明 細 書
エリス口又はスレオ一 2 -ァミノ _ 3 _ヒドロキシプロピオン酸エステルの製 造方法、新規カルボニル還元酵素、その遺伝子、ベクター、形質転換体、および それらを利用した光学活性アルコールの製造方法
技術分野
[0001] 本発明は、エリス口又はスレオ体の N—Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3— ヒドロキシプロピオン酸エステルの製造方法、新規カルボ-ル還元酵素、その遺伝子
、その遺伝子を含むベクター、そのベクターで形質転換された形質転換体、およびそ れらを利用した光学活性アルコールの製造方法に関する。
背景技術
[0002] 光学活性な N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸 エステルは、農薬、医薬品等の合成原料及び中間体として有用な化合物である。光 学活性な N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸エス テルを製造する方法としては、不飽和エステルからシャープレスジヒドロキシレーショ ン反応を経て製造する方法が知られて ヽる (非特許文献 1参照)。
[0003] し力し、 N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3—ォキソプロピオン酸エステ ルを不斉的に還元して、光学活性な N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへキシル 3— ヒドロキシプロピオン酸エステルを製造する方法は見出されて 、な 、。
非特許文献 1 : Momca Alonso et al、 Organic Process Research & Development, 9, o 90-693, 2005
発明の開示
発明が解決しょうとする課題
[0004] 本発明は、上述の非特許文献 1に開示された製造法とは異なる、新規なエリス口又 はスレオ体の N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸 エステルの製造法、新規カルボ-ル還元酵素、その遺伝子、その遺伝子を含むベタ ター、そのベクターで形質転換された形質転換体、およびそれらを利用した光学活 性アルコールの製造方法を提供することを課題とする。
課題を解決するための手段
[0005] 本発明は、以下の 1または複数の特徴を有する。
(1)本発明の一つの特徴は、
下記式(1) :
[0006] [化 6]
[0007] (Rは、置換または無置換の、アルキル基またはァリール基である)
で表される N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸エス テルに、該化合物を下記式(2):
[0008] [化 7]
[0009] (Rは、置換または無置換の、アルキル基またはァリール基である)
で表されるエリス口 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロ ピオン酸エステルに立体選択的に還元する活性を有する酵素源を作用させること〖こ よる、エリス口 N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン 酸エステルの製造方法である。
(2)本発明の別の特徴は、前記式(1)で表される N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへ キシル 3—ォキソプロピオン酸エステルに、アースロバクタ一(Arthrobacter)属、 バシラス(Bacillus)属、ブレヴアンディモナス(Brevundimonas)鼠、コリネバクテリウ ム属 (Corvnebacterium)属、ォエノレスコビア (Oerskovia)属、ノ ェニノシラス (Pa enibacillus)鼠、リゾビゥム(Rhizobium)属、キャンディダ(Candida)属、デバリオ マイセス (Debarvomvces)属、ピキア (Pichia)属、ロドトノレーラ (Rhodotorula)属、 サッカロマイコプシス (Saccharomvcopsis)属、サツル-スポラ (Saturnispora)属、 トリゴノプシス (Trigonopsis)属、ウイリオプシス (Williopsis)属、コリネスポラ(Corvn espora)属、プレクトスファエレラ (Plectosphaerella)属からなる群より選ばれる微生 物、又は該微生物力 得られるポリペプチドをコードする DNAを発現可能な形質転 換体を作用させることを特徴とする、前記式(2)で表されるエリス口一 N— Boc— 2— アミノー 3—シクロへキシル— 3—ヒドロキシプロピオン酸エステルの製造方法である。
(3)本発明の別の特徴は、前記 N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへキシル 3—ォキ ソプロピオン酸エステルに、該化合物を下記式(3):
[0010] [化 8]
[0011] (Rは、置換または無置換の、アルキル基またはァリール基である)
で表されるスレオ N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシノレ 3 ヒドロキシプロピ オン酸エステルに立体選択的に還元する活性を有する酵素源を作用させることによ る、スレオ一 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸 エステルの製造方法である。
(4)本発明の別の特徴は、前記 N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへキシル 3—ォキ ソプロピオン酸エステルに、ェンテロパクター(Enterobacter)属、モルガネラ(Mor_g
anella)属、ぺクトノくクテリゥム (Pectobacterium)属、シノレシネラ (Circinella)属、 ェメリセラ (Emericella)属、ェゥぺニシリウム(Eupenicillium)属、ホルモコミス(Ho rmocomis)属カもなる群より選ばれる微生物を作用させることを特徴とする、前記式 (3)で表されるスレオ N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプ ロピオン酸エステルの製造方法である。
(5)本発明の別の特徴は、以下の(a)、(b)又は (c)のポリペプチドである。
(a)配列表の配列番号 2に示すアミノ酸配列力 なるポリペプチド;
(b)配列表の配列番号 2に示すアミノ酸配列において 1若しくは複数個のアミノ酸が 置換、挿入、欠失及び Z又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、前記 N— Boc 2 アミノー 3 シクロへキシルー 3 ォキソプロピオン酸エステルを不斉的に還元 し、下記式 (4) :
[0012] [化 9]
[0013] (Rは、置換または無置換の、アルキル基またはァリール基である)
で表される(2R, 3R)—N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプ ロピオン酸エステルを生成する活性を有するポリペプチド;
(c)配列表の配列番号 2に示すアミノ酸配列と 60%以上の配列同一性を示すアミノ 酸配列からなり、かつ、前記 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル—3—ォキソ プロピオン酸エステルを不斉的に還元して、前記(2R, 3R)—N— Boc— 2 ァミノ 3—シクロへキシル 3—ヒドロキシプロピオン酸エステルを生成する活性を有する ポリペプチド。
(6)本発明の別の特徴は、以下の(a)、(b)又は (c)の DNAである。
(a)配列表の配列番号 1に示す塩基配列を含む DNA;
(b)配列表の配列番号 1に示す塩基配列と相補的な塩基配列を含む DNAとストリン ジェントな条件下でハイブリダィズし、かつ、前記 N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへ キシルー 3 ォキソプロピオン酸エステルを不斉的に還元して、前記(2R, 3R) -N — Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸エステルを生成 する活性を有するポリペプチドをコードする DNA;
(c)配列表の配列番号 1に示す塩基配列と 60%以上の配列同一性を示す塩基配列 からなり、かつ、前記 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3—ォキソプロピオ ン酸エステルを不斉的に還元して、前記(2R, 3R)—N— Boc— 2 ァミノ 3 シク 口へキシルー 3—ヒドロキシプロピオン酸エステルを生成する活性を有するポリべプチ ドをコードする DNA。
(7)本発明の別の特徴は、前記 DNAを含むベクターである。
(8)本発明の別の特徴は、還元型補酵素再生能を有するポリペプチドをコードする D NAをさらに含む前記ベクターである。
(9)本発明の別の特徴は、前記ベクターにより宿主細胞を形質転換して得られる形 質転換体である。
(10)本発明の別の特徴は、前記ポリペプチド、又は、前記形質転換体を、カルボ- ル基を有する化合物と反応させることを特徴とする光学活性アルコールの製造方法 である。
発明の効果
[0014] 本発明により、エリス口又はスレオ一 N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3 ーヒドロキシプロピオン酸エステルの製造法、新規カルボ-ル還元酵素、その遺伝子 、その遺伝子を含むベクター、そのベクターで形質転換された形質転換体、およびそ れらを利用した有用な光学活性アルコールの製造方法が提供される。
図面の簡単な説明
[0015] [図 1]組換えベクター pNBDGの作製法および構造を示す
発明を実施するための最良の形態
[0016] 以下、本発明を、実施形態を用いて詳細に説明する。本発明はこれらにより限定さ れるものではない。
