TW202317542A - 製備egfr抑制劑的方法 - Google Patents
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Abstract
本發明提供製備結構式(I)化合物或其醫藥上可接受之鹽之方法：
Description
EGFR (表皮生長因子受體)為erbB受體家族之成員，該家族包含跨膜蛋白酪胺酸激酶受體。藉由結合至其配位體，諸如表皮生長因子(EGF)，EGFR可在細胞膜上形成同二聚體或與家族中之其他受體(諸如erbB2、erbB3或erbB4)形成異二聚體。此等二聚體之形成可造成EGFR細胞中之關鍵酪胺酸殘基之磷酸化，從而活化細胞中之許多下游信號路徑。此等細胞內信號路徑於細胞增殖、生存及抗細胞凋亡中起著重要作用。EGFR信號轉導路徑之病症，包括配位體及受體之表現增加、EGFR基因擴增及改變(諸如突變、缺失及類似者)可促進細胞之惡性轉形及於腫瘤細胞增殖、入侵、轉移及血管生成中起著重要作用。例如，於非小細胞肺癌(NSCLC)腫瘤中見到EGFR基因之改變，諸如突變及缺失。於NSCLC腫瘤中見到之兩種最頻繁EGFR改變為外顯子19之短框架內缺失(del19)及L858R，外顯子21中之單錯義突變(
Cancer Discovery2016 6(6) 601)。此等兩種改變造成配位體獨立性EGFR活化及被稱作EGFR突變體NSCLC (EGFR M+)之原發性或活化突變。臨床經驗顯示，利用EGFR酪胺酸激酶抑制劑(TKI)厄洛替尼(erlotinib)、吉非替尼(gefitinib)、阿法替尼(afatinib)及奧希替尼(osimertinib)一線(1L)治療之EGFR M+ NSCLC患者之客觀反應率(ORR)為約60至85%(
Lancet Oncol. 2010，第11卷，121；
Lancet Oncol. 2016，第17卷，577；N. Engl. J. Med. 2017年11月18日Doi:10.1056/NEJMoa1713137；
Lancet Oncol. 2011，第12卷，735)，因此證實，EGFR突變體NSCLC腫瘤依賴於致癌EGFR活性以生存及增殖及建立del19及L858R突變之EGFR作為該疾病之致癌驅動因子及因此，驗證治療NSCLC之藥物標靶及生物標誌物。
然而，於利用第一代(厄洛替尼及吉非替尼)及第二代(阿法替尼) EGFR TKI治療平均10至12月後，於幾乎所有NSCLC患者中觀察到對此等小分子抑制劑之抗性(
Lancet Oncol. 2010年2月；11(2):121-8.；
Lancet Oncol. 2016年5月；17(5):577-89；
Lancet Oncol. 2011年8月；12(8):735-42)。對第一代及第二代EGFR TKI而言最重要的抗性機制係由於EGFR中之二次突變T790M，其於進行第一代及第二代EGFR抑制劑之患者之50%至70%中發生(
Cancer Discov; 2(10); 872–5, 2012;
Cancer Res., 65:(16), 2005)。此二次突變降低藥物與標靶之親和力，從而產生藥物抗性，及導致腫瘤復發或疾病進展。
鑑於肺癌之靶向EGFR之療法中產生之藥物抗性之此突變的盛行，許多公司試圖開發新穎小分子EGFR抑制劑來藉由抑制抗性突變體EGFR-T790M來治療患有藥物抗性肺癌之此等患者。例如，已開發奧希替尼(Tagrisso
®)，第三代EGFR TKI來治療NSCLC患者，若癌細胞對於編碼EGFR之基因中原發性EGFR突變del19或L858R陽性，具有或不具有T790M突變。
雖然第三代EGFR TKI奧希替尼已顯示對NSCLC患者之功效，但是不幸地藉由EGFR中之外顯子20 C797突變介導之抗性通常於約10個月內發展(
European Journal of Medicinal Chemistry2017，第142卷：32-47)及佔奧希替尼抗性病例之大多數(
Cancer Letters2016，第385卷：51-54)。EGFR del19/L858R T790M C797S順式突變體激酶變異體通常於二線(2L)患者中於利用奧希替尼治療後出現及通常被稱作「三重突變體」EGFR及其不再可藉由第一代、第二代或第三代EGFR抑制劑來抑制。
式(I)化合物為EGFR TKI之高度選擇性抑制劑，其可抑制三重突變體變異體。此外，由該式表示之化合物可以高選擇性抑制具有三重突變體del19/L858R T790M C797S之EGFR突變體，同時不具有對野生型EGFR之活性或對其具有低活性。
。
本文中提供製備及純化式(I)化合物之新穎方法。另外，本文中揭示新穎中間體。
相關申請案之交互參照本申請案主張2021年6月23日申請之美國臨時申請案第63/214,069號之優先權。上述申請案之全部內容係以引用的方式併入本文中。
本文中揭示製備式(I)化合物之方法。該方法包括使式(Ic)之第一起始物質：
或其鹽與式(Id)之第二起始物質：
或其鹽反應。本文中亦揭示：i)自易得起始物質製備該式(Ic)化合物之方法；及ii)自該式(Ic)化合物之製備獲得之中間體。
於一個態樣中，式(Ic)之起始物質與式(Id)之起始物質之反應係在存在鈀觸媒及膦配位體下進行。該鈀觸媒及膦配位體為單獨化合物。或者，錯合物包含鈀觸媒及膦配位體二者。
鈀觸媒之非限制性列表包括Pd(dppe)
2(雙[1,2-雙(二苯基膦基)乙烷]鈀(0))、CX-11 (1,3-雙(2,6-二異丙基苯基)咪唑-2-亞基(1,4-萘醌)鈀(0)二聚物)、CX-12 (1,3-雙(2,4,6-三甲基苯基)咪唑-2-亞基 (1,4-萘醌)鈀(0)二聚物)、Pd(t-Bu
3P)
2(雙(三-第三丁基膦)鈀(0))、Pd(PCy
3)
2(雙(三環己基膦)鈀(0))、Pd(PPh
3)
4(肆(三苯基膦)鈀(0))、Pd
2(dba)
3(參(二亞苄基丙酮)二鈀(0))、Pd(OAc)
2(乙酸鈀 (II))、PdCl
2(PPh
3)
2(二氯雙(三苯基膦)鈀(II))、PdCl
2(Amphos)
2(雙(二-第三丁基(4-二甲胺基苯基)膦)二氯鈀(II))、Pd(MeCN)
2Cl
2(雙(乙腈)二氯鈀(II))、PdCl
2(P(
o-Tol)
3)
2(二氯雙(三鄰甲苯基膦)鈀(II))、Pd(dppf)Cl
2(1,1′-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II))、Pd(MeCN)
4(BF
4)
2(肆(乙腈)四氟硼酸鈀(II))、Pd-PEPPSI-IPent (二氯[1,3-雙(2,6-二-3-戊基苯基)咪唑-2-亞基](3-氯吡啶基)鈀(II))、Pd-PEPPSI-IPr ([1,3-雙(2,6-二異丙基苯基)咪唑-2-亞基](3-氯吡啶基)二氯化鈀(II))、Pd-PEPPSI-SIPr ((1,3-雙(2,6-二異丙基苯基)咪唑亞基) (3-氯吡啶基)二氯化鈀(II))及雙(二亞苄基丙酮)鈀(0) (Pd(dba)
2)。
膦配位體及包含鈀觸媒及膦配位體二者之錯合物之非限制性列表包括三苯基膦(PPh
3)、雙(三鄰甲苯基膦) (P(
o-Tol)
3)
2、三第三丁氧基膦(P
t-Bu
3)、三-第三丁基四氟硼酸鏻(P
t-Bu
3HBF
4)、雙(三環己基膦(PCy
3)、雙(1-金剛烷基)丁基膦烷(
n-BuP(AD)
2)、2,2′-雙(二苯基膦基)-1,1′-聯萘(BINAP)、(9,9-二甲基-9H-𠮿
-4,5-二基)雙(二苯基膦烷)(Xantphos)、雙[(2-二苯基膦基)苯基]醚(DPEPhos)、1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵(dppf)、1,1′-雙(二-第三丁基膦基)二茂鐵(dcypf)、1,3-雙(二苯基膦基)丙烷(DPPP)、(2-聯苯基)二-第三丁基膦(JohnPhos)、氯(2-二環己基膦基-1,1′-聯苯)[2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)] (CyJohnPhos)、2-二環己基膦基-2′-(N,N-二甲胺基)聯苯(DavePhos)、(2-二環己基膦基-2′,6′-二異丙氧基-1,1′-聯苯)[2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)] (RuPhos)、2-二環己基膦基-2′,6′-二甲氧基聯苯(SPhos)、[(2-二環己基膦基-3,6-二甲氧基-2′,4′,6′-三異丙基-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)] (BrettPhos)、1,1'-雙(二-第三丁基膦基)二茂鐵(dtbpf)、2-二-第三丁基膦基-2′,4′,6′-三異丙基聯苯(
t-BuXPhos)、[(2-二-第三丁基膦基-3,6-二甲氧基-2′,4′,6′-三異丙基-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)] (
t-BuBrettPhos)、2-二-第三丁基膦基-3,4,5,6-四甲基-2′,4′,6′-三異丙基-1,1′-聯苯(Me
4-
tBuXPhos)、5-(二-第三丁基膦基)-1′, 3′, 5′-三苯基-1′H-1,4′-聯吡唑(BippyPhos)、二(1-金剛烷基)-2-嗎啉基苯基膦(MorDalPhos)、鈀/1,3-雙-(2,6-二異丙基苯基)氯化咪唑啉(IPr
.HCL)、[2-(二-1-金剛烷基膦基)-2′,4′,6′-三異丙基-3,6-二甲氧基聯苯][2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) (AdBrettPhos)、(2-二環己基膦基-2′,6′-二異丙氧基-1,1′-聯苯)[2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) (RuPhos)、[(2-二環己基膦基-3,6-二甲氧基-2′,4′,6′-三異丙基-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) (BrettPhos)、[(2-{雙[3,5-雙(三氟甲基)苯基]膦}-3,6-二甲氧基-2′,4′,6′-三異丙基-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) (JackiePhos)、[(2-二-第三丁基膦基-3,6-二甲氧基-2′,4′,6′-三異丙基-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) (
t-BuBrettPhos)、甲磺醯基(2-(二-第三丁基膦基)-1,1′-聯萘)[2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]鈀(TrixiePhos)、(2-聯苯)二-第三丁基膦、2′-(二-第三丁基膦基)-N,N-二甲基聯苯-2-胺(
t-BuDavePhos)、2-二-第三丁基膦基-2′-甲基聯苯(
