WO2018043972A2 - 신규한 비브리오 앵길라룸 박테리오파지 Vib-ANP-1 및 이의 비브리오 앵길라룸 균 증식 억제 용도 - Google Patents
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Definitions
- the present invention relates to a method for preventing and treating infection of Vibrio anguillalum using a bacteriophage isolated from nature capable of killing Vibrio anguillalum and killing Vibrio anguillalum and a composition comprising the same as an active ingredient. More specifically, the sipovirida bacteriophage Vib-ANP-1 isolated from nature characterized by having a genome represented by SEQ ID NO: 1 having the ability to specifically kill Vibrio anguillalum bacteria. No. KCTC 13075BP), and a method for preventing and post-infection treatment of Vibrio anguillalum bacteria using the composition comprising the bacteriophage as an active ingredient.
- Vibrio anguillarum a genus of Vibrio, is a Gram-negative bacillus that causes Vibriosis with hemorrhagic septicemia in flounder, salmon, fish, eel, and various marine fish. It is known as a representative fish pathogen.
- serotypes of Vibrio anguillalum have been found to date, there are 23 types of antigens, but most of the Vibrio anguillalum pathogenic strains causing fish Vibrio disease are O1 antigen type, which is a bacterial antigen (Somatic, O antigen). And O2 antigen types.
- Vibrio anguillalum causes vibrio disease in a variety of fish, causing serious economic damage to the aquaculture industry.
- vibrio disease of fish caused by Vibrio anguillalum infection is caused by high incidence of economic damage. Therefore, the development of a method that can be used to prevent the infection of Vibrio anguillalum, and further treatment.
- Antibiotics are widely used to suppress and treat infections caused by Vibrio anguillalum, and the effects of antibiotic-resistant bacteria continue to diminish, and the development of other effective methods besides antibiotics has been reinforced by tightening regulations on the use of antibiotics in cultured fish. This situation is required. In particular, there is a great demand for a natural way.
- Bacteriophages are tiny microorganisms that infect bacteria, often called phage. Bacteriophages have the ability to infect bacteria and multiply inside bacterial cells, and kill off bacteria by destroying the cell wall of the host bacteria when the progeny bacteriophages come out of the bacteria.
- Bacteriophage bacterial infections are highly specific, so there are only a few types of bacteriophages that can infect certain bacteria. That is, certain bacteriophages can infect only a specific category of bacteria, so that certain bacteriophages kill only certain bacteria and do not affect other bacteria. Due to the bacterial specificity of these bacteriophages, bacteriophages only provide an antimicrobial effect against the target bacteria and do not affect the environment or flora in fish. Conventional antibiotics, which are commonly used to treat bacteria, have simultaneously affected several types of bacteria. This caused problems such as environmental pollution and disturbance of normal flora in animals. In contrast, bacteriophages operate only on specific bacteria, so the use of bacteriophages does not cause normal bacterial total disturbances in the body. Therefore, the use is very safe compared to the use of antibiotics, and the likelihood of side effects from the use is relatively low.
- Bacteriophage is a British bacteriologist Twort 1915 became discovered while conducting research on Staphylococcus aureus (Micrococcus) melting the colonies are transparent by any developer.
- French bacteriologist d'Herelle discovered that some of the filtrates of ill feces dissolve Shigella dysenteriae and found that they independently discovered bacteriophages. In the sense, they named it bacteriophage. Since then, bacteriophages have been found for many pathogenic bacteria such as dysentery, typhoid, and cholera.
- bacteriophages Because of its special ability to kill bacteria, bacteriophages have been expected to be an effective way to combat bacterial infections since their discovery and many studies have been done. However, after the discovery of penicillin by Fleming, with the widespread use of antibiotics, research on bacteriophages has been limited to some Eastern European countries and the Soviet Union. However, since 2000, due to the increase of antibiotic-resistant bacteria, the limit of existing antibiotics appears, and as the possibility of developing an alternative to the existing antibiotics is highlighted, bacteriophage is attracting attention as an anti-bacterial agent. In particular, with the recent tightening of government-wide regulations on the use of antibiotics, interest in bacteriophages is increasing and industrial use cases are gradually increasing.
- bacteriophages have a very high specificity for bacteria. Due to this specificity, bacteriophages often exert an antimicrobial effect on only some strains of bacteria belonging to the same species. In addition, as the bacteriophages differ, the antibacterial activity of the bacteriophage exerted against the same bacterial strain may vary. For this reason, it is necessary to secure various kinds of useful bacteriophages in order to secure an effective control method for a specific species of bacteria. In order to develop effective bacteriophage in response to Vibrio anguillalum, of course, it is necessary to secure various kinds of useful bacteriophages that can provide antimicrobial effects against Vibrio anguillalum, and furthermore, to obtain various useful bacteriophages. Among them, screening and utilization of bacteriophage, which is comparatively superior in terms of strength and antimicrobial range, is also required.
- the present inventors have developed a composition that can be used to prevent or treat the infection of Vibrio anguillalum by using bacteriophages isolated from nature capable of selectively killing Vibrio anguillalum. After trying to develop a method for preventing or treating the infection of Vibrio anguillalum by using the composition, it is possible to isolate the bacteriophage from nature and to separate the bacteriophage from other bacteriophages. After securing the gene sequence, the present invention was completed by developing a composition using the bacteriophage as an active ingredient, and then confirming that the composition can be effectively used for preventing and treating Vibrio anguillalum.
- an object of the present invention is Siphoviridae bacteriophage Vib- ANP- isolated from nature, which has a genome represented by SEQ ID NO: 1 having the ability to specifically kill Vibrio anguillalum . 1 (Accession No. KCTC 13075BP).
- Another object of the present invention is to prevent the infection of Vibrio anguillalum bacteria containing bacteriophage Vib-ANP-1, which can kill Vibrio anguillalum bacteria and kill Vibrio anguillalum bacteria, as an active ingredient. It is to provide a possible composition and a method for preventing infection of Vibrio anguillalum using the composition.
- Another object of the present invention is used to treat the infection of Vibrio anguillalum, including bacteriophage Vib-ANP-1, which can kill Vibrio anguillalum and kill Vibrio anguillalum. It is possible to provide a possible composition and a method for treating infection of Vibrio anguillalum using the composition.
- Still another object of the present invention is to provide a bath for the purpose of preventing infection and treatment of Vibrio anguillalum bacteria using the compositions.
- Another object of the present invention to provide a feed additive for the purpose of providing a specification effect through the prevention and treatment of infection of Vibrio anguillalum bacteria using the compositions.
- the present invention is Sibivirida bacteriophage Vib-ANP-1 (Accession No. KCTC 13075BP) isolated from nature, characterized by having a genome represented by SEQ ID NO: 1 having the ability to specifically kill Vibrio anguillalum ), And a method for preventing and treating infection of Vibrio anguillalum using the composition comprising the same as an active ingredient.
- Bacteriophage Vib-ANP-1 was isolated by the inventors and deposited in the Korea Institute of Biotechnology and Biotechnology Center on August 16, 2016 (Accession No. KCTC 13075BP).
- the present invention also provides a bath and feed additive comprising bacteriophage Vib-ANP-1 as an active ingredient that can be used to prevent or treat the infection of Vibrio anguillalum.
- Bacteriophage Vib-ANP-1 contained in the composition of the present invention effectively kills Vibrio anguillalum, and thus has an effect on prevention (infection prevention) or treatment (infection treatment) of diseases caused by Vibrio anguillalum. Therefore, the composition of the present invention can be used for the purpose of preventing and treating diseases caused by Vibrio anguillalum.
- prevention refers to (i) prevention of Vibrio anguillalum bacterial infection; And (ii) inhibiting the development into a disease caused by Vibrio anguillalum bacterial infection.
- treatment refers to (i) suppression of diseases caused by Vibrio anguillalum; And (ii) all actions to alleviate the pathological condition of the disease caused by Vibrio anguillalum.
- isolated refers to the separation of bacteriophages from the natural state by using various experimental techniques and to secure features that can be used to specify the target bacteriophages different from other bacteriophages. In addition, biotechnology can be used to multiply the target bacteriophage for industrial use.
- compositions of the present invention are those commonly used in the preparation, such as lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, starch, acacia rubber, calcium phosphate, alginate, gelatin, calcium silicate, Microcrystalline cellulose, polyvinylpyrrolidone, cellulose, water, syrup, methyl cellulose, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate and mineral oil, and the like, but are not limited to these. .
- the composition of the present invention may further include lubricants, wetting agents, sweeteners, flavoring agents, emulsifiers, suspending agents, preservatives and the like in addition to the above components.
