TW202235107A - 結合至多種乙型冠狀病毒的抗體 - Google Patents

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Abstract

本揭露內容提供抗體及其抗原結合片段,其可結合至多種乙型冠狀病毒之S蛋白且在某些實施例中能夠中和多種乙型冠狀病毒之感染。

Description

結合至多種乙型冠狀病毒的抗體
關於序列表之陳述
以文字格式代替紙張複本提供與本申請案相關之序列表,且特此以引用之方式併入本說明書中。含有序列表之文字檔案之名稱為930585_420WO_SEQUENCE_LISTING.txt。文字檔案係206 KB,在2021年11月22日創建,且經由EFS-Web以電子方式提交。
本發明係有關於結合至多種乙型冠狀病毒的抗體。
發明背景
2019年末一種新穎乙型冠狀病毒出現於中國武漢。截至2021年5月8日,已經確認全球有約1.57億感染此病毒(被稱為SARS-CoV-2等其他名稱)之案例,且已導致約327.5萬例死亡。其他乙型冠狀病毒,諸如SARS-CoV、MERS、OC43及HKU1,亦對人類及其他物種構成健康風險。需要用於預防或治療乙型冠狀病毒感染之療法及用於診斷乙型冠狀病毒感染之診斷試劑。
依據本發明之一實施例,係特地提出一種抗體或其抗原結合片段,其包含有:包含一CDRH1、一CDRH2及一CDRH3之一重鏈可變區域(VH)及包含一CDRL1、一CDRL2及一CDRL3之一輕鏈可變區域(VL),其中: (i)    該CDRH1包含根據SEQ ID NO: 27、37、48、67或80之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個酸取代之一功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代; (ii)   該CDRH2包含根據SEQ ID NO: 28、38、49、68或81之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之一功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代; (iii)  該CDRH3包含根據SEQ ID NO: 29、39或50之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之一功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代; (iv)  該CDRL1包含根據SEQ ID NO: 31、41、52、70、76、78或83之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之一功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代; (v)   該CDRL2包含根據SEQ ID NO: 32、42或53之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之一功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代;及/或 (vi)  該CDRL3包含根據SEQ ID NO: 33、43或54之胺基酸序列或其包含具有一個、二個或三個胺基酸取代之一功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代, 其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至一乙型冠狀病毒之一表面醣蛋白。
較佳實施例之詳細說明
本文提供能夠結合至乙型冠狀病毒(例如SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43或HKU之如本文所述之表面醣蛋白)的抗體及抗原結合片段。在一些實施例中,抗體或抗原結合片段能夠結合至二種或更多種(例如二種、三種、四種、五種或更多種)乙型冠狀病毒的表面醣蛋白。在一些實施例中,抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒病毒粒子之表面醣蛋白及/或表現於經乙型冠狀病毒感染之細胞之表面上的表面醣蛋白。在某些實施例中,本發明所揭露之抗體及抗原結合片段可中和活體外感染模型及/或人類個體中之二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之感染。在某些其他實施例中,抗體或抗原結合片段能夠結合至甲型冠狀病毒表面醣蛋白。亦提供編碼抗體及抗原結合片段的多核苷酸、載體、宿主細胞及相關組成物,以及使用該等抗體、核酸、載體、宿主細胞及相關組成物治療(例如減少、延遲、消除或預防)個體中之任何二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒感染及/或製造用於治療個體中之任何二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒感染的藥劑的方法。
在更詳細地闡述本揭露內容之前,提供要被用於本文中之某些術語之定義可有助於理解本揭露內容。額外定義闡述於整個本揭露內容中。
如本文所用,「SARS-CoV-2」,在本文中亦稱為「武漢海鮮市場肺炎病毒」或「武漢冠狀病毒」或「武漢CoV」或「新穎CoV」或「nCoV」或「2019 nCoV」或「武漢nCoV」,為一種咸信屬於譜系B (薩貝冠狀病毒)之乙型冠狀病毒。2019年末,在中國湖北省武漢市首次識別到SARS-CoV-2,且到2020年年初,在中國境內及世界其他地區傳播。SARS-CoV-2感染之症狀包括發熱、乾咳及呼吸困難。
SARS-CoV-2分離株Wuhan-Hu-1之基因體序列提供於SEQ ID NO:1 ( 亦參見GenBank MN908947.3,2020年1月23日)中,且基因體之胺基酸轉譯提供於SEQ ID NO:2 ( 亦參見GenBank QHD43416.1,2020年1月23日)中。如同其他冠狀病毒(例如,SARS-CoV-1),SARS-CoV-2包含含有受體結合區域(RBD)之「刺突」或表面(「S」) I型跨膜醣蛋白。咸信RBD藉由結合至細胞表面受體血管收縮素轉化酶2 (ACE2)介導譜系B SARS冠狀病毒進入呼吸上皮細胞。特定言之,咸信病毒RBD中之受體結合模體(RBM)與ACE2相互作用。
Wuhan-Hu-1表面醣蛋白之胺基酸序列提供於SEQ ID NO:3中。Wuhan-Hu-1 RBD之胺基酸序列提供於SEQ ID NO:4中。Wuhan-Hu-1 S蛋白與SARS-CoV S蛋白具有約73%胺基酸序列一致性。Wuhan-Hu-1 RBM之胺基酸序列提供於SEQ ID NO:5中。Wuhan-Hu-1 RBD與SARS-CoV RBD具有約75%至77%胺基酸序列相似性,且SARS-CoV-2 RBM與SARS-CoV RBM具有約50%胺基酸序列相似性。除非本文中另外規定,否則Wuhan-Hu-1係指任擇地具有SEQ ID NO:1中所闡述之基因體序列的包含SEQ ID NO: 2、3、4及5中之任一或多者中所闡述之胺基酸序列的病毒。
已出現多種新興SARS-CoV-2變體。一些SARS-CoV-2變體含有N439K突變,該突變增強與人類ACE2受體之結合親和力(Thomson, E.C.等人, The circulating SARS -CoV -2 spike variant N439K maintains fitness while evading antibody -mediated immunity .bioRxiv, 2020)。一些SARS-CoV-2變體含有N501Y突變,該突變與增加之可傳播性相關聯,包括譜系B.1.1.7 (亦稱為20I/501Y.V1及VOC 202012/01;(del69-70、del144、N501Y、A570D、D614G、P681H、T716I、S982A及D1118H突變))及B.1.351 (亦稱為20H/501Y.V2;L18F、D80A、D215G、R246I、K417N、E484K、N501Y、D614G及A701V突變),其分別發現於英國及南非(Tegally, H.等人, Emergence and rapid spread of a new severe acute respiratory syndrome -related coronavirus 2 (SARS -CoV -2 ) lineage with multiple spike mutations in South Africa .medRxiv, 2020: p. 2020.12.21.20248640;Leung, K.等人, Early empirical assessment of the N501Y mutant strains of SARS -CoV -2 in the United Kingdom , October to November 2020 .medRxiv, 2020: p. 2020.12.20.20248581)。B.1.351亦包括在SARS-CoV2刺突蛋白之RBD區域中的二個其他突變K417N及E484K (Tegally, H.等人, Emergence and rapid spread of a new severe acute respiratory syndrome -related coronavirus 2 (SARS -CoV -2 ) lineage with multiple spike mutations in South Africa .medRxiv, 2020: p. 2020.12.21.20248640)。其他SARS-CoV-2變體包括譜系B.1.1.28,其在巴西首次報導;變體P.1(亦稱為20J/501Y.V3),其在日本首次報導;變體L452R,其在美國加利福尼亞首次報導(Pan American Health Organization, Epidemiological update : Occurrence of variants of SARS -CoV -2 in the Americas, 2021年1月20日,可在reliefweb.int/sites/reliefweb.int/files/resources/2021-jan-20-phe-epi-update-SARS-CoV-2.pdf獲得)。其他SARS-CoV-2變體包括分枝系19A之SARS CoV-2;分枝系19B之SARS CoV-2;分枝系20A之SARS CoV-2;分枝系20B之SARS CoV-2;分枝系20C之SARS CoV-2;分枝系20D之SARS CoV-2;分枝系20E (EU1)之SARS CoV-2;分枝系20F之SARS CoV-2;分枝系20G之SARS CoV-2;及SARS CoV-2 B1.1.207;及Rambaut, A.等人, A dynamic nomenclature proposal for SARS -CoV -2 lineages to assist genomic epidemiology .Nat Microbiol 5, 1403-1407 (2020)中所述之其他SARS CoV-2譜系。包括D614G突變之變體包括A23.1、B.1.429、B.1.258、B.1.1.318、R.2、B.1.528、B.1.526及B.1.617。前述SARS-CoV-2變體及其胺基酸及核苷酸序列以引用的方式併入本文中。因此,應理解SARS-CoV-2包括Wuhan Hu-1及其變體,包括本發明所揭露之變體。
SARS-CoV為在受感染個體中引起呼吸道症狀之另一乙型冠狀病毒。SARS-CoV Urbani病毒株之基因體序列具有GenBank寄存編號AAP13441.1。SARS-CoV表面醣蛋白(「S蛋白」)之胺基酸序列提供於SEQ ID NO: 22中。
人類冠狀病毒OC43亦為乙型冠狀病毒。OC43表面醣蛋白(「S蛋白」)之胺基酸序列提供於SEQ ID NO:23中( 亦參見GenBank AY585229.1)。
MERS-CoV為又另一乙型冠狀病毒。MERS-CoV病毒株London 1/2012表面醣蛋白(「S蛋白」)之胺基酸序列提供於SEQ ID NO:24中( 亦參見GenBank KC164505)。
人類冠狀病毒HKU1為另一乙型冠狀病毒。HKU1表面醣蛋白(「S蛋白」)之胺基酸序列提供於SEQ ID NO:25中(亦參見GenBank YP_173238)。儘管SARS-CoV及SARS-CoV-2結合ACE2,但咸信其他乙型冠狀病毒藉由結合至其他受體而進入細胞。舉例而言,咸信MERS-CoV結合二肽基肽酶-4 (DPP4),且咸信OC43及HKU1結合9-O-乙醯化唾液酸(9-O-Ac-Sia)受體。
在本說明書中,除非另外指明,否則任何濃度範圍、百分比範圍、比率範圍或整數範圍應理解為包括在所列舉範圍內之任何整數值及(在適當時)其分數(諸如整數之十分之一及百分之一)。此外,除非另外指示,否則本文所敍述之與諸如聚合物次單元、尺寸或厚度之任何物理特點相關之任何數值範圍應理解為包括所敍述範圍內之任何整數。除非另外指示,否則如本文所使用之術語「約」意謂所指示範圍、值或結構之± 20%。應理解,如本文所使用之術語「一(a/an)」係指所列舉之組分之「一或多者」。應瞭解替代物(例如「或」)之使用意謂替代物之一者、二者或其任何組合。如本文所用,術語「包括」、「具有」及「包含」同義地使用,該等術語及其變化形式意欲被理解為非限制性的。
「任擇的」或「任擇地」意謂隨後描述之元件、組分、事件或情況可能發生或可能不發生,且該描述包括元件、組分、事件或情況發生之情況及其不發生之情況。
另外,應理解,來源於本文所述之結構及次單位之各種組合的個別構築體或構築體之群體係由本申請案揭露,其程度如同各構築體或構築體之群體單獨地闡述一般。因此,特定結構或特定次單位之選擇在本揭露內容之範疇內。
術語「基本上由……組成」不等效於「包含」,且係指技術方案之指定材料或步驟,或不顯著地影響所主張之主題之基礎特徵的材料或步驟。舉例而言,當蛋白質區域、區、模組或蛋白質之胺基酸序列包括延伸、缺失、突變或其組合(例如,在胺基或羧基末端處或在區域之間的胺基酸)時,區域、區或模組(例如結合區域)或蛋白質「基本上由特定胺基酸序列組成」,其組合地佔區域、區、模組或蛋白質之長度的至多20% (例如,至多15%、10%、8%、6%、5%、4%、3%、2%或1%)且不實質上影響(亦即,活性降低不超過50%,諸如不超過40%、30%、25%、20%、15%、10%、5%或1%)區域、區、模組或蛋白質之活性(例如,結合蛋白之目標結合親和力)。
如本文所用,「胺基酸」係指天然存在及合成之胺基酸,以及以類似於天然存在之胺基酸的方式起作用的胺基酸類似物及胺基酸模擬物。天然存在之胺基酸為藉由遺傳密碼編碼之胺基酸,以及隨後經修飾之胺基酸,例如,羥基脯胺酸、γ-羧基麩胺酸及O-磷絲胺酸。胺基酸類似物係指具有與天然存在之胺基酸相同之基礎化學結構,亦即與氫、羧基、胺基及R基結合之α-碳的化合物,例如高絲胺酸、正白胺酸、甲硫胺酸亞碸、甲硫胺酸甲基硫鎓。此等類似物具有經修飾之R基(例如正白胺酸)或經修飾之肽主鏈,然而保留與天然存在之胺基酸相同之基本化學結構。胺基酸模擬物係指具有與胺基酸之一般化學結構不同之結構,然而以與天然存在之胺基酸類似之方式起作用的化合物。
如本文所用,「突變」係指核酸分子或多肽分子之序列分別與參考或野生型核酸分子或多肽分子相比的變化。突變可引起若干不同類型之序列的變化,包括核苷酸或胺基酸之取代、插入或缺失。
「守恆取代」係指不顯著影響或改變特定蛋白質之結合特徵的胺基酸取代。「守恆取代」係指不顯著影響或改變特定蛋白質之結合特徵的胺基酸取代。一般而言,守恆取代為其中經取代之胺基酸殘基經具有類似側鏈之胺基酸殘基置換的取代。守恆取代包括在以下群組中之一者中存在之取代:第1組;丙胺酸(Ala或A)、甘胺酸(Gly或G)、絲胺酸(Ser或S)、蘇胺酸(Thr或T);第2組:天冬胺酸(Asp或D)、麩胺酸(Glu或Z);第3組:天冬醯胺酸(Asn或N)、麩醯胺酸(Gln或Q);第4組:精胺酸(Arg或R)、離胺酸(Lys或K)、組胺酸(His或H);第5組:異白胺酸(Ile或I)、白胺酸(Leu或L)、甲硫胺酸(Met或M)、纈胺酸(Val或V);及第6組:苯丙胺酸(Phe或F)、酪胺酸(Tyr或Y)、色胺酸(Trp或W)。另外或可替代地,胺基酸可根據類似功能、化學結構或組成(例如酸性、鹼性、脂族、芳族或含硫)經分組至守恆取代組中。舉例而言,脂族分組可包括出於取代之目的的Gly、Ala、Val、Leu及Ile。其他守恆取代組包括:含硫:Met及半胱胺酸(Cys或C);酸性:Asp、Glu、Asn及Gln;小脂族、非極性或略微極性殘基:Ala、Ser、Thr、Pro及Gly;極性、帶負電殘基及其醯胺:Asp、Asn、Glu及Gln;極性、帶正電殘基:His、Arg及Lys;大脂族、非極性殘基:Met、Leu、Ile、Val及Cys;及大芳族殘基:Phe、Tyr及Trp。額外資訊可見於Creighton (1984) Proteins, W.H. Freeman and Company中。
如本文所用,「蛋白質」或「多肽」係指胺基酸殘基之聚合物。蛋白質適用於天然存在之胺基酸聚合物,以及適用於其中一或多個胺基酸殘基為相應天然存在之胺基酸的人工化學模擬物的胺基酸聚合物,及非天然存在之胺基酸聚合物。亦考慮本揭露內容之蛋白質、肽及多肽之變體。在某些實施例中,變體蛋白質、肽及多肽包含與本文所述之經定義或參考胺基酸序列的胺基酸序列至少70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或99.9%一致的胺基酸序列或由其組成。
「核酸分子」或「多核苷酸」或「聚核酸」係指包括可由天然次單元(例如,嘌呤或嘧啶鹼基)或非天然次單元(例如,𠰌啉環)構成之經共價連接的核苷酸的聚合化合物。嘌呤鹼基包括腺嘌呤、鳥嘌呤、次黃嘌呤及黃嘌呤,且嘧啶鹼基包括尿嘧啶、胸腺嘧啶及胞嘧啶。核酸分子包括聚核糖核酸(RNA),其包括mRNA、微小RNA、siRNA、病毒基因體RNA及合成RNA;及聚脫氧核糖核苷酸(DNA),其包括cDNA、基因體DNA及合成DNA;其中之任一者可為單股或雙股。若為單股,則核酸分子可為編碼股或非編碼(反義)股。編碼胺基酸序列之核酸分子包括所有編碼相同胺基酸序列之核苷酸序列。核苷酸序列之一些型式亦可包括內含子,其達到經由共轉錄或轉錄後機制移除內含子的程度。換言之,由於遺傳密碼之冗餘或簡併或藉由剪接,不同核苷酸序列可編碼相同胺基酸序列。
在一些實施例中,多核苷酸包含經修飾之核苷、cap-1結構、cap-2結構或其任何組合。在某些實施例中,多核苷酸包含假尿苷、N6-甲基腺苷、5-甲基胞苷、2-硫代尿苷或其任何組合。在一些實施例中,假尿苷包含N1-甲基假尿苷。此等特徵在此項技術中已知且論述於例如Zhang等人 . Front. Immunol.,DOI=10.3389/fimmu.2019.00594 (2019);Eyler等人 . PNAS 116(46): 23068-23071; DOI: 10.1073/pnas.1821754116 (2019);Nance及Meier, ACS Cent. Sci.2021, 7, 5, 748-756; doi.org/10.1021/acscentsci.1c00197 (2021)以及van Hoecke及Roose, J. Translational Med17:54 (2019); https://doi.org/10.1186/s12967-019-1804-8,其經修飾之核苷及mRNA特徵以引用之方式併入本文中。
亦考慮本揭露內容之核酸分子之變體。變體核酸分子為與如本文所述之經定義或參考多核苷酸的核酸分子至少70%、75%、80%、85%、90%,且較佳95%、96%、97%、98%、99%或99.9%一致,或在約65-68℃下在0.015M氯化鈉、0.0015M檸檬酸鈉或在約42℃下在0.015M氯化鈉、0.0015M檸檬酸鈉及50%甲醯胺的嚴格雜交條件下與多核苷酸雜交。核酸分子變體保留編碼具有本文所述之官能性之其結合區域,諸如結合目標分子的能力。
「序列一致性百分比」係指如藉由對序列進行比較來確定之二個或更多個序列之間的關係。確定序列一致性之較佳方法經設計以給出在所比較序列之間的最大匹配。舉例而言,出於最佳比較目的來比對序列(例如,可在第一及第二胺基酸或核酸序列中的一者或二者中引入間隔以用於最佳比對)。此外,出於比較目的可忽略非同源序列。除非另外指示,否則根據參考序列之長度計算本文所提及之序列一致性百分比。用以確定序列一致性及相似性之方法可見於公開可用的電腦程式中。序列比對及一致性百分比計算可使用BLAST程式(例如BLAST 2.0、BLASTP、BLASTN或BLASTX)來執行。用於BLAST程式中之數學算法可見於Altschul等人, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402, 1997。在本揭露內容之上下文內,將理解,當序列分析軟體用於分析時,分析結果係基於所參考之程式的「預設值」。「預設值」意謂最初在首次初始化時用軟體加載之任一組值或參數。
術語「經分離」意謂自物質之初始環境(例如若物質為天然存在的,則為天然環境)中移出物質。舉例而言,存在於活動物中之天然存在之核酸或多肽為未經分離的,但與天然系統中之一些或所有共存物質分離之相同核酸或多肽為經分離的。該核酸可為載體之一部分及/或此類核酸或多肽可為組成物(例如細胞裂解物)之一部分,且仍為經分離的,此係因為此類載體或組成物不為核酸或多肽之天然環境的一部分。在一些實施例中,「經分離」亦可描述抗體、抗原結合片段、多核苷酸、載體、宿主細胞或在人體外部之組成物。
術語「基因」意謂參與產生多肽鏈之DNA或RNA之區段;在某些情況下,其包括在編碼區之前及之後的區域(例如5'非轉譯區(UTR)及3' UTR)以及個別編碼區段(外顯子)之間的介入序列(內含子)。
「功能變體」係指在結構上類似或在結構上實質上類似於本揭露內容之親代或參考化合物、但在組成(例如,一個鹼基、原子或官能基不同、經添加或移除)方面略微不同的多肽或多核苷酸,使得該多肽或經編碼多肽能夠以親代多肽之活性位準之至少50%效率,較佳地至少55%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、99.9%或100%效率執行親代多肽之至少一個功能。換言之,當功能變體與親代或參考多肽相比在所選分析中,諸如用於量測結合親和力之分析(例如,量測締合(Ka)或解離(K D)常數之Biacore®或四聚體染色),展現出效能減小不超過50%時,本揭露內容之多肽或經編碼多肽的功能變體具有「類似結合」、「類似親和力」或「類似活性」。
如本文所用,「功能部分」或「功能片段」係指包含僅親代或參考化合物之區域、部分或片段的多肽或多核苷酸,且多肽或經編碼多肽保留與親代或參考化合物之區域、部分或片段相關之至少50%活性,較佳地為至少親代多肽之活性的55%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、99.9%或100%位準,或提供生物效益(例如,效應功能)。當本揭露內容之多肽或經編碼多肽之功能部分或片段與親代或參考多肽相比在所選分析中展現出不超過50%之效能減少時(關於親和力,與親代或參考相比,較佳地不超過20%或10%或不超過對數差異),該「功能部分」或「功能片段」具有「類似結合」或「類似活性」。
如本文所用,術語「經工程改造」、「重組」或「非天然」係指包括至少一個基因改變或已藉由引入外源性或異源性核酸分子而經修飾之生物體、微生物、細胞、核酸分子或載體,其中此類改變或修飾藉由基因工程改造(亦即,人工干預)來引入。基因改變包括例如引入編碼功能性RNA、蛋白質、融合蛋白質或酶類之可表現的核酸分子的修飾,或其他核酸分子添加、缺失、取代或細胞之基因物質的其他功能性破壞。額外修飾包括例如非編碼調節區,其中修飾改變多核苷酸、基因或操縱子之表現。
如本文所用,「異源性」或「非內源性」或「外源性」係指對於宿主細胞或個體而言非天然之任何基因、蛋白質、化合物、核酸分子或活性、或已經更改之對於宿主細胞或個體而言天然之任何基因、蛋白質、化合物、核酸分子或活性。異源性、非內源性或外源性包括已經突變或以其他方式經更改以使得結構、活性或二者在天然與經更改之基因、蛋白質、化合物或核酸分子之間不同的基因、蛋白質、化合物或核酸分子。在某些實施例中,異源性、非內源性或外源性基因、蛋白質或核酸分子(例如,受體、配體等)可能不對宿主細胞或個體為內源性的,但實際上,編碼此類基因、蛋白質或核酸分子之核酸可藉由共軛、轉型、轉染、電穿孔或其類似方式添加至宿主細胞,其中經添加之核酸分子可整合至宿主細胞基因體中或可以染色體外基因物質之形式存在(例如,作為質體或其他自我複製載體)。術語「同源性」或「同源物」係指見於或衍生自宿主細胞、物種或病毒株之基因、蛋白質、化合物、核酸分子或活性。舉例而言,編碼多肽之異源性或外源性多核苷酸或基因可與天然多核苷酸或基因同源且編碼同源性多肽或活性,但多核苷酸或多肽可具有經更改之結構、序列、表現位準或其任何組合。非內源性多核苷酸或基因以及經編碼多肽或活性可來自相同物種、不同物種或其組合。
在某些實施例中,若其已改變或突變,則宿主細胞原生之核酸分子或其部分將視為對宿主細胞為異源的,或若其已經異源表現控制序列改變或已經通常不與宿主細胞原生之核酸分子相關的內源性表現控制序列改變,則宿主細胞原生之核酸分子可視為異源的。另外,術語「異源性」可指與宿主細胞不同、改變或不為內源性的生物活性。如本文所述,超過一個異源核酸分子可作為單獨核酸分子、作為多個單獨受控基因、作為多順反子核酸分子、作為編碼融合蛋白之單核酸分子或其任何組合引入至宿主細胞中。
如本文所用,術語「內源性」或「天然」係指通常存在於宿主細胞或個體中之多核苷酸、基因、蛋白質、化合物、分子或活性。
如本文所用之術語「表現」係指基於核酸分子,諸如基因之編碼序列產生多肽之方法。方法可包括轉錄、轉錄後控制、轉錄後修飾、轉譯、轉譯後控制、轉譯後修飾,或其任何組合。經表現之核酸分子通常可操作地連接至表現控制序列(例如啟動子)。
術語「可操作地連接」係指單一核酸片段上之二個或更多個核酸分子結合,使得一者之功能受另一者影響。舉例而言,當啟動子能夠影響編碼序列之表現時(亦即編碼序列處於啟動子之轉錄控制下),啟動子與彼編碼序列可操作地連接。「不連接」意謂相關基因元件彼此不緊密相關,且一者之功能不影響另一者。
如本文所描述,超過一個異源核酸分子可作為獨立核酸分子、作為多個個別地受控基因、作為多順反子核酸分子、作為編碼蛋白質(例如抗體重鏈)之單核酸分子或其任何組合經引入至宿主細胞中。當二個或更多個異源核酸分子經引入至宿主細胞中時,應理解,二個或更多個異源核酸分子可作為於獨立載體上之單核酸分子(例如於單一載體上)經引入,在單個位點或多個位點處經整合至宿主染色體中,或其任何組合。所提及之異源核酸分子或蛋白質活性之數目係指編碼核酸分子之數目或蛋白質活性之數目,而非經引入宿主細胞中之獨立核酸分子之數目。
術語「構築體」係指含有重組核酸分子之任何多核苷酸。(多核苷酸)構築體可存在於載體(例如,細菌載體、病毒載體)中,或可整合至基因體中。「載體」為能夠輸送另一核酸分子之核酸分子。載體可為例如質體、黏質體、病毒、RNA載體或線性或環狀DNA或RNA分子,其可包括染色體、非染色體、半合成或合成核酸分子。本揭露內容之載體亦包括轉位子系統(例如,Sleeping Beauty,參見例如 Geurts等人 , Mol. Ther. 8:108, 2003: Mátés等人 , Nat. Genet. 41:753, 2009)。例示性載體為能夠自主複製(附加型載體)、能夠將多核苷酸遞送至細胞基因體(例如,病毒載體)或能夠表現其所連接之核酸分子(表現載體)的載體。
如本文所用,「表現載體」或「載體」係指含有可操作地連接至適合之控制序列的核酸分子的DNA構築體,該控制序列能夠實現適合之宿主中核酸分子之表現。此類控制序列包括實現轉錄之啟動子、控制此類轉錄之任擇的操縱序列、編碼適合之mRNA核糖體結合位點之序列及控制轉錄及轉譯終止之序列。載體可為質體、噬菌體粒子、病毒或僅為潛在基因體插入片段。一旦轉型至適合之宿主中,載體可獨立於宿主基因體複製及起作用,或可在某些情況下整合至基因體自身中,或將載體中所含之多核苷酸遞送至不具有載體序列之基因體中。在本說明書中,「質體」、「表現質體」、「病毒」及「載體」通常可互換地使用。
在將核酸分子插入至細胞中之上下文中,術語「引入」意謂「轉染」、「轉型」或「轉導」,且包括提及到將核酸分子併入至真核或原核細胞中,其中該核酸分子可併入至細胞之基因體(例如,染色體、質體、色素體或粒線體DNA)中,轉化成自主複製子或暫時表現(例如,經傳染mRNA)。
在某些實施例中,本揭露內容之多核苷酸可操作地連接至載體之某些元件。舉例而言,實現與其接合之編碼序列之表現及加工所需的多核苷酸序列可操作地連接。表現控制序列可包括適當轉錄起始、終止、啟動子及強化子序列;有效RNA加工信號,諸如剪接及聚腺苷酸化信號;使細胞質mRNA穩定之序列;增強轉譯效率之序列(亦即克紮克共有序列(Kozak consensus sequence));增強蛋白質穩定性之序列;及增強蛋白質分泌之可能的序列。若表現控制序列與感興趣之基因及以反式或在一定距離下作用以控制感興趣之基因的表現控制序列相連,則表現控制序列可操作地連接。
在某些實施例中,載體包含質體載體或病毒載體(例如慢病毒載體或γ-反轉錄病毒載體)。病毒載體包括反轉錄病毒;腺病毒;微小病毒(例如腺相關病毒);冠狀病毒;負股RNA病毒,諸如正黏病毒(例如流感病毒)、棒狀病毒(例如狂犬病及水泡性口炎病毒)、副黏病毒(例如麻疹及仙台);正股RNA病毒,諸如小核糖核酸病毒及α病毒;及雙股DNA病毒,包括腺病毒、疱疹病毒(例如1型及2型單純疱疹病毒、艾司坦-巴爾病毒(Epstein-Barr virus)、巨細胞病毒)及痘病毒(例如牛痘、禽痘及金絲雀痘)。其他病毒包括例如諾沃克病毒(Norwalk virus)、披衣病毒、黃病毒、呼腸孤病毒(reoviruses)、乳多泡病毒、嗜肝DNA病毒及肝炎病毒。反轉錄病毒之實例包括:鳥類白血病性肉瘤性病毒、哺乳動物C型病毒、B型病毒、D型病毒、HTLV-BLV群、慢病毒、泡沫病毒(Coffin, J. M., Retroviridae: The viruses and their replication, In Fundamental Virology, 第三版, B. N. Fields等人編, Lippincott-Raven Publishers, Philadelphia, 1996)。
「反轉錄病毒」為具有RNA基因體之病毒,該RNA基因體係使用反轉錄酶反轉錄至DNA中,接著經反轉錄之DNA經併入至宿主細胞基因體中。「γ反轉錄病毒」係指反轉錄病毒科之一屬。γ反轉錄病毒之實例包括小鼠幹細胞病毒、鼠類白血病病毒、貓白血病病毒、貓肉瘤病毒及禽類網狀內皮細胞增生病毒。
「慢病毒載體」包括用於基因遞送之以HIV為主之慢病毒載體,該等慢病毒載體可為整合或非整合的,具有相對較大之封裝容量,且可轉導一系列不同細胞類型。慢病毒載體通常在將三個(封裝、包膜及轉移)或更多個質體短暫轉染至生產細胞中之後產生。與HIV相同,慢病毒載體經由病毒表面醣蛋白與細胞表面上之受體的相互作用而進入目標細胞。在進入後,病毒RNA進行反轉錄,此係由病毒反轉錄酶複合物所介導。反轉錄產物為雙股線性病毒DNA,該病毒DNA為整合至經感染細胞之DNA中之病毒受質。
在某些實施例中,病毒載體可為γ反轉錄病毒,例如莫洛尼鼠類白血病病毒(Moloney murine leukemia virus,MLV)衍生之載體。在其他實施例中,病毒載體可為更複雜反轉錄病毒衍生之載體,例如慢病毒衍生之載體。HIV-1衍生之載體屬於此類別。其他實例包括衍生自HIV-2、FIV、馬類感染性貧血病毒、SIV及梅迪-威司奈病病毒(Maedi-Visna virus) (綿羊慢病毒)之慢病毒載體。使用反轉錄病毒及慢病毒病毒載體及封裝細胞以便用含有轉殖基因之病毒粒子轉導哺乳動物宿主細胞的方法為此項技術中已知的且先前已描述於例如以下中:美國專利8,119,772;Walchli等人, PLoS One 6:327930, 2011;Zhao等人, J. Immunol. 174:4415, 2005;Engels等人, Hum. Gene Ther. 14:1155, 2003;Frecha等人, Mol. Ther. 18:1748, 2010;及Verhoeyen等人, Methods Mol. Biol. 506:97, 2009。反轉錄病毒及慢病毒載體構築體及表現系統亦為市售的。其他病毒載體亦可用於包括DNA病毒載體之多核苷酸遞送,該等DNA病毒載體包括例如腺病毒類載體及腺相關病毒(AAV)類載體;衍生自單純疱疹病毒(HSV)之載體,包括擴增子載體、複製缺陷型HSV及毒性減弱HSV (Krisky等人, Gene Ther. 5:1517, 1998)。
可用於本揭露內容之組成物及方法的其他載體包括衍生自桿狀病毒及α-病毒之載體(Jolly, D J. 1999. Emerging Viral Vectors.第209-40頁於Friedmann T.編. The Development of Human Gene Therapy. New York: Cold Spring Harbor Lab中),或質體載體(諸如睡美人或其他轉位子載體)。
當病毒載體基因體包含待在宿主細胞中表現之多個多核苷酸作為獨立轉錄物時,病毒載體亦可包含二個(或更多個)轉錄物之間的額外序列,從而允許雙順反子或多順反子表現。用於病毒載體之此類序列的實例包括內部核糖體入口位點(IRES)、弗林裂解位點、病毒2A肽或其任何組合。
本文進一步描述用於直接投予至個體之質體載體,該等質體載體包括編碼以DNA為主之抗體或抗原結合片段的質體載體。
如本文所用,術語「宿主」係指靶向用異源核酸分子基因修飾以產生感興趣的多肽(例如,本揭露內容之抗體)的細胞或微生物。
宿主細胞可包括可接受載體或併入核酸或表現蛋白質之任何單獨的細胞或細胞培養物。該術語亦涵蓋宿主細胞之後代,不論基因或表現型上相同或不同。適合之宿主細胞可取決於載體,且可包括哺乳動物細胞、動物細胞、人類細胞、猿猴細胞、昆蟲細胞、酵母細胞及細菌細胞。此等細胞可藉由使用病毒載體、經由磷酸鈣沈澱之轉型作用、DEAE-聚葡萄糖、電穿孔、顯微注射或其他方法來誘導以併入載體或其他物質。參見例如Sambrook等人, Molecular Cloning:  A Laboratory Manual第2版. (Cold Spring Harbor Laboratory, 1989)。
在乙型冠狀病毒感染之情形下,「宿主」係指感染乙型冠狀病毒之細胞或個體。
如本文所用,「抗原」或「Ag」係指引起免疫反應之免疫原性分子。此免疫反應可涉及抗體產生、特異性免疫感受態細胞之活化、補體活化、抗體依賴性細胞毒性或其任何組合。抗原(免疫原性分子)可為例如肽、醣肽、多肽、醣多肽、多核苷酸、多醣、脂質或其類似物。容易地顯而易見,抗原可由生物樣品合成、以重組方式產生或自其衍生。可含有一或多個抗原之例示性生物樣品包括組織樣品、糞便樣品、細胞、生物流體或其組合。抗原可藉由已經修飾或遺傳工程改造以表現抗原之細胞產生。抗原亦可存在於乙型冠狀病毒(例如表面醣蛋白或其部分)中,諸如存在於病毒粒子中,或表現或呈遞於經乙型冠狀病毒感染之細胞的表面上。
術語「表位」或「抗原表位」包括由諸如免疫球蛋白之同源結合分子或其他結合分子、區域或蛋白質識別且特異性結合的任何分子、結構、胺基酸序列或蛋白質決定子。表位決定子通常含有分子,諸如胺基酸或糖側鏈之化學活性表面群組,且可具有特定三維結構特徵以及荷質比特徵。當抗原為或包含肽或蛋白質時,表位可包含連續胺基酸(例如,線性表位),或可包含來自蛋白質之不同部分或區的因蛋白質摺疊而接近之胺基酸(例如,非連續或構象表位),或與蛋白質摺疊無關的緊密相鄰的非鄰接胺基酸。 抗體、抗原結合片段及組成物
在一個態樣中,本揭露內容提供一種經分離之抗體或其抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),且能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。在一些實施例中,抗體或其抗原結合片段能夠結合至二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。在一些實施例中,抗體或其抗原結合片段能夠結合至任何二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。在一些實施例中,抗體或其抗原結合片段能夠結合至SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV、OC43及HKU之表面醣蛋白。
在某些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段與乙型冠狀病毒表面醣蛋白表位或包含該表位之抗原結合或聯合,但不與樣品中之任何其他分子或組分顯著結合或聯合。在一些實施例中,表位包含於刺突(S)蛋白之S2次單元中。在其他實施例中,表位不包含於S蛋白之S1次單元或受體結合區域(RBD)中。在一些實施例中,表位為構形表位或線性表位。在一些實施例中,表位以S蛋白之融合後構形、S蛋白之融合前構形或二者存在。在一些實施例中,表位包含於安置於S蛋白之HR2區與中央螺旋(CH)區之間的連接區域或連接子區域中。在某些實施例中,表位包含於S蛋白胺基酸序列FX 1X 2ELX 3X 4X 5FKNX 6X 7X 8X 9X 10X 11X 12X 13X 14(SEQ ID NO:46)中,或包含其之S蛋白胺基酸中之一或多者,其中:X 1為K、E或Q;X 2為E、S或D;X 3為D或S;X 4為K、Q、H或E;X 5為Y、W或F;X 6為H、Q或V;X 7為T或S;X 8為S、L或T;X 9為P、V、L或S;X 10為D、A、P或I;X 11為V或P;X 12為D或N;X 13為L或F;且X 14為G、S或T。在特定實施例中,SEQ ID NO:46之位置11處的N經醣基化。
在某些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段與第一乙型冠狀病毒表面醣蛋白表位結合或聯合(例如,結合),且亦可與來自存在於樣品中之另一乙型冠狀病毒的表位結合或聯合,但不與樣品中之任何其他分子或組分顯著結合或聯合。換言之,在某些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段針對二種、三種、四種或更多種乙型冠狀病毒具有交叉反應性且對其具有特異性。在一些實施例中,抗體或抗原結合片段不結合至甲型冠狀病毒,如藉由ELISA所量測(例如在1 μg/mL抗原下)。
在某些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段特異性結合至乙型冠狀病毒表面醣蛋白。如本文所用,「特異性結合」係指抗體或抗原結合片段與抗原以等於或大於10 5M -1之親和力或K a(亦即,特定結合相互作用之平衡締合常數,單位為1/M) (其等於此締合反應之締合速率[K on]與解離速率[K off]的比率)之締合或聯合,但不與樣品中之任何其他分子或組分顯著締合或聯合。可替代地,親和力可經定義為以M為單位之特定結合相互作用之平衡解離常數(K d) (例如10 -5M至10 -13M)。抗體可分類為「高親和力」抗體或「低親和力」抗體。「高親和力」抗體係指K a為至少10 7M -1、至少10 8M -1、至少10 9M -1、至少10 10M -1、至少10 11M -1、至少10 12M -1或至少10 13M -1的彼等抗體。「低親和力」抗體係指K a為至多10 7M -1、至多10 6M -1、至多10 5M -1的彼等抗體。可替代地,親和力可經定義為以M為單位之特定結合相互作用之平衡解離常數(K d) (例如10 -5M至10 -13M)。
已知多種用於鑑別結合特定目標之本揭露內容之抗體以及測定結合區域或結合蛋白親和力之分析,諸如西方墨點法、ELISA(例如直接、間接或夾心)、分析型超速離心、光譜法、生物層干涉法及表面電漿子共振(Biacore®)分析(參加例如Scatchard等人, Ann. N.Y. Acad. Sci. 51:660, 1949;Wilson, Science 295:2103, 2002;Wolff等人, Cancer Res. 53:2560, 1993;及美國專利第5,283,173號、第5,468,614號或同等物)。用於評定親和力或表觀親和力或相對親和力之分析亦為已知的。
在某些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段以約7至約75 μg/mL範圍內之EC50結合至來自MERS、HKU1、OC43、SARS-CoV及SARS-CoV-2中之每一者的刺突(S)蛋白。在某些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段以約5至約9 μg/mL範圍內、或約6至約8.5 μg/mL範圍內、或約7、7.5、8或8.5 μg/mL之EC50結合至MERS、OC43、SARS-CoV及SARS-CoV-2中之每一者,如藉由ELISA(例如使用融合前穩定之刺突蛋白及以1 μg/mL刺突蛋白塗佈之孔)所測定。在一些實施例中,抗體或抗原結合片段以約72 μg/mL之EC50結合至HKU1之S蛋白,如藉由ELISA所測定。
在某些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段以約200至約4300 μg/mL範圍內之EC50結合至MERS、HKU1及OC43中之每一者。在某些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段以約200至約800 μg/mL範圍內、或約230至約730 μg/mL範圍內、或約230或約730 μg/mL之EC50結合至MERS及OC432中之每一者,如藉由ELISA(例如使用融合前穩定之刺突蛋白及以1 μg/mL刺突蛋白塗佈之孔)所測定。
在某些實例中,結合可藉由在宿主細胞中以重組方式表現乙型冠狀病毒抗原(例如,藉由轉染)及用抗體對(例如,固定的,或固定的及預滲透的)宿主細胞免疫染色,及藉由流式細胞測量術(例如,使用ZE5細胞分析儀(BioRad®)及FlowJo軟體(TreeStar)分析結合來確定。在一些實施例中,陽性結合可由表現乙型冠狀病毒之細胞相對於對照(例如,模擬)細胞之抗體的不同染色來定義。
在一些實施例中,如藉由流式細胞測量術所測定,本揭露內容之抗體或抗原結合片段結合至表現於宿主細胞(例如Expi-CHO細胞)表面上之乙型冠狀病毒刺突蛋白(亦即,來自SARS-CoV-2、SARS-CoV、OC43及MERS中之二種、三種、四種或所有五種)。
在一些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段結合至乙型冠狀病毒S蛋白,如使用生物層干涉法所量測。
在某些實施例中,本揭露內容之抗體能夠中和乙型冠狀病毒之感染。在某些實施例中,本揭露內容之抗體能夠中和二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之感染。如本文所用,「中和抗體」為可中和,亦即防止、抑制、減少、阻礙或干擾病原體在宿主中引發及/或維持感染之能力的抗體。術語「中和抗體」及「中和……之抗體(an antibody that neutralizes/antibodies that neutralize)」在本文中可互換使用。在本發明所揭露之實施例中之任一者中,抗體或抗原結合片段在活體外感染模型中及/或活體內動物感染模型中及/或人類中能夠阻止及/或中和任何二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之感染。
在一些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段能夠以約3,300 μg/mL至約3,900 μg/mL範圍內、或約3,400 μg/mL至約3,800 μg/mL範圍內、或約3,500 μg/mL至約3,700 μg/mL範圍內、或約3,600 μg/mL、約3,650 μg/mL、或約3,700 μg/mL之IC50來中和活SARS-CoV-2之感染。在一些實施例中,使用SARS-CoV-2/螢光素酶在VeroE6細胞上以0.01之感染倍率(MOI)持續24h測定感染之中和。
在一些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段能夠以約4 μg/mL至約7 μg/mL範圍內或約4.5 μg/mL至約6.5 μg/mL範圍內的IC50中和MERS-CoV假病毒(例如MLV-pp)及SARS-CoV-2假病毒(例如MLV-pp)的感染。在一些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段能夠以約6.3 μg/mL的IC50中和MERS-CoV假病毒(例如MLV-pp)之感染,且/或能夠以約4.7 μg/mL的IC50中和SARS-CoV-2假病毒(例如MLV-pp)之感染。在一些實施例中,感染之中和使用MERS-CoV在Huh7細胞上測定。在一些實施例中,感染之中和使用SARS-CoV-2在Vero E6細胞上測定。
在一些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段能夠以約1至約10 μg/ml範圍內之IC50中和乙型冠狀病毒感染(例如藉由一種、二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒)或乙型冠狀病毒假型病毒。在一些實施例中,抗體或抗原結合片段能夠以約3至約6 μg/ml範圍內之IC50中和乙型冠狀病毒感染或乙型冠狀病毒假型病毒。
在某些實施例中,抗體或抗原結合片段(i)識別二種、三種、四種、五種或更多種乙型冠狀病毒之刺突蛋白中之表位;(ii)能夠阻斷一或多種乙型冠狀病毒之刺突蛋白與細胞表面受體之間的相互作用;(iii)識別二種、三種、四種、五種或更多種乙型冠狀病毒之刺突蛋白中守恆的表位;(iv)針對二種、三種、四種、五種或更多種乙型冠狀病毒具有交叉反應性;或(v)(i)-(iv)之任何組合。
除非本文中明確地不同定義,否則熟習此項抗體技術者理解之術語各自賦予此項技術中獲得之含義。舉例而言,術語「抗體」係指包含藉由二硫鍵互連之至少二個重(H)鏈及二個輕(L)鏈的完整抗體,以及具有或保持結合至由完整抗體所識別之抗原目標分子之能力的完整抗體之任何抗原結合部分或片段,諸如scFv、Fab或Fab'2片段。因此,本文中術語「抗體」係在最廣泛的意義上使用且包括多株及單株抗體,包括完整抗體及其功能性(抗原結合)抗體片段,包括抗原結合片段(Fab)片段、F(ab')2片段、Fab'片段、Fv片段、重組IgG (rIgG)片段、單鏈抗體片段,包括單鏈可變片段(scFv),及單區域抗體(例如sdAb、sdFv、奈米抗體)片段。該術語涵蓋免疫球蛋白之經基因工程改造及/或以其他方式修飾之形式,諸如胞內抗體、肽體、嵌合抗體、完全人類抗體、人源化抗體,及異結合抗體、多特異性(例如雙特異性)抗體、雙功能抗體、三功能抗體、四功能抗體、串聯二scFv及串聯三scFv。除非另有陳述,否則術語「抗體」應理解為涵蓋其功能性抗體片段。該術語亦涵蓋完整或全長抗體,包括任何種類或亞類的抗體,包括IgG及其子類(IgG1、IgG2、IgG3、IgG4)、IgM、IgE、IgA及IgD。
術語「V L」或「VL」及「V H」或「VH」係指分別來自抗體輕鏈及抗體重鏈之可變結合區。在某些實施例中,VL為卡帕(κ)類(本文中亦為「VK」)。在某些實施例中,VL為拉姆達(λ)類。可變結合區包含稱為「互補決定區」(CDR)及「骨架區」(FR)之分散的定義明確的子區。術語「互補決定區」及「CDR」與「高變區」或「HVR」同義,且係指抗體可變區內之胺基酸序列,其一般而言一同賦予抗原特定性及/或該抗體之結合親和力,其中連續CDR (亦即,CDR1及CDR2,CDR2及CDR3)在一級結構中藉由骨架區彼此分離。在各可變區中存在三個CDR (HCDR1、HCDR2、HCDR3;LCDR1、LCDR2、LCDR3;分別亦稱為CDRH及CDRL)。在某些實施例中,抗體VH包含如下四個FR及三個CDR:FR1-HCDR1-FR2-HCDR2-FR3-HCDR3-FR4;且抗體VL包含如下四個FR及三個CDR:FR1-LCDR1-FR2-LCDR2-FR3-LCDR3-FR4。一般而言,VH及VL經由其對應的CDR共同形成抗原結合位點。
如本文所用,CDR之「變體」係指具有至多1-3個胺基酸取代(例如,守恆或非守恆取代)、缺失或其組合之CDR序列的功能變體。
可根據任何已知方法或方案,諸如Kabat、Chothia、EU、IMGT、Contact、North、Martin及AHo編號方案對CDR及骨架區進行編號(參見例如Kabat等人, 「Sequences of Proteins of Immunological Interest」, US Dept. Health and Human Services, Public Health Service National Institutes of Health, 1991, 第5版;Chothia及Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987));Lefranc等人, Dev. Comp. Immunol. 27:55, 2003;Honegger及Plückthun, J. Mol. Bio. 309:657-670 (2001);North等人. J Mol Biol. (2011) 406:228-56; doi:10.1016/j.jmb.2010.10.030;Abhinandan及Martin, Mol Immunol.(2008) 45:3832-9. 10.1016/j.molimm.2008.05.022)。等效殘基位置可使用抗原受體編號及受體分類(ANARCI)軟體工具(2016,Bioinformatics 15:298-300)標註且比較不同分子。因此,根據一個編號方案鑑別如本文所提供之例示性可變區域(VH或VL)序列的CDR不包括包含使用不同編號方案確定的相同可變區域之CDR的抗體。在某些實施例中,提供包含根據SEQ ID NO: 26、36、47、66、71、72、73或79中之任一者之VH序列之CDR及根據SEQ ID NO: 30、40、51、69、75、77或82中之任一者之VL序列之CDR的抗體或抗原結合片段,如使用任何已知CDR編號方法所測定,包括Kabat、Chothia、EU、IMGT、Martin(增強Chothia)、Contact、North及AHo編號方法。在某些實施例中,CDR係根據IMGT編號方法。在某些實施例中,CDR係根據由化學計算組(CCG)研發之抗體編號方法;例如使用分子操作環境(MOE)軟體(www.chemcomp.com)。
在某些實施例中,提供一種抗體或抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中:(i)CDRH1包含根據SEQ ID NO: 27、37、48、67或80中之任一者之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個酸取代之序列變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代;(ii)CDRH2包含根據SEQ ID NO: 28、38、49、68或81中之任一者之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之序列變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代;(iii) CDRH3包含根據SEQ ID NO: 29、39、50或74中之任一者之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之序列變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代;(iv)CDRL1包含根據SEQ ID NO: 31、41、52、70、76、78或83中之任一者的胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之序列變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代;(v)CDRL2包含根據SEQ ID NO: 32、42或53中之任一者的胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之序列變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代;及/或(vi)CDRL3包含根據SEQ ID NO: 33、43或54中之任一者的胺基酸序列或其包含具有一個、二個或三個胺基酸取代之序列變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中抗體或抗原結合片段能夠結合至表現於宿主細胞之表面上及/或病毒粒子上的一或多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
在某些實施例中,抗體或其抗原結合片段在活體外感染模型中及/或活體內動物感染模型中及/或人類中能夠中和乙型冠狀病毒之感染。在某些實施例中,抗體或其抗原結合片段在活體外感染模型中及/或活體內動物感染模型中及/或人類中能夠中和一種、二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之感染。
在本發明所揭露之實施例中之任一者中,抗體或抗原結合片段包含根據以下之CDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2及CDRL3胺基酸序列:SEQ ID NO: (i)分別為27-29及31-33;(ii)分別為37-39及41-43;(iii)分別為48-50及52-54,(iv)分別為67、68及29以及70、32及33,(v)分別為26、27及74以及31-33,(vi)分別為27-29以及76、32及33,(vii)分別為27-29以及78、32及33,(viii)分別為80、81及50以及83、53及54。
在某些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段包含CDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2及CDRL3,其中各CDR獨立地選自如表1中所提供之抗體420_1_1(亦稱為抗體S2P6)、抗體420_1_2(亦稱為抗體S2S8)或抗體S2S43或其變體抗體之對應CDR。亦即,考慮表1中所提供之來自乙型冠狀病毒抗體及其變體序列之CDR的所有組合。
在一些實施例中,本揭露內容之抗體或其抗原結合片段包含有包含SEQ ID NO: 26、36、47、66、71、72、73或79之胺基酸序列的重鏈及包含SEQ ID NO: 30、40、51、69、75、77或82之胺基酸序列的輕鏈。
在一些實施例中,本揭露內容之抗體或其抗原結合片段包含二個重鏈,其皆包含胺基酸序列SEQ ID NO: 26、36、47、66、71、72、73或79;及二個輕鏈,其皆包含胺基酸序列SEQ ID NO: 30、40、51、69、75、77或82。
術語「CL」係指「免疫球蛋白輕鏈恆定區」或「輕鏈恆定區」,亦即來自抗體輕鏈之恆定區。術語「CH」係指「免疫球蛋白重鏈恆定區」或「重鏈恆定區」,根據抗體同型可進一步分為CH1、CH2及CH3 (IgA、IgD、IgG)或CH1、CH2、CH3及CH4區域(IgE,IgM)。抗體重鏈之Fc區進一步描述於本文中。在本發明所揭露之實施例中之任一者中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段包含CL、CH1、CH2及CH3中之任一或多者。在某些實施例中,CL包含與胺基酸序列SEQ ID NO:8或SEQ ID NO: 9具有90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致性的胺基酸序列。在某些實施例中,CH1-CH2-CH3包含與胺基酸序列SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:7具有90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致性的胺基酸序列。
應理解,例如在哺乳動物細胞株中產生可移除抗體重鏈之一或多個C端離胺酸(參見例如Liu等人. mAbs 6(5):1145-1154 (2014))。因此,本揭露內容之抗體或抗原結合片段可包含重鏈、CH1-CH3、CH3或Fc多肽,其中存在或不存在C端離胺酸殘基;換言之,涵蓋其中重鏈、CH1-CH3或Fc多肽之C端殘基不為離胺酸的實施例,及其中離胺酸為C端殘基的實施例。在某些實施例中,組成物包含本揭露內容之多個抗體及/或抗原結合片段,其中一或多個抗體或抗原結合片段不包含在重鏈、CH1-CH3或Fc多肽之C端末端處的離胺酸殘基,且其中一或多個抗體或抗原結合片段包含在重鏈、CH1-CH3或Fc多肽之C端末端處的離胺酸殘基。
「Fab」(抗原結合片段)為結合至抗原之抗體之一部分,且包括可變區及經由鏈間雙硫鍵連接至輕鏈之重鏈的CH1。各Fab片段關於抗原結合為單價的,亦即其具有單一抗原結合位點。用胃蛋白酶處理抗體產生單一大型F(ab')2片段,其大致對應於具有二價抗原結合活性之二個二硫鍵連接的Fab片段且仍能夠交聯抗原。Fab及F(ab')2二者為「抗原結合片段」的實例。Fab'片段與Fab片段之不同之處在於在包括一或多個來自抗體鉸鏈區之半胱胺酸之CH1區域之羧基端處具有額外極少殘基。Fab'-SH在本文中為其中恆定區域之半胱胺酸殘基攜有游離硫醇基的Fab'名稱。F(ab')2抗體片段最初以其間具有鉸鏈半胱胺酸之Fab'片段對形式產生。亦已知抗體片段之其他化學偶聯。
Fab片段可例如藉由肽連接子連接以形成單鏈Fab,該單鏈Fab在本文中亦稱為「scFab」。在此等實施例中,可能不會存在存在於原生Fab中之鏈間二硫鍵,且連接子完全或部分用以連接(link)或連接(connect)單一多肽鏈中之Fab片段。重鏈衍生之Fab片段(例如包含以下、由以下組成或基本上由以下組成:VH + CH1或「Fd」)及輕鏈衍生之Fab片段(例如包含以下、由以下組成或基本上由以下組成:VL + CL)可以任何排列形式連接以形成scFab。舉例而言,scFab可根據(重鏈Fab片段-連接子-輕鏈Fab片段)或(輕鏈Fab片段-連接子-重鏈Fab片段)自N端至C端方向排列。用於scFab中之肽連接子及例示性連接子序列在本文中進一步詳細地論述。
「Fv」為含有完整抗原識別及抗原結合位點之小抗體片段。此片段一般由具有緊密、非共價締合之一個重鏈可變區區域及一個輕鏈可變區區域之二聚體組成。然而,即使單一可變區域(或僅包含對抗原具有特異性之三個CDR之Fv的一半)能夠識別且結合抗原,但通常親和力比整個結合位點低。
「單鏈Fv」亦縮寫為「sFv」或「scFv」,為包含連接至單一多肽鏈中之VH及VL抗體區域的抗體片段。在一些實施例中,scFv多肽包含安置於V H區域與V L區域之間且連接V H區域與V L區域之多肽連接子,從而使得scFv能夠保留或形成抗原結合所需之結構。可使用在此項技術中熟知之標準技術將此類肽連接子併入至融合多肽中。關於scFv之評述,參見Pluckthun in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, 第113卷, Rosenburg及Moore編, Springer-Verlag, New York, 第269-315頁(1994);Borrebaeck 1995, 見下文。在某些實施例中,抗體或抗原結合片段包含scFv,該scFv包含VH區域、VL區域及將VH區域連接至VL區域之肽連接子。在特定實施例中,scFv包含藉由肽連接子連接至VL區域之VH區域,該肽連接子可呈VH-連接子-VL取向或呈VL-連接子-VH取向。本揭露內容之任何scFv可經工程改造以使得VL區域之C端末端藉由短肽序列連接至VH區域之N端末端,或反之亦然(亦即,(N)VL(C)-連接子-(N)VH(C)或(N)VH(C)-連接子-(N)VL(C)。可替代地,在一些實施例中,連接子可連接至VH區域、VL區域或二者之N端部分或N端末端。
肽連接子序列可例如基於以下進行選擇:(1)其能呈現可撓性延伸構形;(2)其不能或缺乏呈現可與第一及第二多肽上之及/或目標分子上之功能性表位相互作用的二級結構的能力;及/或(3)缺乏或相對缺乏可能與多肽及/或目標分子反應之疏水性或帶電殘基。關於連接子設計(例如,長度)之其他考慮因素可包括其中VH及VL可形成功能性抗原結合位點之構形或構形範圍。在某些實施例中,肽連接子序列含有例如Gly、Asn及Ser殘基。諸如Thr及Ala之其他幾乎中性之胺基酸亦可包括於連接子序列中。可適用作連接子之其他胺基酸序列包括以下中所揭露之序列:Maratea等人, Gene 40:39 46 (1985);Murphy等人, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83:8258 8262 (1986);美國專利第4,935,233號及美國專利第4,751,180號。連接子之其他例示性及非限制性實例可包括例如Glu-Gly-Lys-Ser-Ser-Gly-Ser-Gly-Ser-Glu-Ser-Lys-Val-Asp (SEQ ID NO: 19) (Chaudhary等人,  Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:1066-1070 (1990))及Lys-Glu-Ser-Gly-Ser-Val-Ser-Ser-Glu-Gln-Leu-Ala-Gln-Phe-Arg-Ser-Leu-Asp (SEQ ID NO: 20) (Bird等人, Science 242:423-426 (1988))及五聚體Gly-Gly-Gly-Gly-Ser (SEQ ID NO: 21),當存在於單一迭代中或重複1至5次或更多次時,或更高;參見例如SEQ ID NO: 17。可使用任何合適之連接子,且一般可為約3、4、5、6、7、 8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、15 23、24、25、26、27、28、29、30、40、50、60、70、80、90、100個胺基酸長,或小於約200個胺基酸長,且將較佳包含可撓性結構(可為由連接子連接之二個區、區域、模體、片段或模組之間的構形移動提供靈活性及空間),且將較佳具有生物惰性及/或具有人類中之低免疫原性風險。例示性連接子包括包含以下或由以下組成之連接子:SEQ ID NO: 10-21中之任一或多者中所闡述的胺基酸序列。在某些實施例中,連接子包含與SEQ ID NO: 10-21中之任一者中所闡述之胺基酸序列具有至少75% (亦即至少約75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高)一致性的胺基酸序列或由其組成。
scFv可使用本文所揭露之VH及VL序列之任何組合或CDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2及CDRL3序列之任何組合來構築。
在一些實施例中,不需要連接子序列;例如當第一及第二多肽具有可用於分離功能區域且防止空間干擾之非必需N端胺基酸區時。
在抗體發展期間,生殖系可變(v)、連接(J)及多樣性(D)基因座中之DNA可重新佈置且編碼序列中之核苷酸插入及/或缺失可出現。體細胞突變可由所得序列編碼,且可參照相對應的已知生殖系序列來鑑別。在一些情況下,對於抗體之所需特性(例如,結合至SARS-CoV-2抗原)而言並不重要,或對抗體賦予非所需特性(例如,投予抗體之個體的增加之免疫原性風險)或二者之體細胞突變可經相對應的經生殖系編碼之胺基酸或藉由不同胺基酸置換,使得改進或維持抗體之所需特性且降低或消除抗體之非所需特性。因此,在一些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段包含與親體抗體或抗原結合片段相比在可變區中之至少一個更多經生殖系編碼之胺基酸,其限制條件為親體抗體或抗原結合片段包含一或多個體細胞突變。本揭露內容之例示性抗乙型冠狀病毒抗體之可變區及CDR胺基酸序列提供於本文表1中。
在某些實施例中,抗體或抗原結合片段包含胺基酸修飾(例如,取代突變)以消除氧化、去醯胺及/或異構化之不良風險。
本文亦提供與本發明所揭露之(「親本」)抗體相比包含在可變區(例如,VH、VL、構架或CDR)中之一或多個胺基酸改變的變體抗體,其中該變體抗體能夠結合至SARS-CoV-2抗原。
在某些實施例中,VH包含與如SEQ ID NO: 26、36、47、66、71、72、73及79中任一者之胺基酸序列具有至少85%(亦即85%、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100%)一致性的胺基酸序列或由其組成,其中變化任擇地限於一或多個骨架區及/或變化包含一或多個對經生殖系編碼之胺基酸的取代;及/或(ii) VL包含與如SEQ ID NO: 30、40、51、69、75、77及82中任一者之胺基酸序列具有至少85%(亦即85%、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100%)一致性的胺基酸序列或由其組成,其中變化任擇地限於一或多個骨架區及/或變化包含一或多個對經生殖系編碼之胺基酸的取代。
在某些實施例中,該VH包含表1中所闡述之任何VH胺基酸序列或由其組成,且該VL包含表1中所闡述之任何VL胺基酸序列或由其組成。在特定實施例中,VH及VL包含根據以下之胺基酸序列或由其組成:SEQ ID NO: (i)分別為26及30;(ii)分別為26及69,(iii)分別為26及75,(iv)分別為26及77,(v)分別為66及69,(vi)分別為66及30,(vii)分別為66及75,(viii)分別為66及77,(ix)分別為71及30,(x)分別為71及69,(xi)分別為71及75,(xii)分別為71及77,(xiii)分別為72及30,(xiv)分別為72及69,(xv)分別為72及75,(xvi)分別為72及77,(xvii)分別為73及30,(xviii)分別為73及69,(xix)分別為73及75,(xx)分別為73及77,(xxi)分別為36及40;(xxii)分別為47及51;(xxiii)分別為47及82,(xiv)分別為79及82或(xv)分別為79及51。
在特定實施例中,VH及VL包含與以下具有至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%一致性之胺基酸序列或由其組成,SEQ ID NO: (i)分別為26及30;(ii)分別為26及69,(iii)分別為26及75,(iv)分別為26及77,(v)分別為66及69,(vi)分別為66及30,(vii)分別為66及75,(viii)分別為66及77,(ix)分別為71及30,(x)分別為71及69,(xi)分別為71及75,(xii)分別為71及77,(xiii)分別為72及30,(xiv)分別為72及69,(xv)分別為72及75,(xvi)分別為72及77,(xvii)分別為73及30,(xviii)分別為73及69,(xix)分別為73及75,(xx)分別為73及77,(xxi)分別為36及40;(xxii)分別為47及51;(xxiii)分別為47及82,(xiv)分別為79及82或(xv)分別為79及51。
在一些實施例中,提供包含以下之抗體或抗原結合片段:(1) VH,其包含CDRH1、CDRH2及CDRH3;及(2) VL,其包含CDRL1、CDRL2及CDRL3,其中CDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2及CDRL3係根據以下中所闡述之VH及VL胺基酸序列:SEQ ID NO: (i)分別為26及30;(ii)分別為36及40;(iii)分別為47及50;(iv)分別為66及69;(v)分別為71及30;(vii)分別為72及30;(viii)分別為73及30;(ix)分別為26及69;(x)分別為71及69,;(xi)分別為72及69;(xii)分別為73及69;(xiii)分別為26及75;(xiv)分別為26及77;(xv)分別為66及75;(xvi)分別為66及77;(xvii)分別為73及75;(xviii)分別為73及77;(xix)分別為72及75;(xx)分別為72及77;(xxi)分別為36及40;(xxii)分別為47及51;(xxiii)分別為47及82;(xxiv)分別為47及82;(xxv)分別為79及51;或(xxvi)分別為79及82。
在一些實施例中,CDR根據IMGT編號系統。在一些實施例中,CDR根據Kabat編號系統。在一些實施例中,CDR根據Chothia編號系統。在一些實施例中,CDR根據AHo編號系統。在一些實施例中,CDR根據North編號系統。在一些實施例中,CDR根據Martin編號系統。
在一些實施例中,抗體或抗原結合片段為IgG、IgA、IgM、IgE或IgD同型。在一些實施例中,抗體或抗原結合片段為人類、人源化或嵌合的。
在一些實施例中,抗體或抗原結合片段包含人類抗體、單株抗體、純化抗體、單鏈抗體、Fab、Fab'、F(ab')2、Fv、scFv或scFab。
在某些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段為單特異性的(例如,結合至單一表位)或為多特異性的(例如,結合至多個表位及/或目標分子)。抗體及抗原結合片段可以多種形式構築。例示性抗體形式揭露於Spiess等人, Mol. Immunol. 67(2):95 (2015)中,且揭露於Brinkmann及Kontermann, mAbs 9(2):182-212 (2017)中,其形式及其製備方法以引用的方式併入本文中且包括例如雙特異性T細胞銜接器(BiTE)、DART、杵-入-臼(KIH)組件、scFv-CH3-KIH組件、KIH共同輕鏈抗體、TandAb、三體(Triple Bodies)、TriBi迷你抗體、Fab-scFv、scFv-CH-CL-scFv、F(ab')2-scFv2、四價HCab、胞內抗體、CrossMab、雙功能Fab (DAF) (二合一或四合一)、DutaMab、DT-IgG、電荷對、Fab臂交換、SEED體、Triomab、LUZ-Y組件、Fcab、κλ-體、正交Fab、DVD-Ig (例如,美國專利案第8,258,268號,其形式以全文引用之方式併入本文中)、IgG(H)-scFv、scFv-(H)IgG、IgG(L)-scFv、scFv-(L)IgG、IgG(L,H)-Fv、IgG(H)-V、V(H)-IgG、IgG(L)-V、V(L)-IgG、KIH IgG-scFab、2scFv-IgG、IgG-2scFv、scFv4-Ig、Zy體及DVI-IgG (四合一)、以及所謂的FIT-Ig (例如,PCT公開案第WO 2015/103072號,其形式以全文引用之方式併入本文中)、所謂的Wuxi體形式(例如,PCT公開案第WO 2019/057122號,其形式以全文引用之方式併入本文中)及所謂的In-Elbow-Insert Ig形式(IEI-Ig,例如PCT公開案第WO 2019/024979及WO 2019/025391號,其形式以全文引用之方式併入本文中)。
在某些實施例中,抗體或抗原結合片段包含VH區域、二個或更多個VL區域或二者(亦即,二個或更多個VH區域及二個或更多個VL區域)中之二者或更多者。在特定實施例中,抗原結合片段包含形式(N端至C端方向) VH-連接子-VL-連接子-VH-連接子-VL,其中該等二個VH序列可能相同或不同,且二個VL序列可能相同或不同。此類連接之scFv可包括佈置成結合至給定目標之VH及VL區域的任何組合,且呈包含二個或更多個VH及/或二個或更多個VL之形式,可結合一個、二個或更多個不同表位或抗原。應瞭解,併入多個抗原結合區域之形式可包括以任何組合或定向之VH及/或VL序列。舉例而言,抗原結合片段可包含形式VL-連接子-VH-連接子-VL-連接子-VH、VH-連接子-VL-連接子-VL-連接子-VH或VL-連接子-VH-連接子-VH-連接子-VL。
本揭露內容之構築的單特異性或多特異性抗體或抗原結合片段包含本文中所揭露之VH及VL序列之任何組合及/或CDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2及CDRL3序列之任何組合。在一些實施例中,雙特異性或多特異性抗體或抗原結合片段可包含本揭露內容之一個、二個或更多個抗原結合區域(例如,VH及VL)。可存在結合至相同或不同乙型冠狀病毒表位之二個或更多個結合區域,且如本文所提供之雙特異性或多特異性抗體或抗原結合片段可在一些實施例中包含另一SARS-CoV-2結合區域,及/或可包含完全結合至不同抗原或病原體之結合區域。
在本發明所揭露之實施例中之任一者中,抗體或抗原結合片段可為多特異性的;例如雙特異性、三特異性或其類似性質。
在某些實施例中,抗體或抗原結合片段包含:(i)第一VH及第一VL;及(ii)第二VH及第二VL,其中第一VH及第二VH不同且各自獨立地包含與SEQ ID NO: 26、36、47、66、71、72、73及79中之任一者中所闡述之胺基酸序列具有至少85%(亦即85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)一致性的胺基酸序列,且其中第一VL及第二VL不同且各自獨立地包含與SEQ ID NO: 30、40、51、69、75、77及82中之任一者中所闡述之胺基酸序列具有至少85%(亦即85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)一致性的胺基酸序列,且其中第一VH及第一VL一起形成第一抗原結合位點,且其中第二VH及第二VL一起形成第二抗原結合位點。
在某些實施例中,抗體或抗原結合片段包含Fc多肽或其片段。Fc多肽、Fc二聚體或Fc之片段亦可稱為Fc部分。「Fc」片段或Fc多肽包含藉由二硫鍵固持在一起的二個抗體H鏈的羧基端部分(亦即,IgG之CH2及CH3區域)。抗體「效應功能」係指可歸因於抗體之Fc區(原生序列Fc區或胺基酸序列變體Fc區)的彼等生物活性,且隨抗體同型而變化。抗體效應功能之實例包括:C1q結合及補體依賴性細胞毒性;Fc受體結合;抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC);吞噬作用;細胞表面受體(例如B細胞受體)之下調;及B細胞活化。如本文所論述,可對Fc區域進行修飾(例如,胺基酸取代),以便改變(例如,改進、降低或消除)含Fc之多肽(例如,本揭露內容之抗體)的一或多種功能性。此類功能包括例如Fc受體(FcR)結合、抗體半衰期調節(例如藉由結合至FcRn)、ADCC功能、蛋白A結合、蛋白G結合及補體結合。改變(例如,改進、降低或消除)Fc功能性之胺基酸修飾包括例如T250Q/M428L、M252Y/S254T/T256E、H433K/N434F、M428L/N434S、E233P/L234V/L235A/G236 + A327G/A330S/P331S、E333A、S239D/A330L/I332E、P257I/Q311、K326W/E333S、S239D/I332E/G236A、N297Q、K322A、S228P、L235E + E318A/K320A/K322A、L234A/L235A (在本文中亦稱為「LALA」)及L234A/L235A/P329G突變,該等突變概述且標註於由InvivoGen (2011)所公開且在invivogen.com/PDF/review/review-Engineered-Fc-Regions-invivogen.pdf?utm_source=review&utm_medium=pdf&utm_ campaign=review&utm_content=Engineered-Fc-Regions下線上可用之「工程改造Fc區」中,且以引用之方式併入本文中。
