RU2012151273A - Прогностические маркеры, пригодные для лечения синдрома ломкой х-хромосомы (fxs) - Google Patents

Прогностические маркеры, пригодные для лечения синдрома ломкой х-хромосомы (fxs) Download PDF

Info

Publication number
RU2012151273A
RU2012151273A RU2012151273/10A RU2012151273A RU2012151273A RU 2012151273 A RU2012151273 A RU 2012151273A RU 2012151273/10 A RU2012151273/10 A RU 2012151273/10A RU 2012151273 A RU2012151273 A RU 2012151273A RU 2012151273 A RU2012151273 A RU 2012151273A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
individual
fmr1
sample
fxs
determining
Prior art date
Application number
RU2012151273/10A
Other languages
English (en)
Inventor
Бальтазар Гомес-Манкилла
Юньшэн ХЭ
Дональд Джонс
Джоанн МЕЙЕР
Чарльз ПАУЛДИНГ
Original Assignee
Новартис Аг
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=44121075&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=RU2012151273(A) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Новартис Аг filed Critical Новартис Аг
Publication of RU2012151273A publication Critical patent/RU2012151273A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/5308Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for analytes not provided for elsewhere, e.g. nucleic acids, uric acid, worms, mites
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/154Methylation markers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

1. Способ определения восприимчивости индивида с синдромом ломкой Х-хромосомы (FXS) к лечению антагонистом mGluR5, причем указанный способ включает:выделение образца РНК от индивида, имеющего синдром ломкой Х-хромосомы;проведение анализа, который детектирует транскрипт мРНК FMR1 в указанном образце; ипризнание индивида в качестве респондера mGluR5, если указанный образец имеет пониженный уровень экспрессии мРНК FMR1 по сравнению с контролем.2. Способ по п. 1, где указанный анализ является выбранным из группы, состоящей из анализа по методике норзерн-блоттинга, полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (RT-PCR), RT-PCR ELISA, количественной RT-PCR, основанной на применении TaqMan (количественной RT-PCR, основанной на применении зонда) и количественной RT-PCR, основанной на применении SYBR green.3. Способ определения восприимчивости индивида с FXS к лечению антагонистом mGluR5, причем указанный способ включает:выделение образца от индивида, имеющего синдром ломкой Х-хромосомы;проведение анализа, который определяет количество белка FMR1 в указанном образце; ипризнание индивида в качестве респондера mGluR5, если указанный образец имеет пониженное количество белка FMR1 (FMRP) по сравнению с контролем.4. Способ по п. 3, где указанный анализ является выбранным из группы, состоящей из иммуногистохимии, ELISA, проточной цитометрии, вестерн-блоттинга, HPLC и масс-спектрометрии.5. Способ определения восприимчивости индивида с синдромом ломкой Х-хромосомы (FXS) к лечению антагонистом mGluR5, причем указанный способ включает:предоставление образца нуклеиновой кислоты от индивида, имеющего FXS;определение степени метилирования области гена умственной отсталости 1, связа�

Claims (14)

