerpinA3 antibody (SerpinA3-SerpinA3) also show accuracy having a certain degree of usefulness.
- Example 5 Analysis of Serum of Patients with Pancreatic Cancer by Stage
- serum samples of patients with various pancreatic cancers from stage 1A to stage 4 were evaluated by a sandwich assay.
- the stage of cancer was determined by the doctor based on the UICC TNM classification (UICC: TNM Classification of Malignant Tumors, 8th Edn. Wiley-Blackwell; 2017.94-95).
- Serum of cancer patients as described in Examples 1 and 3 sandwich assay with rBC2LCN and rBC2LCN, sandwich assay with rBC2LCN and anti-SerpinA3 antibody, sandwich assay with rBC2LCN and anti-Gal3BP antibody, and anti-SerpinA3 antibody and anti-SerpinA3 antibody.
- sandwich assay according to. The results were as shown in FIGS. 8A-8D.
- the sandwich assay with rBC2LCN and rBC2LCN, the sandwich assay with rBC2LCN and anti-Serpin A3 antibody, and the sandwich assay with rBC2LCN and anti-Gal3BP antibody had high measurements at all stages 1 through 4. Samples showing strength were found.
- the sandwich assay with anti-Serpin A3 and anti-Serpin A3 antibodies showed high measurement intensities in all samples, similar to that shown in FIG.
- stage I pancreatic cancer patients were successfully detected in any of the sandwich assays.
- Pancreatic cancer was removed from patients with pancreatic cancer.
- the results of the sandwich assay of rBC2LCN and anti-Serpin A3 antibody are shown in FIG. 16, the results of the sandwich assay of rBC2LCN and anti-Gal3BP antibody are shown in FIG. 17, and the results of the CA19-9 assay are shown in FIG.
- 30 POD means 30 days after surgery and 3 m means 3 months after surgery.
- the signal for each sandwich assay was reduced by cancer resection. Therefore, in these assays, it can be seen that the outcome of cancer removal affects the content of components in the blood.
- the assay was a sandwich assay using BC2LCN and anti-Serpin A3 antibody.
- the results were as shown in FIG. As shown in FIG. 19, in patient A, the assay signal decreased over time after surgery. However, analysis of the blood of patient A who had relapsed showed a marked increase in signal. This suggests that the assay system of the present invention can be used to detect recurrence.
- pancreatic cancer such as stages 1 and 2 can be obtained by appropriately setting the cutoff value. It can detect a wide range of cancers from stage 4 pancreatic cancer.
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Abstract
本発明は、対象ががんであるか否かを予測するために、当該対象から得られた生体サンプル(例えば、血液サンプル)中の特定成分を検出する方法に関する。本発明によれば、生体サンプル中のSerpin3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分を分離することを含む方法が提供される。本発明によればまた、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子、SerpinA3に結合する分子、およびGal3BPに結合する分子からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する第2の分子とを用いて実施されるアッセイによって、対象から得られた生体生体サンプル(例えば、血液サンプル)中に含まれる糖タンパク質を検出することを含む、方法が提供される。
Description
本発明は、がんの検査方法およびそのための検査キットに関する。
BC2LCNは、糖結合タンパク質、すなわちレクチンの一種であり、以前の報告によれば、糖タンパク質糖鎖であるH-type1(Fucα1-2Galβ1-3GlcNAc)およびH-type3(Fucα1-2Galβ1-3GalNAc)に親和性を有し、H-type3糖鎖を有するポドカリキシンを発現するヒトES細胞やiPS細胞の未分化マーカー検出用プローブとして用いることができることが明らかにされている(特許文献1)。また、以前の報告によれば、BC2LCNは、がんの組織に強く結合し、がんマーカー検出プローブとして用いることができることが明らかにされている(特許文献2)。特許文献2によれば、BC2LCNとケラタン硫酸に結合する抗体とのサンドイッチアッセイによって、一部のがん患者の血液成分において、BC2LCNとケラタン硫酸により認識されるタンパク質の存在が確認されている。
SerpinA3は、α1-アンチキモトリプシンともよばれ、いくつかの腫瘍などの疾患に関連していることが知られる。SerpinA3は、血液検査マーカーとして開発されている(非特許文献1)。
Gal3BPは、LGAL3SBPもしくはMAC-2-BPともよばれ、乳がん、肺がん、直腸結腸がん、卵巣がん、および子宮内膜がんの患者の血清において高濃度で見出される(非特許文献2)。
Nie, S. et al., J. Proteome Res. 13:1873-1884, 2014
Koths, K. et al., J. Biol. Chem. 268:14245-14249, 1993
本発明は、がんの検査方法およびそのための検査キットに関する。
本発明によれば以下の発明が提供される。
(1)対象から得られた血液サンプル中を分析する方法であって、
BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるサンドイッチアッセイまたはイムノクロマトアッセイによって、血液サンプル中に含まれる血液成分を分析することを含む、方法。
(2)第1の分子がSerpinA3に結合する抗体である、上記(1)に記載の方法。
(3)第1の分子がGal3BPに結合する抗体である、上記(1)に記載の方法。
(4)第1の分子がBC2LCNである、上記(1)に記載の方法。
(5)対象が、がんを有する、またはその可能性を有する、上記(1)~(4)のいずれかに記載の方法。
(6)対象が、膵がんを有する、またはその可能性を有する、上記(5)に記載の方法。
(7)対象が、ステージ1または2の膵がんを有する、またはその可能性を有する、上記(6)に記載の方法。
(8)BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを含み、第1の分子と第2の分子とを用いて対象の血液サンプル中の糖タンパク質の量を測定することができる、サンドイッチアッセイ用またはイムノクロマトアッセイ用のキット。
(9)第1の分子がSerpinA3に結合する抗体であり、糖タンパク質におけるタンパク質部分がSerpinA3である、上記(8)に記載のキット。
(10)第1の分子がGal3BPに結合する抗体であり、糖タンパク質におけるタンパク質部分がGal3BPである、上記(8)に記載のキット。
(11)固相化されたBC2LCNである第2の分子と、標識されたBC2LCN、標識されたSerpinA3に結合する抗体、および標識されたGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される標識された第1の分子とを含む、上記(8)に記載のキット。
(12)がんを検出することに用いられる、上記(8)~(11)のいずれかに記載のキット。
(13)がんが、膵がんおよび大腸がんからなる群から選択されるがんである、上記(12)に記載のキット。
(14)がんが、ステージ1または2の膵がんである、上記(13)に記載のキット。
(15)対象ががんであるか否かを予測する方法であって、上記(1)~(7)のいずれかに記載の方法を実施することを含む、方法。
(16)対象から得られた血液サンプル中を分析する方法であって、
血液サンプル中の血液成分の有無または濃度を分析することを含み、血液成分は、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、BC2LCN結合性のSerpinA3、およびBC2LCN結合性のGal3BPからなる群から選択される成分である、方法。
本発明によればまた、以下の発明が提供され得る。
(1A)対象から得られた生体サンプルを分析する方法であって、
BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子、SerpinA3に結合する分子、およびGal3BPに結合する分子からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるアッセイによって、生体サンプル中に含まれる成分を分析することを含む、方法。
(2A)第1の分子がSerpinA3に結合する抗体である、上記(1A)に記載の方法。
(3A)第1の分子がGal3BPに結合する抗体である、上記(1A)に記載の方法。
(4A)第1の分子がBC2LCNである、上記(1A)に記載の方法。
(5A)対象が、がんを有する、またはその可能性を有する、上記(1A)~(4A)のいずれかに記載の方法。
(6A)対象が、膵がんを有する、またはその可能性を有する、上記(5A)に記載の方法。
(7A)対象が、ステージ1または2の膵がんを有する、またはその可能性を有する、上記(6A)に記載の方法。
(8A)BC2LCN、SerpinA3に結合する分子、およびGal3BPに結合する分子からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子である第2の分子とを含み、第1の分子と第2の分子とを用いて対象の生体サンプル中の糖タンパク質の量を測定することができる、サンドイッチアッセイ用のキット、イムノクロマトアッセイ用のキット、レクチン電気泳動用のキット、質量分析用のキット、レクチンアフィニティークロマトグラフィー用のキットまたはμTAS用のキット。
(9A)第1の分子がSerpinA3に結合する抗体であり、糖タンパク質におけるタンパク質部分がSerpinA3である、上記(8A)に記載のキット。
(10A)第1の分子がGal3BPに結合する抗体であり、糖タンパク質におけるタンパク質部分がGal3BPである、上記(8A)に記載のキット。
(11A)固相化されたBC2LCNである第2の分子と、標識されたBC2LCN、標識されたSerpinA3に結合する抗体、および標識されたGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される標識された第1の分子とを含む、上記(8A)に記載のキット。
(12A)がんを検出することに用いられる、上記(8A)~(11A)のいずれか一項に記載のキット。
(13A)がんが、膵がんである、上記(12A)に記載のキット。
(14A)がんが、ステージ1または2の膵がんである、上記(13A)に記載のキット。
(15A)対象ががんであるか否かを予測する方法であって、上記(1A)~(7A)のいずれかに記載の方法を実施することを含む、方法。
(16A)対象から得られた生体サンプル中において特定成分を検出する方法であって、
特定成分は、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、BC2LCN結合性のSerpinA3、およびBC2LCN結合性のGal3BPからなる群から選択される成分である、方法。