舉例而言,為了活化補體級聯,當免疫球蛋白分子附接至抗原目標時,C1q蛋白質複合物可結合至IgG1之至少二個分子或IgM之一個分子(Ward, E. S.及Ghetie, V., Ther. Immunol.2 (1995) 77-94)。Burton, D. R., ( Mol. Immunol.22 (1985) 161-206)描述包含胺基酸殘基318至337之重鏈區參與補體結合。使用定點突變誘發之Duncan, A. R.及Winter, G. ( Nature332 (1988) 738-740)報導Glu318、Lys320及Lys322形成與C1q之結合位點。Glu318、Lys320及Lys 322殘基在C1q結合中之作用係藉由含有此等殘基之短合成肽抑制補體介導之裂解的能力來確認。
舉例而言,FcR結合可由(抗體之) Fc部分與Fc受體(FcR)之相互作用介導,該等FcR為包括造血細胞之細胞上之特殊化細胞表面受體。Fc受體屬於免疫球蛋白超家族,且展示介導藉由免疫複合物之吞噬作用進行之經抗體塗佈之病原體的移除及塗佈有對應抗體之紅血球及各種其他細胞目標(例如腫瘤細胞)的裂解,以上係經由抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC;Van de Winkel, J. G.及Anderson, C. L., J. Leukoc. Biol.49 (1991) 511-524)進行。FcR係根據其對免疫球蛋白種類之特異性界定;針對IgG抗體之Fc受體稱為FcγR,針對IgE抗體之Fc受體稱為FcεR,針對IgA抗體之Fc受體稱為FcαR,諸如此類,且新生兒Fc受體稱為FcRn。Fc受體結合描述於例如Ravetch, J. V.及Kinet, J. P., Annu. Rev. Immunol.9 (1991) 457-492;Capel, P. J.等人, Immunomethods4 (1994) 25-34;de Haas, M.等人, J Lab. Clin. Med.126 (1995) 330-341;及Gessner, J. E.等人, Ann. Hematol.76 (1998) 231-248中。
受體對原生IgG抗體之Fc區域(FcγR)的交聯觸發多種效應功能,包括吞噬作用、抗體依賴性細胞毒性,及炎性介體釋放,以及免疫複合物清除及對抗體產生的調控。本文考慮提供受體(例如FcγR)之交聯之Fc部分。在人類中,迄今為止已表徵三類FcγR,其為:(i) FcγRI (CD64),其以高親和力結合單體IgG且在巨噬細胞、單核球、嗜中性白血球及嗜酸性白血球上經表現;(ii) FcγRII (CD32),其以中等至低親和力結合複合IgG,尤其在白血球上經廣泛表現,咸信其為抗體介導之免疫之中樞參與者,且其可分成FcγRIIA、FcγRIIB及FcγRIIC,其在免疫系統中執行不同功能,但以類似低親和力結合至IgG-Fc,且此等受體之胞外區域為高度同源的;及(iii) FcγRIII (CD16),其以中等至低親和力結合IgG且已發現呈二種形式:FcγRIIIA,其已經發現於NK細胞、巨噬細胞、嗜酸性白血球及一些單核球及T細胞上且咸信其介導ADCC;及FcγRIIIB,其高度表現於嗜中性白血球上。
在許多涉及殺死作用之細胞(例如巨噬細胞、單核球、嗜中性球)上發現FcγRIIA,且其似乎能夠活化殺死過程。FcγRIIB似乎在抑制過程中起一定作用,且在B細胞、巨噬細胞上及肥大細胞及嗜酸性白血球上發現FcγRIIB。重要的是,已展示75%之所有FcγRIIb發現於肝臟中(Ganesan, L. P.等人, 2012: 「FcγRIIb on liver sinusoidal endothelium clears small immune complexes」 Journal of Immunology 189: 4981-4988)。FcγRIIB在稱為LSEC之肝竇內皮上經充分表現,且在肝及LSEC中之庫弗細胞(Kupffer cell)中為小免疫複合物清除之主要位點(Ganesan, L. P.等人, 2012: FcγRIIb on liver sinusoidal endothelium clears small immune complexes. Journal of Immunology 189: 4981-4988)。
在一些實施例中,本文中所揭露之抗體及其抗原結合片段包含用於結合至FcγRIIb,尤其Fc區之Fc多肽或其片段,諸如例如IgG型抗體。此外,有可能藉由引入突變S267E及L328F對Fc部分工程改造以增強FcγRIIB結合,如由Chu, S. Y.等人, 2008: Inhibition of B cell receptor-mediated activation of primary human B cells by coengagement of CD19 and FcgammaRIIb with Fc-engineered antibodies. Molecular Immunology 45, 3926-3933所描述。藉此,可增強免疫複合物之清除(Chu, S.等人, 2014: Accelerated Clearance of IgE In Chimpanzees Is Mediated By Xmab7195, An Fc-Engineered Antibody With Enhanced Affinity For Inhibitory Receptor FcγRIIb. Am J Respir Crit, American Thoracic Society International Conference Abstracts)。在一些實施例中,本揭露內容之抗體或其抗原結合片段包含具有突變S267E及L328F之經工程改造Fc部分,尤其如以下所述:Chu, S. Y.等人, 2008: Inhibition of B cell receptor-mediated activation of primary human B cells by coengagement of CD19 and FcgammaRIIb with Fc-engineered antibodies. Molecular Immunology 45, 3926-3933。
在B細胞上,FcγRIIb可用以抑制免疫球蛋白進一步產生及同型轉換為例如IgE類。在巨噬細胞上,認為FcγRIIb抑制如經由FcγRIIA介導之吞噬作用。在嗜酸性白血球及肥胖細胞上,B形式可有助於經由IgE結合至其獨立受體而抑制此等細胞之活化。
關於FcγRI結合,E233-G236、P238、D265、N297、A327及P329中之至少一者的原生IgG中之修飾減少結合至FcγRI。經取代至對應位置IgG1及IgG4中之位置233-236處之IgG2殘基使IgG1及IgG4與FcγRI之結合減少10 3倍,且消除人類單核球對抗體致敏型紅血球之反應(Armour, K. L等人. Eur. J. Immunol.29 (1999) 2613-2624)。
關於FcγRII結合,發現針對FcγRIIA之結合降低,例如針對E233-G236、P238、D265、N297、A327、P329、D270、Q295、A327、R292及K414中之至少一者的IgG突變。
人類FcγRIIA之二個對偶基因形式為「H131」變體,其以較高親和力結合至IgG1 Fc;及「R131」變體,其以較低親和力結合至IgG1 Fc。參見例如Bruhns等人, Blood 113:3716-3725 (2009)。
關於FcγRIII結合,發現與FcγRIIIA之結合減少,例如對於E233-G236、P238、D265、N297、A327、P329、D270、Q295、A327、S239、E269、E293、Y296、V303、A327、K338及D376中之至少一者的突變而言如此。人類IgG1上用於Fc受體之結合位點定位、上文所提及之突變位點及用於量測與FcγRI及FcγRIIA之結合之方法描述於Shields, R. L.等人, J. Biol. Chem.276 (2001) 6591-6604中。
人類FcγRIIIA之二個對偶基因形式為「F158」變體,其以較低親和力結合至IgG1 Fc;及「V158」變體,其以較高親和力結合至IgG1 Fc。參見例如Bruhns等人, Blood 113:3716-3725 (2009)。
關於與FcγRII之結合,天然IgG Fc之二個區似乎參與FcγRII與IgG之間的相互作用,亦即(i) IgG Fc之下部鉸鏈位點,詳言之胺基酸殘基L、L、G、G (234-237,EU編號),及(ii) IgG Fc之CH2區域之相鄰區,詳言之鄰近於下部鉸鏈區之上部CH2區域,例如P331區中之環及股(Wines, B.D.等人, J. Immunol. 2000; 164: 5313 - 5318)。此外,FcγRI似乎結合至IgG Fc上之相同位點,而FcRn及蛋白A結合至IgG Fc上之不同位點,該不同位點似乎在CH2-CH3界面處(Wines, B.D.等人, J. Immunol. 2000;164: 5313-5318)。
亦涵蓋增加本揭露內容之Fc多肽或其片段與(亦即,一或多個) Fcγ受體之結合親和力的突變(例如,與參考Fc多肽或其片段或含有不包含一或多個突變之多肽或其片段相比)。參見例如,Delillo及Ravetch, Cell 161(5):1035-1045 (2015)及Ahmed等人, J. Struc. Biol. 194(1):78 (2016),Fc突變及其技術以引用之方式併入本文中。
在本發明所揭露之實施例中之任一者中,抗體或抗原結合片段可包含Fc多肽或其片段,其包含選自G236A;S239D;A330L及I332E之突變;或包含該等突變中之任何二者或更多者的組合;例如S239D/I332E;S239D/A330L/I332E;G236A/S239D/I332E;G236A/A330L/I332E (在本文中亦稱為「GAALIE」);或G236A/S239D/A330L/I332E。在一些實施例中,Fc多肽或其片段不包含S239D。
在某些實施例中,Fc多肽或其片段可包含以下或由以下組成:參與結合至FcRn結合之Fc多肽或其片段的至少一部分。在某些實施例中,Fc多肽或其片段包含改進針對(例如,促進結合至) FcRn之結合親和力(例如,在pH為約6.0下),且在一些實施例中,藉此延長包含Fc多肽或其片段之分子之活體內半衰期(例如,與參考Fc多肽或其片段或在其他方面相同但不包含該(該等)修飾之抗體相比)的一或多個胺基酸修飾。在某些實施例中,Fc多肽或其片段包含或衍生自IgG Fc,且半衰期延長之突變包含以下中之任一或多者:M428L;N434S;N434H;N434A;N434S;M252Y;S254T;T256E;T250Q;P257I;Q311I;D376V;T307A;E380A (EU編號)。在某些實施例中,延長半衰期之突變包含M428L/N434S (在本文中亦稱為「MLNS」)。在某些實施例中,延長半衰期之突變包含M252Y/S254T/T256E。在某些實施例中,延長半衰期之突變包含T250Q/M428L。在某些實施例中,延長半衰期之突變包含P257I/Q311I。在某些實施例中,延長半衰期之突變包含P257I/N434H。在某些實施例中,延長半衰期之突變包含D376V/N434H。在某些實施例中,延長半衰期之突變包含T307A/E380A/N434A。
在一些實施例中,抗體或抗原結合片段包括包含取代型突變M428L/N434S之Fc部分。在一些實施例中,抗體或抗原結合片段包括包含取代型突變G236A/A330L/I332E之Fc多肽或其片段。在某些實施例中,抗體或抗原結合片段包括(例如,IgG) Fc部分,其包含G236A突變、A330L突變及I332E突變(GAALIE),且不包含S239D突變(例如,包含位置239處之原生S)。在特定實施例中,抗體或抗原結合片段包括Fc多肽或其片段,其包含取代型突變:M428L/N434S及G236A/A330L/I332E,且任擇地不包含S239D。在某些實施例中,抗體或抗原結合片段包括Fc多肽或其片段,其包含取代型突變:M428L/N434S及G236A/S239D/A330L/I332E。
在某些實施例中,抗體或抗原結合片段包含改變醣基化之突變,其中改變醣基化之突變包含N297A、N297Q或N297G,及/或抗體或抗原結合片段經部分或完全去醣基化及/或部分或完全去岩藻醣基化。宿主細胞株及部分或完全去醣基化或部分或完全去岩藻醣基化抗體及抗原結合片段之製備方法為已知的(參見例如,PCT公開案第WO 2016/181357號;Suzuki等人. Clin. Cancer Res. 13(6):1875-82 (2007);Huang等人. MAbs 6:1-12 (2018))。
在某些實施例中,抗體或抗原結合片段即使當在個體中未發現可偵測位準之抗體或抗原結合片段時(亦即,當抗體或抗原結合片段在投予之後已自個體中清除時),亦能夠在個體中引發活體內持續保護。此類保護在本文中稱為疫苗作用。在不希望受理論束縛的情況下,咸信樹突狀細胞可內化抗體與抗原之複合物,且其後誘導或促成針對抗原之內源性免疫反應。在某些實施例中,抗體或抗原結合片段包含一或多個修飾,諸如例如Fc中之突變,包含G236A、A330L及I332E,該等修飾能夠活化可誘導例如對抗原之T細胞免疫性的樹突狀細胞。
在本發明所揭露之實施例中之任一者中,抗體或抗原結合片段包含Fc多肽或其片段,其包括CH2 (或其片段)、CH3 (或其片段)或CH2及CH3,其中該CH2、CH3或二者可具有任何同型且可含有胺基酸取代或分別與對應野生型CH2或CH3相比之其他修飾。在某些實施例中,本揭露內容之Fc多肽包含締合以形成二聚體之二個CH2-CH3多肽。
在本發明所揭露之實施例中之任一者中,抗體或抗原結合片段可為單株的。如本文所用,術語「單株抗體」(mAb)係指獲自基本上同種之抗體群體(亦即構成該群體之個別抗體為相同的,除了在一些情況下可少量存在的可能天然存在之突變外)的抗體。單株抗體為高度特異性的,其針對單一抗原位點。此外,與包括針對不同表位之不同抗體的多株抗體製劑相反,各單株抗體針對抗原之單一表位。除其特異性以外,單株抗體亦為有利的,在於其可由其他抗體未經污染地合成。術語「單株」不應解釋為需要藉由任何特定方法來產生抗體。舉例而言,適用於本發明之單株抗體可藉由首先由Kohler等人, Nature 256:495 (1975)描述之融合瘤方法製備,或可在細菌、真核動物或植物細胞中使用重組DNA方法製得(參見例如美國專利案第4,816,567號)。亦可使用例如Clackson等人, Nature, 352:624-628 (1991)及Marks等人, J. Mol. Biol., 222:581-597 (1991)中描述之技術自噬菌體抗體庫中分離單株抗體。單株抗體亦可使用揭露於PCT公開案第WO 2004/076677A2號中之方法獲得。
本揭露內容之抗體及抗原結合片段包括「嵌合抗體」,其中重鏈及/或輕鏈之一部分與衍生自特定物種或屬於特定抗體類別或子類別之抗體中的對應序列相同或同源,而該(等)鏈之其餘部分與衍生自另一物種或屬於另一抗體類別或子類別之抗體,以及此類抗體之片段(只要其展現出所需生物活性)中的對應序列相同或同源(參見美國專利第4,816,567號;第5,530,101號及第7,498,415號;及Morrison等人, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 (1984))。舉例而言,嵌合抗體可包含人類及非人類殘基。此外,嵌合抗體可包含在接受者抗體或供體抗體中未發現之殘基。進行此等修飾以進一步改進抗體效能。關於其他細節,參見Jones等人, Nature321:522-525 (1986);Riechmann等人, Nature332:323-329 (1988);及Presta, Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596 (1992)。嵌合抗體亦包括靈長類化及人源化抗體。
「人源化抗體」通常被視為具有自非人類來源引入其中之一或多個胺基酸殘基的人類抗體。此等非人類胺基酸殘基通常獲自可變區域。人源化可遵循Winter及同事之方法(Jones等人, Nature, 321:522-525 (1986);Reichmann等人, Nature, 332:323-327 (1988);Verhoeyen等人, Science, 239:1534-1536 (1988)),藉由用非人類可變序列取代人類抗體之對應序列進行。相應地,此類「人源化」抗體為嵌合抗體(美國專利第4,816,567號;第5,530,101號及第7,498,415號),其中實質上小於完整人類可變區域已經來自非人類物種的對應序列取代。在一些情況下,「人源化」抗體為一種藉由非人類細胞或動物產生且包含人類序列,例如H C區域之抗體。
「人類抗體」為一種僅含有存在於由人類產生之抗體中之序列的抗體。然而,如本文所用,人類抗體可包含未在天然存在之人類抗體(例如,自人類中分離之抗體)中發現的殘基或修飾,包括本文所述之彼等修飾及變體序列。此等通常為了進一步改進或增強抗體效能而進行。在某些情況下,人類抗體藉由轉殖基因動物產生。例如參見美國專利第5,770,429號、第6,596,541號及第7,049,426號。
在某些實施例中,本揭露內容之抗體或抗原結合片段為嵌合、人源化或人類的。 多核苷酸、載體及宿主細胞
在另一態樣中,本揭露內容提供經分離多核苷酸,其編碼本發明所揭露之抗體或其抗原結合片段或其部分(例如,CDR、VH、VL、重鏈或輕鏈)中之任一者。
在某些實施例中,多核苷酸包含去氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA),其中該RNA任擇地包含信使RNA (mRNA)。
在一些實施例中,多核苷酸包含經修飾之核苷、cap-1結構、cap-2結構或其任何組合。在某些實施例中,多核苷酸包含假尿苷、N6-甲基腺苷、5-甲基胞苷、2-硫代尿苷或其任何組合。在一些實施例中,假尿苷包含N1-甲基假尿苷。
在某些實施例中,多核苷酸經密碼子最佳化以表現於宿主細胞中。當已知或鑑別到編碼序列時,密碼子最佳化可使用已知技術及工具,例如使用GenScript® OptimiumGene TM工具進行;亦參見Scholten等人, Clin. Immunol. 119:135, 2006)。密碼子最佳化序列包括經部分密碼子最佳化(亦即,一或多個密碼子經最佳化以在宿主細胞中表現)之序列及經完全密碼子最佳化之序列。
亦應瞭解,本揭露內容之編碼抗體及抗原結合片段的多核苷酸可能具有不同核苷酸序列,但因例如遺傳密碼之簡併、剪接及其類似物仍編碼相同抗體或抗原結合片段。
在某些實施例中,多核苷酸包含與根據SEQ ID NO:34、35、44、45、55及56中之任一或多者的多核苷酸序列具有至少50% (亦即50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)一致性的多核苷酸。
在一些實施例中,編碼抗體重鏈之多核苷酸包含SEQ ID NO: 34、44或55之多核苷酸序列。
在一些實施例中,編碼抗體輕鏈之多核苷酸包含SEQ ID NO: 35、45或56之多核苷酸序列。
在一些實施例中,編碼抗體重鏈之多核苷酸包含SEQ ID NO: 34、44或55之多核苷酸序列,且編碼抗體輕鏈之多核苷酸包含SEQ ID NO: 34、44或55之多核苷酸序列或由其組成。
在本發明所揭露之實施例中之任一者中,多核苷酸可包含去氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA)。在一些實施例中,RNA包含信使RNA (mRNA)。
亦提供載體,其中載體包含或含有如本文所揭示之多核苷酸(例如編碼結合至任何二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之抗體或抗原結合片段的多核苷酸)。載體可包含本文中所揭露之載體中之任一或多者。在特定實施例中,提供一種載體,其包含編碼抗體或抗原結合片段或其部分之DNA質體構築體(例如,所謂的「DMAb」;參見例如Muthumani等人, J Infect Dis. 214(3):369-378 (2016);Muthumani等人, Hum Vaccin Immunother 9:2253-2262 (2013));Flingai等人, Sci Rep. 5:12616 (2015);及Elliott等人, NPJ Vaccines18 (2017),其抗體編碼DNA構築體及相關使用方法,包括投予抗體編碼DNA構築體,以引用的方式併入本文中)。在某些實施例中,DNA質體構築體包含編碼抗體或抗原結合片段之重鏈及輕鏈(或VH及VL)的單一開放閱讀框架,其中編碼重鏈之序列及編碼輕鏈之序列任擇地藉由編碼蛋白酶裂解位點之多核苷酸及/或藉由編碼自裂解肽之多核苷酸分隔開。在一些實施例中,抗體或抗原結合片段之取代性組分由包含於單一質體中之多核苷酸編碼。在其他實施例中,抗體或抗原結合片段之取代性組分由包含於二個或更多個質體(例如,第一質體包含編碼重鏈、VH或VH+CH之多核苷酸,且第二質體包含編碼同源輕鏈、VL或VL+CL之多核苷酸)中之多核苷酸編碼。在某些實施例中,單一質體包含編碼來自本揭露內容之二個或更多個抗體或抗原結合片段之重鏈及/或輕鏈的多核苷酸。例示性表現載體為pVax1,可購自Invitrogen®。本揭露內容之DNA質體可藉由例如電穿孔(例如,肌肉內電穿孔)或藉由適當的調配物(例如,玻尿酸酶)遞送至個體。
在一些實施例中,提供一種方法,其包含向個體投予編碼抗體重鏈、VH或Fd (VH + CH1)之第一多核苷酸(例如mRNA),及向個體投予編碼同源抗體輕鏈、VL或VL+CL之第二多核苷酸(例如mRNA)。
在一些實施例中,提供編碼抗體或其抗原結合片段之重鏈及輕鏈的多核苷酸(例如mRNA)。在一些實施例中,提供編碼抗體或其抗原結合片段之二個重鏈及二個輕鏈的多核苷酸(例如mRNA)。參見例如Li, JQ., Zhang, ZR., Zhang, HQ等人. Intranasal delivery of replicating mRNA encoding neutralizing antibody against SARS-CoV-2 infection in mice. Sig Transduct Target Ther 6, 369 (2021). https://doi.org/10.1038/s41392-021-00783-1,編碼抗體之mRNA構築體、載體及其相關技術以引用之方式併入本文中。在一些實施例中,多核苷酸經由甲型病毒複製子粒子(VRP)遞送系統遞送至個體。在一些實施例中,複製子包含經修飾之包含二個亞基因體啟動子之VEEV複製子。在一些實施例中,多核苷酸或複製子可同時轉譯抗體或其抗原結合片段之重鏈(或VH或VH+1)及輕鏈(或VL或VL+CL)。在一些實施例中,提供一種方法,其包含向個體遞送此類多核苷酸或複製子。
在另一態樣中,本揭露內容亦提供一種宿主細胞,其表現根據本揭露內容之抗體或抗原結合片段;或包含或含有根據本揭露內容之載體或多核苷酸。
此類細胞之實例包括但不限於真核細胞,例如酵母細胞、動物細胞、昆蟲細胞、植物細胞;及原核細胞,包括大腸桿菌。在一些實施例中,細胞為哺乳動物細胞。在某些此類實施例中,細胞為哺乳動物細胞株,諸如CHO細胞(例如,DHFR-CHO細胞(Urlaub等人, PNAS 77:4216 (1980))、人類胚胎腎細胞(例如,HEK293T細胞)、PER.C6細胞、Y0細胞、Sp2/0細胞、NS0細胞、例如Hepa RG細胞之人類肝細胞、骨髓瘤細胞或融合瘤細胞。哺乳動物宿主細胞株之其他實例包括小鼠塞特利氏細胞(例如TM4細胞);由SV40轉型之猴腎CV1株(COS-7);幼倉鼠腎細胞(BHK);非洲綠猴腎細胞(VERO-76);猴腎細胞(CV1);人類子宮頸癌細胞(HELA);人類肺細胞(W138);人類肝細胞(Hep G2);犬腎細胞(MDCK;水牛鼠肝細胞(BRL 3A);小鼠乳房腫瘤(MMT 060562);TRI細胞; MRC5細胞;及FS4細胞。適用於抗體生產之哺乳動物宿主細胞株亦包括例如Yazaki及Wu, Methods in Molecular Biology, 第248卷(B. K. C. Lo編, Humana Press, Totowa, N.J.), 第255-268頁(2003)中所描述之哺乳動物宿主細胞株。
在某些實施例中,宿主細胞為諸如大腸桿菌之原核細胞。充分建立諸如大腸桿菌之原核細胞中之肽的表現(參見例如Pluckthun, A. Bio/Technology 9:545-551 (1991)。舉例而言,抗體可於細菌中產生,在不需要醣基化及Fc效應功能時尤其如此。關於抗體片段及多肽在細菌中之表現,參見例如美國專利第5,648,237號、第5,789,199號及第5,840,523號。
在特定實施例中,細胞可經根據本說明書之載體及表現載體轉染。術語「轉染」係指將諸如DNA或RNA (例如mRNA)分子之核酸分子引入細胞中,諸如引入真核細胞中。在本說明書之情形下,術語「轉染」涵蓋熟習此項技術者已知用於將核酸分子引入至細胞中,諸如引入至真核細胞中,包括引入至哺乳動物細胞中的任何方法。此類方法涵蓋例如電穿孔、例如基於陽離子脂質及/或脂質體之脂質體轉染、磷酸鈣沈澱、基於奈米粒子之轉染、基於病毒之轉染或基於陽離子聚合物(諸如DEAE-聚葡萄糖或聚乙烯亞胺等)之轉染。在某些實施例中,引入為非病毒。
此外,本揭露內容之宿主細胞可經根據本揭露內容之載體穩定地或暫時地轉染,例如用於表現根據本揭露內容之抗體或其抗原結合片段。在此類實施例中,細胞可經如本文所述之載體穩定地轉染。或者,細胞可經編碼如本文中所揭露之抗體或抗原結合片段之根據本揭露內容的載體暫時地轉染。在本發明所揭露之實施例中之任一者中,多核苷酸對於宿主細胞而言可為異源的。
因此,本揭露內容亦提供異源性地表現本揭露內容之抗體或抗原結合片段的重組宿主細胞。舉例而言,細胞可屬於與完全或部分產生抗體之物種(例如表現人類抗體或經工程改造人類抗體之CHO細胞)不同的物種。在一些實施例中,宿主細胞之細胞類型在本質上不表現抗體或抗原結合片段。此外,宿主細胞可在不存在於抗體或抗原結合片段之原生狀態中(或在抗體或抗原結合片段經工程改造或自其衍生之親代抗體的原生狀態中)之抗體或抗原結合片段上賦予轉譯後修飾(PTM;例如醣基化或岩藻醣基化)。此類PTM可產生功能差異(例如,降低之免疫原性)。因此,由如本文所揭露之宿主細胞產生之本揭露內容的抗體或抗原結合片段可包括不同於在原生狀態中之該抗體(或親代抗體)的一或多個轉譯後修飾(例如,由CHO細胞產生之人類抗體可包含當與人類分離及/或由原生人類B細胞或漿細胞產生時不同於該抗體之多個轉譯後修飾)。
適用於表現本揭露內容之結合蛋白之昆蟲細胞為此項技術中已知的且包括例如草地貪夜蛾( Spodoptera frugipera) Sf9細胞、粉紋夜蛾(Trichoplusia ni) BTI-TN5B1-4細胞及草地貪夜蛾SfSWT01「Mimic TM」細胞。參見例如Palmberger等人, J. Biotechnol. 153(3-4):160-166 (2011)。已鑑別出眾多可與昆蟲細胞聯合使用,尤其用於轉染草地黏蟲( Spodoptera frugiperda)細胞之桿狀病毒株。
諸如絲狀真菌或酵母菌之真核微生物亦為適用於選殖或表現編碼蛋白質之載體的宿主,且包括具有「人源化」醣基化路徑之真菌及酵母菌株,從而引起產生具有部分或完全人類醣基化模式之抗體。參見Gerngross, Nat. Biotech.22:1409-1414 (2004);Li等人, Nat. Biotech.24:210-215 (2006)。
植物細胞亦可用作用於表現本揭露內容之結合蛋白之宿主。舉例而言,PLANTIBODIES™技術(描述於例如美國專利第5,959,177號;第6,040,498號;第6,420,548號;第7,125,978號;及第6,417,429號中)採用基因轉殖植物以產生抗體。
在某些實施例中,宿主細胞包含哺乳動物細胞。在特定實施例中,宿主細胞為CHO細胞、HEK293細胞、PER.C6細胞、Y0細胞、Sp2/0細胞、NS0細胞、人類肝臟細胞、骨髓瘤細胞或融合瘤細胞。
在相關態樣中,本揭露內容提供用於產生抗體或抗原結合片段之方法,其中該等方法包含在足以產生抗體或抗原結合片段之條件及時間下培養本揭露內容之宿主細胞。舉例而言,適用於分離及純化以重組方式產生之抗體的方法可包括獲得來自適合宿主細胞/載體系統(分泌重組抗體至培養基中)的上清液,且接著使用可商購的過濾器濃縮培養基。在濃縮之後,可將濃縮物施加至單一適合之純化基質或施加至一系列適合之基質,諸如親和基質或離子交換樹脂。一或多個逆相HPLC步驟可用以進一步純化重組多肽。當免疫原與其自然環境分離時,亦可使用此等純化方法。大規模生產本文所述之經分離/重組抗體中之一或多者的方法包括分批細胞培養,其經監測及控制以維持適當培養條件。可溶性抗體之純化可根據本文所述及此項技術中已知之方法進行,且與國內及外來管控機構之法律及指導原則一致。 組成物
本文亦提供包含單獨或以任何組合形式之本發明所揭露之抗體、抗原結合片段、多核苷酸、載體或宿主細胞中之任一或多者,且可進一步包含醫藥學上可接受之載體、賦形劑或稀釋劑的組成物。本文進一步詳細論述載劑、賦形劑及稀釋劑。
在某些實施例中,組成物包含根據本揭露內容之二個或更多個不同抗體或抗原結合片段。在某些實施例中,待以組合形式使用之抗體或抗原結合片段各自獨立地具有以下特徵中之一或多者:中和一個、二個、三個、四個、五個或更多個天然存在之乙型冠狀病毒變體;不與彼此競爭刺突蛋白結合;結合不同乙型冠狀病毒刺突蛋白表位;對乙型冠狀病毒之抗性的形成減少;當以組合形式時,對乙型冠狀病毒之抗性的形成減少;強力中和一個、二個、三個、四個、五個或更多個活乙型冠狀病毒;當組合使用時對中和一個、二個、三個、四個、五個或更多個活乙型冠狀病毒表現累加或協同效應;表現效應功能;在相關動物感染模型中具有保護性;能夠以充足數量產生以用於大規模生產。
在某些實施例中,組成物包含根據本揭露內容之二個或更多個不同抗體或抗原結合片段。在某些實施例中,組成物包含第一抗體或抗原結合片段,其包含:VH,該VH包含如SEQ ID NO: 26、66、71、72或73中所闡述之胺基酸序列或由其組成,及VL,該VL包含如SEQ ID NO: 30、69、75或77中所闡述之胺基酸序列或由其組成;及第二抗體或抗原結合片段,其包含:VH,該VH包含如SEQ ID NO: 36中所闡述之胺基酸序列或由其組成,及VL,該VL包含如SEQ ID NO: 40中所闡述之胺基酸序列或由其組成。
在某些實施例中,組成物包含第一抗體或抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中該CDRH1、CDRH2及CDRH3包含以下中闡述之胺基酸序列或由其組成:SEQ ID NO: (i)分別為27-29,(ii)分別為67、68及29或(iii)分別為27、27及74,以及該CDRL1、CDRL2及CDRL3包含以下中闡述之胺基酸序列或由其組成:SEQ ID NO: (i)分別為31-33,(ii) 70、32及33,(iii)分別為76、32及33,(iv)分別為78、32及33;且包含第二抗體或抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中該CDRH1、CDRH2及CDRH3包含分別SEQ ID NO: 37-39中闡述之胺基酸序列或由其組成,以及該CDRL1、CDRL2及CDRL3包含分別SEQ ID NO: 41-43中闡述之胺基酸序列或由其組成。
在某些實施例中,組成物包含根據本揭露內容之二個或更多個不同抗體或抗原結合片段。在某些實施例中,組成物包含第一抗體或抗原結合片段,其包含有包含如SEQ ID NO: 26、66、71、72或73中所闡述之胺基酸序列或由其組成的VH,及包含如SEQ ID NO: 30、69、75或77中所闡述之胺基酸序列或由其組成的VL;及第二抗體或抗原結合片段,其包含有包含如SEQ ID NO: 47或79中所闡述之胺基酸序列或由其組成的VH,及包含如SEQ ID NO: 51或82中所闡述之胺基酸序列或由其組成的VL。
在某些實施例中,組成物包含第一抗體或抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中該CDRH1、CDRH2及CDRH3包含以下中闡述之胺基酸序列或由其組成:SEQ ID NO: (i)分別為27-29,(ii)分別為67、68及29或(iii)分別為27、27及74,以及該CDRL1、CDRL2及CDRL3包含以下中闡述之胺基酸序列或由其組成:SEQ ID NO: (i)分別為31-33,(ii) 70、32及33,(iii)分別為76、32及33,(iv)分別為78、32及33;且包含第二抗體或抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中該CDRH1、CDRH2及CDRH3包含分別SEQ ID NO: 48-50或分別80、81及50中闡述之胺基酸序列或由其組成,以及該CDRL1、CDRL2及CDRL3包含分別SEQ ID NO: 52-54或分別83、83及54中闡述之胺基酸序列或由其組成。
在某些實施例中,組成物包含根據本揭露內容之二個或更多個不同抗體或抗原結合片段。在某些實施例中,組成物包含第一抗體或抗原結合片段,其包含有包含如SEQ ID NO: 26、66、71、72或73中所闡述之胺基酸序列或由其組成的VH,及包含如SEQ ID NO: 30、69、75或77中所闡述之胺基酸序列或由其組成的VL;及第二抗體或抗原結合片段,其包含有包含如SEQ ID NO: 47或79中所闡述之胺基酸序列或由其組成的VH,及包含如SEQ ID NO: 51或82中所闡述之胺基酸序列或由其組成的VL。
在某些實施例中,組成物包含第一抗體或抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中該CDRH1、CDRH2及CDRH3包含以下中闡述之胺基酸序列或由其組成:SEQ ID NO: (i)分別為27-29,(ii)分別為67、68及29或(iii)分別為27、27及74,以及該CDRL1、CDRL2及CDRL3包含以下中闡述之胺基酸序列或由其組成:SEQ ID NO: (i)分別為31-33,(ii)70、32及33,(iii)分別為76、32及33,(iv)分別為78、32及33;且包含第二抗體或抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中該CDRH1、CDRH2及CDRH3包含分別SEQ ID NO: 48-50或分別80、81及50中闡述之胺基酸序列或由其組成,以及該CDRL1、CDRL2及CDRL3包含分別SEQ ID NO: 52-54或分別83、83及54中闡述之胺基酸序列或由其組成。
在某些實施例中,組成物包含有包含第一質體之第一載體及包含第二質體之第二載體,其中該第一質體包含編碼抗體或其抗原結合片段之重鏈、VH或VH+CH之多核苷酸,且第二質體包含編碼該抗體或其抗原結合片段之同源輕鏈、VL或VL+CL之多核苷酸。在某些實施例中,組成物包含偶合至合適遞送媒劑或載劑之多核苷酸(例如mRNA)。用於向人類個體投予之例示性媒劑或載劑包括脂質或脂質衍生之遞送媒劑,諸如脂質體、固體脂質奈米粒子、油性懸浮液、次微米級脂質乳液、脂質微泡、逆脂質微胞、耳蝸脂質體、脂質微管、脂質微柱或脂質奈米粒子(LNP)或奈米尺度平台(參見例如Li等人 . Wilery Interdiscip Rev . Nanomed Nanobiotechnol . 11(2):e1530 (2019))。用於設計適當mRNA及調配mRNA-LNP以及遞送其之原理、試劑及技術描述於例如Pardi等人( J Control Release 217345-351 (2015));Thess等人( Mol Ther 23: 1456-1464 (2015));Thran等人( EMBO Mol Med 9(10):1434-1448 (2017);Kose等人( Sci . Immunol . 4eaaw6647 (2019);及Sabnis等人( Mol . Ther . 26:1509-1519 (2018))中,該等技術包括加帽、密碼子最佳化、核苷修飾、mRNA純化、將mRNA併入穩定脂質奈米粒子(例如可離子化陽離子脂質/磷脂醯膽鹼/膽固醇/PEG-脂質;可離子化脂質:二硬脂醯基PC:膽固醇:聚乙二醇脂質)中及其皮下、肌內、皮內、靜脈內、腹膜內及氣管內投予,該等技術係以引用之方式併入本文中。 方法及用途
本文亦提供使用揭露內容之抗體或抗原結合片段、核酸、載體、細胞或組成物診斷(例如人類個體中或獲自人類個體之樣品中)乙型冠狀病毒感染的方法。
診斷方法(例如,活體外、離體)可包括使抗體、抗體片段(例如,抗原結合片段)與樣品接觸。此類樣品可自個體分離,例如獲自例如鼻道、鼻竇腔、唾液腺、肺、肝、胰臟、腎、耳、眼、胎盤、消化道、心臟、卵巢、垂體、腎上腺、甲狀腺、腦、皮膚或血液之經分離組織樣品。診斷之方法亦可包括偵測抗原/抗體複合物,尤其在使抗體或抗體片段與樣品接觸之後。此類偵測步驟可在實驗台上進行,亦即不與人類或動物身體有任何接觸。偵測方法之實例為熟習此項技術者所熟知,且包括例如酶聯結免疫吸附分析(ELISA),包括直接、間接及夾層ELISA。
本文亦提供使用本揭露內容之抗體或抗原結合片段或包含其之組成物治療個體的方法,其中該個體具有、咸信具有或處於患有乙型冠狀病毒感染之風險下。「治療(treat)」、「治療(treatment)」或「改善」係指個體(例如,人類或非人類哺乳動物,諸如靈長類動物、馬、貓、犬、山羊、小鼠或大鼠)之病症、疾病或病狀的醫學管理。一般而言,包含本揭露內容之抗體或組成物的適當劑量或治療方案係以足以引發治療效益或預防效益的量投予。治療性或預防性/預防性效益包括改進的臨床結果;減輕或緩解與疾病相關之症狀;減少症狀的發生;改進的生活品質;更長的無疾病狀態;疾病嚴重程度減輕;疾病病況之穩定;延緩或預防疾病進展;緩解;存活期;延長的存活期;或其任何組合。在某些實施例中,治療性或預防性/預防性效益包括減小或預防因治療乙型冠狀病毒感染而住院(亦即,以統計學上顯著之方式)。在某些實施例中,治療性或預防性/預防性效益包括減少因治療乙型冠狀病毒感染而住院的持續時間(亦即,以統計學上顯著之方式)。在某些實施例中,治療性或預防性/預防性效益包括減少或消除對呼吸干預,諸如插管及/或使用呼吸器裝置之需求。在某些實施例中,治療性或預防性/預防性效益包括逆轉晚期疾病病理學及/或減少之死亡率。
本揭露內容之抗體、抗原結合片段、多核苷酸、載體、宿主細胞或組成物的「治療有效量」或「有效量」係指足以產生治療作用之該組成物或分子的量,該治療作用包括以統計學上顯著之方式改進的臨床結果;減輕或緩解與疾病相關之症狀;減少症狀的發生;改進的生活品質;更長的無疾病狀態;疾病嚴重程度減輕;疾病病況之穩定;延緩疾病進展;緩解;存活期;或延長的存活期。當提及單獨投予之個別活性成分時,治療有效量係指彼成分或單獨表現彼成分之細胞的效果。當提及組合時,治療有效量係指不論連續、依次或同時投予,產生治療作用之活性成分或組合的輔助活性成分與表現活性成分之細胞的組合量。組合可包含例如二種特異性結合乙型冠狀病毒抗原的不同抗體,該等乙型冠狀病毒抗原在某些實施例中可為相同或不同的乙型冠狀病毒抗原,且/或可包含相同或不同的表位。
因此,在某些實施例中,提供用於治療個體之乙型冠狀病毒感染的方法,其中該等方法包含向該個體投予有效量之如本文所揭示之抗體、抗原結合片段、多核苷酸、載體、宿主細胞或組成物。
一般而言,可藉由本揭露內容治療之個體為人類及其他靈長類動物個體,諸如用於獸醫學目的之猴及猿。諸如小鼠及大鼠之其他模型生物亦可根據本揭露內容治療。在前述實施例中之任一者中,個體可為人類個體。個體可為雄性或雌性且可為任何適齡個體,包括嬰兒、幼年、青年、成年及老年個體。
咸信多個準則引起與乙型冠狀病毒感染相關之重度症狀或死亡的較高風險。此等包括但不限於年齡、職業、一般健康、預先存在之健康狀況及生活方式習慣。在一些實施例中,根據本揭露內容治療之個體包含一或多種風險因子。
在某些實施例中,根據本揭露內容治療之人類個體為嬰兒、兒童、青少年、中年或老年個體。在某些實施例中,根據本揭露內容治療之人類個體低於1歲、或為1至5歲、或在5與125歲之間(例如,5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115或125歲,包括其中或其間之任何及所有年齡)。在某些實施例中,根據本揭露內容治療之人類個體為0-19歲、20-44歲、45-54歲、55-64歲、65-74歲、75-84歲或85歲,或更大年齡。咸信,中年個體,及尤其老年個體具有特定風險。在特定實施例中,人類個體為45-54歲、55-64歲、65-74歲、75-84歲或85歲,或更大年齡。在一些實施例中,人類個體為男性。在一些實施例中,人類個體為女性。
在某些實施例中,根據本揭露內容治療之人類個體為護理之家或長期照護設施的居住者;為臨終關懷照護工作者;為健康照護提供者或健康照護工作者;為第一線救護人員;為經診斷具有或疑似具有乙型冠狀病毒感染之個體的家族成員或其他密切接觸者;為超重或臨床上肥胖;為或曾經為吸菸者;具有或曾具有慢性阻塞性肺病(COPD);為氣喘(例如,具有中度至重度氣喘);具有自體免疫疾病或病狀(例如,糖尿病);及/或具有受損或耗乏的免疫系統(例如,歸因於AIDS/HIV感染,癌症諸如血液癌症,淋巴細胞耗竭(lymphodepleting)療法諸如化療,骨髓或器官移植,或基因免疫病狀);具有慢性肝病;具有心血管疾病;具有肺病或心臟病;與他人一起工作或以其他方式近距離接觸,諸如在工廠、運輸中心、醫院環境或其類似環境中。
在某些實施例中,根據本揭露內容治療之個體已接受針對乙型冠狀病毒之疫苗,且該疫苗藉由臨床診斷或科學或法規準則,例如藉由該個體之疫苗後感染或症狀確定為無效的。
在某些實施例中,治療係作為暴露期間預防投予。在某些實施例中,向具有輕度至中度疾病之個體,其可在門診環境中,投予治療。在某些實施例中,向具有中度至重度疾病,諸如需要住院之個體投予治療。
投予本發明所揭露之組成物之典型途徑因此包括但不限於經口、局部、經皮、吸入、非經腸、舌下、經頰、經直腸、經陰道及鼻內。如本文所用,術語「非經腸」包括皮下注射、靜脈內、肌肉內、胸骨內注射或輸注技術。在某些實施例中,投予包含藉由選自以下之途徑投予:經口、靜脈內、非經腸、胃內、胸膜內、肺內、直腸內、皮內、腹膜內、瘤內、皮下、局部、經皮、腦池內、鞘內、鼻內及肌肉內。在特定實施例中,方法包含向個體經口投予該抗體、抗原結合片段、多核苷酸、載體、宿主細胞或組成物。
調配根據本發明之某些實施例之醫藥組成物以使得含於其中之活性成分在向患者投予該組成物後為生物可用的。將投予至個體或患者之組成物可呈一或多個劑量單位之形式,其中例如錠劑可為單一劑量單位,且本文所述之呈氣霧劑形式之抗體或抗原結合的容器可容納多個劑量單位。製備此類劑型之實際方法對熟習此項技術者為已知的或將為顯而易見的;舉例而言,參見Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 第20版(Philadelphia College of Pharmacy and Science, 2000)。待投予之組成物將在任何情況下含有有效量之本揭露內容之抗體或抗原結合片段、多核苷酸、載體、宿主細胞或組成物,以根據本文中之教示治療感興趣的疾病或病狀。
組成物可呈固體或液體形式。在一些實施例中,一或多種載劑為微粒,以使得組成物例如呈錠劑或散劑形式。一或多種載劑可為液體,且組成物為例如口服油、可注射液體或適用於例如吸入投予之氣霧劑。當意欲經口投予時,醫藥組成物較佳呈固體或液體形式,其中半固體、半液體、懸浮液及凝膠形式包括在本文視為固體或液體之形式內。
作為用於經口投予之固體組成物,醫藥組成物可調配成散劑、顆粒、壓縮錠劑、丸劑、膠囊、口嚼錠、粉片或其類似物。此類固體組成物將通常含有一或多種惰性稀釋劑或可食載劑。另外,可存在以下中之一或多者:黏合劑,諸如羧甲基纖維素、乙基纖維素、微晶纖維素、黃蓍膠或明膠;賦形劑,諸如澱粉、乳糖或糊精;崩解劑,諸如海藻酸、海藻酸鈉、澱粉羥基乙酸鈉(Primogel)、玉米澱粉及其類似物;潤滑劑,諸如硬脂酸鎂或氫化植物油(Sterotex);助滑劑,諸如膠態二氧化矽;甜味劑,諸如蔗糖或糖精;調味劑,諸如胡椒薄荷、水楊酸甲酯或柑橘調味劑;及著色劑。當組成物呈例如明膠膠囊之膠囊形式時,除以上類型之材料之外,其亦可含有諸如聚乙二醇或油之液體載劑。
組成物可呈例如酏劑、糖漿、溶液、乳液或懸浮液之液體形式。舉二個例子而言,液體可用於經口投予或用於藉由注射遞送。當意欲用於經口投予時,除本發明化合物之外,較佳組成物亦含有甜味劑、防腐劑、染料/著色劑及增香劑中之一或多者。在意欲藉由注射投予之組成物中,可包括界面活性劑、防腐劑、濕潤劑、分散劑、懸浮劑、緩衝劑、穩定劑及等張劑中之一或多者。
液體醫藥組成物,無論其為溶液、懸浮液或其他類似形式,均可包括以下佐劑中之一或多者:無菌稀釋劑,諸如注射用水、鹽水溶液(較佳生理鹽水)、林格氏溶液(Ringer's solution)、等張氯化鈉、非揮發性油,諸如可充當溶劑或懸浮介質之合成單甘油酯或二甘油酯;聚乙二醇、甘油、丙二醇或其他溶劑;抗菌劑,諸如苯甲醇或對羥基苯甲酸甲酯;抗氧化劑,諸如抗壞血酸或亞硫酸氫鈉;螯合劑,諸如乙二胺四乙酸;緩衝劑,諸如乙酸酯、檸檬酸酯或磷酸酯;及張力調節劑,諸如氯化鈉或右旋糖。非經腸製劑可封裝於由玻璃或塑膠製成之安瓿、拋棄式注射器或多劑量小瓶中。生理鹽水係較佳佐劑。可注射醫藥組成物較佳地為無菌的。
意欲用於非經腸或經口投予之液體組成物應含有一定量之如本文所揭露之抗體或抗原結合片段以使得將獲得合適劑量。通常,此量為組成物中至少0.01%抗體或抗原結合片段。當意欲用於經口投予時,此量可變化為介於組成物重量的0.1%與約70%之間。某些口服醫藥組成物含有在約4%與約75%之間的抗體或抗原結合片段。在某些實施例中,製備根據本發明之醫藥組成物及製劑以使得非經腸劑量單位在稀釋之前含有在0.01重量%至10重量%之間的抗體或抗原結合片段。
組成物可意欲用於局部投予,在該情況下,載劑可適當地包含溶液、乳液、軟膏或凝膠基質。舉例而言,基質可包含以下中之一或多者:石蠟脂、羊毛蠟、聚乙二醇、蜂蠟、礦物油、諸如水及醇之稀釋劑及乳化劑以及穩定劑。增稠劑可存在於組成物中以用於局部投予。若意欲用於經皮投予,則組成物可包括經皮貼片或離子電滲療法(iontophoresis)裝置。醫藥組成物可意欲用於以例如栓劑形式經直腸投予,該栓劑將在直腸中熔融且釋放藥物。用於經直腸投予之組成物可含有油性基質作為適合之無刺激性賦形劑。此類基質包括但不限於羊毛蠟、可可脂及聚乙二醇。
組成物可包括各種材料,該等材料修改固體或液體劑量單位之物理形式。舉例而言,組成物可包括圍繞活性成分形成包覆殼層之材料。形成包覆殼層之材料通常為惰性的,且可選自例如糖、蟲膠及其他腸溶包覆劑。或者,活性成分可裝入明膠膠囊中。呈固體或液體形式之組成物可包括結合至本揭露內容之抗體或抗原結合片段且藉此幫助遞送化合物之藥劑。可起此能力作用之適合藥劑包括單株或多株抗體、一或多種蛋白質或脂質體。組成物可基本上由可以氣霧劑形式投予之劑量單位組成。術語氣霧劑用於表示介於膠態性質之彼等系統至由加壓封裝組成之系統範圍內的多種系統。遞送可藉由液化或壓縮氣體或藉由分配活性成分的適合之泵系統。氣霧劑可以單相、雙相或三相系統形式遞送以便遞送活性成分。氣霧劑之遞送包括必需容器、活化劑、閥門、次容器及其類似物,其在一起可形成套組。一般熟習此項技術者在不進行不當實驗之情況下可確定較佳氣霧劑。
應理解,本揭露內容之組成物亦涵蓋用於如本文所描述之多核苷酸的載劑分子(例如脂質奈米粒子、奈米尺度遞送平台及其類似物)。
醫藥組成物可藉由醫藥技術中熟知之方法製備。舉例而言,意欲藉由注射投予之組成物可藉由將包含如本文所述之抗體、其抗原結合片段或抗體結合物及任擇地,鹽、緩衝液及/或穩定劑中之一或多者的組成物與無菌蒸餾水組合以形成溶液來製備。可添加界面活性劑以促進形成均勻溶液或懸浮液。界面活性劑為與肽組成物非共價相互作用,以促進抗體或其抗原結合片段在水性遞送系統中之溶解或均勻懸浮的化合物。
一般而言,適當劑量及治療方案提供呈足以提供治療及/或預防效益(諸如本文所述,包括改進的臨床結果(例如,腹瀉或相關脫水或發炎之頻率、持續時間或嚴重程度降低,或更長的無疾病期及/或總存活期,或症狀嚴重程度減輕)之量的組成物。對於預防用途,劑量應足以預防與疾病或病症相關之疾病、延遲其發作或減輕其嚴重程度。根據本文所述之方法投予之組成物的預防效益可藉由進行臨床前(包括活體外及活體內動物研究)及臨床研究,且藉由適當的統計、生物學及臨床方法及技術分析自其得到的資料確定,其皆可藉由熟習此項技術者容易地實踐。
組成物以有效量投予(例如以治療乙型冠狀病毒感染),該有效量將視多種因素而變化,該等多種因素包括所採用之特定化合物之活性;化合物之代謝穩定性及作用時長;個體之年齡、體重、一般健康狀況、性別及飲食;投予模式及時間;排泄速率;藥物組合;特定病症或病狀之嚴重程度;及經受療法之個體。在某些實施例中,在根據本揭露內容之調配物及方法投予療法之後,與經安慰劑治療之個體或其他合適對照個體相比,測試個體將展現出與所治療之疾病或病症相關之一或多種症狀之約10%至約99%減少。
一般而言,抗體或抗原結合片段之治療有效日劑量為(對於70 kg哺乳動物)約0.001 mg/kg (亦即0.07 mg)至約100 mg/kg (亦即7.0 g);較佳地,治療有效劑量為(對於70 kg哺乳動物)約0.01 mg/kg (亦即0.7 mg)至約50 mg/kg (亦即3.5 g);更佳地,治療有效劑量為(對於70 kg哺乳動物)約1 mg/kg (亦即70 mg)至約25 mg/kg (亦即1.75 g)。本揭露內容之多核苷酸、載體、宿主細胞及相關組成物之治療有效劑量可不同於抗體或抗原結合片段之治療有效劑量。
在某些實施例中,一種方法包含向個體投予抗體、抗原結合片段、多核苷酸、載體、宿主細胞或組成物2、3、4、5、6、7、8、9、10次或更多次。
在某些實施例中,一種方法包含向個體投予抗體、抗原結合片段或組成物多次,其中第二次或連續投予係各別地在第一次或先前投予之後約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約24、約48、約74、約96小時或更長時間進行。
在某些實施例中,一種方法包含在個體經乙型冠狀病毒感染之前至少一次投予抗體、抗原結合片段、多核苷酸、載體、宿主細胞或組成物。
包含本揭露內容之抗體、抗原結合片段、多核苷酸、載體、宿主細胞或組成物的組成物亦可與一或多種其他治療劑投予同時、在其之前或在其之後投予。此類組合療法可包括投予含有本發明化合物及一或多種額外活性劑之單一醫藥劑型,以及投予包含本揭露內容之抗體或抗原結合片段及呈自身獨立劑型之各活性劑的組成物。舉例而言,如本文所描述之抗體或其抗原結合片段及其他活性劑可以諸如錠劑或膠囊之單一口服劑量組成物形式一同向患者投予,或各藥劑係以獨立口服劑量調配物形式投予。類似地,如本文所描述之抗體或抗原結合片段及其他活性劑可以諸如鹽水溶液或其他生理學上可接受之溶液之單一非經腸劑量組成物形式一同向個體投予,或各藥劑係以獨立非經腸劑量調配物形式投予。在使用獨立劑量調配物之情況下,包含抗體或抗原結合片段及一或多種額外活性劑之組成物可基本上同時,亦即並行地投予,或在單獨地交錯時間,亦即依序及按任何次序投予;組合療法應理解為包括所有此等方案。
在某些實施例中,提供一種組合療法,其包含一或多種本揭露內容之抗乙型冠狀病毒抗體(或一或多種核酸、宿主細胞、載體或組成物)及一或多種抗炎劑及/或一或多種抗病毒劑。在特定實施例中,該一或多種抗炎劑包含皮質類固醇,諸如例如地塞米松、普賴松或其類似物。在一些實施例中,一或多種抗炎劑包含細胞介素拮抗劑,諸如例如結合至IL6 (諸如司妥昔單抗(siltuximab)),或結合至IL-6R (諸如托珠單抗(tocilizumab)),或結合至IL-1β、IL-7、IL-8、IL-9、IL-10、FGF、G-CSF、GM-CSF、IFN-γ、IP-10、MCP-1、MIP-1A、MIP1-B、PDGR、TNF-α或VEGF之抗體。在一些實施例中,使用抗炎劑,諸如勒隆利單抗(leronlimab)、盧利替尼(ruxolitinib)及/或阿那白滯素(anakinra)。在一些實施例中,一或多種抗病毒劑包含核苷酸類似物或核苷酸類似物前藥,諸如例如瑞德西韋(remdesivir)、索非布韋(sofosbuvir)、無環鳥苷(acyclovir)及齊多夫定(zidovudine)。在特定實施例中,抗病毒劑包含咯匹那韋(lopinavir)、利托那韋(ritonavir)、法維拉韋(favipiravir)或其任何組合。用於本揭露內容之組合療法的其他抗炎劑包括非類固醇抗炎藥(NSAIDS)。應瞭解,在此類組合療法中,一或多個抗體(或一或多種核酸、宿主細胞、載體或組成物)及一或多種抗炎劑及/或一或多種抗病毒劑可以任何次序及任何順序或一起投予。
在一些實施例中,向先前已接受一或多種抗炎劑及/或一或多種抗病毒劑之個體投予抗體(或一或多種核酸、宿主細胞、載體或組成物)。在一些實施例中,向先前已接受抗體(或一或多種核酸、宿主細胞、載體或組成物)之個體投予一或多種抗炎劑及/或一或多種抗病毒劑。
在某些實施例中,提供一種組合療法,其包含二種或更多種本揭露內容之抗乙型冠狀病毒抗體。一種方法可包含向已接受第二抗體之個體投予第一抗體,或可包含一起投予二個或更多個抗體。舉例而言,在特定實施例中,提供一種方法,其包含向個體投予(a)第一抗體或抗原結合片段,當該個體已接受第二抗體或抗原結合片段時;(b)第二抗體或抗原結合片段,當該個體已接受第一抗體或抗原結合片段時;或(c)第一抗體或抗原結合片段,及第二抗體或抗原結合片段。
在一相關態樣中,提供本發明所揭露之抗體、抗原結合片段、載體、宿主細胞及組成物之用途。
在某些實施例中,提供一種抗體、抗原結合片段、多核苷酸、載體、宿主細胞或組成物,其用於治療個體之乙型冠狀病毒感染的方法中。
在某些實施例中,提供一種抗體、抗原結合片段或組成物,其用於製造或製備供治療個體之乙型冠狀病毒感染用之藥劑的方法中。
除非另外規定,否則任何給定變體抗體(諸如S2P6 Q32Y)之VH、CDRH1、CDRH2、CDRH3、Vl、CDRL1、CDRL2或CDRL3與命名抗體(諸如S2P6)相同,除非表1中另外指明。 表1.序列
序列描述 SEQ ID NO. 序列
SARS-CoV-2 BetaCoV/Wuhan-Hu-1/2019分離株;基因體序列(GenBank: MN908947.3;2020年1月23日) 1 attaaaggtt tataccttcc caggtaacaa accaaccaac tttcgatctc ttgtagatct gttctctaaa cgaactttaa aatctgtgtg gctgtcactc ggctgcatgc ttagtgcact cacgcagtat aattaataac taattactgt cgttgacagg acacgagtaa ctcgtctatc ttctgcaggc tgcttacggt ttcgtccgtg ttgcagccga tcatcagcac atctaggttt cgtccgggtg tgaccgaaag gtaagatgga gagccttgtc cctggtttca acgagaaaac acacgtccaa ctcagtttgc ctgttttaca ggttcgcgac gtgctcgtac gtggctttgg agactccgtg gaggaggtct tatcagaggc cgtcaacat cttaaagatg gcacttgtgg cttagtagaa gttgaaaaag gcgttttgcc tcaacttgaa cagccctatg tgttcatcaa acgttcggat gctcgaactg cacctcatgg tcatgttatg gttgagctgg tagcagaact cgaaggcatt cagtacggtc gtagtggtga gacacttggt gtccttgtcc ctcatgtggg cgaaatacca gtggcttacc gcaaggttct tcttcgtaag  aacggtaata aaggagctgg tggccatagt tacggcgccg atctaaagtc atttgactta ggcgacgagc ttggcactga tccttatgaa gattttcaag aaaactggaa cactaaacat agcagtggtg ttacccgtga actcatgcgt gagcttaacg gaggggcata cactcgctat gtcgataaca 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cggaagagac aggtacgtta atagttaata gcgtacttct ttttcttgct ttcgtggtat tcttgctagt tacactagcc atccttactg cgcttcgatt gtgtgcgtac tgctgcaata ttgttaacgt gagtcttgta aaaccttctt tttacgttta ctctcgtgtt aaaaatctga attcttctag agttcctgat cttctggtct aaacgaacta aatattatat tagtttttct gtttggaact ttaattttag ccatggcaga ttccaacggt actattaccg ttgaagagct taaaaagctc cttgaacaat ggaacctagt aataggtttc ctattcctta catggatttg tcttctacaa tttgcctatg ccaacaggaa taggtttttg tatataatta agttaatttt cctctggctg ttatggccag taactttagc ttgttttgtg cttgctgctg tttacagaat aaattggatc accggtggaa ttgctatcgc aatggcttgt cttgtaggct tgatgtggct cagctacttc attgcttctt tcagactgtt tgcgcgtacg cgttccatgt ggtcattcaa tccagaaact aacattcttc tcaacgtgcc actccatggc actattctga ccagaccgct tctagaaagt gaactcgtaa tcggagctgt gatccttcgt ggacatcttc gtattgctgg acaccatcta ggacgctgtg acatcaagga cctgcctaaa gaaatcactg ttgctacatc acgaacgctt tcttattaca aattgggagc ttcgcagcgt gtagcaggtg actcaggttt tgctgcatac agtcgctaca ggattggcaa ctataaatta aacacagacc attccagtag cagtgacaat 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SARS-CoV-2 Wuhan-Hu-1分離株基因體序列(GenBank: MN908947.3;2020年1月23日) -胺基酸轉譯 2 MESLVPGFNEKTHVQLSLPVLQVRDVLVRGFGDSVEEVLSEARQHLKDGTCGLVEVEKGVLPQLEQPYVFIKRSDARTAPHGHVMVELVAELEGIQYGRSGETLGVLVPHVGEIPVAYRKVLLRKNGNKGAGGHSYGADLKSFDLGDELGTDPYEDFQEN                  WNTKHSSGVTRELMRELNGGAYTRYVDNNFCGPDGYPLECIKDLLARAGKASCTLSEQLDFIDTKRGVYCCREHEHEIAWYTERSEKSYELQTPFEIKLAKKFDTFNGECPNFVFPLNSIIKTIQPRVEKKKLDGFMGRIRSVYPVASPNECNQMCLSTLMKCDHCGETSWQTGDFVKATCEFCGTENLTKEGATTCGYLPQNAVVKIYCPACHNSEVGPEHSLAEYHNESGLKTILRKGGRTIAFGGCVFSYVGCHNKCAYWVPRASANIGCNHTGVVGEGSEGLNDNL 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SARS-CoV-2 Wuhan Hu-1表面醣蛋白;GenBank: QHD43416.1;2020年1月23日 3 MFVFLVLLPL VSSQCVNLTT RTQLPPAYTN SFTRGVYYPD KVFRSSVLHS TQDLFLPFFS NVTWFHAIHV SGTNGTKRFD NPVLPFNDGV YFASTEKSNI IRGWIFGTTL DSKTQSLLIV NNATNVVIKV CEFQFCNDPF LGVYYHKNNK SWMESEFRVY SSANNCTFEY GKQGNFKNLR EFVFKNIDGY FKIYSKHTPI NLVRDLPQGF SALEPLVDLP IGINITRFQT LLALHRSYLT PGDSSSGWTA GAAAYYVGYL QPRTFLLKYN ENGTITDAVD CALDPLSETK CTLKSFTVEK GIYQTSNFRV QPTESIVRFP NITNLCPFGE VFNATRFASV YAWNRKRISN CVADYSVLYN SASFSTFKCY GVSPTKLNDL CFTNVYADSF VIRGDEVRQI APGQTGKIAD YNYKLPDDFT GCVIAWNSNN LDSKVGGNYN YLYRLFRKSN LKPFERDIST EIYQAGSTPC NGVEGFNCYF PLQSYGFQPT NGVGYQPYRV VVLSFELLHA PATVCGPKKS TNLVKNKCVN FNFNGLTGTG VLTESNKKFL PFQQFGRDIA DTTDAVRDPQ TLEILDITPC SFGGVSVITP GTNTSNQVAV LYQDVNCTEV PVAIHADQLT PTWRVYSTGS NVFQTRAGCL IGAEHVNNSY ECDIPIGAGI CASYQTQTNS PRRARSVASQ SIIAYTMSLG AENSVAYSNN SIAIPTNFTI SVTTEILPVS MTKTSVDCTM YICGDSTECS NLLLQYGSFC TQLNRALTGI AVEQDKNTQE VFAQVKQIYK TPPIKDFGGF NFSQILPDPS KPSKRSFIED LLFNKVTLAD AGFIKQYGDC LGDIAARDLI CAQKFNGLTV LPPLLTDEMI AQYTSALLAG TITSGWTFGA GAALQIPFAM QMAYRFNGIG VTQNVLYENQ KLIANQFNSA IGKIQDSLSS TASALGKLQD VVNQNAQALN TLVKQLSSNF GAISSVLNDI LSRLDKVEAE VQIDRLITGR LQSLQTYVTQ QLIRAAEIRA SANLAATKMS ECVLGQSKRV DFCGKGYHLM SFPQSAPHGV VFLHVTYVPA QEKNFTTAPA ICHDGKAHFP REGVFVSNGT HWFVTQRNFY EPQIITTDNT FVSGNCDVVI GIVNNTVYDP LQPELDSFKE ELDKYFKNHT SPDVDLGDIS GINASVVNIQ KEIDRLNEVA KNLNESLIDL QELGKYEQYI KWPWYIWLGF IAGLIAIVMV TIMLCCMTSC CSCLKGCCSC GSCCKFDEDD SEPVLKGVKL HYT
SARS-CoV-2 Wuhan Hu-1表面醣蛋白RBD;GenBank: QHD43416.1;2020年1月23日 4 NITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTG
SARS-CoV-2 Wuhan Hu-1表面醣蛋白RBD中之受體結合模體(RBM);GenBank: QHD43416.1;2020年1月23日 5 NSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPY
SARS-CoV-2 CH1-CH3 LS G1m17 IgHG1*01 (aa) 6 ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVLHEALHSHYTQKSLSLSPGK   
SARS-CoV-2 CH1-CH3 LS,ALE G1m17 IgHG1*01 (aa) 7 ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLAGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPLPEEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVLHEALHSHYTQKSLSLSPGK   
SARS-CoV-2 CL IgLC*01 (aa) 8 GQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS   
SARS-CoV-2 CL (CK) k1m3 IgKC*01 (aa) 9 RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC   
連接子(aa) 10 GSTSGSGKPGSGEGSTKG
連接子(aa) 11 GSGKPGSGEG
連接子(aa) 12 GKPGSGEG
連接子(aa) 13 SGKPGSGE
連接子(aa) 14 BPXXXZ,其中各X獨立地為甘胺酸(G)或絲胺酸(S),B為帶正電胺基酸且Z為甘胺酸(G)或帶負電胺基酸
連接子(aa) 15 (GxS)y,其中x為1-10且y為1-10
連接子(aa) 16 GGGGSGGGGSGGGGS
連接子(aa) 17 GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS
連接子(aa) 18 GSTSGGGSGGGSGGGGSS
連接子(aa) 19 EGKSSGSGSESKVD
連接子(aa) 20 KESGSVSSEQLAQFRSLD
連接子(aa) 21 GGGGS
SARS-CoV;Urbani病毒株;表面醣蛋白;GenBank:AAP13441.1 22 MFIFLLFLTL TSGSDLDRCT TFDDVQAPNY TQHTSSMRGV YYPDEIFRSD TLYLTQDLFL PFYSNVTGFH TINHTFGNPV IPFKDGIYFA ATEKSNVVRG WVFGSTMNNK SQSVIIINNS TNVVIRACNF ELCDNPFFAV SKPMGTQTHT MIFDNAFNCT FEYISDAFSL DVSEKSGNFK HLREFVFKNK DGFLYVYKGY QPIDVVRDLP SGFNTLKPIF KLPLGINITN FRAILTAFSP AQDIWGTSAA AYFVGYLKPT TFMLKYDENG TITDAVDCSQ NPLAELKCSV KSFEIDKGIY QTSNFRVVPS GDVVRFPNIT NLCPFGEVFN ATKFPSVYAW ERKKISNCVA DYSVLYNSTF FSTFKCYGVS ATKLNDLCFS NVYADSFVVK GDDVRQIAPG QTGVIADYNY KLPDDFMGCV LAWNTRNIDA TSTGNYNYKY RYLRHGKLRP FERDISNVPF SPDGKPCTPP ALNCYWPLND YGFYTTTGIG YQPYRVVVLS FELLNAPATV CGPKLSTDLI KNQCVNFNFN GLTGTGVLTP SSKRFQPFQQ FGRDVSDFTD SVRDPKTSEI LDISPCSFGG VSVITPGTNA SSEVAVLYQD VNCTDVSTAI HADQLTPAWR IYSTGNNVFQ TQAGCLIGAE HVDTSYECDI PIGAGICASY HTVSLLRSTS QKSIVAYTMS LGADSSIAYS NNTIAIPTNF SISITTEVMP VSMAKTSVDC NMYICGDSTE CANLLLQYGS FCTQLNRALS GIAAEQDRNT REVFAQVKQM YKTPTLKYFG GFNFSQILPD PLKPTKRSFI EDLLFNKVTL ADAGFMKQYG ECLGDINARD LICAQKFNGL TVLPPLLTDD MIAAYTAALV SGTATAGWTF GAGAALQIPF AMQMAYRFNG IGVTQNVLYE NQKQIANQFN KAISQIQESL TTTSTALGKL QDVVNQNAQA LNTLVKQLSS NFGAISSVLN DILSRLDKVE AEVQIDRLIT GRLQSLQTYV TQQLIRAAEI RASANLAATK MSECVLGQSK RVDFCGKGYH LMSFPQAAPH GVVFLHVTYV PSQERNFTTA PAICHEGKAY FPREGVFVFN GTSWFITQRN FFSPQIITTD NTFVSGNCDV VIGIINNTVY DPLQPELDSF KEELDKYFKN HTSPDVDLGD ISGINASVVN IQKEIDRLNE VAKNLNESLI DLQELGKYEQ YIKWPWYVWL GFIAGLIAIV MVTILLCCMT SCCSCLKGAC SCGSCCKFDE DDSEPVLKGV KLHYT
OC43表面醣蛋白;GenBank: AAT84362.1 23 MFLILLISLPTAFAVIGDLKCTSDNINDKDTGPPPISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLFLNGYYPTSGSTYRNMALKGSVLLSRLWFKPPFLSDFINGIFAKVKNTKVIKDRVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPRTINSTQDGDNKLQGLLEVSVCQYNMCEYPQTICHPNLGNHRKELWHLDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGMALSHYYVMPLTCNSKLTLEYWVTPLTSRQYLLAFNQDGIIFNAVDCMSDFMSEIKCKTQSIAPPTGVYELNGYTVQPIADVYRRKPNLPNCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNKRFGFIEDSVFKPRPAGVLTNHDVVYAQHCFKAPKNFCPCKLNGSCVGSGPGKNNGIGTCPAGTNYLTCDNLCTPDPITFTGTYKCPQTKSLVGIGEHCSGLAVKSDYCGGNSCTCRPQAFLGWSADSCLQGDKCNIFANFILHDVNSGLTCSTDLQKANTDIILGVCVNYDLYGILGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYITNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNSLTRQLQPINYFDSYLGCVVNAYNSTAISVQTCDLTVGSGYCVDYSKNRRSRGAITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMVEFIQTSSPKVTIDCAAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSECSKASSRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYKGIKVLPPLLSENQFSGYTLAATSASLFPPWTAAAGVPFYLNVQYRINGLGVTMDVLSQNQKLIANAFNNALYAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISASLQEILSRLDALEAEAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTARVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMYTGSGYYYPEPITENNVVVMSTCAVNYTKAPYVMLNTSIPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQVEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLICLAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGYQELVIKTSHDD
MERS-CoV;London1/2012病毒株表面醣蛋白;GenBank: KC164505 24 MIHSVFLLMFLLTPTESYVDVGPDSVKSACIEVDIQQTFFDKTWPRPIDVSKADGIIYPQGRTYSNITITYQGLFPYQGDHGDMYVYSAGHATGTTPQKLFVANYSQDVKQFANGFVVRIGAAANSTGTVIISPSTSATIRKIYPAFMLGSSVGNFSDGKMGRFFNHTLVLLPDGCGTLLRAFYCILEPRSGNHCPAGNSYTSFATYHTPATDCSDGNYNRNASLNSFKEYFNLRNCTFMYTYNITEDEILEWFGITQTAQGVHLFSSRYVDLYGGNMFQFATLPVYDTIKYYSIIPHSIRSIQSDRKAWAAFYVYKLQPLTFLLDFSVDGYIRRAIDCGFNDLSQLHCSYESFDVESGVYSVSSFEAKPSGSVVEQAEGVECDFSPLLSGTPPQVYNFKRLVFTNCNYNLTKLLSLFSVNDFTCSQISPAAIASNCYSSLILDYFSYPLSMKSDLSVSSAGPISQFNYKQSFSNPTCLILATVPHNLTTITKPLKYSYINKCSRFLSDDRTEVPQLVNANQYSPCVSIVPSTVWEDGDYYRKQLSPLEGGGWLVASGSTVAMTEQLQMGFGITVQYGTDTNSVCPKLEFANDTKIASQLGNCVEYSLYGVSGRGVFQNCTAVGVRQQRFVYDAYQNLVGYYSDDGNYYCLRACVSVPVSVIYDKETKTHATLFGSVACEHISSTMSQYSRSTRSMLKRRDSTYGPLQTPVGCVLGLVNSSLFVEDCKLPLGQSLCALPDTPSTLTPRSVRSVPGEMRLASIAFNHPIQVDQLNSSYFKLSIPTNFSFGVTQEYIQTTIQKVTVDCKQYVCNGFQKCEQLLREYGQFCSKINQALHGANLRQDDSVRNLFASVKSSQSSPIIPGFGGDFNLTLLEPVSISTGSRSARSAIEDLLFDKVTIADPGYMQGYDDCMQQGPASARDLICAQYVAGYKVLPPLMDVNMEAAYTSSLLGSIAGVGWTAGLSSFAAIPFAQSIFYRLNGVGITQQVLSENQKLIANKFNQALGAMQTGFTTTNEAFHKVQDAVNNNAQALSKLASELSNTFGAISASIGDIIQRLDVLEQDAQIDRLINGRLTTLNAFVAQQLVRSESAALSAQLAKDKVNECVKAQSKRSGFCGQGTHIVSFVVNAPNGLYFMHVGYYPSNHIEVVSAYGLCDAANPTNCIAPVNGYFIKTNNTRIVDEWSYTGSSFYAPEPITSLNTKYVAPQVTYQNISTNLPPPLLGNSTGIDFQDELDEFFKNVSTSIPNFGSLTQINTTLLDLTYEMLSLQQVVKALNESYIDLKELGNYTYYNKWPWYIWLGFIAGLVALALCVFFILCC        TGCGTNCMGKLKCNRCCDRYEEYDLEPHKVHVH
