RU2010130453A - Улучшенный способ мутагенеза с использованием полиэтиленгликоль-опосредованного введения мутагенных нуклеиновых оснований в растительные протопласты - Google Patents
Улучшенный способ мутагенеза с использованием полиэтиленгликоль-опосредованного введения мутагенных нуклеиновых оснований в растительные протопласты Download PDFInfo
- Publication number
- RU2010130453A RU2010130453A RU2010130453/10A RU2010130453A RU2010130453A RU 2010130453 A RU2010130453 A RU 2010130453A RU 2010130453/10 A RU2010130453/10 A RU 2010130453/10A RU 2010130453 A RU2010130453 A RU 2010130453A RU 2010130453 A RU2010130453 A RU 2010130453A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- dna
- mutagenic
- nucleic base
- dna sequence
- mutagenic nucleic
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8201—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
- C12N15/8206—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation by physical or chemical, i.e. non-biological, means, e.g. electroporation, PEG mediated
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8201—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
- C12N15/8213—Targeted insertion of genes into the plant genome by homologous recombination
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
1. Способ направленного изменения дуплексной акцепторной ДНК-последовательности в протопласте растительной клетки, включающий объединение дуплексной акцепторной ДНК-последовательности с донорным мутагенным нуклеиновым основанием, где дуплексная акцепторная ДНК-последовательность содержит первую ДНК-последовательность и вторую ДНК-последовательность, которая комплементарна первой ДНК-последовательности, и где донорное мутагенное нуклеиновое основание включает по меньшей мере одну ошибочную пару по отношению к дуплексной акцепторной ДНК-последовательности, которую необходимо изменить, предпочтительно, по отношению к первой ДНК-последовательности, где способ дополнительно включает стадию введения мутагенного нуклеинового основания в протопласты клеток с использованием полиэтиленгликоль (ПЭГ)-опосредованной трансформации. ! 2. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание представляет собой мутагенное одноцепочечное нуклеиновое основание. ! 3. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание включает LNA-замены, которые представляют собой по меньшей мере один нуклеотид, удаленный из ошибочной пары-мишени, и, необязательно, по меньшей мере 3, 4 или 5 нуклеотидов, удаленных из 5'- и 3'-концов мутагенного нуклеинового основания. ! 4. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание включает пропиновые замены. ! 5. Способ по п.1, где акцепторную ДНК берут из геномной ДНК, линейной ДНК, искусственных хромосом млекопитающих, бактериальных искусственных хромосом, дрожжевых искусственных хромосом, растительных искусственных хромосом, ядерной хромосомной ДНК, хромосомной ДНК органелл, эписомной ДНК. !6.
Claims (13)
1. Способ направленного изменения дуплексной акцепторной ДНК-последовательности в протопласте растительной клетки, включающий объединение дуплексной акцепторной ДНК-последовательности с донорным мутагенным нуклеиновым основанием, где дуплексная акцепторная ДНК-последовательность содержит первую ДНК-последовательность и вторую ДНК-последовательность, которая комплементарна первой ДНК-последовательности, и где донорное мутагенное нуклеиновое основание включает по меньшей мере одну ошибочную пару по отношению к дуплексной акцепторной ДНК-последовательности, которую необходимо изменить, предпочтительно, по отношению к первой ДНК-последовательности, где способ дополнительно включает стадию введения мутагенного нуклеинового основания в протопласты клеток с использованием полиэтиленгликоль (ПЭГ)-опосредованной трансформации.
2. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание представляет собой мутагенное одноцепочечное нуклеиновое основание.
3. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание включает LNA-замены, которые представляют собой по меньшей мере один нуклеотид, удаленный из ошибочной пары-мишени, и, необязательно, по меньшей мере 3, 4 или 5 нуклеотидов, удаленных из 5'- и 3'-концов мутагенного нуклеинового основания.
4. Способ по п.1, где мутагенное нуклеиновое основание включает пропиновые замены.
5. Способ по п.1, где акцепторную ДНК берут из геномной ДНК, линейной ДНК, искусственных хромосом млекопитающих, бактериальных искусственных хромосом, дрожжевых искусственных хромосом, растительных искусственных хромосом, ядерной хромосомной ДНК, хромосомной ДНК органелл, эписомной ДНК.
6. Способ по п.1 для изменения клетки, коррекции мутации путем восстановления дикого типа, индуцирования мутации, инактивации фермента путем нарушения кодирующей области, модификации биоактивности фермента путем изменения кодирующей области, модификации белка путем нарушения кодирующей области.
7. Способ улучшения эффективности направленного мутагенеза в растительных протопластах, включающий стадию ПЭГ-опосредованной трансформации.
