WO2012111142A1 - 蛍光色素 - Google Patents
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- RWOOWFGUCRJIPB-UHFFFAOYSA-N CCOC(c(nc(c1n[o]nc11)-c(cc2)ccc2OC)c1-c(cc1)ccc1OC)=O Chemical compound CCOC(c(nc(c1n[o]nc11)-c(cc2)ccc2OC)c1-c(cc1)ccc1OC)=O RWOOWFGUCRJIPB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
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Definitions
- the present invention relates to a fluorescent dye that is used for detecting biomolecules such as nucleic acids, proteins, peptides, and saccharides, and emits water in a solid state and has water solubility.
- probe DNA fixed on a DNA microarray substrate and sample DNA labeled with a fluorescent dye are hybridized to form a double strand, and sample DNA is detected.
- This is a technique in which a nucleic acid labeled with a fluorescent dye is subjected to PCR extension and hybridization is performed on a substrate, followed by measurement.
- a technique using a primer having a larger number of amino groups and a technique for introducing amino groups into DNA have been employed.
- fluorescent dyes are widely used, and are required to have high fluorescence intensity, emit light even in a dry state (solid state), and have water solubility.
- Cy3 or Cy5 is used as the fluorescent dye (for example, Non-Patent Document 1). Science 283,1, January, 1999,83-87
- fluorescent dyes that emit light even in a dry state are oil-soluble and have a problem of low water solubility. As a result, the fluorescent dye cannot be sufficiently dissolved in the sample solution, and as a result, the labeling rate does not increase. As a result, there is a problem that sufficient fluorescence intensity cannot be obtained.
- a fluorescent dye according to one embodiment of the present invention is characterized by comprising an azole derivative represented by the following general formula (1), (2) or (3).
- R 1 and in formula (2) one of R 1 and R 4 is represented by the general formula L 1 -M 1 , and M 1 has a substituent.
- a fluorescent dye according to another aspect of the present invention is characterized by comprising an azole derivative represented by the following general formula (4), (5) or (6).
- R 1 and in formula (5) one of R 1 and R 4 is represented by the general formula L 2 -M 2 , and M 2 has a substituent.
- R ' is an aliphatic hydrocarbon group or aromatic hydrocarbon group consisting of an alkyl group which may contain an aromatic ring
- An - is a halide ion, CF 3 SO 3 -, BF 4 - or PF 6 - Indicates.
- the fluorescent dye of the present invention is an organic EL dye having a conjugated system and comprising an azole derivative containing one or more heteroatoms, selenium atoms, or boron atoms, and has a nitrogen cation-containing group or a nitrogen-containing group. Due to its high water solubility, the labeling rate for biomolecules can be improved, and highly sensitive biomolecules can be detected. As a result, the amount of the labeling dye to be used can be greatly reduced, so that the cost for detecting the target molecule can be greatly reduced.
- the organic EL dye since the organic EL dye has a high quantum yield in a solid state (including solid and semi-solid), it gives a high fluorescence intensity even in a dry state on a substrate such as a microarray or on a bead. In addition, since organic EL dyes are less expensive than Cy3 and Cy5, biomolecules can be detected at a lower cost. In addition, since the excitation wavelength and emission wavelength can be changed by changing the substituent of the organic EL dye, the degree of freedom in selecting the fluorescence wavelength increases, and many fluorescence wavelengths such as red, orange, yellow, green, and blue can be obtained. Can be used.
- the fluorescent dye according to the present embodiment is a fluorescent dye made of an azole derivative and can be represented by the following general formulas (1), (2), and (3).
- R 1 and in formula (2) one of R 1 and R 4 is represented by the general formula L 1 -M 1 , and M 1 has a substituent.
- An alkoxy group that may have; an aldehyde group that may have a substituent; a carboxyl group that may have a substituent; an aromatic group that may have a substituent; the remainder of R 1 and R 4 (2), and from equation (1) ( R 2 and R 3 in) are each independently a hydrogen atom, a halogen atom, an optionally aromatic substituted hydrocarbon group or an aliphatic hydrocarbon group or a heterocyclic group,
- X is a substituent A nitrogen atom, a sulfur atom, an oxygen atom, a selenium atom or a boron atom which may have,
- R ′ represents an aliphatic hydrocarbon group or an aromatic hydrocarbon group comprising an alkyl group which may contain an aromatic ring
- R 2 and R 3 are preferably each independently an aromatic hydrocarbon group, an aliphatic hydrocarbon group or a heterocyclic group which may have a substituent.
- substituent Mention may be made of alkyl groups, alkenyl groups, alkynyl groups, alkoxy groups, alkyl ester groups, phosphate ester groups, sulfate ester groups, nitrile groups, hydroxyl groups, cyano groups, sulfonyl groups, aromatic hydrocarbon groups or heterocyclic groups. it can.
- the alkyl group as the substituent is a substituted or unsubstituted linear or branched alkyl group having 1 to 20 carbon atoms.
- the alkenyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkenyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkynyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkynyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkoxy group as the substituent is, for example, a methoxy group, an ethoxy group, a propoxy group, an isopropoxy group, a butoxy group, a pentyloxy group, or a phenoxy group.
- the alkyl ester group as the substituent is a linear or branched alkyl ester having 1 to 6 carbon atoms.
- the aromatic hydrocarbon group as the substituent is an aryl group containing a monocyclic ring or a polycyclic ring.
- the heterocyclic group as the substituent is, for example, a thienyl group, furanyl group, pyrrolyl group, imidazolyl group, oxazolyl group, thiadiazolyl group, pyrazolyl group, pyridyl group or quinolyl group.
- R 2 and R 3 may be an aryl group having a sulfonyl group.
- R 2 and R 3 described above are each independently an optionally substituted thienyl group, it is a furanyl group, a pyrrolyl group, an imidazolyl group, an oxazolyl group, a thiadiazolyl group, a pyrazolyl group, a pyridyl group or a quinolyl group Is preferred. This is because the fluorescence wavelength is greatly shifted by a longer wavelength and a large Stokes shift can be obtained as compared with the case where an unsubstituted or phenyl group is used.
- R 2 and R 3 represent a thienyl group which may have a substituent, and the substituent may have an aromatic hydrocarbon group, an aliphatic hydrocarbon group or a heterocycle which may have a substituent. It is a cyclic group.
- the aromatic hydrocarbon group which may have a substituent is an aryl group containing a monocyclic ring or a polycyclic ring, and examples thereof include a substituted or unsubstituted phenyl group, a naphthyl group, and a biphenyl group.
- the aromatic hydrocarbon group which may have a substituent may contain 1 to 3 of the substituent, and the substituent includes an alkyl group, an alkenyl group, an alkynyl group, an alkoxy group, and an alkyl ester.
- the alkyl group as the substituent is a substituted or unsubstituted linear or branched alkyl group having 1 to 20 carbon atoms.
- the alkenyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkenyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkynyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkynyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkoxy group as the substituent is, for example, a methoxy group, an ethoxy group, a propoxy group, an isopropoxy group, a butoxy group, a pentyloxy group, or a phenoxy group.
- the alkyl ester group as the substituent is a linear or branched alkyl ester having 1 to 6 carbon atoms.
- examples of the aliphatic hydrocarbon group which may have a substituent include a substituted or unsubstituted linear or branched alkyl group having 1 to 20 carbon atoms, and an unsubstituted straight chain having 2 to 20 carbon atoms. And a straight or branched alkynyl group having 2 to 20 carbon atoms, and the like.
- examples of the heterocyclic group that may have a substituent include a substituted or unsubstituted furanyl group, pyrrolyl group, imidazolyl group, oxazolyl group, thiadiazolyl group, pyrazolyl group, pyridyl group, or quinolyl group.
- the substituent of the thienyl group is preferably an aromatic hydrocarbon group or an aliphatic hydrocarbon group which may have a substituent, more preferably an aromatic hydrocarbon group which may have a substituent, more preferably A monocyclic or polycyclic aryl group, and specific examples include a substituted or unsubstituted phenyl group, a naphthyl group, a biphenyl group, and the like.
- the aromatic hydrocarbon group which may have a substituent may contain 1 to 3 of the substituent, and the substituent includes an alkyl group, an alkenyl group, an alkynyl group, an alkoxy group, and an alkyl ester.
- the alkyl group as the substituent is a substituted or unsubstituted linear or branched alkyl group having 1 to 20 carbon atoms.
- the alkenyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkenyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkynyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkynyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkoxy group as the substituent is, for example, a methoxy group, an ethoxy group, a propoxy group, an isopropoxy group, a butoxy group, a pentyloxy group, or a phenoxy group.
- the alkyl ester group as the substituent is a linear or branched alkyl ester having 1 to 6 carbon atoms.
- the fluorescent dye since the fluorescent dye has high water solubility, the labeling rate for biomolecules can be improved, and highly sensitive biomolecules can be detected.
- the substituent of the fluorescent dye by changing the substituent of the fluorescent dye, the excitation wavelength and the emission wavelength can be changed, and two or more fluorescent dyes having a large Stokes shift can be used, and a plurality of target molecules contained in one sample can be used simultaneously. It becomes possible to detect.
- R 2 and R 3 when using a thienyl group which may have a substituent, because the Stokes shift in excess of 100nm obtained, can be detected with high sensitivity without being affected by the excitation light Become.
- a diazole derivative is shown as the azole derivative, but a triazole derivative represented by the following general formula can also be used. Even if a triazole derivative is used, the same effect as in the case of a diazole derivative can be obtained.
- R 1 and in formula (8) one of R 1 and R 7 is represented by the general formula L 3 -M 3 , and M 3 has a substituent.
- R 2 and R 3 are preferably each independently an aromatic hydrocarbon group, an aliphatic hydrocarbon group or a heterocyclic group which may have a substituent.
- substituent Mention may be made of alkyl groups, alkenyl groups, alkynyl groups, alkoxy groups, alkyl ester groups, phosphate ester groups, sulfate ester groups, nitrile groups, hydroxyl groups, cyano groups, sulfonyl groups, aromatic hydrocarbon groups or heterocyclic groups. it can.
- the alkyl group as the substituent is a substituted or unsubstituted linear or branched alkyl group having 1 to 20 carbon atoms.
- the alkenyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkenyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkynyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkynyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkoxy group as the substituent is, for example, a methoxy group, an ethoxy group, a propoxy group, an isopropoxy group, a butoxy group, a pentyloxy group, or a phenoxy group.
- the alkyl ester group as the substituent is a linear or branched alkyl ester having 1 to 6 carbon atoms.
- the aromatic hydrocarbon group as the substituent is an aryl group containing a monocyclic ring or a polycyclic ring.
- the heterocyclic group as the substituent is, for example, a thienyl group, furanyl group, pyrrolyl group, imidazolyl group, oxazolyl group, thiadiazolyl group, pyrazolyl group, pyridyl group or quinolyl group.
- R 2 and R 3 may be an aryl group having a sulfonyl group.
- R 2 and R 3 are each independently a thienyl group, furanyl group, pyrrolyl group, imidazolyl group, oxazolyl group, thiadiazolyl group, pyrazolyl group, which may have a substituent. It is preferably a pyridyl group or a quinolyl group. This is because the fluorescence wavelength is greatly shifted by a longer wavelength and a large Stokes shift can be obtained as compared with the case where an unsubstituted or phenyl group is used.
- R 2 and R 3 represent a thienyl group which may have a substituent, and the substituent may have an aromatic hydrocarbon group, an aliphatic hydrocarbon group or a heterocycle which may have a substituent. It is a cyclic group.
- the substituent of the thienyl group the same as in the case of the diazole derivative can be used.
- FIG. 1 The fluorescent dye according to the present embodiment is a fluorescent dye made of an imidazole derivative and can be represented by the following general formula. Even when an imidazole derivative is used, the same effect as in the first embodiment can be obtained.
- R 1 and R 4 in formulas (10), (12) and (13), and any one of R 1 , R 4 and R 5 in formulas (11) and (14) Formula L 4 -M 4 is shown, and M 4 is an optionally substituted pyridinium group, secondary aminium group, tertiary aminium group, quaternary ammonium group, piperidinium group, piperazinium group, imidazolium group, thiazolium.
- a nitrogen-containing group that is a xazolyl group, L 4 is represented by — (CH ⁇ CR 6 ) n —, and is a linker that connects M 4 to a central pyridine ring or a central benzene ring, and n is 1 to 5
- R 6 is a hydrogen atom; a linear or branched alkyl group having 1 to 6 carbon atoms which may have a substituent; a sulfo
- R ′ represents an aliphatic hydrocarbon group or aromatic hydrocarbon group which may contain an aromatic ring
- An ⁇ represents a halide ion. , CF 3 SO 3 ⁇ , BF 4 — or PF 6 — .
- R 2 and R 3 are preferably each independently an aromatic hydrocarbon group, an aliphatic hydrocarbon group or a heterocyclic group which may have a substituent.
- substituent Mention may be made of alkyl groups, alkenyl groups, alkynyl groups, alkoxy groups, alkyl ester groups, phosphate ester groups, sulfate ester groups, nitrile groups, hydroxyl groups, cyano groups, sulfonyl groups, aromatic hydrocarbon groups or heterocyclic groups. it can.
