TW202015736A - 經腫瘤微環境活化之藥物-結合子共軛物及與其相關之用途 - Google Patents

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Abstract

本發明揭示在細胞外活化之結合子-藥物共軛物，其中該結合子與該游離藥物部分均具有藥理學活性。

Description

經腫瘤微環境活化之藥物-結合子共軛物及與其相關之用途
本發明係關於經腫瘤微環境活化之藥物-結合子共軛物及與其相關之用途的技術領域。
已知PD-1-PD-L1相互作用驅動T細胞功能異常，T細胞功能異常可藉由抗PD-1/PD-L1抗體來阻斷。然而，研究亦顯示PD-1-PD-L1軸線之功能受複雜免疫調節網影響。在大部分晚期癌症中，除霍奇金淋巴瘤(Hodgkin lymphoma)(其具有高PD-L1/L2表現)及黑色素瘤(其具有高腫瘤突變負荷)外，抗PD-1/PD-L1單一療法之客觀反應率僅僅約20%，且免疫相關毒性及過度進展可在PD-1/PD-L1阻斷療法期間在小批患者亞群中發生。在多達80%患者中缺乏功效不一定與陰性PD-1及PD-L1表現相關，此表明PD-1/PD-L1在免疫抑制中之作用及抗體作用機制仍然有待更好地定義。同樣，在CTLA-4及其他檢查點路徑下觀測到類似限制。因此，需要靶向PD-1/PD-L1、CTLA-4及其他檢查點網路內或外之重要協同免疫調節機制，以增加免疫檢查點阻斷療法之反應率，及在一些狀況下降低其毒性。
在此方面，咸信誘發先天性免疫反應之藥劑，諸如STING、RIG-I及TLR促效劑，能夠提高免疫腫瘤檢查點抑制劑之效力。然而，此等類型藥劑對於全身使用而言常常毒性過大，因為劑量限制毒性係整個體內先天性免疫活化之產物，且最大耐受劑量在許多患者中未實現治療劑量。
本發明係基於一種新系統，其尤其用於共同遞送此兩種類別之治療劑-在腫瘤中引發激起有效免疫反應之局部發炎事件的先天性免疫誘導劑與促進或維持適應性免疫反應之一或多種檢查點抑制劑或共刺激促效劑，該新系統係呈解決任一組分、尤其先天性免疫誘導劑之全身毒性問題，但保持其呈藥理學上非活性形式直至在腫瘤微環境中藉由蛋白酶釋放的格式。簡單而言，一種藥劑誘發抗腫瘤免疫反應，且另一藥劑確保當其到達腫瘤時發揮作用。檢查點抑制劑或共刺激促效劑連同TME酶釋放一起幫助藥物定位在腫瘤中且相對於個別組分藥物提高治療指數。
本發明之一個態樣係關於一種結合子-藥物共軛物，其包含： (i)    結合於處於疾病病況之組織中目標細胞上之細胞表面特徵的細胞結合部分，該細胞表面特徵當由結合子-藥物共軛物結合時進行緩慢內化； (ii)   對靠近目標細胞之旁觀者細胞具有藥理學作用的藥物部分，該藥物部分作為結合子-藥物共軛物之一部分時實現藥理學作用之EC50相對於自結合子-藥物共軛物釋放之游離藥物部分減弱至少2倍；以及 (iii)  將多肽結合子部分共價連接於藥物部分之連接部分，該連接部分包括藉由患病組織中胞外存在之酶可裂解的受質識別序列，其中在酶存在下連接部分可裂解且釋放游離藥物部分。
在某些實施例中，該藥物部分作為結合子-藥物共軛物之一部分時實現藥理學作用之EC50相對於自結合子-藥物共軛物釋放之游離藥物部分減弱至少5倍，且更佳地，減弱至少10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、75倍、100倍、250倍、500倍或甚至1000倍。
在某些實施例中，患病組織為腫瘤。在某些實施例中，目標細胞為腫瘤細胞。在某些實施例中，目標細胞為巨噬細胞、單核球衍生之抑制細胞(MDSC)、樹突狀細胞、纖維母細胞、T細胞、NK細胞、肥大細胞、粒細胞、嗜伊紅白血球及B細胞。
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物在與目標細胞上之表面特徵結合時具有至少6小時，更佳至少10小時、12小時、14小時、16小時、18小時、20小時、24小時、36小時、48小時、60小時、75小時或甚至100小時之內化半衰期。
在某些實施例中，細胞表面特徵為相對於來自健康狀態之組織的正常細胞，患病組織中由目標細胞選擇性表現或上調之蛋白質。舉例而言，蛋白質在目標細胞之表面上以比來自組織之正常細胞高2倍的水準，甚至更佳比來自組織之正常細胞高至少5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、75倍、100倍、250倍、500倍或甚至1000倍的水準可偵測。
在某些實施例中，細胞表面特徵為相對於來自其他組織之細胞、尤其來自關鍵器官之細胞，患病組織中由目標細胞選擇性表現或上調之蛋白質。舉例而言，蛋白質在目標細胞之表面上以比來自其他組織之細胞高2倍的水準，甚至更佳比來自其他組織之細胞高至少5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、75倍、100倍、250倍、500倍或甚至1000倍的水準可偵測。
在某些實施例中，細胞表面特徵為檢查點蛋白且結合子部分為檢查點之拮抗劑。檢查點蛋白之實例包括選自由以下組成之群的檢查點蛋白：CTLA-4、PD-1、LAG-3、BTLA、KIR、TIM-3、PD-L1、PD-L2、B7-H3、B7-H4、HVEM、GAL9、CD160、VISTA、BTNL2、TIGIT、PVR、BTN1A1、BTN2A2、BTN3A2及CSF-1R，更佳CTLA-4、PD-1、LAG-3、TIM-3、BTLA、VISTA、HVEM、TIGIT、PVR、PD-L1及CD160。
在某些實施例中，細胞表面特徵為共刺激受體且結合子部分為受體之共刺激促效劑。實例包括表面特徵為選自由以下組成之群的共刺激受體或配位體：4-1BB、4-1BB-L、OX40、OX40-L、GITR、CD28、CD40、CD40-L、ICOS、ICOS-L、LIGHT及CD27，更佳4-1BB、OX40、GITR、CD40及ICOS。
在某些實施例中，細胞結合部分為抗體，諸如人類化抗體、人類抗體或嵌合抗體，或包含結合細胞表面特徵之其抗原結合部分，諸如Fab、F(ab)2、F(ab')、F(ab')2、F(ab')3、Fd、Fv、二硫鍵連接之Fv、dAb或sdAb (或奈米抗體)、CDR、scFv、(scFv)2、二-scFv、雙-scFv、tascFv (串聯scFv)、AVIBODY (例如雙功能抗體、三功能抗體、四功能抗體)、T細胞接合分子(BiTE)、scFv-Fc、Fcab、mAb2、小模塊免疫藥物(small modular immunopharmaceutical，SMIP)、Genmab/單抗體或duobody、V-NAR結構域、IgNAR、微型抗體、IgGACH2、DVD-Ig、probody、胞內抗體或多特異性抗體。
在其他實施例中，結合子部分為諸如選自由以下組成之群的非抗體骨架：親和抗體、親和體、阿非林(Affilin)、抗運載蛋白、Atrimer、高親和性多聚體、達爾潘蛋白(DARPin)、FN3骨架(例如阿德奈汀(Adnectin)及辛替恩(Centyrin))、非諾莫(Fynomer)、孔尼茲結構域(Kunitz domain)、Nanofitin、Pronectin、OBodies、三功能抗體、高親和性多聚體、雙環肽及Cys結。
在某些實施例中，連接部分包括藉由患病組織中存在之相同或不同酶(至少一種存在於細胞外)可裂解的兩種、三種或甚至四種受質識別序列，其中在多種酶同時或相繼存在下連接部分可完全裂解以釋放游離藥物部分。舉例而言，可建立具有兩種不同受質識別序列之連接子，需要藉由MMP與FAPα裂解。在較佳實施例中，藉由兩種酶中之一者裂解需要首先發生藉由另一種酶裂解-亦即藉由建立在完整時作為FAPα不良受質且在發生MMP裂解之後改良成FAPα裂解之受質的連接子，可在FAPα裂解之前需要MMP裂解。
為進一步說明，結合子-藥物共軛物可由以下各式之一表示：
Figure 02_image007
其中 CBM表示每次出現可相同或不同之細胞結合部分； L1 表示間隔子或一鍵； SRS表示受質識別序列； L2 表示自我分解型連接子或一鍵； DM表示藥物部分； m表示整數1至6；且 n表示整數1至500，更佳1至100、1至10或1至5。
在某些實施例中，L1 為烴(直鏈或環狀)，諸如6-順丁烯二醯亞胺基己醯基、順丁烯二醯亞胺基丙醯基及順丁烯二醯亞胺基甲基環己烷-1-甲酸酯，或L1 為N-丁二醯亞胺基4-(2-吡啶基硫基)戊酸酯、N-丁二醯亞胺基4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸酯、N-丁二醯亞胺基(4-碘-乙醯基)胺基苯甲酸酯。
在某些實施例中，L1 為聚醚，諸如聚(乙二醇)或其他親水性連接子。舉例而言，在CBM包括硫醇(諸如半胱胺酸殘基)下，L1 可為經由順丁烯二醯亞胺部分與硫醇基偶合之聚(乙二醇)，諸如下式中所示：
Figure 02_image009
其中p表示整數1至100，較佳6至50，更佳6至12。
在其他實施例中，在CBM包括硫醇且L1 為經由順丁烯二醯亞胺部分與硫醇基偶合之烴部分下，L1 可如下式中所示：
Figure 02_image011
其中p表示整數1至20，較佳1至4。
在本發明之結合子-藥物共軛物之某些實施例中，受質識別序列藉由位於目標組織之細胞外域中，亦即作為細胞表面蛋白酶或分泌/釋放之蛋白酶的具有蛋白酶活性之細胞外蛋白酶，較佳絲胺酸蛋白酶、金屬蛋白酶或半胱胺酸蛋白酶裂解。
在某些實施例中，蛋白酶在患者中處於疾病病況之組織中在細胞外存在的水準比其在患者中處於健康狀態之組織中在細胞外存在的水準高至少5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、75倍、100倍、250倍、500倍或甚至1000倍。
在某些實施例中，蛋白酶在患者中處於疾病病況之組織中在細胞外存在的水準比患者之其他組織高至少5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、75倍、100倍、250倍、500倍或甚至1000倍。
在某些實施例中，蛋白酶為基質金屬蛋白酶。基質金屬蛋白酶可為膜結合之基質金屬蛋白酶(諸如MMP14-17及MMP24-25)或分泌之基質金屬蛋白酶(諸如MMP1-13及MMP18-23及MMP26-28)。在某些實施例中，金屬蛋白酶為MMP1、MMP2、MMP3、MMP4、MMP9、MMP11、MMP13、MMP14、MMP17或MMP19，且更佳為MMP2、MMP9或MMP14。
在某些實施例中，蛋白酶為A解整合素及金屬蛋白酶(ADAM)，或具有血小板反應蛋白模體之A解整合素或金屬蛋白酶(ADAMTS)。
在某些實施例中，蛋白酶為豆莢蛋白、間質蛋白酶(MT-SP1)、嗜中性白血球彈性蛋白酶、TMPRSS、凝血酶、u型纖維蛋白溶酶原活化因子(uPA，亦稱為尿激酶)、PSMA或CD10 (CALLA)。
在某些實施例中，蛋白酶為脯胺酸後裂解蛋白酶，諸如纖維母細胞活化蛋白α (FAPα)。
在主題結合子-藥物共軛物之某些實施例中，受質識別序列藉由纖維母細胞活化蛋白α (FAPα)裂解且由下式表示：
Figure 02_image013
其中 R2 表示H或(C1 -C6 )烷基，且較佳為H； R3 表示H或(C1 -C6 )烷基，較佳為甲基、乙基、丙基或異丙基，且更佳甲基； R4 不存在或表示(C1 -C6 )烷基、-OH、-NH2 或鹵素； X表示O或S；且 若L2 為自我分解型連接子，則-NH-表示作為L2 之部分的胺或若L2 為一鍵，則-NH-表示DM之部分。
在某些實施例中，在某些實施例中，R2 為H，R3 為甲基，R4 不存在且X為O。
在某些實施例中，L2 為選自由以下組成之群的自我分解型連接子：-NH-(CH2 )4 -C(=O)-、-NH-(CH2 )3 -C(=O)-、對胺基苄氧羰基(PABC)及2,4-雙(羥基甲基)苯胺。在某些實施例中，L2 為對胺基苄氧羰基(PABC)，尤其在主題識別序列藉由FAPα裂解之情況下，因為對胺基苄氧羰基(PABC)滿足P'1對FAPα之特殊要求。
在某些實施例中，游離藥物部分與細胞內目標相互作用且藥物部分之藥理學作用視游離藥物部分為細胞可滲透而定，亦即能夠與其細胞內目標相互作用，而當作為結合子-藥物共軛物之一部分時藥物部分實質上不可滲透細胞。舉例而言，結合子-藥物共軛物在細胞內之累積速率小於游離藥物部分之速率的50%，更佳小於游離藥物部分之速率的25%、10%、5%、1%或甚至小於0.1%。舉例而言，游離藥物部分之藥理學作用的EC50比結合子-藥物共軛物小(有效)至少2倍，更佳至少5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、100倍、250倍、500倍或甚至1000倍。
在某些實施例中，游離藥物部分與細胞外目標相互作用且當共價連接至L1 時藥物部分之藥理學作用實質上減弱。舉例而言，游離藥物部分之藥理學作用的EC50比結合子-藥物共軛物小(有效)至少2倍，更佳至少5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、100倍、250倍、500倍或甚至1000倍。
在某些實施例中，當全身遞送時結合子藥物共軛物之治療指數比游離藥物部分之全身傳遞大至少2倍，且甚至更佳比游離藥物部分之全身傳遞大至少5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、100倍、250倍、500倍或甚至1000倍。
在某些實施例中，游離藥物部分為免疫調節劑，其包括充當免疫活化劑及/或先天性免疫路徑反應誘導劑之藥物部分。在某些實施例中，游離藥物部分誘發IFN-α之產生。在某些實施例中，游離藥物部分誘發促炎性細胞介素之產生。在某些實施例中，游離藥物部分誘發IL-1β之產生。在某些實施例中，游離藥物部分誘發IL-18之產生。
在某些實施例中，游離藥物部分促進包括NK、γδ T及CD8+ T細胞之擴增及存活。
在某些實施例中，游離藥物部分為抑制DPP8及DPP9之酶活性且誘導活體外及/或活體內巨噬細胞細胞焦亡的免疫-DASH抑制劑。
在某些實施例中，游離藥物部分為損傷相關分子模式分子。在某些實施例中，游離藥物部分為病原體相關分子模式分子。
在某些實施例中，游離藥物部分為STING促效劑。
在某些實施例中，游離藥物部分為RIG-1促效劑。
在某些實施例中，游離藥物部分為類鐸受體(TLR)促效劑，諸如選自由TLR1/2促效劑、TLR2促效劑、TLR3促效劑、TLR4促效劑、TLR5促效劑、TLR6/2促效劑、TLR7促效劑、TLR7/8促效劑、TLR7/9促效劑、TLR8促效劑、TLR9促效劑及TLR11促效劑組成之群，較佳選自由TLR3促效劑、TLR7促效劑、TLR7/8促效劑及TLR9促效劑組成之群。
在某些實施例中，游離藥物部分為環二核苷酸。
在某些實施例中，游離藥物部分為ADU-S100。
在某些實施例中，游離藥物部分為RIG-I促效劑，其中該RIG-I促效劑為KIN700、KIN1148、KIN600、KIN500、KIN100、KIN101、KIN400、KIN2000或SB-9200。
在某些實施例中，游離藥物部分係選自由以下各者組成之群：S-27609、CL307、UC-IV150、咪喹莫特(imiquimod)、嘎德莫特(gardiquimod)、雷西莫特(resiquimod)、莫托莫特(motolimod)、VTS-1463GS-9620、GSK2245035、TMX-101、TMX-201、TMX-202、艾沙托立賓(isatoribine)、AZD8848、MEDI9197、3M-051、3M-852、3M-052、3M-854A、S-34240、KU34B或CL663。
在某些實施例中，游離藥物部分對癌症相關纖維母細胞(CAF)具有細胞毒性。
在某些實施例中，游離藥物部分使腫瘤相關巨噬細胞群體偏向M1巨噬細胞及/或抑制M2巨噬細胞之免疫抑制活性。
在某些實施例中，游離藥物部分加速T細胞激活及/或樹突狀細胞遷移。
在某些實施例中，游離藥物部分諸如藉由阻斷免疫抑制功能或遷移至淋巴結及/或腫瘤微環境而抑制或耗竭Treg細胞。
在某些實施例中，其中當全身給與時結合子-藥物共軛物之治療指數(TI)比游離藥物部分之治療指數大至少5倍，更佳大至少10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、75倍或甚至100倍。
在某些實施例中，游離藥物部分為低分子抑制劑，亦即分子量小於5000 amu、較佳小於2500 amu且甚至更佳小於1500 amu。
本發明之另一態樣提供一種結合子-藥物共軛物，其包含包括結合於腫瘤中細胞上之細胞表面蛋白的一或多個小結構域結合多肽序列(諸如抗體片段或非抗體骨架)、較佳一或多個親和體序列且附接一或多個藥物-共軛物部分的多肽，該等藥物-共軛物部分如以下各式所示：
Figure 02_image015
其中 L1 表示間隔子或一鍵； SRS表示在腫瘤細胞外空間中表現之細胞外蛋白酶的受質識別序列； L2 表示自我分解型連接子或一鍵； DM表示藥物部分； m表示整數1至6，較佳1、2或3；且 n表示整數1至500，更佳1至100、1至10或1至5。
結合子-藥物共軛物在與目標細胞上之表面特徵結合時具有至少6小時，更佳至少10小時、12小時、14小時、16小時、18小時、20小時、24小時、36小時、48小時、60小時、75小時或甚至100小時之內化半衰期。
在某些實施例中，至少一種小結構域結合多肽序列為PD-L1結合部分。
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物之多肽以1×10-6 M或更低之Kd (且更佳地以1×10-7 M、1×10-8 M、1×10-9 M、1×10-10 M或甚至1×10-11 M或更低之Kd，尤其在其中對於PD-L1結合而言多肽為二價或更高階多價之實施例中)結合於PD-L1，且抑制其結合之PD-L1與PD-1的相互作用。
本發明之另一態樣提供一種多特異性結合子-藥物共軛物，其包含 (i)    多肽，其包括選擇性結合於腫瘤中兩種不同細胞類型上之兩種不同細胞表面蛋白的兩個或更多個不同結合域多肽序列，及 (ii)   附接於該多肽之一或多個藥物-共軛物部分，該藥物-共軛物部分如以下各式所示：
Figure 02_image017
其中 L1 表示間隔子或一鍵； SRS表示在腫瘤細胞外空間中表現之細胞外蛋白酶的受質識別序列； L2 表示自我分解型連接子或一鍵； DM表示藥物部分； m表示整數1至6，較佳1、2或3；且 n表示整數1至500，更佳1至100、1至10或1至5。
多特異性結合子-藥物共軛物在與表面蛋白中之任一者結合時具有至少6小時，更佳至少10小時、12小時、14小時、16小時、18小時、20小時、24小時、36小時、48小時、60小時、75小時或甚至100小時之內化半衰期。
在多特異性結合子-藥物共軛物之某些實施例中，多肽包括選擇性結合於腫瘤細胞抗原之第一結合域多肽序列及選擇性結合於選自由以下組成之群之細胞的第二結合域多肽序列：巨噬細胞、單核球衍生抑制細胞(MDSC)、樹突狀細胞、纖維母細胞、NK細胞、肥大細胞、粒細胞、嗜伊紅白血球及B細胞。
在多特異性結合子-藥物共軛物之某些實施例中，多肽包括作為檢查點抑制劑或共刺激促效劑且結合於在腫瘤浸潤性淋巴細胞上表現之檢查點蛋白或共刺激受體蛋白(諸如在檢查點之情況下LAG-3、TIM-3、TIGIT、PD-1、BTLA或CTLA-4，及在共刺激蛋白之情況下CD28、ICOS、OX40、GITR、CD137或CD27)的第一結合域多肽序列及作為檢查點抑制劑之結合於在腫瘤細胞上表現之檢查點(諸如PD-L1、PD-L2、CD80、CD86、B7-H3、B7-H4、CD155、HVEM或半乳糖凝集素-9)的第二結合域多肽序列。
本發明之另一態樣係關於一種組合PD-L1抑制劑/先天性免疫刺激劑，其包含結合PD-L1之多肽及作為先天性免疫反應之無菌誘導劑(諸如免疫-DASH抑制劑、STING促效劑、TRL7/8促效劑或RIG-1促效劑)的與其共軛之藥物部分，其中相對於患者之其他組織，該結合PD-L1之多肽引起PD-L1抑制劑/先天性刺激劑累積在腫瘤中，且其中相對於患者之其他組織，該藥物部分在腫瘤微環境中自該結合PD-L1之多肽選擇性釋放。
在本發明之藥物-共軛物之某些實施例中，分子包括PD-L1結合部分，其為以1×10-6 M或更低之Kd (且更佳地1×10-7 M、1×10-8 M、1×10-9 M、1×10-10 M或更低之Kd)結合於PD-L1且抑制其結合之PD-L1與PD-1的相互作用之親和體多肽序列。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽結合人類PD-L1且阻斷與人類PD-1之相互作用。在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽以1×10-7 M或更低之Kd、1×10-8 M或更低之Kd、1×10-9 M或更低之Kd或甚至1×10-10 M或更低之Kd結合PD-L1。在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽以10-3 s-1 或更慢、10-4 s-1 或更慢或甚至10-5 s-1 或更慢之Koff 結合PD-L1。在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽以103 M-1 s-1 或更快、104 M-1 s-1 或更快、105 M-1 s-1 或更快或甚至106 M-1 s-1 或更快之Kon 結合PD-L1。在某些實施例中，在用人類PD-1進行之競爭性結合分析法中，結合PD-L1之親和體多肽以1 μM或更低、100 nM或更低、40 nM或更低、20 nM或更低、10 nM或更低、1 nM或更低或甚至0.1 nM或更低之IC50結合PD-L1。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽具有65℃或更高及70℃或更高、75℃或更高、80℃或更高或85℃或更高之Tm。在某些實施例中，蛋白質具有65℃或更高及70℃或更高、75℃或更高、80℃或更高或85℃或更高之Tm。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽具有通式(I)中表示之胺基酸序列： FR1-(Xaa)n -FR2-(Xaa)m -FR3(I) 其中 FR1為由MIPGGLSEAK PATPEIQEIV DKVKPQLEEK TNETYGKLEA VQYKTQVLA(SEQ ID No. 1) 表示之多肽序列或與其具有至少70%同源性之多肽序列； FR2為由GTNYYIKVRA GDNKYMHLKV FKSL(SEQ ID No. 2) 表示之多肽序列或與其具有至少70%同源性之多肽序列； FR3為由EDLVLTGYQV DKNKDDELTG F(SEQ ID No. 3) 表示之多肽序列或與其具有至少70%同源性之多肽序列；且 Xaa每次出現時個別地為胺基酸殘基；且 n及m各獨立地為整數3至20。
對於某些實施例，FR1可為與SEQ ID No. 1具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%同源性之多肽序列。對於某些實施例，FR2為與SEQ ID No. 2具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%同源性之多肽序列。對於某些實施例，FR3為與SEQ ID No. 2具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%同源性之多肽序列。
對於至少一個藥物-共軛物部分經由引入親和體序列中之半胱胺酸之硫醇側鏈附接於親和體序列的彼等實施例，半胱胺酸將較佳提供於與FR1、FR2及/或FR3對應之親和體序列區域之部分中，且更佳地置換親和體中側鏈為溶劑可接近且與親和體之其他部分的氫鍵鍵結無關的胺基酸殘基。一般而言，半胱胺酸將不引入環(Xaa)n 或(Xaa)m 中。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽具有以下通式中表示之胺基酸序列： MIP-Xaa1-GLSEAKPATPEIQEIVDKVKPQLEEKTNETYGKLEAVQYKTQVLA-(Xaa)n -Xaa2-TNYYIKVRAGDNKYMHLKVF-Xaa3-Xaa4-Xaa5-(Xaa)m -Xaa6-D-Xaa7-VLTGYQVDKNKDDELTGF(SEQ ID No. 4) 其中 Xaa每次出現時個別地為胺基酸殘基； n及m各獨立地為整數3至20； Xaa1為Gly、Ala、Val、Arg、Lys、Asp或Glu； Xaa2為Gly、Ala、Val、Ser或Thr； Xaa3為Arg、Lys、Asn、Gln、Ser或Thr； Xaa4為Gly、Ala、Val、Ser或Thr； Xaa5為Ala、Val、Ile、Leu、Gly或Pro； Xaa6為Gly、Ala、Val、Asp或Glu；且 Xaa7為Ala、Val、Ile、Leu、Arg或Lys。
對於某些實施例，Xaa1為Gly、Ala、Arg或Lys，甚至更佳地Gly或Arg。對於某些實施例，Xaa2為Gly或Ser。對於某些實施例，Xaa3為Arg Arg、Lys、Asn或Gln，更佳地Lys或Asn。對於某些實施例，Xaa4為Gly或Ser。對於某些實施例，Xaa5為Ala、Val、Ile、Leu、Gly或Pro，更佳地Ile、Leu或Pro，且甚至更佳地Leu或Pro。對於某些實施例，Xaa6為Ala、Val、Asp或Glu，甚至更佳地Ala或Glu。對於某些實施例，Xaa7為Ile、Leu或Arg，更佳地Leu或Arg。
對於其中至少一個藥物-共軛物部分經由引入親和體序列中之半胱胺酸的硫醇側鏈附接於親和體序列的彼等實施例，半胱胺酸將較佳提供於除環序列(Xaa)n 或(Xaa)m 外之親和體序列部分中。因此，SEQ ID No. 4可包括1至5個半胱胺酸代替在該序列之變化位置處之胺基酸殘基。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽具有以下通式中表示之胺基酸序列： MIPRGLSEAKPATPEIQEIVDKVKPQLEEKTNETYGKLEAVQYKTQVLA-(Xaa)n -STNYYIKVRAGDNKYMHLKVFNGP-(Xaa)m -ADRVLTGYQVDKNKDDELTGF(SEQ ID No. 5) 其中Xaa每次出現時個別地為胺基酸殘基；且n及m各獨立地為整數3至20。
對於其中至少一個藥物-共軛物部分經由引入親和體序列中之半胱胺酸的硫醇側鏈附接於親和體序列的彼等實施例，半胱胺酸將較佳提供於除環序列(Xaa)n 或(Xaa)m 外之親和體序列部分中。因此，SEQ ID No. 5可包括1至5個半胱胺酸代替在該序列之變化位置處之胺基酸殘基。
在以上序列之某些實施例中，(Xaa)n (「環2」)為通式(II)中表示之胺基酸序列： -aa1-aa2-aa3-Gly-Pro-aa4-aa5-Trp-aa6-(II) 其中 aa1表示具有鹼性側鏈之胺基酸殘基； aa2表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈，更佳小型脂族側鏈、中性極性側鏈或鹼性或酸性側鏈之胺基酸殘基； aa3表示具有芳族或鹼性側鏈之胺基酸殘基； aa4表示具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈，較佳中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈之胺基酸殘基； aa5表示具有中性極性或帶電(酸性或鹼性)或小型脂族或芳族側鏈，較佳中性極性側鏈或帶電側鏈之胺基酸殘基；及 aa6表示具有芳族或酸性側鏈之胺基酸殘基。
對於某些實施例，aa1表示Lys、Arg或His，更佳Lys或Arg。對於某些實施例，aa2表示Ala、Pro、Ile、Gln、Thr、Asp、Glu、Lys、Arg或His，更佳Ala、Gln、Asp或Glu。對於某些實施例，aa3表示Phe、Tyr、Trp、Lys、Arg或His，較佳Phe、Tyr、Trp，更佳His或Tyr、Trp或His。對於某些實施例，aa4表示Ala、Pro、Ile、Gln、Thr、Asp、Glu、Lys、Arg或His，更佳Gln、Lys、Arg、His、Asp或Glu。對於某些實施例，aa5表示Ser、Thr、Asn、Gln、Asp、Glu、Arg或His，更佳Ser、Asn、Gln、Asp、Glu或Arg。對於某些實施例，aa6表示Phe、Tyr、Trp、Asp或Glu；較佳Trp或Asp；更佳Trp。
在以上序列之某些其他實施例中，(Xaa)n (「環2」)為通式(III)中表示之胺基酸序列： -aa1-aa2-aa3-Phe-Pro-aa4-aa5-Phe-Trp-(III) 其中 aa1表示具有鹼性側鏈或芳族側鏈之胺基酸殘基； aa2表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈，更佳小型脂族側鏈、中性極性側鏈或鹼性或酸性側鏈之胺基酸殘基； aa3表示具有芳族或鹼性側鏈之胺基酸殘基，較佳為Phe、Tyr、Trp、Lys、Arg或His，更佳為Phe、Tyr、Trp或His，且甚至更佳為Tyr、Trp或His； aa4表示具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈，較佳中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈之胺基酸殘基；更佳為Ala、Pro、Ile、Gln、Thr、Asp、Glu、Lys、Arg或His，且甚至更佳為Gln、Lys、Arg、His、Asp或Glu；及 aa5表示具有中性極性或帶電(酸性或鹼性)或小型脂族或芳族側鏈，較佳中性極性側鏈或帶電側鏈之胺基酸殘基；更佳為Ser、Thr、Asn、Gln、Asp、Glu、Arg或His，且甚至更佳為Ser、Asn、Gln、Asp、Glu或Arg。
對於某些實施例，aa1表示Lys、Arg、His、Ser、Thr、Asn或Gln，更佳Lys、Arg、His、Asn或Gln，且甚至更佳Lys或Asn。對於某些實施例，aa2表示Ala、Pro、Ile、Gln、Thr、Asp、Glu、Lys、Arg或His，更佳Ala、Gln、Asp或Glu。對於某些實施例，aa3表示Phe、Tyr、Trp、Lys、Arg或His，更佳Phe、Tyr、Trp或His，且甚至更佳Tyr、Trp或His。對於某些實施例，aa4表示Ala、Pro、Ile、Gln、Thr、Asp、Glu、Lys、Arg或His，且甚至更佳Gln、Lys、Arg、His、Asp或Glu。對於某些實施例，aa5表示Ser、Thr、Asn、Gln、Asp、Glu、Arg或His，且甚至更佳Ser、Asn、Gln、Asp、Glu或Arg。
在以上序列之某些實施例中，(Xaa)n (「環2」)為選自SEQ ID No.6至40之胺基酸序列或與其具有至少80%同源性之胺基酸序列，且更佳為與其具有至少85%、90%、95%或甚至98%同源性之胺基酸序列。
在以上序列之某些實施例中，(Xaa)n (「環2」)為選自SEQ ID No.6至40之胺基酸序列或與其具有至少80%一致性之胺基酸序列，且更佳為與其具有至少85%、90%、95%或甚至98%一致性之胺基酸序列。
在以上序列之某些實施例中，(Xaa)m (「環4」)為通式(IV)中表示之胺基酸序列： -aa7-aa8-aa9-aa10-aa11-aa12-aa13-aa14-aa15-(IV) 其中 aa7表示具有中性極性或非極性側鏈或酸性側鏈之胺基酸殘基； aa8表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或芳族側鏈，更佳帶電(鹼性或酸性)側鏈之胺基酸殘基； aa9表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或芳族側鏈，更佳中性極性側鏈或酸性側鏈之胺基酸殘基； aa10表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或芳族側鏈，更佳中性極性側鏈或鹼性或酸性側鏈之胺基酸殘基； aa11表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或非極性脂族側鏈或芳族側鏈，更佳中性極性側鏈或鹼性或酸性側鏈之胺基酸殘基； aa12表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或非極性脂族側鏈或芳族側鏈，更佳酸性側鏈之胺基酸殘基； aa13表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或非極性脂族側鏈或芳族側鏈，更佳酸性側鏈之胺基酸殘基； aa14表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈之胺基酸殘基；及 aa15表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或中性非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈之胺基酸殘基。
對於某些實施例，aa7表示Gly、Ala、Val、Pro、Trp、Gln、Ser、Asp或Glu，且甚至更佳Gly、Ala、Trp、Gln、Ser、Asp或Glu。對於某些實施例，aa8表示Asp、Glu、Lys、Arg、His、Gln、Ser、Thr、Asn、Ala、Val、Pro、Gly、Tyr或Phe，且甚至更佳Asp、Glu、Lys、Arg、His或Gln。對於某些實施例，aa9表示Gln、Ser、Thr、Asn、Asp、Glu、Arg、Lys、Gly、Leu、Pro或Tyr，且甚至更佳Gln、Thr或Asp。對於某些實施例，aa10表示Asp、Glu、Arg、His、Lys、Ser、Gln、Asn、Ala、Leu、Tyr、Trp、Pro或Gly，且甚至更佳Asp、Glu、His、Gln、Asn、Leu、Trp或Gly。對於某些實施例，aa11表示Asp、Glu、Ser、Thr、Gln、Arg、Lys、His、Val、Ile、Tyr或Gly且甚至更佳Asp、Glu、Ser、Thr、Gln、Lys或His。對於某些實施例，aa12表示Asp、Glu、Ser、Thr、Gln、Asn、Lys、Arg、Val、Leu、Ile、Trp、Tyr、Phe或Gly且甚至更佳Asp、Glu、Ser、Tyr、Trp、Arg或Lys。對於某些實施例，aa13表示Ser、Thr、Gln、Asn、Val、Ile、Leu、Gly、Pro、Asp、Glu、His、Arg、Trp、Tyr或Phe且甚至更佳Ser、Thr、Gln、Asn、Val、Ile、Leu、Gly、Asp或Glu。對於某些實施例，aa14表示Ala、Ile、Trp、Pro、Asp、Glu、Arg、Lys、His、Ser、Thr、Gln或Asn且甚至更佳Ala、Pro、Asp、Glu、Arg、Lys、Ser、Gln或Asn。對於某些實施例，aa15表示His、Arg、Lys、Asp、Ser、Thr、Gln、Asn、Ala、Val、Leu、Gly或Phe且甚至更佳His、Arg、Lys、Asp、Ser、Thr、Gln或Asn。
在以上序列之某些實施例中，(Xaa)n (「環4」)為選自SEQ ID No. 41至75之胺基酸序列或與其具有至少80%同源性之胺基酸序列，且更佳為與其具有至少85%、90%、95%或甚至98%同源性之胺基酸序列。
在以上序列之某些實施例中，(Xaa)n (「環4」)為選自SEQ ID No. 41至75之胺基酸序列或與其具有至少80%一致性之胺基酸序列，且更佳為與其具有至少85%、90%、95%或甚至98%一致性之胺基酸序列。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽具有選自SEQ ID No. 76至84之胺基酸序列，或與其具有至少70%同源性，且甚至更佳與其具有至少75%、80%、85%、90%、95%或甚至98%同源性之胺基酸序列。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽具有選自SEQ ID No. 76至84之胺基酸序列，或與其具有至少70%一致性，且甚至更佳與其具有至少75%、80%、85%、90%、95%或甚至98%一致性之胺基酸序列。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽具有可由如下核酸編碼之胺基酸序列，該核酸具有對應於SEQ ID No. 85至92中之一者之核苷酸1-336之編碼序列，或與其至少70%一致之編碼序列，且甚至更佳與其具有至少75%、80%、85%、90%、95%或甚至98%一致性之編碼序列。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽具有可由具有在45℃下之6X氯化鈉/檸檬酸鈉(SSC)，接著在65℃下在0.2X SSC中洗滌之嚴格條件下與SEQ ID No. 85至92中之任一者雜交的編碼序列之核酸編碼之胺基酸序列。
在某些實施例中，本文所述之結合PD-L1之親和體以與抗PD-L1抗體阿特珠單抗(Atezolizumab)、阿維魯單抗(Avelumab)及/或德瓦魯單抗(Durvalumab)競爭結合PD-L1之方式結合PD-L1。
在某些實施例中，該結合PD-L1之親和體多肽與PD-L1形成晶體結構，該晶體結構包含涉及至少10個選自以下之PD-L1之殘基的界面：Ile-54、Tyr-56、Glu-58、Glu-60、Asp-61、Lys-62、Asn-63、Gln 66、Val-68、Val-76、Val-111、Arg-113、Met-115、Ile-116、Ser-117、Gly-120、Ala-121、Asp-122、Tyr-123及Arg-125。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽與PD-L1之結合(a)在混合淋巴細胞反應(MLR)分析法中增加T細胞增殖；(b)在MLR分析法中增加干擾素-γ產生；及/或(c)在MLR分析法中增加介白素-2 (IL-2)分泌。
在某些實施例中，本發明之結合子-藥物共軛物為融合蛋白，其除結合PD-L1之親和體多肽或其他目標結合部分之外，亦可包括例如一或多個選自由以下組成之群的其他胺基酸序列：分泌信號序列、肽連接子序列、親和標籤、跨膜結構域、細胞表面保留序列、用於轉譯後修飾之受質識別序列、產生經由蛋白質-蛋白質相互作用聚集之蛋白質多聚結構的多聚結構域、延長半衰期之多肽部分、用於改變抗體之組織定位及抗原結合位點之多肽序列及一或多個結合於其他及不同目標之其他親和體多肽序列。
在某些實施例中，融合蛋白包括延長半衰期之多肽部分，諸如選自由以下組成之群：Fc結構域或其一部分、白蛋白或其一部分、結合白蛋白之多肽部分、運鐵蛋白或其一部分、結合運鐵蛋白之多肽部分、纖網蛋白或其一部分或結合纖網蛋白之多肽部分。
在融合蛋白包括Fc結構域或其一部分之情況下，在某些實施例中，其為保留FcN結合之Fc結構域。
當融合蛋白包括Fc結構域或其一部分時，在某些實施例中，該Fc結構域或其一部分係來自IgA、IgD、IgE、IgG及IgM或其子類別(同型)，諸如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1或IgA2。
在某些實施例中，融合蛋白具有SEQ ID No. 108或SEQ ID No. 109之胺基酸序列，或與其具有至少70%同源性且甚至更佳與其具有至少75%、80%、85%、90%、95%或甚至98%一致性之序列。
在融合蛋白包括Fc結構域或其一部分之情況下，在某些實施例中，Fc結構域或其一部分保留選自C1q結合、補體依賴性細胞毒性(CDC)、抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)、吞噬作用、下調B細胞受體或其組合之效應功能。
在某些實施例中，在融合蛋白包括延長半衰期之多肽部分的情況下，相對於該蛋白質不存在其時，該部分使蛋白質之血清半衰期增加至少5倍，更佳10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍、100倍、200倍、500倍或甚至1000倍。
在某些實施例中，本發明之融合蛋白呈適合於在人類患者中治療性使用之醫藥製劑提供，該醫藥製劑進一步包含一或多種醫藥學上可接受之賦形劑、緩衝劑、鹽或其類似物。
本發明之另一態樣係關於適合於在人類患者中治療性使用之醫藥製劑，其包含(i)本文所述之結合子-藥物共軛物或組合PD-L1抑制劑/先天性免疫刺激劑，及(ii)一或多種醫藥學上可接受之賦形劑、緩衝劑、鹽或其類似物。
在本發明之藥物-共軛物之某些實施例中，游離藥物部分為免疫-DASH抑制劑。在某些實施例中，免疫-DASH抑制劑在人類巨噬細胞中抑制DPP8及DPP9之活體外細胞內IC50小於200 nM。在某些實施例中，抑制DPP8及/或DPP9(及較佳DPP8與DPP9)之活體外無細胞IC50小於100 nM、10 nM、1.0 nM、0.1 nM、0.01 nM或甚至0.001 nM。在某些實施例中，抑制DPP8及/或DPP9 (及較佳DPP8與DPP9)之EnPlex IC50小於100 nM、10 nM、1.0 nM、0.1 nM、0.01 nM、0.001 nM (1皮莫耳)或甚至0.0001 nM (100飛莫耳)。在某些實施例中，抑制DPP8及/或DPP9 (及較佳DPP8與DPP9)之Ki小於100 nM、10 nM、1.0 nM、0.1 nM、0.01 nM、0.001 nM (1皮莫耳)或甚至0.0001 nM (100飛莫耳)。
在某些實施例中，主題免疫-DASH抑制劑在作為有效抗腫瘤劑之藥物之濃度範圍內亦抑制纖維母細胞活化蛋白(FAP)。舉例而言，免疫-DASH抑制劑抑制FAP之Ki可小於100 nM、10 nM、1.0 nM、0.1 nM、0.01 nM、0.001 nM (1皮莫耳)或甚至0.0001 nM (100飛莫耳)。
在某些實施例中，主題免疫-DASH抑制劑以比誘導人類巨噬細胞之細胞焦亡之IC50高至少2倍，更佳高至少3倍、4倍、5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍或甚至至少100倍的IC50抑制人類纖維母細胞活化蛋白(FAP)，亦即免疫-DASH為比抑制FAP有效之細胞焦亡誘導劑。
在某些實施例中，免疫-DASH抑制劑展現緩慢結合抑制動力學。在某些實施例中，免疫-DASH抑制劑與DPP4相互作用之koff速率小於1×10-4/sec，且較佳小於5×10-5/sec、3×10-5/sec或甚至小於1×10-5/sec。
在某些實施例中，免疫-DASH抑制劑呈結合子-藥物共軛物以足以降低腫瘤相關巨噬細胞之數目的量投與患者。
在某些實施例中，免疫-DASH抑制劑呈結合子-藥物共軛物以足以減少腫瘤中單核球性骨髓衍生之抑制細胞的量投與患者。
在某些實施例中，免疫-DASH抑制劑呈結合子-藥物共軛物以足以降低腫瘤中顆粒球性骨髓衍生之抑制細胞的T細胞抑制活性的量投與患者。
在某些實施例中，免疫-DASH抑制劑呈結合子-藥物共軛物以在治療有效量下使腫瘤完全消退之量投與患者，且治療有效量小於結合子-藥物共軛物之最大耐受劑量。
在某些實施例中，免疫-DASH抑制劑呈單獨或與PGE2抑制劑、諸如cPLA-2抑制劑組合之結合子-藥物共軛物投與患者。
在某些實施例中，免疫-DASH抑制劑呈單獨或與DPP4抑制劑、諸如西他列汀(sitagliptin)、維格列汀(vildagliptin)、沙格列汀(saxagliptin)、利格列汀(linagliptin)及阿格列汀(alogliptin)組合之結合子-藥物共軛物投與患者。
相關申請案
本申請案主張2018年6月4日申請之美國臨時專利申請案第62/680,300號之優先權益。 I.概述
本發明之一個態樣係關於一種結合子-藥物共軛物，其包含： (i)    結合於處於疾病病況之組織中目標細胞上之細胞表面特徵的細胞結合部分，該細胞表面特徵當由結合子-藥物共軛物結合時進行緩慢內化； (ii)   對靠近目標細胞之旁觀者細胞具有藥理學作用的藥物部分，該藥物部分作為結合子-藥物共軛物之一部分時實現藥理學作用之EC50相對於自結合子-藥物共軛物釋放之游離藥物部分減弱至少2倍；以及 (iii)  將多肽結合子部分共價連接於藥物部分之連接部分，該連接部分包括藉由患病組織中胞外存在之酶可裂解的受質識別序列，其中在酶存在下連接部分可裂解且釋放游離藥物部分。 II.定義
為促進對本發明之理解，下文定義多個術語及短語。 a.  親和體
術語「Stefin多肽」係指胱抑素超家族中蛋白質之一子群，胱抑素超家族為涵蓋含有多個胱抑素樣序列之蛋白質之家族。
胱抑素家族之Stefin子群為相對較小(約100個胺基酸)之單結構域蛋白質。其未接受已知之轉譯後修飾且不含二硫鍵，此表明其將能夠在廣泛範圍之細胞外及細胞內環境中相同地摺疊。Stefin A本身為具有98個胺基酸之單體、單鏈、單結構域蛋白質。已解析Stefin A之結構，此促進Stefin A合理突變成親和體骨架。胱抑素之唯一已知之生物活性為抑制組織蛋白酶活性，其使得吾人能夠詳盡地測試經工程改造之蛋白質之殘餘生物活性。
術語「親和體」(或「親和體骨架」或「親和體多肽」)係指作為Stefin多肽之以重組方式工程改造之變異體的高度穩定之小型蛋白。親和體蛋白顯示兩個肽環及N端序列，其皆可隨機化成以與單株抗體類似之方式，以高親和力及特異性結合於所需目標蛋白。Stefin蛋白質骨架對兩種肽之穩定化可限制肽可採取之可能構形，與游離肽之文庫相比增加結合親和力及特異性。此等經工程改造之非抗體結合蛋白經設計以模擬不同應用中單株抗體之分子識別特徵。Stefin多肽序列之其他部分可進行變異，其中此類變異改善此等親和力試劑之特性，諸如增加穩定性，使其在一系列溫度及pH值以及其類似條件下穩定。較佳地，親和體包括來源於Stefin A之序列，與Stefin A野生型序列(諸如人類Stefin A)共有實質一致性。熟習此項技術者將顯而易見，可在不偏離本發明之情況下對骨架序列進行修飾。詳言之，親和體骨架可具有與人類Stefin A之相應序列至少25%、35%、45%、55%或60%一致之胺基酸序列，較佳至少70%、較佳至少80%、較佳至少85%、較佳至少90%、較佳至少92%、較佳至少94%、較佳至少95%一致，例如其中序列變異不會不利地影響骨架結合於所需目標(諸如PD-L1)之能力，及例如不會恢復或產生生物學功能，諸如由野生型Stefin A所具有，但在本文中所描述之突變變化中消除之功能。
「結合子-藥物共軛物」係指一種多肽，其包括親和體多肽序列且具有任何其他修飾(例如共軛、轉譯後修飾等)，以便呈現意欲用於遞送至患者之治療活性蛋白質。
「計劃性死亡配位體1」亦稱為「PD-L1」、「分化簇274」、「CD274」、「B7同源物1」或「B7-H1」，係指在人類之情況下由CD274基因編碼之蛋白質。人類PD-L1為40 kDa 1型跨膜蛋白，其在不同情形下在抑制免疫系統中起主要作用。代表性人類PD-L1序列由UniProtKB主要寄存編號Q9NZQ7提供，且將包括該序列之其他人類同功異型物。PD-L1結合於在經活化T細胞、B細胞及骨髓細胞上發現之其受體PD-1以調節活化或抑制。PD-L1亦對共刺激性分子CD80 (B7-1)具有顯著親和力。PD-L1與T細胞上其受體PD-1 (「計劃性細胞死亡蛋白1」或「CD279」)之接合遞送一種信號，該信號抑制TCR介導之IL-2產生及T細胞增殖之活化。在此方面，PD-L1視為檢查點，且其在腫瘤中之表現上調有助於抑制T細胞介導之抗腫瘤反應。儘管將通常在提及來自各種哺乳動物物種之PD-L1時使用PD-L1，但應理解，本申請案通篇，任何對PD-L1之提及皆包括人類PD-L1且較佳係指人類PD-L1本身。
「PD-L1結合子-藥物共軛物」係指具有至少一種以至少10-6 M之解離常數(Kd)結合於PD-L1、尤其人類PD-L1的親和體多肽的結合子-藥物共軛物。 b.  多肽
術語「多肽」及「肽」及「蛋白質」在本文中可互換使用，且係指任何長度之胺基酸之聚合物。聚合物可為直鏈或分支鏈，其可包含經修飾之胺基酸，且其可間雜有非胺基酸。該等術語亦涵蓋已經天然地或藉由干預修飾之胺基酸聚合物；該干預例如形成雙硫鍵、糖基化、脂質化、乙醯化、磷酸化或諸如與標記組分共軛之任何其他操縱或修飾。定義內亦包括例如含有胺基酸之一或多種類似物(包括例如非天然胺基酸)以及此項技術中已知之其他修飾的多肽。