HKU1表面醣蛋白;GenBank: YP173238.1 25 MLLIIFILPTTLAVIGDFNCTNFAINDLNTTVPRISEYVVDVSYGLGTYYILDRVYLNTTILFTGYFPKSGANFRDLSLKGTTYLSTLWYQKPFLSDFNNGIFSRVKNTKLYVNKTLYSEFSTIVIGSVFINNSYTIVVQPHNGVLEITACQYTMCEYPHTICKSKGSSRNESWHFDKSEPLCLFKKNFTYNVSTDWLYFHFYQERGTFYAYYADSGMPTTFLFSLYLGTLLSHYYVLPLTCNAISSNTDNETLQYWVTPLSKRQYLLKFDNRGVITNAVDCSSSFFSEIQCKTKSLLPNTGVYDLSGFTVKPVATVHRRIPDLPDCDIDKWLNNFNVPSPLNWERKIFSNCNFNLSTLLRLVHTDSFSCNNFDESKIYGSCFKSIVLDKFAIPNSRRSDLQLGSSGFLQSSNYKIDTTSSSCQLYYSLPAINVTINNYNPSSWNRRYGFNNFNLSSHSVVYSRYCFSVNNTFCPCAKPSFASSCKSHKPPSASCPIGTNYRSCESTTVLDHTDWCRCSCLPDPITAYDPRSCSQKKSLVGVGEHCAGFGVDEEKCGVLDGSYNVSCLCSTDAFLGWSYDTCVSNNRCNIFSNFILNGINSGTTCSNDLLQPNTEVFTDVCVDYDLYGITGQGIFKEVSAVYYNSWQNLLYDSNGNIIGFKDFVTNKTYNIFPCYAGRVSAAFHQNASSLALLYRNLKCSYVLNNISLTTQPYFDSYLGCVFNADNLTDYSVSSCALRMGSGFCVDYNSPSSSSSRRKRRSISASYRFVTFEPFNVSFVNDSIESVGGLYEIKIPTNFTIVGQEEFIQTNSPKVTIDCSLFVCSNYAACHDLLSEYGTFCDNINSILDEVNGLLDTTQLHVADTLMQGVTLSSNLNTNLHFDVDNINFKSLVGCLGPHCGSSSRSFFEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGSEIRDLLCVQSFNGIKVLPPILSESQISGYTTAATVAAMFPPWSAAAGIPFSLNVQYRINGLGVTMDVLNKNQKLIATAFNNALLSIQNGFSATNSALAKIQSVVNSNAQALNSLLQQLFNKFGAISSSLQEILSRLDALEAQVQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDISLVKFGAALAMEKVNECVKSQSPRINFCGNGNHILSLVQNAPYGLLFMHFSYKPISFKTVLVSPGLCISGDVGIAPKQGYFIKHNDHWMFTGSSYYYPEPISDKNVVFMNTCSVNFTKAPLVYLNHSVPKLSDFESELSHWFKNQTSIAPNLTLNLHTINATFLDLYYEMNLIQESIKSLNNSYINLKDIGTYEMYVKWPWYVWLLISFSFIIFLVLLFFICCCTGCGSACFSKCHNCCDEYGGHHDFVIKTSHDD
抗體420_1_1 (稱為S2P6) VH (aa) 26 EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYTFTSQYMHWVRQAPGQGLEWIGI INPSGVHTSYAQKFQGRVTLTRDTSTSTLYMELSSLRSEDTAVYYC ARGSPKGAFDYWGQGTLVTVSS
抗體420_1_1 (稱為S2P6) CDRH1 (aa) 27 GYTFTSQY
抗體420_1_1 (稱為S2P6) CDRH2 (aa) 28 INPSGVHT
抗體420_1_1 (稱為S2P6) CDRH3 (aa) 29 ARGSPKGAFDY
抗體420_1_1 (稱為S2P6) VL(VK) (aa) 30 EIVMMQSPGTLSLSPGERATLSCRAS QSVRSNYLAWYQQKPGQAPRLLIY GASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYGSSPPRFTFGPGTKVEIK
抗體420_1_1 (稱為S2P6) CDRL1 (aa) 31 QSVRSNY
抗體420_1_1  (稱為S2P6) CDRL2 (aa) 32 GAS
抗體420_1_1 (稱為S2P6) CDRL3 (aa) 33 QQYGSSPPRFT
抗體420_1_1 (稱為S2P6) VH (nt) 34 GAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGGGCTGAGGTGAAGAAGCCTGGGGCCTCAGTGAAGGTTTCCTGCAAGGCATCTGGATACACCTTCACCAGCCAATATATGCACTGGGTGCGACAGGCCCCTGGACAAGGGCTTGAGTGGATAGGAATAATCAACCCTAGTGGTGTTCACACAAGTTACGCACAGAAATTCCAGGGCAGAGTCACCCTGACCAGGGACACGTCCACGAGCACACTATACATGGAACTGAGCAGCCTGAGATCTGAAGACACGGCCGTGTATTACTGTGCGAGAGGGTCTCCCAAAGGGGCCTTTGACTACTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTCTCCTCAG
抗體420_1_1 (稱為S2P6) VL(VK) (nt) 35 GAAATAGTGATGATGCAGTCTCCAGGCACCCTGTCTTTGTCTCCAGGGGAAAGAGCCACCCTCTCCTGCAGGGCCAGTCAGAGTGTTAGAAGCAACTACTTAGCCTGGTACCAGCAGAAACCTGGCCAGGCTCCCAGACTCCTCATCTATGGTGCATCCAGCAGGGCCACTGGCATCCCAGACAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACTCTCACCATCAGCAGACTGGAGCCTGAAGATTTTGCAGTGTATTACTGTCAGCAGTATGGTAGTTCACCCCCCAGATTCACTTTCGGCCCTGGGACCAAAGTGGAAATCAAAC
抗體420_1_2 (稱為S2S8) VH (aa) 36 EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAAS GFTFSDYGMHWVRQAPGKGLEWVAV ISFEGRNEYFADSVKGRFAISRDNSKNTVSLHMNSLRVEDTAVYYC ARDAGYDLIRFFLDSWGQGTRVTVSS
抗體420_1_2 (稱為S2S8) CDRH1 (aa) 37 GFTFSDYG
抗體420_1_2 (稱為S2S8) CDRH2 (aa) 38 ISFEGRNE
抗體420_1_2 (稱為S2S8) CDRH3 (aa) 39 ARDAGYDLIRFFLDS
抗體420_1_2 (稱為S2S8) VL(VK) (aa) 40 EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRAS QRIGSTSLAWYQQKPGQAPRLLIY AASTRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYHSSPLLTFGGGTKVDIK
抗體420_1_2 (稱為S2S8) CDRL1 (aa) 41 QRIGSTS
抗體420_1_2 (稱為S2S8) CDRL2 (aa) 42 AAS
抗體420_1_2 (稱為S2S8) CDRL3 (aa) 43 QQYHSSPLLT
抗體420_1_2 (稱為S2S8) VH (nt) 44 GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCGTGGTCCAGCCTGGGAGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCGTCTGGATTCACCTTCAGTGACTACGGCATGCACTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGCAAGGGGCTGGAGTGGGTGGCAGTTATATCATTTGAAGGAAGAAATGAATATTTTGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCGCCATCTCCAGAGACAATTCCAAGAACACGGTGTCTCTGCACATGAACAGCCTGAGAGTTGAGGATACGGCTGTGTATTACTGTGCGAGAGATGCTGGCTACGATTTGATCCGGTTCTTCCTTGACTCCTGGGGCCAGGGAACGCGGGTCACCGTCTCCTCAG
抗體420_1_2 (稱為S2S8) VL(VK) (nt) 45 GAAATTGTGTTGACACAGTCTCCAGGCACCCTGTCTTTGTCTCCAGGGGAAAGAGCCACCCTCTCCTGCAGGGCCAGTCAGAGAATTGGCAGCACCTCCTTAGCCTGGTACCAGCAGAAACCTGGCCAGGCTCCCAGGCTCCTCATCTATGCTGCATCCACCAGGGCCACTGGCATCCCAGACAGATTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACTCTCACCATCAGCAGACTGGAGCCTGAAGATTTTGCAGTCTATTACTGTCAGCAGTATCATTCTTCACCCCTGCTCACTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGATATCAAAC
乙型冠狀病毒部分S蛋白序列(aa) 46 FX 1X 2ELX 3X 4X 5FKNX 6X 7X 8X 9X 10X 11X 12X 13X 14,其中:X 1為K、E或Q;X 2為E、S或D;X 3為D或S;X 4為K、Q、H或E;X 5為Y、W或F;X 6為H、Q或V;X 7為T或S;X 8為S、L或T;X 9為P、V、L或S;X 10為D、A、P或I;X 11為V或P;X 12為D或N;X 13為L或F;且X 14為G、S或T   
抗體S2S43 VH (aa) 47 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYTFTNYYMHWVRQAPGQGLEWMGI INRSGGSTIYAQRFQGRVTMTRDTSTSIVYMELSSLRSDDTAVYYC ARGGSHGMDVWGQGTTVTVSS
抗體S2S43 CDRH1 (aa) 48 GYTFTNYY
抗體S2S43 CDRH2 (aa) 49 INRSGGST
抗體S2S43 CDRH3 (aa) 50 ARGGSHGMDV
抗體S2S43 VL (aa) 51 QSVLTQPPSVSAAPGQKVTISCSGS TSNIGNNYVSWYQQLPGTAPRLLIF ENNKRPSGIPDRISGSKSGTSATLGITGLQTGDEADYYC GTWDSSLSACVFGTGTKVTVL
抗體S2S43 CDRL1 (aa) 52 TSNIGNNY
抗體S2S43 CDRL2 (aa) 53 ENN
抗體S2S43 CDRL3 (aa) 54 GTWDSSLSACV
抗體S2S43 VH (nt) 55 CAGGTCCAGCTGGTGCAGTCTGGGGCTGAGGTGAAGAAGCCTGGGGCCTCAGTGAAGGTATCCTGCAAGGCATCT GGATACACCTTCACCAATTATTATATGCACTGGGTGCGACAGGCCCCTGGACAAGGGCTTGAGTGGATGGGAATA ATCAACCGTAGTGGTGGTAGCACAATCTACGCACAGAGGTTCCAGGGCAGAGTCACCATGACCAGGGACACGTCCACGAGCATAGTCTACATGGAGCTGAGCAGCCTGAGATCTGACGACACGGCCGTGTATTACTGT GCGAGAGGTGGATCCCACGGTATGGACGTCTGGGGCCAAGGGACCACGGTCACCGTCTCCTCA
抗體S2S43 VL (nt) 56 CAGTCTGTGCTGACGCAGCCGCCCTCAGTGTCTGCGGCCCCAGGACAGAAGGTCACCATCTCCTGCTCTGGAAGC ACCTCCAACATTGGGAATAATTATGTATCCTGGTACCAGCAGCTCCCAGGAACAGCCCCCAGACTCCTCATCTTT GAAAATAATAAGCGACCCTCAGGGATTCCTGACCGTATCTCTGGCTCCAAGTCTGGCACGTCAGCCACCCTGGGCATCACCGGACTCCAGACTGGGGACGAGGCCGATTATTACTGC GGAACATGGGATAGCAGCCTGAGTGCCTGTGTCTTCGGAACTGGGACCAAGGTCACCGTCCTAG
SARS-CoV-2 S蛋白及SARS-CoV S蛋白肽 57 FK EELDK YF
MERS-CoV S蛋白肽 58 GID FQ DELDE FFK
HCoV-OC43 S蛋白肽 59 DF KEELDQ WFK
SARS-CoV-2 S蛋白及SARS-CoV S蛋白肽 60 K RSFIEDLLFN
MERS-CoV S蛋白肽 61 A RSAIEDLLFD
HCoV-OC43 S蛋白肽 62 S RSAIEDLLFD
HCoV-HKU1 S蛋白肽 63 RSFFEDLLF
HCoV-NL63 S蛋白肽 64 RSALEDLLFSK
HCoV-229E S蛋白肽 65 G RSAIEDILFS
抗體S2P6 UCA VH (aa) 66 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYTFTSYYMHWVRQAPGQGLEWMGI INPSGGSTSYAQKFQGRVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYC ARGSPKGAFDYWGQGTLVTVSS
抗體S2P6 UCA CDRH1 (aa) 67 GYTFTSYY
抗體S2P6 UCA CDRH2 (aa) 68 INPSGGST
抗體S2P6 UCA VL(VK) (aa) 69 EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRAS QSVSSSYLAWYQQKPGQAPRLLIY GASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYGSSPPRFTFGPGTKVDIK   
抗體S2P6 UCA CDRL1 (aa) 70 QSVSSSY
抗體S2P6 Q32Y VH (aa) 71 EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYTFTSYYMHWVRQAPGQGLEWIGI INPSGVHTSYAQKFQGRVTLTRDTSTSTLYMELSSLRSEDTAVYYC ARGSPKGAFDYWGQGTLVTVSS
抗體S2P6 V56G H57S VH (aa) 72 EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYTFTSQYMHWVRQAPGQGLEWIGI INPSGGSTSYAQKFQGRVTLTRDTSTSTLYMELSSLRSEDTAVYYC ARGSPKGAFDYWGQGTLVTVSS
抗體S2P6 G103V VH (aa) 73 EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYTFTSQYMHWVRQAPGQGLEWIGI INPSGVHTSYAQKFQGRVTLTRDTSTSTLYMELSSLRSEDTAVYYC ARGSPKVAFDYWGQGTLVTVSS
抗體S2P6 G103V CDRH3 (aa) 74 ARGSPKVAFDY
抗體S2P6 R30S VL(VK) (aa) 75 EIVMMQSPGTLSLSPGERATLSCRAS QSVSSNYLAWYQQKPGQAPRLLIY GASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYGSSPPRFTFGPGTKVEIK
抗體S2P6 R30S CDRL1 (aa) 76 QSVSSNY
抗體S2P6 N32S VL(VK) (aa) 77 EIVMMQSPGTLSLSPGERATLSCRAS QSVRSSYLAWYQQKPGQAPRLLIY GASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYGSSPPRFTFGPGTKVEIK
抗體S2P6 N32S CDRL1 (aa) 78 QSVRSSY
抗體S2S43 UCA VH (aa) 79 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYTFTSYYMHWVRQAPGQGLEWMGI INPSGGSTSYAQKFQGRVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYC ARGGSHGMDVWGQGTTVTVSS
抗體S2S43 UCA CDRH1 (aa) 80 GYTFTSYY
抗體S2S43 UCA CDRH2 (aa) 81 INPSGGST
抗體S2S43 UCA VL (aa) 82 QSVLTQPPSVSAAPGQKVTISCSGS SSNIGNNYVSWYQQLPGTAPKLLIY ENNKRPSGIPDRFSGSKSGTSATLGITGLQTGDEADYYC GTWDSSLSACVFGTGTKVTVL
抗體S2S43 UCA CDRL1 (aa) 83 SSNIGNNY
乙型冠狀病毒莖螺旋肽模體 84 X 1X 2FX 3X 4ELDX 5YF,其中    X 1為任何胺基酸,且較佳不為A、I、Y、N、K、H、E或C,且最佳為D;    X 2為任何胺基酸,且較佳不為A、V、L、I、F、Y、W、N、K、R、H、E、C或P,且較佳為S;    X 3為K、D、R或S,且較佳為K;    X 4為E、D、Q、N、S或M,且較佳為E;且    X 5為除P外的任何胺基酸,且較佳為K   
SARS-CoV-2 S309 mAb VH (aa) 85 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYPFTSYGISWVRQAPGQGLEWMGW ISTYNGNTNYAQKFQGRVTMTTDTSTTTGYMELRRLRSDDTAVYYC ARDYTRGAWFGESLIGGFDNWGQGTLVTVSS
SARS-CoV-2 S309 mAb CDRH1 (aa) 86 GYPFTSYG
SARS-CoV-2 S309 mAb CDRH2 (aa) 87 ISTYNGNT
SARS-CoV-2 S309 mAb CDRH3 (aa) 88 ARDYTRGAWFGESLIGGFDN
SARS-CoV-2 S309 mAb VL (aa) 89 EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRAS QTVSSTSLAWYQQKPGQAPRLLIY GASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQHDTSLTFGGGTKVEIK
SARS-CoV-2 S309 mAb CDRL1 (aa) 90 QTVSSTS
SARS-CoV-2 S309 mAb CDRL2 (aa) 91 GAS
SARS-CoV-2 S309 mAb CDRL3 (aa) 92 QQHDTSLT
SARS-CoV-2 S309 N55Q mAb VH (aa) 93 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYPFTSYGISWVRQAPGQGLEWMGW ISTYQGNTNYAQKFQGRVTMTTDTSTTTGYMELRRLRSDDTAVYYC ARDYTRGAWFGESLIGGFDNWGQGTLVTVSS
SARS-CoV-2 S309 N55Q CDRH2 (aa) 94 ISTYQGNT
乙型冠狀病毒莖螺旋肽模體 95 DSFKEELDKYFKNH
乙型冠狀病毒莖螺旋肽模體 96 QPELDSFKEELDKYFKNHTSP
根據特定實施例,本揭露內容亦提供以下經編號實施例,其在其他實施例中可由數字提及: 1.   一種抗體或其抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中: (i)   該CDRH1包含根據SEQ ID NO: 27、37、48、67或80之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個酸取代之功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代; (ii)  該CDRH2包含根據SEQ ID NO: 28、38、49、68或81之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代; (iii) 該CDRH3包含根據SEQ ID NO: 29、39或50之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代; (iv) 該CDRL1包含根據SEQ ID NO: 31、41、52、70、76、78或83之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代; (v)  該CDRL2包含根據SEQ ID NO: 32、42或53之胺基酸序列或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代;及/或 (vi) 該CDRL3包含根據SEQ ID NO: 33、43或54之胺基酸序列或其包含具有一個、二個或三個胺基酸取代之功能變體或由其組成,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代, 其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
2. 如1之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
3. 如2之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
4. 如1至3中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV、OC43及HKU1。
5. 如1至4中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至表現於宿主細胞之表面上及/或病毒粒子上的一或多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
6. 如1至5中任一項之抗體或抗原結合片段,其在活體外感染模型中及/或活體內動物感染模型中及/或人類中能夠中和乙型冠狀病毒之感染。
7. 如1至5中任一項之抗體或抗原結合片段,其在活體外感染模型中及/或活體內動物感染模型中及/或人類中能夠中和一種、二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之感染。
8. 如請求項1至7中任一項之抗體或抗原結合片段,其在活體外感染模型中及/或活體內動物感染模型中及/或人類中能夠中和任何一種、二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之感染。
9. 如1至8中任一項之抗體或抗原結合片段,其包含以下中闡述之CDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2及CDRL3胺基酸序列:(i)分別為SEQ ID No: 27、28、29、31、32、33;(ii) 分別為SEQ ID NO: 27、28、29、70、32、33;(iii)分別為SEQ ID NO: 27、28、74、31、32、33;(iv)分別為SEQ ID NO: 27、28、74、70、32、33;(v)  分別為SEQ ID NO: 27、28、29、76、32、33;(vi)分別為SEQ ID NO: 27、28、29、78、32、33;(vii)分別為SEQ ID NO: 27、28、74、76、32、33;(viii)分別為SEQ ID NO: 27、28、74、78、32、33;(ix)分別為SEQ ID NO: 27、68、29、31、32、33;(x)分別為SEQ ID NO: 27、68、29、70、32、33;(xi)分別為SEQ ID NO: 27、68、74、31、32、33;(xii)分別為SEQ ID NO: 27、68、74、70、32、33;(xiii)   分別為SEQ ID NO: 27、68、29、76、32、33;(xiv)分別為SEQ ID NO: 27、68、29、78、32、33;(xv)分別為SEQ ID NO: 27、68、74、76、32、33;(xvi)分別為SEQ ID NO: 27、68、74、78、32、33;(xvii)分別為SEQ ID NO: 67、28、29、31、32、33;(xviii)分別為SEQ ID NO: 67、28、74、31、32、33;(xix)分別為SEQ ID NO: 67、28、74、70、32、33;(xx)分別為SEQ ID NO: 67、28、29、76、32、33;(xxi)分別為SEQ ID NO: 67、28、29、78、32、33;(xxii)分別為SEQ ID NO: 67、28、74、76、32、33;(xxiii)分別為SEQ ID NO: 67、28、74、78、32、33;(xxiv)分別為SEQ ID NO: 67、68、29、31、32、33;(xxv)分別為SEQ ID NO: 67、68、29、70、32、33;(xxvi)分別為SEQ ID NO: 67、68、74、31、32、33;(xxvii)分別為SEQ ID NO: 67、68、74、70、32、33;(xxviii)分別為SEQ ID NO: 67、68、29、76、32、33;(xxix)分別為SEQ ID NO: 67、68、29、78、32、33;(xxx)分別為SEQ ID NO: 67、68、74、76、32、33;(xxxi)分別為SEQ ID NO: 48、49、50、52、53、54;(xxxii)分別為SEQ ID NO: 48、49、50、83、53、54;(xxxiii)分別為SEQ ID NO: 48、81、50、52、53、54;(xxxiv)分別為SEQ ID NO: 48、81、50、83、53、54;(xxxv)分別為SEQ ID NO: 80、49、50、52、53、54;(xxxvi)分別為SEQ ID NO: 80、49、50、83、53、54;(xxxvii)分別為SEQ ID NO: 80、81、50、52、53、54;(xxxviiii)分別為SEQ ID NO: 80、81、50、83、53、54;或(xxxix)分別為SEQ ID NO: 37、38、39、41、42、43。
10.  如1至9中任一項之抗體或抗原結合片段,其包含:(i)   SEQ ID NO:27或SEQ ID NO:67中闡述之CDRH1胺基酸序列;(ii)  SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:68中闡述之CDRH2胺基酸序列;(iii) SEQ ID NO:29中闡述之CDRH3胺基酸序列;(iv) SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:76或SEQ ID NO:78中闡述之CDRL1胺基酸序列;(v) SEQ ID NO:32中闡述之CDRL2胺基酸序列;及(vi) SEQ ID NO:33中之CDRL3胺基酸序列。
11.  如1至8中任一項或10之抗體或抗原結合片段,其包含以下中闡述之CDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2及CDRL3胺基酸序列:(i)分別為SEQ ID NO:27、28、29、70、32及33;(ii)分別為SEQ ID NO:27、28、29、76、32及33;(iii)分別為SEQ ID NO:27、28、29、78、32及33;(iv)分別為SEQ ID NO:27、68、29、31、32及33;(v)分別為SEQ ID NO:27、68、29、70、32及33;(vi)分別為SEQ ID NO:27、68、29、76、32及33;(vii)分別為SEQ ID NO:27、68、29、78、32及33;(viii)分別為SEQ ID NO:67、28、29、30、32及33;(ix)分別為SEQ ID NO:67、28、29、70、32及33;(x)分別為SEQ ID NO:67、28、29、76、32及33;(xi)分別為SEQ ID NO:67、28、29、78、32及33;(xii)分別為SEQ ID NO:67、68、29、31、32及33;(xiii)分別為SEQ ID NO:67、68、29、70、32及33;(xiv)分別為SEQ ID NO:67、68、29、76、32及33;或(vii)分別為SEQ ID NO:67、68、29、78、32及33。
12.  如1至11之抗體或抗原結合片段,其包含:(i) SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:80中闡述之CDRH1胺基酸序列;(ii) SEQ ID NO:49或SEQ ID NO:81中闡述之CDRH2胺基酸序列;(iii) SEQ ID NO:50中闡述之CDRH3胺基酸序列;(iv) SEQ ID NO:52或SEQ ID NO:83中闡述之CDRL1胺基酸序列;(v) SEQ ID NO:53中闡述之CDRL2胺基酸序列;及(vi) SEQ ID NO:54中之CDRL3胺基酸序列。
13.  如12之抗體或抗原結合片段,其包含以下中闡述之CDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2及CDRL3胺基酸序列:(i)分別為SEQ ID NO:48、49、50、52、53及54;(ii)分別為SEQ ID NO:48、49、50、83、53及54;(iii)分別為SEQ ID NO:48、81、50、52、53及54;或(iv)分別為SEQ ID NO:48、81、50、83、53及54。
14.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:26、66、71、72及73中之任一者中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:30中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據IMGT,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
15.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:26、66、71、72及73中之任一者中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:30中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據Kabat,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
16.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:26、66、71、72及73中之任一者中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:69中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據IMGT,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
17.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:26、66、71、72及73中之任一者中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:69中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據Kabat,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
18.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:26、66、71、72及73中之任一者中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:75中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據IMGT,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
19.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:26、66、71、72及73中之任一者中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:75中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據Kabat,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
20.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含: (i)   SEQ ID NO:26、66、71、72及73中之任一者中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及 (ii)  SEQ ID NO:75中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代, 其中CDR係根據IMGT, 且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
21.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含: (i)   SEQ ID NO:26、66、71、72及73中之任一者中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及 (ii)  SEQ ID NO:75中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代, 其中CDR係根據Kabat, 且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
22.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:26、66、71、72及73中之任一者中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:77中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據IMGT,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
23.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:26、66、71、72及73中之任一者中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:77中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據Kabat,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
24.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:36中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:40中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據IMGT,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
25.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:36中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2及CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:40中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據Kabat,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
26.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:47或79中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2、CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:51中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據IMGT,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
27.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:47或79中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2、CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:51中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據Kabat,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
28.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:47或79中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2、CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:82中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據IMGT,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
29.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含:(i)SEQ ID NO:47或79中闡述之VH胺基酸序列的CDRH1、CDRH2、CDRH3;及(ii) SEQ ID NO:82中闡述之VL胺基酸序列的CDRL1、CDLR2或其包含一個、二個或三個胺基酸取代之變體及CDRL3,該等取代中之一或多者任擇地為守恆取代及/或為對經生殖系編碼之胺基酸的取代,其中CDR係根據Kabat,且其中抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,其中任擇地,乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任一種、二種、三種、四種或五種。
30.  如1-29中任一項之抗體或抗原結合片段,其中:(i)VH包含與根據SEQ ID NO: 26、36、47、66、71、72或81之胺基酸序列具有至少85%一致性之胺基酸序列或由其組成,其中變化任擇地限於一或多個骨架區及/或變化包含對經生殖系編碼之胺基酸的一或多個取代;及/或(ii)VL包含與根據SEQ ID NO: 30、40、51、69、75、77或84之胺基酸序列具有至少85%一致性之胺基酸序列或由其組成,其中變化任擇地限於一或多個骨架區及/或變化包含對經生殖系編碼之胺基酸的一或多個取代。
31.  如請求項1至30中任一項之抗體或抗原結合片段,其中VH及VL包含根據以下之胺基酸序列或由其組成:SEQ ID NO: (i)分別為26及30;(ii)分別為26及69,(iii)分別為26及75,(iv)分別為26及77,(v)分別為66及69,(vi)分別為66及30,(vii)分別為66及75,(viii)分別為66及77,(ix)分別為71及30,(x)分別為71及69,(xi)分別為71及75,(xii)分別為71及77,(xiii)分別為72及30,(xiv)分別為72及69,(xv)分別為72及75,(xvi)分別為72及77,(xvii)分別為73及30,(xviii)分別為73及69,(xix)分別為73及75,(xx)分別為73及77,(xxi)分別為36及40;(xxii)分別為47及51;(xxiii)分別為47及82,(xxiv)分別為79及82或(xxv)分別為79及51。
32.  如請求項1至31中任一項之抗體或抗原結合片段,其中該VH及該VL具有至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少99%以下中闡述之胺基酸序列或包含以下中闡述之胺基酸序列或由其組成:SEQ ID NO: (i)分別為26及30;(ii)分別為26及69,(iii)分別為26及75,(iv)分別為26及77,(v)分別為66及69,(vi)分別為66及30,(vii)分別為66及75,(viii)分別為66及77,(ix)分別為71及30,(x)分別為71及69,(xi)分別為71及75,(xii)分別為71及77,(xiii)分別為72及30,(xiv)分別為72及69,(xv)分別為72及75,(xvi)分別為72及77,(xvii)分別為73及30,(xviii)分別為73及69,(xix)分別為73及75,(xx)分別為73及77,(xxi)分別為36及40;(xxii)分別為47及51;(xxiii)分別為47及82,(xxiv)分別為79及82或(xxv)分別為79及51。
33.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含重鏈可變區域(VH)及輕鏈可變區域(VL),其中該VH包含如SEQ ID NO: 26中所闡述之胺基酸序列或由其組成,且該VL包含如SEQ ID NO: 30中所闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
34.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含重鏈可變區域(VH)及輕鏈可變區域(VL),其中該VH包含如SEQ ID NO: 26中所闡述之胺基酸序列或由其組成,且該VL包含如SEQ ID NO: 77中所闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
35.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含重鏈可變區域(VH)及輕鏈可變區域(VL),其中該VH包含如SEQ ID NO: 72中所闡述之胺基酸序列或由其組成,且該VL包含如SEQ ID NO: 30中所闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
36.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含重鏈可變區域(VH)及輕鏈可變區域(VL),其中該VH包含如SEQ ID NO: 26中所闡述之胺基酸序列或由其組成,且該VL包含如SEQ ID NO: 75中所闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
37. 一種抗體或其抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中CDRH1、CDRH2及CDRH3包含分別SEQ ID NO: 27-29中闡述之胺基酸序列或由其組成,且CDRL1、CDRL2及CDRL3包含分別SEQ ID NO: 31-33中闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
38. 一種抗體或其抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中CDRH1、CDRH2及CDRH3包含分別SEQ ID NO: 27-29中闡述之胺基酸序列或由其組成,且CDRL1、CDRL2及CDRL3包含分別SEQ ID NO: 78、32及33中闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
39. 一種抗體或其抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中CDRH1、CDRH2及CDRH3包含分別SEQ ID NO: 27、68及29中闡述之胺基酸序列或由其組成,且CDRL1、CDRL2及CDRL3包含分別SEQ ID NO: 31-33中闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
40. 一種抗體或其抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中CDRH1、CDRH2及CDRH3包含分別SEQ ID NO: 27-29中闡述之胺基酸序列或由其組成,且CDRL1、CDRL2及CDRL3包含分別SEQ ID NO: 76、32及33中闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
41.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含重鏈可變區域(VH)及輕鏈可變區域(VL),其中VH包含如SEQ ID NO: 36中所闡述之胺基酸序列或由其組成,且VL包含如SEQ ID NO: 40中所闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,且/或能夠結合至甲型冠狀病毒、任擇地NL63-CoV及/或229E-CoV之表面醣蛋白。
42.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中CDRH1、CDRH2及CDRH3包含分別SEQ ID NO: 37-39中闡述之胺基酸序列或由其組成,且CDRL1、CDRL2及CDRL3包含分別SEQ ID NO: 41-43中所闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白,且/或能夠結合至甲型冠狀病毒、任擇地NL63-CoV及/或229E-CoV之表面醣蛋白。
43.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含重鏈可變區域(VH)及輕鏈可變區域(VL),其中該VH包含如SEQ ID NO: 47中所闡述之胺基酸序列或由其組成,且該VL包含如SEQ ID NO: 51中所闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
44.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含重鏈可變區域(VH)及輕鏈可變區域(VL),其中該VH包含如SEQ ID NO: 79中所闡述之胺基酸序列或由其組成,且該VL包含如SEQ ID NO: 82中所闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
45.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中CDRH1、CDRH2及CDRH3包含分別SEQ ID NO: 48-50中闡述之胺基酸序列或由其組成,且CDRL1、CDRL2及CDRL3包含分別SEQ ID NO: 52-54中闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
46.  一種抗體或其抗原結合片段,其包含有包含CDRH1、CDRH2及CDRH3之重鏈可變區域(VH)及包含CDRL1、CDRL2及CDRL3之輕鏈可變區域(VL),其中CDRH1、CDRH2及CDRH3包含分別SEQ ID NO: 80、81及50中闡述之胺基酸序列或由其組成,且CDRL1、CDRL2及CDRL3包含分別SEQ ID NO: 83及53-54中闡述之胺基酸序列或由其組成,其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至乙型冠狀病毒、任擇地二種或更多種乙型冠狀病毒之表面醣蛋白。
47.  如1至46中任一項之抗體或抗原結合片段,其中該VH及該VL具有至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少99%以下中闡述之胺基酸序列或包含以下中闡述之胺基酸序列或由其組成:SEQ ID NO:(i)分別為26及30;(ii)分別為26及69;(iii)分別為26及75;(iv) 分別為26及77;(v)分別為66及30;(vi)分別為66及69;(vii)   分別為66及75;(viii)分別為66及77;(ix)分別為71及30;(x)分別為71及69;(xi)分別為71及75;(xii)分別為71及77;(xiii)分別為72及30;(xiv)分別為72及69;(xv)分別為72及75;(xvi)分別為72及77;(xvii)分別為73及30;(xviii)分別為73及69;(xix)分別為73及75;(xx)分別為73及77;(xxi)分別為36及40;(xxii)分別為47及51;(xxiii)分別為47及82;(xxiv)分別為79及51;或(xxv)分別為79及82。
48.  如1-47中任一項之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段能夠以融合前構形結合至人類乙型冠狀病毒表面醣蛋白,其KD:(i)小於1.0E-12 M,其中該表面醣蛋白來自SARS-CoV-2;(ii)小於1.0E-12 M,其中該表面醣蛋白來自SARS-CoV;(iii)為約3.72E-10 M,其中該表面醣蛋白來自OC43;(iv)為約2.44E-09 M,其中該表面醣蛋白來自HKU-1;及/或(v)為約1.14E-09 M,其中該表面醣蛋白來自MERS,其中任擇地,KD係使用生物層干涉法(BLI)測定。
49.  一種抗體或其抗原結合片段,其能夠結合至乙型冠狀病毒表面醣蛋白胺基酸序列或肽,該乙型冠狀病毒表面醣蛋白胺基酸序列或肽包含(i)-(iii)中之任一者:(i) FKEELDKYF [SEQ ID NO:57];(ii) GIDFQDELDEFFK [SEQ ID NO:58];及/或(iii) DFKEELDQWFK [SEQ ID NO:59]。
50.  一種抗體或其抗原結合片段,其能夠結合至乙型冠狀病毒表面醣蛋白胺基酸序列或肽,該乙型冠狀病毒表面醣蛋白胺基酸序列或肽包含(i)-(vi)中之任一者:(i) KRSFIEDLLFN [SEQ ID NO:60];(ii) ARSAIEDLLFD [SEQ ID NO:61];(iii) SRSAIEDLLFD [SEQ ID NO:62];(iv) RSFFEDLLF [SEQ ID NO:63];(v) RSALEDLLFSK [SEQ ID NO:64];及/或(vi) GRSAIEDILFS [SEQ ID NO:65]。
51.  一種抗體或其抗原結合片段,其識別乙型冠狀病毒表面醣蛋白之莖螺旋中的表位,其中該表位在二種、三種、四種、五種或更多種乙型冠狀病毒中守恆。
52.  如51之抗體或抗原結合片段,其中二種、三種、四種、五種或更多種乙型冠狀病毒包含SARS-CoV-2、SARS-CoV、OC43、MERS-CoV、HKU1或其任何組合。
53.  如1至52中任一項之抗體或抗原結合片段,其在VH中包含由V1-46*01編碼之胺基酸序列及/或由D5-12*01編碼之胺基酸序列。
54.  如53之抗體或抗原結合片段,其進一步包含以下中之任一或多者:(i)在VH中,由J4*03或J*602編碼之胺基酸序列;(ii)在VL中,由KV3-20*01編碼之胺基酸序列及/或由K3*01編碼之胺基酸序列;(iii)在VL中,由LV1-51*02編碼之胺基酸序列及/或由J1*01編碼之胺基酸序列。
55.  如1至54中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至分枝系1a之薩貝冠狀病毒、分枝系1b之薩貝冠狀病毒、分枝系2之薩貝冠狀病毒及分枝系3之薩貝冠狀病毒的表面醣蛋白。
56.  如1至55中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至包含胺基酸序列X 1X 2FX 3X 4ELDX 5YF (SEQ ID NO:84)之肽。
57.  一種抗體或抗原結合片段,其能夠結合至包含胺基酸序列X 1X 2FX 3X 4ELDX 5YF (SEQ ID NO:84)之肽。
58.  如1至57中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至SARS-CoV-2,其中SARS-CoV-2包含D614G突變或選自A23.1、B.1.429、B.1.258、B.1.1.318、R.2、B.1.528、B.1.526及B.1.617。
59.  如1至58中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠中和SARS-CoV-2 B.1.1.7、B.1.351、B.1.1.28、B.1.1.207及/或P.1之感染。
60.  如1至59中任一項之抗體或抗原結合片段,其:(i)識別二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之刺突蛋白中之表位;(ii)能夠阻斷二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之刺突蛋白與其各別細胞表面受體之間的相互作用;(iii)識別在二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之刺突蛋白中守恆的表位;(iv)   針對二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒具有交叉反應性;(v)針對SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任何三者具有交叉反應性;(vi)針對SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任何四者具有交叉反應性;(vii)針對SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV、OC43及HKU1具有交叉反應性;(viii)在活體外感染模型中及/或活體內動物感染模型中及/或人類中能夠中和一種、二種、三種、四種、五種或更多種不同人類乙型冠狀病毒之感染;(ix)  當該抗體或抗原結合片段結合至該乙型冠狀病毒及/或甲型冠狀病毒表面醣蛋白時,能夠活化人類FcγRIIa (任擇地V131)、人類FcγRIIIa (任擇地V158)或二者;(x)當結合至乙型冠狀病毒之該表面醣蛋白時,不抑制該表面醣蛋白與人類ACE2之間的結合;(xi) 能夠抑制經SARS-CoV-2 S醣蛋白感染或轉染之第一細胞與第二細胞之間的細胞-細胞融合;(xii)能夠針對經乙型冠狀病毒感染之目標細胞介導ADCC、ADCP、CDC或其任何組合;(xiii)能夠預防哺乳動物中之乙型冠狀病毒感染或預防其之嚴重程度之進展;或(xiv) (i)-(xii)之任何組合。
61.  如1-60中任一項之抗體或抗原結合片段,其中:(i)抗體或抗原結合片段之Fab能夠以約7.3 nM之Kd結合至固定融合前SARS-CoV S蛋白三聚體,以約16 nM之Kd結合至固定融合前OC43 S蛋白三聚體,以約12 nM之Kd結合至固定融合前MER S蛋白三聚體,及/或以約120 nM之Kd結合至固定融合前HKU1 S蛋白三聚體,如使用表面電漿子共振測定;及/或(ii)抗體或抗原結合片段之Fab能夠以約6.8 nM之KD及pH 7.4及/或以約44 nM之KD在pH 5.4下結合至固定融合前SARS-CoV-2 S蛋白胞外區域三聚體,如使用表面電漿子共振測定;及/或(iii)抗體為IgG1同型且能夠以約0.4 nM之KD及pH 7.4及/或以約2.3 nM之KD在pH 5.4下結合至固定融合前SARS-CoV-2 S蛋白胞外區域三聚體,如使用表面電漿子共振測定。
62.  如1至61中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至包含胺基酸序列DSFKEELDKYFKNH (SEQ ID NO:95)或由其組成之肽。
63.  如1至62中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至SARS-CoV-2表面醣蛋白中之表位,該表面醣蛋白包含胺基酸序列DSFKEELDKYFKNH (SEQ ID NO:95)或由其組成。
64.  如1至63中任一項之抗體或抗原結合片段,其中SEQ ID NO:95包含於胺基酸序列QPELDSFKEELDKYFKNHTSP (SEQ ID NO:96)內。
65.  如64中任一項之抗體或抗原結合片段,其為IgG、IgA、IgM、IgE或IgD同型。
66.  如1至65中任一項之抗體或抗原結合片段,其為選自IgG1、IgG2、IgG3及IgG4之IgG同型。
67.  如1至66中任一項之抗體或抗原結合片段,其為人類、人源化或嵌合的。
68.  如1-67中任一項之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段包含人類抗體、單株抗體、純化抗體、單鏈抗體、Fab、Fab'、F(ab')2、Fv、scFv或scFab。
69.  如68之抗體或抗原結合片段,其中該scFv包含超過一個VH區域及超過一個VL區域。
70.  如1至69中任一項之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段為多特異性抗體或抗原結合片段。
71.  如70之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段為雙特異性抗體或抗原結合片段。
72.  如70或71之抗體或抗原結合片段,其包含:(i)第一VH及第一VL;及(ii)第二VH及第二VL,其中第一VH及第二VH不同且各自獨立地包含與SEQ ID NO: 26、36、47、66、71、72或79中闡述之胺基酸序列具有至少85%一致性的胺基酸序列;且其中第一VL及第二VL不同且各自獨立地包含與SEQ ID NO: 30、40、51、69、75、77或82中闡述之胺基酸序列具有至少85%一致性的胺基酸序列;且其中第一VH及第一VL一起形成第一抗原結合位點,且其中第二VH及第二VL一起形成第二抗原結合位點。
73.  如1至72中任一項之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段進一步包含Fc多肽或其片段。
74.  如73之抗體或抗原結合片段,其中該Fc多肽或其片段包含:(i)一突變,與不包含該突變之參考Fc多肽相比,其增強與FcRn之結合;及/或(ii)一突變,與不包含該突變之參考Fc多肽相比,其增強與FcγR之結合。
75.  如74之抗體或抗原結合片段,其中增強與FcRn之結合之該突變包含:M428L、N434S、N434H、N434A、N434S、M252Y、S254T、T256E、T250Q、P257I、Q311I、D376V、T307A、E380A或其任何組合。
76.  如74之抗體或抗原結合片段,其中增強與FcRn之結合之該突變包含:(i) M428L/N434S;(ii) M252Y/S254T/T256E;(iii) T250Q/M428L;(iv) P257I/Q311I;(v) P257I/N434H;(vi) D376V/N434H;(vii) T307A/E380A/N434A;或(viii) (i)-(vii)之任何組合。
77.  如74之抗體或抗原結合片段,其中增強與FcRn之結合之該突變包含M428L/N434S。
78.  如74之抗體或抗原結合片段,其中增強與FcγR之結合之該突變包含S239D、I332E、A330L、G236A或其任何組合。
79.  如74之抗體或抗原結合片段,其中增強與FcγR之結合之該突變包含:(i) S239D/I332E;(ii) S239D/A330L/I332E;(iii) G236A/S239D/I332E;或(iv) G236A/A330L/I332E。
80.  如1至79中任一項之抗體或抗原結合片段,其包含改變醣基化之突變,其中改變醣基化之突變包含N297A、N297Q或N297G,及/或其經去醣基化及/或去岩藻醣基化。
81.  如1至80中任一項之抗體或抗原結合片段,其中Fc多肽包含L234A突變及L235A突變。
82.  如1至81中任一項之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段結合至二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒S蛋白質,如使用生物層干涉法所量測。
83.  如1至82之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段能夠以約1至約10 μg/ml之IC50中和乙型冠狀病毒感染及/或中和目標細胞之感染。
84.  如1至83中任一項之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段能夠針對經乙型冠狀病毒感染之目標細胞誘導抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)及/或抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP)。
85.  一種抗體或其抗原結合片段,其與如1至84中任一項之抗體或抗原結合片段競爭結合至乙型冠狀病毒表面醣蛋白。
86.  如1至85中任一項之抗體,其中該抗體包含在等同位置處經來自對應UCA之胺基酸取代的野生型序列之至少一個胺基酸。
87.  一種經分離多核苷酸,其編碼如1至86中任一項之抗體或抗原結合片段,或編碼該抗體或該抗原結合片段之VH、重鏈、VL及/或輕鏈。
88.  如87之多核苷酸,其中該多核苷酸包含去氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA),其中該RNA任擇地包含信使RNA (mRNA)。
89.  如87或88之多核苷酸,其包含經修飾之核苷、cap-1結構、cap-2結構或其任何組合。
90.  如89之多核苷酸,其中該多核苷酸包含假尿苷、N6-甲基腺苷、5-甲基胞苷、2-硫代尿苷或其任何組合。
91.  如90之多核苷酸,其中假尿苷包含N1-甲基假尿苷。
92.  如87至91中任一項之多核苷酸,其經密碼子最佳化以表現於宿主細胞中。
93.  如87至92中任一項之多核苷酸,其包含與根據SEQ ID NO: 34、35、44或45之多核苷酸序列具有至少50%一致性的多核苷酸。
94.  如87至93中任一項之多核苷酸,其包含編碼抗體之多核苷酸,該抗體在VH中及/或在VL中包含在等同位置處經來自對應UCA之胺基酸取代的野生型序列之至少一個胺基酸。
95.  一種重組載體,其包含如87至94中任一項之多核苷酸。
96.  一種宿主細胞,其包含如87至94中任一項之多核苷酸及/或如95之載體,其中該多核苷酸對於該宿主細胞為異源的。
97.  一種人類B細胞,其包含如87至94中任一項之多核苷酸,其中多核苷酸對於該人類B細胞為異源的及/或其中該人類B細胞為永生化的。
98.  一種組成物,其包含:(i)如1至86中任一項之抗體或抗原結合片段;(ii)如87至94中任一項之多核苷酸;(iii)如95之重組載體;(iv)如96之宿主細胞;及/或(v)如97之人類B細胞及醫藥學上可接受之賦形劑、載劑或稀釋劑。
99.  如98之組成物,其包含二種或更多種如1至86中任一項之抗體或抗原結合片段。
100.一種組成物,其包含第一抗體或抗原結合片段及第二抗體或抗原結合片段,其中:(i)  該第一抗體或抗原結合片段係1至86中之任一項;且(ii)該第二抗體或抗原結合片段包含:(ii)(a) CDRH1胺基酸序列GYPFTSYG (SEQ ID NO: 86)、CDRH2胺基酸序列ISTYQGNT (SEQ ID NO: 94)或ISTYNGNT (SEQ ID NO: 87)、CDRH3胺基酸序列ARDYTRGAWFGESLIGGFDN (SEQ ID NO: 88)、CDRL1胺基酸序列QTVSSTS (SEQ ID NO: 90)、CDRL2胺基酸序列GAS (SEQ ID NO: 91)及CDRL3胺基酸序列QQHDTSLT (SEQ ID NO: 92);任擇地(ii)(a)(1) VH胺基酸序列QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYPFTSYGISWVRQAPGQGLEWMGW ISTYQGNTNYAQKFQGRVTMTTDTSTTTGYMELRRLRSDDTAVYYC ARDYTRGAWFGESLIGGFDNWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO: 93) 或 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYPFTSYGISWVRQAPGQGLEWMGW ISTYNGNTNYAQKFQGRVTMTTDTSTTTGYMELRRLRSDDTAVYYC ARDYTRGAWFGESLIGGFDNWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO: 85) 及(ii)(a)(2) VL胺基酸序列 EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRAS QTVSSTSLAWYQQKPGQAPRLLIY GASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQHDTSLTFGGGTKVEIK (SEQ ID NO: 89)。
101.如100之組成物,其中該第一抗體或抗原結合片段及/或該第二抗體或抗原結合片段包含Fc多肽,該Fc多肽包含:(i) M428L及N434S突變;(ii) G236A、A330L及I332E突變;或(iii) M428L、N434S、G236A、A330L及I332E突變。
102.一種組合,其包含:(i)如1至86中任一項之抗體或抗原結合片段;及(ii)抗體或抗原結合片段,其能夠結合至在莖螺旋外部,且任擇地包含於受體結合區域(RBD)中之乙型冠狀病毒表面醣蛋白表位。
103.如102之組合,其中(ii)之抗體或抗原結合片段在結合至其表位時抑制乙型冠狀病毒表面醣蛋白與選自ACE2、DC-SIGN、L-SIGN、SIGLEC-1、二肽基肽酶-4 (DPP4)及9-O-乙醯化唾液酸(9-O-Ac-Sia)受體之細胞表面受體之間的相互作用。
104.一種組成物,其包含囊封於載劑分子中之如87至94中任一項之多核苷酸,其中該載劑分子任擇地包含脂質、脂質衍生之遞送媒劑,諸如脂質體、固體脂質奈米粒子、油性懸浮液、次微米級脂質乳液、脂質微泡、逆脂質微胞、耳蝸脂質體、脂質微管、脂質微柱、脂質奈米粒子(LNP)或奈米尺度平台。
105. 一種治療個體之乙型冠狀病毒感染的方法,該方法包含向該個體投予有效量之(i)如1至86中任一項之抗體或抗原結合片段;(ii)如87至94中任一項之多核苷酸;(iii)如95之重組載體;(iv)如96之宿主細胞;(v)如97之人類B細胞;(vi)如98至101中任一項或104之組成物;及/或(vii)如102或103之組合。
106.如105之方法,其包含投予有效量之如102或103之組合,其中投予有效量之該組合包含投予有效量之(i)之該抗體或抗原結合片段及任擇地並行地或以順序投予有效量之(ii)之多核苷酸。
107.如105之方法,其包含投予有效量之102或103之組合,其中投予有效量之該組合包含投予有效量之(i)之抗體或抗原結合片段且隨後投予有效量之(ii)之多核苷酸。
108.如105之方法,其包含投予有效量之102或103之組合,其中投予有效量之該組合包含投予有效量之(ii)之多核苷酸且隨後投予有效量之(i)之抗體或抗原結合片段。
109.如1至86中任一項之抗體或抗原結合片段、如87至94中任一項之多核苷酸、如95之重組載體、如96之宿主細胞、如97之人類B細胞、如98至101中任一項或104之組成物及/或如102或103之組合,其用於治療個體之乙型冠狀病毒感染的方法中。
110 如1至86中任一項之抗體或抗原結合片段、如87至94中任一項之多核苷酸、如95之重組載體、如96之宿主細胞、如97之人類B細胞、如98至101中任一項或104之組成物及/或如102或103之組合,其用於製備供治療個體之乙型冠狀病毒感染用的藥劑中。
111.如109或110之供使用的抗體、抗原結合片段、多核苷酸、重組載體、宿主細胞、人類B細胞、組成物及/或組合,其中該乙型冠狀病毒包含:(i) SARS-CoV;(ii) SARS-CoV-2;(iii) MERS-CoV;(iv) OC43;(v) HKU1;或(vi) (i)-(iii)之任何組合。
112.如109或110之供使用的抗體、抗原結合片段、多核苷酸、重組載體、宿主細胞、人類B細胞、組成物及/或組合,其中治療乙型冠狀病毒之方法包含投予有效量之該抗體或抗原結合片段及任擇地同時或以順序投予有效量之多核苷酸。
113.如112之供使用的抗體、抗原結合片段、多核苷酸、重組載體、宿主細胞、人類B細胞、組成物及/或組合,其中投予有效量之該組合包含投予有效量之該抗體或抗原結合片段且隨後投予有效量之多核苷酸。
114.如112之供使用的抗體、抗原結合片段、多核苷酸、重組載體、宿主細胞、人類B細胞、組成物及/或組合,其中投予有效量之該組合包含投予有效量之該多核苷酸且隨後投予有效量之該抗體或抗原結合片段。
115.如109或110之供使用的抗體、抗原結合片段、多核苷酸、重組載體、宿主細胞、人類B細胞、組成物及/或組合,其中該用途包含在治療個體中之乙型冠狀病毒感染之方法中同時或以順序使用該抗體或抗原結合片段之第一用途及使用該多核苷酸之第二用途。
116.如115之供使用的抗體、抗原結合片段、多核苷酸、重組載體、宿主細胞、人類B細胞、組成物及/或組合,其中該用途包含在治療個體中之乙型冠狀病毒感染之方法中以順序使用該抗體或抗原結合片段之第一用途及使用該多核苷酸之第二用途。
117.如115之供使用的抗體、抗原結合片段、多核苷酸、重組載體、宿主細胞、人類B細胞、組成物及/或組合,其中該用途包含在治療個體中之乙型冠狀病毒感染之方法中以順序使用該多核苷酸之第一用途及使用該抗體或抗原結合片段之第二用途。
118.一種用於活體外診斷乙型冠狀病毒感染之方法,該方法包含:(i)使來自個體之樣品與如1至86中任一項之抗體或抗原結合片段接觸;及(ii)偵測包含抗原及該抗體,或包含抗原及該抗原結合片段之複合物。
119.如118之方法,其中該樣品包含自該個體分離之血液。
120.如118或119之方法,其中乙型冠狀病毒包含:(i) SARS-CoV;(ii) SARS-CoV-2;(iii) MERS-CoV;(iv) OC43;(v) HKU1;或(vi) (i)-(iii)之任何組合。 實例 實例1 針對多個乙型冠狀病毒測試抗體
人類單株抗體抗體420_1_2 (圖1A)及抗體420_1_1 (圖1B)與不同人類乙型冠狀病毒之刺突蛋白的結合藉由酶聯免疫吸附分析(ELISA)量測。抗體420_1_2,在本文中亦稱為S2S8,包含有包含SEQ ID NO:36中提供之序列的VH及包含SEQ ID NO:40中提供之序列的VL。抗體420_1_1,在本文中亦稱為S2P6,包含有包含SEQ ID NO:26中提供之序列的VH及包含SEQ ID NO:30中提供之序列的VL。以1 µg/ml塗佈來自SARS-CoV (Urbani病毒株,GenBank: AAP13441;ncbi.nlm.nih.gov/protein/30027620)、SEQ ID NO:22、SARS-CoV-2 (BetaCoV/Wuhan-Hu-1/2019,GenBank: MN908947)、SEQ ID NO:3、MERS (Lundon1/2012;GenBank: KC164505)、SEQ ID NO:24、OC43 (GenBank AAT84362.1)、SEQ ID NO:23及HKU1 (GenBank YP_173238.1)、SEQ ID NO:25之融合前穩定刺突蛋白,且僅PBS用作陰性對照。測定半最大有效濃度(EC50)且以ng/ml報告。亦藉由ELISA量測此等抗體與甲型冠狀病毒之結合;未觀測到結合(資料未示出)。其他ELISA研究展示抗體S2S8結合至甲型冠狀病毒NL63-CoV及229E-CoV之刺突蛋白。
測試單株抗體S2S40、S2S41、S2S42、S2S43及S2X529之與不同人類乙型冠狀病毒之刺突蛋白的結合及與SARS-CoV-2之刺突蛋白次單元S2之結合,如上文所描述。結果展示於表2中。 表2.
