RU2020110056A - Обнаружение рекомбиназной полимеразной амплификации с применением зонда с двойным гаптеном - Google Patents

Обнаружение рекомбиназной полимеразной амплификации с применением зонда с двойным гаптеном Download PDF

Info

Publication number
RU2020110056A
RU2020110056A RU2020110056A RU2020110056A RU2020110056A RU 2020110056 A RU2020110056 A RU 2020110056A RU 2020110056 A RU2020110056 A RU 2020110056A RU 2020110056 A RU2020110056 A RU 2020110056A RU 2020110056 A RU2020110056 A RU 2020110056A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
kda
nucleic acid
zone
hapten
bulking agent
Prior art date
Application number
RU2020110056A
Other languages
English (en)
Inventor
Майкл Л. ПАУЭЛЛ
Фрэнк Рэй БОУЛЕР
Кэтрин Джин ГРИНВУД
Олаф ПИПЕНБУРГ
Найл А. АРМС
Original Assignee
Эбботт Диагностикс Скарборо, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Эбботт Диагностикс Скарборо, Инк. filed Critical Эбботт Диагностикс Скарборо, Инк.
Publication of RU2020110056A publication Critical patent/RU2020110056A/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C12Q1/6818—Hybridisation assays characterised by the detection means involving interaction of two or more labels, e.g. resonant energy transfer
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/713—Double-stranded nucleic acids or oligonucleotides
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
    • B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
    • B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
    • B01L3/5023—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures with a sample being transported to, and subsequently stored in an absorbent for analysis
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
    • B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
    • B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
    • B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
    • B01L3/502769—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by multiphase flow arrangements
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6881—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for tissue or cell typing, e.g. human leukocyte antigen [HLA] probes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L2300/00—Additional constructional details
    • B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
    • B01L2300/0809—Geometry, shape and general structure rectangular shaped
    • B01L2300/0825—Test strips
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2527/00—Reactions demanding special reaction conditions
    • C12Q2527/125—Specific component of sample, medium or buffer
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y301/00—Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
    • C12Y301/11—Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters (3.1.11)
    • C12Y301/11002—Exodeoxyribonuclease III (3.1.11.2)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/02—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2) hydrolysing N-glycosyl compounds (3.2.2)
    • C12Y302/02023—DNA-formamidopyrimidine glycosylase (3.2.2.23)

Claims (85)

