RU2756474C1 - Тест-система для обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени - Google Patents

Тест-система для обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени Download PDF

Info

Publication number
RU2756474C1
RU2756474C1 RU2021114811A RU2021114811A RU2756474C1 RU 2756474 C1 RU2756474 C1 RU 2756474C1 RU 2021114811 A RU2021114811 A RU 2021114811A RU 2021114811 A RU2021114811 A RU 2021114811A RU 2756474 C1 RU2756474 C1 RU 2756474C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
cov
sars
virus
rna
animals
Prior art date
Application number
RU2021114811A
Other languages
English (en)
Inventor
Анна Михайловна Тимина
Анастасия Сергеевна Яковлева
Алексей Владимирович Щербаков
Илья Александрович Чвала
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ")
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ")
Priority to RU2021114811A priority Critical patent/RU2756474C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2756474C1 publication Critical patent/RU2756474C1/ru

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6804Nucleic acid analysis using immunogens

Abstract

Изобретение относится к ветеринарной вирусологии, а именно к средствам молекулярной диагностики. Разработана высокочувствительная тест-система, состоящая из ОТ-ПЦР смеси, Taq-ДНК-полимеразы, обратной транскриптазы, положительного контроля и отрицательного контроля, позволяющая в кратчайшие сроки обнаруживать РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды. Разработаны олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченый зонд для амплификации и детекции участка гена N вируса SARS-CoV-2:
Figure 00000005
Изобретение может быть использовано для выявления РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды с целью постановки и уточнения диагноза в клинической и лабораторной диагностике в ветеринарии. 1 з.п. ф-лы, 1 ил., 3 табл., 3 пр.

