RU2015104763A - Олигонуклеотиды для введения изменения в последовательность молекулы целевой рнк в живой клетке - Google Patents

Олигонуклеотиды для введения изменения в последовательность молекулы целевой рнк в живой клетке Download PDF

Info

Publication number
RU2015104763A
RU2015104763A RU2015104763A RU2015104763A RU2015104763A RU 2015104763 A RU2015104763 A RU 2015104763A RU 2015104763 A RU2015104763 A RU 2015104763A RU 2015104763 A RU2015104763 A RU 2015104763A RU 2015104763 A RU2015104763 A RU 2015104763A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
oligonucleotide
sequence
paragraphs
target rna
change
Prior art date
Application number
RU2015104763A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2663110C2 (ru
Inventor
БОЕР Дэниел Антон ДЭ
Тита РИТСЕМА
Original Assignee
ПРОКЬЮЭР ТЕРАПЬЮТИКС II Би.Ви.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ПРОКЬЮЭР ТЕРАПЬЮТИКС II Би.Ви. filed Critical ПРОКЬЮЭР ТЕРАПЬЮТИКС II Би.Ви.
Publication of RU2015104763A publication Critical patent/RU2015104763A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2663110C2 publication Critical patent/RU2663110C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1138Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against receptors or cell surface proteins
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/712Nucleic acids or oligonucleotides having modified sugars, i.e. other than ribose or 2'-deoxyribose
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/46Hydrolases (3)
    • A61K38/465Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. lipases, ribonucleases
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/08Solutions
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00Drugs for disorders of the respiratory system
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/01Preparation of mutants without inserting foreign genetic material therein; Screening processes therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/111General methods applicable to biologically active non-coding nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/11Antisense
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/32Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/3212'-O-R Modification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00Applications; Uses
    • C12N2320/30Special therapeutic applications
    • C12N2320/31Combination therapy
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00Applications; Uses
    • C12N2320/30Special therapeutic applications
    • C12N2320/34Allele or polymorphism specific uses

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)

Abstract

1. Применение олигонуклеотида, где все нуклеозиды олигонуклеотида представляют собой 2′-O-алкилрибонуклеозиды, для введения изменения в последовательность молекулы целевой РНК, находящейся в живой клетке, включающее стадию предоставления олигонуклеотида в живую клетку в условиях, способствующих всасыванию живой клеткой указанного олигонуклеотида, причем указанный олигонуклеотид содержит последовательность, которая по меньшей мере частично комплементарна молекуле целевой РНК, так что в указанной живой клетке происходит гибридизация олигонуклеотида с целевой РНК, или ее предшественником, или ее матрицей, в результате этого в указанной живой клетке происходят биохимические процессы, вследствие которых различие между последовательностью олигонуклеотида и последовательностью целевой РНК копируется в молекуле РНК, либо непосредственно, либо с использованием ее предшественника или ее матрицы, что приводит к изменению последовательности указанной целевой РНК.2. Применение по п. 1, где живая клетка является частью многоклеточного организма.3. Применение по п. 1, где живая клетка представляет собой животную клетку.4. Применение по п. 1, где живая клетка представляет собой человеческую клетку.5. Применение по любому из пп. 1-4, где изменение в последовательности целевой РНК вызывает изменение фенотипа клетки.6. Применение по любому из пп. 1-4, где изменение в указанной целевой РНК подтверждается путем определения последовательности указанной целевой РНК, или ее предшественника или ее матрицы.7. Применение по любому из пп. 1-4, где изменение в указанной целевой РНК подтверждается путем определения последовательности полипептидного продукта,

Claims (58)

