PT652960E - Materiais para fosfodiesterases especificas e de ligacao do mpg ciclico e respectivos metodos - Google Patents
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Description
1
Descrição & - “Materiais para fosfodiesterases específicas e de ligação do MPG cíclico e respectivos métodos” O trabalho experimental aqui descrito foi parcialmente suportado pelas subvenções de pesquisa GM15731, DK21723, DK40029 e GM41269 e pela subvenção GM07347 do Programa de Formação de Cientistas Médicos, concedidas pelos Institutos Nacionais de Saúde. O governo dos Estados Unidos da América do Norte possui determinados direitos na presente invenção.
CAMPO PA INVENÇÃO A presente invenção diz respeito genericamente a uma fosfodiesterase específica de ligação ao monofosfato de guanosina cíclico, designada por PDE-LGc (em inglês cGB-PDE) e mais particulannente diz respeito a novos polinucleótidos purificados e isolados que codificam os polipeptidos de PDE-LGc, aos métodos e aos materiais para a produção recombinante dos polipeptidos de PDE-LGc e aos métodos para identificar os moduladores da actividade de PDE-LGc.
ANTECEDENTES
As fosfodiesterases (PDE) de nucleótidos cíclicos, que catalisam a hidrólise de nucleótidos cíclicos em 3’,5’, tais como o monofosfato de guanosina cíclico (MPGc, em inglês cGMP) e o monofosfato de adenosina cíclico (MPAc, em inglês cAMP), daí resultando os correspondentes monofosfatos de nucleósidos em 5’, constituem uma família complexa de 2 enzimas. Ao mediarem a concentração intracelular dos nucleótidos cíclicos, as isoenzimas PDE intervêm nos circuitos de transdução do sinal, envolvendo os segundos mensageiros de nucleótidos cíclicos.
Foram já isoladas inúmeras PDE a partir de diferentes fontes tedduais e muitas das PDE, até ao momento presente caractenzadas, revelam diferenças nas suas propriedades biológicas, incluindo as suas propriedades físico-químicas, a especificidade dos substratos, a sensibilidade aos inibidores, a reactividade imunológica e o modo de regulação. [Ver Beavo et al, Cyclic Nucleotide Phosphodiesterases: Structure, Regulation and DrugAction, John Wiley & Sons, Chichester, R U (1990)] Uma comparação das sequências conhecidas de aminoácidos das diversas PDE indica que a maior parte das PDE são proteínas quiméricas de multidomínios que possuem domínios catalíticos e regulativos distintos. [Ver Charbonneau, págs. 267-296 em Beavo et al., supra]. Todas as PDE de mamíferos, caracterizadas até ao momento presente, partilham uma sequência com um comprimento aproximado de 250 aminoácidos onde parece estar o local catalítico e cuja localização se encontra na região do terminal carboxilo da enzima. Presume-se que os domínios das PDE que interactuam com as moléculas alostéricas ou regulativas estejam localizados dentro das regiões do terminal amino das isoenzimas. Com base nas suas propriedades biológicas, é possível classificar as PDE em seis famílias gerais: as PDE (tipo I) estimuladas por Ca2+/calmodulina, as PDE (tipo Π) estimuladas pelos MPGc, as PDE (tipo III) inibidas pelos MPGc, as PDE (tipo IV) específicas dos MPAc, as PDE-LGc (tipo V) que são fosfodiesterases específicas dos MPGc e que constituem o objecto da presente invenção e ainda as PDE fotorreceptoras (tipo VI) específicas dos MPGc.
As PDE de ligação aos MPGc (as PDE de tipo Π, tipo V e tipo VI), para além de terem um domínio catalítico homólogo junto ao seu terminal carboxilo, possuem uma segunda sequência conservada que se encontra localizada mais próximo do seu terminal amino e que pode compreender um domínio alostérico de ligação dos MPGc. Ver Charbonneau et al., proc. Natl. Acad. Sei. USA, 87:288-292 (1990)).
As PDE estimuladas pelos MPGc de tipo II (PDE-eGc, em inglês cGs-PDE) estão profusamente distribuídas em diferentes tipos de tecidos e presume-se que existam sob a forma de heterodímeros de subunidades de 100-105 kDa. As PDE-eGc respondem, em condições fisiológicas, a concentrações elevadas de MPGc, mediante um aumento da velocidade de hidrólise do MPAc. A sequência de aminoácidos das PDE-eGc do coração de bovino e uma sequência parcial de ADNc de uma PDE-eGc do córtex das supra-renais de bovino foram descritas por LeTrong et al. em Biochemistry, 29:10280-10288 (1990) e as sequências de ADNc de PDE-eGc de comprimento completo do cérebro de feto humano e das supra--renais de bovino estão descritas na publicação n° W092/18541, ao abrigo do Tratado Internacional de Cooperação sobre Patentes de Invenção, publicada a 29 de Outubro de 1992. A sequência de ADNc de comprimento completo das supra-renais de bovino também foi descrita por Sonncnburg et al. cm J. Biol. Chem., 206:17655-17661 (1991).
As PDE fotorreceptoras e as PDE-LGc foram descritas como sendo PDE específicas de MPGc devido ao facto de revelarem uma selectividade 50 vezes superior ou mesmo maior em termos de hidrólise de MPGc comparativamente com o MPAc.
As PDE fotorreceptoras são as PDE do segmento exterior dos bastonetes (PDE-SEB, em inglês ROS-PDE) e as PDE dos cones (PDE-SCO, em inglês COS-PDE). A estrutura holoenzimática das PDE-SEB é constituída por duas grandes subunidades α (88 kDa) e β (84 kDa), sendo as duas cataliticamente activas, e por duas subunidades regulativas γ mais pequenas (tendo as duas 11 kDa). Também foi já identificada uma forma solúvel de PDE-SEB que compreende subunidades α, β e γ e uma subunidade δ (15 kDa) que parece ser idêntica à subunidade de 15 kDa da PDE-SEB. Ovchinnikov et al, FEBS Lett., 223:169-173 (1987) descrevem ADNc de comprimento completo correspondente à subunidade α da PDE-SCO associada à membrana de bovinos e Lipkin et al., J. Biol. Chem., 265:12955-12959 (1990), descrevem um ADNc de comprimento completo correspondente à subunidade β da PDE do segmento exterior dos bastonetes de bovino. Ovchinnikov et al, FEBS Lett., 204:169-173 (1986), apresentam um ADNc de comprimento completo correspondente à subunidade γ da PDE-SEB e a sequência de aminoácidos da subunidade δ. A expressão da PDE-SEB também foi estudada no cérebro por Collins et al. em Genomics, 73:698-704 (1992). A PDE-SCO é constituída por duas subunidades a’ idênticas (94 kDa) c três subunidadcs mais pequenas de 11 kDa, 13 kDa e 15 kDa. Li et al. em proc. Natl. Acad Sei. USA, 87:293-297 (1990) descrevem um ADNc de comprimento completo correspondente à subunidade a’ da PDE-SCO de bovino. A PDE-LGc foi purificada até à homogeneidade a partir de tecido dos pulmões do rato [Francis et al, Methods Enzymol, 159:722-729 (1988)] e dos bovinos [Thomas et al, J. Biol Chem., 205:14964-14970 (1990), obra esta doravante designada por “Thomas F’]. A presença destas enzimas ou de enzimas semelhantes foi assinalada em inúmeros tecidos e espécies, incluindo as plaquetas do rato e dos seres humanos [Hamet et al, Adv. Cyclic Nucleotide Protein Phosphorylation Res., 76:119-136 (1984)], o baço do rato [Coquil et al, Biochem. Biophys. Res. Commun., 727:226-231 (1985)], o pulmão da cobaia [Davis et al., J. Biol. Chem., 252:4078-4084 (1977)], o músculo liso vascular [Coquil et al., Biochim. Biophys. Acta, 637:148-165 (1980)] e esperma do ouriço-do-mar [Francis et al, J. Biol Chem., 255:620-626 (1979)]. A PDE-LGc pode ser um homodímero constituído por duas subunidades de 93 kDa [ver Thomas I, supra\. Demonstrou-se que a PDE-LGc contém um local singular <·'' -· 5. » não encontrado noutras PDE conhecidas que se ligam ao MPGc e que são fosforiladas por cinases de proteínas dependentes do MPGc (designadas por KGc, em inglês cGK) e com menor afinidade por cinases de proteínas dependentes de MPAc (designadas por KAc, em inglês cAK) [Ver Thomas et d, J. Biol. Chern, 265:14971-14978 (1990), obra esta doravante aqui designada por “Thomas Π”]. A sequência de aminoácidos primários do local de fosforilação e a extremidade do terminal amino de um fragmento gerado por digestão quimotripsmica de PDE-LGc estão descritas respectivamente nas obras ‘Thomas Π’, supra, e ‘Thomas Γ, supra. No entanto, a maior parte da sequência de aminoácidos da PDE-LGc ainda não tinha sido descrita anteriormente. Há diversos inibidores de diferentes tipos de PDE já descritos na literatura. Dois inibidores que possuem uma certa especificidade para as PDE de tipo V são o zaprinaste e o dipiridamol. Ver Francis et al., págs. 117-140 em Beavo et ai, supra. A explicitação das sequências de ADN e dos aminoácidos codificadoras das PDE-LGc e a produção do polipeptido de PDE-LGc por métodos recombinantes poderiam fornecer informação e material que possibilitassem a identificação de novos agentes que modulem de forma selectiva a actividade dos PDE-LGc. O reconhecimento de que há tipos distintos ou famílias distintas de isoenzimas PDE e de que há tecidos diferentes que exprimem diferentes complementos das PDE conduziu ao desenvolvimento de modul adores de PDE que podem ter indicações terapêuticas para estados patológicos que impliquem os circuitos de transdução do sinal, utilizando nucleótidos cíclicos como segundo mensageiros. Murray et al. em Biochem. Soc. Trans., 20(2):460-464 (1992) descrevem diversos inibidores selectivos e não selectivos da actividade das PDE. O desenvolvimento de moduladores de PDE, sem capacidade para produzirem uma PDE específica, por meio de técnicas recombinantes de 6 ADN é difícil porque todas as PDE catalisam a mesma reacção básica, possuem especificidades de sobreposição no substrato e ocorrem apenas em quantidades exíguas. Em consequência, a purificação até se obter a homogeneidade de muitas PDE é um processo moroso e difícil.
Assim, continua a ser necessário, na especialidade, que haja informação sobre as sequências de ADN e de aminoácidos para as PDE-LGc e que haja métodos e materiais para a produção recombinante de polipeptidos de PDE-LGc e também que haja métodos para a identificação de moduladores específicos da actividade das PDE-LGc.
DESCRIÇÃO ABREVIADA DA INVENÇÃO A presente invenção proporciona novos polinucleótidos purificados e isolados (v.g. sequências de ADN e produtos de transcrição de ARN, tanto as cadeias de sentido concordante como anti-sentido, incluindo as suas variantes obtidas por divisão) que codificam a PDE humana de ligação ao MPGc e específica do MPGc (PDE-LBc, polipeptido a que corresponde a SEQ ID NO:23). A presente invenção também proporciona um polinucleótido purificado e isolado que codifica uma variante alélica humana do polipeptido PDE-T Gc a que corresponde a SEQ ID NO:23, em que o referido polinucleótido híbrida a cerca de 65°C em SSC 3X com fosfato de sódio 20 nM a pH 6,8, com lavagem a cerca de 65°C em SSC 2X, até à cadeia não codificadora do ADN a que corresponde a SEQ ID NO:22. De acordo com a presente invenção, esta proporciona também um polinucleótido purificado e isolado que compreende o ADN com a sequência designada por SEQ ID NO:22. As sequências de ADN preferidas da presente invenção compreendem as sequências genómicas e de ADNc e também as sequências de ADN sintetizadas total ou parcialmente por via química As sequências de ADN que codificam as PDE-LGc estão explicitadas nas SEQ ID NOS: 9 ou 20 e também são aqui reveladas as sequências de ADN que hibridam com aquelas em condições rigorosas / 7 -7 ou as sequências de ADN que poderiam hibridar com aquelas, não obstante a redundância do código genético. Também estão contempladas as réplicas biológicas (isto é, cópias de sequências isoladas de ADN produzidas in vivo ou in vitro) das sequências de ADN da invenção. A invenção proporciona também arquétipos recombinantes replicativos de forma autónoma, tais como os vectores de ADN plasmídico e virai, que incorporam as sequências de PDE-LGc da invenção, e em especial os vectores em que o ADN que codifica as PDE-LGc da invenção está funcionalmente ligado a uma sequência de ADN endógeno ou exógeno de conirolo da expressão e a um terminador transcricional. Para ilustrar de forma específica os plasmídeos de expressão da presente invenção, refere-se o plasmídeo hcgbmetl56-2 6n na estirpe JM109 de E. coli que foi depositado na Colecção Americana de Culturas Tipo (‘American Type Culture Collection’ (‘ATCC’), 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852) em 4 de Maio de 1993 com o n° 69296 de admissão.
De acordo com outro aspecto da presente invenção, células hospedeiras, quer sejam procarióticas quer sejam eucarióticas, são transformadas de forma estável com sequências de ADN da invenção, de modo a permitir que nelas sejam expressos os polipeptidos desejados. As células hospedeiras que exprimam produtos de PDE-LGc podem servir para diversos fins úteis. Tais células constituem uma fonte valiosa de imunogénios para o desenvolvimento de substâncias que são anticorpos especificamente imunorreactivos com as PDE-LGc. As células hospedeiras da presente invenção são manifestamente úteis em métodos para a produção de polipeptidos de PDE-LGc em grande escala, crescendo pois as células num meio de cultura adequado e sendo os produtos polipeptídicos desejados isolados a partir dessas células ou a partir do meio onde as células estiveram a crescer, por exemplo, por purificação por imunoafinidade.
Os produtos de PDE-LGc podem ser obtidos como isolados a partir de fontes celulares naturais ou podem ser sintetizados por via química, sendo no entanto produzidos 8 preferencialmente por meio de procedimentos recombinantes em que estão envolvidas as células hospedeiras da presente invenção. Prevê-se que a utilização de células hospedeiras de mamíferos venha a permitir as modificações pós-traducionais (v.g., glicosilação, truncadura, lipidação e fosforilação da tirosina, serina ou treonina) necessárias para se conferir uma actividade biológica óptima aos produtos de expressão recombinante da invenção. Os produtos de PDE-LGc da invenção podem ser polipeptidos, fiagmentos ou variantes de comprimento completo. Tais variantes podem ser análogos de polipeptidos de PDE-LGc em que um ou vários dos aminoácidos especificados (isto é, codificados naturalmente) são suprimidos ou substituídos ou cm que um ou vários aminoácidos não especificados são acrescentados: (1) sem perda de uma ou várias das actividades biológicas ou das características imunológicas específicas das PDE-LGc; ou (2) com inutilização específica de uma actividade biológica particular das PDE-LGc.
De acordo com a presente invenção, esta proporciona também um fragmento de uma PDE-LGc humana, constituído pelos aminoácidos 516 a 875 da SEQID NO:23, um fragmento da PDE-LGc humana, constituído pelos aminoácidos 1 a 494 da SEQ ID NO:23, um fragmento da PDE-LGc humana, constituído pelos aminoácidos 1 a 549 da SEQ ID NO:23 e um fragmento da PDE-LGc humana, constituído pelos aminoácidos 515 a 879 da SEQ ID NO:23. A presente invenção também diz respeito a substâncias que são anticoipos (v.g., anticorpos monoclonais e policlonais, anticorpos de cadeia singular, anticorpos quiméricos, anticorpos enxertados na RDC (em inglês CDR) e outros que tais) especificamente imunorreactivos com a PDE-LGc a que corresponde a SEQ ID NO:23. A invenção também diz respeito a outras proteínas de ligação específicas para a PDE-LGc. As proteínas de ligação específicas podem ser desenvolvidas utilizando PDE-LGc isoladas ou recombinantes ou então variantes de PDE-LGc ou então células que exprimam tais produtos. Por sua vez, as proteínas de ligação ^V" 9 são úteis em composições para imunização e também para a purificação de polipeptidos de PDE-LGc e para a detecção ou para a quantificação de polipeptidos de PDE-LGc em amostras de fluídos e de tecidos, por meio de procedimentos imunológicos conhecidos. Também são manifestamente úteis na modulação (isto é, bloqueio, inibição ou estimulação) de actividades bioquímicas das PDE-LGC, em especial no caso das actividades implicadas na transdução do sinal. Também estão previstos os anticorpos anti-idiotípicos específicos para as substâncias que são anticorpos anti-PDE-LGc. O valor científico da informação associada à divulgação das sequências de ADN e de aminoácidos da presente invenção é manifesto. Entre vários exemplos, o conhecimento da sequência de um ADNc para a PDE-LGc faz com que seja possível isolar, por hibridação de tipo ADN/ADN, as sequências de ADN genómico que codificam a PDE-LGc e que especificam as sequências regulativas de controlo da expressão da PDE-LGc, tais como promotores, operadores e não só. Prevê-se também que os procedimentos de hibridação de tipo ADN/ADN efectuados com as sequências de ADN da presente invenção, em condições rigorosas, permitam isolar os ADN codificadores de variantes alélicas de PDE-LGc, outras proteínas estruturalmente congéneres que partilhem uma ou várias das propriedades bioquímicas e/ou imunológjcas específicas de PDE-LGc e proteínas de espécies não humanas homólogas da PDE-LGc. Os polinucleótidos da invenção, quando convenientemente marcados, são úteis em ensaios de hibridação para a detecção da capacidade das células para sintetizarem PDE-LGc. Os polinucleótidos da invenção também podem constituir a base para métodos de diagnóstico úteis para a identificação de uma ou várias alterações genéticas no loccus de PDE-LGc que esteja subjacente a um ou vários estados patológicos. A invenção faculta também polinucleótidos anti-sentido relevantes para a regulação da expressão dos PDE-LGc pelas células que vulgarmente os exprimem. 10 A informação respeitante às sequências de ADN e de aminoácidos da presente invenção também faz com que seja possível a análise sistemática da estrutura e da actividade de PDE-LGc e a definição das moléculas com que estas interactuam É possível identificar os agentes que modulam a actividade de PDE-LGc fazendo a incubação de um modulador putativo com um lisado de células eucarióticas que exprimam PDE-LGc recombinante e determinando o efeito do modulador putativo sobre a actividade da fosfodiesterase de nucleótidos cíclicos. Para se ilustrar de forma específica uma célula eucariótica deste tipo refere-se a estirpe de leveduras YKS45 que foi depositada na instituição ATCC a 19 de Maio de 1993 com o n° 74225 de admissão. A selectividade de um composto que module a actividade das PDE-LGc pode ser avaliada comparando a sua actiyidade sobre as PDE-LGc com a sua actividade sobre outras isoenzimas PDE. A combinação de produtos de PDE-LGc recombinantes da presente invenção com outros produtos de PDE recombinantes num conjunto de ensaios independentes constitui um sistema para o desenvolvimento de moduladores selectivos das PDE-LGc.
Os moduladores selectivos podem ser, por exemplo, anticorpos e outras proteínas ou outros péptidos que se liguem de forma específica às PDE-LGc ou ao ácido nucleico das PDE-LGc, oligonucleótidos que se liguem de forma específica às PDE-LGc ou ao ácido nucleico das PDE-LGc ou outros compostos de tipo não peptídico (v.g., moléculas orgânicas isoladas ou sintéticas) que reajam de forma específica com as PDE-LGc ou com o ácido nucleico das PDE-LGc. Também são contempladas as formas mutantes de PDE-LGc que afectam a actividade enzimática ou a localização celular das PDE-LGc genuínas de tipo natural. Os alvos actualmente preferidos para o desenvolvimento de moduladores selectivos compreendem, por exemplo. (1) as regiões das PDE-LGc que contactam com outras proteínas e/ou que localizam as PDE-LGc dentro de uma célula, (2) as regiões das PDE-LGc que se 11 ligam a um substrato, (3) os locais alostéricos das PDE-LGc que se ligam aos MPGc, (4) o(s) local(is) de fosforilação das PDE-LGc e (5) as regiões das PDE-LGc implicadas na dimerização de unidades de PDE-LGc. Os moduladores da actividade das PDE-LGc podem ser terapeuti-camente úteis no tratamento de diversas doenças e estados fisiológicos. DESCRIÇÃO ABREVIADA DOS DESENHOS Há muitos outros aspectos e vantagens da presente invenção que se tomam evidentes tendo em consideração a memória descritiva minuciosa subsequente, tomando como referência os desenhos em que: as figuras IA a 1C ilustram um alinhamento dos domínios catalíticos conservados de diversas isoenzimas PDE em que os resíduos que são idênticos em todas as PDE enumeradas são indicados pela correspondente abreviatura de uma só letra dos aminoácidos na linha “conservada”, os resíduos que são idênticos nas PDE-LGc e nas PDE fotorreceptoras são indicados apenas por um asterisco na linha “conservada” e os espaços vazios introduzidos para optimizar o alinhamento são indicados por períodos; as figuras 2A a 2C ilustram um alinhamento dos domínios de ligação de MPGc de diversas isoenzimas PDE em que os resíduos que são idênticos em todas as PDE são indicados pela sua abreviatura de aminoácidos de uma só letra na linha “conservada” e os espaços vazios introduzidos para o melhor alinhamento são indicados por períodos; a figura 3 é um alinhamento de repetições intemamente homólogas de diversas isoenzimas PDE em que os resíduos idênticos em cada repetição A e B de todas as PDE enumeradas de ligação dos MPGc são indicados pela sua abreviatura de aminoácidos de uma só letra na linha “conservada” e em que os asteriscos na linha “conservada” representam posições em que todos os resíduos são quimicamente conservados; 12 a figura 4 ilustra de forma esquemática a organização dos domínios de PDE-LGc; a figura 5 é um gráfico de barras que representa os resultados de experiências em que extractos de células COS transfectadas com sequências de PDE-LGc ou extracto de células COS não transfectadas foram analisados para pesquisa da actividade de fosfodiesterase, utilizando como substrato MPGc 20 μΜ ou MPAc 20 μΜ; a figura 6 é um gráfico que ilustra os resultados de experiências efectuadas com extractos de células transfectadas com sequências de PDE-LGc de bovino, realizadas para a pesquisa da actividade de fosfodiesterase de MPGc na presença de uma série de concentrações de inibidores de fosfodiesterases, incluindo o dipiridamol (quadrados a cheio), o zapiinaste (círculos a cheio), a metoximetil-xantina (triângulos a cheio) e o rolipram (círculos em branco); a figura 7 é um gráfico de barras que representa os resultados de experiências em que os extractos obtidos a partir de células COS transfectadas com sequências de PDE-LGc de bovino ou de células COS não transfectadas, de contraprova, foram estudados para pesquisa da actividade de ligação de [^fJ-MPGc na ausência (-) ou na presença (+) de IBMX 0,2 mM; e a figura 8 é um gráfico que traduz os resultados de experiências em que extractos de células transfectadas com sequências de PDE-LGc de bovino foram estudados para pesquisa da actividade de ligação de [3H]-MPGc na presença de MPAc ((círculos em branco) ou de MPGc (círculos a cheio), em excesso e não marcados, nas concentrações indicadas.
