TW202342454A - 一種多功能化合物、其製備方法及其在醫藥上的應用 - Google Patents

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Abstract

本發明提供了一類新的安全有效的通式為I或II的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥: (D) nL-G(L-D) m或(G) nL-D(L-G) m式I                 式II。

Description

一種多功能化合物、其製備方法及其在醫藥上的應用
本發明涉及一類靶向降解目標蛋白的新化合物、其製備方法、及含有該化合物的藥物組合物及其在醫藥上的應用。
靶向蛋白降解嵌合體(Proteolysis-Targeting Chimeric,PROTAC)技術利用細胞內的泛素-蛋白酶體系統誘導靶蛋白的降解,近年來已成為新藥研發的熱門領域。PROTAC分子是由linker將目標蛋白配體和E3泛素連接酶配體連接起來形成的雙功能小分子,其可以同時結合目標蛋白和E3泛素連接酶,使得目標蛋白與E3泛素連接酶靠近、被泛素化(Ubiquitination),從而被細胞內蛋白酶體(Proteasome)降解。因為工作機制和選擇性的特殊性,PROTAC分子相比傳統小分子藥物具有下列的潛在優勢:靶向目前還無法成藥的蛋白組,例如引起癌症、病毒感染、退行性疾病的蛋白;泛素化取決於目標蛋白和E3泛素連接酶的空間關係和反應活性,因此低選擇性配體可以產生具有選擇性的PROTAC分子,且因泛素化是催化效應,不需要高濃度的藥物去結合靶蛋白、PROTAC分子可循壞使用,因此脫靶副作用小;目標蛋白配體結合力不需要太強即可降解該蛋白;目標蛋白重新合成之前不需要藥物存在,因此PROTAC分子的藥效長;PROTAC分子通過蛋白降解方式來降低蛋白水平且對蛋白的抑制更加徹底,可克服傳統小分子抑制劑由於旁路啟動產生的耐藥問題,以及避免蛋白骨架功能導致的耐藥問題(Pharmacology & Therapeutics 174 (2017) 138–144; Chemical & Engineering News, 96(8), February 19, 2018)。
儘管PROTAC技術在醫藥行業具有極大的應用前景,但當前開發的PROTAC分子都是針對單一目標蛋白,其作用效果有限。本發明的PROTAC分子含有兩個目標蛋白配體或兩個E3泛素連接酶配體,可以降解兩個靶蛋白,達到藥效上的協同效應,或提高對單一靶蛋白的降解效率,因此具有高效、低毒、克服耐藥性等優勢。
本發明的一方面提供一類新的安全有效的通式為I或II的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥: (D) nL-G(L-D) m或(G) nL-D(L-G) m式I           式II 其中,G是與泛素連接酶結合的部分,能夠與L共價連接,且G每次出現為相同或者不相同; D是與靶蛋白結合的部分,能夠與L共價連接,且D每次出現為相同或者不相同,該靶蛋白是與任何人類疾病相關的蛋白或能與人類疾病相關蛋白結合的其它蛋白,包括但不限於結構蛋白質、受體、酶、轉錄因數、細胞表面蛋白質、細胞整體功能相關蛋白質等; L是連接體部分,L每次出現為相同或者不相同,且化學地(共價地)將D與G連接; m選自0、1或2; n選自1或2且當m為0時,n不等於1。
在本發明較佳的實施方案中,L選自 和/或 ,其中x、y、z是1到30之間的整數,M選自N、CH、C、P=O、SiH、C 3-12環烷基、C 3-12雜環基、C 6-12芳基或5-12元雜芳基,所述的環烷基、雜環基、芳基、雜芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代,且R 1或R 2每次出現時可以相同或者不相同;
J 1、J 2、J 3各自獨立地選自: 鍵、-CR 1R 2-、-O-、-S-、-SO-、-SO 2-、-NR 3-、-SO 2NR 3-、-SONR 3-、-CONR 3-、-NR 3CONR 4-、-NR 3SO 2NR 4-、-CO-、-CR 1=CR 2-、-C≡C-、-SiR 1R 2-、-P(O)OR 1-、-NR 3C(=NCN)NR 4-、-NR 3C(=NCN)-、-NR 3C(=CNO 2)NR 4-、C 3-12亞環烷基、C 3-12亞雜環基、C 6-12亞芳基或5-12元亞雜芳基;所述的亞環烷基、亞雜環基、亞芳基、亞雜芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代,且R 1或R 2每次出現時可以相同或者不相同,其中: R 1、R 2、R 3、R 4和R 5各自獨立地選自:H、鹵素、C 1-8烷基、SC 1-8烷基、-NHC 1-8烷基、-N(C 1-8烷基) 2、C 3-11環烷基、C 6-14芳基、雜芳基、C 3-11雜環基、-OC 3-8環烷基、-SC 3-8環烷基、-NHC 3-8環烷基、-N(C 3-8環烷基) 2、-N(C 3-8環烷基)(C 1-8烷基)、-OH、-NH 2、-SH、-SO 2C 1-8烷基、-P(O)(OC 1-8烷基)(C 1-8烷基)、-P(O)(OC 1-8烷基) 2、-C≡C-C 1-8烷基、-C≡CH、-CH=CH(C 1-8烷基)、-C(C 1-8烷基)=CH(C 1-8烷基)、-C(C 1-8烷基)=C(C 1-8烷基) 2、-Si(OH) 3、-Si(C 1-8烷基) 3、-Si(OH)( C 1-8烷基) 2、-COC 1-8烷基、-COOH、鹵素、-CN、-CF 3、-CHF 2、-CH 2F、-NO 2、-SF 5、-SO 2NH-C 1-8烷基、-SO 2N(C 1-8烷基) 2、-SONH C 1-8烷基、-SON(C 1-8烷基) 2、-CONH-C 1-8烷基、-CON(C 1-8烷基) 2、-N(C 1-8烷基)CONH(C 1-8烷基)、-N(C 1-8烷基)CON(C 1-8烷基) 2、-NHCONH(C 1-8烷基)、-NHCON(C 1-8烷基) 2、-NHCONH 2、-N(C 1-8烷基)SO 2NH(C 1-8烷基)、-N(C 1-8烷基)SO 2N(C 1-8烷基) 2、-NHSO 2(C 1-8烷基)、-NHSO 2N(C 1-8烷基) 2和-NHSO 2NH 2;且當x、y、z大於1時,R 1或R 2獨立地可以連接至另一個J 1或J 2或J 3基團以形成環烷基和/或雜環基,該環烷基和雜環基可以進一步被0-4個R 5基團取代; 當x>1時,J 1可以相同或不同; 當y>1時,J 2可以相同或不同; 當z>1時,J 3可以相同或不同。
本發明較佳的實施方案中,L為 ,其中x、y、z是1到30之間的整數,M選自N、CH或C 6-12芳基,所述的芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代,J 1、J 2、J 3各自獨立地選自:鍵、-CR 1R 2-、-O-、-S-、-SO-、-SO 2-、-NR 3-、-SO 2NR 3-、-SONR 3-、-CONR 3-、-NR 3CONR 4-、-NR 3SO 2NR 4-、-CO-、-CR 1=CR 2-、-C≡C-、-SiR 1R 2-、-P(O)OR 1-、-NR 3C(=NCN)NR 4-、-NR 3C(=NCN)-、-NR 3C(=CNO 2)NR 4-、C 3-12亞環烷基、C 3-12亞雜環基、C 6-12亞芳基或5-12元亞雜芳基;所述的亞環烷基、亞雜環基、亞芳基、亞雜芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代,且R 1或R 2每次出現時可以相同或者不相同; 當x>1時,J 1可以相同或不同; 當y>1時,J 2可以相同或不同; 當z>1時,J 3可以相同或不同;
較佳地,x、y、z彼此獨立地是5到25之間的整數,更佳5到20之間的整數,例如5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20;
較佳地,J 1、J 2、J 3獨立地選自鍵、-CR 1R 2-、-O-、-S-、-NR 3-、-CONR 3-、-NR 3CONR 4-、-CO-、-C≡C-或C 6-12亞芳基;該亞芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代,且R 1或R 2每次出現時可以相同或者不相同;
較佳地,J 1、J 2、J 3獨立地選自鍵、-CR 1R 2-、-O-、-S-、-NR 3-、-CONR 3-、-CO-、-C≡C-或亞苯基;其中R 1、R 2、R 3彼此獨立地選自H或C 1-C 6烷基;
較佳地,J 1、J 2、J 3各自獨立地選自: -CR 1R 2-、-O-、-S-、-NR 3-和-CO-,其中: R 1和R 2各自獨立地選自:H和C 1-4烷基。
在本發明較佳的實施方案中,L選自: ; 其中,Z選自-CH 2-、-NH-和-O-; n 1、n 2、n 3、n 4、n 5、n 6和n 7各自獨立地選自0-20中的整數;較佳0-15中的整數;更佳0-10中的整數;例如0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在本發明較佳的實施方案中,L選自: ,其中r1、r2和r3為0-30之間的整數,較佳0-10之間的整數,例如0、1、2、3、4、5、6、7、8、9和10。
在本發明較佳的實施方案中,L選自:
在本發明較佳的實施方案中,G選自馮希佩爾-林道(VHL)、小腦蛋白(CRBN)、小鼠雙微體2同系物(MDM2)或細胞凋亡抑制因數(cIAP1)的配體片段或配體衍生物片段。
在本發明較佳的實施方案中,G選自但不限於以下化合物及其衍生物的片段: 其中:R 6選自H、鹵素、OH、NH 2或SH。
以上G1至G10 是本領域已知的化合物,G11為G10衍生物,其中已知化合物記載於例如下表所列的文獻中:
編號 結構 a 來源
G1 R 6=NH 2:WO2017059062 R 6=H:WO2017024317 R 6=OH:WO2017024317 R 6=F:WO2018052945 R 6=Cl:US2018179183 R 6=Br:WO2017176958 R 6=I:Bioorg Med Chem Lett. 2007;17(21):5819-5824
G2 R 6=NH 2:WO2017024317 R 6=H:WO2017059062 R 6=OH:WO2008115516 R 6=F:Youji Huaxue 2015; 35(5): 1123-1130 R 6=Cl:WO2010139266 R 6=Br:WO2018052949 R 6=I:WO2018052949
G3 R 6=NH 2:WO2017197056 R 6=H:WO2017007612 R 6=F:WO2017024319 R 6=Cl:WO2014179661   
G4 J. Med. Chem., 2018, 61 (2), pp 543–575
G5 WO2017030814
G6 WO2017157813
G7 WO2017117118
G8 Chembiochem. 2010; 11(11): P1531-1534
G9 WO2017030814
G10 WO2018051107
在本發明較佳的實施方案中,G通過任意連接位點與L進行連接。
在本發明較佳的實施方案中,G選自但不限於以下片段:
在本發明較佳的實施方案中,G選自但不限於以下片段:G1’-1、G1’-3、G1’-4、G5’、G5’-1、G5’-2、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1。
在本發明較佳的實施方案中,D選自但不限於以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:激酶抑制劑、磷酸酶抑制劑、HDM2/MDM2抑制劑、Hsp90抑制劑、靶向人類含BET溴結構域的蛋白質的化合物、HDAC抑制劑、人類賴氨酸甲基轉移酶抑制劑、靶向RAF受體的化合物、靶向FKBP的化合物、血管產生抑制劑、免疫抑制化合物、靶向芳基烴受體的化合物、靶向雄性激素受體的化合物、靶向雌性激素受體的化合物、靶向甲狀腺激素受體的化合物、靶向HIV蛋白酶的化合物、靶向HBV蛋白的化合物、靶向HIV整合酶的化合物、靶向HCV蛋白酶的化合物或靶向醯基蛋白質硫酯酶1或靶向醯基蛋白質硫酯酶2的化合物。
在本發明較佳的實施方案中,D選自但不限於以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段: WEE1、PARP、IDO、Arg、mTOR、JAK、ATR、BTK、VEGFR、EGFR、RAF、MEK、HDAC、HER2、ALK、Src、MET、IGF-1R、Akt、CDK、ABL、BCR-Abl、FKBP12、PIPK2、TBK1、AR、ER、BRD4、JNK1、SMAD3、ROR1、PA、PB1、PB2、NP、NA、FXR、HBX、PXR、RTKs、TBK1、HDM2、Bcl-2、IL-2、HPV、TNF、MYC、β-catenin 、MCL1、RAS、SRC、CBFβ、SMMHC、eIF4E、KLF4、Nrf2和MDM-2;
較佳地,D選自但不限於以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段: WEE1、PARP、IDO、Arg、mTOR、JAK、ATR、BTK、VEGFR、EGFR、RAF、MEK、HDAC、HER2、ALK、Src、MET、IGF-1R、AkT、BRD4、ABL、BCR-Abl、FKBP12、PIPK2、CDK8、CDK9、AR、ER、Bcl-2、MCL-1和TBK1;
較佳地,D選自但不限於以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段: WEE1、PARP、IDO、Arg、mTOR、JAK、ATR、BTK、VEGFR、EGFR、RAF、MEK、HDAC、HER2、ALK、Src、MET、IGF-1R和AkT。
在本發明較佳的實施方案中,D選自但不限於以下化合物及其衍生物的片段:
上述D1至D247是本領域已知的化合物,其作用靶點以及文獻記載如下:
編號 作用靶點 來源 編號 作用靶點 來源
D1 Wee1 Adavosertib WO2014062454 D111 RAF Lifirafenib WO2013097224
D2 Wee1 Milciclib WO2004104007 D112 RAF DP-4978 WO2013134243
D3 ATR AZD-6738 WO2011154737 D113 RAF MLN-2480 WO2009006389
D4 ATR Berzosertib WO2010071837 D115 RAF PLX-8394 WO2012109075
D5 ATR BAY-1895344 WO2016020320 D116 RAF Lucitanib WO2008112408
D6 PARP Olaparib WO2002036576 D117 RAF Encorafenib WO2011025927
D7 PARP Veliparib US2017172985 D118 RAF Dabrafenib WO2009137391
D8 PARP Pamiparib WO2013097225 D119 RAF Vemurafenib WO2007002325
D9 PARP Talazoparib WO2010017055 D121 VEGFR、 PDGFR、RAF、RET Sorafenib US 2003207872
D10 PARP 2X-121 WO2009046205 D122 MEK Binimetinib WO 2003077914
D11 PARP Simmiparib WO2014019468 D123 MEK Selumetinib WO 2003077914
D12 PARP Niraparib WO2008084261 D124 MEK PD-0325901 WO 2002006213
D13 IDO Epacadostat WO2010005958 D125 MEK Refametinib WO 2007014011
D14 IDO Linrodostat WO2016073770 D126 MEK Cobimetinib WO 2007044515
D15 IDO EOS-200271 WO2015173764 D127 MEK、FLT3 E-6201 WO 2003076424
D16 IDO Navoximod WO2012142237 D128 MEK Pimasertib WO 2006045514
D17 Arg1 CB-1158 WO2017075363 D130 HDAC Vorinostat WO 1993007148
D18 mTOR Sirolimus WO2016066608 D131 HDAC Entinostat EP 0847992
D19 mTOR Everolimus WO2013124867 D132 HDAC Givinostat US 6034096
D20 mTOR Temsirolimus WO2005011688 D133 HDAC Belinostat WO 2002030879
D21 mTOR Zotarolimus WO1999015530 D134 HDAC Mocetinostat WO 2004069823
D22 mTOR Dactolisib WO2005054237 D135 HDAC Abexinostat US 2014249215
D23 mTOR SG-00529 WO2007133249 D136 HDAC Panobinostat WO 2002022577
D24 mTOR NVP-BGT226 WO2006122806 D137 HDAC Resminostat WO 2005087724
D25 mTOR Sapanisertib US2015140013 D138 HDAC Quisinostat WO 2006010750
D26 mTOR PKI-179 WO2009143317 D139 HDAC CHR-3996 WO 2006123121
D27 mTOR Gedatolisib WO2009143313 D140 HDAC AZD-9468 WO 2007045844
D28 mTOR Apitolisib WO2008070740 D141 HDAC Tucidinostat WO 2004071400
D29 mTOR PF-04691502 WO2008032162 D142 HDAC Pracinostat WO 2007030080
D30 mTOR Bimiralisib WO2010052569 D143 HDAC CG-200745 WO 2007052938
D31 mTOR SF-1126 WO2004089925 D144 HDAC 4SC-202 WO 2006097474
D32 mTOR Panulisib WO2012007926 D145 HDAC [11C] Martinostat In vivo imaging of histone deacetylases (HDACs) in the central nervous system and major peripheral organs. J Med Chem 2014, 57(19): 7999
D33 mTOR LY-3023414 WO2012097039 D146 HDAC Citarinostat WO 2011091213
D34 mTOR, DNA-PK CC-115 WO2010062571 D147 HDAC BEBT-908 WO 2010080996
D35 mTOR CPX-POM WO2012075396 D148 HDAC Tefinostat WO 2006117549
D36 JAK Tofacitinib WO1996011953 D149 HDAC SHP-141 WO 2007095584
D37 JAK,SYK Cerdulatinib WO2009145856 D150 HDAC Tinostamustine WO 2010085377
D38 mTOR ASN-002 WO2013028818 D151 HDAC Ricolinostat WO 2011091213
D39 JAK Delgocitinib WO2011013785 D152 HDAC Fimepinostat WO 2012135571
D40 JAK HENGRUI WO2013091539 D158 HER2 CP-724714 WO 2001098277
D41 ABL, BTK Dasatinib WO2000062778 D167 HER2、VEGFR、EGFR BMS-690514 WO 2005066176
D42 BTK Ibrutinib WO2016123504 D172 HER2 Tucatinib WO 2007059257
D43 BTK Tirabrutinib WO2011152351 D173 ALK、C-Met Crizotinib WO 2004076412
D44 BTK Olmutinib WO2011162515 D174 ALK、TRKA Entrectinib WO 2009013126
D45 BTK Evobrutinib WO2012170976 D176 ALK Ceritinib WO 2008073687
D46 BTK Fenebrutinib WO2013067274 D177 ALK、RET Alectinib WO 2010143664
D48 BTK BMS-986142 WO2014210085 D178 ALK Ensartinib WO 2012048259
D49 BTK Acalabrutinib WO2005037836 D179 ALK、ROS PF-06463922 WO 2013132376
D50 BTK CK-101 WO2015027222 D181 SRC Saracatinib WO 2001094341
D51 BTK (S)-Zanubrutinib WO2014173289 D183 SRC AZD-0424 WO 2004041829
D52 VEGFR Tivozanib WO2002088110 D185 SRC、VEGFR TG-100572 WO 2005096784
D53 VEGFR Dovitinib WO2002022598 D186 ARC、ABL、IGF1R XL-228 WO 2006074057
D54 VEGFR ZK-304709 WO2002096888 D187 SRC KX-01 WO 2006071960
D55 VEGFR OSI-930 WO2004063330 D188 SRC KX2-361 WO 2008002676
D56 VEGFR Brivanib alaninate WO2004009784 D189 VEGFR、PDGFR Ilorasertib WO 2010065825
D57 VEGFR Fruquintinib WO2009137797 D190 VEGFR Semaxanib WO 1996040116
D58 VEGFR Nintedanib WO2001027081 D191 VEGFR、C-Met Foretinib WO 2005030140
D59 VEGFR PF-337210 WO2005063739 D194 C-Met Tivantinib WO 2006086484
D60 VEGFR Regorafenib WO2000042012 D195 VEGFR 、C-Met Glesatinib WO 2009026717
D61 VEGFR JNJ-26483327 WO2004105765 D196 C-Met SGX-523 WO 2008051808
D62 VEGFR TG-100572 WO2005096784 D197 C-Met MK-2461 US 2006293358
D63 VEGFR Anlotinib WO2008112407 D198 C-Met JNJ-38877605 WO 2007075567
D65 VEGFR Rivoceranib WO2010031266 D199 C-Met MK-8033 WO 2007002258
D66 ABL,FLT3 Ponatinib WO2007075869 D200 VEGFR、C-Met Golvatinib WO 2007023768
D67 VEGFR,FLT3 4SC-203 US2006142570 D201 C-Met ASLAN-002 WO 2008058229
D68 VEGFR NRC-2694 WO2009090661 D202 C-Met Capmatinib WO 2008064157
D69 VEGFR PD-153035 CA2086968 D203 C-Met、VEGFR Sitravatinib WO 2009026717
D70 VEGFR Gefitinib CA2086968 D204 C-Met、VEGFR BMS-817378 WO 2009094417
D71 EGFR Erlotinib WO2010013139 D205 C-Met、VEGFR TAS-115 WO 2009125597