抗體 SARS-CoV-2 刺突蛋白 SARS-CoV-2 S2 SARS 刺突蛋白 MERS 刺突蛋白 OC43 刺突蛋白 HKU-1 刺突蛋白
S2S40 + + + - + -
S2S41 + + + + + -
S2S42 + - - - + +
S2S43 + + + + + -
S2X529 + 未測試 + + + -
藉由流式細胞測量術量測單株抗體抗體420_1_2 (亦稱為S2S8)及抗體420_1_1 (亦稱為S2P6) (二種抗體均表現為攜有M428L/N434S Fc突變之重組IgG1;「MLNS」)與表現於哺乳動物細胞表面上之不同人類乙型冠狀病毒之刺突蛋白的結合。簡言之,Expi-CHO細胞經編碼來自人類乙型冠狀病毒之全長刺突蛋白的phCMV1表現質體短暫地轉染。量測與來自SARS-CoV-2 (BetaCoV/Wuhan-Hu-1/2019;圖2A)、SARS-CoV (Urbani病毒株,AAP13441;圖2B)、OC43 (圖2C)及MERS-CoV (London1/2012;圖2D)之刺突蛋白的結合。
另外,藉由ELISA量測抗體420_1_1 (亦稱為S2P6) (圖3A)及抗體420_1_2 (亦稱為S2S8) (圖3B)與來自SARS-CoV-2 (BetaCoV/Wuhan-Hu-1/2019) S蛋白之S1、S2及受體結合區域(RBD)的結合。以1 µg/ml塗佈蛋白質。此等資料指示抗體420_1_1及420_1_2在S2中結合。
使用螢光素酶報導體分析評估抗體420_1_1針對SARS-CoV-2病毒感染之中和活性。以0.01之感染倍率(MOI),用SARS-CoV-2-螢光素酶報導體病毒感染VeroE6細胞24小時。圖4中展示一曲線,其展示增加之抗體濃度下的中和百分比以及所計算之IC50值(ng/ml)。亦測試藉由比較抗體「S309」之中和(參見Pinto等人, Cross-neutralizaiton of SARS-CoV-2 by a human monoclonal SARS-CoV antibody, Nature 583:290-295 (2020年7月))。
藉由螢光素酶報導體分析評估藉由抗體420_1_1及抗體420_1_2之對假型化病毒的中和。檢驗對Huh7細胞中MERS-CoV(圖5A)及Vero E6細胞中SARS-CoV-2(圖5B)的抗體420_1_1中和。亦評估藉由抗體420_1_2對Huh7細胞中MERS-CoV感染(圖6A)及Vero E6細胞中SARS-CoV-2(圖6B)之中和。展示示出在增加之抗體濃度(ng/ml)下中和百分比的曲線,且IC50值以µg/ml報告。亦量測藉由比較抗體LCA60 (抗MERS;Corti等人, PNAS 122(33):10473-10478 (2015))及S309之中和。
分離另一人類抗體S2S43。S2S43包含SEQ ID NO:47中所闡述之VH胺基酸序列(CDRH1-H3分別為SEQ ID NO:48-50)及SEQ ID NO:51中所闡述之VL胺基酸序列(CDRL1-L3分別為SEQ ID NO:52-54)。
評估S2P6及S2S43 V區之生殖系序列。產生包含S2P6及S2S43中之每一者的未突變共同祖先(UCA) V區序列的抗體。亦產生S2P6抗體,其中一或多個CDR (IMGT)胺基酸殘基恢復成生殖系胺基酸。參見圖76及圖78。
利用圖34-75及77中所示之資料進行其他研究。本發明所揭露之抗體可結合至且中和不同人類乙型冠狀病毒。S2S8而非S2P6針對甲型冠狀病毒具有交叉反應性(圖37)。S2P6可活化人類FcγRIIa (H131對偶基因)及FcγRIIIa (V158對偶基因) (圖42A、42B及62),引發效應功能(圖63),且防止敍利亞倉鼠模型中之SARS-CoV-2感染(圖45、64及65)。S2P6結合不阻斷SARS-CoV-2 RBD結合至人類ACE2 (圖60)。S2P6使用經SARS-CoV-2 S轉染之Vero-E6細胞抑制細胞-細胞融合(圖61)。
進行肽定位研究以鑑別表位區。參見圖43、圖44、圖53及圖54。根據此等研究,S2P6結合β-冠狀病毒莖螺旋區中之守恆表位(圖54;位於S2次單元內之莖螺旋中的SARS-CoV-2模體F 1148KEELDKYF 1156,其在人類乙型冠狀病毒中高度守恆)。
展示S2P6結合至所有所測試之全長SARS-CoV-2 S變體及代表在ExpiCHO細胞之表面上短暫表現之所有薩貝冠狀病毒分枝系之24種S醣蛋白(圖50、圖67A-67C及圖68)。S2P6可同等地與感染人類之五種乙型冠狀病毒(儘管對於HKU1具有較快的解離速率)以及MERS-CoV相關蝙蝠病毒(HKU4及HKU5)及鼠類肝炎病毒(MHV)之莖螺旋肽結合(資料未示出)。S2P6亦展現與融合後SARS-CoV-2刺突蛋白之結合,即使其表位似乎埋在靶向原聚體與刺突蛋白之棒狀三聚體之其他二種原聚體之界面處,且因此,可能不預期為完全可及的(資料未示出)。
發現攜有生殖系化CDR胺基酸之大部分S2P6抗體亦有效地結合至少一種乙型冠狀病毒。在CDRH3中之殘基103處包含纈胺酸代替甘胺酸之變體缺乏與測試病毒之結合(圖59及圖76-77)。 其他論述
S2P6活體外活化免疫細胞依賴性效應功能且保護用SARS-CoV-2 Wuhan-1及B.1.351病毒株攻擊之倉鼠。 自恢復期SARS -CoV -2 暴露個體分離廣泛中和 β - 冠狀病毒mAb
為鑑別靶向S醣蛋白之高度守恆區的mAb,查詢來自COVID-19恢復期供體之人類IgG +記憶B細胞。鑑定mAb,其結合至屬於所有三種感染人類之β-冠狀病毒亞屬之病毒(亦即薩貝冠狀病毒(SARS-CoV及SARS-CoV-2)、莫貝冠狀病毒(MERS-CoV)及埃貝冠狀病毒(OC43及HKU1))的融合前穩定之S胞外區域三聚體,但不結合至人類a-冠狀病毒(229E及NL63)。S2P6及S2S43 mAb衍生自二個供體且使用VH1-46*01及D5-12*01基因。總體而言,可變區中之此等mAb中體細胞突變之位準有限。mAb以相當的表觀親合力結合至融合前及融合後SARS-CoV-2 S,指示其同源表位可在S醣蛋白之二個構形狀態下獲得。
選擇S2P6用於進一步表徵且展示S2P6結合至所有所測試之全長SARS-CoV-2 S變體、結合至代表在ExpiCHO細胞之表面上短暫表現之所有薩貝冠狀病毒分枝系之24種S醣蛋白。使用表面電漿子共振(SPR),發現S2P6 Fab片段對於SARS-CoV-2 S及SARS-CoV S具有最高親和力,隨後為MERS-CoV S及OC43 S,其平衡解離常數(K D)分別為7、7、12及16 nM。S2P6亦結合至HKU1 S,儘管親和力降低(K D為約120 nM)。此mAb對融合前SARS-CoV-2 S之識別為pH依賴性的,在IgG及Fab形式二者中,在pH 7下,相對於pH 5,結合親和力更高。此等資料展現S2P6對於所有感染人類之β-冠狀病毒之獨特及有效交叉反應性。
為評估S2P6之中和效能及廣度,研究其在S活化蛋白酶TMPRSS2存在或不存在下抑制真SARS-CoV-2進入Vero-E6細胞之能力。S2P6完全中和TMPRSS2陽性Vero-E6細胞之感染,但在中和Vero-E6細胞之感染方面不太有效。先前研究確定SARS-CoV-2進入經培養之肺細胞的主要途徑經由與細胞質膜之TMPRSS2活化融合發生(Hoffmann, Mösbauer等人. 2020;Hoffmann, Kleine-Weber等人. 2020;Hoffmann, Kleine-Weber及Pöhlmann 2020)。相對於缺乏此蛋白酶之細胞,更有效S2P6介導之對SARS-CoV-2進入表現TMPRSS2之Vero-E6細胞的中和與在核內體pH值下之抑制結合一致,且表明S2P6對與肺細胞感染相關之病毒進入路徑最大限度地有效。評估S2P6介導之對用SARS-CoV-2 S及若干受關注之變體(VOC)(包括B.1.1.7、B.1.351及P.1)假型化的水皰性口炎病毒(VSV)之中和(Kaname等人. 2010)。觀測到針對親代SARS-CoV-2 D614G S發現的效能類似。此外,S2P6以0.02至17 μg/ml範圍內之IC50值抑制SARS-CoV S、廣東穿山甲2019 (P-GD) S、MERS-CoV S及OC43 S VSV假型。S2P6因此特徵為前所未有的廣泛β-冠狀病毒中和活性,包括SARS-CoV-2及循環VOC。
為界定由鑑定之mAb識別之表位,使用15聚體線性重疊肽進行肽定位實驗。發現所有mAb結合至含有SARS-CoV-2模體F 1148KEELDKYF 1156之肽,該模體位於S2次單元內之莖螺旋中。此區在β-冠狀病毒中高度守恆。S2P6以類似量值結合至感染人類之五種β-冠狀病毒(儘管對於HKU1具有較快的解離速率)以及MERS-CoV相關蝙蝠病毒(HKU4及HKU5)及鼠類肝炎病毒(MHV)之莖螺旋肽。S2S43展現與S2P6之類似整體結合,其中對HKU1、HKU4及HKU5肽之反應性明顯較弱。
在S2P6存在下,使用複製勝任型VSV-SARS-CoV-2 S嵌合病毒活體外進行病毒逃逸突變選擇(Case等人. 2020)。二次繼代之後,藉由S2P6進行的病毒中和完全消除且深度定序分析揭示五個不同抗性突變之出現:L1152F、D1153N/G/A及F1156L。此等突變與取代掃描分析中藉由S2P6之結合降低一致。此等突變之累積頻率在第二次繼代之後大於90%且其作為準物種出現(亦即,其在同一定序讀段內不可見)。在關鍵界面殘基處進行中和逃脫突變體之分離強調針對S2P6 mAb結合所鑑別之相互作用的關鍵作用。然而,已在循環SARS-CoV-2分離株中以極低流行率偵測到此等突變(0.01%,截至2021年4月30日偵測到1,217,814個序列中之146個)。
為驗證S2P6介導之廣泛冠狀病毒中和之所推斷機制,首先展示使用ELISA,S2P6結合未藉由ACE2阻斷SARS-CoV-2 S之參與。然而,S2P6阻斷經全長SARS-CoV-2 S轉染之Vero-E6細胞之間的細胞-細胞融合,其如將SARS-CoV-2 S鎖定在閉合態的S2M11 mAb同樣有效(M. A. Tortorici等人. 2020)。已描述靶向RBD抗原位點Ia (例如S2E12)及IIa (例如S2X259或S2X35)之mAb,其可模擬受體附著且過早地觸發促融S構形變化(A. C. Walls等人. 2019;Lempp等人. 2021;Piccoli等人. 2020)。因此,S2P6消除由S2E12在低至1 ng/ml之濃度下介導之融合細胞的形成。總體而言,此等結果表明S2P6中和之主要機制為經由由阻礙S促融重排導致的對膜融合的抑制來防止病毒進入。 針對SARS -CoV -2 攻擊之S2P6 介導之保護藉由倉鼠中之Fc 介導之效應功能增強
Fc介導之效應功能可藉由促進病毒清除及抗病毒免疫反應而有助於活體內保護(Schäfer等人. 2021;Bournazos, Wang及Ravetch 2016;Bournazos等人. 2020;Winkler等人. 2020)。分析S2P6觸發FcγRIIa及FcγRIIIa之活化以及活體外發揮Fc效應功能之潛力。S2P6使用螢光素酶報導體分析促進中等劑量依賴性FcγRIIa及FcγRIIIa介導之信號傳導。在表現SARS-CoV-2 S之ExpiCHO目標細胞(CHO-S)與人類NK細胞一起培育之後,S2P6促進Ab依賴性細胞毒性(ADCC)之穩固活化,達到與S309 mAb下觀測到之位準相當的位準(Pinto等人. 2020)。使用Cell-Trace-Violet標記之周邊血液單核細胞(PBMC)作為吞噬細胞及CHO-S細胞,S2P6亦展示Ab依賴性細胞吞噬作用(ADCP)活性。最後,S2P6不促進補體依賴性細胞毒性(CDC),指示S2P6 Fc介導之效應功能,而非補體活化,可能參與活體內病毒控制。
評估敍利亞倉鼠模型中S2P6(含有完全人類IgG1或倉鼠IgG2a恆定區)針對原型(Wuhan-1相關) SARS-CoV-2之攻擊的預防性活性(Boudewijns等人. 2020)。先前發現展示,人類IgG1 mAb不能識別倉鼠FcgR (Lempp等人. 2021);因此亦在倉鼠IgG2型式中產生S2P6以提供與倉鼠FcgR之最佳相互作用。在鼻內SARS-CoV-2攻擊之前24h投予二種不同劑量之人類IgG1 (Hu-S2P6)或倉鼠IgG2 (Hm-S2P6),且在感染後4天評估動物之肺的病毒RNA負荷及複製病毒。相對於對照(不相關) mAb,以20 mg/kg投予之Hm-S2P6使倉鼠之肺中的病毒RNA複本及複製病毒效價降低二個數量級。此外,20 mg/kg之Hm-S2P6使肺中偵測到之病毒RNA複本降低至顯著地低於在Hu-S2P6下觀測到之位準的位準,表明活體內S2P6效應功能之有益作用。基於活體外觀測到之針對SARS-CoV-2 VOC之相當S2P6中和效能,評估用SARS-CoV-2 B.1.351攻擊之倉鼠中S2P6之保護功效。相對於對照組,以20 mg/kg預防性投予Hu-S2P6使肺中之複製病毒效價(而非RNA複本數)降低約1.5個數量級,符合迄今為止鑑別之所有VOC中的莖螺旋表位之嚴格守恆性。
總體而言,此等發現指示靶向S融合機構中高度守恆表位之Ab可活體外觸發Fc介導之ADCC及ADCP且經由活體內中和及效應功能二者保護免受SARS-CoV-2攻擊。 天然感染或疫苗接種主要引發具有窄特異性之莖螺旋導引 Ab
為瞭解引發莖螺旋特異性Ab之頻繁程度,使用來自大流行前、恢復期及經疫苗接種之個體的血漿樣品進行血清學分析。測定血漿IgG與SARS-CoV-2/SARS-CoV (SARS-CoV/-2)、OC43、MERS-CoV、HKU1、HKU4及HKU5之莖螺旋肽之結合的效價。總體而言,血漿Ab與莖螺旋肽之結合在大流行前樣品中未發現,但HKU1除外,可能反映此群組中之先前經此病毒之感染。相反地,在先前感染SARS-CoV-2或接受二次劑量之mRNA疫苗的個體中發現呈低頻率的莖螺旋特異性Ab。總體而言,此等資料展示,對莖螺旋之血漿Ab反應在SARS-CoV-2感染或疫苗接種後誘發,但其相對罕見。
使用基於活體外多株刺激之純系分析(此處稱為抗原特異性B細胞記憶譜系分析(AMBRA)),研究21個恢復期及17個經疫苗接種之個體之記憶B細胞譜系中的莖螺旋特異性Ab之頻率(Pinna等人. 2009)。在二個群組中,觀測到介於0.1-2.5%範圍內之莖螺旋特異性IgG頻率,不同之處在於一個個體(經感染及經單次劑量之mRNA疫苗接種),對此個體,量測到97%頻率之SARS-CoV/-2特異性Ab。發現大多數SARS-CoV-2莖螺旋特異性Ab可與OC43交叉反應,與此二種病毒之莖螺旋之較高序列一致性一致。在一些個體中發現對HKU1 S莖螺旋具有特異性之Ab,但其不與其他b-冠狀病毒交叉反應。此分析揭露對所有測試之莖螺旋b-冠狀病毒肽具有交叉反應性的單一實例。
此等發現表明,莖螺旋Ab很少在SARS-CoV-2感染或疫苗接種後誘導且似乎在b-冠狀病毒中具有有限的交叉反應性。 廣泛反應性 b - 冠狀病毒 Ab 經由體細胞突變獲得親和力及廣度
為界定S2P6之個體發生,產生一組生殖系變體。相對於生殖系經突變之7種S2P6重鏈殘基中之二個促成表位識別(Q32及H57),而5種輕鏈突變殘基中無一者參與S結合。為應對VH及VK體細胞突變之作用,產生一組S2P6生殖系變體的重鏈或輕鏈或二個可變區(VH及VK)。完全生殖系S2P6 (UCA)結合至OC43及MERS-CoV莖螺旋肽(相較於突變mAb具有高於約1數量級的EC50)但不結合至SARS-CoV/-2或HKU1肽。VH中之體細胞突變對於高親合力結合至SARSCoV/-2足夠,而VH與VK突變為最佳結合至HKU1所需。發現CDRH3中殘基G103之存在對於結合至所有b-冠狀病毒而言為必需的。總體而言,此等發現指示S2P6 mAb可能回應於OC43感染而產生,且其特異性針對SARS-CoV-2及HKU1在天然感染此等β-冠狀病毒中之一者或二者後經由選擇的體細胞突變擴大。
冠狀病毒S 2次單元(所謂的融合機構)含有若干重要抗原位點,包括融合肽及七肽重複2區,且比S 1次單元更守恆(Daniel等人. 1993;Zhang等人. 2004;Poh等人. 2020;Elshabrawy等人. 2012;Zheng等人. 2020)。因此,其為用於廣泛冠狀病毒偵測及中和之引人注目之目標(A. C. Walls等人. 2016)。最近鑑別靶向莖螺旋之3種交叉反應性mAb揭示此先前未知的S2次單元表位,其在β-冠狀病毒S醣蛋白中守恆(Sauer等人. 2020;C. Wang等人. 2021;Song等人. 2020),儘管其中無一者抑制所有三種β-冠狀病毒亞屬(譜系)的成員。此處,鑑別出靶向S莖螺旋中之重疊表位且與人類及動物b-冠狀病毒交叉反應的mAb。S2P6經由抑制膜融合廣泛地中和所評估之所有薩貝冠狀病毒、莫貝冠狀病毒及埃貝冠狀病毒,且提供證據證明S2次單元引導mAb保護倉鼠免於SARS-CoV-2攻擊,包括經SARS-CoV-2 B.1.351 VOC之攻擊,具有Fc介導之效應功能之有益作用。此等資料擴展描述效應功能參與SARS-CoV-2 RBD特異性mAb (Schäfer等人. 2021;Winkler等人. 2020)以及A型流感紅血球凝集素莖特異性廣泛中和mAb (Corti等人. 2011;DiLillo等人. 2014)之活體內功效的先前研究。此觀察結果暗示針對mAb之在流感紅血球凝集素之莖上之高度守恆表位的類似發現,且指示交叉反應性加效應功能之組合可為針對此等感染之抗體提供特定效能(參考文獻)。
S2P6之格外廣泛交叉反應性及中和廣度可藉由b-冠狀病毒中之莖螺旋之守恆性質解釋。在SARS-CoV-2內,已報告少於0.01%序列在GISAID (日期)中保藏之超過1.3百萬基因體中S殘基1146與1159之間突變且無SARS-CoV-2 VOC在此區內具有殘基取代。
認為莖螺旋在融合前SARS-CoV-2 S中形成3螺旋束,且可能需要動態構形變化以暴露原本埋的疏水性表位,該疏水性表位由守恆聚醣包圍,可能進一步屏蔽此守恆位點。此處所示之結果提供證據證明,莖螺旋靶向之Ab在藉由地方流行性(OC43或HKU1)或大流行性(SARS-CoV-2)冠狀病毒天然感染後以及藉由COVID-19 mRNA疫苗引發。然而,可能由於表位暴露有限,因此莖螺旋特異性Ab以較低效價存在於恢復期或經疫苗接種之個體的血漿樣品中且以低頻率存在於其記憶B細胞譜系中。
靶向莖螺旋之Ab主要具有窄特異性且其中僅少數經由體細胞突變積聚介導廣泛β-冠狀病毒中和及保護。 實施例2 人類乙型冠狀病毒刺突蛋白之分析
來自人類乙型冠狀病毒刺突蛋白的部分S2區段展示於圖7中。確定融合前胞外區域之C端部分中之區(圖8A)具有一定守恆性。圖8B中提供一模型,該模型展示融合前胞外區域尾部處之暴露表面連接子區的螺旋結構。圖8C展示暴露表面連接子區之近視圖且指示某些胺基酸殘基。結構分析提供以下: 表3.乙型冠狀病毒連接子螺旋構件中胺基酸之結構特徵(胺基酸編號如同融合前構形)
殘基 觀測結果
F1148 未暴露
K1149 部分暴露(側鏈)
E1150 完全暴露(HKU1中之S及MERS-CoV中之D)
E1151 完全暴露且完全守恆
L1152 未暴露
D1153 完全暴露(HKU1中之S)
K1154 極暴露(OC43中之Q,HKU1中之H及MERS-COV中之E)
Y1155 部分暴露(OC43及HKU1中之W,及MERS-COV中之F)
F1156 未暴露
K1157 完全暴露且完全守恆
N1158 完全暴露且完全守恆(在所有薩貝冠狀病毒中守恆之醣基化位點)
亦檢驗融合後刺突蛋白之結構(圖9A)。連接子區之詳細視圖(圖9B及圖9C(展示為9C之底部的融合前構形以用於比較))展示部分重排及暴露殘基1148-1158。融合後圖9A-9C中殘基之編號不考慮信號肽,此添加額外18個殘基位置。 實例3 材料及方法
對於圖1-46中所呈現之資料,使用以下材料及方法: 產生穩定的過度表現細胞株
藉由用編碼DC-SIGN (CD209)、L-SIGN (CLEC4M)、SIGLEC1、TMPRSS2或ACE2 (所有自Genecopoeia獲得)之慢病毒表現質體及對應的慢病毒輔助質體共轉染Lenti-X 293T細胞(Takara)來產生慢病毒。轉染後四十八小時,收穫上清液中之慢病毒且藉由在20,000 rpm下超速離心2 h濃縮。在6 ug/mL凝聚胺(Millipore)存在下使Lenti-X 293T (Takara)、Vero E6 (ATCC)、MRC5 (Sigma-Aldrich)、A549 (ATCC)轉導24 h。隨後轉導過度表現二個轉殖基因之細胞株。在轉導之後二天開始用嘌呤黴素及/或殺稻瘟菌素(Gibco)之選擇且使選擇試劑保持在生長介質中以用於所有後續培養。單一細胞純系衍生自A549-ACE2-TMPRSS2細胞株,所有其他細胞株表示細胞池。 SARS-CoV-2 中和
使在補充有10% FBS (VWR)及1x青黴素/鏈黴素(Thermo Fisher Scientific)之DMEM中培養之Vero E6或Vero E6-TMPRSS2細胞以20,000個細胞/孔接種於黑色96孔盤中。在37℃下在BSL-3設施中使單株抗體之連續1:4稀釋液與200 pfu之SARS-CoV-2 (分離株USA-WA1/2020,第3代,在Vero E6細胞中繼代)一起培育30 min。移除細胞上清液且將病毒-抗體混合物添加至細胞中。感染後24 h,用4%多聚甲醛固定細胞30 min,接著進行二次PBS (pH 7.4)洗滌,且用含0.25% Triton X-100之PBS滲透30 min。在5%奶粉/PBS中阻斷30 min之後,將細胞與靶向SARS-CoV-2核衣殼蛋白(Sino Biological,目錄號40143-R001)之一級抗體在1:2000稀釋度下一起培育1h。在洗滌且與與1 μg/ml Hoechst33342混合之二級經Alexa647標記之抗體一起培育1小時之後,使盤在自動細胞成像讀取器(Cytation 5,Biotek)上成像,且使用製造商提供的軟體對核衣殼-陽性細胞進行計數。 SARS-CoV-2-Nluc 中和
使用SARS-CoV-2-Nluc,一種編碼奈米螢光素酶之SARS-CoV-2之感染性純系(基於病毒株2019-nCoV/USA_WA1/2020),代替病毒ORF7來確定中和,該病毒ORF7展現與野生型病毒相當的生長動力學(Xie等人, Nat Comm, 2020, https://doi.org/10.1038/s41467-020-19055-7)。使細胞以20,000個細胞/孔接種至黑色外壁、透明底的96孔盤中(293T細胞以35,000個細胞/孔接種至經聚-L-離胺酸塗佈之孔中)且在37℃下培養隔夜。次日,在感染培養基(DMEM + 10% FBS)中製備抗體之9點4倍連續稀釋液。將SARS-CoV-2-Nluc以指定MOI稀釋於感染培養基中,添加至抗體稀釋液且在37℃下培育30 min。自細胞中移除培養基,添加mAb-病毒複合物,且在37℃下培育細胞24 h。自細胞中移除培養基,根據製造商的建議添加奈米-Glo螢光素酶受質(Promega),在室溫下培育10 min,且在VICTOR Nivo盤讀取器(Perkin Elmer)上定量螢光素酶信號。 SARS-CoV-2 假型化 VSV 產生及中和
為了產生SARS-CoV-2假型化水泡性口炎病毒,使Lenti-X 293T細胞(Takara)接種於10-cm培養皿中,直至80%次日匯合。次日,根據製造商說明書使用TransIT-Lenti (Mirus Bio)使細胞經編碼含有C端19 aa截斷之SARS-CoV-2 S-醣蛋白(YP_009724390.1)的質體轉染。轉染後一天,使細胞以3個感染性單位/細胞之MOI經VSV (G*ΔG-螢光素酶) (Kerafast)感染。在一小時之後洗去病毒接種物且在37℃下再培育細胞一天。在轉染後第2天收集含有SARS-CoV-2假型化VSV之細胞上清液,在1000 x g下離心5分鐘,以移除細胞碎片,等分且在-80℃下冷凍。
對於病毒中和,使細胞以20,000個細胞/孔接種至黑色外壁、透明底的96孔盤中(293T細胞以35,000個細胞/孔接種至經聚-L-離胺酸塗佈之孔中)且在37℃下培養隔夜。次日,在培養基中製備抗體之9點4倍連續稀釋液。SARS-CoV-2假型化VSV在100 ng/mL抗VSV-G抗體(純系8G5F11,絕對抗體)存在下在培養基中以1:30稀釋,且1:1添加至各抗體稀釋液中。病毒:抗體混合物在37℃下培育1小時。自細胞中移除培養基且將50 μL病毒:抗體混合物添加至細胞中。感染後一小時,將100 μL培養基添加至所有孔中且在37℃下培育17-20小時。移除培養基且將50 μL Bio-Glo試劑(Promega)添加至各孔中。在室溫下使盤在盤振盪器上在300 RPM下振盪15分鐘,且在EnSight盤讀取器(Perkin-Elmer)上讀取RLU。 基於轉染之黏附受體篩選
Lenti-X 293T細胞(Takara)經編碼以下受體候選物之質體(所有購自Genecopoeia)轉染:ACE2 (NM_021804)、DC-SIGN (NM_021155)、L-SIGN (BC110614)、LGALS3 (NM_002306)、SIGLEC1 (NM_023068)、SIGLEC3 (XM_057602)、SIGLEC9 (BC035365)、SIGLEC10 (NM_033130)、MGL (NM_182906)、MINCLE (NM_014358)、CD147 (NM_198589)、ASGR1 (NM_001671.4)、ASGR2 (NM_080913)、NRP1 (NM_003873)。轉染後一天,在37℃下使細胞在100 ng/ml抗VSV-G抗體(純系8G5F11,絕對抗體)存在下經SARS-CoV-2假型化VSV以1:20稀釋度感染。感染後一小時,將100 μL培養基添加至所有孔中且在37℃下培育17-20小時。移除培養基且將50 μL Bio-Glo試劑(Promega)添加至各孔中。在室溫下使盤在盤振盪器上在300 RPM下振盪15分鐘,且在EnSight盤讀取器(Perkin-Elmer)上讀取RLU。 轉染
使穩定地表現DC-SIGN、L-SIGN或SIGLEC1之親代HeLa細胞或HeLa細胞以5,000個細胞/孔接種於黑色外壁、透明底的96孔盤中。一天後,細胞達成約50%匯合且在37℃下在100 ng/mL抗VSV-G抗體(純系8G5F11,絕對抗體)存在下經SARS-CoV-2假型化VSV以1:10稀釋度接種2 h。對於抗體介導之轉染的抑制,使細胞與10 ug/mL抗SIGLEC1抗體(Biolegend,純系7-239)一起預培育30 min。2 h接種之後,將細胞用完全培養基洗滌四次且添加10,000個VeroE6-TMPRSS2細胞/孔,且在37℃下培育17-20 h以用於轉染。移除培養基且將50 μL Bio-Glo試劑(Promega)添加至各孔中。在室溫下使盤在盤振盪器上在300 RPM下振盪15分鐘,且在EnSight盤讀取器(Perkin-Elmer)上讀取RLU。 CHO-S 細胞之細胞 - 細胞融合
使穩定地表現SARS-CoV-2 S醣蛋白之CHO細胞以12'500個細胞/孔接種於96孔盤中以用於顯微法(Thermo Fisher Scientific),且在第二天,將不同濃度之mAb及細胞核標記物Hoechst (最終稀釋度1:1000)添加至細胞且再培育24小時。使用Cytation 5 Imager (BioTek)確立融合程度,且使用對象偵測方案將細胞核偵測作為對象且量測其大小。發現稠合細胞(亦即,融合細胞)之細胞核在融合細胞之中心處聚集,且識別為獨特的較大對象,根據其大小來門控。稠合細胞中之對象的面積除以所有對象之總面積乘以100得到稠合細胞之百分比。 免疫螢光分析
在用4%多聚甲醛接種30 min之後,將HEK 293T細胞接種到經聚-D-離胺酸塗佈之96孔盤(Sigma-Aldrich)上且固定24 h,接著進行二次PBS (pH 7.4)洗滌且用含0.25% Triton X-100之PBS滲透30 min。使細胞與在室溫下稀釋於3%奶粉/PBS中之一級抗體抗DC-SIGN/L-SIGN (Biolegend,目錄號845002,1:500稀釋度)、抗DC-SIGN (Cell Signaling,目錄號13193S,1:500稀釋度)、抗SIGLEC1 (Biolegend,目錄號346002,1:500稀釋度)或抗ACE2 (R&D Systems,目錄號AF933,1:200稀釋度)一起培育2 h。在洗滌且與與1 ug/mL Hoechst33342混合之二級經Alexa647標記之抗體一起培育1小時之後,將盤在反向螢光顯微鏡(Echo Revolve)上成像。 ACE2/TMPRSS2 RT-qPCR
使用NucleoSpin RNA Plus套組(Macherey-Nagel)根據製造商的方案自細胞中提取RNA。RNA根據製造商說明書使用高容量cDNA反轉錄套組(Applied Biosystems)進行反轉錄。根據製造商的方案使用Luna Universal qPCR主混合物(新英格蘭生物實驗室)來定量ACE2 (正向引子:CAAGAGCAAACGGTTGAACAC (SEQ ID NO: 99)、反向引子:CCAGAGCCTCTCATTGTAGTCT (SEQ ID NO: 100))、HPRT (正向引子:CCTGGCGTCGTGATTAGTG (SEQ ID NO: 102)、反向引子:ACACCCTTTCCAAATCCTCAG (SEQ ID NO:103))及TMPRSS2 (正向引子:CAAGTGCTCCRACTCTGGGAT (SEQ ID NO: 104)、反向引子:AACACACCGRTTCTCGTCCTC (SEQ ID NO: 105))之胞內位準。使ACE2及TMPRSS2之位準正規化至HPRT。HeLa細胞用作參考樣品。所有qPCR在QuantStudio 3即時PCR系統(Applied Biosystems)上運行。 SARS2 D614G 刺突蛋白產生及生物素標記
使用293fectin作為轉染劑,將具有C端TEV裂解位點、T4噬菌體纖維蛋白摺疊子、8x His-、Avi-及EPEA-標籤之融合前穩定的SARS2 D614G刺突蛋白(包含胺基酸序列Q14至K1211)轉染至HEK293自由式細胞中。使細胞在37℃下靜置三天以產生蛋白質。隨後,藉由在500 xg下使細胞離心30分鐘,之後在4000 xg下再自旋30分鐘來收穫上清液。細胞培養物上清液經由0.2 μM過濾器過濾,且負載到5 mL C-標籤親和基質管柱上,用50 mM Tris pH 8及200 mM NaCl預平衡。使用10管柱體積之100 mM Tris、200 mM NaCl及3.8 mM SEPEA肽使SARS2 D614G刺突蛋白溶離。濃縮溶離峰且使用50 mM Tris pH 8及200 mM NaCl作為操作緩衝液,在Superose 6增加10/300 GL凝膠過濾管柱上注射。收集對應於單分散SARS2 D614G刺突蛋白之SEC溶離份且在液氮中急驟冷凍以儲存在-80℃下。使用來自Avidity之BirA500生物素標記套組對純化的SARS2 D614G刺突蛋白生物素標記。向50 μg刺突蛋白中添加5 ug BirA及11 uL BiomixA及BiomixB。在生物素標記反應期間之最終刺突蛋白濃度為約1 μM。使反應在4℃下進行16小時。隨後,使用用1×PBS pH 7.4預平衡之二個Zeba自旋管柱使蛋白質去鹽化。 針對 DC-SIGN L-SIGN SIGLEC1 ACE-2 之流式細胞測量術分析
使表現DC-SIGN、L-SIGN、SIGLEC1或ACE2之HEK 293T細胞在4x10 6個細胞/mL下再懸浮且將100 μL/孔接種到V形底96孔盤(Corning,3894)上。使盤在2,000 rpm下離心5分鐘且用PBS (pH 7.4)洗滌。使細胞再懸浮於含有Ghost violet 510成活力染料(Cell Signaling,目錄號13-0870-T100,1:1,000稀釋度)之200 μL PBS中,在冰上培育15分鐘且接著洗滌。使細胞再懸浮於在含有以1:100稀釋度之一級抗體(小鼠抗DC/L-SIGN (Biolegend,目錄號845002)、兔抗-DC-SIGN (Cell Signaling,目錄號13193)、小鼠抗SIGLEC1 (Biologend,目錄號346002)或山羊抗ACE2 (R&D Systems,目錄號AF933))的PBS中用0.5% BSA (Sigma-Aldrich)製備之100 μL FACS緩衝液中。在冰上培育1 h之後,將細胞洗滌二次且再懸浮於含有在1:200稀釋度下之Alexa Fluor-488標記的二級抗體(山羊抗小鼠(Invitrogen目錄號A11001)、山羊抗兔(Invitrogen目錄號A11008)或驢抗山羊(Invitrogen目錄號A11055))之FACS緩衝液中。在冰上培育45 min之後,將細胞用200 μL FACS緩衝液洗滌三次且在室溫下用200 μL 4% PFA (Alfa Aesar)固定15 min。洗滌細胞三次,再懸浮於200 μL FACS緩衝液中且藉由流式細胞測量術使用CytoFLEX流式細胞儀(Beckman Coulter)分析。 結合至細胞之 SARS-CoV-2 刺突蛋白及 RBD 的流式細胞測量術
在室溫下使生物素標記之SARS-CoV-2刺突蛋白D614G蛋白質(Spikebiotin,內部產生)或生物素標記之SARS-CoV-2刺突蛋白受體結合區域(RBDbiotin,Sino Biological,40592-V08B)與Alexa Fluor® 647鏈黴抗生物素蛋白(AF647-鏈黴素,Invitrogen,S21374)以1:20體積比一起培育20 min。接著將標記之蛋白質儲存於4℃下直至進一步使用。將細胞用TrpLE Express (Gibco,12605-010)解離且使10 5個細胞轉移至96孔V底盤(Corning,3894)之各孔中。在流式細胞測量術緩衝液(2% FBS於PBS中(不含Ca/Mg))中洗滌細胞二次,且在冰上在20 µg/ml之最終濃度下用Spikebiotin-AF647-鏈黴素染色或在7.5 µg/ml之最終濃度下用RBDbiotin-AF647-鏈黴素染色1h。將染色細胞用流式細胞測量術緩衝液洗滌二次,再懸浮於1% PFA (Electron Microscopy Sciences,15714-S)中且用Cytoflex LX (Beckman Coulter)分析。 SARS - CoV - 2 特異性 mAb 之重組表現
如先前所描述,自SARS-CoV-2免疫供體之漿細胞或記憶B細胞中分離人類mAb。重組抗體在37℃及8% CO 2下表現於ExpiCHO細胞中。使用ExpiFectamine轉染細胞。在用ExpiCHO進料及ExpiFectamine CHO增強劑轉染之後1天,補充經轉染的細胞。在轉染之後八天收集細胞培養物上清液,且經由0.2 µm過濾器過濾。重組抗體使用5 mL HiTrap™ MabSelect™ PrismA管柱在ÄKTA xpress FPLC裝置上進行親和力純化,之後使用HiPrep 26/10去鹽化管柱與組胺酸緩衝液(20 mM組胺酸,8%蔗糖,pH 6)進行緩衝液交換。 倉鼠中之 SARS-CoV-2 感染模型 病毒製劑
自獲自2020年2月自中國武漢返回的經RT-qPCR確認之無症狀性患者的鼻咽拭子中回收用於此研究中之SARS-CoV-2病毒株BetaCov/Belgium/GHB-03021/2020 (EPI ISL 109 407976|2020-02-03)。藉由譜系學分析確認與原型Wuhan-Hu-1 2019-nCoV (GenBank寄存112編號MN908947.3)病毒株之密切關係。藉由在HuH7及Vero E6細胞上連續繼代來分離感染性病毒;第6代病毒用於本文所述之研究中。病毒原液之效價藉由用Reed及Muench方法在Vero E6細胞上進行端點稀釋來確定。 細胞
在補充有10%胎牛血清(Integro)、1% L-麩醯胺酸(Gibco)及1%碳酸氫鹽(Gibco)之最小基本培養基(Gibco)中培養Vero E6細胞(非洲綠猴腎臟,ATCC CRL-1586)。用含有2%胎牛血清而非10%之培養基進行端點滴定。 倉鼠中之 SARS-CoV-2 感染模型
先前已描述SARS-CoV-2之倉鼠感染模型。特定研究設計展示於以下示意圖中。簡言之,野生型敍利亞黃金倉鼠(金倉鼠( Mesocricetus auratus))係購自Janvier實驗室,且每二隻圈養在通氣的隔離籠(IsoCage N Biocontainment System,Tecniplast)中,可隨意獲取食物及水且具有籠豐富化(cage enrichment) (木塊)。在研究開始之前使動物適應4天。飼養條件及實驗程序經魯汶大學動物實驗倫理委員會批准(許可證P065-2020)。雌性6-8週齡倉鼠用氯胺酮/甲苯噻嗪/阿托品麻醉且鼻內接種50 μL含有2×10 6TCID50 SARS-CoV-2 (第0天)。 治療方案
在藉由腹膜內投予(i.p.)感染之前48h預防性處理動物,且監測外觀、行為及體重。在感染後(p.i.)第4天,藉由腹膜內注射500 μL Dolethal (200 mg/mL戊巴比妥鈉,Vétoquinol SA)使倉鼠安樂死。收集肺且分別藉由RT-qPCR及端點病毒滴定來定量病毒RNA及感染性病毒。在感染之前收集血液樣品用於PK分析。 SARS-CoV-2 RT-qPCR
使用珠粒破壞(Precellys)使所收集之肺組織在350 μL RLT緩衝液(RNeasyMinikit,Qiagen)中均質化,且離心(10.000 rpm,5 min)以集結細胞碎片。根據製造商說明書提取RNA。在50 μL溶離液中,4 μL用作RT-qPCR反應中之模板。使用具有靶向核衣殼之N2引子及探針的iTaq通用探針一步驟RT-qPCR套組(BioRad)在LightCycler96平台(Roche)上進行RT-qPCR。SARS-CoV-2 cDNA (IDT)之標準物用於表現每mg組織或每mL血清之病毒基因體複本。 端點病毒滴定
使用珠粒破壞(Precellys)使肺組織在350 μL最小基本培養基中均質化,且離心(10.000 rpm,5 min,4℃)以集結細胞碎片。為了定量感染性SARS-CoV-2粒子,在96孔盤中在匯合的Vero E6細胞上進行終點滴定。藉由Reed及Muench方法使用Lindenbach計算器計算病毒效價,且表示為每mg組織50%組織培養物感染劑量(TCID50)。 組織學
對於組織學檢查,將肺在4%甲醛中固定隔夜且包埋於石臘中。在用蘇木精及曙紅染色之後分析組織切片(5 μm),且藉由專門病理學家對肺損害無分別地進行評分。累積評分為1至3之評分參數如下:充血、肺泡內出血、支氣管壁中之凋亡體、壞死性細支氣管炎、血管周水腫、支氣管性肺炎、血管周發炎、支氣管周發炎及血管炎。 免疫複合物與倉鼠單核球之結合
免疫複合物(IC)藉由使用精確莫耳比(分別為4:8:1)使S309 mAb (倉鼠IgG,wt或N297A)與經生物素標記之抗個體基因型Fab片段及Alexa-488-鏈黴抗生物素蛋白複合來產生。在4℃下用自未處理動物中獲得之新鮮成活的倉鼠脾細胞連續稀釋培育預先產生之螢光IC持續3小時。接著在排除死亡細胞及在單核球群體上物理門控時藉由細胞測量術評估細胞結合。結果表示為整個單核球群體之Alexa-488平均螢光強度。 生物資訊分析
自Github (github.com/krasnowlab/HLCA)下載所處理之人類肺細胞圖譜(HLCA)資料及細胞類型標註。自NCBI GEO資料庫(ID:GSE158055)及Github (github.com/zhangzlab/covid_balf)下載所處理之單細胞轉錄組資料及來自SARS-CoV-2感染個體之肺上皮及免疫細胞的標註。自NCBI SRA (ID:PRJNA608742)下載來自藉由Liao等人之第二單細胞轉錄組學研究之可用的序列資料,以用於檢驗對應於病毒RNA之讀數。藉由對支持前導-TRS接合點之含TRS之讀數進行計數估計sgRNA相對於基因體RNA之比例。自Alexandersen等人中改編用於偵測前導-TRS接合點讀數的準則及方法。病毒基因體參考及TRS標註係基於Wuhan-Hu-1 NC_045512.2/MN908947 49。僅來自具有重度COVID-19之個體的2個樣品具有可偵測之前導-TRS接合點讀數(SRR11181958,SRR11181959)。
對於圖47-79中所呈現之資料,使用以下材料及方法: 細胞株
用於此研究中之細胞株獲自ATCC (HEK293T及Vero-E6)或ThermoFisher Scientific (Expi CHO細胞、FreeStyle™ 293-F細胞及Expi293F™細胞)。 樣品供體
在由當地機構審查委員會(瑞士提契諾州倫理委員會(Canton Ticino Ethics Committee, Switzerland),意大利米蘭路易吉-薩科醫院倫理委員會(the Ethical committee of Luigi Sacco Hospital, Milan, Italy)及北美WCG (WCG North America) (美國新澤西州普林斯頓(Princeton, NJ, US)))批准之研究方案下,樣品獲自2019年6月前募集之個體(大流行前)、SARS-CoV-2感染個體或經Moderna或Pfizer/BioNTech BNT162b2疫苗免疫接種之經疫苗接種個體的群組。所有供體提供書面知情同意書用於使用血液及血液組分(諸如PBMC、血清或血漿)且在醫院或作為門診募集。藉由Ficoll密度梯度離心自血液分離PBMC且新鮮使用或儲存於液氮中以便後續使用。自使用含有凝血活化劑之管收集的血液獲得血清,之後離心且儲存在-80℃下。 IgG 抗體之 AMBRA ( 抗原特異性記憶 B 細胞譜系分析 )
將PBMC之一式多份培養物接種於96 U底盤(Corning)中且在37℃、5% CO2下用2.5 μg/ml R848 (3 M)及1000 U/ml人類重組IL-2刺激10天。收集細胞培養物上清液用於進一步分析。 抗體發現及表現
自恢復期個體之總PBMC分離及選殖抗原特異性IgG+記憶B細胞。藉由反轉錄PCR (RT-PCR)獲得抗體VH及VL序列,且mAb表現為重組人類IgG1,在Fc區或Fab片段中攜有半衰期延長M428L/N434S (LS)突變。如先前所描述用重鏈及輕鏈表現載體短暫轉染ExpiCHO細胞(Pinto等人. 2020)。對於敍利亞倉鼠中之活體內實驗,用敍利亞倉鼠IgG2 Fc產生S2P6。使用IMGT/V-QUEST構築UCA序列且重組產生具有體細胞突變之VH及VL。使用PBS作為移動相,使用針對全長人類及倉鼠mAb之HiTrap蛋白A管柱(Cytiva)及針對Fab片段之CaptureSelect CH1-XL MiniChrom管柱(ThermoFisher Scientific),在由UNICORN軟體版本5.11 (Build 407)操作之ÄKTA Xpress FPLC (Cytiva)上進行MAb親和純化。用HiTrap快速去鹽化管柱(Cytiva)進行對適當調配緩衝液之緩衝液交換。最終產物藉由經由0.22 µm過濾器過濾來滅菌且儲存在4℃下。 表現刺突蛋白之ExpiCHO -S 細胞上抗體之流式細胞測量術
對於Expi-CHO細胞短暫轉染,S質體(Pinto等人. 2020;M. Alejandra Tortorici等人. 2021)在冷OptiPRO SFM中稀釋,與ExpiFectamine CHO試劑(Life Technologies,A29130)混合且於50 ml生物反應器中添加至5 ml體積的以6×10 6個細胞/毫升接種之細胞中。將經轉染細胞在37℃、8% CO2下以209 rpm之軌道震盪速度(25 mm之軌道直徑)培育42小時。為了測試mAb結合,收集經轉染之ExpiCHO細胞,在洗滌緩衝液(含牛血清白蛋白(BSA;Sigma)之PBS的1% w/v溶液,2 mM EDTA)中洗滌二次,且以60,000個細胞/孔分佈至96 U底盤(Corning)中。將來自10 µg/ml之mAb連續稀釋液在冰上添加至細胞上持續30分鐘,且在二次洗滌之後,使用經Alexa Fluot647標記之山羊抗人類IgG二次Ab (Jackson Immunoresearch,109-606-098)進行偵測。在冰上培育15分鐘之後,洗滌細胞二次且使用ZE5細胞分析儀(Biorard)藉由流式細胞測量術分析mAb結合。 酶聯免疫吸附分析(ELISA)
在4℃下用重組穩定的融合前刺突蛋白三聚體或S2次單元以1 µg/ml或冠狀病毒莖螺旋肽以8 µg/ml (全部均在磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)中稀釋)塗佈具有高蛋白質結合處理之Spectraplate-384 (Perkin Elmer)或96孔盤(Corning)隔夜。將盤用含牛血清白蛋白(BSA;Sigma)之PBS的1% w/v溶液阻斷,或對於使用血漿之ELISA,用補充有0.05%吐溫(Tween) 20之PBS(Thermo Fisher Scientific)中之阻斷劑酪蛋白(1% w/v)阻斷。在室溫下添加mAb或血漿之連續稀釋液持續1小時。在進一步洗滌之後,使用與培育1小時之鹼性磷酸酶(Jackson Immunoresearch)偶聯之抗人類IgG揭露mAb結合。使用受質(p-NPP,Sigma)進行顯色且藉由微量盤讀取器(Biotek)在405 nm下讀取盤。資料已用Graph Prism軟體繪製。 SARS - CoV - 2 刺突蛋白至 ACE2 之阻斷
將SARS-CoV-2 S融合前(最終濃度300 ng/ml)在37℃下與1 µg/ml S309小鼠Fc標記之mAb (S309-mFc)一起培育30分鐘,之後添加連續稀釋之S2P6 (自20 µg/ml)且在37℃下再培育30分鐘。接著將複合刺突蛋白:S309:S2P6添加至預塗佈hACE2 (2 µg/ml於PBS中) 96孔盤MaxiSorp (Nunc)中且在室溫下培育1小時。隨後,洗滌盤且添加二級Ab山羊抗小鼠IgG (Southern Biotech)以偵測SARS-CoV-2刺突蛋白:S309-mFc結合。在進一步洗滌之後,添加受質(p-NPP,Sigma),且使用微量盤讀取器(Biotek)在405 nm下讀取盤。如下計算抑制百分比:(1-((OD樣品-OD陰性對照)/(OD陽性對照-OD陰性對照))*100。 表位鑑別及取代掃描
進行PEPperMAP表位定位(PEPperPRINT有限公司,德國海德堡(Heidelberg, Germany))以經由覆蓋所有乙型冠狀病毒之刺突蛋白的泛冠狀病毒刺突蛋白微陣列測定mAb表位。簡言之,將含有15聚體肽(重疊13聚體)之微陣列與10 µg/ml mAb一起在4℃下在140 rpm下振盪培育16小時,之後在室溫下用二級及對照Ab染色45分鐘。以7/7(紅色/綠色)之掃描強度用LI-COR Odyssey成像系統進行微陣列讀出。基於所有胺基酸位置上之逐步單一胺基酸交換對所鑑別之表位進行表位取代掃描。結合至所產生微陣列之mAb如上進行。 SPR 結合量測
使用Biacore T200儀器,使用共價固定於CM5晶片上以捕捉S ECD之抗AviTag pAb進行SPR結合量測,不同之處在於使用Cytiva生物素捕捉套組以捕捉經生物素標記之OC43 S ECD。分別針對中性或酸性pH實驗,操作緩衝液為Cytiva HBS-EP+ (pH 7.4)或20 mM磷酸鹽pH 5.4、150 mM NaCl、0.05% P-20。所有量測在25℃下進行。S2P6 Fab或IgG濃度為11、33、100及300 nM,作為單循環動力學操作。使用Biacore評估軟體將減去雙參考之資料擬合至結合模型。SARS-CoV-2 S、SARS-CoV S及OC43 S之所有資料擬合至1:1結合模型。將MERS S之資料擬合至異質配體結合模型,因為動力學相具有極緩慢解離被假定為假影;由擬合得到之二個KD之較低親和力報告為S2P6:MERS S相互作用之KD且指示為近似值(與較高親和力動力學相相關之Rmax與高於基線之最終信號的量值成比例)。HKU1 S之資料擬合至穩態結合模型,因為信號低及在各締合階段內快速接近於平衡;所報告之KD指示為近似的。IgG結合資料得到由於親合力所致之「表觀KD」。 中和真SARS -CoV -2 病毒
對於SARS-CoV-2中和實驗,在補充有10% FBS (VWR 97068-085批次號345K19)及100 U/ml青黴素-鏈黴素(Gibco 15140-122)之DMEM (Gibco 11995-040)中培養細胞。將細胞以20,000個細胞/孔之密度接種在黑色、96孔玻璃底盤(Cellvis P96-1.5H-N)中。在BSL3設施中,在37℃下,將mAb之連續稀釋液(1:4)與200 PFU(空斑形成單位,對應於0.01之感染倍率)之真SARS-CoV-2(分離株USA-WA1/2020,第3代,在Vero-E6細胞中繼代)一起培育30分鐘。在移除細胞培養物上清液之後,細胞經病毒:抗體混合物感染且在37℃下培育20小時。將細胞接著用PBS (Gibco 10010-031)中之4%多聚甲醛(Electron Microscopy Sciences,15714-S)固定30分鐘,用0.1% Triton X-100 (Sigma,X100-500ML)滲透30分鐘,且用人類SARS冠狀病毒核蛋白/NP抗體、兔Mab(Sino Biological,40143-R001)以1:2000稀釋度之稀釋液於2%牛奶(RPI,M17200-500.0)中染色1小時。隨後,將細胞用呈1:1000之稀釋度的山羊抗兔IgG (H+L) AF647 (Invitrogen,目錄號A21245批次223 2862)及2 ug/mL Hoechst 33342於2%牛奶中染色持續1小時。用自動化顯微鏡(Cytation5,Biotek)使盤成像,且使用所提供之Gen5軟體定量對於SARS-CoV-2核蛋白呈陽性之細胞核及細胞。 中和SARS-CoV-2 Nluc 病毒
將細胞在補充有10% FBS (VWR 97068-085批次號345K19)及100 U/ml青黴素-鏈黴素(Gibco 15140-122)之DMEM (Gibco 11995-040)中培養。對於中和實驗,以20,000個細胞/孔將細胞接種在黑色、96孔玻璃底盤(Corning,3904)中且轉移至BSL3設施。將連續1:4稀釋系列之mAb與200 PFU之SARS-CoV-2 Nluc (SARS-CoV-2之感染性純系(病毒株2019-nCoV/USA_WA1/2020))一起培育,其中病毒ORF7基因經奈米螢光素酶報導體置換(Xie等人. 2020)。在37℃下培育30分鐘之後,使用病毒:抗體混合物感染目標細胞,感染倍率為0.01。在感染後20小時,使細胞平衡至室溫且抽吸細胞培養物上清液。將Nano-Glo®活細胞分析系統(Promega N2012)試劑及DPBS (具有Ca/Mg) (Gibco 14040-133)之1: 1混合物添加至細胞中。在室溫下培育10分鐘之後,用發光盤式讀取器(PerkinElmer VICTOR Nivo™)讀出螢光素酶信號。 VSV 假型病毒產生及中和
合成C端缺失19個胺基酸(D19)的薩貝冠狀病毒刺突蛋白卡匣且選殖至哺乳動物表現構築體(pcDNA3.1(+)或pTwist-CMV)中用於以下薩貝冠狀病毒:SARS-CoV-2 (寄存QOU99296.1)、SARS-CoV-1 (寄存AAP13441.1)、hCoV-19/穿山甲/廣東/1/2019 (GD19,寄存QLR06867.1)及中東呼吸道症候群相關冠狀病毒(MERS,寄存YP_009047204)。為產生假型化VSV,在15 cm培養皿中接種293T Lenti-X封裝細胞(Takara,632180),使得第二天細胞80%匯合。接著根據製造商說明書使用TransIT-Lenti轉染劑(Mirus,6600)將培養物經各種刺突蛋白表現質體轉染。轉染之後24小時,將封裝細胞經VSV-G*ΔG-螢光素酶(Kerafast,EH1020-PM)感染。感染之後48小時,收集含有薩貝冠狀病毒假型化VSV-luc之上清液,在1000×g下離心5 min,加以等分且在-80℃下冷凍。為進行假病毒中和分析,採用以下支持穩定假病毒之細胞:對於VSV-SARS-CoV-2、VSV-SARS-CoV-1及VSV-GD19使用VeroE6-TMPRSS2細胞及對於VSV-MERS使用Huh7細胞。將細胞以20,000個細胞/孔接種至透明底部白壁96孔盤中。第二天,一式三份地在基礎DMEM中製備Ab之1:3連續稀釋液。假型化VSV在基礎DMEM中稀釋且添加至各Ab稀釋物中,使得假病毒之最終稀釋度為1:20。假病毒:抗體混合物在37℃下培育1小時。自先前天接種之細胞移除培養基,且用50 μl假病毒:Ab混合物置換且在37℃下培育。感染後一小時,將50 μl完整培養基添加至各孔中且在37℃下培育細胞隔夜。接著自感染細胞移除培養基且將100 μl 1:1稀釋之PBS:Bio-Glo (Promega,G7940)螢光素酶受質添加至各孔中。在室溫下以300 rpm震盪盤10 min且接著在EnSight微量盤讀取器(Perkin Elmer)上讀取相對光單位(RLU)。藉由自所有資料點減去各盤6個孔之平均背景(單獨具有螢光素酶受質之未感染細胞)值來測定中和百分比。相對於針對各盤未接受抗體之對照孔計算各抗體濃度之中和百分比。使用Prism (GraphPad,v9.0.1)分析中和百分比資料。藉由使用可變斜率4參數非線性回歸模型擬合曲線來計算絕對EC50值且自y=50處之曲線內插值。 VSV -SARS -CoV -2 mAb 逃逸突變體之選擇 抗性病毒選擇:
將細胞在補充有10% FBS (VWR 97068-085批次號345K19)及100 U/ml青黴素-鏈黴素(Gibco 15140-122)之DMEM (Gibco 11995-040)中培養。感染前一天,將250,000個VeroE6-TMPRSS2細胞在補充有10% FBS (VWR 97068-085批次號345K19)及100 U/ml青黴素-鏈黴素(Gibco 15140-122)之2 ml DMEM (Gibco 11995-040)中接種於12孔盤中,且在37℃下培育隔夜。次日,在感染培養基(DMEM(補充有2% FBS及20mM HEPES(Gibco,15630-080))中以80 ug/ml開始將S2P6以1:4連續稀釋且在37℃下以MOI 2與複製勝任型VSV-SARS-CoV-2 (Case等人. 2020)一起培育1小時。不包括Ab對照以考慮在病毒複製期間可發生之任何組織培養物調適及準物種可變性。在37℃下,將mAb-病毒複合物吸附於細胞上1小時,同時每15分鐘手動搖動。在吸附之後,將細胞用PBS洗滌且用含有如用於初始感染之等量S2P6的感染培養基覆疊。感染後第1天及第3天,針對細胞之GFP表現及細胞病變效應(CPE),藉由顯微鏡目測感染。感染後第3天,當無mAb對照孔達到>50% CPE時,選擇展示>20% CPE之具有最高Ab濃度之孔(在此情況下80 ug/ml孔)進行繼代。細胞上清液經離心以移除細胞碎片,在感染培養基中1:10稀釋且添加至具有如對於初始繼代相同S2P6濃度範圍及處理之新鮮VeroE6-TMPRRS2細胞中。在二次繼代之後,在所測試之最高濃度下未觀測到病毒中和之後,停止選擇。 S 基因之定序
根據製造商說明書,使用QIAamp病毒RNA小型套組(Qiagen,52904)自病毒繼代之上清液提取病毒RNA而無需添加載體RNA。根據製造商說明書,使用NEB ProtoScript II第一股cDNA合成套組(NEB,E6560S)用6 μl經純化RNA及隨機引子進行反轉錄反應。使用具有引子5'- CGAGAAAAAGGCATCTGGAG -3' (SEQ ID NO: 106)及5'- CATTGAACTCGTCGGTCTC -3' (SEQ ID NO: 107)之KapaBio系統聚合酶(KAPA HiFi HotStart Ready PCR Kit  KK2601),將所得cDNA用作刺突蛋白基因之PCR擴增的模板。擴增條件包括95℃下之初始3分鐘,繼之為28個循環,其中98℃下20秒、59℃及72℃下15秒持續2分鐘,72℃下最後4分鐘。使用AMPure XP珠粒(Beckman Coulter,A63881)遵循製造商說明書純化PCR產物。藉由使用Agilent D5000 ScreenTape系統(Agilent D5000 ScreenTap,5067-5588,Agilent D5000,試劑5067-5589)分析2 μl PCR產物來確認擴增子之尺寸。藉由用Quant-iT dsDNA高敏感性分析套組(Thermo Fisher,Q331120)分析2 μl來定量產物。使用NEBNext Ultra II FS DNA庫製備套組(NEB,E6177S)遵循製造商說明書,將二十ng純化PCR產物用作庫構築之輸入。進行DNA片段化13分鐘。使用Illumina雙索引引子組1之NEBNext多重寡核苷酸(NEB,E7600S)用於庫構築,總共具有6個PCR循環。使用Agilent D1000 ScreenTape系統(Agilent D1000 ScreenTape,5067-5582,Agilent D5000試劑,5067-5583)測定庫大小且用Quant-iT dsDNA高敏感性分析套組定量。將等量之各庫匯集在一起用於多重化且使用Illumina庫製備指導之『方案A:標準歸一化方法』來製備具有1% PhiX尖峰之8 pM最終多重庫用於定序。Illumina MiSeq試劑套組v3 (600-循環) (Illumina,MS-102-300)用於對Illumina MiSeq平台上之庫進行定序,其中用於讀數1之300個循環,用於讀數2之300個循環,用於索引1之8個循環及用於索引2之8個循環。 生物資訊分析:
在運行Illumina之Bcl2fastq命令之後的平均讀數長度平均每樣品在149至188bp範圍內。對於整個樣品之一致性,最初將成對末端讀數修整成2×150 bp且使用Trimmomatic (Bolger、Lohse及Usadel 2014)進一步清理以移除Illumina之銜接子及低品質鹼基。使用定製參考序列用Burrows- Wheeler比對器(BWA (Li 2013))進行讀取比對。使用1%之頻率臨限值,在插入缺失再比對及鹼基品質再校準時用LoFreq識別變體(Wilm等人. 2012)。進行二個連續輪之比對及變體識別,其中在第一輪期間以>50%之對偶基因頻率識別之變體以針對第二輪之參考整合以便比對比率及變體識別準確度。用SnpEff (Cingolani等人. 2012)標註變體。參考序列座標映射回至SARS-CoV-2 Wuhan-Hu-1序列(NCBI: NC_045512.2)以便匹配參考序列命名法。使用FastQC、samtools、picard、mosdepth(Pedersen及Quinlan 2018)、bcftools (Danecek等人. 2021)、MultiQC (Ewels等人. 2016)及內部指令碼,在讀數、比對及變體位準方面進行廣泛QC,尤其以移除在讀數中之靜態位置(諸如攜帶其的讀數之起點或末端,而非隨機分佈在整個彼等讀數中)一致識別的變體。使用NextFlow (Di Tommaso等人. 2017)自動化端對端工作流。所有程式均可經由Bioconda Initiative獲得(Grüning等人. 2018)(bioconda.github.io)。 人類Fc γRIIIa 及Fc γRIIa 之MAb 依賴性活化
人類FcγRIIIa及FcγRIIa之mAb依賴性活化的測定係使用穩定表現全長野生型SARS-CoV-2刺突蛋白(S)之ExpiCHO細胞(目標細胞)進行。將細胞與不同量之mAb一起培育10分鐘,之後與以針對FcγRIIIa之6:1之效應:目標比率及針對FcγRIIa之5:1之比率穩定地表現FcγRIIIa受體(V158變體)或FcγRIIa受體(H131變體)及NFAT驅動之螢光素酶基因(效應細胞)的Jurkat細胞一起培育。人類FcyR之活化藉由根據NFAT路徑活化所產生之螢光素酶信號來定量。根據製造商說明書,使用Bio-Glo-TM螢光素酶分析試劑(Promega,目錄編號:G7018及G9995),在用光度計在5% CO2在37℃下培育21小時之後量測發光。 抗體依賴性細胞毒性 ( ADCC )
使用SARS-CoV2 CHO-K1細胞(經基因工程改造以穩定地表現HaloTag-HiBit標籤)作為目標細胞及PBMC作為效應細胞以33:1之E:T比率進行ADCC分析。將HiBit細胞以3,000個細胞/孔接種且在37℃下培育16小時,而將自新鮮血液分離之PBMC (VV供體)在培育箱中在37℃下在5 ng/ml之IL-2存在下培養隔夜。一天後,移除培養基且添加滴定濃度之mAb,隨後以100,000個細胞/孔添加PBMC。作為100%特異性裂解,使用100 μg/ml之毛地黃皂苷。在37℃下培育4小時之後,用Nano-Glo HiBiT細胞外偵測系統(Promega;目錄編號:N2421)使用光度計(積分時間00:30)量測ADCC。 抗體依賴性細胞吞噬作用 ( ADCP )
使用經PKH67螢光細胞連接子套組(Sigma Aldrich;目錄編號:MINI67)螢光標記之穩定表現全長野生型SARS-CoV-2 S醣蛋白之CHO細胞(目標細胞)進行ADCP。將目標細胞與滴定濃度之mAb一起培育10分鐘,之後在5 ng/ml IL-2(重組人類介白素-2;ImmunoTools有限公司;目錄編號:11340027)中培育隔夜之後與用Cell Trace Violet(Invitrogen,目錄號C34557)螢光標記之PBMC一起培育。使用20:1之效應:目標比。在37℃下隔夜培育之後,將細胞用抗人類CD14-APC抗體(BD Pharmingen,目錄號561708,純系M5E2)染色,以染色單核球。藉由流式細胞量測術,對cell trace violet及PKH67呈雙陽性之CD14+細胞上門控,測定ADCP。 補體依賴性細胞毒性 (CDC )
對穩定表現SARS-CoV-2 S醣蛋白之CHO細胞(目標細胞)進行CDC,該醣蛋白與mAb之連續稀釋液一起培育10分鐘,隨後以1:12之最終稀釋度與經預吸附之Low-Tox M兔補體(Cederlane Laboratories Limited;目錄編號:CL3051)一起培育。在37℃、5% CO2下培育3小時之後使用CytoTox-Glo細胞毒性分析(Promega;目錄編號:G9291)根據製造商說明書用光度計量測CDC。 對於不同合成冠狀病毒S 莖肽之S2P6 結合及S2P6 /B6 競爭實驗
所有經生物素標記之冠狀病毒S莖螺旋肽結合實驗在Octet Red儀器(Fortebio)上在30℃下及1,000 rpm震盪下在補充有0.005%吐溫20之PBS (PBST)中進行。對於S2P6結合至不同莖螺旋肽,將1 µg/ml經生物素標記之莖肽(來自Genscript之15殘基或16殘基長莖肽-PEG6-Lys-生物素合成)負載於SA生物感測器上至0.5 nm之臨限值。接著,在將感測器分別浸沒於0.1 µM S2P6 mAb中持續300秒之前,系統在PBST中平衡300秒,隨後在緩衝液中解離300秒。對於S2P6-B6競爭,1 µg /ml經生物素標記成SARS CoV-2肽負載於SA生物感測器上至0.5 nm之臨限值。系統在PBST中平衡180秒且監測各後續步驟900秒。將第一樣品生物感測器浸沒於0.1 µM mAb S2P6中,隨後將樣品生物感測器分別浸沒於0.1 µM mAb S2P6及B6的溶液中。將第二樣品生物感測器浸沒於PBST中且隨後浸沒於0.1 µM mAb B6中。為監測非特異性結合,執行相同實驗而不將莖肽負載至生物感測器。 融合抑制分析
為了測試對刺突蛋白介導之細胞-細胞融合之抑制,將VeroE6細胞在70 μl具有高葡萄糖及2.4% FBS (Hyclone)之DMEM中以20,000個細胞/孔接種於96孔盤中。16小時之後,用SARS-CoV-2-S-D19_pcDNA3.1如下轉染細胞:對於10孔,將0.57 µg質體SARS-CoV-2- S-D19_pcDNA3.1與1.68 µl X-tremeGENE HP於30 µl OPTIMEM中混合。培育15分鐘後,將混合物在DMEM培養基中1:10稀釋且每孔添加30 μl。製備4倍連續稀釋mAb且將其添加至細胞中,起始濃度為20 μg/ml。第二天,每孔添加30 μl含5倍濃縮DRAQ5之DMEM且在37℃下培育2小時。藉由Cytation 5設備獲取各孔之九個影像以用於分析。 使用敍利亞倉鼠模型進行之活體內 mAb 測試
KU LEUVEN R&D已研發且驗證SARS-CoV-2敍利亞金倉鼠感染模型(Boudewijns等人. 2020)。 SARS - CoV - 2 病毒產生
自獲自2020年2月自中國武漢返回的經RT-qPCR確認之無症狀性患者的鼻咽拭子中回收用於此研究中之野生型SARS-CoV-2病毒株BetaCov/Belgium/GHB-03021/2020 (EPI ISL 109 407976|2020-02-03)。藉由譜系學分析確認與原型Wuhan-Hu-1 2019-nCoV (GenBank寄存112編號MN908947.3)病毒株之密切關係。藉由在HuH7及VeroE6細胞上連續繼代來分離感染性病毒(Boudewijns等人. 2020);第6代病毒用於本文所述之研究中。病毒原液之效價藉由用Reed及Muench方法在Vero-E6細胞上進行端點稀釋來確定(Reed及Muench 1938)。變體病毒株B.1.351 (hCoV-19/Belgium/rega-1920/2021;EPI_ISL_896474,2021-01-11)自獲自返回至比利時且罹患呼吸道症狀之行進者之鼻咽拭子分離。患者之鼻咽拭子直接在MinION平台(Oxford Nanopore)上進行定序(Abdelnabi等人https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.02.26.433062v1)。
根據機構指南,在許可AMV 30112018 SBB 219 2018 0892及AMV 23102017 SBB 219 20170589下,在魯汶大學雷加研究所(KU Leuven Rega Institute)之高容器A3及BSL3+設施中進行活病毒相關工作(3CAPS)。 倉鼠中之SARS-CoV-2 感染模型
野生型敍利亞倉鼠(金倉鼠)係購自Janvier實驗室,且每二隻圈養在通氣的隔離籠(IsoCage N Biocontainment System,Tecniplast)中,可隨意獲取食物及水且具有籠豐富化(木塊)。飼養條件及實驗程序經魯汶大學動物實驗倫理委員會批准(許可P065-2020)。將6-10週齡之雌性倉鼠用氯胺酮/甲苯噻嗪/阿托品麻醉且鼻內接種50 μl之分別對於野生型或B.1.351變體含有2×106或1×104 TCID50。在藉由腹膜內注射感染之前24小時或48小時開始單株抗體(人類或倉鼠S2P6 (2-20 mg/kg))處理。監測倉鼠之外觀、行為及體重。在感染後第4天,藉由腹膜內注射500 μL Dolethal (200 mg/mL戊巴比妥鈉,Vétoquinol SA)使倉鼠安樂死。收集肺且分別藉由RT-qPCR及端點病毒滴定來定量病毒RNA及感染性病毒。在感染之前收集血液樣品用於藥物動力學分析。 SARS-CoV-2 RT-qPCR:
在處死之後收集倉鼠組織,且使用珠粒破壞(Precellys)在350 μll RLT緩衝液(RNeasy Mini套組,Qiagen)中均質化,且離心(10,000 rpm,5分鐘)以集結細胞碎片。根據製造商說明書提取RNA。為自血清提取RNA,使用NucleoSpin套組(Macherey-Nagel)。50 μL溶離液中之4 μL用作RT-qPCR反應中之模板。使用具有靶向核衣殼之N2引子及探針的iTaq通用探針一步驟RTqPCR套組(BioRad)在LightCycler96平台(Roche)上進行RT-qPCR (Boudewijns等人. 2020)。SARS-CoV-2 cDNA (IDT)之標準物用於表現每mg組織或每ml血清之病毒基因體複本。 端點病毒滴定
使用珠粒破壞(Precellys)使肺組織在350 μL最小基本培養基中均質化,且離心(10.000 rpm,5分鐘,4℃)以集結細胞碎片。為了定量感染性SARS-CoV-2粒子,在96孔盤中在匯合的Vero-E6細胞上進行終點滴定。藉由Reed及Muench方法(Reed及Muench 1938)使用Lindenbach計算器計算病毒效價,且表示為每mg組織50%組織培養物感染劑量(TCID50)。 參考文獻
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可組合上述各種實施例以提供其他實施例。本說明書中所提及及/或本申請資料清單中所列之所有美國專利、美國專利申請公開案、美國專利申請案、外國專利、外國專利申請案及非專利公開案均以全文引用的方式併入本文中,包括在2020年11月25日申請之美國臨時申請案第63/118,474號;在2021年4月2日申請之美國臨時申請案第63/170,342號;在2021年4月21日申請之美國臨時申請案第63/177,724號及在2021年5月10日申請之美國臨時申請案第63/186,779號。必要時,可以修改實施例之態樣以採用多個專利、申請案及公開案之構思以提供又另外的實施例。
可鑒於以上實施方式對實施例進行此等及其他改變。一般而言,在以下申請專利範圍中,所用術語不應解釋為將申請專利範圍限制於本說明書及申請專利範圍中所揭露之特定實施例,而應解釋為包括所有可能之實施例以及該申請專利範圍有權要求的等效物之全部範疇。因此,申請專利範圍不受本揭露內容限制。
專利或申請案文件含有至少一個彩製圖式。在申請且支付必要費用後,專利局將提供附有彩圖之此專利或專利申請公開案之複本。
圖1A 及1B展示單株抗體抗體420_1_2(在本文中亦稱為抗體S2S8)(圖1A)及抗體420_1_1(在本文中亦稱為抗體S2P6)(圖1B)與不同人類乙型冠狀病毒之刺突(S)蛋白之結合,如藉由酶聯免疫吸附分析(ELISA)所量測,該抗體420_1_2包含SEQ ID NO:36之VH (CDRH1、CDRH2及CDRH3分別為SEQ ID NO:37-39)及SEQ ID NO:40之VL (CDRL1、CDRL2及CDRL3分別為SEQ ID NO:41-43),該抗體420_1_1包含SEQ ID NO:26之VH (CDRH1、CDRH2及CDRH3分別為SEQ ID NO:27-29)及SEQ ID NO:30之VL (CDRL1、CDRL2及CDRL3分別為SEQ ID NO:31-33)。以1 µg/ml塗佈來自SARS-CoV (Urbani病毒株,AAP13441)、SARS-CoV-2 (BetaCoV/Wuhan-Hu-1/2019)、MERS (London1/2012)、OC43及HKU1之融合前穩定S蛋白。僅PBS用作陰性對照。以ng/ml報告半最大有效濃度(EC50)。除非另外陳述,否則在本發明實例中所測試之所有抗體均以重組方式表現為人類IgG1。
圖2A -2D展示單株抗體抗體420_1_2及抗體420_1_1與表現於Expi-CHO細胞中之不同人類乙型冠狀病毒之S蛋白的結合。抗體表現為帶有M428L/N434S Fc突變(「MLNS」)之重組IgG1。藉由流式細胞測量術量測與來自SARS-CoV-2 (BetaCoV/Wuhan-Hu-1/2019;圖2A)、SARS-CoV (Urbani病毒株,AAP13441;圖2B)、OC43 (圖2C)及MERS-CoV (London1/2012;圖2D)之S蛋白的結合。
圖3A 及3B展示單株抗體抗體420_1_1 (圖3A)及抗體420_1_2 (圖3B)與來自SARS-CoV-2 (BetaCoV/ Wuhan -Hu-1/2019) S之S1次單元、S2次單元及受體結合區域(RBD)的結合,如ELISA所量測。以1 µg/ml塗佈蛋白質。
圖4展示抗體420_1_1針對活SARS-CoV-2之中和活性,在VeroE6細胞中使用SARS-CoV-2螢光素酶報導體病毒分析報告為以ng/ml為單位之IC50。亦測試藉由抗體「S309」之中和(參見Pinto等人, Cross -neutralizaiton of SARS -CoV -2 by a human monoclonal SARS -CoV antibody, Nature 583:290-295 (2020年7月))。資料來自一式三份孔。
圖5A 及5B展示藉由抗體420_1_1對Huh7細胞中MERS-CoV假型化病毒感染(圖5A)及Vero E6細胞中SARS-CoV-2假型化病毒(圖5B)的活體外中和(報告為µg/ml)。亦測試藉由比較抗體LCA60(抗MERS;Corti等人, PNAS 122(33):10473-10478 (2015))及S309之中和。
圖6A 及6B展示藉由抗體420_1_2對Huh7細胞中MERS-CoV假型化病毒感染(圖6A)及Vero E6細胞中SARS-CoV-2假型化病毒(圖6B)的活體外中和。亦測試藉由比較抗體LCA60及S309之中和。
圖7展示來自人類乙型冠狀病毒刺突蛋白之部分S2區段的比對。融合前胞外區域之C端部分中之連接子區用紅色方塊指示。
圖8A -8C說明人類乙型冠狀病毒刺突蛋白之融合前胞外區域之C端部分中的部分守恆連接子區。圖8A展示來自不同人類乙型冠狀病毒之部分刺突蛋白胺基酸序列的比對。圖8B展示SARS-CoV-2刺突蛋白且鑑別連接子區(方塊內部之區,含有N1158聚醣)。圖8C展示圖8B中所示之連接子區之詳細視圖,且指示某些胺基酸殘基(編號係根據融合前構形)。
圖9A -9C展示SARS-CoV-2 S蛋白之結構(圖9A)以及守恆連接子區及某些胺基酸殘基及N1158聚醣之詳細視圖(圖9B)。在圖9C中,展示呈融合前(底部)及融合後(頂部)構形的殘基。融合後影像中殘基之編號不考慮信號肽。
圖10展示經轉染以過度表現ACE2或一組所選凝集素及受體候選物中之一者的HEK293T細胞藉由VSV-SARS-CoV-2假病毒之感染。
圖11展示過度表現DC-SIGN、L-SIGN、SIGLEC1或ACE2之穩定的HEK293T細胞株的顯微照片,該等細胞株經真SARS-CoV-2 (MOI為0.1)感染,接著加以固定且針對SARS-CoV-2核蛋白(紅色)進行免疫染色24小時。
圖12展示過度表現DC-SIGN、L-SIGN、SIGLEC1或ACE2之穩定的HEK293T細胞株中之螢光素酶位準之定量,如在用SARS-CoV-2-Nluc感染之後24小時所量測。
圖13展示在與不同濃度之抗SIGLEC1單株抗體(純系7-239)一起培育且用SARS-CoV-2-Nluc感染之後,過度表現DC-SIGN、L-SIGN、SIGLEC1或ACE2之穩定的HEK293T細胞株中之螢光素酶位準之定量。
圖14展示經短暫轉導以過度表現DC-SIGN、L-SIGN、SIGLEC1或ACE2之細胞藉由VSV-SARS-CoV-2假病毒之感染。展示HEK293T細胞(左側圖)、HeLa細胞(中間圖)及MRC5細胞(右側圖)之結果。
圖15展示在用ACE2 siRNA處理,之後用VSV-SARS-CoV-2假病毒感染後過度表現DC-SIGN、L-SIGN、SIGLEC1或ACE2之穩定的HEK293T細胞株之感染。
圖16展示在用不同濃度之抗ACE2抗體(多株血清)處理,之後用VSV-SARS-CoV-2假病毒感染後過度表現DC-SIGN、L-SIGN、SIGLEC1或ACE2之穩定的HEK293T細胞株之感染。
圖17A展示人類肺細胞圖譜中之ACE2、DC-SIGN (CD209)、L-SIGN (CLEC4M)及SIGLEC1之分佈及表現。
圖17B展示在重度COVID-19患者之支氣管肺泡灌洗液或痰液中對具有可偵測SARS-CoV-2基因體之主要細胞類型的分析。單一細胞基因表現譜繪示為t-SNE (t-分佈隨機鄰域嵌入)曲線,其根據細胞類型著色且根據病毒負荷設定大小。
圖18展示在重度COVID-19患者之支氣管肺泡灌洗液或痰液中對具有可偵測SARS-CoV-2基因體之主要細胞類型的分析。展示所指示細胞類型中之每一者之細胞累積分數(y軸),其中所偵測之病毒RNA/細胞達至相對應的logCPM (log(計數/百萬);x軸)。
圖19展示具有針對x軸上所示之受體基因及y軸上所示之SARS-CoV-2+細胞類型的所偵測之轉錄物之細胞計數的熱圖矩陣。來自八名個體之總n=3,085個細胞。參見Ren, X.等人. COVID-19 immune features revealed by a large-scale single cell transcriptome atlas. Cell, doi:10.1016/j.cell.2021.01.053 (2021)。
圖20展示在巨噬細胞中及在分泌細胞中受體轉錄物計數(各曲線之y軸)與SARS-CoV-2 RNA計數(各曲線之x軸)的相關性。相關性係基於來自Ren等人之對數轉換前的計數。
圖21展示經VSV-SARS-CoV-2之轉染的結果。轉染過程之示意圖展示於左側圖中。使經DC-SIGN、L-SIGN或SIGLEC1轉導之HeLa細胞與VSV-SARS-CoV-2一起培育,充分洗滌且與Vero-E6-TMPRSS2敏感性目標細胞共培養。在存在或不存在目標細胞下之結果展示於右側圖中。
圖22展示轉染之結果,其中在存在或不存在抗SIGLEC1阻斷抗體下進行VSV-SARS-CoV-2病毒吸收。
圖23展示如藉由流式細胞測量術所量測,純化的螢光標記之SARS-CoV-2刺突蛋白或RBD與所指示之細胞株的結合的定量。「A」指示過度表現ACE2之細胞株;「T」指示過度表現TMPRSS2之細胞株。
圖24展示如藉由RT-qPCR所量測,所指示之細胞株中細胞ACE2及TMPRSS2轉錄物的定量。「A」指示過度表現ACE2之細胞株;「T」指示過度表現TMPRSS2之細胞株。
圖25展示藉由15 µg/ml所指示之抗體抑制CHO-S細胞之抗體S2E12誘導之細胞-細胞融合。
圖26展示在不存在ACE2之情況下S陽性CHO-S細胞與經螢光標記之S陰性CHO細胞的抗體S2E12誘導之單向融合(亦稱為反融合)。細胞核用Hoechst染料染色;細胞質用CellTracker綠色染色。
圖27展示如藉由流式細胞測量術所量測,在穩定地過度表現對應的黏附受體之HEK293T細胞上靶向DC/L-SIGN、DC-SIGN、SIGLEC1或ACE2之抗體之結合的分析。
圖28展示如藉由免疫螢光所量測,在穩定地過度表現對應的黏附受體之HEK293T細胞上靶向DC/L-SIGN、DC-SIGN、SIGLEC1或ACE2之抗體之結合的分析。
圖29展示穩定地過度表現所指示之黏附受體的HEK293T細胞藉由經野生型刺突蛋白(灰色條)假型化之VSV-SARS-CoV-2或經攜帶B1.1.7譜系之突變的刺突蛋白(紅色條)假型化之VSV-SARS-CoV-2的感染。感染後一天分析發光。
圖30展示如藉由流式細胞測量術所量測,純化的螢光標記之SARS-CoV-2刺突蛋白(左側圖)或RBD (右側圖)與所指示之細胞株的結合的定量。
圖31展示如藉由流式細胞測量術所量測,純化的螢光標記之SARS-CoV-2刺突蛋白(左側圖)或RBD (右側圖)與所指示之細胞株的結合的定量。
圖32展示免疫複合物與倉鼠脾細胞之結合。滴定Alexa-488螢光免疫複合物(IC) (0-200 nM範圍)且與總未處理倉鼠脾細胞一起培育。在排除死亡/凋亡細胞且對真正單核球群體實體門控時用細胞計數器揭露結合。左側圖展示與用倉鼠或人類Fc抗體皮內製得之倉鼠細胞相關的螢光強度(人類S309展示為綠色;GH-S309展示為深灰色;GH-S309-N297A展示為藍色)。展示二個之單次重複。右側圖展示在整個單核球群體上量測之複本的相對Alexa-488平均螢光強度。
圖33展示在SARS-CoV-2攻擊中宿主效應功能之作用的分析。對敍利亞倉鼠以指定量(mg/kg)之倉鼠IgG2a S309,wt或Fc沉默(S309-N297A),注射。上圖展示感染後4天肺中病毒RNA之定量。中間圖展示感染後4天肺中複製病毒之定量。下部圖展示感染後4天肺中之組織病理學評分。向對照動物(白色符號)注射4 mg/kg不相關對照同型抗體。使用曼-惠特尼檢定,相對於對照動物之* p< 0.05、** p< 0.01、*** p< 0.001、**** p< 0.0001。
圖34展示抗體S2S43與來自乙型冠狀病毒SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、OC43及HKU1之刺突蛋白的結合。所計算的EC50值展示於圖式之右側。抗體S2S43包含SEQ ID NO:47之VH (CDRH1、CDRH2及CDRH3分別為SEQ ID NO:48-50)及SEQ ID NO:51之VL (CDRL1、CDRL2及CDRL3分別為SEQ ID NO:52-54)。
圖35展示抗體S2S43及S2P6對經SARS-CoV-2刺突蛋白假型化之MLV的感染之中和。所計算的IC50值展示於圖式之右側。
圖36A 及36B展示抗體S2P6 (圖36A)及S2S8 (圖36B)與乙型冠狀病毒MERS、HKU1、OC43、SARS-CoV及SARS-CoV-2之融合前刺突蛋白的結合。所計算的EC50值展示於各圖式之右側。
圖37展示抗體S2S8及S2P6與甲型冠狀病毒NL63-CoV (左側圖)及ss9E-CoV (右側圖)之刺突蛋白的結合。展示S2S8結合之所計算的EC50值。
圖38A -38E展示抗體S2P6與乙型冠狀病毒SARS-CoV-2 (圖37A)、SARS (圖37B)、OC43 (圖37C)、HKU1 (圖37D)及MERS (圖37E)之融合前刺突蛋白的結合,如藉由BLI所量測。S2P6以<1.0E-12 M之KD、4.53E+05 1/Ms之Kon及<1.0E-07 1/s之Kdis結合SARS-CoV-2刺突蛋白。S2P6以<1.0E-12 M之KD、2.32E+05 1/Ms之Kon及<1.0E-07 1/s之Kdis結合SARS-CoV刺突蛋白。S2P6以3.72E-10 M之KD、以1.08E+05 1/Ms之Kon及6.70E-05 1/s之Kdis結合OC43刺突蛋白。S2P6以2.44E-09 M之KD、2.32E+05 1/Ms之Kon及5.66E-04 1/s之Kdis結合HKU1刺突蛋白。S2P6以1.14E-09 M之KD、3.06E+05 1/Ms之Kon及3.48E-04 1/s之Kdis結合MERS刺突蛋白。使用BLI未觀測到抗體S2S8結合此等乙型冠狀病毒之融合前刺突蛋白(資料未示出)。
圖39A -39D展示使用抗體S2P6對四種不同乙型冠狀病毒之感染的中和。圖39A展示對Vero E6細胞之SARS-CoV-2假病毒感染的中和。包括抗體S309作為參考。S309包含SEQ ID NO: 85中所闡述之VH胺基酸序列及SEQ ID NO: 89中所闡述之VL胺基酸序列(CDRH1-H3及L1-L3分別如SEQ ID NO:86-88及90-92中所闡述),且為自SARS-CoV-1感染康復之患者分離的抗體。圖39B展示對Vero E6細胞之SARS-CoV假病毒感染的中和。圖39C展示對Huh 7細胞之MERS假病毒感染的中和。包括抗體LCA60作為參考。圖39D展示對Vero E6細胞之PangGD19假病毒感染的中和。所計算之IC50值展示在圖39A、39C及39D之曲線圖右側。
圖40展示使用抗體S2S8中和MERS假病毒(左側圖)及SARS-CoV-2假病毒(右側圖)之感染。展示比較抗體LCA60對MERS假病毒之中和且展示比較抗體S309對SARS-CoV-2之中和。
圖41A 及41B展示使用抗體S2P6及比較抗體S309對真SARS-CoV-2病毒之感染的中和。圖41A展示在24小時時對藉由SARS-CoV-2-luc以0.01之MOI感染VeroE6細胞的中和。展示來自一式三份孔的結果。針對S2P6計算之EC50為3.4 µg/ml。圖41B展示在24小時時藉由SARS-CoV-2以0.01之MOI感染VeroE6-TMPRSS2細胞的中和。針對S2P6計算之EC50為1.9 µg/ml。
圖42A 及42B展示抗體S2P6及S2S8以及比較抗體S309對FcγRIIa (H131對偶基因) (圖42A)及FcγRIIIa (V158對偶基因) (圖42B)之活化。
圖43展示肽掃描之結果,該肽掃描使用PEPperCHIP ®泛冠狀病毒刺突蛋白微陣列鑑別七個冠狀病毒刺突蛋白中之每一者內的由抗體S2P6(表現為具有M428L及N434S Fc突變之重組IgG1)結合之冠狀病毒刺突蛋白模體。微陣列包括SARS-CoV-2 (UniProt ID P0DTC2)、SARS-CoV (UniProt ID P59594)、MERS-CoV (UniProt ID A0A140AYZ5)、HCoV-OC43 (UniProt ID P36334)、HCoV-HKU1 (UniProt ID U3NAI2)、HCoV-NL63 (UniProt ID Q6Q1S2)及HCoV-229E (UniProt ID P15423)之刺突蛋白。各刺突蛋白序列轉化為具有13個胺基酸之肽-肽重疊的15胺基酸肽。陣列含有一式二份列印之4,564種不同肽。表現為具有M428L及N434S (「MLNS」) Fc突變之重組IgG1的抗體S2P6與濃度為10 µg/ml之陣列一起培育。觀測到具有共同模體 FK EELDK YF(發現於SARS-CoV-2及SARS-CoV中;SEQ ID NO:57)且具有類似模體GID FQ DELDE FFK (發現於MERS-CoV中;SEQ ID NO:58)及DF KEELDQ WFK (發現於HCoV-OC43中;SEQ ID NO:59)之鄰近肽的反應。此等模體在融合前胞外區域之尾部處位於表面暴露之連接子區中。
圖44展示肽掃描之結果,該肽掃描使用上文所述之PEPperCHIP ®泛冠狀病毒刺突蛋白微陣列鑑別針對七個冠狀病毒刺突蛋白中之每一者的與抗體S2S8(表現為具有MLNS Fc突變之重組IgG1)結合之冠狀病毒刺突蛋白模體。觀測到具有共同模體K RSFIEDLLFN (SEQ ID NO: 60) (發現於SARS-CoV-2及SARS-CoV中)、A RSAIEDLLFD (SEQ ID NO: 61) (發現於MERS-CoV中)、S RSAIEDLLFD (SEQ ID NO: 62) (發現於HCoV-OC43中)、 RSFFEDLLF(SEQ ID NO: 63) (發現於HCoV-HKU1中)、 RSALEDLLFSK (SEQ ID NO: 64) (發現於HCoV-NL63中)及G RSAIEDILFS (SEQ ID NO: 65) (發現於HCoV-229E中)之鄰近肽的反應。此等模體位於S2'裂解位點中,其為融合所需的且在甲型冠狀病毒及乙型冠狀病毒中高度守恆。
圖45展示在用SARS-CoV-2 Wuhan Hu-1鼻內攻擊之前向敍利亞倉鼠預防性投予抗體S2P6(表現為倉鼠IgG2a)的結果。量測感染之後的肺中之病毒RNA(左側圖)及病毒效價(右側圖)。
圖46展示抗體S2X529與來自SARS-CoV-2、SARS-CoV、HKU1、OC43及MERS之刺突蛋白的結合。
圖47展示如藉由ELISA所測定,抗體S2P6及抗體S2S43對於融合前SARS-CoV-2刺突蛋白之結合親合力(EC50)。
圖48展示資料概述於 47中之分析中的代表性抗體S2P6結合。
圖49展示經由最大似然分析推斷之代表性α-冠狀病毒及β-冠狀病毒S醣蛋白胺基酸序列之分歧圖。β-冠狀病毒以紅色突出顯示。
圖50展示抗體S2P6結合(10至0.22 µg/ml)至一組代表所有薩貝冠狀病毒(sarbecovirus)分枝系之26個S醣蛋白(左側)及8個SARS-CoV-2變體(右側)之流式細胞測量術分析之結果,顯示為對數幾何-MFI (幾何平均螢光強度)之熱度圖。
圖51展示使用對於S活化蛋白酶TMPRSS2 (VeroE6-TMPRSS2)呈陽性或對於TMPRSS2 (Vero E6)呈陰性之VeroE6細胞測定的S2P6對真SARS-CoV-2的中和。包括結合RBD位點IV之單株抗體S309 (Pinto等人. 2020)以用於比較。展示來自一個實驗之一式四份的平均值± s.d.。展示3個中之一個代表性實驗。針對VeroE6-TMPRSS2之抗體S2P6的IC50為1.87 μg/ml。針對VeroE6-TMPRSS2之抗體S309之IC50為0.09 μg/ml。針對VeroE6之抗體S2P6的IC50為3.68 μg/ml。針對VeroE6之抗體S309的IC50為0.02 μg/ml。
圖52展示上圖中之對SARS-CoV-2 B.1.1.7 S、B.1.351 S及P.1 S水泡性口炎病毒(VSV)假型及野生型(D614G) S VSV假型之抗體S2P6介導的中和。下圖展示表示為相對於野生型(D614G) S VSV假型之IC50倍數變化的對B1.1.7、B. 1.351及P.1假型之中和。紅色上線表示用於降低之效能之截止值。
圖53展示抗體S2P6與跨越SARS-CoV/SARS-CoV-2 S、OC43 S及MERS-CoV S序列之線性肽(由13個殘基重疊之15聚體肽)的結合。
圖54展示多種β-冠狀病毒之β-冠狀病毒莖螺旋區與加框之抗體S2P6表位區的比對。根據SARS-CoV-2 S展示殘基編號。N連接之醣基化序列子以藍色突出顯示。
圖55展示1:10稀釋之大流行前(P,n=88)、COVID-19恢復期(C,n=72)、疫苗接種者免疫(VI,n=9)及疫苗接種者未經治療(VN,n=37)血漿與各種β-冠狀病毒莖螺旋肽之結合,如ELISA所分析。基於大流行前樣品之信號及與未經塗佈之ELISA盤之結合確定0.7之截止值。
圖56展示對來自21名COVID-19恢復期個體之記憶B細胞結合至β-冠狀病毒莖螺旋肽的分析。各點表示含有寡純系B細胞之個別培養物,在ELISA中針對莖螺旋肽篩選(左側圖)。截止值(0.4)由虛線指示。展示SARS-CoV/-2及OC43(中間圖)以及SARS-CoV/-2及HKU1(右側圖)之成對反應性比較。
圖57展示對來自16名疫苗接種者之記憶B細胞結合至β-冠狀病毒莖螺旋肽的分析。各點表示含有寡純系B細胞之個別培養物,在ELISA中針對莖螺旋肽篩選(左側圖)。截止值(0.4)由虛線指示。展示SARS-CoV/-2及OC43(中間圖)以及SARS-CoV/-2及HKU1(右側圖)之成對反應性比較。
圖58展示對疫苗接種者之血漿抗體結合至β-冠狀病毒莖螺旋肽的縱向分析。
圖59展示 76中所示之S2P6抗體與莖螺旋肽之莖螺旋肽結合。(突變之SH/SK)、完全生殖系恢復(UCA/UCA)、與成熟輕鏈配對之生殖系恢復重鏈(UCA/SK)、與生殖系恢復輕鏈配對之成熟重鏈(SH/UCA)。
圖60展示如藉由ELISA所分析,在抗體S2P6存在下,與ACE2之SARS-CoV-2 S結合。包括S2E12 (Tortorici等人, Science370(6519):950-957 (2020))作為陽性對照。
圖61展示使用經SARS-CoV-2 S轉染之Vero-E6細胞,抗體S2P6對細胞-細胞融合之抑制。包括S2M11 (Tortorici等人, Science370(6519):950-957 (2020))作為陽性對照。抑制融合值相對於無mAb之融合百分比(100%)及未經轉染之細胞之融合百分比(0%)歸一化。
圖62展示在抗體S2P6結合至ExpiCHO目標細胞表面表現之全長野生型SARS-CoV-2 S後,在穩定表現FcγRIIIa (V158,左側)或FcγRIIa (V131,右側)之Jurkat細胞中誘導的NFAT驅動之螢光素酶信號。包括S309作為陽性對照。RLU表示相對發光單位。
圖63展示細胞效應功能之抗體S2P6活化。使用SARS-CoV-2 CHO-K1細胞(經基因工程改造以穩定地表現HaloTag-HiBit標籤)作為目標細胞及PBMC作為效應細胞之抗體介導之ADCC(抗體依賴性細胞毒性)分析的分析結果呈現於左圖中。NK細胞介導之殺死之量值表示為特異性裂解之百分比。使用Cell-Trace-Violet標記之PBMC作為吞噬細胞(單核球)源及表現PKH67螢光標記之S的CHO細胞作為目標細胞之抗體介導之ADCP(抗體依賴性細胞吞噬作用)分析的分析結果呈現於中間圖中。y軸指示抗CD14(單核球)標記及PKH67之單核球雙陽性百分比。在補體存在下藉由mAb使SARS-CoV-2 S穩定轉染之CHO細胞裂解的分析結果(CDC分析)呈現於右圖中。抗體曲線圖如同圖62中。
圖64展示在用原型SARS-CoV-2 (Wuhan-1相關)鼻內攻擊之前投予指定量之含有倉鼠(Hm)或人類(Hu)恆定區之抗體S2P6的敍利亞倉鼠中之測試結果。病毒RNA負荷展示於左圖中且複製病毒效價展示於右圖中。* P<0.05,曼-惠特尼檢定。
圖65展示預防性投予20 mg/kg人類抗體S2P6之後的敍利亞倉鼠中之結果。在抗體投予之後用SARS-CoV-2 B.1.351 VOC攻擊倉鼠。病毒RNA負荷展示於左圖中且複製病毒效價展示於右圖中。
圖66展示藉由ELISA量測之抗體S2P6(左圖)及抗體S2S43(右圖)與融合前β-冠狀病毒S胞外區域三聚體之結合。
圖67A -67C展示如在流式細胞測量術中量測之抗體S2P6與一組代表所有薩貝冠狀病毒分枝系之26種S醣蛋白及8種SARS-CoV-2變體結合的幾何平均螢光強度。
圖68展示如經由對刺突蛋白胺基酸序列之最大似然分析推斷之薩貝冠狀病毒之系統發生樹。
圖69展示對抗體S2P6 Fab與固定融合前β-冠狀病毒S三聚體之SPR(表面電漿子共振)之結合的分析。
圖70展示對抗體S2P6 Fab及IgG與固定融合前SARS-CoV-2 S胞外區域三聚體在pH 7.4及pH 5.4下之結合的SPR分析。
圖71展示抗體S2P6與在指定莖螺旋肽胺基酸位置處含有各可能胺基酸取代(沿熱度圖之左側)之莖螺旋肽(熱度圖底部處之胺基酸序列)的結合(螢光強度)熱度圖。右側處呈標度之梯度指示與展示為交叉方塊之原生殘基(界定白色)相比之結合損失程度。綠色/虛線正方形指示與原生殘基相比之取代增強結合。星號突出顯示在抗體S2P6病毒逃逸中發現之取代。
圖72展示如自GISAID擷取之具有人類及動物宿主之β-冠狀病毒序列之間的表位守恆。SARS-CoV-2之共有序列以x軸報告且主要取代藉由粗體字母指示。
圖73A -73F展示針對所測試之各個體與來自恢復期個體之IgG記憶B細胞之β-冠狀病毒莖螺旋肽的結合。截止值(OD=0.4)係由虛線指示,且報告針對各抗原之評分陽性培養物之頻率。
圖74A -74D展示針對各所測試之個體與來自疫苗接種者之IgG記憶B細胞之β-冠狀病毒莖螺旋肽的結合。截止值(OD=0.4)係由虛線指示,且報告針對各抗原之評分陽性培養物之頻率。
圖75展示在第一疫苗劑量展示對SARS-CoV2之高反應之後與來自免疫個體(左上圖)及二個大流行前個體(右頂圖及下圖)之IgG記憶B細胞之β-冠狀病毒莖螺旋肽的結合。
圖76展示抗體S2P6未突變共同祖先(UCA) (頂部)、S2P6野生型及S2P6完全生殖系恢復變體之可變區胺基酸序列的比對。CDR區以灰色突出顯示。
圖77展示 76之S2P6抗體與各種β-冠狀病毒之莖螺旋肽的結合。
圖78展示抗體S2S43 UCA及野生型S2S43的VH及VL胺基酸序列的比對。
圖79提供展示抗體S2P6及S2S43之基因使用及其他特性的表。
                         
          <![CDATA[<110>  美商維爾生物科技股份有限公司(VIR BIOTECHNOLOGY, INC.)]]>
                 瑞士商休曼生物醫藥股份公司(HUMABS BIOMED SA)
          <![CDATA[<120>  結合至多種乙型冠狀病毒的抗體]]>
          <![CDATA[<140>  TW 110143607]]>
          <![CDATA[<141>  2021-11-23]]>
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          <![CDATA[<160>  104]]>
          <![CDATA[<170>  PatentIn版本3.5]]>
          <![CDATA[<210>  1]]>
          <![CDATA[<211>  29902]]>
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          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒SARS冠狀病毒2]]>
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          gaaactgctc aaaattctgt gcgtgtttta cagaaggccg ctataacaat actagatgga     1980
          atttcacagt attcactgag actcattgat gctatgatgt tcacatctga tttggctact     2040
          aacaatctag ttgtaatggc ctacattaca ggtggtgttg ttcagttgac ttcgcagtgg     2100
          ctaactaaca tctttggcac tgtttatgaa aaactcaaac ccgtccttga ttggcttgaa     2160
          gagaagttta aggaaggtgt agagtttctt agagacggtt gggaaattgt taaatttatc     2220
          tcaacctgtg cttgtgaaat tgtcggtgga caaattgtca cctgtgcaaa ggaaattaag     2280
          gagagtgttc agacattctt taagcttgta aataaatttt tggctttgtg tgctgactct     2340
          atcattattg gtggagctaa acttaaagcc ttgaatttag gtgaaacatt tgtcacgcac     2400
          tcaaagggat tgtacagaaa gtgtgttaaa tccagagaag aaactggcct actcatgcct     2460
          ctaaaagccc caaaagaaat tatcttctta gagggagaaa cacttcccac agaagtgtta     2520
          acagaggaag ttgtcttgaa aactggtgat ttacaaccat tagaacaacc tactagtgaa     2580
          gctgttgaag ctccattggt tggtacacca gtttgtatta acgggcttat gttgctcgaa     2640
          atcaaagaca cagaaaagta ctgtgccctt gcacctaata tgatggtaac aaacaatacc     2700
          ttcacactca aaggcggtgc accaacaaag gttacttttg gtgatgacac tgtgatagaa     2760
          gtgcaaggtt acaagagtgt gaatatcact tttgaacttg atgaaaggat tgataaagta     2820
          cttaatgaga agtgctctgc ctatacagtt gaactcggta cagaagtaaa tgagttcgcc     2880
          tgtgttgtgg cagatgctgt cataaaaact ttgcaaccag tatctgaatt acttacacca     2940
          ctgggcattg atttagatga gtggagtatg gctacatact acttatttga tgagtctggt     3000
          gagtttaaat tggcttcaca tatgtattgt tctttctacc ctccagatga ggatgaagaa     3060
          gaaggtgatt gtgaagaaga agagtttgag ccatcaactc aatatgagta tggtactgaa     3120
          gatgattacc aaggtaaacc tttggaattt ggtgccactt ctgctgctct tcaacctgaa     3180
          gaagagcaag aagaagattg gttagatgat gatagtcaac aaactgttgg tcaacaagac     3240
          ggcagtgagg acaatcagac aactactatt caaacaattg ttgaggttca acctcaatta     3300
          gagatggaac ttacaccagt tgttcagact attgaagtga atagttttag tggttattta     3360
          aaacttactg acaatgtata cattaaaaat gcagacattg tggaagaagc taaaaaggta     3420
          aaaccaacag tggttgttaa tgcagccaat gtttacctta aacatggagg aggtgttgca     3480
          ggagccttaa ataaggctac taacaatgcc atgcaagttg aatctgatga ttacatagct     3540
          actaatggac cacttaaagt gggtggtagt tgtgttttaa gcggacacaa tcttgctaaa     3600
          cactgtcttc atgttgtcgg cccaaatgtt aacaaaggtg aagacattca acttcttaag     3660
          agtgcttatg aaaattttaa tcagcacgaa gttctacttg caccattatt atcagctggt     3720
          atttttggtg ctgaccctat acattcttta agagtttgtg tagatactgt tcgcacaaat     3780
          gtctacttag ctgtctttga taaaaatctc tatgacaaac ttgtttcaag ctttttggaa     3840
          atgaagagtg aaaagcaagt tgaacaaaag atcgctgaga ttcctaaaga ggaagttaag     3900
          ccatttataa ctgaaagtaa accttcagtt gaacagagaa aacaagatga taagaaaatc     3960
          aaagcttgtg ttgaagaagt tacaacaact ctggaagaaa ctaagttcct cacagaaaac     4020
          ttgttacttt atattgacat taatggcaat cttcatccag attctgccac tcttgttagt     4080
          gacattgaca tcactttctt aaagaaagat gctccatata tagtgggtga tgttgttcaa     4140
          gagggtgttt taactgctgt ggttatacct actaaaaagg ctggtggcac tactgaaatg     4200
          ctagcgaaag ctttgagaaa agtgccaaca gacaattata taaccactta cccgggtcag     4260
          ggtttaaatg gttacactgt agaggaggca aagacagtgc ttaaaaagtg taaaagtgcc     4320
          ttttacattc taccatctat tatctctaat gagaagcaag aaattcttgg aactgtttct     4380
          tggaatttgc gagaaatgct tgcacatgca gaagaaacac gcaaattaat gcctgtctgt     4440
          gtggaaacta aagccatagt ttcaactata cagcgtaaat ataagggtat taaaatacaa     4500
          gagggtgtgg ttgattatgg tgctagattt tacttttaca ccagtaaaac aactgtagcg     4560
          tcacttatca acacacttaa cgatctaaat gaaactcttg ttacaatgcc acttggctat     4620
          gtaacacatg gcttaaattt ggaagaagct gctcggtata tgagatctct caaagtgcca     4680
          gctacagttt ctgtttcttc acctgatgct gttacagcgt ataatggtta tcttacttct     4740
          tcttctaaaa cacctgaaga acattttatt gaaaccatct cacttgctgg ttcctataaa     4800
          gattggtcct attctggaca atctacacaa ctaggtatag aatttcttaa gagaggtgat     4860
          aaaagtgtat attacactag taatcctacc acattccacc tagatggtga agttatcacc     4920
          tttgacaatc ttaagacact tctttctttg agagaagtga ggactattaa ggtgtttaca     4980
          acagtagaca acattaacct ccacacgcaa gttgtggaca tgtcaatgac atatggacaa     5040
          cagtttggtc caacttattt ggatggagct gatgttacta aaataaaacc tcataattca     5100
          catgaaggta aaacatttta tgttttacct aatgatgaca ctctacgtgt tgaggctttt     5160
          gagtactacc acacaactga tcctagtttt ctgggtaggt acatgtcagc attaaatcac     5220
          actaaaaagt ggaaataccc acaagttaat ggtttaactt ctattaaatg ggcagataac     5280
          aactgttatc ttgccactgc attgttaaca ctccaacaaa tagagttgaa gtttaatcca     5340
          cctgctctac aagatgctta ttacagagca agggctggtg aagctgctaa cttttgtgca     5400
          cttatcttag cctactgtaa taagacagta ggtgagttag gtgatgttag agaaacaatg     5460
          agttacttgt ttcaacatgc caatttagat tcttgcaaaa gagtcttgaa cgtggtgtgt     5520
          aaaacttgtg gacaacagca gacaaccctt aagggtgtag aagctgttat gtacatgggc     5580
          acactttctt atgaacaatt taagaaaggt gttcagatac cttgtacgtg tggtaaacaa     5640
          gctacaaaat atctagtaca acaggagtca ccttttgtta tgatgtcagc accacctgct     5700
          cagtatgaac ttaagcatgg tacatttact tgtgctagtg agtacactgg taattaccag     5760
          tgtggtcact ataaacatat aacttctaaa gaaactttgt attgcataga cggtgcttta     5820
          cttacaaagt cctcagaata caaaggtcct attacggatg ttttctacaa agaaaacagt     5880
          tacacaacaa ccataaaacc agttacttat aaattggatg gtgttgtttg tacagaaatt     5940
          gaccctaagt tggacaatta ttataagaaa gacaattctt atttcacaga gcaaccaatt     6000
          gatcttgtac caaaccaacc atatccaaac gcaagcttcg ataattttaa gtttgtatgt     6060
          gataatatca aatttgctga tgatttaaac cagttaactg gttataagaa acctgcttca     6120
          agagagctta aagttacatt tttccctgac ttaaatggtg atgtggtggc tattgattat     6180
          aaacactaca caccctcttt taagaaagga gctaaattgt tacataaacc tattgtttgg     6240
          catgttaaca atgcaactaa taaagccacg tataaaccaa atacctggtg tatacgttgt     6300
          ctttggagca caaaaccagt tgaaacatca aattcgtttg atgtactgaa gtcagaggac     6360
          gcgcagggaa tggataatct tgcctgcgaa gatctaaaac cagtctctga agaagtagtg     6420
          gaaaatccta ccatacagaa agacgttctt gagtgtaatg tgaaaactac cgaagttgta     6480
          ggagacatta tacttaaacc agcaaataat agtttaaaaa ttacagaaga ggttggccac     6540
          acagatctaa tggctgctta tgtagacaat tctagtctta ctattaagaa acctaatgaa     6600
          ttatctagag tattaggttt gaaaaccctt gctactcatg gtttagctgc tgttaatagt     6660
          gtcccttggg atactatagc taattatgct aagccttttc ttaacaaagt tgttagtaca     6720
          actactaaca tagttacacg gtgtttaaac cgtgtttgta ctaattatat gccttatttc     6780
          tttactttat tgctacaatt gtgtactttt actagaagta caaattctag aattaaagca     6840
          tctatgccga ctactatagc aaagaatact gttaagagtg tcggtaaatt ttgtctagag     6900
          gcttcattta attatttgaa gtcacctaat ttttctaaac tgataaatat tataatttgg     6960
          tttttactat taagtgtttg cctaggttct ttaatctact caaccgctgc tttaggtgtt     7020
          ttaatgtcta atttaggcat gccttcttac tgtactggtt acagagaagg ctatttgaac     7080
          tctactaatg tcactattgc aacctactgt actggttcta taccttgtag tgtttgtctt     7140
          agtggtttag attctttaga cacctatcct tctttagaaa ctatacaaat taccatttca     7200
          tcttttaaat gggatttaac tgcttttggc ttagttgcag agtggttttt ggcatatatt     7260
          cttttcacta ggtttttcta tgtacttgga ttggctgcaa tcatgcaatt gtttttcagc     7320
          tattttgcag tacattttat tagtaattct tggcttatgt ggttaataat taatcttgta     7380
          caaatggccc cgatttcagc tatggttaga atgtacatct tctttgcatc attttattat     7440
          gtatggaaaa gttatgtgca tgttgtagac ggttgtaatt catcaacttg tatgatgtgt     7500
          tacaaacgta atagagcaac aagagtcgaa tgtacaacta ttgttaatgg tgttagaagg     7560
          tccttttatg tctatgctaa tggaggtaaa ggcttttgca aactacacaa ttggaattgt     7620
          gttaattgtg atacattctg tgctggtagt acatttatta gtgatgaagt tgcgagagac     7680
          ttgtcactac agtttaaaag accaataaat cctactgacc agtcttctta catcgttgat     7740
          agtgttacag tgaagaatgg ttccatccat ctttactttg ataaagctgg tcaaaagact     7800
          tatgaaagac attctctctc tcattttgtt aacttagaca acctgagagc taataacact     7860
          aaaggttcat tgcctattaa tgttatagtt tttgatggta aatcaaaatg tgaagaatca     7920
          tctgcaaaat cagcgtctgt ttactacagt cagcttatgt gtcaacctat actgttacta     7980
          gatcaggcat tagtgtctga tgttggtgat agtgcggaag ttgcagttaa aatgtttgat     8040
          gcttacgtta atacgttttc atcaactttt aacgtaccaa tggaaaaact caaaacacta     8100
          gttgcaactg cagaagctga acttgcaaag aatgtgtcct tagacaatgt cttatctact     8160
          tttatttcag cagctcggca agggtttgtt gattcagatg tagaaactaa agatgttgtt     8220
          gaatgtctta aattgtcaca tcaatctgac atagaagtta ctggcgatag ttgtaataac     8280
          tatatgctca cctataacaa agttgaaaac atgacacccc gtgaccttgg tgcttgtatt     8340
          gactgtagtg cgcgtcatat taatgcgcag gtagcaaaaa gtcacaacat tgctttgata     8400
          tggaacgtta aagatttcat gtcattgtct gaacaactac gaaaacaaat acgtagtgct     8460
          gctaaaaaga ataacttacc ttttaagttg acatgtgcaa ctactagaca agttgttaat     8520
          gttgtaacaa caaagatagc acttaagggt ggtaaaattg ttaataattg gttgaagcag     8580
          ttaattaaag ttacacttgt gttccttttt gttgctgcta ttttctattt aataacacct     8640
          gttcatgtca tgtctaaaca tactgacttt tcaagtgaaa tcataggata caaggctatt     8700
          gatggtggtg tcactcgtga catagcatct acagatactt gttttgctaa caaacatgct     8760
          gattttgaca catggtttag ccagcgtggt ggtagttata ctaatgacaa agcttgccca     8820
          ttgattgctg cagtcataac aagagaagtg ggttttgtcg tgcctggttt gcctggcacg     8880
          atattacgca caactaatgg tgactttttg catttcttac ctagagtttt tagtgcagtt     8940
          ggtaacatct gttacacacc atcaaaactt atagagtaca ctgactttgc aacatcagct     9000
          tgtgttttgg ctgctgaatg tacaattttt aaagatgctt ctggtaagcc agtaccatat     9060
          tgttatgata ccaatgtact agaaggttct gttgcttatg aaagtttacg ccctgacaca     9120
          cgttatgtgc tcatggatgg ctctattatt caatttccta acacctacct tgaaggttct     9180
          gttagagtgg taacaacttt tgattctgag tactgtaggc acggcacttg tgaaagatca     9240
          gaagctggtg tttgtgtatc tactagtggt agatgggtac ttaacaatga ttattacaga     9300
          tctttaccag gagttttctg tggtgtagat gctgtaaatt tacttactaa tatgtttaca     9360
          ccactaattc aacctattgg tgctttggac atatcagcat ctatagtagc tggtggtatt     9420
          gtagctatcg tagtaacatg ccttgcctac tattttatga ggtttagaag agcttttggt     9480
          gaatacagtc atgtagttgc ctttaatact ttactattcc ttatgtcatt cactgtactc     9540
          tgtttaacac cagtttactc attcttacct ggtgtttatt ctgttattta cttgtacttg     9600
          acattttatc ttactaatga tgtttctttt ttagcacata ttcagtggat ggttatgttc     9660
          acacctttag tacctttctg gataacaatt gcttatatca tttgtatttc cacaaagcat     9720
          ttctattggt tctttagtaa ttacctaaag agacgtgtag tctttaatgg tgtttccttt     9780
          agtacttttg aagaagctgc gctgtgcacc tttttgttaa ataaagaaat gtatctaaag     9840
          ttgcgtagtg atgtgctatt acctcttacg caatataata gatacttagc tctttataat     9900
          aagtacaagt attttagtgg agcaatggat acaactagct acagagaagc tgcttgttgt     9960
          catctcgcaa aggctctcaa tgacttcagt aactcaggtt ctgatgttct ttaccaacca    10020
          ccacaaacct ctatcacctc agctgttttg cagagtggtt ttagaaaaat ggcattccca    10080
          tctggtaaag ttgagggttg tatggtacaa gtaacttgtg gtacaactac acttaacggt    10140
          ctttggcttg atgacgtagt ttactgtcca agacatgtga tctgcacctc tgaagacatg    10200
          cttaacccta attatgaaga tttactcatt cgtaagtcta atcataattt cttggtacag    10260
          gctggtaatg ttcaactcag ggttattgga cattctatgc aaaattgtgt acttaagctt    10320
          aaggttgata cagccaatcc taagacacct aagtataagt ttgttcgcat tcaaccagga    10380
          cagacttttt cagtgttagc ttgttacaat ggttcaccat ctggtgttta ccaatgtgct    10440
          atgaggccca atttcactat taagggttca ttccttaatg gttcatgtgg tagtgttggt    10500
          tttaacatag attatgactg tgtctctttt tgttacatgc accatatgga attaccaact    10560
          ggagttcatg ctggcacaga cttagaaggt aacttttatg gaccttttgt tgacaggcaa    10620
          acagcacaag cagctggtac ggacacaact attacagtta atgttttagc ttggttgtac    10680
          gctgctgtta taaatggaga caggtggttt ctcaatcgat ttaccacaac tcttaatgac    10740
          tttaaccttg tggctatgaa gtacaattat gaacctctaa cacaagacca tgttgacata    10800
          ctaggacctc tttctgctca aactggaatt gccgttttag atatgtgtgc ttcattaaaa    10860
          gaattactgc aaaatggtat gaatggacgt accatattgg gtagtgcttt attagaagat    10920
          gaatttacac cttttgatgt tgttagacaa tgctcaggtg ttactttcca aagtgcagtg    10980
          aaaagaacaa tcaagggtac acaccactgg ttgttactca caattttgac ttcactttta    11040
          gttttagtcc agagtactca atggtctttg ttcttttttt tgtatgaaaa tgccttttta    11100
          ccttttgcta tgggtattat tgctatgtct gcttttgcaa tgatgtttgt caaacataag    11160
          catgcatttc tctgtttgtt tttgttacct tctcttgcca ctgtagctta ttttaatatg    11220
          gtctatatgc ctgctagttg ggtgatgcgt attatgacat ggttggatat ggttgatact    11280
          agtttgtctg gttttaagct aaaagactgt gttatgtatg catcagctgt agtgttacta    11340
          atccttatga cagcaagaac tgtgtatgat gatggtgcta ggagagtgtg gacacttatg    11400
          aatgtcttga cactcgttta taaagtttat tatggtaatg ctttagatca agccatttcc    11460
          atgtgggctc ttataatctc tgttacttct aactactcag gtgtagttac aactgtcatg    11520
          tttttggcca gaggtattgt ttttatgtgt gttgagtatt gccctatttt cttcataact    11580
          ggtaatacac ttcagtgtat aatgctagtt tattgtttct taggctattt ttgtacttgt    11640
          tactttggcc tcttttgttt actcaaccgc tactttagac tgactcttgg tgtttatgat    11700
          tacttagttt ctacacagga gtttagatat atgaattcac agggactact cccacccaag    11760
