RU2011129747A - Способы, относящиеся к модифицированным гликанам - Google Patents
Способы, относящиеся к модифицированным гликанам Download PDFInfo
- Publication number
- RU2011129747A RU2011129747A RU2011129747/04A RU2011129747A RU2011129747A RU 2011129747 A RU2011129747 A RU 2011129747A RU 2011129747/04 A RU2011129747/04 A RU 2011129747/04A RU 2011129747 A RU2011129747 A RU 2011129747A RU 2011129747 A RU2011129747 A RU 2011129747A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- glycans
- glycan preparation
- contain less
- separated
- glycoconjugates
- Prior art date
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/5308—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for analytes not provided for elsewhere, e.g. nucleic acids, uric acid, worms, mites
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/52—Use of compounds or compositions for colorimetric, spectrophotometric or fluorometric investigation, e.g. use of reagent paper and including single- and multilayer analytical elements
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2400/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates
- G01N2400/10—Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
- G01N2400/38—Heteroglycans, i.e. polysaccharides having more than one sugar residue in the main chain in either alternating or less regular sequence, e.g. gluco- or galactomannans, e.g. Konjac gum, Locust bean gum, Guar gum
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Abstract
1. Способ, включающий стадии:a) обеспечения препарата гликана, из которого выделены сиаловые кислоты;b) подвергания препарата гликана методу разделения, который разделяет гликаны на основании отношения заряда к массе; иc) количественного определения, по меньшей мере, одного отделенного гликана, используя, по меньшей мере, один стандарт количественной оценки.2. Способ по п.1, где стадия обеспечения включает воздействие на композицию, содержащую гликаны, по меньшей мере, одним средством, которое отщепляет остатки сиаловой кислоты при условиях, которые позволяют отщепить остатки сиаловой кислоты.3. Способ по п.1, где препарат гликана содержит необычно модифицированные гликаны, выбранные из группы, содержащей сульфатированные гликаны, фосфорилированные гликаны, полиацетилированные сиалированные гликаны и их комбинации.4. Способ по п.3, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 50% гликанов, присутствующих в препарате гликана.5. Способ по п.4, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 10% гликанов, присутствующих в препарате гликана.6. Способ по п.4, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 5% гликанов, присутствующих в препарате гликана.7. Способ по п.4, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 1% гликанов, присутствующих в препарате гликана.8. Способ по п.4, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 0,1% гликанов, присутствующих в препарате гликана.9. Способ по п.4, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 0,05% гликанов, присутствующих в препарате гликана.10. Способ по п.1, дополнительно включающи�
Claims (31)
1. Способ, включающий стадии:
a) обеспечения препарата гликана, из которого выделены сиаловые кислоты;
b) подвергания препарата гликана методу разделения, который разделяет гликаны на основании отношения заряда к массе; и
c) количественного определения, по меньшей мере, одного отделенного гликана, используя, по меньшей мере, один стандарт количественной оценки.
2. Способ по п.1, где стадия обеспечения включает воздействие на композицию, содержащую гликаны, по меньшей мере, одним средством, которое отщепляет остатки сиаловой кислоты при условиях, которые позволяют отщепить остатки сиаловой кислоты.
3. Способ по п.1, где препарат гликана содержит необычно модифицированные гликаны, выбранные из группы, содержащей сульфатированные гликаны, фосфорилированные гликаны, полиацетилированные сиалированные гликаны и их комбинации.
4. Способ по п.3, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 50% гликанов, присутствующих в препарате гликана.
5. Способ по п.4, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 10% гликанов, присутствующих в препарате гликана.
6. Способ по п.4, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 5% гликанов, присутствующих в препарате гликана.
7. Способ по п.4, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 1% гликанов, присутствующих в препарате гликана.
8. Способ по п.4, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 0,1% гликанов, присутствующих в препарате гликана.
9. Способ по п.4, где необычно модифицированные гликаны содержат меньше чем около 0,05% гликанов, присутствующих в препарате гликана.
10. Способ по п.1, дополнительно включающий анализ структурных характеристик разделенных гликанов.
11. Способ по п.1, дополнительно включающий анализ моносахаридной композиции разделенных гликанов.
12. Способ по пп.10 или 11, где стадия анализа структурных характеристик включает осуществление метода, выбранного из группы, включающей ядерно-магнитный резонанс (ЯМР), масс-спектрометрию, жидкостную хроматографию, двумерную хроматографию, капиллярный электрофорез (CE) и их комбинации.
13. Способ по пп.1, 10 или 11, дополнительно включающий сравнение разделенных гликанов с ранее определенными разделенными гликанами.
14. Способ по п.13, где характеристики ранее определенных разделенных гликанов сохраняют в базе данных.
15. Способ по п.12, дополнительно включающий сравнение разделенных гликанов с ранее определенными разделенными гликанами.