DESCRICÃO MINUCIOSA
Os exemplos seguintes ilustram a invenção. O exemplo 1 descreve o isolamento de um fragmento de ADNc de PDE-LGc por RCP e o subsequente isolamento de um ADNc de PDE-LGc de comprimento completo utilizando como sonda o fragmento obtido por RCP. O exemplo 2 apresenta uma análise da relação entre a sequência de aminoácidos de PDE-LGc 13 de bovino e as sequências explicitadas para outras PDE. No exemplo 3 são apresentadas as análises pelas autorradiografias de Northern de ARNm de PDE-LGc para diversos tecidos de bovino. No exemplo 4 descreve-se a expressão do ADNc de PDE-LGc em células COS. O exemplo 5 apresenta os resultados de experiências sobre o produto de expressão de PDE-LGc em células COS para pesquisa da actividade de fosfodiesterase, actividade de ligação dos MPGc e da actividade da hidrolase de Zn2+. O exemplo 6 descreve o isolamento dos ADNc humanos homólogos do ADNc de PDE-LGc de bovino. O exemplo 7 descreve a expressão de um ADNc de PDE-LGc humana em células de leveduras. O exemplo 8 descreve ensaios de protecçõo de RNase para detectar PDE-LGc em tecidos humanos. O exemplo 9 descreve a expressão bacteriana de ADNc de PDE-LGc de seres humanos e o desenvolvimento de anticorpos reactivos com o produto de expressão bacteriana de PDE-LGc. O exemplo 10 descreve fragmentos e análogos de PDE-LGc. O exemplo 11 descreve a geração de anticorpos monoclonais que reconhecem a PDE-LGc. O exemplo 12 diz respeito à utilização de produtos recombinantes de PDE-LGc da presente invenção para o desenvolvimento de agentes que modulem de forma selectiva as actividades biológicas de PDE-LGc. F.xemplo 1
Utilizou-se a reacção em cadeia com polimerase (RCP) para isolar um fragmento de ADNc que codifica uma parcela de PDE-LGc de ADNc de cadeia singular de pulmão de bovino. Foram concebidos iniciadores de RCP completamente degenerados de sentido concordante e anti-sentido, com base na sequência parcial dos aminoácidos de PDE-LGc, descrita por Thomas \ supra, e na nova informação sobre a sequência parcial de aminoácidos. A. Purificação da proteína PDE-LGc purificou-se PDE-LGc conforme descrito por Thomas 1, supra, ou de acordo com uma modificação de tal método, adiante descrita.
Obteve-se num matadouro pulmões recentes de bovino (5-10 kg), tendo sido colocados imediatamente em gelo. Fragmentou-se muito bem o tecido pulmonar e combinou-se com tampão PEM frio (fosfato de sódio 20 mM a pH 6,8 contendo EDTA 2 mM e β-mercaptoetanol 25 mM). Após a homogeneização e a centrifugação efectuou-se a incubação do sobrenadante resultante com 4 L a 7 L de DEAE-celulose (Whatman, UK) durante 3 a 4 horas. Depois filtrou-se a massa de DEAE sob uma pressão hipobárica e enxaguou-se com vários volumes de PEM frio. Verteu-se a resina dentro de uma coluna de vidro e lavou-se com 3 a 4 volumes de PEM. A eluição da proteína foi efectuada com NaCl 100 mM em PEM, tendo ido recolhidas 12 fracções de 1 L. Submeteu-se essas ftacções a experiências para analisar a actividade de ligação do MPGc estimulado por IBMX e da actividade da fosfodiesterase de MPGc, segundo procedimentos convencionais descritos por Thomas et al, supra. Juntou-se as fracções adequadas, diluiu-se 2 vezes com água íiia desionizada e efectuou-se a cioma-tografia com ‘Blue Sepharose®’ (Pharmacia LKB Biotechnology Inc., Piscataway, NJ). A seguir realizou-se uma cromatografia adsorvente por afinidade com quelato de zinco, utilizando quer uma matriz e gelose quer uma matriz de gel à base de ‘Sepharose’. A massa proteínica resultante do passo de quelação com o quelato de zinco foi tratada conforme descrito por Thomas I, supra, ou foi submetida a um procedimento modificado de purificação.
Conforme descrito por Thomas I, supra, aplicou-se essa massa proteínica em cargas múltiplas a uma coluna de CLER de tipo ‘Bio-Sil TSK-545 DEAE’ (150 mm x 21,5 mm) (BioRad Laboratories, Hercules, CA) equilibrada em PEM a 4°C. Decorrido um período de equilíbrio, a seguir a uma lavagem com 120 mL de NaCl 50 mM em PEM, seguiu-se uma 15 eluição com 120 mL de um gradiente linear de NaCl variando entre 50 mM e 200 mM em PEM, com um caudal de 2 mL/minuto. Juntou-se as fracções adequadas e concentrou-se em tubagem de diálise em presença de ‘Sephadex G-200’ (Boehringer Mannheim Biochemicals, UK), até se obter um volume final de 1,5 mL. A massa agregada de PDE-LGc concentrada foi aplicada numa coluna de CLER de filtração através de gel (Bio-Sil TSK-250, 500 mm x 21,5 mm) equilibrada em fosfato de sódio 100 mM a pH 6,8 contendo EDTA 2 mM e β--mercaptoetanol 25 mM, tendo a eluição decorrido com um caudal de 2 mL/minuto a 4°C.
Quando foi executado o procedimento modificado, menos trabalhoso, a diálise da massa proteínica agregada foi efectuada em presença de PEM durante 2 horas, tendo sido carregada numa coluna de tipo ‘DEAE Sephacel’ preparatória de 10 mL (Pharmacia) equilibrada em tampão PEM. Efectuou-se a eluição da proteína por lotes com NaCl 0,5 M em PEM, daí resultando a proteína com uma concentração aproximada de 10 a 15 vezes. Carregou-se a amostra de proteína concentrada numa coluna de 800 mL (2,5 cm x 154 cm) de filtração através de gel ‘Sephacryl S400’ (Boehringer) equilibrada em NaCl 0,1 M em PEM, tendo a eluição decorrido com um caudal de 1,7 mL/minuto.
Avaliou-se a pureza da proteína por contrastação com o corante de Coomassie após electroforese em gel de poliacrilamida com dodecil-sulfato de sódio (EGPA-DSS). Obteve-se aproximadameníe entre 0,5 mg e 3,0 mg de PDE-LGc pura por cada 10% de pulmões de bovino.
Os anticorpos policlonais de coelho, específicos para a PDE-LGc de bovino purificada, foram gerados por meio de procedimentos convencionais. B. Sequenciação dos aminoácido da PDE-LGc A PDE-LGc fosforilada com [32P]ATP foi então digerida com protease para proporcionar fosfopeptidos marcados com 32P. Foram fosforílados aproximadamente 100 pg de PDE-LGc purificada, numa mistura de reacção contendo MgCk 9 mM, [32P]ATP 9 μΜ, MPGc 10 μΜ e 4,2 pg da subunidade catalítica de cinase proteínica, dependente de MPAc, purificada dos bovinos (KAc, em inglês cAK), num volume final de 900 pL. A subunidade catalítica de KAc foi preparada em conformidade com o método de Flockhart et d., págs. 209-215 em Marangos et d., Brain Receptor Methodologies, Part A, Academic Press, Orlando, Florida (1984). A mistura de reacção ficou a incubar durante 30 minutos a 30°C e interrompeu-se a reacção por adição de 60 pL de EDTA 200 mM.
Para se obter uma primeira sequência peptídica a partir de PDE-LGc acrescentou-se 3,7 pL de uma solução de α-quimotripsina na concentração de 1 mg/mL em tampão de KPE (fosfato de potássio 10 mM a pH 6,8 contendo EDTA 2 mM) a 100 pg de PDE-LGc fosforilada e purificada e manteve-se a mistura a incubar durante 30 minutos a 30°C. Interrompeu-se a proteólise por adição de 50 pL de DSS a 10% e 50 pL de β-mercaptoetanol. Manteve-se a amostra em ebulição até o volume ter sido reduzido para menos de 400 pL e depois aplicou-se sobre um gel preparatório de poliacrilamida com DSS a 8% e efectuou-se a electroforese com uma corrente de 50 mA. Os produtos de digestão separados foram electrotransferidos para uma membrana de difluoreto de polivinilideno ‘Immobilon’ (Millipore, Bedford, MA), em conformidade com o método de Matsudaira, J. Biol. Chem., 262:10035-10038 (1987). A proteína transferida foi identificada par contraste com o corante azul-de-coomassie e excisou-se uma banda de 50 kDa a partir da membrana para se efectuar uma sequenciação automática dos aminoácidos, em fase gasosa. A sequência do péptido obtido graças ao procedimento de digestão com α-quimotripsina está indicada a seguir e é designada por SEQ DD NO: 1. SEQIDNO:l
REXDANRINYMYAQYVKNTM " 17
Obteve-se uma segunda sequência a partir do fragmento peptídico de PDE-LGc gerado por proteólise em V8. Acrescentou-se aproximadamente 200 jug de PDE-LGc purificada a meio constituído por MgCl2 10 mM, [32P]ATP 10 μΜ, MPGc 100 μΜ e pela subunidade catalítica de KAc purificada na concentração de 1 pg/mL num volume final de 1,4 mL. Manteve-se a reacção a incubar durante 30 minutos a 30°C e interrompeu-se a reacção por adição de 160 pL de EDTA 0,2 Μ. A seguir acrescentou-se 9 pL de protease Y8 de Staphylococcal aureus na concentração de 1 pg/mL (hrteirational Chemical Nuclear Biomedicals, Costa Mesa, CA) diluída em KPE, seguindo-se uma incubação de 15 minutos a 30°C. Interrompeu-se a proteólise por adição de 88 pL de DSS a 10% e 45 pL de β-mercaptoetanol. Efectuou-se a separação dos produtos de digestão por electroforese sobre um gel preparatório de poliacrilamída com DSS a 10% sob a acção de uma corrente de 25 mA durante 4,5 horas. As proteínas foram electrotransferidas e contrastadas conforme descrito antes. Excisou-se uma banda proteínica de 28 kDa a partir da membrana e submeteu-se a uma sequenciação automática de aminoácidos em fase gasosa. A sequência obtida está indicada a seguir e é designada por SEQIDNO.-2.
SEQID NO:2 QSLAAAWP
C. Amplificação de ADNc de bovinos por RCP
As sequências parciais de aminoácidos utilizadas para conceber os iniciadores (SEQ ID NO:3, infra, e aminoácidos 9-20 da SEQ ID NO. 1) e as sequências dos correspondentes iniciadores da RCP (em nomenclatura da ‘IUPAC’) estão indicadas a seguir, sendo a SEQ ID NO:3 a que está indicada na obra de Thomas I, supra. SEQID N0:3 F D N D E G E Q 5’ TTY GAY AAY GAY GAR GGN GAR CA 3’ (SEQ ID NO:4) 3’ AAR CTR TTR CTR CTY CCN CTY GT 5’ (SEQ ID NO:5) SEQ ID NO: 1, aminoácido 9-20 N Y M Y A Q Y V K N T M 5’ AAY TAY ATG TAY GCN CAR TAY GT 3’ (SEQ ID NO:6) 3’ TTR AIR TAC ATR CGN GTY ATR CA 5’ (SEQ ID NO:7) 3’ TTR AIR TAC AIR CGN GTY ATR CAN TTY TIR TGN TAC 5’ (SEQ ID NO:8)
Os iniciadores de sentido natural e anti-sentido, sintetizados utilizando um síntetizador de ADN de modelo 380A da ‘Applied Biosystems’ (Foster City, CA), foram utilizados em todas as combinações possíveis para a amplificação de sequências específicas de PDE-LGc a partir de ADNc de cadeia singular de pulmão de bovino, conforme adiante descrito.
Após a precipitação em etanol efectuou-se a combinação de pares de oligonucleótidos (SEQ ID NOS:4 ou 5 combinadas com as SEQ ID NOS:6, 7 ou 8) na concentração de 400 nM para cada uma delas numa RCP. A reacção teve lugar utilizando 50 ng de ADNc de cadeia singular de pulmão de bovino (gerado utilizando transcriptase reversa de AMV e iniciadores aleatórios sobre ARNm de pulmão de bovino seleccionado por oligo-dT), diversos dNTP 200 μΜ e duas unidades de polimerase de Taq. O passo inicial de desnaturação decorreu a 94°C durante 5 minutos, seguindo-se 30 ciclos constituídos por um passo de desnaturação durante 1 minuto a 94°C, um passo de recombinação de 2 minutos a 50°C e um passo de amplificação de 2 minutos a 72°C. A RCP foi realizada utilizando um reactor de modelo 19 ‘Hybaid Thennal Reactor’ (ENK Scientific Products, Saratoga, CA) e os produtos foram separados por electroforese em gel em que se utilizou um gel de agarose a 1%, de baixo ponto de fusão, utilizando Tris-acetato 40 mM e EDTA 2 mM. Observou-se uma banda fiaca de cerca de 800-840 pb com os iniciadores identificados nas SEQ DD NOS:4 e 7 e com os iniciadores identificados nas SEQ ID NOS:4 e 8. Nenhum dos outros pares de iniciadores proporcionou bandas visíveis. O produto da RCP gerado por amplificação com os iniciadores identificados nas SEQ Π) NOS:4 e 7 foi isolado utilizando o estojo de purificação de ADN ‘Gene Clean®’ (BiolOl, La Jolla, CA), em conformidade com o protocolo do fabricante. Ligou-sc o produto da RCP (20 ng) a 200 ng dc ‘pBlucscript KS(+)’ linearizado (Slratagcnc, La Jolla, CA) e utilizou-se o arquétipo plasmídico resultante para a transformação de células ‘XL1 Blue’ de E coli (Stratagene Clomng Systems, La Jolla, CA). Os arquétipos positivos de transformação putativa foram então analisados e investigados por sequenciação. As sequências obtidas não eram homólogas de nenhuma das sequências conhecidas de PDE nem das sequências parciais conhecidas de PDE-LGc.
Efectuou-se outra vez uma RCP com ADNc de cadeia singular de pulmão de bovino utilizando para tal os iniciadores identificados nas SEQ DD NOS:4 e 7. Foi identificado um clone que continha um fragmento intercalar de 0,8 Kb com um único bloco grande de leitura ininterrupta. O bloco de leitura ininterrupta codificava um polipeptido que continha os aminoácidos KNTM (aminoácidos 17-20 da SEQ ID NO:l que não foram utilizados para a concepção da sequência do iniciador identificada na SEQ ID NO: 7) e que tinha um elevado grau de homologia com as sequências deduzidas de aminoácidos das PDE-eGc, PDE-SEB e PDE-SCO (o mesmo que cGs-PDE, ROS-PDE e COS-PDE). O clone identificado corresponde aos nucleótidos 489-1313 da SEQ ID NO:9. 20 D. Construção e pesquisa de hibridacão de um banco de ADNc de bovino
Com o intuito de se obter um ADNc codificador de tuna PDE-LGc de comprimento completo, pesquisou-se um banco de ADNc de pulmão de bovino, tendo para tal sido utilizado como sonda um fragmento intercalar de ADNc gerado por RCP e marcado com 32P.
Preparou-se ARN poliadenilado a partir de pulmão de bovino conforme descrito por Sonnenburg et cd., J. Biol. Chem., 266:17655-17661 (1991). Sintetizou-se ADNc de cadeia singular utilizando transcriptase reversa de AMV (Life Sciences, St. Petersburg, FL) com iniciadores hexanucleotídicos aleatórios, conforme descrito por Ausubel et al, Current protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Nova Iorque (1987). Sintetizou-se ADNc de cadeia dupla utilizando polimerase I de ADN de E. coli na presença de ligase de ADN de E. coli e de RNase H de E. coli. Efectuou-se a selecção dos ADNc com mais de 500 pb por cromatografia em ‘Sepharose® CL-4B’ (Millipore). Os adaptadores de EcóBl (Promega, Madison, WI) foram ligados ao ADNc utilizando ligase de ADN das T4. Após a inactivação térmica da ligase, fosforilou-se o ADNc utilizando cinase dos polinucleótidos das T4. Os adaptadores não ligados foram removidos por cromatografia sobre ‘Sepharose® CL-4B’ (Pharmacia, Piscataway, NJ). Efectuou-se a ligação do ADNc dentro de braços ‘lambda Zap®IF (Stratagene) desfosforilados e digeridos com Ler;Ri, tendo sido acondicionado com extractos de ‘Gigapack® Gold’ (Stratagene), em conformidade com as instruções do fabricante. A titulação do banco não amplificado foi de 9,9 x 105 com 18% de não recombinantes. Amplificou-se o banco aplicando sobre 20 placas de 150 mm um total de 50 000 unidades formadores de placas (u.f.p.), daí resultando uma titulação final de 5,95 x 106 u.f.p./mL com 21% de não recombinantes.
Esse banco foi aplicado sobre 24 placas de 150 mm à razão de 50 000 u.f.p./placa e foi pesquisado com o clone de ADNc marcado com 32P. Preparou-se a sonda utilizando o método ,4" 21 de Feinberg et al., Anal. Biochem., 737:266-267 (9184) e purificou-se o ADN marcado com 32P recorrendo a colunas de ‘Elutip-D®’ (Schleicher e Schuell Inc., Keene, NH), em conformidade com as instruções do fabricante. As remoções a partir das placas foram efectuadas utilizando filtros de nitrocelulose de 15 cm. A seguir à desnaturação e à neutralização, fixou-se o ADN sobre os filtros por cozedura a 80°C durante 2 horas. Efectuou-se a hibridação a 42°C de um dia para o outro numa solução que continha formamida a 50%, SSC 5X (NaCl 0,75 M, citrato de sódio 0,75 M a pH 7), fosfato de sódio 25 mM (pH 7,0), solução de Denhardt 2X, sulfato de dextrano a 10%, ARNt de levedura na concentração de 90 pg/mL e sonda marcada com 32P à razão aproximada de 106 c.p.m./mL (5 x 108 c.p.m./pg). Efectuou-se a lavagem dos filtros duas vezes em SSC 0,1X, DSS a 0,1% à temperatura ambiente, durante 15 minutos por cada lavagem, seguindo-se uma única lavagem de 20 minutos em SSC 0,1X e DSS a 1% a 45°C. Os filtros foram depois expostos a uma película sensível aos raios X à temperatura de -70°C durante vários dias.
As placas que hibridaram com a sonda marcada foram purificadas por meio de uma série de experiências de reaplicação em placas e novas filtrações. Os ADNc inseridos foram subclonados no vector ‘pBluescript SK(-)’ (Stratagene) pelo método de excisão in vivo descrito nas instruções do fabricante. Foram obtidas autorradiografias a Southern com o intuito de se verificar se o ADNc assim obtido hibridava com a sonda de RCP. Os ADNc putativos de PDE-LGc foram sequenciados utilizando a versão 2.0 de ‘Sequenase®’ (United States Biochemical Corporation, Cleveland, Ohio) ou os estojos de ‘TaqTrack®’ (Promega).
Foram isolados três clones distintos de ADNc designados por LGc-2, LGc-8 e LGc-10 (em inglês cGR-2, cGR-8 e cGR-10) As sequências de ADN e as sequências deduzidas de aminoácidos do clone LGc-8 estão explicitadas nas SEQID NOS:9 e 10. A sequência de ADN a jusante do nucleótido 2686 pode representar eventualmente uma espúria de clonagem. A 22 sequência de ADN do LGc-10 é idêntica à sequência do LGc-8 com a excepção de um nucleótido. A sequência de ADN do clone LGc-2 diverge da sequência do clone LGc-8 desde 5’ até ao nucleótido 219 do clone LGc-8 (SEQ ID NO:9) e poderia codificar uma proteína com um terminal amino diferente. O clone de ADNc de LGc-8 tem um comprimento de 4474 pb e contém um quadro grande de leitura ininterrupta com 2625 pb. Presume-se que o tripleto ATG na posição 99-101 na sequência nucleotídica seja o local do início da tradução do gene de PDErLGc uma vez que está precedido por um codão de paragem concatenado e as bases adjacentes são compatíveis com o local de Kozak de iniciação de consenso para os ARNm eucarióticos. O codão de paragem TAG está localizado nas posições 2724-2726 e é seguido por 1748 pb da sequência não traduzida em 3’. A sequência do clone LGc-8 não contém uma sequência de consenso de terminação da transcrição, pelo que o clone pode eventualmente não representar a região completa não traduzida em 3’ do correspondente ARNm. O bloco de leitura ininterrupta do ADNc do LGc-8 codifica um polipeptido de 875 aminoácidos com uma massa molecular calculada igual a 99,5 kDa. Esta massa molecular calculada é apenas ligeiramente superior à massa molecular atribuída à PDE-LGc purificada, para a qual se conclui por análise efectuada por EGPA-DSS que era aproximadamente igual a 93 kDa A sequência deduzida de aminoácidos do clone LGc-8 corresponde exactamente a todas as sequências peptídicas obtidas a partir de PDE-LGc de pulmão de bovino, purificada, o que constitui uma forte prova de que o LGc-8 codifica a PDE-LGc.