- the alkyl group as the substituent is a substituted or unsubstituted linear or branched alkyl group having 1 to 20 carbon atoms.
- the alkenyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkenyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkynyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkynyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkoxy group as the substituent is, for example, a methoxy group, an ethoxy group, a propoxy group, an isopropoxy group, a butoxy group, a pentyloxy group, or a phenoxy group.
- the alkyl ester group as the substituent is a linear or branched alkyl ester having 1 to 6 carbon atoms.
- the aromatic hydrocarbon group as the substituent is an aryl group containing a monocyclic ring or a polycyclic ring.
- the heterocyclic group as the substituent is, for example, a thienyl group, furanyl group, pyrrolyl group, imidazolyl group, oxazolyl group, thiadiazolyl group, pyrazolyl group, pyridyl group or quinolyl group.
- R 2 and R 3 may be an aryl group having a sulfonyl group.
- R ′ and R ′′ each represents an aliphatic hydrocarbon group or an aromatic hydrocarbon group comprising an alkyl group that may contain an aromatic ring.
- the aliphatic hydrocarbon group or the aromatic hydrocarbon group includes: The thing similar to the above can be used.
- R 2 and R 3 are each independently a thienyl group, furanyl group, pyrrolyl group, imidazolyl group, oxazolyl group, thiadiazolyl group, which may have a substituent,
- a pyrazolyl group, a pyridyl group or a quinolyl group is preferred. This is because the fluorescence wavelength is greatly shifted by a longer wavelength and a large Stokes shift can be obtained as compared with the case where an unsubstituted or phenyl group is used.
- R 2 and R 3 represent a thienyl group which may have a substituent, and the substituent may have an aromatic hydrocarbon group, an aliphatic hydrocarbon group or a heterocycle which may have a substituent. It is a cyclic group.
- the substituent of the thienyl group the same as in the case of Embodiment 1 can be used.
- the fluorescent dye according to the present embodiment is a fluorescent dye made of an azole derivative and can be represented by the following general formulas (4), (5), and (6).
- R 1 and in formula (5) one of R 1 and R 4 is represented by the general formula L 2 -M 2 , and M 2 has a substituent.
- R ' is an aliphatic hydrocarbon group or aromatic hydrocarbon group consisting of an alkyl group which may contain an aromatic ring
- An - is a halide ion, CF 3 SO 3 -, BF 4 - or PF 6 - Indicates.
- R 2 and R 3 represent a thienyl group which may have a substituent, and the substituent may have an aromatic hydrocarbon group, an aliphatic hydrocarbon group or a heterocycle which may have a substituent. It is a cyclic group.
- the aromatic hydrocarbon group which may have a substituent is an aryl group containing a monocyclic or polycyclic ring, and specific examples thereof include a substituted or unsubstituted phenyl group, naphthyl group, biphenyl group and the like. Can be mentioned.
- the aromatic hydrocarbon group which may have a substituent may contain 1 to 3 of the substituent, and the substituent includes an alkyl group, an alkenyl group, an alkynyl group, an alkoxy group, and an alkyl ester.
- the alkyl group as the substituent is a substituted or unsubstituted linear or branched alkyl group having 1 to 20 carbon atoms.
- the alkenyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkenyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkynyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkynyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkoxy group as the substituent is, for example, a methoxy group, an ethoxy group, a propoxy group, an isopropoxy group, a butoxy group, a pentyloxy group, or a phenoxy group.
- the alkyl ester group as the substituent is a linear or branched alkyl ester having 1 to 6 carbon atoms.
- examples of the aliphatic hydrocarbon group which may have a substituent include a substituted or unsubstituted linear or branched alkyl group having 1 to 20 carbon atoms, and an unsubstituted straight chain having 2 to 20 carbon atoms. And a straight or branched alkynyl group having 2 to 20 carbon atoms, and the like.
- examples of the heterocyclic group that may have a substituent include a substituted or unsubstituted furanyl group, pyrrolyl group, imidazolyl group, oxazolyl group, thiadiazolyl group, pyrazolyl group, pyridyl group, or quinolyl group.
- the substituent of the thienyl group is preferably an aromatic hydrocarbon group or an aliphatic hydrocarbon group which may have a substituent, more preferably an aromatic hydrocarbon group which may have a substituent. Examples include a substituted or unsubstituted phenyl group, naphthyl group, biphenyl group and the like.
- the aromatic hydrocarbon group which may have a substituent may contain 1 to 3 of the substituent, and the substituent includes an alkyl group, an alkenyl group, an alkynyl group, an alkoxy group, and an alkyl ester.
- the alkyl group as the substituent is a substituted or unsubstituted linear or branched alkyl group having 1 to 20 carbon atoms.
- the alkenyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkenyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkynyl group as the substituent is an unsubstituted straight-chain or branched alkynyl group having 2 to 20 carbon atoms.
- the alkoxy group as the substituent is, for example, a methoxy group, an ethoxy group, a propoxy group, an isopropoxy group, a butoxy group, a pentyloxy group, or a phenoxy group.
- the alkyl ester group as the substituent is a linear or branched alkyl ester having 1 to 6 carbon atoms.
- This embodiment also has the same effect as that of the first embodiment. That is, since the fluorescent dye has high water solubility, the labeling rate for biomolecules can be improved, and highly sensitive biomolecules can be detected.
- the excitation wavelength and emission wavelength can be changed, and two or more fluorescent dyes with a large Stokes shift can be used, and multiple target molecules contained in one sample can be detected simultaneously. Is possible.
- the fluorescence wavelength is 600 nm or more and exceeds 100 nm, preferably exceeds 120 nm, more preferably exceeds 150 nm. Since Stokes shift can be obtained, highly sensitive detection is possible without being affected by excitation light.
- the fluorescent dye of the present invention contains a pyridyl group as a nitrogen-containing group
- a phosphonium salt is prepared by reacting an azole derivative or imidazole derivative haloalkyl with triphenylphosphine, and a pyridyl group is introduced through a double bond by Wittig reaction using this phosphonium salt and formylpyridine. To obtain a pyridyl form.
- a pyridinium group when included as a nitrogen cation containing group, it can manufacture by making the pyridyl body and the bromo body of an active ester react, and obtaining a pyridinium salt.
- the haloalkyl form can be obtained by using a method in which a halogenating agent is reacted with a hydroxy form of an azole derivative or an imidazole derivative.
- halogenating agent thionyl chloride, phosphoryl chloride, phosphorus trichloride, phosphorus pentachloride, sulfuryl chloride, chlorine, thionyl bromide, bromine and the like can be used, and thionyl chloride or phosphoryl chloride is preferable.
- a method for obtaining a pyridinium salt containing an active ester to be a bonding portion described below using a bromo form of an active ester has been described, but methyl iodide is introduced into the pyridine introduced above.
- a pyridinium salt can also be produced by reacting haloalkanes such as haloalkenes, haloalkenes or halocarboxylic acids.
- the terminal of the haloalkanes or haloalkenes contains a functional group that becomes a bonding portion described below, such as an isothiocyanate group or maleic anhydride, it can be bonded to a biomolecule.
- a pyridinium compound having a carboxylic acid at the terminal is obtained by chemically bonding to pyridine, so that an active ester group such as hydroxysuccinimide can be introduced.
- the fluorescent dye of the present invention can be provided with a binding part that binds to a biomolecule.
- the bonding portion can be provided, for example, on a nitrogen cation-containing group or a nitrogen-containing group.
- the binding portion has a reactive group that binds to a biomolecule, and the reactive group binds to the biomolecule through a covalent bond or an ionic bond.
- the reactive group when forming an amide bond, an imide bond, a urethane bond, an ester bond, or a guanidine bond as a covalent bond, the reactive group reacts with an amino group, imino group, thiol group, carboxyl group, or hydroxyl group of a biomolecule.
- Possible functional groups are preferred.
- the functional groups include, for example, isothiocyanate groups, isocyanate groups, maleic anhydride groups, epoxy groups, halogenated sulfonyl groups, acyl chloride groups, halogenated alkyl groups, glyoxal groups, aldehyde groups, triazine groups, carbodiimide groups and active groups.
- An esterified carbonyl group or the like can be used.
- any one selected from an isothiocyanate group, an isocyanate group, an epoxy group, a halogenated alkyl group, a triazine group, a carbodiimide group, and an active esterified carbonyl group is preferably used.
- any one selected from an isothiocyanate group, an isocyanate group, an epoxy group, a halogenated alkyl group, a triazine group, a carbodiimide group, and an active esterified carbonyl group is preferably used. More preferred are a triazine group, a carbodiimide group, or an active esterified carbonyl group.
- a carboxyl group can be used as the functional group of the nitrogen cation-containing group that reacts with these reactive groups.
- a carboxyl group can be used as the functional group of the nitrogen cation-containing group that reacts with these reactive groups.
- an N-hydroxy-succinimide ester or a maleimide ester can be used for the active esterified carbonyl group.
- DCC N-hydroxy-succinimide and N, N'-dicyclohexylcarbodiimide
- a carbodiimide reagent such as DCC or 1-cyclohexyl-3- (2-morpholinoethyl) carbodiimide can be used for the carbodiimide group.
- a fluorescent dye and a biomolecule can be bound by an amide bond via a carbodiimide body.
- an anionic group or a cationic group can be used as the reactive group that forms an ionic bond.
- the anionic group for example, a sulfonyl group or a carboxyl group can be used. These anionic groups are ionically bonded to a cationic group of the biomolecule, such as an amino group.
- a nitrogen cation-containing group such as a quaternary ammonium group or a pyridinium group can be used. These cationic groups are ionically bonded to an anionic group of the biomolecule, such as a carboxyl group.
- the nitrogen cation-containing group bonded to the central pyridine ring or the central benzene ring can also serve as a cationic group as a reactive group.
- the fluorescent dye of the present invention can be applied to any biomolecule detection method as long as it is a detection method that measures fluorescence of labeled solid or semi-solid biomolecules.
- the fluorescent dye of the present invention may be labeled by directly reacting the biomolecule sample with the fluorescent dye, or a method of labeling by reacting the biomolecule sample with the probe labeled with the fluorescent dye of the present invention is used.
- You can also Furthermore, a method of separating the size of a biomolecule sample labeled with the fluorescent dye of the present invention by electrophoresis can also be used. For example, it can be used in a DNA microarray method for detecting nucleic acids or a PCR method using primers and terminators.
- a staining dye is usually used for detection of the protein after electrophoresis.
- a staining dye for example, Coomassie Brilliant Blue (CBB)
- CBB Coomassie Brilliant Blue
- the conventional method using a staining dye is simple, but the sensitivity is as low as about 100 ng, and it is not suitable for detecting a trace amount of protein.
- the dye is infiltrated through the gel, there is also a problem that it takes a long time for dyeing.
- the fluorescent dye of the present invention it has high sensitivity and is suitable for detecting a trace amount of protein. Further, the size separated protein can be identified by mass spectrometry.
- the protein should be a detection target for simple proteins such as albumin, globulin, glutelin, histone, protamine, and collagen, and complex proteins such as nucleoprotein, glycoprotein, riboprotein, phosphoprotein, and metal protein.
- simple proteins such as albumin, globulin, glutelin, histone, protamine, and collagen
- complex proteins such as nucleoprotein, glycoprotein, riboprotein, phosphoprotein, and metal protein.
- phosphoproteins, glycoproteins and total proteins can be stained in protein samples separated by two-dimensional electrophoresis using three types of fluorescent dyes corresponding to the staining dyes of phosphoproteins, glycoproteins, and total proteins.
- the protein can be identified by performing mass spectrometry such as TOF-Mass, it can be applied to diagnosis and treatment of diseases such as cancer and virus infections that produce special proteins.
- Collagen is a protein constituting the connective tissue of animals and has a unique fibrous structure. That is, it consists of three polypeptide chains, and the peptide chains gather to form a triple chain. Collagen is generally a protein with very low immunogenicity, and is widely used in the fields of food, cosmetics, pharmaceuticals and the like. However, even if a fluorescent dye is introduced into the peptide chain of collagen, the conventional fluorescent dye cannot be said to have sufficient stability, and a more stable fluorescent dye is required. Thus, stable and highly sensitive detection can be performed by labeling collagen with the fluorescent dye of the present invention.
- a protein can be labeled by labeling an antibody that specifically binds to the protein with the fluorescent dye of the present invention.
- an antibody that specifically binds to the protein For example, when an IgG antibody is treated with pepsin, a fragment called F (ab ′) 2 is obtained. When this fragment is reduced with dithiothreitol or the like, a fragment called Fab ′ is obtained.
- Fab ′ fragments have one or two thiol groups (—SH).
- a specific reaction can be carried out by allowing a maleimide group to act on the thiol group. That is, an antibody can be labeled by introducing a maleimide group as a reactive group into the fluorescent dye of the present invention and reacting with the thiol group of the fragment. In this case, the physiological activity (antigen capturing ability) of the antibody is not lost.
- the aptamer can also be labeled with the fluorescent dye of the present invention.