- the composition of the present invention includes bacteriophage Vib-ANP-1 as an active ingredient.
- the bacteriophage Vib-ANP-1 included at this time is included in 1 ⁇ 10 1 pfu / ml to 1 ⁇ 10 30 pfu / ml or 1 ⁇ 10 1 pfu / g to 1 ⁇ 10 30 pfu / g, preferably 1 ⁇ . 10 4 pfu / ml to 1 ⁇ 10 15 pfu / ml or 1 ⁇ 10 4 pfu / g to 1 ⁇ 10 15 pfu / g.
- compositions of the present invention may be prepared in unit dosage form by being formulated with pharmaceutically acceptable carriers and / or excipients, according to methods which may be readily practiced by those skilled in the art. It may also be prepared by incorporation into a multi-dose container.
- the formulations here may be in the form of solutions, suspensions or emulsions in oils or aqueous media or in the form of extracts, powders, granules, tablets or capsules, and may further comprise dispersants or stabilizers.
- composition of the present invention may be implemented as a bath and feed additives.
- Bacteriophages that can provide antimicrobial activity against other bacterial species can be added to the composition of the present invention in order to increase the efficiency in this application.
- other kinds of bacteriophages having antimicrobial activity against Vibrio anguillalum may be added. Even bacteriophages that have antimicrobial activity against Vibrio anguillalum may differ in terms of strength and antimicrobial range of antimicrobial activity, so a proper combination of these can maximize the effect.
- the present invention can also provide the advantage of being very natural because it is used as an active ingredient of the composition to separate the bacteriophage already present in nature.
- bacteriophage is like a bacterial species that can exert its antimicrobial activity
- the antibacterial activity of the bacteriophage against individual bacterial strains in terms of the strength of the antimicrobial activity and the antimicrobial range [strains of several strains belonging to Vibrio anguillalum] Range of activity.
- bacteriophages can exert antimicrobial activity against some strains belonging to the same bacterial species. That is, even if they belong to the same bacterial species, there may be a difference in sensitivity to bacteriophages according to individual bacterial strains]. Therefore, the present invention provides a differential antimicrobial effect compared to other bacteriophages having antimicrobial activity against Vibrio anguillalum. Can be provided. This makes a big difference in the effectiveness of industrial sites.
- Figure 2 is an experimental result showing the killing ability against Vibrio anguillalum bacteria of bacteriophage Vib-ANP-1. Based on the middle line of the plate medium, the left side is only a buffer containing no bacteriophage Vib-ANP-1, and the right side is a liquid containing bacteriophage Vib-ANP-1. The transparent part on the right is the lysate plaque formed by the bacteria under test lysed by the action of bacteriophage Vib-ANP-1.
- Example 1 vibrio Anguilla Room Isolation of Bacteriophage Can Kill Bacteria
- Vibrio anguillalum strains used for bacteriophage separation are those previously identified by the present inventors and identified as Vibrio anguillalum.
- LB Lia-Bertani
- tryptone 10 g / L
- yeast extract 5 g / L
- sodium chloride 10 g
- Vibrio anguillalum 1 / 1,000 ratio / L
- collected samples were added together and then shaken for 3-4 hours at 30 °C.
- the supernatant was recovered by centrifugation at 8,000 rpm for 20 minutes.
- the recovered supernatants were inoculated with Vibrio anguillalum at a rate of 1 / 1,000 and then incubated again at 30 ° C. for 3-4 hours.
- bacteriophage When bacteriophage was included in the sample, this process was repeated five times in order to sufficiently increase the number of bacteriophages (Titer). After five repetitions, the culture was centrifuged at 8,000 rpm for 20 minutes. After centrifugation, the recovered supernatant was filtered using a 0.45 ⁇ m filter. The usual spot assay using the filtrate thus obtained was carried out to determine whether there were bacteriophages capable of killing Vibrio anguillalum.
- the drip experiment was conducted as follows. Vibrio anguillalum bacteria were inoculated in LB medium at a rate of 1 / 1,000 and then shaken at 30 ° C. for one night. 3 ml of the Vibrio anguillalum fungus prepared in this way (OD 600 1.5) were transferred to Luria-Bertani Agar (LA) plate medium (tryptone, 10 g / L; yeast extract, 5 g / L; sodium chloride, 10 g). / L; agar, 15 g / L). The plated flat medium was left in a clean bench for about 30 minutes to allow the smear to dry.
- LA Luria-Bertani Agar
- the filtrate in which the transparent ring is formed contains bacteriophages capable of killing Vibrio anguillalum. Through this investigation, it was possible to obtain a filtrate including bacteriophages having the ability to kill Vibrio anguillalum.
- Pure bacteriophage separation was carried out using a filtrate confirmed the presence of bacteriophages having killing ability against Vibrio anguillalum.
- a conventional Plaque assay was used for pure bacteriophage separation. To explain this in detail, one of the lytic plaques formed in the lytic plaque assay was recovered using a sterile tip, and then added to Vibrio anguillalum culture medium and incubated together at 30 ° C. for 4-5 hours. After incubation, the supernatant was obtained by centrifugation at 8,000 rpm for 20 minutes. Vibrio anguillalum culture medium was added to the obtained supernatant at a volume of 50/50 and then incubated at 30 ° C for 4-5 hours.
- this procedure was performed at least five times, and finally, the supernatant was obtained by centrifugation at 8,000 rpm for 20 minutes. Using the obtained supernatant, lysis plate analysis was performed again. Since the separation of the pure bacteriophage is usually not achieved only once in the above process, the previous step was repeated again using the lysate formed. This process was repeated at least five times to obtain a solution containing pure bacteriophage. Typically, the separation of the pure bacteriophage was repeated until both the size and shape of the lysate formed were similar. Finally, electron microscopic analysis confirmed the pure separation of bacteriophages. The procedure described above was repeated until pure separation was confirmed by electron microscopy analysis.
- Electron microscopic analysis was performed according to a conventional method. This is briefly described as follows. The solution containing the pure bacteriophage was buried in a copper grid, subjected to reverse staining and drying with 2% uranyl acetate, and its shape was observed through a transmission electron microscope. Electron micrographs of purely isolated bacteriophages are shown in FIG. 1. Judging from the morphological features, the newly acquired bacteriophage belonged to Siphoviridae bacteriophage.
- the solution containing pure bacteriophage identified in this way was subjected to the following purification process.
- Vibrio anguillalum culture medium was added at a volume of 1/50 of the total volume of the solution, and then incubated again for 4-5 hours. After incubation, the supernatant was obtained by centrifugation at 8,000 rpm for 20 minutes. This procedure was repeated a total of five times to obtain a solution containing a sufficient number of bacteriophages.
- the supernatant obtained by the final centrifugation was filtered using a 0.45 ⁇ m filter followed by a conventional polyethylene glycol (PEG) precipitation process.
- PEG polyethylene glycol
- PEG and NaCl were added to 100 ml of the filtrate to be 10% PEG 8000 / 0.5 M NaCl, and then allowed to stand at 4 ° C. for 2-3 hours, followed by centrifugation at 8,000 rpm for 30 minutes to obtain a bacteriophage precipitate.
- the bacteriophage precipitate thus obtained was suspended in 5 ml of buffer (Buffer; 10 mM Tris-HCl, 10 mM MgSO 4 , 0.1% Gelatin, pH 8.0). This is called bacteriophage suspension or bacteriophage solution.
- Example 2 bacteriophage Vib - ANP -1 genome isolation and sequencing
- the genome of bacteriophage Vib-ANP-1 was isolated as follows. Bacteriophage suspension obtained in the same manner as in Example 1 was used for dielectric separation. First, in order to remove DNA and RNA of Vibrio anguillalum bacteria which may be contained in the suspension, 200 U of each of DNase I and RNase A was added to 10 ml of the bacteriophage suspension, followed by standing at 37 ° C for 30 minutes. In order to remove the activity of DNase I and RNase A after 30 minutes, 500 ⁇ l of 0.5 M ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) was added and allowed to stand for 10 minutes. The mixture was left at 65 ° C.
- EDTA ethylenediaminetetraacetic acid
- genome sequence information of bacteriophage Vib-ANP-1 was obtained by performing next generation sequencing analysis using an illumina Mi-Seq instrument in Macrogen. Finally, the analyzed bacteriophage Vib-ANP-1 genome has a size of 213,970 bp and the entire genome sequence is set forth in SEQ ID NO: 1.
- the bacteriophage Vib-ANP-1 could be considered as a novel bacteriophage that has not been reported previously. With this fact, it is determined that the bacteriophage Vib-ANP-1 can provide different antimicrobial effects from other bacteriophages that have been previously reported from the fact that different kinds of bacteriophages have different strengths and antimicrobial ranges.
