RU2010130453A - Улучшенный способ мутагенеза с использованием полиэтиленгликоль-опосредованного введения мутагенных нуклеиновых оснований в растительные протопласты - Google Patents
Улучшенный способ мутагенеза с использованием полиэтиленгликоль-опосредованного введения мутагенных нуклеиновых оснований в растительные протопласты Download PDFInfo
- Publication number
- RU2010130453A RU2010130453A RU2010130453/10A RU2010130453A RU2010130453A RU 2010130453 A RU2010130453 A RU 2010130453A RU 2010130453/10 A RU2010130453/10 A RU 2010130453/10A RU 2010130453 A RU2010130453 A RU 2010130453A RU 2010130453 A RU2010130453 A RU 2010130453A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- dna
- mutagenic
- nucleic base
- dna sequence
- mutagenic nucleic
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8201—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
- C12N15/8206—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation by physical or chemical, i.e. non-biological, means, e.g. electroporation, PEG mediated
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8201—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
- C12N15/8213—Targeted insertion of genes into the plant genome by homologous recombination
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
Abstract
1. Способ направленного изменения дуплексной акцепторной ДНК-последовательности в протопласте растительной клетки, включающий объединение дуплексной акцепторной ДНК-последовательности с донорным мутагенным нуклеиновым основанием, где дуплексная акцепторная ДНК-последовательность содержит первую ДНК-последовательность и вторую ДНК-последовательность, которая комплементарна первой ДНК-последовательности, и где донорное мутагенное нуклеиновое основание включает по меньшей мере одну ошибочную пару по отношению к дуплексной акцепторной ДНК-последовательности, которую необходимо изменить, предпочтительно, по отношению к первой ДНК-последовательности, где способ дополнительно включает стадию введения мутагенного нуклеинового основания в протопласты клеток с использованием полиэтиленгликоль (ПЭГ)-опосредованной трансформации. ! 2. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание представляет собой мутагенное одноцепочечное нуклеиновое основание. ! 3. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание включает LNA-замены, которые представляют собой по меньшей мере один нуклеотид, удаленный из ошибочной пары-мишени, и, необязательно, по меньшей мере 3, 4 или 5 нуклеотидов, удаленных из 5'- и 3'-концов мутагенного нуклеинового основания. ! 4. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание включает пропиновые замены. ! 5. Способ по п.1, где акцепторную ДНК берут из геномной ДНК, линейной ДНК, искусственных хромосом млекопитающих, бактериальных искусственных хромосом, дрожжевых искусственных хромосом, растительных искусственных хромосом, ядерной хромосомной ДНК, хромосомной ДНК органелл, эписомной ДНК. !6.
Claims (13)
1. Способ направленного изменения дуплексной акцепторной ДНК-последовательности в протопласте растительной клетки, включающий объединение дуплексной акцепторной ДНК-последовательности с донорным мутагенным нуклеиновым основанием, где дуплексная акцепторная ДНК-последовательность содержит первую ДНК-последовательность и вторую ДНК-последовательность, которая комплементарна первой ДНК-последовательности, и где донорное мутагенное нуклеиновое основание включает по меньшей мере одну ошибочную пару по отношению к дуплексной акцепторной ДНК-последовательности, которую необходимо изменить, предпочтительно, по отношению к первой ДНК-последовательности, где способ дополнительно включает стадию введения мутагенного нуклеинового основания в протопласты клеток с использованием полиэтиленгликоль (ПЭГ)-опосредованной трансформации.
2. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание представляет собой мутагенное одноцепочечное нуклеиновое основание.
3. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание включает LNA-замены, которые представляют собой по меньшей мере один нуклеотид, удаленный из ошибочной пары-мишени, и, необязательно, по меньшей мере 3, 4 или 5 нуклеотидов, удаленных из 5'- и 3'-концов мутагенного нуклеинового основания.
4. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание включает пропиновые замены.
5. Способ по п.1, где акцепторную ДНК берут из геномной ДНК, линейной ДНК, искусственных хромосом млекопитающих, бактериальных искусственных хромосом, дрожжевых искусственных хромосом, растительных искусственных хромосом, ядерной хромосомной ДНК, хромосомной ДНК органелл, эписомной ДНК.
6. Способ по п.1 для изменения клетки, коррекции мутации путем восстановления дикого типа, индуцирования мутации, инактивации фермента путем нарушения кодирующей области, модификации биоактивности фермента путем изменения кодирующей области, модификации белка путем нарушения кодирующей области.
7. Способ улучшения эффективности направленного мутагенеза в растительных протопластах, включающий стадию ПЭГ-опосредованной трансформации.
