RU2012121096A

RU2012121096A - Биомаркер меланомы

Info

Publication number: RU2012121096A
Application number: RU2012121096/10A
Authority: RU
Inventors: Ричард МОРГАН; Харви С. ПАНДХА
Original assignee: Зе Юниверсити Оф Саррей
Priority date: 2009-12-04
Filing date: 2010-07-13
Publication date: 2014-01-10
Also published as: ZA201203517B; EP2507384A1; CN102791878A; AU2010326433A1; CA2782034A1; IL219834A0; IN2012DN04381A; JP2013512668A; GB0921329D0; MX2012006229A; US20120263654A1; WO2011067549A1; BR112012013041A2

Abstract

1. Биомаркер, специфичный для меланомы, включающий:(I) последовательность нуклеиновой кислоты, включающую SEQ ID NO: 1 или фрагмент или вариант указанной последовательности нуклеиновой кислоты, или молекулу нуклеиновой кислоты, которая содержит указанную последовательность нуклеиновой кислоты, или(II) аминокислотную последовательность, включающую SEQ ID NO: 2 или фрагмент или вариант указанной аминокислотной последовательности, или аминокислотную молекулу, которая содержит указанную аминокислотную последовательность.2. Биомаркер по п.1, отличающийся тем, что указанный фрагмент включает: (I) по меньшей мере четыре, предпочтительно, по меньшей мере пять, предпочтительно, по меньшей мере шесть, предпочтительно по меньшей мере семь, предпочтительно по меньшей мере восемь последовательных аминокислот из SEQ ID NO: 2 или (II), фрагмент нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1, кодирующий по меньшей мере четыре, предпочтительно, по меньшей мере пять, предпочтительно, по меньшей мере шесть, предпочтительно, по меньшей мере семь, предпочтительно, по меньшей мере восемь последовательных аминокислот из SEQ ID NO: 2.3. Биомаркер по п.1, отличающийся тем, что указанный фрагмент или вариант включает:(I) последовательность нуклеиновой кислоты, которая имеет по меньшей мере приблизительно 50%, или по меньшей мере приблизительно 60%, или по меньшей мере приблизительно 70%, или по меньшей мере приблизительно 75%, или по меньшей мере приблизительно 80%, или по меньшей мере приблизительно 85%, или по меньшей мере приблизительно 90%, или по меньшей мере приблизительно 95%, или по меньшей мере приблизительно 96%, или по меньшей мере приблизительно 97%, или по меньшей мере приблизител

Claims

1. Биомаркер, специфичный для меланомы, включающий:

(I) последовательность нуклеиновой кислоты, включающую SEQ ID NO: 1 или фрагмент или вариант указанной последовательности нуклеиновой кислоты, или молекулу нуклеиновой кислоты, которая содержит указанную последовательность нуклеиновой кислоты, или

(II) аминокислотную последовательность, включающую SEQ ID NO: 2 или фрагмент или вариант указанной аминокислотной последовательности, или аминокислотную молекулу, которая содержит указанную аминокислотную последовательность.

2. Биомаркер по п.1, отличающийся тем, что указанный фрагмент включает: (I) по меньшей мере четыре, предпочтительно, по меньшей мере пять, предпочтительно, по меньшей мере шесть, предпочтительно по меньшей мере семь, предпочтительно по меньшей мере восемь последовательных аминокислот из SEQ ID NO: 2 или (II), фрагмент нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1, кодирующий по меньшей мере четыре, предпочтительно, по меньшей мере пять, предпочтительно, по меньшей мере шесть, предпочтительно, по меньшей мере семь, предпочтительно, по меньшей мере восемь последовательных аминокислот из SEQ ID NO: 2.

3. Биомаркер по п.1, отличающийся тем, что указанный фрагмент или вариант включает:

(I) последовательность нуклеиновой кислоты, которая имеет по меньшей мере приблизительно 50%, или по меньшей мере приблизительно 60%, или по меньшей мере приблизительно 70%, или по меньшей мере приблизительно 75%, или по меньшей мере приблизительно 80%, или по меньшей мере приблизительно 85%, или по меньшей мере приблизительно 90%, или по меньшей мере приблизительно 95%, или по меньшей мере приблизительно 96%, или по меньшей мере приблизительно 97%, или по меньшей мере приблизительно 98%, или по меньшей мере приблизительно 99% идентичности последовательности нуклеиновой кислоты с SEQ ID NO: 1, последовательность нуклеиновой кислоты, которая гибридизуется с указанной последовательностью при жестких условиях и/или последовательность нуклеиновой кислоты, которая комплементарна указанной последовательности;

(II) аминокислотную последовательность, которая имеет по меньшей мере приблизительно 50%, или по меньшей мере приблизительно 60%, или по меньшей мере приблизительно 70%, или по меньшей мере приблизительно 75%, или по меньшей мере приблизительно 80%, или по меньшей мере приблизительно 85%, или по меньшей мере приблизительно 90%, или по меньшей мере приблизительно 95%, или по меньшей мере приблизительно 96%, или по меньшей мере приблизительно 97%, или по меньшей мере приблизительно 98%, или по меньшей мере приблизительно 99% идентичности по последовательности аминокислот с SEQ ID NO: 2, или

(III) аминокислотную последовательность, кодируемую нуклеиновой кислотой (I).

4. Биомаркер по п.3, отличающийся тем, что указанный фрагмент включает: (I) по меньшей мере четыре, предпочтительно, по меньшей мере пять, предпочтительно, по меньшей мере шесть, предпочтительно по меньшей мере семь, предпочтительно по меньшей мере восемь последовательных аминокислот из SEQ ID NO: 2 или (II), фрагмент нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 1, кодирующий по меньшей мере четыре, предпочтительно, по меньшей мере пять, предпочтительно, по меньшей мере шесть, предпочтительно, по меньшей мере семь, предпочтительно, по меньшей мере восемь последовательных аминокислот из SEQ ID NO: 2.