(17A)対象から得られた生体サンプルから2つのBC2LCNに同時に結合できる成分、SerpinA3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分を分離することを含む、方法。
(18A)対象が、膵がんまたは膵がんを有する可能性を有する対象である、上記(17A)に記載の方法。
(19A)膵がんが、ステージIまたはIIの膵がんである、上記(17A)に記載の方法。
(20A)分離された成分の量を測定することをさらに含む、上記(17A)~(19A)のいずれかに記載の方法。
(21A)カットオフ値と前記測定された成分の量とを比較することをさらに含む、上記(20A)に記載の方法。
(22A)カットオフ値が、健常者の前記測定された成分に対応する成分の量の平均値以上の値であり、膵がん患者の前記測定された成分に対応する成分の量の平均値以下の値である、上記(21A)に記載の方法。
(23A)分離された成分を検出することをさらに含む、上記(17A)~(19A)のいずれかに記載の方法。
(1)対象から得られた血液サンプル中を分析する方法であって、
BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるサンドイッチアッセイまたはイムノクロマトアッセイによって、血液サンプル中に含まれる血液成分を分析することを含む、方法。
(2)第1の分子がSerpinA3に結合する抗体である、上記(1)に記載の方法。
(3)第1の分子がGal3BPに結合する抗体である、上記(1)に記載の方法。
(4)第1の分子がBC2LCNである、上記(1)に記載の方法。
(5)対象が、がんを有する、またはその可能性を有する、上記(1)~(4)のいずれかに記載の方法。
(6)対象が、膵がんを有する、またはその可能性を有する、上記(5)に記載の方法。
(7)対象が、ステージ1または2の膵がんを有する、またはその可能性を有する、上記(6)に記載の方法。
(8)BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを含み、第1の分子と第2の分子とを用いて対象の血液サンプル中の糖タンパク質の量を測定することができる、サンドイッチアッセイ用またはイムノクロマトアッセイ用のキット。
(9)第1の分子がSerpinA3に結合する抗体であり、糖タンパク質におけるタンパク質部分がSerpinA3である、上記(8)に記載のキット。
(10)第1の分子がGal3BPに結合する抗体であり、糖タンパク質におけるタンパク質部分がGal3BPである、上記(8)に記載のキット。
(11)固相化されたBC2LCNである第2の分子と、標識されたBC2LCN、標識されたSerpinA3に結合する抗体、および標識されたGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される標識された第1の分子とを含む、上記(8)に記載のキット。
(12)がんを検出することに用いられる、上記(8)~(11)のいずれかに記載のキット。
(13)がんが、膵がんおよび大腸がんからなる群から選択されるがんである、上記(12)に記載のキット。
(14)がんが、ステージ1または2の膵がんである、上記(13)に記載のキット。
(15)対象ががんであるか否かを予測する方法であって、上記(1)~(7)のいずれかに記載の方法を実施することを含む、方法。
(16)対象から得られた血液サンプル中を分析する方法であって、
血液サンプル中の血液成分の有無または濃度を分析することを含み、血液成分は、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、BC2LCN結合性のSerpinA3、およびBC2LCN結合性のGal3BPからなる群から選択される成分である、方法。
本発明によればまた、以下の発明が提供され得る。
(1A)対象から得られた生体サンプルを分析する方法であって、
BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子、SerpinA3に結合する分子、およびGal3BPに結合する分子からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるアッセイによって、生体サンプル中に含まれる成分を分析することを含む、方法。
(2A)第1の分子がSerpinA3に結合する抗体である、上記(1A)に記載の方法。
(3A)第1の分子がGal3BPに結合する抗体である、上記(1A)に記載の方法。
(4A)第1の分子がBC2LCNである、上記(1A)に記載の方法。
(5A)対象が、がんを有する、またはその可能性を有する、上記(1A)~(4A)のいずれかに記載の方法。
(6A)対象が、膵がんを有する、またはその可能性を有する、上記(5A)に記載の方法。
(7A)対象が、ステージ1または2の膵がんを有する、またはその可能性を有する、上記(6A)に記載の方法。
(8A)BC2LCN、SerpinA3に結合する分子、およびGal3BPに結合する分子からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子である第2の分子とを含み、第1の分子と第2の分子とを用いて対象の生体サンプル中の糖タンパク質の量を測定することができる、サンドイッチアッセイ用のキット、イムノクロマトアッセイ用のキット、レクチン電気泳動用のキット、質量分析用のキット、レクチンアフィニティークロマトグラフィー用のキットまたはμTAS用のキット。
(9A)第1の分子がSerpinA3に結合する抗体であり、糖タンパク質におけるタンパク質部分がSerpinA3である、上記(8A)に記載のキット。
(10A)第1の分子がGal3BPに結合する抗体であり、糖タンパク質におけるタンパク質部分がGal3BPである、上記(8A)に記載のキット。
(11A)固相化されたBC2LCNである第2の分子と、標識されたBC2LCN、標識されたSerpinA3に結合する抗体、および標識されたGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される標識された第1の分子とを含む、上記(8A)に記載のキット。
(12A)がんを検出することに用いられる、上記(8A)~(11A)のいずれか一項に記載のキット。
(13A)がんが、膵がんである、上記(12A)に記載のキット。
(14A)がんが、ステージ1または2の膵がんである、上記(13A)に記載のキット。
(15A)対象ががんであるか否かを予測する方法であって、上記(1A)~(7A)のいずれかに記載の方法を実施することを含む、方法。
(16A)対象から得られた生体サンプル中において特定成分を検出する方法であって、
特定成分は、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、BC2LCN結合性のSerpinA3、およびBC2LCN結合性のGal3BPからなる群から選択される成分である、方法。
(17A)対象から得られた生体サンプルから2つのBC2LCNに同時に結合できる成分、SerpinA3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分を分離することを含む、方法。
(18A)対象が、膵がんまたは膵がんを有する可能性を有する対象である、上記(17A)に記載の方法。
(19A)膵がんが、ステージIまたはIIの膵がんである、上記(17A)に記載の方法。
(20A)分離された成分の量を測定することをさらに含む、上記(17A)~(19A)のいずれかに記載の方法。
(21A)カットオフ値と前記測定された成分の量とを比較することをさらに含む、上記(20A)に記載の方法。
(22A)カットオフ値が、健常者の前記測定された成分に対応する成分の量の平均値以上の値であり、膵がん患者の前記測定された成分に対応する成分の量の平均値以下の値である、上記(21A)に記載の方法。
(23A)分離された成分を検出することをさらに含む、上記(17A)~(19A)のいずれかに記載の方法。
本明細書では、「対象」とは、哺乳動物、特に、ヒトを含むほ乳類を意味する。本明細書では、「対象」は、健常者であり得、または、がんを有する患者であり得、若しくはがんを有する可能性を有する患者であり得る。
本明細書では、「腫瘍」とは、自立性増殖を示す細胞集団を意味する。自立性増殖とは、体内の正常な細胞増殖制御を逃れて、自律的に増殖を続ける細胞の性質を意味する。腫瘍は、良性腫瘍と悪性腫瘍(がん)に大別される。良性腫瘍は、自立性増殖をするが、転移および浸潤、並びに悪液質を起こすことがない腫瘍である。悪性腫瘍は、自律増殖に加えて、正常組織への浸潤、転移、および悪液質のいずれか1以上を起こす。
本明細書では、「生体サンプル」とは、対象から得られるサンプル(例えば、組織、細胞、細胞外液、および体液)を意味する。体液としては、血液、尿、腹水、胸水、および分泌液(例えば、内分泌液および外分泌液、例えば、膵液などの消化液)が挙げられる。本明細書では、「血液サンプル」とは、対象から得られる血液(例えば、末梢血)または血液に由来するサンプル(例えば、血清および血漿)である。本明細書では、「血液成分」とは、血液に含まれる成分であり、特に血液に含まれる液体成分である。本明細書では、後述するように、生体サンプルが血液サンプルである場合、成分は血液成分である。
本明細書では、「抗体」は、免疫グロブリンを意味する。抗体は、抗原に対して結合する特性を有する生体分子である。抗体は、抗原に対して特異性を有し得る。抗体は、モノクローナル抗体であっても、ポリクローナル抗体であってもよい。抗体は、二重特異性抗体を含み得る。抗体は、全長の抗体と、抗原に対する結合性を有するその断片であり得る。
本明細書では、「BC2LCN」とは、Burkholderia cenocepacia由来のレクチンであるBC2L-CのN末端ドメインである(Sulak,O.,et al.,Structure,18(1):59-72,2010)。以前の報告によれば、BC2LCNは、糖タンパク質糖鎖であるH-type1(Fucα1-2Galβ1-3GlcNAc)およびH-type3(Fucα1-2Galβ1-3GalNAc)に親和性を有することが明らかにされ、かつ、BC2LCNは、H-type3糖鎖を有するポドカリキシンを発現するヒトES細胞やiPS細胞の未分化マーカーとして用いることができることが明らかにされている(WO2014/1236146)。また、以前の報告によれば、BC2LCNは、がんの組織に特異的に発現し、がんを検出するものとして用いることができることが明らかにされている(WO2017/061449)。WO2017/061449によれば、BC2LCNとケラタン硫酸に結合する抗体とのサンドイッチアッセイによって、一部のがん患者の血液成分において、BC2LCNとケラタン硫酸により認識されるタンパク質の存在が確認されている。本明細書では、大腸菌等のB. cenocepacia以外の宿主を用いて産生されたBC2LCNを、組換えBC2LCNまたはrBC2LCNということがある。本明細書では、BC2LCNが結合する糖鎖またはタンパク質を、BC2LCN結合性の糖鎖またはタンパク質という。BC2LCN結合性のタンパク質は、BC2LCN結合性の糖鎖により修飾されている。BC2LCN結合性の糖鎖は、H-type1の糖鎖および/またはH-type3の糖鎖であり得る。BC2LCNとしては、例えば、米国国立生物工学情報センター(NCBI)においてYP_002232818として登録されたレクチンが挙げられる。BC2LCNとしては糖鎖に対する結合能を有する限り用いることができるが、BC2LCNとしては、JP2020-146027に開示されるような糖鎖に対する結合能を改変(例えば、向上)したものを用いることもできる。BC2LCNの改変体を用いてもよい。BC2LCNとしては、YP_002232818として登録されたレクチンのアミノ酸配列と90%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、99%以上または100%同一のアミノ酸配列を有するタンパク質(BC2LCN)が挙げられる。BC2LCNは、少なくともH-type3糖鎖およびH-type1糖鎖からなる群から選択される1以上に結合する。
本明細書では、「SerpinA3」とは、α1アンチキモトリプシン(AACT)としても知られるセリンプロテアーゼ阻害剤(セルピン)である。ヒトでは、例えば、GenBank登録番号K01500.1として登録された塩基配列を有するmRNAから翻訳されて得られるタンパク質であり得る。ヒトでは、SerpinA3のタンパク質は、423アミノ酸長の前駆体(例えば、NCBI参照番号:NP_001076.2)から1~23番目のアミノ酸配列からなるシグナルペプチドが切断されて生じ得る。
本明細書では、「Gal3BP」とは、ガレクチン-3-結合タンパク質である。Gal3BPは、米国国立生物工学情報センター(NCBI)参照番号NM_005567.4として登録された塩基配列を有するmRNAから翻訳されて得られるタンパク質であり得る。ヒトでは、Gal3BPのタンパク質は、例えば、585アミノ酸長の前駆体(例えば、NCBI参照番号:NP_005558.1として登録されたアミノ酸配列を有する)から1~18番目のアミノ酸配列からなるシグナルペプチドが切断されて生じ得る。Gal3BPは、血清中では90kDaの分子量を有し、乳がん、肺がん、直腸結腸がん、卵巣がん、および子宮内膜がんの患者の血清で高濃度で見出される(Koths,K.etal.,J.Biol.Chem.268:14245-14249,1993)。
