WO2015093495A1 - TGF-β1遺伝子発現制御のための一本鎖核酸分子 - Google Patents

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雅彦 黒田
エステバン ガバザ
小林 哲
忠明 大木
智洋 濱崎
志織 加藤
松本 貴博
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株式会社ボナック
国立大学法人三重大学
学校法人東京医科大学
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    • C12N15/1136Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against growth factors, growth regulators, cytokines, lymphokines or hormones
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    • C12N2310/53Physical structure partially self-complementary or closed
    • C12N2310/531Stem-loop; Hairpin

Definitions

  • the present invention relates to a nucleic acid molecule that suppresses the expression of TGF- ⁇ 1 gene, a composition containing the same, and use thereof.
  • Lung fibrosis is a disease in which lung tissue becomes fibrotic due to the accumulation of excess collagen and other cell matrices.
  • pulmonary fibrosis idiopathic pulmonary fibrosis is a chronic intractable disease with an average intermediate survival period of 3 years and a 5-year survival rate of 20 to 40%.
  • Acute lung injury is a kind of acute respiratory disorder and is acute respiratory failure showing lung infiltration shadow.
  • the pathology of acute lung injury is pulmonary edema due to increased permeability caused by lung capillary endothelial cells and alveolar wall cell damage. This interstitial pulmonary edema, alveolar pulmonary edema and pulmonary collapse leads to increased dead space ventilation and hypoxemia.
  • Patent Documents 1-5 Non-Patent Document 1
  • Patent Documents 1-7 Patent Documents 1-7).
  • RNA interference is known as a technique for suppressing gene expression. Inhibition of gene expression by RNA interference is generally performed, for example, by administering a short double-stranded RNA molecule to a cell or the like.
  • the double-stranded RNA molecule is usually referred to as siRNA (small interfering RNA).
  • siRNA small interfering RNA
  • an object of the present invention is to provide a new nucleic acid molecule that is effective for treating diseases involving the expression of TGF- ⁇ 1, such as pulmonary fibrosis and acute lung injury, and a medicine using the same. To do.
  • the TGF- ⁇ 1 gene expression suppressing nucleic acid molecule of the present invention is characterized by comprising the following nucleotide sequence as a TGF- ⁇ 1 gene expression suppressing sequence.
  • SEQ ID NO: 1 3'-CGUCUCAUGUGUGUCGUAU-5 '
  • composition of the present invention is a composition for suppressing the expression of the TGF- ⁇ 1 gene, and includes the nucleic acid molecule of the present invention.
  • composition of the present invention is a pharmaceutical composition and is characterized by containing the nucleic acid molecule of the present invention.
  • the expression suppression method of the present invention is a method of suppressing the expression of TGF- ⁇ 1 gene, characterized by using the nucleic acid molecule of the present invention.
  • the method for treating pulmonary fibrosis of the present invention is characterized by including a step of administering the nucleic acid molecule of the present invention to a patient.
  • the method for treating acute lung injury of the present invention is characterized by including a step of administering the nucleic acid molecule of the present invention to a patient.
  • the nucleic acid molecule of the present invention can suppress the expression of TGF- ⁇ 1 gene. Therefore, the present invention is effective for treating diseases caused by the expression of the TGF- ⁇ 1 gene, such as pulmonary fibrosis and acute lung injury.
  • FIG. 1 is a schematic diagram showing an example of the nucleic acid molecule of the present invention.
  • FIG. 2 is a schematic diagram showing another example of the nucleic acid molecule of the present invention.
  • FIG. 3 is a schematic diagram showing another example of the nucleic acid molecule of the present invention.
  • FIG. 4 is a schematic diagram showing another example of the nucleic acid molecule of the present invention.
  • FIG. 5 is a graph showing the relative value of TGF- ⁇ 1 amount in Example 1 of the present invention.
  • FIG. 6 is an electrophoretogram of serum stability in Example 2 of the present invention.
  • FIG. 7 is a photograph of electrophoresis for reactivity to Dicer protein in Example 3 of the present invention.
  • FIG. 8 is a graph showing the inhibitory effect of TGF- ⁇ expression in lung tissue by administration of the nucleic acid molecule of the present invention in pulmonary fibrosis spontaneous model mice.
  • FIG. 9 is a graph showing the effect of suppressing the amount of hydroxyproline in lung tissue by administration of the nucleic acid molecule of the present invention in a pulmonary fibrosis spontaneous model mouse.
  • FIG. 10 is a graph showing the inhibitory effect on the total number of cells in bronchoalveolar lavage fluid (BALF) by administration of the nucleic acid molecule of the present invention in bleomycin-induced pulmonary fibrosis model mice.
  • BALF bronchoalveolar lavage fluid
  • FIG. 11 is a graph showing the survival rate improving effect of the bleomycin-induced pulmonary fibrosis model mouse by the administration of the nucleic acid molecule of the present invention.
  • FIG. 12 is a graph showing the effect of suppressing the amount of hydroxyproline in lung tissue by administration of the nucleic acid molecule of the present invention in a bleomycin-induced pulmonary fibrosis model mouse.
  • FIG. 13 is a graph showing the inhibitory effect on the total number of cells in bronchoalveolar lavage fluid (BALF) by administration of the nucleic acid molecule of the present invention in LPS-induced pulmonary fibrosis / acute lung injury combined model mice.
  • FIG. 14 is a graph showing the effect of administration of the nucleic acid molecule of the present invention on the amount of IFN in the bronchoalveolar lavage fluid (BALF) of LPS-induced pulmonary fibrosis / acute lung injury combined model mice.
  • BALF bronchoalveolar lavage fluid
  • nucleic acid molecule for suppressing expression of TGF- ⁇ 1 gene (1) Expression suppressing sequence and complementary sequence As described above, the nucleic acid molecule of the present invention is for suppressing the expression of TGF- ⁇ 1 gene and suppresses the expression of TGF- ⁇ 1 gene.
  • the sequence includes the following nucleotide sequence. (SEQ ID NO: 1) 3'-CGUCUCAUGUGUGUCGUAU-5 '
  • the expression suppression sequence may be, for example, a sequence consisting of the nucleotide sequence or a sequence containing the nucleotide sequence.
  • the length of the expression suppression sequence is not particularly limited, and is, for example, 18 to 32 bases long, preferably 19 to 30 bases long, and more preferably 19, 20, or 21 bases long.
  • the numerical range of the number of bases discloses all positive integers belonging to the range.
  • the description “1 to 4 bases” includes “1, 2, 3, 4 bases”. "Means all disclosures (the same applies hereinafter).
  • the single-stranded nucleic acid molecule of the present invention preferably further has, for example, a complementary sequence that can be annealed with the expression suppressing sequence.
  • the complementary sequence is, for example, in the same strand as the expression suppressing sequence and forms a single-stranded nucleic acid molecule composed of one single strand.
  • the complementary sequence only needs to be annealable with the expression suppression sequence, for example.
  • the complementary sequence may be, for example, a sequence exhibiting 100% complementarity with the expression suppression sequence, or a sequence exhibiting complementarity of less than 100% within a range that can be annealed.
  • the complementarity is not particularly limited, and examples thereof include 90% to 100%, 93% to 100%, 95% to 100%, 98% to 100%, and 99% to 100%.
  • Examples of the complementary sequence include those containing the following nucleotide sequences. (SEQ ID NO: 2) 5'-GCAGAGUACACACAGCAUA-3 '
  • nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 is referred to as s nucleotide sequence.
  • the complementary sequence may be, for example, a sequence composed of the s nucleotide sequence or a sequence containing the s nucleotide sequence.
  • the length of the complementary sequence is not particularly limited, and is, for example, 18 to 32 bases long, preferably 19 to 30 bases long, and more preferably 19, 20, or 21 bases long.
  • the expression suppression sequence and the complementary sequence may each be, for example, an RNA molecule consisting only of ribonucleotide residues, or an RNA molecule containing deoxyribonucleotide residues in addition to ribonucleotide residues.
  • nucleic acid molecule examples include a form in which the expression suppressing sequence and the complementary sequence are directly linked and a form in which they are indirectly linked.
  • Examples of the direct linking include linking by a phosphodiester bond.
  • Examples of the indirect linkage include linkage via a linker region.
  • the order in which the expression suppressing sequence and the complementary sequence are linked is not particularly limited, and for example, the 3 ′ end of the expression suppressing sequence and the 5 ′ end of the complementary sequence may be linked. The 5 ′ end and the 3 ′ end of the complementary sequence may be linked, preferably the former.
  • the linker region may be composed of, for example, nucleotide residues, may be composed of non-nucleotide residues, or may be composed of the nucleotide residues and non-nucleotide residues.
  • nucleotide residues include a ribonucleotide residue and a deoxyribonucleotide residue.
  • a molecule in which a 5′-side region and a 3′-side region are annealed with each other to form a double-stranded structure can be mentioned.
  • This can also be said to be a form of shRNA (small hairpin RNA or short hairpin RNA).
  • shRNA small hairpin RNA or short hairpin RNA.
  • the shRNA has a hairpin structure and generally has one stem region and one loop region.
  • the nucleic acid molecule of this embodiment includes, for example, a region (X), a linker region (Lx), and a region (Xc), and the linker region (Lx) is between the region (X) and the region (Xc). Takes a linked structure.
  • the region (Xc) preferably has a structure complementary to the region (X). Specifically, one of the region (X) and the region (Xc) has the expression suppressing sequence.
  • the other includes the complementary sequence. Since the region (X) and the region (Xc) each have one of the expression suppression sequence and the complementary sequence, for example, a stem structure can be formed by intramolecular annealing, and the linker region (Lx) It becomes a loop structure.
  • the nucleic acid molecule may have, for example, the region (Xc), the linker region (Lx), and the region (X) in the order from 5 ′ side to 3 ′ side, or from the 3 ′ side. You may have the said area
  • the expression suppressing sequence may be arranged, for example, in any of the region (X) and the region (Xc), and may be arranged upstream of the complementary sequence, that is, 5 ′ side of the complementary sequence. preferable.
  • FIG. 1A is a schematic diagram showing an outline of the order of each region
  • FIG. 1B is a schematic diagram showing a state in which the nucleic acid molecule forms a double strand in the molecule. is there.
  • the nucleic acid molecule forms a double strand between the region (Xc) and the region (X), and the Lx region loops according to its length.
  • FIG. 1 merely shows the linking order of the regions and the positional relationship of each region forming a duplex. For example, the length of each region, the shape of the linker region (Lx), etc. Not limited.
  • the number of bases in the region (Xc) and the region (X) is not particularly limited. Although the length of each area
  • the relationship between the number of bases (X) in the region (X) and the number of bases (Xc) in the region (Xc) satisfies, for example, the following (3) or (5) In this case, specifically, for example, the following condition (11) is satisfied.
  • X ⁇ Xc 1 to 10, preferably 1, 2 or 3, More preferably 1 or 2 (11)
  • X Xc (5)
  • the region may be a region composed of only the expression suppression sequence or a region including the expression suppression sequence, for example.
  • the number of bases of the expression suppression sequence is, for example, as described above.
  • the region containing the expression suppression sequence may further have an additional sequence on the 5 'side and / or 3' side of the expression suppression sequence, for example.
  • the number of bases of the additional sequence is, for example, 1 to 31 bases, preferably 1 to 21 bases, and more preferably 1 to 11 bases.
  • the number of bases in the region (Xc) is not particularly limited.
  • the lower limit is, for example, 19 bases.
  • the upper limit is, for example, 50 bases, preferably 30 bases, and more preferably 25 bases.
  • Specific examples of the number of bases in the region (X) are, for example, 19 to 50 bases, preferably 19 to 30 bases, more preferably 19 to 25 bases.
  • the number of bases in the region (X) is not particularly limited.
  • the lower limit is, for example, 19 bases, preferably 20 bases, and more preferably 21 bases.
  • the upper limit is 50 bases, for example, More preferably, it is 40 bases, More preferably, it is 30 bases.
  • the linker region (Lx) includes a nucleotide residue as described above, the length is not particularly limited.
  • the linker region (Lx) preferably has a length that allows the region (X) and the region (Xc) to form a double chain.
  • the lower limit of the number of bases in the linker region (Lx) is, for example, 1 base, preferably 2 bases, more preferably 3 bases, and the upper limit thereof is, for example, 100 bases, preferably 80 bases, more preferably 50 bases.
  • a second form of the single-stranded nucleic acid molecule is a molecule in which the 5 ′ region and the 3 ′ region are separately annealed in the molecule to form two double-stranded structures (stem structures).
  • the nucleic acid molecule of the present embodiment includes, for example, a 5 ′ side region (Xc), an internal region (Z), and a 3 ′ side region (Yc) from the 5 ′ side to the 3 ′ side in the order described above.
  • Z) is formed by connecting an inner 5 ′ side region (X) and an inner 3 ′ side region (Y), and the 5 ′ side region (Xc) is complementary to the inner 5 ′ side region (X).
  • the 3 ′ side region (Yc) is preferably complementary to the inner 3 ′ side region (Y).
  • the 5 ′ region (Xc) when the internal 5 ′ region (X) of the internal region (Z) has the expression suppressing sequence, the 5 ′ region (Xc) preferably has the complementary sequence, When the internal 3 ′ side region (Y) of the region (Z) has the expression suppressing sequence, the 3 ′ side region (Yc) preferably has the complementary sequence.
  • the inner 5 ′ region (X) of the inner region (Z) when the 5 ′ region (Xc) has the expression suppressing sequence, the inner 5 ′ region (X) of the inner region (Z) preferably has the complementary sequence, and the 3 ′ region When (Yc) has the expression suppression sequence, the internal 3 ′ side region (Y) of the internal region (Z) preferably has the complementary sequence.
  • the 5′-side region (Xc) is complementary to the inner 5′-side region (X), and the 3′-side region (Yc) is the inner 3′-side region (Y).
  • the region (Xc) is folded toward the region (X), and the region (Xc) and the region (X) can form a double chain by self-annealing.
  • the region (Yc) is folded toward the region (Y), and the region (Yc) and the region (Y) can form a double chain by self-annealing.
  • the inner region (Z) is connected to the inner 5 'region (X) and the inner 3' region (Y).
  • the region (X) and the region (Y) are directly connected, for example, and do not have an intervening sequence therebetween.
  • the inner region (Z) is defined as “the inner 5 ′ side region (X) and the inner 3 ′ side in order to indicate the arrangement relationship between the 5 ′ side region (Xc) and the 3 ′ side region (Yc)”.
  • the region (Y) is connected to each other ”, and in the inner region (Z), the 5 ′ side region (Xc) and the 3 ′ side region (Yc) are, for example,
  • the use of nucleic acid molecules is not limited to being a separate and independent region. That is, for example, when the internal region (Z) has the expression suppression sequence, the expression suppression sequence is arranged across the region (X) and the region (Y) in the internal region (Z). Also good.
  • the 5 'side region (Xc) and the inner 5' side region (X) may be directly connected or indirectly connected, for example.
  • direct linkage includes, for example, linkage by a phosphodiester bond.
  • a linker region (Lx) is provided between the region (Xc) and the region (X), and the region (Xc) and the region ( And X) are linked together.
  • the 3'-side region (Yc) and the internal 3'-side region (Y) may be directly connected or indirectly connected, for example.
  • direct linkage includes, for example, linkage by a phosphodiester bond.
  • a linker region (Ly) is provided between the region (Yc) and the region (Y), and the region (Yc) and the region ( And Y) are linked.
  • the nucleic acid molecule may have, for example, both the linker region (Lx) and the linker region (Ly), or one of them.
  • the linker region (Lx) is provided between the 5 ′ side region (Xc) and the inner 5 ′ side region (X), and the 3 ′ side region (Yc) and the inner 3 'The linker region (Ly) is not present between the side region (Y), that is, the region (Yc) and the region (Y) are directly linked.
  • the linker region (Ly) is provided between the 3 ′ side region (Yc) and the inner 3 ′ side region (Y), and the 5 ′ side region (Xc) and the The linker region (Lx) is not provided between the internal 5′-side region (X), that is, the region (Xc) and the region (X) are directly linked.
  • the linker region (Lx) and the linker region (Ly) each preferably have a structure that does not cause self-annealing within its own region.
  • FIG. 2 (A) is a schematic diagram showing an outline of the order of each region from the 5 ′ side to the 3 ′ side of the nucleic acid molecule
  • FIG. 2 (B) shows that the nucleic acid molecule is the molecule. It is a schematic diagram which shows the state which forms the double chain
  • FIG. 2 merely shows the connection order of the regions and the positional relationship of the regions forming the double chain.
  • the length of each region is not limited to this.
  • the number of bases in the 5 ′ region (Xc), the internal 5 ′ region (X), the internal 3 ′ region (Y) and the 3 ′ region (Yc) is particularly limited. For example, it is as follows.
  • the 5′-side region (Xc) may be complementary to the entire region of the inner 5′-side region (X), for example.
  • the region (Xc) has the same base length as the region (X), and is composed of a base sequence complementary to the entire region from the 5 ′ end to the 3 ′ end of the region (X).
  • the region (Xc) has the same base length as the region (X), and all bases in the region (Xc) are complementary to all bases in the region (X). That is, for example, it is preferably completely complementary.
  • the present invention is not limited to this.
  • 1 to several (2, 3, 4 or 5) bases may be non-complementary.
  • the 5′-side region (Xc) may be complementary to a partial region of the inner 5′-side region (X), for example.
  • the region (Xc) has, for example, the same base length as the partial region of the region (X), that is, consists of a base sequence having a base length shorter by one base or more than the region (X). preferable. More preferably, the region (Xc) has the same base length as the partial region of the region (X), and all the bases of the region (Xc) are included in the partial region of the region (X). It is preferred that it is complementary to all bases, that is, for example, completely complementary.
  • the partial region of the region (X) is preferably, for example, a region (segment) having a base sequence continuous from the 5 ′ terminal base (first base) in the region (X).
  • the 3′-side region (Yc) may be complementary to the entire region of the inner 3′-side region (Y), for example.
  • the region (Yc) has, for example, the same base length as the region (Y) and is composed of a base sequence complementary to the entire region from the 5 ′ end to the 3 ′ end of the region (Y).
  • the region (Yc) has the same base length as the region (Y), and all bases in the region (Yc) are complementary to all bases in the region (Y). That is, for example, it is preferable to be completely complementary.
  • the present invention is not limited to this.
  • 1 to several (2, 3, 4 or 5) bases may be non-complementary.
  • the 3′-side region (Yc) may be complementary to a partial region of the inner 3′-side region (Y), for example.
  • the region (Yc) has, for example, the same base length as the partial region of the region (Y), that is, consists of a base sequence having a base length shorter by one base or more than the region (Y). preferable. More preferably, the region (Yc) has the same base length as the partial region of the region (Y), and all the bases of the region (Yc) are included in the partial region of the region (Y). It is preferred that it is complementary to all bases, that is, for example, completely complementary.
  • the partial region of the region (Y) is preferably, for example, a region (segment) having a base sequence continuous from the base at the 3 'end (first base) in the region (Y).
  • the number of bases (Z) in the internal region (Z), the number of bases (X) in the internal 5 ′ side region (X), and the number of bases (Y) in the internal 3 ′ side region (Y) Relationship between the number of bases (Z) in the internal region (Z), the number of bases (Xc) in the 5′-side region (Xc), and the number of bases (Yc) in the 3′-side region (Yc) Satisfies, for example, the conditions of the following formulas (1) and (2).
  • Z X + Y (1)
  • the relationship between the number of bases (X) in the inner 5 ′ region (X) and the number of bases (Y) in the inner 3 ′ region (Y) is not particularly limited, For example, any condition of the following formula may be satisfied.
  • X Y (19) X ⁇ Y (20) X> Y (21)
  • the number of bases (X) in the inner 5 ′ side region (X), the number of bases (Xc) in the 5 ′ side region (Xc), the number of bases in the inner 3 ′ side region (Y) (Y ) And the number of bases (Yc) in the 3′-side region (Yc) satisfy, for example, the following conditions (a) to (d).
  • Y Yc (4)
  • X Xc (5) Y> Yc (6) (C)
  • the conditions of the following formulas (7) and (8) are satisfied.
  • X> Xc (7) Y> Yc (8) (D)
  • the conditions of the following formulas (9) and (10) are satisfied.
  • X Xc (9)
  • Y Yc (10)
  • the difference between the number of bases (X) in the inner 5 ′ side region (X) and the number of bases (Xc) in the 5 ′ side region (Xc), the inner 3 ′ side region ( The difference between the number of bases (Y) of Y) and the number of bases (Yc) of the 3 ′ side region (Yc) preferably satisfies the following condition, for example.
  • A The conditions of the following formulas (11) and (12) are satisfied.
  • FIG. 4 has the number of bases (X) in the inner 5 ′ side region (X) and the number of bases (Y) in the inner 3 ′ side region (Y) as “X ⁇ Y” in the formula (20).
  • FIG. 4 is merely a relationship between the inner 5 ′ side region (X) and the 5 ′ side region (Xc), and the relationship between the inner 3 ′ side region (Y) and the 3 ′ side region (Yc).
  • the length and shape of each region are not limited thereto, and the presence or absence of the linker region (Lx) and the linker region (Ly) is not limited thereto.
  • the nucleic acid molecules (a) to (c) include, for example, the 5 ′ side region (Xc) and the internal 5 ′ side region (X), and the 3 ′ side region (Yc) and the internal 3 ′ side.
  • the region (Y) has a base that cannot be aligned with any of the 5 ′ side region (Xc) and the 3 ′ side region (Yc) in the internal region (Z) by forming a double chain, respectively. It can be said that the structure has a base that does not form a double chain.
  • the base that cannot be aligned also referred to as a base that does not form a double chain
  • free base In FIG.
  • the free base region is indicated by “F”.
  • the number of bases in the region (F) is not particularly limited.
  • the number of bases (F) in the region (F) is, for example, the number of bases “X-Xc” in the case of the nucleic acid molecule (a), and “Y—Yc” in the case of the nucleic acid molecule (b). In the case of the nucleic acid molecule (c), it is the total number of bases “X—Xc” and “Y—Yc”.
  • the nucleic acid molecule of (d) has a structure in which, for example, the entire region of the internal region (Z) is aligned with the 5 ′ side region (Xc) and the 3 ′ side region (Yc), It can also be said that the entire region (Z) forms a double chain.