1. Применение олигонуклеотида, где все нуклеозиды олигонуклеотида представляют собой 2′-O-алкилрибонуклеозиды, для введения изменения в последовательность молекулы целевой РНК, находящейся в живой клетке, включающее стадию предоставления олигонуклеотида в живую клетку в условиях, способствующих всасыванию живой клеткой указанного олигонуклеотида, причем указанный олигонуклеотид содержит последовательность, которая по меньшей мере частично комплементарна молекуле целевой РНК, так что в указанной живой клетке происходит гибридизация олигонуклеотида с целевой РНК, или ее предшественником, или ее матрицей, в результате этого в указанной живой клетке происходят биохимические процессы, вследствие которых различие между последовательностью олигонуклеотида и последовательностью целевой РНК копируется в молекуле РНК, либо непосредственно, либо с использованием ее предшественника или ее матрицы, что приводит к изменению последовательности указанной целевой РНК.
2. Применение по п. 1, где живая клетка является частью многоклеточного организма.
3. Применение по п. 1, где живая клетка представляет собой животную клетку.
4. Применение по п. 1, где живая клетка представляет собой человеческую клетку.
5. Применение по любому из пп. 1-4, где изменение в последовательности целевой РНК вызывает изменение фенотипа клетки.
6. Применение по любому из пп. 1-4, где изменение в указанной целевой РНК подтверждается путем определения последовательности указанной целевой РНК, или ее предшественника или ее матрицы.
7. Применение по любому из пп. 1-4, где изменение в указанной целевой РНК подтверждается путем определения последовательности полипептидного продукта, кодируемого указанной целевой РНК.
8. Применение по любому из пп. 1-4, где изменение в указанной целевой РНК подтверждается путем определения фенотипического изменения в указанной живой клетке или в указанном организме, содержащем указанную клетку.
9. Применение по п. 8, где изменение представляет собой уменьшение интенсивности нарушения, причинно связанного с последовательностью целевой РНК, до изменения.
10. Применение по п. 9, где нарушение представляет собой генетическое нарушение.
11. Применение по любому из пп. 1-4, где протяженность олигонуклеотида составляет 15-100 нуклеотидов.
12. Применение по любому из пп. 1-4, где протяженность олигонуклеотида составляет от 20 до 50 нуклеотидов, более предпочтительно от 25 до 45 нуклеотидов, более предпочтительно от 27 до 35 нуклеотидов.
13. Применение по любому из пп. 1-4, где олигонуклеотид содержит инозин и/или содержит модифицированные нуклеотиды, предпочтительно выбранные из группы, состоящей из РМО (ФМО), 5-метил-dC, 2-амино-dA, С5-пиримидина, и/или модифицированные межнуклеозидные связи, выбранные из группы, состоящей из фосфоротиоатных связей и метилфосфонатных связей.
14. Применение по любому из пп. 1-4, где все нуклеозиды олигонуклеотида представляют собой 2′-O-метилрибонуклеозиды.
15. Применение по любому из пп. 1-4, где изменение в последовательности целевой молекулы РНК включает инсерцию или замену одного или более нуклеозидов.
16. Применение по любому из пп. 1-4, где целевая РНК кодирует человеческий CFTR и изменение приводит в результате к созданию или восстановлению нуклеозидного триплета, кодирующего фенилаланин в аминокислотном положении 508 белка CFTR.
17. Применение по п. 16, где изменение включает инсерцию нуклеозидного триплета, выбранного из группы, состоящей из 5′-UUU-3′ и 5′-CUU-3′.
18. Применение по любому из пп. 1-4, где олигонуклеотид комплементарен последовательности, имеющей идентичность по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% нуклеотидам 16-30 и 34-48 последовательности SEQ ID NO: 6, и изменение включает инсерцию нуклеозидного триплета, выбранного из группы, состоящей из 5′-UUU-3′ и 5′-CUU-3′.