Exemplo 2
Uma pesquisa efectuada nos bancos de dados ‘SWISS-PROT’ e ‘GEnEmbl’ (Publicação de Fevereiro de 1992), efectuada com recurso ao programa informático ‘FASTA’ fornecido com a aplicação lógica de ‘Genetics Computer Group’ (GCG) (Madison, Wisconsin), revelou que apenas as sequências de ADN e de aminoácidos identificadas para outras PDE tinham uma semelhança significativa com a sequência de ADN e com a sequência deduzida de aminoácidos do clone LGc-8.
Foram efectuadas comparações emparelhadas da sequência deduzida de aminoácidos da PDE-LGc com as sequências de outras 8 PDE utilizando os programas ‘ALIGN’ [Dayhoff et al., Methods Enzymol., 92:524-545 (1983)] e ‘BESTFIT’ [Wilbur et al, Proc. Natil. Acad. Sei. USA, #0:726-730 (1983)]. Tal como sucede com todas as fosfodiesterases de mamíferos até agora sequenciadas, a PDE-LGc contém uma sequência conservada do domínio catalítico que possui aproximadamente 250 aminoácidos na metade do terminal carboxilo da proteína para a qual se presume que seja essencial para a actividade catalítica. Este segmento compreende os aminoácidos 578-812 da SEQ Π) NO:9 e manifesta uma conservação de sequência com as regiões correspondentes de outras PDE. O quadro 1 seguinte estabelece os valores específicos de identidade obtidos nas comparações emparelhadas de outras PDE com os aminoácidos 578-812 da PDE-LGc, em que o termo “ratdunce” é a PDE específica de MPAc do rato; o termo “61 kCaM” designa a PDE dependente de cálcio/calmodulina de 61 kDa de bovino; o termo “63 kCaM” designa a PDE dependente de cálcio/calmodulina de 63 kDa de bovino; o termo “drosdunce” é a PDE específica de MPAc de drosófila; o termo “SEB-α” (em inglês “ROS-a”) designa a subunidade α da PDE-SEB (em inglês ROS-PDE) de bovino; o termo “SEB-β” designa a subunidade β de PDE-SEB de bovino; o termo “SCO-α” (em inglês “COS-a'”) designa a subunidade a’ da PDE-SCO (em inglês COS-PDE); e o termo “eGc” (em inglês “cGs”) designa a PDE-eGc (em inglês cGs-PDE) (612-844). 24 &
Fosfodiesterase Quadro 1 Resíduos de domínios catalíticos % de identidade ‘Ratdunce’ 77-316 31 61 kCaM 193-422 29 63 kCaM 195-424 29 ‘Drosdunce’ 1-239 28 SEB-α (ROS-a) 535-778 45 SEB-β (ROS-β) 533-776 46 SCO-a’ (COS-a’) 533-776 48 EGc (cGs) 612-844 40
Foram efectuados vários alinhamentos de sequências utilizando o Algoritmo de Alinhamento Progressivo [Feng et al., Methods. Enzymol., 183:375-387 (1990)] implementado no programa ‘PILEUP’ (aplicação lógica GCG). As figuras IA a 1C mostram um alinhamento múltiplo de sequências do domínio catalítico proposto da PDE-LGc com todas as regiões correspondentes das PDE do quadro 1. Há 28 resíduos (ver os resíduos indicados pelas abreviaturas de aminoácidos de uma só letra na linha “conservada” nas figuras IA a 1C) que são invariantes entre as isoenzimas que incluem vários resíduos hisfidina conservados para os quais se presume que desempenhem um papel funcional na catálise. Ver Charbonneau et al., Proc. Natl. AcadL Sei. USA, supra. O domínio catalítico da PDE-LGc assemelha-se muito mais aos domínios catalíticos das PDE-SEB e das PDE-SCO do que as regiões correspondentes das outras isoenzimas PDE. Há várias regiões conservadas entre as PDE fotorreceptoras e as PDE-LGc que não são partilhadas por outras PDE. As posições dos aminoácidos nestas regiões, que são invariantes nas sequências das PDE fotorreceptoras e nas sequências das PDE-LGc, estão indicadas por asteriscos na linha “conservada” das figuras IA a 1C. As regiões de homologia entre as PDE-LGc e as PDE-SEB e as PDE-SCO podem desempenhar papeis importantes no que diz respeito a conferirem especificidade para a hidrólise do MPGc, coinparativamente com a hidrólise do MPAc ou para a sensibilidade a agentes farmacológicos específicos. A semelhança de sequências entre as PDE-LGc, as PDE-eGc e as PDE fotorreceptoras nâo se limita ao domínio catalítico conservado, incluindo também o domínio não catalítico de ligação do MPGc na metade do terminal amino da proteína. A optimização do alinhamento entre as PDE-LGc, as PDE-eGc e as PDE fotorreceptoras indica que pode haver um segmento conservado do terminal amino que contenha os aminoácidos 142-526 da SEQ ID NO:9. Uma análise emparelhada da sequência do domínio das PDE-LGc de ligação dos MPGc com as correspondentes regiões das PDE fotorreceptoras e das PDE-eGc revelou uma identidade das sequências entre 26% e 28%. O alinhamento múltiplo de sequências dos domínios propostos de ligação do MPGc com as PDE de ligação dos MPGc está ilustrado nas figuras 2A a 2C em que as abreviaturas utilizadas são as mesmas indicadas no quadro 1. Há 38 posições deste domínio não catalítico que parecem ser invariantes entre todas as PDE de ligação dos MPGc (ver as posições indicadas pelas abreviaturas de uma só letra identificadoras dos aminoácidos na linha “conservada” nas figuras 2A a 2C). O domínio de ligação de MPGc das PDE que se ligam ao MPGc contém repetições intemamente homólogas que podem formar eventualmente dois locais semelhantes, embora distintos, da inter-subunidade ou da intra-subunidade de ligação do MPGc. A figura 3 mostra um alinhamento múltiplo de sequências da repetição a (correspondente aos aminoácidos 228-311 da PDE-LGc) e da repetição b (correspondente aos aminoácidos 410-500 da PDE-LGc) das PDE que se ligam ao MPGc. Há 7 resíduos que são invariantes em cada uma das regiões A e B (ver os resíduos indicados pelas abreviaturas de uma só letra utilizadas para os aminoácidos na linha “conservada” da figura 3). Os resíduos que são quimicamente conservados nas regiões AeB estão indicados por asteriscos na linha “conservada” da figura 3. Estados das PDE-LGc com análogos de MPGc comprovam a existência de uma ponte hidrogénio entre o local de ligação nucleotídico cíclico na PDE-LGc e o grupo 2ΌΗ do MPGc. Há três regiões das PDE-LGc que não têm nenhuma semelhança significativa de sequências com outras isoenzimas PDE. Estas regiões incluem a sequência que flanqueia a extremidade do terminal carboxilo do domínio catalítico (aminoácidos 812-875), separando a sequência o domínio de ligação do MPGc e o domínio catalítico (aminoácidos 527-577) e abrangendo a sequência do terminal amino os aminoácidos 1-141. O local (a serina na posição 92 da SEQID NO: 10) de fosforilação da PDE-LGc pela KGc está localizado nesta região do terminal amino da sequência. A ligação do MPGc ao local alostérico da PDE-LGc é necessária para a sua fosforilação.
Na figura 4 apresenta-se uma estrutura de domínio proposta da PDE-LGc com base nas comparações a seguir apresentadas, feitas em relação a outras isoenzimas PDE. Esta estrutura de domínio é fundamentada pelos estudos bioquímicos da PDE-LGc purificada a partir de pulmão de bovino.
Exemplo 3
Examinou-se a presença de ARNm de PDE-LGc em diversos tecidos de bovinos, pelo método de hibridação das autorradiografias à Northern.
Purificou-se ARN poliadenilado a partir de preparações de ARN total, utilizando para tal o estojo de purificação de ARNm de modelo ‘Poly(A) Quick®’ (Stratagene), em conformidade com as instruções do fabricante. As amostras de ARN (5 pg) foram aplicadas sobre um gel contendo 1,2% de agarose e 6,7% de formaldeído. A electroforese e a transferência de ARN são operações que foram efectuadas conforme anteriormente descrito na obra de Sonnenburg et αί, supra. A pré-hibridação das autorradiografias de ARN decorreu durante 4 horas a 45°C numa solução que continha 50% de fonnamida, SSC 5X, fosfato de sódio 25 mM a pH 7, solução de Denhardt 2X, sulfato de dextrano a 10% e ARNt de levedura na concentração de 0,1 mg/mL. Preparou-se uma sonda marcada com o iniciador hexanucleotídico aleatório (5 x 108 c.p.m./pg) conforme descrito por Feinberg et ai, supra, utilizando o clone de ADNc dc 4,7 kb dc LGc-8 do exemplo 2, excisado por digestão comAccl e SacYL Desnaturou-se a sonda termicamente e injectou-se num saco para a preparação da autorradiografia (6 x 10s c.p.m./mL) a seguir à pré-hibridação. A mancha de Northern foi hibridada de um dia para o outro a 45°C, seguindo-se uma lavagem de 15 minutos com SSC 2X e DSS a 0,1% à temperatura ambiente e depois três lavagens de 20 minutos com SSC 0,1X e DSS a 0,1% a 45°C. Expôs-se a mancha a uma película sensível aos raios X durante 24 horas a -70°C. Estimou-se o tamanho do ARN que hibridou com a sonda de PDE-LGc, utilizando para tal uma escala gradativa de ARN entre 0,24 e 9,5 kb que foi contrastada com brometo de etídio e visualizada com luz UV. O ADNc de PDE-LGc marcado com 32P hibridou com uma única espécie de ARN de 6,8 kb do pulmão de bovino. Também foi detectada uma banda de ARNm de tamanho idêntico no ARN poliadenilado isolado a partir de traqueia, aorta, rim e baço de bovino.
Exemplo 4 O ADNc de PDE-LGc no clone LGc-8 do exemplo 2 foi expresso em células COS-7 (ATCC CRL1651).
Isolou-se uma porção de ADNc de LGc-8 a seguir à digestão com a enzima de restrição Xbal. A enzima Abai corta numa posição da sequência do poliligador ‘pBluescript’ localizada 30 pb a montante da extremidade 5’ do fragmento intercalar de LGc-8 e na 28 posição 3359 dentro do fragmento intercalar de LGc-8. O fragmento resultante de 3389 pb, que contém toda a região codificadora de LGc-8, foi então ligado dentro do local exclusivo de clonagem deXbal do vector de expressão pCDM8 (Invitrogen, San Diego, CA). O plasmídeo pCDM8 é um vector de expressão eucariótico de 4,5 Kb que contém um promotor e um intensificador de citomegalovírus, uma origem de replicação proveniente do VS40 (em inglês SV40), um sinal de poliadenilação, uma origem de replicação procariótica (proveniente de pBR322) e um marcador genético procariótico (supF). As células MC1061/P3 de E. coli (Invitrogen) foram transformadas com os produtos de ligação resultantes e as colónias positivas à transformação foram pesquisadas para se investigar a orientação adequada do fragmento intercalar de LGc-8, tendo-se recorrido para tal às técnicas de RCP e de análise pelas enzimas de restrição. O arquétipo de expressão resultante, que contém o fragmento intercalar LGc-8 com a orientação adequada, recebeu a designação de pCDM8-PDE-LGc (em inglês pCDM8-cGB-PDE).
Purificou-se o ADN de pCDM8-PDE-LGc a partir de preparações plasmídicas em grande escala, utilizando para tal colunas de tipo ‘Qiagen pack-500’ (Chatsworth, CA), em conformidade com as instruções do fabricante. As células COS-7 foram criadas em cultura em Meio de Eagle Modificado por Dulbecco (MEMD) que continha 10% de soro fetal de bovino, penicilina na concentração de 50 pg/mL e estreptomicina na concentração de 50 pg/mL a 37°C em atmosfera humidificada contendo 5% de CO2. Aproximadamente 24 horas antes da transfecção recolocou-se novamente em placas as células confluentes de pratos de 100 mm, com uma densidade em relação ao valor original compreendida entre um quarto e um quinto. Numa experiência de transfecção típica, as células foram lavadas com uma solução tampão que continha NaCl 137 mM, KC12,7 mM, fosfato de potássio 1,1 mM e fosfato de sódio 8,1 mM a pH 7,2 (STP, em inglês PBS). Depois acrescentou-se a cada placa 4-5 mL de MEMD / ,ν' 29 contendo 10% de ‘NuSerum’ (Collaborative Biomedical Products, Bedford, MA). A transfecção com 10 μg de ADN de pCDM8-PDE-LGc ou de ADN do vector pCDM8 misturado com 400 pg de DEAE-dextrano (Pharmacia) em 60 pL de STT (em inglês TBS) [soluto salino tamponado com Tris: Tris 25 mM-HCl (pH 7,4), NaCl 137 mM, KQ 5 mM, NaHP04 0,6 mM, CaCl2 0,7 mM e MgCk 0,5 mM) teve lugar adicionando gota a gota a mistura a cada placa. As cclulas foram incubadas a 37°C cm atmosfera contendo 5% de CO2, durante 4 horas, e depois foram tratadas com dimetilsulfóxido a 10% em STP durante 1 minuto. Decorridos 2 minutos removeu-se 0 dimetilsulfóxido e efectuou-se a lavagem das células com STP e a subsequente incubação em meio completo. Ao fim de 48 horas colocou-se as células em suspensão em 0,5-1 mL de tampão de homogeneização [Tris 40 mM-HCl (pH 7,5), benzamidina 15 mM, β-mercaptoetanol 15 mM, pepstatina A na concentração de 0,7 pg/mL, leupeptina na concentração de 0,5 pg/mL e EDTA 5 pM] por cada placa de células, tendo estas sido desmembradas numa homogencizadora de modelo ‘Dounce’. Os extractos resultantes de células inteiras foram analisados para se pesquisar a actividade de fosfodiesterase, a actividade de ligação do MPGc e a concentração total de proteínas, conforme adiante se descreve no exemplo 5. F.xemnln 5
Mediu-se a actividade de fosfodiesterase em extractos de células COS transfectadas, do exemplo 4, ou em extractos de células COS pseudo-transfectadas, utilizando uma modificação do procedimento experimental descrito para as PDE-eGc na obra de Martins et al, J. Biol. Chem., 257:1973-1979 (1982). As células foram colhidas e os extractos preparados 48 horas após a transfecção. As misturas de incubação continham tampão de MOPS 40 mM (pH 7), EDTA 0,8 mM, acetato de magnésio 15 mM, albumina do soro de bovino na concentração de 2 mg/mL, [3H]-MPGc ou [3H]-MPAc 20 μΜ (100 000-200 000 cpm/ensaio) e exbacto de células COS-7 num volume total de 250 μι. Efectuou-se a incubação da mistura de reacção durante 10 minutos a 30°C e depois interrompeu-se a incubação por fervura. A seguir acrescentou-se 10 pL de veneno de Croíalus atrox na concentração de 10 mg/mL (Sigma) a que se seguiu uma incubação durante 10 minutos a 30UC. Os produtos nucleosídicos foram separados dos nucleótidos que não reagiram, conforme descrito na obra de Martins et ai, supra. Em todos os estudos, durante a reacção, teve lugar a hidrólise de menos de 15% dos nucleótidos cíclicos totais marcados com [3H].
Os resultados das experiências estão apresentados na figura 3 e representam as médias de 3 transfecções independentes. A transfecção das células COS-7 com ADN de pCDM8-PDE-LGc teve como consequência a expressão de níveis aproximadamente 15 vezes superiores de actividade de fosfodiesterase de MPGc, comparativamente com as células pseudo-transfectadas ou comparativamente com as células transfectadas apenas com o vector pCDM8. Não foi detectado nenhum aumento da actividade de fosfodiesterase de MPAc, comparativamente com as células pseudo-transfectadas ou comparativamente com as células transfectadas apenas com o vector nos extractos de células transfectadas com o ADN de pCDM8-PDE-LGc. Estes resultados confirmam que o ADNc de PDE-LGc de bovino codifica uma fosfodiesterase específica de MPGc.
Os extractos de células COS transfectadas do exemplo 4 também foram pesquisados para se investigar a actividade de PDE de MPGc na presença de uma série de concentrações dos inibidores de PDE, desígnadamente zaprinaste, dipiridamol (Sigma), isobutil-l-metil-8--metoximetil-xantina (MeOxMeMlX) e rolipram. 31
Os resultados das experiências estão apresentados na figura 6 em que se iguala a 100% a actividade das PDE na ausência de inibidor e em que cada ponto dos dados representa a média de duas determinações independentes. As potências relativas dos inibidores de PDE para a inibição da hidrólise de MPGc pelo produto proteínico de ADNc de PDE-LGc foram idênticas às potências relativas assinaladas para as PDE-LGc purificadas a partir do pulmão de bovino (Thomas I, supra). Os valores CI50 calculados a partir das curvas da figura 6 são os seguintes: zaprinaste (círculos a cheio), 2 μΜ; dipiridamol (quadrados a cheio), 3,5 μΜ; MeOxMeMIX (triângulos a cheio), 30 μΜ; e rolipram (círculos em branco), > 300 μΜ. O valor CI50 para o zaprinaste, que é uni inibidor rclativamente específico das fosfodiesterascs específicas de MPGc, foi pelo menos duas ordens de grandeza inferior ao assinalado para a inibição da actividade de fosfodiesterase das PDE-LGc ou da fosfodiesterase inibida por MPGc (PDE-iGc, em inglês cGi-PDE) (Reeves et al., págs. 300-316 em Beavo et al.7 supra). O dipiridamol, que é um inibidor eficaz das fosfodiesterases específicas de MPAc e MPGc, foi também um inibidor potente da PDE-LGc expressa. O inibidor relativamente selectivo da fosfodiesterase estimulada por cálcio/calmodulina (PDE-CaM, em inglês CaM-PDE), designado por MeOxMeMIX, foi aproximadamente 10 vezes menos potente do que o zaprinaste e 0 dipiridamol, em conformidade com os resultados obtidos quando se utilizou a actividade de PDE-LGc purificada a partir de pulmão de bovino. O rolipram, que é um inibidor potente das fosfodiesterases de MPAc de valor K™ baixo, foi um inibidor fraco do produto proteínico de ADNc de PDE-LGc expresso. Estes resultados mostram que o ADNc de PDE-LGc codifica uma fosfodiesterase que possui actividade catalítica característica das PDE-LGc isoladas a partir de tecidos de bovinos, 0 que permite concluir que a identidade do clone de ADNc de LGc-8 é pois uma PDE-LGc. 32 É interessante notar que embora as potências relativas dos inibidores de PDE para a inibição da hidrólise de MPGc sejam idênticas para as PDE-LGc recombinantes e isoladas a partir de bovinos, os valores absolutos CI50 para todos os inibidores testados foram 2 a 7 vezes superiores para as PDE-LGc recambinantes. Esta diferença não pôde ser atribuída aos efeitos de nenhuns factores presentes nos extractos de células COS-7 sobre a actividade hidrolitica de MPGc, uma vez que as PDE-LGc isoladas a partir de tecidos de bovinos revelaram cinéticas de inibição idênticas às da enzima pura, ou quando adicionadas outra vez a extractos de células COS-7 pseudo-transfectadas. Esta diferença aparente de sensibilidade farmacológica pode ser devida a uma diferença subtil na estrutura do produto proteínico de ADNc recombinante de PDE-LGc e da PDE-LGc de pulmão de bovino, por exemplo, uma diferença na modificação pós-traducional ou na vizinhança do local catalítico. Em alternativa, esta diferença pode ser devida a uma alteração da actividade catalítica da PDE-LGc de pulmão de bovino que tenha tido lugar nos diversos passos de purificação.
Efectuou-se a análise dos extractos celulares para se investigar a actividade de ligação de [3H]-MPGc na ausência ou na presença de 3-isobutil-l-metil-xantina 0,2 mM (IBMX) (Sigma), que é um inibidor competitivo da hidrólise de MPGc. O ensaio de ligação de MPGc, modificado a partir do ensaio descrito na obra de Thomas I, supra, foi realizado num volume total de 80 pL. Efectuou-se a combinação de 60 pL de extracto celular com 20 pL de uma mistura de ligação, de tal modo que a concentração final dos componentes na mistura foi de 1 pM de [3H]-MPGc, 5 pM de MPAc e 10 pM de 8-bromo-MPGc. As substâncias MPGc e 8-bromo-MPGc foram acrescentadas para bloquear a ligação de [3H]-MPGc respectivamente a KAc e KGc. As experiências foram realizadas na ausência e na presença de IBMX 0,2 mM. A reacção teve início mediante a adição do extracto celular e ficou a incubar durante ' ·' 33 60 minutos a 0°C. Efectuou-se a filtração conforme descrito na obra de Thomas I, supra. As contraprovas foram obtidas por incubações efectuadas em paralelo, em que os extractos celulares foram substituídos por tampão de homogeneização ou com um excesso 100 vezes superior de MPGc não marcado. Foram obtidos resultados idênticos com os dois métodos. Determinou-se a concentração total de proteínas dos extractos celulares pelo método de Bradford, Anal. Biochem., 72:248-254 (1976), utilizando como padrão albumina de soro de bovino.
Os resultados da experiência estão ilustrados na figura 7. Nas medições efectuadas com 1 μΜ de [!H]-MPGc na presença de IBMX 0,2 mM, os extractos de células COS-7 transfectadas com pCDM8-PDE-LGc revelaram uma actividade de ligação de MPGc que é 8 vezes superior à dos extractos das células pseudo-transfectadas. Não foi observada nenhuma estimulação da ligação espontânea de MPGc com IBMX, sugerindo isso de que havia muito pouca ou mesmo nenhuma PDE-LGc endógena presente nos extractos de células COS-7. Nos extractos de células transfectadas com pCDM8-PDE-LGc, a actividade específica de MPGc foi estimulada aproximadamente 1,8 vezes pela adição de IBMX 0,2 mM. A capacidade do IBMX para estimular 2 a 5 vezes a ligação de MPGc é uma propriedade distintiva das fosfodiesterases de ligação de MPGc.