1. Композиция для рекомбиназной полимеразной амплификации, содержащая:
объемообразующий агент;
олигонуклеотидный зонд с уходящей группой с двойным гаптеном; и
фермент-нуклеазу.
2. Композиция по п. 1, характеризующаяся тем, что указанный объемообразующий агент содержит полиэтиленгликоль (ПЭГ), поливиниловый спирт (ПВС), поливинилпирролидон (ПВП), фиколл или декстран.
3. Композиция по п. 1 или 2, характеризующаяся тем, что указанный объемообразующий агент имеет молекулярную массу по меньшей мере 1 кДа, по меньшей мере 2 кДа, по меньшей мере 3 кДа, по меньшей мере 4 кДа, по меньшей мере 5 кДа, по меньшей мере 6 кДа, по меньшей мере 8 кДа или по меньшей мере 10 кДа.
4. Композиция по пп. 1-3, характеризующаяся тем, что указанный объемообразующий агент присутствует в композиции в концентрации по меньшей мере 15% об./об., концентрации по меньшей мере 12% об./об., концентрации по меньшей мере 10% об./об, концентрации по меньшей мере 8% об./об., по меньшей мере 6% об./об., концентрации по меньшей мере 5% об./об., концентрации по меньшей мере 4% об./об. или концентрации по меньшей мере 3% об./об.
5. Композиция по пп. 1-4, характеризующаяся тем, что указанный объемообразующий агент имеет профиль вязкости при 20°С менее или равный 5 мПа/с, менее или равный 4 мПа/с, менее или равный 3 мПа/с, менее или равный 2 мПа/с или менее или равный 1 мПа/с.
6. Композиция по пп. 1-5, характеризующаяся тем, что указанный объемообразующий агент представляет собой ПЭГ, имеющий вязкость при 20°С меньше или равную 3 мПа/с.
7. Композиция по пп. 1-6, характеризующаяся тем, что указанный объемообразующий агент представляет собой ПЭГ, имеющий молекулярную массу 3 кДа, и при этом концентрация указанного ПЭГ составляет 6,5% об./об.
8. Композиция по п. 1, характеризующаяся тем, что указанный олигонуклеотидный зонд содержит нуклеотид dR-O-[C]n, у которого отсутствует основание, связывающий уходящую группу с олигонуклеотидом.
9. Композиция по п. 1, характеризующаяся тем, что указанная нуклеаза представляет собой формамидопиримидин-ДНК-гликозилазу.
10. Композиция по пп. 1-9, характеризующаяся тем, что указанный олигонуклеотидный зонд с двойным гаптеном, при расщеплении формамидопиримидин-ДНК-гликозилазой, когда олигонуклеотидный зонд гибридизован с комплементарной нуклеотидной последовательностью, высвобождает уходящую группу с двойным гаптеном.
11. Композиция по п. 1, характеризующаяся тем, что указанная уходящая группа с двойным гаптеном содержит две иммуногенные группы, имеющие различные эпитопы.
12. Композиция по п. 11, характеризующаяся тем, что указанные иммуногенные группы содержат флуоресцентную группу, фермент или его фрагмент, пептид или его фрагмент, биотин.
13. Композиция по п. 12, характеризующаяся тем, что указанные иммуногенные группы выбраны из группы, включающей биотин, флуоресцеин, дигоксигенин или динитрофенил.
14. Композиция по п. 1, характеризующаяся тем, что указанный олигонуклеотидный зонд расщепляется экзонуклеазой, и при этом указанный олигонуклеотид высвобождает указанную уходящую группу с двойным гаптеном при расщеплении.
15. Композиция по п. 14, характеризующаяся тем, что указанная экзонуклеаза представляет собой экзонуклеазу III.
16. Композиция по п. 14, характеризующаяся тем, что указанный олигонуклеотидный зонд имеет структуру 5’X(n)aL(n)bH(n)cB3', где n представляют собой нуклеотиды, a, b и c представляют собой целые числа, X представляет собой 5' гексил, H представляет собой остаток ТГФ, B представляет собой спейсер C3, и L представляет собой разветвленный модификатор, содержащий множество гаптенов.
17. Композиция по п. 16, характеризующаяся тем, что указанные гаптены выбраны из группы, состоящей из DNP, FAM и биотина.
18. Композиция по п. 16, характеризующаяся тем, что указанный олигонуклеотидный зонд содержит фосфотиоатную связь между гаптенами.
19. Композиция по п. 16, характеризующаяся тем, что указанный спейсер C3 представляет собой пропанол.
20. Композиция, содержащая:
Figure 00000001
,
где R представляет собой OH или -NH(CH2)6OH.
21. Композиция, содержащая:
Figure 00000002
,
где R представляет собой OH или -NH(CH2)6OH.
22. Композиция, содержащая:
Figure 00000003
,
где DMTr представляет собой диметокситритил.
23. Композиция, содержащая:
Figure 00000004
,
где DMTr представляет собой диметокситритил.
24. Композиция, содержащая:
Figure 00000005
,
где Гаптен 1 и Гаптен 2 представляют собой иммуногенные группы по пп. 22 или 23;
Z выбран из: (i) C1' лишенного азотистого основания рибозного или дезоксирибозного кольца в случае РНК- или ДНК-олигонуклеотида, соответственно; с бета-конфигурацией у аномерного атома углерода; (ii) фосфоамидитного соединения, сконфигурированного для присоединения в ДНК или РНК-олигонуклеотид; и при этом, если Z представляет собой фосфоамидит ДНК или РНК, реакционноспособные группы Гаптена 1 и Гаптена 2 могут быть необязательно защищены пивалоилом; трет-бутилбензоилом; ацилом; бензоилом; или изобутирилом;
