WO2014126044A1 - 発がんリスクの検査方法 - Google Patents

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直子 大谷
真 吉本
智文 羅
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Definitions

  • the present invention provides a method for examining cancer and / or carcinogenic risk and a method for screening a medicine.
  • Cancer is a disease caused by multi-stage gene mutations, and it has been revealed that some genes are damaged and cells continue to grow without restriction. Even if a gene is damaged due to stress that causes DNA damage to normal cells, it is usually restored to its original state by a repair mechanism. However, when a strong stress is applied to the cells, cell death called apoptosis occurs, the cell cycle stops at the cell cycle checkpoint, and cell growth stops irreversibly. This phenomenon in which cell growth is irreversibly stopped is called “cell senescence” and is considered to be an important mechanism for preventing carcinogenesis along with apoptosis (Non-Patent Documents 1 to 4).
  • Non-patent Documents 5 and 6 This inflammatory cytokine secretion phenomenon associated with cell aging is called senescence-associated secretory phenotype (SASP) or senescence-messaging secretome (SMS), and may be one of the causes of carcinogenesis based on chronic inflammation and chronic inflammation. Sex has been suggested (Non-Patent Documents 5 to 7).
  • the present inventors have developed a carcinogenic model in which liver cancer and lung cancer frequently occur and analyzed the carcinogenic mechanism. As a result, it was clarified that the gram-positive bacteria rate increased due to changes in the gut microbiota, and the blood concentration of deoxycholic acid produced by the gram-positive bacteria increased. Furthermore, the mechanism by which deoxycholic acid causes cell senescence in hepatic stellate cells and the hepatic stellate cells secrete SASP factor, thereby promoting the carcinogenesis of the surrounding hepatocytes.
  • the present invention is based on the elucidation of the above-mentioned carcinogenic mechanism, and an object of the present invention is to provide an inspection method that leads to detection of an individual with a high carcinogenic risk and early detection of cancer by detecting changes in the intestinal flora. . Also provided are a method and a pharmaceutical composition for screening a pharmaceutical compound using changes in the intestinal flora as an index.
  • the test method for cancer and / or carcinogenic risk according to the present invention is characterized by measuring intestinal flora and / or a product of bacteria constituting the intestinal flora in a sample collected from a subject. .
  • the present inventors have clarified that cancer develops due to changes in the intestinal bacterial flora by analyzing a carcinogenesis model. Therefore, it is possible to examine the risk of carcinogenesis by analyzing the intestinal flora.
  • the ratio of gram-positive bacteria to gram-negative bacteria is significantly different from that of normal individuals in individuals who are carcinogenic or at a high cancer risk.
  • the intestinal bacterial flora has changed prior to carcinogenesis. Therefore, by analyzing the ratio of Gram-positive bacteria and Gram-negative bacteria, it is possible to detect cancer risk prior to cancer development.
  • secondary bile acids produced by anaerobic bacteria have been shown to induce cancer, so cancer can be caused by detecting anaerobic bacteria or detecting secondary bile acids. It is possible to detect an individual who has a high cancer risk.
  • the method for examining cancer and / or carcinogenic risk of the present invention is characterized in that the product is at least one of deoxycholic acid and lithocholic acid, which are metabolites of bile acids.
  • the cancer and / or carcinogenic risk testing method of the present invention is characterized in that the cancer to be examined is selected from at least one of digestive organ cancer, liver cancer, bile duct cancer, and lung cancer.
  • the sample collected from the subject is blood, saliva, mouth washing, digestive tract, digestive tract washing, stool, urine, sputum, lung washing, tracheal washing. It is characterized by being. Any sample can be used as long as it can detect enterobacteria or measure metabolites of enterobacteria, but blood, saliva, mouthwash, digestive tract, digestive tract wash, stool, urine, sputum Preferably, it is a lung washing liquid or a tracheal washing liquid. This is because the sample contains a lot of intestinal bacteria to be detected and their products. In particular, feces and blood are preferable from the viewpoint of measurement sensitivity and ease of obtaining a sample.
  • the method for examining cancer and / or carcinogenic risk of the present invention is characterized in that the intestinal bacterium belongs to the genus Clostridium.
  • Analysis of model animals detected an increase in the number of bacteria belonging to the genus Clostridium, and also included bacteria that produce deoxycholic acid. By detecting bacteria of this genus, changes in the gut microbiota with high sensitivity Can be captured.
  • the test kit for cancer and / or carcinogenic risk of the present invention is characterized by one or more bacteria constituting the intestinal flora and / or a product of the bacteria constituting the intestinal flora, and further by bacterial metabolism. And a reagent for detecting a change (oxidation, reduction, decomposition, etc.).
  • the present inventors have found that there is a correlation between changes in the gut microbiota, carcinogenesis, and carcinogenic risk. Therefore, anything that can detect changes in the intestinal microflora can be used to detect carcinogenesis and carcinogenic risk.
  • a PCR primer for identifying a specific bacterium constituting the intestinal flora, an antibody for detecting the product of the bacterium, or the like can be used.
  • the method for screening a pharmaceutical compound for reducing carcinogenic risk according to the present invention is characterized by using as an index the growth of bacteria constituting the intestinal flora and / or the products of the bacteria constituting the intestinal flora. .
  • a compound having an effect on the growth of specific bacteria constituting the human intestinal flora and metabolites produced by the intestinal bacteria may be screened. Since human intestinal bacteria live as resident bacteria in other animals, screening can be performed using animals, or a bacterial culture system can be used.
  • the compound screening method of the present invention is characterized in that the product of intestinal bacteria is at least one of deoxycholic acid and lithocholic acid, which are metabolites of bile acids.
  • changes in the intestinal microflora cause carcinogenesis, and secondary bile acids, particularly deoxycholic acid and lithocholic acid, which are products of intestinal bacteria, may be closely related to carcinogenesis. It was revealed. Therefore, the compound may be screened using this as an index.
  • the compound screening method of the present invention is characterized in that the intestinal bacterium belongs to the genus Clostridium.
  • the present invention is characterized in that a compound selected from at least one of vancomycin, ampicillin, neomycin, rifampicin, metronidazole compounds and glycopeptide antibiotics is used in combination. Moreover, it is a method for reducing the risk of carcinogenesis by administering a compound selected from at least one of these antibiotics.
  • Vancomycin, ampicillin, neomycin, rifampicin, metronidazole compounds, and glycopeptide antibiotics have been shown to improve intestinal flora and have a carcinogenic inhibitory effect. Therefore, by using these antibiotics in combination with other agents or administering these antibiotics to groups with a high risk of carcinogenesis, it becomes possible to improve the intestinal microflora and suppress carcinogenesis.
  • the breeding schedule in the case of administering antibiotics to a carcinogenic model with a high fat diet is schematically shown.
  • B. The change of the gene amount which codes bacterial 16S (rho) RNA by antibiotics administration is shown.
  • C. The effect which antibiotic administration has on liver cancer onset is shown. The liver findings of each group are shown.
  • D. Shows the average number of liver cancer and its size distribution. The change of the intestinal microflora by obesity is shown. The influence of deoxycholic acid on the development of liver cancer is shown.
  • A. A breeding schedule for administering deoxycholic acid to mice fed with a high fat diet and antibiotic cocktail is schematically shown.
  • Liver findings in a control group (high fat diet + antibiotic cocktail administration) and a deoxycholic acid administration group (high fat diet + antibiotic cocktail administration + deoxycholic acid administration) are shown.
  • C. The average number of liver cancer in each group and its size distribution are shown.
  • D. The expression ratios of cell aging markers, SASP-related markers, and DNA damage markers in hepatic stellate cells ( ⁇ -smooth muscle actin positive cells) administered with deoxycholic acid are shown.
  • An experiment for inducing liver cancer in a sterile environment is shown.
  • A. Sterile mice that do not have enteric bacteria (Germ Free) and mice that have resident bacteria (Control) are fed with a high fat diet after DMBA treatment and show liver findings at 30 weeks of age.
  • B. Shows the average number of liver cancer and its size distribution. The mechanism by which changes in the intestinal microflora due to obesity and the development of liver cancer is schematically shown.
  • the carcinogenesis and / or carcinogenic risk detection method of the present invention detects a very early step of the carcinogenic mechanism, and contributes to early diagnosis and early detection of cancer. Needless to say, the onset of cancer can be detected as shown in the following examples.
  • test animal of the method for examining cancer and / or carcinogenic risk according to the present invention is not particularly limited as long as it is an animal related to changes in intestinal microflora and carcinogenesis, but humans and mice, Examples include laboratory animals such as rabbits, rats, guinea pigs and monkeys, pets such as dogs and cats, and mammals such as livestock such as goats, cows and sheep.
  • test method When the method for examining cancer and / or carcinogenic risk according to the present invention is performed on humans, for example, by examining the intestinal bacterial flora of a test individual on a regular basis, for example, in a medical examination, a change of a certain level or more is recognized.
  • the test individual can be predicted to have cancer or have a high risk of developing cancer.
  • the gut microbiota range is set for a healthy group, a high cancer risk group, or a cancer affected group, and the gut microbiota of the test individual falls within the high carcinogenic risk group, the carcinogenic risk of the test individual If the intestinal microflora of the test individual falls within the range of the cancer-affected group, the test individual can be predicted to have cancer.
  • test method according to the present invention by applying the test method according to the present invention to test individuals that exhibit symptoms that suggest changes in the intestinal microflora, such as test populations that have already been diagnosed as obese from BMI values in health checkups, etc. It is possible to detect early carcinogenesis and to examine cancer risk.