- Aptamers are composed of oligonucleic acids and can have various characteristic three-dimensional structures depending on the base sequence, and can bind to any biomolecule including proteins via the three-dimensional structure. Utilizing this property, the aptamer labeled with the fluorescent dye of the present invention is bound to a specific protein, and the detected substance is indirectly detected from the fluorescence change accompanying the structural change of the protein due to the binding with the detected substance. Can do.
- metal ions can be detected using the fluorescent dye of the present invention.
- Metal ions are involved in all life phenomena that occur in the body, such as the stability of DNA and proteins in the body, the maintenance of higher-order structures, functional expression, and the activation of enzymes that control all chemical reactions in the body. . Therefore, the importance of a metal ion sensor capable of observing the movement of metal ions in a living body in real time is sought after in the medical field.
- a metal ion sensor in which a fluorescent dye is introduced into a biomolecule is known.
- the K + ions present of a metal ion sensor that utilizes a nucleic acid having a sequence that takes the K + ions takes in a special structure has been proposed (J. AM.
- a fluorescent dye that causes energy transfer is introduced at both ends of the nucleic acid. Normally, energy transfer does not occur because there is a distance between dyes. However, in the presence of K + ions, as a result of the nucleic acid taking a special form, the fluorescence can be observed by approaching the distance at which the fluorescent dye causes energy transfer.
- a zinc ion sensor in which a fluorescent dye is introduced into a peptide has also been proposed (J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 3053-3054).
- intracellular signal observation can also be performed using the fluorescent dye of the present invention.
- a large number of molecules from ions to enzymes are involved in cellular responses to internal signals and environmental information. It is known that a special protein kinase is activated in the signal transduction process, and leads to phosphorylation of a special cellular protein, thereby carrying out an initial response of various cellular responses. Nucleotide binding and hydrolysis play a critical role in these activities, and signal transduction behavior can be quickly observed by using nucleotide derivatives. For example, protein kinase C (PKC) plays an important role in signal transduction at the cell membrane.
- PKC protein kinase C
- This Ca 2+ -dependent serine / threonine protein kinase is activated on membrane constituent lipids such as diacylglycerol and phosphatidylserine, and membrane surface electrification by phosphorylating serine and threonine present in ion channels and cytoskeletal proteins Is changing signal transduction.
- membrane constituent lipids such as diacylglycerol and phosphatidylserine
- membrane surface electrification by phosphorylating serine and threonine present in ion channels and cytoskeletal proteins Is changing signal transduction.
- nucleotide derivatives are supplied as enzyme substrates and inhibitors, exploring the structure and dynamics of isolated proteins, reconstitution of membrane-bound protein enzymes, organelles like mitochondria, nucleotides in tissues like membrane-removed muscle fibers It binds to the binding protein and regulates it. Recently, the existence of compounds that affect signal transduction, such as G-protein inhibitors and activators, has also been found.
- a labeling dye comprising the organic EL dye of the present invention into this nucleotide derivative, dynamic observation of these intracellular signal transmissions can be performed with high sensitivity and easy handling.
- the fluorescent dye of the present invention can also be used as a staining dye for tissues or cells used for studying the expression level of a target nucleic acid or target protein in a tissue or cell sample. That is, when the staining dye of the present invention is used for staining of eukaryotic cells, it emits fluorescence even in a dry state, and thus exhibits superior performance compared to conventional dyes in terms of storage after labeling. Further, it can be sufficiently used not only as a eukaryotic cell but also as a dye for cytoskeleton. In addition, it can be used for labeling of mitochondria, Golgi apparatus, endoplasmic reticulum, solisome, lipid bilayer membrane and the like. Since these labeled cells can be observed under all wet and dry conditions, they are highly versatile. For observation, a fluorescence microscope or the like can be used.
- tissue collected from the human body at the clinical stage is stained after being sliced into a thin film using a device such as a microtome.
- Cy dye and Alexa dye are used.
- the existing dye is very unstable, and it is necessary to prepare a sample again at the time of rediagnosis.
- the prepared sample cannot be stored as a specimen.
- the fluorescent dye of the present invention is a very stable dye as compared with the conventional dyes described above, the stained tissue can be stored as a specimen.
- an immunoassay utilizing the specific recognition ability of an antibody is used.
- the immunoassay is a method for detecting a target antigen using a labeled antibody, and an enzyme immunoassay (ELISA method) using an enzyme as a labeling substance or a fluorescent immunoassay (FIA method) using a fluorescent dye as a labeling substance is used.
- ELISA method enzyme immunoassay
- FFA method fluorescent immunoassay
- final detection is performed by detecting and quantifying various signals (coloring, luminescence, chemiluminescence, etc.) generated by the reaction of the enzyme that is a labeling substance.
- the FIA method is performed by irradiating a fluorescent dye, which is a labeling substance, with excitation light and detecting and quantifying the resulting fluorescence. Since the FIA method uses a fluorescent dye, it has a clear contrast and excellent quantitativeness, and has a feature that it can be detected in a shorter time and is easy to operate than the ELISA method. However, the conventional fluorescent dye has a problem that the labeling rate is low. For example, about 200-fold mol of the fluorescent dye is used with respect to the antibody, and the labeling rate is about 50-60% even under this condition.
- the fluorescent dye of the present invention can be used in a cosmetic composition.
- Cosmetic compositions containing fluorescent dyes are used in foundations, hair dyeing agents, and the like, not only as makeup for production at night and in the room, but also by using the lightening effect of fluorescent dyes.
- the lightening effect means an effect in which the fluorescent dye absorbs ultraviolet light and emits visible light to give the skin and hair brightness and vividness.
- Japanese indoor lighting uses daylight and white fluorescent lamps, but the light from these fluorescent lamps is mainly blue and green, with little red. Therefore, there is a problem that a woman's makeup skin looks pale and dull.
- the fluorescent dye of the present invention for example, a fluorescent dye that emits orange light can be used to develop a bright reddish color to eliminate dullness.
- the fluorescent dye when used for hair dyeing, not only changes the color of the hair by the emitted light in the visible region, but can also increase the shine of the hair.
- the fluorescent dye of the present invention can also be used as a marking agent.
- the marking agent containing the fluorescent dye of the present invention is invisible under normal visible light, but can be visually recognized by emitting the fluorescent dye by irradiating excitation light such as ultraviolet rays. Utilizing this property, it can be used for identification of articles and human bodies, detection of substances, etc. for the purpose of crime prevention and crime investigation.
- Objects of the marking agent include articles and human bodies that are subject to crime prevention and criminal investigation such as counterfeiting and theft.
- important documents such as banknotes, checks, stock certificates, various certificates, articles such as automobiles, motorcycles, bicycles, arts, furniture, branded goods, clothes, body surface parts such as human skin, hair, nails, latent Examples include retained substances such as fingerprints.
- paper such as high-quality paper, OCR paper, carbonless paper, art paper, plastics such as vinyl chloride, polyester, polyethylene terephthalate, and polypropylene, metals, glass, ceramics, And natural fibers such as wool, cotton, silk and hemp, synthetic fibers such as regenerated cellulose fibers, polyvinyl alcohol fibers, polyamide fibers and polyester fibers, and proteins in human skin and body fluids.
- Synthesis Example 1 The following is an example of synthesis of a nitrogen cation of 4,7-diphenyl-1,2,5-oxadiazolopyridine.
- ester (4) 4,7-diphenyl-1,2,5-oxadiazolopyridine ethyl ester (4) (hereinafter referred to as ester (4)) (yield 7. 6 g, yield 65%).
- ester compound (4) is subjected to a reduction reaction in the presence of NaBH 4 to obtain a diaminoalcohol compound (5), which is reacted with thionyl chloride to obtain a thiadiazolopyridine chloromethyl compound (6).
- a reaction example is shown below.
- Synthesis Example 2 The following is an example of synthesis of a nitrogen cation of 4,7-di (methoxyphenyl) -1,2,5-oxadiazolopyridine.
- ester (13) 4,7-di (methoxyphenyl) -1,2,5-oxadiazolopyridine ethyl ester (13) (hereinafter referred to as ester (13)). (Yield 13.0 g, Yield 70%).
- ester body (13) is subjected to a reduction reaction in the presence of NaBH 4 to obtain a hydroxymethyl body (14), which is reacted with thionyl chloride to obtain an oxadiazolopyridine chloromethyl body (15).
- Phenylphosphine was reacted to obtain a phosphonium salt (16), and a pyridinium salt (18) containing an active ester (when L is —CH ⁇ CH—) was synthesized by a Wittig reaction.
- a reaction example is shown below.
- ester (4) 4,7-diphenyl-1,2,5-oxadiazolopyridine ethyl ester (4) (hereinafter referred to as ester (4)) (yield 7). .6 g, yield 65%).
- ester compound (4) is subjected to a reduction reaction in the presence of NaBH 4 to obtain a diaminoalcohol compound (5), which is reacted with thionyl chloride to obtain a thiadiazolopyridine chloromethyl compound (6).
- Phenylphosphine was reacted to obtain a phosphonium salt (7)
- a vinyl compound was obtained by a Wittig reaction, and a pyridinium salt containing an active ester (when L is —CH ⁇ CH—) was synthesized.
- a reaction example is shown below.
- Synthesis Example 4 A 3-vinylpyridinium salt containing an active ester was synthesized using the phosphonium salt (7) synthesized in Synthesis Example 3 as a starting material. A synthesis example is shown below.
- Synthesis Example 5 A 2-vinylpyridinium salt containing an active ester was synthesized using the phosphonium salt (7) synthesized in Synthesis Example 3 as a starting material. A synthesis example is shown below.
- ester (13) 4,7-di (methylphenyl) -1,2,5-oxadiazolopyridine ethyl ester (13) (hereinafter referred to as ester (13)). (Yield 8.6 g, Yield 70%).
- ester body (13) is subjected to a reduction reaction in the presence of NaBH 4 to obtain a diamino alcohol body (14), which is reacted with thionyl chloride to obtain a thiadiazolopyridine chloromethyl body (15).
- Phenylphosphine was reacted to obtain a phosphonium salt (16), a vinyl compound was obtained by a Wittig reaction, and a pyridinium salt containing an active ester was synthesized.
- a 4-vinylpyridinium salt containing an active ester was synthesized using phosphonium salt (16). The following reaction examples are shown.
- Synthesis Example 7 Using the phosphonium salt (16) synthesized in Synthesis Example 6 as a starting material, a 3-vinylpyridinium salt containing an active ester was synthesized. A synthesis example is shown below.
- Synthesis Example 8 Using the phosphonium salt (16) synthesized in Synthesis Example 6 as a starting material, a 2-vinylpyridinium salt containing an active ester was synthesized. A synthesis example is shown below.
- Synthesis Example 9 The following is an example of the synthesis of an active ester of 4,7-di (methylthienyl) -1,2,5-oxadiazolopyridine-6- (3-pyridinium).
- Synthesis Example 10 In Synthesis Example 9, an active ester was synthesized using bromopropionic acid active ester instead of bromohexanoic acid active ester. A synthesis example is shown below.
- Synthesis Example 11 The following is a synthesis example of an active ester of 4,7-di (methylthienyl) -1,2,5-oxadiazolopyridine-6- (4-pyridinium).
- Synthesis Example 12 An active ester using a phenyl group instead of a thienyl group was synthesized. A synthesis example is shown below.
- Synthesis Example 15 A synthesis example of an active ester of 4,7-di [(2-naphthyl) thienyl] -1,2,5-oxadiazolopyridine-6- (4-pyridinium) is shown.
- Synthesis Example 16 A synthesis example of an active ester of 4,7-di [(2-bromo) thienyl)]-1,2,5-oxadiazolopyridine-6- (4-vinylpyridinium) is shown.
- ethyl ester form (37) Recrystallization from ethanol gave a yield of 1.18 g of 4,7-di (bromothienyl) -1,2,5-oxadiazolopyridine-6-ethyl ester (hereinafter referred to as ethyl ester form (37)). Obtained at a rate of 51%.
- Synthesis Example 17 A synthesis example of an active ester of 4,7-di [(1-naphthyl) thienyl] -1,2,5-oxadiazolopyridine-6- (4-vinylpyridinium) is shown.
- Synthesis Example 18 A synthesis example of an active ester of 4,7-di [(2-naphthyl) thienyl] -1,2,5-oxadiazolopyridine-6- (4-vinylpyridinium) is shown.
- Synthesis Example 19 A synthesis example of an active ester form of 4,7-di [(2-biphenyl) thienyl] -1,2,5-oxadiazolopyridine-6- (4-pyridinium) is shown.
- Synthesis example 21 (comparative example). For comparison, an active ester of 4,7-diphenyl-1,2,5-oxadiazolopyridine ethyl ester was synthesized.
- Fluorescence spectrum measurement A solution with a concentration of 10 ⁇ 4 M was prepared using DMSO with the synthesized fluorescent dye as a solvent, and the fluorescence wavelength and the absorption wavelength were measured.
- Biological specimen observation Use a 7-year-old Wistar Rat to fix perfusion with 4% paraformaldehyde, 0.03% glutaraldehyde, 0.1M cacodylate buffer, remove the kidney after fixation, and fix it with 4% paraformaldehyde. went.