16. Способ по п.15, где характеристики ранее определенных разделенных гликанов сохраняют в базе данных.
17. Способ по п.12, дополнительно включающий одну или более дополнительных стадий анализа структурных характеристик разделенных гликанов.
18. Способ по п.1, где стадия подвергания включает разделение препарата гликана на заряженной колонке.
19. Способ по п.18, где заряженная колонка представляет собой анионообменную колонку.
20. Способ по п.1, дополнительно включающий стадию мечения гликанов в препарате гликана.
21. Способ по п.20, где стандарт количественной оценки метят такими же метками, что и гликаны.
22. Способ по п.1, где стадия обеспечения включает обеспечение препарата гликанов, которые выделяют из гликоконъюгатов.
23. Способ по п.22, где гликоконъюгаты содержат гликопротеины.
24. Способ по п.22, где гликаны выделяют из гликоконъюгатов, используя полипептид гликозидазу.
25. Способ по п.22, где гликаны выделяют из гликоконъюгатов с помощью гидразинолиза.
26. Способ по п.22, где гликоконъюгаты получают из терапевтических составов, коммерческих биологических продуктов, биореакторов и биологических образцов.
27. Способ по п.22, где гликоконъюгаты получают из источников, выбранных из группы, включающей тканевую культуру, ткани людей или животных, растения, фрукты, овощи и их комбинации.
28. Способ по п.26, где гликоконъюгаты получают из жидкостей организма.
29. Способ по п.28, где гликоконъюгаты получают из жидкостей организма, выбранных из группы, включающей сыворотку, плазму, кровь, слюну, семенную жидкость, мочу, спиномозговую жидкость и их комбинации.
30. Способ по п.1, дополнительно включающий определение разделенных гликанов.
31. Способ по п.1, дополнительно включающий осуществление одного или более методов, которые позволяют разделить молекулы на основании размера, гидрофобности, заряда или их комбинации.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US13922408P | 2008-12-19 | 2008-12-19 | |
| US61/139,224 | 2008-12-19 | ||
| PCT/US2009/068790 WO2010071824A2 (en) | 2008-12-19 | 2009-12-18 | Methods related to modified glycans |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2011129747A true RU2011129747A (ru) | 2013-01-27 |
| RU2526250C2 RU2526250C2 (ru) | 2014-08-20 |
Family
ID=42269281
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2011129747/04A RU2526250C2 (ru) | 2008-12-19 | 2009-12-18 | Способы, относящиеся к модифицированным гликанам |
Country Status (9)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US9103821B2 (ru) |
| EP (1) | EP2358731B1 (ru) |
| JP (1) | JP2012513030A (ru) |
| CN (1) | CN102239173A (ru) |
| AU (1) | AU2009327435A1 (ru) |
| BR (1) | BRPI0923191A2 (ru) |
| CA (1) | CA2743181A1 (ru) |
| RU (1) | RU2526250C2 (ru) |
| WO (1) | WO2010071824A2 (ru) |
Families Citing this family (28)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP2702077A2 (en) | 2011-04-27 | 2014-03-05 | AbbVie Inc. | Methods for controlling the galactosylation profile of recombinantly-expressed proteins |
| US9650433B2 (en) | 2011-05-20 | 2017-05-16 | Momenta Pharmaceuticals, Inc. | Modified glycoproteins |
| CN102584728B (zh) * | 2011-12-16 | 2014-06-04 | 北京大学 | 一类基于三嗪结构的糖标记试剂及其合成方法和应用 |
| WO2013158273A1 (en) | 2012-04-20 | 2013-10-24 | Abbvie Inc. | Methods to modulate c-terminal lysine variant distribution |
| US9334319B2 (en) | 2012-04-20 | 2016-05-10 | Abbvie Inc. | Low acidic species compositions |
| US9067990B2 (en) | 2013-03-14 | 2015-06-30 | Abbvie, Inc. | Protein purification using displacement chromatography |
| US9505833B2 (en) | 2012-04-20 | 2016-11-29 | Abbvie Inc. | Human antibodies that bind human TNF-alpha and methods of preparing the same |
| US9512214B2 (en) | 2012-09-02 | 2016-12-06 | Abbvie, Inc. | Methods to control protein heterogeneity |
| WO2014151878A2 (en) | 2013-03-14 | 2014-09-25 | Abbvie Inc. | Methods for modulating protein glycosylation profiles of recombinant protein therapeutics using monosaccharides and oligosacharides |