- Example 3 bacteriophage Vib - ANP Vibrio of -1 Anguilla Room against fungi Death Research
- the killing ability of the isolated bacteriophage Vib-ANP-1 against Vibrio anguillalum was investigated.
- the killing ability was investigated in a manner to investigate the formation of transparent rings through the drip experiment shown in Example 1.
- the Vibrio anguillalum bacteria used for the killing ability investigation were separated by the present inventors and were identified as Vibrio anguillalum bacteria for a total of 17 weeks.
- Bacteriophage Vib-ANP-1 had the killing ability for 16 of the 17 strains of Vibrio anguillalum. Representative experimental results are shown in FIG. 2.
- the bacteriophage Vib-ANP-1 has a specific killing ability against Vibrio anguillalum, and it can be confirmed that the bacteriophage Vib-ANP-1 can exhibit an antimicrobial effect against a number of Vibrio anguillalum. This means that the bacteriophage Vib-ANP-1 can be utilized as an active ingredient for the composition for preventing and treating infections of Vibrio anguillalum.
- Example 4 bacteriophage Vib - ANP Vibrio of -1 Anguilla Room For the prevention of bacterial infection Experimental Example
- Vibrio anguillalum bacteria were added to each tube so that the absorbance at about 600 nm was about 0.5. After the Vibrio anguillalum was added, the tubes were transferred to a 30 ° C. incubator and shaken to observe the growth state of the Vibrio Anguillalum.
- the bacteriophage Vib-ANP-1 of the present invention not only inhibits the growth of Vibrio anguillalum but also has the ability to kill, and from this, the bacteriophage Vib-ANP-1 is Vibrio anguillalum It can be concluded that it can be used as an active ingredient of a composition for the purpose of preventing infection of.
- Example 5 bacteriophage Vib - ANP Vibrio with -1 Anguilla Room Infection prevention animal experiment
- bacteriophage Vib-ANP-1 The effect of bacteriophage Vib-ANP-1 on the prevention of Vibrio anguillalum infection was investigated using olive flounder.
- Flounder fry (weight: 5-7 g, body length: 8-10 cm) was divided into two groups of 50 rats, and then separated and bred in a tank for 14 days. The environment of the bath was controlled and the temperature of the laboratory containing the bath was kept constant. From the start of the experiment, the flounder of the experimental group (bacteriophage administration group) was fed a feed containing 1 ⁇ 10 8 pfu / g of bacteriophage Vib-ANP-1 according to the conventional feeding method.
- the flounder of the control group was fed in the same manner to feed of the same composition without the bacteriophage Vib-ANP-1.
- Vibrio anguillalum bacteria were fed twice a day to induce Vibrio anguillalum infection by incorporating Vibrio anguillalum into the feed at a level of 1 ⁇ 10 8 cfu / g for 2 days from the day of the test. From the 9th day from the start of the test (2 days after the induction of the Vibrio anguillalum infection), all the test animals were examined for the incidence of Vibrio disease. Vibrio disease incidence was investigated by measuring body color blackening index. The body color blackening index was measured by measuring the dark coloration (DC) score (normal: 0, light blackening: 1, dark blackening: 2) which is commonly used. The results were shown in Table 2.
- DC dark coloration
- Body color blackening index measurement result (average value) DC score (mean) date D9 D10 D11 D12 D13 D14 Control group (not administered bacteriophage) 0.76 0.80 0.80 0.96 1.12 1.20 Experimental group (bacteriophage administration) 0.24 0.08 0.04 0 0 0
- Example 6 bacteriophage Vib - ANP Vibrio with -1 Anguilla Room Fungal diseases Treatment example
- the flounder in the experimental group contained bacteriophage Vib-ANP-1 (1 ⁇ 10 8 pfu). / g) was fed according to the conventional feed feeding method.
- the flounder of the control group non-bacterial phage group was fed in the same manner to feed of the same composition without the bacteriophage Vib-ANP-1.
- the test animals were examined for the incidence of Vibrio disease. Vibrio disease occurrence state investigation caused by Vibrio anguillalum was carried out by measuring the body color blackening index as in Example 5. The results were shown in Table 3.
- Body color blackening index measurement result (average value) DC score (mean) date D8 D9 D10 D11 D12 D13 D14 Control group (not administered bacteriophage) 0.87 0.97 1.00 1.13 1.20 1.23 1.33 Experimental group (bacteriophage administration) 0.90 0.80 0.77 0.70 0.43 0.20 0.13
- the bacteriophage Vib-ANP-1 of the present invention is very effective in the treatment of infectious diseases caused by Vibrio anguillalum.
- the feed additive was prepared using bacteriophage Vib-ANP-1 solution to contain 1 ⁇ 10 8 pfu of bacteriophage Vib-ANP-1 per 1 g of feed additive.
- the method of preparing a feed additive was prepared by adding maltodextrin to the bacteriophage solution (50%, w / v) and then lyophilizing. Finally, it was ground to a fine powder form.
- the drying process in the manufacturing process may be replaced by reduced pressure drying, warming drying, room temperature drying.
- the feed additive without bacteriophage also used the buffer used to prepare the bacteriophage solution (Buffer; 10 mM Tris-HCl, 10 mM MgSO 4 , 0.1% Gelatin, pH 8.0) instead of the bacteriophage solution. It was prepared by.
- Each of the two feed additives thus prepared was mixed with 250 times the fish feed for fish in a weight ratio to prepare the final two feeds.
- the bath was prepared as follows.
- the bacteriophage Vib-ANP-1 was prepared using a bacteriophage Vib-ANP-1 solution to contain 1 ⁇ 10 8 pfu of bacteriophage Vib-ANP-1 per 1 ml of the bathing agent.
- the method of preparing a bath detergent is prepared by adding the above-mentioned bacteriophage Vib-ANP-1 solution so as to include 1 ⁇ 10 8 pfu of bacteriophage Vib-ANP-1 per 1 ml of the buffer used to prepare the bacteriophage solution. It was.
- the buffer itself used in the preparation of the bacteriophage solution was used as it is.
- the two types of baths thus prepared were diluted with 1,000 times water by volume and used as the final bath.
- Example 7 and Example 8 Using the feed prepared in Example 7 and Example 8 and the bath was investigated whether the improvement of the specification result when raising the flounder.
- the survey was conducted in terms of mortality.
- a total of 1,000 halibut fry were divided into two groups (group-A fed; group-B treated with a bath) for 4 weeks.
- Each group was divided into 250 subgroups, and each subgroup was divided into a small group (small group-1) to which the bacteriophage Vib-ANP-1 was applied and a small group (small group-2) to which the bacteriophage was not applied.
- the flounder was used for this study (weight: 5-7 g, body length: 8-10 cm), and the flounder fry of each test group were reared in separate tanks located at regular intervals.
- Each subgroup is divided and referred to as Table 4 below.
- Example 7 In the case of feed feeding, the feed prepared in Example 7 was fed according to the conventional feed feeding method according to the classification of Table 4, and in the case of the treatment of the bath preparation, it was prepared according to the preparation method of the bath preparation described in Example 8. One bath was treated according to the conventional bath treatment method according to the division of Table 4. The results were shown in Table 5.
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Abstract
본 발명은 비브리오 앵길라룸 균을 특이적으로 사멸시킬 수 있는 능력을 갖고 서열번호 1로 표시되는 유전체를 갖는 것을 특징으로 하는 자연으로부터 분리한 시포비리대 박테리오파지 Vib-ANP-1(수탁번호 KCTC 13075BP), 및 이를 유효성분으로 포함하는 조성물을 이용한 비브리오 앵길라룸 균의 감염을 방지 및 비브리오 앵길라룸 균의 감염을 치료하는 방법에 관한 것이다.
Description
본 발명은 비브리오 앵길라룸 균에 감염하여 비브리오 앵길라룸 균을 사멸시킬 수 있는 자연으로부터 분리한 박테리오파지 및 이를 유효성분으로 포함한 조성물을 이용한 비브리오 앵길라룸 균의 감염을 방지 및 처치하는 방법에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 비브리오 앵길라룸 균을 특이적으로 사멸시킬 수 있는 능력을 갖는 서열번호 1로 표시되는 유전체를 갖는 것을 특징으로 하는 자연으로부터 분리한 시포비리대 박테리오파지 Vib-ANP-1(수탁번호 KCTC 13075BP), 및 상기 박테리오파지를 유효성분으로 포함하는 조성물을 이용한 비브리오 앵길라룸 균의 감염 방지 및 감염 후 처치 방법에 관한 것이다.
