TWI744866B - 用於治療pah之抗增生藥劑 - Google Patents

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Abstract

本發明係關於通式I之化合物
Figure 109112960-A0101-11-0001-1
其中A、R1 、R2 、R3 及R4 如本文所定義,及其醫藥學上可接受之鹽;包含此類化合物及鹽之醫藥組合物;使用此類化合物、鹽及組合物以治療肺高血壓及相關疾病,如肺動脈高血壓的方法;使用此類化合物、鹽及組合物以治療異常細胞生長,諸如癌症的方法;及製備此類化合物、鹽及組合物之製程。

Description

用於治療PAH之抗增生藥劑
本文中提供1,6-㖠啶基及吡啶并[2,3-d]嘧啶基化合物,其適用於治療肺高血壓及相關疾病且適用於治療異常細胞生長,諸如癌症;製備此類化合物之方法;及此類化合物之使用方法,其用於治療肺高血壓及相關疾病,如肺動脈性高血壓,且用於治療異常細胞生長,諸如癌症。
肺高血壓(Pulmonary hypertension;PH)先前已分類為原發性(特發性)或繼發性。最近,世界衛生組織(World Health Organization;WHO)將肺高血壓分類為五組:第1組:肺動脈高血壓(pulmonary arterial hypertension;PAH);第2組:伴有左心疾病之PH;第3組:伴有肺部疾病及/或低血氧症之PH;第4組:由慢性血栓性及/或栓塞性疾病所致之PH;及第5組:其他病況(例如,類肉瘤病、X組織細胞增生症、淋巴管瘤病及肺血管壓迫)。
肺動脈高血壓為嚴重的、複雜的、進行性且危及生命的肺血管結構疾病,其特徵在於深層血管收縮及肺動脈壁中之平滑肌細胞的異常增殖。肺中之血管的嚴重變窄導致極高的肺動脈壓力。此等高壓使得心臟難以將血液泵送至肺以待氧合。患有PAH之患者罹患呼吸極促,此係因為心臟對抗此等高壓努力泵送。患有PAH之患者通常顯現出肺血管阻力(pulmonary vascular resistance;PVR)顯著增加及肺動脈壓力(pulmonary artery pressure;PAP)持續升高,其最終導致右心室衰竭及死亡。診斷患有PAH之患者預後不佳且生活質量同樣受損,若未經治療,則平均壽命預期自診斷時算起為2至5年。
目前在美國(US)及歐洲存在10種經批准之治療PAH的療法。所有此等療法屬於3種血管舒張劑類中之一者,包括前列環素類似物(依前列醇(epoprostenol)、曲前列環素(treprostinil)、伊洛前列素(iloprost)及司來帕格(selexipag))、內皮素受體拮抗劑(ERA) (波生坦(bosentan)、安立生坦(ambrisentan)及馬西滕坦(macitentan))及影響氧化氮信號傳導路徑之試劑,包括可溶性鳥苷酸環化酶活化劑利奧西哌(riociguat)及磷酸二酯酶5型抑制劑西地那非(sildenafil)及他達拉非(tadalafil)。此等干預主要針對與病況相關之內皮及血管血液動力學功能障礙,且儘管已證實此等療法延緩疾病的進展,但在此患者群體中發病率及死亡率仍然很高。儘管可利用此等療法,但患有PAH之患者的五年存活率仍然很低,僅57%。McGoon MD, Miller DP. REVEAL: A contemporary US pulmonary arterial hypertension registry.Eur Respir Rev . 2012; 21:8-18。
驅動PAH之血管重塑特徵的病理生理學為多因素的且包括異常血管細胞增殖、細胞凋亡減少、發炎、原位血栓形成及血管收縮。PAH經識別為具有惡性表型之諸多特徵,包括異常增殖、肺血管結構附近叢狀病變的形成、經改變之粒線體代謝及儘管足夠的氧氣供應但仍轉換至厭氧代謝路徑。參與向PAH之進展的兩種關鍵細胞類型為肺動脈平滑肌細胞(Pulmonary Arterial Smooth Muscle Cell;PASMC)及肺動脈外膜纖維母細胞(Pulmonary Artery Adventitial Fibroblast;PAAF)。在WO2018/073687中,藉由評估對人類及大鼠PASMC及人類PAAF之效應,鑑別適用於治療PAH的細胞週期蛋白依賴性激酶(CDK)之抑制劑,如帕博西尼(palbociclib)。然而,仍需要治療PAH。
此外,CDK及相關絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶為重要的細胞酶,其在調節細胞分裂及增殖中發揮必不可少的功能。CDK催化單元由稱為細胞週期蛋白之調節次單元活化。已識別至少十六種哺乳動物細胞週期蛋白(Johnson DG, Walker CL. Cyclins and Cell Cycle Checkpoints. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. (1999) 39:295 312)。細胞週期蛋白/CDK外差蛋白(Heterodyne)之額外功能包括調節轉錄、DNA修復、分化及細胞凋亡(Morgan DO. Cyclin dependent kinases: engines, clocks, and microprocessors. Annu. Rev. Cell. Dev. Biol. (1997) 13:261 291)。
CDK抑制劑已證實適用於治療癌症。CDK之活性增加或暫時異常活化已表明導致人類腫瘤之發展,且人類腫瘤發展通常與CDK蛋白質本身或其調節因子之改變相關(Cordon Cardo C. Mutations of cell cycle regulators: biological and clinical implications for human neoplasia. Am. J. Pathol. (1995) 147:545 560;Karp JE, Broder S. Molecular foundations of cancer: new targets for intervention. Nat. Med. (1995) 1:309 320;Hall M, Peters G. Genetic alterations of cyclins, cyclin dependent kinases, and CDK inhibitors in human cancer. Adv. Cancer Res. (1996) 68:67 108)。
CDK4及CDK6為G1-S檢查點處之細胞週期進展的重要調節因子,其受D型細胞週期蛋白及INK4內源性CDK抑制劑(諸如p16INK4a (CDKN2A))控制。據報導,細胞週期蛋白D-CDK4/6-INK4-視網膜母細胞瘤(Rb)路徑之調節異常與內分泌治療耐藥性的發展相關。
已於黑素瘤及其它腫瘤之亞群中描述CDK4及CDK6之突變(Zuo L等人, Germline mutations in the p16INK4a binding domain of CDK4 in familial melanoma.Nature Genet. (1996) 12, 97-99;Ortega S等人,Cyclin D dependent kinases, INK4 inhibitors and cancer.Biochim. Biophys. Acta (2002) 1602:73 87;Smalley KSM等人,Identification of a novel subgroup of melanomas with KIT/cyclin dependent kinase 4 overexpression.Cancer Res (2008) 68: 5743 52)。CDK及細胞週期蛋白之調節次單元之擴增,及內源性INK4 CDK抑制劑之突變、基因缺失或轉錄沈默亦報導為可活化路徑之機制(Smalley KSM (2008))。
文獻中已綜述CDK抑制劑之發展。舉例而言,參見Sánchez-Martínez等人,Cyclin dependent kinase (CDK) inhibitors as anticancer drugs,Bioorg. Med. Chem. Lett. (2015) 25: 3420-3435 (及其中所引用之參考文獻)。CDK4/6抑制劑與內分泌治療組合使用證實在激素受體(HR)-陽性、人類表皮成長因子2 (HER2)-陰性晚期或轉移性乳癌之治療中的顯著功效,且CDK4/6抑制劑(包括帕博西尼、瑞博西尼(ribociclib)及阿貝西尼(abemaciclib))已批准與內分泌治療組合用於一線或二線環境。
然而,由於可能會發展對CDK4/6抑制劑之獲得性抗性及其他旁路機制,仍需要鑑別具有適當藥理學特徵之新型CDK4 /6抑制劑,例如在效力、選擇性、藥代動力學及作用持續時間方面。
在一個態樣中,本發明提供式I化合物:
Figure 02_image006
或其醫藥學上可接受之鹽,其中: A為CH或N; R1 為C1 -C2 烷基或C1 -C2 氟烷基; R2 為視情況經1、2或3個取代基取代之C1 -C4 烷基,該等取代基各自獨立地選自由以下組成之群:-OH、C1 -C2 烷氧基及F; R3 為4員至8員雜環基、C3 -C8 環烷基、(4員至8員雜環基)-C1 -C4 烷基-或(C3 -C8 環烷基)-C1 -C4 烷基-, 其中4員至8員雜環基及(4員至8員雜環基)-C1 -C4 烷基-中之4員至8員雜環基部分中之每一者視情況經1或2個R5 取代, 其中C3 -C8 環烷基及(C3 -C8 環烷基)-C1 -C4 烷基-中之C3 -C8 環烷基部分中之每一者視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代,及 其中(4員至8員雜環基)-C1 -C4 烷基-及(C3 -C8 環烷基)-C1 -C4 烷基-中之C1 -C4 烷基部分中之每一者視情況經1、2或3個R5 取代; R4 為具有以下結構之部分:
Figure 02_image008
; 各R5 係獨立地選自由以下組成之群:-F、-OH、-CN、C1 -C4 烷基、C1 -C4 氟烷基、C1 -C4 烷氧基、C1 -C4 氟烷氧基、C1 -C4 烷氧基-C1 -C4 烷基-、C1 -C4 氟烷氧基-C1 -C4 烷基-、C1 -C4 烷氧基-C1 -C4 氟烷基及C1 -C4 氟烷氧基-C1 -C4 氟烷基-; 各R6 係獨立地選自由H及C1 -C2 烷基組成之群; 各R7 獨立地為H或C1 -C2 烷基;及 各R8 獨立地為H、F或C1 -C2 烷基。
本發明亦提供一種醫藥組合物,其包括式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽,及醫藥學上可接受之賦形劑或載劑。
本發明亦提供一種用於治療個體體內之疾病或病症之方法,該方法包括向有需要之該個體投與治療有效量的式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中該疾病或病症係選自由以下組成之群:肺高血壓、肺動脈高血壓、伴有左心疾病之肺高血壓、伴有肺部疾病及/或低血氧症之肺高血壓、由慢性血栓性及/或栓塞性疾病所致之肺高血壓,及與肺高血壓相關之疾病,包括類肉瘤病、X組織細胞增生症、淋巴管瘤病及肺血管壓迫。
本發明亦提供一種用於治療個體體內之異常細胞生長(諸如癌症)之方法,該方法包括向有需要之該個體投與治療有效量的式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本發明亦提供式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途,其用於治療疾病或病症,或用於製備用於治療疾病或病症之藥劑,其中該疾病或病症係選自由以下組成之群:肺高血壓、肺動脈高血壓、伴有左心疾病之肺高血壓、伴有肺部疾病及/或低血氧症之肺高血壓、由慢性血栓性及/或栓塞性疾病所致之肺高血壓,及與肺高血壓相關之疾病,包括類肉瘤病、X組織細胞增生症、淋巴管瘤病及肺血管壓迫。
本發明亦提供式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途,其用於治療異常細胞生長(諸如癌症),或用於製備用於治療異常細胞生長(諸如癌症)之藥劑。
本發明亦提供一種用於抑制CDK (例如,CDK4及/或CDK6)之方法,該方法包括使CDK與式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽接觸。
應理解,前文一般描述與以下詳細描述僅為例示性及解釋性的且並不限制所主張之本發明。
藉由參考以下詳細描述及本文中所提供之實例及流程可更易於理解本發明。應理解,本文中所使用之術語僅出於描述特定實施例之目的,且並非意欲為限制性的。
應理解,本發明不限於特定合成製備方法,其當然可有所變化。亦應理解,本文中所使用之術語僅出於描述特定實施例之目的且不意欲為限制性的。在本說明書及隨後的申請專利範圍中,將參考多個術語,其經定義應具有以下含義:
如本說明書中所使用,「一(a/an)」可意謂一或多個(種)。如申請專利範圍中所使用,當與字組「包含」結合使用時,字組「一(a/an)」可意謂一個(種)或多於一個(種)。如本文中所使用,「另一」可意謂至少第二個(種)或更多個(種)。
術語「約」係指表示標稱值加或減10%之近似值的相對術語,其在一個實施例中係指加或減5%,在另一實施例中係指加或減2%。在本發明之領域中,此近似值位準為適當的,除非具體陳述需要該值之較緊密的範圍。
如本文中所使用,術語「烷基」定義為包括任何非環狀飽和脂族烴,該等飽和脂族烴包括直鏈及分支鏈。在一些實施例中,烷基1至4個碳原子、1至3個碳原子、1至2個碳原子或僅一個碳原子。舉例而言,術語「C1-6 烷基」係指具有1至6個碳原子(包括端點)之直鏈或分支鏈脂族烴鏈(例如,甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、第二丁基、第三丁基、正戊基或正己基);術語「C1-4 烷基」係指具有1至4個碳原子(包括端點)之直鏈或分支鏈脂族烴鏈(例如,甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、第二丁基或第三丁基);術語「C1-2 烷基」係指具有1至2個碳原子(包括端點)之脂族烴鏈;且術語「C1 烷基」係指甲基且術語「C2 烷基」係指乙基。當如此指定時,烷基視情況可經一或多個(例如1至5個)適合之取代基取代。
如本文中所使用,術語「烷氧基」或「烷基氧基」係指-O-烷基。舉例而言,術語「C1 -C4 烷氧基」或「C1 -C4 烷基氧基」係指-O-(C1 -C4 烷基);且術語「C1 -C2 烷氧基」或「C1 -C2 烷基氧基」係指-O-(C1 -C2 烷基)。烷氧基之實例包括甲氧基、乙氧基、丙氧基(例如正丙氧基及異丙氧基)、第三丁氧基及類似者。C1 -C2 烷氧基包括甲氧基及乙氧基。當如此指定時,烷氧基或烷基氧基視情況可經1個或多個(例如,1至5個)適合之取代基取代。
如本文中所使用,術語「環烷基」係指飽和或不飽和、非芳族、單環或多環(諸如雙環)烴環[例如單環,諸如環丙基、環丁基、環戊基、環戊烯基、環己基、環己烯基、環己二烯基、環庚基、環庚三烯基,或雙環,包括螺環、稠合或橋連系統(諸如雙環[1.1.1]戊基、雙環[2.2.1]庚基、雙環[3.1.0]己基或雙環[3.2.1]辛基等)]。在一些實施例中,環烷基可視情況在環結構中含有一個、兩個或更多個非芳族雙鍵或三鍵,且/或可視情況經一或多個(例如一至三個)側氧基取代。在一些實施例中,雙環烷基具有3至8個碳原子。舉例而言,術語「C3-8 環烷基」係指具有3至8個成環碳原子之飽和或不飽和、非芳族、單環或多環(諸如雙環)烴環(例如,環丙基、環丁基、環戊基、環戊烯基、環己基、雙環[3.1.0]己基、雙環[1.1.1]戊基或雙環[3.2.1]辛基);且術語「C3-6 環烷基」係指具有3至6個成環碳原子之飽和或不飽和、非芳族、單環或多環(諸如雙環)烴環(例如,環丙基、環丁基、環戊基、環己基、雙環[3.1.0]己基、雙環[1.1.1]戊-1-基或雙環[1.1.1]戊-2-基)。又舉例而言,術語「C3-4 環烷基」係指具有3至4個成環碳原子之飽和或不飽和、非芳族、單環烴環(例如環丙基或環丁基)。在一些實施例中,C3-8 環烷基包括具有3至8個成環碳原子之飽和單環或多環(諸如雙環)烴環及具有3至8個成環碳原子及一個環雙鍵之不飽和單環或多環(諸如雙環)烴環。在一些實施例中,C3-8 環烷基包括具有3至8個成環碳原子之飽和單環或多環(諸如雙環)烴環。當如此指定時,環烷基視情況可經1或多個(例如,1至5個)適合之取代基取代。
術語「雜環基」意謂含有一或多個(例如一、二、三或四個)成環碳原子及一或多個(例如一、二、三或四個)各自獨立地選自由氧、氮及硫組成之群的成環雜原子的飽和或部分不飽和、非芳族環系統。雜環基之環系統可為單環或多環(包括2個或更多個環,例如雙環系統),包括螺環、稠合及/或橋連系統,其中環系統內之個別環中之每一者含有1個或多個成環碳原子及0個、1個或更多個(例如0、1、2或3個)成環雜原子(其中之每一者獨立地選自氧、氮及硫)。在一些實施例中,雜環基包括含有一或多個(例如一、二、三或四個)成環碳原子及一或多個(例如一、二、三或四個)各自獨立地選自由氧、氮及硫組成之群的成環雜原子的飽和環系統。「雜環基」之一些實例包括內酯、內醯胺、環醚及環胺。「雜環基」之某些非限制性實例包括:吡咯啶酮基、2,5-二氫-1H-吡咯基、哌啶酮基、嗎啉酮基、哌嗪酮基、噁唑啶酮基、咪唑啶酮基、1,3-氧氮雜環己-2-酮基、四氫嘧啶-2(1H)-酮基、環氧基(epoxidyl)、四氫呋喃基、四氫哌喃基、二氧雜環己烷基、氮雜環丙烷基、氮雜環丁烷基、氧雜環丁烷基、吡咯啶基、噁唑啶基、噻唑啶基、哌啶基、嗎啉基、哌嗪基、硫代嗎啉基、1,3-氧氮雜環己烷基、1,3-噻嗪烷基、2-氮雜螺[3.3]庚基、2-氮雜雙環[2.1.1]己基、5-氮雜雙環[2.1.1]己基、6-氮雜雙環[3.1.1]庚基、2-氮雜雙環[2.2.1]庚基、3-氮雜雙環[3.1.1]庚基、2-氮雜雙環[3.1.1]庚基、3-氮雜雙環[3.1.0]己基、2-氮雜雙環[3.1.0]己基、3-氮雜雙環[3.2.1]辛基、8-氮雜雙環[3.2.1]辛基、3-氧雜-7-氮雜雙環[3.3.1]壬基、3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬基、2-氧雜-5-氮雜雙環[2.2.1]庚基、6-氧雜-3-氮雜雙環[3.1.1]庚基、2-氮雜螺[3.3]庚基及2-氧雜-6-氮雜螺[3.3]庚基。在一些實施例中,當如此指定時,雜環基中之成環S原子可視情況經一或兩個側氧基取代,且/或當如此指定時,雜環基中之成環碳原子可視情況經一個側氧基取代。當如此指定時,雜環基視情況可經1或多個(例如,1至5個)適合之取代基取代。
如本文中所使用,術語「鹵基」或「鹵素」定義為包括氟(F)、氯(Cl)、溴(Br)或碘(I)。
如本文中所使用,術語「氟烷基」係指具有一或多個鹵素取代基之烷基(至多全氟烷基,亦即,烷基之每個氫原子已經氟原子置換,例如烷基之1至5個氫原子已經氟原子置換)。舉例而言,如本文中所使用,術語「C1- C4 」氟烷基意謂如本文所定義具有一或多個氟(F)取代基之C1 -C4 烷基(至多全氟烷基,亦即,C1 -C4 烷基之每個氫原子已經氟原子置換,例如烷基之1至5個氫原子已經氟原子置換);且術語「C1 -C2 氟烷基」意謂如本文所定義具有一或多個氟(F)取代基之C1 -C2 烷基(至多全氟烷基,亦即,C1 -C2 烷基之每個氫原子已經氟原子置換)。另舉例而言,術語「C1 氟烷基」意謂具有一或多個氟(F)取代基之甲基(至多全氟烷基,亦即甲基之每個氫原子已經氟原子置換)。C1 -C4 氟烷基之實例包括CF3 、CHF2 、CH2 F、CH2 CF3 、CH2 CHF2 、C2 F5 、CH2 C2 F5 、CH2 CH2 CH2 CF3 及類似者;C1 -C2 氟烷基包括CF3 、CHF2 、CH2 F、CH2 CF3 、CH2 CHF2 、CH2 CH2 F、CHFCF3 、CHFCHF2 、CHFCH2 F、CHFCH3 、CF2 CF3 、CF2 CHF2 、CF2 CH2 F及CF2 CH3 ;且C1 氟烷基包括CF3 、CHF2 及CH2 F。
如本文中所使用,術語「氟烷氧基」或「氟烷基氧基」係指-O-氟烷基。舉例而言,術語「C1 -C6 氟烷氧基」或「C1 -C6 氟烷基氧基」係指-O-(C1 -C6 氟烷基);術語「C1 -C4 氟烷氧基」或「C1 -C4 氟烷基氧基」係指-O-(C1 -C4 氟烷基);且術語「C1 -C2 氟烷氧基」或「C1 -C2 氟烷基氧基」係指-O-(C1 -C2 氟烷基)。氟烷氧基之實例包括單氟甲氧基(-OCH2 F)、二氟甲氧基(-OCHF2 )、三氟甲氧基(-OCF3 )、-OCH2 CF3 、-OC2 F5 及類似者。
「經取代」之原子或部分指示指定原子或部分上之任何氫可經選擇指定取代基置換(多至指定原子或部分上之每個氫原子經選擇指定取代基置換),其限制條件為不超過指定原子或部分之正常原子價,且取代產生穩定化合物。舉例而言,若甲基(亦即CH3 )經取代,則碳原子上至多3個氫原子可經取代基置換。另舉例而言,若哌啶-4-基經取代基取代,則成環碳原子或成環氮原子上之任何氫原子可經取代基置換。烷基之取代基的一些實例包括鹵素(例如F)、OH及-O-C1 -C4 烷基(亦即,C1 -C4 烷氧基)。環烷基或雜環基之取代基的一些實例包括鹵素、OH、-NH2 、-NH(C1 -C4 烷基)、N(C1 -C4 烷基)2 、C1 -C4 烷基(其進一步可經0個、1個或多個取代基取代,該等取代基各自獨立地選自鹵素、OH、C1 -C4 烷氧基及C1 -C4 鹵烷氧基)及C1 -C4 烷氧基(其進一步可經0個、1個或多個取代基取代,該等取代基各自獨立地選自鹵素、OH、C1 -C4 烷氧基及C1 -C4 氟烷氧基)。
如本文中所使用,術語「視情況經取代」意謂取代為視情況選用的,且因此包括未經取代及經取代之原子及部分。
如本文中所使用,除非規定,否則取代基之連接點可為取代基之任何適合位置。舉例而言,哌啶基可為哌啶-1-基(經由哌啶基之N原子連接)、哌啶-2-基(經由哌啶基之2-位置處之C原子連接)、哌啶-3-基(經由哌啶基之3-位置處之C原子連接)或哌啶-4-基(經由哌啶基之4-位置處之C原子連接)。另舉例而言,吡啶基(pyridinyl/pyridyl)可為2-吡啶基(或吡啶-2-基)、3-吡啶基(或吡啶-3-基)或4-吡啶基(或吡啶-4-基)。
如本文中所使用,其中n為整數之術語「n員」通常描述環部分中之成環原子之數目,其中成環原子之數目為n。舉例而言,哌啶基為6員雜環基環之實例且四氫哌喃基為5員雜環基之實例。相關地,術語「n員至m員」雜環基(其中整數「n」描述雜環基中之成環原子的較低數目且整數「m」描述成環原子之較高數目)尤其意欲包括n員、(n+1)員、…、及最多m員雜環基中之任一者;例如,術語「4員至8員雜環基」尤其意欲包括任一4員、5員、6員、7員或8員雜環基(包括端點)。
在本說明書中之各個位置處,本發明之化合物的取代基以群組或範圍形式揭示。尤其期望本發明包括此類群組及範圍(包括端點)之成員中的每一者及每一個別子組合。舉例而言,烷基及各種其他含烴部分之碳原子含量可由指定部分中之碳原子數的首碼而指示,即首碼Ci 指示具有整數「i」個碳原子之部分。舉一個實例而言,C3 烷基指示具有3個碳原子之任何烷基,包括丙-1-基及丙-2-基。另舉例而言,烷基及各種其他含烴部分之碳原子含量由指定部分中之較低及較高碳原子數目之首碼而指示,即首碼Ci-j 指示具有整數「i」至整數「j」個碳原子(包括端點)的部分。舉一個實例而言,術語「C1 -C6 烷基」尤其意欲包括C1 烷基(甲基)、C2 烷基(乙基)、C3 烷基(亦即丙-1-基或丙-2-基)、C4 烷基(例如正丁基、異丁基或第三丁基)、C5 烷基(例如戊-1-基或3-甲基丁-1-基)及C6 烷基(例如己-1-基或3-甲基戊-1-基)。另舉例而言,術語「C3 -C6 環烷基」尤其意欲包括任一C3 環烷基(環丙基)、C4 環烷基(例如環丁基)、C5 環烷基(例如環戊基)或C6 環烷基(例如環己基)。
在本說明書中之各個位置處,化學術語(諸如烷基、烷氧基、氟烷氧基(例如C1 -C2 烷基、C1 -C4 烷基、C1 -C4 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基))可與一或多種其他化學術語組合使用,例如「C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基-」、「-C1 -C4 烷基-(4員至8員雜環基)」或「-C1 -C4 烷基-(C3 -C8 環烷基)」。在此等情況下,熟習此項技術者將容易地認識到組合之指示連接點[例如「-C1 -C4 烷基-(C3 -C8 環烷基)」之指示連接點係經由「C1 -C4 烷基」部分]且組合之各部分滿足正常原子價規則[例如「-C1 -C4 烷基-(C3 -C8 環烷基)」之「C1 -C4 烷基」部分為二價,亦即經由指示連接點連接至「C3 -C8 環烷基」部分且連接至鹼性分子部分;且另舉例而言,「C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基-」之「C1 -C2 氟烷基」部分為二價,經由指示連接點連接至「C1 -C2 烷氧基」部分且連接至鹼性分子部分]。
本發明之一實施例為式I化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2 為視情況經1、2或3個F取代且進一步視情況經1個OH或C1 -C2 烷氧基取代之C1 -C4 烷基。在另一實施例中,R2 為視情況經1、2或3個F取代且進一步視情況經1個C1 -C2 烷氧基取代之C1 -C4 烷基。在又另一實施例中,R2 為視情況經1、2或3個F取代且進一步視情況經1個C1 -C2 烷氧基取代之C1 -C2 烷基。
本發明之一實施例為式I化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R2 為視情況經1、2或3個F取代之C1 -C2 烷基。在另一實施例中,R2 為C1 -C2 烷基。在又另一實施例中,R2 為甲基。
本發明之一實施例為式I化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 為4員至8員雜環基或C3 -C8 環烷基,其中4員至8員雜環基視情況經1或2個R5 取代,且其中C3 -C8 環烷基視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代。在另一實施例中,R3 為5員至7員雜環基或C3 -C6 環烷基,其中5員至7員雜環基視情況經1或2個R5 取代,且其中C3 -C6 環烷基視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代。
本發明之一實施例為式I化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 為視情況經1或2個R5 取代之4員至8員雜環基。
本發明之一實施例為式I化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 為視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代之C3 -C8 環烷基。在另一實施例中,R3 為C3 -C8 環烷基。在又另一實施例中,R3 為環丙基、環丁基、環戊基、環己基或雙環[3.1.0]己基。
本發明之一實施例為式I化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中: A為CH或N; R1 為CH3 或C1 氟烷基; R2 為CH3 ; R3 為5員至7員雜環基、C3 -C6 環烷基、(5員至7員雜環基)-C1 -C4 烷基-或(C3 -C6 環烷基)-C1 -C4 烷基-, 其中5員至7員雜環基及(5員至7員雜環基)-C1 -C4 烷基-中之5員至7員雜環基部分中之每一者視情況經1個R5 取代, 其中C3 -C6 環烷基及(C3 -C6 環烷基)-C1 -C4 烷基-中之C3 -C6 環烷基部分中之每一者視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代,及 其中(5員至7員雜環基)-C1 -C4 烷基-及(C3 -C6 環烷基)-C1 -C4 烷基-中之C1 -C4 烷基部分中之每一者視情況經1、2或3個R5 取代; R4 為具有以下結構之部分:
Figure 02_image010
; 各R5 係獨立地選自由以下組成之群:-F、-OH、-CN、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-; 各R6 係獨立地選自由H及C1 -C2 烷基組成之群;及 各R7 獨立地為H或CH3 ,其限制條件為不超過兩個R7 為CH3
本發明之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽的一實施例為式II化合物:
Figure 02_image012
或其醫藥學上可接受之鹽(其中A及R3 如本文中所描述的實施例中之任一者中所定義)。在另一實施例中,式II之四氫哌喃環上的兩個取代基彼此為反式(亦即四氫哌喃環上之兩個取代基在四氫哌喃環的相對側上)。
式I或II之化合物或其醫藥學上可接受之鹽的一實施例為式III化合物:
Figure 02_image014
或其醫藥學上可接受之鹽(其中A及R3 如本文中所描述的實施例中之任一者中所定義)。
本發明之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽的一實施例為式II化合物:
Figure 02_image016
或其醫藥學上可接受之鹽,其中: A為CH或N; R3 為視情況經1個R5 取代之5員至7員雜環基;及 R5 係選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。
在式II化合物之另一實施例中,R3 為視情況經1個R5 取代之5員至7員雜環基(且R5 如本文中所描述之實施例中之任一者所定義),且式II之四氫哌喃環上的兩個取代基彼此為反式(亦即四氫哌喃環上之兩個取代基在四氫哌喃環之相對側上)。
本發明之式I或II之化合物或其醫藥學上可接受之鹽的一實施例為式III化合物:
Figure 02_image018
, 或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 為視情況經1個R5 取代之5員至7員雜環基(且R5 如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。
本發明之另一實施例包括式I、II及III中之任一者的化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 之4員至8員雜環基或5員至7員雜環基包含一個選自氮或氧的成環雜原子,且其中雜環基視情況經1個R5 取代,且其中R5 係選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。
本發明之另一實施例包括式I、II及III中之任一者的化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 之4員至8員雜環基或5員至7員雜環基係選自由以下組成之群:2-氮雜螺[3.3]庚基、四氫呋喃基、吡咯啶基及哌啶基,其中雜環基選項中之每一者視情況經1個R5 取代,且其中R5 係選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。熟習此項技術者將理解,R3 之4員至8員雜環基或5員至7員雜環基可經由雜環基之成環碳原子或成環氮原子連接至鹼性分子部分。此外,熟習此項技術者將理解,R5 取代基可連接至雜環基之成環碳原子或成環氮原子。
本發明之另一實施例包括式I、II或III中之任一者的化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 之4員至8員雜環基或5員至7員雜環基係選自由以下組成之群:2-氮雜螺[3.3]庚-6-基、吡咯啶-3-基、哌啶-4-基及四氫呋喃-3-基,各者視情況經1個R5 取代,且R5 係選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。在又另一實施例中,R3 之4員至8員雜環基或5員至7員雜環基係選自由以下組成之群:2-氮雜螺[3.3]庚-6-基、吡咯啶-3-基、1-甲基吡咯啶-3-基、2-(2-甲氧基乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基、2-(2,2-二氟乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基及哌啶-4-基。
本發明之另一實施例包括式I、II或III中之任一者的化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 為視情況經1個R5 取代之2-氮雜螺[3.3]庚-6-基,該R5 係選自由以下組成之群:C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-。
本發明之一實施例為式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為N,且R3 為視情況經1個R5 取代之4員至8員雜環基(且R5 如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。在另一實施例中,化合物或其醫藥學上可接受之鹽為式II或III之化合物,其中R3 為視情況經1個R5 取代之5員至7員雜環基。
本發明之一實施例為式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為CH,且R3 為視情況經1個R5 取代之4員至8員雜環基(且R5 如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。在另一實施例中,化合物或其醫藥學上可接受之鹽為式II或III之化合物,其中R3 為視情況經1個R5 取代之5員至7員雜環基(且R5 如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。
本發明之一實施例為式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 為視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代之C3 -C6 環烷基,其中R5 及R6 中之每一者如本文中所描述之實施例中之任一者所定義。在另一實施例中,R3 係選自由以下組成之群:環丙基、環丁基、環戊基、環戊烯基、環己烷基及雙環[3.1.0]己基,其中環烷基選項中之每一者視情況經1或2個R5 取代,且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代;各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-;且各R6 係獨立地選自由H及C1 -C2 烷基組成之群。
本發明之一實施例為式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 為各自視情況經1或2個R5 取代之環丁基或環戊基;且各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。
本發明之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽的一實施例為式II化合物:
Figure 02_image020
或其醫藥學上可接受之鹽,其中: A為CH或N; R3 為C3 -C6 環烷基,其視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代; 各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-;及 各R6 係獨立地選自由H及C1 -C2 烷基組成之群。
在式II化合物之另一實施例中,其中R3 為視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代之C3 -C6 環烷基(其中R5 及R6 中之每一者如本文中所描述之實施例中之任一者所定義),且式II之四氫哌喃環上的兩個取代基彼此為反式(亦即四氫哌喃環上之兩個取代基在四氫哌喃環之相對側上)。
本發明之式I或II之化合物或其醫藥學上可接受之鹽的一實施例為式III化合物:
Figure 02_image022
, 或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 為視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代之C3 -C6 環烷基(其中R5 及R6 中之每一者如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。
本發明之一實施例包括式I、II或III中之任一者的化合物,其中R3 之C3 -C8 環烷基或C3 -C6 環烷基係選自由以下組成之群:環丙基、環丁基、環戊基、環戊烯基、環己烷基及雙環[3.1.0]己基,其中環烷基選項中之每一者視情況經1或2個R5 取代,且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代;各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-;且各R6 係獨立地選自由H及C1 -C2 烷基組成之群。
本發明之一實施例包括式I、II及III中之任一者的化合物,其中R3 之C3 -C8 環烷基或C3 -C6 環烷基係選自由以下組成之群:環丙基、環丁基、環戊基、環己基及雙環[3.1.0]己基,其中環烷基選項中之每一者視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代;各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-;且各R6 係獨立地選自由H及C1 -C2 烷基組成之群。在另一實施例中,R3 之C3 -C8 環烷基或C3 -C6 環烷基係選自由以下組成之群:環丙基、環丁基、環戊基、環己基及雙環[3.1.0]己-2-基,其中環烷基選項中之每一者視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代。在又另一實施例中,各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。在又另一實施例中,各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基及C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-。在又再另一實施例中,各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、CH3 及CH2 CH3 ;且各R6 係獨立地選自由H及CH3 組成之群。
本發明之一實施例包括式I、II或III中之任一者的化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 為視情況經1或2個R5 取代之雙環[3.1.0]己-2-基;且各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。
本發明之一實施例包括式I、II或III中之任一者的化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 之C3 -C8 環烷基或C3 -C6 環烷基為視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代之環己基(亦稱為環己烷基) (其中R5 及R6 中之每一者如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。在另一實施例中,R3 為經1個-N(R6 )2 取代之環己基(其中R6 中之每一者如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。在又另一實施例中,各R6 係獨立地選自由H及CH3 組成之群。
本發明之一實施例包括式I、II或III中之任一者的化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 之C3 -C8 環烷基或C3 -C6 環烷基為視情況經1或2個R5 取代之環丁基(其中R5 中之每一者如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。在另一實施例中,各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。
本發明之一實施例包括式I、II或III中之任一者的化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3 之C3 -C8 環烷基或C3 -C6 環烷基為視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代之環戊基(其中R5 及R6 中之每一者如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。在另一實施例中,R3 為視情況經1或2個R5 取代之環戊基(其中R5 中之每一者如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。在又另一實施例中,R3 為視情況經1或2個R5 取代之環戊基;且各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。在又另一實施例中,R3 為環戊基。
本發明之一實施例包括式I、II或III中之任一者的化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為CH (且其他變量,諸如R1 、R2 、R3 、R4 (存在時)如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。
本發明之一實施例包括式I、II或III中之任一者的化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為N (且其他變量,諸如R1 、R2 、R3 、R4 (存在時)如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。
本發明之一實施例為式I、II或III之化合物,其中R3 為(5員至7員雜環基)-C1 -C4 烷基-或(C3 -C6 環烷基)-C1 -C4 烷基-,其中(5員至7員雜環基)-C1 -C4 烷基-中之5員至7員雜環基部分中的每一者視情況經1或2個R5 取代,且其中(C3 -C6 環烷基)-C1 -C4 烷基-中之C3 -C6 環烷基部分視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代(其中R5 及R6 中之每一者如本文中所描述之實施例中之任一者所定義)。5員至7員雜環基部分之一些實例包括2-氮雜螺[3.3]庚基、四氫呋喃基、吡咯啶基或哌啶基,其中之每一者視情況經1個R5 取代,且R5 係選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。C3 -C6 環烷基部分之一些實例包括環丙基、環丁基、環戊基、環己烷基或雙環[3.1.0]己基,其中之每一者視情況經1或2個R5 取代且進一步視情況經1個-N(R6 )2 取代;其中各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、CH3 及CH2 CH3 ;且各R6 係獨立地選自H及CH3
本發明之一實施例包括式II或III之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為N;R3 為環丁基、環戊基或雙環[3.1.0]己基,各者視情況經1或2個R5 取代;且各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、CH3 或CH2 CH3 。在另一實施例中,R3 為環丁基、環戊基或雙環[3.1.0]己-2-基,各者視情況經1或2個R5 取代;且各R5 係獨立地選自由F及CH3 組成之群。在又另一實施例中,化合物或其醫藥學上可接受之鹽為式III化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本發明之一實施例包括式II或III之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為CH;R3 為環丁基、環戊基或雙環[3.1.0]己基,各者視情況經1或2個R5 取代;且各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、CH3 或CH2 CH3 。在另一實施例中,R3 為環丁基、環戊基或雙環[3.1.0]己-2-基,各者視情況經1或2個R5 取代;且各R5 係獨立地選自由F及CH3 組成之群。在又另一實施例中,化合物或其醫藥學上可接受之鹽為式III化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本發明之一實施例包括式II或III之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為N;R3 為視情況經1或2個R5 取代之環戊基;且各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、CH3 或CH2 CH3 。在另一實施例中,R3 為視情況經1或2個R5 取代之環戊基;且各R5 係獨立地選自由F及CH3 組成之群。在又另一實施例中,化合物或其醫藥學上可接受之鹽為式III化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本發明之一實施例包括式II或III之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為CH;R3 為視情況經1或2個R5 取代之環戊基;且各R5 係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、CH3 或CH2 CH3 。在另一實施例中,R3 為視情況經1或2個R5 取代之環戊基;且各R5 係獨立地選自由F及CH3 組成之群。在又另一實施例中,化合物或其醫藥學上可接受之鹽為式III化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本發明之一實施例包括式II或III之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為N;R3 為吡咯啶基、哌啶基或2-氮雜螺[3.3]庚基,各者視情況經1個R5 取代,且其中R5 係選自由以下組成之群:C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。在另一實施例中,R3 為吡咯啶-3-基、哌啶-4-基或2-氮雜螺[3.3]庚-6-基,各者視情況經1個R5 取代,且其中R5 係選自由以下組成之群:C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-。在又另一實施例中,R3 為視情況經1個R5 取代之2-氮雜螺[3.3]庚-6-基,該R5 係選自由以下組成之群:C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-。在又另一實施例中,化合物或其醫藥學上可接受之鹽為式III化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
本發明之一實施例包括式II或III之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為CH;R3 為吡咯啶基、哌啶基或2-氮雜螺[3.3]庚基,各者視情況經1個R5 取代,且其中R5 係選自由以下組成之群:C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基、C1 -C2 氟烷氧基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 氟烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 氟烷基-。在另一實施例中,R3 為吡咯啶-3-基、哌啶-4-基或2-氮雜螺[3.3]庚-6-基,各者視情況經1個R5 取代,且其中R5 係選自由以下組成之群:C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-。在又另一實施例中,R3 為視情況經1個R5 取代之2-氮雜螺[3.3]庚-6-基,該R5 係選自由以下組成之群:C1 -C2 烷基、C1 -C2 氟烷基、C1 -C2 烷氧基-C1 -C2 烷基-及C1 -C2 氟烷氧基-C1 -C2 烷基-。在又另一實施例中,化合物或其醫藥學上可接受之鹽為式III化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
在一個實施例中,本發明提供選自下文實例部分中之實例1至34的化合物或其醫藥學上可接受之鹽(或其親本/鹼性化合物,其中例示性化合物例如為鹽)。
一個實施例包括選自以下之化合物: 6-乙醯基-8-環丁基-2-{[3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-環戊基-2-{[3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-(2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-2-{[3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-2-{[3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 3-乙醯基-1-環戊基-7-{[3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H )-酮; 6-乙醯基-8-[雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-[2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮;及 6-乙醯基-8-[2-(2,2-二氟乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基]-2-{[3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮, 或其醫藥學上可接受之鹽。
一個實施例包括選自以下之化合物: 6-乙醯基-8-環丁基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-(2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2S )-2- 甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H )-酮; 6-乙醯基-8-[(1S ,2R ,5R )-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-[(1R ,2S ,5S )-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-[(1R ,2S )-2- 氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-[(1S ,2R )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮;及 6-乙醯基-8-[2-(2,2-二氟乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮, 或其醫藥學上可接受之鹽。
一個實施例包括選自以下之化合物: 6-乙醯基-8-環丁基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-(2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2S )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H )-酮; 6-乙醯基-8-[(1S ,2R ,5R )-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮,或6-乙醯基-8-[(1R ,2S ,5S )-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮,或其混合物; 6-乙醯基-8-[(1R ,2S )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮,或6-乙醯基-8-[(1S ,2R )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮,或其混合物;及 6-乙醯基-8-[2-(2,2-二氟乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮, 或其醫藥學上可接受之鹽。