- the sample was immersed in a 25% hypertonic sucrose solution (solvent KPBS) for 2 hours, and then the sample was embedded with an embedding agent at ⁇ 80 ° C. deep freezer. Samples were frozen. After freezing, an 8 ⁇ m frozen section was prepared with a cryostat set at ⁇ 20 ° C. and attached to a slide glass.
- FIG. 1 is stained using the fluorescent dye of Synthesis Example 9, and FIG. 2 is stained using Texas Red for comparison.
- Texas Red the outside of the tubule was stained due to non-specific adsorption, but with the fluorescent dye of Synthesis Example 9, it was not adsorbed at all and only the brush border on the inside of the tubule was stained. In addition, the brush border on the inner surface of the tubule had no blur and the shape could be clearly observed.
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Abstract
Description
Science 283,1,January,1999,83-87
An-は、ハロゲン化物イオン、CF3SO3 -、BF4 -又はPF6 -を示す。
実施の形態1.
本実施の形態に係る蛍光色素は、アゾール誘導体からなる蛍光色素であり、以下の一般式(1)、(2)、(3)で示すことができる。
アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、アルコキシ基、アルキルエステル基、リン酸エステル基、硫酸エステル基、ニトリル基、ヒドロキシル基、シアノ基、スルホニル基、芳香族炭化水素基または複素環基を挙げることができる。該置換基としてのアルキル基は、置換または無置換の炭素数1~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキル基である。また、該置換基としてのアルケニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルケニル基である。また、該置換基としてのアルキニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキニル基である。また、該置換基としてのアルコキシ基は、例えばメトキシ基、エトキシ基、プロポキシ基、イソプロポキシ基、ブトキシ基、ペンチロキシ基またはフェノキシ基である。また、該置換基としてのアルキルエステル基は、炭素数1から6の直鎖状又は分岐状のアルキルエステルである。また、該置換基としての芳香族炭化水素基は単環又は多環を含むアリール基である。また、該置換基としての複素環基は、例えばチエニル基、フラニル基、ピロリル基、イミダゾリル基、オキサゾリル基、チアジアゾリル基、ピラゾリル基、ピリジル基またはキノリル基である。また、R2、R3が、スルホニル基を有するアリール基であってもよい。
ここで、置換基を有してもよい芳香族炭化水素基としては、単環または多環を含むアリール基であり、置換または無置換のフェニル基、ナフチル基、ビフェニル基等を挙げることができる。なお、置換基を有してもよい芳香族炭化水素基は、該置換基を1から3個含むことができ、該置換基としては、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、アルコキシ基、アルキルエステル基、リン酸エステル基、硫酸エステル基、ニトリル基、ヒドロキシル基、シアノ基、スルホニル基、芳香族炭化水素基または複素環基を挙げることができる。該置換基としてのアルキル基は、置換または無置換の炭素数1~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキル基である。また、該置換基としてのアルケニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルケニル基である。また、該置換基としてのアルキニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキニル基である。また、該置換基としてのアルコキシ基は、例えばメトキシ基、エトキシ基、プロポキシ基、イソプロポキシ基、ブトキシ基、ペンチロキシ基またはフェノキシ基である。また、該置換基としてのアルキルエステル基は、炭素数1から6の直鎖状又は分岐状のアルキルエステルである。
また、置換基を有してもよい脂肪族炭化水素基としては、置換または無置換の炭素数1~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキル基、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルケニル基、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキニル基等を挙げることができる。
また、置換基を有してもよい複素環基としては、置換または無置換のフラニル基、ピロリル基、イミダゾリル基、オキサゾリル基、チアジアゾリル基、ピラゾリル基、ピリジル基またはキノリル基を挙げることができる。
チエニル基の置換基としては、置換基を有してもよい芳香族炭化水素基または脂肪族炭化水素基が好ましく、より好ましくは置換基を有してもよい芳香族炭化水素基、さらに好ましくは単環または多環を含むアリール基であり、具体例としては、置換または無置換のフェニル基、ナフチル基、ビフェニル基等を挙げることができる。なお、置換基を有してもよい芳香族炭化水素基は、該置換基を1から3個含むことができ、該置換基としては、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、アルコキシ基、アルキルエステル基、リン酸エステル基、硫酸エステル基、ニトリル基、ヒドロキシル基、シアノ基、スルホニル基、芳香族炭化水素基または複素環基を挙げることができる。該置換基としてのアルキル基は、置換または無置換の炭素数1~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキル基である。また、該置換基としてのアルケニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルケニル基である。また、該置換基としてのアルキニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキニル基である。また、該置換基としてのアルコキシ基は、例えばメトキシ基、エトキシ基、プロポキシ基、イソプロポキシ基、ブトキシ基、ペンチロキシ基またはフェノキシ基である。また、該置換基としてのアルキルエステル基は、炭素数1から6の直鎖状又は分岐状のアルキルエステルである。
アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、アルコキシ基、アルキルエステル基、リン酸エステル基、硫酸エステル基、ニトリル基、ヒドロキシル基、シアノ基、スルホニル基、芳香族炭化水素基または複素環基を挙げることができる。該置換基としてのアルキル基は、置換または無置換の炭素数1~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキル基である。また、該置換基としてのアルケニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルケニル基である。また、該置換基としてのアルキニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキニル基である。また、該置換基としてのアルコキシ基は、例えばメトキシ基、エトキシ基、プロポキシ基、イソプロポキシ基、ブトキシ基、ペンチロキシ基またはフェノキシ基である。また、該置換基としてのアルキルエステル基は、炭素数1から6の直鎖状又は分岐状のアルキルエステルである。また、該置換基としての芳香族炭化水素基は単環又は多環を含むアリール基である。また、該置換基としての複素環基は、例えばチエニル基、フラニル基、ピロリル基、イミダゾリル基、オキサゾリル基、チアジアゾリル基、ピラゾリル基、ピリジル基またはキノリル基である。また、R2、R3が、スルホニル基を有するアリール基であってもよい。
本実施の形態に係る蛍光色素は、イミダゾール誘導体から成る蛍光色素であり、以下の一般式で示すことができる。イミダゾール誘導体を用いても、実施の形態1の場合と同様の効果を得ることができる。
アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、アルコキシ基、アルキルエステル基、リン酸エステル基、硫酸エステル基、ニトリル基、ヒドロキシル基、シアノ基、スルホニル基、芳香族炭化水素基または複素環基を挙げることができる。該置換基としてのアルキル基は、置換または無置換の炭素数1~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキル基である。また、該置換基としてのアルケニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルケニル基である。また、該置換基としてのアルキニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキニル基である。また、該置換基としてのアルコキシ基は、例えばメトキシ基、エトキシ基、プロポキシ基、イソプロポキシ基、ブトキシ基、ペンチロキシ基またはフェノキシ基である。また、該置換基としてのアルキルエステル基は、炭素数1から6の直鎖状又は分岐状のアルキルエステルである。また、該置換基としての芳香族炭化水素基は単環又は多環を含むアリール基である。また、該置換基としての複素環基は、例えばチエニル基、フラニル基、ピロリル基、イミダゾリル基、オキサゾリル基、チアジアゾリル基、ピラゾリル基、ピリジル基またはキノリル基である。また、R2、R3が、スルホニル基を有するアリール基であってもよい。
また、チエニル基の置換基については実施の形態1の場合と同様のものを用いることができる。
本実施の形態に係る蛍光色素は、アゾール誘導体からなる蛍光色素であり、以下の一般式(4)、(5)、(6)で示すことができる。
また、置換基を有してもよい脂肪族炭化水素基としては、置換または無置換の炭素数1~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキル基、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルケニル基、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキニル基等を挙げることができる。
また、置換基を有してもよい複素環基としては、置換または無置換のフラニル基、ピロリル基、イミダゾリル基、オキサゾリル基、チアジアゾリル基、ピラゾリル基、ピリジル基またはキノリル基を挙げることができる。チエニル基の置換基としては、置換基を有してもよい芳香族炭化水素基または脂肪族炭化水素基が好ましく、より好ましくは置換基を有してもよい芳香族炭化水素基であり、具体例としては、置換または無置換のフェニル基、ナフチル基、ビフェニル基等を挙げることができる。なお、置換基を有してもよい芳香族炭化水素基は、該置換基を1から3個含むことができ、該置換基としては、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、アルコキシ基、アルキルエステル基、リン酸エステル基、硫酸エステル基、ニトリル基、ヒドロキシル基、シアノ基、スルホニル基、芳香族炭化水素基または複素環基を挙げることができる。該置換基としてのアルキル基は、置換または無置換の炭素数1~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキル基である。また、該置換基としてのアルケニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルケニル基である。また、該置換基としてのアルキニル基は、無置換の炭素数2~20の直鎖状もしくは分岐状のアルキニル基である。また、該置換基としてのアルコキシ基は、例えばメトキシ基、エトキシ基、プロポキシ基、イソプロポキシ基、ブトキシ基、ペンチロキシ基またはフェノキシ基である。また、該置換基としてのアルキルエステル基は、炭素数1から6の直鎖状又は分岐状のアルキルエステルである。
本発明の蛍光色素は、例えば窒素含有基としてピリジル基を含む場合、以下の方法により製造することができる。すなわち、アゾール誘導体又はイミダゾール誘導体のハロアルキル体とトリフェニルホスフィンとを反応させてホスホニウム塩を調製し、このホスホニウム塩とフォルミルピリジンとを用いてウィッティヒ反応により二重結合を介してピリジル基を導入してピリジル体を得る。また、窒素カチオン含有基として、ピリジニウム基を含む場合には、そのピリジル体と、活性エステルのブロモ体とを反応させて、ピリジニウム塩を得ることにより製造することができる。ここで、ハロアルキル体は、アゾール誘導体又はイミダゾール誘導体のヒドロキシ体にハロゲン化剤を反応させる方法を用いることにより得ることができる。ハロゲン化剤には、塩化チオニル、塩化ホスホリル、三塩化リン、五塩化リン、塩化スルフリル、塩素、臭化チオニル、臭素等を用いることができ、好ましくは塩化チオニル又は塩化ホスホリルである。