| US9217168B2 (en) | 2013-03-14 | 2015-12-22 | Momenta Pharmaceuticals, Inc. | Methods of cell culture |
| US8956830B2 (en) | 2013-03-14 | 2015-02-17 | Momenta Pharmaceuticals, Inc. | Methods of cell culture |
| US9017687B1 (en) | 2013-10-18 | 2015-04-28 | Abbvie, Inc. | Low acidic species compositions and methods for producing and using the same using displacement chromatography |
| WO2014179601A2 (en) | 2013-05-02 | 2014-11-06 | Momenta Pharmaceuticals, Inc. | Sialylated glycoproteins |
| ES2708759T3 (es) | 2013-05-13 | 2019-04-11 | Momenta Pharmaceuticals Inc | Procedimientos para el tratamiento de la neurodegeneración |
| EP3052640A2 (en) | 2013-10-04 | 2016-08-10 | AbbVie Inc. | Use of metal ions for modulation of protein glycosylation profiles of recombinant proteins |
| WO2015057622A1 (en) | 2013-10-16 | 2015-04-23 | Momenta Pharmaceuticals, Inc. | Sialylated glycoproteins |
| US9085618B2 (en) | 2013-10-18 | 2015-07-21 | Abbvie, Inc. | Low acidic species compositions and methods for producing and using the same |
| US9181337B2 (en) | 2013-10-18 | 2015-11-10 | Abbvie, Inc. | Modulated lysine variant species compositions and methods for producing and using the same |
| US20150139988A1 (en) | 2013-11-15 | 2015-05-21 | Abbvie, Inc. | Glycoengineered binding protein compositions |
| GB201320571D0 (en) | 2013-11-21 | 2014-01-08 | Academisch Ziekenhuis Leiden | Glycan analysis |
| CN104677971B (zh) * | 2013-11-26 | 2017-12-26 | 杭州九源基因工程有限公司 | 一种epo突变体的毛细管电泳检测方法 |
| CN104807927B (zh) * | 2014-01-24 | 2016-08-17 | 中国医学科学院基础医学研究所 | 一种富集唾液酸化糖肽的方法 |
| CA2968372A1 (en) * | 2014-11-19 | 2016-05-26 | Amgen Inc. | Quantitation of glycan moiety in recombinant glycoproteins |
| CA2977271A1 (en) | 2015-03-02 | 2016-09-09 | Synthetic Genomics, Inc. | Regulatory elements from labyrinthulomycetes microorganisms |
| WO2017117218A1 (en) | 2015-12-30 | 2017-07-06 | Momenta Pharmaceuticals, Inc. | Methods related to biologics |
| US10633454B2 (en) | 2016-11-01 | 2020-04-28 | Conagen Inc. | Expression of modified glycoproteins and glycopeptides |
| CN111954713A (zh) * | 2018-03-05 | 2020-11-17 | 科纳根公司 | 用于产生具有低硫酸化的糖分子的生物体和方法 |
| CN108459116B (zh) * | 2018-07-06 | 2021-02-19 | 贵州大学 | 一种荧光高效液相色谱检测发酵红肉制品中Neu5Gc的方法 |
Family Cites Families (13)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5122469A (en) | 1990-10-03 | 1992-06-16 | Genentech, Inc. | Method for culturing Chinese hamster ovary cells to improve production of recombinant proteins |
| GB9022545D0 (en) | 1990-10-17 | 1990-11-28 | Wellcome Found | Culture medium |
| DE19527054A1 (de) | 1995-07-26 | 1997-01-30 | Behringwerke Ag | Verfahren zur Charakterisierung der Glycosylierung von Glycoproteinen sowie zur in-vitro Bestimmung der Bioverfügbarkeit von Glycoproteinen |
| US6045854A (en) * | 1997-03-31 | 2000-04-04 | Abbott Laboraties | Nutritional formulations containing oligosaccharides |
| PT1522590E (pt) | 2000-06-28 | 2009-10-26 | Glycofi Inc | Métodos para a produção de glicoproteínas modificadas |
| US20060127950A1 (en) * | 2004-04-15 | 2006-06-15 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods and products related to the improved analysis of carbohydrates |
| US20120225044A9 (en) * | 2004-09-07 | 2012-09-06 | Zymequest, Inc. | Compositions and methods for prolonging survival of platelets |
| US8039208B2 (en) * | 2005-04-26 | 2011-10-18 | National Institute For Bioprocessing Research And Training Limited (Nibrt) | Automated strategy for identifying physiological glycosylation markers(s) |
| FI20055398A0 (fi) * | 2005-07-08 | 2005-07-08 | Suomen Punainen Risti Veripalv | Menetelmä solupopulaatioiden evaluoimiseksi |
| WO2007061936A2 (en) * | 2005-11-18 | 2007-05-31 | New England Medical Center Hospitals, Inc. | Clearance of abnormal iga1 in iga1 deposition diseases |
| JP5368976B2 (ja) | 2006-06-02 | 2013-12-18 | ロバート サックステイン， | 細胞表面グリカンを修飾するための組成物および方法 |
| BRPI0810065A2 (pt) * | 2007-04-16 | 2020-01-14 | Momenta Pharmaceuticals Inc | caracterização de n-glicanos usando exoglicosidases |
