RU2787584C1 - Штамм дрожжей Komagataella phaffii с инактивированным геном HIS4 - реципиент для конструирования безмаркерных штаммов-продуцентов гетерологичных белков - Google Patents

Штамм дрожжей Komagataella phaffii с инактивированным геном HIS4 - реципиент для конструирования безмаркерных штаммов-продуцентов гетерологичных белков Download PDF

Info

Publication number
RU2787584C1
RU2787584C1 RU2022127026A RU2022127026A RU2787584C1 RU 2787584 C1 RU2787584 C1 RU 2787584C1 RU 2022127026 A RU2022127026 A RU 2022127026A RU 2022127026 A RU2022127026 A RU 2022127026A RU 2787584 C1 RU2787584 C1 RU 2787584C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
phaffii
vkpm
strain
transformants
marker
Prior art date
Application number
RU2022127026A
Other languages
English (en)
Inventor
Артур Александрович Ткаченко
Татьяна Леонидовна Гордеева
Сергей Павлович Синеокий
Лариса Николаевна Борщевская
Татьяна Дмитриевна Федай
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт"
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт"
Application granted granted Critical
Publication of RU2787584C1 publication Critical patent/RU2787584C1/ru

Links

Abstract

Изобретение относится к области биохимии, в частности к штамму дрожжей Komagataella phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013 с инактивированным геном HIS4. Заявленное изобретение позволяет эффективно конструировать безмаркерный штамм дрожжей Komagataella phaffii для получения гетерологичных белков. 2 табл., 3 пр.