  • the 5 'end of the 5' side region (Xc) and the 3 'end of the 3' side region (Yc) are unlinked.
  • each region is exemplified below for the nucleic acid molecule, but the present invention is not limited to this.
  • the total number of bases of the free base (F) in the 5 ′ side region (Xc), the 3 ′ side region (Yc), and the internal region (Z) is the number of bases in the internal region (Z). .
  • the lengths of the 5 ′ side region (Xc) and the 3 ′ side region (Yc) depend on, for example, the length of the internal region (Z), the number of free bases (F), and the position thereof. Can be determined as appropriate.
  • the number of bases in the internal region (Z) is, for example, 19 bases or more.
  • the lower limit of the number of bases is, for example, 19 bases, preferably 20 bases, and more preferably 21 bases.
  • the upper limit of the number of bases is, for example, 50 bases, preferably 40 bases, and more preferably 30 bases.
  • Specific examples of the number of bases in the internal region (Z) include, for example, 19 bases, 20 bases, 21 bases, 22 bases, 23 bases, 24 bases, 25 bases, 26 bases, 27 bases, 28 bases, 29 bases, or , 30 bases.
  • the internal region (Z) may be, for example, a region composed only of the expression suppression sequence or a region including the expression suppression sequence.
  • the number of bases of the expression suppression sequence is, for example, as described above.
  • the internal region (Z) contains the expression suppression sequence it may further have an additional sequence on the 5 'side and / or 3' side of the expression suppression sequence.
  • the number of bases of the additional sequence is, for example, 1 to 31 bases, preferably 1 to 21 bases, more preferably 1 to 11 bases, and further preferably 1 to 7 bases.
  • the number of bases in the 5 ′ side region (Xc) is, for example, 1 to 29 bases, preferably 1 to 11 bases, more preferably 1 to 7 bases, and further preferably 1 to 4 bases. Particularly preferred are 1 base, 2 bases and 3 bases.
  • the internal region (Z) or the 3 'side region (Yc) includes the expression suppression sequence, for example, such a base number is preferable.
  • the number of bases in the internal region (Z) is 19 to 30 bases (for example, 19 bases)
  • the number of bases in the 5 ′ side region (Xc) is, for example, 1 to 11 bases
  • the number is preferably 1 to 7 bases, more preferably 1 to 4 bases, and still more preferably 1 base, 2 bases, and 3 bases.
  • the 5′-side region (Xc) may be, for example, a region composed only of the expression suppression sequence, or a region including the expression suppression sequence But you can.
  • the length of the expression suppression sequence is, for example, as described above.
  • the 5 'region (Xc) contains the expression suppression sequence, it may further have an additional sequence on the 5' side and / or 3 'side of the expression suppression sequence.
  • the number of bases of the additional sequence is, for example, 1 to 11 bases, and preferably 1 to 7 bases.
  • the number of bases in the 3 ′ side region (Yc) is, for example, 1 to 29 bases, preferably 1 to 11 bases, more preferably 1 to 7 bases, and further preferably 1 to 4 bases. Particularly preferred are 1 base, 2 bases and 3 bases.
  • the internal region (Z) or the 5 'side region (Xc) includes the expression suppression sequence, for example, such a base number is preferable.
  • the number of bases in the internal region (Z) is 19 to 30 bases (for example, 19 bases)
  • the number of bases in the 3 ′ side region (Yc) is, for example, 1 to 11 bases
  • the number is preferably 1 to 7 bases, more preferably 1 to 4 bases, and still more preferably 1 base, 2 bases, and 3 bases.
  • the 3 ′ side region (Yc) may be, for example, a region composed only of the expression suppression sequence, or a region including the expression suppression sequence But you can.
  • the length of the expression suppression sequence is, for example, as described above.
  • the 3 'side region (Yc) includes the expression suppression sequence, it may further have an additional sequence on the 5' side and / or 3 'side of the expression suppression sequence.
  • the number of bases of the additional sequence is, for example, 1 to 11 bases, and preferably 1 to 7 bases.
  • the number of bases in the internal region (Z), the 5′-side region (Xc), and the 3′-side region (Yc) is expressed by, for example, “Z ⁇ Xc + Yc” in the formula (2). Can do.
  • the number of bases “Xc + Yc” is, for example, the same as or smaller than the inner region (Z).
  • “Z ⁇ (Xc + Yc)” is, for example, 1 to 10, preferably 1 to 4, more preferably 1, 2 or 3.
  • the “Z ⁇ (Xc + Yc)” corresponds to the number of bases (F) in the free base region (F) in the internal region (Z).
  • the linker region (Lx) preferably has, for example, a length that allows the internal 5 ′ side region (X) and the 5 ′ side region (Xc) to form a double chain, and the linker region (Ly) ) Is, for example, preferably a length such that the inner 3 ′ side region (Y) and the 3 ′ side region (Yc) can form a double chain.
  • the lengths of the linker region (Lx) and the linker region (Ly) may be the same or different, and the base sequences thereof may be the same or different.
  • the lower limit of the number of bases in the linker region (Lx) and the linker region (Ly) is, for example, 1 base, preferably 2 bases, more preferably 3 bases, and the upper limit thereof is, for example, 100 bases, preferably 80 bases, more preferably 50 bases.
  • Specific examples of the number of bases in each linker region include 1 to 50 bases, 1 to 30 bases, 1 to 20 bases, 1 to 10 bases, 1 to 7 bases, and 1 to 4 bases. This is not a limitation.
  • the total length of the nucleic acid molecule is not particularly limited.
  • the lower limit of the total number of bases is, for example, 38 bases, preferably 42 bases, more preferably 50 bases, and even more preferably 51 bases.
  • the upper limit is, for example, 52 bases, and the upper limit thereof is, for example, 300 bases, preferably 200 bases, more preferably 150 bases, still more preferably 100 bases, and particularly preferably 80 bases. .
  • the lower limit of the total number of bases excluding the linker region (Lx) and the linker region (Ly) is, for example, 38 bases, preferably 42 bases, more preferably 50 bases, More preferably, it is 51 bases, particularly preferably 52 bases, and the upper limit is, for example, 300 bases, preferably 200 bases, more preferably 150 bases, still more preferably 100 bases, Preferably, it is 80 bases.
  • the 5 'end and the 3' end may be bound or unbound.
  • the nucleic acid molecule of this form is a circular single-stranded nucleic acid molecule.
  • the nucleic acid molecule of the present embodiment is preferably a non-phosphate group at the 5 'end, for example, since it can maintain unbonded at both ends.
  • a third form of the single-stranded nucleic acid molecule is a molecule in which the linker region has a non-nucleotide structure.
  • This embodiment can use the above description except that the linker region (Lx) and / or the linker region (Ly) has a non-nucleotide structure in the nucleic acid molecules of the first and second forms.
  • the non-nucleotide structure is not particularly limited, and examples thereof include polyalkylene glycol, pyrrolidine skeleton and piperidine skeleton.
  • examples of the polyalkylene glycol include polyethylene glycol.
  • the pyrrolidine skeleton may be, for example, a skeleton of a pyrrolidine derivative in which one or more carbons constituting the 5-membered ring of pyrrolidine are substituted, and when substituted, for example, a carbon atom other than C-2 carbon. It is preferable.
  • the carbon may be substituted with, for example, nitrogen, oxygen or sulfur.
  • the pyrrolidine skeleton may contain, for example, a carbon-carbon double bond or a carbon-nitrogen double bond in the 5-membered ring of pyrrolidine.
  • the carbon and nitrogen constituting the 5-membered ring of pyrrolidine may be bonded, for example, to hydrogen or a substituent as described below.
  • the linker region (Lx) is the region (X) and the region (Xc), and the linker region (Ly) is the region (Y) and the region (Yc), for example, any of the pyrrolidine skeleton. It may be bonded via a group, preferably any one carbon atom of the five-membered ring and nitrogen, preferably two-position carbon (C-2) and nitrogen of the five-membered ring. is there.
  • the pyrrolidine skeleton include a proline skeleton and a prolinol skeleton.
  • the proline skeleton, prolinol skeleton, and the like are excellent in safety because they are, for example, in-vivo substances and their reduced forms.
  • the piperidine skeleton may be, for example, a skeleton of a piperidine derivative in which one or more carbons constituting the six-membered ring of piperidine are substituted, and when substituted, for example, a carbon atom other than C-2 carbon. It is preferable.
  • the carbon may be substituted with, for example, nitrogen, oxygen or sulfur.
  • the piperidine skeleton may contain, for example, a carbon-carbon double bond or a carbon-nitrogen double bond in the 6-membered ring of piperidine.
  • the carbon and nitrogen constituting the piperidine 6-membered ring may be bonded to, for example, a hydrogen group or a substituent as described later.
  • the linker region (Lx) includes the region (X) and the region (Xc), the linker region (Ly) includes the region (Y) and the region (Yc), and any one of the piperidine skeleton, for example. It may be bonded via a group, preferably any one carbon atom of the six-membered ring and nitrogen, more preferably carbon (C-2) at the 2-position of the six-membered ring and nitrogen. It is.
  • the linker region may include, for example, only a non-nucleotide residue having the non-nucleotide structure, or may include a non-nucleotide residue having the non-nucleotide structure and a nucleotide residue.
  • the linker region is represented by the following formula (I), for example.
  • X 1 and X 2 are each independently H 2 , O, S or NH; Y 1 and Y 2 are each independently a single bond, CH 2 , NH, O or S; R 3 is a hydrogen atom or substituent bonded to C-3, C-4, C-5 or C-6 on ring A; L 1 is an alkylene chain consisting of n atoms, wherein the hydrogen atom on the alkylene carbon atom is replaced with OH, OR a , NH 2 , NHR a , NR a R b , SH, or SR a May or may not be substituted, or L 1 is a polyether chain in which one or more carbon atoms of the alkylene chain are substituted with an oxygen atom,
  • L 2 is an alkylene chain consisting of n atoms, wherein the hydrogen atom on the alkylene carbon atom is replaced with OH, OR a , NH 2 , NHR a , NR a R b , SH, or
  • the ring A may contain a carbon-carbon double bond or a carbon-nitrogen double bond
  • the region (Xc) and the region (X) are each bonded to the linker region (Lx) via —OR 1 — or —OR 2 —;
  • the region (Yc) and the region (Y) are each bonded to the linker region (Ly) via —OR 1 — or —OR 2 —,
  • R 1 and R 2 may be present or absent, and when present, R 1 and R 2 are each independently a nucleotide residue or the structure (I).
  • X 1 and X 2 are each independently, for example, H 2 , O, S or NH.
  • X 1 being H 2 means that X 1 together with the carbon atom to which X 1 is bonded forms CH 2 (methylene group). The same is true for X 2.
  • Y 1 and Y 2 are each independently a single bond, CH 2 , NH, O or S.
  • l 1 or 2.
  • ring A is a 5-membered ring, for example, the pyrrolidine skeleton.
  • the pyrrolidine skeleton include a proline skeleton and a prolinol skeleton, and examples thereof include a bivalent structure.
  • ring A is a 6-membered ring, for example, the piperidine skeleton.
  • one carbon atom other than C-2 on ring A may be substituted with nitrogen, oxygen or sulfur.
  • Ring A may contain a carbon-carbon double bond or a carbon-nitrogen double bond in ring A.
  • Ring A may be, for example, either L-type or D-type.
  • R 3 is a hydrogen atom or a substituent bonded to C-3, C-4, C-5 or C-6 on the ring A.
  • R 3 is the above-described substituent, the substituent R 3 may be one, plural, or absent, and when plural, it may be the same or different.
  • the substituent R 3 is, for example, halogen, OH, OR 4 , NH 2 , NHR 4 , NR 4 R 5 , SH, SR 4 or an oxo group ( ⁇ O).
  • R 4 and R 5 are, for example, each independently a substituent or a protecting group, and may be the same or different.
  • substituents include halogen, alkyl, alkenyl, alkynyl, haloalkyl, aryl, heteroaryl, arylalkyl, cycloalkyl, cycloalkenyl, cycloalkylalkyl, cyclylalkyl, hydroxyalkyl, alkoxyalkyl, aminoalkyl, heterocyclylalkenyl. , Heterocyclylalkyl, heteroarylalkyl, silyl, silyloxyalkyl and the like. The same applies hereinafter.
  • the substituent R 3 may be any of these listed substituents.
  • the protecting group is, for example, a functional group that converts a highly reactive functional group to inert, and examples thereof include known protecting groups.
  • the description of the literature J. F. W. McOmie, “Protecting Groups in Organic Chemistry” Prenum Press, London and New York, 1973) can be used for the protecting group.
  • the protective group is not particularly limited, and examples thereof include tert-butyldimethylsilyl group (TBDMS), bis (2-acetoxyethyloxy) methyl group (ACE), triisopropylsilyloxymethyl group (TOM), 1- (2 -Cyanoethoxy) ethyl group (CEE), 2-cyanoethoxymethyl group (CEM), tolylsulfonylethoxymethyl group (TEM), dimethoxytrityl group (DMTr) and the like.
  • R 3 is OR 4
  • the protecting group is not particularly limited, and examples thereof include a TBDMS group, an ACE group, a TOM group, a CEE group, a CEM group, and a TEM group.
  • the silyl-containing group of [Chemical Formula 5] described later is also included. The same applies hereinafter.
  • L 1 is an alkylene chain composed of n atoms.
  • the hydrogen atom on the alkylene carbon atom may be substituted with, for example, OH, OR a , NH 2 , NHR a , NR a R b , SH, or SR a , or may not be substituted.
  • L 1 may be a polyether chain in which one or more carbon atoms of the alkylene chain are substituted with an oxygen atom.
  • the polyether chain is, for example, polyethylene glycol.
  • L 2 is an alkylene chain composed of m atoms.
  • the hydrogen atom on the alkylene carbon atom may be substituted with, for example, OH, OR c , NH 2 , NHR c , NR c R d , SH or SR c , or may not be substituted.
  • L 2 may be a polyether chain in which one or more carbon atoms of the alkylene chain are substituted with an oxygen atom.
  • Y 2 is NH, O or S
  • the L 2 atom bonded to Y 2 is carbon
  • the L 2 atom bonded to OR 2 is carbon
  • oxygen atoms are not adjacent to each other. That is, for example, when Y 2 is O, the oxygen atom and the oxygen atom of L 2 are not adjacent, and the oxygen atom of OR 2 and the oxygen atom of L 2 are not adjacent.
  • N in L 1 and m in L 2 are not particularly limited, and the lower limit is, for example, 0, and the upper limit is not particularly limited.
  • n and m can be appropriately set according to the desired length of the linker region (Lx) or (Ly), for example.
  • n and m are each preferably 0 to 30, more preferably 0 to 20, and still more preferably 0 to 15 from the viewpoint of production cost and yield.
  • n + m is, for example, 0 to 30, preferably 0 to 20, and more preferably 0 to 15.
  • R a , R b , R c and R d are, for example, each independently a substituent or a protecting group.
  • the substituent and the protecting group are the same as described above, for example.
  • hydrogen atoms may be independently substituted with halogens such as Cl, Br, F and I, for example.
  • the region (Xc) and the region (X) are in the linker region (Lx), the region (Yc) and the region (Y) are in the linker region (Ly), for example, —OR 1 — Alternatively, the bonds are made through —OR 2 —.
  • R 1 and R 2 may or may not exist.
  • R 1 and R 2 are each independently a nucleotide residue or the structure of formula (I) above.
  • the linker region (Lx) and the linker region (Ly) are, for example, of the formula (I) except for the nucleotide residue R 1 and / or R 2 It is formed from the non-nucleotide residue consisting of a structure and the nucleotide residue.
  • the linker region (Lx) and the linker region (Ly) are, for example, the non-nucleotide residue having the structure of the formula (I) Two or more structures are connected.
  • the structure of the formula (I) may include 1, 2, 3, or 4, for example.
  • the structure of (I) may be directly linked or may be bonded via the nucleotide residue, for example.
  • R 1 and R 2 are not present, the linker region (Lx) and the linker region (Ly) are formed only from the non-nucleotide residue having the structure of the formula (I), for example.
  • the combination of the region (Xc) and the region (X), the region (Yc) and the region (Y), and the —OR 1 — and —OR 2 — is not particularly limited.
  • One of the following conditions can be given.
  • Condition (1) The region (Xc) is bonded to the structure of the formula (I) through —OR 2 —, and the region (X) is bonded through —OR 1 —.
  • the region (Yc) is bonded to the structure of the formula (I) through —OR 1 —, and the region (Y) is bonded through —OR 2 —.
  • Condition (2) The region (Xc) is bonded to the structure of the formula (I) through —OR 2 —, and the region (X) is bonded through —OR 1 —.
  • the region (Yc) is bonded to the structure of the formula (I) through —OR 2 —, and the region (Y) is bonded through —OR 1 —.
  • Condition (3) The region (Xc) is bonded to the structure of the formula (I) through —OR 1 —, and the region (X) is bonded through —OR 2 —.
  • the region (Yc) is bonded to the structure of the formula (I) through —OR 1 —, and the region (Y) is bonded through —OR 2 —.
  • Condition (4) The region (Xc) is bonded to the structure of the formula (I) through —OR 1 —, and the region (X) is bonded through —OR 2 —.
  • the region (Yc) is bonded to the structure of the formula (I) through —OR 2 —, and the region (Y) is bonded through —OR 1 —.
  • Examples of the structure of the formula (I) include the following formulas (I-1) to (I-9), in which n and m are the same as those in the formula (I).
  • q is an integer of 0 to 10.
  • n, m and q are not particularly limited and are as described above.
  • the structural unit of the nucleic acid molecule of the present invention is not particularly limited, and examples thereof include nucleotide residues.
  • the nucleotide residue include a ribonucleotide residue and a deoxyribonucleotide residue.
  • the nucleotide residue include an unmodified unmodified nucleotide residue and a modified modified nucleotide residue.
  • the nucleic acid molecule of the present invention can improve nuclease resistance and stability, for example, by including the modified nucleotide residue.
  • the nucleic acid molecule of the present invention may further contain a non-nucleotide residue in addition to the nucleotide residue, for example.
  • each of the constituent units in the region other than the linker is preferably the nucleotide residue.
  • Each region is composed of the following residues (1) to (3), for example. (1) Unmodified nucleotide residue (2) Modified nucleotide residue (3) Unmodified nucleotide residue and modified nucleotide residue
  • the structural unit of the linker region is not particularly limited, and examples thereof include the nucleotide residue and the non-nucleotide residue.
  • the linker region may be composed of, for example, only the nucleotide residue, may be composed of only the non-nucleotide residue, or may be composed of the nucleotide residue and the non-nucleotide residue.
  • the linker region is composed of the following residues (1) to (7), for example.
  • both structural units may be the same or different.
  • Specific examples include, for example, a form in which the constituent units of both linker regions are the nucleotide residues, a form in which the constituent units of both linker regions are the non-nucleotide residues, and the constituent units of one region are the nucleotide residues.
  • the other linker region is a non-nucleotide residue.
  • nucleic acid molecule of the present invention examples include a molecule composed only of the nucleotide residue, a molecule containing the non-nucleotide residue in addition to the nucleotide residue, and the like.
  • the nucleotide residue may be, for example, only the unmodified nucleotide residue, only the modified nucleotide residue, or the unmodified nucleotide residue and the modification. Both nucleotide residues may be used.
  • the number of the modified nucleotide residue is not particularly limited, and is, for example, “one or several”, specifically For example, 1 to 5, preferably 1 to 4, more preferably 1 to 3, and most preferably 1 or 2.
  • the number of the non-nucleotide residue is not particularly limited, and is, for example, “one or several”, specifically, for example, 1 to Eight, one to six, one to four, one, two or three.
  • the number of the modified ribonucleotide residue is not particularly limited, and for example, “1 or several” Specifically, for example, 1 to 5, preferably 1 to 4, more preferably 1 to 3, and most preferably 1 or 2.
  • the modified ribonucleotide residue relative to the unmodified ribonucleotide residue may be, for example, the deoxyribonucleotide residue in which a ribose residue is replaced with a deoxyribose residue.
  • the number of the deoxyribonucleotide residue is not particularly limited, and is, for example, “one or several” Specifically, for example, 1 to 5, preferably 1 to 4, more preferably 1 to 3, and most preferably 1 or 2.
  • the nucleic acid molecule of the present invention may contain, for example, a labeling substance and be labeled with the labeling substance.
  • the labeling substance is not particularly limited, and examples thereof include fluorescent substances, dyes, isotopes and the like.
  • the labeling substance include fluorophores such as pyrene, TAMRA, fluorescein, Cy3 dye, and Cy5 dye, and examples of the dye include Alexa dye such as Alexa488.
  • the isotope include a stable isotope and a radioactive isotope, and preferably a stable isotope.
  • the stable isotope has a low risk of exposure and does not require a dedicated facility, so that it is easy to handle and the cost can be reduced.
  • the stable isotope does not change the physical properties of the labeled compound, for example, and is excellent in properties as a tracer.
  • the stable isotope is not particularly limited, and examples thereof include 2 H, 13 C, 15 N, 17 O, 18 O, 33 S, 34 S, and 36 S.
  • the nucleic acid molecule of the present invention can suppress the expression of the TGF- ⁇ 1 gene. Therefore, the nucleic acid molecule of the present invention can be used, for example, as a therapeutic agent for diseases caused by the TGF- ⁇ 1 gene.
  • “treatment” includes, for example, the meanings of preventing the disease, improving the disease, and improving the prognosis. Specific examples of the disease include acute lung injury; pulmonary fibrosis.
  • the method of using the nucleic acid molecule of the present invention is not particularly limited, and for example, the nucleic acid molecule may be administered to an administration subject having the TGF- ⁇ 1 gene.
  • Examples of the administration target include cells, tissues or organs.
  • Examples of the administration subject include non-human animals such as humans and non-human mammals other than humans.
  • the administration may be, for example, in vivo or in vitro.
  • the cells are not particularly limited, and examples thereof include various cultured cells such as A549, HeLa, 293, and COS7, pluripotent stem cells such as ES cells and iPS cells, somatic stem cells such as hematopoietic stem cells, the pluripotent stem cells or Examples thereof include various cultured cells derived from somatic stem cells, cells isolated from living bodies such as primary cultured cells, and the like.