一個實施例包括選自以下之化合物: 6-乙醯基-8-環丁基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2S )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-[(1S ,2S )-2-羥基-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮,或6-乙醯基-8-[(1R ,2R )-2-羥基-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮,或其混合物; 6-乙醯基-8-[(1R ,2S )-2-乙基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 6-乙醯基-8-[(1S ,2R ,5R )-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮,或6-乙醯基-8-[(1R ,2S ,5S )-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮,或其混合物; 6-乙醯基-8-[(1R ,2S )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮,或6-乙醯基-8-[(1S ,2R )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮,或其混合物; 6-乙醯基-8-(3,3-二甲基環丁基)-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; 3-乙醯基-1-(3-羥基環戊基)-7-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H )-酮,包括經溶解的非對映異構體或作為混合物; 6-乙醯基-8-(順式-4-羥基環己基)-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮;及 6-乙醯基-8-(反式-3-羥基環丁基)-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮, 或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中,本發明提供3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H)-酮之結晶形式(例如,如實例5中之結晶形式)。在一些其他實施例中,3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H)-酮之結晶形式為無水的。在一些其他實施例中,無水(無水物)3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H)-酮之結晶形式指定為「形式I」,其相對於例如本文中所描述的(諸如實質上如圖1中所描繪的)粉末X射線繞射(PXRD),根據其獨特的固態標記進行表徵。在本文中之表X1中提供以角度2θ及相對強度(其中相對強度≥ 3.0%) (如圖1所描繪)表示的繞射峰列表。如粉末繞射之技術中所熟知,峰(反射)之相對強度可視樣品製備技術、樣品封固程序及所採用之特定儀器而變化。此外,儀器變化及其他因素可影響2θ值。因此,XRPD峰賦值可變化正或負約0.2°。
在一些實施例中,形式I展現包含至少兩個特徵峰之粉末X射線繞射圖案,該等特徵峰以2θ表示,選自8.0±0.2°;18.6±0.2°;19.1±0.2°;及21.3±0.2º。在一些實施例中,形式I展現包含至少三個特徵峰之粉末X射線繞射圖案,該等特徵峰以2θ表示,選自8.0±0.2°;18.6±0.2°;19.1±0.2°;及21.3±0.2º。在一些實施例中,形式I展現包含所有四個特徵峰之粉末X射線繞射圖案,該等特徵峰以2θ表示,選自8.0±0.2°;18.6±0.2°;19.1±0.2°;及21.3±0.2º。
在一些實施例中,形式I展現包含特徵峰之粉末X射線繞射圖,該等特徵峰以2θ表示,在8.0±0.2°及18.6±0.2°處。
在一些實施例中,形式I展現包含特徵峰之粉末X射線繞射圖,該等特徵峰以2θ表示,在8.0±0.2°及19.1±0.2°處。
在一些實施例中,形式I展現包含特徵峰之粉末X射線繞射圖,該等特徵峰以2θ表示,在18.6±0.2°及19.1±0.2°處。
在一些實施例中,形式I展現包含所有三個特徵峰之粉末X射線繞射圖案,該等特徵峰以2θ表示,選自8.0±0.2°;18.6±0.2°;及19.1±0.2°。
在一些實施例中,形式I展現包含以2θ表示之至少兩個特徵峰的粉末X射線繞射圖案,如表X1中所列舉之彼等特徵峰。
在一些實施例中,形式I展現包含以2θ表示之至少三個特徵峰的粉末X射線繞射圖案,如表X1中所列舉之彼等特徵峰。
在一些實施例中,形式I展現包含以2θ表示之至少四個(例如4、5、6、7、8、9或10個)特徵峰的粉末X射線繞射圖案,如表X1中所列舉之彼等特徵峰。
在一些實施例中,形式I展現粉末X射線繞射圖案,其包含以2θ表示之至少兩個特徵峰,該等特徵峰選自8.0±0.2°;18.6±0.2°;19.1±0.2°;及21.3±0.2º;及以2θ表示之至少一個額外特徵峰,如表X1中所列舉的彼等特徵峰(例如在23.3處之峰)。
在一些實施例中,形式I展現實質上如圖1中所展示之粉末X射線繞射圖案。
本發明包括本文中所描述之任何實施例的任何子集。
本發明包括上文所描述之兩個或更多個實施例或其任何子集的組合。
在另一實施例中,本發明提供一種醫藥組合物,其包含本文中所描述的本發明之化合物及至少一種醫藥學上可接受之賦形劑或載劑。
本發明進一步提供本文中所描述之本發明之化合物的用途,其用於治療本文中所描述之疾病或病症(亦即,治療方法)。
本發明之化合物為CDK抑制劑(例如CDK4及/或CDK6抑制劑)。因此,本發明進一步提供一種用於抑制CDK (亦即活體外或活體內之CDK活性)之方法,其包含使CDK與本文中所描述的本發明之化合物接觸(包括培育)。
如本文中所使用,本文中所描述之本發明的醫藥組合物(包括調配物)、用途、方法及/或套組中的本發明化合物包括式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽(包括式II或III之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,且包括本文中所描述的兩個或更多個實施例或其任何子組合之所有實施例及組合,例如選自實例1至34的化合物中之任一者,或其醫藥學上可接受之鹽)。
如本文中所使用,術語「接觸」係指將所指示部分一起引入活體外系統或活體內系統中。舉例而言,使CDK與本發明之化合物「接觸」包括向患有CDK之個體或患者(諸如人類)投與本發明之化合物,以及例如將本發明之化合物引入至含有包含CDK之細胞或純化製劑的樣品中。
本發明進一步提供一種用於治療患者體內之疾病或病症之方法,該方法包括向有需要之患者投與治療有效量的本發明之化合物或醫藥學上可接受之鹽,其中疾病或病症係選自由以下組成之群:肺高血壓、肺動脈高血壓、伴有左心疾病之肺高血壓、伴有肺部疾病及/或低血氧症之肺高血壓、由慢性血栓性及/或栓塞性疾病所致之肺高血壓,及與肺高血壓相關之疾病,包括類肉瘤病、X組織細胞增生症、淋巴管瘤病及肺血管壓迫。
本發明進一步提供一種用於治療患者體內之肺高血壓之方法,該方法包括向有需要之患者投與有效量的本發明之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,所投與之化合物呈醫藥學上可接受之鹽的形式。在其他實施例中,所投與之化合物不呈醫藥學上可接受之鹽的形式(例如,投與鹼性/親本化合物)。
當論述肺高血壓之治療時,此等相關疾病中之任一者或多者包括於治療內,此係因為其屬於肺高血壓之WHO分類:第1組:肺動脈高血壓(PAH);第2組:伴有左心疾病之PH;第3組:伴有肺部疾病及/或低血氧症之PH;第4組:由慢性血栓性及/或栓塞性疾病所致之PH;及第5組:其他病況(例如,類肉瘤病、X組織細胞增生症、淋巴管瘤病及肺血管壓迫)。
本發明之另一實施例包括一種用於治療患者體內之肺動脈高血壓之方法,該方法包括向有需要之患者投與有效量的本發明之化合物或醫藥學上可接受之鹽。
在一實施例中,本發明進一步提供一種用於治療個體體內之異常細胞生長之方法,該方法包括向有需要之個體投與治療有效量的本發明之化合物或醫藥學上可接受之鹽。在另一實施例中,異常細胞生長為癌症。本發明之化合物或鹽可作為單一試劑投與,或可與一或多種其他抗癌治療劑(尤其適合於特定癌症之護理劑標準品)組合投與。在又另一實施例中,癌症係選自乳癌、卵巢癌、膀胱癌、子宮癌、前列腺癌、肺癌[包括非小細胞肺癌(NSCLC)、小細胞肺癌(SCLC)、鱗狀細胞癌或腺癌]、食道癌、頭頸癌、結腸直腸癌、腎癌(包括腎細胞癌或RCC)、肝癌(包括肝細胞癌或HCC)、胰臟癌、胃(亦即胃(gastric))癌及甲狀腺癌。在本文中所提供之方法的其他實施例中,癌症為乳癌、卵巢癌、膀胱癌、子宮癌、前列腺癌、肺癌、食道癌、肝癌、胰臟癌或胃癌。
在一實施例中,本發明進一步提供一種用於治療個體體內之癌症之方法,該方法包括向有需要之個體投與治療有效量的本發明之化合物或醫藥學上可接受之鹽。在另一實施例中,癌症為乳癌,包括例如ER陽性/HR陽性、HER2陰性乳癌;ER陽性/HR陽性、HER2陽性乳癌;三陰性乳癌(triple negative breast cancer;TNBC);或發炎性乳癌。在另一實施例中,乳癌為耐內分泌性乳癌、耐曲妥珠單抗乳癌或顯示對CDK4/CDK6抑制有先天或後天抗性之乳癌。在又另一實施例中,乳癌為晚期或轉移性乳癌。
在另一態樣中,本發明提供一種用於治療有需要個體之異常細胞生長(尤其癌症)之方法,該方法包括向個體投與一定量的本發明之化合物以及一定量的額外抗癌治療劑,該等量在治療該異常細胞生長中同時有效。
本發明進一步提供本發明之化合物之用途,其用於治療本文中所描述的疾病或病症(例如描述於本文治療方法中的彼等疾病或病症)。
本發明進一步提供本發明之化合物之用途,其用於製造用於治療本文中所描述之疾病或病症(例如描述於本文治療方法中之彼等疾病或病症)的藥劑。
本發明亦包括以下實施例: 本發明之化合物,包括於本文所描述之實施例中之任一者中,用作藥劑; 本發明之化合物,包括本文中所描述之實施例中之任一者,用於藥劑之製造中; 本發明之化合物之用途,包括本文中所描述之實施例中之任一者,用於治療異常細胞生長,諸如癌症; 本發明之化合物之用途,包括本文中所描述之實施例中之任一者,用於製造用於治療異常細胞生長(諸如癌症)之藥劑; 本發明之化合物之用途,包括本文中所描述之實施例中之任一者,用於製造用於治療肺動脈高血壓之藥劑; 本發明之化合物之用途,包括本文中所描述之實施例中之任一者,用於製造用於治療肺高血壓(PH)或在PH之WHO分類內的疾病中之任一者之藥劑; 本發明之化合物,包括本文中所描述之實施例中之任一者,用於治療異常細胞生長(諸如癌症); 本發明之化合物,包括本文中所描述之實施例中之任一者,用於治療肺動脈高血壓;及 本發明之化合物,包括本文中所描述之實施例中之任一者,用於治療肺高血壓(PH)或在PH之WHO分類內的疾病中之任一者。
每一實例或其醫藥學上可接受之鹽可單獨地主張或與任何數目個本文所描述之各實施例任意組合分組在一起。
本發明亦係關於包含本發明之化合物之醫藥組合物,包括本文中所描述的實施例中之任一者,其用於治療本文中所描述之疾病或病症,例如選自以下中之一者:肺高血壓、肺動脈高血壓、伴有左心疾病之肺高血壓、伴有肺部疾病及/或低血氧症之肺高血壓、由慢性血栓性及/或栓塞性疾病所致之肺高血壓,及與肺高血壓相關的疾病,包括類肉瘤病、X組織細胞增生症、淋巴管瘤病及肺血管壓迫。
在本發明之另一實施例中,向診斷患有肺高血壓或PAH或處於罹患該等疾病之風險下的個體投與本發明之化合物,該等疾病包括但不限於:特發性PAH、遺傳性或家族性PAH及繼發性肺高血壓(例如由肺栓塞、肺氣腫、肺纖維化及先天性心臟病引起之高血壓)。在一個實施例中,個體診斷患有特發性PAH或遺傳性PAH。在一些實施例中,處於罹患PAH之風險下之個體具有編碼骨形態生成蛋白2型受體之基因的突變。
本發明亦包括一種用於治療或預防肺動脈高血壓之套組。在一個實施例中,套組包含本發明之化合物及投藥裝置。投藥裝置可設計用於經肺遞送,諸如吸入器、噴霧器、吹入器、滴管及霧化器。在其他實施例中,投藥裝置可設計用於靜脈內或動脈內遞送,諸如導管。本發明之化合物或醫藥學上可接受之鹽可視情況經調配以儲存於投藥裝置中。套組可進一步包含向個體(例如人類)投與本發明之化合物或醫藥學上可接受之鹽以治療或預防本文中所論述之PAH或其他疾病的說明書。在一個實施例中,說明書詳細闡述且限定投藥模式,例如藉由在28天循環期間規定本發明化合物或醫藥學上可接受之鹽的投藥天數。
本發明包括一種治療本文中所揭示之病症(例如PAH或癌症)的方法,其中該方法包括以單一療法或以組合療法形式使用本發明之化合物,其中需要治療的個體或患者經投與本發明之化合物或鹽以及批准用於治療本文中所揭示之疾病或病症(例如PAH或癌症)的一或多種藥物(亦稱為活性劑)。舉例而言,額外活性劑可包括但不限於:前列腺素(例如,依前列醇、曲前列環素、伊洛前列素、司來帕格)、內皮素受體拮抗劑(例如,波生坦、安立生坦、馬西滕坦)、鳥苷酸環化酶抑制劑(例如,利奧西哌)、血管舒張劑(例如,前列環素及西地那非)、鈣離子通道阻斷劑(例如,氨氯地平(amlodipine)、地爾硫卓(diltiazem)及硝苯地平(nifedipine));抗凝劑(例如,華法林(warfarin))及利尿劑。對藥物(例如西地那非)之參考包括西地那非及所有醫藥學上可接受之鹽,例如西地那非檸檬酸鹽。另舉例而言,額外活性劑可包括抗癌劑,諸如適合於待治療之癌症的護理劑標準品中之一者。
在另一態樣中,本發明之化合物用於製造用於治療或預防PAH之藥劑。但在另一態樣中,本發明之化合物用於製造用於治療或預防如本文所討論之相關疾病的藥劑。在各種實施例中,藥劑經調配用於經口投與,包括立即釋放及持續(經改良)釋放醫藥調配物。在其他實施例中,藥劑經調配用以吸入投與。在所有此等實施例中,本發明提供藥劑之單位劑型。
本發明亦提供包括本發明之化合物及另一治療劑之組合。此類組合可用於本文中所描述之本發明之用途及方法中。
本發明亦包括經同位素標記之化合物,其與本發明之化合物(例如式I、II或III之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽)一致,但事實上一或多個原子經具有相同原子數但原子質量或質量數不同於自然界中通常存在之原子質量或質量數的原子置換。可併入本發明之化合物中之同位素的實例包括氫、碳、氮、氧、磷、硫、氟及氯之同位素,分別諸如2 H、3 H、13 C、11 C、14 C、15 N、18 O、17 O、31 P、32 P、35 S、18 F及36 Cl。含有前述同位素及/或其他原子之其他同位素的本發明之化合物及該等化合物之醫藥學上可接受之鹽在本發明之範疇內。某些經同位素標記之本發明之化合物(例如其中併入有諸如3 H及14 C之放射性同位素的彼等化合物)適用於藥物及/或基質組織分佈分析。氚化(亦即3 H)及碳-14 (亦即14 C)同位素因其容易製備及可偵測性而尤其較佳。此外,用諸如氘(亦即2 H)之較重同位素取代可得到由更大代謝穩定性產生之某些治療優勢,例如增加活體內半衰期或降低劑量需求,且因此在某些情況下可為較佳。經同位素標記之式I、II或III之化合物或其醫藥學上可接受之鹽通常可藉由實施流程及/或下文實例及製備中所揭示的程序,藉由用易獲得之經同位素標記之試劑取代未經同位素標記之試劑來製備。
本發明之化合物可展現互變異構及結構異構之現象。舉例而言,本發明之化合物可以數種互變異構形式存在。所有此類互變異構形式包括在本發明之化合物的範疇內。互變異構體可以溶液中之互變異構集合之混合物形式存在。在固體形式中,通常以一種互變異構體佔主導。儘管可描述一種互變異構體,但本發明包括本發明之化合物之所有互變異構體。
本發明亦係關於本發明之化合物之前藥。因此,可具有少量藥理學活性或本身無藥理學活性之本發明之化合物的某些衍生物向患者投與時可例如藉由水解裂解轉化為本發明化合物。此類衍生物稱為「前藥」。關於前藥用途之其他資訊可見於「Pro-drugs as Novel Delivery Systems」, 第14卷, ACS Symposium Series (T Higuchi及W Stella)及「Bioreversible Carriers in Drug Design」, Pergamon Press, 1987 (E B Roche編, American Pharmaceutical Association)中,其揭示內容以全文引用之方式併入本文中。
根據本發明之前藥可例如藉由用熟習此項技術者已知之某些部分作為「前部分」置換本發明化合物中存在之適當官能基而產生,如例如H Bundgaard之「Design of Prodrugs」(Elsevier, 1985)中所描述,其揭示內容以全文引用的方式併入本文中。
根據本發明之前藥的一些非限制性實例包括: (i)在化合物含有醇官能基(-OH)、其醚的情況下,例如用(C1 -C6 )烷醯氧基甲基或用磷酸酯醚基置換氫;及 (ii)在化合物含有一級或二級胺基官能基(-NH2 或-NHR,其中R ≠ H)、其醯胺的情況下,例如用適當代謝不穩定的基團,諸如醯胺、胺基甲酸酯、脲、膦酸酯、磺酸酯等置換一個或兩個氫。
如本文中所使用,術語「個體」或「患者」係指哺乳動物(諸如人類)、靈長類動物、母牛、綿羊或伴侶動物(包括貓或狗)。
除非另外指示,否則如本文中所使用,術語「治療」意謂逆轉、減輕、抑制該術語所應用之病症或病狀或該病症或病狀之一或多種症狀的發展,或預防該病症或病狀或該病症或病狀之一或多種症狀。除非另外指示,否則如本文中所使用,術語「治療(treatment)」係指如本文中所定義之「治療(treating)」的治療行為。術語「治療」亦包括對個體之輔助治療及新輔助治療。
出於本發明之目的,癌症治療中之有益或所需臨床結果包括但不限於以下中之一或多者:減少(或毀壞)贅生性或癌細胞之增殖;抑制癌轉移或贅生性細胞;使腫瘤大小縮小或減小;緩解癌症;減少由癌症引起的症狀;提高罹患癌症之彼等患者的生活品質;減少治療癌症所需之其他藥物的劑量;延緩癌症之進展;治癒癌症;克服一或多種癌症抗性機制;及/或延長癌症患者的存活期。對癌症的積極治療效果可以多種方式量測(參見例如W. A. Weber, Assessing tumor response to therapy, J. Nucl. Med. 50 Suppl. 1:1S-10S (2009))。舉例而言,相對於腫瘤生長抑制(T/C),根據國家癌症研究所(National Cancer Institute;NCI)標準,T/C小於或等於42%為抗腫瘤活性之最低水準。T/C <10%視為高抗腫瘤活性水準,其中T/C (%) =經治療組之腫瘤體積中值/對照組之腫瘤體積中值× 100。
片語「治療有效量」意謂(i)治療或預防特定疾病,(ii)減輕、改善或消除特定疾病之一或多種症狀,或(iii)預防或延緩本文中所描述之特定疾病之一或多種症狀發作的本發明之化合物的量。
片語「醫藥學上可接受」指示物質或組合物必須與包含調配物之其他成分及對於正用其治療之哺乳動物在化學上及毒理學上相容。
適合之酸加成鹽由形成無毒鹽之酸形成。實例包括乙酸鹽、己二酸鹽、天冬胺酸鹽、苯甲酸鹽、苯磺酸鹽、碳酸氫鹽/碳酸鹽、硫酸氫鹽/硫酸鹽、硼酸鹽、樟腦磺酸鹽、檸檬酸鹽、環己胺基磺酸鹽、乙二磺酸鹽、乙磺酸鹽、甲酸鹽、反丁烯二酸鹽、葡庚糖酸鹽、葡糖酸鹽、葡萄糖醛酸鹽、六氟磷酸鹽、海苯酸鹽、鹽酸鹽/氯化物、氫溴酸鹽/溴化物、氫碘酸鹽/碘化物、羥乙磺酸鹽、乳酸鹽、蘋果酸鹽、順丁烯二酸鹽、丙二酸鹽、甲磺酸鹽、甲基硫酸鹽、萘二甲酸鹽、2-萘磺酸鹽、菸酸鹽、硝酸鹽、乳清酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、雙羥萘酸鹽、磷酸鹽/磷酸氫鹽/磷酸二氫鹽、焦麩胺酸鹽、葡糖二酸鹽、硬脂酸鹽、丁二酸鹽、丹寧酸鹽、酒石酸鹽、甲苯磺酸鹽、三氟乙酸鹽、1,5-萘二磺酸及羥萘甲酸鹽。
適合之鹼鹽由形成無毒鹽之鹼形成。實例包括鋁鹽、精胺酸、苄星(benzathine)、鈣鹽、膽鹼、二乙胺、雙(2-羥乙基)胺(二醇胺)、甘胺酸、離胺酸、鎂鹽、葡甲胺、2-胺基乙醇(乙醇胺)、鉀鹽、鈉鹽、2-胺基-2-(羥甲基)丙烷-1,3-二醇(tris或緩血酸胺)及鋅鹽。
亦可形成酸與鹼之半鹽,例如半硫酸鹽及半鈣鹽。關於適合之鹽之綜述,參見Stahl及Wermuth之Handbook of Pharmaceutical Salts: Properties, Selection, and Use (Wiley-VCH, 2002)。
除非另外指示,否則如本文中所使用,「異常細胞生長」係指不依賴於正常調節機制的細胞生長(例如接觸抑制之喪失)。異常細胞生長可為良性(非癌性)或惡性(癌性)的。
異常細胞生長包括以下之異常生長:(1)展示CDK4及/或CDK6表現增加之腫瘤細胞(腫瘤);(2)由異常CDK4及或CDK6活化而增殖的腫瘤;及(3)對內分泌治療、HER2拮抗劑或CDK4/6抑制具有抗性的腫瘤。
如本文中所使用,術語「額外抗癌治療劑」意謂除本發明之化合物以外的任何一或多種治療劑,其為或可用於癌症治療中。在一些實施例中,此類額外抗癌治療劑包括源自以下類別之化合物:有絲分裂抑制劑、烷基化劑、抗代謝物、抗腫瘤抗生素、抗血管生成劑、拓樸異構酶I及II抑制劑、植物鹼、激素劑及拮抗劑、生長因子抑制劑、輻射、信號轉導抑制劑(諸如蛋白質酪胺酸激酶及/或絲胺酸/蘇胺酸激酶之抑制劑)、細胞週期抑制劑、生物反應改質劑、酶抑制劑、反義寡核苷酸或寡核苷酸衍生物、細胞毒劑、腫瘤免疫劑及類似者。
在一些實施例中,額外抗癌劑為內分泌藥劑,諸如芳香酶抑制劑、SERD或SERM。
在其他實施例中,本發明之化合物可與護理劑標準物組合投與,該護理劑標準物諸如他莫昔芬(tamoxifen)、多西他賽(docetaxel)、太平洋紫杉醇(paclitaxel)、順鉑(cisplatin)、卡培他濱(capecitabine)、吉西他濱(gemcitabine)、長春瑞賓(vinorelbine)、依西美坦(exemestane)、來曲唑(letrozole)、氟維司群(fulvestrant)、阿那曲唑(anastrozole)或曲妥珠單抗(trastuzumab)。
在一些實施例中,額外抗癌劑為抗血管生成劑,包括(例如) VEGF抑制劑、VEGFR抑制劑、TIE-2抑制劑、PDGFR抑制劑、血管生成素抑制劑、PKCβ抑制劑、COX-2 (環加氧酶II)抑制劑、整合素(α-v/β-3)、MMP-2 (基質-金屬蛋白酶2)抑制劑及MMP-9 (基質-金屬蛋白酶9)抑制劑。較佳抗血管生成劑包括舒尼替尼(sunitinib) (Sutent™)、貝伐珠單抗(bevacizumab) (Avastin™)、阿西替尼(axitinib) (AG 13736)、SU 14813 (Pfizer)及AG 13958 (Pfizer)。額外抗血管生成劑包括凡塔藍尼(vatalanib) (CGP 79787)、索拉非尼(Sorafenib) (Nexavar™)、派加替尼八鈉(pegaptanib octasodium) (Macugen™)、凡德他尼(vandetanib) (Zactima™)、PF-0337210 (Pfizer)、SU 14843 (Pfizer)、AZD 2171 (AstraZeneca)、蘭比珠單抗(ranibizumab) (Lucentis™)、Neovastat™ (AE 941)、四硫莫里德塔(tetrathiomolybdata) (Coprexa™)、AMG 706 (Amgen)、VEGF Trap (AVE 0005)、CEP 7055 (Sanofi-Aventis)、XL 880 (Exelixis)、特拉替尼(telatinib) (BAY 57-9352)及CP-868,596 (Pfizer)。其他抗血管生成劑包括恩紮妥林(enzastaurin) (LY 317615)、米哚妥林(midostaurin) (CGP 41251)、哌立福新(perifosine) (KRX 0401)、替普瑞酮(teprenone) (Selbex™)及UCN 01 (Kyowa Hakko)。抗血管生成劑之其他實例包括塞內昔布(celecoxib) (Celebrex™)、帕瑞昔布(parecoxib) (Dynastat™)、德拉昔布(deracoxib) (SC 59046)、魯米昔布(lumiracoxib) (Preige™)、伐地昔布(valdecoxib) (Bextra™)、羅非昔布(rofecoxib) (Vioxx™)、艾拉莫德(iguratimod) (Careram™)、IP 751 (Invedus)、SC-58125 (Pharmacia)及依託昔布(etoricoxib) (Arcoxia™)。又其他抗血管生成劑包括依昔舒林(exisulind) (Aptosyn™)、雙水楊酯(salsalate) (Amigesic™)、二氟尼柳(diflunisal) (Dolobid™)、布洛芬(ibuprofen) (Motrin™)、酮洛芬(ketoprofen) (Orudis™)、萘丁美酮(nabumetone) (Relafen™)、吡羅昔康(piroxicam) (Feldene™)、萘普生(naproxen) (Aleve™、Naprosyn™)、雙氯芬酸(diclofenac) (Voltaren™)、吲哚美辛(indomethacin) (Indocin™)、舒林酸(sulindac) (Clinoril™)、托美丁(tolmetin) (Tolectin™)、依託度酸(etodolac) (Lodine™)、酮咯酸(ketorolac) (Toradol™)及奧沙普嗪(oxaprozin) (Daypro™)。又其他抗血管生成劑包括ABT 510 (Abbott)、阿雷司他(apratastat) (TMI 005)、AZD 8955 (AstraZeneca)、英環奈德(incyclinide) (Metastat™)及PCK 3145 (Procyon)。又其他抗血管生成劑包括阿曲汀(acitretin) (Neotigason™)、普利肽新(plitidepsin) (aplidine™)、希倫泰德(cilengtide) (EMD 121974)、康柏斯達汀A4 (combretastatin A4) (CA4P)、芬維A胺(fenretinide) (4 HPR)、鹵夫酮(halofuginone) (Tempostatin™)、Panzem™ (2-甲氧雌二醇)、PF-03446962 (Pfizer)、瑞馬司他(rebimastat) (BMS 275291)、卡妥索單抗(catumaxomab) (Removab™)、來那度胺(lenalidomide) (Revlimid™)、角鯊胺(squalamine) (EVIZON™)、沙立度胺(thalidomide) (Thalomid™)、Ukrain™ (NSC 631570)、Vitaxin™ (MEDI 522)及唑來膦酸(zoledronic acid) (Zometa™)。
在其他實施例中,額外抗癌劑為所謂的信號轉導抑制劑(例如抑制調節分子藉以控制細胞生長、分化及細胞內存活率傳達之基本過程的方式)。信號轉導抑制劑包括小分子、抗體及反義分子。信號轉導抑制劑包括例如激酶抑制劑(例如酪胺酸激酶抑制劑或絲胺酸/蘇胺酸激酶抑制劑)及細胞週期抑制劑。更特定而言,信號轉導抑制劑包括例如法呢基蛋白質轉移酶抑制劑、EGF抑制劑、ErbB-1 (EGFR)、ErbB-2、泛erb、IGF1R抑制劑、MEK、c-Kit抑制劑、FLT-3抑制劑、K-Ras抑制劑、PI3激酶抑制劑、JAK抑制劑、STAT抑制劑、Raf激酶抑制劑、Akt抑制劑、mTOR抑制劑、P70S6激酶抑制劑、WNT路徑之抑制劑及所謂的多-靶向激酶抑制劑。可與本發明化合物及本文中所描述之醫藥組合物結合使用之信號轉導抑制劑的額外實例包括BMS 214662 (Bristol-Myers Squibb)、氯那法尼(lonafarnib) (Sarasar™)、呲利曲索(pelitrexol) (AG 2037)、馬妥珠單抗(matuzumab) (EMD 7200)、尼妥珠單抗(nimotuzumab) (TheraCIM h-R3™)、帕尼單抗(panitumumab) (Vectibix™)、凡德他尼(Zactima™)、帕佐泮尼(pazopanib) (SB 786034)、ALT 110 (Alteris Therapeutics)、BIBW 2992 (Boehringer Ingelheim)及Cervene™ (TP 38)。信號轉導抑制劑之其他實例包括吉非替尼(gefitinib) (Iressa™)、西妥昔單抗(cetuximab) (Erbitux™)、埃羅替尼(erlotinib) (Tarceva™)、曲妥珠單抗(Herceptin™)、舒尼替尼(sunitinib) (Sutent™)、伊馬替尼(imatinib) (Gleevec™)、克唑替尼(crizotinib) (Pfizer)、達可替尼(dacomitinib) (Pfizer)、波舒替尼(bosutinib) (Pfizer)、卡奈替尼(canertinib) (CI 1033)、帕妥珠單抗(pertuzumab) (Omnitarg™)、拉帕替尼(lapatinib) (Tycerb™)、培利替尼(pelitinib) (EKB 569)、米替福新(miltefosine) (Miltefosin™)、BMS 599626 (Bristol-Myers Squibb)、Lapuleucel-T (Neuvenge™)、NeuVax™ (E75癌症疫苗)、Osidem™ (IDM 1)、莫立替尼(mubritinib) (TAK-165)、CP-724,714 (Pfizer)、帕尼單抗(Vectibix™)、ARRY 142886 (Array Biopharm)、依維莫司(everolimus) (Certican™)、唑羅莫司(zotarolimus) (Endeavor™)、坦羅莫司(temsirolimus) (Torisel™)、AP 23573 (ARIAD)及VX 680(Vertex)、XL 647 (Exelixis)、索拉非尼(sorafenib) (Nexavar™)、LE-AON (Georgetown University)及GI-4000 (Globelmmune)。其他信號轉導抑制劑包括ABT 751 (Abbott)、奧爾沃昔布(alvocidib) (夫拉平度(flavopiridol))、BMS 387032 (Bristol Myers)、EM 1421 (Erimos)、依地蘇蘭(indisulam) (E 7070)、塞利昔布(seliciclib) (CYC 200)、BIO 112 (One Bio)、BMS 387032 (Bristol-Myers Squibb)、帕博西尼(palbocyclib) (Pfizer)及AG 024322 (Pfizer)。
在其他實施例中,額外抗癌劑為所謂的典型抗贅生性劑。典型的抗贅生性劑包括但不限於:激素調節劑(諸如激素、抗激素、雄激素促效劑、雄激素拮抗劑及抗雌激素治療劑)、組蛋白去乙醯基酶(HDAC)抑制劑、DNA甲基轉移酶抑制劑、沈默劑或基因活化劑、核糖核酸酶、蛋白質體(proteosomics)、拓樸異構酶I抑制劑、喜樹鹼衍生物、拓樸異構酶II抑制劑、烷基化劑、抗代謝物、聚(ADP-核糖)聚合酶-1 (PARP-1)抑制劑(諸如(例如)拉唑帕尼(talazoparib)、奧拉帕尼(olapariv)、蘆卡帕尼(rucaparib)、尼拉帕尼(niraparib)、依尼帕尼(iniparib)、維利帕尼(veliparib))、微管蛋白抑制劑、抗生素、植物衍生之紡錘體抑制劑、鉑配位化合物、基因治療劑、反義寡核苷酸、血管靶向劑(VTA)及士他汀(statins)。與本發明之化合物(視情況一或多種其他藥劑)一起用於組合治療中之典型抗贅生性劑的實例包括但不限於:糖皮質激素,諸如地塞米松(dexamethasone)、潑尼松(prednisone)、潑尼松龍(prednisolone)、甲基潑尼松龍、氫化可體松(hydrocortisone);及孕激素,諸如甲羥孕酮、乙酸甲地孕酮(Megace)、米非司酮(mifepristone) (RU-486);選擇性雌激素受體調節劑(SERM;諸如他莫昔芬(tamoxifen)、雷洛昔芬(raloxifene)、拉索昔芬(lasofoxifene)、阿非昔芬(afimoxifene)、阿佐昔芬(arzoxifene)、巴多昔芬(bazedoxifene)、非培米芬(fispemifene)、奧美昔芬(ormeloxifene)、奧培米芬(ospemifene)、替米利芬(tesmilifene)、托瑞米芬(toremifene)、曲洛司坦(trilostane)及CHF 4227(Cheisi));選擇性雌激素受體下調劑(SERD's;諸如氟維司群(fulvestrant))、依西美坦(exemestane) (Aromasin)、阿那曲唑(anastrozole) (Arimidex)、阿他美坦(atamestane)、法屈唑(fadrozole)、來曲唑(letrozole) (Femara)、福美司坦(formestane);促性腺素釋放激素(GnRH;亦通常稱為促黃體素釋放激素[LHRH])促效劑,諸如布舍瑞林(buserelin) (Suprefact)、戈舍瑞林(goserelin) (Zoladex)、亮丙瑞林(leuprorelin) (Lupron)及曲普瑞林(triptorelin) (Trelstar)、阿巴瑞克(abarelix) (Plenaxis)、環丙孕酮、氟他胺(flutamide) (Eulexin)、甲地孕酮(megestrol)、尼魯胺(nilutamide) (Nilandron)及奧沙特隆(osaterone)、度他雄胺(dutasteride)、依立雄胺(epristeride)、非那雄胺(finasteride)、棕櫚樹果實(Serenoa repens)、PHL 00801、阿巴瑞克(abarelix)、戈舍瑞林(goserelin)、亮丙瑞林(leuprorelin)、曲普瑞林(triptorelin)、比卡魯胺(bicalutamide);抗雄激素劑,諸如恩雜魯胺(enzalutamide)、乙酸阿比特龍(abiraterone acetate)、比卡魯胺(Casodex);及其組合。與本發明之化合物組合使用之典型抗贅生性劑的其他實例包括但不限於:PARP抑制劑,諸如拉唑帕尼(talazoparib)、奧拉帕尼、蘆卡帕尼、尼拉帕尼、依尼帕尼、維利帕尼;環庚醇苯胺氧肟酸(SAHA, Merck Inc./Aton Pharmaceuticals)、縮酚酞(FR901228或FK228)、G2M-777、MS-275、丁酸特戊醯氧基甲酯及PXD-101;豹蛙酶(Onconase/ranpirnase)、PS-341 (MLN-341)、Velcade (硼替佐米(bortezomib))、9-胺基喜樹鹼、貝洛替康(belotecan)、BN-80915 (Roche)、喜樹鹼、二氟替康(diflomotecan)、艾特咔林(edotecarin)、依昔替康(exatecan) (Daiichi)、吉馬替康(gimatecan)、10-羥基喜樹鹼、伊立替康HCl (irinotecan HCl) (Camptosar)、勒托替康(lurtotecan)、Orathecin (盧比替康(rubitecan),Supergen)、SN-38、拓朴替康(topotecan)、喜樹鹼、10-羥基喜樹鹼、9-胺基喜樹鹼、伊立替康、SN-38、艾特咔林、拓朴替康、阿柔比星(aclarubicin)、阿德力黴素(adriamycin)、氫萘非特(amonafide)、胺柔比星(amrubicin)、安納黴素(annamycin)、柔紅黴素(daunorubicin)、多柔比星(doxorubicin)、依沙蘆星(elsamitrucin)、表柔比星(epirubicin)、依託泊苷(etoposide)、伊達比星(idarubicin)、加柔比星(galarubicin)、羥基脲、奈莫柔比星(nemorubicin)、米托蒽醌(novantrone/mitoxantrone)、吡柔比星(pirarubicin)、匹克生瓊(pixantrone)、丙卡巴肼(procarbazine)、蝴蝶黴素(rebeccamycin)、索布佐生(sobuzoxane)、他氟泊苷(tafluposide)、戊柔比星(valrubicin)、Zinecard (右雷佐生(dexrazoxane))、氮芥N-氧化物、環磷醯胺(cyclophosphamide)、AMD-473、六甲蜜胺(altretamine)、AP-5280、阿帕茲醌(apaziquone)、布洛利辛(brostallicin)、苯達莫司汀(bendamustine)、白消安(busulfan)、卡波醌(carboquone)、卡莫司汀(carmustine)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、達卡巴嗪(dacarbazine)、雌莫司汀(estramustine)、福莫司汀(fotemustine)、葡磷醯胺(glufosfamide)、異環磷醯胺(ifosfamide)、KW-2170、洛莫司汀(lomustine)、馬磷醯胺(mafosfamide)、氮芥(mechlorethamine)、美法侖(melphalan)、二溴甘露醇(mitobronitol)、二溴衛矛醇(mitolactol)、絲裂黴素C、米托蒽醌(mitoxatrone)、尼莫司汀(nimustine)、雷莫司汀(ranimustine)、替莫唑胺(temozolomide)、噻替派(thiotepa);及鉑配位之烷基化化合物,諸如順鉑(cisplatin)、Paraplatin (卡鉑(carboplatin))、依鉑(eptaplatin)、洛鉑(lobaplatin)、奈達鉑(nedaplatin)、Eloxatin (奧沙利鉑(oxaliplatin),Sanofi)、鏈脲黴素(streptozocin)、薩特鉑(satrplatin)及其組合。
在另其他實施例中,額外抗癌劑為所謂的二氫葉酸還原酶抑制劑(諸如甲胺喋呤(methotrexate)及NeuTrexin (葡萄糖醛酸三甲曲(trimetresate glucuronate)))、嘌呤拮抗劑(諸如6-巰基嘌呤核糖苷、巰基嘌呤、6-硫代鳥嘌呤、克拉屈濱(cladribine)、氯法拉濱(clofarabine) (Clolar)、氟達拉賓(fludarabine)、奈拉濱(nelarabine)及雷替曲塞(raltitrexed))、嘧啶拮抗劑(諸如5-氟尿嘧啶(5-FU)、Alimta (培美曲塞二鈉(premetrexed disodium)、LY231514、MTA)、卡培他濱(Xeloda™)、胞嘧啶阿拉伯糖苷(cytosine arabinoside)、Gemzar™ (吉西他濱,Eli Lilly)、喃氟啶(Tegafur) (UFT Orzel或Uforal且包括喃氟啶、吉美嘧啶(gimestat)及奧托嘧啶(otostat)之TS-1組合)、去氧氟尿苷(doxifluridine)、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(包括十八烷基磷酸鹽(ocfosfate)、磷酸鹽、硬脂酸鹽、持續釋放及脂質體形式)、依諾他濱(enocitabine)、5-阿紮胞苷(Vidaza)、地西他濱(decitabine)及乙炔基胞苷(ethynylcytidine))及其他抗代謝物,諸如依氟鳥胺酸(eflornithine)、羥基脲、甲醯四氫葉酸(leucovorin)、諾拉曲特(nolatrexed) (Thymitaq)、三安平(triapine)、三甲曲沙(trimetrexate)、N-(5-[N-(3,4-二氫-2-甲基-4-氧代喹唑啉-6-基甲基)-N-甲胺基]-2-噻吩甲醯基)-L-麩胺酸、AG-014699 (Pfizer Inc.)、ABT-472 (Abbott Laboratories)、INO-1001 (Inotek Pharmaceuticals)、KU-0687 (KuDOS Pharmaceuticals)及GPI 18180 (Guilford Pharm Inc)及其組合。
典型抗贅生性細胞毒素劑之其他實例包括(但不限於):白蛋白結合型紫杉醇(Abraxane) (Abraxis BioScience, Inc.)、巴他布林(Batabulin) (Amgen)、EPO 906 (Novartis)、長春氟寧(Vinflunine) (Bristol-Myers Squibb Company)、放線菌素D、博萊黴素(bleomycin)、絲裂黴素C、新抑癌蛋白(neocarzinostatin) (Zinostatin)、長春鹼(vinblastine)、長春新鹼(vincristine)、長春地辛(vindesine)、長春瑞賓(Navelbine)、多西他賽(Taxotere)、奧他賽(Ortataxel)、太平洋紫杉醇(包括Taxoprexin,DHA/太平洋紫杉醇共軛物)、順鉑、卡鉑、奈達鉑、奧沙利鉑(Eloxatin)、賽特鉑、開普拓(Camptosar)、卡培他濱(Xeloda)、奧沙利鉑(Eloxatin)、多西他賽阿利維A酸(Taxotere alitretinoin)、坎弗醯胺(Canfosfamide) (Telcyta™)、DMXAA (Antisoma)、伊班膦酸(ibandronic acid)、L-天冬醯胺酶、培門冬酶(Oncaspar™)、乙丙昔羅(Efaproxiral) (Efaproxyn™-放射療法)、貝瑟羅汀(bexarotene) (Targretin™)、替米利芬(Tesmilifene) (DPPE-增強細胞毒劑之功效)、Theratope™ (Biomira)、維甲酸(Tretinoin) (Vesanoid™)、替拉紮明(tirapazamine) (Trizaone™)、莫特沙芬釓(motexafin gadolinium) (Xcytrin™)、Cotara™ (mAb)及NBI-3001 (Protox Therapeutics)、聚麩胺酸鹽-太平洋紫杉醇(Xyotax™)及其組合。典型抗贅生性劑之其他實例包括(但不限於):Advexin (ING 201)、TNFerade (GeneVec,回應於放射線療法表現TNFα之化合物)、RB94 (Baylor College of Medicine)、反義寡核苷酸(Genasense) (奧利美生(Oblimersen),Genta)、康柏斯達汀A4P (CA4P)、Oxi-4503、AVE-8062、ZD-6126、TZT-1027、阿托伐他汀(Atorvastatin) (Lipitor,Pfizer Inc.)、普伐他汀(Provastatin) (Pravachol,Bristol-Myers Squibb)、洛伐他汀(Lovastatin) (Mevacor,Merck Inc.)、辛伐他汀(Simvastatin) (Zocor,Merck Inc.)、氟伐他汀(Fluvastatin) (Lesco,Novartis)、西立伐他汀(Cerivastatin) (Baycol,Bayer)、羅素他汀(Rosuvastatin) (Crestor,AstraZeneca)、洛伐他汀(Lovostatin)、菸酸(Advicor,Kos Pharmaceuticals)、多達(Caduet)、立普妥(Lipitor)、托徹普(torcetrapib)及其組合。
在其他實施例中,額外抗癌劑為表觀遺傳調節劑,例如抑制劑或EZH2、SMARCA4、PBRM1、ARID1A、ARID2、ARID1B、DNMT3A TET2、MLL1/2/3、NSD1/2、SETD2、BRD4、DOT1L、HKMTsanti、PRMT1-9、LSD1、UTX、IDH1/2或BCL6。
在其他實施例中,額外抗癌劑為免疫調節劑,諸如CTLA-4、PD-1或PD-L1之抑制劑(例如,普羅珠單抗(pembrolizumab)、納武單抗(nivolumab)或阿維魯單抗(avelumab))、LAG-3、TIM-3、TIGIT、4-1BB、OX40、GITR、CD40或CAR-T-細胞療法。
如本文中所使用,「癌症」係指由異常細胞生長引起之任何惡性及/或侵襲性生長或腫瘤。癌症包括以形成其之細胞類型命名之實體腫瘤,血液、骨髓或淋巴系統之癌症。實體腫瘤之實例包括肉瘤及癌瘤。血液癌症包括(但不限於)白血病、淋巴瘤及骨髓瘤。癌症亦包括源自體內特定部位之原發性癌症、自開始之位置擴散至身體其他部分之轉移性癌症、初始原發性癌症在緩解後之復發,及作為個人之新穎原發性癌症的第二原發性癌症,該個人之先前癌症病史與後一癌症之類型不同。
在本文所提供之方法的一些實施例中,癌症係選自由以下組成之群:乳癌、卵巢癌、膀胱癌、子宮癌、前列腺癌、肺癌(包括NSCLC)、食道癌、肝癌、胰臟癌及胃癌。
本發明亦包含醫藥調配物,其包含治療有效量的本發明之化合物以及醫藥學上可接受之載劑。為了用本發明之化合物製備醫藥組合物,醫藥學上可接受之載劑可為固體或液體。固體形式製劑包括散劑、錠劑、丸劑、膠囊、扁囊劑、栓劑及分散性顆粒。固體載劑可為一或多種物質,其亦可充當稀釋劑、調味劑、黏合劑、防腐劑、錠劑崩解劑或密封材料。對於錠劑劑型,視劑量而定,本發明之化合物或醫藥學上可接受之鹽可構成1 wt%至80 wt%之劑型,通常5 wt%至60 wt%、更通常約10 wt%至約35 wt%或甚至更通常約15 wt%至約25 wt%之劑型。在特定實施例中,本發明之化合物或醫藥學上可接受之鹽包含按重量計約20 wt%的劑型。
在本發明之固體劑型中,載劑可包含各種醫藥學上可接受之賦形劑,包括例如稀釋劑、崩解劑、黏合劑、潤滑劑、滑動劑及界面活性劑。調配物亦可包括賦形劑(諸如防腐劑、抗氧化劑、調味劑及著色劑)以及此項技術中已知的其他賦形劑。
固體劑型(諸如錠劑)通常含有稀釋劑,例如乳糖(單水合物、噴霧乾燥之單水合物、無水物及類似者)、甘露糖醇、木糖醇、右旋糖、蔗糖、山梨糖醇、可壓縮糖、微晶纖維素、粉末狀纖維素、澱粉、預膠凝化澱粉、葡萄糖結合劑(dextrates)、聚葡萄糖、糊精、右旋糖、麥芽糊精、碳酸鈣、磷酸二鈣、磷酸三鈣、硫酸鈣、碳酸鎂、氧化鎂、泊洛沙姆(poloxamers)、聚氧化乙烯、羥丙基甲基纖維素及其混合物。不同類型的微晶纖維素可適合用於本文中所描述之調配物。微晶纖維素之實例包括Avicel®類型:PH101、PH102、PH103、PH105、PH 112、PH113、PH200、PH301及其他類型之微晶纖維素,諸如矽化微晶纖維素(SMCC)。在一些實施例中,稀釋劑係選自由以下組成之群:微晶纖維素、單水合乳糖、甘露糖醇、山梨糖醇、木糖醇、碳酸鎂、磷酸二鈣、磷酸三鈣或其混合物。在某些實施例中,稀釋劑包含微晶纖維素。在一些實施例中,稀釋劑包含一或多種類型之微晶纖維素,例如Avicel® PH105、Avicel® PH200或其混合物。在一些此類實施例中,稀釋劑排除單水合乳糖。在其他此類實施例中,稀釋劑包含微晶纖維素且進一步包含單水合乳糖。稀釋劑通常構成約25 wt%至約75 wt%之固體劑型,及較佳地約50 wt%至約75 wt%之劑型。
固體劑型通常含有崩解劑。崩解劑之實例包括羥基乙酸澱粉鈉、羧甲基纖維素鈉、羧甲基纖維素鈣、交聯羧甲纖維素鈉、交聯聚維酮(crospovidone)、聚乙烯吡咯啶酮、甲基纖維素、微晶纖維素、經低碳數烷基取代之羥丙基纖維素、澱粉、預膠凝化澱粉及海藻酸鈉。在一些實施例中,崩解劑為交聯聚維酮。可使用任何等級之交聯聚維酮;例如CL、CL-SF及XL等級之交聯聚維酮適合用於本文中所描述之調配物。特定實例包括Kollidon、Kollidon CL®、Kollidon CL-M®、Polyplasdone XL®、Polyplasdone XL-10®及Polyplasdone INF-10®。在一些實施例中,載劑包含至少一種選自由以下組成之群的崩解劑:交聯聚維酮、交聯羧甲纖維素鈉及羥基乙酸澱粉鈉。在特定實施例中,崩解劑為交聯聚維酮。崩解劑通常構成約1 wt%至約25 wt%、較佳地約5 wt%至約20 wt%、更佳地約5 wt%至約10 wt%之劑型。
黏合劑可用於向錠劑調配物賦予內聚性質。適合之黏合劑包括微晶纖維素、明膠、糖、聚乙二醇、天然及合成膠、聚乙烯吡咯啶酮、預膠凝化澱粉、羥丙基纖維素及羥丙基甲基纖維素。在一些實施例中,黏合劑係選自由以下組成之群:微晶纖維素、羥丙基纖維素及羥丙基甲基纖維素。在特定實施例中,黏合劑為微晶纖維素,例如Avicel® PH105。若存在,黏合劑可構成約0 wt%至約15 wt%,或約0.2 wt%至約10 wt%之劑型。在一些實施例中,黏合劑構成約5 wt%至約10 wt%之劑型。在特定實施例中,黏合劑構成約10 wt%之劑型。
固體劑型通常含有一或多種潤滑劑。潤滑劑之實例包括硬脂酸鎂、硬脂酸鈣、硬脂酸鋅、硬脂醯反丁烯二酸鈉、硬脂酸鎂與月桂基硫酸鈉之混合物,或此等潤滑劑中之兩者或更多者的混合物。在一些實施例中,潤滑劑為硬脂酸鎂及/或硬脂醯反丁烯二酸鈉。在一些實施例中,潤滑劑為硬脂酸鎂。在一些此類實施例中,固體劑型為包含顆粒內及顆粒外硬脂酸鎂之錠劑。在其他實施例中,固體劑型為包含顆粒內硬脂酸鎂及顆粒外硬脂醯反丁烯二酸鈉。若存在,潤滑劑通常構成約0.25wt%至約10 wt%,較佳地約0.5 wt%至約6 wt%之劑型。
錠劑亦可包含滑動劑,例如二氧化矽、膠態二氧化矽、矽酸鎂、三矽酸鎂、滑石及二氧化矽之其他形式,諸如聚合矽酸鹽及含水矽石。在一些實施例中,滑動劑為二氧化矽。若存在,滑動劑可構成約0 wt%至約10 wt%,較佳地約0.2 wt%至約5 wt%,或約0.5 wt%至約2 wt%之錠劑。
錠劑可視情況包括界面活性劑,諸如月桂基硫酸鈉及聚山梨醇酯80。若存在,界面活性劑可構成0 wt%至10 wt%,或較佳地0.2 wt%至5 wt%之錠劑。
一般而言,本發明之固體劑型係根據醫藥化學中常見的方法來製備。所選擇之載劑(或賦形劑)可與活性醫藥成分一起併入顆粒外或顆粒內隔室中之任一者或兩者中。
本發明之化合物或醫藥學上可接受之鹽的治療有效劑量將在每天約0.01 mg/kg至約100 mg/kg體重之間變化。典型成人劑量將為每天約0.1 mg/至約3000 mg。更通常,本發明之化合物或醫藥學上可接受之鹽之治療有效的成人劑量為每天50 mg、75 mg、100 mg、125 mg、175 mg或200 mg。單位劑量製劑中之活性組分的量可根據特定應用在約0.1 mg至約500 mg,較佳地約25 mg至約200 mg之間變化或調整。組合物必要時亦可含有其他相容治療劑。在24小時的時間段內,向需要用本發明之化合物或醫藥學上可接受之鹽治療的個體單獨或以多個劑量投與約0.6至約500 mg/天及較佳地約25 mg至約200 mg/天之劑量。只要有必要,可以連續時間間隔重複此類治療。
本發明之化合物(包括式I、II或III之化合物,或其鹽)可含有不對稱或對掌性中心,且因此以不同的立體異構形式存在。除非另外規定,否則希望本發明之化合物的所有立體異構形式以及其混合物(包括外消旋混合物)形成本發明之部分。此外,本發明涵蓋所有幾何及位置異構體。舉例而言,若本發明之化合物併有雙鍵或稠環,則順式形式及反式形式以及混合物涵蓋於本發明之範疇內。
本發明之對掌性化合物(及其對掌性前驅體)可在具有不對稱固定相及移動相之樹脂上使用層析法(通常為高壓液相層析法(HPLC)或超臨界流體層析法(SFC))以對映異構性增濃形式獲得,該移動相由烴(通常為庚烷或己烷)組成,含有0至50%異丙醇,通常為2%至20%及0至5%烷胺,通常0.1%二乙胺(DEA)或異丙胺。濃縮溶離劑得到增濃混合物。
非對映異構體混合物可基於其物理化學差異藉由熟習此項技術者熟知之方法(諸如藉由層析及/或分步結晶法)分離成其個別非對映異構體。對映異構體可藉由以下方式分離:藉由與適當光學活性化合物(例如對掌性助劑,諸如對掌性醇或莫舍氏酸氯化物(Mosher's acid chloride))反應將對映異構體混合物轉化為非對映異構體混合物,分離非對映異構體且將個別非對映異構體轉化(例如水解)為相應的純對映異構體。對映異構體亦可藉由使用對掌性HPLC管柱來分離。替代地,特定立體異構體可藉由使用光活性起始材料,藉由使用光活性試劑、基質、催化劑或溶劑之不對稱合成,或藉由不對稱轉換將一種立體異構體轉化為另一種來合成。