Description

Изобретение относится к ветеринарной вирусологии, к средствам молекулярной диагностики, а именно к выявлению РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды.
Новый коронавирус SARS-CoV-2 вызывает тяжелую форму пневмонии у людей (COVID-19), подобную MERS-CoV и SARS-CoV. Он относится к семейству РНК-содержащих вирусов семейства Coronaviridae, линии Beta-CoVB.
Первые случаи заболевания человека пневмонией неизвестного происхождения были зарегистрированы в декабре 2019 года в городе Ухань китайской провинции Хубэй. Новый коронавирус был выделен из эпителиальных клеток дыхательных путей человека и идентифицирован как возбудитель заболевания. В настоящее время подавляющее большинство стран мира сообщили о случаях заболевания людей, и Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) объявила событие COVID-19 пандемией (2).
Пациенты с COVID-19 проявляют яркие клинические симптомы, такие как лихорадка, сухой кашель, одышка, ринорея, ангина, интерстициальные инфильтраты в легких (3).
Считается, что предшественником SARS-CoV-2 является короновирус летучих мышей (rhinolophus sinicus). От летучих мышей к человеку вирус перешел через промежуточного хозяина, установить которого пока не удалось. Глобальное распространение SARS-CoV-2 не ограничилось человеческой популяцией. В настоящее время имеется много сообщений о случаях обнаружения вируса SARS-CoV-2 у животных: норок, собак, кошек, тигров и львов. Опыты по экспериментальному заражению показали, что хорьки и кошки очень восприимчивы к SARS-CoV-2 и могут передавать вирус от инфицированных здоровым животным контактным или воздушно-капельным путем (1, 4).
Восприимчивость животных к SARS-CoV-2, вероятно, объясняется тем, что рецептором SARS-CoV-2 является клеточный ангиотензинпревращающий фермент 2 (АСЕ2), который почти идентичен или похож у человека и таких видов животных, как куньи, кошачьи, свиньи и обезьяны. Таким образом, существует потенциальная возможность формирования резервуара SARS-CoV-2 в популяции домашних животных, и эпидемиологический надзор за COVID-19 должен предусматривать и диагностические и мониторинговые исследования домашних животных.
Рекомендованным методом специфической лабораторной диагностики COVID-19 является выявление РНК SARS-CoV-2 методом ПНР. Благодаря высокой чувствительности и специфичности метод ПНР является идеальным для первичного скрининга.
Целью изобретения является создание тест-системы для обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды.
На сегодняшний день разработано достаточное количество тест-систем, для выявления возбудителя SARS-CoV-2 у людей, однако они не предназначены для анализа биоматериала от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды.
Таким образом, разработка надежного чувствительного и специфичного метода обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды является актуальной технической проблемой. Для ее решения была создана тест-система ПЦР-РВ, содержащая специфичные олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченный олигонуклеотидный зонд, а также осуществлен подбор условий проведения исследований с помощью разработанного диагностикума, обеспечивающий минимальный риск контаминации тестируемых образцов и исключающих субъективность при оценке результатов.
Изобретение относится к тест-системе для специфичной идентификации РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды методом ПНР в режиме реального времени, состоящей из смеси олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченного зонда, фермента Taq-полимеразы, обратной транскриптазы, положительного контроля и отрицательного контроля.
Флуоресценцию измеряют по каналу ROX. Пересечение кривой флуоресценции и линии порогового цикла (Ct), свидетельствует о наличии в образце РНК вируса SARS-CoV-2, причем, чем меньше показатель Ct, тем выше концентрация РНК вируса SARS-CoV-2 в исследуемом образце. Отсутствие пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией свидетельствует об отсутствии РНК вируса SARS-CoV-2 в тестируемом материале.
Представленный метод включает последовательности олигонуклеотидов, специфичные только для вируса SARS-CoV-2 и имеющие следующую нуклеотидную последовательность:
Forward GGACCCCAAAATCAGCGAAA
Reverse CTGGTTACTGCCAGTTGAATC
probe ROX CACCCCGCATTACGTTTGGTGGAC BHQ2
Изобретение может быть использовано для выявления РНК вируса SARS-CoV-2 в пробах биологического материала от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды с целью проведения клинической и лабораторной диагностики, а также научно-исследовательских работ в области ветеринарии.
Техническим результатом изобретения является: высокая специфичность в отношении всех возможных генетических вариантов вируса SARS-CoV-2, широкий спектр пригодного для проведения исследований биологического материала от животных (смывы со слизистых оболочек носовой и ротовой полости, внутренние органы, сыворотка крови, цельная кровь, культура клеток), пищевых продуктов и объектов окружающей среды, без риска получения ложноположительных результатов; минимальные требования для постановки ПЦР-РВ, что дает возможность использования широкого спектра амплификаторов; сокращение времени тестирования проб на наличие РНК вируса SARS-CoV-2, в том числе и при проведении массовых исследований; расширение арсенала средств диагностики Covid-19.
Сущность изобретения заключается в том, что тест-система способна выявлять РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды. Высокая степень специфичности тест-системы подтверждена с помощью лабораторных исследований на панели проб гомологичных и гетерологичных вирусов.