19. Применение по любому из пп. 1-4, где олигонуклеотид содержит нуклеотиды или состоит из нуклеотидов 7-29, предпочтительно нуклеотидов 1-33, последовательности SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 3, предпочтительно SEQ ID NO: 1.
20. Применение по любому из пп. 1-4, где олигонуклеотид предоставляется в носителе, предпочтительно в липосоме, полисоме или наночастице, и/или где олигонуклеотид находится присоединен к соединению для доставки, предпочтительно полиэтиленимину (PEI, ПЭИ), полиэтиленгликолю (PEG, ПЭГ), и/или связан со стеролом, предпочтительно с холестеролом.
21. Применение по любому из пп. 1-4, где олигонуклеотид предоставляется в легкие, предпочтительно через дыхательные пути, в сухом составе или в аэрозоле, предпочтительно с помощью ингалятора, и предпочтительно олигонуклеотид предоставляется вместе с медиатором трансфекции и/или лекарственным средством для лечения муковисцидоза, известным специалисту в данной области техники, предпочтительно ДНКазой, маннитом (предпочтительно, бронхитолом) и/или малой молекулой для лечения CF, предпочтительно Калидеко (ивакафтор; VX-770), VX-809 (лумакафтор) и/или VX-661.
22. Применение по любому из пп. 1-4, где олигонуклеотид предоставляется в гипертоническом солевом растворе, предпочтительно с концентрацией солевого раствора между 2% - 9%, предпочтительно 3% - 8%, более предпочтительно 4% - 8%, более предпочтительно 5% - 8%, более предпочтительно 6% - 8%, более предпочтительно 6% - 7%, еще более предпочтительно с концентрацией солевого раствора около 7%, причем гипертонический солевой раствор, предпочтительно, представляет собой физиологически и фармацевтически приемлемый раствор.
23. Применение по п. 22, где гипертонический солевой раствор по существу представляет собой раствор NaCl.
24. Применение по любому из пп. 1-4, где олигонуклеотид вводят в частице, проникающей в слизь, предпочтительно в наночастице, проникающей в слизь.
25. Применение по любому из пп. 1-4, где введение олигонуклеотида комбинируют с лечением антибиотиками для уменьшения бактериальных инфекций и ослабления их симптомов, таких как увеличение вязкости слизи и/или образование биопленки.
26. Применение по любому из пп. 1-4, где перед введением олигонуклеотида, соответствующего изобретению, проводят бронхоальвеолярный лаваж (BAL).
27. Применение по любому из пп. 1-4, где олигонуклеотид вводят в капсуле с замедленным высвобождением с целью содействовать доставке в клетки кишечника.
28. Применение по любому из пп. 1-4, где введение олигонуклеотида комбинируют с введением композиции биологического или синтетического панкреатического фермента, такой как панкрелипаза или Креон.
29. Одноцепочечный олигонуклеотид, где все нуклеозиды олигонуклеотида представляют собой 2′-O-алкилрибонуклеозиды, для применения в лечении человеческого организма или организма животного, при этом указанный олигонуклеотид способен вводить изменение в последовательность молекулы целевой РНК в живой клетке указанного человеческого организма или организма животного, путем предоставления олигонуклеотида в живую клетку в условиях, способствующих поглощению живой клеткой указанного олигонуклеотида, причем указанный олигонуклеотид содержит последовательность, которая по меньшей мере частично комплементарна молекуле целевой РНК, таким образом что в указанной живой клетке происходит гибридизация олигонуклеотида с целевой РНК, или ее предшественником, или ее матрицей, в результате этого в указанной живой клетке происходят биохимические процессы, вследствие которых различие между последовательностью олигонуклеотида и последовательностью целевой РНК копируется в молекуле РНК, либо непосредственно, либо с использованием ее предшественника или ее матрицы, что приводит к изменению последовательности указанной целевой РНК.
