RU2009148277A - Способ электрохимической детекции последовательностей нуклеидовых кислот - Google Patents

Способ электрохимической детекции последовательностей нуклеидовых кислот Download PDF

Info

Publication number
RU2009148277A
RU2009148277A RU2009148277/04A RU2009148277A RU2009148277A RU 2009148277 A RU2009148277 A RU 2009148277A RU 2009148277/04 A RU2009148277/04 A RU 2009148277/04A RU 2009148277 A RU2009148277 A RU 2009148277A RU 2009148277 A RU2009148277 A RU 2009148277A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nucleic acid
hybridization
probe
acid sequence
electrode
Prior art date
Application number
RU2009148277/04A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2470938C2 (ru
Inventor
АБАД Энкарнасьон ЛОРЕНСО (ES)
АБАД Энкарнасьон ЛОРЕНСО
АЛОНСО Феликс ПАРЬЕНТЕ (ES)
АЛОНСО Феликс ПАРЬЕНТЕ
ПАРРА Моника РЕВЕНГА (ES)
ПАРРА Моника РЕВЕНГА
МЕНДИОЛА Тания ГАРСИЯ (ES)
МЕНДИОЛА Тания ГАРСИЯ
Original Assignee
Универсидад Аутонома Де Мадрид (Es)
Универсидад Аутонома Де Мадрид
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Универсидад Аутонома Де Мадрид (Es), Универсидад Аутонома Де Мадрид filed Critical Универсидад Аутонома Де Мадрид (Es)
Publication of RU2009148277A publication Critical patent/RU2009148277A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2470938C2 publication Critical patent/RU2470938C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D213/00—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D213/02—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D213/89—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hetero atoms directly attached to the ring nitrogen atom
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D213/00—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D213/90—Heterocyclic compounds containing six-membered rings, not condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom and three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members having more than three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C12Q1/6825—Nucleic acid detection involving sensors
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor

Abstract

1. Соединение, получаемое из рутения, формулы (Ι): ! ! 2. Способ детекции гибридизации между зондом и последовательностью нуклеиновой кислоты-мишени, отличающийся тем, что включает в себя следующие стадии: ! a. иммобилизация зонда нуклеиновой кислоты на поверхности электрода, ! b. инкубация электрода, модифицированного зондом нуклеиновой кислоты в растворе, который может содержать последовательность-мишень так, чтобы происходила гибридизация, ! с. погружение электрода после инкубации на стадии b) в раствор, содержащий соединение, получаемое из рутения, формулы (I), ! d. применение циклической развертки потенциала для внедрения соединения, получаемого из рутения, в двойную цепь нуклеиновой кислоты, получаемой при гибридизации, ! е. электрохимическая детекция гибридизации между зондом и последовательностью нуклеиновой кислоты-мишени, !где детекция гибридизации позволяет детектировать последовательность нуклеиновой кислоты, количественно определять последовательности нуклеиновых кислот, детектировать неспаренное основание в последовательности нуклеиновой кислоты или определять положение указанного неспаренного основания. ! 3. Способ по п.2, отличающийся тем, что нуклеиновая кислота зонда и последовательности-мишени представляет собой ДНК. ! 4. Способ по п.3, отличающийся тем, что используемый электрод сделан из золота. ! 5. Способ по п.4, отличающийся тем, что циклическая развертка потенциала применяется 200 раз между -0,5 и 0,1 В. ! 6. Способ по п.4, отличающийся тем, что электрохимическая детекция проводится посредством дифференциальной импульсной вольтамперометрии с частотой развертки 10 Мв/с, амплитудой импульса 5

Claims (12)