Сущность изобретения пояснена на графическом изображении, на котором показана специфичность тест-системы, проверенная на нескольких видах вирусов:
1 - принадлежащих к семейству Coronaviridae (вирус SARS-CoV-2, вирус трансмиссивного гастроэнтерита свиней (ТГС), вирус эпизоотической диареи свиней (ЭДС), респираторный коронавирус свиней (РКВС), коронавирус КРС, вирус инфекционного бронхита кур (ИБК));
2 - на гетерологичных вирусах с/х животных: вирус репродуктивно-респираторного синдрома свиней (РРСС), парвовирус свиней (ПВС), цирковирус свиней типа 2 (ЦВС2), вирус болезни Ауески (ВБА), вирус инфекционной бурсальной болезни (ИББ), вирус гриппа А, вирус инфекционного ринотрахеита (ИРТ), вирус парагриппа-3 (ПГ3) и на РНК/ДНК, выделенной из тканей свиней, КРС, кур. Положительная реакция наблюдалась только с РНК вируса SARS-CoV-2, что свидетельствует о специфичности метода (Фиг. 1).
Детекция продуктов амплификации осуществляется методом регистрации флуоресценции, генерируемой в результате разрушения гибридизационного зонда, находящегося на 5'-конце флуорофора ROX, а на 3'-конце - гасителя BHQ2. В отсутствии мишени флуорофор и гаситель сближены, и наблюдается лишь незначительная флуоресценция, так как гаситель поглощает испускаемое флуорофором излучение. При накоплении в ходе ПЦР специфических продуктов зонд гибридизируется на ампликон, что ведет к его разрушению за счет 5'-экзонуклеазной активности Taq-полимеразы. В результате флуорофор отделяется от гасителя и его излучение может быть детектировано. Таким образом, увеличение флуоресценции прямо пропорционально количеству синтезированного ПЦР-продукта.
Для разработки праймеров, из базы данных GenBank были получены полногеномные последовательности коронавирусов. Последовательности выравнивали, затем визуально оценивали консервативные участки, на основе которых были получены ряд праймеров. В результате тестирования при различных параметрах была получена оптимальная пара праймеров и зонда, которые используются в тест-системе.
Набор для выявления РНК вируса SARS-CoV-2 в ПЦР-РВ состоит из следующих компонентов:
№1 ОТ-ПЦР-смесь, объем 1,100 см3 - 1 пробирка;
№2 фермент Taq ДНК-полимераза, объем 0,015 см3 - 1 пробирка;
№3 фермент M-MLV-ревертаза, объем 0,030 см3 - 1 пробирка;
№4 положительный контроль, объем 0,100 см3 - 1 пробирка;
№5 отрицательный контроль, объем 0,100 см3 - 1 пробирка.
В качестве отрицательного контроля используется деионизованная вода, а в качестве положительного контроля - плазмидная ДНК, содержащая вставку фрагмента гена N вируса SARS-CoV-2.
ПЦР в режиме реального времени с обратной транскрипцией проводится в программируемом амплификаторе в одну стадию с использованием смеси, включающей на одну реакцию: ОТ-ПЦР-смесь (№1), ферментов Taq-ДНК-полимеразы (№2) и обратной транскриптазы (№3). Перед началом постановки реакции необходимо разморозить все компоненты реакции (за исключением ферментов), встряхнуть их на шейкере, затем центрифугировать несколько секунд на низкоскоростной центрифуге.
Смесь для проведения реакции готовят в пробирке в расчете на одну реакцию (V=25 мкл) следующим образом:
- ОТ-ПЦР-смесь №1 20 мкл,
- фермент Taq-ДНК-полимераза №2 0,25 мкл,
- фермент M-MLV-ревертаза №3 0,5 мкл
Приготовленную в отдельных 1,5 мл пробирках смесь для проведения реакции переносят по 20 мкл в 0,2 мл пробирки и вносят 5 мкл суммарной РНК, выделенной из анализируемых проб. В соответствующие пробы вносят также образцы отрицательного и положительного контролей. Общий объем смеси - 25 мкл.
Пробирки устанавливают в амплификатор для постановки ПЦР в режиме реального времени, отмечают в программе расположение и характеристику проб, выбирают рабочий краситель (ROX), устанавливают в программе температурно-временной профиль реакции.
Программирование амплификатора осуществляется согласно инструкции производителя. Подобран режим термического профиля, который должен соответствовать показателям, описанным в таблице 1: обратная транскрипция 42°С - 15 мин, денатурация при 95°С в течение 5 мин и термического циклирования при 95°С - 15 сек., 55°С - 15 сек; 72°С - 20 сек - 40 циклов.
Результаты интерпретируют на основании наличия или отсутствия пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией, что соответствует наличию или отсутствию значения порогового цикла «Ct» в соответствующей графе в таблице результатов реакции, выведенной в результате машинного анализа.
Если регистрируемое значение Ct≤35, результат обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 считается положительным.
Если значение Ct не регистрируется, результат обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 считается отрицательным.
Если регистрируемое значение Ct находится в пределах от 35 до 40, результат обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 считается сомнительным и подлежит повторному исследованию. Если при проведении повторного исследования регистрируемое значение Ct≤40, результат обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 считается положительным; если значение Ct не регистрируется, результат обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 считается отрицательным.
Результат считается достоверным только в случае, если:
- для положительного контроля амплификатором на канале ROX регистрируется значение порогового цикла амплификации - Ct≤30;