t-BuMePhos)、氯(2-二環己基膦基-1,1′-聯苯)[2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]鈀(II) (CyJohnPhos)、2-二環己基膦基-2′-甲基聯苯(MePhos)、2-二環己基膦基-2′-(N,N-二甲胺基)聯苯(PhDavePhos)、2-二環己基膦基-2′-甲氧基-4′,6′-二-第三丁基聯苯(VPhos)、2-[(第三丁基)苯基膦基]-2′,6′-雙(N,N-二甲胺基)聯苯(PhCPhos)、[(2-二環己基膦基-2′,6′-雙(N,N-二甲胺基)-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) (CPhos)、甲磺酸根基[2-二乙基膦基-2',6'-雙(二甲胺基)-1,1-聯苯](2'-胺基-1,1'-聯苯-2-基)鈀(II) (EtCPhos)、2-二(第三丁基)膦基-2′,4′,6′-三異丙基-3-甲氧基-6-甲基聯苯(RockPhos)、二-1-金剛烷基(4″-丁基-2″,3″,5″,6″-四氟-2′,4′,6′-三異丙基-2-甲氧基-間聯三苯)膦(AlPhos)、2-(第三丁基苯基膦基)-2',6'-二甲胺基-1,1'-聯苯((
t-Bu)PhCPhos)及二環己基[2′,4′,6′-參(丙-2-基)[1,1′-聯苯]-2-基]膦烷(XPhos)。上述列表包含其中鈀觸媒及膦配位體為錯合物之一部分之實例。
於一個態樣中，用於製備式(I)化合物的鈀觸媒及膦配位體不是錯合物甲磺酸根基(2-二環己基膦基-3,6-二甲氧基-2',4',6'-三-異丙基-1,1'-聯苯)(2'-甲基胺基-1,1'-聯苯-2-基)鈀(II) (BrettPhos-Pd-G4)。
於另一態樣中，用於製備式(I)化合物之鈀觸媒為雙(二亞苄基丙酮)鈀(0) (Pd(dba)
2)。於另一態樣中，該膦配位體為二環己基[2′,4′,6′-參(丙-2-基)[1,1′-聯苯]-2-基]膦烷(XPhos)。於又一態樣中，用於製備式(I)化合物之鈀觸媒為雙(二亞苄基丙酮)鈀(0) (Pd(dba)
2)，及該膦配位體為二環己基[2′,4′,6′-參(丙-2-基)[1,1′-聯苯]-2-基]膦烷(XPhos)。
於另一態樣中，反應混合物進一步包含鹼。適宜鹼包括碳酸鉀(K
2CO
3)、碳酸銫(Cs
2CO
3)、氫氧化鉀(KOH)及第三丁醇鈉(NaO
tBu)。於另一態樣中，該鹼為碳酸銫(Cs
2CO
3)或第三丁醇鈉(NaO
tBu)。
於另一態樣中，該反應係於諸如甲苯、1,4-二噁烷、四氫呋喃(THF)、甲基四氫呋喃、苯甲醚、水(H
2O)或其混合物之溶劑中進行。於一些實例中，該反應係於1,4-二噁烷、四氫呋喃(THF)、水(H
2O)或其混合物中進行。於一些實例中，該反應係於1,4-二噁烷、甲苯或其混合物中進行。
於一個態樣中，式(I)化合物可藉由於(例如)諸如二甲亞碸(DMSO)及乙醇之溶劑體系中再結晶來純化。例如，可將式(I)化合物溶解於二甲亞碸(DMSO)中，視情況在加熱下，及然後可添加乙醇(或水)，視情況在冷卻下。於另一態樣中，可添加式(I)化合物之晶種以促進結晶。於一個態樣中，該式(I)化合物係自上述或實例中之方法獲得及呈(例如)濕濾餅自反應分離。
實例4中提供自式(Ic)及(Id)化合物製備式(I)化合物之特定條件。
本文中亦揭示式(Ic)化合物之製備。
。
如上所指定，式(Ic)化合物為用於製備式(I)化合物之起始物質。製備式(Ic)化合物之方法包括在存在鹼、鈀觸媒及膦配位體下，使式(Ia)之第一起始物質：
或其鹽與式(Ib)之第二起始物質：
或其鹽反應，以形成該式(Ic)化合物。適宜鈀觸媒及膦配位體係如上針對式(I)化合物之製備所述。適宜鹼係如上針對式(I)化合物之製備所述。
於一個態樣中，在起始物質(Ia)與(Ib)之間之反應中之鹼為碳酸銫(Cs
2CO
3)，鈀觸媒為雙(二亞苄基丙酮)鈀(0) (Pd(dba)
2)，及膦配位體為(9,9-二甲基-9H-𠮿-4,5-二基)雙(二苯基膦烷) (Xantphos)。於一些實例中，該反應係於極性溶劑，諸如二噁烷中進行。該反應亦可在加熱下，諸如在90℃至110℃下，或在92℃至108℃下，或在95℃至105℃下進行。
於一個態樣中，在起始物質(Ia)與(Ib)之間之反應中之鹼為氫氧化鉀(KOH)，鈀觸媒為雙(二亞苄基丙酮)鈀(0) (Pd(dba)
2)，及膦配位體為(9,9-二甲基-9H-𠮿-4,5-二基)雙(二苯基膦烷) (Xantphos)。於一些實例中，該反應係於非極性溶劑，諸如甲苯中進行。該反應亦可在加熱下，諸如在70℃至110℃下，或在80℃至100℃下，或在85℃至95℃下進行。
於一個態樣中，使藉由上述方法製備之化合物(Ic)與式(Id)化合物在不分離該式(Ic)化合物下反應。
實例4中提供製備化合物(Ic)之特定條件。
本文中亦揭示一種製備式(Ia)化合物之方法。如上所述，式(Ia)化合物為用於製備式(Ic)化合物之起始物質。式(Ia)化合物之製備為五步程序，其各者係以下所述。認為各反應步驟為單獨實施例。亦認為此等反應步驟之組合，包括產生式(Ia)化合物之組合之五步程序為單獨實施例。
製備式(Ia)化合物之第一步驟為一種製備式(III)化合物之方法：
。
該方法包括在存在鉑氫解觸媒或鈀氫解觸媒下，使式(II)之起始物質：
氫化以形成該式(III)化合物。適宜氫解觸媒包括碳載20%氫氧化鈀(帕爾曼氏(Perlman's)觸媒)、氯化鈀、鈀、濕鈀/碳、及氧化鉑(PtO
2)。於一個態樣中，該鉑氫解觸媒為PtO
2及該鈀氫解觸媒為濕鈀/碳。於另一態樣中，該反應係於乙酸乙酯(EtOAc)中在20℃至30℃下，或在22℃至28℃下進行。式(II)化合物可自為已知化合物(CAS 15115-60-3)之4-溴-碘酮(參見實例1.1)製備，其亦購自Sigma Aldrich (目錄號644366)。
製備式(Ia)化合物之第二步驟為一種製備式(IV)化合物之方法：
。
該方法包括使式(III)之起始物質：
與亞硝酸第三丁酯(
t-BuONO)及氯化氫反應，以形成該式(IV)化合物。於一個態樣中，該反應係於四氫呋喃(THF)中在0℃至10℃下進行，及該氯化氫為甲醇化氯化氫。於另一態樣中，結構式(III)之起始物質係如第一步驟中所述製備。
製備式(Ia)化合物之第三步驟為一種製備式(V)化合物：
或其鹽之方法。
該方法包括使式(IV)之起始物質：
或其鹽與磷醯氯(POCl
3)、五氯化磷(PCl
5)及氯化氫反應，以形成該式(V)化合物。
於一個態樣中，在0℃至25℃或5℃至20℃或10℃至15℃下將式(IV)之起始物質與POCl
3及PCl
5組合，接著添加氯化氫及升溫至50℃至70℃或55℃至65℃。於一個態樣中，該反應係於二噁烷中進行。於另一態樣中，結構式(IV)之起始物質係如第二步驟中所述製備。
製備式(Ia)化合物之第四步驟為一種製備式(VI)化合物之方法：
。
該方法包括在存在胺鹼、氫化物還原劑及鈀觸媒下使式(V)之起始物質：
或其鹽反應，以形成該式(VI)化合物。
胺鹼為能接受質子之含氮化合物。實例包括甲胺(CH
3NH
2)、二甲胺((CH
3)
2NH)、三甲胺((CH
3)
3N)及其C
2-C
6烷基胺類似物、苯胺(PhNH
2)及其衍生物、N,N-二異丙基乙胺、二甲胺基吡啶(DMAP)、四甲基乙二胺(TMEDA)及吡啶。
氫化物還原劑為可藉由添加帶負電氫離子(H
-離子)還原所關注化合物之化學化合物。實例包括氫化鈉(NaH)、氫化鋰(LiH)、氫化鋁鋰(LiAlH
4)、三乙基硼氫化鈉及硼氫化鈉(NaBH
4)。
適宜鈀觸媒係如上針對第一實施例所述。於一個態樣中，該鈀觸媒為1,1′-雙(二苯基膦基)二茂鐵]-二氯鈀(II) (Pd(dba)
2)，該氫化物還原劑為硼氫化鈉及該胺鹼為四甲基乙二胺(TMEDA)。於一個態樣中，該反應係於四氫呋喃中及在20℃至30℃下進行。於另一態樣中，式(V)之起始物質係如第三步驟中所述製備。
製備式(Ia)化合物之第五步驟包括使式(VI)之起始物質：
於酸中與溴化劑反應，以形成該式(Ia)化合物。
適宜酸包括(但不限於)硫酸、甲磺酸、三氟甲磺酸及類似者。
溴化劑為能將親電溴原子(Br
+)添加至所關注化合物之化合物。適宜溴化劑為溴化氰(CNBr)、溴(Br
2)及
N-溴琥珀醯亞胺(NBS)。於一個態樣中，該溴化劑為
N-溴琥珀醯亞胺(NBS)及該酸為硫酸(H
2SO
4)。於另一態樣中，式(VI)之起始物質係如第四步驟中所述製備。
實例1中示意性顯示製備式(Ia)化合物之五步程序。實例1中提供此等反應步驟各者之特定條件。
本文中亦揭示一種製備式(Ib)化合物之方法：
。
如上所述，式(Ib)化合物為用於製備式(Ic)化合物之起始物質。式(Ib)化合物之製備為五步程序，其各者係以下所述。認為各反應步驟為單獨實施例。亦認為此等反應步驟之組合，包括產生式(Ib)化合物之組合之五步程序為單獨實施例。
製備式(Ib)化合物之第一步驟為一種製備式(VII)化合物之方法：
。
以下提供R之定義。該方法包括使式(VIIa)之起始物質：
與磺醯氯(例如，乙磺醯氯(ethanesulfonyl chloride) (亦稱作乙磺醯氯(esyl chloride)或EsCl))及胺鹼(諸如三乙胺(TEA))反應，以形成該式(VII)化合物。
磺醯氯具有通式RSO
2Cl，其中R為C
1-C
4直鏈或分支鏈烷基，或視情況經鹵素、C
1-C
4烷基及/或硝基取代之苯基、或類似者。實例包括苯磺醯氯、甲苯磺醯氯(對甲苯磺醯氯)、溴苯磺酸氯(對溴苯磺醯氯)、硝基苯磺醯氯(nosyl chloride/nitrophenyl sulfonyl chloride)、甲磺醯氯(mesyl chloride/methyl sulfonyl chloride)及乙磺醯氯(esyl choride/ethyl sulfonyl chloride)。磺醯基由RSO
2-表示。於一個態樣中，該反應係於二氯甲烷中在5℃至20℃下或在10℃至15℃下進行。
適宜胺鹼係如上針對式(VI)化合物之製備所述。
式(VIIa)之起始物質可根據Frigola等人，
J. Med. Chem., 38:1203 (1995) (其完整教示係以引用的方式併入本文中)中所述之程序獲得。
製備式(Ib)化合物之第二步驟為一種製備式(VIII)化合物之方法：
。
該方法包括使式(VII)之第一起始物質：
(例如，
)或其鹽與式(VIIIb)之第二起始物質：
及鹼(諸如碳酸鉀(K
2CO
3))反應，以形成該式(VIII)化合物。R係如上針對式(VII)化合物所述。於另一態樣中，式(VII)之起始物質係如第一步驟中所述製備。
製備式(Ib)化合物之第三步驟為一種製備式(VIIIb)之第二起始物質之方法。該方法包括使2-溴乙酸甲酯與
反應。
製備式(Ib)化合物之第四步驟為一種製備式(IX)化合物之方法：
。
該方法包括在存在水下使式(VIII)之起始物質：
或其鹽與氯化鋰(LiCl)反應，以形成該式(IX)化合物。例如，可使用0.4至0.6 mol當量之水。於一個態樣中，該反應係於二甲基乙醯胺(DMAc)中在160℃至170℃下進行。於另一態樣中，式(VIII)之起始物質係如第三步驟中所述製備。