Description

Область техники
Изобретение относится к микробиологии и биотехнологии и касается получения ауксотрофного штамма-реципиента метилотрофных дрожжей Komagataella phaffii, пригодного для конструирования на его основе безмаркерных штаммов-продуцентов, способных синтезировать гетерологичные белки.
Уровень техники
В настоящее время метилотрофные дрожжи Komagataella phaffii (Pichia pastoris) широко используются в качестве экспрессионной системы для получения гетерологичных белков. Активное использование дрожжей K. phaffii в современных биотехнологических производствах связано с их преимуществами по сравнению с другими прокариотическими и эукариотическими системами экспрессии, к которым относятся: высокая скорость роста при ферментации с высокой плотностью клеток (что позволяет получить более высокий уровень продукции целевого белка), эффективная секреция белка, простота питательных сред и условий культивирования, возможность применения различных генетических манипуляций, способность осуществлять посттрансляционные модификации гетерологичных белков [Appl Microbiol Biotechnol, 2014, 98, 5301-5317].
Конструирование дрожжевых безмаркерных штаммов-продуцентов гетерологичных белков является необходимым условием их дальнейшего использования в современном биотехнологическом производстве. Для получения штаммов-продуцентов гетерологичных белков в настоящее время применяется стратегия мультикопийной интеграции экспрессионных кассет в геном K. phaffii. Для интеграции нескольких копий целевого гена применяют отбор трансформантов на средах, содержащих высокие концентрации антибиотиков.
Необходимость создания безмаркерных штаммов-продуцентов обусловлена определенными запретами на использование маркеров антибиотикорезистентности в крупных микробиологических производствах по соображениям их возможного нежелательного распространения среди микроорганизмов окружающей среды. Кроме того, обычно, продуценты конструируются с помощью последовательных хромосомных модификаций, при которых требуется проведение многократных интеграций генетического материала в хромосому, что вызывает ряд проблем, связанных с ограниченным набором селективных маркеров и законодательным ограничением на их применение. Поэтому конструирование штаммов-реципиентов, на основе которых возможно создавать безмаркерные штаммы-продуценты гетерологичных белков, является актуальным и практически значимым.
Активно используемыми в биотехнологии, а также применяющимися в качестве моделей для изучения метилотрофных дрожжей рода Komagataella, являются штаммы K. phaffii GS115 (his4) (Invitrogen, США), K. phaffii Х-33 (Invitrogen, США), K. phaffii KM71 (Invitrogen, США) и др.
В качестве ближайшего аналога заявляемого изобретения рассмотрим наиболее часто использующийся в научных исследованиях штамм метилотрофных дрожжей K. phaffii GS115 (his4) ВКПМ Y-2837. Данный штамм обладает фенотипом His-, что позволяет отбирать трансформанты на минимальной среде без добавления гистидина [Appl. Biochem Biotechnol, 2007, 142, 105-124]. Он широко используется в качестве экспрессионной системы в биотехнологии. Однако его использование для получения промышленно-ценных продуцентов гетерологичных белков ограничивается невысокой продуктивностью [Биотехнология, 2021, 37(4), 5-13] и коммерческим статусом, установленным компанией Invitrogen (США) [https://www.thermofisher.com/ru/ru/home/brands/invitrogen.html].
Технической проблемой, на решение которой направлено заявляемое изобретение является получение высокопродуктивных безмаркерных штаммов-продуцентов гетерологичных белков, таких как белки, обладающие ферментативной активностью, флуоресцентные белки, белки-гормоны и др.
Раскрытие сущности изобретения
Техническим результатом является получение штамма-реципиента, который даст возможность получать высокопродуктивные безмаркерные штаммы-продуценты гетерологичных белков.
Он достигается путем получения ауксотрофного по гистидину штамма дрожжей Komagataella phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013 - реципиента для конструирования безмаркерных штаммов-продуцентов гетерологичных белков.
Осуществление изобретения
Получение заявляемого штамма осуществляется путем инактивации в штамме дикого типа Komagataella phaffii ВКПМ Y-4287 [Биотехнология, 2021, 37(4), 5-13] нативного гена HIS4, кодирующего фермент гистидинолдегидрогеназу, который участвует в биосинтезе гистидина. Инактивация может быть осуществлена с использованием любой из известных генно-инженерных методик.
