TWI726942B - 位點專一性ｈｅｒ２抗體藥物共軛體 - Google Patents

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Abstract

本發明提供位點專一性HER2抗體藥物共軛體及其製法與用法。

Description

位點專一性HER2抗體藥物共軛體
本發明係關於位點專一性HER2抗體藥物共軛體。本發明另關於將該抗體藥物共軛體用於治療癌之方法。
跨膜受體酪胺酸激酶ErbB家族成員為細胞生長、細胞分化、細胞遷移、與細胞凋亡的重要介質。該受體家族包括四個不同成員，其包括表皮生長因子受體(EGFR或ErbB1)、HER2(ErbB2或p185)、HER3(ErbB3)及HER4(ErbB4或tyro2)。
HER2起初被認定是來自經化學治療的大鼠之神經胚細胞瘤的轉型基因產物。HER2過度表現被證實在體外(Di Fiore et al.,1987,Science 237(4811)：178-82；Hudziak et al.,1987,PNAS 84(20)：7159-63；Chazin et al.,1992,Oncogene 7(9)：1859-66)及在動物模型中(Guy et al.,1992,PNAS 89(22)：10578-82)都是致瘤的。引起受體過度表現之編碼HER2的基因擴增出現於乳癌與卵巢癌且與預後不良有關聯(Slamon et al.,1987,Science 235(4785)：177-82；Slamon et al.,1989,Science 244：707-12；Anbazhagan et al.,1991,Annals Oncology 2(1)：47-53；Andrulis et al.,1998,J Clinical Oncology 16(4)：1340-9)。HER2過度表現(通常但不一定是由於基因擴增)也在其他癌型觀測到，該其他癌型包括胃癌、子宮內膜癌、非小細胞肺癌、結腸癌、胰腺癌、膀胱癌、腎癌、前列腺癌及子宮頸癌(Scholl et al.,2001,Annals Oncology 12(Suppl.1)：S81-7；Menard et al.,2001,Ann Oncol 12(Suppl.1)：S15-9；Martin et al.,2014,Future Oncology 10：1469-86)。
Herceptin®(曲妥珠單抗(trastuzumab))為結合至HER2的胞外功能域之擬人化單株抗體(Carter et al.1992,PNAS 89：4285-9及美國專利第5,821,337號)。Herceptin®用於治療腫瘤過度表現HER2蛋白質的轉移性乳癌患者在1998年9月25日得到食品藥物管理局的上市許可。儘管Herceptin®是治療接受過大規模先前抗癌療法之HER2過度表現性乳癌患者的一個突破性進展，然而有部分患者對Herceptin®治療沒反應、反應很小或變成有抗性。
Kadcyla®(曲妥珠單抗-DM1或T-DM1)為由透過安定的硫醚連接子MCC(4-[N-順丁烯二醯亞胺甲基]環己烷-1-甲酸酯)接合至類美登素藥劑(maytansinoid agent)DM1之曲妥珠單抗組成的抗體藥物共軛體(Lewis et al.,2008,Cancer Res.68：9280-90；Krop et al.,2010,J Clin Oncol.28：2698-2704；美國專利第8,337,856號)。Kadcyla®用於 治療先前經Herceptin®與紫杉烷藥劑治療過且變成Herceptin®難治之患者中HER2陽性轉移性乳癌在2013年2月22日得到食品藥物管理局的上市許可。類似Herceptin®，長期Kadcyla®療法對一部分HER2過度表現性乳癌患者並沒成功。
因此，臨床上很需要針對對Herceptin®與/或Kadcyla®治療沒反應、反應很小或變成有抗性的患HER2過度表現性腫瘤或其他與HER2過度表現有關連之疾病的患者發展另外的HER2導向癌療法。
[發明之概要]
本發明提供位點專一性HER2抗體藥物共軛體及其在治療HER2過度表現性癌的用途。ADC使療法能靶向遞輸給癌細胞且能提供更具選擇性之療法而減少已知的脫靶效應造成的毒性。
本發明之位點專一性HER2 ADC一般如式Ab-(L-D)所示，其中Ab為結合至HER2的抗體或其抗原結合片段；及L-D是連接子-藥物部分，其中L是連接子，及D是藥物。
本發明之ADC的抗體(Ab)可為任何HER2結合抗體。在本發明之某些態樣中，該Ab結合至和曲妥珠單抗(Herceptin®)相同的HER2上的抗原決定位。在本發明之其他態樣中，該Ab具有和曲妥珠單抗相同的重鏈與輕鏈 CDR。在本發明之具體態樣中，該Ab具有和曲妥珠單抗相同的重鏈可變區(VH)與輕鏈可變區(VL)。
本發明之HER2 ADC以位點專一方式接合至藥物。為了符合此型接合，必須將抗體衍生化以提供建構在一或多個特異位點的反應性半胱胺酸殘基或醯基供體麩醯胺酸殘基(建構在一或多個特異位點或附接肽標籤)。該修飾應是在不瓦解抗體之抗原結合力的位點上。在較佳實施方式中，在抗體之重鏈恆定區與/或輕鏈恆定區進行一或多個修飾。
在本發明之某些實施方式中，位點專一性HER2 ADC可以使用包含曲妥珠單抗的重鏈可變區CDR與輕鏈可變區CDR及表1中揭示之重鏈恆定區與輕鏈恆定區的任何組合之抗體，條件是當該重鏈恆定區是SEQ ID No：5時，則該輕鏈恆定區不是SEQ ID No：11。在這樣的實施方式中，該重鏈恆定區可選自SEQ ID No：17、5、13、21、23、25、27、29、31、33、35、37或39中任一者，而該輕鏈恆定區可選自SEQ ID No：41、11或43中任一者，條件是該組合不是SEQ ID No：5與SEQ ID No：11。
在一個具體實施方式中，被用來構成該位點專一性HER2 ADC之抗體包含附接至SEQ ID No：17的重鏈恆定區及SEQ ID No：41的輕鏈恆定區之具有SEQ ID No：2至4的CDR之VH區及具有SEQ ID No：8至10的CDR之VL區。在另一個具體實施方式中，被用來構成該位點專一性HER2 ADC的抗體包含附接至SEQ ID No：13的重鏈恆定 區及SEQ ID No：43的輕鏈恆定區之具有SEQ ID No：2至4的CDR之VH區及具有SEQ ID No：8至10的CDR之VL區。
在其他具體實施方式中，本發明之ADC可以使用包含表1中揭示之重鏈與輕鏈的任何組合之抗體，條件是若該重鏈是SEQ ID No：6，則該輕鏈恆定區不是SEQ ID No：12。在這樣的實施方式中，該重鏈可選自SEQ ID No：18、6、14、22、24、26、28、30、32、34、36、38或40中任一者，而該輕鏈可選自SEQ ID No：42、12或44中任一者，條件是該組合不是SEQ ID No：6與SEQ ID No：12。
在一個具體實施方式中，本發明之ADC可以使用包含SEQ ID No：18的重鏈與SEQ ID No：42的輕鏈。在另一個具體實施方式中，本發明之ADC可以使用包含SEQ ID No：14的重鏈與SEQ ID No：44的輕鏈。
本發明中所揭示之位點專一性HER2 ADC中任一者可以用可用於治療癌的治療劑-藥物(D)製得。在一個具體實施方式中，該治療劑是抗有絲分裂劑。在另一個具體實施方式中，本發明之ADC中的抗有絲分裂劑藥物成分是奧立他汀(auristatin)(例如0101、8261、6121、8254、6780與0131)。在一個更具體實施方式中，本發明之ADC中的奧立他汀藥物成分是2-甲基丙胺醯基-N-[(3R,4S,5S)-3-甲氧基-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-甲氧基-2-甲基-3-側氧基-3-{[(1S)-2-苯基-1-(1,3-噻唑-2-基)乙基]胺基}丙基]吡咯啶 -1-基}-5-甲基-1-側氧基庚-4-基]-N-甲基-L-纈胺醯胺(valinamide)(也通稱為0101)。較佳地，本發明之ADC的藥物成分是可透膜的。
本發明中所揭示之位點專一性HER2 ADC中任一者可以用可裂解的或不可裂解的連接子(L)製得。較佳地，該連接子是可裂解的。可裂解之連接子包括但不限於vc、AcLysvc及m(H20)c-vc。更佳地，該連接子是vc或AcLysvc。
在本發明之一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：18的重鏈與SEQ ID No：42的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是vc且其中該藥物是0101。
在本發明之另一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：14的重鏈與SEQ ID No：44的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是AcLysvc且其中該藥物是0101。
本發明之另一個態樣包括本發明中所揭示之抗體藥物共軛體及用於製備、合成與接合本發明中所揭示之抗體藥物共軛體的中間物之構成方法、製備方法、合成方法、接合方法及純化方法。
本發明另外提供藥學組成物，其包含本發明中所揭示之位點專一性HER2 ADC及藥學上可接受的載子。
本發明設想到編碼位點專一性HER2 ADC之抗體部分的核酸。本發明也設想到另外的包含該核酸之載體與寄主細胞。
本發明也提供位點專一性HER2 ADC在治療HER2表現性癌的用法。欲用本發明之位點專一性HER2 ADC治療的HER2表現性癌可以表現高、中或低位準的HER2。在某些實施方式中，該欲治療之癌對用曲妥珠單抗和/或曲妥珠單抗emtansine(T-DM1)單獨或合併紫杉烷之治療有抗性、是該治療難治的、和/或在該治療後復發。欲治療之癌包括但不限於乳癌、卵巢癌、肺癌、胃癌、食道癌、結腸直腸癌、尿路上皮癌、胰腺癌、唾液腺癌及腦癌或上述癌之轉移。在一個更具體實施方式中，該乳癌是雌激素與黄體激素受體陰性乳癌或三陰性乳癌(TNBC)。在另一個實施方式中，該肺癌是非小細胞肺癌(NSCLC)。
藉由重新探討整個申請案會了解本發明之上述態樣及其他態樣。
圖1A至1B繪示(A)T(kK183C+K290C)-vc0101 ADC及(B)T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101 ADC。各黑圓圈代表接合至單株抗體之連接子/藥物(payload)。顯示各種ADC之一種這樣的連接子/藥物結構。藉以發生接合之抗體上的氨基酸殘基提供加底線實體。
圖2A至2E繪示來自疏水性交互作用層析術(HIC)之 選定ADC光譜，其顯示在將曲妥珠單抗衍生的抗體接合至不同連接子藥物後在滯留時間方面之變化。
圖3A至3B繪示結合至HER2之ADC的圖。(A)直接結合至HER2陽性BT474細胞及(B)與PE標記的曲妥珠單抗競爭性結合至BT474細胞。這些結果指示在這些ADC中的抗體結合性質不隨接合方法而改變。
圖4繪示曲妥珠單抗衍生之ADC的ADCC活性。
圖5繪示一些曲妥珠單抗衍生之ADC對一些具有不同HER2表現位準的細胞株的以nM藥物濃度表示之體外細胞毒性數據(IC50)。
圖6繪示一些曲妥珠單抗衍生之ADC對一些具有不同HER2表現位準的細胞株的以ng/ml抗體濃度表示之體外細胞毒性數據(IC50)。
圖7A至7I繪示9種曲妥珠單抗衍生之ADC對N87異種移植物的以腫瘤體積對時間表示之抗腫瘤活性。(A)T(kK183C+K290C)-vc0101；(B)T(kK183C)-vc0101；(C)T(K290C)-vc0101；(D)T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101；(E)T(K290C+K334C)-vc0101；(F)T(K334C+K392C)-vc0101；(G)T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101；(H)T-vc0101；(I)T-DM1。N87胃癌細胞表現高位準的HER2。
圖8A至8E繪示6種曲妥珠單抗衍生之ADC對HCC1954異種移植物的以腫瘤體積對時間表示之抗腫瘤活性。(A)T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101；(B)T(K290C+K334C)-vc0101；(C)T(K334C+K392C)-vc0101；(D)T (N297Q+K222R)-AcLysvc0101；(E)T-DM1。HCC1954肺癌細胞表現高位準的HER2。
圖9A至9G繪示7種曲妥珠單抗衍生之ADC對JIMT-1異種移植物的以腫瘤體積對時間表示之抗腫瘤活性。(A)T(kK183C+K290C)-vc0101；(B)T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101；(C)T(K290C+K334C)-vc0101；(D)T(K334C+K392C)-vc0101；(E)T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101；(F)T-vc0101；(G)T-DM1。JIMT-1乳癌細胞表現中/低位準的HER2。
圖10A至10D繪示5種曲妥珠單抗衍生之ADC對MDA-MB-361(DYT2)異種移植物的以腫瘤體積對時間表示之抗腫瘤活性。(A)T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101；(B)T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101；(C)T-vc0101；(D)T-DM1。MDA-MB-361(DYT2)乳癌細胞表現中/低位準的HER2。
圖11A至11E繪示5種曲妥珠單抗衍生之ADC對PDX-144580患者衍生之異種移植物的以腫瘤體積對時間表示之抗腫瘤活性。(A)T(kK183C+K290C)-vc0101；(B)T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101；(C)T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101；(D)T-vc0101；(E)T-DM1。PDX-144580患者衍生之細胞是TNBC PDX模型。
圖12A至12D繪示4種曲妥珠單抗衍生之ADC對PDX-37622患者衍生之異種移植物的以腫瘤體積對時間表示之抗腫瘤活性。(A)T(kK183C+K290C)-vc0101；(B) T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101；(C)T(K297C+K334C)-vc0101；(D)T-DM1。PDX-37622患者衍生之細胞是表現中位準的HER2之NSCLC PDX模型。
圖13A至13B繪示經(A)T-DM1或(B)T-vc0101治療且行磷酸化組織蛋白H3與IgG抗體染色之N87腫瘤異種移植物的免疫組織細胞化學法。
圖14繪示一些曲妥珠單抗衍生之ADC與游離藥物對體外T-DM1抗藥性細胞(N87-TM1與N87-TM2)或T-DM1感藥性親代細胞(N87細胞)之以nM藥物濃度及ng/ml抗體濃度表示的體外細胞毒性數據(IC50)。
圖15A至15G繪示7種曲妥珠單抗衍生之ADC對T-DM1感藥性(N87細胞)與抗藥性(N87-TM1與N87-TM2)胃癌細胞的抗腫瘤活性。(A)T-DM1；(B)T-mc8261；(C)T(297Q+K222R)-AcLysvc0101；(D)T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101；(E)T(K290C+K334C)-vc0101；(F)T(K334C+K392C)-vc0101；(G)T(kK183C+K290C)-vc0101。
圖16A至16B繪示顯示T-DM1感藥性(N87細胞)與抗藥性(N87-TM1與N87-TM2)胃癌細胞的(A)MRP1藥物排出泵蛋白質表現與(B)MDR1藥物排出泵蛋白質表現之西方墨點法。
圖17A至17B繪示T-DM1感藥性(N87細胞)與抗藥性(N87-TM1與N87-TM2)胃癌細胞的HER2表現及與曲妥珠單抗之結合。(A)顯示HER2蛋白質表現的西方墨點法 與(B)和細胞表面HER2之結合。
圖18A至18D繪示T-DM1感藥性(N87細胞)與抗藥性(N87-TM1與N87-TM2)胃癌細胞之蛋白質表現位準的特性分析。(A)523蛋白質的蛋白質表現位準變化；(B)顯示IGF2R、LAMP1和CTSB蛋白質表現之西方墨點法；(C)顯示CAV1蛋白質表現的西方墨點法；(D)植入N87細胞(左)與N87-TM2細胞(右)後在體內產生之腫瘤的CAV1蛋白質表現的IHC。
圖19A至19C繪示植入下列後在體內產生之腫瘤對曲妥珠單抗與各種曲妥珠單抗衍生之ADC的感藥性：(A)T-DM1感藥性N87親代細胞；(B)T-DM1抗藥性N87-TM1細胞；(C)T-DM1抗藥性N87-TM2細胞。
圖20A至20F繪示植入T-DM1感藥性N87親代細胞與T-DM1抗藥性N87-TM2細胞或N87-TM1細胞後在體內產生之腫瘤對曲妥珠單抗與各種曲妥珠單抗衍生之ADC的感藥性。(A)在曲妥珠單抗或二種曲妥珠單抗衍生之ADC存在下N87腫瘤體積對時間的圖；(B)在曲妥珠單抗或二種曲妥珠單抗衍生之ADC存在下N87-TM2腫瘤體積對時間的圖；(C)在曲妥珠單抗或二種曲妥珠單抗衍生之ADC存在下N87細胞腫瘤體積加倍的時間；(D)在曲妥珠單抗或二種曲妥珠單抗衍生之ADC存在下N87-TM2細胞腫瘤體積加倍的時間；(E)在7種不同曲妥珠單抗衍生之ADC存在下N87-TM2腫瘤體積對時間的圖；(F)在第14日加入曲妥珠單抗衍生之ADC的N87-TM1 腫瘤體積對時間的圖。
圖21A至21E繪示在體內產生之T-DM1抗藥性細胞的產生與特性分析。
腫瘤對曲妥珠單抗與各種曲妥珠單抗衍生之ADC的感藥性。(A)在植入體內初期N87胃癌細胞對T-DM1有感藥性。(B)隨時間過去，經植入的N87細胞變成對T-DM1有抗藥性，但對下列仍有感藥性：(C)T-vc0101；(D)T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101及(E)T(kK183+K290C)-vc0101。
圖22A至22D繪示4種曲妥珠單抗衍生之ADC對在體內產生之T-DM1抗藥性細胞(N87-TDM)和T-DM1感藥性親代N87細胞的以腫瘤體積對時間表示之體外細胞毒性。(A)T-DM1；(B)T(kK183+K290C)-vc0101；(C)T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101；(D)T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101。
圖23A至23B繪示在體內產生之T-DM1抗藥性細胞(N87-TDM1，來自小鼠2、17與18)和T-DM1感藥性親代N87細胞的HER2蛋白質表現位準比較。(A)FACS分析法與(B)西方墨點分析法。沒有觀測到HER2蛋白質表現的明顯差異。
圖24A至24D繪示在N87-TDM1(小鼠2、17與17)中的T-DM1抗藥性不是由於藥物排出泵。(A)顯示MDR1蛋白質表現之西方墨點法。在藥物(B)0101；(C)多柔比星；(D)T-DM1存在下的T-DM1抗藥性細胞(N87-TDM1) 與T-DM1感藥性N87親代細胞之體外細胞毒性。
圖25A至25B繪示(A)在對馬來猴投藥後之總Ab與曲妥珠單抗ADC(T-vc0101)或T(kK183C+K290C)位點專一性ADC和(B)在對馬來猴投藥後之曲妥珠單抗(T-vc0101)的ADC被分析物或不同位點專一性ADC的濃度對時間特性及藥物動力學/毒物動力學。
圖26繪示由疏水性交互作用層析術(HIC)得到之相對滯留值對在大鼠中的暴露量(AUC)。X軸代表由HIC得到之相對滯留時間；而Y軸代表在大鼠中的藥物動力學劑量標準化之暴露量(「曲線下面積」，AUC，用於抗體，從0至336小時，除以10mg/kg的藥物劑量)。符號形狀表示大概的載藥量(DAR)：菱形=DAR2；圓形=DAR4。箭頭指示T(kK183C+K290C)-vc0101。
圖27繪示使用T-vc0101慣行共軛體ADC與T(kK183C+K290C)-vc0101位點專一性ADC的毒性研究。在5mg/kg下的T-vc0101誘發嚴重的嗜中性白血球減少症，而在9mg/kg下的T(kK183C+K290C)-vc0101造成嗜中性白血球最小的下降。
圖28A至28C繪示下列之晶體結構：(A)T(K290C+K334C)-vc0101；(B)T(K290C+K392C)-vc0101；與(C)T(K334C+K392C)-vc0101。
圖29繪示在使用N87細胞株之異種移植物模型上的體內效力。在3mpk的被試驗的ADC全部顯示功效。
圖30繪示在PDX-GA0044患者衍生之異種移植物上 的曲妥珠單抗與二種曲妥珠單抗衍生之ADC的抗癌活性，以腫瘤體積對時間作圖。動物被下列處治：媒劑(空心菱形)，曲妥珠單抗(空心三角形)，T-DM1(空心圓形)，或T(kK183C+K290C)-vc0101(實心圓形與實心菱形)。PDX-GA0044患者衍生之細胞是表現中位準的HER2的胃PDX模型。
[發明之詳細說明]
本發明提供位點專一性HER2抗體藥物共軛體(ADC)，使用HER2抗體、連接子、與藥物、及編碼用於製造ADC之抗體的核酸來製備該共軛體之方法。本發明之ADC可用於製備與製造能用來治療HER2表現性癌的組成物(例如醫藥)。
ADC由透過連接子的使用接合至藥物之抗體成分組成。慣行ADC接合策略依靠把藥物透過在抗體重鏈與/或輕鏈上的內生性離胺酸或半胱胺酸隨機地接合至該抗體。因此，這樣的ADC是顯出不同藥物：抗體比(DAR)之物種的異質混合物。反之，本發明中所揭示之ADC是在抗體重鏈與/或輕鏈上的特定建構之殘基上把藥物接合至抗體的位點專一性ADC。所以，該位點專一性ADC是由具定義藥物：抗體比(DAR)的物種組成之ADC的同質總體。因此，該位點專一性ADC顯示導致該共軛體之改進的藥性、體內分布性與安全性。本發明之ADC包括接合至一 或多個連接子/藥物部分的本發明之抗體。
本發明提供如式Ab-(L-D)之抗體藥物共軛體，其中(a)Ab是結合至HER2的抗體，或其抗原結合片段，及(b)L-D是連接子-藥物部分，其中L是連接子，及D是藥物。
本發明也包含如式Ab-(L-D)之抗體藥物共軛體，其中(a)Ab是結合至HER2的抗體，或其抗原結合片段，及(b)L-D是連接子-藥物部分，其中L是連接子，及D是藥物。
本發明也包含如式Ab-(L-D)p之抗體藥物共軛體，其中(a)Ab是結合至HER2的抗體，或其抗原結合片段，(b)L-D是連接子-藥物部分，其中L是連接子，及D是藥物，和(c)p是附接至該抗體之連接子/藥物部分的數量。對位點專一性ADC而言，p是整數，由於該ADC的同質性。在某些實施方式中，p是4。在其他實施方式中，p是3。在其他實施方式中，p是2。在其他實施方式中，p是1。在其他實施方式中，p大於4。
本發明中所用之用語「HER2」乃指屬於EGFR家族的跨膜酪胺酸激酶受體。HER2也稱為ErbB2、p185與CD340。此受體家族包括四個成員(EGFR/HER1、HER2、HER3與HER4)，其透過刺激生長因子訊息傳遞路徑(例如PI3K-AKT-mTOR路徑)而產生作用。HER2的放大與/或過度表現和多種人惡性腫瘤有關連。野生型人HER2蛋白質的描述參見，例如，Semba et al.,1985,PNAS 82：6497- 6501及Yamamoto et al.,1986,Nature 319：230-4和Genbank Accession Number X03363。
本發明中所用之用語「抗體(Ab)」乃指能透過至少一個位於免疫球蛋白分子的可變區之抗原識別位點來識別與結合至專一靶或抗原的免疫球蛋白分子(例如多肽)。該用語可以包含任何類型之抗體，其包括但不限於：單株抗體、完整抗體的抗原結合片段(其保留專一性結合至給定抗原(即Fab、Fab'、F(ab')2、Fd、Fv、Fc等)之能力)及其突變體的抗體。
天然抗體(native antibody或naturally-occurring antibody)與天然免疫球蛋白一般是由二個相同輕(L)鏈與二個相同重(H)鏈組成之約150,000道爾頓的異質四聚體糖蛋白。每一輕鏈透過一個共價二硫鍵連接至重鏈，而在不同免疫球蛋白同型之重鏈中的二硫鍵數目不同。每一重鏈與輕鏈也具有規律間隔之鏈間二硫鍵。每一重鏈在一端具有可變區(VH)後面接著一些恆定區。每一輕鏈在一端具有可變區(VL)而另一端有恆定區；該輕鏈恆定區與該重鏈的第一恆定區密切結合，及該輕鏈可變區與該重鏈可變區密切結合。用語「可變的」乃指可變區的某些部分在抗體序列中廣泛不同。