1. Способ определения восприимчивости индивида с синдромом ломкой Х-хромосомы (FXS) к лечению антагонистом mGluR5, причем указанный способ включает:
выделение образца РНК от индивида, имеющего синдром ломкой Х-хромосомы;
проведение анализа, который детектирует транскрипт мРНК FMR1 в указанном образце; и
признание индивида в качестве респондера mGluR5, если указанный образец имеет пониженный уровень экспрессии мРНК FMR1 по сравнению с контролем.
2. Способ по п. 1, где указанный анализ является выбранным из группы, состоящей из анализа по методике норзерн-блоттинга, полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (RT-PCR), RT-PCR ELISA, количественной RT-PCR, основанной на применении TaqMan (количественной RT-PCR, основанной на применении зонда) и количественной RT-PCR, основанной на применении SYBR green.
3. Способ определения восприимчивости индивида с FXS к лечению антагонистом mGluR5, причем указанный способ включает:
выделение образца от индивида, имеющего синдром ломкой Х-хромосомы;
проведение анализа, который определяет количество белка FMR1 в указанном образце; и
признание индивида в качестве респондера mGluR5, если указанный образец имеет пониженное количество белка FMR1 (FMRP) по сравнению с контролем.
4. Способ по п. 3, где указанный анализ является выбранным из группы, состоящей из иммуногистохимии, ELISA, проточной цитометрии, вестерн-блоттинга, HPLC и масс-спектрометрии.
5. Способ определения восприимчивости индивида с синдромом ломкой Х-хромосомы (FXS) к лечению антагонистом mGluR5, причем указанный способ включает:
предоставление образца нуклеиновой кислоты от индивида, имеющего FXS;
определение степени метилирования области гена умственной отсталости 1, связанной с ломкой Х-хромосомой (FMR1), в указанном образце, где уровень метилирования в образце относительно контроля является показателем того, является ли указанный индивид респондером mGluR5.
6. Способ определения восприимчивости индивида с синдромом ломкой Х-хромосомы (FXS) к лечению антагонистом mGluR5, причем указанный способ включает:
предоставление образца нуклеиновой кислоты от индивида, имеющего FXS;
определение степени метилирования области гена умственной отсталости 1, связанной с ломкой Х-хромосомой (FMR1), в указанном образце; и
признание индивида респондером mGluR5, если область гена FMR1, присутствующего в указанном образце, является полностью метилированной.
7. Способ по любому из пп. 1, 3, 5 или 6, где антагонист mGluR5 представляет собой сложный метиловый эфир (-)-(3aR,4S,7aR)-4-гидрокси-4-м-толилэтинилоктагидроиндол-1-карбоновой кислоты.
8. Способ по п. 6, где указанное определение можно проводить, применяя анализ, выбранный из расщепления чувствительным к метилированию рестрикционным ферментом, комбинированного по меньшей мере с одним из следующих способов анализа: Саузерн-блоттинга или количественной PCR (основанной на применении зонда или SYBR green), или из бисульфитного модифицирования ДНК, комбинированного по меньшей мере с одним из следующих способов анализа: специфичной к метилированию PCR (MSP), специфичной к метилированию количественной PCR (основанной на применении зонда или SYBR green) или пиросеквенирования.
9. Способ определения восприимчивости индивида с синдромом ломкой Х-хромосомы (FXS) к лечению антагонистом mGluR5, причем указанный способ включает:
определение в указанном образце, полученном от индивида, имеющего FXS, присутствия транскрипта мРНК FMR1, белка FMR1 или метилирования области гена FMR1, или их комбинации; и
признание указанного индивида респондером mGluR5, если указанный образец имеет пониженный уровень мРНК FMR1 по сравнению с контролем, пониженный уровень белка FMR1 по сравнению с контролем, или если присутствующая область гена FMR1 является полностью метилированной.
10. Способ по п. 9, где указанный способ включает определение присутствия мРНК FMR1 и белка FMR1.
11. Способ по любому из пп. 6, 8 или 9, где участок гена FMR1 представляет собой SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2 или SEQ ID NO:3.
12. Способ по любому из пп. 1, 3, 5, 6 или 9, где указанный способ дополнительно включает введение антагониста mGluR5.
13. Способ по п. 12, где антагонист mGluR5 представляет собой сложный метиловый эфир (-)-(3aR,4S,7aR)-4-гидрокси-4-м-толилэтинилоктагидроиндол-1-карбоновой кислоты.
14. Диагностический комплект для определения того, является ли индивид с синдромом ломкой Х-хромосомы (FXS) респондером антагониста mGluR5, содержащий:
средство для измерения транскрипта мРНК FMR1, уровней белка FMR1 или метилирования области гена FMR1, или их любой комбинации;
и инструкцию по применению.
RU2012151273/10A 2010-04-30 2011-04-28 Прогностические маркеры, пригодные для лечения синдрома ломкой х-хромосомы (fxs) RU2012151273A (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US33029910P 2010-04-30 2010-04-30
US61/330,299 2010-04-30
US37919710P 2010-09-01 2010-09-01
US61/379,197 2010-09-01
PCT/US2011/034244 WO2011137206A1 (en) 2010-04-30 2011-04-28 Predictive markers useful in the treatment of fragile x syndrome (fxs)

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2012151273A true RU2012151273A (ru) 2014-06-10

Family

ID=44121075

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012151273/10A RU2012151273A (ru) 2010-04-30 2011-04-28 Прогностические маркеры, пригодные для лечения синдрома ломкой х-хромосомы (fxs)

Country Status (21)

Country Link
US (1) US20130052644A1 (ru)
EP (1) EP2563934A1 (ru)
JP (1) JP2013524840A (ru)
KR (1) KR20130100906A (ru)
CN (1) CN102869791A (ru)
AU (1) AU2011245372A1 (ru)
BR (1) BR112012027816A2 (ru)
CA (1) CA2797854A1 (ru)
CL (1) CL2012003027A1 (ru)
EC (1) ECSP12012317A (ru)
GT (1) GT201200293A (ru)
IL (1) IL222534A0 (ru)
MA (1) MA34263B1 (ru)
MX (1) MX2012012615A (ru)
PE (1) PE20130213A1 (ru)
RU (1) RU2012151273A (ru)
SG (1) SG184458A1 (ru)
TN (1) TN2012000485A1 (ru)
TW (1) TW201142293A (ru)
WO (1) WO2011137206A1 (ru)
ZA (1) ZA201207481B (ru)