8. Способ по п.7, где улучшение составляет по меньшей мере 10-кратное улучшение по сравнению с трансформацией на основе электропорации.
9. Способ по пп.7 и 8, где мутагенное нуклеиновое основание представляет собой мутагенное одноцепочечное нуклеиновое основание.
10. Способ по п.7, где мутагенное нуклеиновое основание включает LNA-замены, которые представляют собой по меньшей мере один нуклеотид, удаленный из ошибочной пары-мишени, и, необязательно, по меньшей мере 3, 4 или 5 нуклеотидов, удаленных из 5'- и 3'-концов олигонуклеотида.
11. Способ по п.7, где мутагенное нуклеиновое основание включает пропиновые замены.
12. Способ по п.7, где акцепторную ДНК берут из геномной ДНК, линейной ДНК, искусственных хромосом млекопитающих, бактериальных искусственных хромосом, дрожжевых искусственных хромосом, растительных искусственных хромосом, ядерной хромосомной ДНК, хромосомной ДНК органелл, эписомной ДНК.
13. Способ по п.7, для изменения клетки, коррекции мутации путем восстановления дикого типа, индуцирования мутации, инактивации фермента путем нарушения кодирующей области, модификации биоактивности фермента путем изменения кодирующей области, модификации белка путем нарушения кодирующей области.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PCT/NL2007/000326 WO2009082190A1 (en) | 2007-12-21 | 2007-12-21 | An improved mutagenesis method using polyethylene glycol mediated introduction of mutagenic nucleobases into plant protoplasts |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2010130453A true RU2010130453A (ru) | 2012-01-27 |
| RU2515110C2 RU2515110C2 (ru) | 2014-05-10 |
Family
ID=39745349
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2010130453/10A RU2515110C2 (ru) | 2007-12-21 | 2007-12-21 | Улучшенный способ мутагенеза с использованием полиэтиленгликоль-опосредованного введения мутагенных нуклеиновых оснований в растительные протопласты |
Country Status (16)
| Country | Link |
|---|---|
| US (4) | US20100291684A1 (ru) |
| EP (2) | EP2562261B1 (ru) |
| JP (1) | JP5731201B2 (ru) |
| KR (2) | KR101452818B1 (ru) |
| CN (1) | CN101883855B (ru) |
| AU (1) | AU2007362895B2 (ru) |
| BR (1) | BRPI0722219A2 (ru) |
| CA (1) | CA2710262C (ru) |
| DK (2) | DK2235187T3 (ru) |
| ES (2) | ES2551256T3 (ru) |
| HU (1) | HUE025914T2 (ru) |
| IL (2) | IL206513A (ru) |
| NZ (1) | NZ586846A (ru) |
| RU (1) | RU2515110C2 (ru) |
| WO (1) | WO2009082190A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA201004891B (ru) |
Families Citing this family (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2441366C2 (ru) | 2006-01-12 | 2012-02-10 | Сайбас Юроп Б.В. | Мутанты epsps |
| DK2235187T3 (en) * | 2007-12-21 | 2014-03-03 | Keygene Nv | Enhanced mutagenesis using mutagenic introduction of polyethylenglycolmedieret nucleobases in plant protoplasts |
| CN105338805A (zh) * | 2013-03-15 | 2016-02-17 | 希博斯美国有限公司 | 采用寡核苷酸介导的基因修复提高靶向基因修饰的效率的方法和组合物 |
| WO2016105185A1 (en) | 2014-12-22 | 2016-06-30 | Keygene N.V. | Plant callus populations |
| IL263595B2 (en) * | 2016-06-20 | 2023-11-01 | Keygene Nv | A method for targeted modification of DNA in plant cells |
| BR112020020340A2 (pt) | 2018-04-05 | 2021-01-05 | Keygene N.V. | Melhoria da regeneração de brotos por superexpressão de genes chk |
| US11981892B2 (en) | 2018-04-16 | 2024-05-14 | University Of Massachusetts | Compositions and methods for improved gene editing |
| WO2020089448A1 (en) | 2018-11-01 | 2020-05-07 | Keygene N.V. | Dual guide rna for crispr/cas genome editing in plants cells |
| US20220348912A1 (en) | 2019-06-20 | 2022-11-03 | University Of Massachusetts | Compositions and methods for improved gene editing |
| KR102396391B1 (ko) | 2021-08-31 | 2022-05-10 | 주식회사 한성넥스 | 가구용 볼트자동조립장치 |