本發明中所用之抗體專一性結合至HER2。在一個具體實施方式中，該HER2抗體結合至和曲妥珠單抗(Herceptin®)相同之在HER2上的抗原決定位。在一個更具體實施方式中，該HER2抗體具有和曲妥珠單抗 (Herceptin®)相同的可變區CDR。在又一個更具體實施方式中，該HER2抗體具有和曲妥珠單抗(Herceptin®)相同之可變區(即VH與VL)。
本發明中所用之用語「連接子(L)」描述該抗體直接或間接連接至該藥物。可以各式各樣方式將連接子附接至抗體，該方式例如透過表面離胺酸、與氧化碳水化合物還原偶合、還原鏈間二硫鍵釋出半胱胺酸殘基、在特異位點建構反應性半胱胺酸殘基、和在轉麩醯胺酸酶與胺存在下建構多肽使含有醯基供體麩醯胺酸之標籤或內生性麩醯胺酸變成反應性的。本發明使用位點專一方法將抗體連接至藥物。在一個實施方式中，接合透過被建構到抗體恆定區中之半胱胺酸殘基而發生。在另一個實施方式中，接合透過醯基供體麩醯胺酸殘基而發生，該醯基供體麩醯胺酸a)透過肽標籤被加到抗體恆定區，b)被建構到抗體恆定區中，或c)藉由建構周圍之殘基而變成可接近的/反應性的。連接子可為可裂解的(即，在細胞內條件下容易裂解)或不可裂解的。在某些實施方式中，該連接子是可裂解之連接子。
本發明中所用之用語「藥物(D)」乃指可用來治療癌的任何治療劑。該藥物具有生物活性或可檢測之活性，例如細胞毒性劑、化學治療劑、細胞生長抑制劑、與免疫調節劑。在較佳實施方式中，治療劑對腫瘤有細胞毒效應，包括耗減、消除、與/或殺死腫瘤細胞。用語藥物(drug、payload、與drug payload)可交換地使用。在一個具體實 施方式中，該藥物是抗有絲分裂劑。在一個更具體實施方式中，該藥物是奧立他汀。在又一個更具體實施方式中，該藥物是2-甲基丙胺醯基-N-[(3R,4S,5S)-3-甲氧基-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-甲氧基-2-甲基-3-側氧基-3-{[(1S)-2-苯基-1-(1,3-噻唑-2-基)乙基]胺基}丙基]吡咯啶-1-基}-5-甲基-1-側氧基庚-4-基]-N-甲基-L-纈胺醯胺(也稱為0101)。在某些具體實施方式中，該藥物較佳為可透膜的。
本發明中所用之用語「L-D」乃指由連接至連接子(L)的藥物(D)產生的連接子-藥物部分。
與本發明有關之另外的科技用語，除非另外指出，否則應當具有該領域之具有普通技能者一般理解的意義。此外，除非上下文另外要求，否則單數詞應當包括複數，及複數詞應當包括單數。一般來說，本發明中所述之細胞與組織培養、分子生物學、免疫學、微生物學、遺傳學與、蛋白質與核酸化學、和雜交相關命名法與技術是該領域中眾所周知且常用的。
I. HER2抗體
就製備本發明之位點專一性HER2 ADC而言，該抗體可為專一性結合至HER2的胞外功能域之任何抗體。在一個實施方式中，該抗體用來使該ADC結合至和曲妥珠單抗相同之HER2的抗原決定位，與/或使該ADC與曲妥珠單抗競爭HER2結合。在另一個實施方式中，該抗體用來使該ADC具有和曲妥珠單抗相同之重鏈可變區CDR與輕 鏈可變區CDR。在又一個實施方式中，該抗體用來使該ADC具有和曲妥珠單抗相同之重鏈可變區與輕鏈可變區。
本發明中所用之與抗體有關的用語「競爭」表示第一抗體(或其抗原結合片段)以足夠類似於第二抗體(或其抗原結合片段)結合方式結合至抗原決定位，使得在第二抗體存在下第一抗體與其同源抗原決定位之結合比在無第二抗體存在下第一抗體的結合可檢測出地減少。在第一抗體存在下第二抗體與其抗原決定位之結合也可檢測出地減少可為但不必是非此即彼的案例。也就是說，在無第二抗體抑制第一抗體與其抗原決定位之結合的情況下，第一抗體能抑制第二抗體與其抗原決定位之結合。然而，在各抗體在相同、更大或更小的程度上可檢測出地抑制其他抗體與其同源抗原決定位或配體之結合的情況下，認為該抗體彼此「交叉競爭」其各自抗原決定位之結合。本發明包含競爭性抗體與交叉競爭性抗體。不論這樣的競爭或交叉競爭發生之機制(例如，立體阻礙、構象改變、或結合至共同抗原決定位、或其部分)，根據本發明中提供的明示說明，習知技藝者會理解本發明中所揭示之方法包含且能使用這樣的競爭性抗體與/或交叉競爭性抗體。
曲妥珠單抗(商品名稱Herceptin®)是一種結合至HER2之胞外功能域的擬人化單株抗體。其可變區之胺基酸序列的揭示參見美國專利第5,821,337號(VH是SEQ ID No：42及VL是SEQ ID No：41)和下文的表1(分別是SEQ ID No：1 與7)。
重鏈可變區CDR之胺基酸序列是SEQ ID No：2至4，而輕鏈CDR之胺基酸序列是SEQ ID No：6至10(下文的表1)。完整的重鏈與輕鏈之胺基酸序列分別是SEQ ID No：6與12。
T-DM1(商品名稱Kadcyla®)是一種由透過安定的硫醚連接子MCC(4-[N-順丁烯二醯亞胺甲基]環己烷-1-甲酸酯)接合至類美登素藥劑DM1之曲妥珠單抗組成的抗體藥物共軛體(美國專利第8,337,856號)。此ADC之抗體成分同於曲妥珠單抗。使用慣行接合(位點專一接合以外的)技術把藥物接合至曲妥珠單抗，使得該ADC是具有不同量的彼此接合之DM1的物種之異質總體。該DM1藥物透過抑制微管蛋白聚合來抑制在細胞有絲分裂過程中的微管形成以抑制細胞增生(Remillard et al.,1975,Science 189：1002-5)。Kadcyla®獲准於治療先前經Herceptin®與紫杉烷藥劑治療過且變成Herceptin®難治之患者中HER2陽性轉移性乳癌。在實施例節中所述的實驗中所用之T-DM1係使用公開可利用的資訊而自製。
以位點專一方式把本發明之ADC接合至藥物。為符合此類型接合，必須將抗體衍生化來提供建構在一或多個特異位點的反應性半胱胺酸殘基，和在轉麩醯胺酸酶與胺存在下建構多肽使含有醯基供體麩醯胺酸之標籤或內生性麩醯胺酸變成反應性的。可利用該領域中已知之任何方法把胺基酸修飾，及許多這樣的方法是習知技藝者眾所周知 且為標準。例如，但不限於，可能使用任何眾所周知的以PCR為基礎之技術來實現胺基酸取代、刪除與插入。可能利用定點突變法來胺基酸取代(參見，例如，Zoller and Smith,1982,Nucl.Acids Res.10：6487-6500；及Kunkel,1985,PNAS 82：488)。
在需要保留抗原結合之應用上，這樣的修飾應當是在不擾亂抗體之抗原結合能力的位點上。在較佳實施方式中，該一或多個修飾是在重鏈恆定區與/或輕鏈恆定區完成。
本發明中所用之抗體的用語「恆定區」乃指抗體輕鏈之恆定區或抗體重鏈的恆定區，以單一或組合形式。用來製造本發明之ADC的抗體之恆定區可能由下列中任一者的恆定區衍生：IgA、IgD、IgE、IgG、IgM、或其任何同型及亞類和突變型。
恆定區不直接涉及將抗體結合至抗原，但顯出不同效應功能，例如Fc受體(FcR)結合、抗體參與抗體依賴性細胞毒性(ADCC)、調理作用、引發補體依賴性細胞毒性、及肥胖細胞去顆粒作用。該領域中熟悉之用語「Fc區」用於定義免疫球蛋白重鏈的C末端區。該「Fc區」可為天然序列Fc區或變異體Fc區。儘管免疫球蛋白重鏈之Fc區的定義可能改變，然而人IgG重鏈Fc區之定義一般是從第Cys226位或從第Pro230位胺基酸殘基延伸至其羧基末端。在Fc區中的殘基編號是根據Kabat之EU Index(Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.,1991)。免疫球蛋白Fc區一般具有二個恆定區：CH2與CH3。
抗體使用二個不同輕鏈恆定區：CLκ與CLλ。CLκ具有已知的多型基因座CLκ-V/A45與CLκ-L/V83(使用Kabat編號系統，如Kabat et al.(1991,NIH Publication 91-3242,National Technical Information Service,Springfield,VA)明示，所以κ位與λ位全都根據Kabat系統來編號)，因此考慮到多型性Km(1)：CLκ-V45/L83；Km(1,2)：CLκ-A45/L83；與Km(3)：CLκ-A45/V83。本發明之多肽、抗體與ADC能具有抗體成分，其具有這些輕鏈恆定區中任一者。
為了明確起見，除非另外具體指定，否則抗體之人IgG重鏈恆定區中的胺基酸殘基係根據Edelman et al.,1969,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 63(1)：78-85之EU Index，如Kabat et al.,1991中所述(在本發明中稱為「Kabat之EU index」)，來編號。典型上，該Fc區包含人IgG1恆定區的從約第236位至約第447位胺基酸殘基。C編號間的相似處能在(例如)IGMT資料庫中找到。輕鏈恆定區之胺基酸殘基係根據Kabat et al.,1991來編號。抗體恆定區胺基酸殘基的編號也在International Patent Publication No.WO 2013/093809中顯示。Kabat之EU index用於IgG重鏈恆定區的唯一例外是實施例中所述之殘基A114。A114乃指Kabat編號，而對應的EU index 號是118。這是由於此位點之位點專一接合的最初公開使用Kabat編號並且把此位點稱為A114C，且自此以後在該領域中廣泛地以「114」位點來使用。參見Junutula et al.,Nature Biotechnology 26,925-932(2008)。為了和在該領域中此位點的習慣用法一致，在實施例中使用「A114」、「A114C」、「C114」或「114C」。
能將編碼用於製造本發明之ADC的抗體之重鏈與輕鏈的核酸轉殖到用於表現或繁殖之載體上。可把編碼關注抗體之序列保留於寄主細胞內的載體中，然後把該寄主細胞增殖與冷凍以便未來之用。
本發明中所用之用語「載體」乃指能輸送，且較佳地表現寄主細胞內一或多種關注基因或序列的構建體。載體實例包括但不限於：病毒載體、裸DNA或RNA表現載體、質體載體、黏質體載體或噬菌體載體、陽離子型縮合劑關連性DNA或RNA表現載體、包覆於脂質體中的DNA或RNA表現載體、與某些真核細胞(例如生產細胞)。
本發明中所用之用語「寄主細胞」包括可為或已為用於混入多核苷酸嵌入物的載體之接受體的個別細胞或細胞培養物。寄主細胞包括單一寄主細胞之後代，且由於自然突變、意外突變、或人為突變，該後代可能不必和原始母細胞完全相同(在型態上或在基因體DNA互補上)。寄主細胞包括受核酸或本發明之載體體內轉染的細胞。
表1提供用來構建本發明之位點專一性ADC的擬人 化HER2抗體的胺基酸(蛋白質)序列與相關核酸(DNA)序列。所示之CDR利用Kabat編號方案來定義。
表1中所示之抗體重鏈與輕鏈具有曲妥珠單抗重鏈可變區(VH)與輕鏈可變區(VL)。重鏈恆定區與輕鏈恆定區由曲妥珠單抗衍生化且含有一或多個修飾以在製造本發明之ADC時得以位點專一接合。
考慮到位點專一接合之抗體恆定區中的胺基酸序列修飾被加底線且加粗。由曲妥珠單抗衍生化之抗體的命名法是T(曲妥珠單抗)後面接著小括號，在小括號中修飾之胺基酸位點的兩側是野生型殘基之單字母胺基酸碼和現於衍生化抗體中的位點之殘基的單字母胺基酸碼。此命名法之二個例外是「kK183C」，其表示輕(κ)鏈上的第183位已經由離胺酸修飾成半胱胺酸，及「LCQ05」，其表示被附接至輕鏈恆定區之C末端的含有麩醯胺酸的8胺基酸標籤。
表1中所示之修飾中的一者不是用於接合。在重鏈上的第222位之殘基(使用Kabat編號方案的EU index)可被改變而導致更同質性的抗體與藥物共軛體，更佳之在抗體與藥物間的分子間交聯，與/或鏈間交聯明顯減少。
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在某些實施方式中，本發明之ADC能使用包含下列的抗體：曲妥珠單抗之重鏈可變區CDR與輕鏈可變區CDR(SEQ ID No：2至4的VH CDR與SEQ ID No：8至10的VL CDR)及表1中所揭示之重鏈恆定區與輕鏈恆定區的任何組合，條件是當該重鏈恆定區是SEQ ID No：5時，則該輕鏈恆定區不是SEQ ID No：11(由於此組合再產生野生型曲妥珠單抗而因此不會考慮到位點專一接合)。在這樣的實施方式中，該重鏈恆定區可以選自SEQ ID No：17、5、13、21、23、25、27、29、31、33、35、37或39中任一者，而該輕鏈恆定區可以選自SEQ ID No：41、11或43中任一者，條件是該組合不是SEQ ID No：5及SEQ ID No：11，如上所述。
在更具體實施方式中，本發明之ADC能使用包含下列的抗體：曲妥珠單抗之重鏈可變區CDR與輕鏈可變區 CDR(SEQ ID No：2至4的VH CDR與SEQ ID No：8至10的VL CDR)及選自下列的重鏈恆定區與輕鏈恆定區組合：(a)重鏈恆定區是SEQ ID No：17及輕鏈恆定區是SEQ ID No：41；(b)重鏈恆定區是SEQ ID No：5及輕鏈恆定區是SEQ ID No：41；(c)重鏈恆定區是SEQ ID No：17及輕鏈恆定區是SEQ ID No：11；(d)重鏈恆定區是SEQ ID No：21及輕鏈恆定區是SEQ ID No：11；(e)重鏈恆定區是SEQ ID No：23及輕鏈恆定區是SEQ ID No：11；(f)重鏈恆定區是SEQ ID No：25及輕鏈恆定區是SEQ ID No：11；(g)重鏈恆定區是SEQ ID No：27及輕鏈恆定區是SEQ ID No：11；(h)重鏈恆定區是SEQ ID No：23及輕鏈恆定區是SEQ ID No：41；(i)重鏈恆定區是SEQ ID No：25及輕鏈恆定區是SEQ ID No：41；(j)重鏈恆定區是SEQ ID No：27及輕鏈恆定區是SEQ ID No：41；(k)重鏈恆定區是SEQ ID No：29及輕鏈恆定區是SEQ ID No：11； (l)重鏈恆定區是SEQ ID No：31及輕鏈恆定區是SEQ ID No：11；(m)重鏈恆定區是SEQ ID No：33及輕鏈恆定區是SEQ ID No：43；(n)重鏈恆定區是SEQ ID No：35及輕鏈恆定區是SEQ ID No：11；(o)重鏈恆定區是SEQ ID No：37及輕鏈恆定區是SEQ ID No：11；(p)重鏈恆定區是SEQ ID No：39及輕鏈恆定區是SEQ ID No：11；或(q)重鏈恆定區是SEQ ID No：13及輕鏈恆定區是SEQ ID No：43。
在又一個更具體實施方式中，本發明之ADC包含具有下列的抗體：SEQ ID No：2至4之VH CDR與SEQ ID No：8至10的VL CDR和SEQ ID No：17之重鏈恆定區及SEQ ID No：41的輕鏈恆定區。
在另一個更具體實施方式中，本發明之ADC包含具有下列的抗體：SEQ ID No：2至4之VH CDR與SEQ ID No：8至10的VL CDR和SEQ ID No：13之重鏈恆定區及SEQ ID No：43的輕鏈恆定區。
在其他實施方式中，本發明之ADC能使用包含下列的抗體：表1中所揭示之重鏈與輕鏈的任何組合，條件是若該重鏈是SEQ ID No：6，則該輕鏈不是SEQ ID No：12(由於此組合再產生野生型曲妥珠單抗而因此不會考 慮到位點專一接合)。在這樣的實施方式中，該重鏈可以選自SEQ ID No：18、6、14、22、24、26、28、30、32、34、36、38或40中任一者，而該輕鏈可以選自SEQ ID No：42、12或44中任一者，條件是該組合不是SEQ ID No：6及SEQ ID No：12，如上所述。
在更具體實施方式中，本發明之ADC能使用包含選自下列的重鏈與輕鏈組合之抗體：(a)重鏈是SEQ ID No：18及輕鏈是SEQ ID No：42；(b)重鏈是SEQ ID No：6及輕鏈是SEQ ID No：42；(c)重鏈是SEQ ID No：18及輕鏈是SEQ ID No：12；(d)重鏈是SEQ ID No：22及輕鏈是SEQ ID No：12；(e)重鏈是SEQ ID No：24及輕鏈是SEQ ID No：12；(f)重鏈是SEQ ID No：26及輕鏈是SEQ ID No：12；(g)重鏈是SEQ ID No：28及輕鏈是SEQ ID No：12；(h)重鏈是SEQ ID No：24及輕鏈是SEQ ID No：42；(i)重鏈是SEQ ID No：26及輕鏈是SEQ ID No：42；(j)重鏈是SEQ ID No：28及輕鏈是SEQ ID No：42；(k)重鏈是SEQ ID No：30及輕鏈是SEQ ID No：12；(l)重鏈是SEQ ID No：32及輕鏈是SEQ ID No：12；(m)重鏈是SEQ ID No：34及輕鏈是SEQ ID No：44；(n)重鏈是SEQ ID No：36及輕鏈是SEQ ID No：12；(o)重鏈是SEQ ID No：38及輕鏈是SEQ ID No：12；(p)重鏈是SEQ ID No：40及輕鏈是SEQ ID No：12；或 (q)重鏈是SEQ ID No：14及輕鏈是SEQ ID No：44。
在又一個更具體實施方式中，本發明之ADC包含具有下列的抗體：SEQ ID No：18之重鏈及SEQ ID No：42的輕鏈。含有編碼SEQ ID No：18之重鏈及SEQ ID No：42的輕鏈的核酸的質體業已於2015年11月17日寄存於American Type Culture Collection(ATCC),10801 University Blvd.,Manassas,VA 20110-2209，存取編號分別是PTA-122672與PTA-122673。該寄存係根據the Budapest Treaty on the International Recognition of the Deposit of Microorganisms for the Purpose of Patent Procedure and Regulations thereunder(Budapest Treaty)的條款。這確保該寄存之存活性培養物從寄存日起算保持30年。根據布達佩斯條約的條款寄存於ATCC，且遵守Pfizer Inc.與ATCC間之協議，該協議確保在發佈切合的美國專利或向公眾公開任何美國或外國之專利申請案後(以先到者為準)立即向公眾開放該寄存的培養物之後代的永久性與不受限制之可利用性，並且根據35 U.S.C.Section 122及據此的Commissioner's rules(包括37 C.F.R.Section 1.14，特別是886 OG 638)確保由美國專利商標局局長決定之培養物的後代之可利用性的權利。
本申請案之受讓人業已就下列達成協議：萬一寄存的材料之培養物在合適條件下培養時死亡或喪失或被消滅，該材料在通知後將立即被替換成另一個相同材料。所寄存的材料之可利用性不應被理解成在違反任何政府根據其專 利法授權所授予的權利之情況下實踐本發明的許可。
在另一個更具體實施方式中，本發明之ADC包含具有SEQ ID No：14的重鏈及SEQ ID No：44之輕鏈的抗體。
在本發明之某些態樣中，本發明的ADC包括具有包含胺基酸序列之重鏈與/或輕鏈的抗體，該胺基酸序列和上文揭示之重鏈或輕鏈中任一者有至少90%、95%、98%、或99%相同。被改變的殘基可為在抗體可變區或恆定區中。在某些實施方式中，和上文揭示之重鏈或輕鏈中任一者相比，有不超過1、2、3、4或5個殘基被改變。在其他實施方式中，在可變區CDR中任一者中沒有被改變的殘基。
在有關胺基酸序列之論述中，用語「相同率」(或「%相同」)表示在符合最大一致時相同的二個序列中之殘基數。有一些可用於測量胺基酸序列相同率的該領域熟悉之不同演算法(即Basic Local Alignment Tool或BLAST®)。除非另外具體指定，否則使用特定程式或演算法的預設參數。
就製備ADC而言，本發明中所述之HER2抗體可為實質純的，即至少50%純(即不含污染物)，更佳地，至少90%純，更佳地，至少95%純，又更佳地，至少98%純，及最佳地，至少99%純。
II. 藥物
可用於製備本發明之位點專一性HER2 ADC的藥物包 括可用於治療癌的任何治療劑，其包括但不限於：細胞毒性劑、細胞生長抑制劑、免疫調節劑與化學治療劑。細胞毒性效應乃指耗減、消除與/或殺死靶細胞(即腫瘤細胞)。細胞毒性劑乃指對細胞具有細胞毒性效應的藥劑。細胞生長抑制效應乃指抑制細胞增生。細胞生長抑制劑乃指對細胞具有細胞生長抑制效應，藉此抑制專一細胞亞群(即腫瘤細胞)生長與/或增殖的藥劑。免疫調節劑乃指透過直接或間接使另一種藥劑更有效來產生細胞激素與/或抗體與/或調節T細胞功能來刺激免疫反應，藉此抑制或降低細胞亞群(即腫瘤細胞)生長的藥劑。化學治療劑乃指可用於治療癌的化合物。藥物也可能是藥物衍生物，其中已經把藥物官能化以能夠和本發明之抗體接合。
在某些實施方式中，該藥物是可透膜藥物。在這樣的實施方式中，該藥物能引出旁觀者效應，其中包圍住最初把ADC內化之細胞的細胞被該藥物殺死。這在該藥物從抗體中釋出(即藉由可裂解的連接子裂解)及越過細胞膜和在擴散後立即誘發殺死周圍的細胞時發生。
根據所揭示的方法，將該藥物用於製備如式Ab-(L-D)之抗體藥物共軛體，其中(a)Ab是結合至HER2的抗體，及(b)L-D是連接子-藥物部分，其中L是連接子，及D是藥物。
藥物對抗體比(DAR)或載藥量指示每一抗體接合之藥物(D)分子的數量。本發明之抗體藥物共軛體使用位點專一接合，使得ADC組成物中實質有具有1的DAR的ADC 同質總體。在某些實施方式中，該DAR是1。在某些實施方式中，該DAR是2。在其他實施方式中，該DAR是3。在其他實施方式中，該DAR是4。在其他實施方式中，該DAR大於4。
使用慣行接合(位點專一接合以外的)導致不同種ADC之異質總體，各種ADC具有不同的個別DAR。以此方式製得之ADC組成物包括複數個抗體，每一抗體接合至特定數量的藥物分子。因此，該組成物具有平均DAR。T-DM1(Kadcyla®)在離胺酸殘基上使用慣行接合且具有約4的平均DAR，該廣大分布包括載荷0、1、2、3、4、5、6、7或8個藥物分子之ADC(Kim et al.,2014,Bioconj Chem 25(7)：1223-32)。
複數個ADC之組成物、批料、與/或調合物可經由平均DAR鑑定特性。DAR與平均DAR能利用各種慣行方式測得，該方式例如UV光譜分析、質譜分析、ELISA檢定、放射線測定方法、疏水性交互作用層析術(HIC)、電泳法與HPLC。
在本發明之態樣中，HER2 ADC可能具有1的DAR、2之DAR、3的DAR、4之DAR、5的DAR、6之DAR、7的DAR、8之DAR、9的DAR、10之DAR、11的DAR、12之DAR、或大於12的DAR。在本發明之態樣中，HER2 ADC可能具有1個藥物分子、或2個藥物分子、或3個藥物分子、或4個藥物分子、或5個藥物分子、或6個藥物分子、或7個藥物分子、或8個藥物分 子、或9個藥物分子、或10個藥物分子、或11個藥物分子、或12個藥物分子、或大於12個藥物分子。
在本發明之態樣中，HER2 ADC可能具有在約2至約4範圍內的平均DAR、或在約3至約5範圍內之平均DAR、或在約4至約6範圍內的平均DAR、或在約5至約7範圍內之平均DAR、或在約6至約8範圍內的平均DAR、或在約7至約9範圍內之平均DAR、或在約8至約10範圍內的平均DAR、或在約9至約11範圍內之平均DAR、或在約10至約12範圍內的平均DAR等。在某些態樣中，HER2 ADC之組成物、批料、與/或調合物可能具有約1的平均DAR、或約2之平均DAR、或約3的平均DAR、或約4之平均DAR、或約5的平均DAR、或約6之平均DAR、或約7的平均DAR、或約8之平均DAR、或約9的平均DAR、或約10之平均DAR、或約11的平均DAR、或約12之平均DAR、或大於12的平均DAR。如上述平均DAR範圍，用語「約」表示+/-0.5%。
HER2 ADC之組成物、批料、與/或調合物可經由較佳的平均DAR範圍鑑定特性，例如在約3至約5範圍內之平均DAR、在約3至約4範圍內的平均DAR、或在約4至約5範圍內之平均DAR。此外，HER2 ADC之組成物、批料、與/或調合物可經由較佳的平均DAR範圍鑑定特性，例如在3至5範圍內之平均DAR、在3至4範圍內的平均DAR、或在4至5範圍內之平均DAR。
在本發明之某些態樣中，HER2 ADC之組成物、批 料、與/或調合物可經由下列鑑定特性：約1.0的平均DAR、或1.0之平均DAR、或1.1的平均DAR、或1.2之平均DAR、或1.3的平均DAR、或1.4之平均DAR、或1.5的平均DAR、或1.6之平均DAR、或1.7的平均DAR、或1.8之平均DAR、或1.9的平均DAR。在另一個態樣中，HER2 ADC之組成物、批料、與/或調合物可經由下列鑑定特性：約2.0的平均DAR、或2.0之平均DAR、或2.1的平均DAR、或2.2之平均DAR、或2.3的平均DAR、或2.4之平均DAR、或2.5的平均DAR、或2.6之平均DAR、或2.7的平均DAR、或2.8之平均DAR、或2.9的平均DAR。在另一個態樣中，HER2 ADC之組成物、批料、與/或調合物可經由下列鑑定特性：約3.0的平均DAR、或3.0之平均DAR、或3.1的平均DAR、或3.2之平均DAR、或3.3的平均DAR、或3.4之平均DAR、或3.5的平均DAR、或3.6之平均DAR、或3.7的平均DAR、或3.8之平均DAR、或3.9的平均DAR。在另一個態樣中，HER2 ADC之組成物、批料、與/或調合物可經由下列鑑定特性：約4.0的平均DAR、或4.0之平均DAR、或4.1的平均DAR、或4.2之平均DAR、或4.3的平均DAR、或4.4之平均DAR、或4.5的平均DAR、或4.6之平均DAR、或4.7的平均DAR、或4.8之平均DAR、或4.9的平均DAR、或5.0之平均DAR。