本明細書では、「サンドイッチアッセイ」とは、サンプルに含まれる目的成分を検出することに用いられるアッセイである。サンドイッチアッセイは、当業者であれば常法により実施することができる。サンドイッチアッセイは、通常は、支持体(例えば、基板およびビーズ)に固相化された目的成分に結合する捕捉分子Aに当該目的成分を接触させて、支持体上に目的成分を捕捉し、その後、未結合の当該目的成分を除去した(または分離した)後に、標識された当該目的成分に結合する捕捉分子Bを接触させて、支持体上に補足された目的成分を標識を指標として検出するアッセイである。本発明で用いられ得る支持体としては、通常の免疫学的測定法で用いられる支持体(特に、不溶性の支持体)であれば何れも使用可能であるが、例えば、ポリスチレン、ポリアクリル酸、ポリメタクリル酸、ポリメタクリル酸メチル、ポリアクリルアミド、ポリグリシジルメタクリレート、ポリプロピレン、ポリオレフィン、ポリイミド、ポリウレタン、ポリエステル、ポリ塩化ビニール、ポリエチレン、ポリクロロカーボネート、シリコーン樹脂、シリコーンラバー、アガロース、デキストラン、エチレン-無水マレイン酸共重合物等の有機物;ガラス、酸化ケイ素、ケイソウ、多孔性ガラス、スリガラス、アルミナ、シリカゲル、金属酸化物等の無機物質;鉄、コバルト、ニッケル、マグネタイト、クロマイト等の磁性体等;及びこれらの磁性体の合金を材料として調製されたものが挙げられる。固相化は、固相(例えば、ビーズ、磁気ビーズ、メンブレン、プレートなどのあらゆる表面)に対してなされ得る。磁気ビーズは、市販の様々なものを用いることができる。磁気ビーズとしては、例えば、WO2012/173002Aに開示されるビーズを用いてもよい。サンドイッチアッセイでは、通常、固相化される上記捕捉分子Aと標識された上記捕捉分子Bとは、目的成分との結合に関して互いに競合せず、同時に目的成分に結合する必要がある。捕捉分子Aは、以下に説明する第1の分子であり得、捕捉分子Bは、第2の分子であり得る。捕捉分子Aは、以下に説明する第2の分子であり得、捕捉分子Bは、第1の分子であり得る。
サンドイッチアッセイは、マイクロ流体チップ(micro-total analysis systems;μTAS)によって行うこともできる。マイクロ流体チップは、流路を備え、流路はサンプル導入口を有し、例えば、サンプル導入口において、ポリカチオンまたはポリアニオン(例えば、DNA)を結合した捕捉分子Xとサンプルとを接触させて捕捉分子Xと目的成分との複合体を形成させ、電場をかけて複合体を移動させ、流路の途中に存在する標識された捕捉分子Yと複合体が接触すると、目的成分と捕捉分子Xと捕捉分子Yの複合体が形成され、更に電場により複合体は、流路を移動し、流路上の検出部に到達し、そこで捕捉分子Yに結合した標識によって検出され得る。検出は、例えば、レーザー等により光学的に実施され得る。捕捉分子Xは、以下に説明する第1の分子であり得、捕捉分子Yは、第2の分子であり得る。捕捉分子Xは、以下に説明する第2の分子であり得、捕捉分子Yは、第1の分子であり得る。μTASを用いて複数のバイオマーカーの存在を並列的に検出することもできる。
その他サンドイッチアッセイとしては、補足分子Nと補足分子Mとがそれぞれ別のビーズAおよびBに固相化され、目的分子が存在するときには、目的分子、補足分子NおよびビーズA並びに補足分子MおよびビーズBとが複合体を形成し、励起によって一重項酸素を放出するフォトセンシタイザーを含むビーズAに励起光を照射することによって、複合体が形成されているとき(ビーズAとBとが近接しているとき)のみビーズBに一重項酸素が到達し、それによりビーズBが化学発光するようにして、ビーズBからの光を検出することによって目的分子の存在を検出するアッセイ(例えば、AlphaLISA)が挙げられる。従って、本発明では、BC2LCNが固相化されたビーズと、SerpinA3またはGal3BPに結合する抗体が固相化されたビーズとを含む、AlphaLISAアッセイキットが提供されうる。本発明では、第1の蛍光分子で標識されたBC2LCNと第2の蛍光分子で標識されたSerpinA3またはGal3BPに結合する抗体との間の蛍光共鳴エネルギー転移(FRET)および生体発光共鳴エネルギー転移(BRET)等を用いて目的分子の存在を検出するアッセイキットも用い得る。この場合には、固相化のためのビーズや支持体は必要ではない。本発明では、そのようなアッセイ用のキットが提供されうる。
その他サンドイッチアッセイとしては、補足分子Nと補足分子Mとがそれぞれ別のビーズAおよびBに固相化され、目的分子が存在するときには、目的分子、補足分子NおよびビーズA並びに補足分子MおよびビーズBとが複合体を形成し、励起によって一重項酸素を放出するフォトセンシタイザーを含むビーズAに励起光を照射することによって、複合体が形成されているとき(ビーズAとBとが近接しているとき)のみビーズBに一重項酸素が到達し、それによりビーズBが化学発光するようにして、ビーズBからの光を検出することによって目的分子の存在を検出するアッセイ(例えば、AlphaLISA)が挙げられる。従って、本発明では、BC2LCNが固相化されたビーズと、SerpinA3またはGal3BPに結合する抗体が固相化されたビーズとを含む、AlphaLISAアッセイキットが提供されうる。本発明では、第1の蛍光分子で標識されたBC2LCNと第2の蛍光分子で標識されたSerpinA3またはGal3BPに結合する抗体との間の蛍光共鳴エネルギー転移(FRET)および生体発光共鳴エネルギー転移(BRET)等を用いて目的分子の存在を検出するアッセイキットも用い得る。この場合には、固相化のためのビーズや支持体は必要ではない。本発明では、そのようなアッセイ用のキットが提供されうる。
本明細書では、「イムノクロマトアッセイ」とは、サンプルに含まれる目的成分を検出することに用いられるアッセイであり、通常は、金コロイド等の標識で標識された捕捉分子Cと液体試料に含まれる目的成分とを接触させ、標識捕捉分子Cと目的成分との複合体を形成させ、その後クロマトメンブレン上を複合体に移動させ、テストライン上に固相化されている補足分子Dに接触させて、テストライン上に標識捕捉分子Cと目的成分との複合体を捕捉させ、テストライン上の標識を指標として検出するアッセイである。イムノクロマトアッセイでは、通常、標識された捕捉分子Cとテストライン上に固相化されている捕捉分子Dとは、目的成分との結合に関して互いに競合せず、同時に目的成分に結合する必要がある。イムノクロマトアッセイでは、テストラインの他に対照ラインが設けられ、対照ラインには、捕捉分子Cに結合する分子(抗体等であり、捕捉分子CがIgG抗体の場合は抗IgG抗体であり得る)が固相化され、目的成分と結合しなかった標識捕捉成分Cを捕捉することができる。イムノクロマトアッセイでは、サンプルを含ませるサンプルパッドと、標識捕捉分子Cが存在するコンジュゲートパッドと、サンプル中の目的成分と捕捉分子Cとの複合体が移動する移動層であるメンブレンと、サンプル中の水分を吸収する吸収パッドとをこの順番で含むストリップが提供され、メンブレン上には、捕捉分子Dが固相化されたテストラインと捕捉分子Cに対する抗体が固相化された対照ラインが存在する。サンプルパッドにサンプルを含ませると、サンプルが目的成分を含む場合は、ストリップ上を吸収パッドに向けて移動する。コンジュゲートパッドに移動したところで、標識捕捉分子Cと目的成分とが複合体を形成し、複合体はテストラインに固相化された捕捉分子Dに捕捉され、かつ、対照ラインにも捕捉される。サンプルが目的成分を含まない場合は、サンプルは吸収パッドに向けて移動し、標識捕捉分子Cは、複合体を形成せず、テストラインに捕捉されることはなく、対照ラインにのみ捕捉されることとなる。結果、対照ラインが発色し、テストラインが発色した場合には、サンプルに目的成分が含まれていることが示され、対照ラインが発色し、テストラインが発色しない場合には、サンプルに目的成分が含まれていないことが示される。対照ラインが発色しない場合は、イムノクロマトによる評価系が正しく作動していないと判断することができる。捕捉分子Cは、以下に説明する第1の分子であり得、捕捉分子Dは、第2の分子であり得る。捕捉分子Cは、以下に説明する第2の分子であり得、捕捉分子Dは、第1の分子であり得る。
本明細書では、「レクチン電気泳動」は、レクチンを含むゲルを用いた電気泳動であり、電気泳動中にレクチンと相互作用する分子は、移動速度が、相互作用しない分子よりも遅くなることを利用した、レクチン結合分子の分離方法である。レクチンは、ゲル中に遊離しているか、または、ゲル上に固相化されている。レクチンは、電気泳動によってほとんど移動しないため、単にゲルの材料と混合してゲルを作製することによって、糖タンパク質の泳動速度を低下させることができる。あるいは、レクチンは、ゲルに対して非共有結合または共有結合で連結されている。BC2LCN結合性の分子を、BC2LCNに対して非結合性の分子と分離する場合には、レクチンとしてBC2LCNを用いたレクチン電気泳動により、生体サンプルを分離することができる。BC2LCN結合性の糖鎖を有する分子は、泳動中にゲル上に固相化されたレクチンと相互作用を繰り返すために、泳動が遅延する。他方で、BC2LCN非結合性の分子は、ゲル上に固相化されたレクチンとの相互作用がなく、泳動が早い。この原理を用いると、電気泳動によって、BC2LCN結合性の糖鎖を有する分子と、BC2LCN非結合性との分子を分離することができる。レクチン電気泳動は、当業者であれば適宜実施することができる。
本明細書では、「レクチンアフィニティークロマトグラフィー」は、レクチンが糖鎖と特異的に結合する性質を有することを利用したクロマトグラフィーである。レクチンアフィニティークロマトグラフィーでは、例えば、レクチンを固相化した不溶性の支持体を含むカラムを用いて、試料に対してアフィニティークロマトグラフィーを行う。試料中の成分がレクチンに親和性を有する場合には、当該成分は、他の成分から分離されることとなる。本発明では、レクチンとしては、例えば、BC2LCNを用いることができる。
本発明によれば、様々ながんを有する患者の血清を分析したところ、固相化したBC2LCNと標識したBC2LCNとを用いたサンドイッチアッセイにおいて、2つのBC2LCNを同時に結合することができる血液成分が存在すること、およびがんを有する患者における当該血液成分の血清中の量が、健常者よりも高い傾向があることを見出した。
本発明によればまた、様々ながんを有する患者の血清を分析したところ、BC2LCNとSerpinA3に結合する抗体とを用いたサンドイッチアッセイにおいて、BC2LCN結合性のSerpinA3が血液成分として存在すること、およびがんを有する患者におけるBC2LCN結合性のSerpinA3の血清中の量が、健常者よりも高い傾向があることを見出した。
本発明によればさらに、様々ながんを有する患者の血清を分析したところ、BC2LCNとGal3BPに結合する抗体とを用いたサンドイッチアッセイにおいて、BC2LCN結合性のGal3BPが血液成分として存在すること、およびがんを有する患者におけるBC2LCN結合性のGal3BPの血清中の量が、健常者よりも高い傾向があることを見出した。
本発明によればまた、様々ながんを有する患者の血清を分析したところ、BC2LCNとSerpinA3に結合する抗体とを用いたサンドイッチアッセイにおいて、BC2LCN結合性のSerpinA3が血液成分として存在すること、およびがんを有する患者におけるBC2LCN結合性のSerpinA3の血清中の量が、健常者よりも高い傾向があることを見出した。
本発明によればさらに、様々ながんを有する患者の血清を分析したところ、BC2LCNとGal3BPに結合する抗体とを用いたサンドイッチアッセイにおいて、BC2LCN結合性のGal3BPが血液成分として存在すること、およびがんを有する患者におけるBC2LCN結合性のGal3BPの血清中の量が、健常者よりも高い傾向があることを見出した。
本発明によれば、
対象から得られた生体サンプルを分析する方法であって、
対象から得られた生体サンプル中のSerpinA3(例えば、BC2LCN結合性のSerpinA3)およびGal3BP(例えば、BC2LCN結合性のGal3BP)からなる群から選択される1以上の成分(「目的成分」ということがある)を検出することを含む、
方法
が提供される。本発明の方法では、生体サンプルを用意することを含んでもよい。本発明の方法では、上記の成分の量を測定することをさらに含んでもよい。
対象から得られた生体サンプルを分析する方法であって、
対象から得られた生体サンプル中のSerpinA3(例えば、BC2LCN結合性のSerpinA3)およびGal3BP(例えば、BC2LCN結合性のGal3BP)からなる群から選択される1以上の成分(「目的成分」ということがある)を検出することを含む、
方法
が提供される。本発明の方法では、生体サンプルを用意することを含んでもよい。本発明の方法では、上記の成分の量を測定することをさらに含んでもよい。
本発明によれば、SerpinA3(例えば、BC2LCN結合性のSerpinA3)およびGal3BP(例えば、BC2LCN結合性のGal3BP)からなる群から選択される1以上の成分は、当該成分に結合する分子を用いて検出することができる。
ある態様では、上記1以上の成分をそれ以外の成分から分離してから、前記1以上の成分を検出することができる。
例えば、SerpinA3は、SerpinA3に結合する分子を用いて検出することができる。SerpinA3に同時に結合することができる2つの異なる分子を用いることもできる。SerpinA3に同時に結合することができる2つの異なる分子を用いると、イムノクロマトアッセイやサンドイッチアッセイによってSerpinA3を検出することができる。SerpinA3はまた、質量分析によっても検出することができる。いずれの場合もSerpinA3の標準物質を用いて検量線を得ることができる。また、得られた検証線に対して、SerpinA3に関する測定値をあてはめて、SerpinA3を定量することができる。
また、BC2LCN結合性のSerpinA3は、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子とSerpinA3に結合する分子を用いて検出することができる。BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子が、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子を用いて、BC2LCN結合性の分子をそれ以外と分離することを含んでいてもよいし、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子が、BC2LCNである場合、レクチンアフィニティークロマトグラフィーやレクチン電気泳動を用いて、BC2LCN結合性の分子をそれ以外と分離することを含んでいてもよい。また、SerpinA3をそれ以外の成分と分離することを含んでいてもよい。SerpinA3の分離と、BC2LCN結合性の成分の分離は、どちらを先に実施してもよい。