  • a test individual that is suggested to have a high carcinogenic risk for a specific cancer for example, a test individual that exhibits symptoms such as fatty liver and NASH (non-alcoholic fatty liver) for liver cancer, and lung cancer It is possible to test early detection of carcinogenesis and cancer risk by positively applying the test method according to the present invention to a test individual who regularly smokes.
  • Changes in the intestinal flora can be detected by, for example, changes in the ratio of Gram-positive bacteria to Gram-negative bacteria.
  • the standard of the gut microbiota for determining that the test individual suffers from cancer or has a high carcinogenic risk may be appropriately set by those skilled in the art. Compared to the standard set based on the analysis result of the bacterial flora, when the ratio of Gram-positive bacteria to Gram-negative bacteria is increased, it is predicted that the individual is affected with cancer or has a high risk of developing cancer. Also good.
  • the ratio of Gram positive bacteria to Gram negative bacteria may be determined by detecting either Gram positive bacteria or Gram negative bacteria.
  • Gram-positive bacteria for example, bacteria belonging to the genus Clostridium can be used as an index.
  • Gram-positive bacteria to be detected include, in addition to the genus Clostridium, for example, Peptostreptococcus, Eubacterium, Staphylococcus, Enterococcus, Micrococcus, Bacillus, Mycobacterium, etc. it can.
  • bacteria belonging to the genus Clostridium When using bacteria belonging to the genus Clostridium as an index, all bacteria belonging to the genus Clostridium may be detected, but one or more bacteria belonging to the genus Clostridium or bacteria belonging to a specific cluster of the genus Clostridium are detected. May be.
  • bacteria belonging to Clostridium cluster XI produce deoxycholic acid that induces cellular senescence, and the ratio is markedly increased in carcinogenic models, so the risk of carcinogenesis due to changes in intestinal microflora is accurately determined. It can be detected.
  • Changes in the intestinal microflora can be analyzed using reagents that can distinguish between gram-positive and negative bacteria, such as Gram stains and PCR primers that distinguish between gram-positive and gram-negative bacteria, as appropriate.
  • detection primers, PCR conditions, etc. can be designed and set by those skilled in the art.
  • Non-Patent Document 9 Primers specific for the described Clostridium cluster XI can also be used.
  • SASP is induced by deoxycholic acid in the bloodstream.
  • SASP is recognized in various types of cells with cellular senescence, and is involved in canceration of cells in the surrounding area. Therefore, intestinal bacteria that produce deoxycholic acid may be analyzed to determine cancer morbidity or carcinogenic risk.
  • Intestinal bacteria that produce deoxycholic acid are not limited to Gram-positive bacteria.
  • any enteric bacteria that have 7 ⁇ -dehydrogenase, an enzyme that produces secondary bile acids from primary bile acids can be used. May be the detection target.
  • enterobacteria belonging to the aforementioned genus Clostridium (Gram positive, anaerobic) and Bacteroides (Gram negative, anaerobic) can be mentioned.
  • Analysis of changes in the intestinal bacterial flora can also be performed by detecting substances produced by the intestinal bacteria.
  • both substances produced by Gram-positive bacteria and substances produced by Gram-negative bacteria may be detected.
  • bacteria belonging to the genus Clostridium cluster XI and bacteria belonging to the genus Clostridium have 7 ⁇ -dehydrogenase that produces secondary bile acids from primary bile acids, so secondary bile acids should be detected.
  • Examples of secondary bile acids include deoxycholic acid and lithocholic acid, but it is preferable to detect deoxycholic acid because there are many bacteria that produce deoxycholic acid and the concentration in blood is high. .
  • the sample for analyzing the intestinal bacterial flora is not particularly limited as long as it is a sample collected from a test individual and containing intestinal bacteria. Urine, sputum, gastrointestinal fluid, gastrointestinal lavage fluid, lung lavage fluid, tracheal lavage fluid, saliva, oral cavity lavage fluid, and biopsy sample are preferable.
  • the sample for measuring a substance produced by intestinal bacteria is not particularly limited as long as it is a sample collected from a test individual and contains a substance produced by intestinal bacteria.
  • blood feces Urine, sputum, gastrointestinal fluid, gastrointestinal lavage fluid, lung lavage fluid, tracheal lavage fluid, saliva, oral lavage fluid, and biopsy sample are preferred, and the feces, urine, saliva, blood are more Preferably blood is most preferred.
  • SASP is a phenomenon observed with cell senescence not only in hepatic stellate cells but also in various types of cells, and is known to be involved in canceration of cells in the peripheral region of the cells.
  • the SASP phenomenon has been suggested in various cells such as melanocytes, fibroblasts and endothelial cells, and various tissues such as mammary gland, prostate and skin (Non-patent Document 9), and SASP may be involved in the development of melanoma. It has been reported (Non-Patent Document 10).
  • SASP is induced by deoxycholic acid in the bloodstream, so in individuals with a high blood concentration of secondary bile acids such as deoxycholic acid, SASP can be used in other than liver hepatic stellate cells. It can be understood that induction occurs.
  • the carcinogenesis model used in the examples is a model in which carcinogenesis is induced by obesity and a carcinogen, but any cancer is caused by SASP caused by changes in the intestinal microflora. Is also a target of the method for detecting cancer and / or cancer risk according to the present invention. Actually, in the carcinogenesis model of Example 1, not only liver cancer whose correlation with obesity is pointed out epidemiologically, but also the incidence of lung cancer is increasing.
  • the cancer type that is the target of the method for detecting cancer or carcinogenic risk according to the present invention may be any solid cancer.
  • epidemiologically correlates with obesity in humans including gastrointestinal cancers such as esophageal cancer, stomach cancer, gallbladder cancer, liver cancer, bile duct cancer, pancreatic cancer, colon cancer, etc. It can be detected with particularly high sensitivity in the case of lung cancer, which has been shown to develop cancer at a high rate in a carcinogenic model in combination with liver cancer and liver cancer.
  • the test kit according to the present invention is a kit for examining cancer morbidity or carcinogenic risk of a test individual, wherein the bacterial flora in a sample collected from the test individual or the production of the bacterial flora And a reagent for detecting the substance to be detected.
  • a reagent capable of discriminating Gram-positive bacteria and negative bacteria such as a PCR primer capable of distinguishing Gram-positive bacteria and Gram-negative bacteria.
  • secondary bile acid when secondary bile acid is used as an index, for example, a kit containing an antibody for detecting deoxycholic acid can be used.
  • Specific examples include an ELISA method using a DNA chip equipped with a primer for gene detection, a protein chip on which an antibody against a specific bacterial protein is immobilized, a microplate, a strip, or a microbead. it can.
  • a sample pretreatment / extraction kit for subjecting the sample to liquid chromatography or mass spectrometry is included, and an antibody is used.
  • an ELISA kit containing an antibody against 7 ⁇ -dehydrogenase of bile acid converting enzyme or an antibody for detecting deoxycholic acid can be prepared.
  • Simple DNA chips and ELISA methods can be used not only for screening drug candidate compounds but also for monitoring cancer risk patients, and are highly useful.
  • changes in the intestinal bacterial flora can be used as an index using laboratory animals such as mice, or a culture system of intestinal bacteria or a carcinogenic model culture cell system can be used.
  • the use can be determined depending on the type of the selected compound, but it is preferably used as a pharmaceutical compound or as a food ingredient in order to reduce carcinogenic risk.
  • the pharmaceutical compound selected by the screening method of the present invention has a carcinogenic risk reducing action, and can develop a new concept medicine that leads to cancer prevention.
  • Screening method using experimental animals As a specific screening method, experimental animals with altered intestinal flora are used, and candidate substances are administered for a certain period.
  • the obesity model animal system of Example 1 shown below can be used as the experimental animal in which the intestinal flora is changed.
  • the carcinogenesis model mouse of the example is C57BL / 6, any strain of mouse can be used.
  • carcinogens are used here as a carcinogenic model to develop cancer, it is not always necessary to induce carcinogenesis if only changes in the gut microbiota are monitored.
  • the gut microbiota can be artificially changed, for example, by mixing specific bacteria into the animal diet.
  • Candidate substances are administered to experimental animals as described above for a certain period of time, and changes in the intestinal bacterial flora of the experimental animals are detected.
  • the candidate substance can be administered to the laboratory animal by mixing it with food or drinking water, or forcibly using a fixed amount of syringe or the like.
  • the timing of administration it may be appropriately administered according to the candidate substance. Furthermore, as long as it is a substance secreted into breast milk, it can be exposed to a candidate substance from the time of birth by mixing it with the food or drinking water of the mother mouse.
  • the method for detecting changes in the intestinal flora can be performed in the same manner as the method for detecting changes in the intestinal flora described in “Methods for detecting cancer or carcinogenic risk”.
  • the gram-positive bacteria may be detected, or the secondary bile acid produced by the gram-positive bacteria may be detected.
  • the concentration of secondary bile acids in blood is not limited to changing the gut microbiota.
  • a compound having an action of reducing the secondary bile acid concentration in blood may be selected using an increased experimental animal.
  • intestinal bacteria having a high correlation with carcinogenic risk are cultured by a method well known to those skilled in the art, and a candidate substance is allowed to act. Whether or not the candidate substance has a carcinogenic risk reducing action can be determined using the growth of the intestinal bacteria as an index. For example, if the intestinal bacterium is a bacterium that increases the risk of carcinogenesis, a compound that suppresses growth may be selected. On the other hand, if the enteric bacterium is a bacterium that decreases the risk of carcinogenesis, select a compound that promotes growth. That's fine.
  • the candidate substance has a carcinogenic risk reducing action using secondary bile acid produced by intestinal bacteria as an index.
  • it can be determined whether or not the candidate substance has a carcinogenic risk reducing action using the secondary bile acid production activity of enteric bacteria as an index.