在另一個態樣中，HER2 ADC之組成物、批料、與/ 或調合物可經由下列鑑定特性：12或以下的平均DAR、11或以下之平均DAR、10或以下的平均DAR、9或以下之平均DAR、8或以下的平均DAR、7或以下之平均DAR、6或以下的平均DAR、5或以下之平均DAR、4或以下的平均DAR、3或以下之平均DAR、2或以下的平均DAR、或1或以下之平均DAR。
在其他態樣中，HER2 ADC之組成物、批料、與/或調合物可經由下列鑑定特性：11.5或以下的平均DAR、10.5或以下之平均DAR、9.5或以下的平均DAR、8.5或以下之平均DAR、7.5或以下的平均DAR、6.5或以下之平均DAR、5.5或以下的平均DAR、4.5或以下之平均DAR、3.5或以下的平均DAR、2.5或以下之平均DAR、1.5或以下的平均DAR。
在本發明之某些態樣中，本發明中所揭示之透過半胱胺酸殘基的慣行接合方法與純化條件提供具有在約3至5範圍內，較佳為約4之最佳化平均DAR的HER2 ADC之組成物、批料、與/或調合物。
在本發明之某些態樣中，本發明中所揭示的透過建構之半胱胺酸殘基的位點專一接合方法與純化條件提供具有在約3至5範圍內，較佳為約4之最佳化平均DAR的HER2 ADC之組成物、批料、與/或調合物。
在本發明之某些態樣中，透過本發明中所揭示的以轉麩醯胺酸酶為基礎之接合的位點專一接合方法與純化條件提供具有在約1至3範圍內，較佳為約2之最佳化平均 DAR的HER2 ADC之組成物、批料、與/或調合物。
本發明也包含如式Ab-(L-D)p之抗體藥物共軛體，其中(a)Ab是結合至HER2的抗體，或其抗原結合片段，(b)L-D是連接子-藥物部分，其中L是連接子，及D是藥物，和(c)p是附接至該抗體之連接子/藥物部分的數量。對位點專一性ADC而言，p是整數，由於該ADC的同質性。在某些實施方式中，p是4。在其他實施方式中，p是3。在其他實施方式中，p是2。在其他實施方式中，p是1。在其他實施方式中，p大於4。
在一個實施方式中，本發明之ADC的藥物成分是抗有絲分裂劑。在一個具體實施方式中，該抗有絲分裂劑是奧立他汀(例如0101、8261、6121、8254、6780與0131；參見下表2)。在一個更具體實施方式中，該奧立他汀藥物是2-甲基丙胺醯基-N-[(3R,4S,5S)-3-甲氧基-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-甲氧基-2-甲基-3-側氧基-3-{[(1S)-2-苯基-1-(1,3-噻唑-2-基)乙基]胺基}丙基]吡咯啶-1-基}-5-甲基-1-側氧基庚-4-基]-N-甲基-L-纈胺醯胺(也通稱為0101)。
奧立他汀透過透過抑制微管蛋白聚合來抑制在細胞有絲分裂過程中的微管形成以抑制細胞增生。PCT International Publication No.WO 2013/072813(將其全部內容併入本案)揭示可用於製造本發明之ADC的奧立他汀及提供製造該奧立他汀的方法。
Figure 105138129-A0202-12-0060-25
Figure 105138129-A0202-12-0061-26
在本發明之某些態樣中，該細胞毒性劑能使用脂質體或生物相容性聚合物製得。能把本發明中所述之HER2抗體接合至該生物相容性聚合物以增加血清半衰期與生物活性，與/或延長體內半衰期。生物相容性聚合物實例包括水溶性聚合物，例如聚乙二醇(PEG)或其衍生物及含有兩性離子之生物相容性聚合物(例如含有磷酸膽鹼的聚合物)。
III. 連接子
本發明之位點專一性HER2 ADC係使用連接子把藥物連接至或接合至HER2抗體而製得。連接子是可用於連接藥物與抗體以形成抗體藥物共軛體(ADC)的雙官能性化合物。這樣的共軛體使藥物得以選擇性輸送到腫瘤細胞。合適連接子包括，例如，可裂解的連接子與不可裂解的連接子。可裂解之連接子典型地在細胞內條件下容易裂解。經接合的藥物從抗體中裂解之主要機制包括在溶酶體(腙類、縮醛類、與類順式烏頭酸酯的醯胺類)的酸性pH下水解、藉由溶酶體酶類(細胞自溶酶與其他溶酶體酶)使肽裂解、及二硫鍵還原。由於這些不同裂解機制，把藥物連接至抗體的機制也大幅變化並且能使用任何合適連接子。
合適可裂解的連接子包括但不限於可被細胞內蛋白酶裂解的肽連接子，該細胞內蛋白酶例如溶酶體蛋白酶或核內體蛋白酶，例如順丁烯二醯亞胺基己醯基-纈胺酸-瓜胺酸-對胺基苄氧基羰基(vc)、N~2~-乙醯基-L-離胺醯基-L-纈胺醯基-L-瓜胺酸-對胺基苄氧基羰基-N,N'-二甲基胺基乙基-CO-(AcLysvc)及m(H20)c-vc(下表3)。在具體實施方式中，該連接子是可裂解的連接子，使得一旦該連接子裂解，該藥物便能誘發旁觀者效應。該旁觀者效應是在可透膜之藥物從抗體中釋出(即藉由可裂解的連接子裂解)及越過細胞膜和在擴散後立即誘發殺死包圍住最初把ADC內化之細胞的細胞時發生。
合適不可裂解的連接子包括但不限於順丁烯二醯亞胺 基己醯基(mc)、順丁烯二醯亞胺-(聚乙二醇)6(MalPeg6)、Mal-PEG2C2、Mal-PEG3C2及m(H20)c(下表3)。
其他合適連接子包括在特異pH或在pH範圍下可水解的連接子，例如腙連接子。另外之合適可裂解的連接子包括二硫鍵連接子。連接子可能與抗體共價鍵結到該抗體在細胞內一定被降解而釋出藥物的程度，例如mc連接子等。
在本發明之特定態樣中，在本發明之位點專一性HER2 ADC中的連接子是可裂解的且可為vc或AcLysvc。
許多接合至抗體之治療劑(藥物)具有少的(若有的話)水溶性，而該少的水溶性能限制該共軛體之載藥量，由於該共軛體的聚集作用。一個克服這問題之方法是把增溶基加到連接子中。可使用用由PEG與二肽組成的連接子製成之共軛體，其包括具有附接至該抗體的PEG-二酸、硫醇-酸、或順丁烯二醯亞胺-酸、二肽間隔子、及結合至蒽環類抗生素或倍癌黴素之胺的醯胺之共軛體。另一個實例是用結合至細胞毒性劑的含有PEG之二硫化物連接子與結合至抗體的醯胺製得之共軛體。混入PEG基團的方法可能有益於克服聚集作用及限制載藥量。
Figure 105138129-A0202-12-0064-27
連接子透過分子之左側附接至單株抗體及透過分子的右側附接至藥物，如表3中所示。
IV. 製備位點專一性HER2 ADC之方法
本發明也提供製備本發明之抗體藥物共軛體的方法。例如，製造本發明中所揭示之位點專一性HER2 ADC的方法可以包括：(a)將該連接子連接至該藥物；(b)將該連接子藥物部分接合至該抗體；及(c)純化該抗體藥物共軛體。
本發明之HER2 ADC使用位點專一方法來把該HER2抗體接合至該藥物。
在一個實施方式中，該位點專一接合透過一或多個被建構到抗體恆定區中之半胱胺酸殘基而發生。製備用於透過半胱胺酸殘基的位點專一接合之HER2抗體的方法可以按照PCT Publication No.WO2013/093809(將其全部內容併入本案中作為參考)中所述地來進行。以下位點(對IgG1恆定區使用Kabat編號方案的EU Index及對κ鏈恆定區使用Kabat編號方案)中的一或多者可被改變成半胱胺酸從而成為用於接合之位點：a)在重鏈恆定區上的第114、246、249、265、267、270、276、278、283、290、292、293、294、300、302、303、314、315、318、320、327、332、333、334、336、345、347、354、355、358、360、362、370、373、375、376、378、380、382、386、388、390、392、393、401、404、411、413、414、416、418、419、421、428、431、432、437、438、439、443、與444位殘基，與/或b)在κ鏈恆定區上的第111、149、183、188、207、與210位殘基。
在一個具體實施方式中，該一或多個可被改變成半胱胺酸之位點(使用Kabat編號方案的EU Index)a)在重鏈恆定區上的是第290、334、392與/或443位點，與/或b)在輕鏈恆定區上的是第183位點(Kabat編號)。
在一個更具體實施方式中，在重鏈恆定區上的第290位點及在輕鏈恆定區上的第183位點被改變成用於接合之半胱胺酸。
在另一個實施方式中，該位點專一接合透過一或多個被建構到抗體恆定區中之醯基供體麩醯胺酸殘基而發生。製備用於透過麩醯胺酸殘基的位點專一接合之HER2抗體的方法可以按照PCT Publication No.WO2012/059882(將其全部內容併入本案中作為參考)中所述地來進行。可以三種不同方式建構抗體以表現用於位點專一接合的麩醯胺酸殘基。
可以將含有麩醯胺酸殘基之短肽標籤混入輕鏈與/或重鏈的一些不同位點(即在N末端、C末端內)。在第一個實施方式中，可以把含有麩醯胺酸殘基之短肽標籤附接至重鏈與/或輕鏈的C末端。可以附接以下含有麩醯胺酸之標籤中的一或多者以成為用於藥物接合之醯基供體：GGLLQGPP(SEQ ID NO：81)、GGLLQGG(SEQ ID NO：82)、LLQGA(SEQ ID NO：83)、GGLLQGA(SEQ ID NO：84)、LLQG(SEQ ID NO：85)、LLQGPG(SEQ ID NO：86)、LLQGPA(SEQ ID NO：87)、LLQGP(SEQ ID NO：88)、LLQP(SEQ ID NO：89)、LLQPGK(SEQ ID NO：90)、LLQGAPGK(SEQ ID NO：91)、LLQGAPG(SEQ ID NO：92)、LLQGAP(SEQ ID NO：93)、LLQX1X2X3X4X5，其中X1是G或P，其中X2是A、G、P、或不存在，其中X3是A、G、K、P、或不存在，其中X4是G、K、或不存在，及其中X5是K或不存在(SEQ ID NO：94)，或LLQX1X2X3X4X5，其中X1是任何天然胺基酸及其中X2、X3、X4、與X5是任何天然胺基酸或不存在(SEQ ID NO：95)。
在一個具體實施方式中，GGLLQGPP(SEQ ID NO：81)被附接至輕鏈的C末端。
在第二個實施方式中，可以利用定點突變把重鏈與/或輕鏈上的殘基改變成麩醯胺酸殘基。在一個具體實施方式中，可以把重鏈上的第297位殘基(使用Kabat編號方案之EU Index)改變成麩醯胺酸(Q)從而成為用於接合的位點。
在第三個實施方式中，可以改變重鏈或輕鏈上的殘基導致該位點之無糖基化，使得一或多個內生性麩醯胺酸變成接合可接近的/反應性的。在一個具體實施方式中，可以把重鏈上的第297位殘基(使用Kabat編號方案之EU Index)改變成丙胺酸(A)。在這樣的情況下，重鏈上的第295位麩醯胺酸(Q)能用於接合。
可利用反應變數之變型憑經驗求出用於形成共軛體的最佳化反應條件，該反應變數例如溫度、pH、連接子-藥物部分投入、及添加劑濃度。該領域之習知技藝者無庸過 度實驗即可求出適用於接合其他藥物的條件。透過建構之半胱胺酸殘基的位點專一接合在下文實施例5A中被舉例說明。透過麩醯胺酸殘基的位點專一接合在下文實施例5B中被舉例說明。
可將藥物接合至聚乙二醇(PEG)，其包括直鏈或支鏈聚乙二醇聚合物與單體，以進一步增加每一抗體藥物共軛體之藥物分子數量。PEG單體如式-(CH2CH2O)-所示。可把藥物與/或肽類似物直接或間接地結合至PEG，即透過合適間隔基團，例如糖類。PEG-抗體藥物組成物也可包括另外的親油性與/或親水性部分以促進藥物安定性及輸送到體內靶位點。含有PEG之組成物的代表性製法可在美國專利第6,461,603號、第6,309,633號、與第5,648,095號中找到。
在接合後，可利用慣行方法由未接合之反應物與/或共軛體聚集物中分離出共軛體及純化。這可以包括以下方法：粒徑排阻層析術(SEC)、超過濾/滲濾法、離子交換層析術(IEC)、層析聚焦法(CF)、HPLC、FPLC、或Sephacryl S-200層析術。該分離也可利用疏水性交互作用層析術(HIC)實現。合適HIC介質包括Phenyl Sepharose 6 Fast Flow層析介質、Butyl Sepharose 4 Fast Flow層析介質、Octyl Sepharose 4 Fast Flow層析介質、Toyopearl Ether-650M層析介質、Macro-Prep methyl HIC層析介質或Macro-Prep t-Butyl HIC層析介質。
下表4顯示用來產生本發明中明示之實施例節中的數 據之HER2 ADC。表4(第1至17列)中所示的位點專一性HER2 ADC是本發明之位點專一性ADC的實施例。
可以使用位點專一技術透過上文III節中所揭示之任何連接子把上文I節中所揭示的任何HER2抗體接合至上文II節中所揭示之任何藥物，以製造本發明之位點專一性HER2 ADC。在較佳實施方式中，該連接子是可裂解的(例如vc或AcLysvc)。在其他較佳實施方式中，該藥物是奧立他汀(例如0101)。
在本發明的一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：18的重鏈與SEQ ID No：42的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是vc且其中該藥物是0101。這樣的ADC之示意圖參見圖1A。
在本發明的另一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：14的重鏈與SEQ ID No：44的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是AcLysvc且其中該藥物是0101。這樣的ADC之示意圖參見圖1B。
在本發明的另一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：24的重鏈與SEQ ID No：42的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是vc且其中該藥物是0101。
在本發明的另一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：26的重鏈與SEQ ID No：42的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是vc且其中該藥物是0101。
在本發明的另一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：28的重鏈與SEQ ID No：42的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是vc且其中該藥物是0101。
在本發明的另一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：30的重鏈與SEQ ID No：12的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是vc且其中該藥物是0101。
在本發明的另一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：32的重鏈與SEQ ID No：12的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是vc且其中該藥物是0101。
在本發明的另一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：34的重鏈與SEQ ID No：44的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子 是AcLysvc且其中該藥物是0101。
在本發明的另一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：36的重鏈與SEQ ID No：12的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是AcLysvc且其中該藥物是0101。
在本發明的另一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：38的重鏈與SEQ ID No：12的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是vc且其中該藥物是0101。
在本發明的另一個特定態樣中，如式Ab-(L-D)之位點專一性HER2 ADC包含(a)抗體Ab，其包含SEQ ID No：40的重鏈與SEQ ID No：12的輕鏈；及(b)連接子-藥物部分L-D，其中L是連接子，及D是藥物，其中該連接子是vc且其中該藥物是0101。
Figure 105138129-A0202-12-0072-28
Figure 105138129-A0202-12-0073-29
V. 位點專一性HER2抗體藥物共軛體之用途
本發明之抗體藥物共軛體可用於治療HER2表現性癌的治療方法。在本發明之某些態樣中，本發明提供抑制具有HER2表現性腫瘤的個體中腫瘤生長或進展之方法，其包括對有其需要的個體投予有效量之具有一或多種本發明中所述的ADC之組成物(即藥學組成物)。在本發明的其他態樣中，本發明提供抑制個體中HER2表現性癌細胞轉移之方法，其包括對有其需要的個體投予有效量之具有一或多種本發明中所述的ADC之組成物(即藥學組成物)。在本發明的其他態樣中，本發明提供誘發個體中HER2表現性癌消退之方法，其包括對有其需要的個體投予有效量 之具有一或多種本發明中所述的ADC之組成物(即藥學組成物)。在其他態樣中，本發明提供用於上述方法中使用的包含一或多種本發明中所述之ADC的藥學組成物。在其他態樣中，本發明提供一或多種本發明中所述之ADC或包含本發明中所述的ADC之藥學組成物的用途，其係用於製造上述方法中使用之醫藥。
和對照組或基準值相比，本發明中所揭示之治療方法的所欲結果通常是可以計量之值。本發明中所用的相對用語例如「改進」、「增加」或「降低」指示相對於對照組之計量值，例如在開始本發明中所述的治療前相同個體中的計量值，或在沒有本發明中所述之治療的情況下對照個體(或多重對照個體)中的計量值。代表性對照個體是患有和受治療個體相同形式之癌的個體，兩者年齡大約相同(以保證受治療個體與對照個體的疾患期別可相比擬)。
對療法作出反應的變化或改進一般達統計上顯著性。本發明中所用之用語「顯著性」或「顯著的」係關於在二或多個實體間有不均的現象之機率的統計分析。為確定關係是否是「顯著的」或具有「顯著性」，數據之統計處理可為「P值」。低於使用者定義截止點之P值被視為顯著的。小於或等於0.1、小於0.5、小於0.01、小於0.005、或小於0.001之P值可被視為顯著的。
V.A. 癌
本發明之ADC可用於治療HER2表現性癌。在一個 實施方式中，該HER2表現性癌是實性瘤。在一個更具體實施方式中，HER2表現性實性瘤包括但不限於：乳癌(例如雌激素與黄體激素受體陰性、三陰性乳癌)、卵巢癌、肺癌(例如非小細胞肺癌(包括腺癌、鱗狀細胞癌與大細胞癌)和小細胞肺癌)、胃癌、食道癌、結腸直腸癌、尿路上皮癌(例如微乳突狀尿路上皮癌與典型尿路上皮癌)、胰腺癌、唾液腺癌(例如黏液上皮樣癌、腺樣囊狀癌與終末管腺癌)及腦癌或上述癌的轉移(即HER2+乳癌的肺轉移)(Martin et al.,2014,Future Oncol.10(8)：1469-86)。
在一個更具體實施方式中，HER2表現性實性瘤包括但不限於：乳癌、卵巢癌、肺癌與胃癌。
在另一個實施方式中，該乳癌是雌激素受體與黄體激素受體陰性的。在一個更具體實施方式中，該乳癌是三陰性乳癌(TNBC)。
在另一個實施方式中，該肺癌是非小細胞肺癌(NSCLC)。
在本發明的一個態樣中，本發明中所揭示之ADC可用於治療先前未經治療劑治療過的HER2表現性癌(即，作為第一線治療)。
在本發明的另一個態樣中，本發明中所揭示之ADC可用於治療對用另一治療劑治療有抗性、是該治療難治的、和/或在該治療後復發的HER2表現性癌(即，作為第二線治療)。在一個實施方式中，該先前治療是曲妥珠單抗(曲妥珠單抗或Herceptin®)單獨或合併另一治療劑(即紫 杉烷，例如紫杉醇(paclitaxel)、多西他賽(docetaxel)、卡巴他賽(cabazitaxel)等)。在另一個實施方式中，該先前治療是曲妥珠單抗emtansine(T-DM1或Kadcyla®)單獨或合併另一治療劑(即紫杉烷，例如紫杉醇、多西他賽、卡巴他賽等)。
在本發明的另一個態樣中，本發明中所揭示之ADC可用於治療對用多於一種的其他治療劑治療有抗性、是該治療難治的、和/或在該治療後復發的HER2表現性癌(即，作為第三線治療或第四線治療等)。
本發明之ADC可用於治療表現高位準的HER2之癌(即IHC 3+)、表現中位準的HER2之癌(即2+ IHC或2+/3+ IHC)、或表現低位準的HER2之癌(即IHC 1+、IHC 2+或IHC 1+/2+)(參見IVB節HER2檢測方法)。這和曲妥珠單抗與T-DM1相反，該曲妥珠單抗與T-DM1對表現低或中位準的HER2之癌無效(Burris et al.,2011,J Clinical Oncology 29(4)：398-405)。
本發明之ADC可用於治療大部分癌細胞表現相似量的HER2之同源性癌。另外，本發明之ADC可用於治療有表現不同位準的HER2之不同腫瘤細胞總體的異源癌。
V.B. HER2檢測方法
關於評估腫瘤上的HER2表現位準的最佳方式的態樣已被論述且臨床意義已被概述(Sauter et al.,2009,J Clin Oncol.27：1323-33；Wolff et al.,2007,J Clinical Oncology 25：118-45；Wolff et al.,2013,J Clinical Oncology 31：3997-4014)。現在可以利用下列來評估HER2狀態：免疫組織化學法(IHC)、螢光原位雜交法(FISH)、與色質原位雜交法(CISH)。
IHC識別在細胞膜上的HER2蛋白質表現。結果通常使用範圍從0+(無表現)到3+(高度表現)的半定量計分系統來表示。顯示無位準(0+)或低位準(1+)的表現的腫瘤被認為是HER2陰性；相反地，顯示高位準(3+)的表現的腫瘤應當被認為是HER2陽性。此方法具經濟效益且容易取得，但受困於低靈敏度與不同觀測者間的高差異(Gancberg et al.,2002,Breast Cancer Res Treat.74：113-20)。
使用IHC之HER2檢測有四種FDA許可的商用套組：HercepTestTM(Dako Denmark A/S產品)；Pathway(Ventana Medical Systems,Inc.產品)；Insite HER2/NEU kit(Biogenex Laboratories,Inc.產品)和Bond Oracle HER2 IHC System(Leica Biosystems產品)。這些都是高度標準化之半定量檢測法，其將HER2表現位準分成0(每一細胞<20,000個受體，無可看見的表現)、1+(每一細胞~100,000個受體，一部分細胞膜染色，<10%的過度表現HER-2之細胞)、2+(每一細胞~500,000個受體，輕度到中度細胞膜完全染色，>10%的過度表現HER-2之細胞)、和3+(每一細胞~2,000,000個受體，高度細胞膜完全染色，>10%的過度表現HER-2之細胞)。不理會細胞質表現。
FISH用DNA探器檢測HER2基因擴增且比IHC更專一及靈敏(Owens et al.,2004,Clin Breast Cancer.5：63-69；Press et al.,2005,Clin Cancer Res.11：6598-6607；Vogel et al.,2002,J Clinical Oncology 20(3)：719-726)。FISH提供每染色體17中節的HER2基因副本數量之定量結果。結果為HER2信號數對染色體17中節信號數比率。小於1.8的比率被認為在正常限制內。1.8至2.0之比率是可疑的且需要進一步試驗。大於2.0的比率是HER2基因序列擴增。
使用FISH之HER2檢測有四種FDA許可的商用套組：HER2 FISH Pharm DxTM kit(Dako Denmark產品)；Pathvysion HER2 DNA Probe Kit(Abbott Molecular Inc.產品)；Inform HER2/NEU和Inform HER2 Dual ISH DNA Probe Cocktail(二者都是Ventana Medical Systems,Inc.產品)。
另一種評估HER2基因擴增之方法是CISH。CISH非常類似於FISH，但使用在標準亮視野顯微鏡可看見的慣行過氧化酶或鹼性磷酸酶方法。使用CISH之HER2檢測有二種FDA許可的商用套組：HER2 CISH PharmDx Kit(Dako Denmark A/S產品)與Spot-Light HER2 CISH Kit(Life Technologies,Inc.產品)。