Efectuou-se a análise dos extractos celulares conforme descrito antes a propósito da actividade de ligação de [3H]-MPGc (em que a concentração de [3H]-MPGc foi de 2,5 μΜ) na presença de excesso de MPAc ou MPGc não marcados. Os resultados estão ilustrados na figura 8 em que se considerou igual a 100% a ligação do MPGc na ausência de competidor não marcado e em que cada ponto assinalado representa a média de 3 determinações independentes. A actividade de ligação do produto proteínico codificado pelo ADNc de 34 PDE-LGc foi específica para o MPGc, comparativamente com o MPAc. Foram necessárias concentrações inferiores a 10 vezes as concentrações do MPGc não marcado para inibir em 50% a actividade de ligação de [ H]-MPGc, ao passo que foram necessárias concentrações aproximadamente 100 vezes superiores de MPAc para o mesmo grau de inibição.
Os resultados apresentados neste exemplo comprovam que o ADNc de PDE-LGc codifica uma fosfodiesterase que possui actividades bioquímicas características das PDE-LGc naturais.
Os domínios catalíticos das PDE de mamíferos e de uma PDE de Drosophila contêm duas sequências conservadas em série (em tandem) (HX3HX24.26E) que são motivos típicos de ligação de Zn2+ em hidrolases Zn2+, lais como a tennolisma [Vallee e Auld, Biochem., 29\5647-5659 (1990)]. A PDE-LGc liga-se a Zn2+ na presença de excessos grandes de Mg2+, ^ I 1 Λ 1 Λ, Μη , Fe , Fe , Ca ou Cd . Não sendo adicionado nenhum metal, a PDE-LGc tem uma actividade de PDE que é aproximadamente 20% da actividade máxima que ocorre na presença de Mg2+ 40 mM e esta actividade basal é inibida por 1,10-fenantrolina 011 EDTA. Isto sugere que um metal raro (oligoelemento) tem importância para a actividade basal das PDE, apesar dos tratamentos exaustivos para a remoção dos metais. A actividade das PDE é estimulada pela adição de Zn2+ (0,02-1 μΜ) ou Co2+ (1-20 μΜ), mas não por Fe2+, Fe3+, Ca2+, Cd2+ ou Cu2+. O Zn2f aumenta a actividade basal das PDE até 70% da estimulação máxima produzida por Mg2+ 40 mM. O efeito estimulador de Zn2+ nas experiências pode ser comprometido por um efeito inibitório que é originado por concentrações de Zn2+ superiores a 1 μΜ. A actividade das PDE suportada por Zn2+ e a ligação de Zn2+ por PDE-LGc ocorre para concentrações semelhantes de Zn2+. Assim, presume-se que a PDE-LGc seja uma hidrolase de Zn2' e presume-se que o Zn2+ desempenhe um papel crítico na actividade da enzima. Ver Colbran et ai, The FASEB J., 5:Abstract 2148 (15 de Março de 1994). 35
Exemplo 6
Efectuou-se o isolamento de diversos clones de ADNc humano, homólogos do clone de ADNc de bovino que codifica a PDE-LGc, por hibridação em condições rigorosas, utilizando para tal uma sonda de ácido nucleico correspondente a uma parte do clone LGc-8 de bovino (nucleótidos 489-1312 da SEQID NO:9).
Isolamento de fragmentos de ADNc que codificam a PDE-LGc humana
Efectuou-se a hibridação de 3 bancos de ADNc humano (dois glioblastomas e um pulmonar) no vector lambda Zap com a sequência de PDE-LGc de bovino. O clone gerado por RCP, correspondente aos nucleótidos 484-1312 da SEQ ID NO:9, conforme descrito no exemplo 1, foi digerido com EcoRl e daí resultou um fragmento intercalar de ADNc de 0,8 kb que foi isolado e purificado por electroforese em gel de agarose. Marcou-se o fragmento com nucleótidos radioactivos, utilizando para isso um estojo de marcação de ADN estimulado aleatoriamente (Boehringer).
Os bancos de ADNc foram distribuídos por pratos de Petri de 150 mm, com uma densidade aproximada de 50 000 placas por prato. Foram preparadas réplicas de filtros de nitrocelulose, em duplicado. O tampão de pré-hibridação utilizado foi SSC 3X, 0,1% de ‘sarkosyl’, meio de Denhardt 10X, fosfato de sódio 20 mM (pH 6,8) e ADN de testículos de salmão na concentração de 50 pg/mL. Efectuou-se a pré-hibridação a 65°C durante um mínimo de 30 minutos. Realizou-se a hibridação a 65°C de um dia para o outro em tampão com a mesma composição e com a adição de sonda com 1-5 x 105 cpm/mL. Efectuou-se a lavagem dos filtros a 65°C em SSC 2X e 0,1% de DSS. As placas hihridantes foram detectadas por autorradiografia. O número dos ADNc que hibridaram com a sonda de bovino e o número dos ADNc pesquisados estão indicados no quadro 2 seguinte. 36
Quadro 2
Banco de ADNc Ήρο Placas positivas Placas pesquisadas Glioblastoma SW 1088 excitado com dT 1 1,5 x 10b humano Pulmão humano excitado com dT 2 1,5 x 106 Glioblastoma SW 1088 excitado com dT 4 1,5 x 106 humano
Os plasmídeos designados por cgbS2.1, cgbS3.1, cgbL23.1, cgbL27.1 e cgbS27.1 foram excisados in vivo a partir dos clones de lambda Zap e sequenciados. O clone cgbS3.1 contém 2060 pb de um bloco de leitura ininterrupta de PDE seguido por um intrão putativo. A análise do clone cgbS2.1 revela que este corresponde às posições 664 a 2060 do clone cgbS3.1 e que prolonga o bloco de leitura ininterrupta da PDE por mais 585 pb antes de terminar no intrão putativo. As sequências da região putativa não traduzida em 5’ e as partes pioleíuicas codificadoras dos clones cgbS2.1 e cgbS3.1 estão indicadas res-pectivamente nas SEQ ID NOS. 11 e 12. A combinação dos dois ADNc dá origem a uma sequência que contém aproximadamente 2,7 kb de um bloco de leitura ininterrupta que codifica uma PDE. Os outros três ADNc não se prolongam para além de 5’ ou 3’ mais do que o ADNc de cgbS3.1 ou o ADNc de cgbS2.1.
Para se isolar outros ADNc, foram preparadas sondas específicas para a extremidade 5’ do clone cgbS3.1 e para a extremidade 3’ do clone cgbS2.1, tendo sido utilizadas para se pesquisar um banco de ADNc de glioblastoma SW 1088 e um banco de ADNc de aorta humana. Obteve-se uma sonda em 5’ a partir do clone cgbS3.1 por RCP, utilizando para tal os inidadotes cgbS3.1 S311 e cgbL23.1A1286, cujas sequências estão identificadas respectivamente nas SEQ ID NOS:8 e 9 infra. 37
Iniciador cgbS3.1S311 (SEQID NO: 13) 5’ GCCACCAGAGAAATGGTC 3’
Iniciador cgbL23.1A1286 (SEQ ID NO: 14) 5’ ACAATGGGTCTAAGAGGC 3’
Efectuou-se a RCP num volume de reacção de 50 μι contendo 50 pg de ADNc de cgbS3.1, dNTP 0,2 mM, cada iniciador muna concentração de 10 pg/mL, KC1 50 mM, Tris 10 mM-HCl a pH 8,2, MgCl2 1,5 mM e polimerase de Taq. Após um período inicial de 4 minutos de desnaturação a 94°C foram executados 30 ciclos de 1 minuto a 94°C, 2 minutos a 50°C e 4 minutos a 72°C. Foi gerado um fragmento com aproximadamente 0,2 kb pela RCP, o qual corresponde aos nucleótidos 300-496 do clone cgbS3.1.
Obteve-se uma sonda em 3’ a partir de ADNc de cgbS2.1 por RCP utilizando os oligo-nucleótidos cgbL23.1S1190 e cgbS2.1A231, cujas sequências estão indicadas a seguir. Iniciador cgbL23.1S1190 (SEQ ID NO: 15) 5’ TCAGTGCATGTTTGCTGC 3’
Iniciador cgbs2.1A231 (SEQ ID NO: 16) 5’ TACAAACATGTTCATCAG 3’ A RCP foi realizada de forma idêntica à anteriormente descrita para a geração da sonda em 5’ e proporcionou um fragmento de aproximadamente 0,8 kb, correspondente aos nucleótidos 1358-2139 do ADNc do cgbS2.1. Os 157 nucleótidos de 3’ do fragmento da RCP (não ilustrado na SEQ ID NO: 12) estão dentro do intrão presumível.
Os dois fragmentos de RCP foram purificados e isolados por electroforese em gel de agarose e foram marcados com nucleótidos radioactivos por estimulação aleatória. Pesquisou-se um banco dc ADNc do glioblastoma SW 1088 estimulado aleatoriamente (1,5 x 106 placas), 38 com os fragmentos marcados tal como descrito antes, tendo sido isoladas 19 placas hibridantes. Foram isoladas mais 50 placas hibridantes a partir de um banco de ADNc de aorta humana (estimulado com dT e aleatoriamente, Clontech, Paio Alto, CA).
Os plasmídeos foram excisados in vivo a partir de alguns dos clones lambda Zap positivos e foram depois sequenciados. O clone designado por cgbS53.2, cuja sequência está ilustrada na SEQ ID NO:17, contém um fragmento intercalar de aproximadamente 1,1 kb cuja sequência se sobrepõe aos últimos 61 pb do cgbS3.1 e prolonga o bloco de leitura ininterrupta por mais 135 pb para além dos existentes no cgbS2.1. O clone contém um codão de terminação e aproximadamente 0,3 kb de uma sequência putativa não traduzida em 3’.
Geração de um ADNc combinado que codifica a PDE-LGc humana
Foram utilizados os clones cgbS3.1, cgbS2.1 e cgbS53.2, conforme descrito nos parágrafos subsequentes, para se construir um ADNc combinado que continha um bloco de leitura ininterrupta da PDE-LGc humana completa. O ADNc combinado recebeu a designação de cgbmetl56-2 e foi inserido no vector de expressão pBNY6N de levedura ADH1.
Em primeiro lugar foi gerado um plasmídeo designado por ‘cgbstop-2’ que continha a extremidade 3’ do bloco de leitura ininterrupta da PDE-LGc. Uma parte do fragmento intercalar do plasmídeo foi gerada por RCP, utilizando como matriz o clone cgbS53.2. Os iniciadores de RCP utilizados foram cgbS2.1S1700 e cgbstop-2.
Iniciador cgbS2.1S1700 (SEQ ID NO: 18) 5’ TTTGGAAGATCCTCATCA 3’
Iniciador cgbstop-2 (SEQ ID NO: 19) 5’ ATGTCTCGAGTCAGTTCCGCTTGGCCTG 3 ’ 39 A RCP foi efectuada num volume de 50 μι contendo 50 pg de ADN matricial, os dNTP 0,2 mM, Tris 20 mM-HCl a pH 8,2, KC110 mM, (NH^StT, 6 mM, MgCl2 1,5 mM, 0,1% de Triton-X100, 500 ng de cada iniciador e 0,5 unidades de polimerase de ‘Pfu’ (Stratagen). Aqueceu-se a reacção a 94°C durante 4 minutos e depois foram praticados 30 ciclos de 1 minuto a 94°C, 2 minutos a 50°C e 4 minutos a 72°C. A polimerase foi acrescentada durante o primeiro ciclo a 50°C. O produto resultante da RCP foi extraído com fenol/ /clorofórmio, novamente extraído com clorofórmio, precipitado em etanol e cortado com as enzimas de restrição Bell e Xhol. Purificou-se o fragmento de restrição sobre um gel de agarose e a seguir fez-se a eluiçâo.
Ligou-se este fragmento ao ADNc de cgbS2.1 que tinha crescido em E. coli dam', cortou-se com as enzimas de restrição Bell e Xhol e purificou-se sobre gel, tendo para tal sido utilizado o estojo de RCP ‘magic’ da Promega. Efectuou-se a sequenciação do plasmídeo resultante para se verificar que o cgbstop-2 contém a parte de 3’ do bloco de leitura ininterrupta de PDE-LGc.
Em segundo lugar, gerou-se um plasmídeo portador da extremidade 5’ do bloco de leitura ininterrupta da PDE-LGc humana. O seu fragmento intercalar foi gerado por RCP, utilizando como matriz o clone cgbS3.1. Efectuou-se a RCP conforme descrito antes, utilizando os iniciadores cgbmetl56 e cgbS2.1A2150.
Iniciador cgbmetl56 (SEQID NO:20) 5’ TACAGAATTCTGACCATGGAGCGGGCCGGC 3’
Iniciador cgbs2. Ia2150 (SEQ ID NO:21) 5’ CATTCTAAGCGGATACAG 3’ O fragmento resultante da RCP foi extraído com fenol/cloroformio, novamente extraído com clorofórmio, precipitado em etanol e purificado numa coluna de ‘Sepharose CL-6B’. 40
Este fragmento foi cortado com as enzimas de restrição EcoKV e EcoRl, descarregado sobre um gel de agarose e purificado por centrifugação através de lã de vidro. A seguir à extracção com fenol/clorofórmio, nova extracção com clorofórmio e precipitação em etanol, ligou-se o fragmento dentro de BluescriptQ SK(+) digerido com EcoKEEcoKV para se gerar o plasmídeo cgbmetl56. Determinou-se a sequência de ADN do fragmento intercalar e das junções. O fragmento intercalar contém um novo local EcoEl e mais 5 nucleótidos que conjuntamente substituem os 155 nucleótidos originais de 5’ do codão de iniciação. O fragmento intercalar prolonga-se até um local EcoKV, começando 531 nucleótidos a partir do codão de iniciação.
As portes de 5’ e 3’ do bloco de leitura ininterrupta de PDE-LGc foram depois montadas no vector pBNYôa. O vector pBNY6a foi cortado com EcoRl e Xhol, isolado a partir de um gel e combinado com o fragmento do cgbmetl56 tratado com EcoKV EcoKV purificado sobre gel de agarose e com o fragmento do cgbstop-2 tratado com EcoKV/Xhol purificado sobre gel de agarose. As junções do fragmento intercalar foram sequenciadas e o arquétipo recebeu a designação de hcgbmetl56-2 6a. O fragmento intercalar de PDE-LGc do hcgbmetl56-2 6a foi depois levado para dentro do vector de expressão pBNY6a A expressão do ADN inserido neste vector é dirigida pelo terminador e pelo promotor de levedura ADH1. O vector contém a origem de 2 pm de replicação de levedura, a origem de replicação de pUC19 e o gene da resistência à ampicilina. O vector pBNY6n foi cortado com EcoRl e Xhol e purificado sobre gel. O fragmento intercalar do hcgbmetl56-2 6a tratado com EcoKVXhol foi purificado sobre gel, tendo para tal sido utilizadas colunas de RCP de tipo ‘magic’ da Promega, e foi ligado dentro do pBNYón cortado. Efectuou-se a sequenciação de todas as novas junções no arquétipo resultante, o hcgbmet156-2 6n. A sequência de ADN e a sequência deduzida de aminoácidos do fragmento intercalar do hcgbmetl56-2 6n que codifica uma PDE-LGc humana combinada 41 estão identificadas nas SEQ ID NOS.22 e 23. O fragmento intercalar prolonga-se desde o primeiro resíduo metionina no clone cgbS3.1 (nucleótido 156) até ao codáo de paragem (nucleótido 2781) no ADNc combinado. Uma vez que a metionina é o resíduo metionina mais próximo de 5’ no clone cgbS3.1 e atendendo a que não há codões de paragem no bloco com a metionina e a montante desta, o fragmento intercalar no pBNYón pode representar eventualmente uma forma truncada do bloco de leitura ininterrupta.
Variantes dos ADNc
Foram isolados quatro ADNc de PDE-LGc humana que são diferentes do ADNc combinado do hcgbmetl56-2 6n. A um ADNc, do cgbL23.1, falta-lhe uma região interna do hcgbmetl56-2 6n (nucleótidos 997-1000 a 1444-1447). Não é possível determinar os pontos extremos das supressões a partir da sequência de ADNc nessas posições. Três das quatro variantes de ADNc possuem sequências da extremidade 5’ que divergem da sequência do hcgbmetl56-2 6n a montante do nucleótido 151 (os ADNc de cgbA7f cgbA5C e cgbI2). Estes ADNc representam presumivelmente os ARNm altemativamente unidos ou não unidos.
Exemplo 7 O arquétipo de ADNc de PDE-LGc humano combinado, designado por hcgbmetl56-2 6n, foi transformado dentro da estirpe de levedura YKS45 (ATCC 74225) (MATa his3 trpl ura3 leu3 pdel::HlS3 pde2::TRPl) em que foram suprimidos dois genes da PDE endógena. Foram seleccionados os transformantes que complementam a deficiência da estirpe YKS45 em leu e foram analisados para se pesquisar a actividade de PDE-LGc. Confirmou-se que os extractos das células portadoras do plasmídeo hcgbmetl56-2 6n revelam actividade de --7.- & S -., 42 fosfodiesterase específica do MPG cíclico, tendo para tal sido praticada a experiência adiante descrita
Recolheu-se por centrifugação 1 L de células de YKS45 transformadas com o plasmídeo cgbmetl56-2 6n que cresceram em meio SC-leu até uma densidade de 1-2 x 107 células/mL e depois foram lavadas uma vez com água desionizada, congeladas em neve carbónica/etanol e guardadas a -70°C. As massas celulares (1-1,5 mL) foram descongeladas sobre gelo na presença de um volume igual de Tris 25 mM-Cl (pH 8,0)/EDTA 5 mM/EGTA 5 mM/O--fenatrolina 1 mM/AEBSF 0,5 mM (Calbiochem)/0,l% de β-mercaptoetanol e de cada uma das substâncias aprotinina, leupeptina e pepstatina A na concentração de 10 pgãnL. Juntou-se as células descongeladas a 2 mL de esférulas de vidro lavadas com ácido (425-600 μΜ, Sigma) num tubo ‘Corex’ de 15 mL. Efectuou-se o desmembramento das células com 4 ciclos constituídos por uma centrifugação durante 30 segundos regulada para o valor 1 a que se seguiu um período de 60 segundos de incubação sobre gelo. Centrifugou-se o lisado celular a 12000 x g durante 10 minutos e fez-se passar o sobrenadante através de um filtro de 0,8 μ. Analisou-se o sobrenadante para se pesquisar a actividade de PDE-MPGc, conforme a seguir se descreve. Efectuou-se a incubação das amostras durante 20 minutos a 30°C na presença de Tris 45 mM-Cl (pH 8,0), EGTA 2 mM, EDTA 1 mM, ASB na concentração de 0,2 mg/mL, MgCl2 5 mM, o-fenantrolina 0,2 mM e cada uma das substâncias pepstatina A, leupeptina e aprotinina na concentração de 2 pg/mL, AEBSF 0,1 mM, 0,02% de β-mercaptoetanol e [3H]-MPGc 0,1 mM como substrato. Acrescentou-se [14C]-MPA (0,5 nCi/ensaio) como padrão de recuperação. Interrompeu-se a reacção com tampão de interrupção (etanolamina 0,1 M a pH 9,0, sulfato de amónio 0,5 M, EDTA 10 mM, DSS à concentração final de 0,05%). Separou-se o produto do substrato nucleotídico cíclico por cromatografia sobre ‘BioRad 43 *·»
Affi-Gel 60 Γ. Aplicou-se a amostra a uma coluna que continha aproximadamente 0,25 mL de ‘Affi-Gel 60 Γ, equilibrada em tampão de coluna (etanolamina 0,1 M a pH 9,0 contendo sulfato de amónio 0,5 M). Lavou-se a coluna 5 vezes com 0,5 mL de tampão de coluna. Efectuou-se a eluição do produto com 4 aliquotas de 0,5 mL de ácido acético 0,25 M e misturou-se com 5 mL de ‘Ecolume’ (ICN Biochemicals). Mediu-se a radioactividade do produto por contagem da cintilação.
Exemnlo 8
Efectuou-se a análise da expressão do ARNm de PDE-LGc em tecidos humanos, pelo ensaio de protecção de RNase.
Gerou-se por RCP uma sonda correspondente a uma parte do domínio de PDE-LGc (402 pb correspondentes aos nucleótidos 1450 a 1851 da SEQID NO: 13) de ligação putativa do MPGc. Inseriu-se o fragmento da RCP dentro do local do plasmídeo pBSII SK(-) tratado com EcoRI para se gerar o plasmídeo RP3. Linearizou-se o ADN do plasmídeo RP3 coin Xba\ e foram geradas sondas anti-sentido por meio de uma modificação do estojo da polimerase do ARN de T7 da ‘Stratagene’. Efectuou-se a combinação de 25 ng de plasmídeo linearizado com 20 pCi de a-32P-rUTP (800 Ci/mmol, 10 mCi/mL), tampão de transcrição IX (TrisCl 40 mM a pH 8, MgCl2 8 mM, espermidina 2 mM, NaCl 50 mM), cada uma das substâncias ATPr, GTPr e CTPr 0,25 mM, 0,1 unidades de RNase de ‘Block ΙΓ, DTT 5 mM, rUTP 8 μΜ e 5 unidades de polimerase de ARN de T7 num volume total de 5 pL. Deixou-se a reacção prosseguir durante 1 hora à temperatura ambiente e depois removeu-se a matriz de ADN por digestão com DNase isenta de RNase. Diluiu-se a reacção em 100 pL de TrisCl 40 mM a pH 8, MgCl2 6 mM e NaCl 10 mM. Acrescentou-se 5 unidades de DNase isenta de RNase e deixou-se a reacção prosseguir durante mais 15 minutos a 37°C. Interrompeu-se a reacção 44 por extracção com fenol a que se seguiu uma extracção com fenol/clorofórmio. Acrescentou-se NHtOAc 7,5 M numa quantidade igual a metade do volume e fez-se precipitar a sonda em etanol.