R представляет собой водород или линейный или разветвленный C1-C6 алкил;
X1, X2 и X4 представляют собой соединяющие группы, которые могут независимо отсутствовать или могут представлять собой линейный или разветвленный C1-C12 алкил, который необязательно может быть прерван одной или более группами -O-, -C(=O)- или -NR-;
X3 представляет собой линейный или разветвленный C1-C6 алкил; и
Х5 представляет собой линейный или разветвленный С1-С12 алкил, который необязательно прерван одной или более группами -O-, -C(=O)- или -NR-.
25. Устройство, содержащее:
полоску с латеральным потоком, содержащую
зону нанесения образца;
зону реагентов после зоны нанесения образца, находящуюся в жидкостной связи с ней, при этом зона реагентов содержит высушенную композицию реагентов RPA для амплификации целевой нуклеиновой кислоты, связывающий агент, специфичный к амплифицированной продукту целевой нуклеиновой кислоты, и обнаруживаемую молекулу;
по меньшей мере одну тестовую зону после зоны реагентов, находящуюся в жидкостной связи с ней, при этом тестовая зона содержит иммобилизованную захватывающую молекулу, специфичную для амплифицированного продукта целевой нуклеиновой кислоты; и
контрольную зону после тестовой зоны.
26. Устройство по п. 25, характеризующееся тем, что указанная высушенная композиция реагентов RPA содержит объемообразующий агент, рекомбиназу, полимеразу, нуклеазу, зонд с двойным гаптеном и обнаруживаемую молекулу.
27. Устройство по п. 26, характеризующееся тем, что указанный зонд с двойным гаптеном содержит конъюгат биотина и карбоксифлуоресцеина (FAM) или биотина и динитрофенила (DNP).
28. Устройство по п. 25, характеризующееся тем, что указанная иммобилизованная захватывающая молекула, специфичная в отношении амплифицированной целевой нуклеиновой кислоты, выбрана из группы, состоящей из захватывающей молекулы против FAM или захватывающей молекулы против DNP.
29. Устройство по п. 28, характеризующееся тем, что указанная молекула против FAM или молекула против DNP независимо выбраны из группы, состоящей из поликлонального антитела, моноклонального антитела и функционального связывающего фрагмента такого антитела, включая FAB, ScFv, Fv или DAB.
30. Устройство по п. 25, характеризующееся тем, что указанная обнаруживаемая молекула выбрана из группы, состоящей из золя золота, золя серебра, золя латекса, целлюлозной наногранулы или углеродной наноструны и захватывающей молекулы против биотина.
31. Устройство по п. 25, характеризующееся тем, что указанная контрольная зона содержит зону связывания, которая свидетельствует о правильном функционировании полоски с латеральным потоком.
32. Устройство по п. 25, характеризующееся тем, что указанная контрольная зона содержит линию захвата антитела против мышиного белка.
33. Способ обнаружения продуктов амплификации, включающий:
приведение образца, предположительно содержащего целевую нуклеиновую кислоту, представляющую интерес, в контакт с реагентами RPA для амплификации целевой нуклеиновой кислоты, олигонуклеотидным зондом, содержащим последовательность нуклеиновой кислоты, комплементарную целевой нуклеиновой кислоте, и ковалентно связанную уходящую группу с двойным гаптеном, и нуклеазой;
амплификацию целевой нуклеиновой кислоты с получением продукта целевой нуклеиновой кислоты; и
обнаружение продукта целевой нуклеиновой кислоты путем обнаружения свободных фрагментов двойного гаптена, отщепленных от олигонуклеотидного зонда, гибридизованного с целевой нуклеиновой кислотой.
34. Способ по п. 33, характеризующийся тем, что указанные реагенты RPA расположены на зоне нанесения образца полоски с латеральным потоком.
35. Способ по п. 33, характеризующийся тем, что амплификацию нуклеиновой кислоты выполняют на полоске с латеральным потоком после контакта образца с реагентами RPA с образованием смеси для амплификации нуклеиновой кислоты.
36. Способ по п. 33, характеризующийся тем, что амплификацию нуклеиновой кислоты выполняют на полоске с латеральным потоком без разбавления или добавления другой жидкости к смеси RPA.
37. Способ по п. 33, характеризующийся тем, что указанный фрагмент двойного гаптена, отщепленный от олигонуклеотидного зонда, селективно захватывается в тестовой зоне на полоске с латеральным потоком, расположенной после зоны нанесения образца.
38. Способ по пп. 33-37, характеризующийся тем, что олигонуклеотидный зонд, содержащий ковалентно связанный двойной гаптен, не захватывается селективно в тестовой зоне на полоске с латеральным потоком.