本発明の蛍光色素は、標識された固体あるいは半固体状態の生体分子の蛍光を測定する検出方法であれば、あらゆる生体分子の検出方法に適用することができる。従来の蛍光色素に代えて用いることにより、高感度で、化学的に安定で操作性に優れ、さらに低コストの検出方法を提供することができる。本発明の蛍光色素は、生体分子試料に蛍光色素を直接反応させて標識しても良く、あるいは生体分子試料と、本発明の蛍光色素で標識されたプローブとを反応させて標識する方法を用いることもできる。さらに、本発明の蛍光色素で標識した生体分子試料を電気泳動によりサイズ分離する方法を用いることもできる。例えば、核酸を検出対象とするDNAマイクロアレイ法や、プライマーやターミネータを用いるPCR法に用いることができる。
以下に、4,7-ジフェニル-1,2,5-オキサジアゾロピリジンの窒素カチオン体の合成例を示す。
500ml三口フラスコ中で4-メトキシアセトフェノン(1) 30.0g(0.25mol)、亜硝酸ナトリウム0.15gを酢酸100mlに溶解した。水浴中、硝酸100mlを酢酸100mlに溶解したものを1時間かけて滴下した。その後、室温で2日間撹拌した。反応混合物を500mlの水にゆっくりと入れ、沈殿を生成させた。沈殿物は濾過し、クロロホルムに溶解した。クロロホルム相を飽和重曹水で洗浄し、10%NaCl水溶液で2回洗浄した。無水硫酸マグネシウムで脱水した後、減圧下、クロロホルムを留去し、オキサジアゾール-N-オキサイド(2)を得た(収量30.5g、収率82%)。
500ml三口フラスコ中でオキサジアゾール-N-オキサイド(2) 14.7g(0.05mol)をアセトニトリル400mlに溶解した。それに金属亜鉛6.0g、酢酸7ml、無水酢酸20mlを添加した。水浴中で反応温度が35℃を超えないように冷却した。6時間撹拌して反応終点とした。反応混合物を濾過し、不溶分を除去した。アセトニトリルを減圧下留去して残渣を得た。残渣をクロロホルムで再結晶し、オキサジアゾールジベンゾイル体(3)を得た(収量9.6g、収率69%)。
500ml三口フラスコ中でオキサジアゾールジベンゾイル体(3) 10.0g(0.035mol)をブタノール300mlに溶解した。そこへグリシンエチルエステル塩酸塩32.0g(0.23mol)を添加した。24時間加熱還流を行った。ブタノールを減圧下留去し、残渣を得た。残渣を200mlのクロロホルムに溶解し、10%塩酸、飽和重曹水、10%NaCl水溶液で洗浄した。無水硫酸マグネシウムで乾燥し、溶媒を留去した。得られた残渣をクロロホルムで再結晶し、4,7-ジフェニル-1,2,5-オキサジアゾロピリジンエチルエステル(4)(以下、エステル体(4)という。)を得た(収量7.6g、収率65%)。
エステル体(4)(1.73g、5mmol)とNaBH4(1.30g、35mmol)のエタノール溶液(100ml)を12時間加熱還流後、反応液を水に注入し、一夜放置後に沈澱をろ過してジアミノアルコール体(5)を得た(収量1.17g、収率80%)。
室温下、アルコール体(5)(1.17g)のクロロホルム溶液(60ml)に塩化チオニル(6ml)、ピリジン-NaBH4(3ml)をこの順で滴下、その後3時間30分加熱還流後、反応液を水に注入し、飽和重曹水で中和し、クロロホルムで抽出した。抽出液を無水硫酸マグネシウムで乾燥、減圧留去して得た残渣をカラム(Kanto C-60、ヘキサン/クロロホルム=3/1(v/v)処理してクロロメチル体(6)を得た(収量1.11g、収率82%)。
クロロメチル体(6) 112.6mg(0.33mmol)とトリフェニルホスフィン(96mg、0.37mmol)のトルエン溶液(5ml)を3日間加熱還流後、沈澱をろ過し、エーテルで洗浄してホスホニウム塩(7)を得た(収量108mg、収率55%)。
氷冷下、m-フォルミルピリジン(16μL,0.18mmol)と水酸化カリウム(純度85%、15mg)のエタノール溶液(1ml)にホスホニウム塩(7)(140.5mg,0.23mmol)を加え、その温度で1時間30分撹拌した。沈澱をろ過し、エタノール、水で洗浄後、乾燥して、4,7-ジフェニル-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ビニルピリジン)(以下、ビニル体(8)という。)を得た(収量44mg、収率62%)。
ビニル体(8)(40mg、0.10mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(32mg、0.11mmol)のトルエン溶液(2ml)を5日間加熱還流後、沈澱をろ過して活性エステルを含むピリジニウム塩(9)を得た。
以下に、4,7-ジ(メトキシフェニル)-1,2,5-オキサジアゾロピリジンの窒素カチオン体の合成例を示す。
500ml三口フラスコ中で4-メトキシアセトフェノン(10) 37.5g(0.25mol)、亜硝酸ナトリウム0.15gを酢酸100mlに溶解した。水浴中、硝酸100mlを酢酸100mlに溶解したものを2時間かけて滴下した。その後、室温で2日間撹拌した。反応混合物を500mlの水にゆっくりと入れ、沈殿を生成させた。沈殿物を濾過し、クロロホルムに溶解した。クロロホルム相を飽和重曹水で洗浄し、10%NaCl水溶液で2回洗浄した。無水硫酸マグネシウムで脱水した後、減圧下、クロロホルムを留去し、オキサジアゾール-N-オキサイド(11)を得た(収量34.5g、収率78%)。
500ml三口フラスコ中でオキサジアゾール-N-オキサイド(11) 17.7g(0.05mol)をアセトニトリル400mlに溶解した。それに金属亜鉛12.0g、酢酸7ml、無水酢酸20mlを添加した。水浴中で反応温度が30℃を超えないように冷却した。12時間撹拌して反応終点とした。反応混合物を濾過し、不溶分を除去した。アセトニトリルを減圧下留去して残渣を得た。残渣をクロロホルムで再結晶し、オキサジアゾール-N-オキサイド(12)を得た(収量10.2g、収率60%)。
500ml三口フラスコ中でオキサジアゾール-N-オキサイド(12) 15.6g(0.046mol)をブタノール300mlに溶解した。そこへグリシンエチルエステル塩酸塩32.0g(0.23mol)を添加した。24時間加熱還流を行った。ブタノールを減圧下留去し、残渣を得た。残渣を200mlのクロロホルムに溶解し、10%塩酸、飽和重曹水、10%NaCl水溶液で洗浄した。無水硫酸マグネシウムで乾燥し、溶媒を留去した。得られた残渣をクロロホルムで再結晶し、4,7-ジ(メトキシフェニル)-1,2,5-オキサジアゾロピリジンエチルエステル体(13)(以下、エステル体(13)という。)を得た(収量13.0g、収率70%)。
氷冷下、エステル体(13)(202mg、0.50mmol)のTHF溶液(3ml)に DIBALのトルエン溶液(アルドリッチ製、濃度1.5mol/L、6μL)を滴下し、その後氷冷下で30分、続いて室温で30分撹拌した。反応液を水に注入し、3%塩酸水溶液を加えて酸性(沈澱が消失)とし、クロロホルムで抽出した。抽出液を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、減圧留去して得た残渣をシリカゲル(Kanto C-60)に分散させて一夜80℃で加熱した。このシリカゲルを酢酸エチルで洗浄し、洗浄液を減圧留去して得た残渣をカラム(Kanto C-60、ヘキサン/酢酸エチル=2/1(v/v))処理してヒドロキシメチル体(14)を得た(収量69mg、収率41%)。
ヒドロキシメチル体(14)(95mg)と塩化チオニル(3ml)のクロロホルム溶液(3ml)を2時間加熱還流後、反応液を水に注入し、飽和重曹水で中和し、クロロホルムで抽出した。抽出液を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、減圧留去して得た残渣をカラム(Kanto C-60、ヘキサン/クロロホルム=5/1(v/v))処理してクロロメチル体(15)を得た。
クロロメチル体(15)(127mg、0.44mmol)とトリフェニルホスフィン(126mg、0.48mmol)のトルエン溶液(4ml)を24時間加熱還流後、沈澱をろ過してホスホニウム塩(16)を得た(収量168.6mg、収率54%)。
氷冷下、ホスホニウム塩(16)(168.6mg、0.26mmol)と水酸化カリウム(純度85%、30mg)のエタノール溶液(3ml)にm-フォルミルピリジン(27μL、0.29mmol)を加え、その温度で1時間、続いて室温で1時間撹拌した。沈澱をろ過し、カラム(Kanto C-60、クロロホルム/酢酸エチル=10/1(v/v))処理して、4,7-ジ(メトキシフェニル)-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ビニルピリジン)(以下、ビニル体(17)という。)を得た(収量86mg、収率76%)。
ビニル体(17)(86mg、0.20mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(63mg、0.22mol)のトルエン溶液(2ml)を3日間加熱還流後、沈澱をろ過して活性エステルを含むピリジニウム塩(18)を得た。
合成例3.
以下に、4,7-ジフェニル-1,2,5-チアジアゾロピリジンの窒素カチオン体の合成例を示す。
500ml三口フラスコ中で4-メトキシアセトフェノン(1)30.0g (0.25mol)、亜硝酸ナトリウム0.15gを酢酸100mlに溶解した。水浴中、硝酸100mlを酢酸100mlに溶解したものを1時間かけて滴下した。その後、室温で2間撹拌した。反応混合物を500mlの水にゆっくりと入れ、沈殿を生成させた。沈殿物を濾過し、クロロホルムに溶解した。クロロホルム相を飽和重曹水で洗浄し、10%NaCl 水溶液で2回洗浄した。無水硫酸マグネシウムで脱水した後、減圧下、クロロホルムを留去し、オキサジアゾール-N-オキサイド(2)を得た(収量30.5g、収率82%)。
500ml三口フラスコ中でオキサジアゾール-N-オキサイド(2)14.7g(0.05mol)をアセトニトリル400mlに溶解した。それに亜鉛6.0g、酢酸7ml、アセトン20mlを添加した。水浴中で反応温度が35℃を超えないように冷却した6時間撹拌して反応終点とした。反応混合物を濾過し、不溶分を除去した。アセトニトリルを減圧下留去して残渣を得た。残渣をクロロホルムで再結晶し、オキサジアゾールジベンゾイル体(3)を得た(収量9.6g、収率69%)。
500ml三口フラスコ中でオキサジアゾールジベンゾイル体(3)10.0g(0.035mol)をブタノール300mlに溶解した。そこへグリシンエチルエステル塩酸塩 32.0g(0.23mol)を添加した。24時間加熱還流を行った。ブタノールを減圧下留去し、残渣を得た。残渣を200mlのクロロホルムに溶解し、10%HCl、飽和炭酸水素ナトリウム、10%NaCl水溶液で洗浄した。無水硫酸マグネシウムで乾燥し、溶媒を留去した。得られた残渣をクロロホルムで再結晶し、4,7-ジフェニル-1,2,5-オキサジアゾロピリジンエチルエステル体(4)(以下、エステル体(4)という。)を得た(収量7.6g、収率65%)。
エステル体(4) 1.73g(5mmol)とNaBH4 1.30gNaBH4(35mmol)のエタノール溶液(100ml)を12時間加熱還流後、反応液を水に注入し、一夜放置後に沈澱をろ過してジアミノアルコール体 (5)を得た(収量1.17g、収率80%)。
室温下、アルコール体(5)(1.17g)のクロロホルム溶液(60ml)に塩化チオニル(6ml)、ピリジン-NaBH4(3ml)をこの順で滴下、その後3時間30分加熱還流後、反応液を水に注入し、炭酸水素ナトリウムで中和し、クロロホルムで抽出した。抽出液を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、減圧留去して得た残さをカラム(Kanto C-60;ヘキサン/クロロホルム=3/1(v/v))処理してクロロメチル体(6)を得た(収量1.11g、収率82%)。
クロロメチル体(6)(112.6mg、0.33mmol)とトリフェニルホスフィン(96mg、0.37mmol)のトルエン溶液(5ml)を3日間加熱還流後、沈澱をろ過し、エーテルで洗浄してホスホニウム塩(7)を得た(収量108mg、収率55%)。
氷冷下、ホスホニウム塩(7)(168.6mg、0.26mmol)と水酸化カリウム(純度85%、30mg)のエタノール溶液(3ml)にp-フォルミルピリジン(27μL、0.29mmol)を加え、その温度で1時間撹拌後、室温で1時間撹拌した。沈澱をろ過し、カラム処理して、4,7-ジフェニル-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ビニルピリジン)(以下、ビニル体(8a)という。)を得た(収量67mg、66%)。
ビニル体(8a)(63mg、0.16mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(50mg、0.18mol)のトルエン溶液(4ml)を3日間加熱還流後、沈澱をろ過して活性エステルを含む4-ビニルピリジニウム塩(9a)を得た。
合成例3で合成したホスホニウム塩(7)を出発物質として活性エステルを含む3-ビニルピリジニウム塩を合成した。以下に合成例を示す。
氷冷下、ホスホニウム塩(7)(150mg、0.25mmol)と水酸化カリウム(純度85%、30mg)のエタノール溶液(4ml)にm-フォルミルピリジン(26μL、0.28mmol)を加え、その温度で1時間撹拌後、室温で1時間撹拌した。沈澱をろ過し、カラム処理して、4,7-ジフェニル-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(3-ビニルピリジン)(以下、ビニル体(8b)という。)を得た(収量57mg、収率58%)。
ビニル体(8a)(40mg、0.10mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(31mg、0.11mol)のトルエン溶液(4ml)を4日間加熱還流後、沈澱をろ過して活性エステルを含む3-ビニルピリジニウム塩(9a)を得た。
合成例3で合成したホスホニウム塩(7)を出発物質として活性エステルを含む2-ビニルピリジニウム塩を合成した。以下に合成例を示す。
氷冷下、ホスホニウム塩(7)(100mg、0.17mmol)と水酸化カリウム(純度85%、30mg)のエタノール溶液(4ml)にo-フォルミルピリジン(17μL、0.19mmol)を加え、その温度で1時間撹拌後、室温で1時間撹拌した。沈澱をろ過し、カラム処理して、4,7-ジフェニル-1,2,5-チアジアゾロピリジン-6-(2-ビニルピリジン)(以下、ビニル体(8c)という。)を得た(収量49mg、収率73%)。
ビニル体(8c)(40mg、0.10mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(31mg、0.11mol)のトルエン溶液(3ml)を3日間加熱還流後、沈澱をろ過して活性エステルを含む2-ビニルピリジニウム塩(9c)を得た。