- для отрицательного контроля амплификатором не регистрируется какого-либо значения порогового цикла на канале ROX.
Результат считается недостоверным (не подлежат учету) в случае, если: для образца положительного контроля регистрируется значение Ct>30;
- для образца отрицательного контроля регистрируется какое-либо значение Ct.
Сущность предлагаемого изобретения пояснена примерами его использования, которые не ограничивают объем изобретения.
Пример 1. Оценка специфичности тест-системы.
Специфичность метода была проверена на нескольких видах вирусов, принадлежащих к семейству Coronaviridae (вирус SARS-CoV-2, вирус ТГС, вирус ЭДС, респираторный коронавирус свиней, коронавирус КРС, вирус инфекционного бронхита кур), других вирусах с/х животных (РРСС, ПВИС, ЦВС-2, ВБА, ИББ, гриппа А, ИРТ, ПГ-3), а также на РНК/ДНК, выделенной из тканей свиней, КРС, кур. Положительная реакция наблюдалась только с РНК вируса SARS-CoV-2, что свидетельствует о специфичности метода (табл. 2). Полученные данные приведены на графическом изображении (Фиг. 1).
Из таблицы 2 видно, что разработанная тест-система специфично выявляет вирус SARS-CoV-2.
Работу с нуклеиновой кислотой проводили в условиях, регламентированных МУ 1.3. 2569-09 «Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности» (5).
Процедуру выделения нуклеиновых кислот из исследуемого материала проводили с использованием 6М гуанидинтиоцианата и стекловолокнистых фильтров GF/F (6).
ПЦР в режиме реального времени и регистрацию результатов проводили в приборе по описанной выше программе.
Результаты интерпретировали на основании наличия (или отсутствия) пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линии, что соответствует наличию (или отсутствию) значения порогового цикла Ct в соответствующей графе в таблице результатов. Результат считали положительным в случае, если кривая накопления флуоресценции для соответствующего образца имела характерную «сигмовидную» форму и пересекала пороговую линию.
При тестировании специфичности тест-системы с использованием нуклеиновых кислот различных видов вирусов семейства Coronaviridae и гетерологичных вирусов ложноположительных и ложноотрицательных результатов не выявлено (табл. 2).
Пример 2. Оценка чувствительности тест-системы.
Для определения чувствительности исследовали серию последовательных 10-кратных разведений РНК вируса SARS-CoV-2.
Чувствительность определяли как процентное отношение положительных результатов (полученных при использовании предлагаемой тест-системы) к общему количеству исследований. Определение чувствительности осуществляли по формуле:
Se = (ИП/(ИП+ЛО)) × 100%,
где: Se - чувствительность тест-системы;
ИП - истинноположительный результат,
ЛО - ложноотрицательный результат.
Все исследованные пробы с наличием РНК вируса SARS-CoV-2 показали в предлагаемой тест-системе положительный результат (табл. 3). Таким образом, рассчитанная чувствительность предлагаемой тест-системы составила 100%
Пример 3. Оценка воспроизводимости тест-системы.
При определении воспроизводимости исследовали одну положительную и одну отрицательную пробу в 10 повторностях, выполненных при измененных условиях измерения: одним исследователем в параллельных исследованиях в течение разных дней (10 дней) и двумя разными исследователями в параллельных исследованиях (в 10 повторах). Для определения сходимости учитывали степень близости результатов последовательных измерений одной и той же пробы. Для предлагаемой тест-системы воспроизводимость была абсолютна, т.е. положительная проба всегда показывала положительный результат, а отрицательная проба - отрицательный результат.
Таким образом, предлагаемое изобретение может быть использовано в ветеринарной практике для выявления РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды с целью постановки и уточнения диагноза, для решения научно-исследовательских задач, проведения мониторинга распространения вируса SARS-CoV-2 у животных. Полученные характеристики тест-системы соответствуют критериям, предъявляемым к качественным лабораторным методам исследования.
Источники информации, принятые во внимание при составлении описания изобретения к заявке на выдачу патента РФ на изобретение «Тест-система для обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени».
1. Bats, pangolins, minks and other animals - villains or victims of SARS-CoV-2? / B. do Valel, A. P. Lopes, M. da Conceicao Fontes [et al.] // Veterinary Research Communications (2021) https://doi.org/10.1007/s11259-021-09787-2.
2. Diagnosis of the Coronavirus disease (COVID-19): rRT-PCR or CT / C. Long, H. Xu, Q. Shen, [et al.] // European Journal of Radiology 126 (2020) https://doi.org/10.1016/j.ejrad.2020.108961.
3. Featuring COVID-19 cases via screening symptomatic patients with epidemiologiclink during flu season in a medical center ofcentral Taiwan / W. Hsih, M. Cheng, M. Ho [et al.] // Journal of Microbiology, Immunology and Infection (article in press) https://doi.org/10.1016/j.jmii.2020.03.008.
4. SARS-CoV-2 host diversity: An update of natural infections and experimental evidence / G. Hossain, A. Javed, S. Akter [et al] // Journal of Microbiology, Immunology and Infection (2021) 54, 175el81.
5. МУ 1.3.2569-09 Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности.
6. Использование аэросила А-300 и фильтров GF/F (GF/C) для очистки фрагментов ДНК, ДНК-плазмид и РНК / Грибанов О.Г., Щербаков А.В., Перевозчикова Н.А. [и др.] // Биохимия. - 1996. - Т. 21, №6. - С. 1064-1070.
Figure 00000001
Figure 00000002
Figure 00000003