[0017] 1. N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3—ォキソプロピオン酸エステル 本発明の「N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸エス テル」は、下記式(1)
[0018] [化 10]
[0019] で示される化合物であり、 R基は、置換または無置換の、アルキル基またはァリール 基である。アルキル基の例としては、メチル基、ェチル基、イソプロピル基、 n—ブチ ル基、イソブチル基、ターシャルブチル基などが挙げられる。また、ァリール基の例と しては、フ -ル基、ナフチル基などが挙げられる。この化合物は、既存の化学的合 成を組み合わせることにより合成できる。例えば、 J. Org. Chem. 1982, 47, 2663と J. A m. Chem. Soc, 2003, 125, 5139に記載の手法を用いて合成できる。
[0020] 2.エリス口又はスレオ一 N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシ プロピオン酸エステルの製造方法
本発明の「エリス口又はスレオ一 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒ ドロキシプロピオン酸エステルの製造方法」は、基質となる N— Boc— 2 ァミノ 3— シクロへキシルー 3—ォキソプロピオン酸エステルに、該化合物を立体選択的に還元 する活性を有する酵素源を作用させることを特徴とする。その酵素源としては、微生 物菌体、該微生物より得られるポリペプチド、又は該ポリペプチドをコードする DNA を発現可能な形質転換体が挙げられる。
[0021] 本明細書で後述する各微生物は、さまざまな寄託機関より当業者が入手可能であ る。寄託機関としては、各微生物を特定する受託番号に対応する機関が挙げられる 。例えば、 NBRC番号で特定される微生物は、独立行政法人製品評価技術基盤機
構生物遺伝資源部門より入手可能である。
[0022] 本製造方法に使用できる微生物は、特に限定されないが、エリスロー N— Boc— 2 ァミノ 3—シクロへキシル 3—ヒドロキシプロピオン酸エステルを製造する場合 は、例えば、アースロバクタ一(Arthrobacter)属、バシラス(Bacillus)属、ブレヴァ ンディモナス (Brevundimonas)属、コリネノ クテリゥム属 (Corvnebacterium)属、 ォエルスコビア (Qerskovia)属、バエ-バシラス (Paenibacillus)属、リゾビゥム (Rhi zobium)属、キャンディダ (Candida)属、デノ リオマイセス(Debarvomvces)属、ピ キア(Pichia)属、ロドトノレーラ(Rhodotorula)属、サッカロマイコプシス (Saccharo mvcopsis)属、サッノレニスポラ(Saturnispora)属、トリゴノプシス (Trigonopsis)属 、ウイリオプシス (Williopsis)属、コリネスポラ(CorvnesOora)属、プレクトスファエレ ラ (Plectosphaerella)属の微生物などが挙げられる。
[0023] さらに好ましい微生物としては、アースロバクタ一'バラフイネウス (Arthrobacter paraffineus)、バシラス ·リチェ-フオルミス (Bacillus licheniformis)、バシラス'ズ ブチリス (Bacillus subtilis)、ノ シラス ·ッリンギェンシス (Bacillus thuringiensis )、ブレヴアンディモナス'ディミヌータ (Brevundimonas diminuta)、コリネノ クテリ ゥム ·アンモニアゲネス (Corvnebacterium ammoniagenes)、才エノレスコビア ·タ 一ノ タ (Qerskovia turbata)、ノェニノ シラス ·ァノレべィ (Paenibacillus alvei)、 リゾビゥム ·ラジオパクター (Rhizobium radiobacter)、キャンディダ ·マグノリアェ( Candida magnoliae)、ァノ リオマイセス ·ポリモノレファス (Debarvomvces polvm orphus)、ピキア ·ァノマラ (Pichia anomala)、ピキア ·ミヌータ 'バ^ ~ ·ミヌータ(£ hia minuta var. minuta)、ピキア ·ミヌータ ·ノ一'ノンフアーメンタンス (Pichia minuta var. nonfermentans) ,ヒ-や /' ·キン口' ~~サ (Picnia xvlosa)、口卜 I レ ーラ ·グノレティ-ス ·ノ一'タイレネンシス (Rhodotorula glutinis var. dairenen sis)、サッカロマイコプシス ·フイブリゲラ (Saccharomvcopsis fibuligera)、サッノレ ニスポラ ·サイトーィ(Saturnispora saitoi)、トリゴノプシス .ノ リアビリス(Trigonop sis variabilis)、ウイリオプシス ·サターナス ·ノ一 ·ムラキイ(Williopsis saturnus var. mrakii)、コリ不スホフ 'カシィコフ (Corvnespora cassiicola)、プレクトスファ エレラ ·ククメリナ (PlectosDhaerella cucumerina)などが挙げられる。
[0024] 具体的には、当業者が容易に入手可能な以下の、アースロバクタ一 'バラフイネウス (Arthrobacter paraffineus) ATCC21218、バシラス ·リチェニフォルミス(Bacill us licheniformis) NBRC 12195、ノくシラス.ズブチリス(Bacillus subtilis)ATC C14593、バシラス ·ッリンギェンシス (Bacillus thuringiensis) NBRC3951、ブレ ヴアンディモナス ·ディミヌータ(Brevundimonas diminuta) NBRC 12697、コリネ パクテリゥム ·アンモニアゲネス (Corvnebacterium ammoniagenes) NBRC 120
72、ォエノレスコビア ·ターバタ(Oerskovia turbata) NBRC 15015,バエ-バシラ ス ·アルべィ(Paenibacillus alvei) NBRC3343、リゾビゥム ·ラジオパクター(Rhiz obium radiobacter) NBRC 13264,キャンディダ'マグノリアェ(Candida magn oliae) NBRC0705、デバリオマイセス ·ポリモノレファス (Debarvomvces polvmorp hus) ATCC20280,ピキア,ァノマラ(Pichia anomala) NBRC0120,ピキア 'ミヌ ータ 'バー'ミヌータ(pichia minuta var. minuta) NBRC0975.ピキア'ミヌー タ ·バー ·ノンフアーメンタンス (Pichia minuta var. nonfermentans) NBRC 1 4
73、ピキア ·キシローサ(Pichia xylosa) NBRC0950,ロドトルーラ'グルティ-ス' バー .ダイレネンシス (Rhodotorula glutinis var. dairenensis) NBRC0415 , サッカロマイコプシス.フイブリゲラ (Saccharomvcopsis fibuligera) NBRCO 104 , サッノレニスポラ ·サイトーィ(SaturnisOora saitoi) NBRC1134,トリゴノプシス'バリ アビリス(Trigonopsis variabilis) NBRC0671.ウイリオプシス 'サターナス'バー' ムラキイ(Williotisis saturnus var. mrakii) NBRC0895、コリネスポラ '力シィコ ラ (Corvnespora cassiicola) NBRC30049、プレクトスファエレラ ·ククメリナ (Plec tosphaerella cucumerina) NBRC30005などが举げられるハ
[0025] 本製造方法に使用できる微生物は、特に限定されないが、スレオー N— Boc— 2— ァミノ 3—シクロへキシル 3—ヒドロキシプロピオン酸エステルを製造する場合は、 例えば、ェンテロパクター(Enterobacter)属、モノレガネラ(Morganella)属、ぺクト ノ クテリゥム(Pectobacterium)属、シ /レシネラ(Circinella)属、ェメリセラ(Emeric ella)属、ェゥぺニシリウム(Eupenicillium)属、ホルモコミス(Hormocomis)属の微 生物などが挙げられる。
[0026] さらに好ましい微生物としては、ェンテロバクタ一'ァエロゲネス (Enterobacter a
erogenes)、モノレガネラ .モノレガニイ ·サブエスピー ·モノレガニイ (Morganella morg anii subsp. morganii)、ぺクトノくクテリゥム ·カロトボラム ·サブエスピー ·力ロトボラ ム (Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum)、シルシネフ ·アン ベラータ (Circinella umbellata)、ェメリセラ ·アングイス (Emericella unguis)、 ェゥぺニシリウム'バーネンセ(Eupenicillium baarnense)、ホノレモコミス'レシナェ (Hormocomis resinae)など力孕げられる。