Os ensaios de protecção de RNase foram realizados utilizando o estojo de protecção ‘ Ambion RNase’ (Austin, TX) e 10 pg de ARN isolado a partir de tecidos humanos através de um método de extracção com guanidínio ácido. A expressão do ARNm de PDE-LGc foi detectada facilmente no ARN extraído dos músculos do esqueleto, do útero, dos brônquios, da pele, da veia safena direita, da aorta e das células do glioblastoma SW 1088. Verificou-se que havia uma expressão dificilmente detectável no ARN extraído da aurícula direita, do ventrículo direito, do córtex renal e da medula renal. Observou-se tuna protecção completa da sonda RP3. A falta de protecção parcial constitui uma prova contra a possibilidade de o ADNc de cgbL23.1 (uma variante de ADNc descrita no exemplo 7) representar um produto de transcrição importante, pelo menos nas amostras de ARN.
Exemplo 9
Foram criados anti-soros policlonais para os fiagmentos da PDE-LGc humana produzidos por £ coli.
Amplificou-se por RCP uma parte do ADNc da PDE-LGc humana (nucleótidos 1668--2612 da SEQID NO:22, aminoácidos 515-819 da SEQID NO:23) e inseriu-se no vector de expressão pGEX2T de E. coli (Pharmacia) como um fragmento de BamHUEcóSL O plasmídeo pGEX2T é portador de um gene da resistência à ampicilina, um gene laq F de E. coli e uma parte do gene da glntationa-S-transferase (GST) de Schistosoma japonicum. O ADN inserido no plasmídeo pode ser expresso como uma proteína de fusão com GST e pode ser clivado depois com trombina a partir da parcela de GST da proteína. O plasmídeo resultante, designado por cgbPE3, foi transformado dentro da estiipe LE392 de E. coli (Stratagene). As células transformadas cresceram a 37°C até ao valor de DOgoo igual a 0,6. Acrescentou-se IPTG (isopropil-tiogalactopiranósido) até à concentração de 0,1 mM e deixou-se as células crescerem a 37°C durante mais 2 horas. Efectuou-se a colheita das células por centrifugação, tendo sido desmembradas (lise) por tratamento com ultra-sons. Removeu-se os resíduos celulares por centrifugação e fraccionou-se o sobrenadante por EGPA-DSS. Contrastou-se o gel com KC1 0,4 M frio e excisou-se a banda da proteína de fusão GST-cgb e a seguir submeteu-se a electroeluição. A parte de PDE da proteína foi separada da parte de GST por digestão com trombina. O produto de digestão foi fraccionado por EGPA-DSS, a proteína de PDE foi submetida a electroeluição e foi injectada por via subcutânea num coelho. O anti-soro resultante reconhece quer o fragmento de PDE-LGc de bovino, que foi utilizado como antigénio, quer a proteína de PDE-LGc humana de comprimento completo expressa na levedura (ver o exemplo 8).
Exemplo 10
Foram gerados por métodos convencionais polinucleótidos codificadores de diversos análogos de PDE-LGc e fragmentos de PDE-LGc. A. Análogos de PDE-LGc
Todas as PDE conhecidas que se ligam a MPGc possuem duas repetições intemamente homólogas em série (em tandem) dentro dos seus domínios putativos de ligação do MPGc. Na PDE-LGc de bovino da presente invenção, as repetições abrangem pelo menos os resíduos 228-311 (repetição A) e 410-500 (repetição B) da SEQ ID NO: 10. Utilizou-se a mutagénese, dirigida ao local, de um ácido aspártico que está conservado nas repetições A e 46 B de todas as PDE conhecidas de ligação ao MPGc para a criação de análogos de PDE-LGc possuidores quer de Asp-289 substituído com Ala (D289A) quer de Asp-478 substituído com Ala (D478A). As PDE-LGc recombinantes de bovino de tipo natural (TN, em inglês WT) e mutantes de bovino foram expressas em células COS-7. A PDE-LGc purificada a partir de pulmão de bovino (PDE-LGc inata) e a PDE-LGc TN revelaram cinéticas idênticas de ligação do MPGc com um valor Kj de aproximadamente 2 μΜ e com um perfil de dissociação curvilíneo (tia = 1,3 horas a 4°C). Esta curvilinearidade pode ser devida à presença de locais distintos de afinidade elevada (lenta) e afinidade fraca (rápida) de ligação do MPGc. O mutante D289A possuía uma afinidade significativamente reduzida para o MPGc (Kj > 20 μΜ) e uma taxa simples de associação de MPGc (½ = 0,5 hora) que era semelhante à calculada para o local rápido da PDE-LGc TN e também para a inata. Isto sugeriu a perda de um local de ligação lenta do MPGc na repetição A deste mutante. Inversamente, o mutante D478A revelou uma afinidade mais elevada para o MPGc (valor K<i aproximadamente igual a 0,5 μΜ) e uma taxa simples de dissociação do MPGc (fi /2 = 2,8 horas) que era semelhante à taxa calculada do local de ligação lenta da PDE-LGc TN e da inata. Isto sugeriu a perda de um local de ligação rápida quando a repetição B foi modificada. Estes resultados indicam que a PDE-LGc dimérica possui dois locais de ligação de MPGc homólogos mas cineticamente distintos, sendo o ácido aspártico conservado um factor crítico para a interacção com o MPGc emcadalocal. Ver Colbran etal., FASEB J., 5:Abstract 2149 (15 de Maio de 1994). B. Polipeptidos de PDE-LGc truncados no terminal atmno
Foi expresso em levedura um polipeptido truncado de PDE-LGc humana contendo os aminoácidos 516-875 da SEQ ID NO:23. Inseriu-se um fiagmento intercalar de ADNc, que se prolonga desde o local Ncol no nucleótido 1555 da SEQ ID NO:22 até ao local Xhol na ·' 47 extremidade 3’ da SEQ ID NO:22, dentro do vector de expressão YEpC-PADH2d de levedura ADH2 [Price et al., Meth Emyrnol., 755:308-318 (1990)] que havia sido digerido com Ncol e Sall para gerar o plasmídeo YEpC-PADH2d HcGB. O plasmídeo foi transformado nos esferoplastos da estiipe de levedura yBJ2-54 (prcl-407 prbl-1122 pep4-3 leu2 trpl ura3-52 Apdel::URA3, HIS3 Apde2::TRPl cir*). Os genes da PDE endógena estão suprimidos nesta estirpe. As células cresceram em meio SC-leu contendo 2% de glicose, até à concentração de 107 células/mL, foram colhidas por filtração e depois cresceram durante 24 horas em meio YEP contendo 3% de glicerol. As células foram reunidas por centrifugação e foram guardadas congeladas. Efectuou-se o desmembramento das células com esférulas de vidro e o homogenado celular obtido foi analisado para se pesquisar a actividade de fosfodiesterase, essencialmente conforme descrito por Prpic et al. em Anal. Biochem., 205:155-160 (1993). O polipeptido truncado de PDE-LGc humana revelou actividade de fosfodiesterase. C. Polipeptidos de PDE-LGc truncados no terminal carhoxi
Foram construídos dois plasmídeos diferentes codificadores de polipeptidos de PDE--LGc humana, truncados no terminal carboxi. O plasmídeo pBJ6-84Hin contém um ADNc que codifica os aminoácidos 1-494 da SEQ ID NO:23 inserido nos locais Ncol e Sall do vector YEpC-PADH2d. O fragmento intercalar de ADNc prolonga-se desde o local Ncol na posição 10 dos nucleótidos da SEQ ID NO:22 até ao local HinlII na posição 1494 dos nucleótidos da SEQ ID NO:22, seguindo-se um ligador e o local Sall do vector YEpC-PADH2d. O plasmídeo pBJ6-84Ban contém um ADNc que codifica os aminoácidos 1-549 da SEQ ID NO:23 inserido nos locais Ncol e Sall do vector YEpC-PADH2d. O fragmento ' 48 intercalar de ADNc prolonga-se desde o local Ncol na posição 10 dos nucleótidos da SEQ ID NO:22 até ao local Bani na posição 1657 dos nucleótidos da SEQ ID NO:22, seguindo-se um ligador e o local Sall do vector YEpC-PADH2d.
Os polipeptidos de PDE-LGc truncados são úteis para pesquisar moduladores da actividade de PDE-LGc.
Exemplo 11
Foram gerados anticorpos monoclonais reactivos com as PDE-LGc humanas.
Deixou-se fermentar leveduras yBJ2-54 que contêm o plasmídeo YEpADH2 HcGB (Exemplo 10B) num dispositivo ‘Microferm’ de 10 L da “New Brunswick Scientific”. O fragmento intercalar de ADNc da PDE-LGc no plasmídeo YEpADH2 HcGB prolonga-se desde o local Ncol na posição 12 dos nucleótidos da SEQ ID NO:22 até ao local Xhol na extremidade 3’ da SEQ ID NO:22. Acrescentou-se um inoculo de 4 x 109 células a 8 L de meio contendo SC-leu, 5% de glicose, metais raros e vitaminas. Manteve-se a temperatura de fermentação a 26°C sob agitação a 600 r.p.m. por acção de uma roda propulsora convencional para ambiente microbiano, tendo o arejamento sido efectuado com ar comprimido à razão de 10 volumes por minuto. No momento em que a concentração da glicose diminuiu para 0,3%, ao fim de 24 horas após a inoculação, efectuou-se a infusão da cultura com 2 L de meio YEP 5X contendo 15% de glicerol. Decorridas 66 horas após a incubação efectuou-se a colheita da levedura a partir do meio de fermentação por centrifugação a 4000 x g durante 30 minutos a 4°C. A produção total de biomassa nesta fermentação foi de aproximadamente 350 g. A enzima PDE-LGc humana foi purificada a partir da massa agregada de células de levedura. Para o acompanhamento da cromatografia da enzima recorreu-se aos ensaios para 49 a pesquisa da actividade de PDE utilizando como substrato MPGc 1 mM. Todas as manipulações cromatográfícas foram realizadas a 4°C.
Com a levedura (uma massa de 29 g) preparou-se nova suspensão em 70 mL de tampão A (Tris 25 mM a pH 8,0, DTT 0,25 mM, MgCl2 5 mM, ZnS04 10 μΜ, benzamidina 1 mM) e efectuou-se a lise por passagem através de um dispositivo niieroJluidiíicador a uma pressão de 22-24 000 psi. Centrifugou-se o lisado a 10 000 x g durante 30 minutos e aplicou-se o sobrenadante a uma coluna de 2,6 cm x 28 cm que continha a resina de permuta aniónica ‘Pharmacia Fast Flow Q’ equilibrada com tampão B que continha 20 mM de BisTris-propano a pH 6,8, DTT 0,25 mM, MgCb 5 mM e ZnS04 10 μΜ. Lavou-se a coluna com tampão B, num total equivalente a 5 volumes da coluna, contendo NaCl 0,125 M, e depois revelou-se com um gradiente linear de NaCl variando entre 0,125 M e 1,0 M. Juntou-se as fiacções que continham a enzima e fez-se a sua aplicação directamente a uma coluna de 5 cm x 20 cm de hidroxiapatite cerâmica (BioRad) equilibrada em tampão C que continha 20 mM de BisTris-propano a pH 6,8, DTT 0,25 mM, KC1 0,25 M, MgCl2 1 mM e ZnS04 10 μΜ. Lavou-se a coluna com tampão C num total equivalente a 5 volumes de coluna e efectuou-se a eluição com um gradiente linear de fosfato de potássio em tampão C a variar desde 0 mM até 250 mM. Concentrou-se a massa enzimática 8 vezes por ultraliltração (membrana de YM30, Amicon). Efectuou-se a cromatografia da enzima concentrada numa coluna de 2,6 cm x 90 cm da ‘Pharmacia Sephaciyl S300’ (Piscataway, NJ) equilibrada com em 25 mM de BisTris-propano a pGH 6,8, DTT 0,25 mM, NaCl 0,25 M, MgCb 1 mM e ZnS04 20 μΜ. Foram obtidos aproximadamente 4 mg de proteína A enzima PDE-LGc humana recombinante representava aproximadamente 90% da proteína obtida, conforme se concluiu por electroforese em gel de poliacrilamida com DSS a que se seguiu a contrastação com o corante azul-de--coomassie. 50
Utilizou-se a proteína purificada como um antigénio para a criação de anticorpos monoclonais. Efectuou-se a imunização de cada um dos murganhos da estirpe Balb/c com a idade de 19 semanas (Charles River Bioetchnical Services, Inc., Wilmington, Mass.) por administração subcutânea de 50 pg de enzima PDE-LGc humana purificada, numa emulsão de 200 pL constituída por 50% de adjuvante completo de Freund (Sigma Chemical Co.). Os estímulos de reforço subsequentes efectuados ao 20° dia e ao 43° dia foram administrados em adjuvante incompleto de Freund. Aplicou-se um estímulo de reforço pré-fusão ao 86° dia, utilizando 50 pg de enzima em STP (em inglês PBS). A fusão foi realizada ao 90° dia.
Retirou-se o baço do murganho n° 1817, de uma forma estéril, e colocou-se em 10 mL de meio RPMI1640 isento de soro. Foimou-se uma suspensão de células singulares e filtrou-se através de um filtro estéril de células de modelo ‘Nitex’ de malha 70 (Becton Dickinson, Parsippany, New Jersey) e a seguir lavou-se duas vezes por centrifugação a 200 g durante 5 minutos e depois efectuou-se nova suspensão da massa obtida em 20 mL de meio RPMI isento de soro. De uma forma idêntica foram preparados também timócitos retirados de três murganhos genuínos da estirpe Balb/c.
Efectuou-se a centrifugação de células de mieloma NS-1, mantidas em meio RPMI em fase logarítmica com 11% de ‘Fetalclone’ (FBS) (Hyclone Laboratories, Inc., Logan, Utah) durante 3 dias antes da fusão, tendo a centrifugação sido efectuada a 200 g durante 5 minutos, e depois lavou-se a massa obtida duas vezes conforme descrito no parágrafo anterior. Após a lavagem ajustou-se o volume de cada suspensão celular para 10 mL em meio RPMI isento de soro e diluiu-se 20 pL à razão de 1:50 em 1 mL de meio RPMI isento de soro. Retirou-se 20 pL de cada diluição, misturou-se com 20 pL de corante azul-de-tripano a 0,4% em soluto salino a 0,85% (Gibco), aplicou-se a um hemocitómetro (Baxter Healthcare Corp., Deerfield, Illinois) e efectuou-se a contagem. 51
Combinou-se 2 x 108 esplenócitos com 4,0 x 107 células NS-1, centrifugou-se e aspirou-se o sobrenadante. Removeu-se a massa celular agregada batendo ligeiramente com o tubo e acrescentou-se 2 mL de PEG 1500 a 37°C (50% em Hepes 75 mM a pH 8,0) (Boehringer Mannheim) sob agitação durante o período de 1 minuto, seguindo-se a adição de 14 mL de meio RPMI isento de soro ao longo de 7 minutos. Acrescentou-sc mais 16 mL de meio RPMI e efectuou-se a centrifugação das células a 200 x g durante 10 minutos. Depois de se ter deitado fora os sobrenadantes, com a massa obtida preparou-se nova suspensão em 200 mL de meio RPMI contendo 15% de SFB, hipoxantina de sódio 100 pM, aminopterina 0,4 μΜ, timidina 16 μΜ (HAT) (Gibco), IL-6 na concentração de 25 unidades/mL (Boehringer Mannheim) e 1,5 x 106 timócitos/mL. A suspensão foi colocada primeiramente num balão T225 (Corning, Reino Unido) a 37°C durante 2 horas antes de ser distribuída por 10 placas de cultura de tecidos de 96 cavidades de fundo plano (Corning, Reino Unido) à razão de 200 pL/cavidade. As células nas placas foram alimentadas ao 3°, 4° e 5° dias a seguir à fusão, mediante a aspiração de aproximadamente 10 pL de cada cavidade com uma agulha de calibre 20G (Becton Dickinson) e adição do meio alimentar das placas descrito supra, à razão de 20 pL/cavidade, com a excepção de este meio conter IL-6 na concentração de 10 unidades/mL e de não ter timócitos.
A fusão foi pesquisada inicialmente pelo protocolo de EISLE (em inglês ELISA). Efectuou-se o revestimento de placas de ‘Immulon 4’ (Dynatech) a 4°C de um dia para o outro com a enzima PDE-LGc recomhinante purificada (100 ng/cavidade em tampão carbonato 50 mM a pH 9,6). Efectuou-se a lavagem das placas três vezes com STP contendo 0,05% de Tween 20 (STPT, em inglês PBST). Acrescentou-se os sobrenadantes de cada uma das cavidades dos hibridomas às cavidades recobertas com a enzima (50 pL/cavidade). Após incubação a 37°C 52 durante 30 minutos e lavagem conforme descrito supra, acrescentou-se 50 pL de anti-IgG(fc) de murganho, conjugada na cabra com peroxidase de Armoracia rusticana (Jackson ImmunoResearch, West Grove, Pennsylvania), diluída a 1:3500 em STPT. Efectuou-se a incubação das placas conforme descrito antes, realizou-se a lavagem quatro vezes (4X) com STPT e acrescentou-se 100 jjL de substrato constituído por o-fenilencndiamina na concentração de 1 mgúnL (Sigma) e H2O2 a 30% na concentração de 0,1 pL/mL em citrato 100 mM a pH 4,5. A reacção de cor foi interrompida ao fim de 5 minutos com a adição de 50 pL de H2S04 a 15%. Leu-se o valor A490 num leitor de placas (Dynatech).
Foram seleccionadas as cavidades C5G, E4D, F1G, F9H, F11G, J4A e J5D que receberam respectivamente as novas designações de 102A, 102B, 102C, 102D, 102E, 102F e 102G e foram clonadas sucessivamente duas ou três vezes por duplicação da diluição em meio RPMI contendo 15% de SFB, hipoxantina de sódio 100 pM, timidina 16 pM e TL-6 à razão de 10 unidades/mL. As cavidades das placas de clones foram classificadas visualmente ao fim de 4 dias e registou-se o número de colónias nas cavidades menos densas. As cavidades seleccionadas de cada clonagem foram testadas pelo protocolo de EISLE.
Os anticorpos monoclonais produzidos pelos hibridoinas anteriores foram isotipificados num ensaio pelo protocolo de EISLE. Os resultados comprovaram que os anticorpos monoclonais 102A a 102E eram IgGl, o 102F eraIgG2b e o 102G eraIgG2a.
Todos os sete anticorpos monoclonais reagiram com a PDE-LGc humana, conforme determinado por análise à Western.
Exemnln 12
O desenvolvimento de moduladores das actividades biológicas das PDE específicas exige a diferenciação das isozimas PDE presentes numa preparação de ensaio particular. A ^ 53 fonna enzimológica clássica de isolar as PDE a partir de fontes teciduais naturais e de se estudar cada isoenzima nova é dificultada pelos limites das técnicas de purificação e pela incapacidade para se avaliar concludentemente se foi conseguida a resolução completa de uma isoenzima. Uma outra fornia de resolver o problema consiste em identificar as condições de ensaio que eventualmeulc possam favorecer a contribuição de uma isoenzima e minimizar a contribuição de outras numa preparação. Há ainda uma outra forma de resolver este assunto que consiste na separação das PDE por meios imunológicos. Cada uma das formas anteriores de resolver este problema da diferenciação das isoenzimas PDE é morosa e tecnicamente difícil. Rn consequência, foram já feitas inúmeras tentativas para o desenvolvimento de moduladores selectivos de PDE com preparações contendo mais de uma isoenzima. Além disso, as preparações de PDE provenientes de fontes de tecidos naturais são sensíveis a uma proteólise limitada e podem conter misturas de produtos proteolíticos activos que tenham propriedades cinéticas, reguladoras e fisiológicas diferentes das propriedades das PDE de comprimento completo.
Os produtos polipeptídicos de PDE-LGc recombinantes da invenção facilitam imenso o desenvolvimento de moduladores de PDE-LGc, novos e específicos. A utilização de enzimas recombinantes humanas para a pesquisa de moduladores tem muitas vantagens inerentes. A necessidade de purificação de uma isoenzima pode ser evitada exprimindo-a de forma recombinante numa célula hospedeira à qual falte actividade de fosfodiesterase endógena (v.g, a estirpe de levedura YKS45 depositada com a identificação ATCC 74225). A pesquisa de compostos contra proteínas humanas evita complicações que surgem frequentemente ao serem efectuadas pesquisas sobre proteínas não humanas em que um composto optimizado numa proteína não humana pode não ser específico para uma proteína humana ou pode não reagir com esta. Por exemplo, uma única diferença de ammoácidos entre os receptores da ^ 54 serotonina 5HTiB de seres humanos e de roedores é responsável pela diferença na ligação de um composto aos receptores. [Ver Oskenberg et ol, Nature, 360:161-163 (1992)]. Uma vez descoberto um composto que module a actividade das PDE-LGc, pode então ser avaliado de forma selectiva por comparação da sua actividade sobre a PDE-LGc relativamente à sua actividade sobre outras isoenzimas PDE. Assim, a combinação dos produtos de PDE-LGc recombinantes da invenção com outros produtos de PDE recombinantes numa série de experiências independentes constitui um sistema para o desenvolvimento de moduladores selectivos de PDE-LGc. Os moduladores selectivos podem incluir, por exemplo, anticorpos e outras proteínas ou outros péptidos que se liguem de forma específica às PDE-LGc ou ao ácido nucleico das PDE-LGc, oligonucleótidos que se liguem de fornia específica às PDE-LGc (ver a publicação PCT com o n° WO93/05182, publicada a 18 de Março de 1993, que descreve métodos para seleccionar oligonucleótidos que se ligam de forma selectiva a biomoléculas destmatárias) ou ao ácido nucleico das PDE-LGc (v.g., oliganucleótidos anti-sentido) e outros compostos naturais ou sintéticos não peptídicos que se liguem de forma específica às PDE-LGc ou ao ácido nucleico das PDE-LGc. Também estão aqui contempladas as formas mutantes das PDE-LGc que alterem a actividade enzimática das PDE-LGc ou a sua localização numa célula A cristalização de uma PDE-LGc recombinante por si só e ligada a um modulador, a análise da estrutura atómica por cristalografia aos raios X e a formulação de modelos informáticos destas estruturas constituem métodos úteis para a concepção e para a optimização de moduladores selectivos não peptídicos. Ver, por exemplo, Krickson et cd., Am Rep. Med. Chem., 27:271-289 (1992) para um estudo geral da concepção de fármacos com base na estrutura atómica.
