PL443588A1 - Sekwencje starterów do amplifikacji fragmentu genu HvD53 jęczmienia i sposób identyfikacji osobników jęczmienia pod kątem występowania mutacji T4001C w obrębie fragmentu genu HvD53 jęczmienia, wpływającej na zmniejszenie rozkrzewienia części nadziemnej jęczmienia - Google Patents

Sekwencje starterów do amplifikacji fragmentu genu HvD53 jęczmienia i sposób identyfikacji osobników jęczmienia pod kątem występowania mutacji T4001C w obrębie fragmentu genu HvD53 jęczmienia, wpływającej na zmniejszenie rozkrzewienia części nadziemnej jęczmienia

Info

Publication number
PL443588A1
PL443588A1 PL443588A PL44358823A PL443588A1 PL 443588 A1 PL443588 A1 PL 443588A1 PL 443588 A PL443588 A PL 443588A PL 44358823 A PL44358823 A PL 44358823A PL 443588 A1 PL443588 A1 PL 443588A1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
barley
mutation
hvd53
fragment
gene
Prior art date
Application number
PL443588A
Other languages
English (en)
Other versions
PL249492B1 (pl
Inventor
Marek Marzec
Original Assignee
Uniwersytet Śląski W Katowicach
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Uniwersytet Śląski W Katowicach filed Critical Uniwersytet Śląski W Katowicach
Priority to PL443588A priority Critical patent/PL249492B1/pl
Publication of PL443588A1 publication Critical patent/PL443588A1/pl
Publication of PL249492B1 publication Critical patent/PL249492B1/pl

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/13—Plant traits
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Przedmiotem zgłoszenia są sekwencje starterów do amplifikacji fragmentu genu jęczmienia HvD53, przedstawione w wykazie sekwencji: 1) Sekwencja nukleotydowa nr 1, 2) Sekwencja nukleotydowa nr 2. Istotę wynalazku stanowi również sposób identyfikacji osobników jęczmienia pod kątem występowania mutacji T4001C w obrębie fragmentu genu HvD53 jęczmienia, wpływającej na zmniejszenie rozkrzewienia części nadziemnej jęczmienia, polegający na tym, że: a) z dowolnej tkanki badanego jęczmienia izoluje się DNA genomowe; b) ustala się koncentrację DNA genomowego do poziomu od 20 do 500 ng/µl; c) prowadzi się amplifikację fragmentu genu HvD53 przeprowadzając reakcję PCR z użyciem starterów do amplifikacji fragmentu genu HvD53 jęczmienia obejmującego miejsce mutacji T4001C, przedstawionych w wykazie sekwencji: 1) Sekwencja nukleotydowa nr 1, 2) Sekwencja nukleotydowa nr 2, osobno dla prób: i. oryginalnego DNA wyizolowanego z badanej rośliny (próba A); ii. oryginalnego DNA wyizolowanego z badanej rośliny wymieszanego z DNA rośliny nieposiadającej mutacji T4001C, w równych proporcjach w łącznej objętości odpowiadającej próbie A (próba B); iii. DNA wyizolowanego z rośliny nieposiadającej mutacji T4001C (próba kontrolna), z użyciem dowolnego znacznika fluorescencyjnego pozwalającego na znakowanie DNA oraz urządzenia pozwalającego na pomiar przyrastającej intensywności sygnału fluorescencyjnego w czasie rzeczywistym; d) oblicza się krzywą topnienia dla każdej z badanej prób A i B, a także dla próby kontrolnej, którą stanowi fragment genu HvD53 jęczmienia amplifikowany zgodnie z procedurą przedstawioną powyżej z użyciem DNA matrycowego bez mutacji T4001C; e) porównuje się krzywe topnienia otrzymane dla prób A, B oraz próby kontrolnej, analizuje się otrzymane wyniki i identyfikuje się jęczmień: - nieposiadający mutacji — wskazuje na niego identyczny wykres krzywej topnienia dla próby A i B, tożsamy z wykresem dla próby kontrolnej, - niosący mutację w stanie heterozygotycznym — wskazuje na niego identyczny wykres krzywej topnienia dla próby A i B, o wartościach mniejszych niż dla próby kontrolnej, - niosący mutację w stanie homozygotycznym - wskazują na niego różne wykresy krzywej topnienia dla próby A i B.
PL443588A 2023-01-26 2023-01-26 Sekwencje starterów do amplifikacji fragmentu genu HvD53 jęczmienia i sposób identyfikacji osobników jęczmienia pod kątem występowania mutacji T4001C w obrębie fragmentu genu HvD53 jęczmienia, wpływającej na zmniejszenie rozkrzewienia części nadziemnej jęczmienia PL249492B1 (pl)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL443588A PL249492B1 (pl) 2023-01-26 2023-01-26 Sekwencje starterów do amplifikacji fragmentu genu HvD53 jęczmienia i sposób identyfikacji osobników jęczmienia pod kątem występowania mutacji T4001C w obrębie fragmentu genu HvD53 jęczmienia, wpływającej na zmniejszenie rozkrzewienia części nadziemnej jęczmienia

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL443588A PL249492B1 (pl) 2023-01-26 2023-01-26 Sekwencje starterów do amplifikacji fragmentu genu HvD53 jęczmienia i sposób identyfikacji osobników jęczmienia pod kątem występowania mutacji T4001C w obrębie fragmentu genu HvD53 jęczmienia, wpływającej na zmniejszenie rozkrzewienia części nadziemnej jęczmienia

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL443588A1 true PL443588A1 (pl) 2024-07-29
PL249492B1 PL249492B1 (pl) 2026-04-27