[0027] 具体的には、当業者が容易に入手可能な以下の、ェンテロパクター 'ァエロゲネス( Enterobacter aerogenes) NBRC 13534,モノレガネラ'モノレガニイ'サブエスピー 'モル;! ニイ(Morganella morganii subsp. morganii) NBRC 3168,へクトノ クテリゥム .カロトボラム .サブエスピー 'カロトボラム (Pectobacterium carotovoru m subsp. carotovorum) NBRC3830、ぺクトパクテリゥム ·カロトボラム ·サブェ スピ ~~ ·力ロトホフム (Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum) N BRC12380、ぺクトバタテリゥム 'カロトボラム ·サブエスピ一'カロトボラム (Pectobac terium carotovorum suosp. carotovorum) NBRC14082.ンノレンネフ · "?ン ベラータ(Circinella umbellata) NBRC4452、ェメリセラ ·アングイス (Emericella unguis) NBRC8087.ェゥぺ-シリウム'バーネンセ(EuOenicillium baarnens e) NBRC6090、ホノレモコミス .レシナェ(Hormocomis resinae) NBRC6367など が挙げられる。
[0028] 本発明の製造方法に使用する微生物、および、該微生物力 得られるポリペプチド をコードする DNAを発現可能な形質転換体は、培養菌体は言うまでもなぐその処 理物も含まれる。ここで言う処理物とは、例えば、界面活性剤や有機溶媒で処理した 細胞、乾燥細胞、破砕処理した細胞、細胞の粗抽出液等のほか、公知の手段でそれ らを固定化したものを意味し、上述の N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへキシル - 3 ォキソプロピオン酸エステルを不斉的に還元する活性が残存する限りはこれに含 まれる。本発明の製造方法に使用する微生物および形質転換体の培養は、それが 増殖する限り、通常の、炭素源、窒素源、無機塩類、有機栄養素などを含む液体栄 養培地を用いて実施できる。
[0029] 上述の N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸エステ
ルに微生物菌体を作用させることを特徴とする光学活性 N -Boc- 2-ァミノ 3— シクロへキシルー 3—ヒドロキシプロピオン酸エステルの製造方法の実施形態として は、後述して 、る N -Boc- 2-ァミノ 3—シクロへキシル 3—ォキソプロピオン酸 ターシャノレブナノレに、上 のブレワアンティモ "ス.ディミヌータ (Brevundimonas diminuta)を作用させる、エリス口一 N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3— ヒドロキシプロピオン酸ターシャルブチルの製造法などが挙げられる(実施例 1参照)
[0030] 上述の N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸エステ ルに微生物より得られるポリペプチドをコードする DNAを発現可能な形質転換体を 作用させることを特徴とする光学活性 N -Boc- 2-ァミノ 3—シクロへキシル - 3 —ヒドロキシプロピオン酸エステルの製造方法の実施形態としては、後述して ヽる N — Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸ェチルに、上述の ブレヴアンディモナス ·ディミヌータ (Brevundimonas diminuta)より取得したポリぺ プチドをコードする DNAを発現させた形質転換体を作用させる、 (2R, 3R) N— B oc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸ェチルの製造法( 実施例 10参照)、 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン 酸ェチルにキャンディダ.マグノリアェ (Candida magnoliae)より取得したポリぺプ チドをコードする DNAを発現させた形質転換体を作用させる、 (2R, 3R) -N-Boc 2 ァミノ 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸ェチルの製造法(実施 例 11参照)、 N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸ェ チルにピキア'ミヌータ 'バ^ ~ ·ミヌータ(Pichia minuta var. minuta)より取得し たポリペプチドをコードする DNAを発現させた形質転換体を作用させる、 (2S, 3S) — N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸ェチルの 製造法 (実施例 12参照)などが挙げられる。
[0031] また、当業者であれば、これら以外の微生物においても、 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3—ォキソプロピオン酸エステルを不斉的に還元する活性を有す る微生物より、ポリペプチドの単離、該ポリペプチドをコードする DNAの取得、該活 性を有するポリペプチドをコードする DNAを発現する形質転換体の育種を実施する
ことにより、ポリペプチドをコードする DNAを発現する形質転換体を作用させることを 特徴とするエリス口又はスレオ N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒド ロキシプロピオン酸エステルの製造方法を実施することが可能である。
[0032] 3.ポリペプチド
本発明の「ポリペプチド」は、カルボ-ル基を有する化合物を還元し、光学活性アル コールを生成する活性を有するポリペプチド、好ましくは N— Boc— 2 ァミノ 3— シクロへキシルー 3 ォキソプロピオン酸エステルを不斉的に還元し、 (2R, 3R)—N — Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸エステルを生成 する活性を有するポリペプチドである。このようなポリペプチドは、当該活性を有する 微生物などの生物から単離することができる。
[0033] 本発明のポリペプチドの実施形態としては、配列表の配列番号 1に示す塩基配列 によってコードされる、配列表の配列番号 2に示すアミノ酸配列力 なるポリペプチド を挙げることができる。また、配列表の配列番号 2に示すアミノ酸配列からなるポリべ プチドと一定値以上の配列同一性を有し、かつ、 N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへ キシル—3 ォキソプロピオン酸エステルを不斉的に還元し、 (2R, 3R)— N— Boc — 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸エステルを生成する活 性を有するポリペプチドは、当該ポリペプチドと同等であり、本発明に含まれる。
[0034] ここで配列の同一性は、例えば、相同性検索プログラム FASTA (W.R. Pearson & D.J. Lipman P.N.A.S. (1988) 85:2444-2448)を用いて 2つのアミノ酸配列を比較解析 した場合に、配列全体に対する Identityの値で表される。配列表の配列番号 2に示 すアミノ酸配列からなるポリペプチドと一定値以上の配列同一性を有するポリべプチ ドとしては、当該ポリペプチドとの配列同一性が 60%以上、好ましくは 70%以上、より 好ましくは 80%以上、最も好ましくは 85%であるポリペプチドを挙げることができる。
[0035] 配列表の配列番号 2に示すアミノ酸配列を、上記の相同性検索プログラム FASTA を用いて相同性検索をしたところ、ストレブトマイセス 'コエリコラ由来の推定酸化還元 酵素と約 56%の配列同一性を示した。このストレブトマイセス 'コエリコラ由来の酵素 の機能はあくまでも推定であり、また、約 56%という低い配列同一性である。したがつ て、当業者の技術常識によれば、上記ストレブトマイセス 'コエリコラ由来の酵素との
相同性検索結果に基づいて、本発明の実施形態のポリペプチドが光学活性アルコ ールを生成する活性を有することは想到できないのが一般的である。
[0036] このようなポリペプチドは、例えば、先述の、配列表の配列番号 1に示す塩基配列と 相補的な塩基配列力 なる DNAとストリンジヱントな条件下でハイブリダィズする DN Aを適当なベクターに連結した後、適当な宿主細胞に導入して発現させることにより 得りれ 。また、例 ば、し urrent Protocols in Molecular Biology (John Wiley and Son s, Inc., 1989)等に記載の公知の方法に従い、配列表の配列番号 2に示すアミノ酸配 列からなるポリペプチドに、アミノ酸の置換、挿入、欠失または付加を生じさせることに よっても取得できる。置換、挿入、欠失または付加を生じさせるアミノ酸の数は、実施 形態のポリペプチドが備える活性が失われない限り、その個数は制限されないが、好 ましくは 50個以下であり、より好ましくは 30個以下であり、さらに好ましくは 20個以下 であり、最も好ましくは 10個以下である。
[0037] 本発明のポリペプチドの起源となる微生物は、特に限定されないが、例えば上述の 2に示した微生物が挙げられ、好ましいものとしてはブレヴアンディモナス (Eigxmidi mo ^)属に属するバクテリアが挙げられ、特に好ましいものとしてはブレヴアンディ モナス ·ディミヌータ (Brevundimonas diminuta) NBRC12697株を挙げることが できる。当該微生物は、独立行政法人製品評価技術基盤機構バイオテクノロジー本 部 生物遺伝資源部門(NBRC :干 292-0818 千葉県木更津巿かずさ鎌足 2-5-8)よ り人手することがでさる。
[0038] 本発明のポリペプチドの起源となる微生物を培養するための培地としては、その微 生物が増殖する限り、通常の、炭素源、窒素源、無機塩類、有機栄養素などを含む 液体栄養培地を用いることができる。
[0039] 本発明のポリペプチドの起源となる微生物力もの該ポリペプチドの単離は、公知の 蛋白質精製法を適当に組み合わせて用いることにより実施できる。例えば、以下のよ うに実施できる。まず、当該微生物を適当な培地で培養し、培養液から遠心分離、あ るいは、濾過により菌体を集める。得られた菌体を、超音波破砕機、あるいは、グラス ビーズ等を用いた物理的手法で破碎した後、遠心分離にて菌体残さを除き、無細胞 抽出液を得る。そして、塩析 (硫酸アンモ-ゥム沈殿、リン酸ナトリウム沈殿など)、溶
