MXPA05012957A - Variantes del antigeno de celula madre de prostata (psca) y subsecuencias del mismo. - Google Patents

Variantes del antigeno de celula madre de prostata (psca) y subsecuencias del mismo.

Info

Publication number
MXPA05012957A
MXPA05012957A MXPA05012957A MXPA05012957A MXPA05012957A MX PA05012957 A MXPA05012957 A MX PA05012957A MX PA05012957 A MXPA05012957 A MX PA05012957A MX PA05012957 A MXPA05012957 A MX PA05012957A MX PA05012957 A MXPA05012957 A MX PA05012957A
Authority
MX
Mexico
Prior art keywords
psca
protein
amino acid
peptide
cancer
Prior art date
Application number
MXPA05012957A
Other languages
English (en)
Inventor
Pia M Challita-Eid
Original Assignee
Agensys Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Agensys Inc filed Critical Agensys Inc
Publication of MXPA05012957A publication Critical patent/MXPA05012957A/es

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K7/00Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4748Tumour specific antigens; Tumour rejection antigen precursors [TRAP], e.g. MAGE
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4615Dendritic cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/462Cellular immunotherapy characterized by the effect or the function of the cells
    • A61K39/4622Antigen presenting cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/464493Prostate associated antigens e.g. Prostate stem cell antigen [PSCA]; Prostate carcinoma tumor antigen [PCTA]; Prostatic acid phosphatase [PAP]; Prostate-specific G-protein-coupled receptor [PSGR]
    • A61K39/464494Prostate specific antigen [PSA]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K51/00Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo
    • A61K51/02Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo characterised by the carrier, i.e. characterised by the agent or material covalently linked or complexing the radioactive nucleus
    • A61K51/04Organic compounds
    • A61K51/08Peptides, e.g. proteins, carriers being peptides, polyamino acids, proteins
    • A61K51/10Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody
    • A61K51/1045Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody against animal or human tumor cells or tumor cell determinants
    • A61K51/1051Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody against animal or human tumor cells or tumor cell determinants the tumor cell being from breast, e.g. the antibody being herceptin
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K51/00Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo
    • A61K51/02Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo characterised by the carrier, i.e. characterised by the agent or material covalently linked or complexing the radioactive nucleus
    • A61K51/04Organic compounds
    • A61K51/08Peptides, e.g. proteins, carriers being peptides, polyamino acids, proteins
    • A61K51/10Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody
    • A61K51/1045Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody against animal or human tumor cells or tumor cell determinants
    • A61K51/1054Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody against animal or human tumor cells or tumor cell determinants the tumor cell being from lung
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K51/00Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo
    • A61K51/02Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo characterised by the carrier, i.e. characterised by the agent or material covalently linked or complexing the radioactive nucleus
    • A61K51/04Organic compounds
    • A61K51/08Peptides, e.g. proteins, carriers being peptides, polyamino acids, proteins
    • A61K51/10Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody
    • A61K51/1045Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody against animal or human tumor cells or tumor cell determinants
    • A61K51/1057Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody against animal or human tumor cells or tumor cell determinants the tumor cell being from liver or pancreas
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K51/00Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo
    • A61K51/02Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo characterised by the carrier, i.e. characterised by the agent or material covalently linked or complexing the radioactive nucleus
    • A61K51/04Organic compounds
    • A61K51/08Peptides, e.g. proteins, carriers being peptides, polyamino acids, proteins
    • A61K51/10Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody
    • A61K51/1045Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody against animal or human tumor cells or tumor cell determinants
    • A61K51/106Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody against animal or human tumor cells or tumor cell determinants the tumor cell being from kidney or bladder
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K51/00Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo
    • A61K51/02Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo characterised by the carrier, i.e. characterised by the agent or material covalently linked or complexing the radioactive nucleus
    • A61K51/04Organic compounds
    • A61K51/08Peptides, e.g. proteins, carriers being peptides, polyamino acids, proteins
    • A61K51/10Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody
    • A61K51/1045Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody against animal or human tumor cells or tumor cell determinants
    • A61K51/1072Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody against animal or human tumor cells or tumor cell determinants the tumor cell being from the reproductive system, e.g. ovaria, uterus, testes or prostate
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P39/00General protective or antinoxious agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/30Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/30Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
    • C07K16/3069Reproductive system, e.g. ovaria, uterus, testes, prostate
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/566Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor using specific carrier or receptor proteins as ligand binding reagents where possible specific carrier or receptor proteins are classified with their target compounds
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407Specifically defined cancers
    • G01N33/57415Specifically defined cancers of breast
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/53DNA (RNA) vaccination
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2239/00Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46
    • A61K2239/46Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46 characterised by the cancer treated
    • A61K2239/58Prostate
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/73Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Optics & Photonics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Reproductive Health (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)

Abstract

Se describe PSCA y su proteina codificada, y variantes del mismo, en donde el PSCA exhibe expresion especifica de tejido en el tejido adulto normal, y es aberrantemente expresado en los canceres listados en la Tabla I. Consecuentemente, el PSCA proporciona un objetivo de diagnostico, de pronostico, profilactico y/o terapeutico para el cancer. El gen PSCA o fragmento del mismo, o su proteina codificada, o variantes del mismo, o un fragmento del mismo, puede ser dado para inducir una respuesta inmune humoral o celular; anticuerpos o celulas T reactivas con PSCA pueden ser usados en la inmunizacion activa o pasiva.

Description

VARIANTES DEL ANTIGENO DE CELULA MADRE DE PROSTATA (PSCA) Y SUBSECUENCIAS DEL MISMO Campo Técnico La invención descrita en la presente se relaciona a genes y sus proteínas codificadas, llamados PSCA, expresados en ciertos cánceres, y a métodos y composiciones de diagnóstico y terapéuticos útiles en el manejo de cánceres que expresan PSCA. Técnica Antecedente El cáncer es la segunda causa principal de muerte humana después la enfermedad coronaria. Mundialmente, millones de gentes mueren de cáncer cada año. En los Estados Unidos solamente, como es reportado por la American Cáncer Society, el cáncer causa la muerte de muy por arriba de medio millón de gentes anualmente, con arriba de 1.2 millones de nuevos casos diagnosticados por año. Mientras que las muertes de la enfermedad del corazón han estado declinando significativamente, aquellas que resultan del cáncer generalmente están aumentando. En los inicios del siguiente siglo, el cáncer se predice que llegará a ser la causa principal de muerte. Mundialmente, varios cánceres destacan como los causantes principales de muertes. En particular, los carcinomas del pulmón, próstata, pecho, colon, páncreas y ovario, representan las causas primarias de muerte por cáncer. Estos y virtualmente todos los otros carcinomas comparten una característica letal común. Con muy pocas excepciones, la enfermedad metastática de un carcinoma es fatal. Además, aún para aquellos pacientes con cáncer quienes inicialmente sobreviven a sus cánceres primarios, la experiencia común ha mostrado que sus vidas son dramáticamente alteradas. Muchos pacientes con cáncer experimentan fuertes ansiedades inducidas por el conocimiento del potencial para recurrencia o la falla del tratamiento. Muchos pacientes con cáncer experimentan debilitaciones físicas después del tratamiento. Además, muchos pacientes con cáncer experimentan una recurrencia. Mundialmente, el cáncer de próstata es el cuarto cáncer más prevalente en hombres. En Norte América y Europa del Norte, es por mucho el cáncer más común en hombres y la es la segunda causa principal de muerte por cáncer en hombres. En los Estados Unidos solamente, muy por arriba de 30,000 hombres mueren anualmente de esta enfermedad - segundo solamente al cáncer de pulmón. A pesar de la magnitud de estas cifras, todavía no hay tratamiento efectivo para el cáncer de próstata metastático. La prostatectomía quirúrgica, la terapia por radiación, la terapia por ablación de hormona, la castración quirúrgica y la quimioterapia continúan siendo las principales modalidades de tratamiento.
Desafortunadamente, estos tratamientos son inefectivos para muchos y están frecuentemente asociados con consecuencias indeseables . Sobre el frente de diagnóstico, la falta de un marcador de tumor de próstata que pueda precisamente detectar los tumores localizados, en etapa temprana permanece como una limitación significante en el diagnóstico y el manejo de esta enfermedad. Aunque el ensayo del antigeno especifico de próstata de suero (PSA) ha sido una herramienta muy útil, sin embargo su especificidad y utilidad general es ampliamente considerado como que carece de varios aspectos importantes. El progreso en la identificación de marcadores específicos adicionales para el cáncer de próstata se ha mejorado mediante la generación de xenoinjertos de cáncer de próstata que pueden recapitular diferentes etapas de la enfermedad en ratones. Los xenoinjertos de LAPC (Los Angeles Prostate Cáncer) son xenoinjertos de cáncer de próstata que han sobrevivido al pasaje en varios ratones inmunodeficientes combinados (SCID) y han exhibido la capacidad para imitar la transición de la dependencia de andrógeno a la independencia de andrógeno (Klein y colaboradores, 1997, Nat. Med. 3:402). Más recientemente, los marcadores de cáncer de próstata identificados incluyen PCTA-1 (Su y colaboradores, 1996, Proc. Nati. Acad. Sci. EUA 93:7252), antígeno de membrana específico de próstata (PSM) (Pinto y colaboradores, Clin Cáncer Res 1996 septiembre 2 (9) : 1445-51) , STEAP (Hubert y colaboradores, Proc Nati Acad Sci E ü A. 1999 diciembre 7 ; 96 (25 ): 14523-8 ) y el antigeno de célula madre de próstata (PSCA) (Reiter y colaboradores, 1998, Proc. Nati. Acad. Sci. EÜA 95:1735) . Mientras que los marcadores previamente identificados tales como PSA, PSM, PCTA y PSCA han facilitado los esfuerzos para el diagnóstico y el tratamiento del cáncer de próstata, hay una necesidad para la identificación de marcadores adicionales y objetivos terapéuticos para los cánceres de próstata y cánceres relacionados con el fin de mejorar adicionalmente el diagnóstico y la terapia. El carcinoma de célula renal (RCC) tiene en cuenta aproximadamente 3 por ciento de las malignidades de adulto. Una vez que los adenomas alcanzan un diámetro de 2 a 3 cm, existe el potencial maligno. En . el adulto, los dos principales tumores renales malignos son el adenocarcinoma de célula renal y el carcinoma de célula transicional de la pelvis renal o uréter. La incidencia del adenocarcinoma de célula renal es estimada en más de 29,000 casos en los Estados Unidos, y más de 11, 600 pacientes murieron de esta enfermedad en 1998. El carcinoma de célula transicional es menos frecuente, con una incidencia de aproximadamente 500 casos por año en los Estados Unidos. La cirugía ha sido la terapia primaria para el adenocarcinoma de célula renal por muchas décadas. Hasta recientemente, la enfermedad metastática ha sido refractaria a cualquier terapia sistémica. Con desarrollos recientes en terapias sistémicas, particularmente inmunoterapia, el carcinoma de célula renal metastático puede ser abordado agresivamente en pacientes apropiados con una posibilidad de respuestas durables. No obstante, hay una necesidad permanente por terapias efectivas para estos pacientes . De todos los nuevos casos de cáncer en los Estados Unidos, el cáncer de vejiga representa aproximadamente 5 por ciento en hombres (quinto neoplasma más común) y 3 por ciento en mujeres (octavo neoplasma más común) . La incidencia está incrementándose lentamente, concurrente con una población incrementadamente más vieja. En 1998, hubo un estimado de 54,500 casos, incluyendo 39,500 en- hombres y 15,000 en mujeres. La incidencia ajustada por la edad en los Estados Unidos es de 32 por 100, 000 para hombres y ocho por 100, 000 en mujeres. La relación histórica de hombres/mujeres de 3:1 puede ser disminuida con relación a los patrones de fumar en mujeres. Hubo un estimado de 11,000 muertes de cáncer de vejiga en 1998 (7, 800 en hombres y 3, 900 en -mujeres). La incidencia del cáncer de vejiga y la mortalidad fuertemente se incrementan con la edad y será un problema incrementado a medida que la población llegue a ser de más avanzada edad. La mayoría de los cánceres de vejiga recurren en la vejiga. El cáncer de vejiga se maneja con una combinación de resección transuretral de la vejiga (TUR) y la quimioterapia o inmunoterapia intravesical . La naturaleza multifocal y recurrente del cáncer de vejiga puntualiza las limitaciones del TUR. La mayoría de los cánceres invasivos del músculo no son curados por la TUR solamente. La cistectomia radical y la desviación urinaria es el medio más efectivo para eliminar el cáncer pero llevan un impacto innegable sobre la función urinaria y sexual. Continúa existiendo una necesidad significante para modalidades de tratamiento que sean benéficas para los pacientes con cáncer de vejiga. Un estimado de 130,200 cases de cáncer colorrectal ocurrió en el 2000 en los Estados Unidos, incluyendo 93,800 casos de cáncer de colon y 36,400 -de cáncer rectal. Los cánceres colorrectales son los terceros cánceres más comunes en hombres y mujeres. Las proporciones de incidencia declinaron significativamente durante 1992-1996 (-2.1% por año) . La investigación sugiere que estas declinaciones han sido debido a la detección incrementada y la remoción del pólipo, previniendo la progresión de los pólipos a cánceres invasivos. Hubo un estimado de 56,300 muertes (47,700 de cáncer de colon, 8,600 de cáncer rectal) en el 2000, teniendo en cuente aproximadamente 11% de todas las muertes por cáncer de los Estados Unidos. Actualmente, la cirugía es la forma más común de terapia para el cáncer colorrectal y para cánceres que no se han difundido, es frecuentemente curativa. La quimioterapia, o la quimioterapia más radiación, se da antes o después de la cirugía a la mayoría de los pacientes cuyo cáncer ha perforado profundamente la pared del intestino o se ha difundido a los ganglios linfáticos. Una colostomía permanente (creación de una abertura abdominal para la eliminación de desechos del cuerpo] ocasionalmente se necesita para el cáncer del colon ' y es infrecuentemente requerida para el cáncer rectal. Continúan existiendo modalidades efectivas de diagnóstico y tratamiento para el cáncer colorrectal. Hubo un estimado de 164,100 nuevos casos de cáncer de pulmón y bronquial en el 2000, teniendo en cuenta 14% de todos los diagnósticos de cáncer de los Estados Unidos. La proporción de incidencia del cáncer de pulmón y bronquial está declinando significativamente en hombres, desde un valor alto de 86.5 por 100,000 en 1984 a 70.0 en 1996. En los años de 1990, la proporción del incremento entre las mujeres comenzó a disminuir. En 1996, la proporción de incidencia en las mujeres fue de 42.3 por 100,000. El cáncer de pulmón y bronquial causó un estimado de 156,900 muertes en el 2000, teniendo en cuenta 28% de todas las muertes por cáncer. Durante 1992-1996, la mortalidad del cáncer de pulmón declinó significativamente entre los hombres (-1.7% por año) mientras que las proporciones para las mujeres todavía estuvieron significativamente incrementándose (0.9% por año). Desde 1987, más mujeres han muerto cada año de cáncer de pulmón que cáncer de pecho, que, por arriba de 40 años, fue la causa mayor de muerte por cáncer en mujeres. La disminución de la incidencia del cáncer de pulmón y las proporciones de mortalidad más probablemente resultaron de las proporciones de fumar indebidas sobre los 30 años previos; sin embargo, los patrones de fumar disminuyentes entre las mujeres van detrás de aquello de los hombres. De importancia, aunque las declinaciones en el uso de tabaco de los adultos han disminuido, el uso de tabaco en jóvenes está incrementándose nuevamente. Las opciones de tratamiento para el cáncer de pulmón y bronquial son determinadas mediante el tipo y la etapa del cáncer e incluyen la cirugía, terapia de radiación y quimioterapia. Para muchos cánceres localizados, la cirugía es usualmente el tratamiento de elección. Debido a que la enfermedad usualmente se ha difundido a través del tiempo se descubrió, que la terapia de radiación y la quimioterapia son frecuentemente necesarias en combinación con la cirugía. La quimioterapia solamente o combinada con la radiación es el tratamiento de elección para el cáncer de pulmón de célula pequeña; en este régimen, un porcentaje grande de pacientes experimenta remisión, que en algunos casos es perdurable. Sin embargos, hay una necesidad actual para el procedimiento de tratamiento de diagnóstico efectivos para los cánceres de pulmón y bronquiales. Un estimado de 182,800 nuevos casos invasivos de cáncer de pecho se esperaron que ocurran entre mujeres en los Estados Unidos durante 2000. Adicionalmente, aproximadamente 1, 400 nuevos casos de cáncer de pecho se esperaron que sean diagnosticados en hombres en el 2000. Después del incremento de aproximadamente 4% por año en los años de 1980, las proporciones ' de incidencia del cáncer de pecho en mujeres se han nivelado en los años de 1990 a aproximadamente 110.6 casos por 100,000. En los Estados Unidos solamente, hubo un estimado de 41,200 muertes (40,800 mujeres, 400 hombres) en el 2000 debido al cáncer de pecho. El cáncer de pecho se clasifica segundo entres las muertes por cáncer en mujeres. De acuerdo con los datos más recientes, las proporciones de mortalidad declinaron significativamente durante 1992-1996 con las disminuciones más grandes en mujeres más jóvenes, tanto blancas como negras. Estas disminuciones fueron probablemente el resultado de la detección temprana y el tratamiento mejorado. Tomando en cuenta las circunstancias médicas y las preferencias del paciente, el tratamiento del cáncer de pecho puede implicar la lumpectomia (remoción local del tumor) y remoción de los ganglios linfáticos bajo el brazo; mastectomía (remoción quirúrgica del pecho) y remoción de los ganglios linfáticos sobre el brazo; la terapia por radiación; la quimioterapia; o la terapia por hormonas. Frecuentemente, dos o más métodos son utilizados en combinación. Numerosos estudios han mostrado que, para la enfermedad en etapa temprana, las proporciones de supervivencia a largo plazo después de la lumpectomia más la radioterapia son similares a las proporciones de supervivencia después de la mastectomia radical modificada. Los avances significantes en las técnicas de reconstrucción proporcionan varias opciones para la reconstrucción del pecho después de la mastectomia. Recientemente, tal reconstrucción se ha hecho al mismo tiempo como la mastectomia. La escisión local del carcinoma ductal In sítu (DCIS) con cantidades adecuadas de tejido de pecho normal circundante puede prevenir la recurrencia local del DCIS. La radiación al pecho y/o tamoxifen puede reducir la oportunidad de DCIS que ocurre en el tejido de pecho restante. Esto importante debido a que el DCIS, si se deja sin tratar, puede desarrollarse en cáncer de pecho invasivo. No obstante, existen serios efectos secundarios o secuelas a estos tratamientos. Por lo tanto, hay una necesidad por tratamientos eficaces del cáncer de pecho. Hubo un estimado de 23,100 nuevos casos de cáncer ovárico en los Estados Unidos en el 2000. Esto tiene en cuenta 4% de todos los cánceres dentro de las mujeres y se clasifica segundo entre los cánceres ginecológicos. Durante 1992-1996, las proporciones de incidencia del cáncer ovárico estuvieron significativamente disminuyendo. Consecuente al cáncer ovárico, hubo un estimado de 14,000 muertes en el 2000. El cáncer ovárico causa más muertes que cualquier otro cáncer del sistema reproductor femenino. La cirugía, la terapia de radiación y la quimioterapia son opciones de tratamiento para el cáncer ovárico. La cirugía usualmente incluye la remoción de uno o ambos ovarios, las trompas de Falopio, (salpingo-ooforectomía) y el útero (histerectomía) . En algunos tumores tempranos, solamente el ovario involucrado será removido, especialmente en mujeres jóvenes quienes desean tener niños. En la enfermedad avanzada, es un intento para remover toda la enfermedad intra-abdominal para incrementar el efecto de la quimioterapia. Continua existiendo una necesidad importante para opciones de tratamiento efectivo para el cáncer ovárico. Hubo un estimado de 28,300 nuevos casos de cáncer pancreático en los Estados Unidos en el 2000. Durante los pasados 20 años, las proporciones de cáncer pancreático han declinada en los hombres. Las proporciones entre las mujeres han permanecido aproximadamente constantes pero pueden estar comenzando a declinar. El cáncer pancreático causó un estimado 28,200 muertes en el 2000 en los Estados Unidos. Durante los pasados 20 años, hubo una disminución ligera pero significante en las proporciones de mortalidad entre los hombres (aproximadamente -0.9% por año) mientras que las proporciones se han incrementado ligeramente entre las mujeres . La cirugía, la terapia · de radiación y -la quimioterapia son opciones de tratamiento para el cáncer pancreático. Estas opciones de tratamiento pueden extender la supervivencia y/o aliviar los síntomas en muchos pacientes pero no son probables que produzcan una cura para la mayoría. Hay una necesidad significante para opciones adicionales terapéuticas y de diagnóstico para el cáncer pancreático. Descripción de la Invención La presente invención se relaciona a un gen, designado PSCA, que ahora se ha encontrado que es sobreexpresado en el (los) cáncer (es) listado (s) en la Tabla I. El análisis de expresión de manchado de Northern de la expresión del gen PSCA en tejidos normales muestra un patrón de expresión restringido en tejidos adultos. Se proporcionan las secuencias de nucleótidos (Figura 2) y aminoácidos (Figura 2 y Figura 3) del PSCA. El perfil relacionado con el tejido del PSCA .en los tejidos adultos normales, combinado con la sobreexpresion observada en los tejidos listados en la Tabla I, muestra que el PSCA es aberrantemente sobreexpresado en por lo menos algunos cánceres, y de esta manera sirve como un objetivo útil de diagnóstico, profiláctico, de pronóstico y/o terapéutico para cánceres del (los) te ido(s) tales como aquellos listados en la Tabla I. La invención proporciona polinucleótidos correspondientes o complementarios a todos o parte de los genes PSCA, inRNAs y/o secuencias de codificación, de preferencia en forma aislada, incluyendo polinucleótidos que codifican las proteínas relacionadas con PSCA y fragmentos de 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 o más~ de 25 aminoácidos contiguos; por lo menos 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 80, 85, 90, 95, 100 o más de 100 aminoácidos contiguos de una proteína relacionada con PSCA, así como los péptidos/proteínas por sí mismos; DNA, RNA, híbridos de DNA/RNA, y moléculas relacionadas, polinucleótidos u oligonucleótidos complementarios o que tienen por lo menos 90% de homología a los genes PSCA o secuencias de mRNA o partes de los mismos, y polinucleótidos u oligonucleótidos que hibridan a los genes PSCA, mRNAs, o a polinucleótidos que codifican PSCA. También se proporcionan medios para aislar cDNAs y los genes que codifican PSCA. También se proporcionan moléculas de DNA recombinantes que contienen polinucleótidos PSCA, células transformadas o transducidas con tales moléculas y sistemas de vector hospedero para la expresión de los productos del gen PSCA. La invención además proporciona anticuerpos que enlazan a las proteínas PSCA y fragmentos de polipéptido de las mismas, incluyendo anticuerpos policlonales y monoclonales, de murino y otros anticuerpos mamíferos, anticuerpos quiméricos, anticuerpos humanizados y completamente humanos, y anticuerpos marcados con un marcador detectable o agente terapéutico. En ciertas modalidades, hay una condición de que la secuencia de ácido nucleico completa de la Figura 2 no es codificada y/o la 'secuencia de aminoácidos completa de la Figura 2 no es preparada. En ciertas modalidades, la secuencia de ácido nucleico completa de la Figura 2 es codificada y/o la secuencia de aminoácidos completa de la Figura 2 no es preparada, cualquiera de las cuales están en formas de dosis unitarias humanas respectivas. La invención además proporciona métodos para detectar la presencia y el estado de los polinucleótidos PSCA y proteínas en varias muestras biológicas, así como métodos para identificar células que expresan PSCA. Una modalidad típica de la invención proporciona métodos para monitorear los productos del gen PSCA en un tejido o muestra de hematología que tiene o que se sospecha de tener alguna forma de desregulación de crecimiento tal como cáncer. La invención además proporciona varias composiciones inmunogénicas o terapéuticas y estrategias para el tratamiento de cánceres que expresan PSCA tales como los cánceres de tejido listados en la Tabla I, incluyendo terapias dirigidas en inhibir la transcripción, traducción, procesamiento o función del PSCA, asi como vacunas de cáncer. En un aspecto, la invención proporciona composiciones, y métodos que las comprenden, para tratar un cáncer que expresa PSCA en un sujeto humano, en donde la composición comprende un portador adecuado para el uso humano y una dosis unitaria humana de uno o más de un agente que inhibe la producción o función de PSCA. De preferencia, el portador es un portador únicamente humano. En otro aspecto de la invención, el agente es una porción que es inmunorreactiva con la proteina PSCA. Ejemplos no limitativos de tales porciones incluyen, pero no están limitados a, anticuerpos (tales como anticuerpos de una sola cadena, monoclonales, policlonales, humanizados, quiméricos o de humanos) , funciones equivalentes de los mismos (ya sea que ocurren de manera -natural o sintéticos) y combinaciones de los mismos. Los anticuerpos pueden ser conjugados con una porción de diagnóstico o terapéutica. En otro aspecto, el agente es una molécula pequeña como se define en la presente. En otro aspecto, el agente comprende uno o más de un péptido que comprende un epitope de linfocito T citotóxico (CTL) que enlaza una molécula de HLA de clase I en un humano, para inducir una respuesta CTL al PSCA y/o uno o más de un péptido que comprende un epitope de linfocito T ayudante (HTL) que enlaza una molécula de HLA clase II en un humano para inducir una respuesta HTL. Los péptidos de la invención pueden estar sobre las mismas o en una o más moléculas de polipéptidos separadas. En un aspecto adicional de la invención, el agente comprende uno o más de una molécula de ácido nucleico que expresa uno o más de uno de los péptidos de estimulación de respuesta de CTL o HTL como es descrito en lo anterior. Todavía otro aspecto de la invención, la una o más de una molécula de ácido nucleico puede expresar una porción que es inmunológicamente reactiva con PSCA como se describe en lo anterior. La una o más de una molécula de ácido nucleico también puede ser, o codifica, una molécula que inhibe la producción de PSCA. Ejemplos no limitativos de tales moléculas incluyen, pero no están limitados a, aquellos complementarios con una secuencia de nucleótidos esencial para producción de PSCA (por ejemplo secuencias antisentido o moléculas que forman una hélice triple con una doble hélice de nucleótidos esencial para la producción de PCSA) o una ribozima efectiva para lisar el mRNA del PCSA. Observar que para determinar la posición de inicio de cualquier péptido expuesto en las Tablas VIII-XXI y XXIi a XLIX (colectivamente Tablas de Péptido HLA) respectiva a su proteína parental, por ejemplo, variante 1, variante 2, etc., la referencia se hace a tres factores: la variante particular, la longitud del péptido en una Tabla de Péptidos HLA, y los Péptidos de Búsqueda en la Tabla VII. Generalmente, un Péptido de Búsqueda único se utiliza para obtener péptidos HLA de una variante particular para una variante particular. La posición de cada Péptido de Búsqueda con relación a su molécula de origen respectiva se lista en la Tabla VII. Por consiguiente, si un Péptido de Búsqueda comienza en la posición "X", uno debe adicionar el valor ??-1" a cada posición en las Tablas VIII-XXI y XXII a XLIX para obtener la posición actual de los péptidos HLA en su molécula parental. Por ejemplo, si un Péptido de Búsqueda particular comienza en la posición 150 de su molécula parental, uno debe adicionar 150-1, es decir, 149 a cada posición de aminoácidos del péptido HLA para calcular la posición de ese aminoácido en la molécula de origen. Una modalidad de la invención comprende un péptido HLA, que ocurre por lo menos dos veces en las Tablas VIII-XXI y XXII a XLIX colectivamente, o un oligonucleótido que codifica el péptido HLA. Otra modalidad de la invención comprende un péptido HLA que ocurre por lo menos una vez en las Tablas VIII-XXI y por lo menos una vez en las tablas XXII a XLIX, o un oligonucleótido que codifica el péptido HLA. · Otra modalidad de la invención es epitopes de anticuerpo, que "comprende una región de péptido, o un oligonucleótido que codifica la región de péptido, que tiene uno, dos, tres, cuatro o cinco de las siguientes características : i) una región de péptido de por lo menos 5 aminoácidos de un péptido particular de la Figura 3, en cualquier incremento de número entero hasta la longitud completa de esa proteina en la Figura 3, que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor igual a o mayor que 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9 o que tiene un valor igual a 1.0, en el perfil de Hidrofilicidad de la Figura 5; ii) una región de péptido de por lo menos 5 aminoácidos de un péptido particular de la Figura 3, en cualquier incremento de número entero hasta la longitud completa de esa proteína en la Figura 3, que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor igual a o menor que 0.5, 0.4, 0.3, 0.2, 0.1, o que tiene un valor igual a 0.0, en el perfil de Hidropaticidad de la Figura 6; iii) una región de péptido de por lo menos 5 aminoácidos de un péptido particular de la Figura 3, en cualquier incremento de número entero hasta la longitud completa de esa proteína en la Figura 3, que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor igual a o mayor que 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9 o que tiene un valor igual a 1.0, en el perfil del Por ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; iv) una región de péptido de por lo menos 5 aminoácidos de un péptido particular de la Figura 3, en cualquier incremento de número entero hasta la longitud completa de esa proteina en la Figura 3, que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor igual a o mayor que 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9 o que tiene un valor igual a 1.0, en el perfil de Flexibilidad de Promedio de la Figura 8; o v) una región de péptido de por lo menos 5 aminoácidos de un péptido particular de la Figura 3, en cualquier incremento de número entero hasta la longitud completa de esa proteina en la Figura 3, que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor igual a o mayor que 0.5, 0.6, 0.7, 0. 8, 0.9 o que tiene un valor igual a 1.0, en el perfil de Beta-turn de la Figura 9. Breve Descripción de los Dibujos Figura 1. Intencionalmente Omitida. Figura 2. A) El cDNA y la secuencia de aminoácidos del PSCA variante 1 (también llamado "PSCA v.l" o "PSCA variante 1") se muestra en la Figura 2A. La metionina de inicio está subrayada. La estructura de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 18-389 incluyendo el codón de detención. B) El cDNA y la secuencia de aminoácidos del PSCA variante 2 (también llamado "PSCA v.2") se muestra en la Figura 2B. El codón para la metionina de inicio está subrayado. La estructura de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 56-427 incluyendo el codón de detención. C) El cDNA y la secuencia de aminoácidos del PSCA variante 3 (también llamado "PSCA v.3") se muestra en la Figura 2C. El codón para la metionina de inicio está subrayado. La estructura de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 423-707 incluyendo el codón de detención. D) El cDNA y la secuencia de aminoácidos del PSCA variante 4 (también llamado "PSCA v.4") se muestra en la Figura 2D. El codón para la metionina de inicio está subrayado. La estructura de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 424-993 incluyendo el codón de detención. E) El cDNA y la secuencia de aminoácidos del PSCA variante 5 (también llamado "PSCA v.5") se muestra en la Figura 2E. El codón para la metionina de inicio está subrayado. La estructura de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 910-1479 incluyendo .el codón de detención. F) El cDNA y la secuencia de aminoácidos del PSCA variante 6 (también llamado "PSCA v.6") se muestra en la Figura 2F. El codón para la metionina de inicio está subrayado. La estructura de lectura abierta se extiende desde el ácido nucleico 83-427 incluyendo el codón de detención. G) variantes de SNP de PSCA v.2, PSCA v.7 hasta v.18. Las proteínas PSCA ·?.7 hasta v.18 tienen 123 aminoácidos. Las variantes PSCA v.7 hasta v.18 son variantes con diferencia de un nucleótido individual del PSCA v.2, y codifica para la misma proteina como v.2. Aunque estas variantes de SNP se muestran por separado, ellas también pueden ocurrir en cualquiera de las combinaciones y en cualquiera de las variantes de transcripción listadas anteriormente en las Figuras 2A hasta 2F. H) Variantes SNP de PSCA v.4, PSCA v.19 hasta v.30. Las proteínas PSCA v.19 hasta v.30 tienen 189 aminoácidos. Las variantes PSCA v.19 hasta v.30 son variantes con diferencia de nucleótido individual de las proteínas PSCA v.4. PSCA v.9, v.10, v.ll, v.24 y v.25 difieren de la PSCA v.l por un aminoácido. PSCA v.23, v.28, v.29 y v.30 codifican para la misma proteína como v.4. Aunque estas variantes SNP se muestran por separado, ellas pueden ocurrir en cualquiera de las combinaciones y cualquiera de las variantes de transcripción v.3 y v.4. Figura 3. A) La secuencia de aminoácidos de PSCA v.l se muestra en la _ Figura 3A; esta tiene 123 aminoácidos. B) La secuencia de aminoácidos de PSCA v.3 se muestra en la Figura 3B; esta tiene 94 aminoácidos. C) La secuencia de aminoácidos de PSCA v.4 se muestra en la Figura 3C; esta tiene 189 aminoácidos. D) La secuencia de aminoácidos de PSCA v.6 se muestra en la Figura 3D; esta tiene 114 aminoácidos. E) La secuencia de aminoácidos de PSCA v.19 se muestra en la Figura 3E; esta tiene 189 aminoácidos. F) La secuencia de aminoácidos de PSCA v.20 se muestra en la Figura 3F; esta tiene 189 aminoácidos. G) La secuencia, de aminoácidos de PSCA v.21 se muestra en la Figura 3G; esta tiene 189 aminoácidos. H) La secuencia de aminoácidos de PSCA v.22 se muestra en la Figura 3H; esta tiene 189 aminoácidos. I) La secuencia de aminoácidos de PSCA v.24 se muestra en la Figura 31; esta tiene 189 aminoácidos. J) La secuencia de aminoácidos de PSCA v.25 se muestra en la Figura 3J; esta tiene 189 aminoácidos. ) La secuencia de aminoácidos de PSCA v.26 se muestra en la Figura 3k; esta tiene 189 aminoácidos. L) La secuencia de aminoá-cidos de PSCA v.27 se muestra en la Figura 3L; esta tiene 189 aminoácidos. Como se utiliza en la presente, una referencia PSCA incluye todas las variantes del mismo, incluyendo aquellas mostradas en las Figuras 2, 3, 10, 11 y 12 a menos el contexto claramente lo indique de otra manera. Figura 4. Alineación de PSCA v. con el Antigeno de Célula Madre de Próstata humano (gi 27482160) . Figura 5. Figuras 5 (a) -(c): Perfil de aminoácido de hidrofilicidad de PSCA v.l, v.3, y v.4 determinado por el análisis de secuencia de algoritmo por computadora usando el método de Hopp y Woods (Hopp T. P., Woods K.R., 1981. Proc.
Nati. Acad. Sci. E.U.A 78:3824-3828) accesado en el sitio de la red Protscale localizado en la Red Mundial en (expasy . ch/cgi-bin/protscale . l) a través del servidor de biología molecular ExPasy. Figura 6. Figuras 6 (a) - (c) : . Perfil de aminoácido de hidropaticidad de PSCA v.l, v.3 y v.4 determinado por el análisis de secuencia de algoritmo por computadora usando el método de Kyte y Doolittle (Kyte J. , Doclittle R.F., 1982. J. Mol. Biol. 157:105-132) accesado al sitio de la red ProtScale localizado en la Red Mundial en (. expasy. ch/cgi-bin/protscale . pl) a través del servidor de biología molecular ExPasy. Figura 7. Figuras 7 (a) -(c): Perfil de aminoácido del por ciento de residuos accesibles de PSCA v.l, v.3 y v.4 determinado por el análisis de secuencia de algoritmo por computadora usando el método de Janin (Janin J., 1979 Nature 277:491-492) accesado al sitio de la red ProtScale localizado en la Red Mundial Wide en (. expasy. ch/cgi-bin/protscale. l) a través del servidor de biología molecular ExPasy. Figura 8. Figuras 8 (a) -(c): Perfil de aminoácido de flexibilidad promedio de PSCA v.l, v.3 y v.4 determinado por el análisis de secuencia de algoritmo por computadora usando el método de Bhaskaran y Ponnus amy (Bhaskaran R., y Ponnuswamy P. K. , 1988. Int. J. Pept . Protein Res. 32: 242-255) accesado al sitio de la red ProtScale localizado en la Red Mundial en (. expasy. ch/cgi-bin/protscale .pl) a través del servidor de biología molecular ExPasy. Figura 9. Figuras 9(a)-(c): Perfil de aminoácido Beta-turn de PSCA v.l, v.3 y v.4 determinado por el análisis de secuencia de algoritmo por computadora usando el método de Deleage y Roux (Deleage, G., Roux B. 1987 Protein Engineering 1:289-294) accesado al sitio de la red ProtScale localizado en la Red Mundial en (. expasy. ch/cgi-bin/protscale. l) a través del servidor de biología molecular ExPasy. Figura 10. Composiciones de exón de las variantes de transcripción de PSCA. La variante de PSCA v.2, v.3, v.4 y v.5 son variantes de transcripción de v.l. La variante v.2 inició la transcripción de 47 bp además del extremo 5' y que v.l. Variante v.3 tiene un exón más corto 2 como es comprado a v.2. Las variantes v.4 y v.5 tuvieron un primer exón alternativo. La variante 5 conservó un segundo intrón como es comparado con v.4. El orden los exones potenciales en el genoma humano se muestra en el fondo. Los extremos Poly A no se mostraron en la figura. Los extremos de los exones se muestran arriba de los cuadros. Los números en "()" debajo de los recuadros corresponden a aquellos de PSCA v.2. La longitud de los intrones y exones no son proporcionales. Figura 11. Figura 11(a): Alineación esquemática de las variantes de proteína de PSCA. Las variantes proteína corresponden a las variantes de nucleótidos. Las variantes de nucleótidos PSCA v.2, v.7 hasta v.18 codificaron la misma proteina como v.l. La variante v.5 codificó la misma proteina como v.4 y la proteina v.3 fue parte de v.4. Las variantes de nucleótido de PSCA v.2, v.3, v.4 y v.5 fueron variantes de transcripción de v.l, como es mostrado en la Figura 10. El SNP en v.2 que no causó el cambio de codón en v.2 causó un cambio de codón en v.3, v.4 y v.5. Las diferencias de aminoácidos individuales se indicaron arriba de los recuadros. Los recuadros negros representan la misma secuencia como PSCA v.l. Los números debajo del recuadro corresponden a PSCA v.l. Figura 11(b): Alineación esquemática de variantes de proteina traducidas de las variantes de SNP de PSCA v.4. Las variantes de proteina corresponden a variantes de nucleótidos. Las variantes de nucleótidos de PSCA v.23, v.28, v.29 y v.30 codificaron la misma proteina como v.4. SNP en v.4 que dio por resultado un cambio de aminoácido en v.4 y también dio por resultado un cambio de aminoácido en v.5 y si está ocurriendo entre aa 96-189, también en v.3. Las diferencias de aminoácidos individuales fueron indicadas arriba de los recuadros. Los cuadros negros representan la misma secuencia como PSCA v.4. Los números debajo del recuadro corresponden a PSCA v.4. Figura 12. La Figura 12 (a) : Alineación esquemática de las variantes de SNP de PSCA v.2. Las variantes PSCA v.6 hasta v.18 son variantes con diferencias de nucleótidos individuales como es comparado con la variante v.2. La variante v.6 cambió la ORF de 56-427 a 83-4,27. Aunque estas variantes de SNP se mostraron por separado, ellas también podrían ocurrir en cualquiera de las combinaciones o en cualquiera de las variantes de transcripción, tal como v.4 mostrada en la Fig. 12, que contuvo dos pares de bases. Los números corresponden aquellos de PSCA v.2. El recuadro negro muestra la misma secuencia como PSCA v.2. Los SNPs son indicados arriba del recuadro. Figura 12 (b) : Alineación esquemática de variantes de SNP de PSCA v.4. Las variantes PSCA v.19 hasta v.30 son variantes con diferencias de nucleótidos individuales como es comparado con la variante v.4 (ORF: 424-993). Aunque estas variantes de SNP se mostraron por separado, ellas también podrían ocurrir en cualquiera de las combinaciones y cualquiera de las variantes de transcripción que contuvieron los pares de bases, tal como v.5 mostrado en la Fig. 10. Los números corresponden a aquellos de PSCA v.4. El recuadro negro muestra la misma secuencia como PSCA v.4. Los SNPs son indiciados arriba del recuadro . Figura 13. Estructura secundaria y predicción de los dominios transmembrana para las variantes de proteína PSCA. Figuras 13A, 13B, 13C y 13D: La estructura secundaria de la proteína PSCA variante 1 (SEQ ID NO: 6532), variante 3 (SEQ ID NO: 6536), variante 4 (SEQ ID NO: 6540) y variante 6 (SEQ ID NO: 6546) (Figuras A-D-, respectivamente) se predijeron usando el método de Red Neural Jerárquico HNN (NPS@: Network Protein Sequence Analysis TIBS 2000 March Vol. 25, No 3 [291] : 147-150 Combet C, 31anc et C., Geourjon C. and Deleage G. , http://pbil.ibcp.fr/cgi-bin/; psa_automat. pl?page=npsa_nn . html) , accesado del servidor de biología molecular ExPasy localizado en la Red Mundial en ( . expasy . ch/tools/) . Este método predice la presencia y ubicación de las alfa hélices, las hebras extendidas y las espirales aleatorias de la secuencia de proteína primaria. El por ciento de cada proteína en una estructura secundaria dada también es listado. Figuras 13E, 13G, 131 y 13K: representación esquemática de la probabilidad de existencia de regiones de transmembrana de PSCA variantes 1, 3, 4 y 6, respectivamente basado en el algoritmo TM de Hofmann and Stoffel que utiliza TMBASE (K. Hofmann, W. Stoffe. TMBASE-A datábase of membrane spanning protein segments Biol . Chem. Hoppe-Seyler 374:166, 1993). Figuras. 13F, 13H, 13J y 13L: Representación esquemática de la probabilidad de la existencia de las regiones de transmembrana de PSCA variante 1, basado en el algoritmo TMHMM de Sonnhammer, von Heijne, y Krogh (Erik L. L. Sonnhammer, Gunnar von Heijne y Anders Krogh: A hidden Markov model for predicting transmembrane hélices in protein sequences. In Proc. of Sixth Int. Conf. on Intelligent Systems for Molecular Biology, páginas 175-182 Ed J. Glasgow, T. Littlejohn, F. Major, R. La.th.rop, D. Sankoff y C. Sensen Menlo Park, CA: ???? Press, 1998) . EL TMpred y los algoritmos MHMM son accesados del servidor de biología molecular ExPasy (http://www.expasy.ch/tools/). Figura 14. Expresión de variantes de PSCA. Figura 14(A): Se diseñaron cebadores para diferenciar entre PSCA v.l/v.2/v.4, PSCA v.3 y PSCA v.5. PSCA v.l/v.21v.4 conducen a un producto de PCR de 425 bp, PSCA v.3 conduce a un producto de PCR de 300 bp, mientras que PSCA v.5 conduce a un producto de PCR de 910 bp en tamaño. Figura 14 (B) : El cDNA de primera hebra se preparó a partir de la vejiga normal, cerebro, corazón, riñon, hígado, pulmón, próstata, bazo, músculo esquelético, teste, páncreas, colon, estómago, acumulaciones de cáncer de próstata, cáncer de vejiga, cáncer de riñon, cáncer de colon, cáncer de pulmón, cáncer de ovario, cáncer de pecho, metástasis de cáncer y cáncer de páncreas. La normalización se realizó mediante PCR usando cebadores para actina. La PCR semi-cuantitativa, usando los cebadores específicos de variantes se realizó en 30 ciclos e amplificación. Los resultados muestran la expresión de PSCA v.5 principalmente en cáncer de pecho, metástasis de cáncer y cáncer de páncreas y a un nivel menor en cáncer de colon y cáncer de pulmón. El producto de PCR de PSCA v.l/v.2/v.4 se detectó en el cáncer de próstata, cáncer de vejiga, cáncer de riñon, cáncer de colon, cáncer de pulmón, cáncer de ovario, cáncer de pecho, metástasis de cáncer y cáncer de páncreas. Entre los tejidos normales, el producto de PCR de PSCA v.l/v.2/v.4 se detectó solamente en la próstata, estómago y en el nivel inferior en el riñon y el pulmón, mientras que PSCA v.5 no se detectó en cualquier tejido normal. El producto detectado de PCR de PSCA v.3 no se detectó en cualquiera de las muestras probadas . Figura 15. Expresión de PSCA v.4' y PSCA v.5. Figura 15(A) : Los cebadores se diseñaron para diferenciar entre PSCA v.4 y PSCA v.5. PSCA v.4 condujo un producto de PCR de 460 bp, mientras que PSCA v.5 conduce a un producto de PCR de 945 bp en tamaño. Figura 15 (B) : El cDNA de primera hebra se preparó a partir de la vejiga normal, cerebro, corazón, riñon, hígado, pulmón, próstata, bazo, músculo esquelético, teste, páncreas, colon, estómago, acumulaciones de cáncer de próstata, cáncer de vejiga y acumulación de multixenoinj erto, (xenoinj ertos de cáncer próstata, cáncer de riñon y cáncer de vejiga) . La normalización se realizó mediante PCR usando cebadores para actina. La PCR semi-cuantitativa PCR, usando los cebadores específicos de variante se realizó en 30 cíelos de amplificación. Los resultados muestran la expresión de PSCA v.4 en cáncer de próstata, cáncer de vejiga y acumulación de multixenoinj erto, riñon normal y próstata. PSCA v.5 se detectó solamente en la próstata normal y el cáncer de vejiga.
Modos Para Llevar a Cabo la Invención Resumen de las Secciones I . ) Definiciones II. ) Polinucleótidos PSCA. II.A.) Usos de polinucleótidos PSCA. IIA.l.) Monitoreo de Anormalidades Genéticas II .A.2. ) Modalidades Antisentido II.A.3.) Cebadores y Pares de Cebadores II.A.4.) Aislamiento de Moléculas de Acido Nucleico que Codifican PSCA II.A.5.) Moléculas de Acido Nucleico Recombinantes y Sistemas de Vector Hospedero III. ) Proteínas relacionadas con PSCA III.A.) Modalidades de Proteínas que Llevan Porción III.B.) Expresión de las Proteínas relacionadas con PSCA III. C.) Modificación de las Proteínas relacionadas con PSCA III.D.) Usos de Proteínas relacionadas con PSCA IV. ) Anticuerpos PSCA V. ) Respuestas Inmunes Celulares PSCA VI . ) Animales Trangénicos PSCA VII. ) Métodos para la Detección de PSCA VIII . )Métodos para Monitorear el Estado de los genes relacionados con PSCA y Sus Productos IX. ) Identificación de Moléculas que Interactúan con PSCA X. ) Método Terapéuticos y Composiciones X.A.) Vacunas Anti-Cáncer X.B.) PSCA como un Objetivo para la Terapia Basada en Anticuerpo X.C.) PSCA como un Objetivo para Respuestas Inmunes Celulares X. C .1. Vacunas de Minigen X. C .2. Combinaciones de Péptidos de CTL con Péptidos Ayudantes X.C.3. Combinaciones de Péptidos de CTL con Agentes de Cebado de Células T X.C.4. Composiciones de Vacuna que Comprenden DC Pulsado con Péptido CTL y/o HTL X.D . ) Inmunoterapia Adoptiva X.E.) Administración de Vacunas para Propósitos Terapéuticos Profilácticos XI . ) Modalidades de Diagnóstico y Pronóstico de PSCA.
XII . ) Inhibición de la Función de la Proteina PSCA XII.A.) Inhibición de PSCA con Anticuerpos Intracelulares XII.B.) Inhibición de PSCA con Proteínas Recombinantes XII. C.) Inhibición de la Transcripción o Traducción de PSCA XII.D.) Consideraciones Generales para Estrategias Terapéuticas XIII . ) Identificación , Caracterización y Uso de Moduladores de PSCA XIV. ) Equipos/Artículos de Manufactura IjJ Definiciones : A menos que se defina de otra manera, todos los términos de la técnica, anotaciones y otros términos científicos o terminología utilizada en la presente se proponen para tener los significados comúnmente entendidos por aquellos expertos en la técnica a la cual esta invención pertenece. En algunos casos, los términos con significados comúnmente entendidos son definidos en la presente por claridad y/o por referencia fácil, y la inclusión de tales definiciones en la presente no deben ser considerados necesariamente que representan una diferencia sustancial sobre lo que es generalmente entendido en la técnica. Muchas de las técnicas y procedimientos descritos o referidos en la presente son bien entendidos y comúnmente empleados usando la metodología convencionales por aquellos expertos en la técnica, tales como, por ejemplo, las metodologías de clonación molecularmente ampliamente utilizadas descritas en Sambrook y colaboradores, Molecular Cloning: A Laboratory Manual 2- edición (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. Como se ha apropiado, los procedimientos que implican el uso de equipos y reactivos comercialmente disponibles generalmente se llevan a cabo de acuerdo con los protocolos definidos por el fabricante y/o parámetros a menos que se mencione de otra manera. Los términos "cáncer de próstata avanzado", "cáncer de próstata localmente avanzado", "enfermedad avanzada" y "enfermedad locamente avanzada" significan cánceres de próstata que se han extendido a través de la cápsula de la próstata, y se proponen que incluye la enfermedad de etapas C bajo el sistema de American Urological Association (AUA) , la enfermedad de etapa C1-C2 bajo el sistema Whitmore-Je ett y la etapa T3-T4 y la enfermedad N+ bajo el sistema de TNM (tumor, nodo, metástasis) . En general, la cirugía no recomendada para pacientes con enfermedad localmente avanzada, y estos pacientes tiene efectos sustancialmente menos favorables comparados con los pacientes que tienen cáncer de próstata clínicamente localizados (confinados al órgano) . La enfermedad locamente avanzada es clínicamente identificada por la evidencia palpable de la induración más allá del límite lateral de la próstata, o la asimetría o induración arriba de la base de la próstata. El cáncer de próstata localmente avanzado es actualmente diagnosticado patológicamente después de la prostatectomia radical si el tumor invade o penetra la cápsula prostética, se extiende en el margen quirúrgico o invade las vesículas seminales. "Alteración del patrón de glicosilación activo" se propone para propósitos en la presente para dar a entender la supresión de uno o más porciones de carbohidrato encontrados en la secuencia nativa de PSCA (ya sea al remover el sitio de glicosilación implícito al suprimir la glicosilación por medios guímicos y/o enzimáticos) , y/o al adicionar uno o más sitios de glicosilación que no están presentes en la secuencia nativa de PSCA. Además, la frase incluye cambios cualitativos en la glicosilación de las proteínas nativas, implicando un cambio en la naturaleza y las proporciones de las diversas porciones de carbohidrato presentes. El término "análogo" se refiere a una molécula que es estructuralmente similar o comparte atributos similares o correspondientes con otra molécula (por ejemplo una proteína relacionada con PSCA). Por ejemplo, un análogo de una proteína PSCA puede ser específicamente enlazado con un anticuerpo o célula T específicamente enlaza a PSCA. El término "anticuerpo" se utiliza en el sentido más amplio. Por lo tanto, un "anticuerpo" puede estar ocurriendo de manera natural o hecho por hombre tales como anticuerpos monoclonales producidos por la tecnología de hibridoma convencional. Los anticuerpos anti-PSCA comprende anticuerpos monoclonales y policlonales asi como fragmentos que contienen el dominio de enlace de antigeno y/o una o más regiones de determinación de complementariedad de estos anticuerpos . Un "fragmento de anticuerpo" se define como por lo menos una porción de la región variable de la molécula de inmunoglobulina que enlaza a su objetivo, es decir, la región de enlace de antigeno. En una modalidad, esta específicamente cubre los anticuerpos anti-PSCA individuales y clones de los mismos (incluyendo anticuerpos agonistas, antagonistas y neutralizantes) y composiciones de anticuerpo anti-PSCA con especificidad poliepitópica . El término "secuencias optimizadas de codón" se refiere a secuencias de nucleótidos que se han optimizado para una especie hospedera particular al reemplazar cualquiera de los condones que tiene una frecuencia de utilización de menos de aproximadamente 20%. Las secuencias de nucleótidos que se han optimizados para la expresión de una especie hospedera dada mediante la eliminación de las secuencias de poliadenilación espurias, eliminaciones de señales de empalme de exón/intrón, eliminación de repeticiones similares a transposon y/o optimización del contenido de GC además de la optimización de codón son referidas en la presente como "secuencias incrementadas de expresión" .
Una "librería combinatoria" es una recolección de diversos compuestos químicos generados ya sea por síntesis química o síntesis biológica al combinar un número de "bloques de construcción" químicos, tales como reactivos. Por e emplo, una librería química combinatoria lineal, tal como una librería de polipéptido (por ejemplo, muteina) , se forma al combinar un conjunto de bloques de construcción químicos llamados aminoácidos en cada manera posible para una longitud de compuesto dada (es decir el número de aminoácidos en un compuesto de polipéptido. Numerosos compuestos químicos son sintetizados a través del mezclado combinatorio de bloques de construcción químicos (Gallop y colaboradores, J. Med. Chem. 37 (9) .1233-1251 (1994) ) . La preparación y la clasificación de librerías combinatorias, es bien conocidos para aquellos expertos en la técnica. Tales librerías químicas combinatorias incluyen, pero no están limitadas a, librerías de péptidos, (ver, por ejemplo, la patente norteamericana No. 5,010,175, Furka, Pept. Prot. Res. 37:487-493 (1991), Houghton y colaboradores, Nature, 354:84-88 (1991)), peptoides (Publicación de PCT No. WO 91/19735) , péptidos codificados (Publicación de PCT WO 93/20242) , bio-oligómeros aleatorios (Publicación de PCT WO 92/00091) , benzodiazepinas (patente norteamericana No. 5,288,514), diversómeros tales como hidantoinas, benzodiazepinas y dipéptidos (Hobbs y colaboradores, Proc.
Nat. Acad. Sci. EUA 90:6909-6913 (1993)), polipéptidos vinílogos (Hagihara y colaboradores, J. Amer. Chem. Soc. 114:6568 (1992)), peptidomiméticos no peptidales con una estructura de Beta-D-Glucosa (Hirschmann y colaboradores, J. Amer. Chem. Soc. 114:9217-9218 (1992)), síntesis orgánicas análogas de librerías de compuestos pequeños (Chen y colaboradores, J. Amer. Chem. Soc. 116:2661 (1994)), oligocarbamatos (Cho, y colaboradores, Science 261:1303 (1993-) ) y/o fosfonatos de peptidilo (Campbell y colaboradores, J. Org. Chem. 59:658 (1994)) . Ver, generalmente, Gordon y colaboradores, J. ed. Chem. 37:1385 (1994), librerías de ácido nucleico (ver, por ejemplo, Stratagene, Corp.), librerías de ácido nucleico de péptido (ver, por ejemplo, la patente norteamericana No. 5,539,083), librerías de anticuerpos (ver, por ejemplo, Vaughn y colaboradores, Nature Biotechnology .14 ( 3 ) : 309-314 (1996) y PCT/US96/10287 ) , librerías de carbohidratos (ver, por ejemplo, Liang y colaboradores, Science 274:1520-1522 (1996), y la patente norteamericana No. 5,593,853), y librerías de moléculas orgánicas pequeñas (ver, por ejemplo, benzodiazepinas , Baum, C&EN, 18 de enero, página 33 (1993) ; isoprenoides, patente norteamericana No. 5,569,588; tiazolidinonas y metatiazanonas, patente norteamericana No. 5,549,974; pirrolidinas, patentes norteamericanas Nos. 5,525,735 y 5,519,134; compuestos morfolino, patente norteamericana No. 5,506,337; benzodiazepinas, patente norteamericana No. 5,288,514; y los similares). Los dispositivos para preparación de librerías combinatorias con comercialmente disponibles (ver, por ejemplo, 357 NIPS, 390 NIPS, Advanced Chem Tech, Louisville KY; Symphony, Rainin, Woburn, MA; 433A, Applied Biosystems, Foster City, CA; 9050, Plus, Millipore, Bedford, NIA) . Un número .de sistemas robóticos bien conocidos se ha desarrollado para las químicas en fase de solución. Estos sistemas incluyen estaciones de trabajo automatizadas tal como el aparato de síntesis automatizado desarrollado por Takeda Chemical Industries, LTD. (Osaka, Japón) y muchos sistemas robóticos que utilizan brazos robóticos (Zymate H, Zymark Corporation, Hopkinton, Mass.; Orea, Hewlett-Packard, Palo Alto, California) , que imitan las operaciones sintéticas manuales realizadas por un químico. Cualquiera de los dispositivos anteriores, son adecuados para el uso con la presente invención. La naturaleza y la implementación de modificaciones a estos dispositivos (si los hay) de modo que pueden operar como es discutido en la presente serán evidentes para aquellas personas expertas en el técnica relevante. Además, las librerías combinatorias numerosas son por sí mismas comercialmente disponibles (ver, por ejemplo, ComGenex, Princeton, NJ; Asinex, Moscow, RU; Tripos, Inc., St . Louís, MO; ChemStar, Ltd, Moscow, RU; 3D Pharmaceuticals, Exton, PA; Martek Biosciences, Columbia, MD; etc.). El término "agente citotóxico" se refiere a una sustancia que inhibe o previene la expresión de la actividad de las células, función de las células y/o causa destrucción de las células. El término se propone para incluir agentes quimioterapéuticos de isótopos radiactivos, y toxinas tales como toxinas de molécula pequeña o toxinas enzimáticamente activas de origen bacteriano, fungal, de planta o animales, incluyendo fragmentos y/o variantes de las mismas. Ejemplos de agentes citotóxicos incluyen, pero no están limitados a auristatinas, auromicinas, maitansinoides , itrio, bismuto, ricina, cadena A de ricina, combrestatin, duocarmicinas, dolostatinas, doxorubicina, daunorubicina, taxol, cisplatina, ccl065, bromuro de etidio, mitomicina etoposido, tenoposido, vincristina, vinblastina, colquicina, dihidroxi antracin diona, actinomicina, toxina de difteria, exotoxina de Pseudomonas (PE) A, PE40, abrin, abrin A, cadena A de abrin, cadena A de modeccin, alfa-sarcina, gelonina, mitogelin, retstrictocina, fenomicina, enomicina, curicina, crotina, caliqueamicina, inhibidor de Sapaonaría offcinalis y glucocorticoides y otros agentes quimioterapéuticos, asi como radioisótopos tales como At211, l131, I125, Y90, Re186, Re188 Sm153, Bi212 ° 213, P32 e isótopos radioactivos de Lu incluyendo Lu177. Los anticuerpos también pueden ser conjugados a una enzima de activación de profármaco anti-cáncer capaz de convertir el profármaco a su forma activa. El "producto de gen" es algunas veces referido en la presente como una proteina o mRNA. Por ejemplo, un "producto de gen de la invención" es algunas veces referido en la presente como una "secuencia de aminoácidos de cáncer", "proteina de cáncer", "proteina de un cáncer listado en la Tabla I", un "mRNA de cáncer ", "mRNA de un cáncer listado en la Tabla I", etc. En una modalidad, la proteina de cáncer es codificada por un ácido nucleico de la Figura 2. La proteina de cáncér puede ser un fragmento, o alternativamente puede ser la proteina de longitud completa al fragmento codificado por los ácidos nucleicos de la Figura 2. En una modalidad, una secuencia de aminoácidos de cáncer se usa para determinar la identidad o similitud de secuencia. En otra modalidad, las secuencias son variantes alélicas que ocurren de manera natural de una proteina codificada por un ácido nucleico de la Figura 2. En otra modalidad, las secuencias son variantes de secuencias como es descrito en la presente. Ensayos de "clasificación de alto rendimiento" para la presencia o ausencia, cuantificación u otras propiedades de productos de ácidos nucleicos o de proteínas particulares son bien conocidos para aquellos expertos en la técnica. De manera similar, los ensayos de enlace y los ensayos de gen reportador son similarmente bien conocidos. Así, por ejemplo, la patente norteamericana No. 5,559,410 divulga métodos de clasificación de alto rendimiento para proteínas; la patente norteamericana No. 5,585,639 divulga métodos de clasificación de alto rendimiento para el enlace de ácido nucleico (es decir, en arreglos) ; mientras que las patentes norteamericanas Nos. 5,576,220 y 5,541,061 divulgan métodos de clasificación de alto rendimiento para el enlace de ligando/anticuerpo . Además, los sistemas de clasificación de alto rendimiento son comercialmente disponibles (ver, por ejemplo, ersham Biosciences, Piscataway, NJ; Zymark Corp., Hopkinton, MA; Air Technical Industries, Mentor, OH; Beckman Instruments, Inc. Fullerton, CA; Precisión Systems, Inc., Natick, MA; etc.). Estos sistemas típicamente automatizan los procedimientos completos, incluyendo todo el pipeteo de la muestra y el reactivo, suministro de líquido, incubaciones sincronizadas y lecturas finales de la placa en el (los) detector (es) apropiado (s) para el ensayo. Estos sistemas configurables proporcionan alto rendimiento y arranque rápido así como un alto grado de flexibilidad y adaptación. Los fabricantes de tales sistemas proporcionan protocolos detallados para varios sistemas de alto rendimiento. Así, por ejemplo, Zymark Corp. proporciona boletines técnicos que describen sistemas de clasificación para detectar la modulación de la transcripción del gen, enlace de ligando y los similares.