以下に、4,7-ジ(メチルフェニル)-1,2,5-チアジアゾロピリジンの窒素カチオン体の合成例を示す。
500ml三口フラスコ中で4-メトキシアセトフェノン(10) 30.0g(0.22mol)、亜硝酸ナトリウム0.15gを酢酸100mlに溶解した。水浴中、硝酸100mlを酢酸100mlに溶解したものを1時間かけて滴下した。その後、室温で2日間撹拌した。反応混合物を500mlの水にゆっくりと入れ、沈殿を生成させた。沈殿物を濾過し、クロロホルムに溶解した。クロロホルム相を飽和重曹水で洗浄し、10%NaCl水溶液で2回洗浄した。無水硫酸マグネシウムで脱水した後、減圧下、クロロホルムを留去し、オキサジアゾール-N-オキサイド(11)(26.6g、収率75%)を得た。
500ml三口フラスコ中でオキサジアゾール-N-オキサイド(11) 15.0g(0.05mol)をアセトニトリル400mlに溶解した。それに金属亜鉛6.0g、酢酸7ml、アセトン20mlを添加した。水浴中で反応温度が35℃を超えないように冷却した。6時間撹拌して反応終点とした。反応混合物を濾過し、不溶分を除去した。アセトニトリルを減圧下留去して残渣を得た。残渣をクロロホルムで再結晶し、オキサジアゾールジベンゾイル体(12)を得た(収量8.4g 、収率59%)。
500ml三口フラスコ中でオキサジアゾールジベンゾイル体(12)10.0g(0.033mol)をブタノール300mlに溶解した。そこへグリシンエチルエステル塩酸塩32.0g(0.23mol)を添加した。24時間加熱還流を行った。ブタノールを減圧下留去し、残渣を得た。残渣を200mlのクロロホルムに溶解し、10%塩酸、飽和炭酸水素ナトリウム、10%NaClで洗浄した。無水硫酸マグネシウムで乾燥し、溶媒を留去した。得られた残渣をクロロホルムで再結晶し、4,7-ジ(メチルフェニル)-1,2,5-オキサジアゾロピリジンエチルエステル体(13)(以下、エステル体(13)という。)を得た(収量8.6g、収率70%)。
エステル体(13)(1.86g、5mmol)とNaBH4(1.30g、35mmol)のエタノール溶液(100ml)を8時間加熱還流後、反応液を水に注入し、一夜放置後に沈澱をろ過してジアミノアルコール体(14)を得た(収量1.41g、収率88%)。
室温下、アルコール体(14) 1.20g(3.7mmol)のクロロホルム溶液(50ml)に塩化チオニル(5ml)、ピリジン-NaBH4(3ml)をこの順で滴下し、その後3時間加熱還流した。反応液を水に注入し、炭酸水素ナトリウムで中和し、クロロホルムで抽出した。抽出液を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、減圧留去して得た残さをカラム処理してクロロメチル体(15)を得た(収量1.08g、収率80%)。
クロロメチル体(15)(146mg、0.40mmol)とトリフェニルホスフィン(115mg、0.044mmol)のトルエン溶液(6ml)を2日間加熱還流した。沈澱をろ過し、エーテルで洗浄してホスホニウム塩(16)を得た(収量116mg、収率46%)。
氷冷下、ホスホニウム塩(16)(150mg、0.24mmol)と水酸化カリウム(純度85%、30mg)のエタノール溶液(3ml)にp-フォルミルピリジン(24μL、0.26mmol)を加え、その温度で1時間撹拌後、室温で1時間撹拌した。沈澱をろ過し、カラム処理して、4,7-ジ(メチルフェニル)-1,2,5-チアジアゾロピリジン-6-(4-ビニルピリジン)(以下、ビニル体(17a)という。)を得た(収量53mg、収率53%)。
ビニル体(17a)(50mg、0.12mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(36mg、0.08mol)のトルエン溶液(3ml)を3日間加熱還流後、沈澱をろ過して活性エステルを含む4-ビニルピリジニウム塩(18a)を得た。
合成例6で合成したホスホニウム塩(16)を出発物質として、活性エステルを含む3-ビニルピリジニウム塩を合成した。以下に合成例を示す。
氷冷下、ホスホニウム塩(16)(150mg、0.25mmol)と水酸化カリウム(純度85%、30mg)のエタノール溶液(4ml)にm-フォルミルピリジン(26μL、0.28mmol)を加え、その温度で1時間撹拌後、室温で2時間撹拌した。沈澱をろ過し、カラム処理して、4,7-ジ(メチルフェニル)-1,2,5-チアジアゾロピリジン-6-(3-ビニルピリジン)(以下、ビニル体(17b)という。)を得た(収量54mg、収率51%)。
ビニル体(17b)(50mg、0.12mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(37mg、0.11mol)のトルエン溶液(5ml)を5日間加熱還流後、沈澱をろ過して活性エステルを含む3-ビニルピリジニウム塩(18b)を得た。
合成例6で合成したホスホニウム塩(16)を出発物質として、活性エステルを含む2-ビニルピリジニウム塩を合成した。以下に合成例を示す。
氷冷下、ホスホニウム塩(16)(100mg、0.16mmol)と水酸化カリウム(純度85%、30mg)のエタノール溶液(4ml)にo-フォルミルピリジン(16μL、0.18mmol)を加え、その温度で1時間撹拌後、室温で1時間撹拌した。沈澱をろ過し、カラム処理して、4,7-ジ(メチルフェニル)-1,2,5-チアジアゾロピリジン-6-(2-ビニルピリジン)(以下、ビニル体(17c)という。)を得た(収量54mg、収率80%)。
ビニル体(17c)(50mg、0.12mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(36mg、0.13mol)のトルエン溶液(3ml)を3日間加熱還流後、沈澱をろ過して活性エステルを含む2-ビニルピリジニウム塩(18c)を得た。
以下に、4,7-ジ(メチルチエニル)-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(3-ピリジニウム)の活性エステル体の合成例を示す。
三口フラスコ中で2-アセチル-5-メチルチオフェン(21)を 25.00g(0.18mol)、亜硝酸ナトリウムを0.40g入れ、酢酸40mlで攪拌、溶解した。次に硝酸30mlと酢酸40mlの混合液を反応液に2時間かけて滴下した。滴下後、攪拌しながら2日間放置した。反応物を吸引濾過し、上澄みを水で洗浄し、乾燥機で2日間乾燥した。乾燥物をエタノールで再結晶し、ジケトン体(22)を得た(収量20.3g、収率68%)。
ジケトン体(22) 5.00g(0.015mol)をアセトニトリル190mlに溶解した。溶解後、酢酸1.50ml、無水酢酸4.38mlを加え、40℃で攪拌。次に亜鉛粉末6.84gを投入し、30分間反応させた後、セライト上で亜鉛を吸引濾過にて濾別した。減圧下、溶媒を留去し、残渣をクロロホルムに溶解した。飽和重曹水、塩酸水の順に洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥した後、減圧下、留去した。カラムクロマトグラフィーで分離精製を行った後、エタノールで再結晶した。ジケトン体(23)を得た(収量2.76g、収率58%)。
ナスフラスコにジケトン体(23)を1.00g(0.003mol)、エタノール90mlを加え、60℃に加熱し、溶解した。それに3-ピコリルアミン 2.56g(0.02mmol)を溶解した。次にトリエチルアミン7.00mlを投入し、18時間加熱還流した。エタノールを減圧留去した後、塩酸水、飽和重曹水の順に洗浄し、減圧下、乾燥した。残渣をカラムクロマトグラフィーで分離した。エタノールで再結晶し、4,7-ジ(メチルチエニル)-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(3-ピリジン)(以下、ピリジル体(24)という。)を得た(収量0.75g、収率64%)。
ピリジル体(24) 200mg(0.51mmol)、ブロモヘキサン酸活性エステル 148mg(0.51mmol)をトルエン6mlに溶解後、室温で一晩攪拌した。反応終了後吸引濾過を行い、濾物を真空乾燥して活性エステル体(25)を得た。
合成例9において、ブロモヘキサン酸活性エステルに代えてブロモプロピオン酸活性エステルを用いて活性エステル体を合成した。以下に合成例を示す。
ピリジル体(24) 200mg(0.51mmol)、ブロモプロピオン酸活性エステル 127mg(0.51mmol)をトルエン6mlに溶解後、室温で一晩攪拌した。反応終了後吸引濾過を行い、濾物を真空乾燥して活性エステル体26)を得た。
以下に、4,7-ジ(メチルチエニル)-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ピリジニウム)の活性エステル体の合成例を示す。
ナスフラスコにジケトン体(23)を1.00g(0.003mol)、エタノール90mlを加え、60℃に加熱し、溶解した。それに4-ピコリルアミン 2.56g(0.02mmol)を溶解した。次にトリエチルアミン7.00mlを投入し、15時間加熱還流した。エタノールを減圧留去した後、塩酸水、飽和重曹水の順に洗浄し、減圧下、乾燥した。残渣をカラムクロマトグラフィーで分離した。エタノールで再結晶し、4,7-ジ(メチルチエニル)-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ピリジン)(以下、ピリジル体(27)という。)を得た(収量0.67g、収率57%)。
ピリジル体(27) 300mg(0.77mmol)、ブロモヘキサン酸活性エステル 214mg(0.77mmol)をトルエン9mlで溶解後、室温で一晩攪拌した。反応終了後吸引濾過を行い、濾物を真空乾燥して活性エステル体(28)を得た。
チエニル基に代えてフェニル基を用いた活性エステル体を合成した。以下に合成例を示す。
ジケトン体(3) 300mg(1.08mmol)と3-ピコリルアミン 1ml(10mmol)をジオキサン25mlで溶解後、2時間加熱還流を行った。反応終了後、減圧留去した後、シリカゲルカラムクロマトグラフィー精製を行い、目的物を分取した。さらにエタノールで再結晶し、4,7-ジフェニル-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(3-ピリジン)(以下、ピリジル体(29)という。)を得た(収量324.80mg、収率48%)。
ピリジル体(29) 200mg(0.57mmol)、ブロモヘキサン酸活性エステル 158mg(0.57mmol)をトルエン6mlに溶解後、室温で一晩攪拌した。反応終了後吸引濾過を行い、濾物を真空乾燥して活性エステル体(30)を得た。
4,7-ジ(ブロモチエニル)-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ピリジン)の活性エステル体の合成例を示す。
三口フラスコに2-アセチル-5-ブロモチオフェン(21)を 20.00g(0.10mol)、亜硝酸ナトリウムを0.30g入れ、酢酸40mlで攪拌、溶解した。次に硝酸30mlと酢酸40mlの混合液を反応液に2時間かけて滴下した。滴下後、攪拌しながら2日間放置した。反応物を吸引濾過し、上澄みを水で洗浄し、乾燥機で2日間乾燥した。乾燥物をエタノールで再結晶し、ジケトン体(22a)を得た(収量26.3g、収率58%)。
ジケトン体(22a) 5.00g(0.011mol)をアセトニトリル150mlに溶解した。溶解後、酢酸1.50ml、無水酢酸4.0mlを加え、40℃で攪拌。次に亜鉛粉末6.0gを投入し、30分間反応させた後、セライト上で亜鉛を吸引濾過にて濾別した。減圧下、溶媒を留去し、残渣をクロロホルムに溶解した。飽和重曹水、塩酸水の順に洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥した後、減圧下、留去した。カラムクロマトグラフィーで分離精製を行った後、エタノールで再結晶した。ジケトン体(23a)を得た(収量2.67g、収率55%)。
ナスフラスコ中でジケトン体(23a) 2.00g(0.004mol)に、エタノール90mlを加え、60℃に加熱し、溶解した。それに4-ピコリルアミン 2.56g(0.02mmol)を溶解した。次にトリエチルアミン7.00mlを投入し、24時間加熱還流した。エタノールを減圧留去した後、塩酸水、飽和重曹水の順に洗浄し、減圧下、乾燥した。残渣をカラムクロマトグラフィーで分離した。エタノールで再結晶し、4,7-ジ(ブロモチエニル)-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ピリジン)(以下、ピリジル体(24a)という。)を得た(収量1.18g、収率51%)。
ピリジル体(24a) 200mg(0.57mmol)、ブロモヘキサン酸活性エステル 158mg(0.57mmol)をトルエン6mlに溶解後、室温で一晩攪拌した。反応終了後吸引濾過を行い、濾物を真空乾燥して活性エステル体を得た。
4,7-ジ[(2-フェニル)チエニル]-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ピリジニウム)の活性エステル体の合成例を示す。
アルゴン置換したナスフラスコにピリジル体(24a)を200mg(0.38mmol)、テトラキストリフェニルホスフィンパラジウム 12.7mgを入れ、2M-炭酸ナトリウム溶液 2.8mlとベンゼン 4mlで溶解した。フェニルボロン酸 99mg(0.83mmol)をエタノール 2mlで溶解し、反応液に投入した。その後、80℃で5時間加熱還流した。反応液に水20ml2を入れ、クロロホルムを用いて抽出した。クロロホルムを減圧下留去し、残渣をヘキサン-クロロホルムで再結晶した。ピリジル体(31)を収量120mg、収率61%で得た。
ピリジル体(31) 300mg(0.58mmol)、ブロモヘキサン酸活性エステル170mg(0.58mmol)をトルエン8mlに溶解後、室温で一晩攪拌した。反応終了後吸引濾過を行い、濾物を真空乾燥して活性エステル体(32)を得た。
4,7-ジ[(1-ナフチル)チエニル]-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ピリジニウム)の活性エステル体の合成例を示す。