媒沈殿 (アセトンまたはエタノールなどによる蛋白質分画沈殿法)、透析、ゲル濾過ク 口マトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、逆相クロマトグラフィー、限外濾過等 の手法を単独で、または組み合わせて用いることにより、該無細胞抽出液から本発明 のポリペプチドを単離する。
[0040] 4. DNA
本発明の「DNA」は、上述の本発明のポリペプチドをコードする DNAであり、後述 する方法に従って導入された宿主細胞内で該ポリペプチドを発現し得るものであれ ばいかなるものでもよぐ任意の非翻訳領域を含んでいてもよい。該ポリペプチドが取 得できれば、該ポリペプチドの起源となる微生物より、当業者であれば公知の方法で 本発明の DNAを取得できる。例えば、以下に示した方法で本発明の DNAを取得で きる。
[0041] まず、単離された本発明のポリペプチドを適当なエンドべプチダーゼを用いて消化 し、生じたペプチド断片を逆相 HPLCにより分取する。そして、例えば、 ABI492型プ 口ティンシークェンサ一(Applied Biosystems社製)により、これらのペプチド断片 のアミノ酸配列の一部または全部を決定する。
[0042] このようにして得られたアミノ酸配列情報をもとにして、該ポリペプチドをコードする D NAの一部を増幅するための PCR (Polymerase Chain Reaction)プライマーを合成す る。次に、通常の DNA単離法により、該ポリペプチドの起源となる微生物の染色体 D NA、もしくは、 cDNAを調製する。この DNAを铸型として、先述の PCRプライマーを 用いて PCRを行い、該ポリペプチドをコードする DNAの一部を増幅し、その塩基配 列を決定する。塩基配列の決定は、例えば、 ABI373A型 DNA Sequencer (Ap plied Biosystems社製)等を用いて行うことができる。
[0043] 該ポリペプチドをコードする DNAの一部の塩基配列が明らかになれば、例えば、 i — PCR法(Nucl. Acids Res., 16, 8186 (1988))によりその全体の配列を決定すること ができる。
[0044] このようにして得られる本発明の DNAの実施形態としては、配列表の配列番号 1に 示す塩基配列を含む DNAを挙げることができる。また、配列表の配列番号 1に示す 塩基配列と一定値以上の配列同一性を有し、かつ、 N— Boc— 2—アミノー 3—シク
口へキシル—3 ォキソプロピオン酸エステルを不斉的に還元し、 (2R, 3R) -N-B oc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸エステルを生成す る活性を有するポリペプチドをコードする DNAは、当該 DNAと同等であり、本発明 に含まれる。
[0045] ここで塩基配列の同一性は、例えば、相同性検索プログラム FASTA (W.R. Pearso n & D.J. Lipman P.N.A.S. (1988) 85:2444-2448)を用いて 2つの塩基配列を比較解 祈した場合に、配列全体に対する Identityの値で表される。配列表の配列番号 1に 示す塩基配列からなる DNAと一定値以上の配列同一性を有する DNAとしては、当 該 DNAとの配列同一性が 60%以上、好ましくは 70%以上、より好ましくは 80%以上 、最も好ましくは 85%である DNAを挙げることができる。
[0046] さらに、配列表の配列番号 1に示す塩基配列と相補的な塩基配列からなる DNAと ストリンジェントな条件下でハイブリダィズする DNAであって、かつ、 N— Boc— 2— アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸エステルを不斉的に還元し、( 2 R, 3R)—N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸ェ ステルを生成する活性を有するポリペプチドをコードする DNAも本発明の DNAに包 含される。さらに、配列番号 1に示す塩基配列と相補的な塩基配列からなる DNAとス トリンジヱントな条件下でハイブリダィズする DNAであって、かつ、カルボ二ル基を有 する化合物を還元し、光学活性アルコールを生成する活性を有するポリペプチドをコ ードする DNAも本発明の DNAに包含される。
[0047] 配列表の配列番号 1に示す塩基配列と相補的な塩基配列からなる DNAと、ストリン ジェントな条件下でハイブリダィズする DNAとは、コ口-一'ハイブリダィゼーシヨン法 、プラーク 'ハイブリダィゼーシヨン法、あるいはサザンノヽイブリダィゼーシヨン法等を 実施した際、配列表の配列番号 1に示す塩基配列と相補的な塩基配列からなる DN A力 特異的にハイブリッドを形成する DNAを言う。
[0048] ここで、ストリンジェントな条件とは、例えば、 75mMクェン酸三ナトリウム、 750mM 塩化ナトリウム、 0. 5%ドデシル硫酸ナトリウム、 0. 1%ゥシ血清アルブミン、 0. 1%ポ リビュルピロリドン、および、 0. l%Ficoll 400 (アマシャムバイオサイエンス株式会 社製)の組成からなる水溶液中、 65°Cでハイブリダィズさせた後に、 15mMクェン酸
三ナトリウム、 150mM塩化ナトリウム、および 0. 1%ドデシル硫酸ナトリウムの組成か らなる水溶液を用いて、 60°Cで洗浄が行われる条件を言う。好ましくは、上記条件で ハイブリダィズさせた後に、 15mMクェン酸三ナトリウム、 150mM塩化ナトリウム、お よび 0. 1%ドデシル硫酸ナトリウムの組成力もなる水溶液を用いて、 65°Cで洗浄が 行われる条件であり、より好ましくは、 1. 5mMクェン酸三ナトリウム、 15mM塩ィ匕ナト リウム、および 0. 1%ドデシル硫酸ナトリウムの組成力もなる水溶液を用いて、 65°Cで 洗浄が行われる条件である。本明細書において記述されている、上記 DNAの単離、 および後述するベクターの調製、形質転換等の遺伝子操作は、特に明記しない限り 、 Molecular Cloning 2ηα edition (Cold bpnng Harbor Laboratory Press, 1989)等の成 書に記載されている方法により実施できる。また、本明細書の記述に用いられる%は 、特に断りのない限り、%(wZv)を意味する。
[0049] 5.ベクター
本発明の「ベクター」は、適当な宿主細胞内で前記 DNAがコードする遺伝子を発 現できるものであれば、特に限定されない。このようなベクターとしては、例えば、ブラ スミドベクター、ファージベクター、コスミドベクターなどが挙げられ、さらに、他の宿主 株との間での遺伝子交換が可能なシャトルベクターも使用できる。
[0050] このようなベクターは、通常、 lacUV5プロモーター、 trpプロモーター、 trcプロモー ター、 tacプロモーター、 lppプロモーター、 tufBプロモーター、 recAプロモーター、 p Lプロモーター等の制御因子を含み、本発明の DNAと作動可能に連結された発現 単位を含む発現ベクターとして好適に使用できる。例えば、後述する PUCN18が好 適に使用できる。
[0051] 前記制御因子は、機能的プロモーター及び、任意の関連する転写要素(例えばェ ンハンサー、 CCAATボックス、 TATAボックス、 SPI部位など)を有する塩基配列を いう。
[0052] 上記の「作動可能に連結」 t 、う用語は、遺伝子の発現を調節するプロモーター、 ェンハンサ一等の種々の調節エレメントと遺伝子が、宿主細胞中で作動し得る状態 で連結されることをいう。制御因子のタイプ及び種類力 宿主に応じて変わり得ること は、当業者に周知の事項である。本発明のベクターの例としては、上記 pUCN18に
配列番号 1に示す塩基配列の 603番目の Cが Tに変更された塩基配列からなる DN Aを導入した、後述するプラスミド pNBDを挙げることができる(実施例 6参照)。
[0053] 6.宿主細胞
本明細書内に記載される宿主細胞としては、細菌、酵母、糸状菌、植物細胞、動物 細胞などが挙げられるが、導入及び発現効率から細菌が好ましぐ大腸菌が特に好 ましい。本発明の DNAを含むベクターは、公知の方法により宿主細胞に導入できる 。宿主細胞として大腸菌を用いる場合、例えば、市販の coli HB101コンビテン トセル (タカラバイオ社製)を用いることにより、当該ベクターを宿主細胞に導入できる
[0054] 7.形質転換体
本発明の「形質転換体」は、本発明のポリペプチドをコードする DNAを、前記べク ターに組み込み、これを宿主細胞に導入することにより得られる。なお、本発明の「形 質転換体」は、培養菌体は言うまでもなぐその処理物も含まれる。ここで言う処理物 とは、例えば、界面活性剤や有機溶媒で処理した細胞、乾燥細胞、破砕処理した細 胞、細胞の粗抽出液等のほか、公知の手段でそれらを固定ィ匕したものを意味し、上 述の N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸エステルを 不斉的に還元する活性が残存する限りはこれに含まれる。本発明の形質転換体の培 養は、それが増殖する限り、通常の、炭素源、窒素源、無機塩類、有機栄養素などを 含む液体栄養培地を用いて実施できる。
[0055] 本発明の形質転換体の例としては、後述する coli HB101 (pNBD)が挙げら れる (実施例 8参照)。
[0056] 8.光学活性アルコールの製造方法
本発明の「光学活性アルコール類の製造」は、適当な溶媒中に、基質となるカルボ -ル基を有する化合物と、本発明のポリペプチド又は該ポリペプチドをコードする DN Aを含むベクターを導入された形質転換体を添加することにより実施できる。必要に 応じて、 NADH等の補酵素を添加してもよい。反応には水系溶媒を用いてもよいし、 水系の溶媒と有機系の溶媒とを混合して用いてもよい。有機系溶媒としては、例えば 、トルエン、酢酸ェチル、酢酸 n—ブチル、へキサン、イソプロパノール、ジイソプロピ