製備式(Ib)化合物或其鹽之第五步驟包括使式(IX)之起始物質：
或其鹽在鈀氫解觸媒存在下氫化，以形成該式(Ib)化合物。於一個態樣中，該鈀氫解觸媒為碳載氫氧化鈀，20重量%乾基(20% Pd(OH)
2/C)，且該反應係於甲醇(MeOH)中在30℃至50℃或在35℃至45℃進行。於另一態樣中，式(IX)之起始物質係如第四步驟中所述製備。
實例2中示意性顯示製備式(Ib)化合物之五步程序。實例2中提供此等反應步驟各者之特定條件。
本發明之另一實施例為選自以下之化合物：
(其中R係如本文中所定義，例如
(Es為乙基磺醯基))、
、
及
，或上述任一者之鹽。
此等化合物具有鹼性基團及因此可與無機酸及有機酸反應形成鹽。此等鹽之實例包括硫酸鹽、焦硫酸鹽、硫酸氫鹽、亞硫酸鹽、亞硫酸氫鹽、磷酸鹽、磷酸一氫鹽、磷酸二氫鹽、偏磷酸鹽、焦磷酸鹽、氯化物、溴化物、碘化物、乙酸鹽、丙酸鹽(propionate)、癸酸鹽、辛酸鹽、丙烯酸鹽、甲酸鹽、異丁酸鹽、己酸鹽、庚酸鹽、丙炔酸鹽(propiolate)、草酸鹽、丙二酸鹽、琥珀酸鹽、辛二酸鹽、癸二酸鹽、富馬酸鹽、馬來酸鹽、丁炔-1,4-二酸鹽、己炔-1,6-二酸鹽、苯甲酸鹽、氯苯甲酸鹽、甲基苯甲酸鹽、二硝基苯甲酸鹽、羥基苯甲酸鹽、甲氧基苯甲酸鹽、酞酸鹽、磺酸鹽、二甲苯磺酸鹽、苯乙酸鹽、苯丙酸鹽、苯丁酸鹽、檸檬酸鹽、乳酸鹽、γ-羥基丁酸鹽、乙醇酸鹽、酒石酸鹽、甲磺酸鹽、丙磺酸鹽、萘-1-磺酸鹽、萘-2-磺酸鹽、扁桃酸鹽，及類似者。
實例 示例性化合物之製備 定義ACN 乙腈
C 攝氏度
Cs
2CO
3碳酸銫
DCM 二氯甲烷
DMAc 二甲基乙醯胺
DMSO 二甲亞碸
EsCl 乙磺醯氯
EtOAc 乙酸乙酯
EtOH 乙醇
g 克
h 小時
H
2氫氣
H
2O 水
H
2SO
4硫酸
HCl 氯化氫
HPLC 高效液相層析法
IC
50抑制濃度50%
LC-MS 液相層析法-質譜法
LiCl 氯化鋰
K
2CO
3碳酸鉀
kg 千克
mbar 毫巴
MeOH 甲醇
min 分鐘
MTBE 甲基第三丁基醚
N
2氮氣
NaBH
4硼氫化鈉
NaHSO
3亞硫酸氫鈉
Na
2SO
4硫酸鈉
NLT 不少於
NMT 不多於
PtO
2氧化鉑
R1 第一反應器
R2 第二反應器
RT 滯留時間
rt 室溫
SiO
2二氧化矽
t-BuONO 亞硝酸第三丁酯
TEA 三乙胺
TLC 薄層層析法
TMEDA 四甲基乙二胺
THF 四氫呋喃
* 3 重複數目(例如，3次)
LC-MS：液相層析法-質譜法(LC-MS)數據(針對純度及同一性分析樣品)係利用Agilent型號-1260 LC系統使用安裝有Agilent Poroshel 120 (EC-C18，2.7 µm粒子大小，3.0 x 50 mm尺寸)逆相管柱之Agilent型號6120質譜儀利用ES-API電離在22.4℃下獲得。流動相由溶劑0.1%甲酸/水及0.1%甲酸/乙腈之混合物組成。利用歷時4分鐘之過程自95%水溶液/5%有機物至5%水溶液/95%有機流動相之恆定梯度。流率係恆定在1 mL/min下。
或者，液相層析法-質譜法(LC-MS)數據(針對純度及同一性分析樣品)係利用Shimadzu LCMS系統使用安裝有Agilent (Poroshel HPH-C18，2.7 µm粒子大小，3.0 x 50 mm尺寸)逆相管柱之Shimadzu LCMS質譜儀利用ESI電離在22.4℃下獲得。流動相由溶劑5 mM NH
4HCO
3(或0.05%TFA)/水及乙腈之混合物組成。利用歷時2分鐘之過程自90%水溶液/10%有機物至5%水溶液/95%有機流動相之恆定梯度。流率係恆定在1.5 mL/min下。
矽膠層析法：矽膠層析法係在Teledyne Isco CombiFlash® Rf單元、Biotage® Isolera Four單元或Biotage® Isolera Prime單元上進行。
質子 NMR：
1H NMR光譜係利用Varian 400MHz Unity Inova 400 MHz NMR儀器(擷取時間= 3.5秒，具有1秒延遲；16至64次掃描)或Avance 400MHz Unity Inova 400 MHz NMR儀器(擷取時間= 3.99秒，具有1秒延遲；4至64次掃描)或Avance 300MHz Unity Inova 300 MHz NMR儀器(擷取時間= 5.45秒，具有1秒延遲；4至64次掃描)獲得。除非另有指定，否則所有質子於DMSO-
d6溶劑中以相對於殘留DMSO (2.50 ppm)之百萬分率(ppm)報告。
GC：氣相層析法係利用Agilent 7890C氣相層析或相似利用DB-1 15 m x 0.25 mm x 1.0 µm或等效管柱，以250℃之注射器溫度，325℃之檢測器溫度及1.6 mL/min之氮氣載氣之恆定流率獲得。
合成實例： 實例 1 ：合成 8- 溴 -3- 氯 -5- 異丙基異喹啉 (Ia) 
1.1 製備 4-( 丙 -1- 烯 -2- 基 )-2,3- 二氫 -1
H- 茚 -1- 酮 (II) 
在25℃下，向含於二噁烷(2500 mL)及H
2O (500 mL)中之
化合物 (IIa)(500 g，2.37 mol，1.00 eq)之溶液中添加
化合物 (IIb)(398 g，2.37 mol，1.00 eq)、Pd(dppf)Cl
2(17.3 g，23.6 mmol，0.01 eq)及TEA (719 g，7.11 mol，989 mL，3.00 eq)。將反應混合物在80℃下攪拌12小時。LCMS顯示
化合物 (IIa)完全消耗及檢測到所需質量(RT = 0.885 min)。將三個批次合併。將混合物透過矽藻土過濾及將濾餅用乙酸乙酯(500 mL * 3)洗滌。將H
2O (4000 mL)添加至濾液中及用乙酸乙酯(1000 mL * 3)萃取。將有機相用鹽水(2000 mL)洗滌，經Na
2SO
4乾燥，過濾及濃縮，以得到殘留物。將殘留物藉由管柱層析法(SiO
2)，石油醚/乙酸乙酯= 50/1至10/1，Rf = 0.4)純化。獲得呈淺黃色固體之
化合物 (II)(1.05 kg，6.05 mol，85.1%產率，99.0%純度)及經由
1H NMR及LCMS證實。
LC-MS：產物：RT = 0.885 min，m/z = 173.0 (M+H)
+。
1 HNMR：(400 MHz, CDCl
3) [ppm] δ 7.68 (dd,
J= 7.6, 0.8 Hz, 1H), 7.49 (dd,
J= 8.0, 1.2 Hz, 1H), 7.34 - 7.38 (m, 1H), 5.30 - 5.31 (m, 1H), 5.10 (d,
J= 1.2, 0.8 Hz, 1H), 3.15 - 3.18 (m, 2H), 2.67 - 2.71 (m, 2H), 2.14 - 2.15 (m, 3H)。
1.2 製備 4- 異丙基 -2,3- 二氫 -1
H-
茚 -1- 酮 (III) 
在25℃下，在N
2下，向含於EtOAc (10.5 L)中之
化合物 (II)(1.05 kg，6.04 mol，1.00 eq)之溶液中添加濕Pd/C (210 g，10% Pd含量)。將懸浮液在真空下脫氣及用H
2淨化若干次。將混合物在H
2(20 psi)下在25℃下攪拌12小時。LCMS顯示
化合物 (II)完全消耗及檢測到所需質量(RT = 0.802 min)。將混合物透過矽藻土過濾及用乙酸乙酯(2000 mL * 3)洗滌。將濾液濃縮，以得到殘留物。將該殘留物用於下個步驟無需進一步純化。獲得呈白色固體之
化合物 (III)(1.08 kg，粗製物)及經由LCMS證實。
LC-MS：產物：RT = 0.858 min，m/z = 175.1 (M+H)
+。
1.3 製備 (
E)-2-(
羥基亞胺基 )-4- 異丙基 -2,3- 二氫 -1H- 茚 -1- 酮 (IV) 
在0至10℃下，在N
2下，向含於THF (750 mL)中之
化合物 (III)(295 g，1.69 mol，1.00 eq)之溶液中添加t-BuONO (262 g，2.54 mol，302 mL，1.50 eq)。然後在0至10℃下，將HCl/MeOH (4M，110 mL，0.26 eq)逐滴添加至混合物中。於添加後，將反應混合物在0℃下攪拌2小時。LCMS顯示
化合物 (III)消耗及檢測到所需質量(RT = 0.774 min)。將反應混合物濃縮，以得到殘留物。將該殘留物用石油醚/乙酸乙酯= 7/1 (800 mL)漿化及過濾，收集濾餅，以得到淺黃色固體。獲得呈淺黃色固體之
化合物 (IV)(205 g，1.00 mol，59.2%產率，99.4%純度)，其藉由LCMS及
1H NMR證實。
LC-MS：產物：RT = 0.773 min，m/z = 204.1 (M+H)
+。
1 H NMR：(400 MHz, DMSO) δ [ppm] 12.65 (s, 1H), 7.65 (d,
J= 7.6 Hz, 1H), 7.58 (d,
J= 7.2 Hz, 1H), 7.46 (t,
J= 7.6 Hz, 1H), 3.77 (s, 2H), 3.06 - 3.36 (m, 1H), 1.24 (d,
J= 6.8 Hz, 6H)。
1.4 製備 1,3- 二氯 -5- 異丙基異喹啉 (V) 
在25℃下，向含於二噁烷(650 mL)中之
化合物 (IV)(133 g，650 mmol，1.00 eq)之溶液中添加POCl
3(151 g，984 mmol，91.5 mL，1.51 eq)。然後在0至20℃下，將PCl
5(203 g，976 mmol，1.50 eq)分部分添加至混合物中。將混合物在0至20℃下攪拌0.5小時。然後在0至20℃下，將HCl/二噁烷(4M，16.3 mL，0.10 eq)添加至混合物中，及然後將混合物在60℃下攪拌11小時。LCMS顯示
化合物 (IV)完全消耗及檢測到所需質量(RT = 1.074 min)。將混合物用H
2O (1500 mL)中止及用二氯甲烷(300 mL * 3)萃取。將有機相用鹽水(300 mL)洗滌，經Na
2SO
4乾燥，過濾及濃縮，以得到殘留物。合併殘留物及藉由管柱層析法(SiO
2，石油醚/乙酸乙酯= 1/0至100/1，R
f= 0.35)純化。藉由TLC (石油醚/乙酸乙酯= 1/0，R
f= 0.35)檢測殘留物。獲得呈黃色油之
化合物 (V)(138 g，575 mmol，64.5%產率)及藉由LCMS證實。
LC-MS：產物：RT = 1.074 min，m/z = 239.9 (M+H)
+
1.5 製備 3- 氯 -5- 異丙基異喹啉 (VI) 
在25℃下，在氮氣下，向含於THF (850 mL)中之
化合物 (V)(170 g，581 mmol，1.00 eq)之溶液中添加Pd(dppf)Cl
2(4.25 g，5.81 mmol，0.01 eq)。然後將TMEDA (101 g，872 mmol，132 mL，1.50 eq)及NaBH
4(81.6 g，2.16 mol，3.71 eq)添加至混合物中。將反應混合物在25℃下攪拌1小時。TLC (石油醚/乙酸乙酯= 10/1)顯示