例示性實施例包括非對映異構體或對映異構體之以下群組,其中各組中之非對映異構體或對映異構體可如本文中所描述且藉由使用此項技術中熟知的技術來分離或製備: (1)      6-乙醯基-8-環丁基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-8-環丁基-2-{[(3S ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-8-環丁基-2-{[(3R ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮及6-乙醯基-8-環丁基-2-{[(3R ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; (2)      6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3S ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3R ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮及6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3R ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; (3)      6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2S )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3S ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2S )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3R ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2S )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3R ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2S )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1S ,2S )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3S ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1S ,2S )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3R ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1S ,2S )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3R ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1S ,2S )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2R )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3S ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2R )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3R ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2R )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3R ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2R )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1S ,2R )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3S ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1S ,2R )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3R ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1S ,2R )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-2-{[(3R ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1S ,2R )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮; (4)      3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H )-酮;3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H )-酮;3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3R ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H )-酮,及3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3R ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H )-酮; (5)      6-乙醯基-8-[2-(2,2-二氟乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-8-[2-(2,2-二氟乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基]-2-{[(3S ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮、6-乙醯基-8-[2-(2,2-二氟乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基]-2-{[(3R ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮,及6-乙醯基-8-[2-(2,2-二氟乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基]-2-{[(3R ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮。
根據本發明之方法,本發明之化合物或組合較佳以醫藥組合物之形式投與。因此,本發明之化合物或其組合可以任何習知口服、經直腸、經皮、非經腸(例如,靜脈內、肌內或皮下)、腦池內、陰道內、腹膜內、局部(例如,散劑、軟膏、乳膏、噴霧或洗劑)、口腔或經鼻劑型(例如,噴霧、滴劑或吸入劑)形式單獨或共同向患者投與。
本發明之化合物或組合可單獨投與,但將通常以與此項技術中已知且關於預期投藥途徑及標準醫藥實踐而選擇之一或多種適合的醫藥賦形劑、佐劑、稀釋劑或載劑之混合物形式投與。視所需投藥途徑及釋放曲線(與治療需要相稱)之特異性而定,本發明之化合物或組合可經調配以提供立即釋放、延遲釋放、改良釋放、持續釋放、脈衝釋放或控制釋放劑型。
醫藥組合物包含呈一般在約1%至約75%、80%、85%、90%或甚至95% (按重量計)之組合物的範圍內,通常在約1%、2%或3%至約50%、60%或70%之範圍內,更通常在約1%、2%或3%至小於50% (諸如約25%、30%或35%)之範圍內之量的本發明之化合物或其組合。
製備具有特定量之活性化合物之各種醫藥組合物的方法為熟習此項技術者所已知。舉例而言,參見Remington: The Practice of Pharmacy, Lippincott Williams及Wilkins, Baltimore Md. 第20增刊版 2000。
適用於非經腸注射之組合物通常包括醫藥學上可接受之無菌水溶液或非水性溶液、分散液、懸浮液或乳液,及用於復原為無菌可注射溶液或分散液之無菌散劑。適合之水性及非水性載劑或稀釋劑(包括溶劑及媒劑)之實例包括水、乙醇、多元醇(丙二醇、聚乙二醇、甘油及類似者)、其適合之混合物、三甘油酯(包括諸如橄欖油之植物油)及諸如油酸乙酯之可注射有機酯。較佳載劑為具有丙三醇或丙二醇之Miglyol.RTM.商標辛酸/癸酸酯(例如,Miglyol.RTM. 812、Miglyol.RTM. 829、Miglyol.RTM. 840),購自Condea Vista Co., Cranford, N.J。可例如藉由使用包衣(諸如卵磷脂)、在分散液之情況下藉由維持所需粒度及藉由使用界面活性劑來維持適當流動性。
用於非經腸注射之此等組合物亦可含有賦形劑,諸如保持劑、潤濕劑、乳化劑及分散劑。預防組合物之微生物污染可藉由各種抗細菌劑及抗真菌劑來實現,例如對羥苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、山梨酸及類似者。亦可需要包括等張劑,例如糖、氯化鈉及類似者。可注射醫藥組合物之延長吸收可藉由使用能夠延緩吸收之試劑(例如,單硬脂酸鋁及明膠)實現。
用於經口投與之固體劑型包括膠囊、錠劑、口嚼錠、口含錠、丸劑、散劑及多顆粒製劑(顆粒)。在此類固體劑型中,本發明之化合物或組合與至少一種惰性賦形劑、稀釋劑或載劑混合。適合之賦形劑、稀釋劑或載劑包括諸如檸檬酸鈉或磷酸二鈣之材料及/或(a)一或多種填充劑或增效劑(例如,微晶纖維素(可購自FMC Corp.之Avicel.TM.)、澱粉、乳糖、蔗糖、甘露糖醇、矽酸、木糖醇、山梨糖醇、右旋糖、磷酸氫鈣、糊精、α-環糊精、β-環糊精、聚乙二醇、中鏈脂肪酸、氧化鈦、氧化鎂、氧化鋁及類似者);(b)一或多種黏合劑(例如,羧甲基纖維素、甲基纖維素、羥丙基纖維素、羥丙基甲基纖維素、明膠、阿拉伯膠(gum arabic)、乙基纖維素、聚乙烯醇、普魯蘭(pullulan)、預膠凝化澱粉、瓊脂、黃蓍、海藻酸鹽、明膠、聚乙烯吡咯啶酮、蔗糖、阿拉伯膠(acacia)及類似者);(c)一或多種保濕劑(例如,甘油及類似者);(d)一或多種崩解劑(例如,瓊脂-瓊脂、碳酸鈣、馬鈴薯或木薯澱粉、褐藻酸、某些複合矽酸鹽、碳酸鈉、月桂基硫酸鈉、羥基乙酸澱粉鈉(可購自Edward Mendell Co.之Explotab.TM.)、交聯聚乙烯吡咯啶酮、交聯羧甲基纖維素鈉A型(可獲得之Ac-di-sol.TM.)、聚丙烯酸鉀(離子交換樹脂)及類似者);(e)一或多種溶液遲延劑(例如,石蠟及類似者);(f)一或多種吸收促進劑(例如,四級銨化合物及類似者);(g)一或多種濕潤劑(例如,鯨蠟醇(cetyl alcohol)、單硬脂酸甘油酯及類似者);(h)一或多種吸附劑(例如,高嶺土、膨潤土及類似者);及/或(i)一或多種潤滑劑(例如,滑石、硬脂酸鈣、硬脂酸鎂、硬脂酸、聚乙二醇硬脂酸酯、鯨蠟醇、滑石、氫化蓖麻油、脂肪酸之蔗糖酯、二甲基聚矽氧烷、微晶蠟、黃蜂蠟、白蜂蠟、固體聚乙二醇、月桂基硫酸鈉及類似者)。在膠囊及錠劑之情況下,劑型亦可包含緩衝劑。
具有類似類型之固體組合物亦可用作軟填充或硬填充明膠膠囊中之填充劑,該等明膠膠囊使用此類賦形劑作為乳糖(lactose/milk sugar)以及高分子量聚乙二醇及類似者。
固體劑型(諸如錠劑、糖衣藥丸、膠囊及顆粒)可製備有包衣及外殼,諸如腸溶衣及此項技術中熟知之其他包衣。其亦可含有乳濁劑,且亦可具有以延遲方式釋放本發明之化合物及/或額外醫藥藥劑之此類組合物。可使用之包埋組合物之實例為聚合物質及蠟。若適宜,藥物亦可與上文所提及之賦形劑中之一或多者一起呈微囊封形式。
對於錠劑,活性劑將通常構成小於50% (按重量計)之調配物,例如小於約10重量%,諸如5重量%或2.5重量%。調配物之主要部分包含填充劑、稀釋劑、崩解劑、潤滑劑及視情況存在之調味劑。此等賦形劑之組成為此項技術中熟知。通常,填充劑/稀釋劑將包含以下組分中之兩者或更多者之混合物:微晶纖維素、甘露糖醇、乳糖(所有類型)、澱粉及二磷酸鈣。填充劑/稀釋劑混合物通常構成小於98%之調配物,及較佳小於95%,例如93.5%。較佳崩解劑包括Ac-di-sol.TM.、Explotab.TM.、澱粉及月桂基硫酸鈉。若存在,崩解劑將通常構成小於10%之調配物或小於5%,例如約3%。較佳潤滑劑為硬脂酸鎂。當存在時,潤滑劑將通常構成小於5%之調配物,或小於3%,例如約1%。
錠劑可藉由標準制錠製程製造,例如直接壓縮或濕式、乾式或熔融粒化、熔融凝結製程及擠壓。錠劑核可為單層或多層的,且可塗佈有此項技術中已知的適當外塗層。
用於經口投與之液體劑型包括醫藥學上可接受之乳液、溶液、懸浮液、糖漿及酏劑。除了本發明化合物或組合之外,液體劑型可含有此項技術中常用之惰性稀釋劑,諸如水或其他溶劑、助溶劑及乳化劑,例如乙醇、異丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苄醇、苯甲酸苯甲酯、丙二醇、1,3-丁二醇、二甲基甲醯胺、油(例如,棉籽油、花生油、玉米胚芽油、橄欖油、蓖麻油、芝麻籽油及類似者)、Miglyole.RTM. (購自CONDEA Vista Co., Cranford, N.J.)、甘油、四氫糠醇、聚乙二醇及去水山梨醇之脂肪酸酯或此等物質之混合物及類似者。
除此類惰性稀釋劑之外,組合物亦可包括賦形劑,諸如潤濕劑、乳化劑及懸浮劑、甜味劑、調味劑及芳香劑。
本發明之化合物或組合之口服液體形式包括溶液,其中活性化合物完全溶解。溶劑之實例包括適用於經口投與之所有醫藥學上有先例的溶劑,尤其在其中本發明之化合物展示良好溶解度之彼等溶劑,例如聚乙二醇、聚丙二醇、可食用油及基於甘油基及甘油酯之系統。基於甘油基及甘油酯之系統可包括例如以下商標產品(及相應的通用產品):Captex.TM. 355 EP (三辛酸甘油酯/癸酸甘油酯,來自Abitec, Columbus Ohio);Crodamol.TM. GTC/C (中鏈三甘油酯,來自Croda, Cowick Hall, UK)或Labrafac.TM. CC (中鏈三甘油酯(triglyide),來自Gattefosse);Captex.TM. 500P (三乙酸甘油酯,亦即三醋精,來自Abitec);Cap-mul.TM. MCM (中鏈單甘油酯及二甘油酯,來自Abitec);Migyol.TM. 812 (辛酸三甘油酯/癸酸三甘油酯,來自Condea, Cranford N.J.);Migyol.TM. 829 (辛酸/癸酸/丁二酸三酸甘油酯,來自Condea);Migyol.TM. 840 (丙二醇二辛酸酯/二癸酸酯,來自Condea);Labrafil.TM. M1944CS (油醯基聚乙二醇-6甘油酯,來自Gattefosse);Peceol.TM. (單油酸甘油酯,來自Gattefosse);及Maisine.TM. 35-1 (單油酸甘油酯,來自Gattefosse)。備受關注的為中鏈(約C.sub.8至C.sub.10)三甘油酯油。此等溶劑通常構成組合物之主要部分,亦即大於約50%,通常大於約80%,例如約95%或99%。佐劑及添加劑亦可主要作為遮味劑、可口性及調味劑、抗氧化劑、穩定劑、質地及黏度修改劑及助溶劑包括於溶劑內。
除了本發明之化合物或組合之外,懸浮液可進一步包含諸如懸浮劑之載劑,例如乙氧基化異硬脂醇、聚氧乙烯山梨糖醇及去水山梨醇酯、微晶纖維素、偏氫氧化鋁、膨潤土、瓊脂及黃蓍,或此等物質之混合物及類似者。
用於經直腸或陰道投與之組合物較佳地包含栓劑,其可藉由使本發明之化合物或組合與適合之非刺激性賦形劑或載劑(諸如可可脂、聚乙二醇或栓劑蠟)混合來製備,該等栓劑在正常室溫下為固體,但在體溫下為液體,且因此在直腸或陰道腔中熔化,從而釋放活性組分。
用於局部投與本發明之化合物或組合之劑型包括軟膏、乳膏、洗劑、散劑及噴霧劑。將藥物與醫藥學上可接受之賦形劑、稀釋劑或載劑及可能需要的任何防腐劑、緩衝劑或推進劑混合。
大部分本發明之化合物不易溶於水,例如小於約1 μg/mL。因此,諸如上文所論述之中鏈三甘油酯油之溶解性、非水性溶劑中的液體組合物為用於此等化合物之較佳劑型。
固體非晶形分散液(包括由噴霧乾燥製程形成之分散液)亦為用於本發明之難溶性化合物之較佳劑型。「固體非晶形分散液」意謂其中難溶性化合物之至少一部分呈非晶形式且分散於水溶性聚合物中之固體物質。「非晶形」意謂難溶性化合物不為結晶型。「結晶」意謂化合物在各維度具有至少100個重複單位之三維中展現長程有序(long-range order)。因此,術語非晶形意欲包括不僅基本上無序之物質,而且可具有一定較小有序度,但次序小於三維及/或僅大於短距離之物質。非晶形物質可藉由此項技術中已知之技術表徵,諸如粉末x射線繞射(PXRD)結晶學、固態NMR或諸如差示掃描熱量測定(DSC)之熱分析技術。
在一些實施例中,固體非晶形分散液中之難溶性化合物之至少大部分(亦即,至少約60 wt%)為非晶形。化合物可以均勻分佈於整個聚合物中之化合物之固體溶液形式或此等狀態或介於其間的彼等狀態之任何組合的形式而存在於相對純的非晶形區域(domain/region)中之固體非晶形分散液內。較佳地,固體非晶形分散液為實質上均質的,使得非晶形化合物在整個聚合物中儘可能均質地分散。如本文中所使用,「實質上均質的」意謂存在於固體非晶形分散液內之相對較純非晶形區域(domain/region)中之化合物的分率相對較小,約小於藥物總量之20 wt%,且較佳小於10 wt%。
適合用於固體非晶形分散液之水溶性聚合物應為惰性的,意義在於其不以不利方式與難溶性化合物進行化學反應,為醫藥學上可接受的,且在具有生理學相關pH (例如,1-8)之水溶液中具有至少一定溶解度。聚合物可為中性或可離子化的,且在1至8之pH範圍之至少一部分中應具有至少0.1 mg/mL之水溶解度。
適用於與本發明一起使用之水溶性聚合物可為纖維素或非纖維素的。聚合物在水溶液中可為中性或可離子化的。在此等聚合物中,可離子化及纖維素聚合物為較佳的,其中可離子化纖維素聚合物為更佳的。
例示性水溶性聚合物包括羥丙基甲基纖維素乙酸丁二酸酯(HPMCAS)、羥丙基甲基纖維素(HPMC)、羥丙基甲基纖維素鄰苯二甲酸酯(HPMCP)、羧甲基乙基纖維素(CMEC)、鄰苯二甲酸乙酸纖維素(CAP)、偏苯三酸乙酸纖維素(CAT)、聚乙烯吡咯啶酮(PVP)、羥丙基纖維素(HPC)、甲基纖維素(MC)、環氧乙烷及環氧丙烷之嵌段共聚物(PEO/PPO,亦稱為泊洛沙姆(poloxamer))及其混合物。尤佳聚合物包括HPMCAS、HPMC、HPMCP、CMEC、CAP、CAT、PVP、泊洛沙姆及其混合物。最佳為HPMCAS。參見歐洲專利申請公開案第0 901 786 A2號,其揭示內容以引用之方式併入本文中。
固體非晶形分散液可根據用於形成使至少大部分(至少60%)難溶性化合物處於非晶形狀態之固體非晶形分散液的任何製程製備。此類製程包括機械、熱及溶劑方法。例示性機械法包括研磨及擠壓;熔融法包括高溫熔融、溶劑改質融合及熔融冷凍法;且溶劑法包括非溶劑沈澱、噴塗及噴霧乾燥。參見例如以下美國專利,其相關揭示內容以引用之方式併入本文中:第5,456,923號及第5,939,099號,其描述藉由擠壓法形成分散液;第5,340,591號及第4,673,564號,其描述藉由研磨法形成分散液;及第5,707,646號及第4,894,235號,其描述藉由熔融冷凍法形成分散液。在一較佳製程中,固體非晶形分散液由噴霧乾燥形成,如歐洲專利申請公開案第0 901 786 A2號中所揭示。在此方法中,將化合物及聚合物溶解於諸如丙酮或甲醇之溶劑中,且接著藉由噴霧乾燥自溶液快速移除溶劑,以形成固體非晶形分散液。可製備固體非晶形分散液以含有至多約99 wt%化合物,例如按需要1 wt%、5 wt%、10 wt%、25 wt%、50 wt%、75 wt%、95 wt%或98 wt%。
固體分散液可以劑型本身使用,或其可在製備其他劑型(諸如膠囊、錠劑、溶液或懸浮液)時充當製造使用產物(MUP)。水性懸浮液之實例為含有2.5 mg/mL化合物之1:1 (w/w)化合物/HPMCAS-HF噴霧乾燥之分散液於2%聚山梨醇酯-80中之水性懸浮液。用於錠劑或膠囊之固體分散液將通常與常見於此類劑型中之其他賦形劑或佐劑混合。舉例而言,用於膠囊之例示性填充劑含有2:1 (w/w)化合物/HPMCAS-MF噴霧乾燥之分散液(60%)、乳糖(快速流動) (15%)、微晶纖維素(例如,Avicel.sup. (R0-102)) (15.8%)、澱粉鈉(7%)、月桂基硫酸鈉(2%)及硬脂酸鎂(1%)。
HPMCAS聚合物為可分別自Shin-Etsu Chemical Co., LTD, Tokyo, Japan獲得之低級、中級及高級Aqoa.sup.(R)-LF、Aqoat.sup.(R)-MF及Aqoat.sup.(R)-HF。高級MF及HF通常為較佳的。
以下段落描述適用於非人類動物之例示性調配物、劑量等。投與本發明之化合物及本發明之化合物與抗肥胖劑之組合可經口或非經口實現。
投與一定量的本發明之化合物或本發明之化合物與另一抗肥胖劑的組合,使得接受到有效劑量。一般而言,向動物經口投與之日劑量在約0.01與約1,000 mg/kg體重之間,例如,約0.01與約300 mg/kg之間,或約0.01與約100 mg/kg之間,或約0.01與約50 mg/kg體重之間,或約0.01與約25 mg/kg之間,或約0.01至約10 mg/kg,或約0.01至約5 mg/kg。
適宜地,本發明之化合物(或組合)可攜載於飲用水中,使得治療劑量之化合物與日常供水一起攝取。化合物可直接計量入飲用水中,較佳呈液態、水溶性濃縮物(諸如,水溶性鹽之水溶液)形式。
適宜地,本發明之化合物(或其組合)亦可直接添加至飼料中,按原樣或呈動物飼料補充物(亦稱為預混物或濃縮物)形式。化合物於賦形劑、稀釋劑或載劑中之預混物或濃縮物更通常用於將藥劑包括於飼料中。適合之賦形劑、稀釋劑或載劑視需要為液體或固體,諸如水、各種粗粉(諸如苜蓿粉、黃豆粕、棉籽油粉、亞麻籽油粉、玉米芯粉及玉米粉、糖蜜、脲、骨粉)及礦物混合物(諸如通常用於家禽飼料之物質)。尤其有效之賦形劑、稀釋劑或載劑為各別動物飼料本身;亦即,此類飼料之較小部分。載劑促進化合物在與預混物摻合之成品飼料中均勻分佈。較佳地,將化合物充分摻合入預混物中,且隨後摻合入飼料中。就此而言,化合物可分散或溶解於適合之油性媒劑(諸如大豆油、玉米油、棉籽油及類似者)或揮發性有機溶劑中,且隨後與載劑摻合。應瞭解,濃縮物中之化合物之比例能夠廣泛變化,此係因為成品飼料中之化合物的量可藉由摻合適當比例之預混物與飼料調節,以獲得所需含量之化合物。
如上文所描述,可藉由飼料製造商將高效濃縮物與蛋白質載劑(諸如大豆油粉及其他粗粉)摻合,以產生適用於直接餵養動物之濃縮補充物。在此等情況下,准許動物食用常見食物。替代地,此類濃縮補充物可直接添加至飼料中,以產生營養學上平衡之含有治療有效量之本發明之化合物的成品飼料。混合物藉由標準程序諸如在雙殼摻混機中經充分摻合以確保均質性。
若補充物用作飼料之追肥,則其同樣有助於確保化合物在經追肥飼料中之分佈均勻性。
有效增加精肉沈積且改良精肉與脂肪比之飲用水及飼料通常藉由混合本發明之化合物與足夠量的動物飼料來製備,以提供含約10-3 至約500 ppm之化合物的飼料或水。
較佳藥用豬、牛、綿羊及山羊飼料通常含有每公噸飼料約1至約400公克本發明之化合物(或組合),用於此等動物之最佳量通常為每公噸飼料約50至約300公克。
較佳家禽及家養寵物飼料通常含有每公噸飼料約1至約400公克,且較佳約10至約400公克之本發明之化合物(或其組合)。
對於在動物中非經腸投藥,本發明之化合物(或組合)可以糊劑或丸劑形式製備且作為植入物投與,通常在尋求精肉沈積增加且精肉與脂肪比率改良的動物之頭或耳之皮膚處。
糊劑調配物可藉由將藥物分散於醫藥學上可接受之油狀物(諸如花生油、芝麻油、玉米油或類似者)中來製備。
含有有效量之本發明之化合物、醫藥組合物或組合的丸劑可藉由使本發明之化合物或組合與稀釋劑(諸如卡波蠟(carbowax)、巴西棕櫚蠟及類似者)混合來製備,且可添加潤滑劑(諸如硬脂酸鎂或硬脂酸鈣)以改良粒化製程。
當然,已認識到可向動物投與超過一種丸劑以達成將增加精肉沈積且改良所需精肉與脂肪比之所需劑量。此外,亦可在動物治療階段期間進行定期植入,以便在動物身體中維持適當藥物含量。
本發明具有若干有利的獸醫學特徵。對於希望增加寵物動物之精肉及/或修整不合需要之脂肪的寵物擁有者或獸醫,本發明提供可實現此目標之手段。對於家禽、肉牛及豬飼養者,使用本發明之方法產生在肉類工業中獲得更高售價之更精瘦動物。
製備 本發明之化合物可藉由合成途徑合成,該等合成途徑包括類似於化學技術中熟知之彼等方法的方法,尤其根據本文中所含有之描述合成。起始物質通常購自諸如Aldrich Chemicals (Milwaukee, WI)之商業來源,或易於使用熟習此項技術者熟知之方法製備(例如藉由以下通常所描述之方法製備:Louis F. Fieser及Mary Fieser, Reagents for Organic Synthesis, 第1-19卷, Wiley, New York (1967-1999版),或Beilsteins Handbuch der organischen Chemie, 4, Aufl.編Springer-Verlag, Berlin,包括增刊(亦可經由Beilstein線上資料庫獲得))。本文中所使用之諸多化合物係關於其中存在較大科學利益及商業需求之化合物或由其衍生,且因此諸多此類化合物為市售的或報導於文獻中或易於由其他通常可獲得的物質藉由文獻中所報導之方法來製備。
出於說明之目的,以下所描繪之反應流程提供合成本發明之化合物以及關鍵中間物之可能途徑。關於個別反應步驟之更詳細描述,參見以下實例部分。熟習此項技術者應瞭解,其他合成途徑可用於合成本發明化合物。雖然下文論述特定起始物質及試劑,但其他起始物質及試劑可易於取代以提供各種衍生物及/或反應條件。此外,藉由下文所描述之方法製備的諸多化合物可根據本發明使用熟習此項技術者熟知之習知化學方法進一步改質。
除非另外說明,否則流程A至L中之變數具有如本文中所定義的相同含義。本文中所提及之胺可構成受保護之胺,其在熟習此項技術者已知之標準條件下去除保護。對此類保護/去保護之需要將視遠端官能基之性質及製備方法之條件而不同。對此類保護之需要容易由熟習此項技術者判定。此類保護/去保護方法之使用亦在此項技術中之技術範圍內。對於保護基之通用描述及其用途,參見T.W. Greene, Protective Groups in Organic Synthesis, John Wiley & Sons, New York, 1991。
舉例而言,某些化合物含有一級胺或羧酸官能基,若未受到保護,則其可干擾分子之其他位點上之反應。因此,此類官能基可受適當保護基保護,該保護基可在後續步驟中經移除。用於胺及羧酸保護之適合保護基包括常用於肽合成之彼等保護基(諸如用於胺的N -第三丁氧基羰基(Boc)、苯甲氧羰基(Cbz)及9-茀基亞甲氧基羰基(Fmoc),及用於羧酸之低碳數烷基酯或苯甲基酯),其在所描述之反應條件下通常不具有化學反應性且可通常在不以化學方式改變本發明之化合物中之其他官能基的情況下經移除。
下文所描述之反應流程意欲提供用於製備本發明之化合物之方法的一般描述。本發明之化合物中之一些含有單個對掌性中心。在以下流程中,製備化合物之通用方法以外消旋或對映體增濃形成展示。熟習此項技術者將顯而易見,所有合成轉型可以十分類似之方式進行,無論物質為對映體增濃的或外消旋的。此外,對所需光活性物質之解析可在序列中之任何所需位置處,使用諸如本文中所描述及化學文獻中之熟知方法進行。
在以下反應流程中,除了以其他方式標註的情況,變量R1 、R2 、R3 及R4 如發明內容中所描述。 流程A
Figure 02_image024
流程 A 中所說明,將A-1 氧化以得到混合物A-2 [亞碸(n=1)及/或碸(n=2)]可在適當條件下實施,諸如在含過氧單硫酸鉀(Oxone® )之四氫呋喃(THF)及水作為溶劑之情況下(此氧化反應可用於例如流程 D 中)。隨後親核性芳族取代(SN Ar反應)提供2-經取代之吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮A-3 。通常在存在適合之鹼(諸如N,N- 二異丙基乙胺(DIPEA))之情況下在適合之溶劑(諸如二甲亞碸(DMSO)或四氫呋喃(THF))中執行SN Ar反應。 流程B
Figure 02_image026
B-4
如流程B 中所說明,在標準鈀催化之交叉偶合條件下,用乙烯基醚前驅體(諸如三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷或1-(乙烯氧基)丁烷)處理B-1 (諸如6-溴-2-氯-8-環戊基-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮) (購買或以類似於由Duan, S.等人,Org. Process. Dev. 2016 ,20 , 1191-1202所描述之方式合成),獲得乙烯基醚B-2 ,其中R為H。替代地,可採用經取代之乙烯基錫烷或烷氧基乙烯基醚試劑以得到B-2 中間物,其中R不為H,例如其中R為視情況經一或多個氟原子取代之甲基。在存在鹼(諸如DIPEA)之情況下,B-2 與各種經取代之胺在適合之溶劑(諸如DMSO)中之SN Ar反應得到B-3 。在酸性條件(諸如含HCl水溶液之THF)下水解乙烯基醚得到2-經取代之吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮B-4 ( 其中R2 為例如CH2 R,且R為H或視情況經一或多個氟原子取代之甲基)。 流程C
Figure 02_image028
B-4 之替代性合成途徑描繪於流程 C 在存在酸(諸如含HCl水溶液之THF)之情況下水解乙烯基醚B-2 獲得C-1 。在存在鹼(諸如DIPEA)之情況下,C-1 與各種經取代之胺在適合之溶劑(諸如DMSO)中之SN Ar反應得到B-4 。 流程D
Figure 02_image030
流程 D 說明B-1 與各種經取代之胺之替代性SN Ar反應得到嘧啶D-1 。在熟習此項技術者已知之標準交叉偶合條件下,藉由用經適當取代之乙烯基錫烷或烷氧基乙烯基醚處理,隨後對所得乙烯基醚進行酸介導之水解來實現D-1 在C(6)位置處的官能化,以得到酮中間物B-4 。替代地,B-1 與甲硫醇鈉在適合之溶劑(諸如THF或DMSO)中之SN Ar反應產生甲硫基嘧啶D-2 ,其隨後藉由標準交叉偶合條件及酸介導之水解以得到酮D-3 。描述於流程A中之以下程序將得到B-4 。 流程E
Figure 02_image032
流程 E 中所說明,在鹼性條件下,諸如在含三乙胺之乙腈作為溶劑之情況下,E-1 與各種經取代之胺的SN Ar反應得到E-2E-2 與經適當取代之烯酸的Heck反應及使用乙酸酐之伴隨環化反應得到吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮E-3 。在適合之溶劑(諸如二氯甲烷)中使用標準試劑(諸如溴)在C(6)位置處溴化得到溴化物E-4 。如先前論述,與各種經取代之胺的SN Ar反應得到E-5 。在標準交叉偶合條件下,藉由用乙烯基錫烷或烷氧基乙烯基醚處理其,隨後對相應乙烯基醚進行酸介導之水解來實現酮部分在C(6)位置處之安置,以得到E-6 。 流程F
Figure 02_image034
Figure 02_image036
流程 F 中所說明,在鹼性條件下,4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(F-1 ;購買或以類似於由Federico, S.等人,J. Med. Chem. 2014 ,57 , 6210-6225描述之方式合成)與各種經取代之胺的SN Ar反應得到F-2 。使用此項技術中已知之標準方法實施F-2 中之酯官能基轉化為相應的酮以得到F-6 。舉例而言,F-2 之氫化鋰鋁(LiAlH4 )還原產生醇F-3 ,其隨後藉由氧化錳(IV)氧化反應以得到醛F-4 。將諸如氯化甲基鎂之適合之格林納試劑(Grignard reagent) (其中R1 = Me)添加至F-4 中產生醇F-5 ,其接著經由氧化錳(IV)氧化反應轉化為酮F-6 。使用標準霍納-沃茲沃茨-埃蒙斯(Horner-Wadsworth-Emmons)反應條件或乙酸乙酯及適合之鹼(諸如雙(三甲基矽烷基)胺基鈉)經由環化縮合獲得吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮F-7 。在C(6)處溴化得到F-8 ,隨後在先前所描述之標準條件下(流程 A )對C(2)處之硫基甲基進行氧化,從而得到F-9 。如先前論述,與各種經取代之胺進行SN Ar反應得到E-5 。接著如流程 E 中所描述,自E-5 獲得E-6 。替代地,如流程 D 中所描述,在類似條件下將酮部分引入至F-8 上得到A-1 ,接著根據如流程 A 中所描述之程序使用其得到A-3 。將F-2 轉化為F-6 之替代性方法為水解酯F-2 以產生酸F-10 ,其隨後轉化為Weinreb醯胺F-11 。將諸如氯化甲基鎂之適合格林納試劑(在其中R1 = Me的情況下)添加至含F-11 之THF中產生F-6 。 流程G
Figure 02_image038
流程 G 中所說明,在存在鹼(諸如2-第三丁基-1,1,3,3-四甲基胍)之情況下,用化合物R3 -X (諸如烷基鹵化物或甲磺酸鹽(亦即甲烷磺酸鹽))使5-甲基-2-(甲硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮G-1 (購買或以類似於由VanderWel, S. N.等人,J. Med. Chem. 2005 ,48 , 2371-2387描述之方式合成)烷基化,分別得到位置異構體7-O -烷基吡啶并[2,3-d]嘧啶G-2 及8-N -烷基吡啶并[2,3-d]嘧啶F-7 之混合物,該等位置異構體經分離以得到F-7 ,其可如流程 F 中所說明使用以獲得E-6 。 流程H
Figure 02_image040
流程 H 中所說明,在具有或不具有溶劑(諸如甲苯)之情況下,用二乙烯酮前驅體(亦即2,2,6-三甲基-4H -1,3-二氧雜環己烯-4-酮)使1-[4-胺基-2-(甲硫基)嘧啶-5-基]乙-1-酮H-1 醯胺化/環化,得到甲硫基嘧啶H-2 。在標準條件下氧化H-2 之硫基甲基(參見上文),隨後在鹼性條件下與各種經取代之胺R4 -NH2 進行SN Ar反應,得到H-4 。在鹼性條件下,使用鹼(諸如NaH)在H-4 與R3 -X (例如烷基鹵化物)之間進行標準SN 2反應,分別得到7-O -烷基吡啶并[2,3-d]嘧啶H-5 及8-N -烷基吡啶并[2,3-d]嘧啶E-6 之混合物(A-3 之化合物,其中R2 為CH3 )。分離此等位置異構體得到可如本文所論述使用之E-6 。 流程I
Figure 02_image042
流程 I 中所說明,為提高溶解度且能夠隨後轉化,在鹼性條件下,諸如在三乙胺及THF作為溶劑之情況下,使H-3 與各種烷基硫醇R'-SH進行SN Ar反應以產生I-1 ,其中R'為具有至少4個碳原子之烷基(例如,癸基硫醇)。使用各種羧酸R3 -CO2 H,對I-1 進行經光催化之區域選擇性N -烷基化,得到吡啶并嘧啶I-2 。可在二氯甲烷中使用雙(乙醯氧基)(2,4,6-三甲基苯基)-λ3 -碘烷作為氧化劑及六氟磷酸(2,2'-聯吡啶-κ2 N 1 ,N 1' ){雙[3,5-二氟-2-(5-氟吡啶-2-基)苯基]}銥作為催化劑來實施此反應。在上文所描述之標準條件下,氧化C(2)處之硫基甲基產生I-3 。在標準條件下,I-3 與各種經取代之胺R4 -NH2 進行SN Ar反應得到E-6 。 流程J
Figure 02_image044
流程 J 中所說明,在適合之溶劑(諸如THF)中,用鹼(諸如二異丙胺基鋰(LDA))處理市售4-氯-2-(甲硫基)嘧啶J-1 ,隨後添加經適合取代之醛R1 CHO,得到醇J-2 。在標準條件下,諸如用含氧化錳(IV)之氯仿氧化醇J-2 得到酮J-3 。如流程 F 中所說明,在鹼性條件下,J-3 與各種經取代之胺R3 -NH2 進行SN Ar反應得到F-6 ,其可得到例如E-6 。 流程K
Figure 02_image046
流程 K 中所說明,在鹼性條件下,1-(4,6-二氯吡啶-3-基)乙-1-酮K-1 (購買或以類似於由McCoull, W.等人,J. Med. Chem. 2017 ,60 , 3187-3197描述之方式合成)在C-4位置處與各種經取代之胺R3 -NH2 進行SN Ar反應得到K-2 。用二乙烯酮前驅體(例如,2,2,6-三甲基-4H -1,3-二氧雜環己烯-4-酮)使K-2 醯胺化/環化得到甲基酮K-3 。在適合之溶劑(諸如甲苯或THF)中使K-3 與各種胺R4 -NH2 進行經標準過渡金屬催化之C-N偶合反應,得到1,6-㖠啶-2(1H )-酮K-4
如熟習此項技術者顯而易見,描述於流程E至K中之用於引入R3 -取代基之方法允許引入各種R3 -取代基,包括(但不限於)烷基、環烷基及雜環烷基。此可藉由使用經適當取代之胺試劑(流程E、F、J)、鹵化物試劑(流程G、H)或羧酸試劑(流程I)簡單地實現。 流程L
Figure 02_image048
流程 L 中所說明,在鹼性條件下,使市售4,6-二氯菸鹼酸甲酯L-1 與各種經取代之胺R3 -NH2 進行SN Ar反應得到L-2 。使用此項技術中已知之標準方法(如描述於流程 F 中之彼等方法)實現將L-2 之酯官能基轉化為相應的酮基團以得到酮L-3 。使用標準霍納-沃茲沃茨-埃蒙斯條件或乙酸乙酯及適合之鹼(諸如雙(三甲基矽烷基)胺基鈉)使L-3 環化縮合得到㖠啶-2(1H )-酮L-4 。在鹼性條件下,使L-4 與各種經取代之胺R4 -NH2 進行經標準過渡金屬催化之C-N偶合反應得到L-5 。在C(6)位置處溴化L-5 後,在標準交叉偶合反應條件下,藉由用經適當取代之乙烯基錫烷或烷氧基乙烯基醚處理來引入酮部分,隨後進行酸介導之水解以得到胺基吡啶L-7
實例 實驗程序 下文說明本發明之多種化合物之合成。本發明範疇內之額外化合物可使用此等實例中所說明之方法(單獨或與此項技術中通常已知的技術組合)來製備。
實驗通常在惰性氛圍(氮氣或氬氣)下進行,尤其在採用對氧或水分敏感之試劑或中間物的情況下。市售溶劑及試劑通常不經進一步純化即使用。適當時採用無水溶劑,通常為來自Acros Organics之AcroSeal® 產品、來自Sigma-Aldrich之Aldrich® Sure/Seal 或來自EMD Chemicals之DriSolv® 產品。在其他情況下,使市售溶劑通過填充4Å分子篩之管柱,直至獲得以下水之QC標準為止:a)針對二氯甲烷、甲苯、N ,N -二甲基甲醯胺及四氫呋喃<100 ppm;b)針對甲醇、乙醇、1,4-二噁烷及二異丙胺<180 ppm。對於極敏感性反應,進一步用金屬鈉、氫化鈣或分子篩處理溶劑且在使用之前蒸餾。產物在繼續進行進一步反應或提交用於進行生物測試之前通常在真空下乾燥。質譜數據係由液相層析-質譜分析(LCMS)、大氣壓化學電離(APCI)或氣相層析-質譜分析(GCMS)儀器報告。核磁共振(NMR)數據之化學位移以百萬分率(ppm, δ)表示,參考所採用之氘化溶劑的殘餘峰值(氯仿,7.26 ppm;CD2 HOD,3.31 ppm;乙腈-d 2 ,1.94 ppm;二甲亞碸-d 5 ,2.50 ppm;DHO,4.79 ppm)。在一些實例中,實施對掌性分離以分離某些本發明之化合物之對映異構體(在一些實例中,根據其溶離次序,將所分離對映異構體指定為ENT-1及ENT-2)。在一些實例中,使用偏光計量測對映異構體之旋光度。根據其所觀察之旋轉資料(或其特定旋轉資料),順時針旋轉之對映異構體指定為(+)-對映異構體且逆時針旋轉之對映異構體指定為(-)-對映異構體。類似地,在一些實例中,實施分離以分離某些本發明之化合物的非對映異構體;在一些實例中,根據其溶離次序,所分離之非對映異構體指定為DIAST-1及DIAST-2。外消旋化合物則沒有繪製或說明立體化學,或在結構相鄰處以(+/-)表指示;在此後者情況下,所指示立體化學僅代表構成外消旋混合物之兩種對映異構體中之一者。
通常在經由可偵測中間物進行之反應後進行LCMS,且使得在添加後續試劑之前進行至完全轉化。對於其他實例或方法中之合成參考程序,反應條件(反應時間及溫度)可變化。一般而言,在反應之後進行薄層層析或質譜分析,且在適當時進行處理。實驗之間的純化可變化:一般而言,選擇用於溶離劑/梯度之溶劑及溶劑比率以提供適當之Rf s或滯溜時間。此等製備及實例中之所有起始物質均可為市售的或可藉由此項技術中已知或如本文所描述之方法製備。
下文所描述之化合物及中間物使用ACD/ChemSketch 2017.2.1, File Version N40E41, Build 96719 (Advanced Chemistry Development, Inc., Toronto, Ontario, Canada)所提供之命名定則進行命名。由ACD/ChemSketch 2017.2.1提供之命名定則為熟習此項技術者所熟知,且咸信由ACD/ChemSketch 2017.2.1所提供之命名定則通常符合國際理論及應用化學聯合會(International Union for Pure and Applied Chemistry;IUPAC)關於有機化學命名法(Nomenclature of Organic Chemistry)及CAS索引規則之建議。
除非另外規定,否則起始物質通常購自以下商業來源,諸如Aldrich Chemicals Co. (Milwaukee, WI)、Lancaster Synthesis, Inc. (Windham, NH)、Acros Organics (Fairlawn, NJ)、Maybridge Chemical Company, Ltd. (Cornwall, England)及Tyger Scientific (Princeton, NJ)。已採用某些共同縮寫及縮寫字,其可包括:乙酸(AcOH)、1,8-二氮雜雙環[5.4.0]十一-7-烯(DBU)、1,1'-羰基二咪唑(CDI)、二氯甲烷(DCM)、二乙胺(DEA)、N,N-二異丙基乙胺(DIPEA)、4-二甲胺基吡啶(DMAP)、N,N'-二甲基甲醯胺(DMF)、二甲亞碸(DMSO)、N-(3-二甲胺基丙基)-N'-乙基碳化二亞胺(EDCI)、乙醚(Et2O)、乙酸乙酯(EtOAc)、乙醇(EtOH)、2-(1H-7-氮雜苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲鎓六氟磷酸甲銨(HATU)、六氟磷酸O-苯并三唑-1-基-N,N,N',N'-四甲基脲鎓(HBTU)、1-羥基苯并三唑(HOBT)、異丙醇(IPA)、六甲基二矽氮烷鉀(KHMDS)、甲醇(MeOH)、第三丁基甲基醚(MTBE)、三乙醯氧基硼氫化鈉(NaBH(OAc)3)、六甲基二矽氮烷鈉(NaHMDS)、N-甲基吡咯啶酮(NMP)、[2-(三甲基矽烷基)乙氧基]甲基(SEM)、三乙胺(TEA)、三氟乙酸(TFA)、四氫呋喃(THF)、5-FAM-Dyrktide (在肽之5'端處經三氟乙酸鹽標記之肽RRRFRPASPLRGPPK)及丙烷膦酸酐(T3P)。
術語「濃縮」、「蒸發」及「真空濃縮」係指在浴液溫度小於60℃之旋轉式蒸發器中,在減壓下移除溶劑。縮寫「min」及「h」分別代表「分鐘」及「小時」。術語「TLC」係指薄層層析法,「室溫或環境溫度」意謂18℃至25℃之間的溫度,「LCMS」係指液相層析-質譜分析,「UPLC」係指超高效液相層析且「HPLC」係指高壓液相層析。
可在指定溫度下,在加壓氫氣下於帕爾震盪器(Parr Shaker)中,或在全氫氣下於Thales-nano H-Cube流動氫化設備中且以1至2 mL/min的流動速率執行氫化。
使用程序中所標註之方法量測HPLC、UPLC、LCMS及SFC滯留時間。
製劑 P1 6- -2- 氯-8- 環丁基-5- 甲基吡啶并[2,3-d] 嘧啶-7(8 H)- (P1 )
Figure 02_image050
步驟 1. 合成 5- -2- - N- 環丁基嘧啶 -4- (C1 ) 將環丁胺(1.56 g,21.9 mmol)添加至5-溴-2,4-二氯嘧啶(5.00 g,21.9 mmol)及三乙胺(9.51 mL,68.2 mmol)於乙腈中之0℃懸浮液中,且在將其攪拌隔夜時,使反應混合物升溫至室溫。接著將其真空濃縮,且使用矽膠層析法(梯度:0%至30%乙酸乙酯/庚烷)純化殘餘物以得到呈固體狀之C1 。產率:4.67 g,17.8 mmol,81%。LCMSm/z 262.1 (觀測到溴-氯同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ) δ 8.10 (s, 1H), 5.61 (br s, 1H), 4.67 - 4.52 (m, 1H), 2.52 - 2.41 (m, 2H), 2.03 - 1.89 (m, 2H), 1.86 - 1.74 (m, 2H)。
步驟 2. 合成 2- -8- 環丁基 -5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8 H)- (C2 ) 將三乙胺(16.6 mL,119 mmol)及1-甲基吡咯啶-2-酮(70 mL)添加至C1 (4.67 g,17.8 mmol)、(2E)-丁-2-烯酸(6.13 g,71.2 mmol)及乙酸鈀(II) (399 mg,1.78 mmol)之混合物中,且用氮氣充氣所得混合物20分鐘。將反應混合物在65℃下加熱隔夜,接著用三乙胺(1.24 mL,8.90 mmol)及乙酸酐(3.36 mL,35.5 mmol)處理,且在65℃下加熱額外2.5小時。在其冷卻至室溫之後,將反應混合物倒入水(500 mL)中且用乙酸乙酯(4 × 120 mL)萃取。在此時,合併之有機層的LCMS分析指示轉化為產物C2 :LCMSm/z 250.1 (觀測到氯同位素圖案) [M+H]+ 。用水及飽和氯化鈉水溶液依序洗滌合併之有機層,在減壓下濃縮,且經由矽膠層析法(梯度:0%至45%乙酸乙酯/庚烷)純化,從而得到呈固體狀之C2 。產率:3.22 g,12.9 mmol,72%。1 H NMR (400 MHz,氯仿-d ) δ 8.73 (s, 1H), 6.51 (q,J = 1.3 Hz, 1H), 5.83 - 5.71 (m, 1H), 3.15 - 3.02 (m, 2H), 2.43 (d,J = 1.3 Hz, 3H), 2.42 - 2.32 (m, 2H), 2.12 - 1.99 (m, 1H), 1.94 - 1.79 (m, 1H)。
步驟 3. 合成 6- -2- -8- 環丁基 -5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8 H)- (P1 ) 在55℃下攪拌C2 (2.00 g,8.01 mmol)、N -溴代丁二醯亞胺(2.49 g,14.0 mmol)及草酸(147 mg,1.63 mmol)於乙腈(40 mL)中之混合物5小時,接著再次添加草酸(50 mg,0.55 mmol)及N -溴代丁二醯亞胺(800 mg,4.49 mmol)。在其加熱額外3.5小時之後,將反應混合物冷卻至室溫,用亞硫酸氫鈉(1.68 g,16.1 mmol)於水(約10 mL)中之溶液處理,且在室溫下攪拌10分鐘。接著用水(150 mL)稀釋所得混合物;過濾得到呈固體狀之P1 。產率:2.13 g,6.48 mmol,81%。LCMSm/z 328.0 (觀測到溴-氯同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz,氯仿-d ) δ 8.84 (s, 1H), 5.90 - 5.77 (m, 1H), 3.13 - 2.99 (m, 2H), 2.66 (s, 3H), 2.48 - 2.37 (m, 2H), 2.14 - 2.01 (m, 1H), 1.95 - 1.81 (m, 1H)。
製劑 P2 6-[6- 乙醯基 -5- 甲基 -2-( 甲基亞磺醯基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7 H)- ]-2- 氮雜螺 [3.3] 庚烷 -2- 甲酸 第三丁 (P2 )
Figure 02_image052
Figure 02_image054
Figure 02_image056
步驟 1 . 合成 6-{[5- 乙醯基 -2-( 甲硫基 ) 嘧啶 -4- ] 胺基 } -2- 氮雜螺 [3.3] 庚烷 -2- 甲酸 第三丁 (C3 ) 將1-[4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基]乙酮(2.15 g,10.6 mmol)、6-胺基-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯(2.36 g,11.1 mmol)及N,N -二異丙基乙胺(5.54 mL,31.8 mmol)溶解於四氫呋喃(20 mL)及乙腈(5 mL)之混合物中。將反應混合物在室溫下攪拌18小時,接著將其濃縮至乾燥,且對殘餘物進行矽膠層析法(梯度:0%至20%乙酸乙酯/二氯甲烷),從而得到呈淡黃色膠狀物之C3 (4.18 g)。藉由1 H NMR分析,此物質含有一些N,N -二異丙基乙胺鹽酸鹽。考慮到N,N -二異丙基乙胺鹽酸鹽,經校正產率:3.90 g,10.3 mmol,97%。LCMSm/z 379.0 [M+H]+1 H NMR (400 MHz,氯仿-d ) δ 9.26 (br d,J = 6.3 Hz, 1H), 8.56 (s, 1H), 4.55 - 4.42 (m, 1H), 4.00 (s, 2H), 3.88 (s, 2H), 2.73 - 2.63 (m, 2H), 2.52 (s, 3H), 2.50 (s, 3H), 2.23 - 2.13 (m, 2H), 1.43 (s, 9H)。
步驟 2. 合成 6-[5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7 H)- ]-2- 氮雜螺 [3.3] 庚烷 -2- 甲酸 第三丁 (C4 ) 。 以每10秒0.5 mL之速率,以逐份方式向C3 (1.70 g,4.49 mmol)及乙酸乙酯(1.39 g,15.8 mmol)於四氫呋喃(20 mL)中之冰冷溶液中添加雙(三甲基矽烷基)胺基鋰(1 M溶液;13.5 mL,13.5 mmol)。在冰冷卻下攪拌反應混合物30分鐘,且接著在40℃下攪拌大約1小時,接著用氯化銨水溶液(5 mL)將其稀釋,且與使用C3 (100 mg,0.264 mmol)所進行的類似反應合併。在乙酸乙酯(30 mL)與飽和氯化鈉水溶液(20 mL)之間分配所得混合物之後,用乙酸乙酯(2 × 10 mL)萃取水層,且合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且真空濃縮。經由矽膠層析(梯度:0%至30%乙酸乙酯/二氯甲烷)純化殘餘物以得到呈淡黃色固體狀之C4 。合併之產率:1.65 g,4.10 mmol,86%。LCMSm/z 402.9 [M+H]+
步驟 3. 合成 6-[6- -5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7 H)- ]-2- 氮雜螺 [3.3] 庚烷 -2- 甲酸 第三丁 (C5 ) 將草酸(36.9 mg,0.410 mmol)及N -溴代丁二醯亞胺(802 mg,4.51 mmol)逐份添加至C4 (1.65 g,4.10 mmol)於乙腈(20 mL)及二氯甲烷(10 mL)之混合物中之冰冷溶液中。在0℃下將反應混合物攪拌45分鐘之後,用二氯甲烷(50 mL)及飽和氯化鈉水溶液(10 mL)將其稀釋,且接著用亞硫酸鈉水溶液(5 mL)處理。用二氯甲烷(2 × 10 mL)萃取所得水層,且合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且真空濃縮。矽膠層析法(梯度:0%至30%乙酸乙酯/二氯甲烷)提供呈淡黃色固體狀之C5 。產率:1.45 g,3.01 mmol,73%。LCMSm/z 481.1 (觀測到溴同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz,氯仿-d ) δ 8.79 (s, 1H), 6.03 - 5.84 (br m, 1H), 4.08 (s, 2H), 4.05 (s, 2H), 3.35 - 3.22 (m, 2H), 2.67 - 2.56 (m, 2H), 2.63 (s, 3H), 2.62 (s, 3H), 1.44 (s, 9H)。
步驟 4 . 合成 6-[6- 乙醯基 -5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7 H)- ]-2- 氮雜螺 [3.3] 庚烷 -2- 甲酸 第三丁 (C7 ) 將氮氣鼓泡至C5 (2.00 g,4.15 mmol)於甲苯(30 mL)及1,4-二噁烷(15 mL)之混合物中之懸浮液中,且接著依序添加三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(7.50 g,20.8 mmol)及肆(三苯基膦)鈀(0) (480 mg,0.415 mmol)。將反應瓶封蓋,且在110℃下加熱反應混合物6小時。接著將其過濾;在真空濃縮濾液之後,將殘餘物溶解於乙酸乙酯(50 mL)中,用鹽酸(1 M;10 mL)處理,且攪拌大約1小時,直至薄層層析分析(溶離劑:1:2乙酸乙酯/石油醚)指示中間產物C6 {6-[6-(1-乙氧基乙烯基)-5-甲基-2-(甲硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H )-基]-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三 丁酯}完全轉化為C7 。將有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下濃縮。矽膠層析(梯度:0%至70%乙酸乙酯/石油醚)得到呈淡黃色固體狀之C7 。產率:1.30 g,2.92 mmol,70%。LCMSm/z 389.1 [(M-2-甲基丙-1-烯)+H]+1 H NMR (400 MHz,氯仿-d ) δ 8.79 (s, 1H), 5.87 - 5.71 (m, 1H), 4.05 (s, 2H), 4.05 (s, 2H), 3.36 - 3.23 (m, 2H), 2.66 - 2.57 (m, 2H), 2.62 (s, 3H), 2.53 (s, 3H), 2.36 (s, 3H), 1.44 (s, 9H)。
步驟 5. 合成 6-[6- 乙醯基 -5- 甲基 -2-( 甲基亞磺醯基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7 H)- ]-2- 氮雜螺 [3.3] 庚烷 -2- 甲酸 第三丁 (P2 ) C7 (100 mg,0.225 mmol)於四氫呋喃(8 mL)中之0℃溶液中添加過氧單硫酸鉀(Oxone® ;207 mg,0.337 mmol),隨後添加水(4 mL)。將反應混合物在室溫(10℃)下攪拌1小時,接著將其在乙酸乙酯(15 mL)與飽和氯化鈉水溶液(5 mL)之間分配。用乙酸乙酯(2 × 5 mL)萃取水層,且合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且真空濃縮,從而得到呈淡黃色固體狀之P2 (120 mg)。此物質直接用於隨後化學反應中。
製劑 P3 6- -2- -5- 甲基 -8-[(1 R,2 S)-2- 甲基環戊基 ] 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8 H)- (P3 )
Figure 02_image058
步驟 1. 合成 5- -2- -N-[(1 R,2 S)-2- 甲基環戊基 ] 嘧啶 -4- (C8 ) 用氮氣脫氣5-溴-2,4-二氯嘧啶(21.5 g,94.4 mmol)及(1R ,2S )-2-甲基環戊胺鹽酸鹽(此材料使用由W. Wiehl及A. W. Frahm,Chemische Berichte 1986, 119 , 2668-2677描述之方法製備;其絕對立體化學藉由對衍生之P3 進行X射線晶體結構測定來進一步建立,參見下文) (12.8 g,94.4 mmol)之混合物3分鐘,接著添加乙腈(500 mL),且將混合物冷卻至0℃。以逐滴方式添加三乙胺(38.2 g,377 mmol),且在0℃下攪拌反應混合物1小時,且接著在15℃下攪拌12小時。隨後將反應混合物在飽和碳酸氫鈉水溶液(400 mL)與二氯甲烷(400 mL)之間分配。用二氯甲烷(4 × 200 mL)萃取水層,且合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且真空濃縮。經由矽膠層析法(梯度:0%至4%乙酸乙酯/石油醚)實施純化,從而得到呈油狀物之C8 。產率:25.5 g,87.8 mmol,93%。1 H NMR (400 MHz,氯仿-d ) δ 8.09 (s, 1H), 5.44 (br d,J = 7.3 Hz, 1H), 4.55 - 4.43 (m, 1H), 2.35 - 2.23 (m, 1H), 2.16 - 2.03 (m, 1H), 1.98 - 1.87 (m, 1H), 1.84 - 1.71 (m, 1H), 1.70 - 1.51 (m, 2H), 1.42 - 1.31 (m, 1H), 0.90 (d,J = 7.0 Hz, 3H)。