ルエーテル、メタノール、アセトン、ジメチルスルホキシド等が挙げられる。反応は例え ば 10°C〜70°Cの温度で行われ、反応液の pHは例えば 4〜10に維持する。反応は 、ノツチ方式あるいは連続方式で実施できる。バッチ方式の場合、反応基質は例え ば 0. 1%から 70% (w/v)の仕込み濃度で添加される。
[0057] 基質となる「カルボ二ル基を有する化合物」としては、例えば、 N— Boc— 2 ァミノ
3—シクロへキシル 3—ォキソプロピオン酸ェチル等が挙げられるが、上述の反 応条件において還元され、「光学活性アルコール」に変換されるものであれば、特に 限定されない。
[0058] 反応で生じた光学活性アルコール類は、常法により精製できる。例えば、反応で生 じた光学活性アルコール類を含む反応液を、酢酸ェチル、トルエン等の有機溶媒で 抽出し、有機溶媒を減圧下で留去した後、蒸留、再結晶、または、クロマトグラフィー 等の処理を行うことにより、精製できる。
[0059] 9.光学活性アルコールの製造方法の変形例
本発明のポリペプチド又は該ポリペプチドをコードする DNAを含むベクターが導入 された形質転換体、カルボ二ル基を有する化合物、および、必要に応じて NADH等 の補酵素を接触させ、反応させることにより、当該カルボ二ル基を有する化合物を不 斉的に還元し、光学活性アルコール類を製造することができる。この時、当該反応の 進行に伴い、 NADH等の補酵素は酸化型に変換される。この酸化型の補酵素を還 元型に変換する能力(以後、補酵素再生能と呼ぶ)を有するポリペプチド、および、 当該ポリペプチドの基質となる化合物を、本発明のポリペプチドと共存させて当該反 応を行うことにより、補酵素の使用量を削減できる。補酵素再生能を有するポリぺプ チドとしては、例えば、ヒドロゲナーゼ、ギ酸脱水素酵素、アルコール脱水素酵素、ァ ルデヒド脱水素酵素、グルコース 6—リン酸脱水素酵素およびグルコース脱水素酵 素などを使用できる。好適には、グルコース脱水素酵素が使用される。
[0060] 本発明のポリペプチドをコードする DNA及び補酵素再生能を有するポリペプチド をコードする DNAの両者が組込まれたベクターの例としては、前記発現ベクター pN BDにバシラス.メガテリゥム由来のグルコース脱水素酵素遺伝子を導入した、後述す る pNBDGが挙げられる(実施例 7参照)。
[0061] 本発明のポリペプチドをコードする DNAおよび還元型補酵素再生能を有するポリ ペプチドをコードする DNAの両者を含む形質転換体は、本発明のポリペプチドをコ ードする DNAおよび、補酵素再生能を有するポリペプチドをコードする DNAの両者 を、同一のベクターに組み込み、これを宿主細胞に導入することにより得られるほ力、 これら 2種の DNAを不和合性グループの異なる 2種のベクターにそれぞれ組み込み 、それら 2種のベクターを同一の宿主細胞に導入することによつても得られる。本発明 のポリペプチドをコードする DNA、および、補酵素再生能を有するポリペプチドをコ ードする DNAの両者を含む形質転換体の例としては、前記 pNBDGで coli H B101を形質転換して得られる、後述する coli HBlOl (pNBDG)が挙げられ る(実施例 8参照)。
[0062] 本発明のポリペプチドをコードする DNAと補酵素再生能を有するポリペプチドをコ ードする DNAの両者を含む形質転換体の培養は、それが増殖する限り、通常の、炭 素源、窒素源、無機塩類、有機栄養素などを含む液体栄養培地を用いて実施できる
[0063] 本発明のポリペプチドと、補酵素再生能を有するポリペプチドを組み合わせて光学 活性アルコール類を製造する場合は、上記反応組成に、補酵素再生能を有するポリ ペプチド (例えば、グルコース脱水素酵素)と、その基質となる化合物(例えば、ダル コース)をさらに添加する。本発明のポリペプチドをコードする DNA、および、補酵素 再生能を有するポリペプチドをコードする DNAの両者を含む形質転換体を使用して も、同様に光学活性アルコール類を製造することができる。その他、本発明のポリべ プチドをコードする DNAを含む形質転換体、および、補酵素再生能を有するポリべ プチドをコードする DNAを含む形質転換体の両者を利用して上記光学活性アルコ 一ル類を製造してもよい。
[0064] とりわけ、本発明のポリペプチドをコードする DNA、および、補酵素再生能を有す るポリペプチドをコードする DNAの両者を含む形質転換体、または、その処理物を 用いる場合は、補酵素再生能を有するポリペプチド (例えば、グルコース脱水素酵素 )を別途添加する必要がなぐ光学活性アルコール類の製造を効率良く行うことがで きる。
[0065] 上述の反応条件において、本発明の実施形態の一つである E coli HBlOKp NBDG)を添加し、 N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン 酸ェチルを基質とした場合、(2R, 3R)—N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸ェチルが得られる(実施例 10参照)。
[0066] 以上のように、本発明に従えば、本発明のポリペプチドの効率的生産が可能であり 、それを利用することにより、例えば(2R, 3R)—N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへ キシル 3—ヒドロキシプロピオン酸ェチルを始めとする、有用な光学活性アルコ一 ル類の優れた製造法が提供される
実施例
[0067] 以下、実施例で本発明を詳細に説明するが、本発明はこれらにより限定されるもの ではない。なお、以下の実施例において用いた組み換え DNA技術に関する詳細な 操作方法などは、次の成書に記載されている:
Molecularし loning 2nd Edition (し old Spring Harbor Laboratory Press, 1989 J、 Current Protocols in Molecular Biology (Greene Publishing Associates and Wiley— Int erscience) 0
[0068] 各実施例で説明する各微生物は、さまざまな寄託機関より当業者が入手可能であ る。寄託機関としては、各微生物を特定する受託番号に対応する機関が挙げられる 。具体的は、 NBRC番号で特定される微生物は、独立行政法人製品評価技術基盤 機構生物遺伝資源部門より入手可能である。
[0069] (合成例 1)
ベンゾフエノンィミン 18.1gにグリシンターシャルブチルエステル塩酸塩 20gと塩化メチ レン 100mlを加えた後、室温で 62時間攪拌した。蒸留水 100mlで分液後、有機層を減 圧濃縮乾燥し、グリシン誘導体 28.8gを得た。この化合物の THF溶液(140ml)を、 -70 °Cの KOtBu 10.9gを含む THF溶液(60ml)に滴下した。その後、この溶液を- 78°Cのシ クロへキサンカルボ-ルクロリド 14.2gを含む THF溶液(50ml)に滴下した後、 1時間 攪拌した。これに 1Mクェン酸 150mlをカ卩え、室温で 15時間攪拌した。減圧濃縮により THFを除き、酢酸ェチルで抽出後、得られた水層にエタノール 100ml、 Na CO 61.7g
2 3
、 Boc O 23.3gを加えた後、室温で 2時間攪拌した。ろ過により白色固体を取り除き、
ろ液を酢酸ェチルで抽出後、有機層を減圧濃縮乾燥し、黄色油状物 26.2gを得た。こ れをシリカゲルカラムで精製し、 N-Boc- 2-ァミノ— 3—シクロへキシル— 3—ォキ ソプロピオン酸ターシャルブチルエステル 7.5gを得た。
[0070] (実施例 1)バクテリア菌体を用いたエリス口又はスレオ一 N— Boc— 2 ァミノ一 3 ーシクロへキシルー 3—ヒドロキシプロピオン酸ターシャルブチルの製造
大型試験管に、肉エキス 10g、ペプトン 10g、酵母エキス 5g、 NaC13g (いずれも 1L 当たり)の組成力もなる液体培地 (pH7) 5mlを調製し、 120°Cで 20分間蒸気殺菌を おこなった。この培地に、予め同培地プレートで培養しておいた、アースロバクタ一' パラフイネウス(Arthrobacter paraffineus) ATCC21218、バシラス'リチェニフォ ルミス(Bacillus licheniformis) NBRC 12195、バシラス ·ズブチリス(Bacillus s ubtilis) ATCC14593,バシラス ·ッリンギェンシス (Bacillus thuringiensis) NBR C3951、ブレヴアンディモナス ·ディミヌータ(Brevundimonas diminuta) NBRCl 2697、コリネノ クテリゥム ·アンモニアゲネス(Corvnebacterium ammoniagenes ) NBRC 12072、ェンテロパクター ·ァエロゲネス(Enterobacter aerogenes) NB RC13534、モルガネラ 'モルガニイ'サブエスピ^ ~ ·モルガニイ(Morganella more anii subsp. morganii) NBRC 3168,ォエノレスコビア,ターノ タ(Oerskovia tur bata) NBRC15015,バエ-バシラス ·アルべィ(Paenibacillus alvei) NBRC334 3、ぺクトパクテリゥム ·カロトボラム ·サブエスピー ·カロトボラム(Pectobacterium ca rotovorum subsp. carotovorum) NBRC3830,ぺクトノくクテリウム,力ロトボラ ム.サブエスピ ~~ '力ロトホフム (Pectobacterium carotovorum subsp. caroto vorum) NBRC12380、ぺクトバタテリゥム 'カロトボラム ·サブエスピ一'カロトボラム( Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum; NBRC 14082,リゾヒ ゥム ·ラジオパクター(Rhizobium radiobacter) NBRC 13264、の各菌体を一白 金耳接種し、 30°Cで 24〜72時間振とう培養を行った。
[0071] 得られた各培養液を遠心分離にかけて菌体を集め、 0. 1Mリン酸緩衝液 (pH6. 5 ) 1mlに懸濁させた。