  • nucleic acid molecule of the present invention refers to the description of the composition of the present invention, expression suppression method, treatment method and the like described later.
  • nucleic acid molecule of the present invention can suppress the expression of the TGF- ⁇ 1 gene as described above, it is useful, for example, as a research tool for pharmaceuticals, diagnostic agents, agricultural chemicals, agricultural chemicals, medicine, life sciences and the like. is there.
  • nucleotide residues include, for example, sugars, bases and phosphates as constituent elements.
  • examples of the nucleotide residue include a ribonucleotide residue and a deoxyribonucleotide residue as described above.
  • the ribonucleotide residue has, for example, a ribose residue as a sugar, and has adenine (A), guanine (G), cytosine (C) and U (uracil) as bases
  • the deoxyribose residue is For example, it has a deoxyribose residue as a sugar and has adenine (A), guanine (G), cytosine (C) and thymine (T) as bases.
  • the nucleotide residue includes an unmodified nucleotide residue and a modified nucleotide residue.
  • each of the constituent elements is, for example, the same or substantially the same as that existing in nature, and preferably the same or substantially the same as that naturally occurring in the human body. .
  • the modified nucleotide residue is, for example, a nucleotide residue obtained by modifying the unmodified nucleotide residue.
  • the modified nucleotide residue for example, any of the constituent elements of the unmodified nucleotide residue may be modified.
  • “modification” refers to, for example, substitution, addition and / or deletion of the component, substitution, addition and / or deletion of atoms and / or functional groups in the component, and is referred to as “modification”. be able to.
  • modified nucleotide residue include naturally occurring nucleotide residues, artificially modified nucleotide residues, and the like. For example, Limbac et al.
  • modified nucleosides of RNA Nucleic Acids Res. 22: 2183-2196
  • the modified nucleotide residue may be, for example, a residue of the nucleotide substitute.
  • ribophosphate skeleton examples include modification of a ribose-phosphate skeleton (hereinafter referred to as ribophosphate skeleton).
  • a ribose residue can be modified.
  • the ribose residue can be modified, for example, at the 2′-position carbon.
  • a hydroxyl group bonded to the 2′-position carbon can be replaced with hydrogen or a halogen such as fluoro.
  • the ribose residue can be replaced with deoxyribose.
  • the ribose residue can be substituted with, for example, a stereoisomer, and can be substituted with, for example, an arabinose residue.
  • the ribophosphate skeleton may be substituted with a non-ribophosphate skeleton having a non-ribose residue and / or non-phosphate, for example.
  • the non-ribophosphate skeleton include uncharged ribophosphate skeletons.
  • the substitute for the nucleotide substituted with the non-ribophosphate skeleton include morpholino, cyclobutyl, pyrrolidine and the like.
  • Other examples of the substitute include artificial nucleic acid monomer residues. Specific examples include PNA (peptide nucleic acid), LNA (Locked Nucleic Acid), ENA (2'-O, 4'-C-Ethylenebridged Nucleic Acid), and PNA is preferred.
  • a phosphate group can be modified.
  • the phosphate group closest to the sugar residue is called an ⁇ -phosphate group.
  • the ⁇ -phosphate group is negatively charged, and the charge is evenly distributed over two oxygen atoms that are not bound to a sugar residue.
  • the four oxygen atoms in the ⁇ -phosphate group in the phosphodiester bond between nucleotide residues, the two oxygen atoms that are non-bonded to the sugar residue are hereinafter referred to as “non-linking oxygen”.
  • the two oxygen atoms bonded to the sugar residue are hereinafter referred to as “linking oxygen”.
  • the ⁇ -phosphate group is preferably subjected to, for example, a modification that makes it uncharged or a modification that makes the charge distribution in the unbound oxygen asymmetric.
  • the phosphate group may replace the non-bonded oxygen, for example.
  • the oxygen is, for example, one of S (sulfur), Se (selenium), B (boron), C (carbon), H (hydrogen), N (nitrogen), and OR (R is an alkyl group or an aryl group).
  • R is an alkyl group or an aryl group.
  • the non-bonded oxygen for example, both are preferably substituted, and more preferably, both are substituted with S.
  • the modified phosphate group include phosphorothioate, phosphorodithioate, phosphoroselenate, boranophosphate, boranophosphate ester, phosphonate hydrogen, phosphoramidate, alkyl or arylphosphonate, and phosphotriester. Among them, phosphorodithioate in which the two non-bonded oxygens are both substituted with S is preferable.
  • the phosphate group may substitute, for example, the bonded oxygen.
  • the oxygen can be substituted, for example, with any atom of S (sulfur), C (carbon) and N (nitrogen), and the modified phosphate group is, for example, a bridged phosphoramidate, S substituted with N Substituted bridged phosphorothioates, bridged methylene phosphonates substituted with C, and the like.
  • the binding oxygen substitution is preferably performed, for example, on at least one of the 5 ′ terminal nucleotide residue and the 3 ′ terminal nucleotide residue of the nucleic acid molecule of the present invention. For the 'side, substitution with N is preferred.
  • the phosphate group may be substituted with, for example, the phosphorus-free linker.
  • the linker include siloxane, carbonate, carboxymethyl, carbamate, amide, thioether, ethylene oxide linker, sulfonate, sulfonamide, thioform acetal, form acetal, oxime, methyleneimino, methylenemethylimino, methylenehydrazo, methylenedimethyl. Hydrazo, methyleneoxymethylimino and the like, preferably methylenecarbonylamino group and methylenemethylimino group.
  • nucleic acid molecule of the present invention for example, at least one nucleotide residue at the 3 'end and the 5' end may be modified.
  • the modification may be, for example, either the 3 'end or the 5' end, or both.
  • the modification is, for example, as described above, and is preferably performed on the terminal phosphate group.
  • the phosphate group may be modified entirely, or one or more atoms in the phosphate group may be modified. In the former case, for example, the entire phosphate group may be substituted or deleted.
  • Examples of the modification of the terminal nucleotide residue include addition of other molecules.
  • Examples of the other molecule include functional molecules such as a labeling substance and a protecting group as described above.
  • Examples of the protecting group include S (sulfur), Si (silicon), B (boron), ester-containing groups, and the like.
  • the functional molecule such as the labeling substance can be used for detecting the nucleic acid molecule of the present invention, for example.
  • the other molecule may be added to the phosphate group of the nucleotide residue, for example, or may be added to the phosphate group or the sugar residue via a spacer.
  • the terminal atom of the spacer can be added or substituted, for example, to the binding oxygen of the phosphate group or O, N, S or C of the sugar residue.
  • the binding site of the sugar residue is preferably, for example, C at the 3 'position or C at the 5' position, or an atom bonded thereto.
  • the spacer can be added or substituted at a terminal atom of a nucleotide substitute such as PNA.
  • the spacer is not particularly limited.
  • n is a positive integer
  • n 3 or 6 is preferable.
  • the molecule to be added to the terminal includes, for example, a dye, an intercalating agent (for example, acridine), a crosslinking agent (for example, psoralen, mitomycin C), a porphyrin (TPPC4, texaphyrin, suffirin), a polycyclic Aromatic hydrocarbons (eg phenazine, dihydrophenazine), artificial endonucleases (eg EDTA), lipophilic carriers (eg cholesterol, cholic acid, adamantaneacetic acid, 1-pyrenebutyric acid, dihydrotestosterone, 1,3-bis- O (hexadecyl) glycerol, geranyloxyhexyl group, hexadecylglycerol, borneol, menthol, 1,3-propanediol, heptadecyl group, palmitic acid, myristic acid, O3- (oleoy
  • the 5 ′ end may be modified with, for example, a phosphate group or a phosphate group analog.
  • the phosphate group is, for example, 5 ′ monophosphate ((HO) 2 (O) PO-5 ′), 5 ′ diphosphate ((HO) 2 (O) POP (HO) (O) —O— 5 '), 5' triphosphate ((HO) 2 (O) PO- (HO) (O) POP (HO) (O) -O-5 '), 5'-guanosine cap (7-methylated or Unmethylated, 7m-GO-5 '-(HO) (O) PO- (HO) (O) POP (HO) (O) -O-5'), 5'-adenosine cap (Appp), optional Modified or unmodified nucleotide cap structure (NO-5 '-(HO) (O) PO- (HO) (O) POP (HO) (O) -O-5'), 5 'mono
  • the base is not particularly limited.
  • the base may be, for example, a natural base or a non-natural base.
  • the base may be, for example, naturally derived or a synthetic product.
  • As the base for example, a general base or a modified analog thereof can be used.
  • Examples of the base include purine bases such as adenine and guanine, and pyrimidine bases such as cytosine, uracil and thymine.
  • Other examples of the base include inosine, thymine, xanthine, hypoxanthine, nubalarine, isoguanisine, and tubercidine.
  • the base examples include alkyl derivatives such as 2-aminoadenine and 6-methylated purine; alkyl derivatives such as 2-propylated purine; 5-halouracil and 5-halocytosine; 5-propynyluracil and 5-propynylcytosine; -Azouracil, 6-azocytosine and 6-azothymine; 5-uracil (pseudouracil), 4-thiouracil, 5-halouracil, 5- (2-aminopropyl) uracil, 5-aminoallyluracil; 8-halogenated, aminated, Thiolated, thioalkylated, hydroxylated and other 8-substituted purines; 5-trifluoromethylated and other 5-substituted pyrimidines; 7-methylguanine; 5-substituted pyrimidines; 6-azapyrimidines; N-2, N -6 and O-6 substituted purines (2-aminopropyladenyl 5-
  • the modified nucleotide residue may include, for example, a residue lacking a base, that is, an abasic ribophosphate skeleton.
  • the modified nucleotide residues are, for example, US provisional application 60 / 465,665 (filing date: April 25, 2003), and international application PCT / US04 / 07070 (filing date: 2004/3). The residues described on the 8th of May) can be used, and the present invention can incorporate these documents.
  • Method for synthesizing nucleic acid molecule of the present invention is not particularly limited, and conventionally known methods can be adopted.
  • Examples of the synthesis method include a synthesis method using a genetic engineering technique, a chemical synthesis method, and the like.
  • Examples of genetic engineering techniques include in vitro transcription synthesis, a method using a vector, and a method using a PCR cassette.
  • the vector is not particularly limited, and examples thereof include non-viral vectors such as plasmids and viral vectors.
  • the chemical synthesis method is not particularly limited, and examples thereof include a phosphoramidite method and an H-phosphonate method.
  • a commercially available automatic nucleic acid synthesizer can be used.
  • amidite is generally used.
  • the amidite is not particularly limited, and commercially available amidites include, for example, RNA Phosphoramidates (2′-O-TBDMSi, trade name, Michisato Pharmaceutical), ACE amidite, TOM amidite, CEE amidite, CEM amidite, TEM amidite, etc. Can be given.
  • the expression vector of the present invention is characterized by comprising DNA encoding the nucleic acid molecule of the present invention.
  • the expression vector of the present invention is characterized by containing the DNA, and other configurations are not limited at all.
  • the DNA is inserted so that the vector can be expressed.
  • the vector into which the DNA is inserted is not particularly limited, and for example, a general vector can be used, and examples thereof include viral vectors and non-viral vectors. Examples of the non-viral vector include a plasmid vector.
  • composition for suppressing expression of the present invention is a composition for suppressing the expression of the TGF- ⁇ 1 gene, and includes the nucleic acid molecule of the present invention.
  • the composition of the present invention is characterized by including the nucleic acid molecule of the present invention, and other configurations are not limited at all.
  • the expression suppressing composition of the present invention can also be referred to as an expression suppressing reagent, for example.
  • the expression of the TGF- ⁇ 1 gene can be suppressed by administration to a subject in which the TGF- ⁇ 1 gene is present.
  • the pharmaceutical composition of the present invention is characterized by containing the nucleic acid molecule of the present invention.
  • the composition of the present invention is characterized by containing the nucleic acid molecule of the present invention, and other configurations are not limited at all.
  • the pharmaceutical composition of the present invention can also be referred to as a pharmaceutical product, for example.
  • administration to a patient with a disease caused by the TGF- ⁇ 1 gene can suppress the expression of the gene and treat the disease.
  • diseases are as described above, and include acute lung injury, interstitial pneumonia / pulmonary fibrosis and the like.
  • treatment includes, for example, the meanings of prevention of the above-mentioned diseases, improvement of the diseases, and improvement of the prognosis.
  • composition for suppressing expression and the pharmaceutical composition (hereinafter referred to as composition) of the present invention
  • the nucleic acid molecule is administered to an administration subject having the TGF- ⁇ 1 gene. do it.
  • Examples of the administration target include cells, tissues or organs.
  • Examples of the administration subject include non-human animals such as humans and non-human mammals other than humans.
  • the administration may be, for example, in vivo or in vitro.
  • the cells are not particularly limited, and examples thereof include the cells described above.
  • the administration method is not particularly limited, and can be appropriately determined according to the administration subject, for example.
  • the administration subject is a cultured cell
  • examples thereof include a method using a transfection reagent and an electroporation method.
  • composition of the present invention may contain, for example, only the nucleic acid molecule of the present invention or may contain other additives.
  • the additive is not particularly limited, and for example, a pharmaceutically acceptable additive is preferable.
  • the type of the additive is not particularly limited, and can be appropriately selected depending on, for example, the type of administration target.
  • the nucleic acid molecule may form a complex with the additive, for example.
  • the additive can also be referred to as a complexing agent, for example.
  • the complex formation for example, the nucleic acid molecule can be efficiently delivered.
  • the binding between the nucleic acid molecule and the complexing agent is not particularly limited, and examples thereof include non-covalent binding. Examples of the complex include an inclusion complex.
  • the complexing agent is not particularly limited, and examples thereof include a polymer, cyclodextrin, adamantine and the like.
  • examples of the cyclodextrin include a linear cyclodextrin copolymer and a linear oxidized cyclodextrin copolymer.
  • Examples of the additive include a carrier, a binding substance to a target cell, a condensing agent, a fusing agent, an excipient, and the like.
  • the expression suppression method of the present invention is a method of suppressing the expression of the TGF- ⁇ 1 gene, characterized by using the nucleic acid molecule of the present invention.
  • the expression suppression method of the present invention is characterized by using the nucleic acid molecule of the present invention, and other steps and conditions are not limited at all.
  • the expression suppression method of the present invention includes, for example, a step of administering the nucleic acid molecule to a subject in which the TGF- ⁇ 1 gene is present.
  • the administration step for example, the nucleic acid molecule is brought into contact with the administration subject.
  • the administration subject include cells, tissues, and organs.
  • the administration subject include non-human animals such as humans and non-human mammals other than humans.
  • the administration may be, for example, in vivo or in vitro.
  • the nucleic acid molecule may be administered alone, or the composition of the present invention containing the nucleic acid molecule may be administered.
  • the administration method is not particularly limited, and can be appropriately selected depending on, for example, the type of administration target.
  • the therapeutic method of the disease of this invention is characterized by including the process of administering the nucleic acid molecule of the said this invention to a patient as mentioned above.
  • the therapeutic method of the present invention is characterized by using the nucleic acid molecule of the present invention, and other steps and conditions are not limited at all.
  • the diseases targeted by the present invention are, for example, as described above, and include acute lung injury, interstitial pneumonia / pulmonary fibrosis and the like.
  • the expression suppression method of the present invention can be used.
  • the administration method is not particularly limited, and may be, for example, oral administration or parenteral administration.
  • the dosage of the nucleic acid molecule of the present invention in the treatment method of the present invention is not particularly limited as long as it is a therapeutically effective amount for the above-mentioned disease, and the type, severity, species of animal to be administered, age, weight, drug Usually, it is about 0.0001 to about 100 mg / kg per adult, for example about 0.001 to about 10 mg / kg, preferably about 0.005 to about 5 mg / kg, although it varies depending on the acceptability, administration route, etc. obtain.
  • the amount can be administered, for example, at intervals of 3 times a day to once every 2 weeks, preferably once a day to once a week.
  • nucleic acid molecule The use of the present invention is the use of the nucleic acid molecule of the present invention for suppressing the expression of the TGF- ⁇ 1 gene.
  • the present invention also provides a nucleic acid molecule of the present invention for use in suppressing expression of the TGF- ⁇ 1 gene or treating pulmonary fibrosis or acute lung injury.
  • the present invention also provides use of the nucleic acid molecule of the present invention for the manufacture of an inhibitor of TGF- ⁇ 1 gene expression or a therapeutic agent for pulmonary fibrosis or acute lung injury.
  • TGF- ⁇ 1 gene expression inhibitory effect of single-stranded nucleic acid molecules in A549 cells (1) Synthesis of single-stranded nucleic acid molecules The following single-stranded nucleic acid molecules were synthesized based on the phosphoramidite method. The product was synthesized by a synthesizer (trade name: ABI Expedite (registered trademark) 8909 Nucleic Acid Synthesis System, Applied Biosystems). For the synthesis, RNA Phosphoramidites (2′-O-TBDMSi, trade name, Michisato Pharmaceutical) was used as an RNA amidite (hereinafter the same). The deprotection of the amidite followed a conventional method. The synthesized RNA was purified by HPLC. Each purified RNA was lyophilized.
  • PH-0009 is used as a single-stranded nucleic acid molecule in Examples, and single-stranded nucleic acid molecules nkRNA (hereinafter also referred to as NK-0133) and PnkRNA (hereinafter referred to as PKRNA) used by Hamasaki et al. (Also referred to as -0051) (PLoS ONE, 7 (8), e42655, doi: 10.1371, 2012, Table S5) were synthesized as described above.
  • Lx and Ly are linker regions Lx and Ly, respectively, and each has the following structural formula using L-proline diamide amidite.
  • the underlined portion is a human TGF- ⁇ 1 gene expression suppression sequence.
  • PH-0009 SEQ ID NO: 3
  • nkRNA SEQ ID NO: 4
  • PnkRNA SEQ ID NO: 5'-AGCAGAGUACACACAGCAUAUACC-Lx-GGUA UAUGCUGUGUGUACUCUGC UUC-Ly-G-3 '
  • RNA was dissolved in distilled water for injection (Otsuka Pharmaceutical Co., Ltd.) so as to be 20 ⁇ mol / L to prepare an RNA solution.
  • A549 cells (DS Pharma Biomedical) were used.
  • DMEM Invitrogen
  • the culture conditions were 37 ° C. and 5% CO 2 .
  • the cells were cultured in the medium, and the culture solution was dispensed into a 24-well plate in 400 ⁇ L portions at 5 ⁇ 10 4 cells / well. Furthermore, after culturing the cells in the well for 24 hours, the RNA was transfected using the transfection reagent Lipofectamine 2000 (Invitrogen) according to the protocol attached to the transfection reagent. Specifically, the composition per well was set as follows, and transfection was performed. In the following composition, (B) is Opti-MEM (Invitrogen), (C) is 20 ⁇ mol / L of the RNA solution, and 98.5 ⁇ L of both were added. In the well, the final concentration of RNA was 1 nmol / L.
  • PCR was performed using the synthesized cDNA as a template, and the expression level of the TGF- ⁇ 1 gene and the expression level of the ⁇ -actin gene as an internal standard were measured.
  • PCR primer set for TGF- ⁇ 1 gene (SEQ ID NO: 6) 5'-TTGTGCGGCAGTGGTTGAGCCG-3 ' (SEQ ID NO: 7) 5'-GAAGCAGGAAAGGCCGGTTCATGC-3 '
  • Primer set for ⁇ -actin gene (SEQ ID NO: 8) 5'-GCCACGGCTGCTTCCAGCTCCTC-3 ' (SEQ ID NO: 9) 5'-AGGTCTTTGCGGATGTCCACGTCAC-3 '
  • the gene expression level was also measured for cells in which only 100 ⁇ L of the solution (B) was added to the culture solution ( ⁇ ).
  • the RNA solution was not added, and the cells treated in the same manner except that (A) 1.5 ⁇ L and (B) were added in total 100 ⁇ L were also used for gene expression. The amount was measured (mock).
  • the expression level in the cells of the control ( ⁇ ) was taken as 1, and the relative value of the expression level in the cells into which each RNA was introduced was determined.
  • FIG. 5 is a graph showing the relative value of the TGF- ⁇ 1 gene expression level, and the vertical axis represents the relative gene expression level.
  • all single-stranded nucleic acid molecules showed strong gene expression suppression activity.
  • PH-0009 of the present invention exhibits a stronger gene expression suppressing activity than the other two single-stranded nucleic acid molecules.
  • Example 2 Stability of single-stranded nucleic acid molecule in human serum PH-0009 of Example 1 is used as the nucleic acid molecule of Example, and NK- The stability in human serum was examined using 0133 and PK-0051.
  • FIG. 6 (A) shows the result of electrophoresis showing the stability of PH-0009 against serum
  • FIG. 6 (B) shows the result of electrophoresis showing the stability of NK-0133 against serum.
  • lane “M” is a molecular weight marker
  • (min) indicates the incubation time.
  • NK-0133 and PK-0051 of the comparative example already started a rapid degradation reaction after 0.5 minutes of incubation, and as a result, all of 0.5 to 240 minutes In the result, it was confirmed that the size of the nucleic acid molecule was smaller than the result of 0 minute.
  • the change in the mobility with the passage of the incubation time that is, the decrease in the molecular weight due to the degradation was hardly confirmed. From this result, it was shown that PH-0009, which is a nucleic acid molecule of the present invention, has high stability in human serum.
  • Example 3 Reactivity of Single-Stranded Nucleic Acid Molecules to Dicer Protein PH-0009 of Example 1 is used as the nucleic acid molecule of Example, and NK-0133 shown in Example 1 is used as the nucleic acid molecule of Comparative Example. Using PK-0051, reactivity to Dicer protein was examined.
  • a reaction solution containing the Dicer protein and the nucleic acid molecule was prepared according to the attached protocol, and incubated at 37 ° C. Incubation times were 0, 0.5, 1, 2, 6, and 24 hours.
  • the reaction stop solution of the reagent was added to the reaction solution after incubation for a predetermined time, and 7M urea-20% polyacrylamide gel electrophoresis was performed. Thereafter, the polyacrylamide gel was stained with SYBR Green II (trade name, Lonza) and analyzed using ChemiDoc (trade name, Bio-Rad).
  • FIG. 7 shows the results of electrophoresis showing reactivity to Dicer protein
  • lane “M” shows molecular weight markers (20, 30, 40, 50 and 100 base).