Os alvos para o desenvolvimento de moduladores selectivos são, por exemplo: (1) as regiões das PDE-LGc que contactam com outras proteínas e/ou que localizam as PDE-LGc '55 dentro de uma célula, (2) as regiões das PDE-LGc que se ligam ao substrato, (3) os locais alostéricos das PDE-LGc de ligação do MPGc, (4) as regiões das PDE-LGc de ligação de metais (5) o(s) local(is) de fosforilação das PDE-LGc e (6) as regiões das PDE-LGc que estão implicadas na dimerização de subunidades de PDE-LGc. 56
LISTAGEM DE SEQUÊNCIAS (1) INFORMAÇÃO GERAL: (i) REQUERENTE: The Board of Regents of the University of Washington and ICOS Corporation (ii) TÍTULO DA INVENÇÃO: “Materiais para fosfodiesterases específicas e de ligação do MPG cíclico e respectivos métodos” (iii) NÚMERO DE SEQUÊNCIAS: 23 (iv) ENDEREÇO PARA CORRESPONDÊNCIA: (A) ENDEREÇO: Marshall, 0’Toole, Gerstein, Murray & Borun (B) RUA: 6300 Sears Tower, 233 S. Wacker Drive (C) CIDADE: Chicago (D) ESTADO: Illinois (E) PAÍS: E.U.A. (F) CÓDIGO POSTAL: 60606 (v) FORMA LEGÍVEL POR COMPUTADOR: (A) SUPORTE: disquete
(B) COMPUTADOR: CP compatível com IBM
(C) SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS (D) PROGRAMA INFORMÁTICO: Patenln Release #1.0, Versão #1.25 (vi) DADOS ACTUAIS DO PEDIDO: (A) NÚMERO DO PEDIDO. (B) DATA DE DEPÓSITO: (C) CLASSIFICAÇÃO: (vii) DADOS ANTERIORES DO PEDIDO: (A) NÚMERO DO PEDIDO: US 08/068 051 (B) DATA DE DEPÓSITO: 27-MAIO-1993 57 (viii) INFORMAÇÃO SOBRE O REPRESENTANTE/AGENTE: (A) NOME: Noland, Greta E. (B) NÚMERO DO PEDIDO: 35 302 (C) REFERÊNCIA/NÚMERO DO PROCESSO: 32083 (ix) INFORMAÇÃO PARA TELECOMUNICAÇÕES: (A) TELEFONE: (312) 474-6300 (B) TELEFAX: (312) 474-0448 (C) TELEX: 25-3856 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 1: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 20 aminoácidos (B) TIPO: aminoácido (D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: péptido (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO: 1:
Aig Glu Xaa Asp Ala Asn Aig Be Asn Tir Met Tir Ala Qn Ur Vai 1 5 10 15 Lis Asn Thr Met 20 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO:2: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 9 aminoácidos (B) TIPO: aminoácido (D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: péptido (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO.2
Qn Ser Leu Ala Ala Ala Vai Vai Pro 1 5 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 3: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 8 aminoácidos (B) TIPO: aminoácido (D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: péptido (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQID NO:3:
Phe Asp Asn Asp G3u GH Glu Gin 1 5 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO:4: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA. (A) COMPRIMENTO: 23 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear
(ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN
(xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO:4: TTYGAYAAYG AYGARGGNGA RCA (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 5: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 23 pares de bases (B) TEPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear
(ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN (iv) ANTI-SENTIDO: SIM
(xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO:5: AARCTRTTRC TRCTYCCNCT YGT (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO:6: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 23 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico 59 (C) TIPO DE CORDÃO: simples
(D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQID NO: 6: AAYTAYATGT AYGCNCARTA YGT 23 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 7: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 23 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear
(ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN (iv) ANTI-SENTIDO: SIM (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO:7: TTRATRTACA TRCGNGTYAT RCA 23 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO:8: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 36 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO, simples (D) TOPOLOGIA: linear
(ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN (iv) ANTI-SENTIDO: SIM (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID N0.8: TTRATRTACA TRCGNGTYAT RCANTTYTTR TGNTAC 36 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO:9: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 4474 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples 60 (D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADNc (ix) PARTICULARIDADE:
(A) NOME/CÓDIGO: CDS (B) LOCALIZAÇÃO: 99 .2723 (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO:9: GGGAGGGTCT CGAGGCGAGT TTTGCTCCTC GGAGGGAGGG ACCCCAGCTG GAGTGGAAAA 60 CCAGCACCAG CTGACCGCAG AGACACGCCG CGCTGATC AIG GAG AGG GOC GGC 113
Met Qu Atg Ala Gfi 1 5 ooc OOC TOC OOC GOG GOC OCA ACA GCA AIG GGA OCA GGA CIC GGT OGA 161 Pro GE Qs Arg Ala Ala Ala Thr Ala Met GE Pro Gfi Leu Gfi Aig 10 15 20 AOC GIG GCT GGA GGA TCA CIG GGA CTT TAC CTT CIC TAC TTT GIT AGG 209 Ser Vá Ala Gfi Alg Ser Leu Gli Leu Tr Leu Leu Ur Phe Vá Aig 25 30 35 AAA QQC AOC AGA GAA AIG GIC AAC GCA TGG TTT GCT GAG AGA GIT CAC 257 Tis Gli Thr Atg Ou Met Vá Asn Ala Tip Phe Ala Glu Alg Vá Hs 40 45 50 AOC An GCT GIG TGC AAG GAA GGA AIC AAG GGC CAC AGG GAA TOC TOC 306 Ihr ile Pro Vá Os Lis Glu Gli Be Lis GE Hs Ihr Glu Ser Cis 55 60 65 TCT TOC OOC TIG CAG OCA AGT OOC OGT GCA GAG AGC AGT GIC OCT GGA 353 Ser Os Pro Lai Gin Pro Ser Pro Aig Ala G3u Sa- Sa Vá Pro Gfi 70 75 80 85 ACA OCA AOC AGG AAG AIC TCT OOC TCT GAA TIC GAT em CCG CTT AGA 401 Thr Pro Thr Alg Lis Be Ser Ala Ser Gb Phe Αφ Aig Pro Leu Alg 90 95 100 OOC AIC GIT APC AAG gar TCT GAG GGA ACT GIG AGC TIC CIC TCT GAC 449 Pro De Vá Se Lis Asp Ser Gki GE Thr Vá Ser Phe Leu Sa Asp 105 110 115 ICA GAC AAG AAG GAA CAG AIG OCT CIA AOC TOC OCA OGG TTT GAT AAT 497 Sa· Asp lis Lis Glu Gin Met Pro Leu Thr Ser Pro Alg Phe Asp Asn 120 125 130 GAT GAA GOG GAC CAG TOC TOG AGA CIC TIG GAA TTA GIG AAA GAT An 545 Asp Gki Gli Asp Gin Cis Ser Alg Leu Leu Gu Leu Vá Lis Asp ile 135 140 145 TCT AGT CAC TIG GAT GIC ACA GOC TTA TCT CAC AAA ATT ire TTC CAC 393 Ser Ser Hs Leu Asp Vá Ihr Ala Leu Cis TBs Lis Be Phe Leu Hs 150 155 160 165 61 AIC CAT GGA CFC AIC ICC GOC GAC GGC TAC ICC TTA TIC CIO GIC TGT 641 He His GE Leu He Ser Ala Asp Arg Tir Ser Leu Phe Leu Vai Cis 170 175 180 GAG GAC AGC ICC AAC GAC AAG ITT CIT AIC AGC GGC CFC TTT GAT GIT 689 Ou Αφ Sa Ser Asn Asp Lis Phe Leu He Ser Aig Leu Phe Asp Vai 185 190 195 OCA GAA GGT TCA ACA CIG GAA GAA GCT TCA AAC AAC TOC AIC CQC TTA 737 Ala Ou Gfi Ser Thr Leu Qu Qu Ala Ser Asn Asn Os He Aig Leu 200 205 210 GAG TQG AAC AAA GGC AIC GIG GGA CAC GIG GOC GCT TTT GGC GAG GOC 785 Ou Trp Asn Lis Gti He Vai GE His Vai Ala Ala Phe Qi Qu Pro 215 220 225 TIG AAC AIC AAA GAC GOC TAT GAG GAT ocr OGA TIC AAT CiCA GAA GIT 833 Leu Asn He Lis Asp Ala Ur Qu Asp Rd Aig Phe Asn Ala Qu Vai 230 235 240 245 GAC CAA ATT ACA GGC TAC AAG ACA CAA AGT ATT crr TGT AIG CCA ATT 881 Asp Gin He Ihr GE Tn- Lis Thr Qn Ser He Leu Cis Met Pro He 250 255 260 AAG AT CAT AGG GAA GAG GIT GIT GGT GTA GGC CAG GOC AIC AAC AAG 929 Lis Asn Hs Aig Qu Qu Vai Vai GE Vai Ala Qn Ala He Aai Lis 265 270 275 AAA 1CA GGA AAT GGT GGG ACA TIC ACT GAA AAA GAC GAA AAG GAC TTT 977 Lis Ser GK Asn GE GE Ur Phe Thr Qu Lis Asp Qu Lis Asp Phe 280 285 290 ocr GCT TAC TIG OCA TTT TGT GGA ATT GTT CIT CAT AAT GCT CAA CFC 1025 Ala Ala Tír Leu Ala Phe Cis GE He Vai Leu Hs Asn Ala Qn Leu 295 300 305 TAT GAG ACT TCA CIO CFG GAG AAC AAG AGA AAT CAG GIG CIG crr GAC 1073 Tir Qu Ur Ser Leu Leu Qu Aai Lis Aig Asn Qn Vai Leu Leu Asp 310 315 320 325 crr ocr AGC TCA ATT ITT GAA GAA CAA CAA TCA TTA GAA GTA ATT CTA 1121 Leu Ala Ser Leu He Phe Qu Qu Qn Qn Ser Leu Qu Vai He Leu 330 335 340 AGG AAA AEA GCT G0C ACT ATT AIC TCT OCC AIG CAG GIG CAG AAA TOC 1169 Aig Lis He Ala Ala Thr He He Ser Pro Met Qn Vai Qn Lis Cis 345 350 355 AGC ATT TIC ATA GDG GAT GAA GAT TGC TOC GAT TCT TTT TCT AGT GIG 1217 Thr He Phe He Vai Asp Qu Asp Cis Ser Asp Ser Phe Sa Ser Vai 360 365 370 Ur CAC AIG GAG TGT GAG GAA TCA GAA AAA TOG TCA GAT ACT TTA ACA 1265 Phe Hs Met Gu Cis Glu Qu Leu Qu Lis Ser Ser Asp Thr Leu Thr 375 380 385 62 OQG GAA OGT GAT GCA AOC AGA AIC ΑΑΓ TAC AIG TAT GCT CAG TAT GTA 1313 Aig Ghi Aig Asp Ala Thr Aig Se Asn Tr Met Tír Ala Gin Tir Vá 390 395 400 405 AAA AAT AOC AIG GAA GCA CIT AAT AIC OCA GAC GIC AGT AAG GAC AAA 1361 Lis Asn Thr Met GEi Pro Leu Asn Se Pio Asp Vá Ser Lis Asp Lis 410 415 420 AGA Ur OOC TGG ACA ΑΑΓ GAA AAC AIG GGA ΑΑΓ AEA AAC CAG CAG TOC 1409 Alg Phe Pro Tip Thr Asn Glu Asn Met GE Asn Se Asn GJn Gin Cis 425 430 435 ATT AGA AGT TIG CIT TGT ACA OCT ATA AAA AAT GGA AAG AAG AAC AAA 1457 De Aig Sa Leu Leu Cis T1b Pio De Lis Asi OBi Lis lis Asn Lis 440 445 450 GIG ATA GGG GIT TOC CAA CIT GIT ΑΑΓ AAG AIG GAG GAA AOC ACT GOC 1505 Vai Se GE Vai Os Gin Leu Vai Asn lis Met Glu Glu Thr Thr GE 455 460 465 AAA GIT AAG GCT TIC AAC CGC AAC GAT GAA CAG ITT CIG GAA GCT TIC 1553 Lis Vai Lis Ala Phe Asn Alg Asn Asp Gki Gn Phe Leu Glu Ala Phe 470 475 480 485 GIC AIC ΤΓΓ TGT GOC TIG GGG AIC CAG AAC ACA CAG AIG TAC GAA GCA 1601 Vai Se Phe Gs GE Leu GE Se Gn Asn Thr Gin Met Tir Glu Ala 490 495 500 GIG GAG AGA GOC AIG GOC AAG CAA AIG GIC AGG TEA GAG GIT CIG TCT 1619 Vai Glu Aig Ala Met Ala Lis GEi Met Vá Thr Leu Qu Vá Leu Sa 505 510 515 TAT CAT GCT TCA GCT GCA GAG GAA GAA AOC AGA GAG CIG CAG TGC TTA 1697 Tr Hs Ala Sa Ala Ala Glu Glu Glu Thr Alg Glu Leu Gin Ser Leu 520 525 530 GOG GCT GCT GIG GTA OCA TCT GOC CAG AOC CIT AAA AIC ACT GAC TIC 1715 Ala Ala Ala Vai Vai Pro Ser Ala Gin Thr Leu Tis Be Thr Asp Phe 535 540 545 AGC TIC AGC GAC ITT GAG CIG TCT GAC CIG GAA ACA GCA CIG TOC ACA 1793 Ser Phe Ser Asp Phe Glu Leu Ser Asp Leu Glu Thr Ala Leu Cis Thr 550 555 560 565 AIC OQG AIG TIC ACT GAC CIC AAC CIT GIG CAG AAC TIC CAG AIG AAA 1811 Se Aig Met Phe Thr Asp Leu Asn Leu Vá Gin Asn Phe Gin Met Lis 570 575 580 CAT GAG GIC CIT TGC AAG TQG ATT TEA AGT GIG AAG AAG AAC TAT GOG 1889 His Glu Vai Leu Cis Lis Tip Se Leu Ser Vá Lis Lis Asi Tir Aig 585 590 595 AAG AAC GIC GOC TAT CAT ΑΑΓ TGG AGA CAT GOC ITT AAT ACA. GCT CAG 1937 Lis Asn Vai Ala Tir His Asi Tip Arg His Ala Phe Asn Hir Ala Gin 600 605 610 63 TQc AIG ΤΓΓ QOG GCA CTA AAA GCA GGC AAA ATT CAG AAG AGG CIG AGG 1985 Cis Met Phe Ala Ala Leu Lis Ala GE Lis De Gin Tis Arg Leu Thr 615 620 625 GAC CIO GAG ATA cn GCA CIG CIG ΑΤΓ GCT GGC TEA AGC CAT GAT CIG 2033 Asp Leu Glu De Leu Ala Leu Leu De Ala Ala Leu Sa- Lfis Asp Leu 630 635 640 645 GAT CAC CGT GGT GIG ΑΑΓ AAC TCA TAC ATA CAG GGA AGT GAA CAC OCA 2081 Asp His Aig Gfi Vai Asn Asn Ser Ur De Gin Alg So- Glu His Pro 650 655 660 CIT QCT CAG CIC TAC TGC CAT TCA AIC AIG GAG CAT CAT CAT τη GAT 2129 Leu Ala Gin Leu Tu Cis His Ser De Met Glu His His His PIb Asp 665 670 675 CAG TOC CIG AIG AIC cn ΑΑΓ AGT OCT GGC AAT CAG ATT CIC AGT GGC 2177 Gin Cis Leu Met De Leu Asn Ser Pro Gfi Asn Gtn De Leu Ser Gfi 680 685 690 CIC TOC An GAA GAG ΤΑΓ AAG AOC ACC CIG AAG AIC AIC AAG CAA GCT 2225 Leu Ser ile Glu Glu Tr Lis Thr Thr Leu Lis De De Lis Gin Ala 695 700 705 ATT ΊΤΑ GGC ACA GAC CTA GCA CIG TAC ATA AAG AGA GGA GGA GAA τη 2273 De Leu Ala Thr Asp Leu Ala Leu Tír De Lis Alg Aig Gfi Gu Phe 710 715 720 725 τη GAA cn ATA AIG AAA AAT CAA TIC AAT TIG GAA GAT OCT CAT CAA 2321 Phe Gu Leu De Met Lis Asn Gin Phe Asn Leu Glu Asp Pro His Gn 730 735 740 AAG GAG TIG m nA GGG AIG CIG AIG ACA GCT TGT GAT cn TCT OCA 2369 Lis Glu Leu Phe Leu Ala Met Leu Met Thr Ala Cis Asp Leu Ser Ala 745 750 755 ATT ACA AAA ooc TGG ccr An CAA CAA GGG ATA GCA GAA cn Gn GGC 2417 De Thr Lis Pro Tip Pro De Gin Gin Arg De Ala Glu Leu Vai Ala 760 765 770 ACT GAA τη τη GAC CAA GGA GAT AGA GAG AGG AAA GAA CIC AAC ATA 2465 Thr Glu Phe Phe Asp Gin Gfi Asp Aig Glu Arg Lis Gkl Leu Asn De 775 780 785 GAG ar GCT GAT ΟΆ AIG AAC GGG GAG AAG AAA AAC AAA AIC OCA AGT 2513 Gki Pro Ala Asp Leu Met Asn Aig Gbi Lis Lis Asn Lis De Pro Ser 790 795 800 805 AIG CAA Gn GGA TTC AEA GAT OOC AIC TOC TIG CAA OG TAT GAG GGC 2561 Met Gin Vai Gfi Phe De Asp Ala De Os Leu Gin Leu Tir Glu Ala 810 815 820 TIO AOC CAT GIG TGG GAG GAC TGT TIC GCT TIG CIG GAC GGC TGC AGA 2609 Leu Thr TDs Vai Ser Ou Asp Os Phe Pro Leu Leu Asp Gfi Os Arg 825 830 835 64 AAG AAC AGG CAG AAA TGG CAG GCT CTT GCA GAA CAG CAG GAG AAG ACA 2657 lis Asn Alg On Lis Tip On Ala Leu Ma Ou On Qn Qu Lis Πί 840 845 850 CIO A'IC ΑΑΓ GGT GAA AGC AGC CAG AGC AAC CGA CAG CAA CGG ΑΑΓ τα: 2705 Leu De Asn Gfi Ou Ser Ser Qn Thr Asn Alg Gn Qn Aig Asn Ser 855 860 865 GTT GCT GIC GQG PCA GPG TAGCCAGGTG TATCAGATGA GTGAGTGTGT 2753 Vai Ma Vai Gli Thr Vai 870 875 GCTCAGCTCA GTCCTCTGCA ACACCATGAA GCTACCCATT CCAGCTTAAT TCCTGCAGTT 2813 GACTTTAAAA aActggcata AAGCftCTACT CAGCATCTAG TTCTAGCTTG ACCAGTGAAG 2873 AGTAGAACAC CACCACAGTC AGGGTGCAGA GCAGTTGGCA GTCTCCTTTC GAACCCAGAC 2933 TCGTGAATTT AAAGAAGAGC ACTCGTCGTT TATATCTCTG TCTTTTCCTA AGCGGGGTGT 2993 GGAATCTCTA AGAGGAGAGA GAGATCTCGA CCACAGGTCC AATGCGCTCT GTCCTCTCAG 3053 CTGCTTCCCC CACTGTGCTG TGACCTCTCA ATCTGAGAAA CGTGTAAGGA AGGTTTCAGC 3113 GAATTCCCTT TAAAATGTOT CAGACAGTAG CTXCTTGGGC CGGGTTGTTC CCGCAGCTCC 3173 CCATCTGTTT GTTCTCTATC TTGCCTGAAA GAGGCTTTGC TCTACCTGCC ACACTCTCCT 3233 GGATCCCTGT CCAGTAGCTG ATCAAAAAAA AGGATGTGAA ATTCTCGTGT GACTTTTTAG 3293 AAAAGGAAAG TGACCCCGAG GATCGGTGTG GATT CACTAG TTGTCCACAG ATGATCTGTT 3353 TAGTTTCTAG AATTTTCCAA GATGATACAC TCCTCCCTAG TCTAGGGGTC AGACCCTGTA 3413 TGGTGGCTGT GACCCTTGAG GAACTTCTCT CTTTGCATGA CATTAGCCAT AGAACTGTTC 3473 TTGTCCAAAT ACACAGCTCA TATGCAGCTT GCAGGAAACA CTTTAAAAAC ACAACTATCA 3533 CCTATGTXAT TCTGATTACA GAAGTTATCC CTACTCACTG TAAACATAAA CAAAGCCCCC 3593 CAAACTTCAA ATAGTTCTGT GTGGTGAGAA ACTGCAAGTT TTCATCTCCA GAGATAGCTA 3653 TAGGTAATAA GTGGGATGTT TCTGAAACTT TTAAAAATAA TCTTTTACAT ATATCTTAAC 3713 TGTTTTCTTA TGAGCACTAT GGTTTGTTTT ττττττττττ TGCTCTGCTT TGACTTCCCC 3773 TTTTCACTCA ATTATCTTGG CAOTTTTTCT AAATGACTTO CACAGACTTC TCCTGTACTT 3633 CATGGCTGTG CAGTGTTCCA TGCTGTGAAG GCACCATCGT GTATTAAATC AGTTCCCTGG 3893 TCACACATAG GTGAGCTGGT TGGAAATTTT TACCATTAAA AAACCACTTT CCCACATTGA 3953 TGCTTTCTAA TCTGGCACAG GATGCTTCTT TTTTTCCCCT TTTTCTCTGT TTAATTATTG 4013 GAAATGGGAT CTCTGGGATC CTCGTTCCCT GGCACCTACC TGCTCTCAAC GTGGCCTGTC 4073 GCCAGCAGCA TTGGCTAGAC CTGGGGGCTT GTTGGGAACG GAGACCCTCT GCCCTGCCCC 4133 TGGCCTGCTG ACAAGGACCT GCATTTTGCT GAGCTCCCAG TGACCCTGGT GTTTAATTGT 4193 TAACCATTGA AAAAAATCAA ACTATAGTTT ATTTACAATG TTGTGTTAAT TTCGCGTGTA 4253 CAGCAAAGTG ACTCAGTGGT CAAGTACATT TAAAACACTG GGCATACTCT CTCCCTCTCC 4313 TTGTGTACCT GGTTGGTATT TCCAGAAACC ATGCTCTTGT CTGTCCTGTA GTTTTGGAAG 4373 CGCTTTCTCT ttgaagactg ccttctctcc TGTGTCTGCC CTACATGGAC TAGTTCGTTT 4433