  • a candidate substance is added to a culture solution of cultured cells, and a secondary bile acid is allowed to act thereon to induce cell senescence. If the cultured cells do not show cellular senescence due to the action of the secondary bile acid, it can be determined that the candidate substance has an action of inhibiting or suppressing the activity of the secondary bile acid. That is, it can be determined that there is a carcinogenic risk reducing action. In consideration of the accuracy of screening, it is preferable that the cultured cells are cultured cells of the animal species and cancer types that are actually subject to reduce the risk of carcinogenesis.
  • the presence or absence of cell senescence can be examined using a well-known index of cell senescence such as measurement of SASP factor in the culture medium or the presence or absence of expression of a cell senescence marker.
  • a well-known index of cell senescence such as measurement of SASP factor in the culture medium or the presence or absence of expression of a cell senescence marker.
  • Such a pharmaceutical composition is particularly effective when administered to a subject considered to have a high cancer risk.
  • the cancer risk of an individual can be determined by the method for detecting cancer risk of the present invention.
  • the animal to be administered is not particularly limited as long as it is related to changes in the intestinal microflora and carcinogenesis, but humans, laboratory animals such as mice, rabbits, rats, guinea pigs, monkeys, and pets such as dogs and cats And mammals such as goats, cattle, sheep and other livestock.
  • antibiotics in particular vancomycin, which is a glycopeptide antibiotic, has antibacterial properties against Gram-positive bacteria, thus improving the intestinal environment and suppressing carcinogenesis. It is effective for. Therefore, the effect of reducing the carcinogenic risk can be expected by administering a glycopeptide antibiotic such as vancomycin to a patient with a high carcinogenic risk.
  • penicillin antibiotics for example, ampicillin
  • aminoglycoside antibiotics neomycin
  • rifamycin antibiotics rifampicin
  • penicillin antibiotics for example, ampicillin
  • aminoglycoside antibiotics neomycin
  • rifampicin rifampicin
  • a metronidazole compound can be illustrated as a substance which can anticipate the effect similar to these antibiotics.
  • FIG. 1A shows a method for creating a carcinogenic model used in the present invention.
  • the pup mice were reared together with the mother mice on the normal diet (ND) or the high fat diet (HFD) until the 4th week.
  • ND normal diet
  • HFD high fat diet
  • D12492 Rodent Diet with 60% kcal% Fat
  • mice Even after weaning at 4 weeks of age, the pups were kept on a normal diet or a high fat diet. At 30 weeks, the liver and lungs were removed and analyzed for the presence of cancer.
  • the average body weight of the mice at the time of dissection is an average of 33 g for normal diet-fed mice and an average of 51 g for high-fat diet-fed mice.
  • the high-fat diet-fed mice have a weight approximately 1.5 times that of normal diet-fed mice. It was.
  • FIG. 1B shows representative anatomical findings of the livers of mice bred with a normal diet and a high fat diet.
  • the livers of mice bred with a high fat diet are enlarged and become fatty livers, and liver cancer (indicated by ⁇ ) frequently occurs.
  • Fig. 1C shows the rate of cancer occurrence due to diet.
  • 68% of mice had liver cancer and 32% had both liver cancer and lung cancer.
  • FIG. 1D shows the average number of liver cancers occurring in each breeding group and their size distribution.
  • a large number of cancers occur in one individual, and a large size cancer of 2 mm or more accounts for more than half.
  • no liver cancer was observed in the normal diet group.
  • liver cancer and lung cancer frequently occur when mice are obese due to high-fat diet, but the present inventors are ob / ob mice known as genetically obese mice. Similar results are obtained even when using. That is, liver cancer frequently occurs in the same manner even when new ob / ob mice are bred with DMBA after treatment with a normal diet.
  • the carcinogenesis model mouse of the present invention develops cancer at a high rate of 100%, which is a liver cancer incidence rate. Therefore, it can be suitably used not only for basic research but also for screening pharmaceuticals.
  • the mechanism of cancer development was analyzed using a carcinogenesis model mouse.
  • Example 2 SASP induction and hepatocarcinogenesis by hepatic stellate cell aging. Recently, it has been suggested that some secretory factors increase the risk of developing cancer, and some of them are classified as SASP factors (Non-patent Document 8).
  • ⁇ -smooth muscle actin which is a cell marker of hepatic stellate cells, p21 and p16 which induce cell senescence, 53BP1 which is a marker related to DNA damage response, fci of ⁇ H2AX, IL-6 which is a major factor of SASP, Gro -Double staining with ⁇ and CXCL9 was performed to analyze the proportion of hepatic stellate cells secreting cell senescence and SASP factor.
  • Figure 2 shows the results.
  • expression of p21, p16 that induces cellular senescence, and the foci of 53BP1, ⁇ H2AX, which are markers involved in the DNA damage response are observed, whereas in hepatic stellate cells of normal-fed mice, Expression of these proteins was not observed.
  • expression of IL-6, Gro- ⁇ , and CXCL9 showed that cell aging occurred and secreted SASP factor in hepatic stellate cells of mice fed a high-fat diet.
  • p21-p-luc mice capable of noninvasively observing the expression of p21 Waf1 / Cip1 which is an inducer of cell aging, and after DMBA treatment as in the carcinogenic model of Example 1, A liver cancer induction experiment was performed, and the expression of p21 Wafl / Cip1 was observed by bioluminescence imaging.
  • Example 3 Carcinogenesis suppression effect by improvement of intestinal bacterial flora
  • SASP is known to be caused by various causes such as aging of individuals and oxidative stress.
  • the experimental model used in the present invention is due to obesity and is not known as a cause of inducing SASP until now.
  • Fig. 3A shows the experimental system.
  • DMBA was applied to a newborn mouse of wild type, and a high fat diet was raised. From 13 weeks, antibiotic cocktail (4Abx, antibiotic cocktail administration group) or vancomycin (VCM, baicomycin administration group) was mixed with drinking water and administered. Analysis was performed. On the other hand, the control group continued breeding as in the 13th week.
  • Antibiotic cocktails include ampicillin (1 g / l), neomycin (1 g / l), metronidazole (1 g / l) and vancomycin (500 mg / l). When vancomycin was administered alone, vancomycin was administered at 500 mg / l.
  • FIG. 3B shows the amount of gene encoding 16s rRNA of intestinal bacteria 17 weeks after administration of antibiotics, that is, 30 weeks after birth, in three mice in each group. Antibiotic cocktails showed complete and even vancomycin showed very low amounts of enteric bacteria.
  • mice in each group were dissected at 30 weeks and analyzed for the development of liver cancer (FIGS. 3C and 3D). Onset of liver cancer was observed in the control group, whereas in the antibiotic cocktail administration group and vancomycin administration group, it did not develop at all, or the number of liver cancer was remarkably smaller and smaller than the control. .
  • Example 4 Search for enteric bacteria related to cancer development
  • FIG. 4 the feces at 30 weeks from the start of the breeding were collected in three groups of groups fed with normal diet, high fat diet, high fat diet and given vancomycin. Bacterial flora was analyzed.
  • Non-Patent Documents 11 and 12 The identification of the intestinal bacterial flora was analyzed by the PCR method. Specifically, DNA is extracted from stool, purified, PCR amplification is performed on genes encoding 16S rRNA of various types of bacteria using universal primers, and the hypervariable region of V1-V4 is further amplified and identified. It was.
  • Gram-negative bacteria were 54% to 79% and Gram-positive bacteria were 20.9 to 45% (of which Clostridium cluster XI: 0%).
  • Gram-negative bacteria are 1.5-22%, Gram-positive bacteria are 77.4-98.4% (of which Clostridium cluster XI is 3.4-18%) there were.
  • mice HFD + VCM fed with a high fat diet and administered with vancomycin
  • gram-negative bacterial flora accounted for 99% on average.
  • the ratio of gram-negative and gram-positive bacteria in the gut microbiota can be analyzed, and the risk of developing liver cancer can be examined by increasing the ratio of gram-positive bacteria. Moreover, the risk of developing liver cancer can be examined by detecting the intestinal Clostridium cluster XI.
  • the above result is a result of using a mouse model, but it is possible to identify an intestinal bacterial flora that correlates with cancer onset in a similar manner in humans. Moreover, the risk of cancer onset can be test
  • Clostridium genus cluster XI is a bacterium that produces secondary bile acids, we analyzed the relationship between secondary bile acids and the development of liver cancer.
  • a high-fat diet-fed mouse was bred by administering an antibiotic cocktail from the 13th week after the start of the breeding, and this mouse was given only 40 ⁇ g of deoxycholic acid (DCA) per gram of body weight or a solvent (Vehicle) as a control per week. Three oral doses were administered (Figure 5A).
  • FIG. 5B shows representative liver findings of both.
  • many liver cancers occurred (indicated by ⁇ in the figure), whereas in the group of mice administered only with solvent as a control, almost no cancer was observed. I wouldn't.
  • the average number of cancers per individual was 25 or more, and cancer was frequently occurring, and the size was large.
  • deoxycholic acid concentration was 3 times that of normal-fed mice in mice fed with high fat diet, whereas deoxycholic acid was administered in the case where antibiotic cocktail was administered simultaneously. was below the detection limit.
  • Example 6 Cancer risk due to presence or absence of intestinal microbiota
  • mice were raised in a sterile environment that did not have enteric bacteria, and neonatal mice were treated with DMBA in the same manner as in Example 1, raised on a high-fat diet, and obese mice weighing 45 g or more were treated for 30 weeks.
  • the presence or absence of liver cancer was analyzed at age.