步驟 2. 合成 2- -5- 甲基 -8-[(1 R,2 S)-2- 甲基環戊基 ] 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8 H)- (C9 ) 此反應分三個相同批次進行。將三乙胺(14.8 g,146 mmol)及1-甲基吡咯啶-2-酮(100 mL)添加至C8 (8.50 g,29.2 mmol)、(2E)-丁-2-烯酸(7.56 g,87.8 mmol)及乙酸鈀(II) (656 mg,2.92 mmol)之混合物中。用氮氣脫氣反應混合物15分鐘,且接著在65℃下攪拌2小時。在冷卻至室溫(15℃)之後,用三乙胺(1.48 g,14.6 mmol)及乙酸酐(5.97 g,58.5 mmol)處理反應混合物,且在65℃下加熱1小時。在此時合併三個批次,將其倒入至冰水(1.2 L)中,且用乙酸乙酯(4 × 300 mL)萃取。用飽和氟化鉀水溶液(300 mL)、水(300 mL)及飽和氯化鈉水溶液(300 mL)依序洗滌合併之有機層,用硫酸鈉乾燥,過濾且真空濃縮。矽膠層析法(溶離劑:15%乙酸乙酯/石油醚)提供黃色固體(17 g),其在乙酸乙酯及石油醚之1:10混合物中加熱,冷卻且過濾以得到呈淡黃色固體狀之C9 (11.9 g)。在減壓下濃縮母液且使用矽膠層析法純化,從而得到呈淡黃色固體狀之額外C9 (4.4 g)。合併之產率:16.3 g,58.7 mmol,67%。LCMSm/z 277.9 (觀測到氯同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz,氯仿-d ) δ 8.73 (s, 1H), 6.56 - 6.51 (m, 1H), 5.94 (ddd,J = 9.9, 9.8, 6.7 Hz, 1H), 2.62 - 2.35 (m, 2H), 2.45 (d,J = 1.3 Hz, 3H), 2.17 - 2.05 (m, 1H), 2.05 - 1.93 (m, 2H), 1.91 - 1.81 (m, 1H), 1.65 - 1.50 (m, 1H), 0.74 (d,J = 7.1 Hz, 3H)。
步驟 3. 合成 6- -2- -5- 甲基 -8-[(1 R,2 S)-2- 甲基環戊基 ] 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8 H)- (P3 ) C9 (11.9 g,42.8 mmol)於N ,N -二甲基甲醯胺(120 mL)中之溶液劃分為6個反應容器,將其分別加熱至80℃。將N -溴代丁二醯亞胺(3.84 g,21.6 mmol)以8個部分添加至各反應混合物中;在2分鐘內添加各部分。將所得反應混合物在80℃下攪拌隔夜,接著將其倒入至冰水(1 L)中且使其靜置12小時。藉由過濾來收集所得固體,且使用矽膠層析(梯度:10%至20%乙酸乙酯/石油醚)純化以得到呈淡黃色固體狀之P3 。產率:10.74 g,30.1 mmol,70%。LCMSm/z 356.1 (觀測到溴同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 9.21 (s, 1H), 5.91 (ddd,J = 9.8, 9.7, 6.6 Hz, 1H), 2.66 (s, 3H), 2.45 - 2.31 (m, 2H), 2.06 - 1.86 (m, 3H), 1.86 - 1.77 (m, 1H), 1.65 - 1.49 (m, 1H), 0.67 (d,J = 7.0 Hz, 3H)。
P3 (30 mg)之樣本溶解於乙醚(2.0 mL)中且用庚烷(2.0 mL)處理;使混合物在非密封容器中靜置一個週末。所得晶體中之一者用於X射線結構性測定(見下文)。
P3 之單晶 X 射線 結構性測定 單晶 X 射線 分析
在室溫下在Bruker D8 Quest繞射儀上執行資料收集。資料收集由ω及φ掃描組成。 藉由在單斜晶空間群P 21 中使用SHELX軟體程式組之內部定相來解析結構。隨後藉由全矩陣最小平方法精修結構。使用異向性移位參數發現且精修所有非氫原子。
將氫原子置放於所計算位置中,且使其騎乘於其載體原子上。最終精修包括用於所有氫原子之等向性移位參數。
使用PLATON (Spek)執行使用似然法(Hooft,2008)對絕對結構之分析。結果指示絕對結構已經正確地賦值。該方法計算出結構經正確賦值之機率為100%。Hooft參數經報導為0.018,其中esd為(8),且帕森參數經報導為0.024,其中esd為(9)。不對稱單元含有P3 之兩個分子,且針對此等兩者確證絕對構形。
最終R指數為2.8%。最終差異傅里葉法顯示無電子密度之缺失或錯位。
相關晶體、資料收集及精修資訊概述於表A中。原子座標、鍵結長度、鍵結角度及移位參數列於表B至D中。
軟體及參考文獻 SHELXTL , 版本5.1, Bruker AXS, 1997。PLATON , A. L. Spek,J. Appl. Cryst. 2003 ,36 , 7-13。MERCURY , C. F. Macrae, P. R. Edington, P. McCabe, E. Pidcock, G. P. Shields, R. Taylor, M. Towler及J. van de Streek, J. Appl. Cryst.2006 , 39, 453-457。OLEX2 , O. V. Dolomanov, L. J. Bourhis, R. J. Gildea, J. A. K. Howard及H. Puschmann,J. Appl. Cryst. 2009 ,42 , 339-341。 R. W. W. Hooft, L. H. Straver A. L. Spek, J. Appl. Cryst. 2008 , 41, 96-103 H. D. Flack, Acta Cryst. 1983 , A39, 867-881 表A.P3 之晶體資料及結構精修。
實驗式 C14 H15 Br ClN3 O   
式量 356.65   
溫度 296(2) K   
波長 1.54178 Å   
晶體系統 單斜晶   
空間群 P 21   
單位晶胞維度 a = 5.6861(2) Å α = 90°
   b = 20.2339(7) Å β =
101.0660(10)°
   c = 13.3114(4) Å γ = 90°
體積 1503.03(9) Å3   
Z 4   
密度(計算值) 1.576 Mg/m3   
吸收係數 5.358 mm- 1   
F (000) 720   
晶體大小 0.200×0.080×0.040 mm3   
資料收集之θ範圍 3.383至72.473°   
指數範圍 -6<=h <=6, -24<=k <=20, -16<=l <=16   
所收集之反射 19564   
無關反射 5156 [Rint = 0.0354]   
達至θ=67.679°之完整性 99.6%   
吸收校正 實驗   
精修方法 F2 之全矩陣最小平方   
資料/限制/參數 5156 / 1 / 366   
F2 之擬合優度 1.044   
最終R 指數[I>2σ(I) ] R 1 = 0.0281,wR 2 = 0.0688   
R 指數(所有資料) R 1 = 0.0300,wR 2 = 0.0701   
絕對結構參數 0.017(8)   
消光係數 0.0052(3)   
最大差異峰及孔穴 0.501及-0.527 e.Å- 3   
表B.P3 之原子座標(× 104 )及等效等向性移位參數(Å2 × 103 )。U(eq)定義為正交Uij 張量之跡線的三分之一。
   x y z U(eq)
Br(1) 13936(1) 5339(1) 5089(1) 58(1)
Br(2) 13448(1) 5072(1) 15(1) 62(1)
Cl(1) 3798(2) 3623(1) 8132(1) 65(1)
Cl(2) 3620(2) 6807(1) 3210(1) 62(1)
N(1) 6549(7) 4648(2) 8161(3) 58(1)
N(2) 6790(6) 3810(2) 6928(2) 41(1)
N(3) 9393(6) 3894(2) 5775(2) 39(1)
N(4) 6774(8) 5870(2) 3336(3) 55(1)
N(5) 6228(6) 6559(2) 1858(2) 45(1)
N(6) 8391(5) 6408(2) 563(2) 39(1)
O(1) 11893(6) 4004(2) 4646(3) 65(1)
O(2) 10700(6) 6284(2) -638(2) 58(1)
C(1) 8179(8) 4991(3) 7785(3) 55(1)
C(2) 5966(7) 4077(3) 7685(3) 47(1)
C(3) 8448(7) 4166(2) 6566(2) 37(1)
C(4) 9197(7) 4788(2) 6970(3) 40(1)
C(5) 10923(8) 5170(2) 6553(3) 46(1)
C(6) 11664(11) 5836(3) 6997(4) 70(2)
C(7) 11754(7) 4898(2) 5767(3) 43(1)
C(8) 11081(7) 4245(2) 5344(3) 44(1)
C(9) 8789(7) 3201(2) 5447(3) 44(1)
C(10) 10970(10) 2740(3) 5679(4) 60(1)
C(11) 10595(10) 2251(3) 4794(4) 66(1)
C(12) 9406(10) 2661(3) 3887(4) 64(1)
C(13) 7615(8) 3089(2) 4304(3) 49(1)
C(14) 6724(9) 3685(3) 3661(4) 61(1)
C(15) 8377(8) 5526(2) 2955(3) 53(1)
C(16) 5801(7) 6361(2) 2751(3) 46(1)
C(17) 7886(6) 6213(2) 1489(3) 38(1)
C(18) 9050(7) 5663(2) 2018(3) 41(1)
C(19) 10778(7) 5286(2) 1596(3) 45(1)
C(20) 11922(12) 4691(3) 2144(4) 71(2)
C(21) 11254(7) 5503(2) 702(3) 44(1)
C(22) 10159(7) 6090(2) 155(3) 43(1)
C(23) 7006(7) 6962(2) -19(3) 46(1)
C(24) 5941(8) 6783(3) -1141(3) 58(1)
C(25) 6715(14) 7306(4) -1791(4) 110(3)
C(26) 8807(12) 7652(3) -1174(5) 76(2)
C(27) 8382(9) 7608(3) -68(4) 59(1)
C(28) 10582(12) 7712(4) 735(5) 93(2)
表C.P3 之鍵結長度[Å]及角度[°]。
Br(1)-C(7) 1.891(4)
Br(2)-C(21) 1.895(4)
Cl(1)-C(2) 1.731(5)
Cl(2)-C(16) 1.737(5)
N(1)-C(2) 1.329(7)
N(1)-C(1) 1.330(7)
N(2)-C(2) 1.306(5)
N(2)-C(3) 1.347(5)
N(3)-C(3) 1.385(4)
N(3)-C(8) 1.402(5)
N(3)-C(9) 1.490(5)
N(4)-C(16) 1.317(6)
N(4)-C(15) 1.322(6)
N(5)-C(16) 1.320(5)
N(5)-C(17) 1.342(5)
N(6)-C(17) 1.377(4)
N(6)-C(22) 1.388(5)
N(6)-C(23) 1.497(5)
O(1)-C(8) 1.216(5)
O(2)-C(22) 1.220(5)
C(1)-C(4) 1.386(6)
C(1)-H(1) 0.9300
C(3)-C(4) 1.404(6)
C(4)-C(5) 1.441(6)
C(5)-C(7) 1.346(6)
C(5)-C(6) 1.498(7)
C(6)-H(6A) 0.9600
C(6)-H(6B) 0.9600
C(6)-H(6C) 0.9600
C(7)-C(8) 1.460(6)
C(9)-C(10) 1.534(6)
C(9)-C(13) 1.555(6)
C(9)-H(9) 0.9800
C(10)-C(11) 1.521(7)
C(10)-H(10A) 0.9700
C(10)-H(10B) 0.9700
C(11)-C(12) 1.512(7)
C(11)-H(11A) 0.9700
C(11)-H(11B) 0.9700
C(12)-C(13) 1.522(6)
C(12)-H(12A) 0.9700
C(12)-H(12B) 0.9700
C(13)-C(14) 1.509(7)
C(13)-H(13) 0.9800
C(14)-H(14A) 0.9600
C(14)-H(14B) 0.9600
C(14)-H(14C) 0.9600
C(15)-C(18) 1.400(6)
C(15)-H(15) 0.9300
C(17)-C(18) 1.412(6)
C(18)-C(19) 1.440(6)
C(19)-C(21) 1.344(5)
C(19)-C(20) 1.492(7)
C(20)-H(20A) 0.9600
C(20)-H(20B) 0.9600
C(20)-H(20C) 0.9600
C(21)-C(22) 1.469(6)
C(23)-C(27) 1.532(7)
C(23)-C(24) 1.543(6)
C(23)-H(23) 0.9800
C(24)-C(25) 1.486(8)
C(24)-H(24A) 0.9700
C(24)-H(24B) 0.9700
C(25)-C(26) 1.485(9)
C(25)-H(25A) 0.9700
C(25)-H(25B) 0.9700
C(26)-C(27) 1.539(7)
C(26)-H(26A) 0.9700
C(26)-H(26B) 0.9700
C(27)-C(28) 1.496(7)
C(27)-H(27) 0.9800
C(28)-H(28A) 0.9600
C(28)-H(28B) 0.9600
C(28)-H(28C) 0.9600
C(2)-N(1)-C(1) 113.8(4)
C(2)-N(2)-C(3) 115.8(4)
C(3)-N(3)-C(8) 120.4(3)
C(3)-N(3)-C(9) 119.7(3)
C(8)-N(3)-C(9) 119.6(3)
C(16)-N(4)-C(15) 114.3(4)
C(16)-N(5)-C(17) 115.8(4)
C(17)-N(6)-C(22) 120.6(3)
C(17)-N(6)-C(23) 119.9(3)
C(22)-N(6)-C(23) 119.5(3)
N(1)-C(1)-C(4) 124.5(5)
N(1)-C(1)-H(1) 117.8
C(4)-C(1)-H(1) 117.8
N(2)-C(2)-N(1) 129.3(4)
N(2)-C(2)-Cl(1) 115.5(4)
N(1)-C(2)-Cl(1) 115.2(3)
N(2)-C(3)-N(3) 117.4(3)
N(2)-C(3)-C(4) 121.6(3)
N(3)-C(3)-C(4) 121.0(4)
C(1)-C(4)-C(3) 115.1(4)
C(1)-C(4)-C(5) 124.1(4)
C(3)-C(4)-C(5) 120.8(3)
C(7)-C(5)-C(4) 116.6(4)
C(7)-C(5)-C(6) 124.0(4)
C(4)-C(5)-C(6) 119.4(4)
C(5)-C(6)-H(6A) 109.5
C(5)-C(6)-H(6B) 109.5
H(6A)-C(6)-H(6B) 109.5
C(5)-C(6)-H(6C) 109.5
H(6A)-C(6)-H(6C) 109.5
H(6B)-C(6)-H(6C) 109.5
C(5)-C(7)-C(8) 124.4(4)
C(5)-C(7)-Br(1) 122.6(3)
C(8)-C(7)-Br(1) 113.0(3)
O(1)-C(8)-N(3) 120.0(4)
O(1)-C(8)-C(7) 123.2(4)
N(3)-C(8)-C(7) 116.8(3)
N(3)-C(9)-C(10) 112.4(4)
N(3)-C(9)-C(13) 117.1(3)
C(10)-C(9)-C(13) 106.7(3)
N(3)-C(9)-H(9) 106.7
C(10)-C(9)-H(9) 106.7
C(13)-C(9)-H(9) 106.7
C(11)-C(10)-C(9) 104.6(4)
C(11)-C(10)-H(10A) 110.8
C(9)-C(10)-H(10A) 110.8
C(11)-C(10)-H(10B) 110.8
C(9)-C(10)-H(10B) 110.8
H(10A)-C(10)-H(10B) 108.9
C(12)-C(11)-C(10) 103.7(4)
C(12)-C(11)-H(11A) 111.0
C(10)-C(11)-H(11A) 111.0
C(12)-C(11)-H(11B) 111.0
C(10)-C(11)-H(11B) 111.0
H(11A)-C(11)-H(11B) 109.0
C(11)-C(12)-C(13) 104.4(4)
C(11)-C(12)-H(12A) 110.9
C(13)-C(12)-H(12A) 110.9
C(11)-C(12)-H(12B) 110.9
C(13)-C(12)-H(12B) 110.9
H(12A)-C(12)-H(12B) 108.9
C(14)-C(13)-C(12) 115.0(4)
C(14)-C(13)-C(9) 118.3(4)
C(12)-C(13)-C(9) 104.3(4)
C(14)-C(13)-H(13) 106.1
C(12)-C(13)-H(13) 106.1
C(9)-C(13)-H(13) 106.1
C(13)-C(14)-H(14A) 109.5
C(13)-C(14)-H(14B) 109.5
H(14A)-C(14)-H(14B) 109.5
C(13)-C(14)-H(14C) 109.5
H(14A)-C(14)-H(14C) 109.5
H(14B)-C(14)-H(14C) 109.5
N(4)-C(15)-C(18) 124.4(4)
N(4)-C(15)-H(15) 117.8
C(18)-C(15)-H(15) 117.8
N(4)-C(16)-N(5) 129.3(4)
N(4)-C(16)-Cl(2) 115.6(3)
N(5)-C(16)-Cl(2) 115.2(4)
N(5)-C(17)-N(6) 117.4(4)
N(5)-C(17)-C(18) 121.6(3)
N(6)-C(17)-C(18) 121.0(3)
C(15)-C(18)-C(17) 114.7(4)
C(15)-C(18)-C(19) 124.5(4)
C(17)-C(18)-C(19) 120.8(3)
C(21)-C(19)-C(18) 116.2(4)
C(21)-C(19)-C(20) 123.6(4)
C(18)-C(19)-C(20) 120.2(4)
C(19)-C(20)-H(20A) 109.5
C(19)-C(20)-H(20B) 109.5
H(20A)-C(20)-H(20B) 109.5
C(19)-C(20)-H(20C) 109.5
H(20A)-C(20)-H(20C) 109.5
H(20B)-C(20)-H(20C) 109.5
C(19)-C(21)-C(22) 124.4(4)
C(19)-C(21)-Br(2) 122.7(3)
C(22)-C(21)-Br(2) 112.9(3)
O(2)-C(22)-N(6) 120.8(4)
O(2)-C(22)-C(21) 122.4(4)
N(6)-C(22)-C(21) 116.8(3)
N(6)-C(23)-C(27) 116.1(3)
N(6)-C(23)-C(24) 113.3(4)
C(27)-C(23)-C(24) 105.5(3)
N(6)-C(23)-H(23) 107.2
C(27)-C(23)-H(23) 107.2
C(24)-C(23)-H(23) 107.2
C(25)-C(24)-C(23) 107.0(5)
C(25)-C(24)-H(24A) 110.3
C(23)-C(24)-H(24A) 110.3
C(25)-C(24)-H(24B) 110.3
C(23)-C(24)-H(24B) 110.3
H(24A)-C(24)-H(24B) 108.6
C(26)-C(25)-C(24) 108.0(4)
C(26)-C(25)-H(25A) 110.1
C(24)-C(25)-H(25A) 110.1
C(26)-C(25)-H(25B) 110.1
C(24)-C(25)-H(25B) 110.1
H(25A)-C(25)-H(25B) 108.4
C(25)-C(26)-C(27) 104.2(5)
C(25)-C(26)-H(26A) 110.9
C(27)-C(26)-H(26A) 110.9
C(25)-C(26)-H(26B) 110.9
C(27)-C(26)-H(26B) 110.9
H(26A)-C(26)-H(26B) 108.9
C(28)-C(27)-C(23) 117.0(5)
C(28)-C(27)-C(26) 114.3(6)
C(23)-C(27)-C(26) 105.4(4)
C(28)-C(27)-H(27) 106.5
C(23)-C(27)-H(27) 106.5
C(26)-C(27)-H(27) 106.5
C(27)-C(28)-H(28A) 109.5
C(27)-C(28)-H(28B) 109.5
H(28A)-C(28)-H(28B) 109.5
C(27)-C(28)-H(28C) 109.5
H(28A)-C(28)-H(28C) 109.5
H(28B)-C(28)-H(28C) 109.5
表D.P3 之異向性移位參數(Å2 × 103 )。異向性移位因子指數採用以下形式:-2π2 [h2 a*2 U11 + ... + 2 h k a* b* U12 ]。
   U11 U22 U33 U23 U13 U12
Br(1) 61(1) 56(1) 56(1) 8(1) 12(1) -16(1)
Br(2) 61(1) 65(1) 63(1) -9(1) 18(1) 19(1)
Cl(1) 56(1) 90(1) 55(1) 6(1) 27(1) 2(1)
Cl(2) 64(1) 77(1) 55(1) -11(1) 32(1) -2(1)
N(1) 62(2) 69(3) 47(2) -12(2) 19(2) 7(2)
N(2) 43(2) 44(2) 36(1) 2(1) 13(1) 4(1)
N(3) 48(2) 37(2) 34(1) -7(1) 15(1) -1(1)
N(4) 68(2) 58(3) 43(2) 5(2) 23(2) -8(2)
N(5) 46(2) 53(2) 38(2) -3(2) 14(1) -4(2)
N(6) 42(2) 44(2) 34(1) 3(1) 13(1) 4(1)
O(1) 74(2) 66(2) 67(2) -23(2) 42(2) -24(2)
O(2) 69(2) 64(2) 49(2) 10(1) 33(1) 15(2)
C(1) 66(3) 51(3) 47(2) -14(2) 10(2) 5(2)
C(2) 44(2) 62(3) 38(2) 3(2) 12(2) 12(2)
C(3) 42(2) 37(2) 31(2) 2(2) 6(1) 8(2)
C(4) 49(2) 38(2) 33(2) -2(2) 4(1) 7(2)
C(5) 58(2) 36(3) 40(2) 1(2) -2(2) 1(2)
C(6) 101(4) 47(3) 62(3) -11(2) 16(3) -13(3)
C(7) 47(2) 44(3) 37(2) 6(2) 5(1) -6(2)
C(8) 48(2) 47(2) 39(2) -3(2) 13(2) -6(2)
C(9) 55(2) 37(2) 42(2) -7(2) 21(2) -7(2)
C(10) 76(3) 49(3) 53(2) -6(2) 4(2) 9(2)
C(11) 78(3) 50(3) 72(3) -10(2) 16(2) 13(2)
C(12) 88(4) 52(3) 52(2) -12(2) 17(2) 10(3)
C(13) 50(2) 44(2) 53(2) -10(2) 12(2) -7(2)
C(14) 65(3) 57(3) 58(2) -6(2) 3(2) 9(2)
C(15) 66(3) 52(3) 42(2) 7(2) 12(2) -6(2)
C(16) 49(2) 55(3) 38(2) -8(2) 18(2) -10(2)
C(17) 38(2) 44(2) 32(2) -2(2) 9(1) -5(2)
C(18) 46(2) 40(2) 36(2) -1(2) 6(2) -6(2)
C(19) 50(2) 40(2) 43(2) -1(2) 5(2) 2(2)
C(20) 96(4) 56(3) 62(3) 11(3) 18(3) 23(3)
C(21) 44(2) 45(3) 42(2) -6(2) 10(2) 3(2)
C(22) 45(2) 48(2) 38(2) -1(2) 13(2) 4(2)
C(23) 42(2) 60(3) 38(2) 8(2) 15(2) 14(2)
C(24) 49(2) 76(3) 46(2) 5(2) 2(2) 3(2)
C(25) 143(6) 126(6) 53(3) 31(4) -1(3) -39(5)
C(26) 93(4) 64(4) 79(3) 24(3) 34(3) 4(3)
C(27) 65(3) 50(3) 63(3) 0(2) 12(2) 10(2)
C(28) 92(4) 65(4) 110(5) -11(4) -16(4) -9(3)
製劑 P4 3- 乙醯基 -7- -1- 環戊基 -4- 甲基 -1,6- 㖠啶 -2(1H)- (P4 )
Figure 02_image060
步驟 1. 合成 1-[6- -4-( 環戊胺基 ) 吡啶 -3- ] 乙酮 (C10 )
在15℃至30℃下將1-(4,6-二氯吡啶-3-基)乙酮(176 g,926 mmol)、環戊胺(197 g,2.31 mol)及碳酸鉀(448 g,3.24 mol)於乙腈(1.76 L,10體積;針對此實驗中以「體積」呈現之單位,1體積=0.176 L)中之混合物攪拌30小時,接著過濾反應混合物,且用乙腈(3×5體積)洗滌過濾墊。將所合併之濾液在真空中濃縮至大約2至3體積。隨後添加第三丁基甲基醚(5體積),且進行濃縮至2至3體積,直至如由GC分析評定之乙腈殘餘物≤0.3%為止。再次添加第三丁基甲基醚(5體積),且用純化水(2 × 5體積)洗滌所得溶液並在真空中濃縮至大約2至3體積。在添加庚烷(5體積)之後,將混合物在真空中濃縮至大約2至3體積;重複此添加/濃縮直至由GC分析的第三丁基甲基醚剩餘之百分比≤0.1%為止。在-20℃至-5℃下將所得混合物攪拌1至2小時,之後經由過濾收集固體以得到呈固體狀之C10 。產率:204 g,855 mmol,92%。代表性1 H NMR (500 MHz, 氯仿-d ) δ 9.20 (br s, 1H), 8.56 (s, 1H), 6.58 (s, 1H), 3.87 - 3.77 (m, 1H), 2.55 (s, 3H), 2.10 - 1.98 (m, 2H), 1.83 - 1.72 (m, 2H), 1.72 - 1.61 (m, 2H), 1.61 - 1.52 (m, 2H)。
步驟 2. 合成 3- 乙醯基 -7- -1- 環戊基 -4- 甲基 -1,6- 㖠啶 -2(1H)- (P4 )
在75℃至85℃下將C10 (177 g,741 mmol)與2,2,6-三甲基-4H- 1,3-二氧雜環己烯-4-酮(316 g,2.22 mol)之混合物攪拌72小時,接著添加甲苯(354 g,2體積),且將所得混合物冷卻至15℃至30℃。添加二氯甲烷(2體積),且在15℃至30℃下將混合物攪拌30至40分鐘,接著將其用矽膠(354 g)處理,且在15℃至30℃下繼續攪拌20至30分鐘。在此混合物已經矽膠墊(177 g)過濾之後,進一步用乙酸丙-2-基酯與庚烷(大約45體積)之1:1混合物溶離過濾墊,且藉由薄層層析(溶離劑:3:1石油醚/庚烷)監測溶離劑直至無其他產物P4 經偵測到為止。將適當溶離液合併且在真空中濃縮至2至3體積。隨後添加2-丙醇(5體積),且將混合物濃縮至2至3體積;重複此過程直至藉由GC分析之殘餘乙酸丙-2-基酯≤0.2%為止。將所得混合物冷卻至-5℃至5℃且攪拌1至2小時,接著將其過濾以得到呈固體狀之P4 。產率:69.0 g,226 mmol,30%。代表性1 H NMR (500 MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.86 (s, 1H), 7.84 (s, 1H), 5.31 - 5.20 (m, 1H), 2.43 (s, 3H), 2.36 (s, 3H), 2.16 - 2.04 (m, 2H), 2.00 - 1.84 (m, 4H), 1.70 - 1.58 (m, 2H)。
製劑 P5 外消旋 - 乙酸 (1S,2S)-2-[6- -5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ]-1- 甲基環戊基酯 (P5 )
Figure 02_image062
步驟 1. 合成外消旋 -1-[4-{[(1S,2S)-2- 羥基 -2- 甲基環戊基 ] 胺基 }-2-( 甲硫基 ) 嘧啶 -5- ] 乙酮 (C11 )
在室溫下將1-[4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基]乙酮(1.24 g,6.12 mmol)、三乙胺(2.56 mL,18.4 mmol)及反式2-胺基-1-甲基環戊醇(此反應物可使用A. Saeed等人,J. Med. Chem. 2016, 59 , 750-755之方法來製備) (775 mg,6.73 mmol)於乙醇(12 mL)中之混合物攪拌2小時。在反應混合物已在真空中濃縮之後,將殘餘物用水稀釋且用乙酸乙酯萃取三次。合併之有機層經硫酸鎂乾燥,過濾,在減壓下濃縮,且經由矽膠層析(梯度:20%至60%乙酸乙酯/庚烷)純化,從而得到呈淡黃色固體狀之C11 。產率:1.52 g,5.40 mmol,88%。LCMSm/z 282.0 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ) δ 9.29 (br s, 1H), 8.61 (s, 1H), 4.40 - 4.33 (m, 1H), 4.33 (s, 1H), 2.54 (s, 3H), 2.53 (s, 3H), 2.30 - 2.19 (m, 1H), 2.03 - 1.90 (m, 1H), 1.90 - 1.57 (m, 4H), 1.14 (s, 3H)。
步驟 2. 合成外消旋 -8-[(1S,2S)-2- 羥基 -2- 甲基環戊基 ]-5- 甲基 -2-( 甲硫基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C12 ) 將(二乙氧基磷醯基)乙酸乙酯(8.99 mL,45.3 mmol)緩慢添加至氫化鈉(60%於礦物油中;1.73 g,43.2 mmol)於四氫呋喃(60 mL)中之0℃混合物中,接著去除冷卻浴且添加C11 (2.54 g,9.03 mmol)於四氫呋喃(30 mL)中的溶液。將反應混合物加熱至65℃持續18小時,隨後冷卻至室溫,用水稀釋,且用乙酸乙酯萃取兩次。合併之有機層經硫酸鎂乾燥,過濾,且在真空中濃縮;矽膠層析(梯度:0%至60%乙酸乙酯/庚烷)得到呈淡黃色固體狀之C12 (2.52 g)。藉由1 H NMR分析,此材料含有雜質;此材料之一部分直接進行至以下步驟。LCMSm/z 306.1 [M+H]+ .1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 特徵峰: δ 8.71 (s, 1H), 6.42 (br q,J = 1.2 Hz, 1H), 5.81 (dd,J = 9.0, 8.2 Hz, 1H), 2.88 - 2.75 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.43 (d,J = 1.2 Hz, 3H), 2.30 - 2.19 (m, 1H), 1.14 (s, 3H)。
步驟 3. 合成外消旋 - 乙酸 (1S,2S)-1- 甲基 -2-[5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ] 環戊酯 (C13 )
將4-(吡咯啶-1-基)吡啶(124 mg,0.837 mmol)添加至C12 (來自前一步驟;1.26 g,≤4.13 mmol)、三乙胺(1.73 mL,12.4 mmol)及乙酸酐(0.780 mL,8.25 mmol)於氯仿(20 mL)中之混合物中,且將反應混合物加熱至70℃持續16小時。隨後將反應混合物用水淬滅且用乙酸乙酯萃取兩次。合併之有機層經硫酸鎂乾燥,過濾,在真空中濃縮,且經由矽膠層析(梯度:0%至50%乙酸乙酯/庚烷)純化以得到呈白色固體狀之C13 。產率:793 mg,2.28 mmol,51%,歷經2個步驟。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ), 特徵峰: δ 8.91 (s, 1H), 6.45 - 6.41 (m, 1H), 6.28 - 6.20 (m, 1H), 2.62 (s, 3H), 2.45 (d,J = 1.2 Hz, 3H), 2.25 (ddd,J = 13.3, 11.1, 7.3 Hz, 1H), 1.95 (s, 3H), 1.35 (s, 3H)。
步驟 4. 合成外消旋 - 乙酸 (1S,2S)-2-[6- -5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ]-1- 甲基環戊酯 (P5 )
將溴(0.16 mL,3.1 mmol)於二氯甲烷(10 mL)中之溶液添加至C13 (715 mg,2.06 mmol)於二氯甲烷(10 mL)中之溶液中,且將反應混合物在室溫下攪拌1小時。此時,LCMS分析指示產物P5 存在:LCMSm/z 426.0 (觀測到溴同位素圖案) [M+H]+ 。藉由添加10%硫代硫酸鈉水溶液將反應混合物淬滅,且隨後用乙酸乙酯萃取。有機層經硫酸鎂乾燥,過濾,且在真空中濃縮。在經由矽膠層析(梯度:0%至35%乙酸乙酯/庚烷)純化之後,分離呈白色發泡體狀之P5 。產率:475 mg,1.11mmol,54%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 特徵峰: δ 8.81 (s, 1H), 6.52 - 6.34 (br m, 1H), 2.65 (s, 3H), 2.63 (s, 3H), 2.11 - 2.01 (m, 2H), 2.00 (s, 3H), 1.87 - 1.69 (m, 2H, 假定;由水峰部分遮擋), 1.43 (s, 3H)。
製劑 P6 6- 乙醯基 -2- -8- 環戊基 -5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P6 )
Figure 02_image064
步驟 1 . 合成 2- -8- 環戊基 -6-(1- 乙氧基乙烯基 )-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C14 )
將雙(三-第三丁基膦)鈀(0) (1.96 g,3.84 mmol)及三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(36.0 g,99.7 mmol)添加至6-溴-2-氯-8-環戊基-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮(26.3 g,76.8 mmol)於1-甲基吡咯啶-2-酮(400 mL)中之溶液中。在45℃下將反應混合物攪拌48小時之後,將其倒入飽和氯化鈉水溶液(1 L)與冰(400 g)之混合物中,且隨後用乙酸乙酯(1 L)稀釋。用乙酸乙酯(2 × 1 L)萃取水層,且合併之有機層用飽和氯化鈉水溶液(1 L)洗滌,經硫酸鎂(100 g)乾燥,過濾,且在真空中濃縮。矽膠層析(梯度:5%至9%乙酸乙酯/石油醚)得到呈淡黃色膠狀物之C14 。產率:23.0 g,68.9 mmol,90%。LCMSm/z 333.9 (觀測到氯同位素圖案)[M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ) δ 8.78 (s, 1H), 5.93 - 5.81 (m, 1H), 4.54 (d,J = 2.6 Hz, 1H), 4.18 (d,J = 2.6 Hz, 1H), 3.93 (q,J = 7.0 Hz, 2H), 2.46 (s, 3H), 2.27 - 2.15 (m, 2H), 2.15 - 2.04 (m, 2H), 1.94 - 1.83 (m, 2H), 1.70 - 1.58 (m, 2H), 1.35 (t,J = 7.0 Hz, 3H)。
步驟 2. 合成 6- 乙醯基 -2- -8- 環戊基 -5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P6 ) C14 (14.3 g,42.8 mmol)於四氫呋喃(200 mL)中之溶液中添加氫氯酸(1 M;156 mL,156 mmol)。在25℃下將反應混合物攪拌30分鐘之後,將其分配於飽和碳酸氫鈉水溶液(200 mL)與乙酸乙酯(400 mL)之間。在二氧化碳產生停止後,用乙酸乙酯(2 × 200 mL)萃取水層,且合併之有機層經硫酸鎂(30 g)乾燥,過濾,在真空中濃縮,且藉由矽膠層析(梯度:9%至25%乙酸乙酯/石油醚)純化,從而得到呈淡黃色固體狀之P6 。產率:9.1 g,30 mmol,70%。LCMSm/z 305.9 (觀測到氯同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ) δ 8.85 (s, 1H), 5.91 - 5.78 (m, 1H), 2.53 (s, 3H), 2.39 (s, 3H), 2.27 - 2.16 (m, 2H), 2.16 - 2.04 (m, 2H), 1.97 - 1.86 (m, 2H), 1.74 - 1.61 (m, 2H)。
製劑 P7 6- -2- -8-[(1R,2S)-2- 乙基環戊基 ]-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P7 )
Figure 02_image066
步驟 1. 合成 5- -2- -N-[(1R,2S)-2- 乙基環戊基 ] 嘧啶 -4- (C15 )
在室溫下將(1R,2S )-2-乙基環戊胺 鹽酸鹽(使用由W.Wiehl及A. W. Frahm,Chemische Berichte 1986, 119 , 2668-2677描述之方法來製備) (250 mg,1.67 mmol)、5-溴-2,4-二氯嘧啶(381 mg,1.67 mmol)及N,N- 二異丙基乙胺 (864 mg,6.68 mmol)於二甲亞碸(40 mL)中之溶液攪拌20小時。隨後將反應混合物用水(20 mL)稀釋且用乙酸乙酯(3 × 50 mL)萃取;將合併之有機層用水(3 × 50 mL)且用飽和氯化鈉水溶液(30 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮。矽膠層析(梯度:0%至20%乙酸乙酯/庚烷)得到呈無色油狀物之C15 。產率:162 mg,0.532 mmol,32%。LCMSm/z 303.8 (觀測到溴-氯同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ) δ 8.09 (s, 1H), 5.43 (br d,J = 8.2 Hz, 1H), 4.63 - 4.51 (m, 1H), 2.12 - 1.87 (m, 3H), 1.82 - 1.56 (m, 3H), 1.45 - 1.29 (m, 2H), 1.28 - 1.15 (m, 1H), 0.91 (t,J = 7.3 Hz, 3H). 應注意,未確證C15 之絕對立體化學。針對P3 之絕對立體化學測定參見製劑P3,該絕對立體化學測定自對應甲基同類物(1R ,2S )-2-甲基環戊胺導出。經由Wiehl及Frahm之相同方法合成(1R ,2S )-2-甲基環戊胺及(1R ,2S )-2-乙基環戊胺,且已假定(1R ,2S )-2-乙基環戊胺將因此展現關於環戊烷相同的立體化學。
步驟 2. 合成 2- -8-[(1R,2S)-2- 乙基環戊基 ]-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C16 ) C15 (162 mg,0.532 mmol)、(2E)-丁-2-烯酸(137 mg,1.59 mmol)、乙酸鈀(II) (11.9 mg,53.0 µmol)及三乙胺(0.371 mL,2.66 mmol)於1-甲基吡咯啶-2-酮(20 mL)中之混合物用氮氣脫氣10分鐘。隨後將反應瓶加蓋且加熱至65℃持續20小時。再次添加(2E)-丁-2-烯酸(137 mg,1.59 mmol)、乙酸鈀(II) (11.9 mg,53.0 µmol)及三乙胺(0.371 mL,2.66 mmol),隨後用氮氣進行類似脫氣,接著將反應混合物加熱至65℃持續16小時。再次添加乙酸鈀(II) (11.9 mg,53.0 µmol),重複氮氣吹掃,且繼續在65℃下加熱3小時。隨後添加乙酸酐(0.100 mL,1.06 mmol),且將反應混合物加熱至65℃持續16小時,接著將其倒入水中,且藉由添加飽和碳酸氫鈉水溶液來中和。用乙酸乙酯(3 × 10 mL)萃取所得混合物,且將合併之有機層用飽和氯化鈉水溶液(3 × 10 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮。經由矽膠層析(梯度:0%至30%乙酸乙酯/庚烷)純化殘餘物以得到呈黃色油狀物的C16 與(2E)-丁-2-烯酸之混合物(115 mg)。LCMSm/z 291.8 (觀測到氯同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ),C16 之特徵峰: δ 8.72 (s, 1H), 6.51 (br s, 1H), 6.02 - 5.91 (m, 1H), 2.41 (d,J = 1.3 Hz, 3H), 0.74 (t,J = 7.4 Hz, 3H)。
步驟 3. 合成 6- -2- -8-[(1R,2S)-2- 乙基環戊基 ]-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P7 )
N -溴代丁二醯亞胺(105 mg,0.590 mmol)及草酸(9.9 mg,0.11 mmol)添加至C16 (來自前一步驟;115.0 mg,<0.394 mmol)於乙腈中之溶液中,且將反應混合物加熱至60℃持續16小時。隨後在真空中濃縮反應混合物,且使用矽膠層析(梯度:0%至50%乙酸乙酯/庚烷)純化殘餘物以得到呈澄清黃色油狀物之P7 。藉由1 H NMR分析,此材料不完全純淨。產率:80 mg,0.22 mmol,41%,歷經2個步驟。LCMSm/z 369.7 (觀測到溴-氯同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ), 僅產物峰: δ 9.20 (s, 1H), 6.04 - 5.91 (m, 1H), 2.66 (s, 3H), 2.43 - 2.29 (m, 1H), 2.22 - 2.08 (m, 1H), 2.07 - 1.84 (m, 4H), 1.63 - 1.46 (m, 1H), 1.07 - 0.90 (m, 2H), 0.74 (t,J = 7.3 Hz, 3H)。
製劑 P8 7- -4- 甲基 -1-[(3S)- 四氫呋喃 -3- ]-1,6- 㖠啶 -2(1H)- (P8 )
Figure 02_image068
步驟 1 . 合成 6- -4-[(3S)- 四氫呋喃 -3- 基胺基 ] 吡啶 -3- 甲酸甲酯 (C17 )
將(3S )-四氫呋喃-3-胺(1.69 g,19.4 mmol)逐份添加至4,6-二氯吡啶-3-甲酸甲酯(2.0 g,9.7 mmol)於乙腈(50 mL)中之0℃溶液中。在40℃下將反應混合物攪拌44小時之後,將其用乙酸乙酯(50 mL)稀釋,用飽和氯化銨水溶液(20 mL)及飽和氯化鈉水溶液(20 mL)依序洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮。經由矽膠層析(梯度:0%至30%乙酸乙酯/石油醚)之純化得到呈白色固體狀之C17 。產率:1.70 g,6.62 mmol,68%。LCMSm/z 256.7 (觀測到氯同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 甲醇-d 4 ) δ 8.58 (s, 1H), 8.45 (br d,J = 7 Hz, 1H), 6.84 (s, 1H), 4.33 - 4.25 (m, 1H), 4.01 - 3.93 (m, 2H), 3.92 - 3.84 (m, 1H), 3.89 (s, 3H), 3.74 (dd,J = 9.4, 2.7 Hz, 1H), 2.44 - 2.33 (m, 1H), 1.96 - 1.87 (m, 1H)。
步驟 2. 合成 {6- -4-[(3S)- 四氫呋喃 -3- 基胺基 ] 吡啶 -3- } 甲醇 (C18 ) 以逐份方式向C17 (1.90 g,7.40 mmol)於四氫呋喃(30 mL)中之0℃溶液中添加氫化鋰鋁(843 mg,22.2 mmol)。在室溫(15℃)下攪拌反應混合物2小時之後,將其用十水合硫酸鈉淬滅且過濾。用乙酸乙酯(5×50 mL)洗滌濾餅,且在真空中濃縮經合併之濾液以得到呈淡黃色膠狀物之C18 (1.96 g)。藉由1 H NMR分析,此材料不純淨。乙醯化衍生物之LCMSm/z 270.8 (觀測到氯同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 僅產物峰: δ 7.76 (s, 1H), 6.46 (s, 1H), 5.82 - 5.70 (m, 1H), 4.62 (s, 2H), 4.13 - 4.03 (m, 1H), 4.02 - 3.94 (m, 2H), 3.93 - 3.85 (m, 1H), 3.74 (dd,J = 9.3, 2.8 Hz, 1H), 2.38 - 2.27 (m, 1H), 1.96 - 1.86 (m, 1H)。
步驟 3. 合成 6- -4-[(3S)- 四氫呋喃 -3- 基胺基 ] 吡啶 -3- 甲醛 (C19 )
C18 (來自前一步驟;1.96 g,≤7.40 mmol)於氯仿(50 mL)中之溶液中添加氧化錳(IV) (6.44 g,74.1 mmol),且在50℃下將反應混合物攪拌6小時。隨後將反應混合物過濾,且在真空中濃縮濾液;經由矽膠層析(梯度:10%至30%乙酸乙酯/石油醚)純化殘餘物得到呈黃色固體狀之C19 。產率:1.17 g,5.16 mmol,70%,歷經2個步驟。LCMSm/z 227.0 (觀測到氯同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ) δ 9.84 (d,J = 0.7 Hz, 1H), 8.76 (br s, 1H), 8.33 (s, 1H), 6.57 (s, 1H), 4.19 - 4.10 (m, 1H), 4.06 - 3.97 (m, 2H), 3.91 (ddd,J = 8.6, 8.5, 5.3 Hz, 1H), 3.77 (dd,J = 9.4, 3.2 Hz, 1H), 2.46 - 2.30 (m, 1H), 2.01 - 1.90 (m, 1H)。
步驟 4. 合成 1-{6- -4-[(3S)- 四氫呋喃 -3- 基胺基 ] 吡啶 -3- } 乙醇 (C20 )
C19 (1.17 g,5.16 mmol)於四氫呋喃(30 mL)中之0℃溶液中添加溴化甲基鎂(3 M溶液於乙醚中;5.16 mL,15.5 mmol)。在15℃下將反應混合物攪拌16小時,接著將其用水(15 mL)處理,且用乙酸乙酯(4×50 mL)萃取。合併之有機層經過濾,且在真空中濃縮濾液以得到呈白色固體狀之C20 。產率:1.19 g,4.90 mmol,95%。LCMSm/z 243.0 (觀測到氯同位素圖案) [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ) δ 7.68 (s, 1H), 6.42 (s, 1H), 6.25 (br d,J = 6.4 Hz, 1H), 4.88 (q,J = 6.7 Hz, 1H), 4.09 - 4.01 (m, 1H), 4.01 - 3.85 (m, 3H), 3.76 - 3.68 (m, 1H), 2.86 - 2.69 (m, 1H), 2.37 - 2.24 (m, 1H), 1.97 - 1.82 (m, 1H), 1.55 (d,J = 6.6 Hz, 3H)。
步驟 5. 合成 1-{6- -4-[(3S)- 四氫呋喃 -3- 基胺基 ] 吡啶 -3- } 乙酮 (C21 )
將氧化錳(IV) (4.26 g,49.0 mmol)添加至C20 (1.19 g,4.90 mmol)於氯仿(70 mL)中之溶液中,且在50℃下將反應混合物攪拌16小時。隨後將反應混合物過濾;在真空中濃縮濾液得到呈白色固體狀之C21 。產率:1.10 g,4.57 mmol,93%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ) δ 9.36 (br s, 1H), 8.61 (s, 1H), 6.55 (s, 1H), 4.15 - 4.07 (m, 1H), 4.06 - 3.95 (m, 2H), 3.90 (ddd,J = 8.6, 8.4, 5.2 Hz, 1H), 3.75 (dd,J = 9.3, 3.2 Hz, 1H), 2.58 (s, 3H), 2.41 - 2.29 (m, 1H), 1.98 - 1.89 (m, 1H)。
步驟 6. 合成 7- -4- 甲基 -1-[(3S)- 四氫呋喃 -3- ]-1,6- 㖠啶 -2(1H)- (P8 )
以逐滴方式將乙酸乙酯(1.13 mL,11.6 mmol)緩慢添加至雙(三甲基矽烷基)胺基鋰(1 M溶液於四氫呋喃中;11.6 mL,11.6 mmol)於四氫呋喃(10 mL)中之-78℃溶液中。在-78℃下繼續攪拌30分鐘,接著一次性添加C21 (929 mg,3.86 mmol)於四氫呋喃(8 mL)中之溶液。隨後將反應混合物自冷卻浴去除且升溫至室溫(15℃);在室溫下繼續攪拌額外16小時。在用水(30 mL)淬滅反應混合物之後,將其用乙酸乙酯(30 mL)稀釋,且用乙酸乙酯(3×30 mL)萃取。合併之有機層用飽和氯化銨水溶液(20 mL)及飽和氯化鈉水溶液(25 mL)依序洗滌,經硫酸鎂乾燥,過濾,且在真空中濃縮。將殘餘物與使用C21 (250 mg,1.04 mmol)進行之類似反應的粗產物合併,且使用矽膠層析(梯度:0%至50%乙酸乙酯/石油醚)純化。此得到呈白色固體狀之P8 。合併產率:1.20 g,4.53 mmol,92%。LCMSm/z 264.9 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 甲醇-d 4 ) δ 8.78 (s, 1H), 8.01 (s, 1H), 6.57 (q,J = 1.3 Hz, 1H), 6.21 - 6.08 (m, 1H), 4.44 (ddd,J = 8.6, 8.5, 3.1 Hz, 1H), 4.10 (dd,J = 10.1, 4.4 Hz, 1H), 3.98 (dd,J = 9.7, 9.6 Hz, 1H), 3.82 (ddd,J = 9.3, 9.3, 6.8 Hz, 1H), 2.53 (d,J = 1.2 Hz, 3H), 2.40 - 2.21 (m, 2H)。
製劑 P9 外消旋 -8-[(1S,2R,5R)- 雙環 [3.1.0] -2- ]-2- -5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P9 )
Figure 02_image070
Figure 02_image072
步驟 1. 合成外消旋 -(1S,2R,5R)-N- 苯甲基雙環 [3.1.0] -2- (C22 )
在18℃下將雙環[3.1.0]己-2-酮(385 mg,4.00 mmol)、苯甲胺(429 mg,4.00 mmol)、硼氫化鈉(227 mg,6.00 mmol)及乙酸(240 mg,4.0 mmol)於二氯甲烷(5 mL)與甲醇(5 mL)之混合物中之混合物攪拌10小時。在真空中濃縮提供呈黃色膠狀物之C22 。藉由1 H NMR分析,此材料不純淨,且經判斷含有殘餘苯甲胺。產率:700 mg,<3.7 mmol,<92%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ),C22 之特徵/假定峰: δ 7.40 - 7.21 (m, 5H), 3.93 - 3.78 (m, 2H), 3.48 - 3.38 (m, 1H), 0.40 - 0.34 (m, 1H), 0.33 - 0.25 (m, 1H)。
步驟 2. 合成外消旋 -(1S,2R,5R)- 雙環 [3.1.0] -2- 鹽酸鹽 (C23 )
