RU2011143788A

RU2011143788A - Способ детектирования анти-sith-1 антитела в биологическом образце

Info

Publication number: RU2011143788A
Application number: RU2011143788/15A
Authority: RU
Inventors: Йосимицу ТАКАКУРА; Наоми ОКА; Казухиро Кондо; Нобуюки Кобаяси
Original assignee: Джапан Тобакко Инк.
Priority date: 2009-03-31
Filing date: 2010-03-31
Publication date: 2013-05-10
Also published as: JPWO2010114029A1; SG174938A1; WO2010114029A1; KR20110137379A; EP2416159A4; EP2416159A1; US9139617B2; TW201040529A; IL215322A0; BRPI1015458A2; AU2010232303A1; US20120107842A1; CA2756006A1; CN102449483A

Abstract

1. Способ детектирования антитела против небольшого белка, кодируемого транскриптом HHV-6 (SITH-1) на промежуточной стадии инфицирования в биологическом образце, где указанный способ включает:1) обеспечение белка SITH-1;2) связывание белка SITH-1, полученного в стадии (1), с носителем; и3) приведение биологического образца в контакт с носителем, связанным с белком SITH-1 и полученным на стадии (2), для детектирования антитела против белка SITH-1.2. Способ по п.1, где белок SITH-1 выбран из группы, состоящей из:(a) белка, имеющего аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1;(b) белка, который имеет аминокислотную последовательность, содержащую делецию, замену, инсерцию и/или добавление одной или более аминокислот в аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1, и который обладает способностью увеличивать концентрацию внутриклеточного кальция;(c) белка, аминокислотная последовательность которого, по меньшей мере, на 80% идентична аминокислотой последовательности SEQ ID NO:1 и который обладает способностью увеличивать концентрацию внутриклеточного кальция;(d) белка, имеющего аминокислотную последовательность, кодируемую нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:2;(e) белка, который имеет аминокислотную последовательность, кодируемую нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, включающей делецию, замену, инсерцию и/или добавление одного или более нуклеотидов в нуклеотидную последовательность SEQ ID NO:2, и который обладает способностью увеличивать концентрацию внутриклеточного кальция;(f) белка, имеющего аминокислотную последовательность, кодируемую нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотид�

Claims

1. Способ детектирования антитела против небольшого белка, кодируемого транскриптом HHV-6 (SITH-1) на промежуточной стадии инфицирования в биологическом образце, где указанный способ включает:

1) обеспечение белка SITH-1;

2) связывание белка SITH-1, полученного в стадии (1), с носителем; и

3) приведение биологического образца в контакт с носителем, связанным с белком SITH-1 и полученным на стадии (2), для детектирования антитела против белка SITH-1.

2. Способ по п.1, где белок SITH-1 выбран из группы, состоящей из:

(a) белка, имеющего аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1;

(b) белка, который имеет аминокислотную последовательность, содержащую делецию, замену, инсерцию и/или добавление одной или более аминокислот в аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1, и который обладает способностью увеличивать концентрацию внутриклеточного кальция;

(c) белка, аминокислотная последовательность которого, по меньшей мере, на 80% идентична аминокислотой последовательности SEQ ID NO:1 и который обладает способностью увеличивать концентрацию внутриклеточного кальция;

(d) белка, имеющего аминокислотную последовательность, кодируемую нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:2;

(e) белка, который имеет аминокислотную последовательность, кодируемую нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, включающей делецию, замену, инсерцию и/или добавление одного или более нуклеотидов в нуклеотидную последовательность SEQ ID NO:2, и который обладает способностью увеличивать концентрацию внутриклеточного кальция;

(f) белка, имеющего аминокислотную последовательность, кодируемую нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, которая на 80% или более идентична нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:2, где указанный белок обладает способностью увеличивать концентрацию внутриклеточного кальция;

(g) белка, кодируемого нуклеиновой кислотой, гибридизующейся в жестких условиях гибридизации с нуклеиновой кислотой, состоящей из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:2, где указанный белок обладает способностью увеличивать концентрацию внутриклеточного кальция.

3. Способ по п.1, где стадия (3) в п.1 включает добавление смеси:

(a) биологического образца и

(b) экстракта клеточного гомогената, полученного от клеток такого же вида, как и клетки хозяина, используемые для экспрессии белка SITH-1 в стадии (1)

к носителю, связанному с белком SITH-1 и полученному в стадии (2).

4. Способ по п.1, где стадия (2) в п.1 включает связывание белка SITH-1 с носителем посредством связывания биотина с биотинсвязывающим белком.