39. Способ по любому из пп. 33-38, характеризующийся тем, что указанная полоска с латеральным потоком содержит тестовую зону и контрольную зону, причем указанная тестовая зона содержит член связывающейся пары для захвата двойного гаптена, отщепленного от олигонуклеотида, и указанная контрольная зона содержит член связывающейся пары для внутреннего контроля.
40. Способ по п. 39, характеризующийся тем, что указанная контрольная зона содержит антитело против мышиного белка или его фрагмент.
41. Способ по п. 39, характеризующийся тем, что указанная тестовая зона содержит захватывающую молекулу против DNP или захватывающую молекулу против FAM.
42. Способ по п. 40, характеризующийся тем, что указанная захватывающая молекула против FAM выбрана из группы, состоящей из моноклонального антитела, поликлонального антитела и функционального связывающего фрагмента такого антитела.
43. Способ по п. 42, характеризующийся тем, что указанная захватывающая молекула против DNP выбрана из группы, состоящей из моноклонального антитела, поликлонального антитела или функционального связывающего фрагмента такого антитела.
44. Способ по пп. 33-43, характеризующийся тем, что обнаружение продуктов амплификации включает захват уходящей группы с двойным гаптеном в тестовой зоне и мечение захваченной уходящей группы с двойным гаптеном с применением обнаруживаемой молекулы.
45. Способ по п. 44, характеризующийся тем, что указанная обнаруживаемая молекула выбрана из группы, состоящей из золя золота, золя серебра, золя латекса, целлюлозной наногранулы и углеродной наноструны.
46. Способ, включающий:
нанесение образца, предположительно содержащего целевую нуклеиновую кислоту, на полоску с латеральным потоком;
приведение образца в контакт со смесью реагентов RPA для амплификации целевой нуклеиновой кислоты, высушенной на зоне реагентов полоски с латеральным потоком; и
обнаружение продуктов амплификации, если они присутствуют, на тестовой зоне полоски с латеральным потоком.
47. Способ по п. 46, характеризующийся тем, что указанный образец, предположительно содержащий целевую нуклеиновую кислоту, вносят в зону нанесения полоски с латеральным потоком.
48. Способ по п. 47, характеризующийся тем, что указанная смесь реагентов RPA содержит объемообразующий агент, рекомбиназу, полимеразу, нуклеазу и олигонуклеотидный зонд с двойным гаптеном.
49. Способ по п. 48, характеризующийся тем, что указанный объемообразующий агент выбран из группы, состоящей из полиэтиленгликоля (ПЭГ), поливинилового спирта (ПВС), поливинилпирролидона (ПВП), фиколла и декстрана.
50. Способ по п. 48 или 49, характеризующийся тем, что указанный объемообразующий агент имеет молекулярную массу по меньшей мере 1 кДа, по меньшей мере 2 кДа, по меньшей мере 3 кДа, по меньшей мере 4 кДа, по меньшей мере 5 кДа, по меньшей мере 6 кДа, по меньшей мере 8 кДа или по меньшей мере 10 кДа.
51. Способ по п. 49 или 50, характеризующийся тем, что указанный объемообразующий агент присутствует в смеси в концентрации по меньшей мере 15% об./об., по меньшей мере 12% об./об., конечной концентрации по меньшей мере 10% об./об., по меньшей мере 8% об./об., по меньшей мере 6% об./об., по меньшей мере 5% об./об., по меньшей мере 4% об./об. или конечной концентрации по меньшей мере 3% об./об.
52. Способ по любому из пп. 46-51, характеризующийся тем, что указанный объемообразующий агент имеет профиль вязкости при 20°С менее или равный 5 мПа/с, менее или равный 4 мПа/с, менее или равный 3 мПа/с, менее или равный 2 мПа/с или менее или равный 1 мПа/с.
53. Способ по п. 46, характеризующийся тем, что указанный объемообразующий агент представляет собой ПЭГ и имеет вязкость при 20°С меньше или равную 3 мПа/с.
54. Способ по п. 46, характеризующийся тем, что указанный объемообразующий агент представляет собой ПЭГ с молекулярной массой 3 кДа, и при этом конечная концентрация ПЭГ составляет 6,5% об./об.
55. Способ по п. 48, характеризующийся тем, что обнаружение продуктов амплификации, если они присутствуют, включает обнаружение фрагмента двойного гаптена, отщепленного от олигонуклеотидного зонда, гибридизованного с продуктами амплификации.
56. Способ по п. 46, характеризующийся тем, что перед обнаружением продуктов амплификации не требуется разбавление смеси RPA.
RU2020110056A 2017-09-14 2018-09-14 Обнаружение рекомбиназной полимеразной амплификации с применением зонда с двойным гаптеном RU2020110056A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201762558705P 2017-09-14 2017-09-14
US62/558,705 2017-09-14
PCT/US2018/051078 WO2019055780A1 (en) 2017-09-14 2018-09-14 POLYMERASE RECOMBINASE AMPLIFICATION DETECTION USING DOUBLE HAPTEN PROBE