アルゴン置換したナスフラスコ中でピリジル体(24a) 200mg(0.38mmol)と、テトラキストリフェニルホスフィンパラジウム 12.7mgを入れ、2M-炭酸ナトリウム2.8mlとベンゼン4mlで溶解した。1-ナフチルボロン酸144mg(0.83mmol)をエタノール2mlで溶解し、反応液に投入した。その後、80℃で6時間加熱還流した。反応液に水を20ml入れ、クロロホルムを用いて抽出した。クロロホルムを減圧下留去し、残渣をヘキサン-クロロホルムで再結晶した。ピリジル体(33)を収量190mg、収率55%で得た。
ピリジル体(33) 300mg(0.58mmol)、ブロモヘキサン酸活性エステル170mg(0.58mmol)をトルエン8mlで溶解後、室温で一晩攪拌した。反応終了後吸引濾過を行い、濾物を真空乾燥して活性エステル体(34)を得た。
4,7-ジ[(2-ナフチル)チエニル]-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ピリジニウム)の活性エステル体の合成例を示す。
アルゴン置換したナスフラスコにピリジル体(24a) 200mg(0.38mmol)、テトラキストリフェニルホスフィンパラジウム12.7mgを入れ、2M-炭酸ナトリウム2.8mlとベンゼン4mlで溶解した。2-ナフチルボロン酸 144mg(0.83mmol)をエタノール2mlで溶解し、反応液に投入した。その後、80℃で5時間加熱還流した。反応液に水を15ml入れ、クロロホルムを用いて抽出した。クロロホルムを減圧下留去し、残渣をヘキサン-クロロホルムで再結晶した。ピリジル体(35)を収量220mg、収率64%で得た。
(2)活性エステル体(36)の合成
ピリジル体(35)300mg(0.58mmol)、ブロモヘキサン酸活性エステル170mg(0.58mmol)をトルエン8mlで溶解後、室温で一晩攪拌した。反応終了後吸引濾過を行い、濾物を真空乾燥して活性エステル体(36)を得た。
4,7-ジ[(2-ブロモ)チエニル)]-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ビニルピリジニウム)の活性エステル体の合成例を示す。
200mlの三口フラスコにジケトン体(23a) 2.0g(4.5mmol)と、エタノール90mlを加え、60℃に加熱し、溶解した。それにグリシンエチルエステル塩酸塩4.8g(31.4mmol)を溶解した。次にトリエチルアミン7mlを投入し、24時間加熱還流した。エタノールを減圧留去した後、塩酸水、飽和重曹水の順に洗浄し、減圧下、乾燥した。残渣をカラムクロマトグラフィーで分離した。エタノールで再結晶し、4,7-ジ(ブロモチエニル)-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-エチルエステル(以下、エチルエステル体(37)という。)を収量1.18g、収率51%で得た。
アルゴン置換したナスフラスコにエチルエステル体(30) 195mg(0.38mmol)と、テトラキストリフェニルホスフィンパラジウム12.7mgを入れ、2M-炭酸ナトリウム2.8mlとベンゼン4mlで溶解した。フェニルボロン酸101mg(0.83mmol)をエタノール2mlで溶解し、反応液に投入した。その後、80℃で5時間加熱還流した。反応液に水を15ml入れ、クロロホルムを用いて抽出した。クロロホルムを減圧下留去し、残渣をヘキサン-クロロホルムで再結晶した。エチルエステル体(38)を収量112mg、収率58%で得た。
氷冷下、エチルエステル体(38)(255mg,0.50mmol)のTHF溶液(3ml)にDOBALのトルエン溶液(アルドリッチ社製、濃度1.5M,6μl)を滴下、その後氷冷下で30分、続いて室温で30分撹拌した。反応液を水に注入し、3%HCl水溶液を加えて酸性(沈澱が消失)とし、クロロホルムで抽出した。抽出液をMgSO4で乾燥、減圧留去して得た残さをシリカゲル(Kanto C-60)に分散させて一夜80℃で加熱した。このシリカゲルを酢酸エチル(AcOEt)で洗浄し、洗浄液を減圧留去して得た残さをカラム処理して(Kanto C-60; Hexane/AcOEt = 2/1 (v/v))、ヒドロキシメチル体(39)を収量89mg、収率38%で得た。
ヒドロキシメチル体(39)(100mg)とSoCl2(3ml)のクロロホルム溶液(3ml)を2時間加熱還流した。反応液を水に注入、NaHCO3で中和し、クロロホルムで抽出した。抽出液をMgSO4で乾燥し、減圧留去して得た残さをカラム(Kanto C-60; Hexane/CHCl3 = 5/1 (v/v))処理してクロロメチル体(40)を収量102mgで得た。
クロロメチル体(40)(107mg,0.22mmol)とPh3P(63mg,0.24mmol)のトルエン溶液(3ml)を24時間加熱還流した。沈澱をろ過してホスホニウム塩(41)を収量97mg、収率59%で得た。
氷冷下、ホスホニウム塩(41)(210mg,0.28mmol)と水酸化カリウム(純度85%,30mg)のエタノール溶液(3ml)にp-フォルミルピリジン(29μl,0.31mmol)を加え、その温度で1時間、続いて室温で1時間撹拌した。沈澱をろ過し、カラム処理して(Kanto C-60; CHCl3/AcOEt = 10/1 (v/v))、ビニル体(42)を収量118mg、収率78%で得た。
ビニル体(42)(108mg,0.20mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(63mg,0.22mmol)のトルエン溶液(2ml)を2日間加熱還流した。沈澱をろ過してピリジニウム塩の活性エステル体(43)を得た。
4,7-ジ[(1-ナフチル)チエニル]-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ビニルピリジニウム)の活性エステル体の合成例を示す。
アルゴン置換したナスフラスコにエチルエステル体(37) 216mg(0.42mmol)と、テトラキストリフェニルホスフィンパラジウム14mgを入れ、2M-炭酸ナトリウム3mlとベンゼン4.5mlで溶解した。1-ナフチルボロン酸155mg(0.90mmol)をエタノール2.5mlで溶解し、反応液に投入した。その後、80℃で7時間加熱還流した。反応液に水を15ml入れ、クロロホルムを用いて抽出した。クロロホルムを減圧下留去し、残渣をヘキサン-クロロホルムで再結晶した。エチルエステル体(44)を収量154mg、収率 60%で得た。
氷冷下、エチルエステル体44(268mg、0.44mmol)のTHF溶液(3ml)にDIBALのトルエン溶液(アルドリッチ社製、濃度1.5M,6μl)を滴下、その後氷冷下で30分、続いて室温で30分撹拌した。反応液を水に注入し、3%HCl水溶液を加えて酸性(沈澱が消失)とし、クロロホルムで抽出した。抽出液をMgSO4で乾燥、減圧留去して得た残さをシリカゲル(Kanto C-60)に分散させて一夜80℃で加熱した。このシリカゲルを酢酸エチル(AcOEt)で洗浄し、洗浄液を減圧留去して得た残さをカラム処理して(Kanto C-60; Hexane/AcOEt = 2/1 (v/v))、ヒドロキシメチル体(45)を収量75mg、収率30%で得た。
ヒドロキシメチル体(45)(200mg)とSOCl2(6ml)のクロロホルム溶液(6ml)を2時間加熱還流した。反応液を水に注入し、NaHCO3で中和し、クロロホルムで抽出した。抽出液をMgSO4で乾燥し、減圧留去して得た残さをカラム処理して(Kanto C-60; Hexane/CHCl3 = 5/1 (v/v))、クロロメチル体(46)を収量198mgで得た。
クロロメチル体(46)(103mg,0.18mmol)とPh3P(56mg,0.20mmol)のトルエン溶液(3ml)を21時間加熱還流した。沈澱をろ過してホスホニウム塩(47)を収量99mg、収率65%で得た。
氷冷下、ホスホニウム塩(47)(238mg,0.28mmol)と水酸化カリウム(純度85%、30mg)のエタノール溶液(3ml)にp-フォルミルピリジン(29μl,0.31mmol)を加え、その温度で1時間、続いて室温で1時間撹拌した。沈澱をろ過、カラム(Kanto C-60; CHCl3/AcOEt = 10/1 (v/v))処理してビニル体(48)を収量126mg、収率70%で得た。
ビニル体(48)(128mg,0.20mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(63mg,0.22mmol)のトルエン溶液(2ml)を2日間加熱還流した。沈澱をろ過してピリジニウム塩の活性エステル体(49)を得た。
4,7-ジ[(2-ナフチル)チエニル]-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ビニルピリジニウム)の活性エステル体の合成例を示す。
アルゴン置換したナスフラスコにエチルエステル体(37) 232mg(0.45mmol)と、テトラキストリフェニルホスフィンパラジウム15mgを入れ、2M-炭酸ナトリウム3mlとベンゼン4.5mlで溶解した。2-ナフチルボロン酸166mg(0.96mmol)をエタノール2.5mlで溶解し、反応液に投入した。その後、80℃で 7時間加熱還流した。反応液に水を15ml入れ、クロロホルムを用いて抽出した。クロロホルムを減圧下留去し、残渣をヘキサン-クロロホルムで再結晶した。エチルエステル体(50)を収量176mg、収率64%で得た。
氷冷下、エチルエステル体(50)(250mg,0.41mmol)のTHF溶液(3ml)にDIBALのトルエン溶液(アルドリッチ社製、1.5M,5μl)を滴下、その後氷冷下で30分、続いて室温で60分撹拌した。反応液を水に注入し、3%HCl水溶液を加えて酸性(沈澱が消失)とし、クロロホルムで抽出した。抽出液をMgSO4で乾燥し、減圧留去して得た残さをシリカゲル(Kanto C-60)に分散させて一夜80℃で加熱した。このシリカゲルを酢酸エチル(AcOEt)で洗浄し、洗浄液を減圧留去して得た残さをカラム処理して(Kanto C-60; Hexane/AcOEt = 2/1 (v/v))、ヒドロキシメチル体(51)を収量95mg、収率41%で得た。
ヒドロキシメチル体(51)(200mg)とSOCl2(6ml)のクロロホルム溶液(6ml)を2時間加熱還流した。反応液を水に注入し、NaHCO3で中和し、クロロホルムで抽出した。抽出液をMgSO4で乾燥し、減圧留去して得た残さをカラム処理して(Kanto C-60; Hexane/CHCl3 = 5/1 (v/v))、クロロメチル体(52)を収量201mgで得た。
クロロメチル体(52)(100mg,0.17mmol)とPh3P(49mg,0.19mmol)のトルエン溶液(3ml)を24時間加熱還流した。沈澱をろ過してホスホニウム塩(53)を収量61mg、収率42%で得た。
氷冷下、ホスホニウム塩(53)(170mg,0.20mmol)と水酸化カリウム(純度85%、30mg)のエタノール溶液(3ml)にp-フォルミルピリジン(21μl,0.31mmol)を加え、その温度で1時間、続いて室温で45分間撹拌した。沈澱をろ過し、カラム処理して(Kanto C-60; CHCl3/AcOEt = 10/1 (v/v))、ビニル体(54)を収量83mg、収率65%で得た。
ビニル体(54)(150mg,0.23mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(75mg,0.26mmol)のトルエン溶液(2.5ml)を2日間加熱還流した。沈澱をろ過してピリジニウム塩の活性エステル体(55)を得た。
4,7-ジ[(2-ビフェニル)チエニル]-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ピリジニウム)の活性エステル体の合成例を示す。
アルゴン置換したナスフラスコにピリジル体(27a) 200mg(0.38mmol)と、テトラキストリフェニルホスフィンパラジウム12.7mgを入れ、2M-炭酸ナトリウム2.8mlとベンゼン4mlで溶解した。ビフェニルボロン酸164mg(0.83mmol)をエタノール2mlで溶解し、反応液に投入した。その後、80℃で5時間加熱還流した。反応液に水を20ml入れ、クロロホルムを用いて抽出した。クロロホルムを減圧下留去し、残渣をヘキサン-クロロホルムで再結晶した。ピリジル体(56)を収量155mg、収率61%で得た。
ピリジル体(56)(300mg,0.45mmol)、ブロモヘキサン酸活性エステル145mg(0.49mmol)をトルエン8mlで溶解後、室温で一晩攪拌した。反応終了後吸引濾過を行い、濾物を真空乾燥して活性エステル体(57)を得た。
4,7-ジ[(2-ビフェニル)チエニル]-1,2,5-オキサジアゾロピリジン-6-(4-ビニルピリジニウム)の活性エステル体の合成例を示す。
アルゴン置換したナスフラスコにエチルエステル体(37) 200mg(0.39mmol)と、テトラキストリフェニルホスフィンパラジウム14mgを入れ、2M-炭酸ナトリウム3mlとベンゼン4.5mlで溶解した。2-ナフチルボロン酸140mg(0.81mmol)をエタノール2.5mlで溶解し、反応液に投入した。その後、80℃で7時間加熱還流した。反応液に水を15ml入れ、クロロホルムを用いて抽出した。クロロホルムを減圧下留去し、残渣をヘキサン-クロロホルムで再結晶した。エチルエステル体(58)を収量165mg、収率64%で得た。
氷冷下、エチルエステル体(58)(290mg,0.44mmol)のTHF溶液(3ml)にDIBALのトルエン溶液(アルドリッチ社製、濃度1.5M、7μl)を滴下、その後氷冷下で30分、続いて室温で60分撹拌した。反応液を水に注入し、3%HCl水溶液を加えて酸性(沈澱が消失)とし、クロロホルムで抽出した。抽出液をMgSO4で乾燥、減圧留去して得た残さをシリカゲル(Kanto C-60)に分散させて一夜80℃で加熱した。このシリカゲルを酢酸エチル(AcOEt)で洗浄、洗浄液を減圧留去して得た残さをカラム処理して(Kanto C-60; Hexane/AcOEt = 2/1 (v/v))、ヒドロキシメチル体(59)を収量112mg、収率41%で得た。
ヒドロキシメチル体(59)(200mg)とSOCl2(6ml)のクロロホルム溶液(6ml)を2時間加熱還流した。反応液を水に注入し、NaHCO3で中和し、クロロホルムで抽出した。抽出液をMgSO4で乾燥、減圧留去して得た残さをカラム処理して(Kanto C-60; Hexane/CHCl3 = 5/1 (v/v))、クロロメチル体(60)を収量201mgで得た。
クロロメチル体(60)(100mg,0.16mmol)とPh3P(45mg,0.17mmol)のトルエン溶液(3ml)を24時間加熱還流した。沈澱をろ過して、ホスホニウム塩(61)を、収量61mg、収率42%で得た。