化合物 (V)(R
f= 0.8)完全消耗及檢測到主要點(R
f= 0.6)。將混合物倒入經冷卻之1N HCl水溶液(1000 mL)中及用乙酸乙酯(500 mL * 3)萃取。將有機相透過矽藻土過濾及將濾液用鹽水(200 mL)洗滌，經Na
2SO
4乾燥，過濾及濃縮，以得到殘留物。將殘留物藉由管柱層析法(SiO
2，石油醚/乙酸乙酯= 1/0至100/1，R
f= 0.6)純化。獲得呈黃色油之
化合物 (VI)(137 g，粗製物)及經由
1H NMR及LCMS證實。
LC-MS：產物：RT = 0.901 min，m/z = 206.1 (M+H)
+。
1 H NMR：(400 MHz, CDCl
3) δ [ppm] 9.06 (s, 1H), 7.94 (s, 1H), 7.82 (d,
J= 8.0 Hz, 1H), 7.64 (d,
J= 6.8 Hz, 1H), 7.55 - 7.58 (m, 1H), 3.55 - 3.65 (m, 1H), 1.40 (d,
J= 6.8 Hz, 6H)。
1.6 製備 3- 氯 -5- 異丙基異喹啉 (Ia) 
在-10至0℃下，將
化合物 (VI)(93.8 g，392 mmol，1.00 eq)添加至H
2SO
4之溶液(500 mL)中。於添加後，將混合物冷卻降至-10至-20℃及在-10至-20℃下，將NBS (90.7 g，510 mmol，1.30 eq)添加至混合物中。然後將反應混合物在25℃下攪拌2小時。TLC (石油醚/乙酸乙酯= 20/1)顯示
化合物 (VI)(R
f= 0.6)殘餘及形成主要點(R
f= 0.9)。在0至10℃下，將混合物倒入冰(1500 g)中及用氫氧化銨(1800 mL)調整至pH = 9，然後用乙酸乙酯(500 mL * 2)萃取。將有機相用鹽水(1000 mL)洗滌，經Na
2SO
4乾燥，過濾及濃縮，以得到殘留物。將殘留物藉由管柱層析法(SiO
2，石油醚/乙酸乙酯= 1/0至50/1，R
f= 0.9)純化。獲得呈灰白色固體之
化合物 (VI)(70.03 g，230 mmol，58.7%產率，93.6%純度)及經由
1H NMR、LCMS及HPLC證實。
LC-MS：產物：RT = 1.149 min，m/z = 283.9 (M+H)
+。
HPLC：產物：RT = 2.863 min，93.6%純度，在220 nm下。
1 HNMR：(400 (MHz, CDCl
3) δ [ppm] 9.43 (s, 1H), 7.91 (s, 1H), 7.78 (d,
J= 7.6 Hz, 1H), 7.46 (d,
J= 7.6 Hz, 1H), 3.51 - 3.62 (m, 1H), 1.38 (d,
J= 7.2 Hz, 6H)。
實例 2 ： 合成 (
2R,3S)-2-
甲基 -3-(( 甲磺醯基 ) 甲基 ) 氮雜環丁烷鹽酸鹽 (Ib) 
2.1 製備 2-( 甲磺醯基 ) 乙酸甲酯 (VIIIb) ： 向3000 L反應器中放入甲基亞磺酸鈉(153.19 kg，1500 mol，1.2 eq)及丙酮(760.00 kg)，以一份式添加
乙酸 2- 溴甲酯 (BMA)(190.00 kg，1250 mol，1.0 eq)。將反應混合物加熱至55至60℃及在55至60℃下攪拌歷時12至16小時。在反應完全(GC監測)後，將反應混合物冷卻至15至20℃。將反應混合物過濾，及將濾餅用丙酮(50 L)洗滌一次。將合併之濾液在真空下濃縮至300至350 L體積。添加正庚烷(200 L)，及將混合物繼續濃縮至300至350 L體積。重複此操作兩次以移除殘留丙酮。
放入正庚烷(400 L)，及將混合物在20至30℃下攪拌1至2小時。將混合物過濾，及將濾餅用正庚烷(60 L)洗滌一次。將濕濾餅在35至40℃下乾燥6至10小時，以得到呈白色固體之
化合物 (VIIIb)(167.60 kg，88.2%產率)，GCAP：100%。
GC純度：100 % (a/a)，RT = 3.79 min。
1 H NMR：(400 MHz, CDCl
3) δ [ppm] 4.02 (s, 2H), 3.85 (s, 3H), 3.16 (s, 2H)。
2.2 製備 (((2
R, 3
S)-1-
二苯甲基 - 甲基氮雜環丁烷 -3- 基 ) 氧基 ) 乙磺酸酯 (VIIc) 
向2000 L反應器中放入
化合物 (VIIa)(215.00 kg，848.7 mol，1.0 eq)及DCM (1144.00 kg)。於攪拌5分鐘後，添加TEA (111.64 kg，1103.3 mol，1.3 eq)。在氮氣保護下，將反應混合物冷卻至0至10℃。歷時2至3小時將EsCl (120.03 kg，933.5 mol，1.1 eq)緩慢添加至反應中，同時保持溫度＜10℃。在添加期間白色固體形成。於添加後，將反應再攪拌1至2小時。
將反應混合物用H
2O (645 L)中止及攪拌15分鐘。分離有機層，及將水相用DCM (215 L)萃取一次。將合併之有機相用10%鹽水(215 L)洗滌。將有機部分在真空下在40至45℃下濃縮至450至500 L體積。添加正庚烷(645 L)，及將混合物蒸餾至450至500 L體積。重複此操作兩次以移除殘留DCM。放入正庚烷(645 L)，及將混合物在20至30℃下攪拌1至2小時。將混合物過濾，及將濾餅用正庚烷(88 L)洗滌一次，及將濕濾餅在45至55℃下在真空下乾燥6至10小時，以得到呈黃色固體之
化合物 (VIIc)(284.20 kg，96.9%產率)。
HPLC純度：99.7 % (a/a)，RT = 6.70 min。
1 H NMR: (400 MHz, CDCl
3) δ [ppm] 7.45-7.33 (m, 4H), 7.30-7.21 (m, 6H), 4.66-4.61 (ddd, 1H), 4.43 (s, 1H), 3.77-3.73 (dd, 1H), 3.43-3.36 (dq, 1H), 3.43-3.37 (q, 2H), 2.91-2.87 (dd, 1H), 1.43-1.40 (t, 3H), 0.84-0.83 (d, 3H)。
2.3 製備 (S)2-(2
R,3
S)-1-
二苯甲基 -2- 甲基氮雜環丁烷 -3- 基 )-2-(( 甲磺醯基 ) 乙酸甲酯 ) (VIII) 
向2000 L反應器中添加
化合物 (VIIc)(142.2 kg，411.6 mol，1.0 eq)及乙腈(665.50 kg)。於攪拌5分鐘後，分開添加2-(甲磺醯基)乙酸甲酯
化合物 (VIIIb)(75.16 kg，494.0 mol，1.2 eq)及K
2CO
3(113.78 kg，823.3 mol，2.0 eq)。將反應混合物加熱至68至72℃及在68至72℃下攪拌歷時16小時。將K
2CO
3(28.45 kg，205.8 mol，0.5 eq)添加至反應混合物中，然後將其在68至72℃下攪拌24小時。在反應完全(HPLC監測)後，將反應混合物冷卻至15至20℃。將反應混合物離心，將濾液濃縮至150至200 L體積，及將濾液與下個步驟之濾液合併。
將離心濾餅懸浮於乙酸乙酯(570 L)中及攪拌1至2小時。將漿液離心。將濾液與來自先前步驟之濾液合併。將製備之10% NaCl水溶液(156 L)添加至合併之液體中及攪拌15分鐘。分離有機層，將水相用乙酸乙酯(142 L)萃取。將合併之有機相用10%鹽水(142 L x 2)洗滌兩次。將有機相在減壓下在45至55℃下濃縮。
將MTBE (284 L)添加至殘留物中及攪拌1至2小時，然後在15至20℃下緩慢添加正庚烷(383 L)持續2至3小時。將所得漿液過濾，及將濾餅用正庚烷(50 L)洗滌一次。將濕濾餅在45至55℃下在真空下乾燥6至10小時，以得到呈黃色固體之
化合物 (VIII)(125.70 kg，78.9%產率)。
HPLC純度：97.7 % (a/a)，RT = 6.30 min。
1 H NMR: (400 MHz, DMSO-d
6) δ [ppm] 7.43-7.27 (m, 4H), 7.25-7.18 (m, 6H), 4.69-4.59 (dd, 1H), 4.50 (s, 1H), 3.74 (s, 3H), 3.45-3.40 (ddd, 1H), 3.35-3.15 (m, 1H), 3.05 (d, 3H), 2.73-2.55 (m, 2H), 0.76-0.58 (dd, 3H)。
2.4 製備 (2
R,3
S)-1-
二苯甲基 -2- 甲基 -3-(( 甲磺醯基 ) 甲基 ) 氮雜環丁烷 (IX) 
向反應器中放入
化合物 (VIII)(120.8 kg，311.7 mol，1.0 eq)及DMAc (849.00 kg)，然後添加LiCl (19.82 kg，467.6 mol，1.5 eq)及H
2O (3.00 kg，166.7 mol，0.53 eq)，將混合物攪拌直至溶解。使以上混合物於流動反應器中在170至175℃下反應，反應時間為17分鐘。每1至2小時藉由HPLC監測反應混合物。將水(725 L)及乙酸乙酯(966 L)添加至反應混合物中及攪拌15分鐘，分離有機層，將水相用乙酸乙酯(725 L)萃取一次。
將合併之有機相用10%鹽水(725 L x 1，483 L x 1)洗滌兩次，及然後將有機相在減壓下在45至55℃下濃縮。將MTBE (242 L)添加至殘留物中及攪拌1至2小時，然後在15至25℃下歷時2至3小時緩慢添加正庚烷(121 L)。將所得漿液過濾，將濾餅用MTBE (30 L)洗滌一次。將濕濾餅在45至55℃下在真空下乾燥6至10小時，以得到呈黃色固體之
化合物 (IX)(74.70 kg，72.7%產率)。
HPLC純度：98.8 % (a/a)，RT = 8.81 min。
1 H NMR: (400 MHz, CDCl
3) δ [ppm] 7.45-7.40 (m, 4H), 7.32-7.19 (m, 6H), 4.35 (s, 1H), 3.70-3.65 (m, 1H), 3.26-3.10 (m, 3H), 2.85 (s, 3H), 2.65-2.57 (m, 2H), 0.85-0.82 (d, 3H)。
2.5 製備 (2
R,3
S)-2-
甲基 -3-(( 甲磺醯基 ) 甲基 ) 氮雜環丁烷鹽酸鹽 (Ib) 
向1000 L反應器中放入
化合物 (IX)(143.9 kg，436.8 mol，1.0 eq)及MeOH (447.50 kg)，然後分開添加20% Pd(OH)
2/C (28.78 kg，20% w/w%)及AcOH (26.21 kg，436.8 mol，1.0 eq)。在0.5至1.0 MPa H
2下，在25至35℃下，使混合物經受氫解條件歷時8至12小時。在反應完全(HPLC監測)後，將反應混合物過濾，及將濾餅用MeOH (144 L)洗滌一次。將4M HCl/MeOH添加至濾液中以調整pH至1至2之目標範圍。將混合物在真空下在45至55℃下濃縮至400 L體積。將殘留物用正庚烷(288 L x 2)洗滌兩次，遺棄正庚烷相。然後將殘留物在減壓下在45至55℃下濃縮。將MeOH (144 L)添加至殘留物中及在45至55℃下攪拌0.5至1小時，然後在45至55℃下歷時2至3小時將THF (864 L)緩慢添加至混合物中。歷時5小時將混合物冷卻至20至30℃及再攪拌4至5小時。將所得漿液過濾，及將濾餅用THF (32 L)洗滌一次。將濕濾餅在45至55℃下在真空下乾燥6至10小時，以得到呈白色固體之