  • Example 4 Inhibition of pulmonary fibrosis in spontaneously occurring pulmonary fibrosis model mice Using pulmonary fibrosis spontaneously occurring model mice (human TGF- ⁇ 1 transgenic mice described in Non-Patent Documents 6 and 7, hereinafter referred to as TG mice)
  • TG mice human TGF- ⁇ 1 transgenic mice described in Non-Patent Documents 6 and 7, hereinafter referred to as TG mice
  • nucleic acid molecule solution PH-0009 synthesized in Example 1 was used as the nucleic acid molecule of the example.
  • a nucleic acid molecule solution was prepared by dissolving PH-0009 in sterile physiological saline so as to be 2 ⁇ g / 75 ⁇ L.
  • nucleic acid molecule (2) Administration of nucleic acid molecule to spontaneously developing pulmonary fibrosis model mouse Using the above-mentioned nucleic acid molecule solution, MycroSprayer® (MSA-250-M: manufactured by PENNCENTURY), once / week, 4 times in total Administered intratracheally. As a negative control for the nucleic acid molecule solution, 75 ⁇ L of sterile physiological saline was used.
  • Each administration group is shown below. In each treatment group, 5 male mice were used. ⁇ Administration group 1 Wild type mice were administered 75 ⁇ L of sterile physiological saline and administered group 2 TG mice were administered 75 ⁇ L of sterile saline and administered group 3 Administration of 75 ⁇ L of 2 ⁇ g / 75 ⁇ L nucleic acid molecule solution (0.1 mg / kg mouse body weight) to TG mice
  • mice were anesthetized by intraperitoneal administration of pentobarbital (1.62 mg / 200 ⁇ L / head), and heparin-containing was obtained from the right ventricle of the mice after blood collection. After slow reflux with physiological saline, the right lung was extracted.
  • FIG. 8 is a graph showing the amount of TGF- ⁇ 1 in administration groups 2 and 3, and the vertical axis shows the amount of TGF- ⁇ 1 in lung tissue.
  • FIG. 9 is a graph showing the amount of hydroxyproline in each administration group, and the vertical axis shows the amount of hydroxyproline in the lung tissue.
  • TG mouse / nucleic acid molecule solution 0.1 mg / kg
  • administration group 3 the amount of TGF- ⁇ 1 and hydroxyproline in lung tissue was significantly higher than that in TG mouse / sterile saline administration group 2. Suppressed. From this, it was shown that PH-0009, which is a nucleic acid molecule of the present invention, suppresses the expression of target TGF- ⁇ 1 and suppresses lung fibrosis even in vivo.
  • Non-patent Document 7 Lung fibrosis inhibitory effect in bleomycin-induced pulmonary fibrosis model mouse
  • BALF bronchoalveolar lavage fluid
  • PH-0009 or PH-0000 was dissolved in sterile physiological saline so as to be 100 ⁇ g / 50 ⁇ L to prepare a nucleic acid molecule solution.
  • nucleic acid molecule solution was intratracheally administered to mice.
  • a wild-type mouse administered with 50 ⁇ L of sterile physiological saline was used as a normal control.
  • Each administration group is shown below.
  • Bleomycin-administered TG mice were administered 100 ⁇ g / 50 ⁇ L PH-0000 solution 50 ⁇ L and administered group 3 Bleomycin-administered TG mice were administered 100 ⁇ g / 50 ⁇ L PH-0009 solution 50 ⁇ L. Survival of mice in each administration group was monitored for 21 days from the start of bleomycin administration.
  • the total number of cells in the collected BALF was counted with a nucleocounter (ChemoMetec, Allerod, Denmark) on the day of bronchoalveolar lavage, and a cell specimen was prepared by cytospin (Labsystems Japan), and Giemsa staining (Merck Japan) was performed. The cell fraction was calculated. The amount of hydroxyproline in the lung tissue was measured in the same manner as in Example 4.
  • FIG. 10 is a graph showing the degree of inflammation associated with pulmonary fibrosis in each administration group, and the horizontal axis shows the total number of cells in BALF.
  • FIG. 11 is a graph showing a survival curve in each administration group, and the vertical axis shows the cumulative survival rate.
  • FIG. 12 is a graph showing the degree of fibrosis of lung tissue, and the horizontal axis shows the amount of hydroxyproline in lung tissue.
  • the survival rate of the mice was remarkably improved as compared with the TG mouse / PH-0000 administration group 2, and the BALF cell count and hydroxyproline in lung tissue The amount was significantly suppressed.
  • PH-0009 which is a nucleic acid molecule of the present invention, suppresses inflammation and lung fibrosis associated with pulmonary fibrosis and exhibits a therapeutic effect on pulmonary fibrosis in vivo.
  • Example 6 Inflammation inhibitory effect and safety in LPS-induced pulmonary fibrosis / acute lung injury combined model mice
  • Treatment with the nucleic acid molecule of the present invention using mice that have both pulmonary fibrosis and acute lung injury caused by LPS administration The effects and side effects were investigated.
  • the method described in Non-Patent Document 7 is used to confirm the therapeutic effect using the total number of cells in BALF as an index, and to confirm the presence or absence of side effects using the expression levels of interferon (IFN) - ⁇ and - ⁇ in BALF as an index. Went according to.
  • IFN interferon
  • Example 1 (1) Preparation of Nucleic Acid Molecule Solution PH-0009 synthesized in Example 1 was used as the nucleic acid molecule of Example, and PH-0000 was used as a negative control. Further, PK-0051 synthesized in Example 1 was used as a reference example, and PK-0000 having the following sequence was used as a negative control.
  • Lx and Ly represent a linker represented by the following structural formula.
  • Each nucleic acid molecule was dissolved in distilled water so as to be 50 ⁇ g / 50 ⁇ L to prepare a nucleic acid molecule solution.
  • Each administration group is shown below.
  • FIG. 13 is a graph showing the degree of inflammation associated with pulmonary fibrosis in each administration group, and the horizontal axis shows the total number of cells in BALF.
  • FIG. 14 is a graph showing the amount of IFN in BALF (upper: IFN- ⁇ , lower: IFN- ⁇ ) in each administration group, and the vertical axis shows the IFN concentration in BALF.
  • group 6 administered with TG mouse / PH-0009 solution, the number of BALF cells was significantly suppressed as compared with group 5 administered with TG mouse / PH-0000. Even when compared with PK-0051, the number of BALF cells tended to decrease, although there was no significant difference.
  • the amount of IFN in BALF was not significantly different from the control group in any of the nucleic acid molecule administration groups. From this, it was confirmed that PH-0009, which is a nucleic acid molecule of the present invention, suppresses inflammation and exhibits a therapeutic effect in vivo even in patients with pulmonary fibrosis and acute lung injury. Further, since no side effects were observed due to the administration of the nucleic acid molecule, it was suggested that PH-0009 can be safely administered to animals including humans in a therapeutically effective amount.
  • the single-stranded nucleic acid molecule of the present invention can suppress the expression of the TGF- ⁇ 1 gene. Therefore, the present invention is effective for treating diseases caused by the expression of the TGF- ⁇ 1 gene, such as pulmonary fibrosis and acute lung injury.

Abstract

 本発明は、TGF-β1遺伝子の発現を抑制する一本鎖核酸分子であって、領域(X)、リンカー領域(Lx)および領域(Xc)のみからなり、前記リンカー領域(Lx)が、ピロリジン骨格およびピペリジン骨格の少なくとも一方を含む非ヌクレオチド構造を有し、かつ前記領域(X)および前記領域(Xc)の少なくとも一方が、TGF-β1遺伝子の発現を抑制する発現抑制配列を含むことを特徴とする核酸分子、並びに該一本鎖核酸分子を含む、肺線維症または急性肺傷害の治療用薬学的組成物を提供する。

Description

TGF-β1遺伝子発現制御のための一本鎖核酸分子
 本発明は、TGF-β1遺伝子の発現を抑制する核酸分子、それを含む組成物およびその用途に関する。
 肺線維症は、過剰なコラーゲンと他の細胞マトリックスの蓄積により肺組織が線維化する疾患である。肺線維症の中でも特発性肺線維症は、中間生存期間が平均3年、5年生存率が20~40%の慢性難治性疾患である。
 急性肺傷害は、急性呼吸障害の一種であり、肺浸潤陰影を示す急性呼吸不全である。急性肺傷害の病態は、肺毛細血管内皮細胞および肺胞壁細胞障害が原因となる透過性亢進による肺水腫である。この間質性肺水腫、肺胞性肺水腫および肺虚脱によって、死腔換気率が増大し、低酸素血症が発生する。
 肺線維症や急性肺傷害については、効果的な治療法がないのが現状であり、有効な治療薬の開発が望まれている。肺線維症や急性肺傷害の発症には、TGF-β1の発現が関与していることが報告されていることから、この遺伝子発現を抑制する試みがなされている(特許文献1-5、非特許文献1-7)。
 遺伝子の発現を抑制する技術として、例えば、RNA干渉(RNAi)が知られている。RNA干渉による遺伝子の発現抑制は、例えば、短い二本鎖のRNA分子を、細胞等に投与することによって、実施されるのが一般的である。前記二本鎖のRNA分子は、通常、siRNA(small interfering RNA)と呼ばれる。前記TGF-β1遺伝子の発現について、siRNAの研究が行われているが、より効果的な核酸分子の提供が望まれている。
国際公開第2007/109097号 国際公開第2003/035083号 特開2007-119396号 特表2009-516517号 国際公開第2012/050181号
Wangら、J Plast Reconstr Aesthet Surg、1193-1199、60、2007 Hwangら、Exp Mol pathol、48-54、81、2006 Takabatakeら、Gene Ther、965-973、12、2005 Xuら、Hepatobiliary Pancreat Dis Int、300-308、2009 Liuら、Biothechnol Lett、1609-1615、27、2005 Gabazzaら、Am J Respir Cell Mol Biol. 397-406、46、2012 Hamasakiら、PLoS ONE、 7(8)、e42655、doi:10.1371、2012
 そこで、本発明は、肺線維症や急性肺傷害等のTGF-β1の発現が関与している疾患を治療する為に、有効な新たな核酸分子、およびこれを用いた医薬の提供を目的とする。
 前記目的を達成するために、本発明のTGF-β1遺伝子の発現抑制用核酸分子は、TGF-β1遺伝子の発現抑制配列として、下記のヌクレオチド配列を含むことを特徴とする。
 (配列番号1) 3’-CGUCUCAUGUGUGUCGUAU-5’
 本発明の組成物は、TGF-β1遺伝子の発現を抑制するための組成物であって、前記本発明の核酸分子を含むことを特徴とする。
 本発明の組成物は、薬学的組成物であって、前記本発明の核酸分子を含むことを特徴とする。
 本発明の発現抑制方法は、TGF-β1遺伝子の発現を抑制する方法であって、前記本発明の核酸分子を使用することを特徴とする。
 本発明の肺線維症の治療方法は、前記本発明の核酸分子を、患者に投与する工程を含むことを特徴とする。
 本発明の急性肺傷害の治療方法は、前記本発明の核酸分子を、患者に投与する工程を含むことを特徴とする。
 本発明の核酸分子によれば、TGF-β1遺伝子の発現抑制が可能である。このため、本発明は、TGF-β1遺伝子の発現が原因となる疾患、例えば、肺線維症および急性肺傷害等の治療に有効である。
図1は、本発明の核酸分子の一例を示す模式図である。 図2は、本発明の核酸分子のその他の例を示す模式図である。 図3は、本発明の核酸分子のその他の例を示す模式図である。 図4は、本発明の核酸分子のその他の例を示す模式図である。 図5は、本発明の実施例1におけるTGF-β1量の相対値を示すグラフである。 図6は、本発明の実施例2における血清中の安定性についての電気泳動の写真である。 図7は、本発明の実施例3におけるダイサータンパク質に対する反応性についての電気泳動の写真である。 図8は、肺線維症自然発症モデルマウスにおける本発明の核酸分子投与による肺組織中TGF-β発現抑制効果を示すグラフである。 図9は、肺線維症自然発症モデルマウスにおける本発明の核酸分子投与による肺組織中ハイドロキシプロリン量の抑制効果を示すグラフである。 図10は、ブレオマイシン誘発肺線維症モデルマウスにおける本発明の核酸分子投与による気管支肺胞洗浄液(BALF)中の総細胞数の抑制効果を示すグラフである。 図11は、ブレオマイシン誘発肺線維症モデルマウスにおける本発明の核酸分子投与による生存率改善効果を示すグラフである。 図12は、ブレオマイシン誘発肺線維症モデルマウスにおける本発明の核酸分子投与による肺組織中ハイドロキシプロリン量の抑制効果を示すグラフである。 図13は、LPS誘発肺線維症/急性肺傷害併発モデルマウスにおける本発明の核酸分子投与による気管支肺胞洗浄液(BALF)中の総細胞数の抑制効果を示すグラフである。 図14は、LPS誘発肺線維症/急性肺傷害併発モデルマウスの気管支肺胞洗浄液(BALF)中のIFN量に及ぼす本発明の核酸分子投与の影響を示すグラフである。
 本明細書で使用する用語は、特に言及しない限り、当該技術分野で通常用いられる意味で用いることができる。
1.TGF-β1遺伝子の発現抑制用核酸分子
(1)発現抑制配列および相補配列
 本発明の核酸分子は、前述のように、TGF-β1遺伝子の発現抑制用であって、TGF-β1遺伝子の発現抑制配列として、下記のヌクレオチド配列を含むことを特徴とする。
(配列番号1) 3’-CGUCUCAUGUGUGUCGUAU-5’
 前記発現抑制配列は、例えば、前記ヌクレオチド配列からなる配列でもよいし、前記ヌクレオチド配列を含む配列でもよい。
 前記発現抑制配列の長さは、特に制限されず、例えば、18~32塩基長であり、好ましくは19~30塩基長であり、より好ましくは19、20、21塩基長である。本発明において、例えば、塩基数の数値範囲は、その範囲に属する正の整数を全て開示するものであり、例えば、「1~4塩基」との記載は、「1、2、3、4塩基」の全ての開示を意味する(以下、同様)。
 本発明の一本鎖核酸分子は、例えば、さらに、前記発現抑制配列とアニーリング可能な相補配列を有することが好ましい。前記相補配列は、例えば、前記発現抑制配列と同じ鎖にあり、1つの一本鎖から構成される一本鎖核酸分子を形成する。
 前記相補配列は、例えば、前記発現抑制配列とアニーリング可能であればよい。前記相補配列は、例えば、前記発現抑制配列と、100%の相補性を示す配列でもよいし、アニーリング可能な範囲で100%未満の相補性を示す配列でもよい。前記相補性は、特に制限されず、例えば、90%~100%、93%~100%、95%~100%、98%~100%、99%~100%等が例示できる。