          aatagcatag atgccttcaa actcaacatt aaattgttgg gtgttggtgg caaaccttgt    11820
          atcaaagtag ccactgtaca gtctaaaatg tcagatgtaa agtgcacatc agtagtctta    11880
          ctctcagttt tgcaacaact cagagtagaa tcatcatcta aattgtgggc tcaatgtgtc    11940
          cagttacaca atgacattct cttagctaaa gatactactg aagcctttga aaaaatggtt    12000
          tcactacttt ctgttttgct ttccatgcag ggtgctgtag acataaacaa gctttgtgaa    12060
          gaaatgctgg acaacagggc aaccttacaa gctatagcct cagagtttag ttcccttcca    12120
          tcatatgcag cttttgctac tgctcaagaa gcttatgagc aggctgttgc taatggtgat    12180
          tctgaagttg ttcttaaaaa gttgaagaag tctttgaatg tggctaaatc tgaatttgac    12240
          cgtgatgcag ccatgcaacg taagttggaa aagatggctg atcaagctat gacccaaatg    12300
          tataaacagg ctagatctga ggacaagagg gcaaaagtta ctagtgctat gcagacaatg    12360
          cttttcacta tgcttagaaa gttggataat gatgcactca acaacattat caacaatgca    12420
          agagatggtt gtgttccctt gaacataata cctcttacaa cagcagccaa actaatggtt    12480
          gtcataccag actataacac atataaaaat acgtgtgatg gtacaacatt tacttatgca    12540
          tcagcattgt gggaaatcca acaggttgta gatgcagata gtaaaattgt tcaacttagt    12600
          gaaattagta tggacaattc acctaattta gcatggcctc ttattgtaac agctttaagg    12660
          gccaattctg ctgtcaaatt acagaataat gagcttagtc ctgttgcact acgacagatg    12720
          tcttgtgctg ccggtactac acaaactgct tgcactgatg acaatgcgtt agcttactac    12780
          aacacaacaa agggaggtag gtttgtactt gcactgttat ccgatttaca ggatttgaaa    12840
          tgggctagat tccctaagag tgatggaact ggtactatct atacagaact ggaaccacct    12900
          tgtaggtttg ttacagacac acctaaaggt cctaaagtga agtatttata ctttattaaa    12960
          ggattaaaca acctaaatag aggtatggta cttggtagtt tagctgccac agtacgtcta    13020
          caagctggta atgcaacaga agtgcctgcc aattcaactg tattatcttt ctgtgctttt    13080
          gctgtagatg ctgctaaagc ttacaaagat tatctagcta gtgggggaca accaatcact    13140
          aattgtgtta agatgttgtg tacacacact ggtactggtc aggcaataac agttacaccg    13200
          gaagccaata tggatcaaga atcctttggt ggtgcatcgt gttgtctgta ctgccgttgc    13260
          cacatagatc atccaaatcc taaaggattt tgtgacttaa aaggtaagta tgtacaaata    13320
          cctacaactt gtgctaatga ccctgtgggt tttacactta aaaacacagt ctgtaccgtc    13380
          tgcggtatgt ggaaaggtta tggctgtagt tgtgatcaac tccgcgaacc catgcttcag    13440
          tcagctgatg cacaatcgtt tttaaacggg tttgcggtgt aagtgcagcc cgtcttacac    13500
          cgtgcggcac aggcactagt actgatgtcg tatacagggc ttttgacatc tacaatgata    13560
          aagtagctgg ttttgctaaa ttcctaaaaa ctaattgttg tcgcttccaa gaaaaggacg    13620
          aagatgacaa tttaattgat tcttactttg tagttaagag acacactttc tctaactacc    13680
          aacatgaaga aacaatttat aatttactta aggattgtcc agctgttgct aaacatgact    13740
          tctttaagtt tagaatagac ggtgacatgg taccacatat atcacgtcaa cgtcttacta    13800
          aatacacaat ggcagacctc gtctatgctt taaggcattt tgatgaaggt aattgtgaca    13860
          cattaaaaga aatacttgtc acatacaatt gttgtgatga tgattatttc aataaaaagg    13920
          actggtatga ttttgtagaa aacccagata tattacgcgt atacgccaac ttaggtgaac    13980
          gtgtacgcca agctttgtta aaaacagtac aattctgtga tgccatgcga aatgctggta    14040
          ttgttggtgt actgacatta gataatcaag atctcaatgg taactggtat gatttcggtg    14100
          atttcataca aaccacgcca ggtagtggag ttcctgttgt agattcttat tattcattgt    14160
          taatgcctat attaaccttg accagggctt taactgcaga gtcacatgtt gacactgact    14220
          taacaaagcc ttacattaag tgggatttgt taaaatatga cttcacggaa gagaggttaa    14280
          aactctttga ccgttatttt aaatattggg atcagacata ccacccaaat tgtgttaact    14340
          gtttggatga cagatgcatt ctgcattgtg caaactttaa tgttttattc tctacagtgt    14400
          tcccacctac aagttttgga ccactagtga gaaaaatatt tgttgatggt gttccatttg    14460
          tagtttcaac tggataccac ttcagagagc taggtgttgt acataatcag gatgtaaact    14520
          tacatagctc tagacttagt tttaaggaat tacttgtgta tgctgctgac cctgctatgc    14580
          acgctgcttc tggtaatcta ttactagata aacgcactac gtgcttttca gtagctgcac    14640
          ttactaacaa tgttgctttt caaactgtca aacccggtaa ttttaacaaa gacttctatg    14700
          actttgctgt gtctaagggt ttctttaagg aaggaagttc tgttgaatta aaacacttct    14760
          tctttgctca ggatggtaat gctgctatca gcgattatga ctactatcgt tataatctac    14820
          caacaatgtg tgatatcaga caactactat ttgtagttga agttgttgat aagtactttg    14880
          attgttacga tggtggctgt attaatgcta accaagtcat cgtcaacaac ctagacaaat    14940
          cagctggttt tccatttaat aaatggggta aggctagact ttattatgat tcaatgagtt    15000
          atgaggatca agatgcactt ttcgcatata caaaacgtaa tgtcatccct actataactc    15060
          aaatgaatct taagtatgcc attagtgcaa agaatagagc tcgcaccgta gctggtgtct    15120
          ctatctgtag tactatgacc aatagacagt ttcatcaaaa attattgaaa tcaatagccg    15180
          ccactagagg agctactgta gtaattggaa caagcaaatt ctatggtggt tggcacaaca    15240
          tgttaaaaac tgtttatagt gatgtagaaa accctcacct tatgggttgg gattatccta    15300
          aatgtgatag agccatgcct aacatgctta gaattatggc ctcacttgtt cttgctcgca    15360
          aacatacaac gtgttgtagc ttgtcacacc gtttctatag attagctaat gagtgtgctc    15420
          aagtattgag tgaaatggtc atgtgtggcg gttcactata tgttaaacca ggtggaacct    15480
          catcaggaga tgccacaact gcttatgcta atagtgtttt taacatttgt caagctgtca    15540
          cggccaatgt taatgcactt ttatctactg atggtaacaa aattgccgat aagtatgtcc    15600
          gcaatttaca acacagactt tatgagtgtc tctatagaaa tagagatgtt gacacagact    15660
          ttgtgaatga gttttacgca tatttgcgta aacatttctc aatgatgata ctctctgacg    15720
          atgctgttgt gtgtttcaat agcacttatg catctcaagg tctagtggct agcataaaga    15780
          actttaagtc agttctttat tatcaaaaca atgtttttat gtctgaagca aaatgttgga    15840
          ctgagactga ccttactaaa ggacctcatg aattttgctc tcaacataca atgctagtta    15900
          aacagggtga tgattatgtg taccttcctt acccagatcc atcaagaatc ctaggggccg    15960
          gctgttttgt agatgatatc gtaaaaacag atggtacact tatgattgaa cggttcgtgt    16020
          ctttagctat agatgcttac ccacttacta aacatcctaa tcaggagtat gctgatgtct    16080
          ttcatttgta cttacaatac ataagaaagc tacatgatga gttaacagga cacatgttag    16140
          acatgtattc tgttatgctt actaatgata acacttcaag gtattgggaa cctgagtttt    16200
          atgaggctat gtacacaccg catacagtct tacaggctgt tggggcttgt gttctttgca    16260
          attcacagac ttcattaaga tgtggtgctt gcatacgtag accattctta tgttgtaaat    16320
          gctgttacga ccatgtcata tcaacatcac ataaattagt cttgtctgtt aatccgtatg    16380
          tttgcaatgc tccaggttgt gatgtcacag atgtgactca actttactta ggaggtatga    16440
          gctattattg taaatcacat aaaccaccca ttagttttcc attgtgtgct aatggacaag    16500
          tttttggttt atataaaaat acatgtgttg gtagcgataa tgttactgac tttaatgcaa    16560
          ttgcaacatg tgactggaca aatgctggtg attacatttt agctaacacc tgtactgaaa    16620
          gactcaagct ttttgcagca gaaacgctca aagctactga ggagacattt aaactgtctt    16680
          atggtattgc tactgtacgt gaagtgctgt ctgacagaga attacatctt tcatgggaag    16740
          ttggtaaacc tagaccacca cttaaccgaa attatgtctt tactggttat cgtgtaacta    16800
          aaaacagtaa agtacaaata ggagagtaca cctttgaaaa aggtgactat ggtgatgctg    16860
          ttgtttaccg aggtacaaca acttacaaat taaatgttgg tgattatttt gtgctgacat    16920
          cacatacagt aatgccatta agtgcaccta cactagtgcc acaagagcac tatgttagaa    16980
          ttactggctt atacccaaca ctcaatatct cagatgagtt ttctagcaat gttgcaaatt    17040
          atcaaaaggt tggtatgcaa aagtattcta cactccaggg accacctggt actggtaaga    17100
          gtcattttgc tattggccta gctctctact acccttctgc tcgcatagtg tatacagctt    17160
          gctctcatgc cgctgttgat gcactatgtg agaaggcatt aaaatatttg cctatagata    17220
          aatgtagtag aattatacct gcacgtgctc gtgtagagtg ttttgataaa ttcaaagtga    17280
          attcaacatt agaacagtat gtcttttgta ctgtaaatgc attgcctgag acgacagcag    17340
          atatagttgt ctttgatgaa atttcaatgg ccacaaatta tgatttgagt gttgtcaatg    17400
          ccagattacg tgctaagcac tatgtgtaca ttggcgaccc tgctcaatta cctgcaccac    17460
          gcacattgct aactaagggc acactagaac cagaatattt caattcagtg tgtagactta    17520
          tgaaaactat aggtccagac atgttcctcg gaacttgtcg gcgttgtcct gctgaaattg    17580
          ttgacactgt gagtgctttg gtttatgata ataagcttaa agcacataaa gacaaatcag    17640
          ctcaatgctt taaaatgttt tataagggtg ttatcacgca tgatgtttca tctgcaatta    17700
          acaggccaca aataggcgtg gtaagagaat tccttacacg taaccctgct tggagaaaag    17760
          ctgtctttat ttcaccttat aattcacaga atgctgtagc ctcaaagatt ttgggactac    17820
          caactcaaac tgttgattca tcacagggct cagaatatga ctatgtcata ttcactcaaa    17880
          ccactgaaac agctcactct tgtaatgtaa acagatttaa tgttgctatt accagagcaa    17940
          aagtaggcat actttgcata atgtctgata gagaccttta tgacaagttg caatttacaa    18000
          gtcttgaaat tccacgtagg aatgtggcaa ctttacaagc tgaaaatgta acaggactct    18060
          ttaaagattg tagtaaggta atcactgggt tacatcctac acaggcacct acacacctca    18120
          gtgttgacac taaattcaaa actgaaggtt tatgtgttga catacctggc atacctaagg    18180
          acatgaccta tagaagactc atctctatga tgggttttaa aatgaattat caagttaatg    18240
          gttaccctaa catgtttatc acccgcgaag aagctataag acatgtacgt gcatggattg    18300
          gcttcgatgt cgaggggtgt catgctacta gagaagctgt tggtaccaat ttacctttac    18360
          agctaggttt ttctacaggt gttaacctag ttgctgtacc tacaggttat gttgatacac    18420
          ctaataatac agatttttcc agagttagtg ctaaaccacc gcctggagat caatttaaac    18480
          acctcatacc acttatgtac aaaggacttc cttggaatgt agtgcgtata aagattgtac    18540
          aaatgttaag tgacacactt aaaaatctct ctgacagagt cgtatttgtc ttatgggcac    18600
          atggctttga gttgacatct atgaagtatt ttgtgaaaat aggacctgag cgcacctgtt    18660
          gtctatgtga tagacgtgcc acatgctttt ccactgcttc agacacttat gcctgttggc    18720
          atcattctat tggatttgat tacgtctata atccgtttat gattgatgtt caacaatggg    18780
          gttttacagg taacctacaa agcaaccatg atctgtattg tcaagtccat ggtaatgcac    18840
          atgtagctag ttgtgatgca atcatgacta ggtgtctagc tgtccacgag tgctttgtta    18900
          agcgtgttga ctggactatt gaatatccta taattggtga tgaactgaag attaatgcgg    18960
          cttgtagaaa ggttcaacac atggttgtta aagctgcatt attagcagac aaattcccag    19020
          ttcttcacga cattggtaac cctaaagcta ttaagtgtgt acctcaagct gatgtagaat    19080
          ggaagttcta tgatgcacag ccttgtagtg acaaagctta taaaatagaa gaattattct    19140
          attcttatgc cacacattct gacaaattca cagatggtgt atgcctattt tggaattgca    19200
          atgtcgatag atatcctgct aattccattg tttgtagatt tgacactaga gtgctatcta    19260
          accttaactt gcctggttgt gatggtggca gtttgtatgt aaataaacat gcattccaca    19320
          caccagcttt tgataaaagt gcttttgtta atttaaaaca attaccattt ttctattact    19380
          ctgacagtcc atgtgagtct catggaaaac aagtagtgtc agatatagat tatgtaccac    19440
          taaagtctgc tacgtgtata acacgttgca atttaggtgg tgctgtctgt agacatcatg    19500
          ctaatgagta cagattgtat ctcgatgctt ataacatgat gatctcagct ggctttagct    19560
          tgtgggttta caaacaattt gatacttata acctctggaa cacttttaca agacttcaga    19620
          gtttagaaaa tgtggctttt aatgttgtaa ataagggaca ctttgatgga caacagggtg    19680
          aagtaccagt ttctatcatt aataacactg tttacacaaa agttgatggt gttgatgtag    19740
          aattgtttga aaataaaaca acattacctg ttaatgtagc atttgagctt tgggctaagc    19800
          gcaacattaa accagtacca gaggtgaaaa tactcaataa tttgggtgtg gacattgctg    19860
          ctaatactgt gatctgggac tacaaaagag atgctccagc acatatatct actattggtg    19920
          tttgttctat gactgacata gccaagaaac caactgaaac gatttgtgca ccactcactg    19980
          tcttttttga tggtagagtt gatggtcaag tagacttatt tagaaatgcc cgtaatggtg    20040
          ttcttattac agaaggtagt gttaaaggtt tacaaccatc tgtaggtccc aaacaagcta    20100
          gtcttaatgg agtcacatta attggagaag ccgtaaaaac acagttcaat tattataaga    20160
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          tcattgaacg gtataaatta gaaggctatg ccttcgaaca tatcgtttat ggagatttta    20340
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          cacgcgaaca aatagatggt tatgtcatgc atgcaaatta catattttgg aggaatacaa    21360
          atccaattca gttgtcttcc tattctttat ttgacatgag taaatttccc cttaaattaa    21420
          ggggtactgc tgttatgtct ttaaaagaag gtcaaatcaa tgatatgatt ttatctcttc    21480
          ttagtaaagg tagacttata attagagaaa acaacagagt tgttatttct agtgatgttc    21540
          ttgttaacaa ctaaacgaac aatgtttgtt tttcttgttt tattgccact agtctctagt    21600
          cagtgtgtta atcttacaac cagaactcaa ttaccccctg catacactaa ttctttcaca    21660
          cgtggtgttt attaccctga caaagttttc agatcctcag ttttacattc aactcaggac    21720
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          tccactgaga agtctaacat aataagaggc tggatttttg gtactacttt agattcgaag    21900
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          caattttgta atgatccatt tttgggtgtt tattaccaca aaaacaacaa aagttggatg    22020
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          acttttctat taaaatataa tgaaaatgga accattacag atgctgtaga ctgtgcactt    22440
          gaccctctct cagaaacaaa gtgtacgttg aaatccttca ctgtagaaaa aggaatctat    22500
          caaacttcta actttagagt ccaaccaaca gaatctattg ttagatttcc taatattaca    22560
          aacttgtgcc cttttggtga agtttttaac gccaccagat ttgcatctgt ttatgcttgg    22620
          aacaggaaga gaatcagcaa ctgtgttgct gattattctg tcctatataa ttccgcatca    22680
          ttttccactt ttaagtgtta tggagtgtct cctactaaat taaatgatct ctgctttact    22740
          aatgtctatg cagattcatt tgtaattaga ggtgatgaag tcagacaaat cgctccaggg    22800
          caaactggaa agattgctga ttataattat aaattaccag atgattttac aggctgcgtt    22860
          atagcttgga attctaacaa tcttgattct aaggttggtg gtaattataa ttacctgtat    22920
          agattgttta ggaagtctaa tctcaaacct tttgagagag atatttcaac tgaaatctat    22980
          caggccggta gcacaccttg taatggtgtt gaaggtttta attgttactt tcctttacaa    23040
          tcatatggtt tccaacccac taatggtgtt ggttaccaac catacagagt agtagtactt    23100
          tcttttgaac ttctacatgc accagcaact gtttgtggac ctaaaaagtc tactaatttg    23160
          gttaaaaaca aatgtgtcaa tttcaacttc aatggtttaa caggcacagg tgttcttact    23220
          gagtctaaca aaaagtttct gcctttccaa caatttggca gagacattgc tgacactact    23280
          gatgctgtcc gtgatccaca gacacttgag attcttgaca ttacaccatg ttcttttggt    23340
          ggtgtcagtg ttataacacc aggaacaaat acttctaacc aggttgctgt tctttatcag    23400
          gatgttaact gcacagaagt ccctgttgct attcatgcag atcaacttac tcctacttgg    23460
          cgtgtttatt ctacaggttc taatgttttt caaacacgtg caggctgttt aataggggct    23520
          gaacatgtca acaactcata tgagtgtgac atacccattg gtgcaggtat atgcgctagt    23580
          tatcagactc agactaattc tcctcggcgg gcacgtagtg tagctagtca atccatcatt    23640
          gcctacacta tgtcacttgg tgcagaaaat tcagttgctt actctaataa ctctattgcc    23700
          atacccacaa attttactat tagtgttacc acagaaattc taccagtgtc tatgaccaag    23760
          acatcagtag attgtacaat gtacatttgt ggtgattcaa ctgaatgcag caatcttttg    23820
          ttgcaatatg gcagtttttg tacacaatta aaccgtgctt taactggaat agctgttgaa    23880
          caagacaaaa acacccaaga agtttttgca caagtcaaac aaatttacaa aacaccacca    23940
          attaaagatt ttggtggttt taatttttca caaatattac cagatccatc aaaaccaagc    24000
          aagaggtcat ttattgaaga tctacttttc aacaaagtga cacttgcaga tgctggcttc    24060
          atcaaacaat atggtgattg ccttggtgat attgctgcta gagacctcat ttgtgcacaa    24120
          aagtttaacg gccttactgt tttgccacct ttgctcacag atgaaatgat tgctcaatac    24180
          acttctgcac tgttagcggg tacaatcact tctggttgga cctttggtgc aggtgctgca    24240
          ttacaaatac catttgctat gcaaatggct tataggttta atggtattgg agttacacag    24300
          aatgttctct atgagaacca aaaattgatt gccaaccaat ttaatagtgc tattggcaaa    24360
          attcaagact cactttcttc cacagcaagt gcacttggaa aacttcaaga tgtggtcaac    24420
          caaaatgcac aagctttaaa cacgcttgtt aaacaactta gctccaattt tggtgcaatt    24480
          tcaagtgttt taaatgatat cctttcacgt cttgacaaag ttgaggctga agtgcaaatt    24540
          gataggttga tcacaggcag acttcaaagt ttgcagacat atgtgactca acaattaatt    24600
          agagctgcag aaatcagagc ttctgctaat cttgctgcta ctaaaatgtc agagtgtgta    24660
          cttggacaat caaaaagagt tgatttttgt ggaaagggct atcatcttat gtccttccct    24720
          cagtcagcac ctcatggtgt agtcttcttg catgtgactt atgtccctgc acaagaaaag    24780
          aacttcacaa ctgctcctgc catttgtcat gatggaaaag cacactttcc tcgtgaaggt    24840
          gtctttgttt caaatggcac acactggttt gtaacacaaa ggaattttta tgaaccacaa    24900
          atcattacta cagacaacac atttgtgtct ggtaactgtg atgttgtaat aggaattgtc    24960
          aacaacacag tttatgatcc tttgcaacct gaattagact cattcaagga ggagttagat    25020
          aaatatttta agaatcatac atcaccagat gttgatttag gtgacatctc tggcattaat    25080
          gcttcagttg taaacattca aaaagaaatt gaccgcctca atgaggttgc caagaattta    25140
          aatgaatctc tcatcgatct ccaagaactt ggaaagtatg agcagtatat aaaatggcca    25200
          tggtacattt ggctaggttt tatagctggc ttgattgcca tagtaatggt gacaattatg    25260
          ctttgctgta tgaccagttg ctgtagttgt ctcaagggct gttgttcttg tggatcctgc    25320
          tgcaaatttg atgaagacga ctctgagcca gtgctcaaag gagtcaaatt acattacaca    25380
          taaacgaact tatggatttg tttatgagaa tcttcacaat tggaactgta actttgaagc    25440
          aaggtgaaat caaggatgct actccttcag attttgttcg cgctactgca acgataccga    25500
          tacaagcctc actccctttc ggatggctta ttgttggcgt tgcacttctt gctgtttttc    25560
          agagcgcttc caaaatcata accctcaaaa agagatggca actagcactc tccaagggtg    25620
          ttcactttgt ttgcaacttg ctgttgttgt ttgtaacagt ttactcacac cttttgctcg    25680
          ttgctgctgg ccttgaagcc ccttttctct atctttatgc tttagtctac ttcttgcaga    25740
          gtataaactt tgtaagaata ataatgaggc tttggctttg ctggaaatgc cgttccaaaa    25800
          acccattact ttatgatgcc aactattttc tttgctggca tactaattgt tacgactatt    25860
          gtatacctta caatagtgta acttcttcaa ttgtcattac ttcaggtgat ggcacaacaa    25920
          gtcctatttc tgaacatgac taccagattg gtggttatac tgaaaaatgg gaatctggag    25980
          taaaagactg tgttgtatta cacagttact tcacttcaga ctattaccag ctgtactcaa    26040
          ctcaattgag tacagacact ggtgttgaac atgttacctt cttcatctac aataaaattg    26100
          ttgatgagcc tgaagaacat gtccaaattc acacaatcga cggttcatcc ggagttgtta    26160
          atccagtaat ggaaccaatt tatgatgaac cgacgacgac tactagcgtg cctttgtaag    26220
          cacaagctga tgagtacgaa cttatgtact cattcgtttc ggaagagaca ggtacgttaa    26280
          tagttaatag cgtacttctt tttcttgctt tcgtggtatt cttgctagtt acactagcca    26340
          tccttactgc gcttcgattg tgtgcgtact gctgcaatat tgttaacgtg agtcttgtaa    26400
          aaccttcttt ttacgtttac tctcgtgtta aaaatctgaa ttcttctaga gttcctgatc    26460
          ttctggtcta aacgaactaa atattatatt agtttttctg tttggaactt taattttagc    26520
          catggcagat tccaacggta ctattaccgt tgaagagctt aaaaagctcc ttgaacaatg    26580
          gaacctagta ataggtttcc tattccttac atggatttgt cttctacaat ttgcctatgc    26640
          caacaggaat aggtttttgt atataattaa gttaattttc ctctggctgt tatggccagt    26700
          aactttagct tgttttgtgc ttgctgctgt ttacagaata aattggatca ccggtggaat    26760
          tgctatcgca atggcttgtc ttgtaggctt gatgtggctc agctacttca ttgcttcttt    26820
          cagactgttt gcgcgtacgc gttccatgtg gtcattcaat ccagaaacta acattcttct    26880
          caacgtgcca ctccatggca ctattctgac cagaccgctt ctagaaagtg aactcgtaat    26940
          cggagctgtg atccttcgtg gacatcttcg tattgctgga caccatctag gacgctgtga    27000
          catcaaggac ctgcctaaag aaatcactgt tgctacatca cgaacgcttt cttattacaa    27060
          attgggagct tcgcagcgtg tagcaggtga ctcaggtttt gctgcataca gtcgctacag    27120
          gattggcaac tataaattaa acacagacca ttccagtagc agtgacaata ttgctttgct    27180
          tgtacagtaa gtgacaacag atgtttcatc tcgttgactt tcaggttact atagcagaga    27240
          tattactaat tattatgagg acttttaaag tttccatttg gaatcttgat tacatcataa    27300
          acctcataat taaaaattta tctaagtcac taactgagaa taaatattct caattagatg    27360
          aagagcaacc aatggagatt gattaaacga acatgaaaat tattcttttc ttggcactga    27420
          taacactcgc tacttgtgag ctttatcact accaagagtg tgttagaggt acaacagtac    27480
          ttttaaaaga accttgctct tctggaacat acgagggcaa ttcaccattt catcctctag    27540
          ctgataacaa atttgcactg acttgcttta gcactcaatt tgcttttgct tgtcctgacg    27600
          gcgtaaaaca cgtctatcag ttacgtgcca gatcagtttc acctaaactg ttcatcagac    27660
          aagaggaagt tcaagaactt tactctccaa tttttcttat tgttgcggca atagtgttta    27720
          taacactttg cttcacactc aaaagaaaga cagaatgatt gaactttcat taattgactt    27780
          ctatttgtgc tttttagcct ttctgctatt ccttgtttta attatgctta ttatcttttg    27840
          gttctcactt gaactgcaag atcataatga aacttgtcac gcctaaacga acatgaaatt    27900
          tcttgttttc ttaggaatca tcacaactgt agctgcattt caccaagaat gtagtttaca    27960
          gtcatgtact caacatcaac catatgtagt tgatgacccg tgtcctattc acttctattc    28020
          taaatggtat attagagtag gagctagaaa atcagcacct ttaattgaat tgtgcgtgga    28080
          tgaggctggt tctaaatcac ccattcagta catcgatatc ggtaattata cagtttcctg    28140
          tttacctttt acaattaatt gccaggaacc taaattgggt agtcttgtag tgcgttgttc    28200
          gttctatgaa gactttttag agtatcatga cgttcgtgtt gttttagatt tcatctaaac    28260
          gaacaaacta aaatgtctga taatggaccc caaaatcagc gaaatgcacc ccgcattacg    28320
          tttggtggac cctcagattc aactggcagt aaccagaatg gagaacgcag tggggcgcga    28380
          tcaaaacaac gtcggcccca aggtttaccc aataatactg cgtcttggtt caccgctctc    28440
          actcaacatg gcaaggaaga ccttaaattc cctcgaggac aaggcgttcc aattaacacc    28500
          aatagcagtc cagatgacca aattggctac taccgaagag ctaccagacg aattcgtggt    28560
          ggtgacggta aaatgaaaga tctcagtcca agatggtatt tctactacct aggaactggg    28620
          ccagaagctg gacttcccta tggtgctaac aaagacggca tcatatgggt tgcaactgag    28680
          ggagccttga atacaccaaa agatcacatt ggcacccgca atcctgctaa caatgctgca    28740
          atcgtgctac aacttcctca aggaacaaca ttgccaaaag gcttctacgc agaagggagc    28800
          agaggcggca gtcaagcctc ttctcgttcc tcatcacgta gtcgcaacag ttcaagaaat    28860
          tcaactccag gcagcagtag gggaacttct cctgctagaa tggctggcaa tggcggtgat    28920
          gctgctcttg ctttgctgct gcttgacaga ttgaaccagc ttgagagcaa aatgtctggt    28980
          aaaggccaac aacaacaagg ccaaactgtc actaagaaat ctgctgctga ggcttctaag    29040
          aagcctcggc aaaaacgtac tgccactaaa gcatacaatg taacacaagc tttcggcaga    29100
          cgtggtccag aacaaaccca aggaaatttt ggggaccagg aactaatcag acaaggaact    29160
          gattacaaac attggccgca aattgcacaa tttgccccca gcgcttcagc gttcttcgga    29220
          atgtcgcgca ttggcatgga agtcacacct tcgggaacgt ggttgaccta cacaggtgcc    29280
          atcaaattgg atgacaaaga tccaaatttc aaagatcaag tcattttgct gaataagcat    29340
          attgacgcat acaaaacatt cccaccaaca gagcctaaaa aggacaaaaa gaagaaggct    29400
          gatgaaactc aagccttacc gcagagacag aagaaacagc aaactgtgac tcttcttcct    29460
          gctgcagatt tggatgattt ctccaaacaa ttgcaacaat ccatgagcag tgctgactca    29520
          actcaggcct aaactcatgc agaccacaca aggcagatgg gctatataaa cgttttcgct    29580
          tttccgttta cgatatatag tctactcttg tgcagaatga attctcgtaa ctacatagca    29640
          caagtagatg tagttaactt taatctcaca tagcaatctt taatcagtgt gtaacattag    29700
          ggaggacttg aaagagccac cacattttca ccgaggccac gcggagtacg atcgagtgta    29760
          cagtgaacaa tgctagggag agctgcctat atggaagagc cctaatgtgt aaaattaatt    29820
          ttagtagtgc tatccccatg tgattttaat agcttcttag gagaatgaca aaaaaaaaaa    29880
          aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aa                                             29902
          <![CDATA[<210>  2]]>
          <![CDATA[<211>  7096]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒SARS冠狀病毒2]]>
          <![CDATA[<400>  2]]>
          Met Glu Ser Leu Val Pro Gly Phe Asn Glu Lys Thr His Val Gln Leu 
          1               5                   10                  15      
          Ser Leu Pro Val Leu Gln Val Arg Asp Val Leu Val Arg Gly Phe Gly 
                      20                  25                  30          
          Asp Ser Val Glu Glu Val Leu Ser Glu Ala Arg Gln His Leu Lys Asp 
                  35                  40                  45              
          Gly Thr Cys Gly Leu Val Glu Val Glu Lys Gly Val Leu Pro Gln Leu 
              50                  55                  60                  
          Glu Gln Pro Tyr Val Phe Ile Lys Arg Ser Asp Ala Arg Thr Ala Pro 
          65                  70                  75                  80  
          His Gly His Val Met Val Glu Leu Val Ala Glu Leu Glu Gly Ile Gln 
                          85                  90                  95      
          Tyr Gly Arg Ser Gly Glu Thr Leu Gly Val Leu Val Pro His Val Gly 
                      100                 105                 110         
          Glu Ile Pro Val Ala Tyr Arg Lys Val Leu Leu Arg Lys Asn Gly Asn 
                  115                 120                 125             
          Lys Gly Ala Gly Gly His Ser Tyr Gly Ala Asp Leu Lys Ser Phe Asp 
              130                 135                 140                 
          Leu Gly Asp Glu Leu Gly Thr Asp Pro Tyr Glu Asp Phe Gln Glu Asn 
          145                 150                 155                 160 
          Trp Asn Thr Lys His Ser Ser Gly Val Thr Arg Glu Leu Met Arg Glu 
                          165                 170                 175     
          Leu Asn Gly Gly Ala Tyr Thr Arg Tyr Val Asp Asn Asn Phe Cys Gly 
                      180                 185                 190         
          Pro Asp Gly Tyr Pro Leu Glu Cys Ile Lys Asp Leu Leu Ala Arg Ala 
                  195                 200                 205             
          Gly Lys Ala Ser Cys Thr Leu Ser Glu Gln Leu Asp Phe Ile Asp Thr 
              210                 215                 220                 
          Lys Arg Gly Val Tyr Cys Cys Arg Glu His Glu His Glu Ile Ala Trp 
          225                 230                 235                 240 
          Tyr Thr Glu Arg Ser Glu Lys Ser Tyr Glu Leu Gln Thr Pro Phe Glu 
                          245                 250                 255     
          Ile Lys Leu Ala Lys Lys Phe Asp Thr Phe Asn Gly Glu Cys Pro Asn 
                      260                 265                 270         
          Phe Val Phe Pro Leu Asn Ser Ile Ile Lys Thr Ile Gln Pro Arg Val 
                  275                 280                 285             
          Glu Lys Lys Lys Leu Asp Gly Phe Met Gly Arg Ile Arg Ser Val Tyr 
              290                 295                 300                 
          Pro Val Ala Ser Pro Asn Glu Cys Asn Gln Met Cys Leu Ser Thr Leu 
          305                 310                 315                 320 
          Met Lys Cys Asp His Cys Gly Glu Thr Ser Trp Gln Thr Gly Asp Phe 
                          325                 330                 335     
          Val Lys Ala Thr Cys Glu Phe Cys Gly Thr Glu Asn Leu Thr Lys Glu 
                      340                 345                 350         
          Gly Ala Thr Thr Cys Gly Tyr Leu Pro Gln Asn Ala Val Val Lys Ile 
                  355                 360                 365             
          Tyr Cys Pro Ala Cys His Asn Ser Glu Val Gly Pro Glu His Ser Leu 
              370                 375                 380                 
          Ala Glu Tyr His Asn Glu Ser Gly Leu Lys Thr Ile Leu Arg Lys Gly 
          385                 390                 395                 400 
          Gly Arg Thr Ile Ala Phe Gly Gly Cys Val Phe Ser Tyr Val Gly Cys 
                          405                 410                 415     
          His Asn Lys Cys Ala Tyr Trp Val Pro Arg Ala Ser Ala Asn Ile Gly 
                      420                 425                 430         
          Cys Asn His Thr Gly Val Val Gly Glu Gly Ser Glu Gly Leu Asn Asp 
                  435                 440                 445             
          Asn Leu Leu Glu Ile Leu Gln Lys Glu Lys Val Asn Ile Asn Ile Val 
              450                 455                 460                 
          Gly Asp Phe Lys Leu Asn Glu Glu Ile Ala Ile Ile Leu Ala Ser Phe 
          465                 470                 475                 480 
          Ser Ala Ser Thr Ser Ala Phe Val Glu Thr Val Lys Gly Leu Asp Tyr 
                          485                 490                 495     
          Lys Ala Phe Lys Gln Ile Val Glu Ser Cys Gly Asn Phe Lys Val Thr 
                      500                 505                 510         
          Lys Gly Lys Ala Lys Lys Gly Ala Trp Asn Ile Gly Glu Gln Lys Ser 
                  515                 520                 525             
          Ile Leu Ser Pro Leu Tyr Ala Phe Ala Ser Glu Ala Ala Arg Val Val 
              530                 535                 540                 
          Arg Ser Ile Phe Ser Arg Thr Leu Glu Thr Ala Gln Asn Ser Val Arg 
          545                 550                 555                 560 
          Val Leu Gln Lys Ala Ala Ile Thr Ile Leu Asp Gly Ile Ser Gln Tyr 
                          565                 570                 575     
          Ser Leu Arg Leu Ile Asp Ala Met Met Phe Thr Ser Asp Leu Ala Thr 
                      580                 585                 590         
          Asn Asn Leu Val Val Met Ala Tyr Ile Thr Gly Gly Val Val Gln Leu 
                  595                 600                 605             
          Thr Ser Gln Trp Leu Thr Asn Ile Phe Gly Thr Val Tyr Glu Lys Leu 
              610                 615                 620                 
          Lys Pro Val Leu Asp Trp Leu Glu Glu Lys Phe Lys Glu Gly Val Glu 
          625                 630                 635                 640 
          Phe Leu Arg Asp Gly Trp Glu Ile Val Lys Phe Ile Ser Thr Cys Ala 
                          645                 650                 655     
          Cys Glu Ile Val Gly Gly Gln Ile Val Thr Cys Ala Lys Glu Ile Lys 
                      660                 665                 670         
          Glu Ser Val Gln Thr Phe Phe Lys Leu Val Asn Lys Phe Leu Ala Leu 
                  675                 680                 685             
          Cys Ala Asp Ser Ile Ile Ile Gly Gly Ala Lys Leu Lys Ala Leu Asn 
              690                 695                 700                 
          Leu Gly Glu Thr Phe Val Thr His Ser Lys Gly Leu Tyr Arg Lys Cys 
          705                 710                 715                 720 
          Val Lys Ser Arg Glu Glu Thr Gly Leu Leu Met Pro Leu Lys Ala Pro 
                          725                 730                 735     
          Lys Glu Ile Ile Phe Leu Glu Gly Glu Thr Leu Pro Thr Glu Val Leu 
                      740                 745                 750         
          Thr Glu Glu Val Val Leu Lys Thr Gly Asp Leu Gln Pro Leu Glu Gln 
                  755                 760                 765             
          Pro Thr Ser Glu Ala Val Glu Ala Pro Leu Val Gly Thr Pro Val Cys 
              770                 775                 780                 
          Ile Asn Gly Leu Met Leu Leu Glu Ile Lys Asp Thr Glu Lys Tyr Cys 
          785                 790                 795                 800 
          Ala Leu Ala Pro Asn Met Met Val Thr Asn Asn Thr Phe Thr Leu Lys 
                          805                 810                 815     
          Gly Gly Ala Pro Thr Lys Val Thr Phe Gly Asp Asp Thr Val Ile Glu 
                      820                 825                 830         
          Val Gln Gly Tyr Lys Ser Val Asn Ile Thr Phe Glu Leu Asp Glu Arg 
                  835                 840                 845             
          Ile Asp Lys Val Leu Asn Glu Lys Cys Ser Ala Tyr Thr Val Glu Leu 
              850                 855                 860                 
          Gly Thr Glu Val Asn Glu Phe Ala Cys Val Val Ala Asp Ala Val Ile 
          865                 870                 875                 880 
          Lys Thr Leu Gln Pro Val Ser Glu Leu Leu Thr Pro Leu Gly Ile Asp 
                          885                 890                 895     
          Leu Asp Glu Trp Ser Met Ala Thr Tyr Tyr Leu Phe Asp Glu Ser Gly 
                      900                 905                 910         
          Glu Phe Lys Leu Ala Ser His Met Tyr Cys Ser Phe Tyr Pro Pro Asp 
                  915                 920                 925             
          Glu Asp Glu Glu Glu Gly Asp Cys Glu Glu Glu Glu Phe Glu Pro Ser 
              930                 935                 940                 
          Thr Gln Tyr Glu Tyr Gly Thr Glu Asp Asp Tyr Gln Gly Lys Pro Leu 
          945                 950                 955                 960 
          Glu Phe Gly Ala Thr Ser Ala Ala Leu Gln Pro Glu Glu Glu Gln Glu 
                          965                 970                 975     
          Glu Asp Trp Leu Asp Asp Asp Ser Gln Gln Thr Val Gly Gln Gln Asp 
                      980                 985                 990         
          Gly Ser Glu Asp Asn Gln Thr Thr  Thr Ile Gln Thr Ile  Val Glu Val 
                  995                 1000                 1005             
          Gln Pro  Gln Leu Glu Met Glu  Leu Thr Pro Val Val  Gln Thr Ile 
              1010                 1015                 1020             
          Glu Val  Asn Ser Phe Ser Gly  Tyr Leu Lys Leu Thr  Asp Asn Val 
              1025                 1030                 1035             
          Tyr Ile  Lys Asn Ala Asp Ile  Val Glu Glu Ala Lys  Lys Val Lys 
              1040                 1045                 1050             
          Pro Thr  Val Val Val Asn Ala  Ala Asn Val Tyr Leu  Lys His Gly 
              1055                 1060                 1065             
          Gly Gly  Val Ala Gly Ala Leu  Asn Lys Ala Thr Asn  Asn Ala Met 
              1070                 1075                 1080             
          Gln Val  Glu Ser Asp Asp Tyr  Ile Ala Thr Asn Gly  Pro Leu Lys 
              1085                 1090                 1095             
          Val Gly  Gly Ser Cys Val Leu  Ser Gly His Asn Leu  Ala Lys His 
              1100                 1105                 1110             
          Cys Leu  His Val Val Gly Pro  Asn Val Asn Lys Gly  Glu Asp Ile 
              1115                 1120                 1125             
          Gln Leu  Leu Lys Ser Ala Tyr  Glu Asn Phe Asn Gln  His Glu Val 
              1130                 1135                 1140             
          Leu Leu  Ala Pro Leu Leu Ser  Ala Gly Ile Phe Gly  Ala Asp Pro 
              1145                 1150                 1155             
          Ile His  Ser Leu Arg Val Cys  Val Asp Thr Val Arg  Thr Asn Val 
              1160                 1165                 1170             
          Tyr Leu  Ala Val Phe Asp Lys  Asn Leu Tyr Asp Lys  Leu Val Ser 
              1175                 1180                 1185             
          Ser Phe  Leu Glu Met Lys Ser  Glu Lys Gln Val Glu  Gln Lys Ile 
              1190                 1195                 1200             
          Ala Glu  Ile Pro Lys Glu Glu  Val Lys Pro Phe Ile  Thr Glu Ser 
              1205                 1210                 1215             
          Lys Pro  Ser Val Glu Gln Arg  Lys Gln Asp Asp Lys  Lys Ile Lys 
              1220                 1225                 1230             
          Ala Cys  Val Glu Glu Val Thr  Thr Thr Leu Glu Glu  Thr Lys Phe 
              1235                 1240                 1245             
          Leu Thr  Glu Asn Leu Leu Leu  Tyr Ile Asp Ile Asn  Gly Asn Leu 
              1250                 1255                 1260             
          His Pro  Asp Ser Ala Thr Leu  Val Ser Asp Ile Asp  Ile Thr Phe 
              1265                 1270                 1275             
          Leu Lys  Lys Asp Ala Pro Tyr  Ile Val Gly Asp Val  Val Gln Glu 
              1280                 1285                 1290             
          Gly Val  Leu Thr Ala Val Val  Ile Pro Thr Lys Lys  Ala Gly Gly 
              1295                 1300                 1305             
          Thr Thr  Glu Met Leu Ala Lys  Ala Leu Arg Lys Val  Pro Thr Asp 
              1310                 1315                 1320             
          Asn Tyr  Ile Thr Thr Tyr Pro  Gly Gln Gly Leu Asn  Gly Tyr Thr 
              1325                 1330                 1335             
          Val Glu  Glu Ala Lys Thr Val  Leu Lys Lys Cys Lys  Ser Ala Phe 
              1340                 1345                 1350             
          Tyr Ile  Leu Pro Ser Ile Ile  Ser Asn Glu Lys Gln  Glu Ile Leu 
              1355                 1360                 1365             
          Gly Thr  Val Ser Trp Asn Leu  Arg Glu Met Leu Ala  His Ala Glu 
              1370                 1375                 1380             
          Glu Thr  Arg Lys Leu Met Pro  Val Cys Val Glu Thr  Lys Ala Ile 
              1385                 1390                 1395             
          Val Ser  Thr Ile Gln Arg Lys  Tyr Lys Gly Ile Lys  Ile Gln Glu 
              1400                 1405                 1410             
          Gly Val  Val Asp Tyr Gly Ala  Arg Phe Tyr Phe Tyr  Thr Ser Lys 
              1415                 1420                 1425             
          Thr Thr  Val Ala Ser Leu Ile  Asn Thr Leu Asn Asp  Leu Asn Glu 
              1430                 1435                 1440             
          Thr Leu  Val Thr Met Pro Leu  Gly Tyr Val Thr His  Gly Leu Asn 
              1445                 1450                 1455             
          Leu Glu  Glu Ala Ala Arg Tyr  Met Arg Ser Leu Lys  Val Pro Ala 
              1460                 1465                 1470             
          Thr Val  Ser Val Ser Ser Pro  Asp Ala Val Thr Ala  Tyr Asn Gly 
              1475                 1480                 1485             
          Tyr Leu  Thr Ser Ser Ser Lys  Thr Pro Glu Glu His  Phe Ile Glu 
              1490                 1495                 1500             
          Thr Ile  Ser Leu Ala Gly Ser  Tyr Lys Asp Trp Ser  Tyr Ser Gly 
              1505                 1510                 1515             
          Gln Ser  Thr Gln Leu Gly Ile  Glu Phe Leu Lys Arg  Gly Asp Lys 
              1520                 1525                 1530             
          Ser Val  Tyr Tyr Thr Ser Asn  Pro Thr Thr Phe His  Leu Asp Gly 
              1535                 1540                 1545             
          Glu Val  Ile Thr Phe Asp Asn  Leu Lys Thr Leu Leu  Ser Leu Arg 
              1550                 1555                 1560             
          Glu Val  Arg Thr Ile Lys Val  Phe Thr Thr Val Asp  Asn Ile Asn 
              1565                 1570                 1575             
          Leu His  Thr Gln Val Val Asp  Met Ser Met Thr Tyr  Gly Gln Gln 
              1580                 1585                 1590             
          Phe Gly  Pro Thr Tyr Leu Asp  Gly Ala Asp Val Thr  Lys Ile Lys 
              1595                 1600                 1605             
          Pro His  Asn Ser His Glu Gly  Lys Thr Phe Tyr Val  Leu Pro Asn 
              1610                 1615                 1620             
          Asp Asp  Thr Leu Arg Val Glu  Ala Phe Glu Tyr Tyr  His Thr Thr 
              1625                 1630                 1635             
          Asp Pro  Ser Phe Leu Gly Arg  Tyr Met Ser Ala Leu  Asn His Thr 
              1640                 1645                 1650             
          Lys Lys  Trp Lys Tyr Pro Gln  Val Asn Gly Leu Thr  Ser Ile Lys 
              1655                 1660                 1665             
          Trp Ala  Asp Asn Asn Cys Tyr  Leu Ala Thr Ala Leu  Leu Thr Leu 
              1670                 1675                 1680             
          Gln Gln  Ile Glu Leu Lys Phe  Asn Pro Pro Ala Leu  Gln Asp Ala 
              1685                 1690                 1695             
          Tyr Tyr  Arg Ala Arg Ala Gly  Glu Ala Ala Asn Phe  Cys Ala Leu 
              1700                 1705                 1710             
          Ile Leu  Ala Tyr Cys Asn Lys  Thr Val Gly Glu Leu  Gly Asp Val 
              1715                 1720                 1725             
          Arg Glu  Thr Met Ser Tyr Leu  Phe Gln His Ala Asn  Leu Asp Ser 
              1730                 1735                 1740             
          Cys Lys  Arg Val Leu Asn Val  Val Cys Lys Thr Cys  Gly Gln Gln 
              1745                 1750                 1755             
          Gln Thr  Thr Leu Lys Gly Val  Glu Ala Val Met Tyr  Met Gly Thr 
              1760                 1765                 1770             
          Leu Ser  Tyr Glu Gln Phe Lys  Lys Gly Val Gln Ile  Pro Cys Thr 
              1775                 1780                 1785             
          Cys Gly  Lys Gln Ala Thr Lys  Tyr Leu Val Gln Gln  Glu Ser Pro 
              1790                 1795                 1800             
          Phe Val  Met Met Ser Ala Pro  Pro Ala Gln Tyr Glu  Leu Lys His 
              1805                 1810                 1815             
          Gly Thr  Phe Thr Cys Ala Ser  Glu Tyr Thr Gly Asn  Tyr Gln Cys 
              1820                 1825                 1830             
          Gly His  Tyr Lys His Ile Thr  Ser Lys Glu Thr Leu  Tyr Cys Ile 
              1835                 1840                 1845             
          Asp Gly  Ala Leu Leu Thr Lys  Ser Ser Glu Tyr Lys  Gly Pro Ile 
              1850                 1855                 1860             
          Thr Asp  Val Phe Tyr Lys Glu  Asn Ser Tyr Thr Thr  Thr Ile Lys 
              1865                 1870                 1875             
          Pro Val  Thr Tyr Lys Leu Asp  Gly Val Val Cys Thr  Glu Ile Asp 
              1880                 1885                 1890             
          Pro Lys  Leu Asp Asn Tyr Tyr  Lys Lys Asp Asn Ser  Tyr Phe Thr 
              1895                 1900                 1905             
          Glu Gln  Pro Ile Asp Leu Val  Pro Asn Gln Pro Tyr  Pro Asn Ala 
              1910                 1915                 1920             
          Ser Phe  Asp Asn Phe Lys Phe  Val Cys Asp Asn Ile  Lys Phe Ala 
              1925                 1930                 1935             
          Asp Asp  Leu Asn Gln Leu Thr  Gly Tyr Lys Lys Pro  Ala Ser Arg 
              1940                 1945                 1950             
          Glu Leu  Lys Val Thr Phe Phe  Pro Asp Leu Asn Gly  Asp Val Val 
              1955                 1960                 1965             
          Ala Ile  Asp Tyr Lys His Tyr  Thr Pro Ser Phe Lys  Lys Gly Ala 
              1970                 1975                 1980             
          Lys Leu  Leu His Lys Pro Ile  Val Trp His Val Asn  Asn Ala Thr 
              1985                 1990                 1995             
          Asn Lys  Ala Thr Tyr Lys Pro  Asn Thr Trp Cys Ile  Arg Cys Leu 
              2000                 2005                 2010             
          Trp Ser  Thr Lys Pro Val Glu  Thr Ser Asn Ser Phe  Asp Val Leu 
              2015                 2020                 2025             
          Lys Ser  Glu Asp Ala Gln Gly  Met Asp Asn Leu Ala  Cys Glu Asp 
              2030                 2035                 2040             
          Leu Lys  Pro Val Ser Glu Glu  Val Val Glu Asn Pro  Thr Ile Gln 
              2045                 2050                 2055             
          Lys Asp  Val Leu Glu Cys Asn  Val Lys Thr Thr Glu  Val Val Gly 
              2060                 2065                 2070             
          Asp Ile  Ile Leu Lys Pro Ala  Asn Asn Ser Leu Lys  Ile Thr Glu 
              2075                 2080                 2085             
          Glu Val  Gly His Thr Asp Leu  Met Ala Ala Tyr Val  Asp Asn Ser 
              2090                 2095                 2100             
          Ser Leu  Thr Ile Lys Lys Pro  Asn Glu Leu Ser Arg  Val Leu Gly 
              2105                 2110                 2115             
          Leu Lys  Thr Leu Ala Thr His  Gly Leu Ala Ala Val  Asn Ser Val 
              2120                 2125                 2130             
          Pro Trp  Asp Thr Ile Ala Asn  Tyr Ala Lys Pro Phe  Leu Asn Lys 
              2135                 2140                 2145             
          Val Val  Ser Thr Thr Thr Asn  Ile Val Thr Arg Cys  Leu Asn Arg 
              2150                 2155                 2160             
          Val Cys  Thr Asn Tyr Met Pro  Tyr Phe Phe Thr Leu  Leu Leu Gln 
              2165                 2170                 2175             
          Leu Cys  Thr Phe Thr Arg Ser  Thr Asn Ser Arg Ile  Lys Ala Ser 
              2180                 2185                 2190             
          Met Pro  Thr Thr Ile Ala Lys  Asn Thr Val Lys Ser  Val Gly Lys 
              2195                 2200                 2205             
          Phe Cys  Leu Glu Ala Ser Phe  Asn Tyr Leu Lys Ser  Pro Asn Phe 
              2210                 2215                 2220             
          Ser Lys  Leu Ile Asn Ile Ile  Ile Trp Phe Leu Leu  Leu Ser Val 
              2225                 2230                 2235             
          Cys Leu  Gly Ser Leu Ile Tyr  Ser Thr Ala Ala Leu  Gly Val Leu 
              2240                 2245                 2250             
          Met Ser  Asn Leu Gly Met Pro  Ser Tyr Cys Thr Gly  Tyr Arg Glu 
              2255                 2260                 2265             
          Gly Tyr  Leu Asn Ser Thr Asn  Val Thr Ile Ala Thr  Tyr Cys Thr 
              2270                 2275                 2280             
          Gly Ser  Ile Pro Cys Ser Val  Cys Leu Ser Gly Leu  Asp Ser Leu 
              2285                 2290                 2295             
          Asp Thr  Tyr Pro Ser Leu Glu  Thr Ile Gln Ile Thr  Ile Ser Ser 
              2300                 2305                 2310             
          Phe Lys  Trp Asp Leu Thr Ala  Phe Gly Leu Val Ala  Glu Trp Phe 
              2315                 2320                 2325             
          Leu Ala  Tyr Ile Leu Phe Thr  Arg Phe Phe Tyr Val  Leu Gly Leu 
              2330                 2335                 2340             
          Ala Ala  Ile Met Gln Leu Phe  Phe Ser Tyr Phe Ala  Val His Phe 
              2345                 2350                 2355             
          Ile Ser  Asn Ser Trp Leu Met  Trp Leu Ile Ile Asn  Leu Val Gln 
              2360                 2365                 2370             
          Met Ala  Pro Ile Ser Ala Met  Val Arg Met Tyr Ile  Phe Phe Ala 
              2375                 2380                 2385             
          Ser Phe  Tyr Tyr Val Trp Lys  Ser Tyr Val His Val  Val Asp Gly 
              2390                 2395                 2400             
          Cys Asn  Ser Ser Thr Cys Met  Met Cys Tyr Lys Arg  Asn Arg Ala 
              2405                 2410                 2415             
          Thr Arg  Val Glu Cys Thr Thr  Ile Val Asn Gly Val  Arg Arg Ser 
              2420                 2425                 2430             
          Phe Tyr  Val Tyr Ala Asn Gly  Gly Lys Gly Phe Cys  Lys Leu His 
              2435                 2440                 2445             
          Asn Trp  Asn Cys Val Asn Cys  Asp Thr Phe Cys Ala  Gly Ser Thr 
              2450                 2455                 2460             
          Phe Ile  Ser Asp Glu Val Ala  Arg Asp Leu Ser Leu  Gln Phe Lys 
              2465                 2470                 2475             
          Arg Pro  Ile Asn Pro Thr Asp  Gln Ser Ser Tyr Ile  Val Asp Ser 
              2480                 2485                 2490             
          Val Thr  Val Lys Asn Gly Ser  Ile His Leu Tyr Phe  Asp Lys Ala 
              2495                 2500                 2505             
          Gly Gln  Lys Thr Tyr Glu Arg  His Ser Leu Ser His  Phe Val Asn 
              2510                 2515                 2520             
          Leu Asp  Asn Leu Arg Ala Asn  Asn Thr Lys Gly Ser  Leu Pro Ile 
              2525                 2530                 2535             
          Asn Val  Ile Val Phe Asp Gly  Lys Ser Lys Cys Glu  Glu Ser Ser 
              2540                 2545                 2550             
          Ala Lys  Ser Ala Ser Val Tyr  Tyr Ser Gln Leu Met  Cys Gln Pro 
              2555                 2560                 2565             
          Ile Leu  Leu Leu Asp Gln Ala  Leu Val Ser Asp Val  Gly Asp Ser 
              2570                 2575                 2580             
          Ala Glu  Val Ala Val Lys Met  Phe Asp Ala Tyr Val  Asn Thr Phe 
              2585                 2590                 2595             
          Ser Ser  Thr Phe Asn Val Pro  Met Glu Lys Leu Lys  Thr Leu Val 
              2600                 2605                 2610             
          Ala Thr  Ala Glu Ala Glu Leu  Ala Lys Asn Val Ser  Leu Asp Asn 
              2615                 2620                 2625             
          Val Leu  Ser Thr Phe Ile Ser  Ala Ala Arg Gln Gly  Phe Val Asp 
              2630                 2635                 2640             
          Ser Asp  Val Glu Thr Lys Asp  Val Val Glu Cys Leu  Lys Leu Ser 
              2645                 2650                 2655             
          His Gln  Ser Asp Ile Glu Val  Thr Gly Asp Ser Cys  Asn Asn Tyr 
              2660                 2665                 2670             
          Met Leu  Thr Tyr Asn Lys Val  Glu Asn Met Thr Pro  Arg Asp Leu 
              2675                 2680                 2685             
          Gly Ala  Cys Ile Asp Cys Ser  Ala Arg His Ile Asn  Ala Gln Val 
              2690                 2695                 2700             
          Ala Lys  Ser His Asn Ile Ala  Leu Ile Trp Asn Val  Lys Asp Phe 
              2705                 2710                 2715             
          Met Ser  Leu Ser Glu Gln Leu  Arg Lys Gln Ile Arg  Ser Ala Ala 
              2720                 2725                 2730             
          Lys Lys  Asn Asn Leu Pro Phe  Lys Leu Thr Cys Ala  Thr Thr Arg 
              2735                 2740                 2745             
          Gln Val  Val Asn Val Val Thr  Thr Lys Ile Ala Leu  Lys Gly Gly 
              2750                 2755                 2760             
          Lys Ile  Val Asn Asn Trp Leu  Lys Gln Leu Ile Lys  Val Thr Leu 
              2765                 2770                 2775             
          Val Phe  Leu Phe Val Ala Ala  Ile Phe Tyr Leu Ile  Thr Pro Val 
              2780                 2785                 2790             
          His Val  Met Ser Lys His Thr  Asp Phe Ser Ser Glu  Ile Ile Gly 
              2795                 2800                 2805             
          Tyr Lys  Ala Ile Asp Gly Gly  Val Thr Arg Asp Ile  Ala Ser Thr 
              2810                 2815                 2820             
          Asp Thr  Cys Phe Ala Asn Lys  His Ala Asp Phe Asp  Thr Trp Phe 
              2825                 2830                 2835             
          Ser Gln  Arg Gly Gly Ser Tyr  Thr Asn Asp Lys Ala  Cys Pro Leu 
              2840                 2845                 2850             
          Ile Ala  Ala Val Ile Thr Arg  Glu Val Gly Phe Val  Val Pro Gly 
              2855                 2860                 2865             
          Leu Pro  Gly Thr Ile Leu Arg  Thr Thr Asn Gly Asp  Phe Leu His 
              2870                 2875                 2880             
          Phe Leu  Pro Arg Val Phe Ser  Ala Val Gly Asn Ile  Cys Tyr Thr 
              2885                 2890                 2895             
          Pro Ser  Lys Leu Ile Glu Tyr  Thr Asp Phe Ala Thr  Ser Ala Cys 
              2900                 2905                 2910             
          Val Leu  Ala Ala Glu Cys Thr  Ile Phe Lys Asp Ala  Ser Gly Lys 
              2915                 2920                 2925             
          Pro Val  Pro Tyr Cys Tyr Asp  Thr Asn Val Leu Glu  Gly Ser Val 
              2930                 2935                 2940             
          Ala Tyr  Glu Ser Leu Arg Pro  Asp Thr Arg Tyr Val  Leu Met Asp 
              2945                 2950                 2955             
          Gly Ser  Ile Ile Gln Phe Pro  Asn Thr Tyr Leu Glu  Gly Ser Val 
              2960                 2965                 2970             
          Arg Val  Val Thr Thr Phe Asp  Ser Glu Tyr Cys Arg  His Gly Thr 
              2975                 2980                 2985             
          Cys Glu  Arg Ser Glu Ala Gly  Val Cys Val Ser Thr  Ser Gly Arg 
              2990                 2995                 3000             
          Trp Val  Leu Asn Asn Asp Tyr  Tyr Arg Ser Leu Pro  Gly Val Phe 
              3005                 3010                 3015             
          Cys Gly  Val Asp Ala Val Asn  Leu Leu Thr Asn Met  Phe Thr Pro 
              3020                 3025                 3030             
          Leu Ile  Gln Pro Ile Gly Ala  Leu Asp Ile Ser Ala  Ser Ile Val 
              3035                 3040                 3045             
          Ala Gly  Gly Ile Val Ala Ile  Val Val Thr Cys Leu  Ala Tyr Tyr 
              3050                 3055                 3060             
          Phe Met  Arg Phe Arg Arg Ala  Phe Gly Glu Tyr Ser  His Val Val 
              3065                 3070                 3075             
          Ala Phe  Asn Thr Leu Leu Phe  Leu Met Ser Phe Thr  Val Leu Cys 
              3080                 3085                 3090             
          Leu Thr  Pro Val Tyr Ser Phe  Leu Pro Gly Val Tyr  Ser Val Ile 
              3095                 3100                 3105             
          Tyr Leu  Tyr Leu Thr Phe Tyr  Leu Thr Asn Asp Val  Ser Phe Leu 
              3110                 3115                 3120             
          Ala His  Ile Gln Trp Met Val  Met Phe Thr Pro Leu  Val Pro Phe 
              3125                 3130                 3135             
          Trp Ile  Thr Ile Ala Tyr Ile  Ile Cys Ile Ser Thr  Lys His Phe 
              3140                 3145                 3150             
          Tyr Trp  Phe Phe Ser Asn Tyr  Leu Lys Arg Arg Val  Val Phe Asn 
              3155                 3160                 3165             
          Gly Val  Ser Phe Ser Thr Phe  Glu Glu Ala Ala Leu  Cys Thr Phe 
              3170                 3175                 3180             
          Leu Leu  Asn Lys Glu Met Tyr  Leu Lys Leu Arg Ser  Asp Val Leu 
              3185                 3190                 3195             
          Leu Pro  Leu Thr Gln Tyr Asn  Arg Tyr Leu Ala Leu  Tyr Asn Lys 
              3200                 3205                 3210             
          Tyr Lys  Tyr Phe Ser Gly Ala  Met Asp Thr Thr Ser  Tyr Arg Glu 
              3215                 3220                 3225             
          Ala Ala  Cys Cys His Leu Ala  Lys Ala Leu Asn Asp  Phe Ser Asn 
              3230                 3235                 3240             
          Ser Gly  Ser Asp Val Leu Tyr  Gln Pro Pro Gln Thr  Ser Ile Thr 
              3245                 3250                 3255             
          Ser Ala  Val Leu Gln Ser Gly  Phe Arg Lys Met Ala  Phe Pro Ser 
              3260                 3265                 3270             
          Gly Lys  Val Glu Gly Cys Met  Val Gln Val Thr Cys  Gly Thr Thr 
              3275                 3280                 3285             
          Thr Leu  Asn Gly Leu Trp Leu  Asp Asp Val Val Tyr  Cys Pro Arg 
              3290                 3295                 3300             
          His Val  Ile Cys Thr Ser Glu  Asp Met Leu Asn Pro  Asn Tyr Glu 
              3305                 3310                 3315             
          Asp Leu  Leu Ile Arg Lys Ser  Asn His Asn Phe Leu  Val Gln Ala 