El término "homólogo" se refiere a una molécula que exhibe homología a otra molécula, por ejemplo, al tener secuencias de residuos químicos que son las mismas o similares en posiciones correspondientes. "Antígeno de Leucocito humano" o "HLA" es una proteína de Complejo Histocompatibilidad Mayor de clase I o clase II Humana (MHC) (ver, por ejemplo, Stites y colaboradores, IMMÜLOGY, 8a ED., Lange Publishing, Los Altos, CA (1994) . Los términos "hibridar", "que híbrida", "híbrida" y los similares, usado en el contexto de polinucleótidos, se propone para referirse a condiciones de hibridación convencionales, de preferencia tal como la hibridación en formamida al 50%/6XSSC/SDS al 0.1%/100 µg/ l ssDNA, en el cual las temperaturas para la hibridación están arriba de 37 grados centígrados y las temperaturas para el lavado en O.IXSSC/SDS al 0.1% están arriba de 55 grados centígrados. Las frases "aislado" o "biológicamente puro" se refiere al material que está sustancialmente o esencialmente libre de componentes que normalmente acompañan el material como es encontrado en su estado nativo. Así, los péptidos aislados de acuerdo con la invención de preferencia no contienen materiales normalmente asociados con los péptidos en su ambiente in situ. Por ejemplo, un polinucleótido se dice que es "aislado" cuando se separa subsecuentemente de los polinucleótidos contaminantes que corresponden o son complementarios a los genes diferentes a los genes de PSCA o que codifican polipéptidos diferentes al producto del gen PSCA o fragmento del mismo. Una persona experta puede fácilmente emplear los procedimientos de aislamiento de ácido nucleico para obtener un polinucleótidos PSCA aislado. Una proteina se dice que es "aislada" por ejemplo, cuando se emplean métodos físicos, mecánicos o químicos para remover las proteínas PSCA de los constituyentes celulares que están normalmente asociados con la proteína. Una persona experta puede fácilmente emplear métodos de purificación estándares para obtener una proteína PSCA aislada. Alternativamente, una proteína aislada se puede preparar por medios químicos. El término "mamífero" se refiere a cualquier organismo clasificado como un mamífero, incluyendo ratones, ratas, conejos, perros, gatos, vacas, caballos y humanos. En una modalidad de la invención el mamífero es un ratón. En otra modalidad de la invención, el mamífero es un humano. Los términos "cáncer de próstata metastáticos" y "enfermedad metastática" significan cánceres de próstata que se han difundido a los ganglios linfático regionales y a sitios distantes, y se proponen para incluir la enfermedad de la etapa D bajo el sistema AUA y la etapa TxNx + bajo el sistema TNM. Como en el caso con el cáncer de próstata localmente avanzado, la cirugía generalmente no es indicada para pacientes con enfermedad metastática y la terapia hormonal (ablación de andrógeno) es una modalidad de tratamiento preferida. Los pacientes con cáncer de próstata metastático, eventualmente desarrollan un estado refractario de andrógeno dentro de 12 a 18 meses de la iniciación del tratamiento. Aproximadamente la mitad de estos pacientes refractarios de andrógeno mueren dentro de 6 meses después del desarrollo de ese estado. El sitio más común para la metástasis de cáncer de próstata es el hueso. Las metástasis de hueso de cáncer de próstata son frecuentemente osteoblásticas antes que osteolíticas (es decir, dan por resultado la formación de hueso reticular) . Las metástasis de hueso se encuentran más frecuentemente en la espina dorsal, seguido por el fémur, pelvis, caja torácica, cráneo y húmero. Otros sitios comunes para la metástasis incluyen los ganglios linfáticos, pulmón, hígado y cerebro. El cáncer de próstata metastático es típicamente diagnosticado por la linfadenectomía pélvica abierta o laparoscópica, exploraciones de radionúclidos del cuerpo completo, radiografía esquelética y/o biopsia de lesión del hueso. El término "modulador" o "compuesto de prueba" o "candidato de fármaco" o equivalentes gramáticos como se utiliza en la presente describen cualquiera molécula, por ejemplo, proteína, oligopéptido, molécula orgánica pequeña, polisacárido, polinucleótído, etc., que es probado para la capacidad de alterar directamente o indirectamente el fenotipo de cáncer o la expresión de una secuencia de cáncer, por ejemplo, una secuencia de ácido nucleico de proteina, o los efectos de las secuencias del. cáncer (por ejemplo, señalización, expresión del gen, interacción de proteina, etc. ) . En aspecto, un modulador neutralizará el efecto de una proteina de cáncer de la invención. Por "neutralizar" se propone que una actividad de una proteina es inhibida o bloqueada, junto con el efecto consecuente sobre la célula. En otro aspecto, un modulador neutralizará el efecto de un gen y su proteina correspondiente, de la invención al normalizar los niveles de la proteina. . En modalidades preferidas, los modulares alteran los perfiles de expresión, o los ácidos nucleicos o proteínas de perfil de expresión proporcionadas en la presente, o las rutas del efector corriente abajo. En una modalidad, el modular suprime un fenotipo de cáncer, por ejemplo, a una impresión de tejido normal. En otra modalidad, un modulador indujo un fenotipo de cáncer. Generalmente, una pluralidad de mezclas de ensayo es corrida en paralelo con diferentes concentraciones de agente para obtener una respuesta diferencial a las diversas concentraciones. Típicamente, una de estas concentraciones sirve como un control negativo, es decir, en concentración cero o por debajo del nivel de la detección. Los moduladores, candidatos de fármaco o compuesto de prueba comprenden numerosas clases químicas, aunque ellos típicamente son moléculas orgánicas, de preferencia compuestos orgánicos pequeños que tienen un peso molecular de más de 100 y menos de aproximadamente 2,500 Daltons . Las moléculas pequeñas preferidas son menos de 2000, o menos de 1500 o menos de 1000 o menos de 500 D. Los agentes candidatos comprenden grupos funcionales necesarios para la interacción estructural con las proteínas, particularmente el enlace de hidrógeno, y típicamente incluye por lo menos un grupo amina, carbonilo, hidroxilo o carboxilo, de preferencia por lo menos dos de los grupos químicos funcionales. Los agentes candidatos frecuentemente comprenden estructuras de carbono cíclicas o heterocíclicas y/o estructuras aromáticas o poliaromáticas sustituidas con uno más de los grupos funcionales anteriores. Los moduladores también comprenden biomoléculas tales como péptidos, sacáridos, ácidos grasos, esferoides, purinas, pirimidinas derivados, análogos estructurales o combinaciones de los mismos. Particularmente se prefieren los péptidos. Una clase de moduladores son los péptidos, por ejemplo de aproximadamente cinco a aproximadamente 35 aminoácidos, con de aproximadamente cinco a aproximadamente 20 aminoácidos que es preferido, y de aproximadamente 7 a aproximadamente 15 que es particularmente preferido. De preferencia, la proteína moduladora del cáncer es soluble, e incluye región no de transmembrana y/o tiene un Cys N-terminal para ayudar en la solubilidad. En una modalidad, el C-terminal del fragmento se conserva como un ácido libre y el N-terminal es una amina libre para ayudar en el acoplamiento, es decir, la cisteina. En una modalidad, una proteína de cáncer de la invención es conjugada con un agentes inmunogénico como es discutido en la presente. En una modalidad, la proteína de cáncer es conjugada a BSA. Los péptidos de la invención, por ejemplo, de longitudes preferidas, pueden ser enlazados entre sí o a otros aminoácidos para crear un péptido/proteína más largo. Los péptidos moduladores se pueden digerir de proteínas que ocurren de manera natural como es resumido anteriormente, péptidos aleatorios o péptidos aleatorios "desviados". En una modalidad preferida, los moduladores basados en péptido/proteínas son anticuerpos y fragmentos de los mismos, como es definido en la presente. Los moduladores de cáncer también pueden ser ácidos nucleicos. Los agentes de modulación de ácido nucleico pueden ser ácidos nucleicos que ocurren de - manera natural, ácidos nucleicos aleatorios o ácidos nucleicos aleatorios "desviados". Por ejemplo, las digestiones de los genomas procarióticos o eucarióticos se pueden usar en un procedimiento análogo a aquel resumido anteriormente para proteínas . El término "anticuerpo monoclonal" se refiere a un anticuerpo obtenido de una población de anticuerpos sustancialmente homogéneos, es decir, los anticuerpos que comprenden la población son idénticos excepto para posibles mutaciones que ocurren de manera natural que están presentes en cantidades menores. Una "porción", como en la porción biológica de una proteina relacionada con PSCA, se refiere a cualquiera patrón de aminoácidos que forman parte de la secuencia primaria de una proteina, que está asociado con una función particular (por ejemplo interacción de proteina-proteina, interacción de proteina-DNA, etc) o modificación (por ejemplo que es fosforilado, glicosilado o amidado) , o localización (por ejemplo secuencia secretoria, secuencia de localización nuclear, etc.) o una secuencia que está correlacionada con ser inmunogénica, ya sea humoralmente o celularmente . Una porción puede ser ya sea contigua o capaz de ser alineada a ciertas posiciones que están generalmente relacionadas con una cierta función o propiedad. En contexto de porciones de HLA, "porción" se refiere al patrón de residuos en un péptido de longitud definida, usualmente un péptido de aproximadamente 8 a aproximadamente 13 aminoácidos para una porción HLA de clase I y de . aproximadamente 6 a aproximadamente 25 aminoácidos para una porción de HLA de clase II, que es reconocida por una molécula de HLA particular. Las porciones de péptido para el enlace de HLA son típicamente diferentes de cada proteina codificada por cada alelo de HLA humano y difieren en el patrón de los residuos fijadores primarios y secundarios. Un "excipiente farmacéutico" comprende un material tal como un adyuvante, un portador, agentes ajustadores del pH y reguladores, agentes de ajuste de tonicidad, agentes humectantes, conservadores y similares. "Farmacéuticamente aceptable" se refiere a una composición no tóxica, inerte que es fisiológicamente compatible con los humanos u otros mamíferos. El término "polinucleótido" significa una forma polimérica de nucleotidos de por lo menos 10 bases o pares de bases en longitud, ya sea ribonucleótidos o desoxinucleótidos o una forma modificada de cualquier tipo de nucleótido, y se propone para incluir formas de una sola y doble hebra de DNA y/o RNA. En la técnica, el término frecuentemente se utiliza intercambiablemente con "oligonucleótido" . Un polinucleótido puede comprende una secuencia de nucleotidos divulgada en la presente en donde la timidina (T) , como se muestra en el ejemplo en la Figura 2, también puede ser uracilo (U) ; esta definición pertenece a las diferencias entre las estructuras químicas de DNA y RNA, en particular la observación de que una de las cuatro bases mayores en RNA es uracilo (U) en lugar de timidina (T) . El término "polipéptido" significa un polímero de por lo menos aproximadamente 4, 5, 6, 7 u 8 aminoácidos. Por toda la especificación, se utilizan designaciones estándares de tres letras o de una sola letra para aminoácidos. En la técnica, este término es frecuentemente utilizado intercambiablemente con "péptido" o "proteína". Un "residuo fijador primario" de HLA es un aminoácido en una posición específica a largo de una secuencia de péptido que se entiende que proporciona un punto de contacto entre el péptido inmunogénico y la molécula de HLA. Uno a tres, usualmente dos, residuos fijadores primarios dentro de un péptido de longitud definida generalmente define una "porción" para un péptido inmunogénico. Estos residuos se entienden que se fijan en estrecho contacto con la ranura de enlace de péptido de una molécula de HLA, con sus cadenas laterales perforadas en cavidades específicas de la ranura de enlace. En una modalidad, por ejemplo, los residuos fijadores primarios para una molécula de HLA clase I están localizados en la posición 2 (de la posición amino terminal) y en la posición carboxilo terminal de un epítope péptido de 8, 9, 10, 11 o 12 residuos de acuerdo con la invención. Alternativamente, en otra modalidad, los residuos fijadores primarios de un péptido se enlazan a una molécula de HLA de clase II que están espaciados con relación entre sí, antes que a las terminales de un péptido, donde el péptido es generalmente de por lo menos 9 aminoácidos en longitud. Las posiciones fijadoras primarias para cada porción y superporcion se exponen en la Tabla IV. Por e emplo, los péptidos análogos pueden ser crear al alterar la presencia o ausencia de residuos particulares en las posiciones fijadoras primarias y/o secundarias mostradas en la Tabla IV. Tales análogos se usan para modular la afinidad de enlace y/o la cobertura de población de un péptido que comprende una porción o superporcion de HLA particular. "Radioisótopos" incluyen, pero no están limitados a lo siguiente (usos ejemplares no limitativos también se exponen) : **Ejemplos de Isótopos Médicos: Isótopo Descripción de uso Actinio-225 Ver el Torio-229 (Th-229) (AC-225) Actinio-227 Origen del Radio-223 (Ra-223) que es un alfa (AC-227) emisor usado para tratar las metástasis en el esqueleto que resultan del cáncer (es decir, cánceres de pecho y de próstata) y radioinmunoterapia de cáncer Bismuto-212 Ver Torio-228 (Th-228) (Bi-212) Bismuto-213 Ver Torio-229 (Th-229) (Bi-213) Cadmio-109 Detección de cáncer (Cd-109) Cobalto-60 Fuente de radiación para la radioterapia de (Co-60) cáncer, para irradiadores de alimento, y para la esterilización de provisiones médicas Cobre-64 ün emisor de positrones usado para la terapia (Cu-64) de cáncer y la formación de imágenes y SPECT Cobre-67 Emisores de beta/gamma usada en la (Cu-67) radioinmunoterapia de cáncer y estudios de diagnósticos (es decir, cánceres de pecho y de colon y linfoma) Disprosio-166 Radioinmunoterapia de cáncer (Dy-166) Erbio-169 Tratamiento de artritis reumatoide, (Er-169) particularmente para las articulaciones pegueñas asociadas con los dedos de las manos y dedos de los pies Europio-152 Fuente de radiación para la irradiación de (Eu-152) alimentos y para la esterilización de provisiones médicas Europio-154 Fuente para radiación para radiación de (Eu-154) alimento y para la esterilización de provisiones médicas Gadolinio Detección de osteoporosis y dispositivos de (Gd-1 53) aseguramiento de calidad médica nuclear Oro-198 Terapia de implante y de integridad de (Au-198) cánceres de ovario, próstata y de cerebro Holmio-166 Tratamiento de mieloma múltiple en la terapia (Ho-166) esquelética dirigida,- radioinmunoterapia de cáncer, ablación de la médula ósea y tratamiento de la artritis reumatoide Yodo-125 Detección de osteoporosis, formación de (1-125) imagen de diagnóstico, fármacos trazadores, tratamiento de cáncer de cerebro, radiomarcación, formación de imagen de tumor, elaboración del mapa de receptores en el cerebro, terapia de radiación intersticial, branquiterapia para el tratamiento del cáncer de próstata, determinación de la proporción de filtración glomerular (GFR) , determinación del volumen de plasma, defección de la trombosis de vena profunda de las piernas Yodo-131 Evaluación de la función de la tiroides, (1-131) detección de la enfermedad de tiroides, tratamiento del cáncer tiroideo asi como otras enfermedades de tiroides no malignas (es decir enfermedad de Graves, goiters, e hipertiroidismo) , tratamiento de leucemia, linfoma y otras formas de cáncer, (por ejemplo, cáncer de pecho) usando radioinmunoterapia Iridio-192 Braquiterapia, tratamiento de tumor del (Ir-192) cerebro y de médula espinal, tratamiento de arterias bloqueadas (es decir, artexiosclerosis y restenosis) e implantes para tumores de pecho .y de próstata Lutecio-17 Radioinmunoterapia de cáncer y tratamiento (Lu-177) de arterias bloqueadas (es decir, arteriesclerosis y restenosis) Molibdeno- Origen del Technecio-99ni (Tc-99m) que usa (Mo-99) para formar en imagen el cerebro, hígado, pulmones, corazón y otros órganos. Actualmente, el Tc-99m es el radioisótopo más ampliamente utilizado para la formación de imagen de diagnóstico de varios cánceres y enfermedades que implican el cerebro, corazón, hígado, pulmones; también usado en la detección de la trombosis de vena profunda de las piernas Osmio-194 Radioinmunoterapia de cáncer (Os-194) Paladio-103 Tratamiento de cáncer de próstata (Pd-103) Platino-195m Estudios sobre la biodistribución y (Pt-195m) metabolismo del cisplatin, un fármaco quimioterapéutico Fósforo-32 Policitemia rubra vera (enfermedad de células (P-32) de la sangre) y tratamiento de leucemia, diagnóstico/tratamiento de cáncer del hueso; tratamiento del cáncer de colon, pancreático y de hígado; radiomarcación de ácidos nucleicos para la investigación in vitro, diagnóstico de tumores superficiales, tratamientos de arterias bloqueadas, (es decir, arteriosclerosis y restenosis) y terapia de intracavidad Fósforo-33 Tratamiento de leucemia, (P-33) diagnóstico/tratamiento de la enfermedad del hueso, radiomarcación y tratamiento de arterias bloqueadas (es decir, arteriosclerosis y restenosis) Radio-223 Ver Actinio-227 (Ac-227) (Ra-223) Renio-186 Alivio del dolor de cáncer de hueso, (Re-186) tratamiento de artritis reumatoide y diagnóstico y tratamiento de linfoma y cánceres de hueso, pecho, colon y de hígado usando radioinmunoterapia Renio-188 Diagnóstico de cáncer y tratamiento usando (Re-188: radioinmunoterapia, alivio del dolor de cáncer de hueso, tratamiento de la artritis reumatoide y tratamiento del cáncer de próstata Rodio-105 Radioinmunoterapia de cáncer (Rh-105) Samario-145 Tratamiento de cáncer ocular Samario-153 Radioinmunoterapia de cáncer y alivio del (Sm-153) dolor de cáncer de hueso Escandio-47 Radioinmunoterapia de cáncer y alivio del (Sc-47) dolor de cáncer de hueso Selenio-75 Radiotrazador usado en estudios del cerebro, (Se-75) formación de imagen de la corteza adrenal mediante la gamma-scintigrafia, localizaciones laterales de tumores que secretan esteroides, de exploración pancreática, detección de las glándulas paratiroides hiperactivas, proporción de medición de la pérdida de ácido biliar de la acumulación endógena Estroncio Detección del cáncer de hueso y exploraciones (Sr-85) del cerebro Estroncio Alivio del dolor de cáncer de hueso, (Sr-89) tratamiento de mieloma humano múltiple y terapia osteoblástica Tecnecio-99m Ver Molibdeno-99 (Mo-99) (Tc-99m) Torio-228 Origen del Bismuto-212 (Bi-212) que es un (T -228) alfa emisor usado en la radioinmunoterapia de cáncer Torio-229 Origen del Actinio-225 (Ac-225) y abuelo del (Th-229) Bism.uto-213 (Bi-213) que son alfa emisores usados en la radioinmunoterapia de cáncer Tulio-170 Fuente .gamma para irradiadores de sangre, (Tm-170) fuente de energía para dispositivos médicos implantados Tin-117m Inmunoterapia de cáncer y alivio del dolor (Sn-117m) de cáncer de hueso Tungsteno-18£ Origen para' el Rutenio-188 (Re-188) que es ( -188) usado para diagnósticos/tratamiento de cáncer, alivio de dolor cáncer de hueso, tratamiento de artritis reumatoide y tratamiento de arterias bloqueadas (es decir, arteriesclerosis y restenosis) Xenón-127 Neuroformación de imágenes de desordenes del (Xe-127) cerebro, estudios de SPECT alta resolución, pruebas de función pulmonar y estudios de flujo de sangre cerebral, Iterbio-175 Radioinmunoterapia de cáncer (Yb-175) Itrio-90 Microsemillas obtenidas de irradiar Itrio-89 (Y-90) (Y-89) para el tratamiento del cáncer del higado Itrio-91 Una etiqueta gamma-emisora para el Itrio-90 (Y-91) (Y-90) que es usado para la radioinmunoterapia de cáncer (es decir, linfoma, cánceres de pecho, colon, riñon, pulmón, ovario, próstata, pancreático e higado inoperable) . Por "aleatorizado" o equivalentes gramaticales como se aplican en la presente a ácidos nucleicos y proteínas se propone que cada ácido nucleico y péptido consiste de nucleótidos esencialmente aleatorios y aminoácidos, respectivamente. Estos péptidos aleatorios (o ácidos nucleicos, discutidos en la presente) pueden incorporar en cualquier nucleótido o aminoácido en cualquier posición. Los procesos sintéticos pueden ser diseñados para generar proteínas aleatorizadas o ácidos nucleicos, para permitir la formación de todas o las mayorías de las combinaciones posibles sobre la longitud de la secuencia, formando de esta manera una librería de agentes proteinaceos bioactivos candidatos aleatorizados . En una modalidad, una librería es "completamente aleatorizada", sin preferencias de secuencias o constantes en cualquier posición. En otra modalidad, la librería es una librería "aleatoria desviada" esto es, algunas posiciones dentro de la secuencia ya sea que son mantenidas constantes, o se seleccionan de un número limitado de posibilidades. Por ejemplo, los residuos de nucleótidos o aminoácidos son aleatorizados dentro de una clase definida, por ejemplo, de aminoácidos hidrofóbicos , residuos hidrofilicos , residuos que esféricamente desviados (ya sea pequeños o grandes) , hacia la creación de dominios de enlace de ácido nucleico, la creación de cisterna, para reticulación, prolinas para dominios SH-3, serinas, treoninas, tirosinas o histidinas para los sitios de fosforilación, etc., o a purinas, etc. Una molécula de DNA o RNA "recombinante" es una molécula de DNA o RNA que se ha sometido a la manipulación molecular in vitro. Ejemplos no limitativos de moléculas pequeñas incluyen compuestos que enlazan o interactúan con PSCA, ligandos incluyendo hormonas, neuropéptidos , quimioquinas, odorizantes, fosfolipidos y equivalentes funcionales de los mismos que enlazan y de preferencia inhiben la función de la proteina PSCA. Tales moléculas pequeñas no limitativas de preferencia tienen un peso molecular de menos de aproximadamente 10 kDa, más de preferencia por debajo de aproximadamente 9, aproximadamente -8, aproximadamente 7, aproximadamente 6, aproximadamente 5 o aproximadamente 4 kDa. En ciertas modalidades, las moléculas pequeñas físicamente se asocian con, o enlazan, la proteina PSCA; no se encuentran en rutas metabólicas que ocurren de manera natural; y/o son más solubles -en soluciones acuosas que en soluciones no acuosas. "Severidad" de las reacciones de hibridación es fácil determinable por un experto ordinario en la técnica, y generalmente es un calculo empírico dependiente de la longitud de la sonda, temperatura de lavado y la concentración de sal. En general, las sondas más largas requieren más altas temperaturas para el templado apropiado, mientras que las sondas más cortas necesitan temperaturas más bajas. La hibridación generalmente depende la habilidad de las secuencias de ácido nucleico desnaturalizadas para retemplarse cuando las hebras complementarias están presentes en un medio ambiente por debajo de su temperatura de fusión. Entre más alto es el grado de homología deseada entre la sonda y la secuencia hibridable, más alta es la temperatura relativa que puede ser utilizada. Como resultado, esto sigue que las temperaturas relativas más altas tenderían a ser las condiciones de reacción más severas, mientras que las temperaturas más bajas menos severas. Para detalles adiciones y explicaciones de la severidad de reacciones de hibridación, ver Ausubel y colaboradores, Current Protocols in Molecular Biology, Wiley Interscience Publishers, (1995) . Las "condiciones severas" o "condiciones de alta severidad) , como se define en la presente, son identificadas por, pero no limitadas a, aquellas que: (1) emplean baja concentración iónica y alta temperatura para el lavado, por ejemplo cloruro de sodio 0.015 M/citrato de sodio 0.0015 M/dodecil sulfato de sodio 0.1% a 50"°C; (2) emplean durante la hibridación un agente de desnaturalización, tal como formamida, por ejemplo, formamida al 50% (v/v) con albúmina de suero bovino al 0.1%/Ficoll al 0.1%/polivinilpirrolidona al 0.1%/solución reguladora de fosfato de sodio 50 mM a pH 6.5 con cloruro de sodio 750 mM, citrato de sodio 75 mM a 42°C; o (3) emplean formamida al 50%, 5 x SSC (NaCl 0.75 M, citrato de sodio 0.075 M) , fosfato de sodio 50 mM (pH 6.8), pirofosfato de sodio al 0.1%, solución de Denhardt 5 x, DNA de esperma de salmón sonicado (50 µg/ml) , SDS al 0.1% y sulfato de dextrano al 10% a 42 °C, con lavados 42 °C en 0.2 x SSC (cloruro de sodio/citrato de sodio) y formamida al 50% a 55 °C, seguido por un lavado de alta severidad que consiste de 0.1 x SSC que contiene EDTA a 55°C. Las "condiciones moderadamente severas" son descritas por, pero no limitado a, aquellos en Sambrook y colaboradores, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Nueva York: Cold Spring Harbor Press, 1989 e incluyen el uso de la solución de -la\rado y condiciones de hibridación (por ejemplo, temperatura, concentración iónica y % de SDS) menos severidad que aquellos descritos en lo anterior. Un ejemplo de condiciones moderadamente severas es la incubación durante la noche a 37 °C en una solución que comprende: formamida al 20%, 5 x SSC (NaCl 150 mM, citrato de trisodio 15 mM) , fosfato de sodio 50 mM (pH 7.6), solución de Denhardt 5 x, sulfato de dextrano al 10% y 20 mg/mL de DNA de esperma de salmón partido, desnaturalizado, seguido por el lavado de los filtros en 1 x SSC a aproximadamente 37-50 °C. La persona experta reconocerá como ajustar la temperatura, la concentración iónica, etc. como sea ' necesario para adaptar los factores tal como la longitud de la sonda y los similares . Una "superporción" de HLA es un péptido que enlaza la especificidad compartida por las moléculas HLA codificadas por dos o más alelos de HLA. Las frecuencias fenotipicas globales de los supertipos HLA en diferentes poblaciones étnicas se exponen en la Tabla IV (F) . Los constituyentes no limitativos de varios supertipos son como sigue: A2: A*0201, A*0202, A*0203, A*0204, A* 0205, A*0206, A*6802, A*6901, A*0207 A3: A3, All, A31, A*3301, A*6801, A*0301, A*1101, A*3101 B7: B7, B*3501-03, B*51, B*5301, B*5401, B*5501, B*5502, B*5601, B*6701, B*7801, B*0702, B*5101, B*5602 B44: B*3701, B*4402, B*4403, B*60 (B*4001), B61 (B*4006) Al: A*0102, A*2604, A*3601, A*4301, A*8001 A24: A*24, A*30, A*2403, A*2404, A*3002, A*3003 B27: 6*1401-02, B*1503, B*1509, B*1510, B*1518, B*3801-02, B*3901, B*3902, B*3903-04, B*4801-02, B*7301, B*2701-08 B58: B*1516, B*1517, B*5701, B*5702, B58 B62: B*4601, B52, B*1501 (B62) , B*1502 (B75) , B*1513 (B77) La cobertura de población calculada dada por diferentes combinaciones del supertipo de HLA se expone en la Tabla IV (G) . Como se utiliza en la presente "para tratar" o "terapéutico" y términos gramáticamente relacionados, se refieren a cualquier mejora de cualquier consecuencia de enfermedad, tal como supervivencia prolongada, menos morbosidad, y/o una disminución de los efectos secundarios que son los subproductos de una modalidad terapéutica alternativa; no se requiere la erradicación completa de la enfermedad. Un "animal transgénico" (por ejemplo, un ratón o rata) es un animal que tienen células que contiene un transgen, el transgen que se introdujo en animal o un ancestro del animal de una etapa prenatal, por ejemplo una etapa embriónica. Un "transgen" es un DNA que es entregado en el genoma de una célula a partir del cual se desarrolla el animal transgénico. Como se utiliza en la presente, una "vacuna" de HLA o de respuesta inmune celular es una composición que contiene o codifica uno o más péptidos de la invención. Existen numerosas modalidades de tales vacunas, tal como un cóctel de uno o más péptidos individuales; uno o más péptidos de la invención comprendidos por un péptido poliepitópico; o ácidos nucleicos que codifican tales péptidos individuales o polipéptidos , por ejemplo, un minigen que codifica un péptido poliepitópico. El "uno o más péptidos" puede incluir cualquier número entero de unidad completa de 1-150 o más, por ejemplo por lo menos 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 55, _60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145 o 150 o más péptidos de la invención. Los péptidos o polipéptidos opcionalmente pueden ser modificados, tal como mediante lipidación, adición de la dirección u otras secuencias. Los péptidos de HLA clase I de la invención pueden ser mezclados con, o enlazados a, péptidos de HLA de clase II, para facilitar la activación de tanto los linfocitos T citotóxicos y los linfocitos T ayudantes. Las vacunas de HLA también pueden comprender células que presentan antigeno pulsadas por péptido, por ejemplo, células dendriticas . El término "variante" se refiere a una molécula que exhibe una variación de un tipo o norma descrito, tal como una proteina que tiene uno o más residuos de aminoácidos diferentes en la(s) posición (es) correspondiente (s) de una proteina específicamente descrita (por ejemplo la proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3) . Un análogo es un ejemplo de una proteína variante. Las isoformas de empalme y los polimorfirnos de nucleótidos individuales (SNPs) son ejemplos adicionales de variantes. Las "proteínas relacionada con PSCA" de la invención incluyen aquellas específicamente identificadas en la presente, así como variantes alélicas, variantes de sustitución conservativas, análogos y homólogos que pueden ser aislados/generados y caracterizados sin experimentación indebida siguiendo los métodos resumidos en la presente o fácilmente disponibles en la técnica. Las proteínas de fusión que combinan partes de diferentes proteínas PSCA o fragmentos de las mismas, así como proteínas de fusión de una proteína PSCA y un polipéptido heterologo también son incluidas. Tales proteínas PSCA son colectivamente referidas como las proteínas relacionadas con PSCA, las proteínas de la invención, o PSCA. El término "proteína relacionada con PSCA" se refiere a un fragmento de polipéptido o una secuencia de proteína de PSCA de 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 o más de 25 aminoácidos; o por lo menos 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 80, 85, 90, 95, 100, 105, 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145, 150, 155, 160, 165, 170, 175, 180, 185, 190, 195, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575 o 576 o más aminoácidos. II. ) Polinucleótidos PSCA Un aspecto de la invención proporciona polinucleótidos correspondientes o complementarios a todo o parte de un gen PSCA, mRNA, y/o secuencia de codificación, de preferencia en forma en forma aislada, incluyendo polinucléotidos que codifican una proteina relacionada con PSCA y fragmentos de la misma, DNA, RNA, híbrido de DNA/RNA y moléculas relacionadas, polinucleótidos o oligonucleótidos complementarios a un gen PSCA o secuencia de mRNA o una parte de la misma, y polinucleótidos u oligonucleótidos que hibridan un gen PSCA, mRNA, o un polinucleótido que codifica PSCA (colectivamente, "polinucleótidos PSCA") . En todos los casos cuando es referido en esta sección, T también puede ser ü en la Figura 2. Las modalidades de un polinucleótido PSCA incluyen: un polinucleótido PSCA que tiene la secuencia mostrada en la Figura 2, la secuencia de nucleótidos de PSCA como se muestra en la Figura 2 en donde T es U; por lo menos 10 nucleótidos contiguos de un polinucleótido que tiene una secuencia como es mostrada en la Figura 2; o, por lo menos 10 nucleótidos contiguos de un polinucleótido que tiene una secuencia como es mostrada en la Figura 2 en donde T es U. Por ejemplo, las modalidades de nucleótidos de -PSCA comprenden, sin limitación: (I) un polinucleótido que comprende, que consiste esencialmente de, o que consiste de una secuencia como es mostrada en la Figura 2, en donde T también puede ser U; (II) un polinucleótido que comprende, que consiste esencialmente de, o que consiste de la secuencia como es mostrada en la Figura 2A, del residuo de nucleótido número 18 hasta el residuo de nucleótido número 389, incluyendo el codón de detención, en donde T también puede ser U; (III) un polinucleótido que comprende, que consiste esencialmente de, o que consiste de la secuencia como es mostrada en la Figura 2B, del residuo de nucleótido número 56 hasta el residuo de nucleótido número 427, incluyendo el codón de detención, en donde T también puede ser ü; (IV) un polinucleótido que comprende, que consiste esencialmente de, o que consiste de la secuencia como es mostrada en la Figura 2C, del residuo de nucleótido número 423 hasta el residuo de nucleótido número 707, incluyendo el codón de detención, en donde T también puede ser U; (V) un polinucleótido que comprende, que consiste esencialmente de, o que consiste de la secuencia como es mostrada en la Figura 2D, del residuo de nucleótido número 424 hasta el residuo de nucleótido número 993, incluyendo el codón de detención, en donde T también puede ser U; (VI) un polinucleótido que comprende, que consiste esencialmente de, o que consiste de la secuencia como es mostrada en la Figura 2E, del residuo de nucleótido número 910 hasta el residuo de nucleótido número 1479, incluyendo el codón de detención, en donde T también puede ser U; (VII) un polinucleótido que comprende, que consiste esencialmente de, o que consiste de la secuencia como es mostrada en la Figura 2F, del residuo de nucleótido número 83 hasta el residuo de nucleótido número 427, incluyendo el codón de detención, en donde T también puede ser U; (VIII) un polinucleótido que comprende, que consiste esencialmente de, o que consiste de la secuencia como es mostrada en la Figura 2G, del residuo de nucleótido número 56 hasta el residuo de nucleótido número 427, incluyendo el codón de detención, en donde T también puede ser U; (IX) un polinucleótido que comprende, que consiste esencialmente de, o que consiste de la secuencia como es mostrada en la Figura 2H, del residuo de nucleótido número 424 hasta el residuo de nucleótido número 993, incluyendo el codón de detención, en donde T también puede ser U; (X) un polinucleótido que codifica una proteina relacionada con PSCA que es por lo menos 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100% homologa a una secuencia de aminoácidos completa mostrada en las Figuras 2A-H; (XI) un polinucleótido que codifica una proteína relacionada con PSCA que es por lo menos 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100% idéntica a la secuencia de aminoácidos completa mostrada en las Figuras 2A-H; (XII) polinucleótido que codifica por lo menos un péptido expuesto en las Tablas VIII-XXI y XXII-XLIX; (XIII) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3A en cualquier incremento de número entero hasta 123 que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Hidrofilicidad de la Figura 5; (XIV) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3? en cualquier incremento de número entero hasta 123 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor menor que 0.5 en el perfil de Hidropaticidad de la Figura 6; (XV) un polinucleótido que · codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3A en cualquier incremento de número entero hasta 123 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Por Ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; (XVI) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3A en cualquier incremento de número entero hasta 123 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfile de Flexibilidad Promedio de la Figura 8 ; (XVII) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 , 21, 22, 23, 24 , 25, 26, 27 , 28 , 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3? en cualquier incremento de número entero hasta 123 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil Beta-turn de la Figura 9; (XVIII) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3B en cualquier incremento de número entero hasta 94 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de hidrofilicidad de la Figura 5; (XIX) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3B en cualquier incremento de número entero hasta 94 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor menor que 0.5 en el perfil de Hidropaticidad de la Figura 6; (XX) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3B en cualquier incremento de número entero hasta 94 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor - mayor que 0.5 en el perfil de Por Ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; (XXI) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3B en cualquier incremento de número entero hasta 94 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Flexibilidad Promedio de la Figura 8; (XXII) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3B en cualquier incremento de número entero hasta 94 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil Beta-turn de la Figura 9; (XXIII) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de las Figuras 3C, 3E-3L en cualquier incremento de número entero hasta 189 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Hidrofilicidad de la Figura 5; (XXIV) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de las Figuras 3C, 3E-3L en cualquier incremento de número entero hasta 189 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, .6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor menor que 0.5 en el perfil de Hidropaticidad de la Figura 6; (XXV) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de las Figuras 3C, 3E-3L en cualquier incremento de número entero hasta 189 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Por Ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; (XXVI) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de las Figuras 3C, 3E-3L en cualquier incremento de número entero hasta 189 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Flexibilidad Promedio de la Figura 8; (XXVII) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de las Figuras 3C, 3E-3L en cualquier incremento de número entero hasta 189 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil Beta-turn de la Figura 9; (XXVIII) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3D en cualquier incremento de número entero hasta 114 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0. 5 en el perfil de Hidrofilicidad de la Figura 5; (XXIX) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de' un péptido de la Figura 3D en cualquier incremento de número entero hasta 114 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor menor que 0.5 en el perfil de Hidropaticidad de la Figura 6; ( XXX ) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3D en cualquier incremento de número entero hasta 114 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Por Ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; (XXXI) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3D en cualquier incremento de número entero hasta 114 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfile de Flexibilidad Promedio de la Figura 8; (XXXII ) un polinucleótido que codifica una región de péptido de por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de un péptido de la Figura 3D en cualquier incremento de número entero hasta 114 que incluye 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil Beta-turn de la Figura 9; (XXXIII) un polinucleótido que es completamente complementario a un polinucleótido de cualquiera de (I) - (XXXII) ; (XXXIV) un péptido que es codificado por cualquiera de (I) a (XXXIII) ; y (XXXV) una composición que comprende un polinucleótido de cualquiera de (I)- (XXXIII) o péptido de (XXXIV) junto con un excipiente farmacéutico y/o en una forma de dosis unitaria humana; (XXXVI) un método para usar un polinucleótido de cualquiera de (I)- (XXXIII) o péptido de (XXXIV) o una composición de (XXXV) en un método para modular una célula que expresa PSCA; (XXXVII) un método para usar un polinucleótido de cualquiera de (I)- (XXXIII) o péptido de (XXXIV) o una composición de (XXXV) en un método para el diagnóstico, profilaxis, pronóstico, o tratamiento de un individuo quien lleva una célula que expresa PSCA; (XXXVIII) un método para usar un polinucleótido de cualquiera de (I)- (XXXIII) o péptido de (XXXIV) o una composición de (XXXV) en un método para diagnóstico, profilaxis, pronóstico o tratamiento de un individuo quien lleva una célula que expresa PSCA, al célula de un cáncer de un tejido listado en la Tabla I; (XXXIX) un método para usar un polinucleótido de cualquiera de (I)- (XXXIII) o péptido de (XXXIV) o una composición de (XXXV) en un método para diagnóstico, profilaxis, pronóstico o tratamiento de un. cáncer (XL) un método para usar un polinucleótido de cualquiera de (I)- (XXXIII) o péptido de (XXXIV) o una composición de (XXXV) en un método para diagnóstico, profilaxis, pronóstico o tratamiento -de un cáncer listado en la Tabla I; y; (XLI) un método para usar un polinucleótido de cualquiera de (I)- (XXXIII) o péptido de (XXXIV) o una composición de (XXXV) en un método para identificar o caracterizar un modulador de una célula que expresa PSCA. Como se utiliza en la presente, un intervalo se entiende que divulga específicamente todas las posiciones de unidad entera del mismo. Las modalidades típicas de la invención divulgadas en la presente incluyen polinucleótidos PSCA que codifican porciones específicas de secuencias de mRNA de PSCA (y aquellas que son complementarias a tales secuencias) tales como aquellas que codifican las proteínas y/o fragmentos de los mismos, por ejemplo: (a) 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, 110, 115, 120, y 123 o más aminoácidos contiguos de la PSCA variante 1; las longitudes máximas relevantes para las otras variantes son: variante 3, 94 aminoácidos; variante 4, 189 aminoácidos, variante 6, 114 aminoácidos, variante 19, 189 aminoácidos, variante 20, 189 aminoácidos, variante 21, 189 aminoácidos, variante 22, 189 aminoácidos, variante 24, 189 aminoácidos, variante 25, 189 aminoácidos, variante 26, 189 aminoácidos y variante 27, 189 aminoácidos. Por ejemplo, las modalidades representativas de la invención divulgadas en la presente incluyen: polinucleótidos y sus péptidos codificados por si mismos que codifican aproximadamente el aminoácido 1 a aproximadamente el aminoácido 10 de la proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, polinucleótidos que codifican aproximadamente el aminoácido 10 a aproximadamente el aminoácido 20 de la proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o Figura 3, polinucleótidos que codifican aproximadamente el aminoácido 20 a aproximadamente el aminoácido 30 de la proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o Figura 3, polinucleótidos que codifican aproximadamente el aminoácido 30 a aproximadamente el aminoácido 40 de la, proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o Figura 3, polinucleótidos que codifican aproximadamente el aminoácido 40 a aproximadamente el aminoácido 50 de la proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o Figura 3, polinucleótidos que codifican aproximadamente el aminoácido 50 a aproximadamente el aminoácido 60 de la proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o Figura 3, polinucleótidos que codifican aproximadamente el aminoácido 60 a aproximadamente el aminoácido 70 de la proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o Figura 3, polinucleótidos que codifican aproximadamente el aminoácido 70 a aproximadamente el" aminoácido 80 de la proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o Figura 3, polinucleótidos que codifican aproximadamente el aminoácido 80 a aproximadamente el aminoácido 90 de la proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o Figura 3, polinucleótidos que codifican aproximadamente el aminoácido 90 a aproximadamente el aminoácido 100 de la proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o Figura 3, en incrementos de aproximadamente 10 aminoácidos, terminando en el aminoácido carboxilo terminal expuesto en la Figura 2 o Figura 3. Por consiguiente, los polinucleótidos que codifican porciones de la secuencia de aminoácidos (de aproximadamente 10 aminoácidos) , de los aminoácidos 100 hasta el aminoácido carboxilo terminal de la proteina PSCA son modalidades de la invención. En donde se entiende que cada posición de aminoácido particular divulga esa posición más o menos cinco residuos de aminoácido. Los polinucleótidos que codifican porciones relativamente largas de una proteina PSCA también están dentro del alcance de la invención. Por ejemplo, los polinucleótidos que codifican de aproximadamente el aminoácido 1 (o 20 o 30 o 40 etc.) a aproximadamente el aminoácido 20, (o 30, o 40 o 50 etc.) de la proteina PSCA "o variante" mostrada en la Figura 2 o Figura 3 pueden ser generados mediante una variedad de técnicas bien conocidas en el arte. Estos fragmentos de polinucleotido pueden incluir cualquier porción de la secuencia PSCA como es mostrada en la Figura 2. Modalidades ilustrativas adicionales de la invención divulgada en la presente -incluyen fragmentos de polinucleotido. PSCA que codifican una o más de las porciones biológicas contenidas dentro de una secuencia de proteina PSCA "o variantes", incluyendo una o más de las subsecuencias que llevan porción de una proteina PSCA "o variante" expuesta en las Tablas VIII-XXI y XXII-XLIX. En otra modalidad, los fragmentos de polinucleotido típicos de la invención codifican uno o más de las regiones de la proteína PSCA o variante que exhiben homología a una molécula conocida. En otra modalidad de la invención, los fragmentos de polinucleotido típicos pueden codificar uno o más de la proteína PSCA o los sitios de N-glicosilación de la variante, los sitios de fosforilación de proteína quinasa dependiente de cA P y cGMP, sitios de fosforilación de la caseína quinasa II o sitios de N-miristoilación y sitios de amidación. Observar que para determinar la posición de inicio de cualquier péptido expuesto en las Tablas VIII-XXI y Tablas XXII a XLIX (colectivamente Tablas de Péptidos HLA) respectivos con su proteína parental, por ejemplo, variante 1, variante 2, etc., la referencia se hace a tres factores: la variante particular, la longitud del péptido en una Tabla de péptidos HLA y los Péptidos de Búsqueda listados en la Tabla VII. Generalmente, un Péptido de Búsqueda único es utilizado para obtener péptidos HLA para una variante particular. La posición de cada Péptido de Búsqueda con relación a su molécula de origen respectivo es listado en el a Tabla VII. Por consiguiente, si un Péptido de Búsqueda comienza en la posición "X", uno debe adicionar el valor "X menos 1" a cada posición en las Tablas VIII-XXI y Tablas XXII-IL para obtener la posición real de los péptidos HLA y su molécula parental. Por ejemplos, si un Péptido de Búsqueda comienza en la posición 150 de su molécula parental, uno debe adicionar 150-1, es decir, 149 a cada posición de aminoácido del péptido HLA para calcular la posición de ese aminoácido en la molécula de origen. II. .) Usos de Polinucleótidos PSCA II.A.l.) Monitoreo de Anormalidades Genéticas Los polinucleótidos de los párrafos precedentes tienen un número de diferentes usos específicos. El gen PSCA humano mapea a la localización cromosomal expuesta en el ejemplo Intitulado "Mapeo Cromosomal de PSCA". Por ejemplo, debido a que el gen PSCA mapea este cromosoma, los polinucleótidos que codifican diferentes regiones de las proteínas PSCA son utilizados para caracterizar anormalidades citogenéticas de esta localización cromosomal, tales como anormalidades que son identificadas que están asociadas con varios cánceres. En ciertos genes, una variedad de anormalidades cromosomales incluyendo rearreglos se han identificado como anormalidades citogenéticas frecuentes en un número de diferentes cánceres (ver por ejemplo Krajinovic y colaboradores, Mutat. Res. 382 (3-4 ): 81-83 (1998); Johansson y colaboradores, Blood 86 (10) : 3905-3914 (1995) y Finger y colaboradores, P.N.A.S. 85 (23) : 9158-9162 (1988)). Así, los polinucleótidos que codifican las regiones específicas de las proteínas PSCA proporcionan nuevas herramientas que pueden ser usadas para delinear, compresión más grande que la previamente posible, las anormalidades citogenéticas en la región cromosomal que codifica PSCA que puede contribuir al fenotipo maligno. En este contexto, estos polinucleótidos satisfacen una necesidad en la técnica para expandir la sensibilidad de la clasificación cromosomal con el fin de identificar anormalidades más cromosomales más tenues y menos comunes (ver por ejemplo. Evans y colaboradores, Am. J. Obstet. Gynecol 171 ( ): 1055-1057 (1994)).