 前記相補配列は、例えば、下記のヌクレオチド配列を含むものが例示できる。
 (配列番号2)5’-GCAGAGUACACACAGCAUA-3’
 以下、前記配列番号2のヌクレオチド配列をsヌクレオチド配列という。
 前記相補配列は、例えば、前記sヌクレオチド配列からなる配列でもよいし、前記sヌクレオチド配列を含む配列でもよい。
 前記相補配列の長さは、特に制限されず、例えば、18~32塩基長であり、好ましくは19~30塩基長であり、より好ましくは19、20、21塩基長である。
 前記発現抑制配列と前記相補配列はそれぞれ、例えば、リボヌクレオチド残基のみからなるRNA分子でもよいし、リボヌクレオチド残基の他に、デオキシリボヌクレオチド残基を含むRNA分子でもよい。
(2)一本鎖核酸分子
 前記核酸分子は、例えば、前記発現抑制配列と前記相補配列とが、直接的に連結している形態および間接的に連結している形態があげられる。前記直接的な連結は、例えば、ホスホジエステル結合による連結があげられる。前記間接的な連結は、例えば、リンカー領域を介した連結があげられる。前記発現抑制配列と前記相補配列との連結順序は、特に制限されず、例えば、前記発現抑制配列の3’末端と前記相補配列の5’末端とが連結してもよく、前記発現抑制配列の5’末端と前記相補配列の3’末端とが連結してもよく、好ましくは前者である。前記リンカー領域は、例えば、ヌクレオチド残基から構成されてもよいし、非ヌクレオチド残基から構成されてもよく、前記ヌクレオチド残基および非ヌクレオチド残基から構成されてもよい。前記ヌクレオチド残基は、例えば、リボヌクレオチド残基およびデオキシリボヌクレオチド残基があげられる。
 以下に、前記一本鎖核酸分子の具体例を例示するが、本発明は、これには制限されない。
(2-1)
 前記一本鎖核酸分子の第1形態として、5’側領域および3’側領域が、互いにアニーリングして二重鎖構造(ステム構造)を形成する分子があげられる。これは、shRNA(small hairpin RNAまたはshort hairpin RNA)の形態とも言える。shRNAは、ヘアピン構造をとっており、一般的に、一つのステム領域と一つのループ領域とを有する。
 本形態の核酸分子は、例えば、領域(X)、リンカー領域(Lx)および領域(Xc)を含み、前記領域(X)と前記領域(Xc)との間に、前記リンカー領域(Lx)が連結された構造をとる。そして、前記領域(Xc)が、前記領域(X)と相補的である構造が好ましく、具体的には、前記領域(X)および前記領域(Xc)のうち、一方が、前記発現抑制配列を含み、他方が、前記相補配列を含むことが好ましい。前記領域(X)と前記領域(Xc)は、それぞれ、前記発現抑制配列および前記相補配列のいずれかを有するため、例えば、分子内アニーリングにより、ステム構造を形成でき、前記リンカー領域(Lx)がループ構造となる。
 前記核酸分子は、例えば、5’側から3’側にかけて、前記領域(Xc)、前記リンカー領域(Lx)および前記領域(X)を、前記順序で有してもよいし、3’側から5’側にかけて、前記領域(Xc)、前記リンカー領域(Lx)および前記領域(X)を、前記順序で有してもよい。前記発現抑制配列は、例えば、前記領域(X)と前記領域(Xc)のいずれに配置してもよく、前記相補配列の上流側、すなわち、前記相補配列よりも5’側に配置することが好ましい。
 本形態の核酸分子の一例を、図1の模式図に示す。図1(A)は、各領域の順序の概略を示す模式図であり、図1(B)は、前記核酸分子が、前記分子内において二重鎖を形成している状態を示す模式図である。図1(B)に示すように、前記核酸分子は、前記領域(Xc)と前記領域(X)との間で、二重鎖が形成され、前記Lx領域が、その長さに応じてループ構造をとる。図1は、あくまでも、前記領域の連結順序および二重鎖を形成する各領域の位置関係を示すものであり、例えば、各領域の長さ、前記リンカー領域(Lx)の形状等は、これに制限されない。
 前記核酸分子において、前記領域(Xc)および前記領域(X)の塩基数は、特に制限されない。以下に各領域の長さを例示するが、本発明は、これには制限されない。
 前記核酸分子において、前記領域(X)の塩基数(X)と前記領域(Xc)の塩基数(Xc)との関係は、例えば、下記(3)または(5)の条件を満たし、前者の場合、具体的には、例えば、下記(11)の条件を満たす。
   X>Xc ・・・(3)
   X-Xc=1~10、好ましくは1、2または3、
        より好ましくは1または2   ・・・(11)
   X=Xc ・・・(5)
 前記領域(X)または前記領域(Xc)が前記発現抑制配列を含む場合、前記領域は、例えば、前記発現抑制配列のみから構成される領域でもよいし、前記発現抑制配列を含む領域でもよい。前記発現抑制配列の塩基数は、例えば、前述の通りである。前記発現抑制配列を含む領域は、例えば、前記発現抑制配列の5’側および/または3’側に、さらに付加配列を有してもよい。前記付加配列の塩基数は、例えば、1~31塩基であり、好ましくは、1~21塩基であり、より好ましくは、1~11塩基である。
 前記領域(Xc)の塩基数は、特に制限されない。前記領域(X)が、前記発現抑制配列を含む場合、その下限は、例えば、19塩基である。その上限は、例えば、50塩基であり、好ましくは30塩基であり、より好ましくは25塩基である。前記領域(X)の塩基数の具体例は、例えば、19塩基~50塩基であり、好ましくは、19塩基~30塩基、より好ましくは19塩基~25塩基である。
 前記領域(X)の塩基数は、特に制限されない。その下限は、例えば、19塩基であり、好ましくは20塩基であり、より好ましくは21塩基である。その上限は、例えば、50塩基であり、より好ましくは40塩基であり、さらに好ましくは30塩基である。
 前記リンカー領域(Lx)は、それ自体の領域内部において、自己アニーリングを生じない構造であることが好ましい。
 前記リンカー領域(Lx)が、前述のようにヌクレオチド残基を含む場合、その長さは、特に制限されない。前記リンカー領域(Lx)は、例えば、前記領域(X)と前記領域(Xc)とが二重鎖を形成可能な長さであることが好ましい。前記リンカー領域(Lx)の塩基数は、その下限が、例えば、1塩基であり、好ましくは2塩基であり、より好ましくは3塩基であり、その上限が、例えば、100塩基であり、好ましくは80塩基であり、より好ましくは50塩基である。
 前記核酸分子の全長は、特に制限されない。前記核酸分子において、前記塩基数の合計(全長の塩基数)は、下限が、例えば、38塩基であり、好ましくは42塩基であり、より好ましくは50塩基であり、さらに好ましくは51塩基であり、特に好ましくは52塩基であり、その上限は、例えば、300塩基であり、好ましくは200塩基であり、より好ましくは150塩基であり、さらに好ましくは100塩基であり、特に好ましくは80塩基である。前記核酸分子において、前記リンカー領域(Lx)を除く塩基数の合計は、下限が、例えば、38塩基であり、好ましくは42塩基であり、より好ましくは50塩基であり、さらに好ましくは51塩基であり、特に好ましくは52塩基であり、上限が、例えば、300塩基であり、好ましくは200塩基であり、より好ましくは150塩基であり、さらに好ましくは100塩基であり、特に好ましくは80塩基である。
(2-2)
 前記一本鎖核酸分子の第2形態として、5’側領域および3’側領域が、それぞれ別個に分子内アニーリングして、2つの二重鎖構造(ステム構造)を形成する分子があげられる。
 本形態の核酸分子は、例えば、5’側から3’側にかけて、5’側領域(Xc)、内部領域(Z)および3’側領域(Yc)を、前記順序で含み、前記内部領域(Z)が、内部5’側領域(X)および内部3’側領域(Y)が連結して構成され、前記5’側領域(Xc)が、前記内部5’側領域(X)と相補的であり、前記3’側領域(Yc)が、前記内部3’側領域(Y)と相補的である構造が好ましい。そして、前記内部領域(Z)、前記5’側領域(Xc)および前記3’側領域(Yc)の少なくとも一つが、前記発現抑制配列を含むことが好ましい。具体的には、前記内部領域(Z)の前記内部5’側領域(X)が前記発現抑制配列を有する場合、前記5’側領域(Xc)が前記相補配列を有することが好ましく、前記内部領域(Z)の前記内部3’側領域(Y)が前記発現抑制配列を有する場合、前記3’側領域(Yc)が前記相補配列を有することが好ましい。また、前記5’側領域(Xc)が前記発現抑制配列を有する場合、前記内部領域(Z)の前記内部5’側領域(X)が前記相補配列を有することが好ましく、前記3’側領域(Yc)が前記発現抑制配列を有する場合、前記内部領域(Z)の前記内部3’側領域(Y)が前記相補配列を有することが好ましい。
 前記核酸分子において、前記5’側領域(Xc)は、前記内部5’側領域(X)と相補的であり、前記3’側領域(Yc)は、前記内部3’側領域(Y)と相補的である。このため、5’側において、前記領域(Xc)が前記領域(X)に向かって折り返し、前記領域(Xc)と前記領域(X)とが、自己アニーリングによって、二重鎖を形成可能であり、また、3’側において、前記領域(Yc)が前記領域(Y)に向かって折り返し、前記領域(Yc)と前記領域(Y)とが、自己アニーリングによって、二重鎖を形成可能である。
 前記内部領域(Z)は、前述のように、前記内部5’領域(X)と前記内部3’領域(Y)が連結されている。前記領域(X)と前記領域(Y)は、例えば、直接的に連結され、その間に介在配列を有していない。前記内部領域(Z)は、前記5’側領域(Xc)および前記3’側領域(Yc)との配列関係を示すために、「前記内部5’側領域(X)と前記内部3’側領域(Y)が連結して構成される」と表わすものであって、前記内部領域(Z)において、前記5’側領域(Xc)と前記3’側領域(Yc)とが、例えば、前記核酸分子の使用において、別個の独立した領域であることを限定するものではない。すなわち、例えば、前記内部領域(Z)が、前記発現抑制配列を有する場合、前記内部領域(Z)において、前記領域(X)と前記領域(Y)とにわたって、前記発現抑制配列が配置されてもよい。
 前記核酸分子において、前記5’側領域(Xc)と前記内部5’側領域(X)とは、例えば、直接連結してもよいし、間接的に連結してもよい。前者の場合、直接的な連結は、例えば、ホスホジエステル結合による連結があげられる。後者の場合、例えば、前記領域(Xc)と前記領域(X)との間に、リンカー領域(Lx)を有し、前記リンカー領域(Lx)を介して、前記領域(Xc)と前記領域(X)とが連結している形態があげられる。
 前記核酸分子において、前記3’側領域(Yc)と前記内部3’側領域(Y)とは、例えば、直接連結してもよいし、間接的に連結してもよい。前者の場合、直接的な連結は、例えば、ホスホジエステル結合による連結があげられる。後者の場合、例えば、前記領域(Yc)と前記領域(Y)との間に、リンカー領域(Ly)を有し、前記リンカー領域(Ly)を介して、前記領域(Yc)と前記領域(Y)とが連結している形態があげられる。
 前記核酸分子は、例えば、前記リンカー領域(Lx)および前記リンカー領域(Ly)の両方を有してもよいし、いずれか一方を有してもよい。後者の場合、例えば、前記5’側領域(Xc)と前記内部5’側領域(X)との間に前記リンカー領域(Lx)を有し、前記3’側領域(Yc)と前記内部3’側領域(Y)との間に前記リンカー領域(Ly)を有さない、つまり、前記領域(Yc)と前記領域(Y)とが直接連結された形態があげられる。また、後者の場合、例えば、前記3’側領域(Yc)と前記内部3’側領域(Y)との間に前記リンカー領域(Ly)を有し、前記5’側領域(Xc)と前記内部5’側領域(X)との間に前記リンカー領域(Lx)を有さない、つまり、前記領域(Xc)と前記領域(X)とが直接連結された形態があげられる。
 前記リンカー領域(Lx)および前記リンカー領域(Ly)は、それぞれ、それ自体の領域内部において、自己アニーリングを生じない構造であることが好ましい。
 本形態の核酸分子について、前記リンカー領域を有さない一例を、図2の模式図に示す。図2(A)は、前記核酸分子について、5’側から3’側に向かって、各領域の順序の概略を示す模式図であり、図2(B)は、前記核酸分子が、前記分子内において二重鎖を形成している状態を示す模式図である。図2(B)に示すように、前記核酸分子は、前記5’側領域(Xc)が折り返し、前記5’側領域(Xc)と前記内部5’側領域(X)との間で二重鎖が形成され、前記3’側領域(Yc)が折り返し、前記3’側領域(Yc)と前記内部3’側領域(Y)との間で二重鎖が形成される。図2は、あくまでも、各領域の連結順番および二重鎖を形成する各領域の位置関係を示すものであり、例えば、各領域の長さ等は、これに制限されない。
 前記核酸分子について、前記リンカー領域を有する一例を、図3の模式図に示す。図3(A)は、一例として、前記核酸分子について、5’側から3’側に向かって、各領域の順序の概略を示す模式図であり、図3(B)は、前記核酸分子が、前記分子内において二重鎖を形成している状態を示す模式図である。図3(B)に示すように、前記核酸分子は、前記5’側領域(Xc)と前記内部5’側領域(X)との間、前記内部3’側領域(Y)と前記3’側領域(Yc)との間で、二重鎖が形成され、前記Lx領域および前記Ly領域が、ループ構造をとる。図3は、あくまでも、各領域の連結順番および二重鎖を形成する各領域の位置関係を示すものであり、例えば、各領域の長さ等は、これに制限されない。
 前記核酸分子において、前記5’側領域(Xc)、前記内部5’側領域(X)、前記内部3’側領域(Y)および前記3’側領域(Yc)の塩基数は、特に制限されず、例えば、以下の通りである。
 前記5’側領域(Xc)は、前述のように、例えば、前記内部5’側領域(X)の全領域に相補的でもよい。この場合、前記領域(Xc)は、例えば、前記領域(X)と同じ塩基長であり、前記領域(X)の5’末端から3’末端の全領域に相補的な塩基配列からなることが好ましい。前記領域(Xc)は、より好ましくは、前記領域(X)と同じ塩基長であり、且つ、前記領域(Xc)の全ての塩基が、前記領域(X)の全ての塩基と相補的である、つまり、例えば、完全に相補的であることが好ましい。なお、これには制限されず、例えば、前述のように、1ないし数(2、3、4もしくは5)塩基が非相補的でもよい。
 また、前記5’側領域(Xc)は、前述のように、例えば、前記内部5’側領域(X)の部分領域に相補的でもよい。この場合、前記領域(Xc)は、例えば、前記領域(X)の部分領域と同じ塩基長であり、すなわち、前記領域(X)よりも、1塩基以上短い塩基長の塩基配列からなることが好ましい。前記領域(Xc)は、より好ましくは、前記領域(X)の前記部分領域と同じ塩基長であり、且つ、前記領域(Xc)の全ての塩基が、前記領域(X)の前記部分領域の全ての塩基と相補的である、つまり、例えば、完全に相補的であることが好ましい。前記領域(X)の前記部分領域は、例えば、前記領域(X)における、5’末端の塩基(1番目の塩基)から連続する塩基配列からなる領域(セグメント)であることが好ましい。
 前記3’側領域(Yc)は、前述のように、例えば、前記内部3’側領域(Y)の全領域に相補的でもよい。この場合、前記領域(Yc)は、例えば、前記領域(Y)と同じ塩基長であり、前記領域(Y)の5’末端から3’末端の全領域に相補的な塩基配列からなることが好ましい。前記領域(Yc)は、より好ましくは、前記領域(Y)と同じ塩基長であり、且つ、前記領域(Yc)の全ての塩基が、前記領域(Y)の全ての塩基と相補的である、つまり、例えば、完全に相補であることが好ましい。なお、これには制限されず、例えば、前述のように、1ないし数(2、3、4もしくは5)塩基が非相補的でもよい。
 また、前記3’側領域(Yc)は、前述のように、例えば、前記内部3’側領域(Y)の部分領域に相補的でもよい。この場合、前記領域(Yc)は、例えば、前記領域(Y)の部分領域と同じ塩基長であり、すなわち、前記領域(Y)よりも、1塩基以上短い塩基長の塩基配列からなることが好ましい。前記領域(Yc)は、より好ましくは、前記領域(Y)の前記部分領域と同じ塩基長であり、且つ、前記領域(Yc)の全ての塩基が、前記領域(Y)の前記部分領域の全ての塩基と相補的である、つまり、例えば、完全に相補であることが好ましい。前記領域(Y)の前記部分領域は、例えば、前記領域(Y)における、3’末端の塩基(1番目の塩基)から連続する塩基配列からなる領域(セグメント)であることが好ましい。
 前記核酸分子において、前記内部領域(Z)の塩基数(Z)と、前記内部5’側領域(X)の塩基数(X)および前記内部3’側領域(Y)の塩基数(Y)との関係、前記内部領域(Z)の塩基数(Z)と、前記5’側領域(Xc)の塩基数(Xc)および前記3’側領域(Yc)の塩基数(Yc)との関係は、例えば、下記式(1)および(2)の条件を満たす。
   Z=X+Y   ・・・(1)
   Z≧Xc+Yc ・・・(2)
 本発明の核酸分子において、前記内部5’側領域(X)の塩基数(X)と前記内部3’側領域(Y)の塩基数(Y)の長さの関係は、特に制限されず、例えば、下記式のいずれの条件を満たしてもよい。
   X=Y ・・・(19)
   X<Y ・・・(20)
   X>Y ・・・(21)
 前記核酸分子において、前記内部5’側領域(X)の塩基数(X)、前記5’側領域(Xc)の塩基数(Xc)、前記内部3’側領域(Y)の塩基数(Y)および前記3’側領域(Yc)の塩基数(Yc)の関係は、例えば、下記(a)~(d)のいずれかの条件を満たす。
(a)下記式(3)および(4)の条件を満たす。
   X>Xc ・・・(3)
   Y=Yc ・・・(4)
(b)下記式(5)および(6)の条件を満たす。
   X=Xc ・・・(5)
   Y>Yc ・・・(6)
(c)下記式(7)および(8)の条件を満たす。
   X>Xc ・・・(7)
   Y>Yc ・・・(8)
(d)下記式(9)および(10)の条件を満たす。
   X=Xc ・・・(9)
   Y=Yc ・・・(10)
 前記(a)~(d)において、前記内部5’側領域(X)の塩基数(X)と前記5’側領域(Xc)の塩基数(Xc)の差、前記内部3’側領域(Y)の塩基数(Y)と前記3’側領域(Yc)の塩基数(Yc)の差は、例えば、下記条件を満たすことが好ましい。
(a)下記式(11)および(12)の条件を満たす。
   X-Xc=1~10、好ましくは1、2、3または4、
        より好ましくは1、2または3   ・・・(11)
   Y-Yc=0       ・・・(12)
(b)下記式(13)および(14)の条件を満たす。
   X-Xc=0       ・・・(13)
   Y-Yc=1~10、好ましくは1、2、3または4、
        より好ましくは1、2または3   ・・・(14)
(c)下記式(15)および(16)の条件を満たす。
   X-Xc=1~10、好ましくは、1、2または3、
        より好ましくは1または2     ・・・(15)
   Y-Yc=1~10、好ましくは、1、2または3、
        より好ましくは1または2     ・・・(16)
(d)下記式(17)および(18)の条件を満たす。
   X-Xc=0       ・・・(17)
   Y-Yc=0       ・・・(18)
 前記(a)~(d)の核酸分子について、それぞれの構造の一例を、図4の模式図に示す。図4は、前記リンカー領域(Lx)および前記リンカー領域(Ly)を含む核酸分子であり、(A)は、前記(a)の核酸分子、(B)は、前記(b)の核酸分子、(C)は、前記(c)の核酸分子、(D)は、前記(d)の核酸分子の例である。図4において、点線は、自己アニーリングにより二重鎖を形成している状態を示す。図4の核酸分子は、前記内部5’側領域(X)の塩基数(X)と前記内部3’側領域(Y)の塩基数(Y)を、前記式(20)の「X<Y」として表わすが、これには制限されず、前述のように、前記式(19)の「X=Y」でも、前記式(21)の「X>Y」でもよい。また、図4は、あくまでも、前記内部5’側領域(X)と前記5’側領域(Xc)との関係、前記内部3’側領域(Y)と前記3’側領域(Yc)との関係を示す模式図であり、例えば、各領域の長さ、形状等は、これには制限されず、また、リンカー領域(Lx)およびリンカー領域(Ly)の有無も、これには制限されない。
 前記(a)~(c)の核酸分子は、例えば、前記5’側領域(Xc)と前記内部5’側領域(X)、および、前記3’側領域(Yc)と前記内部3’側領域(Y)が、それぞれ二重鎖を形成することによって、前記内部領域(Z)において、前記5’側領域(Xc)および前記3’側領域(Yc)のいずれともアライメントできない塩基を有する構造であり、二重鎖を形成しない塩基を有する構造ともいえる。前記内部領域(Z)において、前記アライメントできない塩基(二重鎖を形成しない塩基ともいう)を、以下、「フリー塩基」という。図4において、前記フリー塩基の領域を、「F」で示す。前記領域(F)の塩基数は、特に制限されない。前記領域(F)の塩基数(F)は、例えば、前記(a)の核酸分子の場合、「X-Xc」の塩基数であり、前記(b)の核酸分子の場合、「Y-Yc」の塩基数であり、前記(c)の核酸分子の場合、「X-Xc」の塩基数と「Y-Yc」の塩基数との合計数である。
 他方、前記(d)の核酸分子は、例えば、前記内部領域(Z)の全領域が、前記5’側領域(Xc)および前記3’側領域(Yc)とアライメントする構造であり、前記内部領域(Z)の全領域が二重鎖を形成する構造ともいえる。なお、前記(d)の核酸分子において、前記5’側領域(Xc)の5’末端と前記3’側領域(Yc)の3’末端は、未連結である。
 前記核酸分子について、各領域の長さを以下に例示するが、本発明は、これには制限されない。
 前記5’側領域(Xc)、前記3’側領域(Yc)、および前記内部領域(Z)における前記フリー塩基(F)の塩基数の合計は、前記内部領域(Z)の塩基数となる。このため、前記5’側領域(Xc)および前記3’側領域(Yc)の長さは、例えば、前記内部領域(Z)の長さ、前記フリー塩基の数(F)およびその位置に応じて、適宜決定できる。
 前記内部領域(Z)の塩基数は、例えば、19塩基以上である。前記塩基数の下限は、例えば、19塩基であり、好ましくは20塩基であり、より好ましくは21塩基である。前記塩基数の上限は、例えば、50塩基であり、好ましくは40塩基であり、より好ましくは30塩基である。前記内部領域(Z)の塩基数の具体例は、例えば、19塩基、20塩基、21塩基、22塩基、23塩基、24塩基、25塩基、26塩基、27塩基、28塩基、29塩基、または、30塩基である。
 前記内部領域(Z)が前記発現抑制配列を含む場合、前記内部領域(Z)は、例えば、前記発現抑制配列のみから構成される領域でもよいし、前記発現抑制配列を含む領域でもよい。前記発現抑制配列の塩基数は、例えば、前述の通りである。前記内部領域(Z)が前記発現抑制配列を含む場合、前記発現抑制配列の5’側および/または3’側に、さらに付加配列を有してもよい。前記付加配列の塩基数は、例えば、1~31塩基であり、好ましくは、1~21塩基であり、より好ましくは、1~11塩基であり、さらに好ましくは、1~7塩基である。
 前記5’側領域(Xc)の塩基数は、例えば、1~29塩基であり、好ましくは1~11塩基であり、より好ましくは1~7塩基であり、さらに好ましくは1~4塩基であり、特に好ましくは1塩基、2塩基、3塩基である。前記内部領域(Z)または前記3’側領域(Yc)が前記発現抑制配列を含む場合、例えば、このような塩基数が好ましい。具体例として、前記内部領域(Z)の塩基数が、19~30塩基(例えば、19塩基)の場合、前記5’側領域(Xc)の塩基数は、例えば、1~11塩基であり、好ましくは1~7塩基であり、より好ましくは1~4塩基であり、さらに好ましくは1塩基、2塩基、3塩基である。
 前記5’側領域(Xc)が前記発現抑制配列を含む場合、前記5’側領域(Xc)は、例えば、前記発現抑制配列のみから構成される領域でもよいし、前記発現抑制配列を含む領域でもよい。前記発現抑制配列の長さは、例えば、前述の通りである。前記5’側領域(Xc)が前記発現抑制配列を含む場合、前記発現抑制配列の5’側および/または3’側に、さらに付加配列を有してもよい。前記付加配列の塩基数は、例えば、1~11塩基であり、好ましくは、1~7塩基である。