              3320                 3325                 3330             
          Gly Asn  Val Gln Leu Arg Val  Ile Gly His Ser Met  Gln Asn Cys 
              3335                 3340                 3345             
          Val Leu  Lys Leu Lys Val Asp  Thr Ala Asn Pro Lys  Thr Pro Lys 
              3350                 3355                 3360             
          Tyr Lys  Phe Val Arg Ile Gln  Pro Gly Gln Thr Phe  Ser Val Leu 
              3365                 3370                 3375             
          Ala Cys  Tyr Asn Gly Ser Pro  Ser Gly Val Tyr Gln  Cys Ala Met 
              3380                 3385                 3390             
          Arg Pro  Asn Phe Thr Ile Lys  Gly Ser Phe Leu Asn  Gly Ser Cys 
              3395                 3400                 3405             
          Gly Ser  Val Gly Phe Asn Ile  Asp Tyr Asp Cys Val  Ser Phe Cys 
              3410                 3415                 3420             
          Tyr Met  His His Met Glu Leu  Pro Thr Gly Val His  Ala Gly Thr 
              3425                 3430                 3435             
          Asp Leu  Glu Gly Asn Phe Tyr  Gly Pro Phe Val Asp  Arg Gln Thr 
              3440                 3445                 3450             
          Ala Gln  Ala Ala Gly Thr Asp  Thr Thr Ile Thr Val  Asn Val Leu 
              3455                 3460                 3465             
          Ala Trp  Leu Tyr Ala Ala Val  Ile Asn Gly Asp Arg  Trp Phe Leu 
              3470                 3475                 3480             
          Asn Arg  Phe Thr Thr Thr Leu  Asn Asp Phe Asn Leu  Val Ala Met 
              3485                 3490                 3495             
          Lys Tyr  Asn Tyr Glu Pro Leu  Thr Gln Asp His Val  Asp Ile Leu 
              3500                 3505                 3510             
          Gly Pro  Leu Ser Ala Gln Thr  Gly Ile Ala Val Leu  Asp Met Cys 
              3515                 3520                 3525             
          Ala Ser  Leu Lys Glu Leu Leu  Gln Asn Gly Met Asn  Gly Arg Thr 
              3530                 3535                 3540             
          Ile Leu  Gly Ser Ala Leu Leu  Glu Asp Glu Phe Thr  Pro Phe Asp 
              3545                 3550                 3555             
          Val Val  Arg Gln Cys Ser Gly  Val Thr Phe Gln Ser  Ala Val Lys 
              3560                 3565                 3570             
          Arg Thr  Ile Lys Gly Thr His  His Trp Leu Leu Leu  Thr Ile Leu 
              3575                 3580                 3585             
          Thr Ser  Leu Leu Val Leu Val  Gln Ser Thr Gln Trp  Ser Leu Phe 
              3590                 3595                 3600             
          Phe Phe  Leu Tyr Glu Asn Ala  Phe Leu Pro Phe Ala  Met Gly Ile 
              3605                 3610                 3615             
          Ile Ala  Met Ser Ala Phe Ala  Met Met Phe Val Lys  His Lys His 
              3620                 3625                 3630             
          Ala Phe  Leu Cys Leu Phe Leu  Leu Pro Ser Leu Ala  Thr Val Ala 
              3635                 3640                 3645             
          Tyr Phe  Asn Met Val Tyr Met  Pro Ala Ser Trp Val  Met Arg Ile 
              3650                 3655                 3660             
          Met Thr  Trp Leu Asp Met Val  Asp Thr Ser Leu Ser  Gly Phe Lys 
              3665                 3670                 3675             
          Leu Lys  Asp Cys Val Met Tyr  Ala Ser Ala Val Val  Leu Leu Ile 
              3680                 3685                 3690             
          Leu Met  Thr Ala Arg Thr Val  Tyr Asp Asp Gly Ala  Arg Arg Val 
              3695                 3700                 3705             
          Trp Thr  Leu Met Asn Val Leu  Thr Leu Val Tyr Lys  Val Tyr Tyr 
              3710                 3715                 3720             
          Gly Asn  Ala Leu Asp Gln Ala  Ile Ser Met Trp Ala  Leu Ile Ile 
              3725                 3730                 3735             
          Ser Val  Thr Ser Asn Tyr Ser  Gly Val Val Thr Thr  Val Met Phe 
              3740                 3745                 3750             
          Leu Ala  Arg Gly Ile Val Phe  Met Cys Val Glu Tyr  Cys Pro Ile 
              3755                 3760                 3765             
          Phe Phe  Ile Thr Gly Asn Thr  Leu Gln Cys Ile Met  Leu Val Tyr 
              3770                 3775                 3780             
          Cys Phe  Leu Gly Tyr Phe Cys  Thr Cys Tyr Phe Gly  Leu Phe Cys 
              3785                 3790                 3795             
          Leu Leu  Asn Arg Tyr Phe Arg  Leu Thr Leu Gly Val  Tyr Asp Tyr 
              3800                 3805                 3810             
          Leu Val  Ser Thr Gln Glu Phe  Arg Tyr Met Asn Ser  Gln Gly Leu 
              3815                 3820                 3825             
          Leu Pro  Pro Lys Asn Ser Ile  Asp Ala Phe Lys Leu  Asn Ile Lys 
              3830                 3835                 3840             
          Leu Leu  Gly Val Gly Gly Lys  Pro Cys Ile Lys Val  Ala Thr Val 
              3845                 3850                 3855             
          Gln Ser  Lys Met Ser Asp Val  Lys Cys Thr Ser Val  Val Leu Leu 
              3860                 3865                 3870             
          Ser Val  Leu Gln Gln Leu Arg  Val Glu Ser Ser Ser  Lys Leu Trp 
              3875                 3880                 3885             
          Ala Gln  Cys Val Gln Leu His  Asn Asp Ile Leu Leu  Ala Lys Asp 
              3890                 3895                 3900             
          Thr Thr  Glu Ala Phe Glu Lys  Met Val Ser Leu Leu  Ser Val Leu 
              3905                 3910                 3915             
          Leu Ser  Met Gln Gly Ala Val  Asp Ile Asn Lys Leu  Cys Glu Glu 
              3920                 3925                 3930             
          Met Leu  Asp Asn Arg Ala Thr  Leu Gln Ala Ile Ala  Ser Glu Phe 
              3935                 3940                 3945             
          Ser Ser  Leu Pro Ser Tyr Ala  Ala Phe Ala Thr Ala  Gln Glu Ala 
              3950                 3955                 3960             
          Tyr Glu  Gln Ala Val Ala Asn  Gly Asp Ser Glu Val  Val Leu Lys 
              3965                 3970                 3975             
          Lys Leu  Lys Lys Ser Leu Asn  Val Ala Lys Ser Glu  Phe Asp Arg 
              3980                 3985                 3990             
          Asp Ala  Ala Met Gln Arg Lys  Leu Glu Lys Met Ala  Asp Gln Ala 
              3995                 4000                 4005             
          Met Thr  Gln Met Tyr Lys Gln  Ala Arg Ser Glu Asp  Lys Arg Ala 
              4010                 4015                 4020             
          Lys Val  Thr Ser Ala Met Gln  Thr Met Leu Phe Thr  Met Leu Arg 
              4025                 4030                 4035             
          Lys Leu  Asp Asn Asp Ala Leu  Asn Asn Ile Ile Asn  Asn Ala Arg 
              4040                 4045                 4050             
          Asp Gly  Cys Val Pro Leu Asn  Ile Ile Pro Leu Thr  Thr Ala Ala 
              4055                 4060                 4065             
          Lys Leu  Met Val Val Ile Pro  Asp Tyr Asn Thr Tyr  Lys Asn Thr 
              4070                 4075                 4080             
          Cys Asp  Gly Thr Thr Phe Thr  Tyr Ala Ser Ala Leu  Trp Glu Ile 
              4085                 4090                 4095             
          Gln Gln  Val Val Asp Ala Asp  Ser Lys Ile Val Gln  Leu Ser Glu 
              4100                 4105                 4110             
          Ile Ser  Met Asp Asn Ser Pro  Asn Leu Ala Trp Pro  Leu Ile Val 
              4115                 4120                 4125             
          Thr Ala  Leu Arg Ala Asn Ser  Ala Val Lys Leu Gln  Asn Asn Glu 
              4130                 4135                 4140             
          Leu Ser  Pro Val Ala Leu Arg  Gln Met Ser Cys Ala  Ala Gly Thr 
              4145                 4150                 4155             
          Thr Gln  Thr Ala Cys Thr Asp  Asp Asn Ala Leu Ala  Tyr Tyr Asn 
              4160                 4165                 4170             
          Thr Thr  Lys Gly Gly Arg Phe  Val Leu Ala Leu Leu  Ser Asp Leu 
              4175                 4180                 4185             
          Gln Asp  Leu Lys Trp Ala Arg  Phe Pro Lys Ser Asp  Gly Thr Gly 
              4190                 4195                 4200             
          Thr Ile  Tyr Thr Glu Leu Glu  Pro Pro Cys Arg Phe  Val Thr Asp 
              4205                 4210                 4215             
          Thr Pro  Lys Gly Pro Lys Val  Lys Tyr Leu Tyr Phe  Ile Lys Gly 
              4220                 4225                 4230             
          Leu Asn  Asn Leu Asn Arg Gly  Met Val Leu Gly Ser  Leu Ala Ala 
              4235                 4240                 4245             
          Thr Val  Arg Leu Gln Ala Gly  Asn Ala Thr Glu Val  Pro Ala Asn 
              4250                 4255                 4260             
          Ser Thr  Val Leu Ser Phe Cys  Ala Phe Ala Val Asp  Ala Ala Lys 
              4265                 4270                 4275             
          Ala Tyr  Lys Asp Tyr Leu Ala  Ser Gly Gly Gln Pro  Ile Thr Asn 
              4280                 4285                 4290             
          Cys Val  Lys Met Leu Cys Thr  His Thr Gly Thr Gly  Gln Ala Ile 
              4295                 4300                 4305             
          Thr Val  Thr Pro Glu Ala Asn  Met Asp Gln Glu Ser  Phe Gly Gly 
              4310                 4315                 4320             
          Ala Ser  Cys Cys Leu Tyr Cys  Arg Cys His Ile Asp  His Pro Asn 
              4325                 4330                 4335             
          Pro Lys  Gly Phe Cys Asp Leu  Lys Gly Lys Tyr Val  Gln Ile Pro 
              4340                 4345                 4350             
          Thr Thr  Cys Ala Asn Asp Pro  Val Gly Phe Thr Leu  Lys Asn Thr 
              4355                 4360                 4365             
          Val Cys  Thr Val Cys Gly Met  Trp Lys Gly Tyr Gly  Cys Ser Cys 
              4370                 4375                 4380             
          Asp Gln  Leu Arg Glu Pro Met  Leu Gln Ser Ala Asp  Ala Gln Ser 
              4385                 4390                 4395             
          Phe Leu  Asn Arg Val Cys Gly  Val Ser Ala Ala Arg  Leu Thr Pro 
              4400                 4405                 4410             
          Cys Gly  Thr Gly Thr Ser Thr  Asp Val Val Tyr Arg  Ala Phe Asp 
              4415                 4420                 4425             
          Ile Tyr  Asn Asp Lys Val Ala  Gly Phe Ala Lys Phe  Leu Lys Thr 
              4430                 4435                 4440             
          Asn Cys  Cys Arg Phe Gln Glu  Lys Asp Glu Asp Asp  Asn Leu Ile 
              4445                 4450                 4455             
          Asp Ser  Tyr Phe Val Val Lys  Arg His Thr Phe Ser  Asn Tyr Gln 
              4460                 4465                 4470             
          His Glu  Glu Thr Ile Tyr Asn  Leu Leu Lys Asp Cys  Pro Ala Val 
              4475                 4480                 4485             
          Ala Lys  His Asp Phe Phe Lys  Phe Arg Ile Asp Gly  Asp Met Val 
              4490                 4495                 4500             
          Pro His  Ile Ser Arg Gln Arg  Leu Thr Lys Tyr Thr  Met Ala Asp 
              4505                 4510                 4515             
          Leu Val  Tyr Ala Leu Arg His  Phe Asp Glu Gly Asn  Cys Asp Thr 
              4520                 4525                 4530             
          Leu Lys  Glu Ile Leu Val Thr  Tyr Asn Cys Cys Asp  Asp Asp Tyr 
              4535                 4540                 4545             
          Phe Asn  Lys Lys Asp Trp Tyr  Asp Phe Val Glu Asn  Pro Asp Ile 
              4550                 4555                 4560             
          Leu Arg  Val Tyr Ala Asn Leu  Gly Glu Arg Val Arg  Gln Ala Leu 
              4565                 4570                 4575             
          Leu Lys  Thr Val Gln Phe Cys  Asp Ala Met Arg Asn  Ala Gly Ile 
              4580                 4585                 4590             
          Val Gly  Val Leu Thr Leu Asp  Asn Gln Asp Leu Asn  Gly Asn Trp 
              4595                 4600                 4605             
          Tyr Asp  Phe Gly Asp Phe Ile  Gln Thr Thr Pro Gly  Ser Gly Val 
              4610                 4615                 4620             
          Pro Val  Val Asp Ser Tyr Tyr  Ser Leu Leu Met Pro  Ile Leu Thr 
              4625                 4630                 4635             
          Leu Thr  Arg Ala Leu Thr Ala  Glu Ser His Val Asp  Thr Asp Leu 
              4640                 4645                 4650             
          Thr Lys  Pro Tyr Ile Lys Trp  Asp Leu Leu Lys Tyr  Asp Phe Thr 
              4655                 4660                 4665             
          Glu Glu  Arg Leu Lys Leu Phe  Asp Arg Tyr Phe Lys  Tyr Trp Asp 
              4670                 4675                 4680             
          Gln Thr  Tyr His Pro Asn Cys  Val Asn Cys Leu Asp  Asp Arg Cys 
              4685                 4690                 4695             
          Ile Leu  His Cys Ala Asn Phe  Asn Val Leu Phe Ser  Thr Val Phe 
              4700                 4705                 4710             
          Pro Pro  Thr Ser Phe Gly Pro  Leu Val Arg Lys Ile  Phe Val Asp 
              4715                 4720                 4725             
          Gly Val  Pro Phe Val Val Ser  Thr Gly Tyr His Phe  Arg Glu Leu 
              4730                 4735                 4740             
          Gly Val  Val His Asn Gln Asp  Val Asn Leu His Ser  Ser Arg Leu 
              4745                 4750                 4755             
          Ser Phe  Lys Glu Leu Leu Val  Tyr Ala Ala Asp Pro  Ala Met His 
              4760                 4765                 4770             
          Ala Ala  Ser Gly Asn Leu Leu  Leu Asp Lys Arg Thr  Thr Cys Phe 
              4775                 4780                 4785             
          Ser Val  Ala Ala Leu Thr Asn  Asn Val Ala Phe Gln  Thr Val Lys 
              4790                 4795                 4800             
          Pro Gly  Asn Phe Asn Lys Asp  Phe Tyr Asp Phe Ala  Val Ser Lys 
              4805                 4810                 4815             
          Gly Phe  Phe Lys Glu Gly Ser  Ser Val Glu Leu Lys  His Phe Phe 
              4820                 4825                 4830             
          Phe Ala  Gln Asp Gly Asn Ala  Ala Ile Ser Asp Tyr  Asp Tyr Tyr 
              4835                 4840                 4845             
          Arg Tyr  Asn Leu Pro Thr Met  Cys Asp Ile Arg Gln  Leu Leu Phe 
              4850                 4855                 4860             
          Val Val  Glu Val Val Asp Lys  Tyr Phe Asp Cys Tyr  Asp Gly Gly 
              4865                 4870                 4875             
          Cys Ile  Asn Ala Asn Gln Val  Ile Val Asn Asn Leu  Asp Lys Ser 
              4880                 4885                 4890             
          Ala Gly  Phe Pro Phe Asn Lys  Trp Gly Lys Ala Arg  Leu Tyr Tyr 
              4895                 4900                 4905             
          Asp Ser  Met Ser Tyr Glu Asp  Gln Asp Ala Leu Phe  Ala Tyr Thr 
              4910                 4915                 4920             
          Lys Arg  Asn Val Ile Pro Thr  Ile Thr Gln Met Asn  Leu Lys Tyr 
              4925                 4930                 4935             
          Ala Ile  Ser Ala Lys Asn Arg  Ala Arg Thr Val Ala  Gly Val Ser 
              4940                 4945                 4950             
          Ile Cys  Ser Thr Met Thr Asn  Arg Gln Phe His Gln  Lys Leu Leu 
              4955                 4960                 4965             
          Lys Ser  Ile Ala Ala Thr Arg  Gly Ala Thr Val Val  Ile Gly Thr 
              4970                 4975                 4980             
          Ser Lys  Phe Tyr Gly Gly Trp  His Asn Met Leu Lys  Thr Val Tyr 
              4985                 4990                 4995             
          Ser Asp  Val Glu Asn Pro His  Leu Met Gly Trp Asp  Tyr Pro Lys 
              5000                 5005                 5010             
          Cys Asp  Arg Ala Met Pro Asn  Met Leu Arg Ile Met  Ala Ser Leu 
              5015                 5020                 5025             
          Val Leu  Ala Arg Lys His Thr  Thr Cys Cys Ser Leu  Ser His Arg 
              5030                 5035                 5040             
          Phe Tyr  Arg Leu Ala Asn Glu  Cys Ala Gln Val Leu  Ser Glu Met 
              5045                 5050                 5055             
          Val Met  Cys Gly Gly Ser Leu  Tyr Val Lys Pro Gly  Gly Thr Ser 
              5060                 5065                 5070             
          Ser Gly  Asp Ala Thr Thr Ala  Tyr Ala Asn Ser Val  Phe Asn Ile 
              5075                 5080                 5085             
          Cys Gln  Ala Val Thr Ala Asn  Val Asn Ala Leu Leu  Ser Thr Asp 
              5090                 5095                 5100             
          Gly Asn  Lys Ile Ala Asp Lys  Tyr Val Arg Asn Leu  Gln His Arg 
              5105                 5110                 5115             
          Leu Tyr  Glu Cys Leu Tyr Arg  Asn Arg Asp Val Asp  Thr Asp Phe 
              5120                 5125                 5130             
          Val Asn  Glu Phe Tyr Ala Tyr  Leu Arg Lys His Phe  Ser Met Met 
              5135                 5140                 5145             
          Ile Leu  Ser Asp Asp Ala Val  Val Cys Phe Asn Ser  Thr Tyr Ala 
              5150                 5155                 5160             
          Ser Gln  Gly Leu Val Ala Ser  Ile Lys Asn Phe Lys  Ser Val Leu 
              5165                 5170                 5175             
          Tyr Tyr  Gln Asn Asn Val Phe  Met Ser Glu Ala Lys  Cys Trp Thr 
              5180                 5185                 5190             
          Glu Thr  Asp Leu Thr Lys Gly  Pro His Glu Phe Cys  Ser Gln His 
              5195                 5200                 5205             
          Thr Met  Leu Val Lys Gln Gly  Asp Asp Tyr Val Tyr  Leu Pro Tyr 
              5210                 5215                 5220             
          Pro Asp  Pro Ser Arg Ile Leu  Gly Ala Gly Cys Phe  Val Asp Asp 
              5225                 5230                 5235             
          Ile Val  Lys Thr Asp Gly Thr  Leu Met Ile Glu Arg  Phe Val Ser 
              5240                 5245                 5250             
          Leu Ala  Ile Asp Ala Tyr Pro  Leu Thr Lys His Pro  Asn Gln Glu 
              5255                 5260                 5265             
          Tyr Ala  Asp Val Phe His Leu  Tyr Leu Gln Tyr Ile  Arg Lys Leu 
              5270                 5275                 5280             
          His Asp  Glu Leu Thr Gly His  Met Leu Asp Met Tyr  Ser Val Met 
              5285                 5290                 5295             
          Leu Thr  Asn Asp Asn Thr Ser  Arg Tyr Trp Glu Pro  Glu Phe Tyr 
              5300                 5305                 5310             
          Glu Ala  Met Tyr Thr Pro His  Thr Val Leu Gln Ala  Val Gly Ala 
              5315                 5320                 5325             
          Cys Val  Leu Cys Asn Ser Gln  Thr Ser Leu Arg Cys  Gly Ala Cys 
              5330                 5335                 5340             
          Ile Arg  Arg Pro Phe Leu Cys  Cys Lys Cys Cys Tyr  Asp His Val 
              5345                 5350                 5355             
          Ile Ser  Thr Ser His Lys Leu  Val Leu Ser Val Asn  Pro Tyr Val 
              5360                 5365                 5370             
          Cys Asn  Ala Pro Gly Cys Asp  Val Thr Asp Val Thr  Gln Leu Tyr 
              5375                 5380                 5385             
          Leu Gly  Gly Met Ser Tyr Tyr  Cys Lys Ser His Lys  Pro Pro Ile 
              5390                 5395                 5400             
          Ser Phe  Pro Leu Cys Ala Asn  Gly Gln Val Phe Gly  Leu Tyr Lys 
              5405                 5410                 5415             
          Asn Thr  Cys Val Gly Ser Asp  Asn Val Thr Asp Phe  Asn Ala Ile 
              5420                 5425                 5430             
          Ala Thr  Cys Asp Trp Thr Asn  Ala Gly Asp Tyr Ile  Leu Ala Asn 
              5435                 5440                 5445             
          Thr Cys  Thr Glu Arg Leu Lys  Leu Phe Ala Ala Glu  Thr Leu Lys 
              5450                 5455                 5460             
          Ala Thr  Glu Glu Thr Phe Lys  Leu Ser Tyr Gly Ile  Ala Thr Val 
              5465                 5470                 5475             
          Arg Glu  Val Leu Ser Asp Arg  Glu Leu His Leu Ser  Trp Glu Val 
              5480                 5485                 5490             
          Gly Lys  Pro Arg Pro Pro Leu  Asn Arg Asn Tyr Val  Phe Thr Gly 
              5495                 5500                 5505             
          Tyr Arg  Val Thr Lys Asn Ser  Lys Val Gln Ile Gly  Glu Tyr Thr 
              5510                 5515                 5520             
          Phe Glu  Lys Gly Asp Tyr Gly  Asp Ala Val Val Tyr  Arg Gly Thr 
              5525                 5530                 5535             
          Thr Thr  Tyr Lys Leu Asn Val  Gly Asp Tyr Phe Val  Leu Thr Ser 
              5540                 5545                 5550             
          His Thr  Val Met Pro Leu Ser  Ala Pro Thr Leu Val  Pro Gln Glu 
              5555                 5560                 5565             
          His Tyr  Val Arg Ile Thr Gly  Leu Tyr Pro Thr Leu  Asn Ile Ser 
              5570                 5575                 5580             
          Asp Glu  Phe Ser Ser Asn Val  Ala Asn Tyr Gln Lys  Val Gly Met 
              5585                 5590                 5595             
          Gln Lys  Tyr Ser Thr Leu Gln  Gly Pro Pro Gly Thr  Gly Lys Ser 
              5600                 5605                 5610             
          His Phe  Ala Ile Gly Leu Ala  Leu Tyr Tyr Pro Ser  Ala Arg Ile 
              5615                 5620                 5625             
          Val Tyr  Thr Ala Cys Ser His  Ala Ala Val Asp Ala  Leu Cys Glu 
              5630                 5635                 5640             
          Lys Ala  Leu Lys Tyr Leu Pro  Ile Asp Lys Cys Ser  Arg Ile Ile 
              5645                 5650                 5655             
          Pro Ala  Arg Ala Arg Val Glu  Cys Phe Asp Lys Phe  Lys Val Asn 
              5660                 5665                 5670             
          Ser Thr  Leu Glu Gln Tyr Val  Phe Cys Thr Val Asn  Ala Leu Pro 
              5675                 5680                 5685             
          Glu Thr  Thr Ala Asp Ile Val  Val Phe Asp Glu Ile  Ser Met Ala 
              5690                 5695                 5700             
          Thr Asn  Tyr Asp Leu Ser Val  Val Asn Ala Arg Leu  Arg Ala Lys 
              5705                 5710                 5715             
          His Tyr  Val Tyr Ile Gly Asp  Pro Ala Gln Leu Pro  Ala Pro Arg 
              5720                 5725                 5730             
          Thr Leu  Leu Thr Lys Gly Thr  Leu Glu Pro Glu Tyr  Phe Asn Ser 
              5735                 5740                 5745             
          Val Cys  Arg Leu Met Lys Thr  Ile Gly Pro Asp Met  Phe Leu Gly 
              5750                 5755                 5760             
          Thr Cys  Arg Arg Cys Pro Ala  Glu Ile Val Asp Thr  Val Ser Ala 
              5765                 5770                 5775             
          Leu Val  Tyr Asp Asn Lys Leu  Lys Ala His Lys Asp  Lys Ser Ala 
              5780                 5785                 5790             
          Gln Cys  Phe Lys Met Phe Tyr  Lys Gly Val Ile Thr  His Asp Val 
              5795                 5800                 5805             
          Ser Ser  Ala Ile Asn Arg Pro  Gln Ile Gly Val Val  Arg Glu Phe 
              5810                 5815                 5820             
          Leu Thr  Arg Asn Pro Ala Trp  Arg Lys Ala Val Phe  Ile Ser Pro 
              5825                 5830                 5835             
          Tyr Asn  Ser Gln Asn Ala Val  Ala Ser Lys Ile Leu  Gly Leu Pro 
              5840                 5845                 5850             
          Thr Gln  Thr Val Asp Ser Ser  Gln Gly Ser Glu Tyr  Asp Tyr Val 
              5855                 5860                 5865             
          Ile Phe  Thr Gln Thr Thr Glu  Thr Ala His Ser Cys  Asn Val Asn 
              5870                 5875                 5880             
          Arg Phe  Asn Val Ala Ile Thr  Arg Ala Lys Val Gly  Ile Leu Cys 
              5885                 5890                 5895             
          Ile Met  Ser Asp Arg Asp Leu  Tyr Asp Lys Leu Gln  Phe Thr Ser 
              5900                 5905                 5910             
          Leu Glu  Ile Pro Arg Arg Asn  Val Ala Thr Leu Gln  Ala Glu Asn 
              5915                 5920                 5925             
          Val Thr  Gly Leu Phe Lys Asp  Cys Ser Lys Val Ile  Thr Gly Leu 
              5930                 5935                 5940             
          His Pro  Thr Gln Ala Pro Thr  His Leu Ser Val Asp  Thr Lys Phe 
              5945                 5950                 5955             
          Lys Thr  Glu Gly Leu Cys Val  Asp Ile Pro Gly Ile  Pro Lys Asp 
              5960                 5965                 5970             
          Met Thr  Tyr Arg Arg Leu Ile  Ser Met Met Gly Phe  Lys Met Asn 
              5975                 5980                 5985             
          Tyr Gln  Val Asn Gly Tyr Pro  Asn Met Phe Ile Thr  Arg Glu Glu 
              5990                 5995                 6000             
          Ala Ile  Arg His Val Arg Ala  Trp Ile Gly Phe Asp  Val Glu Gly 
              6005                 6010                 6015             
          Cys His  Ala Thr Arg Glu Ala  Val Gly Thr Asn Leu  Pro Leu Gln 
              6020                 6025                 6030             
          Leu Gly  Phe Ser Thr Gly Val  Asn Leu Val Ala Val  Pro Thr Gly 
              6035                 6040                 6045             
          Tyr Val  Asp Thr Pro Asn Asn  Thr Asp Phe Ser Arg  Val Ser Ala 
              6050                 6055                 6060             
          Lys Pro  Pro Pro Gly Asp Gln  Phe Lys His Leu Ile  Pro Leu Met 
              6065                 6070                 6075             
          Tyr Lys  Gly Leu Pro Trp Asn  Val Val Arg Ile Lys  Ile Val Gln 
              6080                 6085                 6090             
          Met Leu  Ser Asp Thr Leu Lys  Asn Leu Ser Asp Arg  Val Val Phe 
              6095                 6100                 6105             
          Val Leu  Trp Ala His Gly Phe  Glu Leu Thr Ser Met  Lys Tyr Phe 
              6110                 6115                 6120             
          Val Lys  Ile Gly Pro Glu Arg  Thr Cys Cys Leu Cys  Asp Arg Arg 
              6125                 6130                 6135             
          Ala Thr  Cys Phe Ser Thr Ala  Ser Asp Thr Tyr Ala  Cys Trp His 
              6140                 6145                 6150             
          His Ser  Ile Gly Phe Asp Tyr  Val Tyr Asn Pro Phe  Met Ile Asp 
              6155                 6160                 6165             
          Val Gln  Gln Trp Gly Phe Thr  Gly Asn Leu Gln Ser  Asn His Asp 
              6170                 6175                 6180             
          Leu Tyr  Cys Gln Val His Gly  Asn Ala His Val Ala  Ser Cys Asp 
              6185                 6190                 6195             
          Ala Ile  Met Thr Arg Cys Leu  Ala Val His Glu Cys  Phe Val Lys 
              6200                 6205                 6210             
          Arg Val  Asp Trp Thr Ile Glu  Tyr Pro Ile Ile Gly  Asp Glu Leu 
              6215                 6220                 6225             
          Lys Ile  Asn Ala Ala Cys Arg  Lys Val Gln His Met  Val Val Lys 
              6230                 6235                 6240             
          Ala Ala  Leu Leu Ala Asp Lys  Phe Pro Val Leu His  Asp Ile Gly 
              6245                 6250                 6255             
          Asn Pro  Lys Ala Ile Lys Cys  Val Pro Gln Ala Asp  Val Glu Trp 
              6260                 6265                 6270             
          Lys Phe  Tyr Asp Ala Gln Pro  Cys Ser Asp Lys Ala  Tyr Lys Ile 
              6275                 6280                 6285             
          Glu Glu  Leu Phe Tyr Ser Tyr  Ala Thr His Ser Asp  Lys Phe Thr 
              6290                 6295                 6300             
          Asp Gly  Val Cys Leu Phe Trp  Asn Cys Asn Val Asp  Arg Tyr Pro 
              6305                 6310                 6315             
          Ala Asn  Ser Ile Val Cys Arg  Phe Asp Thr Arg Val  Leu Ser Asn 
              6320                 6325                 6330             
          Leu Asn  Leu Pro Gly Cys Asp  Gly Gly Ser Leu Tyr  Val Asn Lys 
              6335                 6340                 6345             
          His Ala  Phe His Thr Pro Ala  Phe Asp Lys Ser Ala  Phe Val Asn 
              6350                 6355                 6360             
          Leu Lys  Gln Leu Pro Phe Phe  Tyr Tyr Ser Asp Ser  Pro Cys Glu 
              6365                 6370                 6375             
          Ser His  Gly Lys Gln Val Val  Ser Asp Ile Asp Tyr  Val Pro Leu 
              6380                 6385                 6390             
          Lys Ser  Ala Thr Cys Ile Thr  Arg Cys Asn Leu Gly  Gly Ala Val 
              6395                 6400                 6405             
          Cys Arg  His His Ala Asn Glu  Tyr Arg Leu Tyr Leu  Asp Ala Tyr 
              6410                 6415                 6420             
          Asn Met  Met Ile Ser Ala Gly  Phe Ser Leu Trp Val  Tyr Lys Gln 
              6425                 6430                 6435             
          Phe Asp  Thr Tyr Asn Leu Trp  Asn Thr Phe Thr Arg  Leu Gln Ser 
              6440                 6445                 6450             
          Leu Glu  Asn Val Ala Phe Asn  Val Val Asn Lys Gly  His Phe Asp 
              6455                 6460                 6465             
          Gly Gln  Gln Gly Glu Val Pro  Val Ser Ile Ile Asn  Asn Thr Val 
              6470                 6475                 6480             
          Tyr Thr  Lys Val Asp Gly Val  Asp Val Glu Leu Phe  Glu Asn Lys 
              6485                 6490                 6495             
          Thr Thr  Leu Pro Val Asn Val  Ala Phe Glu Leu Trp  Ala Lys Arg 
              6500                 6505                 6510             
          Asn Ile  Lys Pro Val Pro Glu  Val Lys Ile Leu Asn  Asn Leu Gly 
              6515                 6520                 6525             
          Val Asp  Ile Ala Ala Asn Thr  Val Ile Trp Asp Tyr  Lys Arg Asp 
              6530                 6535                 6540             
          Ala Pro  Ala His Ile Ser Thr  Ile Gly Val Cys Ser  Met Thr Asp 
              6545                 6550                 6555             
          Ile Ala  Lys Lys Pro Thr Glu  Thr Ile Cys Ala Pro  Leu Thr Val 
              6560                 6565                 6570             
          Phe Phe  Asp Gly Arg Val Asp  Gly Gln Val Asp Leu  Phe Arg Asn 
              6575                 6580                 6585             
          Ala Arg  Asn Gly Val Leu Ile  Thr Glu Gly Ser Val  Lys Gly Leu 
              6590                 6595                 6600             
          Gln Pro  Ser Val Gly Pro Lys  Gln Ala Ser Leu Asn  Gly Val Thr 
              6605                 6610                 6615             
          Leu Ile  Gly Glu Ala Val Lys  Thr Gln Phe Asn Tyr  Tyr Lys Lys 
              6620                 6625                 6630             
          Val Asp  Gly Val Val Gln Gln  Leu Pro Glu Thr Tyr  Phe Thr Gln 
              6635                 6640                 6645             
          Ser Arg  Asn Leu Gln Glu Phe  Lys Pro Arg Ser Gln  Met Glu Ile 
              6650                 6655                 6660             
          Asp Phe  Leu Glu Leu Ala Met  Asp Glu Phe Ile Glu  Arg Tyr Lys 
              6665                 6670                 6675             
          Leu Glu  Gly Tyr Ala Phe Glu  His Ile Val Tyr Gly  Asp Phe Ser 
              6680                 6685                 6690             
          His Ser  Gln Leu Gly Gly Leu  His Leu Leu Ile Gly  Leu Ala Lys 
              6695                 6700                 6705             
          Arg Phe  Lys Glu Ser Pro Phe  Glu Leu Glu Asp Phe  Ile Pro Met 
              6710                 6715                 6720             
          Asp Ser  Thr Val Lys Asn Tyr  Phe Ile Thr Asp Ala  Gln Thr Gly 
              6725                 6730                 6735             
          Ser Ser  Lys Cys Val Cys Ser  Val Ile Asp Leu Leu  Leu Asp Asp 
              6740                 6745                 6750             
          Phe Val  Glu Ile Ile Lys Ser  Gln Asp Leu Ser Val  Val Ser Lys 
              6755                 6760                 6765             
          Val Val  Lys Val Thr Ile Asp  Tyr Thr Glu Ile Ser  Phe Met Leu 
              6770                 6775                 6780             
          Trp Cys  Lys Asp Gly His Val  Glu Thr Phe Tyr Pro  Lys Leu Gln 
              6785                 6790                 6795             
          Ser Ser  Gln Ala Trp Gln Pro  Gly Val Ala Met Pro  Asn Leu Tyr 
              6800                 6805                 6810             
          Lys Met  Gln Arg Met Leu Leu  Glu Lys Cys Asp Leu  Gln Asn Tyr 
              6815                 6820                 6825             
          Gly Asp  Ser Ala Thr Leu Pro  Lys Gly Ile Met Met  Asn Val Ala 
              6830                 6835                 6840             
          Lys Tyr  Thr Gln Leu Cys Gln  Tyr Leu Asn Thr Leu  Thr Leu Ala 
              6845                 6850                 6855             
          Val Pro  Tyr Asn Met Arg Val  Ile His Phe Gly Ala  Gly Ser Asp 
              6860                 6865                 6870             
          Lys Gly  Val Ala Pro Gly Thr  Ala Val Leu Arg Gln  Trp Leu Pro 
              6875                 6880                 6885             
          Thr Gly  Thr Leu Leu Val Asp  Ser Asp Leu Asn Asp  Phe Val Ser 
              6890                 6895                 6900             
          Asp Ala  Asp Ser Thr Leu Ile  Gly Asp Cys Ala Thr  Val His Thr 
              6905                 6910                 6915             
          Ala Asn  Lys Trp Asp Leu Ile  Ile Ser Asp Met Tyr  Asp Pro Lys 
              6920                 6925                 6930             
          Thr Lys  Asn Val Thr Lys Glu  Asn Asp Ser Lys Glu  Gly Phe Phe 
              6935                 6940                 6945             
          Thr Tyr  Ile Cys Gly Phe Ile  Gln Gln Lys Leu Ala  Leu Gly Gly 
              6950                 6955                 6960             
          Ser Val  Ala Ile Lys Ile Thr  Glu His Ser Trp Asn  Ala Asp Leu 
              6965                 6970                 6975             
          Tyr Lys  Leu Met Gly His Phe  Ala Trp Trp Thr Ala  Phe Val Thr 
              6980                 6985                 6990             
          Asn Val  Asn Ala Ser Ser Ser  Glu Ala Phe Leu Ile  Gly Cys Asn 
              6995                 7000                 7005             
          Tyr Leu  Gly Lys Pro Arg Glu  Gln Ile Asp Gly Tyr  Val Met His 
              7010                 7015                 7020             
          Ala Asn  Tyr Ile Phe Trp Arg  Asn Thr Asn Pro Ile  Gln Leu Ser 
              7025                 7030                 7035             
          Ser Tyr  Ser Leu Phe Asp Met  Ser Lys Phe Pro Leu  Lys Leu Arg 
              7040                 7045                 7050             
          Gly Thr  Ala Val Met Ser Leu  Lys Glu Gly Gln Ile  Asn Asp Met 
              7055                 7060                 7065             
          Ile Leu  Ser Leu Leu Ser Lys  Gly Arg Leu Ile Ile  Arg Glu Asn 
              7070                 7075                 7080             
          Asn Arg  Val Val Ile Ser Ser  Asp Val Leu Val Asn  Asn 
              7085                 7090                 7095     
          <![CDATA[<210>  3]]>
          <![CDATA[<211>  1263]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒SARS冠狀病毒2]]>
          <![CDATA[<400>  3]]>
          Met Phe Val Phe Leu Val Leu Leu Pro Leu Val Ser Ser Gln Cys Val 
          1               5                   10                  15      
          Asn Leu Thr Thr Arg Thr Gln Leu Pro Pro Ala Tyr Thr Asn Ser Phe 
                      20                  25                  30          
          Thr Arg Gly Val Tyr Tyr Pro Asp Lys Val Phe Arg Ser Ser Val Leu 
                  35                  40                  45              
          His Ser Thr Gln Asp Leu Phe Leu Pro Phe Phe Ser Asn Val Thr Trp 
              50                  55                  60                  
          Phe His Ala Ile His Val Ser Gly Thr Asn Gly Thr Lys Arg Phe Asp 
          65                  70                  75                  80  
          Asn Pro Val Leu Pro Phe Asn Asp Gly Val Tyr Phe Ala Ser Thr Glu 
                          85                  90                  95      
          Lys Ser Asn Ile Ile Arg Gly Trp Ile Phe Gly Thr Thr Leu Asp Ser 
                      100                 105                 110         
          Lys Thr Gln Ser Leu Leu Ile Val Asn Asn Ala Thr Asn Val Val Ile 
                  115                 120                 125             
          Lys Val Cys Glu Phe Gln Phe Cys Asn Asp Pro Phe Leu Gly Val Tyr 
              130                 135                 140                 
          Tyr His Lys Asn Asn Lys Ser Trp Met Glu Ser Glu Phe Arg Val Tyr 
          145                 150                 155                 160 
          Ser Ser Ala Asn Asn Cys Thr Phe Glu Tyr Gly Lys Gln Gly Asn Phe 
                          165                 170                 175     
          Lys Asn Leu Arg Glu Phe Val Phe Lys Asn Ile Asp Gly Tyr Phe Lys 
                      180                 185                 190         
          Ile Tyr Ser Lys His Thr Pro Ile Asn Leu Val Arg Asp Leu Pro Gln 
                  195                 200                 205             
          Gly Phe Ser Ala Leu Glu Pro Leu Val Asp Leu Pro Ile Gly Ile Asn 
              210                 215                 220                 
          Ile Thr Arg Phe Gln Thr Leu Leu Ala Leu His Arg Ser Tyr Leu Thr 
          225                 230                 235                 240 
          Pro Gly Asp Ser Ser Ser Gly Trp Thr Ala Gly Ala Ala Ala Tyr Tyr 
                          245                 250                 255     
          Val Gly Tyr Leu Gln Pro Arg Thr Phe Leu Leu Lys Tyr Asn Glu Asn 
                      260                 265                 270         
          Gly Thr Ile Thr Asp Ala Val Asp Cys Ala Leu Asp Pro Leu Ser Glu 
                  275                 280                 285             
          Thr Lys Cys Thr Leu Lys Ser Phe Thr Val Glu Lys Gly Ile Tyr Gln 
              290                 295                 300                 
          Thr Ser Asn Phe Arg Val Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro 
          305                 310                 315                 320 
          Asn Ile Thr Asn Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg 
                          325                 330                 335     
          Phe Ala Ser Val Tyr Ala Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val 
                      340                 345                 350         
          Ala Asp Tyr Ser Val Leu Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys 
                  355                 360                 365             
          Cys Tyr Gly Val Ser Pro Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn 
              370                 375                 380                 
          Val Tyr Ala Asp Ser Phe Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile 
          385                 390                 395                 400 
          Ala Pro Gly Gln Thr Gly Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro 
                          405                 410                 415     
          Asp Asp Phe Thr Gly Cys Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp 
                      420                 425                 430         
          Ser Lys Val Gly Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys 
                  435                 440                 445             
          Ser Asn Leu Lys Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln 
              450                 455                 460                 
          Ala Gly Ser Thr Pro Cys Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe 
          465                 470                 475                 480 
          Pro Leu Gln Ser Tyr Gly Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln 
                          485                 490                 495     
          Pro Tyr Arg Val Val Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala 
                      500                 505                 510         
          Thr Val Cys Gly Pro Lys Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys 
                  515                 520                 525             
          Val Asn Phe Asn Phe Asn Gly Leu Thr Gly Thr Gly Val Leu Thr Glu 
              530                 535                 540                 
          Ser Asn Lys Lys Phe Leu Pro Phe Gln Gln Phe Gly Arg Asp Ile Ala 
          545                 550                 555                 560 
          Asp Thr Thr Asp Ala Val Arg Asp Pro Gln Thr Leu Glu Ile Leu Asp 
                          565                 570                 575     
          Ile Thr Pro Cys Ser Phe Gly Gly Val Ser Val Ile Thr Pro Gly Thr 
                      580                 585                 590         
          Asn Thr Ser Asn Gln Val Ala Val Leu Tyr Gln Asp Val Asn Cys Thr 
                  595                 600                 605             
          Glu Val Pro Val Ala Ile His Ala Asp Gln Leu Thr Pro Thr Trp Arg 
              610                 615                 620                 
          Val Tyr Ser Thr Gly Ser Asn Val Phe Gln Thr Arg Ala Gly Cys Leu 
          625                 630                 635                 640 
          Ile Gly Ala Glu His Val Asn Asn Ser Tyr Glu Cys Asp Ile Pro Ile 
                          645                 650                 655     
          Gly Ala Gly Ile Cys Ala Ser Tyr Gln Thr Gln Thr Asn Ser Pro Arg 
                      660                 665                 670         
          Arg Ala Arg Ser Val Ala Ser Gln Ser Ile Ile Ala Tyr Thr Met Ser 
                  675                 680                 685             
          Leu Gly Ala Glu Asn Ser Val Ala Tyr Ser Asn Asn Ser Ile Ala Ile 
              690                 695                 700                 
          Pro Thr Asn Phe Thr Ile Ser Val Thr Thr Glu Ile Leu Pro Val Ser 
          705                 710                 715                 720 
          Met Thr Lys Thr Ser Val Asp Cys Thr Met Tyr Ile Cys Gly Asp Ser 
                          725                 730                 735     
          Thr Glu Cys Ser Asn Leu Leu Leu Gln Tyr Gly Ser Phe Cys Thr Gln 
                      740                 745                 750         
          Leu Asn Arg Ala Leu Thr Gly Ile Ala Val Glu Gln Asp Lys Asn Thr 
                  755                 760                 765             
          Gln Glu Val Phe Ala Gln Val Lys Gln Ile Tyr Lys Thr Pro Pro Ile 
              770                 775                 780                 
          Lys Asp Phe Gly Gly Phe Asn Phe Ser Gln Ile Leu Pro Asp Pro Ser 
          785                 790                 795                 800 
          Lys Pro Ser Lys Arg Ser Phe Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asn Lys Val 
                          805                 810                 815     
          Thr Leu Ala Asp Ala Gly Phe Ile Lys Gln Tyr Gly Asp Cys Leu Gly 
                      820                 825                 830         
          Asp Ile Ala Ala Arg Asp Leu Ile Cys Ala Gln Lys Phe Asn Gly Leu 
                  835                 840                 845             
          Thr Val Leu Pro Pro Leu Leu Thr Asp Glu Met Ile Ala Gln Tyr Thr 
              850                 855                 860                 
          Ser Ala Leu Leu Ala Gly Thr Ile Thr Ser Gly Trp Thr Phe Gly Ala 
          865                 870                 875                 880 
          Gly Ala Ala Leu Gln Ile Pro Phe Ala Met Gln Met Ala Tyr Arg Phe 
                          885                 890                 895     
          Asn Gly Ile Gly Val Thr Gln Asn Val Leu Tyr Glu Asn Gln Lys Leu 
                      900                 905                 910         
          Ile Ala Asn Gln Phe Asn Ser Ala Ile Gly Lys Ile Gln Asp Ser Leu 
                  915                 920                 925             
          Ser Ser Thr Ala Ser Ala Leu Gly Lys Leu Gln Asp Val Val Asn Gln 
              930                 935                 940                 
          Asn Ala Gln Ala Leu Asn Thr Leu Val Lys Gln Leu Ser Ser Asn Phe 
          945                 950                 955                 960 
          Gly Ala Ile Ser Ser Val Leu Asn Asp Ile Leu Ser Arg Leu Asp Lys 
                          965                 970                 975     
          Val Glu Ala Glu Val Gln Ile Asp Arg Leu Ile Thr Gly Arg Leu Gln 
                      980                 985                 990         
          Ser Leu Gln Thr Tyr Val Thr Gln  Gln Leu Ile Arg Ala  Ala Glu Ile 
                  995                 1000                 1005             
          Arg Ala  Ser Ala Asn Leu Ala  Ala Thr Lys Met Ser  Glu Cys Val 
              1010                 1015                 1020             
          Leu Gly  Gln Ser Lys Arg Val  Asp Phe Cys Gly Lys  Gly Tyr His 
              1025                 1030                 1035             
          Leu Met  Ser Phe Pro Gln Ser  Ala Pro His Gly Val  Val Phe Leu 
              1040                 1045                 1050             
          His Val  Thr Tyr Val Pro Ala  Gln Glu Lys Asn Phe  Thr Thr Ala 
              1055                 1060                 1065             
          Pro Ala  Ile Cys His Asp Gly  Lys Ala His Phe Pro  Arg Glu Gly 
              1070                 1075                 1080             
          Val Phe  Val Ser Asn Gly Thr  His Trp Phe Val Thr  Gln Arg Asn 
              1085                 1090                 1095             
          Phe Tyr  Glu Pro Gln Ile Ile  Thr Thr Asp Asn Thr  Phe Val Ser 
              1100                 1105                 1110             
          Gly Asn  Cys Asp Val Val Ile  Gly Ile Val Asn Asn  Thr Val Tyr 
              1115                 1120                 1125             
          Asp Pro  Leu Gln Pro Glu Leu  Asp Ser Phe Lys Glu  Glu Leu Asp 
              1130                 1135                 1140             
          Lys Tyr  Phe Lys Asn His Thr  Ser Pro Asp Val Asp  Leu Gly Asp 
              1145                 1150                 1155             
          Ile Ser  Gly Ile Asn Ala Ser  Val Val Asn Ile Gln  Lys Glu Ile 
              1160                 1165                 1170             
          Asp Arg  Leu Asn Glu Val Ala  Lys Asn Leu Asn Glu  Ser Leu Ile 
              1175                 1180                 1185             
          Asp Leu  Gln Glu Leu Gly Lys  Tyr Glu Gln Tyr Ile  Lys Trp Pro 
              1190                 1195                 1200             
          Trp Tyr  Ile Trp Leu Gly Phe  Ile Ala Gly Leu Ile  Ala Ile Val 
              1205                 1210                 1215             
          Met Val  Thr Ile Met Leu Cys  Cys Met Thr Ser Cys  Cys Ser Cys 
              1220                 1225                 1230             
          Leu Lys  Gly Cys Cys Ser Cys  Gly Ser Cys Cys Lys  Phe Asp Glu 
              1235                 1240                 1245             
          Asp Asp  Ser Glu Pro Val Leu  Lys Gly Val Lys Leu  His Tyr Thr 
              1250                 1255                 1260             
          <![CDATA[<210>  4]]>
          <![CDATA[<211>  220]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒SARS冠狀病毒2]]>
          <![CDATA[<400>  4]]>
          Asn Ile Thr Asn Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg 
          1               5                   10                  15      
          Phe Ala Ser Val Tyr Ala Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val 
                      20                  25                  30          
          Ala Asp Tyr Ser Val Leu Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys 
                  35                  40                  45              
          Cys Tyr Gly Val Ser Pro Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn 
              50                  55                  60                  
          Val Tyr Ala Asp Ser Phe Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile 
          65                  70                  75                  80  
          Ala Pro Gly Gln Thr Gly Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro 
                          85                  90                  95      
          Asp Asp Phe Thr Gly Cys Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp 
                      100                 105                 110         
          Ser Lys Val Gly Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys 
                  115                 120                 125             
          Ser Asn Leu Lys Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln 
              130                 135                 140                 
          Ala Gly Ser Thr Pro Cys Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe 
          145                 150                 155                 160 
          Pro Leu Gln Ser Tyr Gly Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln 
                          165                 170                 175     
          Pro Tyr Arg Val Val Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala 
                      180                 185                 190         
          Thr Val Cys Gly Pro Lys Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys 
                  195                 200                 205             
          Val Asn Phe Asn Phe Asn Gly Leu Thr Gly Thr Gly 
              210                 215                 220 
          <![CDATA[<210>  5]]>
          <![CDATA[<211>  72]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒SARS冠狀病毒2]]>
          <![CDATA[<400>  5]]>
          Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys Val Gly Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu 
          1               5                   10                  15      
          Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn Leu Lys Pro Phe Glu Arg Asp Ile 
                      20                  25                  30          
          Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly Ser Thr Pro Cys Asn Gly Val Glu 
                  35                  40                  45              
          Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu Gln Ser Tyr Gly Phe Gln Pro Thr 
              50                  55                  60                  
          Asn Gly Val Gly Tyr Gln Pro Tyr 
          65                  70          
          <![CDATA[<210>  6]]>
          <![CDATA[<211>  330]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 CH1-CH3 LS G1m17 IgHG1*01 ]]>
          <![CDATA[<400>  6]]>
          Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys 
          1               5                   10                  15      
          Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr 
                      20                  25                  30          
          Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser 
                  35                  40                  45              
          Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser 
              50                  55                  60                  
          Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr 
          65                  70                  75                  80  
          Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys 
                          85                  90                  95      
          Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys 
                      100                 105                 110         
          Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro 
                  115                 120                 125             
          Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys 
              130                 135                 140                 
          Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp 
          145                 150                 155                 160 
          Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu 
                          165                 170                 175     
          Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu 
                      180                 185                 190         
          His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn 
                  195                 200                 205             
          Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly 
              210                 215                 220                 
          Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu 
          225                 230                 235                 240 
          Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr 
                          245                 250                 255     
          Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn 
                      260                 265                 270         
          Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe 
                  275                 280                 285             
          Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn 
              290                 295                 300                 
          Val Phe Ser Cys Ser Val Leu His Glu Ala Leu His Ser His Tyr Thr 
          305                 310                 315                 320 
          Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys 
                          325                 330 
          <![CDATA[<210>  7]]>
          <![CDATA[<211>  330]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 CH1-CH3 LS,ALE G1m17 IgHG1*01 ]]>