Family

ID=91971338

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL443588A PL249492B1 (pl) 2023-01-26 2023-01-26 Sekwencje starterów do amplifikacji fragmentu genu HvD53 jęczmienia i sposób identyfikacji osobników jęczmienia pod kątem występowania mutacji T4001C w obrębie fragmentu genu HvD53 jęczmienia, wpływającej na zmniejszenie rozkrzewienia części nadziemnej jęczmienia

Country Status (1)

Country Link
PL (1) PL249492B1 (pl)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105695478A (zh) * 2014-12-09 2016-06-22 中国科学院上海生命科学研究院 调节植物株型和产量的基因及其应用
PL437297A1 (pl) * 2021-03-15 2022-09-19 Uniwersytet Śląski W Katowicach Sekwencje starterów do identyfikacji genów jęczmienia, sposób analizy ekspresji genów jęczmienia oraz sposób identyfikacji pozwalający na selekcję mutantów jęczmienia niewrażliwych na strigolaktony

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105695478A (zh) * 2014-12-09 2016-06-22 中国科学院上海生命科学研究院 调节植物株型和产量的基因及其应用
PL437297A1 (pl) * 2021-03-15 2022-09-19 Uniwersytet Śląski W Katowicach Sekwencje starterów do identyfikacji genów jęczmienia, sposób analizy ekspresji genów jęczmienia oraz sposób identyfikacji pozwalający na selekcję mutantów jęczmienia niewrażliwych na strigolaktony

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
HOFINGER B. J. ET AL.: "Theoretical and Applied Genetics, August 2009", "HIGH-RESOLUTION MELTING ANALYSIS OF CDNA-DERIVED PCR AMPLICONS FOR RAPID AND COST-EFFECTIVE IDENTIFICATION OF NOVEL ALLELS IN BARLEY" *
MARZEC, M ET AL.: "Physiol Plant 2016 Nov; 158(3):341-355", "IDENTIFICATION AND FUNCTIONAL ANALYSIS OF THE HVD14 GENE INVOLVED IN STRIGOLACTONE SIGNALING IN HORDEUM VULGARE" *
MARZEC, M., ALQUDAH, A. M.: "Int. J. Mol. Sci. 2018, 19, 795", "KEY HORMONAL COMPONENTS REGULATE AGRONOMICALLY IMPORTANT TRAITS IN BARLEY" *
MARZEC, M.: "IBGS 13 13th International Barley Genetics Symposium, July 3rd-7th, 2022 Riga, Latvia, abstract e-book, str. 137", "NEW BARLEY STRIGOLACTONE MUTANTS IDENTIFIED USING TILLING STRATEGY", DOI: publikacja dostępna na stronie https://wheat.pw.usda.gov/GG3/sites/default/files/IBGS_13_2022_Abstracts_E_Book_15_09_2022.pdf *

Also Published As

Publication number Publication date
PL249492B1 (pl) 2026-04-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Wolfe ISSR techniques for evolutionary biology
EP2660331B1 (en) Method for single cell genome analysis and kit therefor
Nicklas et al. Simultaneous determination of total human and male DNA using a duplex real‐time PCR assay
Nakayama et al. Reference genes for quantitative real-time polymerase chain reaction studies in soybean plants under hypoxic conditions
CN117089631B (zh) 一种基于CRISPR/Cas12a-RPA快速检测红火蚁的序列组合及其应用
Omasheva et al. Evaluation of molecular genetic diversity of wild apple Malus sieversii populations from Zailiysky Alatau by microsatellite markers
Almeida et al. Population data of the GlobalFiler® Express loci in South Portuguese population
CN106801092A (zh) 应用RPA技术对转基因玉米Bt176品系特异性鉴定
KR100919753B1 (ko) 메론 및 참외에서 유용한 흰가루병 저항성 연관 ｓｃａｒ마커 및 이를 이용한 저항성 참외 품종 선발방법
Sumíková et al. Multiplex PCR assay to detect rust resistance genes Lr26 and Lr37 in wheat
Petrigh et al. Improved coprolite identification in Patagonian archaeological contexts
Konrad et al. A sexing technique for highly degraded cetacean DNA
US9598732B2 (en) Method of identifying date palm gender using scar primers
Liu et al. Targeted parallel sequencing of large genetically-defined genomic regions for identifying mutations in Arabidopsis
Aznar et al. I-DNASE21 system: development and SWGDAM validation of a new STR 21-plex reaction
Norrell et al. Development and characterization of eighty-four microsatellite markers for the red snapper (Lutjanus campechanus) using Illumina paired-end sequencing
CN110564822B (zh) 基于LAMP技术的转基因玉米Bt176相关基因检测方法及试剂盒
Prieto-Fernández et al. A new 17 X-STR multiplex for forensic purposes
Enciso-Maldonado et al. Detection of homologous resistance genes to the late blight in wild potatoes
PL443587A1 (pl) Sposób identyfikacji osobników jęczmienia pod kątem występowania mutacji T4001C w obrębie fragmentu genu HvD53 jęczmienia, wpływającej na zmniejszenie rozkrzewienia części nadziemnej
Martins et al. Development and characterization of microsatellite loci for Ocotea species (Lauraceae) threatened with extinction
Song et al. Validation of a multiplex system with 20 multi-Indels for forensic purposes
CN112094940A (zh) 与黄瓜长下胚轴基因lh1连锁的Indel标记及其引物、试剂盒与应用
García‐Verdugo et al. Characterization of microsatellite markers for the endangered Daphne rodriguezii (Thymelaeaceae) and related species
Méndez-Rodríguez et al. Isolation and characterization of microsatellite markers for funnel-eared bats Natalus mexicanus (Chiroptera: Natalidae) and cross-amplification using next-generation sequencing