用氫氣將C22 鹽酸 (800 mg,3.58 mmol)、氫氧化鈀/碳(800 mg)及氯化氫(4 M溶液於乙酸乙酯中;1.8 mL,7.2 mmol)於甲醇(15 mL)中之混合物脫氣3次。隨後在氫氣(1大氣壓)下在50℃下將反應混合物攪拌5小時,接著將其過濾;在真空中濃縮濾液以得到呈白色固體狀之C23 。產率:452 mg,3.38 mmol,94%。
步驟 3. 合成外消旋 -N-[(1S,2R,5R)- 雙環 [3.1.0] -2- ]-5- -2- 氯嘧啶 -4- (C24 )
將三乙胺(1.51 g,14.9 mmol)逐滴添加至5-溴-2,4-二氯嘧啶(850 mg,3.73 mmol)及C23 (452 mg,3.38 mmol)於乙腈(50 mL)中之0℃溶液中。使反應混合物升溫至室溫,且在20℃下攪拌18小時,接著將其用氯化銨水溶液(30 mL)處理,且用乙酸乙酯(2×50 mL)萃取。將合併之有機層乾燥,過濾,在真空中濃縮,且經歷矽膠層析(梯度:1%至4%乙酸乙酯/石油醚),從而得到呈白色固體狀之C24 。產率:790 mg,2.74 mmol,81%。LCMSm/z 289.6 (觀測到溴-氯同位素圖案) [M+H]+
步驟 4. 合成外消旋 -8-[(1S,2R,5R)- 雙環 [3.1.0] -2- ]-2- -5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P9 )
將氬氣鼓泡通過C24 (395 mg,1.37 mmol)、(2E)-丁-2-烯酸(354 mg,4.11 mmol)及N,N -二異丙基乙胺(1.77 g,13.7 mmol)於四氫呋喃(20 mL)中之溶液,且隨後添加雙(苯甲腈)氯化鈀(II) (52.5 mg,0.137 mmol)及三-鄰甲苯基膦(41.7 mg,0.137 mmol)。將反應容器密封且在70℃下加熱18小時,接著添加乙酸酐(279 mg,2.73 mmol),且在70℃下繼續加熱3小時。在減壓下去除揮發物之後,藉由矽膠層析(梯度:1%至30%乙酸乙酯/石油醚)純化殘餘物,從而得到呈淡黃色固體之P9 。產率:290 mg,1.05 mmol,77%。LCMSm/z 275.8 (觀測到氯同位素圖案) [M+H]+
製劑 P10 外消旋 -6- -8-[(1R,2S)-2- -2- 甲基環戊基 ]-5- 甲基 -2-( 甲硫基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P10 )
Figure 02_image074
Figure 02_image076
步驟 1. 合成外消旋 -[(1R,2R)-2- 羥基 -2- 甲基環戊基 ] 胺甲酸苯甲酯 (C25 )
將溴化甲基鎂(3.0 M;11.4 mL,34.2 mmol)緩慢添加至(2-側氧基環戊基)胺甲酸苯甲酯(2.67 g,11.4 mmol)於四氫呋喃(24 mL)中之-78℃溶液中,且在-78℃下將反應混合物攪拌4小時;隨後使其升溫至室溫。將水謹慎地添加至反應混合物中,隨後添加氫氯酸(1 M;2 mL),且用乙酸乙酯將水層萃取兩次。在合併之有機層已經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮之後,經由矽膠層析(梯度:0%至100%乙酸乙酯/庚烷)純化殘餘物以得到呈淡黃色固體狀之C25 。起始物質(2-側氧基環戊基)胺甲酸苯甲酯(1.36 g,5.83 mmol)亦自層析純化復原。C25 之產率:878 mg,3.52 mmol,31%;基於經復原之起始物質料,C25 之產率為63%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ) δ 7.41 - 7.29 (m, 5H), 5.12 (s, 2H), 4.77 (br s, 1H), 3.87 (ddd,J = 9.9, 8.2, 6.0 Hz, 1H), 2.19 - 2.08 (m, 1H), 1.94 - 1.82 (m, 1H), 1.81 - 1.68 (m, 2H), 1.68 - 1.57 (m, 1H), 1.40 - 1.28 (m, 1H), 1.16 (s, 3H)。
步驟 2. 合成外消旋 -[(1R,2S)-2- -2- 甲基環戊基 ] 胺甲酸苯甲酯 (C26 ) 將(二乙胺基)三氟化硫(0.40 mL,3.0 mmol)添加至C25 (349 mg,1.40 mmol)於二氯甲烷(8 mL)中之-78℃溶液中。在-78℃下將反應混合物攪拌4小時,接著在-78℃下將其用2-丙醇稀釋,且隨後升溫至室溫。在真空中濃縮反應混合物之後,經由矽膠層析(梯度:0%至30%乙酸乙酯/庚烷)純化殘餘物,從而得到呈白色固體狀之C26 。基於單晶X射線結構性測定(見下文)來建立C26 之所指示相對立體化學。產率:281 mg,1.12 mmol,80%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ) δ 7.41 - 7.29 (m, 5H), 5.12 (s, 2H), 5.03 - 4.92 (m, 1H), 3.92 - 3.75 (m, 1H), 2.18 - 1.94 (m, 2H), 1.89 - 1.68 (m, 2H), 1.68 - 1.54 (m, 2H), 1.40 (d,J HF = 21.7 Hz, 3H)。
戊烷向C26 之二氯乙烷溶液中的蒸汽擴散得到用於X射線結構測定之晶體。
C26 之單晶 X 射線 結構性測定 單晶 X 射線 分析
在配備有Mo Kα 輻射(λ=0.71073Å)之Bruker Kappa APEX-II CCD繞射儀上執行資料收集。將無色塊之0.313×0.155×0.117 mm碎片安置於具有Paratone油之CryoLoop上。使用Φ及ω掃描在100(2) K下在氮氣流中收集資料。晶體至偵測器距離為40 mm,且使用1.0°之掃描寬度,曝露時間為每幀30秒。達至θ 25.00°的資料收集為99.9%完整性。收集到覆蓋指數-21<=h <=25、-5<=k <=5、-15<=l <=13之總共9647個反射。發現2400個反射為對稱性無關的,其中Rint 為0.0561。指標(indexing)及單位晶胞精修指示原始單斜晶格。發現空間群為P 21 /c 。資料使用Bruker SAINT軟體程式整合且使用SADABS軟體程式縮放。利用直接方法(SHELXS)解析產生與所提出結構相符的完全定相模型。
藉由全矩陣最小平方(SHELXL-2014;G. M. Sheldrick, SHELXTL Version 2014/7. http://shelx.uni-ac.gwdg.de/SHELX/ index.php)異向性地精修所有非氫原子。使用騎乘模型置放所有氫原子。在SHELXL-2014中使用適當HFIX命令限定該等氫原子相對於其母原子的位置。結晶資料概述於表E中。原子座標、鍵結長度、鍵結角度及移位參數列於表F至表K中。 表E.C26 之晶體資料及結構精修。
實驗式 C14 H18 FNO2   
式量 251.29   
溫度 100.0 K   
波長 0.71073 Å   
晶體系統 單斜晶   
空間群 P 1 21 /c 1   
單位晶胞維度 a = 21.238(2) Å α = 90°
   b = 4.8573(5) Å β = 97.271(5)°
   c = 12.8319(13) Å γ = 90°
體積 1313.1(2) Å3   
Z 4   
密度(計算值) 1.271 Mg/m3   
吸收係數 0.094 mm- 1   
F (000) 536   
晶體大小 0.313 x 0.155 x 0.117 mm3   
資料收集之θ範圍 2.901至25.387°   
指數範圍 -21<=h <=25, -5<=k <=5, -15<=l <=13   
所收集之反射 9647   
無關反射 2400 [Rint = 0.0561]   
達至θ=25.000°之完整性 99.9%   
吸收校正 來自等效物之半實驗校正   
最大及最小透射率 0.0916及0.0649   
精修方法 F2 之全矩陣最小平方   
資料/限制/參數 2400 / 120 / 229   
F2 之擬合優度 1.081   
最終 R 指數 [I>2σ(I)] R 1 = 0.0655,wR 2 = 0.1433   
R指數(所有資料) R 1 = 0.1181,wR 2 = 0.1677   
消光係數 n/a   
最大差異峰及孔穴 0.199及-0.206 e.Å- 3   
表F.C26 之原子座標(×104 )及等效等向性移位參數(Å2 ×103 )。U(eq)定義為正交Uij 張量之跡線的三分之一。
   x y z U(eq)
O(1) 7454(1) 1289(4) 6754(2) 44(1)
O(2) 7039(1) 5049(4) 5898(1) 29(1)
N(1) 7846(1) 5561(5) 7148(2) 42(1)
C(7) 7455(1) 3761(6) 6618(2) 29(1)
C(8) 6549(1) 3341(6) 5343(2) 33(1)
C(9) 6224(1) 5088(5) 4470(2) 26(1)
C(10) 5705(1) 6681(6) 4620(2) 33(1)
C(11) 5423(2) 8381(6) 3827(2) 37(1)
C(12) 5665(2) 8493(6) 2874(2) 34(1)
C(13) 6178(2) 6908(6) 2722(2) 35(1)
C(14) 6459(2) 5207(6) 3512(2) 32(1)
F(1) 8476(2) 8644(8) 8816(3) 53(1)
C(1) 8433(5) 4610(20) 7822(7) 37(2)
C(2) 9098(5) 5300(20) 7506(7) 50(2)
C(3) 9531(4) 4960(30) 8517(7) 74(3)
C(4) 9117(5) 4990(30) 9444(7) 42(2)
C(5) 8476(4) 5724(14) 8928(5) 34(1)
C(6) 7938(4) 4967(16) 9490(6) 46(2)
F(1B) 8936(2) 8411(8) 7779(4) 72(2)
C(1B) 8246(4) 4797(19) 8080(7) 45(2)
C(2B) 8106(5) 6190(20) 9124(7) 72(2)
C(3B) 8737(6) 5890(30) 9817(8) 125(4)
C(4B) 9238(6) 5150(30) 9119(10) 73(3)
C(5B) 8919(4) 5541(14) 8036(8) 56(2)
C(6B) 9187(5) 4170(20) 7138(9) 90(3)
表G.C26 之鍵結長度[Å]及角度[°]。
O(1)-C(7) 1.213(3)
O(2)-C(7) 1.349(3)
O(2)-C(8) 1.446(3)
N(1)-H(1A) 0.8800
N(1)-H(1B) 0.8800
N(1)-C(7) 1.331(4)
N(1)-C(1) 1.497(10)
N(1)-C(1B) 1.426(9)
C(8)-H(8A) 0.9900
C(8)-H(8B) 0.9900
C(8)-C(9) 1.501(4)
C(9)-C(10) 1.380(4)
C(9)-C(14) 1.386(4)
C(10)-H(10) 0.9500
C(10)-C(11) 1.387(4)
C(11)-H(11) 0.9500
C(11)-C(12) 1.387(4)
C(12)-H(12) 0.9500
C(12)-C(13) 1.367(4)
C(13)-H(13) 0.9500
C(13)-C(14) 1.383(4)
C(14)-H(14) 0.9500
F(1)-C(5) 1.426(8)
C(1)-H(1) 1.0000
C(1)-C(2) 1.553(14)
C(1)-C(5) 1.510(11)
C(2)-H(2A) 0.9900
C(2)-H(2B) 0.9900
C(2)-C(3) 1.502(11)
C(3)-H(3A) 0.9900
C(3)-H(3B) 0.9900
C(3)-C(4) 1.566(12)
C(4)-H(4A) 0.9900
C(4)-H(4B) 0.9900
C(4)-C(5) 1.479(13)
C(5)-C(6) 1.475(11)
C(6)-H(6A) 0.9800
C(6)-H(6B) 0.9800
C(6)-H(6C) 0.9800
F(1B)-C(5B) 1.434(8)
C(1B)-H(1BA) 1.0000
C(1B)-C(2B) 1.562(12)
C(1B)-C(5B) 1.482(13)
C(2B)-H(2BA) 0.9900
C(2B)-H(2BB) 0.9900
C(2B)-C(3B) 1.519(13)
C(3B)-H(3BA) 0.9900
C(3B)-H(3BB) 0.9900
C(3B)-C(4B) 1.519(16)
C(4B)-H(4BA) 0.9900
C(4B)-H(4BB) 0.9900
C(4B)-C(5B) 1.479(14)
C(5B)-C(6B) 1.505(12)
C(6B)-H(6BA) 0.9800
C(6B)-H(6BB) 0.9800
C(6B)-H(6BC) 0.9800
C(7)-O(2)-C(8) 116.1(2)
C(7)-N(1)-H(1A) 119.6
C(7)-N(1)-H(1B) 119.2
C(7)-N(1)-C(1) 120.9(5)
C(7)-N(1)-C(1B) 121.6(4)
C(1)-N(1)-H(1A) 119.6
C(1B)-N(1)-H(1B) 119.2
O(1)-C(7)-O(2) 123.0(3)
O(1)-C(7)-N(1) 126.1(3)
N(1)-C(7)-O(2) 110.9(2)
O(2)-C(8)-H(8A) 110.5
O(2)-C(8)-H(8B) 110.5
O(2)-C(8)-C(9) 106.1(2)
H(8A)-C(8)-H(8B) 108.7
C(9)-C(8)-H(8A) 110.5
C(9)-C(8)-H(8B) 110.5
C(10)-C(9)-C(8) 120.9(2)
C(10)-C(9)-C(14) 118.9(3)
C(14)-C(9)-C(8) 120.2(3)
C(9)-C(10)-H(10) 119.7
C(9)-C(10)-C(11) 120.7(3)
C(11)-C(10)-H(10) 119.7
C(10)-C(11)-H(11) 120.1
C(10)-C(11)-C(12) 119.8(3)
C(12)-C(11)-H(11) 120.1
C(11)-C(12)-H(12) 120.2
C(13)-C(12)-C(11) 119.7(3)
C(13)-C(12)-H(12) 120.2
C(12)-C(13)-H(13) 119.7
C(12)-C(13)-C(14) 120.6(3)
C(14)-C(13)-H(13) 119.7
C(9)-C(14)-H(14) 119.8
C(13)-C(14)-C(9) 120.3(3)
C(13)-C(14)-H(14) 119.8
N(1)-C(1)-H(1) 107.0
N(1)-C(1)-C(2) 120.1(7)
N(1)-C(1)-C(5) 112.4(7)
C(2)-C(1)-H(1) 107.0
C(5)-C(1)-H(1) 107.0
C(5)-C(1)-C(2) 102.7(8)
C(1)-C(2)-H(2A) 111.1
C(1)-C(2)-H(2B) 111.1
H(2A)-C(2)-H(2B) 109.1
C(3)-C(2)-C(1) 103.2(7)
C(3)-C(2)-H(2A) 111.1
C(3)-C(2)-H(2B) 111.1
C(2)-C(3)-H(3A) 110.0
C(2)-C(3)-H(3B) 110.0
C(2)-C(3)-C(4) 108.3(7)
H(3A)-C(3)-H(3B) 108.4
C(4)-C(3)-H(3A) 110.0
C(4)-C(3)-H(3B) 110.0
C(3)-C(4)-H(4A) 111.0
C(3)-C(4)-H(4B) 111.0
H(4A)-C(4)-H(4B) 109.0
C(5)-C(4)-C(3) 103.6(7)
C(5)-C(4)-H(4A) 111.0
C(5)-C(4)-H(4B) 111.0
F(1)-C(5)-C(1) 105.2(6)
F(1)-C(5)-C(4) 105.8(7)
F(1)-C(5)-C(6) 107.8(7)
C(4)-C(5)-C(1) 106.2(7)
C(6)-C(5)-C(1) 114.4(7)
C(6)-C(5)-C(4) 116.6(6)
C(5)-C(6)-H(6A) 109.5
C(5)-C(6)-H(6B) 109.5
C(5)-C(6)-H(6C) 109.5
H(6A)-C(6)-H(6B) 109.5
H(6A)-C(6)-H(6C) 109.5
H(6B)-C(6)-H(6C) 109.5
N(1)-C(1B)-H(1BA) 108.3
N(1)-C(1B)-C(2B) 116.7(7)
N(1)-C(1B)-C(5B) 112.3(7)
C(2B)-C(1B)-H(1BA) 108.3
C(5B)-C(1B)-H(1BA) 108.3
C(5B)-C(1B)-C(2B) 102.5(8)
C(1B)-C(2B)-H(2BA) 111.3
C(1B)-C(2B)-H(2BB) 111.3
H(2BA)-C(2B)-H(2BB) 109.2
C(3B)-C(2B)-C(1B) 102.2(9)
C(3B)-C(2B)-H(2BA) 111.3
C(3B)-C(2B)-H(2BB) 111.3
C(2B)-C(3B)-H(3BA) 110.1
C(2B)-C(3B)-H(3BB) 110.1
H(3BA)-C(3B)-H(3BB) 108.4
C(4B)-C(3B)-C(2B) 108.0(8)
C(4B)-C(3B)-H(3BA) 110.1
C(4B)-C(3B)-H(3BB) 110.1
C(3B)-C(4B)-H(4BA) 110.8
C(3B)-C(4B)-H(4BB) 110.8
H(4BA)-C(4B)-H(4BB) 108.9
C(5B)-C(4B)-C(3B) 104.6(9)
C(5B)-C(4B)-H(4BA) 110.8
C(5B)-C(4B)-H(4BB) 110.8
F(1B)-C(5B)-C(1B) 107.3(6)
F(1B)-C(5B)-C(4B) 108.7(8)
F(1B)-C(5B)-C(6B) 103.5(8)
C(1B)-C(5B)-C(6B) 112.4(8)
C(4B)-C(5B)-C(1B) 105.2(9)
C(4B)-C(5B)-C(6B) 119.3(8)
C(5B)-C(6B)-H(6BA) 109.5
C(5B)-C(6B)-H(6BB) 109.5
C(5B)-C(6B)-H(6BC) 109.5
H(6BA)-C(6B)-H(6BB) 109.5
H(6BA)-C(6B)-H(6BC) 109.5
H(6BB)-C(6B)-H(6BC) 109.5
表H.C26 之異向性移位參數(Å2 ×103 )。異向性移位因子指數採用以下形式:-2π2 [h2 a*2 U11 + ... + 2 h k a* b* U12 ]。
   U11 U22 U33 U23 U13 U12
O(1) 70(2) 14(1) 44(1) 4(1) -14(1) -2(1)
O(2) 44(1) 15(1) 27(1) 1(1) -5(1) -1(1)
N(1) 62(2) 16(1) 40(2) 8(1) -18(1) -2(1)
C(7) 46(2) 15(2) 24(2) -1(1) 1(1) 0(1)
C(8) 44(2) 23(2) 30(2) 4(1) -3(1) -8(2)
C(9) 38(2) 18(1) 23(2) 1(1) -1(1) -7(1)
C(10) 45(2) 30(2) 23(2) -4(1) 5(1) -6(2)
C(11) 44(2) 32(2) 32(2) -5(1) -1(1) 5(2)
C(12) 48(2) 24(2) 26(2) 2(1) -6(1) 0(2)
C(13) 51(2) 28(2) 24(2) 2(1) 4(1) -5(2)
C(14) 38(2) 25(2) 34(2) 0(1) 4(1) 0(1)
F(1) 76(3) 25(2) 52(3) 0(2) -13(2) -2(2)
C(1) 54(3) 21(3) 32(3) 3(2) -10(2) 3(3)
C(2) 61(3) 58(6) 28(3) -3(3) -6(2) -7(3)
C(3) 49(3) 136(10) 34(3) 6(4) -3(3) 5(3)
C(4) 46(3) 51(5) 28(3) 6(3) -4(2) 0(3)
C(5) 48(3) 20(3) 30(3) 2(2) -7(2) -1(2)
C(6) 62(4) 28(4) 49(4) 5(3) 7(3) 2(3)
F(1B) 64(3) 29(2) 118(4) 8(2) -9(2) -3(2)
C(1B) 61(3) 21(3) 45(3) 10(2) -22(2) -4(3)
C(2B) 83(5) 72(6) 54(3) -3(3) -16(3) 1(4)
C(3B) 99(5) 189(12) 75(4) -23(4) -34(3) 24(5)
C(4B) 77(5) 47(5) 85(4) -1(4) -29(3) -3(4)
C(5B) 60(3) 21(3) 79(4) -1(3) -18(2) -1(2)
C(6B) 95(6) 61(5) 112(5) -14(4) 10(4) -1(4)
表J.C26 之氫座標(×104 )及等向性移位參數(Å2 ×103 )。
   x y z U(eq)
H(1A) 7758 7330 7101 50
H(1B) 7858 7263 6917 50
H(8A) 6243 2747 5820 40
H(8B) 6737 1685 5055 40
H(10) 5539 6611 5273 39
H(11) 5064 9465 3936 44
H(12) 5476 9666 2329 41
H(13) 6342 6975 2067 41
H(14) 6815 4115 3397 39
H(1) 8406 2565 7872 44
H(2A) 9212 4006 6964 60
H(2B) 9112 7204 7237 60
H(3A) 9844 6481 8602 89
H(3B) 9765 3198 8513 89
H(4A) 9116 3163 9784 51
H(4B) 9275 6382 9979 51
H(6A) 7544 5716 9115 70
H(6B) 8005 5726 10203 70
H(6C) 7906 2958 9526 70
H(1BA) 8219 2756 8166 54
H(2BA) 7988 8146 9012 86
H(2BB) 7762 5217 9429 86
H(3BA) 8850 7645 10189 150
H(3BB) 8709 4434 10348 150
H(4BA) 9612 6371 9260 88
H(4BB) 9377 3216 9235 88
H(6BA) 9181 2164 7233 135
H(6BB) 9626 4780 7122 135
H(6BC) 8931 4655 6475 135
表K.C26 之氫鍵[Å及°]。
D-H...A d(D-H) d(H...A) d(D...A) <(DHA)
N(1)-H(1A)...O(1)#1 0.88 2.06 2.930(3) 170.0
用以產生等效原子之對稱性變換: #1 x,y+1,z
步驟 3. 合成外消旋 -(1R,2S)-2- -2- 甲基環戊胺鹽酸鹽 (C27 ) 在氫氣囊下將C26 (281 mg,1.12 mmol)、20%氫氧化鈀/碳(50 mg)及氯化氫(2 M溶液於甲醇中;0.671 mL,1.34 mmol)之混合物攪拌隔夜,接著將該混合物經由矽藻土過濾。使濾液再經歷該反應條件隔夜,且再次經由矽藻土過濾。濃縮濾液得到呈淡黃色固體狀之C27 (189 mg)。藉由1 H NMR分析,此材料不完全純淨;該材料之一部分直接進行至以下步驟。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ), 特徵峰: δ 2.12 - 1.55 (m, 6H), 1.50 (d,J HF = 22.0 Hz, 3H)。
步驟 4. 合成外消旋 -1-[4-{[(1R,2S)-2- -2- 甲基環戊基 ] 胺基 }-2-( 甲硫基 ) 嘧啶 -5- ] 乙酮 (C28 ) 在室溫下將C27 (來自前一步驟;122 mg,≤0.723 mmol)、1-[4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基]乙酮(175 mg,0.864 mmol)及三乙胺(0.401 mL,2.88 mmol)於乙醇(12 mL)中之混合物攪拌1小時。隨後將反應混合物用水稀釋且用乙酸乙酯萃取。合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮;矽膠層析(梯度:0%至30%乙酸乙酯/庚烷)得到呈白色固體狀之C28 。產率:180 mg,0.635 mmol,57%,歷經2個步驟。LCMSm/z 283.9 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 特徵峰: δ 9.55 (br s, 1H), 8.59 (s, 1H), 4.56 - 4.40 (m, 1H), 2.54 (s, 3H), 2.52 (s, 3H), 1.41 (d,J HF = 21.5 Hz, 3H)。
步驟 5. 合成外消旋 -8-[(1R,2S)-2- -2- 甲基環戊基 ]-5- 甲基 -2-( 甲硫基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C29 ) 將(二乙氧基磷醯基)乙酸乙酯(0.633 mL,3.19 mmol)緩慢添加至氫化鈉(60%懸浮液於礦物油中;122 mg,3.05 mmol)於四氫呋喃(4 mL)中之0℃懸浮液中;隨後去除冷卻浴且添加C28 (180 mg,0.635 mmol)於四氫呋喃(4 mL)中之溶液。在60℃下將反應混合物加熱18小時,接著將其冷卻至室溫,藉由添加水來淬滅,且用乙酸乙酯萃取兩次。合併之有機層經硫酸鎂乾燥,過濾,在真空中濃縮,且使用矽膠層析(梯度:0%至60%乙酸乙酯/庚烷)純化,從而得到呈淡黃色固體狀之C29 。產率:190 mg,0.618 mmol,97%。LCMSm/z 307.9 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.68 (s, 1H), 6.44 (br s, 1H), 5.92 - 5.72 (m, 1H), 3.29 - 3.01 (m, 1H), 2.62 (s, 3H), 2.48 - 2.31 (m, 1H), 2.41 (d,J = 1.2 Hz, 3H), 2.31 - 2.19 (m, 1H), 2.00 - 1.81 (m, 2H), 1.73 - 1.6 (m, 1H, 假定;由水峰部分遮擋), 1.46 (d,J HF = 21.8 Hz, 3H)。
步驟 6. 合成外消旋 -6- -8-[(1R,2S)-2- -2- 甲基環戊基 ]-5- 甲基 -2-( 甲硫基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P10 ) 將溴(32 µL,0.62 mmol)添加至C29 (128 mg,0.416 mmol)於二氯甲烷(6.0 mL)中之溶液中,且在室溫下將混合物攪拌15分鐘,接著添加10%硫代硫酸鈉水溶液。用乙酸乙酯萃取所得混合物,且合併之有機層經硫酸鎂乾燥,過濾,且在真空中濃縮。矽膠層析(梯度:0%至100%乙酸乙酯/庚烷)得到呈白色固體狀之P10 。產率:109 mg,0.282 mmol,68%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.79 (s, 1H), 6.04 - 5.84 (m, 1H), 3.15 - 2.95 (m, 1H), 2.63 (s, 3H), 2.63 (s, 3H), 2.54 - 2.37 (m, 1H), 2.35 - 2.22 (m, 1H), 2.02 - 1.82 (m, 2H), 1.72 - 1.6 (m,1H,假定;由水峰部分遮擋), 1.49 (d,J HF = 21.9 Hz, 3H)。
製劑 P11 (3S)-3-[6- -5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ] 吡咯啶 -1- 甲酸第三丁酯 (P11 )
Figure 02_image078
步驟 1. 合成 (3S)-3-{[5- 乙醯基 -2-( 甲硫基 ) 嘧啶 -4- ] 胺基 } 吡咯啶 -1- 甲酸 第三丁 (C30 ) 將1-[4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基]乙酮(4.50 g,22.2 mmol)添加至(3S )-3-胺基吡咯啶-1-甲酸第三丁酯(4.55 g,24.4 mmol)及N,N- 二異丙基乙胺(7.74 mL,44.4 mmol)於乙腈(110 mL)中之溶液中。將反應混合物在室溫(大約15℃)下攪拌2.5天,接著將其在真空中濃縮。經由矽膠層析(梯度:0%至40%乙酸乙酯/石油醚)純化殘餘物以得到呈無色膠狀物之C30 。產率:7.50 g,21.3 mmol,96%。LCMSm/z 353.1 [M+H]+ .1 H NMR (400 MHz, 甲醇-d 4 )δ 8.66 (s, 1H), 4.80 - 4.71 (m, 1H), 3.81 - 3.71 (m, 1H), 3.56 - 3.43 (m, 2H), 3.37 - 3.31 (m,1H,假定;由溶劑峰部分遮擋), 2.56 (s, 3H), 2.53 (s, 3H), 2.37 - 2.25 (m, 1H), 2.10 - 1.97 (m, 1H), 1.47 (s, 9H)。
步驟 2. 合成 (3S)-3-[5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ] 吡咯啶 -1- 甲酸第三丁酯 (C31 ) 將雙(三甲基矽烷基)胺基鋰(1 M溶液於四氫呋喃中;63.8 mL,63.8 mmol)逐滴添加至C30 (7.50 g,21.3 mmol)及乙酸乙酯(6.56 g,74.5 mmol)於四氫呋喃(200 mL)中之0℃溶液中。在冰浴中將反應混合物攪拌30分鐘,接著將其加熱至40℃持續1小時。添加氯化銨水溶液(100 mL),隨後添加水(100 mL),且用乙酸乙酯(3×150 mL)萃取所得混合物。合併之有機層用飽和氯化鈉水溶液(150 mL)洗滌,在真空中濃縮,且經歷矽膠層析(梯度:10%至50%乙酸乙酯/二氯甲烷),從而得到呈微黃色固體狀之C31 。產率:6.27 g,16.7 mmol,78%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.71 (s, 1H), 6.47 - 6.42 (m, 1H), 6.26 - 6.14 (m, 1H), 3.99 (dd,J = 10.2, 8.4 Hz, 1H), 3.88 - 3.75 (m, 1H), 3.72 - 3.57 (m, 1H), 3.52 - 3.40 (m, 1H), 2.97 - 2.81 (m, 1H), 2.58 (s, 3H), 2.43 (d,J = 1.3 Hz, 3H), 2.18 - 2.06 (m, 1H), 1.52 - 1.43 (m, 9H)。
步驟 3. 合成 (3S)-3-[6- -5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ] 吡咯啶 -1- 甲酸第三丁酯 (P11 ) N -溴代丁二醯亞胺(3.26 g,18.3 mmol)逐份添加至C31 (6.27 g,16.7 mmol)及草酸(150 mg,1.67 mmol)於乙腈(100 mL)與二氯甲烷(50 mL)之混合物中的0℃混合物中。在0℃下將反應混合物攪拌45分鐘之後,將其用飽和亞硫酸鈉水溶液(45 mL)處理,用水(80 mL)稀釋,且用二氯甲烷(2×100 mL)萃取。在真空中濃縮經合併之有機層,且經由矽膠層析(梯度:10%至60%乙酸乙酯/石油醚)純化殘餘物,從而得到呈白色固體狀之P11 。產率:5.30 g,11.6 mmol,69%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.82 (s, 1H), 6.37 - 6.26 (m, 1H), 3.99 - 3.78 (m, 2H), 3.78 - 3.61 (m, 1H), 3.56 - 3.45 (m, 1H), 2.90 - 2.71 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.60 (s, 3H), 2.24 - 2.08 (m, 1H), 1.52 - 1.43 (m, 9H)。
製劑 P12 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -5- 甲基 -2-( 甲磺醯基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P12 )
Figure 02_image080
Figure 02_image082
步驟 1. 合成 6- -8- 環戊基 -5- 甲基 -2-( 甲硫基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C32 ) 向6-溴-2-氯-8-環戊基-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮(9.70 g,28.3 mmol)於四氫呋喃(95 mL)與水(50 mL)之混合物中的0℃懸浮液中添加甲硫醇鈉(3.97 g,56.6 mmol)。使反應混合物升溫至室溫且攪拌18小時,接著經由過濾將固體收集且用水洗滌以得到呈白色固體狀之C32 (4.30 g)。用乙酸乙酯(3×150 mL)萃取濾液,且將合併之有機層用飽和氯化鈉水溶液洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮以得到呈白色固體狀之額外C32 (5.60 g)。合併產率:9.90 g,27.9 mmol,99%。LCMSm/z 353.8 (觀測到溴同位素圖案)[M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.79 (s, 1H), 6.12 - 5.99 (m, 1H), 2.63 (s, 6H), 2.36 - 2.22 (m, 2H), 2.17 - 2.04 (m, 2H), 1.95 - 1.83 (m, 2H), 1.74 - 1.62 (m, 2H)。
步驟 2. 合成 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -5- 甲基 -2-( 甲硫基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C33 ) 在110℃下將C32 (18.0 g,50.8 mmol)、三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(83.07 g,230.0 mmol)及肆(三苯基膦)鈀(0)(2.94 g,2.54 mmol)於甲苯(250 mL)中之懸浮液攪拌16小時,接著將其冷卻且用氫氯酸(6 M;20 mL)處理。在將所得混合物攪拌20分鐘之後,將其過濾;藉由添加2 M氫氧化鈉水溶液將濾液調整至pH為7,且隨後用乙酸乙酯萃取(3×50 mL)。經合併之有機層用飽和氯化鈉水溶液(2×50 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮。經由矽膠層析(梯度:0%至20%乙酸乙酯/石油醚)純化得到呈黃色固體狀之C33 。產率:14.0 g,44.1 mmol,87%。LCMSm/z 317.9 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.80 (s, 1H), 5.98-5.88 (m, 1H), 2.63 (s, 3H), 2.55 (s, 3H), 2.38 (s, 3H), 2.37-2.28 (m, 2H), 2.13-2.01 (m, 2H), 1.94-1.84 (m, 2H), 1.75-1.64 (m, 2H)。
步驟 3. 合成 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -5- 甲基 -2-( 甲磺醯基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P12 ) 歷經30分鐘以逐滴方式將3-氯過氧苯甲酸(16.7 g,96.8 mmol)於二氯甲烷(300 mL)中之溶液添加至C33 (14.0 g,44.1 mmol)於二氯甲烷(300 mL)中之-5℃溶液。在15℃下將反應混合物攪拌16小時之後,將其用飽和亞硫酸鈉水溶液(6 mL),隨後用飽和碳酸鈉水溶液(35 mL)稀釋。用二氯甲烷(2×50 mL)萃取所得混合物,且合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮。藉由1 H NMR分析,該反應不完全,因此將此材料溶解於二氯甲烷(150 mL)中,冷卻至-5℃,且用3-氯過氧苯甲酸(3.0 g,17 mmol)於二氯甲烷(10 mL)中之溶液再次逐滴處理。在15℃下將此反應混合物攪拌3小時,接著將其用飽和亞硫酸鈉水溶液(2 mL)處理,用飽和碳酸鈉水溶液(20 mL)稀釋,且用二氯甲烷(2×30 mL)萃取。合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮以得到呈黃色固體狀之P12 (15 g)。將此材料與使用C33 (1.47 g,4.63 mmol)進行類似反應的產物合併,與二氯甲烷(60 mL)及石油醚(400 mL)混合,且攪拌40分鐘。過濾得到呈黃色固體狀之P12 。合併產率:14.3 g,40.9 mmol,84%。LCMSm/z 350.3 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 9.10 (s, 1H), 5.96 - 5.85 (m, 1H), 3.39 (s, 3H), 2.57 (s, 3H), 2.46 (s, 3H), 2.33 - 2.21 (m, 2H), 2.21 - 2.10 (m, 2H), 2.01 - 1.90 (m, 2H), 1.77 - 1.65 (m, 2H)。
P12 替代製劑 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -5- 甲基 -2-( 甲磺醯基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P12 )
Figure 02_image084
步驟 1 . 合成 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -5- 甲基 -2-( 甲基 磺醯基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- 鹽酸鹽 (C33 鹽酸鹽 ) C32 (172.7 g,487.5 mmol)、丁基乙烯基醚(146.0 g,1.458 mol)、N,N -二異丙基乙胺(121 mL,695 mmol)及{雙[2-(二苯膦基)苯基]醚}二氯化鈀(II)[Pd(DPEPhos)Cl2 ;6.98 g,9.75 mmol]於正丁醇(1 L)中之混合物用氮氣脫氣15分鐘,且隨後加熱至89℃之內部溫度。使用機械攪拌器將反應混合物攪拌隔夜,接著添加碳酸鈉水溶液(5%;1 L)。在減壓下使用水浴在50℃下濃縮有機層以去除正丁醇,且將所得固體溶解於乙酸乙酯(1 L)中。添加活性炭(60 g),且在經由矽藻土墊過濾之前將混合物攪拌10分鐘。用乙酸乙酯洗滌過濾墊,且將合併之濾液用SiliCycle SiliaMetS® 硫醇金屬清除劑(45.0 g)處理,在室溫下攪拌30分鐘,且過濾。用乙酸乙酯洗滌過濾墊,且將合併之濾液再次用SiliCycle SiliaMetS® 硫醇金屬清除劑(22.5 g)處理,在室溫下攪拌30分鐘,且過濾。用乙酸乙酯洗滌過濾墊,且在真空中濃縮合併之濾液以得到固體,將該固體溶解於乙酸乙酯(1 L)中且用氫氯酸(6 M;90 mL)處理。在室溫下將此反應混合物攪拌2小時之後,將其過濾,且用第三丁基甲基醚與乙酸乙酯之1:1混合物洗滌所收集固體以得到呈固體狀之C33 鹽酸鹽 (132 g)。在減壓下將濾液濃縮至乾燥;將殘餘物溶解於第三丁基甲基醚與乙酸乙酯之混合物(1:1,300 mL)中,且漿化30分鐘。隨後過濾此混合物,且用第三丁基甲基醚與乙酸乙酯之1:1混合物洗滌所收集固體,從而得到呈灰白色固體狀之額外C33 鹽酸鹽 (31 g)。合併產率:163 g,460 mmol,94%。LCMSm/z 318.2 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, CDCl3 )δ 8.95 (s, 1H), 8.33 (br s, 1H), 5.94-5.83 (m, 1H), 2.79 (s, 3H), 2.55 (s, 3H), 2.41 (s, 3H), 2.34-2.23 (m, 2H), 2.14-2.02 (m, 2H), 1.99-1.88 (m, 2H), 1.78-1.66 (m, 2H)。
步驟 2. 合成 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -5- 甲基 -2-( 甲磺醯基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P12 ) C33 鹽酸鹽 (154 g,435 mmol)於四氫呋喃(1.8 L)中之溶液用水(500 mL)稀釋,用磷酸鉀(40.2 g,189 mmol)處理,且在機械攪拌下冷卻至15℃。隨後歷經數分鐘將過氧單硫酸鉀(Oxone® ;402.0 g,654 mmol)緩慢添加至攪拌溶液中。其後不時地施加冰浴以使內部溫度維持低於25℃,且繼續攪拌額外2小時。此時,LCMS分析指示向產物之轉化:LCMSm/z 350.1 [M+H]+ 。隨後過濾反應混合物,且用乙酸乙酯洗滌所收集固體。用乙酸乙酯萃取經合併之濾液的水層,且將合併之有機層用飽和氯化鈉水溶液洗滌兩次,經硫酸鎂乾燥,過濾,且在真空中濃縮。將殘餘物在乙酸乙酯於庚烷中之混合物(5%;1 L)中漿化1小時;經由過濾將固體收集且用5%乙酸乙酯/庚烷洗滌,從而得到呈淡黃色固體狀之P12 (135 g)。在減壓下濃縮濾液得到殘餘物,將該殘餘物在乙酸乙酯於庚烷中之混合物(5%;250 mL)中漿化4小時,接著經由過濾將固體收集且用5%乙酸乙酯/庚烷洗滌以得到呈白色固體狀之額外P12 (4.0 g)。合併產率:139 g,398 mmol,91%。1 H NMR (400 MHz, CDCl3 )δ 9.11 (s, 1H), 5.96-5.85 (m, 1H), 3.39 (s, 3H), 2.57 (s, 3H), 2.46 (s, 3H), 2.33-2.22 (m, 2H), 2.22-2.10 (m, 2H), 2.01-1.91 (m, 2H), 1.78-1.65 (m, 2H)。
製劑 P13 6- 乙醯基 -2-( 癸硫基 )-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P13 )
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步驟 1. 合成 6- 乙醯基 -5- 甲基 -2-( 甲硫基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C34 ) 在100℃下將1-[4-胺基-2-(甲硫基)嘧啶-5-基]乙酮(17.2 g,93.9 mmol)及2,2,6-三甲基-4H- 1,3-二氧雜環己烯-4-酮(53.4 g,376 mmol)於甲苯(375 mL)中之混合物加熱隔夜,且隨後在室溫(15℃至25℃)下靜置2天。隨後用乙酸乙酯(300 mL)稀釋反應混合物;經由過濾將固體收集且用乙酸乙酯(200 mL)沖洗,從而得到呈淺棕色固體狀之C34 。產率:19.2 g,77.0 mmol,82%。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 )δ 12.59 (br s, 1H), 9.01 (s, 1H), 2.57 (s, 3H), 2.44 (s, 3H), 2.34 (s, 3H)。
步驟 2. 合成 6- 乙醯基 -5- 甲基 -2-( 甲磺醯基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C35 ) 在室溫(20℃)下將過氧單硫酸鉀(Oxone® ;128 g,208 mmol)添加至C34 (17.2 g,69.0 mmol)於四氫呋喃(800 mL)與水(160 mL)之混合物中的懸浮液中。在25℃下將反應混合物攪拌27小時,接著將其用水(800 mL)稀釋,在室溫(15℃)下攪拌2小時,且過濾。將所收集固體用水(300 mL)及第三丁基甲基醚(100 mL)依序洗滌,隨後與水(300 mL)混合,在室溫(20℃)下攪拌1小時,且過濾。將濾餅用水(100 mL)洗滌,且與使用C34 (2.10 g,8.42 mmol)進行類似反應的產物合併。將此材料再次與水(150 mL)混合,在室溫(20℃)下攪拌1小時,且過濾。將此濾餅用水(80 mL)洗滌以得到呈白色固體狀之C35 。合併產率:9.0 g,32.0 mmol,41%。LCMSm/z 282.1 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 )δ 13.31 (br s, 1H), 9.39 (s, 1H), 3.43 (s, 3H), 2.46 (s, 3H), 2.41 (s, 3H)。
步驟 3. 合成 6- 乙醯基 -2-( 癸硫基 )-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (P13 )C35 (1.12 g,3.98 mmol)於四氫呋喃(19 mL)中之溶液中添加三乙胺(1.66 mL,11.9 mmol),隨後添加癸烷-1-硫醇(96%,1.08 g,5.95 mmol),且在62℃下將反應混合物置於加熱塊中。在3小時之後,LCMS分析指示向產物P13 之轉化:LCMSm/z 376.3 [M+H]+ ;將反應混合物冷卻至室溫且攪拌15小時。隨後將反應混合物在真空中濃縮,且使用矽膠層析(梯度:0%至100%乙酸乙酯/庚烷)純化殘餘物,從而得到呈白色固體狀之P13 。(應注意,產物在層析純化期間沈澱。)產率:1.37 g,3.65 mmol,92%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 9.95 (br s, 1H), 8.82 (s, 1H), 3.18 (t,J = 7.3 Hz, 2H), 2.59 (s, 3H), 2.44 (s, 3H), 1.74 (五重峰,J = 7.4 Hz, 2H), 1.50 - 1.39 (m, 2H), 1.37 - 1.19 (m, 12H), 0.87 (t,J = 6.7 Hz, 3H)。
實例 1 6- 乙醯基 -8- 環丁基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (1 )
Figure 02_image088
步驟 1. 合成 6- -8- 環丁基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C36 ) 在60℃下將P1 (150 mg,0.456 mmol)、(3S,4R )-4-胺基四氫-2H- 哌喃-3-醇鹽酸鹽(77.1 mg,0.502 mmol)及N,N -二異丙基乙胺(0.40 mL,2.3 mmol)於二甲亞碸(1.8 mL)中之溶液加熱5小時。隨後將反應混合物冷卻至室溫且用水(15 mL)稀釋;經由過濾收集所得固體以得到呈淡紅色固體狀之C36 。產率:168 mg,0.410 mmol,90%。LCMSm/z 411.1 (觀測到溴同位素圖案)[M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 特徵峰: δ 8.58 (s, 1H), 5.89 - 5.67 (m, 1H), 5.54 - 5.24 (br s, 1H), 4.09 (dd,J = 11.4, 4.9 Hz, 1H), 4.04 - 3.97 (m, 1H), 3.65 (ddd,J = 9.3, 9.1, 4.8 Hz, 1H), 3.50 (br dd,J = 11.8, 11.5 Hz, 1H), 3.32 - 3.18 (m, 1H), 2.54 (s, 3H), 2.41 - 2.28 (m, 2H), 2.16 - 1.96 (m, 2H), 1.91 - 1.78 (m, 1H), 1.78 - 1.66 (m,2H,假定;由水峰部分遮擋)。
步驟 2. 合成 6- 乙醯基 -8- 環丁基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (1 ) C36 (165 mg,0.403 mmol)、肆(三苯基膦)鈀(0)(23.5 mg,20.3 µmol)及三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(204 mg,0.565 mmol)於甲苯(4 mL)中之混合物用氮氣充氣5分鐘,且隨後在110℃下加熱12小時。隨後在真空中濃縮反應混合物,且將殘餘物溶解於2-甲基四氫呋喃(8 mL)中。添加水(150 µL)及氯化氫(4 M溶液於1,4-二噁烷中;0.20 mL,0.80 mmol),且在室溫下攪拌此反應混合物。在2小時之後,LCMS分析指示向1 之轉化:LCMSm/z 373.2 [M+H]+ 。在5小時之後,在減壓下濃縮反應混合物,且用飽和碳酸氫鈉水溶液稀釋殘餘物,且用乙酸乙酯萃取三次。將合併之有機層在真空中濃縮,且經由超臨界流體層析(管柱:Nacalai USA Cosmosil 3-羥苯基;移動相A:二氧化碳;移動相B:甲醇;梯度:12% B持續0.2分鐘,隨後以每分鐘4%斜變至28% B;回壓:100巴)純化以得到1 。產率:83.5 mg,0.224 mmol,56%。1 H NMR (400 MHz, 80 ℃, DMSO-d 6 )δ 8.75 (s, 1H), 7.49 (br s, 1H), 5.80 - 5.65 (m, 1H), 4.70 (br s, 1H), 4.05 - 3.93 (m, 1H), 3.93 - 3.81 (m, 2H), 3.65 - 3.53 (m, 1H), 3.38 (dd,J = 11.8, 11.0 Hz, 1H), 3.27 - 3.05 (m, 3H), 2.41 (s, 3H), 2.36 - 2.21 (m, 2H), 2.28 (s, 3H), 2.07 - 1.91 (m, 2H), 1.91 - 1.75 (m, 1H), 1.69 - 1.53 (m, 1H)。
實例 2 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (2 )
Figure 02_image090
步驟 1. 合成 6- -8- 環戊基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C37 ) 向6-溴-2-氯-8-環戊基-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮(12.0 g,35.0 mmol)及(3S,4R )-4-胺基四氫-2H- 哌喃-3-醇鹽酸鹽(5.92 g,38.5 mmol)於二甲亞碸(100 mL)中之懸浮液中添加N,N -二異丙基乙胺(23.3 mL,134 mmol)。在60℃下將反應混合物加熱21小時,接著將其冷卻至環境溫度且倒入冰水(1.5 L)中。經由過濾收集所得固體以得到呈粉紅色固體狀之C371 H NMR分析指示此化合物以旋轉異構體之混合物形式存在。產率:13.1 g,30.9 mmol,88%。LCMSm/z 423.1 (觀測到溴同位素圖案)[M+H]+1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 )δ 8.79 (br s, 1H), [7.91 - 7.77 (m)及7.74 - 7.61 (m), 總共1H], [6.10 - 5.91 (m)及5.90 - 5.74 (m), 總共1H], 4.95 (d,J = 5.2 Hz, 1H), 4.07 - 3.74 (m, 3H), 3.53 (br s, 1H), 3.40 - 3.24 (m,1H,假定;由水峰部分遮擋), 3.03 (dd,J = 11.1, 9.7 Hz, 1H), 2.52 (s, 3H), 2.43 - 2.24 (m, 1H), 2.23 - 2.07 (m, 1H), 2.06 - 1.83 (m, 3H), 1.83 - 1.69 (m, 2H), 1.69 - 1.46 (m, 3H)。