8. Способ по п.7, где улучшение составляет по меньшей мере 10-кратное улучшение по сравнению с трансформацией на основе электропорации.
9. Способ по пп.7 и 8, где мутагенное нуклеиновое основание представляет собой мутагенное одноцепочечное нуклеиновое основание.
10. Способ по п.7, где мутагенное нуклеиновое основание включает LNA-замены, которые представляют собой по меньшей мере один нуклеотид, удаленный из ошибочной пары-мишени, и, необязательно, по меньшей мере 3, 4 или 5 нуклеотидов, удаленных из 5'- и 3'-концов олигонуклеотида.
11. Способ по п.7, где мутагенное нуклеиновое основание включает пропиновые замены.
12. Способ по п.7, где акцепторную ДНК берут из геномной ДНК, линейной ДНК, искусственных хромосом млекопитающих, бактериальных искусственных хромосом, дрожжевых искусственных хромосом, растительных искусственных хромосом, ядерной хромосомной ДНК, хромосомной ДНК органелл, эписомной ДНК.
13. Способ по п.7, для изменения клетки, коррекции мутации путем восстановления дикого типа, индуцирования мутации, инактивации фермента путем нарушения кодирующей области, модификации биоактивности фермента путем изменения кодирующей области, модификации белка путем нарушения кодирующей области.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PCT/NL2007/000326 WO2009082190A1 (en) | 2007-12-21 | 2007-12-21 | An improved mutagenesis method using polyethylene glycol mediated introduction of mutagenic nucleobases into plant protoplasts |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2010130453A true RU2010130453A (ru) | 2012-01-27 |
| RU2515110C2 RU2515110C2 (ru) | 2014-05-10 |
Family
ID=39745349
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2010130453/10A RU2515110C2 (ru) | 2007-12-21 | 2007-12-21 | Улучшенный способ мутагенеза с использованием полиэтиленгликоль-опосредованного введения мутагенных нуклеиновых оснований в растительные протопласты |
Country Status (16)
| Country | Link |
|---|---|
| US (4) | US20100291684A1 (ru) |
| EP (2) | EP2562261B1 (ru) |
| JP (1) | JP5731201B2 (ru) |
| KR (2) | KR101452818B1 (ru) |
| CN (1) | CN101883855B (ru) |
| AU (1) | AU2007362895B2 (ru) |
| BR (1) | BRPI0722219A2 (ru) |
| CA (1) | CA2710262C (ru) |
| DK (2) | DK2562261T3 (ru) |
| ES (2) | ES2450743T3 (ru) |
| HU (1) | HUE025914T2 (ru) |
| IL (2) | IL206513A (ru) |
| NZ (1) | NZ586846A (ru) |
| RU (1) | RU2515110C2 (ru) |
| WO (1) | WO2009082190A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA201004891B (ru) |
Families Citing this family (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CA2636771C (en) | 2006-01-12 | 2016-05-24 | Greg F.W. Gocal | Epsps mutants |
| KR101452818B1 (ko) * | 2007-12-21 | 2014-10-23 | 키진 엔.브이. | 식물 원형질체 내로 폴리에틸렌 글리콜 매개 돌연변이 뉴클레오염기의 도입을 이용한 개선된 돌연변이 생성방법 |
| CN105338805A (zh) * | 2013-03-15 | 2016-02-17 | 希博斯美国有限公司 | 采用寡核苷酸介导的基因修复提高靶向基因修饰的效率的方法和组合物 |
| WO2016105185A1 (en) | 2014-12-22 | 2016-06-30 | Keygene N.V. | Plant callus populations |
| JP7160465B2 (ja) * | 2016-06-20 | 2022-10-25 | キージーン ナムローゼ フェンノートシャップ | 植物細胞における標的化ｄｎａ変更のための方法 |
| WO2019193143A1 (en) | 2018-04-05 | 2019-10-10 | Keygene N.V. | Improved shoot regeneration by overexpression of chk genes |
| EP3781677A4 (en) * | 2018-04-16 | 2022-01-19 | University of Massachusetts | COMPOSITIONS AND METHODS FOR IMPROVED GENE EDITTING |
| US20220010321A1 (en) | 2018-11-01 | 2022-01-13 | Keygene N.V. | Dual guide rna for crispr/cas genome editing in plants cells |
| EP3987024A4 (en) | 2019-06-20 | 2023-11-01 | University Of Massachusetts | COMPOSITIONS AND METHODS FOR IMPROVED GENE EDITING |
| KR102396391B1 (ko) | 2021-08-31 | 2022-05-10 | 주식회사 한성넥스 | 가구용 볼트자동조립장치 |
Family Cites Families (24)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5731181A (en) | 1996-06-17 | 1998-03-24 | Thomas Jefferson University | Chimeric mutational vectors having non-natural nucleotides |