  • Aseptic mice were free of enteric bacteria, they were less likely to be obese compared to mice with resident bacteria (average weight about 57 g), and the average weight was about 48 g.
  • FIG. 6A shows the liver findings of typical mice in each group.
  • liver cancer is indicated by ⁇ .
  • FIG. 6B shows the average number of liver cancers per individual and the size thereof. The average of 6 control mice and 9 sterile mice is shown.
  • liver cancer In sterile mice, despite being obese, the low risk of developing liver cancer indicates that the presence or absence of enteric bacteria is correlated with the development of liver cancer. Furthermore, in view of the results of Example 5, it is shown that intestinal bacteria produce secondary bile acids and are deeply involved in the development of liver cancer.
  • changes in the intestinal microflora occur prior to the onset of cancer, it is possible to examine the risk of developing cancer by capturing changes in the intestinal microflora. Changes in the gut microbiota can be examined as a balance of Gram-negative and Gram-positive bacteria, or by detecting secondary bile acids.
  • the screening method for a pharmaceutical compound according to the present invention is effective for cancer that has occurred, but it is also possible to select a compound for pharmaceutical use that further reduces the risk of carcinogenesis.

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Abstract

 がん及び/又は発がんのリスクを検出可能な方法、及び検出するための試薬を提供する。また、発がんリスクを軽減するための医薬のスクリーニング方法及び医薬組成物を提供する。 がん発症は、腸内細菌叢の変化と密接な相関があることから、腸内細菌叢の変化、及び腸内細菌が産生する二次胆汁酸を検出することによって、がん発生及び/又はがん発生のリスクを検出する。さらに、腸内細菌叢を指標とする医薬のスクリーニング方法、医薬組成物を提供する。

Description

[規則26に基づく補充 06.03.2014] 発がんリスクの検査方法
 本発明は、がん及び/又は発がんリスクを検査する方法及び医薬のスクリーニング方法を提供する。
 がんは多段階の遺伝子変異によって起こる病気であり、いくつかの遺伝子が損傷し、細胞が制限なく増え続けることにより起こることが明らかにされている。正常細胞にDNA損傷を引き起こすストレスが加わって、遺伝子に損傷が生じても、通常は修復機構により元通りに修復される。しかしながら、細胞に強いストレスが加わった場合には、アポトーシスと呼ばれる細胞死が起こったり、細胞周期チェックポイントで細胞周期が停止し、不可逆的に細胞増殖が停止する。この不可逆的に細胞増殖が停止する現象を「細胞老化(senescence)」と称し、アポトーシスとならぶ重要な発がん防止機構であると考えられている(非特許文献1~4)。
 アポトーシスとは異なり、細胞老化を起こしても細胞がすぐに死滅するわけではなく、生体内に長期間生存し続ける。最近、細胞老化を起こすと様々な炎症性サイトカインが大量に分泌されることが明らかになってきた(非特許文献5、6)。この細胞老化に伴う炎症性サイトカイン分泌現象はsenescence-associated secretory phenotype(SASP)又はsenescence-messaging secretome(SMS)と呼ばれており、慢性炎症や慢性炎症を素地とする発がんの原因のひとつとなる可能性が示唆されている(非特許文献5~7)。
Sharpless NE, DePinho RA., Cancer: crime and punishment.Nature. (2005) Vol. 436(7051):636-7 Adams PD., Healing and hurting: molecular mechanisms, functions, and pathologies of cellular senescence., Mol Cell. (2009) Vol. 36(1):2-14 Collado M., & Serrano, M. Senescence in tumours: evidence from mice and humans., Nat Rev Cancer. (2010) Vol.10(1):51-7. Kuilman, T. et al. The essence of senescence. Genes Dev. (2010) Vol.24, 2463-2479. Coppe J.P., et al., Senescence-associated secretory phenotypes reveal cell-nonautonomous functions of oncogenic RAS and the p53 tumor suppressor., PLoS Biol. (2008) Vol.6(12):2853-68. Rodier F., & Campisi, J., Four faces of cellular senescence., J Cell Biol. (2011) Vol.192(4):547-56. Kuilman, T. & Peeper, D. S. , Senescence-messaging secretome: SMS-ing cellular stress. (2009)Nature Rev. Cancer Vol. 9, 81-94. Ohtani N. and Hara E., Roles and mechanisms of cellular senescence in regulation of tissue homeostasis., (2013) Cancer Sci. Davalos et al., Senescent cells as a source of inflammatory factors for tumor progression., Cancer Metastasis (2010) June; 29(2): 273-283. Ohanna et al., Senescent cells develop a PARP-1 and nuclear factor-kB-associated secretome (PNAS),, Genes Dev. (2011) 25: 1245-1261. Nagashima K. et al., Phylogenetic Analysis of 16S Ribosomal RNA Gene Sequences from Human Fecal Microbiota andImproved Utility of Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism Profiling. (2006)Bioscience and Microflora, Vol.25,No.3 , pp.99-107.
 しかしながら、SASPと発がん機構との関連については不明の点も多い。また、SASPを介した発がん機構が明らかになれば、発がんの初期の段階、又は発がんリスクの高い個体の検出を行うことや、発がん機構に基づいて医薬化合物のスクリーニングを行うことが可能となる。
 本発明者らは、肝がん及び肺がんが多発する発がんモデルを開発し、発がん機構について解析を行った。その結果、腸内細菌叢の変化によりグラム陽性菌率が上昇し、このグラム陽性菌により産生されるデオキシコール酸の血中濃度が上昇することを明らかにした。さらに、デオキシコール酸が肝星細胞に細胞老化を引き起こし、肝星細胞がSASP因子を分泌するようになることでその周囲の肝実質細胞の発がんが促進されるという機構を明らかにした。
 本発明は、上記発がん機構の解明に基づき、腸内細菌叢の変化を検出することによって、発がんリスクの高い個体の検出や、がんの早期発見につながる検査方法を提供することを課題とする。また、腸内細菌叢の変化を指標として医薬化合物をスクリーニングする方法及び医薬組成物を提供する。
 本発明のがん及び/又は発がんリスクの検査法は、被験者から採取された試料中の腸内細菌叢及び/又は該腸内細菌叢を構成する細菌の生産物を測定することを特徴とする。