步驟 2. 合成 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (2 ) C37 (450 mg,1.06 mmol)、肆(三苯基膦)鈀(0)(62.0 mg,53.6 µmol)及三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(537 mg,1.49 mmol)於甲苯(11 mL)中之溶液用氮氣充氣5分鐘,且隨後在110℃下加熱18小時。在真空中去除揮發物,且將殘餘物溶解於2-甲基四氫呋喃(10 mL)中,用水(0.15 mL)及氯化氫(4 M溶液於1,4-二噁烷中;0.30 mL,1.2 mmol)處理,且在室溫下攪拌6小時。隨後濃縮反應混合物,且經由矽膠層析[梯度:15%至100% (9:1乙酸乙酯/乙醇)/庚烷]純化殘餘物。將純化材料(大約500 mg)與乙酸乙酯(8 mL)及庚烷(15 mL)混合,且在75℃下加熱。添加額外庚烷(6 mL),且使混合物冷卻至室溫。經由過濾收集所得材料以得到呈固體狀之2 。產率:310 mg,0.802 mmol,76%。LCMSm/z 387.2 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 80 ℃, DMSO-d 6 )8.76 (s, 1H), 7.44 (br s, 1H), 5.81 (五重峰,J = 9.0 Hz, 1H), 4.68 (br s, 1H), 3.99 - 3.80 (m, 3H), 3.64 - 3.53 (m, 1H), 3.36 (ddd,J = 11.7, 11.6, 2.1 Hz, 1H), 3.08 (dd,J = 11.2, 9.5 Hz, 1H), 2.45 - 2.29 (m, 2H), 2.41 (s, 3H), 2.28 (s, 3H), 2.08 - 1.92 (m, 3H), 1.86 - 1.71 (m, 2H), 1.71 - 1.52 (m, 3H)。
實例 3 6- 乙醯基 -8-(2- 氮雜螺 [3.3] -6- )-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (3 )
Figure 02_image092
步驟 1. 合成 6-[6- 乙醯基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基 -7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ]-2- 氮雜螺 [3.3] 庚烷 -2- 甲酸 第三丁 (C38 ) 在60℃下將P2 (來自製劑P2步驟5;120 mg,≤0.225 mmol)、(3S, 4R )-4-胺基四氫-2H- 哌喃-3-醇(36.6 mg,0.312 mmol)及碳酸鈉(55.2 mg,0.521 mmol)於四氫呋喃(8 mL)中之混合物攪拌18小時。使用矽膠層析(梯度:0%至25%甲醇/二氯甲烷)純化反應混合物以得到呈淡黃色玻璃狀之C38 。產率:100 mg,0.195 mmol,87%,歷經2個步驟。LCMSm/z 535.9 [M+Na+ ]。
步驟 2. 合成 6- 乙醯基 -8-(2- 氮雜螺 [3.3] -6- )-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (3 ) 在室溫(10℃)下將C38 (100 mg,0.195 mmol)於三氟乙酸(2 mL)與二氯甲烷(5 mL)之混合物中的溶液攪拌大約1小時。隨後將反應混合物在真空中濃縮,且經由逆相HPLC (管柱:YMC-Triart C18,7 µm;移動相A:含有0.05%氫氧化銨之水;移動相B:乙腈;梯度:9%至49% B)純化以得到呈白色固體狀之3 。產率:49.1 mg,0.119 mmol,61%。LCMSm/z 414.3 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.59 (s, 1H), 6.06 - 5.30 (m, 2H), 4.06 (dd,J = 11.4, 4.8 Hz, 1H), 4.02 - 3.87 (m, 2H), 3.79 (br s, 2H), 3.75 (br s, 2H), 3.69 - 3.58 (m, 1H), 3.56 - 3.43 (m, 1H), 3.31 - 3.07 (m, 4H), 2.66 - 2.54 (m, 2H), 2.50 (s, 3H), 2.29 (s, 3H), 2.20 - 2.05 (m, 1H), 1.76 - 1.61 (m, 1H)。
實例 4 6- 乙醯基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基 -8-[(1R,2S)-2- 甲基環戊基 ] 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (4 )
Figure 02_image094
步驟 1. 合成 6- -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基 -8-[(1R,2S)-2- 甲基環戊基 ] 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C39 ) 在70℃下將P3 (150 mg,0.421 mmol)、(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇(73.9 mg,0.631 mmol)及N,N -二異丙基乙胺(272 mg,0.366 mL,2.10 mmol)於二甲亞碸(2 mL)中之溶液加熱18小時。隨後將反應混合物用二氯甲烷(30 mL)稀釋,依序用水(3×10 mL)及飽和氯化鈉水溶液(10 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮;矽膠層析(梯度:0%至100%乙酸乙酯/二氯甲烷)得到呈白色玻璃狀之C39 。產率:130 mg,0.297 mmol,71%。LCMSm/z 437.1 (觀測到溴同位素圖案)[M+H]+
步驟 2. 合成 6- 乙醯基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基 -8-[(1R,2S)-2- 甲基環戊基 ] 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (4 ) 將氮氣鼓泡通過C39 (130 mg,0.297 mmol)於甲苯(10 mL)中之溶液,且隨後添加三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(429 mg,1.19 mmol)及肆(三苯基膦)鈀(0)(34.3 mg,29.7 µmol)。將反應容器密封且在110℃下加熱18小時,接著將反應混合物冷卻至室溫且過濾。在將濾液在真空中濃縮之後,將殘餘物溶解於乙酸乙酯(20 mL)中,藉由添加6 M氫氯酸酸化至大約5之pH,且攪拌約10分鐘。藉由添加碳酸氫鈉水溶液將所得二相混合物鹼化至大約8之pH,且用乙酸乙酯(2×10 mL)萃取水層。合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下濃縮;使用矽膠層析(梯度:0%至100%乙酸乙酯/二氯甲烷)純化殘餘物以得到呈白色固體狀之4 。產率:58.8 mg,0.147 mmol,49%。LCMSm/z 401.0 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 甲醇-d 4 )δ 8.76 (s, 1H), 6.22 - 6.05 (m, 1H), 4.14 - 3.89 (m, 3H), 3.73 - 3.57 (br m, 1H), 3.54 - 3.45 (m, 1H), 3.22 (br dd,J = 10.4, 10.1 Hz, 1H), 2.82 - 2.56 (br m, 1H), 2.46 (s, 3H), 2.43 - 2.31 (m, 1H), 2.34 (s, 3H), 2.16 - 1.98 (m, 2H), 1.98 - 1.80 (m, 3H), 1.72 - 1.52 (m, 2H), 0.79 (d,J = 7.1 Hz, 3H)。
實例 5 3- 乙醯基 -1- 環戊基 -7-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-4- 甲基 -1,6- 㖠啶 -2(1H)- (5 )
Figure 02_image096
在一瓶新開的N,N -二甲基甲醯胺中,使用氮氣充氣大約15分鐘。將P4 (63.0 g,207 mmol)、(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇(29.1 g,248 mmol)及第三丁醇鋰(19.9 g,249 mmol)之混合物溶解於經充氣的N,N -二甲基甲醯胺(300 mL)中,且在平緩氮氣壓力下將燒瓶吹掃大約15分鐘。
在另一個的燒瓶中,將二-第三丁基[3,6-二甲氧基-2',4',6'-三(丙-2-基)[聯苯]-2-基]膦(tBuBrettPhos;2.00 g,4.13 mmol)及參(二亞苄基丙酮)二鈀(0)(1.89 g,2.06 mmol)之混合物在平緩氮氣壓力下吹掃大約15分鐘。添加N,N -二甲基甲醯胺(100 mL;預先用氮氣充氣),且所得溶液在70℃油浴中加熱大約7分鐘,接著冷卻至室溫。隨後將此催化劑混合物倒入含有P4 之燒瓶中,且在40℃下將反應混合物攪拌1小時。在反應混合物已冷卻至室溫之後,將反應混合物倒入水(700 mL)中,且藉由添加1 M氫氯酸調整至pH 5至6。隨後添加乙酸乙酯(500 mL),且攪拌所得混合物以促進焦油狀固體之溶解。用乙酸乙酯(4×400 mL)萃取水層,且將合併之有機層依序用氯化鋰水溶液(7重量%;2×400 mL)及飽和氯化鈉水溶液(250 mL)洗滌,經硫酸鎂乾燥,且使用已鋪上矽藻土層(約3.8 cm)、矽膠層(大約3.8 cm)及砂粒層之燒結漏斗(約12.7 cm寬)過濾。用乙酸乙酯(3.5 L)沖洗過濾墊,且在真空中濃縮經合併之濾液;殘餘物使用庚烷形成漿物,且在減壓下濃縮,從而得到淡橙色固體(79.0 g)。此材料與依類似方式使用P4 進行之許多反應的產物(總160 g,525 mmol)合併之後,經由超臨界流體層析(管柱:Chiral Technologies DCpak P4VP,5 µm;移動相:4:1二氧化碳/甲醇;回壓:100巴)純化。合併產率:193.7 g,502.5 mmol,69%。LCMSm/z 386.1 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.49 (s, 1H), 6.32 (s, 1H), 5.66 (br s, 1H), 5.34 (五重峰,J = 9.0 Hz, 1H), 4.64 (d,J = 5.5 Hz, 1H), 4.10 (dd,J = 11.4, 4.9 Hz, 1H), 4.01 (br dd,J = 11.7, 4.5 Hz, 1H), 3.88 - 3.77 (m, 1H), 3.57 (ddd,J = 9.4, 9.2, 4.9 Hz, 1H), 3.47 (ddd,J = 11.9, 11.8, 2.1 Hz, 1H), 3.20 (dd,J = 11.4, 9.9 Hz, 1H), 2.53 (s, 3H), 2.34 (s, 3H), 2.29 - 2.16 (m, 2H), 2.12 - 1.99 (m, 3H), 1.99 - 1.87 (m, 2H), 1.81 - 1.66 (m, 3H)。
如下進行進一步純化。經由施加最少熱量直至5 呈溶液狀態,製備5 (185 g,480 mmol)於二氯甲烷(大約750 mL)中之溶液。添加SiliaMetS Thiol (SH)(Silicycle;18.3 g),且在平緩回流下將所得混合物攪拌30分鐘,接著在冰浴中冷卻5分鐘,且經由1 cm矽藻土墊過濾,隨後使用二氯甲烷(大約250 mL)沖洗過濾墊。合併之濾液在大氣壓下蒸餾,以去除二氯甲烷(大約250 mL)。添加第三丁基甲基醚(500 mL)及5 之晶種(大約100 mg;此等晶體之來源參見下文),且藉由蒸餾去除額外溶劑(大約250 mL,沸點大約45℃)。再次添加第三丁基甲基醚(500 mL),且攪拌混合物,從而導致固體沈澱;繼續蒸餾直至已收集總共大約1.3 L為止,且餾出物之沸點為50.6℃。此時,在攪拌下使混合物冷卻至室溫,接著藉由過濾收集固體,且用第三丁基甲基醚(2×100 mL)沖洗,從而得到呈黃色固體狀之5 (163 g,423 mmol,88%純度)。
P4 及(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇獲得5 之替代性反應條件包括使用(AllylPdCl)2 之Pd(OAc)2t -BuBrettPhos作為催化劑/配位體;使用包括乙酸異丙酯、甲基乙基酮、甲苯、THF及較佳地含有THF [至多大約20%之THF]之2-甲基四氫呋喃的溶劑;及使用包括NaOt-Bu、KOt-Bu、KOt-Amyl、K3 PO4 及Cs2 CO3 之另一種鹼。替代性處理條件包括用水性氯化銨猝滅反應及用與反應溶劑一致的有機溶劑洗滌水層。5 之純化可使用酸/鹼處理隨後使用硫醇矽膠塞來實現。將水添加至經合併之有機層中,且藉由添加1 M氫氯酸將pH調整至約6。將第三丁基甲基醚用作洗滌劑。可用NaOH及K3 PO4 將pH調整至約5。實例5用如二氯甲烷之有機溶劑萃取,且與上文所論述類似地進行純化。例如C1-3 醇之短鏈醇可包括於有機層中以自硫醇矽膠塞溶離5 。在自短鏈醇結晶之前,可藉由標準程序去除所存在之任何顏色。
產生 5 之晶種5 (40 g)於乙醇(235 mL)中之漿液加熱回流直至獲得溶液為止。歷經35分鐘以逐滴方式將水(600 mL)添加至熱溶液中,且使用短程蒸餾頭收集溶劑(乙醇/水共沸物),同時維持大約450 mbar之真空。在完成水添加之後繼續加熱45分鐘;在此期間,收集大約125 mL之溶劑。隨後關掉熱量,且將混合物攪拌且冷卻至室溫隔夜。過濾,隨後用水洗滌濾餅,得到呈淡米色固體狀之5 (37.5 g),經由粉末X射線繞射分析將該淡米色固體展示為結晶體;此材料之一部分用作上文所採用的晶種。
產生用於 X 射線 結構性測定之 5 的晶體5 (150 mg,0.389 mmol)之樣本溶解於甲醇(2 mL)中且加熱至回流,從而得到溶液。添加水(4 mL),且繼續加熱以去除甲醇。經由過濾收集所得固體,且得到適用於X射線結構性測定之5 的晶體(見下文)。結晶體5 基於晶格中溶劑(包括水)之缺乏而為無水的。產率:139 mg,0.361 mmol,93%。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 )δ 8.57 (s, 1H), 7.13 (d,J = 7.4 Hz, 1H), 6.44 (s, 1H), 5.34 (五重峰,J = 9.0 Hz, 1H), 5.12 (d,J = 5.2 Hz, 1H), 3.91 - 3.75 (m, 3H), 3.47 - 3.3 (m,2H,假定;由水峰部分遮擋), 3.07 (dd,J = 11.1, 9.5 Hz, 1H), 2.39 (s, 3H), 2.26 (s, 3H), 2.21 - 2.08 (m, 2H), 2.08 - 1.94 (m, 3H), 1.91 - 1.77 (m, 2H), 1.73 - 1.59 (m, 2H), 1.51 - 1.38 (m, 1H)。
5 之單晶 X 射線 結構性測定 單晶 X 射線 分析
在室溫下在Bruker D8 Venture繞射儀上執行資料收集。資料收集由ω及φ掃描組成。
藉由在單斜晶空間群P 21 中使用SHELX軟體程式組之內部定相來解析結構。隨後藉由全矩陣最小平方法精修結構。使用異向性移位參數發現且精修所有非氫原子。
C17至C15處之無序位置經注意到但不用無序模型來處理。
自傅里葉差異圖發現位於氮及氧上之氫原子,且以制約距離加以精修。將剩餘氫原子置放於所計算位置中,且使其騎乘於其載體原子上。最終精修包括用於所有氫原子之等向性移位參數。
使用PLATON (Spek)執行使用似然法(Hooft,2008)對絕對結構之分析。試圖藉由Hooft方法且亦使用Parsons方法直接自X射線繞射資料測定絕對構形。最終精修Hooft參數及Parsons參數皆給出為0.12,其中esd為0.06。此值指示以上流程中所描繪之5 的立體化學表示絕對構形。
最終R指數為4.2%。最終差異傅里葉法顯示無電子密度之缺失或錯位。
相關晶體、資料收集及精修資訊概述於表L中。原子座標、鍵結長度、鍵結角度及移位參數列於表M至表P中。
軟體及參考文獻 SHELXTL, 版本5.1, Bruker AXS, 1997。PLATON , A. L. Spek,J. Appl. Cryst. 2003 ,36 , 7-13。MERCURY , C. F. Macrae, P. R. Edington, P. McCabe, E. Pidcock, G. P. Shields, R. Taylor, M. Towler及J. van de Streek, J. Appl. Cryst.2006 , 39, 453-457。OLEX2 , O. V. Dolomanov, L. J. Bourhis, R. J. Gildea, J. A. K. Howard及H. Puschmann,J. Appl. Cryst. 2009, 42 , 339-341。 R. W. W. Hooft, L. H. Straver及A. L. Spek,J. Appl. Cryst. 2008 ,41 , 96-103。 H. D. Flack,Acta Cryst. 1983 ,A39 , 867-881。 表L.5 之晶體資料及結構精修。
實驗式 C21 H27 N3 O4   
式量 385.45   
溫度 293(2)K   
波長 1.54178 Å   
晶體系統 單斜晶   
空間群 P 21   
單位晶胞維度 a = 9.6343(3)Å α = 90°
   b = 9.2601(3)Å β = 97.547(2)°
   c = 11.1908(4)Å γ = 90°
體積 989.73(6)Å3   
Z 2   
密度(計算值) 1.293 Mg/m3   
吸收係數 0.736 mm- 1   
F (000) 412   
晶體大小 0.220 x 0.080 x 0.060 mm3   
資料收集之θ範圍 4.630至72.311°   
指數範圍 -11<=h <=11, -11<=k <=11, -13<=l <=13   
所收集之反射 31769   
無關反射 3863 [Rint = 0.0363]   
達至θ=67.679°之完整性 99.3%   
吸收校正 實驗   
精修方法 F2 之全矩陣最小平方   
資料/限制/參數 3863 / 3 / 261   
F2 之擬合優度 1.050   
最終R 指數[I>2σ(I) ] R 1 = 0.0415,wR 2 = 0.1137   
R 指數(所有資料) R 1 = 0.0442,wR 2 = 0.1171   
絕對結構參數 0.11(6)   
消光係數 n/a   
最大差異峰及孔穴 0.302及-0.236 e.Å- 3   
表M.5 之原子座標(×104 )及等效等向性移位參數(Å2 ×103 )。U(eq)定義為正交Uij 張量之跡線的三分之一。
   x y z U(eq)
N(1) 9697(2) 4394(3) 4774(2) 53(1)
N(2) 9158(2) 4372(3) 6695(2) 46(1)
N(3) 4911(2) 5202(2) 5519(2) 36(1)
O(1) 8944(2) 6876(3) 3237(2) 64(1)
O(2) 10612(3) 4542(4) 1214(2) 93(1)
O(3) 3389(4) 6836(4) 8920(4) 115(1)
O(4) 2691(2) 5473(3) 6001(2) 68(1)
C(1) 9889(3) 5800(3) 2945(3) 51(1)
C(2) 9793(4) 5677(5) 1581(3) 74(1)
C(3) 10188(5) 3206(6) 1636(4) 92(1)
C(4) 10309(4) 3151(5) 2992(4) 72(1)
C(5) 9482(3) 4379(3) 3471(2) 45(1)
C(6) 8697(2) 4556(3) 5507(2) 40(1)
C(7) 7301(2) 4863(3) 5087(2) 39(1)
C(8) 6338(2) 4995(2) 5896(2) 34(1)
C(9) 6823(2) 4904(2) 7148(2) 37(1)
C(10) 8236(3) 4569(3) 7462(2) 44(1)
C(11) 5869(3) 5132(3) 8017(2) 41(1)
C(12) 6412(3) 5109(5) 9343(2) 65(1)
C(13) 4512(3) 5366(3) 7620(2) 43(1)
C(14) 3436(3) 5668(4) 8465(2) 55(1)
C(15) 2508(4) 4508(6) 8742(3) 84(1)
C(16) 3955(3) 5346(3) 6343(2) 44(1)
C(17) 4324(3) 5237(3) 4226(2) 41(1)
C(18) 4829(4) 6495(3) 3493(2) 56(1)
C(19) 4950(7) 5850(5) 2262(3) 105(2)
C(20) 4370(5) 4405(5) 2216(3) 80(1)
C(21) 4515(3) 3862(3) 3503(3) 49(1)
表N.5 之鍵結長度[Å]及角度[°]。
N(1)-C(6) 1.353(3)
N(1)-C(5) 1.446(3)
N(1)-H(1X) 0.93(2)
N(2)-C(10) 1.326(3)
N(2)-C(6) 1.357(3)
N(3)-C(16) 1.393(3)
N(3)-C(8) 1.397(3)
N(3)-C(17) 1.483(3)
O(1)-C(1) 1.416(4)
O(1)-H(1Y) 0.98(2)
O(2)-C(3) 1.404(6)
O(2)-C(2) 1.408(5)
O(3)-C(14) 1.199(4)
O(4)-C(16) 1.233(3)
C(1)-C(5) 1.514(4)
C(1)-C(2) 1.522(4)
C(1)-H(1A) 0.9800
C(2)-H(2A) 0.9700
C(2)-H(2B) 0.9700
C(3)-C(4) 1.507(6)
C(3)-H(3A) 0.9700
C(3)-H(3B) 0.9700
C(4)-C(5) 1.526(4)
C(4)-H(4A) 0.9700
C(4)-H(4B) 0.9700
C(5)-H(5) 0.9800
C(6)-C(7) 1.395(3)
C(7)-C(8) 1.384(3)
C(7)-H(7) 0.9300
C(8)-C(9) 1.420(3)
C(9)-C(10) 1.396(3)
C(9)-C(11) 1.439(3)
C(10)-H(10) 0.9300
C(11)-C(13) 1.342(4)
C(11)-C(12) 1.507(3)
C(12)-H(12A) 0.9600
C(12)-H(12B) 0.9600
C(12)-H(12C) 0.9600
C(13)-C(16) 1.459(3)
C(13)-C(14) 1.518(3)
C(14)-C(15) 1.456(5)
C(15)-H(15A) 0.9600
C(15)-H(15B) 0.9600
C(15)-H(15C) 0.9600
C(17)-C(21) 1.533(4)
C(17)-C(18) 1.540(4)
C(17)-H(17) 0.9800
C(18)-C(19) 1.519(5)
C(18)-H(18A) 0.9700
C(18)-H(18B) 0.9700
C(19)-C(20) 1.449(6)
C(19)-H(19A) 0.9700
C(19)-H(19B) 0.9700
C(20)-C(21) 1.514(5)
C(20)-H(20A) 0.9700
C(20)-H(20B) 0.9700
C(21)-H(21A) 0.9700
C(21)-H(21B) 0.9700
C(6)-N(1)-C(5) 126.3(2)
C(6)-N(1)-H(1X) 114(2)
C(5)-N(1)-H(1X) 118(2)
C(10)-N(2)-C(6) 117.2(2)
C(16)-N(3)-C(8) 121.58(18)
C(16)-N(3)-C(17) 116.28(19)
C(8)-N(3)-C(17) 122.12(18)
C(1)-O(1)-H(1Y) 103(2)
C(3)-O(2)-C(2) 111.1(3)
O(1)-C(1)-C(5) 108.4(2)
O(1)-C(1)-C(2) 109.2(3)
C(5)-C(1)-C(2) 109.9(3)
O(1)-C(1)-H(1A) 109.8
C(5)-C(1)-H(1A) 109.8
C(2)-C(1)-H(1A) 109.8
O(2)-C(2)-C(1) 112.8(3)
O(2)-C(2)-H(2A) 109.0
C(1)-C(2)-H(2A) 109.0
O(2)-C(2)-H(2B) 109.0
C(1)-C(2)-H(2B) 109.0
H(2A)-C(2)-H(2B) 107.8
O(2)-C(3)-C(4) 112.4(4)
O(2)-C(3)-H(3A) 109.1
C(4)-C(3)-H(3A) 109.1
O(2)-C(3)-H(3B) 109.1
C(4)-C(3)-H(3B) 109.1
H(3A)-C(3)-H(3B) 107.9
C(3)-C(4)-C(5) 110.7(3)
C(3)-C(4)-H(4A) 109.5
C(5)-C(4)-H(4A) 109.5
C(3)-C(4)-H(4B) 109.5
C(5)-C(4)-H(4B) 109.5
H(4A)-C(4)-H(4B) 108.1
N(1)-C(5)-C(1) 111.9(2)
N(1)-C(5)-C(4) 110.5(3)
C(1)-C(5)-C(4) 109.7(2)
N(1)-C(5)-H(5) 108.2
C(1)-C(5)-H(5) 108.2
C(4)-C(5)-H(5) 108.2
N(1)-C(6)-N(2) 114.4(2)
N(1)-C(6)-C(7) 123.5(2)
N(2)-C(6)-C(7) 122.2(2)
C(8)-C(7)-C(6) 119.9(2)
C(8)-C(7)-H(7) 120.1
C(6)-C(7)-H(7) 120.1
C(7)-C(8)-N(3) 122.15(19)
C(7)-C(8)-C(9) 118.55(19)
N(3)-C(8)-C(9) 119.30(19)
C(10)-C(9)-C(8) 116.5(2)
C(10)-C(9)-C(11) 123.4(2)
C(8)-C(9)-C(11) 120.1(2)
N(2)-C(10)-C(9) 125.6(2)
N(2)-C(10)-H(10) 117.2
C(9)-C(10)-H(10) 117.2
C(13)-C(11)-C(9) 118.7(2)
C(13)-C(11)-C(12) 121.7(2)
C(9)-C(11)-C(12) 119.6(2)
C(11)-C(12)-H(12A) 109.5
C(11)-C(12)-H(12B) 109.5
H(12A)-C(12)-H(12B) 109.5
C(11)-C(12)-H(12C) 109.5
H(12A)-C(12)-H(12C) 109.5
H(12B)-C(12)-H(12C) 109.5
C(11)-C(13)-C(16) 122.7(2)
C(11)-C(13)-C(14) 122.6(2)
C(16)-C(13)-C(14) 114.8(2)
O(3)-C(14)-C(15) 121.1(3)
O(3)-C(14)-C(13) 119.8(3)
C(15)-C(14)-C(13) 119.0(3)
C(14)-C(15)-H(15A) 109.5
C(14)-C(15)-H(15B) 109.5
H(15A)-C(15)-H(15B) 109.5
C(14)-C(15)-H(15C) 109.5
H(15A)-C(15)-H(15C) 109.5
H(15B)-C(15)-H(15C) 109.5
O(4)-C(16)-N(3) 121.1(2)
O(4)-C(16)-C(13) 121.6(2)
N(3)-C(16)-C(13) 117.3(2)
N(3)-C(17)-C(21) 116.1(2)
N(3)-C(17)-C(18) 115.5(2)
C(21)-C(17)-C(18) 106.2(2)
N(3)-C(17)-H(17) 106.1
C(21)-C(17)-H(17) 106.1
C(18)-C(17)-H(17) 106.1
C(19)-C(18)-C(17) 104.7(3)
C(19)-C(18)-H(18A) 110.8
C(17)-C(18)-H(18A) 110.8
C(19)-C(18)-H(18B) 110.8
C(17)-C(18)-H(18B) 110.8
H(18A)-C(18)-H(18B) 108.9
C(20)-C(19)-C(18) 108.7(3)
C(20)-C(19)-H(19A) 110.0
C(18)-C(19)-H(19A) 110.0
C(20)-C(19)-H(19B) 110.0
C(18)-C(19)-H(19B) 110.0
H(19A)-C(19)-H(19B) 108.3
C(19)-C(20)-C(21) 106.6(3)
C(19)-C(20)-H(20A) 110.4
C(21)-C(20)-H(20A) 110.4
C(19)-C(20)-H(20B) 110.4
C(21)-C(20)-H(20B) 110.4
H(20A)-C(20)-H(20B) 108.6
C(20)-C(21)-C(17) 102.9(2)
C(20)-C(21)-H(21A) 111.2
C(17)-C(21)-H(21A) 111.2
C(20)-C(21)-H(21B) 111.2
C(17)-C(21)-H(21B) 111.2
H(21A)-C(21)-H(21B) 109.1
用以產生等效原子之對稱性變換。 表P.5 之異向性移位參數(Å2 ×103 )。異向性移位因子指數採用以下形式:-2π2 [h2 a*2 U11 + ... + 2 h k a* b* U12 ]。
   U11 U22 U33 U23 U13 U12
N(1) 32(1) 79(2) 48(1) 11(1) 7(1) 9(1)
N(2) 35(1) 58(1) 44(1) 8(1) 0(1) 3(1)
N(3) 35(1) 42(1) 32(1) 1(1) 4(1) 4(1)
O(1) 57(1) 53(1) 81(2) 1(1) 2(1) 2(1)
O(2) 91(2) 128(3) 69(2) -6(2) 43(1) -10(2)
O(3) 127(3) 86(2) 151(3) -48(2) 92(2) -17(2)
O(4) 38(1) 118(2) 49(1) 0(1) 9(1) 10(1)
C(1) 41(1) 59(2) 53(2) 3(1) 4(1) -4(1)
C(2) 77(2) 93(3) 51(2) 12(2) 9(2) -12(2)
C(3) 101(3) 96(3) 87(3) -22(2) 45(2) 8(3)
C(4) 68(2) 70(2) 82(2) 2(2) 29(2) 20(2)
C(5) 34(1) 54(2) 49(1) 2(1) 10(1) 1(1)
C(6) 33(1) 44(1) 44(1) 5(1) 6(1) 0(1)
C(7) 35(1) 47(1) 34(1) 3(1) 2(1) 1(1)
C(8) 34(1) 32(1) 36(1) 1(1) 3(1) -3(1)
C(9) 38(1) 39(1) 33(1) 1(1) 2(1) -2(1)
C(10) 42(1) 50(1) 37(1) 5(1) -1(1) -2(1)
C(11) 46(1) 45(1) 34(1) -1(1) 6(1) -7(1)
C(12) 62(2) 99(2) 33(1) -4(2) 5(1) -2(2)
C(13) 47(1) 47(2) 37(1) -2(1) 13(1) -2(1)
C(14) 56(2) 70(2) 43(1) -10(1) 16(1) -2(1)
C(15) 81(2) 113(3) 67(2) -19(2) 38(2) -36(2)
C(16) 42(1) 53(2) 39(1) 0(1) 10(1) 1(1)
C(17) 36(1) 52(1) 35(1) -3(1) 0(1) 7(1)
C(18) 82(2) 44(1) 40(1) 4(1) 2(1) 14(1)
C(19) 200(6) 76(3) 40(2) 0(2) 24(2) -20(3)
C(20) 119(3) 78(2) 41(2) -14(2) 6(2) 11(2)
C(21) 52(1) 48(1) 46(1) -6(1) -1(1) -5(1)
因此,本發明之一個實施例提供呈結晶固體之3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H)-酮。在另一其他實施例中,結晶固體為無水的。
採集晶體 5 之粉末 X 射線繞射 (PXRD) 資料
提供晶體5 之樣本(無水的)以用於PXRD分析,且發現為結晶材料(表示為形式I) 。使用配備有Cu輻射源之Bruker D8 Advance繞射儀來進行粉末X射線繞射分析。發散狹縫設定為10 mm連續照明。繞射輻射藉由具有機動狹縫之LYNXEYE_EX偵測器來偵測。將X射線管電壓及安培分別設定為40 kV及40 mA。在Cu波長(CuK =1.5418λ)下在3.0至40.0度2θ之θ-θ測角計中使用0.01度之步長大小及1.0秒之步長時間在抗散射螢幕就位下收集資料。在資料收集期間旋轉樣本。藉由將樣本放入矽低背景樣本固持器中來準備樣本且在收集期間旋轉樣本。使用Bruker DIFFRAC Plus軟體收集資料,且藉由EVA diffract plus軟體執行分析。在峰搜索之前不處理PXRD資料檔案。使用EVA軟體中之峰搜索演算法,使用具有臨限值為1之所選峰來進行初步峰賦值。為確保有效性,人工地進行調節;視覺上檢查自動賦值之輸出且將峰位置調整至峰最大值。一般選擇相對強度≥3%之峰。典型地,不選擇未解析出或與雜訊一致的峰。USP中所陳述的與PXRD之峰位置相關的典型誤差為至多+/- 0.2° 2θ (USP-941)。持續觀測一個繞射圖案且將其提供於圖1中。根據晶體5 樣本(藉由本文所提供之方法獲得)之PXRD的角度2θ及相對強度(其中相對強度≥之3.0%)所表述的繞射峰之清單展示於下表X1中。 表X1
角度(2-θ) 相對強度(%)
8.0 100.0
14.9 3.7
16.0 45.3
16.2 34.9
17.4 3.5
18.6 50.5
19.1 71.8
19.9 7.3
20.8 18.2
20.9 17.7
21.3 19.8
21.5 9.3
21.8 4.1
22.3 6.1
23.3 68.9
26.0 9.2
26.2 12.7
26.5 7.7
28.1 9.5
30.0 13.7
30.4 3.3
31.1 7.3
32.3 4.1
33.2 4.2
33.9 7.8
36.2 5.3
實例 6 及實例 7 6- 乙醯基 -8-[(1S,2S)-2- 羥基 -2- 甲基環戊基 ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- 6- 乙醯基 -8-[(1R,2R)-2- 羥基 -2- 甲基環戊基 ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- [6 (DIAST-1) 7 (DIAST-2)]
Figure 02_image098
Figure 02_image100
步驟 1. 合成外消旋 - 乙酸 (1S,2S)-2-[6-(1- 乙氧基乙烯基 )-5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ]-1- 甲基環戊酯 (C40 ) P5 (447 mg,1.05 mmol)、三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(568 mg,1.57 mmol)及肆(三苯基膦)鈀(0)(72.7 mg,62.9 µmol)於甲苯(10 mL)中之混合物加熱回流5小時。此時,反應混合物之LCMS分析指示產物C40 之存在:LCMSm/z 418.1 [M+H]+ 。在反應混合物已經由矽藻土過濾之後,在真空中濃縮濾液,且使用矽膠層析(梯度:20%至60%乙酸乙酯/庚烷)純化殘餘物以得到呈淡黃色發泡體之C40 。產率:380 mg,0.91 mmol,87%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 特徵峰: δ 8.76 (s, 1H), 6.48 - 6.23 (m, 1H), 4.54 (d,J = 2.5 Hz, 1H), 4.17 (d,J = 2.5 Hz, 1H), 3.93 (q,J = 7.0 Hz, 2H), 2.62 (s, 3H), 2.62 - 2.52 (m, 1H), 2.45 (s, 3H), 1.99 (s, 3H), 1.85 - 1.71 (m, 1H), 1.44 (br s, 3H), 1.35 (t,J = 7.0 Hz, 3H)。
步驟 2. 合成外消旋 - 乙酸 (1S,2S)-2-[6- 乙醯基 -5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ]-1- 甲基環戊酯 (C41 ) 將氫氯酸(1.0 M;3.46 mL,3.46 mmol)添加至C40 (361 mg,0.865 mmol)於四氫呋喃(27 mL)中之溶液中,且將反應混合物在室溫下攪拌40分鐘。此時,反應混合物之LCMS分析指示產物C41 之存在:LCMSm/z 390.1 [M+H]+ 。添加飽和碳酸氫鈉水溶液,且用乙酸乙酯萃取所得混合物。合併之有機層經硫酸鎂乾燥,過濾,在真空中濃縮,且經歷矽膠層析,從而得到呈固體狀之C41 。產率:315 mg,0.809 mmol,94%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 特徵峰: δ 8.80 (s, 1H), 6.48 - 6.24 (br s, 1H), 2.61 (s, 3H), 2.51 (s, 3H), 2.38 (s, 3H), 2.36 - 2.24 (m, 1H), 2.10 - 1.97 (m, 2H), 1.99 (s, 3H), 1.87 - 1.73 (m, 1H), 1.45 (br s, 3H)。
步驟 3. 合成外消旋 - 乙酸 (1S,2S)-2-[6- 乙醯基 -5- 甲基 -2-( 甲基亞磺醯基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ]-1- 甲基環戊酯 (C42 ) 將過氧單硫酸鉀(Oxone® ;1.05 g,1.71 mmol)於水(5 mL)中之溶液添加至C41 (315 mg,0.809 mmol)於四氫呋喃(20 mL)中之溶液中,且將反應混合物在室溫下攪拌16小時。此時,反應混合物之LCMS分析指示已形成C42 :LCMSm/z 346.0 [(M-乙酸)+H]+ 。添加水,且用乙酸乙酯將所得混合物萃取兩次。合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮以得到呈淡黃色固體狀之C42 。產率:299 mg,0.737 mmol,91%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 特徵峰: δ 9.13 (s, 1H), 6.46 - 6.02 (br s, 1H), 3.36 (s, 3H), 2.53 (s, 3H), 2.46 (s, 3H), 2.36 - 2.20 (m, 2H), 2.16 - 2.02 (m, 2H), 1.98 (s, 3H), 1.44 (br s, 3H)。
步驟 4. 合成乙酸 (1S,2S)-2-[6- 乙醯基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基 -7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ]-1- 甲基環戊酯及乙酸 (1R,2R)-2-[6- 乙醯基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基 -7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ]-1- 甲基環戊酯 (C43 ) 在50℃下將C42 (170 mg,0.419 mmol)、(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇鹽酸鹽(129 mg,0.840 mmol)及N,N -二異丙基乙胺(0.348 mL,2.00 mmol)於二甲亞碸(3 mL)中之混合物攪拌1小時。此時,反應混合物之LCMS分析指示C43 之存在,因為針對雙組分非對映異構體具有相等大小之兩個峰:LCMSm/z 399.2 [(M-乙酸)+H]+ 。在將反應混合物用水稀釋且用二氯甲烷萃取之後,合併之有機層經硫酸鎂乾燥,過濾,且在真空中濃縮。矽膠層析(梯度:0%至10%乙酸乙酯/庚烷)得到呈灰白色固體狀之C43C431 H NMR光譜與2種非對映異構體之存在一致。產率:170 mg,0.371 mmol,88%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 特徵峰: δ [8.63 (s)and 8.62 (s), total 1H], 6.35 - 6.07 (m, 1H), 4.13 - 4.04 (m, 1H), 4.04 - 3.91 (m, 2H), 3.71 - 3.42 (m, 2H), 3.21 (ddd,J = 11.3, 9.6, 6.2 Hz, 1H), [2.49 (s)及2.49 (s), 總共3H], [2.34 (s)及2.33 (s), 總共3H], [2.04 (s)及2.02 (s), 總共3H], 1.47 (br s, 3H)。
步驟 5. 合成 6- 乙醯基 -8-[(1S,2S)-2- 羥基 -2- 甲基環戊基 ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- 6- 乙醯基 -8-[(1R,2R)-2- 羥基 -2- 甲基環戊基 ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- [6 (DIAST-1) 7 (DIAST-2)] 將碳酸鉀(512 mg,3.70 mmol)添加至C43 (170 mg,0.371 mmol)於甲醇(12 mL)中之溶液中。將反應混合物在室溫下攪拌24小時,接著將其用水稀釋,且用二氯甲烷萃取。合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾,在真空中濃縮,且經由矽膠層析(梯度:0%至10%乙酸乙酯/庚烷)純化以得到呈淡黃色固體狀的67 之混合物。產率:115 mg,0.276 mmol,74%。使用超臨界流體層析(管柱:Chiral Technologies Chiralcel OJ-H,5 µm;移動相:4:1二氧化碳/甲醇;回壓:100巴)進行兩種非對映異構體之分離。第一溶離非對映異構體表示為6 ,且第二溶離非對映異構體表示為7 ;兩者皆分離為固體。
6 (DIAST-1)- 產率:23.1 mg,55.5 µmol,20%用於分離。LCMSm/z 416.9 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 80 ℃, DMSO-d 6 ), 特徵峰: δ 8.77 (s, 1H), 7.45 (br s, 1H), 5.91 - 5.82 (m, 1H), 4.11 (s, 1H), 4.03 - 3.93 (m, 1H), 3.90 - 3.81 (m, 2H), 3.58 - 3.47 (m, 1H), 3.38 (ddd,J = 11.7, 11.6, 2.3 Hz, 1H), 3.08 (dd,J = 11.2, 9.6 Hz, 1H), 2.66 - 2.55 (m, 1H), 2.39 (s, 3H), 2.29 (s, 3H), 2.20 - 2.10 (m, 1H), 2.05 - 1.81 (m, 4H), 1.78 - 1.69 (m, 1H), 1.69 - 1.56 (m, 1H), 1.03 (s, 3H)。滯留時間:0.54分鐘(管柱:Chiral Technologies Chiralcel OJ-3,4.6×100 mm,3 µm;移動相:4:1二氧化碳/甲醇;流動速率:4 mL/分鐘;回壓:120巴)。
7 (DIAST-2)- 產率:23.4 mg,56.2 µmol,20%用於分離。LCMSm/z 416.9 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 80 ℃, DMSO-d 6 ), 特徵峰: δ 8.77 (s, 1H), 7.41 (br d,J = 7.6 Hz, 1H), 5.88 (dd,J = 9.4, 7.5 Hz, 1H), 3.99 (s, 1H), 3.97 - 3.87 (m, 1H), 3.87 (dd,J = 11.1, 4.8, 1H), 3.84 - 3.77 (m, 1H), 3.64 - 3.54 (m, 1H), 3.37 (ddd,J = 11.8, 11.5, 2.4 Hz, 1H), 3.09 (dd,J = 11.0, 9.6 Hz, 1H), 2.39 (s, 3H), 2.29 (s, 3H), 2.27 - 2.17 (m, 1H), 2.15 - 2.06 (m, 1H), 2.04 - 1.93 (m, 1H), 1.93 - 1.82 (m, 2H), 1.76 - 1.67 (m, 1H), 1.58 - 1.44 (m, 1H), 1.04 (s, 3H)。滯留時間:0.79分鐘(與用於6 之彼等一致的分析條件)。
實例 8 及實例 9 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基 -2,2- 二甲基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -2-{[(3R,4S)-3- 羥基 -2,2- 二甲基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- [8 (ENT-1) 9 (ENT-2) ]
Figure 02_image102
Figure 02_image104
步驟 1. 合成外消旋 -(1S,6S)-2,2- 二甲基 -3,7- 二氧雜雙環 [4.1.0] 庚烷 (C44 ) 將3-氯過氧苯甲酸(70%,11.2 g,45.4 mmol)添加至6,6-二甲基-3,6-二氫-2H-哌喃(參見L-I. Olsson及A. Claesson,Synthesis 1979 , 743-745)(3.9 g,35 mmol)於氯仿(35 mL)中之溶液中,將其在水浴中攪拌以使反應混合物維持在室溫下。在16小時之後,將仍在水浴中之反應混合物用亞硫酸鈉(4.4 g,35 mmol)於水(20 mL)中之溶液謹慎處理。添加飽和碳酸氫鈉水溶液(20 mL),且用二氯甲烷(2×80 mL)萃取水層。合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾,且平緩地蒸發(10 mm Hg,<20℃)以得到直接用於以下步驟的C44 (4.49 g)。藉由1 H NMR分析,此材料含有3-氯苯甲酸衍生之雜質。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 僅C44 峰: δ 3.58 (ddd,J = 11.8, 8.6, 4.7 Hz, 1H), 3.44 (ddd,J = 11.8, 5.2, 4.2 Hz, 1H), 3.40 - 3.36 (m, 1H), 2.91 (d,J = 4.3 Hz, 1H), 2.00 - 1.86 (m, 2H), 1.32 (s, 3H), 1.29 (s, 3H)。
步驟 2. 合成外消旋 -(3S,4R)-4-( 苯甲基胺基 )-2,2- 二甲基四氫 -2H- 哌喃 -3- (C45 ) 在60℃下將C44 (來自前一步驟;4.49 g,≤35 mmol)、苯甲胺(11.5 mL,105 mmol)及溴化鋰(30.4 g,350 mmol)於甲苯(35 mL)中之混合物加熱16小時。隨後將反應混合物在真空中濃縮,與甲醇混合,且再次濃縮,接著將殘餘物分配於飽和碳酸氫鈉水溶液(100 mL)與乙酸乙酯(500 mL)之間。添加水(400 mL)以輔助溶解,且用乙酸乙酯(2×400 mL)萃取水層。合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾,且在減壓下濃縮以得到C45 (14.2 g)。藉由1 H NMR分析,此樣本含有大量苯甲胺。苯甲胺之校正產率:7.5 g,32 mmol,91%,歷經2個步驟。LCMSm/z 236.3 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ),C45 之特徵峰: δ 3.95 (d,J = 12.9 Hz, 1H), 3.75 - 3.68 (m, 2H), 3.62 (ddd,J = 12.4, 12.3, 2.4 Hz, 1H), 3.11 (d,J = 9.9 Hz, 1H), 2.69 (ddd,J = 11.6, 9.9, 4.3 Hz, 1H), 2.08 - 2.00 (m, 1H), 1.47 - 1.35 (m, 1H), 1.30 (s, 3H), 1.17 (s, 3H)。
步驟 3. 合成外消旋 -(3S,4R)-4- 胺基 -2,2- 二甲基四氫 -2H- 哌喃 -3- 鹽酸鹽 (C46 ) C45 (2.0 g,8.5 mmol)於甲醇(85 mL)中之溶液用氮氣脫氣,且隨後用20%氫氧化鈀/碳(400 mg)處理。在氫氣囊下將此混合物攪拌16小時,接著再次添加20%氫氧化鈀/碳(400 mg),且繼續氫化3天。在經由過濾去除催化劑之後,用甲醇(30 mL)洗滌濾餅,且用氫氯酸(4 M;10.7 mL,43 mmol)處理經合併之濾液。在真空中濃縮(10 mm Hg,40℃)所得混合物,從而得到淡褐色固體。將此淡褐色固體與乙醚(30 mL)混合且進行音波處理;傾析出透明醚層,且乾燥剩餘膠狀固體以得到呈淡褐色固體狀之C46 。產率:820 mg,4.5 mmol,53%。LCMSm/z 146.3 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 )δ 8.22 (br s, 3H), 3.58 - 3.44 (m, 2H), 3.23 (d,J = 10.2 Hz, 1H), 3.15 - 3.02 (m, 1H), 1.98 - 1.89 (m, 1H), 1.73 - 1.59 (m, 1H), 1.14 (s, 3H), 1.06 (s, 3H)。
步驟 6. 合成 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基 -2,2- 二甲基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- 6- 乙醯基 -8- 環戊基 -2-{[(3R,4S)-3- 羥基 -2,2- 二甲基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- [8 (ENT-1) 9 (ENT-2)] 將含有P6 (317 mg,1.04 mmol)、C46 (290 mg,1.6 mmol)及N,N -二異丙基乙胺(0.90 mL,5.2 mmol)於二甲亞碸(4 mL)中之溶液的小瓶加蓋且在攪拌下加熱至80℃ (塊溫度)持續16小時。隨後將反應混合物分配於二氯甲烷(100 mL)與飽和碳酸氫鈉水溶液(20 mL)之間,且用二氯甲烷(30 mL)萃取水層。合併之有機層經硫酸鈉乾燥、過濾,且在真空中濃縮。使用超臨界流體層析(管柱:Chiral Technologies Chiralpak AD-H,5 µm;移動相:3:2二氧化碳/甲醇;回壓:100巴)進行組分對映異構體之分離;呈現負(-)旋轉之第一溶離對映異構體表示為8 ,且呈現正(+)旋轉之第二溶離對映異構體表示為9 。根據對1 H NMR光譜之檢查,假定此等材料兩者均以旋轉異構體之混合物形式存在。
8 (ENT-1)- 產率:162 mg,0.391 mmol,38%。LCMSm/z 415.0 [M+H]+1 H NMR (700 MHz, DMSO-d 6 )δ [8.78 (s)及8.73 (s), 總共1H], [7.72 - 7.65 (m)及7.56 - 7.50 (m), 總共1H], [5.91 - 5.81 (m)及5.74 - 5.62 (m), 總共1H], 5.08 - 4.99 (m, 1H), [4.14 (br s)及4.04 (br s), 總共1H], [3.6 - 3.49 (m)及3.31 - 3.19 (m), 總共1H, 假定;由水峰部分遮擋之低場信號], 2.38 (s, 3H), 2.36 - 2.28 (m, 1H), 2.23 (s, 3H), 2.16 (br s, 1H), 2.01 - 1.49 (m, 10H), 1.16 (s, 3H), 1.12 (s, 3H). 滯留時間:1.27分鐘(管柱:Chiral Technologies Chiralpak AD-3,4.6×100 mm,3 µm;移動相:3:2二氧化碳/甲醇;流動速率:4毫升/分鐘;回壓:120巴)。
9 (ENT-2)- 產率:151 mg,0.364 mmol,35%。LCMSm/z 415.0 [M+H]+1 H NMR (700 MHz, DMSO-d 6 )δ [8.78 (s)及8.73 (s), 總共1H], [7.69 (br s)及7.53 (br s), 總共1H], [5.86 (br s)及5.68 (br s), 總共1H], 5.08 - 4.98 (m, 1H), [4.14 (br s)及4.04 (br s), 總共1H], [3.6 - 3.49 (m)及3.30 - 3.18 (m), 總共1H, 假定;由水峰部分遮擋之低場信號], 2.38 (s, 3H), 2.36 - 2.29 (m, 1H), 2.23 (s, 3H), 2.20 - 2.12 (m, 1H), 2.01 - 1.49 (m, 10H), 1.16 (s, 3H), 1.12 (s, 3H). 滯留時間:2.24分鐘(與用於8 之彼等一致的分析條件)。