1. Соединение, получаемое из рутения, формулы (Ι):
Figure 00000001
2. Способ детекции гибридизации между зондом и последовательностью нуклеиновой кислоты-мишени, отличающийся тем, что включает в себя следующие стадии:
a. иммобилизация зонда нуклеиновой кислоты на поверхности электрода,
b. инкубация электрода, модифицированного зондом нуклеиновой кислоты в растворе, который может содержать последовательность-мишень так, чтобы происходила гибридизация,
с. погружение электрода после инкубации на стадии b) в раствор, содержащий соединение, получаемое из рутения, формулы (I),
d. применение циклической развертки потенциала для внедрения соединения, получаемого из рутения, в двойную цепь нуклеиновой кислоты, получаемой при гибридизации,
е. электрохимическая детекция гибридизации между зондом и последовательностью нуклеиновой кислоты-мишени,
где детекция гибридизации позволяет детектировать последовательность нуклеиновой кислоты, количественно определять последовательности нуклеиновых кислот, детектировать неспаренное основание в последовательности нуклеиновой кислоты или определять положение указанного неспаренного основания.
3. Способ по п.2, отличающийся тем, что нуклеиновая кислота зонда и последовательности-мишени представляет собой ДНК.
4. Способ по п.3, отличающийся тем, что используемый электрод сделан из золота.
5. Способ по п.4, отличающийся тем, что циклическая развертка потенциала применяется 200 раз между -0,5 и 0,1 В.
6. Способ по п.4, отличающийся тем, что электрохимическая детекция проводится посредством дифференциальной импульсной вольтамперометрии с частотой развертки 10 Мв/с, амплитудой импульса 50 мВ и длиной импульса 0,2 с.
7. Применение соединения по п.1 в качестве электрохимического индикатора гибридизации между последовательностями нуклеиновой кислоты.
8. Применение соединения по п.7 для детекции последовательности нуклеиновой кислоты.
9. Применение соединения по п.7 для количественного определения последовательностей нуклеиновой кислоты.
10. Применение соединения по п.7 для детекции неспаренного основания в последовательности нуклеиновой кислоты.
11. Применение соединения по п.7 для детекции положения неспаренного основания в последовательности нуклеиновой кислоты.
12. Применение соединения по любому из пп. 7-11, где нуклеиновой кислотой является ДНК.
RU2009148277/04A 2007-05-25 2008-05-23 Способ электрохимической детекции последовательностей нуклеиновых кислот RU2470938C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
ESP200701446 2007-05-25
ES200701446A ES2310125B1 (es) 2007-05-25 2007-05-25 Metodo para la deteccion electroquimica de secuencias de acidos nucleicos.
PCT/ES2008/000364 WO2008145785A1 (es) 2007-05-25 2008-05-23 Método para la detección electroquímica de secuencias de ácidos nucléicos

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2009148277A true RU2009148277A (ru) 2011-06-27
RU2470938C2 RU2470938C2 (ru) 2012-12-27

Family

ID=40074601

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2009148277/04A RU2470938C2 (ru) 2007-05-25 2008-05-23 Способ электрохимической детекции последовательностей нуклеиновых кислот

Country Status (11)

Country Link
US (1) US20100236942A1 (ru)
EP (1) EP2168949A4 (ru)
JP (1) JP2010529007A (ru)
CN (1) CN101796029B (ru)
AU (1) AU2008257342A1 (ru)
BR (1) BRPI0812108A2 (ru)
CA (1) CA2687933A1 (ru)
ES (1) ES2310125B1 (ru)
MX (1) MX2009012733A (ru)
RU (1) RU2470938C2 (ru)
WO (1) WO2008145785A1 (ru)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU179185U1 (ru) * 2016-12-30 2018-05-03 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки "Институт химии и химических технологий" Сибирского Отделения Российской академии наук - обособленное подразделение ФИЦ КНЦ СО РАН Мультиплексная система для диагностики онкологических заболеваний
RU182822U1 (ru) * 2016-12-30 2018-09-04 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химии и химической технологии Сибирского отделения Российской академии наук - обособленное подразделение ФИЦ КНЦ СО РАН Мультиплексный электрохимический биочип для выявления опухолеассоциированных белков-биомаркеров рака легкого
WO2020129452A1 (ja) * 2018-12-18 2020-06-25 株式会社ヨコオ 計測装置及び計測方法