 本発明者らは、発がんモデルの解析により、腸内細菌叢の変化によりがんが発症することを明らかにした。したがって、腸内細菌叢を解析することによって、発がんリスクを検査することが可能となる。
 特に、発がんしている、又は、発がんリスクの高い個体では、グラム陽性菌とグラム陰性菌の比率が正常個体と比較して著しく異なっていることが明らかとなった。本発明者らの見出したがん発症の機構に鑑みると、発がんに先立って腸内細菌叢が変化しているものと考えられる。そのため、グラム陽性菌とグラム陰性菌の比率を解析することにより、がん発生に先立って発がんリスクを検出できる。特に、嫌気性菌が産生する二次胆汁酸ががんを誘発することが明らかとなったことから、嫌気性菌の検出や、二次胆汁酸を検出することによって、がんを発症している個体や発がんリスクの高い個体を検出することが可能である。
 本発明のがん及び/又は発がんリスクの検査法は、前記生産物が胆汁酸の代謝物であるデオキシコール酸、リトコール酸の少なくとも1種であることを特徴とする。
 モデル動物の解析により、二次胆汁酸を産生する菌の増加と、がん発症との間に相関が見られた。さらに、デオキシコール酸の血中濃度を測定すると、がんを発症している個体では優位に血中濃度が上昇していることが明らかとなった。
 本発明のがん及び/又は発がんリスクの検査法は、検査対象とするがんが、消化器がん、肝がん、胆管がん、肺がんの少なくとも1つから選ばれることを特徴とする。
 モデル動物の解析により、腸内細菌叢の変化と二次胆汁酸を産生する菌の増加と肝がん、肺がんの増加が直接的に明らかとなった。また、疫学的に肥満との関連が認められている消化器がん、胆管がんも、本発明者らが明らかにした発がん機構に鑑みれば、本発明の検査法の対象となることは明らかである。
 本発明のがん及び/又は発がんリスクの検査法は、被験者から採取された試料が、血液、唾液、口腔洗浄液、消化管液、消化管洗浄液、糞便、尿、喀痰、肺洗浄液、気管洗浄液であることを特徴とする。腸内細菌を検出、又は腸内細菌の代謝物を測定できる試料であれば、どのようなものでもかまわないが、血液、唾液、口腔洗浄液、消化管液、消化管洗浄液、糞便、尿、喀痰、肺洗浄液、気管洗浄液であることが好ましい。検出すべき腸内細菌やその生産物が多く含まれる試料だからである。特に、糞便や血液は測定感度、試料の得やすさから好適である。
 本発明のがん及び/又は発がんリスクの検査法は、前記腸内細菌がクロストリジウム属に属する菌であることを特徴とする。
 モデル動物の解析から、クロストリジウム属に属する菌の増加が検出され、また、デオキシコール酸を産生する菌も含まれることから、この属の菌を検出することにより、感度良く腸内細菌叢の変化を捉えることが可能となる。
 本発明のがん及び/又は発がんリスクの検査キットは、腸内細菌叢を構成する1以上の細菌及び/又は該腸内細菌叢を構成する細菌の生産物、さらには細菌の代謝によって特徴的な変化(酸化、還元、分解など)を検出する試薬を含むことを特徴とする。
 本発明者らは、腸内細菌叢の変化と発がん、発がんリスクに相関があることを見出した。したがって、腸内細菌叢の変化を検出するものであればどのようなものであっても、発がんや発がんリスクの検出に用いることができる。例えば、腸内細菌叢を構成する特定の細菌を識別するPCRプライマーや、該細菌の生産物を検出する抗体等を使用することができる。
 本発明の発がんリスクを軽減する医薬化合物をスクリーニングする方法は、腸内細菌叢を構成する細菌の増殖及び/又は該腸内細菌叢を構成する細菌の生産物を指標とすることを特徴とする。
 本発明者らが明らかにした発がん機構によれば、腸内細菌叢の変化が発がんリスクを高める。したがって、ヒトの腸内細菌叢を構成する特定の細菌の増殖や腸内細菌が生産する代謝物を指標として、これらに対し効果を有する化合物をスクリーニングすればよい。ヒトの腸内細菌は、他の動物でも常在菌として生息しているものであるから、動物を用いてスクリーニングを行ったり、また、細菌の培養系を用いて行うことができる。
 本発明の化合物のスクリーニング方法は、腸内細菌の生産物が胆汁酸の代謝物であるデオキシコール酸、リトコール酸の少なくとも1種であることを特徴とする。
 本発明者らにより腸内細菌叢の変化が発がんの原因となること、腸内細菌の生産物である二次胆汁酸、特に、デオキシコール酸とリトコール酸が発がんと密接に相関があることが明らかにされた。したがって、これを指標として化合物をスクリーニングすればよい。
 本発明の化合物のスクリーニング方法は、前記腸内細菌がクロストリジウム属に属する菌であることを特徴とする。
 腸内細菌の変化、特にクロストリジウム属に属する菌の増加が顕著であることから、これを指標とすることにより、感度良くスクリーニングを行うことが可能である。
 本発明は、バンコマイシン、アンピシリン、ネオマイシン、リファンピシン、メトロニダゾール化合物、グリコペプチド系抗生物質のうち、少なくとも1種から選ばれる化合物を併用することを特徴とする。また、これら抗生物質のうち、少なくとも1種から選ばれる化合物を投与する発がんリスクの軽減方法であることを特徴とする。
 バンコマイシン、アンピシリン、ネオマイシン、リファンピシン、メトロニダゾール化合物、グリコペプチド系抗生物質は、腸内細菌叢を改善し、発がん抑制効果があることが示された。したがって、これら抗生物質を他剤と併用したり、発がんリスクの高い群にこれらの抗生物質を投与することにより、腸内細菌叢を改善し、発がんを抑制することが可能となる。
野生型マウスを用いた肥満によりがんを多発する発がんモデルの作成、及び結果を示す。A.高脂肪食飼育による発がんモデルの飼育スケジュールを模式的に示す。B.通常食(ND)及び高脂肪食飼育マウス(HFD)の肝臓所見を示す。C.通常食及び高脂肪食飼育マウスのがん発症率を示す。D.平均肝がん数とそのサイズ分布を示す。 通常食及び高脂肪食飼育マウスの肝星細胞(α-平滑筋アクチン陽性細胞)での細胞老化マーカー、SASP関連マーカー、DNA損傷マーカーの発現割合を示す。 抗生物質投与による肝がん発症率の変化を示す。A.高脂肪食飼育による発がんモデルに抗生物質投与をする場合の飼育スケジュールを模式的に示す。B.抗生物質投与によるバクテリア16S rRNAをコードする遺伝子量の変化を示す。C.抗生物質投与が肝がん発症に及ぼす効果を示す。各群の肝臓所見を示す。D.平均肝がん数とそのサイズ分布を示す。 肥満による腸内細菌叢の変化を示す。 デオキシコール酸の肝がん発症に対する影響を示す。A.高脂肪食、抗生物質カクテル投与飼育マウスにデオキシコール酸を投与する飼育スケジュールを模式的に示す。B.コントロール群(高脂肪食+抗生物質カクテル投与)、及びデオキシコール酸投与群(高脂肪食+抗生物質カクテル投与+デオキシコール酸投与)における肝臓所見を示す。C.各群での平均肝がん数とそのサイズ分布を示す。D.デオキシコール酸を投与したマウスの肝星細胞(α-平滑筋アクチン陽性細胞)での細胞老化マーカー、SASP関連マーカー、DNA損傷マーカーの発現割合を示す。 無菌環境での肝がん誘発実験を示す。A.腸内細菌を保有しない無菌マウス(Germ Free)及び常在菌を保有するマウス(Control)に、DMBA処理後、高脂肪食飼育を与え飼育し、30週齢時の肝臓所見を示す。B.平均肝がん数とそのサイズ分布を示す。 肥満により腸内細菌叢の変化が起こり肝がんを発症する機構を模式的に示す。
 [がん及び/又は発がんリスクを検査する方法]
 本発明者らの動物モデルを用いたがん発症機構の研究により、腸内細菌叢の変化によってがん発症が引き起こされることが明らかとなった。したがって、腸内細菌叢の変化を指標として、がん及び/又は発がんリスクを検出することができる。
 腸内細菌叢の変化は、がん発症に先立って起こるものであるから、がんを発症する前に発がんリスクとして検出することが可能である。これまで実用化されているいわゆるがんマーカーは発がんを検出するものであるのに対し、本発明では、がん発症前に発がんリスクを検出可能である点で非常に画期的である。すなわち、本発明の発がん及び/又は発がんリスク検出方法は、発がん機構の非常に初期のステップを検出するものであり、がんの早期診断、早期発見に寄与するものである。また、以下の実施例で示すように、がん発症を検出可能であることはいうまでもない。
 さらに、腸内細菌叢という複数の菌のバランスでがんのリスクやがん発症を検出可能である点で非常にユニークである。
 (検査方法の対象となる動物)
 ここで、本発明に係るがん及び/又は発がんリスクを検査する方法の被験動物は、腸内細菌叢の変化と発がんに関連のある動物であれば特に制限されないが、ヒト、及び、マウス、ウサギ、ラット、モルモット、サル等の実験動物、イヌ、ネコ等のペット、ヤギ、ウシ、ヒツジ等の家畜等の哺乳動物が挙げられる。
 (判定の方法)
 本発明に係るがん及び/又は発がんリスクを検査する方法をヒトに対して行う場合、例えば、健康診断等で、定期的に被験個体の腸内細菌叢を解析し、一定以上の変化が認められた場合にその被験個体ががんに罹患している、又は発がんリスクが高いと予測することができる。あるいは、健常群、高発がんリスク群、がん罹患群について腸内細菌叢の範囲を設定し、被験個体の腸内細菌叢が高発がんリスク群の範囲に該当した場合にその被験個体の発がんリスクが高いと予測し、被験個体の腸内細菌叢ががん罹患群の範囲に該当した場合にその被験個体ががんに罹患していると予測することができる。
 特に、腸内細菌叢の変化が示唆されている症状を呈する被験個体、例えば、健康診断等で既にBMI値から肥満と診断された被験個体群について、本発明に係る検査方法を適用することにより、発がんの早期発見や発がんリスクを検査することが可能である。また、特定のがんについて発がんリスクが高いことが示唆される被験個体、例えば、肝がんについては、脂肪肝、NASH(非アルコール性脂肪肝)等の症状を呈する被験個体、また、肺がんについては、常習的に喫煙している被験個体に対しても、積極的に本発明に係る検査方法を適用することにより、発がんの早期発見や発がんリスクを検査することが可能である。
 (腸内細菌叢の検出の方法)