비브리오 속(Genus)에 속하는 비브리오 앵길라룸(Vibrio anguillarum)은 그람음성 간균으로 넙치를 비롯하여 연어과 어류, 뱀장어, 및 각종 해산어에 있어 출혈성 패혈증(Hemorrhagic septicemia)을 수반하는 비브리오병(Vibriosis)을 유발하는 대표적인 어류 병원세균으로 알려져 있다. 비브리오 앵길라룸 균의 항원형(Serotype)은 현재까지 23 종류의 항원형이 있다고 밝혀졌지만, 어류 비브리오병을 야기하는 비브리오 앵길라룸 병원성 균주 대부분은 균체항원(Somatic, O 항원)인 O1 항원형과 O2 항원형인 것으로 알려졌다.
비브리오 앵길라룸 균은 다양한 어류에서 비브리오병을 유발하여 수산 양식 산업에 있어 심각한 경제적 피해를 초래하고 있다. 특히 비브리오 앵길라룸 균 감염에 의한 어류의 비브리오병은 그 발병 빈도가 높기 때문에 경제적 피해 초래가 크다. 따라서 비브리오 앵길라룸 균 감염을 예방하고 나아가 감염 처치에까지 활용될 수 있는 방안의 개발이 절실한 실정이다.
비브리오 앵길라룸 균에 의한 감염 억제 및 치료를 위해 항생제가 널리 사용되고 있는데, 최근 항생제 내성균의 증가로 인해 그 효과는 계속 떨어지고 있으며 양식 어류에의 항생제 사용에 대한 규제 강화로 항생제 외의 다른 효과적 방법의 개발이 요구되고 있는 실정이다. 특히 자연 친화적 방법에 대한 요구가 크다.
최근 세균성 질환의 대처 방안으로 박테리오파지(Bacteriophage)의 활용이 크게 주목을 받고 있다. 특히 자연친화적 방식의 선호로 인하여 박테리오파지에 대한 관심은 어느 때보다 높다고 할 수 있다. 박테리오파지는 세균에 감염하는 아주 작은 미생물로서 보통 파지(Phage)라고 줄여서 부르기도 한다. 박테리오파지는 박테리아에 감염(Infection)한 후 박테리아 세포 내부에서 증식을 하고, 증식 후 자손 박테리오파지들이 박테리아 밖으로 나올 때 숙주인 박테리아의 세포벽을 파괴하는 방식으로 박테리아를 사멸시키는 능력을 갖고 있다.
박테리오파지의 박테리아 감염 방식은 매우 특이성이 높아서 특정 박테리아에 감염할 수 있는 박테리오파지의 종류는 일부로 한정된다. 즉, 특정 박테리오파지는 특정 범주의 박테리아에만 감염할 수 있고 이로 인하여 특정 박테리오파지는 특정 박테리아만을 사멸시키며 다른 박테리아에는 영향을 주지 않는다. 이러한 박테리오파지의 세균 특이성으로 인하여 박테리오파지는 목적으로 하는 세균에 대해서만 항균효과를 제공하고 환경이나 어류 내의 상재균들에는 영향을 초래하지 않는다. 통상적으로 세균 처치에 널리 활용되던 기존의 항생제들은 여러 종류의 세균들에 대하여 동시에 영향을 끼쳤다. 이로 인하여 환경오염이나 동물의 체내 정상 세균총(Normal flora) 교란 등의 문제를 초래하였다. 이와는 달리 박테리오파지는 특정 세균에 대해서만 작동하므로 박테리오파지 사용에 의해서 체내 정상 세균총 교란 등이 발생하지 않는다. 따라서 그 사용이 항생제 사용에 비교하여 매우 안전하다고 할 수 있고 그 만큼 사용에 의한 부작용 초래 가능성이 상대적으로 크게 낮다.
박테리오파지는 1915년 영국의 세균학자 Twort가 포도상구균(Micrococcus) 집락이 어떤 것에 의해 투명하게 녹는 현상에 대한 연구를 수행하면서 발견되었다. 또한, 1917년에는 프랑스의 세균학자 d'Herelle이 이질환자 변의 여과액 중에 적리균(Shigella dysenteriae)을 녹이는 작용을 가진 것이 있다는 것을 발견하고 이에 대한 연구를 통해 독립적으로 박테리오파지를 발견하였으며, 세균을 잡아먹는다는 뜻에서 박테리오파지라고 명명하였다. 이후 이질균, 장티푸스균, 콜레라균 등 여러 병원성 박테리아에 대한 박테리오파지가 계속적으로 발견되었다.
박테리아를 사멸시킬 수 있는 특별한 능력으로 인하여 박테리오파지는 발견 이후 박테리아 감염에 대응하는 효과적 방안으로 기대를 모았으며 관련하여 많은 연구들이 있었다. 그러나 Fleming에 의해 페니실린이 발견된 이후, 항생제의 보급이 일반화되면서 박테리오파지에 대한 연구는 일부 동유럽 국가들 및 구소련에 한정되어서만 명맥이 유지되었다. 그런데 2000년 이후에 항생제 내성균의 증가로 인하여 기존 항생제의 한계성이 나타나고, 기존 항생제의 대체 물질로의 개발 가능성이 부각되면서 다시 박테리오파지가 항-박테리아제로 주목을 받고 있다. 특히 최근 항생제 사용에 대한 정부 차원의 규제가 전 세계적으로 강화됨에 따라 박테리오파지에 대한 관심이 더욱 높아지고 있으며 산업적 활용 사례도 점차 증가하고 있다.
앞에서 설명했듯이 박테리오파지는 세균에 대한 특이성이 매우 높다. 이러한 특이성으로 인하여 박테리오파지는 동일 종(Species)에 속하는 세균들이라 할지라도 그 일부 주(Strain)에 대해서만 항균효과를 발휘하는 경우가 많다. 또한 박테리오파지가 다름에 따라 동일 세균 주에 대하여 발휘되는 박테리오파지의 항균력 세기 자체도 다를 수 있다. 이러한 이유로 특정 종의 세균에 대하여 효과적 제어법을 확보하려면 다양한 종류의 유용 박테리오파지들의 확보가 필요하다. 비브리오 앵길라룸 균에 대응하여 효과적인 박테리오파지 활용법을 개발하기 위해서도 당연히 비브리오 앵길라룸 균에 대하여 항균효과를 제공할 수 있는 여러 종류의 다양한 유용 박테리오파지들의 확보가 필요하고, 더 나아가 확보한 다양한 유용 박테리오파지들 중에서 항균력의 세기나 항균범위 측면에서 비교우위에 있는 박테리오파지의 선발 활용도 필요하다.
이에, 본 발명자들은 비브리오 앵길라룸 균을 선택적으로 사멸시킬 수 있는 자연으로부터 분리된 박테리오파지를 이용하여 비브리오 앵길라룸 균의 감염을 방지 또는 처치하는 데에 활용될 수 있는 조성물을 개발하고, 또 이 조성물을 이용하여 비브리오 앵길라룸 균의 감염을 방지 또는 처치하는 방법을 개발하고자 노력한 끝에, 이에 적합한 박테리오파지를 자연으로부터 분리하고 이 분리된 박테리오파지를 타 박테리오파지와 구별하여 특정 지을 수 있도록 유전체(Genome)의 유전자 서열을 확보한 후 상기 박테리오파지를 유효성분으로 한 조성물을 개발한 다음 이 조성물이 비브리오 앵길라룸 균의 감염 방지 및 처치에 효과적으로 활용될 수 있음을 확인함으로써 본 발명을 완성하였다.
따라서 본 발명의 목적은 비브리오 앵길라룸 균을 특이적으로 사멸시킬 수 있는 능력을 갖는 서열번호 1로 표시되는 유전체를 갖는 것을 특징으로 하는 자연으로부터 분리한 시포비리대(Siphoviridae) 박테리오파지 Vib-ANP-1(수탁번호 KCTC 13075BP)을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 비브리오 앵길라룸 균에 감염하여 비브리오 앵길라룸 균을 사멸시킬 수 있는 박테리오파지 Vib-ANP-1을 유효성분으로 포함하는 비브리오 앵길라룸 균의 감염을 방지하는 데에 활용 가능한 조성물 및 이 조성물을 이용한 비브리오 앵길라룸 균의 감염 방지 방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 비브리오 앵길라룸 균에 감염하여 비브리오 앵길라룸 균을 사멸시킬 수 있는 박테리오파지 Vib-ANP-1을 유효성분으로 포함하는 비브리오 앵길라룸 균의 감염을 처치하는 데에 활용 가능한 조성물 및 이 조성물을 이용한 비브리오 앵길라룸 균의 감염 처치 방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 조성물들을 이용한 비브리오 앵길라룸 균의 감염 방지 및 처치 목적의 약욕제를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 조성물들을 이용한 비브리오 앵길라룸 균의 감염 방지 및 처치를 통한 사양 효과 제공 목적의 사료첨가제를 제공하는 것이다.