30. Олигонуклеотид по любому из п. 29, где изменение в последовательности целевой РНК приводит к изменению фенотипа клетки.
31. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, где изменение в последовательности указанной целевой РНК подтверждено посредством определения последовательности указанной целевой РНК, или ее предшественника или ее матрицы.
32. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, где изменение в последовательности указанной целевой РНК подтверждается посредством определения последовательности полипептидного продукта, кодируемого указанной целевой РНК.
33. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, где изменение в последовательности указанной целевой РНК подтверждено посредством определения фенотипического изменения в указанной живой клетке или в указанном организме, содержащем указанную клетку.
34. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, где фенотипическое изменение представляет собой уменьшение интенсивности нарушения, причинно связанного с последовательностью целевой РНК, до изменения.
35. Олигонуклеотид по п. 34, где нарушение представляет собой генетическое нарушение.
36. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, протяженность которого составляет 15 -100 нуклеотидов.
37. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, протяженность которого составляет от 20 до 50, более предпочтительно от 25 до 45 нуклеотидов, более предпочтительно от 27 до 35 нуклеотидов.
38. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, где олигорибонуклеотид содержит инозин и/или содержит модифицированные нуклеотиды, предпочтительно выбранные из группы, состоящей из РМО (ФМО), 5-метил-dC, 2-амино-dA, С5-пиримидина, и/или модифицированные межнуклеозидные связи, выбранные из группы, состоящей из фосфоротиоатных связей и метилфосфонатных связей.
39. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, где изменение в последовательности молекулы целевой РНК включает инсерцию или замену одного или более нуклеозидов.
40. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, где целевая РНК кодирует человеческий CFTR, и изменение приводит к созданию или восстановлению нуклеозидного триплета, кодирующего фенилаланин в аминокислотном положении 508 белка CFTR.
41. Олигонуклеотид по п. 40, где изменение включает инсерцию нуклеозидного триплета, выбранного из группы, состоящей из 5′-UUU-3′ и 5′-CUU-3′.
42. Олигонуклеотид по п. 40, где последовательность олигонуклеотида комплементарна последовательности, имеющей идентичность по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% нуклеотидам 16-30 и 34-48 последовательности SEQ ID NO: 6, и изменение включает инсерцию нуклеозидного триплета, выбранного из группы, состоящей из 5′-UUU-3′ и 5′-CUU-3.
43. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, где олигонуклеотид содержит нуклеотиды или состоит из нуклеотидов 7-29, предпочтительно нуклеотидов 1-33, последовательности SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 3, предпочтительно последовательности SEQ ID NO: 1.
44. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, где олигонуклеотид предоставляется в носителе, предпочтительно в липосоме, полисоме или наночастице, и/или где олигонуклеотид присоединен к соединению для доставки, предпочтительно полиэтиленимину (PEI, ПЭИ), полиэтиленгликолю (PEG, ПЭГ), и/или он связан со стеролом, предпочтительно с холестеролом.