D72 EGFR Canertinib WO2000031048 D206 C-Met Tepotinib WO 2009007074
D73 EGFR Falnidamol WO1997032880 D207 C-Met Merestinib WO 2010011538
D74 EGFR CP-547632 WO1999062890 D208 C-Met AMG-337 US 2009124609
D75 EGFR Pelitinib WO2001012227 D209 C-Met、VEGFR S-49076 EP 2281822
D76 EGFR Lapatinib WO1998002434 D210 C-Met SAR-125844 WO 2009056692
D77 EGFR Bosutinib WO2004045563 D211 VEGRF、TRKA Altiratinib WO 2011137342
D78 EGFR Vandetanib WO2001032651 D212 C-Met、VEGFR Ningetinib US 2012219522
D79 EGFR Afatinib WO2002050043 D213 C-Met、AXL CEP-40783 WO 2013074633
D80 EGFR MP-412 WO2002066445 D214 C-Met JNJ-38877618 WO 2007075567
D81 EGFR AEE-788 WO2003013541 D215 C-Met Savolitinib WO 2011079804
D82 EGFR Neratinib WO2005028443 D216 IGF1R Picropodophyllin WO 2002102804
D84 EGFR Tesevatinib WO2004006846 D219 IGF1R BMS-754807 WO 2008005956
D85 EGFR Cabozantinib WO2016019285 D222 PI3K Enzastaurin WO 1995017182
D86 EGFR AC-480 WO2004054514 D223 AKT SR-13668 WO 2004018475
D87 EGFR Varlitinib WO2005016346 D224 AKT XL-418 WO 2005117909
D89 EGFR Dacomitinib WO2005107758 D225 AKT AT-13148 WO 2005061463
D90 EGFR AZD-8931 WO1996015118 D227 VEGFR、AKT、PI3K SG-00529 US 2006257337
D91 EGFR BMS-690514 WO2005066176 D228 AKT Ipatasertib WO 2008006040
D92 EGFR AL-6802 WO2007084875 D229 AKT、ERK ONC-201 WO 2012149546
D93 EGFR Icotinib WO2010003313 D230 EGFR ODS-2004436 WO 2017148925
D94 EGFR Brigatinib WO2009143389 D231 EGFR AZD-3759 WO 2014135876
D95 EGFR Poziotinib WO2008150118 D232 BRD4 (+)-JQ-1 WO 2011143651
D96 EGFR CEP-32496 WO2009117080 D233 RIP2 WO2011140442
D97 IGF-1R,EGFR Linsitinib WO2005097800 D236 ER JNJ-35815208 WO 2008109727
D98 EGFR Epertinib WO2006090717 D237 CDK2、GSK-3 WO2002018346
D99 EGFR Selatinib WO2011035540 D238 AR Enzalutamide WO 2006124118
D100 EGFR SKLB-1028 WO2011147066 D239 AR Enobosarm WO 2005120483
D102 EGFR,BTK Spebrutinib WO2009158571 D241 Bcl-2 CN 107382862
D103 EGFR Osimertinib WO2013014448 D242 CDK8 WO 2017185034
D104 EGFR Abivertinib US2014038940 D243 TBK-1 WO 2016197114
D105 EGFR AZD-3759 WO2014135876 D244 CDK9 SNS-032 WO 2017185023
D106 EGFR Mavelertinib WO2015075598 D245 mTOR WO 2017024318
D107 EGFR Neratinib WO2005028443 D246 BRD4 (±)-JQ-1 WO 2011143651
D109 EGFR Nazartinib WO2013184757 D247 BRD4 WO 2017091673
D110 RAF RO-5126766 WO2007091736         
在本發明較佳的實施方案中,D獨立地選自但不限於以下片段: , 其中,D247’-1為D247羧酸化的衍生物片段,D247’-2為D247酯基還原的衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了一類新的安全有效的通式為III或IV的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥: (D) nL-G 或   (G) nL-D 式III           式IV 其中,D、L、G如上文所定義,n為2。
在較佳的實施方案中,本發明提供了一類新的安全有效的通式為V或VI的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥: 其中D、L、G如上文所定義且D每次出現時彼此相同或不同, G每次出現時彼此相同或不同,較佳地,D每次出現時彼此相同。
本發明較佳的實施方案中,L為 ,其中x、y、z是1到30之間的整數,M選自N、CH或C 6-12芳基,所述的芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代,J 1、J 2、J 3各自獨立地選自:鍵、-CR 1R 2-、-O-、-S-、-SO-、-SO 2-、-NR 3-、-SO 2NR 3-、-SONR 3-、-CONR 3-、-NR 3CONR 4-、-NR 3SO 2NR 4-、-CO-、-CR 1=CR 2-、-C≡C-、-SiR 1R 2-、-P(O)OR 1-、-NR 3C(=NCN)NR 4-、-NR 3C(=NCN)-、-NR 3C(=CNO 2)NR 4-、C 3-12亞環烷基、C 3-12亞雜環基、C 6-12亞芳基或5-12元亞雜芳基;所述的亞環烷基、亞雜環基、亞芳基、亞雜芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代,且R 1或R 2每次出現時可以相同或者不相同; 當x>1時,J 1可以相同或不同; 當y>1時,J 2可以相同或不同; 當z>1時,J 3可以相同或不同;
較佳地,x、y、z彼此獨立地是5到25之間的整數,更佳5到20之間的整數,例如5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20;
較佳地,J 1、J 2、J 3獨立地選自鍵、-CR 1R 2-、-O-、-S-、-NR 3-、-CONR 3-、-NR 3CONR 4-、-CO-、-C≡C-或C 6-12亞芳基;該亞芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代,且R 1或R 2每次出現時可以相同或者不相同;
較佳地,J 1、J 2、J 3獨立地選自鍵、-CR 1R 2-、-O-、-S-、-NR 3-、-CONR 3-、-CO-、-C≡C-或亞苯基;其中R 1、R 2、R 3彼此獨立地選自H或C 1-C 6烷基。
本發明較佳的實施方案中,M選自N、CH或苯基。
本發明較佳的實施方案中,通式為V或VI的PROTAC化合物中L選自: ; 其中,Z選自-CH 2-、-NH-和-O-; n 1、n 2、n 3、n 4、n 5、n 6和n 7各自獨立地選自0-20中的整數;較佳0-15中的整數;更佳0-10中的整數;例如0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
本發明較佳的實施方案中,通式為V或VI的PROTAC化合物中L選自: 、L3、L4-3、L7、L9、L10、L15、L16-1、L17、L18、L19、L20-3、L21-2、L22-2、L23-2、L24-2、L25-2、L26-2、L27-2、L28-2、L30-1、L31-2、L32-2和L34-3; 其中r1、r2和r3為0-30之間的整數,較佳為0-10之間的整數,例如0、1、2、3、4、5、6、7、8、9和10。
本發明較佳的實施方案中,通式為V或VI的PROTAC化合物中L選自: 、L3、L4-3、L7、L10、L15和L16-1,其中r1、r2和r3為0-30之間的整數。
本發明較佳的實施方案中,通式為V或VI的PROTAC化合物中,L選自:L1、L3、L7、L10、L17、L18、L19、L20-3、L21-2、L22-2、L23-2、L24-2、L25-2、L26-2、L27-2、L28-2、L30-1、L31-2、L32-2和L34-3; D選自:D1’-1、D4’-1、D4’-2、D12’-1、D41’-1、D60’-1、D122’-1、D123’-1、D232’-1、D246’-1、D247’-1和D247’-2,更佳選自D1’-1、D4’-1、D4’-2、D12’-1、D60’-1、D123’-1、D232’-1、D246’-1、D247’-1和D247’-2; G選自:G1’-1、G5’-1、G10’-1和G11’-1。
本發明較佳的實施方案中,通式為V或VI的PROTAC化合物中,L選自:L17、L18、L19、L20-3、L21-2、L22-2、L23-2、L24-2、L25-2、L26-2、L27-2、L28-2、L30-1、L31-2、L32-2和L34-3;較佳地,L選自L22-2、L23-2和L24-2; D選自:D232’-1、D246’-1、D247’-1和D247’-2,較佳為D232’-1; G選自:G1’-1、G5’-1、G10’-1和G11’-1,較佳為G10’-1。
在一個較佳的實施方案中,本發明提供的通式為V-1或VI-1的PROTAC 化合物選自: 其中,R 7、R 8、R 9為上文定義的D或G,且R 7、R 8和R 9不同時為D或不同時為G,r1、r2、r3為0到30之間的整數,較佳1到8,更佳2到6之間的整數,例如2、3、4、5、6。
在上述實施方案中,較佳所述的D彼此獨立地選自D1、D4、D12、D41、D60、D122、D123、D232、D246和D247的化合物或衍生物的片段,更佳選自D60和D122的片段。在上述實施方案中,較佳所述的D彼此獨立地選自D1’-1、D4’-1、D12’ -1、D41’-1、D60’-1 、D122’-1、D123’-1、D232’-1、D246’ -1、D247’-1和D247’-2,更佳選自D60’-1和D123’-1。
在上述實施方案中,較佳的G獨立地選自G1、G5、G9、G10和G11的片段,較佳的G獨立地選自G1、G5、G10和G11的片段,更佳G1的片段。
在上述實施方案中,較佳的G獨立地選自G1’-1至G1’-5、G5’、G9’、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1,較佳的G獨立地選自G1’-1至G1’-5、G5’、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1,更佳獨立地選自G1’-1至G1’-5。
在上述實施方案中,較佳該化合物為式V-1的化合物。
在另一個較佳的實施方案中,本發明提供的通式為V-2或VI-2的PROTAC化合物選自: 其中,R 10、R 11、R 12為上文定義的D或G,且R 10、R 11和R 12不同時為D或不同時為G,r1、r2、r3為0到30之間的整數,較佳1到8,更佳2到6之間的整數,例如2、3、4、5、6。
在上述實施方案中,較佳所述的D彼此獨立地選自D1、D4、D12、D41、D60、D122、D232、D246和D247的化合物或衍生物的片段,更佳獨立地選自選自D1、D4和D246的片段,更佳獨立地選自選自D1和D4的片段。
在上述實施方案中,較佳所述的D彼此獨立地選自D1’-1、D4’-1、D4’-2、D12’-1、D41’-1、D60’-1、D122’-1、D232’-1、D246’-1、D247’-1和D247’-2,更佳選自D1’-1、D4’-1、D4’-2、和D246’-1,更佳獨立地選自D4’-2。
在上述實施方案中,較佳所述的G選自G1、G5、G9、G10和G11的片段,較佳所述的G選自G1、G5、G10和G11的片段,更佳G1的片段。
在上述實施方案中,較佳所述的G獨立地選自G1’-1至G1’-5、G5’、G9’、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1,較佳所述的G獨立地選自G1’-1至G1’-5、G5’、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1,更佳獨立地選自G1’-1至G1’-5。
在另一個較佳的實施方案中,本發明提供的通式為V-3或VI-3的PROTAC化合物選自: 其中,R 13、R 14、R 15為上文定義的D或G,且R 13、R 14和R 15不同時為D或不同為G,r1、r2、r3為0到30之間的整數,較佳1到8,更佳2到6之間的整數,例如2、3、4、5、6。
在上述實施方案中,較佳所述的D彼此獨立地選自D1、D4、D12、D41、D60、D122、D232、D246和D247的化合物或衍生物的片段,更佳選自D1和D12的片段。
在上述實施方案中,較佳所述的D彼此獨立地選自D1’-1、D4’-1、D12’-1、D41’-1、D60’-1、D122’-1、D232’-1、D246’ -1、D247’-1和D247’-2,更佳選自D1’-1和D12’-1。
在上述實施方案中,較佳所述的G獨立地選自G1’-1至G1’-5、G5’、G9’、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1,更佳獨立地選自G1’-1至G1’-5。
在上述實施方案中,較佳該化合物為式V-3的化合物。
在另一個較佳的實施方案中,本發明提供的通式為V-4或VI-4的PROTAC化合物選自: 其中,R 16、R 17、R 18為上文定義的D或G,且R 16、R 17和R 18不同時為D或不同時為G,r1、r2、r3為0到30之間的整數,較佳1到8,更佳2到6之間的整數,例如2、3、4、5、6。
在上述實施方案中,較佳所述的D彼此獨立地選自D1、D4、D12、D41、D60、D122、D232、D246和D247的化合物或衍生物的片段,更佳選自D1、D4、D12和D60的片段。
在上述實施方案中,較佳所述的D彼此獨立地選自D1’-1、D4’-1、D12’-1、D41’-1、D60’-1、D122’-1、D232’-1、D246’-1、D247’-1和D247’-2,更佳獨立地選自D1’-1、D4’-1、D12’-1和D60’-1。在上述實施方案中,較佳所述的G獨立地選自G1’-1至G1’-5、G5’、G9’、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1,較佳所述的G獨立地選自G1’-1至G1’-5、G5’、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1,更佳獨立地選自G1’-1至G1’-5。
在較佳的實施方案中,本發明提供的通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥: 其中,G如上文所定義,D I與D II彼此相同或不同且各自獨立地選自上文所定義的與靶蛋白結合的部分,L如通式V或VI化合物所定義,較佳地,D I與D II彼此相同,較佳地,D I與D II彼此不相同。
在較佳的實施方案中,本發明提供的通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I和D II獨立地選自以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:PARP、IDO、ATR、VEGFR、MEK、ALK、RAF、EGFR、WEE1、BRD4、Abl、BCR-Abl、CDK8、CDK9、FKBP12、PIPK2、JAK、Src、MET、mTOR、IGF-1R、AKT、BRAF、HDAC、HER2、BTK、Arg、Bcl-2、Mcl-1、AR或ER;
較佳地,D I選自以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:PARP、IDO、ATR、VEGFR、MEK、ALK、RAF、EGFR或WEE1,D II選自以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:JAK、Src、MET、mTOR、IGF-1R、MEK、WEE1、ATR、AKT、EGFR、BRAF、HDAC、HER2、ALK或BTK;或者D II選自以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:PARP、IDO、ATR、VEGFR、MEK、ALK、RAF、EGFR或WEE1,D I選自以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:JAK、Src、MET、mTOR、IGF-1R、MEK、WEE1、ATR、AKT、EGFR、BRAF、HDAC、HER2、ALK或BTK。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為PARP的配體片段或配體衍生物片段,D II為WEE1或ATR的配體片段或配體衍生物片段;或者D II為PARP的配體片段或配體衍生物片段,D I為WEE1或ATR的配體片段或配體衍生物片段;
較佳地,D I和D II其中之一為PARP的配體片段或配體衍生物片段,另一個為WEE1的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為IDO的配體片段或配體衍生物片段,D II選自以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:JAK、mTOR或Arg;或者D II為IDO的配體片段或配體衍生物片段,D I選自以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:JAK、mTOR或Arg。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為ATR的配體片段或配體衍生物片段,D II為WEE1或BTK的配體片段或配體衍生物片段;或者D II為ATR的配體片段或配體衍生物片段,D I為WEE1或BTK的配體片段或配體衍生物片段;
較佳地,D I和D II其中之一為WEE1的配體片段或配體衍生物片段,另一個為ATR的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為VEGFR的配體片段或配體衍生物片段,D II選自以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:EGFR、BRAF、MEK、mTOR、HDAC、HER2或ALK;或者D II為VEGFR的配體片段或配體衍生物片段,D I選自以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:EGFR、BRAF、MEK、mTOR、HDAC、HER2或ALK。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為MEK的配體片段或配體衍生物片段,D II為AKT的配體片段或配體衍生物片段;或者D II為MEK的配體片段或配體衍生物片段,D I為AKT的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為ALK的配體片段或配體衍生物片段,D II為Src的配體片段或配體衍生物片段;或者D II為ALK的配體片段或配體衍生物片段,D I為Src的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為RAF的配體片段或配體衍生物片段,D II為mTOR或MEK的配體片段或配體衍生物片段;或者D II為RAF的配體片段或配體衍生物片段,D I為mTOR或MEK的配體片段或配體衍生物片段;
較佳地,D I和D II其中之一為RAF的配體片段或配體衍生物片段,另一個為MEK的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為EGFR的配體片段或配體衍生物片段,D II選自以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:JAK、Src、MET、mTOR或IGF-1R;或者D II為靶蛋白EGFR的配體片段或配體衍生物片段,D I選自以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:JAK、Src、MET、mTOR或IGF-1R。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為BRD4的配體片段或配體衍生物片段,D II為Abl、BCR-Abl、CDK8、CDK9、BCl-2/Mcl-1、AR、ER、ERRα、Alk的配體片段或配體衍生物片段;或者,D II為BRD4的配體片段或配體衍生物片段,D I為Abl、BCR-Abl、CDK8、CDK9、BCl-2/Mcl-1、AR、ER、ERRα、Alk的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為Abl的配體片段或配體衍生物片段,D II為BCR-Abl、CDK8、CDK9、BCl-2/Mcl-1、AR、ER、ERRα、Alk的配體片段或配體衍生物片段;或者D II為Abl的配體片段或配體衍生物片段,D I為BCR-Abl、CDK8、CDK9、BCl-2/Mcl-1、AR、ER、ERRα、Alk的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為BCR-Abl的配體片段或配體衍生物片段,D II為CDK8、CDK9、BCl-2/Mcl-1、ER、ERRα、Alk的配體片段或配體衍生物片段;或者,D II為BCR-Abl的配體片段或配體衍生物片段,D I為CDK8、CDK9、BCl-2/Mcl-1、ER、ERRα、Alk的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為CDK8的配體片段或配體衍生物片段,D II為CDK9、BCl-2/Mcl-1、AR、Alk的配體片段或配體衍生物片段;或者,D II為CDK8的配體片段或配體衍生物片段,D I為CDK9、BCl-2/Mcl-1、AR、Alk的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為CDK9的配體片段或配體衍生物片段,D II為BCl-2/Mcl-1、AR、Alk的配體片段或配體衍生物片段;或者,D II為CDK9的配體片段或配體衍生物片段,D I為BCl-2/Mcl-1、AR、Alk的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為Alk的配體片段或配體衍生物片段,D II為BCl-2/Mcl-1、AR的配體片段或配體衍生物片段;或者,D II為Alk的配體片段或配體衍生物片段,D I為BCl-2/Mcl-1、AR的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為FKBP12的配體片段或配體衍生物片段,D II為BRD4、Abl、BCR-Abl、CDK8、CDK9、BCl-2/Mcl-1、AR、Alk的配體片段或配體衍生物片段;或者,D II為FKBP12的配體片段或配體衍生物片段,D I為BRD4、Abl、BCR-Abl、CDK8、CDK9、BCl-2/Mcl-1、AR、Alk的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為PIPK2的配體片段或配體衍生物片段,D II為BRD4、Abl、BCR-Abl、AR、TBK1、Alk、ERRα的配體片段或配體衍生物片段;或者,D II為PIPK2的配體片段或配體衍生物片段,D I為BRD4、Abl、BCR-Abl、AR、TBK1、Alk、ERRα的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為TBK1的配體片段或配體衍生物片段,D II為BRD4、Abl、BCR-Abl、AR、Alk、ERRα的配體片段或配體衍生物片段;或者,D II為TBK1的配體片段或配體衍生物片段,D I為BRD4、Abl、BCR-Abl、AR、Alk、ERRα的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為ERRα的配體片段或配體衍生物片段,D II為Abl、BCR-Abl的配體片段或配體衍生物片段;或者,D II為ERRα的配體片段或配體衍生物片段,D I為Abl、BCR-Abl的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I為BRD4的配體片段或配體衍生物片段,D II為BRD4的配體片段或配體衍生物片段。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自以下化合物及其衍生物的片段:D6、D7、D8、D9、D10、D11和D12;