 腸内細菌叢の変化は、例えば、グラム陽性菌とグラム陰性菌の比率の変化により検出することができる。
 被験個体ががんに罹患、又は、発がんリスクが高いと判断する腸内細菌叢の基準の設定は、当業者が適宜設定すればよいが、その個体の健常時、あるいは、健常群の腸内細菌叢の解析結果を基に設定した基準に比較し、グラム陽性菌のグラム陰性菌に対する比率が増加している場合に、その個体ががんに罹患、又は、発がんリスクが高いと予測してもよい。
 ここで、グラム陽性菌とグラム陰性菌の比率は、グラム陽性菌又はグラム陰性菌の何れか一方を検出することにより判定してもよい。グラム陽性菌の場合、例えば、クロストリジウム属に属する菌を指標にすることもできる。検出対象となるグラム陽性菌としては、クロストリジウム属の他に、例えばペプトストレプトコッカス属、ユーバクテリウム属、ブドウ球菌属、エンテロコッカス属、マイクロコッカス属、バチルス属、マイコバクテリウム属等を挙げることができる。
 クロストリジウム属に属する菌を指標にする場合、クロストリジウム属に属する全ての菌を検出してもよいが、クロストリジウム属に属する1種以上の菌、又は、クロストリジウム属の特定のクラスターに属する菌を検出してもよい。特に、クロストリジウム属クラスターXIに属する菌は、細胞老化を誘導するデオキシコール酸を産生することや、発がんモデルにおいて著しく比率が増加していることから、腸内細菌叢の変化による発がんリスクを精度良く検出できるものと考えられる。
 腸内細菌叢の変化は、グラム染色剤、グラム陽性菌とグラム陰性菌を識別するPCRプライマー等、グラム陽性菌と陰性菌を識別可能な試薬を適宜用いて解析することができる。PCR法を用いる場合、検出用のプライマー、PCR条件等は当業者が設計及び設定することが可能であるが、例えば、クロストリジウム属クラスターXIに属する菌を検出する場合には、非特許文献9に記載のクロストリジウム属クラスターXIに特異的なプライマーを用いることもできる。
 また、実施例で示すようにSASPは血流にのったデオキシコール酸により誘導される。SASPは、様々な種類の細胞において細胞老化に伴い認められ、周辺領域の細胞のがん化に関与する。したがって、デオキシコール酸を産生する腸内細菌を解析してがんの罹患、又は、発がんリスクを判定してもよい。デオキシコール酸を産生する腸内細菌としては、グラム陽性菌に限らず、例えば、一次胆汁酸から二次胆汁酸を産生する酵素である7α-dehydrogenaseを有する腸内細菌であればどのような菌を検出対象としてもよい。例えば、前述のクロストリジウム属(グラム陽性、嫌気性)、及び、バクテロイデス属(グラム陰性、嫌気性)に属する腸内細菌が挙げられる。
 (腸内細菌産生産物の検出方法)
 腸内細菌叢の変化の解析は、腸内細菌が産生する物質を検出することによっても行うことができる。
 グラム陽性菌とグラム陰性菌の比率を解析する場合、グラム陽性菌の産生する物質、及び、グラム陰性菌の産生する物質の両方を検出してもよいが、そのいずれかのみを検出してもよい。例えば、クロストリジウム属クラスターXIに属する菌をはじめ、クロストリジウム属に属する菌は、一次胆汁酸から二次胆汁酸を産生する7α-dehydrogenaseを有しているから、二次胆汁酸を検出対象とすることができる。二次胆汁酸としては、例えば、デオキシコール酸、及び、リトコール酸が挙げられるが、デオキシコール酸を産生する菌が多く、血中等での濃度が高いことからデオキシコール酸を検出することが好ましい。
 ここで、腸内細菌が産生する物質の検出方法は、検出対象の物質が検出できればどのような方法を用いても良い。例えば、ガスクロマトグラフィー等のクロマトグラフィーによる方法、マススペクトロメトリー法、特異的抗体を用いた検出方法が挙げられる。これらの検出方法に関する検出条件等は、当業者が適宜設定することができる
 (試料)
 本発明に係るがん又は発がんリスクを検出する方法において、腸内細菌叢を解析する試料としては、被験個体から採取され、腸内細菌が含まれる試料であれば特に限定されず、例えば、糞便、尿、喀痰、消化管液、消化管洗浄液、肺洗浄液、気管洗浄液、唾液、口腔洗浄液、生検試料が好ましく、被験個体の負担を考慮すると、糞便又は唾液がさらに好ましく、糞便が最も好ましい。
 また、腸内細菌が産生する物質を測定する場合の試料としては、被験個体から採取され、腸内細菌が産生する物質が含まれている試料であれば特に限定されず、例えば、血液、糞便、尿、喀痰、消化管液、消化管洗浄液、肺洗浄液、気管洗浄液、唾液、口腔洗浄液、生検試料が好ましく、被験個体の負担及び検出感度を考慮すると、糞便、尿、唾液、血液がさらに好ましく、血液が最も好ましい。
 (がんの種類)
 SASPは肝星細胞だけでなく、様々な種類の細胞において細胞老化に伴い認められる現象であり、その細胞の周辺領域の細胞のがん化に関与することが知られている。SASP現象は、メラノサイト、繊維芽細胞、内皮細胞等の種々の細胞、乳腺、前立腺、皮膚等の種々の組織で示唆されており(非特許文献9)、メラノーマの発症にSASPが関与することも報告されている(非特許文献10)。実施例で示すようにSASPは血流にのったデオキシコール酸により誘導されるので、デオキシコール酸等の二次胆汁酸の血中濃度の高い個体では、肝臓の肝星細胞以外でも、SASP誘導が生じると理解できる。実施例で用いた発がんモデルは、肥満及び発がん物質により発がんを誘導したモデルであるが、腸内細菌叢の変化によって引き起こされるSASPが原因となっているがんであればどのようながんであっても、本発明に係るがん及び/又は発がんリスクを検出する方法の対象となる。実際に、実施例1の発がんモデルでは、疫学的に肥満との相関が指摘される肝がんだけではなく、肺がんの発症率も増加している。すなわち、本発明に係るがん又は発がんリスクの検出方法の対象となるがん種は、固形がんであればどのようなものでもよい。中でも、食道がん、胃がん、胆嚢がん、肝がん、胆管がん、膵臓がん、大腸がん等の消化器がんをはじめとする、ヒトにおいて疫学的に肥満と相関が示されているがん、及び、肝がんとならんで発がんモデルにおいてがんが高率に発症することが示された肺がんでは、特に感度良く検出が可能である。
 (キット)
 本発明に係る検査用キットは、被験個体のがんの罹患、又は、発がんリスクを検査するためのキットであって、被験個体から採取された試料中の細菌叢、又は、前記細菌叢の産生する物質を検出するための試薬を含むことを特徴とする。
 例えば、グラム陽性菌とグラム陰性菌を識別することのできるPCRプライマー等、グラム陽性菌と陰性菌を識別可能な試薬を含むことを特徴とする。
 また、二次胆汁酸を指標とする場合には、例えば、デオキシコール酸を検出する抗体を含むキットとすることができる。
 具体的な態様としては、遺伝子検出用のプライマーを搭載したDNAチップや、特定の細菌のタンパク質に対する抗体を固定化したプロテインチップやマイクロプレート、ストリップ、マイクロビーズなどを用いたELISA法を挙げることができる。
 二次胆汁酸を指標とする場合には、例えば、試料を液体クロマトグラフィーや質量分析(GC/MS,LC/MS)に供するための試料前処理・抽出キットも含まれ、さらに抗体を利用する場合には、胆汁酸変換酵素の7α-dehydrogenaseに対する抗体やデオキシコール酸を検出する抗体を含むELISAキットとすることができる。
 簡便なDNAチップやELISA法は、医薬品候補化合物のスクリーニング法のみならず、発がんリスク患者のモニタリングにも利用でき、有用性が高い。
 [スクリーニング方法]
 本発明者らが解明した、腸内細菌叢の変化から、がん発症までの多段階にわたる機構を基に、以下に例示するスクリーニング方法によって、発がんリスクを低減する作用を有する化合物を選択することができる。
 例えば、このスクリーニング方法では、マウス等、実験動物を用いて腸内細菌叢の変化を指標としたり、あるいは、腸内細菌の培養系、発がんモデル培養細胞系を用いることができる。
 選択された化合物の種類によって、その用途を定めることができるが、発がんリスク軽減のためには、医薬化合物として、あるいは、食品成分としての用途が好ましい。
 本発明のスクリーニング方法により選択された医薬化合物は、発がんリスクの軽減作用を有し、がんの予防につながる新しいコンセプトの医薬を開発することができる。
(実験動物を用いたスクリーニング方法)
 具体的なスクリーニング方法としては、腸内細菌叢を変化させた実験動物を用い、候補物質を一定期間投与する。ここで、腸内細菌叢を変化させた実験動物としては、例えば、以下で示す実施例1の肥満モデル動物系を用いることができる。実施例1に記載のように、肥満によって、腸内細菌叢を変化させることができれば、マウスに限らず一般的に用いられているラット、ウサギ等どのような動物を用いることもできる。ここで、実施例の発がんモデルマウスはC57BL/6であるが、どのような系統のマウスでも用いることができる。
 さらに、ここでは発がんモデルとして発がん物質を用いてがんを発症させているが、腸内細菌叢の変化をモニターするだけであれば、必ずしも発がんを誘導する必要はない。
 また、腸内細菌叢は、動物の食餌に特定の細菌を混ぜて与える等により、人為的に変化させることも可能である。
 上記のような実験動物に一定期間、候補物質を投与し、実験動物の腸内細菌叢の変化を検出する。
 実験動物に対する、候補物質の投与は、食餌や飲み水に混ぜて与えることもできるし、あるいは、強制的に一定量シリンジ等を用いて投与してもよい。
 また、投与する時期に関しても、候補物質に合わせて適宜投与すればよい。さらに、母乳に分泌される物質であれば、母マウスの食餌、又は飲み水に混ぜることによって、出生時から候補物質に曝露することも可能である。
 腸内細菌叢の変化の検出方法は、「がん又は発がんリスクを検出する方法」で説明した腸内細菌叢の変化の検出方法と同様に行うことができ、グラム陽性菌とグラム陰性菌との比率を検出しても、グラム陽性菌を検出しても、あるいは、グラム陽性菌の産生する二次胆汁酸を検出してもよい。