          <![CDATA[<400>  7]]>
          Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys 
          1               5                   10                  15      
          Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr 
                      20                  25                  30          
          Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser 
                  35                  40                  45              
          Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser 
              50                  55                  60                  
          Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr 
          65                  70                  75                  80  
          Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys 
                          85                  90                  95      
          Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys 
                      100                 105                 110         
          Pro Ala Pro Glu Leu Leu Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro 
                  115                 120                 125             
          Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys 
              130                 135                 140                 
          Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp 
          145                 150                 155                 160 
          Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu 
                          165                 170                 175     
          Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu 
                      180                 185                 190         
          His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn 
                  195                 200                 205             
          Lys Ala Leu Pro Leu Pro Glu Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly 
              210                 215                 220                 
          Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu 
          225                 230                 235                 240 
          Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr 
                          245                 250                 255     
          Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn 
                      260                 265                 270         
          Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe 
                  275                 280                 285             
          Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn 
              290                 295                 300                 
          Val Phe Ser Cys Ser Val Leu His Glu Ala Leu His Ser His Tyr Thr 
          305                 310                 315                 320 
          Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys 
                          325                 330 
          <![CDATA[<210>  8]]>
          <![CDATA[<211>  106]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 CL IgLC*01 ]]>
          <![CDATA[<400>  8]]>
          Gly Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser 
          1               5                   10                  15      
          Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp 
                      20                  25                  30          
          Phe Tyr Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Ser Ser Pro 
                  35                  40                  45              
          Val Lys Ala Gly Val Glu Thr Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn 
              50                  55                  60                  
          Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys 
          65                  70                  75                  80  
          Ser His Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val 
                          85                  90                  95      
          Glu Lys Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser 
                      100                 105     
          <![CDATA[<210>  9]]>
          <![CDATA[<211>  107]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 CL (CK) k1m3 IgKC*01 ]]>
          <![CDATA[<400>  9]]>
          Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu 
          1               5                   10                  15      
          Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe 
                      20                  25                  30          
          Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln 
                  35                  40                  45              
          Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser 
              50                  55                  60                  
          Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu 
          65                  70                  75                  80  
          Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser 
                          85                  90                  95      
          Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys 
                      100                 105         
          <![CDATA[<210>  10]]>
          <![CDATA[<211>  18]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<400>  10]]>
          Gly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr 
          1               5                   10                  15      
          Lys Gly 
          <![CDATA[<210>  11]]>
          <![CDATA[<211>  10]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<400>  11]]>
          Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly 
          1               5                   10  
          <![CDATA[<210>  12]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<400>  12]]>
          Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  13]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<400>  13]]>
          Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  14]]>
          <![CDATA[<211>  6]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221>  misc_feature]]>
          <![CDATA[<222>  1]]>
          <![CDATA[<223>  Xaa =帶正電胺基酸]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221>  misc_feature]]>
          <![CDATA[<222>  3,4,5]]>
          <![CDATA[<223>  Xaa = Gly或Ser]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221>  misc_feature]]>
          <![CDATA[<222>  6]]>
          <![CDATA[<223>  Xaa = Gly或帶負電胺基酸]]>
          <![CDATA[<400>  14]]>
          Asx Pro Xaa Xaa Xaa Xaa
          1               5       
          <![CDATA[<210>  15]]>
          <![CDATA[<211>  110]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<400>  15]]>
          Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly 
          1               5                   10                  15      
          Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly 
                      20                  25                  30          
          Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly 
                  35                  40                  45              
          Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly 
              50                  55                  60                  
          Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly 
          65                  70                  75                  80  
          Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly 
                          85                  90                  95      
          Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Ser 
                      100                 105                 110 
          <![CDATA[<210>  16]]>
          <![CDATA[<211>  15]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<400>  16]]>
          Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 
          1               5                   10                  15  
          <![CDATA[<210>  17]]>
          <![CDATA[<211>  50]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<400>  17]]>
          Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 
          1               5                   10                  15      
          Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly 
                      20                  25                  30          
          Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly 
                  35                  40                  45              
          Gly Ser 
              50  
          <![CDATA[<210>  18]]>
          <![CDATA[<211>  18]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<400>  18]]>
          Gly Ser Thr Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly 
          1               5                   10                  15      
          Ser Ser 
          <![CDATA[<210>  19]]>
          <![CDATA[<211>  14]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<400>  19]]>
          Glu Gly Lys Ser Ser Gly Ser Gly Ser Glu Ser Lys Val Asp 
          1               5                   10                  
          <![CDATA[<210>  20]]>
          <![CDATA[<211>  18]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<400>  20]]>
          Lys Glu Ser Gly Ser Val Ser Ser Glu Gln Leu Ala Gln Phe Arg Ser 
          1               5                   10                  15      
          Leu Asp 
          <![CDATA[<210>  21]]>
          <![CDATA[<211>  5]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成連接子序列]]>
          <![CDATA[<400>  21]]>
          Gly Gly Gly Gly Ser 
          1               5   
          <![CDATA[<210>  22]]>
          <![CDATA[<211>  1255]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒SARS冠狀病毒1]]>
          <![CDATA[<400>  22]]>
          Met Phe Ile Phe Leu Leu Phe Leu Thr Leu Thr Ser Gly Ser Asp Leu 
          1               5                   10                  15      
          Asp Arg Cys Thr Thr Phe Asp Asp Val Gln Ala Pro Asn Tyr Thr Gln 
                      20                  25                  30          
          His Thr Ser Ser Met Arg Gly Val Tyr Tyr Pro Asp Glu Ile Phe Arg 
                  35                  40                  45              
          Ser Asp Thr Leu Tyr Leu Thr Gln Asp Leu Phe Leu Pro Phe Tyr Ser 
              50                  55                  60                  
          Asn Val Thr Gly Phe His Thr Ile Asn His Thr Phe Gly Asn Pro Val 
          65                  70                  75                  80  
          Ile Pro Phe Lys Asp Gly Ile Tyr Phe Ala Ala Thr Glu Lys Ser Asn 
                          85                  90                  95      
          Val Val Arg Gly Trp Val Phe Gly Ser Thr Met Asn Asn Lys Ser Gln 
                      100                 105                 110         
          Ser Val Ile Ile Ile Asn Asn Ser Thr Asn Val Val Ile Arg Ala Cys 
                  115                 120                 125             
          Asn Phe Glu Leu Cys Asp Asn Pro Phe Phe Ala Val Ser Lys Pro Met 
              130                 135                 140                 
          Gly Thr Gln Thr His Thr Met Ile Phe Asp Asn Ala Phe Asn Cys Thr 
          145                 150                 155                 160 
          Phe Glu Tyr Ile Ser Asp Ala Phe Ser Leu Asp Val Ser Glu Lys Ser 
                          165                 170                 175     
          Gly Asn Phe Lys His Leu Arg Glu Phe Val Phe Lys Asn Lys Asp Gly 
                      180                 185                 190         
          Phe Leu Tyr Val Tyr Lys Gly Tyr Gln Pro Ile Asp Val Val Arg Asp 
                  195                 200                 205             
          Leu Pro Ser Gly Phe Asn Thr Leu Lys Pro Ile Phe Lys Leu Pro Leu 
              210                 215                 220                 
          Gly Ile Asn Ile Thr Asn Phe Arg Ala Ile Leu Thr Ala Phe Ser Pro 
          225                 230                 235                 240 
          Ala Gln Asp Ile Trp Gly Thr Ser Ala Ala Ala Tyr Phe Val Gly Tyr 
                          245                 250                 255     
          Leu Lys Pro Thr Thr Phe Met Leu Lys Tyr Asp Glu Asn Gly Thr Ile 
                      260                 265                 270         
          Thr Asp Ala Val Asp Cys Ser Gln Asn Pro Leu Ala Glu Leu Lys Cys 
                  275                 280                 285             
          Ser Val Lys Ser Phe Glu Ile Asp Lys Gly Ile Tyr Gln Thr Ser Asn 
              290                 295                 300                 
          Phe Arg Val Val Pro Ser Gly Asp Val Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr 
          305                 310                 315                 320 
          Asn Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Lys Phe Pro Ser 
                          325                 330                 335     
          Val Tyr Ala Trp Glu Arg Lys Lys Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr 
                      340                 345                 350         
          Ser Val Leu Tyr Asn Ser Thr Phe Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly 
                  355                 360                 365             
          Val Ser Ala Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Ser Asn Val Tyr Ala 
              370                 375                 380                 
          Asp Ser Phe Val Val Lys Gly Asp Asp Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly 
          385                 390                 395                 400 
          Gln Thr Gly Val Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro Asp Asp Phe 
                          405                 410                 415     
          Met Gly Cys Val Leu Ala Trp Asn Thr Arg Asn Ile Asp Ala Thr Ser 
                      420                 425                 430         
          Thr Gly Asn Tyr Asn Tyr Lys Tyr Arg Tyr Leu Arg His Gly Lys Leu 
                  435                 440                 445             
          Arg Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Asn Val Pro Phe Ser Pro Asp Gly 
              450                 455                 460                 
          Lys Pro Cys Thr Pro Pro Ala Leu Asn Cys Tyr Trp Pro Leu Asn Asp 
          465                 470                 475                 480 
          Tyr Gly Phe Tyr Thr Thr Thr Gly Ile Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val 
                          485                 490                 495     
          Val Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu Asn Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly 
                      500                 505                 510         
          Pro Lys Leu Ser Thr Asp Leu Ile Lys Asn Gln Cys Val Asn Phe Asn 
                  515                 520                 525             
          Phe Asn Gly Leu Thr Gly Thr Gly Val Leu Thr Pro Ser Ser Lys Arg 
              530                 535                 540                 
          Phe Gln Pro Phe Gln Gln Phe Gly Arg Asp Val Ser Asp Phe Thr Asp 
          545                 550                 555                 560 
          Ser Val Arg Asp Pro Lys Thr Ser Glu Ile Leu Asp Ile Ser Pro Cys 
                          565                 570                 575     
          Ser Phe Gly Gly Val Ser Val Ile Thr Pro Gly Thr Asn Ala Ser Ser 
                      580                 585                 590         
          Glu Val Ala Val Leu Tyr Gln Asp Val Asn Cys Thr Asp Val Ser Thr 
                  595                 600                 605             
          Ala Ile His Ala Asp Gln Leu Thr Pro Ala Trp Arg Ile Tyr Ser Thr 
              610                 615                 620                 
          Gly Asn Asn Val Phe Gln Thr Gln Ala Gly Cys Leu Ile Gly Ala Glu 
          625                 630                 635                 640 
          His Val Asp Thr Ser Tyr Glu Cys Asp Ile Pro Ile Gly Ala Gly Ile 
                          645                 650                 655     
          Cys Ala Ser Tyr His Thr Val Ser Leu Leu Arg Ser Thr Ser Gln Lys 
                      660                 665                 670         
          Ser Ile Val Ala Tyr Thr Met Ser Leu Gly Ala Asp Ser Ser Ile Ala 
                  675                 680                 685             
          Tyr Ser Asn Asn Thr Ile Ala Ile Pro Thr Asn Phe Ser Ile Ser Ile 
              690                 695                 700                 
          Thr Thr Glu Val Met Pro Val Ser Met Ala Lys Thr Ser Val Asp Cys 
          705                 710                 715                 720 
          Asn Met Tyr Ile Cys Gly Asp Ser Thr Glu Cys Ala Asn Leu Leu Leu 
                          725                 730                 735     
          Gln Tyr Gly Ser Phe Cys Thr Gln Leu Asn Arg Ala Leu Ser Gly Ile 
                      740                 745                 750         
          Ala Ala Glu Gln Asp Arg Asn Thr Arg Glu Val Phe Ala Gln Val Lys 
                  755                 760                 765             
          Gln Met Tyr Lys Thr Pro Thr Leu Lys Tyr Phe Gly Gly Phe Asn Phe 
              770                 775                 780                 
          Ser Gln Ile Leu Pro Asp Pro Leu Lys Pro Thr Lys Arg Ser Phe Ile 
          785                 790                 795                 800 
          Glu Asp Leu Leu Phe Asn Lys Val Thr Leu Ala Asp Ala Gly Phe Met 
                          805                 810                 815     
          Lys Gln Tyr Gly Glu Cys Leu Gly Asp Ile Asn Ala Arg Asp Leu Ile 
                      820                 825                 830         
          Cys Ala Gln Lys Phe Asn Gly Leu Thr Val Leu Pro Pro Leu Leu Thr 
                  835                 840                 845             
          Asp Asp Met Ile Ala Ala Tyr Thr Ala Ala Leu Val Ser Gly Thr Ala 
              850                 855                 860                 
          Thr Ala Gly Trp Thr Phe Gly Ala Gly Ala Ala Leu Gln Ile Pro Phe 
          865                 870                 875                 880 
          Ala Met Gln Met Ala Tyr Arg Phe Asn Gly Ile Gly Val Thr Gln Asn 
                          885                 890                 895     
          Val Leu Tyr Glu Asn Gln Lys Gln Ile Ala Asn Gln Phe Asn Lys Ala 
                      900                 905                 910         
          Ile Ser Gln Ile Gln Glu Ser Leu Thr Thr Thr Ser Thr Ala Leu Gly 
                  915                 920                 925             
          Lys Leu Gln Asp Val Val Asn Gln Asn Ala Gln Ala Leu Asn Thr Leu 
              930                 935                 940                 
          Val Lys Gln Leu Ser Ser Asn Phe Gly Ala Ile Ser Ser Val Leu Asn 
          945                 950                 955                 960 
          Asp Ile Leu Ser Arg Leu Asp Lys Val Glu Ala Glu Val Gln Ile Asp 
                          965                 970                 975     
          Arg Leu Ile Thr Gly Arg Leu Gln Ser Leu Gln Thr Tyr Val Thr Gln 
                      980                 985                 990         
          Gln Leu Ile Arg Ala Ala Glu Ile  Arg Ala Ser Ala Asn  Leu Ala Ala 
                  995                 1000                 1005             
          Thr Lys  Met Ser Glu Cys Val  Leu Gly Gln Ser Lys  Arg Val Asp 
              1010                 1015                 1020             
          Phe Cys  Gly Lys Gly Tyr His  Leu Met Ser Phe Pro  Gln Ala Ala 
              1025                 1030                 1035             
          Pro His  Gly Val Val Phe Leu  His Val Thr Tyr Val  Pro Ser Gln 
              1040                 1045                 1050             
          Glu Arg  Asn Phe Thr Thr Ala  Pro Ala Ile Cys His  Glu Gly Lys 
              1055                 1060                 1065             
          Ala Tyr  Phe Pro Arg Glu Gly  Val Phe Val Phe Asn  Gly Thr Ser 
              1070                 1075                 1080             
          Trp Phe  Ile Thr Gln Arg Asn  Phe Phe Ser Pro Gln  Ile Ile Thr 
              1085                 1090                 1095             
          Thr Asp  Asn Thr Phe Val Ser  Gly Asn Cys Asp Val  Val Ile Gly 
              1100                 1105                 1110             
          Ile Ile  Asn Asn Thr Val Tyr  Asp Pro Leu Gln Pro  Glu Leu Asp 
              1115                 1120                 1125             
          Ser Phe  Lys Glu Glu Leu Asp  Lys Tyr Phe Lys Asn  His Thr Ser 
              1130                 1135                 1140             
          Pro Asp  Val Asp Leu Gly Asp  Ile Ser Gly Ile Asn  Ala Ser Val 
              1145                 1150                 1155             
          Val Asn  Ile Gln Lys Glu Ile  Asp Arg Leu Asn Glu  Val Ala Lys 
              1160                 1165                 1170             
          Asn Leu  Asn Glu Ser Leu Ile  Asp Leu Gln Glu Leu  Gly Lys Tyr 
              1175                 1180                 1185             
          Glu Gln  Tyr Ile Lys Trp Pro  Trp Tyr Val Trp Leu  Gly Phe Ile 
              1190                 1195                 1200             
          Ala Gly  Leu Ile Ala Ile Val  Met Val Thr Ile Leu  Leu Cys Cys 
              1205                 1210                 1215             
          Met Thr  Ser Cys Cys Ser Cys  Leu Lys Gly Ala Cys  Ser Cys Gly 
              1220                 1225                 1230             
          Ser Cys  Cys Lys Phe Asp Glu  Asp Asp Ser Glu Pro  Val Leu Lys 
              1235                 1240                 1245             
          Gly Val  Lys Leu His Tyr Thr  
              1250                 1255 
          <![CDATA[<210>  23]]>
          <![CDATA[<211>  1353]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒OC43]]>
          <![CDATA[<400>  23]]>
          Met Phe Leu Ile Leu Leu Ile Ser Leu Pro Thr Ala Phe Ala Val Ile 
          1               5                   10                  15      
          Gly Asp Leu Lys Cys Thr Ser Asp Asn Ile Asn Asp Lys Asp Thr Gly 
                      20                  25                  30          
          Pro Pro Pro Ile Ser Thr Asp Thr Val Asp Val Thr Asn Gly Leu Gly 
                  35                  40                  45              
          Thr Tyr Tyr Val Leu Asp Arg Val Tyr Leu Asn Thr Thr Leu Phe Leu 
              50                  55                  60                  
          Asn Gly Tyr Tyr Pro Thr Ser Gly Ser Thr Tyr Arg Asn Met Ala Leu 
          65                  70                  75                  80  
          Lys Gly Ser Val Leu Leu Ser Arg Leu Trp Phe Lys Pro Pro Phe Leu 
                          85                  90                  95      
          Ser Asp Phe Ile Asn Gly Ile Phe Ala Lys Val Lys Asn Thr Lys Val 
                      100                 105                 110         
          Ile Lys Asp Arg Val Met Tyr Ser Glu Phe Pro Ala Ile Thr Ile Gly 
                  115                 120                 125             
          Ser Thr Phe Val Asn Thr Ser Tyr Ser Val Val Val Gln Pro Arg Thr 
              130                 135                 140                 
          Ile Asn Ser Thr Gln Asp Gly Asp Asn Lys Leu Gln Gly Leu Leu Glu 
          145                 150                 155                 160 
          Val Ser Val Cys Gln Tyr Asn Met Cys Glu Tyr Pro Gln Thr Ile Cys 
                          165                 170                 175     
          His Pro Asn Leu Gly Asn His Arg Lys Glu Leu Trp His Leu Asp Thr 
                      180                 185                 190         
          Gly Val Val Ser Cys Leu Tyr Lys Arg Asn Phe Thr Tyr Asp Val Asn 
                  195                 200                 205             
          Ala Asp Tyr Leu Tyr Phe His Phe Tyr Gln Glu Gly Gly Thr Phe Tyr 
              210                 215                 220                 
          Ala Tyr Phe Thr Asp Thr Gly Val Val Thr Lys Phe Leu Phe Asn Val 
          225                 230                 235                 240 
          Tyr Leu Gly Met Ala Leu Ser His Tyr Tyr Val Met Pro Leu Thr Cys 
                          245                 250                 255     
          Asn Ser Lys Leu Thr Leu Glu Tyr Trp Val Thr Pro Leu Thr Ser Arg 
                      260                 265                 270         
          Gln Tyr Leu Leu Ala Phe Asn Gln Asp Gly Ile Ile Phe Asn Ala Val 
                  275                 280                 285             
          Asp Cys Met Ser Asp Phe Met Ser Glu Ile Lys Cys Lys Thr Gln Ser 
              290                 295                 300                 
          Ile Ala Pro Pro Thr Gly Val Tyr Glu Leu Asn Gly Tyr Thr Val Gln 
          305                 310                 315                 320 
          Pro Ile Ala Asp Val Tyr Arg Arg Lys Pro Asn Leu Pro Asn Cys Asn 
                          325                 330                 335     
          Ile Glu Ala Trp Leu Asn Asp Lys Ser Val Pro Ser Pro Leu Asn Trp 
                      340                 345                 350         
          Glu Arg Lys Thr Phe Ser Asn Cys Asn Phe Asn Met Ser Ser Leu Met 
                  355                 360                 365             
          Ser Phe Ile Gln Ala Asp Ser Phe Thr Cys Asn Asn Ile Asp Ala Ala 
              370                 375                 380                 
          Lys Ile Tyr Gly Met Cys Phe Ser Ser Ile Thr Ile Asp Lys Phe Ala 
          385                 390                 395                 400 
          Ile Pro Asn Gly Arg Lys Val Asp Leu Gln Leu Gly Asn Leu Gly Tyr 
                          405                 410                 415     
          Leu Gln Ser Phe Asn Tyr Arg Ile Asp Thr Thr Ala Thr Ser Cys Gln 
                      420                 425                 430         
          Leu Tyr Tyr Asn Leu Pro Ala Ala Asn Val Ser Val Ser Arg Phe Asn 
                  435                 440                 445             
          Pro Ser Thr Trp Asn Lys Arg Phe Gly Phe Ile Glu Asp Ser Val Phe 
              450                 455                 460                 
          Lys Pro Arg Pro Ala Gly Val Leu Thr Asn His Asp Val Val Tyr Ala 
          465                 470                 475                 480 
          Gln His Cys Phe Lys Ala Pro Lys Asn Phe Cys Pro Cys Lys Leu Asn 
                          485                 490                 495     
          Gly Ser Cys Val Gly Ser Gly Pro Gly Lys Asn Asn Gly Ile Gly Thr 
                      500                 505                 510         
          Cys Pro Ala Gly Thr Asn Tyr Leu Thr Cys Asp Asn Leu Cys Thr Pro 
                  515                 520                 525             
          Asp Pro Ile Thr Phe Thr Gly Thr Tyr Lys Cys Pro Gln Thr Lys Ser 
              530                 535                 540                 
          Leu Val Gly Ile Gly Glu His Cys Ser Gly Leu Ala Val Lys Ser Asp 
          545                 550                 555                 560 
          Tyr Cys Gly Gly Asn Ser Cys Thr Cys Arg Pro Gln Ala Phe Leu Gly 
                          565                 570                 575     
          Trp Ser Ala Asp Ser Cys Leu Gln Gly Asp Lys Cys Asn Ile Phe Ala 
                      580                 585                 590         
          Asn Phe Ile Leu His Asp Val Asn Ser Gly Leu Thr Cys Ser Thr Asp 
                  595                 600                 605             
          Leu Gln Lys Ala Asn Thr Asp Ile Ile Leu Gly Val Cys Val Asn Tyr 
              610                 615                 620                 
          Asp Leu Tyr Gly Ile Leu Gly Gln Gly Ile Phe Val Glu Val Asn Ala 
          625                 630                 635                 640 
          Thr Tyr Tyr Asn Ser Trp Gln Asn Leu Leu Tyr Asp Ser Asn Gly Asn 
                          645                 650                 655     
          Leu Tyr Gly Phe Arg Asp Tyr Ile Thr Asn Arg Thr Phe Met Ile Arg 
                      660                 665                 670         
          Ser Cys Tyr Ser Gly Arg Val Ser Ala Ala Phe His Ala Asn Ser Ser 
                  675                 680                 685             
          Glu Pro Ala Leu Leu Phe Arg Asn Ile Lys Cys Asn Tyr Val Phe Asn 
              690                 695                 700                 
          Asn Ser Leu Thr Arg Gln Leu Gln Pro Ile Asn Tyr Phe Asp Ser Tyr 
          705                 710                 715                 720 
          Leu Gly Cys Val Val Asn Ala Tyr Asn Ser Thr Ala Ile Ser Val Gln 
                          725                 730                 735     
          Thr Cys Asp Leu Thr Val Gly Ser Gly Tyr Cys Val Asp Tyr Ser Lys 
                      740                 745                 750         
          Asn Arg Arg Ser Arg Gly Ala Ile Thr Thr Gly Tyr Arg Phe Thr Asn 
                  755                 760                 765             
          Phe Glu Pro Phe Thr Val Asn Ser Val Asn Asp Ser Leu Glu Pro Val 
              770                 775                 780                 
          Gly Gly Leu Tyr Glu Ile Gln Ile Pro Ser Glu Phe Thr Ile Gly Asn 
          785                 790                 795                 800 
          Met Val Glu Phe Ile Gln Thr Ser Ser Pro Lys Val Thr Ile Asp Cys 
                          805                 810                 815     
          Ala Ala Phe Val Cys Gly Asp Tyr Ala Ala Cys Lys Ser Gln Leu Val 
                      820                 825                 830         
          Glu Tyr Gly Ser Phe Cys Asp Asn Ile Asn Ala Ile Leu Thr Glu Val 
                  835                 840                 845             
          Asn Glu Leu Leu Asp Thr Thr Gln Leu Gln Val Ala Asn Ser Leu Met 
              850                 855                 860                 
          Asn Gly Val Thr Leu Ser Thr Lys Leu Lys Asp Gly Val Asn Phe Asn 
          865                 870                 875                 880 
          Val Asp Asp Ile Asn Phe Ser Pro Val Leu Gly Cys Leu Gly Ser Glu 
                          885                 890                 895     
          Cys Ser Lys Ala Ser Ser Arg Ser Ala Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asp 
                      900                 905                 910         
          Lys Val Lys Leu Ser Asp Val Gly Phe Val Glu Ala Tyr Asn Asn Cys 
                  915                 920                 925             
          Thr Gly Gly Ala Glu Ile Arg Asp Leu Ile Cys Val Gln Ser Tyr Lys 
              930                 935                 940                 
          Gly Ile Lys Val Leu Pro Pro Leu Leu Ser Glu Asn Gln Phe Ser Gly 
          945                 950                 955                 960 
          Tyr Thr Leu Ala Ala Thr Ser Ala Ser Leu Phe Pro Pro Trp Thr Ala 
                          965                 970                 975     
          Ala Ala Gly Val Pro Phe Tyr Leu Asn Val Gln Tyr Arg Ile Asn Gly 
                      980                 985                 990         
          Leu Gly Val Thr Met Asp Val Leu  Ser Gln Asn Gln Lys  Leu Ile Ala 
                  995                 1000                 1005             
          Asn Ala  Phe Asn Asn Ala Leu  Tyr Ala Ile Gln Glu  Gly Phe Asp 
              1010                 1015                 1020             
          Ala Thr  Asn Ser Ala Leu Val  Lys Ile Gln Ala Val  Val Asn Ala 
              1025                 1030                 1035             
          Asn Ala  Glu Ala Leu Asn Asn  Leu Leu Gln Gln Leu  Ser Asn Arg 
              1040                 1045                 1050             
          Phe Gly  Ala Ile Ser Ala Ser  Leu Gln Glu Ile Leu  Ser Arg Leu 
              1055                 1060                 1065             
          Asp Ala  Leu Glu Ala Glu Ala  Gln Ile Asp Arg Leu  Ile Asn Gly 
              1070                 1075                 1080             
          Arg Leu  Thr Ala Leu Asn Ala  Tyr Val Ser Gln Gln  Leu Ser Asp 
              1085                 1090                 1095             
          Ser Thr  Leu Val Lys Phe Ser  Ala Ala Gln Ala Met  Glu Lys Val 
              1100                 1105                 1110             
          Asn Glu  Cys Val Lys Ser Gln  Ser Ser Arg Ile Asn  Phe Cys Gly 
              1115                 1120                 1125             
          Asn Gly  Asn His Ile Ile Ser  Leu Val Gln Asn Ala  Pro Tyr Gly 
              1130                 1135                 1140             
          Leu Tyr  Phe Ile His Phe Ser  Tyr Val Pro Thr Lys  Tyr Val Thr 
              1145                 1150                 1155             
          Ala Arg  Val Ser Pro Gly Leu  Cys Ile Ala Gly Asp  Arg Gly Ile 
              1160                 1165                 1170             
          Ala Pro  Lys Ser Gly Tyr Phe  Val Asn Val Asn Asn  Thr Trp Met 
              1175                 1180                 1185             
          Tyr Thr  Gly Ser Gly Tyr Tyr  Tyr Pro Glu Pro Ile  Thr Glu Asn 
              1190                 1195                 1200             
          Asn Val  Val Val Met Ser Thr  Cys Ala Val Asn Tyr  Thr Lys Ala 
              1205                 1210                 1215             
          Pro Tyr  Val Met Leu Asn Thr  Ser Ile Pro Asn Leu  Pro Asp Phe 
              1220                 1225                 1230             
          Lys Glu  Glu Leu Asp Gln Trp  Phe Lys Asn Gln Thr  Ser Val Ala 
              1235                 1240                 1245             
          Pro Asp  Leu Ser Leu Asp Tyr  Ile Asn Val Thr Phe  Leu Asp Leu 
              1250                 1255                 1260             
          Gln Val  Glu Met Asn Arg Leu  Gln Glu Ala Ile Lys  Val Leu Asn 
              1265                 1270                 1275             
          Gln Ser  Tyr Ile Asn Leu Lys  Asp Ile Gly Thr Tyr  Glu Tyr Tyr 
              1280                 1285                 1290             
          Val Lys  Trp Pro Trp Tyr Val  Trp Leu Leu Ile Cys  Leu Ala Gly 
              1295                 1300                 1305             
          Val Ala  Met Leu Val Leu Leu  Phe Phe Ile Cys Cys  Cys Thr Gly 
              1310                 1315                 1320             
          Cys Gly  Thr Ser Cys Phe Lys  Lys Cys Gly Gly Cys  Cys Asp Asp 
              1325                 1330                 1335             
          Tyr Thr  Gly Tyr Gln Glu Leu  Val Ile Lys Thr Ser  His Asp Asp 
              1340                 1345                 1350             
          <![CDATA[<210>  24]]>
          <![CDATA[<211>  1353]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒MERS]]>
          <![CDATA[<400>  24]]>
          Met Ile His Ser Val Phe Leu Leu Met Phe Leu Leu Thr Pro Thr Glu 
          1               5                   10                  15      
          Ser Tyr Val Asp Val Gly Pro Asp Ser Val Lys Ser Ala Cys Ile Glu 
                      20                  25                  30          
          Val Asp Ile Gln Gln Thr Phe Phe Asp Lys Thr Trp Pro Arg Pro Ile 
                  35                  40                  45              
          Asp Val Ser Lys Ala Asp Gly Ile Ile Tyr Pro Gln Gly Arg Thr Tyr 
              50                  55                  60                  
          Ser Asn Ile Thr Ile Thr Tyr Gln Gly Leu Phe Pro Tyr Gln Gly Asp 
          65                  70                  75                  80  
          His Gly Asp Met Tyr Val Tyr Ser Ala Gly His Ala Thr Gly Thr Thr 
                          85                  90                  95      
          Pro Gln Lys Leu Phe Val Ala Asn Tyr Ser Gln Asp Val Lys Gln Phe 
                      100                 105                 110         
          Ala Asn Gly Phe Val Val Arg Ile Gly Ala Ala Ala Asn Ser Thr Gly 
                  115                 120                 125             
          Thr Val Ile Ile Ser Pro Ser Thr Ser Ala Thr Ile Arg Lys Ile Tyr 
              130                 135                 140                 
          Pro Ala Phe Met Leu Gly Ser Ser Val Gly Asn Phe Ser Asp Gly Lys 
          145                 150                 155                 160 
          Met Gly Arg Phe Phe Asn His Thr Leu Val Leu Leu Pro Asp Gly Cys 
                          165                 170                 175     
          Gly Thr Leu Leu Arg Ala Phe Tyr Cys Ile Leu Glu Pro Arg Ser Gly 
                      180                 185                 190         
          Asn His Cys Pro Ala Gly Asn Ser Tyr Thr Ser Phe Ala Thr Tyr His 
                  195                 200                 205             
          Thr Pro Ala Thr Asp Cys Ser Asp Gly Asn Tyr Asn Arg Asn Ala Ser 
              210                 215                 220                 
          Leu Asn Ser Phe Lys Glu Tyr Phe Asn Leu Arg Asn Cys Thr Phe Met 
          225                 230                 235                 240 
          Tyr Thr Tyr Asn Ile Thr Glu Asp Glu Ile Leu Glu Trp Phe Gly Ile 
                          245                 250                 255     
          Thr Gln Thr Ala Gln Gly Val His Leu Phe Ser Ser Arg Tyr Val Asp 
                      260                 265                 270         
          Leu Tyr Gly Gly Asn Met Phe Gln Phe Ala Thr Leu Pro Val Tyr Asp 
                  275                 280                 285             
          Thr Ile Lys Tyr Tyr Ser Ile Ile Pro His Ser Ile Arg Ser Ile Gln 
              290                 295                 300                 
          Ser Asp Arg Lys Ala Trp Ala Ala Phe Tyr Val Tyr Lys Leu Gln Pro 
          305                 310                 315                 320 
          Leu Thr Phe Leu Leu Asp Phe Ser Val Asp Gly Tyr Ile Arg Arg Ala 
                          325                 330                 335     
          Ile Asp Cys Gly Phe Asn Asp Leu Ser Gln Leu His Cys Ser Tyr Glu 
                      340                 345                 350         
          Ser Phe Asp Val Glu Ser Gly Val Tyr Ser Val Ser Ser Phe Glu Ala 
                  355                 360                 365             
          Lys Pro Ser Gly Ser Val Val Glu Gln Ala Glu Gly Val Glu Cys Asp 
              370                 375                 380                 
          Phe Ser Pro Leu Leu Ser Gly Thr Pro Pro Gln Val Tyr Asn Phe Lys 
          385                 390                 395                 400 
          Arg Leu Val Phe Thr Asn Cys Asn Tyr Asn Leu Thr Lys Leu Leu Ser 
                          405                 410                 415     
          Leu Phe Ser Val Asn Asp Phe Thr Cys Ser Gln Ile Ser Pro Ala Ala 
                      420                 425                 430         
          Ile Ala Ser Asn Cys Tyr Ser Ser Leu Ile Leu Asp Tyr Phe Ser Tyr 
                  435                 440                 445             
          Pro Leu Ser Met Lys Ser Asp Leu Ser Val Ser Ser Ala Gly Pro Ile 
              450                 455                 460                 
          Ser Gln Phe Asn Tyr Lys Gln Ser Phe Ser Asn Pro Thr Cys Leu Ile 
          465                 470                 475                 480 
          Leu Ala Thr Val Pro His Asn Leu Thr Thr Ile Thr Lys Pro Leu Lys 
                          485                 490                 495     
          Tyr Ser Tyr Ile Asn Lys Cys Ser Arg Phe Leu Ser Asp Asp Arg Thr 
                      500                 505                 510         
          Glu Val Pro Gln Leu Val Asn Ala Asn Gln Tyr Ser Pro Cys Val Ser 
                  515                 520                 525             
          Ile Val Pro Ser Thr Val Trp Glu Asp Gly Asp Tyr Tyr Arg Lys Gln 
              530                 535                 540                 
          Leu Ser Pro Leu Glu Gly Gly Gly Trp Leu Val Ala Ser Gly Ser Thr 
          545                 550                 555                 560 
          Val Ala Met Thr Glu Gln Leu Gln Met Gly Phe Gly Ile Thr Val Gln 
                          565                 570                 575     
          Tyr Gly Thr Asp Thr Asn Ser Val Cys Pro Lys Leu Glu Phe Ala Asn 
                      580                 585                 590         
          Asp Thr Lys Ile Ala Ser Gln Leu Gly Asn Cys Val Glu Tyr Ser Leu 
                  595                 600                 605             
          Tyr Gly Val Ser Gly Arg Gly Val Phe Gln Asn Cys Thr Ala Val Gly 
              610                 615                 620                 
          Val Arg Gln Gln Arg Phe Val Tyr Asp Ala Tyr Gln Asn Leu Val Gly 
          625                 630                 635                 640 
          Tyr Tyr Ser Asp Asp Gly Asn Tyr Tyr Cys Leu Arg Ala Cys Val Ser 
                          645                 650                 655     
          Val Pro Val Ser Val Ile Tyr Asp Lys Glu Thr Lys Thr His Ala Thr 
                      660                 665                 670         
          Leu Phe Gly Ser Val Ala Cys Glu His Ile Ser Ser Thr Met Ser Gln 
                  675                 680                 685             
          Tyr Ser Arg Ser Thr Arg Ser Met Leu Lys Arg Arg Asp Ser Thr Tyr 
              690                 695                 700                 
          Gly Pro Leu Gln Thr Pro Val Gly Cys Val Leu Gly Leu Val Asn Ser 
          705                 710                 715                 720 
          Ser Leu Phe Val Glu Asp Cys Lys Leu Pro Leu Gly Gln Ser Leu Cys 
                          725                 730                 735     
          Ala Leu Pro Asp Thr Pro Ser Thr Leu Thr Pro Arg Ser Val Arg Ser 
                      740                 745                 750         
          Val Pro Gly Glu Met Arg Leu Ala Ser Ile Ala Phe Asn His Pro Ile 
                  755                 760                 765             
          Gln Val Asp Gln Leu Asn Ser Ser Tyr Phe Lys Leu Ser Ile Pro Thr 
              770                 775                 780                 
          Asn Phe Ser Phe Gly Val Thr Gln Glu Tyr Ile Gln Thr Thr Ile Gln 
          785                 790                 795                 800 
          Lys Val Thr Val Asp Cys Lys Gln Tyr Val Cys Asn Gly Phe Gln Lys 
                          805                 810                 815     
          Cys Glu Gln Leu Leu Arg Glu Tyr Gly Gln Phe Cys Ser Lys Ile Asn 
                      820                 825                 830         
          Gln Ala Leu His Gly Ala Asn Leu Arg Gln Asp Asp Ser Val Arg Asn 
                  835                 840                 845             
          Leu Phe Ala Ser Val Lys Ser Ser Gln Ser Ser Pro Ile Ile Pro Gly 
              850                 855                 860                 
          Phe Gly Gly Asp Phe Asn Leu Thr Leu Leu Glu Pro Val Ser Ile Ser 
          865                 870                 875                 880 
          Thr Gly Ser Arg Ser Ala Arg Ser Ala Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asp 
                          885                 890                 895     
          Lys Val Thr Ile Ala Asp Pro Gly Tyr Met Gln Gly Tyr Asp Asp Cys 
                      900                 905                 910         
          Met Gln Gln Gly Pro Ala Ser Ala Arg Asp Leu Ile Cys Ala Gln Tyr 
                  915                 920                 925             
          Val Ala Gly Tyr Lys Val Leu Pro Pro Leu Met Asp Val Asn Met Glu 
              930                 935                 940                 
          Ala Ala Tyr Thr Ser Ser Leu Leu Gly Ser Ile Ala Gly Val Gly Trp 
          945                 950                 955                 960 
          Thr Ala Gly Leu Ser Ser Phe Ala Ala Ile Pro Phe Ala Gln Ser Ile 
                          965                 970                 975     
          Phe Tyr Arg Leu Asn Gly Val Gly Ile Thr Gln Gln Val Leu Ser Glu 
                      980                 985                 990         
          Asn Gln Lys Leu Ile Ala Asn Lys  Phe Asn Gln Ala Leu  Gly Ala Met 
                  995                 1000                 1005             
          Gln Thr  Gly Phe Thr Thr Thr  Asn Glu Ala Phe His  Lys Val Gln 
              1010                 1015                 1020             
          Asp Ala  Val Asn Asn Asn Ala  Gln Ala Leu Ser Lys  Leu Ala Ser 
              1025                 1030                 1035             
          Glu Leu  Ser Asn Thr Phe Gly  Ala Ile Ser Ala Ser  Ile Gly Asp 
              1040                 1045                 1050             
          Ile Ile  Gln Arg Leu Asp Val  Leu Glu Gln Asp Ala  Gln Ile Asp 
              1055                 1060                 1065             
          Arg Leu  Ile Asn Gly Arg Leu  Thr Thr Leu Asn Ala  Phe Val Ala 
              1070                 1075                 1080             
          Gln Gln  Leu Val Arg Ser Glu  Ser Ala Ala Leu Ser  Ala Gln Leu 
              1085                 1090                 1095             
          Ala Lys  Asp Lys Val Asn Glu  Cys Val Lys Ala Gln  Ser Lys Arg 
              1100                 1105                 1110             
          Ser Gly  Phe Cys Gly Gln Gly  Thr His Ile Val Ser  Phe Val Val 
              1115                 1120                 1125             
          Asn Ala  Pro Asn Gly Leu Tyr  Phe Met His Val Gly  Tyr Tyr Pro 
              1130                 1135                 1140             
          Ser Asn  His Ile Glu Val Val  Ser Ala Tyr Gly Leu  Cys Asp Ala 
              1145                 1150                 1155             
          Ala Asn  Pro Thr Asn Cys Ile  Ala Pro Val Asn Gly  Tyr Phe Ile 
              1160                 1165                 1170             
          Lys Thr  Asn Asn Thr Arg Ile  Val Asp Glu Trp Ser  Tyr Thr Gly 
              1175                 1180                 1185             
          Ser Ser  Phe Tyr Ala Pro Glu  Pro Ile Thr Ser Leu  Asn Thr Lys 
              1190                 1195                 1200             
          Tyr Val  Ala Pro Gln Val Thr  Tyr Gln Asn Ile Ser  Thr Asn Leu 
              1205                 1210                 1215             
          Pro Pro  Pro Leu Leu Gly Asn  Ser Thr Gly Ile Asp  Phe Gln Asp 
              1220                 1225                 1230             
          Glu Leu  Asp Glu Phe Phe Lys  Asn Val Ser Thr Ser  Ile Pro Asn 
              1235                 1240                 1245             
          Phe Gly  Ser Leu Thr Gln Ile  Asn Thr Thr Leu Leu  Asp Leu Thr 
              1250                 1255                 1260             
          Tyr Glu  Met Leu Ser Leu Gln  Gln Val Val Lys Ala  Leu Asn Glu 
              1265                 1270                 1275             
          Ser Tyr  Ile Asp Leu Lys Glu  Leu Gly Asn Tyr Thr  Tyr Tyr Asn 
              1280                 1285                 1290             
          Lys Trp  Pro Trp Tyr Ile Trp  Leu Gly Phe Ile Ala  Gly Leu Val 
              1295                 1300                 1305             
          Ala Leu  Ala Leu Cys Val Phe  Phe Ile Leu Cys Cys  Thr Gly Cys 
              1310                 1315                 1320             
          Gly Thr  Asn Cys Met Gly Lys  Leu Lys Cys Asn Arg  Cys Cys Asp 
              1325                 1330                 1335             
          Arg Tyr  Glu Glu Tyr Asp Leu  Glu Pro His Lys Val  His Val His 
              1340                 1345                 1350             
          <![CDATA[<210>  25]]>
          <![CDATA[<211>  1356]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒HKU1]]>
          <![CDATA[<400>  25]]>
          Met Leu Leu Ile Ile Phe Ile Leu Pro Thr Thr Leu Ala Val Ile Gly 
          1               5                   10                  15      
          Asp Phe Asn Cys Thr Asn Phe Ala Ile Asn Asp Leu Asn Thr Thr Val 
                      20                  25                  30          
          Pro Arg Ile Ser Glu Tyr Val Val Asp Val Ser Tyr Gly Leu Gly Thr 
                  35                  40                  45              
          Tyr Tyr Ile Leu Asp Arg Val Tyr Leu Asn Thr Thr Ile Leu Phe Thr 
              50                  55                  60                  
          Gly Tyr Phe Pro Lys Ser Gly Ala Asn Phe Arg Asp Leu Ser Leu Lys 
          65                  70                  75                  80  
          Gly Thr Thr Tyr Leu Ser Thr Leu Trp Tyr Gln Lys Pro Phe Leu Ser 
                          85                  90                  95      
          Asp Phe Asn Asn Gly Ile Phe Ser Arg Val Lys Asn Thr Lys Leu Tyr 
                      100                 105                 110         
          Val Asn Lys Thr Leu Tyr Ser Glu Phe Ser Thr Ile Val Ile Gly Ser 
                  115                 120                 125             
          Val Phe Ile Asn Asn Ser Tyr Thr Ile Val Val Gln Pro His Asn Gly 
              130                 135                 140                 
          Val Leu Glu Ile Thr Ala Cys Gln Tyr Thr Met Cys Glu Tyr Pro His 
          145                 150                 155                 160 
          Thr Ile Cys Lys Ser Lys Gly Ser Ser Arg Asn Glu Ser Trp His Phe 
                          165                 170                 175     
          Asp Lys Ser Glu Pro Leu Cys Leu Phe Lys Lys Asn Phe Thr Tyr Asn 
                      180                 185                 190         
          Val Ser Thr Asp Trp Leu Tyr Phe His Phe Tyr Gln Glu Arg Gly Thr 
                  195                 200                 205             
          Phe Tyr Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser Gly Met Pro Thr Thr Phe Leu Phe 
              210                 215                 220                 
          Ser Leu Tyr Leu Gly Thr Leu Leu Ser His Tyr Tyr Val Leu Pro Leu 
          225                 230                 235                 240 
          Thr Cys Asn Ala Ile Ser Ser Asn Thr Asp Asn Glu Thr Leu Gln Tyr 
                          245                 250                 255     
          Trp Val Thr Pro Leu Ser Lys Arg Gln Tyr Leu Leu Lys Phe Asp Asn 
                      260                 265                 270         
          Arg Gly Val Ile Thr Asn Ala Val Asp Cys Ser Ser Ser Phe Phe Ser 
                  275                 280                 285             
          Glu Ile Gln Cys Lys Thr Lys Ser Leu Leu Pro Asn Thr Gly Val Tyr 
              290                 295                 300                 
          Asp Leu Ser Gly Phe Thr Val Lys Pro Val Ala Thr Val His Arg Arg 
          305                 310                 315                 320 
          Ile Pro Asp Leu Pro Asp Cys Asp Ile Asp Lys Trp Leu Asn Asn Phe 
                          325                 330                 335     
          Asn Val Pro Ser Pro Leu Asn Trp Glu Arg Lys Ile Phe Ser Asn Cys 
                      340                 345                 350         
          Asn Phe Asn Leu Ser Thr Leu Leu Arg Leu Val His Thr Asp Ser Phe 
                  355                 360                 365             
          Ser Cys Asn Asn Phe Asp Glu Ser Lys Ile Tyr Gly Ser Cys Phe Lys 
              370                 375                 380                 
          Ser Ile Val Leu Asp Lys Phe Ala Ile Pro Asn Ser Arg Arg Ser Asp 
          385                 390                 395                 400 
          Leu Gln Leu Gly Ser Ser Gly Phe Leu Gln Ser Ser Asn Tyr Lys Ile 
                          405                 410                 415     
          Asp Thr Thr Ser Ser Ser Cys Gln Leu Tyr Tyr Ser Leu Pro Ala Ile 
                      420                 425                 430         
          Asn Val Thr Ile Asn Asn Tyr Asn Pro Ser Ser Trp Asn Arg Arg Tyr 
                  435                 440                 445             
          Gly Phe Asn Asn Phe Asn Leu Ser Ser His Ser Val Val Tyr Ser Arg 
              450                 455                 460                 
          Tyr Cys Phe Ser Val Asn Asn Thr Phe Cys Pro Cys Ala Lys Pro Ser 
          465                 470                 475                 480 
          Phe Ala Ser Ser Cys Lys Ser His Lys Pro Pro Ser Ala Ser Cys Pro 
                          485                 490                 495     
          Ile Gly Thr Asn Tyr Arg Ser Cys Glu Ser Thr Thr Val Leu Asp His 
                      500                 505                 510         
          Thr Asp Trp Cys Arg Cys Ser Cys Leu Pro Asp Pro Ile Thr Ala Tyr 
                  515                 520                 525             
          Asp Pro Arg Ser Cys Ser Gln Lys Lys Ser Leu Val Gly Val Gly Glu 
              530                 535                 540                 
          His Cys Ala Gly Phe Gly Val Asp Glu Glu Lys Cys Gly Val Leu Asp 
          545                 550                 555                 560 
          Gly Ser Tyr Asn Val Ser Cys Leu Cys Ser Thr Asp Ala Phe Leu Gly 
                          565                 570                 575     
          Trp Ser Tyr Asp Thr Cys Val Ser Asn Asn Arg Cys Asn Ile Phe Ser 
                      580                 585                 590         
          Asn Phe Ile Leu Asn Gly Ile Asn Ser Gly Thr Thr Cys Ser Asn Asp 
                  595                 600                 605             
          Leu Leu Gln Pro Asn Thr Glu Val Phe Thr Asp Val Cys Val Asp Tyr 
              610                 615                 620                 
          Asp Leu Tyr Gly Ile Thr Gly Gln Gly Ile Phe Lys Glu Val Ser Ala 
          625                 630                 635                 640 
          Val Tyr Tyr Asn Ser Trp Gln Asn Leu Leu Tyr Asp Ser Asn Gly Asn 
                          645                 650                 655     
          Ile Ile Gly Phe Lys Asp Phe Val Thr Asn Lys Thr Tyr Asn Ile Phe 
                      660                 665                 670         
          Pro Cys Tyr Ala Gly Arg Val Ser Ala Ala Phe His Gln Asn Ala Ser 
                  675                 680                 685             
          Ser Leu Ala Leu Leu Tyr Arg Asn Leu Lys Cys Ser Tyr Val Leu Asn 
              690                 695                 700                 
          Asn Ile Ser Leu Thr Thr Gln Pro Tyr Phe Asp Ser Tyr Leu Gly Cys 
          705                 710                 715                 720 
          Val Phe Asn Ala Asp Asn Leu Thr Asp Tyr Ser Val Ser Ser Cys Ala 
                          725                 730                 735     
          Leu Arg Met Gly Ser Gly Phe Cys Val Asp Tyr Asn Ser Pro Ser Ser 
                      740                 745                 750         
          Ser Ser Ser Arg Arg Lys Arg Arg Ser Ile Ser Ala Ser Tyr Arg Phe 
                  755                 760                 765             
          Val Thr Phe Glu Pro Phe Asn Val Ser Phe Val Asn Asp Ser Ile Glu 
              770                 775                 780                 
          Ser Val Gly Gly Leu Tyr Glu Ile Lys Ile Pro Thr Asn Phe Thr Ile 
          785                 790                 795                 800 
          Val Gly Gln Glu Glu Phe Ile Gln Thr Asn Ser Pro Lys Val Thr Ile 
                          805                 810                 815     
          Asp Cys Ser Leu Phe Val Cys Ser Asn Tyr Ala Ala Cys His Asp Leu 
                      820                 825                 830         