Families Citing this family (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3578205A1 (en) 2010-08-06 2019-12-11 ModernaTX, Inc. A pharmaceutical formulation comprising engineered nucleic acids and medical use thereof
HUE058896T2 (hu) 2010-10-01 2022-09-28 Modernatx Inc N1-metil-pszeudo-uracilt tartalmazó ribonukleinsavak és azok felhasználásai
EP2655326A1 (en) * 2010-12-20 2013-10-30 Novartis AG 4- (hetero) aryl - ethynyl - octahydro - indole - 1 - carboxylic acid esters
JP2014511687A (ja) 2011-03-31 2014-05-19 モデルナ セラピューティクス インコーポレイテッド 工学操作された核酸の送達および製剤
US9464124B2 (en) 2011-09-12 2016-10-11 Moderna Therapeutics, Inc. Engineered nucleic acids and methods of use thereof
RU2648950C2 (ru) 2011-10-03 2018-04-02 Модерна Терапьютикс, Инк. Модифицированные нуклеозиды, нуклеотиды и нуклеиновые кислоты и их применение
EP2791160B1 (en) 2011-12-16 2022-03-02 ModernaTX, Inc. Modified mrna compositions
WO2013131981A1 (en) 2012-03-08 2013-09-12 Novartis Ag Predictive markers useful in the diagnosis and treatment of fragile x syndrome (fxs)
US9254311B2 (en) 2012-04-02 2016-02-09 Moderna Therapeutics, Inc. Modified polynucleotides for the production of proteins
US9572897B2 (en) 2012-04-02 2017-02-21 Modernatx, Inc. Modified polynucleotides for the production of cytoplasmic and cytoskeletal proteins
US9283287B2 (en) 2012-04-02 2016-03-15 Moderna Therapeutics, Inc. Modified polynucleotides for the production of nuclear proteins
AU2013243951A1 (en) 2012-04-02 2014-10-30 Moderna Therapeutics, Inc. Modified polynucleotides for the production of secreted proteins
EP2922554B1 (en) 2012-11-26 2022-02-23 ModernaTX, Inc. Terminally modified rna
US8980864B2 (en) 2013-03-15 2015-03-17 Moderna Therapeutics, Inc. Compositions and methods of altering cholesterol levels
WO2014152600A2 (en) * 2013-03-15 2014-09-25 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Measurement of cellular fmrp levels for high throughput drug screening and diagnosis of fragile x syndrome
EA201690675A1 (ru) 2013-10-03 2016-08-31 Модерна Терапьютикс, Инк. Полинуклеотиды, кодирующие рецептор липопротеинов низкой плотности
WO2015057736A1 (en) * 2013-10-14 2015-04-23 Indiana University Research And Technology Corporation Use of acamprosate to modulate erk 1-2 activation in animal models for fxs and asd and individuals diagnosed with fxs and asd
CN103981253A (zh) * 2014-03-27 2014-08-13 江苏佰龄全基因生物医学技术有限公司 一种用于检测脆性x染色体综合征的cgg重复数及agg插入信息的pcr试剂盒
WO2022104098A1 (en) * 2020-11-13 2022-05-19 Children's Hospital Medical Center Refined uses of gabaa receptor modulators in treatment of fragile x syndrome

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5786146A (en) 1996-06-03 1998-07-28 The Johns Hopkins University School Of Medicine Method of detection of methylated nucleic acid using agents which modify unmethylated cytosine and distinguishing modified methylated and non-methylated nucleic acids
US6017704A (en) 1996-06-03 2000-01-25 The Johns Hopkins University School Of Medicine Method of detection of methylated nucleic acid using agents which modify unmethylated cytosine and distinguishing modified methylated and non-methylated nucleic acids
US6143504A (en) * 1998-10-27 2000-11-07 Arch Development Corporation Methods and compositions for the diagnosis of fragile X syndrome
GB0128996D0 (en) * 2001-12-04 2002-01-23 Novartis Ag Organic compounds
IL166510A0 (en) 2002-08-09 2006-01-15 Nps Pharma Inc 1,2,4"oxadiazole as modulators of metabotropic glutamate receptor-5
JP4453297B2 (ja) 2003-05-27 2010-04-21 トヨタ自動車株式会社 車両用遊星歯車式多段変速機
TW200801005A (en) 2005-08-15 2008-01-01 Astrazeneca Ab Acetylenic piperazines as metabotropic glutamate receptor antagonists
WO2007044780A2 (en) * 2005-10-07 2007-04-19 Emory University Methods and systems for screening for and diagnosing dna methylation associated abnormalities and sex chromosome aneuploidies
US7855053B2 (en) * 2006-07-19 2010-12-21 The Regents Of The University Of California Methods for detecting the presence of expanded CGG repeats in the FMR1 gene 5′ untranslated region
BRPI0917564A2 (pt) 2008-08-04 2015-11-17 Novartis Ag bioensaio para proteína poli-q
US20100248239A1 (en) * 2009-03-24 2010-09-30 Mayo Foundation For Medical Education And Research Methods and materials for detecting fragile x mutations