Family Cites Families (24)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5731181A (en) | 1996-06-17 | 1998-03-24 | Thomas Jefferson University | Chimeric mutational vectors having non-natural nucleotides |
| US6010907A (en) | 1998-05-12 | 2000-01-04 | Kimeragen, Inc. | Eukaryotic use of non-chimeric mutational vectors |
| EP1218524A2 (en) * | 1999-10-07 | 2002-07-03 | Valigen Inc. | Compositions and methods for plant genetic modification |
| US6824983B1 (en) * | 1999-11-26 | 2004-11-30 | Basf Plant Science Gmbh | Method for the mutagenesis of nucleotide sequences in plants algae or fungi |
| CA2404780A1 (en) | 2000-03-27 | 2001-10-04 | University Of Delaware | Targeted chromosomal genomic alterations with modified single stranded oligonucleotides |
| EP1284985A2 (en) | 2000-05-17 | 2003-02-26 | University Of Delaware | Plant gene targeting using oligonucleotides |
| US20030017593A1 (en) * | 2000-06-05 | 2003-01-23 | Gamper Howard B. | Binary hybrid mutational vectors |
| EP1364008A2 (en) | 2000-07-27 | 2003-11-26 | University Of Delaware | Methods for enhancing targeted gene alteration using oligonucleotides |
| WO2002026967A2 (en) | 2000-09-25 | 2002-04-04 | Thomas Jefferson University | Targeted gene correction by single-stranded oligodeoxynucleotides |
| WO2002097433A1 (en) * | 2001-05-30 | 2002-12-05 | Biolex, Inc. | Use of duckweed in high throughput screening |
| AU2002341905A2 (en) | 2001-09-27 | 2003-04-07 | University Of Delaware | Composition and methods for enhancing oligonucleotide-directed nucleic acid sequence alteration |
| US20040029275A1 (en) * | 2002-08-10 | 2004-02-12 | David Brown | Methods and compositions for reducing target gene expression using cocktails of siRNAs or constructs expressing siRNAs |
| DE10242531A1 (de) * | 2002-09-12 | 2004-03-25 | Basf Plant Science Gmbh | Verfahren zur Veränderung mehrerer Zielgene in Moosen |
| US20050074801A1 (en) * | 2003-09-09 | 2005-04-07 | Monia Brett P. | Chimeric oligomeric compounds comprising alternating regions of northern and southern conformational geometry |
| JP2009502143A (ja) | 2005-07-29 | 2009-01-29 | ハイブリッド バイオサイエンシーズ ピーティーワイ リミテッド | 雑種強勢又は雑種衰弱を促進する遺伝子とその産生物の同定とその応用 |
| EP1929036A1 (en) * | 2005-09-29 | 2008-06-11 | Keygene N.V. | Method and means for targeted nucleotide exchange |
| US20070141134A1 (en) * | 2005-12-16 | 2007-06-21 | Kosak Matthew K | Shielded micelles for polynucleotide delivery |
| WO2007073149A1 (en) * | 2005-12-22 | 2007-06-28 | Keygene N.V. | Alternative nucleotides for improved targeted nucleotide exchange |
| JP2007167011A (ja) | 2005-12-23 | 2007-07-05 | Tohoku Univ | 血圧制御に関する新たな蛋白質 |
| JP5467999B2 (ja) | 2007-06-22 | 2014-04-09 | キージーン・エン・フェー | 改善された修飾オリゴヌクレオチドを用いた標的ヌクレオチドの交換 |
| PL2203565T3 (pl) * | 2007-10-05 | 2016-02-29 | Cibus Europe Bv | Zmutowane geny syntazy kwasu acetohydroksy roślin kapustnych |
| DK2235187T3 (en) * | 2007-12-21 | 2014-03-03 | Keygene Nv | Enhanced mutagenesis using mutagenic introduction of polyethylenglycolmedieret nucleobases in plant protoplasts |
| CA2737303C (en) | 2008-09-11 | 2019-06-11 | Keygene N.V. | Method for diagnostic marker development |
| US20110312094A1 (en) | 2008-12-22 | 2011-12-22 | Keygene N.V. | Use of double stranded rna to increase the efficiency of targeted gene alteration in plant protoplasts |
-
2007
- 2007-12-21 DK DK07860889.0T patent/DK2235187T3/en active
- 2007-12-21 EP EP12193811.2A patent/EP2562261B1/en active Active
- 2007-12-21 BR BRPI0722219-0A2A patent/BRPI0722219A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2007-12-21 WO PCT/NL2007/000326 patent/WO2009082190A1/en active Application Filing
- 2007-12-21 CN CN2007801017879A patent/CN101883855B/zh active Active
- 2007-12-21 KR KR1020107016236A patent/KR101452818B1/ko active IP Right Grant