化合物 (Ib)(76.20 kg，87.7%產率)。
GC純度：98.9 % (a/a)，RT = 18.98 min。
1 H NMR: (400 MHz, DMSO-d
6) δ [ppm] 9.22-9.13 (m, 2H), 4.32-4.25 (m, 1H), 3.90 (m, 1H), 3.75 (m, 1H), 3.55 (m, 2H), 2.95 (m, 4H), 1.48-1.46 (d, 3H)。
實例 3a ：合成 2-((3s, 4R)-3- 氟 -4- 甲氧基哌啶 -1- 基 ) 嘧啶 -4- 胺 (Id) 
3.1 合成 (3S,4R)-3- 氟 -4- 羥基哌啶 -1- 甲酸第三丁酯 (i) 化合物 (i)((3S,4R)-3-氟-4-羥基哌啶-1-甲酸第三丁酯)係根據
J. Org. Chem., 2013, 78, 8892-8897中所述之方法合成。
3.2 合成 (3S,4R)-3- 氟 -4- 甲氧基哌啶 -1- 甲酸第三丁酯 (ii)在0℃下，將氫化鈉(218.90 mg，9.122 mmol，4 equiv.)添加至含((3S,4R)-3-氟-4-羥基哌啶-1-甲酸第三丁酯)
化合物 (i)(500 mg，2.280 mmol，1 equiv.)之THF (10 mL)中。於攪拌20分鐘後，添加碘甲烷(1294.73 mg，9.122 mmol，4 equiv.)。將所得溶液在0℃下再攪拌1小時。然後藉由添加10 mL水將反應中止。過濾除去固體。將所得溶液用EA萃取及在真空下濃縮。此產生500 mg (94.1%)呈淺黃色油之標題化合物。
LC-MS: (ES, m/z) = 178 [M+1-56]。
3.3 合成 (3S,4R)-3- 氟 -4- 甲氧基哌啶 (iii)將含於TFA/DCM (3/10 mL)中之(3S,4R)-3-氟-4-甲氧基哌啶-1-甲酸第三丁酯
化合物 (ii)(500 mg，2.143 mmol，1 equiv.)之溶液在室溫下攪拌1小時。將所得混合物在真空下濃縮，以得到500 mg (粗製物)呈固體之
化合物 (iii)。
3.4 合成 2-((3S,4R)-3- 氟 -4- 甲氧基哌啶 -1- 基 ) 嘧啶 -4- 胺 (Id)將含於IPA (3 mL)中之(3S,4R)-3-氟-4-甲氧基哌啶
化合物 (iii)(3 g，22.528 mmol，1 equiv.)、2-氯嘧啶-4-胺
化合物 (iv)(2.33 g，0.018 mmol，0.8 equiv.)及TEA (6.84 g，0.068 mmol，3 equiv.)之混合物在100℃下攪拌12小時。在真空下移除溶劑及將殘留物藉由FLASH (5% MeOH/DCM)純化，以得到3.3 g (66 %)呈淺黃色固體之
化合物 (Id)。
LC-MS：(ES, m/z) = 227 [M+1]。
1 H-NMR(400 MHz, 6d-DMSO) δ ppm 7.72 (d, 1H, J=5.6 Hz), 6.39 (s, 2H), 5.71 (d, 1H, J=5.6 Hz), 4.83 (d, 1H, J=49.3 Hz), 4.60 - 4.49 (m, 1H), 4.29 (d, 1H, J=13.3 Hz), 3.55 - 3.42 (m, 1H), 3.28 (d, 1H, J=13.3 Hz), 3.20 - 3.04 (m, 1H), 1.76 - 1.48 (m, 2H)。
實例 3b ：合成 2-((3s,4R)-3- 氟 -4- 甲氧基哌啶 -1- 基 ) 嘧啶 -4- 胺 (Id) 
步驟 1 及 2 ：合成 (3S,4R)-3- 氟 -4- 甲氧基哌啶 (iii)將精確75 mL四氫呋喃及30.0 g (0.1368 mol) N-Boc-(3S,4R)-3-氟-4-羥基哌啶
化合物 (i)放入安裝有頂部攪拌器及氮氣入口/出口之250 mL 3頸圓底燒瓶中。然後放入5 g (6.4 mL)第三丁醇，及將玻璃漏斗用2.5 g (2.8 mL)四氫呋喃(註釋：亦可使用甲苯/THF)沖洗。向此中添加26 g (0.20 mol，1.5 mol eq)硫酸二甲酯(註釋：亦可使用CH
3I)及將所得混合物攪拌5分鐘。歷時1小時時間經由添加漏斗添加於THF中之20%第三丁酸鉀(26.5 g，0.24 mol，1.75 mol eq)，維持內部溫度介於20至30℃之間。該添加係放熱，及藉由添加速率控制溫度。反應混合物最初增稠及然後隨著添加進行而變稀。於添加完全後，將添加漏斗用3 mL THF沖洗。將反應混合物在20至30℃攪拌30分鐘，及然後針對反應完全進行採樣。當＜ 2.0 %-a/a之
化合物 (i)殘餘時，測定反應係完全。可將反應在20至40℃保持24小時而不負面影響產率或品質。然後將30 mL水添加至反應混合物中，同時攪拌。
向2 L錐形瓶中放入850 ml去離子水及100 g 25 %氨水溶液及將所得溶液攪拌5分鐘。然後將32 mL此溶液添加至反應混合物中，接著添加15 mL水，維持溫度介於20至30℃之間。將所得混合物在此溫度攪拌2小時及然後針對硫酸二甲酯之完全消耗進行採樣。當＜ 5 ppm殘餘時，硫酸二甲酯確定為完全淬滅。將混合物轉移至250 mL分液漏斗中及使層分離30分鐘。抽掉下廢水相丟棄。將任何界層(rag layer)與有機層合併。使富含產物之上有機層靜置5分鐘，然後抽掉任何另外廢水層丟棄。將富含產物之有機層移回至3頸圓底燒瓶中。然後將4.5 g乙酸添加至混合物中，接著添加45 mL水。將所得兩相混合物在20至30℃攪拌30分鐘。停止攪拌，及將兩相混合物移回至250 mL分液漏斗中。使層分離30分鐘，然後抽掉下廢水層丟棄。使有機層再靜置5分鐘及然後抽掉任何水層丟棄。將有機層移回至250 mL 3頸燒瓶中，及將混合物在略微室內真空(house vacuum)下升溫至40至50℃直至達成輕微回流及蒸餾除去約20 mL THF/水共沸物。然後添加75 mL甲苯，將混合物在略微室內真空下升溫至40至50℃直至達成輕微回流及蒸餾除去約20 mL THF/甲苯/水共沸物。將
步驟 1混合物採樣用於Karl-Fischer分析(KF)。在＜ 0.25 %-w/w到達KF終點。可將
步驟 1混合物在20至30℃保持72小時而不負面影響產率或品質。將
步驟 1混合物移至玻璃罐中及添加20 mL甲苯。
將精確80 g (100 mL) 異丙醇放入安裝有頂部攪拌器及氮氣入口/出口之500 mL 3頸燒瓶中。經由氣體入口管及利用輕輕攪拌，將25 g氯化氫(100 %)放入反應器中，確保氣體入口管低於異丙醇之表面。此添加係高度放熱。將含於甲苯中之鹽酸溶液在0至15℃下在氮氣下攪拌1小時。將含於異丙醇中之鹽酸溶液之溫度調整至20至30℃及歷時90分鐘時間經由添加漏斗逐滴添加
步驟 1混合物。觀察CO
2排氣，其由添加速率控制。於添加完全後，將添加漏斗用10 mL甲苯沖洗及將所得漿液在20至30℃下攪拌3至4小時。當＜ 0.5 %-a/a
步驟 1混合物殘餘時，反應確定為完全。可將漿液在20至30℃下保持24小時而不負面影響產率或品質。將漿液在稍真空下加熱至40至50℃直至獲得輕微回流及約70至80 mL異丙醇/甲苯被蒸餾除去。放入另外100 mL甲苯，同時蒸餾以維持3頸燒瓶中之恆定體積及將約100 mL溶劑蒸餾除去(重複兩次)。將漿液冷卻至20至30℃及採樣以評價溶劑交換。當＜ 2 %-a/a異丙醇殘餘時，達到終點。將9 mL異丙醇放入漿液中及再攪拌1小時。經由過濾收集晶體及將濾餅用兩個濾餅體積(約50 mL)之甲苯洗滌。將濾餅在氮氣下脫液1小時及然後在45至50℃下在真空下乾燥24小時。
步驟 3. 合成 2-((3S,4R)-3- 氟 -4- 甲氧基哌啶 -1- 基 ) 嘧啶 -4- 胺 (Id)將精確80 g (78 mL)二噁烷、31.0 g (0.183 mol，1.09 mol eq)
化合物 (iii)、21.6 g (0.167 mol，1.0 mol eq) 4-胺基-2-氯嘧啶、14.5 g (0.027 mol，0.16 mol eq) 25% ZnCl
2之2-甲基四氫呋喃溶液及44.0 g (60.0 mL，0.43 mol)三乙胺放入安裝有頂部攪拌器及氮氣入口/出口之500 mL 3頸燒瓶中。將所得混合物加熱至回流(90至100℃)及在此溫度下攪拌16小時。將反應混合物冷卻至50至60℃及針對反應完全進行採樣。當＜ 1.0 %-a/a 4-胺基-2-氯嘧啶殘餘時，反應測定為完全。將反應冷卻至20至30℃，然後添加43 mL水及110 g 30 % NaOH。將所得兩相混合物在20至30℃下攪拌20分鐘。停止攪拌及允許層分離30分鐘。抽掉下廢水相丟棄。抽掉任何界層與下廢水相，然後將其針對pH測定進行採樣。廢水層之pH係＞ 12。允許將上富有機物流再靜置5分鐘。抽掉任何廢水層丟棄。向富含產物之有機層中添加40 g 30% NaOH及16 g水。將所得兩相混合物在20至30℃下攪拌20分鐘。停止攪拌及允許層分離30分鐘。抽掉下廢水層丟棄。抽掉任何界層並丟棄。允許將富含產物之上有機層再靜置5分鐘。抽掉任何廢水層丟棄。將富含產物之有機相拋光過濾至第二安裝有頂部攪拌器及氮氣入口/出口之500 mL 3頸燒瓶中。將第一燒瓶用1,4-二噁烷(28 mL)沖洗及將沖洗液轉移至第二燒瓶中。將溶液在室內真空下加熱至40至60℃直至達成輕微回流及將100至120 mL 1,4-二噁烷過濾除去。然後將130 mL甲苯放入混合物中及將所得溶液在室內真空下升溫至40至60℃直至達成輕微回流。經由蒸餾移除1,4-二噁烷/甲苯溶劑混合物。在蒸餾期間添加另外200 mL甲苯以維持恆定體積。移除總計180至220 mL 1,4-二噁烷/甲苯蒸餾物。當＜ 5 %-a/a 1,4-二噁烷殘餘時，測定溶劑交換係完全。將所得漿液升溫至65至75℃，在此溫度下攪拌30分鐘，冷卻至20至30℃及然後至0至10℃。將漿液在此溫度下保持30分鐘。經由過濾收集晶體，用30 mL甲苯洗滌及然後在氮氣下脫液30分鐘。
LC-MS：(ES, m/z) = 227 [M+1]。
1 H-NMR(400 MHz, 6d-DMSO) δ ppm 7.72 (d, 1H, J=5.6 Hz), 6.39 (s, 2H), 5.71 (d, 1H, J=5.6 Hz), 4.83 (d, 1H, J=49.3 Hz), 4.60 - 4.49 (m, 1H), 4.29 (d, 1H, J=13.3 Hz), 3.55 - 3.42 (m, 1H), 3.28 (d, 1H, J=13.3 Hz), 3.20 - 3.04 (m, 1H), 1.76 - 1.48 (m, 2H)。
實例 4a ：合成 N -(2-((3
S,4
R)-3-
氟 -4- 甲氧基哌啶 -1- 基 ) 嘧啶 -4- 基 )-5- 異丙基 -8-((2