D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D1、D2、D3、D4和D5;較佳地,D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D1和D2。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自以下化合物及其衍生物的片段:D13、D14、D15和D16;
D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D17、D18、D19、D20、D21、D22、D23、D24、D25、D26、D27、D28、D29、D30、D32、D33、D34、D35、D36、D37、D38、D39和D40。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自以下化合物及其衍生物的片段:D3、D4和D5;
D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D1、D2、D41、D42、D43、D44、D45、D46、D48、D49、D50和D51;較佳地,D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D1和D2。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自以下化合物及其衍生物的片段:D23、D52、D53、D54、D55、D56、D57、D58、D59、D60、D61、D62、D63、D65、D66、D67和D68;
D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D18、D19、D20、D21、D22、D23、D24、D25、D26、D27、D28、D29、D30、D32、D33、D34、D44、D50、D53、D61、D69、D70、D71、D72、D73、D74、D75、D76、D77、D78、D79、D80、D81、D82、D84、D85、D86、D87、D89、D90、D91、D92、D93、D94、D95、D96、D97、D98、D99、D100、D102、D103、D104、D105、D106、D107、D109、D110、D111、D112、D113、D115、D116、D117、D118、D119、D121、D130、D131、D132、D133、D134、D135、D136、D137、D138、D139、D140、D141、D142、D143、D144、D145、D146、D147、D148、D149、D150、D151、D152、D158、D167、D172、D173、D174、D176、D177、D178、D179、D190、D191、D194、D195、D196、D197、D198、D199、D200、D201、D202、D203、D204、D205、D206、D207、D208、D209、D210、D211、D212、D213、D214和D215。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自以下化合物及其衍生物的片段:D122、D123、D124、D125、D126、D127、D128和D110;
D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D222、D223、D224、D225、D227、D228、D229和D23。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自以下化合物及其衍生物的片段:D173、D174、D176、D177、D178、D179和D94;
D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D41、D61、D77、D181、D183、D185、D186、D187、D188和D189。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,DI選自以下化合物及其衍生物的片段:D60、D96、D110、D111、D112、D113、D115、D116、D117、D118、D119和D121;
DII選自以下化合物及其衍生物的片段:D18、D19、D20、D21、D22、D23、D24、D25、D26、D27、D28、D29、D30、D31、D32、D33、D34、D35、D110、D122、D123、D124、D125、D126、D127和D128。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自以下化合物及其衍生物的片段:D44、D50、D53、D61、D69、D70、D71、D72、D73、D74、D75、D76、D77、D78、D79、D80、D81、D82、D84、D85、D86、D87、D89、D90、D91、D92、D93、D94、D95、D96、D97、D98、D99、D100、D102、D103、D104、D106、D107、D109、D230和D231;
D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D18、D19、D20、D21、D22、D23、D24、D25、D26、D27、D28、D29、D30、D31、D32、D33、D34、D35、D36、D37、D38、D39、D40、D41、D61、D77、D85、D94、D97、D173、D174、D181、D183、D185、D186、D187、D188、D189、D190、D191、D194、D195、D196、D197、D199、D200、D201、D202、D203、D204、D205、D206、D207、D208、D209、D210、D211、D212、D215、D216和D219。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自以下化合物及其衍生物的片段:D60、D96、D110、D111、D112、D113、D115、D116、D117、D118、D119和D121;
D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D110、D122、D123、D124、D125、D126、D127和D128。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自以下化合物及其衍生物的片段:D6、D7、D8、D9、D10、D11和D12;
D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D1和D2。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自以下化合物及其衍生物的片段:D3、D4和D5;
D II選自以下化合物及其衍生物的片段:D1和D2。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自:D60’、D110’、D111’、D112’、D113’、D96’、D115’、D116’、D117’、D118’、D119’和D121’;
D II選自:D110’、D122’、D123’、D124’、D125’、D126’、D127’和D128’。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自:D6’、D7’、D8’、D9’、D10’、D11’和D12’;
D II選自:D1’和D2’。
在較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,D I選自:D1’和D2’;
D II選自:D3’、D4’和D5’。
在一個較佳的實施方案中,本發明提供了通式為V-5的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥:
其中,G選自以下化合物的片段:G1、G5、G9和G10,較佳地,G選自以下化合物的片段:G1、G5、G10和G11;較佳地,G選自以下的片段:G1’-1、G1’-2、G1’-3、G1’-4、G1’-5、G5’、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1;
D I與D II彼此相同或不同且各自獨立地選自以下化合物或其衍生物的片段:D1、D4、D12、D60、D122、D232、D246和D247;較佳地,D I與D II彼此相同或不同且各自獨立地選自以下片段:D1’-1、D4’-1、D12’-1、D60’-1、D122’-1、D232’-1、D246’-1、D247’-1、D247’-2和D4’-2;
L選自L1、L3、L4-3、L7、L9、L10、L15、L16-1、L17、L18、L19、L20-3、L21-2、L22-2、L23-2、L24-2、L25-2、L26-2、L27-2、L28-2、L30-1、L31-2、L32-1、L32-2、L34-1、L34-2和L34-3。
在較佳的實施方案中,本發明通式為V-5的PROTAC化合物中,L選自L1、L4-3、L7、L8-3、L9、L12、L15和L16-1;
D I和D II彼此不同,且各自獨立地選自D1、D4、D12、D41、D123、D60、D122和D232的片段;
G選自G1’-1至G1’-5和G5’。
在較佳的實施方案中,本發明通式為V-5的PROTAC化合物中L選自L1、L4-3、L7、L8-3、L9、L12、L15和L16-1;
D I和D II彼此不同,且各自獨立地選自D1’、D4’、D12’、D41’、D123’、D60’、D122’和D232’;
G選自G1’-1至G1’-5和G5’。
在較佳的實施方案中,本發明提供了一類新的安全有效的通式為VII或VIII的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥: D-L-G-L-D 或     G-L-D-L-G 式VII           式VIII 其中,G、L、D如上文所定義且D每次出現時相同。
在較佳的實施方案中,通式為VII或VIII的PROTAC化合物中L選自: 、L4-1、L4-2、L4-4、L8-1、L8-2、L8-3、L12、L14-1、L14-2、L16-2、L16-3、L20-1、L20-2、L21-1、L22-1、L23-1、L24-1、L25-1、L26-1、L27-1、L28-1、L31-1和L34-2,其中r1、r2和r3為0-30之間的整數。
在較佳的實施方案中,通式為VII或VIII的PROTAC化合物中L選自:L4-1、L4-2、L4-4、L8-1、L8-2、L8-3、L12、L14-1、L14-2、L16-2、L16-3、L20-1、L20-2、L21-1、L22-1、L23-1、L24-1、L25-1、L26-1、L27-1、L28-1、L31-1和L34-2。
在一個較佳的實施方案中,通式為VII或VIII的PROTAC化合物中的D選自以下化合物或衍生物的片段:D1、D4、D12、D41、D60、D122、D232、D246和D247;更佳地,D選自以下化合物或其衍生物的片段:D232、D246和D247。
在一個較佳的實施方案中,通式為VII或VIII的PROTAC化合物中的D獨立地選自以下片段:D1’-1、D4’-1、D12’-1、D41’-1、D60’-1、D122’-1、D232’-1、D246’-1、D247’-1和D247’-2;更佳地,D獨立地選自以下片段:D232’-1、D246’-1、D247’-1和D247’-2。
在一個較佳的實施方案中,通式為VII或VIII的PROTAC化合物中的G選自以下化合物的片段:G1、G5、G9、G10和G11。
在一個較佳的實施方案中,通式為VII或VIII的PROTAC化合物中的G獨立地選自以下片段:G1’-1、G1’-2、G1’-3、G1’-4、G1’-5、G5’-1、G9’、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1;較佳地,G獨立地選自以下片段:G1’-1、G1’-2、G1’-3、G1’-4、G1’-5、G5’-1、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1。
在一個較佳的實施方案中,通式為VII或VIII的PROTAC化合物中的L選自:L8-1、L14-1、L20-1、L20-2、L21-1、L22-1、L23-1、L24-1、L25-1、L26-1、L27-1、L28-1、L31-1和L34-2; D選自以下片段:D4’-1、D232’-1、D247’-1和D247’-2; G選自以下片段:G1’-1、G1’-2、G1’-3、G1’-4、G1’-5、G10’和G11’。
在較佳的實施方案中,本發明提供了一類新的安全有效的通式為VII-1的PROTAC化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽、共晶、多晶型物或溶劑合物,或者該化合物的穩定同位素衍生物、代謝物或前藥: D I-L-G-L-D II式VII-1 其中,G、L、D I、D II如上文所定義且D I與D II不相同。
在較佳的實施方案中,通式為VII-1的PROTAC化合物中L如通式為VII或VIII化合物所定義。
在較佳的實施方案中,通式為VII-1的PROTAC化合物中L選自:L4-1、L4-2、L8-1、L8-2、L16-2和L16-3; D選自以下片段:D1’-1、D4’-1、D41’-1、D60’-1、D122’-1和D232’-1; G選自如下片段:G1’-1、G1’-2、G1’-3、G1’-4、G1’-5和G5’-1。
在本發明較佳的實施方案中,化合物選自但不限於以下化合物:
在本發明較佳的實施方案中,该化合物選自化合物4、化合物8、化合物12、化合物14、化合物16、化合物17、化合物18、化合物19、化合物20、化合物21、化合物22、化合物23、化合物24、化合物25、化合物26、化合物27、化合物28、化合物29、化合物30、化合物31、化合物32、化合物33和化合物34。
本發明的另一方面提供藥物組合物,其包含預防或治療有效量的本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥以及一種或多種藥學上可接受的載體。
本發明的另一方面提供製備藥物組合物的方法,該方法包括將本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥與一種或多種藥學上可接受的載體組合。
本發明的另一方面提供本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物在製備用於預防或治療蛋白活性異常表達相關疾病的藥物中的用途。
本發明的另一方面提供本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物在製備用於預防或治療腫瘤相關疾病的藥物中的用途。
本發明的另一方面提供本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物,其用於預防或治療蛋白活性異常表達相關疾病。
本發明的另一方面提供本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物,其用於預防或治療腫瘤相關疾病。
本發明的另一方面提供預防或治療蛋白活性異常表達相關疾病的方法,該方法包括向需要其的個體給藥有效量的本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物。
本發明的另一方面提供預防或治療腫瘤相關疾病的方法,該方法包括向需要其的個體給藥有效量的本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物。 定義
除非在下文中另有定義,本文中所用的所有技術術語和科學術語的含義意圖與本領域技術人員通常所理解的相同。提及本文中使用的技術意圖指在本領域中通常所理解的技術,包括那些對本領域技術人員顯而易見的技術的變化或等效技術的替換。雖然相信以下術語對於本領域技術人員很好理解,但仍然闡述以下定義以更好地解釋本發明。
術語“包括”、“包含”、“具有”、“含有”或“涉及”及其在本文中的其它變體形式為包含性的(inclusive)或開放式的,且不排除其它未列舉的元素或方法步驟。
術語“肽”(peptide)是指氨基酸以肽鍵連接在一起而形成的化合物,根據肽中氨基酸的數量的不同,肽有多種不同的稱呼:由兩個氨基酸分子脫水縮合而成的化合物叫做二肽,同理類推還有三肽、四肽、五肽等,如本文中缺氧誘導因數-1α(HIF-1α)的五肽結構為:NH 2-Leu-Ala-Pro(OH)-Tyr-Ile-COOH。
如本文中所使用,術語“烷基”定義為直鏈或支鏈飽和脂肪族烴。在一些實施方案中,烷基具有1至12個,例如1至6個碳原子。例如,如本文中所使用,術語“C 1-8烷基”指1至8個碳原子的線性或支化的基團(例如甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基、正己基、正庚基和正辛基),其任選地被1或複數(諸如1至3個)適合的取代基如鹵素取代(此時該基團被稱作“鹵代烷基”) (例如CF 3、C 2F 5、CHF 2、CH 2F、CH 2CF 3、CH 2Cl或-CH 2CH 2CF 3等)。
如本文中所使用,術語“環烷基”指飽和或不飽和的非芳族單環或多環(諸如雙環)烴環(例如單環,諸如環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基、環辛基、環壬基,或雙環,包括螺環、稠合或橋連系統(諸如雙環[1.1.1]戊基、雙環[2.2.1]庚基、雙環[3.2.1]辛基或雙環[5.2.0]壬基、十氫化萘基等),其任選地被1或複數(諸如1至3個)適合的取代基取代。該環烷基具有3至15個碳原子。例如,術語“C 3-8環烷基”指3至8個成環碳原子的飽和或不飽和的非芳族單環或多環(諸如雙環)烴環(例如環丙基、環丁基、環戊基、環己基或環辛基),其任選地被1或複數(諸如1至3個)適合的取代基取代,例如甲基取代的環丙基。
如本文中所使用,術語“芳基”指具有共軛π電子系統的全碳單環或稠合環多環芳族基團。例如,如本文中所使用,術語“C 6-14芳基”意指含有6至14個碳原子的芳族基團,諸如苯基或萘基。芳基任選地被1或複數(諸如1至3個)適合的取代基(例如鹵素、-OH、-CN、-NO 2、C 1-6烷基等)取代。
如本文中所使用,術語“雜芳基”指一價單環、雙環或三環芳族環系,其具有5、6、8、9、10、11、12、13或14個環原子,特別是1或2或3或4或5或6或9或10個碳原子,且其包含至少一個可以相同或不同的雜原子(該雜原子是例如氧、氮或硫),並且,另外在每一種情況下可為苯並稠合的。特別地,雜芳基選自噻吩基、呋喃基、吡咯基、噁唑基、噻唑基、咪唑基、吡唑基、異噁唑基、異噻唑基、噁二唑基、三唑基、噻二唑基等,以及它們的苯並衍生物;或吡啶基、噠嗪基、嘧啶基、吡嗪基、三嗪基等,以及它們的苯並衍生物。
如本文中所使用,術語“鹵代”或“鹵素”基團定義為包括F、Cl、Br或I。
術語“取代”指所指定的原子上的一個或複數(例如一個、兩個、三個或四個)氫被從所指出的基團的選擇代替,條件是未超過所指定的原子在當前情況下的正常原子價並且所述取代形成穩定的化合物。取代基和/或變數的組合僅僅當這種組合形成穩定的化合物時才是允許的。
如果取代基被描述為“任選地被……取代”,則取代基可(1)未被取代或(2)被取代。如果取代基的碳被描述為任選地被取代基列表中的一個或複數取代,則碳上的一個或複數氫(至存在的任何氫的程度)可單獨和/或一起被獨立地選擇的任選的取代基替代。如果取代基的氮被描述為任選地被取代基列表中的一個或複數取代,則氮上的一個或複數氫(至存在的任何氫的程度)可各自被獨立地選擇的任選的取代基替代。
如果取代基被描述為“獨立地選自”一組,則各取代基獨立於另一者被選擇。因此,各取代基可與另一(其他)取代基相同或不同。
如本文中所使用,術語“一個或複數”意指在合理條件下的1個或超過1個,例如2個、3個、4個、5個或10個。
除非指明,否則如本文中所使用,取代基的連接點可來自取代基的任意適宜位置。
當取代基的鍵顯示為穿過環中連接兩個原子的鍵時,則這樣的取代基可鍵連至該可取代的環中的任一成環原子。
術語“立體異構體”表示由於至少一個不對稱中心形成的異構體。在具有一個或複數(例如一個、兩個、三個或四個)不對稱中心的化合物中,其可產生外消旋混合物、單一對映異構體、非對映異構體混合物和單獨的非對映異構體。特定個別分子也可以幾何異構體(順式/反式)存在。類似地,本發明的化合物可以兩種或更多種處於快速平衡的結構不同的形式的混合物(通常稱作互變異構體)存在。互變異構體的代表性實例包括酮-烯醇互變異構體、苯酚-酮互變異構體、亞硝基-肟互變異構體、亞胺-烯胺互變異構體等。要理解,本申請的範圍涵蓋所有這樣的以任意比例(例如60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%)的異構體或其混合物。
本文中可使用實線( )、實楔形( )或虛楔形( )描繪本發明的化合物的碳-碳鍵。使用實線以描繪鍵連至不對稱碳原子的鍵欲表明,包括該碳原子處的所有可能的立體異構體(例如,特定的對映異構體、外消旋混合物等)。使用實或虛楔形以描繪鍵連至不對稱碳原子的鍵欲表明,存在所示的立體異構體。當存在於外消旋混合物中時,使用實及虛楔形以定義相對立體化學,而非絕對立體化學。除非另外指明,否則本發明的化合物意欲可以立體異構體(其包括順式及反式異構體、光學異構體(例如R及S對映異構體)、非對映異構體、幾何異構體、旋轉異構體、構象異構體、阻轉異構體及其混合物)的形式存在。本發明的化合物可表現一種以上類型的異構現象,且由其混合物(例如外消旋混合物及非對映異構體對)組成。
本發明涵蓋本發明的化合物的所有可能的結晶形式或多晶型物,其可為單一多晶型物或多於一種多晶型物的任意比例的混合物。
如本文所述“衍生物”是指母體化合物分子中的原子或原子團被其他原子或原子團取代所形成的化合物,稱為該母體化合物的衍生物。
如本文所述“經修飾的化合物”是指為了便於母體化合物與連接體部分L相連接,對母體化合物引入一些活性基團(如NH 2、OH、COOH、F、Cl、Br、I等),使其能與連接體部分L化學地(共價地)連接在一起。
本發明還包括所有藥學上可接受的同位素化合物,其與本發明的化合物相同,除了一或複數原子被具有相同原子序數但原子品質或質量數不同於在自然界中佔優勢的原子品質或質量數的原子替代。適合包含入本發明的化合物中的同位素的實例包括(但不限於)氫的同位素(例如 2H、 3H);碳的同位素(例如 11C、 13C及 14C);氯的同位素(例如 36Cl);氟的同位素(例如 18F);碘的同位素(例如 123I及 125I);氮的同位素(例如 13N及 15N);氧的同位素(例如 15O、 17O及 18O);磷的同位素(例如 32P);及硫的同位素(例如 35S)。
還應當理解,本發明的某些化合物可以遊離形式存在用於治療,或適當時,以其藥學上可接受的衍生物形式存在。在本發明中,藥學上可接受的衍生物包括但不限於,藥學上可接受的鹽、溶劑合物、代謝物或前藥,在將它們向需要其的患者給藥後,能夠直接或間接提供本發明的化合物或其代謝物或殘餘物。因此,當在本文中提及“本發明的化合物”時,也意在涵蓋化合物的上述各種衍生物形式。
本發明的化合物的藥學上可接受的鹽包括其酸加成鹽及鹼加成鹽。適合的酸加成鹽由形成藥學可接受鹽的酸來形成。適合的鹼加成鹽由形成藥學可接受鹽的鹼來形成。適合的鹽的綜述參見Stahl及Wermuth的“Handbook of Pharmaceutical Salts: Properties, Selection, and Use” (Wiley-VCH, 2002)。用於製備本發明的化合物的藥學上可接受的鹽的方法為本領域技術人員已知的。
本發明的化合物可以溶劑合物(較佳水合物)的形式存在,其中本發明的化合物包含作為該化合物晶格的結構要素的極性溶劑,特別是例如水、甲醇或乙醇。極性溶劑特別是水的量可以化學計量比或非化學計量比存在。