術語「胺基酸殘基」及「胺基酸」可互換地使用且在多肽之情形下意謂涉及多肽之一或多個肽鍵之胺基酸。一般而言，本文中用於指定胺基酸之縮寫係基於IUPAC-IUB生物化學命名委員會之建議(參見Biochemistry (1972) 11:1726-1732)。舉例而言，Met、Ile、Leu、Ala及Gly分別表示甲硫胺酸、異白胺酸、白胺酸、丙胺酸及甘胺酸之「殘基」。殘基意謂藉由消除羧基之OH部分及α-胺基之H部分而衍生自相應α-胺基酸之基團。術語「胺基酸性側鏈」為胺基酸中除--CH(NH2)COOH部分以外之部分，如由K. D. Kopple, 「Peptides and Amino Acids」, W. A. Benjamin Inc., New York and Amsterdam, 1966, 第2及33頁所定義。
通常，本發明之申請案中使用之胺基酸為在蛋白質中發現之彼等天然存在之胺基酸，或此類胺基酸之含有胺基及羧基的天然存在之合成代謝或分解產物。尤其適合之胺基酸性側鏈包括選自以下胺基酸之側鏈的側鏈：甘胺酸、丙胺酸、纈胺酸、半胱胺酸、白胺酸、異白胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、甲硫胺酸、麩胺酸、天冬胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺、離胺酸、精胺酸、脯胺酸、組胺酸、苯丙胺酸、酪胺酸及色胺酸，以及已鑑別為肽基聚糖細菌細胞壁之成分之彼等胺基酸及胺基酸類似物。
具有「鹼性側鏈」之胺基酸殘基包括Arg、Lys及His。具有「酸性側鏈」之胺基酸殘基包括Glu及Asp。具有「中性極性側鏈」之胺基酸殘基包括Ser、Thr、Asn、Gln、Cys及Tyr。具有「中性非極性側鏈」之胺基酸殘基包括Gly、Ala、Val、Ile、Leu、Met、Pro、Trp及Phe。具有「非極性脂族側鏈」之胺基酸殘基包括Gly、Ala、Val、Ile及Leu。具有「疏水性側鏈」之胺基酸殘基包括Ala、Val、Ile、Leu、Met、Phe、Tyr及Trp。具有「小型疏水性側鏈」之胺基酸殘基包括Ala及Val。具有「芳族側鏈」之胺基酸殘基包括Tyr、Trp及Phe。
術語胺基酸殘基進一步包括本文中提及之任何特定胺基酸之類似物、衍生物及同類物，例如，主題親和體(尤其若由化學合成產生)可包括胺基酸類似物，諸如氰基丙胺酸、刀豆胺酸、黎豆胺酸、正白胺酸、3-磷酸絲胺酸、高絲胺酸、二羥基-苯丙胺酸、5-羥基色胺酸、1-甲基組胺酸、3-甲基組胺酸、二胺基庚二酸、鳥胺酸或二胺基丁酸。熟習此項技術者辨識具有適合於本文中之側鏈的其他天然存在之胺基酸代謝物或前驅體且包括在本發明之範疇中。
當胺基酸之結構容許立體異構形式時，亦包括此類胺基酸之(D)及(L)立體異構體。本文中之胺基酸及胺基酸殘基之組態由適當符號(D)、(L)或(DL)指定，此外當未指定組態時，胺基酸或殘基可具有組態(D)、(L)或(DL)。應注意，一些本發明化合物之結構包括不對稱碳原子。因此應理解，由此類不對稱性產生之異構體包括於本發明之範疇內。此類異構體可藉由經典分離技術及空間控制合成以實質上純之形式獲得。出於本申請案之目的，除非明確地相反指出，否則所命名之胺基酸應視為包括(D)或(L)立體異構體。
術語「一致」或「一致性」百分比在兩種或更多種核酸或多肽之情形中係指兩個或更多個序列或子序列當根據最大對應性比較及比對(視需要引入空隙)時為相同的或具有指定百分比之相同核苷酸或胺基酸殘基，不考慮任何保守性胺基酸取代作為序列一致性之一部分。一致性百分比可使用序列比較軟體或演算法或藉由目視檢查來量測。此項技術中熟知可用於獲得胺基酸或核苷酸序列之比對的各種演算法及軟體。此等演算法及軟體包括(但不限於) BLAST、ALIGN、Megalign、BestFit、GCG Wisconsin Package及其變化形式。在一些實施例中，本發明之兩種核酸或多肽實質上一致，意謂當根據最大對應性比較及比對時，如使用序列比較演算法或藉由目視檢查所量測，其具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%及在一些實施例中至少95%、96%、97%、98%、99%核苷酸或胺基酸殘基一致性。在一些實施例中，在長度為至少約10個殘基、至少約20個殘基、至少約40-60個殘基、至少約60-80個殘基或其間任何整數值的胺基酸序列區域內存在一致性。在一些實施例中，在長度超過60-80個殘基之區域(諸如至少約80-100個殘基)上存在一致性，且在一些實施例中，序列在所比較之序列(諸如目標蛋白或抗體之編碼區)之全部長度內實質上一致。在一些實施例中，在長度為至少約10個鹼基、至少約20個鹼基、至少約40-60個鹼基、至少約60-80個鹼基或其間任何整數值的核苷酸序列區域內存在一致性。在一些實施例中，在長度超過60-80個鹼基(諸如至少約80-1000個鹼基或更多)之區域內存在一致性，且在一些實施例中，序列在所比較之序列(諸如編碼所關注蛋白質之核苷酸序列)之全部長度內實質上一致。
「保守性胺基酸取代」為一個胺基酸殘基經具有類似側鏈之另一個胺基酸殘基置換之取代。此項技術中通常已定義具有類似側鏈之胺基酸殘基家族，包括鹼性側鏈(例如離胺酸、精胺酸、組胺酸)、酸性側鏈(例如天冬胺酸、麩胺酸)、不帶電極性側鏈(例如甘胺酸、天冬醯胺、麩醯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸)、非極性側鏈(例如丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸、色胺酸)、β分支側鏈(例如蘇胺酸、纈胺酸、異白胺酸)及芳族側鏈(例如酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)。舉例而言，用苯丙胺酸取代酪胺酸為保守性取代。一般而言，本發明之多肽、可溶性蛋白質及/或抗體之序列中的保守性取代不消除含有該胺基酸序列之多肽、可溶性蛋白質或抗體與目標結合位點之結合。鑑別不消除結合之胺基酸保守性取代的方法在此項技術中熟知。
「經分離」之多肽、可溶性蛋白質、抗體、多核苷酸、載體、細胞或組合物為呈未在自然界中發現之形式之多肽、可溶性蛋白質、抗體、多核苷酸、載體、細胞或組合物。經分離之多肽、可溶性蛋白質、抗體、多核苷酸、載體、細胞或組合物包括已純化至其不再呈其在自然界中所發現之形式之程度的多肽、可溶性蛋白質、抗體、多核苷酸、載體、細胞或組合物。在一些實施例中，經分離之多肽、可溶性蛋白質、抗體、多核苷酸、載體、細胞或組合物為實質上純的。
如本文所用，術語「實質上純」係指至少50%純(亦即，不含污染物)、至少90%純、至少95%純、至少98%純或至少99%純的材料。
如本文所用，術語「融合蛋白」或「融合多肽」係指由包含至少兩種基因之核苷酸序列之核酸分子表現之雜交蛋白質。
如本文所用，術語「連接子」或「連接區域」係指在第一多肽(例如親和體之複本)與第二多肽(例如另一親和體、Fc結構域、配位體結合域等)之間插入之連接子。在一些實施例中，連接子為肽連接子。連接子不應不利地影響多肽之表現、分泌或生物活性。較佳地，連接子無抗原性且不引起免疫反應。
「親和體-抗體融合物」係指包括親和體多肽部分及抗體可變區之融合蛋白。親和體-抗體融合物包括有例如一或多個親和體多肽序列附接至VH及/或VL鏈中之一或多者之C端或N端的全長抗體，亦即，所組裝之抗體之至少一條鏈為具有親和體多肽之融合蛋白。親和體-抗體融合物亦包括其中一或多個親和體多肽序列作為具有抗體片段之抗原結合位點或可變區之融合蛋白的一部分提供之實施例。
如本文所用，術語「抗體」係指識別且經由至少一個抗原結合位點特異性結合目標(諸如蛋白質、多肽、肽、碳水化合物、多核苷酸、脂質或前述任一者之組合)之免疫球蛋白分子，其中抗原結合位點通常位於免疫球蛋白分子之可變區內。如本文所用，該術語涵蓋完整多株抗體、完整單株抗體、抗體片段(諸如Fab、Fab'、F(ab')2及Fv片段)、單鏈Fv (scFv)抗體(限制條件為此等片段已格式化以包括Fc或其他FcγRIII結合域)、多特異性抗體、雙特異性抗體、單特異性抗體、單價抗體、嵌合抗體、人類化抗體、人類抗體、包含抗體之抗原結合位點之融合蛋白(經格式化以包括Fc或其他FcγRIII結合域)及任何其他經修飾之包含抗原結合位點之免疫球蛋白分子，只要抗體呈現所需生物活性即可。
同時基於抗體之稱為α、δ、ε、γ及μ之重鏈恆定域的身分，抗體可為免疫球蛋白之五種主要類別中之任一種：IgA、IgD、IgE、IgG及IgM，或其子類(同型)(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2)。
術語抗體之「可變區」係指單獨或組合形式之抗體輕鏈之可變區或抗體重鏈之可變區。通常，重鏈及輕鏈之可變區各自由四個構架區(FR)及三個互補決定區(CDR，亦稱為「高變區」)組成。各鏈中之CDR由構架區緊密固持在一起且與來自其他鏈之CDR共同促進抗體之抗原結合位點的形成。存在至少兩項技術用於確定CDR：(1)基於交叉物種序列變化性之方法(亦即Kabat等人, 1991, Sequences of Proteins of Immunological Interest, 第5版 National Institutes of Health, Bethesda Md.)；以及(2)基於抗原-抗體複合物之結晶研究之方法(Al-lazikani等人 (1997) J. Molec. Biol. 273:927-948))。此外，此兩種方法之組合有時用於此項技術中來確定CDR。
如本文所用，術語「人類化抗體」係指非人類(例如鼠類)抗體之形式，其為含有最小非人類序列之特異性免疫球蛋白鏈、嵌合免疫球蛋白或其片段。通常，人類化抗體為其中CDR之殘基經來自非人類物種(例如小鼠、大鼠、兔或倉鼠)之CDR之殘基置換的具有所需特異性、親和力及/或結合能力之人類免疫球蛋白。在一些情況下，人類免疫球蛋白之Fv構架區殘基經來自非人類物種之抗體中之相應殘基置換。人類化抗體可利用Fv構架區及/或所置換之非人類殘基內之其他殘基之取代而進一步修飾，以優化及最佳化抗體特異性、親和力及/或結合能力。人類化抗體可包含含有與非人類免疫球蛋白對應之全部或基本上全部CDR的可變域，而全部或基本上全部構架區為人類免疫球蛋白序列之構架區。在一些實施例中，可變域包含人類免疫球蛋白序列之構架區。在一些實施例中，可變域包含人類免疫球蛋白共同序列之構架區。人類化抗體亦可包含免疫球蛋白恆定區或域(Fc)，通常人類免疫球蛋白恆定區或域之至少一部分。通常認為人類化抗體與嵌合抗體不同。
術語「抗原決定基」及「抗原決定子」在本文中可互換地使用且係指抗原中能夠由特定抗體、特定親和體或其他特定結合域識別及特異性結合之部分。當抗原為多肽時，抗原決定基可由藉由蛋白質之三級摺疊而並列之相鄰胺基酸及非相鄰胺基酸形成。由相鄰胺基酸形成之抗原決定基(亦稱為線性抗原決定基)通常在蛋白質變性時保留，而由三級摺疊形成之抗原決定基(亦稱為構形抗原決定基)通常在蛋白質變性時喪失。抗原決定基在獨特空間構形中通常包括至少3個，且更通常至少5個、6個、7個或8-10個胺基酸。
如本文所用，術語「特異性結合於」或「對……具有特異性」係指可量測及可再現之相互作用，諸如目標與親和體、抗體或其他結合搭配物之間的結合，其決定在分子(包括生物分子)之非均勻群體存在下目標是否存在。舉例而言，特異性結合於目標之親和體為與其與其他目標之結合相比，以更大親和力、親合力(若經多聚格式化)、更易於及/或以更長持續時間結合此目標之親和體。 c.  檢查點抑制劑、共刺激促效劑及化學治療劑
「檢查點分子」係指由組織及/或免疫細胞表現且以視檢查點分子之表現量而定的方式降低免疫反應之功效的蛋白質。當此等蛋白質經阻斷時，免疫系統上之「制動器」解除且例如T細胞能夠更有效地殺滅癌細胞。在T細胞或癌細胞上發現之檢查點蛋白質之實例包括PD-1/PD-L1及CTLA-4/B7-1/B7-2、PD-L2、NKG2A、KIR、LAG-3、TIM-3、CD96、VISTA及TIGIT。
「檢查點抑制劑」係指逆轉來自檢查點分子之免疫抑制性信號傳導之藥物實體。
「共刺激分子」係指特異性結合於共刺激配位體，籍此介導共刺激，諸如(但不限於)增殖的免疫細胞，諸如T細胞同源結合搭配物。共刺激分子為除抗原受體或配位體以外之促進有效免疫反應的細胞表面分子。共刺激分子包括(但不限於) MHCI分子、BTLA受體及Toll配位體，以及OX40、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1 (CD11a/CD18)、ICOS (CD278)及4-1BB (CD137)。共刺激分子之實例包括(但不限於)：CDS、ICAM-1、GITR、BAFFR、HVEM (LIGHTR)、SLAMF7、NKp80 (KLRF1)、NKp44、NKp30、NKp46、CD160、CD19、CD4、CD8α、CD8β、IL2Rβ、IL2Rγ、IL7Rα、ITGA4、VLA1、CD49a、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA-6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA-1、ITGAM、CD11b、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、LFA-1、ITGB7、NKG2D、NKG2C、TNFR2、TRANCE/RANKL、DNAM1 (CD226)、SLAMF4 (CD244,2B4)、CD84、CD96 (Tactile)、CEACAM1、CRTAM、Ly9 (CD229)、CD160 (BY55)、PSGL1、CD100 (SEMA4D)、CD69、SLAMF6 (NTB-A、Ly108)、SLAM (SLAMF1、CD150、IPO-3)、BLAME (SLAMF8)、SELPLG (CD162)、LTBR、LAT、GADS、SLP-76、PAG/Cbp、CD19a及CD83配位體。
「共刺激促效劑」係指諸如共刺激性配位體一般，活化(促效)共刺激性分子，且產生免疫刺激性信號或以其他方式提高免疫反應之效力或功效的藥物實體。
「化學治療劑」為適用於治療癌症之化合物。化學治療劑之實例包括烷基化劑，諸如噻替派(thiotepa)及環磷醯胺(cyclosphosphamide) (CYTOXAN)；烷基磺酸鹽，諸如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)及哌泊舒凡(piposulfan)；氮丙啶，諸如苯唑多巴(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、米特多巴(meturedopa)及尤利多巴(uredopa)；乙烯亞胺及甲基三聚氰胺，包括六甲蜜胺(altretamine)、三伸乙基三聚氰胺(triethylenemelamine)、三伸乙基磷醯胺(triethylenephosphoramide)、三伸乙基硫代磷醯胺(triethylenethiophosphoramide)及三羥甲基三聚氰胺；多聚乙醯(尤其布拉他辛(bullatacin)及布拉他辛酮(bullatacinone))；δ-9-四氫大麻酚(屈大麻酚(dronabinol)，MARINOL)；β-拉帕酮；拉帕醇；秋水仙鹼；樺木酸；喜樹鹼(包括合成類似物拓朴替康(topotecan)(HYCAMTIN)、CPT-11 (伊立替康(irinotecan，CAMPTOSAR))、乙醯基喜樹鹼(acetylcamptothecin)、東莨菪素(scopolectin)及9-胺基喜樹鹼)；苔蘚蟲素(bryostatin)；培美曲塞(pemetrexed)；海洋抑素(callystatin)；CC-1065 (包括阿多來新(adozelesin))、卡折來新(carzelesin)及比折來新(bizelesin)合成類似物)；鬼臼毒素(podophyllotoxin)；鬼臼酸；替尼泊甙(teniposide)；念珠藻環肽(cryptophycin)(尤其克瑞托欣(cryptophycin) 1及克瑞托欣8)；海兔毒素(dolastatin)；倍癌黴素(duocarmycin)(包括合成類似物KW-2189及CB1-TM1)；艾榴塞洛素(eleutherobin)；水鬼蕉鹼(pancratistatin)；TLK-286；CDP323，口服α-4整合素抑制劑；匍枝珊瑚醇(sarcodictyin)；海綿抑素(spongistatin)；氮芥，諸如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、氯磷醯胺(chlorophosphamide)、雌莫司汀(estramustine)、異環磷醯胺(ifosfamide)、甲氮芥(mechlorethamine)、甲氮芥氧化物鹽酸鹽、美法侖(melphalan)、新恩比興(novembichin)、芬司特瑞(phenesterine)、潑尼氮芥(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥(uracil mustard)；亞硝基脲，諸如卡莫司汀(carmustine)、氯脲菌素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)及雷莫司汀(ranimnustine)；抗生素，諸如烯二炔抗生素(例如卡奇黴素(calicheamicin)，尤其卡奇黴素γ1I及卡奇黴素ΩI1 (參見例如Nicolaou等人, Angew. Chem Intl. Ed. Engl., 33: 183-186 (1994))；達米辛(dynemicin) (包括達米辛A)；埃斯培拉黴素；以及新抑癌蛋白發色團及相關色蛋白烯二炔抗生素發色團)、阿克拉黴素(aclacinomysin)、放射菌素(actinomycin)、安麯黴素(authramycin)、偶氮絲胺酸(azaserine)、博萊黴素(bleomycin)、放線菌素C (cactinomycin)、卡拉比辛(carabicin)、洋紅黴素(caminomycin)、嗜癌菌素(carzinophilin)、色黴素(chromomycinis)、放線菌素d (dactinomycin)、道諾黴素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮-5-側氧基-L-正白胺酸、小紅莓(doxorubicin)(包括ADRIAMYCIN、N-嗎啉基-小紅莓、氰基-N-嗎啉基-小紅莓、2-吡咯啉基-小紅莓、小紅莓HCl脂質體注射液(DOXIL)及去氧小紅莓)、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、艾達黴素(idarubicin)、麻西羅黴素(marcellomycin)、絲裂黴素(mitomycin)(諸如絲裂黴素C (mitomycin C))、黴酚酸(mycophenolic acid)、諾加黴素(nogalamycin)、橄欖黴素(olivomycins)、培洛黴素(peplomycin)、潑非黴素(potfiromycin)、嘌呤黴素(puromycin)、奎那黴素(quelamycin)、羅多比星(rodorubicin)、鏈黑黴素(streptonigrin)、鏈脲菌素(streptozocin)、殺結核菌素、烏苯美司(烏苯美司)、淨司他丁(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin))；抗代謝物(諸如甲胺喋呤(methotrexate)、吉西他濱(gemcitabine，GEMZAR)、喃氟啶(tegafur，UFTORAL)、卡培他濱(capecitabine。XELODA)、埃坡黴素(epothilone)及5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil，5-FU))；葉酸類似物，諸如迪諾特寧(denopterin)、甲胺喋呤、蝶羅呤(pteropterin)、曲美沙特(trimetrexate)；嘌呤類似物，諸如氟達拉濱(fludarabine)、6-巰基嘌呤(6-mercaptopurine)、硫米嘌呤(thiamiprine)、硫鳥嘌呤(thioguanine)；嘧啶類似物，諸如安西他濱(ancitabine)、阿紮胞苷(azacitidine)、6-氮雜尿苷、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、二去氧尿苷、去氧氟尿苷、依諾他濱(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine)及伊馬替尼(imatinib)(2-苯基胺基嘧啶衍生物)以及其他c-Kit抑制劑；抗腎上腺劑，諸如胺魯米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane)；葉酸補充劑，諸如亞葉酸；乙醯葡醛酯(aceglatone)；醛磷醯胺糖苷(aldophosphamide glycoside)；胺基乙醯丙酸；恩尿嘧啶(eniluracil)；安吖啶(amsacrine)；倍思塔布(bestrabucil)；比生群(bisantrene)；艾達曲克(edatraxate)；得弗伐胺(defofamine)；秋水仙胺(demecolcine)；地吖醌(diaziquone)；依氟鳥氨酸(elfornithine)；依利醋銨(elliptinium acetate)；依託格魯(etoglucid)；硝酸鎵；羥基脲；香菇多醣(lentinan)；氯尼達明(lonidainine)；類美登素，諸如美登素(maytansine)及安絲菌素 (ansamitocins)、丙脒腙(mitoguazone)、米托蒽醌(mitoxantrone)；莫哌達醇(mopidanmol)；二胺硝吖啶(nitraerine)；噴司他丁(pentostatin)；凡那明(phenamet)；吡柔比星(pirarubicin)；洛索蒽醌(losoxantrone)；2-乙基醯肼；丙卡巴肼(procarbazine)；PSK多醣複合物(JHS Natural Products,Eugene,Oreg.)；雷佐生(razoxane)；根瘤菌素(rhizoxin)；西佐糖(sizofiran)；螺旋鍺(spirogermanium)；細交鏈孢菌酮酸(tenuazonic acid)；三亞胺醌(triaziquone)；2,2',2''-三氯三乙胺；單端孢黴烯(trichothecene)(尤其T-2毒素、弗納庫林(verracurin) A、桿孢菌素(roridin) A及胺癸叮(anguidine))；尿烷(urethan)；長春地辛(vindesine)(ELDISINE、FILDESIN)；達卡巴嗪(dacarbazine)；甘露莫司汀(mannomustine)；二溴甘露醇(mitobronitol)；二溴衛矛醇(mitolactol)；哌泊溴烷(pipobroman)；加西托星(gacytosine)；阿拉伯糖苷(arabinoside，「Ara-C」)；噻替派(thiotepa)；類紫杉醇(taxoid)，例如太平洋紫杉醇(paclitaxel，TAXOL)、太平洋紫杉醇經白蛋白工程改造之奈米粒子調配物(ABRAXANE)及多西他賽(doxetaxel，TAXOTERE)；苯丁酸氮芥(chloranbucil)；6-硫代鳥嘌呤(6-thioguanine)；巰基嘌呤(mercaptopurine)；甲胺喋呤(methotrexate)；鉑類似物，諸如順鉑(cisplatin)及卡鉑(carboplatin)；長春鹼(vinblastine，VELBAN)；鉑；依託泊苷(etoposide，VP-16)；異環磷醯胺；米托蒽醌(mitoxantrone)；長春新鹼(vincristine，ONCOVIN)；奧沙利鉑(oxaliplatin)；亮克沃林(leucovovin)；長春瑞賓(vinorelbine，NAVELBINE)；諾凡特龍(novantrone)；依達曲沙(edatrexate)；道諾黴素(daunomycin)；胺基喋呤(aminopterin)；伊班膦酸鹽(ibandronate)；拓樸異構酶抑制劑RFS 2000；二氟甲基鳥胺酸(DMFO)；類視黃素，諸如視黃酸；以上各者中之任一者的醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物；以及以上中之兩者或超過兩者的組合，諸如CHOP (環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松龍之組合療法之縮寫)及FOLFOX (奧沙利鉑(ELOXATIN)與5-FU及亮克沃林組合之治療方案的縮寫)。
此定義中亦包括用來調控、減少、阻斷或抑制可能會促進癌症生長之激素之影響的抗激素劑，且其通常呈全身性或整個身體治療形式。其本身可為激素。實例包括抗雌激素及選擇性雌激素受體調節劑(selective estrogen receptor modulator，SERM)，包括例如他莫昔芬(tamoxifen) (包括NOLVADEX他莫昔芬)、雷諾昔酚(raloxifene) (EVISTA)、曲洛昔芬(droloxifene)、4-羥基他莫昔芬、曲沃昔芬(trioxifene)、雷洛昔芬(keoxifene)、LY117018、奧那司酮(onapristone)及托瑞米芬(toremifene) (FARESTON)；抗孕酮；雌激素受體下調劑(estrogen receptor down-regulator，ERD)；雌激素受體拮抗劑，諸如氟維司群(fulvestrant) (FASLODEX)；用以遏制或關閉卵巢，例如黃體生成激素釋放激素(leutinizing hormone-releasing hormone，LHRFl)促效劑，諸如乙酸亮丙立德(leuprolide acetate) (LUPRON及ELIGARD)、乙酸戈舍瑞林(goserelin acetate)、乙酸布舍瑞林(buserelin acetate)及曲特瑞林(tripterelin)；抗雄激素，諸如氟他胺(fiutamide)、尼魯胺(nilutamide)及比卡魯胺(bicalutamide)；及芳香酶(aromatase)抑制劑，其抑制芳香酶，其調節腎上腺中之雌激素產生，諸如4(5)-咪唑、胺魯米特(aminoglutethimide)、乙酸甲地孕酮(megestrol acetate，MEGASE)、依西美坦(exemestane，AROMASIN)、福美斯坦(formestanie)、法屈唑(fadrozole)、伏羅唑(vorozole) (RIVISOR)、來曲唑(letrozole) (FEMARA)及阿那曲唑(anastrozole) (ARIMIDEX)。另外，化學治療劑之該定義包括：雙膦酸鹽，諸如氯屈膦酸鹽(clodronate) (例如BONEFOS或OSTAC)、依替膦酸鹽(etidronate) (DIDROCAL)、NE-58095、唑來膦酸/唑來膦酸鹽(zoledronic acid/zoledronate) (ZOMETA)、阿侖膦酸鹽(alendronate) (FOSAMAX)、帕米膦酸鹽(pamidronate) (AREDIA)、替魯膦酸鹽(tiludronate) (SKELID)或利塞膦酸鹽(risedronate) (ACTONEL)；以及曲沙他濱(troxacitabine) (1,3-二氧雜環戊烷核苷胞嘧啶類似物)；反義寡核苷酸，尤其抑制基因在涉及異常細胞增殖之信號傳導路徑中表現之反義寡核苷酸，諸如PKC-α、Raf、H-Ras及表皮生長因子受體(EGF-R)；疫苗，諸如THERATOPE疫苗及基因療法疫苗，例如ALLOVECTIN疫苗、LEUVECTIN疫苗及VAXID疫苗；拓樸異構酶1抑制劑(例如LURTOTECAN)；抗雌激素，諸如氟維司群；Kit抑制劑，諸如伊馬替尼或EXEL-0862 (酪胺酸激酶抑制劑)；EGFR抑制劑，諸如埃羅替尼(erlotinib)或西妥昔單抗(cetuximab)；抗VEGF抑制劑，諸如貝伐單抗(bevacizumab)；伊立替康(arinotecan)；rmRH (例如ABARELIX)；拉帕替尼(lapatinib)及二甲苯磺酸拉帕替尼(ErbB-2及EGFR雙重酪胺酸激酶小分子抑制劑，亦稱為GW572016)；17AAG (格爾德黴素(geldanamycin)衍生物，其為熱休克蛋白(heat shock protein，Hsp) 90毒物)及以上各者中之任一者的醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。
如本文所用，術語「細胞介素」通常係指由一個細胞群體釋放之蛋白質，其作為細胞間介體作用於另一細胞或對產生該等蛋白質之細胞具有自分泌作用。此類細胞介素之實例包括淋巴介質、單核球激素；介白素(「IL」)，諸如IL-1、IL-1α、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-10、IL-11、IL-12、IL-13、IL-15、IL-17A-F、IL-18至IL-29 (諸如IL-23)、IL-31，包括PROLEUKIN rIL-2；腫瘤壞死因子，諸如TNF-α或TNF-β、TGF-β1-3；及其他多肽因子，包括白血病抑制因子(「LIF」)、睫狀神經營養因子(「CNTF」)、類CNTF細胞介素(「CLC」)、心營養素(「CT」)及kit配位體(「KL」)。
如本文所用，術語「趨化因子」係指能夠選擇性誘發白細胞之趨化及活化的可溶因子(例如細胞介素)。其亦引起血管生成、發炎、傷口癒合及腫瘤形成過程。實例趨化因子包括IL-8，一種鼠角質細胞化學引誘劑(KC)之人類同源物。 d.  治療
如本文所用，術語「功能異常」亦包括阻礙抗原識別或對抗原識別不起反應，特別是將抗原識別轉變成下游T細胞效應功能(諸如增殖、細胞介素產生(例如IL-2)及/或目標細胞殺傷)之能力減弱。
術語「能力缺失」係指由經由T細胞受體遞送之信號不完全或不充分引起的對抗原刺激不起反應之狀態(例如在不存在ras活化之情況下細胞內Ca+2 升高)。在不存在共刺激之情況下，T細胞能力缺失亦可在用抗原刺激時產生，引起細胞變得隨後即使在共刺激情形下亦難以藉由抗原進行活化。無反應狀態常常可由介白素-2之存在而解決。能力缺失T細胞不進行純系擴增及/或獲得效應功能。
術語「耗竭」係指T細胞耗竭，作為在多種慢性感染及癌症期間發生之由持續TCR信號傳導引起的T細胞功能異常狀態。其與能力缺失之區別在於其並非由信號傳導不完全或不足引起，而係由持續信號傳導引起。其由不良效應功能、抑制性受體之持續表現及與功能性效應子或記憶T細胞不同之轉錄狀態定義。耗竭阻止感染及腫瘤之最佳控制。
「增強T細胞功能」意謂誘導、引起或刺激T細胞使其具有持續或擴增之生物功能，或更新或再活化耗竭或惰性T細胞。增強T細胞功能之實例包括：與干預之前的水準相比，增加CD8+ T細胞之γ干擾素之分泌、增加增殖、增加抗原反應(例如病毒、病原體或腫瘤清除率)。在一個實施例中，增強水準為至少50%，或者60%、70%、80%、90%、100%、120%、150%、200%。量測此增強作用之方式為一般技術者已知。
「T細胞功能異常病症」為特徵在於對抗原刺激之反應降低的T細胞病症或病狀。在一特定實施例中，T細胞功能異常病症為與不當增加之PD-1含量特定相關之病症。T細胞功能異常病症亦可與腫瘤中不當增加之PD-L1含量相關，該不當增加之含量引起T細胞抗腫瘤功能之遏制。在另一實施例中，T細胞功能異常病症為其中T細胞能力缺失或分泌細胞介素、增殖或進行細胞溶解活性之能力降低的病症。在一特定態樣中，反應降低可引起對表現免疫原之病原體或腫瘤之控制無效。特徵在於T細胞功能異常之T細胞功能異常病症之實例包括起因不明之急性感染、慢性感染及腫瘤免疫性。
「腫瘤免疫性」係指其中腫瘤躲避免疫識別及清除之過程。因此，作為治療概念，腫瘤免疫性在該躲避作用減弱且腫瘤由免疫系統識別及攻擊時得以「治療」。腫瘤識別之實例包括腫瘤結合、腫瘤縮小及腫瘤清除。
「持續反應」係指在停止治療之後，對降低腫瘤生長之持續作用。舉例而言，與投藥階段開始時之尺寸相比，腫瘤尺寸可保持相同或更小。在一些實施例中，持續反應之持續時間長度至少與治療持續時間相同，為治療持續時間之至少1.5倍、2.0倍、2.5倍或3.0倍。
如本文所用，術語「癌症」及「癌性」係指或描述哺乳動物中細胞群體之特徵在於不受調控之細胞生長的生理學病狀。癌症之實例包括(但不限於)癌瘤、母細胞瘤、肉瘤及血液癌，諸如淋巴瘤及白血病。
如本文所用，術語「腫瘤」及「贅瘤」係指任何由過度細胞生長或增殖產生之組織塊狀物，其為良性(非癌性)或惡性(癌性)的，包括癌前病灶。腫瘤生長通常為不受控制及進行性的，不誘導或抑制正常細胞之增殖。腫瘤可影響多種細胞、組織或器官，包括(但不限於)選自膀胱、骨骼、腦部、乳房、軟骨、膠細胞、食道、輸卵管、膽囊、心臟、腸、腎臟、肝、肺、淋巴結、神經組織、卵巢、胰臟、前列腺、骨胳肌、皮膚、脊髓、脾、胃、睪丸、胸腺、甲狀腺、氣管、尿道、尿管、尿道、子宮、陰道器官或組織或相應細胞。腫瘤包括癌症，諸如肉瘤、癌瘤、漿細胞瘤或(惡性漿細胞)。本發明之腫瘤可包括(但不限於)白血病(例如急性白血病、急性淋巴母細胞白血病、急性骨髓性白血病、急性骨髓性白血病、急性前髓細胞性白血病、急性骨髓單核球性白血病、急性單核球性白血病、急性白血病、慢性白血病、慢性骨髓性白血病、慢性淋巴球性白血病、真性紅細胞增多症)、淋巴瘤(例如霍奇金氏病、非霍奇金氏病)、原發性巨球蛋白血症、重鏈病及實體腫瘤，諸如肉瘤癌症(例如纖維肉瘤、黏液肉瘤、脂肪肉瘤、軟骨肉瘤、骨肉瘤、脊索瘤、內皮肉瘤、淋巴管肉瘤、血管肉瘤、淋巴管內皮肉瘤、滑膜瘤、間皮瘤、尤文氏腫瘤(Ewing's tumor)、平滑肌肉瘤、橫紋肌肉瘤、結腸癌、胰臟癌、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、鱗狀細胞癌、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳頭狀癌、乳頭狀腺癌、癌瘤、支氣管癌、髓性癌、腎細胞癌、肝瘤、膽管癌、絨毛膜癌、精原細胞瘤、胚胎性癌、威爾姆斯瘤(Wilms'tumor)、子宮頸癌、子宮癌、睪丸癌、肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神經膠質瘤、星形細胞瘤、髓母細胞瘤、顱咽管瘤、室管膜瘤、松果體瘤、血管母細胞瘤、聽神經瘤、少突神經膠質瘤、神經鞘瘤、腦膜瘤、黑色素瘤、神經母細胞瘤、視網膜母細胞瘤)、食道癌、膽囊癌、腎癌、多發性骨髓瘤。較佳地，「腫瘤」包括(但不限於)：胰臟癌、肝癌、肺癌、胃癌、食道癌、頭頸部鱗狀細胞癌、前列腺癌、結腸癌、乳癌、淋巴瘤、膽囊癌、腎癌、白血病、多發性骨髓瘤、卵巢癌、子宮頸癌及神經膠質瘤。
如本文所用，術語「轉移」係指癌症自原發部位擴散或轉移至身體其他區域，同時在新位置處產生類似癌性病灶之過程。「轉移性」或「轉移」細胞為喪失與相鄰細胞之黏著性接觸且經由血流或淋巴自疾病原發位點遷移以侵襲相鄰身體結構之細胞。
術語「癌細胞」及「腫瘤細胞」係指來源於癌症或腫瘤或癌前病灶之總細胞群體，包括佔癌細胞群體大部分之非致瘤性細胞與致瘤性幹細胞(癌症幹細胞)。如本文所用，當僅僅指缺乏更新及分化能力之彼等細胞以區分腫瘤細胞與癌症幹細胞時，術語「癌細胞」或「腫瘤細胞」將由術語「非致瘤性」修飾。
如本文所用，術語「有效量」係指提供治療或預防效益之量。
如本文所用，「完全反應」或「CR」係指所有目標病灶消失；「部分反應」或「PR」係指以基線SLD作為參考，目標病灶之最長直徑之總和(SLD)降低至少30%；及「穩定疾病」或「SD」係指以治療開始時之最小SLD作為參考，目標病灶既未充分收縮至認定為PR，亦未充分增加至認定為PD。
如本文所用，「無進展存活率」(PFS)係指在治療期間及治療之後，所治療之疾病(例如癌症)不會惡化之持續時間長度。無進展存活期可包括患者經歷完全反應或部分反應之時間量，以及患者經歷穩定疾病之時間量。
如本文所用，「總反應率」(ORR)係指完全反應(CR)率與部分反應(PR)率之總和。
如本文所用，「總存活率」係指組中可能在特定持續時間之後存活之個體之百分比。
如本文所用，術語「治療」係指用於改變由細胞干預(可能為臨床病理學之預防性干預過程)引起的臨床疾病之過程或治療之個別嘗試。包括(但不限於)治療以預防疾病發生或復發、緩解症狀、減輕任何疾病之直接或間接病理性結果、預防癌轉移、減緩疾病進展速率、改善或緩解疾病或改良預後。
術語「個體」係指作為特定治療之接受者的任何動物(例如哺乳動物)，包括(但不限於)人類、非人類靈長類動物、犬科動物、貓科動物、嚙齒動物及其類似物。通常，關於人類個體之術語「個體」及「患者」在本文中可互換使用。
如本文所用，術語「促效劑」及「促效」係指能夠直接地或間接地顯著誘導、活化、促進、增加或增強目標或目標路徑之生物活性之藥劑。本文中使用之術語「促效劑」包括任何部分或完全誘導、活化、促進、增加或增強蛋白質或其他相關目標之活性之藥劑。
如本文所用，術語「拮抗劑」及「拮抗」係指或描述能夠直接地或間接地部分或完全阻斷、抑制、降低或中和目標及/或路徑之生物活性之藥劑。本文中使用之術語「拮抗劑」包括任何部分或完全阻斷、抑制、降低或中和蛋白質或其他所關注目標之活性之藥劑。
如本文所用，術語「調節(modulation)」及「調節(modulate)」係指生物活性之改變或變化。調節包括(但不限於)刺激活性或抑制活性。調節可為活性增加或活性降低、結合特徵之變化或與蛋白質、路徑、系統或其他所關注生物學目標之活性相關的生物學、功能性或免疫特性之任何其他變化。
如本文所用，術語「免疫反應」包括來自先天性免疫系統及後天性免疫系統之反應。其包括細胞介導及/或體液免疫反應。其包括T細胞及B細胞反應，以及來自免疫系統之其他細胞，諸如自然殺手(NK)細胞、單核球、巨噬細胞等之反應。
術語「醫藥學上可接受」意謂經聯邦政府或州政府之監管機構批准或可經其批准或在美國藥典或其他一般公認之藥典中列出用於動物，包括人類的物質。
術語「醫藥學上可接受之賦形劑、載劑或佐劑」或「可接受之醫藥載劑」係指可與本發明之至少一種藥劑一起投與個體且當以足以遞送治療作用之劑量投與時不破壞該藥劑之藥理學活性且無毒性的賦形劑、載劑或佐劑。一般而言，熟習此項技術者及U.S. FDA認為醫藥學上可接受之賦形劑、載體或佐劑為任何調配物之非活性成分。
術語「有效量」或「治療有效量」或「治療作用」係指本文所述之結合子-藥物共軛物有效「治療」個體、諸如哺乳動物之疾病或病症的量。在癌症或腫瘤之情況下，治療有效量之PD-L1結合子-藥物共軛物具有治療作用，因而可增強免疫反應，增強抗腫瘤反應，增加免疫細胞之細胞溶解活性，增加免疫細胞對腫瘤細胞之殺死，減少腫瘤細胞之數目；降低致瘤性、致瘤頻率或致瘤能力；減少癌症幹細胞之數目或頻率；減小腫瘤尺寸；減少癌細胞群體；抑制或阻止癌細胞浸潤至周邊器官中，包括(例如)癌症擴散至軟組織及骨骼中；抑制及阻止腫瘤或癌細胞轉移；抑制及阻止腫瘤或癌症細胞生長；在一定程度上緩解與癌症相關之一或多種症狀；降低發病率及死亡率；改善生活品質；或此類作用之組合。
術語「治療(treating)」或「治療(treatment)」或「治療(to treat)」或「緩解(alleviating)」或「緩解(to alleviate)」係指以下兩者：(1)經診斷之病理性病狀或病症治癒、減緩、症狀減輕及/或進展停止的治療性量度；及(2)防止及/或減慢目標病理性病狀或病症發展的預防性或防治性量度。因此，需要治療者包括已患該病症者；傾向於患該病症者；以及有待預防該病症者。在癌症或腫瘤之情況下，若患者展示以下各者中之一或多者，則根據本發明之方法成功地「治療」個體：增加免疫反應，增加抗腫瘤反應，增加免疫細胞之細胞溶解活性，增加免疫細胞對腫瘤細胞之殺死，減少癌細胞之數目或使其完全不存在；減小腫瘤尺寸；抑制或缺乏癌細胞浸潤至周邊器官中，包括癌細胞擴散至軟組織及骨骼中；抑制或缺乏腫瘤或癌細胞轉移；抑制或缺乏癌症生長；緩解與特定癌症相關之一或多種症狀；降低發病率及死亡率；改善生活品質；降低致瘤性；減少癌症幹細胞之數目或頻率；或此類作用之某一組合。 e.  其他(Miscellaneous)
術語「烷基」係指飽和脂族基團之自由基，包括直鏈烷基、分支鏈烷基、環烷基(脂環族)基團、經烷基取代之環烷基及經環烷基取代之烷基。在某些實施例中，直鏈或分支鏈烷基在其骨架中具有30個或更少碳原子(例如直鏈之C1 -C30 、分支鏈之C3 -C30 )，例如20個或更少。同樣，某些環烷基在其環結構中具有3-10個碳原子，例如在環結構中具有5個、6個或7個碳。如在整個本說明書及申請專利範圍中使用之「烷基」(或「低碳烷基」)意欲包括「未經取代之烷基」與「經取代之烷基」。
如本文所用，術語「芳烷基」係指經芳基(例如芳族基或雜芳族基)取代之烷基。
術語「烯基」及「炔基」係指長度及可能之取代基與上述烷基類似，但分別含有至少一個雙鍵或參鍵的不飽和脂族基。
除非另外指定碳數，否則如本文所用，「低碳烷基」意謂如上所定義但在主鏈結構中具有一至十個碳、例如一至四個或一至六個碳原子之烷基。同樣，「低碳烯基」及「低碳炔基」具有類似鏈長鏈長 在一些實施例中，烷基為低碳烷基。在一些實施例中，本文中指定為烷基之取代基為低碳烷基。
如本文所用，術語「芳基」包括可包括零至四個雜原子之5員、6員及7員單環芳族基，例如苯、吡咯、呋喃、噻吩、咪唑、噁唑、噻唑、三唑、吡唑、吡啶、吡嗪、噠嗪及嘧啶及其類似物。在環結構中具有雜原子之彼等芳基亦可稱為「芳基雜環」或「雜芳族化合物」。芳環可在一或多個環位置處經如上所述之取代基取代，該等取代基例如鹵素、疊氮化物、烷基、芳烷基、烯基、炔基、環烷基、羥基、胺基、硝基、硫氫基、亞胺基、醯胺基、膦酸酯基、亞膦酸酯基、羰基、羧基、矽烷基、醚、烷硫基、磺醯基、磺醯胺基、酮、醛、酯、雜環基、芳族或雜芳族部分、-CF3 、-CN或其類似物。術語「芳基」亦包括具有兩個或更多個環之多環環系統，其中兩個或更多個碳為兩個鄰接環(環為「稠環」)所共用，其中至少一個環為雜環，例如其他環可為環烷基、環烯基、環炔基、芳基及/或雜環基。
術語「雜環基(heterocyclyl)」或「雜環基(heterocyclic group)」係指環結構包括一至四個雜原子之3員至10員環結構，例如3至7員環。雜環亦可為多環。雜環基包括例如噻吩、噻嗯、呋喃、哌喃、異苯并呋喃、𠳭烯、呫噸、啡噁噻、吡咯、咪唑、吡唑、異噻唑、異噁唑、吡啶、吡嗪、嘧啶、噠嗪、吲哚嗪、異吲哚、吲哚、吲唑、嘌呤、喹嗪、異喹啉、喹啉、酞嗪、㖠啶、喹喏啉、喹唑啉、㖕啉、喋啶、咔唑、咔啉、啡啶、吖啶、嘧啶、啡啉、吩嗪、啡砷嗪、吩噻嗪、呋呫、啡噁嗪、吡咯啶、氧雜環戊烷、硫雜環戊烷、噁唑、哌啶、哌嗪、嗎啉、內酯、內醯胺(諸如氮雜環丁酮)及吡咯啶酮、磺內醯胺、磺內酯及其類似物。雜環可在一或多個環位置處經如上所述之取代基取代，該等取代基例如鹵素、烷基、芳烷基、烯基、炔基、環烷基、羥基、胺基、硝基、硫氫基、亞胺基、醯胺基、膦酸酯基、亞膦酸酯基、羰基、羧基、矽烷基、醚、烷硫基、磺醯基、酮、醛、酯、雜環基、芳族或雜芳族部分、-CF3 、-CN或其類似物。
術語「雜芳基」係指其中至少一個環原子為獨立地選自由O、N及S組成之群之雜原子的單價芳族單環環系統。術語5員雜芳基係指環原子數目為5之雜芳基。5員雜芳基之實例包括吡咯基、吡唑基、噁唑基、異噁唑基、噻唑基、異噻唑基、噁二唑基、噻二唑基、呋呫基、咪唑啉基及三唑基。
術語「雜環烷基」係指其中1至4個環原子為獨立地選自由O、N及S組成之群之雜原子的單環或雙環單價飽和或非芳族不飽和環系統。術語「3員至10員雜環烷基」係指環原子數目為3至10之雜環烷基。3員至10員雜環烷基之實例包括3至6員雜環烷基。雙環系統包括稠合、橋接及螺環環系統。雜環烷基之更特定實例包括氮雜環庚烷基、氮雜環丁烷基、氮雜環丙烷基、咪唑啶基、嗎啉基、噁唑啶基、噁唑啶基、哌嗪基、哌啶基、吡唑啶基、吡咯啶基、
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啶基及硫代嗎啉基。
術語「多環基」及「多環基團」係指其中兩個或更多個碳為兩個鄰接環所共用，例如該等環為「稠環」之兩個或更多個環(例如環烷基、環烯基、環炔基、芳基、雜芳基及/或雜環基)。經由不相鄰原子接合之環稱為「橋」環。多環之各環可經如上所述之取代基取代，該等取代基例如鹵素、烷基、芳烷基、烯基、炔基、環烷基、羥基、胺基、硝基、硫氫基、亞胺基、醯胺基、膦酸酯基、亞膦酸酯基、羰基、羧基、矽烷基、醚、烷硫基、磺醯基、酮、醛、酯、雜環基、芳族或雜芳族部分、-CF3 、-CN或其類似物。
如本文所用，術語「碳環」係指環之各原子為碳的芳環或非芳環。
如本文所用，術語「雜原子」意謂除碳或氫之外的任何元素之原子。例示性雜原子為氮、氧、硫及磷。
如本文所用，術語「硝基」意謂-NO2 ；術語「鹵素」表示-F、-Cl、-Br或-I；術語「硫氫基」意謂-SH；術語「羥基」意謂-OH；且術語「磺醯基」意謂-SO2 -。
「鹵素」或「鹵基」本身或作為另一取代基之部分係指氟、氯、溴及碘，或氟基、氯基、溴基及碘基。
應瞭解「取代」或「經取代」包括暗示的限制條件，即此類取代符合經取代原子及取代基之允許價數，及取代產生穩定化合物，例如化合物不會自發地諸如藉由重排、環化、消除等進行轉變。
如本文所用，預期術語「經取代」包括有機化合物之所有可容許取代基。在一個廣泛態樣中，可容許取代基包括有機化合物之非環狀及環狀、分支鏈及未分支鏈、碳環及雜環、芳族及非芳族取代基。例示性取代基包括例如上文所描述之彼等取代基。對於適當有機化合物，可容許取代基可為一或多個且相同或不同。取代基可包括例如鹵素、羥基、羰基(諸如羧基、酯、甲醯基或酮)、硫羰基(諸如硫代酯、硫代乙酸酯或硫代甲酸酯)、烷氧基、磷醯基、膦酸酯、亞膦酸酯、胺基、醯胺基、脒、亞胺、氰基、硝基、疊氮基、硫氫基、烷基硫基、硫酸酯、磺酸酯、胺磺醯基、磺醯胺基、磺醯基、雜環基、芳烷基或芳族或雜芳族部分。熟習此項技術者應瞭解烴鏈上經取代之部分本身在適當時可經取代。舉例而言，經取代烷基之取代基可包括胺基、疊氮基、亞胺基、醯胺基、磷醯基(包括膦酸酯及亞膦酸酯)、磺醯基(包括硫酸酯、磺醯胺基、胺磺醯基及磺酸酯)及矽烷基之經取代及未經取代形式，以及醚、烷基硫基、羰基(包括酮、醛、羧酸酯及酯)、-CF3 、-CN及類似基團。下文描述例示性經取代之烷基。環烷基可進一步經烷基、烯基、烷氧基、烷基硫基、胺基烷基、經羰基取代之烷基、-CF3 、-CN及類似基團取代。出於本發明之目的，諸如氮之雜原子可具有氫取代基及/或本文所描述之滿足雜原子價數之有機化合物的任何可容許取代基。本發明並不意欲以任何方式受有機化合物之可容許取代基限制。
術語「胺基酸殘基」及「肽殘基」意謂羧基不具有-OH之胺基酸或肽分子。一般而言，本文中用於指定胺基酸及保護基之縮寫係基於IUPAC-IUB生物化學命名委員會之建議(參見Biochemistry (1972) 11:1726-1732)。舉例而言，Met、Ile、Leu、Ala及Gly分別表示甲硫胺酸、異白胺酸、白胺酸、丙胺酸及甘胺酸之「殘基」。殘基意謂藉由消除羧基之OH部分及α-胺基之H部分而衍生自相應α-胺基酸之基團。術語「胺基酸性側鏈」為胺基酸中除--CH(NH2 )COOH部分以外之部分，如由K. D. Kopple, 「Peptides and Amino Acids」, W. A. Benjamin Inc., New York and Amsterdam, 1966, 第2及33頁所定義。
通常，本發明之申請案中使用之胺基酸為在蛋白質中發現之彼等天然存在之胺基酸，或此類胺基酸之含有胺基及羧基的天然存在之合成代謝或分解產物。尤其適合之胺基酸性側鏈包括選自以下胺基酸之側鏈的側鏈：甘胺酸、丙胺酸、纈胺酸、半胱胺酸、白胺酸、異白胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、甲硫胺酸、麩胺酸、天冬胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺、離胺酸、精胺酸、脯胺酸、組胺酸、苯丙胺酸、酪胺酸及色胺酸，以及已鑑別為肽基聚糖細菌細胞壁之成分之彼等胺基酸及胺基酸類似物。
主題化合物可包括胺基酸類似物，諸如氰基丙胺酸、刀豆胺酸、黎豆胺酸、正白胺酸、3-磷酸絲胺酸、高絲胺酸、二羥基-苯丙胺酸、5-羥基色胺酸、1-甲基組胺酸、3-甲基組胺酸、二胺基庚二酸、鳥胺酸或二胺基丁酸。熟習此項技術者辨識具有適合於本文中之側鏈的其他天然存在之胺基酸代謝物或前驅體且包括在本發明之範疇中。
當胺基酸之結構容許立體異構形式時，亦包括此類胺基酸之(D)及(L)立體異構體。本文中之胺基酸及胺基酸殘基之組態由適當符號(D)、(L)或(DL)指定，此外當未指定組態時，胺基酸或殘基可具有組態(D)、(L)或(DL)。應注意，一些本發明化合物之結構包括不對稱碳原子。因此應理解，由此類不對稱性產生之異構體包括於本發明之範疇內。此類異構體可藉由經典分離技術及空間控制合成以實質上純之形式獲得。出於本申請案之目的，除非明確地相反指出，否則所命名之胺基酸應視為包括(D)或(L)立體異構體。
如上所指出，某些本發明化合物可呈特定幾何或立體異構形式存在。本發明涵蓋所有此類化合物在本發明範疇內，包括順式-及反式-異構體、R-及S-對映異構體、非對映異構體、(D)-異構體、(L)-異構體、其外消旋混合物及其其他混合物。其他不對稱碳原子可存在於諸如烷基之取代基中。所有此類異構體以及其混合物意欲包括於本發明中。