R,3
S)-2-
甲基 -3-(( 甲磺醯基 ) 甲基 ) 氮雜環丁烷 -1- 基 ) 異喹啉 -3- 胺 (I) 
在20至30℃下，向玻璃夾套反應器(R1)中添加1,4-二噁烷(18.0 L，4.0 vol)、
化合物 (Ia)(6.0 kg，1.0 eq)、
化合物 (Ib)(4.5 kg，1.05 eq)及Cs
2CO
3(23.6 kg，3.4 eq)。將R1用N
2及真空惰性化(2個循環)，接著放入Pd(dba)
2(364 g，0.03 eq)及XantPhos (366 g，0.03 eq)。將R1再次用N
2及真空惰性化(2個循環)，將批料加熱至100℃持續4至8小時，然後冷卻至40至50℃。然後將含有
化合物 (Ic)之反應混合物冷卻至20至30℃及直接用於下個步驟中。
1 H NMR (CDCl
3):
δ [ppm] = 9.43 (s, 1H), 7.91 (s, 1H), 7.78 (d, 1H, 7.8 Hz), 7.45 (d, 1H, 7.8 Hz), 3.56 (hept, 1H, 6.9 Hz), 1.38 (d, 6H, 6.9 Hz)。
向含有
化合物 (Ic)之反應混合物中添加
化合物 (Id)(4.2 kg，1.05 eq)、Pd(dba)
2(352 g，0.04 eq)、XPhos (501 g，0.06 eq)及作為沖洗劑之1,4-二噁烷(5 L，0.83 vol)。將批料加熱至100℃持續4小時，然後冷卻至50℃及添加另外Pd(dba)
2(241 g，0.024 eq)與作為沖洗劑之1,4-二噁烷(1 L，0.15 vol)。將反應在100℃下再攪拌4小時。
將批料冷卻至50至60℃，用水(12 L，2 vol)稀釋，在55至65℃下攪拌30分鐘及移除水層(在層分離期間保持在50℃)。添加水(9 L，1.50 vol)及38% (w/w) NaHSO
3(10.4 kg，2.2 eq)，將批料在55至65℃下攪拌2小時，然後用1,4-二噁烷(72 L，12 vol)稀釋。將批料藉由蒸餾(40至50℃，200 mbar)共沸乾燥，以移除14體積蒸餾物。藉由添加另外1,4-二噁烷(72 L，12 vol)繼續共沸蒸餾，接著蒸餾以移除另外12體積蒸餾物。檢查批料含水量(水為NMT 1.0%)及若含水量係高的，則重複另外1,4-二噁烷放入及蒸餾。於達到NMT 1.0%水後，將批料用1,4-二噁烷(84 L，14 vol)稀釋及在65至75℃下攪拌NLT 1小時。將批料冷卻至25℃及過濾(R1至R2)以移除亞硫酸氫Pd沉澱。將R1用1,4-二噁烷(5 L，0.80 vol)沖洗及透過過濾器送至R2。將濾液濃縮(50至60℃，150 mbar)以移除16.3體積(約98 L)蒸餾物。
在50至60℃下添加先前合成之
化合物 (I)晶種(0.15% w/w)，接著在50至60℃下歷時NLT 1小時緩慢添加EtOH (60 L，10 vol)抗溶劑。檢查1,4-二噁烷與EtOH之比率(1,4-二噁烷NMT 15%)，及然後歷時NLT 3小時將反應緩慢冷卻至15至25℃及再攪拌NLT 3小時。藉由過濾分離所得化合物(I)固體，用EtOH (9 L，1.4 vol)置換洗滌，接著用水(2 x 18 L，2 x 2.8 vol)兩次再漿液洗滌及然後用三次EtOH置換洗滌(3 x 6 L，3 x 0.9 vol)。然後將
化合物 (I)在真空(50 mbar，65至75℃)下乾燥，以得到
化合物 (I)粗製物(5.6 kg，37%產率，藉由HPLC，純度94% a/a)。
HPLC ：93.7% (a/a)。
1 H NMR (DMSO-d
6):
δ [ppm] = 9.94 (1H, bs), 9.07 (1H, bs), 8.65 (1H, bs), 8.01 (1H, d, J=5.67), 7.42 (1H, d, J=8.08), 6.56 (1H, d, J=8.08), 6.49 (1H, d, J=5.67), 4.94 (1H, dddd, J=50.0, 4.95, 2.17, 2.17), 4.74 (1H, dddd, J=14.35, 9.53, 5.31, 1.57), 4.67 (1H, dd, J=7.25, 7.25), 4.49 (1H, bd, J=12.46), 4.20 (1H, dq, J=6.25, 6.25), 3.64 (1H, dd, J=7.25, 7.25), 3.59 (1H, dddd, J=24.88, 10.15, 4.44, 2.26), 3.57 (1H, dd, J=14.34, 6.33), 3.53-3.48 (1H, bm), 3.52-3.44 (1H, m), 3.51 (1H, dd, J=14.34, 8.33), 3.37 (3H, s), 3.29 (1H, ddd, J=12.46, 10.12, 3.13), 3.00 (3H, s), 2.90 (1 H, dddd, J=7.80, 7.80, 7.80, 7.80), 1.82 (1H, dddd, J=12.95, 4.27, 4.27, 3.99), 1.75 (1H, ddddd, J=10.56, 10.56, 10.56, 4.22, 1.64), 1.43 (3H, d, J=6.09), 1.31 (3H, d, J=6.95), 1.30 (3H, d, J=6.92)。
實例 4b ：合成 N -(2-((3
S,4
R)-3-
氟 -4- 甲氧基哌啶 -1- 基 ) 嘧啶 -4- 基 )-5- 異丙基 -8-((2
R,3
S)-2-
甲基 -3-(( 甲磺醯基 ) 甲基 ) 氮雜環丁烷 -1- 基 ) 異喹啉 -3- 胺 (I) 
在氮氣下，將精確44 g (45 mL)甲苯、12.3 g (43.2 mmol，1.0 eq) 8-溴-3-氯-5-異喹啉(
化合物 (Ia))、9.1 g (45.6 mmol，1.05 mol eq) (2R,3S)-2-甲基-3-((甲磺醯基)甲基)氮雜環丁烷HCl (
化合物 (Ib))、110 mg (0.2 mmol，0.005 mol eq)雙(二亞苄基丙酮)鈀(0) (Pd(dba)
2)、110 mg (0.2 mmol，0.005 mol eq) Xantphos放入安裝有頂部攪拌器及回流冷凝器之250 mL 3頸燒瓶中。將燒瓶用室內真空排空兩次及然後用氮氣破壞真空。然後添加11.8 g (7.7 mL，105 mmol，2.65 mol eq) 50%氫氧化鉀及8.0 mL去離子水。將燒瓶再次用室內真空排空及用氮氣破壞真空。將所得兩相混合物升溫至85至95℃及在此溫度下保持10小時。將反應混合物冷卻至55至65℃。當＜1.0 %-a/a
化合物 (Ia)殘餘時，測定反應係完全。將反應混合物冷卻至20至30℃及然後放入9 mL去離子水，接著9 mL甲苯。將兩相混合物再攪拌0.5小時。停止攪拌，及將混合物轉移至分液漏斗中及允許層分離持續0.5小時。丟棄下廢水流連同任何界層。將富含產物之上有機相靜置5分鐘，及丟棄水層。將富含產物之有機物流放回至3頸燒瓶中。將9 mL去離子水及30 mg (30 µL)乙酸放入單獨25 mL錐形瓶中。將乙酸水溶液放入有機層中及將兩相混合物攪拌30分鐘。停止攪拌，將兩相混合物轉移至分液漏斗中及允許層分離0.5小時。丟棄下廢水流連同任何界層。將富含產物之有機物流靜置5分鐘，丟棄任何水層。將富含產物之甲苯物流轉移回至3頸燒瓶中，加熱至回流以蒸餾除去15至25 mL甲苯/水共沸物。將另外40 mL甲苯放入3頸燒瓶中，將其升溫至回流以蒸餾除去另外 40 mL甲苯/水共沸物。將富含產物之甲苯物流冷卻至20至30℃及針對KF進行採樣。當KF係＜ 0.2 %-w/w時，將混合物(
化合物 Ic)透過矽藻土墊拋光過濾，將墊用約2 mL甲苯沖洗及充分混合。
將以上製備之含有15.06 g (0.041 mol，1.03 eq) (分析35.95 %)之精確42 mL
化合物 Ic溶液放入安裝有頂部攪拌器及氮氣入口/出口之250 mL 3頸圓底燒瓶中。然後將9.0 g (0.0398 mol，1.00 eq)
化合物 (Id)、46 mg (0.08 mmol，0.02 mol eq)雙(二亞苄基丙酮)鈀、39 mg (0.08 mmol，0.02 mol eq) Xphos及7.5 mL甲苯放入燒瓶中。將反應器用室內真空排空兩次。將真空用氮氣破壞。然後將29 g (0.06 mol，1.5 mol eq) 20重量%第三丁酸鈉之THF溶液放入燒瓶中，接著放入3 mL甲苯。將所得混合物升溫至45℃及保持15分鐘，然後緩慢升溫至80至95℃。將反應混合物在此溫度下保持6小時。將混合物冷卻至55至60℃。當＜ 4 %-a/a
化合物 (Ic)或
化合物 (Id)殘餘時，測定反應係完全。向反應中放入63 mL 1,4-二噁烷，接著3.5 mL (3.67 g，0.061 mol)乙酸。
於單獨500 mL錐形瓶中放入23 g (0.141 mol)
N-乙醯基半胱胺酸、284 mL去離子水及20 mL 30 wt %氫氧化鈉。將混合物在室溫下攪拌15分鐘。將25 mL此溶液放入反應混合物中。將混合物加熱至55至60℃及在此溫度下攪拌30分鐘。停止攪拌，將混合物轉移至250 mL分液漏斗中及允許層分離30分鐘。丟棄下暗棕色廢水層。將界層與富含產物之上有機相合併，及允許上有機相靜置15分鐘。丟棄另外廢水層。將反應混合物轉移回至3頸圓底燒瓶中及放入25 mL N-乙醯基半胱胺酸溶液。將所得兩相混合物升溫至55至60℃及在此溫度下攪拌30分鐘。停止攪拌，將混合物轉移至250 mL分液漏斗中及允許層分離30分鐘。丟棄下暗棕色廢水層。將界層與富含產物之上有機相合併，及允許上有機相靜置15分鐘。丟棄另外廢水層。將有機相轉移回至3頸圓底燒瓶中及放入25 mL N-乙醯基半胱胺酸溶液。將所得兩相混合物升溫至55至60℃及在此溫度下攪拌30分鐘。停止攪拌，將混合物轉移至250 mL分液漏斗中及允許層分離30分鐘。丟棄下暗棕色廢水層。將界層與富含產物之上有機相合併，及允許上有機相靜置15分鐘。丟棄另外廢水層。將27 mL去離子水放入反應混合物中。將10 g 1,4-二噁烷(不含過氧化物)放入反應混合物中，將其加熱至55至60℃及在此溫度下保持30分鐘。停止攪拌，將混合物轉移至分液漏斗中及允許層分離30分鐘。丟棄下暗棕色廢水層。將界層與富含產物之上有機相合併，及允許上有機相靜置15分鐘。丟棄另外廢水層。將反應混合物放回至3頸圓底燒瓶中及將50 mL甲苯放入混合物中。將混合物加熱至回流(80至120℃)及將50 mL甲苯/二噁烷/水共沸物蒸餾除去。將另外90至110 mL甲苯添加至混合物中以在蒸餾期間維持恆定體積。將富含產物之甲苯物流冷卻至70至90℃及檢查結晶。歷時4小時時間將晶體漿液冷卻至15至25℃，利用氮氣維持惰性氛圍。將晶體漿液在此溫度下再攪拌2小時。經由過濾收集晶體。將濾餅利用約30 mL甲苯經由置換洗滌來洗滌。將濾餅用約30 mL用甲苯變性之乙醇洗滌兩次及將濾餅脫液，以得到粗製化合物(I)。
LC-MS：(ES, m/z) = 557 [M+1]。
1 H NMR (DMSO-d
6):