Además, como el PSCA se mostró que es altamente expresado en la próstata y otros cánceres, los polinucleótidos de PSCA se utilizan en métodos para estimar el estado de los productos de gen PSCA en tejidos normales contra cancerosos. Típicamente, los polinucleótidos que codifican regiones específicas' de las proteínas PSCA se utilizan para estimar la presencia de perturbaciones (tales como supresiones, inserciones, mutaciones puntales o alteraciones que dan por resultado la pérdida de un antígeno, etc. ) en regiones específicas del gen PSCA, tales como regiones que contiene una o más porciones. Ensayos ejemplares incluyen tanto los ensayos de RT-PCR así como el análisis de polimorfismo de conformación de un sola hebra (SSCP) (ver por ejemplo, Marrogi y colaboradores, J. Cutan. Pathol. 26 (8) : 369-378 (1999), ambas de las cuales utilizan polinucleótidos que codifican regiones específicas de una proteína al examinar estas regiones dentro de la proteína. II.A.2.) Modalidades Antisentido Otras modalidades relacionadas con ácido nucleico específicamente contempladas de la invención, divulgadas en la presente, son el DNA genómico, cDNAs, ribozimas y moléculas antisentido, así como moléculas de ácido nucleico basadas en una cadena principal alternativa, o que incluye bases alternativas, ya sea derivadas de fuentes naturales o sintetizadas e incluyen moléculas capaces de inhibir el RNA o la expresión de proteina del PSCA. Por ejemplo, las moléculas antisentido pueden ser RNAs u otras moléculas, incluyendo ácidos nucleicos de péptidos (PNAs) o moléculas no de ácido nucleico tales como derivados de fosforotioato que específicamente enlazan DNA o RNA en una manera dependiente de pares de bases. Una persona experta fácilmente puede obtener estas clases de moléculas de ácido nucleico usando las secuencias de polinucleótidos PS'CA y las secuencias de polinucleótidos divulgadas en la presente. La tecnología antisentido comprende la administración de oligonucleótidos exógenos que enlazan a un polinucleótido objetivo localizado dentro de las células. El término "antisentido" se refiere al hecho de que tales oligonucleótidos son complementarios a sus objetivos intracelulares , por ejemplo, PSCA. Ver por ejemplo, Jack Cohén, Oligodeoxynucleotides , Antisense Inhibitors of Gene Expression, CRC Press, 1989; y Synthesis 1:1-5 (1988). Los oligonucleótidos antisentido PSCA de la presente invención incluyen derivados tales como S-oligonucleótidos (derivados de fosforotioato o S-oligos, ver, Jack Cohén, supra) , que exhiben acción inhibitoria del crecimiento de la célula de cáncer incrementada. S-oligo (fosforotioatos de nucleósidos) son análogos isoelectrónicos de un oligonucleótido (O-oligo) en el cual un átomo de oxígeno no de puente del grupo fosfato es reemplazado por un átomo de azufre. Los S-oligo de la presente invención se pueden preparar mediante el tratamiento de los O-oligos correspondientes con 3H-1, 2-benzoditiol-3-ona-1, 1-dióxido, que es un reactivo de transferencia de azufre. Ver, por ejemplo, lyer, R. P. y colaboradores, J. Org. Chem. 55:4693-4698 (1990); y lyer, R. P. y colaboradores, J. Am. Chem. Soc. 112:1253-1254 (1990). Los oligonucleotidos antisentido PSCA adicionales de la presente invención incluyen oligonucleotidos antisentido de morfolino conocidos en la técnica (ver, por ejemplo, Partridge y colaboradores, 1996, Antisense & Nuciere Acid Drug Development 6:169-175). Los oligonucleotidos antisentido de PSCA de la presente invención típicamente pueden ser RNA o DNA que es complementario a, y establemente se híbrida con los primeros 100 codones 5' o por lo menos 100 codones 3' de una secuencia genómica PSCA o el mRNA correspondiente. No se requiere complementariedad absoluta, aunque altos grados de complementariedad son preferidos. El uso de un oligonucleótido complementario a esta región permite la hibridación selectiva del mRNA de PSCA y no al mRNA que específica otra subunidad regulatoria de la proteína quinasa. En una modalidad, los oligonucleotidos antisentido PSCA de la presente invención son de 15 a 30-mer fragmentos de la molécula de DNA antisentido que tiene una secuencia que híbrida al mRNA de PSCA. Opcionalmente, el oligonucleótido antisentido PSCA es un oligonucleótido de 30- er que es complementario a una región en los primeros 10 codones 5' o por lo menos 10 codones 3' del PSCA. Alternativamente, las moléculas antisentido son modificadas par emplear ribozimas en la inhibición de la expresión PSCA, ver, por ejemplo, L. A. Couture & D. . Stinchcomb; Trends Genet 12:510-515 (1996) . II.A.3.) Cebadores y Pares de Cebadores Modalidades especificas adicionales de estos nucleótidos de la invención incluyen cebadores y pares de cebadores, que permiten la amplificación especifica de polinucleótidos de la invención o cualquiera de las partes específicas de los mismos, y sondas que selectivamente o específicamente hibridan a moléculas de ácido nucleico de la invención o a cualquier parte de las mismas. Las sondas pueden ser marcadas con un marcador detectable, tal como, por ejemplo, un radioisótopo, compuesto fluorescente, compuesto bioluminiscente, un compuesto quimioluminiscente, agentes quelante de metal o enzima. Tales sondas y cebadores se usan para detectar la presencia de un polinucleótido PSCA en una muestra y como un medio para detectar una célula que expresa una proteína PSCA. Ejemplos de tales sondas incluyen polipéptidos que comprenden todo o parte de la secuencia de cDNA de PSCA humano mostrado en la Figura 2. Ejemplos de pares de cebadores capaces de amplificar específicamente los mRNA de PSCA también se describen en los ejemplos. Como será entendido por la persona experta, una gran cantidad de diferentes cebadores y sondas se pueden preparar basados en las secuencias proporcionadas en la presente y usadas efectivamente para amplificar y/o detectar un mRNA de PSCA. Los polinucleótidos PSCA de la invención son útiles para una variedad de propósitos, incluyendo pero no limitados a, su uso como sondas y cebadores para la amplificación y/o la detección del (los) gene(s) PSCA, mRNA(s) o fragmentos de los mismos; como reactivos para el diagnóstico y/o pronóstico de cáncer de próstata y otros cánceres; como secuencias de codificación capaces de dirigir la expresión de los polipéptidos PSCA; como herramientas para modulara o inhibir la expresión del (los) gen(s) de PSCA y/o la traducción del (los) transcripto ( s ) de PSCA; y como agentes terapéuticos. La presente invención incluye el uso de cualquier sonda como es descrito en la presente para identificar y aislar un PSCA o secuencia de ácido nucleico relacionada con PSCA de una fuente que ocurre de manera natural, tales como humanos y otros mamíferos, así como la secuencia de ácido nucleico aislada per se, que comprendería toda o la mayoría de las secuencias encontradas en la sonda utilizada. II.A. .) Aislamiento de Moléculas de Acido Nucleico que Codifican PSCA Las secuencias de cDNA de PSCA descritas en la presente permite el aislamiento de otros polinucleótidos que codifican el (los) producto (s) de gen PSCA, asi como el aislamiento de polinucleótidos que codifican los homólogos de producto de gen PSCA, alternativamente isoformas empalmadas, variante es alélicas y formas imitantes de un producto de gen PSCA asi como polinucleótidos que codifican análogos de proteinas relacionadas con PSCA. Varios métodos de clonación molecular que pueden ser empleados para aislar los cDNAs de longitud completa que codifican un gen PSCA son bien conocidos (ver, por ejemplo, Sambrook, J. y colaboradores, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2- edición, Cold Spring Harbor Press, New York, 1989; Current Protocols in Molecular Biology. Ausubel y colaboradores, Eds., Wiley y Sons, 1995) . Por ejemplo, las metodologías de clonación de lambda fago pueden ser convenientemente empleadas, usando sistemas de clonación comercialmente disponibles (por ejemplo, Lambda ZAP Express, Stratagene) . Los clones de fago que contiene cDNAs del gen PSCA pueden ser identificados al sondear con un cDNA de PSCA marcado o fragmento del mismo. Por ejemplo, en una modalidad, un cDNA de PSCA (por ejemplo, Figura 2) o una porción del mismo, se puede sintetizar y usar como una sonda para recuperar los cDNAs sobrepuestos y de longitud completa correspondientes a un gen PSCA. Un gen PSCA por sí mismos puede ser aislado al clasificar librerías de DNA genómicas, librerías de cromosomas artificiales bacterianos (BACs) , librerías de cromosomas artificiales de levadura (YACs) y los similares, con sondas o cebadores de DNA de PSCA. II. A.5.) Moléculas de Acido Nucleico Recombinantes y Sistemas de Hospedero-Vector La invención también proporciona moléculas de DNA o RNA recombinantes que contienen polinucleótido PSCA, un fragmento, análogo u homólogo del mismc que incluye pero no limitados a fagos, plásmidos, fagémidos, cósmidos, YACs, BACs, así como varios vectores virales y no virales bien conocidos en la técnica y células transformadas o transfectadas con tales moléculas de DNA o RNA recombinantes. Los métodos para generar tales moléculas son bien conocidos (ver, por ejemplo, Sambrook y colaboradores, 1989, supra) . La invención además proporciona un sistema de hospedero-vector que comprende una molécula de DNA recombinante que contiene un polinucleótido PSCA, fragmento, análogo u homólogo del mismo dentro de una célula hospedera procariótica o eucariótica adecuada. Ejemplos de células hospederas eucarióticas adecuadas incluyen una célula de levadura, una célula de planta o una célula de animal, tal como una célula de mamífero o una célula de insecto (por ejemplo, una célula infectable con baculovirus tal como una célula Sf9 o HighFive) . Ejemplos de células de mamíferos adecuadas incluyen varias líneas de células de cáncer de próstata tal como DU145 y TsuPrl, otras líneas de células de cáncer de próstata transfectables o transducibles , células primarias (PrEC) , así como un número de células de mamífero rutinariamente usadas para la expresión de las proteínas recombinantes (por ejemplo, células COS, CHO, 293, 293T) . Más particularmente, un polinucleótido que comprende la secuencia de codificación de PSCA o un fragmento, análogo u homólogo del mismo se puede usar para generar proteínas PSCA o fragmentos de las mismas usando cualquier número de sistemas de hospedero-vector rutinariamente utilizados y ampliamente conocidos en la técnica. Una amplia gamma de sistemas de hospedero-vector adecuados para la expresión de proteínas PSCA o fragmentos de las mismas están disponibles, ver por ejemplo, Sambrook y colaboradores, 1989, supra; Current Protocols in Molecular Biology, 1995, supra) . Los vectores preferidos para la expresión del mamífero incluyen pero no están limitados a pcDNA 3.1 myc-His-tag (Invitrogen) y el vector retroviral pSRoctkneo (Muller y colaboradores, 1991, MCB 11:1785). Usando estos vectores de expresión, PSCA puede ser expresada en varias líneas de células de cáncer de próstata y no de próstata, incluyendo por ejemplo 293, 293T, rat-1, NIH 3T3 y TsuPrl. Los sistemas de hospedero-vector de la invención son útiles para la producción de una proteína PSCA o fragmento de la misma. Tales sistemas de hospedero-vector se pueden emplear para estudiar las propiedades funcionales de PSCA y las mutaciones o análogos de PSCA. La proteina PSCA humana recombinante o un análogo u homólogo o fragmento de la misma se puede producir mediante células de mamífero transfectadas con una construcción que codifica un nucleótido relacionado con PSCA. Por ejemplo, las células de 293T pueden ser transfectadas con un plásmido de expresión que codifica PSCA o fragmento, análogo u homólogo del mismo, una proteína relacionada con PSCA expresada en la células 293T y la proteína PSC recombinante es aislada usando métodos de purificación estándar (por ejemplo, la purificación por afinidad usando anticuerpos anti-PSCA) . En otra modalidad, una secuencia de codificación PSCA es subclonada en el vector retroviral pSR MSVtkneo y usada para infectar varias líneas de células de mamífero, tal como NIH 3T3, TsuPrl, 293 y rat-1 con el fin de establecer líneas de células que expresan PSCA. Otros diversos sistemas de expresión bien conocidos en la técnica también pueden ser empleados. Las construcciones de expresión que codifican un péptido guía unido en la estructura a una secuencia de codificación PSCA se pueden usar para la generación de una forma secretada de proteína PSCA recombinante. Como es discutido en la presente, la redundancia en el código genético permite la variación en las secuencias del gen PSCA. En particular, es conocido en la técnica que las especies hospederas especificas frecuentemente tienen preferencias de codón, especificas, y asi se pueden adaptar la secuencia divulgada como sea preferido para un hospedero deseado. Por ejemplo, las secuencias de codón de análogo preferidas típicamente tiene codones raros (es decir, codones que tiene una frecuencia de utilización de menos de aproximadamente 20% en secuencias conocidas del hospedero deseado) reemplazado con codones de más alta frecuencia. Las preferencias de codón para una especie específica son calculadas, por ejemplo, al utilizar tablas de utilización de codón disponibles en el INTERNET tal como URL dna . affre .go.jp/-nakamura/codon. html . Las modificaciones de secuencias adicionales son conocidas que incrementan la expresión de proteína a un hospedero celular. Estos incluyen la eliminación de secuencias que codifican señales de poliadenilación espurias, señales de sitio de empalme de exón/intrón, repeticiones similares a transposon y/u otras secuencias bien caracterizadas de tal clase que son perjudiciales para la expresión del gen. El contenido GC de la secuencia se ajusta a niveles promedios para un hospedero celular dado, como es calculado por referencia a genes conocidos expresados en la célula hospedera. Donde es posible, la secuencia es modificada para evitar las estructuras de mRNA de orquillas secundaria predichas. Otras modificaciones útiles incluyen la adición de una secuencia de consenso de iniciación traduccional en el inicio de la estructura de lectura abierta, como es descrito en Kozak, Mol. Cell Biol., 9:5073-5080 (1989) . Personas expertas entienden que la regla general de que los ribosomas eucarióticos inician la traducción exclusivamente en el codón AUG próximo 5' es anulado solamente . bajo condiciones raras (ver, por ejemplo, Kozak PNAS 92 (7) :2662-2666, (1995) y Kozak NAR 15 (20 ): 8125-8148 (1987) ) . III.) Proteínas relacionadas con PSCA Otro aspecto de la invención proporciona proteínas relacionadas con PSCA. Modalidades específicas de prote'ínas de PSCA comprenden un polipéptido que tiene todo o parte de las secuencias de aminoácidos del PSCA como es mostrado en la Figura 2 o la Figura 3. Alternativamente, las modalidades de las proteínas PSCA comprenden p'olipéptidos variantes, homólogos o análogos que tienen alteraciones en la secuencia de aminoácidos de PSCA mostrado en la Figura 2 o Figura 3. Las modalidades de un polipéptido PSCA incluyen: un polipéptido PSCA que tiene una secuencia mostrada en la Figura 2, una secuencia de péptido de un PSCA como se muestra en la Figura 2 donde T es U; por lo menos 10 nucleótidos contiguos de un de un polipéptido que tiene la secuencia como es mostrada en la Figura 2; o, por lo menos 10 péptidos contiguos de un polipéptido que tiene la secuencia como es mostrada en la Figura 2 donde T es U. Por ejemplo, las modalidades de péptidos PSCA comprenden, son limitación: (I) una proteina que comprende, que consiste esencialmente de, o que consiste de una secuencia de aminoácidos como es mostrada en la Figura 2A-H o Figura 3A-L; (II) una proteina relacionada con PSCA que es por lo menos 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100% homologa a una secuencia de aminoácidos completa mostrada en la Figura 2A-H o 3A-L; (III) una proteina relacionada con PSCA que es por lo menos 90, 91, 92, 93, 94, 95, "96, 97, 98, 99 o 100% idéntica a una secuencia de aminoácidos completa mostrada en la Figura 2A-H o 3A-L; (IV) una proteina que comprende por lo menos un péptido expuesto en las Tablas VIII a XLIX, opcionalmente con una condición de que no es una proteina completa de la Figura 2; (V) una proteina que comprende por lo menos un péptido expuesto en las Tablas VIII-XXI, colectivamente, el péptido que también se expone en las Tablas XXII a XLIX, colectivamente, opcionalmente con una condición de que no es una proteina completa de la Figura 2; (VI) una proteina que comprende por lo menos dos péptidos seleccionados de los péptidos expuestos en las Tablas VJII-XLIX, opcionalmente con una condición de que no es una protelna completa de la Figura 2; (VII) una proteína que comprende por lo menos dos péptidos seleccionados de los péptidos expuestos en las Tablas VIII a XLIX colectivamente, con una condición de que la proteina no es una secuencia contigua de una secuencia de aminoácidos de la Figura 2; (VIII) una proteína que comprende por lo menos un péptido seleccionado de los péptidos expuestos en las Tablas VIII-XXI; y por lo menos un péptido seleccionado de los péptidos expuestos en las Tablas XXII a XLIX, con una condición de que la proteína no es una secuencia contigua de una secuencia de aminoácido de la Figura 2; (IX) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteína de la Figura 3A en cualquier incremento de número entero de hasta 123 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Hidrofilicidad de la Figura 5; (X) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6 , 7 , 8 , 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 , 20 , 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de la Figura 3A, en cualquier incremento de número entero de hasta 123 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor menor que 0.5 en el perfil de Hidropaticidad de la Figura 6; (XI) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8,' 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, -16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de la Figura 3A, en cualquier incremento de número entero de hasta 123 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil del Por Ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; (XII) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteína de la Figura 3A, en cualquier incremento de número entero de hasta 123 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22 , 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Flexibilidad Promedio de la Figura 8 ; (XIII) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, "16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34 aminoácidos de una proteina de la Figura 3A en cualquier incremento de número entero de hasta 123 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil Beta-turn de la Figura 9; (XIV) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de la Figura 3B, en cualquier incremento de número entero de hasta 94 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Hidrofilicidad de la Figura 5; (XV) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de la Figura 3B, en cualquier incremento de número entero de hasta 94 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor menor que 0.5 en el perfil de Hidropaticidad de la Figura 6; (XVI) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de la Figura 3B, en cualquier incremento de número entero de hasta 94 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posició (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil del Por Ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; (XVII) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de la Figura 3B, en cualquier incremento de número entero de hasta 94 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 , 20 , 21, 22 , 23 , 24 , 25 , 26 , 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor más mayor que 0.5 en el perfil de Flexibilidad Promedio de la Figura 8; (XVIII) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, aminoácidos de una proteina de la Figura 3B en cualquier incremento de número entero de hasta 94 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil Beta-turn de la Figura 9; (XIX) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de las Figuras 3C, 3E-3L en cualquier incremento de número entero de hasta 189 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, .18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición(es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Hidrofilicidad de la Figura 5; (XX) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de las Figuras 3C, 3E-3L en cualquier incremento de número entero de hasta 189 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, "30, 31, 32, 33, 34, 35 posición(es) de aminoácido que tiene un valor menor que 0.5 en el perfil de Hidropaticidad de la Figura 6; (XXI) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de las Figuras 3C, 3E-3L en cualquier incremento de número entero de hasta 189 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, -18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición(es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil del Por Ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; (XXII) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de las Figuras 3C, 3E-3L en cualquier incremento de número entero de hasta 189 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, .33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Flexibilidad Promedio de la Figura 8; (XXIII) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, aminoácidos de una proteina de las Figuras 3C, 3E-3L en cualquier incremento de número entero de hasta 189 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17,' 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24,. 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición(es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0. 5 en el perfil Beta-turn de la Figura 9; (XXIV) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de la Figura 3D, en cualquier incremento de número entero de hasta 114 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Hidrofilicidad de la Figura 5; (XXV) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de la Figura 3D, en cualquier incremento de número entero de hasta 114 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor menor que 0.5 en el perfil de Hidropaticidad de la Figura 6; (XXVI) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, .21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de la Figura 3D, en cualquier incremento de número entero de hasta -114 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil del Por Ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; (XXVII) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 aminoácidos de una proteina de la Figura 3D, en cualquier incremento de número entero de hasta 114 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 , 20 , 21, 22 , 23 , 24 , 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Flexibilidad Promedio de la Figura 8 ; (XXVIII) un polipéptido que comprende por lo menos 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, aminoácidos de una proteína de la Figura 3D en cualquier incremento de número entero de hasta "114 respectivamente que incluye por lo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35 posición (es) de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil Beta-turn de la Figura 9; (XXIX) un péptido que ocurre por lo menos dos veces en las Tablas VIII-XXI y XXII a XLIX, colectivamente; (XXX) un péptido que ocurre por lo menos tres veces en las Tablas VIII-XXI y XXII a XLIX, colectivamente ; (XXXI) un péptido que ocurre por lo menos cuatro veces en las Tablas VIII-XXI y XXII a XLIX, colectivamente; (XXXII) un péptido que ocurre por lo menos cinco veces en las Tablas VIII-XXI y XXII a XLIX, colectivamente; (XXXIII) un péptido que ocurre por lo menos una vez en las Tablas VIII-XXI y por lo menos una vez en la tablas XXII a XLIX; (XXXIV) un péptido que ocurre por lo menos una vez en las Tablas VII-XXI y por lo menos dos veces en las tablas XXII a XLIX; (XXXV) un péptido que ocurre por lo menos dos veces en las Tablas VIII-XXI y por lo menos una ves en las tablas XXII a XLIX; (XXXVI) un péptido que ocurre por lo menos dos veces en las Tablas VIII-XXI y por lo menos dos veces en las tablas XXII a XLIX; (XXXVII) un péptido que comprende uno, dos, tres, cuatro o cinco de las siguientes características o un oligonucleótido que codifica tal péptido: i) una región de por lo menos 5 aminoácidos de un péptido particular de la Figura 3, en cualquier incremento de número entero de hasta la longitud completa de esa proteína en la Figura 3, que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor igual a, o mayor que 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9, o que tiene un valor igual a 1.0, en el perfil de Hidrofilicidad de la Figura 5; ii) una región de por lo menos 5 aminoácidos de un péptido particular de la Figura 3, en cualquier incremento de número entero de hasta la longitud completa de esa proteína en la Figura 3, que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor igual a, o menor que 0.5, 0.4, 0.3, 0.2, 0.1 o que tiene un valor igual a 0.0, en el perfil de Hidropaticidad de la Figura 6; iii) una región de por lo menos 5 aminoácidos de un péptido particular de la Figura 3, en cualquier incremento de número entero de hasta la longitud completa de esa proteina en la Figura 3, que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor igual a, o mayor que 0; 5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9 o que tiene un valor igual a 1.0, en el perfil del Por Ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; iv) una región de por lo menos 5 aminoácidos de un péptido particular de la Figura 3, en cualquier incremento de número entero de hasta la longitud completa de esa proteina en la Figura 3, que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor igual a, o mayor que 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9 o que tiene un valor igual a 1.0, en el perfil de Flexibilidad Promedio de la Figura 8; o, v) una región de por lo menos 5 aminoácidos de un péptido particular de la Figura 3, en cualquier incremento de número entero de hasta la longitud completa de esa proteina en la Figura 3, que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor igual a, o mayor que 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9 o que tiene un valor igual a 1.0, en el perfil Beta-turn de la Figura 9; (XXXVIII) una composición que comprende un péptido de (I)- (XXXVII) o un anticuerpo o región de enlace del mismo junto con excipiente farmacéutico y/o en una forma de dosis unitaria humana; (XXXIX) un método para utilizar un péptido de (I) - (XXXVII) , o un anticuerpo o región de enlace del mismo o una composición de (XXXVIII) en un método para modular una célula que expresa PSCA; (XL) un método para usar un péptido de (I)- (XXXVII) o un anticuerpo o región de enlace del mismo o una composición de (XXXVIII) en un método para el diagnóstico, profilaxis, pronóstico o tratamiento de un individuo guien lleva una célula que expresa PSCA; (XLI) un método para usar un péptido de (I)- (XXXVII) o un anticuerpo o región de enlace del mismo o una composición de (XXXVIII) en un método para el diagnóstico, profilaxis, pronóstico o tratamiento de un individuo quien lleva una célula que expresa PSCA, la célula de un cáncer de un tejido listado en la Tabla I; (XLII) un método para usar un péptido de (I)- (XXXVII) o un anticuerpo o región de enlace del mismo o una composición "de (XXXVIII) en un método para el diagnóstico, profilaxis, pronóstico o tratamiento de un cáncer; (XLIII) un método para usar un péptido de (I)- (XXXVII) o un anticuerpo o región de enlace del mismo o una composición de (XXXVIII) en un método para el diagnóstico, profilaxis, pronóstico o tratamiento de un cáncer de un tejido listado en la Tabla I; y; (XLIV) un método para usar un a péptido de (I)- (XXXVII) o un anticuerpo o región de enlace del mismo o una composición de (XXXVIII) en un método para identificar o caracterizar un modulador de una célula que expresa PSCA. Como se utiliza en la presente, un intervalo se entiende que divulga específicamente todas las posiciones unitarias enteras del mismo. Las modalidades típicas de la invención divulgadas en la presente incluyen polinucleótidos PSCA que codifican posiciones específicas de secuencias de mRNA de PSCA (y aquellas que son complementarias a aquellas secuencias) tales como aquellas que codifican las proteínas y/o fragmentos de las mismas, por ejemplo: (a) 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, 110, 115, 120 y 123 o más aminoácidos contiguos de PSCA variante 1; las longitudes máximas relevantes para otras variante es son: variante 3, 94 aminoácidos; variante 4, 189 aminoácidos, variante 6, 114 aminoácidos, variante 19, 189 aminoácidos, variante 20, 189 aminoácidos, variante 21, 189 aminoácidos, variante 22, 189 aminoácidos, variante 24, 189 aminoácidos, variante 25, 189 aminoácidos, variante 26, 189 aminoácidos y variante 27, 189 aminoácidos. En general, las variantes alélicas que ocurren de manera natural del PSCA humano comparten un alto grado de identidad estructural y homología (por ejemplo, 90% o más homología) . Típicamente, las variantes alélicas de una proteína de PSCA contienen sustituciones de aminoácidos conservativas dentro de las secuencias PSCA descritas en la presente o contienen una sustitución de un aminoácido de una posición correspondiente en un homólogo de PSCA. Una clase de variantes alélicas de PSCA son proteínas que comparten un alto grado de homología con por lo menos una región pequeña de una secuencia de aminoácidos PSCA particular, pero además contiene una desviación radical de la secuencia, tal como una sustitución no conservativa, truncamiento, inserción o desplazamiento de estructura. En comparaciones de secuencias de proteínas, los términos, similitud, identidad y homología cada uno tiene un significado distinto como es apreciado en el campo de la genética. Además, la ortología y paralogía pueden ser conceptos importantes que describen la relación de miembros de una familia de proteínas dadas en un organismo a los miembros de la misma familia en otros organismos. Las abreviaciones de aminoácidos se proporcionan en la Tabla II. Las sustituciones de aminoácido conservativas frecuentemente se pueden hacer una proteína sin alterar ya sea la conformación o la función de la proteína. Las proteínas de la invención pueden comprender 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 sustituciones conservativas.
Tales cambios incluyen la sustitución de cualquiera de isoleucina (I), valina (V) y leucina (L) para cualquiera de estos otros aminoácidos hidrofóbicos ; ácido aspártico (D) para ácido glutámico (E) y viceversa; glutamina (Q) para asparagina (N) y viceversa; y serina (S) para treonina (T) y viceversa. Otras sustituciones también pueden ser consideradas conservativas, dependiendo del medio ambiente del aminoácido particular y su función en la estructura tridimensional de la proteina. Por ejemplo, glicina (G) y alanina (A) pueden ser frecuentemente intercambiables, como puede ser alanina (A) y valina (V) . la metionina (M) , que es relativamente idrofóbica, frecuentemente puede ser intercambiable con leucina e isoleucina, y algunas veces con valina. Lisina (K) y arginina (R) son frecuentemente intercambiables en localizaciones en las cuales la característica significante del residuo de aminoácido es su carga y las pK' s diferentes de estos dos residuos de aminoácidos no son significantes. Todavía otros cambios pueden ser considerados "conservativos" en ambientes particulares (ver, por ejemplo Tabla III en la presente; páginas 13-15 "Bioc emistry" 2- Edición. Lubert Stryer ed (Stanford üniversity) ; Henikoff y colaboradores, PNAS 1992 Volumen 89 10915-10919; Lei y colaboradores, J Biol Chem 1995 mayo 19; 270 (20 ): 11882-6) . Las modalidades de la invención divulgadas en la presente incluyen una amplia variedad de variantes o análogos aceptados en la técnica de proteínas PSCA tales como polipéptidos que tienen inserciones de aminoácidos, supresiones y sustituciones. Las variantes PSCA se pueden hacer usando métodos conocidos en la técnica tal como la mutagénesis dirigida al sitio, exploración de alanina y la mutagénesis de PCR. La mutagénesis dirigida al sitio (Cárter y colaboradores, Nucí. Acids Res., 13:4331 (1986); Zoller y colaboradores, Nucí. Acids Res., 10:6487 (1987)), mutagénesis de cásete (Wells y colaboradores, Gene, 34:315 (1985)), mutagénesis de selección de restricción (Wells y colaboradores, Philos. Trans. R. Soc. London SerA, 317:415 (1986) ) u otras técnicas conocidas se pueden realizar en DNA clonado para producir el DNA de la variante de PSCA. El análisis de aminoácidos de exploración también se puede emplear para identificar uno o más aminoácidos a lo largo de una secuencia contigua que está implicada en la actividad biológica especifica tal como una interacción de proteina-proteina . Entre los aminoácidos de exploración preferidos están los aminoácidos relativamente pequeños, neutros. Tales aminoácidos incluyen alanina, glicina, serina y cisteina. La alanina es típicamente un aminoácido de exploración preferido entre este grupo debido a que elimina la cadena lateral más allá del beta-carbono y es menos probable que altere la conformación de la cadena principal de la variante. La alanina también es hípicamente preferida debido a que es el aminoácido más común. Además, frecuentemente se encuentra en posiciones tanto perforadas como expuestas (Cxeighton, The Proteins, (W.H. Freeman & Co., N.Y.); Chothia, J. Mol. Biol., 150:1 (1976)). Si la sustitución de alanina no produce cantidades adecuadas de variante, se puede utilizar un aminoácido isostérico. Como es definida en la presente, las variantes, análogos u homólogos de PSCA, tiene el atributo distintivo de tener por lo menos un epitope que es "reactivo cruzadamente" con una proteina PSCA que tiene una secuencia de aminoácidos de la Figura 3. Como se utiliza en esta oración, "reactivo cruzadamente" significa que un anticuerpo o célula T que específicamente enlaza una variante PSCA también específicamente enlaza una proteína PSCA que una secuencia de aminoácidos expuesta en la Figura 3.. Un polipéptido deja de ser una variante de una proteína mostrada en la Figura 3, cuando no contiene por más tiempo cualquier epitope capaz de ser reconocido por un anticuerpo o célula T que específicamente enlaza la proteína PSCA de partida. Aquellos expertos en la técnica entienden que los anticuerpos que reconocen proteínas se enlaza a epítopes de tamaño variable, y un agrupamiento del orden de aproximadamente cuatro o cinco aminoácidos, contiguos o no contiguos, se considera como un número típico de aminoácidos en el epitope mínimo. Ver, por ejemplo, Nair y colaboradores, J. Immunol 2000 165 (12) : 6949-6955; Hebbes y colaboradores, Mol Immunol (1989) 26(9) :865-73; Schwartz y colaboradores, J Immunol (1985) 135(4) :2598-608. Otras clases de variantes de proteína relacionadas con PSCA comparten 70%, 75%, 80%, 85% o 90% o más similitud con una secuencia de aminoácidos de la Figura 3, o un fragmento de la misma. Otra clase específica de variantes o análogos de proteína PSCA comprende una o más de las porciones biológicas PSCA descritas en la presente actualmente conocidas en la técnica. Así, comprendido por la presente invención están los análogos de fragmentos PSCA (nucleico o aminoácido) que tienen propiedades funcionales alteradas (por ejemplo inmunogénicas ) con relación al fragmento de partida. Se va a apreciar que las porciones ahora o que llegan a ser parte de la técnica van a ser aplicadas a las secuencias nucleicas o de aminoácidos de la Figura 2 o la Figura 3. Como es discutido en la presente, las modalidades de la invención reivindicada incluyen polipéptidos que contienen menos que la secuencia de aminoácidos completa de una proteína PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3. Por ejemplos, las modalidades representativas de la invención comprende péptidos/proteínas que tienen cualquiera de 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 o más aminoácidos contiguos de una proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3. Además, las modalidades representativas de la invención divulgadas en la presente incluyen polipéptidos que consisten de aproximadamente el aminoácido 1 a aproximadamente el aminoácido 10 de una proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, polipéptidos que consisten de aproximadamente el aminoácido 10 a aproximadamente el aminoácido 20 de una proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, polipéptidos que consisten de aproximadamente el aminoácido 20 a aproximadamente el aminoácido 30 de una proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, polipéptidos que consisten de aproximadamente el aminoácido 30 a aproximadamente el aminoácido 40 de una proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, polipéptidos que consisten de aproximadamente el aminoácido 40 a aproximadamente el aminoácido 50 de una proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, polipéptidos que consisten de aproximadamente el aminoácido 50 a aproximadamente el aminoácido 60 de una proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, polipéptidos que consisten de aproximadamente el aminoácido 60 a aproximadamente el aminoácido 70 de una proteina PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, polipéptidos que consisten de aproximadamente el aminoácido 70 a aproximadamente el aminoácido 80 de una proteína PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, polipéptidos que consisten de aproximadamente el aminoácido 80 a aproximadamente el aminoácido 90 de una proteína PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, polipéptidos que consisten de aproximadamente el aminoácido 90 a aproximadamente el aminoácido 100 de una proteína PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, etc. por toda la totalidad de una secuencia de aminoácidos PSCA. Además, los polipéptidos que consisten de aproximadamente el aminoácido 1 (o 20 o 30 o 40 etc.) a aproximadamente el aminoácido 20, (o 130, o 140 o 150 etc.) de una proteína PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3 son modalidades de la invención. Se va apreciar que las posiciones de inicio y de detención en este párrafo se refieren a la posición especificada así como esa posición más o menos 5 residuos. Las proteínas relacionadas con PSCA son generadas usando la tecnología de síntesis de péptido estándar o usando métodos de segmentación químicos bien conocidos en la técnica. Alternativamente, los métodos recombinantes se pueden usar para generar moléculas de ácido nucleico que codifica una proteína relacionada con PSCA. En una modalidad, las moléculas de ácido nucleico proporcionan un medio para generar fragmentos definidos de una proteína PSCA (o variantes, homólogos o análogos de la misma) . III.A.) Modalidades de Proteina que Llevan Porción Las modalidades ilustrativas adicionales de la invención, divulgadas en la presente incluyen polipéptidos PSCA que comprende los residuos de aminoácidos de una o más de las porciones biológicas contenidas dentro de una secuencia de polipéptido PSCA expuesta en la Figura 2 o la Figura 3. Varias porciones son conocidas en 'la técnica, y una proteina puede ser evaluada para la presencia de tales porciones mediante un número de sitios del Internet públicamente disponibles (ver, por ejemplo, las direcciones de URL: pfam.wustl.edu/; searchlauncher.bcm.tmc.edu/seq-search/struc-predict . html; psort . ims . u-tokyo .ac.jp/; cbs . dtu . dk/; ebi . ac . uk/interpro/scan. html ; expasy . ch/tools/scnpsitl .html; Epimatrix™ y Epimer™, Brown Uni ersity, brown. edu/Research/TB- HIV_Lab/epimatrix/epimatrix.html; y BIMAS, bimas . dcrt . nih . gov/ . ) . Las subsecuencias que llevan porción de todas las proteínas variantes de PSCA se exponen y se identifican en las Tablas VIII-XXI y XXII-XLIX. La Tabla V expone varias porciones f ecuentemente ocurrentes basados en búsquedas pfam (ver la dirección de URL pfam.wusti.edu/). Las columnas de la Tabla V listan (1) la abreviación del nombre de la posición, (2) el por ciento de identidad encontrado entre los diferentes miembros de la familia de porciones, (3) nombre o descripción de la porción y (4) la función más común; la información de la localización es incluida si la porción es relevante para la localización. Los polipéptidos que comprende uno o más de las porciones PSCA discutidas en lo anterior son útiles en poner en claro las características específicas de un fenotipo maligno en vista de la observación de que las porciones PSCA discutidas en lo anterior están asociadas con la desregulación del crecimiento y debido al PSCA es sobreexpresado en ciertos cánceres (Ver, por ejemplo, Tabla I) . La caseína quinasa II, cAMP y proteína quinasa dependiente de caitip, y Proteína Quinasa C, por ejemplo, son enzimas conocidas que están asociadas con el desarrollo del fenotipo maligno (ver por ejemplo Chen y colaboradores, Lab Invest., 78 (2) : 165-174 (1998); Gaiddon y colaboradores, Endocrinology 136 (10) : 4331-4338 (1995); Hall y colaboradores, Nucleic Acids Research 24 ( 6) : 1119-1126 (1996); Peterziel y colaboradores, Oncogene 18 (46) : 6322-6329 (1999) y O'Brían, Oncol. Rep. 5(2): 305-309 (1998)). Además, tanto la glicosilación y la miristoilación son modificaciones de proteína que están asociadas con el cáncer y la progresión del cáncer (ver, por ejemplo Dermis y colaboradores, Biochem. Biophys. Acta 1473 (1) : 21-34 (1999); Raju y colaboradores, Exp. Cell Res. 235 ( 1 ): 145-154 (1997)). La amidación es otra modificación de la proteina también asociada con el cáncer y la provisión del cáncer (ver por ejemplo Treston y colaboradores, J. Nati. Cáncer Inst. Monogr. (13) .169-175 (1992) ) . En otra modalidad, las proteínas de la invención comprenden uno o más de los epítopes inmunorreactivos identificados de acuerdo con métodos aceptados en la técnica, tal como los péptidos expuestos en las Tablas VIII-XXI y XXII-XLIX. Los epítopes CTL pueden ser determinados usando algoritmos específicos para identificar péptidos dentro de una proteína PSCA que son capaces de enlazar óptimamente a los alelos de HLA especificados (por ejemplo, Tabla IV; EpimatrixMR y EimerMR, Brown University, URL brown . edu/Research/TB-HIV__Lab/epimatrix/epimatrix . html; y BIMAS, URL bimas.dcrt.nih.gov/). Además, los procesos para identificar péptidos que tienen suficiente afinidad de enlace para las moléculas HLA y que están correlacionados con ser epítopes inmunogénicos, son bien conocidos en la técnica, y son llevados a cabo sin experimentación indebida. Además, los proceso para identificar péptidos que son epítopes inmunogénicos, son bien conocidos en la técnica, y se lleva a cabo sin experimentación indebida ya sea in vitro o in vivo. También conocidos en la técnica están los principios para crear análogos de tales epítopes con el fin de modular la inmunogenicidad. Por ejemplo, se comienza con epitope que lleva una porción CTL o HTL (ver, por ejemplo, las porciones/superporciones de HLA Clase I y HLA Clase II de la Tabla IV) . El epitope es análogo al sustituir un aminoácido en una de las posiciones especificas, y al reemplazarlo con otro aminoácido especifico para esa posición. Por ejemplo, en la base de los residuos definidos en la Tabla IV, se pueden sustituir un residuo perjudicial en favor de otro residuo, tal como un residuo preferido; sustituir un residuo preferido con un residuo preferido; o sustituir un residuo preferido que ocurre originalmente con otro residuo preferido. Las sustituciones pueden ocurrir en las posiciones fijadoras primarias y en otras posiciones de un péptido; ver, por e emplo, la Tabla IV. Una variedad de referencias reflejan la técnica que considera la identificación y generación de epitopes en una proteina de interés asi como análogos de la misma. Ver, por ejemplo, WO 97/33602 to Chesnut y colaboradores; Sette, Immunogenetics 1999 50(3-4): 201-212; Sette y colaboradores, J. Immunol. 2001 166 (2 ) : 1389-1397 ; Sidney y colaboradores, Hum. Immunol. 1997 58(l) :12-20; Kondo y colaboradores, Immunogenetics 1997 45 ( 4 ) : 249-258 ; Sidney y colaboradores, J. Immunol. 1996 157 ( 8 ) : 3480-90 ; y Falk y colaboradores, Nature 351:290-6 (1991); Hunt y colaboradores, Science 255:1261-3 (1992); Parker y colaboradores, J. Immunol. 149:3580-7 (1992); Parker y colaboradores, J. Immunol. 152:163-75 (1994)); Kast y colaboradores, 1994 152 ( 8 ) : 3904-12 ; Borras-Cuesta y colaboradores, Hum. Immunol . 2000 61 (3) :266-278; Alexander y colaboradores, J. Immunol. 2000 164(3); 164 (3) : 1625-1633; Alexander y colaboradores, PMID: 7895164, ül: 95202582; 0' Sullivan y colaboradores, J. Immunol. 1991 147 ( 8 ) : 2663-266 ; Alexander y colaboradores, Immunity 1994 1(9) :751-761 y Alexander y colaboradores, Immunol. Res. 1998 18 (2) :79-92. Modalidades relacionadas de la invención incluyen polipéptidos que comprenden combinaciones de las diferentes porciones expuestas en la Tabla VI y/o uno o más de los epitopes CTL predichos de las Tablas VIII-XXI y XXII-XLIX, y/o, uno o más epitopes HTL predichos de las Tablas XLVI-XLIX, y/o uno o más de las porciones de enlace de célula T conocidas en la técnica. Las modalidades preferidas no contienen inserciones, supresiones o sustituciones ya sea dentro de las porciones o dentro de las secuencias de intervención de los polipéptidos. Además, las modalidades que incluyen un número de residuos de aminoácidos ya sea N-terminales y/o C-terminales en cualquier lado de estas porciones pueden ser deseables (por ejemplo para incluir una porción más grande de la arquitectura del polipéptido en la cual está localizada la porción) . Típicamente, el número de residuos de aminoácidos de N-terminales y/o C-terminales en cualquier lado de una porción está entre aproximadamente 1 a 120 (1994)); Kast y colaboradores, 1994 152 (8) : 3904-12; Borras-Cuesta y colaboradores, Hum. Immunol . 2000 61(3) :266-278; Alexander y colaboradores, J. Immunol. 2000 164(3); 164 (3) :1625-1633; Alexander y colaboradores, PMID: 7895164, Ul: 95202582; O' Sullivan y colaboradores, J. Immunol. 1991 147 ( 8 ): 2663-2669; Alexander y colaboradores, Immunity- 1994 1(9):751-761 y Alexander y colaboradores, Immunol. Res. 1998 18 (2) :79-92. Modalidades relacionadas de la invención incluyen polipéptidos que comprenden combinaciones de las diferentes porciones expuestas en la Tabla VI y/o uno o más de los epitopes CT1 predichos de las Tablas VIII-XXI y XXII-XLIX, y/o, uno o más epitopes HTL predichos de las Tablas XLVI-XLIX, y/o uno o más de las porciones de enlace de célula T conocidas en la técnica. Las modalidades preferidas no contienen inserciones, supresiones o sustituciones ya sea dentro de las porciones o dentro de las secuencias de intervención de los polipéptidos. Además, las modalidades que incluyen un número de residuos de aminoácidos ya sea N-terminales y/o C-terminales en cualquier lado de estas porciones pueden ser deseables (por ejemplo para incluir una porción más grande de la arquitectura del polipéptido en la cual está localizada la porción) . Típicamente, el número de residuos de aminoácidos de N-terminales y/o C-terminales en cualquier lado de una porción está entre aproximadamente 1 a aproximadamente 100 residuos de aminoácido, de preferencia 5 a aproximadamente 50 residuos de aminoácido. Las proteínas relacionadas con PSCA están englobadas en muchas formas, de preferencia en forma aislada. Una molécula de proteína es PSCA purificada será sustancialmente libre de otras proteínas o moléculas que deterioran el enlace del PSCA al anticuerpo, célula T u otro ligando. La naturaleza y grado de aislamiento y purificación dependerá del uso propuesto. Las modalidades de las proteínas relacionadas con PSCA incluyen proteínas relacionadas con PSCA purificadas y proteínas relacionadas con . PSCA solubles, funcionales. En una modalidad, una proteína de PSCA soluble, funcional o fragmento de la misma retiene la habilidad para ser enlazada por el anticuerpo, célula T u otro ligando. La invención también proporciona proteínas PSCA que comprenden fragmentos biológicamente activos de una secuencia de aminoácidos PSCA mostrada en la Figura 2 o Figura 3. Tales proteínas exhiben propiedades de la proteína de PSCA de partida, tal como la habilidad para inducir la generación de anticuerpos que enlazan específicamente un epítope asociado con la proteína de PSCA de partida; para ser enlazada por tales anticuerpos; para inducir la activación de HTL o CTL; y/o, para ser reconocida por HTL o CTL que también específicamente enlaza la proteína de partida. Los polipéptidos relacionados con PSCA que 122 contienen estructuras particularmente interesantes pueden ser predichos y/o identificados usando varias técnicas analíticas bien conocidas en el arte, incluyen, por ejemplo, los métodos de análisis de C ou-Fasman, Garnier-Robson, Kyte-Doolittle, Eisenberg, Karplus-Schultz o Jameson-Wolf, o basado en inmunogenicidad. Los fragmentos que contienen tales estructuras son particularmente útiles en generar anticuerpos anti-PSCA específicos de subunidad o células T o en la identificación de factores celulares que enlazan a PSCA. Por ejemplo, se pueden generar perfiles de hidrofilicidad, y fragmentos de péptido inmunogénicos identificados, usando el método de Hopp, T.P. y Woods, K.R., 1981, Proc. Nati. Acad. Sci. E.Ü.A. 78:3824-3828. Los perfiles de hidropaticidad pueden ser generados, y los fragmentos de péptido inmunogénicos identificados, usando el método de Kyte, J. y Doolíttle, R.F., 1982, J. Mol. Biol. 157:105-132. Los perfiles del por ciento (%) de Residuos Accesibles pueden ser generados, y los fragmentos de péptido inmunogénicos identificados, usando el método de Janin J. , 1979, Nature 277:491-492. Los perfiles de flexibilidad promedio pueden ser generados, y los fragmentos de péptido inmunogénicos identificados, usando el método de Bhaskaran R., Ponnuswamy P.K., 1988, Int. J. Pept . Protein Res. 32:242-255. Los perfiles Beta-turn pueden ser generados, y los fragmentos de péptido inmunogénicos identificados, usando el método de 123 Deleage, G., Roux B . , 1987 , Protein Engineering 1:289-294. Los epitopes CTL pueden ser determinados usando algoritmos específicos para identificar péptidos dentro de una proteina PSCA que son capaces de enlazar óptimamente a los alelos HLA especificados (por ejemplo, al usar el sitio SYFPEITHI en la Red Mundial URL syfpeithi . bmi-heidelberg.com/; los listados en la Tabla IV (A) -(E); Epimatrix y Epimer , Bro n Umversxty, URL (brown.edu/Research/TB-HIV_Lab/epimatrix/epimatrix.html) ; y BIMAS, ÜRL bimas.dcrt.nih.gov/). Ilustrando esto, los péptidos de epitopes de PSCA que se presentan en el contexto de moléculas MHC de Clase I humanas, por ejemplo, HLA-A1, A2, ?3, All, A24, B7 y B35 fueron predichos (ver, por ejemplo, las Tablas VIII-XXI, XXII-XLIX) . Especificamente, la secuencia de aminoácidos completa de la proteina PSCA y porciones relevantes de otras variantes, es decir, para predicciones de HLA de Clase I de 9 residuos flanqueantes sobre lado de una mutación puntual o unión de exón, y para predicciones de HLA Clase II de 14 residuos flanqueantes sobre el otro lado de una mutación puntual o unión de exón correspondientes a variante, se introdujeron en el algoritmo de Búsqueda de Porción de Péptido HLA encontrado en el sito de la red de Bioinformatics and Molecular Analysis Section (BIMAS) listado en lo anterior; además del sitio SYFPEITHI, en URL syfpeithi.bmi-heidelberg.com/. 124 El algoritmo de búsqueda de porción de péptido HLA fue desarrollado por Dr. Ken Parker basado en enlaces de las secuencias de péptido especificas en la ranura de las moléculas de HLA Clase I, en particular HLA-A2 (ver, por ejemplo, Falk y colaboradores, Nature 351:290-6 (1991); Hunt y colaboradores, Science 255:1261-3 (1992); Parker y colaboradores, J. Immunol . 149:3580-7 (1992); Parker y colaboradores, J. Immunol. 152:163-75 (1994)). Este algoritmo permite la ubicación y la clasificación de péptidos 8-mer, 9-mer y 10-mer a partir de una secuencia de proteina completa para el enlace predicho al HLA-A2 asi como otras numerosas moléculas HLA Clase I. Muchos péptidos de enlace de HLA clase I son 8-, 9-, 10 o 11-mers. Por ejemplo, para HLA-A2 de Clase I, los epitopes de preferencia contienen una leucina (L) o metionina (M) en la posición 2 y una valina (V) o leucina (L) en el C-terminal (ver, por ejemplo, Parker y colaboradores, J. Immunol. 149:3580-7 (1992)). Los resultados seleccionados de los péptidos de enlace predichos de PSCA se muestran en las Tablas VIII-XXI y XXII-XLIX en la presente. En las Tablas VIII-XXI y XXII-XLVII, los candidatos seleccionados, 9-iuers y 10-mers, para cada miembro de familia se muestran junto con su ubicación, la secuencia de aminoácidos de cada péptido especifico y un registro de enlace estimado. En las Tablas XLVI-XLIX, los candidatos seleccionados, 15-mers, para cada miembro de familia se muestran junto con su ubicación, la 125 secuencia de aminoácidos de cada péptido especifico y un registro de enlaces estimado. El registro de enlace corresponde a la mitad de tiempo estimada de la disociación de los complejos que contienen el péptido a 37 °C en pH 6.5. Los péptidos con el registro de enlace más altos se predicen que son los más herméticamente enlazados a la HLA Clase I sobre la superficie de la célula por el periodo más grande de tiempo y asi representan los mejores objetivos inmunogénicos para el reconocimiento de la célula T. El enlace actual de los péptidos a un alelo HLA puede ser evaluado mediante la estabilización de la expresión HLA sobre la linea de células T2 defectuosas de procesamiento de antigenos (ver, por ejemplo, Xue y colaboradores, Prostate 30:73-8 (1997) y Peshwa y colaboradores, Prostate 36:129-38 (1998)). La inmunogenicidad de péptido específicos se puede evaluar in vitro mediante la estimulación de linfocitos T citotóxicos CD8+ (CTL) en la presencia de células que presentan antígeno tales como células dendríticas. Se va apreciar que cada epítope predicho por el sito BIMAS, los sitios Eimer™ y Epimatrix™, o especificado por las porciones del HLA clase I o clase II disponibles en la técnica o que llegan a ser parte de la técnica tal como se expone en la Tabla IV (o determinado usando el sitio de la Red Mundial URL syfpeithi.bmi-heidelberg.com/ o BIMAS, bimas.dcrt.nih.gov/) van a ser "aplicado" a una proteína PSCA 126 de acuerdo con la invención. Como se utiliza en este texto, "aplicado" significa que una proteina PSCA es evaluada, por ejemplo, visualmente o mediante métodos de descubrimiento de patrones basados en computadora, como es apreciado por aquellos expertos en la técnica relevante. Cada subsecuencia de proteina PSCA de 8, 9, 10 u 11 residuos de aminoácidos que lleva una porción de HLA Clase I, o una subsecuencia de 9 o más residuos de aminoácidos que llevan una porción HLA Clase II están dentro del alcance de la invención. III. B.) Expresiones de Proteínas Relacionadas de PSCA En una modalidad descrita en los ejemplos que siguen, PSCA puede ser convenientemente expresada en células (tal como células 293T) transfectadas con un vector de expresión comercialmente disponible tal como un vector de expresión inducido por CMV que codifica PSCA con una 6XHis C-terminal y marca MYC (pcDNA3.1/mycHIS, Invitrogen o Tag5, GenHunter Corporation, Nashville TN) . El vector Tag5 proporciona una señal secreción IgGK que puede ser usada para facilitar la producción de una proteína PSCA secretada en células transfectadas . El PSCA marcado con HIS secretado en el medio de cultivo puede ser purificado, por ejemplo, usando una columna de níquel usando técnicas estándares. III. C.) Modificaciones de Proteínas Relacionadas con PSCA 127 Las - modificaciones de las proteínas relacionadas con PSCA tales como modificaciones covalentes son incluidas dentro del alcance de la esta invención. Un tipo de modificación covalente incluye hacer reaccionar residuos de aminoácidos dirigidos de un polipéptido PSCA con un agente de derivación orgánico que es capaz de reaccionar con las cadenas laterales seleccionadas de los residuos N- o C-terminales de una proteina PSCA. Otro tipo de modificación covalente de un polipéptido PSCA incluido dentro del alcance de esta invención comprende alterar el patrón de glicosilación activo de una proteina de la invención. Otro tipo de modificación .covalente de PSCA comprende enlazar un polipéptido PSCA a una de una variedad de polímeros no proteinaceos , por ejemplo, polietilenglicol (PEG) , polipropilenglicol o polioxialquilenos , en la manera expuesta en las patentes norteamericanas Nos. 4,640,835; 4, 496, 689; 4,301,144; 4,670,417; 4,791,192 o 4,179,337. Las proteínas relacionadas con PSCA de la presente invención también se pueden modificar para formar una molécula quimérica que comprende PSCA fusionada a otro, secuencia de polipéptido o aminoácido heteróloga. Tal molécula quimérica puede ser sintetiza químicamente o recombinantemente . Una molécula quimérica puede tener una proteína de la invención fusionada a otro antígeno asociado con tumor o fragmento del mismo. Alternativamente, una proteina de acuerdo con la invención puede comprender una fusión de fragmentos de una secuencia PSCA (amino o ácido nucleico) tal que una molécula es creada que no es, a través de su longitud, directamente homologa a las secuencias de amino o ácido nucleico mostradas en las Figura 2 o Figura 3. Tal molécula quimérica puede comprender múltiplos de la subsecuencia misma de PSCA. Una molécula quimérica puede comprende una fusión de una proteina relacionada con PSCA con una marca de epitope polihistidina, que proporciona un epitope al cual el níquel inmovilizado puede enlazarse selectivamente, con citoquinas o factores de crecimiento. La marca de epitope es generalmente colocada en el amino o carboxilo-terminal de una proteína PSCA. En una modalidad alternativa, la molécula quimérica puede comprender una fusión de una proteína relacionada con PSCA con una inmunoglobulina o una región particular de una inmunoglobulína . Para una forma bivalente de la molécula quimérica (también referida como una "inmunoadhesina") , tal fusión podría ser a la región Fe de. una molécula IgG. Las fusiones Ig de preferencia incluyen la sustitución de una forma soluble (dominio de transmembrana suprimido o inactivado) de un polipéptido PSCA en lugar de por lo menos una región variable dentro de una molécula Ig. En una modalidad preferida, la fusión de inmunoglobulina incluye la articulación, CH2 y CH3, o la articulación de las regiones, 129 CH1, CH2 y CH3 de una molécula IgGI. Para producción de fusiones de inmunoglobulina ver, por ejemplo, patente norteamericana No. 5,428,130 expedida el 27 de junio de 1995. III. D.) Usos de proteínas relacionadas con PSCA Las proteínas de la invención tienen un número de diferentes usos específicos. Como la PSCA es altamente expresada en cánceres de próstata y otros cánceres, las proteínas relacionadas con PSCA se usan en métodos que estiman el estado de los productos de gen de PSCA en tejidos normales contra cancerosos, para de esta manera poner el claro el fenotipo maligno. Típicamente, los polipéptidos de regiones específicas de una proteína PSCA se usan para estimar la presencia de perturbaciones (tales como supresiones, inserciones, mutaciones puntuales etc.) en esas regiones (tales como regiones que contienen una o más porciones). Ensayes ejemplares utilizan anticuerpos o células T que dirigen las proteínas relacionadas con PSCA que comprende los residuos de aminoácidos de una o más de las porciones biológicas contenidas dentro una secuencia de polipéptido PSCA con el fin de evaluar las características de esta región en tejidos normales contra cancerosos o para inducir una respuesta inmune al epítope . Alternativamente, las proteínas relacionadas con PSCA que contienen los residuos de aminoácidos de una o más de las porciones biológicas en una proteína PSCA se usan para clasificar 130 factores que interactúan con esa región de PSCA. Los fragmentos/subsecuencias de proteina PSCA son particularmente útiles en generar y caracterizar anticuerpos específicos de dominio (por ejemplo, anticuerpos que reconocen un epítope extracelular o intracelular de una proteina PSCA) , para identificar agentes o factores celulares que enlazan a PSCA o un dominio estructural particular del mismo, en varios contextos terapéuticos y de diagnóstico, incluyendo pero no limitados a ensayos de diagnóstico, vacunas de cáncer y métodos para preparar tales vacunas. Las proteínas codificadas por los genes PSCA, o por análogos, homólogos o fragmentos de los mismos, tiene una variedad de usos, incluyendo pero no limitados a la generación de anticuerpos y en métodos para identificar ligandos y otros agentes y constituyentes celulares que enlazan a un producto de gen PSCA. Los anticuerpos resaltados contra una proteína PSCA o fragmento ' de la misma son útiles en ensayos de diagnóstico y de pronóstico, y metodologías de formación de imagen en el manejo de cánceres humanos caracterizado por la expresión de la proteína PSCA, tal como aquellos listados en la Tabla I. Tales anticuerpos pueden ser expresados intracelularmente y usados en métodos para tratar pacientes con tales cánceres. Los ácidos nucleicos o proteínas relacionadas con PSCA también se utilizan en la generación de respuestas HTL o CTL.