舉例而言，若需要本發明化合物之特定對映異構體，則其可藉由不對稱合成或藉由用對掌性助劑衍生來製備，其中所得非對映異構性混合物經分離且輔助基團裂解以提供純的所需對映異構體。或者，在分子含有鹼性官能基(諸如胺基)或酸性官能基(諸如羧基)之情況下，用適當光學活性酸或鹼形成非對映異構性鹽，接著藉由此項技術中熟知之分步結晶或層析手段解析由此形成之非對映異構體，且隨後回收純對映異構體。
術語「IC50 」係指使反應(或結合)減少一半之抑制劑濃度，且可在全細胞、動物或活體外無細胞(純化酶)系統中量測。在一些正式動力學量測下，無細胞酶之抑制亦可報導為Ki值。
術語「ICIC50 」或「IIC50 」為在全細胞之情況下使細胞滲透性變成因子之DPP8及DPP9抑制之量度(DPP8及DPP9為細胞可滲透的，用於量測IC50 之無細胞可滲透需求之純化酶)。
術語「DPP8」係指蛋白質二肽基肽酶8。
術語「DPP9」係指蛋白質二肽基肽酶9。
出於本發明之目的，根據元素週期表, CAS版, Handbook of Chemistry and Physics, 第67版, 1986-87, 內封鑑別化學元素。亦出於本發明之目的，涵蓋術語「烴(hydrocarbon)」包括具有至少一個氫原子及一個碳原子之所有可容許化合物。在一廣泛態樣中，可容許烴包括可經取代或未經取代之非環狀及環狀、分支鏈及非分支鏈、碳環及雜環、芳族及非芳族有機化合物。
在二肽(或二肽類似物)之情況下，術語「P1位置」及「P2位置」分別係指羧基端及胺基端殘基。在主題I-DASH抑制劑之情況下，P1位置為
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酸替換羧基端之胺基酸(或胺基酸類似物)。
應理解，當本文中用語言「包含」描述實施例時，亦提供用術語「由……組成」及/或「基本上由……組成」描述之其他類似實施例。亦應理解，當本文中用語言「基本上由……組成」描述實施例時，亦提供用術語「由……組成」描述之其他類似態樣。
如本文所用，對「約」或「大約」值或參數之提及包括(及描述)與該值或參數相關之實施例。舉例而言，涉及「約X」之描述包括「X」之描述。
如在諸如「A及/或B」之短語中所使用的術語「及/或」在本文中意欲包括A及B；A或B；A (單獨)；及B (單獨)。類似地，在諸如「A、B及/或C」之短語中使用的術語「及/或」意欲涵蓋以下實施例中之每一者：A、B及C；A、B或C；A或C；A或B；B或C；A及C；A及B；B及C；A (單獨)；B (單獨)；及C (單獨)。 III.  例示性實施例
本發明之一態樣提供結合子-藥物共軛物，其包含(i)結合於腫瘤中之細胞上上調或選擇性呈現之細胞表面特徵，諸如蛋白質的細胞結合部分，諸如抗體、抗體片段、非抗體骨架或其他多肽實體；及(ii)附接於其之一或多個藥物-共軛物部分，該等藥物-共軛物部分如以下各式中所示：
Figure 02_image019
其中 L1 表示間隔子或一鍵； SRS表示在腫瘤細胞外空間中表現之細胞外蛋白酶的受質識別序列； L2 表示自我分解型連接子或一鍵； DM表示藥物部分； m表示整數1至6，較佳1、2或3；且 n表示整數1至500，更佳1至100、1至10或1至5。
結合子-藥物共軛物在與目標細胞上之表面特徵結合時具有至少6小時，更佳至少10小時、12小時、14小時、16小時、18小時、20小時、24小時、36小時、48小時、60小時、75小時或甚至100小時之內化半衰期。 a. 受質識別序列
在某些實施例中，受質識別序列為藉由在組織中結合部分針對之細胞中表現之酶裂解的部分(通常肽或肽基部分)。「在靶向細胞附近選擇性可裂解之裂解位點」意謂僅僅可藉由在靶向細胞附近選擇性存在之藥劑裂解，以便減少游離藥物部分釋放離開患病組織的位點。較佳地，裂解受質識別序列之酶以比目標細胞附近以外之酶的濃度高至少五倍或十倍之濃度且更佳以高至少100倍或500倍或1000倍之濃度存在於目標細胞附近。最佳地，裂解受質識別序列之酶僅僅在目標細胞附近發現。舉例而言，當目標細胞為特定腫瘤細胞(例如乳房腫瘤細胞)時，受質識別序列可為藉由在特定腫瘤(例如乳房腫瘤)中選擇性存在但在特定腫瘤(例如乳房腫瘤)附近以外不存在之酶裂解的受質識別序列。
『細胞附近』意謂在細胞表面上或在該組織中之間質流體中或兩者，或在直接包圍細胞之環境中，例如血液、淋巴及其他體液。
受質識別序列在目標細胞附近選擇性裂解，從而使得游離藥物部分優先在目標細胞附近自共軛物釋放，以便優先在鄰近目標細胞之細胞/組織上發揮其藥理學活性，而非在所需(健康)細胞上。因此，較佳地，受質識別序列選擇性地裂解，使得藥物部分在目標細胞附近以超過游離藥物部分在健康細胞/組織附近釋放之程度至少五倍或十倍且更佳地至少100倍或500倍或1000倍更多倍呈游離藥物部分釋放。
對於既定目標細胞，技術人員將能夠使用此項技術中公認之方法鑑別在目標細胞附近選擇性可裂解之適當受質識別序列。舉例而言，可藉由查閱肽文庫且研究裂解後碎片化概況之MS分析來評估哪些蛋白酶裂解哪些肽。另外，可如下文進一步描述蛋白酶裂解模體之公開文獻及肽裂解資料。
一般而言，受質識別序列為蛋白酶裂解位點。因此，當目標細胞為腫瘤細胞時，受質識別序列可藉由存在於腫瘤細胞附近之蛋白酶選擇性地裂解。換言之，受質識別序列可為藉由腫瘤相關蛋白酶可裂解之受質識別序列。熟知在腫瘤發展期間，腫瘤異常地表現允許腫瘤侵入局部組織及最終轉移之蛋白酶。
蛋白酶可為金屬蛋白酶(MMP1-28)，包括膜結合(MMP14-17及MMP24-25)及分泌之形式(MMP1-13及MMP18-23及MMP26-28)。蛋白酶可屬於蛋白酶之A解整合素及金屬蛋白酶(ADAM)及具有血小板反應蛋白模體之A解整合素或金屬蛋白酶(ADAMTS)家族。其他實例包括CD10 (CALLA)及前列腺特異性抗原(PSA)。在某些較佳實施例中，蛋白酶為纖維母細胞活化蛋白(FAPα)。應理解，蛋白酶可結合膜或不結合膜。
蛋白酶裂解位點為科學文獻中熟知，且容易用作使用此項技術中已知之公認合成技術包括在藥物-共軛物部分中之既定受質識別序列的基礎。
就表示在目標組織中細胞外濃度因表現變化、細胞運輸或在細胞內酶因疾病狀態引起之細胞溶解而變為細胞外酶之情況下上調/增加的蛋白酶而言，可利用經設計以藉由選自由以下組成之群的人類蛋白酶中之一者或精選子群選擇性可裂解的受質識別序列(MEROPS肽酶資料庫編號以圓括號提供；Rawlings N. D., Morton F. R., Kok, C. Y., Kong, J.及Barrett A. J. (2008) MEROPS: the peptidase database. Nucleic Acids Res. 36 Database issue, D320-325)：胃蛋白酶A (MER000885)、胃亞蛋白酶(MER000894)、膜天冬胺酸蛋白酶-2 (MER005870)、腎素(MER000917)、組織蛋白酶D (MER000911)、組織蛋白酶E (MER000944)、膜天冬胺酸蛋白酶-1 (MER005534)、天冬胺酸蛋白酶A (MER004981)、Mername-AA034肽酶(MER014038)、胃蛋白酶A4 (MER037290)、胃蛋白酶A5 (智人) (MER037291)、hCG1733572 (智人)型假定肽酶(MER107386)、天冬胺酸蛋白酶B假基因(MER004982)、CYMP g.p. (智人) (MER002929)、子族A1A未指定肽酶(MER181559)、小鼠乳腺腫瘤病毒反轉錄病毒蛋白酶(MER048030)、兔內源性反轉錄病毒內肽酶(MER043650)、S71相關人類內源性反轉錄病毒蛋白酶(MER001812)、RTVL-H型假定肽酶(MER047117)、RTVL-H型假定肽酶(MER047133)、RTVL-H型假定肽酶(MER047160)、RTVL-H型假定肽酶(MER047206)、RTVL-H型假定肽酶(MER047253)、RTVL-H型假定肽酶(MER047260)、RTVL-H型假定肽酶(MER047291)、RTVL-H型假定肽酶(MER047418)、RTVL-H型假定肽酶(MER047440)、RTVL-H型假定肽酶(MER047479)、RTVL-H型假定肽酶(MER047559)、RTVL-H型假定肽酶(MER047583)、RTVL-H型假定肽酶(MER015446)、人類內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶同源物1 (MER015479)、人類內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶同源物2 (MER015481)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因1 (智人染色體14) (MER029977)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因2 (智人染色體8) (MER029665)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因3 (智人染色體17) (MER002660)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因3 (智人染色體17) (MER030286)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因3 (智人染色體17) (MER047144)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因5 (智人染色體12) (MER029664)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因6 (智人染色體7) (MER002094)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因7 (智人染色體6) (MER029776)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因8 (智人染色體Y) (MER030291)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因9 (智人染色體19) (MER029680)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因10 (智人染色體12) (MER002848)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因11 (智人染色體17) (MER004378)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因12 (智人染色體11) (MER003344)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因13 (智人染色體2及類似) (MER029779)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因14 (智人染色體2) (MER029778)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因15 (智人染色體4) (MER047158)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因15 (智人染色體4) (MER047332)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因15 (智人染色體4) (MER003182)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因16 (MER047165)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因16 (MER047178)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因16 (MER047200)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因16 (MER047315)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因16 (MER047405)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因16 (MER030292)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因17 (智人染色體8) (MER005305)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因18 (智人染色體4) (MER030288)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因19 (智人染色體16) (MER001740)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因21 (智人) (MER047222)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因21 (智人) (MER047454)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因21 (智人) (MER047477)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因21 (智人) (MER004403)、內源性反轉錄病毒反轉錄病毒蛋白酶假基因22 (智人染色體X) (MER030287)、子族A2A非肽酶同源物(MER047046)、子族A2A非肽酶同源物(MER047052)、子族A2A非肽酶同源物(MER047076)、子族A2A非肽酶同源物(MER047080)、子族A2A非肽酶同源物(MER047088)、子族A2A非肽酶同源物(MER047089)、子族A2A非肽酶同源物(MER047091)、子族A2A非肽酶同源物(MER047092)、子族A2A非肽酶同源物(MER047093)、子族A2A非肽酶同源物(MER047094)、子族A2A非肽酶同源物(MER047097)、子族A2A非肽酶同源物(MER047099)、子族A2A非肽酶同源物(MER047101)、子族A2A非肽酶同源物(MER047102)、子族A2A非肽酶同源物(MER047107)、子族A2A非肽酶同源物(MER047108)、子族A2A非肽酶同源物(MER047109)、子族A2A非肽酶同源物(MER047110)、子族A2A非肽酶同源物(MER047111)、子族A2A非肽酶同源物(MER047114)、子族A2A非肽酶同源物(MER047118)、子族A2A非肽酶同源物(MER047121)、子族A2A非肽酶同源物(MER047122)、子族A2A非肽酶同源物(MER047126)、子族A2A非肽酶同源物(MER047129)、子族A2A非肽酶同源物(MER047130)、子族A2A非肽酶同源物(MER047134)、子族A2A非肽酶同源物(MER047135)、子族A2A非肽酶同源物(MER047137)、子族A2A非肽酶同源物(MER047140)、子族A2A非肽酶同源物(MER047141)、子族A2A非肽酶同源物(MER047142)、子族A2A非肽酶同源物(MER047148)、子族A2A非肽酶同源物(MER047149)、子族A2A非肽酶同源物(MER047151)、子族A2A非肽酶同源物(MER047154)、子族A2A非肽酶同源物(MER047155)、子族A2A非肽酶同源物(MER047156)、子族A2A非肽酶同源物(MER047157)、子族A2A非肽酶同源物(MER047159)、子族A2A非肽酶同源物(MER047161)、子族A2A非肽酶同源物(MER047163)、子族A2A非肽酶同源物(MER047166)、子族A2A非肽酶同源物(MER047171)、子族A2A非肽酶同源物(MER047173)、子族A2A非肽酶同源物(MER047174)、子族A2A非肽酶同源物(MER047179)、子族A2A非肽酶同源物(MER047183)、子族A2A非肽酶同源物(MER047186)、子族A2A非肽酶同源物(MER047190)、子族A2A非肽酶同源物(MER047191)、子族A2A非肽酶同源物(MER047196)、子族A2A非肽酶同源物(MER047198)、子族A2A非肽酶同源物(MER047199)、子族A2A非肽酶同源物(MER047201)、子族A2A非肽酶同源物(MER047202)、子族A2A非肽酶同源物(MER047203)、子族A2A非肽酶同源物(MER047204)、子族A2A非肽酶同源物(MER047205)、子族A2A非肽酶同源物(MER047207)、子族A2A非肽酶同源物(MER047208)、子族A2A非肽酶同源物(MER047210)、子族A2A非肽酶同源物(MER047211)、子族A2A非肽酶同源物(MER047212)、子族A2A非肽酶同源物(MER047213)、子族A2A非肽酶同源物(MER047215)、子族A2A非肽酶同源物(MER047216)、子族A2A非肽酶同源物(MER047218)、子族A2A非肽酶同源物(MER047219)、子族A2A非肽酶同源物(MER047221)、子族A2A非肽酶同源物(MER047224)、子族A2A非肽酶同源物(MER047225)、子族A2A非肽酶同源物(MER047226)、子族A2A非肽酶同源物(MER047227)、子族A2A非肽酶同源物(MER047230)、子族A2A非肽酶同源物(MER047232)、子族A2A非肽酶同源物(MER047233)、子族A2A非肽酶同源物(MER047234)、子族A2A非肽酶同源物(MER047236)、子族A2A非肽酶同源物(MER047238)、子族A2A非肽酶同源物(MER047239)、子族A2A非肽酶同源物(MER047240)、子族A2A非肽酶同源物(MER047242)、子族A2A非肽酶同源物(MER047243)、子族A2A非肽酶同源物(MER047249)、子族A2A非肽酶同源物(MER047251)、子族A2A非肽酶同源物(MER047252)、子族A2A非肽酶同源物(MER047254)、子族A2A非肽酶同源物(MER047255)、子族A2A非肽酶同源物(MER047263)、子族A2A非肽酶同源物(MER047265)、子族A2A非肽酶同源物(MER047266)、子族A2A非肽酶同源物(MER047267)、子族A2A非肽酶同源物(MER047268)、子族A2A非肽酶同源物(MER047269)、子族A2A非肽酶同源物(MER047272)、子族A2A非肽酶同源物(MER047273)、子族A2A非肽酶同源物(MER047274)、子族A2A非肽酶同源物(MER047275)、子族A2A非肽酶同源物(MER047276)、子族A2A非肽酶同源物(MER047279)、子族A2A非肽酶同源物(MER047280)、子族A2A非肽酶同源物(MER047281)、子族A2A非肽酶同源物(MER047282)、子族A2A非肽酶同源物(MER047284)、子族A2A非肽酶同源物(MER047285)、子族A2A非肽酶同源物(MER047289)、子族A2A非肽酶同源物(MER047290)、子族A2A非肽酶同源物(MER047294)、子族A2A非肽酶同源物(MER047295)、子族A2A非肽酶同源物(MER047298)、子族A2A非肽酶同源物(MER047300)、子族A2A非肽酶同源物(MER047302)、子族A2A非肽酶同源物(MER047304)、子族A2A非肽酶同源物(MER047305)、子族A2A非肽酶同源物(MER047306)、子族A2A非肽酶同源物(MER047307)、子族A2A非肽酶同源物(MER047310)、子族A2A非肽酶同源物(MER047311)、子族A2A非肽酶同源物(MER047314)、子族A2A非肽酶同源物(MER047318)、子族A2A非肽酶同源物(MER047320)、子族A2A非肽酶同源物(MER047321)、子族A2A非肽酶同源物(MER047322)、子族A2A非肽酶同源物(MER047326)、子族A2A非肽酶同源物(MER047327)、子族A2A非肽酶同源物(MER047330)、子族A2A非肽酶同源物(MER047333)、子族A2A非肽酶同源物(MER047362)、子族A2A非肽酶同源物(MER047366)、子族A2A非肽酶同源物(MER047369)、子族A2A非肽酶同源物(MER047370)、子族A2A非肽酶同源物(MER047371)、子族A2A非肽酶同源物(MER047375)、子族A2A非肽酶同源物(MER047376)、子族A2A非肽酶同源物(MER047381)、子族A2A非肽酶同源物(MER047383)、子族A2A非肽酶同源物(MER047384)、子族A2A非肽酶同源物(MER047385)、子族A2A非肽酶同源物(MER047388)、子族A2A非肽酶同源物(MER047389)、子族A2A非肽酶同源物(MER047391)、子族A2A非肽酶同源物(MER047394)、子族A2A非肽酶同源物(MER047396)、子族A2A非肽酶同源物(MER047400)、子族A2A非肽酶同源物(MER047401)、子族A2A非肽酶同源物(MER047403)、子族A2A非肽酶同源物(MER047406)、子族A2A非肽酶同源物(MER047407)、子族A2A非肽酶同源物(MER047410)、子族A2A非肽酶同源物(MER047411)、子族A2A非肽酶同源物(MER047413)、子族A2A非肽酶同源物(MER047414)、子族A2A非肽酶同源物(MER047416)、子族A2A非肽酶同源物(MER047417)、子族A2A非肽酶同源物(MER047420)、子族A2A非肽酶同源物(MER047423)、子族A2A非肽酶同源物(MER047424)、子族A2A非肽酶同源物(MER047428)、子族A2A非肽酶同源物(MER047429)、子族A2A非肽酶同源物(MER047431)、子族A2A非肽酶同源物(MER047434)、子族A2A非肽酶同源物(MER047439)、子族A2A非肽酶同源物(MER047442)、子族A2A非肽酶同源物(MER047445)、子族A2A非肽酶同源物(MER047449)、子族A2A非肽酶同源物(MER047450)、子族A2A非肽酶同源物(MER047452)、子族A2A非肽酶同源物(MER047455)、子族A2A非肽酶同源物(MER047457)、子族A2A非肽酶同源物(MER047458)、子族A2A非肽酶同源物(MER047459)、子族A2A非肽酶同源物(MER047463)、子族A2A非肽酶同源物(MER047468)、子族A2A非肽酶同源物(MER047469)、子族A2A非肽酶同源物(MER047470)、子族A2A非肽酶同源物(MER047476)、子族A2A非肽酶同源物(MER047478)、子族A2A非肽酶同源物(MER047483)、子族A2A非肽酶同源物(MER047488)、子族A2A非肽酶同源物(MER047489)、子族A2A非肽酶同源物(MER047490)、子族A2A非肽酶同源物(MER047493)、子族A2A非肽酶同源物(MER047494)、子族A2A非肽酶同源物(MER047495)、子族A2A非肽酶同源物(MER047496)、子族A2A非肽酶同源物(MER047497)、子族A2A非肽酶同源物(MER047499)、子族A2A非肽酶同源物(MER047502)、子族A2A非肽酶同源物(MER047504)、子族A2A非肽酶同源物(MER047511)、子族A2A非肽酶同源物(MER047513)、子族A2A非肽酶同源物(MER047514)、子族A2A非肽酶同源物(MER047515)、子族A2A非肽酶同源物(MER047516)、子族A2A非肽酶同源物(MER047520)、子族A2A非肽酶同源物(MER047533)、子族A2A非肽酶同源物(MER047537)、子族A2A非肽酶同源物(MER047569)、子族A2A非肽酶同源物(MER047570)、子族A2A非肽酶同源物(MER047584)、子族A2A非肽酶同源物(MER047603)、子族A2A非肽酶同源物(MER047604)、子族A2A非肽酶同源物(MER047606)、子族A2A非肽酶同源物(MER047609)、子族A2A非肽酶同源物(MER047616)、子族A2A非肽酶同源物(MER047619)、子族A2A非肽酶同源物(MER047648)、子族A2A非肽酶同源物(MER047649)、子族A2A非肽酶同源物(MER047662)、子族A2A非肽酶同源物(MER048004)、子族A2A非肽酶同源物(MER048018)、子族A2A非肽酶同源物(MER048019)、子族A2A非肽酶同源物(MER048023)、子族A2A非肽酶同源物(MER048037)、子族A2A未指定肽酶(MER047164)、子族A2A未指定肽酶(MER047231)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2 (MER124239)、ETL蛋白(MER126267)、G蛋白偶合受體112 (MER126114)、七跨膜螺旋受體(MER125448)、Gpr114蛋白(MER159320)、GPR126血管誘導性G蛋白偶合受體(MER140015)、GPR125 (智人)型蛋白(MER159279)、GPR116 (智人)型 G蛋白偶合受體(MER159280)、GPR128 (智人)型 G蛋白偶合受體(MER162015)、GPR133 (智人)型蛋白(MER159334) GPR110 G蛋白偶合受體(MER159277)、GPR97蛋白(MER159322)、KPG_006蛋白(MER161773) KPG_008蛋白(MER161835)、KPG_009蛋白(MER159335)、未指定同源物(MER166269)、GPR113蛋白(MER159352)、腦特定血管生成抑制劑2 (MER159746)、PIDD自動加工蛋白單元1 (MER020001)、PIDD自動加工蛋白單元2 (MER063690)、MUC1自裂解黏蛋白(MER074260)、營養不良聚糖蛋白(MER054741)、前蛋白轉化酶9 (MER022416)、site-1肽酶(MER001948)、弗林蛋白酶(MER000375)、前蛋白轉化酶1 (MER000376)、前蛋白轉化酶2 (MER000377)、前蛋白轉化酶4 (MER028255)、PACE4前蛋白轉化酶(MER000383)、前蛋白轉化酶5 (MER002578)、前蛋白轉化酶7 (MER002984)、三肽基-肽酶II (MER000355)、子族S8A非肽酶同源物(MER201339)、子族S8A非肽酶同源物(MER191613)、子族S8A未指定肽酶(MER191611)、子族S8A未指定肽酶(MER191612)、子族S8A未指定肽酶(MER191614)、三肽基-肽酶I (MER003575)、脯胺醯基寡肽酶(MER000393)、二肽基-肽酶IV (真核生物) (MER000401)、醯基胺基醯基-肽酶(MER000408)、纖維母細胞活化蛋白α 次單元(MER000399)、PREPL A蛋白(MER004227)、二肽基-肽酶8 (MER013484)、二肽基-肽酶9 (MER004923)、FLJ1假定肽酶(MER017240)、Mername-AA194假定肽酶(MER017353)、Mername-AA195假定肽酶(MER017367)、Mername-AA196假定肽酶(MER017368)、Mername-AA197假定肽酶(MER017371)、C14orf29蛋白(MER033244)、假定蛋白(MER033245)、假定酯酶/脂肪酶/硫酯酶(MER047309)、蛋白質bat5 (MER037840)、假定蛋白flj40219 (MER033212)、假定蛋白flj37464 (MER033240)、假定蛋白flj33678 (MER033241)、二肽基肽酶同源物DPP6 (MER000403)、二肽基肽酶同源物DPP10 (MER005988)、蛋白質類似於小家鼠染色體20開放閱讀框135之蛋白質(MER037845)、犬尿胺酸甲醯胺酶(MER046020)、甲狀球蛋白前驅體(MER011604)、乙醯膽鹼酯酶(MER033188)、膽鹼酯酶(MER033198)、羧酸酯酶D1 (MER033213)、肝羧酸酯酶(MER033220)、羧酸酯酶3 (MER033224)、羧酸酯酶2 (MER033226)、膽汁鹽依賴性脂肪酶(MER033227)、羧酸酯酶相關蛋白(MER033231)、神經連接蛋白3 (MER033232)、神經連接蛋白4、X連鎖(MER033235)、神經連接蛋白4、Y連鎖(MER033236)、酯酶D (MER043126)、芳基乙醯胺去乙醯酶(MER033237)、KIAA1363樣蛋白(MER033242)、激素敏感性脂肪酶(MER033274)、神經連接蛋白1 (MER033280)、神經連接蛋白2 (MER033283)、家族S9非肽酶同源物(MER212939)、家族S9非肽酶同源物(MER211490)、子族S9C未指定肽酶(MER192341)、家族S9未指定肽酶(MER209181)、家族S9未指定肽酶(MER200434)、家族S9未指定肽酶(MER209507)、家族S9未指定肽酶(MER209142)、絲胺酸羧基肽酶A (MER000430)、卵黃羧基肽酶樣蛋白(MER005492)、RISC肽酶(MER010960)、家族S15未指定肽酶(MER199442)、家族S15未指定肽酶(MER200437)、家族S15未指定肽酶(MER212825)、溶酶體Pro-Xaa羧基肽酶(MER000446)、二肽基-肽酶II (MER004952)、胸腺特定絲胺酸肽酶(MER005538)、環氧化物水解酶樣假定肽酶(MER031614)、Loc328574樣蛋白(MER033246)、含自水解酶結構域之蛋白4 (MER031616)、環氧化物水解酶(MER000432)、中胚層特定轉錄蛋白(MER199890)、中胚層特定轉錄蛋白(MER017123)、胞溶質環氧化物水解酶(MER029997)、胞溶質環氧化物水解酶(MER213866)、類似於假定蛋白FLJ22408 (MER031608)、CGI-58假定肽酶(MER030163)、威廉姆斯-博伊倫症候群關鍵區蛋白21 環氧化物水解酶(MER031610)、環氧化物水解酶(MER031612)、假定蛋白flj22408 (環氧化物水解酶) (MER031617)、單甘油酸酯脂肪酶(MER033247)、假定蛋白(MER033249)、發昔洛韋水解酶(MER033259)、Ccg1相互作用因子b (MER210738)。
在一些實施例中，受質識別序列為長度達15個胺基酸之肽部分。受質識別序列藉由蛋白酶裂解。在一些實施例中，蛋白酶與細胞結合部分之目標共同位於組織中，且當結合子-藥物共軛物暴露於蛋白酶時蛋白酶使藥物-共軛物部分中之受質識別序列裂解。在一些實施例中，蛋白酶無活性，或在不顯著表現細胞表面特徵之組織中活性顯著較小。在一些實施例中，蛋白酶無活性，或在健康，例如未患病組織中活性顯著較小。
在某些實施例中，受質識別序列藉由選自以下之蛋白酶裂解： •   ADAMS或ADAMTS，例如ADAM8、ADAM9、ADAM10、ADAM12、ADAM15、ADAM17/TACE、ADAMDEC1、ADAMTS1、ADAMTS4或ADAMTS5。 •   天冬胺酸蛋白酶，例如BACE或腎素。 •   天冬胺酸組織蛋白酶(在細胞外空間中藉由細胞溶解上調或釋放之情況下)，例如組織蛋白酶D或組織蛋白酶E。 •   凋亡蛋白酶(在細胞外空間中藉由細胞溶解上調或釋放之情況下)，例如凋亡蛋白酶1、凋亡蛋白酶2、凋亡蛋白酶3、凋亡蛋白酶4、凋亡蛋白酶5、凋亡蛋白酶6、凋亡蛋白酶7、凋亡蛋白酶8、凋亡蛋白酶9、凋亡蛋白酶10或凋亡蛋白酶14。 •   半胱胺酸組織蛋白酶，例如組織蛋白酶B、組織蛋白酶C、組織蛋白酶K、組織蛋白酶L、組織蛋白酶S、組織蛋白酶V/L2、組織蛋白酶X/Z/P。 •   半胱胺酸蛋白酶，例如克魯茲蛋白酶(Cruzipain)、豆莢蛋白或Otubain-2。 •   KLK，例如KLK4、KLK5、KLK6、KLK7、KLK8、KLK10、KLK11、KLK13或KLK14。 •   金屬蛋白酶，例如穿膜肽酶、腦啡肽酶、PSMA或BMP-1， •   MMP，例如MMP1、MMP2、MMP3、MMP7、MMP8、MMP9、MMP10、MMP11、MMP12、MMP13、MMP14、MMP15、MMP16、MMP17、MMP19、MMP20、MMP23、MMP24、MMP26、MMP27。 •   絲胺酸蛋白酶，例如活化蛋白C、組織蛋白酶A、組織蛋白酶G、凝乳酶、凝血因子蛋白酶(例如FVIIa、FIXa、FXa、FXIa、FXIIa)、彈性蛋白酶、顆粒酶B、胍基苯甲酸酶、HtrA1、人類嗜中性白血球彈性蛋白酶、乳鐵傳遞蛋白、馬拉蛋白、NS3/4A、PACE4、纖溶酶、PSA、tPA、凝血酶、類胰蛋白酶或uPA。 •   II型跨膜絲胺酸蛋白酶(TTSP)，例如DESC1、DPP-4、FAP、肝絲酶、間質蛋白酶-2、MT-SP1/間質蛋白酶、TMPRSS2、TMPRSS3、TMPRSS4。
舉例而言，結合子-藥物共軛物中可包括之合適受質識別序列，亦即SRS，為選自由以下組成之群的肽部分：TGRGPSWV、SARGPSRW、TARGPSFK、LSGRSDNH、GGWHTGRN、HTGRSGAL、PLTGRSGG、AARGPAIH、RGPAFNPM、SSRGPAYL、RGPATPIM、RGPA、GGQPSGMWGW、FPRPLGITGL、VHMPLGFLGP、SPLTGRSG、SAGFSLPA、LAPLGLQRR、SGGPLGVR、PLGL、GPRSFGL及GPRSFG。
在一些實施例中，受質識別序列為MMP受質，諸如選自由以下組成之群的序列：ISSGLLSS、QNQALRMA、AQNLLGMV、STFPFGMF、PVGYTSSL、DWLYWPGI、MIAPVAYR、RPSPMWAY、WATPRPMR、FRLLDWQW、LKAAPRWA、GPSHLVLT、LPGGLSPW、MGLFSEAG、SPLPLRVP、RMHLRSLG、LAAPLGLL、AVGLLAPP、LLAPSHRA、PAGLWLDP及ISSGLSS。
在一些實施例中，受質識別序列為MMP受質，諸如選自由以下組成之群的序列：ISSGLSS、QNQALRMA、AQNLLGMV、STFPFGMF、PVGYTSSL、DWLYWPGI、ISSGLLSS、LKAAPRWA、GPSHLVLT、LPGGLSPW、MGLFSEAG、SPLPLRVP、RMHLRSLG、LAAPLGLL、AVGLLAPP、LLAPSHRA及PAGLWLDP。
在一些實施例中，受質識別序列為凝血酶受質，諸如GPRSFGL或GPRSFG。
在主題結合子-藥物共軛物之某些實施例中，受質識別序列藉由纖維母細胞活化蛋白α (FAPα)裂解且由下式表示：
Figure 02_image021
其中 R2 表示H或(C1 -C6 )烷基，且較佳為H； R3 表示H或(C1 -C6 )烷基，較佳為甲基、乙基、丙基或異丙基，且更佳甲基； R4 不存在或表示(C1 -C6 )烷基、-OH、-NH2 或鹵素； X表示O或S；且 若L2 為自我分解型連接子，則-NH-表示作為L2 之部分的胺，或若L2 為一鍵，則為DM之部分。
在某些實施例中，R2 為H，R3 為甲基，R4 不存在且X為O。 b.     自我分解
本發明之結合子-藥物共軛物可採用共價連接至藥物部分及可裂解受質識別序列部分之雜環自我分解型部分。自我分解型部分可定義為能夠將兩個間隔開之化學部分一同共價連接成通常穩定分子的雙官能化學基團，藉助於酶促裂解自該分子釋放該等間隔開之化學部分中之一者，以及在該酶促裂解之後，自雙官能化學基團之剩餘部分自然地裂解，從而釋放該等間隔開之化學部分中的另一者。根據本發明，該自我分解型部分在其末端中之一端，直接或間接經由間隔子單元，藉由醯胺鍵共價連接至配位體，且在其另一端共價連接至側接藥物之化學反應位點(官能基)。用該自我分解型部分將藥物部分衍生可致使藥物藥理學上活性較小(例如較小毒性)或無活性，直至藥物裂解。
結合子-藥物共軛物一般在循環中穩定，或至少在不存在能夠使受質識別序列與自我分解型部分之間的醯胺鍵裂解的酶下應如此。然而，在結合子-藥物共軛物暴露於合適酶時，醯胺鍵裂解，引發自發的自我分解型反應從而引起共價連接自我分解型部分至藥物之鍵的裂解，藉此影響游離藥物部分呈其未衍生化或藥理學活性形式釋放。
本發明之共軛物中的自我分解型部分併有一或多個雜原子且藉此提高溶解性，提高裂解速率且減小共軛物聚集之傾向。本發明之雜環自分解型連接子構築體優於非雜環PAB型連接子的此等提高可產生出人意料及意外之生物特性，諸如增加功效、減少毒性及更合意之藥物動力學。
在某些實施例中，L2 為苄氧羰基。
在某些實施例中，L2 為
Figure 02_image023
， 其中R1 為氫、未經取代或經取代之C1-3 烷基或未經取代或經取代之雜環基。在某些實施例中，R1 為氫。在某些情況下，R1 為甲基。
在某些實施例中，L2 係選自
Figure 02_image025
。
在某些實施例中，自我分解型部分L2 係選自
Figure 02_image027
其中 U為O、S或NR6 ； Q為CR4 或N； V1 、V2 及V3 獨立地為CR4 或N，限制條件為對於式II及III，Q、V1 及V2 中之至少一者為N； T為側接該藥物部分之NH、NR6 、O或S； R1 、R2 、R3 及R4 獨立地選自H、F、Cl、Br、I、OH、-N(R5 )2 、-N(R5 )3 + 、C1 -C8 烷基鹵、羧酸酯、硫酸酯、胺基磺酸酯、磺酸酯、-SO2 R5 、-S(═O)R5 、-SR5 、-SO2 N(R5 )2 、-C(═O)R5 、-CO2 R5 、-C(═O)N(R5 )2 、-CN、-N3 、-NO2 、C1 -C8 烷氧基、C1 -C8 鹵取代烷基、聚伸乙基氧基、膦酸酯、磷酸酯、C1 -C8 烷基、C1 -C8 取代烷基、C2 -C8 烯基、C2 -C8 取代烯基、C2 -C8 炔基、C2 -C8 取代炔基、C6 -C20 芳基、C6 -C20 取代芳基、C1 -C20 雜環及C1 -C20 取代雜環；或當一起採用時，R2 及R3 形成羰基(═O)或3至7個碳原子之螺碳環；且 R5 及R6 獨立地選自H、C1 -C8 烷基、C1 -C8 取代烷基、C2 -C8 烯基、C2 -C8 取代烯基、C2 -C8 炔基、C2 -C8 取代炔基、C6 -C20 芳基、C6 -C20 取代芳基、C1 -C20 雜環及C1 -C20 取代雜環； 其中C1 -C8 取代烷基、C2 -C8 取代烯基、C2 -C8 取代炔基、C6 -C20 取代芳基及C2 -C20 取代雜環獨立地經一或多個選自以下之取代基取代：F、Cl、Br、I、OH、-N(R5 )2 、-N(R5 )3 + 、C1 -C8 烷基鹵、羧酸酯、硫酸酯、胺基磺酸酯、磺酸酯、C1 -C8 烷基磺酸酯、C1 -C8 烷基胺基、4-二烷基胺基吡錠、C1 -C8 烷基羥基、C1 -C8 烷基硫醇、-SO2 R5 、-S(═O)R5 、-SR5 、-SO2 N(R5 )2 、-C(═O)R5 、-CO2 R5 、-C(═O)N(R5 )2 、-CN、-N3 、-NO2 、C1 -C8 烷氧基、C1 -C8 三氟烷基、C1 -C8 烷基、C3 -C12 碳環、C6 -C20 芳基、C2 -C20 雜環、聚伸乙基氧基、膦酸酯及磷酸酯。
應瞭解當T為NH時，其衍生自側接藥物部分之一級胺(-NH2)(在偶合至該自我分解型部分前)，且當T為N時，其衍生自側接藥物部分之二級胺(-NH-)(在偶合至該自我分解型部分前)。類似地，當T為O或S時，其衍生自分別在偶合至該自我分解型部分前側接藥物部分之羥基(-OH)或硫氫基(-SH)。
在某些實施例中，自我分解型部分L2 為-NH-(CH2 )4 -C(=O)-或-NH-(CH2 )3 -C(=O)-。
在某些實施例中，自我分解型部分L2 為對胺基苄氧羰基(PABC)。
在某些實施例中，自我分解型部分L2 為2,4-雙(羥基甲基)苯胺。
適用於本發明中之其他例示性自分解型連接子教示於以下中：例如美國專利US7754681、WO2012074693A1、US9089614、EP1732607A2、WO2015038426A1 (皆以引用的方式併入)；Walther等人 「Prodrugs in medicinal chemistry and enzyme prodrug therapies」 Adv Drug Deliv Rev. 2017年9月1日;118:65-77；及Tranoy-Opalinski等人 「Design of self-immolative linkers for tumour-activated prodrug therapy」, Anticancer Agents Med Chem. 2008年8月;8(6):618-37；各者之教示內容以引用的方式併入本文中。 c.   藥物部分
各種藥物實體可用作主題結合子藥物共軛物之藥物部分DM。
在某些實施例中，游離藥物部分為免疫調節劑，其包括充當免疫活化劑及/或先天性免疫路徑反應誘導劑之藥物部分。在某些實施例中，游離藥物部分誘發IFN-α之產生。在某些實施例中，游離藥物部分誘發促炎性細胞介素之產生。在某些實施例中，游離藥物部分誘發IL-1β之產生。在某些實施例中，游離藥物部分誘發IL-18之產生。
在某些實施例中，游離藥物部分促進包括NK、γδT及CD8+ T細胞之擴增及存活。
在某些實施例中，游離藥物部分誘發巨噬細胞細胞焦亡。(i) 例示性免疫 -DASH 抑制劑
在某些實施例中，用於本發明方法之免疫-DASH抑制劑由以下通式表示；
Figure 02_image029
其中 A表示包括N及Cα碳之4-8員雜環； Z表示C或N； W表示-CN、-CH═NR5、
Figure 02_image031
； R'1表示C端連接之胺基酸殘基或胺基酸類似物或C端連接之肽或肽類似物，其胺末端與L1形成共價鍵或若L1為一鍵，則與受質識別序列形成共價鍵； R'2不存在或表示環A之一或多個取代基，各獨立地為鹵素、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、羰基(諸如羧基、酯、甲酸酯或酮)、硫羰基(諸如硫酯、硫代乙酸酯或硫代甲酸酯)、胺基、醯基胺基、醯胺基、氰基、硝基、疊氮基、硫酸酯、磺酸酯、磺醯胺基、-(CH2 )m -R7、-(CH2 )m -OH、-(CH2 )m -O-低碳烷基、-(CH2 )m -O-低碳烯基、-(CH2)n -O-(CH2 )m -R7、-(CH2 )m -SH、-(CH2 )m -S-低碳烷基、-(CH2 )m -S-低碳烯基、-(CH2)n -S-(CH2 )m -R7； 若X為N，則R'3表示氫，若X為C，則R'3表示氫或鹵素、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、羰基(諸如羧基、酯、甲酸酯或酮)、硫羰基(諸如硫酯、硫代乙酸酯或硫代甲酸酯)、胺基、醯基胺基、醯胺基、氰基、硝基、疊氮基、硫酸酯、磺酸酯、磺醯胺基、-(CH2 )m -R7、-(CH2 )m -OH、-(CH2 )m -O-低碳烷基、-(CH2 )m -O-低碳烯基、-(CH2 )n -O-(CH2)m -R7、-(CH2 )m -SH、-(CH2 )m -S-低碳烷基、-(CH2 )m -S-低碳烯基、-(CH2 )n -S-(CH2 )m -R7； R4表示氫、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、-(CH2 )m -R3、-(CH2 )n -OH、-(CH2 )n -O-低碳烷基、-(CH2 )n -O-烯基、-(CH2 )n -O-炔基、-(CH2 )n -O-(CH2 )m -R7、-(CH2 )n -SH、-(CH2 )n -S-低碳烷基、-(CH2 )n -S-低碳烯基、-(CH2 )n -S-低碳炔基、-(CH2 )n -S-(CH2 )m -R3、-C(O)C(O)NH2 或-C(O)C(O)OR8； R5表示H、烷基、烯基、炔基、-C(X1)(X2)X3、-(CH2 )m -R7、-(CH2 )n -OH、-(CH2 )n -O-烷基、-(CH2 )n -O-烯基、-(CH2 )n -O-炔基、-(CH2 )n -O-(CH2 )m -R7、-(CH2 )n -SH、-(CH2 )n -S-烷基、-(CH2 )n -S-烯基、-(CH2 )n -S-炔基、-(CH2 )n -S-(CH2 )m -R7、-C(O)C(O)NH2 或-C(O)C(O)OR'7； R6表示氫、鹵素、烷基、烯基、炔基、芳基、-(CH2)m -R7、-(CH2 )m -OH、-(CH2 )m -O-低碳烷基、-(CH2 )m -O-低碳烯基、-(CH2 )n -O-(CH2 )m -R7、-(CH2 )m -SH、-(CH2 )m -S-低碳烷基、-(CH2 )m -S-低碳烯基、-(CH2 )n -S-(CH2 )m -R7， R7每次出現時表示取代或未經取代之芳基、芳烷基、環烷基、環烯基或雜環； R'7每次出現時表示氫或取代或未經取代烷基、烯基、芳基、芳烷基、環烷基、環烯基或雜環；且 Y1及Y2可獨立或一起為OH或能夠水解成羥基之基團，包括其中Y1及Y2經由環結構中具有5至8個原子之環連接的環狀衍生物(諸如頻哪醇或其類似物)， R50表示O或S； R51表示N3 、SH2 、NH2 、NO2 或O-R'7； R52表示氫、低碳烷基、胺、OR'7或醫藥學上可接受之鹽，或R51及R52連同其附接之磷原子一起構成在環結構中具有5至8個原子之雜環； X1表示鹵素； X2及X3各表示氫或鹵素； m為0或1至8範圍內之整數；且 n為1至8範圍內之整數。
在較佳實施例中，環A為5、6或7員環，例如由下式表示：
Figure 02_image033
且更佳為5或6員環(亦即n為1或2，不過n亦可為3或4)。環可視情況進一步經取代。
在較佳實施例中，W表示
Figure 02_image035
。
在較佳實施例中，R'1為
Figure 02_image037
其中R36為小疏水性基團，例如低碳烷基或鹵素且R38為氫，或R36及R37一起形成包括N及Cα碳之4-7員雜環，如以上針對A所定義。
在較佳實施例中，R'2不存在或表示小疏水性基團，諸如低碳烷基或鹵素。
在較佳實施例中，R'3為氫或小疏水性基團，諸如低碳烷基或鹵素。
在較佳實施例中，R'5為氫或鹵化低碳烷基。
在較佳實施例中，X1為氟且X2及X3若為鹵素，則為氟。
任何可水解轉化成前述化合物中之任一者的化合物，包括
Figure 108119354-A0304-12-02
酸酯及鹵化物，以及包括縮醛、半縮醛、縮酮及半縮酮之羰基同等物，以及環狀二肽類似物，亦視為同等物。
在某些較佳實施例中，主題方法利用胺基酸之
Figure 108119354-A0304-12-02
酸類似物作為免疫-DASH抑制劑。舉例而言，本發明涵蓋硼-脯胺醯基衍生物在主題方法中之使用。本發明之例示性
Figure 108119354-A0304-12-02
酸衍生抑制劑由以下通式表示：
Figure 02_image039
其中 R'1表示C端連接之胺基酸殘基或胺基酸類似物或C端連接之肽或肽類似物，其胺末端與形成共價鍵L1或若L1為一鍵，則與受質識別序列形成共價鍵；且 R11及R12各獨立地表示氫、烷基或醫藥學上可接受之鹽或R11及R12連同其附接之O-B-O原子一起構成在環結構中具有5至8個原子之雜環。
在某些實施例中，免疫-DASH抑制劑為在P1特異性位置包括脯胺醯基或其類似物且在P2特異性位置包括非極性(及較佳疏水性)胺基酸，例如非極性胺基酸，諸如丙胺酸、白胺酸、異白胺酸、纈胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、色胺酸或甲硫胺酸的肽或肽模擬物，或其類似物。在其他實施例中，P2位置為具有帶電側鏈之胺基酸，諸如精胺酸、離胺酸、天冬胺酸或麩胺酸。舉例而言，免疫-DASH抑制劑可包括Ala-Pro或Val-Pro二肽序列或其同等物，且如以下通式表示：
Figure 02_image041
。
在較佳實施例中，環A為5、6或7員環，例如由下式表示：
Figure 02_image043
。
在某些較佳實施例中，R32為小疏水性基團，例如低碳烷基或鹵素.