 前記3’側領域(Yc)の塩基数は、例えば、1~29塩基であり、好ましくは1~11塩基であり、より好ましくは1~7塩基であり、さらに好ましくは1~4塩基であり、特に好ましくは1塩基、2塩基、3塩基である。前記内部領域(Z)または前記5’側領域(Xc)が前記発現抑制配列を含む場合、例えば、このような塩基数が好ましい。具体例として、前記内部領域(Z)の塩基数が、19~30塩基(例えば、19塩基)の場合、前記3’側領域(Yc)の塩基数は、例えば、1~11塩基であり、好ましくは1~7塩基であり、より好ましくは1~4塩基であり、さらに好ましくは1塩基、2塩基、3塩基である。
 前記3’側領域(Yc)が前記発現抑制配列を含む場合、前記3’側領域(Yc)は、例えば、前記発現抑制配列のみから構成される領域でもよいし、前記発現抑制配列を含む領域でもよい。前記発現抑制配列の長さは、例えば、前述の通りである。前記3’側領域(Yc)が前記発現抑制配列を含む場合、前記発現抑制配列の5’側および/または3’側に、さらに付加配列を有してもよい。前記付加配列の塩基数は、例えば、1~11塩基であり、好ましくは、1~7塩基である。
 前述のように、前記内部領域(Z)、前記5’側領域(Xc)および前記3’側領域(Yc)の塩基数は、例えば、前記式(2)の「Z≧Xc+Yc」で表わすことができる。具体例として、「Xc+Yc」の塩基数は、例えば、前記内部領域(Z)と同じ、または、前記内部領域(Z)より小さい。後者の場合、「Z-(Xc+Yc)」は、例えば、1~10、好ましくは1~4、より好ましくは1、2または3である。前記「Z-(Xc+Yc)」は、前記内部領域(Z)における前記フリー塩基の領域(F)の塩基数(F)に相当する。
 前記リンカー領域(Lx)および前記リンカー領域(Ly)が、前述のようにヌクレオチド残基を含む場合、その長さは、特に制限されない。前記リンカー領域(Lx)は、例えば、前記内部5’側領域(X)と前記5’側領域(Xc)とが二重鎖を形成可能な長さであることが好ましく、前記リンカー領域(Ly)は、例えば、前記内部3’側領域(Y)と前記3’側領域(Yc)とが二重鎖を形成可能な長さであることが好ましい。前記リンカー領域(Lx)および前記リンカー領域(Ly)の長さは、例えば、同じでも異なってもよく、また、その塩基配列も、同じでも異なってもよい。前記リンカー領域(Lx)および前記リンカー領域(Ly)の塩基数は、その下限が、例えば、1塩基であり、好ましくは2塩基であり、より好ましくは3塩基であり、その上限が、例えば、100塩基であり、好ましくは80塩基であり、より好ましくは50塩基である。前記各リンカー領域の塩基数は、具体例として、例えば、1~50塩基、1~30塩基、1~20塩基、1~10塩基、1~7塩基、1~4塩基等が例示できるが、これには制限されない。
 前記核酸分子の全長は、特に制限されない。前記核酸分子において、前記塩基数の合計(全長の塩基数)は、下限が、例えば、38塩基であり、好ましくは42塩基であり、より好ましくは50塩基であり、さらに好ましくは51塩基であり、特に好ましくは52塩基であり、その上限は、例えば、300塩基であり、好ましくは200塩基であり、より好ましくは150塩基であり、さらに好ましくは100塩基であり、特に好ましくは80塩基である。前記核酸分子において、前記リンカー領域(Lx)およびリンカー領域(Ly)を除く塩基数の合計は、下限が、例えば、38塩基であり、好ましくは42塩基であり、より好ましくは50塩基であり、さらに好ましくは51塩基であり、特に好ましくは52塩基であり、上限が、例えば、300塩基であり、好ましくは200塩基であり、より好ましくは150塩基であり、さらに好ましくは100塩基であり、特に好ましくは80塩基である。
 本形態の核酸分子は、例えば、5’末端と3’末端とが、結合してもよいし、未結合でもよい。前者の場合、本形態の核酸分子は、環状の一本鎖核酸分子である。後者の場合、本形態の核酸分子は、例えば、両末端の未結合を維持できることから、5’末端が非リン酸基であることが好ましい。
(2-3)
 前記一本鎖核酸分子の第3形態として、前記リンカー領域が、非ヌクレオチド構造である分子があげられる。
 本形態は、前記第1形態および前記第2形態の核酸分子において、前記リンカー領域(Lx)および/または前記リンカー領域(Ly)が、非ヌクレオチド構造を有する以外は、前述の説明を援用できる。
 前記非ヌクレオチド構造は、特に制限されず、例えば、ポリアルキレングリコール、ピロリジン骨格、ピペリジン骨格等があげられる。前記ポリアルキレングリコールは、例えば、ポリエチレングリコールがあげられる。
 前記ピロリジン骨格は、例えば、ピロリジンの5員環を構成する炭素が、1個以上、置換されたピロリジン誘導体の骨格でもよく、置換される場合、例えば、C-2の炭素以外の炭素原子であることが好ましい。前記炭素は、例えば、窒素、酸素または硫黄で置換されてもよい。前記ピロリジン骨格は、例えば、ピロリジンの5員環内に、例えば、炭素-炭素二重結合または炭素-窒素二重結合を含んでもよい。前記ピロリジン骨格において、ピロリジンの5員環を構成する炭素および窒素は、例えば、水素が結合してもよいし、後述するような置換基が結合してもよい。前記リンカー領域(Lx)は、前記領域(X)および前記領域(Xc)と、前記リンカー領域(Ly)は、前記領域(Y)および前記領域(Yc)と、例えば、前記ピロリジン骨格のいずれの基を介して結合してもよく、好ましくは、前記5員環のいずれか1個の炭素原子と窒素であり、好ましくは、前記5員環の2位の炭素(C-2)と窒素である。前記ピロリジン骨格としては、例えば、プロリン骨格、プロリノール骨格等があげられる。前記プロリン骨格およびプロリノール骨格等は、例えば、生体内物質およびその還元体であるため、安全性にも優れる。
 前記ピペリジン骨格は、例えば、ピペリジンの6員環を構成する炭素が、1個以上、置換されたピペリジン誘導体の骨格でもよく、置換される場合、例えば、C-2の炭素以外の炭素原子であることが好ましい。前記炭素は、例えば、窒素、酸素または硫黄で置換されてもよい。前記ピペリジン骨格は、例えば、ピペリジンの6員環内に、例えば、炭素-炭素二重結合または炭素-窒素二重結合を含んでもよい。前記ピペリジン骨格において、ピペリジンの6員環を構成する炭素および窒素は、例えば、水素基が結合してもよいし、後述するような置換基が結合してもよい。前記リンカー領域(Lx)は、前記領域(X)および前記領域(Xc)と、前記リンカー領域(Ly)は、前記領域(Y)および前記領域(Yc)と、例えば、前記ピペリジン骨格のいずれの基を介して結合してもよく、好ましくは、前記6員環のいずれか1個の炭素原子と窒素であり、より好ましくは、前記6員環の2位の炭素(C-2)と窒素である。
 前記リンカー領域は、例えば、前記非ヌクレオチド構造からなる非ヌクレオチド残基のみを含んでもよいし、前記非ヌクレオチド構造からなる非ヌクレオチド残基と、ヌクレオチド残基とを含んでもよい。
 前記リンカー領域は、例えば、下記式(I)で表わされる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000002
 前記式(I)中、例えば、
およびXは、それぞれ独立して、H、O、SまたはNHであり;
およびYは、それぞれ独立して、単結合、CH、NH、OまたはSであり;
は、環A上のC-3、C-4、C-5またはC-6に結合する水素原子または置換基であり、
は、n個の原子からなるアルキレン鎖であり、ここで、アルキレン炭素原子上の水素原子は、OH、OR、NH、NHR、NR、SH、もしくはSRで置換されても置換されていなくてもよく、または、
は、前記アルキレン鎖の一つ以上の炭素原子が、酸素原子で置換されたポリエーテル鎖であり、
ただし、Yが、NH、OまたはSの場合、Yに結合するLの原子は炭素であり、ORに結合するLの原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接せず;
は、m個の原子からなるアルキレン鎖であり、ここで、アルキレン炭素原子上の水素原子は、OH、OR、NH、NHR、NR、SHもしくはSRで置換されても置換れていなくてもよく、または、
は、前記アルキレン鎖の一つ以上の炭素原子が、酸素原子で置換されたポリエーテル鎖であり、
ただし、Yが、NH、OまたはSの場合、Yに結合するLの原子は炭素であり、ORに結合するLの原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接せず;
、R、RおよびRは、それぞれ独立して、置換基または保護基であり;
lは、1または2であり;
mは、0~30の範囲の整数であり;
nは、0~30の範囲の整数であり;
環Aは、前記環A上のC-2以外の1個の炭素原子が、窒素、酸素、硫黄で置換されてもよく、
前記環A内に、炭素-炭素二重結合または炭素-窒素二重結合を含んでもよく、
前記領域(Xc)および前記領域(X)は、それぞれ、-OR-または-OR-を介して、前記リンカー領域(Lx)に結合し、
前記領域(Yc)および前記領域(Y)は、それぞれ、-OR-または-OR-を介して、前記リンカー領域(Ly)に結合し、
ここで、RおよびRは、存在しても存在しなくてもよく、存在する場合、RおよびRは、それぞれ独立して、ヌクレオチド残基または前記構造(I)である。
 前記式(I)中、XおよびXは、例えば、それぞれ独立して、H、O、SまたはNHである。前記式(I)中において、XがHであるとは、Xが、Xの結合する炭素原子とともに、CH(メチレン基)を形成することを意味する。Xについても同様である。
 前記式(I)中、YおよびYは、それぞれ独立して、単結合、CH、NH、OまたはSである。
 前記式(I)中、環Aにおいて、lは、1または2である。l=1の場合、環Aは、5員環であり、例えば、前記ピロリジン骨格である。前記ピロリジン骨格は、例えば、プロリン骨格、プロリノール骨格等があげられ、これらの二価の構造が例示できる。l=2の場合、環Aは、6員環であり、例えば、前記ピペリジン骨格である。環Aは、環A上のC-2以外の1個の炭素原子が、窒素、酸素または硫黄で置換されてもよい。また、環Aは、環A内に、炭素-炭素二重結合または炭素-窒素二重結合を含んでもよい。環Aは、例えば、L型およびD型のいずれでもよい。
 前記式(I)中、Rは、環A上のC-3、C-4、C-5またはC-6に結合する水素原子または置換基である。Rが前記置換基の場合、置換基Rは、1でも複数でも、存在しなくてもよく、複数の場合、同一でも異なってもよい。
 置換基Rは、例えば、ハロゲン、OH、OR、NH、NHR、NR、SH、SRまたはオキソ基(=O)等である。
 RおよびRは、例えば、それぞれ独立して、置換基または保護基であり、同一でも異なってもよい。前記置換基は、例えば、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロアルキル、アリール、ヘテロアリール、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルケニル、シクロアルキルアルキル、シクリルアルキル、ヒドロキシアルキル、アルコキシアルキル、アミノアルキル、ヘテロシクリルアルケニル、ヘテロシクリルアルキル、ヘテロアリールアルキル、シリル、シリルオキシアルキル等があげられる。以下、同様である。置換基Rは、これらの列挙する置換基でもよい。
 前記保護基は、例えば、反応性の高い官能基を不活性に変換する官能基であり、公知の保護基等があげられる。前記保護基は、例えば、文献(J. F. W. McOmie、 「Protecting Groups in Organic Chemistry」 Prenum Press、 London and New York、 1973)の記載を援用できる。前記保護基は、特に制限されず、例えば、tert-ブチルジメチルシリル基(TBDMS)、ビス(2-アセトキシエチルオキシ)メチル基(ACE)、トリイソプロピルシリルオキシメチル基(TOM)、1-(2-シアノエトキシ)エチル基(CEE)、2-シアノエトキシメチル基(CEM)およびトリルスルフォニルエトキシメチル基(TEM)、ジメトキシトリチル基(DMTr)等があげられる。RがORの場合、前記保護基は、特に制限されず、例えば、TBDMS基、ACE基、TOM基、CEE基、CEM基およびTEM基等があげられる。この他にも、後述する[化5]のシリル含有基もあげられる。以下、同様である。
 前記式(I)中、Lは、n個の原子からなるアルキレン鎖である。前記アルキレン炭素原子上の水素原子は、例えば、OH、OR、NH、NHR、NR、SH、もしくはSRで置換されてもよいし、置換されていなくてもよい。または、Lは、前記アルキレン鎖の1つ以上の炭素原子が酸素原子で置換されたポリエーテル鎖でもよい。前記ポリエーテル鎖は、例えば、ポリエチレングリコールである。なお、Yが、NH、OまたはSの場合、Yに結合するLの原子は炭素であり、ORに結合するLの原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接しない。つまり、例えば、YがOの場合、その酸素原子とLの酸素原子は隣接せず、ORの酸素原子とLの酸素原子は隣接しない。
 前記式(I)中、Lは、m個の原子からなるアルキレン鎖である。前記アルキレン炭素原子上の水素原子は、例えば、OH、OR、NH、NHR、NR、SHもしくはSRで置換されてもよいし、置換されていなくてもよい。または、Lは、前記アルキレン鎖の1つ以上の炭素原子が酸素原子で置換されたポリエーテル鎖でもよい。なお、Yが、NH、OまたはSの場合、Yに結合するLの原子は炭素であり、ORに結合するLの原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接しない。つまり、例えば、YがOの場合、その酸素原子とLの酸素原子は隣接せず、ORの酸素原子とLの酸素原子は隣接しない。
 LのnおよびLのmは、特に制限されず、それぞれ、下限は、例えば、0であり、上限も、特に制限されない。nおよびmは、例えば、前記リンカー領域(Lx)または(Ly)の所望の長さに応じて、適宜設定できる。nおよびmは、例えば、製造コストおよび収率等の点から、それぞれ、0~30が好ましく、より好ましくは0~20であり、さらに好ましくは0~15である。nとmは、同じでもよいし(n=m)、異なってもよい。n+mは、例えば、0~30であり、好ましくは0~20であり、より好ましくは0~15である。
 R、R、RおよびRは、例えば、それぞれ独立して、置換基または保護基である。前記置換基および前記保護基は、例えば、前述と同様である。
 前記式(I)において、水素原子は、例えば、それぞれ独立して、Cl、Br、FおよびI等のハロゲンに置換されてもよい。
 前記領域(Xc)および前記領域(X)は、前記リンカー領域(Lx)に、前記領域(Yc)および前記領域(Y)は、前記リンカー領域(Ly)に、例えば、それぞれ、-OR-または-OR-を介して、結合する。ここで、RおよびRは、存在しても存在しなくてもよい。RおよびRが存在する場合、RおよびRは、それぞれ独立して、ヌクレオチド残基または前記式(I)の構造である。Rおよび/またはRが前記ヌクレオチド残基の場合、前記リンカー領域(Lx)および前記リンカー領域(Ly)は、例えば、ヌクレオチド残基Rおよび/またはRを除く前記式(I)の構造からなる前記非ヌクレオチド残基と、前記ヌクレオチド残基とから形成される。Rおよび/またはRが前記式(I)の構造の場合、前記リンカー領域(Lx)および前記リンカー領域(Ly)は、例えば、前記式(I)の構造からなる前記非ヌクレオチド残基が、2つ以上連結された構造となる。前記式(I)の構造は、例えば、1個、2個、3個または4個含んでもよい。このように、前記構造を複数含む場合、前記(I)の構造は、例えば、直接連結されてもよいし、前記ヌクレオチド残基を介して結合してもよい。他方、RおよびRが存在しない場合、前記リンカー領域(Lx)および前記リンカー領域(Ly)は、例えば、前記式(I)の構造からなる前記非ヌクレオチド残基のみから形成される。
 前記領域(Xc)および前記領域(X)、ならびに、前記領域(Yc)および前記領域(Y)と、前記-OR-および-OR-との結合の組合せは、特に制限されず、例えば、以下のいずれかの条件があげられる。
条件(1)
 前記領域(Xc)は、-OR-を介して、前記領域(X)は、-OR-を介して、前記式(I)の構造と結合し、
 前記領域(Yc)は、-OR-を介して、前記領域(Y)は、-OR-を介して、前記式(I)の構造と結合する。
条件(2)
 前記領域(Xc)は、-OR-を介して、前記領域(X)は、-OR-を介して、前記式(I)の構造と結合し、
 前記領域(Yc)は、-OR-を介して、前記領域(Y)は、-OR-を介して、前記式(I)の構造と結合する。
条件(3)
 前記領域(Xc)は、-OR-を介して、前記領域(X)は、-OR-を介して、前記式(I)の構造と結合し、
 前記領域(Yc)は、-OR-を介して、前記領域(Y)は、-OR-を介して、前記式(I)の構造と結合する。
条件(4)
 前記領域(Xc)は、-OR-を介して、前記領域(X)は、-OR-を介して、前記式(I)の構造と結合し、
 前記領域(Yc)は、-OR-を介して、前記領域(Y)は、-OR-を介して、前記式(I)の構造と結合する。
 前記式(I)の構造は、例えば、下記式(I-1)~式(I-9)が例示でき、下記式において、nおよびmは、前記式(I)と同じである。下記式において、qは、0~10の整数である。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000003
 前記式(I-1)~(I-9)において、n、mおよびqは、特に制限されず、前述の通りである。具体例として、前記式(I-1)において、n=8、前記(I-2)において、n=3、前記式(I-3)において、n=4または8、前記(I-4)において、n=7または8、前記式(I-5)において、n=3およびm=4、前記(I-6)において、n=8およびm=4、前記式(I-7)において、n=8およびm=4、前記(I-8)において、n=5およびm=4、前記式(I-9)において、q=1およびm=4があげられる。前記式(I-4)の一例(n=8)を、下記式(I-4a)に、前記式(I-6)の一例(n=5、m=4)を、下記式(I-6a)に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000004
 本発明の核酸分子の構成単位は、特に制限されず、例えば、ヌクレオチド残基があげられる。前記ヌクレオチド残基は、例えば、リボヌクレオチド残基およびデオキシリボヌクレオチド残基があげられる。前記ヌクレオチド残基は、例えば、修飾されていない非修飾ヌクレオチド残基および修飾された修飾ヌクレオチド残基があげられる。本発明の核酸分子は、例えば、前記修飾ヌクレオチド残基を含むことによって、ヌクレアーゼ耐性を向上し、安定性を向上可能である。また、本発明の核酸分子は、例えば、前記ヌクレオチド残基の他に、さらに、非ヌクレオチド残基を含んでもよい。
 本発明の核酸分子において、前記リンカー以外の領域の構成単位は、それぞれ、前記ヌクレオチド残基が好ましい。前記各領域は、例えば、下記(1)~(3)の残基で構成される。
 (1)非修飾ヌクレオチド残基
 (2)修飾ヌクレオチド残基
 (3)非修飾ヌクレオチド残基および修飾ヌクレオチド残基
 本発明の核酸分子において、前記リンカー領域の構成単位は、特に制限されず、例えば、前記ヌクレオチド残基および前記非ヌクレオチド残基があげられる。前記リンカー領域は、例えば、前記ヌクレオチド残基のみから構成されてもよいし、前記非ヌクレオチド残基のみから構成されてもよいし、前記ヌクレオチド残基と前記非ヌクレオチド残基から構成されてもよい。前記リンカー領域は、例えば、下記(1)~(7)の残基で構成される。
 (1)非修飾ヌクレオチド残基
 (2)修飾ヌクレオチド残基
 (3)非修飾ヌクレオチド残基および修飾ヌクレオチド残基
 (4)非ヌクレオチド残基
 (5)非ヌクレオチド残基および非修飾ヌクレオチド残基
 (6)非ヌクレオチド残基および修飾ヌクレオチド残基
 (7)非ヌクレオチド残基、非修飾ヌクレオチド残基および修飾ヌクレオチド残基
 本発明の核酸分子が、前記リンカー領域(Lx)および前記リンカー領域(Ly)の両方を有する場合、例えば、両方の構成単位が同じでもよいし、異なってもよい。具体例として、例えば、両方のリンカー領域の構成単位が前記ヌクレオチド残基である形態、両方のリンカー領域の構成単位が前記非ヌクレオチド残基である形態、一方の領域の構成単位が前記ヌクレオチド残基であり、他方のリンカー領域の構成単位が非ヌクレオチド残基である形態等があげられる。
 本発明の核酸分子は、例えば、前記ヌクレオチド残基のみから構成される分子、前記ヌクレオチド残基の他に前記非ヌクレオチド残基を含む分子等があげられる。本発明の核酸分子において、前記ヌクレオチド残基は、前述のように、例えば、前記非修飾ヌクレオチド残基のみでもよいし、前記修飾ヌクレオチド残基のみでもよいし、前記非修飾ヌクレオチド残基および前記修飾ヌクレオチド残基の両方でもよい。前記核酸分子が、前記非修飾ヌクレオチド残基と前記修飾ヌクレオチド残基を含む場合、前記修飾ヌクレオチド残基の個数は、特に制限されず、例えば、「1もしくは数個」であり、具体的には、例えば、1~5個、好ましくは1~4個、より好ましくは1~3個、最も好ましくは1または2個である。本発明の核酸分子が、前記非ヌクレオチド残基を含む場合、前記非ヌクレオチド残基の個数は、特に制限されず、例えば、「1もしくは数個」であり、具体的には、例えば、1~8個、1~6個、1~4個、1、2または3個である。
 前記核酸分子が、例えば、前記非修飾リボヌクレオチド残基の他に前記修飾リボヌクレオチド残基を含む場合、前記修飾リボヌクレオチド残基の個数は、特に制限されず、例えば、「1もしくは数個」であり、具体的には、例えば、1~5個、好ましくは1~4個、より好ましくは1~3個、最も好ましくは1または2個である。前記非修飾リボヌクレオチド残基に対する前記修飾リボヌクレオチド残基は、例えば、リボース残基がデオキシリボース残基に置換された前記デオキシリボヌクレオチド残基でもよい。前記核酸分子が、例えば、前記非修飾リボヌクレオチド残基の他に前記デオキシリボヌクレオチド残基を含む場合、前記デオキシリボヌクレオチド残基の個数は、特に制限されず、例えば、「1もしくは数個」であり、具体的には、例えば、1~5個、好ましくは1~4個、より好ましくは1~3個、最も好ましくは1または2個である。
 本発明の核酸分子は、例えば、標識物質を含み、前記標識物質で標識化されてもよい。前記標識物質は、特に制限されず、例えば、蛍光物質、色素、同位体等があげられる。前記標識物質は、例えば、ピレン、TAMRA、フルオレセイン、Cy3色素、Cy5色素等の蛍光団があげられ、前記色素は、例えば、Alexa488等のAlexa色素等があげられる。前記同位体は、例えば、安定同位体および放射性同位体があげられ、好ましくは安定同位体である。前記安定同位体は、例えば、被ばくの危険性が少なく、専用の施設も不要であることから取り扱い性に優れ、また、コストも低減できる。また、前記安定同位体は、例えば、標識した化合物の物性変化がなく、トレーサーとしての性質にも優れる。前記安定同位体は、特に制限されず、例えば、H、13C、15N、17O、18O、33S、34Sおよび36Sがあげられる。
 本発明の核酸分子は、前述のように、TGF-β1遺伝子の発現抑制ができる。このため、本発明の核酸分子は、例えば、TGF-β1遺伝子が原因となる疾患の治療剤として使用できる。本発明において、「治療」は、例えば、前記疾患の予防、疾患の改善、予後の改善の意味を含み、いずれでもよい。前記疾患としては、具体的には、急性肺傷害;肺線維症があげられる。
 本発明の核酸分子の使用方法は、特に制限されず、例えば、前記TGF-β1遺伝子を有する投与対象に、前記核酸分子を投与すればよい。
 前記投与対象は、例えば、細胞、組織または器官があげられる。前記投与対象は、例えば、ヒト、ヒトを除く非ヒト哺乳類等の非ヒト動物があげられる。前記投与は、例えば、in vivoでもin vitroでもよい。前記細胞は、特に制限されず、例えば、A549、HeLa、293、COS7等の各種培養細胞、ES細胞、iPS細胞等の多能性幹細胞、造血幹細胞等の体性幹細胞、前記多能性幹細胞もしくは体性幹細胞から分化誘導された各種培養細胞、初代培養細胞等の生体から単離した細胞等があげられる。