          Leu Ser Glu Tyr Gly Thr Phe Cys Asp Asn Ile Asn Ser Ile Leu Asp 
                  835                 840                 845             
          Glu Val Asn Gly Leu Leu Asp Thr Thr Gln Leu His Val Ala Asp Thr 
              850                 855                 860                 
          Leu Met Gln Gly Val Thr Leu Ser Ser Asn Leu Asn Thr Asn Leu His 
          865                 870                 875                 880 
          Phe Asp Val Asp Asn Ile Asn Phe Lys Ser Leu Val Gly Cys Leu Gly 
                          885                 890                 895     
          Pro His Cys Gly Ser Ser Ser Arg Ser Phe Phe Glu Asp Leu Leu Phe 
                      900                 905                 910         
          Asp Lys Val Lys Leu Ser Asp Val Gly Phe Val Glu Ala Tyr Asn Asn 
                  915                 920                 925             
          Cys Thr Gly Gly Ser Glu Ile Arg Asp Leu Leu Cys Val Gln Ser Phe 
              930                 935                 940                 
          Asn Gly Ile Lys Val Leu Pro Pro Ile Leu Ser Glu Ser Gln Ile Ser 
          945                 950                 955                 960 
          Gly Tyr Thr Thr Ala Ala Thr Val Ala Ala Met Phe Pro Pro Trp Ser 
                          965                 970                 975     
          Ala Ala Ala Gly Ile Pro Phe Ser Leu Asn Val Gln Tyr Arg Ile Asn 
                      980                 985                 990         
          Gly Leu Gly Val Thr Met Asp Val  Leu Asn Lys Asn Gln  Lys Leu Ile 
                  995                 1000                 1005             
          Ala Thr  Ala Phe Asn Asn Ala  Leu Leu Ser Ile Gln  Asn Gly Phe 
              1010                 1015                 1020             
          Ser Ala  Thr Asn Ser Ala Leu  Ala Lys Ile Gln Ser  Val Val Asn 
              1025                 1030                 1035             
          Ser Asn  Ala Gln Ala Leu Asn  Ser Leu Leu Gln Gln  Leu Phe Asn 
              1040                 1045                 1050             
          Lys Phe  Gly Ala Ile Ser Ser  Ser Leu Gln Glu Ile  Leu Ser Arg 
              1055                 1060                 1065             
          Leu Asp  Ala Leu Glu Ala Gln  Val Gln Ile Asp Arg  Leu Ile Asn 
              1070                 1075                 1080             
          Gly Arg  Leu Thr Ala Leu Asn  Ala Tyr Val Ser Gln  Gln Leu Ser 
              1085                 1090                 1095             
          Asp Ile  Ser Leu Val Lys Phe  Gly Ala Ala Leu Ala  Met Glu Lys 
              1100                 1105                 1110             
          Val Asn  Glu Cys Val Lys Ser  Gln Ser Pro Arg Ile  Asn Phe Cys 
              1115                 1120                 1125             
          Gly Asn  Gly Asn His Ile Leu  Ser Leu Val Gln Asn  Ala Pro Tyr 
              1130                 1135                 1140             
          Gly Leu  Leu Phe Met His Phe  Ser Tyr Lys Pro Ile  Ser Phe Lys 
              1145                 1150                 1155             
          Thr Val  Leu Val Ser Pro Gly  Leu Cys Ile Ser Gly  Asp Val Gly 
              1160                 1165                 1170             
          Ile Ala  Pro Lys Gln Gly Tyr  Phe Ile Lys His Asn  Asp His Trp 
              1175                 1180                 1185             
          Met Phe  Thr Gly Ser Ser Tyr  Tyr Tyr Pro Glu Pro  Ile Ser Asp 
              1190                 1195                 1200             
          Lys Asn  Val Val Phe Met Asn  Thr Cys Ser Val Asn  Phe Thr Lys 
              1205                 1210                 1215             
          Ala Pro  Leu Val Tyr Leu Asn  His Ser Val Pro Lys  Leu Ser Asp 
              1220                 1225                 1230             
          Phe Glu  Ser Glu Leu Ser His  Trp Phe Lys Asn Gln  Thr Ser Ile 
              1235                 1240                 1245             
          Ala Pro  Asn Leu Thr Leu Asn  Leu His Thr Ile Asn  Ala Thr Phe 
              1250                 1255                 1260             
          Leu Asp  Leu Tyr Tyr Glu Met  Asn Leu Ile Gln Glu  Ser Ile Lys 
              1265                 1270                 1275             
          Ser Leu  Asn Asn Ser Tyr Ile  Asn Leu Lys Asp Ile  Gly Thr Tyr 
              1280                 1285                 1290             
          Glu Met  Tyr Val Lys Trp Pro  Trp Tyr Val Trp Leu  Leu Ile Ser 
              1295                 1300                 1305             
          Phe Ser  Phe Ile Ile Phe Leu  Val Leu Leu Phe Phe  Ile Cys Cys 
              1310                 1315                 1320             
          Cys Thr  Gly Cys Gly Ser Ala  Cys Phe Ser Lys Cys  His Asn Cys 
              1325                 1330                 1335             
          Cys Asp  Glu Tyr Gly Gly His  His Asp Phe Val Ile  Lys Thr Ser 
              1340                 1345                 1350             
          His Asp  Asp 
              1355     
          <![CDATA[<210>  26]]>
          <![CDATA[<211>  118]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_1 (稱為S2P6) VH]]>
          <![CDATA[<400>  26]]>
          Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 
          1               5                   10                  15      
          Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Gln 
                      20                  25                  30          
          Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile 
                  35                  40                  45              
          Gly Ile Ile Asn Pro Ser Gly Val His Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe 
              50                  55                  60                  
          Gln Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Leu Tyr 
          65                  70                  75                  80  
          Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 
                          85                  90                  95      
          Ala Arg Gly Ser Pro Lys Gly Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 
                      100                 105                 110         
          Leu Val Thr Val Ser Ser 
                  115             
          <![CDATA[<210>  27]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_1 (稱為S2P6) CDRH1]]>
          <![CDATA[<400>  27]]>
          Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Gln Tyr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  28]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_1 (稱為S2P6) CDRH2 ]]>
          <![CDATA[<400>  28]]>
          Ile Asn Pro Ser Gly Val His Thr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  29]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_1 (稱為S2P6) CDRH3 ]]>
          <![CDATA[<400>  29]]>
          Ala Arg Gly Ser Pro Lys Gly Ala Phe Asp Tyr 
          1               5                   10      
          <![CDATA[<210>  30]]>
          <![CDATA[<211>  110]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_1 (稱為S2P6) VL(VK) ]]>
          <![CDATA[<400>  30]]>
          Glu Ile Val Met Met Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 
          1               5                   10                  15      
          Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Arg Ser Asn 
                      20                  25                  30          
          Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 
                  35                  40                  45              
          Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 
              50                  55                  60                  
          Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 
          65                  70                  75                  80  
          Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro 
                          85                  90                  95      
          Pro Arg Phe Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 
                      100                 105                 110 
          <![CDATA[<210>  31]]>
          <![CDATA[<211>  7]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_1 (稱為S2P6) CDRL1 ]]>
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          Gln Ser Val Arg Ser Asn Tyr 
          1               5           
          <![CDATA[<210>  32]]>
          <![CDATA[<211>  3]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_1 (稱為S2P6) CDRL2 ]]>
          <![CDATA[<400>  32]]>
          Gly Ala Ser 
          1           
          <![CDATA[<210>  33]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_1 (稱為S2P6) CDRL3 ]]>
          <![CDATA[<400>  33]]>
          Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro Pro Arg Phe Thr 
          1               5                   10      
          <![CDATA[<210>  34]]>
          <![CDATA[<211>  355]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_1 (稱為S2P6) VH ]]>
          <![CDATA[<400>  34]]>
          gaggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtt       60
          tcctgcaagg catctggata caccttcacc agccaatata tgcactgggt gcgacaggcc      120
          cctggacaag ggcttgagtg gataggaata atcaacccta gtggtgttca cacaagttac      180
          gcacagaaat tccagggcag agtcaccctg accagggaca cgtccacgag cacactatac      240
          atggaactga gcagcctgag atctgaagac acggccgtgt attactgtgc gagagggtct      300
          cccaaagggg cctttgacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc ctcag           355
          <![CDATA[<210>  35]]>
          <![CDATA[<211>  331]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_1 (稱為S2P6) VL(VK) ]]>
          <![CDATA[<400>  35]]>
          gaaatagtga tgatgcagtc tccaggcacc ctgtctttgt ctccagggga aagagccacc       60
          ctctcctgca gggccagtca gagtgttaga agcaactact tagcctggta ccagcagaaa      120
          cctggccagg ctcccagact cctcatctat ggtgcatcca gcagggccac tggcatccca      180
          gacaggttca gtggcagtgg gtctgggaca gacttcactc tcaccatcag cagactggag      240
          cctgaagatt ttgcagtgta ttactgtcag cagtatggta gttcaccccc cagattcact      300
          ttcggccctg ggaccaaagt ggaaatcaaa c                                     331
          <![CDATA[<210>  36]]>
          <![CDATA[<211>  122]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_2 (稱為S2S8) VH]]>
          <![CDATA[<400>  36]]>
          Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 
          1               5                   10                  15      
          Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr 
                      20                  25                  30          
          Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 
                  35                  40                  45              
          Ala Val Ile Ser Phe Glu Gly Arg Asn Glu Tyr Phe Ala Asp Ser Val 
              50                  55                  60                  
          Lys Gly Arg Phe Ala Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Val Ser 
          65                  70                  75                  80  
          Leu His Met Asn Ser Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 
                          85                  90                  95      
          Ala Arg Asp Ala Gly Tyr Asp Leu Ile Arg Phe Phe Leu Asp Ser Trp 
                      100                 105                 110         
          Gly Gln Gly Thr Arg Val Thr Val Ser Ser 
                  115                 120         
          <![CDATA[<210>  37]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_2 (稱為S2S8) CDRH1]]>
          <![CDATA[<400>  37]]>
          Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Gly 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  38]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_2  (稱為S2S8) CDRH2]]>
          <![CDATA[<400>  38]]>
          Ile Ser Phe Glu Gly Arg Asn Glu 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  39]]>
          <![CDATA[<211>  15]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_2 (稱為S2S8) CDRH3 ]]>
          <![CDATA[<400>  39]]>
          Ala Arg Asp Ala Gly Tyr Asp Leu Ile Arg Phe Phe Leu Asp Ser 
          1               5                   10                  15  
          <![CDATA[<210>  40]]>
          <![CDATA[<211>  109]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_2 (稱為S2S8) VL(VK) ]]>
          <![CDATA[<400>  40]]>
          Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 
          1               5                   10                  15      
          Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Arg Ile Gly Ser Thr 
                      20                  25                  30          
          Ser Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 
                  35                  40                  45              
          Ile Tyr Ala Ala Ser Thr Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 
              50                  55                  60                  
          Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 
          65                  70                  75                  80  
          Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr His Ser Ser Pro 
                          85                  90                  95      
          Leu Leu Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys 
                      100                 105                 
          <![CDATA[<210>  41]]>
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          <![CDATA[<212>  PRT]]>
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          Gln Arg Ile Gly Ser Thr Ser 
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          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<400>  42]]>
          Ala Ala Ser 
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          <![CDATA[<210>  43]]>
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          <![CDATA[<212>  PRT]]>
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          Gln Gln Tyr His Ser Ser Pro Leu Leu Thr 
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          <![CDATA[<210>  44]]>
          <![CDATA[<211>  367]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體420_1_2 (稱為S2S8) VH ]]>
          <![CDATA[<400>  44]]>
          gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc       60
          tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt gactacggca tgcactgggt ccgccaggct      120
          ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatttg aaggaagaaa tgaatatttt      180
          gcagactccg tgaagggccg attcgccatc tccagagaca attccaagaa cacggtgtct      240
          ctgcacatga acagcctgag agttgaggat acggctgtgt attactgtgc gagagatgct      300
          ggctacgatt tgatccggtt cttccttgac tcctggggcc agggaacgcg ggtcaccgtc      360
          tcctcag                                                                367
          <![CDATA[<210>  45]]>
          <![CDATA[<211>  328]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
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          <![CDATA[<400>  45]]>
          gaaattgtgt tgacacagtc tccaggcacc ctgtctttgt ctccagggga aagagccacc       60
          ctctcctgca gggccagtca gagaattggc agcacctcct tagcctggta ccagcagaaa      120
          cctggccagg ctcccaggct cctcatctat gctgcatcca ccagggccac tggcatccca      180
          gacagattca gtggcagtgg gtctgggaca gacttcactc tcaccatcag cagactggag      240
          cctgaagatt ttgcagtcta ttactgtcag cagtatcatt cttcacccct gctcactttc      300
          ggcggaggga ccaaggtgga tatcaaac                                         328
          <![CDATA[<210>  46]]>
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          <![CDATA[<223>  Xaa = D或S]]>
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          <![CDATA[<223>  Xaa = S、L或T]]>
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          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221>  misc_feature]]>
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          <![CDATA[<223>  Xaa = L或F]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221>  misc_feature]]>
          <![CDATA[<222>  20]]>
          <![CDATA[<223>  Xaa = G、S或T]]>
          <![CDATA[<400>  46]]>
          Phe Xaa Xaa Glu Leu Xaa Xaa Xaa Phe Lys Asn Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 
          1               5                   10                  15      
          Xaa Xaa Xaa Xaa 
                      20  
          <![CDATA[<210>  47]]>
          <![CDATA[<211>  117]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 VH ]]>
          <![CDATA[<400>  47]]>
          Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 
          1               5                   10                  15      
          Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr 
                      20                  25                  30          
          Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met 
                  35                  40                  45              
          Gly Ile Ile Asn Arg Ser Gly Gly Ser Thr Ile Tyr Ala Gln Arg Phe 
              50                  55                  60                  
          Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Ile Val Tyr 
          65                  70                  75                  80  
          Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 
                          85                  90                  95      
          Ala Arg Gly Gly Ser His Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr 
                      100                 105                 110         
          Val Thr Val Ser Ser 
                  115         
          <![CDATA[<210>  48]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 CDRH1 ]]>
          <![CDATA[<400>  48]]>
          Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr Tyr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  49]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 CDRH2 ]]>
          <![CDATA[<400>  49]]>
          Ile Asn Arg Ser Gly Gly Ser Thr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  50]]>
          <![CDATA[<211>  10]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 CDRH3]]>
          <![CDATA[<400>  50]]>
          Ala Arg Gly Gly Ser His Gly Met Asp Val 
          1               5                   10  
          <![CDATA[<210>  51]]>
          <![CDATA[<211>  110]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 VL ]]>
          <![CDATA[<400>  51]]>
          Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Ala Ala Pro Gly Gln 
          1               5                   10                  15      
          Lys Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Thr Ser Asn Ile Gly Asn Asn 
                      20                  25                  30          
          Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Arg Leu Leu 
                  35                  40                  45              
          Ile Phe Glu Asn Asn Lys Arg Pro Ser Gly Ile Pro Asp Arg Ile Ser 
              50                  55                  60                  
          Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Thr Leu Gly Ile Thr Gly Leu Gln 
          65                  70                  75                  80  
          Thr Gly Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gly Thr Trp Asp Ser Ser Leu 
                          85                  90                  95      
          Ser Ala Cys Val Phe Gly Thr Gly Thr Lys Val Thr Val Leu 
                      100                 105                 110 
          <![CDATA[<210>  52]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 CDRL]]>
          <![CDATA[<400>  52]]>
          Thr Ser Asn Ile Gly Asn Asn Tyr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  53]]>
          <![CDATA[<211>  3]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 CDRL2 ]]>
          <![CDATA[<400>  53]]>
          Glu Asn Asn 
          1           
          <![CDATA[<210>  54]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 CDRL3 ]]>
          <![CDATA[<400>  54]]>
          Gly Thr Trp Asp Ser Ser Leu Ser Ala Cys Val 
          1               5                   10      
          <![CDATA[<210>  55]]>
          <![CDATA[<211>  351]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 VH]]>
          <![CDATA[<400>  55]]>
          caggtccagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggta       60
          tcctgcaagg catctggata caccttcacc aattattata tgcactgggt gcgacaggcc      120
          cctggacaag ggcttgagtg gatgggaata atcaaccgta gtggtggtag cacaatctac      180
          gcacagaggt tccagggcag agtcaccatg accagggaca cgtccacgag catagtctac      240
          atggagctga gcagcctgag atctgacgac acggccgtgt attactgtgc gagaggtgga      300
          tcccacggta tggacgtctg gggccaaggg accacggtca ccgtctcctc a               351
          <![CDATA[<210>  56]]>
          <![CDATA[<211>  331]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 VL ]]>
          <![CDATA[<400>  56]]>
          cagtctgtgc tgacgcagcc gccctcagtg tctgcggccc caggacagaa ggtcaccatc       60
          tcctgctctg gaagcacctc caacattggg aataattatg tatcctggta ccagcagctc      120
          ccaggaacag cccccagact cctcatcttt gaaaataata agcgaccctc agggattcct      180
          gaccgtatct ctggctccaa gtctggcacg tcagccaccc tgggcatcac cggactccag      240
          actggggacg aggccgatta ttactgcgga acatgggata gcagcctgag tgcctgtgtc      300
          ttcggaactg ggaccaaggt caccgtccta g                                     331
          <![CDATA[<210>  57]]>
          <![CDATA[<211>  9]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 S蛋白及SARS-CoV S蛋白肽]]>
          <![CDATA[<400>  57]]>
          Phe Lys Glu Glu Leu Asp Lys Tyr Phe 
          1               5                   
          <![CDATA[<210>  58]]>
          <![CDATA[<211>  13]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒MERS]]>
          <![CDATA[<400>  58]]>
          Gly Ile Asp Phe Gln Asp Glu Leu Asp Glu Phe Phe Lys 
          1               5                   10              
          <![CDATA[<210>  59]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒OC43]]>
          <![CDATA[<400>  59]]>
          Asp Phe Lys Glu Glu Leu Asp Gln Trp Phe Lys 
          1               5                   10      
          <![CDATA[<210>  60]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒SARS冠狀病毒2]]>
          <![CDATA[<400>  60]]>
          Lys Arg Ser Phe Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asn 
          1               5                   10      
          <![CDATA[<210>  61]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒MERS]]>
          <![CDATA[<400>  61]]>
          Ala Arg Ser Ala Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asp 
          1               5                   10      
          <![CDATA[<210>  62]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒OC43]]>
          <![CDATA[<400>  62]]>
          Ser Arg Ser Ala Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asp 
          1               5                   10      
          <![CDATA[<210>  63]]>
          <![CDATA[<211>  9]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒HKU1]]>
          <![CDATA[<400>  63]]>
          Arg Ser Phe Phe Glu Asp Leu Leu Phe 
          1               5                   
          <![CDATA[<210>  64]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  甲型冠狀病毒NL63]]>
          <![CDATA[<400>  64]]>
          Arg Ser Ala Leu Glu Asp Leu Leu Phe Ser Lys 
          1               5                   10      
          <![CDATA[<210>  65]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  甲型冠狀病毒229E]]>
          <![CDATA[<400>  65]]>
          Gly Arg Ser Ala Ile Glu Asp Ile Leu Phe Ser 
          1               5                   10      
          <![CDATA[<210>  66]]>
          <![CDATA[<211>  118]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 UCA VH ]]>
          <![CDATA[<400>  66]]>
          Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 
          1               5                   10                  15      
          Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr 
                      20                  25                  30          
          Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met 
                  35                  40                  45              
          Gly Ile Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe 
              50                  55                  60                  
          Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr 
          65                  70                  75                  80  
          Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 
                          85                  90                  95      
          Ala Arg Gly Ser Pro Lys Gly Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 
                      100                 105                 110         
          Leu Val Thr Val Ser Ser 
                  115             
          <![CDATA[<210>  67]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 UCA CDRH1 ]]>
          <![CDATA[<400>  67]]>
          Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Tyr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  68]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 UCA CDRH2 ]]>
          <![CDATA[<400>  68]]>
          Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  69]]>
          <![CDATA[<211>  110]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 UCA VL(VK) ]]>
          <![CDATA[<400>  69]]>
          Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 
          1               5                   10                  15      
          Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser 
                      20                  25                  30          
          Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 
                  35                  40                  45              
          Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 
              50                  55                  60                  
          Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 
          65                  70                  75                  80  
          Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro 
                          85                  90                  95      
          Pro Arg Phe Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys 
                      100                 105                 110 
          <![CDATA[<210>  70]]>
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          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 UCA CDRL1 ]]>
          <![CDATA[<400>  70]]>
          Gln Ser Val Ser Ser Ser Tyr 
          1               5           
          <![CDATA[<210>  71]]>
          <![CDATA[<211>  118]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 Q32Y VH]]>
          <![CDATA[<400>  71]]>
          Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 
          1               5                   10                  15      
          Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr 
                      20                  25                  30          
          Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile 
                  35                  40                  45              
          Gly Ile Ile Asn Pro Ser Gly Val His Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe 
              50                  55                  60                  
          Gln Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Leu Tyr 
          65                  70                  75                  80  
          Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 
                          85                  90                  95      
          Ala Arg Gly Ser Pro Lys Gly Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 
                      100                 105                 110         
          Leu Val Thr Val Ser Ser 
                  115             
          <![CDATA[<210>  72]]>
          <![CDATA[<211>  118]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 V56G H57S VH ]]>
          <![CDATA[<400>  72]]>
          Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 
          1               5                   10                  15      
          Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Gln 
                      20                  25                  30          
          Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile 
                  35                  40                  45              
          Gly Ile Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe 
              50                  55                  60                  
          Gln Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Leu Tyr 
          65                  70                  75                  80  
          Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 
                          85                  90                  95      
          Ala Arg Gly Ser Pro Lys Gly Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 
                      100                 105                 110         
          Leu Val Thr Val Ser Ser 
                  115             
          <![CDATA[<210>  73]]>
          <![CDATA[<211>  118]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 G103V VH ]]>
          <![CDATA[<400>  73]]>
          Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 
          1               5                   10                  15      
          Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Gln 
                      20                  25                  30          
          Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile 
                  35                  40                  45              
          Gly Ile Ile Asn Pro Ser Gly Val His Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe 
              50                  55                  60                  
          Gln Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Leu Tyr 
          65                  70                  75                  80  
          Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 
                          85                  90                  95      
          Ala Arg Gly Ser Pro Lys Val Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 
                      100                 105                 110         
          Leu Val Thr Val Ser Ser 
                  115             
          <![CDATA[<210>  74]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 G103V CDRH3 ]]>
          <![CDATA[<400>  74]]>
          Ala Arg Gly Ser Pro Lys Val Ala Phe Asp Tyr 
          1               5                   10      
          <![CDATA[<210>  75]]>
          <![CDATA[<211>  110]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 R30S VL(VK) ]]>
          <![CDATA[<400>  75]]>
          Glu Ile Val Met Met Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 
          1               5                   10                  15      
          Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Asn 
                      20                  25                  30          
          Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 
                  35                  40                  45              
          Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 
              50                  55                  60                  
          Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 
          65                  70                  75                  80  
          Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro 
                          85                  90                  95      
          Pro Arg Phe Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 
                      100                 105                 110 
          <![CDATA[<210>  76]]>
          <![CDATA[<211>  7]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 R30S CDRL1 ]]>
          <![CDATA[<400>  76]]>
          Gln Ser Val Ser Ser Asn Tyr 
          1               5           
          <![CDATA[<210>  77]]>
          <![CDATA[<211>  110]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 N32S VL(VK) ]]>
          <![CDATA[<400>  77]]>
          Glu Ile Val Met Met Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 
          1               5                   10                  15      
          Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Arg Ser Ser 
                      20                  25                  30          
          Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 
                  35                  40                  45              
          Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 
              50                  55                  60                  
          Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 
          65                  70                  75                  80  
          Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro 
                          85                  90                  95      
          Pro Arg Phe Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 
                      100                 105                 110 
          <![CDATA[<210>  78]]>
          <![CDATA[<211>  7]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2P6 N32S CDRL1 ]]>
          <![CDATA[<400>  78]]>
          Gln Ser Val Arg Ser Ser Tyr 
          1               5           
          <![CDATA[<210>  79]]>
          <![CDATA[<211>  117]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 UCA VH]]>
          <![CDATA[<400>  79]]>
          Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 
          1               5                   10                  15      
          Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr 
                      20                  25                  30          
          Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met 
                  35                  40                  45              
          Gly Ile Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe 
              50                  55                  60                  
          Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr 
          65                  70                  75                  80  
          Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 
                          85                  90                  95      
          Ala Arg Gly Gly Ser His Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr 
                      100                 105                 110         
          Val Thr Val Ser Ser 
                  115         
          <![CDATA[<210>  80]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 UCA CDRH1 ]]>
          <![CDATA[<400>  80]]>
          Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Tyr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  81]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 UCA CDRH2]]>
          <![CDATA[<400>  81]]>
          Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  82]]>
          <![CDATA[<211>  110]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 UCA VL ]]>
          <![CDATA[<400>  82]]>
          Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Ala Ala Pro Gly Gln 
          1               5                   10                  15      
          Lys Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Asn Asn 
                      20                  25                  30          
          Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu 
                  35                  40                  45              
          Ile Tyr Glu Asn Asn Lys Arg Pro Ser Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 
              50                  55                  60                  
          Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Thr Leu Gly Ile Thr Gly Leu Gln 
          65                  70                  75                  80  
          Thr Gly Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gly Thr Trp Asp Ser Ser Leu 
                          85                  90                  95      
          Ser Ala Cys Val Phe Gly Thr Gly Thr Lys Val Thr Val Leu 
                      100                 105                 110 
          <![CDATA[<210>  83]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列抗體S2S43 UCA CDRL1 ]]>
          <![CDATA[<400>  83]]>
          Ser Ser Asn Ile Gly Asn Asn Tyr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  84]]>
          <![CDATA[<211>  11]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221>  misc_feature]]>
          <![CDATA[<222>  1]]>
          <![CDATA[<223>  Xaa =任一胺基酸,且較佳不為A、I、Y、N、K、H、E或C且最佳為D]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221>  misc_feature]]>
          <![CDATA[<222>  2]]>
          <![CDATA[<223>  Xaa =任一胺基酸,且較佳不為A、V、L、I、F、Y、W、N、K、R、H、E、C或P且較佳為S]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221>  misc_feature]]>
          <![CDATA[<222>  4]]>
          <![CDATA[<223>  Xaa = K、D、R或S,且較佳為K]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221>  misc_feature]]>
          <![CDATA[<222>  5]]>
          <![CDATA[<223>  Xaa = E、D、Q、N、S或M,且較佳為E]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<221>  misc_feature]]>
          <![CDATA[<222>  9]]>
          <![CDATA[<223>  Xaa =除P之外的任一胺基酸,且較佳為K]]>
          <![CDATA[<400>  84]]>
          Xaa Xaa Phe Xaa Xaa Glu Leu Asp Xaa Tyr Phe 
          1               5                   10      
          <![CDATA[<210>  85]]>
          <![CDATA[<211>  127]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 S309 mAb VH ]]>
          <![CDATA[<400>  85]]>
          Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 
          1               5                   10                  15      
          Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Pro Phe Thr Ser Tyr 
                      20                  25                  30          
          Gly Ile Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met 
                  35                  40                  45              
          Gly Trp Ile Ser Thr Tyr Asn Gly Asn Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe 
              50                  55                  60                  
          Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Thr Asp Thr Ser Thr Thr Thr Gly Tyr 
          65                  70                  75                  80  
          Met Glu Leu Arg Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 
                          85                  90                  95      
          Ala Arg Asp Tyr Thr Arg Gly Ala Trp Phe Gly Glu Ser Leu Ile Gly 
                      100                 105                 110         
          Gly Phe Asp Asn Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 
                  115                 120                 125         
          <![CDATA[<210>  86]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 S309 mAb CDRH1]]>
          <![CDATA[<400>  86]]>
          Gly Tyr Pro Phe Thr Ser Tyr Gly 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  87]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 S309 mAb CDRH2]]>
          <![CDATA[<400>  87]]>
          Ile Ser Thr Tyr Asn Gly Asn Thr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  88]]>
          <![CDATA[<211>  20]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 S309 mAb CDRH3 ]]>
          <![CDATA[<400>  88]]>
          Ala Arg Asp Tyr Thr Arg Gly Ala Trp Phe Gly Glu Ser Leu Ile Gly 
          1               5                   10                  15      
          Gly Phe Asp Asn 
                      20  
          <![CDATA[<210>  89]]>
          <![CDATA[<211>  107]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220> ]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 S309 mAb VL ]]>
          <![CDATA[<400>  89]]>
          Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 
          1               5                   10                  15      
          Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Thr Val Ser Ser Thr 
                      20                  25                  30          
          Ser Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 
                  35                  40                  45              
          Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 
              50                  55                  60                  
          Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 
          65                  70                  75                  80  
          Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln His Asp Thr Ser Leu 
                          85                  90                  95      
          Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 
                      100                 105         
          <![CDATA[<210>  90]]>
          <![CDATA[<211>  7]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 S309 mAb CDRL1 ]]>
          <![CDATA[<400>  90]]>
          Gln Thr Val Ser Ser Thr Ser 
          1               5           
          <![CDATA[<210>  91]]>
          <![CDATA[<211>  3]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 S309 mAb CDRL2 ]]>
          <![CDATA[<400>  91]]>
          Gly Ala Ser 
          1           
          <![CDATA[<210>  92]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 S309 mAb CDRL3 ]]>
          <![CDATA[<400>  92]]>
          Gln Gln His Asp Thr Ser Leu Thr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  93]]>
          <![CDATA[<211>  127]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 S309 N55Q mAb VH ]]>
          <![CDATA[<400>  93]]>
          Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 
          1               5                   10                  15      
          Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Pro Phe Thr Ser Tyr 
                      20                  25                  30          
          Gly Ile Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met 
                  35                  40                  45              
          Gly Trp Ile Ser Thr Tyr Gln Gly Asn Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe 
              50                  55                  60                  
          Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Thr Asp Thr Ser Thr Thr Thr Gly Tyr 
          65                  70                  75                  80  
          Met Glu Leu Arg Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 
                          85                  90                  95      
          Ala Arg Asp Tyr Thr Arg Gly Ala Trp Phe Gly Glu Ser Leu Ile Gly 
                      100                 105                 110         
          Gly Phe Asp Asn Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 
                  115                 120                 125         
          <![CDATA[<210>  94]]>
          <![CDATA[<211>  8]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  合成序列SARS-CoV-2 S309 N55Q CDRH2 ]]>
          <![CDATA[<400>  94]]>
          Ile Ser Thr Tyr Gln Gly Asn Thr 
          1               5               
          <![CDATA[<210>  95]]>
          <![CDATA[<211>  14]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒]]>
          <![CDATA[<400>  95]]>
          Asp Ser Phe Lys Glu Glu Leu Asp Lys Tyr Phe Lys Asn His 
          1               5                   10                  
          <![CDATA[<210>  96]]>
          <![CDATA[<211>  21]]>
          <![CDATA[<212>  PRT]]>
          <![CDATA[<213>  乙型冠狀病毒]]>
          <![CDATA[<400>  96]]>
          Gln Pro Glu Leu Asp Ser Phe Lys Glu Glu Leu Asp Lys Tyr Phe Lys 
          1               5                   10                  15      
          Asn His Thr Ser Pro 
                      20      
          <![CDATA[<210>  97]]>
          <![CDATA[<211>  21]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  正向引子]]>
          <![CDATA[<400>  97]]>
          caagagcaaa cggttgaaca c                                                 21
          <![CDATA[<210>  98]]>
          <![CDATA[<211>  22]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  反向引子]]>
          <![CDATA[<400>  98]]>
          ccagagcctc tcattgtagt ct                                                22
          <![CDATA[<210>  99]]>
          <![CDATA[<211>  19]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  正向引子]]>
          <![CDATA[<400>  99]]>
          cctggcgtcg tgattagtg                                                    19
          <![CDATA[<210>  100]]>
          <![CDATA[<211>  21]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  反向引子]]>
          <![CDATA[<400>  100]]>
          acaccctttc caaatcctca g                                                 21
          <![CDATA[<210>  101]]>
          <![CDATA[<211>  21]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  正向引子]]>
          <![CDATA[<400>  101]]>
          caagtgctcc ractctggga t                                                 21
          <![CDATA[<210>  102]]>
          <![CDATA[<211>  21]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  反向引子]]>
          <![CDATA[<400>  102]]>
          aacacaccgr ttctcgtcct c                                                 21
          <![CDATA[<210>  103]]>
          <![CDATA[<211>  20]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  引子序列]]>
          <![CDATA[<400>  103]]>
          cgagaaaaag gcatctggag                                                   20
          <![CDATA[<210>  104]]>
          <![CDATA[<211>  19]]>
          <![CDATA[<212>  DNA]]>
          <![CDATA[<213>  人工序列]]>
          <![CDATA[<220>]]>
          <![CDATA[<223>  引子序列]]>
          <![CDATA[<400>  104]]>
          cattgaactc gtcggtctc                                                    19
          
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Claims (42)

  1. 一種抗體或其抗原結合片段,其包含有包含一重鏈可變區域(VH)及一輕鏈可變區域(VL),該重鏈可變區域(VH)包含一CDRH1、一CDRH2及一CDRH3,該輕鏈可變區域(VL)包含一CDRL1、一CDRL2及一CDRL3,其中: (i)   該CDRH1包含下述或由下述組成:根據SEQ ID NO: 27、37、48、67或80之胺基酸序列或其一功能變體,該功能變體包含一個、二個或三個酸取代之一功能變體,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代; (ii)  該CDRH2包含下述或由下述組成:根據SEQ ID NO: 28、38、49、68或81之胺基酸序列或其一功能變體,該功能變體包含一個、二個或三個胺基酸取代,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代; (iii) 該CDRH3包含下述或由下述組成:根據SEQ ID NO: 29、39或50之胺基酸序列或其一功能變體,該功能變體包含一個、二個或三個胺基酸取代,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代; (iv) 該CDRL1包含下述或由下述組成:根據SEQ ID NO: 31、41、52、70、76、78或83之胺基酸序列或其一功能變體,該功能變體包含一個、二個或三個胺基酸取代,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代; (v)  該CDRL2包含下述或由下述組成:根據SEQ ID NO: 32、42或53之胺基酸序列或其一功能變體,該功能變體包含一個、二個或三個胺基酸取代,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代;及/或 (vi) 該CDRL3包含下述或由下述組成:根據SEQ ID NO: 33、43或54之胺基酸序列或其一功能變體,該功能變體包含一個、二個或三個胺基酸取代,該等取代中之一或多者任擇地為一守恆取代及/或為對一經生殖系編碼之胺基酸的一取代, 其中該抗體或抗原結合片段能夠結合至一乙型冠狀病毒之一表面醣蛋白。
  2. 如請求項1之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至二種或更多種乙型冠狀病毒之一表面醣蛋白。
  3. 如請求項2之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之一表面醣蛋白。
  4. 如請求項1至3中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至一SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV、OC43及HKU1。
  5. 如請求項1至4中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠結合至表現於一宿主細胞之一表面上及/或一病毒粒子上的一或多種乙型冠狀病毒之該表面醣蛋白。
  6. 如請求項1至5中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠在一活體外感染模型中及/或一活體內動物感染模型中及/或一人類中中和一乙型冠狀病毒之感染。
  7. 如請求項1至5中任一項之抗體或抗原結合片段,其能夠在一活體外感染模型中及/或一活體內動物感染模型中及/或一人類中中和一種、二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之感染。
  8. 如請求項1至7中任一項之抗體或抗原結合片段,其在一活體外感染模型中及/或一活體內動物感染模型中及/或一人類中能夠中和任何一種、二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之感染。
  9. 如請求項1至8中任一項之抗體或抗原結合片段,其包含以下中闡述之CDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2及CDRL3胺基酸序列: (i)            分別為SEQ ID Nos: 27、28、29、31、32、33; (ii)           分別為SEQ ID NOs: 27、28、29、70、32、33; (iii)          分別為SEQ ID NOs: 27、28、74、31、32、33; (iv)          分別為SEQ ID NOs: 27、28、74、70、32、33; (v)           分別為SEQ ID NOs: 27、28、29、76、32、33; (vi)          分別為SEQ ID NOs: 27、28、29、78、32、33; (vii)         分別為SEQ ID NOs: 27、28、74、76、32、33; (viii)        分別為SEQ ID NOs: 27、28、74、78、32、33; (ix)          分別為SEQ ID NOs: 27、68、29、31、32、33; (x)           分別為SEQ ID NOs: 27、68、29、70、32、33; (xi)          分別為SEQ ID NOs: 27、68、74、31、32、33; (xii)         分別為SEQ ID NOs: 27、68、74、70、32、33; (xiii)        分別為SEQ ID NOs: 27、68、29、76、32、33; (xiv)        分別為SEQ ID NOs: 27、68、29、78、32、33; (xv)         分別為SEQ ID NOs: 27、68、74、76、32、33; (xvi)        分別為SEQ ID NOs: 27、68、74、78、32、33; (xvii)       分別為SEQ ID NOs: 67、28、29、31、32、33; (xviii)      分別為SEQ ID NOs: 67、28、74、31、32、33; (xix)        分別為SEQ ID NOs: 67、28、74、70、32、33; (xx)         分別為SEQ ID NOs: 67、28、29、76、32、33; (xxi)        分別為SEQ ID NOs: 67、28、29、78、32、33; (xxii)       分別為SEQ ID NOs: 67、28、74、76、32、33; (xxiii)      分別為SEQ ID NOs: 67、28、74、78、32、33; (xxiv)      分別為SEQ ID NOs: 67、68、29、31、32、33; (xxv)       分別為SEQ ID NOs: 67、68、29、70、32、33; (xxvi)      分別為SEQ ID NOs: 67、68、74、31、32、33; (xxvii)     分別為SEQ ID NOs: 67、68、74、70、32、33; (xxviii)    分別為SEQ ID NOs: 67、68、29、76、32、33; (xxix)      分別為SEQ ID NOs: 67、68、29、78、32、33; (xxx)       分別為SEQ ID NOs: 67、68、74、76、32、33; (xxxi)      分別為SEQ ID NOs: 48、49、50、52、53、54; (xxxii)     分別為SEQ ID NOs: 48、49、50、83、53、54; (xxxiii)    分別為SEQ ID NOs: 48、81、50、52、53、54; (xxxiv)    分別為SEQ ID NOs: 48、81、50、83、53、54; (xxxv)     分別為SEQ ID NOs: 80、49、50、52、53、54; (xxxvi)    分別為SEQ ID NOs: 80、49、50、83、53、54; (xxxvii)   分別為SEQ ID NOs: 80、81、50、52、53、54; (xxxviiii) 分別為SEQ ID NOs: 80、81、50、83、53、54;或 (xxxix)    分別為SEQ ID NOs: 37、38、39、41、42、43。
  10. 如請求項1至9中任一項之抗體或抗原結合片段,其中: (i)   該VH包含一胺基酸序列或由其組成,該胺基酸序列與根據SEQ ID NO: 26、36、47、66、71、72或79之胺基酸序列具有至少85%一致性,其中變化任擇地限於一或多個骨架區及/或該變化包含一或多個對一經生殖系編碼之胺基酸的取代;及/或 (ii)  該VL包含一胺基酸序列或由其組成,該胺基酸序列與根據SEQ ID NO: 30、40、51、69、75、77或82之胺基酸序列具有至少85%一致性,其中該變化任擇地限於一或多個骨架區及/或該變化包含一或多個對一經生殖系編碼之胺基酸的取代。
  11. 如請求項1至10中任一項之抗體或抗原結合片段,其中該VH及該VL包含根據以下SEQ ID NOs之胺基酸序列或由所述胺基酸序列組成:(i)分別為26及30;(ii)分別為26及69;(iii)分別為26及75;(iv)分別為26及77;(v)分別為66及69;(vi)分別為66及30;(vii)分別為66及75;(viii)分別為66及77;(ix)分別為71及30;(x)分別為71及69;(xi)分別為71及75;(xii)分別為71及77;(xiii)分別為72及30;(xiv)分別為72及69;(xv)分別為72及75;(xvi)分別為72及77;(xvii)分別為73及30;(xviii)分別為73及69;(xix)分別為73及75;(xx)分別為73及77;(xxi)分別為36及40;(xxii)分別為47及51;(xxiii)分別為47及82;(xxiv)分別為79及82;或(xxv)分別為79及51。
  12. 如請求項1至10中任一項之抗體或抗原結合片段,其中該VH及該VL具有至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少99%下述SEQ ID NOs中闡述之胺基酸序列,或者包含或由下述SEQ ID NOs中闡述之胺基酸序列組成:(i)分別為26及30;(ii)分別為26及69;(iii)分別為26及75;(iv)分別為26及77;(v)分別為66及69;(vi)分別為66及30;(vii)分別為66及75;(viii)分別為66及77;(ix)分別為71及30;(x)分別為71及69;(xi)分別為71及75;(xii)分別為71及77;(xiii)分別為72及30;(xiv)分別為72及69;(xv)分別為72及75;(xvi)分別為72及77;(xvii)分別為73及30;(xviii)分別為73及69;(xix)分別為73及75;(xx)分別為73及77;(xxi)分別為36及40;(xxii)分別為47及51;(xxiii)分別為47及82;(xxiv)分別為79及82;或(xxv)分別為79及51。
  13. 一種抗體或其抗原結合片段,其能夠結合至一乙型冠狀病毒表面醣蛋白胺基酸序列或肽,該乙型冠狀病毒表面醣蛋白胺基酸序列或肽包含(i)-(iii)中之任一者: (i)   FKEELDKYF [SEQ ID NO:57]; (ii)  GIDFQDELDEFFK [SEQ ID NO:58];及/或 (iii) DFKEELDQWFK [SEQ ID NO:59]。
  14. 一種抗體或其抗原結合片段,其能夠結合至一乙型冠狀病毒表面醣蛋白胺基酸序列或肽,該乙型冠狀病毒表面醣蛋白胺基酸序列或肽包含(i)-(vi)中之任一者: (i)      KRSFIEDLLFN [SEQ ID NO:60]; (ii)     ARSAIEDLLFD [SEQ ID NO:61]; (iii)    SRSAIEDLLFD [SEQ ID NO:62]; (iv)    RSFFEDLLF [SEQ ID NO:63]; (v)     RSALEDLLFSK [SEQ ID NO:64];及/或 (vi)    GRSAIEDILFS [SEQ ID NO:65]。
  15. 一種抗體或其抗原結合片段,其識別一乙型冠狀病毒表面醣蛋白之一莖螺旋中的一表位,其中該表位在二種、三種、四種、五種或更多種乙型冠狀病毒中為守恆的。
  16. 一種抗體或抗原結合片段,其能夠結合至包含胺基酸序列X 1X 2FX 3X 4ELDX 5YF (SEQ ID NO:84)之一肽。
  17. 如請求項1至16中任一項之抗體或抗原結合片段,其: (i)      識別二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之刺突蛋白中之一表位; (ii)     能夠阻斷二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之該刺突蛋白與其各別細胞表面受體之間的一相互作用; (iii)    識別在二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒之該刺突蛋白中為守恆的一表位; (iv)    針對二種、三種、四種或五種乙型冠狀病毒具有交叉反應性; (v)     針對SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任三者具有交叉反應性; (vi)    針對SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV、OC43及HKU1中之任四者具有交叉反應性; (vii)   針對SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV、OC43及HKU1具有交叉反應性; (viii)  能夠在一活體外感染模型中及/或一活體內動物感染模型中及/或一人類中來中和一種、二種、三種、四種、五種或更多種不同人類乙型冠狀病毒之感染; (ix)    當該抗體或抗原結合片段結合至該乙型冠狀病毒及/或甲型冠狀病毒表面醣蛋白時,能夠活化一人類FcγRIIa (任擇地V131)、一人類FcγRIIIa (任擇地V158)或二者; (x)     當結合至一乙型冠狀病毒之該表面醣蛋白時,不抑制該表面醣蛋白與一人類ACE2之間的結合; (xi)    能夠抑制一第一細胞與一第二細胞之間的細胞-細胞融合,該第一細胞經SARS-CoV-2 S醣蛋白感染或轉染; (xii)   能夠介導ADCC、ADCP、CDC或其任何組合來對抗經一乙型冠狀病毒感染之一目標細胞; (xiii)  能夠預防一哺乳動物中之一乙型冠狀病毒感染,或預防一哺乳動物中之一乙型冠狀病毒感染之嚴重程度之一進展;或 (xiv)  (i)-(xii)之任何組合。
  18. 如請求項1至16中任一項之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段為一多特異性抗體或抗原結合片段。
  19. 如請求項17之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段為一雙特異性抗體或抗原結合片段。
  20. 如請求項1至18中任一項之抗體或抗原結合片段,其中Fc多肽或其片段包含: (i)   一突變,當與不包含該突變之一參考Fc多肽相比,其增強與一FcRn之結合;及/或 (ii)  一突變,當與不包含該突變之一參考Fc多肽相比,其增強與一FcγR之結合。
  21. 如請求項19之抗體或抗原結合片段,其中增強與一FcRn之結合之該突變包含:M428L、N434S、N434H、N434A、N434S、M252Y、S254T、T256E、T250Q、P257I、Q311I、D376V、T307A、E380A或其等之任何組合;M428L/N434S、S239D、I332E、A330L、G236A或其等任何組合;或者S239D/I332E、S239D/A330L/I332E、G236A/S239D/I332E或G236A/A330L/I332E。
  22. 一種抗體或其一抗原結合片段,其與如請求項1至20中任一項之抗體或抗原結合片段競爭結合至一乙型冠狀病毒表面醣蛋白。
  23. 如請求項1至21中任一項之抗體,其中該抗體包含在等同位置處經來自一對應UCA之一胺基酸予以取代的一野生型序列之至少一個胺基酸。
  24. 一種經分離的多核苷酸,其編碼如請求項1至22中任一項之抗體或抗原結合片段,或編碼該抗體或該抗原結合片段之一VH、一重鏈、一VL及/或一輕鏈。
  25. 如請求項23之多核苷酸,其中該多核苷酸包含去氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA),其中該RNA任擇地包含信使RNA (mRNA)。
  26. 如請求項23或24之多核苷酸,其經密碼子最佳化以於一宿主細胞中表現。
  27. 如請求項23至25中任一項之多核苷酸,其包含與根據SEQ ID NO: 34、35、44或45之多核苷酸序列具有至少50%一致性之一多核苷酸。
  28. 一種重組載體,其包含如請求項23至26中任一項之多核苷酸。
  29. 一種宿主細胞,其包含如請求項23至26中任一項之多核苷酸及/或如請求項27之載體,其中該多核苷酸對於該宿主細胞為異源的。
  30. 一種人類B細胞,其包含如請求項23至26中任一項之多核苷酸,其中多核苷酸對於該人類B細胞為異源的及/或其中該人類B細胞為永生化的。
  31. 一種組成物,其包含: (i)    如請求項1至22中任一項之抗體或抗原結合片段; (ii)   如請求項23至26中任一項之多核苷酸; (iii)  如請求項27之重組載體; (iv)  如請求項28之宿主細胞;及/或 (v)   如請求項29之人類B細胞, 及一醫藥學上可接受之賦形劑、載劑或稀釋劑。
  32. 如請求項30之組成物,其包含二種或更多種如請求項1至22中任一項之抗體或抗原結合片段。
  33. 一種組合,其包含: (i)   如請求項1至22中任一項之抗體或抗原結合片段;及 (ii)  一抗體或抗原結合片段,其能夠結合至一乙型冠狀病毒表面醣蛋白表位,該乙型冠狀病毒表面醣蛋白表位在莖螺旋外部,且任擇地包含於一受體結合區域(RBD)中。
  34. 一種組成物,其包含囊封於一載劑分子中之如請求項23至26中任一項之多核苷酸,其中該載劑分子任擇地包含一脂質、一脂質衍生之遞送媒劑,諸如一脂質體、一固體脂質奈米粒子、一油性懸浮液、一次微米級脂質乳液、一脂質微泡、一逆脂質微胞、一耳蝸脂質體、一脂質微管、一脂質微柱、脂質奈米粒子(LNP)或一奈米尺度平台。
  35. 一種治療一個體之一乙型冠狀病毒感染的方法,該方法包含向該個體投予一有效量之 (i)    如請求項1至22中任一項之抗體或抗原結合片段; (ii)   如請求項23至26中任一項之多核苷酸; (iii)  如請求項27之重組載體; (iv)  如請求項28之宿主細胞; (v)   如請求項29之人類B細胞; (vi)  如請求項30至21中任一項或請求項33之組成物;及/或 (vii) 如請求項32之組合。
  36. 如請求項34之方法,其包含投予一有效量之如請求項32之組合,其中投予一有效量之該組合包含投予一有效量之(i)之該抗體或抗原結合片段及任擇地同時或以一順序投予一有效量之(ii)之該多核苷酸。
  37. 如請求項1至22中任一項之抗體或抗原結合片段、如請求項23至26中任一項之多核苷酸、如請求項276之重組載體、如請求項28之宿主細胞、如請求項29之人類B細胞、如請求項30至31中任一項或請求項33之組成物及/或如請求項32之組合,其使於治療一個體之一乙型冠狀病毒感染的一方法中。
  38. 如請求項1至22中任一項之抗體或抗原結合片段、如請求項23至26中任一項之多核苷酸、如請求項276之重組載體、如請求項28之宿主細胞、如請求項29之人類B細胞、如請求項30至31中任一項或請求項33之組成物及/或如請求項32之組合,其使用於製備供治療一個體之一乙型冠狀病毒感染用的一藥劑中。
  39. 如請求項36或37之供使用的抗體、抗原結合片段、多核苷酸、重組載體、宿主細胞、人類B細胞、組成物及/或組合,其中該乙型冠狀病毒包含: (i)    SARS-CoV; (ii)   SARS-CoV-2; (iii)  MERS-CoV; (iv)  OC43; (v)   HKU1;或 (vi)  (i)-(iii)之任何組合。
  40. 如請求項36或37之供使用的抗體、抗原結合片段、多核苷酸、重組載體、宿主細胞、人類B細胞、組成物及/或組合,其中治療該乙型冠狀病毒之該方法包含投予一有效量之該抗體或抗原結合片段及任擇地同時或以一順序投予一有效量之該多核苷酸。
  41. 如請求項36或37之供使用的抗體、抗原結合片段、多核苷酸、重組載體、宿主細胞、人類B細胞、組成物及/或組合,其中所述使用包含在治療一個體中之一乙型冠狀病毒感染之一方法中之該抗體或抗原結合片段之一第一使用及該多核苷酸之一第二使用,該第一使用和第二使用係同時或按順序地進行。
  42. 一種用於活體外診斷一乙型冠狀病毒感染之方法,該方法包含: (i)   使來自一個體之一樣品與如請求項1至22中任一項之一抗體或抗原結合片段接觸;及 (ii)  偵測一複合物,其包含一抗原及該抗體,或包含一抗原及該抗原結合片段。
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