Штамм-реципиент депонирован в Биоресурсном Центре Всероссийская Коллекция Промышленных Микроорганизмов (БРЦ ВКПМ) НИЦ «Курчатовский институт» (117545 Москва, 1-ый Дорожный пр-д, д. 1) как Komagataella phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013.
Культурально-морфологические характеристики заявляемого штамма
При культивировании при температуре 28°С в течение 48 часов на агаризованной среде YP следующего состава (мас.%: пептон - 2, дрожжевой экстракт - 1, агар - 2, вода - остальное) с добавлением глюкозы (2 мас.%), клетки имеют овальную форму, 3-4 мкм в диаметре. Клетки почкуются, при этом почкование истинное, многостороннее. Истинного мицелия не образуют. Споруляция происходит при инкубации культуры на агаризованной среде следующего состава (мас.%): хлорид калия - 1.0, ацетат натрия - 0.5, глюкоза - 1.0, агар - 2.0, вода - остальное. Аски имеют тетраэдрическую форму, включают 4 аскоспоры.
На агаризованной среде YP с добавлением глюкозы (2 мас.%) колонии светло-бежевого цвета с ровным краем, матовой поверхностью, линзовидным профилем и пастообразной консистенцией. При росте в жидкой среде YP следующего состава (мас.%: пептон - 2, дрожжевой экстракт - 1, вода - остальное) с добавлением глюкозы (2 мас.%), при 28°С в течение 24 ч культивирования - жидкость мутная, осадок белый, коагуляции не наблюдается, пристеночных пленок не образует.
Физиолого-биохимические признаки
Штамм-реципиент способен к росту как в аэробных, так и в анаэробных условиях.
В качестве единственного источника углерода способен использовать метанол, этанол, глюкозу, глицерин, лактат, сукцинат, не способен ассимилировать мальтозу, сахарозу, ацетат, крахмал, лактозу.
Пример 1. Получение штамма K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013 с инактивированным геном HIS4
Заявленный штамм получают на основе штамма дикого типа K. phaffii ВКПМ Y-4287 путем инактивации гена HIS4, кодирующего гистидинолдегидрогеназу.
Инактивацию проводят с использованием системы геномного редактирования CRISPR-Cas9 [FEMS Yeast Research, 2017, 17(5)].
Методом Гиббсона [Nat Methods. 2009, 6(5), 343-345] конструируют плазмиду pGAP-sgRNA_his4-pTEF-Cas9-Km (фиг.1), содержащую следующие генетические элементы:
1. Последовательность НН - sgRNA_his4 - HDV, содержащая рибозим типа Hammerhead (НН) [Nature, 1994, 372(6501), 68-74] на 5'- конце, sgRNA_his4, которая нацелена на ген HIS4, и рибозим вируса гепатита дельта (HDV) [Nature, 1998, 395(6702), 567-574] на 3'- конце, под контролем дрожжевого GAP промотора.
2. Оптимизированную последовательность гена cas9, встроенную в единую рамку считывания с нуклеотидной последовательностью сигнала ядерной локализации большого Т-антигена SV40 [Cell Commun Signal, 2021, 19(60), 1-10], под контролем дрожжевого TEF промотора и CYC1 терминатора;
3. Дрожжевой селективный маркер kanR, под контролем дрожжевого TEF промотора, обуславливающий у дрожжей K. phaffii устойчивость к антибиотику генетицину (G418).
4. Последовательность CEN/ARS, обеспечивающая сохранение трансформируемой ДНК в клетках реципиентного штамма.
Полученную автономно реплицируемую плазмиду трансформируют в штамм K. phaffii ВКПМ Y-4287 методом электропорации.
Штамм K. phaffii ВКПМ Y-4287 предварительно выращивают в жидкой питательной среде YPD (мас.%: дрожжевой экстракт - 1, пептон - 2, глюкоза - 2, вода - остальное) до концентрации 1×108 клеток на 1 мл. Клетки центрифугируют, промывают в ледяной стерильной воде, а затем в ледяном растворе 1М сорбитола. Затем клетки инкубируют в 25 мМ растворе дитиотреитола в течение 15 минут и промывают в ледяном растворе 1М сорбитола. Обработанные таким образом клетки ресуспендируют в ледяном растворе 1 М сорбитола в концентрации 1-5×109 клеток на 1 мл. Аликвоту, объемом 40 мкл клеточной суспензии, переносят в охлажденный эппендорф, добавляют 400 нг ДНК экспрессионной интеграционной кассеты, и инкубируют во льду 5 минут. Смесь клеток и ДНК переносят в предварительно охлажденную кювету для электропорации. Электропорацию проводят при следующих условиях: 1,5 кВ, 400 Ом, 25uF. После электропорации добавляют 1 мл ледяного раствора 1М сорбитола.
Селекцию трансформантов ведут на агаризованной среде YP с добавлением глюкозы (2 мас.%) в течение 5 суток при температуре 30°С. В качестве селективного агента добавляют антибиотик G418 в количестве 600 мкг/мл.