在本發明的範圍內還包括本發明的化合物的代謝物,即在給藥本發明的化合物時體內形成的物質。這樣的產物可由例如被給藥的化合物的氧化、還原、水解、醯胺化、脫醯胺化、酯化、脫脂化、酶解等產生。因此,本發明包括本發明的化合物的代謝物,包括通過使本發明的化合物與哺乳動物接觸足以產生其代謝產物的時間的方法制得的化合物。
本發明在其範圍內進一步包括本發明的化合物的前藥。通常這樣的前藥會是該化合物的官能團衍生物,其易於在體內轉化成期望的治療活性化合物。因此,在這些情況中,用於本發明的治療方法的術語“給藥”應包括用所要求保護的化合物中的一種或多種的前藥形式來治療各種疾病或病症,但是在向個體給藥後該前藥形式在體內轉化成上述化合物。例如,在“Design of Prodrug”, ed. H. Bundgaard, Elsevier, 1985中,描述了選擇和製備適合的前藥衍生物的常規方法。
本發明還涵蓋含有保護基的本發明的化合物。在製備本發明的化合物的任何過程中,保護在任何有關分子上的敏感基團或反應基團可能是必需的和/或期望的,由此形成本發明的化合物的化學保護的形式。這可以通過常規的保護基實現,例如,在Protective Groups in Organic Chemistry, ed. J.F.W. McOmie, Plenum Press, 1973;和T.W. Greene & P.G.M. Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis, John Wiley & Sons, 1991中所述的那些保護基,這些參考文獻通過援引加入本文。使用本領域已知的方法,在適當的後續階段可以移除保護基。
在本申請中,當化學名稱和結構式不一致時,應當以結構式所示為准,除非根據上下文可以推斷化學名稱而非結構式是正確的。
在本申請中,各化合物或基團的代號與其化學式具有唯一對應關係,因此當僅用代號表示該化合物或基團時,應當被理解為與用化學式表示時具有相同含義。 藥物組合物和治療方法
在另一方面,本發明提供藥物組合物,其包含預防或治療有效量的本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥以及一種或多種藥學上可接受的載體。
在另一方面,本發明提供製備藥物組合物的方法,該方法包括將本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥與一種或多種藥學上可接受的載體組合。
在另一方面,本發明提供本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物在製備用於預防或治療蛋白活性異常表達相關疾病的藥物中的用途。
在另一方面,本發明提供本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物在製備用於預防或治療腫瘤相關疾病的藥物中的用途。
在另一方面,本發明提供本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物,其用於預防或治療蛋白活性異常表達相關疾病。
在另一方面,本發明提供本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物,其用於預防或治療腫瘤相關疾病。
在另一方面,本發明提供預防或治療蛋白活性異常表達相關疾病的方法,該方法包括向需要其的個體給藥有效量的本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物。
在另一方面,本發明提供預防或治療腫瘤相關疾病的方法,該方法包括向需要其的個體給藥有效量的本發明的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體、多晶型物、溶劑合物、代謝物或前藥或者本發明的藥物組合物。
上述腫瘤相關疾病包括但不限於鱗狀細胞癌、基底細胞癌、腺癌、肝細胞癌、腎細胞癌、膀胱癌、腸癌、乳腺癌、子宮頸癌、子宮癌、睾丸癌、甲狀腺癌、結腸癌、食管癌、腦癌、腎癌、肝癌、肺癌、頸癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌和胃癌;白血病;良性和惡性淋巴瘤,具體如伯基特淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤;良性和惡性黑色素瘤;骨髓增值性疾病;肉瘤,包括尤文肉瘤、血管肉瘤、卡波西氏肉瘤、脂肪肉瘤、肌肉瘤、周圍神經上皮瘤、滑膜肉瘤、神經膠質瘤、星形細胞瘤、少突神經膠質瘤、室管膜瘤、成膠質細胞瘤、成神經細胞瘤、神經節瘤、神經節神經膠質瘤、成神經管細胞瘤、松果體細胞瘤、腦膜瘤、腦膜肉瘤、神經纖維瘤和神經鞘瘤;霍奇金氏病、威爾姆斯腫瘤或畸胎瘤。
本發明中“藥學上可接受的載體”是指與治療劑一同給藥的稀釋劑、輔劑、賦形劑或媒介物,並且其在合理的醫學判斷的範圍內適於接觸人類和/或其它動物的組織而沒有過度的毒性、刺激、過敏反應或與合理的益處/風險比相應的其它問題或併發症。
在本發明的藥物組合物中可使用的藥學上可接受的載體包括但不限於無菌液體,例如水和油,包括那些石油、動物、植物或合成來源的油,例如花生油、大豆油、礦物油、芝麻油等。當該藥物組合物通過靜脈內給藥時,水是示例性載體。還可以使用生理鹽水和葡萄糖及甘油水溶液作為液體載體,特別是用於注射液。適合的藥物賦形劑包括澱粉、葡萄糖、乳糖、蔗糖、明膠、麥芽糖、白堊、矽膠、硬脂酸鈉、單硬脂酸甘油酯、滑石、氯化鈉、脫脂奶粉、甘油、丙二醇、水、乙醇等。該組合物還可以視需要包含少量的濕潤劑、乳化劑或pH緩衝劑。口服製劑可以包含標準載體,如藥物級的甘露醇、乳糖、澱粉、硬脂酸鎂、糖精鈉、纖維素、碳酸鎂等。適合的藥學上可接受的載體的實例如在Remington’s Pharmaceutical Sciences (1990)中所述。
本發明的藥物組合物可以系統地作用和/或局部地作用。為此目的,它們可以適合的途徑給藥,例如通過注射(如靜脈內、動脈內、皮下、腹膜內、肌內注射,包括滴注)或經皮給藥;或通過口服、含服、經鼻、透粘膜、局部、以眼用製劑的形式或通過吸入給藥。
對於這些給藥途徑,可以適合的劑型給藥本發明的藥物組合物。該劑型包括但不限於片劑、膠囊劑、錠劑、硬糖劑、散劑、噴霧劑、乳膏劑、軟膏劑、栓劑、凝膠劑、糊劑、洗劑、軟膏劑、水性混懸劑、可注射溶液劑、酏劑、糖漿劑。
如本文中所使用的術語“有效量”指被給藥後會在一定程度上緩解所治療病症的一種或多種症狀的化合物的量。
可調整給藥方案以提供最佳所需回應。例如,可給藥單次推注,可隨時間給藥數個分劑量,或可如治療情況的急需所表明而按比例減少或增加劑量。要注意,劑量值可隨要減輕的病況的類型及嚴重性而變化,且可包括單次或多次劑量。要進一步理解,對於任何特定個體,具體的給藥方案應根據個體需要及給藥組合物或監督組合物的給藥的人員的專業判斷來隨時間調整。
所給藥的本發明的化合物的量會取決於所治療的個體、病症或病況的嚴重性、給藥的速率、化合物的處置及處方醫師的判斷。一般而言,有效劑量在每日每kg體重約0.0001至約50 mg,例如約0.01至約10 mg/kg/日(單次或分次給藥)。對70 kg的人而言,這會合計為約0.007 mg/日至約3500 mg/日,例如約0.7 mg/日至約700 mg/日。在一些情況下,不高於前述範圍的下限的劑量水平可以是足夠的,而在其它情況下,仍可在不引起任何有害副作用的情況下採用較大劑量,條件是首先將該較大劑量分成數個較小劑量以在一整天中給藥。
本發明的化合物在藥物組合物中的含量或用量可以是約0.01 mg至約1000 mg。
除非另外說明,否則如本文中所使用,術語“治療(treating)”意指逆轉、減輕、抑制這樣的術語所應用的病症或病況或者這樣的病症或病況的一種或多種症狀的進展,或預防這樣的病症或病況或者這樣的病症或病況的一種或多種症狀。
如本文所使用的“個體”包括人或非人動物。示例性人個體包括患有疾病(例如本文所述的疾病)的人個體(稱為患者)或正常個體。本發明中“非人動物”包括所有脊椎動物,例如非哺乳動物(例如鳥類、兩棲動物、爬行動物)和哺乳動物,例如非人靈長類、家畜和/或馴化動物(例如綿羊、犬、貓、奶牛、豬等)。 發明效果
本發明的PROTAC分子可以降解兩個靶蛋白,達到藥效上的協同效應,或提高對單一靶蛋白的降解效率。本發明提供的化合物成藥性好,具有高效、低毒、克服耐藥性等優勢。 合成方案
化合物V-1或VI-1的合成 其中:R 7、R 8、R 9為上文定義的D或G,且R 7、R 8和R 9不同時為D或不同時為G,r1、r2、r3為0到30之間的整數。 第一步:Ⅴ-a/VI-a和Ⅴ-b/VI-b在縮合劑作用下反應,所得產物經還原得到化合物Ⅴ-c/VI-c; 該縮合劑為EEDQ、HOBT、HBTU、TBTU、HATU等,還原劑為NaBH 4、Pd/H 2、LAH、PPh 3等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至50℃; 第二步:化合物Ⅴ-c/VI-c和化合物Ⅴ-d/VI-d在縮合劑作用下縮合,所得產物再用酸脫保護得到化合物Ⅴ-e/VI-e; 該縮合劑為EEDQ、HOBT、HBTU、TBTU、HATU等,酸為TFA、HOAc、HBr、HCl等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至50℃; 第三步:化合物Ⅴ-e/VI-e和化合物Ⅴ-f /VI-f在縮合劑作用下縮合,所得產物再用鹼脫保護得到化合物Ⅴ-g/VI-g; 該縮合劑為EEDQ、HOBT、HBTU、TBTU、HATU等,鹼為二乙胺、三乙胺、氨水、呱啶、乙醇胺、環己胺等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至50℃; 第四步:化合物Ⅴ-g/VI-g和化合物Ⅴ-h/VI-h縮合劑作用下縮合,所得產物再用酸脫保護得到通式化合物Ⅴ-1或VI-1; 該縮合劑為EEDQ、HOBT、HBTU、TBTU、HATU等,酸為TFA、HOAc、HBr、HCl等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至50℃。
化合物V-2或VI-2的合成 其中:R 10、R 11、R 12為上文定義的D或G,且R 10、R 11和R 12不同時為D或不同時為G,r1、r2、r3為0到30之間的整數; 第一步:化合物V-2-a/Ⅵ-2-a和化合物V-2-b/Ⅵ-2-b在縮合劑作用下縮合,所得產物再用酸脫保護得到化合物V-2-c/Ⅵ-2-c; 該縮合劑為EEDQ、HOBT、HBTU、TBTU、HATU等,酸為TFA、HOAc、HBr、HCl等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至50℃; 第二步:化合物V-2-c/Ⅵ-2-c和化合物V-2-d/Ⅵ-2-d在鹼性條件下縮合得到化合物V-2-e/Ⅵ-2-e; 該鹼為碳酸鉀、碳酸銫、碳酸鈉、NaOH等,溶劑為THF、CH 3CN、DMF、DMSO、1,4-二氧六環或丙酮等,溫度為0℃至80℃; 第三步:化合物V-2-e/Ⅵ-2-e和化合物V-2-f/Ⅵ-2-f在鹼性條件下縮合得到化合物V-2-g/Ⅵ-2-g; 該鹼為碳酸鉀、碳酸銫、碳酸鈉、二乙胺、三乙胺、環己胺等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至50℃; 第四步:化合物V-2-g/Ⅵ-2-g和化合物V-2-h/Ⅵ-2-h在縮合劑作用下縮合得到化合物V-2/Ⅵ-2; 該縮合劑為EEDQ、HOBT、HBTU、TBTU、HATU等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至50℃。
化合物V-3或VI-3的合成 其中:R 13、R 14、R 15為上文定義的D或G,且R 13、R 14和R 15不同時為D或不同時為G,r1、r2、r3為0到30之間的整數; 第一步:化合物V-3-a/VI-3-a和化合物V-3-b/VI-3-b在縮合劑作用下縮合,所得產物再用鐵粉還原得到化合物V-3-c/VI-3-c; 該縮合劑為EEDQ、HOBT、HBTU、TBTU、HATU等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至50℃; 第二步:化合物V-3-c/VI-3-c和化合物V-3-d/VI-3-d在縮合劑作用下縮合得到化合物V-3-e/VI-3-e; 該縮合劑為EEDQ、HOBT、HBTU、TBTU、HATU等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至50℃; 第三步:化合物V-3-e/VI-3-e和化合物V-3-f/VI-3-f在鈀催化下偶聯得到化合物V-3-g/VI-3-g; 該鈀催化劑為Pd(PPh) 2Cl 2、Pd(PPh 3) 4、Pd(dppf) 2Cl 2等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至90℃; 第四步:化合物V-3-g/VI-3-g和化合物V-3-h/VI-3-h在縮合劑作用下縮合得到通式化合物V-3或VI-3; 該縮合劑為EEDQ、HOBT、HBTU、TBTU、HATU等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至50℃。
化合物V-4或VI-4的合成 其中:R 16、R 17、R 18為上文定義的D或G,且R 16、R 17和R 18不同時為D或不同時為G,r1、r2、r3為0到30之間的整數; 第一步:化合物V-4-a/VI-4-a和化合物V-4-b/VI-4-b在鹼性條件下縮合,所得產物的羥基再用磺醯基保護得到化合物V-4-c/VI-4-c; 該鹼為碳酸鉀、碳酸銫、碳酸鈉、二乙胺、三乙胺、環己胺等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至90℃; 第二步:化合物V-4-c/VI-4-c和化合物V-4-d/VI-4-d在鹼性條件下縮合得到化合物V-4-e/VI-4-e; 該鹼為碳酸鉀、碳酸銫、碳酸鈉、NaOH等,溶劑為THF、CH 3CN、DMF、DMSO、1,4-二氧六環或丙酮等,溫度為0℃至80℃; 第三步:化合物V-4-e/VI-4-e和化合物V-4-f /VI-4-f在縮合劑作用下縮合得到通式化合物V-4或VI-4; 該縮合劑為EEDQ、HOBT、HBTU、TBTU、HATU等,溶劑為THF、DMF、DCM或DCE等,溫度為0℃至50℃。
實施例
以下結合實施例進一步描述本發明,但提供這些實施例並非意在限制本發明的範圍。
除非另外說明,均使用市售的無水溶劑和HPLC級溶劑而不經進一步的純化。
用Bruker儀器(400 MHz)在室溫下記錄 1H NMR光譜,使用TMS為內標。化學位移(δ)以ppm為單位給出,耦合常數( J)以赫茲(Hz)為單位給出。 1H NMR波譜峰的裂分重數縮寫如下:s:單峰(singlet)、d:二重峰(doublet)、t:三重峰(triplet)、q:四重峰(quartet)、dd:雙二重峰(double doublet)、qd:四二重峰(quartet doublet)、ddd:雙雙二重峰(double double doublet)、ddt:雙雙三重峰(double double triplet)、dddd:雙雙雙二重峰(double double double doublet)、m:多重峰(multiplet)、br:寬峰(broad)。
質譜(MS)測定使用Agilent (ESI)質譜儀,型號為Agilent 6120B。
本發明中的縮寫具有以下含義:
縮寫 含義 縮寫 含義
Fmoc 笏甲氧羰基 MMT 對甲氧基三苯甲基
Boc 叔丁氧羰基 EEDQ 2-乙氧基-1-乙氧碳醯基-1,2-二氫喹啉
HOBT 1-羥基苯並三唑 HBTU 苯並三氮唑-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸鹽
HATU 2-(7-氧化苯並三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸鹽 TBTU 2-(1H-苯並三偶氮L-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲四氟硼酸鹽
THF 四氫呋喃 DMF N,N-二甲基甲醯胺
DCM 二氯甲烷 DCE 1,2-二氯乙烷
TFA 三氟乙酸 HOAc 醋酸
PPh3 三苯基膦 DMSO 二甲基亞碸
DMAP 4-二甲氨基吡啶 TIPS 三異丙基矽烷
DIPEA N,N-二異丙基乙胺 Et 3N 三乙胺
Ts 對甲苯磺醯基 LAH 氫化鋁鋰
dppf 1,1'-雙(二苯基膦)二茂鐵 Ile 異亮氨酸
Leu 亮氨酸 Ala 丙氨酸
Pro 脯氨酸 Tyr 酪氨酸
DMSO-d6 氘化二甲基亞碸 Arg Arginase(精氨酸酶)
CD 3OD 氘化甲醇 CDCl 3 氘化氯仿
min 分鐘 Prep-HPLC 製備高效液相層析
ESI-MS 電噴霧質譜 m/z 質荷比
JAK Janus Kinase(Janus激酶) BTK Bruton Tyrosine Kinase(布魯頓酪氨酸激酶)
HIV Human Immunodeficiency Virus(人類免疫缺陷病毒) VEGFR Vascular Endothelial Growth Factor Receptor(血管內皮細胞生長因數受體)
MEK Mitogen-Activated Extracellular Signal-Regulated Kinase(絲裂原活化的細胞外信號調節激酶) HER2 Human Epidermal Growth Factor Receptor 2(人表皮生長因數受體2)
IGF-1R Insulin-Like Growth Factor-1 Receptor(胰島素樣生長因數1受體) WEE1 Wee1蛋白激酶
ABL Abelson Tyrosine Kinase(Abelson酪氨酸激酶) ER Estrogen Receptor(雌激素受體)
JNK1 C-Jun N-Terminal Kinase1(c-Jun氨基末端激酶1) ROR1 Receptor Tyrosine Kinase-Like Orphan Receptor-1(受體酪氨酸激酶樣孤兒受體1)
NP Nuclear Protein(核蛋白) FXR Farnesoid X Receptor(核受體法尼酯衍生物X受體)
PXR Pregnane X Receptor(孕烷X受體) TBK1 Tank Binding Kinase 1(TANK結合激酶1)
Bcl-2 B-Cell Lymphoma-2(B淋巴細胞瘤-2基因) HPV Human Papilloma Virus(人類乳突病毒)
MYC Myc蛋白 RAS Ras激酶
CBFβ Core-Binding Factor Beta(核心結合因數β) eIF4E Eukaryotic Translation Initiation Factor 4e(真核翻譯起始因數4E)
BCR-Abl Breakpoint Cluster Region- Abelson Tyrosine Kinase(斷裂點簇集區–Abelson酪氨酸激酶) RIPK2 Receptor-Interacting Serine/Threonine-Protein Kinase 2(受體相互作用的絲氨酸蘇氨酸激酶2)
IDO Indoleamine 2,3-Dioxygenase(吲哚胺-2,3雙加氧酶) mTOR Mammalian Target Of Rapamycin(哺乳動物雷帕黴素靶蛋白)
ATR Ataxia Telangiectasia And Rad3-Related Kinase(共濟失調毛細血管擴張症Rad3相關激酶) Hsp90 Heat Shock Protein 90(熱休克蛋白90)
HCV Hepatitis C Virus(C型肝炎病毒) EGFR Epithelial Growth Factor Receptor(表皮生長因數受體)
HDAC Histone Deacetylase(組蛋白去乙醯化酶) ALK Anaplastic Lymphoma Kinase(間變性淋巴瘤激酶)
PARP Poly(ADP-Ribose)Polymerase(聚腺苷酸二磷酸核糖轉移酶) CDK Cyclin-Dependent Protein Kinases(週期蛋白依賴性激酶)
AR Androgen Receptor(雄激素受體) BRD9 Bromodomain Containing Protein 9(溴結構域蛋白9)
Nrf2 Nuclear Factor Erythroid 2-Related Factor 2(轉錄因數NF-E2相關因數2) PA Polymerase Acidic(酸性聚合酶)
PB1 Polymerase Basic-1(鹼性聚合酶Ⅰ) PB2 Polymerase Basic-2(鹼性聚合酶Ⅱ)
NA Neuraminidase(神經氨酸酶) HBX Hepatitis B Virus X Protein(B型肝炎病毒X蛋白)
RTKs Receptor Tyrosine Kinase(受體酪氨酸激酶) HDM2 Human Double Minute 2 Protein(人雙微體2蛋白)
IL-2 Interleukin-2(白細胞介素-2) TNF Tumor Necrosis Factor(腫瘤壞死因數)
MCL1 Myeloid Cell Lekemia-1(骨髓細胞白血病基因-1) Src Src激酶
SMMHC Vascular Smooth Muscle Myosin Heavy Chain(血管平滑肌肌球蛋白重鏈) KLF4 Krüppel-Like Factor4(Krüppel樣因數4)
FKBP12 FK506 Binding Protein 12(FK506結合蛋白12) FKBP FK506 Binding Protein (FK506結合蛋白)
BRD2 Bromodomain-containing protein 2(含溴結構域的蛋白質2) BRD3 Bromodomain-containing protein 3(含溴結構域的蛋白質3)
BRD4 Bromodomain-containing protein 4(含溴結構域的蛋白質4) GAPDH glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)
h/hr 小時      
實施例一:(2S,4R)-1-((2S)-2-(叔丁基)-23-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-6-(2-(2-(2-(2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)乙氧基)乙氧基)乙基)-4,7,11,22-四氧代-9,15,18-三氧雜-3,6,12,21-四氮雜二十三烷-1-醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物17)
第一步:(2-(2-(2-(2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)乙氧基)乙氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(化合物17-2)的製備 將化合物17-1(470.0 mg,1.17 mmol,基於文獻 Nature468,1067–1073合成)和2-(7-氧化苯並三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸鹽(891.6 mg,2.34 mmol)溶於N ,N-二甲基甲醯胺(20.0 mL)中,25℃攪拌5分鐘,然後加入(2-(2-(2-氨基乙氧基)乙氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(349.4 mg,1.41 mmol)和N ,N-二異丙基乙胺(454.6 mg,3.52 mmol),加完後25℃攪拌2小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=25/1)分離純化得到目標化合物17-2(703.0 mg,產率95.1%),ESI-MS (m/z):632.2 [M+1] +
第二步:N-(2-(2-(2-氨基乙氧基)乙氧基)乙基)-2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯胺(化合物17-3)的製備 將化合物17-2(470.0 mg,1.17 mmol)溶於含有4M HCl的1,4-二氧六環溶液(15.0 mL)中,25℃攪拌1小時。反應完畢後將反應溶液濃縮乾,得到目標化合物17-3的鹽酸鹽粗產物,直接用於下一步反應。
第三步:(2S,4R)-1-((S)-2-(2-溴乙醯氨基)-3,3-二甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物17-5)的製備 將化合物17-4(400 mg,0.85 mmol)溶於二氯甲烷(30.0 mL)中,冰水浴冷卻,然後依次加入三乙胺(260.0 mg,2.57 mmol)和溴乙醯溴(181.5 mg,0.90 mmol),加完後25℃攪拌2小時。加水淬滅,用乙酸乙酯萃取,無水硫酸鈉乾燥,過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=15/1)分離純化得到目標化合物17-5(470.0 mg,產率99.5%),ESI-MS (m/z):522.2 [M+1] +