45. Олигонуклеотид по любому из пп. 29-30, где олигонуклеотид предоставляется в респираторный тракт или легкие, предпочтительно через дыхательные пути, в сухом составе или в аэрозоле, предпочтительно с помощью ингалятора, и предпочтительно олигонуклеотид предоставляется вместе с медиатором трансфекции и/или лекарственным средством для лечения муковисцидоза, известным специалисту в данной области техники, предпочтительно, ДНКазой, маннитом (предпочтительно, бронхитолом) и/или малой молекулой для лечения CF, предпочтительно, Калидеко (ивакафтор; VX-770), VX-809 (лумакафтор) и/или VX-661.
46. Олигонуклеотид по п. 45, где олигонуклеотид предоставляется в композиции гипертонического солевого раствора, предпочтительно с концентрацией солевого раствора между 2% - 9%, предпочтительно 3% - 8%, более предпочтительно 4% - 8%, более предпочтительно 5% - 8%, более предпочтительно 6% - 8%, более предпочтительно 6% - 7%, еще более предпочтительно с концентрацией солевого раствора около 7%, причем гипертонический солевой раствор, предпочтительно, представляет собой физиологически и фармацевтически приемлемый раствор.
47. Олигонуклеотид по п. 46, где гипертонический солевой раствор по существу представляет собой раствор NaCl.
48. Олигонуклеотид по п. 45, который предоставляется в частице, проникающей в слизь, предпочтительно в наночастице, проникающей в слизь.
49. Олигонуклеотид по п. 45, где введение олигонуклеотида комбинируют с лечением антибиотиками для уменьшения бактериальных инфекций и ослабления их симптомов, таких как увеличение вязкости слизи и/или образование биопленки.
50. Олигонуклеотид по п. 45, где перед введением олигонуклеотида, соответствующего изобретению, проводят бронхоальвеолярный лаваж (BAL).
51. Олигонуклеотид по любому из пп. 29 и 30, который вводят в капсуле с замедленным высвобождением с целью содействовать доставке в клетки кишечника.
52. Олигонуклеотид по п. 51, причем введение олигонуклеотида комбинируют с введением композиции биологического или синтетического панкреатического фермента, такой как панкрелипаза или Креон.
53. Фармацевтическая композиция, содержащая олигонуклеотид по любому из пп. 29-43, фармацевтически приемлемый носитель и/или гипертонический физиологически и фармацевтически приемлемый солевой раствор, предпочтительно с концентрацией солевого раствора между 2% - 9%, предпочтительно 3% - 8%, более предпочтительно 4% - 8%, более предпочтительно 5% - 8%, более предпочтительно 6% - 8%, более предпочтительно 6% - 7%, еще более предпочтительно с концентрацией солевого раствора около 7%.
54. Фармацевтическая композиция по п. 53, в которой гипертонический солевой раствор представляет собой по существу раствор NaCl.
55. Фармацевтическая композиция по п. 53 или 54, дополнительно содержащая медиатор трансфекции.
56. Фармацевтическая композиция по п. 53 или 54, содержащая также лекарственное средство для лечения муковисцидоза, известное специалистам в данной области техники, предпочтительно, ДНКазу, маннит и/или малую молекулу для лечения CF, предпочтительно, Калидеко (ивакафтор; VX-770), VX-809 (лумакафтор) и/или VX-661.
57. Одноцепочечный олигорибонуклеотид или фармацевтическая композиция, содержащая одноцепочечный олигорибонуклеотид, комплементарный последовательности, имеющей идентичность по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% нуклеотида 16-30 и 34-48 последовательности SEQ ID NO: 6, где все нуклеозиды олигонуклеотида представляют собой 2′-0-алкилрибонуклеозиды.
58. Одноцепочечный олигорибонуклеотид или фармацевтическая композиция, содержащая одноцепочечный олигорибонуклеотид, который содержит нуклеотиды 7-29, предпочтительно нуклеотиды 1-33, последовательности SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 3, предпочтительно, SEQ ID NO: 1, где все нуклеозиды олигонуклеотида представляют собой 2′-O-алкилрибонуклеозиды.
RU2015104763A 2012-07-12 2013-07-12 Олигонуклеотиды для введения изменения в последовательность молекулы целевой рнк в живой клетке RU2663110C2 (ru)