例えば、Gal3BPは、Gal3BPに結合する分子を用いて検出することができる。Gal3BPに同時に結合することができる2つの異なる分子を用いることもできる。Gal3BPに同時に結合することができる2つの異なる分子を用いると、イムノクロマトアッセイやサンドイッチアッセイによってGal3BPを検出することができる。Gal3BPはまた、質量分析によっても検出することができる。いずれの場合もGal3BPの標準物質を用いて検量線を得ることができる。また、得られた検証線に対して、Gal3BPに関する測定値をあてはめて、Gal3BPを定量することができる。
また、BC2LCN結合性のGal3BPは、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子とGal3BPに結合する分子を用いて検出することができる。BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子が、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子を用いて、BC2LCN結合性の分子をそれ以外と分離することを含んでいてもよいし、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子が、BC2LCNである場合、レクチン電気泳動を用いて、BC2LCN結合性の分子をそれ以外と分離することを含んでいてもよい。また、Gal3BPをそれ以外の成分と分離することを含んでいてもよい。Gal3BPの分離と、BC2LCN結合性の成分の分離は、どちらを先に実施してもよい。
ある態様では、上記1以上の成分をそれ以外の成分から分離してから、前記1以上の成分を検出することができる。
例えば、SerpinA3は、SerpinA3に結合する分子を用いて検出することができる。SerpinA3に同時に結合することができる2つの異なる分子を用いることもできる。SerpinA3に同時に結合することができる2つの異なる分子を用いると、イムノクロマトアッセイやサンドイッチアッセイによってSerpinA3を検出することができる。SerpinA3はまた、質量分析によっても検出することができる。いずれの場合もSerpinA3の標準物質を用いて検量線を得ることができる。また、得られた検証線に対して、SerpinA3に関する測定値をあてはめて、SerpinA3を定量することができる。
また、BC2LCN結合性のSerpinA3は、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子とSerpinA3に結合する分子を用いて検出することができる。BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子が、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子を用いて、BC2LCN結合性の分子をそれ以外と分離することを含んでいてもよいし、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子が、BC2LCNである場合、レクチンアフィニティークロマトグラフィーやレクチン電気泳動を用いて、BC2LCN結合性の分子をそれ以外と分離することを含んでいてもよい。また、SerpinA3をそれ以外の成分と分離することを含んでいてもよい。SerpinA3の分離と、BC2LCN結合性の成分の分離は、どちらを先に実施してもよい。
例えば、Gal3BPは、Gal3BPに結合する分子を用いて検出することができる。Gal3BPに同時に結合することができる2つの異なる分子を用いることもできる。Gal3BPに同時に結合することができる2つの異なる分子を用いると、イムノクロマトアッセイやサンドイッチアッセイによってGal3BPを検出することができる。Gal3BPはまた、質量分析によっても検出することができる。いずれの場合もGal3BPの標準物質を用いて検量線を得ることができる。また、得られた検証線に対して、Gal3BPに関する測定値をあてはめて、Gal3BPを定量することができる。
また、BC2LCN結合性のGal3BPは、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子とGal3BPに結合する分子を用いて検出することができる。BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子が、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子を用いて、BC2LCN結合性の分子をそれ以外と分離することを含んでいてもよいし、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子が、BC2LCNである場合、レクチン電気泳動を用いて、BC2LCN結合性の分子をそれ以外と分離することを含んでいてもよい。また、Gal3BPをそれ以外の成分と分離することを含んでいてもよい。Gal3BPの分離と、BC2LCN結合性の成分の分離は、どちらを先に実施してもよい。
本発明によれば、
対象から得られた生体サンプルを分析する方法であって、
BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子、SerpinA3に結合する分子、およびGal3BPに結合する分子からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるアッセイによって、生体サンプル中に含まれる成分(「目的成分」ということがある)を分析することを含む、方法
が提供される。
対象から得られた生体サンプルを分析する方法であって、
BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子、SerpinA3に結合する分子、およびGal3BPに結合する分子からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるアッセイによって、生体サンプル中に含まれる成分(「目的成分」ということがある)を分析することを含む、方法
が提供される。
生体サンプルは、上記対象から得られた生体サンプルである。対象は、がんを有する、またはがんを有する可能性を有する対象であり得る。がんは、例えば、膵がんであり得る。膵がんは、例えば、ステージI、II、III、およびIVからなる群から選択されるステージの膵がんであり得、例えば、ステージIの膵がんであり得、例えば、ステージIIの膵がんであり得る。生体サンプルとしては、例えば、組織、細胞、および体液が上げられる。体液としては、血液(例えば、血漿および血清)、汗、唾液、尿、腹水、胸水、および分泌液(例えば、内分泌液および外分泌液、例えば、膵液などの消化液)が挙げられる。組織および細胞はそれぞれ、例えば、がんであるか、またはがんであると疑われる組織および細胞とすることができる。組織および細胞はそれぞれ、例えば、がんであるか、またはがんであると疑われる部分を含む。
BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子としては、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する抗体またはその抗原結合性断片が挙げられる。BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子としてはまた、BC2LCN結合性の糖鎖に結合するアプタマー(例えば、DNAおよびRNAからなる群から選択される核酸アプタマー)が挙げられる。BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子としてはさらに、環状ペプチドなどの中分子が挙げられる。これらのBC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子は、当業者に周知の方法によって取得することができる。例えば、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する抗体は、BC2LCN結合性の糖鎖を免疫した非ヒト哺乳動物から得ることができる。BC2LCN結合性の糖鎖に結合するアプタマーは、核酸プールからBC2LCN結合性の糖鎖に対する親和性を利用して取得することができる。BC2LCN結合性の糖鎖に結合する環状ペプチドは、環状ペプチドプールからBC2LCN結合性の糖鎖に対する親和性を利用して取得することができる。BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子は、例えば、BC2LCNであり得る。
SerpinA3に結合する分子としては、SerpinA3に結合する抗体またはその抗原結合性断片が挙げられる。SerpinA3に結合する分子としてはまた、SerpinA3に結合するアプタマー(例えば、DNAおよびRNAからなる群から選択される核酸アプタマー)が挙げられる。SerpinA3に結合する分子としてはさらに、環状ペプチドなどの中分子が挙げられる。これらのSerpinA3に結合する分子は、当業者に周知の方法によって取得することができる。例えば、SerpinA3に結合する抗体は、SerpinA3を免疫した非ヒト哺乳動物から得ることができる。SerpinA3に結合するアプタマーは、核酸プールからSerpinA3に対する親和性を利用して取得することができる。SerpinA3に結合する環状ペプチドは、環状ペプチドプールからSerpinA3に対する親和性を利用して取得することができる。SerpinA3は、生体試料中で他の成分と複合体を形成している場合がある。本発明では、そのような複合体を検出してもよい。例えば、SerpinA3と複合体を形成する他の成分としてはPSAがあげられる。したがって、PSAに結合する分子とSerpinA3に結合する分子を用いてSerpinA3を検出することもできる。または、標識した組換えPSAを用いて、SerpinA3がPSAに結合する性質を利用してSerpinA3を検出することもできる。
Gal3BPに結合する分子としては、Gal3BPに結合する抗体またはその抗原結合性断片が挙げられる。Gal3BPに結合する分子としてはまた、Gal3BPに結合するアプタマー(例えば、DNAおよびRNAからなる群から選択される核酸アプタマー)が挙げられる。Gal3BPに結合する分子としてはさらに、環状ペプチドなどの中分子が挙げられる。これらのGal3BPに結合する分子は、当業者に周知の方法によって取得することができる。例えば、Gal3BPに結合する抗体は、Gal3BPを免疫した非ヒト哺乳動物から得ることができる。Gal3BPに結合するアプタマーは、核酸プールからGal3BPに対する親和性を利用して取得することができる。Gal3BPに結合する環状ペプチドは、環状ペプチドプールからGal3BPに対する親和性を利用して取得することができる。Gal3BPは、生体試料中で他の成分と複合体を形成している場合がある。本発明では、そのような複合体を検出してもよい。例えば、Gal3BPと複合体を形成する他の成分としてはガレクチン(特に、ガレクチン3)があげられる。したがって、ガレクチン(特に、ガレクチン3)に結合する分子とGal3BPに結合する分子を用いてGal3BPを検出することもできる。または、標識した組換えガレクチン(特に、ガレクチン3)を用いて、Gal3BPがガレクチン(特に、ガレクチン3)に結合する性質を利用してGal3BPを検出することもできる。
本発明によれば、対象から得られた生体サンプル(例えば、血液サンプル)を分析する方法であって、
生体サンプル(例えば、血液サンプル)中の成分(特定成分、例えば、血液成分)の有無または濃度を分析することを含み、成分(例えば、血液成分)は、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、SerpinA3(例えば、BC2LCN結合性のSerpinA3)、およびGal3BP(例えば、BC2LCN結合性のGal3BP)からなる群から選択される成分(目的成分(例えば、目的血液成分)ということがある)である、方法が提供される。本発明の分析方法においては、上記成分の1、2またはすべてが検出された場合には、対象ががんである可能性が示される。本発明の分析方法においては、上記成分の1つの濃度が、カットオフ値よりも大きい場合には、対象ががんである可能性が示される。
生体サンプル(例えば、血液サンプル)中の成分(特定成分、例えば、血液成分)の有無または濃度を分析することを含み、成分(例えば、血液成分)は、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、SerpinA3(例えば、BC2LCN結合性のSerpinA3)、およびGal3BP(例えば、BC2LCN結合性のGal3BP)からなる群から選択される成分(目的成分(例えば、目的血液成分)ということがある)である、方法が提供される。本発明の分析方法においては、上記成分の1、2またはすべてが検出された場合には、対象ががんである可能性が示される。本発明の分析方法においては、上記成分の1つの濃度が、カットオフ値よりも大きい場合には、対象ががんである可能性が示される。
本発明の分析方法では、対象は、ヒトであり得、例えば、健常者、がんを有する患者、およびがんを有する可能性を有する患者であり得る。
ある態様では、がんは、膵がん、大腸がん、直腸腺がん、膀胱がん、乳がん、非小細胞肺がん、胃がん、子宮頸部がん、子宮体がん、肝細胞がん、甲状腺がん、前立腺がん、メラノーマ、食道がん、卵巣がん、胆管がん、非ホジキンリンパ腫、および慢性骨髄性白血病からなる群から選択される1以上のがんであり得る。ある態様では、がんは、膵がんであり得る。ある態様では、膵がんは、ステージIおよびIIからなる群から選択されるステージの膵がんであり得る。ある態様では、膵がんは、ステージIであり得る。ある態様では、膵がんは、ステージIIであり得る。