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2020110056A true RU2020110056A (ru) 2021-10-14

Family

ID=65630678

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2020110056A RU2020110056A (ru) 2017-09-14 2018-09-14 Обнаружение рекомбиназной полимеразной амплификации с применением зонда с двойным гаптеном

Country Status (11)

Country Link
US (1) US20190078147A1 (ru)
EP (1) EP3682029A4 (ru)
JP (2) JP7412332B2 (ru)
KR (1) KR20200054268A (ru)
CN (1) CN111201328A (ru)
AU (1) AU2018334226A1 (ru)
BR (1) BR112020005121A2 (ru)
CA (1) CA3075629A1 (ru)
MX (1) MX2020002826A (ru)
RU (1) RU2020110056A (ru)
WO (1) WO2019055780A1 (ru)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE102020103958B4 (de) * 2020-02-14 2021-08-26 Testo bioAnalytics GmbH Oligonukleotidsonde zum spezifischen Nachweis von Mikroorganismen, korrespondierendes Verfahren und Verwendung
EP3950955A1 (en) * 2020-08-06 2022-02-09 Albert-Ludwigs-Universität Freiburg Multianalyte assay for the simultaneous detection of nucleic acid and analytes
CN113552106B (zh) * 2021-07-23 2022-12-30 济南大学 一种检测ATP、谷胱甘肽、Fpg糖基化酶的通用荧光传感器
GR20220100698A (el) * 2022-08-18 2024-03-12 Πανεπιστημιο Πατρων, Μεθοδος βελτιωσης της ανιχνευσιμοτητας των δοκιμων που βασιζονται σε ταινιες ξηρων αντιδραστηριων