| US6010907A (en) | 1998-05-12 | 2000-01-04 | Kimeragen, Inc. | Eukaryotic use of non-chimeric mutational vectors |
| EP1218524A2 (en) * | 1999-10-07 | 2002-07-03 | Valigen Inc. | Compositions and methods for plant genetic modification |
| US6824983B1 (en) * | 1999-11-26 | 2004-11-30 | Basf Plant Science Gmbh | Method for the mutagenesis of nucleotide sequences in plants algae or fungi |
| KR20030003240A (ko) | 2000-03-27 | 2003-01-09 | 유니버시티 오브 델라웨어 | 개질된 단일 가닥 올리고뉴클레오티드를 이용한 표적염색체 게놈 변경법 |
| CA2409172A1 (en) * | 2000-05-17 | 2001-11-22 | University Of Delaware | Plant gene targeting using oligonucleotides |
| WO2001094610A2 (en) | 2000-06-05 | 2001-12-13 | Thomas Jefferson University | Binary hybrid mutational vectors |
| EP1364008A2 (en) | 2000-07-27 | 2003-11-26 | University Of Delaware | Methods for enhancing targeted gene alteration using oligonucleotides |
| US20020119570A1 (en) | 2000-09-25 | 2002-08-29 | Kyonggeun Yoon | Targeted gene correction by single-stranded oligodeoxynucleotides |
| WO2002097433A1 (en) * | 2001-05-30 | 2002-12-05 | Biolex, Inc. | Use of duckweed in high throughput screening |
| US7112405B2 (en) | 2001-09-27 | 2006-09-26 | University Of Delaware | Compositions and methods for enhancing oligonucleotide-mediated gene alteration |
| US20040029275A1 (en) * | 2002-08-10 | 2004-02-12 | David Brown | Methods and compositions for reducing target gene expression using cocktails of siRNAs or constructs expressing siRNAs |
| DE10242531A1 (de) * | 2002-09-12 | 2004-03-25 | Basf Plant Science Gmbh | Verfahren zur Veränderung mehrerer Zielgene in Moosen |
| US20050074801A1 (en) * | 2003-09-09 | 2005-04-07 | Monia Brett P. | Chimeric oligomeric compounds comprising alternating regions of northern and southern conformational geometry |
| KR20080040735A (ko) | 2005-07-29 | 2008-05-08 | 하이브리드 바이오사이언시스 피티와이 엘티디 | 잡종 강세 또는 잡종 약세를 촉진시키는 유전자 및 그산물의 동정 방법 및 이의 용도 |
| WO2007037676A1 (en) * | 2005-09-29 | 2007-04-05 | Keygene N.V. | Method and means for targeted nucleotide exchange |
| US20070141134A1 (en) * | 2005-12-16 | 2007-06-21 | Kosak Matthew K | Shielded micelles for polynucleotide delivery |
| WO2007073149A1 (en) * | 2005-12-22 | 2007-06-28 | Keygene N.V. | Alternative nucleotides for improved targeted nucleotide exchange |
| JP2007167011A (ja) | 2005-12-23 | 2007-07-05 | Tohoku Univ | 血圧制御に関する新たな蛋白質 |
| JP5467999B2 (ja) | 2007-06-22 | 2014-04-09 | キージーン・エン・フェー | 改善された修飾オリゴヌクレオチドを用いた標的ヌクレオチドの交換 |
| EP2700721B1 (en) * | 2007-10-05 | 2019-01-02 | Cibus Europe B.V. | Mutated acetohydroxyacid synthase genes in brassica |
| KR101452818B1 (ko) * | 2007-12-21 | 2014-10-23 | 키진 엔.브이. | 식물 원형질체 내로 폴리에틸렌 글리콜 매개 돌연변이 뉴클레오염기의 도입을 이용한 개선된 돌연변이 생성방법 |
| JP5653921B2 (ja) | 2008-09-11 | 2015-01-14 | キージーン・エン・フェー | 特徴的なマーカー作製方法 |
| EP2376637A1 (en) | 2008-12-22 | 2011-10-19 | Keygene N.V. | Use of double stranded rna to increase the efficiency of targeted gene alteration in plant protoplasts |
-
2007
- 2007-12-21 KR KR1020107016236A patent/KR101452818B1/ko active IP Right Grant
- 2007-12-21 WO PCT/NL2007/000326 patent/WO2009082190A1/en active Application Filing
- 2007-12-21 HU HUE12193811A patent/HUE025914T2/en unknown
- 2007-12-21 US US12/809,384 patent/US20100291684A1/en not_active Abandoned
- 2007-12-21 EP EP12193811.2A patent/EP2562261B1/en active Active
- 2007-12-21 JP JP2010539319A patent/JP5731201B2/ja active Active
- 2007-12-21 BR BRPI0722219-0A2A patent/BRPI0722219A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2007-12-21 ES ES07860889.0T patent/ES2450743T3/es active Active
- 2007-12-21 EP EP07860889.0A patent/EP2235187B1/en active Active
- 2007-12-21 DK DK12193811.2T patent/DK2562261T3/en active