[0072] 得られた菌体懸濁液 lmlを試験管に入れ、さらにグルコース 5mg、 N— Boc— 2— アミノー 3—シクロへキシル 3—ォキソプロピオン酸ターシャルブチル 0. 5mgをカロ
えて、振とうしながら 30°Cで 24時間反応させた。反応後、酢酸ヱチル lmlを加えて抽 出を行った。 N-Boc- 2-ァミノ 3—シクロへキシル 3—ヒドロキシプロピオン酸 ターシャルブチルの定量、および、そのスレオ Zエリス口比の測定は、キヤピラリーガ スクロマトグラフィー(カラム: GLサイエンス株式会社製 InertCAP5 (IDO. 25mm X 30m)、カラム温度: 200°C、キャリアガス:ヘリウム(70kPa)、検出: FID)を用いて行 つた。その結果を表 1に示した。
[0073] 表 1: N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸ターシャ ルブチルを不斉的に還元するバクテリア
[0074] [表 1]
[0075] (実施例 2)酵母菌体を用いたエリスロー N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシノレ
3 ヒドロキシプロピオン酸ターシャルブチルの製造
大型試験管に、グルコース 40g、酵母エキス 3g、 KH PO 7g、 (NH ) HPO 13g、
NaCllg、 MgSO - 7H OO. 8g、 ZnSO - 7H O60mg、 FeSO - 7H O90mg、 CuS
O ' 5H 05mg、 MnSO ·4〜6Η OlOmg (いずれも 1L当たり)の組成からなる液体 培地 (pH7) 5mlを調製し、 120°Cで 20分間蒸気殺菌をおこなった。この培地に、モ ルトエキス 200g、寒天 20g (l、ずれも 1L当たり)の組成からなる寒天培地(pH7)で 培養しておいた、キャンディダ 'マグノリアェ(Candida magnoliae) NBRCO 705、 デバリオマイセス ·ポリモルファス (Debarvomvces polvmorphus) ATCC20280、 ピキア,ァノマラ(Pichia anorn k) NBRCO 120,ピキア'ミヌータ 'ノ 一'ミヌータ(£ ichia minuta var. minuta) NBRC0975、ピキア ·ミヌータ ·バー ·ノンフアーメン タンス (Pichia minuta var. nonfermentans) NBRC1473、ピキア 'キシローサ
(Pichia xylosa) NBRC0950,ロドトルーラ 'グルティ-ス'バー'ダイレネンシス(β hodotorula glutinis var. dairenensis) NBRC0415、サッカロマイコプシス ·フ イブリゲラ (Saccharomvcopsis fibuligera) NBRC0104、サッノレニスポラ .サイト ーィ(SaturnisOora saitoi) NBRC1134、トリゴノプシス.バリアビリス(Trigonoosi s variabilis) NBRC0671、ウイリオプシス 'サターナス'バ^ ~ ·ムラキイ(Williopsis saturnus var. mmMi) NBRC0895、の各菌体を一白金耳接種し、 30°Cで 24〜 72時間振とう培養を行った。
[0076] 得られた各培養液を遠心分離にかけて菌体を集め、 0. 1Mリン酸緩衝液 (pH6. 5 ) 1mlに懸濁させた。
[0077] 得られた菌体懸濁液 lmlを試験管に入れ、さらにグルコース 5mg、 N— Boc— 2— アミノー 3 シクロへキシルー 3 ォキソプロピオン酸ターシャルブチル 0. 5mgを加 えて、振とうしながら 30°Cで 24時間反応させた。反応後、酢酸ェチル lmlを加えて抽 出を行った。 N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸 ターシャルブチルの定量、および、そのスレオ Zエリス口比の測定は、実施例 1と同様 に行った。その結果を表 2に示した。
[0078] 表 2: N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシノレ 3 ォキソプロピオン酸ターシャ ルブチルを不斉的に還元する酵母
[0079] [表 2]
(実施例 3)力ビ菌体を用!/、たエリス口又はスレ才 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロ へキシルー 3—ヒドロキシプロピオン酸ターシャルブチルの製诰
大型試験管に、グノレコース 10g、ポリペプトン 10g、肉エキス 10g、酵母エキス 5g、 NaCllg、 MgSO · 7Η ΟΟ. 5g (いずれも 1L当たり)の組成力 なる液体培地(ρΗ7
) 5mlを調製し、 120°Cで 20分間蒸気殺菌をおこなった。この培地に、モルトエキス 6 0g、寒天 20g (いずれも 1L当たり)の組成からなる寒天培地(pH6. 2)で培養してお Vヽたシノレシネラ ·アンべラータ (Circinella umbellata) NBRC4452、ェメリセラ ·ァ ングイス(Emericella unguis) NBRC8087,ェゥぺニシリウム 'バーネンセ(Eupen icillium baarnense) NBRC6090、ホノレモコ^ス ·レシナェ (Hormocomis resina e) NBRC6367,コリネスポラ .カシィコラ(Corvnesnora cassiicola) NBRC3004 9、プレクトスファエレラ ·ククメリナ (Plectosphaerella cucumerina) NBRC30005 、の各菌体を一白金耳接種し、 30°Cで 24〜72時間振とう培養を行った。
[0081] 得られた各培養液からろ過により菌体を集め、 0. 1Mリン酸緩衝液 (pH6. 5) lml に懸濁させた。
[0082] 得られた菌体懸濁液 lmlを試験管に入れ、さらにグルコース 5mg、 N— Boc— 2— アミノー 3—シクロへキシル 3—ォキソプロピオン酸ターシャルブチル 0. 5mgをカロ えて、振とうしながら 30°Cで 24時間反応させた。反応後、酢酸ヱチル lmlを加えて抽 出を行った。 N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸 ターシャルブチルの定量、および、そのスレオ Zエリス口比の測定は、実施例 1と同様 に行った。その結果を表 3に示した。
[0083] 表 3 :N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸ターシャ ルブチルを不斉的に還元するカビ
Hormocomis resinae NBRC 6367 30 threo
Corynespora cassiicola NBRC 30049 33 erythro
Emericella unguis NBRC 8087 48 threo
Eupenicif um baarnense NBRC 6090 90 threo
Plec tosphaerella cucumerina NBRC 30005 39 erythro
以下の方法に従って、ブレヴアンディモナス ·ディミヌータ(Brevundimonas dimi miia) NBRC 12697株より、 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシノレ一 3 ォキソ プロピオン酸ェチルを不斉的に還元し、 (2R, 3R)— N— Boc— 2 アミノー 3 シク 口へキシルー 3—ヒドロキシプロピオン酸ェチルを生成する活性を有するポリペプチド
を分離し、単一に精製した。特に断りのない限り、精製操作は 4°Cで行った。
[0086] N—Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸ェチルに対す る還元活性は、以下のように算出した。まず、試験管に適量の粗酵素液と lOOmMリ ン酸緩衝液 (PH6. 5)を加えて、総量で 0. 5mlにする。さらに N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3—ォキソプロピオン酸ェチル 0. 25mg、 NADHlmgを加えて 、振とうしながら 30°Cで 2時間反応させた。反応後、酢酸ェチル lmlを加えて抽出を 行った。生成した N— Boc— 2 ァミノ 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオ ン酸ェチルの定量は、キヤビラリーガスクロマトグラフィー(カラム: GLサイエンス株式 会社製 InertCAP5 (IDO. 25mm X 30m)、カラム温度: 200°C、キャリアガス:へリウ ム(70kPa)、検出: FID)を用いて行った。生成した N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロ へキシル 3—ヒドロキシプロピオン酸ェチルの量力も酵素活性を算出した。なお、 本反応条件において 1分間に: L molの N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル — 3—ヒドロキシプロピオン酸ェチルを生成する活性を、 lunitと定義した。
[0087] (微生物の培養)
5Lジャーフアーメンター(丸菱バイオェンジ社製)に、肉エキス 10g、ペプトン 10g、 酵母エキス 5g、塩ィ匕ナトリウム 3g、アデ力ノール LG— 109 (日本油脂製) 0. lg (いず れも 1L当たり)の組成カゝらなる液体培地 (pH7) 3Lを調製し、 120°Cで 20分間蒸気 殺菌をおこなった。この培地に、予め同培地にて前培養しておいたブレヴアンディモ ナス ·ディミヌータ(Brevundimonas diminuta) NBRC12697株の培着液を 15ml 接種し、攪拌回転数 450rpm、通気量 0. 9NL/min, 30°Cで 16時間培養を行った
[0088] (無細胞抽出液の調製)
上記の培養液から遠心分離により菌体を集め、 0. 8%塩ィ匕ナトリウム水溶液を用い て菌体を洗浄した。この菌体を、 5mMの j8—メルカプトエタノールを含む 10mMリン 酸緩衝液 (PH7. 0)に懸濁し、 SONIFIER250型超音波破砕機(BRANSON社製 )を用いて破砕した後、遠心分離にて菌体残渣を除き、無細胞抽出液を得た。