5.Способ по п.4, где стадия (3) в п.1 включает добавление смеси:

(а) биологического образца и

(b-i) экстракта клеточного гомогената, полученного от клеток такого же вида, как и клетки хозяина, используемые для экспрессии белка SITH-1, биотинилированного белка SITH-1 и/или биотинсвязывающего белка в стадии (1) или (2), в комбинации с биотинсвязывающим белком; или

(b-ii) экстракта клеточного гомогената, полученного от клеток, генетически сконструированных так, чтобы они экспрессировали биотинсвязывающий белок, где указанные клетки принадлежат к такому же виду, как и клетки-хозяева, используемые для экспрессии белка SITH-1, биотинилированного белка SITH-1 и/или биотинсвязывающего белка в стадии (1) или (2);

к носителю с присоединенным к нему белком SITH-1, полученному в стадии (2).

6. Способ по п.3, где стадия 3(b) в п.3 или стадия 3(b-i) в п.5 включает добавление в качестве экстракта клеточного гомогената, экстракта клеточного гомогената, выделенного из клеток, содержащих любой вектор.

7. Способ по п.4 или 5, где указанный биотинсвязывающий белок представляет собой тамавидин или его мутант.

8. Способ по п.1 или 2, где биологический образец выбран из группы, состоящей из крови, сыворотки, цереброспинальной жидкости, слюны, мазка из горла, пота, мочи, слез, лимфы, спермы, перитонеальной жидкости и материнского молока.

9. Носитель для детектирования антитела против небольшого белка, кодируемого транскриптом HHV-6 (SITH-1) на промежуточной стадии инфицирования в биологическом образце, где указанный носитель содержит связанный с ним белок SITH-1.

10. Носитель по п.9, где белок SITH-1 и носитель связаны друг с другом посредством связывания биотина с биотинсвязывающим белком.

11. Набор для детектирования антитела против небольшого белка, кодируемого транскриптом HHV-6 (SITH-1) на промежуточной стадии инфицирования в биологическом образце, где указанный набор включает:

A) носитель, содержащий связанный с ним белок SITH-1; и

B) агент для разведения биологического образца, включающий экстракт клеточного гомогената, полученный из клеток такого же вида, как и клетки-хозяева, используемые для экспрессии белка SITH-1 из А).

12. Набор по п.11, где носителем из А) является носитель, содержащий белок SITH-1, связанный с указанным носителем посредством связывания биотина с биотинсвязывающим белком, и где агентом из В) является агент для разведения биологического образца, включающий:

(i) экстракт клеточного гомогената, полученный из клеток такого же вида, как и клетки-хозяева, используемые для экспрессии белка SITH-1, биотинилированного белка SITH-1 и/или биотинсвязывающего белка из А) в комбинации с биотинсвязывающим белком, или

(ii) экстракт клеточного гомогената, полученный из клеток, генетически сконструированных так, чтобы они экспрессировали биотинсвязывающий белок, где указанные клетки принадлежат к такому же виду, как и клетки-хозяева, используемые для экспрессии белка SITH-1; биотинилированного белка SITH-1 и/или биотинсвязывающего белка из А).

13. Набор для детектирования антитела против небольшого белка, кодируемого транскриптом HHV-6 (SITH-1) на промежуточной стадии инфицирования в биологическом образце, где указанный набор включает:

A) белок SITH-1;

B) носитель для иммобилизации белка SITH-1 из А); и

C) агент для разведения биологического образца, включающий экстракт клеточного гомогената, полученный из клеток такого же вида, как и клетки-хозяева, используемые для экспрессии белка SITH-1 из А).

14. Набор по п.13, где:

белок SITH-1 из А) является биотинилированным,

носитель из В) непосредственно или опосредованно связан с биотинсвязывающим белком, и

агентом из С) является агент для разведения биологического образца, который включает:

(i) экстракт клеточного гомогената, полученный из клеток такого же вида, как и клетки-хозяева, используемые для экспрессии белка SITH-1, биотинилированного белка SITH-1 и/или биотинсвязывающего белка из А) или В), в комбинации с биотинсвязывающим белком; или

(ii) экстракт клеточного гомогената, полученный из клеток, генетически сконструированных так, чтобы они экспрессировали биотинсвязывающий белок, где указанные клетки принадлежат к такому же виду, как и клетки-хозяева, используемые для экспрессии белка SITH-1; биотинилированного белка SITH-1 и/или биотинсвязывающего белка из А) или В).

15. Способ по п.6, где биотинсвязывающий белок представляет собой тамавидин или его мутант.