본 발명은 비브리오 앵길라룸 균을 특이적으로 사멸시킬 수 있는 능력을 갖는 서열번호 1로 표시되는 유전체를 갖는 것을 특징으로 하는 자연으로부터 분리한 시포비리대 박테리오파지 Vib-ANP-1(수탁번호 KCTC 13075BP), 및 이를 유효성분으로 포함하는 조성물을 이용한 비브리오 앵길라룸 균의 감염 방지 및 처치 방법을 제공한다.
박테리오파지 Vib-ANP-1은 본 발명자들에 의해 분리된 후 2016년 8월 16일자로 한국생명공학연구원 생물자원센터에 기탁되었다(수탁번호 KCTC 13075BP).
또한, 본 발명은 비브리오 앵길라룸 균의 감염을 방지 또는 처치하는 데에 활용될 수 있는 박테리오파지 Vib-ANP-1을 유효성분으로 포함하는 약욕제 및 사료첨가제를 제공한다.
본 발명의 조성물에 포함되는 박테리오파지 Vib-ANP-1은 비브리오 앵길라룸 균을 효과적으로 사멸시키므로 비브리오 앵길라룸 균에 의해 유발되는 질환의 예방(감염 방지)이나 치료(감염 처치)에 효과를 나타낸다. 따라서 본 발명의 조성물은 비브리오 앵길라룸 균에 의해 유발되는 질환에 대한 예방 및 치료 목적으로 활용될 수 있다.
본 명세서에서 사용된 "방지" 또는 "예방"이라는 용어는 (i) 비브리오 앵길라룸 균 감염의 방지; 및 (ii) 비브리오 앵길라룸 균 감염에 의한 질병으로의 발전을 억제하는 것을 의미한다.
또한, 본 명세서에서 사용된 "처치" 또는 "치료"라는 용어는 (i) 비브리오 앵길라룸 균에 의해 유발된 질환의 억제; 및 (ii) 비브리오 앵길라룸 균에 의해 유발된 질환의 병적 상태를 경감시키는 모든 행위를 의미한다.
본 명세서의 “분리”, “분리한” 또는 “분리된”은 자연 상태로부터 여러 실험 기법을 활용하여 박테리오파지를 분리하는 것과 타 박테리오파지와 구별하여 대상 박테리오파지를 특정 지을 수 있는 특징들을 확보하는 것을 지칭하며, 이에 더하여 생물공학기술로 대상 박테리오파지를 산업적으로 활용할 수 있게끔 증식시키는 것도 포함한다.
본 발명의 조성물에 포함되는 약제학적으로 허용되는 담체는 제제 시에 통상적으로 이용되는 것으로서, 락토오스, 덱스트로오스, 수크로오스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산칼슘, 알지네이트, 젤라틴, 규산칼슘, 미세결정성 셀룰로오스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로오스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로오스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 조성물은 상기 성분들 이외에 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제, 보존제 등을 추가로 포함할 수 있다.
본 발명의 조성물에는 박테리오파지 Vib-ANP-1이 유효성분으로 포함된다. 이때 포함되는 박테리오파지 Vib-ANP-1은 1× 101 pfu/㎖ 내지 1× 1030 pfu/㎖ 또는 1× 101 pfu/g 내지 1× 1030 pfu/g로 포함되며, 바람직하게는 1× 104 pfu/㎖ 내지 1× 1015 pfu/㎖ 또는 1× 104 pfu/g 내지 1× 1015 pfu/g로 포함된다.
본 발명의 조성물은 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 약학적으로 허용되는 담체 및/또는 부형제를 이용하여 제제화 됨으로써 단위 용량 형태로 제조되거나 또는 다용량 용기 내에 내입시켜 제조될 수도 있다. 이때 제형은 오일 또는 수성 매질 중의 용액, 현탁액 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캡슐제 형태일 수도 있으며, 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수도 있다.
본 발명의 조성물은 활용 방식에 따라, 이에 국한되지 않지만, 약욕제 및 사료첨가제로 구현될 수 있다.
이러한 활용 목적에서의 효율성을 높이기 위하여 다른 세균종에 대하여 항균활성을 제공할 수 있는 박테리오파지들이 본 발명의 조성물에 추가될 수 있다. 또한, 비브리오 앵길라룸 균에 대하여 항균활성을 갖는 다른 종류의 박테리오파지들도 추가될 수 있다. 비브리오 앵길라룸 균에 대하여 항균활성을 갖는 박테리오파지라 하더라도 항균력의 세기나 항균범위 측면에서 서로 간에 차이가 있으므로 이들의 적절한 조합은 그 효과를 극대화 할 수 있다.
본 발명의 박테리오파지 Vib-ANP-1을 유효성분으로 포함하는 조성물을 이용한 비브리오 앵길라룸 균의 감염 방지 및 처치 방법은 기존의 항생제 등의 화학물질에 기반을 둔 방식에 비하여 비브리오 앵길라룸 균에 대한 특이성이 매우 높다는 장점을 제공할 수 있다. 이는 다른 유용한 상재균에는 영향을 주지 않으면서도 비브리오 앵길라룸 균의 감염 방지 또는 처치 목적으로 사용될 수 있음을 의미하며, 이의 사용에 따른 부작용이 매우 적다는 것을 의미한다. 통상적으로 항생제 등의 화학물질을 사용하면 일반 상재균들도 피해를 함께 입게 되어 결과적으로 동물에 면역력 저하 등을 초래하여 사용에 따른 다양한 부작용이 나타날 수 있다. 또한, 본 발명은 자연계에 이미 존재하는 박테리오파지를 분리하여 조성물의 유효성분으로 사용하기 때문에 매우 자연 친화적이라는 장점도 제공할 수 있다. 한편, 박테리오파지는 항균활성을 발휘할 수 있는 세균 종이 같다 하더라도 항균효과 발휘에 있어 항균력의 세기나 항균범위[비브리오 앵길라룸 균에 속하는 여러 세균 주(Strain)의 측면에서 개별 세균 주에 대하여 박테리오파지의 항균활성이 발휘되는 범위. 통상적으로 박테리오파지는 같은 세균 종(Species)에 속하는 일부 세균 주(Strain)에 대하여 항균활성을 발휘할 수 있음. 즉, 같은 세균 종에 속한다 하더라도 개별 세균 주에 따라 박테리오파지에 대한 감수성에서 차이가 있을 수 있음] 측면에서 차이가 있으므로 본 발명은 비브리오 앵길라룸 균에 대한 항균력을 갖는 타 박테리오파지에 비교하여 차별적 항균효과를 제공할 수 있다. 이는 산업현장 활용 시에 그 효과에 있어 큰 차이를 제공한다.
도 1은 박테리오파지 Vib-ANP-1의 전자현미경 사진이다.
도 2는 박테리오파지 Vib-ANP-1의 비브리오 앵길라룸 균에 대한 사멸능을 보여주는 실험 결과이다. 평판배지의 가운데 선을 기준으로 왼쪽은 박테리오파지 Vib-ANP-1이 포함되지 않은 완충액(Buffer)만을 점적한 것이고, 오른쪽은 박테리오파지 Vib-ANP-1이 포함된 액을 점적한 것이다. 오른쪽에서 관찰되는 투명한 부분은 시험대상 박테리아가 박테리오파지 Vib-ANP-1의 작용에 의하여 용균되어 결과적으로 형성된 용균반이다.
이하, 실시예에 의거하여 본 발명을 보다 구체적으로 설명하지만, 이들 실시예는 본 발명의 예시일 뿐이며 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예
1: 비브리오
앵길라룸
균을 사멸시킬 수 있는 박테리오파지의 분리
비브리오 앵길라룸 균을 사멸시킬 수 있는 박테리오파지의 분리에는 자연 환경으로부터 확보된 시료들을 이용하였다. 한편, 박테리오파지 분리에 사용된 비브리오 앵길라룸 균주들은 본 발명자들에 의해 미리 분리되어 비브리오 앵길라룸 균으로 동정(Identification)된 것들이다.