在某些較佳實施例中，R32為-低碳烷基-胍、-低碳-烷基-胺、低碳烷基-C(O)OH，諸如-(CH2 )m -NH-C(=N)(NH2 )、-(CH2 )m -NH2 或-(CH2 )m -COOH，其中m為1-6且較佳為1-3。
在較佳實施例中，R'2不存在或表示小疏水性基團，諸如低碳烷基或鹵素。
在較佳實施例中，R'3為氫或小疏水性基團，諸如低碳烷基或鹵素。
本發明之另一態樣係關於由式III表示之免疫-DASH抑制劑或其醫藥鹽：
Figure 02_image045
其中 環Z表示包括N及Cα碳之4-10員雜環； W表示-CN、-CH═NR4、與目標之活性位點殘基反應之官能基，或
Figure 02_image047
； X為O或S； X2為H、鹵素或低碳烷基； Y1及Y2獨立地為OH或連同其附接之硼原子一起表示可水解成
Figure 108119354-A0304-12-02
酸之基團或連同其附接之硼原子一起形成可水解成
Figure 108119354-A0304-12-02
酸之5-8員環； R1每次出現時獨立地表示鹵素、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、羰基、硫羰基、胺基、醯基胺基、醯胺基、氰基、硝基、疊氮基、硫酸酯、磺酸酯、磺醯胺基、-CF3 、-(CH2 )m -R3、-(CH2 )m OH、-(CH2 )m -O-低碳烷基、-(CH2 )m -O-低碳烯基、-(CH2 )n -O-(CH2 )m -R3、-(CH2 )m -SH、-(CH2 )m -S-低碳烷基、-(CH2 )m -S-低碳烯基或-(CH2 )n -S-(CH2 )m -R3； R2每次出現時表示氫、低碳烷基、低碳炔基、-(CH2 )m -R3、-C(═O)-烷基、-C(═O)-烯基、-C(═O)-炔基或-C(═O)-(CH2 )m -R3； R3每次出現時表示氫或取代或未經取代之低碳烷基、低碳烯基、芳基、芳烷基、環烷基、環烯基或雜環； R4表示氫、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、-(CH2 )m -R3、-(CH2 )n -OH、-(CH2 )n -O-低碳烷基、-(CH2 )n -O-烯基、-(CH2 )n -O-炔基、-(CH2 )n -O-(CH2 )m -R7、-(CH2 )n -SH、-(CH2 )n -S-低碳烷基、-(CH2 )n -S-低碳烯基、-(CH2 )n -S-低碳炔基、-(CH2 )n -S-(CH2 )m -R3、-C(O)C(O)NH2 或-C(O)C(O)OR8； R5表示O或S； R6表示N3 、SH、NH2 、NO2 或OR8； R7表示氫、低碳烷基、胺，OR8或醫藥學上可接受之鹽或R5及R6連同其附接之磷原子一起構成在環結構中具有5至8個原子之雜環； R8表示氫、取代或未經取代烷基、烯基、芳基、芳烷基、環烷基、環烯基或雜環基； R10不存在或表示其附接之環Z之一或三個取代，各獨立地為鹵素、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、羰基(諸如羧基、酯、甲酸酯或酮)、硫羰基(諸如硫酯、硫代乙酸酯或硫代甲酸酯)、胺基、醯基胺基、醯胺基、氰基、異氰基、硫氰基、異硫氰基、氰酸酯基、硝基、疊氮基、硫酸酯、磺酸酯、磺醯胺基、低碳烷基-C(O)OH、-O-低碳烷基-C(O)OH、-胍基、-(CH2 )m -R7、-(CH2 )m -OH、-(CH2 )m -O-低碳烷基、-(CH2 )m -O-低碳烯基、-(CH2 )n -O-(CH2 )m -R3、-(CH2 )m -SH、-(CH2 )m -S-低碳烷基、-(CH2 )m -S-低碳烯基、-(CH2 )n -S-(CH2 )m -R3； n為0、1、2或3；且 m為0、1、2或3。
本發明之另一態樣係關於由式IV表示之免疫-DASH抑制劑或其醫藥鹽：
Figure 02_image049
其中 環A表示包括N之3-10員環結構； 環Z表示包括N及Cα碳之4-10員雜環； W表示-CN、-CH═NR4、與目標之活性位點殘基反應之官能基，或
Figure 02_image051
； X為O或S； X1表示鹵素； Y1及Y2獨立地為OH或連同其附接之硼原子一起表示可水解成
Figure 108119354-A0304-12-02
酸之基團或連同其附接之硼原子一起形成可水解成
Figure 108119354-A0304-12-02
酸之5-8員環； R1表示鹵素、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、羰基、硫羰基、胺基、醯基胺基、醯胺基、氰基、硝基、疊氮基、硫酸酯、磺酸酯、磺醯胺基、-CF3、-(CH2)m-R3、-(CH2)mOH、-(CH2)m-O-低碳烷基、-(CH2)m-O-低碳烯基、-(CH2)n-O-(CH2)m-R3、-(CH2)m-SH、-(CH2)m-S-低碳烷基、-(CH2)m-S-低碳烯基或-(CH2)n-S-(CH2)m-R3； R2每次出現時表示氫、低碳烷基、低碳炔基、-(CH2)m-R3、-C(═O)-烷基、-C(═O)-烯基、-C(═O)-炔基或-C(═O)-(CH2)m-R3； R3每次出現時表示氫或取代或未經取代之低碳烷基、低碳烯基、芳基、芳烷基、環烷基、環烯基或雜環； R4表示氫、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、-(CH2)m-R3、-(CH2)n-OH、-(CH2)n-O-低碳烷基、-(CH2)n-O-烯基、-(CH2)n-O-炔基、-(CH2)n-O-(CH2)m-R7、-(CH2)n-SH、-(CH2)n-S-低碳烷基、-(CH2)n-S-低碳烯基、-(CH2)n-S-低碳炔基、-(CH2)n-S-(CH2)m-R3、-C(O)C(O)NH2或-C(O)C(O)OR8； R5表示O或S； R6表示N3 、SH、NH2 、NO2 或OR8； R7表示氫、低碳烷基、胺，OR8或醫藥學上可接受之鹽或R5及R6連同其附接之磷原子一起構成在環結構中具有5至8個原子之雜環； R8表示氫、取代或未經取代烷基、烯基、芳基、芳烷基、環烷基、環烯基或雜環基； R9及R10各獨立地不存在或表示其附接之環A或至環Z之一至三個取代，各獨立地為鹵素、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、羰基(諸如羧基、酯、甲酸酯或酮)、硫羰基(諸如硫酯、硫代乙酸酯或硫代甲酸酯)、胺基、醯基胺基、醯胺基、氰基、異氰基、硫氰基、異硫氰基、氰酸酯基、硝基、疊氮基、硫酸酯、磺酸酯、磺醯胺基、-(CH2)m-R7、-(CH2)m-OH、-(CH2)m-O-低碳烷基、-(CH2)m-O-低碳烯基、-(CH2)n-O-(CH2)m-R3、-(CH2)m-SH、-(CH2)m-S-低碳烷基、-(CH2)m-S-低碳烯基、-(CH2)n-S-(CH2)m-R3； n為0、1、2或3；且 m為0、1、2或3。
在某些較佳實施例中，免疫-DASH抑制劑為DASH酶DPP8及DPP9(及視情況亦為DPP-4及/或FAP)之
Figure 108119354-A0304-12-02
酸抑制劑。
在某些較佳實施例中，免疫-DASH抑制劑為DASH酶DPP8及DPP9(及視情況亦為DPP-4及/或FAP)之二肽
Figure 108119354-A0304-12-02
酸抑制劑。在某些較佳實施例中，免疫-DASH抑制劑二肽
Figure 108119354-A0304-12-02
酸在P1位置具有脯胺酸或脯胺酸類似物。主題免疫-DASH抑制劑可藉由免疫介導之機制介導腫瘤消退。主題免疫-DASH抑制劑誘發巨噬細胞之細胞焦亡，且直接或間接地具有諸如免疫原性調節之活性，使腫瘤細胞對抗原特異性CTL殺死敏感，改變免疫-細胞亞群及功能，經由調節樹突狀細胞遷移加速T細胞激活，及引起通用T細胞介導之抗腫瘤活性。
在某些實施例中，主題免疫-DASH抑制劑與PD-1抑制劑之組合可作為涉及一或多種其他化學治療劑、免疫腫瘤學藥劑或輻射之療法的一部分投與。其亦可用作包括腫瘤疫苗、授受細胞療法、基因療法、溶瘤病毒療法及其類似療法之療法的一部分。
在某些實施例中，本發明方法之免疫-DASH抑制劑由式I或其醫藥鹽表示：
Figure 02_image053
其中 環A表示3-10員環結構； 環Z表示包括N及Cα碳之4-10員雜環； W表示-CN、-CH═NR4、與目標之活性位點殘基反應之官能基，或
Figure 02_image055
； X為O或S； X1表示鹵素； Y1及Y2獨立地為OH或連同其附接之硼原子一起表示可水解成
Figure 108119354-A0304-12-02
酸之基團或連同其附接之硼原子一起形成可水解成
Figure 108119354-A0304-12-02
酸之5-8員環； R1表示鹵素、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、羰基、硫羰基、胺基、醯基胺基、醯胺基、氰基、硝基、疊氮基、硫酸酯、磺酸酯、磺醯胺基、-CF3、-(CH2)m-R3、-(CH2)mOH、-(CH2)m-O-低碳烷基、-(CH2)m-O-低碳烯基、-(CH2)n-O-(CH2)m-R3、-(CH2)m-SH、-(CH2)m-S-低碳烷基、-(CH2)m-S-低碳烯基或-(CH2)n-S-(CH2)m-R3； R2每次出現時表示氫、低碳烷基、低碳炔基、-(CH2)m-R3、-C(═O)-烷基、-C(═O)-烯基、-C(═O)-炔基或-C(═O)-(CH2)m-R3； R3每次出現時表示氫或取代或未經取代之低碳烷基、低碳烯基、芳基、芳烷基、環烷基、環烯基或雜環； R4表示氫、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、-(CH2)m-R3、-(CH2)n-OH、-(CH2)n-O-低碳烷基、-(CH2)n-O-烯基、-(CH2)n-O-炔基、-(CH2)n-O-(CH2)m-R7、-(CH2)n-SH、-(CH2)n-S-低碳烷基、-(CH2)n-S-低碳烯基、-(CH2)n-S-低碳炔基、-(CH2)n-S-(CH2)m-R3、-C(O)C(O)NH2或-C(O)C(O)OR8； R5表示O或S； R6表示N3 、SH、NH2 、NO2 或OR8； R7表示氫、低碳烷基、胺，OR8或醫藥學上可接受之鹽或R5及R6連同其附接之磷原子一起構成在環結構中具有5至8個原子之雜環； R8表示氫、取代或未經取代烷基、烯基、芳基、芳烷基、環烷基、環烯基或雜環基； R9及R10各獨立地不存在或表示其附接之環A或環Z的一個、兩個或三個取代，各獨立地為鹵素、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、羰基(諸如羧基、酯、甲酸酯或酮)、硫羰基(諸如硫酯、硫代乙酸酯或硫代甲酸酯)、胺基、醯基胺基、醯胺基、氰基、異氰基、硫氰基、異硫氰基、氰酸酯基、硝基、疊氮基、硫酸酯、磺酸酯、磺醯胺基、低碳烷基-C(O)OH、-O-低碳烷基-C(O)OH、-胍基;-(CH2)m-R7、-(CH2)m-OH、-(CH2)m-O-低碳烷基、-(CH2)m-O-低碳烯基、-(CH2)n-O-(CH2)m-R3、-(CH2)m-SH、-(CH2)m-S-低碳烷基、-(CH2)m-S-低碳烯基、-(CH2)n-S-(CH2)m-R3； n為0、1、2或3；且 m為0、1、2或3。
在某些實施例中，式I之免疫-DASH抑制劑以式Ia表示，或為其醫藥鹽：
Figure 02_image057
其中X、W、Z、R1 、R2 、R9 及R10 如以上針對式I所定義且p為1、2或3。
在Ia之某些較佳實施例中：R1 為低碳烷基；R9 不存在或每次出現時獨立地為低碳烷基、-OH、-NH2 、-N3 、-低碳烷基-C(O)OH、-O-低碳烷基、-O-低碳烷基-C(O)OH、-胍基；X為O；各R2 為氫，R10 不存在或表示-OH、-NH2 、-CN或-N3 之單個取代；且W為-B(OH)2 或-CN (且更佳為-B(OH)2)。
在某些實施例中，式I之免疫-DASH抑制劑以式Ib表示，或為其醫藥鹽：
Figure 02_image059
其中X、W、R1 、R2 、R9 及R10 如以上針對式I所定義且p為1、2或3。
在Ib之某些較佳實施例中：R1 為低碳烷基；R9 不存在或每次出現時獨立地為低碳烷基、-OH、-NH2 、-N3 、-低碳烷基-C(O)OH、-O-低碳烷基、-O-低碳烷基-C(O)OH、-胍基；X為O；各R2 為氫，R10 不存在或表示-OH、-NH2 、-CN或-N3 之單個取代；且W為-B(OH)2 或-CN (且更佳為-B(OH)2 )。
在某些實施例中，式I之免疫-DASH抑制劑以式Ic表示，或為其醫藥鹽：
Figure 02_image061
其中X、W、R1 、R2 、R9 及R10 如以上針對式I所定義且p為1、2或3。
在Ic之某些較佳實施例中：R1 為低碳烷基；R9 不存在或每次出現時獨立地為低碳烷基、-OH、-NH2 、-N3 、-低碳烷基-C(O)OH、-O-低碳烷基、-O-低碳烷基-C(O)OH、-胍基；X為O；各R2 為氫，R10 不存在或表示-OH、-NH2 、-CN或-N3 之單個取代；且W為-B(OH)2 或-CN (且更佳為-B(OH)2 )。
在一些實施例中，免疫-DASH抑制劑由以下表示：
Figure 02_image063
。
本發明之另一態樣係關於由式II表示之免疫-DASH抑制劑或其醫藥鹽：
Figure 02_image065
其中 環A與每次出現之R1a 一起表示7-12員多環環結構； 環Z表示包括N及Cα碳之4-10員雜環； W表示-CN、-CH═NR4 、與目標之活性位點殘基反應之官能基，或
Figure 02_image067
； X為O或S； X1 表示鹵素； Y為C或N； Y1 及Y2 獨立地為OH或連同其附接之硼原子一起表示可水解成
Figure 108119354-A0304-12-02
酸之基團或連同其附接之硼原子一起形成可水解成
Figure 108119354-A0304-12-02
酸之5-8員環； R1a表示低碳烷基、-(CH2 )m-、-(CH2 )m-O-(CH2 )m-；-(CH2 )m-N-(CH2 )m-；或-(CH2 )m-S-(CH2 )m-； R2 每次出現時表示氫、低碳烷基、低碳炔基、-(CH2 )m-R3 、-C(═O)-烷基、-C(═O)-烯基、-C(═O)-炔基或-C(═O)-(CH2 )m-R3 ； R3 每次出現時表示氫或取代或未經取代之低碳烷基、低碳烯基、芳基、芳烷基、環烷基、環烯基或雜環； R4 表示氫、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、-(CH2 )m -R3 、-(CH2 )n -OH、-(CH2 )n -O-低碳烷基、-(CH2 )n -O-烯基、-(CH2 )n -O-炔基、-(CH2 )n -O-(CH2 )m -R7 、-(CH2 )n -SH、-(CH2 )n -S-低碳烷基、-(CH2 )n -S-低碳烯基、-(CH2 )n -S-低碳炔基、-(CH2 )n -S-(CH2 )m -R3 、-C(O)C(O)NH2 或-C(O)C(O)OR8 ； R5 表示O或S； R6 表示N3 、SH、NH2 、NO2 或OR8 ； R7 表示氫、低碳烷基、胺，OR8 或醫藥學上可接受之鹽或R5 及R6 連同其附接之磷原子一起構成在環結構中具有5至8個原子之雜環； R8 表示氫、取代或未經取代烷基、烯基、芳基、芳烷基、環烷基、環烯基或雜環基； R9 及R10 各獨立地不存在或表示其附接之環A或環Z之一個、兩個或三個取代，各獨立地為鹵素、低碳烷基、低碳烯基、低碳炔基、羰基(諸如羧基、酯、甲酸酯或酮)、硫羰基(諸如硫酯、硫代乙酸酯或硫代甲酸酯)、胺基、醯基胺基、醯胺基、氰基、異氰基、硫氰基、異硫氰基、氰酸酯基、硝基、疊氮基、硫酸酯、磺酸酯、磺醯胺基、低碳烷基-C(O)OH、-O-低碳烷基-C(O)OH、-胍基;-(CH2 )m -R7 、-(CH2 )m -OH、-(CH2 )m -O-低碳烷基、-(CH2 )m -O-低碳烯基、-(CH2 )n -O-(CH2 )m-R3 、-(CH2 )m -SH、-(CH2 )m -S-低碳烷基、-(CH2 )m -S-低碳烯基、-(CH2 )n -S-(CH2 )m -R3 ； n為0、1、2或3； m為0、1、2或3；且 p為1、2或3。
在某些實施例中，式II之免疫-DASH抑制劑以式IIa表示，或為其醫藥鹽：
Figure 02_image069
其中X、W、Z、R2 、R9 及R10 如以上針對式II所定義。
在IIa之某些較佳實施例中：R9 每次出現時獨立地為低碳烷基、-OH、-NH2 、-N3 、-低碳烷基-C(O)OH、-O-低碳烷基、-O-低碳烷基-C(O)OH、-胍基；X為O；各R2 為氫，R10 不存在或表示-OH、-NH2 、-CN或-N3 之單個取代；且W為-B(OH)2 或-CN (且更佳為-B(OH)2)。
在某些實施例中，式II之免疫-DASH抑制劑以式IIb表示，或為其醫藥鹽：
Figure 02_image071
其中X、W、R2 、R9 及R10 如以上針對式II所定義。
在IIb之某些較佳實施例中：R9 每次出現時獨立地為低碳烷基、-OH、-NH2 、-N3 、-低碳烷基-C(O)OH、-O-低碳烷基、-O-低碳烷基-C(O)OH、-胍基；X為O；各R2 為氫，R10 不存在或表示-OH、-NH2 、-CN或-N3 之單個取代；且W為-B(OH)2 或-CN (且更佳為-B(OH)2 )。
在某些實施例中，式II之免疫-DASH抑制劑以式IIc表示，或為其醫藥鹽：
Figure 02_image073
其中X、W、R2 、R9 及R10 如以上針對式II所定義。
在IIc之某些較佳實施例中：R9 每次出現時獨立地為低碳烷基、-OH、-NH2 、-N3 、-低碳烷基-C(O)OH、-O-低碳烷基、-O-低碳烷基-C(O)OH、-胍基；X為O；各R2 為氫，R10 不存在或表示-OH、-NH2 、-CN或-N3之單個取代；且W為-B(OH)2 或-CN (且更佳為-B(OH)2 )。
在某些實施例中，式II之免疫-DASH抑制劑以式IId表示，或為其醫藥鹽：
Figure 02_image075
其中X、W、R2 、R9 及R10 如以上針對式II所定義。
在IId之某些較佳實施例中：R9 每次出現時獨立地為低碳烷基、-OH、-NH2 、-N3 、-低碳烷基-C(O)OH、-O-低碳烷基、-O-低碳烷基-C(O)OH、-胍基；X為O；各R2 為氫，R10 不存在或表示-OH、-NH2 、-CN或-N3 之單個取代；且W為-B(OH)2 或-CN (且更佳為-B(OH)2 )。
在某些實施例中，式II之免疫-DASH抑制劑以式IIe表示，或為其醫藥鹽：
Figure 02_image077
其中X、W、Z、R2 、R9 及R10 如以上針對式II所定義。
在IIe之某些較佳實施例中：R9 每次出現時獨立地為低碳烷基、-OH、-NH2 、-N3 、-低碳烷基-C(O)OH、-O-低碳烷基、-O-低碳烷基-C(O)OH、-胍基；X為O；各R2 為氫，R10 不存在或表示-OH、-NH2 、-CN或-N3之單個取代；Z為吡咯啶或哌啶環(且更佳為吡咯啶環)；且W為-B(OH)2 或-CN (且更佳為-B(OH)2 )。
在一些實施例中，免疫-DASH抑制劑為以下中之一者：
Figure 02_image079
Figure 02_image081
。(ii) 例示性 STING 促效劑
STING促效劑之非限制性實例包括以如下通式中之一者表示之促效劑：
Figure 02_image083
其中 X1 及X2 獨立地為O或S且較佳相同(O,O或S,S)； X3 及X4 獨立地為嘌呤，諸如鳥嘌呤或鳥嘌呤類似物或嘧啶且其中波形線指示與L1之共價附接位點或在L1為一鍵之情況下，與受質識別序列之共價附接位點； R1 及R2 獨立地為H、羥基、鹵素(較佳F或Cl)或視情況經取代之具有1至18個碳及0至3個雜原子之直鏈烷基、視情況經取代之具有1-9個碳之烯基、視情況經取代之具有1-9個碳之炔基或視情況經取代之芳基，其中取代基在存在時可獨立地選自由以下組成之群：直鏈或分支鏈C1-6 烷基、苯甲基、鹵素、三鹵甲基、C1-6 烷氧基、-NO2 、-NH2 、-OH、═O、-COOR'或-OR'，其中R1 及R2 皆不為H， R'為H或低碳烷基、-CH2 OH或-CONH2 。
在某些實施例中，STING促效劑以如下各式中之一者表示：
Figure 02_image085
在以上STING促效劑結構中，X3 及X4 可各獨立地為例如9-嘌呤、9-腺嘌呤、9-鳥嘌呤、9-次黃嘌呤、9-黃嘌呤、9-尿酸或9-異鳥嘌呤，限制條件為X3 或X4 之一包括在L2 為自分解型連接子下與L2 共享一鍵之官能基，或在L2 為一鍵下與DM共享一鍵之官能基。
X3 及X4 可相同或不同。
在一些實施例中，STING促效劑可呈主要Rp,Rp或Rp,Sp立體異構體形式提供。在一些實施例中，STING促效劑可呈主要Rp,Rp立體異構體形式提供。
例示性STING促效劑包括：
Figure 02_image087
Figure 02_image089
Figure 02_image091
Figure 02_image093
在某些實施例中，STING促效劑以如下各結構中之一者表示：
Figure 02_image095
。
可用作本發明結合子共軛物中之藥物部分的再一STING促效劑為
Figure 02_image097
。
僅僅舉例而言，適用作本發明之共軛物中之藥物部分的其他例示性STING促效劑教示於PCT公開案WO2017123669A1及WO2015077354A1以及美國專利公開案US20150056224A1 (各以引用的方式併入本文中)。
熟習此項技術者亦應瞭解，尤其在使用自分解型連接子下，STING促效劑可與連接子經由除如上所示之胺外之官能基，諸如經由游離羥基偶合。(iii) 例示性 TLR 促效劑
「類鐸受體(TLR)促效劑」之實例包括(但不限於)TLR1/2促效劑、TLR2促效劑、TLR3促效劑(例如PolyI:C)、TLR4促效劑(例如S型脂多醣、太平洋紫杉醇(paclitaxel)、脂質A及單磷醯基脂質A)、TLR5促效劑(例如鞭毛蛋白(flagellin))、TLR6/2促效劑(例如MALP-2)、TLR7促效劑、TLR7/8促效劑(例如嘎德莫特(gardiquimod)、咪喹莫特(imiquimod)、洛索立賓(loxoribine)及雷西莫特(R848))、TLR7/9促效劑(例如硫酸羥基氯奎(hydroxychloroquine sulfate))、TLR8促效劑(例如莫托莫特(motolimod) (VTX-2337))、TLR9促效劑(例如CpG-ODN)及TLR11促效劑(例如肌動蛋白抑制蛋白)。
可用作本發明之結合子共軛物中之藥物部分的例示性TRL促效劑包括S-27609、CL307、UC-IV150、咪喹莫特、嘎德莫特、雷西莫特、莫托莫特、VTS-1463GS-9620、GSK2245035、TMX-101、TMX-201、TMX-202、艾沙托立賓(isatoribine)、AZD8848、MEDI9197、3M-051、3M-852、3M-052、3M-854A、S-34240、KU34B或CL663或適當時具有用於直接連接及自受質識別序列釋放或藉由連接於自分解型連接子之適當官能基的其類似物。
例示性TRL促效劑、尤其TRL7促效劑、TRL8促效劑及TRL7/8促效劑包括：
Figure 108119354-A0304-0001
Figure 108119354-A0304-0002
Figure 02_image117
Figure 02_image119
在某些實施例中，藥物部分為以如下通式表示之TRL7/8促效劑：
Figure 02_image121
其中 X為CH2 、O、S或N，較佳CH2 、O或N，且更佳CH2 或O； n為0 (N至O為直接鍵)或整數1至5，較佳1或2； z為整數1至5； m為整數1至20，較佳1至16； p為0 (環至X為直接鍵)或整數1至5，較佳1或2；且 q為整數1至5，較佳1或2。
舉例而言，TRL促效劑為TRL7/8促效劑，諸如以下之一：
Figure 02_image123
。
公開案第WO2008135791號、第WO2016141092號亦描述具有經由TLR7起作用之免疫調節特性之咪唑并喹啉化合物類別。
適用作本發明之結合子共軛物之藥物部分的其他例示性TRL促效劑揭示於例如以下各者中：Yoo等人 「Structure-activity relationships in Toll-like receptor 7 agonistic 1H-imidazo[4,5-c]pyridines」 Org. Biomol. Chem., 2013, 11, 6526-6545；Fletcher等人 「Masked oral prodrugs of Toll-like receptor 7 agonists: a new approach for the treatment of infectious disease」, 2006 Current opinion in investigational drugs (London, England). 7. 702-708；及Pryde等人 「The discovery of a novel prototype small molecule TLR7 agonist for the treatment of hepatitis C virus infection」 Med. Chem. Commun., 2011, 2, 185-189。
熟習此項技術者亦應瞭解，尤其在使用自分解型連接子下，TRL促效劑可與連接子經由除如上所示之胺外之官能基，諸如經由游離羥基偶合。(iv) 例示性 RIG-1 促效劑
前述實施例中任一例之共軛物，其中該免疫刺激促效劑為RIG-I促效劑，其中該RIG-I促效劑為KIN700、KIN1148、KIN600、KIN500、KIN100、KIN101、KIN400、KIN2000或SB-9200。(v) 例示性蒽環黴素
在某些實施例中，藥物部分為蒽環黴素或其衍生物，較佳小紅莓或能夠誘發腫瘤細胞之免疫原性細胞死亡之其他類似物。
蒽環黴素及其類似物特別包括(但不限於)小紅莓、道諾黴素、表柔比星、艾達黴素、吡柔比星、伐柔比星(valrubicin)、阿克拉黴素、米托蒽醌、放射菌素、博萊黴素、普卡黴素(plicamycin)及絲裂黴素。舉例而言，蒽環黴素部分可由下式表示：
Figure 02_image125
其中 Rc 表示(C1 -C6 )烷基、(C1 -C6 )羥基烷基或(C1 -C6 )烷醯氧基(C1 -C6 )烷基，尤其甲基、羥基甲基、二乙氧基乙醯氧基甲基或丁醯氧基甲基； Rd 表示氫、羥基或(C1 -C6 )烷氧基，尤其甲氧基； Re 及Rf 中之一者表示氫原子；且另一者表示氫原子或羥基或四氫哌喃-2-基氧基(OTHP)。(vi) 例示性蛋白酶體抑制劑
在某些實施例中，藥物部分為蛋白酶體抑制劑。例示性蛋白酶體抑制劑包括
Figure 02_image127
Figure 02_image129
。 d.  細胞結合部分
在某些實施例中，患病組織為腫瘤。在某些實施例中，結合子-藥物共軛物之細胞結合部分經選擇以結合於腫瘤細胞上之細胞表面蛋白。在其他實施例中，結合子-藥物共軛物之細胞結合部分經選擇以結合於巨噬細胞、單核球衍生抑制細胞(MDSC)、樹突狀細胞、纖維母細胞、T細胞、NK細胞、肥大細胞、粒細胞、嗜伊紅白血球及B細胞上之細胞表面蛋白。
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物之細胞結合部分經選擇，以使得當結合子-藥物共軛物與目標細胞上之表面特徵結合時，其具有至少6小時、更佳至少10小時、12小時、14小時、16小時、18小時、20小時、24小時、36小時、48小時、60小時、75小時或甚至100小時之內化半衰期。
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物之細胞結合部分結合相對於來自健康狀態之組織的正常細胞，患病組織中由目標細胞選擇性表現或上調之細胞表面蛋白。舉例而言，蛋白質在目標細胞之表面上以比來自組織之正常細胞高2倍的水準，甚至更佳比來自組織之正常細胞高至少5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、75倍、100倍、250倍、500倍或甚至1000倍的水準可偵測。
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物之細胞結合部分經選擇以結合於相對於來自其他組織之細胞，尤其來自關鍵器官之細胞，患病組織中由目標細胞選擇性表現或上調之細胞表面蛋白。舉例而言，蛋白質在目標細胞之表面上以比來自其他組織之細胞高2倍的水準，甚至更佳比來自其他組織之細胞高至少5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、75倍、100倍、250倍、500倍或甚至1000倍的水準可偵測。
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物之細胞結合部分經選擇以結合於檢查點蛋白質且細胞結合部分較佳為檢查點拮抗劑。檢查點蛋白之實例包括選自由以下組成之群的檢查點蛋白：CTLA-4、PD-1、LAG-3、BTLA、KIR、TIM-3、PD-L1、PD-L2、B7-H3、B7-H4、HVEM、GAL9、CD160、VISTA、BTNL2、TIGIT、PVR、BTN1A1、BTN2A2、BTN3A2及CSF-1R，更佳CTLA-4、PD-1、LAG-3、TIM-3、BTLA、VISTA、HVEM、TIGIT、PVR、PD-L1及CD160。
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物之細胞結合部分經選擇以結合於共刺激受體且細胞結合部分為共刺激受體促效劑。實例包括表面特徵為選自由以下組成之群的共刺激受體或配位體：4-1BB、4-1BB-L、OX40、OX40-L、GITR、CD28、CD40、CD40-L、ICOS、ICOS-L、LIGHT及CD27，更佳4-1BB、OX40、GITR、CD40及ICOS。
在某些實施例中，細胞結合部分為抗體，諸如人類化抗體、人類抗體或嵌合抗體，或包含結合細胞表面特徵之其抗原結合部分，諸如Fab、F(ab)2、F(ab')、F(ab')2、F(ab')3、Fd、Fv、二硫鍵連接之Fv、dAb或sdAb (或奈米抗體)、CDR、scFv、(scFv)2、二-scFv、雙-scFv、tascFv (串聯scFv)、AVIBODY (例如雙功能抗體、三功能抗體、四功能抗體)、T細胞接合分子(BiTE)、scFv-Fc、Fcab、mAb2、小模塊免疫藥物(SMIP)、Genmab/單抗體或duobody、V-NAR結構域、IgNAR、微型抗體、IgGACH2、DVD-Ig、probody、胞內抗體或多特異性抗體。
在其他實施例中，細胞結合部分為諸如選自由以下組成之群的非抗體骨架：親和抗體、親和體、阿非林(Affilin)、抗運載蛋白、Atrimer、高親和性多聚體、達爾潘蛋白(DARPin)、FN3骨架(例如阿德奈汀(Adnectin)及辛替恩(Centyrin))、非諾莫(Fynomer)、孔尼茲結構域(Kunitz domain)、Nanofitin、Pronectin、OBodies、三功能抗體、高親和性多聚體、雙環肽及Cys結。(i) 結合 PD-L1 之 親和體
在某些實施例中，細胞結合部分為結合於PD-L1之親和體。親和體為基於stefin A之骨架，意謂其具有來源於stefin A，例如哺乳動物Stefin A，且更佳人類Stefin A之序列。本申請案之一個態樣提供結合PD-L1之親和體(亦稱為「抗PD-L1親和體」)，其包含其中來自野生型stefin A蛋白質之一或多個溶劑可達環具有用於提供能夠結合PD-L1 (較佳選擇性且較佳以10-6 M或更低之Kd)之親和體的胺基酸序列之親和體。
在某些實施例中，抗PD-L1親和體來源於具有主鏈序列之野生型人類Stefin A蛋白質且其中環2 [稱為(Xaa)n ]及環4 [稱為(Xaa)m ]中之一者或兩者由替代環序列(Xaa)n 及(Xaa)m 置換，以具有通式(i) FR1-(Xaa)n -FR2-(Xaa)m -FR3(I) 其中 FR1為由MIPGGLSEAK PATPEIQEIV DKVKPQLEEK TNETYGKLEA VQYKTQVLA (SEQ ID No. 1 )表示之多肽序列或與其具有至少70%同源性之多肽序列； FR2為由GTNYYIKVRA GDNKYMHLKV FKSL (SEQ ID No. 2 )表示之多肽序列或與其具有至少70%同源性之多肽序列； FR3為由EDLVLTGYQV DKNKDDELTG F (SEQ ID No. 3 )表示之多肽序列或與其具有至少70%同源性之多肽序列；及 Xaa在每次出現時獨立地為胺基酸殘基，n及m各自獨立地為3至20之整數。
在某些實施例中，FR1為與SEQ ID No. 1具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%同源性之多肽序列。在某些實施例中，FR1為與SEQ ID No. 1具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%一致性之多肽序列。在某些實施例中，FR2為與SEQ ID No. 2具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%同源性之多肽序列。在某些實施例中，FR2為與SEQ ID No. 2具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%一致性之多肽序列。在某些實施例中，FR3為與SEQ ID No. 3具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%同源性之多肽序列。在某些實施例中，FR3為與SEQ ID No. 3具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%一致性之多肽序列。
對於至少一個藥物-共軛物部分經由引入親和體序列中之半胱胺酸之硫醇側鏈附接於親和體序列的彼等實施例，半胱胺酸將較佳提供於與FR1、FR2及/或FR3對應之親和體序列區域之部分中，且更佳地置換親和體中側鏈為溶劑可接近且與親和體之其他部分的氫鍵鍵結無關的胺基酸殘基。一般而言，半胱胺酸將不引入環(Xaa)n 或(Xaa)m 中。
在某些實施例中，抗PD-L1親和體具有以下通式中表示之胺基酸序列(SEQ ID No. 4 )： MIP-Xaa1-GLSEAKPATPEIQEIVDKVKPQLEEKTNETYGKLEAVQYKTQVLA-(Xaa)n -Xaa2-TNYYIKVRAGDNKYMHLKVF-Xaa3-Xaa4-Xaa5-(Xaa)m -Xaa6-D-Xaa7-VLTGYQVDKNKDDELTGF 其中 Xaa每次出現時個別地為胺基酸殘基；n及m各獨立地為整數3至20；Xaa1為Gly、Ala、Val、Arg、Lys、Asp或Glu，更佳Gly、Ala、Arg或Lys且甚至更佳Gly或Arg；Xaa2為Gly、Ala、Val、Ser或Thr，更佳Gly或Ser；Xaa3為Arg、Lys、Asn、Gln、Ser、Thr，更佳Arg、Lys、Asn或Gln，且甚至更佳Lys或Asn；Xaa4為Gly、Ala、Val、Ser或Thr，更佳Gly或Ser；Xaa5為Ala、Val、Ile、Leu、Gly或Pro，更佳Ile、Leu或Pro，且甚至更佳Leu或Pro；Xaa6為Gly、Ala、Val、Asp或Glu，更佳Ala、Val、Asp或Glu，且甚至更佳Ala或Glu；且Xaa7為Ala、Val、Ile、Leu、Arg或Lys，更佳Ile、Leu或Arg，且甚至更佳Leu或Arg。
對於其中至少一個藥物-共軛物部分經由引入親和體序列中之半胱胺酸的硫醇側鏈附接於親和體序列的彼等實施例，半胱胺酸將較佳提供於除環序列(Xaa)n 或(Xaa)m 外之親和體序列部分中。因此，SEQ ID No. 4可包括1至5個半胱胺酸代替在該序列之變化位置處之胺基酸殘基。
舉例而言，抗PD-L1親和體可具有以下通式中表示之胺基酸序列(SEQ ID No. 5 )： MIPRGLSEAKPATPEIQEIVDKVKPQLEEKTNETYGKLEAVQYKTQVLA-(Xaa)n -STNYYIKVRAGDNKYMHLKVFNGP-(Xaa)m -ADRVLTGYQVDKNKDDELTGF 其中Xaa每次出現時個別地為胺基酸殘基；n及m各獨立地為整數3至20。
在某些實施例中，n為3至15、3至12、3至9、3至7、5至7、5至9、5至12、5至15、7至12或7至9。
在某些實施例中，m為3至15、3至12、3至9、3至7、5至7、5至9、5至12、5至15、7至12或7至9。
在某些實施例中，Xaa在每次出現時獨立地為胺基酸，其可藉由原核或真核細胞中之重組表現添加至多肽中，且甚至更佳為20種天然存在之胺基酸中之一者。
對於其中至少一個藥物-共軛物部分經由引入親和體序列中之半胱胺酸的硫醇側鏈附接於親和體序列的彼等實施例，半胱胺酸將較佳提供於除環序列(Xaa)n 或(Xaa)m 外之親和體序列部分中。因此，SEQ ID No. 5可包括1至5個半胱胺酸代替在該序列之變化位置處之胺基酸殘基。
在以上序列及式之某些實施例中，(Xaa)n 為以通式(II)表示之胺基酸序列： -aa1-aa2-aa3-Gly-Pro-aa4-aa5-Trp-aa6-(II) 其中 aa1表示具有鹼性側鏈之胺基酸殘基，更佳為Lys、Arg或His且甚至更佳為Lys或Arg； aa2表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈，更佳小型脂族側鏈、中性極性側鏈或鹼性或酸性側鏈之胺基酸殘基，甚至更佳為Ala、Pro、Ile、Gln、Thr、Asp、Glu、Lys、Arg或His，且甚至更佳為Ala、Gln、Asp或Glu； aa3表示具有芳族或鹼性側鏈之胺基酸殘基，較佳為Phe、Tyr、Trp、Lys、Arg或His，更佳為Phe、Tyr、Trp且甚至更佳為His或Tyr、Trp或His； aa4表示具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈，較佳中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈之胺基酸殘基；更佳為Ala、Pro、Ile、Gln、Thr、Asp、Glu、Lys、Arg或His，且甚至更佳為Gln、Lys、Arg、His、Asp或Glu； aa5表示具有中性極性或帶電(酸性或鹼性)或小型脂族或芳族側鏈，較佳中性極性側鏈或帶電側鏈之胺基酸殘基；更佳為Ser、Thr、Asn、Gln、Asp、Glu、Arg或His，且甚至更佳為Ser、Asn、Gln、Asp、Glu或Arg；及 aa6表示具有芳族或酸性側鏈之胺基酸殘基，較佳為Phe、Tyr、Trp、Asp或Glu；更佳為Trp或Asp；且甚至更佳為Trp。
在以上序列及式之某些實施例中，(Xaa)n 為以通式(III)表示之胺基酸序列： -aa1-aa2-aa3-Phe-Pro-aa4-aa5-Phe-Trp-(III) 其中 aa1表示具有鹼性側鏈或芳族側鏈之胺基酸殘基，較佳為Lys、Arg、His、Ser、Thr、Asn或Gln，更佳為Lys、Arg、His、Asn或Gln且甚至更佳為Lys或Asn； aa2表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈，更佳小型脂族側鏈、中性極性側鏈或鹼性或酸性側鏈之胺基酸殘基，甚至更佳為Ala、Pro、Ile、Gln、Thr、Asp、Glu、Lys、Arg或His，且甚至更佳為Ala、Gln、Asp或Glu； aa3表示具有芳族或鹼性側鏈之胺基酸殘基，較佳為Phe、Tyr、Trp、Lys、Arg或His，更佳為Phe、Tyr、Trp或His，且甚至更佳為Tyr、Trp或His； aa4表示具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈，較佳中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈之胺基酸殘基；更佳為Ala、Pro、Ile、Gln、Thr、Asp、Glu、Lys、Arg或His，且甚至更佳為Gln、Lys、Arg、His、Asp或Glu；及 aa5表示具有中性極性或帶電(酸性或鹼性)或小型脂族或芳族側鏈，較佳中性極性側鏈或帶電側鏈之胺基酸殘基；更佳為Ser、Thr、Asn、Gln、Asp、Glu、Arg或His，且甚至更佳為Ser、Asn、Gln、Asp、Glu或Arg。
在以上序列及式之某些實施例中，(Xaa)n 為選自SEQ ID No. 6至40之胺基酸序列或與選自SEQ ID No. 6至40之序列具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%同源性的胺基酸序列。在某些實施例中，(Xaa)n 為選與選自SEQ ID No. 6至40之序列具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%一致性的胺基酸序列。
Figure 108119354-A0304-0003
在以上序列及式之某些實施例中，(Xaa)n 為以通式(IV)表示之胺基酸序列： -aa7-aa8-aa9-aa10-aa11-aa12-aa13-aa14-aa15-(IV) 其中 aa7表示具有中性極性或非極性側鏈或酸性側鏈之胺基酸殘基；較佳為Gly、Ala、Val、Pro、Trp、Gln、Ser、Asp或Glu且甚至更佳為Gly、Ala、Trp、Gln、Ser、Asp或Glu； aa8表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或芳族側鏈，更佳帶電(酸性或鹼性)側鏈之胺基酸殘基，更佳為Asp、Glu、Lys、Arg、His、Gln、Ser、Thr、Asn、Ala、Val、Pro、Gly、Tyr或Phe，且甚至更佳為Asp、Glu、Lys、Arg、His或Gln； aa9表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或芳族側鏈，更佳中性極性側鏈或酸性側鏈之胺基酸殘基，更佳為Gln、Ser、Thr、Asn、Asp、Glu、Arg、Lys、Gly、Leu、Pro或Tyr且甚至更佳為Gln、Thr或Asp； aa10表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或芳族側鏈，更佳中性極性側鏈或鹼性或酸性側鏈之胺基酸殘基，更佳為Asp、Glu、Arg、His、Lys、Ser、Gln、Asn、Ala、Leu、Tyr、Trp、Pro或Gly且甚至更佳為Asp、Glu、His、Gln、Asn、Leu、Trp或Gly； aa11表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或非極性脂族側鏈或芳族側鏈，更佳中性極性側鏈或鹼性或酸性側鏈之胺基酸殘基，更佳為Asp、Glu、Ser、Thr、Gln、Arg、Lys、His、Val、Ile、Tyr或Gly且甚至更佳為Asp、Glu、Ser、Thr、Gln、Lys或His； aa12表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或非極性脂族側鏈或芳族側鏈，更佳酸性側鏈之胺基酸殘基，更佳為Asp、Glu、Ser、Thr、Gln、Asn、Lys、Arg、Val、Leu、Ile、Trp、Tyr、Phe或Gly且甚至更佳為Asp、Glu、Ser、Tyr、Trp、Arg或Lys； aa13表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈或非極性脂族側鏈或芳族側鏈，更佳酸性側鏈之胺基酸殘基，更佳為Ser、Thr、Gln、Asn、Val、Ile、Leu、Gly、Pro、Asp、Glu、His、Arg、Trp、Tyr或Phe且甚至更佳為Ser、Thr、Gln、Asn、Val、Ile、Leu、Gly、Asp或Glu； aa14表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈之胺基酸殘基；更佳為Ala、Ile、Trp、Pro、Asp、Glu、Arg、Lys、His、Ser、Thr、Gln或Asn且甚至更佳為Ala、Pro、Asp、Glu、Arg、Lys、Ser、Gln或Asn；且 aa15表示胺基酸殘基，較佳為具有中性極性或中性非極性側鏈或帶電(酸性或鹼性)側鏈之胺基酸殘基，更佳為His、Arg、Lys、Asp、Ser、Thr、Gln、Asn、Ala、Val、Leu、Gly或Phe且甚至更佳為His、Arg、Lys、Asp、Ser、Thr、Gln或Asn。
在以上序列及式之某些實施例中，(Xaa)m 為選自SEQ ID No. 41至75之胺基酸序列或與選自SEQ ID No. 41至75之序列具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%同源性的胺基酸序列。在某些實施例中，(Xaa)m 為與選自SEQ ID No. 41至75之序列具有至少80%、85%、90%、95%或甚至98%一致性的胺基酸序列。
Figure 108119354-A0304-0004
在某些實施例中，抗PD-L1親和體具有選自SEQ ID No. 76至84之胺基酸序列，或與選自SEQ ID No. 76至84之序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%或甚至98%同源性之胺基酸序列。在某些實施例中，抗PD-L1親和體具有與選自SEQ ID No. 76至84之序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%或甚至98%一致性之胺基酸序列。
對於其中至少一個藥物-共軛物部分經由引入親和體序列中之半胱胺酸的硫醇側鏈附接於親和體序列的彼等實施例，半胱胺酸將較佳提供於除環序列(Xaa)n 或(Xaa)m 外之親和體序列部分中。因此，藉由至少包括1至5個半胱胺酸代替在該序列之變化位置的胺基酸殘基，不過較佳不在環2或環4序列中，抗PD-L1親和體將具有在SEQ ID No. 76至84之間變化的序列。
Figure 108119354-A0304-0005
在某些實施例中，抗PD-L1親和體具有由具有對應於SEQ ID No. 85至92中之一者之核苷酸1-336的編碼序列之核酸編碼之胺基酸序列，或可由具有與SEQ ID No. 85至92中之一者之核苷酸1-336至少70%、75%、80%、85%、90%、95%或甚至98%一致的編碼序列之核酸編碼之胺基酸序列，或可由具有與SEQ ID No. 85至92中之一者之核苷酸1-336在嚴格條件(諸如在45℃下，在6X氯化鈉/檸檬酸鈉(SSC)存在下，接著在65℃下，在0.2X SSC中洗滌)下雜交的編碼序列之核酸編碼之胺基酸序列。
對於其中至少一個藥物-共軛物部分經由引入親和體序列中之半胱胺酸的硫醇側鏈附接於親和體序列的彼等實施例，半胱胺酸將較佳提供於除環序列(Xaa)n 或(Xaa)m 外之親和體序列部分中。因此，藉由至少包括1至5個半胱胺酸代替在該序列之變化位置的胺基酸殘基，不過較佳不在環2或環4序列中，抗PD-L1親和體將具有在由SEQ ID No. 85至92編碼之胺基酸序列之間變化的序列。
Figure AA1
Figure AA2
此外，較小修飾亦可包括除上文所描述之環2及環4插入物以外，對本文中所揭示之stefin A或stefin A衍生之序列進行小型缺失或添加，諸如與stefin A或stefin A衍生之親和體多肽相比添加或缺失至多10個胺基酸。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽呈單體以約1 μM或更低、約100 nM或更低、約40 nM或更低、約20 nM或更低、約10 nM或更低、約1 nM或更低或約0.1 nM或更低之解離常數(KD )結合人類PD-L1。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽部分呈單體以諸如藉由Biacore量測約10-3 s-1 (亦即，1/秒之單位)或更慢、約10-4 s-1 或更慢或甚至約10-5 s-1 或更慢的解離速率常數(Koff )結合人類PD-L1。
在某些實施例中，結合PD-L1之親和體多肽部分呈單體以諸如藉由Biacore量測至少約103 M-1 s-1 或更快、至少約104 M-1 s-1 或更快、至少約105 M-1 s-1 或更快或甚至至少約106 M-1 s-1 或更快的締合常數(Kon )結合人類PD-L1。
在某些實施例中，在與人類PD-1之競爭性結合分析中，結合PD-L1之親和體多肽部分呈單體以1 μM或更低、約100 nM或更低、約40 nM或更低、約20 nM或更低、約10 nM或更低、約1 nM或更低或約0.1 nM或更低之IC50結合人類PD-1。 融合蛋白-綜述
在一些實施例中，親和體多肽可進一步包含其他調節親和體多肽之生物活性之插入、取代或缺失。舉例而言，添加、取代或缺失可調節經修飾之親和體之一或多種特性或活性。舉例而言，添加、取代或缺失可調節親和體多肽例如結合及抑制PD-1之親和力、調節循環半衰期、調節治療半衰期、調節親和體多肽之穩定性、調節蛋白酶裂解、調節劑量、調節釋放或生物可用性、促進純化、降低去醯胺化、改良存放期或者改良或改變特定投藥途徑。類似地，親和體多肽可包含蛋白酶裂解序列、反應性基團、抗體結合域(包括(但不限於) FLAG或聚-His)或其他改良多肽之偵測、純化或其他特性之基於親和力之序列(包括(但不限於)FLAG、聚-His、GST等)或連接分子(包括(但不限於)生物素)。
在一些情況下，此等其他序列添加至呈融合蛋白形式之親和體多肽之一端及/或另一端。因此，在本發明之某些態樣中，結合子-藥物共軛物為具有至少一個親和體多肽序列及一或多個異源多肽序列之融合蛋白(本文中之「融合域」)。融合域可經選擇以便提供所需性質，僅作為實例，諸如自細胞分泌或保留在細胞表面上(亦即，對於經編碼之親和體)、充當轉譯後修飾之受質或其他識別序列、建立經由蛋白質-蛋白質相互作用聚集之多聚結構、改變(通常延長)血清半衰期或者改變組織定位或組織排除及其他ADME特性。
舉例而言，一些融合域尤其適用於融合蛋白之分離及/或純化，諸如藉由親和層析。僅作為說明，此類促進表現或純化之融合域之熟知實例包括親和標籤，諸如聚組胺酸(亦即，His6 標籤)、Strep II標籤、抗生蛋白鏈菌素結合肽(SBP)標籤、鈣調蛋白結合肽(CBP)、麩胱甘肽S-轉移酶(GST)、麥芽糖結合蛋白質(MBP)、S-標籤、HA標籤、c-Myc標籤、硫氧還蛋白、蛋白質A及蛋白質G。
為了使親和體在以重組方式製成時得以分泌，其通常將含有引導蛋白質運輸至內質網之腔中且最終分泌(或若為跨膜域或其他細胞表面保留信號，則保留在細胞表面上)之信號序列。信號序列(亦稱為信號肽或前導序列)位於新生多肽之N端。其使多肽靶向內質網且將蛋白質分選至其目的地，例如到達細胞器之內部空間、到達內膜、到達細胞外膜或經由分泌到達細胞外部。在蛋白質運輸至內質網之後，大部分信號序列藉由信號肽酶自蛋白質裂解。信號序列自多肽之裂解通常在胺基酸序列中之特定位點處發生且視信號序列內之胺基酸殘基而定。
在一些實施例中，信號肽之長度為約5至約40個胺基酸(諸如長度為約5至約7個、約7至約10個、約10至約15個、約15至約20個、約20至約25個，或約25至約30個、約30至約35個，或約35至約40個胺基酸)。
在一些實施例中，信號肽為來自人類蛋白質之天然信號肽。在其他實施例中，信號肽為非天然信號肽。舉例而言，在一些實施例中，非天然信號肽為來自相應天然人類分泌蛋白之突變型天然信號肽，且可包括一或多個(諸如2、3、4、5、6、7、8、9或10個或更多個)取代、插入或缺失。
在一些實施例中，信號肽為來自非IgSF蛋白質家族之信號肽或其突變體，諸如來自免疫球蛋白(諸如IgG重鏈或IgG-κ輕鏈)、細胞介素(諸如介白素-2 (IL-2)或CD33)、血清白蛋白蛋白質(例如HSA或白蛋白)、人類天青殺素(azurocidin)前蛋白信號序列、螢光素酶、胰蛋白酶原(例如胰凝乳蛋白酶原或胰蛋白酶原)之信號肽，或其他能夠自細胞有效分泌蛋白質之信號肽。例示性信號肽包括(但不限於)：
Figure 108119354-A0304-0007
主題融合蛋白亦可包括一或多個分離異源蛋白質序列或結構域，亦即在結合子藥物共軛物中包括超過一個細胞結合部分的情況下分離細胞結合部分之連接子。如本文所用，術語「連接子」係指在第一多肽(例如親和體)與第二多肽(例如第二親和體、Fc區、受體陷阱、白蛋白等)之間插入的連接子胺基酸序列。由研究人員設計之經驗連接子通常根據其結構分為3類：可撓性連接子、剛性連接子及活體內可裂解連接子。除將功能域連接在一起(如在可撓性及剛性連接子中)或活體內釋放游離功能域(如在活體內可裂解連接體中)之基本作用以外，連接子可提供許多用於產生融合蛋白之其他優點，諸如改良生物活性、增加表現量及實現理想藥物動力學概況。連接子不應不利地影響融合蛋白之表現、分泌或生物活性。連接子不應為抗原性的且不應引發免疫反應。