[0089] (DEAE— TO YOPEARLカラムクロマトグラフィー)
上記の無細胞抽出液を、 5mMの j8—メルカプトエタノールを含む 10mMリン酸緩
衝液(pH7. 0)で予め平衡化した DEAE—TOYOPEARL 650M (東ソ一株式会 社製)カラム (400ml)に供し、活性画分を吸着させた。同一緩衝液でカラムを洗浄し た後、 NaClのリニアグラジェント (0M力も 0. 3Mまで)により活性画分を溶出させた。
[0090] (Phenyl— TOYOPEARLカラムクロマトグラフィー)
DEAE—TOYOPEARLカラムクロマトグラフィーにより得られた活性画分に終濃 度 1.0Mとなるよう硫酸アンモ-ゥム及び終濃度 10%となるようにグリセリンを溶解し、 1.0Mの硫酸アンモ-ゥム及び 5mMの 13—メルカプトエタノール及び 10%のグリセリ ンを含む 10mMリン酸緩衝液 (pH7. 0)で予め平衡化した Phenyl—TOYOPEAR L 650M (東ソ一株式会社製)カラム(50ml)に供し、活性画分を吸着させた。同一 緩衝液でカラムを洗浄した後、硫酸アンモ-ゥムのリニアグラジェント(1.0M力も 0M まで)により活性画分を溶出させた。活性画分を集め、 5mMの /3 メルカプトエタノ ール及び 10%グリセリンを含む 10mMリン酸緩衝液 (pH7. 0)にて 1夜透析を行つ た。
[0091] (5' -AMP Sepharoseカラムクロマトグラフィー)
Phenyl— TOYOPEARLカラムクロマトグラフィーにより得られた活性画分を、 5m Mの β メルカプトエタノール及び 10%グリセリンを含む 10mMリン酸緩衝液(ρΗ7 . 0)で予め平衡化した 5'— AMP Sepharose6 4B (アマシャムバイオサイエンス株 式会社製)カラム(14ml)に供し、活性画分を吸着させた。同一緩衝液でカラムを洗 浄した後、 NaClのリニアグラジェント (0Mから 2Mまで)により活性画分を溶出させ、 電気泳動的に単一なポリペプチドの精製標品を得た。
[0092] (実施例 5) 遣伝子のクローニング
(PCRプライマーの作製)
実施例 4で得られた精製ポリペプチドを 8M尿素存在下で変性した後、ァクロモバク ター由来のリシルエンドべプチダーゼ (和光純薬工業株式会社製)で消化し、得られ たペプチド断片のアミノ酸配列を ABI492型プロテインシーケンサー(Applied Bio systems社製)により決定した。このアミノ酸配列から予想される DNA配列に基づき 、該ポリペプチドをコードする遺伝子の一部を PCRにより増幅するためのプライマー 1 : 5'—TGGGARATHGAYCTNGGNGA—3' (配列表の配列番号 3)、および、プライマ
—2: 5'— GGNGTRTCDATRTANCCYGG— 3' (配列表の配列番号 4)を合成した。
[0093] (PCRによる遺伝子の増幅)
実施例 4と同様に培養したブレヴアンディモナス ·ディミヌータ (Brevundimonas d imimi^) NBRC12697株の菌体から G NOMER DNA KIT (B- BIO gene社製)を用 い、取り扱い説明書に従って染色体 DNAを抽出した。次に、上記で調製した DNA プライマー 1および 2を用い、得られた染色体 DNAを铸型として PCRを行ったところ 、 目的遺伝子の一部と考えられる約 0. 4kbpの DNA断片が増幅された。 PCRは、 D NAポリメラ一ゼとして TaKaRa Ex Taq (タカラノィォ社製)を用いて行い、反応条 件はその取り扱い説明書に従った。この DNA断片を、 ABI PRISM Dye Termi nator Cycle Sequencing Ready Reaction Kit (Perkin Elmer社製)およ び ABI 373A DNA Sequencer (Perkin Elmer社製)を用いてダイレクトシ一 ケンスを行い、その塩基配列を解析した。その結果判明した塩基配列を、配列表の 配列番号 5に示した。
[0094] (i—PCR法による目的遺伝子の全長配列の決定)
上己で調 したブレヴアンアイモナス ·ティミヌータ ( Brevundimona s diminuta) NBRC12697株の染色体 DNAを、制限酵素 BamHIで完全消化し、得られた DNA 断片の混合物を T4リガーゼにより分子内環化させた。これを铸型として用い、 i PC R法(Nucl. Acids Res., 16, 8186 (1988))〖こより、上述の配列番号 5に示す塩基配列 を含む遺伝子の全塩基配列を決定した。その結果を配列表の配列番号 1に示した。 i — PCRは、 DNAポリメラ一ゼとして TaKaRa LA Taq (タカラバイオ社製)を用いて 行い、反応条件はその取り扱い説明書に従った。また、配列番号 1に示した塩基配 列がコードするアミノ酸配列を配列番号 2に示した。
[0095] (実施例 6) 発現ベクターの構築
プライマー 3: 5' AGGACAAGCATATGGATCACGACTTCGCAGGC - 3' (配列 表の配列番号 6)、プライマー 4: 5' - CAGGGTGAATTCTTACTATTGCGCCGTAT ATCCG- 3' (配列表の配列番号 7)、プライマー 5: 5' AGTGCGACGATCCCGTC AAATTCCTCCTGGCTGAC - 3' (配列表の配列番号 8)プライマー 6: 5'— GTCAG CCAGGAGGAATTTGACGGGATCGTCGCACT- 3' (配列表の配列番号 9)を用い
、実施例 5で得たブレヴアンディモナス ·ディミヌータ(Brevundimonas diminuta) NBRC 12697株の染色体 DN Aを铸型として PCRを行つた。プライマー 3と 5の組合 せ、及び、プライマー 4と 6の組合せで、それぞれ約 0. 6kbp、 0. 2kbpの二本鎖 DN Aが得られた。次に、これらの二本鎖 DNAを混合したものを铸型として、プライマー 3 と 4の組合せで PCRを行った。その結果、配列表の配列番号 1に示す塩基配列の 60 3番目の C力 に改変され EcoRIサイトが破壊された塩基配列力もなる遺伝子で、そ の開始コドン部分に Ndel認識部位が付加され、かつ終始コドンの直後に EcoRI認 識部位が付加された二本鎖 DNAを得た。 PCRは、 DNAポリメラーゼとして Pyrobes t DNA Polymerase (タカラバイオ社製)を用いて行い、反応条件はその取り扱い 説明書に従った。この DNAを Ndel及び EcoRIで消化し、プラスミド pUCN 18 (PCR 法により PUC18 (タカラバイオ社製)の 185番目の Tを Aに改変して Ndelサイトを破 壊し、更に 471— 472番目の GCを TGに改変することにより新たに Ndelサイトを導入 したプラスミド)の lacプロモーターの下流の Ndel認識部位と EcoRI認識部位の間に 挿入し、組換えベクター pNBDを構築した。なお、ここで用いた 185番目の T、及び、 471— 472番目の GCの記載は、 GenBank Accession No. L09136の記載に従った。
プライマー 7 : 5' - CAGGAGCTCTAAGGAGGTTAACAATGTATAAAG - 3' (配列 表の配列番号 10)と、プライマー 8: 3'— CACGGATCCTTATCCGCGTCCTGCTTG G— 5' (配列表の配列番号 11)を用い、プラスミド pGDKl (Eur. J. Biochem., 186, 38 9 (1989)に記載の方法で調製可能)を铸型として PCRを行い、バシラス'メガテリゥム( Bacillus megaterium) IAM1030株(IAMカルチャーコレクション(〒 113- 0032 東 京都文京区弥生 1 1 1)力 入手できる)由来のグルコース脱水素酵素(以後、 G DHと呼ぶ)遺伝子の開始コドンから 5塩基上流に大腸菌のリボゾーム結合配列が、 さらにその直前に Sacl認識部位が付加され、かつ、終止コドンの直後に BamHI認識 部位が付カ卩された、二本鎖 DNAを取得した。得られた DNA断片を Saclおよび Bam HIで消化し、実施例 6記載のプラスミド pNBDの lacプロモーターの下流の Sacl認識 部位と BamHI認識部位の間に挿入し、組換えベクター pNBDGを構築した。 pNBD Gの作製法および構造を図 1に示す。
[0097] (実施例 8) 形皙転椽体の作製
実施例 6で構築した組換えベクター pNBDを用いて、 coH HB101コンビテン トセル (タカラバイオ社製)を形質転換し、 coli HB101 (pNBD)を得た。
[0098] また、同様に、実施例 7で構築した組換えベクター pNBDGを用いて、 coli H
B101コンビテントセル(タカラバイオ社製)を形質転換し、 £ coli HBlOKpNB
DG)を得た。
[0099] (実施例 9) 形皙転椽体における遣伝早の 現
実施例 8で得た 2種の形質転換体、および、ベクタープラスミド pUCN 18を含む形 質転換体である coli HB101 (pUCN18) (比較例)のそれぞれを、 200 /z g/ mlのアンピシリンを含む 2 XYT培地(トリプトン 1. 6%、イーストエキス 1. 0%、 NaCl 0. 5%、 pH7. 0) 5mlに接種し、 37°Cで 24時間振盪培養した。遠心分離により菌体 を集め、 5mlの lOOmMリン酸緩衝液 (pH6. 5)に懸濁した。これを、 UH— 50型超 音波ホモゲナイザー(SMT社製)を用いて破砕した後、遠心分離により菌体残渣を 除去し、無細胞抽出液を得た。この無細胞抽出液の N— Boc— 2 アミノー 3 シク 口へキシルー 3—ォキソプロピオン酸ェチル還元活性、および、 GDH活性を測定し、 比活性として表したものを、表 4に示した。
[0100] 表 4 :無細胞抽出液の比活性
[0101] [表 4] strain reductase activity (U/mg) GDH activity (U/mg)