實例 10 6- 乙醯基 -8-[(1R,2S)-2- 乙基環戊基 ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (10 )
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Figure 02_image108
步驟 1. 合成 6- -8-[(1R,2S)-2- 乙基環戊基 ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C47 ) 在60℃下將P7 (80 mg,0.22 mmol)、(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇(75.8 mg,0.647 mmol)及N,N -二異丙基乙胺(0.239 mL,1.37 mmol)於二甲亞碸(1.5 mL)中之溶液攪拌16小時。再次添加(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇(75.8 mg,0.647 mmol)及N,N -二異丙基乙胺(0.239 mL,1.37 mmol),且在65℃下將反應混合物攪拌3小時,接著將其用水稀釋。將所得固體經由過濾收集且用水洗滌,隨後溶解於乙酸乙酯中且經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮。使用矽膠層析(梯度:0%至100%乙酸乙酯/庚烷)純化殘餘物;將所得材料溶解於水與乙腈之混合物中,且隨後凍乾,從而得到呈淡黃色固體狀之C47 。產率:60 mg,0.13 mmol,59%。LCMSm/z 452.8 (觀測到溴同位素圖案)[M+H]+1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 )δ 8.76 (s, 1H), 7.39 (br s, 1H), 6.15 - 6.05 (m, 1H), 4.71 - 4.65 (m, 1H), 3.95 - 3.79 (m, 3H), 3.64 - 3.54 (m, 1H), 3.37 (ddd,J = 11.7, 11.5, 2.2 Hz, 1H), 3.10 (dd,J = 11.1, 9.5 Hz, 1H), 2.54 (s, 3H), 2.14 - 2.04 (m, 1H), 2.04 - 1.94 (m, 2H), 1.94 - 1.82 (m, 3H), 1.62 - 1.42 (m, 3H), 1.15 - 1.03 (m, 2H), 0.74 (t,J = 7.4 Hz, 3H)。
步驟 2. 合成 6- 乙醯基 -8-[(1R,2S)-2- 乙基環戊基 ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (10 ) C47 (60 mg,0.13 mmol)、三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(84.0 mg,0.233 mmol)及肆(三苯基膦)鈀(0)(7.8 mg,6.8 µmol)於甲苯(8 mL)中之溶液用氮氣吹掃,且隨後加熱至110℃持續20小時。在反應混合物已經由針筒過濾器過濾之後,在真空中濃縮濾液,且用四氫呋喃稀釋殘餘物。添加氯化氫(4 M溶液於1,4-二噁烷中;0.332 mL,1.33 mmol)及水(0.5 mL),且在室溫下將反應混合物攪拌1.5小時,接著將其在減壓下濃縮。經由超臨界流體層析(管柱:Nacalai Cosmosil 3-羥苯基;移動相:88:12二氧化碳/甲醇)純化得到10 。根據1 H NMR分析,假定此材料以旋轉異構體之混合物形式存在。產率:30 mg,72 µmol,55%。LCMSm/z 415.2 [M+H]+1 H NMR (700 MHz, DMSO-d 6 ), 特徵峰: δ [8.80 (s)及8.77 (s), 總共1H], [7.91 (br s)及7.75 (br s), 總共1H], [6.12 (br s)及6.00 (br s), 總共1H], [5.00 (s)及4.98 (s), 總共1H], 4.03 - 3.75 (m, 3H), 3.62 - 3.48 (m, 1H), 3.11 - 2.99 (m, 1H), 2.38 (s, 3H), 2.26 (s, 3H), 2.07 - 1.78 (m, 5H), 1.57 - 1.40 (m, 2H), 1.15 - 0.99 (m, 2H), [0.75 (br s)及0.71 (br s), 總共3H]。
實例 11 3- 乙醯基 -7-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-4- 甲基 -1-[(3S)- 四氫呋喃 -3- ]-1,6- 㖠啶 -2(1H)- (11 )
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步驟 1. 合成 7-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-4- 甲基 -1-[(3S)- 四氫呋喃 -3- ]-1,6- 㖠啶 -2(1H)- (C48 ) P8 (150 mg,0.567 mmol)、(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇(79.7 mg,0.680 mmol)、碳酸銫(554 mg,1.70 mmol)、肆(三苯基膦)鈀(0)(65.5 mg,56.7 µmol)及4,5-雙(二苯基膦)-9,9-二甲基二苯并哌喃(Xantphos;65.6 mg,0.113 mmol)之混合物中添加甲苯(6 mL)。將氮氣鼓泡通過所得懸浮液,隨後將所得懸浮液在110℃下攪拌16小時。在另一次添加4,5-雙(二苯基膦)-9,9-二甲基二苯并哌喃(32.8 mg,56.7 µmol)及肆(三苯基膦)鈀(0)(32.8 mg,28.4 µmol)之後,再次將氮氣鼓泡通過反應混合物,且隨後將該反應混合物在110℃下加熱4小時,隨後過濾。在真空中濃縮濾液;此時,LCMS分析指示C48 之存在:LCMSm/z 346.0 [M+H]+ 。在矽膠上進行製備型薄層層析(溶離劑:10:1二氯甲烷/甲醇)後,分離出呈黃色油狀物之C48 。產率:80 mg,0.23 mmol,41%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.39 (s, 1H), 6.80 (s, 1H), 6.45 - 6.34 (m, 1H), 6.24 (d,J = 1.3 Hz, 1H), 4.76 (br d,J = 5.7 Hz, 1H), 4.50 - 4.42 (m, 1H), 4.14 (dd,J = 10.3, 4.0 Hz, 1H), 4.09 (dd,J = 11.4, 4.9 Hz, 1H), 4.03 - 3.97 (m, 1H), 3.92 (dd,J = 10.1, 10.0 Hz, 1H), 3.82 - 3.69 (m, 2H), 3.56 (ddd,J = 9.4, 9.2, 4.8 Hz, 1H), 3.47 (ddd,J = 11.8, 11.7, 2.1 Hz, 1H), 3.22 (dd,J = 11.3, 9.7 Hz, 1H), 2.37 (br s, 3H), 2.33 - 2.23 (m, 2H), 2.08 - 1.98 (m, 1H), 1.78 - 1.66 (m, 1H)。
步驟 2. 合成 3- -7-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-4- 甲基 -1-[(3S)- 四氫呋喃 -3- ]-1,6- 㖠啶 -2(1H)- (C49 ) C48 (80 mg,0.23 mmol)於乙腈(5 mL)與二氯甲烷(2.5 mL)之混合物中的0℃溶液中添加N -溴代丁二醯亞胺(45.3 mg,0.255 mmol)於乙腈(5 mL)中之溶液。在0℃下將反應混合物攪拌10分鐘;此時,反應混合物之LCMS分析指示向C49 之轉化:LCMSm/z 425.9 (觀測到溴同位素圖案)[M+H]+ 。在已用二氯甲烷(50 mL)稀釋反應混合物之後,將反應混合物依序用飽和亞硫酸鈉水溶液(10 mL)及飽和氯化鈉水溶液(30 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮。在矽膠上進行製備型薄層層析(溶離劑:15:1二氯甲烷/甲醇)得到呈白色固體狀之C49 。產率:60 mg,0.14 mmol,61%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.51 (s, 1H), 6.81 (s, 1H), 6.45 - 6.31 (m, 1H), 4.86 - 4.76 (m, 1H), 4.52 - 4.41 (m, 1H), 4.21 - 4.04 (m, 2H), 4.04 - 3.89 (m, 2H), 3.86 - 3.70 (m, 2H), 3.62 - 3.53 (m, 1H), 3.53 - 3.43 (m, 1H), 3.27 - 3.18 (m, 1H), 2.60 (s, 3H), 2.35 - 2.24 (m, 2H), 2.09 - 2.00 (m, 1H), 1.78 - 1.64 (m, 1H)。
步驟 3. 合成 3- 乙醯基 -7-{[( 3S,4R)-3- 羥基四氫 -2 H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-4- 甲基 -1-[(3S)- 四氫呋喃 -3- ]-1,6- 㖠啶 -2(1H)- (11 ) C49 (60 mg,0.14 mmol)於甲苯(10 mL)中之懸浮液中添加三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(255 mg,0.706 mmol)及肆(三苯基膦)鈀(0)(16.3 mg,14.1 µmol)。在將反應混合物用氮氣脫氣三次之後,將該反應混合物在110℃下攪拌16小時,且冷卻至室溫。添加濃鹽酸(0.333 mL),且在10℃下將反應混合物攪拌15分鐘,接著將該反應混合物用二氯甲烷(30 mL)稀釋,且依序用水(15 mL)、氫氧化鈉水溶液(2 M;10 mL)及飽和氯化鈉水溶液(2×15 ml)洗滌。隨後將有機層經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮。在矽膠上進行製備型薄層層析(溶離劑:10:1二氯甲烷/甲醇)之後,將產物與使用C49 (23 mg,54 µmol)進行之類似反應的產物合併,且藉由逆相HPLC (管柱:Agela Durashell C-18,5 µm;移動相A:0.05%氫氧化銨/水;移動相B:乙腈;梯度:14%至34% B)純化以得到呈固體狀之11 。合併產率:28.5 mg,73.6 µmol,38%。LCMSm/z 388.3 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 甲醇-d 4 )δ 8.57 (s, 1H), 6.89 (s, 1H), 6.27 - 6.16 (m, 1H), 4.54 - 4.46 (m, 1H), 4.13 (dd,J = 10.1, 4.2 Hz, 1H), 4.01 - 3.89 (m, 3H), 3.84 - 3.69 (m, 2H), 3.57 (ddd,J = 9.5, 9.3, 4.8 Hz, 1H), 3.50 (ddd,J = 11.8, 11.8, 2.2 Hz, 1H), 3.22 (dd,J = 11.1, 9.7 Hz, 1H), 2.47 (s, 3H), 2.43 - 2.33 (m, 1H), 2.35 (s, 3H), 2.32 - 2.22 (m, 1H), 2.12 - 2.05 (m, 1H), 1.66 - 1.55 (m, 1H)。
實例 12 及實例 13 6- 乙醯基-8-[(1 S, 2R,5R)- 雙環[3.1.0]己-2- ]-2-{[( 3S,4R)-3- 羥基四氫-2 H- 哌喃-4- ] 胺基}-5- 甲基吡啶并[2,3-d] 嘧啶-7(8 H)- 6- 乙醯基-8-[(1 R,2 S,5 S)- 雙環[3.1.0]己-2- ]-2-{[( 3S,4R)-3- 羥基四氫-2H- 哌喃-4- ] 胺基}-5- 甲基吡啶并[2,3-d] 嘧啶-7(8 H)- [12 (DIAST-1) 13 (DIAST-2)]
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Figure 02_image118
步驟 1. 合成 8-[(1S,2R,5R)- 雙環 [3.1.0] -2- ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- 8-[(1R,2S,5S)- 雙環 [3.1.0] -2- ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C50 ) 在70℃下將P9 (260 mg,0.897 mmol)、(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇(158 mg,1.35 mmol)及N,N -二異丙基乙胺(348 mg,2.69 mmol)於二甲亞碸(3 mL)中之混合物攪拌三小時,接著將反應混合物倒入水(50 mL)中且用乙酸乙酯(2×50 ml)萃取。合併之有機層經硫酸鈉乾燥、過濾,且在真空中濃縮。在將殘餘物與使用P9 (30 mg,0.10 mmol)進行之類似反應的產物合併之後,將其使用矽膠層析(梯度:0%至5%甲醇/二氯甲烷)純化以得到呈白色固體狀之C50 ,其由2種非對映異構體之所指示混合物組成。合併產率:150 mg,0.421 mmol,42%。
步驟 2. 合成 8-[(1S,2R,5R)- 雙環 [3.1.0] -2- ]-6- -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- 8-[(1R,2S,5S)- 雙環 [3.1.0] -2- ]-6- -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C51 ) 在25℃下在密封管中將C50 (120 mg,0.337 mmol)、N- 溴代丁二醯亞胺(65.9 mg,0.370 mmol)及乙二酸(3.0 mg,33 µmol)於乙腈(10 mL)中之溶液攪拌5小時。添加亞硫酸氫鈉水溶液(10 mL);在將所得混合物在室溫下攪拌幾分鐘之後,將所得混合物分配於乙酸乙酯(50 mL)與水(50 mL)之間,且用乙酸乙酯(2×50 mL)萃取水層。合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮,從而得到呈膠狀物之C51 (150 mg)。此材料進行至以下步驟。
步驟 3. 合成 6- 乙醯基 -8-[(1S,2R,5R)- 雙環 [3.1.0] -2- ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- 6- 乙醯基 -8-[(1R,2S,5S)- 雙環 [3.1.0] -2- ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- [12 (DIAST-1) 13 (DIAST-2)] 將氬氣鼓泡通過C51 (來自前一步驟;≤0.337 mmol)及三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(531 mg,1.47 mmol)於甲苯(10 mL)中之溶液持續幾分鐘,接著添加肆(三苯基膦)鈀(0)(42.5 mg,36.8 µmol)。在110℃下在密封管中將反應混合物攪拌18小時,冷卻至室溫,且用氫氯酸(1.0 M,5 mL,5 mmol)處理。將此反應混合物在25℃下攪拌4小時,且隨後藉由添加碳酸鈉水溶液鹼化至pH 8至9。將所得混合物分配於乙酸乙酯(30 mL)與水(30 mL)之間,且用乙酸乙酯(2×30 mL)萃取水層。在合併之有機層經乾燥、過濾且在真空中濃縮之後,藉由逆相HPLC純化殘餘物以得到呈油狀物之粗產物(140 mg);此混合物之組分非對映異構體隨後經由超臨界流體層析[管柱:Regis Technologies,(S,S)-Whelk-01,5 µm;移動相:3:2二氧化碳/(含有0.05%二乙胺之乙醇)]分離。第一溶離非對映異構體表示為12 ,且第二溶離非對映異構體表示為13 ;兩種化合物皆以固體形式獲得。
12 (DIAST-1)- 產率:22 mg,55 µmol,16%,歷經2個步驟。LCMSm/z 398.9 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.59 (s, 1H), 6.00 (br s, 1H), 5.52 - 5.23 (br m, 1H), 4.08 (dd,J = 11.4, 4.8 Hz, 1H), 4.05 - 3.90 (m, 2H), 3.71 - 3.59 (m, 1H), 3.55 - 3.44 (m, 1H), 3.28 - 3.17 (m, 1H), 2.52 (s, 3H), 2.50 - 2.37 (m, 1H), 2.30 (s, 3H), 2.15 - 2.04 (m, 1H), 1.97 - 1.83 (m, 2H), 1.81 - 1.68 (m,1H,假定;由水峰部分遮擋), 1.53 - 1.43 (m, 1H), 1.42 - 1.27 (m, 3H), 0.65 - 0.56 (m, 1H)。滯留時間:4.36分鐘[管柱:Regis Technologies,(S,S)-Whelk-01,4.6×250 mm;5 µm;移動相:3:2二氧化碳/(含有0.05%二乙胺之乙醇);流動速率:2.5毫升/分鐘]。此化合物呈現負(-)旋轉。
13 (DIAST-2)- 產率:18 mg,45 µmol,13%,歷經2個步驟。LCMSm/z 398.9 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.59 (s, 1H), 6.01 (br s, 1H), 5.51 - 5.22 (br m, 1H), 4.09 (dd,J = 11.4, 5.0 Hz, 1H), 4.05 - 3.90 (m, 2H), 3.70 - 3.60 (m, 1H), 3.55 - 3.44 (m, 1H), 3.28 - 3.17 (m, 1H), 2.52 (s, 3H), 2.48 - 2.35 (m, 1H), 2.31 (s, 3H), 2.15 - 2.03 (m, 1H), 1.96 - 1.84 (m, 2H), 1.80 - 1.67 (m, 1H), 1.54 - 1.44 (m, 1H), 1.41 - 1.24 (m, 3H), 0.66 - 0.57 (m, 1H)。 滯留時間:4.90分鐘(與用於12 之彼等一致的分析條件)。此化合物呈現正(+)旋轉。
實例 14 及實例 15 3- 乙醯基 -1-(3- 羥基環戊基 )-7-{[( 3S,4R)-3- 羥基四氫 -2 H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-4- 甲基 -1,6- 㖠啶 -2(1H)- DIAST-1[14 (DIAST-1)] 3- 乙醯基 -1-(3- 羥基環戊基 )-7-{[( 3S,4R)-3- 羥基四氫 -2 H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-4- 甲基 -1,6- 㖠啶 -2(1H)- DIAST-2[15 (DIAST-2)]
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用去離子水(27.0 mL)裝填500 mL錐形瓶(Erlenmeyer flask),向該錐形瓶中添加磷酸鉀緩衝溶液(pH 7.5,1.0 M;4.0 mL)、氯化鎂水溶液(0.165 M;0.8 mL,132 µmol)及5 於乙腈(0.005 M;0.16 mL,0.8 µmol)中之溶液。用雌性小鼠肝臟微粒體(4.0 mL,Corning Gentest 452702)處理混合物,隨後添加新鮮製備的NADPH (二氫菸醯胺腺二核苷酸磷酸酯;0.013 M;4.0 mL,52 µmol)之水溶液。在37℃下使用具有1"投擲(throw)之Thermo Scientific Precision振盪器將未加蓋錐形瓶振盪1小時。將反應混合物分為均等份(每份20 mL),且倒入兩根50 mL Falcon圓錐形離心管中。藉由將乙腈(20 mL)添加至各Falcon管中來淬滅溶液。以3000 rpm將Falcon管渦動且離心5分鐘。將上澄液傾析且以均等份(每份20 mL)轉移至兩根50mL Falcon圓錐形離心管中,且使用EZ-2 Plus Genevac (1小時HPLC設定,34℃/238 mbar至41℃/7 mbar)蒸發溶劑。將剩餘水溶液合併(約20 mL)至50 mL Falcon圓錐形離心管中,且用乙腈(0.5 mL)及純甲酸(0.5 mL)處理,隨後用去離子水裝填至50 mL之最終體積。將溶液分為均等份(每份25 mL),倒入兩根高速離心管中,且以40,000G離心30分鐘。將上澄液傾析至50 mL玻璃錐形管中,且使用JASCO PU-1580 HPLC泵以0.8 mL/min之流動速率歷經約60分鐘使溶液吸附至C18 HPLC管柱(Zorbax Polaris C18-A,250×4.6 mm,5 µm)上。將HPLC管柱轉移至與包含四元泵、自動取樣器及光電二極體陣列UV/Vis偵測器之Waters Acquity UHPLC儀器相符的Thermo LTQ Velos質譜儀。應用梯度(0.1%甲酸/水(A)及乙腈(B))以分離所關注產物。在通過光電二極體陣列偵測器之後,以大約15:1之比率分離溶離劑,其中較大部分進入溶離份收集器,且較小部分進入質譜儀(每20秒收集一次溶離份)。藉由UHPLC-UV-HRMS使用與Waters Acquity UPLC System-1相符之AB Sciex TripleTOF 5600-1質譜儀來分析含有所關注峰的溶離份。將樣本注入(2 µL)至C18 UHPLC管柱(Phenomenex Kinetex C18,2.1×50 mm,1.7 µm)上,且以0.4 mL/min之流動速率施加0.1%甲酸/水(A)及乙腈(B)梯度,維持於40℃下。在UHPLC-UV-HRMS分析之後,合併溶離份,且使用EZ-2 Plus Genevac (3小時HPLC設定,34℃/238 mbar至41℃/7 mbar)去除溶劑。藉由NMR光譜法分析乾燥樣本,且藉由使用Topspin V3.2內之ERETIC2功能針對DMSO-d6 中之5.0 mM苯甲酸標準溶液的1 H NMR光譜進行外部校準來量化乾燥樣本。所收集之第一溶離非對映異構體表示為14 (DIAST-1) 。產率:18 µg,45 nmol。1 H NMR (600 MHz, DMSO-d 6 )δ 8.57 (s, 1H), 7.26 (d,J = 7.5 Hz, 1H), 6.44 (s, 1H), 5.58 - 5.44 (m, 1H), 4.49 - 4.41 (m, 1H), 3.90 - 3.76 (m, 3H), 3.45 - 3.33 (m, 2H), 3.08 (t,J = 10.3 Hz, 1H), 2.39 (s, 3H), 2.38 - 2.32 (m, 1H), 2.30 - 2.23 (m, 4H), 2.12 - 1.97 (m, 3H), 1.74 (t,J = 10.8 Hz, 1H), 1.70 - 1.63 (m, 1H), 1.50 - 1.38 (m, 1H)。HRMS (TOF,m/z ): 針對C21 H28 N3 O5 計算之[M+H]+ , 402.2029; 實驗值, 402.2031 (0.5 ppm)。UHPLC滯留時間2.605分鐘;Phenomenex Kinetex C18管柱(2.1×50 mm,1.7 µm);管柱溫度40℃;流動速率0.1毫升/分鐘;偵測範圍UV 220至400 nm;移動相:溶劑A=甲酸(0.1%),溶劑B=乙腈(100%);梯度溶離:0至0.5分鐘溶劑A (95%)及溶劑B (5%)、0.5至6.5分鐘溶劑A (50%)及溶劑B (50%)、6.5至7.9分鐘溶劑A (20%)及溶劑B (80%)、7.9至8.0分鐘溶劑A (5%)及溶劑B (95%)、8.0至9.1分鐘溶劑A (95%)及溶劑B (5%)、9.1至10.0分鐘溶劑A (100%)及溶劑B (0%);總運行時間10.0分鐘。
所收集之第二溶離非對映異構體表示為15 (DIAST-2) 。產率:3 µg,7.5 nmol。1 H NMR (600 MHz, DMSO-d 6 )δ 8.58 (s, 1H), 7.00 (d,J = 7.8 Hz, 1H), 6.76 (s, 1H), 5.57 - 5.35 (m, 1H), 4.27 - 4.20 (m, 1H), 3.85 - 3.77 (m, 3H), 3.47 - 3.35 (m, 2H), 3.08 (t,J = 10.4 Hz, 1H), 2.40 (s, 3H), 2.27 (s, 3H), 2.18 - 2.08 (m, 2H), 2.02 - 1.96 (m, 1H), 1.96 - 1.90 (m, 1H), 1.82 - 1.74 (m, 2H), 1.51 - 1.38 (m, 2H). HRMS (TOF,m/z ): C21 H28 N3 O5 之[M+H]+ 計算值:402.2029;實驗值:402.2028 (-0.2 ppm)。UHPLC滯留時間2.796分鐘;Phenomenex Kinetex C18管柱,與上文用於14 (DIAST-1) 之彼等一致的條件。
未測定1415 關於環戊烷之相對及絕對立體化學;此等化合物表示4種可能非對映異構體中之2種。與1415 相關之4種非對映異構體可由熟習此項技術者自可商購起始材料(1S,3R )-3-胺基環戊醇(A1 )、(1R ,3R )-3-胺基環戊醇(A2 )、(1S,3S )-3-胺基環戊醇(A3 )及(1R ,3S )-3-胺基環戊醇(A4 )單獨地合成。使用A1 作為一實例,使用製劑P4中所描述之方法與1-(4,6-二氯吡啶-3-基)乙酮反應之後可為使用第三丁基(二甲基)矽烷基氯化物及1H -咪唑之羥基保護,以得到1-(4-{[(1R ,3S )-3-{[第三丁基(二甲基)矽烷基]氧基}環戊基]胺基}-6-氯吡啶-3-基)乙酮。再次使用製劑P4中所描述之方法與2,2,6-三甲基-4H- 1,3-二氧雜環己烯-4-酮反應得到3-乙醯基-1-[(1R ,3S )-3-{[第三丁基(二甲基)矽烷基]氧基}環戊基]-7-氯-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H)-酮(B1 )。B1 與(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇使用如實例5之方法的反應,繼之使用酸(諸如乙酸或三氟乙酸),或可替代地使用氟離子源(諸如氟化四丁銨)的矽烷基去除將隨後得到3-乙醯基-1-[(1R ,3S )-3-羥基環戊基]-7-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H)-酮(D1 ),由結構1415 表示之非對映異構體中之一者。
以類似方式,起始材料A2A3A4 可分別轉化為非對映異構體3-乙醯基-1-[(1R ,3R )-3-羥基環戊基]-7-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H)-酮(D2 )、3-乙醯基-1-[(1S,3S )-3-羥基環戊基]-7-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H)-酮(D3 )及3-乙醯基-1-[(1S ,3R )-3-羥基環戊基]-7-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H)-酮(D4 )。
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實例 16 及實例 17 6- 乙醯基 -8-[(1R,2S)-2- -2- 甲基環戊基 ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- 6- 乙醯基 -8-[(1S,2R)-2- -2- 甲基環戊基 ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- [16 (DIAST-1) 17 (DIAST-2)]
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步驟 1. 合成外消旋 -6-(1- 乙氧基乙烯基 )-8-[(1R,2S)-2- -2- 甲基環戊基 ]-5- 甲基 -2-( 甲硫基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C52 ) 在110℃下將P10 (108 mg,0.280 mmol)、三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(151 mg,0.418 mmol)及肆(三苯基膦)鈀(0)(19.4 mg,16.8 µmol)於甲苯(3.0 mL)中之混合物加熱2小時。此時,反應混合物之LCMS分析指示產物C52 之存在:LCMSm/z 377.9 [M+H]+ 。反應混合物經由矽藻土過濾,且在真空中濃縮濾液。經由矽膠層析(梯度:20%至60%乙酸乙酯/庚烷)純化得到呈淡黃色發泡體之C52 。產率:91 mg,0.24 mmol,86%。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.74 (s, 1H), 5.94 - 5.72 (m, 1H), 4.54 (d,J = 2.5 Hz, 1H), 4.20 (d,J = 2.5 Hz, 1H), 3.94 (q,J = 7.0 Hz, 2H), 2.62 (s, 3H), 2.51 - 2.33 (m, 1H), 2.44 (s, 3H), 2.31 - 2.19 (m, 1H), 1.98 - 1.81 (m, 3H), 1.71 - 1.57 (m, 1H), 1.48 (d,J HF = 21.8 Hz, 3H), 1.36 (t,J = 7.0 Hz, 3H)。
步驟 2. 合成外消旋 -6- 乙醯基 -8-[(1R,2S)-2- -2- 甲基環戊基 ]-5- 甲基 -2-( 甲硫基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C53 ) 將氯化氫(4.0 M溶液於1,4-二噁烷中;0.181 mL,0.724 mmol)添加至C52 (91 mg,0.24 mmol)於二氯甲烷(2 mL)中之溶液中,且將反應混合物在室溫下攪拌1小時。此時,反應混合物之LCMS分析指示產物C53 之存在:LCMSm/z 350.2 [M+H]+ 。在真空中濃縮得到呈固體狀之C53 ,將其直接用於以下步驟。
步驟 3. 合成外消旋 - 6- 乙醯基 -8-[(1R,2S)-2- -2- 甲基環戊基 ]-5- 甲基 -2-( 甲基亞磺醯基 ) 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C54 ) 將過氧單硫酸鉀(Oxone® ;326 mg,0.530 mmol)於水(1 mL)中之溶液添加至C53 (來自前一步驟;88 mg,≤0.24 mmol)於四氫呋喃(4 mL)中之溶液中,且將反應混合物在室溫下攪拌16小時。此時,反應混合物之LCMS分析指示產物C54 之存在:LCMSm/z 345.9 [(M-HF)+H]+ 。添加水,且用乙酸乙酯將所得混合物萃取兩次。合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮以得到呈淡黃色固體狀之C54 。產率:89.0 mg,0.24 mmol,定量,歷經2個步驟。
步驟 4. 合成 6- 乙醯基 -8-[(1R,2S)-2- -2- 甲基環戊基 ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- 6- 乙醯基 -8-[(1S,2R)-2- -2- 甲基環戊基 ]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- [16 (DIAST-1) 17 (DIAST-2 )] 在室溫下將C54 (43 mg,0.12 mmol)、(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇(24.1 mg,0.206 mmol)及N,N -二異丙基乙胺(86 µL,0.49 mmol)於二甲亞碸(2 mL)中之混合物攪拌3小時。使用超臨界流體層析[管柱:Chiral Technologies Chiralpak IC,5 µm;移動相:3:2二氧化碳/(含有10 mM氫氧化銨之2-丙醇)]來進行組分非對映異構體之分離。第一溶離非對映異構體表示為16 ,且第二溶離非對映異構體表示為17 ;兩者均以固體形式獲得。
16 (DIAST-1)- 產率:17 mg,41 µmol,34%。LCMSm/z 418.9 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 80 ℃, DMSO-d 6 ), 特徵峰: δ 8.75 (s, 1H), 7.50 - 7.37 (m, 1H), 5.87 - 5.73 (m, 1H), 4.72 - 4.59 (m, 1H), 3.99 - 3.80 (m, 3H), 3.63 - 3.54 (m, 1H), 3.35 (ddd,J = 11.7, 11.6, 2.3 Hz, 1H), 3.10 (dd,J = 11.1, 9.5 Hz, 1H), 2.39 (s, 3H), 2.29 (s, 3H), 2.18 - 2.06 (m, 1H), 2.00 - 1.84 (m, 3H), 1.69 - 1.54 (m, 2H), 1.44 (d,J HF = 21.9 Hz, 3H). 滯留時間:1.22分鐘[管柱:Chiral Technologies Chiralpak IC-3,4.6×100 mm,3 µm;移動相:3:2二氧化碳/(含有10 mM氫氧化銨之2-丙醇);流動速率:4毫升/分鐘;回壓:120巴]。此化合物呈現負(-)旋轉。
17 (DIAST-2)- 產率:14 mg,33 µmol,28%。LCMSm/z 419.0 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 80 ℃, DMSO-d 6 ), 特徵峰: δ 8.75 (s, 1H), 7.50 - 7.38 (m, 1H), 5.87 - 5.73 (m, 1H), 4.66 (br s, 1H), 4.00 - 3.79 (m, 3H), 3.64 - 3.54 (m, 1H), 3.36 (ddd,J = 11.7, 11.5, 2.4 Hz, 1H), 3.10 (dd,J = 11.1, 9.5 Hz, 1H), 2.39 (s, 3H), 2.29 (s, 3H), 2.19 - 2.06 (m, 1H), 2.01 - 1.81 (m, 3H), 1.70 - 1.51 (m, 2H), 1.44 (d,J HF = 21.9 Hz, 3H). 滯留時間:1.51分鐘(與用於16 彼等一致的分析條件)。此化合物呈現正(+)旋轉。
實例 18 6- 乙醯基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基 -8-[(3S)- 吡咯啶 -3- ] 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (18 )
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步驟 1. 合成 (3S)-3-[6-(1- 乙氧基乙烯基 )-5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ] 吡咯啶 -1- 甲酸第三丁酯 (C55 ) 將三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫烷(10.1 g,28.0 mmol)及肆(三苯基膦)鈀(0)(1.34 g,1.16 mmol)添加至P11 (5.30 g,11.6 mmol)於甲苯(80 mL)與1,4-二噁烷(40 mL)之混合物中的溶液中。在110℃下將反應混合物攪拌5小時,接著將其在真空中濃縮,且經由矽膠層析(梯度:10%至60%乙酸乙酯/石油醚)純化,從而得到呈黃色油狀物之C55 。產率:4.48 g,10.0 mmol,86%。LCMSm/z 447.2 [M+H]+
步驟 2. 合成 (3S)-3-[6- 乙醯基 -5- 甲基 -2-( 甲硫基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ] 吡咯啶 -1- 甲酸第三丁酯 (C56 ) 將氫氯酸(1 M;40.1 mL,40.1 mmol)添加至C55 (4.48 g,10.0 mmol)於四氫呋喃(150 mL)中之20℃溶液中,且將反應混合物攪拌2小時。在藉由添加飽和碳酸氫鈉水溶液鹼化該反應混合物之後,用乙酸乙酯(2×100 mL)萃取反應混合物;合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮。矽膠層析(梯度:10%至60%乙酸乙酯/石油醚)得到呈白色膠狀物之C56 。產率:2.64 g,6.31 mmol,63%。LCMSm/z 441.1 [M+Na+ ]。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 8.81 (s, 1H), 6.27 - 6.12 (m, 1H), 3.97 (dd,J = 10.2, 8.3 Hz, 1H), 3.88 - 3.74 (m, 1H), 3.74 - 3.57 (m, 1H), 3.52 - 3.40 (m, 1H), 2.94 - 2.75 (m, 1H), 2.58 (s, 3H), 2.53 (s, 3H), 2.38 (s, 3H), 2.20 - 2.05 (m, 1H), 1.52 - 1.41 (m, 9H)。
步驟 3. 合成 (3S)-3-[6- 乙醯基 -5- 甲基 -2-( 甲磺醯基 )-7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ] 吡咯啶 -1- 甲酸第三丁酯 (C57 ) C56 (1.00 g,2.39 mmol)於四氫呋喃(40 mL)與水(20 mL)之混合物中的溶液中添加過氧單硫酸鉀(Oxone® ;2.64 g,4.29 mmol)。將反應混合物在室溫(17℃)下攪拌3小時,接著將其用水(40 mL)稀釋,且用乙酸乙酯(2×40 mL)萃取。合併之有機層用飽和氯化鈉水溶液(50 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮以得到不經額外純化即使用的呈黃色膠狀物之C57 。產率:1.08 g,定量。LCMSm/z 473.1 [M+Na+ ]。
步驟 4. 合成 (3S)-3-[6- 乙醯基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基 -7- 側氧基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -8(7H)- ] 吡咯啶 -1- 甲酸第三丁酯 (C58 ) 在室溫(20℃)下將(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇(226 mg,1.93 mmol)、C57 (700 mg,1.55 mmol)及碳酸鈉(341 mg,3.22 mmol)於四氫呋喃(15 mL)中之懸浮液攪拌大約20小時。隨後將反應混合物分配於水(35 mL)與乙酸乙酯(35 mL)之間,且將有機層用飽和氯化鈉水溶液(20 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥,過濾,且在真空中濃縮。使用矽膠層析(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷)純化殘餘物以得到呈黃色膠狀物之C58 。產率:700 mg,1.44 mmol,93%。LCMSm/z 510.2 [M+Na+ ]。
步驟 5. 合成 6- 乙醯基 -2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基 -8-[(3S)- 吡咯啶 -3- ] 吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (18 ) C58 (700 mg,1.44 mmol)於甲醇(10 mL)中之溶液用氯化氫(4 M溶液於甲醇中;8 mL)處理,且在室溫(20℃)下攪拌大約20小時。隨後將反應混合物在減壓下濃縮,且經由正相HPLC (管柱:Agela Durashell NH2 ,5 µm;移動相A:4:1石油醚/二氯甲烷;移動相B:甲醇;梯度:5%至95% B)純化以得到呈白色固體狀之18 。產率:350 mg,0.903 mmol,63%。LCMSm/z 388.2 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 特徵峰: δ 8.64 (s, 1H), 6.18 - 5.97 (m, 1H), 4.15 - 3.85 (m, 3H), 3.77 - 3.16 (m, 5H), 3.15 (dd,J = 11.0, 10.5 Hz, 1H), 2.92 (ddd,J = 10.8, 10.6, 6.6 Hz, 1H), 2.53 (s, 3H), 2.33 (s, 3H), 1.81 - 1.61 (m, 1H)。
實例 19 6- 乙醯基 -8-(3,3- 二甲基環丁基 )-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (19 )
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Figure 02_image146
步驟1. 合成二-μ- { [3,5- 二氟-2-(5- 氟吡啶-2- N) 苯基 C 1 ]} 二銥 (C59 ) 。 在真空下將2-(2,4-二氟苯基)-5-氟吡啶(2.46 g,11.8 mmol)與氯化銥(III)(1.56 g,5.23 mmol)於2-乙氧基乙醇(24 mL)及水(10 mL)中之混合物脫氣,且隨後用氮氣裝填反應容器。將此排空循環重複兩次,接著將反應混合物加熱至120℃持續18小時。隨後將反應混合物冷卻至室溫(28℃),且經由過濾收集固體;用水(150 mL)洗滌濾餅以得到呈黃色固體狀之C59 。產率:3.11 g,2.41 mmol,92%。
步驟 2. 合成六氟磷酸 (2,2'- 聯吡啶 2 N1 ,N1' ){ [3,5- 二氟 -2-(5- 氟吡啶 -2- ) 苯基 ]} (C60 ) 在真空下將C59 (3.11 g,2.41 mmol)及2,2'-聯吡啶(901 mg,5.77 mmol)於乙烷-1,2-二醇(120 mL)中之混合物脫氣且用氮氣吹掃;重複此排空循環,且隨後在145℃下將反應混合物攪拌19小時。在冷卻至室溫(20℃)之後,將反應混合物倒入去離子水(900 mL)中,且用正己烷(6×300 mL)萃取所得混合物。在真空中濃縮水層以去除殘餘正己烷。向此溶液中添加六氟磷酸鈉(0.1 g/mL於去離子水中;460 mL)之水溶液;將所得固體經由過濾收集,且用水(50 mL)隨後用正己烷(50 mL)洗滌。將此固體(3.7 g)溶解於丙酮(30 mL)中且回流20分鐘,接著添加正庚烷(20 mL)。過濾所得混合物;將濾餅用正己烷(50 mL)洗滌,且隨後藉由矽膠層析(梯度:0%至10%丙酮/二氯甲烷)純化。將此材料(1.5 g)由丙酮再結晶以得到呈亮黃色固體狀之C60 。產率:1.0 g,1.1 mmol,46%。LCMSm/z 765.3 [M+ ]。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 )δ 8.88 (d,J = 8.1 Hz, 2H), 8.37 - 8.27 (m, 4H), 8.11 - 8.02 (m, 2H), 7.88 (br d,J = 5.8 Hz, 2H), 7.74 - 7.67 (m, 2H), 7.65 (br dd,J = 2.7, 2.6 Hz, 2H), 7.00 (ddd,J = 12.2, 9.4, 2.4 Hz, 2H), 5.73 (dd,J = 8.4, 2.4 Hz, 2H)。
步驟 3. 合成 {[(3,3- 二甲基環丁基 ) 羰基 ] 氧基 }(2,4,6- 三甲基苯基 )-λ3 - 碘烷 (C61 ) 用雙(乙醯氧基)(2,4,6-三甲基苯基)-λ3 -碘烷(56 mg,0.15 mmol)於二氯甲烷(1 mL)中之溶液處理3,3-二甲基環丁烷甲酸(38.4 mg,0.300 mmol)。添加甲苯(2 mL),將反應瓶加蓋,且將反應混合物加熱至55℃隔夜,接著使用Genevac蒸發器將該反應混合物濃縮。將殘餘物與甲苯(1 mL)混合且在55℃下攪拌30分鐘。在混合物已再次蒸發之後,將殘餘物(C61 )存儲於冷凍機中以用於以下步驟。1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d )δ 7.06 (s, 2H), 2.93 (五重峰,J = 8.8 Hz, 2H), 2.69 (s, 6H), 2.34 (s, 3H), 1.99 - 1.80 (m, 8H), 1.07 (s, 6H), 1.01 (s, 6H)。
步驟 4. 合成 6- 乙醯基 -2-( 癸硫基 )-8-(3,3- 二甲基環丁基 )-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (C62 ) 將含有C60 (0.7 mg,0.8 µmol)與噻吩-2-甲酸銅(I)(3 mg,16 µmol)之混合物的反應瓶用氮氣吹掃。添加4,7-二甲氧基-1,10-啡啉(5.5 mg,22 µmol)及2-第三丁基-1,1,3,3-四甲基胍(26 mg,0.15 mmol)於1,4-二噁烷(0.25 mL)中之溶液,且將小瓶渦動且再次用氮氣吹掃。添加P13 (28 mg,75 µmol)於1,4-二噁烷(0.5 mL)中之溶液,隨後添加C61 (來自前一步驟;≤0.15 mmol)於1,4-二噁烷(1 mL)中之溶液;用添加至反應混合物中之額外1,4-二噁烷(0.5 mL)沖洗C61 容器。在已密封反應瓶之後,用Kessil LED燈在440 nm下將反應瓶輻照3小時。隨後伴以渦動將反應混合物分配於10%檸檬酸水溶液與乙酸乙酯(2 mL)之間。分離有機層,且重複萃取;經由SiliCycle二氧化矽固相萃取濾筒使用乙酸乙酯溶離經合併之有機層。在真空中去除溶劑,且經由逆相HPLC (管柱:Waters XBridge C18,5 µm;移動相A:含有0.03%氫氧化銨之水;移動相B:含有0.03%氫氧化銨之乙腈;梯度:80%至95% B)進行純化以得到C62 。產率:6.1 mg,13 µmol,17%。LCMSm/z 458.6 [M+H]+1 H NMR (400 MHz, 甲醇-d 4 )δ 8.92 (s, 1H), 5.93 (五重峰,J = 9.2 Hz, 1H), 3.27 - 3.20 (m, 2H), 3.01 - 2.92 (m, 2H), 2.49 (s, 3H), 2.38 (s, 3H), 2.16 - 2.09 (m, 2H), 1.86 - 1.75 (m, 2H), 1.57 - 1.47 (m, 2H), 1.44 - 1.21 (m, 18H), 0.88 (t,J = 7 Hz, 3H)。
步驟 5. 合成 6- 乙醯基 -8-(3,3- 二甲基環丁基 )-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫 -2H- 哌喃 -4- ] 胺基 }-5- 甲基吡啶并 [2,3-d] 嘧啶 -7(8H)- (19 ) 在室溫下將C62 (6.1 mg,13 µmol)與過氧單硫酸鉀(Oxone® ;15 mg,24 µmol)於四氫呋喃與水(4:1,0.75 mL)之混合物中的混合物攪拌66小時。隨後將反應混合物分配於水(0.75 mL)與乙酸乙酯(2 mL)之間,且經由裝載有硫酸鈉之固相萃取濾筒溶離有機層;重複此萃取過程,且在真空中去除溶劑以得到中間物C63 [6-乙醯基-2-(癸基磺醯基)-8-(3,3-二甲基環丁基)-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮]。將此材料溶解於甲醇(1 mL)中,且將其一半在減壓下濃縮,且隨後用(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇(1.2 mg,10 µmol)於四氫呋喃(0.25 mL)中之溶液處理。在65℃下將反應瓶振盪隔夜,接著伴以渦動將反應混合物分配於乙酸乙酯(1.2 mL)與水(0.60 mL)之間。經由裝載有硫酸鈉之固相萃取濾筒溶離有機層;使用乙酸乙酯(0.60 mL)重複萃取過程,且在真空中自經合併之有機層去除溶劑。經由逆相HPLC (管柱:Waters Sunfire C18,5 µm;移動相A:0.05%三氟乙酸/水;移動相B:0.05%三氟乙酸/乙腈;梯度:5%至60% B)進行純化以得到19 。產率:1.6 mg,4.0 µmol,62%。LCMSm/z 401.4 [M+H]+ 。滯留時間:0.922分鐘(管柱:Phenomenex Kinetex C18,2.1×30 mm,2.6 µm;移動相A:0.05%三氟乙酸/水;移動相B:0.05%三氟乙酸/乙腈;梯度:2.0分鐘內5%至95% B,隨後保持於95% B持續0.7分鐘;流動速率:1.0毫升/分鐘)。 表1.實例20至34之合成方法、結構及物理化學資料。
實例編號 製備方法;非商購起始材料 結構 1 H NMR;質譜,所觀測離子m/z [M+H]+ 或HPLC滯留時間;質譜m/z [M+H]+
20 實例21
Figure 02_image148
1 H NMR (700 MHz,DMSO-d6),旋轉異構體之混合物,特徵峰: δ [8.78 (s)及8.75 (s), 總共1H], [7.82 (br s)及7.69 (br s), 總共1H], 2.40 (s, 3H), 2.25 (s, 3H), 1.96 - 1.75 (m, 3H), 1.57 - 1.43 (m, 3H), 1.31 - 1.21 (m, 2H); 416.9
21 實例16及172
Figure 02_image150
1 H NMR (400 MHz, 80 ℃, DMSO-d 6 )δ 8.75 (s, 1H), 7.47 (d,J = 8.0 Hz, 1H), 6.10 (五重峰,J = 8.9 Hz, 1H), 4.73 (d,J = 4.3 Hz, 1H), 4.69 (d,J = 5.2 Hz, 1H), 4.63 - 4.52 (m, 1H), 4.01 - 3.81 (m, 3H), 3.63 - 3.53 (m, 1H), 3.38 (ddd,J = 11.7, 11.5, 2.4 Hz, 1H), 3.33 - 3.19 (m, 2H), 3.10 (dd,J = 11.1, 9.5 Hz, 1H), 2.41 (s, 3H), 2.28 (s, 3H), 2.27 - 2.16 (m, 2H), 2.05 - 1.96 (m, 1H), 1.67 - 1.52 (m, 1H); 389.1
22 實例16及173,4
Figure 02_image152
第一溶離非對映異構體(參見腳註4);1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 )δ 8.81 (s, 1H), 7.63 - 7.53 (m, 1H), 6.25 - 6.08 (m,J HF = 32.2 Hz, 1H), 4.71 (br s, 1H), 3.96 - 3.77 (m, 3H), 3.67 - 3.55 (m, 1H), 3.34 (ddd,J = 11.7, 11.6, 2.1 Hz, 1H), 3.08 (dd,J = 11.1, 9.7 Hz, 1H), 2.40 (s, 3H), 2.32 (s, 3H), 2.10 - 1.91 (m, 4H), 1.89 - 1.75 (m, 1H), 1.60 - 1.48 (m, 1H), 1.36 - 1.23 (m, 2H), 1.24 (d,J HF = 22.8 Hz, 3H); 419.0
23 實例16及173,4
Figure 02_image154
第二溶離非對映異構體(參見腳註4);1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 )δ 8.81 (s, 1H), 7.62 - 7.49 (m, 1H), 6.23 - 6.03 (m,J HF = 32.3 Hz, 1H), 4.64 (d,J = 5.3 Hz, 1H), 3.96 - 3.80 (m, 3H), 3.65 - 3.53 (m, 1H), 3.34 (ddd,J = 11.6, 11.6, 2.1 Hz, 1H), 3.06 (dd,J = 11.1, 9.6 Hz, 1H), 2.40 (s, 3H), 2.31 (s, 3H), 2.08 - 1.93 (m, 4H), 1.88 - 1.75 (m, 1H), 1.68 - 1.55 (m, 1H), 1.32-1.19 (m, 2H), 1.26 (d,JHF = 22.7 Hz, 3H); 419.0