合適連接子為熟習此項技術者已知且通常包括甘胺酸及絲胺酸殘基之混合物，且通常包括非位阻胺基酸。可併入適用連接子中之其他胺基酸包括蘇胺酸及丙胺酸殘基。連接子之長度可在某一範圍內，例如長度為1-50個胺基酸、長度為1-22個胺基酸、長度為1-10個胺基酸、長度為1-5個胺基酸或長度為1-3個胺基酸。在一些實施例中，連接子可包含裂解位點。在一些實施例中，連接子可包含酶裂解位點，使得第二多肽可自第一多肽分離。
在某些較佳實施例中，連接子之特徵為可撓性。當所接合之結構域需要某種程度之移動或相互作用時，可撓性連接子通常為適用的。其通常由小型、非極性(例如Gly)或極性(例如Ser或Thr)胺基酸構成。參見例如Argos P. (1990) 「An investigation of oligopeptides linking domains in protein tertiary structures and possible candidates for general gene fusion」 J Mol Biol. 211:943-958。此等胺基酸之小尺寸提供可撓性且實現連接之功能域之活動性。併入Ser或Thr可藉由與水分子形成氫鍵來保持連接子在水溶液中之穩定性，且因此降低連接子與蛋白質部分之間的不利相互作用。最常用的可撓性連接子具有主要由Gly及Ser殘基之延伸部分組成之序列(「GS」連接子)。最廣泛使用之可撓性連接子之實例具有(Gly-Gly-Gly-Gly-Ser)n之序列。藉由調節複本數「n」，可最佳化此GS連接子之長度以實現功能域之適合分離，或保持必要的結構域間相互作用。除GS連接子以外，已設計許多其他可撓性連接子用於重組型融合蛋白。儘管此等可撓性連接子亦富含小型或極性胺基酸，諸如Gly及Ser，但可含有諸如Thr及Ala之其他胺基酸以維持可撓性，以及諸如Lys及Glu之極性胺基酸以改良可溶性。
在某些較佳實施例中，連接子之特徵為剛性。儘管可撓性連接子具有被動地連接功能域及實現某種程度之移動的優勢，但此等連接子缺乏剛性在某些融合蛋白實施例中可對諸如表現量或生物活性造成限制。可撓性連接子在此等情況下無效係歸因於蛋白質結構域之分離低效或其彼此之干擾之降低不足。在此等情形下，剛性連接子已成功地用於保持各結構域之間的固定距離及保持其獨立功能。
許多天然連接子呈現α-螺旋結構。α-螺旋結構為剛性及穩定的，具有區段內氫鍵及緊密堆積之主鏈。因此，剛性α-螺旋連接子可充當蛋白質結構域之間的剛性間隔子。George等人 (2002) 「An analysis of protein domain linkers: their classification and role in protein folding」 Protein Eng. 15(11):871-9。一般而言，剛性連接子藉由採用α-螺旋結構或藉由含有多個Pro殘基而呈現相對剛性結構。在許多情形下，其比可撓性連接子更有效地分離功能域。容易藉由改變複本數來調節連接子之長度以實現各結構域之間的最佳距離。因此，當結構域之空間分離對於保持融合蛋白之穩定性或生物活性而言重要時，選擇剛性連接子。在此方面，具有(EAAAK)n之序列的形成α螺旋之連接子已用於構築許多重組型融合蛋白。另一類型之剛性連接子具有富含Pro之序列，(XP)n，其中X表示任何胺基酸，較佳為Ala、Lys或Glu。
僅作為說明，例示性連接子包括：
Figure 108119354-A0304-0008
可用於主題融合蛋白中之其他連接子包括(但不限於) SerGly、GGSG、GSGS、GGGS、S(GGS)n (其中n為1-7)、GRA、聚(Gly)、聚(Ala)、GGGSGGG、ESGGGGVT、LESGGGGVT、GRAQVT、WRAQVT及ARGRAQVT。下文所描述之Fc融合物之鉸鏈區亦可視為連接子。
可對親和體多肽序列本身或呈融合蛋白之一部分形式提供之側接多肽部分進行的其他修飾為作為用於由酶進行之轉譯後修飾之位點的一或多個序列。此等修飾可包括(但不限於)糖基化、乙醯化、醯化、脂質修飾、棕櫚醯化、棕櫚酸添加、磷酸化、糖脂鍵修飾及其類似修飾。 工程改造PK及ADME特性
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物可能不具有對於投藥途徑(諸如非經腸治療性給藥)而言最佳之半衰期及/或PK概況。術語「半衰期」係指物質(諸如本發明之結合子-藥物共軛物)失去其一半藥理學或生理學活性或濃度所花費之時間量。生物半衰期可受物質之消除、分泌、降解(例如酶促)，或吸收及濃縮於某些身體器官或組織中影響。在一些實施例中，生物半衰期可藉由測定物質之血漿濃度達到其一半穩態水準所需之時間(「血漿半衰期」)來評估。為克服此缺點，存在多種用於延長半衰期之在其他蛋白質治療劑之情況下使用的通用策略，包括半衰期延長部分作為結合子-藥物共軛物之一部分併入。
術語「半衰期延長部分」係指視情況經由非天然編碼之胺基酸、直接或經由連接子共價連接(「共軛」或「融合」)至親和體多肽以形成本文中所描述之結合子-藥物共軛物的醫藥學上可接受之部分、結構域或分子，其防止或減緩親和體多肽之活體內蛋白水解降解或其他降低活性之修飾、延長半衰期及/或改良或改變其他藥物動力學或生理學特性，包括(但不限於)與比較物(諸如經修飾之親和體多肽之未共軛形式)相比，提高吸收率、降低毒性、改良可溶性、降低蛋白質聚集、提高經修飾之親和體多肽之生物活性及/或目標選擇性、提高可製造性及/或降低經修飾之親和體多肽之免疫原性。術語「半衰期延長部分」包括非蛋白質半衰期延長部分，諸如水溶性聚合物，諸如聚乙二醇(PEG)或離散PEG、羥乙基澱粉(HES)、脂質、分支鏈或未分支醯基、分支鏈或未分支C8-C30醯基、分支鏈或未分支烷基及分支鏈或未分支C8-C30烷基；及蛋白質半衰期延長部分，諸如血清白蛋白、轉鐵蛋白、纖連蛋白(例如白蛋白結合或藥物動力學延伸(PKE)之纖連蛋白)、Fc結構域及非結構化多肽，諸如XTEN及PAS多肽(例如由胺基酸Pro、Ala及/或Ser構成之構形無序之多肽序列)及前述中之任一者之片段。對親和體之晶體結構及其與其目標(諸如圖中所示之與PD-1之抗PD-L1親和體複合物)之相互作用的檢查可指示哪些胺基酸殘基具有完全或部分為溶劑可接近之側鏈。
在某些實施例中，與未與部分共軛之蛋白質之半衰期相比(諸如相對於單獨的親和體多肽)，半衰期延長部分延長所得結合子-藥物共軛物在哺乳動物血清中循環之半衰期。在一些實施例中，半衰期延長超過或大於約1.2倍、1.5倍、2.0倍、3.0倍、4.0倍、5.0倍或6.0倍。在一些實施例中，與不具有半衰期延長部分之蛋白質相比，在活體內投與之後，半衰期延長超過6小時、超過12小時、超過24小時、超過48小時、超過72小時、超過96小時或超過1週。
作為進一步例示，可用於產生本發明之結合子-藥物共軛物之半衰期延長部分包括以下： •   藥理學親和體序列與天然長半衰期蛋白質或蛋白質結構域之基因融合物(例如Fc融合物、轉鐵蛋白[Tf]融合物或白蛋白融合物)。參見例如Beck等人 (2011) 「Therapeutic Fc-fusion proteins and peptides as successful alternatives to antibodies. MAbs. 3:1-2；Czajkowsky等人 (2012) 「Fc-fusion proteins: new developments and future perspectives」. EMBO Mol Med. 4:1015-28；Huang等人 (2009) 「Receptor-Fc fusion therapeutics, traps, and Mimetibody technology」 Curr Opin Biotechnol. 2009;20:692-9；Keefe等人 (2013) 「Transferrin fusion protein therapies: acetylcholine receptor-transferrin fusion protein as a model」. Schmidt S編輯，Fusion protein technologies for biopharmaceuticals: applications and challenges. Hoboken: Wiley；第345-56頁；Weimer等人 (2013) 「Recombinant albumin fusion proteins. Schmidt S編輯. Fusion protein technologies for biopharmaceuticals: applications and challenges」. Hoboken: Wiley；2013. 第297-323頁；Walker等人 (2013) 「Albumin-binding fusion proteins in the development of novel long-acting therapeutics」. Schmidt S編輯, Fusion protein technologies for biopharmaceuticals: applications and challenges. Hoboken: Wiley；2013. 第325-43頁。 •   藥理學親和體序列與惰性多肽，例如XTEN (亦稱為重組型PEG或「rPEG」)、高胺基酸聚合物(HAP；HAP化)、脯胺酸-丙胺酸-絲胺酸聚合物(PAS；PAS化)或類彈性蛋白肽(ELP；ELP化)之基因融合物。參見例如Schellenberger等人 (2009) 「A recombinant polypeptide extends the in vivo half-life of peptides and proteins in a tunable manner」. Nat Biotechnol. 2009; 27:1186-90；Schlapschy等人 Fusion of a recombinant antibody fragment with a homo-amino-acid polymer: effects on biophysical properties and prolonged plasma half-life. Protein Eng Des Sel. 2007; 20:273-84；Schlapschy (2013) PASylation: a biological alternative to PEGylation for extending the plasma halflife of pharmaceutically active proteins. Protein Eng Des Sel. 26:489-501. Floss等人 (2012) 「Elastin-like polypeptides revolutionize recombinant protein expression and their biomedical application」. Trends Biotechnol. 28:37-45. Floss等人 「ELP-fusion technology for biopharmaceuticals」. Schmidt S編輯, Fusion protein technologies for biopharmaceuticals: application and challenges. Hoboken: Wiley；2013. 第372-98頁。 •   藉由藥理學活性肽或蛋白質與重複化學部分，例如PEG (PEG化)或玻尿酸之化學共軛來增加流體動力學半徑。參見例如Caliceti等人 (2003) 「Pharmacokinetic and biodistribution properties of poly(ethylene glycol)-protein conjugates」 Adv Drug Delivery Rev. 55:1261-77；Jevsevar等人 (2010) PEGylation of therapeutic proteins. Biotechnol J 5:113-28；Kontermann (2009) 「Strategies to extend plasma half-lives of recombinant antibodies」 BioDrugs. 23:93-109；Kang等人 (2009) 「Emerging PEGylated drugs」 Expert Opin Emerg Drugs. 14:363-80；及Mero等人 (2013) 「Conjugation of hyaluronan to proteins」 Carb Polymers. 92:2163-70。 •   藉由聚唾液酸化顯著增加融合藥理學活性肽或蛋白質之負電荷；或替代性地，(b)使已知可延長天然蛋白質(諸如人類CG b-子單元)之半衰期的帶負電之高度唾液酸化肽(例如羧基末端肽[CTP；絨膜促性腺激素(CG) b-鏈])與生物學候選藥物融合。參見例如Gregoriadis等人 (2005) 「Improving the therapeutic efficacy of peptides and proteins: a role for polysialic acids」 Int J Pharm. 2005；300:125-30；Duijkers等人 「Single dose pharmacokinetics and effects on follicular growth and serum hormones of a long-acting recombinant FSH preparation (FSHCTP) in healthy pituitary-suppressed females」 (2002) Hum Reprod. 17:1987-93；及Fares等人 「Design of a longacting follitropin agonist by fusing the C-terminal sequence of the chorionic gonadotropin beta subunit to the follitropin beta subunit」 (1992) Proc Natl Acad Sci USA. 89:4304-8. 35；及Fares 「Half-life extension through O-glycosylation」。 •   經由肽或蛋白質結合域與生物活性蛋白質之連接來非共價結合於一般長半衰期蛋白質，諸如HSA、人類IgG、轉鐵蛋白或纖網蛋白。參見例如Andersen等人 (2011) 「Extending half-life by indirect targeting of the neonatal Fc receptor (FcRn) using a minimal albumin binding domain」 J Biol Chem. 286:5234-41；O'Connor-Semmes等人 (2014) 「GSK2374697, a novel albumin-binding domain antibody (albudAb), extends systemic exposure of extendin-4: first study in humans-PK/PD and safety」 Clin Pharmacol Ther. 2014;96:704-12；Sockolosky等人 (2014) 「Fusion of a short peptide that binds immunoglobulin G to a recombinant protein substantially increases its plasma half-life in mice」 PLoS One. 2014;9:e102566。
與長期存活之血清蛋白之經典基因融合物提供與PEG或脂質之化學共軛不同的替代性延長半衰期之方法。傳統上使用兩種主要蛋白質作為融合搭配物：抗體Fc結構域及人類血清白蛋白(HSA)。Fc融合物涉及肽、蛋白質或受體胞外域與抗體之Fc部分之融合。Fc及白蛋白融合物不僅藉由增加肽藥物之尺寸，且亦皆利用人體之天然再循環機制：新生Fc受體FcRn來延長半衰期。此等蛋白質與FcRn之pH值依賴性結合可防止核內體中融合蛋白質之降解。基於此等蛋白質之融合物可具有在3-16天範圍內之半衰期，遠長於典型聚乙二醇化或脂化肽。與抗體Fc結構域之融合可改良肽或蛋白質藥物之可溶性及穩定性。肽Fc融合物之一實例為度拉糖肽(dulaglutide)，一種當前處於晚期臨床試驗中之GLP-1受體促效劑。人類血清白蛋白(由脂肪醯基化肽採用之同一種蛋白質)為另一種流行之融合搭配物。阿必魯肽(albiglutide)為基於此平台之GLP-1受體促效劑。Fc與白蛋白之間的主要差異為Fc相對於HSA之單體結構的二聚性質，其引起以二聚體或單體形式呈現融合之肽，視融合搭配物之選擇而定。若親和體目標(諸如腫瘤細胞上之PD-L1)一同足夠緊密地間隔或本身為二聚體，則親和體-Fc融合物之二聚性質可產生親合力作用。此可能為合乎需要的或不視目標而定。 Fc融合物
在一些實施例中，親和體多肽可為具有免疫球蛋白Fc結構域(「Fc結構域」)或其片段或變異體(諸如功能性Fc區)之融合蛋白的一部分。在此情形中，Fc融合物(「Fc-融合物」)，諸如以親和體-Fc融合蛋白形式產生之結合子-藥物共軛物，為包含一或多個親和體序列經由肽主鏈(直接或間接地)共價連接至免疫球蛋白之Fc區的多肽。Fc-融合物可包含例如抗體之Fc區(其有助於效應功能及藥物動力學)及作為相同多肽之一部分之親和體序列。免疫球蛋白Fc區亦可間接連接至一或多種親和體。各種連接子為此項技術中已知的且可視情況用於將Fc連接至包括親和體序列之多肽，以產生Fc-融合物。在某些實施例中，Fc-融合物可二聚形成Fc-融合物均二聚體，或使用不一致結構域，形成Fc-融合物雜二聚體。
存在若干個選擇人類抗體之Fc區用於產生呈親和體融合蛋白形式之主題結合子-藥物共軛物之原因。基本原理為產生穩定蛋白質，其足夠大以顯示與抗體相比類似之藥物動力學概況；及利用由Fc區賦予之特性；此包括涉及以下之救助新生FcRn受體路徑：內飲作用後FcRn介導之融合蛋白再循環至細胞表面，避免溶酶體降解及引起釋放回血流中，因此有助於延長血清半衰期。另一明顯益處為結構域結合於蛋白質A，此可簡化結合子-藥物共軛物產生期間之下游加工且允許結合子-藥物共軛物之高度純之製劑的產生。
因此，Fc結構域將包括除第一恆定區免疫球蛋白結構域外之抗體恆定區。因此，Fc結構域係指IgA、IgD及IgG之最後兩個恆定區免疫球蛋白域，及IgE及IgM之最後三個恆定區免疫球蛋白域，及此等結構域N端之可撓性鉸鏈。對於IgA及IgM，Fc可包括J鏈。對於IgG，Fc包含免疫球蛋白域Cγ2及Cγ3以及Cγ1與Cγ2之間的鉸鏈。儘管Fc結構域之邊界可變化，但通常定義人類IgG重鏈Fc區包含殘基C226或P230至其羧基端，其中編號係根據如Kabat中所闡述之EU索引(Kabat等人, Sequences of Proteins of Immunological Interest, 第5版, Public Health Service, NIH, Bethesda, Md. (1991))。Fc可指單獨此區域或在完全抗體、抗體片段或Fc融合蛋白之情形下的此區域。已在許多不同Fc位置處觀測到多形現象且亦包括其作為Fc域，如本文中所使用。
在某些實施例中，如本文中所使用之Fc，「功能性Fc區」係指保持結合FcRn之能力之Fc結構域或其片段。功能性Fc區結合於FcRn，但不具有效應功能。Fc區或其片段結合於FcRn之能力可藉由此項技術中已知之標準結合分析法來測定。例示性「效應功能」包括C1q結合；補體依賴性細胞毒性(CDC)；Fc受體結合；抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)；吞噬作用；細胞表面受體(例如B細胞受體；BCR)之下調等。此類效應功能可使用此項技術中已知的用於評估此類抗體效應功能之各種分析法評估。
在一例示性實施例中，Fc結構域衍生自IgG1子類，然而，亦可使用其他子類(例如IgG2、IgG3及IgG4)。可使用之人類IgG1免疫球蛋白Fc結構域之一例示性序列為：
Figure 02_image131
在一些實施例中，用於融合蛋白中之Fc區可包含Fc分子之鉸鏈區。一例示性鉸鏈區包含跨越上文所提供之例示性人類IgG1免疫球蛋白Fc結構域序列之位置1-16的核心鉸鏈殘基(亦即DKTHTCPPCPAPELLG)。在某些實施例中，部分歸因於上文所提供之例示性人類IgG1免疫球蛋白Fc結構域序列之鉸鏈區內的位置6及9處之半胱胺酸殘基，含有親和體之融合蛋白可呈多聚結構(例如二聚體)。在其他實施例中，如本文所用之鉸鏈區可進一步包括衍生自CH1及CH2區的側接上文所提供之例示性人類IgG1免疫球蛋白Fc結構域序列之核心鉸鏈序列的殘基。在其他實施例中，鉸鏈序列可包含GSTHTCPPCPAPELLG或EPKSCDKTHTCPPCPAPELLG或由其組成。
在一些實施例中，鉸鏈序列可包括一或多個賦予所需藥物動力學、生物物理學及/或生物學特性之取代。一些例示性鉸鏈序列包括： EPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPS； EPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPS； EPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGSS； EPKSSGSTHTCPPCPAPELLGGSS； DKTHTCPPCPAPELLGGPS；及 DKTHTCPPCPAPELLGGSS。
在一個實施例中，上文所提供之例示性人類IgG1免疫球蛋白Fc結構域序列之位置18處之殘基P可經S置換以除去Fc效應功能；此置換例示於具有序列EPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGSS、EPKSSGSTHTCPPCPAPELLGGSS及DKTHTCPPCPAPELLGGSS之鉸鏈中。在另一實施例中，上文所提供之例示性人類IgG1免疫球蛋白Fc結構域序列之位置1-2的殘基DK可經GS置換以移除可能之剪切位點；此置換例示於序列EPKSSGSTHTCPPCPAPELLGGSS中。在另一實施例中，人類IgG1之重鏈恆定區(亦即，結構域CH1 -CH3 )之位置103處的C可由S置換以防止在不存在輕鏈下形成不當半胱胺酸鍵；此置換例示為EPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPS、EPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGSS及EPKSSGSTHTCPPCPAPELLGGSS中。
在一些實施例中，Fc為哺乳動物Fc，諸如人類Fc，包括來源於IgG1、IgG2、IgG3或IgG4之Fc結構域。Fc區可與天然Fc區及/或親本多肽之Fc區具有至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性。在一些實施例中，Fc區可與天然Fc區及/或親本多肽之Fc區具有至少約90%序列一致性。
在一些實施例中，Fc結構域包含選自SEQ ID NO: 93之胺基酸序列，或來自由SEQ ID No. 94-106提供之實例的Fc序列。應瞭解，Fc結構域之C端離胺酸為包含Fc結構域之融合蛋白的視情況存在之組分。在一些實施例中，Fc結構域包含選自SEQ ID NO: 93-106之胺基酸序列，但省略其C端離胺酸。在一些實施例中，Fc結構域包含SEQ ID NO: 93之胺基酸序列。在一些實施例中，Fc結構域包含SEQ ID NO: 93之胺基酸序列，但省略其C端離胺酸。
Figure AA3
Figure AA4
Figure AA5
結合PD-L1之親和體與Fc之例示性Fc融合物提供於實例及圖式中，表明親和體序列可置於Fc結構域之N端或C端，且可直接附接或融合蛋白可具有其他介於Fc結構域與親和體多肽序列之間的多肽序列。在所說明之實例中，非結構化(可撓性)連接子(Gly4 Ser)n 與結合PD-L1之親和體「251」(SEQ ID No. 84)及人類IgG1之Fc結構域(SEQ ID No. 93)一起使用，其中鉸鏈區為EPKSCDKTHTCPPCPAPELLG。構築體皆包括自蛋白質之成熟型式裂解之CD33分泌信號序列MPLLLLLPLLWAGALA。
Figure AA6
「抗體依賴性細胞介導之細胞毒性」或「ADCC」係指一種細胞毒性形式，其中結合至某些細胞毒性細胞(例如自然殺手(NK)細胞、嗜中性白血球及巨噬細胞)上存在之Fc受體(FcR)的分泌性Ig使得此等細胞毒性效應細胞能夠特異性結合於攜帶抗原之目標細胞且接著用細胞毒素殺死目標。
在某些實施例中，融合蛋白包括使所得結合子-藥物共軛物不具有(或具有降低之)ADCC及/或補體活化或效應功能性的Fc結構域序列。舉例而言，Fc結構域可包含IgG2或IgG4同型之自然失能恆定區或突變型IgG1恆定區。合適修飾之實例描述於EP0307434中。一個實例包含位置235及237 (EU指數編號)處之丙胺酸殘基之取代。
在其他實施例中，融合蛋白包括如例如若融合蛋白包含來自人類IgG1或IgG3之Fc結構域，使所得結合子-藥物共軛物將保留一些或全部Fc功能性，例如將能夠具有ADCC及CDC活性中之一或兩者的Fc結構域序列。效應功能之水準可根據已知技術變化，該等技術例如藉由CH2結構域中之突變，例如其中IgG1 CH2結構域在選自239及332及330之位置處具有一或多個突變，例如突變係選自S239D及I332E及A330L，使得抗體具有增強之效應功能，及/或例如改變本發明之抗原結合蛋白質之糖基化概況使得Fc區之岩藻糖基化減少。 白蛋白融合物
在其他實施例中，結合子-藥物共軛物為融合蛋白，其除至少一個親和體序列以外亦包含白蛋白序列或白蛋白片段。在其他實施例中，結合子-藥物共軛物經由化學鍵與白蛋白序列或白蛋白片段共軛，而非併入包括親和體之多肽序列中。在一些實施例中，白蛋白、白蛋白變異體或白蛋白片段為人類血清白蛋白(HSA)、人類血清白蛋白變異體或人類血清白蛋白片段。在例如食蟹獼猴、牛、犬、兔及大鼠中發現與HSA類似之白蛋白血清蛋白。在非人類物種中，牛血清白蛋白(BSA)在結構上與HSA最類似。參見例如Kosa等人, (2007) J Pharm Sci. 96(11):3117-24。本發明涵蓋來自非人類物種之白蛋白，包括(但不限於)來源於食蟹獼猴血清白蛋白或牛血清白蛋白之白蛋白序列的使用。
成熟HSA，一種具有約20天之血清半衰期之585胺基酸多肽(約67 kDa)，主要負責維持膠體滲透血壓、血液pH值以及大量內源性及外源性配位體之運輸及分佈。該蛋白質具有三個結構上同源之結構域(結構域I、II及III)，幾乎完全呈α-螺旋構形且藉由17個二硫橋鍵高度穩定。在某些較佳實施例中，結合子-藥物共軛物可為白蛋白融合蛋白，其包括一或多個親和體多肽序列及成熟人類血清白蛋白之序列(SEQ ID No. 111)或維持成熟白蛋白之PK及/或生物分佈特性達到融合蛋白中所需之程度的其變異體或片段。
Figure 02_image133
Figure 02_image135
白蛋白序列可使用如上文所描述之連接序列與親和體多肽序列或結合子-藥物共軛物中之其他側接序列分開。
除非另有指示，否則本文中提及「白蛋白」或「成熟白蛋白」意指HSA。然而，應注意，全長HSA具有含有18個胺基酸之信號肽(MKWVTFISLLFLFSSAYS)，接著具有6個胺基酸之前結構域(RGVFRR)；此24個胺基酸殘基肽可稱為預先前結構域。親和體-HSA融合蛋白可使用重組型蛋白質編碼序列中之HSA預先前結構域表現及分泌。或者，親和體-HSA融合物可經由包括其他分泌信號序列(諸如上文所描述之信號序列)表現及分泌。
在替代實施例中，不以具有親和體多肽之融合蛋白之一部分形式提供，血清白蛋白多肽可經由除主鏈醯胺鍵以外的鍵與含有親和體之多肽共價偶合，諸如經由白蛋白多肽中之每一者上的胺基酸側鏈與含有親和體之多肽之間的化學共軛來交聯。 白蛋白結合域
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物可包括血清結合部分-作為具有親和體多肽序列之融合蛋白(若亦為多肽)之部分，或經由除作為相鄰多肽鏈之一部分外的位點化學共軛。
在某些實施例中，血清結合多肽為白蛋白結合部分。白蛋白含有多個疏水性結合袋且天然地充當多種不同配位體(諸如脂肪酸及類固醇)以及不同藥物之轉運子。此外，白蛋白之表面帶負電，使其具有高水溶性。
如本文所用，術語「白蛋白結合部分」係指能夠結合於白蛋白，亦即具有白蛋白結合親和力之任何化學基團。白蛋白結合於內源性配位體，諸如脂肪酸；然而，其亦與外源性配位體(諸如華法林(warfarin)、青黴素及安定(diazepam))相互作用。由於此等藥物與白蛋白之結合為可逆的，故白蛋白-藥物複合物物充當可增強藥物生物分佈及生物可用性之藥物儲存器。併入可模擬內源性白蛋白結合配位體之組分(諸如脂肪酸)用於增強白蛋白締合及提高藥物功效。
在某些實施例中，在主題結合子-藥物共軛物之產生中可採用以提高蛋白質半衰期之化學修飾方法為脂質化，其涉及脂肪酸與肽側鏈共價結合。最初作為一種用於延長胰島素半衰期之方法構思及研發，脂質化與聚乙二醇化共有相同的基本半衰期延長機制，亦即增加流體動力學半徑以減少腎過濾。然而，脂質部分本身相對較小且作用係經由脂質部分與循環白蛋白之非共價結合間接地介導。脂質化之一個結果為其降低肽之水溶性，但例如藉由在連接子內使用麩胺酸或微型PEG，肽與脂肪酸之間的連接子之工程改造可調節此作用。連接子工程改造及脂質部分之變化可影響自行聚集，此可藉由延緩生物分佈來延長半衰期(與白蛋白無關)。參見例如Jonassen等人 (2012) Pharm Res. 29(8):2104-14。
用於產生某些結合子-藥物共軛物之白蛋白結合部分之其他實例包括白蛋白結合(PKE2)纖連蛋白(參見WO2011140086，「Serum Albumin Binding Molecules」；WO2015143199，「Serum albumin-binding Fibronectin Type III Domains」；及WO2017053617，「Fast-off rate serum albumin binding fibronectin type iii domains」)、鏈球菌菌株G148之蛋白質G之白蛋白結合域3 (ABD3)及白蛋白結合域抗體GSK2374697 (「AlbudAb」)或ATN-103 (奧利珠單抗(Ozoralizumab))之白蛋白結合奈米抗體部分。 聚乙二醇化、XTEN、PAS及其他聚合物
各種大分子聚合物及其他分子可連接於本發明之含有親和體之多肽以調節所得結合子-藥物共軛物之生物特性，及/或向結合子-藥物共軛物提供新穎生物特性。此等大分子聚合物可經由天然編碼之胺基酸、非天然編碼之胺基酸或者天然或非天然胺基酸之任何功能性取代基或者添加至天然或非天然胺基酸之任何取代基或官能基連接於含有親和體之多肽。聚合物分子量可在包括(但不限於)約100 Da與約100,000 Da或更大之間的廣泛範圍內。聚合物之分子量可在約100 Da與約100,000 Da之間，包括(但不限於) 100,000 Da、95,000 Da、90,000 Da、85,000 Da、80,000 Da、75,000 Da、70,000 Da、65,000 Da、60,000 Da、55,000 Da、50,000 Da、45,000 Da、40,000 Da、35,000 Da、30,000 Da、25,000 Da、20,000 Da、15,000 Da、10,000 Da、9,000 Da、8,000 Da、7,000 Da、6,000 Da、5,000 Da、4,000 Da、3,000 Da、2,000 Da、1,000 Da、900 Da、800 Da、700 Da、600 Da、500 Da、400 Da、300 Da、200 Da及100 Da。在一些實施例中，聚合物之分子量介於約100 Da與約50,000 Da之間。在一些實施例中，聚合物之分子量介於約100 Da與約40,000 Da之間。在一些實施例中，聚合物之分子量介於約1,000 Da與約40,000 Da之間。在一些實施例中，聚合物之分子量介於約5,000 Da與40,000 Da之間。在一些實施例中，聚合物之分子量介於約10,000 Da與約40,000 Da之間。
出於此目的，已研發出多種方法，包括聚乙二醇化、聚唾液酸化、羥乙基澱粉化、糖基化或與可撓性及親水性胺基酸鏈(500至600個胺基酸)融合之重組PEG類似物(參見Chapman, (2002) Adv Drug Deliv Rev. 54. 531-545；Schlapschy等人, (2007) Prot Eng Des Sel. 20, 273-283；Contermann (2011) Curr Op Biotechnol. 22, 868-876；Jevsevar等人, (2012) Methods Mol Biol. 901, 233-246)。
聚合物之實例包括(但不限於)聚烷基醚及其烷氧基封端類似物(例如聚氧乙烯二醇、聚氧乙烯/丙二醇及其甲氧基或乙氧基封端類似物，尤其聚氧乙烯二醇，後者亦稱為聚乙二醇或PEG)；離散PEG (dPEG)；聚乙烯吡咯啶酮；聚乙烯基烷基醚；聚噁唑啉、聚烷基噁唑啉及聚羥烷基噁唑啉；聚丙烯醯胺、聚烷基丙烯醯胺及聚羥烷基丙烯醯胺(例如聚羥丙基甲基丙烯醯胺及其衍生物)；聚羥烷基丙烯酸酯；聚唾液酸及其類似物；親水性肽序列；多醣及其衍生物，包括聚葡萄糖及聚葡萄糖衍生物，例如羧基甲基聚葡萄糖、硫酸聚葡萄糖、胺基聚葡萄糖；纖維素及其衍生物，例如羧甲基纖維素、羥烷基纖維素；甲殼素及其衍生物，例如聚葡萄胺糖、丁二醯聚葡萄胺糖、羧甲基甲殼素、羧甲基聚葡萄胺糖；玻尿酸及其衍生物；澱粉；海藻酸鹽；硫酸軟骨素；白蛋白；普魯蘭(pullulan)及羧甲基普魯蘭；聚胺基酸及其衍生物，例如聚麩胺酸、聚離胺酸、聚天冬胺酸、聚天冬醯胺；順丁烯二酸酐共聚物，諸如：苯乙烯順丁烯二酸酐共聚物、二乙烯基乙基醚順丁烯二酸酐共聚物；聚乙烯醇；其共聚物；其三聚物；其混合物；及前述各者之衍生物。
所選聚合物可為水溶性的，以使得其附接之結合子-藥物共軛物不會在水性環境(諸如生理環境)中沈澱。水溶性聚合物可為任何結構形式，包括(但不限於)線性、叉狀或分支形。典型地，水溶性聚合物為聚(烷二醇)，諸如聚(乙二醇)(PEG)，但亦可使用其他水溶性聚合物。舉例而言，PEG用以描述本發明之某些實施例。對於結合子-藥物共軛物之治療用途，聚合物可為醫藥學上可接受的。
廣泛使用術語「PEG」涵蓋任何聚乙二醇分子，與尺寸或PEG之一端處之修飾無關，且可表示為連接於含有親和體之多肽，如下式： XO-(CH2 CH2 O)n -CH2 CH2 - 或 XO-(CH2 CH2 O)n - 其中n為2至10,000，且X為H或末端修飾，包括(但不限於) C1-4烷基、保護基或末端官能基。在一些情況下，用於本發明多肽中之PEG端接於具有羥基或甲氧基之一端上，亦即X為H或CH3 (「甲氧基PEG」)。
應注意，PEG之另一端，其在上式中由末端「-」展示，可經由天然存在或非天然編碼之胺基酸附接至含有親和體之多肽。舉例而言，附接可經由與多肽之胺基(包括(但不限於)離胺酸之ε胺或N端)之醯胺、胺基甲酸酯或脲鍵進行。或者，聚合物藉由順丁烯二醯亞胺鍵連接至硫醇基(包括(但不限於)半胱胺酸之硫醇基)，其在附接至親和體多肽序列本身之情況下需要將親和體序列中之殘基改變成半胱胺酸。
可調節連接至含有親和體之多肽之水溶性聚合物的數目(亦即，聚乙二醇化或糖基化之程度)以提供所得結合子-藥物共軛物中之改變(包括(但不限於)增加或降低)之藥理學、藥物動力學或藥效學特徵，諸如活體內半衰期。在一些實施例中，所得結合子-藥物共軛物之半衰期相比於未經修飾之多肽增加至少約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、2倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、11倍、12倍、13倍、14倍、15倍、16倍、17倍、18倍、19倍、20倍、25倍、30倍、35倍、40倍、50倍或至少約100倍。
適用於改良所得結合子-藥物共軛物之PK或其他生物特性的聚合物系統之另一變異為使用作為PEG之功能性類似物，尤其作為與親和體多肽序列之融合蛋白之一部分的非結構化之親水性胺基酸聚合物。多肽平台之固有生物可降解性使得其具有作為PEG之可能更良性替代物之吸引力。另一優勢為與PEG之多分散性相比，重組分子之精確分子結構。與其中需要保持融合搭配物之三維摺疊之HSA及Fc肽融合物不同，在許多情況下，與非結構化搭配物之重組融合物可經歷更高溫度或嚴格條件，諸如HPLC純化。
此類別多肽中之一種更高級多肽稱為XTEN (Amunix)且長度為864個胺基酸且包含六個胺基酸(A、E、G、P、S及T)。參見Schellenberger等人 「A recombinant polypeptide extends the in vivo half-life of peptides and proteins in a tunable manner」 2009 Nat Biotechnol. 27(12):1186-90。由於聚合物之生物可降解性質，此比通常使用之40 KDa PEG大得多且賦予伴隨更大之半衰期延長。XTEN與含有親和體之多肽之融合物應引起最終結合子-藥物共軛物與未經修飾之多肽相比半衰期延長60至130倍。
基於類似概念考慮因素之第二聚合物為PAS (XL-Protein GmbH)。Schlapschy等人 「PASYlation: a biological alternative to PEGylation for extending the plasma half-life of pharmaceutically active proteins」 2013 Protein Eng Des Sel. 26(8):489-501。無規捲曲聚合物由僅三種小型不帶電胺基酸(脯胺酸、丙胺酸及絲胺酸)之甚至更受限集合構成。與Fc、HAS及XTEN相同，PAS修飾可與親和體多肽序列一起進行遺傳編碼以在表現時產生內嵌融合蛋白。 多特異性融合蛋白
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物為包括(例如)第一抗PD-L1親和體多肽及至少一個其他結合域之多特異性多肽。作為說明，其他結合域可為選自以下之多肽序列：第二親和體多肽序列(其可與第一親和體多肽序列相同或不同)、抗體或其片段或其他抗原結合多肽、受體之配位體結合部分(諸如受體陷阱多肽)、受體結合配位體(諸如細胞介素、生長因子或其類似物)、經工程改造之T細胞受體、酶或其催化片段或其他賦予一些性質之多肽序列。
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物包括一或多個亦針對PD-L1之其他親和體多肽序列。其他抗PD-L1親和體(或其混合物)可與第一抗PD-L1親和體多肽相同或不同，以產生多特異性親和體融合蛋白。結合子-藥物共軛物可結合PD-L1上之相同或重疊位點，或可結合兩個不同位點，使得結合子-藥物共軛物可同時結合同一個PD-L1蛋白質上之兩個位點(雙互補位)或超過兩個位點(多互補位)。
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物包括來自抗體之一或多個抗原結合位點。所得結合子-藥物共軛物可為包括抗PD-L1親和體與抗原結合位點兩者之單鏈(諸如在scFV之情況下)，或可為多聚蛋白複合物，諸如其中抗PD-L1抗體之序列亦與組裝有重鏈及/或輕鏈之抗體融合。此格式之例示性親和體/抗體融合物為圖11A中所示之伊派利單抗(Ipilimumab)-AVA04-141雙特異性抗體，其對於CTLA-4及PD-L1中之每一者為二價的。另一種為圖13A中之貝伐單抗(Bevacizumab)-AVA04-251雙特異性抗體，其對於VEGF-A及PD-L1中之每一者為二價的。
在所說明之伊派利單抗-AVA04-141雙特異性抗體之情況下，抗PD-L1親和體多肽呈在抗CTLA-4抗體之重鏈之C端末端處之串聯融合物形式提供，其中重鏈(包括可移除之分泌信號序列MPLLLLLPLLWAGALA及Gly4 -Ser重複連接子)具有親和體融合序列：
Figure 02_image137
且輕鏈(包括可移除之分泌信號序列MPLLLLLPLLWAGALA)具有天然伊派利單抗抗體之序列：
Figure 02_image139
同樣，在所說明之貝伐單抗-AVA04-251雙特異性抗體之情況下，抗PD-L1親和體多肽呈在抗VEGF-A抗體之重鏈之C端末端處之串聯融合物形式提供，其中重鏈(包括可移除之分泌信號序列MPLLLLLPLLWAGALA及可撓性Gly4 -Ser重複連接子)具有親和體融合序列：
Figure 02_image141
且輕鏈(包括可移除之分泌信號序列MPLLLLLPLLWAGALA)具有天然貝伐單抗抗體之序列：
Figure 02_image143
為進一步說明格式化所提供之本發明之親和體時的靈活性，亦產生貝伐單抗-AVA04-251雙特異性抗體之如下型式，其中輕鏈與以上相同，但重鏈在抗體重鏈與抗PD-L1親和體之間包括剛性連接子，其中重鏈(包括可移除之分泌信號序列MPLLLLLPLLWAGALA及剛性A(EAAAK)3 連接子)具有親和體融合序列：
Figure 02_image145
如熟習此項技術者顯而易見且圖17中所示，抗PD-L1親和體多肽序列可添加在抗體重鏈或輕鏈之N端或C端末端中之任一者處，或其組合/排列。此外，如圖9中所示，在多聚親和體之情形下，任何既定抗體鏈可包括超過一個親和體序列。
在關於包含全長免疫球蛋白之多特異性結合子-藥物共軛物的一些實施例中，親和體多肽序列與抗體之融合將保留免疫球蛋白Fc區之Fc功能。舉例而言，在某些實施例中，結合子-藥物共軛物將能夠經由其Fc部分結合於Fc受體陽性細胞之Fc受體。在一些其他實施例中，結合子-藥物共軛物可藉由結合於Fc受體陽性細胞來活化Fc受體陽性細胞，藉此起始或增加細胞介素及/或共刺激抗原之表現。此外，結合子-藥物共軛物可至少經由共刺激抗原及/或細胞介素將T細胞之生理學活化所需的第二活化信號轉移至T細胞。
在一些實施例中，由於其Fc部分與表現在來自免疫系統之效應細胞(諸如免疫細胞、肝細胞及內皮細胞)之表面上存在之Fc受體的其他細胞之結合，結合子-藥物共軛物可具有抗體依賴性細胞毒性(ADCC)功能，此為一種細胞介導之免疫防禦機制，藉此免疫系統之效應細胞有效溶解膜表面抗原已由抗體結合之目標細胞且因此，經由ADCC引起腫瘤細胞死亡。在一些其他實施例中，結合子-藥物共軛物能夠顯示ADCC功能。
如上所述，除Fc介導之細胞毒性以外，Fc部分可有助於維持結合子-藥物共軛物之血清含量，此對於其在體內之穩定性及持久性而言係關鍵的。舉例而言，當Fc部分結合於內皮細胞及吞噬細胞上之Fc受體時，結合子-藥物共軛物可變內化且再循環回至血流，增強其在體內之半衰期。
僅作為說明，其他親和體多肽之例示性目標包括(但不限於)另一免疫檢查點蛋白及免疫共刺激性受體(尤其在其他親和體可促效共刺激性受體之情況下)、受體、細胞介素、生長因子或腫瘤相關抗原。
在結合子-藥物共軛物為親和體/抗體融合蛋白之情況下，例如可為免疫球蛋白之免疫球蛋白部分為針對CD20、CD30、CD33、CD38、CD52、VEGF、VEGF受體、EGFR或Her2/neu之單株抗體。此類免疫球蛋白之少數例示性實例包括以下中之任一者中所包含之抗體：曲妥珠單抗(trastuzumab)、帕尼單抗(panitumumab)、西妥昔單抗(cetuximab)、奧比珠單抗(obinutuzumab)、利妥昔單抗(rituximab)、帕妥珠單抗(pertuzumab)、阿侖單抗(alemtuzumab)、貝伐單抗、托西莫單抗(tositumomab)、布突默單抗(ibritumomab)、奧伐木單抗(ofatumumab)、貝倫妥單抗(brentuximab)及吉妥珠單抗(gemtuzumab)。
在某些實施例中，抗PD-L1親和體多肽為如下結合子-藥物共軛物之一部分，其包括一或多個抑制諸如在T細胞上表現之免疫檢查點分子(包括(但不限於) PD-1、PD-L2、CTLA-4、NKG2A、KIR、LAG-3、TIM-3、CD96、VISTA或TIGIT)之結合域。
在某些實施例中，抗PD-L1親和體多肽為如下結合子-藥物共軛物之一部分，其包括一或多個促效諸如表現在T細胞上表現之免疫共刺激分子(包括(但不限於) CD28、ICOS、CD137、OX40、GITR、CD27、CD30、HVEM、DNAM-1或CD28H)之結合域。
在某些實施例中，抗PD-L1親和體多肽為如下結合子-藥物共軛物之一部分，其包括免疫共刺激性分子之一或多種配位體促效劑，諸如CD28、ICOS、CD137、OX40、GITR、CD27、CD30、HVEM、DNAM-1或CD28H之促效劑配位體。
藉由抗PD-L1親和體之PD-L1抑制活性與阻斷一個或若干個抑制性免疫檢查點及/或活化免疫共刺激路徑中之一或多者的結合域組合，多特異性結合子-藥物共軛物可以其他方式救援耗竭之抗腫瘤T細胞，增強抗腫瘤免疫，藉此引發癌症患者中之陽性反應。在一些其他實施例中，結合子-藥物共軛物對協同表現之免疫檢查點蛋白質之雙重阻斷可產生累加或協同抗腫瘤活性。
在某些實施例中，抗PD-L1親和體多肽為如下結合子-藥物共軛物之一部分，其包括一或多個抑制可溶性免疫遏制分子之結合域，諸如結合於可溶性免疫遏制分子(諸如受體陷阱)之結合域或結合於對應同源受體且防止受體配位體活化之結合域，包括(但不限於)PGE2、TGF-β、VEGF、CCL2、IDO、CSF1、IL-10、IL-13、IL-23、腺苷或STAT3活化劑。在某些情況下，結合子-藥物共軛物包括VEGF受體陷阱結構域，諸如阿柏西普之(Aflibercept)之VEGF結合受體結構域。在另一實例中，結合子-藥物共軛物包括TGF-β受體陷阱結構域，諸如MSB0011359C之TGF-β結合受體結構域。
在某些實施例中，抗PD-L1親和體多肽為如下結合子-藥物共軛物之一部分，其包括一或多個結合於腫瘤微環境中上調，諸如在腫瘤中之腫瘤細胞或巨噬細胞、纖維母細胞、T細胞或其他浸潤腫瘤之免疫細胞上上調之蛋白質(亦即，腫瘤相關抗原)的結合域。
在某些實施例中，抗PD-L1親和體多肽為結合子-藥物共軛物之一部分，其包括一或多個結合於選自由以下組成之群之蛋白質的結合域：CEACAM-1、CEACAM-5、BTLA、LAIR1、CD160、2B4、TGFR、B7-H3、B7-H4、CD40、CD4OL、CD47、CD70、CD80、CD86、CD94、CD137、CD137L、CD226、半乳糖凝集素-9、GITRL、HHLA2、ICOS、ICOSL、LIGHT、I或II類MHC、NKG2a、NKG2d、OX4OL、PVR、SIRPα、TCR、CD20、CD30、CD33、CD38、CD52、VEGF、VEGF受體、EGFR、Her2/neu、ILT1、ILT2、ILT3、ILT4、ILT5、ILT6、ILT7、ILT8、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL4、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL3、NKG2A、NKG2C、NKG2E或TSLP。(ii) 其他 PD-L1 結合子
在一些實施例中，細胞結合部分為抑制PD-L1與PD-1及B7-1兩者之結合的PD-L1結合拮抗劑。在一些實施例中，PD-L1結合拮抗劑為抗PD-L1抗體。在一些實施例中，抗PD-L1抗體為單株抗體。在一些實施例中，抗PDL1抗體為諸如選自由Fab、Fab'-SH、Fv、scFv及(Fab')2片段組成之群的抗體片段。在一些實施例中，抗PD-Ll抗體為人類化抗體或人類抗體。在一些實施例中，PD-L1結合拮抗劑選自由YW243.55.S70、MPDL3280A、MDX-1105及MEDI4736組成之群。
在某些實施例中，細胞結合部分為包含以下之抗PD-L1抗體或其片段：重鏈可變區，其包含胺基酸序列
Figure 02_image147
或
Figure 02_image149
及輕鏈可變區，其包含胺基酸序列
Figure 02_image151
Figure 02_image153
。
其他人類及人類化抗體及其片段為此項技術中所熟知且適用於本發明中。 IV.使用方法及醫藥組合物
本發明之結合子-藥物共軛物可用於多種應用，包括(但不限於)治療性治療方法，諸如癌症免疫療法。在某些實施例中，本文所述之結合子-藥物共軛物適用於活化、促進、增加及/或增強免疫反應、抑制腫瘤生長、減小腫瘤體積、誘導腫瘤消退、增加腫瘤細胞之細胞凋亡及/或降低腫瘤之致瘤性。在某些實施例中，本發明之多肽或藥劑亦適用於針對病原體(諸如病毒)之免疫療法。在某些實施例中，本文所述之結合子-藥物共軛物適用於抑制病毒感染、減少病毒感染、增加病毒之細胞的細胞凋亡及/或增加病毒感染細胞之殺死。使用方法可為活體外、離體或活體內方法。
本發明提供使用結合子-藥物共軛物活化個體之免疫反應的方法。在一些實施例中，本發明提供使用本文所述之結合子-藥物共軛物促進個體之免疫反應的方法。在一些實施例中，本發明提供使用結合子-藥物共軛物增加個體之免疫反應的方法。在一些實施例中，本發明提供使用結合子-藥物共軛物增強個體之免疫反應的方法。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含提高細胞介導之免疫性。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含增加Th1型反應。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含提高T細胞活性。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含提高CD4+ T細胞活性。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含提高CD8+ T細胞活性。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含提高CTL活性。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含提高NK細胞活性。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含提高T細胞活性及提高NK細胞活性。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含提高CU活性及提高NK細胞活性。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含抑制或降低Treg細胞之抑制活性。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含抑制或降低MDSC之抑制活性。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含增加記憶T細胞之百分比之數值。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含提高長期免疫記憶功能。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含提高長期記憶。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含不存在顯著副作用及/或基於免疫之毒性之跡象。在一些實施例中，免疫反應之活化、促進、增加及/或增強包含不存在細胞介素釋放症候群(CRS)或細胞介素風暴之跡象。在一些實施例中，免疫反應為抗原刺激結果。在一些實施例中，抗原刺激為腫瘤細胞。在一些實施例中，抗原刺激為癌症。在一些實施例中，抗原刺激為病原體。在一些實施例中，抗原刺激為病毒感染之細胞。
用於確定結合子-藥物共軛物是否活化或抑制免疫反應之活體內及活體外分析係此項技術中已知的。
在一些實施例中，增加個體之免疫反應的方法包含向個體投與治療有效量之本文所述之結合子-藥物共軛物，其中該結合子-藥物共軛物結合人類PD-L1。
在一些實施例中，增加個體之免疫反應的方法包含向個體投與治療有效量之本文所述之結合子-藥物共軛物，其中結合子-藥物共軛物為包括特異性結合於PD-L1之親和體多肽的含親和體之抗體或受體陷阱融合多肽。
在本文所述之方法之某些實施例中，活化或增強針對腫瘤之持續性或長期免疫反應的方法包含向個體投與治療有效量之結合人類PD-L1之結合子-藥物共軛物。在一些實施例中，活化或增強針對腫瘤之持續性免疫反應之方法包含向個體投與治療有效量之本文所述之結合子-藥物共軛物，其中該結合子-藥物共軛物為包括特異性結合於PD-L1之親和體多肽的含親和體之抗體或受體陷阱融合多肽。
在本文所述之方法的某些實施例中，抑制腫瘤復發或腫瘤再生之方法包含向個體投與治療有效量之結合人類PD-L1之結合子-藥物共軛物。在一些實施例中，抑制腫瘤復發或腫瘤再生之方法包含向個體投與治療有效量之本文所述之結合子-藥物共軛物，其中該結合子-藥物共軛物為包括特異性結合於PD-L1之親和體多肽的含親和體之抗體或受體陷阱融合多肽。