Varios ensayos inmunológicos útiles para la detección de proteínas PSCA son utilizados, incluyendo pero no limitados a varios tipos de radioinmunoensayos , ensayos inmunosorbentes enlazados a enzima (ELISA) , ensayos inmunofluorescentes enlazados a enzima (ELIFA) , métodos inmunocitoquímicos y los similares. Los anticuerpos pueden ser marcados y utilizados como reactivos de formación de imagen inmunológicos capaces de detectar las células que expresan PSCA (por ejemplo, en métodos de formación de imagen radioscintigráficos) . Las proteínas PSCA también son particularmente útiles en la generación de vacunas de cáncer, como es descrito adicionalmente en la presente. IV.) Anticuerpos PSCA Otro aspecto de la invención proporciona anticuerpos que enlazan a proteínas relacionadas con PSCA. Los anticuerpos preferidos específicamente enlazan una proteína relacionada PSCA y no enlazan (o enlazan débilmente) a péptidos o proteínas que no son proteínas relacionadas con PSCA bajo condiciones fisiológicas. En este contexto, ejemplos de condiciones fisiológicas- incluyen: 1) solución salina regulada con fosfato; 2) solución salina Tris-regulada que contiene Tris 25 mM y NaCl 150 mM ; o solución salina normal (NaCl 0.9%); 4) suero de animal tal como suero de humano; o 5) una combinación de cualquiera de 1) hasta 4); estas reacciones que de preferencia toman lugar en pH 7,5, 132 alternativamente en un intervalo de pH 7.0 a 8.0, o alternativamente en un intervalo de pH 6.5 a 8.5; también, estas reacciones que toman lugar a una temperatura entre 4°C a 37 °C. Por ejemplo, los anticuerpos que enlazan PSCA pueden enlazar proteínas relacionadas con PSCA tales como los homólogos o análogos de las mismas. Los anticuerpos PSCA de la invención son particularmente útiles en los ensayos de diagnóstico y pronóstico de cáncer (ver, por ejemplo, Tabla I) , y metodologías de formación de imagen. De manera similar, tales anticuerpos son útiles en el tratamiento, diagnóstico y/o en el pronóstico de otros cánceres, al grado de que el PSCA también es expresado o sobreexpresado en estos otros cánceres. Además, anticuerpos intracelularmente expresados (por ejemplo, anticuerpos de cadena individual) son terapéuticamente útiles en tratar cánceres en los cuales está involucrada la expresión de PSCA, tal como los cánceres de próstata avanzados o metastáticos . La invención también proporciona varios ensayos inmunológicos útiles para al detección y cuantificación de PSCA y proteínas relacionadas con PSCA imitantes. Tales ensayos pueden comprender uno o más anticuerpos PSCA capaces de reconocer y enlazar una proteína relacionada con PSCA, como sea apropiado. Estos ensayos se realizan con varios formatos de ensayo inmunológico bien conocido en la técnica, incluyendo pero no limitados a varios tipos de radioinmunoensayos , ensayos inmunosorbentes enlazados a enzima (ELISA) , ensayos inmunofluorescentes enlazados a enzima (ELIFA) y los similares. Los ensayos no de anticuerpo inmunológicos de la invención también comprenden ensayos de inmunogenicidad de célula T (inhibitorios o estimulatorios ) asi como ensayos de enlace del complejo de histocompatibilidad mayor (MHC) . Además, métodos de formación de imagen inmunológicos para la detección del cáncer de próstata y otros cánceres que expresan PSCA también son proporcionados por la invención, incluyendo pero no limitados a los métodos de formación de imagen radioscintigráficos usando anticuerpos PSCA marcados. Tales ensayos son clínicamente útiles en la detección, monitoreo y pronóstico de cánceres que expresan PSCA tal como el cáncer de próstata. Los anticuerpos de PSCA también se usan en métodos para purificar una proteína relacionada con PSCA y para aislar homólogos de PSCA y moléculas relacionadas. Por ejemplo, un método para purificar una proteína relacionada con PSCA comprende incubar un anticuerpo PSCA, que se ha acoplado a una matriz sólida, con un lisado u otra solución que contienen una proteína relacionada con PSCA bajo condiciones que permiten que el anticuerpo PSCA enlace a la proteína relacionada con PSCA; lavar la matriz sólida para 134 eliminar las impurezas; y eluir la proteina relacionada con PSCA del anticuerpo acoplado. Otros usos de anticuerpos PSCA de acuerdo con la invención incluyen la generación de anticuerpos anti-idiotipicos que imitan una proteina PSCA. Varios métodos para la preparación de anticuerpos son bien conocidos en la técnica. Por ejemplo, los anticuerpos se pueden preparar al inmunizar un hospedero mamifero adecuado usando una proteina relacionada con PSCA, péptido, o fragmento, en forma aislada o inmunoconjugada (Antibodies: A Laboratory Manual, CSH Press, Eds . , Harlow, and Lañe (1988) ; Harlow, Antibodies, Cold Spring Harbor Press, Y (1989) . Además, las proteínas de fusión de PSCA también pueden ser utilizadas, tal como una proteina de fusión GST PSCA. En una modalidad particular, una proteina de la fusión GST que comprende todo o la mayor parte de la secuencia de aminoácido de la Figura 2 o la Figura 3 es producida, luego utilizada como un inir.unógeno para generar anticuerpos apropiados. En otra modalidad, una proteina relacionada con PSCA es sintetiza y es usada como un inmunógeno . Además, las técnicas de inmúnización de DNA desnudo conocidas son utilizadas (con o sin proteina relacionada con PSCA purificada o células que expresan PSCA) para generar una respuesta inmune al inmunógeno codificado (para revisión, Donnelly y colaboradores, 1997, Ann. Rev. Immunol . 15: 617- 135 648) . La secuencia de aminoácidos de una proteina PSCA como se muestra en la Figura 2 o la Figura 3 puede ser analizada para seleccionar regiones especificas de la proteina PSCA para generar anticuerpos. Por ejemplo, los análisis de hidrofobicidad e hidrofilicidad de una secuencia de aminoácidos PSCA son utilizadas para identificar regiones hidrofilicas en la estructura de PSCA. Las regiones de una proteina PSCA que muestran estructura inmunogénica, asi como otras regiones y dominios, fácilmente pueden ser identificadas usando otros diversos métodos conocidos en la técnica, tal como el análisis de Chou-Fasman, Garnier-Robson, Kyte-Doolittle, Eisenberg, Karplus-Schultz o Jameson-Wolf . Los perfiles de hidrofilicidad pueden ser generados usando el método de Hopp, T.P. y el Bosque, K.R., 1981, Proc. Nati. Acad. Sci. E. ü. A. 78:3824-3828. Los perfiles de hidropaticidad pueden ser generados usando el método de Kyte, J. y Doolittle, R.F., 1982, J. Mol. Biol. 157:105-132. Los perfiles del por ciento (%) de Residuos Accesibles pueden ser generador usando el método de Janin J. , 1979, Nature 277:491-492. Los perfiles de Flexibilidad Promedio pueden ser generados usando el método de Bhaskaran R. , Ponnuswamy P.K., 1988, Int. J. Pept. Protein Res. 32:242-255. Los perfiles de beta-tunr pueden ser generados usando el método de Deleage, G. , Roux B., 1987, Protein Engineering 1:289-294. Asi, cada 136 región identificada por cualquiera de estos programas o métodos está dentro del alcance de la presente invención. Los métodos por la generación de anticuerpos PSCA además son ilustrados por medio de los ejemplos proporcionados en la presente. Los métodos para preparar una proteina o polipéptido para uso como un inmunógeno son bien conocidos en la técnica. También bien conocido en la técnica son los métodos para preparar conjugados inmunogénicos de una proteina con un portador, tal como BSA, KLH u otra proteina portadora. En algunas circunstancias,' la conjugación directa usando, por ejemplo, reactivos de carbodiimida son utilizados; en otros casos los reactivos de enlace tales como aquellos suministrados por Pierce Chemical Co., Rockford, IL, son efectivos. La administración de un inmunógeno PSCA es f ecuentemente conducida mediante la inyección durante un periodo de tiempo adecuado y con el uso de un adyuvante adecuado, como es entendido en la técnica. Durante el programa de inmunización, los títulos de anticuerpos pueden ser tomados para determinar la eficacia de la formación de anticuerpo. Los anticuerpos monoclonales PSCA pueden ser producidos por varios medios bien conocido en la técnica. Por ejemplo, las líneas de células inmortalizadas que secretan un anticuerpo monoclonal deseado son preparadas utilizando la tecnología hibridoma estándar de Kohler y Milsteín o 137 modificaciones que inmortalizan células B que producen anticuerpo, como es generalmente conocido. Las lineas de células inmortalizadas que secretan los anticuerpos deseados son clasificadas mediante inmunoensayo en el cual el antigeno es una proteina relacionada con PSCA. Cuándo se identifica el cultivo de célula inmortalizado apropiado, las células pueden ser expandidas y los anticuerpos producidos ya sea de cultivos ín vitro o de fluido de ascites. Los anticuerpos o fragmentos de la invención también pueden ser producidos, por medios recombinantes . Las regiones que enlazan específicamente a las regiones deseadas de una proteína PSCA también pueden ser producidas en el contexto de anticuerpos injertados quiméricos o de región de determinación de complementariedad (CDR) de múltiples orígenes de especies. Los anticuerpos PSCA humanos o humanizados también pueden ser producidos, y son producidos para el uso en contextos terapéuticos. Los métodos para humanizar anticuerpos de murino y otros anticuerpos no humanos, al sustituir uno o más de los CDRs de anticuerpo no humanos por secuencias de anticuerpo humanas correspondientes, son bien conocidos (ver por ejemplo, Jones y colaboradores, 1986, Nature 321:522-525; Riechmann y colaboradores, 1988, Nature 332:323-327; Verhoeyen y colaboradores, 1988, Science 239:1534-1536). Ver también, Cárter y colaboradores, 1993, Proc. Nati. Acad. Sci. EUA 138 89:4285 y Sims y colaboradores, 1993, J. Immunol. 151:2296. Los métodos para producir anticuerpos monoclonales completamente humanos incluyen los métodos de exhibición de fago transgénicos (para revisión ver, Vaughan y colaboradores, 1998, Nature Biotechnology 16:535-539). Los anticuerpos monoclonales PSCA completamente humanos pueden ser generados usando tecnologías de clonación empleando librerías combinatorias de gen Ig humano grandes (es decir, exhibición de fago) (Griffiths y Hoogenboom, Building an in vitro inmune system: human anribodies from phage display libraries. In: Protein Engineering of Antibody Molecules for Prophylactic and Therapeutic Applications in Man, Clark, M. (Ed.), Nottingham Academic, páginas 45-64 (1993); Burton y Barbas, Human Antibodies from combinatorial librarles. Id., páginas 65-82) . Los anticuerpos monoclonales PSCA completamente humanos también pueden ser producidos usando ratones transgénicos diseñados para contener los sitios del gene de inmunoglobulina humana como es descrito en Solicitud de Patente de PCT WO 98/24893, Kucherlapati y Jakobovits y colaboradores, publicada el 3 diciembre de 1997 (ver también, Jakobovits, 1998, Exp. Opin. Inves. Drugs 7(4): 607-614; patentes norteamericanas Nos. 6,162,963 expedida el 19 de diciembre del 2000; 6,150,584 expedida el 12 de noviembre del 2000; y 6,114598 expedida el 5 de septiembre del 2000). Este método evita la manipulación in v-itro requerida con la tecnología de exhibición de fago y eficientemente produce anticuerpos humanos auténticos de alta afinidad. La reactividad de los anticuerpos PSCA con una proteina relacionada con PSCA puede ser establecida mediante un número de medios bien conocidos, incluyendo el manchado de Western, inmunoprecipitación, ELISA, y análisis de FACS usando, como sea apropiado, proteínas relacionadas con PSCA, células que expresan PSCA o extractos de las mismas. Un anticuerpo PSCA o fragmento del mismo puede ser marcado con un marcador detectable o conjugados con una segunda molécula. Los marcadores detectables adecuados 'incluyen, pero no están limitados a, un radioisótopo, un compuesto fluorescente, un compuesto bioluminiscente, un compuesto quimioluminiscente, un agente quelante de metal o una enzima. Además, los anticuerpos bi-específicos específicos para dos o más epítopes PSCA son generados usando métodos generalmente conocidos en la técnica. Los anticuerpos homodiméricos también pueden ser generados mediante técnicas de reticulación conocidas en el arte (por ejemplo, Wolff y colaboradores, Cáncer Res. 53:2560-2565). V. ) Respuestas Inmunes Celulares PSCA El mecanismo mediante el cual las · células T reconocen antígenos ha sido delineado. Las composiciones de vacuna de epítope de péptido eficaces de la invención inducen una respuesta inmune terapéutica o profiláctica en segmentos 140 muy amplios de la población mundial . Para un entendimiento del valor y la eficacia de las composiciones de la invención que inducen respuestas inmunes celulares, se proporciona una breve revisión de la tecnología relacionada con la inmunología. Un complejo de una molécula HLA y un antígeno peptídico actúa como el ligando reconocido por las células T restringidas de HLA (Buus, y colaboradores, Cell 47:1071, 1986; Babbitt, B.P. y colaboradores, Nature 317:359, 1985; Townsend, A. y Bodmer, H., Annu. Rev. Inmuno1. 7:601, 1989; Germain, R.N., Annu. Rev. Immunol. 11:403, 1993). A través del estudio de los análogos de antígenos sustituidos de aminoácidos individuales y la secuenciación de los péptidos naturalmente procesados, endógenamente enlazados, los residuos críticos que corresponden a las porciones requeridas para el enlace específico a las moléculas de antígeno HLA han sido identificados y se exponen en la Tabla IV (ver también, por ejemplo, Southwood y colaboradores, J. Immunol. 160:3363, 1998; Rammensee y colaboradores, Immunogenetics 41:178, 1995; Rammensee y colaboradores, SYFPEITHI, access via World Wide Web at URL (134.2.96.221/scripts . hlaserver . dll/home . htm) ; Sette, A. y Sidney, J. Curr. Opin. Immunol. 10:478, 1998; Engelhard, V.H., Curr. Opin. Immunol. 6:13, 1994; Sette, A. y Grey, H.M., Curr. Opin. Immunol. 4:79, 1992; Sinigaglia, F. y Hammer, J. Curr. Biol. 6:52, 1994; Ruppert y colaboradores, 141 74:929-937, 1993; Kondo y colaboradores, J. Immunol. 155:4307-4312, 1995; Sidney y colaboradores, J. Immunol. 157:3480-3490, 1996; Sidney y colaboradores, Human Immunol. 45:79-93, 1996; Sette, A. y Sidney, J. Immunogenetics noviembre de 1999; 50(3-4): 201-12 Review) . Además, los análisis cristalográficos de rayos x de complejos de péptido HLA han revelados cavidades dentro de la hendidura/ranura de enlace de péptido de moléculas HLA que acomodan, en un modo especifico de alelo, los residuos llevados por los ligandos de péptido; estos residuos a su vez determinan la capacidad de enlace de HLA de los péptidos en los cuales ellos están presentes. (Ver, por ejemplo, Madden, D.R. Annu. Rev. Immunol. 13:587, 1995; Smith y colaboradores, Immunity 4:203, 1996; Fremont y colaboradores, Immunity 8:305, 1998; Stern y colaboradores, Structure 2:245, 1994; Jones, E.Y. Curr. Opin. Immunol. 9:75, 1997; Brown, J.H. y colaboradores, Nature 364:33, 1993; Guo, H.C. y colaboradores, Proc. Nati. Acad. Sci. EüA 90:8053, 1993; Guo, H.C. y colaboradores, Nature 360:364, 1992; Silver, M.L. y colaboradores, Nature 360:367, 1992; Matsumura, M. y colaboradores, Science 257:927, 1992; Madden y colaboradores, Cell 70:1035, 1992; Fremont, D.H. y colaboradores, Science 257:919, 1992; Saper, M.A., Bjorkman, P.J. y Wiley, D.C., J. Mol. Biol. 219:277, 1991). Por consiguiente, la definición de las porciones de enlace de HLA especificas del alelo de la clase I y clase II, o superporciones de la clase I o clase II permite la identificación de regiones dentro de una proteina que están relacionadas con el enlace al (los) antigeno (s) de HLA particular (es) . Asi, mediante un proceso de identificación de la porción HLA, se han identificado candidatos para las vacunas basadas en epitope; tales candidatos pueden ser además evaluados mediante los ensayos de enlace de HLA-péptido para detener el enlace de afinidad y/o por el periodo de tiempo de asociación del epitope y su molécula HLA correspondiente. El trabajo confirmatorio adicional se puede realizar para seleccionar, entre estos candidatos de vacuna, epitopes con características preferidas en términos de la cobertura de población y/o inmunogenicidad. Varias estrategias pueden ser utilizadas para evaluar la inmunogenicidad celular, incluyendo: 1) Evaluación de los cultivos de células T primarias a partir de individuos normales (ver, por ejemplo, Wentworth, P.A. y colaboradores, Mol Immunol. 32:603, 1995; Celis, E. y colaboradores, Proc. Nati. Acad. Sci. EUA 91:2105, 1994; Tsai, V. y colaboradores, J. Immunol 158:1796, 1997; Kawashima, I. y colaboradores, Human Immunol. 59:1, 1998). Este procedimiento implica la estimulación de los linfocitos de sangre periférica (PBL) de sujetos normales con un péptido de prueba en la presencia de células que presentan antigeno in vitro durante un periodo de varias semanas. Las células T especificas para el péptido llegan a ser activadas durante este tiempo y son detectadas usando, por ejemplo, un ensayo de linfocina o 51 Cr-liberación que implica células objetivo sensibilizadas de péptido. 2) Inmunización de ratones transgénicos HLA (ver, por ejemplo, Wentworth, P.A. y colaboradores, J. Immunol. 26:97, 1996; Wentworth, P.A. y colaboradores, Int. Immunol. 8:651, 1996; Alexander, J. y colaboradores, J. Immunol. 159:4753, 1997). Por ejemplo, en tales métodos los péptidos en adyuvante de Freund incompleto son administrados subcutáneamente a ratones transgénicos HLA. Varias semanas después de la inmunización, los esplenocitos son removidos y cultivados in vitro en la presencia del péptido de prueba por aproximadamente una semana. Las células T especificas de péptido son detectadas usando, por ejemplo, un ensayo de liberación de 51Cr que implica células objetivo, sensibilizadas de péptido y las células objetivo que expresan antigeno endógenamente generado. ¦ 3) Demostración de las respuestas de célula T de rellamada a partir de individuos inmunes quienes han sido efectivamente vacunados y/o de pacientes crónicamente enfermos (ver, por ejemplo, Rehermann, B. y colaboradores, J. Exp. Med. 181:1047, 1995; Doolan, D.L. y colaboradores, 144 Immunity 7:97, 1997; Bertoni, R. y colaboradores, J. Clin. Invest. 100:503, 1997; Threlkeld, S.C. y colaboradores, J. Immunol. 159:1648, 1997; Diepolder, H.M. y colaboradores, J. Virol. 71:6011, 1997). Por consiguiente, las respuestas de rellamada son detectadas al cultivar PBL de sujetos que se han expuesto al antigeno debido a la enfermedad y asi han generado una respuesta inmune "naturalmente" o de pacientes quienes se vacunaron contra el antigeno. PBL de sujetos se cultivaron in vitro durante 1-2 semanas en la presencia de las células que presentan antigeno más el péptido de prueba (APC) para permitir la activación de las células T "memoria", es comparado con las células "naive". Al final _ del periodo de cultivo, la actividad de la célula T es detectado usando ensayos incluyendo la liberación de 51Cr que implica objetivos sensibilizados de péptido, proliferación de célula T o la liberación de linfocina. VI.) Animales Transgénicos PSCA Los ácidos nucleicos que codifican una proteina relacionada con PSCA también pueden utilizados para generar animales ya sea transgénicos o animales "inactivados" que, a su vez, son útiles en el desarrollo y la clasificación de reactivos terapéuticamente útiles. De acuerdo con técnicas establecidas, el cDNA que codifica PSCA puede ser usado para clonar DNA genómico que codifica PSCA. Las secuencias genómicas clonadas luego pueden ser utilizadas para generar animales transgénicos que contienen células que expresa DNA que codifica PSCA. Los métodos para generar animales transgénicos, particularmente animales tales como ratones o ratas, han llegado a ser convencionales en la técnica y son descritos, por ejemplo, en las patentes norteamericana No. 4,736,866 expedida el 12 abril de 1988, y 4,870,009 expedida el 26 septiembre 1989. Típicamente, las células particulares serían dirigidas para la incorporación del transgen PSCA con los incrementadores específicos del tejido. Los animales transgénicos que incluyen una copia de un transgen que codifica PSCA pueden ser usados para examinar el efecto de la expresión incrementada de DNA que codifica PSCA. Tales animales pueden ser usados como animales probadores para reactivos a través de conferir protección de, por ejemplo, condiciones patológicas asociadas con su sobreexpresió . De acuerdo con este aspecto de la invención, un animal es tratado con un reactivo y una incidencia reducida de una condición patológica, comparada con los animales sin tratar que llevan el transgen, lo cual indicaría una intervención terapéutica potencial para la condición patológica. Alternativamente, homólogos no humanos de PSCA pueden ser usados para construir un animal "inactivado" PSCA que tiene un gen defectuoso o alterado que codifica PSCA como resultado de la recombinación homologa entre el gen endógeno 146 que codifica PSCA y DNA genómico alterado que codifica PSCA introducido en una célula embriónica del animal. Por ejemplo, el cDNA que codifica PSCA puede ser usado para clonar el DNA genómico que codifica PSCA de acuerdo con técnicas establecidas. Una porción del DNA genómico que codifica PSCA puede ser suprimida o reemplazada con otro gen, tal como un gen que codifica un marcador seleccionable que puede ser usado para monitorear la integración. Típicamente, varias kilobases de DNA flanqueantes no alterados (ambos en los extremos 5' y 3') son incluidos en el vector (ver, por ejemplo, Thomas y Capecchi, Cell, 51:503 (1987) para una descripción de vectores de recombinación homólogos) . El vector es introducido en una línea de células madre embriónicas (por ejemplo, mediante electroporacion) y células en las cuales el DNA introducido se ha recombinado homologamente con el DNA endógeno son seleccionadas (ver, por ejemplo, Li y colaboradores, Cell, 69:915 (1992)). Las células seleccionadas luego son inyectadas en un blastocisto de un animal (por ejemplo, un ratón o rata) para formar quimeras de agregación (ver, por ejemplo, Bradley, in Teratocarcínomas and Embryonic Stem Cells: A Practica! Approach, E.J. Robertson, ed. (IRL, Oxford, 1987), páginas 113-152). Un embrión quimérico luego puede ser implantado en un animal foster hembra, seudopreñado adecuado, y el embrión llevado al término para crear un animal "inactivado" . La 147 progenie que alberga el DNA homólogamente recombinado en sus células germinales puede ser identificado mediante técnicas estándares y usado para reproducir animales en las cuales todas las células del animal contienen el DNA homólogamente recombinado. Los animales inactivados pueden ser caracterizados, per ejemplo, por su habilidad para defenderse contra ciertas condiciones patológicas o para su desarrollo de condiciones patológicas debido a la ausencia de un polipéptido de PSCA. VII.) Métodos para la Detección de PSCA Otro aspecto de la presente invención se relaciona a métodos para detectar polinucleótidos PSCA y proteínas relacionadas con PSCA, así como métodos para identificar una célula que expresa PSCA. El perfil de expresión de PSCA lo hace un marcador de diagnóstico para la enfermedad metastasizada . Por consiguiente, el estado de los productos de gen PSCA proporciona información útil para predecir una variedad de factores incluyendo la susceptibilidad a la enfermedad en etapa avanzada, la proporción de progresión y/o agresividad del tumor. Como es discutido en detalle en la presente, el estado de los productos de gen PSCA en muestras de pacientes puede ser analizado mediante una variedad de protocolos que son bien conocidos en la técnica incluyendo el análisis de inmunohistoquímico, la- variedad técnicas de manchado Northern incluyendo la hibridación in situ, el 148 análisis RT-PCR (por ejemplo en muestras micro-disectadas de captura de láser) , análisis de manchado de Western y el análisis de arreglo de tejido. Más particularmente, la invención proporciona ensayos para la detección de polinucleótidos PSCA en una muestra biológica, tal como suero, hueso, próstata y otros tejidos, orina, semen, preparaciones celulares y similares. Los polinucleótidos PSCA detectables incluyen, por ejemplo, un gen PSCA o fragmento del mismo, mRNA de PSCA, mRNAs de PSCA variantes de empalme alternativos y moléculas de DNA o RNA recombinantes que contienen un polinucleótido PSCA. Un número de métodos para amplificar y/o detectar la presencia de polinucleótidos PSCA son bien conocidos en la técnica y se pueden emplear en la práctica de este aspecto de la invención . En una modalidad, un método para detectar un mRNA de PSCA en una muestra biológica comprende producir cDNA de la muestra mediante la transcripción inversa usando por lo menos un cebador; amplificar el cDNA asi producido usando polinucleótidos PSCA como cebadores de sentido y antisentido para amplificar los cDNAs de PSCA en la misma; y detectar la presencia del cDNA de PSCA amplificado. Opcionalmente, la secuencia del cDNA de PSCA amplificado puede ser determinada. En otra modalidad, un método para detectar un gen PSCA en una muestra biológica comprende primero aislar el DNA 149 genómico de la muestra; amplificar el DNA genómico aislado usando polinucleótidos PSCA como cebadores de sentido y antisentido; y detectar la presencia del gen PSCA amplificado. Cualquier número combinaciones de sondas de sentido y antisentido apropiadas pueden ser diseñadas a partir de una secuencia de nucleótido de PSCA (ver, por ejemplo, la Figura 2) y utilizada para este propósito. La invención proporciona también ensayos para detectar la presencia de una proteina PSCA en un tejido u otra muestra biológica tal como suero, semen, hueso, próstata, orina, preparaciones celulares y los similares. Los métodos para detectar una proteina relacionada con PSCA también son bien conocidos e incluyen, por ejemplo, la inmunoprecipitación, análisis inmunohistoquimico, análisis de manchado de Westerm, ensayos de enlaces moleculares, ELISA, ELIFA y los similares. Por ejemplo, un método para detectar la presencia de una proteina relacionada con PSCA en una muestra biológica comprende primero poner en contacto la muestra con un anticuerpo PSCA, un fragmento reactivo con PSCA del mismo, o una proteina recombinante que contiene una región de enlace de antigeno de un anticuerpo PSCA; y luego detectar el enlace de la proteina relacionada con PSCA en la muestra . Los métodos para identificar una célula que expresa PSCA también están dentro del alcance de la invención. En una 150 modalidad, un ensayo para identificar una célula que expresa un gen PSCA comprende detectar la presencia del mRNA de PSCA en la célula. Los métodos para la detección de mRNAs particulares en células son bien conocidos e incluyen, por ejemplo, los ensayos de hibridación usando sondas de DNA complementarias (tal como la hibridación in situ usando ribosondas de PSCA marcadas, manchado de Northern y técnicas relacionadas) y varios ensayos de amplificación de ácidos nucleicos (tal como RT-PCR usando cebadores complementarios específicos para PSCA, y otros métodos de detección de tipo de amplificación, tal como por ejemplo, DNA ramificado, SISBA, TMA y los similares) . Alternativamente, un ensayo para identificar una célula que expresa un gen PSCA comprende detectar la presencia de la proteína relacionada con PSCA en la célula o secretada por la célula. Varios métodos para detección de proteínas son bien conocidos en la técnica y son empleados para la detección de proteínas relacionadas con PSCA y células que expresan proteínas relacionadas con PSCA. El análisis de expresión PSCA también es útil como una herramienta para identificar y evaluar agentes que modulan la expresión del gen PSCA. Por ejemplo, la expresión PSCA es significativamente regulada hacia arriba en el cáncer de próstata, y es expresada en el cáncer de los tejidos listados en la Tabla I. La identificación de una molécula o agente biológico que inhibe la expresión de PSCA o la 151 sobreexpresión en células de cáncer es de valor terapéutico. Por ejemplo, tal agente puede ser identificado al usar una clasificación lo que cuantifica la expresión PSCA mediante RT-PCR, la hibridación de ácido nucleico o el enlace de anticuerpo . VIII.) Métodos para Monitorear el Estado de los Genes Relacionados con PSCA y sus Productos La oncogénesis se conoce que es un proceso de multietapas donde el crecimiento celular llega a ser progresivamente desregulado y las células progresan de un estado fisiológico normal a estados- precancerosos y luego cancerosos (ver, por ejemplo, Alers y colaboradores, Lab Invest, 77 (5) : 437-438 (1997) e Isaacs y colaboradores, Cáncer Surv. 23:19-32 (1995)). En este contexto, el examen de una muestra biológica para la evidencia del crecimiento de célula desregulado (tal como la expresión de PSCA aberrante en cánceres) permite la detección temprana de tal fisiología aberrante, - antes de un estado patológico tal como cáncer que haya progresado en una etapa de modo que las opciones terapéuticas más son limitadas y/o el pronóstico es peor. En tales exámenes, el estado del PSCA en una muestra biológica de interés puede ser comparado, por ejemplo, el estado del PSCA en una muestra normal correspondiente (por ejemplo una muestra de ese individuo o alternativamente otro individuo que no es afectado por una patología) . Una alteración en el 152 estado de PSCA en la muestra biológica (como es comparado con la muestra normal) proporciona evidencia del crecimiento celular desregulaco. Además de utilizar una muestra biológica que no es afectada por una patología como una muestra normal, también se puede usar un valor normativo predeterminado tal como un nivel normal predeterminado de la expresión de mRNA (ver, por ejemplo, Grever y colaboradores, J. Comp. Neurol. 9 de diciembre de 1996; 376 (2) : 306-14 y la patente norteamericana No. 5,837,501) para comparar el estado PSCA en una muestra. El término "estado" en este contexto se utiliza de acuerdo con su significado aceptado en la técnica y se refiere a la condición o estado de un gen y sus productos. Típicamente, las personas expertas usan un número de parámetros para evaluar la condición o estado de un gen y sus productos. Estos incluyen, pero no están limitados a la localización de productos de gen expresados (incluyendo la localización de células de expresan PSCA) así como el nivel, y la actividad biológica de los productos de gen expresados (tal como mRNA de PSCA, polinucleótidos y polipéptidos) . Típicamente, una alteración en el estado de PSCA comprende un cambio en la localización de PSCA y/o células que expresan PSCA y/o un incremento en el mRNA de PSCA y/o expresión de la proteína . El estado PSCA en una muestra puede ser analizado 153 mediante un número de medios bien conocidos en el arte, incluyendo sin limitación, el análisis inmunohistoquímico, hibridación in situ, análisis de RT-PCR sobre muestras micro-disectadas de captura de láser, análisis de manchado de Western y el análisis de arreglo de tejido. Los protocolos típicos para evaluar el estado de un gen PSCA y los productos de gen son encontrados, por ejemplo en Ausubel y colaboradores eds., 1995, Current Protocols In Molecular Biology, Unidades 2 (manchado de Northern) , 4 (manchado de Southern) , 15 (Inmunomanchado) y 18 (Análisis de PCR) . Así, el estado de PSCA en una muestra biológica es evaluado por varios métodos utilizados por personas expertas incluyendo, pero no limitado al análisis Southern genómico (para examinar, por ejemplo, las perturbaciones en un gen PSCA) , el análisis de Northern y/o el análisis de PCR del mRNA de PSCA (para examinar, por ejemplo las alteraciones en las secuencias de polinucleótido o niveles de expresión de mRNAs de PSCA) y, análisis de Western y/o inmunohistoquímicos (para examinar, las alteraciones en las secuencias de polipéptido, alteraciones en la localización del polipéptido dentro de una muestra, las alteraciones en los niveles de expresión de proteínas PSCA y/o asociaciones de proteínas PSCA con asociados de enlace polipéptido) . Los polinucleótidos PSCA detectables incluyen, por ejemplo, un gen PSCA o fragmento del mismo, mRNA de PSCA, variantes de empalmen alternativos, 154 mRNAs de PSCA y moléculas de DNA o RNA recombinantes que contienen un polinucleótido PSCA. El perfil de expresión de PSCA hace un marcador de diagnóstico para la enfermedad local y/o metastasizada, y proporciona información sobre el 'crecimiento o potencial oncogénico de una muestra biológica. En particular, el estado de PSCA proporciona información útil para predecir susceptibilidad a estados de enfermedad particulares, progresión y/o agresividad del tumor. La invención proporciona métodos y ensayos para determinar el estado de PSCA y diagnosticar cánceres que expresan PSCA, tal como los cánceres de los tejidos listados en la Tabla I. Por ejemplo, debido a que el mRNA de PSCA es altamente expresado en la próstata y otros cánceres con relación al tejido de próstata normal, los ensayos que evalúan los niveles de los transcriptos de mRNA de PSCA o proteínas en una muestra biológica pueden ser usados para el diagnóstico de una enfermedad asociada con la desregulación de PSCA, y puede proporcionar información de pronóstico útil en definir opciones terapéuticas apropiadas. El estado de expresión de PSCA proporciona información incluyendo la presencia, etapa y localización de células displásticas, precancerosas y cancerosas, que predicen la susceptibilidad a varias etapas de enfermedad, y/o para calibrar la agresividad del tumor. Además, el perfil 155 de expresión lo hace útil como un reactivo de formación de imagen para la enfermedad metastasizada . Consecuentemente, un aspecto de la invención se dirige a los diversos métodos de pronóstico y diagnóstico moleculares para examinar el estado de PSCA en muestras biológicas tales como aquellas de individuos que sufren de, o que sospechan de sufrir de una patología caracterizada por el crecimiento celular desrregulado, tal como cáncer. Como es descrito en lo anterior, el estado de PSCA en una muestra biológica puede ser examinado mediante un número de procedimientos bien conocidos en la técnica. Por ejemplo, el estado de PSCA en una muestra biológica tomada de una localización específica en el cuerpo puede ser examinado al evaluar la muestra para la presencia o ausencia de células que expresan PSCA (por ejemplo aquellas que expresan mRNAs de PSCA o proteínas) . Este examen puede proporcionar evidencia del crecimiento celular desregulado, por ejemplo, cuando las células que expresan PSCA son encontrados en una muestra biológica que normalmente no contiene tales células (tal como un ganglio linfático) , debido a que tales alteraciones en el estado de PSCA en una muestra biológica son frecuentemente asociados con el crecimiento celular desregulado. Específicamente, un indicador del crecimiento celular desregulado es la metástasis de células de cáncer de un órgano de origen (tal como la próstata) a un área diferente del cuerpo (tal como un ganglio linfático) . En este contexto, la evidencia del crecimiento celular desregulado es importante por ejemplo debido a que oculta las metástasis del ganglio linfático pueden ser detectadas en una proporción substancial de pacientes con cáncer de próstata, y tales metástasis están asociadas con predictores conocidos de la progresión de la enfermedad (ver, por ejemplo, Murphy y colaboradores, Prostate 42 ( 4 ) : 315-317 (2000); Su y colaboradores, Semin. Surg. Oncol . 18(l) :17-28 (2000) y Freeman y colaboradores, J Urol 1995 agosto 154(2 Pt 1) : 474-8) . En un aspecto, la invención proporciona métodos para monitorear los productos de gen PSCA al determinar el estado de los productos de gen PSCA expresados por las células de un individuo que sospecha de tener una enfermedad asociada con el crecimiento celular desrregulado (tal como la hiperplasia o cáncer) y luego al comparar el estado asi determinado con el estado de los productos de gen PSCA en una muestra normal correspondiente. La presencia de productos de gen PSCA aberrantes en la muestra de prueba con relación a la muestra normal proporciona una indicación de la presencia del crecimiento celular desrregulado dentro de las células del individuo . En otro aspecto, la invención proporciona ensayos útiles en determinar la presencia del cáncer en un individuo, que comprende detectar un incremento significante en el mRNA de PSCA o la expresión de proteína en una célula de prueba o muestra de tejido con relación a los niveles de expresión en la célula o tejido normal correspondiente. La presencia de mRNA de PSCA puede ser, por ejemplo, evaluado en tejidos incluyendo pero no limitados a aquellos listados en la Tabla I. La presencia de expresión PSCA significante en cualquiera de estos tejidos es útil para indicar la emergencia, presencia y/o severidad de un cáncer, puesto que los tejidos normales correspondientes no expresan mRNA de PSCA o lo expresan en niveles inferiores. En una modalidad relacionada, el estado PSCA se determina al nivel de proteína antes' que el nivel de ácido nucleico. Por ejemplo, tal método comprende determinar el nivel de proteína PSCA expresada por las células en una muestra de tejido de prueba y comparar el nivel así determinado con el nivel del PSCA expresado en una muestra normal correspondiente. En una modalidad, la presencia de proteína PSCA se evaluada, por ejemplo, usando métodos inmunohistoquímicos . Los anticuerpos PSCA o asociados de enlace capaces de detectar la expresión de proteína PSCA son utilizados en una variedad de formatos de ensayo bien conocido en la técnica para este propósito. En una modalidad adicional, se puede evaluar el estado de las secuencias de nucleótidos y aminoácidos PSCA en una muestra biológica con el fin de identificar las perturbaciones en la estructura de estas moléculas. Estas perturbaciones pueden incluir inserciones, supresiones, sustituciones y los similares. Tales evaluaciones son útiles debido a que las perturbaciones en las secuencias de nucleótidos y aminoácidos son observadas en un gran número de proteínas asociadas con un fenotipo desregulado de crecimiento (ver, por ejemplo, Marrogi y colaboradores, 1999, J. Cutan. Pathol . 26(8) :369-378. Por ejemplo, una mutación en la secuencia de PSCA puede ser indicativa de la presencia o promoción de un tumor. Tales ensayos por lo tanto tienen valor de diagnóstico y predictivo donde una mutación en PSCA indica una pérdida potencial de función o incremento en el crecimiento del tumor. Una gran variedad de ensayos para observar perturbaciones en secuencias de nucleótidos y aminoácidos son bien conocidos en la técnica. Por ejemplo, el tamaño y la estructura de las secuencias de ácido nucleico de aminoácido de los productos de gen PSCA son observados mediante los protocolos de Northern, Southern, Westerm, PCR y secuenciación de DNA discutidos en la presente. Además, otros métodos para observar perturbaciones en las secuencias de nucleótidos y el aminoácidos tal como el análisis de polimorfismo de conformación de hebra individual son bien conocidos en la técnica (ver, por ejemplo, las patentes 159 norteamericanas Nos. 5,382,510 expedida el 7 de septiembre de 1999 y 5,952,170 expedida el 17 de enero de 1995). Adicionalmente, se puede examinar el estado de metilación de un gen PSC7A en una muestra biológica. La desmetilación y/o hipermetilación aberrante de las isletas CpG en las regiones regulatorias 5' del gen, frecuentemente ocurre en células inmortalizadas y transformadas, y puede dar por resultado la expresión alterada de varios genes. Por ejemplo, la hipermetilación de promotor de la glutationa S-transferasa de clase pi (una proteina expresada en la próstata normal pero no expresada en >90% de carcinomas de próstata) aparece para permanentemente silenciar la transcripción de este gen y es la alteración genómica más frecuentemente detectada en los carcinomas de próstata (De Marzo y colaboradores, Am. J . Pathol. 155 ( 6) : 1985-1992 (1999) ) . Además, esta alteración está presente por lo menos 70% de los casos de neoplasia intraepitelial prostática de alto grado (PIN) (Brooks y colaboradores, Cáncer Epidemiol. Biomarkers Prev., 1998. 7:531-536).- En otro ejemplo, la expresión de gel especifico de tumor LAGE-I (que no es expresado en la próstata normal pero es expresado en 25-50% de cánceres de próstata) es inducido por deoxi-azacitidina en células linfoblastoides, sugiriendo que la expresión tumoral es debido a la desmetilación (Lethe y colaboradores, Int. J. Cáncer 76 (6):903-908 (1998)). Una variedad de ensayos para examinar el estado de metilación de un gen son bien conocidos en la técnica. Por ejemplo, se puede utilizar, en procedimientos de hibridación de Southern, enzimas de restricción sensibles a la metilación que no pueden segmentar las secuencias que contienen sitios CpG metilados para estimar el estado de metilación de las isletas CpG. Además, MSP (PCR especifica de metilación) puede rápidamente perfilar el estado de metilación de todos los sitios CpG presentes en una isleta CpG de un gen dado. Este procedimiento implica la modificación inicial del DNA mediante bisulfito de sodio (que convertirá toda la citocinas no metiladas a uracilo) seguido por la amplificación usando cebadores específicos para el DNA metilado contra el no metilado. Los protocolos que implican la interferencia de metilación también pueden ser encontrados, por ejemplo en Current Protocols In Molecular Biology, Unidad 12, Frederick M. Ausubel y colaboradores, eds., 1995. La amplificación del gen es un método adicional para estimar el estado del PSCA. La amplificación del gen se mide en una muestra directamente, por ejemplo, mediante el manchado de Southern o manchado de Northern convencional para cuantificar la transcripción de mRNA (Thomas, 1980, Proc. Nati. Acad. Sci. EUA, 77:5201-5205), manchado por punto (análisis de DNA) , o la hibridación in situr usando una sonda apropiadamente marcada, basada en las secuencias 161 proporcionadas en la presente. Alternativamente, los anticuerpos son empleados de modo que reconocen dúplex específicos, incluyendo dúplex DNA, dúplex RNA, y dúplex híbridos DNA-RNA o dúplex de DNA-proteína . Los anticuerpos a su vez son marcados y el ensayo llevado a cabo donde el dúplex es enlazado a una superficie, de modo que en la formación del dúplex sobre la superficie, puede detectar en la presencia del anticuerpo enlazado al dúplex. El tejido de biopsia o sangre periférica puede ser convenientemente analizado para la presencia de células de cáncer usando, por ejemplo, Northern, manchado por punto o análisis de RT-PCR para detectar la expresión de PSCA. La presencia del mRNA de PSCA amplificable por RT-PCR proporciona una indicación de la presencia de cáncer. Los ensayos de RT-PCR son bien conocidos en la técnica. Los ensayos de detección RT-PCR para células de tumor en sangre periférica están siendo actualmente evaluados para el uso en el diagnóstico y el manejo de un número de tumores sólidos humanos. En el campo del cáncer de próstata, estos incluyen ensayos de RT-PCR para la detección de células que expresan PSA y PSM (Verkaik y colaboradores, 1997, Urol . Res. 25:373-384; Ghossein y colaboradores, 1995, J. Clin. Oncol . 13:1195-2000; Heston y colaboradores, 1995, Clin, Chem. 41:1687-1688) . Un aspecto adicional de la invención es una estimación de la susceptibilidad de que un individuo tiene para desarrollar cáncer. En una modalidad, un método para predecir la susceptibilidad al cáncer comprende detectar el mRNA de PSCA o la proteina de PSCA en una muestra de tejido, su presencia que indica la susceptibilidad al cáncer, en donde el grado de expresión de mRNA de PSCA se correlaciona con el grado de susceptibilidad. En una modalidad especifica, la presencia de PSCA en la próstata u otro tejido es examinada, con la presencia de PSCA en la muestra que proporciona una indicación de la susceptibilidad de cáncer de próstata (o la emergencia o existencia de un tumor de próstata) . De manera similar, se puede evaluar la integridad de las secuencias de nucleótidos y aminoácidos de PSCA en una muestra biológica, con el fin de identificar las perturbaciones en la estructura de estas moléculas tales como inserciones, supresiones, sustituciones y los similares. La presencia de uno o más perturbaciones en los productos de gen PSCA en la muestra es una indicación de la susceptibilidad al cáncer (o la emergencia o existencia de un tumor) . La invención también comprende métodos para calibrar la agresividad del tumor. En una modalidad, un método para calibrar la agresividad de un tumor comprende determinar el nivel de mRNA de PSCA o proteina PSCA expresada por las células de tumor, comparar el nivel asi determinado con el nivel de mRNA de PSCA o proteina PSCA expresada en un 163 tejido normal correspondiente tomado del mismo individuo o una muestra de referencia de tejido normal, en donde el grado de mRNA de PSCA o expresión de proteina de PSCA en la muestra de tumor con relación a la muestra normal indica el grado de agresividad. En una modalidad específica, la agresividad de un tumor es evaluada al determinar el grado al cual el PSCA es expresado en las células del tumor, con los niveles expresión más altos que indican tumores más agresivos. Otra modalidad es la evaluación de la integridad de las secuencias de nucleótidos y aminoácidos de PSCA en una muestra biológica, con el fin de identificar las perturbaciones en la estructura de estas moléculas tales como inserciones, supresiones, sustituciones y los similares. La presencia de una o más perturbaciones indica tumores más agresivos. Otra modalidad de la invención se dirige a métodos para observar la progresión de una malignidad en un individuo a través del tiempo. En una modalidad, los métodos para observar la progresión de una malignidad en un individuo a través del tiempo comprende determinar el nivel de mRNA de PSCA o la proteína PSCA expresada por las células en una muestra del tumor, comparar el nivel así determinado con el nivel de mRNA de PSCA o proteína PSCA expresada en una muestra de tejido equivalente tomada del mismo individuo en un tiempo diferente, en donde el grado de mRNA de PSCA o expresión de proteína PSCA en la muestra de tumor a través del tiempo proporciona información sobre la progresión del cáncer. En una modalidad especifica, la progresión de un cáncer es evaluada al determinar la expresión de PSCA en las células de tumor a través del tiempo, donde la expresión incrementada a través del tiempo indica una progresión del cáncer. También, se puede evaluar integridad de las secuencias de nucleótidos y aminoácidos de PSCA en una muestra biológica con el fin de identificar las perturbaciones en la estructura de estas moléculas tales como inserciones, supresiones, sustituciones y los similares, donde la presencia de una o más perturbaciones indica una progresión del cáncer. Los procedimientos de diagnóstico anteriores pueden ser combinados con cualquiera de una amplia variedad de protocolos de pronóstico y diagnóstico conocidos en la técnica. Por ejemplo, otra modalidad de la invención se dirige a métodos para observar una coincidencia entre la expresión del gen PSCA o productos de gen PSCA (o perturbaciones en el gen PSCA y productos de gen PSCA) y un factor que está asociado con la malignidad, como un medio para diagnosticar y pronosticar el estado de una muestra de tejido. Una amplia variedad de factores asociados con la malignidad pueden ser utilizados, ta-1 como la expresión de genes asociados con la malignidad (por ejemplo PSA, PSCA y la expresión de PSM para el cáncer de próstata, etc.) así como observaciones citológicas gruesas (ver, por ejemplo, Bocking y colaboradores, 1984, Anal. Quant. Cytol. 6(2):74-88; Epstein, 1995, Hum. Pathol . 26 (2) : 223-9; Thorson y colaboradores, 1998, Mod. Pathol. 11 ( 6) : 543-51; Baisden y colaboradores, 1999, Am. J. Surg. Pathol. 23 ( 8 ) : 918-24 ) . Los métodos para observar una coincidencia entre la expresión del gen PSCA y los productos de gen PSCA (o perturbaciones en el gen PSCA y los productos de gen PSCA) y otro factor que está asociado con la malignidad son útiles-, por ejemplo, debido a la presencia de un conjunto de factores específicos que coinciden con la enfermedad proporciona información crucial para el diagnóstico y pronóstico del estado de una muestra de tej ido . En una modalidad, los métodos para observar una coincidencia entre la expresión del gen PSCA y los productos de gen PSCA (o perturbaciones en el gen PSCA y los productos de gen PSCA) y otro factor asociado con la malignidad comprende detectar la sobreexpresión del mRNA de PSCA o proteína en una muestra de tejido, detectar la sobreexpresión de mRNA de PSA o proteína en una muestra de tejido (o expresión de PSCA o PSM) , y observar una coincidencia del mRNA de PSCA o la proteína y el mRNA de PSCA o la sobreexpresión de proteína (o la expresión PSCA o PSM) . En una modalidad específica, la expresión de PSCA y mRNA de PSA en el tejido de próstata es examinado, donde la coincidencia 166 del PSCA y la sobreexpresión de mRNA de PSA en la muestra indica la existencia del cáncer de próstata, susceptibilidad al cáncer de próstata o emergencia o estado de un tumor de próstata . Los métodos para detectar y cuantificar. la expresión de mRNA de PSCA o proteínas son descritos en la presente, y las tecnologías de detención y cuantificación de ácido nucleico y proteína estándares son bien conocidas en la técnica. Los métodos estándares para la detección y cuantificación de mRNA de PSCA incluye la hibridación in situ usando ribosondas de PSCA marcadas, manchado de Northern y técnicas relacionadas usando sondas, de polinucleótido de PSCA, análisis de RT-PCR usando cebadores específico para PSCA, y otros métodos de detección de tipo amplificación, tal como, por ejemplo, DNA ramificado, SISBA, TMA y los similares. En una modalidad específica, el RT-PCR semi-cuantitativo es utilizado para detectar y cuantificar la expresión de mRNA de PSCA. Cualquier número de cebadores capaces de amplificar PSCA pueden ser usados para este propósito, incluyendo pero no limitados a varios conjuntos cebadores específicamente descritos en la presente. En una modalidad específica, los anticuerpos policlonales o monoclónales específicamente reactivos con la proteína PSCA de tipo silvestre pueden ser utilizados en un ensayo inmunohistoquímico de tejido de biopsia. 167 IX. ) Identificación de Moléculas que Interactúan con PSCA La proteina PSCA y secuencias de ácido nucleico divulgadas en la presente permiten a una persona experta identificar proteínas, moléculas pequeñas y otros agentes que interactúan con PSCA, así como rutas activadas por el PSCA por la vía de una variedad de protocolos aceptados en la técnica. Por ejemplo, se puede utilizar los llamados sistemas de trampa de interacción (también referido como el "ensayo de dos híbridos") . En tales sistemas, las moléculas interactúan y reconstituyen un factor de transcripción que dirige la expresión de un gen reportador, en donde la expresión del gen reportador es analizada. Otros sistemas identifican interacciones de proteína-proteína in vivo a través de la reconstitución de un activador transcripcional eucariótico, ver, por ejemplo, las patentes norteamericana No. 5,955,280 expedida el 21 de septiembre de 1999, 5,925,523 expedida el 20 de julio de 1999, 5,846,722 expedida el 8 de diciembre de 1998 y 6,004,746 expedida el 21 de diciembre de 1999. También están disponibles algoritmos en la técnica para las predicciones basadas en el genoma de la función de la proteína (ver, por ejemplo, Marcotte y colaboradores, Nature 402: 4 de noviembre de 1999, 83-86). Alternativamente se pueden -clasificar librerías de péptidos para identificar moléculas que interactúan con las 168 secuencias de proteina PSCA. En tales métodos, los péptidos que enlazan a PSCA son identificados al clasificar librerías que codifican una colección aleatoria o controlada de aminoácidos. Los péptidos codificados por las librerías son expresados como proteínas de fusión de proteínas de recubrimiento de bacteriófago, las partículas de bacteriófago luego son clasificadas contra la(s) proteina (s) de PSCA. Por consiguiente, los péptidos que tienen una amplia variedad de usos, tales como los reactivos terapéuticos, de pronóstico o de - diagnóstico, son así identificados sin ninguna información previa sobre la estructura de ligando esperado o la molécula receptora. Las librerías de péptidos típicas y los métodos de clasificación que pueden utilizados para identificar moléculas que interactúan con las secuencias de la proteína PSCA son divulgados por ejemplo en las patentes norteamericanas Nos. 5,723,286 expedida el 3 marzo de 1998 y 5,733,731 expedida el 31 de marzo de 1998. Alternativamente, las líneas de células que expresan PSCA son utilizadas para identificar interacciones de proteína-proteína mediadas por PSCA. Tales interacciones pueden ser examinadas usando técnicas de inmunoprecipitación (ver, por ejemplo, Hamilton B.J. y colaboradores, Biochem. Biophys. Res. Común. 1999, 261:646-51). La proteína PSCA puede ser inmunoprecipitada a partir de líneas de células que 169 expresan PSCA usando anticuerpos anti-PSCA. Alternativamente, los anticuerpos contra His-tag se pueden utilizar en una linea de células diseñada para expresar fusiones de PSCA y un His-tag (vectores mencionados en lo anterior) . El complejo inmunoprecipitado se puede examinar para la asociación de proteina mediante procedimientos tal como el manchado de Western, marcación con S-metiomna de proteínas, microsecuenciación de proteina, manchado de plata y electroforesis en gel bi-dimensional. Las moléculas pequeñas y ligandos que interactúan con PSCA pueden ser identificados a través de modalidades relacionadas de tales ensayos de clasificación. Por ejemplo, se pueden identificar moléculas pequeñas que interfieren con la función de la proteina, incluyendo moléculas que interfieren con la habilidad del PSCA para mediar fosforilación y desfosforilación, la interacción con moléculas de DNA o RNA como una indicación de la regulación de ciclos celulares, señalización de segundo mensajero o tumorigénesis . De manera similar, moléculas pequeñas que modulan el canal de ión relacionado con PSCA, bomba de proteina, o funciones de comunicación celular son identificadas y utilizadas para tratar pacientes que tienen un cáncer que expresa PSCA (ver, por ejemplo, Hille, B . , Ionic Channels of Excitable Membranes 2- Edición, Sinauer Assoc, Sunderland, MA, 1992). Además, los ligandos que 170 regulan la función PSCA pueden ser identificados basados en su habilidad para enlazar PSCA y activar una construcción reportadora. Los métodos típicos son discutidos por ejemplo en la patentes norteamericana No. 5,928,868 expedida el 27 de julio de 1999, e incluye métodos para formar ligandos de híbridos en los cuales un ligando es una molécula pequeña. En una modalidad ilustrativa, las células diseñadas para expresar una proteína de fusión de PSCA y una proteína de enlace de DNA es usan para co-expresar una proteína de fusión de un ligando híbrido/molécula pequeña y una proteína activadora transcripcional de librería de cDNA. Las células además contienen un gen reportador, la expresión del cual es condicionado sobre la proximidad de la primera y segunda proteína de fusión entre sí, un evento que ocurre solamente si el ligando híbrido enlaza los sitios objetivos en ambas proteínas híbridas. Esas células que expresan el gen reportador son seleccionadas y la molécula pequeña desconocida o el ligando desconocido es identificado. Este método proporciona un medio para identificar moduladores, que activan o inhiben PSCA. Una modalidad de esta invención comprende un método para clasificar una molécula que interactúa con una secuencia de aminoácidos PSCA mostrada en la Figura 2 o la Figura 3, que comprende las etapas de poner en contacto una población de moléculas con una secuencia " de aminoácidos PSCA, permitiendo que la población de moléculas y la secuencia de aminoácidos PSCA interactué bajo condiciones que facilitan una interacción, determinando la presencia de una molécula que interactúa con la secuencia de aminoácidos PSCA y luego separando las moléculas que no interactúan con la secuencia de aminoácidos PSCA de las moléculas que forman. En una modalidad especifica, el método además comprende purificar, caracterizar e identificar una molécula que interactúa con la secuencia de aminoácidos PSCA. La molécula identificada se puede usar para modular una función realizada por PSCA. En una modalidad preferida, la secuencia" de aminoácidos PSCA se pone en contacto con una librería de péptidos. X. ) Métodos y Composiciones Terapéuticas La identificación de PSCA como una proteína que es normalmente expresada en un conjunto restringido de tejidos, pero que también es expresada en cánceres tales como aquellos listados en la Tabla I, abre un número de procedimientos terapéuticos para el tratamiento de tales cánceres. Como se observa, las terapias antitumorales dirigidas han sido útiles cuando la proteína dirigida se expresa en tejidos normales, aun tejidos de órganos normales vitales. ün órgano vital es uno que es necesario para mantener la vida, tal como el corazón o el colon. Un órgano no vital es uno que puede ser removido después de lo cual el individuo es todavía capaz de sobrevivir. Ejemplos de órganos 172 no vitales son el ovario, pecho y próstata. Por ejemplo, Herceptin® es una sustancia farmacéutica aprobada por la FDA que tiene como su ingrediente activo un anticuerpo que es inmunorreactivo con la proteína variadamente conocida como HER2, HER2/neu y erb-b-2. Este es comercializado por Genentech y ha sido un tumor antitumoral comercialmente exitoso. Las ventas de Herceptin alcanzaron casi $400 millones en el 2002. Herceptin es un tratamiento para cáncer de pecho metastático positivo de HER2. Sin embargo, la expresión de HER2 no está limitada a tales tumores. La misma proteína es expresada en número de tejidos normales. En particular, se conoce que HER2/neu está presente en el riñon y el corazón normal, así estos tejidos están presentes en todos los recipientes humanos de Herceptin. La presencia de HER2/neu en el riñon normal también es confirmado por Latif, Z. y colaboradores, B.J.U. International (2002) 89:5-9. Como es mostrado en este artículo (que evaluó si el carcinoma de célula renal debe ser una indicación preferida para los anticuerpos anti-HER2 tal como Herceptin) tanto la proteína y el mRNA son producidos en tejidos renales benignos. Notablemente, la proteína HER2/neu fue fuertemente sobreexpresada en el tejido renal benigno. A pesar del hecho de que el HER2/neu es expresado en tales tejidos vitales como corazón y riñon, Herceptin es un fármaco muy útil, aprobado por la FDA y comercialmente 173 útil. El efecto de Herceptin en el tejido cardiaco, es decir, "cardiotoxicidad, " ha sido meramente un efecto secundario al tratamiento. Cuando los pacientes se trataron con Herceptin solamente, ocurrió cardiotoxicidad significante en un porcentaje muy bajo de pacientes. De observación particular, aunque el tejido del riñon es indicado que exhibe expresión normal, posiblemente aun la expresión más alta que el tejido cardiaco, el riñon no tiene efecto secundario al Herceptin apropiable cualquiera que sea. Además, del arreglo diverso de tejidos normales en el cual es expresada el HER2, hay muy poca ocurrencia de cualquier efecto secundario. Solamente el tejido cardiaco ha manifestado algún efecto secundario apreciable en todo. Un tejido tal como el riñon, donde la expresión HER2/neu es especialmente notable, no ha sido la base para ningún efecto secundario . Además, los efectos terapéuticos favorables se han encontrado para terapias antitumorales que dirigen el receptor de factor de crecimiento epidérmico (EGFR) . EGFR también es expresado en numerosos tejidos normales. Han existido efectos secundarios limitados en tejidos normales después del uso de la terapéutica anti-EGFR. Asi, la expresión de una proteina objetivo en el tejido normal, aun que el tejido normal vital, no anula la utilidad de un agente de dirección para la proteina como un 174 terapéutico para ciertos tumores en la cual la proteína también es sobreexpresada . Por consiguiente, los procedimientos terapéuticos que inhiben la actividad de una proteína de PSCA son útiles para pacientes que sufren de un cáncer que expresa PSCA. Estos procedimientos terapéuticos generalmente caen en dos clases. Una clase comprende varios métodos para inhibir el enlace o asociación de una proteína PSCA con su asociado de enlace o con otras proteínas. Otra clase comprende una variedad de métodos para inhibir la transcripción de un gen PSCA o la traducción de mRNA de PSCA. X.A.) Vacunas Anti-Cáncer La invención proporciona vacunas para el cáncer que comprenden una proteína relacionada con PSCA o ácido nucleico relacionado con PSCA. En vista de la expresión del PSCA, las vacunas para cáncer previenen y/o tratan los cánceres que expresan el PSCA con efectos mínimos o nada de efectos sobre los tejidos de no objetivo. El uso de un antígeno de tumor en una vacuna que genera respuestas humorales y/o inmunes mediadas por las célula como terapia anti-cáncer es bien conocida en la técnica y se ha empleado en el cáncer de próstata usando inmunógenos de PSMA humano y PAP de roedor (Hodge y colaboradores, 1995, Int. J. Cáncer 63:231-237; Fong y colaboradores, 1997, J. Immunol . 