第四步:(2S,4R)-1-((2S)-2-(叔丁基)-17-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-4,16-二氧代-9,12-二氧雜-3,6,15-三氮雜十七烷-1-醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物17-6)的製備 將化合物17-3(74.0 mg,0.13 mmol,鹽酸鹽)和17-5(60.0 mg,0.11 mmol)溶於N,N-二甲基甲醯胺(3.0 mL)中,加入三乙胺(55.0 mg,0.54 mmol)後25℃攪拌18小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=8/1)分離純化得到目標化合物17-6(30 mg,產率26.15%),ESI-MS (m/z):1002.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ 8.67 (s,1H),8.07 (d, J= 39.7 Hz,1H),7.86 (d, J= 20.4 Hz,1H),7.42 – 7.37 (m,2H),7.35 – 7.29 (m,6H),4.80 (t, J= 7.6 Hz,1H),4.67 (t, J= 7.0 Hz,1H),4.53 (ddd, J= 25.5,16.6,9.8 Hz,4H),4.34 (td, J= 14.9,5.3 Hz,1H),4.13 – 4.04 (m,1H),3.72 – 3.53 (m,15H),3.48 – 3.41 (m,3H),2.94 (s,2H),2.62 (d, J= 2.9 Hz,3H),2.51 (s,3H),2.39 (s,3H),1.66 (s,3H),1.00 (dd, J= 24.6,6.1 Hz,8H)。
第五步:1-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-2,13-二氧代-6,9,15-三氧雜-3,12-二氮雜十七烷-17-酸(化合物17-7)的製備 將化合物17-3(80.0 mg,0.14 mmol,鹽酸鹽)溶於四氫呋喃(10.0 mL)中,依次加入1,4-二惡烷-2,6-二酮(49.1 mg,0.42 mmol)和三乙胺(71.3 mg,0.7 mmol),加完後25℃攪拌2小時。加水淬滅反應,用乙酸乙酯萃取,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=8/1)純化得到目標化合物17-7(86.0 mg,94.3%),ESI-MS (m/z):647.2 [M+1] +
第六步:化合物17的製備 將化合物17-7(19.4 mg,0.03 mmol)和2-(7-氧化苯並三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸鹽(11.4 mg,0.03 mmol)溶於N ,N-二甲基甲醯胺(2.0 mL)中,25℃攪拌5分鐘,然後加入化合物17-6(15.0 mg,0.015 mmol)和N ,N-二異丙基乙胺(19.4 mg,0.15 mmol),加完後25℃攪拌2小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經Prep-HPLC分離純化得到目標化合物17(13.0 mg,53.2%),ESI-MS (m/z):1629.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ 8.65 (s,1H),7.52 (s,1H),7.47 – 7.28 (m,15H),4.87 – 4.56 (m,4H),4.56 – 4.36 (m,4H),3.70 – 3.35 (m,22H),2.63 (s,6H),2.49 (s,3H),2.39 (s,6H),2.01 – 1.75 (m,16H),1.66 (s,6H),0.97 (s,9H)。
Prep-HPLC分離方法: 儀器型號:Agilent 1260。 製備柱:Waters XBridge C18 OBD (5μm*19mm*150mm)。 層析柱溫:25℃。 流速:20 mL/min。 檢測波長:254 nm。 流動相:A:乙腈;B:0.05%碳酸氫銨水溶液。 梯度:0-16min:30%-90% A,70-10% B。 化合物收集時間:8.5-8.9 min。
實施例二:N1-(2-(2-(2-(2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)乙氧基)乙氧基)乙基)-N4-(3-(2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)丙基)-N1-(2-(((S)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨甲醯基)吡咯烷-1-基)-3,3-二甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)-2-氧代乙基)琥珀醯胺(化合物18)
第一步: (3-(2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)丙基)氨基甲酸叔丁酯(化合物18-1)的製備 將化合物17-1(100.0 mg,0.25 mmol)和2-(7-氧化苯並三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸鹽(189.7 mg,0.5 mmol)溶於N ,N-二甲基甲醯胺(3.0 mL)中,25℃攪拌5分鐘,然後加入N-叔丁氧羰基-1,3-丙二胺(86.9 mg,0.5 mmol)和N ,N-二異丙基乙胺(96.7 mg,0.75 mmol),加完後25℃攪拌2小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=20/1)分離純化得到目標化合物18-1(136.0 mg,產率97.8%),ESI-MS (m/z):558.2 [M+1] +
第二步:N-(3-氨基丙基)-2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯胺(化合物18-2)的製備 將化合物18-1(136.0 mg,0.24 mmol)溶於含有4M HCl的1,4-二氧六環溶液(4.0 mL)中,25℃攪拌1小時。反應完畢後將反應溶液濃縮乾,得到目標化合物18-2的鹽酸鹽粗產物,直接用於下一步反應。
第三步:4-((3-(2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)丙基)氨基)-4-氧代丁酸(化合物18-3)的製備 將化合物18-2(120.1 mg,0.24 mmol,鹽酸鹽)溶於二氯甲烷(10.0 mL)中,依次加入三乙胺(126.2 mg,1.25 mmol)、丁二酸酐(99.8 mg,0.6 mmol)和4-二甲氨基吡啶(6.0 mg,0.05 mmol),加完後25℃攪拌2小時。加水淬滅反應,用乙酸乙酯萃取,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=6/1)分離純化得到目標化合物18-3(137.6 mg,產率99.1%),ESI-MS (m/z):558.2 [M+1] +
第四步:化合物18的製備 將化合物18-3(44.5 mg,0.08 mmol)和2-(7-氧化苯並三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸鹽(30.4 mg,0.08 mmol)溶於N ,N-二甲基甲醯胺(2.0 mL)中,25℃攪拌5分鐘,然後加入化合物17-6(40.0 mg,0.04 mmol)和N ,N-二異丙基乙胺(15.5 mg,0.12 mmol),加完後25℃攪拌2小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經Prep-HPLC分離純化得到目標化合物18(13.0 mg,產率20.5%),ESI-MS (m/z):1539.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ 8.79 (s,1H),7.95 (dd, J= 33.0,8.0 Hz,4H),7.41 (s,4H),7.33 (s,8H),4.69 (d, J= 43.9 Hz,8H),4.51 – 4.28 (m,10H),3.63 (s,10H),3.49 (s,2H),2.68 (s,6H),2.50 (d, J= 7.8 Hz,4H),2.41 (s,5H),2.13 (s,10H),1.67 (s,6H),0.98 (s,9H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 化合物收集時間:8.7-9.1 min。
實施例三:(2S,4R)-1-((2S)-2-(叔丁基)-20-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-6-(2-(2-(2-(2-(4-(4-氯苯基)- 2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)乙氧基)乙氧基)乙基)-4,7,19-三氧代-12,15-二氧雜-3,6,9,18-四氮雜二十烷-1-醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物19)
第一步:(2S,4R)-1-((2S)-6-(2-溴乙醯基)-2-(叔丁基)-17-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-4,16-二氧代-9,12-二氧雜-3,6,15-三氮雜十七烷-1-醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物19-1)的製備 將化合物17-6(40.0 mg,0.04 mmol)溶於二氯甲烷(3.0 mL)中,冰水浴冷卻,然後依次加入三乙胺(10.2 mg,0.1 mmol)和溴乙醯溴(10.0 mg,0.05 mmol),加完後25℃攪拌2小時。加水淬滅反應,用乙酸乙酯萃取,有機相用無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=20/1)分離純化得到目標化合物19-1(25.0 mg,產率56.1%),ESI-MS (m/z):1123.1 [M+1] +
第二步:化合物19的製備 將化合物17-3(25.0 mg,0.04 mmol,鹽酸鹽)和19-1(25.0 mg,0.02 mmol)溶於N ,N-二甲基甲醯胺(2.0 mL)中,加入三乙胺(10.2 mg,0.1 mmol)後25℃攪拌18小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經Prep-HPLC分離純化得到目標化合物19(2.0 mg,產率6.2%),ESI-MS (m/z):1571.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ: 8.67 (s,1H),8.01-7.74 (m,3H),7.52-7.37 (m,5H),7.33-7.28 (m,8H),4.79-4.59 (m,4H),4.52-4.21 (m,5H),4.15-3.88 (m,1H),3.75-3.33 (m,32H),2.82 (s,2H),2.64-2.62 (m,6H),2.50 (s,3H),2.39 (s,6H),1.66 (s,6H),0.97-0.92(m,9H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 化合物收集時間:9.5-10.0 min。
實施例四:(2S,4R)-1-((R)-17-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-2-(2-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)硫基)丙-2-基)-4,16-二氧代-6,9,12-三氧雜-3,15-二氮雜十七烷-1-醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物20)
第一步: ((R)-4-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-3,3-二甲基-6-氧代-1,1,1-三苯基-8,11,14-三氧雜-2-硫雜-5-氮雜十六烷-16-基)氨基甲酸叔丁酯(化合物20-3)的製備 將化合物20-2(300.0 mg,0.98 mmol)和2-(7-氧化苯並三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸鹽(438.0 mg,1.15 mmol)溶於N ,N-二甲基甲醯胺(4.0 mL)中,25℃攪拌5分鐘,然後加入化合物20-1(613.1 mg,0.89 mmol)和N ,N-二異丙基乙胺(172.3mg,1.33 mmol),加完後25℃攪拌2小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=20/1)分離純化得到目標化合物20-3(791.0 mg,產率90.9%)。
第二步:(R)-13-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-14-巰基-14-甲基-11-氧代-3,6,9-三氧雜-12-氮雜十五烷)氨基甲酸叔丁酯(化合物20-4)的製備 將化合物20-3(200.0 mg,0.2 mmol)溶於DCM(6.0 mL)中,依次加入三異丙基矽烷(0.3 mL)和三氟乙酸(0.2 mL),加完後25℃攪拌1小時。加入水淬滅反應,用乙酸乙酯萃取,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=20/1)分離純化得到目標化合物20-4(127.3 mg,產率84.4%),ESI-MS (m/z):738.3 [M+1] +
第三步:二(叔丁基)((R)-13-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-14,14-二甲基-11-氧代-3,6,9-三氧雜-15-硫雜-12-氮雜二十一烷-1,21-二基)二氨基甲酸酯(化合物20-6)的製備 將化合物20-4(70.0 mg,0.095 mmol)和20-5(38.8 mg,0.104 mmol)溶於N ,N-二甲基甲醯胺(3.0 mL)中,加入1,8-二氮雜二環十一碳-7-烯(28.9 mg,0.19 mmol)後25℃攪拌3小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=20/1)分離純化得到目標化合物20-6(61.0 mg,產率68.6%),ESI-MS (m/z):937.4 [M+1] +
第四步:(2S,4R)-1-((R)-14-氨基-2-(2-((6-氨基己基)硫基)丙-2-基)-4-氧代-6,9,12-三氧雜-3-氮雜十四烷-1-醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物20-7)的製備 將化合物20-6(50.0 mg,0.053 mmol)溶於二氯甲烷(4.0 mL)中,然後滴入三氟乙酸(0.5 mL),25℃下攪拌2小時。反應完畢後將反應液直接濃縮乾,得到化合物20-7的三氟乙酸鹽粗產物(51.0 mg,產率100%),ESI-MS (m/z):738.5 [M+1] +,直接用於下一步反應。
第五步:化合物20的製備 將化合物20-8(43.5 mg,0.11 mmol,光學純,採購自商業產品)溶於N ,N-二甲基甲醯胺(2.0 mL)中,25℃攪拌5分鐘,然後加入N ,N-二異丙基乙胺(64.5 mg,0.5 mmol)和化合物20-7(50.0 mg,0.05 mmol,三氟乙酸鹽),加完後25℃攪拌2小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經Prep-HPLC分離純化得到目標化合物20(34.0 mg,產率42.4%),ESI-MS (m/z):1501.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ 8.69 (s,1H),7.82 (s,1H),7.62 (t, J= 5.8 Hz,1H),7.50 (d, J= 9.3 Hz,1H),7.39 (d, J= 8.3 Hz,4H),7.36 – 7.28 (m,8H),7.17 (s,1H),5.04 (d, J= 9.3 Hz,1H),4.79 (t, J= 7.7 Hz,1H),4.66 (dd, J= 14.5,7.5 Hz,2H),4.55 – 4.34 (m,3H),4.23 (d, J= 15.9 Hz,1H),4.17 – 4.00 (m,2H),3.80 (dd, J= 10.7,4.0 Hz,1H),3.75 – 3.47 (m,13H),3.47 – 3.19 (m,6H),2.66 (s,3H),2.63 (s,3H),2.57 (t, J= 7.3 Hz,3H),2.51 (s,3H),2.40 (d, J= 2.7 Hz,6H),2.29 (dd, J= 7.3,3.9 Hz,3H),1.66 (s,6H),1.53 – 1.43 (m,4H),1.35 (d, J= 8.7 Hz,8H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:24 mL/min。 化合物收集時間:8.9-9.2 min。
實施例五:(2S,4R)-1-((R)-2-(6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己醯氨基)-3-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物21)
第一步: (6-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-甲基-1-氧代-3-(三苯甲基硫基)丁-2-基)氨基)-6-氧代己基)氨基甲酸叔丁酯(化合物21-2)的製備 參考實施例四第一步化合物20-3的製備方法,得到化合物21-2。
第二步: (6-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-巰基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)-6-氧代己基)氨基甲酸叔丁酯(化合物21-3)的製備 參考實施例四第二步化合物20-4的製備方法,得到化合物21-3,ESI-MS (m/z):662.2 [M+1] +
第三步:二(叔丁基)((R)-8-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-9,9-二甲基-6-氧代-10-硫雜-7-氮雜十六烷-1,16-二基)二氨基甲酸酯(化合物21-4)的製備 參考實施例四第三步化合物20-6的製備方法,得到化合物21-4,ESI-MS (m/z):862.3 [M+1] +
第四步:(2S,4R)-1-((R)-2-(6-氨基己醯氨基)-3-((6-氨基己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物21-5)的製備 參考實施例四第四步化合物20-7的製備方法,得到化合物21-5,ESI-MS (m/z):661.3 [M+1] +
第五步:化合物21的製備 參考實施例四第五步化合物20的製備方法,得到化合物21,ESI-MS (m/z):1425.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CD 3OD) δ: 8.86 (s,1H),7.44-7.37 (m,12H),4.94 (s,1H),4.63-4.57 (m,3H),4.48 (t, J= 7.6 Hz,2H),4.36 (d, J= 15.6 Hz,1H),3.95 (d, J= 10.8 Hz,1H),3.84 (dd, J 1 = 10.8, J 2 = 4.0 Hz,1H),3.40 (dd, J 1 = 14.4, J 2 = 9.2 Hz,2H),3.28-3.22 (m,4H),3.21-3.16 (m,1H),2.68 (s,6H),2.55 (t, J= 7.2 Hz,2H),2.45 (s,3H),2.42 (s,6H),2.35-2.23 (m,3H),2.12-2.05 (m,1H),1.67 (s,6H),1.58-1.28 (m,22H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:26 mL/min。 化合物收集時間:9-9.5 min。
實施例六:(2S,4R)-1-((R)-3-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)硫基)-2-(8-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)辛醯氨基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物22)
第一步: (8-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-甲基-1-氧代-3-(三苯甲基硫基)丁-2-基)氨基)-8-氧代辛基)氨基甲酸叔丁酯(化合物22-2)的製備 參考實施例四第一步化合物20-3的製備方法,得到化合物22-2。
第二步:(8-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-巰基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)-8-氧代辛基)氨基甲酸叔丁酯(化合物22-3)的製備 參考實施例四第二步化合物20-4的製備方法,得到化合物22-3,ESI-MS (m/z):689.3 [M+1] +
第三步:二叔丁基((R)-9-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-8,8-二甲基-11-氧代-7-硫雜-10-氮雜十八烷-1,18-二基)二氨基甲酸酯(化合物22-4)的製備 參考實施例四第三步化合物20-6的製備方法,得到化合物22-4,ESI-MS (m/z):890.4 [M+1] +
第四步:(2S,4R)-1-((R)-3-((6-氨基己基)硫基)-2-(8-氨基辛醯氨基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物22-5)的製備 參考實施例四第四步化合物20-7的製備方法,得到化合物22-5,ESI-MS (m/z):689.3 [M+1] +
第五步:化合物22的製備 參考實施例四第五步化合物20的製備方法,得到化合物22,ESI-MS (m/z):1453.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CD 3OD) δ: 8.86 (s,1H),7.44-7.37 (m,12H),4.93 (s,1H),4.63-4.55 (m,3H),4.49 (d, J= 11.6 Hz,2H),4.37 (d, J= 15.6 Hz,1H),3.93 (d, J= 11.2 Hz,1H),3.84 (dd, J 1 = 10.8, J 2 = 4.0 Hz,1H),3.40 (dd, J 1 = 15.2, J 2 = 9.2 Hz,2H),3.28-3.22 (m,5H),3.19-3.14 (m,1H),2.68 (s,6H),2.55 (t, J= 7.2 Hz,2H),2.45 (s,3H),2.42 (s,6H),2.34-2.20 (m,4H),2.12-2.05 (m,1H),1.67 (s,6H),1.56-1.27 (m,24H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:24 mL/min。 化合物收集時間:9.9-10.0 min。
實施例七:(2S,4R)-1-((R)-2-(10-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)癸醯氨基)-3-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物23)