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB9206671D0 (en) 1992-03-27 1992-05-13 Cranfield Biotech Ltd Electrochemical detection of dna hybridisation
RU2243231C2 (ru) * 1997-09-12 2004-12-27 Эксикон А/С Бициклические аналоги нуклеозидов, нуклеотидов и олигонуклеотидов
JP2003144152A (ja) * 2001-11-09 2003-05-20 Fuji Photo Film Co Ltd ターゲット核酸断片の検出方法及びターゲット核酸断片の検出キット
GB0205455D0 (en) * 2002-03-07 2002-04-24 Molecular Sensing Plc Nucleic acid probes, their synthesis and use
US7258978B2 (en) * 2002-11-06 2007-08-21 Geneohm Sciences Electrochemical method to measure DNA attachment to an electrode surface in the presence of molecular oxygen
EP1620570B1 (en) 2003-05-02 2010-09-15 Geneohm Sciences Electrochemical method to measure dna attachment to an electrode surface in the presence of molecular oxygen
US7741033B2 (en) * 2003-05-13 2010-06-22 Trustees Of Boston College Electrocatalytic nucleic acid hybridization detection

Also Published As

Publication number Publication date
RU2470938C2 (ru) 2012-12-27
US20100236942A1 (en) 2010-09-23
BRPI0812108A2 (pt) 2014-11-25
AU2008257342A1 (en) 2008-12-04
MX2009012733A (es) 2009-12-11
CN101796029B (zh) 2012-05-23
CN101796029A (zh) 2010-08-04
WO2008145785A1 (es) 2008-12-04
CA2687933A1 (en) 2008-12-04
EP2168949A4 (en) 2011-05-25
EP2168949A1 (en) 2010-03-31
ES2310125A1 (es) 2008-12-16
ES2310125B1 (es) 2010-01-07
JP2010529007A (ja) 2010-08-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN106525940B (zh) 基于g-四链体-血红素复合物和聚合链式放大反应检测单链目标dna浓度的电化学方法
CN102778492B (zh) 一种用于汞离子检测的电化学传感器及其制作方法和检测方法
Cobb et al. Enhancing square wave voltammetry measurements via electrochemical analysis of the non-faradaic potential window
CN102375021B (zh) 一种采用dna为探针的电化学检测环境污染物方法
CN110274941A (zh) 利用DSN酶和DNAzyme的DNA自组装电化学生物传感器的制备方法
CN102262118A (zh) 检测肿瘤标志物的生物电化学传感器及其制备方法
CN103940872A (zh) 同时检测两种急性白血病标志物电化学传感器的制备方法及应用
Zhu et al. Label-free electrochemical DNA sensing with a one-target-multitriggered hybridization chain reaction strategy
Liu et al. A sensitive, non-damaging electrochemiluminescent aptasensor via a low potential approach at DNA-modified gold electrodes
Nurmalasari et al. Label-free electrochemical DNA biosensor for the detection of Mycobacterium tuberculosis using gold electrode modified by self-assembled monolayer of thiol
RU2009148277A (ru) Способ электрохимической детекции последовательностей нуклеидовых кислот
DE502006004013D1 (de) Verfahren zur markierung und analyse von nukleinsäuren
CN105259349B (zh) 一种免固定生物传感电极的制备及其在免标记均相光致电化学农残检测与癌症诊断中的应用
Yan et al. Target-triggered substantial stacking of electroactive indicators based on digestion-to-growth regulated tandem isothermal amplification for ultrasensitive miRNA determination
CN104897742A (zh) 基于核酸适配体检测四环素的生物传感器及其制备方法
CN105866211B (zh) 一种氨苄西林分子印迹传感器的制备方法及应用
CN104198557A (zh) 一种用于痕量汞离子检测的酶基电化学生物传感方法
CN104297314B (zh) 一种电化学膀胱癌dna传感器的制备方法
CN110672696A (zh) 一种检测铜离子、磷酸根离子和碱性磷酸酶的新型电化学方法及其应用
Liu et al. Electrochemical detection of hepatitis C virus based on site-specific DNA cleavage of Bam HI endonuclease
CN104359957B (zh) 一种电化学传感器及其制备与应用
CN104391018A (zh) 三维dna纳米结构、电化学生物传感器及其制备方法和应用
Kara et al. Development of a label free IGE sensitive aptasensor based on electrochemical impedance spectrometry
CN109254039A (zh) 基于ebfc的自供能细菌生物传感器及其应用
WO2010076865A1 (ja) 核酸の定量方法

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20130524