박테리오파지 분리 과정을 상세히 설명하면, 비브리오 앵길라룸 균을 1/1,000 비율로 접종한 LB(Luria-Bertani) 배지(트립톤, 10 g/L; 효모 추출물, 5 g/L; 염화 나트륨, 10 g/L)에 수집된 시료를 함께 첨가한 다음 30℃에서 3-4시간동안 진탕배양 하였다. 배양 후, 8,000 rpm에서 20분간 원심분리하여 상등액을 회수하였다. 회수된 상등액에 비브리오 앵길라룸 균을 1/1,000 비율로 접종한 다음 30℃에서 3-4시간동안 또 다시 진탕배양 하였다. 박테리오파지가 시료에 포함되어 있었을 경우에는 박테리오파지의 수(Titer)가 충분히 증가될 수 있도록 이러한 과정을 총 5회 반복 실시하였다. 5회 반복 실시 후에 배양액을 8,000 rpm에서 20분간 원심분리 하였다. 원심분리 후, 회수된 상등액에 대하여 0.45 ㎛의 필터를 이용하여 여과를 실시해 주었다. 이렇게 하여 얻어진 여과액을 사용한 통상의 점적 실험(Spot assay)을 통하여 비브리오 앵길라룸 균을 사멸시킬 수 있는 박테리오파지가 있는지를 조사하였다.
상기 점적 실험은 다음과 같이 실시하였다. LB 배지에 비브리오 앵길라룸 균을 1/1,000 비율로 접종한 다음 30℃에서 한밤동안 진탕배양 하였다. 이렇게 하여 준비된 비브리오 앵길라룸 균의 배양액 3 ㎖(OD600이 1.5)을 LA(Luria-Bertani Agar) 평판배지(트립톤, 10 g/L; 효모 추출물, 5 g/L; 염화 나트륨, 10 g/L; 아가, 15 g/L)에 도말(Spreading)하였다. 도말한 평판배지를 클린벤치(Clean bench)에서 약 30분 정도 방치하여 도말액이 건조되게 하였다. 건조 후 앞에서 준비한 여과액 10 μl를 비브리오 앵길라룸 균이 도말된 평판배지 위에 점적한 다음 이를 30분 정도 방치하여 건조시켰다. 건조 후 점적한 평판배지를 30℃에서 하루 동안 정치 배양한 다음 여과액이 떨어진 위치에 투명환(Clear zone)이 생성되는가를 조사하였다. 투명환이 생성되는 여과액의 경우가 비브리오 앵길라룸 균을 사멸 시킬 수 있는 박테리오파지가 포함되어 있다고 판단할 수 있다. 이러한 조사를 통하여 비브리오 앵길라룸 균에 대한 사멸능을 가진 박테리오파지를 포함한 여과액을 확보할 수 있었다.
비브리오 앵길라룸 균에 대한 사멸능을 가진 박테리오파지의 존재가 확인된 여과액을 이용하여 순수 박테리오파지 분리를 실시하였다. 순수 박테리오파지 분리에는 통상의 용균반 분석(Plaque assay)을 이용하였다. 이를 자세히 설명하면, 용균반 분석에서 형성된 용균반 하나를 멸균된 팁을 이용하여 회수한 다음 이를 비브리오 앵길라룸 균 배양액에 첨가해 주어 4-5 시간 동안 30℃에서 함께 배양하였다. 배양 후 8,000 rpm에서 20분간 원심분리하여 상등액을 얻었다. 얻어진 상등액에 50분의 1의 부피로 비브리오 앵길라룸 균 배양액을 첨가해 준 다음 다시 30℃에서 4-5 시간 배양해 주었다. 박테리오파지의 수를 증가시키기 위하여 이러한 과정을 최소 5회 이상 실시한 다음 최종적으로 8,000 rpm에서 20분간 원심분리하여 상등액을 얻었다. 얻어진 상등액을 사용하여 다시 용균반 분석을 실시하였다. 통상 순수 박테리오파지의 분리가 상기 과정의 1회만으로는 달성되지 않기 때문에 이때 형성된 용균반을 이용하여 앞 단계를 전체적으로 다시 반복하였다. 이와 같은 과정을 최소 5회 이상 반복 실시하여 순수한 박테리오파지를 포함한 용액을 확보하였다. 통상적으로 순수 박테리오파지의 분리는 형성된 용균반의 크기 및 모양이 모두 유사하게 될 때까지 반복 수행하였다. 그리고 최종적으로는 전자현미경 분석을 통하여 박테리오파지의 순수 분리 여부를 확인하였다. 전자현미경 분석에서 순수 분리가 확인될 때까지 앞에 기술한 과정을 반복하였다. 전자현미경 분석은 통상의 방법에 따라 실시하였다. 이를 간단히 설명하면 다음과 같다. 순수한 박테리오파지를 포함한 용액을 구리 격자(Copper grid)에 묻히고 2% 우라닐 아세테이트(Uranyl acetate)로 역 염색법(Negative staining)과 건조를 수행한 후 투과전자현미경을 통하여 그 형태를 관찰하였다. 순수 분리한 박테리오파지의 전자현미경 사진이 도 1에 제시되어 있다. 형태적 특징으로 판단할 때 신규 확보된 박테리오파지는 시포비리대(Siphoviridae) 박테리오파지에 속함을 확인할 수 있었다.
이런 방식으로 확인된 순수 박테리오파지를 포함한 용액은 다음의 정제 과정을 거쳤다. 순수 박테리오파지를 포함한 용액에 용액 전체 부피의 50분의 1의 부피로 비브리오 앵길라룸 균 배양액을 첨가해 준 다음 다시 4-5 시간 배양하였다. 배양 후 8,000 rpm에서 20분간 원심분리하여 상등액을 얻었다. 충분한 수의 박테리오파지가 포함된 액을 얻기 위해 이러한 과정을 총 5회 반복 수행하였다. 최종 원심분리로 얻어진 상등액을 0.45 μm의 필터를 이용하여 여과한 다음 통상의 폴리에틸렌 글리콜(Polyethylene Glycol; PEG) 침전 과정을 실시하였다. 구체적으로, 여과액 100 ㎖에 10% PEG 8000/0.5 M NaCl이 되게 PEG와 NaCl을 첨가한 다음 4℃에서 2-3시간 동안 정치한 후, 8,000 rpm에서 30분간 원심분리하여 박테리오파지 침전물을 얻었다. 이렇게 얻어진 박테리오파지 침전물을 완충액(Buffer; 10 mM Tris-HCl, 10 mM MgSO4, 0.1% Gelatin, pH 8.0) 5 ㎖로 부유시켰다. 이를 박테리오파지 부유액 또는 박테리오파지 액이라 지칭한다.
상기한 과정을 통하여 정제된 순수 박테리오파지를 확보할 수 있었고, 이 박테리오파지를 박테리오파지 Vib-ANP-1로 명명한 뒤, 2016년 8월 16일자로 한국생명공학연구원 생물자원센터(수탁번호 KCTC 13075BP)에 기탁하였다.
실시예
2: 박테리오파지
Vib
-
ANP
-1의 유전체 분리 및 서열 분석
박테리오파지 Vib-ANP-1의 유전체를 다음과 같이 분리하였다. 유전체 분리에는 실시예 1에서와 같은 방법으로 얻어진 박테리오파지 부유액을 이용하였다. 먼저 부유액에 포함되어 있을 수 있는 비브리오 앵길라룸 균의 DNA와 RNA를 제거하기 위해, 박테리오파지 부유액 10 ㎖에 DNase I과 RNase A를 각각 200 U씩 첨가한 다음 37℃에서 30분간 방치하였다. 30분 방치 후에 DNase I과 RNase A의 활성을 제거하기 위해, 0.5 M 에틸렌디아민테트라아세트산(Ethylenediaminetetraacetic acid; EDTA) 500 μl를 첨가한 다음 다시 10분간 정치시켰다. 그리고 이를 추가로 10분간 65℃에 정치시킨 다음 박테리오파지 외벽을 와해시키기 위해 proteinase K(20 ㎎/㎖) 100 μl를 첨가한 후 37℃에서 20분간 반응시켰다. 그 후 10% 도데실 황산 나트륨염(Sodium dodecyl sulfate; SDS) 500 μl를 첨가한 다음 다시 65℃에서 1시간 동안 반응시켰다. 1 시간 반응 후, 이 반응액에 25:24:1의 구성비를 갖는 페놀(Phenol):클로로포름(Chloroform):이소아밀알코올(Isoamylalcohol)의 혼합액 10 ㎖을 첨가해 준 후 잘 섞어 주었다. 그리고는 이것을 13,000 rpm에서 15분간 원심분리하여 층이 분리되게 한 다음 분리된 층들 중에서 위층을 취하여 여기에 1.5 부피비의 이소프로필 알코올(Isopropyl alcohol)을 첨가한 다음 13,000 rpm에서 10분간 원심분리하여 유전체를 침전시켰다. 침전물을 회수한 후 침전물에 70% 에탄올(Ethanol)을 첨가한 다음 다시 13,000 rpm에서 10분간 원심분리하여 침전물의 세척을 실시하였다. 세척된 침전물을 회수하고 진공 건조 시킨 다음 100 μl의 물을 사용하여 침전물을 녹였다. 상기 과정을 반복하여 박테리오파지 Vib-ANP-1의 유전체를 다량 확보하였다.