Applications Claiming Priority (11)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201261670681P 2012-07-12 2012-07-12
US61/670,681 2012-07-12
US201261718801P 2012-10-26 2012-10-26
US61/718,801 2012-10-26
EP13166465 2013-05-03
EP13166465.8 2013-05-03
EP13172515 2013-06-18
EP13172515.2 2013-06-18
EP13173818.9 2013-06-26
EP13173818 2013-06-26
PCT/NL2013/050534 WO2014011053A1 (en) 2012-07-12 2013-07-12 Oligonucleotides for making a change in the sequence of a target rna molecule present in a living cell

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2015104763A true RU2015104763A (ru) 2016-08-27
RU2663110C2 RU2663110C2 (ru) 2018-08-01

Family

ID=49916369

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2015104763A RU2663110C2 (ru) 2012-07-12 2013-07-12 Олигонуклеотиды для введения изменения в последовательность молекулы целевой рнк в живой клетке

Country Status (24)

Country Link
US (2) US9605255B2 (ru)
EP (2) EP3103872B1 (ru)
JP (1) JP6373833B2 (ru)
KR (1) KR20150037968A (ru)
CN (1) CN104640986B (ru)
AU (1) AU2013287353B2 (ru)
BR (1) BR112015000710A8 (ru)
CA (1) CA2878934A1 (ru)
CY (1) CY1117858T1 (ru)
DK (2) DK2852668T3 (ru)
ES (2) ES2698522T3 (ru)
HK (1) HK1208491A1 (ru)
HR (1) HRP20160854T1 (ru)
HU (1) HUE029977T2 (ru)
IL (1) IL236654B (ru)
MX (1) MX356625B (ru)
NZ (1) NZ703824A (ru)
PL (1) PL2852668T3 (ru)
PT (1) PT2852668T (ru)
RS (1) RS54944B1 (ru)
RU (1) RU2663110C2 (ru)
SI (1) SI2852668T1 (ru)
SM (1) SMT201600234B (ru)
WO (1) WO2014011053A1 (ru)

Families Citing this family (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP5409010B2 (ja) 2005-12-28 2014-02-05 バーテックス ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド N−[2,4−ビス(1,1−ジメチルエチル)−5−ヒドロキシフェニル]−1,4−ジヒドロ−4−オキソキノリン−3−カルボキサミドの固体形態
US8563573B2 (en) 2007-11-02 2013-10-22 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Azaindole derivatives as CFTR modulators
US8802868B2 (en) 2010-03-25 2014-08-12 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Solid forms of (R)-1(2,2-difluorobenzo[D][1,3]dioxo1-5-yl)-N-(1-(2,3-dihydroxypropyl-6-fluoro-2-(1-hydroxy-2-methylpropan2-yl)-1H-Indol-5-yl)-Cyclopropanecarboxamide
EP3381899B1 (en) 2010-04-22 2021-01-06 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Intermediate compound for process of producing cycloalkylcarboxamido-indole compounds
SI2852668T1 (sl) 2012-07-12 2016-09-30 Proqr Therapeutics Ii B.V. Oligonukleotidi za izvedbo spremembe v sekvenci tarčne molekule rna, prisotne v živeči celici
RS57476B9 (sr) 2014-04-15 2021-10-29 Vertex Pharma Farmaceutske kompozicije za lečenje bolesti posredovanih transmembranskim regulatorom provodljivosti cistične fibroze
KR102472590B1 (ko) 2014-05-14 2022-11-30 타르그이뮨 테라퓨틱스 아게 개선된 폴리에틸렌이민 폴리에틸렌글리콜 벡터
CA2963945C (en) 2014-10-07 2023-01-10 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Co-crystals of modulators of cystic fibrosis transmembrane conductance regulator
GB201418892D0 (en) * 2014-10-23 2014-12-10 Proqr Therapeutics B V DNA editing
US20210395729A1 (en) * 2014-12-12 2021-12-23 Tod M. Woolf Compositions and methods for Editing Nucleic Acids in Cells Utilizing Oligonucleotides
PL3234134T3 (pl) 2014-12-17 2020-12-28 Proqr Therapeutics Ii B.V. Ukierunkowana edycja rna
GB201507926D0 (en) * 2015-05-08 2015-06-24 Proqr Therapeutics N V Improved treatments using oligonucleotides
WO2017060317A1 (en) 2015-10-05 2017-04-13 Proqr Therapeutics Ii B.V. Use of single-stranded antisense oligonucleotide in prevention or treatment of genetic diseases involving a trinucleotide repeat expansion
US10801026B2 (en) 2015-10-15 2020-10-13 City Of Hope Compounds and compositions including phosphorothioated oligodeoxynucleotide, and methods of use thereof
AU2017281497B2 (en) * 2016-06-22 2023-04-06 Proqr Therapeutics Ii B.V. Single-stranded RNA-editing oligonucleotides
NZ751483A (en) 2016-09-01 2022-07-01 Proqr Therapeutics Ii Bv Chemically modified single-stranded rna-editing oligonucleotides
US11274300B2 (en) 2017-01-19 2022-03-15 Proqr Therapeutics Ii B.V. Oligonucleotide complexes for use in RNA editing
GB2574769A (en) 2017-03-03 2019-12-18 Univ California RNA Targeting of mutations via suppressor tRNAs and deaminases
CN107267516B (zh) * 2017-07-28 2020-09-29 佛山科学技术学院 双sgRNA介导的基因精确修饰方法及应用
WO2019076919A1 (en) * 2017-10-17 2019-04-25 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) COMBINED TREATMENT OF CYSTIC FIBROSIS
US11866702B2 (en) 2018-03-27 2024-01-09 University Of Rochester Nucleic acid molecules for pseudouridylation
JP2023504314A (ja) 2019-12-02 2023-02-02 シェイプ セラピューティクス インコーポレイテッド 治療的編集
CN113397996A (zh) * 2021-07-23 2021-09-17 河南省人民医院 一种抗菌漱口水及其制备方法
CN114917227B (zh) * 2022-05-19 2023-10-31 中国人民解放军海军军医大学 依伐卡托在制备抗蜱传脑炎病毒、西尼罗病毒、黄热病毒和基孔肯雅热病毒感染药中的应用