| DK2135081T3 (da) * | 2007-04-16 | 2013-03-11 | Momenta Pharmaceuticals Inc | Fremgangsmåder i forbindelse med celleoverfladeglycosylering |
-
2009
- 2009-12-18 EP EP09833844.5A patent/EP2358731B1/en active Active
- 2009-12-18 WO PCT/US2009/068790 patent/WO2010071824A2/en active Application Filing
- 2009-12-18 AU AU2009327435A patent/AU2009327435A1/en not_active Abandoned
- 2009-12-18 RU RU2011129747/04A patent/RU2526250C2/ru active
- 2009-12-18 JP JP2011542496A patent/JP2012513030A/ja active Pending
- 2009-12-18 CN CN200980147771.0A patent/CN102239173A/zh active Pending
- 2009-12-18 US US13/140,553 patent/US9103821B2/en active Active
- 2009-12-18 BR BRPI0923191A patent/BRPI0923191A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2009-12-18 CA CA2743181A patent/CA2743181A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JP2012513030A (ja) | 2012-06-07 |
| RU2526250C2 (ru) | 2014-08-20 |
| AU2009327435A1 (en) | 2010-06-24 |
| EP2358731A4 (en) | 2012-08-08 |
| BRPI0923191A2 (pt) | 2016-02-16 |
| CA2743181A1 (en) | 2010-06-24 |
| EP2358731B1 (en) | 2016-03-09 |
| US20110306075A1 (en) | 2011-12-15 |
| US9103821B2 (en) | 2015-08-11 |
| WO2010071824A3 (en) | 2010-10-28 |
| WO2010071824A2 (en) | 2010-06-24 |
| EP2358731A2 (en) | 2011-08-24 |
| CN102239173A (zh) | 2011-11-09 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2011129747A (ru) | Способы, относящиеся к модифицированным гликанам | |
| Arul et al. | Sample multiplexing strategies in quantitative proteomics | |
| RU2475759C2 (ru) | Исследование n-гликанов с использованием экзогликозидаз | |
| Feist et al. | Proteomic challenges: sample preparation techniques for microgram-quantity protein analysis from biological samples | |
| Jerkovic et al. | Afamin is a novel human vitamin E-binding glycoprotein characterization and in vitro expression | |
| Sekiya et al. | Derivatization for stabilizing sialic acids in MALDI-MS | |
| JP5116837B2 (ja) | グリカンを評価するためのｍｓ法 | |
| AU2003256819B2 (en) | Method for automated, large-scale measurement of the molecular flux rates of the proteome or the organeome using mass spectrometry | |
| He et al. | Identification of cell surface glycoprotein markers for glioblastoma-derived stem-like cells using a lectin microarray and LC− MS/MS approach | |
| JP2012513030A5 (ru) | ||
| CA3047665A1 (en) | Metabolic profiling with magnetic resonance mass spectrometry (mrms) | |
| Kim | Chemical arsenal for the study of O-GlcNAc | |
| Tang et al. | Metabonomic analysis of fatty acids in seminal plasma between healthy and asthenozoospermic men based on gas chromatography mass spectrometry | |
| JP6407247B2 (ja) | 組織サンプルからのタンパク質キネティックスバイオマーカーを、生体内で同位体標識した後の、体液からのタンパク質キネティックスバイオマーカーに取りかえるための方法 | |
| US7537704B2 (en) | Method for determining the concentration of asymmetric dimethylarginine (ADMA) | |
| Wang et al. | High-throughput glycopeptide profiling of prostate-specific antigen from seminal plasma by MALDI-MS | |
| CN102944604A (zh) | 哌嗪基嘧啶类同位素标记试剂的用途 | |
| CN104411833B (zh) | 应用maldi‑toff质谱分析法的侵染性真菌感染的体外诊断方法 | |
| Shih et al. | Feasibility of utilizing stable-isotope dimethyl labeling in liquid chromatography–tandem mass spectrometry-based determination for food allergens—Case of kiwifruit | |
| Ouni et al. | The human ovary and future of fertility assessment in the post-genome era | |
| Yang et al. | Recent advances in protein profiling of tissues and tissue fluids | |
| Holgersson et al. | Blood group A glycolipid antigen expression in kidney, ureter, kidney artery, and kidney vein from a blood group A1Le (a-b+) human individual. Evidence for a novel blood group A heptaglycosylceramide based on a type 3 carbohydrate chain. | |
| KR101778634B1 (ko) | Maldi-ms 기반의 생체물질의 정성 및 정량 분석 방법 | |
| Grocholska et al. | Qualitative and Quantitative Mass Spectrometry in Salivary Metabolomics and Proteomics | |
| Velic et al. | Toward quantitative proteomics of organ substructures: implications for renal physiology |