이렇게 얻어진 유전체를 이용하여 ㈜마크로젠에서 illumina Mi-Seq 기기를 이용하여 차세대 염기서열 분석(Next generation sequencing analysis)을 수행하여 박테리오파지 Vib-ANP-1의 유전체 서열 정보를 확보하였다. 최종적으로 분석된 박테리오파지 Vib-ANP-1 유전체는 213,970 bp의 크기를 가지며, 전체 유전체 서열은 서열번호 1로 제시되어 있다.
확보된 박테리오파지 Vib-ANP-1의 유전체 서열을 기반으로 Web상의 BLAST를 이용하여 기존에 알려진 박테리오파지 유전체 서열과의 상동성(Similarity)을 조사해 보았다. BLAST 조사 결과, 50% 이상의 상동성을 가진 박테리오파지 서열은 확인할 수 없었다.
이러한 사실에 근거하여 박테리오파지 Vib-ANP-1은 기존에 보고된 바 없는 신규한 박테리오파지라고 판단할 수 있었다. 이러한 사실과 함께 통상적으로 박테리오파지의 종류가 다르면 제공할 수 있는 항균력의 세기 및 항균범위가 다르다는 사실로부터 박테리오파지 Vib-ANP-1은 기존에 보고된 다른 박테리오파지들과는 다른 항균효과를 제공해 줄 수 있다고 판단하였다.
실시예
3: 박테리오파지
Vib
-
ANP
-1의 비브리오
앵길라룸
균에 대한
사멸능
조사
분리된 박테리오파지 Vib-ANP-1의 비브리오 앵길라룸 균에 대한 사멸능을 조사하였다. 사멸능 조사는 실시예 1에서 제시한 점적 실험을 통하여 투명환 생성 여부를 조사하는 방식으로 수행하였다. 사멸능 조사에 사용되어진 비브리오 앵길라룸 균은 본 발명자들에 의해 분리되어 비브리오 앵길라룸 균으로 동정된 것들로 총 17주였다. 박테리오파지 Vib-ANP-1은 실험에 대상이 된 비브리오 앵길라룸 균 17주 중에 총 16주에 대하여 사멸능을 갖고 있었다. 대표적 실험 결과가 도 2에 제시되어 있다. 한편, 박테리오파지 Vib-ANP-1의 에드워드시엘라 타르다(Edwardsiella
tarda), 비브리오 파라헤몰리티쿠스(Vibrio
parahaemolyticus), 락토코커스 가르비에(Lactococcus
garvieae), 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus
parauberis), 스트렙토코커스 이니에(Streptococcus
iniae), 및 에로모나스 살모니시다 (Aeromonas
salmonicida)에 대한 사멸능 조사도 별도 실험으로 실시하였는데, 그 결과로 박테리오파지 Vib-ANP-1은 이들 균종들에 대해서는 사멸능을 갖고 있지 않았다.
이상의 결과로 박테리오파지 Vib-ANP-1은 비브리오 앵길라룸 균에 대하여 특이적인 사멸능을 가지며, 다수의 비브리오 앵길라룸 균에 대하여 항균 효과를 발휘할 수 있음을 확인할 수 있었다. 이는 박테리오파지 Vib-ANP-1이 비브리오 앵길라룸 균의 감염 방지 및 처치 목적의 조성물의 유효성분으로 활용 가능함을 의미한다.
실시예
4: 박테리오파지
Vib
-
ANP
-1의 비브리오
앵길라룸
균의 감염 예방에 대한
실험예
9 ㎖의 LB 배지를 담은 하나의 튜브에 1× 108 pfu/㎖ 수준의 박테리오파지 Vib-ANP-1 액 100 μl를 넣어주고, 다른 하나의 9 ㎖의 LB 배지를 담은 튜브에는 동량의 LB 배지만을 추가로 첨가하였다. 그 다음에 각 튜브에 600 nm에서 흡광도가 약 0.5 정도가 되도록 비브리오 앵길라룸 균의 배양액을 넣어 주었다. 비브리오 앵길라룸 균을 첨가한 후 튜브들을 30℃의 배양기에 옮겨 진탕배양하면서 비브리오 앵길라룸 균의 성장 상태를 관찰하였다. 표 1에 제시된 바와 같이, 박테리오파지 Vib-ANP-1 액을 첨가해 준 튜브에서는 비브리오 앵길라룸 균의 성장 억제가 관찰된 반면에 박테리오파지 액을 첨가하지 않은 튜브에서는 비브리오 앵길라룸 균의 성장 억제가 관찰되지 않았다.
구분 | OD600 흡광도 값 | ||
배양 0분 | 배양후 60분 | 배양후 120분 | |
박테리오파지 액 미첨가 | 0.504 | 0.987 | 1.342 |
박테리오파지 액 첨가 | 0.504 | 0.324 | 0.238 |
이 결과로부터 본 발명의 박테리오파지 Vib-ANP-1이 비브리오 앵길라룸 균의 성장을 저해할 뿐만 아니라 사멸까지 시키는 능력이 있음을 확인할 수 있었고, 이로부터 박테리오파지 Vib-ANP-1이 비브리오 앵길라룸 균의 감염을 방지하는 목적의 조성물의 유효성분으로 활용될 수 있다고 결론지을 수 있었다.
실시예
5: 박테리오파지
Vib
-
ANP
-1을 이용한 비브리오
앵길라룸
균의 감염 예방 동물실험
넙치를 이용하여 박테리오파지 Vib-ANP-1의 비브리오 앵길라룸 균 감염 예방 효과를 조사하였다. 넙치 치어(체중: 5~7 g, 체장: 8~10 cm) 50마리를 한 그룹으로 하여 총 두 그룹으로 나눈 후 수조에서 분리 사육하면서 14일간 실험을 실시하였다. 수조의 주위환경은 통제하였고, 수조가 있는 실험실의 온도는 일정하게 유지시켰다. 실험 개시일로부터 시험 전기간 동안에 걸쳐 실험군(박테리오파지 투여군)의 넙치들에게는 1× 108 pfu/g의 박테리오파지 Vib-ANP-1을 포함하고 있는 사료를 통상적인 사료 급이 방식에 따라 급이하였다. 반면에 대조군(박테리오파지 미투여군)의 넙치들에게는 박테리오파지 Vib-ANP-1이 포함되지 않은 동일 조성의 사료를 동일한 방식으로 급이하였다. 시험개시일로부터 7일째가 되는 날부터 2일간 1× 108 cfu/g 수준으로 비브리오 앵길라룸 균을 급이하는 사료에 포함시켜 하루 2회씩 급이하여 비브리오 앵길라룸 균 감염을 유도하였다. 시험 개시일로부터 9일째가 되는 날(비브리오 앵길라룸 균 감염 유도 후 2일째)부터는 매일 모든 시험동물들을 대상으로 비브리오병 발생 상태를 조사하였다. 비브리오병 발생 상태 조사는 체색 흑화지수를 측정하는 방식으로 실시하였다. 체색 흑화지수 측정은 통상 사용되는 Dark Coloration(DC) score(정상: 0, 연한 흑화: 1, 진한 흑화: 2)를 측정하는 방식으로 실시하였다. 그 결과는 표 2와 같았다.
DC score(mean) | ||||||
날짜 | D9 | D10 | D11 | D12 | D13 | D14 |
대조군(박테리오파지 미투여) | 0.76 | 0.80 | 0.80 | 0.96 | 1.12 | 1.20 |
실험군(박테리오파지 투여) | 0.24 | 0.08 | 0.04 | 0 | 0 | 0 |
이 결과로부터 본 발명의 박테리오파지 Vib-ANP-1이 비브리오 앵길라룸 균의 감염 억제에 매우 효과적이라는 것을 확인할 수 있었다.