常將利用FISH或CISH檢測之基因擴增及利用IHC的蛋白質表現二者作為最初試驗來評估HER2狀態。該二種方法間有良好關係(Jacobs et al.,1999,J Clinical Oncology 17(7)：1974-82)。然而在腫瘤被分成可疑的(即IHC 2+，或1.8至2.2的FISH/CISH比，或每核4至6個信號的平均HER2基因副本數量)情況下，常見的方法是用另一種方法檢驗該腫瘤(Wolff et al.,2007,J Clinical Oncology 25：118-45)。
因此，具有如免疫組織化學法(IHC)所測得之3+位準和/或
Figure 105138129-A0202-12-0079-350
2.0的螢光原位雜交(FISH)放大率的腫瘤被認為是高HER2表現。具有如免疫組織化學法(IHC)所測得之2+位準和/或<2.0的螢光原位雜交(FISH)放大率的腫瘤被認為是中HER2表現。具有如免疫組織化學法(IHC)所測得之1+位準和/或<2.0的螢光原位雜交(FISH)放大率的腫瘤被認為是低HER2表現。
在一個實施方式中，利用IHC測得HER2位準。在一個更具體實施方式中，使用Dako HercptestTM檢定來進行IHC。
在另一個實施方式中，利用FISH測得HER2位準。在一個更具體實施方式中，使用Dako HER2 FISH Pharm DxTM檢定來進行FISH。
代表性腫瘤樣品包括含有腫瘤細胞的任何生物樣品或臨床樣品，例如組織樣品、活體組織切片、血液樣品、血漿樣品、唾液樣品、尿液樣品等。
VI. 調合物
本發明提供藥學組成物，其包括本發明中所揭示之位 點專一性HER2抗體藥物共軛體與藥學上可接受的載子中任一者。此外，該藥學組成物可以包括多於一種的本發明中所揭示之位點專一性HER2 ADC。
本發明中所用之組成物可以進一步包括藥學上可接受的載子、賦形劑、或安定劑(Remington：The Science and practice of Pharmacy 21st Ed.,2005,Lippincott Williams and Wilkins,Ed.K.E.Hoover)，其呈冷凍乾燥調合物或水溶液形式。可接受之載子、賦形劑、或安定劑在使用的劑量與濃度下對接受者無毒性，且可能包括緩衝劑(例如磷酸鹽、檸檬酸鹽、與其他有機酸類)、抗氧化劑(包括抗壞血酸與甲硫胺酸)、防腐劑(例如氯化十八基二甲基苄基銨、氯化六甲雙銨、氯化烷基二甲基苄基銨、氯化苄乙氧銨、酚、丁醇或苯甲醇、羥苯甲酸烷基酯(例如羥苯甲酸甲酯或羥苯甲酸丙酯)、兒茶酚、間苯二酚、3-戊醇、與間甲酚)、低分子量(小於約10個殘基)多肽類、蛋白質(例如血清白蛋白、明膠、或免疫球蛋白)、親水性聚合物(例如聚乙烯吡咯啶酮)、胺基酸類(例如甘胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺酸、組胺酸、精胺酸、或離胺酸)、單醣類、雙醣類、及其他碳水化合物類(包括葡萄糖、甘露糖、或葡聚糖)、螯合劑(例如EDTA)、糖類(例如蔗糖、甘露糖醇、海藻糖、或山梨糖醇)、成鹽相對離子(例如鈉)、金屬複合物(例如Zn-蛋白質複合物)、與/或非離子性界面活性劑(例如TWEENTM、PLURONICSTM、或聚乙二醇(PEG))。本發明中所用的「藥學上可接受之鹽」乃指藥學上可接受 的分子或巨分子之有機鹽或無機鹽。藥學上可接受之賦形劑在本發明中進一步說明。
一或多種位點專一性HER2 ADC的各種調合物可用於投予，該調合物包括但不限於包含一或多種藥學上可接受之賦形劑的調合物。藥學上可接受之賦形劑是該領域中熟悉且為促進藥理學有效物質之投予的相對惰性物質。例如，賦形劑能賦予形態或堅硬度，或作為稀釋劑。合適賦形劑包括但不限於安定劑、潤濕劑與乳化劑、用於改變容積滲透濃度的鹽類、包封劑、緩衝劑、與皮膚穿透增強劑。賦形劑與用於非腸道與經腸道之藥物傳輸的調合物參見Remington,The Science and Practice of Pharmacy 20th Ed.Mack Publishing,2000。
在本發明之某些態樣中，這些藥劑可針對注射投予(例如腹膜內注射、靜脈內注射、皮下注射、肌內注射等)而配製。因此，這些藥劑可和藥學上可接受之媒劑(例如鹽溶液、林格氏液、葡萄糖溶液等)混合。特定給藥方案(即劑量、時機與重複)將取決於特定個體及其病史。
把具有所欲純度ADC和隨意的藥學上可接受之載子、賦形劑或安定劑混合來製得用於儲存的根據本發明使用之位點專一性HER2 ADC的治療用調合物(Remington,The Science and Practice of Pharmacy 21st Ed.Mack Publishing,2005)，其呈冷凍乾燥調合物或水溶液形式。可接受之載子、賦形劑、或安定劑在使用的劑量與濃度下對接受者無毒性，且可能包括緩衝劑(例如磷酸鹽、檸檬 酸鹽、與其他有機酸類)、鹽類(例如氯化鈉)、抗氧化劑(包括抗壞血酸與甲硫胺酸)、防腐劑(例如氯化十八基二甲基苄基銨、氯化六甲雙銨、氯化烷基二甲基苄基銨、氯化苄乙氧銨、酚、丁醇或苯甲醇、羥苯甲酸烷基酯(例如羥苯甲酸甲酯或羥苯甲酸丙酯)、兒茶酚、間苯二酚、3-戊醇、與間甲酚)、低分子量(小於約10個殘基)多肽類、蛋白質(例如血清白蛋白、明膠、或免疫球蛋白)、親水性聚合物(例如聚乙烯吡咯啶酮)、胺基酸類(例如甘胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺酸、組胺酸、精胺酸、或離胺酸)、單醣類、雙醣類、及其他碳水化合物類(包括葡萄糖、甘露糖、或糊精)、螯合劑(例如EDTA)、糖類(例如蔗糖、甘露糖醇、海藻糖、或山梨糖醇)、成鹽相對離子(例如鈉)、金屬複合物(例如Zn-蛋白質複合物)、與/或非離子性界面活性劑(例如TWEENTM、PLURONICSTM、或聚乙二醇(PEG))。
含有位點專一性HER2 ADC的脂質體可以利用該領域中熟悉之方法製得，該方法的描述參見(例如)：Eppstein,et al.,1985,PNAS 82：3688-92；Hwang,et al.,1908,PNAS 77：4030-4；和美國專利第4,485,045號與第4,544,545號。具有增強循環時間之脂質體在美國專利第5,013,556號中揭示。特別有用的脂質體可以藉由逆相蒸發法用包括卵磷脂、膽固醇與PEG衍生之磷脂醯乙醇胺(PEG-PE)的脂質組成物產生。透過定義孔徑之濾器來擠壓脂質體產生具有所欲直徑的脂質體。
活性成分也可包埋於所製得之微囊劑中，例如利用凝聚技術或界面聚合(例如羥甲基纖維素微囊劑或明膠微囊劑及聚甲基丙烯酸甲酯微囊劑)，包埋於膠態藥物輸送系統(例如脂質體、白蛋白微球體、微乳液、奈米粒子與毫微囊劑)或包埋於巨乳液。這樣的技術之揭示參見Remington,The Science and Practice of Pharmacy 21st Ed.Mack Publishing,2005。
可製得持續釋放式製劑。合適持續釋放式製劑實例包括含有抗體之固體疏水性聚合物的半透性基質，該基質呈成形物件(例如膜或微囊劑)形式。持續釋放式基質實例包括聚酯、水凝膠(例如聚(2-羥乙基-甲基丙烯酸酯)、或聚乙烯醇)、聚交酯(美國專利第3,773,919號)、L-麩胺酸與7乙基-L-麩胺酸酯共聚物、不可降解的乙烯-乙酸乙烯酯、可降解的乳酸-羥基乙酸共聚物，例如LUPRON DEPOTTM(由乳酸-羥基乙酸共聚物與leuprolide acetate組成之可注射的微囊劑)、蔗糖乙酸異丁酸酯、聚-D-(-)-3-羥基丁酸。
活體投予用的調合物必須滅菌。這利用(例如)透過過濾滅菌薄膜來過濾容易第實現。治療用位點專一性HER2 ADC組成物一般放進具無菌入口的容器中，例如靜脈溶液袋或具有可由皮下注射針刺穿的塞子的管形瓶中。
可溶性界面活性劑包括，特別是，非離子性藥劑，例如聚氧乙烯山梨糖醇酐(例如TWEENTM 20、40、60、80或85)及其他山梨糖醇酐(例如SpanTM 20、40、60、80或 85)。具界面活性劑之組成物會便利地包括在0.05至5%間，且可為在0.1至2.5%間的界面活性劑。應瞭解可視需要加入其他成分，例如甘露糖醇或其他藥學上可接受的媒劑。
合適乳液可使用市售脂肪乳液，例如INTRALIPIDTM、LIPOSYNTM、INFONUTROLTM、LIPOFUNDINTM與LIPIPHYSANTM。可將活性成分溶於預混乳液組成物，或可溶於油(例如大豆油、紅花油、棉籽油、芝麻油、玉米油或杏仁油)及與磷脂(例如卵磷脂、大豆磷脂或大豆卵磷脂)與水混合後形成的乳液。應瞭解可加入其他成分，例如甘油或葡萄糖，來調整乳液的滲性。合適乳液典型地會含有至多20%，例如在5至20%間的油。脂肪乳液可包括在0.1至1.0μm間，特別是在0.1至0.5μm間的脂肪滴，及具有在5.5至8.0範圍內的pH。乳液組成物可利用把位點專一性HER2 ADC與INTRALIPIDTM或其組分(大豆油、卵磷脂、甘油與水)混合來製得。
本發明也提供用於即用方法之套件。本發明之套件包括一或多個裝有一或多種本發明中所述之位點專一性HER2 ADC的容器，及根據本發明中所述之方法中任一者用的指示說明書。一般來說，這些指示說明書包括把用於上述治療處治的位點專一性HER2 ADC的投予說明。
關於本發明中所述之位點專一性HER2 ADC的用途之指示說明一般包括用於意圖治療的劑量、給藥方案、與投 予途徑之資訊。容器可為單位劑量、散裝包裝(例如多劑量包裝)、或亞單位劑量包裝。本發明之套件中提供的指示說明書典型地是在標籤或包裝說明書上的書面式指示說明(例如套件中所包括的紙張)，但也可提供機器可讀式指示說明(例如在磁性或光學儲存碟上載的指示說明)。
本發明之套件在合適的包裝中。合適的包裝包括但不限於：管型瓶、瓶、大口瓶、軟質包裝(例如密封Mylar袋或塑膠袋)等。也包含和特殊裝置(例如輸注裝置(例如袖珍泵))併用的包裝。套件可能具有無菌入口(例如容器可能是靜脈溶液袋或具有可由皮下注射針刺穿的塞子的管形瓶)。組成物中的至少一種活性藥劑是位點專一性HER2 ADC。容器可能進一步包括第二藥學活性藥劑。
套件可能隨意地提供額外的組分，例如緩衝液與解說用資料。通常，套件包括容器與在該容器上或和該容器一起的標籤或包裝說明書。
VII. 調合物與投予
對體內施用而言，提供或投予有效劑量之位點專一性HER2 ADC。本發明中所用之措辭「有效劑量」或「有效量」乃指要直接或間接地達到任何一或多個有益或所欲之治療結果必需的藥物、化合物、或藥學組成物的量。例如當對患癌個體投予時，有效劑量包括足夠引出抗癌活性的量，該抗癌活性包括癌細胞溶解、抑制癌細胞增生、誘發癌細胞凋亡、減少癌細胞抗原、延遲腫瘤生長、與/或抑 制轉移。腫瘤縮小被普遍接受為效力之臨床替代指標。另一個被普遍接受的效力之指標是無疾病進展存活期。
有效劑量可以一或多次投予來投予。藥物、化合物、或藥學組成物之有效劑量可能連同或可能不連同另一種藥物、化合物、或藥學組成物來達到。因此，有效劑量可能被認為是投予一或多種治療劑，及單一藥劑可能被考慮以有效量被給予，若(連同一或多種其他藥劑)可能達到或達到滿意的結果。
可透過合適途徑對個體投予位點專一性HER2 ADC。該領域之習知技藝者應當理解本發明中所述之實施例無意限制而是要介紹可用之技術。因此，在本發明之某些態樣中，根據已知方法對個體投予位點專一性HER2 ADC，該已知方法例如靜脈內投予(例如推注或在一段期間內連續輸注)、肌內投予、腹膜內投予、腦脊髓內投予、顱內投予、透皮投予、皮下投予、關節內投予、舌下投予、滑液膜內投予、透過吹入、腦脊髓膜內投予、口服、透過吸入、或局部投予。投予可為全身投予，例如靜脈內投予或局部投予。市售用於液體調合物的氣霧器(包括噴射氣霧器與超音波氣霧器可用於投予。液體調合物可被直接霧化，及冷凍乾燥的粉末可在重新配製後被霧化。或者，可使用氟碳化合物調合物與計量吸入器把位點專一性HER2 ADC噴霧化，或以冷凍乾燥粉末及磨細粉末形式吸入。
在本發明之某些態樣中，透過位點專一或靶向局部輸送技術投予位點專一性HER2 ADC。位點專一或靶向局部 輸送技術實例包括：各種位點專一性HER2 ADC可植入式儲庫源或局部輸藥導管(例如輸注導管、留置導管、針型導管、合成植入物、外膜套、引流管及支架或其他可植入式裝置、位點專一性載子、直接注射、或直接施用。見，例如，PCT International Publication No.WO 2000/53211與美國專利第5,981,568號。
為了本發明之目的，位點專一性HER2 ADC的合適劑量將取決於：所用之特定ADC(或其組成物)，要治療之症狀的類型與嚴重程度，藥劑是否以治療目的投予，先前療法，患者病史及對藥劑的反應，患者之所投予的藥物廓清率，及主治醫師的裁量。臨床醫師可投予位點專一性HER2 ADC直到劑量達到或超出所欲之結果為止。劑量與/或次數可以隨療程而變動，但也可能保持固定。經驗上的考量(例如半衰期)通常有助於劑量的決定。例如，和人類免疫系統相容的抗體(例如擬人化抗體或純人類抗體)可用來延長抗體的半衰期及防止抗體被寄主免疫系統攻擊。在療程中可決定與調整給藥次數，通常，但不必根據症狀的治療與/或抑制與/或改善，例如抑制腫瘤或延遲生長等。或者，位點專一性HER2 ADC的持續釋放式調合物可能合適。用於達到持續釋放的各種調合物與裝置是該領域中已知的。
通常，位點專一性HER2 ADC投予的初始候選劑量可為約2mg/kg。為了本發明之目的，典型每日劑量範圍可能從約3μg/kg至30μg/kg至300μg/kg至3mg/kg，至 30mg/kg，至100mg/kg或更多中任一者。例如，可能使用約1mg/kg，約2.5mg/kg，約5mg/kg，約10mg/kg，與約25mg/kg的劑量。對在幾日或更長的時間內重複投予而言，視疾患而定，持續治療直到所欲之症狀的抑制發生，或直到達到足夠的治療位準，例如，足夠抑制或延遲腫瘤生長/進展或癌細胞轉移。示範性給藥方案包括約2mg/kg的初始劑量，接著保持每週約1mg/kg的位點專一性HER2 ADC的劑量，或接著保持每隔一週約1mg/kg的劑量。其他示範性給藥方案包括投予遞增的劑量(例如1mg/kg的初始劑量與逐步增加為每週或更長的期間內一或多次較高劑量)。視醫師希望達到的藥物動力學衰減模式而定，也可能使用其他給藥方案。例如，在本發明之某些態樣中，包含1週從1次至4次。在其他態樣中，包含1個月1次，或每隔1個月1次，或每3個月1次，及每週1次，每2週1次與每3週1次投予。此療法之進展可利用慣行技術與檢定容易地監控。給藥方案(包括所用之特定位點專一性HER2 ADC)可以隨時間而變動。
VIII. 組合療法
在本發明之某些態樣中，本發明中所述之方法進一步包括用另一形式的療法治療個體的步驟。在某些態樣中，該另一形式的療法是附加抗癌療法，其包括但不限於化學療法、放射線療法、外科手術、激素療法、與/或附加免 疫療法。
本發明所揭示之位點專一性HER2 ADC可以初步處治形式被投予，或可被投予用於處治對慣行療法無反應的癌。此外，位點專一性HER2 ADC可與其他療法(例如切除、放射線、額外的抗癌藥劑等)併用，藉此引出加成或增強的治療效應與/或降低某些抗癌藥劑之細胞毒性。本發明之位點專一性HER2 ADC可和額外的藥劑共同投予或共同配製、或可針對和額外的藥劑以任何順序連續投予而配製。
本發明之位點專一性HER2 ADC可和其他治療劑併用，該其他治療劑包括但不限於治療用抗體、ADC、免疫調節劑、細胞毒性劑、與細胞生長抑制劑。細胞毒性效應乃指耗減、消除、與/或殺死靶細胞(即癌細胞)。細胞毒性劑乃指對細胞具有細胞毒性效應與/或細胞生長抑制效應的藥劑。細胞生長抑制效應乃指抑制細胞增生。細胞生長抑制劑乃指對細胞具有細胞生長抑制效應，藉此抑制特異細胞亞群(即癌細胞)生長與/或增殖的藥劑。免疫調節劑乃指透過產生細胞激素與/或抗體與/或調節T細胞功能來刺激免疫反應，藉此直接或間接允許另一種更有效之藥劑來抑制或降低細胞亞群(即癌細胞)生長的藥劑。
就組合療法而言，位點專一性HER2 ADC與/或一或多種額外的治療劑在適合進行意圖之療法的任何時段內被投予。因此，單一藥劑可被實質上合併投予(即單一調合物或在數分鐘或數小時內)或被以任何順序連續投予。例 如，單一藥劑治療可彼此在約1年內(例如在約10、8、6、4、或2個月內、或在4、3、2、或1週內、或在5、4、3、2、或1日內)被投予。
本發明所揭示之組合療法可引出加乘治療效應，即大於其個別效應或治療結果的總和的效應。例如加乘治療效應可為大於單一藥劑所引出之治療效應，或給定組合的單一藥劑所引出之治療效應總和的至少約2倍、或至少約5倍、或至少約10倍、或至少約20倍、或至少約50倍、或至少約100倍之效應。加乘治療效應也可為比單一藥劑所引出的治療效應，或給定組合之單一藥劑所引出的治療效應總和增加至少10%、或至少20%、或至少30%、或至少40%、或至少50%、或至少60%、或至少70%、或至少80%、或至少90%、或至少100%、或更多之治療效應。加乘治療效應也是在將治療劑併用時允許降低給藥的效應。
[實施例]
以下實施例被提供僅作介紹用，並且無意以任何方式限制本發明之範圍。當然，除本發明中所顯示及描述者外，本發明的各式各樣修改為該領域之習知技藝者從前面的描述中顯而易知的並且屬於後附申請專利範圍之範圍內。
實施例1：用於位點專一接合之曲妥珠單抗衍生的抗體之 製備
A. 透過半胱胺酸接合
一般按PCT Publication WO2013/093809(將其全部內容併入本案)中所述地進行透過半胱胺酸殘基來製備用於位點專一接合之曲妥珠單抗衍生物的方法。將在輕鏈(第183位，使用Kabat編號方案)或重鏈(第290、334、392與/或443位，使用Kabat編號方案的EU index)上的一或多個殘基利用定點突變法改變成半胱胺酸(C)殘基。
B. 透過轉麩醯胺酸酶接合
一般按PCT Publication WO2012/059882(將其全部內容併入本案)中所述地進行透過麩醯胺酸殘基來製備用於位點專一接合之曲妥珠單抗衍生物的方法。以三種不同方式建構曲妥珠單抗以表現用於接合的麩醯胺酸殘基。
就第一種方法而言，把含有麩醯胺酸殘基的8胺基酸殘基標籤(LCQ05)附接至輕鏈之C末端(即SEQ ID No：81)。
就第二種方法而言，將重鏈上的殘基(第297位，使用Kabat編號方案的EU index)利用定點突變法由天冬醯胺酸(N)改變成麩醯胺酸(Q)殘基。
就第三種方法而言，將重鏈上之殘基(第297位，使用Kabat編號方案的EU index)由天冬醯胺酸(N)改變成丙胺酸(A)。這導致第297位的無糖基化及第295位之可接近的/反應性的內生性麩醯胺酸。
另外，某些曲妥珠單抗衍生物具有接合沒用到的改變。將重鏈上之第222位殘基(使用Kabat編號方案的EU Index)由離胺酸(K)改變成精胺酸(R)殘基。我們發現K222R取代導致更同質性的抗體與藥物共軛體，更佳之在抗體與藥物間的分子間交聯，與/或和在抗體輕鏈C末端上的麩醯胺酸標籤之鏈間交聯明顯減少。
實施例2：表現曲妥珠單抗衍生的抗體之安定性轉染的細胞之製造
A. 半胱胺酸突變體
為了測定能在細胞中穩定地表現且大量製造的單與雙半胱胺酸建構之曲妥珠單抗衍生的抗體變異體，用編碼九種曲妥珠單抗衍生之抗體變異體(T(kK183C)、T(K290C)、T(K334C)、T(K382C)、T(kK183C+K290C)、T(kK183C+K382C)、T(K290C+K334C)、T(K334C+K392C)、與T(K290C+K392C))的DNA轉染CHO細胞，及使用該領域中眾所周知的標準方法單離安定之大量生產庫。用使用標準方法編碼此雙半胱胺酸建構之抗體變異體的重鏈DNA與輕鏈DNA過渡性共轉染HEK-293細胞(ATCC Accession # CRL-1573)。使用二管柱法(即Protein-A親和捕獲管柱後面接著TMAE管柱)或三管柱法(即Protein-A親和捕獲管柱後面接著TMAE管柱再接著CHA-TI管柱)從濃縮CHO庫起始原料中單離這些曲妥珠單抗變異體。使用這些純化法，利用分析粒徑排阻層析測得全部半胱胺 酸建構之曲妥珠單抗衍生的抗體變異體製劑都含有>97%之關注峰(peak-of-interest)(POI)(表5)。表5中所示之這些結果表明在Protein A樹脂洗提十種曲妥珠單抗衍生的半胱胺酸變異體後都檢測到可接受位準之高分子量(HMW)聚集物種，及此不理想的HMW物種可使用粒徑排阻層析術移除。另外，該數據表明建構之半胱胺酸殘基的存在不改變人IgG1恆定區中的Protein A結合位點。
Figure 105138129-A0202-12-0093-30
實施例3：曲妥珠單抗衍生的抗體之完整性
進行該建構之半胱胺酸與轉麩醯胺酸酶變異體的分子評估來評估相對於曲妥珠單抗野生型抗體之關鍵生物物理學性質，以保證該變異體會適合於標準抗體製造平台製 程。
A. 半胱胺酸突變體
為測定經純化之透過安定的CHO表現所製得之建構的半胱胺酸抗體變異體製劑之完整性，使用非還原毛細管凝膠電泳術(Caliper LabChip GXII：Perkin Elmer Waltham,MA)求出峰的純度。結果顯示建構之半胱胺酸抗體變異體T(kK183C+K290C)與T(K290C+K334C)含有低位準的片段與高分子量物種(HMMS)，類似於曲妥珠單抗野生型抗體。反之，T(K334C+K392C)含有相對於所評估的其他雙建構之半胱胺酸變異體而言高位準的片段抗體峰(表6)。這些結果表明建構之半胱胺酸的特異組合物能影響用於位點專一接合之抗體的完整性。
Figure 105138129-A0202-12-0094-31
實施例4：藥物(payload)藥物(drug)化合物之產生
根據PCT Publication WO2013/072813(將其全部內容併入本案)中所述之方法製得奧立他汀藥物化合物0101、0131、8261、6121、8254與6780。在公開的申請案中，利用表7中所示的編號系統來標示該奧立他汀化合物。
Figure 105138129-A0202-12-0095-32
根據PCT Publication WO2013/072813，根據以下步驟製得藥物化合物0101。
Figure 105138129-A0202-12-0095-33
步驟1. 合成N-[(9H-茀-9-基甲氧基)羰基]-2-甲基丙胺醯基-N-[(3R,4S,5S)-3-甲氧基-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-甲氧基-2-甲基-3-側氧基-3-{[(1S)-2-苯基-1-(1,3-噻唑-2-基)乙基]胺基}丙基]吡咯啶-1-基}-5-甲基-1-側氧基庚-4-基]-N-甲基-L-纈胺醯胺。根據通用步驟D，由#32(2.05g,2.83mmol,1eq.)與二氯甲烷(2.05mL,0.1M)和N,N-二甲基甲醯胺(3mL)溶液、胺#19(2.5g,3.4mmol,1.2eq.)、HATU(1.29g,3.38mmol,1.2eq.)與三乙胺(1.57mL,11.3mmol,4eq.)合成粗製所欲材料，利用矽膠層析純化(溶劑梯度：0%至55%丙酮之庚烷溶液)，產生固體狀#53(2.42 g,74%)。LC-MS：m/z 965.7[M+H+],987.6[M+Na+]，滯留時間=1.04分鐘；HPLC(Protocol A)：m/z 965.4[M+H+],滯留時間=11.344分鐘(純度>97%)；1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )，被推定為旋轉異構物之混合物，特性信號：δ 7.86-7.91(m,2H),[7.77(d,J=3.3Hz)與7.79(d,J=3.2Hz)，總共1H],7.67-7.74(m,2H),[7.63(d,J=3.2Hz)與7.65(d,J=3.2Hz)，總共1H],7.38-7.44(m,2H),7.30-7.36(m,2H),7.11-7.30(m,5H),[5.39(ddd,J=11.4,8.4,4.1Hz)與5.52(ddd,J=11.7,8.8,4.2Hz)，總共1H],[4.49(dd,J=8.6,7.6Hz)與4.59(dd,J=8.6,6.8Hz)，總共1H],3.13,3.17,3.18與3.24(4s，總共6H),2.90與3.00(2 br s，總共3H),1.31與1.36(2 br s，總共6H),[1.05(d,J=6.7Hz)與1.09(d,J=6.7Hz)，總共3H]。
步驟2. 合成2-甲基丙胺醯基-N-[(3R,4S,5S)-3-甲氧基-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-甲氧基-2-甲基-3-側氧基-3-{[(1S)-2-苯基-1-(1,3-噻唑-2-基)乙基]胺基}丙基]吡咯啶-1-基}-5-甲基-1-側氧基庚-4-基]-N-甲基-L-纈胺醯胺(#54或0101)。根據通用步驟A，由#53(701mg,0.726mmol)與二氯甲烷(10mL,0.07M)合成粗製所欲材料，利用矽膠層析純化(溶劑梯度：0%至10%甲醇之二氯甲烷溶液)。用二乙醚與庚烷稀釋殘留物，以真空濃縮，產生白色固體狀#54(或0101)(406mg,75%)。LC-MS：m/z 743.6[M+H+],滯留時間=0.70分鐘；HPLC(Protocol A)：m/z 743.4[M+H+]，滯留時間=6.903分鐘，(純度>97%)；1H NMR(400 MHz,DMSO-d 6 )，被推定為旋轉異構物之混合物，特性信號：δ[8.64(br d,J=8.5Hz)與8.86(br d,J=8.7Hz)，總共1H],[8.04(br d,J=9.3Hz)與8.08(br d,J=9.3Hz)，總共1H],[7.77(d,J=3.3Hz)與7.80(d,J=3.2Hz)，總共1H],[7.63(d,J=3.3Hz與7.66(d,J=3.2Hz)，總共1H],7.13-7.31(m,5H),[5.39(ddd,J=11,8.5,4Hz)與5.53(ddd,J=12,9,4Hz)，總共1H],[4.49(dd,J=9,8Hz)與4.60(dd,J=9,7Hz)，總共1H],3.16,3.20,3.21與3.25(4s,總共6H),2.93與3.02(2 br s，總共3H),1.21(s,3H),1.13與1.13(2s，總共3H),[1.05(d,J=6.7Hz)與1.10(d,J=6.7Hz)，總共3H],0.73-0.80(m,3H)。