ある態様では、目的成分または目的血液成分は、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分である。ある態様では、目的成分または目的血液成分は、BC2LCN結合性のSerpinA3である。ある態様では、目的成分または目的血液成分は、BC2LCN結合性のGal3BPである。これらの態様において、がんは、上記の通りであり得るが、例えば、膵がん、大腸がん、直腸腺がん、膀胱がん、乳がん、子宮体がん、肝細胞がん、甲状腺がん、メラノーマ、食道がん、胆管がん、卵巣がん、非ホジキンリンパ腫、および慢性骨髄性白血病からなる群から選択される1以上のがんであり得る。ある態様では、がんは、膵がんであり得る。ある態様では、膵がんは、ステージIおよびIIからなる群から選択されるステージの膵がんであり得る。ある態様では、膵がんは、ステージIであり得る。ある態様では、膵がんは、ステージIIであり得る。
ある態様において、カットオフ値は、例えば、0、健常者群の目的成分(例えば、目的血液成分)濃度の第1四分位値、平均値、第3四分位値、若しくは最大値、またはこれらのいずれか2つの間の値(例えば、第3四分位値若しくは最大値またはその間の値)とすることができる。ある態様において、カットオフ値は、例えば、0、がん患者群の目的成分(例えば、目的血液成分)濃度の第1四分位値、平均値、第3四分位値、若しくは最大値、またはこれらのいずれか2つの間の値とすることができる。
ある態様において、カットオフ値は、ROC曲線上の感度1および特異度1の点からの距離が最も近い点におけるカットオフ値、当該カットオフ値より大きな値、または当該カットオフ値よりも小さな値であり得る。ある態様において、カットオフ値はまた、Youden Indexが最大値となる点におけるカットオフ値、当該カットオフ値より大きな値、または当該カットオフ値よりも小さな値であり得る。
ある態様において、カットオフ値は、ROC曲線上の感度1および特異度1の点からの距離が最も近い点におけるカットオフ値、当該カットオフ値より大きな値、または当該カットオフ値よりも小さな値であり得る。ある態様において、カットオフ値はまた、Youden Indexが最大値となる点におけるカットオフ値、当該カットオフ値より大きな値、または当該カットオフ値よりも小さな値であり得る。
カットオフ値は、感度と偽陽性率との兼ね合いによって決めることができる。カットオフ値は、擬陽性が多くてもがん患者をできるだけ多く検出したい場合(感度を高めたい場合)には、低く設定することができ、擬陽性を減らしたい(その代わり、感度が低下してもよい場合)には、高く設定することができ、当業者であれば、検査の目的に応じて適宜設定することができる。
本発明の分析方法において、対象から得られた生体サンプル(例えば、血液サンプル)中の目的成分(例えば、目的血液成分)の濃度がカットオフ値よりも大きい場合には、当該対象は、がんを有する可能性があるとの情報を得ることができる。従って、本発明の分析方法は、対象から得られた生体サンプル(例えば、血液サンプル)中の目的成分(例えば、目的血液成分)の濃度がカットオフ値よりも大きい場合に、当該対象が、がんを有する可能性があることを示す情報を提供することを含みうる。
本発明の分析方法において、対象から得られた生体サンプル(例えば、血液サンプル)中の目的成分(例えば、目的血液成分)の濃度がカットオフ値よりも大きい場合には、当該対象は、膵がんを有する可能性があるとの情報を得ることができる。従って、本発明の分析方法は、対象から得られた生体サンプル(例えば、血液サンプル)中の目的成分(例えば、目的血液成分)の濃度がカットオフ値よりも大きい場合に、当該対象が、膵がんを有する可能性があることを示す情報を提供することを含みうる。
本発明の分析方法においては、早期がん(ステージIおよびII)を有する患者の生体サンプル(例えば、血液サンプル)中においても目的成分(例えば、目的血液成分)が検出されうる。従って、本発明の分析方法は、対象から得られた生体サンプル(例えば、血液サンプル)中の目的成分(例えば、目的血液成分)の濃度がカットオフ値よりも大きい場合に、当該対象が、早期がんを有する可能性があることを示す情報を提供することを含みうる。早期がんは、早期膵がんであり得る。膵がんのステージ分類は、UICC TNM分類(UICC: TNM Classification of Malignant Tumours, 8th Edn. Wiley-Blackwell; 2017.94-95)に基づいて医師が決定することができる。ステージIは、ステージ1Aおよび1Bを含み、ステージIIは、ステージ2Aと2Bを含む。ステージIIIおよびIVは、ステージ3および4とそれぞれ同義である。
情報の提供は、情報の送信または出力により行うことができる。情報の出力は、ディスプレイまたは印刷物上になされ得る。
本発明の分析方法は、さらに対象ががんを有する可能性を有すると決定することを含んでいてもよい。
本発明によれば、本発明の分析方法においてがんを有する可能性があると決定された対象の少なくとも一部をがん療法に供することを含む、がんを処置する方法が提供される。がん療法としては、放射線療法、化学療法、および外科的療法からなる群から選択される1以上が挙げられる。がん療法は、標準療法であり得る。放射線療法は、がんに対して放射線を照射することを含み得る。化学療法は、対象に抗がん剤を投与することを含み得る。外科的療法は、がんを切除することを含み得る。がん(例えば、膵臓がん)に対する化学療法としては、例えば、フォルフィリノックス療法、ゲムシタビン・ナブパクリタキセル療法(GnP療法)、ゲムシタビン・S1療法(GS療法)、リポソーマルイリノテカン・5FU/LV療法(Nal-IRI/FL療法)、ゲムシタビン療法、およびS1療法などが挙げられ、これらの療法のいずれか1以上により対象を処置することができる。抗がん剤としては、例えば、オキサリプラチンなどの白金製剤、イリノテカン、リポソーム型イリノテカン、レボホリナート、ゲムシタビン、ナブパクリタキセル、5-フルオロウラシル(5-FU)、およびS-1からなる群から選択される1以上が挙げられる。
本発明によれば、上記の抗がん剤からなる群から選択される1以上の治療上有効量を含む医薬組成物であって、本発明の分析方法においてがんを有する可能性があると決定された対象においてがんを処置することに用いるための医薬組成物が提供され得る。医薬組成物は、医薬有効成分に加えて、薬学上許容可能な賦形剤をさらに含んでいてもよい。薬学上許容可能な賦形剤は、当業者であれば適宜選択することができる。
本発明によれば、上記の抗がん剤からなる群から選択される1以上の治療上有効量を含む医薬組成物であって、本発明の分析方法においてがんを有する可能性があると決定された対象においてがんを処置することに用いるための医薬組成物が提供され得る。医薬組成物は、医薬有効成分に加えて、薬学上許容可能な賦形剤をさらに含んでいてもよい。薬学上許容可能な賦形剤は、当業者であれば適宜選択することができる。
本発明の分析方法のある態様では、
対象から得られた生体サンプル(例えば、血液サンプル)中を分析する方法であって、
BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるサンドイッチアッセイまたはイムノクロマトアッセイによって、生体サンプル(例えば、血液サンプル)中に含まれる成分(例えば、血液成分)を分析することを含む、方法が提供される。
対象から得られた生体サンプル(例えば、血液サンプル)中を分析する方法であって、
BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるサンドイッチアッセイまたはイムノクロマトアッセイによって、生体サンプル(例えば、血液サンプル)中に含まれる成分(例えば、血液成分)を分析することを含む、方法が提供される。
ある態様では、第1の分子は、支持体(例えば、基板)に固相化され、第2の分子は、標識され得る。ある態様では、第1の分子は、標識され、第2の分子は、支持体に固相化され得る。
固相化は、例えば、直接法、ポリスチレンタグ法(WO2018/190357)、ビオチン-ストレプトアビジン法、HaloTag法、アミンカップリング法などの化学結合を用いた方法、およびV5タグ法などの公知の固相化法を用いることができる。直接法では、固相化される捕捉分子は、そのまま支持体と接触され、これにより、支持体上に固相化される。ポリスチレンタグ法では捕捉分子に融合させたポリスチレンタグを介して、ポリスチレンプレートに固相化される。ビオチン-ストレプトアビジン法では、ストレプトアビジンで被覆した支持体に対して、ビオチンで修飾した捕捉分子が結合することにより、捕捉分子が支持体上に固相化される。HaloTag法では、捕捉分子に融合させたHaloTagタンパク質を介して、HaloTagで被覆した支持体上に捕捉分子が固相化される。アミンカップリング法では、固相表面に形成したカルボキシル基を活性エステル化し、アミノ基を介してタンパク質などを化学結合により固定化することができる。V5タグ法では、抗V5タグ抗体で被覆した支持体に対して、V5タグを連結させた捕捉分子を結合することにより、捕捉分子が支持体上に固相化される。
標識としては、サンドイッチアッセイにおいては、基質(発色基質、蛍光基質、および発光基質)、酵素抗体法で用いられる酵素(例えば、ペルオキシダーゼ、グルコースオキシダーゼ、およびアルカリフォスファターゼ)を用いることができる。標識は、当業者であれば常法を用いて行うことができる。標識は、例えば、共有結合性に行うことができる。標識は、例えば、ビオチン連結抗体とアビジン連結標識とを反応させて行ってもよい。基質としては、例えば、蛍光基質が挙げられる。ペルオキシダーゼとしては、例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼが用いられ得る。西洋ワサビペルオキシダーゼは、発色基質、蛍光基質または発光基質を加えることにより発色、蛍光または化学発光を生じる。従って、発色、蛍光または化学発光を指標として標識した捕捉分子の存在を検出することができる。西洋ワサビペルオキシダーゼの発色基質としては、例えば、テトラメチルベンジダイン(TMB)、o-フェニレンジアミン(OPD)、2,2-アジノビス[3-エチルベンゾ-チアゾリン-6-スルホン酸(ABTS)、およびAmplex(商標)Redが挙げられ、過酸化水素存在下において、標識分子の検出に用いることができる。アルカリフォスファターゼの発光基質としては、p-ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、4-メチルウンベリフェリルホスフェート(4-MUP)、およびAttoPhos(商標)が挙げられ、捕捉分子の検出に用いることができる。グルコースオキシダーゼは、グルコースを酸化し、グルコン酸と過酸化水素を発生する。過酸化水素は、例えば、過酸化水素検出用の比色プローブ(例えば、ペルオキシダーゼ)を用いて容易に検出できる。過酸化水素は、例えば、ペルオキシダーゼとその発色基質存在下において、発色させることができる。
標識としては、イムノクロマトアッセイにおいては、色素(例えば、着色料、例えば、金コロイド)を用いることができる。
ある態様では、第1の分子は、BC2LCNである。この態様では、BC2LCNとしては、組換えBC2LCNを用いることができる。BC2LCNは、直接固相化しても、例えば、ビオチン標識した上でストレプトアビジン(またはニュートラビジン)被覆された支持体に対して固相化してもよい。その他、BC2LCNをHaloTagタンパク質と融合させた上でHaloTagリガンドで被覆された支持体に固相化してもよい。また、BC2LCNにポリスチレンタグを融合させた上でポリスチレンプレートに直接固相化しても良い。サンドイッチアッセイにおいてもイムノクロマトアッセイにおいても、第1の分子がBC2LCNである場合、目的成分は、第1の分子であるBC2LCNと第2の分子であるBC2LCNの両方と同時に結合するものである。従って、第1の分子がBC2LCNであるサンドイッチアッセイおよびイムノクロマトアッセイにより検出される目的成分は、複数のBC2LCNと同時に結合することができる成分である。イムノクロマトアッセイにおいては、対照ラインには、BC2LCNに対する抗体や、H-type1糖鎖抗原やH-type3糖鎖抗原等のBC2LCNと結合する糖鎖抗原が固相化され得る。
ある態様では、第1の分子は、SerpinA3に結合する抗体である。この態様では、BC2LCN結合性の糖鎖を有するSerpinA3が検出されていると考えられる。SerpinA3に結合する抗体は、SerpinA3に対する結合性を指標として常法により調製することができる。
SerpinA3に結合する抗体は、BC2LCN結合性の糖鎖を有するSerpinA3に対する結合性を有することでさらに確認してもよい。BC2LCN結合性の糖鎖を有するSerpinA3は、実施例で用いたように、固相化したBC2LCNとSerpinA3に結合する抗体に反応する成分として精製することができる。SerpinA3に結合する抗体は、当該精製された成分に結合するか否かを指標として、選択してもよい。
第1の分子がSerpinA3に結合する抗体である態様において、第1の分子は、支持体(例えば、基板またはビーズ)に固相化され、第2の分子は、標識され得る;または、第1の分子は、標識され、第2の分子は、支持体に固相化され得る。
ある態様では、第1の分子は、Gal3BPに結合する抗体である。この態様では、BC2LCN結合性の糖鎖を有するGal3BPが検出されていると考えられる。Gal3BPに結合する抗体は、Gal3BPに対する結合性を指標として常法により調製することができる。
Gal3BPに結合する抗体は、BC2LCN結合性の糖鎖を有するGal3BPに対する結合性を有することでさらに確認してもよい。BC2LCN結合性の糖鎖を有するGal3BPは、実施例で用いたように、固相化したBC2LCNとGal3BPに結合する抗体に反応する成分として精製することができる。Gal3BPに結合する抗体は、当該精製された成分に結合するか否かを指標として、選択してもよい。