Для инактивации гена HIS4 отобранные трансформанты пересевают 2 раза на среде YP с добавлением глюкозы (2 мас.%) и антибиотика G418 в количестве 600 мкг/мл.
Селекцию трансформантов с инактивированным геном HIS4 проводят по способности к росту на минимальной среде М9 с добавлением и без добавления в среду гистидина в количестве 50 мкг/мл. Состав среды М9 (мас.%): Na2HPO4 - 0,6; KH2PO4 - 0,3; NaCl - 0,05; NH4Cl - 0,1; MgSO4 7H2O - 0,065; агар - 2; глюкоза - 2; CaCl2 - 0,07; биотин, мг - 0,0002; кальций пантотенат - 0,04; фолиевая кислота - 0,0002; ниацин - 0,04; р-аминобензойная к-та - 0,02; пиридоксин гидрохлорид - 0,04; рибофлавин - 0,02; тиамин гидрохлорид - 0,04; борная кислота - 0,05; CuSO4 - 0,004; KJ - 0,01; FeCl3 - 0,02; натрий молибдат - 0,02; ZnSO4 - 0,04, вода - остальное. Отбирают трансформант, обладающий фенотипом His-, не способный расти на среде М9 без содержания гистидина.
Выщепление репликативной плазмиды pGAP-sgRNA_his4-pTEF-Cas9-Km из клеток трансформанта проводят путем его ферментации в течение 48 ч в жидкой питательной среде YP с добавлением 2% глюкозы. Далее клетки высевают на агаризованную питательную среду YP с добавлением глюкозы (2 мас.%). Инкубируют в течение 48 ч при 30°С. Полученные колонии реплицируют на чашку с агаризованной средой YP и 2% глюкозой без антибиотика G418 и аналогичную чашку с антибиотиком G418. Клон, потерявший плазмиду pGAP-sgRNA_his4-pTEF-Cas9-Km, отбирают по неспособности к росту на среде, содержащей антибиотик G418. Получают штамм с инактивированным геном HIS4.
Полученный штамм депонирован в Биоресурсном Центре Всероссийская Коллекция Промышленных Микроорганизмов (БРЦ ВКПМ) НИЦ «Курчатовский институт» (117545 Москва, 1-ый Дорожный пр-д, д. 1) как Komagataella phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013.
В приведенных примерах получения трансформантов на основе штамма K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013, в качестве репортерных гетерологичных белков были использованы ферменты, легко детектируемые в культуральной жидкости путем измерения их активности.
Пример 2. Получение трансформантов штамма дрожжей K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013, продуцирующих фитазу Citrobacter gillenii
Трансформанты штамма K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013, продуцирующие фитазу С. gillenii, получают трансформацией клеток этого штамма интегративной экспрессионной кассетой 1.
При конструировании интегративной экспрессионной кассеты 1 используют синтезированный ранее ген phyCg-op [FEMS Microbiology letters, 2021, 368, fnaa217], кодирующий фитазу С. gillenii [Genbank, № МТ157261].
Методом "фьюжн-пцр" [Gene., 1989, 15, 77(1), 61-68.] синтезируют кассету 1 (фиг. 2), в состав которой входят следующие генетические элементы:
1. Ген phyCg-op, кодирующий фитазу С. gillenii, встроенный в единую рамку считывания с нуклеотидной последовательностью сигнального пептида α-фактора, под контролем АОХ1 промотора;
2. Терминатор транскрипции ТТАОХ1;
3. Дрожжевой селективный маркер PpHIS4, комплементирующий у дрожжей K. phaffii мутацию в гене HIS4;
4. Область интеграции - 3' фрагмент нуклеотидной последовательности гена АОХ1.
Указанную интегративную экспрессионную кассету 1 трансформируют в штамм К. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013, который предварительно выращивают в жидкой питательной среде YP (мас.%: дрожжевой экстракт - 1, пептон - 2, вода - остальное) с добавлением глюкозы (2 мас.%) до концентрации 1×108 клеток на 1 мл. Клетки центрифугируют, промывают в ледяной стерильной воде, а затем в ледяном растворе 1М сорбитола. Затем клетки инкубируют в 25 мМ растворе дитиотрейтола в течение 15 минут и промывают в ледяном растворе 1М сорбитола. Далее клетки ресуспендируют в ледяном растворе 1 М сорбитола в концентрации 1-5×109 клеток на 1 мл. Аликвоту, объемом 40 мкл клеточной суспензии, переносят в охлажденный эппендорф, добавляют 400 нг ДНК экспрессионной интеграционной кассеты, и инкубируют во льду 5 минут. Смесь клеток и ДНК переносят в предварительно охлажденную кювету для электропорации. Электропорацию проводят при следующих условиях: 1,5 кВ, 400 Ом, 25uF. После электропорации добавляют 1 мл ледяного раствора 1М сорбитола.