 ここで、実施例に示すように、腸内細菌が産生する二次胆汁酸が発がんに関連しているから、腸内細菌叢を変化させるのに限らず、血中の二次胆汁酸濃度を増加させた実験動物を用い、血中の二次胆汁酸濃度を低下させる作用を有する化合物を選択してもよい。
 (培養系によるスクリーニング方法)
 腸内細菌の培養系を用いることによって、実験動物を用いるよりも多くの候補物質を短時間にスクリーニングし、効率よく目的化合物を選択することが可能である。
 具体的には、例えば、発がんリスクとの相関の高い腸内細菌を当業者に周知の方法で培養し、候補物質を作用させる。この腸内細菌の増殖を指標として、候補物質に発がんリスク軽減作用があるか否かを判定することができる。例えば、腸内細菌が発がんリスクを高める菌である場合、増殖を抑制する化合物を選択すればよく、一方、腸内細菌が発がんリスクを低下させる菌である場合、増殖を促進する化合物を選択すればよい。
 あるいは、腸内細菌の産生する二次胆汁酸を指標として、候補物質に発がんリスク軽減作用があるか否かを判定することができる。又は、腸内細菌の二次胆汁酸産生活性を指標として、候補物質に発がんリスク軽減作用があるか否かを判定することができる。
 さらに、発がんモデル培養細胞系を用いることによっても、候補物質をスクリーニングすることが可能である。
 具体的には、例えば、培養細胞の培養液に候補物質を添加し、ここに二次胆汁酸を作用させ、細胞老化を誘導する。二次胆汁酸の作用によって、培養細胞が細胞老化を示さなければ、候補物質が、二次胆汁酸の活性を阻害又は抑制する作用を有すると判断できる。すなわち、発がんリスク軽減作用があるものと判定することができる。スクリーニングの精度を考慮すると、培養細胞は、実際に発がんリスクを軽減させる対象の動物種及びがん種の培養細胞であることが好ましい。ここで、細胞老化の有無は、培養液中のSASP因子の測定、あるいは、細胞老化マーカーの発現の有無等、細胞老化の周知の指標を使用して調べることができる。
[医薬組成物、治療方法]
 本発明のスクリーニング方法により選択された化合物は、発がんリスクを軽減するため、あるいは、発がん予防のための医薬組成物の有効成分として使用することができる。
 このような医薬組成物は、特に、発がんリスクが高いと考えられる対象に投与することが有効である。個体の発がんリスクは、本発明の発がんリスクの検出方法によって判定することができる。
 投与対象動物は、腸内細菌叢の変化と発がんに関連のある動物であれば特に制限されないが、ヒト、及び、マウス、ウサギ、ラット、モルモット、サル等の実験動物、イヌ、ネコ等のペット、ヤギ、ウシ、ヒツジ等の家畜等の哺乳動物が挙げられる。
 実施例3及び4で示すように、抗生物質、特に、グリコペプチド系の抗生物質であるバンコマイシンは、グラム陽性菌に対して抗菌性があることから、腸内環境を改善し、発がんを抑制するために有効である。したがって、発がんリスクの高い患者に対して、バンコマイシン等、グリコペプチド系の抗生物質を投与することによって、発がんリスクを軽減する効果が期待できる。
 ここで、グリコペプチド系の抗生物質と同様の効果が期待できる物質として、ペニシリン系抗生物質(例えば、アンピシリン)、アミノグリコシド系抗生物質(ネオマイシン)、リファマイシン系抗生物質(リファンピシン)が例示できる。また、これらの抗生物質と同様の効果が期待できる物質として、メトロニダゾール化合物が例示できる。
 [実施例1:がんを多発する発がんモデルの作成]
 図1Aに本発明で用いた発がんモデルの作成方法を示す。野生型(C57BL/6)の新生仔マウスに、発がん物質であるDMBA(7,12-dimethylbenz [a] anthracene)を0.5%含むアセトン溶液を背部に1回塗布した。仔マウスは母マウスとともに、通常食(ND)又は高脂肪食(HFD)で4週目まで共に飼育した。高脂肪食は米国Research Diets社のD12492(Rodent Diet with 60% kcal%Fat)を用いている。生後4週で離乳させた後も、仔マウスは引き続き通常食又は高脂肪食で飼育した。30週で肝臓及び肺を摘出し、がん発生の有無を解析した。解剖時のマウスの平均体重は通常食飼育マウスでは平均33g、高脂肪食飼育マウスでは平均51gであり、高脂肪食飼育マウスは、通常食飼育マウスに比べて約1.5倍の体重であった。
 図1Bは通常食、高脂肪食で飼育したマウスの肝臓の代表的な解剖所見を示す。高脂肪食で飼育したマウスの肝臓は肥大し、脂肪肝となり肝がん(△で示す)が多発している。
 図1Cに食餌によるがん発生の比率を示す。正常食飼育マウス(n=9)では5%のマウスで肺がんが生じていたが、95%のマウスはがん発生が見られなかった。これに対し、高脂肪食飼育マウス(n=18)では68%のマウスが肝がんを、32%のマウスが肝がんと肺がんの両方を併発していた。
 図1Dには、各飼育群で生じていた平均肝がん数とそのサイズ分布を示したものである。高脂肪食飼育群では1個体に多数のがんが生じており、そのサイズも2mm以上の大きなサイズのがんが半数以上を占めている。一方、正常食飼育群では、肝がんの発生は全く観察されなかった。
 ここでは、高脂肪食飼育によって、マウスを肥満させた場合に肝がん、肺がんが多発することを示しているが、本発明者らは、遺伝的肥満マウスとして知られているob/obマウスを用いた場合でも同様の結果を得ている。すなわち、ob/obマウス新生仔をDMBA処理後、通常食で飼育した場合でも同様に肝がんが多発する。
 本発明の発がんモデルマウスは、肝がんの発症率は100%と、高率にがんを発症する。したがって、基礎研究だけではなく、医薬のスクリーニングにも好適に用いることができる。以下、発がんモデルマウスを用いて、がん発症の機構の解析を行った。
 [実施例2:肝星細胞の細胞老化によるSASP誘導と肝がん発症]
 最近、いくつかの分泌因子ががん発生リスクを増加することが示唆されており、それらの中にはSASP因子に分類されるものも含まれていた(非特許文献8)。
 これまでの解析の結果、肝臓でSASP因子を分泌する細胞は、肝星細胞であることが明らかになった。そこで、高脂肪食飼育マウス及び正常食飼育マウスの肝臓で細胞染色を行い、肝星細胞に細胞老化が生じ、SASPが観察されるか解析を行った。
 肝星細胞の細胞マーカーであるα-平滑筋アクチンと、細胞老化を誘導するp21、p16、DNA損傷応答に関わるマーカーである53BP1、γH2AXのfoci、SASPの主要な因子であるIL-6、Gro‐α、CXCL9との二重染色を行い、細胞老化、SASP因子を分泌している肝星細胞の割合を解析した。
 図2に結果を示す。高脂肪食飼育マウスの肝臓では、細胞老化を誘導するp21、p16の発現、DNA損傷応答に関わるマーカーである53BP1、γH2AXのfociが観察されるのに対し、通常飼育マウスの肝星細胞では、これらタンパク質の発現は観察されなかった。また、高脂肪食飼育マウスの肝星細胞では細胞老化が起こりSASP因子を分泌していることがIL-6、Gro‐α、CXCL9の発現により示された。
 また、細胞老化の誘導因子であるp21Waf1/Cip1の発現を非侵襲的に観察可能なp21-p-lucマウスを用い、実施例1の発がんモデルと同様にDMBA処理後、高脂肪食飼育によって肝がん誘発実験を行い、バイオルミネッセンスイメージングによるp21Waf1/Cip1の発現を観察した。
 データは示さないが、肝がん領域にp21Waf1/Cip1の発現が観察されたことから、細胞老化と肝がん発症の相関が示された。
 以上の結果から、肝星細胞の細胞老化によりSASPが生じること、SASPが肝がん発症に密接に関わっていることが示される。
 [実施例3:腸内細菌叢の改善による発がん抑制効果]
 本発明の発がんモデルでは、肝星細胞の細胞老化に伴うSASPを介していることが明らかとなった。
 SASPは個体の加齢や、酸化ストレス等、様々な原因によって生じることが知られている。しかしながら、本発明で用いた実験モデルは肥満によるものであり、これまでSASPを誘因する原因として知られているものではない。本モデルにおいてSASPを誘導している原因を解析するために、肥満によって生じる様々な変化を解析した結果、腸内細菌叢の変化がSASP誘導に相関があることが明らかになった。
 図3Aに実験系を示す。野生型マウス新生仔に対し、DMBA塗布を行い、高脂肪食飼育を行った。13週から抗生物質カクテル(4Abx、抗生物質カクテル投与群)又はバンコマイシン(VCM、バイコマイシン投与群)を飲み水に混ぜて投与し、飼育開始から30週目に肝臓を摘出し、肝がん発症の解析を行った。一方、コントロール群は、13週目までと同様に飼育を続けた。抗生物質カクテルには、アンピシリン(1g/l)、ネオマイシン(1g/l)、メトロニダゾール(1g/l)及びバンコマイシン(500mg/l)が含まれている。バンコマイシン単独投与の場合はバンコマイシン500mg/lで投与した。
 図3Bは、各群3匹ずつのマウスにおける抗生物質投与後17週、すなわち生後30週の腸内細菌の16s rRNAをコードする遺伝子量を示す。抗生物質カクテルにより完全に、また、バンコマイシンによっても、腸内細菌の量が非常に少なくなっていることが示された。
 各群のマウスを30週目に解剖し肝がん発症の解析を行った(図3C,D)。コントロール群では肝がん発症が認められたが、一方、抗生物質カクテル投与群、バンコマイシン投与群では、全く発症しないか、又はコントロールに比べて肝がんの数は著しく少なく、大きさは小さかった。
 この結果は、がん発症より前の腸内細菌叢の状態が、がんを誘発することを示している。したがって、肝がん発症に先立つ腸内細菌の変化を捉えることができれば、これをがん発症の指標として、がん発症リスクを検出することが可能である。
 [実施例4:がん発症に関連する腸内細菌の探索]
 本実施例では、がん発症に関連する腸内細菌の探索のため、腸内細菌叢がどのように変化しているかを解析した(図4)。図3Aに示した実験系で、通常食飼育、高脂肪食飼育、高脂肪食飼育で飼育するとともにバンコマイシンを与えた群の3群で、飼育開始から30週目の糞を回収し、腸内細菌叢の解析を行った。