δ [ppm] = 9.94 (1H, bs), 9.07 (1H, bs), 8.65 (1H, bs), 8.01 (1H, d, J=5.67), 7.42 (1H, d, J=8.08), 6.56 (1H, d, J=8.08), 6.49 (1H, d, J=5.67), 4.94 (1H, dddd, J=50.0, 4.95, 2.17, 2.17), 4.74 (1H, dddd, J=14.35, 9.53, 5.31, 1.57), 4.67 (1H, dd, J=7.25, 7.25), 4.49 (1H, bd, J=12.46), 4.20 (1H, dq, J=6.25, 6.25), 3.64 (1H, dd, J=7.25, 7.25), 3.59 (1H, dddd, J=24.88, 10.15, 4.44, 2.26), 3.57 (1H, dd, J=14.34, 6.33), 3.53-3.48 (1H, bm), 3.52-3.44 (1H, m), 3.51 (1H, dd, J=14.34, 8.33), 3.37 (3H, s), 3.29 (1H, ddd, J=12.46, 10.12, 3.13), 3.00 (3H, s), 2.90 (1 H, dddd, J=7.80, 7.80, 7.80, 7.80), 1.82 (1H, dddd, J=12.95, 4.27, 4.27, 3.99), 1.75 (1H, ddddd, J=10.56, 10.56, 10.56, 4.22, 1.64), 1.43 (3H, d, J=6.09), 1.31 (3H, d, J=6.95), 1.30 (3H, d, J=6.92)。
實例 5a ： N-(2-((3
S,4
R)-3-
氟 -4- 甲氧基哌啶 -1- 基 ) 嘧啶 -4- 基 )-5- 異丙基 -8-((2
R,3
S)-2-
甲基 -3-(( 甲磺醯基 ) 甲基 ) 氮雜環丁烷 -1- 基 ) 異喹啉 -3- 胺 (I) 之再結晶 
將獲自實例4之粗製
化合物 (I)(6.3 kg)溶解於DMSO (10 L，1.5 vol)中及用Pd清除劑Quadrasil MP (850 g，基於
化合物 (I)14% w/w當量)處理。於70℃下攪拌1.5小時後，藉由過濾移除清除劑(50℃)，將矽膠清除劑固體用DMSO (5 L，0.8 vol)洗滌，及合併所有濾液。將批料加熱至55℃及歷時NLT 3小時緩慢添加EtOH (95 L，15.0 vol) (於添加2 vol EtOH後，將混合物用先前合成之
化合物 (I)接晶種)，然後將批料冷卻至45℃。繼續緩慢冷卻至10℃，同時攪拌NLT 2小時。將批料過濾及將
化合物 (I)固體用EtOH置換洗滌液(3 x 6.3 L，3 x 1.0 vol)洗滌兩次。將
化合物 (I)固體在真空(50℃，35 mbar)下乾燥NLT 16小時，以得到再結晶之
化合物 (I)(4.9 kg，78%產率，藉由HPLC，純度99.3% a/a)
HPLC ：99.3% (a/a)
1 H NMR (DMSO-d
6):
δ [ppm] = 9.94 (1H, bs), 9.07 (1H, bs), 8.65 (1H, bs), 8.01 (1H, d, J=5.67), 7.42 (1H, d, J=8.08), 6.56 (1H, d, J=8.08), 6.49 (1H, d, J=5.67), 4.94 (1H, dddd, J=50.0, 4.95, 2.17, 2.17), 4.74 (1H, dddd, J=14.35, 9.53, 5.31, 1.57), 4.67 (1H, dd, J=7.25, 7.25), 4.49 (1H, bd, J=12.46), 4.20 (1H, dq, J=6.25, 6.25), 3.64 (1H, dd, J=7.25, 7.25), 3.59 (1H, dddd, J=24.88, 10.15, 4.44, 2.26), 3.57 (1H, dd, J=14.34, 6.33), 3.53-3.48 (1H, bm), 3.52-3.44 (1H, m), 3.51 (1H, dd, J=14.34, 8.33), 3.37 (3H, s), 3.29 (1H, ddd, J=12.46, 10.12, 3.13), 3.00 (3H, s), 2.90 (1 H, dddd, J=7.80, 7.80, 7.80, 7.80), 1.82 (1H, dddd, J=12.95, 4.27, 4.27, 3.99), 1.75 (1H, ddddd, J=10.56, 10.56, 10.56, 4.22, 1.64), 1.43 (3H, d, J=6.09), 1.31 (3H, d, J=6.95), 1.30 (3H, d, J=6.92)。
實例 5b ： N-(2-((3
S,4
R)-3-
氟 -4- 甲氧基哌啶 -1- 基 ) 嘧啶 -4- 基 )-5- 異丙基 -8-((2
R,3
S)-2-
甲基 -3-(( 甲磺醯基 ) 甲基 ) 氮雜環丁烷 -1- 基 ) 異喹啉 -3- 胺 (I) 之再結晶 
向安裝有頂部攪拌器、氮氣入口/出口及底閥之500 ml夾套3頸燒瓶中放入65 mL二甲亞碸(DMSO)、5.4 g Quadrasil MP (清除劑)、2.8 g SiliaMetS二胺及23 g (0.0413 mol)化合物I。將所得懸浮液升溫至85至95℃及在此溫度下保持2小時。將懸浮液冷卻至65至75℃及過濾。將廢Quadrasil/SiliaMetS二胺濾餅用25 mL熱(65至75℃) DMSO洗滌。將合併之濾液及洗滌液加熱至85至95℃。然後歷時10分鐘時間緩慢添加23 mL去離子水，接著添加2 g晶種。最後，歷時20分鐘時間添加8 mL水。將所得漿液在85至95℃下攪拌2小時，然後歷時4小時時間冷卻至15至25℃及在此溫度下保持至少3小時。經由過濾收集晶體，用60 mL無水乙醇洗滌，在氮氣下脫液1小時及在真空下在50至55℃下乾燥24小時。
LC-MS：(ES, m/z) = 557 [M+1]。
1 H NMR (DMSO-d
6):
δ [ppm] = 9.94 (1H, bs), 9.07 (1H, bs), 8.65 (1H, bs), 8.01 (1H, d, J=5.67), 7.42 (1H, d, J=8.08), 6.56 (1H, d, J=8.08), 6.49 (1H, d, J=5.67), 4.94 (1H, dddd, J=50.0, 4.95, 2.17, 2.17), 4.74 (1H, dddd, J=14.35, 9.53, 5.31, 1.57), 4.67 (1H, dd, J=7.25, 7.25), 4.49 (1H, bd, J=12.46), 4.20 (1H, dq, J=6.25, 6.25), 3.64 (1H, dd, J=7.25, 7.25), 3.59 (1H, dddd, J=24.88, 10.15, 4.44, 2.26), 3.57 (1H, dd, J=14.34, 6.33), 3.53-3.48 (1H, bm), 3.52-3.44 (1H, m), 3.51 (1H, dd, J=14.34, 8.33), 3.37 (3H, s), 3.29 (1H, ddd, J=12.46, 10.12, 3.13), 3.00 (3H, s), 2.90 (1 H, dddd, J=7.80, 7.80, 7.80, 7.80), 1.82 (1H, dddd, J=12.95, 4.27, 4.27, 3.99), 1.75 (1H, ddddd, J=10.56, 10.56, 10.56, 4.22, 1.64), 1.43 (3H, d, J=6.09), 1.31 (3H, d, J=6.95), 1.30 (3H, d, J=6.92)。
Claims (44)
- 一種製備式(Ic)化合物之方法：該方法包括使式(Ia)之第一起始物質：
或其鹽， 與式(Ib)之第二起始物質：
或其鹽， 在鹼、鈀觸媒及膦配位體存在下反應，形成該式(Ic)化合物。
- 如請求項1之方法，其中該鹼為碳酸銫(Cs 2CO 3)，該鈀觸媒為雙(二亞苄基丙酮)鈀(0) (Pd(dba) 2)，及該膦配位體為(9,9-二甲基-9H-𠮿-4,5-二基)雙(二苯基膦烷) (Xantphos)。
- 如請求項1之方法，其中該鹼為氫氧化鉀(KOH)，該鈀觸媒為雙(二亞苄基丙酮)鈀(0) (Pd(dba) 2)，及該膦配位體為(9,9-二甲基-9H-𠮿-4,5-二基)雙(二苯基膦烷) (Xantphos)。
- 如請求項1至3中任一項之方法，其中該反應係於二噁烷中在90℃至110℃進行。
- 一種製備式(III)化合物之方法：其包括使式(II)之起始物質：
在鉑氫解觸媒或鈀氫解觸媒存在下氫化，形成該式(III)化合物。
- 如請求項5之方法，其中該鉑氫解觸媒為PtO 2及該鈀氫解觸媒為濕鈀/碳。
- 如請求項5或請求項6之方法，其中該反應係於乙酸乙酯(EtOAc)中在20℃至30℃進行。
- 一種製備式(IV)化合物之方法：其包括使式(III)之起始物質：
與亞硝酸第三丁酯( t-BuONO)及氯化氫反應，形成該式(IV)化合物。
- 如請求項8之方法，其中該反應係於四氫呋喃(THF)中在0℃至10℃進行，且其中該氯化氫為甲醇化氯化氫(methanolic hydrogen chloride)。
- 一種製備式(V)化合物或其鹽之方法：其包括使式(IV)之起始物質：
或其鹽與磷醯氯(POCl 3)、五氯化磷(PCl 5)及氯化氫反應，形成該式(V)化合物。
- 如請求項10之方法，其中將該起始物質與POCl 3及PCl 5在0℃至25℃合併，接著添加氯化氫及升溫至50℃至70℃，且其中該反應係於二噁烷中進行。
- 一種製備式(VI)化合物之方法：其包括使式(V)之起始物質：
或其鹽在胺鹼、氫化物還原劑及鈀觸媒存在下反應，形成該式(VI)化合物。
- 如請求項12之方法，其中該鈀觸媒為1,1′-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II) (Pd(dba) 2)，該氫化物還原劑為硼氫化鈉(NaBH 4)，及該胺鹼為四甲基乙二胺(TMEDA)。
- 如請求項12或請求項13之方法，其中該反應係於四氫呋喃(THF)中在20℃至30℃進行。
- 一種製備式(Ia)化合物之方法：其包括使式(VI)之起始物質：
與溴化劑於酸中反應，形成該式(Ia)化合物。
- 如請求項15之方法，其中該溴化劑為 N-溴琥珀醯亞胺(NBS)及該酸為硫酸(H 2SO 4)。
- 一種化合物，該化合物選自以下：或其鹽。
- 一種製備式(VII)化合物之方法：其包括使式(VIIa)之起始物質：
與磺醯氯(RSO 2Cl)及胺鹼，例如乙磺醯氯(EsCl)及三乙胺(TEA)反應，形成該式(VII)化合物，其中R為C 1-C 4直鏈或分支鏈烷基，或視情況經鹵素、C 1-C 4烷基及/或硝基取代之苯基。