Селекцию трансформантов ведут в течение 5 суток при температуре 30°С на минимальной агаризованной среде без содержания гистидина следующего состава (мас.%): Na2HPO4 - 0,6; KH2PO4 - 0,3; NaCl - 0,05; NH4Cl - 0,1; MgSO4 7H2O - 0,065; агар - 2; глюкоза - 2; СаС12 - 0,07; биотин, мг - 0,0002; кальций пантотенат - 0,04; фолиевая кислота - 0,0002; ниацин - 0,04; р-аминобензойная к-та - 0,02; пиридоксин гидрохлорид - 0,04; рибофлавин - 0,02; тиамин гидрохлорид - 0,04; борная кислота - 0,05; CuSO4 - 0,004; KJ - 0,01; FeCl3 - 0,02; натрий молибдат - 0,02; ZnSO4 - 0,04, вода - остальное. Отбирают произвольно по 10 трансформантов.
Наличие целевого гена в составе хромосомной ДНК полученных трансформантов определяют методом ПЦР с использованием праймеров PhyCg-op-F и PhyCg-op-R
PhyCg-op-F 5'- gacgaacaatctggtatgcaatt -3',
PhyCg-op-R 5'- ttacttttcagcacattcgct -3'.
Режим реакции ПЦР: 95°С - 3 мин - 1 цикл; 30 циклов: 95°С - 30 с, 56°С - 30 с, 72°С - 80 с; 72°С - 5 мин. - 1 цикл.
Наличие ПЦР-фрагмента размером 1233 п.н. подтверждает присутствие целевого гена в составе хромосомы полученных трансформантов.
Для сравнения продуктивности получают трансформанты штаммов K. phaffii GS115 Y-2837 и K. phaffii Y-4287, продуцирующие фитазу С. gillenii.
Трансформанты штамма K. phaffii GS115 Y-2837, продуцирующие фитазу С. gillenii, получают аналогично трансформантам штамма K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013 путем интеграции экспрессионной кассеты 1 в хромосому штамма K. phaffii GS115 Y-2837.
Трансформанты штамма K. phaffii Y-4287, продуцирующие фитазу С. gillenii, получают трансформацией клеток штамма K. phaffii Y-4287 интегративной экспрессионной кассетой, содержащей в своем составе ген phyCg-op, кодирующий фитазу С. gillenii, полученной аналогично и трансформированной как описано ранее [Биотехнология, 2021, 37(4), 5-13].
Для сравнения уровней продукции фитазы в штаммах K. phaffii GS 115 ВКПМ Y-2837, K. phaffii ВКПМ Y-4287 и K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013 проводят ферментацию десяти отобранных трансформантов каждого штамма, несущих в составе хромосомы ген, кодирующий фитазу С. gillenii. Ферментацию проводят при следующих условиях:
- Посевную культуру каждого трансформанта выращивают в пробирках (50 мл) с 5 мл жидкой питательной среды YP с добавлением глюкозы (2 мас.%) при 30°С в течение 24 ч на качалке (250 об/мин). Посев ферментационной среды осуществляют в соотношении 1/10.
- Ферментацию проводят при 30°С на качалке (250 об/мин) в питательной среде YP с добавлением 2% метанола в течение 2 суток.
Продуктивность трансформантов, несущих в составе хромосомы ген, кодирующий фитазу С. gillenii, оценивают по уровню активности фитазы в культуральной жидкости. Для этого по окончании ферментации клетки трансформантов осаждают центрифугированием, а в отделенном супернатанте определяют фитазную активность модифицированным методом Фиске-Субарроу [J Microbiol Methods, 1999, 39(1), 17-22].
В табл. 1 представлены продуктивности трансформантов штаммов K. phaffii GS115 ВКПМ Y-2837, K. phaffii ВКПМ Y-4287 и K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013, несущих в составе хромосомы ген, кодирующий фитазу С. gillenii, среднее значение продуктивности, рассчитанное для 10 трансформантов каждого штамма, и относительная продуктивность трансформантов.
Figure 00000001
Figure 00000002
Из данных, приведенных в таблице 1, следует, что среднее значение продуктивности трансформантов K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013 значительно превышает таковое для трансформантов K. phaffii GS115 ВКПМ Y-2837, а для трансформантов K. phaffii ВКПМ Y-4287 превышает на 16%.
Пример 3. Получение трансформантов штамма дрожжей K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013, продуцирующих амилазу Bacillus licheniformis
Трансформанты штамма K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013, продуцирующие амилазу В. licheniformis, получают трансформацией клеток этого штамма интегративной экспрессионной кассетой 2.
При конструировании интегративной экспрессионной кассеты 2 в качестве источника гена amyS [Genbank, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/CP093290.1?report=genbank&log$=nuclal ign&blast_rank=2&RID=B 3 RY15 3 T013], кодирующего амилазу В. licheniformis, используют тотальную геномную ДНК В. licheniformis ВКПМ В-10958. Синтезируют ДНК гена amyS методом ПЦР с использованием праймеров AmyS-F и AmyS-R:
AmyS-F 5'- gcaaatcttaatgggacgct -3',
AmyS-R 5'- tctttgaacataaattgaaa -3'.
Режим реакции ПЦР: 95°С - 3 мин - 1 цикл; 30 циклов: 95°С - 30 с, 57°С - 30 с, 72°С - 90 с; 72°С - 5 мин - 1 цикл.