E. coli HB 101 (pUCN 18) N.D. N.D.
E. coli HB 101 (pNBD) 0.003 N.D.
E. coli HB 101 (pNBDG) 0.003 1 1 9
N.D.; not detectable
[0102] 表 4に示すように実施例 8で得られた 2種の形質転換体のいずれにおいても、 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソプロピオン酸ェチル還元活性の発 現が認められた。また、 GDH遺伝子を含む E coH HBlOl (pNBDG)では、 GD H活性の発現も認められた。 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ォキソ プロピオン酸ェチル還元活性は、実施例 4に記載の方法で測定した。 GDH活性は、 1Mトリス塩酸緩衝液(pH8. 0)に、グルコース 0. 1M、補酵素 NAD2mM、および
粗酵素液を添加して 25°Cで 1分間反応を行 、、波長 340nmにおける吸光度の増加 速度より算出した。この反応条件において、 1分間に: molの NADを NADHに還 元する酵素活性を lunitと定義した。
[0103] (実施例 10) 形質転換体を用いた(2R. 3R)— N— Boc— 2 アミノー 3 シクロ へキシルー 3—ヒドロキシプロピオン酸ェチルの製造
実施例 9と同様に培養した coli HBlOl (pNBDG)の培養液 5mlに、ダルコ ース 25mg、 NADlmg、 N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシノレ 3 ォキソプロ ピオン酸ェチル 10mgを添加し、 30°Cで 40時間攪拌した。反応 8、 28時間経過後に NAD lmgを追添カ卩した。 40時間目の変換率は 97%であった。
[0104] 反応終了後、反応液を酢酸ェチルで抽出し、得られた有機層を無水硫酸ナトリウム で乾燥した。遠心によって硫酸ナトリウムを除去し、減圧下有機溶媒を留去して、 (2R , 3R)—N— Boc— 2 ァミノ一 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸ェチ ルを得た。このものの光学純度は、スレオ:エリス口比 = 1. 5 : 98. 5、 99%ee以上で めつに。
[0105] N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸ェチルの定 量およびスレオ Zエリス口比の測定は、キヤビラリーガスクロマトグラフィー(カラム: GL サイエンス株式会社製 lnertCAP5 (IDO. 25mm X 30m)、カラム温度: 200°C、キ ャリアガス:ヘリウム(70kPa)、検出: FID)を用いて行った。また、 N— Boc— 2 アミ ノー 3—シクロへキシル 3—ヒドロキシプロピオン酸ェチルの光学純度の測定は、ト リフルォロ酢酸無水物で処理した後、キヤビラリーガスクロマトグラフィー (カラム:東京 化成工業株式会社製 CHIRALDEX G—TA(ID0. 25mm X 20m)、カラム温度: 120°C、キャリアガス:ヘリウム(70kPa)、検出: FID)を用いて行った。
(実施例 11) 形質転換体を用いた(2R. 3R)—N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへ キシルー 3—ヒドロキシプロピオン酸ェチルの製造
形質転換体としてキャンディダ ·マグノリアェ (Candida magnoliae)力も取得した ポリペプチドをコードする DNAを発現させた形質転換体 £ coH HB101 (pNTC RG) (国際公開第 WO01Z040450号公報記載の方法で調製可能)を用いること、 および NADの代わりに NADPを用いること以外は実施例 10と同様に実施した。そ
の結果、 40時間目の変換率は 55%であり、得られた(2R, 3R)— N— Boc— 2 アミ ノー 3—シクロへキシル 3—ヒドロキシプロピオン酸ェチルの光学純度は、スレオ:ェ リス口比 = 15 : 85、 99%ee以上であった。
(実施例 12) 形質転換体を用いた(2S. 3S)—N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへ キシルー 3—ヒドロキシプロピオン酸ェチルの製造
开質転換体としてピキア'ミヌータ 'バ^ ~ .ミヌータ(Pichia minuta var. minuta )から取得したポリペプチドをコードする DNAを発現させた形質転換体 coli H B101 (pNTOM5Gl) (国際公開第 WO2006— 013801号公報記載の方法で調 製可能)を用いること、および NADの代わりに NADPを用いること以外は実施例 10 と同様に実施した。その結果、 40時間目の変換率は 97%であり、得られた(2S, 3S )— N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシル 3 ヒドロキシプロピオン酸ェチルの 光学純度は、スレオ:エリス口比 =0 : 100、 99%ee以上であった。
( mis) ポリペプチドの
0. 4% (vZv)のジメチルスルホキシドを含む lOOmMリン酸緩衝液(pH6. 5)に、 基質となるカルボ-ルイ匕合物を終濃度 2mM、補酵素 NADHを終濃度 0. 167mM となるようそれぞれ溶解した。これに、実施例 4で調製した精製ポリペプチドを適当量 添加し、 30°Cで 3分間反応を行った。当該反応液の波長 340nmにおける吸光度の 減少速度から、各カルボ-ルイ匕合物に対する還元活性を算出し、これを N— Boc— 2 アミノー 3 シクロへキシルー 3 ォキソプロピオン酸ェチルに対する活性を 100% とした場合の相対値で表し、表 5に示した。表 5から明らかなように本発明の実施形態 としてのポリペプチドは、広範なカルボ-ルイ匕合物に対して還元活性を示した。
表 5:カルボニル化合物に対する還元活性
[表 5]
relative activity sub strate ( % )
Ethyl N - Boc - 2- amino - 3 - cyclohexyト 3 - oxopropionate 100
Ethyl 2-chloroacetoacetate 7264
Ethyl 2-methylacetoacetate 42o
Ethyl 2 - chloro— 3 - oxo - 3 - phenylpropionate 1 139
Ethyl 4-chloroacetoacetate 533470
Methyl acetoacetate 1095
Ethyl 2-oxocyclopentanecarboxylate 199
Methyl pyruvate 5o25
Ethyl 2-oxopentanoate 6046
Ethyl benzoylformate 12198
2-hexanone 1540 chloroacetone 4655
3 - chloro - hydroxyacetone 484 o-chloroacetophenone
m-chloroacetophenone 43b8 p-chloroacetophenone 534
2,3'-dichloroacetophenone 12719
2-chloroacetophenone 12789
2,2,2-trifluoroacetophenone 42277
4-acetylpyrridine 1 149
2-acetylfuran 164 tetrahydrothiophen - 3 - one 156 acetylacetone 273 diacetyl 4830 camphorquinone 4737 n-hexylaldehyde 2160 methylglyoxal 248
2-phenylpropionaldehyde 621 o-chlorobenzaldehyde 1219 m-chlorobenzaldehyde 2138 p-chlorobenzaldehyde 445