 本発明の核酸分子の使用に関しては、後述する本発明の組成物、発現抑制方法および治療方法等の記載を参照できる。
 本発明の核酸分子は、前述のように、TGF-β1遺伝子の発現を抑制可能であることから、例えば、医薬品、診断薬および農薬、ならびに、農薬、医学、生命科学等の研究ツールとして有用である。
2.ヌクレオチド残基
 前記ヌクレオチド残基は、例えば、構成要素として、糖、塩基およびリン酸を含む。前記ヌクレオチド残基は、前述のように、例えば、リボヌクレオチド残基およびデオキシリボヌクレオチド残基があげられる。前記リボヌクレオチド残基は、例えば、糖としてリボース残基を有し、塩基として、アデニン(A)、グアニン(G)、シトシン(C)およびU(ウラシル)を有し、前記デオキシリボース残基は、例えば、糖としてデオキシリボース残基を有し、塩基として、アデニン(A)、グアニン(G)、シトシン(C)およびチミン(T)を有する。
 前記ヌクレオチド残基は、未修飾ヌクレオチド残基および修飾ヌクレオチド残基があげられる。前記未修飾ヌクレオチド残基は、前記各構成要素が、例えば、天然に存在するものと同一または実質的に同一であり、好ましくは、人体において天然に存在するものと同一または実質的に同一である。
 前記修飾ヌクレオチド残基は、例えば、前記未修飾ヌクレオチド残基を修飾したヌクレオチド残基である。前記修飾ヌクレオチド残基は、例えば、前記未修飾ヌクレオチド残基の構成要素のいずれが修飾されてもよい。本発明において、「修飾」は、例えば、前記構成要素の置換、付加および/または欠失、前記構成要素における原子および/または官能基の置換、付加および/または欠失であり、「改変」ということができる。前記修飾ヌクレオチド残基は、例えば、天然に存在するヌクレオチド残基、人工的に修飾したヌクレオチド残基等があげられる。前記天然由来の修飾ヌクレオチド残基は、例えば、リンバックら(Limbach et al.、1994、Summary:the modified nucleosides of RNA、Nucleic Acids Res.22:2183~2196)を参照できる。また、前記修飾ヌクレオチド残基は、例えば、前記ヌクレオチドの代替物の残基でもよい。
 前記ヌクレオチド残基の修飾は、例えば、リボース-リン酸骨格(以下、リボリン酸骨格)の修飾があげられる。
 前記リボリン酸骨格において、例えば、リボース残基を修飾できる。前記リボース残基は、例えば、2’位炭素を修飾でき、具体的には、例えば、2’位炭素に結合する水酸基を、水素またはフルオロ等のハロゲンに置換できる。前記2’位炭素の水酸基を水素に置換することで、リボース残基をデオキシリボースに置換できる。前記リボース残基は、例えば、立体異性体に置換でき、例えば、アラビノース残基に置換してもよい。
 前記リボリン酸骨格は、例えば、非リボース残基および/または非リン酸を有する非リボリン酸骨格に置換してもよい。前記非リボリン酸骨格は、例えば、前記リボリン酸骨格の非荷電体があげられる。前記非リボリン酸骨格に置換された、前記ヌクレオチドの代替物は、例えば、モルホリノ、シクロブチル、ピロリジン等があげられる。前記代替物は、この他に、例えば、人工核酸モノマー残基があげられる。具体例として、例えば、PNA(ペプチド核酸)、LNA(Locked Nucleic Acid)、ENA(2’-O、4’-C-Ethylenebridged Nucleic Acid)等があげられ、好ましくはPNAである。
 前記リボリン酸骨格において、例えば、リン酸基を修飾できる。前記リボリン酸骨格において、糖残基に最も隣接するリン酸基は、αリン酸基と呼ばれる。前記αリン酸基は、負に荷電し、その電荷は、糖残基に非結合の2つの酸素原子にわたって、均一に分布している。前記αリン酸基における4つの酸素原子のうち、ヌクレオチド残基間のホスホジエステル結合において、糖残基と非結合である2つの酸素原子は、以下、「非結合(non-linking)酸素」ともいう。他方、前記ヌクレオチド残基間のホスホジエステル結合において、糖残基と結合している2つの酸素原子は、以下、「結合(linking)酸素」という。前記αリン酸基は、例えば、非荷電となる修飾、または、前記非結合酸素における電荷分布が非対称型となる修飾を行うことが好ましい。
 前記リン酸基は、例えば、前記非結合酸素を置換してもよい。前記酸素は、例えば、S(硫黄)、Se(セレン)、B(ホウ素)、C(炭素)、H(水素)、N(窒素)およびOR(Rは、アルキル基またはアリール基)のいずれかの原子で置換でき、好ましくは、Sで置換される。前記非結合酸素は、例えば、両方が置換されていることが好ましく、より好ましくは、両方がSで置換される。前記修飾リン酸基は、例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、ボラノホスフェート、ボラノホスフェートエステル、ホスホネート水素、ホスホロアミデート、アルキルまたはアリールホスホネート、およびホスホトリエステル等があげられ、中でも、前記2つの非結合酸素が両方ともSで置換されているホスホロジチオエートが好ましい。
 前記リン酸基は、例えば、前記結合酸素を置換してもよい。前記酸素は、例えば、S(硫黄)、C(炭素)およびN(窒素)のいずれかの原子で置換でき、前記修飾リン酸基は、例えば、Nで置換した架橋ホスホロアミデート、Sで置換した架橋ホスホロチオエート、およびCで置換した架橋メチレンホスホネート等があげられる。前記結合酸素の置換は、例えば、本発明の核酸分子の5’末端ヌクレオチド残基および3’末端ヌクレオチド残基の少なくとも一方において行うことが好ましく、5’側の場合、Cによる置換が好ましく、3’側の場合、Nによる置換が好ましい。
 前記リン酸基は、例えば、前記リン非含有のリンカーに置換してもよい。前記リンカーは、例えば、シロキサン、カーボネート、カルボキシメチル、カルバメート、アミド、チオエーテル、エチレンオキサイドリンカー、スルホネート、スルホンアミド、チオホルムアセタール、ホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、およびメチレンオキシメチルイミノ等を含み、好ましくは、メチレンカルボニルアミノ基およびメチレンメチルイミノ基を含む。
 本発明の核酸分子は、例えば、3’末端および5’末端の少なくとも一方のヌクレオチド残基が修飾されてもよい。前記修飾は、例えば、3’末端および5’末端のいずれか一方でもよいし、両方でもよい。前記修飾は、例えば、前述の通りであり、好ましくは、末端のリン酸基に行うことが好ましい。前記リン酸基は、例えば、全体を修飾してもよいし、前記リン酸基における1つ以上の原子を修飾してもよい。前者の場合、例えば、リン酸基全体の置換でもよいし、欠失でもよい。
 前記末端のヌクレオチド残基の修飾は、例えば、他の分子の付加があげられる。前記他の分子は、例えば、前述のような標識物質、保護基等の機能性分子があげられる。前記保護基は、例えば、S(硫黄)、Si(ケイ素)、B(ホウ素)、エステル含有基等があげられる。前記標識物質等の機能性分子は、例えば、本発明の核酸分子の検出等に利用できる。
 前記他の分子は、例えば、前記ヌクレオチド残基のリン酸基に付加してもよいし、スペーサーを介して、前記リン酸基または前記糖残基に付加してもよい。前記スペーサーの末端原子は、例えば、前記リン酸基の前記結合酸素、または、糖残基のO、N、SもしくはCに、付加または置換できる。前記糖残基の結合部位は、例えば、3’位のCもしくは5’位のC、またはこれらに結合する原子が好ましい。前記スペーサーは、例えば、前記PNA等のヌクレオチド代替物の末端原子に、付加または置換することもできる。
 前記スペーサーは、特に制限されず、例えば、-(CH-、-(CHN-、-(CHO-、-(CHS-、O(CHCHO)CHCHOH、無塩基糖、アミド、カルボキシ、アミン、オキシアミン、オキシイミン、チオエーテル、ジスルフィド、チオ尿素、スルホンアミド、およびモルホリノ等、ならびに、ビオチン試薬およびフルオレセイン試薬等を含んでもよい。前記式において、nは、正の整数であり、n=3または6が好ましい。
 前記末端に付加する分子は、これらの他に、例えば、色素、インターカレート剤(例えば、アクリジン)、架橋剤(例えば、ソラレン、マイトマイシンC)、ポルフィリン(TPPC4、テキサフィリン、サッフィリン)、多環式芳香族炭化水素(例えば、フェナジン、ジヒドロフェナジン)、人工エンドヌクレアーゼ(例えば、EDTA)、親油性担体(例えば、コレステロール、コール酸、アダマンタン酢酸、1-ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、1、3-ビス-O(ヘキサデシル)グリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、1、3-プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、O3-(オレオイル)リトコール酸、O3-(オレオイル)コール酸、ジメトキシトリチル、またはフェノキサジン)およびペプチド複合体(例えば、アンテナペディアペプチド、Tatペプチド)、アルキル化剤、リン酸、アミノ、メルカプト、PEG(例えば、PEG-40K)、MPEG、[MPEG]、ポリアミノ、アルキル、置換アルキル、放射線標識マーカー、酵素、ハプテン(例えば、ビオチン)、輸送/吸収促進剤(例えば、アスピリン、ビタミンE、葉酸)、合成リボヌクレアーゼ(例えば、イミダゾール、ビスイミダゾール、ヒスタミン、イミダゾールクラスター、アクリジン-イミダゾール複合体、テトラアザマクロ環のEu3+複合体)等があげられる。
 本発明の核酸分子は、前記5’末端が、例えば、リン酸基またはリン酸基アナログで修飾されてもよい。前記リン酸基は、例えば、5’一リン酸((HO)2(O)P-O-5’)、5’二リン酸((HO)2(O)P-O-P(HO)(O)-O-5’)、5’三リン酸((HO)2(O)P-O-(HO)(O)P-O-P(HO)(O)-O-5’)、5’-グアノシンキャップ(7-メチル化または非メチル化、7m-G-O-5’-(HO)(O)P-O-(HO)(O)P-O-P(HO)(O)-O-5’)、5’-アデノシンキャップ(Appp)、任意の修飾または非修飾ヌクレオチドキャップ構造(N-O-5’-(HO)(O)P-O-(HO)(O)P-O-P(HO)(O)-O-5’)、5’一チオリン酸(ホスホロチオエート:(HO)2(S)P-O-5’)、5’一ジチオリン酸(ホスホロジチオエート:(HO)(HS)(S)P-O-5’)、5’-ホスホロチオール酸((HO)2(O)P-S-5’)、硫黄置換の一リン酸、二リン酸および三リン酸(例えば、5’-α-チオ三リン酸、5’-γ-チオ三リン酸等)、5’-ホスホルアミデート((HO)2(O)P-NH-5’、(HO)(NH2)(O)P-O-5’)、5’-アルキルホスホン酸(例えば、RP(OH)(O)-O-5’、(OH)2(O)P-5’-CH2、Rはアルキル(例えば、メチル、エチル、イソプロピル、プロピル等))、5’-アルキルエーテルホスホン酸(例えば、RP(OH)(O)-O-5’、Rはアルキルエーテル(例えば、メトキシメチル、エトキシメチル等))等があげられる。
 前記ヌクレオチド残基において、前記塩基は、特に制限されない。前記塩基は、例えば、天然の塩基でもよいし、非天然の塩基でもよい。前記塩基は、例えば、天然由来でもよいし、合成品でもよい。前記塩基は、例えば、一般的な塩基、その修飾アナログ等が使用できる。
 前記塩基は、例えば、アデニンおよびグアニン等のプリン塩基、シトシン、ウラシルおよびチミン等のピリミジン塩基があげられる。前記塩基は、この他に、イノシン、チミン、キサンチン、ヒポキサンチン、ヌバラリン(nubularine)、イソグアニシン(isoguanisine)、ツベルシジン(tubercidine)等があげられる。前記塩基は、例えば、2-アミノアデニン、6-メチル化プリン等のアルキル誘導体;2-プロピル化プリン等のアルキル誘導体;5-ハロウラシルおよび5-ハロシトシン;5-プロピニルウラシルおよび5-プロピニルシトシン;6-アゾウラシル、6-アゾシトシンおよび6-アゾチミン;5-ウラシル(プソイドウラシル)、4-チオウラシル、5-ハロウラシル、5-(2-アミノプロピル)ウラシル、5-アミノアリルウラシル;8-ハロ化、アミノ化、チオール化、チオアルキル化、ヒドロキシル化および他の8-置換プリン;5-トリフルオロメチル化および他の5-置換ピリミジン;7-メチルグアニン;5-置換ピリミジン;6-アザピリミジン;N-2、N-6、およびO-6置換プリン(2-アミノプロピルアデニンを含む);5-プロピニルウラシルおよび5-プロピニルシトシン;ジヒドロウラシル;3-デアザ-5-アザシトシン;2-アミノプリン;5-アルキルウラシル;7-アルキルグアニン;5-アルキルシトシン;7-デアザアデニン;N6、N6-ジメチルアデニン;2、6-ジアミノプリン;5-アミノ-アリル-ウラシル;N3-メチルウラシル;置換1、2、4-トリアゾール;2-ピリジノン;5-ニトロインドール;3-ニトロピロール;5-メトキシウラシル;ウラシル-5-オキシ酢酸;5-メトキシカルボニルメチルウラシル;5-メチル-2-チオウラシル;5-メトキシカルボニルメチル-2-チオウラシル;5-メチルアミノメチル-2-チオウラシル;3-(3-アミノ-3-カルボキシプロピル)ウラシル;3-メチルシトシン;5-メチルシトシン;N4-アセチルシトシン;2-チオシトシン;N6-メチルアデニン;N6-イソペンチルアデニン;2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデニン;N-メチルグアニン;O-アルキル化塩基等があげられる。また、プリンおよびピリミジンは、例えば、米国特許第3、687、808号、「Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering」、858~859頁、クロシュビッツ ジェー アイ(Kroschwitz J.I.)編、John Wiley & Sons、1990、およびイングリッシュら(Englischら)、Angewandte Chemie、International Edition、1991、30巻、p.613に開示されるものが含まれる。
 前記修飾ヌクレオチド残基は、これらの他に、例えば、塩基を欠失する残基、すなわち、無塩基のリボリン酸骨格を含んでもよい。また、前記修飾ヌクレオチド残基は、例えば、米国仮出願第60/465、665号(出願日:2003年4月25日)、および国際出願第PCT/US04/07070号(出願日:2004年3月8日)に記載される残基が使用でき、本発明は、これらの文献を援用できる。
3.本発明の核酸分子の合成方法
 本発明の核酸分子の合成方法は、特に制限されず、従来公知の方法が採用できる。前記合成方法は、例えば、遺伝子工学的手法による合成法、化学合成法等があげられる。遺伝子工学的手法は、例えば、インビトロ転写合成法、ベクターを用いる方法、PCRカセットによる方法があげられる。前記ベクターは、特に制限されず、プラスミド等の非ウイルスベクター、ウイルスベクター等があげられる。前記化学合成法は、特に制限されず、例えば、ホスホロアミダイト法およびH-ホスホネート法等があげられる。前記化学合成法は、例えば、市販の自動核酸合成機を使用可能である。前記化学合成法は、一般に、アミダイトが使用される。前記アミダイトは、特に制限されず、市販のアミダイトとして、例えば、RNA Phosphoramidites(2’-O-TBDMSi、商品名、三千里製薬)、ACEアミダイトおよびTOMアミダイト、CEEアミダイト、CEMアミダイト、TEMアミダイト等があげられる。
4.発現ベクター
 本発明の発現ベクターは、前記本発明の核酸分子をコードするDNAを含むことを特徴とする。本発明の発現ベクターは、前記DNAを含むことが特徴であり、その他の構成は、何ら制限されない。本発明の発現ベクターは、例えば、ベクターに発現可能なように前記DNAが挿入されている。前記DNAを挿入するベクターは、特に制限されず、例えば、一般的なベクターが使用でき、ウイルスベクターおよび非ウイルスベクター等があげられる。前記非ウイルスベクターは、例えば、プラスミドベクターがあげられる。
5.組成物
 本発明の発現抑制用組成物は、前述のように、TGF-β1遺伝子の発現を抑制するための組成物であり、前記本発明の核酸分子を含むことを特徴とする。本発明の組成物は、前記本発明の核酸分子を含むことが特徴であり、その他の構成は、何ら制限されない。本発明の発現抑制用組成物は、例えば、発現抑制用試薬ということもできる。
 本発明によれば、例えば、前記TGF-β1遺伝子が存在する対象に投与することで、前記TGF-β1遺伝子の発現抑制を行うことができる。
 また、本発明の薬学的組成物は、前述のように、前記本発明の核酸分子を含むことを特徴とする。本発明の組成物は、前記本発明の核酸分子を含むことが特徴であり、その他の構成は何ら制限されない。本発明の薬学的組成物は、例えば、医薬品ということもできる。
 本発明によれば、例えば、前記TGF-β1遺伝子が原因となる疾患の患者に投与することで、前記遺伝子の発現を抑制し、前記疾患を治療できる。前記疾患は、例えば、前述の通りであって、急性肺傷害、間質性肺炎/肺線維症等があげられる。本発明において、「治療」は、前述のように、例えば、前記疾患の予防、疾患の改善、予後の改善の意味を含み、いずれでもよい。
 本発明の発現抑制用組成物および薬学的組成物(以下、組成物という)は、その使用方法は、特に制限されず、例えば、前記TGF-β1遺伝子を有する投与対象に、前記核酸分子を投与すればよい。
 前記投与対象は、例えば、細胞、組織または器官があげられる。前記投与対象は、例えば、ヒト、ヒトを除く非ヒト哺乳類等の非ヒト動物があげられる。前記投与は、例えば、in vivoでもin vitroでもよい。前記細胞は、特に制限されず、例えば、前述のような細胞等があげられる。
 前記投与方法は、特に制限されず、例えば、投与対象に応じて適宜決定できる。前記投与対象が培養細胞の場合、例えば、トランスフェクション試薬を使用する方法、エレクトロポレーション法等があげられる。
 本発明の組成物は、例えば、本発明の核酸分子のみを含んでもよいし、さらにその他の添加物を含んでもよい。前記添加物は、特に制限されず、例えば、薬学的に許容された添加物が好ましい。前記添加物の種類は、特に制限されず、例えば、投与対象の種類に応じて適宜選択できる。
 本発明の組成物において、前記核酸分子は、例えば、前記添加物と複合体を形成してもよい。前記添加物は、例えば、複合化剤ということもできる。前記複合体形成により、例えば、前記核酸分子を効率よくデリバリーすることができる。前記核酸分子と前記複合化剤との結合は、特に制限されず、例えば、非共有結合があげられる。前記複合体は、例えば、包接複合体があげられる。
 前記複合化剤は、特に制限されず、ポリマー、シクロデキストリン、アダマンチン等があげられる。前記シクロデキストリンは、例えば、線状シクロデキストリンコポリマー、線状酸化シクロデキストリンコポリマー等があげられる。
 前記添加剤は、この他に、例えば、担体、標的細胞への結合物質、縮合剤、融合剤、賦形剤等があげられる。
6.発現抑制方法
 本発明の発現抑制方法は、前述のように、TGF-β1遺伝子の発現を抑制する方法であって、前記本発明の核酸分子を使用することを特徴とする。本発明の発現抑制方法は、前記本発明の核酸分子を使用することが特徴であって、その他の工程および条件は、何ら制限されない。
 本発明の発現抑制方法は、例えば、前記TGF-β1遺伝子が存在する対象に、前記核酸分子を投与する工程を含む。前記投与工程により、例えば、前記投与対象に前記核酸分子を接触させる。前記投与対象は、例えば、細胞、組織または器官があげられる。前記投与対象は、例えば、ヒト、ヒトを除く非ヒト哺乳類等の非ヒト動物があげられる。前記投与は、例えば、in vivoでもin vitroでもよい。
 本発明の発現抑制方法は、例えば、前記核酸分子を単独で投与してもよいし、前記核酸分子を含む前記本発明の組成物を投与してもよい。前記投与方法は、特に制限されず、例えば、投与対象の種類に応じて適宜選択できる。
7.治療方法
 本発明の疾患の治療方法は、前述のように、前記本発明の核酸分子を、患者に投与する工程を含むことを特徴とする。本発明の治療方法は、前記本発明の核酸分子を使用することが特徴であって、その他の工程および条件は、何ら制限されない。本発明が対象とする疾患は、例えば、前述の通りであって、急性肺傷害、間質性肺炎/肺線維症等があげられる。
 本発明の治療方法は、例えば、前記本発明の発現抑制方法等を援用できる。前記投与方法は、特に制限されず、例えば、経口投与および非経口投与のいずれでもよい。
 本発明の治療方法における本発明の核酸分子の投与量は、前記疾患の治療上有効な量であれば特に制限されず、疾患の種類、重症度、投与対象の動物種、齢、体重、薬物受容性、投与経路等によって異なるが、通常、成人1回あたり約0.0001~約100mg/kg、例えば約0.001~約10mg/kg、好ましくは約0.005~約5mg/kgであり得る。当該量を、例えば、1日3回~2週間に1回、好ましくは1日~1週間に1回の間隔で投与することができる。
8.核酸分子の使用
 本発明の使用は、前記TGF-β1遺伝子の発現抑制のための、前記本発明の核酸分子の使用である。
 本発明はまた、TGF-β1遺伝子の発現抑制、あるいは肺線維症または急性肺傷害の治療における使用のための、本発明の核酸分子を提供する。
 本発明はまた、TGF-β1遺伝子の発現抑制剤、あるいは肺線維症または急性肺傷害の治療剤の製造のための、本発明の核酸分子の使用を提供する。
 以下、実施例等により、本発明を詳しく説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
(実施例1)A549細胞における一本鎖核酸分子のTGF-β1遺伝子の発現抑制効果
(1)一本鎖核酸分子の合成
 以下に示す一本鎖核酸分子を、ホスホロアミダイト法に基づき、核酸合成機(商品名ABI Expedite(登録商標) 8909 Nucleic Acid Synthesis System、アプライドバイオシステムス)により合成した。前記合成には、RNAアミダイトとして、RNA Phosphoramidites(2’-O-TBDMSi、商品名、三千里製薬)を用いた(以下、同様)。前記アミダイトの脱保護は、定法に従った。合成したRNAは、HPLCにより精製した。精製後のRNAは、それぞれ凍結乾燥した。
 実施例の一本鎖核酸分子としてPH-0009を、参考例の一本鎖核酸分子として、Hamasakiらが用いた一本鎖核酸分子nkRNA(以下、NK-0133ともいう)、PnkRNA(以下、PK-0051ともいう)(PLoS ONE、 7(8)、e42655、doi:10.1371、2012、Table S5)を、それぞれ上記のように合成した。PH-0009およびPnkRNAにおいて、LxおよびLyは、それぞれリンカー領域LxおよびLyであり、それぞれ、L-プロリンジアミドアミダイトを用いて下記構造式とした。各配列において、下線部は、ヒトTGF-β1遺伝子の発現抑制配列である。
PH-0009(配列番号3)
 5’-GCAGAGUACACACAGCAUAUACC-Lx-GGUAUAUGCUGUGUGUACUCUGCUU-3’ 
nkRNA(配列番号4)
 5’-AGCAGAGUACACACAGCAUAUACCCCACACCGGUAUAUGCUGUGUGUACUCUGCUUCUUCGG-3’
PnkRNA(配列番号5)
 5’-AGCAGAGUACACACAGCAUAUACC-Lx-GGUAUAUGCUGUGUGUACUCUGCUUC-Ly-G-3’
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000005
(2)TGF-β1遺伝子の発現量の測定
 前記各RNAを、20μmol/Lとなるように、注射用蒸留水(大塚製薬)に溶解し、RNA溶液を調製した。
 細胞は、A549細胞(DSファーマバイオメディカル)を使用した。培地は、10%FBSを含むDMEM(Invitrogen)を使用した。培養条件は、37℃、5%CO下とした。