ATTGTCCTAC ATGGCTTTCC TTCCATGTTC CTCTCAACTT T 4474 65 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 10: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 875 aminoácidos (B) TIPO: aminoácido (D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: proteína (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO: 10:
Met 1 Gu Aig Ala Pro GH Leu Gli 20 Leu Tr Phe 35 Vai Ala Gu 50 Aig Vai His 65 Thr Gu Ser Sar Ser Vai Pro Asp Aig Pro Leu 100 Sa Phe Leu 115 Ser Pro Aig 130 Phe Asp Leu 145 Vai Lis Asp Lis He Phe Leu Leu Phe Leu Vai 180 Aig Leu Phe 195 Asp Asn Cís 210 He Aig Ala 225 Phe GJi Ou Phe Asn Ala Glu
Gli 5 Pro Gli Cis Aig Sa Vá Ala Aig Tis Gli Thr 40 His Thr He 55 Pro Cis Ser 70 Os Pro Gli 85 Thr Pro Thr Aig Pro He Vá Asp Sa Asp Tis 120 Asn Asp Glu 135 G1l He Sa 150 Ser His His 165 He His Gli Cis Glu Asp Ser Vá Ala Glu Gli 200 Leu Gkr Tip 215 Asn Pro Leu 230 Asn He Vá 245 Asp Gn He
Arg Ala 10 Ala Ala GE 25 Aig Sa Leu Arg Gu Met Vá Vá Cis Tis Gu 60 Leu Gin Pro 75 Ser Aig Lis 90 He Sa He 105 Lis Asp Sa Lis Gu Gn Met Asp Gn Gs Sa 140 Leu Asp Vá 155 Thr Leu He 170 Sa Ala Ser 185 Asn Asp Lis Ser Thr Leu Gu Lis GE He Vá 220 Lis Asp Ala 235 Trr Thr GE 250 Trr Lis
Thr Ala Met 15 GE GE Leu 30 Tír Leu Asn 45 Ala lip Phe GE He Lis GE Pro Arg Ala Gu 80 Ala Sa Gu 95 Phe Gu GE 110 Thr Vá Pro 125 Leu Thr Sa Arg Leu Leu Gu Ala Leu Cis His 160 Asp Arg Tir 175 Sa Phe Leu 190 Be Sa Gu 205 Ala Sa Asn GE His Vá Ala Gu Asp Pro Aig 240 Thr Gn Sa 255 He
Leu Cis Met Pro De Lis Asn His Atg Gh Gh Vá Vá GE Vá Ala 260 265 270 Qn Ala De Asn Lis Lis Ser ca Asn GH GH Thr Phe Thr Gh Lis 275 280 285 Asp Gh Lis Αφ Phe Ala Ala Tir Leu Ala Phe Cis GE De Vá Leu 290 295 300 His Asn Ala Gh Leu Tír Gh Thr Ser Leu Leu Gh Asn Lis Atg Asn 305 310 315 320 Gh Vai Leu Leu Αφ Leu Ala Ser Leu De Phe Gh Gh Gh Gh Ser 325 330 335 Leu Gh Vai De Leu Aig Lis De Ala Ala Thr De De Ser Pro Met 340 345 350 Gin Vai Gh Lis Cis Thr De Phe De Vá Αφ Gh Αφ Cis Ser Αφ 355 360 365 Ser Phe Ser Ser Vai Phe His Met Gh Os Gh Gh Leu G3u Lis Ser 370 375 380 Ser Asp Thr Leu Thr Arg Gh Aig Αφ Ala Thr Aig De Aai Tir Met 385 390 395 400 Tir Ala Gh Tír Vai Lis Asn Thr Met Gh Pro Leu Asn De Pro Αφ 405 410 415 Vai Ser Lis Αφ Lis Atg Phe Pro Tip Thr Asn Gh Asn Met GE Asn 420 425 430 De Asn Gh Gh Cis De Atg Ser Leu Leu Cis Thr Pro De Lis Asn 435 440 445 ca Lis Lis Asn Lis Vai De GE Vá Os Gh Leu Vá Asn Lis Met 450 455 460 Ou Gh Thr Thr GE Lis Vá Tis Ala Phe Aai Atg Asn Αφ Gh Gh 465 470 475 480 Phe Leu Gh Ala Phe Vai De Phe Cis GH Leu GH De Gh Asn Thr 485 490 495 Gh Met Tír Gh Ala Vai Gh Atg Ala Met Ala Lis Gh Met Vá Thr 500 505 510 Leu Gh Vai Leu Ser Tr His Ala Ser Ala Ala Gh Gh Gh Thr Atg 515 520 525 Ou Leu Gh Ser Leu Ala Ala Ala Vá Vá Pro Ser Ala Gh Thr Leu 530 535 540 lis De Thr Asp Phe Ser Phe Ser Αφ Phe Ou Leu Ser Αφ Leu Gh 545 550 555 560 Thr Ala Leu Cis Thr De Arg Met Phe Thr Αφ Leu Asn Leu Vá Gh 565 570 575 67
Asn Phe Gb Met Lis Hs Gb Vai Leu Cis Lis Tip Be Leu Ser Vá 580 585 590 1 is lis Asn lir Aig las Asn Vá Ala Ur Hs Asn Tip Arg Hs Ala 595 600 605 Phe Asn Thr Ala Gb Cis Met Phe Ala Ala Lai lis Ala Gfi Tis Be 610 615 620 Gin Tis Alg Leu Thr Asp Leu Gb Be Leu Ala Leu Leu Be Ala Ala 625 630 635 640 Leu Ser His Asp Leu Asp Hs Aig Gfi Vá Asn Asn Ser Tir Be Gb 645 650 655 Arg Ser Gb Hs Pro Leu Ala Gb Leu Tir Cis Hs Ser Be Met Gb 660 665 670 His KBs Hs Phe Asp On Os Leu Met Be Leu Asn Ser Pro Gfi Asn 675 680 685 Gb Be Leu Ser Gfi Leu Ser Be Gb Gb Tir Lis Thr Thr Leu Lis 690 695 700 Se Be Lis Gb Ala Be Leu Ala Thr Asp Leu Ala Leu Tir Be Lis 705 710 715 720 Arg Aig Gfi Gb Phe Phe Gb Leu Be Met Lis Asn Gb Phe Asn Leu 725 730 735 Gb Asp Pto Hs Gb Lis Ou Leu Phe Leu Ala Met Leu Met Thr Ala 740 745 750 Cis Asp Leu Ser Ala Be Thr Tis Pro Tip Pro Be Gb Gb Arg Be 755 760 765 Ala Gb Leu Vai Ala Thr Gb Phe Phe Asp Gb ca Asp Aig Gb Aig 770 775 780 Tis Gb Leu Asn Be Gb Pro Ala Asp Leu Met Asn Arg Gb Lis Lis 785 790 795 800 Asn Lis Be Pro Ser Met Gb Vá Gfi Phe Be Asp Ala Be Os Leu 805 810 815 Gb Leu Tír Gb Ala Leu Thr His Vá Ser Gb Asp Os Phe Pro Leu 820 825 830 Leu Asp Gfi Cis Aig Lis Asn Arg Gb Lis Tip Gb Ala Leu Ala Gb 835 840 845 Gb Gb Gb Tis Thr Leu Be Asn GE Gb Ser Ser On Thr Asn Arg 850 855 860 Gb Gb Aig Asn So- Vai Ala Vá Gfi Thr Vá 865 870 875 68 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUENCIAID NO: 11: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 2060 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADNc (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO: 11: GCGOCCGCGC TCCGGCCGCT TTGTCGAAAG CCGCCCCGAC TGGAGCAGGA CGAAGGGGGA 60 GGGTCTCGAG GCCGAGTCCT GTTcrrcTGA GGGACGGACC CCAGCTGGGG TGGAAAAGCA 120 GTACCAGAGA GCCXCCGAGG CGCGCGGTGC CAACCATGGA GGGGGCCGGC CCCAGCTTCG 180 GGCAGCAGCG ACAGCAGCAG CAGCCCCAGC AGCAGAAGCA GCAGCAGAGG GATCAGGACT 240 CGGTCGAAGC ATGGCTGGAC GATCACTGGG ACTTTACCTT CTCATACTTT GTTAGAAAAG 300 CCACCAGAGA AATGGTCAAT GCATGGTTTG CTGAGAGAGT TCACACCATC CCTGTGTGCA 360 AGGAAGGTAT CAGAGGCCAC ACCGAATCTT GCTCTTGTCC CTTGCAGCAG AGTCCTCGTG 420 CAGATAACAG TGTCCCTGGA ACACCAACCA GGAAAATCTC TGCCTCTGAA TTTGACCGGC 480 CTCTTAGACC CATTGTTGTC AAGGATTCTG AGGGAACTGT GAGCTTCCTC TCTGACTCAG 540 AAAAGAAGGA ACAGATGCCT CTAACCCCTC CAAGGTTTGA TCATGATGAA GGGGACCAGT 600 OCTCAAGACT CTTGGAATTA GTGAAGGATA TTTCTAGTCA TTTGGATGTC ACAGCCTTAT 660 GTCACAAAAT TTTCTTGCAT ATCCATGGAC TGATATCTGC TGACCGCTAT TCCCTGTTCC 720 TTCTCTCTCA ACACACCTOC AATCACAACT TTCTTATOAG ccccctcttt GATCTTCCTG 780 AAGGTTCAAC ACTGGAAGAA GTTTCAAATA ACTGTATCCG •CTTAGAATGG AACAAAGGCA B40 TTGTGGGACA TGTGGCAGCG CTTGGTGAGC CCTTGAACAT CAAAGATGCA TATGAGGATC 900 CTCGGTTCAA TGCAGAAGTT GACCAAATTA CAGGCTACAA GACACAAAGC ATTCTTTGTA 960 TGCCAATTAA GAATCATAGG GAÀGAGGTTG TTGGTGTAGC CCAGGCCATC AACAAGAAAT 1020 CAGGAAACGG TGGGACATTT ACTGAAAAAG ATGAAAAGGA CTTTGCTGCT TATTTGGCAT 1080 TTTGTGGTAT TGTTCTTCAT AATGCTCAGC TCTATGAGAC TTCACTGCTG GAGAACAAGA 1140 GAAATCAGGT GCTGCTTGAC CTTGCTAGTT TAATTTTTGA 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TCAGTGCATG TTTGCTGCTC 2040 TAAAAGCAGG CAAAATTCAG 2060 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 12: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 1982 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADNc (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO: 12: ACAAAATTTT CTTGCATATC CATGGACTGA TATCTGCTGA CCGCTATTCC CTCTTCCTTG 60 TCTGTGAAGA CAGCTCCAAT GACAAGTTTC TTATCAGCCG CCTCTTTGAX GTTGCTGAAG 120 CTTCAACACT GGAAGAAGTT TCAAATAACT GTATCCGCTT AGAATGGAAC AAAGGCAXTG 180 TGGGACATGT GGCAGCGCTT GGTGAGCCCT TGAACATCAA AGATGCATAT GAGGATCCTC 240 GGTTCAATGC AGAAGTTGAC CAAATTACAG CCTACAAGAC ACAAAGCATT CTTTGTATGC 300 CAATTAAGAA TCATAGGGAA GAGGTTGTTG CTGTAGCCCA GGCCATCAAC AAGAAATCAG 360 GAAACGGTGG GACATTTACT GAAAAAGATG AAAAGGACTT TGCTGCTXAT TTCGCATTTT 420 GTGGTATTGT TCTTCATAAT GCTCAGCTCT ATGAGACTTC ACTGCTGGAG AACAAGAGAA 480 ATCAGGTGCT GCTTGACCTT GCTAGTTTAA TTTTTGAAGA ACAACAATCA TTAGAAGTAA 540 TTTTGAAGAA AATACCTGCC actattatct CTTTCATCCA AGTGCAGAAA TGCACCATTT 600 TCATACTGGA TGAAGATTGC TCCGATTCTT TTTCTAGTGT GTTTCACATG GAGTGTGAGG 660 AATTAGAAAA ATCATCTGAT ACATTAACAA GGGAACATGA TGCAAACAAA ATCAATTACA 720 TGTATGCTCA GTATGTCAAA AATACTATGG AACCACTTAA TATCCCAGAT GTCAGTAAGG 780 ATAAAAGATT TCCCTGGACA ACTGAAAATA CAGGAAATGT AAACCAGCAG TGCATTAGAA 840 GTTTGCTTTG TACACCTATA AAAAATGGAA AGAAGAATAA AGTTATAGGG GTTTGCCAAC 900 TTGTTAATAA GATGGAGGAG AATACTGGCA AGGTTAAGCC TTTCAACCGA AATGACGAAC 960 AGTTTCTGGA AGCTTTTGTC ATCTTTTGTG gcttggggat CCAGAACACG CAGATGTATG 1020 70 AAGCAGTGGA GAGAGCCATG GCCAAGCAAA TGGTCACATT GGAGGTTCTG TCGTATCATG 1080 CXXCAGCAGC AGAGGAAGAA ACAAGAGAGC TACAGTCGTT AGCGGCTGCT GTGGTGCCAT 1140 CTGCCCAGAC CCXXAAAAXI ACTGACTTXA GCTTCAGTGA CXTXGAGCXG TCTGATCTGG 1200 AAACAGCACT GTGTACAATT CGGATGTTTA CTGACCTCAA CCTTGTGCAG AACTTCCAGA 1260 TGAAACATGA GGTTCTTTGC AGATGGATTT TAAGTGTTAA GAAGAATTAT CGGAAGAATG 1320 TTGCCTATCA TAATTGGAGA CAIGCCXXXA ATACAGCTCA GTCCATGTTT GCXCCXCIAA 1380 AAGCAGGCAA AAXXCAGAAC AAGCTGACTG ACCTGGAGAT ACTTGCATTG CTGATTGCTG 1440 CACXAAGCCA CGATTTGGAT CACCGTGGTG IGAAIAACXC TTACATACAG CGAAGTGAAC 1500 ATCCACTTGC CCAGCTTTAC TGCCATTCAA TCATGGAACA CCATCATTTT GACCAGTGCC 1560 TGATGATTCT TAATAGTCCA GGCAATCAGA TTCTCAGTGG CCXCXCCATI GAAGAATATA 1620 AGACCACGTT GAAAATAATC AAGCAAGCTA TTTTAGCXAC AGACCTAGCA CTGTACATTA 1680 AGAGGCGAGG AGAATTTTTT GAACTTATAA 6AAAAAKXCA ATTCAATTTG GAAGATCCTC 1740 AICAAAAGGA GTTGTTTTTG GCAATGCTGA TGACAGCTTG TGATCTTTCT GCAATTACAA 1800 AACCCTGGCC TATTCAACAA CGGATAGCAG AACTTGTAGC AACTGAATXT TTTGATCAAG 1860 GAGACAGAGA GAGAAAAGAA CTCAACATAG AACCCACXGA XCXAAXGAAC AGGGAGAAGA 1920 AAAACAAAAX CCCAAGXAXG CAAGTTGGGT TCATAGATGC CAXCXGCXTG CAACXGXAXG 1980 AG 1982 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 13: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 18 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear
(ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO: 13: GCCACCAGAG AAATGGTC 18 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 14: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 18 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear 71
(ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQID NO.T4: ACAATGGGTC TAAGAGGC 18 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 15: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 18 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear
(ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO: 15: TCAGTGCATG TTTGCTGC 18 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 16: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 18 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear
(ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN <xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO: 16: TACAAACATG TTCATCAG 18 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO. 17: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 1107 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADNc (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO.T7: 72 GAGACATGCC TTTAATACAG CTCAGTGCAT GTTTGCTGCT CTAAAAGCAG GCAAAATTCA 60 GAACAAGCTG ACTGACCTGG AGATACTTGC ATTGCTGATT GCTGCACTAA GCCACGATTT 120 GGATCACCGT GGTGTGAATA ACTCTTACAT ACAGCGAAGT GAACATCCAC TTGCCCAGCT ιβο TTACTGCCAT TCAATCATGG AACACCATCA TTTTGACCAG TGCCTGATGA TTCTTAATAG 240 TCCAGGCAAT CAGATTCTCA GTGGCCTCTC CATTGAAGAA TATAAGACGA CGTTGAAAAT 300 AATCAAGCAA GCTATTTTAG CTACAGACCT AGCACTGTAC ATTAAGAGGC GACGAGAATT 360 TTTTGAACTT ATAAGAAAAA ATCAATTCAA TTTGGAAGAT CCTCATCAAA AGGAGTTGTT 420 TTTGGCAATG CTGATGACAG CTTGTGATCT TTCTGCAATT ACAAAACCCT GGCCTATTCA 480 ACAACGGATA GCAGAACTTG TAGCAACTGA ATTTTTTGAT CAAGGAGACA GAGAGAGAAA 540 AGAACTCAAC ATAGAACCCA CTGATCTAAT GAACAGGGAG AAGAAAAACA AAATCCCAAG 600 TATGCAAGXT GGCTTGATAG atgccatctg CTTGCAACTG TATGAGGCCC TCACCCACGT 660 CTCAGAGGAC TGTTTCCCTT TGCTAGKTGG CTGCAGAAAG AACAGGCAGA AATGGCAGGC 720 CCTTCCACAA CAGCACGACA AGATGCTGAT TAATGGGGAA AGCCGCCAGG CCAAGCGGAA 780 CTGAGTGGCC TATTTCATGC AGAGTTGAAG TTTACAGAGA TGGTGTGTTC TGCAATATGC 840 CTAGTTTCTT acacactgtc TGTATAGTGT CTGTATTTGG TKTATACTTT CCCACTGCTG 900 TATTTTTATT TTTGCACAAC TTTTGAGAGT ATAGCATGAA TGTTTTTAGA GGACTATTAC 960 ATATTTTTTG TATATTTGTT TTATGCTACT GAACTGAAAG GATCAACAAC ATCCACTGTT 1020 AGCACATTGA TAAAAGCATT GTTTGTGATA TTTCGTGTAC TGCAAAGTGT ATGCAGTATT 1080 CTTGCACTGA GGTTTTTTTG CTTGGGG 1107 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 18: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 18 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear
(ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO: 18: TTTGGAAGAT CCTCATCA 18 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 19: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 28 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico 73 (C) TIPO DE CORDÃO: simples
(D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQID NO: 19: ATGTCTCGAG TCAGTTCCGC TTGGCCTG 28 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO:20: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 30 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear
(ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO:20: TACAGAATTC TGACCATGGA GCGGGCCGGC 30 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 21: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 18 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear
(ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADN (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID NO:21: CATTCTAAGC GGATACAG 18 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO:22: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 2645 pares de bases (B) TIPO: ácido nucleico (C) TIPO DE CORDÃO: simples (D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: ADNc 74
(ix) PARTICULARIDADE