第一步:(10-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-甲基-1-氧代-3-(三苯甲基硫基)丁-2-基)氨基)-10-氧代癸基)氨基甲酸叔丁酯(化合物23-2)的製備 參考實施例四第一步化合物20-3的製備方法,得到化合物23-2。
第二步:(10-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-巰基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)-10-氧代癸基)氨基甲酸叔丁酯(化合物23-3)的製備 參考實施例四第二步化合物20-4的製備方法,得到化合物23-3,ESI-MS (m/z):718.3 [M+1] +
第三步:二叔丁基((R)-12-((2S,4R)-4-羥基-2 -((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-13,13-二甲基-10-氧代-14-硫雜-11-氮雜二十烷-1,20-二基)二氨基甲酸酯(化合物23-4)的製備 參考實施例四第三步化合物20-6的製備方法,得到化合物23-4,ESI-MS (m/z):917.4 [M+1] +
第四步:(2S,4R)-1-((R)-2-(10-氨基癸醯氨基)-3-((6-氨基己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物23-5)的製備 參考實施例四第四步化合物20-7的製備方法,得到化合物23-5,ESI-MS (m/z):717.3 [M+1] +
第五步:化合物23的製備 參考實施例四第五步化合物20的製備方法,得到化合物23,ESI-MS (m/z):1481.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ 8.73 (s,1H),7.47 (t, J= 5.3 Hz,1H),7.43 – 7.36 (m,5H),7.36 – 7.30 (m,8H),6.85 (t, J= 5.5 Hz,1H),6.41 (d, J= 8.9 Hz,1H),4.97 (d, J= 8.9 Hz,1H),4.75 – 4.62 (m,3H),4.50 – 4.42 (m,3H),4.02 (d, J= 10.7 Hz,1H),3.74 (dd, J= 10.7,4.2 Hz,1H),3.60 – 3.50 (m,2H),3.35 (dd, J= 14.3,6.6 Hz,3H),3.24 (ddd, J= 28.6,14.4,8.4 Hz,4H),2.67 (s,6H),2.57 (d, J= 7.7 Hz,1H),2.52 (s,3H),2.40 (s,6H),2.35 (d, J= 7.3 Hz,1H),2.22 (t, J= 7.4 Hz,3H),1.67 (s,6H),1.63 – 1.57 (m,2H),1.49 (dd, J= 15.1,6.7 Hz,7H),1.41 – 1.34 (m,3H),1.34 – 1.21 (m,18H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 梯度:0-16min:40%-90% A,60-10% B。 化合物收集時間:8.7-9.0 min。
實施例八:(2S,4R)-1-((R)-2-(6-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)氧基)己醯氨基)-3-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物24)
第一步:(6-((6-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-甲基-1-氧代-3-(三苯甲基硫基)丁-2-基)氨基)-6-氧代己基)氧基)己基)氨基甲酸叔丁酯(化合物24-2)的製備 參考實施例四第一步化合物20-3的製備方法,得到化合物24-2。
第二步:(6-((6-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-巰基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)-6-氧代己基)氧基)己基)氨基甲酸叔丁酯(化合物24-3)的製備 參考實施例四第二步化合物20-4的製備方法,得到化合物24-3,ESI-MS (m/z):762.3 [M+1] +
第三步:二叔丁基((R)-9-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-8,8-二甲基-11-氧代-17-氧雜-7-硫雜-10-氮雜二十三烷-1,23-二基)二氨基甲酸酯(化合物24-4)的製備 參考實施例四第三步化合物20-6的製備方法,得到化合物24-4,ESI-MS (m/z):961.3 [M+1] +
第四步:(2S,4R)-1-((R)-2-(6-((6-氨基己基)氧基)己醯氨基)-3-((6-氨基己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物24-5)的製備 參考實施例四第四步化合物20-7的製備方法,得到化合物24-5,ESI-MS (m/z):761.3 [M+1] +
第五步:化合物24的製備 參考實施例四第五步化合物20的製備方法,得到化合物24,ESI-MS (m/z):1525.4 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ 8.71 (d, J= 5.4 Hz,1H),7.48 – 7.30 (m,14H),6.96 (s,1H),6.54 (d, J= 8.8 Hz,1H),4.96 (d, J= 8.9 Hz,1H),4.76 – 4.60 (m,3H),4.50 – 4.41 (m,3H),4.02 (d, J= 10.7 Hz,1H),3.75 (dd, J= 10.7,3.9 Hz,1H),3.61 – 3.47 (m,2H),3.43 – 3.28 (m,8H),3.25 – 3.14 (m,3H),2.66 (s,6H),2.59 – 2.47 (m,5H),2.40 (s,6H),2.23 (t, J= 7.3 Hz,3H),1.76 – 1.59 (m,8H),1.61 – 1.43 (m,8H),1.43 – 1.24 (m,16H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 梯度:0-16min:40%-90% A,60-10% B。 化合物收集時間:9.7-10.2 min。
實施例九:(2S,4R)-1-((R)-14-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-2-(2-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)硫基)丙-2-基)-4,13-二氧代-6,9-二氧雜-3,12-二氮雜十四烷-1-醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物25)
第一步:((R)-4-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-3,3-二甲基-6-氧代-1,1,1-三苯基-8,11-二氧雜-2-硫雜-5-氮雜十三烷-13-基)氨基甲酸叔丁酯(化合物25-2)的製備 參考實施例四第一步化合物20-3的製備方法,得到化合物25-2。
第二步:(2-(2-(2-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-巰基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)-2-氧代乙氧基)乙氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(化合物25-3)的製備 參考實施例四第二步化合物20-4的製備方法,得到化合物25-3,ESI-MS (m/z):694.3 [M+1] +
第三步:二叔丁基((R)-10-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-11,11-二甲基-8-氧代-3,6-二氧雜-12-硫雜-9-氮雜十八烷-1,18-二基)二氨基甲酸酯(化合物25-4)的製備 參考實施例四第三步化合物20-6的製備方法,得到化合物25-4,ESI-MS (m/z):893.4 [M+1] +
第四步:(2S,4R)-1-((R)-2-(2-(2-(2-氨基乙氧基)乙氧基)乙醯氨基)-3-((6-氨基己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物25-5)的製備 參考實施例四第四步化合物20-7的製備方法,得到化合物25-5,ESI-MS (m/z):693.3 [M+1] +
第五步:化合物25的製備 參考實施例四第五步化合物20的製備方法,得到化合物25,ESI-MS (m/z):1457.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ:8.71 (s,1H),8.67-8.64 (m,1H),8.21 (t, J= 6.0 Hz,1H),7.87-7.84(m,1H),7.75 (d, J= 10.3 Hz,1H),7.40-7.31 (m,6H),7.25 (s,1H),7.11 (q, J= 8.1 Hz,4H),5.27 (d, J= 10.3 Hz,1H),4.84 (t, J= 7.9 Hz,1H),4.72 (t, J= 6.9 Hz,1H),4.59 (dd, J= 10.2,3.2 Hz,1H),4.50 (s,1H),4.36 (dd, J= 15.4,6.3 Hz,1H),4.24 (dd, J= 15.3,5.0 Hz,1H),4.13-4.09 (m,2H),3.97 (d, J= 16.6 Hz,1H),3.89-3.83 (m,2H),3.69-3.34 (m,12H),3.24-3.20 (m,1H),3.11-3.05 (m,1H),2.82 (q, J= 8.4 Hz,1H),2.67 (s,3H),2.61-2.56 (m,4H),2.46 (s,7H),2.39 (d, J= 6.0 Hz,9H),2.20-2.14 (m,1H),1.67 (d, J= 3.0 Hz,6H),1.63-1.50 (m,4H),1.48 (s,3H),1.38-1.25 (m,1H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 製備柱:Waters SunFire C18 OBD (5 μm*19 mm*150 mm)。 流速:28 mL/min。 流動相:A:乙腈;B:0.05%甲酸水溶液。 梯度:0-16min:30%-90% A,70-10% B。 化合物收集時間:10.1-10.6 min。
實施例十:(2S,4R)-1-((R)-20-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-2-(2-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)硫基)丙-2-基)-4,19-二氧代-6,9,12,15-四氧雜-3,18-二氮雜二十烷-1-醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物26)
第一步: ((R)-4-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-3,3-二甲基-6-氧代-1,1,1-三苯基-8,11,14,17-四氧雜-2-硫雜-5-氮雜十九烷-19-基)氨基甲酸叔丁酯(化合物26-2)的製備 參考實施例四第一步化合物20-3的製備方法,得到化合物26-2。
第二步:(R)-16-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-17-巰基-17-甲基-14-氧代-3,6,9,12-四氧雜-15-氮雜十八烷基)氨基甲酸叔丁酯(化合物26-3)的製備 參考實施例四第二步化合物20-4的製備方法,得到化合物26-3,ESI-MS (m/z):783.3 [M+1] +
第三步:二叔丁基((R)-16-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-17,17-二甲基-14-氧-3,6,9,12-四氧雜-18-硫雜-15-氮雜二十四烷-1,24-二基)二氨基甲酸酯(化合物26-4)的製備 參考實施例四第三步化合物20-6的製備方法,得到化合物26-4,ESI-MS (m/z):981.4 [M+1] +
第四步:(2S,4R)-1-((R)-17-氨基-2-(2-((6-氨基己基)硫基)丙-2-基)-4-氧代-6,9,12,15-四氧雜-3-氮雜十七烷-1-醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物26-5)的製備 參考實施例四第四步化合物20-7的製備方法,得到化合物26-5,ESI-MS (m/z):781.3 [M+1] +
第五步:化合物26的製備 參考實施例四第五步化合物20的製備方法,得到化合物26,ESI-MS (m/z):1545.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ 8.77 (s,1H),7.65 (s,1H),7.60 – 7.51 (m,2H),7.45 – 7.30 (m,12H),7.24 (s,1H),5.01 (d, J= 9.3 Hz,1H),4.80 – 4.62 (m,3H),4.53 – 4.38 (m,3H),4.17 – 3.97 (m,3H),3.76 (dd, J= 10.8,3.8 Hz,1H),3.72 – 3.19 (m,23H),2.68 (s,6H),2.61 – 2.36 (m,21H),1.67 (d, J= 2.3 Hz,6H),1.55 – 1.42 (m,4H),1.40 – 1.28 (m,8H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:24 mL/min。 化合物收集時間:9.1-9.4 min。
實施例十一:(2S,4R)-1-((R)-2-(7-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)庚醯氨基)-3-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物27)
第一步:(7-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-甲基-1-氧代-3-(三苯甲基硫基)丁-2-基)氨基)-7-氧代庚基)氨基甲酸叔丁酯(化合物27-2)的製備 參考實施例四第一步化合物20-3的製備方法,得到化合物27-2。
第二步:(7-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-巰基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)-7-氧代庚基)氨基甲酸叔丁酯(化合物27-3)的製備 參考實施例四第二步化合物20-4的製備方法,得到化合物27-3,ESI-MS (m/z):675.3 [M+1] +
第三步:N-(6-((R)-2-(7-(叔丁氧基羰基氨基)庚醯基氨基)-3-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑)-5-基)苯基)甲基氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-1,1-二甲基-3-氧代丙基)硫基己基)氨基甲酸叔丁酯(化合物27-4)的製備 參考實施例四第三步化合物20-6的製備方法,得到化合物27-4,ESI-MS (m/z):876.4 [M+1] +
第四步:(2S,4R)-1-((R)-2-(7-氨基庚醯氨基)-3-((6-氨基己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物27-5)的製備 參考實施例四第四步化合物20-7的製備方法,得到化合物27-5,ESI-MS (m/z):675.3 [M+1] +
第五步:化合物27的製備 參考實施例四第五步化合物20的製備方法,得到化合物27,ESI-MS (m/z):1439.3 [M+1] +1H-NMR (400 MHz,CD 3OD) δ: 8.86 (s,1H),7.44-7.38 (m,12H),4.94 (s,1H),4.63-4.60 (m,4H),4.57 (d, J= 8.4 Hz,1H),4.48 (d, J= 15.6 Hz,2H),4.37 (d, J= 15.6 Hz,1H),3.94 (d, J= 11.2 Hz,1H),3.84 (dd, J 1 = 11.2, J 2 = 4.0 Hz,1H),3.39 (dd, J 1 = 15.2, J 2 = 9.2 Hz,2H),3.27-3.22 (m,5H),3.19-3.14 (m,1H),2.68 (s,6H),2.55 (t, J= 7.2 Hz,2H),2.45 (s,3H),2.43 (s,6H),2.36-2.21 (m,4H),2.12-2.03 (m,1H),1.68 (s,6H),1.62-1.27 (m,24H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:24 mL/min。 梯度:0-16min:40%-90% A,60-10% B。 化合物收集時間:8.1-8.4 min。
實施例十二:(2S,4R)-1-((R)-3-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)硫基)-2-(9-(2 -((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基氨基)乙醯氨基)壬醯氨基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物28)
第一步:(9-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-甲基-1-氧代-3-(三苯甲基硫基)丁-2-基)氨基)-9-氧代壬基)氨基甲酸叔丁酯(化合物28-2)的製備 參考實施例四第一步化合物20-3的製備方法,得到化合物28-2。
第二步:(9-(((R)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3-巰基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)-9-氧代壬基)氨基甲酸叔丁酯(化合物28-3)的製備 參考實施例四第二步化合物20-4的製備方法,得到化合物28-3,ESI-MS (m/z):704.3 [M+1] +
第三步:N-(9-(((1R)-2-(6-(叔丁氧基羰基氨基)己基硫基)-1-((2S,4R)-4-羥基-2 -((4-(4-甲基噻唑))-5-基)苯基)甲基氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-2-甲基丙基)氨基)-9-氧代壬基)氨基甲酸叔丁酯(化合物28-4)的製備 參考實施例四第三步化合物20-6的製備方法,得到化合物28-4,ESI-MS (m/z):903.3 [M+1] +
第四步:(2S,4R)-1-((R)-3-((6-氨基己基)硫基)-2-(9-氨基壬醯氨基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物28-5)的製備 參考實施例四第四步化合物20-7的製備方法,得到化合物28-5,ESI-MS (m/z):703.3 [M+1] +
第五步:化合物28的製備 參考實施例四第五步化合物20的製備方法,得到化合物28,ESI-MS (m/z) 1467.4 [M+1] +1H-NMR (400 MHz,CDCl 3) δ: 8.81 (s,1H),7.52-7.45 (m,12H),7.40 (d, J= 7.2 Hz,4H),7.36-7.31 (m,8H),7.06-7.00 (m,1H),6.55 (d, J= 8.8 Hz,1H),4.95 (d, J= 8.8 Hz,1H),4.73-4.64 (m,3H),4.49-4.38 (m,3H),4.07 (d, J= 10.8 Hz,1H),3.73 (dd, J 1 = 10.8, J 2 = 4.0 Hz,1H),3.58-3.49 (m,2H),3.41-3.19 (m,6H),2.68 (s,6H),2.58 (t, J= 7.2 Hz,2H),2.52 (s,3H),2.46-2.42 (m,8H),2.32-2.20 (m,5H),1.67 (s,6H),1.60-1.26 (m,24H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:24 mL/min。 梯度:0-16min:40%-90% A,60-10% B。 化合物收集時間:8.9-9.1 min。
實施例十三:2,2'-((6S,6'S)-2,2'-((R)-11-((2S,4R)-4-羥基-2- ((4-(4-甲基噻唑-5-基)基)苄基)氨甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-10,10-二甲基-13-氧代-9-硫雜-2,12,21-三氮雜二十二烷-1,22-二醯基)雙(4-(4-氯苯基)-3,9-二甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜-6,2-二基))二乙酸(化合物29)
將化合物29-1(33.0 mg,0.074 mmol,參考專利WO 2017024317合成方法製備)和2-(7-氧化苯並三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸鹽(31.3 mg,0.082 mmol)溶於N ,N-二甲基甲醯胺(2.0 mL)中,25℃攪拌5分鐘,然後加入化合物22-5(31.4 mg,0.037 mmol,三氟乙酸鹽)和N ,N-二異丙基乙胺(24.6 mg,0.19 mmol),加完後25℃攪拌2小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經製備層析分離純化得到化合物29(16.0 mg,產率26.9%),ESI-MS (m/z):1541.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 8.71 (s, 1H), 7.49 – 7.29 (m, 14H), 6.46 – 6.37 (m, 1H), 6.28 (s, 1H), 4.76 (d, J= 8.1 Hz, 1H), 4.71 – 4.55 (m, 3H), 4.55 – 4.34 (m, 3H), 4.10 – 3.96 (m, 1H), 3.77 (s, 6H), 3.73 – 3.55 (m, 5H), 3.41 (s, 4H), 2.71 (s, 6H), 2.58 – 2.42 (m, 6H), 2.40 – 2.32 (m, 1H), 2.32 – 2.13 (m, 4H), 2.05 (s, 6H), 1.59 (s, 6H), 1.39 – 1.22 (m, 17H)
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:20 mL/min。 梯度:0-16min:30%-90% A,70-10% B。 化合物收集時間:12.1-12.3 min。
實施例十四:(2S,4R)-1-((R)-2-(6- ((6-(2- ((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)氧基)己醯胺基)-3-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜-6-基)乙氧基)己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物31)
第一步:(6S)-6-(2- ((6-溴己基)氧基)乙基)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓(化合物31-2)的製備 將化合物32-2 (400 mg, 1.03 mmol)溶於四氫呋喃 (20 mL)中,冰浴10 min後加入氫化鈉 (413.51 mg, 10.34 mmol) ,移出冰水浴,自然升溫至20℃,20min後,將此反應液滴入1,6-二溴己烷(19.08 g, 78.21 mmol, 12.00 mL)中,25℃下攪拌16小時,反應完畢後加入50mL水淬滅,再用50mL*3乙酸乙酯萃取,收集有機層,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濃縮濾液得棕色油狀物,油狀物經矽膠柱層析,100%二氯甲烷沖出過量的1,6-二溴己烷,逐步提高甲醇含量,二氯甲烷/甲醇=19/1分離純化得到目標化合物31-2(258 mg, 產率36.30%),ESI-MS (m/z):551.0 [M+1] +