Claims (4)

1. Тест-система для обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, включающая ОТ-ПЦР смесь, содержащую олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченный зонд для амплификации и детекции участка гена N вируса SARS-CoV-2:
Figure 00000004
фермент Taq-ДНК-полимеразу, обратную транскриптазу, положительный контроль, отрицательный контроль; отличающаяся тем, что используются олигонуклеотидные праймеры и зонд в реакции ПЦР в режиме реального времени, состоящей из следующих этапов: обратная транскрипция 42°С - 15 мин, денатурация при 95°С в течение 5 мин и термического циклирования при 95°С - 15 с, 55°С - 15 с; 72°С - 20 с - 40 циклов, образец считается положительным на наличие РНК вируса SARS-CoV-2, если значение Ct≤35, образец считается отрицательным на наличие РНК вируса SARS-CoV-2, если значение Ct отсутствует/не регистрируется, однако в случае, если значение Ct для проб находится в пределах от 35 до 40, результат обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 считается сомнительным и подлежит повторному исследованию, при этом, если при проведении повторного исследования регистрируемое значение Ct≤40, результат обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 считается положительным; если значение Ct не регистрируется, результат обнаружения РНК вируса SAPvS-CoV-2 считается отрицательным.
2. Тест-система по п. 1, обладающая высокой чувствительностью и специфичностью, позволяющая обнаружить и выявить РНК вируса SARS-CoV-2 в биологическом материале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды.
RU2021114811A 2021-05-24 2021-05-24 Тест-система для обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени RU2756474C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2021114811A RU2756474C1 (ru) 2021-05-24 2021-05-24 Тест-система для обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2021114811A RU2756474C1 (ru) 2021-05-24 2021-05-24 Тест-система для обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2756474C1 true RU2756474C1 (ru) 2021-09-30

Family

ID=77999972

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2021114811A RU2756474C1 (ru) 2021-05-24 2021-05-24 Тест-система для обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2756474C1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2772362C1 (ru) * 2021-12-31 2022-05-19 федеральное государственное бюджетное учреждение "Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева" Министерства здравоохранения Российской Федерации Тест-система для выявления SARS-CoV-2 линии Омикрон методом одношаговой полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2731390C1 (ru) * 2020-04-12 2020-09-02 Общество с ограниченной ответственностью «Система-БиоТех» Тест-система и способ для выявления РНК коронавируса SARS-COV-2, вируса-возбудителя коронавирусного заболевания 2019 COVID-19, методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Варианты)
RU2733665C1 (ru) * 2020-06-16 2020-10-06 Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) Набор олигодезоксирибонуклетидных праймеров и флуоресцентно-меченого зонда для идентификации РНК коронавирусов человека SARS и 2019-nCoV методом ОТ-ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени
US20210040571A1 (en) * 2018-07-25 2021-02-11 Sense Biodetection Limited Nucleic acid detection method

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20210040571A1 (en) * 2018-07-25 2021-02-11 Sense Biodetection Limited Nucleic acid detection method
RU2731390C1 (ru) * 2020-04-12 2020-09-02 Общество с ограниченной ответственностью «Система-БиоТех» Тест-система и способ для выявления РНК коронавируса SARS-COV-2, вируса-возбудителя коронавирусного заболевания 2019 COVID-19, методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Варианты)
RU2733665C1 (ru) * 2020-06-16 2020-10-06 Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) Набор олигодезоксирибонуклетидных праймеров и флуоресцентно-меченого зонда для идентификации РНК коронавирусов человека SARS и 2019-nCoV методом ОТ-ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2775481C1 (ru) * 2021-12-06 2022-07-01 Общество с ограниченной ответственностью "БиотехГен" (ООО "БиотехГен") Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК вирусов SARS-CoV-2, SARS-CoV, MERS-CoV, HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 семейства Coronaviridae методом петлевой изотермальной амплификации (LAMP)
RU2772362C1 (ru) * 2021-12-31 2022-05-19 федеральное государственное бюджетное учреждение "Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева" Министерства здравоохранения Российской Федерации Тест-система для выявления SARS-CoV-2 линии Омикрон методом одношаговой полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией
RU2779025C1 (ru) * 2022-05-20 2022-08-30 федеральное государственное бюджетное учреждение "Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева" Министерства здравоохранения Российской Федерации Тест-система на основе полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией для выявления SARS-CoV-2 линии Омикрон с определением субварианта BA.1