根據PCT Publication WO 2013/072813中所揭示之方法自製藥物化合物MMAD、MMAE與MMAF。
透過美國專利第5,208,020號中概述之步驟由購得的美登醇(maytansinol)自製藥物化合物DM-1。
實施例5：曲妥珠單抗衍生之抗體的生物接合
將本發明之曲妥珠單抗衍生的抗體透過連接子接合至藥物以產生ADC。所用之接合法是位點專一接合法(即，透過特定半胱胺酸殘基或特定麩醯胺酸殘基)或慣行接合法。
A. 半胱胺酸位點專一方法
透過下述半胱胺酸位點專一方法來接合表8之 ADC。
Figure 105138129-A0202-12-0098-34
將500mM參(2-羧乙)膦鹽酸鹽(TCEP)溶液(50至100莫耳當量)加到抗體(5mg)中，使得在含有20mM EDTA之PBS中的最終抗體濃度為5至15mg/mL。使反應物在37℃下靜置2.5小時，使用凝膠過濾管柱(PD-10脫鹽管柱，GE Healthcare)把抗體之緩衝液交換成含有5mM EDTA的PBS。用新製50mM的DHA之1：1 PBS/EtOH溶液(最終DHA濃度=1mM至4mM)處理所產生之在含有5mM EDTA的PBS中之抗體(5至10mg/mL)並且使混合物在4℃下靜置過夜。
把該抗體/DHA混合物之緩衝液交換成含有5mM EDTA的PBS(用磷酸把平衡緩衝液之pH調整成~7.0)及用50kD MW截止自旋濃縮裝置來濃縮。用5至7莫耳當量的10mM之順丁烯二醯亞胺藥物的DMA溶液處理所產生之在含有5mM EDTA的PBS中之抗體(抗體濃度~5至10mg/mL)。靜置1.5至2.5小時後，將材料之緩衝液交換(PD-10)。利用SEC純化(根據需要)以移除任何聚集的材料且保留游離藥物。
B. 轉麩醯胺酸酶位點專一方法
透過下述轉麩醯胺酸酶位點專一方法來接合表9之ADC。
Figure 105138129-A0202-12-0099-35
在轉醯胺基反應中，在抗體中的麩醯胺酸具有醯基供體作用，而含有胺之化合物具有醯基受體(胺供體)作用。將濃度33μM的經純化之HER2抗體在2%(w/v)茂原鏈輪絲菌轉麩醯胺酸酶(ACTIVATM,Ajinomoto,Japan)與150-mM氯化鈉和Tris HCl緩衝液(pH範圍7.5至8)和0.31mMe還原型谷胱甘肽(除非指明)存在下，培養於10至25M過量之醯基受體(範圍在33至83.3μM間的AcLysvc-0101)中。針對個別醯基供體來調整反應條件，其中T(LCQ05+K222R)在pH 8.0與無還原型谷胱甘肽下培養於10M過量之醯基受體中，T(N297Q+K222R)與T(N297Q)在pH 7.5下培養於20M過量的醯基受體中，和T(N297A+K222R+LCQ05)在pH 7.5下培養於25M過量之醯基受體中。在37℃下培養16至20個小時後，把抗體在MabSelect SuReÔ resin或Butyl Sepharose High Performance(GE Healthcare,Piscataway,NJ)上用該領域之習知技藝者熟悉的標準層析方法純化，該標準層析方法例如來自GE Healthcare的商用親和層析術與疏水性交互作用層析術。
C. 慣行接合方法
透過下述慣行接合方法來接合表10與11之ADC。
Figure 105138129-A0202-12-0100-36
Figure 105138129-A0202-12-0100-37
將抗體透析到Dulbecco氏磷酸鹽緩衝鹽水(DPBS,Lonza)中。把經透析之抗體用含有5mM乙二胺四乙酸(2,2’,2”,2'''-(ethane-1,2-diyldinitrilo)tetraacetic acid)(EDTA)的PBS(pH 7)稀釋成15mg/mL。用2至3當量之參(2-羧乙)膦鹽酸鹽(TCEP，5mM之蒸餾水溶液)處理所產生的抗體並且在37℃下靜置1至2個小時。在冷卻至室溫後立即加入二甲基乙醯胺(DMA)到10%(v/v)總有機物。將混合物用8至10當量的適當連接子-藥物處理成為10mM之以DMA為溶劑的母液。使反應在室溫下靜置1至2個小時，然後使用GE Healthcare Sephadex G-25 M緩衝液交換管柱根據製造商指示把緩衝液交換成DPBS(pH 7.4)。
利用粒徑排阻層析術(SEC)使用GE AKTA Explorer系統(具有GE Superdex200管柱與PBS(pH 7.4)洗提液)來純 化保持閉環的材料(表10之ADC)。把最終樣品濃縮成~5mg/mL蛋白質，用過濾方法滅菌，及用下文概述的質譜分析條件來檢驗載藥。
立即使用超過濾裝置(50kD MW截止)把用於丁二醯亞胺環水解的材料(表11之ADC)的緩衝液交換成50mM硼酸鹽緩衝液(pH 9.2)。將所產生之溶液加熱到45℃維持48個小時。冷卻所產生之溶液，把緩衝液交換成PBS，及利用SEC(如下所述)純化，以移除任何聚集的材料。將最終樣品濃縮成~5mg/mL蛋白質，用過濾方法滅菌，及用下文概述的質譜分析條件來檢驗載藥。
D. T-DM1接合方法
曲妥珠單抗-類美登素共軛體(T-DM1)結構類似於曲妥珠單抗emtansine(Kadcyla®)。T-DM1由透過雙官能性連接子4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸硫代丁二醯亞胺基酯(sulfo-SMCC)與DM1類美登素共價鍵結的曲妥珠單抗抗體組成。首先在25℃下於50mM磷酸鉀，2mM EDTA，pH 6.8，在10：1反應化學計量下，把sulfo-SMCC接合至抗體上的游離胺1個小時，然後從經接合之
抗體中把未結合的連接子脫鹽。然後在25℃下於50mM磷酸鉀，50mM NaCl，2mM EDTA，pH 6.8，在10：1反應化學計量下，把此抗體-MCC中間物接合至該MCC連接子抗體上的游離順丁烯二醯亞胺基末端之DM1硫化物。然後用L-半胱胺酸將剩餘的未反應之順丁烯二醯亞 胺封端，及透過Superdex200管柱把ADC分級以除去非單體物種(Chari et al.,1992,Cancer Res 52：127-31)。
實施例6：ADC之純化
一般使用下述粒徑排阻層析術(SEC)來將ADC純化及特性分析。使用各式各樣方法來測定到指定接合位點上的載藥，該方法包括如下文更完全地描述之質譜分析(MS)、逆相HPLC、與疏水性交互作用層析術(HIC)。這三種分析方法之組合提供各式各樣證實與定量到抗體上的載藥量之方式，藉此精確測定各共軛體的DAR。
A. 製備型SEC
一般使用SEC層析術來純化ADC以移除蛋白質聚集體及移除反應混合物中剩下的微量藥物-連接子，該SEC層析術使用Akta Explorer FPLC系統與Waters Superdex200 10/300GL管柱。有時ADC在SEC純化前並沒有聚集體與小分子，因此不進行製備級SEC。所用之洗提液是流率1mL/分鐘的PBS。在這些條件下，從非聚集材料(在室溫下洗提約15分鐘)容易地分離出聚集材料(在室溫下洗提約10分鐘)。疏水性藥物-連接子組合物常導致SEC峰「右偏移」。在不希望受任何特定理論所束縛情況下，此SEC峰偏移可能由於該連接子-藥物與固定相的疏水性交互作用。在某些情況下，此右偏移使經接合之蛋白質得以從未接合的蛋白質部分地析出。
B. 分析型SEC
在Agilent 1100 HPLC上使用PBS作為洗提液進行分析型SEC以評估ADC之純度與單體狀態。在220與280nm下偵測洗提液。當管柱為TSKGel G3000SW管柱(7.8x300mm，型號R874803P)時，所用之移動相為流率0.9mL/分鐘與洗提30分鐘的PBS。當管柱為BiosepSEC3000管柱(7.8x300mm)時，所用之移動相為流率1.0mL/分鐘與洗提25分鐘的PBS。
實施例7：ADC之特性分析
A. 質譜分析(MS)
將約20μl的樣品(約1mg/ml的ADC之PBS溶液)與20μl的20mM二硫蘇糖醇(DTT)混合來製得用於LCMS分析之樣品。把混合物在室溫下靜置5分鐘，然後將樣品注入安裝Agilent Poroshell 300SB-C8(2.1x75mm)管柱的Agilent 110 HPLC系統中。把系統溫度設定於60℃。使用從20%至45%丙酮之水溶液(具有0.1%甲酸改質劑)梯度洗提5分鐘。利用UV(220nM)與Waters Micromass ZQ質譜儀(電噴霧電離；錐電壓：20V；離子源溫度：120℃；去溶劑化溫度：350℃)來偵測洗提液。使用MaxEnt1 within MassLynx 4.1套裝軟體根據製造商指示來反褶積含有多電荷物種的原質譜。
B. 每一抗體載藥量之MS測定
製造ADC之抗體的總載藥量稱為藥物對抗體比或DAR。計算出每一所製得之ADC的DAR(表12)。
將整個洗提窗域(通常5分鐘)的質譜合併到單一總質譜(即代表整個樣品的MS的質譜)中。把ADC樣品的MS結果直接和對應的相同無載藥對照組抗體的MS作比較。這能識別載藥/無載藥重鏈(HC)峰及載藥/無載藥輕鏈(LC)峰。可使用各種峰的比率來建立以下列方程式(方程式1)為基礎的載藥量。
進行下列計算來建立DAR：方程式1：載藥量=2*[LC1/(LC1+LC0)]+2*[HC1/(HC0+HC1+HC2)]+4*[HC2/(HC0+HC1+HC2)]
其中指示變數是下列的相對豐富度：LC0=無載藥輕鏈，LC1=單載藥輕鏈，HC0=無載藥重鏈，HC1=單載藥重鏈，及HC2=雙載藥重鏈。該領域之具有普通技能者可理解本發明包含此計算放大到包含更高載藥物種(例如LC2、LC3、HC3、HC4、HC5等)。
下列方程式2被用於估計到建構之半胱胺酸殘基上的載藥量。對建構之Fc突變體而言，到輕鏈(LC)上的載藥量藉由定義被認為是非專一性載藥量。此外，假設僅LC有載藥是HC-LC二硫鍵非故意還原之結果(即該抗體被「過度還原」)。已知把大量過量的順丁烯二醯亞胺用於共軛反應(通常對單突變體而言是約5當量及對雙突變體 而言是約10當量)，假設到輕鏈上的任何非專一性載藥量伴有對應量之到重鏈上的任何非專一性載藥量(即另「一半」之斷裂的HC-LC二硫鍵)。基於這些假設，使用下列方程式(方程式2)來估計到蛋白質上的非專一性載藥量：方程式2：非專一性載藥量=4*[LC1/(LC1+LC0)]
其中指示變數是下列的相對豐富度：LC0=無載藥輕鏈，LC1=單載藥輕鏈。
Figure 105138129-A0202-12-0106-38
C. 用FabRICATOR®蛋白質水解來建立載藥之位點
對半胱胺酸突變之ADC而言，到抗體上的親電子藥 物之任何非專一性載藥量被推定發生在「鏈間」，也稱為「內部」半胱胺酸殘基(即，其典型上是HC-HC或HC-LC二硫鍵之一部分)。為了區別到Fc區中的建構之半胱胺酸上的載親電子劑量對到內部半胱胺酸殘基(典型上另外形成在HC-HC或HC-LC間之S-S鍵)上的載親電子劑量，用已知把抗體之Fab區與Fc區間切斷的蛋白酶來處理共軛體。一種這樣之蛋白酶是半胱胺酸蛋白酶IdeS，作為「FabRICATOR®」由Genovis銷售，及其說明參見von Pawel-Rammingen et al.,2002,EMBO J.21：1607。
簡單地說，按照製造商建議之條件，用FabRICATOR®蛋白酶處理ADC，及把樣品在37℃下培養30分鐘。將約20μl的樣品(在PBS中約1mg/ml)與20μl的20mM二硫蘇糖醇(DTT)混合來製得用於LCMS分析之樣品，及把混合物在室溫下靜置5分鐘。這樣處理人IgG1產生三種抗體片段，大小全都是在約23至26kD範圍內：LC片段，其包含典型地形成LC-HC鏈間二硫鍵之內部半胱胺酸；N末端的HC片段，其包含三個內部半胱胺酸(其中一個典型地形成LC-HC二硫鍵，而其餘二個半胱胺酸在抗體之絞鏈區中發現且典型地形成在抗體的二重鏈間的HC-HC二硫鍵)；和C末端之HC片段，其不含由本發明中所揭示之構建體中的突變導入的以外之反應性半胱胺酸。如上所述利用MS來分析樣品。以和上述相同的方式進行載藥量計算以定量LC、N末端之HC、與C末端的HC之載藥量。在C末端的HC上的載藥量被認為是 「專一性」載藥量，而在LC與N末端之HC上的載藥量被認為是「非專一性」載藥量。
D. 逆相HPLC分析
將約20μl的樣品(在PBS中約1mg/ml)與20μl的20mM二硫蘇糖醇(DTT)混合來製得用於逆相HPLC分析之樣品。把混合物在室溫下靜置5分鐘，然後將樣品注入安裝Agilent Poroshell 300SB-C8(2.1x75mm)管柱的Agilent 1100 HPLC系統中。把系統溫度設定於60℃，利用UV(220nM與280nM)來偵測洗提液。使用從20%至45%丙酮之水溶液(具有0.1%TFA改質劑)梯度洗提20分鐘：T=0分鐘：25%丙酮；T=2分鐘：25%丙酮；T=19分鐘：45%丙酮；及T=20分鐘：25%丙酮。使用這些條件把抗體的HC與LC基線分離。此分析結果指示LC仍有大量未被修飾(除含有T(kK183C)與T(LCQ05)的抗體外)，而HC被修飾(數據未顯示)。
E. 疏水性交互作用層析(HIC)
將樣品用PBS稀釋成約1mg/ml來製得用於HIC分析之化合物。自動注射15μl到具TSK-GEL Butyl NPR管柱(4.6 x 3.5mm，2.5μm孔徑；Tosoh Biosciences part #14947)的Agilent 1200 HPLC上來分析樣品。該系統包括具恆溫裝置、管柱加熱器與UV檢測器之自動取樣器。
按照下列來使用梯度洗提法：
移動相A：1.5M硫酸銨、50mM磷酸氫二鉀(pH 7)；移動相B：20%異丙醇、50mM磷酸氫二鉀(pH 7)；T=0分鐘，100% A；T=12分鐘，0% A。
滯留時間參見表13。選定譜參見圖2A至2E。使用位點專一接合(T(kK183C+K290C)-vc0101、T(K334C+K392C)-vc0101與T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101)的ADC(圖1A至1C)顯示一個主峰，而使用慣行接合(T-vc0101與T-DM1)的ADC(圖2D至2E)顯示差別載藥之共軛體的混合物。
Figure 105138129-A0202-12-0110-40
F. 熱安定性
使用微差掃描熱量分析(DCS)來測定建構之半胱胺酸與轉麩醯胺酸酶抗體變異體、及對應的Aur-06380101位點專一性共軛體之熱安定性。對此分析法而言，將在PBS-CMF(pH 7.2)中配製的樣品分配到具Autosampler(GE Healthcare Bio-Sciences,Piscataway,NJ)之MicroCal VP- Capillary DSC的樣品盤中，在5℃下平衡5分鐘，然後在100℃/小時速率下掃描到110℃為止。選定16秒之過濾週期。把原數據作基線校正，及將蛋白質濃度標準化。使用Origin Software 7.0(OriginLab Corporation,Northampton,MA)用合適的轉變數把數據擬合MN2-State Model。
全部單與雙半胱胺酸建構之抗體變異體、及含有建構之LCQ05醯基供體麩醯胺酸的標籤之抗體顯出出色的熱安定性，如由第一熔化轉變(Tm1)>65℃測得(表14)。
使用位點專一接合方法接合至0101之曲妥珠單抗衍生的單株抗體也被評估且表明也具有優秀熱安定性(表15)。然而，T(K392C+L443C)-vc0101 ADC的Tm1最受到藥物接合之影響，由於其相對於未接合的抗體是-4.35℃。
將這些結果合在一起顯示建構之半胱胺酸的抗體變異體與含有醯基供體麩醯胺酸之標籤的抗體變異體皆是熱安定的，及顯示透過vc連接子之0101位點專一接合產生具有出色熱安定性的共軛體。此外，觀測到T(K392C+L443C)-vc0101比未接合之抗體更低的熱安定性指示透過vc連接子把0101接合至建構之半胱胺酸殘基的某些組合物能對ADC之安定性產生影響。
Figure 105138129-A0202-12-0112-41
Figure 105138129-A0202-12-0112-42
實施例8：結合至HER2之ADC
A. 直接結合
使BT474細胞(HTB-20)受胰蛋白酶作用，離心而甩 到底部及在新培樣基中再懸浮。然後將該細胞在4℃下培養於ADC或未接合之曲妥珠單抗的起始濃度1μg/ml之一連串梯度稀釋液中1個小時。然後把該細胞用冰冷PBS清洗2次，及培養於抗人Alexafluor 488二級抗體(Cat# A-11013,Life technologies)中30分鐘。然後把該細胞清洗2次及然後在PBS中再懸浮。使用Accuri流式細胞儀(BD Biosciences San Jose,CA)讀取平均螢光強度。
Figure 105138129-A0202-12-0113-43
如圖3A與表16中所示，在直接結合上，ADC T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101、T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101、T(kK183C+K290C)-vc0101、T(kK183C+K392C)-vc0101、T(K290C+K392C)-vc0101具有和T-DM1與曲妥珠單抗類似的親和力。這指示修飾本發明之ADC中的抗體及加入連接子-藥物不顯著地影響結合。
B. 利用FACS競爭性結合
使BT474細胞受胰蛋白酶作用，離心而甩到底部及在新培樣基中再懸浮。然後將該細胞在4℃下培養於ADC或未接合之曲妥珠單抗和1μg/mL的曲妥珠單抗-PE(1：1 PE標記之曲妥珠單抗，向eBiosciences(San Diego,CA)訂製)的一連串梯度稀釋液中1個小時。然後把該細胞清洗2次及然後在PBS中再懸浮。使用Accuri流式細胞儀(BD Biosciences San Jose,CA)讀取平均螢光強度。
如圖3B中所示，在競爭性結合至PE標記之曲妥珠單抗上，ADC T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101、T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101、T(kK183C+K290C)-vc0101、T(kK183C+K392C)-vc0101、T(K290C+K392C)-vc0101具有和T-DM1與曲妥珠單抗類似的親和力。這指示修飾本發明之ADC中的抗體及加入連接子-藥物不顯著地影響結合。
實施例9：結合至人FcR n之ADC
A. 直接結合
該領域中相信FcRn以pH依賴性方式與IgG(不拘亞型)相互作用及藉由阻止抗體進入使抗體降解之溶酶體區而保護抗體免於降解。因此，考慮選擇反應性半胱胺酸導入野生型IgG-Fc區中的位點是為了避免改變FcRn結合性質與包含建構之半胱胺酸的抗體之半衰期。
進行BIAcore®分析來測定曲妥珠單抗衍生的單株抗體及其個別ADC結合至人FcRn之穩態親和力(KD)。 BIAcore®技術利用在曲妥珠單抗衍生的單株抗體或其個別ADC結合至被固定在感測器表面層上的人FcRn蛋白質後該表面層之折射率變化。利用從該表面折射的雷射光之表面電漿共振(SPR)來檢測結合。透過使用BirA試劑(Catalog #：BIRA500,Avidity,LLC,Aurora,Colorado)且被固定在鏈黴抗生物素蛋白(SA)感測器基片上的建構之Avi-標籤把人FcRn專一生物素化，使在感測器上的人FcRn蛋白質能均勻定位。接著，將各種濃度之曲妥珠單抗衍生的單株抗體或其個別ADC，或20mM MES(2-(N-嗎啉基)乙磺酸)(pH 6.0)與150mM NaCl、3mM EDTA(乙二胺四乙酸)、0.5% Surfactant P20(MES-EP)注射到基片表面上。在注射週期間使用HBS-EP+0.05% Surfactant P20(GE Healthcare,Piscataway,NJ)(pH 7.4)使該表面再生。測定曲妥珠單抗衍生之單株抗體或其個別ADC的穩態親和力，並將其與野生型曲妥珠單抗抗體(在IgG1 Fc區中不含半胱胺酸，無TGase建構之標籤或藥物的位點專一接合)作比較。
這些數據顯示建構之半胱胺酸殘基混入在本發明之指示位點上的IgG-Fc區不改變對FcRn之親和力(表17)。
Figure 105138129-A0202-12-0116-44
實施例10：結合至Fcγ受體之ADC
評估使用位點專一接合法之ADC對人Fcγ受體的結合以了解是否接合至藥物改變了能對抗體相關官能性(例如抗體依賴性之細胞媒介的細胞毒性(ADCC))產生影響之結合。FcγIIIa(CD16)在NK細胞及巨噬細胞上被表現，及其透過抗體結合與靶表現細胞的共同結合誘發ADCC。使用BIAcore®分析來測定曲妥珠單抗衍生之單株抗體及其個別ADC對Fc-γ受體IIa(CD32a)、IIb(CD32b)、IIIa(CD16)與FcγRI(CD64)的結合。
對此表面電漿共振(SPR)檢定而言，將重組人表皮生長因子受體2(Her2/neu)胞外功能域蛋白質(Sino Biological Inc.,Beijing,P.R.China)固定於CM5基片(GE Healthcare,Piscataway,NJ)上，及捕獲曲妥珠單抗衍生之單株抗體或其個別ADC的~300至400個反應單位(RU)。將T-DM1納入本評估中作為正控制組，由於其保留比得上未接合之曲妥珠單抗抗體的在接合至Fcγ受體後的結合性質。然後，在測定表面與結合期間注入各種濃度之Fcγ受體FcγIIa(CD32a)、FcγIIb(CD32b)、FcγIIIa(CD16a)與FcγRI(CD64)。
FcγRs IIa、IIb與IIIa顯出快速開/關速率，所以使感應圖譜擬合穩態模型而得到Kd值。FcγRI顯出較慢的開/關速率，所以使數據擬合動態模型而得到Kd值。
藥物接合至建構之第290與334位半胱胺酸和其未接合之對應抗體與T-DM1相比，顯出FcγR親和力中度喪 失，尤其是對CD16a、CD32a與CD64的親和力(表18)。然而，用T(K290C+K334C)-vc0101與T(K334C+K392C)-vc0101觀測到同步接合至第290、334與392位點導致對CD16a、CD32a與CD32b的親和力實質喪失，但未喪失對CD64之親和力(表18)。有趣地，T(kK183C+K290C)-vc0101顯出對此研究中所評估的一切FcγR之可比擬的結合，儘管包含在K290C位點之藥物(表18)。觀測到轉麩醯胺酸酶媒介的接合之T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101未結合至所評估的Fcγ受體中任一者，由於含有醯基供體麩醯胺酸之標籤的位置消除了N-糖基化。相反地，T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101保留完全結合至Fcγ受體，由於含有麩醯胺酸的標籤被建構於人κ輕鏈恆定區中。
綜合言之，這些結果表明接合的藥物之位置能影響ADC結合至FcγR，及可能影響共軛體的抗體官能性。
Figure 105138129-A0202-12-0119-45
實施例11：ADCC活性
在ADCC檢定中，將Her2表現性細胞株BT474與SKBR3作為靶細胞，而把NK-92細胞(來自50歲男性白種人的周邊血液單核球細胞衍生的介白素-2依賴型自然殺手細胞株，Conkwest)或人類周邊血液單核球(PBMC)(由從健康捐血人新抽的血單離，#179)作為效應細胞。
將1X104細胞/100μl/孔之靶細胞(BT474或SKBR3)放進96孔盤中，及在37℃/5%CO2下於RPMI1640培養基中培養過夜。次日，移除培養基及替換成60μl檢定緩衝液(含有10mM HEPES的RPMI1640培養基)、20μl之1 μg/ml抗體或ADC，然後在每一孔中加入20μl 1 X 105(對SKBR3而言)或5x105(對BT474而言)PBMC懸浮液或2.5 X 105 NK92細胞來達到50：1的效應細胞對靶細胞比(對BT474而言)或25：1(對用於PBMC的SKBR3而言)，10：1(對NK92而言)。所有樣品一式三份地進行。