159:3113-3117) . Tales métodos pueden ser practicados fácilmente al 175 emplear una proteína relacionada con PSCA, o una molécula de ácido nucleico que codifica PSCA y vectores recom inantes capaces de expresar y presentar el inmunógeno PSCA (que típicamente comprende un número de anticuerpos o epítopes de células T) . las personas expertas entienden que una amplia variedad de sistemas de vacuna para el suministro de epítopes inmunorreactivos son conocidas en la técnica (ver, por ejemplo, Heryln y colaboradores, Ann Med 1999 febrero 31 (1) : 66-78; Maruyama y colaboradores, Cáncer Immunol Immunother 2000 junio 49 (3) : 123-32) . Brevemente, tales métodos para generar una respuesta inmune (por ejemplo humoral y/o mediada por las células) en un mamífero, comprende las etapas de: exponer el sistema inmune del mamífero a un epítope inmunorreactivo (por ejemplo un epítope presente en una proteína PSCA mostrada en la Figura 3 o análogo u homologa de la misma) de modo que el mamífero genere una respuesta inmune que es específica para ese epítope (por ejemplo genera anticuerpos que específicamente reconocen ese epítope) . En un método preferido, un inmunógeno PSCA contiene una porción biológica, ve por ejemplo, la Tablas VIII-XXI y XXII-XLIX, o un péptido de un intervalo de tamaño de PSCA indicado en la Figura 5, Figura 6 , Figura 7, Figura 8 y Figura 9. La proteína PSCA completa, regiones inmunogénicas o epítopes de la misma se pueden combinar y suministrar por varios medios. Tales composiciones dé vacuna pueden incluir, por ejemplo, lipopéptidos (por ejemplo, Vitiello, A. y colaboradores, J. Clin. Invest. 95:341, 1995), composiciones de péptido encapsuladas en microesferas de poli (DL-lacturo-co-glicoluro) ("PLG") (ver, por ejemplo, Eldridge y colaboradores, Molec. Imunol. 28:287-294, 1991: Alonso y colaboradores, Vaccine 12:299-306, 1994; Jones y colaboradores, Vaccine 13:675-681, 1995), composiciones de péptido contenidas en complejos inmuno estimulantes (ISCOMS) (ver, por ejemplo, Takahashi y colaboradores, Nature 344:873-875, 1990; Hu y colaboradores, Clin Exp Immunol. 113:235-243, 1998) , sistemas de péptido de antigeno múltiples (MAPAs) (ver por ejemplo, (ver por ejemplo, Tam, J.P., Proc. Nati. Acad. Sci. E.U.A. 85:5409-5413, 1988; Tam, J.P., J. Immunol. Methods 196:17-32, 1996), péptidos formulados como péptidos multivalentes ; péptidos para uso en sistemas de suministro balísticos, péptidos típicamente cristalizados, vectores de suministro viral (Perkus, M.E. y colaboradores, In: Concepts in vaccine development, Kaufmann, S.H.E., ed. , página 379, 1996; Chakrabarti, S. y colaboradores, Nature 320:535, 1986; Hu, S.L. y colaboradores, Nature 320:537, 1986; Kieny, M.-P. y colaboradores, AIDS BiolTechnology 4:790, 1986; op, F.H. y colaboradores, J. Infect. Dís. 124:148, 1971; Chanda, P.K. y colaboradores, Virology 175:535, 1990), partículas de origen viral o sintético (por ejemplo, Kofler, N. y colaboradores, 177 J. Immunol. Methods . 192:25, 1996; Eldridge, J.H. y colaboradores, Sem. Hematol 30:16, 1993; Falo, L.D., Jr. y colaboradores, Nature Med. 7:649., 1995), adyuvantes (Warren, H.S., Vogel, F.R. y Chedid, L.A. Annu. Rev. Immunol. 4:369, 1986; Gupta, R.K. y colaboradores, Vaccine 11:293, 1993), liposomas (Reddy, R. y colaboradores, J. Immunol. 148:1585, 1992; Rock, K.L., Immunol. Today 17:131, 1996), o cDNA desnudo o absorbido en partícula (Ulmer, J.B. y colaboradores, Science 259:1745, 1993; Robinson, H.L., Hunt, L.A. y Webster, R.G., Vaccine 11:957, 1993; Shiver, J.W. y colaboradores, In: Concepts in vaccine development, Kaufmann, S. H. E . , ed., página 423, 1996; Cease, K.B. y Berzofsky, J.A., Annu. Rev. Immunol. 12:923, 1994 y Eldridge, J.H. y colaboradores, Sem. Hematol. 30:16, 1993) . Las tecnologías de suministro dirigidas a la toxina también conocidas como dirección mediada por el receptor, tales como aquellas de Avant Immunotherapeutics, Inc. (Needham, Massachusetts) también pueden ser utilizadas. En pacientes con cáncer asociado con PSCA, las composiciones de vacuna de la invención también pueden se usadas en conjunción con otros tratamientos usados para cáncer, por ejemplo, cirugía, quimioterapia, terapias de fármaco, terapias de radiación, etc. incluyendo el uso en combinación con adyuvantes inmunes tales como IL-2, IL-12, GM-CSF y los similares. 178 Vacunas celulares: Los epítopes CTL puede ser determinados usando algoritmos específicos para identificar péptidos dentro de la proteína PSCA que enlaza los alelos HLA correspondientes (ver por ejemplo, Tabla IV; Epimer™ y Epimatrix™, Brown üniversity (URL brown.edu/Research/TB- HIV_Lab/epimatrix/epimatrix.html) ; y BIMAS, (URL bimas.dcrt.nih.gov/; SYFPEITHI en URL syfpeithi . bmi-heidelberg.com/). En una modalidad preferida, un inmunógeno PSCA contiene una o más secuencias de aminoácidos identificadas usando técnicas bien conocidas en el arte, tal como las secuencias mostradas en las Tablas VIII-XXI y XXII-XLIX o un péptido de 8, 9, 10 u 11 aminoácidos especificado por una porción/superporción HLA de la Clase I (por ejemplo, Tabla IV (A), Tabla IV (D) , o Tabla IV (E) ) y/o un péptido de por lo menos 9 aminoácidos que comprende una porción/superporción de HLA de Clase II (por ejemplo, Tabla IV (B) o Tabla IV (C) ) . Como es apreciado en el arte, la ranura de enlace HLA de Clase I es esencialmente de extremo cerrado de modo que los péptidos de sólo un intervalo de tamaño particular pueden fijarse en la ranura y ser enlazados, generalmente epítopes HLA de Clase I son de 8, 9, 10 u 11 aminoácidos de largo. En contraste, la ranura de enlace HLA de Clase II es esencialmente de extremo abierto; por lo tanto un péptido de aproximadamente 9 o más aminoácidos puede ser enlazado por una molécula HLA de Clase II. Debido a las diferencias de ranura de enlace entre las porciones de HLA de Clase I y II, HLA de Clase I son especificas de longitud, es decir, la posición dos de una porción de la Clase I es el segundo aminoácido en un amino para la dirección carboxilo del péptido. Las posiciones de aminoácidos en una porción de Clase II son relativamente solamente entre si, no el péptido global, es decir, los aminoácidos adicionales pueden ser unidos al amino y/o carboxilo terminal de una secuencia que lleva porción. Los epitopes HLA de Clase II son frecuentemente de 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 o 25 aminoácidos de largo, o más largos que 25 aminoácidos. Vacunas Basadas en Anticuerpo Una amplia variedad de métodos para generar una respuesta inmune en un mamífero son conocidos en la técnica (por ejemplo como la primera etapa en la generación de hibridomas) . Los métodos para generar una respuesta inmune en un mamífero comprenden exponer el sistema inmune del mamífero a un epítope inmunogénico sobre una proteína (por ejemplo una proteína PSCA) de modo que se genera una respuesta inmune. Una modalidad típica consiste de un método para generar una respuesta inmune PSCA en un hospedero, al poner en contacta el hospedero con una cantidad suficiente de por lo menos una célula B PSCA o epítope de célula T citotóxica o análogo del 180 mismo; y por lo menos un intervalo periódico después de poner en contacto nuevamente el hospedero con la célula B PSCA o el epitope de célula T citotóxico o análogo de la misma. Una modalidad especifica, consiste en un método para generar una respuesta inmune contra una proteina - relacionada con PSCA o un péptido multiepitópico hecho por el hombre que comprenden: administrar inmunógeno PSCA (por ejemplo una proteina PSCA o un fragmento de péptido del mismo, una proteina de fusión PSCA o análogo etc.) en una preparación de vacuna a un humano u otro mamífero. Típicamente, tales preparaciones de vacuna además contienen un adyuvante adecuado (ver, por ejemplo, la patente norteamericana No. 6,146,635) o un epitope ayudante universal tal como el péptido PADRE™ (Epimmune Inc., San Diego, CA; ver, por ejemplo, Alexander y colaboradores, J. Immunol. 2000 164 (3); 164 (3) : 1625-1633; Alexander y colaboradores, Immunity 1994 1(9):751-761 y Alexander y colaboradores, Immunol. Res. 1998 18 (2) : 79-92) . Un método alternativo comprende generar una respuesta inmune de un individuo contra un inmunógeno PSCA al : administrar in vivo al músculo o la piel del cuerpo del individuo una molécula de DNA que comprende una secuencia de DNA que codifica un inmunógeno PSCA, la secuencia de DNA . operativamente enlazada a las secuencias regulatorias que controlan la expresión de la secuencia de DNA; en donde la molécula de DNA es captada por las células, la secuencia de DNA es expresa en las 181 células y una respuesta inmune es generada contra el inmunógeno (ver, por ejemplo, la patente norteamericana No. 5,962,428). Opcionalmente un facilitador de vacuna genético tal como lipidos aniónicos; saponinas; lectinas; compuestos estrogénicos; alquilos inferiores hidroxilados; sulfóxido de dimetilo; y urea también es administrado. Además, un anticuerpo antiidiotipico puede ser administrado el cual imita el PSCA, con el fin de generar una respuesta al antigeno objetivo. Vacunas de Acido Nucleico: Las composiciones de vacunas de la invención incluyen modalidades mediadas por ácido nucleico. El DNA o el RNA que codifican la(s) proteína (s) de la invención se puede administrar a un paciente. Los métodos de inmunización genéticos pueden ser empleados para generar respuestas humorales e inmunes celulares profilácticas o terapéuticas dirigidas contra células de cáncer que expresan PSCA. Las construcciones que comprende DNA que codifica una proteína/inmunógeno relacionado con PSCA y las secuencias regulatorias apropiadas pueden ser inyectadas directamente en músculo o la piel de un individuo, tal que las células del músculo o la piel captan la construcción y expresan la proteína/inmunógeno PSCA codificado. Alternativamente, una vacuna comprende una proteína relacionada con PSCA. La expresión del inmunógeno de proteína .relacionado con PSCA da • por resultado la generación de la inmunidad humoral y celular profiláctica o terapéutica contra células que lleva una proteína PSCA. Varias técnicas de inmunización genéticas profilácticas y terapéuticas conocidas en la técnica pueden ser utilizadas (para revisión, ver la información y las referencias publicadas en la dirección de Internet genwéb.com). El suministro basado en ácido nucleico es descrito, por ejemplo en Wolff. y colaboradores, Science 247:1465 (1990) así como en las patentes norteamericanas Nos. 5, 580, 859; 5,58.9,466; 5, 804,566; 5,739,118; 5,736,524; 5,679,647; WO 98/04720. Ejemplos de tecnologías de suministro basados en DNA incluyen el suministro facilitado de "D A desnudo" (bupivicaína, polímeros, mediado por péptidos) complejos de lípido catiónico y el suministro mediado por partícula ("pistola génica") o el suministro mediado por presión (ver, por ejemplo, la patente norteamericana No. 5, 922, 687) . Para propósitos de inmunización terapéutica o profiláctica, las proteínas de la invención se pueden expresar por la vía de vectores virales o bacterianos. Varios sistemas de suministro de genes virales que pueden ser utilizado en la práctica de la invención incluyen, pero no están limitados a, vaccinia, fowlpox, canarypox, adenovirus, influenza, poliovirus, virus adenó-asociado, lentivirus y virus sindbis (ver, por ejemplo, Restifo, 1996, Curr. Opin. 183 Immunol. 8:658-663; Tsang y colaboradores J. Nati. Cáncer Inst . 87:982-990 (1995)). Los sistemas de suministro no virales también pueden ser empleados al introducir DNA desnudo que codifica una proteína relacionada con PSCA en el paciente (por ejemplo, intramuscularmente o intradérmicamente) para inducir una respuesta anti-tumoral. El virus de vaccinia es utilizad, por ejemplo, como un vector para expresar secuencias de nucleótidos que codifican los péptidos de la invención. En la introducción en un huésped, el virus de vaccinia recombinante expresa el péptido inmunogénico de proteina, y de esta manera induce una respuesta inmune del hospedero. Los vectores de vaccinia y métodos útiles en los protocolos de inmunización son descritos en, por ejemplo, la patente norteamericana No. 4, 722, 848. Otro vector es BCG (Bacill-e Calmette Guerin) . Los vectores de BCG son descritos en Stover y colaboradores, Nature 351:456-460 (1991). Una amplia variedad de otros vectores útiles para la administración terapéutica o la inmunización de los péptidos de la invención, por ejemplo adeno y vectores de virus de adeno-asociados, vectores retrovirales, vectores Salmonella typhi, vectores de toxina ántrax detoxicada y los similares, serán evidentes para aquellos expertos en la técnica a partir de la descripción en la presente. Así, los sistemas de suministro de gen se utilizan para suministrar una molécula de ácido nucleico relacionada con PSCA. En una modalidad, se emplea el cDNA de PSCA humano de longitud completa. En otra modalidadr las moléculas ácido nucleico PSCA que codifican el linfocito T citotóxico especifico (CTL) y/o epitopes de anticuerpos son empleados. Vacunas Ex Vivo Varias estrategias ex vivo también pueden ser empleada para generar una respuesta inmune. Un procedimiento involucra el uso células que presentan antigenos (APCs) tales como células de dendriticas (DC) para presentar antigeno PSCA al sistema inmune de un paciente. Las células dendriticas expresan moléculas MHC de clase I y clase II, co-estimulador B7 e IL-12, y asi de esta manera son células que presentan antigeno altamente especializadas. En el cáncer de próstata, las células de dendriticas autólogas pulsadas con péptidos del antigeno de membrana específicos de próstata (PSMA) están siendo usadas en un ensayo clinico de Fase I para estimular los sistemas inmunes de los pacientes, con cáncer de próstata (Tjoa y colaboradores, 1996, Prostate 28:65-69; Murphy y colaboradores, 1996, Prostate 29:371-380). Asi, las células dendriticas se pueden usar para presentar péptidos PSCA a células T en el contexto de las moléculas MHC clase I o II. En una modalidad, las células dendriticas autólogas son pulsadas con péptidos PSCA capaces de enlazar a moléculas MHC clase I y/o clase II. En otra modalidad, las células 185 dendriticas son pulsadas con la proteina PSCA completa. Todavía otra modalidad implica diseñar la sobreexpresión de un gen PSCA en células dendriticas usando varios vectores de implementación conocidos en la técnica, tal como adenovirus (Arthur y colaboradores, 1997, Cáncer Gene Ther. 4:17-25), retrovirus (Henderson y colaboradores, 1996, Cáncer Res. 56:3763-3770), lentivirus, virus adeno-asociado, transfección de DNA (Ribas y colaboradores, 1997, Cáncer Res. 57:2865-2869) , o transfección de RNA derivada de tumor (Ashley y colaboradores, 1997, J. Exp. Med. 186:1177-1182). Las células que expresan PSCA también pueden ser diseñadas para expresar moduladores inmunes, tales como GM-CSF y usados como agentes inmunizantes . X.B.) PSCA como un Objetivo Para la Terapia Basada en Anticuerpo La terapia es capaz del uso de dosificaciones reducidas de quimioterapia concomitante, particularmente para pacientes quienes no toleran la toxicidad del agente quimioterapéutico muy bien. Los pacientes con cáncer pueden ser evaluados para la presencia y nivel de expresión de PSCA, de preferencia utilizando estimaciones inmunohistoquímicas del tejido de tumor, formación de imagen PSCA cuantitativo, u otras técnicas que indican confiablemente la presencia y el grado de expresión PSCA, el análisis inmunohistoquímico de biopsias 186 de tumor o muestras quirúrgicas es preferido para propósito. Los métodos para análisis inmunohistoquimico de tejidos de tumor son bien conocidos en el arte. Los anticuerpos monoclonal anti-PSCA que tratan los cánceres de próstata y otros cánceres incluyen aquellos que inician una potente respuesta inmune contra el tumor o aquellos que son directamente citotóxicos. ? este respecto, los anticuerpos monoclonal anti-PSAC (mAbs) pueden inducir la lisis de célula de tumor mediante mecanismos de citotoxicidad de célula mediada por complemento o dependiente de anticuerpo (ADCC) , ambos de 'los cuales requieren una porción Fe intacta de la molécula de inmunoglobulina para la interacción con los sitios receptores Fe de la célula efectora o proteínas de complemento. Además, mAbs anti-PSCA que ejerce un efecto biológico directo sobre el crecimiento del tumor son útiles para tratar cánceres que expresan' PSCA. Los mecanismos mediante los cuales los mAbs directamente citotóxicos actúan incluyen: la inhibición del crecimiento de la célula, modulación de la diferenciación celular, modulación de los perfiles de factor de angiogénesis de tumor y la inducción de apoptosis. El (los) mecanismo (s) mediante el cual un mAb anti-PSCA particular ejerce un efecto anti-tumoral es avaluado usando cualquier número de ensayos in vitro que evalúan la muerte celular tal como ADCC, ADMMC, lisis de célula mediada por complemento y así sucesivamente, como es 187 generalmente en la técnica. En algunos pacientes, ' el uso anticuerpos monoclonales de murino y otros no humanos, o mAbs quiméricos humanos/de ratón pueden inducir respuestas inmunes de moderadas a fuertes contra el anticuerpo no humano. Esto puede dar por como resultado la evacuación del anticuerpo de la circulación y la eficacia reducida. En la mayoría de los casos severos, tal respuesta inmune puede conducir a la formación extensiva de complejos inmunes que, potencialmente, pueden causar falla renal. Por consiguiente, los anticuerpos monoclonales preferidos usados en los métodos terapéuticos de la invención son aquellos que son, ya sean completamente humanos o humanizados y que enlazan específicamente al antígeno PSCA objetivo con alta afinidad pero exhiben baja o nada de antigenicidad en el paciente. Los métodos terapéuticos de la invención contemplan la administración de mAbs anti-PSCA así como combinaciones, o cócteles, de diferentes mAbs. Tales cócteles de mAbs pueden tener ciertas ventajas mientras que ellos contengan mAbs que se dirigen a los epítopes diferentes, explotan diferentes mecanismos del efector o combinan mAbs directamente citotóxicos con mAbs que dependen de la funcionalidad del efector inmune. Tales mAbs en combinación pueden exhibir efectos terapéuticos sinergísticos . Además, los mAbs anti-PSCA pueden ser administrados concomitantemente con 188 otras modalidades terapéuticas, incluyendo pero no limitados a varios agentes quimioterapéuticos, bloqueadores de andrógeno, moduladores inmunes (por ejemplo, IL-2, GM-CSF) , cirugía o radiación. Los mAbs anti-PSCA son administrados en su forma "desnuda" o no conjugada, . o pueden tener un (os) agente (s) terapéutico (s) conjugado con estos. Las formulaciones de anticuerpo anti-PSCA son administradas por vía de cualquier ruta capaz de suministrar los anticuerpos a una célula de tumor. Las rutas de administración incluyen, pero no están limitadas a, intravenosa, intraperitoneal, intramuscular, intratumoral, intradérmica y los similares. El tratamiento generalmente involucra la administración repetida de la preparación de anticuerpo anti-PSCA, por la vía de una ruta aceptable de administración tal como la administración intravenosa (IV) , típicamente en una dosis en el intervalo de aproximadamente 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20 o 25 mg/kg de peso del cuerpo. En general, las dosis en el intervalo de 10-1000 mg de mAb por semana son efectivas y bien toleradas. Basado en la experiencia clínica con el mAb Herceptin™ en el tratamiento del cáncer de pecho metastático, una dosis de carga inicial de aproximadamente 4 mg/kg de peso del cuerpo del paciente IV, seguido por dosis semanales de aproximadamente 2 mg/kg IV de la preparación mAb anti-PSCA representa un régimen de dosificación aceptable. De 189 preferencia, la dosis de carga inicial se administra como una infusión de 90 minutos o de más tiempo. La dosis de mantenimiento periódica se administra como una infusión de 30 minutos o más tiempo, siempre que esté bien tolerada la dosis inicial. Como es apreciado por aquellos expertos en la técnica, varios factores pueden influenciar el régimen de dosis ideal en un caso particular. Tales factores incluyen, por ejemplo, la afinidad de enlace y la vida media del Ab o mAbs utilizados, el grado de expresión PSCA en el paciente, el grado de antigeno PSCA de cubierta en la circulación, el nivel de concentración de anticuerpo en estado permanente deseado, frecuencia del tratamiento y la influencia de agentes quimioterapéuticos u otros agentes usados en combinación con el método de tratamiento de la invención, asi como el estado de salud de un paciente particular. Opcionalmente, los pacientes deben ser evaluados para los niveles de PSCA en una muestra dada (por ejemplo los niveles de antigeno PSCA en circulación y/o células que expresan PSCA) con el fin de ayudar en la determinación del régimen de dosificación más efectivo, etc. Tales evaluaciones también son utilizadas para propósitos de monitoreo a través de la terapia, y son útiles para calibrar el éxito terapéutico en combinación con la evaluación de otros parámetros (por ejemplo, la citología de urina y/o niveles de inmunoCyt en la terapia de cáncer de vejiga, o por analogía, 190 niveles de PSA en el suero en la terapia de cáncer de próstata) . Los anticuerpos anti-PSCA ánti-idiotipicos también pueden ser utilizados en la terapia anti-cáncer como una vacuna para inducir una respuesta inmune a células que expresan una proteina relacionada con PSCA. En particular, la generación de anticuerpos anti-idiotipicos es bien conocida en la técnica; esta metodología puede ser fácilmente adaptada para generar anticuerpos anti-PSCA anti-idiotípicos que imitan un epítope sobre una proteína relacionada con PSCA (ver, (ver, por ejemplo, Wagner y colaboradores, 1997, Hybridoma 16:33-40; Foon y colaboradores, 1995, J. Clin. Invest. 96:334-342; Herlyn y colaboradores, 1996, Cáncer Immunol. Immunother. 43:65-76). Tal anticuerpo anti-idiotípico puede ser usado en estrategias de vacuna de cáncer. X.C.) PSCA como un Objetivo para Respuestas Inmunes Celulares Vacunas y métodos para preparar vacunas que contienen una cantidad inmunológicamente efectiva de uno o más péptidos de enlace HLA como es descrito en la presente son modalidades adicionales de la invención. Además, las vacunas de acuerdo con la invención comprenden composiciones de uno o de más de los péptidos reivindicados . Un péptido puede estar presente en una vacuna individualmente. 191 Alternativamente, el péptido puede existir como un homopolimero que comprende múltiples copias del mismo péptido, o como un heteropolimero de varios péptidos . Los polímeros tienen la ventaja de la reacción inmunológica incrementada y, donde epítopes de péptido diferentes son utilizados para constituir el polímero, la habilidad adicional para inducir anticuerpos y/o CTLs que reaccionan con diferentes determinantes antigénicos del organismo patogénico o el péptido relacionado con el tumor dirigido para una respuesta inmune. La composición puede ser una región que ocurre de manera naturalmente de un antígeno o se puede preparar, por ejemplo, recombinantemente o mediante síntesis química. Los portadores que pueden ser utilizados con las vacunas de la invención son bien conocidos en la técnica, e incluyen, por ejemplo, tiroglobulina, albúminas tal como albúmina de suero humano, toxoide de tétano, poliaminoácidos tales poli-L-licina, poli-L-ácido glutámico, influenza, proteína de núcleo del virus de hepatitis B, y los similares. Las vacunas pueden contener un diluyente fisiológicamente tolerable (es decir, aceptable) tal como agua, o solución salina, de preferencia solución salina regulada con fosfato. Las vacunas también típicamente incluyen un adyuvante. Los adyuvantes tal como el adyuvante de Freund incompleto, fosfato de aluminio-, hidróxido de aluminio, o alum son 192 ejemplos de materiales bien conocidos en la técnica. Adicionalmente, como es divulgado en la presente, las respuestas CTL pueden ser cebadas al conjugar péptidos de la invención a lipidos, tal como tripalmitoil-S-glicerilcisteinliseril-serina (P3CSS) . Además, un adyuvante tal como los oligonucleótidos sintéticos que contienen citosina-fosforotiolado-guanina (CpG) se han encontrado que incrementan las respuestas CTL de 10 a 100 veces. (Ver, por ejemplo E. G. Davila y Celis, J. Immunol . 165:539-547 (2000) ) . En la inmunización con una composición de péptido de acuerdo con la invención, por la vía de inyección, aerosol, oral, transdérmica, transmucosal, intrapleural, intratecal u otras rutas adecuadas, el sistema inmune del hospedero responde a la vacuna al producir grandes cantidades de CTLs y/o HTLs específicos para el antígeno deseado. Consecuentemente, el hospedero llega a ser por lo menos parcialmente inmune para el desarrollo posterior de células que expresan o sobreexpresan el antígeno PSCA, o se deriva en algún beneficio terapéutico cuando el antígeno fue asociado con el tumor. En algunas modalidades, puede ser deseable combinar los componentes de péptido clase 1 con componentes que inducen o facilitan la neutralización del anticuerpo y/o las respuestas de célula de T ayudantes dirigidas al antígeno 193 objetivo. Una modalidad preferida de tal composición comprende epitopes clase I y clase II de acuerdo con la invención. Una modalidad alternativa de tal composición comprende un epitopes clase I y/o clase II de acuerdo con la invención, junto con un epitope HTL reactivo cruzadamente tal como la molécula PADRE™ (Epi mune, San Diego, CA) (descrita por ejemplo, en la patente norteamericana número 5,736,142). Una vacuna de la invención también puede incluir células que presentan antigeno (APC) , tales como células dendriticas (DC) , como un vehículo para presentar péptidos de la invención. Las composiciones de vacuna pueden ser creadas in vitro, después de la movilización y recolección de células dendriticas, mediante lo cual la carga de células dendriticas ocurre in vitro. Por ejemplo, las células dendriticas son transferidas, por ejemplo, con un minigen de acuerdo con la invención, o son pulsadas con péptidos. La célula dendrítica luego puede ser administrada a un paciente para inducir respuestas inmunes in vivo. Las composiciones de vacuna, ya sea basadas en DNA o en péptido, también pueden ser administradas in vivo en combinación con la movilización de célula dendrítica mediante lo cual la carga de las células dendriticas ocurre in vivo. De preferencia, los siguientes principios son utilizados cuando se selecciona un arreglo de epitopes para la inclusión en una composición poliepitópica para el uso en 194 una vacuna, o para seleccionar epítopes discretos para ser incluidos en una vacuna y/o para ser codificados por ácidos nucleicos tal como un minigen. Es preferido que cada uno de los- siguientes principios sea equilibrado con el fin de hacer la selección. Los múltiples epítopes que son incorporados en una composición de vacuna dada, pueden ser, pero no necesitan ser, contiguos en secuencia en el antígeno nativo del cual se derivan los epítopes. 1. ) Se seleccionan epítopes que, en la administración, imitan las respuestas inmunes que se han observado que son correlacionadas con la evacuación del tumor. Para HLA Clase I este incluye 3-4 epítopes que proviene de por lo menos un antígeno asociado con tumor (TAA) . Para HLA Clase I una exposición razonada similar es empleada; nuevamente 3-4 epítopes son seleccionados de por lo menos un ??? (ver, por ejemplo, Rosenberg y colaboradores, la Science 278:1447-1450). Epítopes de un TAA pueden ser usados en combinación con epítopes de uno o más TAAs adicionales para producir una vacuna que se dirige a los tumores con patrones de expresión variables de TAAs frecuentemente expresados . 2. ) Se seleccionan epítopes que tiene la afinidad de enlace necesaria establecida para ser correlacionada con la inmunogenicidad: para HLA Clase I un IC50 de 500 nM o menor, frecuentemente 200 nM o menor; y para Clase II una IC50 195 de 1000 nM o menor. 3.) Suficientes péptidos que llevan superporción o un arreglo suficiente de péptidos que llevan porción especifica de alelo son seleccionados para dar cobertura de población amplia. Por ejemplo, es preferible tener por lo menos 80% de cobertura de la población. Un análisis de Monte Cario, una evaluación estadística conocida en la técnica, se puede emplear para estimar la extensión, o redundancia de, la cobertura de población. 4. ) Cuando seleccionan epítopes de antígenos relacionados con cáncer frecuentemente es utilizar seleccionar análogos debido a que el paciente puede tener tolerancia desarrollada al epítope nativo. 5.) De relevancia particular son los epítopes referidos como "epítopes empalmados". Los epítopes empalmados ocurren donde por lo menos dos epítopes se sobreponen en una secuencia de péptido dada. Una secuencia de péptido empalmada puede comprender epítopes de célula B, HLA clase I y/o HLA clase de II. Cuando se proporcionan .epítopes empalmados, un objetivo general es proporcionar el número más grande de epítopes por secuencia. Así, un aspecto es evitar proporcionar un péptido que es más largo que el amino terminal del epítope amino terminal y el carboxilo terminal del epítope carboxilo terminal en el péptido. Cuando se proporciona una secuencia multi-epitópica, tal como una 196 secuencia que comprende epitopes empalmados, generalmente es importante clasificar la secuencia con el fin de asegurar de que esta no tenga propiedades patológicas u otras propiedades biológicas perjudiciales. 6.) Si se crea una proteina poliepitópica, o cuando se crea un minigen, un objetivo es generar el péptido más pequeño que comprende los epitopes de interés. Este principio similar, si no es que el mismo como aquel empleado cuando se selecciona un péptido que comprende epitopes empalmados. Sin embargo, con un péptido poliepitópico artificial, el objetivo de minimización de tamaño es equilibrado contra la necesidad de integrar cualquiera de las secuencias espadadoras entre los epitopes en la proteina poliepitópica. Los residuos de aminoácidos espaciadores pueden ' ser, por ejemplo, introducidos para evitar epitopes conjuncionales (un epitope reconocido por el sistema inmune, no presente en el antigeno objetivo, y solamente creado por la yuxtaposición de epitopes hecha por el hombre) , o para facilitar la segmentación entre epitopes y de esta manera incrementar la presentación del epitope. Los epitopes conjuncionales son generalmente evitados debido a que el recipiente puede generar una respuesta inmune a ese epitope no nativo. De particular interés es un epitope conjuncional que es un "epitope dominante" . ün epitope dominante puede conducir a tal respuesta fervorosa de modo que las respuestas inmunes a otro epítopes son disminuidas o suprimidas. 7. ) Donde las secuencias de múltiples variantes de la misma proteína objetivo están presentes, los epítopes de péptido potenciales también pueden ser seleccionados en la base de su conservación. Por ejemplo, un criterio para la conservación puede definir que la secuencia completa de un péptido de enlace de HLA clase I o el núcleo 9-mer de un péptido de enlace clase II será conservado en un porcentaje designado de las secuencias evaluadas para un antígeno de proteína específico. X.C.l. Vacunas de inigen ün número de diferentes procedimientos están disponibles los cuales permiten el suministro simultáneo de múltiples epítopes. Los ácidos nucleicos que codifican los péptidos de la invención son una modalidad particularmente útil de la invención. Los epítopes para la inclusión en un minigen de preferencia son seleccionados de acuerdo con las guías expuestas en la sección previa. Un medio preferido para administrar ácidos nucleicos que codifican los péptidos de la invención usa construcciones de minigen que codifican un péptido que comprende uno o múltiples epítopes de la invención. El uso de minigenes de multi-epítopes es descrita enseguida y en, Ishioka y colaboradores, J. Immunol. 162:3915-3925, 1999; An, L. y Whitton, J.L., J. Virol. 198 71:2292, 1997; Thomson, S.A. y colaboradores, J. Immunol. 157:822, 1996; Whitton, J.L. y colaboradores, J. Virol. 67:348, 1993; Hanke, R. y colaboradores, Vaccine 16:26, 1998. Por ejemplo, un plásmido de DNA multí-epítope que codifica epitopes que llevan superporción y/o porción derivados de PSCA, el epitope de célula T ayudante universal PADRE®; o epitopes de HTL múltiples de PSCA (ver por ejemplo, las Tablas VIII-XXI y XXII a XLIX) , y una secuencia de señal de translocalización de retículo endoplásmico puede ser diseñada. Una vacuna también puede comprender epitopes que son derivados de otros TAAs . La inmunogenicidad de un minigen multi-epitópico puede ser confirmada en ratones transgénicos para evaluar la magnitud de las respuestas de inducción de CTL contra los epitopes probados. Además, la inmunogenicidad de los epitopes codificados de DNA in vivo puede ser correlacionada con las respuestas in vitro de líneas CTL específicas contra células objetivo transfectadas con el plásmido de DNA. Así, estos experimentos pueden mostrar que el minigen sirve pata tanto: 1.) generar una respuesta CTL y 2.) que los CTLs inducidos reconocieron células que expresan los epitopes codificados. Por ejemplo, para aplicar una secuencia de DNA que codifica los epitopes seleccionados (minigen) para la expresión en células humanas, las secuencias de aminoácido de los epitopes pueden ser traducidas inversamente. Una tabla de 199 utilización de codones humanos puede ser usada para guiar la elección de codón para cada aminoácido. Estas secuencias de DNA que codifican epitope pueden ser directamente unidas, de modo que cuando se traducen, se crea una secuencia polipéptido continuo. Para optimizar la expresión y/o inmunogenicidad, elementos adicionales pueden ser incorporados en el diseño de minigen. Ejemplos de secuencias de aminoácidos que pueden ser traducidas inversamente e incluidas en la secuencia de minigen incluyen: epitopes HLA clase I, epitopes HLA clase II, epitopes de anticuerpo, una secuencia de señal de ubiquitinación, y/o una señal de dirección de retículo endoplásmico . Además, la presentación de HLA de los epitopes CTL y HTL puede ser mejorada al incluir secuencias flanqueantes sintéticas (por ejemplo poli-alanina) o que ocurren de manera natural adyacentes a los epitopes CTL o HTL; estos péptidos más grande que comprenden el (los) epitope (s) están dentro del alcance de la invención. La secuencia de minigen puede ser convertida a DNA al ensamblar oligonucleótidos que codifican las hebras más y menos del minigen. Los oligonucleótidos sobrepuestos (30-100 bases de largo) pueden ser sintetizados, fosforilados, purificados y templados bajo condiciones apropiadas usando técnicas bien ' conocidas . Los extremos de los oligonucleótidos pueden ser unidos, por ejemplo, usando ligase de DNA T4. Este 200 minigen sintético, que codifica el polipéptido de epítope, luego puede ser clonado en un vector de expresión deseado. Las secuencias regulatorias estándares bien conocidas para aquellos expertos en la técnica de preferencia son incluidas en el vector para asegurar la expresión en las células objetivo. Varios elementos de vector son deseables: un promotor con un sitio de clonación corriente abajo para la inserción del minigen; una señal de poliadenilación para la terminación de transcripción eficiente; un origen de E. coli de replicación; y un marcador seleccionable de E. coli (por e emplo resistencia a ampicilina o canamicina) . Numerosos promotores pueden ser utilizados para este propósito, por e emplo, el promotor de citomegalovirus humano (hCMV) . Ver, por ejemplo, las patentes norteamericanas Nos. 5,580,859 y 5,589,466 para otras secuencias de promotor adecuadas. Las modificaciones del vector adicionales pueden ser deseadas para optimizar la expresión de minigen y la inmunogenicidad. En algunos casos, los intrones son requeridos para la expresión del gen eficiente, y uno o más intrones que ocurren de manera natural o sintética podrían ser incorporados en la región transcrita del minigen. La inclusión de secuencias de estabilización de mRNA y secuencias para la replicación en células mamíferas también pueden ser consideras para incrementar la expresión del minigen. 201 Una vez que se selecciona un vector de expresión, el minigen es clonado en la región del polienlazador corriente abajo del promotor. Este plásmido es transformado en una cepa de E. coli apropiada, y el DNA es preparado usando técnicas estándares. La orientación y la secuencia de DNA del minigen, asi como otros elementos incluidos en el vector, son confirmados usando el mapeo de restricción y el análisis de secuencia de DNA. Las células bacterianas que albergan el plásmido correcto pueden ser almacenadas como un banco células maestro y un banco de células de trabajo. Además, las secuencias inmunoestimulatorias (ISSs o CpGs) aparecen para desempañar una función en la inmunogenicidad de las vacunas de DNA. Estas secuencias pueden ser incluidas en el vector, fuera de la secuencia de codificación de minigen, si es deseado para incrementar la inmunogenicidad. En algunas modalidades, un vector de expresión bi-cistrónico que permite la producción de ambos de los epitopes codificados de minigen y una segunda proteina (incluida para incrementar o disminuir la inmunogenicidad) puede ser utilizado. Ejemplos de proteínas o polipéptidos que podrían incrementar benéficamente la · respuesta inmune si es co-expresado incluyen citoquinas (por ejemplo, IL-2, IL-12, GM-CSF) , moléculas que inducen citoquina (por ejemplo, LelF) , moléculas coestimulatorias , o para respuestas HTL, proteínas 202 que enlazan pan-DR (PADRE™, Epimmune, San Diego, CA) . Epitopes ayudantes (HTL) pueden ser unidos a las señales de dirección intracelular y expresados por separado de epitopes CTL expresados; esto permite la dirección de los epitopes HTL a un compartimiento celular diferente de aquel de los epitopes CTL. Si es requerido, esto podría facilitar la entrada más eficiente de epitopes HTL en la ruta de HLA clase II, mejorando de esta manera la inducción- de HTL. En contraste a la inducción de HTL o CTL, específicamente la disminución de la respuesta inmune mediante la co-expresión moléculas inmunosupresoras (por ejemplo TGF-ß) puede ser benéfico en ciertas enfermedades. Cantidades terapéuticas de DNA plásmido pueden ser producidas' por ejemplo, mediante fermentación en E. coli, seguido por la purificación. Las alícuotas del banco de células de trabajo se utilizan para inocular el medio de crecimiento, y se cultivan a saturación en matraces agitadores o un biorreactor de acuerdo con técnicas bien conocidas. El DNA de plásmido puede ser purificado usando tecnologías de bioseparación estándares tal como las resinas de intercambio aniónico de fase sólida, suministradas por QIAGEN, Inc. (Valencia, California). Si es requerido, el DNA superenrollado puede ser aislado de las formas circulares y lineales abiertas usando la electroforesis en gel y otros métodos . 203 El DNA de plásmido purificado puede ser preparado para la inyección usando una variedad de formulaciones. La más simple de estas es la reconstitución de DNA liofilizado en solución salina regulada con fosfato estéril (PBS) . Este procedimiento, conocido como "DNA desnudo" está siendo actualmente utilizado para la administración intramuscular (IM) en experimentos clínicos. Para maximizar los efectos inmunoterapéuticos de las vacunas de DNA de minigen, un método alternativo para formular DNA de plásmido purificado puede ser deseable. Una variedad de métodos han sido descritos, y nuevas técnicas pueden llegar a ser disponibles. Los lípidos catiónicos, glicolípidos y liposomas fusogénicos también pueden ser usados en la formulación (ver, por ejemplo, como es descrito por O 93/24640; Mannino & Gould-Fogerite, Bio Techniques 6(7):682 (1988); patente norteamericana No. 5,279, 833;. WO 91/06309; y Felgne y colaboradores, Proc. Nat'l Acad. Sci. EUA 84:7413 (1987). Además, los péptidos y compuestos referidos colectivamente como compuestos protectores, interactivos, no condensantes (PINC) también podrían ser formados en complejos con el DNA plásmido purificado para influenciar las variables tal como la estabilidad, dispersión intramuscular o tráfico u órganos específicos o tipos de células. La sensibilización de la célula objetivo puede ser usada como un ensayo funcional para la expresión y la 204 presentación de HLA clase I de epitopes CTL codificados de minigen. Por ejemplo, el DNA de plásmido es introducido en una linea de célula mamifera que es adecuada para un objetivo para ensayos de liberación de cromo de CTL estándares. El método de transfección usado será dependiente de la formulación final. La electroporación puede ser usada para el DNA "desnudo", mientras que los lipidos catiónicos permiten la transfección in vitro directa, ün plásmido que expresa proteina fluorescente verde (GFP) puede ser co-transfectado para permitir el enriquecimiento de células transfectadas usando la clasificación de célula activada con florescencia (FACS) . Estas células luego son marcadas con crqmos-51 (51Cr) y usadas como células objetivo para lineas de CTL especificas de epitope; citolisis, detectada por la liberación de 51Cr, indica tanto la producción de, y la presentación de, epitopes CTL codificados de minigen. La expresión de epitopes HTL puede ser evaluado de una manera análoga usando ensayos para estimar la actividad HTL. La inmunogenicidad ín vivo es un segundo procedimiento para la prueba funcional de las formulaciones de DNA de minigen. Los ratones transgénicos que expresan proteínas HLA humanas apropiadas son inmunizados con el producto de DNA. La dosis y ruta de administración son dependientes de la formulación (por ejemplo, IM para DNA en PBS, intraperitoneal (i.p.) para el DNA formar un complejo 205 con lipido) . Veintiún dias después de la inmunización, los esplenocitos son colectados y reestimulados durante una semana en la presencia de péptidos que codifican cada epitope que es probando. Después, para células efectoras CTL, se conducen los ensayos para la citólisis de las células objetivo marcadas con 51Cr cargadas con péptido usando técnicas estándares. La lisis de células objetivo que se sensibilizaron mediante el HLA cargado con epitopes de péptido, correspondiente a epitopes codificados de minigen, demuestra la función de la vacuna de DNA para la inducción in vivo de CTLs . La inmunogenicidad de epitopes HTL es confirmada en ratones transgénicos de una manera análoga. Alternativamente, los ácidos nucleicos pueden ser administrados usando el suministro balístico como es descrito, por ejemplo en la patente norteamericana No. 5,204,253. Utilizando esta técnica, se administran partículas comprendidas solamente de DNA. En una modalidad alternativa adicional, el DNA puede ser adherido a partículas, tales como partículas de oro. Los minigenes también pueden ser suministrados usando otros sistemas de suministros bacterianos o virales bien conocidos en el arte, por ejemplo, una construcción de expresión que codifica epitopes de la invención puede ser incorporada en un vector viral tal como vaccinia. X.C.2. Combinaciones de Péptidos CTL con Péptidos 206 Ayudan es Las composiciones de vacuna que comprenden péptidos CTL de la invención pueden ser modificadas, por ejemplo, de manera análoga, para proporcionar atributos deseados, tal como la vida media en el suero mejorada, cobertura de población ampliada o inmunogenicidad incrementada. Por ejemplo, la habilidad de un péptido para inducir la actividad CTL puede ser incrementada al enlazar el péptido a una secuencia que contiene por lo menos un epitope que es capaz de inducir una respuesta de célula T ayudante. Aunque un péptido CTL puede ser enlazado directamente a un péptido T ayudante, frecuentemente conjugados de epitope CTL/epitope HTL son enlazados por una molécula espadadora. El espaciador está típicamente comprendido de moléculas neutras relativamente pequeñas, tales como aminoácidos o miméticos de aminoácidos, que están sustancialmente sin carga bajo condiciones fisiológicas. Los espaciadores son típicamente seleccionados, por ejemplo, Ala, Gly u otros espaciadores neutros de aminoácidos no polares o aminoácidos polares neutros. Será entendido que el espaciador opcionalmente presente no necesita estar comprendido de los mismos residuos y así puede ser un hetero- u homo-oligómero . Cuando está presente, el espaciador usualmente será por lo menos de uno o dos residuos, más usualmente de tres a seis residuos y algunas veces 10 o más residuos. El epitope de 207 péptido CTL puede ser enlazado al epitope de péptido T ayudante ya sea directamente o por la vía de un espaciador ya sea en el amino o carboxi terminal del péptido CTL. El amino terminal cualquier péptido inmunogénico o el péptido ayudante T puede ser acilado. En ciertas modalidades, el péptido T ayudante es uno que es reconocido por las células T ayudantes presentes en la mayoría de una población genéticamente diversa. Esto se puede realizar al seleccionar péptidos que enlazan a muchos, la mayoría, o todas las moléculas HLA clase II. Ejemplos de tal enlace de aminoácido de muchas moléculas HLA Clase de II incluyen secuencias de antígenos tal tetanus toxoid en las posiciones 830-843 (QYIKANS FIGITE; SEQ ID NO:l), la proteína circumsporozoita de Plasmodium falciparum (CS) en las posiciones 378-398 (DIEKKIAKMEKASSVFNVVNS; SEQ ID NO: 2) y la proteína de 18 kD de Streptococcus en las posiciones 116-131 (GAVDSILGGVATYGAA; SEQ ID NO: 3) . Otros ejemplos incluyen péptidos que llevan una superporción DR. 1-4-7, o cualquiera de las porciones DR3. Alternativamente, es posible preparar péptidos sintéticos capaces de estimular linfocitos T ayudantes, en un aspecto restringido de HLA, usando secuencias de aminoácidos no encontradas en la naturaleza (ver, por ejemplo, la publicación de PCT WO 95/07707). Estos compuestos sintéticos llamados epítopes que enlazan Pan-DR (por ejemplo, PADRE™, 208 Epimmune, Inc. , San Diego, CA) son diseñados, más de preferencia, para enlazar la mayoría de las moléculas HLA-DR (HLA Clase II humanas) . Por ejemplo un péptido de epitope que enlaza Pan-DR que tiene la fórmula: aKXVAAWTLKAa (SEQ ID NO: 4) , donde "X" es ya sea ciclohexilalanina, fenilalanina o tirosina, y a es ya sea D-alanina o L-alanina, se ha encontrado que enlaza la mayoría de alelos de HLA-DR, y para estimular la respuesta de los linfocitos T ayudantes de la mayoría de los individuos, sin considerar su de tipo HLA. Una alternativa de un epitope que enlaza pan-DR comprende todos los aminoácidos naturales "L" y pueden ser proporcionados en la forma de ácidos nucleicos que codifican el epitope. Los epítopes de péptido- de HTL también pueden ser modificados para alterar sus propiedades biológicas. Por ejemplo, ellos se pueden modificar para incluir D-aminoácidos para incrementar su resistencia a proteasas y así extender su vida media en el suero, o ellos se pueden conjugar a otras moléculas tales como lípidos, proteínas, carbohidratos y los similares para incrementar su actividad biológica. Por ejemplo, un péptido T ayudante puede ser conjugado a una o más cadenas de ácido de palmítico en ya sea el amino o carboxilo terminal X.C.3. Combinaciones de Péptidos CTL con Agentes de Cebado de Células T En algunas modalidades puede ser deseable inclui 209 en las composiciones farmacéuticas de la invención por lo menos un componente que ceba los linfocitos B o linfocitos T. Se han identificado lipidos como agentes capaces de cebar CTL in vivo. Por ejemplo, los residuos de ácido palmítico pueden ser unidos a los grupos e- y -amino en un residuo de lisina y luego enlazados, por ejemplo, por la vía de uno o más residuos de enlace tales como Gly, Gly-Gly, Ser, Ser-Ser o los similares a un péptido inmunogénico. El péptido lipidado luego puede ser administrado ya sea directamente en un miscela o partícula, incorporado en un liposoma o emulsificado en un adyuvante, por ejemplo, adyuvante de Freund incompleto. En una modalidad preferida, una composición inmunogénica particularmente efectiva comprende ácido palmítico unido a los grupos e- y a-amino de Lys, que es unido por la vía del enlace, por ejemplo, Ser-Ser, al amino terminal del péptido inmunogénico. Como otro ejemplo de cebado de lípido de respuesta CTL, las lipoproteínas de E. col!, tal como tripalmitoil-S-glicerilcisteinliseril-serina (P3CSS) se pueden usar para cebar el CTL específico del virus cuando se une covalentemente a un péptido apropiado (ver, por ejemplo, Deres y colaboradores, Nature 342:561, 1989). Los péptidos de la invención pueden ser acoplados a P3CSS, por ejemplo, y el lipopéptido administrado a un individuo para cebar específicamente una respuesta inmune al antígeno objetivo. 210 Además, debido a que la inducción de los anticuerpos neutralizantes también puede ser cebada con epitopes conjugados con P3CSS, dos de tales composiciones se pueden combinar para inducir más efectivamente las respuestas tanto humorales mediadas por las células. X.C.4. Composiciones de Vacuna que Comprenden PC Pulsado con Péptidos CTL y/o HTL Una modalidad de una composición de vacuna de acuerdo con la invención comprende la administración ex vivo de un cóctel de péptidos que llevan epitope a PBMC, o DC aislado del mismo, de la sangre del paciente. Una sustancia farmacéutica para facilitar la recolección de DC puede ser utilizada, tal como Progenipoietin™ (Pharmacia-Monsanto, St . Louis, MO) o GM-CSF/IL-4. Después de la pulsación del DC con péptido y antes de la reinfusión en pacientes, el DC son lavados para remover los péptidos no enlazados. En esta modalidad, una vacuna comprende DCs pulsados con péptido que presentan los epitopes de péptido pulsados formados en complejo con moléculas HLA sobre sus superficies. El DC puede ser pulsado ex vivo con un cóctel de péptidos, algunos de los cuales estimulan las respuestas CTL a PSCA. Opcionalmente, un péptido de célula T ayudante (HTL) , tal como un péptido HLA Clase II natural o artificialmente restringido puede ser incluido para facilitar la respuesta CTL. Asi, una vacuna de acuerdo con la invención es usada para tratar un cáncer que expresa o sobreexpresa PSCA. X.D. Inmunoterapia Adoptiva Los péptidos relacionados con PSCA antigénicos son utilizados para inducir una respuesta CTL y/o HTL ex vivo, también. Las células CTL o HTL resultantes, pueden ser usadas para tratar tumores en pacientes que no responden a otras formas convencionales de terapia, o no responderán a una vacuna terapéutica de péptido o ácido nucleico de acuerdo con la invención. Las respuestas CTL o HTL ex vivo a un antigeno particular son inducidas al incubar en el cultivo de tejido del paciente, o genéticamente compatible, las células precursoras CTL o HTL junto con una fuente de células que presentan antigenos (APC) , tales como células dendriticas y el péptido inmunogénico apropiado. Después de un tiempo de incubación apropiado (típicamente de manera aproximadamente 7-28 días) , en las cuales las células precursoras son activadas y expandidas en células efectoras, las células son infusionadas nuevamente en el paciente, donde ellas destruirán (CTL) o facilitarán la destrucción (HTL) de su célula objetivo especifica (por ejemplo, una célula de tumor) . Las células dendriticas transíectadas también pueden ser utilizadas como células que presentan antigeno. X.E. Administración de Vacunas para Propósitos Terapéuticos o Profilácticos Las composiciones farmacéuticas y de vacuna de la invención son típicamente usadas para tratar y/o prevenir un cáncer que expresa o sobreexpresa PSCA. En aplicaciones terapéuticas, las composiciones de péptido y/o ácido nucleico son administradas a un paciente en una cantidad suficiente para inducir una célula B efectiva, respuestas CTL y/o HTL al antígeno y para curar o por lo menos parcialmente detener o hacer lentos los síntomas y/o complicaciones. Una cantidad adecuada para realizar esto es definida como "dosis terapéuticamente efectiva". Las cantidades efectivas para este uso dependerán de, por ejemplo, la composición particular administrada, la manera de administración, el estado y la severidad de la enfermedad que es tratada, el peso y el estado de salud general del paciente, y el criterio del médico que prescribe. Para composiciones farmacéuticas, los péptidos inmunogénicos de la invención, o DNA que los codifican, son generalmente administrados a un individuo que ya lleva un tumor que expresa PSCA. Los péptidos o DNA que codifica estos pueden ser administrados individualmente o como fusiones de uno o más secuencias de péptido. Los pacientes pueden ser tratados con los péptidos inmunogénicos por separado o en conjunción con otros tratamientos, tal como la cirugía, como sea apropiado. Para uso terapéutico, la administración debe generalmente comenzar en el primer diagnóstico del cáncer 213 asociado con PSCA. Esto es seguido dosis de refuerzo hasta que por lo menos los síntomas son substancialmente abatidos y durante un período posterior. La modalidad de la composición de vacuna (es decir, que incluye, pero no limitado a modalidades tales como cócteles de péptído, polipéptidos poliepitópicos, minigenes, o CTLs específicos de ??? o células dendríticas pulsadas) suministradas al paciente pueden variar con el estado de la enfermedad o estado de salud del paciente. Por ejemplo, en un paciente con un tumor que expresa PSCA, una vacuna que comprende CTL específico PSCA puede ser más eficaz en exterminar las células de tumor en el paciente con enfermedad avanzada que en modalidades alternativas . Generalmente es importante proporcionar una cantidad del epítope de péptido suministrado por un modo de administración suficiente para estimular efectivamente una respuesta de célula T citotóxica; composiciones que estimulan las respuestas de célula T ayudante también pueden ser dadas de acuerdo con esta modalidad de la invención. La dosificación para una inmunización terapéutica inicial generalmente ocurre en un intervalo de dosificación unitaria donde el valor más bajo es de aproximadamente 1.5, 50, 500 o 1,000 µg y el valor más alto es de aproximadamente de 10,000; 20,000; 30,000 o 50,000 µ?. Los valores de dosificación para un humano típicamente varían de 214 aproximadamente de 500 aproximadamente 50,000 por pacientes de 70 kilogramos. Las dosificaciones de refuerzo de entre aproximadamente de 1.0 µg aproximadamente 50,000 µg de péptido conforme un régimen de refuerzo durante semanas a meses puede ser administrado dependiendo de la respuesta y la condición del paciente como es determinado por la medición de la actividad especifica de CTL y HTL obtenido de la sangre del paciente. La administración debe continuar hasta que por lo menos los síntomas clínicos o las pruebas de laboratorio indican que la neoplasia, se ha eliminado o reducido y por un periodo después. Las dosificaciones, rutas de administración, y los programas de dosis se ajustan de acuerdo con metodologías conocidas en la técnica. En ciertas modalidades, los péptidos y composiciones de la presente invención se emplean en estados de enfermedad serios, esto es, situaciones amenazantes de la vida o potencialmente amenazantes de la vida. En tales casos, como un resultado de las cantidades mínimas de sustancias extrañas y la naturaleza no tóxica relativa de los péptidos en las composiciones preferidas de la invención, es posible y se puede percibir deseable por el médico tratante administrar excesos substanciales de estas composiciones de péptido con relación a estas cantidades de dosificación establecidas. Las composiciones de vacuna de la invención también pueden ser usadas puramente como agentes profilácticos. 215 Generalmente la dosificación para una inmunización profiláctica inicial generalmente ocurre en un intervalo de dosificación unitario donde el valor más bajo es de aproximadamente de 1, 5, 50, 500 o 1000 µg y el valor más alto es de aproximadamente 10,000; 20,000; 30,000 o 50,000 g. Los valores de dosificación para un humano típicamente varían de aproximadamente de 500 µg aproximadamente de 50,000 µg por paciente de 70 kilogramos. Esto es seguido por dosificaciones de refuerzo de entre aproximadamente 1.0 µg aproximadamente de 50,000 µg de péptido administrado en intervalos definidos de aproximadamente cuatro semanas a seis meses después de la administración inicial de la vacuna. El inmunogenicidad de la vacuna se puede estimar al medir la actividad específica de CTL y HTL obtenido de una muestra de sangre de paciente. Las composiciones farmacéuticas para el tratamiento terapéutico se proponen para la administración parenteral, tópica, oral, nasal, intratecal o local (por ejemplo como una crema o ungüento tópico) . De preferencia, las composiciones farmacéuticas se administran parenteralmente, por ejemplo, intravenosamente, subcutáneamente, intradérmicamente o intramuscularmente . Así, la invención proporciona composiciones para la administración parenteral que comprende una solución de los péptidos inmunogénicos disueltos o suspendidos en un portador aceptable, de preferencia un portador acuoso. Una variedad de portadores acuosos pueden ser utilizados, por ejemplo, agua, agua en solución regulada, solución salina al 0.8%, glicina al 0.3%, ácido hialurónico y los similares. Estas composiciones pueden ser esterilizadas mediante técnicas de esterilización bien conocidas, convencionales, o pueden ser filtradas estérilmente. Las soluciones acuosas resultantes pueden ser envasadas para uso como se encuentra, o liofilizada, la preparación liofilizada que es combinada con una solución estéril antes de la administración. Las composiciones pueden contener sustancias auxiliares, farmacéuticamente aceptables como sea requerido para aproximarse a las condiciones fisiológicas, tales como agentes ajustadores del pH y reguladores, agentes de ajuste de tonicidad, agentes humectantes, conservadores y los similares, por ejemplo, acetato, de sodio, lactato de sodio, cloruro de sodio, cloruro de potasio, cloruro de calcio, monolaurato de sorbitan, oleato de trietanolamina, etc. La concentración de péptidos de la invención en las formulaciones farmacéuticas pueden variar ampliamente, es decir, de menos de aproximadamente de 0.1%, usualmente de por lo menos aproximadamente de 2% a tanto como 20% a 50% o más en peso, y serán seleccionados principalmente por los volúmenes de fluido, viscosidades, etc., de acuerdo con el 217 modo particular de administración seleccionado. Una forma de dosis unitaria humana de una composición es típicamente incluida en una composición farmacéutica que comprende una dosis unitaria humana de un portador aceptable, en una modalidad un portador acuoso, y es administrado en un volumen/cantidad que es conocido por aquellos expertos en la técnica, para ser utilizada para la administración de tales composiciones a humanos (ver, por ejemplo, Remington' s Pharmaceutical Sciences, 17a Edición, ?. Gennaro, Editor, Mack Publishing Co., Easton, Pennsylvania, 1985) . Por ejemplo, una dosis de péptido para inmunización inicial puede ser de aproximadamente de 1 a aproximadamente de 50,000 µg, generalmente 100-5, 000 µg, para un paciente de 70 kg. Por ejemplo, para ácidos nucleicos una inmunización inicial puede ser realizada usando un vector de expresión en la forma del ácido nucleico desnudo administrado IM (o SC o ID) en las cantidades de 0.5-5 mg en sitios múltiples. El ácido nucleico (0.1 a 1000 µg) también puede ser administrado usando una pistola génica. Después de un período de incubación de 3-4 semanas, luego se administra una dosis de refuerzo. El refuerzo pueden ser virus fowlpox recombinante administrado a una dosis de 5-107 a 5xl09 pfu. Para anticuerpos, un tratamiento generalmente implica la administración repetida de la preparación de anticuerpo anti-PSCA, por la vía de una aceptable de 218 administración, tal como inyección intravenosa (IV) , típicamente en una dosis en el intervalo de aproximadamente de 0.1 a aproximadamente de 10 mg/kg de peso del cuerpo. En general, las dosis en el intervalo de 10-500 mg de itiAb por la semana son efectivas y bien toleradas. Además, una dosis de carga inicial de aproximadamente 4 mg/kg de peso del cuerpo del paciente IV, seguido por dosis semanales de aproximadamente de 2 mg/kg IV de la preparación de mAb anti-PSCA representa un régimen de dosificación aceptable. Como es apreciado por aquellos expertos en la técnica, varios factores pueden influenciar la dosis ideal en un caso particular. Tales factores incluyen, por ejemplo, la vida media de una composición, la afinidad de enlace de una Ab, la inmunogenicidad de una sustancia, el grado de expresión de PSCA en el paciente, el grado de circulación del antígeno PSCA de cubierta, el nivel de concentración de estado permanente deseado, la frecuencia del tratamiento, y la influencia de · agentes quimioterapéuticos u otros agentes usados en combinación con el método de tratamiento de la invención, así como del estado de salud de un paciente particular. Dosis unitarias humanas preferidas no limitativas son, por ejemplo, 500 µg, -1 mg, 1 mg, -50 mg, 50 mg, -100 mg, 100 mg, -200 mg, 200 mg, -300 mg, 400 mg, -500 mg, 500 mg, -600 mg, 600 mg, -700 mg, 700 mg, -800 mg, 800 mg, -900 mg, 900 mg, -1 g o 1 mg, -700 mg. En ciertas modalidades, la dosis está en un intervalo de 2-5 mg/kg de peso del cuerpo, por ejemplo, con el seguimiento en dosis semanales de 1-3 mg/kg; 0.5 mg, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 mg/Kg de peso del cuerpo seguido, por ejemplo, en dos, tres o cuatro semanas por dosis semanales; 0.5-10 mg/Kg de peso del cuerpo, por ejemplo, seguido en dos, tres o cuatro semanas por dosis semanales; 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400 mg/m2 de área del cuerpo semanalmente; 1-600 mg/m2 de área del cuerpo semanalmente; 225-400 mg/m2 de área del cuerpo semanalmente; esto puede ser seguido por dosis semanales durante 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 19, 11, 12 o más semanas. En una modalidad, las formas de dosis unitarias humanas de polinucleótidos comprenden un intervalo de dosificación adecuado o cantidad efectiva que proporciona algún efecto terapéutico. Como es apreciado por un experto ordinario en la técnica un efecto terapéutico depende de un número de factores, incluyendo la secuencia del polinucleotido, peso molecular del polinucleotido y la ruta de administración. Las dosificaciones son generalmente seleccionadas por el médico u otro profesional del cuidado de la salud de acuerdo con una variedad de parámetros conocidos en la técnica, tal como la severidad de los síntomas historias del paciente y los similares. Generalmente, para un polinucleotido de aproximadamente de 20 bases, un intervalo de dosificación puede ser seleccionado de, por ejemplo, 220 limite inferior independientemente seleccionado tal como aproximadamente de 0.1, 0.25, 0.5, 1, 2, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 400 o 500 mg/kg hasta un limite superior independientemente seleccionado, mayor que el limite inferior, de aproximadamente de 60, 80, 100, 200, 300, 400, 500, 750, 1000, 1500, 2000, 3000, 4000, 5000, 6000, 7000, 8000, 9000 o 10,000 mg/kg. Por ejemplo, una dosis puede ser aproximadamente cualquiera de lo siguiente: 0.1 a 100 mg/kg, 0.1 a 50 mg/kg, 0.1 a 25 mg/kg, 0.1 a 10 mg/kg, 1 a 500 mg/kg, 100 a 400 mg/kg, 200 a 300 mg/kg, 1 a 100 mg/kg, 100 a 200 mg/kg, 300 a 400 mg/kg, 400 a 500 mg/kg, 500 a 1000 mg/kg, 500 a 5000 mg/kg, o 500 a 10,000 mg/kg. Generalmente, las rutas parenterales de administración pueden requerir dosis más altas de polinucleótido comparado con la aplicación más directa del nucleótido al tejido enfermo, como es con los polinucleótidos de longitud incrementada. En una modalidad, las formas de dosis unitarias humanas de células T comprenden un intervalo de dosificación adecuado o cantidad efectiva que proporciona algún efecto terapéutico. Como es apreciado por un experto ordinario en la técnica, un efecto terapéutico depende de un número de factores. Las dosificaciones son generalmente seleccionadas por el médico u otro profesional del cuidado de la salud de acuerdo con una variedad de parámetros conocidos en la técnica, tal como la severidad de síntomas, historia del paciente y los similares. Una dosis puede ser de aproximadamente de 104 células a aproximadamente de 106 células, aproximadamente de 106 células a aproximadamente 108 células, aproximadamente de 108 aproximadamente 1011 células, o aproximadamente de 108 a aproximadamente 5 x 1010 células. Una dosis también puede ser de aproximadamente de 106 células /m2 a aproximadamente 101? células /m2 o aproximadamente de 106 células/m2 a aproximadamente de 1C8 células/m2. La (s) proteina(s) de la invención y/o ácidos nucleicos que codifican la(s) proteína (s), también puede ser administrada por la vía de liposomas, que también pueden servir para: 1) dirigir la(s) proteína (s) a un tejido particular, tal como tejido linfoide; 2) para dirigir selectivamente a células enfermas; o, 3) para incrementar la vida media de la composición de péptido. Los liposomas incluyen emulsiones, espumas, micelas, monocapas insolubles, cristales líquidos, dispersiones de fosfolípidos , capas laminares y los similares. En estas preparaciones, el péptido que es suministrado es incorporado como parte de un liposoma, solo o en conjunción con una molécula que enlaza a un receptor prevalente entre las células linfoides, tales como anticuerpos monoclonales que enlazan el antígeno CD45, o con otras composiciones terapéuticas o inmunogénicas . Así, los liposomas ya sea llenos o decorados con un péptido deseado de la invención pueden ser dirigidos al sitio de las células 222 linfoides, donde los liposomas luego suministran las composiciones de péptido. Los liposomas para uso de acuerdo con la invención se forman a partir de lipidos formadores de vesículas estándares, que qeneralmente incluyen fosfolípidos neutros y negativamente cargados y un esterol, tal como colesterol. La selección de lipidos es generalmente guiada por la consideración de, por ejemplo, el tamaño de liposoma, estabilidad del ácido y estabilidad de los liposomas en la corriente sanguínea. Una variedad de métodos están disponibles para preparar liposomas, como descrito en, por ejemplo, Szoka, y colaboradores, Anri. Rev. Biophys. Bioeng. 