第1の分子がGal3BPに結合する抗体である態様において、第1の分子は、支持体(例えば、基板またはビーズ)に固相化され、第2の分子は、標識され得;または、第1の分子は、標識され、第2の分子は、支持体に固相化され得る。
本発明によれば、対象ががんであるか否かを予測する方法、対象ががんであるか否かの予備的情報を得る方法、対象ががんであるか否かを判定する方法、対象ががんであるか否かを予測するための方法若しくは予備的方法、対象においてがんを検出する方法、対象においてがん細胞を検出する方法、対象においてがんのバイオマーカーを検出する方法(バイオマーカーは、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、BC2LCN結合性のSerpinA3、およびBC2LCN結合性のGal3BPからなる群から選択される成分である)、または対象ががんであるか否かを分析する方法であって、
当該方法は、
生体サンプル(例えば、血液サンプル)中の成分(例えば、血液成分)の有無または濃度を分析することを含み、成分(例えば、血液成分)は、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、BC2LCN結合性のSerpinA3、およびBC2LCN結合性のGal3BPからなる群から選択される成分であるか;または
BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるサンドイッチアッセイまたはイムノクロマトアッセイによって、生体サンプル(例えば、血液サンプル)中に含まれる成分(例えば、血液成分)を分析することを含む、
方法が提供される。
当該方法は、
生体サンプル(例えば、血液サンプル)中の成分(例えば、血液成分)の有無または濃度を分析することを含み、成分(例えば、血液成分)は、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、BC2LCN結合性のSerpinA3、およびBC2LCN結合性のGal3BPからなる群から選択される成分であるか;または
BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるサンドイッチアッセイまたはイムノクロマトアッセイによって、生体サンプル(例えば、血液サンプル)中に含まれる成分(例えば、血液成分)を分析することを含む、
方法が提供される。
本発明によれば、対象の生体サンプル(例えば、血液サンプル)において成分(例えば、血液成分)を検出する方法であって、成分(例えば、血液成分)が、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、BC2LCN結合性のSerpinA3、およびBC2LCN結合性のGal3BPからなる群から選択される成分である方法が提供される。この方法は、BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを生体サンプル(例えば、血液サンプル)と接触させることと、その結果、形成された成分(例えば、血液成分)と第1の分子と第2の分子との複合体を検出することを含み得る。この方法は、BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるサンドイッチアッセイまたはイムノクロマトアッセイによって、前記成分(例えば、血液成分)を検出することを含み得る。
本発明によれば、BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを含み、第1の分子と第2の分子とを用いて対象の生体サンプル(例えば、血液サンプル)中の糖タンパク質の量を測定することができる、サンドイッチアッセイ用またはイムノクロマトアッセイ用のキットが提供される。本発明のキットにおいて、ある態様では、第1の分子は、基板またはストリップ上に固相化され、第2の分子は標識されている。本発明のキットにおいて、ある態様では、第1の分子は標識され、第2の分子は基板またはストリップ上に固相化されている。ある態様では、第1の分子は標識され、第2の分子はゲル中に含まれる、またはゲル上に固相化されている。本発明のキットは、標識が酵素抗体法で用いられる酵素である場合には、発色基質をさらに含んでいてもよい。生体サンプルが血液サンプルである場合、成分は血液成分である。
本発明のキットのある態様では、第1の分子は、BC2LCNである。本発明のある態様では、第1の分子は、SerpinA3に結合する抗体である。本発明のある態様では、第1の分子は、Gal3BPに結合する抗体である。
本発明のキットは、目的分子の検出、またはがんの検出、判定、予測、若しくは診断の用途において用いることができる。
本発明によれば、BC2LCN、SerpinA3に結合する抗体、およびGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子との組合せが提供される。本発明の組合せは、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、BC2LCN結合性のSerpinA3、およびBC2LCN結合性のGal3BPからなる群から選択される成分をサンプル中(例えば、生体サンプルまたは生体サンプル(例えば、血液サンプル))において検出することに用いることができる。上記組合せにおいては、第1の分子および第2の分子の一方は支持体に固相化されていてもよく、かつ、他方は検出のために標識されていてもよい。上記組合せは、生体サンプル(例えば、血液サンプル)を用いてがんを診断することに用いることができる。本発明によれば、上記組合せを含む、生体サンプル(例えば、血液サンプル)を用いてがんを診断することに用いるキットが提供される。上記組合せは、サンドイッチアッセイ用のキット、イムノクロマトアッセイ用のキット、レクチン電気泳動用のキット、質量分析用のキット、レクチンアフィニティークロマトグラフィー用のキットまたはμTAS用のキットであり得る。レクチン電気泳動用のキットは、レクチンを含むゲルを含んでいることができる。レクチンアフィニティークロマトグラフィー用のキットは、レクチンが固相化された支持体を含むカラムを含んでいることができる。これらのキットには、標準物質として、精製されたSerpinA3、精製されたBC2LCN結合性のSerpinA3、精製されたGal3BP、または精製されたBC2LCN結合性のGal3BPなどがさらに含まれていてもよい。μTAS用のキットは、マイクロ流体チップを含んでいてもよい。マイクロ流体チップは、検出部を有し、検出部には、SerpinA3、BC2LCN結合性のSerpinA3、Gal3BP、およびBC2LCN結合性のGal3BP、並びにこれらを含むタンパク質複合体からなる群から選択される1以上を結合する分子が固相化されていることができる。
本発明における
対象から得られた生体サンプルを分析する方法であって、
BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子、SerpinA3に結合する分子、およびGal3BPに結合する分子からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるアッセイによって、生体サンプル中に含まれる成分(「目的成分」ということがある)を分析することを含む、方法
では、アッセイによって得られるシグナルが、体内のがんが減少すること(例えば、がんが摘出されること)によって減少し得る。したがって、本発明の方法では、アッセイシグナルは、体内のがんの量を示し得る。また、上記方法では、アッセイによって得られるシグナルが、再発することによって増大し得る。したがって、本発明の方法では、シグナルが増大したことは、がんの再発を示し得る。
対象から得られた生体サンプルを分析する方法であって、
BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子、SerpinA3に結合する分子、およびGal3BPに結合する分子からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるアッセイによって、生体サンプル中に含まれる成分(「目的成分」ということがある)を分析することを含む、方法
では、アッセイによって得られるシグナルが、体内のがんが減少すること(例えば、がんが摘出されること)によって減少し得る。したがって、本発明の方法では、アッセイシグナルは、体内のがんの量を示し得る。また、上記方法では、アッセイによって得られるシグナルが、再発することによって増大し得る。したがって、本発明の方法では、シグナルが増大したことは、がんの再発を示し得る。
本発明によれば、対象から得られた生体サンプルから、2つのBC2LCNに同時に結合できる成分、SerpinA3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分を分離することを含む、方法が提供される。本発明によればまた、対象から得られた生体サンプルから、2つのBC2LCNに同時に結合できる成分、SerpinA3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分を検出することを含む、方法が提供される。本発明によればまた、
対象から得られた生体サンプルを分析する方法であって、
対象から得られた生体サンプル中の、2つのBC2LCNに同時に結合できる成分、SerpinA3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分を分離することを含む、
方法
が提供される。分離とは、それ以外の成分の少なくとも1以上から目的の成分を分離することを意味する。分離は、目的の成分の濃縮、富化、および精製を含み得る。濃縮は、濃度を高めることを意味する。富化および精製は、他の成分に対して目的の成分の存在比率を選択的に高めることを意味する。富化および精製は、目的の成分の濃縮を伴っていてもよい。分離はまた、固相化された分子に結合させることを含み得る。この場合、固相化された分子に結合することによって、結合しない他の成分から分離されている。分離は、目的の成分の固相化表面への吸着に加えて、吸着しなかった成分を除去することを含んでいてもよい。吸着しなかった成分の除去は、前記表面の洗浄によって行うことができる。吸着しなかった成分の除去はまた、液相の除去によって行うことができる。吸着しなかった成分の除去はまた、固相がビーズ表面上に存在する場合には、ビーズを回収することによって行ってもよい。この態様において、本発明は、分離された成分の量を測定することをさらに含んでいてもよい。測定は、種々の当業者に周知のアッセイによって行うことができ、これによりアッセイシグナルを得ることができる。測定された量は、指標となる他の量(例えば、カットオフ値)と比較することができる。カットオフ値は、上記で説明した通りであり得る。
対象から得られた生体サンプルを分析する方法であって、
対象から得られた生体サンプル中の、2つのBC2LCNに同時に結合できる成分、SerpinA3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分を分離することを含む、
方法
が提供される。分離とは、それ以外の成分の少なくとも1以上から目的の成分を分離することを意味する。分離は、目的の成分の濃縮、富化、および精製を含み得る。濃縮は、濃度を高めることを意味する。富化および精製は、他の成分に対して目的の成分の存在比率を選択的に高めることを意味する。富化および精製は、目的の成分の濃縮を伴っていてもよい。分離はまた、固相化された分子に結合させることを含み得る。この場合、固相化された分子に結合することによって、結合しない他の成分から分離されている。分離は、目的の成分の固相化表面への吸着に加えて、吸着しなかった成分を除去することを含んでいてもよい。吸着しなかった成分の除去は、前記表面の洗浄によって行うことができる。吸着しなかった成分の除去はまた、液相の除去によって行うことができる。吸着しなかった成分の除去はまた、固相がビーズ表面上に存在する場合には、ビーズを回収することによって行ってもよい。この態様において、本発明は、分離された成分の量を測定することをさらに含んでいてもよい。測定は、種々の当業者に周知のアッセイによって行うことができ、これによりアッセイシグナルを得ることができる。測定された量は、指標となる他の量(例えば、カットオフ値)と比較することができる。カットオフ値は、上記で説明した通りであり得る。
本発明の方法では、測定された量が、指標となる他の量と比較した多い場合には、生体サンプルが由来する対象ががんである可能性が示され得る。したがって、本発明の方法は、がんを検出する方法、がん細胞を検出する方法、がんであると診断する方法、がんであると診断するための非診断的な方法、がんであると診断するための予備的情報を得る方法、がんであると予測する方法、またはがんであると予測するための非診断的方法であり得る。本発明の方法では、アッセイによって得られるシグナルが、体内のがんが減少すること(例えば、がんが摘出されること)によって減少し得る。したがって、本発明の方法では、アッセイシグナルは、体内のがんの量を示し得る。また、上記方法では、アッセイによって得られるシグナルが、再発することによって増大し得る。したがって、本発明の方法では、シグナルが増大したことは、がんの再発を示し得る。本発明の方法は、異なる時点で回収された2以上の生体サンプルに対して実施することができる。したがって、ある態様では、生体サンプルは、異なる時点で回収された2以上の生体サンプルであり得る。ある態様では、本発明の方法は、アッセイによって得られるシグナル(測定された量に対応する)は、当該異なる時点で回収され得た別のサンプルにおいて得られたシグナルと比較することをさらに含んでいてもよい。このようにすることで、本発明は、患者のがんの治療過程および/または再発過程のモニタリングに用いることができる。