第二步:叔丁基((R)-1-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-12-((2S,4R)-4-羥基-2-(((S)-1-(4-(4-甲基-5-基)苯基)乙基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-11,11-二甲基-14-氧代-3,20-二氧雜-10-硫雜-13-氮雜二十六烷-26-基)氨基甲酸叔丁酯(化合物31-3)的製備 取25mL單口瓶,依次加入化合物31-2(70 mg, 90.20 μmol)、化合物32-7(49.61 mg, 90.21 μmol, FR)和N,N-二甲基甲醯胺 (5 mL),攪拌均勻後向體系滴入1,8-二氮雜二環十一碳-7-烯(113.59 mg, 451.00 μmol),25℃攪拌18h,LCMS監測反應完畢,加入乙酸乙酯稀釋,加水萃取,合併有機層,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濃縮濾液,經Prep-HPLC分離純化得到目標化合物31-3 (36.0 mg, 32.05%),ESI-MS (m/z): 623.0[1/2M+H] +
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:24 mL/min。 梯度:0-16min:50%-100% A,50-0% B。 化合物收集時間:9.2-10.5 min。
第三步:(2S,4R)-1-((R)-2-(6-((6-氨基己基)氧基)己醯胺基)-3-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙氧基)己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物31-4)的製備 將化合物31-3(36 mg, 28.91 μmol)溶於二氯甲烷(5.0 mL)中,滴入TFA (1.0 mL),25℃攪拌1小時,LCMS監測反應完全,將反應液濃縮乾得到目標化合物31-4(36.40 mg,產率100.00%, 三氟乙酸鹽),直接用於下一步反應,ESI-MS (m/z): 573.8 [1/2M+H] +
第四步:化合物31的製備 將化合物20-8 (12.74 mg, 31.79 μmol)、2-(7-氧化苯並三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸鹽(18.13 mg, 47.69 μmol)和N ,N-二甲基甲醯胺(4.0 mL)加入單口瓶中,攪拌10min後加入N,N-二異丙基乙胺(20.54 mg, 158.95 μmol)和化合物31-4 (36.4mg, 31.79 μmol) ,25℃攪拌2小時,LCMS監測反應完全,乙酸乙酯稀釋,水洗兩次,飽和氯化鈉溶液洗滌一次,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濃縮濾液,經Prep-HPLC分離純化得到目標化合物31 (4.0 mg, 收率7.94%)。 ESI-MS (m/z):1526.3[M+1] +1H-NMR (400 MHz, CDCl 3) δ:8.67 (s, 1H), 7.45 – 7.30 (m, 10H), 7.18 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.01 (d, J= 6.7 Hz, 1H), 6.90 (m, 1H), 6.49 – 6.43 (m, 1H), 5.14 – 5.05 (m, 1H), 4.90 – 4.70 (m, 3H), 4.67 – 4.45 (m, 3H), 4.27 – 4.19 (m, 1H), 4.10 (dd, J= 28.9, 10.7 Hz, 2H), 3.85 (dd, J= 10.5, 5.3 Hz, 2H), 3.77 – 3.66 (m, 2H), 3.57 – 3.16 (m, 11H), 2.83 (ddd, J= 20.5, 13.3, 5.9 Hz, 2H), 2.66 (d, J= 5.7 Hz, 3H), 2.63 (s, 1H), 2.58 (s, 1H), 2.52 (s, 3H), 2.40 (d, J= 2.6 Hz, 4H), 2.36 (s, 1H), 2.24 (dd, J= 13.8, 8.4 Hz, 3H), 1.67 (d, J= 4.4 Hz, 8H), 1.54 (m, 10H), 1.46 (dd, J= 6.9, 3.4 Hz, 4H), 1.35 (m, 15H), 1.25 (s, 2H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:24 mL/min。 梯度:0-16min:50%-100% A,50-0% B。 化合物收集時間:7.2-8.5 min。
實施例十五:(2S,4R)-1-((R)-1-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜-6-基)-14-(6-((6-(2- ((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)氧基)己醯胺)-13,13-二甲基-3,6,9-三氧雜-12-硫雜十五烷-15-醯基)-4-羥基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物32)
第一步:(S)-2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜-6-基)乙酸甲酯(化合物32-1)的製備 將化合物20-8(2.00 g,4.99 mmol)溶於甲醇(30.0 mL)中,冰水浴冷卻,然後滴加二氯亞碸(2.10 g,17.46 mmol),加完後25攝氏度攪拌3小時。加水淬滅,用乙酸乙酯萃取,無水硫酸鈉乾燥,過濾、濃縮得到目標化合物32-1(2.06g,產率99.5%),ESI-MS (m/z):415.0 [M+1] +
第二步:(S)-2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜-6-基)乙醇(化合物32-2)的製備 將化合物32-1(2.06 g,4.99 mmol)溶於無水四氫呋喃(100.0 mL)中,0攝氏度攪拌5分鐘,然後分批次加入四氫鋁鋰(846.1 mg,24.95 mmol),加完後0攝氏度攪拌1小時。將反應液倒入冰水中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=15/1)分離純化得到目標化合物32-2(1.40 g,產率72.5%),ESI-MS (m/z):387.1 [M+1] +
第三步:(S)-6-(2-(2-(2-(2-溴乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓(化合物32-4)的製備 將化合物32-2(1.00 g,2.58 mmol)溶於甲苯(10.0 mL)中,冰浴下加入32-3(2.14 g,7.75 mmol),TBAHS(0.88 g,2.58 mmol),滴加50%氫氧化鈉溶液(37.5 mL),滴加完畢25攝氏度攪拌15小時。將反應液倒入冰水中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=25/1)分離純化得到目標化合物32-4(0.40 g,產率26.6%),ESI-MS (m/z):583.3 [M+1] +
第四步:N-[6-[6-[[(1R)-1-[(2S,4R)-4-羥基-2-[[(1S)-1- [4-(4-甲基噻唑-5-)]叔丁基基)苯基]乙基]氨基甲醯基]吡咯烷-1-羰基] -2-甲基-2-三苯甲基硫烷基-丙基]氨基]-6-氧代己氧基]己基]氨基甲酸叔丁酯(化合物32-6)的製備 將化合物24-1(0.47 g,1.42 mmol)和2-(7-氧化苯並三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸鹽(0.81 g,2.13 mmol)溶於N ,N-二甲基甲醯胺(10.0 mL)中,25攝氏度攪拌5分鐘,然後加入化合物32-5(1.00 g,1.42 mmol,參考文獻WO2017030814A1和Nature Chemical Biology, 2017, 13(5), 514-521合成方法製備)和N ,N-二異丙基乙胺(0.55 g,4.26 mmol),加完後25攝氏度攪拌2小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=10/1)分離純化得到目標化合物32-6(0.89 g,產率61.6%),ESI-MS (m/z):1019.3 [M+1] +
第五步:N-[6-[6-[[(1R)-1-[(2S,4R)-4-羥基-2-[[(1S)-1- [4-(4-甲基噻唑-5-)]叔丁基基)苯基]乙基]氨基甲醯基]吡咯烷-1-羰基]-2-甲基-2-硫烷基-丙基]氨基]-6-氧代己氧基]己基]氨基甲酸叔丁酯(化合物32-7)的製備 參考實施例四第二步化合物20-4的製備方法,得到化合物32-7,ESI-MS (m/z):776.4 [M+1] +
第六步:叔丁基((R)-1- ((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-14-((2S,4R)-4-羥基-2-(((S)-1-(4-(4-甲基-5-基)苯基)乙基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-13,13-二甲基-16-氧代-3,6,9,22-四氧雜-12-硫雜-15-氮雜二十八烷-28-基)氨基甲酸叔丁酯(化合物32-8)的製備 參考實施例四第三步化合物20-5的製備方法,得到化合物32-8,ESI-MS (m/z):1279.3 [M+1] +
第七步:(2S,4R)-1-((R)-14-(6-((6-氨基己基)氧基)己醯胺)-1-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-13,13-二甲基-3,6,9-三氧雜-12-硫雜十五烷-15-醯基)-4-羥基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物32-9)的製備 參考實施例四第四步化合物20-7的製備方法,得到化合物32-9,ESI-MS (m/z):1179.3 [M+1] +
第八步:化合物32的製備 參考實施例四第五步化合物20的製備方法,得到化合物32,ESI-MS (m/z):1558.8 [M+1] +1H-NMR (400 MHz,CDCl 3) δ: 8.67 (s,1H),7.41-7.30 (m,12H),7.17 (d, J= 8.0 Hz,1H),7.06-7.01 (m,1H),6.86-6.81 (m,1H),5.12-5.05 (m,1H),4.95-4.90 (m,1H),4.76-4.60 (m,2H),4.53-4.41 (m,1H),4.14 (d, J= 10.0 Hz,1H),3.93-3.75 (m,2H),3.,62 -3.46 (m,7H),3.39-3.17(m,8H),2.85-2.77(m,1H),2.66-2.57(m,4H),2.51 (s,3H),2.40 (s,3H),2.36-1.95 (m,12H),1.6,6 (s,6H),1.54-1.26 (m,29H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:24 mL/min。 梯度:0-16min:40%-90% A,60-10% B。 化合物收集時間:9.1-9.7 min。
實施例十六:(2S,4R)-1-((R)-2-(6-((6-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)己基)氧基)己醯胺基)-3-((6-((2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,24]二氮雜-6-基)乙基)氨基)己基)硫基)-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基甲基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物33)
第一步:(S)-2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜-6-基)乙基-4-甲基苯磺酸酯 (化合物33-1)的製備 將化合物32-2(1580.0 mg,4.08 mmol)溶於二氯甲烷(60.0 mL)中,加入三乙胺(826.5 mg,8.17 mmol),冰水浴冷卻,然後分批加入對甲苯磺醯氯(1170.0 mg,6.13 mmol),加完後40攝氏度攪拌12小時。加水淬滅,用乙酸乙酯萃取,無水硫酸鈉乾燥,過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=20/1)分離純化得到目標化合物33-1(940.0 mg,產率42.5%),ESI-MS (m/z):542.0 [M+1] +
第二步:(S)-6-((2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜-6-基)乙基)氨基)己-1-醇(化合物33-3)的製備 將化合物33-1(150.0 mg,0.28 mmol)溶於N,N-二甲基甲醯胺(5.0 mL)中,加入33-2(164.4 mg,1.39 mmol),碳酸氫鈉(232.9 mg,2.77 mmol),加完後升溫至80攝氏度攪拌12小時。乙酸乙酯稀釋反應液,水洗,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=15/1)分離純化得到目標化合物33-3(50.0 mg,產率37.1%),ESI-MS (m/z):487.1 [M+1] +
第三步:(S)-叔丁基(2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜-6-基)乙基)(6-羥基己基)氨基甲酸叔丁酯(化合物33-4)的製備 將化合物33-3(50.0 mg,0.10 mmol)溶於二氯甲烷(5.0 mL)中,加入三乙胺(20.8 mg,0.21 mmol),二碳酸二叔丁酯(24.7 mg,0.11 mmol),加完25攝氏度攪拌2小時。乙酸乙酯稀釋反應液,水洗,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=25/1)分離純化得到目標化合物33-4(50.0 mg,產率82.9%),ESI-MS (m/z):587.2 [M+1] +
第四步:(S)-6- ((叔丁氧基羰基)(2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜-6-基)乙基)氨基)己基-4-甲基苯磺酸酯(化合物33-5)的製備 參考實施例十六第一步化合物33-1的製備方法,得到化合物33-5,ESI-MS (m/z):741.2 [M+1] +
第五步:(2S,4R)-1-((R)-2-(6-((6-氨基己基)氧基)己醯胺基)-3-巰基-3-甲基丁醯基)-4-羥基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物33-6)的製備 參考實施例四第四步化合物20-7的製備方法,得到化合物33-6,ESI-MS (m/z):676.3 [M+1] +
第六步:叔丁基(6-(((R)-3-(6-((6-氨基己基)氧基)己醯胺基)-4-((2S,4R)-4-羥基-2-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-2-甲基-4-氧代丁-2-基)硫基)己基)(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜-6-基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(化合物33-7)的製備 參考實施例四第三步化合物20-5的製備方法,得到化合物33-7,ESI-MS (m/z):1245.3 [M+1] +
第七步:叔丁基((R)-1- ((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)-18-((2S,4R)-4-羥基-2-(((S)-1-(4-(4-甲基-5-基)苯基)乙基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-羰基)-19,19-二甲基-2,16-二氧代-10-氧雜-20-硫雜-3,17-二氮雜二十六烷-26-基)(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜-6-基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(化合物33-8)的製備 參考實施例四第五步化合物20的製備方法,得到化合物33-8,ESI-MS (m/z):1628.3 [M+1] +
第八步:化合物33的製備。 參考實施例四第四步化合物20-7的合成方法,經製備層析分離純化得到化合物33,ESI-MS (m/z):1525.4 [M+1] +1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ: 8.66 (s,1H),7.44-7.29 (m,15H),6.87 (t, J= 8.0 Hz,1H),6.46 (d, J= 12.0 Hz,1H),5.38-5.31 (m,1H),5.13-5.06 (m,1H),4.93 (d, J= 8.0 Hz,1H),4.74-4.70 (m,1H),4.64 (t, J= 8.0 Hz,1H),4.57-4.53 (m,1H),4.32 (t, J= 4.0 Hz,1H),4.02 (d, J= 12.0 Hz,1H),3.77 (dd, J 1 = 8.0, J 2 = 4.0 Hz,1H),3.70-3.51 (m,4H),3.39-3.34 (m,6H),3.09-2.84 (m,4H),2.67 (d, J= 4.0 Hz,6H),2.61 (t, J= 8.0 Hz,2H),2.52 (s,3H),2.42 (s,3H),2.40 (s,3H),2.26-2.17 (m,4H),2.02-1.99 (m,2H),1.69 (s,3H),1.67 (s,3H),1.57-1.50 (m,9H) ,1.48-1.33 (m,19H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:24 mL/min。 梯度:0-16min:50%-90% A,50-10% B。 化合物收集時間:7.0-10.0 min。
實施例十七:(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(5-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基)-N-(5-(2-((S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩並[3,2-f][1,2,4]三唑並[4,3-a][1,4]二氮雜卓-6-基)乙醯氨基基)戊基)戊氨基)乙醯氨基)-3,3-二甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺(化合物34)
第一步:(5-((2-(((S)-1-((2S,4R)-4-羥基-2-((4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲醯基)吡咯烷-1-基)-3,3-二甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)-2-氧代乙基)氨基)戊基)氨基甲酸叔丁酯(化合物34-2)的製備 將化合物34-1(58.7 mg,0.29 mmol)和17-5(160.0 mg,0.29 mmol)溶於乙腈(10.0 mL)中,加入無水碳酸鉀(120.0 mg,0.87 mmol)後50攝氏度攪拌20小時。將反應液過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=8/1)分離純化得到目標化合物34-2(77 mg),ESI-MS (m/z):673.3 [M+1] +
第二步:N-[5-[5-(叔丁氧基羰基氨基)戊醯基]-[2-[[(1S)-1-[(2S,4R)-4-羥基-2-[[4-(4-甲基噻唑)]-5-基)苯基]甲基氨基甲醯基]吡咯烷-1-羰基]-2,2-二甲基丙基]氨基]-2-氧代乙基]氨基]戊基]氨基甲酸叔丁酯(化合物34-4)的製備 將化合物34-3(27.4 mg,0.13 mmol)和2-(7-氧化苯並三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸鹽(56.6 mg,0.15 mmol)溶於N ,N-二甲基甲醯胺(3.0 mL)中,25攝氏度攪拌5分鐘,然後加入化合物34-2(77.0 mg,0.11 mmol)和N ,N-二異丙基乙胺(59.2 mg,0.45 mmol),加完後25攝氏度攪拌2小時。將反應液倒入飽和氯化鈉溶液中,用乙酸乙酯萃取,有機相用飽和氯化鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥、過濾、濃縮,經矽膠柱層析(二氯甲烷/甲醇=10/1)分離純化得到目標化合物34-4(56.0 mg,56.1%),ESI-MS (m/z):872.4 [M+1] +
第三步:(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(5-氨基-N-(5-氨基戊基)戊氨基)乙醯氨基)-3,3-二甲基丁醯基)-4-羥基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲醯胺 (化合物34-5)的製備 參考實施例四第四步化合物20-7的製備方法,得到化合物34-5(鹽酸鹽),ESI-MS (m/z):672.3 [M+1] +
第四步:化合物34的製備 參考實施例四第五步化合物20的製備方法,得到化合物34。ESI-MS (m/z) 1436.3 [M+1] +1H NMR (400 MHz, CDCl 3) δ 8.73 (s, 1H), 7.97 (s, 1H), 7.58 – 7.50 (m, 1H), 7.45 – 7.36 (m, 5H), 7.36 – 7.27 (m, 6H), 7.24 – 7.13 (m, 3H), 4.87 (t, J= 8.4 Hz, 1H), 4.75 – 4.61 (m, 3H), 4.57 – 4.46 (m, 2H), 4.43 – 4.28 (m, 2H), 4.12 (d, J= 11.0 Hz, 1H), 3.70 (dd, J= 11.0, 3.1 Hz, 1H), 3.62 (dd, J= 14.5, 9.3 Hz, 1H), 3.56 – 3.43 (m, 4H), 3.42 – 3.06 (m, 5H), 3.06 – 2.94 (m, 1H), 2.66 (d, J= 10.1 Hz, 6H), 2.58 – 2.46 (m, 4H), 2.44 – 2.32 (m, 8H), 1.85 – 1.73 (m, 1H), 1.73 – 1.59 (m, 9H), 1.58 – 1.43 (m, 5H), 1.34 – 1.19 (m, 3H), 1.02 (s, 9H)。
Prep-HPLC分離方法(除下列條件外,其餘條件均和實施例一Prep-HPLC分離方法相同): 流速:24 mL/min。 梯度:0-16min:30%-90% A,70-10% B。 化合物收集時間:8.0-9.6 min。 生物學評價
實驗例1. 用免疫印跡法測試PROTAC分子對靶蛋白的降解效率 採用與文獻(Matthias Schiedel et al., J. Med. Chem., 2018, 61 (2), pp 482–491; Jing Lu et al., Chemistry & Biology 22, 755–763, June 18, 2015)中類似的方法,用western blot評估化合物對細胞內靶蛋白的降解能力,並計算出各化合物的DC 50(達到50%降解效率時的化合物濃度)。 抗體:RAF、MEK、WEE1、PARP和ATR等蛋白抗體。 細胞:人惡性黑色素瘤細胞、人卵巢癌細胞、人三陰性乳腺癌細胞等。 將所測的化合物用DMSO配製成合適濃度的儲備液,用合適的緩衝液或細胞培養基稀釋配成適當的濃度,取適當量的溶液加入細胞中使得化合物濃度範圍為1 ~ 100000 nM。在37℃/5%CO 2條件下孵育0至48小時後,進行細胞裂解,用western blot檢測RAF、MEK、WEE1、PARP或ATR等蛋白含量。