9:467 (1980) y las patentes norteamericanas Nos. 4,235,871, 4,501,728, 4,837,028 y 5,019,369. Para la dirección a las células del sistema inmune, un ligando que es incorporado en el liposoma puede incluir, por ejemplo, anticuerpos o fragmentos de los mimos específicos para los determinantes de superficie celular de las células del sistema inmune deseados. Una suspensión de liposoma que contiene un péptido puede ser administrada intravenosamente, localmente, tópicamente, etc. en una dosis que varía de acuerdo, inter alia, la manera de administración, el péptido que es suministrado y la etapa de la enfermedad que es tratada. Para composiciones sólidas, los portadores sólidos, no tóxicos convencionales pueden ser utilizados los cuales 223 incluyen, por ejemplo, grados farmacéuticos de manitol, lactosa, almidón, estearato de magnesio, sacarina sódica, talco, celulosa, glucosa, sacarosa, carbonato de magnesio y los similares. Para la administración oral, una composición no tóxica farmacéuticamente aceptable se forma al incorporar cualquiera de los excipientes normalmente empleados, tales como aquellos portadores previamente listados, y generalmente 10-95% del ingrediente activo, esto es, uno o más péptidos de la invención, y más de preferencia una concentración de Para la administración en aerosol, los péptidos inmunogénicos de preferencia se suministran en forma finamente dividida junto con un surfactante y propelente. Los porcentajes típicos de péptidos son. de aproximadamente de 0.01%-20% en peso, de preferencia de aproximadamente 1%-10%. El surfactante, por su puesto, debe no ser tóxico, y de preferencia soluble en el propelente. Representativos de tales agentes son los ésteres o ésteres parciales de ácidos grasos que contienen de aproximadamente de 6 a 22 átomos de carbono, tales como ácido caproico, octanoico, laúrico, palmítico, esteárico, linoleico, linolénico, olestérico y oleico con un alcohol polihídrico alifático o su anhídrido cíclico. Los ésteres mezclados, tales como glicéridos mezclados o naturales pueden ser empleados. El surfactante puede constituir aproximadamente 0.1%-20% en peso de la 224 composición, de preferencia aproximadamente 0.25-5%. El balance de la composición es ordinariamente propelente. Un portador también puede ser incluido, como sea deseado, como con, por ejemplo, lecitina para suministro intranasal. XI.) Modalidades de Diagnóstico y Pronóstico de PSCA. Como es divulgado en la presente, los polinucleótidos PSCA, polipéptidos, células T citotóxicas reactivas (CTL) , células T ayudantes reactivas (HTL) y anticuerpos anti-polipéptido son usados en ensayos de diagnóstico, pronóstico y terapéuticos bien conocidos que examinan las condiciones asociadas con el crecimiento celular desregulado tal como el cáncer, en particular los cánceres listaron en la Tabla I (ver, por ejemplo, tanto su patrón especifico de expresión de tejido asi como su sobreexpresión en ciertos cánceres como es descrito por ejemplo en el Ejemplo intitulado "Análisis de expresión de PSCA en tejidos normales, y especímenes de pacientes") . PSCA puede ser formado análogamente a un PSA de antígeno asociado con la próstata, el marcador arquetipico que se ha utilizado por los profesionales médicos por años para identificar y monitorear la presencia del cáncer de próstata (ver, por ejemplo, Merrill y colaboradores, J. Urol . 163 (2) :503-5120 (2000); Polascik y colaboradores, J. Urol. Agosto; 162 (2 ): 293-306 (1999) y Fortier y colaboradores, J. 225 Nat. Cáncer Inst. 91 (19) : 1635-1640 (1999)). Una variedad de otros marcadores de diagnóstico también son utilizados en contextos similares incluyendo p53 y K-ras (ver, por ejemplo, Tulchinsky y colaboradores, Int J Mol Med 1999 julio 4(1): 99-102 y Miniraoto y colaboradores, Cáncer Detect Prev 2000; 24(1): 1-12). Por lo tanto, esta descripción de polinucleótidos y polipéptidos PSCA (asi como sondas de polinucleótido de PSCA y anticuerpos anti-PSCA usados para identificar la presencia de estas moléculas) y sus propiedades permite a las personas expertas utilizar estas moléculas en métodos que son análogos a aquellos utilizados, por ejemplo, en una variedad de ensayos de diagnóstico dirigidos a examinar condiciones asociadas con el cáncer. Las modalidades típicas de métodos de diagnóstico que utilizan los polinucleótidos PSCA, polipéptidos, células T reactivas y anticuerpos son análogos a aquellos métodos de ensayos de diagnóstico bien establecidos que emplean, por ejemplo, polinucleótidos PSA, polipéptidos, células T reactivas y anticuerpos. Por ejemplo, solo como los polinucleótidos PSA son utilizados como sondas (por ejemplo en análisis Northern, ver, por ejemplo, Sharief y colaboradores, Biochem. Mol. Biol. Int. 33(3):567-74 (1994)) y cebadores (por ejemplo en el análisis de PCR, ver, por ejemplo, Okegawa y colaboradores, J. ürol. 163 (4 ): 1189-1190 (2000) ) para observar la presencia y/o el nivel de mRNAs de PSA en métodos para monitorear la sobreexpresión de PSA o la metástasis de cánceres de próstata, los polinucleótidos PSCA descritos en la presente pueden ser utilizados de la misma manera para detectar la sobreexpresión de PSCA o la metástasis de próstata y otros cánceres que expresan este gen. Alternativamente, solo como los polipéptidos PSA son utilizados para generar anticuerpos específicos para PSA que pueden ser utilizados para observar la presencia y/o el nivel • de proteínas PSA en métodos para monitorear la sobreexpresión de proteína PSA (ver, por ejemplo, Stephan y colaboradores, ürology 55(4):560-3 (2000)) o la metástasis de células de próstata (ver, por ejemplo, Alanen y. colaboradores, Pathol. Res. Pract. 192(3):233-7 (1996)), los polipéptidos PSCA descritos en la presente pueden ser utilizados para generar anticuerpos para el uso en la detección de la sobreexpresión de PSCA o la metástasis de células de próstata y células de otros cánceres que expresan este gen. Específicamente, debido a que las metástasis implica el movimiento de células de cáncer de un órgano de · origen (tal como el pulmón o" la glándula de próstata etc.) a un área diferente del cuerpo (tal como un ganglio linfático) , los ensayos que examinan una muestra biológica para la presencia de células que expresan polinucleótidos y/o polipéptidos PSCA se pueden usar para proporcionar evidencia de la metástasis. Por ejemplo, cuando una muestra biológica 227 de tejido que no normalmente no contiene células que expresan PSCA (ganglio linfático) se encuentra que contiene células que expresan PSCA tal como la expresión PSCA observada en LAPC4 y LAPC9, los xenoinjertos aislados del ganglio linfático y metástasis del hueso, respectivamente, este descubrimiento es indicativo de la metástasis. Alternativamente, los polinucleótidos y/o polipéptidos PSCA pueden ser usados para proporcionar evidencia del cáncer, por ejemplo, cuando las células en una muestra biológica que normalmente no expresa PSCA o expresan PSCA a un nivel diferente se encuentran que expresan PSCA o tienen una expresión incrementada de PSCA (ver, por ejemplo, la expresión PSCA en los cánceres listados en la Tabla I y en muestras de pacientes etc. mostrados en las Figuras acompañantes) . En tales ensayos, las personas pueden además desear generar evidencia suplementaria de metástasis al probar la muestra biológica para la presencia de un segundo marcador restringido de tejido (además de PSCA) tal como PSA, PSCA, etc. (Ver, por ejemplo, Alanen y colaboradores, Pathol . Res. Pract. 192 (3) : 233-237 (1996)). El uso de la inmunohistoquímica para identificar la presencia de un polipéptido PSCA dentro de una sección de tejido puede indicar un estado alterado de ciertas células con ese tejido. Es bien entendido 'en la técnica que la habilidad de un anticuerpo para localizar un polipéptido que 228 es expresado en células de cáncer es una manera de diagnosticar la presencia de la enfermedad, etapa de la enfermedad, progresión y/o agresividad del tumor. Tal anticuerpo también puede detectar una distribución alterada del polipéptido dentro de las células del cáncer, como es comparado con el tejido no maligno correspondiente. El polipéptido PSCA y las composiciones inmunogénicas también son útiles en vista de los fenómenos de la localización de proteina subcelular alterada en estados de enfermedad. La alteración de células del estado normal al estado enfermo causa cambios en la morfología celular y es frecuentemente asociado con los cambios en la localización/distribución de la proteína subcelular. Por ejemplo, las proteínas de membrana celular que son expresadas de una manera polarizada en células normales pueden ser alteradas en la enfermedad, dando por resultado la distribución de la proteína de una manera no polar sobre la superficie de la célula completa. El fenómeno de la localización de proteína subcelular alterada en un estado de enfermedad se ha demostrado con la expresión de la proteína MUC1 y Her2 mediante el uso de medios de inmunohistoquímicos . Las células epiteliales normales tienen una distribución apical típica de MUC1, además de alguna localización supranuclear de la glicoproteína, mientras que las lesiones malignas frecuentemente demuestran un patrón de manchado apolar (Diaz y colaboradores, The Breast Journal, 7; 40-45 (2001); Zhang y colaboradores, Clinical Cáncer Research, 4; 2669-2676 (1998): Cao y colaboradores, The Journal of Histochemistry and Cytochemistry, 45: 1547-1557 (1997) ).' Además, el epitelio de pecho normal es ya sea negativo para la proteina Her2 o exhibe solamente una distribución basolateral mientras que las células malignas pueden expresar la proteina sobre la superficie de la célula completa (De Potter y colaboradores, International Journal of Cáncer, 44; 969-974 (1989) : McCormick y colaboradores, 117; 935-943 (2002)). Alternativamente, la distribución de la proteina puede ser alterada de una superficie solamente de la localización para incluir la expresión citoplásmica difusa en el e.stado enfermo. Tal ejemplo se puede observar MÜC1 (Diaz y colaboradores, The Breast Journal, 7:40-45 (2001)). La alteración en la localización/distribución de una proteina en la célula, como es detectado por métodos inmunohistoquimicos, también puede proporcionar información valiosa concerniente a la favorabilidad de ciertas modalidades de tratamiento. Este último punto es ilustrado por una situación donde una proteina- puede ser intracelular en el tejido normal, pero la superficie de la célula en células malignas; la localización de la superficie celular hace a las células favorablemente disponibles a y regímenes 230 de diagnóstico y tratamiento basado en anticuerpo. Cuando tal alteración de la localización de la proteina ocurre para PSCA, la proteina PSCA y las respuestas inmunes relacionadas con la misma son muy útiles. Por consiguiente, la habilidad para determinar si la alteración de la localización de proteina subcelular ocurrió para 24P4C12 hace a la proteina PSCA y las respuestas inmunes relacionadas con la misma muy útiles. El uso de las composiciones. PSCA permite aquellos expertos en la técnica hacer decisiones importantes de diagnóstico y terapéuticas . Los reactivos inmunohistoquimicos específicos a PSCA también son útiles para detectar metástasis de tumores que expresan PSCA cuando el polipéptido aparece en tejidos donde el PSCA no es normalmente producido. Así, los polipéptidos PSCA y anticuerpos que resultan de las respuestas inmunes al mismo son útiles en una variedad de contextos importantes tales como propósitos de diagnóstico, pronóstico, preventivos y/o terapéuticos conocidos para aquellos expertos en la técnica. Los mismos que los fragmentos de polinucleótido PSA y variantes de polinucleótidos son empleados por expertas para el uso en métodos de monitoreo de PSA, los fragmentos de polinucleótido PSCA y variantes de polinucleótido son utilizados de una manera análoga. En particular, los polinucleótidos PSA típicos usando en los . métodos de monitoreo de PSA son sondas o cebadores que consisten de fragmentos de la secuencia de cDNA de PSA. Ilustrando esto, los cebadores usados para amplificar por PCR un polinucleótido PSA deben incluir menos de la secuencia de PSA completa para funcionar en la reacción en cadena de polimerasa. En el contexto de tales reacciones de PCR, las personas expertas generalmente crean una variedad de diferentes fragmentos de polinucleótido que pueden ser usados como cebadores con el fin de amplificar diferentes porciones de un polinucleótido de interés o para optimizar las reacciones de amplificación (ver, por ejemplo, Caetano-Anolles, G. Biotechniques 25 (3) : 472-476, 478-480 (1998); Robertson y colaboradores, Methods Mol. Biol. 98:121-154 (1998)). Una ilustración adicional del uso de tales fragmentos se proporciona en el Ejemplo intitulado "Análisis de expresión de PSCA en tejidos normales, y especímenes de pacientes" donde un fragmento de polinucleótido PSCA es usado como una sonda para mostrar la expresión de RNAs de PSCA en células de cáncer. Además, las secuencias de polinucleótido variantes son típicamente usadas como ¦ cebadores y sondas para los mRNAs correspondiente en PCR y análisis de Northern (ver, por ejemplo, Sawai y colaboradores, Fetal Diagn. Ther. 1996 noviembre-diciembre 11 (6): 407-13 and Current Protocols In Molecular Biology, Volumen 2, Unidad 2, Frederick M. Ausubel y colaboradores, eds . , 1995)). Los fragmentos de polinucleótidos y variantes son útiles en este contexto donde son capaces de enlazar una secuencia de polinucleótido objetivo (por ejemplo, un polinucleótido PSCA mostrado en la Figura 2 o variante del mismo) bajo condiciones de alta severidad. Además, los polipéptidos .PSA que contienen un epítope que puede ser reconocido por un anticuerpo o célula T que específicamente enlaza a ese epítope son usados en métodos de monitoreo de PSA. Los fragmentos de polipéptido PSCA y análogos o variantes de polipéptido también pueden ser usados de una manera análoga. Esta práctica de usar fragmentos de polipéptido o variantes de polipéptido para generar anticuerpos (tal como anticuerpos anti-PSA o células T) es típico en la técnica con una amplia variedad de sistemas tal como las proteínas de fusión que son usadas por los profesionales (ver, por ejemplo, Current Protocols In Molecular Biology, Volumen 2, Unidad 16, Frederick M. Ausubel y colaboradores, 1995). En este contexto, cada epítope (s) funciona para proporcionar la arquitectura con la cual un anticuerpo o célula T es reactiva. Típicamente, las personas expertas crean una variedad de diferentes fragmentos de polipéptido que pueden ser usados con el fin de generar respuestas inmunes específicas para diferentes porciones de un polipéptido de interés (ver, por ejemplo, la patente norteamericana No. 5,840,501 y la patente norteamericana No. 233 5,939,533). Por ejemplo puede ser 'preferible utilizar un polipéptido que comprende una de las porciones biológicas PSCA discutidas en la presente o una subsecuencia que lleva porción que es fácilmente identificada por un experto en la técnica basado en porciones disponibles en la técnica. Los fragmentos de polipéptido, variantes o análogos son típicamente útiles en este contexto mientras que ellos comprendan un epítope capaz de generar un anticuerpo o célula T especifica para una secuencia de polipéptido objetivo (por ejemplo un polipéptido PSCA mostrado en la Figura 3) . Como se muestra en la presente, los polinucleótidos PSCA y polipéptidos (así como las sondas de polinucleótido PSCA y anticuerpos anti-PSCA o células T usadas para identificar la presencia de estas moléculas) exhiben propiedades específicas que los hacen útiles en el diagnóstico de cánceres tales como aquellos listados en la Tabla I. Los ensayos de diagnósticos que miden la presencia de productos de gen PSCA, con el fin -de evaluar la presencia o inicio de una condición de enfermedad descrita en la presente, tal como cáncer de próstata, son utilizados para identificar pacientes para medidas preventivas o para el monitoreo adicional, como se ha hecho exitosamente con PSA. Además, estos materiales satisfacen una necesidad en la técnica para moléculas que tienen características semejantes o complementarias al PSA en situaciones donde, por ejemplo, un diagnóstico definido de metástasis de origen prostático no puede ser hecho en la base de una prueba para PSA solamente (ver, por ejemplo, Alanen y colaboradores, Pathol. Res. Pract. 192 (3) : 233-237 (1996)) y consecuentemente, como materias tales como polinucleótidos y polipéptidos PSCA (asi como las sondas de polinucleótido PSCA y anticuerpos anti-PSCA usados para identificar la presencia de estas moléculas) necesitan ser empleadas para confirmar una metástasis de origen prostático. Finalmente, además de su uso en ensayos de diagnóstico, los polinucleótidos PSCA divulgados en la presente tiene un número de otras utilidades tal como su uso en la identificación anormalidades cromosomales asociadas oncogenéticas en la región cromosomal a la cual el gen PSCA mapea (ver el Ejemplo intitulado " Mapeo Cromosomal del PSCA" enseguida) . Por otra parte, además de su uso en ensayos de diagnóstico, las proteínas relacionadas con PSCA y polinucleótidos divulgados en la presente tiene otras utilidades tales como su uso en el análisis forense de tejidos de origen desconocido (ver, por ejemplo, Takahama K Forensic Sci Int 1996 junio 28; 80 ( 1-2 ) : 63-9 ) . Adicionalmente, las proteínas relacionadas con PSCA o polinucleótidos de la invención se pueden usar para tratar una condición patológica caracterizada por la sobre-expresión de PSCA. Por ejemplo, la secuencia de aminoácidos o ácido 235 nucleico de la Figura 2 o la Figura 3, o fragmentos de cualquiera, se puede usar para generar una respuesta inmune a un antigeno PSCA. Los anticuerpos u otras moléculas que reaccionan con PSCA se pueden usar para modular la función de esta molécula, y de esta manera proporcionar un beneficio terapéutico . XII.) Inhibición de la Función de la Proteina PSCA La invención incluye varios métodos y composiciones para inhibir el enlace de PSCA a su asociado de enlace o su asociación con otra(s) proteina (s) asi como métodos para inhibir la función de PSCA. XII.A.) Inhibición de PSCA con Anticuerpos Intracelula es En un procedimiento, un vector recombinante que codifica anticuerpos de cadena individual que específicamente enlaza PSCA, son introducidos en células que expresar PSCA por la vía de tecnologías de transferencia de gen. Por consiguiente, el anticuerpo anti-PSCA de cadena individual codificado es expresado intracelularmente, se enlaza a la proteína PSCA, y de esta manera inhibe su función. Los métodos para diseñar tales anticuerpos de cadena individual intracelulares son bien conocidos. Tales anticuerpos intracelulares, también conocidos como "intracuerpos", son específicamente dirigidos a un compartimiento particular dentro de la célula, proporcionando control sobre donde la 236 actividad inhibitoria del tratamiento es enfocado. Esta tecnología se ha aplicado exitosamente en la técnica (para revisión, ver Richardson y Marasco, 1995, TIBTECH vol. 13) . Los intracuerpos se han mostrado que virtualmente eliminan la expresión de otros receptores de superficie celular abundantes (ver, por ejemplo, Richardson y colaboradores, 1995, Proc. Nati. Acad. Sci. EUA 92:3137-3141; Beerli y colaboradores, 1994, J. Biol. Chem. 289:23931-23936; Deshane y colaboradores, 1994, Gene Ther. 1:332-337). Los anticuerpos de cadena individual comprenden los dominios variables de la cadena pesada y ligera unida por un polipéptido enlazador flexible, y son expresados como un polipéptido individual. Opcionalmente, los anticuerpos de cadena individual son expresados como fragmento de región variable de cadena individual unido a la región constante de cadena ligera. Las señales tráfico intracelular bien conocidas son diseñadas en vectores de polinucleótidos recombinantes que codifican tales anticuerpos de cadena individual con el fin de dirigir precisamente el intracuerpo al compartimiento intracelular deseado. Por ejemplo, intracuerpos dirigidos al retículo endoplásmico (ER) son diseñados para incorporar un péptido guía y, opcionalmente, una señal de retención ER C-terminal, tal como la porción de aminoácido KDEL. Los intracuerpos propuestos para ejercer actividad en el núcleo son diseñados para incluir una señal de localización nuclear. Las porciones de lipido son unidas a intracuerpos con el fin de introducir el intracuerpo al sitio citosólico de la membrana de plasma. Los intracuerpos también pueden ser dirigidos para ejercer función en el citosol. Por ejemplo, los intracuerpos citosólicos son usados para secuestrar factores dentro del citosol, para de esta manera prevenirlos de que sean transportados de su destino celular natural . En una modalidad, los intracuerpos se usan para capturar PSCA en el núcleo, para de esta manera prevenir su actividad dentro del núcleo. Las señales dirección nuclear son diseñadas en tales intracuerpos PSCA con el fin lograr la dirección deseada. Tales intracuerpos PSCA son diseñados para enlazar específicamente a un dominio PSCA particular. En otra modalidad, los intracuerpos citosólicos que específicamente enlazan una proteína de PSCA son usados para prevenir al PSCA de que gane acceso al núcleo, para de esta manera prevenirlo de ejerza cualquier actividad biológica dentro del núcleo (por ejemplo, previniendo al PSCA de que forme complejos de transcripción con otros factores) . Con el fin de dirigir específicamente la expresión de tales intracuerpos a células particulares, la transcripción del intracuerpo es colocada bajo el control regulatorio de un promotor y/o incrementador específico de tumor apropiado. Con el fin de dirigir la expresión de 238 intracuerpo específicamente a la próstata, por ejemplo, el promotor PSA y/o promotor/incrementador puede ser utilizado (ver, por ejemplo, la patente norteamericana No. 5,919,652 expedida el 6 julio de 1999) . XII. B.) Inhibición del PSCA con Proteínas Recombinantes En otro procedimiento, las moléculas recombinantes enlazan a PSCA y de esta manera inhibe la función de PSCA. Por ejemplo, estas moléculas recombinantes previenen o inhiben el PSCA de ingresar/enlazar a su(s) asociado (s) de enlace o asociado con otra(s) proteína (s). Tales moléculas recombinantes pueden contener, por ejemplo, la(s) parte (s) reactiva (s) de una molécula de anticuerpo específico de PSCA. En una modalidad particular, el dominio de enlace de PSCA de un asociado de enlace PSCA es diseñado en una proteína de fusión dimérica, mediante lo cual la proteína de fusión comprende dos dominios de enlace de ligados PSCA enlazados a la porción Fe a un IgG humano, tal como IgGl humano. Tal porción IgG puede contener, por ejemplo, los dominios CH2 y CH3 y la región de articulación, pero no el dominio CH1- Tales proteínas de fusión diméricas son administradas en forma soluble a pacientes que sufren de un cáncer asociado con la expresión de PSCA, mediante lo cual la proteína de fusión dimérica específicamente enlaza PSCA y bloquea la interacción de PSCA con un asociado de enlace. Tales proteínas de fusión 239 diméricas son además combinadas en proteínas multiméricas usando tecnologías de anticuerpo conocidas. XII. C.) Inhibición de la Transcripción o Traducción de PSCA La presente invención también comprende varios métodos y composiciones para inhibir la transcripción del gen PSCA. De manera similar, la invención también proporciona los métodos y composiciones para inhibir la traducción de mRNA de PSCA en la proteína. \ En un procedimiento, un método para inhibir la transcripción del gen PSCA comprende poner contactando el gen PSCA con un polinucleótido antisentido PSCA. En otro procedimiento, un método para inhibir la traducción de mRNA de PSCA comprende poner en contacta un mRNA de PSCA con un polinucleótido antisentido. En otro procedimiento, una ribozima específica de PSCA se usa para segmentar un mensaje de PSCA, para de esta manera inhibir la traducción. Tales métodos basados en antisentido y ribozima también pueden ser dirigidos a secciones regulatorias del gen PSCA, tales como los elementos promotores y/o incrementadores de PSCA. De manera similar, las proteínas capaces de inhibir un factor de transcripción del gen PSCA se utilizan para inhibir la transcripción de mRNA de PSCA. Los diversos polinucleótidos y composiciones útiles en los métodos mencionados en lo anterior se han descrito anteriormente. El uso de moléculas 240 antisentido y ribozima para inhibir la transcripción y traducción es bien conocida en la técnica. Otros factores que inhiben la transcripción de PSCA al interferir con la activación transcripcional de PSCA también son útiles para tratar cánceres que expresan PSCA. De manera similar, los factores que interfieren con el procesamiento de PSCA son útiles para tratar cánceres que expresan PSCA. Los métodos de tratamiento del cáncer que utilizan tales factores también están dentro del alcance de la invención. XII . D.) Consideraciones Generales para Estrategias Terapéuticas Las tecnologías de transferencia de gen y de terapia génica se pueden usar para suministrar moléculas de polinucleotido terapéuticas a células 'de tumor que sintetizan PSCA (es decir, antisentido, ribozima, polinucleótidos que codifica intracuerpos y otras moléculas inhibitorias de PSCA) . ün número de procedimiento de terapia génica, son conocidos en la técnica. Los vectores recombinantes que codifican los polinucleótidos antisentido PSCA, ribozimas, factores capaces de interferir con la transcripción PSCA y así sucesivamente, se pueden suministrar a las células de tumor objetivo usando tales procedimiento de terapia génica. Los procedimientos terapéuticos anteriores se pueden combinar con cualquiera de una amplia variedad de regímenes quirúrgicos, de quimioterapia y de terapia de radiación. Los procedimientos terapéuticos de la invención pueden permitir el uso de dosis reducidas de quimioterapia (u otras terapias) y/o la administración menos frecuente, una ventaja para todos los pacientes y particularmente para aquellos que no toleran la toxicidad del agente quimioterapéutico bien. La actividad anti-tumoral de una composición particular (por ejemplo, antisentido, ribozima, intracuerpo) , o una combinación de tales composiciones, se puede evaluar usando varios sistemas de ensayo in vitro e in vivo. Los ensayos in vitro que evalúan la actividad terapéutica incluyen los ensayos de crecimiento celular, ensayos en agar blando y otros ensayos indicativos de la actividad promotora del tumor, ensayos de enlace capaces de determinar el grado al cual una composición terapéutica inhibirá en enlace de PSCA a un asociado de enlace, etc. In vivo, el efecto de una -composición terapéutica de PSCA se pueden evaluar en un modelo de animal adecuado. Por ejemplo, se pueden utilizar modelos de cáncer de próstata xenogénicos, en donde las explantaciones de cáncer de próstata humanos o tejidos de xenoinjerto en pasaje son introducidos en animales inmunocomprometidos , tales como ratones desnudos o SCID (Klein y colaboradores, 1997, Nature Medicine 3:402-408) . Por ejemplo, la solicitud de patente de 242 PCT W098/16628 y la patente norteamericana No. 6,107,540 describe varios modelos de xenoinjerto de cáncer de próstata humano capaz de recapitular el desarrollo de tumores primarios, micrometástasis y la formación de metástasis osteoblásticos característicos de la enfermedad en etapa tardía. La eficacia puede ser predicha usando ensayos que miden la inhibición de la formación de tumor, regresión de tumor o metástasis y los similares. Los ensayos in vivo que evalúan la promoción de la apoptosis son útiles en evaluar composiciones terapéuticas. En una modalidad, los xenoinjertos de ratones que llevan tumor tratados con la composición terapéutica pueden ser examinados para la presencia de focos apoptóticos y comparados con los ratones que llevan xenoinjerto de control no tratado. El grado al cual los focos apoptóticos son encontrados en los tumores de los ratones tratados proporciona una indicación de la eficacia terapéutica de la composición . Las composiciones terapéuticas usadas en la práctica de los métodos anteriores se pueden formular en composiciones farmacéuticas que comprenden un portador adecuado para el método de suministro deseado. Los portadores adecuados incluyen cualquier material que cuando se combina con la composición terapéutica retiene la función anti-tumoral de la composición terapéutica y es generalmente 243 no reactivo con el sistema inmune del paciente. Ejemplos incluyen, pero no están limitados a, cualquiera de un número de portadores farmacéuticos estándares tal como las soluciones salinas reguladas con fosfato estériles, agua bacteriostática y los similares (ver, generalmente, Remington's Pharmaceutical Sciences 16a Edición, A. Osal., Ed., 1980). Las formulaciones terapéuticas se pueden solubilizar y administrar por la via de cualquier ruta capaz de suministrar la composición terapéutica al sitio del tumor. Las rutas potencialmente efectivas de administración incluyen, pero no están limitadas a, la ruta intravenosa, parente al, intraperitoneal, intramuscular, intratumoral, intradérmica, intraórgano, ortotópica y los similares, üna formulación preferida para inyección intravenosa comprende la composición terapéutica en una- solución de agua bacteriostática conservada, agua no conservada estéril y/o diluido en bolsas de cloruro de polivinilo o polietileno que contienen Cloruro de Sodio estéril al 0.9% para inyección, ÜSP. Las preparaciones de proteínas terapéuticas pueden ser liofilizadas y almacenadas como polvos estériles, de preferencia bajo vacío, y luego reconstituidas en agua bacteriostática (que contiene por ejemplo, el conservador alcohol bencílico) o en agua estéril antes de la inyección. Las dosificaciones y protocolos de administración 244 para el tratamiento de cáncer usando los métodos anteriores variarán con el método y el cáncer objetivo, y generalmente dependerán de un número de otros factores apreciados en la técnica. XIII.) Identificación, Caracterización y Uso de Moduladores de PSCA Métodos para Identificar y Utilizar Moduladores En una modalidad, la clasificación se realiza para identificar moduladores que inducen o suprimen un perfil de expresión particular, suprimen o inducen rutas especificas, generando de preferencia el fenotipo asociado de esta manera. En otra modalidad, habiéndose identificado · los genes diferencialmente expresados importantes en un estado particular; las clasificaciones se realizan para identificar moduladores que alteran la expresión de genes individuales, ya sea que lo incrementan o disminuyen. En otra modalidad, la clasificación se realiza para identificar moduladores que alteran una función biológica del producto de expresión de un gen diferencialmente expresado. Nuevamente, habiéndose identificado la importancia de un gen en un estado particular, las clasificaciones se realizan para identificar agentes que enlazan y/o modulan la actividad biológica del producto de gen. Además, las clasificaciones se hacen para genes que son inducidos en respuesta a un agente candidato. Después de 245 la identificación de un modulador (uno que suprime un patrón de expresión de cáncer que conduce un patrón de expresión normal o un modulador de un gen cáncer que conduce a la expresión del gen como en el tejido normal) una clasificación se realiza para identificar genes que son específicamente modulados en respuesta al agente. La comparación de los perfiles de expresión entre el tejido normal y el tejido de cáncer tratado con el agente revela genes que no son expresados en el tejido normal o el tejido de cáncer, pero son expresados en el tejido tratado con el agente y viceversa. Estas secuencias específicas del agente son identificadas y usadas por los métodos descritos en la presente para genes o proteínas de cáncer. En particular estas secuencias y las proteínas que ellos codifican son utilizadas en marcar o identificar células tratadas con agente. Además, los anticuerpos son resaltados contra las proteínas inducidas por el agente y usados para dirigirse a nuevas sustancias terapéuticas para la muestra de tejido con cáncer tratado. Identificación Relacionada con el Modulador y Ensayos de Clasificación: Ensayos Relacionados con la Expresión del Gen Las proteínas, ácidos nucleicos y anticuerpos de la invención son utilizados en ensayos de clasificación. Las proteínas asociadas con el cáncer, anticuerpos, ácidos 246 nucleicos, proteínas modificadas y células que contienen estas secuencias son usadas en ensayos de clasificación, tal como la evaluación del efecto de los candidatos de fármaco sobre un "perfil de expresión de gen", perfil de expresión de polipéptidos o la alteración de la función biológica. En una modalidad, se utilizan perfiles de expresión, de preferencia en conjunción con técnicas de clasificación de alto rendimiento para permitir el monitoreo de genes de perfil de expresión después del tratamiento con un agente candidato (por ejemplo, Davis, GF y colaboradores, J Biol Screen 7:69 (2002); Zlokarnik y colaboradores, Science 279:84-8 (1998); Heid, · Genome Res 6:986-94, 1996). Las proteínas de cáncer, anticuerpos, ácidos nucleicos, proteínas y modificadas y células que contienen las proteínas o genes de cáncer nativos o modificados son utilizados en ensayos de clasificación. Esto es, la presente invención comprende métodos para clasificar composiciones que modulan el fenotipo de cáncer o una función fisiológica de una proteína de cáncer de la invención. Esto se hace sobre un gen mismo o al evaluar el efecto de los candidatos de fármaco sobre un "perfil de expresión de gen" o función biológica. En una modalidad, se utilizan perfiles de expresión, de preferencia en conjunción con las técnicas de clasificación de alto rendimiento para permitir el monitoreo después del tratamiento con un agente candidato, ver Zlokarnik, supra. 247 Una variedad de ensayos son ejecutados dirigidos a los genes y proteínas de la invención. Los ensayos son corridos sobre un nivel de ácido nucleico o proteína individual. Eso es, habiéndose identificado un gen particular como regular hacia arriba en el cáncer, los compuestos de prueba son clasificados para la habilidad para modular la expresión de o para el enlace a la proteína de cáncer de la invención. La "modulación" en este contexto incluye un incremento o una disminución en la expresión de gen. La cantidad preferida de modulación dependerá del cambio original de la expresión de gen en el cáncer implícito normal contra el tejido, que cambia de por lo menos 10%, de preferencia 50%, más de preferencia 100-300% y en algunas modalidades 300-1000% o más grande. Así, si un gen exhibe un incremento de 4 veces en el tejido de cáncer comparado con el tejido normal, una disminución de aproximadamente cuatro veces es frecuentemente deseada; de manera similar, una disminución de 10 veces en el tejido del cáncer comparado con el tejido normal un incremento del valor objetivo de 10 veces en la expresión por el compuesto de prueba es frecuentemente deseado. Los moduladores que exacerban el tipo de expresión de gen observado en el cáncer también son útiles, por ejemplo, como un objetivo regulado hacia arriba en análisis adiciónales . La cantidad de expresión en gen es monitoreada 248 usando sondas de ácido nucleico y la cuantificación de los niveles de expresión de gen, o alternativamente, un producto de gen por si mismo es monitoreado, por ejemplo, a través del uso de anticuerpos a la proteina de cáncer y inmunoensayos estándares. Las técnicas de proteómicas y de separación también permiten la cuantificación de la expresión. Monitoreo para Identificar Compuestos que Modifican la Expresión de Gen En una modalidad, el monitoreo de la expresión de gen, es decir, un perfil de expresión, es monitoreado simultáneamente para un número de entidades. Tales perfiles típicamente involucrarán uno o más de los genes de la Figura 2. En esta modalidad, por ejemplo, sondas de ácido nucleico de cáncer son unidas biochips para detectar y cuantificar secuencias de cáncer en una célula particular. Alternativamente, se puede utilizar PCR. Así, una serie, por ejemplo, de cavidades de una placa microtítulo se puede utilizar con cebadores suministrados en cavidades deseadas. Una reacción de PCR luego se puede realizar y analizar para cada cavidad. El monitoreo de la expresión se realiza para identificar compuestos que modifican la expresión de uno o más secuencias asociadas con cáncer, por ejemplo, una secuencia de polinucleótido expuesta en la Figura 2. Generalmente, se adiciona un modulador de prueba a la célula 249 antes del análisis. Por otro parte, también se proporcionan clasificaciones para identificar agentes que modulan el cáncer, modular proteínas de cáncer de la invención, enlazar a una proteína de cáncer de la invención, o interferir con el enlace de una proteína del cáncer de la invención y un anticuerpo u otro asociado de enlace. En una modalidad, los métodos de clasificación de alto rendimiento involucran proporcionar una librería que contiene un número grande de compuestos terapéuticos potenciales (compuesto candidato) . Tales "librerías químicas combinatorias" luego se clasifican en uno o más ensayos para identificar aquellos miembros de la librería (particularmente especies químicas o subclases) que exhiben una actividad característica deseada. Los compuestos así identificados pueden servir como "compuestos - de guía" convencionales, como compuestos para la clasificación o como terapéuticos. En ciertas modalidades, las librerías combinatorias de moduladores potenciales se clasifican por una habilidad para enlazar a un polipéptido de cáncer o para modular la actividad. Convencionalmente, nuevas entidades químicas con propiedades útiles son generadas al identificar un compuesto químico (llamado un "compuesto de guía") con alguna propiedad o actividad deseable, por ejemplo, que inhibe la actividad, creando variantes al compuesto de guía, y evaluar la propiedad y actividad de estos compuestos variantes. 250 Frecuentemente, los métodos de clasificación de alto rendimiento (HTS) son empleados para tal análisis. Como es mencionado en lo anterior, el monitoreo de la expresión de gen es convenientemente utilizado para probar moduladores candidatos (por ejemplo, proteina, ácido nucleico, molécula pequeña) . Después de que se ha adicionado el agente candidato y las células se dejan incubar durante un periodo, la muestra que contiene una secuencia objetivo que es analizada es, por ejemplo, adicionada a un biochip. Si es requerido, la secuencia objetivo es preparada usando técnicas conocidas. Por ejemplo, una muestra es tratada para lisar las células, usando soluciones reguladoras de lisis conocidas, electroporación, etc., con purificación y/o amplificación tal como PCR realizado como sea apropiado. Por ejemplo, una transcripción in vitro que marca covalentemente unido a los nucleótidos es realizada. Generalmente, los ácidos nucleicos son marcados con biotin-FITC o PE, o con cy3 o cy5. La secuencia objetivo puede ser marcada con, por ejemplo, un compuesto fluorescente, un quimioluminiscente, una sustancia química o una señal radioactiva, para proporcionar un medio para detectar el enlace especifico de la secuencia objetivo a una sonda. La marca también puede ser una enzima, tal como fosfatasa alcalina o peroxidasas de rábano picante, que cuando se proporcionado con un substrato 251 apropiado produce un producto que es detectado. Alternativamente, la marca es un compuesto marcado o molécula pequeña, tal como un inhibidor de enzima, que enlaza pero no es catalizada o alterada por la enzima. La marca también puede ser una porción o compuesto, tal como, una marca de epitope o biotina que específicamente enlaza estreptavidina . Para el ejemplo de biotina, la estreptavidina es marcada como es descrito en lo anterior, proporcionando de esta manera una señal detectable para la secuencia objetivo enlazada. La estreptavidina marcada no enlazada es típicamente removida antes del análisis. Como será apreciado por aquellos en la técnica, estos ensayos pueden ser ensayos de' hibridación directos o pueden comprender "ensayos de intercalación", que incluyen el uso de múltiples sondas, como es generalmente resumido en las patentes norteamericanas Nos. 5,681,702; 5,597,909; 5,545,730; 5,594,117; 5,591,584; 5,571,670; 5,580,731; 5,571,670; 5,591,584; 5,624,802; 5,635,352; 5,594,118; 5,359,100; 5,124,246; y 5,681,697. En esta modalidad, en general, el ácido nucleico objetivo es preparado como es resumido en lo anterior y luego adicionado al biochip que comprende una pluralidad de sondas de ácido nucleico, bajo condiciones que permiten la formación de un complejo de hibridación. Una variedad de condiciones de hibridación son 252 utilizadas en la presente invención, incluyendo condiciones de alta, moderada y baja severidad como es resumido en lo anterior. Los ensayos son generalmente corridos bajo condiciones de severidad que permiten la formación del complejo de hibridación de sonda marcada solamente en la presencia del objetivo. La severidad puede ser controlada al alterar un parámetro de etapa que es una variable termodinámica, incluyendo, pero no limitado a, temperatura, concentración de formamida, concentración de sal, pH de la concentración de sal caotrópica, concentración de solvente orgánico, etc. Estos parámetros también pueden ser usados para controlar el enlace no especifico, como es generalmente resumido en la patente norteamericana No. 5,681,697. Asi, puede ser deseable realizar ciertas etapas en condiciones de más alta severidad para reducir el enlace no especifico. Las reacciones resumidas en- la presente pueden ser realizadas en una variedad de maneras. Los componentes de la reacción se pueden adicionar simultáneamente, o secuencialmente, en diferentes ordenes, con modalidades preferidas resumidas enseguida. Además, la reacción puede incluir una variedad de otros reactivos. Estos incluyen sales, solución reguladora, proteínas neutral, por ejemplo albúmina, detergentes, etc. que pueden ser usados para facilitar la hibridación óptima y la detección y/o reducir las interacciones no específicas o antecedentes. Los 253 reactivos que de otra manera mejoran la eficiencia del ensayo, tales como inhibidores de proteasa, inhibidores de nucleasa, agentes anti-microbianos, etc., también pueden ser utilizados como sea apropiado, dependiendo de los métodos de preparación de la muestra y la pureza del objetivo. Los datos del ensayo son analizados para determinar los niveles de expresión de genes individuales, y los cambios en los niveles de expresión como entre los estados, formando un perfil de expresión de gen. Ensayos Relacionados con la Actividad Biológica La invención proporciona métodos para identificar o clasificar un compuesto que modula la actividad de un gen relacionado con el cáncer o proteina de la invención. Los métodos comprenden adicionar un compuesto de prueba, como es definido en lo anterior, a una célula que comprende una proteina de cáncer de la invención. Las células contienen un ácido nucleico recombinante que codifica una proteina de cáncer de la invención. En otra modalidad, una librería de agentes de candidato es probada sobre una pluralidad de células. En un aspecto, los ensayos son evaluados en la presencia o ausencia de la exposición previa o subsecuente de señales fisiológicas, por ejemplo hormonas, anticuerpos, péptidos, antígenos, citoquinas, factores de crecimiento, potenciales de acción, agentes farmacológicos incluyendo 254 quimioterapéuticos, radiación, cancerigénicos u otras células (es decir, contacto de célula-célula) . En otro ejemplo, la determinación se hace en diferentes etapas del proceso del ciclo celular. De esta manera, los compuestos que modulan los genes o proteínas de la invención son identificados. Los compuestos con actividad f rmacológica son capaces de incrementar o interferir con la actividad de la proteína de cáncer de la invención. Una vez identificadas las estructuras similares son evaluadas para identificar características estructurales críticas del compuesto. En una modalidad, un método para modular (por ejemplo, inhibir) la división de célula de cáncer es proporcionado; el método comprende la administración de un modulador de cáncer. En otra modalidad, se proporciona un método para modular el cáncer (por ejemplo, inhibir); el método comprende la administración de un modulador de cáncer. En una modalidad adicional, se proporcionan métodos para tratar células o individuos con cáncer; el método comprende la administración de un modulador de cáncer. En una modalidad, se proporciona un método para modular el estado de una célula que expresa un gen de la invención. Como se utiliza en la presente estado comprende tales parámetros aceptados en la técnica tal como el crecimiento, proliferación, supervivencia, función, apoptosis, senescencia, ubicación, actividad enzimática, transd cción de señal, etc. de una célula. En una modalidad, un inhibidor de cáncer es un anticuerpo como es discutido en lo anterior. En otra modalidad, el inhibidor de cáncer es una molécula antisentido. Una variedad de ensayos de crecimiento de célula, proliferación y metástasis son conocidos para aquellos expertos en la técnica, como es descrito en la presente . Clasificación de Alto Rendimiento para Identificar Moduladores Los ensayos para identificar moduladores adecuados están disponibles para la clasificación de alto rendimiento. Los ensayos preferidos de esta manera detectan el incremento o la inhibición de la transcripción de gen de cáncer, inhibición o incremento de la expresión de polipéptido y la inhibición o incremento de la actividad del polipéptido. En una modalidad, los moduladores evaluados en los métodos de clasificación de alto rendimiento son proteínas, frecuentemente proteínas que ocurren de manera natural o fragmentos de proteínas que ocurren de manera natural. Así, por ejemplo, los extractos celulares que contienen proteínas, o digestiones aleatorias o digeridas de extractos celulares proteináceos, son utilizados. De esta manera, las librerías de proteínas se hacen para la clasificación en los métodos de la invención. Particularmente preferidas en esta modalidad son las librerías de proteínas bacterianas, fúngales, virales 256 y mamíferas, con la última que es preferida, y las proteínas humanas que son especialmente preferidas. El compuesto de prueba particularmente útil será dirigido a la clase de proteínas a la cual el objetivo pertenece, por ejemplo, substratos para enzimas o ligandos y receptores. Uso del Crecimiento en Agar Blando y la Formación de Colonia para Identificar y Caracterizar Moduladores Las células normales requieren un substrato sólido para unirse y crecer. Cuándo las células son transformadas, ellas pierden su fenotipo y crecen desunidas del substrato. Por ejemplo, las células transformadas pueden crecer en cultivos de suspensión agitada o suspendido en un medio semisólido, tal como agar semisólido o blando. Las células transformadas, cuando son transfectadas con genes supresores de tumor, pueden regenerar el fenotipo normal y una vez nuevamente requerir un substrato sólido para unirse y crecer. El crecimiento en agar blando o la formación de colonia en los ensayos son utilizados para identificar moduladores de secuencias de cáncer, que cuando se expresan en células hospederas, inhibe la proliferación y transformación celular anormal . Un modulador reduce o elimina la habilidad de la célula hospedera para crecer suspendida en un medio sólido o semisólido, tal como agar. Las técnicas para el crecimiento en agar blando o la formación de colonia en ensayos de suspensión se describen 257 en Freshney, Culture of Animal Cells a Manual of Basic Technique (3- edición, 1994) . Ver también, la sección de métodos de Garkavtsev y colaboradores, (1996) , supra. Evaluación de la Inhibición de Contacto y Limitación de Densidad de Crecimiento para Identificar y Caracterizar Moduladores Las células normales típicamente crecen en un patrón plano y organizado en el cultivo de célula hasta que ellas tocan otras células. Cuando las células se tocan entre sí, ellas son inhibidas del contacto y se detiene el crecimiento. Las células transformadas, sin embargo, no son inhibidas en el contacto y continúan creciendo a altas densidades en focos desorganizados. Así, las células transformadas crecen a una densidad de saturación más alta que las células normales correspondientes. Esto es detectado morfológicamente mediante la formación de un monocapa desorientada de células o células en los focos. Alternativamente, el índice de marcación con (3H) -timidina a la densidad de saturación es utilizada para medir la limitación de densidad de crecimiento, de manera similar un ensayo MTT o Alamar blue revelerá la capacidad proliferación de las células y la habilidad de los moduladores para afectar las mismas. Ver Freshney (1994), supra. Las células transformadas, cuando son transfectadas con genes supresores de tumor, pueden regenerar un fenotipo normal y llega a ser 258 inhibidas en el contacto y c ecerían a una densidad menor. En este ensayo, el índice de marcación con 3H) -timidina a la densidad de a saturación es un método preferido para medir la limitación de densidad de crecimiento. Las células hospederas transformadas son transfectadas con una secuencia asociada con cáncer y son cultivadas durante 24 horas a la densidad de saturación en condiciones del medio no limitativas. El porcentaje de células marcadas con (3H) -tumidina es determinado mediante el cpm incorporado. El crecimiento independiente del contacto se utiliza para identificar moduladores de secuencias de cáncer, que han conducido a la proliferación y transformación celular anormal . Un modulador reduce o elimina el crecimiento independiente del contacto y regresan las células a un fenotipo normal . Evaluación del Factor de Crecimiento o Dependencia del Suero para Identificar y Caracterizar Moduladores Las células transformadas tienen dependencia de suero inferior que sus contrapartes normales (ver, por ejemplo, Temin, J. Nati, por ejemplo, Temin, J. Nati. Cáncer Inst. 37:167-175 (1966); Eagle y colaboradores, J. Exp. Med 131:836-879 (1970)); Freshney, supra. Esto en parte debido a la liberación de varios factores de crecimiento por las células transformadas. El grado del factor de crecimiento o dependencia del suero de las células hospederas transformadas puede ser comparado con aquel del control. Por ejemplo, el factor de crecimiento o la dependencia de suero de una célula es monitoreada en métodos para identificar y caracterizar compuestos que modulan las secuencias asociados con el cáncer de la invención. Uso de Niveles Marcadores Específicos de Tumor para Identificar y Caracterizar Moduladores Las células de tumor liberan una cantidad incrementada de ciertos factores (después en la presente "marcadores específicos de tumor") que sus contrapartes normales. Por ejemplo, el activador de plasminógeno (PA) es liberado del glioma humano a un nivel más alto que aquel de las células del cerebro normales (ver, por ejemplo, Gullino, Angiogenesis, Tumor Vascularization, and Potential interference with Tumor Growth, in Biological Responses in Cáncer, páginas. 178-184 (Mihich (ed.) 1985)). De manera similar, el factor angiogénesis de tumor (TAF) es liberado a un nivel más alto en células de tumor que sus contrapartes normales. Ver, por ejemplo, Folkman, Angiogenesis and Cáncer, Sem Cáncer Biol. (1992)), mientras bFGF es liberado de tumors endoteliales (Ensoli, B y colaboradores) . Varias técnicas que miden 'la liberación de estos factores son descritas en Freshney (1994), supra. También, ver, ünkless y colaboradores, J. Biol. Chem. 249:4295-4305 (1974); Strickland & Beers, J. Biol. Chem. 251:5694-5702 260 (1976); Whur y colaboradores, Br. J. Cáncer 42:305 312 (1980); Gullino, Angiogenesis, el Tumor Vascularization and Potential Interference whith Tumor Growth, in Biological Responses in Cáncer, páginas. 178-184 (Minien (ed. ) 1985); Freshney, Anticancer Res. 5:111-130 (1985). Por ejemplo, los niveles de marcadores específicos de tumor son monitoreados en métodos para identificar y caracterizar compuestos que modulan las secuencias asociados 'con el cáncer de la invención . Invasividad en MatriGel para Identificar y Caracterizar Moduladores El grado de invasividad en Matrigel o un constituyente de matriz extracelular, puede ser utilizado como un ensayo para identificar y caracterizar compuestos que modulan secuencias asociadas con el cáncer. Las células de tumor exhiben una correlación positiva entre la malignidad y la invasividad de las células en Matrigel o algún otro constituyente de matriz extracelular. En este ensayo, las células tumorigénicas son típicamente utilizadas como células hospederas. La expresión de un gen supresor de tumor en estas células hospederas disminuiría la invasividad de las células hospederas. Las técnicas descritas en Cáncer Res. 1999; 59:6010; Freshney (1994), supra, pueden ser utilizadas. Brevemente, el nivel de invasión de las células hospederas es medido al usar filtros de recubiertos con Matrigel u otro constituyente de matriz extracelular. La penetración en el gel, o a través del extremo distal del filtro, es clasificada como invasividad, y clasificada histológicamente por número de células y la distancia movida, o mediante la premarcación de las células con 125I y contando la radioactividad en el extremo distal del filtro o el fondo del disco. Ver, por ejemplo, Freshney (1984), supra. Evaluación del Crecimiento de Tumor In Vivo para Identificar y Caracterizar Moduladores Los efectos de las secuencias asociadas con el cáncer sobre el crecimiento de la -célula son probados en organismos transgénicos o inmunosuprimidos . Los organismos transgénicos son preparados en una variedad de manera aceptadas en al técnica. Por ejemplo, los organismos transgénicos inactivados, por ejemplo, mamíferos tales como ratones, se hacen, en los cuales un gen de cáncer es interrumpido o en el cual un gen de cáncer es insertado. Los ratones transgénicos inactivados se hacen mediante la inserción de un gen marcador u otro gen heterólogo en el sitio del gen de cáncer endógeno en el genoma del ratón por la vía de la recombinación homologa. Tales ratones también se pueden hacer" al sustituir el gen de cáncer endógeno con una versión mutada del gen de cáncer, o al mutar el gen de cáncer endógeno, por ejemplo, mediante la exposición a carcinógenos. Para preparar animales quiméricos transgénicos, por ejemplo, ratones, una construcción de DNA es introducida en los núcleos de células madres embriónicas . Las células que contienen la lesión genética recientemente diseñada son inyectadas en un embrión de ratón hospedero, que es re-implantado en una hembra recipiente. Algunos de estos embriones se desarrollan en ratones" quiméricos que poseen células germinales algunas de las cuales son derivadas de la linea de célula mutante. Por lo tanto, al reproducir los ratones quiméricos es posible obtener una nueva linea de ratones que contienen la lesión genética introducida (ver, por ejemplo, Capecchi y colaboradores, Science 244:1288 (1989) ) . Los ratones quiméricos pueden ser derivados de acuerdo con la patente norteamericana 6,365,797, expedida el 2 de Abril de 2002; patente norteamericana 6,107,540 expedida el 22 de Agosto de 2000; Hogan y colaboradores, Manipulating the Mouse Embryo: A laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory (1988) and Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells: A Practical Approach, Robertson, ed., IRL Press, Washington, D. C, (1987). Alternativamente, se pueden utilizar varios animales hospederos inmunosuprimídos o inmunodeficientes . Por ejemplo, un ratón "desnudo" genéticamente atímico (ver, por ejemplo, Giovanella y colaboradores, -J. Nati. Cáncer. 52:921 (1974)), un ratón timectonizado SCID, o un ratón irradiado (ver, por ejemplo, Bradley y colaboradores, Br. J. Cáncer 263 38:263 (1978); Selby y colaboradores, Br. J. Cáncer 41:52 (1980)) puede ser usado como un hospedero. Las células de tumor transplantables (típicamente de manera aproximadamente 106 células) inyectadas en los hospederos isogénicos producen tumores invasivos en una alta proporción de casos, mientras que las células normales de origen similar no lo producen. En hospederos que desarrollaron tumores invasivos, las células que expresan secuencias asociadas con el cáncer son inyectadas subcutáneamente u ortotópicamente . Los ratones luego se separan en grupos, incluyendo grupos de control y grupos experimentales tratados (por ejemplo tratados con un modulador) . Después de una duración de tiempo adecuado, de preferencia 4-8 semanas, se mide el crecimiento del tumor (por ejemplo, por volumen o por sus dos dimensiones más grandes, o peso) y compara con el control. Los tumores que tienen reducción estadísticamente significante (usando, por ejemplo, la prueba T del estudiante) se dicen que tienen crecimiento inhibido. Ensayos In Vitro para Identificar y Caracterizar Moduladores Los ensayos para identificar compuestos con actividad de modulación se pueden realizar in vitro. Por ejemplo, un polipéptido de cáncer primero se pone en contacto con un modulador potencial y se incuba durante una cantidad de tiempo adecuada, por ejemplo, de 0.5 a 48 horas. En una modalidad, los niveles de polipéptido de cáncer se determinan in vitro al medir el nivel de proteina o mRNA. El nivel de proteina se mide usando inmunoensayos tal como el manchado de Western, ELISA y los similares con un anticuerpo que selectivamente enlaza el polipéptido de cáncer o fragmento del mismo. Para la medición de mRNA, la amplificación, por ejemplo, usando PCR, LCR, o ensayos de hibridación, por ejemplo, hibridación de Northern, la protección de RNAsa, manchado de puntos, son preferidos. El nivel de proteina o mRNA es detectado usando agentes de detección directamente o indirectamente marcados, por ejemplo, ácidos nucleicos fluorescentemente o radioactivamente marcados, anticuerpos radioactivamente o enzimáticamente marcado y los similares, como es descrito en la presente. Alternativamente, un sistema de gen reportador puede ser ideado usando un promotor de proteina de cáncer operablemente enlazado a un gen reportador tal como luciferasa, proteina fluorescente verde, el CAT o P-gal. La construcción reportadora es típicamente transfectada en una célula. Después del tratamiento con un modulador potencial, la cantidad de transcripción del gen ' reportador, traducción, o actividad es medida de acuerdo técnicas estándares conocidas para aquellos expertos en la técnica (Davis GF, supra; González, J. & Negulescu, P. Curr. Opin. Biotechnol. 1998:9:624).