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2227512T3 (es) * 1991-12-02 2005-04-01 Medical Research Council Produccion de anticuerpos contra auto-antigenos a partir de repertorios de segmentos de anticuerpos fijados en un fago.
DE4441626A1 (de) * 1994-11-23 1996-05-30 Boehringer Mannheim Gmbh Verfahren zum besonders sensitiven Nachweis von Nukleinsäuren
EP1929049B1 (en) 2005-07-25 2013-04-10 Alere San Diego, Inc. Methods for multiplexing recombinase polymerase amplification
US8071308B2 (en) 2006-05-04 2011-12-06 Alere San Diego, Inc. Recombinase polymerase amplification
US9334531B2 (en) * 2010-12-17 2016-05-10 Life Technologies Corporation Nucleic acid amplification
US9469867B2 (en) * 2009-05-20 2016-10-18 Alere San Diego, Inc. DNA glycosylase/lyase and AP endonuclease substrates
WO2011038197A1 (en) * 2009-09-25 2011-03-31 Alere San Diego, Inc. Detection of nucleic acids in crude matrices
CA2921620C (en) 2013-08-19 2021-01-19 Abbott Molecular Inc. Next-generation sequencing libraries
GB201519565D0 (en) 2015-11-05 2015-12-23 Alere San Diego Inc Sample preparation device
US20180320228A1 (en) * 2015-10-30 2018-11-08 Alere Inc. Determination of polymorphisms using isothermal nucleic acid amplification

Also Published As

Publication number Publication date
JP7412332B2 (ja) 2024-01-12
EP3682029A1 (en) 2020-07-22
US20190078147A1 (en) 2019-03-14
AU2018334226A1 (en) 2020-04-02
MX2020002826A (es) 2020-07-22
WO2019055780A1 (en) 2019-03-21
CN111201328A (zh) 2020-05-26
JP2024045115A (ja) 2024-04-02
BR112020005121A2 (pt) 2020-09-24
EP3682029A4 (en) 2021-06-02
KR20200054268A (ko) 2020-05-19
CA3075629A1 (en) 2019-03-21
JP2020537499A (ja) 2020-12-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2020110056A (ru) Обнаружение рекомбиназной полимеразной амплификации с применением зонда с двойным гаптеном
US7122319B2 (en) Multiplexed immunohistochemical assays using molecular tags
JP2020537499A5 (ru)
KR101719285B1 (ko) 표적 물질에 의해 조절되는 핵산 중합효소 활성을 이용한 생체물질의 검출 및 정량 방법
WO2011062933A2 (en) Array-based proximity ligation association assays
EP2358898B1 (en) Methods and compositions in particle-based detection of target molecules using covalent bond forming reactive pairs
US9487774B2 (en) Compositions, methods, and kits for identifying candidate molecules from encoded chemical libraries
CN106544434B (zh) 多交叉扩增结合金纳米生物传感检测单增李斯特菌的方法
US20200116712A1 (en) Rapid and sensitive detection and quantification of analytes in complex samples using polymer-based methods
WO2019084458A1 (en) HIGHLY SPECIFIC DOSINGS
WO2013176992A2 (en) Methods and compositions for the diagnosis of sepsis using gamma peptide nucleic acids
US8927210B2 (en) Conjugate complexes for analyte detection
Xiang et al. Graphene oxide and molecular beacons-based multiplexed DNA detection by synchronous fluorescence analysis
US11293055B2 (en) Nucleic acid detection kit and nucleic acid detection method using nanoparticles
CN104404162A (zh) 采用引物关联通用探针检测多重基因或不同靶标的实时荧光pcr方法
WO2018003550A1 (ja) ２以上の標的核酸を検出するためのプライマーセット、キット及び方法
CN116735867A (zh) 基于HCR介导的多价适配体和CRISPR-Cas12a系统检测沙门氏菌的方法
US11254971B2 (en) Nucleic acid amplification and detection assays
US10781480B1 (en) Method of detecting nucleic acids with amplified signal using nanoparticles
US20180148772A1 (en) Method for Quantitatively Profiling Nucleic Acids
US7118864B2 (en) Amplifiable probe
JPWO2009054320A1 (ja) 核酸プローブ及びプローブポリマーの形成方法
WO2007108378A1 (ja) シグナルプローブポリマーの形成方法
US11692215B2 (en) Nucleic acid cleaving enzyme-based biosensor and methods of use thereof
WO2021215989A1 (en) Rapid detection of specific genetic sequences using a multi-labelled dna hybrid comprising a reporter strand and an anchor strand

Legal Events

Date Code Title Description
FA93 Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination)

Effective date: 20210915