Family Cites Families (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5616483A (en) * 1992-06-11 1997-04-01 Aktiebolaget Astra Genomic DNA sequences encoding human BSSL/CEL
NZ266386A (en) 1993-05-11 1997-11-24 Univ North Carolina Use of antisense rna oligonucleotides in regulating gene expression
US6207455B1 (en) 1997-05-01 2001-03-27 Lung-Ji Chang Lentiviral vectors
JP4390860B2 (ja) 1997-05-13 2009-12-24 ユニヴァーシティ・オヴ・ノース・キャロライナ・アト・チャペル・ヒル レンチウイルスをベースにした遺伝子転移ベクター
US5994136A (en) 1997-12-12 1999-11-30 Cell Genesys, Inc. Method and means for producing high titer, safe, recombinant lentivirus vectors
US6218181B1 (en) 1998-03-18 2001-04-17 The Salk Institute For Biological Studies Retroviral packaging cell line
US6683173B2 (en) 1998-04-03 2004-01-27 Epoch Biosciences, Inc. Tm leveling methods
DE19909769A1 (de) 1999-03-05 2000-09-07 Bundesrepublik Deutschland Let Von SIVagm abgeleitete lentivirale Vektoren, Verfahren zu ihrer Herstellung und ihre Verwendung zur Genübertragung in Säugerzellen
WO2005094370A2 (en) 2004-03-29 2005-10-13 The General Hospital Corporation Oligonucleotide complex compositions and methods of use as gene alteration tools
EP2151248A1 (en) 2008-07-30 2010-02-10 Johann Bauer Improved pre-mRNA trans-splicing molecule (RTM) molecules and their uses
US20130059902A1 (en) 2010-02-08 2013-03-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions useful in treatment of diseases or conditions related to repeat expansion
EP3431604A1 (en) * 2010-04-23 2019-01-23 Arrowhead Pharmaceuticals, Inc. Organic compositions to treat beta-enac-related diseases
US8779128B2 (en) 2010-05-28 2014-07-15 Sarepta Therapeutics, Inc. Oligonucleotide analogues having modified intersubunit linkages and/or terminal groups
SI2852668T1 (sl) * 2012-07-12 2016-09-30 Proqr Therapeutics Ii B.V. Oligonukleotidi za izvedbo spremembe v sekvenci tarčne molekule rna, prisotne v živeči celici
US20150209448A1 (en) 2012-07-12 2015-07-30 Proqr Therapeutics N.V. Exon replacement with stabilized artificial rnas