5. Биомаркер по любому из предыдущих пунктов, отличающийся тем, что указанный фрагмент или вариант представляет собой функциональный фрагмент или вариант.

6. Способ диагностики меланомы у пациента или способ выявления пациента, у которого присутствует риск развития меланомы, включающий:

(а) определение количества специфичного для меланомы биомаркера по любому предыдущих пунктов в образце, полученном от пациента;

(б) сравнение количества выявленного указанного специфичного для меланомы биомаркера в образце от указанного пациента с количеством указанного специфичного для меланомы биомаркера в нормальном контрольном образце;

при этом разница в количестве указанного специфичного для меланомы биомаркера в образце от указанного пациента по сравнению с количеством указанного специфичного для меланомы биомаркера в нормальном контрольном образце ассоциирована с наличием меланомы или ассоциирована с риском развития меланомы.

7. Способ по п.6, который применяют для выявления ранней стадии меланомы, согласно которому увеличение количества биомаркера в образце, полученном от пациента, по сравнению с контролем, свидетельствует о ранней стадии меланомы.

8. Способ по п.6, который применяют для выявления поздней стадии меланомы, согласно которому увеличение количества биомаркера в образце, полученном от пациента по сравнению с контролем, свидетельствует о поздней стадии меланомы.

9. Способ по любому из пп.6-8, отличающийся тем, что указанный образец включает биологическую жидкость или ткань, полученную от пациента.

10. Способ по п.9, отличающийся тем, что указанная биологическая жидкость или ткань включает кровь, сыворотку, плазму или лимфатическую жидкость.

11. Способ мониторинга прогрессирования меланомы у пациента, включающий:

(а) определение количества специфичного для меланомы биомаркера по любому из пп.1-5 в образце, полученном от пациента;

(б) сравнение указанного определенного количества специфичного для меланомы биомаркера в образце от указанного пациента с количеством специфичного для меланомы биомаркера в нормальном контрольном образце; и

(в) повторение этапов (а) и (б) в два или более моментов времени,

при этом увеличение количества указанного специфичного для меланомы биомаркера у пациента с течением времени ассоциировано с увеличением прогрессирования меланомы, а снижение количества указанного специфичного для меланомы биомаркера у пациента со временем ассоциировано с уменьшением прогрессирования меланомы.

12. Способ по п.11, который применяют для мониторинга изменений стадии меланомы, согласно которому увеличение количества биомаркера, по сравнению с образцом, взятом на более ранней стадии заболевания, или контролем, свидетельствует о прогрессировании меланомы с более ранней стадии к более поздней стадии заболевания.

13. Способ по любому из пп.11 или 12, отличающийся тем, что указанный образец включает биологическую жидкость или ткань, полученную от пациента.

14. Способ по п.13, отличающийся тем, что указанная биологическая жидкость или ткань включает кровь, сыворотку, плазму или лимфатическую жидкость.

15. Способ мониторинга эффективности лечения меланомы, включающий детектирование и/или количественную оценку специфичного для меланомы биомаркера по любому из пп.1-5 в образце, полученном от пациента.

16. Способ по п.15, отличающийся тем, что указанный образец включает биологическую жидкость или ткань, полученную от пациента.

17. Способ по п.16, отличающийся тем, что указанная биологическая жидкость или ткань включает кровь, сыворотку, плазму или лимфатическую жидкость.

18. Способ лечения пациента с меланомой, включающий введение пациенту терапевтически эффективного количества (I) биомаркера по любому из пп.1-5, или (II) антитела или его фрагмента, специфически связывающегося с биомаркером по любому из пп.1-5.

19. Способ по п.18, отличающийся тем, что указанное антитело конъюгировано с цитотоксическим агентом.

20. Способ визуализации меланомы у пациента, включающий введение пациенту антитела или его фрагмента, специфически связывающегося с биомаркером по любому из пп.1-5.

21. Способ по любому из пп.18-20, отличающийся тем, что указанное антитело конъюгировано с выявляемым маркером.

22. Композиция, содержащая биомаркер по любому из пп.1-5, или антитело или фрагмент указанного антитела, которое связывается с биомаркером по любому из пп.1-5.

23. Фармацевтическая композиция, содержащая композицию по п.22.

24. Вакцина против меланомы, включающая биомаркер по любому из пп.1-5.

25. Применение специфичного для меланомы биомаркера по любому из пп.1-5, обнаруживаемого в жидкости организма, в качестве биомаркера меланомы.

26. Применение (I) биомаркера по любому из пп.1-5, или (II) антитела или его фрагмента, специфично связывающегося с биомаркером по любому из пп.1-5, в производстве лекарственного средства для лечения меланомы.

27. Композиция, которая содержит (I) биомаркер по любому из пп.1-5, или (II) антитело или фрагмент указанного антитела, которое специфично связывается с биомаркером по любому из пп.1-5, при этом указанная композиция предназначена для применения при лечении меланомы.

28. Антитело или фрагмент указанного антитела, которое специфично связывается с биомаркером по любому из пп.1-4, для применения в способе визуализации меланомы у пациента.

29. Набор для использования в способе по любому из пп.6-21 или для применения по п.25, при этом указанный набор включает лиганд, способный связываться или специфично узнавать специфичный для меланомы биомаркер по любому из пп.1-5, обнаруживаемый в жидкости или ткани организма, и репортерное средство.