將檢定盤在37℃/5%CO2下培養6個小時，然後平衡至室溫。使用CytoTox-OneTM試劑在560nm的激發波長及590nm的發射波長下測量細胞裂解釋出的LDH。就正控制組而言，在對照孔中加入8μL的Triton來產生最大LDH釋出。圖4中所示之比細胞毒性是用下式計算出：
Figure 105138129-A0202-12-0120-46
「試驗」對應於在上述條件中的一者之實測信號。
「自發效應」對應在PBMC單獨存在下之實測信號。
「自發靶」對應在靶細胞單獨存在下之實測信號。
「最大靶」對應在經洗滌劑溶解的靶細胞單獨存在下之實測信號。
圖4顯示曲妥珠單抗、T-DM1、與vc0101 ADC共軛體之實測ADCC活性。數據符合曲妥珠單抗與T-DM1被報告的ADCC活性。由於N297Q之突變體位於糖基化位點，T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101不會具有ADCC活性，這也在檢定中被確認。對單突變體(K183C、K290C、K334C、K392C，包括LCQ05)ADC而言，保留ADCC活 性。出乎意外地，對雙突變體(K183C+K290C,K183C+K392C,K183C+K334C K290C+K392C,K290C+K334C,K334C+K392C)ADC而言，全部保留ADCC活性，除二個和K334C位點有關的雙突變體ADC(K290C+K334C與K334C+K392C)外。
實施例12：體外細胞毒性檢定
按照實施例3中指示製得抗體藥物共軛體。將細胞在低密度下接種於96孔盤中，然後在後續日子用ADC與未接合之藥物一式二份地以10個濃度的3倍系列稀釋來處理。把細胞在加濕的37℃/5% CO2培養箱培養4日。將孔盤用CellTiter® 96 AQueous One MTS Solution(Promega,Madison,WI)培養1.5小時來收穫孔盤及在Victor plate reader(Perkin-Elmer,Waltham,MA)上於波長490nm下測量吸光度。
使用具XLfit的四參數邏輯模型(IDBS,Bridgewater,NJ)計算出IC50值及在圖5中被報告為nM藥物濃度和在圖6中被報告為ng/ml抗體濃度。IC50被顯示為在小括號中的獨立測定之數字+/-標準偏差。
和基準ADC、T-DM1(Kadcyla)相比，含有vc-0101或AcLysv-0101連接子-藥物之ADC高效對抗Her2陽性細胞模型及選擇性對抗Her2陰性細胞模型。
用位點專一接合至曲妥珠單抗所製得之ADC顯示對抗Her2細胞模型的高效力及選擇性。尤其，在中或低的 Her2表現性細胞模型中，幾種曲妥珠單抗-vc0101 ADC比T-DM1更有效。例如，在MDA-MB-175-VII細胞(具1+Her2表現)中T(kK183C+K290C)-vc0101之體外細胞毒性IC50是351ng/ml，比T-DM1的3626ng/ml的十分之一更低。對具2++位準之Her2表現的細胞(例如MDA-MB-361-DYT2細胞與MDA-MB-453細胞)而言，(kK183C+K290C)-vc0101之IC50是12至20ng/ml，T-DM1的IC50是38至40ng/ml。
實施例13：異種移植物模型
本發明之曲妥珠單抗衍生的ADC在下列中測試：N87胃癌異種移植物模型、37622肺癌異種移植物模型、與一些乳癌異種移植物模型(即，HCC 1954、JIMT-1、MDA-MB-361(DYT2)與144580(PDX)模型)。對下述之每一模型而言，在第1日給予第一劑。每週至少測量一次腫瘤及其體積用下式計算出：腫瘤體積(mm3)=0.5x(腫瘤寬度2)(腫瘤長度)。計算出每一治療組的平均腫瘤體積(±S.E.M.)，該治療組包括最多8至10隻與最少6至8隻的動物。
A. N87胃腺異種移植物
在免疫缺陷小鼠中測驗曲妥珠單抗衍生的ADC之效應，該免疫缺陷小鼠體內有由具有高位準HER2表現的N87細胞株(ATCC CRL-5822)建立之人腫瘤異種移植物生長。在母裸小鼠(Nu/Nu,Charles River Lab,Wilmington, MA)皮下植入7.5x106 N87細胞與50% Matrigel(BD Biosciences)來產生異種移植物。當腫瘤體積達到250至450mm3時，將腫瘤分期以保證在不同治療組中的腫瘤塊一致。N87胃腺模型接受每4日給一次藥，共給4次(Q4dx4)的靜脈內投予PBS媒劑、曲妥珠單抗ADC(在0.3、1與3mg/kg下)、或T-DM1(1、3與10mg/kg)(圖7)。
數據表明曲妥珠單抗衍生之ADC以劑量依賴性方式抑制N87胃腺異種移植物的生長(圖7A至7H)。
如圖7I中所示，在1與3mg/kg下的T-DM1使腫瘤生長延遲，而在10mg/kg下使腫瘤完全消退。然而，在1與3mg/kg下的T(kK183C+K290C)-vc0101使腫瘤完全消退，而在0.3mg/kg下使腫瘤一部分消退(圖7A)。數據顯示在此模型中，T(kK183C+K290C)-vc0101明顯比T-DM1更有效(~10倍)。
具DAR4之ADC的體內效力(圖7E、7F與7G)類似於183+290(圖7A)。此外，評估單突變體DAR2 ADC(圖7B、7C與7D)。一般而言，這些ADC比DAR4 ADC效力差但比T-DM1更有效。在DAR2 ADC中，以體內效力數據為基礎，LCQ05似乎是最有效的ADC。
B.HCC1954乳腺異種移植物
HCC1954(ATCC# CRL-2338)是一種高HER2表現性乳癌細胞株。在母SHO小鼠(Charles River,Wilmington, MA)皮下植入5x106 HCC1954細胞與50% Matrigel(BD Biosciences)來產生異種移植物。當腫瘤體積達到200至250mm3時，將腫瘤分期以保證在不同治療組中的腫瘤塊一致。HCC1954乳腺模型接受Q4dx4的靜脈內投予PBS媒劑、曲妥珠單抗衍生之ADC及負控制組ADC(圖8A至8E)。
數據表明曲妥珠單抗ADC以劑量依賴性方式抑制HCC1954乳腺異種移植物的生長。比較1mg/kg劑量，vc0101共軛體比T-DM1更有效。比較3mg/kg劑量，載荷DAR4之ADC(圖8B、8C與8D)比載荷DAR2之ADC(圖8A)更有效。此外，和媒劑對照組相比，在1mg/kg下的負控制組ADC對腫瘤生長影響很小(圖8D)。然而，T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101使腫瘤完全消退指示靶專一性。
C. JIMT-1乳腺異種移植物
JIMT-1是一種中/低Her2表現性乳癌細胞株且固有地對曲妥珠單抗有抗藥性。在母裸(Nu/Nu)小鼠皮下植入5x106 JIMT-1細胞(DSMZ# ACC-589)與50% Matrigel(BD Biosciences)來產生異種移植物。當腫瘤體積達到200至250mm3時，將腫瘤分期以保證在不同治療組中的腫瘤塊一致。JIMT-1乳腺模型接受Q4dx4的靜脈內投予PBS媒劑、T-DM1(圖9G)、使用位點專一接合的曲妥珠單抗衍生之ADC(圖9A至9E)、使用慣行接合的曲妥珠單抗衍生之 ADC(圖9F)、及負控制組huNeg-8.8 ADC。
數據表明被試驗之vc0101共軛體以劑量依賴性方式造成腫瘤減少。這些ADC在1mg/kg劑量下能造成腫瘤消退。然而，在此中/低Her2表現性乳癌模型中T-DM1無效，即使在6mg/kg下。
D. MDA-MB-361(DYT2)乳腺異種移植物
MDA-MB-361(DYT2)是一種中/低Her2表現性乳癌細胞株。在100 cGy/分鐘下對母裸(Nu/Nu)小鼠照射4分鐘，及在3日後在皮下植入1.0x107 MDA-MB-361(DYT2)細胞(ATCC# HTB-27)與50% Matrigel(BD Biosciences)來產生異種移植物。當腫瘤體積達到300至400mm3時，將腫瘤分期以保證在不同治療組中的腫瘤塊一致。
DYT2乳腺模型接受Q4dx4的靜脈內投予PBS媒劑、使用位點專一接合與慣行接合的曲妥珠單抗衍生之ADC、T-DM1、及負控制組ADC(圖10A至10D)。
數據表明曲妥珠單抗ADC以劑量依賴性方式抑制DYT2乳腺異種移植物的生長。儘管DYT2是中/低Her2表現性細胞株，然而對微管抑制劑比其他中/低Her2表現性細胞株更有感藥性。
E. 144580患者衍生之乳癌異種移植物
在免疫缺陷小鼠中測驗曲妥珠單抗衍生的ADC之效應，該免疫缺陷小鼠體內有由根據合適同意程序所得到的 新切除的144580乳腺腫瘤的片段建立的人腫瘤異種移植物生長。在採用新鮮活體組織切片時144580的腫瘤特性分析是三陰性(ER-、PR-、與HER2-)乳癌腫瘤。將144580患者衍生之乳癌異種移植物片段以從動物到動物方式植入母裸(Nu/Nu)小鼠皮下。當腫瘤體積達到150至300mm3時，將腫瘤分期以保證在不同治療組中的腫瘤塊一致。該144580乳腺模型接受每4日給一次藥，共給4次(Q4dx4)的靜脈內投予PBS媒劑、使用位點專一接合的曲妥珠單抗ADC、使用慣行接合的曲妥珠單抗衍生之ADC、及負控制組ADC(圖11A至11E)。
在此HER2-(由臨床定義)PDX模型中，T-DM1在全部試驗劑量(1、5、3與6mg/kg)下是無效的(圖11E)。對DAR4 vc0101 ADC(圖11A、11C與11D)而言，在3mg/kg下能造成腫瘤消退(在圖11C中甚至還在1mg/kg下)。在3mg/kg下，DAR2 vc0101 ADC(圖11B)比DAR4 ADC沒效。然而，在6mg/kg下，DAR 2 vc0101 ADC有效，不像T-DM1。
F.37622患者衍生之非小細胞肺癌異種移植物
在根據合適同意程序所得到的37622患者衍生之非小細胞肺癌異種移植物模型中試驗幾種ADC。將37622患者衍生之異種移植物片段以從動物到動物方式植入母裸(Nu/Nu)小鼠皮下。當腫瘤體積達到150至300mm3時，將腫瘤分期以保證在不同治療組中的腫瘤塊一致。該 37622 PDX模型接受每4日給一次藥，共給4次(Q4dx4)的靜脈內投予PBS媒劑、使用位點專一接合的曲妥珠單抗衍生之ADC、T-DM1、及負控制組ADC(圖12A至12D)。
Her2表現利用經修飾的Hercept試驗來特性分析及被歸類為2+，比在細胞株中看到的更不均勻。以連接子-藥物形式接合vc0101的ADC(圖12A至12C)在1 and 3mg/kg下有效造成腫瘤消退。然而，T-DM1僅在10mg/kg下提供某些治療效益(圖12D)。比較從10mg/kg(T-DM1)到1mg/kg(vc0101 ADC)，vc0101 ADC似乎比T-DM1夠有效了10倍。對異源性腫瘤來說，旁觀者效應可能對效力很重要。
G. GA0044患者衍生之胃癌異種移植物
在根據合適同意程序所得到的患者衍生之胃癌異種移植物模型(GA0044)中試驗曲妥珠單抗與抗HER2 ADC。將GA0044患者衍生之異種移植物片段以從動物到動物方式植入母裸(Nu/Nu)小鼠皮下。當腫瘤體積達到150至300mm3時，將腫瘤分期以保證在不同治療組中的腫瘤塊一致。該GA0044 PDX模型接受每4日給一次藥，共給4次(Q4dx4)的靜脈內投予PBS媒劑、曲妥珠單抗、T-DM1、或使用位點專一接合至vc0101的曲妥珠單抗衍生之ADC(圖30)。
在GA0044中HER2表現利用經修飾的Hercept試驗 來特性分析及被歸類為2+，具有不均勻的分布。以藥物形式接合vc0101(即T(kK183C+K290C)-vc0101)的ADC在1 and 3mg/kg劑量下有效且造成腫瘤完全消退。和經媒劑治療的腫瘤相比，曲妥珠單抗與T-DM1沒有在腫瘤生長上顯示明顯差異。在此具有異源性靶(即HER2)表現的腫瘤中，旁觀者效應可能對效力很重要。
H. 在N87胃腺異種移植物中T-vc0101 ADC之旁觀者效應的示範
T-DM1 ADC之釋出的代謝產物已經證實為經離胺酸封端之mcc-DM1連接子藥物(即Lys-mcc-DM1)，其為不可透膜的化合物(Kovtun et al.,2006,Cancer Res 66：3214-21；Xie et al.,2004,J Pharmacol Exp Ther 310：844)。然而，由T-vc0101 ADC釋出的代謝產物是奧立他汀0101，一種比Lys-mcc-DM1更可透膜之化合物。釋出的ADC藥物殺死附近細胞之能力就是旁觀者效應。由於可透膜藥物釋出，T-vc0101能引出強的旁觀者效應，而T-DM1不能。圖13顯示N87細胞株異種移植物腫瘤的免疫組織化學，該腫瘤接受單次劑量的在6mg/kg下的T-DM1(圖13A)或在3mg/kg下的T-vc0101(圖13B)，然後收穫及在甲醛中浸泡96個小時。將腫瘤切片進行染色，以人IgG為標記來檢測結合至腫瘤細胞的ADC，及以磷酸化組織蛋白H3(pHH3)為標記來檢測有絲分裂細胞，作為二種ADC之藥物的假定作用機制之讀出。
在二種情況下在腫瘤週邊檢出ADC。在經T-DM1治療之腫瘤(圖13A)中，pHH3陽性腫瘤細胞大多數位於ADC附近。然而，在經T-vc0101治療的腫瘤(圖13B)中，pHH3陽性腫瘤細胞大多數延伸到ADC位置以外及在腫瘤內部。這些數據表明具有可裂解之連接子與可透膜的藥物之ADC能引出強的體內旁觀者效應。
實施例14：體外T-DM1抗藥性模型
A. 體外T-DM1抗藥性細胞之產生
將N87細胞通入二個燒瓶中及每一燒瓶用相同抗藥性產生操作程序來處理使能產生生物複製品。把細胞暴露於5個週期之在約IC80濃度(10nM藥物濃度)下的T-DM1共軛體3日，接著在沒有處理下恢復約4至11日。在10nM之T-DM1共軛體下5個週期後，把細胞以相似方式暴露於另外6個週期的100nM之T-DM1。本步驟意圖模擬在典型地被用於臨床細胞毒性治療劑之最大耐受劑量下的長期且多週期(開/關)投藥，接著恢復期。由N87衍生之親代細胞稱為N87，而長期暴露於T-DM1的細胞稱為N87-TM。N87-TM細胞在4個月內發展出中至高位準之抗藥性。在~3至4個月的處理週期後，當持續暴露於藥物後抗藥性位準不再增加時，藥物選擇壓力消除。在之後的約3至6個月在所培養之細胞株中的反應與表現型保持穩定。後來，偶爾觀測到細胞毒性檢定所測得之抗藥性表現型的數量降低，在此種情況下，將先前經冷凍保存之T- DM1抗藥性細胞解凍用於另外的研究。所有被報告之特性分析都是在T-DM1選擇壓力消除至少2至8週後才進行以保證細胞穩定。在模型開發後約1至2年內從各種解凍之經冷凍保存的由單一選擇衍生之總體採集數據以保證結果的一致性。
選定胃癌細胞株N87用於對曲妥珠單抗-類美登素抗體藥物共軛體(T-DM1)之抗藥性研究，對個別細胞株在約IC80(~10nM藥物濃度)劑量下進行處理週期。親代N87細胞對該共軛體固有地具感藥性(IC50=1.7nM藥物濃度；62ng/ml抗體濃度)(圖14)。將二個親代N87細胞總體暴露於處理週期，及在只暴露於100nM之T-DM1下約4個月的週期後，和親代細胞相比，這二個總體(以後命名為N87-TM-1與N87-TM-2)的ADC難治性分別變成114倍與146倍(圖14與15A)。有趣地是觀測到對該對應之未接合的無類美登素之藥物DM1有極小的交叉抗藥性(~2.2-2.5X)(圖14)。
B. 細胞毒性研究
按照實施例3中指示製得ADC。未接合之美登素類似物(DM1)與奧立他汀類似物製造商為Pfizer Worldwide Medicinal Chemistry(Groton,CT)。其他標準照護化學治療劑購自Sigma(St.Louis,MO)。將細胞在低密度下接種於96孔盤中，然後在後續日子用ADC與未接合之藥物一式二份地以10個濃度的3倍系列稀釋來處理。把細胞在 加濕的37℃/5% CO2培養箱培養4日。將孔盤用CellTiter® 96 AQueous One MTS Solution(Promega,Madison,WI)培養1.5小時來收穫孔盤及在Victor plate reader(Perkin-Elmer,Waltham,MA)上於波長490nm下測量吸光度。使用具XLfit的四參數邏輯模型(IDBS,Bridgewater,NJ)計算出IC50值。
測得對其他曲妥珠單抗衍生之ADC的交叉抗藥性特性。觀測到對許多由用抗微管蛋白作用機制來輸送藥物之不可裂解的連接子組成之曲妥珠單抗衍生的ADC之顯著交叉抗藥性(圖14)。例如，在N87-TM對N87-親代細胞中，觀測到對T-mc8261(圖14與15B)與T-MalPeg8261(圖14)的效力降低>330倍及>272倍，其分別代表以奧立他汀為基礎之藥物透過不可裂解的順丁烯二醯亞胺基己醯基或Mal-PEG連接子連接至曲妥珠單抗。在對抗T-mcMalPegMMAD的N87-TM細胞中觀測到超過235倍之抗藥性，該抗T-mcMalPegMMAD N87-TM細胞是另一種具輸送單甲基尾海兔素(monomethyl dolastatin)(MMAD)的不同之不可裂解的連接子之曲妥珠單抗ADC(圖14)。
明顯地，觀測到當透過可裂解之連接子輸送時，N87-TM細胞株保留感藥性，即使這些藥物在功能上抑制類似的靶(即微管解聚合)。克服抗藥性之ADC實施例包括但不限於：T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101(圖14與圖15C)、T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101(圖14與圖15D)、T(K290C+K334C)-vc0101(圖10與圖11E)、T(K334C+ K392C)-vc0101(圖14與圖15F)及T(kK183C+K290C)-vc0101(圖14與圖15G)。這些代表輸送奧立他汀類似物0101的以曲妥珠單抗為基礎之ADC，但該藥物被vc連接子蛋白溶解性裂解而在細胞內釋出。
為了測定這些ADC抗藥性癌細胞是否大體上對其他療法具抗藥性，用一組具不同作用機制的標準照護化學治療劑來治療N87-TM細胞模型。通常，微管與DNA功能的小分子抑制劑保留有效對抗N87-TM抗藥性細胞株的能力(圖14)。儘管這些細胞被製成對輸送微管解聚合劑(美登素)類似物的ADC有抗藥性，仍然觀測到對幾種微管蛋白解聚合劑或聚合劑有最低的或沒有交叉抗藥性。相似地，二種細胞株保留對干擾DNA功能的藥劑有感藥性，該藥劑包括拓樸異構酶抑制劑、抗代謝藥、及烷基化劑/交聯劑。通常，N87-TM細胞不是大範圍的細胞毒性劑難治的，排除一般生長或與抗藥性極相似的細胞週期缺陷。
二個N87-TM總體也保留對對應未接合之藥物的感藥性(即DM1與0101；圖14)。因此，當時，N87-TM細胞是曲妥珠單抗-類美登素共軛體難治的，其顯出對透過不可裂解之連接子輸送的其他以微管為基礎之ADC的交叉抗藥性，但保留對未接合之微管抑制劑與其他化學治療劑的感藥性。
我們測得MDR1與MRP1藥物排出泵之蛋白質表現位準來求出在N87-TM細胞中的T-DM1抗藥性的分子機制。這是由於小分子微管蛋白抑制劑是MDR1與MRP1藥 物排出泵的已知基質(Thomas and Coley,2003,Cancer Control 10(2)：159-165)。我們測得來自親代N87與N87-TM抗藥性細胞之總溶胞產物的這二種蛋白質之蛋白質表現位準(圖16)。免疫墨點分析表明N87-TM抗藥性細胞不顯著地過度表現MDR1(圖16A)或MRP1(圖16B)蛋白質。綜合言之，這些數據和缺乏在N87-TM細胞中的藥物排出泵之已知基質(例如紫杉醇、多柔比星(doxorubicin))的交叉抗藥性表明藥物排出泵過度表現不是在N87-TM細胞中的T-DM1抗藥性之分子機制。
由於ADC之作用機制需要結合至特異抗原，抗原耗減或降低的抗體結合可能引起在N87-TM細胞中的T-DM1抗藥性。將來自親代N87與N87-TM抗藥性細胞之總溶胞產物的HER2蛋白質表現位準相比較來求出在N87-TM細胞中T-DM1的抗原是否已經顯著地耗減(圖17A)。免疫墨點分析表明和親代N87細胞相比，N87-TM細胞不具有顯著地降低之HER2蛋白質表現量。
我們測得結合至N87-TM細胞之細胞表面HER2抗原的抗體量。在使用螢光活化細胞分選法之細胞表面結合研究中，N87-TM細胞確實具有~50%減少的結合至細胞表面抗原之曲妥珠單抗(圖17B)。由於在癌細胞株中N87細胞是HER2蛋白質的高表現者(Fujimoto-Ouchi et al.,2007,Cancer Chemother Pharmacol 59(6)：795-805)，在這些細胞中HER2抗體結合降低~50%可能不代表在N87-TM細胞中的T-DM1抗藥性的主要機制。支持此解釋的證據是N87- TM抗藥性細胞保留對其他具不同連接子與藥物的HER2結合曲妥珠單抗衍生之ADC的感藥性(圖14)。
透過蛋白質體方法作出親代N87與N87-TM抗藥性細胞模型之特性以便大範圍識別可能引起T-DM1抗藥性的膜蛋白質表現位準變化，來以不偏差的方法求出T-DM1抗藥性之潛在機制。觀測到在二個細胞株模型間的523蛋白質表現位準之顯著變化(圖18A)。對被預測相對於N87細胞來說在N87-TM細胞中表現不足的蛋白質(IGF2R、LAMP1、CTSB)(圖18B)與過度表現蛋白質(CAV1)(圖18C)進行N87與N87-TM之總溶胞產物的免疫墨點分析，來證實這些被預測之蛋白質變化的選擇。在NSG小鼠皮下植入N87與N87-TM-2細胞來產生體內腫瘤，以評估在體內觀測到的蛋白質變化是否和在試管內看到的蛋白質變化極相似。和N87腫瘤相比，N87-TM-2腫瘤保留CAV1蛋白質之過度表現(圖18D)。儘管已預測在二個模型中在小鼠基質中的CAV1染色，然而上皮之CAV1染色僅在N87-TM-2模型看到。
C. 體內效力研究
將親代N87細胞與N87-TM-2細胞增殖及注入取自The Jackson Laboratory(Bar Harbor,ME)的母非肥胖糖尿病型重症聯合(NSG)免疫缺陷型小鼠(NOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1Wjl/SzJ)側腹來測定在細胞培養中觀測到之抗藥性是否在體內重演。把N87或N87-TM細胞懸浮液注入右 側腹皮下(每一注射有7.5x106細胞和50% Matrigel)。當腫瘤達到~0.3g(~250mm3)時，將小鼠隨機分派至研究組。在第0日靜脈內投予T-DM1共軛體或媒劑之鹽溶液及每4日給一次藥，共給4次(Q4Dx4)。每週一次測量腫瘤且將腫瘤塊計算為：體積=(寬度x寬度x長度)/2。進行事件發生時間分析(腫瘤倍增)及利用對數等級(Mantel-Cox)檢定來評估重要性。在這些研究中，在所有治療組中都沒觀測到小鼠體重減輕。
用下列藥劑治療小鼠：(1)媒劑對照組PBS；(2)在13mg/kg下，接著在4.5mg/kg下的曲妥珠單抗抗體；(3)在6mg/kg下之T-DM1；(4)在10mg/kg下的T-DM1；(5)在10mg/kg下之T-DM1，然後在3mg/kg下的T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101；(6)在3mg/kg下之T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101。偵測腫瘤大小及結果參見圖20。N87(圖19與圖20A)腫瘤及N87-TM-2(圖19與圖20B)腫瘤顯示類似於體外細胞毒性檢定中看到的ADC效力特性(圖19與圖20B)，其中N87-TM抗藥性細胞是T-DM1難治的，但仍對具可裂解之連接子的曲妥珠單抗衍生之ADC有反應。事實上，將T-DM1難治的且生長到約1克之腫瘤傳換成用T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101的療法且有效地消退(圖20B)。在此研究之事件發生時間分析中，在6與10mg/kg下的T-DM1在N87模型中在至少60日內防止>50%之小鼠腫瘤倍增，但T-DM1在N87-TM-2模型中卻不能做到(圖20C與圖20D)。投予在3mg/kg 下的T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101在研究期間內(~80日)防止在小鼠中N87與N87-TM腫瘤的任何腫瘤倍增(圖20C與圖20D)。
在另一個研究中，克服體外T-DM1抗藥性的所有具可裂解之連接子的ADC在此對T-DM1無反應的N87-TM2腫瘤模型中仍然有效(圖19與圖20E)。
然後評估T(kK183+K290C)-vc0101 ADC是否能抑制T-DM1難治之腫瘤的生長。儘管用媒劑或T-DM1治療之N87-TM腫瘤生長，然而在第14日轉換成T(kK183C+K290C)-vc0101療法的腫瘤立即消退(圖20F)。
實施例15：體內T-DM1抗藥性模型
A. 體內T-DM1抗藥性細胞之產生
一切動物研究都是由Pfizer Pearl River Institutional Animal Care and Use Committee根據明確指導方針而核准。把7.5x106 N87細胞和50% Matrigel(BD Biosciences)植入母裸小鼠皮下來產生異種移植物。當平均腫瘤體積達到~300mm3時，將小鼠隨機分派成二組：1)媒劑對照組(n=10)及2)T-DM1治療組(n=20)。在第0日靜脈內投予T-DM1 ADC(6.5mg/kg)或媒劑(PBS)之鹽溶液，然後每週投予6.5mg/kg到30週為止。每週二次或每週一次測量腫瘤且將腫瘤塊計算為：體積=(寬度x寬度x長度)/2。在這些研究中，在所有治療組中都沒觀測到小鼠體重減輕。