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Reid et al. Comparison of reverse transcription polymerase chain reaction, enzyme linked immunosorbent assay and virus isolation for the routine diagnosis of foot-and-mouth disease
CN111286559B (zh) 检测非洲猪瘟病毒的引物、探针及试剂盒
RU2694558C1 (ru) Способ выявления генома возбудителя коронавирусной инфекции у крупного рогатого скота
CN110747293B (zh) 用于鉴别猪水泡病毒、口蹄疫病毒与塞尼卡谷病毒的三重荧光rt-pcr检测试剂盒
RU2756474C1 (ru) Тест-система для обнаружения РНК вируса SARS-CoV-2 в биоматериале от животных, пищевых продуктах и объектах окружающей среды методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени
Landolt et al. Use of real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction assay and cell culture methods for detection of swine influenza A viruses
RU2668398C1 (ru) Олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченый зонд, способ и тест-система для выявления генома полевых изолятов вируса заразного узелкового дерматита (нодулярного дерматита) КРС в реакции полимеразной цепной реакции в режиме реального времени
RU2733665C1 (ru) Набор олигодезоксирибонуклетидных праймеров и флуоресцентно-меченого зонда для идентификации РНК коронавирусов человека SARS и 2019-nCoV методом ОТ-ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени
RU2698662C1 (ru) Тест-система для выявления РНК возбудителя вируса артериита у лошадей
RU2700481C1 (ru) Способ выявления РНК возбудителя вируса артериита у лошадей
RU2694499C1 (ru) Тест-система для обнаружения генома возбудителя коронавирусной инфекции у крупного рогатого скота с помощью мультиплексной полимеразной цепной реакции с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени
KR101423303B1 (ko) 소설사병 바이러스성 원인체의 유전자 진단을 위한 프로브, 프라이머 및 이를 이용한 진단방법
CN111363849A (zh) 一种新型冠状病毒核酸检测试剂盒及检测方法
CN111500793A (zh) 一种犬细小病毒的检测引物、试剂盒及其使用方法
Geng et al. Triplex qRT-PCR with specific probe for synchronously detecting Bovine parvovirus, bovine coronavirus, bovine parainfluenza virus and its applications
KR100904772B1 (ko) 유전자칩, 이를 이용한 돼지콜레라 바이러스 또는소바이러스성설사증 바이러스 유전자의 검사방법 및 그를포함하는 진단키트
RU2738901C1 (ru) Тест-система для выявления генома вируса ЧМЖ методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени
RU2732626C1 (ru) Система олигонуклеотидных праймеров и зонда для выявления ДНК Mycoplasma bovigenitalium
CN113699219B (zh) 一种同时检测猪肺炎支原体和猪衣原体的巢氏pcr引物组及其应用
RU2700254C1 (ru) Тест-система для выявления ДНК вируса ринотрахеита (bovine herpes virus 1, BoHV-1) у крупного рогатого скота
CN112501351B (zh) 尼帕病毒TaqMan探针荧光定量PCR试剂盒及其应用
RU2740808C1 (ru) Система олигонуклеотидных праймеров и зонда для выявления ДНК Mycoplasma bovis
Lin et al. DEVELOPMENT OF A UPL PROBE-BASED REAL-TIME PCR ASSAY OF PORCINE DELTACORONAVIRUS IN TAIWAN
RU2809224C1 (ru) Способ опосредованного определения титра инфекционной активности альфа-коронавируса собак производственного штамма РИЧ в сырье для вакцины методом ОТ-ПЦР в режиме реального времени
RU2756924C2 (ru) Способ ранней пцр-диагностики вируса алеутской болезни норок carnivore amdoparvovirus