24 實例16及175
Figure 02_image156
1 H NMR (400 MHz, 80 ℃, DMSO-d 6 )δ 8.75 (s, 1H), 7.59 - 7.47 (m, 1H), 5.34 - 5.20 (m, 1H), 4.82 - 4.70 (m, 1H), 3.97 - 3.81 (m, 3H), 3.67 - 3.54 (m, 1H), 3.37 (ddd,J = 11.7, 11.6, 2.1 Hz, 1H), 2.81 - 2.68 (m, 3H), 2.40 (s, 3H), 2.27 (s, 3H), 2.06 - 1.96 (m, 1H), 1.96 - 1.87 (m, 2H), 1.66 - 1.49 (m, 3H), 1.30 - 1.12 (m, 2H); 416.4
25 實例246
Figure 02_image158
1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ), 旋轉異構體之混合物,特徵峰: δ [8.79 (s)及8.77 (s), 總共1H], [7.98 (d,J = 8.0 Hz)及7.81 - 7.73 (m), 總共1H], 5.4 - 4.94 (m, 2H), 4.03 - 3.76 (m, 3H), 3.03 (dd,J = 10.5, 10.4 Hz, 1H), 2.39 (s, 3H), 2.27 - 2.23 (m, 3H), 2.21 (s, 6H), 2.00 - 1.84 (m, 3H), 1.70 - 1.47 (m, 3H), 1.40 - 1.21 (m, 2H); 444.3
26 實例187
Figure 02_image160
1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 特徵峰: δ 8.62 (s, 1H), 6.13 - 6.00 (m, 1H), 4.15 - 3.14 (m, 7H), 3.13 - 3.01 (m, 1H), 2.82 - 2.23 (m, 2H), 2.53 (s, 3H), 2.44 (s, 3H), 2.33 (s, 3H), 2.21 - 1.99 (m, 2H), 1.8 - 1.57 (m,1H,假定;由水峰部分遮擋);402.3
27 實例188
Figure 02_image162
1 H NMR (400 MHz, 氯仿-d ), 特徵峰: δ 8.63 (s, 1H), 6.14 - 6.03 (m, 1H), 4.10 - 3.89 (m, 3H), 2.52 (s, 3H), 2.33 (s, 3H), 2.17 - 2.04 (m, 2H), 1.80 - 1.61 (m, 1H); 388.4
28 實例39
Figure 02_image164
1.33分鐘10 ;472.6
29 實例311
Figure 02_image166
1.43分鐘10 ;478.6
30 P12 12
Figure 02_image168
1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ), 旋轉異構體之混合物,特徵峰: δ 8.79 (br s, 1H), [7.91 (br d,J = 8 Hz)及7.81 - 7.67 (m), 總共1H], 5.98 - 5.64 (m, 1H), 5.05 - 4.90 (m, 1H), 4.03 - 3.62 (m, 3H), 3.61 - 3.47 (m, 1H), 3.03 (dd,J = 11.2, 9.8 Hz, 1H), 2.40 (s, 3H), 2.26 (s, 3H), 2.05 - 1.84 (m, 3H), 1.70 - 1.46 (m, 3H); 386.9
31 製劑P1,實例113
Figure 02_image170
1.54分鐘10 ;389.2
32 實例1814
Figure 02_image172
1 H NMR (400 MHz,氧化氘)δ 8.79 (s, 1H), 5.74 - 5.57 (m, 1H), 4.19 - 4.0 (m, 1H), 4.06 (dd,J = 11.4, 4.7 Hz, 1H), 4.00 (dt,J = 12, 4 Hz, 1H), 3.92 - 3.76 (m, 1H), 3.69 - 3.56 (m, 3H), 3.45 - 3.33 (m, 1H), 3.25 - 3.09 (m, 2H), 3.10 - 2.88 (m, 2H), 2.54 (s, 3H), 2.32 (s, 3H), 2.22 - 2.11 (m, 1H), 2.09 - 1.94 (m, 2H), 1.87 - 1.72 (m, 1H); 402.3
33 P4 15
Figure 02_image174
1 H NMR (400 MHz, 甲醇-d 4 ), 特徵峰: δ 8.56 (s, 1H), 6.56 (s, 1H), 5.40 (五重峰,J = 9 Hz, 1H), 4.02 - 3.82 (m, 3H), 3.60 - 3.45 (m, 2H), 2.46 (s, 3H), 2.34 (s, 3H), 2.31 - 2.19 (m, 2H), 2.17 - 2.04 (m, 3H), 2.00 - 1.88 (m, 2H), 1.82 - 1.69 (m, 2H), 1.68 - 1.56 (m, 1H); 386.3
34 實例19;P13
Figure 02_image176
0.567分鐘16 ;359.3
1. 使用製劑P1 中所描述之方法藉由使用順式-4-胺基環己醇代替環丁胺來合成必需的6-溴-2-氯-8-(順式-4-羥基環己基)-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮。保護中間物順式-4-[(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)胺基]環己醇之羥基作為其第三丁基二甲基矽烷基醚;此保護基在溴化步驟(在此情況下,使用二氯甲烷中之溴進行)期間脫落。 2. 1-[4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基]乙酮與反式-3-胺基環丁醇及三乙胺之反應,繼之使用第三丁基(二苯基)矽烷基氯化物及1H -咪唑的羥基保護得到1-{4-[(反式-3-{[第三丁基(二苯基)矽烷基]氧基}環丁基)胺基]-2-(甲硫基)嘧啶-5-基}乙酮。使用針對在製劑P10中由C28 合成P10 所描述之化學物質將此材料轉化為必需的6-溴-8-(反式-3-{[第三丁基(二苯基)矽烷基]氧基}環丁基)-5-甲基-2-(甲硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮。在其向6-乙醯基-8-(反式-3-羥基環丁基)-5-甲基-2-(甲硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮之酸介導轉化期間,自中間物8-(反式-3-{[第三丁基(二苯基)矽烷基]氧基}環丁基)-6-(1-乙氧基乙烯基)-5-甲基-2-(甲硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮去除矽烷基保護基。 3. 溴化甲基鎂與2-(二苯甲基胺基)環戊酮之反應得到外消旋-(1S ,2R )-2-(二苯甲基胺基)-1-甲基環戊醇,經由氫氧化鈀將其氫化以得到外消旋-(1S ,2R )-2-胺基-1-甲基環戊醇。使用氯甲酸苯甲酯保護胺基得到外消旋-[(1R ,2S )-2-羥基-2-甲基環戊基]胺甲酸苯甲基酯,使用在製劑P10中所描述之化學物質將其轉化為外消旋-6-溴-8-[(1R,2R )-2-氟-2-甲基環戊基]-5-甲基-2-(甲硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮。藉由比較中間物外消旋-8-[(1R,2R )-2-氟-2-甲基環戊基]-5-甲基-2-(甲硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮之物理化學資料{1 H NMR(400 MHz,氯仿-d)δ 8.72 (s, 1H), 6.45 - 6.18 (m, 2H), 2.65 (s, 3H), 2.43 (d, J = 1.3 Hz, 3H), [2.60 - 2.28 (m)and 2.14 - 1.83 (m), 總共6H], 1.28 (d, JHF = 22.9 Hz, 3H). LCMS m/z 308.1 [M+H]+ }與在製劑P10中之外消旋-(1R,2S)異構體C29 的物理化學資料,來獲得對此系列中之化合物與製劑P10之彼等為非對映異構體的確證。 4. 使用超臨界流體層析(管柱:Phenomenex Lux Cellulose-4,3 µm;移動相:18%甲醇/二氧化碳;回壓:100巴)進行非對映異構體實例22與23之分離。第一溶離非對映異構體表示為實例22,且第二溶離非對映異構體表示為23。實例22之滯留時間:2.56分鐘(管柱:Chiral Technologies Chiralpak IC,4.6×100 mm,5 µm;移動相A:二氧化碳;移動相B:甲醇;梯度:在10分鐘內12%至70% B;流動速率:4.0毫升/分鐘;回壓:100巴)。實例23之滯留時間:1.83分鐘(與用於實例22之彼等一致的分析條件)。 5. 1-[4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基]乙酮與(反式-4-胺基環己基)胺甲酸第三丁酯及N,N -二異丙基乙胺之反應得到(反式-4-{[5-乙醯基-2-(甲硫基)嘧啶-4-基]胺基}環己基)胺甲酸第三丁酯,根據製劑P10中針對由C28 合成P10 所描述之方法將其轉化為{ -4-[6-溴-5-甲基-2-(甲硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H )-基]環己基}胺基甲酸第三丁酯(除使用N -溴代丁二醯亞胺及催化性乙二酸代替溴以外)。在最終步驟中使用含氯化氫之甲醇去除第三丁氧基羰基以得到實例24。 6. 實例24之鹽酸鹽與甲醛及三乙醯氧基硼氫化鈉之反應得到實例25。 7. 實例18與甲醛、N,N -二異丙基乙胺及三乙醯氧基硼氫化鈉之反應得到實例26。 8. 使用製劑P10中所描述之方法,但採用(3R )-3-胺基吡咯啶-1-甲酸第三丁酯代替C27 來合成必需的(3R )-3-[6-溴-5-甲基-2-(甲硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H )-基]吡咯啶-1-甲酸第三丁酯。使用N -溴代丁二醯亞胺及催化性乙二酸而非溴來進行溴化反應。 9. 實例3與1-溴-2-甲氧基乙烷及N,N -二異丙基乙胺之烷基化得到實例28。 10. 分析型HPLC之條件。管柱:Waters Atlantis dC18,4.6×50 mm,5 µm;移動相A:0.05%三氟乙酸/水(v/v);移動相B:0.05%三氟乙酸/乙腈(v/v);梯度:5.0%至95% B,歷經4.0分鐘線性變化;流動速率:2毫升/分鐘。 11. 實例3與三氟甲烷磺酸2,2-二氟乙酯及N,N -二異丙基乙胺之烷基化得到實例29。 12. 使大部分由(3S,4R )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇組成,但含有少量(3R,4S )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇之反式-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇的樣本與P12N,N -二異丙基乙胺反應。使用超臨界流體層析(管柱:Chiral Technologies Chiralpak AS-H,5 µm;移動相:4:1二氧化碳/甲醇)進行所得對映異構體之分離。呈現正(+)旋轉之第一溶離對映異構體為次要組分,且表示為實例30。第二溶離對映異構體為2 ,其呈現負(-)旋轉。實例30之滯留時間:0.86分鐘(管柱:Chiral Technologies Chiralpak AS-3,4.6×100 mm,3 µm;移動相:4:1二氧化碳/甲醇;流動速率:4毫升/分鐘;回壓:120巴)。2 之滯留時間:1.03分鐘(與用於實例30之彼等一致的分析條件)。 13. 在此情況下,中間物6-溴-2-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(3S )-四氫呋喃-3-基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮藉由與1-(乙烯氧基)丁烷及N,N -二異丙基乙胺在二氯[雙(2-(二苯基膦)苯基)醚]鈀(II)之存在下反應[參見M. T. Maloney等人,Organic Process Research & Development 2016, 20, 1203-1216],繼之藉由氫氯酸的烯醇醚裂解而轉化為實例31。 14. 使用製劑P2中所描述之方法,經由使用4-胺基哌啶-1-甲酸第三丁酯代替6-胺基-2-氮雜螺[3.3]庚烷-2-甲酸第三丁酯來進行必需的4-[6-溴-5-甲基-2-(甲硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H )-基]哌啶-1-甲酸第三丁酯之合成。 15.P4 與(3R,4S )-4-胺基四氫-2H -哌喃-3-醇在甲磺酸[(2-二環己基膦基-3,6-二甲氧基-2',4',6'-三異丙基-1,1'-聯苯基)-2-(2'-胺基-1,1'-聯苯基)]鈀(II)(BrettPhos Pd G3)及碳酸銫之存在下在100℃下於甲苯中的反應得到實例33。 16. 分析型HPLC之條件。管柱:Phenomenex Kinetex C18,2.1×30 mm,2.6 µm;移動相A:0.05%三氟乙酸/水;移動相B:0.05%三氟乙酸/乙腈;梯度:在2.0分鐘內5%至50% B,隨後保持於95% B持續0.7分鐘;流動速率:1.0毫升/分鐘。
用以測定 CDK 效力的活體外純化酶檢定 CDK4/ 細胞週期素 D1 CDK6/ 細胞週期素 D3 CHEF 檢定
螯合增強螢光(CHEF)實時監測磷酸化狀態,其中螢光之含量與磷酸化基質的量成正比。CHEF利用具有攜帶8-羥基喹啉衍生物(磺醯胺基-奧辛,Sox)之側鏈的合成性α-胺基酸,其在與Mg (II)配位後傳遞關於基於肽之激酶基質中的鄰近絲胺酸、蘇胺酸或酪胺酸殘基之磷酸化狀態的資訊。來自AssayQuant Technologies之特異性肽(目錄# AQT0258)的磷酸化導致螢光在360nm Ex/485nm Em之激發及發射波長下增加。
將實例連同DMSO (負)及Palbociclib (正)對照組一起以其最終濃度之100倍添加至384孔盤,隨後添加10nM CDK4/細胞週期素D1 (LJIC-2007F1)或10nM CDK6/細胞週期素D3 (LJIC-2009H2)以用於在含有40mM HEPES、1mM Dithiothreito (DTT)、10mM MgCl2、1%甘油、0.1% BSA之分析緩衝液中進行20分鐘預培育。藉由添加AssayQuant Technologies肽及ATP基質(10µM CHEF肽(目錄# AQT0258)、2mM ATP)引發酶反應,且使其進行2小時,繼之以反應之螢光讀取。
根據級分速率隨抑制劑濃度變化之曲線圖來進行Ki 測定,該曲線圖擬合至其中酶濃度作為變數的莫里森(Morrison)等式。
CDK4/ 細胞週期素 D1 遷移率變化檢定 (MSA)
CDK4/細胞週期素D1檢定之目的為藉由使用基於螢光的微流體遷移率變化檢定來評估在小分子抑制劑之存在下的抑制(抑制%、Kiapp 及Ki 值)。CDK4/細胞週期素D1催化由ATP產生ADP,並伴隨向基質肽5-FAM-Dyrktide之磷醯基轉移。在激酶反應之後,遷移率變化檢定將經螢光標記之肽(基質及磷酸化產物)電泳分離。量測基質及產物兩者,且此等值之比率用以藉由LabChip EZ讀取器產生基質向產物的轉化%。典型反應溶液在pH 7.5的40 mM HEPES緩衝液中含有2% DMSO (±抑制劑)、10 mM MgCl2 、1 mM DTT、3.5 mM ATP、0.005% Tween-20、3 μM 5-FAM-Dyrktide、3 nM經活化CDK4/細胞週期素D1。
藉由添加ATP (50 μL最終反應體積),隨後在22℃下在反應混合物中進行酶及抑制劑的十八分鐘預培育來開始對經活化CDK4/細胞週期素D1 (2007 E1/2008 +PO4)之抑制劑Ki 測定。在195分鐘之後,藉由添加50 μL之30 mM EDTA來終止反應。根據級分速率隨抑制劑濃度變化之曲線圖來進行Ki 測定,該曲線圖擬合至其中酶濃度作為變數的莫里森等式。
CDK6/ 細胞週期素 D3 遷移率變化 檢定
CDK6/細胞週期素D3檢定之目的為藉由使用基於螢光的微流體遷移率變化檢定來評估在小分子抑制劑之存在下的抑制(抑制%、Kiapp 及Ki 值)。CDK6/細胞週期素D3催化由ATP產生ADP,並伴隨向基質肽5-FAM-Dyrktide之磷醯基轉移。在激酶反應之後,遷移率變化檢定將經螢光標記之肽(基質及磷酸化產物)電泳分離。量測基質及產物兩者,且此等值之比率用以藉由LabChip EZ讀取器產生基質向產物的轉化%。典型反應溶液在pH 7.5的40 mM HEPES緩衝劑液含有2% DMSO (±抑制劑)、2%甘油、10 mM MgCl2 、1 mM DTT、3.5 mM ATP、0.005% Tween 20 (TW-20)、3 μM 5-FAM-Dyrktide、4 nM經活化CDK6/細胞週期素D3。
藉由添加ATP (50 μL最終反應體積),隨後在22℃下在反應混合物中進行酶及抑制劑的十八分鐘預培育來開始對經活化CDK6/細胞週期素D3 (LJIC-2009G1/2010 +PO4)之抑制劑Ki 測定。在95分鐘之後,藉由添加50 μL之30 mM EDTA來終止反應。根據級分速率隨抑制劑濃度變化之曲線圖來進行Ki 測定,該曲線圖擬合至其中酶濃度作為變數的莫里森等式。
CDK6/ 細胞週期素 D1 遷移率變化 檢定 (MSA)
CDK6/細胞週期素D1檢定之目的為藉由使用基於螢光的微流體遷移率變化檢定來評估在小分子抑制劑之存在下的抑制(抑制%、Kiapp 及Ki 值)。CDK6/細胞週期素D1催化由ATP產生ADP,並伴隨向基質肽5-FAM-Dyrktide之磷醯基轉移。在激酶反應之後,遷移率變化檢定將經螢光標記之肽(基質及磷酸化產物)電泳分離。量測基質及產物兩者,且此等值之比率用以藉由LabChip EZ讀取器產生基質向產物的轉化%。典型反應溶液在pH 7.5的40 mM HEPES緩衝液中含有2% DMSO (±抑制劑)、2%甘油、10 mM MgCl2 、1 mM DTT、3.5 mM ATP、0.005% Tween 20 (TW-20)、3 μM 5-FAM-Dyrktide、4 nM經活化CDK6/細胞週期素D1。
藉由添加ATP (50 μL最終反應體積),隨後在22℃下在反應混合物中進行酶及抑制劑的十五分鐘預培育來開始對經活化CDK6/細胞週期素D1 (LJIC-2003 A2/1865)之抑制劑Ki 測定。在35分鐘之後,藉由添加50 µL之30 mM EDTA來終止反應。根據級分速率隨抑制劑濃度變化之曲線圖來進行Ki 測定,該曲線圖擬合至其中酶濃度作為變數的莫里森等式。
Ki 計算
對於所有CDK4及CDK6檢定,使用莫里森等式針對各酶計算化合物之Ki 常數。在不同化合物濃度下量測級分活性,[I]及將資料擬合至莫里森等式,其中[E]為酶濃度,[S]為ATP濃度,且KmApp 為在各檢定型式下各酶之ATP的表觀Km。在Ki 計算依賴於各檢定型式之檢定條件的情況下,所得Ki 變得與檢定無關,其中以兩種檢定型式測試之化合物的Ki 值具有較強的一對一相關性。
Figure 02_image178
對於Ki計算,亦見Morrison, J. F. (1969)Kinetics of the reversible inhibition of enzyme-catalysed reactions by tight-binding inhibitors, Biochimica et biophysica acta 185, 269-286;及Murphy, D. J. (2004)Determination of accurate KI values for tight-binding enzyme inhibitors: an in silico study of experimental error and assay design, Analytical biochemistry 327, 61-67。
在表2中,基於所列出之重複數目(數目)將檢定資料以兩位(2)有效數字呈現為幾何平均值(Ki )。帶有NA之單元意謂對於所指示檢定中之彼實例不存在資料。 表2.實例1至34之生物活性及化合物名稱。
實例編號 CDK4/細胞週期素D1 GMean Ki (nM)(CI) CDK4/細胞週期素D1數目 CDK6/細胞週期素D3: GMean Ki (nM) (CI) CDK6/細胞週期素D3: 數目 化合物名稱
1 1.8a (0.8,2.9) 3 2.0a (1.1,2.9) 3 6-乙醯基-8-環丁基-2-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
2 0.8b (0.6,1.0) 7 1.2b (0.9,1.4) 7 6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
3 1.1a (0.8,1.5) 6 2.1a (1.3,2.0) 6 6-乙醯基-8-(2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-2-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
4 1.6a (0.6,2.6) 4 2.1a (1.3,3.0) 5 6-乙醯基-2-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R ,2S )-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
5 0.4b (0.2,0.5) 14 1.3b (1.1,1.4) 19 3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H)-酮
6 113a (51,175) 3 190a (116,263) 3 第一溶離非對映異構體(DISAT-1,參見實例6及實例7); 6-乙醯基-8-[(1S,2S )-2-羥基-2-甲基環戊基]-2-{[(3S,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮, 或 6-乙醯基-8-[(1R, 2R )-2-羥基-2-甲基環戊基]-2-{[(3S, 4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
7 7.2a (4.5,10.0) 3 7.7a (5.2,10.2) 3 第二溶離非對映異構體(DISAT-2,參見實例6及實例7); 6-乙醯基-8-[(1S, 2S )-2-羥基-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮 或 6-乙醯基-8-[(1R ,2R )-2-羥基-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
8 >1200a (NA) 3 >560a (NA) 3 第一溶離對映異構體(ENT-1)(參見實例8及實例9); 6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基-2,2-二甲基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮 或 6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3R ,4S )-3-羥基-2,2-二甲基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
9 2.7a (1.6,3.9) 2 6.7a (2.8,10.7) 3 第二溶離對映異構體(ENT-2)(參見實例8及實例9); 6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基-2,2-二甲基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮 或 6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3R ,4S )-3-羥基-2,2-二甲基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
10 2.7a (1.1,4.3) 3 5.0a (2.8,7.3) 3 6-乙醯基-8-[(1R ,2S )-2-乙基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
11 34a (NA) 1 16a (NA) 1 3-乙醯基-7-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1-[(3S )-四氫呋喃-3-基]-1,6-㖠啶-2(1H )-酮
12 8.5a (4.5,12.6) 3 9.7a (6.2,13.1) 3 第一溶離非對映異構體(DIAST-1,參見實例12及實例13); 6-乙醯基-8-[(1S ,2R, 5R )-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮 或 6-乙醯基-8-[(1R ,2S ,5S )-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
13 2.1a (1.1,3.0) 3 3.3a (2.8,3.8) 3 第二溶離非對映異構體(DIAST-2,參見實例12及實例13); 6-乙醯基-8-[(1S ,2R, 5R )-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮 或 6-乙醯基-8-[(1R ,2S ,5S )-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
14 0.9a (0.5,1.2) 2 2.6a (0,5.5) 2 3-乙醯基-1-(3-羥基環戊基)-7-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H)-酮,DIAST-1 (參見實例14及實例15)
15 3.8a (3.1,4.5) 2 7.7a (NA) 1 3-乙醯基-1-(3-羥基環戊基)-7-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H )-酮,DIAST-2 (參見實例14及實例15)
16 2.6a (1.1,4.1) 3 5.0a (4.5,5.5) 3 第一溶離非對映異構體(DIAST-1,參見實例16及實例17); 6-乙醯基-8-[(1R ,2S )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮 或 6-乙醯基-8-[(1S ,2R )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
17 N/A N/A 10.5c (9.5,11.5) 2 第二溶離非對映異構體(DIAST-2,參見實例16及實例17); 6-乙醯基-8-[(1R ,2S )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮 或 6-乙醯基-8-[(1S ,2R )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
18 9.6a (7.7,11.5) 3 34a (19,49) 3 6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(3S )-吡咯啶-3-基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
19 4.5a (1.0,8.0) 4 4.2a (0,9.9) 2 6-乙醯基-8-(3,3-二甲基環丁基)-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
20 54a (18,90) 3 58a (40,75) 3 6-乙醯基-8-(順式-4-羥基環己基)-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
21 13a (7,20) 3 13a (11,16) 3 6-乙醯基-8-(反式-3-羥基環丁基)-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
22 N/A N/A 2.8c (2.2,3.4) 2 第一溶離非對映異構體(參見表1中之腳註4);6-乙醯基-8-[(1S ,2S )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮 或 6-乙醯基-8-[(1R ,2R )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
23 >1100a (N/A) 3 >560a (N/A) 3 第二溶離非對映異構體(參見表1中之腳註4);6-乙醯基-8-[(1S ,2S )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮 或 6-乙醯基-8-[(1R ,2R )-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
24 13a (11,14) 2 24a (8,39) 3 6-乙醯基-8-(反式-4-胺基環己基)-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
25 36a (5,67) 2 110a (8,216) 3 6-乙醯基-8-[反式-4-(二甲胺基)環己基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
26 13a (11,15) 3 39a (16,63) 3 6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(3S )-1-甲基吡咯啶-3-基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
27 9.9a (6,14) 3 25a (4,46) 3 6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(3R )-吡咯啶-3-基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
28 10a (7,14) 3 36a (29,44) 4 6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-8-[2-(2-甲氧基乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基]-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮三氟乙酸鹽
29 1.9a (1.6,2.1) 3 4.9a (3.0,6.9) 3 6-乙醯基-8-[2-(2,2-二氟乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基]-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮三氟乙酸鹽
30 430a (320,540) 4 >570a (N/A) 5 6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3R ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
31 27a (N/A) 1 29a (N/A) 1 6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(3S )-四氫呋喃-3-基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
32 16a (11,21) 5 27a (21,33) 5 6-乙醯基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-(哌啶-4-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮鹽酸鹽
33 62a (39,85) 4 130a (60,200) 4 3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3R ,4S )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-㖠啶-2(1H )-酮
34 52a (44,59) 2 85a (56,115) 3 6-乙醯基-8-環丙基-2-{[(3S ,4R )-3-羥基四氫-2H -哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮
a 以CHEF檢定測試b 以CHEF及MSA兩者測試c 於CDK6/D1 Ki 檢定中使用MSA測試 CI-95%置信區間
貫穿本申請案,參考各種公開案。出於所有目的,此等公開案之揭示內容特此以全文引用的方式併入本申請案中。
熟習此項技術者將顯而易見,在不脫離本發明之範疇或精神的情況下,可在本發明中做出各種修改及變化。考慮本文中所揭示之本發明的說明書及實踐,本發明之其他實施例將對熟習此項技術者顯而易見。意欲將本說明書及實例視為僅例示性的,其中本發明之真實範疇及精神由以下申請專利範圍指示。
圖1表示針對化合物5 之無水(無水物)結晶形式(指定為形式1)所觀測到的粉末X射線繞射圖案。
Figure 109112960-A0101-11-0002-3

Claims (45)

  1. 一種式I化合物:
    Figure 109112960-A0305-02-0224-15
    或其醫藥學上可接受之鹽,其中:A為CH或N;R1為C1-C2烷基或C1-C2氟烷基;R2為視情況經1、2或3個取代基取代之C1-C4烷基,該等取代基各自獨立地選自由以下組成之群:-OH、C1-C2烷氧基及F;R3為4員至8員雜環基、C3-C8環烷基、(4員至8員雜環基)-C1-C4烷基-或(C3-C8環烷基)-C1-C4烷基-,其中4員至8員雜環基及(4員至8員雜環基)-C1-C4烷基-中之4員至8員雜環基部分中之每一者視情況經1或2個R5取代,其中C3-C8環烷基及(C3-C8環烷基)-C1-C4烷基-中之C3-C8環烷基部分中之每一者視情況經1或2個R5取代且進一步視情況經1個-N(R6)2取代,及其中(4員至8員雜環基)-C1-C4烷基-及(C3-C8環烷基)-C1-C4烷基-中之C1-C4烷基部分中之每一者視情況經1、2或3個R5取代;R4為具有以下結構之部分:
    Figure 109112960-A0305-02-0225-3
    各R5係獨立地選自由以下組成之群:-F、-OH、-CN、C1-C4烷基、C1-C4氟烷基、C1-C4烷氧基、C1-C4氟烷氧基、C1-C4烷氧基-C1-C4烷基-、C1-C4氟烷氧基-C1-C4烷基-、C1-C4烷氧基-C1-C4氟烷基及C1-C4氟烷氧基-C1-C4氟烷基-;各R6係獨立地選自由H及C1-C2烷基組成之群;各R7獨立地為H或C1-C2烷基;及各R8獨立地為H、F或C1-C2烷基。
  2. 如請求項1之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中:A為CH或N;R1為CH3或C1氟烷基;R2為CH3;R3為5員至7員雜環基、C3-C6環烷基、(5員至7員雜環基)-C1-C4烷基-或(C3-C6環烷基)-C1-C4烷基-,其中5員至7員雜環基及(5員至7員雜環基)-C1-C4烷基-中之5員至7員雜環基部分中之每一者視情況經1個R5取代,其中C3-C6環烷基及(C3-C6環烷基)-C1-C4烷基-中之C3-C6環烷基部分中之每一者視情況經1或2個R5取代且進一步視情況經1個-N(R6)2取代,及 其中(5員至7員雜環基)-C1-C4烷基-及(C3-C6環烷基)-C1-C4烷基-中之C1-C4烷基部分中之每一者視情況經1、2或3個R5取代;R4為具有以下結構之部分:
    Figure 109112960-A0305-02-0226-5
    各R5係獨立地選自由以下組成之群:-F、-OH、-CN、C1-C2烷基、C1-C2氟烷基、C1-C2烷氧基、C1-C2氟烷氧基、C1-C2烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2氟烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2烷氧基-C1-C2氟烷基-及C1-C2氟烷氧基-C1-C2氟烷基-;各R6係獨立地選自由H及C1-C2烷基組成之群;及各R7獨立地為H或CH3,其限制條件為不超過兩個R7為CH3
  3. 如請求項1或2之化合物,其中該化合物為式II化合物:
    Figure 109112960-A0305-02-0226-8
    或其醫藥學上可接受之鹽。
  4. 如請求項3之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中式II之四氫哌喃環上之兩個取代基彼此呈反式。
  5. 如請求項3之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中該化合物為式III化合物:
    Figure 109112960-A0305-02-0227-12
  6. 如請求項3之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中:A為CH或N;R3為視情況經1個R5取代之5員至7員雜環基;及R5係選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1-C2烷基、C1-C2氟烷基、C1-C2烷氧基、C1-C2氟烷氧基、C1-C2烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2氟烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2烷氧基-C1-C2氟烷基-及C1-C2氟烷氧基-C1-C2氟烷基-。
  7. 如請求項6之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中該化合物為 式III化合物:
    Figure 109112960-A0305-02-0228-13
  8. 如請求項7之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3係選自由以下組成之群:2-氮雜螺[3.3]庚基、四氫呋喃基、吡咯啶基及哌啶基,其中雜環基選項中之每一者視情況經1個R5取代;且R5係選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1-C2烷基、C1-C2氟烷基、C1-C2烷氧基、C1-C2氟烷氧基、C1-C2烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2氟烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2烷氧基-C1-C2氟烷基-及C1-C2氟烷氧基-C1-C2氟烷基-。
  9. 如請求項7之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3為視情況經1個R5取代之2-氮雜螺[3.3]庚-6-基,該R5係選自由以下組成之群:C1-C2烷基、C1-C2氟烷基、C1-C2烷氧基-C1-C2烷基-及C1-C2氟烷氧基-C1-C2烷基-。
  10. 如請求項3之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中:A為CH或N; R3為C3-C6環烷基,其視情況經1或2個R5取代且進一步視情況經1個-N(R6)2取代;各R5係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1-C2烷基、C1-C2氟烷基、C1-C2烷氧基、C1-C2氟烷氧基、C1-C2烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2氟烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2烷氧基-C1-C2氟烷基及C1-C2氟烷氧基-C1-C2氟烷基-;及各R6係獨立地選自由H及C1-C2烷基組成之群。
  11. 如請求項10之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中該化合物為式III化合物:
    Figure 109112960-A0305-02-0229-14
  12. 如請求項11之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中:A為CH或N;R3係選自由以下組成之群:環丙基、環丁基、環戊基、環戊烯基、環己基及雙環[3.1.0]己基,其中該等選項中之每一者視情況經1或2個R5取代,且進一步視情況經1個-N(R6)2取代; 各R5係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、-CN、C1-C2烷基、C1-C2氟烷基、C1-C2烷氧基、C1-C2氟烷氧基、C1-C2烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2氟烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2烷氧基-C1-C2氟烷基及C1-C2氟烷氧基-C1-C2氟烷基-;及各R6係獨立地選自由H及C1-C2烷基組成之群。
  13. 如請求項12之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3係選自由以下組成之群:環丙基、環丁基、環戊基、環己基及雙環[3.1.0]己基,其中該等選項中之每一者視情況經1或2個R5取代且進一步視情況經1個-N(R6)2取代。
  14. 如請求項12之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3係選自由以下組成之群:環丙基、環丁基、環戊基、環己基及雙環[3.1.0]己-2-基,其中該等環烷基選項中之每一者視情況經1或2個R5取代且進一步視情況經1個-N(R6)2取代。
  15. 如請求項12之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中各R5係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、C1-C2烷基、C1-C2氟烷基及C1-C2烷氧基-C1-C2烷基-。
  16. 如請求項12之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中各R5係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、CH3及CH2CH3;且各R6係獨立地選自由H及CH3組成之群。
  17. 如請求項12之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3為視情況經1或2個R5取代之環丁基。
  18. 如請求項12之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3為視情況經1或2個R5取代之環丁基;且各R5係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、C1-C2烷基、C1-C2氟烷基、C1-C2烷氧基、C1-C2氟烷氧基、C1-C2烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2氟烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2烷氧基-C1-C2氟烷基及C1-C2氟烷氧基-C1-C2氟烷基-。
  19. 如請求項12之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3為視情況經1或2個R5取代之環戊基。
  20. 如請求項12之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3為視情況經1或2個R5取代之環戊基;且各R5係獨立地選自由以下組成之群:F、OH、C1-C2烷基、C1-C2氟烷基、C1-C2烷氧基、C1-C2氟烷氧基、C1-C2烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2氟烷氧基-C1-C2烷基-、C1-C2烷氧基-C1-C2氟烷基及C1-C2氟烷氧基-C1-C2氟烷基-。
  21. 如請求項12之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中R3為環戊基。
  22. 如請求項12之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為CH。
  23. 如請求項12之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,其中A為N。
  24. 如請求項1之化合物,其係選自:6-乙醯基-8-環丁基-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;6-乙醯基-8-(2-氮雜螺[3.3]庚-6-基)-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;6-乙醯基-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R,2S)-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-
    Figure 109112960-A0305-02-0232-16
    啶-2(1H)-酮;6-乙醯基-8-[(1S,2R,5R)-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;6-乙醯基-8-[(1R,2S,5S)-雙環[3.1.0]己-2-基]-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;6-乙醯基-8-[(1R,2S)-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;6-乙醯基-8-[(1S,2R)-2-氟-2-甲基環戊基]-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;及6-乙醯基-8-[2-(2,2-二氟乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基]-2-{[(3S,4R)-3- 羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮,或其醫藥學上可接受之鹽。
  25. 一種化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,該化合物為6-乙醯基-8-環丁基-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。
  26. 一種化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,該化合物為6-乙醯基-8-環戊基-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。
  27. 一種化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,該化合物為6-乙醯基-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基-8-[(1R,2S)-2-甲基環戊基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。
  28. 一種化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,該化合物為3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-
    Figure 109112960-A0305-02-0233-17
    啶-2(1H)-酮。
  29. 一種化合物,或其醫藥學上可接受之鹽,該化合物為6-乙醯基-8-[2-(2,2-二氟乙基)-2-氮雜螺[3.3]庚-6-基]-2-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-5-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。
  30. 一種3-乙醯基-1-環戊基-7-{[(3S,4R)-3-羥基四氫-2H-哌喃-4-基]胺基}-4-甲基-1,6-
    Figure 109112960-A0305-02-0234-18
    啶-2(1H)-酮之結晶形式。
  31. 如請求項30之結晶形式,其中該結晶形式為無水形式。
  32. 如請求項31之結晶形式,其中該結晶形式(指定為形式I)具有包含以2θ表示之至少兩個特徵峰之粉末X射線繞射圖案(CuKα輻射),該等特徵峰選自8.0±0.2°;18.6±0.2°;19.1±0.2°;及21.3±0.2°。
  33. 如請求項32之結晶形式,其具有包含以2θ表示之至少三個特徵峰之粉末X射線繞射圖案(CuKα輻射),該等特徵峰選自8.0±0.2°;18.6±0.2°;19.1±0.2°;及21.3±0.2°。
  34. 如請求項32或33之結晶形式,其具有包含以2θ表示之四個特徵峰之粉末X射線繞射圖案(CuKα輻射),該等特徵峰選自8.0±0.2°;18.6±0.2°;19.1±0.2°;及21.3±0.2°。
  35. 如請求項32之結晶形式,其具有進一步包含以2θ表示之至少一個額外特徵峰之粉末X射線繞射圖案(CuKα輻射),該特徵峰選自於8.0±0.2°;14.9±0.2°;16.0±0.2°;16.2±0.2°;17.4±0.2°;18.6±0.2°;19.1±0.2°;19.9±0.2°;20.8±0.2°;20.9±0.2°;21.3±0.2°;21.5±0.2°;21.8±0.2°;22.3±0.2°;23.3±0.2°;26.0±0.2°;26.2±0.2°;26.5±0.2°;28.1±0.2°;30.0±0.2°;30.4±0.2°;31.1±0.2°;32.3±0.2°;33.2±0.2°; 33.9±0.2°;及36.2±0.2°。
  36. 如請求項32之結晶形式,其具有實質上如圖1中所展示之粉末X射線繞射圖案。
  37. 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至29中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽,或如請求項30至36中任一項之結晶形式,及醫藥學上可接受之載劑。
  38. 一種如請求項1至29中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項30至36中任一項之結晶形式的用途,其用於製造治療疾病或病症之藥劑,其中該疾病或病症係選自由以下組成之群:肺高血壓、肺動脈高血壓、伴有左心疾病之肺高血壓、伴有肺部疾病及/或低血氧症之肺高血壓、由慢性血栓性及/或栓塞性疾病所致之肺高血壓,及與肺高血壓相關之疾病。
  39. 如請求項38之用途,其中該與肺高血壓相關之疾病為類肉瘤病、X組織細胞增生症、淋巴管瘤病或肺血管壓迫。
  40. 如請求項38之用途,其中該疾病或病症為肺動脈高血壓。
  41. 一種如請求項1至29中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項30至36中任一項之結晶形式之用途,其用於製造治療異常細胞 生長之藥劑。
  42. 如請求項41之用途,其中該異常細胞生長為癌症。
  43. 如請求項42之用途,其中癌症係選自由以下組成之群:乳癌、卵巢癌、膀胱癌、子宮癌、前列腺癌、肺癌、食道癌、頭頸癌、結腸直腸癌、腎癌、肝癌、胰臟癌、胃癌及甲狀腺癌。
  44. 一種如請求項1至29中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項30至36中任一項之結晶形式之用途,其用於製造抑制CDK之藥劑。
  45. 一種組合,其包含如請求項1至29中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或如請求項30至36中任一項之結晶形式,及另一治療劑。
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