在一些實施例中，腫瘤表現或過表現由結合子-藥物共軛物中所提供之除抗PD-L1親和體多肽以外的其他結合實體靶向之腫瘤抗原，亦即其中結合子-藥物共軛物為雙特異性或多特異性試劑。
在某些實施例中，抑制腫瘤生長之方法包含向個體投與治療有效量之本文所述之結合子-藥物共軛物。在某些實施例中，個體為人類。在某些實施例中，個體具有腫瘤，或個體之腫瘤已移除。
在一些實施例中，腫瘤為實體腫瘤。在某些實施例中，腫瘤為選自由以下組成之群的腫瘤：結腸直腸腫瘤、胰臟腫瘤、肺腫瘤、卵巢腫瘤、肝臟腫瘤、乳房腫瘤、腎臟腫瘤、前列腺腫瘤、神經內分泌腫瘤、胃腸道腫瘤、黑色素瘤、子宮頸腫瘤、膀胱腫瘤、神經膠母細胞瘤及頭頸部腫瘤。在某些實施例中，腫瘤為結腸直腸腫瘤。在某些實施例中，腫瘤為卵巢腫瘤。在一些實施例中，腫瘤為肺腫瘤。在某些實施例中，腫瘤為胰臟腫瘤。在某些實施例中，腫瘤為黑色素瘤腫瘤。在一些實施例中，腫瘤為膀胱腫瘤。
為進一步說明，主題結合子-藥物共軛物可用於治療罹患如下癌症之患者：骨肉瘤、橫紋肌肉瘤、神經母細胞瘤、腎癌、白血病、腎移行細胞癌、膀胱癌、威爾姆氏癌(Wilm's cancer)、卵巢癌、胰臟癌、乳癌、前列腺癌、骨癌、肺癌(例如非小細胞肺癌)、胃癌、結腸直腸癌、子宮頸癌、滑膜肉瘤、頭頸癌、鱗狀細胞癌、多發性骨髓瘤、腎細胞癌、視網膜母細胞瘤、肝母細胞瘤、肝細胞癌、黑色素瘤、腎橫紋肌樣瘤、尤文氏肉瘤(Ewing's sarcoma)、軟骨肉瘤、腦癌、神經膠母細胞瘤、腦膜瘤、垂體腺瘤、前庭神經鞘瘤、原始神經外胚層瘤、神經管胚細胞瘤、星形細胞瘤、多形性星形細胞瘤、少突神經膠質瘤、室管膜瘤、脈絡叢乳頭狀瘤、真性紅細胞增多症、血小板增多症、特發性骨髓纖維化、軟組織肉瘤、甲狀腺癌、子宮內膜癌、類癌瘤癌或肝癌、乳癌或胃癌。在本發明之一實施例中，癌症為例如上述種類之轉移性癌症。
在某些實施例中，癌症為血液癌。在一些實施例中，癌症選自由以下組成之群：急性骨髓白血病(AML)、霍奇金氏淋巴瘤(Hodgkin lymphoma)、多發性骨髓瘤、T細胞急性淋巴母細胞白血病(T-ALL)、慢性淋巴球性白血病(CLL)、毛細胞白血病、慢性骨髓性白血病(CML)、非霍奇金氏淋巴瘤、彌漫性大型B細胞淋巴瘤(DLBCL)、套細胞淋巴瘤(MCL)及皮膚T細胞淋巴瘤(CTCL)。
本發明亦提供包含本文所述之結合子-藥物共軛物及醫藥學上可接受之媒劑的醫藥組合物。在一些實施例中，醫藥組合物可用於免疫療法中。在一些實施例中，醫藥組合物可用於免疫腫瘤學中。在一些實施例中，組合物可用於抑制腫瘤生長。在一些實施例中，醫藥組合物可用於抑制個體(例如人類患者)中之腫瘤生長。在一些實施例中，組合物可用於治療癌症。在一些實施例中，醫藥組合物可用於治療個體(例如人類患者)之癌症。
藉由經純化之本發明之結合子-藥物共軛物與醫藥學上可接受之媒劑(例如載劑或賦形劑)組合，製備調配物供儲存及使用。熟習此項技術者一般將醫藥學上可接受之載劑、賦形劑及/或穩定劑視為調配物或醫藥組合物之非活性成分。
在一些實施例中，本文所述之結合子-藥物共軛物經凍乾及/或以凍乾形式儲存。在一些實施例中，包含本文所述之結合子-藥物共軛物之調配物經凍乾。
合適醫藥學上可接受之媒劑包括(但不限於)無毒性緩衝劑，諸如磷酸鹽、檸檬酸鹽及其他有機酸；鹽，諸如氯化鈉；抗氧化劑，包括抗壞血酸及甲硫胺酸；防腐劑，諸如十八烷基二甲基苯甲基氯化銨、氯化六羥季銨、苯紮氯銨、苄索氯銨、苯酚、丁醇或苯甲醇、對羥基苯甲酸烷基酯(諸如對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯)、兒茶酚、間苯二酚、環己醇、3-戊醇及間甲酚；低分子量多肽(例如小於約10個胺基酸殘基)；蛋白質，諸如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白；親水性聚合物，諸如聚乙烯吡咯啶酮；胺基酸，諸如甘胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺、組胺酸、精胺酸或離胺酸；碳水化合物，諸如單醣、雙醣、葡萄糖、甘露糖或糊精；螯合劑，諸如EDTA；糖，諸如蔗糖、甘露糖醇、海藻糖或山梨糖醇；成鹽相對離子，諸如鈉；金屬錯合物，諸如Zn-蛋白質錯合物；及非離子性界面活性劑，諸如TWEEN或聚乙二醇(PEG)(Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 第22版, 2012, Pharmaceutical Press, London.)。
本發明之醫藥組合物可以多種方式投與以用於局部或全身治療。投藥可為局部的，藉由表皮或經皮貼片、軟膏、洗劑、乳膏、凝膠、滴劑、栓劑、噴霧劑、液體及散劑；經肺，藉由吸入或吹入散劑或氣霧劑，包括藉由噴霧器；氣管內及鼻內；經口；或非經腸，包括靜脈內、動脈內、瘤內、皮下、腹膜內、肌肉內(例如注射或輸注)或顱內(例如鞘內或室內)。
治療調配物可呈單位劑型。此類調配物包括錠劑、丸劑、膠囊、散劑、顆粒劑、於水或非水性培養基中之溶液或懸浮液或栓劑。在諸如錠劑之固體組合物中，主要活性成分與醫藥載劑混合。習知製錠成分包括玉米澱粉、乳糖、蔗糖、山梨糖醇、滑石、硬脂酸、硬脂酸鎂、磷酸二鈣或樹膠及稀釋劑(例如水)。此等可用於形成固體預調配組合物，其含有本發明化合物之均質混合物或其無毒性之醫藥學上可接受之鹽。接著，將固體預調配組合物細分成上文所描述之類型之單位劑型。調配物或組合物之錠劑或丸劑等可經包衣或以其他方式進行混配以提供具有長期作用優勢之劑型。舉例而言，錠劑或丸劑可包含由外部組分覆蓋之內部組合物。此外，兩種組分可由用於抵抗崩解及允許內部組分完整地通過胃或延遲釋放之腸溶層間隔開。多種材料可用於此類腸溶層或腸溶包衣，此類材料包括多種聚合酸及聚合酸與諸如蟲膠、十六醇及乙酸纖維素之材料之混合物。
本文所述之結合子-藥物共軛物亦可包埋於微膠囊中。此類微膠囊例如藉由凝聚技術或藉由界面聚合製備，例如分別為羥基甲基纖維素或明膠微膠囊及聚-(甲基丙烯酸甲酯)微膠囊，製備成膠體藥物遞送系統(例如脂質體、白蛋白微球體、微乳液、奈米粒子及奈米膠囊)或製備成巨乳液，如Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 第22版, 2012, Pharmaceutical Press, London中所描述。
在某些實施例中，醫藥調配物包括本發明之結合子-藥物共軛物與脂質體的複合物。用於產生脂質體之方法為熟習此項技術者已知。舉例而言，一些脂質體可藉由逆相蒸發法用包含磷脂醯膽鹼、膽固醇及PEG衍生化之磷脂醯乙醇胺(PEG-PE)的脂質組合物產生。脂質體可經具有界定孔徑之過濾器擠出以產生具有所需直徑之脂質體。
在某些實施例中，可產生包含本文所述之結合子-藥物共軛物的持續釋放型製劑。持續釋放型製劑之合適實例包括含有結合子-藥物共軛物之固體疏水性聚合物之半滲透基質，其中該等基質呈成形製品形式(例如薄膜或微膠囊)。持續釋放基質之實例包括聚酯；水凝膠，諸如聚(2-羥乙基-甲基丙烯酸酯)或聚(乙烯醇)；聚乳酸交酯；L-麩胺酸與7-L-麩胺酸乙酯之共聚物；不可降解之乙烯-乙酸乙烯酯；可降解之乳酸-乙醇酸共聚物，諸如LUPRON DEPOT.TM. (由乳酸-乙醇酸共聚物及乙酸亮丙立德構成之可注射微球體)；蔗糖乙酸酯異丁酸鹽；及聚-D-(-)-3-羥基丁酸。
在某些實施例中，除投與本文所述之結合子-藥物共軛物之外，該方法或治療進一步包含投與至少一種其他免疫反應刺激劑。在一些實施例中，其他免疫反應刺激劑包括(但不限於)群落刺激因子(例如顆粒球巨噬細胞群落刺激因子(GM-CSF)、巨噬細胞群落刺激因子(M-CSF)、粒細胞群落刺激因子(G-CSF)、幹細胞因子(SCF))、介白素(例如IL-1、IL2、IL-3、IL-7、IL-12、IL-15、IL-18)、檢查點抑制劑、阻斷免疫抑制功能之抗體(例如抗CTLA-4抗體、抗CD28抗體、抗CD3抗體)、類鐸受體(例如TLR4、TLR7、TLR9)或B7家族之成員(例如CD80、CD86)。其他免疫反應刺激劑可在結合子-藥物共軛物投與之前、與其並行及/或之後投與。亦提供包含結合子-藥物共軛物及免疫反應刺激劑之醫藥組合物。在一些實施例中，免疫反應刺激劑包含1種、2種、3種或更多種免疫反應刺激劑。
在某些實施例中，除投與本文所述之結合子-藥物共軛物之外，該方法或治療進一步包含投與至少一種其他治療劑。其他治療劑可在結合子-藥物共軛物投與之前、與其並行及/或之後投與。亦提供包含結合子-藥物共軛物及其他治療劑之醫藥組合物。在一些實施例中，至少一種其他治療劑包含1種、2種、3種或更多種其他治療劑。
具有兩種或更多種治療劑之組合療法通常使用藉由不同作用機制起作用之藥劑，不過此並非所需。使用具有不同作用機制之藥劑之組合療法可引起累加或協同作用。組合療法可允許各藥劑之劑量低於單一療法中所用劑量，藉此減少結合子-藥物共軛物之毒副作用及/或提高其治療指數。組合療法可降低顯現抗性癌細胞之可能性。在一些實施例中，組合療法包含影響免疫反應(例如增強或活化反應)之治療劑及影響(例如抑制或殺滅)腫瘤/癌細胞之治療劑。
在本文所述之方法之一些實施例中，本文所述之結合子-藥物共軛物與至少一種其他治療劑之組合產生累加或協同結果。在一些實施例中，組合療法提高結合子-藥物共軛物之治療指數。在一些實施例中，組合療法提高其他治療劑之治療指數。在一些實施例中，組合療法降低結合子-藥物共軛物之毒性及/或副作用。在一些實施例中，組合療法降低其他治療劑之毒性及/或副作用。
適用類別之治療劑包括例如抗微管蛋白劑、奧瑞他汀(auristatins)、DNA小溝結合劑、DNA複製抑制劑、烷基化劑(例如鉑錯合物，諸如順鉑、單(鉑)、雙(鉑)及三核鉑錯合物及卡鉑)、蒽環黴素、抗生素、抗葉酸劑、抗代謝物、化學治療敏化劑、倍癌黴素、依託泊苷、氟化嘧啶、離子載體、萊克希托普森(lexitropsin)、亞硝基脲、普拉汀諾(platinol)、嘌呤抗代謝物、嘌呤黴素(puromycin)、輻射敏化劑、類固醇、紫杉烷、拓樸異構酶抑制劑、長春花生物鹼或其類似物。在某些實施例中，第二治療劑為烷化劑、抗代謝物、抗有絲分裂劑、拓樸異構酶抑制劑或血管生成抑制劑。
可與本文所述之結合子-藥物共軛物組合投與之治療劑包括化學治療劑。因此，在一些實施例中，該方法或治療包括投與本發明之結合子-藥物共軛物與化學治療劑組合或與化學治療劑之混合物組合。結合子-藥物共軛物治療可在投與化學療法之前、與其並行或之後進行。組合投與可包括以單一醫藥調配物或使用分開的調配物共同投與，或以任一順序但通常在一段時間內連續投與以使得所有活性劑可同時發揮其生物活性。此類化學治療劑之製備及給藥時程可根據製造商說明書使用或由熟習此項技術者根據經驗來確定。此類化學療法之製備及給藥時程亦描述於The Chemotherapy Source Book, 第4版, 2008, M. C. Perry編輯, Lippincott, Williams & Wilkins, Philadelphia, Pa中。
適用於本發明中之化學治療劑包括(但不限於)烷基化劑，諸如噻替派及環磷醯胺(CYTOXAN)；磺酸烷基酯，諸如白消安、英丙舒凡及哌泊舒凡；氮丙啶，諸如苯唑多巴、卡波醌、米特多巴及尤利多巴；乙烯亞胺及甲基三聚氰胺，包括六甲蜜胺、三伸乙基三聚氰胺、三伸乙基磷醯胺、三伸乙基硫代磷醯胺及三羥甲基三聚氰胺；氮芥，諸如苯丁酸氮芥、萘氮芥、氯磷醯胺、雌莫司汀、異環磷醯胺、甲氮芥、甲氮芥氧化物鹽酸鹽、美法侖、新恩比興、芬司特瑞、潑尼氮芥、曲磷胺、尿嘧啶氮芥；亞硝基脲，諸如卡莫司汀、氯脲菌素、福莫司汀、洛莫司汀、尼莫司汀、雷莫司汀；抗生素，諸如阿克拉黴素、放射菌素、安麯黴素、偶氮絲胺酸、博萊黴素、放線菌素C、卡奇黴素、卡拉比辛、洋紅黴素、嗜癌菌素、色黴素、放線菌素D、道諾黴素、地托比星、6-重氮-5-側氧基-L-正白胺酸、小紅莓、表柔比星、依索比星、艾達黴素、麻西羅黴素、絲裂黴素、黴酚酸、諾加黴素、橄欖黴素、培洛黴素、潑非黴素、嘌呤黴素、奎那黴素、羅多比星、鏈黑菌素、鏈脲菌素、殺結核菌素、烏苯美司、淨司他丁、佐柔比星；抗代謝物，諸如甲胺喋呤及5-氟尿嘧啶(5-FU)；葉酸類似物，諸如迪諾特寧、甲胺喋呤(methotrexate)、蝶羅呤、曲美沙特；嘌呤類似物，諸如氟達拉濱、6-巰基嘌呤、硫米嘌呤、硫鳥嘌呤；嘧啶類似物，諸如安西他濱、阿紮胞苷、6-氮雜尿苷、卡莫氟、胞嘧啶阿拉伯糖苷(cytosine arabinoside)、二去氧尿苷、去氧氟尿苷、依諾他濱、氟尿苷、5-FU；雄激素，諸如卡魯睾酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、環硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睾內酯(testolactone)；抗腎上腺劑，諸如胺魯米特、米托坦、曲洛司坦；葉酸補充劑，諸如亞葉酸；乙醯葡醛酯；醛磷醯胺糖苷；胺基乙醯丙酸；安吖啶；倍思塔布；比山群；艾達曲克；得弗伐胺；秋水仙鹼；地吖醌；依氟鳥氨酸；依利醋銨；依託格魯；硝酸鎵；羥基脲；香菇多醣(lentinan)；氯尼達明；丙脒腙；米托蒽醌；莫哌達醇；二胺硝吖啶；噴司他丁；凡那明；吡柔比星；鬼臼酸；2-乙基醯肼；丙卡巴肼；PSK；雷佐生；西佐喃；螺旋鍺；細交鏈孢菌酮酸；三亞胺醌；2,2',2''-三氯三乙胺；尿烷；長春地辛；達卡巴嗪；甘露莫司汀；二溴甘露醇；二溴衛矛醇；哌泊溴烷；加西托星；阿拉伯糖苷(Ara-C)；類紫杉醇，例如太平洋紫杉醇(TAXOL)及多烯紫杉醇(TAXOTERE))；苯丁酸氮芥；吉西他濱；6-硫鳥嘌呤；巰基嘌呤；鉑類似物，諸如順鉑及卡鉑；長春鹼；鉑；依託泊苷(VP-16)；異環磷醯胺；絲裂黴素C；米托蒽醌；長春新鹼；長春瑞賓；溫諾平(navelbine)；諾凡特龍；替尼泊甙；道諾黴素；胺基喋呤；伊班膦酸鹽；CPT11；拓樸異構酶抑制劑RFS 2000；二氟甲基鳥胺酸(DMFO)；視黃酸；埃斯培拉黴素；卡培他濱(XELODA)；及以上各者中之任一者的醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。化學治療劑亦包括用來調控或抑制激素對腫瘤之作用之抗激素劑，諸如抗雌激素，包括例如他莫昔芬、雷洛昔芬、抑制芳香酶之4(5)-咪唑、4-羥基他莫昔芬、曲沃昔芬、雷洛昔芬、LY117018、奧那司酮及托瑞米芬(FARESTON)；及抗雄激素，諸如氟他胺、尼魯胺、比卡魯胺、亮丙立德及戈舍瑞林；及以上中之任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。在某些實施例中，其他治療劑為順鉑。在某些實施例中，其他治療劑為卡鉑。
在本文所述之方法之某些實施例中，化學治療劑為拓樸異構酶抑制劑。拓樸異構酶抑制劑為干擾拓樸異構酶(例如拓樸異構酶I或II)之作用之化學療法劑。拓樸異構酶抑制劑包括(但不限於)小紅莓HCl、檸檬酸道諾黴素、米托蒽醌HCl、放線菌素D、依託泊苷、拓朴替康HCl、替尼泊苷(VM-26)及伊立替康以及此等中之任一者的醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。在一些實施例中，其他治療劑為伊立替康。
在某些實施例中，化學治療劑為抗代謝物。抗代謝物為具有與正常生物化學反應所需之代謝物類似的結構，但不同，足以干擾細胞之一或多種正常功能，諸如細胞分裂之化學物質。抗代謝物包括(但不限於)吉西他濱、氟尿嘧啶、卡培他濱、甲胺喋呤鈉、雷替曲塞(ralitrexed)、培美曲塞、喃氟啶、胞嘧啶阿拉伯糖苷、硫鳥嘌呤、5-氮雜胞苷、6-巰基嘌呤、硫唑嘌呤、6-硫鳥嘌呤、噴司他丁、磷酸氟達拉濱及克拉屈濱(cladribine)以及此等中之任一者的醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。在某些實施例中，其他治療劑為吉西他濱。
在本文所述之方法之某些實施例中，化學治療劑為抗有絲分裂劑，包括(但不限於)結合微管蛋白之藥劑。在一些實施例中，藥劑為紫杉烷。在某些實施例中，藥劑為太平洋紫杉醇或多烯紫杉醇，或太平洋紫杉醇或多烯紫杉醇之醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。在某些實施例中，藥劑為太平洋紫杉醇(TAXOL)、多烯紫杉醇(TAXOTERE)、白蛋白結合型太平洋紫杉醇(nab-太平洋紫杉醇；ABRAXANE)、DHA-太平洋紫杉醇或PG-太平洋紫杉醇。在某些替代實施例中，抗有絲分裂劑包含長春花生物鹼，諸如長春新鹼、長春鹼、長春瑞濱或長春地辛或其醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。在一些實施例中，抗有絲分裂劑為驅動蛋白Eg5之抑制劑或有絲分裂激酶之抑制劑，諸如Aurora A或Plk1。在某些實施例中，其他治療劑為太平洋紫杉醇。在某些實施例中，其他治療劑為nab-太平洋紫杉醇。
在本文所述之方法之一些實施例中，其他治療劑包含諸如小分子之藥劑。舉例而言，治療可涉及本發明之結合子-藥物共軛物與充當針對包括(但不限於) EGFR、HER2 (ErbB2)及/或VEGF之腫瘤相關抗原之抑制劑的小分子的組合投與。在一些實施例中，本發明之結合子-藥物共軛物與選自由以下組成之群的蛋白激酶抑制劑組合投與：吉非替尼(gefitinib) (IRESSA)、埃羅替尼(erlotinib) (TARCEVA)、舒尼替尼(sunitinib) (SUTENT)、拉帕替尼(lapatanib)、凡德他尼(vandetanib) (ZACTIMA)、AEE788、CI-1033、西地尼布(cediranib) (RECENTIN)、索拉非尼(sorafenib) (NEXAVAR)及帕唑帕尼(pazopanib) (GW786034B)。在一些實施例中，其他治療劑包含mTOR抑制劑。
在本文所述之方法之某些實施例中，其他治療劑為抑制癌症幹細胞路徑之小分子。在一些實施例中，其他治療劑為Notch路徑之抑制劑。在一些實施例中，其他治療劑為Wnt路徑之抑制劑。在一些實施例中，其他治療劑為BMP路徑之抑制劑。在一些實施例中，其他治療劑為Hippo路徑之抑制劑。在一些實施例中，其他治療劑為mTOR/AKR路徑之抑制劑。在一些實施例中，其他治療劑為RSPO/LGR路徑之抑制劑。
在本文所述之方法之一些實施例中，其他治療劑包含生物分子，諸如抗體。舉例而言，治療可涉及本發明之結合子-藥物共軛物與針對腫瘤相關抗原之抗體，包括(但不限於) 結合EGFR、HER2/ErbB2及/或VEGF之抗體的組合投與。在某些實施例中，其他治療劑為對癌症幹細胞標記物具有特異性之抗體。在一些實施例中，其他治療劑為結合Notch路徑之組分之抗體。在一些實施例中，其他治療劑為結合Wnt路徑之組分之抗體。在某些實施例中，其他治療劑為抑制癌症幹細胞路徑之抗體。在一些實施例中，其他治療劑為Notch路徑之抑制劑。在一些實施例中，其他治療劑為Wnt路徑之抑制劑。在一些實施例中，其他治療劑為BMP路徑之抑制劑。在一些實施例中，其他治療劑為抑制β-連環蛋白信號傳導之抗體。在某些實施例中，其他治療劑為血管生成抑制劑之抗體(例如抗VEGF或VEGF受體抗體)。在某些實施例中，其他治療劑為貝伐單抗(AVASTIN)、雷莫蘆單抗(ramucirumab)、曲妥珠單抗(HERCEPTIN)、帕妥珠單抗(OMNITARG)、帕尼單抗(VECTIBIX)、尼妥珠單抗(nimotuzumab)、紮魯姆單抗(zalutumumab)或西妥昔單抗(cetuximab)(ERBITUX)。
在本文所述之方法之一些實施例中，其他治療劑為調節免疫反應之抗體。在一些實施例中，其他治療劑為抗PD-1抗體、抗LAG-3抗體、抗CTLA-4抗體、抗TIM-3抗體或抗TIGIT抗體。
此外，用本文所述之結合子-藥物共軛物進行之治療可包括用其他生物分子進行之組合治療，該等生物分子為諸如一或多種細胞介素(例如淋巴介質、介白素、腫瘤壞死因子及/或生長因子)，或可伴有手術移除腫瘤、移除癌細胞或治療醫師認為必需的任何其他療法。在一些實施例中，其他治療劑為免疫反應刺激劑。
在本文所述之方法之一些實施例中，結合子-藥物共軛物可與選自由以下組成之群之生長因子組合：腎上腺髓素(AM)、血管生成素(Ang)、BMP、BDNF、EGF、紅血球生成素(EPO)、FGF、GDNF、G-CSF、GM-CSF、GDF9、HGF、HDGF、IGF、遷移刺激因子、肌肉抑制素(GDF-8)、NGF、神經營養素、PDGF、血小板生成素、TGF-α、TGF-β、TNF-α、VEGF、P1GF、IL-1、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-12、IL-15及IL-18。
在本文所述之方法之一些實施例中，其他治療劑為免疫反應刺激劑。在一些實施例中，免疫反應刺激劑係選自由以下組成之群：顆粒球巨噬細胞群落刺激因子(GM-CSF)、巨噬細胞群落刺激因子(M-CSF)、粒細胞群落刺激因子(G-CSF)、介白素3 (IL-3)、介白素12 (IL-12)、介白素1 (IL-1)、介白素2 (IL-2)、B7-1 (CD80)、B7-2 (CD86)、4-1BB配位體、抗CD3抗體、抗CTLA-4抗體、抗TIGIT抗體、抗PD-1抗體、抗LAG-3抗體及抗TIM-3抗體。
在本文所述之方法之一些實施例中，免疫反應刺激劑係選自由以下組成之群：PD-1活性調節劑、PD-L2活性調節劑、CTLA-4活性調節劑、CD28活性調節劑、CD80活性調節劑、CD86活性調節劑、4-1BB活性調節劑、OX40活性調節劑、KIR活性調節劑、Tim-3活性調節劑、LAG3活性調節劑、CD27活性調節劑、CD40活性調節劑、GITR活性調節劑、TIGIT活性調節劑、CD20活性調節劑、CD96活性調節劑、IDO1活性調節劑、細胞介素、趨化因子、干擾素、介白素、淋巴介質、腫瘤壞死因子(TNF)家族之成員及免疫刺激性寡核苷酸。
在本文所述之方法之一些實施例中，免疫反應刺激劑係選自由以下組成之群：PD-1拮抗劑、PD-L2拮抗劑、CTLA-4拮抗劑、CD80拮抗劑、CD86拮抗劑、KIR拮抗劑、Tim-3拮抗劑、LAG3拮抗劑、TIGIT拮抗劑、CD20拮抗劑、CD96拮抗劑及/或IDO1拮抗劑。
在本文所述之方法之一些實施例中，PD-1拮抗劑為特異性結合PD-1之抗體。在一些實施例中，結合PD-1之抗體為KEYTRUDA (MK-3475)、皮立珠單抗(pidilizumab)(CT-011)、納武單抗(nivolumab)(OPDIVO、BMS-936558、MDX-1106)、MEDI0680 (AMP-514)、REGN2810、BGB-A317、PDR-001或STI-A1110。在一些實施例中，結合PD-1之抗體描述於PCT公開案WO 2014/179664中，例如，鑑別為APE2058、APE1922、APE1923、APE1924、APE 1950或APE1963之抗體，或含有此等抗體中之任一者之CDR區之抗體。在其他實施例中，PD-1拮抗劑為包括PD-L2之融合蛋白，例如AMP-224。在其他實施例中，PD-1拮抗劑為肽抑制劑，例如AUNP-12。
在一些實施例中，CTLA-4拮抗劑為特異性結合CTLA-4之抗體。在一些實施例中，結合CTLA-4之抗體為伊派利單抗(YERVOY)或曲美木單抗(tremelimumab)(CP-675,206)。在一些實施例中，CTLA-4拮抗劑為CTLA-4融合蛋白，例如KAHR-102。
在一些實施例中，LAG3拮抗劑為特異性結合LAG3之抗體。在一些實施例中，結合LAG3之抗體為IMP701、IMP731、BMS-986016、LAG525及GSK2831781。在一些實施例中，LAG3拮抗劑包括可溶性LAG3受體，例如IMP321。
在一些實施例中，KIR拮抗劑為特異性結合KIR之抗體。在一些實施例中，結合KIR之抗體為利瑞路單抗(lirilumab)。
在一些實施例中，免疫反應刺激劑係選自由以下組成之群：CD28促效劑、4-1BB促效劑、OX40促效劑、CD27促效劑、CD80促效劑、CD86促效劑、CD40促效劑及GITR促效劑。在一些實施例中，OX40促效劑包括OX40配位體或其OX40結合部分。舉例而言，OX40促效劑可為MEDI6383。在一些實施例中，OX40促效劑為特異性結合OX40之抗體。在一些實施例中，結合OX40之抗體為MEDI6469、MEDI0562或MOXR0916 (RG7888)。在一些實施例中，OX40促效劑為能夠表現OX40配位體之載體(例如表現載體或病毒，諸如腺病毒)。在一些實施例中，表現OX40之載體為δ-24-RGDOX或DNX2401。
在一些實施例中，4-1BB (CD137)促效劑為結合分子，諸如抗運載蛋白。在一些實施例中，抗運載蛋白為PRS-343。在一些實施例中，4-1BB促效劑為特異性結合4-1BB之抗體。在一些實施例中，結合4-1BB之抗體為PF-2566 (PF-05082566)或烏瑞魯單抗(urelumab)(BMS-663513)。
在一些實施例中，CD27促效劑為特異性結合CD27之抗體。在一些實施例中，結合CD27之抗體為瓦里木單抗(varlilumab)(CDX-1127)。
在一些實施例中，GITR促效劑包含GITR配位體或其GITR結合部分。在一些實施例中，GITR促效劑為特異性結合GITR之抗體。在一些實施例中，結合GITR之抗體為TRX518、MK-4166或INBRX-110。
在一些實施例中，免疫反應刺激劑包括(但不限於)細胞介素，諸如趨化因子、干擾素、白細胞間介素、淋巴介質及腫瘤壞死因子(TNF)家族之成員。在一些實施例中，免疫反應刺激劑包括免疫刺激性寡核苷酸，諸如CpG二核苷酸。
在一些實施例中，免疫反應刺激劑包括(但不限於)抗PD-1抗體、抗PD-L2抗體、抗CTLA-4抗體、抗CD28抗體、抗CD80抗體、抗CD86抗體、抗4-1BB抗體、抗OX40抗體、抗KIR抗體、抗Tim-3抗體、抗LAG3抗體、抗CD27抗體、抗CD40抗體、抗GITR抗體、抗TIGIT抗體、抗CD20抗體、抗CD96抗體或抗IDO1抗體。
在特定實施例中，本文所揭示之結合子-藥物共軛物可單獨或與放射線療法結合使用。
在特定實施例中，本文所揭示之結合子-藥物共軛物可單獨或與靶向療法結合使用。靶向療法之實例包括：激素療法、信號轉導抑制劑(例如EGFR抑制劑，諸如西妥昔單抗(Erbitux)及埃羅替尼(Tarceva))；HER2抑制劑(例如曲妥珠單抗(Herceptin)及帕妥珠單抗(Perjeta))；BCR-ABL抑制劑(諸如伊馬替尼(Gleevec)及達沙替尼(dasatinib)(Sprycel))；ALK抑制劑(諸如克卓替尼(crizotinib)(Xalkori)及色瑞替尼(ceritinib)(Zykadia))；BRAF抑制劑(諸如維羅非尼(vemurafenib)(Zelboraf)及達拉非尼(dabrafenib)(Tafinlar))、基因表現調節劑、細胞凋亡誘導劑(例如硼替佐米(bortezomib)(Velcade)及卡非佐米(carfilzomib)(Kyprolis))、血管生成抑制劑(例如貝伐單抗(Avastin)及雷莫蘆單抗(Cyramza)、附接至毒素之單株抗體(例如貝倫妥單抗維多汀(brentuximab vedotin)(Adcetris)及阿多曲妥珠單抗恩他新(ado-trastuzumab emtansine)(Kadcyla))。
在特定實施例中，本發明之結合子-藥物共軛物可與抗癌治療劑或免疫調節藥物，諸如免疫調節受體抑制劑，例如特異性結合於受體之抗體或其抗原結合片段組合使用。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與Tim-3路徑拮抗劑聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與Vista路徑拮抗劑聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與BTLA路徑拮抗劑聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與LAG-3路徑拮抗劑聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與TIGIT路徑拮抗劑聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗PDL1抗體聯合。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與BMS-936559、MSB0010718C或MPDL3280A聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗CTLA4抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗CS1抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗KIR2DL1/2/3抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗CD137抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗GITR抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗PD-L2抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗ILT1抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗ILT2抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗ILT3抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗ILT4抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗ILT5抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗ILT6抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗ILT7抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗ILT8抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗CD40抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗OX40抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗KIR2DL1抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗KIR2DL2/3抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗KIR2DL4抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗KIR2DL5A抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗KIR2DL5B抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗KIR3DL1抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗KIR3DL2抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗KIR3DL3抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗NKG2A抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗NKG2C抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗ICOS抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗SIRPα抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗CD47抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗4-1 BB抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗IL-10抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗TSLP抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與IL-10或聚乙二醇化IL-10聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗APRIL抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一實施例中，本發明之抗PD-1抗體或其抗原結合片段與抗CD27抗體聯合，較佳作為醫藥組合物之一部分。
在本發明之一些實施例中，本發明之結合子-藥物共軛物與STING促效劑聯合，例如作為醫藥組合物之一部分。環狀二核苷酸(CDN)環狀二-AMP(由單核球增多性李氏菌(Listeria monocytogenes)及其他細菌產生)以及其類似物環狀二-GMP及環狀GMP-AMP由宿主細胞識別為病原體相關分子模式(PAMP)，其結合於稱為干擾素基因刺激劑(STING)之病原體識別受體(PRR)。STING為宿主哺乳動物細胞之細胞質中之接附蛋白，其活化TANK結合激酶(TBK1)-IRF3及NF-κB信號傳導軸，誘導IFN-β及其他強烈活化先天性免疫之基因產物。現認識到STING為宿主胞質監視路徑之組分，其感測細胞內病原體感染，因而誘發IFN-β產生。本發明與STING促效劑聯合，產生由抗原特異性CD4+及CD8+ T細胞以及病原體特異性抗體組成的適應性保護性病原體特異性免疫反應。美國專利第7,709,458號及第7,592,326號；PCT公開案第WO2007/054279號、第WO2014/093936號、第WO2014/179335號、第WO2014/189805號、第WO2015/185565號、第WO2016/096174號、第WO2016/145102號、第WO2017/027645號、第WO2017/027646號及第WO2017/075477號 (均以引用的方式併入本文中)；及Yan等人, Bioorg. Med. Chem Lett. 18:5631-4, 2008。
在本發明之一實施例中，本發明之結合子-藥物共軛物與一或多種意欲刺激針對一或多種預定抗原之免疫反應的疫苗結合投與。抗原可直接投與個體，或可在個體內由例如自體或同種異體腫瘤細胞疫苗(例如GVAX)、樹突狀細胞疫苗、DNA疫苗、RNA疫苗、基於病毒之疫苗、細菌或酵母疫苗(例如單核球增多性李氏菌或釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae))等表現。參見例如Guo等人,Adv. Cancer Res. 2013; 119: 421-475；Obeid等人, Semin Oncol. 2015年8月; 42(4): 549-561。可用於本發明中之目標抗原之實例列於下表4中。目標抗原亦可為包含表中列出之抗原之免疫活性部分的片段或融合多肽。此清單不意欲為限制性。
在本發明之一實施例中，本發明之結合子-藥物共軛物與一或多種包括(但不限於)以下之止吐藥聯合投與：卡索匹坦(casopitant)(GlaxoSmithKline)、奈妥吡坦(Netupitant)(MGI-Helsinn)及其他NK-1受體拮抗劑、帕洛諾司瓊(palonosetron)(由MGI Pharma以Aloxi出售)、阿匹坦(aprepitant)(由Merck and Co.以Emend出售；Rahway, N.J.)、苯海拉明(diphenhydramine)(由Pfizer以Benadryl出售；New York, N.Y.)、安泰樂(hydroxyzine)(由Pfizer以Atarax出售；New York, N.Y.)、甲氧氯普胺(metoclopramide)(由AH Robins Co以Reglan出售；Richmond, Va.)、勞拉西泮(lorazepam)(由Wyeth以Ativan出售；Madison, N.J.)、阿普唑侖(alprazolam)(由Pfizer以Xanax出售；New York, N.Y.)、氟哌啶醇(由Ortho-McNeil以Haldol出售；Raritan, N.J.)、氟哌啶(droperidol)(Inapsine)、屈大麻酚(dronabinol)(由Solvay Pharmaceuticals, Inc.以Marinol出售；Marietta, Ga.)、地塞米松(dexamethasone)(由Merck and Co.以Decadron出售；Rahway, N.J.)、甲基潑尼松龍(methylprednisolone)(由Pfizer以Medrol出售；New York, N.Y.)；丙氯拉嗪(由Glaxosmithkline以Compazine出售；Research Triangle Park, N.C.)、格拉司瓊(granisetron)(由Hoffmann-La Roche Inc.以Kytril出售；Nutley, N.J.)、昂丹司瓊(ondansetron)(由Glaxosmithkline以Zofran出售；Research Triangle Park, N.C.)、多拉司瓊(dolasetron)(由Sanofi-Aventis以Anzemet出售；New York, N.Y.)、特比司瓊(tropisetron)(由Novartis以Navoban出售；East Hanover, N.J.)。
癌症治療之其他副作用包括紅血球及白血球缺乏。因此，在本發明之一些實施例中，結合子-藥物共軛物與治療或預防此類不足之藥劑(諸如非格司亭(filgrastim)、PEG-非格司亭、紅細胞生成素、阿法依泊汀(epoetin alfa)或阿法達貝泊汀(darbepoetin alfa))聯合投與。
在本發明之一實施例中，本發明之結合子-藥物共軛物與抗癌放射線療法聯合投與。舉例而言，在本發明之一實施例中，放射線療法為外部光束療法(EBT)：傳遞一束高能X射線至腫瘤位置之方法。光束在患者外側產生(例如藉由線性加速器)且靶向腫瘤部位。此等X射線可破壞癌細胞且謹慎的治療計劃允許繞過周圍正常組織。不將放射性來源置放在患者體內。在本發明之一實施例中，放射線療法為質子束療法：以質子代替X-射線轟擊患病組織之一類保形療法。在本發明之一實施例中，放射線療法為保形外部光束放射線療法：使用先進技術將放射線療法針對個體身體結構調整的程序。在本發明之一實施例中，放射線療法為近接療法：放射性物質暫時置放體內，通常採用以將超劑量或增強劑量之放射線給與一區域。
在本文所述之方法之某些實施例中，該治療包括本發明之結合子-藥物共軛物與抗病毒療法組合投與。用結合子-藥物共軛物進行之治療可在投與抗病毒療法之前、與其並行或之後進行。組合療法中使用之抗病毒藥將視個體所感染之病毒而定。
組合投與可包括以單一醫藥調配物或使用分開的調配物共同投與，或以任一順序但通常在一段時間內連續投與以使得所有活性劑可同時發揮其生物活性。
應瞭解，本文所述之結合子-藥物共軛物與至少一種其他治療劑之組合可以任何順序或並行投與。在一些實施例中，將向此前經受第二治療劑治療之患者投與結合子-藥物共軛物。在某些其他實施例中，結合子-藥物共軛物及第二治療劑將實質上同時或並行投與。舉例而言，可在進行用第二治療劑(例如化學療法)進行之治療過程的同時給與個體結合子-藥物共軛物。在某些實施例中，結合子-藥物共軛物將在用第二治療劑進行之治療的1年內投與。在某些替代實施例中，結合子-藥物共軛物將在用第二治療劑進行之任何治療的10個月、8個月、6個月、4個月或2個月內投與。在某些其他實施例中，結合子-藥物共軛物將在用第二治療劑進行之任何治療的4週、3週、2週或1週內投與。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物將在用第二治療劑進行之任何治療的5天、4天、3天、2天或1天內投與。將進一步瞭解，可在約數小時或分鐘(亦即，實質上同時)內向個體投與兩種(或更多種)藥劑或治療。
對於疾病治療而言，本發明之結合子-藥物共軛物之適合劑量取決於所治療之疾病類型、疾病之嚴重度及病程、疾病反應、投與結合子-藥物共軛物係出於治療還是預防目的、先前療法、患者之臨床病史等，皆由治療醫師酌情處理。結合子-藥物共軛物可一次性投與，或經持續若干天至若干月之一系列治療投與，或直至實現治癒或實現疾病病況減弱(例如腫瘤尺寸減小)。最佳給藥時程可由患者體內藥物累積之量測結果來計算且將視個別藥劑之相對效能而變化。投與醫師可決定最優劑量、給藥方法及重複率。在某些實施例中，劑量為每公斤體重0.01 μg至100 mg、每公斤體重0.1 μg至100 mg、每公斤體重1 μg至100 mg、每公斤體重1 mg至100 mg、每公斤體重1 mg至80 mg、每公斤體重10 mg至100 mg、每公斤體重10 mg至75 mg或每公斤體重10 mg至50 mg。在某些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重0.1 mg至約20 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約0.1 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約0.25 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約0.5 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約1 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約1.5 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約2 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約2.5 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約5 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約7.5 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約10 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約12.5 mg。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物之劑量為每公斤體重約15 mg。在某些實施例中，劑量可每天、每週、每月或每年投與一次或多次。在某些實施例中，結合子-藥物共軛物每週一次、每兩週一次、每三週一次或每四週一次投與。
在一些實施例中，結合子-藥物共軛物可以初始較高「負載」劑量，接著一或多個較低劑量投與。在一些實施例中，亦可改變投藥頻率。在一些實施例中，給藥方案可包含一週一次、每兩週一次、每三週一次或每月一次投與初始劑量，接著其他劑量(或「維持」劑量)。舉例而言，給藥方案可包含投與初始起始劑量，接著例如二分之一初始劑量之每週維持劑量。或給藥方案可包含投與初始起始劑量，接著例如每隔一週二分之一初始劑量之維持劑量。或給藥方案可包含投與三個初始劑量持續3週，接著例如每隔一週相同量之維持劑量。
如熟習此項技術者已知，投與任何治療劑均可能引起副作用及/或毒性。在一些情況下，副作用及/或毒性如此嚴重以至於妨礙以治療學上有效劑量投與特定藥劑。在一些情況下，藥物療法必須中斷，且可嘗試其他藥劑。然而，相同治療類型中之許多藥劑通常顯示類似副作用及/或毒性，意謂患者必須停止療法，或若有可能，遭受與治療劑相關聯之不適副作用。
在一些實施例中，給藥時程可限於特定數目之投藥或「循環」。在一些實施例中，結合子-藥物共軛物投與3、4、5、6、7、8或更多個週期。舉例而言，每2週投與結合子-藥物共軛物歷時6個週期，每3週投與結合子-藥物共軛物歷時6個週期，每2週投與結合子-藥物共軛物歷時4個週期，每3週投與結合子-藥物共軛物歷時4個週期等。給藥時程可由熟習此項技術者決定且隨後進行修改。
因此，本發明提供向個體投與本文所述之多肽或藥劑之方法，其包含使用間歇性給藥策略投與一或多種藥劑，該方法可減少與投與結合子-藥物共軛物、化學治療劑等相關的副作用及/或毒性。在一些實施例中，一種治療人類個體之癌症之方法包含向該個體投與治療有效劑量之結合子-藥物共軛物以及治療有效劑量之化學治療劑，其中藥劑中之一或兩者係根據間歇性給藥策略投與。在一些實施例中，間歇性給藥策略包含向個體投與初始劑量之結合子-藥物共軛物，且約每2週投與隨後劑量之結合子-藥物共軛物一次。在一些實施例中，間歇性給藥策略包含向個體投與初始劑量之結合子-藥物共軛物，且約每3週投與隨後劑量之結合子-藥物共軛物一次。在一些實施例中，間歇性給藥策略向個體投與初始劑量之結合子-藥物共軛物，且約每4週投與隨後劑量之結合子-藥物共軛物一次。在一些實施例中，使用間歇性給藥策略投與結合子-藥物共軛物且每週投與化學治療劑一次。
在某些實施例中，本發明亦提供使用本發明之結合子-藥物共軛物治療個體之方法，其中個體罹患病毒感染。在一個實施例中，病毒感染係感染選自由以下各者組成之群的病毒：人類免疫缺乏病毒(HIV)、肝炎病毒(A、B或C)、疱疹病毒(例如VZV、HSV-I、HAV-6、HSV-II及CMV、愛潑斯坦-巴爾二氏病毒(Epstein Barr virus))、腺病毒、流感病毒、黃病毒、埃可病毒、鼻病毒、科沙奇病毒、冠狀病毒、呼吸道合胞病毒、腮腺炎病毒、輪狀病毒、麻疹病毒、風疹病毒、細小病毒、牛痘病毒、HTLV病毒、登革熱病毒、乳突狀瘤病毒、軟疣病毒、脊髓灰白質炎病毒、狂犬病病毒、JC病毒或蟲媒病毒性腦炎病毒。
在一實施例中，本發明提供使用本發明之結合子-藥物共軛物治療個體之方法，其中個體罹患細菌感染。在一個實施例中，細菌感染係感染選自由以下各者組成之群的細菌：披衣菌(Chlamydia)、立克次體細菌(rickettsial bacteria)、分枝桿菌(mycobacteria)、葡萄球菌(staphylococci)、鏈球菌(streptococci)、肺炎球菌(pneumonococci)、腦膜炎球菌(meningococci)及淋球菌(gonococci)、克雷伯氏菌(klebsiella)、變形桿菌(proteus)、沙雷菌屬(serratia)、假單胞菌(pseudomonas)、軍團菌屬(Legionella)、白喉棒狀桿菌(Corynebacterium diphtheriae)、沙門氏菌(Salmonella)、桿菌(bacilli)、霍亂弧菌(Vibrio cholerae)、破傷風梭菌(Clostridium tetan)、肉毒梭菌(Clostridium botulinum)、炭疽桿菌(Bacillus anthricis)、鼠疫耶爾森菌(Yersinia pestis)、麻風分支桿菌(Mycobacterium leprae)、彌漫型麻風分枝桿菌(Mycobacterium lepromatosis)及包柔體屬(Borriella)。
在一實施例中，本發明提供使用本發明之結合子-藥物共軛物治療個體之方法，其中個體罹患真菌感染。在一個實施例中，真菌感染係感染選自由以下各者組成之群的真菌：念珠菌屬(Candida)(白色念珠菌(albican)、克魯斯氏念珠菌(krusei)、光滑念珠菌(glabrata)、熱帶念珠菌(tropicalis)等)、新型隱球菌(Cryptococcus neoformans)、麴菌屬(Aspergillus)(煙麯黴(fumigatus)、黑麯黴(niger)等)、毛黴屬(Genus Mucorales)(白黴菌屬(mucor)、犁頭黴屬(absidia)、根黴菌屬(rhizopus))、申克氏胞絲菌(Sporothrix schenkii)、皮炎芽生菌(Blastomyces dermatitidis)、巴西副球孢子菌(Paracoccidioides brasiliensis)、粗球孢子菌(Coccidioides immitis)及莢膜組織胞漿菌(Histoplasma capsulatum)。
在一實施例中，本發明提供使用本發明之結合子-藥物共軛物治療個體之方法，其中個體罹患寄生蟲感染。在一個實施例中，寄生蟲感染係感染選自由以下各者組成之群的寄生蟲：溶組織內阿米巴(Entamoeba histolytica)、大腸纖毛蟲(Balantidium coli)、福勒氏耐格里原蟲(Naegleria fowleri)、棘阿米巴蟲屬(Acanthamoeba)、蘭比亞梨形鞭毛蟲(Giardia lambia)、隱胞子蟲屬(Cryptosporidium)、肺炎肺囊蟲(Pneumocystis carinii)、間日瘧原蟲(Plasmodium vivax)、微小巴倍蟲(Babesia microti)、布氏錐蟲(Trypanosoma brucei)、克氏錐蟲(Trypanosoma cruzi)、杜氏利什曼原蟲(Leishmania donovani)、剛地弓形蟲(Toxoplasma gondii)及巴西日圓線蟲(Nippostrongylus brasiliensis)。 a.   PGE2抑制劑
在某些實施例中，結合子-藥物共軛物與抑制PGE2產生之藥劑組合投與。PGE2合成過程涉及使花生四烯酸自細胞膜活動之磷脂酶A2 (PLA2)家族成員、將花生四烯酸轉化成前列腺素H2 (PGH2)之環加氧酶(構成性活性COX1及誘導性COX2)及為最終調配PGE2所需之前列腺素E合成酶(PGES)。雖然PGE2合成速率及所引起之發炎過程可受諸如AA之局部可用性之其他因素影響，但在大部分生理條件下，PGE2合成速率受COX2之局部表現及活性控制。
在其他實施例中，主題結合子-藥物共軛物與促進PGE2降解之藥劑組合投與。PGE2降解速率受15-羥基前列腺素脫氫酶(15-PGDH)控制，此表明除PGE2合成速率之外，PGE2衰變速率亦構成主題結合子-藥物共軛物組合中治療性干預之目標。
在其他實施例中，主題結合子-藥物共軛物與減少PGE2反應性之藥劑組合投與。四種不同PGE2受體為EP1、EP2、EP3及EP4。經由兩種Gs偶合受體EP2及EP4之信號傳導係藉由腺苷酸環化酶觸發之cAMP/PKA/CREB路徑介導，介導PGE2之消炎及抑制活性的顯性方面。雖然咸信EP2以主要cAMP依賴性方式傳導信號，EP4亦活化PI3K依賴性ERK1/2路徑。然而，EP2與EP4均顯示活化GSK3/β-連環蛋白路徑。EP2之表現及所引起之對PGE2之反應性可藉由過度甲基化遏制，如在特發性肺纖維化患者中觀測到。此等觀測結果提出以下可能性：除調節PGE2產生及其降解之外，在表現個別PGE2受體之層面上調節PGE2反應性亦可影響人類疾病之病原性且用於療法中。為支持此，優先影響EP2、EP3或EP4信號傳導之合成抑制劑地使用允許PGE2活性之不同態樣之不同遏制。
減少PGE2反應性之藥劑亦包括前列腺素(PG)信號傳導抑制劑。前列腺素經由大量受體傳導信號，其中關鍵免疫抑制作用由腺苷酸環化酶活化介導，引起細胞內環狀(c)AMP、PKA升高及PKA/CREB路徑之下游活化。
另一層面對PG反應性之干擾包括干擾其與PG受體之結合。在PGE2之情況下，兩種關鍵cAMP活化受體為EP2及EP4，存在大量針對其之特定抑制劑。
藉由前列腺素或其他因素誘發之cAMP水準之增加可藉由磷酸二酯酶(PDE；當前已知6類，PDE1-PDE5及PDE10，其減少細胞內cAMP水準)預防。PDE可由磷酸二酯酶抑制劑控制，該等抑制劑包括諸如黃嘌呤(咖啡鹼、胺茶鹼、IBMX、己酮可可鹼、可可豆鹼、茶鹼或副黃嘌呤)之增加細胞內cAMP水準的物質及更具選擇性之合成及天然因素，包括長春西汀(vinpocetine)、西洛他唑(cilostazol)、伊奈米酮(inaminone)、西洛他唑、番杏鹼、洛利普南(rolipram)、異丁司特(ibudilast)、屈他維林(drotaverine)、吡拉米司特(piclamilast)、司達芬尼(sildafenil)、他達拉非(tadalafil)、維德納非(verdenafil)或罌粟鹼。
此外，對PGE2信號傳導(或β-腎上腺素激導性促效劑之對諸如組織胺之其他cAMP升高因子之信號傳導)之干擾可藉由抑制諸如PKA或CREB之cAMP之下游信號來實現。 (a) 環加氧酶抑制劑