Como es resumido en lo anterior, las clasificaciones in vitro se hacen en genes individuales y productos de gen. Esto es, habiéndose identificado un gen diferencial ente expresado particular como importante en un estado particular, la clasificación de moduladores de la expresión del gen o el producto de gen mismo es realizada. En una modalidad, la clasificación para moduladores de expresión de gen (es) especifico ( s) es realizada. Típicamente, la expresión de solamente unos cuantos genes es evaluada. En otra modalidad, las clasificaciones son diseñadas para primero encontrar compuestos que enlazan a proteínas diferencialmente expresadas. Estos compuestos luego son evaluados para la habilidad para modular la actividad diferencialmente expresada. Por otra parte, una vez que se identifican compuestos candidatos iniciales, las variantes pueden ser además clasificadas para mejor evaluar las relaciones de estructura y actividad. Ensayos de Enlace para Identificar y Caracterizar Moduladores En los ensayos de enlace de acuerdo con la invención, un producto de gen purificado o aislado de la invención es generalmente utilizado. Por ejemplo, los anticuerpos son generados a una proteína de la invención, y los inmunoensayos son corridos para ¦ determinar la cantidad y/o la localización de la proteína. Alternativamente, las 266 células que comprenden las proteínas de cáncer son utilizadas en los ensayos. Asi, los métodos comprenden la combinación de una proteina de cáncer de la invención y un compuesto candidato tal como un ligando, y determinar el enlace del compuesto a la proteina de cáncer de la invención. Las modalidades preferidas utilizan la proteina de cáncer humano; modelos animales de enfermedad humana también pueden ser desarrollados utilizados. También, otras proteínas mamíferas análogas también pueden ser utilizadas como es apreciado por aquellos expertos en la técnica. Además, en algunas modalidades se utilizan proteínas de cáncer variantes o derivadas . Generalmente, la proteína de cáncer de la invención, o ligando, es enlazado no difundiblemente a un soporte insoluble. El soporte puede, por ejemplo, uno que tiene áreas receptoras de muestra aislada (una placa microtítulo, un arreglo, etc.). Los soportes insolubles se pueden hacer de cualquier composición a la cual se pueden enlazar las composiciones, es fácilmente separada de la materia soluble, y de otra manera compatible con el método total de clasificación. La superficie de tales soportes puede ser sólida o porosa y de cualquier forma conveniente. Ejemplos de soportes insolubles, adecuados incluyen placas microtítulo, arreglos, membranas y cuentas. Estos son 267 típicamente hechos de vidrio, plástico (por ejemplo, poliestireno) , polisacárido, nilón, nitrocelulosa o Teflón™, etc. Las placas microtítulo y arreglo son especialmente convenientes debido a que gran número de ensayos pueden ser llevados simultáneamente, usando pequeñas cantidades de reactivos y muestras. La manera particular de enlace de la composición al soporte no es crucial mientras que sea compatible con los reactivos y los métodos totales de la invención, mantenga la actividad de la composición y no sea difundible. Los métodos preferidos de enlace incluyen el uso de anticuerpos que no bloquean estéricamente ya sea el sitio de enlace de ligando o la secuencia de activación cuando se une la proteína al soporte, el enlace directo a los soportes "pegajoso" o iónicos, la reticulación químico, la síntesis de la proteína o agente sobre la superficie, etc. Después del enlace de la proteína o el agente de ligando/enlace al soporte, se remueve el exceso de material no enlazado mediante lavado. Las áreas que reciben la muestra luego pueden ser bloqueadas a través de la incubación con albúmina de suero bovino (BSA) , caseína u otra proteína inocua u otra porción . Una vez que una proteína de cáncer de la invención es enlazada al soporte, un compuesto de prueba se adiciona al ensayo. Alternativamente, el agente de enlace candidato se enlaza al soporte y la proteína de cáncer de la invención 268 luego es adicionada. Los agentes de enlace incluyen anticuerpos específicos, agentes de enlace no naturales identificados en clasificaciones de librerías químicas, análogos de péptido, etc. De interés particular son los ensayos para identificar agentes que tienen una baja toxicidad para células humanas. Una amplia variedad de ensayos pueden ser usados para este propósito, incluyendo ensayos de proliferación, ensayos ci¾MP, ensayos de enlace de proteína-proteína in vitxo marcada, ensayos de desplazamiento de movilidad electroforética, inmunoensayos para enlace de proteína, ensayos funcionales (ensayos de fosforilación, etc.) y los similares. Dna determinación del enlace del compuesto de prueba (ligando, agente de enlace, modulador, etc.) a una proteína de cáncer de la invención se puede hacer en un número de maneras. El compuesto de prueba puede ser marcado, y el enlace determinado directamente, por ejemplo, al unir toda o una porción de la proteína de cáncer de la invención a un soporte sólido, al adicionar un compuesto candidato marcado (por ejemplo, una etiqueta fluorescente) , al lavar el reactivo en exceso, y al determinar si la etiqueta está presente sobre el soporte sólido. Varias etapas de bloqueo y de lavado pueden ser utilizadas como sea apropiado. En ciertas modalidades, -solamente uno de los 269 componentes es marcado, por ejemplo, una proteina de la invención o ligandos marcados. Alternativamente, más de un componente es marcado con diferentes marcas, por ejemplo, I125, para las proteínas y un fluoróforo para el compuesto. Los reactivos de proximidad, por ejemplo, reactivos de transferencia de energía o de apagamiento también son útiles. Enlace Competitivo para Identificar y Caracterizar Moduladores En una modalidad, el enlace del "compuesto de prueba" es determinado mediante el ensayo de enlace competitivo con un "competidor. El competidor es una porción de enlace que enlaza a la molécula objetivo (por ejemplo, una proteína de cáncer de la invención) . Los competidores incluye compuestos tales como anticuerpos, péptidos, asociados de enlace, ligandos, etc. Bajo ciertas circunstancias, el enlace competitivo entre el compuesto de prueba y el competidor desplaza el compuesto de prueba. En una modalidad, el compuesto de prueba es marcado. Ya sea el compuesto de prueba, el competidor, o ambos, se adicionan a la proteína durante un tiempo suficiente para permitir el enlace. Las incubaciones se realizan a una temperatura que facilita la actividad óptima, típicamente entre cuatro y 40°C. Los períodos de incubación son típicamente optimizados, por ejemplo, para facilitar la clasificación de alto rendimiento rápida; típicamente entre cero y una hora será suficiente. El 270 reactivo en exceso es generalmente removido o deslavado. El segundo componente luego es adicionado, y la presencia o ausencia del componente marcado es seguido, para indicar el enlace . En una modalidad, el competidor se adiciona primero, seguido por el compuesto de prueba. El desplazamiento del competidor es una indicación de que el compuesto de prueba está enlazando a la proteína de cáncer y así es capaz de enlazar a, y potencialmente modular, la actividad de la proteína de cáncer. En esta modalidad, cualquier componente puede ser marcado. Así, por ejemplo, si el competidor es marcado, la presencia de la etiqueta en la solución de lavado del compuesto de pos-prueba indica el desplazamiento por el compuesto de prueba. Alternativamente, si el compuesto de prueba es marcado, la presencia de la etiqueta sobre el soporte indica el desplazamiento. En una modalidad alternativa, el compuesto de prueba se agrega primero, con la incubación y lavado, seguido por el competidor. La ausencia de enlace por el competidor indica que el compuesto de prueba enlaza la proteína de cáncer con más alta afinidad que el competidor. Así, si el compuesto de prueba es marcado, la presencia de la etiqueta sobre el soporte, acoplada con una falta de enlace del competidor, indica que el compuesto de prueba enlaza a y, así potencialmente modula la proteína de cáncer de la invención. 271 Por consiguiente, los métodos de enlace competitivos comprenden la clasificación diferencial para identificar agentes que son capaces de modular la actividad de las proteínas de cáncer de la invención. En esta modalidad, el método comprenden combinar una proteína de cáncer y un competidor en una primera muestra. Una segunda muestra comprende un compuesto de prueba, la proteína de cáncer y un competidor. El enlace del competidor es determinado por ambas muestras, y un cambio, o diferencia en la enlace entre las dos muestras indica la presencia de un agente capaz de enlazar a la proteína de cáncer y potencialmente modulando su actividad. Esto es, si el enlace del competidor es diferente de la segundo muestra con relación a la primera muestra, el agente es capaz de enlazar a la proteína de cáncer . Alternativamente, la clasificación diferencial es utilizada para identificar candidatos de fármaco que enlazan a la proteína de cáncer nativa, pero no pueden enlazar a las proteínas de cáncer modificadas. Por ejemplo, la estructura de la proteína de cáncer es modelada y usada en el diseño de fármaco racional para sintetizar agentes que interactúan con ese sitio, agentes que generalmente no enlazan a las proteínas -modificadas en el sitio. Además, tales candidatos de fármaco que afectan la actividad de una proteína de cáncer nativa también son identificados al clasificar fármacos para 272 la habilidad para ya sea incrementar o reducir la actividad de tales proteínas . Los controles positivos y controles negativos pueden ser utilizados en los ensayos. De preferencia las muestras de prueba y de control se realizan por lo menos por triplicado para obtener resultados estadísticamente significantes. La incubación de todas las muestras ocurre durante un tiempo suficiente para permitir el enlace del agente a la proteína. Después de la incubación, las muestras son lavadas libres del material no específicamente enlazado y la cantidad de agente generalmente marcado, enlazado determinado. Por ejemplo, donde se emplea una radiomarca, las muestras pueden ser contadas en un contador de centelleo para determinar la cantidad de compuesto enlazado. Una variedad de otros reactivos pueden ser incluidos en los ensayos de clasificación. Estos incluyen reactivos similares a sales, proteínas neutral, por ejemplo albúmina, detergentes, etc. que son utilizados para facilitar la enlace óptimo de proteína-proteína y/o reducir las interacciones no específicas o de antecedente. También los reactivos que de otro manera mejoran la eficiencia del ensayo, tal como inhibidores de proteasa, inhibidores de nucleasa, agentes anti-microbianos, etc., pueden ser utilizados. La mezcla de componentes es adicionada en un orden que proporciona el enlace necesario. 273 Uso de Polinucleótidos para Regular Hacia Abajo o nhibir una Proteína de la Invención Los moduladores de polinucleotido de cáncer pueden ser introducidos en una célula que contiene la secuencia de nucleótido objetivo mediante al formación de un conjugado con una molécula de enlace de ligando, como es descrito en WO 91/04753. Las moléculas de enlace de ligando adecuadas incluyen, pero no están limitadas a, receptores de superficie celular, factores de crecimiento, otras citoquinas, u otros ligandos que enlazan a receptores de superficie celular. De preferencia, la conjugación de la molécula de enlace de ligando no substancialmente interfiere con la habilidad de la molécula de enlace de ligando para enlazar a su molécula o su receptor correspondiente, o bloquear la entrada del oligonucleótido de sentido o antisentido o su versión conjugada en la célula. Alternativamente, un modulador de polinucleotido de cáncer puede ser introducido en una célula que contiene la secuencia de ácido nucleico objetivo, por ejemplo, mediante la formación de un complejo de polinucleótido-lípido, como es descrito en WO 90/10448. Se entiende que el uso de moléculas antisentido o inactivación en modelos también puede ser usado en ensayos clasificación como es discutido en lo anterior, además de los métodos de tratamiento . Nucleótidos Inhibitorios y Antisentido 274 En ciertas modalidades, la actividad de una proteina asociada con cáncer es regulada hacia abajo, o completamente inhibida, mediante el uso de polinucleótido antisentido o RNA nuclear, pequeño e inhibitorio (snRNA) , es decir, un ácido nucleico complementario a, y que de preferencia pueda hibridar específicamente a, una secuencia de ácido nucleico de mRNA de codificación, por ejemplo, una proteína de cáncer de la invención, mRNA, o una consecuencia de la misma. El enlace del polinucleótido antisentido mRNA reduce la traducción y/o la estabilidad del mRNA. En el contexto de esta invención, los polinucleótidos antisentido pueden comprender nucleotidos que ocurren de manera natural, o especies sintéticas formadas de subunidades que ocurren de manera natural o sus homólogos estrechos. Los polinucleótidos antisentido también pueden tener porciones de azúcar alteradas o enlace de inter-azúcar . Ejemplares entre éstos están el fosforotioato y otras especies que contienen azufre que son conocidos para uso en la técnica. Los análogos están comprendidos mediante esta invención mientras que ellos funcionen efectivamente para hibridar con los nucleotidos de la invención. Ver, por ejemplo, Isis Pharmaceuticals , Carlsbad, CA; Sequitox, Inc., Natick, MA. Tales polinucleótidos antisentido fácilmente pueden ser sintetizados usando medios recombinantes, o se pueden 275 sintetizar in vitro. El equipo para tal síntesis es vendido por varios vendedores, incluyendo Applied Biosystems. La preparación de otros oligonucleótidos tales como fosforotioatos y derivados alquilados también es bien conocidos para aquellos expertos en la técnica. Las moléculas antisentido cono se utilizan en la presente incluyen oligonucleótidos antisentido o de sentido. Los oligonucleótidos de sentido pueden, por ejemplo, empleados para bloquear la transcripción mediante el enlace a la hebra antisentido. El oligonucleótido de antisentido y sentido comprende una secuencia de ácido nucleico de una sola hebra (ya sea RNA o DNA) capaz de enlazar al mRNA objetivo (sentido) o las secuencias de DNA (antisentido) para moléculas de cáncer. Los oligonucleótidos antisentido o de sentido, de acuerdo con la presente invención, comprenden un fragmento generalmente de por lo menos aproximadamente 12 nucleótidos, de preferencia de aproximadamente 12 a 30 nucleótidos. La habilidad para derivar oligonucleótido antisentido o de sentido, basado en una secuencia de cDNA que codifica una proteína dada se describe en, por ejemplo, Stein & Cohén (Cáncer Res. 48:2659 (1988 y van der Krol y colaboradores, (BioTechniques 6:958 (1988)). Ribozimas Además de los polinucleótidos antisentido, las ribozimas se pueden usar para dirigir e inhibir la 276 transcripción de secuencias de nucleótidos asociadas con cáncer. Una ribozima es una molécula de RNA que catalíticamente segmenta otras moléculas de RNA. Diferentes clases de ribozimas han sido descritas, incluyendo la ribozimas del grupo I, ribozimas de cabeza de martillo, ribozimas de horquilla, RNasa P y ribozimas de cabeza axial (ver, por ejemplo, Castanotto y colaboradores, Adv. in Pharmacology 25:289-317 (1994) para una revisión general de las propiedades de diferentes ribozimas) . Las características generales de ribozimas de horquilla son descritas, por ejemplo, en Hampel y colaboradores, Nucí. Acids Res. 18:299-304 (1990); publicación de patente Europea .No. 0360257; patente norteamericana No. 5,254,678. Los métodos de preparación son bien conocidos para aquellos expertos enla técnica (ver, por ejemplo, O 94/26877; Oj ang y colaboradores, Proc. Nati. Acad. Sci. EUA 90:6340-6344 (1993); Yamada y colaboradores, Human Gene Therapy 1:39-45 (1994); Leavitt y colaboradores, Proc. Nati. Acad Sci. EUA 92:699-703 (1995); Leavitt y colaboradores, Human Gene Therapy 5:1151-120 (1994) yand Yamada y colaboradores, Virology 205:121-126 (1994)). Uso de Moduladores en la Clasificación Fenotipica En una modalidad, un compuesto de prueba es administrado a una población de células de cáncer, que tienen un perfil expresión de cáncer asociado. Por "administración" 277 o "contacto" en la presente se propone que el modulador se adicione a las células de una manera tal para permitir que el modulador actúe en la célula, ya sea mediante la captación y la acción intracelular, o mediante la acción en la superficie de la célula. En algunas modalidades, un ácido nucleico que codifica un agente proteinaceo (es decir, un péptido) se coloca en una construcción viral tal como una construcción adenoviral o retroviral, y se adiciona a la célula, tal que la expresión del agente de péptido es realizada, por ejemplo, PCT US 97/01019. También se pueden utilizar sistemas de terapia génica regulables. Una vez que el modulador se ha administrado a las células, las células son lavadas si es deseado y se dejan incubar bajo condiciones de preferencia fisiológicas durante algún periodo. Las células luego son recolectadas y un nuevo perfil de expresión de gen es generado. Asi, por ejemplo, el tejido de cáncer es clasificado para agentes que modulan, por ejemplo, inducen o suprimen, el fenotipo de cáncer. Un cambio en por lo menos un gen, de preferencia muchos, del perfil de expresión indica que el agente tiene un efecto sobre la actividad del cáncer. De manera similar, la alteración de una función biológica o una ruta de señalización es indicativa de la actividad del modulador. Al definir tal prescripción para el fenotipo de cáncer, se dan clasificaciones para nuevos fármacos que alteran el fenotipo. Con este procedimiento, el fármaco 278 objetivo no necesita ser conocido y no necesita ser presentado en la plataforma de clasificación de expresión de gen/proteina original, ni el nivel de transcripción para la proteina objetivo necesita cambiar. La función de inhibición del modulador servirá como un marcador suplente. Como es resumido anteriormente, las clasificaciones se hacen para estimar genes o productos de gen. Esto es, teniendo identificado un gen diferencialmente expresado particular como importante en un estado particular, se realiza la clasificación de moduladores de ya sea la expresión del gen o el producto de gen mismo. Uso de Moduladores para Afectar Péptidos de la Invención Las mediciones de la actividad de polipéptido de cáncer, o del fenotipo de cáncer se realizan usando una variedad de ensayos. Por ejemplo, los efectos de moduladores en la función de un (os) polipéptido (s) de cáncer se miden al examinar los parámetros descritos en lo anterior. Un cambio fisiológico que afecta la actividad es usada para estimar la influencia de un compuesto de prueba sobre los polipéptidos de esta invención. Cuando los efectos funcionales son determinados usando células intactas o animales, una variedad de efectos pueden ser estimaciones tales como, en el cáncer de un cáncer asociado con tumores sólidos, crecimiento de tumor, metástasis de tumor, neovascularización, liberación de 279 hormona, cambios transcripcionales a marcadores genéticos tanto conocidos como no caracterizados (por ejemplo, mediante manchados de Northern) , cambios en el metabolismo de la célula tal como el crecimiento de la célula o cambios de pH, y cambios en los segundos mensajeros intracelulares tales como cGNIP. Métodos para Identificar Secuencias Asociadas con Cáncer Caracterizantes La expresión de varias secuencias de genes está correlacionada con el cáncer. Por consiguiente, los desórdenes basados en genes de cáncer mutantes o variantes son determinados. En una modalidad, la invención proporciona métodos para identificar células que contienen genes de cáncer variantes, por ejemplo, determinando la presencia de, toda o parte, la secuencia de por lo menos un gen de cáncer endógeno en una célula. Esto se realiza usando cualquier número de técnicas de secuenciación. La invención comprende métodos para identificar el genotipo de cáncer de un individuo, por ejemplo, la determinación de todo o parte de la secuencia de por lo menos un gen de la invención en el individuo . Esto generalmente se hace en por lo menos un tejido del individuo, por ejemplo, un tejido expuesto en la Tabla I, y puede incluir la evaluación de un número de tejidos o diferentes muestras del mismo tejido. El método puede incluir la comparación de la secuencia del gen secuenciado a un gen de cáncer conocido, es decir, un gen de tipo silvestre para determinar la presencia de miembros de familia, homologías, mutaciones o variantes. La secuencia de toda o parte del gen luego puede ser comparada con la secuencia de un gen cáncer conocido para determinar si existen algunas diferencias. Esto se hace usando cualquier número de programas de homología conocidos, tal como BLAST, Bestfit, etc. La presencia de una diferencia en la secuencia entre el gen de cáncer del paciente y el gen de cáncer conocido se correlaciona con un estado de enfermedad o una propensión para un estado de enfermedad, como es resumido en la presente. En una modalidad preferida, los genes de cáncer se usan como sondas para determinar el número de copias del gen de cáncer en el genoma. Los genes de cáncer se usan como sondas para determinar la localización cromosomal de los genes de cáncer. La información tal como la localización cromosomal encuentra uso en proporcionar un diagnóstico o pronóstico en particular cuando anormalidades cromosomales tales como translocaciones, y similares son identificadas en el sitio del gen de cáncer. XIV. ) Equipos/Artículos de Manufactura Para uso en las aplicaciones de laboratorio, de pronóstico, profilácticas, de diagnóstico y terapéuticas descritas en la presente, equipos están dentro del alcance de 281 la invención. Tales equipos pueden comprender un portador, paquete o contenedor que está formado en compartimientos para recibir uno o más contenedores tales como frasquitos, tubos y similares, cada uno de los contenedores comprende uno de los elementos separados para ser usados en el método, junto con una etiqueta o inserto que comprende instrucciones para el uso, tal como un uso descrito en la presente. Por ejemplo, el (los) contenedor (es) puede comprender una sonda que es o puede ser detectablemente marcada. Tal sonda puede ser un anticuerpo o polinucleótido especifico para una proteina o un gen o mensaje de la invención, respectivamente. Donde el método utiliza la hibridación ácido nucleico para detectar el ácido nucleico objetivo, el equipo también puede contener contenedores que contienen nucleótido (s) para la amplificación de la secuencia de ácido nucleico objetivo. Los equipos pueden comprender un contenedor que comprende un reportador, tal como una proteina de enlace de biotina, tal como avidina o estreptavidina, enlazado a una molécula d reportadora, tal como una etiqueta enziir.ática, fluorescente o radioisótopo; tal reportador se puede usar con, por ejemplo, un ácido nucleico o anticuerpo. El equipo puede incluir toda o parte de las secuencias de aminoácidos en la Figura 2 o la Figura 3 o análogos de las mismas, o una molécula de ácido nucleico que codifica tales secuencias de aminoácidos. El equipo de la invención típicamente comprenderá 282 el contenedor descrito en lo anterior y uno o más de otros contenedores asociados con el mismo que comprenden materiales deseables desde un punto de vista comercial y el usuario, incluyendo soluciones reguladoras, diluyentes, filtros, agujas, jeringas; portador, paquete, contenedor, frasquito y/o marcas de tubos que listan. los contenidos y/o instrucciones para el uso, e insertos de paquete con instrucciones para uso. Una etiqueta puede estar presente en o con el contenedor para indicar que la composición es usada para una terapia especifica o aplicación no terapéutica, tal como una aplicación de pronóstico, profiláctica, diagnóstico o laboratorio, y también pueden indicar instrucciones para el uso ya sea in vivo o in vitro, tales como aquellos descritos en la presente. Las instrucciones y/u otra información también pueden ser incluidas en un (os) inserto (s) o etiqueta (s) que es incluida con o sobre el equipo, la etiqueta puede estar sobre, o asociada con el contenedor. Una etiqueta puede estar sobre un contenedor cuando las letras, números u otros caracteres que forman la etiqueta son moldeados o grabados en el contenedor mismo; una etiqueta puede ser asociada con un contenedor cuando se presente dentro de un receptáculo o portador que también sostiene el contenedor, por ejemplo, como un inserto de paquete. La etiqueta puede indicar que la composición es usada para 283 diagnóstico, tratamiento, profilaxis o pronóstico de una condición, tal cono una neoplasia de un tejido expuesta en la Tabla I. Los términos "equipo" y "artículo de manufactura" se pueden usar como sinónimos. En otra modalidad de la invención, un (os) artículo (s) de manufactura que contiene composiciones, tales como secuencia (s) de aminoácidos (s) , molécula (s) pequeña (s), secuencia (s) de ácido nucleico (s) y/o anticuerpo (s ) , por ejemplo, materiales útiles para el diagnóstico, pronóstico, profilaxis y/o tratamiento de neoplasias de tejidos tales como aquellos expuestos en la en Tabla I es proporciono. El artículo de manufactura típicamente comprende por lo menos un contenedor y por lo menos una etiqueta. Los contenedores adecuados incluyen, por ejemplo, botellas, frasquitos, jeringas y tubos de prueba. Los contenedores pueden ser formados a partir de una variedad de materias tales como vidrio, metal o plástico. El contenedor puede contener la(s) secuencia (s) , molécula (s) pequeña (s), secuencia (s) de ácido nucleico (s), población (es) de célula y/o anticuerpo (s) . En una modalidad, el contenedor contiene un polinucleótido para el uso en el examen del perfil de expresión de mRNA de una célula, junto con reactivos usados para este propósito. En otra modalidad un contenedor comprende un anticuerpo, fragmento de enlace del mismo o proteína de enlace específica 284 para el uso en la evaluación de la expresión de proteina de 282P1G3 en células y tejidos, o para propósitos relevantes de laboratorio, pronóstico, diagnóstico, profilaxis y terapéuticos; indicaciones y/o instrucciones para tales usos pueden ser incluidos sobre o con tal contenedor, como pueden ser los reactivos y otras composiciones o herramientas utilizadas para estos propósitos. En otra modalidad, un contenedor comprende materiales para inducir una respuesta inmune celular o humoral, junto con indicaciones y/o instrucciones asociadas. En otra modalidad, un contenedor comprende materiales para la inmunoterapia adoptiva, tales como células T citotóxicas (CTL) o células Y ayudantes (HTL) , junto con indicaciones y/o instrucciones asociadas; reactivos y otras composiciones o herramientas utilizadas para tal propósito también pueden ser incluidos. El contenedor puede tener alternativamente contener una composición que es efectiva para tratar, diagnosticar, pronosticar o la profilaxis de una condición y puede tener un orificio de acceso estéril (por ejemplo el contenedor puede ser una bolsa de solución intravenosa o un frasquito que tiene un tapón perforable mediante -una aguja de inyección hipodérmica) . Los agentes activos en la composición pueden ser un anticuerpo capaz de enlazar específicamente 282P1 G3 y modular la función de 282P1 G3. El articulo de manufactura puede además comprender 285 un segundo contenedor que comprende una solución reguladora farmacéuticamente aceptable, tal como solución salina regulada con fosfato, solución de Ringer y/o solución de dextrosa. Este además puede incluir otros materiales deseables desde un punto de vista comercial y del usuario incluyendo otras soluciones reguladoras, diluyentes, filtros, agitadores, agujas, jeringas y/o insertos de paquete con indicaciones y/o instrucciones para el uso. EJEMPLOS Varios aspectos de la invención se describen adicionalmente y se ilustran por medio de los diversos ejemplos que siguen, ninguno de los cuales se propone para limitar el alcance de la invención. Ejemplo 1: Aislamiento Generado por SSH del Fragmento cDNA del Gen PSCA ¦ Intencionalmente Omitido Ejemplo 2: Aislamiento del cDNA que Codifica PSCA de Longitud Completa Intencionalmente Omitido Ejemplo 3: Mapeo Cromosomal del PSCA Intencionalmente Omitido Ej emplo 4 Análisis de Expresión de Variantes de PSCA en Tejidos Normales y Especímenes de Pacientes Previamente, PSCA, referido en la presente como 286 PSCA .l, se identificó como un antigeno expresado en el cáncer de próstata. Su expresión se detectó en mayor que 80% de los cánceres de próstata primarios y en la mayoría de metástasis de próstata. También se ha mostrado que es expresado en el cáncer de vejiga, cáncer de ovario y cáncer pancreático; estos cánceres son listados en la Tabla I. Mediante el análisis inmunohistoquímico, PSCA se ha mostrado que es sobreexpresado sobre la superficie de la célula de la mayoría de carcinomas transicionales uroteliales, y el 60% de adenocarcinomas pancreáticos primarios. Los datos de expresión de PSCA se han reportado en publicaciones de patentes (PCT/US98/04664 , PCT/US/28883, PCT/US00/19967 ) y en artículos previamente revisados (Saffran y colaboradores, Proc Nati Acad Sci E ü A. 27 de Febrero 2001; 98(5): 2658-2663; Amara y colaboradores, Cáncer Res. 15 de Junio de 2001.; 61 (12) : 4660-65; Reiter y colaboradores, Proc Nati Acad Sci USA. 17 de Febrero de 1998; 95 ( ): 1735-40; Argani y colaboradores, Cáncer Res. 1 de Junio de 2001; 61(11) :4320-24) . La expresión específica de diferentes variantes de PSCA se estudió en especímenes de pacientes normales y de cáncer (Figura 14 y Figura 15) . Los cebadores se diseñaron para diferenciar entre PSCA v.l/v.2/v.4, PSCA v.3 y PSCA v.5. PSCA v.l/v.2/v.4 condujo a un producto de PCR de 425 bp, PSCA v.3 conduce un producto de PCR de 300 bp, mientras que PSCA 287 v.5 conduce un producto de PCR de 910 bp en tamaño (Figura 14A) . El cDNA de primera hebra se preparó a partir de vejiga normal, cerebro, corazón, riñon, hígado, pulmón, próstata, bazo, músculo esquelético, -teste, páncreas, colon, estómago, acumulaciones de cáncer de próstata, cáncer de vejiga, cáncer de riñon, cáncer de colon, cáncer de pulmón, cáncer de ovario, cáncer de pecho, metástasis de cáncer y del cáncer de páncreas (Figura 14B) . La normalización se realizó mediante PCR usando cebadores para actina. La PCR semicuantitativa, usando los cebadores específicos variantes se realizaron en 30 ciclos de amplificación. Los resultados muestran la expresión de PSCA v.5 principalmente en el cáncer de pecho, metástasis de cáncer y el cáncer de páncreas, y a nivel inferior en el cáncer de colon y cáncer de pulmón. El producto PSCA v.l/v.2/v.4 se detectó en el cáncer de próstata, cáncer de vejiga, cáncer de riñon, cáncer de colon, cáncer de pulmón, cáncer de ovario, cáncer de pecho, metástasis de cáncer y cáncer de páncreas. Entre los tejidos normales, el producto de PSCA v.l/v.2/v.4 se detectó solamente en la próstata, estómago y en nivel inferior en el riñon y el pulmón, mientras que PSCA v.5 no se detectó en cualquier tejido normal. El producto detectado de PSCA v.3 no se detectó en cualquiera de las muestras probadas. 288 Los cebadores se diseñaron para diferenciar entre PSCA v.4 y PSCA v.5 (la Figura 15A) . PSCA v.4 conduce a un producto de PCR de 460 bp, mientras que PSCA v.5 conduce a un producto de PCR de 945 bp en tamaño. El cDNA primera hebra se preparó a partir de la vejiga normal, cerebro, corazón, riñon, hígado, pulmón, próstata, bazo, músculo esquelético, teste, páncreas, colon, estómago, acumulaciones de cáncer de próstata, cáncer de vejiga y acumulación de multi-xenoinj erto (xenoinjertos de cáncer de próstata, cáncer de riñon y cáncer de vejiga) (Figura 15B) . La normalización se realizó mediante PCR usando cebadores para actina. La PCR semicuantitati a, usando los cebadores específicos variantes se realizó en 30 ciclos de amplificación. Los resultados muestran la expresión de PSCA v.4 en el cáncer de próstata, cáncer de vejiga y acumulación de multi-xenoinj ertos , riñon normal y próstata. PSCA v.5 se detectó solamente en la próstata normal y el cáncer de vejiga . La expresión restringida de las variantes de PSCA en tejidos normales y la expresión detectada en los especímenes de pacientes de cáncer indican que las variantes de PSCA son objetivos terapéuticos, de pronóstico, de laboratorio, profilácticos y de diagnóstico para cánceres humanos. 289 Ejemplo 5: Variantes de Transcripción del PSCA Como se utiliza en la presente, el término variante incluye variantes de transcripción y polimorfismos de nucleótido individual (SNPs) . Las variantes de transcripción son variantes de mRNA maduro del mismo gen que surgen mediante la transcripción alternativa o empalme alternativo. Las transcripciones alternativas son transcripciones del mismo gen pero inician la transcripción en diferentes puntos. Las variantes de empalme son variantes de mRNA empalmadas diferentemente de la transcripción. En eucariotes, cuando se transcripción un gen de multi-exón del DNA genómino, el RNA inicial es empalmado para producir mRNA funcional, que tiene solamente exones y es usado para la traducción en una secuencia de aminoácidos. Por consiguiente, un gen dado puede tener cero a muchas transcripciones alternativas y cada transcripción puede tener cero a muchas variantes de empalme. Cada variante de transcripción tiene una constitución de exón única, y puede tener diferentes porciones de codificación y/o no codificación (5' o 3' terminales), de la transcripción original. Las variantes de transcripción pueden codificar para las mismas, similares o diferentes proteínas, tales proteínas que tienen la misma o una función similar o una función diferente. Las proteínas variantes pueden ser expresadas en el mismo tejido al mismo tiempo, en un tejido diferente al mismo tiempo, o en el mismo tejido en diferentes 290 tiempos, o en diferente tejido en un diferente tiempo. Las proteínas codificadas por una variante de transcripción pueden tener localizaciones subcelulares o extracelulares similares o diferentes (por ejemplo, secretada contra intracelular) . Las variantes de transcripción son identificadas por una variedad de métodos aceptados en la técnica. Por ejemplo, las variantes de transcripción y de empalme alternativas son identificadas por la clonación de longitud completa, o mediante el uso de transcripción de longitud completa secuencias EST. Primero, todos los ESTs humanos se agruparon en agrupaciones que muestra la identidad directa o indirecta entre sí. Segundo, los ESTs en la misma agrupación se agruparon adicíonalmente en sub-grupos y se ensamblaron en una secuencia de consenso. La secuencia de gen original es comparada a la(s) secuencia (s) de consenso u otras secuencias de longitud completa. Cada secuencia de consenso es una variante de empalme potencial para ese gen. Varias modalidades de confirmación son bien conocidas en la técnica, tal como la identificación de la variante mediante el análisis de Northern, la clonación de longitud completa o mediante el uso de librerías de sondas, etc.. Aun cuando una variante es identificada que no e.s todavía un clon de longitud completa, esa porción de la variante es muy útil como una herramienta de investigación, por ejemplo, para la 291 generación de antigeno o para la clonación adicional de la variante de empalme de longitud completa, usando técnicas conocidas en el arte. Además, los programas de computadora están disponibles en la técnica que identifican variantes de transcripción basados en secuencias genómicas. Los programas de identificación de variantes de transcripción basados en Genómica incluyen FgenesH (A. Salamov y V. Solovyev, "include FgenesH (A. Salamov y V. Solovyev, ""Ab initio gene finding in Drosophila genomic DNA, "Genome Research. 2000 Abril; 10 (4) : 516-22) ; Grail (URL compbio.ornl.gov/Grail-bin/EmptyGrailForm) y GenScan (URL genes. mit.edu/GENSCAN. Para una discusión general de los protocolos de identificación de variante en empalme, ver, por ejemplo, Southan, C, A genomic perspective on human proteases, FEBS Lett. 8 de Junio de 2001 8; 498 (2-3) : 214-8 ; de Souza, S. J. , y colaboradores, Identification of human chromosome 22 transcripciónd sequences ith 0RF expxessed sequence tags, Proc. Nati Acad Sci E U A. 7 de Noviembre de 2000; 97 (23) :12690-3. Para además confirmar los parámetros de una variante de transcripción, una variedad de técnicas están disponibles en el arte, tal como la clonación de longitud completa, validación proteómica, validación basada en PCR y la validación 5' RACE, etc. (Ver por ejemplo, Validación 292 Proteómica: Brennan, S. 0. y colaboradores, Albumin banks península: a new termination variant characterized by electrospray mass spectrometry, Biochem Biophys Acta. 17 de Agosto de 1999; 1433 (1-2) : 321-6; Ferranti P y colaboradores, Differential splicing of pre-messenger RNA produces múltiple forms of mature caprine alpha (si) -casein, Eur J Biochem. 1 de Octubre de 1997; 249(1) :l-7. Para la validación basada en PCR: Wellmann S y colaboradores, Specific reverse transcription-PCR quantification of vascular endothelial growth factor (VEGF) splice variants by LightCycler technology, Clin Chem. Abril de 2001; 47 ( 4 ) : 654-60; Jia, H. P. y colaboradores, Discovery of new human beta-defensins using a genomics-based approach, Gene. 24 de Enero de 2001; 263 (1-2) : 211-8. Para la validadación basada en PCR 5'RACE: Brigle, K. E, y colaboradores, Organization of the murine reduced folate carrier gene and Identification of variant splice forms, Biochem Biophys Acta. 7 de Agosto de 1997; 1353 (2) : 191-8) . Es conocido en la técnica que las regiones genómicas son moduladas en los cánceres. Cuando la región genómica a la cual un gen mapea es modulada en un cáncer particular, las variantes de transcripciones o de empalme alternativos del gen son modulados también. En la presente se divulga que el PSCA tiene un perfil de expresión particular relacionado con el cáncer (ver por ejemplo, Tabla I) . Las 293 variantes de transcripción y de empalme alternativas de PSCA también serán involucradas en cánceres, por ejemplo en uno o en más de estos tejidos y en ciertos tejidos adicionales también. Las variantes asi sirven como marcadores/antigenos asociados con tumor. Usando el gen PSCA de longitud completa juntos con las secuencias EST, cuatro variantes de transcripción adicionales fueron identificadas, designadas como PSCA v.2, v.3, v.4, y v.5. Los limites de los exones en la transcripción original, PSCA v.l se mostraron en la Tabla LI . Las estructuras esquemáticas de las secuencias de ácido nucleico de la variante de transcripción se muestra en la Figura 10. En la Figura 10, las barras con el mismo patrón gráfico representan estiramientos del material genético contiguo, por ejemplo, las barras negras designan la secuencia genómica encontrada en la variante 1. Las Tablas Lll(a) - (d) hasta LV(a) - (d) se exponen en una base de variante por variante. LII (a) - (d) muestras las secuencias de nucleótido de las variantes de transcripción. La tabla LUI (a) - (d) muestra la alineación de las variantes de transcripción con la secuencia ácido nucleico de PSCA v.l (para v.2 solamente) o con PSCAv.2 (para todas las otras variantes). La tabla LIV(a)- (d) presenta la traducción de aminoácidos de las variantes de transcripción para la orientación de la estructura de lectura identificada. 294 JLa tabla LV(a) - (d) exhibe las alineaciones de la secuencia de aminoácidos codificadas por la variante de empalme con aquella de PSCA v.l. Ejemplo 6: Polimorfirnos de Nucleótido Individual de PSCA Un polimorfismo de nucleótido individual (SNP) es una variación de pares de base individual en una secuencia de nucleótido a una localización específica. En cualquier punto dado del genoma, existen cuatro posibles pares de bases de nucleótidos: AIT, C/G, G/C, y T/A. Como se utiliza en la presente, un alelo es uno de una serie de formas alternativas de un gen dado, difiriendo en la secuencia de DNA, y afectando un producto (RNA y/o la proteína). ÜN SNP que ocurre en un cDNA es llamado un cSNP. Este cSNP puede cambiar los aminoácidos de la proteína codificada por el gen y así cambiar la función de la proteína. Algunos SNPs causan enfermedades heredadas; otros contribuyen a variaciones cuantitativas en el fenotipo y las reacciones a los factores ambientales incluyendo la dieta y fármacos entre individuos. Por lo tanto, la existencia de un SNP y/o combinación de alelos (llamados haplotipos) tienen muchas aplicaciones útiles, tal como el diagnóstico de enfermedades heredadas, la determinación de reacciones del fármaco y dosificación, identificación de genes responsables por enfermedades, y análisis de la relación genética entre individuos (P. Nowotny, J. M. Kwon y A. M. Goate, "SNP 295 analysis to dissect human traits, "Curr. Opin. Neurobiol. Octubre de 2001; 11 (5) : 637-641; M. Pirmohamed y B. K. Park, "Genetic susceptibility to adverse drug reactions", Trends Pharmacol. Sci. Junio de 2001; 22 (6) : 298-305; J. H. Riley, C. J. Alian, E. Lai y A. Roses, "The use of single nucleotide polymorphisms in the isolation of common disease genes," Pharmacogenomics. Febrero de 2000; l(l):39-47; R. Judson, J. C. Stephens y ?. Windemuth, "The predictive power of haplotypes in clinical response, "Pharmacogenomics. Febrero de 2000; 1(1) -.15-26) . Los SNPs son identificados por una variedad de métodos aceptados en la técnica (P. Bean, "The promising voyage of SNP target discovery, "7Am. Clin. Lab. Octubre-Noviembre de 2001; 20(9): 18-20; K. M. Weiss, "In search of human variation, "Genome Res. Julio de 1998; 8 (7 ): 691-697 ; M. M. She, "Enabling large-scale pharmacogenetic studies by high-throughput mutation detection and genotyping technologies", Clin. Chem. Febrero de 2001; 47 (2 ): 164-172 ) . Por ejemplo, los SNPs son identificados al secuenciar fragmentos de DNA que muestran polimorfismo mediante los métodos basados en gel tal como el polimorfismo de longitud fragmento de restricción (RFLP) y electroforesis de gel gradiente desnaturalizante (DGGE) . Ellos están se descubrieron mediante la secuenciación directa de muestras de DNA acumuladas de diferentes individuos o al comparar 296 secuencias de diferentes muestras de DNA. Con la acumulación rápida de datos de secuencia en bases de datos públicas y privadas, también se descubren los SNPs al comparar secuencias usando programas de computadora (Z. Gu, L. Hillier y P. Y. Kwok, "Single nucleotide polymorphism hunting in cyberspace", Hum. Mutat. 1998; 12 (4) -.221-225) . Los SNPs pueden ser verificados y el genotipo o haplotipo de un individuo puede ser determinado mediante una variedad de métodos incluyendo la secuenciación directa y microarreglos de alto rendimiento (P. Y. Kwok, "Methods for genotyping single nucleotide polymorphisms, "Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2001; 2:235-258; M. Kokoris, K. Dix, K. Moynihan, J. Mathis, B. Erwin, P. Grass, B. Hiñes y A. Duesterhoeft", High-throughput SNP genotyping with" the Masscode system", Mol. Diagn. Diciembre de 2000; 5 ( 4 ) : 329-340 ) . Usando los métodos descritos en lo anterior, trece SNP se identificaron en la transcripción PSCA v.2. la Variante 2 se utilizó, antes que para la variante 1 de ejemplo, ya que esta tuvo menos bases ambiguas que la variante 1. Por consiguiente, los SNPs fueron identificados en la PSCA v.2, en las posiciones 57 (t/c) , 367 (c/t) , 424 (a/c), 495 (c/g), 499 (c/t), 563 (c/t), 567 (g/a) , 627 (g/a) , 634 (tag) , 835 (g/a), 847 (g/a), 878 (g/a) y 978 (c/g). Las transcripciones o proteínas con alelos alternativos se designaron como variante PSCA v.6 hasta v.18, como se muestra 297 en la Tabla LVI y Figura 12a. El cambio de nucleótido en v.6 cambió el codón de inicio de v.l y asi, la traducción no iniciaría hasta el siguiente ATG (mRNA) , dando por resultado una proteína 9 ?? más corta que la proteína v.l (Figura lia). Los cambios de nucleótido para v.l y v. 8 fueron silenciosos al nivel de la proteína . Doce de estos 13 SNPs también estuvieron presentes en la variante 4 como se expone en la Figura 12b y la tabla LVI. Las 12 variantes SNP con relación a PSCA v.4 son designadas PSCA v.19 hasta v.30. Las variantes. 19 hasta 27 codifican aminoácidos alternativos. (Figura 11b y Tabla LVI). La Tabla LVI también muestra los cambios de aminoácidos de la secuencia de proteína. Estos SNP, aunque se mostraron individualmente separados en la presente, pueden ocurrir en diferentes combinaciones en cualquiera de las variantes de transcripción que contiene el sitio del SNP. Ejemplo 7: Producción de PSCA Recombinante en Sistemas Procarióticos Para expresar PSCA recombinante y variantes de PSCA en células procarióticas, el PSCA de longitud completa o parcial y las secuencias de cDNA de la variante de PSCA son clonadas en cualquiera de una variedad de vectores de expresión conocidos en el arte. Una o más de las siguientes regiones de variantes de PSCA son expresadas: la secuencia de 298 longitud completa representada en las Figuras 2 y 3, o cualquiera de 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 o más aminoácidos contiguos de PSCA, variantes o análogos de los mismos. A. Construcciones de transcripción y traducción in vitro: pCRII : Para generar el sentido de PSCA y sondas anti sentido de RNA para las investigaciones in situ de RNA, construcciones de pCRII (Invitrogen, Carlsbad CA) son generadas que codifican ya sea todos o los fragmentos del cDNA de PSCA. El vector pCRII tiene los promotores Sp6 y T7 que flanquean el inserto para inducir la transcripción del RNA de PSCA para uso como sondas en experimentos de hibridación in situ de RNA. Estas sondas se utilizan para analizar la célula y la expresión del tejido de PSCA al nivel del RNA. El RNA de PSCA transcrito que representa la región de codificación de aminoácidos de cDNA del gen PSCA es usada en sistemas de traducción in vitro tal como el TnT™ Coupled Reticulolysate System (Promega, S.a., Madison, WI) para sintetizar la proteina PSCA. B. Construcciones Bacterianas: Construcciones pGEX: Para generar proteínas PSCA recombinantes en bacterias que son fusionadas a la proteina Glutationa-transferasa (GST) , toda o partes de la secuencia de codificación de proteina de cDNA de PSCA son clonadas en 299 la familia pGEX de los vectores de sufusión GST (Amersham Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ) . Estas construcciones permiten la expresión controlada de las secuencias de proteina PSCA recom inantes con GST fusionado en al amino terminal y un epitope de seis histidinas (6X His) en el carboxilo terminal. El GST y los fragmentos 6X His permiten la purificación de la proteina de fusión recombinante a partir de bacterias inducidas con la matriz de afinidad apropiada y permite el reconocimiento de la proteina de fusión con anti-GST y anticuerpos de anti-His. El fragmento 6X His es generado al adicionar 6 codones de histidina al cebados de clonación en el extremo 3', por ejemplo, de la estructura de lectura abierta (ORF) . Un sitio de segmentación proteolitico, tal como el sitio de reconocimiento PreScission™ en pGEX-6P-l, puede ser empleado tal que permite la segmentación del fragmento GST de la proteina relacionada con PSCA. El gen de resistencia ampicilina y el origen pBR322 permiten la selección y mantenimiento de los plásmidos pGEX en E. coli. Construcciones pMAL: Para generar en bacterias, proteínas de PSCA recombinantes que son fusionadas a la proteína de enlace de maltosa (MBP) , toda o partes de la secuencia de codificación de proteína de cDNA de PSCA son fusionadas al gen e MBP al clonar en los vectores pMAL-c2X y pMAL-p2X (Nueva Inglaterra Biolabs, Beverly, MA) . Estas construcciones permiten la expresión controlada de secuencias de proteina PSCA recombinantes con MBP fusionado en el amino terminal y un fragmento de epitope 6X His en el carboxilo terminal. El MBP y los fragmentos 6X His permiten la purificación de la proteina recombinante a partir de bacterias inducidas con la matriz de afinidad apropiada y permiten el reconocimiento de la proteina de fusión con anti-MBP y anticuerpos de anti-His. El fragmento de epitope 6X His es generado al adicionar 6 codones de histidina al cebador de clonación 3' . Un sitio de reconocimiento del Factor Xa permite la segmentación del fragmento pMAL de PSCA. Los vectores pMAL-c2X y p AL-p2X son optimizados para expresar la proteina recombinante en el citoplasma o periplasma respectivamente. La expresión del periplasma incrementa el plegamiento de las proteínas con enlaces de disulfuro. Construcciones pET: Para expresar PSCA en células bacterianas, todo o partes de las secuencias de codificación de proteina de cDNA de PSCA son clonadas en la familia pEt de vectores (Novagen, Madison, WI) . Estos vectores permiten la expresión estrechamente controlada de la proteina PSCA recombinante en bacterias con y sin fusión a proteínas que incrementan la solubilidad, tal como NusA y tioredoxina (Trx) y fragmentos de epitope, tal como 6X His y S-Tag™ que ayudan a la purificación y detección de la proteína recombinante. Por ejemplo, las construcciones se hacen utilizando el 301 sistema de fusión pET NusA 43.1 tal que las regiones de la proteina PSCA son expresadas como fusiones amino-terminales a NusA. C. Construcciones de Levadura Construcciones pESC: Para expresar PSCA en las especies de levadura de Saccharomyces cerevisiae para la generación de proteina recombinante y estudios funcionales, todo o partes de la secuencia de codificación de proteina de cDNA de PSCA son clonadas en la familia de vectores pESC cada una de las cuales contiene 1 o 4 marcadores selecciónateles, HIS3, TRP1, LEU2, y URA3 (Stratagene, La Jolla, CA) . Estos vectores permiten la expresión controlada del mismo plásmido de hasta 2 diferentes genes o secuencias clonadas que contienen ya sea los fragmentos de epitope Flag™ o Myc en la misma célula de levadura. Este sistema es útil para confirmar las interacciones de proteina-proteina del PSCA. Además, la expresión en levadura produce modificaciones pos-traducionales similares, tal como glicosilaciones y fosforilaciones, que se encuentran cuando se expresan células eucarióticas . Construcciones pESP: Para expresar PSCA en las especies de levadura Saccharomyces pombe, toda o partes de la secuencia de codificación de proteina de cDNA de PSCA se clonan en la familia de vectores pESP. Estos vectores permiten el nivel controlado alto de expresión de una 302 secuencia de proteina PSCA que es fusionada en ya sea el amino terminal o el carboxilo terminal a GST que ayuda a la purificación de la proteina recombinante . Un fragmento de epitope Flag™ permite la detección de la proteina recombinante con el anticuerpo anti Flag™. Ejemplo 8: Producción de PSCA Recombinante en Sistemas Eucarióticos Superiores Intencionalmente Omitido Ejemplo 9: Perfiles de Antigenicidad y Estructura Secundaria La Figura 5A-C, Figura 6A-C, Figura 7A-C, Figura 8A-C y a Figura 9A C representan gráficamente cinco perfiles de aminoácidos de las variantes de PSCA 1, 3, y 4, cada estimación disponible al ingresar al sitio de la red ProtScale (URL www. expasy. ch/cgi-bin/protscale . l) o en el sevidor de biología molecular ExPasy. Estos perfiles: Figura 5, Hidrofilicidad, (Hopp T. P., Woods K. R., 1981. Proc. Nati. Acad. Sci. E.Ü.A. 78:3824-3828); Figura 6, Hidropaticidad, (Kyte J. , Doolittle R. F., 1982. J. Mol. Biol. 157:105-132); Figura 7, Percentaje de Residuos Accessibles (Janin J. , 1979 Nature 277:491-492); Figura 8, Flexibilidad Promedio, (Bhaskaran R. y Ponnuswamy P. K., 1988. Int. J. Pept . Protein Res. 32:242-255); Figura 9, Beta-turn (Deleage, G., Roux B. 1987 Protein Engineering 1:289-294); y opcionalmente otros disponibles en la técnica, tal como el sitio de la red ProtScale, se usaron para 303 identificar regiones antigénicas de cada una de las proteínas variante de PSCA. Cada uno de los perfiles de aminoácidos anteriores de variantes PSCA se generaron usando los siguientes parámetros ProtScale para el análisis: 1) un tamaño de ventana de 9; 2) 100% de peso de los bordes de ventana comparados con el centro de la ventana; y 3) valores del perfil de aminoácidos normalizados para encontrarse entre 0 y 1. Los perfiles de Hidrofilicidad (Figura 5), Hidropaticidad (Figura 6) y Porcentaje ce Residuos Accesibles (Figura 7) se usaron para determinar estiramientos de aminoácidos hidrofilicos (es decir, valores mayores gue 0.5 en el perfil de Hidrofilicidad y el Porcentaje de Residuos Accesibles, y valores menores que 0.5 en el perfil de Hidropaticidad) . Tales regiones son probables que sean expuestas al medio ambiente acuoso, que está presente sobre la superficie de la proteína, y así disponible para el reconocimiento inmune, tal como mediante anticuerpos. Los perfiles de Flexibilidad Promedio (Figura 8) y Beta-turn (Figura 9) determinan estiramientos de aminoácidos (es decir, 1 valores mayor que 0.5 en el perfil Beta-turn y el perfil Flexibilidad Promedio) que no son restringidos en estructuras secundarias tales como láminas beta y hélices alfa. Tales regiones también se hicieron más probables que sean expuestas en la proteína y así accesibles al 304 reconocimiento inmune, tal como mediante anticuerpos. Las secuencias antigénicas de las proteínas variantes de PSCA indicadas, por ejemplo, mediante los perfiles expuestos en la Figura 5A-C, Figura 6A-C, Figura 7A-C, Figura 8A-C y/o la Figura 9A C se usan para preparar inmunógenos, ya sea péptidos o ácidos nucleicos que los codifican, para generar anticuerpos anti-PSCA terapéuticos y de diagnóstico. El inmunógeno puede ser cualquiera de 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45, 50 o más que 50 aminoácidos contiguos, o los ácidos nucleicos correspondientes que los codifican, de las variantes de proteína PSCA listadas en las Figuras 2 y 3 de las cuales se muestran los perfiles de aminoácidos en la Figura 9, o pueden ser deducidos debido a que la variante contiene secuencia que es la misma como una variante representada en la figura 9. En particular, los inmunógenos de péptido de la invención pueden comprender, una región de péptido de por lo menos 5 aminoácidos de las Figuras 2 y 3 en cualquier incremento de número entero que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en los perfiles de Hidrofilicidad de la Figura 5; una región de péptido de por lo menos 5 aminoácidos de las Figuras 2 y 3 en cualquier incremento de número entero que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor menor que 0.5 en el perfil de Hidropaticidad de la Figuras 6; una 305 región de péptido de por lo menos 5 aminoácidos de las Figuras 2 y 3 en cualquier incremento de número entero que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en los perfiles del por ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; una región de péptido de por lo menos 5 aminoácidos de las Figuras 2 y 3 en cualquier incremento de número entero que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en los perfiles de Flexibilidad Promedio en la Figura 8; y, una región de péptido de por lo menos 5 aminoácidos de las Figuras 2 y 3 en cualquier incremento de número entero que incluye una posición de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil Beta-Vuelta de la Figura 9. Los inmunógenos de péptido de la invención también pueden comprende ácidos nucleicos que codifican cualquiera de los anteriores. Todos los inmunógenos de la invención, péptido o ácido nucleico, pueden ser englobados en forma de dosis unitaria humana, o comprendidos por una composición que incluye un excipiente farmacéutico compatible con la fisiología humana. La estructura secundaria de las variantes de proteina PSCA 1, 3, 4 y 6, específicamente la presencia predicha y la localización de hélices alfa, hebras extendidas y espirales aleatorias es predicha de la secuencia de aminoácidos primaria usando el método HNN - Hierarchical 306 Neural Network method (NPS@: Network Protein Sequence Analysis TIBS Marzo de 2000 Volumen 25, No 3 [291] : 147-150 Combet C, Blanchet C, Geourjon C. y Deléage G., htt : // bil . ibcp . fr/cgí-bin/npsa_automat . l?page=npsa_nn. tml ) , accesado del servidor de biología molecular ExPasy (http://www.expasy.ch/tools/). El análisis indica que la variante de ?SCA 1 está compuesta de 30.89% de hélice alfa, 21.95% de hebra extendida y 47.15% de espiral aleatorio (Figura 13A) . La" variante de proteina de PSCA 3 está compuesta de 14.89% de hélice alfa, 8.51% de hebra extendida y 76, 60% de espiral aleatorio (Figura 13B) . La variante de proteina de PSCA 4 está compuesta de 9.52% de hélice alfa, 8.99% de hebra extendida y 81.48% de espiral aleatorio (Figura 13C) . La variante de proteina de PSCA 6 está compuesta de 24.56% de hélice alfa, 21.93% de hebra extendida y 53.51% de espiral aleatorio (Figura 13D) . El análisis para la presencia potencial de dominios de transmembrana en las proteínas variantes PSCA se llevó a cabo usando una variedad de algoritmos de predicción de transmembrana accesados del servidor de biología molecular ExPasy (http://www.expasy.ch/tools/). Mostrado gráficamente en la figura 13E, G, I y K están los resultados de análisis de las variantes 1, 3, 4 y 6, respectivamente, usando el programa TMpred. Mostrado gráficamente en la figura 13F, H, J, y L están los resultados de análisis de las variantes 1, 307 3, 4 y 6, respectivamente usando el programa TMHM . Las proteínas PSCA variante 1 y variante 6 son probables que codifiquen las proteínas GPI-enlazadas . Las variantes 3 y 4 son probables de codifique proteínas solubles puesto aquellos que no contienen predicciones significantes para los dominios de transmembrana . Los resultados de los programas de análisis estructural se resumen en la Tabla VI. Ejemplo 10: Generación de Anticuerpos Policlonales PSCA Los anticuerpos policlonales pueden ser cultivados en un mamífero, por ejemplo, mediante una o más inyecciones de un agente inmunizante y, si es deseado, un adyuvante. Típicamente, el agente inmunizante y/o adyuvante será inyectado en el mamífero mediante múltiples inyecciones subcutáneas o intraperitoneales . Además de la inmunización con una variante de proteína PSCA de longitud completa, algoritmos de computadora son empleados en el diseño de inmunógenos, que, basado en el análisis de secuencia de aminoácido contienen características de ser antigénicos y disponibles para el reconocimiento del sistema inmune del hospedero inmunizado (ver el Ejemplo intitulado "Perfiles de Antigenicidad y Estructura Secundaria") . Tales regiones serán predichas que son hidrofílicas, flexibles, en conformaciones beta-turn, y se exponen en la superficie de la proteína (ver, por ejemplo, Figura 5A-C, Figura 6A-C, Figura 7A-C, Figura 8A-C o Figura 9A-C para perfiles de aminoácidos que indican 308 tales regiones de la variante de proteina PSCA 1) . Por ejemplo, las proteínas o péptidos de fusión bacterianos, recombinantes que contienen regiones hidrofilicas, flexibles, beta-turn de variantes de proteina PSCA se usan como antigenos para generar anticuerpos policlonales en conejos blancos de Nueva Zelanda o anticuerpos monoclonales como es descrito en el Ejemplo 11. Por ejemplo, en la variante 1 de PSCA, tal región incluye, pero no está limitado a, aminoácidos 28-56 y aminoácidos 66-94. Para la variante 3, tales regiones incluyen, pero no están limitadas a, a aminoácidos 7-39 y aminoácidos 70-94. Para la variante 4 tales regiones incluyen, pero no están limitadas a, aminoácidos 6-18, aminoácidos 27-39, aminoácidos 103-133 y 177-189. Para la variante 6, tales regiones incluyen, pero no están limitadas a, aminoácidos 19-35 y aminoácidos 57-85. Es útil conjugar al agente inmunizante a una proteina conocida que es inmunogénica en el mamífero que es inmunizado. Ejemplos de tales proteínas inmunogénicas incluyen, pero no están limitadas a, hemocianina de lapa de punta (KLH) , albúmina de suero, tiroglobulina bovina, e inhibidor de tripsina de soya. En una modalidad, un péptido que codifica aminoácidos 103-133 de la variante 4 de PSCA es conjugado con KLH y usando para inmunizar un conejo. Alternativamente el agente inmunizante puede incluir todo o porciones de las proteínas variantes PSCA, análogos o proteínas de fusión de las mismas. Por ejemplo, las secuencias de aminoácidos de las variantes de PSCA pueden ser fusionadas usando técnicas de DNA recombinantes con cualquiera de una variedad de asociados de proteína de fusión que son bien conocidos en la técnica, tal como glutationa-S-transferasa (GST) y proteínas de fusión marcadas con His . En una modalidad, la secuencia de la variante 1 PSCA, aminoácidos 18-98 se fusionó a GST usando técnicas recombinantes en el vector de expresión pGEX, expresado, purificado y usado para inmunizar tanto conejos como ratones para generar anticuerpos políclonales y monoclonales respectivamente. Tales proteínas de fusión son purificadas de bacterias inducidas usando la matriz de afinidad apropiada. Otras proteínas de fusión bacterianas recombinantes que pueden ser empleadas incluyen la proteína de enlace de maltosa, LacZ, tioredoxina, NusA, o una región constante de inmunoglobulina (ver la sección intitulada "Producción de PSCA en Sistemas Procarióticos" y Current Protocols In Molecular Biology, Volumen 2, Unidad 16, Frederick M. Ausubul y colaboradores, eds . , 1995; Linsley, P. S., Brady, W., Urnes, M., Grosmaire, L. , Damle, N. y Ledbetter, L. (1991) J. Exp. Med. 174, 561-566) . Además de las proteínas de fusión derivadas de bacterias, los antígenos de proteina expresados en mamíferos también son utilizados. Estos antígenos son expresados de vectores de expresión de mamíferos tal como los vectores de fusión Tag5 y Fe (ver la sección intitulada "Producción de PSCA Recombinante en Sistemas Eucarióticos") , y retiene las modificaciones pos-traduccionales tal como las glicosilaciones encontradas en la proteína nativa. En una modalidad, el cDNA de la variante 1 de PSCA, menos el péptido guía N-terminal y el fijador GPI C-terminal se clonó en el vector de secreción mamífero Tag5, y se expresó en células 293T. La proteína recombinante se purificó mediante la cromatografía de quelato de metal a partir del sobrenadante de cultivo de tejido de células 293T que expresan establemente el vector recombinante. La proteína PSCA tag5 purificada luego se usó como inmunógeno. Durante el protocolo de inmunización, es útil mezclar o emulsicar el antígeno en adyuvantes que incrementan la respuesta inmune del animal hospedero. Ejemplos de adyuvantes incluyen, pero no están limitados a, el adyuvante de Freund completo (CFA) y adyuvante de MPL-TDM (Lípido A de monofosforilo, dicorinomicolato de trehalosa sintético) . En un protocolo típico, los conejos son inicialmente inmunizados subcutáneamente con hasta 200 µg, típicamente 100-200 µg, de proteína o péptido de fusión conjugado con LH y mezclado en adyuvante Freund incompleto (CFA) . Los conejos luego son inyectados subcutáneamente cada dos semanas con hasta 200 µg, típicamente 100-200 g, del 311 inmunogeno ' en adyuvante Freund incompleto (IFA) . Los sangrados de prueba se toman a aproximadamente 7-10 días después de cada inmunización y se usan para monitorear el titulo del antísuero por ELISA. Para probar la reactividad y especificidad del suero inmune, tal como el suero de conejo derivado de la inmunización con una fusión GS de proteína variante 3 o 4 de PSCA, el cDNA variante de PSCA los longitud completa respectivo es clonado en el vector de expresón myc-His pCDNA 3.1 (Invitrogen, ver el Ejemplo intitulado Producción de PSCA Recombinante en Sistemas Eucarióticos") . Después de la transfección de las construcciones en células 293T, lisados de células son sondeados con el suero anti-variante y con el anticuerpo anti-His (Santa Cruz Biotechnologies, Santa Cruz, CA) para determinar la reactividad específica a la proteína variante desnaturalizada usando la técnica de manchado de Western. Además, el suero inmune es probado mediante la microscopía de florescencia, citometría de flujo e inmunoprecipitacion contra 293T y otras células que expresan la variante de PSCA recombinante para determinar el reconocimiento específico de la proteína nativa. El manchado de Western, la inmunoprecipición, la microscopía fluorescente y las técnicas de citometría de flujo usando células que expresan endógenamente PSCA también se llevan a cabo para probar la reactividad y la especificidad. 