Also Published As

Publication number Publication date
TW201142293A (en) 2011-12-01
EP2563934A1 (en) 2013-03-06
KR20130100906A (ko) 2013-09-12
IL222534A0 (en) 2012-12-31
ZA201207481B (en) 2013-06-26
AU2011245372A1 (en) 2012-11-29
WO2011137206A1 (en) 2011-11-03
MA34263B1 (fr) 2013-05-02
BR112012027816A2 (pt) 2017-08-08
JP2013524840A (ja) 2013-06-20
SG184458A1 (en) 2012-11-29
PE20130213A1 (es) 2013-03-19
MX2012012615A (es) 2012-12-17
US20130052644A1 (en) 2013-02-28
GT201200293A (es) 2014-06-09
CL2012003027A1 (es) 2014-02-14
ECSP12012317A (es) 2013-01-31
CN102869791A (zh) 2013-01-09
TN2012000485A1 (en) 2014-04-01
CA2797854A1 (en) 2011-11-03

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2012151273A (ru) Прогностические маркеры, пригодные для лечения синдрома ломкой х-хромосомы (fxs)
Daskalos et al. UHRF1‐mediated tumor suppressor gene inactivation in nonsmall cell lung cancer
Devaney et al. Epigenetic deregulation across chromosome 2q14. 2 differentiates normal from prostate cancer and provides a regional panel of novel DNA methylation cancer biomarkers
US20120053083A1 (en) Hepatocellular carcinoma
WO2012022634A1 (en) Classification, diagnosis and prognosis of multiple myeloma
Yao et al. microRNA-22 can regulate expression of the long non-coding RNA MEG3 in acute myeloid leukemia
Li et al. MiR-4500 regulates PLXNC1 and inhibits papillary thyroid cancer progression
Kloth et al. The SNP rs6441224 influences transcriptional activity and prognostically relevant hypermethylation of RARRES1 in prostate cancer
US20170253932A1 (en) Method for detecting bcr-abl inhibitor resistance-related mutation and data acquisition method for predicting bcr-abl inhibitor resistance using the same
Fan et al. RETRACTED ARTICLE: Circular RNA circGSE1 Promotes Cervical Cancer Progression Through miR-138-5p/Vimentin
JP6762539B2 (ja) Ocln−arhgap26遺伝子の検出方法
Thuresson et al. A novel Bweak hybrid allele lacks three enhancer repeats but generates normal ABO transcript levels
MY149655A (en) Detection and enumeration of microorganisms
WO2016183679A1 (en) Prognostic markers of acute myeloid leukemia survival
US20210292853A1 (en) Detection of cldn18-arhgap6 fusion gene or cldn18-arhgap26 fusion gene in pancreatic cancer
Zhong et al. SNP rs322931 (C> T) in miR-181b and rs7158663 (G> A) in MEG3 aggravate the inflammatory response of anal abscess in patients with Crohn’s disease
JP2019530451A (ja) 皮膚バリア機能診断用バイオマーカー組成物
CA3023841C (en) Methods and compositions for classifying dlbcl
ES2640524B1 (es) Uso de tcfl5/cha como nuevo marcador para el pronóstico y/o diagnóstico diferencial de leucemias linfoblásticas agudas
EP3218478B1 (en) Predicting productivity in early cell line development
WO2015148645A2 (en) Methods and kits for the prognosis and treatment of prostate cancer
JP2013000067A5 (ru)
AU2017270496B2 (en) Determination of genetic predisposition to aggressive prostate cancer
CN105671036A (zh) 一种检测人类cox-2基因多态性的试剂盒及其应用
Chen et al. Senescence and longevity in amniotic fluid derived cells

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20151109