- 2007-12-21 CA CA2710262A patent/CA2710262C/en active Active
- 2007-12-21 CN CN2007801017879A patent/CN101883855B/zh active Active
- 2007-12-21 NZ NZ586846A patent/NZ586846A/en not_active IP Right Cessation
- 2007-12-21 DK DK07860889.0T patent/DK2235187T3/en active
- 2007-12-21 ES ES12193811.2T patent/ES2551256T3/es active Active
- 2007-12-21 RU RU2010130453/10A patent/RU2515110C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2007-12-21 AU AU2007362895A patent/AU2007362895B2/en active Active
- 2007-12-21 KR KR1020147010128A patent/KR20140050759A/ko not_active Application Discontinuation
-
2010
- 2010-06-21 IL IL206513A patent/IL206513A/en active IP Right Grant
- 2010-07-12 ZA ZA2010/04891A patent/ZA201004891B/en unknown
-
2012
- 2012-07-17 US US13/551,143 patent/US9365860B2/en active Active
-
2013
- 2013-08-13 IL IL227942A patent/IL227942A/en active IP Right Grant
-
2016
- 2016-03-30 US US15/084,935 patent/US11008579B2/en active Active
-
2021
- 2021-05-11 US US17/316,758 patent/US20210324393A1/en active Pending
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2010130453A (ru) | Улучшенный способ мутагенеза с использованием полиэтиленгликоль-опосредованного введения мутагенных нуклеиновых оснований в растительные протопласты | |
| Tonti‐Filippini et al. | What can we do with 1000 plastid genomes? | |
| Gao | Genome engineering for crop improvement and future agriculture | |
| Naduthodi et al. | Progress of CRISPR‐Cas based genome editing in photosynthetic microbes | |
| Bock | Engineering plastid genomes: methods, tools, and applications in basic research and biotechnology | |
| CN108546716A (zh) | 一种基因组编辑方法 | |
| Li et al. | Complete chloroplast genome sequence of Magnolia grandiflora and comparative analysis with related species | |
| Masood et al. | The complete nucleotide sequence of wild rice (Oryza nivara) chloroplast genome: first genome wide comparative sequence analysis of wild and cultivated rice | |
| RU2010101882A (ru) | Направленная нуклеотидная замена при применении улучшенных модифицированных олигонуклеотидов | |
| RU2014127702A (ru) | Модифицированные Cascade-рибонуклеопротеины и их применения | |
| Seligmann et al. | Stem-loop RNA hairpins in giant viruses: invading rRNA-like repeats and a template free RNA | |
| Gerasimova et al. | Targeted genome modification in protoplasts of a highly regenerable Siberian barley cultivar using RNA-guided Cas9 endonuclease | |
| CA2263958A1 (en) | Homologous recombination in mismatch repair inactivated eukaryotic cells | |
| CN104846009B (zh) | 一种水稻工程保持系的构建方法及其应用 | |
| CN105154566A (zh) | 一种用于筛选水稻靶向基因编辑植株的方法 | |
| Birchler | Promises and pitfalls of synthetic chromosomes in plants | |
| ES2759628T3 (es) | Procedimiento de mejora de cepas de levadura | |
| Stephens et al. | Genetic engineering for microalgae strain improvement in relation to biocrude production systems | |
| Racharaks et al. | Development of CRISPR-Cas9 knock-in tools for free fatty acid production using the fast-growing cyanobacterial strain Synechococcus elongatus UTEX 2973 | |
| CN110408652A (zh) | 一种基于CRISPR/Cas9系统对新疆野苹果基因多靶点定点突变的方法 | |
| Smith et al. | Protists and the wild, wild west of gene expression: new frontiers, lawlessness, and misfits | |
| Wong | Emergence of life: from functional RNA selection to natural selection and beyond | |
| CN106011160A (zh) | 一种细胞内支架结构及方法 | |
| Vergara et al. | Gene editing in Prunus Spp.: The challenge of adapting regular gene transfer procedures for precision breeding | |
| Szabó et al. | Diversity and postzygotic evolution of the mitochondrial genome in hybrids of Saccharomyces species isolated by double sterility barrier |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20181222 |