在某些較佳實施例中，主題結合子-藥物共軛物與一或多種前列腺素(PG)合成抑制劑組合投與。一般抑制PG合成或特定類型PG之合成之因子。PG合成抑制劑包括COX-1及COX-2 (PG合成路徑中之兩種關鍵酶)之非選擇性抑制劑及COX-2之選擇性抑制劑，咸信其對COX-2更具特異性且毒性更小。非選擇性PG抑制劑之實例包括阿司匹林(aspirin)、吲哚美辛(indomethacin)或布洛芬(ibuprofen)(Advil、Motrin)。COX-2選擇性抑制劑之實例包括塞內昔布(Celecoxib)(Celebrex)及羅非考昔(rofecoxib)(Vioxx)。COX-1特異性抑制劑之實例為舒林酸(sulindac)(Clinoril)。遏制前列腺素合成之其他藥物包括類固醇(實例：氫化可的松(hydrocortisone)、皮質醇(cortisol)、潑尼松(prednisone)或地塞米松)及乙醯胺苯酚(acetaminophen)(Tylenol、Panadol)，常用作消炎、解熱及鎮痛藥物。最常用選擇性COX2抑制劑之實例包括塞內昔布、阿萊昔布(alecoxib)、伐地考昔(valdecoxib)及羅非考昔。
最常用非選擇性COX1及COX2抑制劑之實例包括：乙醯水楊酸(阿司匹林)及其他水楊酸鹽、乙醯胺苯酚(Tylenol)、布洛芬(Advil、Motrin、Nuprin、Rufen)、萘普生(Naprosyn、Aleve)、萘丁美酮(nabumetone)(Relafen)或雙氯芬酸(diclofenac)(Cataflam)。
本發明之一組分為Cox-2抑制劑。術語「環加氧酶-2抑制劑」或「Cox-2抑制劑」在本文中可互換使用，涵蓋抑制Cox-2酶之化合物，無論Cox-1酶之抑制程度如何，且包括彼等化合物之醫藥學上可接受之鹽。因此，出於本發明之目的，無論化合物抑制Cox-2酶之程度與Cox-1酶程度同等、比起大或比其小，化合物均視為Cox-2抑制劑。
在本發明之一個實施例中，Cox-2抑制劑化合物較佳為非類固醇消炎藥(NSAID)。因此，可用作本發明之Cox-2抑制劑之較佳物質包括非類固醇消炎藥化合物、其醫藥學上可接受之鹽或其純(-)或(+)光學異構體形式。
可用於本發明之NSAID化合物之實例包括阿西美辛(acemetacin)、乙醯基水楊酸、阿氯芬酸(alclofenac)、阿明洛芬(alminoprofen)、阿紮丙酮(azapropazone)、貝諾酯(benorylate)、苯噁洛芬(benoxaprofen)、布氯酸(bucloxic acid)、卡洛芬(carprofen)、膽鹼三水楊酸鎂(choline magnesium trisalicylate)、環氯茚酸(clidanac)、可洛平納(clopinac)、達普松(dapsone)、雙氯芬酸(diclofenac)、二氟尼柳(diflunisal)、屈噁昔康(droxicam)、依託度酸(etodolac)、非諾洛芬(fenoprofen)、芬布芬(fenbufen)、芬克芬(fenclofenec)、芬替酸(fentiazac)、夫洛非寧(floctafenine)、氟苯柳(flufenisal)、氟比洛芬(flurbiprofen)、(r)-氟比洛芬、(s)-氟比洛芬、呋羅芬酸(furofenac)、非普拉宗(feprazone)、氟芬那酸(flufenamic acid)、氟洛芬(fluprofen)、異丁芬酸(ibufenac)、布洛芬、吲哚美辛、吲哚美辛、吲哚洛芬(indoprofen)、伊索克酸(isoxepac)、伊索昔康(isoxicam)、酮基布洛芬(ketoprofen)、酮咯酸(ketorolac)、咪洛芬(miroprofen)、吡羅昔康(piroxicam)、美洛昔康(meloxicam)、甲芬那酸(mefenamic)、甲芬那酸(mefenamic acid)、甲氯芬那酸(meclofenamic acid)、米羅芬(meclofen)、萘丁美酮(nabumetone)、萘普生、氟尼酸(niflumic acid)、奧沙普嗪(oxaprozin)、奧西平(oxipinac)、羥布宗(oxyphenbutazone)、苯基丁氮酮(phenylbutazone)、鬼臼毒素衍生物(podophyllotoxin derivatives)、丙谷美辛(proglumetacin)、吡布芬(piprofen)、吡洛芬(pirprofen)、布普洛芬(prapoprofen)、水楊酸、水楊酸鹽、舒多昔康(sudoxicam)、舒洛芬(suprofen)、舒林酸(sulindac)、替諾昔康(tenoxicam)、噻洛芬酸(tiaprofenic acid)、硫平酸(tiopinac)、硫噁洛芬(tioxaprofen)、托芬那酸(tolfenamic acid)、托美丁(tolmetin)、齊多美辛(zidometacin)、佐美酸(zomepirac)及2-氟-a-甲基[1,1'-聯苯]-4-乙酸4-(硝氧基)丁酯。
在一較佳實施例中，Cox-2抑制劑為Cox-2選擇性抑制劑。術語「Cox-2選擇性抑制劑」涵蓋相比於Cox-1酶選擇性抑制Cox-2酶之化合物，且亦包括彼等化合物之醫藥學上可接受之鹽及前藥。在某些實施例中，PGE2拮抗劑並非吲哚美辛。
實際上，Cox-2抑制劑之選擇性視進行測試之病狀及測試之抑制劑而變化。然而，出於本說明書之目的，Cox-2抑制劑之選擇性可量測為抑制Cox-1之活體外或活體內IC50值除以抑制Cox-2之IC50值的比率(Cox-1 IC50/Cox-2 IC50)。Cox-2選擇性抑制劑為Cox-1 IC50與Cox-2 IC50之比率超過1的任何抑制劑。在較佳實施例中，此比率超過2，更佳超過5，但更佳超過10，再更佳超過50，且更佳超過100。
如本文所用，術語「IC50」係指化合物使環加氧酶活性抑制50%所需之濃度。本發明之較佳Cox-2選擇性抑制劑具有小於約1 μM、更佳小於約0.5 μM及甚至更佳小於約0.2 μM之Cox-2 IC50。
較佳Cox-2選擇性抑制劑具有大於約1 μM且更佳超過20 μM之Cox-1 IC50 。此類較佳選擇性可指示減少常見NSAID誘發之副作用發生的能力。
充當Cox-2選擇性抑制劑之前藥的化合物亦包括於本發明之範疇內。如本文所用，在提及Cox-2選擇性抑制劑時，術語「前藥」係指可在個體體內藉由代謝或簡單化學過程而轉化成活性Cox-2選擇性抑制劑之化合物。Cox-2選擇性抑制劑之前藥的一個實例為帕瑞考昔(parecoxib)，其為三環Cox-2選擇性抑制劑伐地考昔之治療有效前藥。較佳Cox-2選擇性抑制劑前藥之一實例為帕瑞考昔鈉。Cox-2抑制劑之一類前藥描述於美國專利案第5,932,598號(以引用的方式併入)。
本發明之Cox-2選擇性抑制劑可為例如Cox-2選擇性抑制劑美洛昔康(meloxicam)(CAS登記號71125-38-7)，或其醫藥學上可接受之鹽或前藥。
Figure 02_image155
在本發明之另一實施例中，Cox-2選擇性抑制劑可為Cox-2選擇性抑制劑RS 57067，6-[[5-(4-氯苯甲醯基)-1,4-二甲基-1H-吡咯-2-基]甲基]-3(2H)-噠嗪酮(CAS登記號179382-91-3)或其醫藥學上可接受之鹽或前藥。
Figure 02_image157
Figure 108119354-A0304-0011
在較佳實施例中，𠳭烯Cox-2抑制劑係選自(S)-6-氯-7-(1,1-二甲基乙基)-2-(三氟甲基)-2H-1-苯并哌喃-3-甲酸、(2S)-6,8-二甲基-2-(三氟甲基)-2H-𠳭烯-3-甲酸、(2S)-6-氯-8-甲基-2-(三氟甲基)-2H-𠳭烯-3-甲酸、(2S)-8-乙基-6-(三氟甲氧基)-2-(三氟甲基)-2H-𠳭烯-3-甲酸、(S)-6,8-二氯-2-(三氟甲基)-2H-1-苯并哌喃-3-甲酸、(2S)-6-氯-5,7-二甲基-2-(三氟甲基)-2H-𠳭烯-3-甲酸及其混合物。
在本發明之一較佳實施例中，Cox-2抑制劑可選自由以下通用結構表示之三環Cox-2選擇性抑制劑類別：
Figure 02_image195
其中： Z1 係選自由部分不飽和或不飽和雜環基及部分不飽和或不飽和碳環組成之群； R24 係選自由雜環基、環烷基、環烯基及芳基組成之群、其中R24 視情況在可取代位置上經一或多個選自以下各基之基團取代：烷基、鹵烷基、氰基、羧基、烷氧羰基、羥基、羥基烷基、鹵烷氧基、胺基、烷基胺基、芳基胺基、硝基、烷氧基烷基、烷基亞磺醯基、鹵基、烷氧基及烷基硫基； R25 係選自由甲基或胺基組成之群；且 R26 係選自由選自以下各基之基團組成之群：H、鹵基、烷基、烯基、炔基、側氧基、氰基、羧基、氰基烷基、雜環氧基、烷氧基、烷基硫基、烷基羰基、環烷基、芳基、鹵烷基、雜環基、環烯基、芳烷基、雜環基烷基、醯基、烷基硫基烷基、羥基烷基、烷氧羰基、芳基羰基、芳烷基羰基、芳烯基、烷氧基烷基、芳硫基烷基、芳氧基烷基、芳烷基硫基烷基、芳烷氧基烷基、烷氧基芳烷氧基烷基、烷氧羰基烷基、胺基羰基、胺基羰基烷基、烷基胺基羰基、N-芳基胺基羰基、N-烷基-N-芳基胺基羰基、烷基胺基羰基烷基、羧基烷基、烷基胺基、N-芳基胺基、N-芳烷基胺基、N-烷基-N-芳烷基胺基、N-烷基-N-芳基胺基、胺基烷基、烷基胺基烷基、N-芳基胺基烷基、N-芳烷基胺基烷基、N-烷基-N-芳烷基胺基烷基、N-烷基-N-芳基胺基烷基、芳氧基、芳烷氧基、芳硫基、芳烷基硫基、烷基亞磺醯基、烷基磺醯基、胺基磺醯基、烷基胺基磺醯基、N-芳基胺基磺醯基、芳基磺醯基、N-烷基-N-芳基胺基磺醯基；或其前藥。
在本發明之一較佳實施例中，由上式表示之Cox-2選擇性抑制劑係選自包括以下之化合物之群：塞內昔布(B-21)、伐地考昔(B-22)、德拉昔布(deracoxib) (B-23)、羅非考昔(B-24)、依他昔布(etoricoxib) (MK-663；B-25)、JTE-522 (B-26)。
關於上文所論述之Cox-2選擇性抑制劑之精選實例的額外資訊可見於下文：塞內昔布(CAS RN 169590-42-5、C-2779、SC-58653及美國專利第5,466,823號(以引用的方式併入))；德拉昔布(CAS RN 169590-41-4)；羅非考昔(CAS RN 162011-90-7)；化合物B-24 (美國專利第5,840,924號)；化合物B-26 (WO 00/25779 (以引用的方式併入))；及依他昔布(CAS RN 202409-33-4、MK-663、SC-86218及WO 98/03484 (以引用的方式併入))。 結構式
Figure 02_image197
Figure 02_image199
在本發明之一更佳實施例中，Cox-2選擇性抑制劑係選自由塞內昔布、羅非考昔及依他昔布組成之群。
在一較佳實施例中，具有B-27中所示結構且為三環Cox-2選擇性抑制劑伐地考昔B-22 (參見美國專利第5,633,272號(以引用的方式併入))之治療有效前藥的帕瑞考昔(參見美國專利第5,932,598號(以引用的方式併入))宜用作本發明之Cox-2抑制劑。
Figure 02_image201
帕瑞考昔之一較佳形式為帕瑞考昔鈉。
可用於本發明之另一三環Cox-2選擇性抑制劑為化合物ABT-963，其具有以下所示之式B-28，先前已描述於國際公開案第WO 00/24719號中。
Figure 02_image203
(b)    胞質磷脂酶A2 (cPLA2)抑制劑
在某些實施例中，PGE2抑制劑為胞質磷脂酶A2 (cPLA2)之抑制劑，諸如僅僅舉例而言，花生醯基三氟甲基酮
Figure 02_image205
、 伐瑞拉迪(Varespladib)
Figure 02_image207
、 達雷拉地(Darapladib)
Figure 02_image209
或 甲基伐瑞拉迪。 VI.某些實例
Figure AA7
 實例 1 ： 自噬菌體呈現文庫選擇結合 PD-L1 之親和體
可藉由自具有兩個無規環，例如一般但非排他地具有9個胺基酸之相同長度的親和體之文庫進行選擇來鑑別本發明之肽，例如結合PD-L1之組分。
如上文所指示，藉由自包含基於Stefin A之序列之恆定親和體構架主鏈中所顯示的長度為九個胺基酸之隨機環序列的噬菌體呈現文庫進行選擇來鑑別本發明之結合PD-L1之肽。此類選擇程序一般為已知的。根據此類程序，將噬菌體懸浮液與目標抗原(捕捉在抗生蛋白鏈菌素珠粒上之生物素化抗原或捕捉在盤上之未生物素化抗原)一起培育。接著洗去未結合之噬菌體且接著，藉由將抗原與低pH值溶液接著高pH值溶液一起培育來溶離結合之噬菌體。接著，大腸桿菌感染經釋放之經pH值中和之噬菌體且獲得第一輪噬菌體製劑。重複進行循環，例如兩次或三次且為富集靶向噬菌體，可在後兩輪選擇中增加嚴格度條件，例如增加洗滌步驟次數、降低抗原濃度及預先選擇經阻斷之抗生蛋白鏈菌素珠粒或經阻斷試劑塗佈之孔。
在藉由連續數輪噬菌體擴增進行選擇後，藉由可溶性親和體ELISA鑑別結合PD-L1之純系。簡言之，親和體由噬菌粒載體過表現，使細菌細胞溶解且溶解物用於ELISA中，用針對親和體上之His6標籤之共軛抗體偵測親和體與固定在盤上之PD-L1之結合。
作為說明，自親和體文庫選擇結合PD-L1之噬菌體係使用自約6×1010 多樣性之尺寸之文庫添加的約1×1011 個噬菌體如下文所描述進行。
在M280抗生蛋白鏈菌素或中性抗生物素蛋白珠粒(Thermo Scientific)上捕捉生物素化抗原。簡言之，親和體由噬菌粒載體過表現，使細菌細胞溶解且溶解物用於ELISA中，用針對親和體上之His6標籤之共軛抗體偵測親和體與固定在盤上之PD-L1之結合，用於選擇。抗原係由R&D以Fc裂解之格式提供且使用EZ Link Sulfo-NHS-LC Biotin套組(Pierce)內部生物素化。
在噬菌體添加至珠粒上之抗原之前，噬菌體與珠粒均用2% Marvel-PBS阻斷，各1小時，以減少非特異性結合相互作用。接著使噬菌體在室溫下結合抗原1小時，接著藉由用PBS-0.1% Tween 20洗滌五次，接著用PBS洗滌2次來移除未結合或微弱結合之噬菌體，使用100 mM三乙胺溶離噬菌體，移除溶離液且用Tris緩衝液中和，接著用0.1M HCl第二次溶離，亦用Tris緩衝液中和。將溶離液彙集且以菌落形成單位(CFU)滴定所收穫之噬菌體，接著在大腸桿菌TG1細胞中擴增，使用輔助噬菌體M13KO7救援，且在滴定之前純化且用作下一輪淘選之輸入。對於第二輪及第三輪淘選，藉由使用更多次PBS-Tween洗滌循環及減少抗原，增加洗滌嚴格度。亦在第2輪及第3輪，藉由用經阻斷之珠粒預先選擇輸入噬菌體以移除珠粒結合子進行取消選擇步驟，且在每一輪珠粒在中性抗生物素蛋白與抗生蛋白鏈菌素之間交換以減少抗生蛋白鏈菌素結合子。
自第二輪及第三輪溶離份滴定階段後，挑選單一良好分離之斑塊，使可溶性親和體表現且藉由粗提取ELISA表徵抗原結合。簡言之，親和體藉由IPTG誘導由噬菌粒載體過表現，使用試劑B-PER II (Thermo Scientific)使細菌細胞溶解且經離心清除之溶解物用於ELISA中，用針對親和體上之His6標籤之HRP共軛抗體(Miltenyi Biotec)偵測親和體與固定在盤上之PD-L1之結合，使用1步Ultra TMB-ELISA受質(Thremo Scientific)使ELISA顯影。展示超過無抗原塗佈之陰性對照盤上之背景之結合的純系作為非特異性結合子而丟棄。將展示特異性結合之純系測序以鑑別環序列。實例 2 ： 抗 PD-L1 親和體與表現 PD-L1 之 人類癌細胞株之結合親和力
使用流動式細胞量測術測定AVA04親和體之親和力。
表現PD-L1之H441細胞在含有具有青黴素(100 U/ml，Hyclone)及鏈黴素(100 μg/ml，Hyclone)之10% FBS (Gibco)的RPMI-2640 (Sigma)中生長，其中自組織培養物剝離，使用DPBS洗滌。藉由在300 rpm下離心5分鐘來收集細胞。細胞再懸浮於PBS中且在圓底96孔盤中以50000個細胞/孔進行分配。用PBS洗滌細胞。親和體及對照在染色緩衝液(R&D)中一式兩份地稀釋且在4±1℃下，添加在細胞上以用於染色，歷時約60分鐘。洗滌細胞且二級抗胱抑素A (R&D)在染色緩衝液(R&D)中以1:15稀釋，且在4±1℃下，添加在細胞上以用於染色，歷時約40分鐘。洗滌細胞且偵測抗體A488抗山羊(Biolegend)在染色緩衝液(R&D)中以1:100稀釋，且在4±1℃下，添加在細胞上以用於染色，歷時約30分鐘。最終，洗滌細胞，在4±1℃下，使用在染色緩衝液中稀釋之L/D染料Zombie Aqua (Biolegend)將活及死的細胞染色10分鐘。洗滌細胞且在4±1℃下經10分鐘向各孔添加固定緩衝液(R&D)，接著添加具有EDTA之PBS (Lonza)，隨後用流式細胞儀(Guava 12 HT，Millipore)對盤進行讀取。排除死細胞且獲得綠色螢光通道(488 nm/525/30)。使用Incyte分析結果且使用graphpad繪製資料。
MDA-MB-231 上之細胞結合分析
•     製備細胞： 分離MDA-MB-231細胞(ATCC)且稀釋成0.25×10e6個細胞/毫升，80 ml。 將200 μl細胞懸浮液(50000個細胞)吸取至各孔中，4個盤。 300 g離心5分鐘，丟棄上清液。 細胞再懸浮於200 μl PBS中。300g離心5分鐘且丟棄上清液。
•     親和體及對照稀釋及染色 根據表製備親和體及稀釋抗體(阿特珠單抗(Invivogen)自3.5 nM起，及親和體自500 nM起) 在分開之稀釋盤上： 孔A1、B1、A2及B2上60 μl染色緩衝液 60 μl染色緩衝液至行A及B孔4至12 60 μl染色緩衝液至行C至H孔2至12 1.  在孔A3及B3上100 μl阿特珠單抗(InVivogen)自3.5 nM起 自孔A3及B3轉移30 μl至A4及B4等直至A12及B12 2.  根據上表，吸取100 μl親和體稀釋液至對應管柱1孔中。 自孔1轉移20 μl至2，2轉移至3等直至12 自稀釋盤孔吸取50 μl至具有細胞之分析盤上之對應孔中，且充分混合。 在+5℃下培育60分鐘
•  洗滌：添加150微升/孔之PBS及以300 g離心5分鐘。丟棄上清液。 再次重複
•  用抗胱抑素染色： 吸取50微升/孔染色緩衝液至孔A1至A12中，及B2至B12 在染色緩衝液中製備22000 μl抗胱抑素抗體之1:15稀釋液：1467 μl Ab+20533 μl染色緩衝液。吸取50微升/孔至B1及行C至H孔。在+5℃下培育40分鐘
•  洗滌：添加150微升/孔之PBS及以300 g離心5分鐘。丟棄上清液。 再次重複
•  用二級Ag染色： 製備5000 μl AF488抗人類IgG(Biolegend)之1:100稀釋液：50 μl抗人類IgG+4950 μl染色緩衝液 吸取50微升/孔至行A及B孔2至12中 在染色緩衝液中製備25000 μl 抗山羊AF488(Biolegend)抗體之1:500稀釋液：50 μl Ab+24950 μl染色緩衝液。 吸取50微升/孔至B1及行C至H孔。 在+5℃下培育30分鐘 添加150微升/孔之PBS及以300 g離心5分鐘。丟棄上清液。
•  活及死細胞染色： 在染色緩衝液中製備25000 μl L/D染料Zombie Aqua (Biolegend)之1:500稀釋液：50 μl L/D染料+24950 μl染色緩衝液。 吸取50 μl至分析盤上之每個孔。 在+5℃下培育10分鐘 添加150微升/孔之PBS及以300 g離心5分鐘。丟棄上清液。 再次重複
•  固定步驟： 添加100微升/孔固定緩衝液 在+5℃下培育10分鐘 添加100微升/孔之PBS及以300 g離心5分鐘。丟棄上清液。 細胞再懸浮至100 μl染色緩衝液中，儲存在+5℃下
H441 上之細胞結合分析
•  製備細胞： 分離H441細胞，且稀釋成0.25×10e6個細胞/毫升，85 ml。 將200 μl細胞懸浮液(50000個細胞)吸取至各孔中，4個盤。 300 g離心5分鐘，丟棄上清液。
•  洗滌： 細胞再懸浮至200 μl具有EDTA之PBS中 300 g離心5分鐘，且丟棄上清液。
•  親和體及對照稀釋及染色 自對應稀釋盤孔吸取50 μl至具有細胞之分析盤上之對應孔中，且充分混合。 在+5℃下培育120分鐘
•  洗滌： 添加150微升/孔之具有EDTA之PBS且300 g離心5分鐘。丟棄上清液。 再次重複
•  用抗胱抑素染色： 吸取50微升/孔染色緩衝液至行A孔中 在染色緩衝液中製備18000 μl抗胱抑素抗體(50 μg/ml原液)之1:15稀釋液：1200 μl Ab+16800 μl染色緩衝液。 吸取50微升/孔至行B至H孔。 無原液在冷凍機中，不過LabGuru顯示多種。實際上，必須在此分析中使用BAF1407。 在+5℃下培育40分鐘 洗滌： 添加150微升/孔之具有EDTA之PBS且300 g離心5分鐘。丟棄上清液。 再次重複
•  用二級Ag染色： 製備3000 μl AF488抗人類IgG之1:100稀釋液：30 μl抗人類IgG+2970 μl染色緩衝液 吸取50微升/孔至行A孔2至12中 在染色緩衝液中製備18000 μl抗山羊AF488 (Biolegend)抗體之1:500稀釋液：36 μl Ab+18 ml染色緩衝液。 吸取50微升/孔至行B至H孔。 吸取50 μl染色緩衝液至所有盤之A1中 在+5℃下培育30分鐘 添加150微升/孔之具有EDTA之PBS且300 g離心5分鐘。丟棄上清液。
•  活及死細胞染色： 在染色緩衝液中製備22ml L/D染料Zombie Aqua (Biolegend)之1:500稀釋液：44 μl L/D染料+22 ml染色緩衝液。 吸取50 μl至分析盤上之每個孔。 在+5℃下培育10分鐘 添加150微升/孔之具有EDTA之PBS且300 g離心5分鐘。丟棄上清液。 再次重複
•  固定步驟： 添加100微升/孔固定緩衝液 在+5℃下培育10分鐘 添加100微升/孔之具有EDTA之PBS且300 g離心5分鐘。丟棄上清液。 細胞再懸浮至100 μl染色緩衝液中，儲存在+5℃下實例 3 ：親和體 Fc 及串聯融合物產生及表徵
遵循製造商之方案，使用Expifectamine試劑(Thermo)，用親和體Fc融合物構築體(AVA04-251 Fc及AVA04-182 Fc；參見上表，示意圖分別為圖 5A 及圖 1A )進行懸浮HEK細胞(Expi293F細胞株；Thermo)短暫轉染。轉染後七(7)天，藉由在20,000 g下離心1小時且經0.45 µm過濾，收穫上清液。在AKTA Xpress (GE Healthcare)上使用mabSelect Sure HiTrap管柱對蛋白質進行親和力純化。將樹脂用五(5)管柱體積(CV)蒸餾水洗滌且用五(5) CV 1x PBS平衡。接著，使上清液以5 mL/min之流動速率流過，接著用十(10) CV 1x PBS洗滌。在五(5) CV 0.1 M甘胺酸pH 2.8中溶離結合之蛋白質，使用Centripure脫鹽管柱(empBiotech GmbH)將緩衝液更換成1x PBS。第二階段純化藉由製備型尺寸排阻層析(SEC)進行，層析係使用HiLoad 26/600 Superdex 200pg管柱(GE Healthcare)，在AKTA Xpress (GE Healthcare)上，在1x PBS中以2.6 mL/min流動速率操作。在1x PBS中，在0.8 mL/min下，使用在Ultimate 3000 HPLC (Thermo)上操作之MAbPac SEC-1管柱(Thermo)或Yarra-3000管柱(Phenomenex)進行分析型SEC。AVA04-182 Fc (SEQ ID NO: 118 )及AVA04-251 Fc (SEQ ID NO: 117 )最終蛋白質批料顯示＞95%純度(分別圖 1C 及圖 4A )。使用Nanodrop (Thermo) A280讀數估計蛋白質產率，且產物在SDS-PAGE Bolt Bis Tris加4-12%凝膠(Thermo)上在Novex™ 20X Bolt™ MES SDS操作緩衝液(Thermo)中在200V下操作，其中樣品在還原緩衝液中加熱。凝膠上之蛋白質條帶用Quick Coommassie (Generon)染色。在凝膠上操作PageRuler預染色之蛋白質分子量標記物(Thermo)以估計融合蛋白質之分子量(圖 1B 及圖 5B )。
親和體串聯融合蛋白AVA04-251 BH cys (SEQ ID NO: 119 ，示意圖為圖 8A )由大腸桿菌產生且使用親和力、離子交換及尺寸排阻層析來純化。使用製造商方案將表現質體pD861 (Atum)轉型至BL21大腸桿菌細胞(Millipore)中。將所有轉型細胞混合物塗鋪至含有50 μg/ml之卡那黴素(AppliChem)之LB瓊脂盤上且在37℃下培育隔夜。第二天，將經轉型之大腸桿菌之菌苔轉移至1x terrific broth培養基(Melford)及50 μg/ml之卡那黴素之無菌燒瓶中且在30℃下，在250 rpm下振盪培育。在細胞達到約0.8-1.0之OD600後，用10 mM鼠李糖(Alfa Aesar)誘導表現，且在37℃下再培育培養物5小時。藉由離心及使細胞集結粒溶解來收穫細胞。使用鎳瓊脂糖親和力樹脂(Super-NiNTA500；Generon)進行His標記蛋白質之批料結合親和純化，對親和體進行純化。用五(5) CV NPI20移除未結合之蛋白質，接著用五(5) CV NPI400緩衝液及還原劑(50 mM磷酸鈉、0.5 M NaCl、0.4 M咪唑、10 mM TCEP)溶離結合之蛋白質。隨後使用基於在20 mM MES pH 6中操作之CM FF離子交換管柱(GE Healthcare)，利用0.1% triton X-114 (Sigma)洗滌步驟及用1 M NaCl梯度溶離進行陽離子交換純化步驟，對溶離蛋白質進行緩衝液交換。基於製備型SEC，使用在1x PBS中操作之HiLoad 26/600 Superdex 75pg管柱(GE Healthcare)進行第三階段純化。AVA04-251 BH cyswas於含有50 mM MES pH 6.0、150 mM NaCl、10 mM TCEP之最終還原緩衝液中調配。使用在Ultimate 3000 HPLC (Thermo)上在1x PBS移動相中，以0.7 mL/min操作的Accliam SEC-300管柱(Thermo)，進行分析型SEC。SEC HPLC及SDS-PAGE分析顯示當還原時最終蛋白質＞99%純(分別圖 8B 及 圖 8C )。實例 4 ： 抗 PD-L1 與親和體 Fc 融合蛋白之結合的動力學分析
使用操作緩衝液HBS-EP+ (GE Healthcare)及用人類或小鼠PD-L1 Fc固定之Series S感測器CM5晶片(R&D Systems)，在10 mM乙酸鈉pH 4.0中使用胺偶合試劑(GE Healthcare)進行Biacore T200動力學分析。在30 µL/min之流動速率下進行親和體Fc融合物之單循環動力學濃度滴定。經PD-L1 Fc固定之表面用3-5 mM NaOH再生20-30秒(GE Healthcare)。減去資料空白且針對1:1朗格繆爾結合模型(Langmuir binding model)(BIAcore評估軟體；GE)擬合以計算表觀KD 值。使用多循環動力學，AVA04-182 Fc融合蛋白顯示具有36.1 pM之KD (圖 2 )。使用單循環動力學。AVA04-251 Fc具有23.4 pM之KD (圖 6 )。
實例 5 ：用於表徵抗 PD-L1 親和體之競爭性 Elisa 藉由酶聯結免疫吸附分析(ELISA)，與抗小鼠PD-L1抗體10F9.G2相比，評估親和體Fc融合物之競爭性抑制(圖 3 )。人類或小鼠PD-1 Fc(R&D Systems)以0.5 µg /mL塗佈在盤上。將盤使用盤洗滌器，用150 μl洗滌緩衝液(PBS、0.1% Tween 20)洗滌2次，且在室溫下(25±1℃)在含5%酪蛋白(Sigma)之PBS中飽和90分鐘。如先前所描述洗滌盤。接著，一式兩份地稀釋親和體及對照物(PD-1 Fc；空白)，且與1 µg/mL之小鼠PD-L1 Fc (R&D Systems)或30 ng/mL人類PD-L1 (R&D Systems)一起預培育30分鐘，接著在室溫(25±1℃)下裝載在盤上，保持90分鐘。如先前所描述洗滌盤3次。接著在稀釋緩衝液中稀釋生物素化多株抗體抗人類PD-L1 (R&D Systems)且在室溫(25±1℃)下培育90分鐘。如先前所描述洗滌盤3次且在室溫(25±1℃)下培育抗生蛋白鏈菌素HRP 30分鐘。洗滌盤且在盤上經10分鐘添加受質(TMB，Pierce Thermo-Scientific)。使用酸性溶液停止反應且在450-630 nm下讀取盤。接著使用內插非線性四參數擬合標準曲線計算IC50 。實例 6 ： AVA04-182 Fc 之小鼠混合淋巴細胞反應分析
進行小鼠混合淋巴細胞反應(MLR)分析以評定AVA04-182 Fc調節T細胞反應之能力。在此MLR分析中，由一(1)隻在GM-CSF存在下培養七(7)天之C57BL/6小鼠的骨髓產生BMDC (骨髓樹突狀細胞)。接著細胞與使用陰性選擇自Balb/c小鼠脾臟分離之同種異體CD4+ T細胞共同培養。在測試產物(AVA04-182 Fc，SQTgly Fc [SEQ ID NO: 120 ；不靶向PD-L1之親和體Fc融合物]、阿維魯單抗及其同型對照HuIgG1)及對照(抗小鼠PD-L1純系10F9.G2及其同型對照大鼠IgG2b)存在或不存在下進行MLR分析。評估三種濃度(700、70及7 nM)之測試產物及一種濃度(70 nM)之對照。在培養3天之後，收穫細胞培養上清液，且使用ELISA評估干擾素γ (IFNγ)及介白素-2 (IL-2)之分泌。與同型對照相比，抗小鼠PD-L1及阿維魯單抗誘發IL-2增加(資料未示出)及IFNγ分泌(圖 4 )。類似地，與SQTGly Fc相比，在所有測試濃度下AVA04-182 Fc處理引起IL-2增加(資料未示出)及IFNγ分泌(圖 4 )。實例 7 ：在基於細胞之 PD-1/PD-L1 阻斷分析中抗 PD-L1 親和體 AVA04-251 Fc 之活性
根據製造商說明書進行基於細胞之PD-1/PD-L1分析(Promega)。簡言之，表現人類PD-1之Jurkat T細胞及由NFAT反應元件(NFAT-RE)驅動之螢光素酶報導子與表現人類PD-L1之PD-L1 aAPC/CHO-K1細胞及經設計以依與抗原無關之方式活化同源TCR的經工程改造之細胞表面蛋白共同培養。當共同培養時，PD-1/PD-L1相互作用抑制TCR信號傳導及NFAT-RE介導之發光。抗PD-L1親和體AVA04-251 Fc之添加阻斷PD-1/PD-L1相互作用，釋放抑制信號及引起TCR活化及NFAT-RE介導之發光(圖 7 )。使用Bio-Glo™螢光素酶分析系統(Promega)偵測及定量生物發光信號，且在Clariostar盤式讀取器(BMG LabTech)。上讀取信號。實例 8 ： 6323 (MAL-PEG8 -Ser-D-Ala-Pro-Val-boroPro) 之 合成方案
順丁烯二醯亞胺6323(順丁烯二醯亞胺[MAL]活化之PEG8 連接子-Val-boroPro [VbP]前藥)之化學結構及合成流程分別呈現於圖 9 及圖 10 。 化合物 3 之合成
在冰水浴冷卻下將HATU (0.8 g，2.1 mmol)、DIEA (0.8 mL，4.6 mmol)及H-Val-boroPro-pn.HCl (化合物2，845 mg，2.2 mmol)添加至N -Boc-D-Ala-Pro-OH (化合物1，572 mg，2 mmol)於無水DMF (8 mL)中之溶液中。將所得混合物在室溫下攪拌2小時且接著真空濃縮。殘基用乙酸乙酯(100 mL)溶解，先後用0.1 N KHSO4 (3×20 mL)、5% NaHCO3 (3×20 mL)、鹽水(20 mL)洗滌。有機相經無水MgSO4 乾燥，過濾且在真空中蒸發，得到N-Boc-D-Ala-L-Pro-L-Val-L-boroPro-pn，接著在冰水冷卻下將其添加至4 N HCl之二噁烷溶液(20 mL)中。將所得混合物在室溫下攪拌2小時且接著真空濃縮。將殘餘物與二氯甲烷(3×30 mL)一起真空共蒸發至完全無水。因此獲得呈白色粉末狀之化合物3(1.0 g，兩步驟92%)。 化合物 4 之 合成
藉由利用與上述相同之方法使N-Fmoc-Ser-(OtBu)-OH與化合物3偶合來製備N-Fmoc-Ser(OtBu)-D-Ala-L-Pro-L-Val-L-boroPro-pn。接著藉由含20%哌啶之DMF移除Fmoc。真空濃縮所得混合物，且使殘餘物與二氯甲烷(3×30 mL)一起真空共蒸發，直至完全無水，得到粗化合物4，其未經進一步純化直接用於下一步驟。 化合物 6323 之合成
藉由利用與上述相同之方法使MAL-dPEG8 -酸與粗化合物4偶合以0.2 mmol規模來製備MAL-dPEG8 -Ser(OtBu)-D-Ala-L-Pro-L-Val-L-boroPro-pn。接著藉由含50% TFA之DCM移除OtBu。真空濃縮所得混合物，且使殘餘物與二氯甲烷(3×10 mL)一起真空共蒸發，直至完全無水，得到粗MAL-dPEG8 -Ser-D-Ala-L-Pro-L-Val-L-boroPro-pn，藉由在己烷-乙腈-水中與PhB(OH)2 反應以移除蒎烷二醇基，來進一步脫除保護基。分離水層且接著藉由半製備型HPLC，用20%至25%乙腈/水(具有0.1% TFA)溶離來純化。收集所需溶離份且凍乾，得到呈良好無色晶體狀之化合物6323(40 mg，最後三步驟19%)。實例 9 ： 6325 (NHS-PEG8 -Ser-D-Ala-Pro-Val-boroPro) 之 合成方案
6325 (NHS活化之PEG8 連接子-VbP前藥)之化學結構及合成流程分別呈現於圖 11 及圖 12 中。 化合物 2 之 合成
在冰水浴冷卻下將DSC (71 mg，0.275 mmol)及DIEA (0.1 mL，0.58 mmol)添加至化合物1 (51 mg, 0.25 mmol)於無水DMF (1.5 mL)中之溶液中。在室溫下攪拌反應混合物2小時且接著在冰水浴冷卻下緩慢添加至NH2 -dPEG®8 -酸(110 mg，0.25 mmol)於pH 7.8磷酸鹽緩衝液(5 mL)中之另一溶液中。在室溫下攪拌反應混合物1小時且接著藉由半製備型HPLC，用2%至98%乙腈/水(具有0.1% TFA)溶離來純化。收集所需溶離份且凍乾，得到化合物2 (120 mg，兩步驟77%)。 化合物 4 之 合成
在冰水浴冷卻下將HATU (30 mg，0.08 mmol)、DIEA (28 μL，0.16 mmol)及化合物3 (53 mg，0.08 mmol；來自化合物6323之合成；實例 8 )添加至化合物2 (50 mg，0.08 mmol)於無水DMF (1.5 mL)中之溶液中。將所得混合物在室溫下攪拌1小時且接著藉由半製備型HPLC，用20%至98%乙腈/水(具有0.1% TFA)溶離來純化。收集所需溶離份且凍乾，得到化合物4 (80 mg，79%)。 化合物 5 之合成
在冰水浴冷卻下將TFA (1.0 mL)添加至化合物4 (80 mg，0.063 mmol)於DCM (0.5 mL)中之溶液中。將所得混合物在室溫下攪拌2小時且接著真空濃縮。將殘餘物與二氯甲烷(3×10 mL)一起真空共蒸發至完全無水，且接著溶解於水-乙腈-己烷(2:1:2，3.0 mL)之混合物中。添加PhB(OH)2 (8 mg，0.065 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌3小時且接著真空濃縮。殘餘物藉由半製備型HPLC，用20%至98%乙腈/水(具有0.1% TFA)溶離來純化。收集所需溶離份且凍乾，得到化合物5 (57 mg，88%)。 化合物 6325 之合成
在冰水浴冷卻下將DSC (15.5 mg，0.06 mmol)及TEA (30 μL，0.21 mmol)添加至化合物5 (57 mg，0.056 mmol)於無水DMF (1.5 mL)中之溶液中。在室溫下攪拌反應混合物2小時且接著藉由半製備型HPLC，用5%至98%乙腈/水(具有0.1% TFA)溶離來純化。收集所需溶離份且凍乾，得到呈白色粉末狀之化合物6325 (24 mg，53%)。實例 10 ：使用順丁烯二醯亞胺化學使化合物 6323 與 AVA04-251 BH cys 共軛
AVA04-251 BH cys-6323前藥之合成流程呈現於圖 13 中。
使化合物6323 (MAL-PEG8 -Ser-DAla-Pro-VbP；實例 8 )溶解於DMSO中，濃度為100 mM。1 mg/mL AVA04-251 BH cys之1 mL樣品用1 L 50 mM MES、150 mM NaCl、1 mM TCEP pH 6透析隔夜。將化合物6323以分別100:1之莫耳比添加至AVA04-251 BH cys。將混合物在室溫下培育隔夜(17小時)。用1 mL HisTrap FF管柱(GE Healthcare)移除未共軛之化合物6323。共軛之AVA04-251 BH cys-6323前藥利用1M咪唑自HisTrap管柱溶離且用PBS 1x (2 X 1 L)透析以移除咪唑及交換緩衝液。使用自AVA04-251 BH cys之序列計算的消光係數(39151 M-1 cm-1 ；ExPASy ProtParam)，自280 nm下之吸光度確定所得溶液之濃度。
隨後，藉由結合ELISA顯示，利用順丁烯二醯亞胺化學使AVA04-251 BH cys與IRDye 800CW共軛未改善其結合能力(圖 20 )。
簡言之，將人類PD-L1 Fc(R&D Systems)嵌合蛋白於碳酸鹽緩衝液中以0.5 µg/mL塗佈至96孔盤上。在用含5%酪蛋白之PBS飽和之後，洗滌盤，且培育共軛之親和體或未共軛之對照的稀釋液90分鐘。接著洗滌盤，添加生物素化多株抗胱抑素A抗體(R&D Systems)，且將盤培育1小時。將盤洗滌且使用抗生蛋白鏈菌素-HRP偵測結合之親和體。在最後洗滌步驟之後，添加TMB且在450 nM下讀取盤。與親本分子(AVA04-251 BH cys；圖 20 )相比，共軛親和體(AVA04-251 BH cys-800)展示類似EC50。實例 11 ：使用 NHS 化學使化合物 6325 與 AVA04-182 Fc 共軛
AVA04-182 Fc-6325前藥之合成流程呈現於圖 14 中。
使化合物6325 (NHS-PEG8 -Ser-DAla-Pro-VbP；實例9)溶解於DMSO中，濃度為100 mM。將AVA04-182 Fc用PBS稀釋至1 mg/mL。藉由添加1/10體積之1 M磷酸鉀pH 9增加pH值。將化合物6325以分別4:1之莫耳比添加至AVA04-182 Fc。將混合物在室溫下培育隔夜(17小時)。藉由使反應混合物通過5 mL Zeba旋轉去鹽管柱(Thermo Scientific，7000 MWCO)及針對1 L PBS滲析，移除未共軛化合物6325且進行緩衝液交換。使用自AVA04-182 Fc之序列計算的消光係數(92430 M-1 cm-1 ；ExPASy ProtParam)，自280 nm下之吸光度確定所得溶液之濃度。實例 12 ：在 MB49 同基因型鼠類膀胱癌模型中用 AVA04-182 Fc 與 VbP 組合處理後的腫瘤生長抑制
在第0天，將小鼠(n=10/組，C57BL/6)用每隻動物1×106 個MB49細胞皮下接種在右側腹中。經由IP途徑測試10及20 mg/kg之AVA04-182 Fc及SQTgly Fc對照(不靶向PD-L1之親和體Fc融合物)，10天內3次。當平均腫瘤體積達到60 mm3 時，在隨機分組之後開始，經口給與VbP (20 μg；Tufts University)，一週5天，歷時4週。
在開始處理之後二十一(21)天，分析腫瘤生長。利用VbP之組對照(SQTgly Fc)顯示與單獨SQTgly Fc相比顯著腫瘤生長抑制(p＜0.001，鄧尼特檢驗(Dunnett's test))(圖 15 )。
雖然未在單藥療法(AVA04-182 Fc或VbP)之間看到顯著差異，但與SQTgly Fc加VbP組合組相比，在用AVA04-182 Fc加VbP處理後觀測到累加效應，在來自該組之一些小鼠中引起腫瘤消退(p＜0.01，鄧尼特檢驗)。
為評估對免疫反應之作用，在顯示完全消退之小鼠中在接種MB49細胞後60天之後再激發。小鼠中無一者出現新腫瘤，此證實充分增強特異性T細胞活化能夠觸發記憶反應。如所預期，接種MB49細胞之相同培養物的未處理小鼠出現腫瘤(圖 16 )。實例 13 ：在 C57BL/6 小鼠同基因型結腸直腸癌模型中人類化 PD-L1 MC38 中用 AVA04-251 Fc 與 VbP 組合處理後的腫瘤生長抑制
小鼠(n=8隻/組，C57BL/6)用人類化PD-L1 MC38腫瘤細胞株(其中小鼠PD-L1細胞外域經同等人類結構域置換；CrownBio Inc)皮下接種在右側腹區域。一旦腫瘤≥80 mm3 ，經由IP途徑注射AVA04-251 Fc及相關對照(SQTgly Fc)。一週以10 mg/kg之劑量投與處理兩次，歷時3週(AVA04-251 Fc及其對照SQTgly Fc)。一週以0.02毫克/小鼠經口投與VbP (Tufts University)5次(中斷2天)。總體而言，兩種處理皆展示腫瘤生長抑制(圖 17 )。與對照相比，所有用AVA04-251 Fc處理之小鼠具有減小之腫瘤尺寸。與單一療法相比，在用VbP處理後，小鼠中無一者在第13天顯示逃避腫瘤生長。
在腫瘤接種之後七十(70)天，三(3)隻來自用AVA04-251 Fc及VbP處理之組的小鼠第二次接種huMC38細胞株(對照組同時接種)以評定免疫系統是否發展記憶反應，阻止隨後腫瘤生長。如圖 19 中所示，在第二次接種之後十(10)天，處理組中之腫瘤小於80 mm3 ，而對照組中腫瘤達到＞750 mm3 。圖 14 ： A375 小鼠異種移植模型中 AVA04-251 Fc-800 之生物分佈
在小鼠異種移植模型中，基於使用螢光成像隨著時間追蹤之IR染料共軛之親和體的生物分佈，評估抗PD-L1親和體對表現人類PD-L1之腫瘤的靶向。利用NHS化學使AVA04-251 Fc與IRDye800CW (LI-COR)共軛，以修飾蛋白質上可接近之胺基。AVA04-251 Fc (PBS中1 mg/mL)與IRDye 800CW (水中4 mg/mL)以4:1染料:蛋白質之化學計量一起在黑暗條件下在室溫下(約23℃)培育2小時。使用5 mL Zeba旋轉去鹽管柱(MWCO 7000；Pierce)根據製造商說明書自與染料共軛之親和體(AVA04-251 Fc-800)分離游離染料。根據下式基於280 nm及780 nm下之吸光度計算染料:蛋白質比率： 染料:蛋白質比率 = (A780/ε染料)/(A280-(0.03×A780))/ε蛋白質 其中0.03為280 nm下IRDye 800CW之吸光度的校正因子，且ε染料及ε蛋白質分別為該染料(為270,000 M-1 cm-1 )及蛋白質(針對AVA04-251 Fc，為115000 M-1 cm-1 )之莫耳消光係數。
使用結合PD-L1之ELISA (如實例 10 中所述)，將經染料共軛之AVA04-251 Fc-800與人類PD-L1之結合與未共軛之親和體相比。基於可比較之EC50值，資料表明染料共軛不影響AVA04-251 Fc對PD-L1目標之親和力(圖 21 )。此外，基於SEC HPLC (Yarra 3000管柱，在1x PBS中以0.8 mL/min操作)，染料共軛未顯示影響高聚集體之水準。
在雌性無胸腺裸小鼠(Charles River Laboratories)中，在皮下注射A375細胞(100 µL無菌PBS中5×106 細胞[ATCC])至動物腰窩中之後，建立A375小鼠異種移植模型。每週監測腫瘤三(3)次，且用測徑規量測顯現之腫瘤。使腫瘤生長500-1000 mm3 之間，接著靜脈內投與AVA04-251 Fc-800 (0.1或0.5奈莫耳)至三(3)隻小鼠之尾部靜脈中。緊接在注射之後(時間0)及在給藥後1小時、2小時、4小時、8小時及26小時，用Xenogen IVIS 200生物光子成像器記錄螢光影像。圖 22 中呈現來自投與AVA04-251 Fc-800 (0.5奈莫耳)之代表性動物(M4-1)的時程影像，顯示在26小時時間點抗PD-L1親和體靶向腫瘤。箭頭表明腎臟、肝臟及腫瘤之大致位置。
在投與AVA04-251 Fc-800 (動物M4-2；0.1奈莫耳)後切開腫瘤之後，證明經染料共軛之親和體的腫瘤滲透。將小鼠在給藥後26小時處死，取出腫瘤且切成兩半。如先前描述使切開之腫瘤成像(圖 23 )。實例 15 ：親和體 - 連接子 -VbP 前藥之活體外 rhFAP α 裂解
基於藉由LC-MS/MS定量時程內釋放之VbP，研究在藉由重組人類纖維母細胞活化蛋白α(rhFAPα)裂解親和體-連接子-VbP前藥之後生物活性VbP之釋放動力學。
實例 8 及 9 中呈現基於不同數目之乙二醇次單元，具有變化長度之合成MAL及NHS活化之FAPα可裂解連接子-VbP前藥的實例。隨後MAL活化之連接子-VbP前藥(諸如6323 [PEG8 ]、6324 [PEG16 ]及6327 [PEG24 ])與包括AVA04-251 BH cys之親和體中之單一Cys殘基共軛。類似地，NHS活化之連接子-VbP前藥(諸如6325 [PEG8 ]、6326 [PEG16 ]及6328 [PEG24 ])與包括AVA04-182 Fc之親和體的游離胺基共軛。代表性親和體共軛方法呈現於實例 10 及 11 中。
將親和體-連接子-VbP前藥樣品(PBS中5 µM)與rhFAPα (12 nM最終濃度；R&D Systems)一起在37℃下培育15分鐘。藉由添加TCA (5%最終濃度)使反應停止，其中藉由離心(6,000 g，10分鐘)移除所得沈澱蛋白。藉由在添加rhFAPα之前添加TCA製備對照樣品。利用經設計以特異性偵測VbP之多反應監測方法進行LC-MS/MS (Applied Biosystems 4000Qtrap質譜儀與Agilent 1200 HPLC)。簡言之，利用Zorbax Eclipse Plus C18管柱(4.6×50 mm，1.8 μm)，使用3分鐘內95:5水:5%甲醇(0.1%甲酸、5 mM銨酸)至5:95水:甲醇(0.1%甲酸、5 mM銨酸)之線性梯度進行層析。母離子在215.3 Da下且子離子在126.1 Da下。內標為水中d8-Val-boroPro，pH 2 (母離子223.3 Da，子離子126.1 Da)。
代表性LC-MS/MS層析圖呈現於圖 24 中，其顯示VbP自分別併有PEG8及PEG24-連接子-VbP前藥之AVA04-251 BH cys-6323及AVA04-182 Fc-6328釋放。資料證實rhFAPα催化VbP自併有具有變化PEG長度之連接子-VbP前藥且基於MAL及NHS-共軛化學的親和體-連接子-VbP前藥釋放。
隨後，將親和體-連接子-VbP前藥樣品(PBS中5.5 µM)與rhFAPα (12 nM最終濃度；R&D Systems)一起在37℃下培育。緊接在添加rhFAPα之後(時間0)及隨後在培育2分鐘、5分鐘及10分鐘之後，抽取等分試樣。藉由添加TCA (5%最終濃度)使反應停止，其中藉由離心(6,000 g，10分鐘)移除所得沈澱蛋白。如先前所描述，藉由LC-MS/MS，基於針對在0.1-1000 ng/mL VbP (0.47-4700 nM；Tufts University)範圍內製備的標準曲線內推之峰面積，定量釋放之VbP。
FAPα催化VbP自與6325 (PEG8 -連接子-VbP前藥)、6326 (PEG16 -連接子-VbP前藥)及6328 (PEG24 -連接子-VbP前藥)共軛之AVA04-182 Fc釋放的時程呈現於圖 25 中。資料指示VbP自親和體-連接子-VbP前藥釋放之速率與PEG連接子長度之間的依賴性，此表明改變VbP釋放動力學之能力視所需治療概況而定。實例 16 ：在史泊格多利大鼠之急性毒性研究中連接子 -VbP 前藥與 VbP 相比之評估
在史泊格多利(SD)大鼠中建立劑量等於VbP最大耐受劑量(MTD)的10倍，亦即殺死至少20% SD大鼠之VbP劑量的10倍的皮下投與之代表性連接子-VbP前藥的比較活體內安全性。
在投與前，MAL活化之6323 (PEG8 -連接子-VbP前藥)與L-半胱胺酸共軛，以使MAL部分不活化。使L-半胱胺酸(5 mg；Sigma)溶解於1 mL MAL活化之6323 (50 mM MES、150 mM NaCl pH 6中4.8 mM)中，以實現10:1 L-半胱胺酸:6323之大致化學計量。將所得溶液在室溫下培育2-3小時，之後藉由LC-MS分析來證實反應完成。所得經Cys修飾之6323藉由製備型RP-HPLC，使用Supelco Discovery C18管柱，利用10分鐘內2:98乙腈:水(0.1% TFA)梯度進行純化，且隨後凍乾。
向六(6)隻雄性SD大鼠(Charles River)皮下注射含1.47 mg/kg經Cys修飾之6323 (等於0.25 mg VbP/kg)之無菌PBS。在給藥後1小時、2小時、4小時、6小時、8小時及24小時，觀測動物之毒性跡象，其中安全性終點為24小時存活比率；24小時之存活動物數目/總處理數目。圖 26 呈現經Cys修飾之6323 (1.47 mg/kg；等於0.25 mg VbP/kg)及以於無菌PBS中0.010、0.025及0.050 mg VbP/kg皮下投與之VbP (Tufts University)的可比較安全性資料。在此研究中，VbP之MTD視為0.025 mg VbP/kg。在24小時，投與劑量等於VbP MTD 10倍之經Cys修飾之6323的6隻動物中之5隻存活，此表明VbP前藥相對VbP之安全界限。實例 17 ： J774 小鼠巨噬細胞細胞株中活體外親和體 - 連接子 -VbP 前藥誘發之細胞焦亡
親和體-連接子-VbP前藥經設計以藉由FAPα裂解而釋放VbP。VbP藉由活化NLRP1及CARD8炎性體(1-3)中之凋亡蛋白酶-1而誘發巨噬細胞中之細胞焦亡，但當VbP併入至前藥共軛物中時，可防止其誘發細胞焦亡，因為纈胺酸之胺基與FAPα可裂解連接子形成肽鍵。在細胞焦亡之活體外分析中在存在及不存在rhFAPα下測試AVA04-182 Fc之前藥共軛物，以證明親和體-連接子-VbP前藥誘發巨噬細胞中之細胞焦亡的能力嚴格視FAPα裂解而定。
J774A.1細胞(小鼠單核球巨噬細胞；ATCC)在75 cm2 組織培養瓶中在DMEM-10%-FBS中生長，藉由刮在PBS中收穫，再懸浮於DMEM-1%-FBS中，以每孔5×103 細胞之密度塗鋪在96孔盤(VWR)中，且置於5% CO2 培育箱中37℃下。在培育24小時之後，將VbP、未共軛之AVA04-182 Fc、連接子-VbP前藥(6325、6326及6328)及親和體-連接子-VbP前藥(AVA04-182 Fc-6325、-6326及-6328)之連續10倍稀釋液以25 nM之最終濃度添加至添加及未添加rhFAPα (R&D Systems)之孔。一式三份地測試各反應混合物且在37℃下進一步培育24小時。使用CytoTox 96非放射性細胞毒性分析(Promega)，根據製造商說明書來量測釋放至培養上清液中之乳酸脫氫酶(LDH；細胞焦亡之標記物[4])。藉由在SpectraMax® M2e 微定量盤式讀數器(Molecular Devices)中量測吸光度(A490 )來測定LDH濃度。藉由減去含有無細胞之DMEM-1%-FBS之孔中的背景釋放且將所得值表示為藉由CytoTox 96溶解試劑釋放之LDH百分比，算得LDH釋放百分比。
在1 μM濃度下，所有三種親和體-連接子-VbP前藥均展示在rhFAPα存在下顯著LDH釋放(單色條柱；圖 27 )，但在其不存在時無顯著LDH釋放(深色條柱；圖 27 )。亦針對連接子-VbP前藥觀測到此。如所預期(5)，VbP產生顯著LDH釋放，無論是否存在rhFAPα。未共軛之親和體不產生LDH釋放。此等結果表明親和體-連接子-VbP前藥以FAPα依賴性方式釋放VbP，但在不存在FAPα下保持生物非活性。實例 18 ： BALB/c 小鼠中活體內經 Cys 修飾之連接子 -VbP 前藥誘發之 G-CSF 刺激
在巨噬細胞中，VbP已顯示誘發凋亡蛋白酶-1募集至NLRP1炎性體中，將前凋亡蛋白酶-1加工成酶促活性凋亡蛋白酶-1，接著其將前IL-1β加工成成熟及生物活性形式，隨後分泌(3、6)。以自分泌與旁分泌兩種方式起作用，成熟IL-1β可誘發多種細胞介素在轉錄水準下表現(7)。小鼠中，VbP之投與引起細胞介素表現增加，且G-CSF之血清濃度增加已顯示為此作用之穩固標記物(8、9)。G-CSF作為活體內VbP之生物活性之標記物的有效性由casp-1-/- 及Nlrp1b-/- 基因剔除小鼠中血清G-CSF反應完全喪失支持(1、5)。在經Cys修飾之6323前藥中，VbP藉由涉及纈胺酸之胺基的肽鍵附接至FAPα可裂解連接子，因此VbP為生物非活性的，直至其藉由FAPα裂解而釋放。正常小鼠之組織及血液中所存在之顯著水準之FAPα酶活性(10)允許使用G-CSF之血清濃度作為生物標記物測試前藥在活體內藉由內源性FAPα活化之能力。
如實例 16 中所述產生經Cys修飾之6323前藥。向7-8週齡之雄性BALB/c小鼠(Charles River Laboratories)，每次處理每組5隻小鼠，皮下注射媒劑(PBS)、1.28或0.64毫克/小鼠經Cys修飾之6323。在給藥之後六(6)小時，藉由心臟穿刺收集血液，且使用小鼠G-CSF Quantikine ELISA套組(R&D Systems)，根據製造商說明書來量測G-CSF之血清濃度。
與經媒劑處理之小鼠(暗色條柱；圖 28 )相比，在兩種測試劑量1.28及0.64毫克/小鼠下，經Cys修飾之6323 (分別灰色及空心條柱；圖 28 )引起G-CSF之血清濃度顯著增加。結果表明6323中之FAPα可裂解連接子能夠在活體內藉由內源性FAPα裂解而釋放生物活性VbP。實例 19 ：例示性合成方案