 まず、細胞を、前記培地中で培養し、その培養液を、24穴プレートに、400μLずつ、5×10細胞/ウェルとなるように分注した。さらに、前記ウェル中の細胞を24時間培養した後、前記RNAをトランスフェクション試薬Lipofectamine2000(Invitrogen)を用い、前記トランスフェクション試薬の添付プロトコールに従って、トランスフェクションした。具体的には、前記ウェルあたりの組成を以下のように設定し、トランスフェクションを行った。下記組成において、(B)は、Opti-MEM(Invitrogen)、(C)は、20μmol/L 前記RNA溶液であり、両者をあわせて98.5μL添加した。なお、前記ウェルにおいて、前記RNAの最終濃度は、1nmol/Lとした。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
 トランスフェクション後、前記ウェル中の細胞を24時間培養した後、RNeasy Mini Kit(Qiagen、オランダ)を用い、添付のプロトコールに従って、RNAを回収した。次に、逆転写酵素(商品名SuperScript III、Invitrogen)を用い、添付のプロトコールに従って、前記RNAからcDNAを合成した。そして、以下に示すように、合成した前記cDNAを鋳型としてPCRを行い、TGF-β1遺伝子の発現量および内部標準であるβ-アクチン遺伝子の発現量を測定した。前記TGF-β1遺伝子の発現量は、前記β-アクチン遺伝子の発現量により補正した。
 前記PCRは、試薬としてLightCycler FastStart DNA Master SYBR Green I(商品名、Roche)、機器としてLight Cycler DX400(商品名、Roche)を用いた(以下、同様)。前記TGF-β1遺伝子およびβ-アクチン遺伝子の増幅には、それぞれ、以下のプライマーセットを使用した。
TGF-β1遺伝子用PCRプライマーセット
  (配列番号6) 5’-TTGTGCGGCAGTGGTTGAGCCG-3’
  (配列番号7) 5’-GAAGCAGGAAAGGCCGGTTCATGC-3’
β-アクチン遺伝子用プライマーセット
  (配列番号8) 5’-GCCACGGCTGCTTCCAGCTCCTC-3’
  (配列番号9) 5’-AGGTCTTTGCGGATGTCCACGTCAC-3’ 
 なお、コントロール1として、前記培養液に前記(B)液100μLのみを添加した細胞についても、遺伝子発現量を測定した(-)。また、コントロール2として、トランスフェクションにおいて、前記RNA溶液を未添加とし、前記(A)1.5μLと前記(B)とを合計100μL添加した以外は、同様にして処理した細胞についても、遺伝子発現量を測定した(mock)。
 補正後のTGF-β1遺伝子の発現量について、コントロール(-)の細胞における発現量を1として、各RNAを導入した細胞での発現量の相対値を求めた。
(3)結果
 これらの結果を、図5に示す。図5は、TGF-β1遺伝子発現量の相対値を示すグラフであり、縦軸は、相対遺伝子発現量である。図5に示すように、全ての一本鎖核酸分子は、強い遺伝子発現抑制活性を示した。特に本発明のPH-0009は他の二つの一本鎖核酸分子を上回る強い遺伝子発現抑制活性を示すことがわかった。
(実施例2)一本鎖核酸分子のヒト血清中での安定性
 実施例の核酸分子として、前記実施例1のPH-0009を、比較例の核酸分子として、前記実施例1に示すNK-0133とPK-0051を使用し、ヒト血清中での安定性を検討した。
(1)材料および方法
 まず、1×PBSに、前記核酸分子および正常ヒト血清(MP Biomedicals)を混合した混合液30μLを、37℃でインキュベートした。前記混合液30μLにおいて、前記核酸分子の添加量は、60pmolとし、前記正常ヒト血清の添加量は、終濃度10%とした。そして、インキュベート開始から、0分後、0.5分後、1分後、5分後、10分後、30分後、60分後、120分後および240分後に、フェノール・クロロフォルム抽出によって反応を停止した。得られた抽出液を15%ポリアクリルアミドゲルで電気泳動した後、SYBR Green II(商品名、Lonza)で染色し、E-BOX-VX2(エムエス機器、東京)を用いて分析した。
(2)結果
 この結果を図6に示す。図6(A)はPH-0009の血清に対する安定性を示す電気泳動の結果であり、図6(B)はNK-0133の血清に対する安定性を示す電気泳動の結果であり、図6(C)はPK-0051の血清に対する安定性を示す電気泳動の結果である。各々の図において、レーン「M」は分子量マーカーであり、(min)はインキュベート時間を示す。
 図6に示すように、比較例のNK-0133とPK-0051は、インキュベート0.5分後において、速やかな分解反応がすでに開始しており、その結果、0.5~240分の全ての結果において、0分の結果よりも、核酸分子のサイズが小さくなったことが確認された。これに対して、本発明のPH-0009は、インキュベート時間の経過にともなう泳動度の変化、すなわち、分解による分子量の減少が、ほとんど確認されなかった。この結果から、本発明の核酸分子であるPH-0009は、ヒト血清中での高い安定性を有することが示された。
(実施例3)一本鎖核酸分子のダイサータンパク質に対する反応性
 実施例の核酸分子として、前記実施例1のPH-0009を、比較例の核酸分子として、前記実施例1に示すNK-0133とPK-0051を使用し、ダイサータンパク質に対する反応性を検討した。
(1)材料および方法
 試薬としてRecombinant Human Dicer Enzyme Kit(商品名、Genlantis)を用い、添付プロトコールに従って、前記ダイサータンパク質と前記核酸分子を含む反応液を調製し、これを37℃でインキュベートした。インキュベート時間は、0、0.5、1、2、6、24時間とした。所定時間インキュベート後の前記反応液に、前記試薬の反応停止液を加え、7M尿素-20%ポリアクリルアミドゲル電気泳動を行った。その後、前記ポリアクリルアミドゲルを、SYBR Green II(商品名、Lonza)で染色し、ChemiDoc(商品名、Bio-Rad)を使用して分析した。
(2)結果
 結果を図7に示す。図7はダイサータンパク質に対する反応性を示す電気泳動の結果であり、レーン「M」は分子量マーカー(20、30、40、50および100 base)を示す。
 比較例のNK-0133とPK-0051においては、前記ダイサータンパク質に対する反応が穏やかに進行し24時間後でも反応が完結していなかった。これに対して、本発明のPH-0009は、前記ダイサータンパク質に速やかに反応し、遅くとも24時間後までには反応が終了していた。
 以上の結果から、本発明の一本鎖核酸分子は、ダイサータンパク質に対して高い反応性を有していることがわかった。
(実施例4)肺線維症自然発症モデルマウスにおける肺線維化抑制効果
 肺線維症自然発症モデルマウス(非特許文献6および7記載のヒトTGF-β1トランスジェニックマウス、以下TGマウスと呼ぶ)を用いて、本発明の核酸分子の肺線維化抑制効果を確認した。前記効果の確認は、肺組織中のハイドロキシプロリン量を指標として、非特許文献7記載の方法に従って行った。
(1)核酸分子溶液の調製
 実施例の核酸分子として、前記実施例1で合成したPH-0009を使用した。PH-0009を、2μg/75μLとなるように滅菌生理食塩水に溶解して、核酸分子溶液を調製した。
(2)肺線維症自然発症モデルマウスへの核酸分子の投与
 前記核酸分子溶液を、MycroSprayer(R)(MSA-250-M:PENNCENTURY社製)を用いて、1回/週、計4回マウスに気管内投与した。前記核酸分子溶液に対するネガティブコントロールとして、滅菌生理食塩水75μLを用いた。
 以下に、各投与群を示す。各投与群において、5匹の雄マウスを使用した。
・投与群1
 野生型マウスに、滅菌生理食塩水75μL投与
・投与群2
 TGマウスに、滅菌生理食塩水75μL投与
・投与群3
 TGマウスに、2μg/75μL核酸分子溶液75μL(0.1mg/kgマウス体重)投与
(3)肺組織のサンプリング
 最初の投与から4週間後、前記マウスに、ペントバルビタール(1.62mg/200μL/頭)の腹腔内投与により麻酔をし、採血後のマウスの右心室より、ヘパリン含有生理食塩液で低速還流したのち、肺右葉を摘出した。
(4)肺組織中のTGF-β1量の測定
 前記肺右葉を、ビーズ式細胞破砕装置(MS-100:トミー精工社製)を用いてホモジナイズし、一部を遠心し上清を回収した。回収した上清について、Human TGF-β1 ELISA Set(商品名、日本ベクトン・ディッキンソン社製)を用いてTGF-β1発現量を測定した。各投与群の定量結果は、投与群2のTGF-β1量を100とし相対値として表した。
(5)肺組織中のハイドロキシプロリン量の測定
 前記ホモジネートを110℃で一晩インキュベートして乾燥させた後、再度ビーズ式細胞破砕装置を用いて粉砕した。その後、蒸留水100mlにゆっくりかき混ぜながら濃塩酸100mlを少しずつ注いで調製した6N HClを2mL加え、粉砕した肺右葉の懸濁液をあらかじめ重量を測定しておいたスクリュー管に移し、蓋をして110℃で一晩、ドラフト内でインキュベートした。その後、蓋を外し110℃で一晩、ドラフト内でインキュベートして乾燥させた。そこに2mLのPBSを加え60℃で1時間インキュベートし、フィルター濾過したものを、ハイドロキシプロリン量測定用サンプルとした。測定は、非特許文献7に記載の方法に従って行った。
(6)結果
 その結果を、図8、9に示す。図8は、投与群2および3におけるTGF-β1量を示すグラフであり、縦軸は、肺組織中のTGF-β1量を示す。図9は、各投与群におけるハイドロキシプロリン量を示すグラフであり、縦軸は、肺組織中のハイドロキシプロリン量を示す。TGマウス/核酸分子溶液(0.1mg/kg)の投与群3は、TGマウス/滅菌生理食塩水の投与群2と比較して、肺組織中のTGF-β1量およびハイドロキシプロリン量が有意に抑制された。
 このことから、本発明の核酸分子であるPH-0009は、in vivoにおいてもターゲットであるTGF-β1の発現を抑制し、かつ肺線維化を抑制することが示された。
(実施例5)ブレオマイシン誘発肺線維症モデルマウスにおける肺線維化抑制効果
 次に、ブレオマイシン誘発肺線維症モデルマウス(非特許文献7)を用いて、本発明の核酸分子の肺線維化抑制効果を確認した。前記効果の確認は、気管支肺胞洗浄液(BALF)中総細胞数、マウスの生存率、肺組織中のハイドロキシプロリン量を指標として、非特許文献7記載の方法に従って行った。
(1)モデルマウスの作製
 野生型(C57BL/6)および実施例4のTGマウスに、ペントバルビタール(大日本住友製薬株式会社製)を腹腔内に投与後、マウス背部皮下にALZET浸透圧ポンプを埋め込んだ。なお、ALZET浸透圧ポンプには、ブレオマイシン生理食塩水溶液200μLをあらかじめ注入した(非特許文献7)。
(2)核酸分子溶液の調製
 実施例の核酸分子として、前記実施例1で合成したPH-0009を使用した。また、ネガティブコントロールとして、下記の配列を有するPH-0000を使用した。ここでLxは下記構造式で表されるリンカーを示す。
PH-0000(配列番号10)
5’- UACUAUUCGACACGCGAAGUUCC-Lx-GGAACUUCGCGUGUCGAAUAGUAUU-3’ 
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000007
 PH-0009またはPH-0000を、100μg/50μLとなるように滅菌生理食塩水に溶解して、核酸分子溶液を調製した。
(3)ブレオマイシン誘発肺線維モデルマウスへの核酸分子の投与
 ブレオマイシン投与開始後3、5および7日目に、前記核酸分子溶液をマウスに気管内投与した。正常対照として、野生型マウスに滅菌生理食塩水50μLを投与したものを用いた。
 以下に、各投与群を示す。
・投与群1
 ブレオマイシン投与野生型マウス(n=7)に、滅菌生理食塩水50μL投与
・投与群2
 ブレオマイシン投与TGマウスに、100μg/50μL PH-0000溶液50μL投与
・投与群3
 ブレオマイシン投与TGマウスに、100μg/50μL PH-0009溶液50μL投与
 各投与群におけるマウスの生存を、ブレオマイシン投与開始から21日間モニタリングした。
(4)BALF細胞数および肺組織中のハイドロキシプロリン量の測定
 ブレオマイシン投与開始後21日目に、ペントバルビタールをマウス腹腔内に投与し、麻酔下のマウスの頚部皮膚および筋肉を剥離し気管を露出させた。頚静脈から全採血し致死させた後、留置針を用いて生理食塩水を気管内へ注入し、気管支肺胞洗浄液(BALF)を回収した。次いで、開胸し、生理食塩水で灌流を行い、肺を摘出した。
 回収したBALF中の総細胞数は、気管支肺胞洗浄の当日、nucleocounter(ChemoMetec, Allerod, Denmark)でカウントし、サイトスピン(Labsystems Japan)法で細胞標本を作製し、ギムザ染色(Merck Japan)を行い、細胞分画を算定した。また、肺組織中のハイドロキシプロリン量の測定は、実施例4と同様にして行った。
(5)結果
 その結果を、図10~12に示す。図10は、各投与群における肺線維症に伴う炎症の程度を示すグラフであり、横軸は、BALF中の総細胞数を示す。図11は、各投与群における生存曲線を示すグラフであり、縦軸は累積生存率を示す。図12は、肺組織の線維化の程度を示すグラフであり、横軸は、肺組織中のハイドロキシプロリン量を示す。TGマウス/PH-0009溶液の投与群3では、TGマウス/PH-0000の投与群2と比較して、マウスの生存率が顕著に改善され、また、BALF細胞数および肺組織中のハイドロキシプロリン量が有意に抑制された。
 このことから、本発明の核酸分子であるPH-0009は、in vivoにおいて、肺線維症に伴う炎症および肺線維化を抑制し、肺線維症に対して治療効果を示すことが確認された。
(実施例6)LPS誘発肺線維症/急性肺傷害併発モデルマウスにおける炎症抑制効果および安全性
 LPS投与により肺線維症と急性肺傷害とを併発したマウスを用いて、本発明の核酸分子による治療効果と副作用を調べた。治療効果の確認は、BALF中総細胞数を指標として、また、副作用有無の確認は、BALF中のインターフェロン(IFN)-γおよび-βの発現量を指標にして、非特許文献7記載の方法に従って行った。
(1)核酸分子溶液の調製
 実施例の核酸分子として、前記実施例1で合成したPH-0009を、ネガティブコントロールとして、PH-0000を使用した。また、参考例として、実施例1で合成したPK-0051を、ネガティブコントロールとして、下記の配列を有するPK-0000を使用した。ここでLxおよびLyは下記構造式で表されるリンカーを示す。
PK-0000(配列番号11)
5’- AUACUAUUCGACACGCGAAGUUCC-Lx-GGAACUUCGCGUGUCGAAUAGUAUUC-Ly-G -3’ 
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000008
 上記各核酸分子を50μg/50μLとなるように蒸留水に溶解して、核酸分子溶液を調製した。
(2)核酸分子およびLPSの投与
 0、1、2日目に、上記各核酸分子溶液50μLを計3回、実施例4のTGマウスに経鼻投与した。3回目の核酸分子投与から6時間後にLPS(100μg/75μL)を気管内投与して、肺線維症/急性肺傷害を誘発した。
 以下に、各投与群を示す。
・投与群1
 蒸留水50μLを3回投与後、滅菌生理食塩水75μL投与(n=4)
・投与群2
 滅菌生理食塩水50μLを3回投与後、LPS溶液75μL投与(n=5)
・投与群3
 PK-0000(50μg)を3回投与後、LPS溶液75μL投与(n=4)
・投与群4
 PK-0051(50μg)を3回投与後、LPS溶液75μL投与(n=5)
・投与群5
 PH-0000(50μg)を3回投与後、LPS溶液75μL投与(n=3)
・投与群6
 PH-0009(50μg)を3回投与後、LPS溶液75μL投与(n=5)
(3)BALF中の総細胞数およびIFN量の測定
 LPS投与24時間後、麻酔(ペントバルビタ―ルナトリウム)による安楽死、気管支肺胞洗浄(BAL)を行った。BALF中の総細胞数は、実施例5と同様にして算定した。BALF中のIFN量は、IFN-γ(BD Bioscience)およびIFN-β(PBL Biomedical Laboratories)測定用キットを用いて、酵素免疫測定法(EIA)にて測定した。
(4)結果
 その結果を、図13、14に示す。図13は、各投与群における肺線維症に伴う炎症の程度を示すグラフであり、横軸は、BALF中の総細胞数を示す。図14は、各投与群におけるBALF中IFN(上:IFN-γ、下:IFN-β)量を示すグラフであり、縦軸は、BALF中のIFN濃度を示す。TGマウス/PH-0009溶液の投与群6では、TGマウス/PH-0000の投与群5と比較して、BALF細胞数が有意に抑制された。PK-0051との比較でも、有意差はないものの、BALF細胞数は減少傾向であった。一方、BALF中のIFN量は、いずれの核酸分子投与群でも、コントロールと比較して有意差は認められなかった。
 このことから、本発明の核酸分子であるPH-0009は、肺線維症に急性肺傷害を併発した患者に対しても、in vivoにおいて、炎症を抑制し治療効果を示すことが確認された。また、該核酸分子投与による副作用は認めらなかったことから、PH-0009は、治療上有効な量において、ヒトを含む動物に安全に投与し得ることが示唆された。
 以上、実施形態を参照して本願発明を説明したが、本願発明は、上記実施形態に限定されるものではない。本願発明の構成や詳細には、本願発明のスコープ内で当業者が理解しうる様々な変更をすることができる。
 この出願は、平成25年12月16日に出願された特願2013-259500および平成26年4月4日に出願された特願2014-078083を基礎とする優先権を主張し、その開示の全てをここに取り込む。
 本発明の一本鎖核酸分子によれば、TGF-β1遺伝子の発現抑制が可能である。このため、本発明は、TGF-β1遺伝子の発現が原因となる疾患、例えば、肺線維症および急性肺傷害等の治療に有効である。

Claims (20)

  1.  TGF-β1遺伝子の発現を抑制する一本鎖核酸分子であって、
    領域(X)、リンカー領域(Lx)および領域(Xc)のみからなり、
    前記リンカー領域(Lx)が、ピロリジン骨格およびピペリジン骨格の少なくとも一方を含む非ヌクレオチド構造を有し、
    かつ前記領域(X)および前記領域(Xc)の少なくとも一方が、TGF-β1遺伝子の発現を抑制する発現抑制配列を含むことを特徴とする核酸分子。
  2.  5’側から3’側にかけて、前記領域(Xc)、リンカー領域(Lx)および領域(X)を、当該順序で有してなる、請求項1記載の一本鎖核酸分子。
  3.  前記リンカー領域(Lx)が、下記式(I)で表わされる、請求項1または2記載の一本鎖核酸分子。
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000001
    前記式中、
    およびXは、それぞれ独立して、H、O、SまたはNHであり;
    およびYは、それぞれ独立して、単結合、CH、NH、OまたはSであり;
    は、環A上のC-3、C-4、C-5またはC-6に結合する水素原子または置換基であり;
    は、n個の原子からなるアルキレン鎖であり、ここで、アルキレン炭素原子上の水素原子は、OH、OR、NH、NHR、NR、SH、もしくはSRで置換されても置換されていなくてもよく、または、
    は、前記アルキレン鎖の一つ以上の炭素原子が、酸素原子で置換されたポリエーテル鎖であり、
    ただし、Yが、NH、OまたはSの場合、Yに結合するLの原子は炭素であり、ORに結合するLの原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接せず;
    は、m個の原子からなるアルキレン鎖であり、ここで、アルキレン炭素原子上の水素原子は、OH、OR、NH、NHR、NR、SHもしくはSRで置換されても置換されていなくてもよく、または、
    は、前記アルキレン鎖の一つ以上の炭素原子が、酸素原子で置換されたポリエーテル鎖であり、
    ただし、Yが、NH、OまたはSの場合、Yに結合するLの原子は炭素であり、ORに結合するLの原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接せず;
    、R、RおよびRは、それぞれ独立して、置換基または保護基であり;
    lは、1または2であり;
    mは、0~30の範囲の整数であり;
    nは、0~30の範囲の整数であり;
    環Aは、前記環A上のC-2以外の1個の炭素原子が、窒素、酸素または硫黄で置換されてもよく、
    前記環A内に、炭素-炭素二重結合または炭素-窒素二重結合を含んでもよく、
    前記領域(Xc)および前記領域(X)は、それぞれ、-OR-または-OR-を介して、前記リンカー領域(Lx)に結合し、
    ここで、RおよびRは、存在しても存在しなくてもよく、存在する場合、RおよびRは、それぞれ独立して、ヌクレオチド残基または前記構造(I)である。
  4.  前記領域(X)の塩基数(X)および前記5’側領域(Xc)の塩基数(Xc)が、下記式(3)または式(5)の条件を満たす、請求項2または3記載の一本鎖核酸分子。
       X>Xc ・・・(3)
       X=Xc ・・・(5)
  5.  前記領域(X)の塩基数(X)および前記5’側領域(Xc)の塩基数(Xc)が、下記式(11)の条件を満たす、請求項4記載の一本鎖核酸分子。
       X-Xc=1、2または3 ・・・(11)
  6.  前記領域(Xc)の塩基数(Xc)が、19塩基~30塩基である、請求項1から5のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
  7.  RNA分子である、請求項1から6のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
  8.  前記一本鎖核酸分子において、塩基数の合計が、38塩基以上である、請求項1から7のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
  9.  前記発現抑制配列として、下記配列番号1の塩基配列を含む、請求項1から8のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
    配列番号1 3’-CGUCUCAUGUGUGUCGUAU-5’
  10.  前記一本鎖核酸分子の塩基配列が、配列番号3の塩基配列である、請求項9記載の一本鎖核酸分子。
  11.  TGF-β1遺伝子の発現を抑制するための組成物であって、
    請求項1から10のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子を含むことを特徴とする、TGF-β1遺伝子の発現抑制用組成物。
  12.  請求項1から10のいずれか一項に記載の核酸分子を含むことを特徴とする、薬学的組成物。
  13.  肺線維症または急性肺傷害の治療用である、請求項12記載の薬学的組成物。
  14.  TGF-β1遺伝子の発現を抑制する方法であって、
    請求項1から10のいずれか一項に記載の核酸分子を使用することを特徴とする発現抑制方法。
  15.  前記核酸分子を、細胞、組織または器官に投与する工程を含む、請求項14記載の発現抑制方法。
  16.  前記核酸分子を、in vivoまたはin vitroで投与する、請求項15記載の発現抑制方法。
  17.  請求項1から10のいずれか一項に記載の核酸分子を、患者に投与する工程を含むことを特徴とする肺線維症の治療方法。
  18.  請求項1から10のいずれか一項に記載の核酸分子を、患者に投与する工程を含むことを特徴とする急性肺傷害の治療方法。
  19.  TGF-β1遺伝子の発現抑制における使用のための、請求項1から10のいずれか一項に記載の核酸分子。
  20.  TGF-β1遺伝子の発現抑制剤の製造のための、請求項1から10のいずれか一項に記載の核酸分子の使用。
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