本発明の方法は、既存の方法と組み合わせて実施されてもよい。例えば、既存の方法として、体液サンプル中のCA19-9の量を測定することを含む方法が知られている。CA19-9は、がんを有する体液サンプル中で濃度を高めている。また、がんの量が増えるとその濃度が高まり、がんの量が減少するとその濃度が低下する。このように、CA19-9と本発明の方法とを組み合わせることで、体液サンプルの分析によるがんの検出の精度および/または特異度を高め得る。CA19-9は、膵がん、特に、ステージIIIおよびIVなどの膵がんの指標となり得る。したがって、本発明は、生体サンプル中のCA19-9の濃度を測定することをさらに含んでいてもよい。
測定されるSerpinA3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分は、BC2LCN結合性の糖鎖修飾を有することを指標としてさらに分析されてもよい。SerpinA3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分が、BC2LCN結合性の糖鎖修飾を有するか否かは、上述のように、当該糖修飾(糖鎖)に結合する因子を用いて決定することができる。あるいは、SerpinA3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分は、当該糖修飾(糖鎖)に結合する因子を用いて分離した後に検出されてもよい。SerpinA3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分は、SerpinA3に結合する分子およびGal3BPに結合する分子を用いて分離した後に検出されてもよい。
実施例1:がん患者の血清中の糖タンパク質のrBC2LCNを用いた検出
各種がんを有する患者の血清中の糖タンパク質をrBC2LCNによるサンドイッチアッセイによって検出した。
各種がんを有する患者の血清中の糖タンパク質をrBC2LCNによるサンドイッチアッセイによって検出した。
まず、ビオチン化rBC2LCNをPBSで0.3μg/mLに希釈し、50μL/wellでアビジンプレート(ブロッキングレスタイプ)(住友ベークライト社、BS-X7603)に添加し、室温で1時間インキュベートした。得られたrBC2LCN固相化プレートをPBS/0.1% Tween20で5回洗浄後、PBSで100倍希釈した各種がん患者の希釈血清50μL/well(n=3)と反応させた。室温1時間反応後、プレートをPBS/0.1% Tween20で5回洗浄して、HRP標識rBC2LCN(1μg/mL)を50μL/wellアプライし、室温1時間反応させた。PBS/0.1% Tween20で5回洗浄後、TMB solution(富士フィルム和光純薬)を50μL/wellアプライし、室温30分発色させて、1N HClを50μL/well反応させて発色反応を停止させ、OD450/620を測定した。得られた数値の平均を示した。本rBC2LCNによるサンドイッチアッセイにおいては、OD450/620の値が高いほど、rBC2LCNに結合する糖タンパク質が大量に存在していることを意味する。
結果は、図1に示される通りであった。図1に示されるように、rBC2LCNによるサンドイッチアッセイにより検出される糖タンパク質は、膵がん患者、結腸がん患者、膀胱がん患者、乳がん患者、非ホジキンリンパ腫患者、子宮体がん患者、卵巣がん患者、および慢性骨髄性白血病患者において、健常者群において認められた最大値よりも高い濃度を有することが明らかとなった。
検出された糖タンパク質は、固相化されたrBC2LCNと検出用のrBC2LCNの2分子と同時に結合することができなければならない。本実施例の結果から、2分子のrBC2LCNと同時に結合することができる成分(例えば、血液成分)が、がん患者において広く、健常者よりも高い濃度を有し、従って、成分(例えば、血液成分)の分析に有用であることが明らかとなった。
実施例2:rBC2LCNにより認識される糖タンパク質の同定
本実施例では、rBC2LCN結合ビーズで膵がん患者および健常者の血清中の糖タンパク質をそれぞれ沈降させ、沈降した糖タンパク質をrBC2LCNで溶出して、得られた溶出液を電気泳動し、膵がんに固有の糖タンパク質を質量分析により同定した。
本実施例では、rBC2LCN結合ビーズで膵がん患者および健常者の血清中の糖タンパク質をそれぞれ沈降させ、沈降した糖タンパク質をrBC2LCNで溶出して、得られた溶出液を電気泳動し、膵がんに固有の糖タンパク質を質量分析により同定した。
DynabeadsM280 Streptavidin (Invitrogen)にビオチン化rBC2LCNを結合させた。そして、膵がん及び健常者血清と4℃一晩インキュベートして、洗浄後、0.2Mフコースを添加して、室温1時間インキュベートすることで、rBC2LCNに結合した糖タンパク質を溶出した。得られた溶出液を電気泳動して、PVDF膜に転写後、HRP標識rBC2LCNでブロットした。その結果、健常者血清ではrBC2LCNブロットで反応性が見られなかったものの、膵がん血清では75-150kDa付近に反応性が認められた。そこで、電気泳動して銀染色したゲルから、100-150 kDaの赤で囲った部分を切り出した。切り出した各ゲル片からトリプシン加水分解を経てペプチド混合物を得た。ペプチド混合物をLC-MS/MSに供し、MS/MSデータを取得した。MS/MSデータのアミノ酸配列データベース検索の結果をペプチド同定一覧として出力した。その結果、SerpinA3とGal3BPがrBC2LCNによりがん患者において検出される候補タンパク質として取得された。
そこで、膵がん及び健常者血清からrBC2LCN固定化ビーズに結合性を示した糖タンパク質を電気泳動して、SerpinA3に対する抗体およびGal3BPに対する抗体とHRP標識2次抗体を用いてウエスタンブロットした。その結果、図3に示されるように、SerpinA3、およびGal3BPは、健常者と比べて膵がん患者血清で有意に強く検出された。SerpinA3とGal3BPは、rBC2LCNでビーズに吸着するタンパク質として得られたものであり、そのため、これら糖タンパク質はrBC2LCNに反応性であることがわかった。
正常な膵臓の組織と膵がんの組織とを患者から得て、免疫組織化学染色に供した。免疫組織化学染色は常法に基づいて行った。一次抗体としては、SerpinA3の染色に対しては、抗SerpinA3抗体(R&D Systems社製,製品番号:MAB12945、希釈倍率:200倍)を用い、Gal3BPの染色に対しては、抗Gal3BP抗体(R&D Systems社製,製品番号:AF2226、1 μg/mL)を用いた。また、二次抗体としては、それぞれビオチン化抗マウスIgG(ニチレイバイオサイエンス社製、製品番号:424021、希釈倍率:原液)、及びビオチン化抗ヤギIgG(ニチレイバイオサイエンス社製、製品番号:414011、希釈倍率:原液)を用いた。結果は、図9に示される通りであった。図9に示される通り、正常膵臓組織では、染色像がほとんど認められなかったのに対して、膵がん組織では、膵管においてSerpinA3とGal3BPが強く発現していることが明らかになった。
血液中で検出されるSerpinA3およびGal3BPは、膵がん組織の膵管に由来することが示唆される。
実施例3:rBC2LCNとSerpinA3抗体またはGal3BP抗体を用いたサンドイッチアッセイにおけるがん患者の血清の分析
そこで、rBC2LCNとSerpinA3抗体のサンドイッチアッセイを構築して、健常者、及び膵がんを含む各種がん患者の血清の解析を行った。ビオチン化rBC2LCNをPBSで0.3μg/mLに希釈し、50μL/wellでアビジンプレート(ブロッキングレスタイプ)(住友ベークライト社、BS-X7603)に添加し、室温で1時間インキュベートした。得られたrBC2LCN固相化プレートをPBS/0.1% Tween20で5回洗浄後、PBSで100倍希釈した各種がん患者の希釈血清50μL/well(n=3)と反応させた。室温1時間反応後、プレートをPBS/0.1% Tween20で5回洗浄して、HRP標識SerpinA3抗体(1μg/mL;R&D Systems,Cat#:AF1295)を50μL/wellアプライし、室温1時間反応させた。PBS/0.1% Tween20で5回洗浄後、TMB solution(富士フィルム和光純薬)を50μL/wellアプライし、室温30分発色させて、1N HCLを50μL/well反応させて発色反応を停止させ、OD450/620を測定した。得られた数値の平均を示した。
そこで、rBC2LCNとSerpinA3抗体のサンドイッチアッセイを構築して、健常者、及び膵がんを含む各種がん患者の血清の解析を行った。ビオチン化rBC2LCNをPBSで0.3μg/mLに希釈し、50μL/wellでアビジンプレート(ブロッキングレスタイプ)(住友ベークライト社、BS-X7603)に添加し、室温で1時間インキュベートした。得られたrBC2LCN固相化プレートをPBS/0.1% Tween20で5回洗浄後、PBSで100倍希釈した各種がん患者の希釈血清50μL/well(n=3)と反応させた。室温1時間反応後、プレートをPBS/0.1% Tween20で5回洗浄して、HRP標識SerpinA3抗体(1μg/mL;R&D Systems,Cat#:AF1295)を50μL/wellアプライし、室温1時間反応させた。PBS/0.1% Tween20で5回洗浄後、TMB solution(富士フィルム和光純薬)を50μL/wellアプライし、室温30分発色させて、1N HCLを50μL/well反応させて発色反応を停止させ、OD450/620を測定した。得られた数値の平均を示した。
結果は、図4に示される通りであった。図4に示されるように、rBC2LCNとSerpinA3抗体のサンドイッチアッセイにより検出される糖タンパク質(すなわち、BC2LCNレクチンと結合する特定の糖鎖を有するSerpinA3)は、健常者においてはほとんど検出することができなかった一方で、結腸がん、膵がん、膀胱がん、胃がん、小細胞肺がん、乳がん、非ホジキンリンパ腫、子宮頸部がん、直腸腺がん、幹細胞がん、甲状腺がん、前立腺がん、子宮体がん、メラノーマ、食道がん、卵巣がん、胆管がん、および慢性骨髄性白血病のすべて(調べたがんのすべて)において、強く検出された。
次にrBC2LCNとGal3BP抗体のサンドイッチアッセイを構築して、健常者、膵がんを含む各種がん患者の血清の解析を行った。ビオチン化rBC2LCNをPBSで0.3μg/mLに希釈し、50μL/wellでアビジンプレート(ブロッキングレスタイプ)(住友ベークライト社、BS-X7603)に添加し、室温で1時間インキュベートした。得られたrBC2LCN固相化プレートをPBS/0.1% Tween20で5回洗浄後、PBSで100倍希釈した各種がん患者の希釈血清50μL/well(n=3)と反応させた。室温1時間反応後、PBS/0.1% Tween20で5回洗浄して、HRP標識Gal3BP抗体(1μg/mL;R&D Systems,Cat#:AF2226)を50μL/wellアプライし、室温1時間反応させた。PBS/0.1% Tween20で5回洗浄後、TMB solution(富士フィルム和光純薬)を50μL/wellアプライし、室温30分発色させて、1N HCLを50μL/well反応させて発色反応を停止させ、OD450/620を測定した。得られた数値の平均でグラフを作成した。得られた数値の平均を示した。
結果は、図5に示される通りであった。図5に示されるように、rBC2LCNとGal3BP抗体のサンドイッチアッセイにより検出される糖タンパク質(すなわち、BC2LCNレクチンと結合する特定の糖鎖を有するGal3BP)は、健常者においてはほとんど検出することができなかった一方で、結腸がん、膵がん、膀胱がん、胃がん、小細胞肺がん、乳がん、非ホジキンリンパ腫、子宮頸部がん、直腸腺がん、幹細胞がん、甲状腺がん、前立腺がん、子宮体がん、メラノーマ、食道がん、卵巣がん、胆管がん、および慢性骨髄性白血病のすべて(調べたがんのすべて)において、強く検出された。
また、図10では、健常者、膵炎患者、および膵臓がん患者とで分けて、比較を行った。その結果、rBC2LCNとrBC2LCNのサンドイッチアッセイ、rBC2LCNと抗SerpinA3抗体とのサンドイッチアッセイ、rBC2LCNおよび抗Gal3BP抗体とのサンドイッチアッセイ、抗SerpinA3抗体と抗SerpinA3抗体とのサンドイッチアッセイにおいて、膵がん患者で、健常者や膵炎患者と比較して強いシグナルを検出した。このことから、これらのアッセイにより、膵臓がん患者を、健常者や膵炎患者とから区別できることが示唆された。
このことから、がん患者の血清において広く、BC2LCNレクチンと結合する特定の糖鎖を有するSerpinA3及びBC2LCNレクチンと結合する特定の糖鎖を有するGal3BPが存在することが明らかとなった。
さらに、他の健常者の血清検体および膵がん患者の血清検体を用いて、上記に記載された通りの方法で、rBC2LCNとrBC2LCNによるサンドイッチアッセイ、rBC2LCNと抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ、rBC2LCNと抗Gal3BP抗体によるサンドイッチアッセイ、および抗SerpinA3抗体(R&D Systems,Cat#:AF1295)と抗SerpinA3抗体(R&D Systems,Cat#:AF1295)によるサンドイッチアッセイを実施した。
結果は、図6に示される通りであった。図6に示されるように、rBC2LCNとrBC2LCNによるサンドイッチアッセイ、rBC2LCNと抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ、およびrBC2LCNと抗Gal3BP抗体によるサンドイッチアッセイにおいては、健常者の血清よりも、膵がん患者の血清においてサンドイッチアッセイで高い測定強度が得られた。これに対して、抗SerpinA3抗体と抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイでは、健常者と膵がん患者の血清とで測定強度が同等であった。このことは、健常者血清においても、膵がん患者の血清においても、SerpinA3は存在するが、膵がん患者において特異的にSerpinA3がrBC2LCNによって認識可能な糖による修飾を受けていることを示唆する結果である。