當個別腫瘤體積達到~600mm3(在隨機分派時的原本 大小加倍)時，小鼠被認為是T-DM1治療難治的或是在T-DM1治療後復發。和對照組相比，大多數腫瘤剛開始時對T-DM1治療有反應，如圖21A中所示。更具體地說，20隻小鼠中有17隻剛開始時對T-DM1治療有反應，但大量腫瘤(20隻中有13隻)在T-DM1治療後復發。隨時間過去，被植入之N87腫瘤細胞變成T-DM1抗藥性(圖21B)。收集剛開始時對T-DM1治療無反應的3顆腫瘤用於HER2表現測定，IHC指示HER2表現沒變化。其餘之10顆復發的腫瘤如下所述。
將4顆剛開始時對T-DM1治療有反應然後復發之腫瘤在第77日轉換成每週一次在2.6mg/kg下的T-vc0101治療(小鼠1與16)，在第91日轉換(小鼠19)，在第140日轉換(小鼠6)。如圖19 C中所示，體內產生之T-DM1抗藥性腫瘤對T-vc0101有反應指示後天性T-DM1抗藥性腫瘤對vc0101 ADC治療有感藥性。
另外3顆剛開始時對T-DM1治療有反應然後復發之腫瘤在第110日轉換成每週一次在2.6mg/kg下的T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101治療(小鼠4、13與18)。如圖21D中所示，體內產生之T-DM1抗藥性腫瘤對T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101有反應指示後天性T-DM1抗藥性腫瘤對vc0101 ADC治療有感藥性。進行後續試驗來評估T(kK183C+K290C)-vc0101，得到類似的結果指示體內產生之T-DM1抗藥性腫瘤對T(kK183C+K290C)-vc0101治療有感藥性，如圖21E中所示。
總而言之，一切具有後續治療之T-DM1難治性腫瘤都對vc0101 ADC治療有感藥性(7隻中有7隻)指示可以用可裂解的vc0101共軛體治療體內產生之T-DM1抗藥性腫瘤。
將另外3顆剛開始時對T-DM1治療有反應然後復發之腫瘤(小鼠7、17與2，如圖21B中所示)切除用於體外特性分析。該被切除的腫瘤在體外培養2至5個月後，對這些細胞評估T-DM1抗藥性及進行體外特性分析(見以下的本實施例的B與C節)。
B. 細胞毒性研究
將在T-DM1治療後復發且經體外培養之細胞(如本實施例的A節中所述)接種於96孔盤中及在後續日子用ADC或未接合之藥物以4倍系列稀釋來處理。把細胞在加濕的37℃/5%CO2培養箱培養96個小時。把CellTiter Glo Solution(Promega,Madison,WI)加到該盤中及在Victor plate reader(Perkin-Elmer,Waltham,MA)上於波長490nm下測量吸光度。使用具XLfit的四參數邏輯模型(IDBS,Bridgewater,NJ)計算出IC50值。
細胞毒性篩選結果匯總於表19與20中。該細胞和親代相比較時具有T-DM1抗藥性(圖22A)，但對可裂解的vc0101共軛體T-vc0101(數據未顯示)、T(kK183C+K290C)-vc0101(圖22B)、T(LCQ05+K222R)-AcLysvc0101(圖22C)、T(N297Q+K222R)-AcLysvc0101(圖22D)有感藥 性(表19)。出乎意外地，T-DM1抗藥性細胞對親代藥物DM1及0101藥物有感藥性(表20)。
Figure 105138129-A0202-12-0139-47
Figure 105138129-A0202-12-0139-48
C. 利用FACS與西方墨點法之Her2表現
對在T-DM1治療後復發且經體外培養之細胞(如本實施例的A節中所述)進行Her2表現特性分析。對FACS分析而言，使細胞受胰蛋白酶作用，離心而甩到底部及在新培樣基中再懸浮。然後將該細胞在4℃下培養於5μg/mL的曲妥珠單抗-PE(1：1 PE標記之曲妥珠單抗，向eBiosciences(San Diego,CA)訂製)中1個小時。然後把該細胞清洗2次及然後在PBS中再懸浮。使用Accuri流式 細胞儀(BD Biosciences San Jose,CA)讀取平均螢光強度。
對西方墨點法分析而言，把細胞在冰上使用RIPA lysis buffer(具蛋白酶抑制劑與磷酸酶抑制劑)來溶解15分鐘，然後在4℃下於微量離心機中在最大速度下渦漩震盪與甩到底部。採集上清液，加入4X樣品緩衝液與還原劑(標準化每一樣品中的總蛋白質)。將樣品在4至12%的Bis tris gel上運行及轉移到硝化纖維素薄膜上。把薄膜阻塞1個小時及在4℃下培養於HER2抗體(Cell Signalling,1：1000)中過夜。然後將薄膜在1X TBST中清洗3次及培養於抗-小鼠HRP抗體(Cell Signalling,1：5000)中1個小時及清洗3次和探測。
在T-DM1治療後復發之腫瘤的HER2表現位準類似於對照組腫瘤(無T-DM1治療)，評估方法係利用FACS(圖23A)及西方墨點法(圖23B)。
D. T-DM1抗樣性不是由於藥物排出泵
利用西方墨點法得知該細胞株不表現MDR1(圖24A)及該細胞對MDR-1基質游離藥物0101無抗藥性(圖24B)。觀測到對多柔比星無抗藥性(圖24C)指示抗藥機制不是透過MRP1。然而，該細胞對游離DM1仍有抗藥性(圖24D)。
實施例16：藥物動力學(PK)
在對馬來猴投予5或6mg/kg劑量之靜脈推注後測定 慣行的或位點專一性vc0101抗體藥物共軛體之暴露量。使用(LBA)配體結合分析測量總抗體(總Ab；接合之mAb與未接合之mAb的計量)與ADC(接合至至少一個藥物分子之mAb)濃度。在所有情況下，ADC是用vc0101製得，除T(LCQ05)是用AcLysvc0101製得外。使用慣行接合(非位點專一接合)由曲妥珠單抗製得ADC。
在對馬來猴投予總Ab與曲妥珠單抗ADC(T-vc0101)(5mg/kg)或T(kK183C+K290C)位點專一性ADC(6mg/kg)後之濃度對時間特性和藥物動力學/毒物動力學(圖25A與表21)。和慣行的共軛體相比，T(kK183C+K290C)位點專一性ADC之暴露量與安定性都增加。
在對馬來猴投予曲妥珠單抗(T-vc0101)(5mg/kg)或T(kK183C+K290C)、T(LCQ05)、T(K334C+K392C)、T(K290C+K334C)、T(K290C+K392C)與T(kK183C+K392C)位點專一性ADC(6mg/kg)後ADC被分析物的濃度對時間特性和藥物動力學/毒物動力學(圖25B與表21)。和使用慣行接合法之曲妥珠單抗ADC相比，幾種位點專一性ADC(T(LCQ05)、T(kK183C+K290C)、T(K290C+K392C)與T(kK183C+K392C))的暴露量更高。然而，其餘二種位點專一性ADC(T(K290C+K334C)與T(K334C+K392C))之暴露量沒比曲妥珠單抗ADC更高，這指示並非全部位點專一性ADC都具有優於使用慣行接合法所製得之曲妥珠單抗ADC的藥物動力學性質。
Figure 105138129-A0202-12-0142-49
實施例17：利用疏水性交互作用層析術的相對滯留值對大鼠中暴露量(AUC)。
疏水性是可以利用疏水性交互作用層析術(HIC)評估的蛋白質之物理性質，而蛋白質樣品的滯留時間根據其相對疏水性而不同。藉由計算相對滯留時間(RRT)可以將ADC與其個別抗體作比較，該相對滯留時間是ADC之HIC滯留時間除以個別抗體的HIC滯留時間之比值。高疏水性ADC具有較高的RRT，且高疏水性ADC也可能更具 有藥物動力學可靠度，尤其是較低之曲線下面積(AUC或暴露量)。當把具各種位點突變的ADC之HIC值和其在大鼠中的實測AUC相比較時，觀測到在圖26中的分布。
具RRT
Figure 105138129-A0202-12-0143-351
1.9之ADC顯示較低的AUC值，而具較低RRT之ADC傾向於具有較高的AUC，儘管不是直接的關係。觀測到ADCT(kK183C+K290C)-vc0101具有相對高之RRT(1.77的平均值)，因此預測具有相對低之AUC。出乎意外地，觀測到的ADC相對高，因此從疏水性數據不太能預測此ADC之暴露量。
實施例18：毒性研究
在二個獨立探究之毒性研究中，將公母共10隻的馬來猴分成5個劑量組(1/性別/劑量)及每3週IV投藥一次(第1、22與43個研究日)。在第46個研究日(第3次投藥後第3日)使馬來猴安樂死，及採集操作程序規定的血液與組織樣品。在生存時及驗屍後進行臨床觀測、臨床病理學、巨觀病理學與微觀病理學評估。對解剖病理學評估而言，以主觀的、相對的、研究專一性為基礎來記錄組織病理學發現之嚴重程度。
在3與5mg/kg下的馬來猴探究毒性研究中，在第一次投藥後第11日，T-vc0101引起短暫而明顯(390/μl)到嚴重(40/μl至不能檢測)之嗜中性白血球減少症。和在9mg/kg下相反，被投予T(kK183C+K290C)-vc0101的馬來猴都沒有嗜中性白血球減少症，在試驗之任何時間點都是 大於500/μl的良好嗜中性白血球計數(圖27)。事實上，和媒劑對照組相比，被投予T(kK183C+K290C)-vc0101之馬來猴在第11與14日顯示平均的嗜中性白血球計數(>1000/μL)。
在3與5mg/kg下的骨髓中，顯微鏡觀測到被投予T-vc0101之馬來猴具有化合物相關的增加之M/E比。增加的骨髓/類紅血球(M/E)比由減少的類紅血球前驅物和主要成熟顆粒球增加組成。相反地，在6與9mg/kg下，只有被投予6mg/kg的T(kK183C+K290C)-vc0101之公馬來猴具有最小至中度的增加之成熟顆粒球細胞構成(數據未顯示)。
因此，顯微鏡觀測之血液數據清楚地指示以位點專一性突變技術為基礎的ADC共軛體T(kK183C+K290C)-vc0101清楚地改進T-vc0101誘發的骨髓毒性與嗜中性白血球減少症。
實施例19：ADC晶體結構
得到T(K290C+K334C)-vc0101、T(K290C+K392C)-vc0101與T(K334C+K392C)-vc0101之晶體結構。選擇這些特定ADC作晶體照相術是由於接合至K290C+K334C與K334C+K392C雙半胱胺酸變異體，而不是K290C+K392C，徹底破壞ADCC活性。
使用木瓜酵素使ADC裂解來製得用於晶體照相術的經接合之Fc區。使用下列相同條件得到三個經接合之 IgG1-Fc區的相同型態的結晶：100mM檸檬酸鈉(pH 5.0)+100mM MgCl2+15% PEG 4K。
寄存於PDB中的野生型人IgG1-Fc結構相對地相似，表明CH2-CH2區透過經Asn297鍵聯之多糖(碳水化合物或多糖末端)彼此接觸，及表明CH3-CH3區形成在結構間相對固定的安定界面。Fc結構以「閉合」或「開放」構象存在及去糖基化之Fc結構採取「開放」結構構象從而表明該多糖末端把CH2區固定在一起。此外，未接合的Phe241Ala-IgG1 Fc突變體(Yu et al.“Engineering Hydrophobic Protein-Carbohydrate interactions to fine-tune monoclonal antibodies”.JACS 2013)被公開之結構顯示一個部份無序的CH2區，由於此突變體導致CH2-多糖界面與CH2-CH2界面不安定，乃因為芳香族Phe殘基不能使碳水化合物安定。
人IgG Fc區之「CH2」區(也稱為「Cγ2」區)通常從約第231位胺基酸延伸至約第340位胺基酸。該CH2區在與另一區不緊密配對方面是唯一的。相反，二個N-鍵聯之分支碳水化合物鏈置於完整天然IgG分子的二個CH2區間。推測該碳水化合物可能提供區-區配對之代替物及幫助使該CH2區安定(Burton et al.,1985,Molec.Immunol.22：161-206)。
「CH3區」包含C末端殘基延伸至Fc中的CH2區(即從約第341位胺基酸殘基到IgG之約第447位胺基酸殘基)。
T(K290C+K334C)-vc0101與T(K290C+K392C)-vc0101 Fc區之已解釋的結構相似，表明該Fc二聚體含有一個CH2與二個高度有序之CH3(像野生型Fc)。然而，其也含有附接多糖的無序之CH2(圖28A與圖28B)。一個CH2區的較高程度之去安定化乃歸因於接合位點緊密接近多糖末端。考慮到0101藥物幾何形狀，在K290、K334、K392位點中任一者上的接合能擾亂多糖從CH2界面離開之總體軌跡，使多糖與CH2結構自身去安定化，結果產生CH2-CH2界面(圖28C)。相對於WT-Fc、Phe241Ala-Fc或去糖基化的Fc，較高程度之不均勻性有助於這些0101位點專一接合雙半胱胺酸-Fc-變異體。當建構之半胱胺酸-變異體位點對應到WT-Fc與FcYR型IIb複合物的結構時，顯示在C334之接合可以直接干擾對FcYRIIb的結合(圖28C)。此由突變或接合引起之在CH2定位時的不均勻性可以導致FcRIIb結合明顯減少。因此，這些結果表明構象不均勻性或0101接合至在IgG1-Fc內的建構之半胱胺酸的某些組合物或可能二者，可以影響含有K334位點之雙半胱胺酸變異體的ADCC活性。
實施例20：不同接合位點導致不同的ADC性質
A. 用於合成半胱胺酸突變之ADC的通用步驟
混入一或多個建構之半胱胺酸殘基的曲妥珠單抗溶液(如表22中所示)是在50mM磷酸鹽緩衝液(pH 7.4)中製得。加入PBS、EDTA(0.5M原液)、與TCEP(0.5M原 液)，使得最終蛋白質濃度是10mg/mL，最終EDTA濃度是20mM，及最終TCEP濃度是約6.6mM(100莫耳當量)。使反應在室溫下靜置48個小時，然後使用GE PD-10 Sephadex G25管柱根據製造商指示把緩衝液交換成PBS。用50當量之脫氫抗壞血酸(在1：1 EtOH/水中的50mM原液)處理所產生之溶液。使抗體在4℃下靜置過夜，接著使用GE PD-10 Sephadex G25管柱根據製造商指示把緩衝液交換成PBS。對某些突變體使用上述步驟之輕微的變型。
將所製得之抗體在含有10%(v/v)DMA的PBS中稀釋成~2.5mg/mL，及用vc0101(10莫耳當量)處理成為在DMA中的10mM原液。在室溫下經過2小時後，把緩衝液交換成PBS(如上述)及利用粒徑排阻層析術在Superdex200管柱上純化。將單體餾份濃縮及用過濾方法滅菌，而產生最終ADC。參見下表22的產物特性分析。
Figure 105138129-A0202-12-0148-50
B. 用於接合實施例之通用分析方法
LCMS：管柱=Waters BEH300-C4,2.1 x 100mm(P/N=186004496)；儀器=Acquity UPLC(具SQD2質譜檢測器)；流率=0.7mL/min；溫度=80℃；緩衝液A=水+0.1%甲酸；緩衝液B=丙酮+0.1%甲酸。梯度：在2分鐘內從 3%B進行至95%B，在95%B下保持0.75分鐘，然後在3%B下再平衡。在即將注射前用TCEP或DTT把樣品還原。利用LCMS(400至2000道爾頓)偵測洗出液，及使用MaxEnt1把蛋白質峰反摺積。DAR為重量平均載藥量。
SEC：管柱=Superdex200(5/150 GL)；移動相：磷酸鹽緩衝液(含有2%丙酮)(pH 7.4)；流率=0.25mL/min；溫度=環境溫度；儀器=Agilent 1100 HPLC。
HIC：管柱=TSKGel Butyl NPR,4.6mm x 3.5cm(P/N=S0557-835)；緩衝液A=1.5M硫酸銨(含有10mM磷酸鹽)(pH 7)；緩衝液B=10mM磷酸鹽(pH 7)+20%異丙醇；流率=0.8mL/min；溫度=環境溫度；梯度=在12分鐘內從0%B進行至100%B，在100%B下保持2分鐘，然後在100%A下再平衡；儀器：Agilent 1100 HPLC。
C. 位點專一性vc0101共軛體之疏水性的測定
利用疏水性交互作用層析術(上述方法)評估表22之ADC，以測定各種共軛體的相對疏水性。ADC疏水性業已被報告和總抗體暴露量有關係。
和未修飾之抗體相比，第334、375、與392位點共軛體顯出最小的滯留時間偏移，而第421、443、與347位點共軛體顯出最大的滯留時間偏移。將ADC之滯留時間除以未修飾之抗體的滯留時間計算出各ADC之相對疏水性，從而求出「相對滯留時間」或「RRT」。~1的RRT指示ADC具有和未修飾之抗體大約相同的疏水性。
D. 位點專一性vc0101共軛體的ADC之血漿中安定性
將ADC樣品(~1.5mg/mL)在小鼠、大鼠或人血漿中稀釋而產生在血漿中50μg/mL ADC的最終溶液。把樣品在37℃下於5%CO2下培養，在三個時間點(0、24小時與72小時)採取等分樣品。將各時間點之來自血漿培養的ADC樣品(25μL)在37℃下用IgG0去糖基化1個小時。在去糖基化後，加入捕獲抗體(用於小鼠與大鼠血漿的1mg/mL生物素化之山羊抗人IgG1 Fcγ專一性片段，或用於人血漿的1mg/mL生物素化之抗曲妥珠單抗抗體)及在37℃下加熱混合物1個小時，接著在室溫下輕輕地攪拌1個小時。將Dynabead MyOne Streptavidin T1磁珠加到樣品中及在室溫下輕輕地攪拌下培育1個小時。然後用200μL PBS+0.05% Tween-20，200μL PBS與HPLC等級水清洗試樣板。用55μL之2%(v/v)甲酸(FA)洗提結合的ADC。把50μL之各等分樣品移到新板中，接著加入5μL的200mM TCEP。
用外加nanoAcquity UPLC(Waters)(使用BEH300 C4,1.7μm,0.3×100mm iKey管柱)之Xevo G2 Q-TOF質譜儀來進行完整蛋白質分析。移動相A(MPA)由0.1%(v/v)FA之水溶液組成，及移動相B(MPB)由0.1%(v/v)FA之丙酮溶液組成。使用從5%至90%的MPB之線性梯度在流率0.3μL/分鐘下洗提，在7分鐘內達到層析分離。把LC管柱溫度設定於85℃。用MassLynx software version 4.1 進行數據擷取。質量擷取範圍從700Da至2400Da。使用Biopharmalynx version 1.33進行包括反摺積的數據分析。
隨著時間偵測載藥與丁二醯亞胺開環(一個+18道爾頓峰)。載藥數據為和0小時DAR相比的%DAR喪失。開環數據為和在72小時時存在之全部物種相比的已開環物種的%。幾個位點突變體導致很安定之ADC(334C、421C、與443C)，而某些位點喪失大量的連接子-藥物(380C與114C)。開環率在位點間有相當大之不同。幾個位點(例如392C、183C、與334C)導致很少的開環，而其他位點(例如421C、388C、與347C)導致快速且自發之開環。
導致快速且自發之開環的位點可能可用於產生具有降低的疏水性與/或增加之PK暴露量的共軛體。此一發現和環之安定性與血漿中安定性相互關聯之普遍理解相反。因此在某些態樣中，當使用具高疏水性的連接子-藥物時在位點421C、388C、與347C中之一或多者上的接合會特別有優勢。在某些態樣中，高疏水性是1.5或更多之相對滯留時間(RRT)值(利用HIC測得)。在某些態樣中，高疏水性是1.7或更多的RRT值。在某些態樣中，高疏水性是1.8或更多之RRT值。在某些態樣中，高疏水性是1.9或更多的RRT值。在某些態樣中，高疏水性是2.0或更多之RRT值。
Figure 105138129-A0202-12-0152-51
E. 位點專一性vc0101共軛體之麩胱甘肽中安定性
將ADC樣品在麩胱甘肽水溶液中稀釋而產生在磷酸鹽緩衝液(pH 7.4)中0.5mM之最終GSH濃度與~0.1mg/mL的最終蛋白質濃度。然後把樣品在37℃下培養及在三個時間點取出等分來測定DAR(T-0、T-3日、T-6日)。將各時間點之等分樣品用TCEP處理及利用LC-MS根據實施例20.A中所述之方法來分析。
隨著時間偵測載藥與丁二醯亞胺開環(一個+18道爾頓峰)。載藥數據為和0小時DAR相比的%DAR喪失(表24)。開環數據為和在72小時時存在之全部物種相比之已開環物種的%。幾個位點突變體導致很安定之ADC (334C、421C、與443C)，而某些位點喪失大量的連接子-藥物(380C與114C)。開環率在位點間有相當大之不同。幾個位點(例如392C、183C、與334C)導致很少的開環，而其他位點(例如421C、388C、與347C)導致大量開環。此檢定之結果和血漿中安定性結果(實施例20.D)十分相互關聯表明特定位點(例如334、443、290、與392)可能特別地可用於透過硫醇媒介之早期解離而容易喪失的藥物-連接子的接合。這樣之藥物-連接子包括使用常見的mc與vc鍵聯(例如vc-101、vc-MMAE、mc-MMAF等)之藥物-連接子。
Figure 105138129-A0202-12-0153-52
F. 位點專一性vc0101共軛體之麩胱甘肽中安定性
由Charles River Laboratories取得不帶腫瘤之母無胸腺(裸)小鼠(6至8週齡)。所有使用到小鼠的步驟都是由Institutional Animal Care and Use Committee根據明確指導方針而核准。根據抗體成分，對小鼠(n=3或4)靜脈內投予一次3mg/kg之ADC。在投藥後的0.083、6、24、48、96、168與336小時透過尾靜脈對每隻小鼠採集血液樣品。利用LBA測得總抗體(Tab)與ADC濃度，其中把綿羊抗人IgG抗體用於捕獲，將山羊抗人IgG抗體用於檢測Tab，或把抗藥物抗體用於檢測ADC。使用Watson LIMS version 7.4(Thermo)分析每隻小鼠之血漿中濃度數據。暴露量根據位點而不同。用290C與443C突變體製成的ADC顯出最低暴露量，而用183C與392C位點製成之ADC顯出最高暴露量。就許多應用而言，具高暴露量的位點可能較佳，由於這將導致治療劑持續時間增加。然而，就某些應用而言，較佳為使用具低暴露量的共軛體(例如290C與443C)。特別地，較低暴露量(即，較低PK)之應用可能包括但不限於用於腦、CNS、及眼。適應症包括癌，尤其是腦癌、CNS癌、及眼癌。
Figure 105138129-A0202-12-0155-53
G. 位點專一性vc0101共軛體之細胞自溶酶裂解
在37℃下使用6mM二硫蘇糖醇(DTT)之150mM乙酸鈉溶液(pH 5.2)把細胞自溶酶B活化15分鐘。然後將50ng活化的細胞自溶酶B與20uL之1mg/mL的ADC在2mM DTT、50mM乙酸鈉(pH 5.2)之最終濃度下混合。在37℃下培育20分鐘、1個小時、2個小時與4個小時後，使用10uM E-64半胱胺酸蛋白酶抑制劑之250mM硼酸鹽緩衝液(pH 8.5)終止反應。在檢定後，使用TCEP將樣品還原及利用LC/MS使用實施例21.A中所述之條件來分析。數據顯示連接子裂解速率大大地取決於接合的位點。特定位點很快地被裂解(例如443C、388C、與290C)，而其他位點很慢地被裂解(例如334C、375C、與392C)。在某些態樣中，接合至提供自身來使裂解變慢之位點可能有利。在其他態樣中，較佳為快速裂解。例如，可能較佳為快速釋放藥物來降低花費在核內體的時間。在 另外的態樣中，快速藥物裂解能有利於使藥物能穿透，其中接合之分子可能不能這樣做，例如某些實性瘤。在另外的態樣中，快速裂解能使藥物能輸送至沒表現抗體之抗原的相鄰細胞，從而能治療(例如)異源性腫瘤。
Figure 105138129-A0202-12-0156-54
H. 位點專一性vc0101共軛體之熱安定性
將ADC在含有10mM EDTA之PBS(pH 7.4)中稀釋成0.2mg/mL。把ADC放入密封的管形瓶中及加熱到45℃。每增加1週取出等分樣品(10μL)利用粒徑排阻層析術(SEC)來評估隨著時間而形成之高分子量物種(HMWS)與低分子量物種(LMWS)的位準。SEC條件在實施例21.A中概述。在這些條件下，在約3.6分鐘洗提出單體。洗提到單體峰左側的任何蛋白質材料被視為HMWS，及洗提到單體 峰右側之任何蛋白質材料被視為LMWS。結果參見下表27。選定ADC顯示極高的熱安定性(例如183C、375C、與334C)，而其他ADC顯示顯著的分解(例如443C與392C+443C)。
Figure 105138129-A0202-12-0157-55
I. 各種vc0101位點突變體之效力
在使用N87細胞株之靶表現性異種移植物模型中進行抗體藥物共軛體的體內效力研究。把在50%基質膠中的約 750萬個腫瘤細胞植入6至8週齡的裸小鼠皮下到腫瘤大小達到在250與350mm3間為止。透過尾靜脈推注來投藥。每4日(在第1、5、9、與13日)一次為小鼠注射10、3、或1mg/kg之抗體藥物共軛體，共注射4次。每週為所有小鼠偵測體重變化。在前50日每週2次而之後每週1次用卡尺測量腫瘤大小，並且用下式計算：腫瘤體積=(長度x寬度2)/2。在腫瘤體積達到2500mm3前將小鼠人道處死。通常在治療一週後觀測到腫瘤大小減少。在中止治療後持續為小鼠偵測腫瘤復發(到治療後100日為止)。來自3mpk投藥組之數據參見圖29。由388C與347C突變體產生的ADC顯出比由334C、183C、392C與443C突變體產生之ADC稍低的效價。
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<210> 35