可併入本發明之結合子-藥物共軛物中的免疫-DASH抑制劑之合成可包括使用諸如HATU等偶合劑進行偶合反應，接著需要時使用例如BCl3 之試劑或需要時HCl-PhB(OH)2 方法脫除保護基。藉由RP-HPLC，使用Varian半製備型系統，利用Discovery C18 569226-U RP-HPLC管柱純化一些目標化合物。通常藉由將水(0.1% TFA)與乙腈(0.08%TFA)以梯度濃度混合而製得。化合物編碼、結構及表徵展示於表1中。
流程 1. 通用合成方法
Figure 02_image211
Gly(1- 金剛烷基 )-boroPro (ARI-5544 或 3102A-2C) 之示例合成程序 流程 2. ARI-5544 之合成方法 a
Figure 02_image213
a 試劑及條件：i. L-boroPro-pn、HATU、DIEA、DMF、0℃至室溫，93%；ii. 4 N HCl (g)之二噁烷溶液，0℃至室溫；iii. PhB(OH)2 、MTBE-H2 O，兩步67%。
Gly(1- 金剛烷基 )-boroPro (ARI-5544) 之合成 . 在乾冰/丙酮冷卻下將4 N HCl (g)之二噁烷溶液(5 mL，20 mmol)添加至化合物1 (0.86 g，1.6 mmol)且接著在室溫下攪拌3小時。在減壓下濃縮反應混合物，且接著與乙醚(3×15 mL)一起共蒸發，得到經(+)-蒎烷二醇保護之ARI-5544，將其溶於預先冷卻之0.08 N HCl (10 mL)。接著添加第三丁基甲基醚MTBE)(10 mL)及苯基
Figure 108119354-A0304-12-02
酸(0.22 g，1.7 mmol)。將混合物在室溫下攪拌3小時且分離水相。將MTBE層用0.08 N HCl (5 mL)萃取且合併之水萃取物用乙醚(3×10 ml)洗滌。在旋轉蒸發儀上濃縮水相(＜30℃)且藉由製備型HPLC(溶離劑：溶劑A，含0.1% TFA之水溶液；溶劑B，含0.08% TFA之乙腈)純化粗產物。收集所需溶離份且濃縮至大約10 mL且冷凍乾燥，得到呈TFA鹽形式之化合物ARI-5544 (0.45 g，兩步67%)。1 H NMR (D2 O): δ 1.60 - 1.75 (m, 14 H), 1.85 - 2.15 (m, 6H), 3.07 (dd, J = 11.1, 6.9 Hz, 1H), 3.46 - 3.52 (m, 1H), 3.76 (t, J = 9.4 Hz, 1H), 3.91 (s, 1H)。C16 H27 BN2 O3 之MS (ESI+) m/z (相對強度): 577.5 ([2 x (M - H2O) + H]+, 76), 307.4 2 ([M + H]+, 100), 289.4 ([M - H2O + H]+, 24)。
3102C 之示例合成程序 流程 3. 3102C 之合成方法 a
Figure 02_image215
a 試劑及條件：i. L-boroPro-pn、HATU、DIEA、DMF、0℃至室溫，90%；ii. 含BCl3 之CH2 Cl2 、-78℃至室溫，55%。
3102C 之合成 . 以N -Boc-L -3-羥基-1-金剛烷基-甘胺酸為起始物質，利用以上針對製備1 所述之類似偶合反應，製備化合物2 。使此產物(0.28 g，0.5 mmol)溶解於無水二氯甲烷(5.0 mL)中，且冷卻至-78℃，同時逐滴添加BCl3 (1 M二氯甲烷，5.0 mL)。將混合物在-78℃下攪拌1小時，達至室溫，且接著在真空中濃縮。將殘餘物分配於乙醚(5 mL)與水(5 mL)之間。將水層用更多乙醚(2×5 mL)洗滌兩次，在真空中濃縮且藉由半製備型RP-HPLC進一步純化，得到呈TFA鹽形式之3102C(0.13 g，55%)。
5870 之合成 . 合成流程：i. DAST；ii. LiOH；iii. L-boroPro-pn、HATU、DIEA；iv. BCl3。
Figure 02_image217
5871 之合成 . 合成流程：i. MeI、K2 CO3 、DMF；ii.4當量DAST及高溫；iii. LiOH；iv. L-boroPro-pn、HATU、DIEA；v. HCl，接著PhB(OH)2 。
Figure 02_image219
5873 之合成 . 合成流程：i.L-boroPro-pn、HATU、DIEA；ii. BCl3
Figure 02_image221
5874 之合成 . 合成流程：i. 1當量DAST，在低溫下；ii. LiOH；iii. L-boroPro-pn、HATU、DIEA；iv. HCl，接著PhB(OH)2 。
Figure 02_image223
Gly(3- 羥基 -5,7,- 二甲基 - 金剛烷基 )-boroPro 之合成 . 合成流程：i. MeI、K2 CO3 ；ii. TrisylN3 、KHMDS；iii. H2 /Pd-C、Boc2O；iv. KOH；v. KMnO4 ；vi. L-boroPro-pn、HATU、DIEA；vii. HCl，接著PhB(OH)2 。
Figure 02_image225
5879 之合成 . 合成流程：i. DAST；ii. LiOH；iii. L-boroPro-pn、HATU、DIEA；iv. BCl3 。
Figure 02_image227
5880 之合成 . 合成流程：i. L-boroPro-pn、HATU、DIEA；ii. BCl3 。
Figure 02_image229
6067 之合成 . 合成流程：i. 氧化；ii. DAST；iii. H2 /Pd-C；iv. L-boroPro-pn、HATU、DIEA；v. HCl；vi. PhB(OH)2 。
Figure 02_image231
表 1. 化合物編碼、結構及化學表徵
Figure 108119354-A0304-0013
 實例 20 ：例示性免疫 -DASH 抑制劑
在列3-7中，下表提供如針對DPP8、DPP9、DPP4、DPP2、FAP (纖維母細胞活化蛋白)及PREP之無細胞製劑測定的抑制IC50。按照以下實例4中闡述之方案測定此等IC50值(以nM為單位)。在計算時，根據以下實例3中描述之方案，該表亦提供抑制全細胞中DPP8及DPP9之細胞內IC50 (「IIC50」)。在某些情況下，該表亦提供誘導細胞培養物中巨噬細胞之細胞焦亡的IC50。
Figure 108119354-A0304-0014
 實例 21 ： 用於確定針對 293T 細胞中 DPP 活性之細胞內 IC50 的方案
因為293T細胞表現低水準之內源性DPP8/9而非DPP IV、DPP II或FAP，所以此允許評定細胞內DPP8/9抑制，無來自其他背景DPP活性之干擾。(Danilova, O.等人 (2007)Bioorg. Med. Chem. Lett. 17 , 507-510；Wang, X.M.等人 (2005)Hepatology 42 , 935-945) 此資訊允許評定化合物之細胞滲透性。
材料 - 293T細胞(ATCC，目錄號CRL-11268) - 無酚紅之RPMI 1640細胞培養基(VWR，目錄號45000-410)，補充有2 mM L-麩醯胺酸(VWR，目錄號45000-676)、10 mM HEPES (VWR，目錄號45000-690)、1 mM丙酮酸鈉(VWR，目錄號45000-710)、4500 mg/L葡萄糖(VWR，目錄號45001-116)、1x青黴素-鏈黴素(VWR，目錄號45000-652) - 抑制劑或前藥 - 4000x受質溶液(100 mM Ala-Pro-AFC (Bachem，目錄號I-1680)之DMSO溶液) - 96孔黑色透明底盤(BD Biosciences，目錄號353948)
儀器 - 盤式震盪器 - Molecular Devices SpectraMax® M2e微定量盤式讀數器
方案 分析設定
使細胞胰蛋白酶化且自75 cm2或更大燒瓶短暫離心，用PBS洗滌且再懸浮於RPMI 1640中。計數所得懸浮液中之細胞且調整體積，使得每75 μL具有100,000個細胞。添加100 μL單獨RPMI 1640至96孔黑色透明底盤中之管柱1之行A-C。添加75 μL細胞懸浮液至列2-10中之剩餘孔。使盤在37℃下平衡隔夜。樣品製備
1. 為製備化合物用於分析，使其溶解於DMSO中，或若懷疑環化，則溶解於pH 2.0水(0.01 N HCl)中，達100 mM之最終濃度。對於pH 2.0原液，在室溫下培育最少四小時且長達隔夜。由此，於RPMI 1640中製備4 mM原液。若在此濃度濃度下抑制劑不溶，則按1:10稀釋100 mM原液至10 mM。使用此原液，製備如上所述之0.4 mM原液。應證實各稀釋樣品之pH值為細胞培養基之pH值(pH 7-8)。
2. 準備稀釋盤用於步驟3中製備之化合物。為進行此，添加4 mM或0.4 mM預先製備之原液至96孔盤之行A。由此，在RPMI 1640中進行1:10連續稀釋，直至行G，如下文所示。行H應具有單獨RPMI 1640細胞培養基：
Figure 02_image293
3. 適當時添加25 μL來自步驟4中製備之稀釋盤之化合物至分析盤之列2-10中。各樣品應一式三份地測試。短暫震盪盤，且使其在37℃下培育兩小時。
4. 在此期間，應製備受質。為進行此，在RPMI 1640中按1:400稀釋100 mM原液，達250 μM之最終工作濃度。
5. 在37℃下之培育結束之後，添加10 μL步驟5中製備之受質至各孔。短暫震盪盤，且使其在37℃下培育10分鐘。一旦結束，即在λex：400、λem：505下讀取螢光。 資料分析
1. 螢光值作為y值直接輸入Prism。對於作為x值之抑制劑濃度，確保稀釋盤中之濃度除以4，以考慮其在分析中之稀釋。x值在輸入Prism前必須轉化成對數值。無抑制劑孔(行H)之濃度應作為-14 (等於10-14 M)輸入。
2. 一旦該等值已輸入，則在「分析」下，選擇「非線性回歸(曲線擬合)」。隨後迅速選擇「對數(抑制劑)對比反應」。此將計算出IC50值，可見於「結果」部分。實例 22 ：二肽基肽酶 IV 、二肽基肽酶 8 、二肽基肽酶 9 、二肽基肽酶 II 、纖維母細胞活化蛋白或脯胺醯基寡肽酶之活體外抑制分析方案
此分析可用於確定多種抑制劑針對重組人類二肽基肽酶IV (DPPIV)、二肽基肽酶8 (DPP8)、二肽基肽酶9 (DPP9)、二肽基肽酶II、纖維母細胞活化蛋白(FAP)或脯胺醯基寡肽酶(PREP)之IC50。
材料 酶 - 重組人類DPPIV (R&D Systems，目錄號1180-SE) - 重組人類DPP8 (Enzo Life Sciences，目錄號BML-SE527) - 重組人類DPP9 (R&D Systems，目錄號5419-SE) - 重組人類DPPII (R&D Systems，目錄號3438-SE) - 重組人類FAP (R&D Systems，目錄號3715-SE) - 重組人類PREP (R&D Systems，目錄號4308-SE) 分析緩衝液 - 25 mM Tris，pH 8.0 (DPPIV及DPP9) - 50 mM Tris，pH 7.5 (DPP8) - 25 mM MES，pH 6.0 (DPPII) - 50 mM Tris、140 mM NaCl，pH 7.5 (FAP) - 25 mM Tris、0.25 M NaCl，pH 7.5 (PREP) 受質 - 4000x受質溶液(100 mM Gly-Pro-AMC (VWR，目錄號100042-646)之DMSO溶液、DPPIV、DPP8及DPP9) - 4000x受質溶液(100 mM Lys-Pro-AMC (Bachem，目錄號I-1745)之DMSO溶液、DPPII) - 100x受質溶液(2.5 mM Z-Gly-Pro-AMC (VWR，目錄號I-1145.0050BA)之DMSO溶液、FAP及PREP) 通用材料 - 化合物 - 96孔黑色透明底盤(Costar，目錄號3603) 儀器 - 盤式震盪器 - Molecular Devices SpectraMax® M2e微定量盤式讀數器
方案
1. 為製備化合物用於分析，使其溶解於DMSO中，或若懷疑環化，則溶解於pH 2.0水(0.01 N HCl)中，達100 mM之最終濃度。對於pH 2.0原液，在室溫下培育最少四小時且長達隔夜。由此，在50 mM Tris中製備1 mM原液pH 7.4。若在此濃度下抑制劑不溶，則按1:10稀釋100 mM原液至10 mM。使用此原液，製備如上所述之0.1 mM原液。
2. 準備稀釋盤用於待測試之化合物原液。添加0.1 mM及/或1 mM預先製備之原液至96孔盤之行A。由此，沿著各列向下，在適當分析緩衝液中進行1:10連續稀釋，如下文所示：
3. 藉由在適當分析緩衝液中稀釋DMSO原液來製備20x受質溶液。
4. 在適當分析緩衝液中稀釋酶。稀釋因子視批號而定且必須在進行分析前確定。DPPIV、DPP8、DPP9、DPPII、FAP及PREP之最終酶濃度分別為0.1 nM、0.8 nM、0.4 nM、0.2 nM、1.2 nM及0.6 nM。添加180 μL至列2-10中需要之各孔。管柱1應如下文所示製備：
5. 適當時添加20 μL來自步驟2中製備之稀釋盤之所關注化合物至分析盤之列2-10中。各樣品應一式三份地測試。允許此在室溫下培育10分鐘，前兩分鐘震盪盤。
6. 添加10 μL步驟3中製備之20x受質至各孔且使其在室溫下培育15分鐘，前兩分鐘震盪盤。
7. 在λex：380、λem：460下讀取螢光。
資料分析
1. 將孔A1、B1及C1中之空白的值求平均值且自剩餘孔減去該平均值。所得螢光值作為y值直接輸入Prism。對於作為x值之化合物濃度，確保稀釋盤中之濃度除以10.5，以考慮其在分析盤中之稀釋。此等值在輸入Prism前必須轉化成對數值。
2. 一旦該等值已輸入，則在「分析」下且選擇「非線性回歸(曲線擬合)」。隨後迅速選擇「對數(抑制劑)對比反應」。此將計算出IC50值，可見於「結果」部分。引用之參考文獻 1.        Okondo MC, Rao SD, Taabazuing CY, Chui AJ, Poplawski SE, Johnson DC, Bachovchin DA. Inhibition of Dpp8/9 Activates the Nlrp1b Inflammasome. Cell Chem Biol. 2018;25(3):262-7 e5. Epub 2018/02/06. doi: 10.1016/j.chembiol.2017.12.013. PubMed PMID: 29396289; PMCID: PMC5856610. 2.        Johnson DC, Taabazuing CY, Okondo MC, Chui AJ, Rao SD, Brown FC, Reed C, Peguero E, de Stanchina E, Kentsis A, Bachovchin DA. DPP8/DPP9 inhibitor-induced pyroptosis for treatment of acute myeloid leukemia. Nat Med. 2018;24(8):1151-6. Epub 2018/07/04. doi: 10.1038/s41591-018-0082-y. PubMed PMID: 29967349; PMCID: PMC6082709. 3.        Zhong FL, Robinson K, Teo DET, Tan KY, Lim C, Harapas CR, Yu CH, Xie WH, Sobota RM, Au VB, Hopkins R, D'Osualdo A, Reed JC, Connolly JE, Masters SL, Reversade B. Human DPP9 represses NLRP1 inflammasome and protects against autoinflammatory diseases via both peptidase activity and FIIND domain binding. J Biol Chem. 2018;293(49):18864-78. Epub 2018/10/07. doi: 10.1074/jbc.RA118.004350. PubMed PMID: 30291141; PMCID: PMC6295727. 4.        Rayamajhi M, Zhang Y, Miao EA. Detection of pyroptosis by measuring released lactate dehydrogenase activity. Methods Mol Biol. 2013;1040:85-90. doi: 10.1007/978-1-62703-523-1_7. PubMed PMID: 23852598; PMCID: PMC3756820. 5.        Okondo MC, Johnson DC, Sridharan R, Go EB, Chui AJ, Wang MS, Poplawski SE, Wu W, Liu Y, Lai JH, Sanford DG, Arciprete MO, Golub TR, Bachovchin WW, Bachovchin DA. DPP8 and DPP9 inhibition induces pro-caspase-1-dependent monocyte and macrophage pyroptosis. Nature chemical biology. 2017;13(1):46-53. doi: 10.1038/nchembio.2229. PubMed PMID: 27820798. 6.        de Vasconcelos NM, Vliegen G, Goncalves A, De Hert E, Martin-Perez R, Van Opdenbosch N, Jallapally A, Geiss-Friedlander R, Lambeir AM, Augustyns K, Van Der Veken P, De Meester I, Lamkanfi M. DPP8/DPP9 inhibition elicits canonical Nlrp1b inflammasome hallmarks in murine macrophages. Life Sci Alliance. 2019;2(1). Epub 2019/02/06. doi: 10.26508/lsa.201900313. PubMed PMID: 30718379; PMCID: PMC6362307. 7.        Dinarello CA. Biologic basis for interleukin-1 in disease. Blood. 1996;87(6):2095-147. Epub 1996/03/15. PubMed PMID: 8630372. 8.        Adams S, Miller GT, Jesson MI, Watanabe T, Jones B, Wallner BP. PT-100, a small molecule dipeptidyl peptidase inhibitor, has potent antitumor effects and augments antibody-mediated cytotoxicity via a novel immune mechanism. Cancer Res. 2004;64(15):5471-80. Epub 2004/08/04. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-04-044764/15/5471 [pii]. PubMed PMID: 15289357. 9.        Jones B, Adams S, Miller GT, Jesson MI, Watanabe T, Wallner BP. Hematopoietic stimulation by a dipeptidyl peptidase inhibitor reveals a novel regulatory mechanism and therapeutic treatment for blood cell deficiencies. Blood. 2003;102(5):1641-8. Epub 2003/05/10. doi: 10.1182/blood-2003-01-02082003-01-0208 [pii]. PubMed PMID: 12738665. 10.      Keane FM, Yao TW, Seelk S, Gall MG, Chowdhury S, Poplawski SE, Lai JH, Li Y, Wu W, Farrell P, Vieira de Ribeiro AJ, Osborne B, Yu DM, Seth D, Rahman K, Haber P, Topaloglu AK, Wang C, Thomson S, Hennessy A, Prins J, Twigg SM, McLennan SV, McCaughan GW, Bachovchin WW, Gorrell MD. Quantitation of fibroblast activation protein (FAP)-specific protease activity in mouse, baboon and human fluids and organs. FEBS open bio. 2013;4:43-54. doi: 10.1016/j.fob.2013.12.001. PubMed PMID: 24371721; PMCID: 3871272.以引用的方式併入
本說明書中所提及之所有公開案、專利及專利申請案均以引用的方式併入本文中，其引用的程度如同各個別的公開案、專利或專利申請案經特定及個別地指示以引用的方式併入一般。
圖 1A 、圖 1B 及圖 1C ：AVA04-182 Fc融合蛋白之結構及表徵。圖 2 ：藉由Biacore評估之AVA04-182 Fc與小鼠PD-L1之結合動力學。圖 3 ：藉由ELISA，AVA04-182 Fc與小鼠PD-L1/小鼠PD-1競爭。圖 4 ：藉由ELISA，AVA04-182 Fc之小鼠混合淋巴細胞反應。圖 5A 及圖 5B ：AVA04-251 Fc融合蛋白之結構及表徵。圖 6 ：藉由Biacore評估之AVA04-251 Fc與人類PD-L1之結合動力學。圖 7 ：藉由NFAT基因報導分析法(Promega)評估之AVA04-251 Fc對PD-1/PD-L1相互作用之抑制。圖 8A 、圖 8B 及圖 8C ：AVA04-251 BH cys串聯融合蛋白之結構及表徵。圖 9 ：化合物6323之化學結構。圖 10 ：化合物6323之合成流程。圖 11 ：化合物6325之化學結構。圖 12 ：化合物6325之合成流程。圖 13 ：使用順丁烯二醯亞胺化學之AVA04-251 BH cys-6323之合成流程。圖 14 ：使用NHS化學之AVA04-183 Fc-6325之合成流程。圖 15 ：同基因型鼠類膀胱癌(MB49)模型中組合處理(AVA04-182 Fc + VbP)對腫瘤生長之作用。圖 16 ：同基因型鼠類膀胱癌(MB49)模型中在激發腫瘤之後對腫瘤生長之作用。圖 17 ：人類化同基因型結腸直腸癌模型(MC38 HuPD-L1)中組合處理(AVA04-251 Fc + VbP)對腫瘤生長之作用。圖 18 ：人類化同基因型結腸直腸癌模型(MC38 HuPD-L1)中組合處理(AVA04-251 Fc + VbP)對腫瘤生長之作用。圖 19 ：人類化同基因型結腸直腸癌模型(MC38 HuPD-L1)中在腫瘤激發之後對腫瘤生長之作用。圖 20 ：在使用順丁烯二醯亞胺化學與IR Dye 800CW共軛前後AVA04-251 BH cys與人類PD-L1之結合的比較。圖 21 ：在使用NHS化學與IR Dye 800CW共軛前後AVA04-251 Fc與人類PD-L1之結合的比較。圖 22 ：A375小鼠異種移植模型中AVA04-251 Fc-800之生物分佈。圖 23 ：A375小鼠異種移植模型中AVA04-251 Fc-800之腫瘤滲透。圖 24 ：親和體-連接子-VbP前藥之活體外rhFAPα裂解。圖 25 ：親和體-連接子-VbP前藥之活體外rhFAPα裂解動力學。圖 26 ：在史泊格多利大鼠(Sprague Dawley rats)之急性毒性研究中連接子-VbP前藥與VbP相比之評估。圖 27 ：J774小鼠巨噬細胞細胞株中活體外親和體-連接子-VbP前藥誘發之細胞焦亡。圖 28 ：BALB/c小鼠中活體內經Cys修飾之連接子-VbP前藥誘發之G-CSF刺激。圖 29 ：在Expi293細胞中暫時表現之伊派利單抗(Ipilimumab，生物仿製藥)/AVA04-141，在蛋白質A純化後之純化產率為約160 mg/L。圖 30 ：在Expi293細胞中暫時表現之貝伐單抗(Bevacizumab，生物仿製藥)/AVA04-251可純化至超過97%產率，且Biacore表明無論構築體包括可撓性連接子[(G4S)3]還是剛性連接子[A(EAAAK)3]，雙特異性抗體-親和體融合物皆能夠接合兩個目標。圖 31 ：可用於產生本發明之抗PD-L1-藥物共軛物之抗PD-L1親和體格式化的說明性實例，包括Fc融合物(展示二價PD-L1結合子格式及雙特異性二價PD-L1結合子及目標X結合子格式)、串聯抗體融合物之多種格式、BiTE格式及抗PD-L1親和體與受體陷阱結構域之串聯融合物。此等格式中之每一者可用一或多種藥物-共軛物衍生化。圖 32 ：親和體可在Fc上之各個位點處格式化，且因此應轉譯成IgG-親和體融合物。典型(未最佳化)表現產率在400-800 mg/l範圍內。使用分析型SEC-HPLC評定純度。圖 33 ：說明FAPα受質識別序列之裂解選擇性，甚至在諸如FAPα及PREP之緊密酶之間。僅僅FAPa能夠裂解及釋放游離藥物部分。圖 34 ：說明經設計以增加DAR及保留各藥物部分之酶釋放的FAPα可裂解連接子。在此連接子設計下，DAR可超過25、50或甚至100。圖 35A 及圖 35B ：展示FAPα在大部分實體腫瘤之腫瘤微環境中選擇性過度表現。如藉由mRNA分析(圖35A)、組織化學(圖35A)及偵測酶活性(圖35B)所證實，相對於正常上皮組織，FAPα在惡性人類上皮組織中上調。圖 36 ：FAPα活化之連接子僅僅由FAPα選擇性活化。圖 37A 及圖 37B ：游離藥物部分Val-boroPro在活體外在AML細胞株中誘發細胞焦亡。人類PDX模型證實Val-boroPro本身在活體內針對MV4-11 AML細胞(人類急性單核球性白血病模型)之功效。一百萬個MV4-11細胞注射至10週齡雌性NOD-SCID Il2rg-/-小鼠之尾部靜脈中。Val-boroPro以20毫克/小鼠一日一次腹膜內投與-週期時程為5天給藥，2天中斷。圖 38 ：自與人類PD-L1結合之抗PD-L1親和體ACA04-261之晶體衍生結構推導，圖16提供與兩種蛋白質之間的接觸界面有關之胺基酸殘基的列表。

Claims (84)

  1. 一種結合子-藥物共軛物，其包含：(i)結合於處於疾病病況之組織中目標細胞上之細胞表面特徵的細胞結合部分，該細胞表面特徵當由該結合子-藥物共軛物結合時進行緩慢內化；(ii)對靠近該目標細胞之旁觀者細胞具有藥理學作用的藥物部分，該藥物部分作為該結合子-藥物共軛物之一部分時實現藥理學作用之EC50相對於自該結合子-藥物共軛物釋放之游離藥物部分減弱至少10倍；以及(iii)將該多肽結合子部分共價連接於該藥物部分之連接部分，該連接部分包括藉由該患病組織中胞外存在之酶可裂解的受質識別序列，其中在該酶存在下該連接部分可裂解且釋放該游離藥物部分。
  2. 如請求項1之結合子-藥物共軛物，其中該患病組織為腫瘤。
  3. 如請求項1或2之結合子-藥物共軛物，其中該目標細胞為腫瘤細胞。
  4. 如請求項1或2之結合子-藥物共軛物，其中該目標細胞為巨噬細胞、單核球衍生之抑制細胞(MDSC)、樹突狀細胞、纖維母細胞、T細胞、NK細胞、肥大細胞、粒細胞、嗜伊紅白血球、B細胞或血管內皮細胞。
  5. 如請求項1至4中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該結合子-藥物共軛物在與該目標細胞上之該表面特徵結合時具有至少6小時，更佳至少10小時、12小時、14小時、16小時、18小時、20小時、24小時、36小時、48小時或60小時之內化半衰期。
  6. 如請求項1至5中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該細胞表面特徵為相對於來自健康狀態之該組織的正常細胞，該患病組織中由該目標細胞選擇性表現之蛋白質。
  7. 3或4之結合子-藥物共軛物，其中該細胞表面特徵為檢查點蛋白或共刺激受體。
  8. 如請求項7之結合子-藥物共軛物，其中該表面特徵為選自由以下組成之群的檢查點蛋白：CTLA-4、PD-1、LAG-3、BTLA、KIR、TIM-3、PD-L1、PD-L2、B7-H3、B7-H4、HVEM、GAL9、CD160、VISTA、BTNL2、TIGIT、PVR、BTN1A1、BTN2A2、BTN3A2及CSF-1R，更佳CTLA-4、PD-1、LAG-3、TIM-3、BTLA、VISTA、HVEM、TIGIT、PVR、PD-L1及CD160，且該結合子部分為檢查點拮抗劑。
  9. 如請求項7之結合子-藥物共軛物，其中該表面特徵為選自由以下組成之群的共刺激受體或配位體：4-1BB、4-1BB-L、OX40、OX40-L、GITR、CD28、CD40、CD40-L、ICOS、ICOS-L、LIGHT及CD27，更佳4-1BB、OX40、GITR、CD40及ICOS，且該結合子部分為共刺激促效劑。
  10. 如請求項1至9中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該細胞結合部分為抗體，諸如人類化抗體、人類抗體或嵌合抗體，或包含結合該細胞表面特徵之其抗原結合部分，諸如Fab、F(ab)2、F(ab')、F(ab')2、F(ab')3、Fd、Fv、二硫鍵連接之Fv、dAb或sdAb (或奈米抗體)、CDR、scFv、(scFv)2、二-scFv、雙-scFv、tascFv (串聯scFv)、AVIBODY (例如雙功能抗體、三功能抗體、四功能抗體)、T細胞接合分子(BiTE)、scFv-Fc、Fcab、mAb2、小模塊免疫藥物(SMIP)、Genmab/單抗體或duobody、V-NAR結構域、IgNAR、微型抗體、IgGACH2、DVD-Ig、probody、胞內抗體或多特異性抗體。
  11. 如請求項1至9中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該結合子部分為諸如選自由以下組成之群的非抗體骨架：親和抗體、親和體、阿非林(Affilin)、抗運載蛋白、Atrimer、高親和性多聚體、達爾潘蛋白(DARPin)、FN3骨架(例如阿德奈汀(Adnectin)及辛替恩(Centyrin))、非諾莫(Fynomer)、孔尼茲結構域(Kunitz domain)、Nanofitin、Pronectin、OBodies、三功能抗體、高親和性多聚體、雙環肽及Cys結。
  12. 如前述請求項中任一項之結合子-藥物共軛物，其由以下各式中之一者表示：
    Figure 03_image295
    其中 CBM表示每次出現可相同或不同之細胞結合部分； L1 表示間隔子或一鍵； SRS表示受質識別序列； L2 表示自我分解型連接子或一鍵； DM表示藥物部分； m表示整數1至6；且 n表示整數1至500，更佳1至100、1至10或1至5。
  13. 如請求項12之結合子-藥物共軛物，其中L1 為烴(直鏈或環狀)，諸如6-順丁烯二醯亞胺基己醯基、順丁烯二醯亞胺基丙醯基及順丁烯二醯亞胺基甲基環己烷-1-甲酸酯，或L1 為N-丁二醯亞胺基4-(2-吡啶基硫基)戊酸酯、N-丁二醯亞胺基4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸酯、N-丁二醯亞胺基(4-碘-乙醯基)胺基苯甲酸酯，或L1 為聚醚，諸如聚(乙二醇)。
  14. 如請求項12之結合子-藥物共軛物，其中CBM包括硫醇，且L1 為經由順丁烯二醯亞胺部分與該硫醇基偶合之聚(乙二醇)，L1 如下式中所示：
    Figure 03_image297
    其中p表示整數1至100，較佳6至50，更佳6至12。
  15. 如請求項12之結合子-藥物共軛物，其中CBM包括硫醇，且L1 為經由順丁烯二醯亞胺部分與該硫醇基偶合之烴部分，L1 如下式中所示：
    Figure 03_image299
    其中p表示整數1至20，較佳1至4。
  16. 如前述請求項中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該受質識別序列由蛋白酶、較佳絲胺酸蛋白酶、金屬蛋白酶或半胱胺酸蛋白酶裂解。
  17. 如請求項16之結合子-藥物共軛物，其中該蛋白酶在患者中處於該疾病病況之該組織中細胞外存在的水準比其在患者中處於該健康狀態之該組織中的水準大至少2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍或甚至100倍。
  18. 如請求項16之結合子-藥物共軛物，其中該蛋白酶在患者中處於該疾病病況之該組織中細胞外存在的水準比該患者之其他組織大至少2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍或甚至100倍。
  19. 如請求項1至18中任一項之結合子-藥物共軛物，其中蛋白酶為選自以下之基質金屬蛋白酶：膜結合之基質金屬蛋白酶(諸如MMP14-17及MMP24-25)或分泌之基質金屬蛋白酶(諸如MMP1-13及MMP18-23及MMP26-28)，較佳為MMP1、MMP2、MMP3、MMP4、MMP9、MMP11、MMP13、MMP14、MMP17或MMP19，更佳為MMP2、MMP9或MMP14。
  20. 如請求項1至18中任一項之結合子-藥物共軛物，其中蛋白酶為A解整合素及金屬蛋白酶(ADAM)，或具有血小板反應蛋白模體之A解整合素或金屬蛋白酶(ADAMTS)。
  21. 如請求項1至18中任一項之結合子-藥物共軛物，其中蛋白酶為豆莢蛋白、間質蛋白酶(MT-SP1)、嗜中性白血球彈性蛋白酶、TMPRSS、凝血酶、u型纖維蛋白溶酶原活化因子(uPA，亦稱為尿激酶)、PSMA或CD10 (CALLA)。
  22. 如請求項1至18中任一項之結合子-藥物共軛物，其中蛋白酶為脯胺酸後裂解蛋白酶，諸如纖維母細胞活化蛋白α (FAPα)。
  23. 如請求項12至15中任一項之結合子-藥物共軛物，其中受質識別序列由纖維母細胞活化蛋白α (FAPα)裂解且如下所示：
    Figure 03_image301
    其中 R2 表示H或(C1 -C6 )烷基，且較佳為H； R3 表示H或(C1 -C6 )烷基，較佳為甲基、乙基、丙基或異丙基，且更佳甲基； R4 不存在或表示(C1 -C6 )烷基、-OH、-NH2 或鹵素； X表示O或S；且 若L2 為自我分解型連接子，則-NH-表示作為L2 之部分的胺，或若L2 為一鍵，則為DM之一部分。
  24. 如請求項12至15或23中任一項之結合子-藥物共軛物，其中L2 為選自由以下組成之群的自我分解型連接子：-NH-(CH2 )4 -C(=O)-、-NH-(CH2 )3 -C(=O)-、對胺基苄氧羰基(PABC)及2,4-雙(羥基甲基)苯胺。
  25. 如請求項1至24中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分之該藥理學作用視該游離藥物部分為細胞可滲透而定，而當作為該結合子-藥物共軛物之一部分時該藥物部分實質上不可滲透細胞。
  26. 如請求項1至24中任一項之結合子-藥物共軛物，其中共價連接於L1 實質上使該藥物部分之該藥理學作用減弱。
  27. 如請求項1至26中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分為免疫調節劑。
  28. 如請求項27之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分為免疫活化劑。
  29. 如請求項27之結合子-藥物共軛物，其中該游離藥物部分誘導先天性免疫路徑。
  30. 如請求項27、28或29之結合子-藥物共軛物，其中該免疫調節劑為抑制DPP8及DPP9之酶活性且誘發巨噬細胞之細胞焦亡的免疫-DASH抑制劑。
  31. 如請求項27、28或29之結合子-藥物共軛物，其中該免疫活化劑為STING促效劑。
  32. 如請求項27、28或29之結合子-藥物共軛物，其中該免疫活化劑為RIG-1促效劑。
  33. 如請求項27、28或29之結合子-藥物共軛物，其中該免疫活化劑為類鐸受體(TLR)促效劑，諸如選自由TLR1/2促效劑、TLR2促效劑、TLR3促效劑、TLR4促效劑、TLR5促效劑、TLR6/2促效劑、TLR7促效劑、TLR7/8促效劑、TLR7/9促效劑、TLR8促效劑、TLR9促效劑及TLR11促效劑組成之群，較佳選自由TLR3促效劑、TLR7促效劑、TLR7/8促效劑及TLR9促效劑組成之群。
  34. 如請求項1至26中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分對癌症相關纖維母細胞(CAF)具有細胞毒性。
  35. 如請求項1至26中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分使腫瘤相關巨噬細胞偏向M1巨噬細胞或抑制M2巨噬細胞之免疫抑制活性。
  36. 如請求項1至26中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分加速T細胞激活及/或樹突狀細胞遷移。
  37. 如請求項1至26中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分諸如藉由阻斷免疫抑制功能或遷移至淋巴結及/或腫瘤微環境而抑制或耗竭Treg細胞。
  38. 如請求項1至26中任一項之結合子-藥物共軛物，其中當全身給與時該結合子-藥物共軛物之治療指數比該游離藥物部分之治療指數大至少5倍，更佳大至少10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、75倍或甚至100倍。
  39. 如前述請求項中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該免疫調節劑為分子量小於5000 amu、較佳小於2500 amu之低分子量抑制劑。
  40. 一種結合子-藥物共軛物，其包含包括結合於腫瘤中細胞上之細胞表面蛋白的一或多個親和體序列且附接一或多個藥物-共軛物部分的多肽，該等藥物-共軛物部分如以下各式所示：
    Figure 03_image303
    其中 L1 表示間隔子或一鍵； SRS表示在腫瘤細胞外空間中表現之細胞外蛋白酶的受質識別序列； L2 表示自我分解型連接子或一鍵； DM表示藥物部分； m表示整數1至6，較佳1、2或3；且 n表示整數1至500，更佳1至100、1至10或1至5。
  41. 如請求項40之結合子-藥物共軛物，其中該親和體序列為PD-L1結合部分。
  42. 如請求項41之結合子-藥物共軛物，其中該PD-L1結合部分為以1×10-6 M或更低之Kd結合於PD-L1，且抑制其結合之PD-L1與PD-1的相互作用的親和體多肽序列。
  43. 如請求項41或42之結合子-藥物共軛物，其中該結合PD-L1之親和體多肽具有以下通式(I)中表示之胺基酸序列： FR1-(Xaa)n -FR2-(Xaa)m -FR3(I) 其中 FR1為由MIPGGLSEAK PATPEIQEIV DKVKPQLEEK TNETYGKLEA VQYKTQVLA(SEQ ID No. 1) 表示之多肽序列或與其具有至少70%同源性之多肽序列； FR2為由GTNYYIKVRA GDNKYMHLKV FKSL(SEQ ID No. 2) 表示之多肽序列或與其具有至少70%同源性之多肽序列； FR3為由EDLVLTGYQV DKNKDDELTG F(SEQ ID No. 3) 表示之多肽序列或與其具有至少70%同源性之多肽序列；且 Xaa每次出現時個別地為胺基酸殘基；且 n及m各獨立地為整數3至20。
  44. 如請求項41或42之結合子-藥物共軛物，其中該結合PD-L1之親和體多肽具有以下通式中表示之胺基酸序列： MIP-Xaa1-GLSEAKPATPEIQEIVDKVKPQLEEKTNETYGKLEAVQYKTQVLA-(Xaa)n -Xaa2-TNYYIKVRAGDNKYMHLKVF-Xaa3-Xaa4-Xaa5-(Xaa)m -Xaa6-D-Xaa7-VLTGYQVDKNKDDELTGF(SEQ ID No. 4) 其中 Xaa每次出現時個別地為胺基酸殘基； n及m各獨立地為整數3至20； Xaa1為Gly、Ala、Val、Arg、Lys、Asp或Glu； Xaa2為Gly、Ala、Val、Ser或Thr； Xaa3為Arg、Lys、Asn、Gln、Ser或Thr； Xaa4為Gly、Ala、Val、Ser或Thr； Xaa5為Ala、Val、Ile、Leu、Gly或Pro； Xaa6為Gly、Ala、Val、Asp或Glu；且 Xaa7為Ala、Val、Ile、Leu、Arg或Lys。
  45. 如請求項41或42之結合子-藥物共軛物，其中該結合PD-L1之親和體多肽具有以下通式中表示之胺基酸序列：
    Figure 03_image305
    其中 Xaa每次出現時個別地為胺基酸殘基；且 n及m各獨立地為整數3至20。
  46. 如前述請求項中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該結合PD-L1之親和體多肽具有選自SEQ ID No. 76至84之胺基酸序列，或與其具有至少70%同源性之胺基酸序列。
  47. 如請求項41至46中任一項之結合子-藥物共軛物，其中至少一個藥物-共軛物部分經由引入該親和體序列中，較佳與FR1、FR2及/或FR3對應之該親和體序列區域之部分中的半胱胺酸之硫醇側鏈附接於該親和體序列。
  48. 如請求項41至47中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該親和體與PD-L1之結合(a)在混合淋巴細胞反應(MLR)分析法中增加T細胞增殖；(b)在MLR分析法中增加干擾素-γ產生；及/或(c)在MLR分析法中增加介白素-2 (IL-2)分泌。
  49. 如請求項41至48中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該親和體為包含選自由以下組成之群的延長半衰期之多肽部分的融合蛋白之一部分：Fc結構域或其一部分、白蛋白或其一部分、結合白蛋白之多肽部分、運鐵蛋白或其一部分、結合運鐵蛋白之多肽部分、纖網蛋白或其一部分或結合纖網蛋白之多肽部分。
  50. 如請求項41至49中任一項之結合子-藥物共軛物，其中L1 為烴(直鏈或環狀)，諸如6-順丁烯二醯亞胺基己醯基、順丁烯二醯亞胺基丙醯基及順丁烯二醯亞胺基甲基環己烷-1-甲酸酯，或L1 為N-丁二醯亞胺基4-(2-吡啶基硫基)戊酸酯、N-丁二醯亞胺基4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸酯、N-丁二醯亞胺基(4-碘-乙醯基)胺基苯甲酸酯，或L1 為聚醚，諸如聚(乙二醇)。
  51. 如請求項50之結合子-藥物共軛物，其中該親和體包括具有游離硫醇之半胱胺酸，且L1 為經由順丁烯二醯亞胺部分與該硫醇基偶合之聚(乙二醇)，L1 如下式中所示：
    Figure 03_image307
    其中p表示整數1至100，較佳6至50，更佳6至12。
  52. 如請求項50之結合子-藥物共軛物，其中該親和體包括具有游離硫醇之半胱胺酸，且L1 為經由順丁烯二醯亞胺部分與該硫醇基偶合之烴部分，L1 可如下式中所示：
    Figure 03_image309
    其中p表示整數1至20，較佳1至4。
  53. 如前述請求項41至52中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該受質識別序列由絲胺酸蛋白酶、金屬蛋白酶或半胱胺酸蛋白酶裂解。
  54. 如請求項53之結合子-藥物共軛物，其中該蛋白酶在患者中之腫瘤組織中細胞外存在的水準比其在患者中之非腫瘤組織的水準大至少2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍或甚至100倍。
  55. 如請求項53之結合子-藥物共軛物，其中該蛋白酶在患者中之腫瘤組織中細胞外存在的水準比其在該患者之其他組織大至少2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍或甚至100倍。
  56. 如請求項41至55中任一項之結合子-藥物共軛物，其中蛋白酶為選自以下之基質金屬蛋白酶：膜結合之基質金屬蛋白酶(諸如MMP14-17及MMP24-25)或分泌之基質金屬蛋白酶(諸如MMP1-13及MMP18-23及MMP26-28)，較佳為MMP1、MMP2、MMP3、MMP4、MMP9、MMP11、MMP13、MMP14、MMP17或MMP19，更佳為MMP2、MMP9或MMP14。
  57. 如請求項41至55中任一項之結合子-藥物共軛物，其中蛋白酶為A解整合素及金屬蛋白酶(ADAM)，或具有血小板反應蛋白模體之A解整合素或金屬蛋白酶(ADAMTS)。
  58. 如請求項41至55中任一項之結合子-藥物共軛物，其中蛋白酶為豆莢蛋白、間質蛋白酶(MT-SP1)、嗜中性白血球彈性蛋白酶、TMPRSS、凝血酶、u型纖維蛋白溶酶原活化因子(uPA，亦稱為尿激酶)、PSMA或CD10 (CALLA)。
  59. 如請求項41至55中任一項之結合子-藥物共軛物，其中蛋白酶為脯胺酸後裂解蛋白酶，諸如纖維母細胞活化蛋白α (FAPα)。
  60. 如請求項41至55中任一項之結合子-藥物共軛物，其中受質識別序列由纖維母細胞活化蛋白α (FAPα)裂解且如下所示：
    Figure 03_image311
    其中 R2 表示H或(C1 -C6 )烷基，且較佳為H； R3 表示H或(C1 -C6 )烷基，較佳為甲基、乙基、丙基或異丙基，且更佳甲基； R4 不存在或表示(C1 -C6 )烷基、-OH、-NH2 或鹵素； X表示O或S；且 若L2 為自我分解型連接子，則-NH-表示作為L2 之部分的胺，或若L2 為一鍵，則為DM之部分。
  61. 如請求項41至55或60中任一項之結合子-藥物共軛物，其中L2 為選自由以下組成之群的自我分解型連接子：-NH-(CH2 )4 -C(=O)-、-NH-(CH2 )3 -C(=O)-、對胺基苄氧羰基(PABC)及2,4-雙(羥基甲基)苯胺。
  62. 如請求項41至61中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分之該藥理學作用視該游離藥物部分為細胞可滲透而定，而當作為該結合子-藥物共軛物之一部分時該藥物部分實質上不可滲透細胞。
  63. 如請求項41至61中任一項之結合子-藥物共軛物，其中共價連接於L1 實質上使該藥物部分之該藥理學作用減弱。
  64. 如請求項41至61中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分為免疫調節劑。
  65. 如請求項64之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分為免疫活化劑。
  66. 如請求項64之結合子-藥物共軛物，其中該游離藥物部分誘導先天性免疫路徑。
  67. 如請求項64至66中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該免疫調節劑為抑制DPP8及DPP9之酶活性且誘發巨噬細胞之細胞焦亡的免疫-DASH抑制劑。
  68. 如請求項64至66中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該免疫調節劑為STING促效劑。
  69. 如請求項64至66中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該免疫調節劑為RIG-1促效劑。
  70. 如請求項64至66中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該免疫調節劑為類鐸受體(TLR)促效劑，諸如選自由TLR1/2促效劑、TLR2促效劑、TLR3促效劑、TLR4促效劑、TLR5促效劑、TLR6/2促效劑、TLR7促效劑、TLR7/8促效劑、TLR7/9促效劑、TLR8促效劑、TLR9促效劑及TLR11促效劑組成之群，較佳選自由TLR3促效劑、TLR7促效劑、TLR7/8促效劑及TLR9促效劑組成之群。
  71. 如請求項41至61中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分對癌症相關纖維母細胞(CAF)具有細胞毒性。
  72. 如請求項41至61中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分使腫瘤相關巨噬細胞偏向M1巨噬細胞或抑制M2巨噬細胞之免疫抑制活性。
  73. 如請求項41至61中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分加速T細胞激活及/或樹突狀細胞遷移。
  74. 如請求項41至61中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該藥物部分諸如藉由阻斷免疫抑制功能或遷移至淋巴結及/或腫瘤微環境而抑制或耗竭Treg細胞。
  75. 如請求項41至61中任一項之結合子-藥物共軛物，其中當全身給與時該結合子-藥物共軛物之治療指數比該游離藥物部分之治療指數大至少5倍，更佳大至少10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、75倍或甚至100倍。
  76. 如請求項41至75中任一項之結合子-藥物共軛物，其中該免疫調節劑為分子量小於5000 amu、較佳小於2500 amu之低分子量抑制劑。
  77. 一種組合PD-L1抑制劑/先天性免疫刺激劑，其包含結合PD-L1之多肽及作為先天性免疫反應之無菌誘導劑(諸如免疫-DASH抑制劑、STING促效劑、TRL7/8促效劑或RIG-1促效劑)的與其共軛之藥物部分，其中相對於患者之其他組織，該結合PD-L1之多肽引起PD-L1抑制劑/先天性刺激劑累積在腫瘤中，且其中相對於患者之其他組織，該藥物部分在腫瘤微環境中自該結合PD-L1之多肽選擇性釋放。
  78. 一種適合於在人類患者中治療性使用之醫藥製劑，其包含(i)如請求項1至76中任一項之結合子-藥物共軛物或如請求項77之組合PD-L1抑制劑/先天性刺激劑，及(ii)一或多種醫藥學上可接受之賦形劑、緩衝劑、鹽或其類似物。
  79. 一種如請求項78之醫藥製劑之用途，其用作罹患癌症之患者之治療的一部分。
  80. 如請求項79之醫藥製劑之用途，其中該治療包括向該患者投與PGE2抑制劑。
  81. 一種用於殺死AML細胞之結合子-藥物共軛物，其包含：(i)結合於在AML細胞上選擇性表現之細胞表面特徵(諸如CD33或CD123)的細胞結合部分，該細胞表面特徵當由該結合子-藥物共軛物結合時由AML細胞內化；(ii)免疫-DASH抑制劑部分，當自該共軛物釋放，呈游離免疫-DASH抑制劑時，其對該等AML細胞具有毒性；以及(iii)將該細胞結合部分共價連接於該I-DASH抑制劑部分之連接部分，該連接部分包括藉由該等AML細胞中細胞內存在之酶(諸如組織蛋白酶)可裂解的受質識別序列，其中在結合該細胞表面特徵時AML細胞對該結合子-藥物共軛物之內化使該連接部分暴露於細胞內酶且使該連接部分裂解，且在該等AML細胞中細胞內釋放該游離免疫-DASHG部分。
  82. 一種結合子-藥物共軛物，其包含AML細胞結合部分(諸如CD33結合子或CD123結合子)且附接一或多個藥物-共軛物部分，該等藥物-共軛物部分如下式中所示：
    Figure 03_image313
    其中 L1 表示間隔子或一鍵； SRS表示在該等AML細胞中表現之細胞內蛋白酶的受質識別序列； L2 表示自我分解型連接子或一鍵； DM表示免疫-DASH抑制劑部分； m表示整數1至6，較佳1、2或3；且 n表示整數1至500，更佳1至100、1至10或1至5。
  83. 一種適合於在人類患者中作為AML治療之一部分治療性使用之醫藥製劑，其包含(i)如請求項80或18中任一項之結合子-藥物共軛物，及(ii)一或多種醫藥學上可接受之賦形劑、緩衝劑、鹽或其類似物。
  84. 一種如請求項82之醫藥製劑之用途，其用作罹患AML之患者之治療的一部分。
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