실시예
6: 박테리오파지
Vib
-
ANP
-1을 이용한 비브리오
앵길라룸
균의 감염 질환
치료예
비브리오 앵길라룸 균에 의해 비브리오병이 유발된 넙치에서 박테리오파지 Vib-ANP-1의 치료 효과를 조사하였다. 넙치 치어(체중: 5~7 g, 체장: 8~10 cm) 60마리를 한 그룹으로 하여 총 두 그룹으로 나눈 후 수조에서 분리 사육하면서 14일간 실험을 실시하였다. 수조의 주위환경은 통제하였고, 수조가 있는 실험실의 온도는 일정하게 유지시켰다. 실험 개시일로부터 5일째 되는 날부터 3일간 1× 108 cfu/g 수준으로 비브리오 앵길라룸 균이 오염된 사료를 하루 2회씩 통상적인 사료 급이 방식으로 급이하였다. 비브리오 앵길라룸 균이 오염된 사료 급이 마지막 날부터 비브리오병의 임상증상을 보이는 개체가 두 수조 모두에서 확인되었다. 3일간의 비브리오 앵길라룸 균이 오염된 사료 급이 시행 다음날(시험 개시일로부터 8일째가 되는 날)부터 실험군(박테리오파지 투여군)의 넙치들에게는 박테리오파지 Vib-ANP-1을 포함(1× 108 pfu/g)하고 있는 사료를 통상적인 사료 급이 방식에 따라 급이하였다. 반면에 대조군(박테리오파지 미투여군)의 넙치들에게는 박테리오파지 Vib-ANP-1이 포함되지 않은 동일 조성의 사료를 동일한 방식으로 급이하였다. 비브리오 앵길라룸 균의 강제감염 후부터 3일째가 되는 날(시험 개시 8일째)부터는 매일 모든 시험동물들을 대상으로 비브리오병 발생 상태를 조사하였다. 비브리오 앵길라룸 균에 의해 유발되는 비브리오병 발생 상태 조사는 실시예 5에서와 같이 체색 흑화지수를 측정하는 방식으로 실시하였다. 그 결과는 표 3과 같았다.
DC score(mean) | |||||||
날짜 | D8 | D9 | D10 | D11 | D12 | D13 | D14 |
대조군(박테리오파지 미투여) | 0.87 | 0.97 | 1.00 | 1.13 | 1.20 | 1.23 | 1.33 |
실험군(박테리오파지 투여) | 0.90 | 0.80 | 0.77 | 0.70 | 0.43 | 0.20 | 0.13 |
이 결과로부터 본 발명의 박테리오파지 Vib-ANP-1이 비브리오 앵길라룸 균을 원인으로 하는 감염 질환의 치료에도 매우 효과적이라는 것을 확인할 수 있었다.
실시예
7: 사료첨가제 및 사료의 제조
박테리오파지 Vib-ANP-1 액을 이용하여 사료첨가제 1 g 당 1× 108 pfu의 박테리오파지 Vib-ANP-1이 포함되도록 사료첨가제를 제조하였다. 사료첨가제의 제조 방법은 박테리오파지 액에 말토덱스트린을 첨가(50%, w/v)한 다음에 동결건조시켜 제조하였다. 최종적으로 고운 가루 형태로 분쇄하였다. 상기 제조 과정 중의 건조 과정에는 감압 건조, 가온 건조, 상온 건조도 대체 가능하다. 대조 실험을 위해, 박테리오파지가 포함되지 않은 사료첨가제도 박테리오파지 액 대신에 박테리오파지 액의 제조 시에 사용한 완충액(Buffer; 10 mM Tris-HCl, 10 mM MgSO4, 0.1% Gelatin, pH 8.0)을 사용하는 방식으로 제조하였다.
이렇게 제조된 2종의 사료첨가제 각각을 중량비로 250배의 양어용 생사료와 혼합하여 최종 2종의 사료를 제조하였다.
실시예
8:
약욕제의
제조
약욕제는 다음과 같이 제조하였다. 박테리오파지 Vib-ANP-1 액을 이용하여 약욕제 1 ㎖ 당 1× 108 pfu의 박테리오파지 Vib-ANP-1이 포함되도록 약욕제를 제조하였다. 약욕제의 제조 방법은 박테리오파지 액 제조 시에 사용하는 완충액 1 ㎖ 당 1× 108 pfu의 박테리오파지 Vib-ANP-1이 포함되도록 상기 박테리오파지 Vib-ANP-1 액을 첨가하여 잘 혼합해 주는 방식으로 제조하였다. 대조 실험을 위해, 박테리오파지가 포함되지 않은 약욕제로는 박테리오파지 액의 제조 시에 사용한 완충액 자체를 그대로 사용하였다.
이렇게 제조된 2종의 약욕제는 부피비로 1,000배의 물로 희석하여 최종적인 약욕제로 사용하였다.
실시예
9: 넙치 사육에서의 사양 효과 확인
실시예 7 및 실시예 8에서 제조한 사료와 약욕제를 이용하여 넙치 사육 시의 사양 결과 개선 여부에 대하여 조사해 보았다. 특히 본 조사는 폐사율 관점에서 실시되었다. 총 1,000 마리의 넙치 치어를 500 마리씩 한 그룹으로 총 2개 그룹(사료로 급이한 그룹-A; 약욕제로 처치한 그룹-B)으로 나누어 4주간 시험을 실시하였다. 각 그룹은 다시 250마리씩으로 구성되는 소그룹으로 나누어지며 각 소그룹은 박테리오파지 Vib-ANP-1이 적용된 소그룹(소그룹-①) 및 박테리오파지가 적용되지 않은 소그룹(소그룹-②)으로 나누었다. 본 시험에 대상이 된 넙치는 치어(체중: 5~7 g, 체장: 8~10 cm)였으며, 각 시험 소그룹의 넙치 치어는 일정 간격을 두고 위치한 격리된 각각의 수조에서 사육되었다. 각 소그룹은 다음의 표 4와 같이 구분되고 지칭되었다.
적용 | 소그룹 구분 및 표시 | |
박테리오파지 Vib-ANP-1 적용 | 박테리오파지가 적용되지 않음 | |
사료로 급이한 그룹 | A-① | A-② |
약욕제로 처치한 그룹 | B-① | B-② |
사료 급이의 경우에는 실시예 7에서 제조한 사료를 표 4의 구분에 따라 통상적인 사료 급이 방식을 따라 급이하였으며, 약욕제 처치의 경우에는 실시예 8에서 설명한 약욕제 제조 방식에 따라 제조한 약욕제를 표 4의 구분에 따라 통상적인 약욕제 처치 방식에 따라 처치하였다. 그 결과는 표 5와 같았다.
그룹 | 폐사개체수/시험개체수 | 폐사율(%) |
A-① | 8/250 | 3.2 |
A-② | 43/250 | 17.2 |
B-① | 10/250 | 4.0 |
B-② | 55/250 | 22.0 |
이상의 결과로 본 발명에 따라 제조된 사료의 급이 및 약욕제의 처치가 넙치 사육에서의 사양 결과 개선에 효과가 있음을 확인할 수 있었다. 이로부터 본 발명의 조성물의 적용이 동물의 사양 결과 개선에 효과적이라는 결론을 내릴 수 있었다.
이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현 예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
기탁기관명 : 한국생명공학연구원
수탁번호 : KCTC13075BP
수탁일자 : 20160816
Claims (5)
- 비브리오 앵길라룸 균을 특이적으로 사멸시킬 수 있는 능력을 갖고 서열번호 1로 표시되는 유전체를 갖는 것을 특징으로 하는 자연으로부터 분리된 시포비리대 박테리오파지 Vib-ANP-1(수탁번호 KCTC 13075BP).
- 제1항의 박테리오파지 Vib-ANP-1(수탁번호 KCTC 13075BP)를 유효성분으로 포함하는 비브리오 앵길라룸 균의 감염 방지 및 비브리오 앵길라룸 균의 감염 치료용 조성물.
- 제2항에 있어서, 상기 조성물은 약욕제 또는 사료첨가제 제조 용도로 사용되는 것을 특징으로 하는 비브리오 앵길라룸 균의 감염 방지 및 비브리오 앵길라룸 균의 감염 치료용 조성물.
- 제2항 또는 제3항에 의한 박테리오파지 Vib-ANP-1(수탁번호 KCTC 13075BP)을 유효성분으로 포함하는 조성물을 사람을 제외한 동물에 투여하는 단계를 포함하는, 비브리오 앵길라룸 균에 의한 감염을 방지 또는 비브리오 앵길라룸 균의 감염을 치료하는 방법.
- 제4항에 있어서, 상기 조성물이 약욕제 또는 사료첨가제 용도로 사람을 제외한 동물에 투여되는 것을 특징으로 하는 비브리오 앵길라룸 균에 의한 감염을 방지 또는 비브리오 앵길라룸 균의 감염을 치료하는 방법.
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