<211> 330
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 35
Figure 105138129-A0202-12-0212-141
Figure 105138129-A0202-12-0213-142
Figure 105138129-A0202-12-0214-143
<210> 36
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 36
Figure 105138129-A0202-12-0214-144
Figure 105138129-A0202-12-0215-145
Figure 105138129-A0202-12-0216-146
<210> 37
<211> 329
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 37
Figure 105138129-A0202-12-0216-147
Figure 105138129-A0202-12-0217-148
Figure 105138129-A0202-12-0218-149
<210> 38
<211> 449
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 38
Figure 105138129-A0202-12-0218-150
Figure 105138129-A0202-12-0219-151
Figure 105138129-A0202-12-0220-152
<210> 39
<211> 329
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 39
Figure 105138129-A0202-12-0220-153
Figure 105138129-A0202-12-0221-154
Figure 105138129-A0202-12-0222-155
<210> 40
<211> 449
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 40
Figure 105138129-A0202-12-0222-156
Figure 105138129-A0202-12-0223-157
Figure 105138129-A0202-12-0224-158
<210> 41
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 41
Figure 105138129-A0202-12-0224-159
Figure 105138129-A0202-12-0225-160
<210> 42
<211> 213
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 42
Figure 105138129-A0202-12-0225-161
Figure 105138129-A0202-12-0226-162
<210> 43
<211> 115
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 43
Figure 105138129-A0202-12-0226-163
<210> 44
<211> 222
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 44
Figure 105138129-A0202-12-0227-164
Figure 105138129-A0202-12-0228-165
<210> 45
<211> 360
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 45
Figure 105138129-A0202-12-0228-166
<210> 46
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 46
Figure 105138129-A0202-12-0228-167
Figure 105138129-A0202-12-0229-168
<210> 47
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 47
Figure 105138129-A0202-12-0229-169
Figure 105138129-A0202-12-0230-170
<210> 48
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 48
Figure 105138129-A0202-12-0230-171
<210> 49
<211> 990
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 49
Figure 105138129-A0202-12-0230-172
Figure 105138129-A0202-12-0231-173
<210> 50
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 50
Figure 105138129-A0202-12-0231-174
Figure 105138129-A0202-12-0232-175
<210> 51
<211> 987
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 51
Figure 105138129-A0202-12-0232-176
Figure 105138129-A0202-12-0233-177
<210> 52
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 52
Figure 105138129-A0202-12-0233-178
Figure 105138129-A0202-12-0234-179
<210> 53
<211> 987
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 53
Figure 105138129-A0202-12-0234-180
Figure 105138129-A0202-12-0235-181
<210> 54
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 54
Figure 105138129-A0202-12-0235-182
Figure 105138129-A0202-12-0236-183
<210> 55
<211> 990
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 55
Figure 105138129-A0202-12-0236-184
<210> 56
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 56
Figure 105138129-A0202-12-0237-185
<210> 57
<211> 1055
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 57
Figure 105138129-A0202-12-0238-186
<210> 58
<211> 1415
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 58
Figure 105138129-A0202-12-0238-187
Figure 105138129-A0202-12-0239-188
<210> 59
<211> 987
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 59
Figure 105138129-A0202-12-0239-189
Figure 105138129-A0202-12-0240-190
<210> 60
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 60
Figure 105138129-A0202-12-0240-191
Figure 105138129-A0202-12-0241-192
<210> 61
<211> 987
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 61
Figure 105138129-A0202-12-0241-193
Figure 105138129-A0202-12-0242-194
<210> 62
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 62
Figure 105138129-A0202-12-0242-195
Figure 105138129-A0202-12-0243-196
<210> 63
<211> 987
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 63
Figure 105138129-A0202-12-0243-197
Figure 105138129-A0202-12-0244-198
<210> 64
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 64
Figure 105138129-A0202-12-0244-199
Figure 105138129-A0202-12-0245-200
<210> 65
<211> 987
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 65
Figure 105138129-A0202-12-0245-201
Figure 105138129-A0202-12-0246-202
<210> 66
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 66
Figure 105138129-A0202-12-0246-203
Figure 105138129-A0202-12-0247-204
<210> 67
<211> 987
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 67
Figure 105138129-A0202-12-0247-205
<210> 68
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 68
Figure 105138129-A0202-12-0248-206
<210> 69
<211> 990
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 69
Figure 105138129-A0202-12-0249-207
<210> 70
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 70
Figure 105138129-A0202-12-0249-208
Figure 105138129-A0202-12-0250-209
<210> 71
<211> 1055
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 71
Figure 105138129-A0202-12-0250-210
Figure 105138129-A0202-12-0251-211
<210> 72
<211> 1415
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 72
Figure 105138129-A0202-12-0251-212
Figure 105138129-A0202-12-0252-213
<210> 73
<211> 987
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 73
Figure 105138129-A0202-12-0252-214
Figure 105138129-A0202-12-0253-215
<210> 74
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 74
Figure 105138129-A0202-12-0253-216
Figure 105138129-A0202-12-0254-217
<210> 75
<211> 987
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 75
Figure 105138129-A0202-12-0254-218
Figure 105138129-A0202-12-0255-219
<210> 76
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 76
Figure 105138129-A0202-12-0255-220
Figure 105138129-A0202-12-0256-221
<210> 77
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 77
Figure 105138129-A0202-12-0256-222
<210> 78
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 78
Figure 105138129-A0202-12-0256-223
Figure 105138129-A0202-12-0257-224
<210> 79
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 79
Figure 105138129-A0202-12-0257-225
<210> 80
<211> 666
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成核苷酸序列
<400> 80
Figure 105138129-A0202-12-0257-226
Figure 105138129-A0202-12-0258-227
<210> 81
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 81
Figure 105138129-A0202-12-0258-228
<210> 82
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 82
Figure 105138129-A0202-12-0258-229
<210> 83
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 83
Figure 105138129-A0202-12-0258-230
<210> 84
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 84
Figure 105138129-A0202-12-0259-231
<210> 85
<211> 4
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 85
Figure 105138129-A0202-12-0259-232
<210> 86
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 86
Figure 105138129-A0202-12-0259-233
<210> 87
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 87
Figure 105138129-A0202-12-0259-234
<210> 88
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 88
Figure 105138129-A0202-12-0260-235
<210> 89
<211> 4
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 89
Figure 105138129-A0202-12-0260-236
<210> 90
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 90
Figure 105138129-A0202-12-0260-237
<210> 91
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 91
Figure 105138129-A0202-12-0260-238
<210> 92
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 92
Figure 105138129-A0202-12-0261-239
<210> 93
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<400> 93
Figure 105138129-A0202-12-0261-240
<210> 94
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> Xaa是G或P
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (5)..(5)
<223> Xaa是A,G,P，或不存在
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (6)..(6)
<223> Xaa是A,G,K,P，或不存在
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (7)..(7)
<223> Xaa是G,K或不存在
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (8)..(8)
<223> Xaa是K或不存在
<400> 94
Figure 105138129-A0202-12-0262-241
<210> 95
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽序列
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> Xaa是任何天然胺基酸
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (5)..(5)
<223> Xaa是任何天然胺基酸或不存在
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (6)..(6)
<223> Xaa是任何天然胺基酸或不存在
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (7)..(7)
<223> Xaa是任何天然胺基酸或不存在
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (8)..(8)
<223> Xaa是任何天然胺基酸或不存在
<400> 95
Figure 105138129-A0202-12-0262-242

Claims (29)

  1. 一種如下式之抗體藥物共軛體：Ab-(L-D)，其中：(a)Ab是結合至HER2的抗體及包含(1)重鏈可變區，其包含三個包含SEQ ID No：2、3與4之CDR；及(2)重鏈恆定區，其包含SEQ ID No：17；(3)輕鏈可變區，其包含三個包含SEQ ID No：8、9與10之CDR；(4)輕鏈恆定區，其包含SEQ ID No：41；及(b)L-D是連接子-藥物部分，其中L是如順丁烯二醯亞胺基己醯基-纈胺酸-瓜胺酸-對胺基苄氧基羰基(vc)之連接子，及D是藥物，其中該藥物是如2-甲基丙胺醯基-N-[(3R,4S,5S)-3-甲氧基-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-甲氧基-2-甲基-3-側氧基-3-{[(1S)-2-苯基-1-(1,3-噻唑-2-基)乙基]胺基}丙基]吡咯啶-1-基}-5-甲基-1-側氧基庚-4-基]-N-甲基-L-纈胺醯胺(valinamide)之奧立他汀(auristatin)或其藥學上可接受的鹽或溶劑化物。
  2. 如申請專利範圍第1項之抗體藥物共軛體，其中Ab包括含有SEQ ID No：18之重鏈及含有SEQ ID No：42的輕鏈。
  3. 一種藥學組成物，其包含如申請專利範圍第1或2項之抗體藥物共軛體及藥學上可接受的載子。
  4. 一種組成物，其包含複數個如申請專利範圍第1或2項之抗體藥物共軛體，及隨意地藥學載子，其中該組成物具有4的平均DAR。
  5. 一種組成物，其包含複數個如申請專利範圍第1或2項之抗體藥物共軛體，及隨意地藥學載子，其中該組成物具有2的平均DAR。
  6. 一種核酸，其編碼如申請專利範圍第1或2項之Ab的重鏈及輕鏈。
  7. 一種載體，其包含如申請專利範圍第6項之核酸。
  8. 一種寄主細胞，其包含如申請專利範圍第6項之核酸。
  9. 一種製造如申請專利範圍第1或2項之抗體藥物共軛體的方法，該方法包含：(a)將該連接子連接至該藥物；(b)將該連接子藥物部分接合至該抗體；及(c)純化該抗體藥物共軛體。
  10. 如申請專利範圍第9項之方法，其中該接合對該抗體上的一或多個建構之半胱胺酸和/或麩醯胺酸殘基具位點專一性。
  11. 一種如申請專利範圍第1或2項之抗體藥物共軛體的用途，其係用於製造供治療個體中HER2表現性癌的醫藥。
  12. 如申請專利範圍第11項之用途，其中該癌是實 性瘤。
  13. 如申請專利範圍第12項之用途，其中該實性瘤係選自由下列所組成之群組：乳癌、卵巢癌、肺癌、胃癌、食道癌、結腸直腸癌、尿路上皮癌、胰腺癌、唾液腺癌及腦癌。
  14. 如申請專利範圍第13項之用途，其中該實性瘤係選自由下列所組成之群組：乳癌、卵巢癌、肺癌及胃癌。
  15. 如申請專利範圍第14項之用途，其中該乳癌是雌激素與黄體激素受體陰性或三陰性乳癌(TNBC)。
  16. 如申請專利範圍第14項之用途，其中該肺癌是非小細胞肺癌(NSLC)。
  17. 如申請專利範圍第12至16項中任一項之用途，其中該個體事先用曲妥珠單抗和/或曲妥珠單抗emtansine單獨或合併另一治療劑治療過。
  18. 如申請專利範圍第17項之用途，其中該治療劑是紫杉烷。
  19. 如申請專利範圍第17項之用途，其中該癌對用曲妥珠單抗和/或曲妥珠單抗emtansine單獨或合併另一治療劑之治療有抗性、是該治療難治的、和/或在該治療後復發。
  20. 如申請專利範圍第19項之用途，其中該治療劑是紫杉烷。
  21. 如申請專利範圍第12至16項中任一項之用途， 其中該癌表現高位準的HER2。
  22. 如申請專利範圍第21項之用途，其中該癌表現如免疫組織化學法(IHC)所測得之3+位準和/或
    Figure 105138129-A0305-02-0268-106
    2.0的螢光原位雜交(FISH)放大率的HER2。
  23. 如申請專利範圍第12至16項中任一項之用途，其中該癌表現中位準的HER2。
  24. 如申請專利範圍第23項之用途，其中該癌表現如免疫組織化學法(IHC)所測得之2+位準和/或<2.0的螢光原位雜交(FISH)放大率的HER2。
  25. 如申請專利範圍第12至16項中任一項之用途，其中該癌表現低位準的HER2。
  26. 如申請專利範圍第25項之用途，其中該癌表現如免疫組織化學法(IHC)所測得之1+位準和/或<2.0的螢光原位雜交(FISH)放大率的HER2。
  27. 如申請專利範圍第22項之用途，其中使用Dako HercptestTM檢定進行IHC及使用Dako HER2 FISH Pharm DxTM檢定進行FISH。
  28. 如申請專利範圍第24項之用途，其中使用Dako HercptestTM檢定進行IHC及使用Dako HER2 FISH Pharm DxTM檢定進行FISH。
  29. 如申請專利範圍第26項之用途，其中使用Dako HercptestTM檢定進行IHC及使用Dako HER2 FISH Pharm DxTM檢定進行FISH。
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