(A) NOME/CÓDIGO: CDS (B) LOCALIZAÇÃO: 12.2636 (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQID NO:22: GAATICIGACC ATO GAG GGG GCC GOC OGC AGC TIC GGG CAG CAG OGA CAG 50 Met Gb Aig Ala Gfi Pro Ser Phe Gfi Gb Gb Arg Gb 1 5 10 CAG CAG CAG COC CAG CAG CAG AAG CAG CAG CAG AGG GAT CAG GAC TOG 98 Gb On Gb Pro Gb Gb Gb Lis Gb On Gb Aig Αφ Gb Αφ Ser 15 20 25 GIC GAA GCA TOG CIG GAC GAT CAC TOG GAC ITT ACC TIC TCA TAC TTT 146 Vai Gb Ala Tip Leu Asp Αφ His Τφ Αφ Phe Thr Phe Ser Tír Phe 30 35 40 45 GIT AGA AAA ar ACC AGA GAA ATO GIC ΑΑΓ GCA TOG ITT GCT GAG AGA m Vai Aig Lis Ala Thr Aig Gb Met Vai Asn Ala Tip Phe Ala Gb Alg 50 55 60 GIT CAC ACC ATC CCT GIG TOC AAG GAA GGT ATO AGA GGT CAC ao: GAA 242 Vai His Thr De Pro Vai Os Lis Gb GE De Aig GE His Thr Gb 65 70 75 TCT TOC TCT TCT COC TIG CAG CAG AGT CCT CGT GCA GAT AAC AGT GIC 290 Ser Cis Ser Cis Pro Leu Gb On Ser Pro Arg Ala Arp Aoi Ser Vai 80 85 90 ccr GGA ACA OCA ACC ACG AAA ATO TCT GOC TCT GAA ITT GAC OOG CCT 338 Pro GB Thr Pro Thr Aig Lis De Ser Ala Ser Gb Phe Αφ Aig Pro 95 100 105 CTT AGA OGC ATT GIT GIC AAG GAT TCT GAG GGA ACT GIG AGC TIC CIC 386 Leu Aig Pro He Vai Vai Lis Αφ Ser Gb GE Thr Vai Ser Phe Leu 110 115 120 125 TCT GAC TCA GAA AAG AAG GAA CAG ATO CCT CIA AOC GCT OCA AGG TTT 434 Ser Asp Ser Gki Lis lis Gb Gb Met Pro Leu Thr Pro Pro Aig Phe 130 135 140 GAT CAT GAT GAA GGG GAC CAG TOC TCA AGA CIC TIG GAA TTA GIG AAG 482 Αφ His Asp Gb GE Asp Gb Cis Ser Aig Leu Leu Gb Leu Vai lis 145 150 155 GAT ATT TCT AGT CAT TIG GAT GIC ACA GOC ΤΓΑ TCT CAC AAA ATT TIC 530 Asp He Ser Ser His Leu Αφ Vai Thr Ala Leu Cis His lis De Phe 160 165 170 TIG CAT ATO CAT GGA CIG ATA TCT GCT GAC COC TAT TOC CIG TIC crr 578 Leu His De His GE Leu De Ser Ala Αφ Aig Tir Ser Leu Phe Leu 175 180 185 75 GIC IGT GAA GAC AGC TOC AAT GAC AAG TTT CIT AIC AGC OGC CPC TTT 626 Vai Qs Gb Asp Ser Ser Asn Αφ lis Phe Leu He Ser Aig Leu Phe 190 195 200 205 GAT GIT GCT GAA GGT TOA ACA CIG GAA GAA GIT TOA AAT AAC TCT ATO 674 Αφ Vai Ala Gb GH Ser Thr Leu Gb Gb Vai Ser Asn Asn Qs He 210 215 220 OGC TTA GAA TOG AAC AAA GGC ATT GIG GGA CAT GIG GCA GCG CIT GGT 722 Aig Leu Gb Tip Asn Lis GE He Vai GE Hs Vai Ala Ala Leu GE 225 230 235 GAG OOC ΤΤΌ AAC AIC AAA GAT GCA TAT GAG GAT CCT CGG TIC AAT GCA 770 Gb Pro Leu Asn He Lis Αφ Ala Tir Gb Αφ Pro Aig Phe Asn Ala 240 245 250 GAA GIT GAC CAA ATT ACA GGC TAC AAG ACA CAA AGC ATT CIT TGT AIG 818 Gb Vai Asp Gb He Thr GE Tff Lis Thr Gb Ser He Leu Os Met 255 260 265 OCA ATT AAG AAT CAT AGG GAA GAG GIT GIT GGT GTA G0C CAG GGC ATO 866 Pro He Lis Asn tfis Aig Gb Gb Vai Vai GE Vai Ala Gb Ala He 270 275 280 285 AAC AAG AAA 1CA GGA AAC GGT GGG ACA ΉΤ ACT GAA AAA GAT GAA AAG 914 Asn Lis Lis Sa· GE Asn GE GE Tir Phe Thr Gb Lis Αφ Gb Lis 290 295 300 GAC ΤΓΓ GCT GCT ΤΑΓ TIG GCA ITT TGT GGT ATT GIT CIT CAT AAT GCT 962 Asp Phe Ala Ala Tff Leu Ala Phe Os GE He Vai Leu Hs Asn Ala 305 310 315 CAG CIO ΤΑΓ GAG act TOA CIG CIG GAG AAC AAG AGA AAT CAG GIG CIG 1010 Gb Leu Tr Gb Thr Ser Leu Leu Ou Asn Lis Aig Asn Gb Vai Leu 320 325 330 CIT GAC CIT GCT AGT ΤΓΑ ATT TTT GAA GAA CAA CAA TOA TTA GAA GTA 1058 Leu Asp Leu Ala Ser Leu He Phe Gb Gb Gb Gb Ser Leu Gb Vai 335 340 345 ATT ΤΊΌ AAG AAA ATA GCT GCC ACT ATT ATO TCT TIC AIG CAA GIG CAG 1106 De Leu Lis Lis He Ala Ala Thr He He Ser Phe Met Gb Vai Gb 350 355 360 365 AAA TOC ACC ATT TIC ATA GPG GAT GAA GAT TOC TOC GAT TCT TTT TCT 1154 Lis Os Thr He Phe He Vai Αφ Gb Αφ Os Ser Αφ Ser Phe Ser 370 375 380 AGT GIG τη- CAC AIG GAG TGT GAG GAA TTA GAA AAA TOA TCT GAT ACA 1202 So- Vai Phe Hs Met Gb Os Gb Gb Leu Ou Lis Ser Ser Αφ Thr 385 390 395 TTA ACA AGG GAA CAT GAT GCA AAC AAA AIC AAT TAC AIG TAT GCT CAG 1250 Leu Thr Aig Gb Hs Asp Ala Asn L3s Be Asn Tff Met Tir Ala Gb 400 405 410 76 ΤΑΓ GIC AAA ΑΑΓ ACT AIG GAA OCA CIT AAT AIC CJCA GAT GIC AGT AAG 1298 Τϊτ Vai Lis Asn Thr Met Ou Pto Leu Asn De Pto Asp Vá Ser lis 415 420 425 GAT AAA AGA TTT OOC TGG ACA ACT GAA AAT ACA GGA AAT GTA AAC CAG 1346 Asp Lis Aig Phe Pto Tip Thr Thr Glu Asn Thr Gfi Asn Vá Asn Qn 430 435 440 445 CAG TOC ATT AGA AGT TIG CIT TGT ACA ocr ATA AAA AAT GGA AAG AAG 1394 Οη Cis De Aig Ser Leu Leu Cis Thr Pro De Lis Asn Gfi lis lis 450 455 460 ΑΑΓ AAA GTT ATA GGG GIT TOC CAA CIT GIT AAT AAG ATO GAG GAG AAT 1442 Asa Lis Vá De GD Vá Os On Leu Vá Asn Lis Met Qu Qu Asn 465 470 475 ACT GGC AAG GTT AAG ocr tic AAC OGA AAT GAC GAA CAG TTT CIG GAA 1490 Thr α Lis Vá Lis Pro lhe Asn Atg Asn Asp Qu On Phe Leu Qu 480 485 490 GCT TTT GIC AIC TIT TGT GGC TIG GGG AIC CAG AAC ACG CAG AIG TAT 1538 Ala Phe Vá De Phe Cis Qi Leu <3i De Gin Asn Thr Qn Met Tir 495 500 505 GAA GCA GIG GAG AGA GGC AIG GOC AAG CAA AIG GIC ACA TIG GAG GIT 1586 Glu Ala Vá Qu Aig Ala Met Ala Lis On Met Vá Thr Leu Qu Vá 510 515 520 525 CTG TOG TAT CAT GCT TCA GCA GCA GAG GAA GAA ACA AGA GAG CTA CAG 1634 Leu Ser Tir Hs Ala Ser Ala Ala Glu GE Glu Thr Aig Qu Leu Qn 530 535 540 TOG TTA GGG GCT GCT GIG GIG OCA TCT GOC CAG ACC CIT AAA AIT ACT 1682 Ser Leu Ala Ala Ala Vá Vá Pro Ser Ala C3n Thr Leu lis De Thr 545 550 555 GAC TIT AGC TIC AGT GAC TTT GAG CTG TCT GAT CIO GAA ACA GCA CTG 17» Asp Phe Ser Phe Se- Asp Phe Qu Leu Ser Asp Leu Ou Thr Ala Leu 560 565 570 TCT ACA ATT OGG AIG TTT ACT GAC CIC AAC CIT GIG CAG AAC TIC CAG 1778 Cis Thr De Aig Met Phe Thr Asp Leu Asn Leu Vá Qn Asn Phe Qn 575 580 585 ATO AAA CAT GAG GIT CIT TOC AGA TOG ATT TTA AGT GIT AAG AAG AAT 1826 Met Lis His Glu Vá Leu Os Aig Tip De Leu Ser Vá Lis Lis Asn 590 595 600 605 TAT OGG AAG ΑΑΓ GIT OOC TAT CAT AAT TOG AGA CAT GOC ITT AAT ACA 1874 Tir Aig Lis Asn Vá Ala Tr Eis Asn Trp Atg His Ala Phe Asn Thr 610 615 620 GCT CAG TOC AIG TTT GCT GCT CTA AAA GCA GGC AAA ATT CAG AAC AAG 1922 Ala On Cis Met Phe Ala Ala Leu lis Ala Gfi lis De Qn Asn Lis 625 630 635 77 CIG ACT GAC CIG GAG AEA CIT GCA TIG CIG ATT GCT GCA CTA AGC CAC 1970 Leu Thr Asp Leu Ou Se Leu Ala Leu Leu Be Ala Ala Leu Ser His 640 645 650 GAT TIG GAT CAC CGT GGT GIG AAT AAC TCT TAC ATA CAG GGA AGT GAA 2018 Asp Leu Asp His Alg Gli Vai Asn Asn Ser Tír Se Gn Aig Ser Qu 655 660 665 CAT OCA CIT G0C CAG CIT TAC TGC CAT TCA AIC ATG GAA CAC CAT CAT 2066 His Pio Leu Ala Gin Leu Tír Os His Ser Se Met Gu His His HLs 670 675 680 685 TTT GAC CAG TGC CIG APG ATT CIT AAT AGT CCA GGC AAT CAG ATT CIC 2114 Phe Asp Gin Gs Leu Met Be Leu Asn Ser Pro Gfi Asn Gn Se Leu 690 695 700 AGT GGC CIC ICC ATT GAA GAA ΤΑΓ AAG ACC ACG TIG AAA ATA AIC AAG 2162 Ser Gli Leu Ser Se Glu Gu Tv Lis Thr Thr Leu Lis Se Se lis 705 710 715 CAA Gcr ATT TTA GCT ACA GAC CIA GCA CIG TAC ATT AAG AGG GGA GGA 2210 Gn Ala Se Leu Ala Thr Asp Leu Ala Leu Tír Se Lis Aig Alg GS 720 725 730 GAA TTT TTT GAA CIT ATA AGA AAA AAT CAA TIC AAT TIG GAA GAT OCT 2258 Gu Phe Phe Glu Leu Se Alg Lis Asn Gn Phe Asn Leu Gu Asp Pro 735 740 745 CAT CAA AAG GAG TIG TTT TIG GCA ATG CIG ATG ACA GCT TCT GAT CIT 2306 His Oh Lis Glu Leu Phe Leu Ala Met Leu Met Thr Ala Cis Asp Leu 750 755 760 765 TCT OCA ATT ACA AAA OOC TQG OCT ATT CAA CAA OGG ATA GCA GAA CIT 2354 Ser Ala Be Thr Lis Pro Tip Pro Be Gn Gn Aig Be Ala Gu Leu 770 775 780 GTA OCA ACT GAA TTT TTT GAT CAA GGA GAC AGA GAG AGA AAA GAA CIC 2402 Vai Ala Thr Ou Phe Phe Asp Gn Gi Asp Aig Gu Alg Lis Gu Leu 785 790 795 AAC ATA GAA ooc ACT GAT CTA APG AAC AGG GAG AAG AAA AAC AAA AIC 2450 Asn Se GL> Pio Thr Asp Leu Met Asn Aig Gu Lis Lis Asn Lis Se 800 805 810 CCA AGT AJG CAA GIT GGG TIC ATA GAT GGC AIC TGC TIG CAA CIG ΤΑΓ 2498 Pío Ser Met Gin Vai Gli Phe Be Aso Ala Be Os Leu Gn Leu Tír 815 820 825 GAG GGC CIG ADC CAC GIG TCA GAG GAC TGT TIC GCT TIG CTA GAT GGC 2546 Ou Ala Leu Thr His Vai Ser Gu Asp Cis Phe Pro Leu Leu Asp GS 830 835 840 845 TGC AGA AAG AAC AGG CAG AAA TQG CAG OOC CIT GCA GAA CAG CAG GAG 2594 Os Alg lis Asn Alg Gin Lis Trp Gn Ala Leu Ala Gu Gn Gn Gu 850 855 860 ,/ 78 AAG Lis AFG Met CIG Leu ATT Ue 865 AAT Asn OQG Gfi GAA. Qu AGC Ser QQC GE 870 CAG Gin GOC Ala AAG I is OQG Arg AAC Asn 875 2636 TCACTOGAG 2645 (2) INFORMAÇÃO PARA A SEQUÊNCIA ID NO: 23: (i) CARACTERÍSTICAS DA SEQUÊNCIA: (A) COMPRIMENTO: 875 aminoácidos (B) TIPO: aminoácido (D) TOPOLOGIA: linear (ii) TIPO DE MOLÉCULA: proteína (xi) DESCRIÇÃO DA SEQUÊNCIA: SEQ ID N0.23:
Met Glu Arg Ala Gfi Pro Ser Phe Gfi On On Aig Gin On Gin On 1 5 10 15 Pro G3n Qn Gb Tis Gin Gin Gin Arg Αφ Gin Αφ Sa Vai Glu Ala 20 25 30 Tip Leu Αφ Αφ Os Τφ Αφ Phe Thr Phe Sa Tír Phe Vai Aig Lis 35 40 45 Ala Thr Aig Glu Met Vai Asn Ala Tip Phe Ala Gfii Arg Vai Os Thr 50 55 60 De Pro Vai Cis Lis Glu Gfi De Arg Gfi Os Thr Glu Sa Cis Sa 65 70 75 80 Cis Pro Leu Gin Gin Ser Pro Arg Ala Αφ Asn Ser Vai Pro Gli Thr 85 90 95 Pro Thr Arg Lis De Sa Ala Sa Glu Phe Αφ Arg Pro Leu Arg Pro 100 105 110 De Vai Vai Lis Αφ Ser Ou Gfi Thr Vai Sa Phe Leu Sa Αφ Sa 115 120 125 Glu Tis Lis Glu Gh Met Pro Leu Thr Pro Pro Aig Phe Αφ Os Αφ 130 135 140 Giu Gfi Αφ GEi Cis Ser Aig Leu Leu Glu Leu Vai Lis Αφ De Sa 145 150 155 160 Ser Os Leu Αφ Vai Thr Ala Leu Cis Os lis De Phe Leu Os De 165 170 175 His GE Leu De Sa Ala Αφ Arg lir Sa Leu Phe Leu Vai Cis Ou 180 185 190 Αφ Ser Ser Asn Αφ Lis Phe Leu De Sa Arg Leu Phe Αφ Vai Ala 195 200 205
Ou Qi Ser Thr Leu Glu Glu Vd Ser Asn Asn Cis He Arg Leu Gfii 210 215 220 Τιρ Asn Tis Gli He Vd Gfi His Vd Ala Ala Leu Gfi Glu Pro Leu 225 230 235 240 Asn He Lis Asp Ala Tr Glu Asp Pio Aig Phe Asn Ala Ou Vd Asp 245 250 255 On He Thr Gfi Τη- Lis Thr Gin Ser He Leu Os Met Pro He Lis 260 265 270 Asn His Arg Glu Glu Vd Vd Gfi Vd Ala On Ala He Asn Lis Lis 275 280 285 Sa Gfi Asn Gfi Gfi Thr Phe Thr Glu Lis Asp Glu Tis Asp Phe Ala 290 295 300 Ala Tir Leu Ala Phe Os Gli He Vd Leu His Asa Ala Gin Leu Th 305 310 315 320 G3u Thr Ser Leu Leu Glu Asn lis Arg Asn Qn Vd Leu Leu Asp Leu 325 330 335 Ala Ser Leu He Phe Gki Glu Gin Gh Sa Leu Glu Vd He Leu Lis 340 345 350 Lãs He Ala Ala Thr He He Ser Phe Met On Vd On lis Cis Thr 355 360 365 He Phe He Vai Asp Ou Asp Os Ser Asp Sa Phe Sa Sa Vd Phe 370 375 380 His Met Ou Os Qu Glu Leu Ou Lis Sa Sa Asp Thr Leu Thr Arg 385 390 395 400 Ou His Asp Ala Asn Lis He Asn Tír Met Trr Ala Gin Tir Vd lis 405 410 415 Asn Thr Met Glu Pro Leu Asn He Pro Asp Vd Sa Lis Asp Lis Arg 420 425 430 Phe Pro Tip Thr Thr Ou Asn Thr Gfi Asn Vd Asn On On Os He 435 440 445 Aig Ser Leu Leu Cis Thr Pro He Lis Asn Gfi Lis Lis Asn Lis Vd 450 455 460 He GE Vai Os Gin Leu Vd Asn Lis Met Glu Glu Asn Thr Gfi Lis 465 470 475 480 Vai Tis Pro Phe Asn Aig Asn Asp Glu Gin Phe Leu Glu Ala Phe Vd 485 490 495 He Phe Os Gfi Leu Gfi He Gin Asn Thr Gin Met Tr Ou Ala Vd 500 505 510 Ou Aig Ala Met Ala Lis Gin Met Vd Thr Leu Glu Vd Leu Sa Tir 515 520 525
His Ala Ser Ala Ala Glu Gfi Glu Th Arg Gh Leu Gh Ser Leu Ala 530 535 540 Ala Ala Vai Vá Pro Ser Ala Gn Th Leu Lis De Th Asp Phe Ser 545 550 555 560 Phe Ser Asp Phe Glu Leu Ser Asp Leu Ou Th Ala Leu Cis Th De 565 570 575 Aig Met Phe Thr Asp Leu Asn Leu Vá Gin Asn Phe Gh Met Lis Hs 580 585 590 Ou Vai Leu Os Aig Trp De Leu Ser Vá Lis Lis Asn Ttr Arg Lis 595 600 605 Asm Vai Ala Trr His Asn Τφ Arg His Ala Phe Asn Th Ala Gh Cis 610 615 620 Met Phe Ala Ala Leu lis Ala Gfi Tis De Gh Asn Lis Leu Th Asp 625 630 635 640 Leu Ou De Leu Ala Leu Leu De Ala Ala Leu Ser His Asp Leu Asp 645 650 655 His Aig Gli Vá Asn Asn Ser Tír De Gh Arg Ser Gh lis Pro Leu 660 665 670 Ala Gh Leu Tír Cis His Ser Be Met Gh His His His Phe Asp Gh 675 680 685 Cis Leu Met De Leu Asn Ser Pro Gfi Asn Gh De Leu Ser Gfi Leu 690 695 700 Ser De Gh Glu Trr Lis Th Th Leu lis De De Lis Gh Ala De 705 710 715 720 Leu Ala Thr Asp Leu Ala Leu Tff De Lis Arg Arg Gfi Gh Phe Phe 725 730 735 Ou Leu De Arg Lis Asn Gin Phe Asn Leu Gh Asp Pro Efis Gh lis 740 745 750 Gh Leu Phe Leu Ala Met Leu Met Th Ala Cis Asp Leu Ser Ala De 755 760 765 Thr Lis Pro Trp Pro De Gin Gin Aig De Ala Gh Leu Vá Ala Th 770 775 780 Glu Phe Phe Asp Gin Gfi Asp Aig Glu Arg Lis Gh Leu Asn De Gh 785 790 795 800 Pro Thr Asp Leu Met Asn Arg Glu lis lis Asn Lis De Pro Ser Met 805 810 815 Gin Vai Gfi Phe De Aso Ala De Cis Leu Gh Leu Tír Gh Ala Leu 820 825 830 Th· His Vai Ser Glu Asp Cis Phe Pro Leu Leu Asp Gfi Crs Arg Lis 835 840 845 81 Asn Aig 850 Gin Lis Tip On Ala 855 Leu Ala Ou Gin Gin Gu lis Met Leu 860 Be 865 Asn GB Gu Ser GE 870 On Ala T is Aig Asn 875
Lisboa, 29 de Junho de 2001
Claims (21)
- Reivindicações 1. Polinucleótído purificado e isolado que codifica o polipeptído de fosfodiesterase específico e de ligação do monofosfato de guanosina cíclico humano (MPc), designado por PDE-LGc, explicitado na SEQID NO:23.
- 2. Polinucleótído purificado e isolado que codifica uma variante alélica humana do polipeptído de PDE-LGc explicitado na SEQ DD NO:23, em que o referido polinucleótído hibrida a cerca de 65°C em SSC 3X e fosfato de sódio 20 mM a pH 8,0, com lavagem a cerca de 65°C em SSC 2X, até à cadeia não codificadora do ADN explicitado na SEQ ID NO:22.
- 3. Polinucleótído de acordo com uma qualquer das reivindicações 1 ou 2, o qual é um ADN.
- 4. ADN de acordo com a reivindicação 3, o qual é um ADNc.
- 5. ADN de acordo com a reivindicação 3, o qual é um ADN genómico.
- 6. ARN transcrito de um ADN de acordo com a reivindicação 5.
- 7. ADN de acordo com a reivindicação 5, o qual compreende também uma sequência de ADN de controlo endógeno da expressão.
- 8. Vcctor que compreende um ADN de acordo com a reivindicação 3. *' 2
- 9. Vector de acordo com a reivindicação 8, em que o ADN está funcionalmente ligado a uma sequência de controlo da expressão.
- 10. Célula hospedeira estavelmente transformada ou transfectada com uma sequência de ADN de acordo com a reivindicação 3 de modo a permitir a expressão, na referida célula hospedeira, da PDE-LGc de SEQID NO:23.
- 11. Método para a produção de um polipeptido de PDE-LGc, consistindo esse método em deixar crescer a célula hospedeira de acordo com a reivindicação 10 num meio nutriente adequado e em isolar o polipeptido de PDE-LGc a partir da célula ou a partir do meio para o seu crescimento.
- 12. Polipeptido de PDE-LGc produzido pelo método da reivindicação 11.
- 13. Polinucleótido purificado e isolado que compreende a sequência de ADN explicitada na SEQ ID NO:22.
- 14. Fragmento da PDE-LGc humana constituído pelos aminoácidos 516 a 875 da SEQ ID NO:23.
- 15. Fragmento da PDE-LGc humana constituído pelos aminoácidos 1 a 494 da SEQ ID NO:23. 3
- 16. Fragmento da PDE-LGc humana constituído pelos aminoácidos 1 a 549 da SEQ ID NO:23.
- 17. Fragmento da PDE-LGc humana constituído pelos aminoácidos 515 a 879 da SEQ ID NO:23.
- 18. Anticorpo especifícamente imunorreactivo com a PDE-LGc explicitada na SEQ ID NO:23.
- 19. Anticorpo de acordo com a reivindicação 18, o qual é um anticorpo monoclonal.
- 20. Linhagem de células de hibridoma, produtora de um anticorpo de acordo com a reivindicação 19.
- 21. Anticorpo de acordo com a reivindicação 18, o qual é um anticorpo humanizado.Lisboa, 29 de Junho de ^2001 O Oíícící da rtcpnenac& aaííaíqíΑ.Ο.Γ.Ϊ. K?a’. do SrJiifC, Bd, v'n-D~í. 1269-003 LISBOA
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