- 2007-12-21 NZ NZ586846A patent/NZ586846A/en not_active IP Right Cessation
- 2007-12-21 ES ES12193811.2T patent/ES2551256T3/es active Active
- 2007-12-21 CA CA2710262A patent/CA2710262C/en active Active
- 2007-12-21 AU AU2007362895A patent/AU2007362895B2/en active Active
- 2007-12-21 RU RU2010130453/10A patent/RU2515110C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2007-12-21 DK DK12193811.2T patent/DK2562261T3/en active
- 2007-12-21 EP EP07860889.0A patent/EP2235187B1/en active Active
- 2007-12-21 JP JP2010539319A patent/JP5731201B2/ja active Active
- 2007-12-21 US US12/809,384 patent/US20100291684A1/en not_active Abandoned
- 2007-12-21 ES ES07860889.0T patent/ES2450743T3/es active Active
- 2007-12-21 KR KR1020147010128A patent/KR20140050759A/ko not_active Application Discontinuation
- 2007-12-21 HU HUE12193811A patent/HUE025914T2/en unknown
-
2010
- 2010-06-21 IL IL206513A patent/IL206513A/en active IP Right Grant
- 2010-07-12 ZA ZA2010/04891A patent/ZA201004891B/en unknown
-
2012
- 2012-07-17 US US13/551,143 patent/US9365860B2/en active Active
-
2013
- 2013-08-13 IL IL227942A patent/IL227942A/en active IP Right Grant
-
2016
- 2016-03-30 US US15/084,935 patent/US11008579B2/en active Active
-
2021
- 2021-05-11 US US17/316,758 patent/US20210324393A1/en active Pending
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2010130453A (ru) | Улучшенный способ мутагенеза с использованием полиэтиленгликоль-опосредованного введения мутагенных нуклеиновых оснований в растительные протопласты | |
| CN107858346B (zh) | 一种敲除酿酒酵母染色体的方法 | |
| Tonti‐Filippini et al. | What can we do with 1000 plastid genomes? | |
| Naduthodi et al. | Progress of CRISPR‐Cas based genome editing in photosynthetic microbes | |
| CN108546716A (zh) | 一种基因组编辑方法 | |
| CN106244591A (zh) | 修饰crRNA在CRISPR/Cpf1基因编辑系统中的应用 | |
| Masood et al. | The complete nucleotide sequence of wild rice (Oryza nivara) chloroplast genome: first genome wide comparative sequence analysis of wild and cultivated rice | |
| RU2010101882A (ru) | Направленная нуклеотидная замена при применении улучшенных модифицированных олигонуклеотидов | |
| RU2014127702A (ru) | Модифицированные Cascade-рибонуклеопротеины и их применения | |
| CN106244555A (zh) | 一种提高基因打靶的效率的方法及β‑球蛋白基因位点的碱基原位修复方法 | |
| CN105543270A (zh) | 双抗性CRISPR/Cas9载体及应用 | |
| RU2016133286A (ru) | Способы мутагенеза | |
| CN105154566B (zh) | 一种用于筛选水稻靶向基因编辑植株的方法 | |
| Seligmann et al. | Stem-loop RNA hairpins in giant viruses: invading rRNA-like repeats and a template free RNA | |
| Gerasimova et al. | Targeted genome modification in protoplasts of a highly regenerable Siberian barley cultivar using RNA-guided Cas9 endonuclease | |
| Wang et al. | Plant organellar genomes: much done, much more to do | |
| CN104846009B (zh) | 一种水稻工程保持系的构建方法及其应用 | |
| Birchler | Promises and pitfalls of synthetic chromosomes in plants | |
| Racharaks et al. | Development of CRISPR-Cas9 knock-in tools for free fatty acid production using the fast-growing cyanobacterial strain Synechococcus elongatus UTEX 2973 | |
| Stephens et al. | Genetic engineering for microalgae strain improvement in relation to biocrude production systems | |
| CN110408652A (zh) | 一种基于CRISPR/Cas9系统对新疆野苹果基因多靶点定点突变的方法 | |
| Ramírez et al. | Genome organization of a new double-stranded RNA LA helper virus from wine Torulaspora delbrueckii killer yeast as compared with its Saccharomyces counterparts | |
| CN105695461B (zh) | 一种小麦旗叶特异表达的启动子及其应用 | |
| Wong | Emergence of life: from functional RNA selection to natural selection and beyond | |
| Vergara et al. | Gene editing in Prunus Spp.: The challenge of adapting regular gene transfer procedures for precision breeding |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20181222 |