Методом "фьюжн-пцр" [Gene., 1989, 15, 77(1), 61-68.] синтезируют экспрессионную кассету 2 (фиг. 3), в состав которой входят следующие генетические элементы:
1. Ген amyS, кодирующий амилазу В. licheniformis, встроенный в единую рамку считывания с нуклеотидной последовательностью сигнального пептида α-фактора, под контролем АОХ1 промотора;
2. Терминатор транскрипции ТТАОХ1;
3. Дрожжевой селективный маркер PpHIS4, комплементирующий у дрожжей K. phaffii мутацию в гене HIS4;
4. Область интеграции - 3' фрагмент нуклеотидной последовательности гена АОХ1.
Интегративную экспрессионную кассету 2 трансформируют в штаммы K. phaffii GS115 Y-2837 и K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013. Трансформацию экспрессионной кассеты 2 и селекцию трансформантов осуществляют, как описано в примере 1.
Наличие целевого гена в составе хромосомной ДНК полученных трансформантов определяют методом ПЦР с использованием праймеров AmyS-F и AmyS-R, описанных выше.
Для получения трансформантов контрольного штамма K. phaffii ВКПМ Y-4287, продуцирующих амилазу В. licheniformis, конструируют экспрессионную кассету 3.
При конструировании интегративной экспрессионной кассеты 3 используют последовательность гена amyS.
Методом "фьюжн-пцр" [Gene., 1989, 15, 77(1), 61-68] синтезируют экспрессионную кассету 3 (фиг. 4), в состав которой входят следующие генетические элементы:
1. Ген amyS, кодирующий амилазу В. licheniformis, встроенный в единую рамку считывания с нуклеотидной последовательностью сигнального пептида α-фактора, под контролем АОХ1 промотора;
2. Терминатор транскрипции ТТАОХ1;
3. Дрожжевой селективный маркер kanR, под контролем дрожжевого TEF промотора, обуславливающий у дрожжей K. phaffii устойчивость к антибиотику генетицину (G418);
4. Область интеграции - 3' фрагмент нуклеотидной последовательности гена АОХ1.
Интегративную экспрессионную кассету 3 трансформируют в штамм K. phaffii Y-4287. Трансформацию экспрессионной кассеты 3 и селекцию трансформантов осуществляют, как описано ранее [Биотехнология, 2021, 37(4), 5-13].
Наличие целевого гена в составе хромосомной ДНК полученных трансформантов определяют методом ПЦР с использованием праймеров AmyS-F и AmyS-R, описанных выше.
Для сравнения уровней продукции амилазы В. licheniformis в штаммах K. phaffii GS115 ВКПМ Y-2837, K. phaffii ВКПМ Y-4287 и K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013 проводят ферментацию десяти отобранных трансформантов каждого штамма с генами, кодирующими амилазу В. licheniformis. Ферментацию проводят, как описано в примере 1.
Определение активности амилазы в культуральной жидкости проводят с использованием ДНС метода [Anal. Chem., 1959, 31 (3), 426-428] в 96-луночном планшете следующим образом: в каждой лунке смешивают 25 мкл 1% раствора субстрата крахмала в 0,5 М ацетатном буфере (рН 6) и 25 мкл культуральной жидкости. Инкубацию проводят при 50°С 10 минут, после чего добавляют в лунку 50 мкл раствора ДНС. Планшет прогревают при 99°С 10 минут и измеряют оптическую плотность окрашенного раствора при длине волны 546 нм. В качестве стандарта используют раствор глюкозы.
В табл. 2 представлены продуктивности трансформантов штаммов K. phaffii GS115 ВКПМ Y-2837, K. phaffii ВКПМ Y-4287 и K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013, несущих в составе хромосомы ген, кодирующий амилазу В. licheniformis, среднее значение продуктивности, рассчитанное для 10 трансформантов каждого штамма, и относительная продуктивность трансформантов.
Figure 00000003
Figure 00000004
Из данных, приведенных в таблице 2, следует, что среднее значение продуктивности трансформантов K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013 значительно превышает таковое для трансформантов коммерческого штамма K. phaffii GS 115 ВКПМ Y-2837, а относительно трансформантов K. phaffii ВКПМ Y-4287 превышает на 14%.
Таким образом, полученные результаты показывают, что использование заявляемого штамма-реципиента приводит к получению безмаркерных штаммов с продуктивностью гетерологичных белков, значительно повышенной относительно родительского штамма K. phaffii ВКПМ Y-4287.
Отсутствие генов антибиотикорезистентности и повышенная продуктивность штаммов, получаемых на основе заявленного штамма K. phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013, расширяют возможность их дальнейшего использования в современном биотехнологическом производстве.