 腸内細菌叢の同定はPCR法により解析した(非特許文献11、12)。具体的には、糞便よりDNAを抽出、精製し、ユニバーサルプライマーを使用して多種類の菌の16S rRNAをコードする遺伝子をPCR増幅し、さらにV1‐V4の超可変領域を増幅し同定を行った。
 通常食飼育(n=5)では、グラム陰性菌が54%~79%、グラム陽性菌が20.9~45%(うち、クロストリジウム属クラスターXI:0%)であった。高脂肪食飼育(n=4)では、グラム陰性菌が1.5~22%、グラム陽性菌が77.4~98.4%(うち、クロストリジウム属クラスターXI:3.4~18%)であった。バンコマイシン投与(n=2)では、グラム陰性菌が98~99.8%、グラム陽性菌が0~1.9%(うち、クロストリジウム属クラスターXI:0%)であった。
 以上の比率の平均値を図4に示す。通常食飼育マウス群(ND)は、グラム陰性菌が平均65%であるのに対し、高脂肪食飼育マウス群(HFD)では、平均8%と著しく減少し、平均88%をグラム陽性菌が占めていた。グラム陽性菌の中でもクロストリジウム属クラスターXIが平均13%と、非常に多くの割合を占めていた。
 また、高脂肪食飼育で飼育するとともにバンコマイシン投与したマウス群(HFD+VCM)では、グラム陰性細菌叢が平均99%とほとんどを占めていた。
 これら腸内細菌叢の変化と、がん発症とを比較し、グラム陽性菌の比率増加と、肝がん発症のリスク上昇の相関が明らかとなった。加えて、クロストリジウム属クラスターXIの増加と、肝がん発症のリスク上昇の相関が明らかとなった。
 したがって、腸内細菌叢のグラム陰性菌とグラム陽性菌の比率を解析し、グラム陽性菌の比率の増加によって肝がん発症リスクを検査することができる。また、腸内クロストリジウム属クラスターXIを検出することにより、肝がん発症リスクを検査することができる。
 上記結果はマウスモデルを用いた結果であるが、ヒトにおいても同様の手法により、がん発症と相関する腸内細菌叢を同定することが可能である。また、グラム陰性菌とグラム陽性菌の比率や、同定されたがん発症と相関する特定の菌を検出することにより、がん発症のリスクを検査することができる。
 [実施例5:デオキシコール酸によるSASPを介した発がん誘発]
 クロストリジウム属クラスターXIは二次胆汁酸を産生する菌であることから、二次胆汁酸と肝がん発症の関連の解析を行った。
 高脂肪食飼育マウスに、飼育開始から13週目から抗生物質カクテルを投与して飼育し、このマウスに体重1gあたり40μgのデオキシコール酸(DCA)、又はコントロールとして溶媒(Vehicle)のみを週に3回経口投与した(図5A)。
 図5Bに両者の代表的な肝臓所見を示す。デオキシコール酸を投与したマウスでは、多数の肝がんが生じているのに対し(図中、△で示している。)、コントロールとして溶媒のみを投与したマウス群では、がん発生がほとんど見られなかった。図5Cに個体あたりの平均的な肝がん数、及びその大きさを示している(n=3)。コントロールとして溶媒のみを投与したマウス群では、ほとんどがんが発生しておらず、また、発生していても、がんのサイズが小さかった。一方、デオキシコール酸投与群では、個体あたり平均25以上と、がんが多発しており、またそのサイズも大きかった。
 上記解析より、デオキシコール酸が肝がん発症を引き起こしていることが示された。
 これらマウスの血中のデオキシコール酸を測定したところ、高脂肪食飼育マウスでは通常飼育マウスの3倍のデオキシコール酸濃度であるのに対し、抗生物質カクテルを同時に投与したものでは、デオキシコール酸は検出限界以下であった。
 したがって、血中のデオキシコール酸濃度が健常者の数倍程度であっても、発がんリスクが高まることが予測される。
 ここにデータは示さないが、肝星細胞の培養細胞を10%Dulbecco's modified Eagle's medium(10%FBS添加、3%O、5%CO)において培養し、200μMのデオキシコール酸を添加すると、細胞老化を引き起こす活性酸素(ROS)の増加や、SASP関連因子の発現が確認された。したがって、デオキシコール酸に代表される二次胆汁酸が非常に低濃度であっても、発がんリスクが高まることが示唆される。
 さらに、肝臓に運ばれたデオキシコール酸が、肝星細胞でSASPを誘導していることを免疫染色法を用いて確認した。
 図5Dに示すように、デオキシコール酸投与群では、SASPを誘導することが知られているp21、SASP因子であるIL-1β、IL-6,Gro‐αが発現しているのに対し、コントロール群では発現が確認されなかった。
 [実施例6:腸内細菌叢の有無による発がんリスク]
 実施例3、4に示すように、抗生物質投与によって、腸内細菌数を減少させることにより、肝発がんのリスクが減少することが示された。そこで、腸内細菌を保有しない無菌環境でマウスを飼育し、実施例1と同様に新生仔マウスにDMBA処理し、高脂肪食で飼育し、体重が45g以上になった肥満したマウスについて30週齢時に肝がん発症の有無を解析した。
 無菌マウスは腸内細菌がいないため、常在菌のいるマウス(平均体重約57g)に比べ肥満しにくく平均体重は約48gであった。
 図6Aに各群の典型的なマウスの肝臓所見を示す。図6A中、肝がんは△で示す。図6Bに個体あたりの平均的な肝がん数、及びその大きさを示している。なお、コントロールマウスは6匹、無菌マウスは9匹の平均を示している。
 常在菌のいるマウス(コントロールマウス)では肝がん発症が見られるのに対し、腸内細菌叢を保有しない無菌マウスでは、肥満状態であるにもかかわらず、がん発症が抑制されていた。
 無菌マウスでは、肥満であるにもかかわらず、肝がんを発症のリスクが低いという結果は、腸内細菌の有無が肝がん発症と相関していることを示す。さらに、実施例5の結果を鑑みると、腸内細菌が二次胆汁酸を産生し、肝がん発症に深く関与していることを示す。
 実施例2~6の結果から、がん発症には以下の機構が働いているものと考えられる(図7)。腸内細菌叢の変化、特にデオキシコール酸を産生するクリストリジウム属クラスターXIに属する腸内細菌の増加が起こり、その結果、血中のデオキシコール酸濃度が上昇する。肝がんの場合であれば、デオキシコール酸は腸肝循環によって、肝臓に運ばれて肝星細胞の細胞老化を引き起こし細胞老化した肝星細胞はSASP因子を分泌する。このSASPは肝星細胞の周囲肝実質細胞の細胞増殖を誘導し、肝がん発症を引き起こす。
 本発明によれば、腸内細菌叢の変化はがん発症に先立ち生じることから、腸内細菌叢の変化を捉えることにより、がん発症のリスクを検査することが可能である。腸内細菌叢の変化は、グラム陰性菌、グラム陽性菌のバランスとして検査することもできるし、二次胆汁酸の検出によっても可能である。
 また、上記実施例のモデルマウスの系を用い、さらに候補化合物を投与することにより、肝がん発症を抑制する化合物を探索することも可能である。したがって、新規の医薬化合物のスクリーニングを行うこともできる。
 本発明による医薬化合物のスクリーニング方法は、発生したがんに対しても効果を有するが、さらに発がんリスクを軽減する医薬用途化合物を選定するたことも可能である。
 すなわち、本発明では腸内細菌叢の改善を図ることによって、発がんが抑制されることが示された。したがって、当該スクリーニング方法によれば、発がんリスクを軽減する医薬用途化合物を探索することができる。
 特に、腸内細菌叢の変化が、消化器がん、肝がん、胆管がん、肺がんを誘発する可能性が示されたことから、これらの疾患を有する患者、あるいは疾患のリスクを有する者に投与可能な医薬のスクリーニングを行うことができる。

Claims (11)

  1.  被験者から採取された試料中の腸内細菌叢及び/又は該腸内細菌叢を構成する細菌の生産物を測定するがん及び/又は発がんリスクの検査法。
  2.  請求項1記載のがん及び/又は発がんリスクの検査法であって、
     前記生産物が胆汁酸の代謝物であるデオキシコール酸、リトコール酸の少なくとも1種であることを特徴とする検査法。
  3.  請求項1記載のがん及び/又は発がんリスクの検査法であって、
     検査対象とするがんが、消化器がん、肝がん、胆管がん、肺がんの少なくとも1つから選ばれることを特徴とする検査法。
  4.  請求項1記載のがん及び/又は発がんリスクの検査法であって、
     被験者から採取された試料が、血液、唾液、口腔洗浄液、消化管液、消化管洗浄液、糞便、尿、喀痰、肺洗浄液、気管洗浄液であることを特徴とする検査法。
  5.  請求項1記載のがん及び/又は発がんリスクの検査法であって、
     前記細菌がクロストリジウム属に属する菌であることを特徴とする検査法。
  6.  がん及び/又は発がんリスクの検査キットであって、
     腸内細菌叢を構成する1以上の細菌及び/又は該腸内細菌叢を構成する細菌の生産物を検出する試薬を含むことを特徴とする
     請求項1記載のがん及び/又は発がんリスクの検査を行うためのキット。
  7.  発がんリスクを軽減する医薬化合物をスクリーニングする方法であって、
     腸内細菌叢を構成する細菌の増殖及び/又は該腸内細菌叢を構成する細菌の生産物を指標とすることを特徴とする方法。
  8.  請求項7記載の医薬化合物のスクリーニング方法であって、
     前記細菌の生産物が胆汁酸の代謝物であるデオキシコール酸、リトコール酸の少なくとも1種であることを特徴とするスクリーニング方法。
  9.  請求項7に記載の医薬化合物のスクリーニング方法であって、
     前記細菌がクロストリジウム属に属する菌であることを特徴とするスクリーニング方法。
  10.  バンコマイシン、アンピシリン、ネオマイシン、リファンピシン、メトロニダゾール化合物、グリコペプチド系抗生物質のうち、少なくとも1種から選ばれる化合物を投与する発がんリスクの軽減方法。
  11.  バンコマイシン、アンピシリン、ネオマイシン、リファンピシン、メトロニダゾール化合物、グリコペプチド系抗生物質のうち、少なくとも1種を含有することを特徴とする発がんリスク軽減組成物。
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