Also Published As

Publication number Publication date
US20150197744A1 (en) 2015-07-16
WO2014011053A1 (en) 2014-01-16
BR112015000710A8 (pt) 2018-04-03
CY1117858T1 (el) 2017-05-17
CN104640986A (zh) 2015-05-20
IL236654B (en) 2018-02-28
JP6373833B2 (ja) 2018-08-15
JP2015523082A (ja) 2015-08-13
DK3103872T3 (en) 2018-10-22
EP2852668B1 (en) 2016-04-27
US9994856B2 (en) 2018-06-12
RS54944B1 (sr) 2016-11-30
US20170152518A1 (en) 2017-06-01
ES2584856T3 (es) 2016-09-29
HRP20160854T1 (hr) 2016-09-23
BR112015000710A2 (ru) 2017-08-15
CA2878934A1 (en) 2014-01-16
NZ703824A (en) 2018-06-29
PL2852668T3 (pl) 2016-11-30
EP2852668A1 (en) 2015-04-01
EP3103872A1 (en) 2016-12-14
HUE029977T2 (en) 2017-04-28
SMT201600234B (it) 2016-08-31
PT2852668T (pt) 2016-07-13
MX356625B (es) 2018-06-06
CN104640986B (zh) 2018-08-28
RU2663110C2 (ru) 2018-08-01
AU2013287353B2 (en) 2018-11-08
EP3103872B1 (en) 2018-08-29
HK1208491A1 (zh) 2016-03-04
US9605255B2 (en) 2017-03-28
MX2015000506A (es) 2015-06-03
IL236654A0 (en) 2015-02-26
DK2852668T3 (en) 2016-05-30
AU2013287353A1 (en) 2015-02-26
SI2852668T1 (sl) 2016-09-30
ES2698522T3 (es) 2019-02-05
KR20150037968A (ko) 2015-04-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2015104763A (ru) Олигонуклеотиды для введения изменения в последовательность молекулы целевой рнк в живой клетке
JP2015523082A5 (ru)
JP7504464B2 (ja) 核酸ワクチン
CN109477103A (zh) 单链rna-编辑寡核苷酸
US20170362605A1 (en) Terminal modifications of polynucleotides
CN110799647A (zh) 双尾自递送sirna及相关的方法
WO2013138427A1 (en) Microvesicle-mediated delivery of therapeutic molecules
US20180078620A1 (en) Method of Treating or Preventing Eye Disease Using Cas9 Protein and Guide RNA
CN111936150A (zh) 抗癌微小rna及其脂质制剂
WO2020261227A1 (en) Micellar nanoparticles and uses thereof
US20240131048A1 (en) Micellar nanoparticles and uses thereof
US20240091151A1 (en) Micellar nanoparticles and uses thereof
EP4183879A1 (en) Double-stranded oligonucleotide and composition for treating covid-19 containing same
CA3186872A1 (en) Baculovirus expression systems
WO2021204928A1 (en) Genetically reprogrammed mycoplasma bacteria and uses thereof
Tekintaş et al. Antisense oligonucleotides: a promising therapeutic option against infectious diseases
EP4008785A1 (en) Circular nucleic acids and uses thereof for interfering with genome expression and proliferation of coronaviruses
TW202223095A (zh) 串聯指環病毒構築體
JP2009203173A (ja) siRNA−ポリカチオン複合体を含有するイオントフォレーシス用組成物
Lei et al. Nanomaterials-assisted gene editing and synthetic biology for optimizing the treatment of pulmonary diseases
WO2020154594A2 (en) Compositions and methods for treatment of human papillomavirus
US20220143065A1 (en) Use of the mir-27a-5p microrna for treating clostridium difficile-induced bowel inflammation
TW202313068A (zh) 用於抑制黏蛋白5AC(MUC5AC)表現之RNAi藥劑、其組合物及使用方法
TW202221126A (zh) 用於鑑別及特徵化指環病毒之方法及其用途
US20240216529A1 (en) Extracellular vesicles with targeting moiety

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20190713