Claims (1)

  1. Штамм дрожжей Komagataella phaffii TGBF7 ВКПМ Y-5013 с инактивированным геном HIS4 - реципиент для конструирования безмаркерных штаммов-продуцентов гетерологичных белков.
RU2022127026A 2022-10-18 Штамм дрожжей Komagataella phaffii с инактивированным геном HIS4 - реципиент для конструирования безмаркерных штаммов-продуцентов гетерологичных белков RU2787584C1 (ru)

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2787584C1 true RU2787584C1 (ru) 2023-01-11

Family

ID=

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2016183163A1 (en) * 2015-05-11 2016-11-17 Impossible Foods Inc. Expression constructs and methods of genetically engineering methylotrophic yeast
WO2020232553A1 (en) * 2019-05-22 2020-11-26 Hyasynth Biologicals Inc. Methods and cells for production of phytocannabinoids and phytocannabinoid precursors
RU2756330C1 (ru) * 2021-01-22 2021-09-29 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов Национального исследовательского центра "Курчатовский институт" (НИЦ "Курчатовский институт" - ГосНИИгенетика) Трансформант дрожжей Komagataella phaffii, продуцирующий фитазу Cronobacter turicensis

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2016183163A1 (en) * 2015-05-11 2016-11-17 Impossible Foods Inc. Expression constructs and methods of genetically engineering methylotrophic yeast
WO2020232553A1 (en) * 2019-05-22 2020-11-26 Hyasynth Biologicals Inc. Methods and cells for production of phytocannabinoids and phytocannabinoid precursors
RU2756330C1 (ru) * 2021-01-22 2021-09-29 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов Национального исследовательского центра "Курчатовский институт" (НИЦ "Курчатовский институт" - ГосНИИгенетика) Трансформант дрожжей Komagataella phaffii, продуцирующий фитазу Cronobacter turicensis

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN105229154A (zh) 组成型启动子
US4816405A (en) Vectors for transformation by ascomycetes
US20160289690A1 (en) Mortierella alpina recombinant gene expression system and construction method and use thereof
CN112592881B (zh) 用于高效外源蛋白表达和高密度培养的工程枯草芽孢杆菌
JPH0773499B2 (ja) 組換えdna発現ベクタ−およびペニシリウム・クリソゲナムのイソペニシリンnシンセタ−ゼをコ−ドしているdna化合物
HU193516B (en) Process for cloning a thermostable gene coding alpha-amylase in e. coli and b. subtilis strains
Wang et al. Improved protein synthesis and secretion through medium enrichment in a stable recombinant yeast strain
RU2787584C1 (ru) Штамм дрожжей Komagataella phaffii с инактивированным геном HIS4 - реципиент для конструирования безмаркерных штаммов-продуцентов гетерологичных белков
RU2652877C9 (ru) Способ модификации дрожжей Schizosaccharomyces pombe с помощью Cre-lox системы бактериофага Р1, трансформант, полученный таким способом
RU2788528C1 (ru) Штамм дрожжей Komagataella phaffii с инактивированным геном LEU2 - реципиент для конструирования штаммов-продуцентов гетерологичных белков
JP4526638B2 (ja) タンパク質の高発現システム
RU2737623C1 (ru) Рекомбинантный штамм дрожжей Pichia pastoris с увеличенной продукцией фитазы Escherichia coli
WO2003016525A9 (fr) Procede de production d'alcool a partir d'amidon
JP6206408B2 (ja) シゾサッカロミセス・ポンベ変異体の形質転換体、およびクローニングベクター
CN111849790B (zh) 重组顶头孢霉工程菌及其构建方法和应用
CN112760338B (zh) 一种适用于深海真菌FS140的CRISPR/Cpf1载体及其构建方法和应用
JP3443605B2 (ja) 間性ヘテロ接合フィコマイセス
RU2751595C2 (ru) Рекомбинантный штамм дрожжей Pichia pastoris - продуцент фитазы Escherichia coli
KR100545563B1 (ko) 재조합 단백질 생산 능력이 향상된 사카로마이세스세레비지애 변이주
RU2728243C1 (ru) Штамм дрожжей Pichia pastoris, продуцирующий ксиланазу из Paenibacillus brasilensis
CN114806992B (zh) 一种rsh过表达基因工程淀粉酶产色链霉菌及提高丰加霉素发酵产量的方法
US7550281B2 (en) Method for production of alpha-amylase in recombinant Bacillus
KR102613937B1 (ko) 갈락토스 이용에 관여하는 모든 유전자가 결손된 효모 균주 및 이를 이용한 재조합 단백질 생산방법
US20210355434A1 (en) Methods of Producing Cannabinoids
RU2736441C1 (ru) Штамм дрожжей Komagataella kurtzmanii, продуцирующий бета-глюканазу из Bacillus pumilus и бета-глюканазу из Paenibacillus jamilae