- 如請求項18之方法，其中該反應係於二氯甲烷中在5℃至20℃進行。
- 一種式(VIIc)化合物：或其鹽，其中Es為乙基磺醯基。
- 一種製備式(VIII)化合物之方法：其包括使式(VIIc)之第一起始物質：
或其鹽與式(VIIIb)之第二起始物質：
及碳酸鉀(K 2CO 3)反應，形成該式(VIII)化合物。
- 如請求項21之方法，其中該式(VIIIb)之第二起始物質係藉由使2-溴乙酸甲酯與反應製備。
- 一種製備式(IX)化合物之方法：其包括使式(VIII)之起始物質：
或其鹽與氯化鋰(LiCl)反應，形成該式(IX)化合物。
- 如請求項23之方法，其中該反應係於二甲基乙醯胺(DMAc)中在160℃至170℃進行。
- 一種製備式(Ib)化合物或其鹽之方法：其包括使式(IX)之起始物質：
或其鹽在鈀氫解觸媒存在下氫化，形成該式(Ib)化合物。
- 如請求項25之方法，其中該鈀氫解觸媒為碳載氫氧化鈀，20重量%乾基(20% Pd(OH) 2/C)，且其中該反應係於甲醇(MeOH)中在30℃至50℃進行。
- 一種製備式(I)化合物之方法：其包括使式(Ic)之第一起始物質或其鹽：
與式(Id)之第二起始物質或其鹽：
在鈀觸媒及膦配位體存在下反應，形成該式(I)化合物，其中該鈀觸媒及該膦配位體為各別化合物或為包含該鈀觸媒及該膦配位體二者之錯合物。
- 如請求項27之方法，其中該鈀觸媒及膦配位體為非錯合物甲磺酸根基(methanesulfonato)(2-二環己基膦基-3,6-二甲氧基-2',4',6'-三異丙基-1,1'-聯苯)(2'-甲胺基-1,1'-聯苯-2-基)鈀(II) (BrettPhos-Pd-G4)。
- 如請求項27或請求項28之方法，其中該鈀觸媒選自由以下組成之群：Pd(dppe) 2(雙[1,2-雙(二苯基膦基)乙烷]鈀(0))、CX-11 (1,3-雙(2,6-二異丙基苯基)咪唑-2-亞基(1,4-萘醌)鈀(0)二聚物)、CX-12 (1,3-雙(2,4,6-三甲基苯基)咪唑-2-亞基(1,4-萘醌)鈀(0)二聚物)、Pd(t-Bu 3P) 2(雙(三-第三丁基膦)鈀(0))、Pd(PCy 3) 2(雙(三環己基膦)鈀(0))、Pd(PPh 3) 4(肆(三苯基膦)鈀(0))、Pd 2(dba) 3(參(二亞苄基丙酮)二鈀(0))、Pd(OAc) 2(乙酸鈀 (II))、PdCl 2(PPh 3) 2(二氯雙(三苯基膦)鈀(II))、PdCl 2(Amphos) 2(雙(二-第三丁基(4-二甲胺基苯基)膦)二氯鈀(II))、Pd(MeCN) 2Cl 2(雙(乙腈)二氯鈀(II))、PdCl 2(P( o-Tol) 3) 2(二氯雙(三鄰甲苯基膦)鈀(II))、Pd(dppf)Cl 2([1,1′-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II))、Pd(MeCN) 4(BF 4) 2(肆(乙腈)四氟硼酸鈀(II))、Pd-PEPPSI-IPent (二氯[1,3-雙(2,6-二-3-戊基苯基)咪唑-2-亞基](3-氯吡啶基)鈀(II))、Pd-PEPPSI-IPr ([1,3-雙(2,6-二異丙基苯基)咪唑-2-亞基](3-氯吡啶基)二氯化鈀(II))、Pd-PEPPSI-SIPr ((1,3-雙(2,6-二異丙基苯基)咪唑亞基(imidazolidene)) (3-氯吡啶基)二氯化鈀(II))，及雙(二亞苄基丙酮)鈀(0) (Pd(dba) 2)。
- 如請求項27至29中任一項之方法，其中該膦配位體或該包含該鈀觸媒及膦配位體之錯合物選自由以下組成之群：三苯基膦(PPh3)、雙(三鄰甲苯基膦) (P( o-Tol) 3) 2、三-第三丁氧基膦(P t-Bu 3)、三-第三丁基四氟硼酸鏻(P t-Bu 3HBF 4)、雙(三環己基膦(PCy 3)、雙(1-金剛烷基)丁基膦烷( n-BuP(AD) 2)、2,2′-雙(二苯基膦基)-1,1′-聯萘(BINAP)、(9,9-二甲基-9H-𠮿-4,5-二基)雙(二苯基膦烷)(Xantphos)、雙[(2-二苯基膦基)苯基]醚(DPEPhos)、1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵(dppf)、1,1′-雙(二-第三丁基膦基)二茂鐵(dcypf)、1,3-雙(二苯基膦基)丙烷(DPPP)、(2-聯苯基)二-第三丁基膦(JohnPhos)、氯(2-二環己基膦基-1,1′-聯苯)[2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)] (CyJohnPhos)、2-二環己基膦基-2′-(N,N-二甲胺基)聯苯(DavePhos)、(2-二環己基膦基-2′,6′-二異丙氧基-1,1′-聯苯)[2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)] (RuPhos)、2-二環己基膦基-2′,6′-二甲氧基聯苯(SPhos)、[(2-二環己基膦基-3,6-二甲氧基-2′,4′,6′- 三異丙基-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)] (BrettPhos)、1,1'-雙(二-第三丁基膦基)二茂鐵(dtbpf)、2-二-第三丁基膦基-2′,4′,6′-三異丙基聯苯( t-BuXPhos)、[(2-二-第三丁基膦基-3,6-二甲氧基-2′,4′,6′-三異丙基-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)] ( t-BuBrettPhos)、2-二-第三丁基膦基-3,4,5,6-四甲基-2′,4′,6′-三異丙基-1,1′-聯苯(Me 4- tBuXPhos)、5-(二-第三丁基膦基)-1′, 3′, 5′-三苯基-1′H-1,4′-聯吡唑(BippyPhos)、二(1-金剛烷基)-2-嗎啉基苯基膦(MorDalPhos)、鈀/1,3-雙-(2,6-二異丙基苯基)氯化咪唑啉(imidazolinium chloride)(IPr .HCL)、[2-(二-1-金剛烷基膦基)-2′,4′,6′-三異丙基-3,6-二甲氧基聯苯][2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) (AdBrettPhos)、(2-二環己基膦基-2′,6′-二異丙氧基-1,1′-聯苯)[2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) (RuPhos)、[(2-二環己基膦基-3,6-二甲氧基-2′,4′,6′-三異丙基-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) (BrettPhos)、[(2-{雙[3,5-雙(三氟甲基)苯基]膦}-3,6-二甲氧基- 2′,4′,6′- 三異丙基-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) (JackiePhos)、[(2-二-第三丁基膦基-3,6-二甲氧基-2′,4′,6′-三異丙基-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) ( t-BuBrettPhos)、甲磺醯基(2-(二-第三丁基膦基)-1,1′-聯萘)[2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]鈀(TrixiePhos)、(2-聯苯)二-第三丁基膦、2′-(二-第三丁基膦基)-N,N-二甲基聯苯-2-胺( t-BuDavePhos)、2-二-第三丁基膦基-2′-甲基聯苯( t-BuMePhos)、氯(2-二環己基膦基-1,1′-聯苯)[2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]鈀(II) (CyJohnPhos)、2-二環己基膦基-2′-甲基聯苯(MePhos)、2-二環己基膦基-2′-(N,N-二甲胺基)聯苯(PhDavePhos)、2-二環己基膦基-2′-甲氧基-4′,6′-二-第三丁基聯苯(VPhos)、2-[(第三丁基)苯基膦基]-2′,6′-雙(N,N-二甲胺基)聯苯(PhCPhos)、[(2-二環己基膦基-2′,6′-雙(N,N-二甲胺基)-1,1′-聯苯)-2-(2′-胺基-1,1′-聯苯)]甲磺酸鈀(II) (CPhos)、甲磺酸根基[2-二乙基膦基-2',6'-雙(二甲胺基)-1,1-聯苯](2'-胺基-1,1'-聯苯-2-基)鈀(II) (EtCPhos)、2-二(第三丁基)膦基-2′,4′,6′-三異丙基-3-甲氧基-6-甲基聯苯(RockPhos)、二-1-金剛烷基(4″-丁基-2″,3″,5″,6″-四氟-2′,4′,6′-三異丙基-2-甲氧基-間聯三苯)膦(AlPhos)、2-(第三丁基苯基膦基)-2',6'-二甲胺基-1,1'-聯苯(( t-Bu)PhCPhos)，及二環己基[2′,4′,6′-參(丙-2-基)[1,1′-聯苯]-2-基]膦烷(XPhos)。
- 如請求項27至30中任一項之方法，其中該鈀觸媒為雙(二亞苄基丙酮)鈀(0) (Pd(dba) 2)。
- 如請求項27至31中任一項之方法，其中該膦配位體為二環己基[2′,4′,6′-參(丙-2-基)[1,1′-聯苯]-2-基]膦烷(XPhos)。
- 如請求項27至32中任一項之方法，其中該反應混合物進一步包含鹼。
- 如請求項33之方法，其中該鹼選自由碳酸鉀(K 2CO 3)、碳酸銫(Cs 2CO 3)、氫氧化鉀(KOH)及第三丁醇鈉(NaO tBu)組成之群。
- 如請求項33或請求項34之方法，其中該鹼為碳酸銫(Cs 2CO 3)或第三丁醇鈉(NaO tBu)。
- 如請求項27至35中任一項之方法，其中該反應係於選自甲苯、1,4-二噁烷、四氫呋喃(THF)、甲基四氫呋喃(Me-THF)、苯甲醚、水(H 2O)或其混合物之溶劑中進行。
- 如請求項27至36中任一項之方法，其中該反應係於1,4-二噁烷、四氫呋喃(THF)、水(H 2O)或其混合物中進行。
- 如請求項27至36中任一項之方法，其中該反應係於1,4-二噁烷、甲苯或其混合物中進行。
- 如請求項27至38中任一項之方法，其中該式(Ic)化合物係藉由如請求項1或請求項2之方法製備。
- 如請求項39之方法，其中使藉由如請求項1或2之方法製備之該式(Ic)化合物與該式(Id)化合物在不分離該式(Ic)化合物下反應。
- 一種純化式(I)化合物以形成結晶產物之方法：其包括使式(I)化合物於溶劑體系中(例如於包含二甲亞碸(DMSO)及乙醇之溶劑體系中)再結晶。
- 一種純化式(I)化合物以形成結晶產物之方法：其包括使式(I)化合物於溶劑體系中(例如於包含二甲亞碸(DMSO)及水之溶劑體系中)再結晶。
- 如請求項41或請求項42之方法，其中該式(I)化合物經分離呈濕濾餅。
- 如請求項43之方法，其中該式(I)化合物係自如請求項27至40中任一項之方法獲得。
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