上記で得られた結果を解析し、特異度(Specificity)を横軸とし、感度(Sensitivity)を縦軸として、ROC曲線を描いた。結果は、図7に示される通りであった。
図7の左上パネルに示されるように、rBC2LCNとrBC2LCNによるサンドイッチアッセイ(rBC2-rBC2)では、ROC曲線下面積(AUC)が0.679であり、当該ROC曲線におけるカットオフ(感度1、特異度1からの最短距離にあるROC曲線状の点から求められる)は0.329であり、そのときの特異度は0.820であり、感度は0.575であった。
図7の右上パネルに示されるように、rBC2LCNと抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ(rBC2-SerpinA3)では、ROC曲線下面積(AUC)が0.892であり、当該ROC曲線におけるカットオフ(感度1、特異度1からの最短距離にあるROC曲線状の点から求められる)は0.014であり、そのときの特異度は0.840であり、感度は0.825であった。
図7の左下パネルに示されるように、rBC2LCNと抗Gal3BP抗体によるサンドイッチアッセイ(rBC2-Gal3BP)では、ROC曲線下面積(AUC)が0.743であり、当該ROC曲線におけるカットオフ(感度1、特異度1からの最短距離にあるROC曲線状の点から求められる)は0.01であり、そのときの特異度は0.900であり、感度は0.575であった。
さらに、図7の右下パネルに示されるように、抗SerpinA3抗体と抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ(SerpinA3-SerpinA3)では、ROC曲線下面積(AUC)が0.718であり、当該ROC曲線におけるカットオフ(感度1、特異度1からの最短距離にあるROC曲線状の点から求められる)は1.056であり、そのときの特異度は0.8であり、感度は0.65であった。
図7の左上パネルに示されるように、rBC2LCNとrBC2LCNによるサンドイッチアッセイ(rBC2-rBC2)では、ROC曲線下面積(AUC)が0.679であり、当該ROC曲線におけるカットオフ(感度1、特異度1からの最短距離にあるROC曲線状の点から求められる)は0.329であり、そのときの特異度は0.820であり、感度は0.575であった。
図7の右上パネルに示されるように、rBC2LCNと抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ(rBC2-SerpinA3)では、ROC曲線下面積(AUC)が0.892であり、当該ROC曲線におけるカットオフ(感度1、特異度1からの最短距離にあるROC曲線状の点から求められる)は0.014であり、そのときの特異度は0.840であり、感度は0.825であった。
図7の左下パネルに示されるように、rBC2LCNと抗Gal3BP抗体によるサンドイッチアッセイ(rBC2-Gal3BP)では、ROC曲線下面積(AUC)が0.743であり、当該ROC曲線におけるカットオフ(感度1、特異度1からの最短距離にあるROC曲線状の点から求められる)は0.01であり、そのときの特異度は0.900であり、感度は0.575であった。
さらに、図7の右下パネルに示されるように、抗SerpinA3抗体と抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ(SerpinA3-SerpinA3)では、ROC曲線下面積(AUC)が0.718であり、当該ROC曲線におけるカットオフ(感度1、特異度1からの最短距離にあるROC曲線状の点から求められる)は1.056であり、そのときの特異度は0.8であり、感度は0.65であった。
上記結果からは、rBC2LCNと抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ(rBC2-SerpinA3)が、最も優れた精度を有し、rBC2LCNと抗Gal3BP抗体によるサンドイッチアッセイ(rBC2-Gal3BP)が、最も優れた特異度を示すことが明らかとなった。また、rBC2LCNとrBC2LCNによるサンドイッチアッセイ(rBC2-rBC2)や、抗SerpinA3抗体と抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ(SerpinA3-SerpinA3)でも、一定の有用性を有する精度を示すことが明らかとなった。
さらに、健常者(n=49)および膵炎患者(n=9)と膵がん患者(n=85)とを区別できる否かをROC曲線を作成して検討した。すると、図11に示されるように、rBC2LCNと抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ(rBC2-SerpinA3)とrBC2LCNと抗Gal3BP抗体によるサンドイッチアッセイ(rBC2-Gal3BP)が、最も優れたAUCを示すことが明らかとなった。また、rBC2LCNとrBC2LCNによるサンドイッチアッセイ(rBC2-rBC2)や、抗SerpinA3抗体と抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ(SerpinA3-SerpinA3)でも、一定の有用性を有することが明らかとなった。
実施例5:ステージ別膵がん患者の血清の分析
本実施例では、ステージ1Aからステージ4までの様々な膵がんを有する患者の血清検体を、サンドイッチアッセイによって評価した。
本実施例では、ステージ1Aからステージ4までの様々な膵がんを有する患者の血清検体を、サンドイッチアッセイによって評価した。
がんのステージは、UICC TNM分類(UICC: TNM Classification of Malignant Tumours, 8th Edn. Wiley-Blackwell; 2017.94-95)に基づいて医師が決定した。がん患者の血清を実施例1および3の記載の通りに、rBC2LCNとrBC2LCNによるサンドイッチアッセイ、rBC2LCNと抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ、rBC2LCNと抗Gal3BP抗体によるサンドイッチアッセイ、および抗SerpinA3抗体と抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイにそれぞれ供した。結果は、図8A~8Dに示される通りであった。
図8A~8Cに示されるように、rBC2LCNとrBC2LCNによるサンドイッチアッセイ、rBC2LCNと抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ、およびrBC2LCNと抗Gal3BP抗体によるサンドイッチアッセイでは、ステージ1から4までのすべてのステージにおいて、高い測定強度を示すサンプルが認められた。
図8Dに示されるように、抗SerpinA3抗体と抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイでは、図6で示されたのと同様に、すべてのサンプルにおいて高い測定強度が示された。
図8Dに示されるように、抗SerpinA3抗体と抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイでは、図6で示されたのと同様に、すべてのサンプルにおいて高い測定強度が示された。
ステージIの膵がん患者(n=9)と健常者(n=49)との間でROC曲線を作成した。結果は、図12に示される通りであった。図12に示されるように、いずれのサンドイッチアッセイにおいても、ステージIの膵がん患者を良好に検出することができた。ステージIIの膵がん患者(n=51)と健常者(n=49)との間でROC曲線を作成した。結果は、図13に示される通りであった。図13に示されるように、いずれのサンドイッチアッセイにおいても、ステージIIの膵がん患者を良好に検出することができた。ステージIIIの膵がん患者(n=8)と健常者との間(n=49)のROC曲線を作成した。結果は、図14に示される通りであった。図14に示されるように、示されるいずれのサンドイッチアッセイにおいても、ステージIIIの膵がん患者を良好に検出することができた。ステージIVの膵がん患者(n=17)と健常者(n=49)との間のROC曲線を作成した。結果は、図15に示される通りであった。図15に示されるように、示されるいずれのサンドイッチアッセイにおいても、ステージIVの膵がん患者を良好に検出することができた。
膵がん患者に対して膵がんの摘出手術を実施した。術前と術後の血液サンプル(n=38)についてサンドイッチアッセイで分析した。rBC2LCNと抗SerpinA3抗体とのサンドイッチアッセイの結果は図16に示され、rBC2LCNと抗Gal3BP抗体とのサンドイッチアッセイの結果は図17に示され、CA19-9アッセイの結果は図18に示された。それぞれの図において、30PODは術後30日を意味し、3mは術後3ヶ月を意味する。図16~18に示されるように、各サンドイッチアッセイのシグナルは、がんの摘出術によって低下した。したがって、これらのアッセイでは、がんの摘出の結果が、血液中の成分含量に影響することが理解できる。
さらに、再発した患者の血液サンプルを経時的にアッセイした。アッセイは、BC2LCNと抗SerpinA3抗体を用いたサンドイッチアッセイとした。結果は図19に示される通りであった。図19に示されるように、患者Aにおいては、手術後、時間経過と共にアッセイのシグナルが低下した。しかしながら、再発した患者Aの血液を分析すると、シグナルが顕著に増大していた。このことから、本発明のアッセイ系は、再発の検出に用いることができることが示唆された。
このことから、rBC2LCNとrBC2LCNによるサンドイッチアッセイ、rBC2LCNと抗SerpinA3抗体によるサンドイッチアッセイ、およびrBC2LCNと抗Gal3BP抗体によるサンドイッチアッセイでは、適切にカットオフ値を設定することによってステージ1および2などの早期膵がんからステージ4の膵がんまでを幅広く検出することができる。
Claims (23)
- 対象から得られた生体サンプルを分析する方法であって、
BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子、SerpinA3に結合する分子、およびGal3BPに結合する分子からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCNである第2の分子とを用いて実施されるアッセイによって、生体サンプル中に含まれる成分を分析することを含む、方法。 - 第1の分子がSerpinA3に結合する抗体である、請求項1に記載の方法。
- 第1の分子がGal3BPに結合する抗体である、請求項1に記載の方法。
- 第1の分子がBC2LCNである、請求項1に記載の方法。
- 対象が、がんを有する、またはその可能性を有する、請求項1~4のいずれか一項に記載の方法。
- 対象が、膵がんを有する、またはその可能性を有する、請求項5に記載の方法。
- 対象が、ステージ1または2の膵がんを有する、またはその可能性を有する、請求項6に記載の方法。
- BC2LCN、SerpinA3に結合する分子、およびGal3BPに結合する分子からなる群から選択される第1の分子と、BC2LCN結合性の糖鎖に結合する分子である第2の分子とを含み、第1の分子と第2の分子とを用いて対象の生体サンプル中の糖タンパク質の量を測定することができる、サンドイッチアッセイ用のキット、イムノクロマトアッセイ用のキット、レクチン電気泳動用のキット、質量分析用のキット、レクチンアフィニティークロマトグラフィー用のキットまたはμTAS用のキット。
- 第1の分子がSerpinA3に結合する抗体であり、糖タンパク質におけるタンパク質部分がSerpinA3である、請求項8に記載のキット。
- 第1の分子がGal3BPに結合する抗体であり、糖タンパク質におけるタンパク質部分がGal3BPである、請求項8に記載のキット。
- 固相化されたBC2LCNである第2の分子と、標識されたBC2LCN、標識されたSerpinA3に結合する抗体、および標識されたGal3BPに結合する抗体からなる群から選択される標識された第1の分子とを含む、請求項8に記載のキット。
- がんを検出することに用いられる、請求項8~11のいずれか一項に記載のキット。
- がんが、膵がんである、請求項12に記載のキット。
- がんが、ステージ1または2の膵がんである、請求項13に記載のキット。
- 対象ががんであるか否かを予測する方法であって、請求項1~7のいずれか一項に記載の方法を実施することを含む、方法。
- 対象から得られた生体サンプル中において特定成分を検出する方法であって、
特定成分は、2つのBC2LCNを同時に結合することができる成分、BC2LCN結合性のSerpinA3、およびBC2LCN結合性のGal3BPからなる群から選択される成分である、方法。 - 対象から得られた生体サンプルから2つのBC2LCNに同時に結合できる成分、SerpinA3およびGal3BPからなる群から選択される1以上の成分を分離することを含む、方法。
- 対象が、膵がんまたは膵がんを有する可能性を有する対象である、請求項17に記載の方法。
- 膵がんが、ステージIまたはIIの膵がんである、請求項17に記載の方法。
- 分離された成分の量を測定することをさらに含む、請求項17~19のいずれか一項に記載の方法。
- カットオフ値と前記測定された成分の量とを比較することをさらに含む、請求項20に記載の方法。
- カットオフ値が、健常者の前記測定された成分に対応する成分の量の平均値以上の値であり、膵がん患者の前記測定された成分に対応する成分の量の平均値以下の値である、請求項21に記載の方法。
- 前記成分が、BC2LCN結合性のSerpinA3、およびBC2LCN結合性のGal3BPからなる群から選択される成分である、請求項17~22のいずれか一項に記載の方法。
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