實驗例2. 用免疫印跡法測試PROTAC分子對BRD4靶蛋白的降解效率 採用與文獻(Matthias Schiedel et al., J. Med. Chem., 2018, 61 (2), pp 482–491; Jing Lu et al., Chemistry & Biology 22, 755–763, June 18, 2015)中類似的方法,使用western blot免疫印跡法評估待測化合物對細胞內BRD4的降解能力。具體來說,Hela細胞培養於含有10% FBS(Gibco)的RPMI-1640培養基(HyClone)中,實驗第1天用胰蛋白酶消化、重懸,計數,每孔3×10 5個細胞接種於6孔板中;第2天將20 μL不同濃度化合物加入6孔板中,使其終濃度分別為0.5,0.05,0.02 μM,陽性對照化合物AT1終濃度為1,0.1,0.02 μM,對照孔中加入適量的DMSO溶液(即待測化合物濃度為0 μM), 所有孔DMSO終濃度為0.5%。待測化合物與細胞在37℃、5% CO 2培養箱中共孵育18-24 h後收集並裂解細胞,準備蛋白樣品,用western blot免疫印跡法檢測BRD4的蛋白表達水平,GAPDH作為內參照。 陽性對照化合物AT1(圖1-B)的合成基於文獻 Nature Chemical Biology,2017,13, 14–521。 抗體: 一抗:BRD4 (Cell Signal)、GAPDH(Cell Signal) 二抗:辣根酶標記山羊抗兔IgG抗體(中杉金橋) 本發明中部分PROTAC分子對BRD4靶蛋白的降解結果顯示於圖1中。由圖1可見,化合物22、23和24降解BRD4能力明顯優於兩倍濃度下AT1對BRD4的降解能力。
實驗例3:化合物24對SCID小鼠RS4;11移植瘤模型的抑瘤作用 實驗方法: RS4;11細胞培養於含10%胎牛血清的RPMI1640 培養基中(置於37℃、含5%CO 2空氣的培養箱中),收集指數生長期的細胞,懸浮於PBS和基質膠1:1混合液中。每隻SCID小鼠腋窩皮下接種1×10 7個RS4; 11細胞(0.1mL上述混合液),接種後待腫瘤生長到100-150 mm 3時,按體積進行隨機分為4組,每組6隻,每週1、3、5分別給於化合物24 (1mg/kg, 3mg/kg, 10mg/kg)和溶媒對照(20%PEG400+6%聚氧乙烯蓖麻油+74%PBS),給藥3周。每週2次用遊標卡尺測量腫瘤直徑,並稱量體重。按V = 0.5× a× b 2計算腫瘤體積, ab分別表示腫瘤的長徑和短徑。 實驗結果: 在本實驗條件下,化合物24在3mg/kg和10mg/kg劑量下有明顯的抑制RS4; 11腫瘤生長的作用(圖2)。
BRD4:Bromodomain-containing protein 4(含溴結構域的蛋白質4) GAPDH:glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)
圖1顯示了本發明中部分PROTAC分子對BRD4靶蛋白的降解結果。 圖2顯示了本發明中部分PROTAC分子對SCID小鼠RS4;11移植瘤模型的抑瘤。

Claims (35)

  1. 通式為I或II所示的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物: (D) nL-G(L-D) m或(G) nL-D(L-G) m式I           式II 其中,G是與泛素連接酶結合的部分,能夠與L共價連接,且G每次出現為相同或者不相同; D是與靶蛋白結合的部分,能夠與L共價連接,且D每次出現為相同或者不相同,該靶蛋白是與任何人類疾病相關的蛋白或能與人類疾病相關蛋白結合的其它蛋白,包括但不限於結構蛋白質、受體、酶、轉錄因數、細胞表面蛋白質、細胞整體功能相關蛋白質等; L是連接體部分,L每次出現為相同或者不相同,且化學地(共價地)將D與G連接; m選自0、1或2; n選自1或2且當m為0時,n不等於1。
  2. 如請求項1所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物: 其中,L選自 和/或 ,其中x、y、z是1到30之間的整數,M選自N、CH、C、P=O、SiH、C 3-12環烷基、C 3-12雜環基、C 6-12芳基或5-12元雜芳基,所述的環烷基、雜環基、芳基、雜芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代,且R 1或R 2每次出現時可以相同或者不相同; J 1、J 2、J 3各自獨立地選自: 鍵、-CR 1R 2-、-O-、-S-、-SO-、-SO 2-、-NR 3-、-SO 2NR 3-、-SONR 3-、-CONR 3-、-NR 3CONR 4-、-NR 3SO 2NR 4-、-CO-、-CR 1=CR 2-、-C≡C-、-SiR 1R 2-、-P(O)OR 1-、-NR 3C(=NCN)NR 4-、-NR 3C(=NCN)-、-NR 3C(=CNO 2)NR 4-、C 3-12亞環烷基、C 3-12亞雜環基、C 6-12亞芳基或5-12元亞雜芳基;所述的亞環烷基、亞雜環基、亞芳基、亞雜芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代,且R 1或R 2每次出現時可以相同或者不相同,其中: R 1、R 2、R 3、R 4和R 5各自獨立地選自:H、鹵素、C 1-8烷基、SC 1-8烷基、NHC 1-8烷基、N(C 1-8烷基) 2、C 3-11環烷基、C 6-14芳基、雜芳基、C 3-11雜環基、-OC 3-8環烷基、-SC 3-8環烷基、-NHC 3-8環烷基、-N(C 3-8環烷基) 2、-N(C 3-8環烷基)(C 1-8烷基)、-OH、-NH 2、-SH、-SO 2C 1-8烷基、-P(O)(OC 1-8烷基)(C 1-8烷基)、-P(O)(OC 1-8烷基) 2、-C≡C-C 1-8烷基、-C≡CH、-CH=CH(C 1-8烷基)、-C(C 1-8烷基)=CH(C 1-8烷基)、-C(C 1-8烷基)=C(C 1-8烷基) 2、-Si(OH) 3、-Si(C 1-8烷基) 3、-Si(OH)( C 1-8烷基) 2、-COC 1-8烷基、-COOH、鹵素、-CN、-CF 3、-CHF 2、-CH 2F、-NO 2、-SF 5、-SO 2NH-C 1-8烷基、-SO 2N(C 1-8烷基) 2、-SONH C 1-8烷基、-SON(C 1-8烷基) 2、-CONHC 1-8烷基、-CON(C 1-8烷基) 2、-N(C 1-8烷基)CONH(C 1-8烷基)、-N(C 1-8烷基)CON(C 1-8烷基) 2、-NHCONH(C 1-8烷基)、-NHCON(C 1-8烷基) 2、-NHCONH 2、-N(C 1-8烷基)SO 2NH(C 1-8烷基)、-N(C 1-8烷基)SO 2N(C 1-8烷基) 2、-NHSO 2(C 1-8烷基)、-NHSO 2N(C 1-8烷基) 2和-NHSO 2NH 2;且當x、y、z大於1時,R 1或R 2獨立地可以連接至另一個J 1或J 2或J 3基團以形成環烷基和/或雜環基,該環烷基和雜環基­­可以進一步被0-4個R 5基團取代; 當x>1時, J 1可以相同或不同; 當y>1時, J 2可以相同或不同; 當z>1時, J 3可以相同或不同。
  3. 如請求項1至請求項2中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中, L選自 ,其中r1、r2和r3為0-30之間的整數。
  4. 如請求項1至請求項3中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,L選自:
  5. 如請求項1至請求項4中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,G選自馮希佩爾-林道(VHL)、小腦蛋白(CRBN)、小鼠雙微體2同系物(MDM2)或 細胞凋亡抑制因數(cIAP1)的配體片段或配體衍生物片段。
  6. 如請求項1至請求項5中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,G選自但不限於以下化合物及其衍生物的片段: ,R 6選自H、鹵素、OH、NH 2或SH。
  7. 如請求項1至請求項6中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,G通過任意連接位點與L進行連接。
  8. 如請求項1至請求項7中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,G選自但不限於以下片段:
  9. 如請求項1至請求項8中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,D選自但不限於以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段:激酶抑制劑、磷酸酶抑制劑、HDM2/MDM2抑制劑、Hsp90抑制劑、靶向人類含BET溴結構域的蛋白質的化合物、HDAC抑制劑、人類賴氨酸甲基轉移酶抑制劑、靶向RAF受體的化合物、靶向FKBP的化合物、血管產生抑制劑、免疫抑制化合物、靶向芳基烴受體的化合物、靶向雄性激素受體的化合物、靶向雌性激素受體的化合物、靶向甲狀腺激素受體的化合物、靶向HIV蛋白酶的化合物、靶向HBV蛋白的化合物、靶向HIV整合酶的化合物、靶向HCV蛋白酶的化合物或靶向醯基蛋白質硫酯酶1或靶向醯基蛋白質硫酯酶2的化合物。
  10. 如請求項1至請求項9中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,D選自但不限於以下靶蛋白的配體片段或配體衍生物片段: WEE1、PARP、IDO、Arg、mTOR、JAK、ATR、BTK、VEGFR、EGFR、RAF、MEK、HDAC、HER2、ALK、Src、MET、IGF-1R、Akt、CDK、ABL、BCR-Abl、FKBP12、PIPK2、TBK1、AR、ER、BRD4、JNK1、SMAD3、ROR1、PA、PB1、PB2、NP、NA、FXR、HBX、PXR、RTKs、TBK1、HDM2、Bcl-2、IL-2、HPV、TNF、MYC、β-catenin 、MCL1、RAS、SRC、CBFβ、SMMHC、eIF4E、KLF4、Nrf2和MDM-2。
  11. 如請求項1至請求項10中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,D選自但不限於以下化合物及其衍生物的片段:
  12. 如請求項1至請求項11中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中該化合物具有通式III或IV所示結構, (D) nL-G 或   (G) nL-D 式III           式IV 其中,D、L、G如請求項1至請求項11中任一項所定義,n為2。
  13. 如請求項1至請求項12中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,該化合物具有通式V或VI所示結構, 其中D、L、G如請求項12所定義且D每次出現時彼此相同或不同,G每次出現時彼此相同或不同。
  14. 如請求項13所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物的藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,L為 ,其中M選自N、CH或C 6-12芳基,所述的芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代; 當x>1時,J 1可以相同或不同; 當y>1時,J 2可以相同或不同; 當z>1時,J 3可以相同或不同; x、y、z彼此獨立地是5到25之間的整數; J 1、J 2、J 3獨立地選自鍵、-CR 1R 2-、-O-、-S-、-NR 3-、-CONR 3-、-NR 3CONR 4-、-CO-、-C≡C-或C 6-12亞芳基;該亞芳基任選地被0-6個R 1和/或R 2基團取代,且R 1或R 2每次出現時可以相同或者不相同。
  15. 如請求項14所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,M選自N、CH或苯基。
  16. 如請求項12至請求項15中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,L選自: ; 其中r1、r2和r3為0-10之間的整數。
  17. 如請求項12至請求項15中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中, L選自:L1、L3、L7、L10、L17、L18、L19、L20-3、L21-2、L22-2、L23-2、L24-2、L25-2、L26-2、L27-2、L28-2、L30-1、L31-2、L32-2和L34-3; D選自:D1’-1、D4’-1、D4’-2、D12’-1、D41’-1、D60’-1、D122’-1、D123’-1、D232’-1、D246’-1、D247’-1和D247’-2; G選自:G1’-1、G5’-1、G10’-1和G11’-1。
  18. 如請求項1至請求項11中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,該化合物具有通式VII或VIII所示結構, D-L-G-L-D 或     G-L-D-L-G 式VII           式VIII 其中,G、L、D如請求項1至請求項17中任一項所定義且D每次出現時相同。
  19. 如請求項18所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中, ,其中r1、r2和r3為0-30之間的整數。
  20. 如請求項18或請求項19所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,L選自: L4-1、L4-2、L4-4、L8-1、L8-2、L8-3、L12、L14-1、L14-2、L16-2、L16-3、L20-1、L20-2、L21-1、L22-1、L23-1、L24-1、L25-1、L26-1、L27-1、L28-1、L31-1和L34-2。
  21. 如請求項1至請求項20中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,D選自以下化合物或衍生物的片段:D1、D4、D12、D41、D60、D122、D232、D246和D247。
  22. 如請求項1至請求項21中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,D獨立地選自以下片段:D1’-1、D4’-1、D12’-1、D41’-1、D60’-1、D122’-1、D232’-1、D246’-1 D247’-1和D247’-2。
  23. 如請求項1至請求項22中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,G選自以下化合物的片段:G1、G5、G9、G10和G11。
  24. 如請求項1至請求項23中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,G獨立地選自以下片段: G1’-1、G1’-2、G1’-3、G1’-4、G1’-5、G5’-1、G9’、G10’、G10’-1、G11’和G11’-1。
  25. 如請求項1至請求項24中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,L選自: L8-1、L14-1、L20-1、L20-2、L21-1、L22-1、L23-1、L24-1、L25-1、L26-1、L27-1、L28-1、L31-1和L34-2; D選自以下片段:D4’-1、D232’-1、D247’-1和D247’-2; G選自以下片段:G1’-1、G1’-2、G1’-3、G1’-4、G1’-5、G10’和G11’。
  26. 如請求項20至請求項25中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,該化合物具有通式VII-1所示結構, D I-L-G-L-D II式VII-1 其中,G、L、D I、D II如請求項1至請求項25中任一項所定義且D I與D II不相同。
  27. 如請求項26所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,L選自: L4-1、L4-2、L8-1、L8-2、L16-2和L16-3;D選自以下片段:D1’-1、D4’-1、D41’-1、D60’-1、D122’-1和D232’-1。
  28. 如請求項1至請求項27中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物,其中,該化合物選自但不限於以下化合物:
  29. 一種藥物組合物,其包含預防或治療有效量的如請求項1至請求項28中任一項所述的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體、互變異構體以及一種或多種藥學上可接受的載體。
  30. 如請求項1至請求項28中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物或者如請求項29的藥物組合物在製備用於預防或治療蛋白活性異常表達相關疾病的藥物中的用途。
  31. 如請求項1至請求項28中任一項所述的化合物,該化合物的立體異構體、互變異構體或其混合物,該化合物藥學上可接受的鹽,或者該化合物的穩定同位素衍生物或者如請求項29的藥物組合物在製備用於預防或治療腫瘤相關疾病的藥物中的用途。
  32. 如請求項1至請求項28中任一項所述的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體或互變異構體或者如請求項29的藥物組合物,其用於預防或治療蛋白活性異常表達相關疾病。
  33. 如請求項1至請求項28中任一項所述的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體或互變異構體或者如請求項29的藥物組合物,其用於預防或治療腫瘤相關疾病。
  34. 一種預防或治療蛋白活性異常表達相關疾病的方法,該方法包括向需要其的個體給藥有效量的如請求項1至請求項28中任一項所述的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體或互變異構體或者如請求項29所述的藥物組合物。
  35. 一種預防或治療腫瘤相關疾病的方法,該方法包括向需要其的個體給藥有效量的如請求項1至請求項28中任一項所述的化合物或其藥學上可接受的鹽、酯、立體異構體或互變異構體或者如請求項29所述的藥物組合物。
TW112124199A 2018-04-20 2019-04-10 一種多功能化合物、其製備方法及其在醫藥上的應用 TW202342454A (zh)

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Families Citing this family (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2020069105A1 (en) * 2018-09-27 2020-04-02 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Degraders of wee1 kinase
MX2022006741A (es) * 2019-12-05 2022-06-14 Viracta Subsidiary Inc Formas de estado solido del inhibidor de hdac.
WO2021141662A1 (en) * 2020-01-10 2021-07-15 Massachusetts Institute Of Technology Proteolysis targeting chimeric molecules (protacs) with functional handles and uses thereof
CN113402520A (zh) * 2020-03-16 2021-09-17 中国科学院上海药物研究所 Wee1蛋白降解剂
IL302289A (en) 2020-10-28 2023-06-01 Viracta Subsidiary Inc Solid state forms of HDAC inhibitor
GB202017717D0 (en) * 2020-11-10 2020-12-23 Univ Dundee Improved small molecules
CN112457297B (zh) * 2020-11-24 2023-04-28 福建医科大学 一种parp蛋白降解剂及其制备方法与应用
CN114044775B (zh) * 2021-08-30 2023-04-07 杭州医学院 一种靶向泛素化诱导bcr-abl蛋白降解的化合物及其应用
WO2023125908A1 (en) * 2021-12-30 2023-07-06 Beigene, Ltd. Degradation of bruton's tyrosine kinase (btk) by conjugation of btk inhibitors with e3 ligase ligand and methods of use
WO2023125944A1 (zh) * 2021-12-31 2023-07-06 正大天晴药业集团股份有限公司 含有杂环的化合物
CN114890989B (zh) * 2022-05-25 2024-03-22 广东晨康生物科技有限公司 一种含氮衍生物为Linker的HDAC8降解剂其制备方法和应用
CN115385859B (zh) * 2022-08-22 2024-03-08 西安交通大学 一种可细胞内自组装的蛋白降解剂及其制备方法和应用
CN115403561B (zh) * 2022-08-22 2024-03-08 西安交通大学 一种基于沙利度胺类似物的细胞内自组装蛋白降解剂及其制备方法和应用
WO2024056077A1 (en) * 2022-09-15 2024-03-21 Cullgen (Shanghai) , Inc. Modified proteins and protein binders and degraders
CN117143114B (zh) * 2023-10-30 2024-02-20 深圳大学 一种BRD4和Src双靶点抑制剂及其制备方法与应用

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3608317A1 (en) * 2012-01-12 2020-02-12 Yale University Compounds & methods for the enhanced degradation of targeted proteins & other polypeptides by an e3 ubiquitin ligase
WO2015160845A2 (en) * 2014-04-14 2015-10-22 Arvinas, Inc. Imide-based modulators of proteolysis and associated methods of use
GB201504314D0 (en) * 2015-03-13 2015-04-29 Univ Dundee Small molecules
GB201610147D0 (en) * 2016-06-10 2016-07-27 Glaxosmithkline Ip Dev Ltd Novel compounds
GB201614134D0 (en) * 2016-08-18 2016-10-05 Glaxosmithkline Ip Dev Ltd Novel compounds
CN107698657A (zh) * 2017-09-26 2018-02-16 中国药科大学 基于vhl配体和bet抑制剂诱导bet降解的双功能分子及其制备和应用
CN107698575A (zh) * 2017-09-26 2018-02-16 中国药科大学 cereblon配体介导的新型BET蛋白降解的双功能分子及其制备和应用
CA3088059A1 (en) * 2018-01-10 2019-07-18 Development Center For Biotechnology Antibody protac conjugates
GB202017717D0 (en) * 2020-11-10 2020-12-23 Univ Dundee Improved small molecules

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