氷冷下、ホスホニウム塩(61)(252mg、0.28mmol)と水酸化カリウム(純度85%、30mg)のエタノール溶液(3ml)にp-フォルミルピリジン(29μl,0.31mmol)を加え、その温度で1時間、続いて室温で45分間撹拌した。沈澱をろ過し、カラム処理して(Kanto C-60; CHCl3/AcOEt = 10/1 (v/v))、ビニル体(62)を収量126mg、収率65%で得た。
ビニル体(62)(150mg,0.22mmol)とブロムヘキサン酸活性エステル(69mg,0.24mol)のトルエン溶液(2.5ml)を2日間加熱還流した。沈澱をろ過して、ピリジニウム塩の活性エステル体(63)を得た。
比較として、4,7-ジフェニル-1,2,5-オキサジアゾロピリジンエチルエステルの活性エステル体を合成した。
(測定方法)
合成した蛍光色素を溶媒にDMSOを用いて濃度10-4Mの溶液を調製し、蛍光波長の測定および吸収波長の測定を行った
合成例1から22の蛍光色素は、いずれも直接水に溶解可能であった。これに対し、窒素カチオン含有基又は窒素含有基を持たない合成例23の蛍光色素は、直接水に溶解させることができなかった。また、合成したすべての蛍光色素で100nm以上のストークスシフトが得られた。また、4,7-ジフェニル体では、吸収波長が400~450nmであるのに対し、4,7-チエニル体では、吸収波長が500nm以上であり、600nm以上の蛍光波長が得られた。また、合成例21の蛍光強度を1.0とすると、合成例1では、11.2、合成例12では6.0と、非常に高い蛍光強度が得られた。
(標本作製方法)
生後7年齢Wistar Ratを用い、4%パラホルムアルデヒド,0.03%グルタールアルデヒド、0.1Mカコジル酸緩衝液にて灌流固定を行い、固定後腎臓を取り出し、4%パラホルムアルデヒドにて後固定を行った。次に、凍結による切片へのダメージを回避するため、25%の高張ショ糖液(溶媒KPBS)に2時間浸漬させた後、包埋剤で試料を包埋し-80℃のディープフリーザーにて試料を凍結させた。凍結後、-20℃に設定したクリオスタットで、8μmの凍結切片を作成し、スライドガラスに貼り付けた。PBSで20分間の洗浄を3回行い、ビオチン化レクチンを室温下、一日間付加させた。次にPBSで10分間の洗浄を3回行なった後、蛍光標識ストレプトアビジンを用い3時間染色させた。染色後、PBSにて洗浄を行い、水溶性封入剤で封入後、蛍光顕微鏡で観察した。
図1は、合成例9の蛍光色素を用いて染色したもので、図2は、比較のため、Texas Redを用いて染色したものである。Texas Redでは、非特異的吸着のため尿細管の外側が染色されているが、合成例9の蛍光色素では、外側に全く吸着せず、尿細管内面のブラッシュボーダーのみが染色された。また、尿細管内面のブラッシュボーダーについては、にじみも無く、形状が明確に観察可能であった。
Claims (5)
- 以下の一般式(1)、(2)又は(3)で表されるアゾール誘導体から成る蛍光色素。
(式(1)および式(3)ではR1は、そして式(2)ではR1とR4の一方は、一般式L1-M1で示され、
M1は、置換基を有してもよいピリジニウム基、2級アミニウム基、3級アミニウム基、4級アンモニウム基、ピペリジニウム基、ピペラジニウム基、イミダゾリウム基、チアゾリウム基、オキサゾリウム基、キノリウム基、ベンゾイミダゾリウム基、ベンゾチアゾリウム基又はベンゾオキサゾリウム基である窒素カチオン含有基、あるいは置換基を有してもよいピリジル基、2級アミノ基、3級アミノ基、ピペリジル基、ピペラジル基、イミダゾリル基、チアゾリル基、オキサゾリル基、キノリル基、ベンゾイミダゾリル基、ベンゾチアゾリル基又はベンゾオキサゾリル基である窒素含有基を示し、
L1は、-(CH=CR6)n-で表され、Mと中心ピリジン環または中心ベンゼン環とを連結するリンカーであり、nは1から5の整数からなり、R6は、水素原子;置換基を有してもよい炭素数1から6の直鎖状または分岐状のアルキル基;置換基を有してもよいスルホ基;置換基を有してもよいイミダゾリウム基、ピリジニウム基およびフラン基からなる群から選択された複素環基;置換基を有してもよい2級アミノ基、3級アミノ基および4級アミノ基からなる群から選択されたアミノ基;置換基を有してもよいヒドロキシ基;置換基を有してもよいアルコキシ基;置換基を有してもよいアルデヒド基;置換基を有してもよいカルボキシル基;置換基を有してもよい芳香族基のいずれか1種を示し、
式(2)のR1とR4の残部、式(1)から式(3)のR2およびR3は、それぞれ独立に、水素原子、ハロゲン原子、置換基を有してもよい芳香族炭化水素基又は脂肪族炭化水素基又は複素環基を示し、
Xは置換基を有していてもよい窒素原子、硫黄原子、酸素原子、セレン原子又はボロン原子を示し、
R’は芳香環を含んでもよいアルキル基からなる脂肪族炭化水素基あるいは芳香族炭化水素基、
An-は、ハロゲン化物イオン、CF3SO3 -、BF4 -又はPF6 -を示す。) - 上記のR2およびR3が、それぞれ独立に、置換基を有してもよいチエニル基、フラニル基、ピロリル基、イミダゾリル基、オキサゾリル基、チアジアゾリル基、ピラゾリル基、ピリジル基またはキノリル基を示す請求項1記載の蛍光色素
- 上記のR2およびR3が、置換基を有してもよいチエニル基を示し、該置換基が、置換基を有してもよい芳香族炭化水素基、脂肪族炭化水素基または複素環基である請求項2記載の蛍光色素。
-
(式(4)および式(6)ではR1は、そして式(5)ではR1とR4の一方は、一般式L2-M2で示され、
M2は、置換基を有してもよいピリジニウム基、2級アミニウム基、3級アミニウム基、4級アンモニウム基、ピペリジニウム基、ピペラジニウム基、イミダゾリウム基、チアゾリウム基、オキサゾリウム基、キノリウム基、ベンゾイミダゾリウム基、ベンゾチアゾリウム基又はベンゾオキサゾリウム基である窒素カチオン含有基、あるいは置換基を有してもよいピリジル基、2級アミノ基、3級アミノ基、ピペリジル基、ピペラジル基、イミダゾリル基、チアゾリル基、オキサゾリル基、キノリル基、ベンゾイミダゾリル基、ベンゾチアゾリル基又はベンゾオキサゾリル基である窒素含有基を示し、
L2は、M2と中心ピリジン環または中心ベンゼン環とを連結するリンカーであり、
直接結合、あるいは-(CH2)n-(nは1~4の整数)、-NHCOO-、-CONH-、-COO-、-SO2NH-、-HN-C(=NH)-NH-、-O-、-S-、-NR(Rはアルキル基)、-Ar-(Arは芳香族炭化水素基)、-CO-Ar-NR-、からなる群から選択された1種以上の官能基を示し、
式(5)のR1とR4の残部、式(4)から式(6)のR2およびR3は、それぞれ独立に、置換基を有してもよいチエニル基、フラニル基、ピロリル基、イミダゾリル基、オキサゾリル基、チアジアゾリル基、ピラゾリル基、ピリジル基またはキノリル基を示し、
Xは置換基を有していてもよい窒素原子、硫黄原子、酸素原子、セレン原子又はボロン原子を示し、
R’は芳香環を含んでもよいアルキル基からなる脂肪族炭化水素基あるいは芳香族炭化水素基、
An-は、ハロゲン化物イオン、CF3SO3 -、BF4 -又はPF6 -を示す。) - 上記のR6およびR7が、置換基を有してもよいチエニル基を示し、該置換基が、置換基を有してもよい芳香族炭化水素基、脂肪族炭化水素基または複素環基である請求項4記載の蛍光色素。
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Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2016068324A1 (ja) * | 2014-10-31 | 2016-05-06 | 信一郎 礒部 | アルコキシシリル基含有有機el色素およびその製造方法 |
JP2016196608A (ja) * | 2015-04-06 | 2016-11-24 | 学校法人 中村産業学園 | 蛍光色素 |
WO2019017386A1 (ja) * | 2017-07-19 | 2019-01-24 | 株式会社ニコン | 化合物、パターン形成用基板、カップリング剤及びパターン形成方法 |
JP2019031604A (ja) * | 2017-08-07 | 2019-02-28 | 信一郎 礒部 | 蛍光色素 |
US10287282B2 (en) | 2014-12-31 | 2019-05-14 | Angion Biomedica Corp. | Methods and agents for treating disease |
CN113336778A (zh) * | 2021-05-11 | 2021-09-03 | 复旦大学 | 基底上潜指纹荧光可视化识别探针及方法 |
US11459319B2 (en) | 2014-08-11 | 2022-10-04 | Angion Biomedica Corp. | Cytochrome P450 inhibitors and uses thereof |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2005258388A (ja) * | 2003-12-03 | 2005-09-22 | Mitsubishi Chemicals Corp | 有機非線形光学材料 |
JP2008156556A (ja) * | 2006-12-26 | 2008-07-10 | Shinichiro Isobe | 蛍光色素及びその製造方法 |
JP2010037511A (ja) * | 2008-08-08 | 2010-02-18 | Shinichiro Isobe | 蛍光色素 |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP5392664B2 (ja) * | 2007-01-31 | 2014-01-22 | 信一郎 礒部 | 重合性蛍光色素及びその製造方法並びにその重合体 |
-
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Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2005258388A (ja) * | 2003-12-03 | 2005-09-22 | Mitsubishi Chemicals Corp | 有機非線形光学材料 |
JP2008156556A (ja) * | 2006-12-26 | 2008-07-10 | Shinichiro Isobe | 蛍光色素及びその製造方法 |
JP2010037511A (ja) * | 2008-08-08 | 2010-02-18 | Shinichiro Isobe | 蛍光色素 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
BAOCUN ZHU ET AL.: "The determination of thiols based using a probe that utilizes both an absorption red-shift and fluorescene enhancement", DYES AND PIGMENTS, vol. 86, 2010, pages 87 - 92 * |
Cited By (14)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US11459319B2 (en) | 2014-08-11 | 2022-10-04 | Angion Biomedica Corp. | Cytochrome P450 inhibitors and uses thereof |
JPWO2016068324A1 (ja) * | 2014-10-31 | 2017-08-10 | 信一郎 礒部 | アルコキシシリル基含有有機el色素およびその製造方法 |
WO2016068324A1 (ja) * | 2014-10-31 | 2016-05-06 | 信一郎 礒部 | アルコキシシリル基含有有機el色素およびその製造方法 |
US10851095B2 (en) | 2014-12-31 | 2020-12-01 | Angion Biomedica Corp. | Methods and agents for treating disease |
US11434234B2 (en) | 2014-12-31 | 2022-09-06 | Angion Biomedica Corp. | Methods and agents for treating disease |
US10287282B2 (en) | 2014-12-31 | 2019-05-14 | Angion Biomedica Corp. | Methods and agents for treating disease |
JP2016196608A (ja) * | 2015-04-06 | 2016-11-24 | 学校法人 中村産業学園 | 蛍光色素 |
WO2019017386A1 (ja) * | 2017-07-19 | 2019-01-24 | 株式会社ニコン | 化合物、パターン形成用基板、カップリング剤及びパターン形成方法 |
JP2019019092A (ja) * | 2017-07-19 | 2019-02-07 | 株式会社ニコン | 化合物、パターン形成用基板、カップリング剤及びパターン形成方法 |
US11767327B2 (en) | 2017-07-19 | 2023-09-26 | Nikon Corporation | Compound, pattern forming substrate, coupling agent, and pattern formation method |
JP7045752B2 (ja) | 2017-08-07 | 2022-04-01 | 信一郎 礒部 | 蛍光色素 |
JP2019031604A (ja) * | 2017-08-07 | 2019-02-28 | 信一郎 礒部 | 蛍光色素 |
CN113336778A (zh) * | 2021-05-11 | 2021-09-03 | 复旦大学 | 基底上潜指纹荧光可视化识别探针及方法 |
CN113336778B (zh) * | 2021-05-11 | 2022-12-20 | 复旦大学 | 基底上潜指纹荧光可视化识别探针及方法 |
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