312 El anti- Suero de los conejos inmunizados con las proteínas de fusión variantes de PSCA, tal como las proteínas de fusión GST MBP, son purificados mediante el agotamiento de anticuerpos reactivos a la secuencia asociada de fusión mediante el pasaje sobre una columna de afinidad que contiene el asociado de fusión ya sea solo o en el contexto de una proteína de fusión irrelevante. Por ejemplo, el antisuero derivado de la proteína de fusión de la variante 1 de GST-PSCA primero se purifica mediante el pasaje sobre una columna de proteína GST covalentemente acoplada a la matriz AffiGel (BioRad, Hercules, Calíf.) El antisuero luego es purificado por afinidad mediante el pasaje sobre una columna compuesta de una proteína de fusión MBP-PSCA covalentemente acoplada al matriz Affigel. El suero luego es además purificado mediante la cromatografía de afinidad de proteína G para aislar la fracción IgG. Los sueros de otros antígenos marcados con His y conejos inmunizados con péptido así como el asociado de fusión agotado del suero son purificados por afinidad mediante el pasaje sobre una matriz de columna compuesta del inmunógeno de proteína original o péptido libre. Ejemplo 11: Generación de Anticuerpos Monoclonales (mAbs) de PSCA En una modalidad, los mAbs terapéuticos a las variantes PSCA comprenden aquellos que reaccionan con epítopes específicos para cada proteína variante o específico a las secuencias en común entre las variantes que interrumpirían o modularían la función biológica de las variantes de PSCA, por ejemplo aquellas interrumpirían la interacción con los ligandos y los socios de enlace. Los inmunógenos para la generación de tales mAbs incluyen aquellos diseñados para codificar o contener la secuencia variante de proteína PSCA completa, regiones de las variantes de proteína de PSCA predichas que son antigénicas del análisis por computadora de la secuencia de aminoácidos (ver, por ejemplo, Figura 5A-C, Figura 6A-C, Figura 7A-C, Figura 8A-C o Figura 9A-C, y el Ejemplo intitulado "Perfiles de Antigenicidad") . Los inmunógenos incluyen péptidos, proteínas bacterianas recombinantes, y proteínas Tag 5 expresadas en mamíferos y proteínas y fusión IgG FC de humano y de murino. Además, las células diseñadas para expresar altos niveles y una variante PSCA respectiva, tal como la variante 4 de 293T PSCA o la variante 4 de 300.19 PSCA de células Pre-B de murino, son utilizadas para inmunizar ratones. Para generar mAbs a una variante PSCA, los ratones primero son inmunizados intraperitonealmente (IP) con, típicamente, 10-50 g de inmunogeno de proteína o 107 células que expresan PSCA mezcladas en adyuvante de Freund completo. Los ratones luego se inmunizaron subsecuentemente IP cada 2-4 semanas con, típicamente, 10-50 µg de inmunogeno de proteína 107 células mezcladas en adyuvante de Freund incompleto 314 Alternativamente, el adyuvante MPL-TDM se utiliza en las inmunizaciones. Además de la proteina anterior y las estrategias de inmunización basadas en células, un protocolo de inmunización basado en DNA es empleado en el cual un vector de expresión mamífero que codifica una secuencia de la variante de PSCA se usa para inmunizar los ratones mediante la inyección directa del DNA de plásmido. Por ejemplo, el cDNA completo de PSCA de la variante 4 es clonado en el vector de secreción mamífero Tag5 y. el vector recombinante luego será usado como el inmunógeno. En otro ejemplo, los mismos aminoácidos son clonados en un vector de secreción de fusión Fe en el cual la secuencia de la variante 4 de PSCA es fusionada en el amino terminal a una secuencia guía IgK y en el carboxilo-terminal de la secuencia de codificación de la región IgG Fe de humano o murino. Este vector recombinante luego es utilizado como inmunógeno. Los protocolos de inmunización de plásmido son utilizados en combinación con proteínas purificadas expresadas del mismo vector y con células que expresan la variante de PSCA respectiva. Durante el protocolo de inmunización, sangrados de prueba se toman 7-10 días de una inyección para monitorear el título y la especificidad de la respuesta inmune, üna vez que se obtiene la reactividad y especificidad apropiadas, es como determinado por ELISA, manchado de Western, inmunoprecipitación, microscopía de florescencia y análisis 315 citommétrico de flujo, la fusión y la generación de hibridoma luego se lleva a cabo con procedimientos establecidos bien conocido en la técnica (ver, por ejemplo, Harlow and Lañe, 1988) . En una modalidad para generar anticuerpos monoclonales PSCA, una GST-fusión del antigeno de la variante 4 que codifica los aminoácidos 1-189 es expresada y luego purificada de células 293T establemente transfectada. Ratones Balb C son inicialmente inmunizados intraperitonealmente con 25 de la proteina variante 4 de GST-PSCA mezclada en adyuvante de Freund completo. Los ratones son subsecuentemente inmunizados cada dos semanas con 25 µg del antigeno mezclado en adyuvante de Freund incompleto para un total de tres inmunizaciones. ELISA usando el antigeno de fusión GST y un producto de segmentación del cual la porción GST es removida determina el titulo del suero de los ratones inmunizados. La reactividad y la especificidad del suero a la proteina de variante 4 de PSCA de longitud completa es monitoreada mediante el manchado de Western, inmunoprecipitación y citometria de flujo usando células 293T transfectadas con un vector de expresión que codifica el cDNA de la variante 1 de PSCA (ver por ejemplo, el Ejemplo intitulado "Producción de PSCA Recombina te en Sistemas Eucarióticos") . Otras células que expresan la variante 4 de PSCA recobinante o células que expresando endógenamente la variante 4 de PSCA también son utilizadas. Los ratones que muestran la reactividad más fuerte son puestos en reposos y se les da una inyección final de antigeno Tag5 en PBS y luego se sacrifican cuatro dias después. Los bazos de los ratones sacrificados son recolectados y fusionados las células de mieloma SPO/2 usando procedimientos estándares (Harlow and Lañe, 1988) . Los sobrenadantes de las cavidades de crecimiento seleccionadas de HAT son clasificadas por ELISA, manchado de Western, inmunoprecipitación, microscopía fluorescente y citometría de flujo para identificar los clones que producen anticuerpo específico de PSCA. Para generar anticuerpos monoclonales que son específicos para la proteína de variante 4 de PSCA, los inmunógenos son diseñados para codificar la secuencia única a esa variante. Por ejemplo, un péptido que codifica los aminoácidos 6-18 de la variante 4 de PSCA 4 es sintetizado, conjugado con KLH y usado como inmunógeno. Los sobrenadantes de hibridoma luego son clasificados en el antígeno de péptido y luego además clasificados en células que expresan la proteína de variante 4 de PSCA y clasificados cruzadamente sobre células que expresan las otras variantes de PSCA para derivar anticuerpos monoclonales específicos de la variante 4. La afinidad de enlace de anticuerpo monoclonal de la variante de PSCA es determinada usando tecnologías 317 estándares. Las medidas de afinidad cuantifican la concentración de anticuerpo al enlace de epitope y se usan para ayudar a definir que anticuerpos monoclonales de la variante de PSCA preferidos para el uso de diagnóstico o terapéutico, como es apreciado por un experto en la técnica. El sistema BIAcore (Uppsala, Suecia) es un método preferido para determinar la afinidad de enlace. El sistema BIAcore usa la resonancia de plasmón de superficie (SPR, Welford K. 1991, Optan. Quant. Elect. 23:1; Morton y Myszka, 1998, Methods in Enzymology 295:268) para monitorear las interacciones biomoleculares en tiempo real. El análisis BiAcore convenientemente genera constantes de proporción de .asociación, constantes de proporción de disociación, constantes de disociación de equilibrio y constantes de afinidad. Ejemplo 12: Ensayos de Enlace de HLA Clase I y Clase II Los ensayos de enlace de HLA clase I y clase II usando moléculas de HLA purificadas son realizados de acuerdo con los protocolos divulgados (por ejemplo, publicaciones de PCT WO 94/20127 y WO 94/03205; Sidney y colaboradores, Current Protocols in immunology 18.3.1 (1998); Sydney y colaboradores, J. Immunol. 154:247 (1995); Sette y colaboradorss, Mol Immunol. 31:813 (1994)). Brevemente, moléculas MHC purificadas (5 a 500 nM) son incubadas con varios inhibidores de péptido no maracados y 1-10 nM péptidos de sonda 125I-radiomarcados como es descrito. Después déla incubación, los complejos de MHC-péptido son separados del péptido libre mediante filtración en gel y la fracción del péptido enlazado es determinada. Típicamente, en experimentos preliminares, cada preparación de MHC es titulada en la presencia fijas de péptido radiomarcados para determinar la concentración de moléculas de HLA necesarias para enlazar 10-20% de la radioactividad total. Toda la inhibición subsecuente y los ensayos de enlace directo son realizados usando estas concentraciones de HLA. Puesto que bajo estas condiciones [etiqueta] < [HLA] y IC50>[HLA], los valores de IC50 medidos son aproximaciones razonables de los valores KD reales. Los inhibidores de péptido son típicamente probados en concentraciones que varían de 120 µ?/p?? a 1.2 ng/ml, y son probados en dos a cuatro experimentos completamente independientes. Para permitir la comparación de los datos obtenidos en diferentes experimentos, una cifra de enlace relativa se calcula para cada péptido al dividir la IC50 de un control positivo para la inhibición entre el IC50 para cada péptido probado (típicamente versiones no marcadas del péptido de sonda radiomarcados) . Para propósitos de bases de datos, y comparaciones de inter-experimentos , son compilados valores de enlace relativos. Estos valores subsecuentemente pueden ser convertidos nuevamente en valores IC50 nM al dividir el 319 IC50 nM de los controles positivos para la inhibición entre enlace relativo del péptido de interés. Este método de datos de compilación es preciso y consistente para comparar péptidos que se han probado en diferentes dias, o con diferentes lotes de MHC purificado. Los ensayos de enlace como son resumidos en lo anterior pueden ser usados para analizar los péptidos que llevan superporción HLA y/o porción HLA (ver la Tabla IV) . Ejemplo 13: Identificación de Epitopes Candidatos de CTL que Llevan la Superporción HLA y la porción HLA Composiciones de vacuna de HLA de la invención pueden incluir múltiples epitopes. Los múltiples epitopes puede comprender múltiples superporciones de porciones de HLA para lograr la cobertura de población amplia. Este ejemplo ilustra la identificación y confirmación de los epitopes que llevan superporción y porción para la inclusión en tal composición de vacuna. El cálculo de la cobertura de población se realiza usando la estrategia descrita enseguida. Búsquedas y algoritmos de computadora para la identificación de epitopes que llevan superporción y/o porción Las búsquedas realizadas para identificar las secuencias de péptidos que llevan porción en el Ejemplo-intitulado "Perfiles de Antigenicidad" y las Tablas VIII-XXI y XXII-XLIX emplea los datos de la secuencia de proteina del 320 producto de gen del PSCA expuesto en las Figuras 2 y 3, los péptidos de búsqueda específicos usados para generar las tablas son listados en la Tabla VII. Las búsquedas por computadora por epitopes que llevan la superporciones o porciones HLA de Clase I o . Clase II son realizados como sigue. Todas secuencias de proteina PSCA traducidas son analizadas usando un programa de software de búsqueda de cadena de texto para identificar las secuencias de péptido potenciales apropiadas de las porciones de enlace de HLA; tales programas son fácilmente producidos de acuerdo con la información en la técnica en vista de las descripciones conocidas de porción/superporción. Además, tales cálculos se pueden hacer mentalmente. Las secuencias de superporción ?2-, A3- y DR-identificadas son registradas usando algoritmos polinomiales para predecir su capacidad para enlazar a las moléculas HLA Clase I o Clase II especificas. Estos algoritmos polinomiales tiene en cuenta el impacto de diferentes aminoácidos en diferentes posiciones, y están esencialmente basados enla premisa de que la afinidad global (o AG) de las interacciones de péptido-molécula de HLA pueden ser aproximadas como una función polinomial lineal del tipo: "AG" = aii,- X a2i x a3i x ani donde aj¿ es un coeficiente que representa el efecto de la presencia de un aminoácido dado (j) en una posición 321 dada (í) a lo largo de la secuencia de un péptido de N aminoácidos. La asunción crucial de este método es que los efectos de cada posición son esencialmente independientes entre si (es decir, enlace independiente de cadenas ilaterales e individuales) . Cuando el residuo j ocurre en la posición i en el péptido, se asume que contribuye una cantidad constante jí a la energía libre de enlace del péptido y respectivo de la secuencia del resto del péptido. El método de derivación de coeficientes de algoritmos específicos se ha descrito en Gulukota y colaboradores, J. Mol. Biol. 267:1258-126, 1997; (ver también Sidney y colaboradores, Human Immunol. 45:79-93, 1996; y Southwood y colaboradores, J. Immunol. 160:3363-3373, 1998). Brevemente, para todas las posiciones i, el fijador y no fijador distinto, el promedio geométrico del enlace relativo (ARB) de todos péptidos que llevan j es calculado con relación al resto del grupo, y usado como el estimado de ji. Para los péptidos de Clase II, si son posibles múltiples alineaciones, solamente se utiliza la alineación de registro más alta, después de un procedimiento iterativo. Para calcular una registro de algoritmo para un péptido dado en un conjunto de prueba, los valores ARB correspondientes a la secuencia del péptido son multiplicados . Si este producto excede un umbral seleccionado, el péptido se predice que enlaza. Los umbrales apropiados son seleccionados con una 322 función del grado de severidad de la predicción deseada. Selección de péptidos reactivos cruzadamente del supertipo HLA-A2 Las secuencias de proteina de PSCA son exploradas utilizando el software de identificación de porción, para identificar secuencias de 8, 9-10- y 11-mer que contiene la especificidad del fijador principal de la superporción HLA-A2. Típicamente, estas secuencias luego son registradas usando el protocolo descrito en lo anterior y los péptidos correspondientes a las secuencias dé registro positivo son sintetizados y probados por su capacidad para enlazar las moléculas HLA-A*0201 purificadas in vitro (HLA-A*0201 se considera una molécula de supertipo A2 prototipo) . Estos péptidos luego se prueban para la capacidad para enlazar a moléculas supertipo A2 adicionales (A*0202, A*0203, A*0206, y A*6802) . Los péptidos que enlazan a por lo menos tres de los cinco alelos de supertipo A2 probados son típicamente considerados enlazadores reactivos cruzadamente del supertipo A2. Los péptidos preferidos se enlazan a una afinidad igual o menor que 500 nM a tres o más moléculas de supertipo HLA-A2. Selección de epítopes que llevan la superporción HLA-A3 La (s) secuencia (s) de proteína PSCA explorada anteriormente también se examina para la presencia de péptidos con los fijadores primarios -de la superporción HLA-A3. Los péptidos correspondientes a las secuencias que llevan la superporción HLA A3 luego son sintetizados y probados por el enlace a las moléculas HLA-A*0301 y HLA-A*1101, las moléculas codificadas por los alelos de supertipo A3 más prevalentes. Los péptidos que enlazan por lo menos uno de los dos alelos con afinidades de enlace de <500 nM, frecuentemente <200 nM, luego se prueban para el enlace de reactividad cruzada a los otros alelos de supertipo A3 comunes (por ejemplo, A*3101, A*3301 y A*6801) para identificar aquellos que enlazan a por lo menos tres de las cinco moléculas de supertipo HLA-A3 probadas. Selección de epitopes que llevan la superporción HLA-B7 La(s) proteína (s) de PSCA escaneada anteriormente también es analizada para la presencia de péptidos de 8, 9- 10- u 11-mer con la superporción HLA-B7. Los péptidos correspondientes son sintetizados y probados para el enlace a HLA-B*0702, la molécula codificada por el mismo alelo del supertipo B7 común (es decir, el alelo del supertipo B7 prototipo) . Los péptidos que enlazan B*0702 con IC50 de <500 nM son identificados usando métodos estándares. Estos péptidos luego son probados para el enlace a otra moléculas del supertipo B7 común (por ejemplo, B*3501, B*5101, B*5301 y B*5401) . Los péptidos capaces de enlazar a tres o más 324 de los cinco alelos del supertipo B7 probados son identificados de esta manera. Selección de epitopes que llevan la porción Al y A2 Para incrementar adicionalmente la cobertura de la población, los epitopes HLA-Al y A24 también pueden ser incorporados en composiciones de vacuna. Un análisis de la proteina PSCA también puede ser realizada para identificar secuencias que contienen la porción HLA-Al y A24. Los epitopes de enlace de alta afinidad /o reactivos cruzadamente que llevan otra porción y/o superporciones son identificados usando la metodología análoga . Ejemplo 14: Confirmación de Inmunogenicidad Los péptidos que llevan la superporción CTL A2-candidatos reactivos cruzadamente, que son identificados como es descrito en la presente son seleccionados para confirmar la inmunogenicidad in v tro. La confirmación se realiza usando la siguiente metodología: Líneas de Células Objetivo para la Clasificación Celular: La línea de células .221A2.1, producida al transferir el gen HLA-A2.1 en la línea de células 721.221 B-linfoblastoide humana mutante nula de HLA-A, -B, -C, es utilizada como el objetivo de carga de péptido para medir la 325 actividad de CTL restringir HLA-A2.1. Esta linea de células es cultivada en el medio RPMI-1640 complementado con antibióticos, piruvato de sodio, aminoácidos no esenciales y FCS inactivado con calor al 10% (v/v) . Las células que expresan un antigeno de interés, o transfectantes que comprenden el gen que codifican el antigeno de interés, pueden ser usadas como células e objetivo para confirmar la habilidad de los CTLs específicos de péptido para reconocer el antígeno endógeno. Cultivo de Inducción de CTL Primarios ; Generación de Células de Dendríticas (DC) : PBMCs son congeladas en RPMI con 30 µg/nl de DNAsa, lavadas dos veces y resuspendidas en el medio completo (RPMI-1640 más 5% de suero humano Ab, aminoácidos no esenciales, piruvato de sodio, L-glutamina y penicilina/estreptomicina) . Los monocitos son purificados al colocar 10 x 106 PBMC/cavidad en una placa de 6 cavidades. Después que 2 horas a 37 °C, las células no adherentes son removidas durante la agitación moderada de las placas y al aspirar los sobrenadantes. Las cavidades fueron lavadas un total de tres veces con 3 mi de PRMI para remover la mayoría de la s células no -adherentes y sueltamente adherentes. Tres mi del medio completo que contiene 50 ng/ml de GM-CSF y 1, 000 µ/ml de IL-4 luego son adicionados a cada cavidad. TNFoc es adicionado a las DCs en el día 6 en 75 ng/ml y las células son usadas para los 326 cultivos de inducción de CTL en el dia 7. Inducción de CTL con DC y Péptido: Las células T CD8 + son aisladas mediante la selección positiva con las cuentas inmunomagnéticas Dynal (Dynabeads® M-450) y el reactivo detacha-bead ) . De manera típicamente aproximadamente 200-250xl06 PB C son procesadas para obtener 24xl06 células T CD8 + (bastante para un cultivo en placa de 48 cavidades) . Brevemente, las PBMCs son congeladas en RPMI con 30 µg/DNAsa, lavados una vez con PBS que contiene suero AB humano al 1% y resuspendidas en PBS/suero AB al 1% a una concentración de 20xl06 células/ml. 'Las cuentas magnéticas son lavadas 3 veces con PBS/suero AB, adicionadas alas células (140 µ? de cuentas/20xlOs células) e incubadas durante 1 hora a 4°C con mezclado continuo. Las cuentas y las células son lavadas 4x con PBS/suero AB para remover las células no adherentes y resuspendidas en lOOxlO6 células/ml (basado en el número de célula original) en PBS/suero AB que contiene 100 µ?/ml de reactivo de detacha-bead y 30 µ?/ml de DNAsa. La mezcla es incubada durante 1 hora a temperatura ambiente con mezclado continuo. Las cuentas son lavadas nuevamente PBS/AB/DNAsa para recolectar las células T CD8 +. Las DC son recolectadas y centrifugadas a 1300 Rpm durante 5-7 minutos, lavadas una vez con PBS con BSA al 1%, contadas y pulsadas con 40 µg/ml de péptido a una concentración de células de l-2xl06/ml en la presencia de 3 µg ml de ß2- 327 microglobulina durante 4 horas a 20 °C. Las DC luego son irradiadas (4.200 rads) , lavadas 1 vez con el medio y contadas nuevamente. Establecimiento de cultivos de inducción: 0.25 mi de DC generadas con citoquinas en lxlO5 células/mi) son co-cultivadas con 0.25 mi de células T CD8 + (en 2xl06 células/mi) en cada cavidad de una placa de 48 cavidades en la presencia de 10 ng/ml de de IL-7. IL-7 humano recombinante es adicionada al siguiente dia a una concentración final de 10 ng/ml e IL-2 humano es adicionado 48 horas después en 10 µ Reestimulación de los cultivos de inducción con células adherentes pulsadas con péptido: Siete y catorce días después de la inducción primaria, las células son reestimuladas con células adherentes pulsadas con péptido. Las PBMCs son descongeladas y lavadas dos veces con RPMI y DNAsa. Las células son resuspendidas en 5xl06 células/ml e irradiadas en ~4200 rads. Las PBMCs son colocadas en 2xl06 en 0.5 mi de medio completo por cavidad e incubadas durante 2 horas a 37 °C. Los placas son lavadas dos veces con RPMI mediante el removimiento de la placa suavemente para remover las células no adherentes y las células adherentes pulsadas con 10 µg/ml de péptido en la presencia de 3 µg/ml de ß2 microglobulina en 0.25 mi de RPMI/AB al 5% por cavidad durante 2 horas a 37 °C. La solución de péptido de cada cavidad es aspirada y las cavidades son lavadas una vez con RPMI . La mayoría del medio es aspirado de los cultivos d inducción (células CD8 +) y llevado a 0.5 mi con medio fresco. Las células luego son transferidas a la cavidades que contienen las células adherentes pulsadas con péptido. Veinte cuatro horas después IL-10 humano recombinante en adicionado a una concentración final de 10 ng/ml e IL2 humana recombinante es adicionado al siguiente día y nuevamente 2-3 días después en 50 iü/ml (Tsai y colaboradores, Critical Revie s in Immunology 18 (1-2 ) : 65-75, 1998) . Siete días después, los cultivos son analizados para la actividad de CTL en un ensayo de liberación 51Cr. En algunos experimentos, los cultivos son analizados para el reconocimiento específico de péptido en la ELISA de IFNy in situ en el tiempo de la segunda restimulación seguido por el ensayo del reconocimiento endógeno 7 días después . Después de la expansión, la actividad es medida en ambos ensayos para una comparación de lado por lado. Medida de actividad lítica de CTL mediante la liberación de 51Cr. Siete días después de la segunda restimulación, la citotoxicidad es determinada en un ensayo de liberación de 51Cr estándar (5 hr) al analizar las cavidades individuales en un E: T individual. Los objetivos pulsados con péptidos son preparados al incubar las células con 10 µg/ml de péptido 329 durante la noche a 37 °C. Las células objetivo adherentes son removidas de los matraces de cultivo con tripsina-EDTA. Las células objetivo son marcadas con 20 µ?? de cromato de sodio 51Cr (Dupont, Wilmington, DE) durante 1 hora a 37 °C. Las células objetivo marcadas son resuspendidas en 106 por mi y diluidas 1:10 con las células K562 a una concentración de 3.3xl06/ml (una linea de células eritroblastoma sensible a NK usada para reducir lisis no especifico) . Las células objetivo (100 µ?) y los efectores (100 µ?) se colocan en placas de fondo redondo de 96 cavidades y se incuban durante 5 horas a 37 °C. En ese tiempo, 100 µ? de sobrenadante son recolectados de cada cavidad y el por ciento de lisis es determinado de acuerdo con la fórmula: [ (cpm de la muestra de prueba cpm de la muestra liberación de 51Cr espontánea) / (cpm de la muestra de liberación de 51Cr máxima - cpm de la muestra de liberación de 51Cr espontánea)] x 100. La liberación máxima y espontánea son determinadas al incubar los objetivos marcados con Tritón X-100 al 1% y el medio solamente, de manera respectiva Un cultivo positivo es definido como uno en el cuál la lisis especifica (muestra-antecedente) es de 10% o más alta en el caso de cavidades individuales y es 15% o más en la dos relaciones E:T más alta cuando son analizados los cultivos expandidos. 330 Medición in situ de la Producción IFNy Humana como un Indicador del Reconocimiento Especifico de Péptido y Endógeno 2 placas Immulon son recubiertas con anticuerpo monoclonal IFNy anti-humano de ratón (4 µq/ l de NaHC03 0.1 M, pH 8.2) durante la noche a 4°C. Las placas son lavadas con PBS libre de Ca2+, Mg2+/T een 20 0.05% y bloqueadas con PBS/FCS al 10% durante dos horas, después de lo cual la CTLs (100 µ?/cavidad) y los objetivos (100 µ?/cavidad) son adicionados a cada cavidad, dejado cavidades vacias para los estándares y blancos (que recibieron medios solamente) . Las células objetivo, ya sea objetivos pulsados con péptido o endógenos, son utilizadas en una concentración de lxlO6 células/ml. Las placas son incubadas durante 48 horas a 37 °C con C02 al 5%. El IFN-gama humano recombinante se adiciona a las cavidades estándares iniciando 400 pg o 1200 pg/100 microlitros/cavidad y la placa incubada durante dos horas a 37 °C. Las placas son lavadas y 100 µ? de anticuerpo monoclonal de IFN-gama anti-humano de ratón biotinilado (2 microg amos/ml en PBS/FCS al 3%/Tween 20 al 0.05%) son adicionados e incubados durante 2 horas a temperatura ambiente. Después del lavado nuevamente, 100 microlitros de HRP-estreptavidina (1:4000) son adicionados y las placas se incubaron durante una hora a temperatura ambiente. Las placas 331 luego son lavadas 6x con solución reguladora de lavado, 100 microlitros/cavidad de solución de revelado (TMB 1:1) son adicionados, y las placas dejadas de revelar durante 5-15 minutos. La reacción es detenida con 50 microlitros/cavidad H3PO4 1 M y leídas en OD450. ün cultivo es considerado positivo si es medido por lo menos 50 pg de IFN-gama/cavidad arriba del antecedente y es dos veces el nivel de expresión antecedente . Expansión de CTL. Aquellos cultivos que demuestran actividad lítica específica contra objetivos pulsados con péptido y/o objetivos de tumor son expandidos durante un período de dos semanas con anti-CD3. Brevemente, 5xl04 células CD8 + son adicionadas a un matraz T25 que contiene lo siguiente: IxlO6 PBMC irradiada (4,200 rad) (autologas o alogeneicas) por mi, 2xl05 células transformadas con EBV irradiadas (8,000 rad) por mi, y OKT3 (anti-CD3) en 30 ng por mi en RPMI-1640 que contiene 10% de suero ?? humano (v/v) , aminoácidos no esenciales, piruvato de sodio, 2-mercaptoetanol 25 µ?, L-glutamina y penicilina/estreptomicina. IL2 humano recombinante es adicionado 24 horas después a una concentración final de 200 IU/ml y cada tres días después con medio fresco en 50 IU/ml. Las células son divididas y la concentración de células excede lxl06/ml y los cultivos son analizados entre los días 13 y 15 en relaciones de: T de 30, 332 10, 3 y 1:1 en el ensayo de la liberación de 51Cr o en IxIOVml en el ensayo IFNy in situ usando los mismos objetivos como antes de la expansión. Los cultivo son expandidos en la ausencia de anti-CD3 + como sigue. Aquellos cultivos que demuestran actividad litica especifica contra los objetivos de peptido y endógenos son seleccionados y 5xl04 células CD8 + son adicionadas a un matraz T25 que contiene lo siguiente: 1x10s PBMC autologo por m que se ha pulsado con péptido con 10 g ml· de péptidos durante dos horas a 37°C e irradiada (4,200 rad) ; 2xl05 células transformadas con EBV irradiadas (8,000 rad) por mi de RPMI-1640 que contiene suero AB humano al 10% (v/v) ?? no esencial, piruvato de sodio, 2- E · 25 mM, L-glutamina y gentamicina . Inmunogenicidad de péptidos que llevan la superporción ?2 Los péptidos de enlace reactivos cruzadamente de superporción A2 son probados en un ensayo celular para la habilidad para inducir CTL especifico de péptido den individuos normales. En este análisis, un péptido típicamente considerado que es epitope si este induce CTLs específicos de péptido en por lo menos individuos, y preferiblemente, también reconoce el péptido endógenamente expresado. La inmunogenicidad también puede ser confirmada usando PBMCs aisladas de pacientes que llevan un tumor que 333 expresa PSCA. Brevemente, las PBMCs son aisladas de pacientes, re-estimuladas con monocitos pulsados con péptido y analizadas para la habilidad para reconocer células objetivo pulsadas con péptido así como células transfectadas endógenamente que expresan el antígeno. Evaluación de la Inmunoqenicidad A*03/A11 Los péptidos de enlace reactivos cruzadamente que llevan la superporcion HLA-A3 también son evaluados para la inmunogenicidad usando la metodología análoga para aquella utiliza para evaluar la inmunogenicidad de los péptidos de superporcion HLA-A2. La evaluación de la inmunogenicidad B7 Evaluación de inmunogenicidad de B7 La clasificación por inmunogenicidad de los péptidos de enlace reactivos cruzadamente del supertipo B7 identificados como se exponen en la presente son confirmados de una manera análoga a la confirmación de los péptidos que llevan la superporcion A2 y A3. Los péptidos que llevan otras superporciones /porciones, por ejemplo, HLA-A1, HLA-A24 etc, también son confirmados usando la metodología similar. Ejemplo 15: Implementación de la Superporcion Extendida para Mejorar la Capacidad de Enlace de Epítopes Nativos al Crear Análogos Las porciones y superporciones de HLA (que comprenden residuos primarios y/o secundarios) son útil en la 334 identificación y preparación de péptidos nativos altamente reactivos cruzadamente, como es demostrado en la presente. Además, la definición de porciones y superporciones de HLA también permite diseñar epitopes altamente reactivos cruzadamente al identificar residuos dentro de una secuencia de péptido nativo que puede ser análoga para conferir en el péptido ciertas características, por ejemplo más grande reactividad cruzada dentro del grupo de moléculas HLA que comprenden un supertipo y/o más grande afinidad de enlace para algunas o todas esas moléculas de HLA. Ejemplos de analogía de péptidos que exhiben afinidad de enlace modulada se exponen en este ejemplo. Analogía en los Residuos Fijadores Primarios Las estrategias de ingeniería de péptidos son implementadas para incrementar adicionalmente la reactividad cruzada de los epitopes. Por ejemplo, los fijadores principales de los péptidos que llevan la superporción A2 son alterados, por ejemplo, para introducir un L, I, V o M preferido en la posición 2 e I o V en el C-terminal. Para analizar la reactividad cruzada de los péptidos análogos, cada análogo diseñado es inicialmente probado para el enlace al alelo A*0201 del supertipo A2 del prototipo, luego, si es mantenida la capacidad de enlace de A*0201, para la reactividad cruzada del supertipo A2. Alternativamente, un péptido es confirmado como enlace de uno o todos los miembros de supertipo y luego puesto en analogía para modular la afinidad de enlace a cualquiera (o más) de los miembros de supertipo para adicionar cobertura de población. La selección de análogos para inmunogenicidad en un análisis de clasificación celular es típicamente además restringida por la capacidad del péptido del tipo silvestre de origen (WT) por lo menos débilmente, es decir, enlazar a una IC50 de 5000 nM o menor, a tres o alelos del supertipo- A2. La exposición razonada para este requerimiento es que los péptidos WT deben estar presentes endógenamente en cantidad suficiente para ser biológicamente relevantes. Los péptidos análogos se han mostrado que tienen inmunogenicidad incrementada y reactividad cruzada por las células T específicas para el epítope de origen (ver, por ejemplo, Parkhurst y colaboradores, J. Immunol 157:2539, 1996; y Pogue y colaboradores, Proc. Nati. Acad. Sci. EUA 92:8166, 1995) . En la clasificación celular de estos análogos de péptido, es importante confirmar que los CTLs específicos de análogo también son capaces de reconocer el péptido de tipo silvestre y, cuando posible, células objetivo que expresan endógenamente el epítope. Analogía de péptidos que llevan la superporción HLA-A3 y B7 Los análogos de los epítopes que llevan la superporción HLA-A3 son generados usando estrategias similares a aquellas empleadas en la analogía de péptidos que llevan la superporción HLA-A2. Por ejemplo, los péptidos que enlazan a 3/5 de las moléculas del supertipo A3 son diseñados en residuos fijadores primarios para poseer un residuo preferido (V, S, M o ?) en la posición 2. Los péptidos análogos luego son probados para la habilidad para enlazar A*03 y A*ll (alelos del supertipo A3 de prototipo) . Esos péptidos que demuestran < 500 nM de capacidad de enlace luego son confirmados por tener reactividad cruzada del supertipo A3. De manera similar a los péptidos que llevan la porción A2 y A3, los péptidos que enlazan 3 o más alelos del supertipo B7 pueden ser mejorados, donde es posible, para lograr el enlace reactivo cruzadamente incrementado o afinidad de enlace más grande o vida media del enlace. Los péptidos que llevan la superporción .B7 son, diseñados, por ejemplo, para poseer un residuo preferido (V, I, L o F) en la posición fijadora primaria C-terminal, como demostrado por Sidney y colaboradores, (J. Immunol. 157:3480-3490, 1996) . Analogía en los residuos fijadores primarios de otros epítopes que llevan porción y/o superporción es realizada de una manera similar. Los péptidos análogos luego son confirmados para inmunogenicidad, típicamente en un ensayo de clasificación celular. Nuevamente, es generalmente importante demostrar que la CTLs especificas de análogo también son capaces de reconocer el péptido de tipo silvestre y, cuando es posible, los objetivos que expresan endógenamente el epitope. Analogía en los Residuos Fijadores Secundarios Además, las superporciones HLA son de valor en la ingeniería de péptidos altamente reactivos cruzadamente y/o péptidos que enlazan moléculas HLA con afinidad incrementada al identificar residuos particulares en posiciones fijadoras secundarias que son asociadas con tales propiedades. Por ejemplo, la capacidad enlace del péptido que lleva la superporción B7 con un residuo F " en la posición 1 es analizada. El péptido luego es puesto en analogía a, por ejemplo, sustituto L para F en la posición 1. El péptido análogo es de evaluado para la afinidad de enlace incrementada, la vida media de enlace y/o la reactividad cruzada incrementada. Tal procedimiento identifica péptidos análogos con propiedades incrementadas. Los análogos diseñados con suficientemente capacidad de enlace mejorada o reactividad cruzada también pueden ser probados para la inmunogenicidad en ratones transgénicos HLA-B7, siguiendo, por ejemplo, la inmunización de IFA o la inmunización de lipopéptido. Los péptidos análogos son adicionalmente probados para la habilidad para estimular una respuesta de rellamamiento usando PBMC de los 338 pacientes con los tumores que expresan PSCA. Otras estrategias de analogía Otra forma de analogía del péptido, no relacionada con las posiciones del fijador, implica la sustitución de un cisterna con ácido a-aminobutírico . Debido a su naturaleza química, la cisteína tiene la propensión para formar puentes de disulfuro y alterar suficientemente el péptido estructuralmente para reducir la capacidad de enlace. La sustitución del ácido a-butírico por cisteína no solamente alivia este problema, sino se ha mostrado que mejora las capacidades de enlace y enlace cruzado en algunos casos (ver, por ejemplo, la revisión por S Sette y colaboradores, In: Persistent Viral Infections, Eds . R. Ahmed and 1. Chen, John Wiley & Sons, Inglaterra, 1999) . Así, mediante el uso sustituciones de aminoácidos, individuales, las propiedades de enlace y/o reactividad cruzada de los ligandos de péptido para las moléculas del supertipo HLA e pueden ser moduladas. Ejemplo 16: Identificación y confirmación de las secuencias derivadas de PSCA con porciones de enlace de HLA-DR Los epítopes de péptido que llevan una superporción o porción de HLA clase II son identificados y confirmados com es resumido enseguida usando la metodología similar a aquella descrita para los péptidos HLA de Clase I. Selección de epítopes que llevan la superporción 339 HLA DR. Para identificar epitopes HT1 de HLA de clase II, derivados de PSCA, un antigeno de PSCA es analizado para Iza presencia de secuencias que llevan una porción o superporción HLA-DR. Específicamente", secuencias de 15 mer son seleccionada que comprenden una superporción DR, que comprende un núcleo de 9 mer y regiones flanqueantes N- y extermínales de tres residuos (15 aminoácidos total) . Los protocolos para predecir el enlace de péptido a las moléculas DR han sido desarrollados (Southwood y colaboradores, J. I munol. 160:3363-3373, 1998). Estos protocolos, específicos para moléculas DR individuales, permiten el registro y la clasificación, de regiones de núcleo de 9 mer. Cada protocolo no solamente registra las secuencias de péptido para la presencia de los fijadores primarios de la superporción Dr (es decir, en la posición 1 y la posición 6) dentro de un núcleo de 9 mer, sino adicionalmente evaluar las secuencias para la presencia de fijadores secundarios. Usando las tablas de selección específicas de alelos (ver, por ejemplo, Southwood y colaboradores, ibid. ) , se ha encontrado que estos protocolos eficientemente seleccionan secuencias de péptido con una alta probabilidad de enlace de una molécula DR particular. Adicionalmente, se ha encontrado que al realizar estos protocolos entandem, específicamente aquellos para DR1, DR4w4 340 y DR7, eficientemente se pueden seleccionar péptidos reactivos cruzadamente con DR. Los péptidos derivados de PSCA identificados en lo anterior son probados para su capacidad de enlace para varias moléculas HLA-DR comunes. Todos los péptidos son inicialmente probados para el enlace a las moléculas DR en el panel primario: DR , DR4w4 y DR7. Los péptidos que enlazan a por lo menos dos de estas moléculas DR luego son probadas por el enlace a las moléculas DR2w2 ß?, DR2w2 ß2, DR6wl9 y DR9 en ensayos secundarios. Finalmente, los péptidos que enlazan a por lo menos dos de las cuatro moléculas DR del panel secundario, y asi cumulativamente por lo menos cuatro de siete moléculas DR diferentes, son clasificados para el enlace a las moléculas DR4 l5, DR5wll y DR8w2 en ensayos terciarios. Los péptidos que enlazan a por lo menos siete de las diez moléculas DR que comprenden los ensayos de clasificación primario, secundario y terciario son considerados enlazadores DR reactivos cruzadamente. Los péptidos derivados de PSCA encontradas que enlazan los alelos HLA-DR comunes son de particular interés. Selección de péptidos de porción DR3 Debido a que HLA-DR3 es un alelo que es prevalente en poblaciones Caucásicas, Negras e hispánicas, la capacidad de enlace DR3 es un criterio relevante en la selección de epitopes HTL . Asir los péptidos mostrados que son candidatos 341 también pueden ser analizados para su capacidad de enlace DR3. Sin embargo, en vista de la especificidad de enlace de la porción DR3, los péptidos que enlazan solamente a DR3 también pueden ser considerados como candidatos para la inclusión en una formulación de vacuna. Para identificar eficientemente péptidos que enlazan DR3, los antigenos PSCA objetivo son analizados para secuencias que llevan una de las dos porciones de enlace especificas DR3 reportadas por Geluk y colaboradores, (<J. Immunol. 152:5742-5748, 1994). Los péptidos correspondientes luego son sintetizados y confirmados por tener la habilidad para enlazar DR3 con una afinidad de 1 µ? o mejor, es decir, menos de 1 µ?. Los péptidos son encontrados que satisfacen este criterio de enlace y califican como enlazadores de alta afinidad de HLA de clase II. Los epxtopes de enlace de DR3 identificados de esta manera son incluidos en composiciones de vacuna con epitopes de péptido que llevan la superporcion DR. De manera similar al caso de los péptidos que llevan la porción HLA de clase I, los péptidos que llevan la porción de clase II son análogos para mejora la afinidad o reactividad cruzada. Por ejemplo, el ácido aspártico en la posición 4 de la secuencia de núcleo de 9 mer es un residuo óptimo para el enlace de DR3, y sustitución por ese residuo frecuentemente mejore el enlace de DR3. 342 Ejemplo 17: Inmunogenicidad de los epítopes HTL derivados de PSCA Este ejemplo determina los epitopes que llevan la superporción DR y la porción DR3 inmunogénicos entre aquellos identificados usando la metodología expuesta en la presente. La inmunogenicidad de epítopes HTL es confirmado de una manera análoga a la determinación de la inmunogenicidad de los epítopes CTL, al estimar la habilidad para estimular las respuestas HTL y/o al usar modelos de ratón transgénicos apropiados. La inmunogenicidad es determinada al clasificar para: 1.) la inducción primaria in vitro usando PB C normal o 2.) respuestas de rellamamiento a partir de pacientes quienes tienen tumores que expresan PSCA. Ejemplo 18: Cálculo de frecuencias fenotipicas de supertipos HLA en varios antecedentes étnicos para determinar el ancho de la cobertura de población Este ejemplo ilustra la estimación del ancho de cobertura de población de una composición de vacuna comprendida de múltiples epítopes que comprenden múltiples superporciones y/o porciones. Con el fin de analizar la cobertura de población, las frecuencias de gen de los alelos HLA son determinadas. Las frecuencias de gen para cada alelo HLA son calculadas del antígeno o frecuencias de alelo utilizando las fórmulas de distribución binomial de gf = 1- (SQRT(l-af)) (ver, por 343 ejemplo, Sidney y colaboradores, Human Immunol. 45:79-93, 1996) . Para obtener frecuencias fenotipicas globales, son calculadas las frecuencias de gen acumulativas, y las frecuencias de antigeno acumulativas derivadas mediante el uso de la fórmula inversa [af=l- (1-Cgf) 2] . Donde los datos de frecuencia no son disponibles en el nivel de tipo de DNA, la correspondencia a las frecuencias de antigenos celulógicamente definidas es asumida. Para obtener la cobertura de población de supertipo potencial total n se asume el desequilibrio de enlace, y solamente los alelos confirmados que pertenecen a cada uno los supertipos son incluidos (estimados mínimos) . Los estimados de la cobertura potencial total logrado por las combinaciones inter-sitios se hacen al adicionar a la cobertura A la proporción de la población no cubierta A que podría ser esperada que sea cubierta por los alelos B considerados (por ejemplo, total = A + B*(l-A)). Los miembros confirmados del supertipo similar A3 son ?3, All, ?31, A*3301 y A*6801. Aunque el supertipo similar A3 también pueden incluir A34, A66 y A*7401, estos alelos no se incluyeron en los cálculos de la frecuencia global. Del mismo modo, los miembros confirmados de la familia del supertipo similar A2 son A*0201, A*0202, A*0203, A*0204, A*0205, A*0206, A*Q207, A*6802 y A*6901. Finalmente, los alelos confirmados del supertipo similar a B7 son: B7, B*3501-03, B51, B*5301, B*5401, B*5501-2, B*5601, 344 B*6701 y B*7801 (potencialmente también B*1401, B*3504-06, B*4201 y B*5602) . La cobertura de población lograda al combinar los supertipos A2, ?3 y B7 es de aproximadamente 86% en cinco grupos étnicos mayores. La cobertura puede ser extendida al incluir péptidos que llevan las porciones Al y A24. En promedio, Al está presente en 12% y ?24 en 29% de la población a través de cinco grupos étnicos mayores diferentes (Caucásico, Negro norteamericano, chino, japonés e hispánico) . Conjuntamente, estos alelos son representados con una frecuencia promedio de 39% en estas mismas poblaciones étnicas. La cobertura total a través de las etnicidades mayores cuando Al y A24 son combinados con la cobertura de los alelos del supertipo A2, A3 y B7 es >95%, ver, por ejemplo, Tabla IV (G) . Un procedimiento análogo puede ser usado para estimar la cobertura de población lograda con combinaciones de los epitopes que llevan la porción de clase II. Los estudios de inmunogenicidad en humanos (por ejemplo, Bertoni y colaboradores, J. Clin. Invest. 100:503, 1997; Doolan y colaboradores, Immunity 7:.97, 1997; y Threlkeld y colaboradores, J. Immunol. 159:1648, 1997) han mostrado que los péptidos de enlace altamente reactivos cruzadamente son casi siempre reconocidos como epitopes. El uso de péptidos de enlace altamente reactivos cruzadamente es un criterio de selección importante en la identificación de epitopes candidato para la inclusión en una vacuna que es inmunogénica en una población diversa. Con un número suficiente de epitopes (como es divulgado en la presente y de la técnica) , una cobertura de población promedio se predice que es mayor que 95% en cada una de cinco poblaciones étnicas mayores. El análisis de simulación de Monte Cario de teoría de juegos, que es conocida en la técnica (ver por ejemplo, Osborne, M. J. y Rubinstein, A. "A course in game theory" MIT Press, 1994), se puede usar para estimar que porcentaje de los individuos en una población comprendida de los grupos étnicos Caucásico, Negro norteamericano, japonés, chino e hispánico reconocerían los epitopes de vacuna descritos en la presente. Un porcentaje preferido es 90%, un porcentaje más preferido es 95%. Ejemplo 19: Reconocimiento CTL de los Antígenos Endógenamente Procesados Después del Cebado Este ejemplo confirma que CTL inducida por epitopes de péptido nativos o análogos identificados y seleccionados como es descrito en la presente reconocen antígenos endógenamente sintetizados, es decir nativos. Las células efectoras aisladas de ratones transgénicos que son inmunizadas con epitopes de péptido, por ejemplo epitopes que llevan la superporción HLA-A2, son re- 346 estimuladas in vitro usando células de estimuladoras recubiertas de péptido. Seis dias después, las células efectoras son analizadas para citotoxicidad y las lineas de células que contienen actividad citotóxica especifica de péptido son además re-estimuladas. Seis dias adicionales después, estas lineas de células son probadas para la actividad citotóxica sobre células objetivo Jurkat-A2.1/Kb marcadas con 51Cr en la ausencia o presencia de péptido, y también probadas sobre células objetivo marcadas con 51Cr que llevan el antigeno endógenamente sintetizado, es decir, células que son establemente transfectadas con vectores de expresión PSCA. Los resultados demuestran que las lineas de CTL obtenidas de animales cebadas con el epitope de péptido reconocen el antigeno PSCA endógenamente sintetizado. La elección del modelo de ratón transgénico para ser utilizado para tal análisis depende del (los) epitope (s) que son evaluados. Además de los ratones transgénicos HLA-A*0201/Kb, otros diversos de ratón transgénicos incluyendo ratones con All humana, que también pueden ser usados para evaluar epitopes A3 y alelos B7 se han carácterizado y otros (por ejemplo, ratones transgénicos para HLA-A1 y ?24) están siendo desarrollados. Los modelos de ratón HLA-DR1 y HLA-DR3 también han sido desarrollados, los cuales pueden ser usados para evaluar los epitopes HTL. 347 Ejemplo 20: Actividad de los Epitopes Conjugados CTL-HTL en Ratones Transgénicos Este ejemplo ilustra la inducción de CTLs y HTLs en ratones transgénicos, mediante el uso de un CTL derivado de PSCA y composiciones de vacuna de péptido HTL. La composición de vacuna usada en la presente comprende péptidos que son administrados a un paciente con un tumor que expresa PSCA. La composición de péptido puede comprender múltiples epitopes CTL y/o HTL. Los . epitopes son identificados usando la metodología como es descrita en la presente. Este ejemplo también ilustra que la inmunogenicidad incrementada puede ser lograda mediante la inclusión de uno o más epitopes HTL en una composición de vacuna CTL; tal composición de péptido puede comprender un epítope HTL conjugado a un epítope CTL. El epítope CTL puede ser uno que enlace a múltiples miembros de la familia HLA en una afinidad de 500 nM o menor, o análogos de ese epítope. Los péptidos pueden ser lipidados, si se desea. Procedimientos de Inmunización: La inmunización de ratones transgénicos es realiza como es descrito (Alexander y colaboradores, J. Immunol. 159: 4753-4761, 1997). Por ejemplo, los ratones A2/Kb, que son transgénicos para el alelo HLA ?2.1 humano son usados para confirmar la inmunogenicidad de los epitopes que llevan la porción HLA-A*0201 o la superporción HLA-A2, y son cebados 348 subcutáneamente (base de la cola) con un 0.1 mi de péptido en adyuvante de Freund incompleto, o si la composición de péptido es un conjugado CTL/HTL lipidado, en DMSO/soluciónj salina, o si la composición de péptido es un polipéptido, en PBS adyuvante de Freund incompleto. Siete dias después del cebado, los esplenocitos obtenidos de estos animales son reestimulados con linfoblastos activados con LPS irradiados singénicos recubiertos con péptido. Líneas de células: Las células objetivo para los ensayos citotoxicidad específicos de péptido son las células Jurkat transfectadas con el gen quimérico HLA-A2.1/Kb (por ejemplo, Vitiello y colaboradores, J. Exp. Med. 173:1007, 1991) Activación de CTL in vitro: Una semana después del cebado, las células del bazo (30xl06 células/matraz) son co-cultivadas a 37 °C con linfoblastos recubiertos de péptido (lOxlO6 células/matraz) irradiado (3000 rads) , singeneicos en 10 mi de medio de cultivo/matraz T25. Después de seis dias, las células efectoras son recolectadas y analizadas para la actividad citotóxica. Ensayo para la actividad citotóxica : Células objetivo (1.0 a 1.5xl06) son incubadas a 37°C en la presencia de 200 µ? del 1Cr. Después de 60 minutos, las células son lavadas tres veces y resuspendidas en el medio RIO. El péptido es adicionado donde es requerido en una concentración 349 de 1 µg ml. Para el ensayo, 104 células objetivo marcadas con 51Cr son adicionadas a diferentes concentraciones de células efectoras (volumen final de 200 µ?) en placas de 96 cavidades de fondo en forma de U. Después de un período de incubación de seis horas a 37 °C, una alícuota de 0.1 mi de sobrenadante es removida de cada cavidad y la radioactividad es determinada en un cantador gama automático Micromedic. El por ciento de lisis específico es determinado por la fórmula: por ciento de liberación específica = 100 x (liberación experimental/liberación espontánea) / (liberación máxima-liberación-espontánea) . Para facilitar la comparación entre los ensayos de CTL separados corridos bajo las mismas condiciones, el % de los datos de liberación 51Cr es expresado como unidades líticas/106 células. ' Una unidad lítica es arbitrariamente definida como el número de células efectoras requeridas para lograr 30% de lisis de 10.000 células objetivo en un ensayo de liberación de 51Cr de seis horas. Para obtener las unidades líticas específicas/106, las unidades líticas/106 obtenidas en la ausencia de péptido es substraída de las unidades líticas/105 obtenidas en la presencia de péptido. Por ejemplo, si 30% de la liberación de 51Cr es obtenida en la relación de efector (E) : objetivo (T) de 50:1 (es decir, 5xl05 células efectoras para 10.000 objetivos) en la ausencia de péptido y 5:1 (es decir, 5xl04 células efectoras para 10.000 objetivos) en la presencia de 350 péptido, las unidades liticas especificas serian: [ (1/50, 000)-(l/500, 000) ]x 106 = 18 LU. Los resultados son analizados para estimar la magnitud de las respuestas CTL de animales inyectados con la preparación de vacuna de conjugado CTL/HTL inmunogénica y son comparados con la magnitud de la respuesta CTL lograda usando, por ejemplo, epitopes CTL como es resumido en lo anterior en el Ejemplo intitulado "Confirmación de Inmunogenicidad" . Los análisis similares a esto pueden ser realizados para confirmar la inmunogenicidad de los conjugados de péptido que contienen múltiples epitopes CTL y/o múltiples epitopes HTL. De acuerdo con estos procedimientos, se encuentra que una respuesta CTL es inducida, y concomitantemente que una respuesta HTL es inducida en la administración de tales composiciones. Ejemplo 21: Selección de epitopes CTL y HTL para la inclusión en una vacuna especifica de PSCA Este ejemplo ilustra un procedimiento para seleccionar epitopes de péptido para composiciones de vacuna de la invención. Los péptidos en la composición pueden estar en la forma de una secuencia de ácido nucleico, ya sea individual o una o más secuencias (es decir, minigen) que codifica péptido (s), o puede ser individual y/o péptidos poliepitópicos . Los siguientes principios se utilizan cuando se 351 seleccionan en una pluralidad de epitopes para la inclusión en una composición de vacuna. Cada uno de los siguientes principios es equilibrado con el fin de hacer la selección. Se seleccionan epitopes que, en la administración, imitan las respuestas inmunes que están correlacionados con la evacuación de PSCA. El número de epitopes utilizados depende de las observaciones de los pacientes quienes espontáneamente evacúan PSCA. Por ejemplo, se ha observado que los pacientes quienes espontáneamente evacúan células que expresan PSCA generan una respuesta inmune a por lo menos tres (3) epitopes del antigeno PSCA, luego por lo menos tres epitopes deben ser incluidos para HLA clase I. Una exposición razonada similar se utiliza para determinar los epitopes HLA clase II. Los epitopes son frecuentemente seleccionados de modo que tienen una afinidad de enlace de un IC50 de 500 nM o menos para una molécula HLA clase I, o para a clase II, un IC50 de 1000 nM o menor; o péptidos HLA Clase I con altos registros de enlace del sitio de la red BIMAS, en URL bimas.dcrt.nih.gov/. Con el fin de lograr la cobertura amplia de la vacuna a través de una población diversa, suficientes péptidos que llevan superporcion, o un arreglo suficiente de péptidos que llevan porciones especificas de alelos son seleccionados para dar la cobertura de población amplia. En 352 una modalidad, los epitopes son seleccionados para proporcionar por lo menos 80% de cobertura de la población. Un análisis de Monte Cario, una evaluación estadística conocida en el técnica, puede se empleada para estimar la anchura, o redundancia de la cobertura de población. Cuando se crean composiciones poliepitópicas , o un minigen que codifica las mismas, típicamente es deseable generar el péptido más pequeño posible que comprende los epitopes de interés. Los principios empleados son similares, sino es que los mismos, como aquellos empleados cuando se selecciona un péptido que comprende epitopes empalmados. Por ejemplo, una secuencia de proteína para la composición de vacuna es seleccionado debido a que tiene el número máximo de epitopes contenidos dentro de la secuencia, es decir, tiene una alta concentración de epitopes. Los epitopes pueden ser empalmados o sobrepuestos (es decir, estructura desplazada con la relación a la otra) . Por ejemplo, epitopes sobrepuestos, dos epitopes de 9 mer y un epítope de 10 mer puede estar presente en un péptido de 10 aminoácidos. Cada epítope puede ser expuesto y enlazado por una molécula HLA en la administración de tal péptido. Un péptido multiepitópico pueden ser generado sintéticamente, recombinantemente, o por la vía de la segmentación de la fuente nativa. Alternativamente, un análogo se pueden hacer de esta secuencia nativa, mediante lo cual uno o más de los epitopes 353 o comprenden sustituciones que alteran la reactividad cruzada y/o las propiedades de afinidad de enlace del péptido poliepitópico . Tal composición de vacuna es administrada para propósitos terapéuticos o profilácticos. Esta modalidad 5 proporciona para la posibilidad de que todavía un aspecto no descubierto del procesamiento del sistema inmune aplicará la secuencia empalmada nativa y de esta manera facilitará la producción de composiciones de vacuna de inducción de respuesta inmune terapéuticas o profilácticas. 10 Adicionalmente, tal modalidad proporciona la posibilidad de epitopes que llevan porción para una constitución HLA que es actualmente desconocida. Además, esta modalidad (ausente de la creación de cualquiera de los análogos) dirige la respuesta inmune a múltiples secuencias de péptido que están 15 actualmente presentes en PSCA, evitando de esta manera la necesidad para evaluar cualquiera de los epitopes conjuncionales . Por último, la modalidad proporciona una economía de escala cuando se producen composiciones de vacuna de ácido nucleico. Relacionado con esta modalidad, los 20 programas de computadora pueden ser llevados de acuerdo con los principios en la técnica, que identifican en una '* secuencia objetivo, el número más grande de epitopes por longitud de secuencia. Una composición de vacuna comprendida de péptidos 25 seleccionados, cuando es administrada, es segura, eficaz e 354 induce una respuesta similar en magnitud a una respuesta inmune que controla o evacúa las ¦ células que llevan o sobreexpresan PSCA. Ejemplo 22: Construcción de Plásmidos de DNA de Multi-Epitope de "Minigen" Este ejemplo discute la construcción de un plásmido de expresión de minigen. Los plásmidos de Minigen puede, por supuesto, varias configuraciones de células B, epitopes CTL y/o HTL o análogos de epitope como es descrito en la presente . Un plásmido de expresión de minigen típicamente incluye múltiples epitopes de péptido CTL y HTL. En el presente ejemplo, los epitopes de péptido que llevan la superporción HLA-A2, A3, B7 y los epitopes de péptido que llevan la porción HLA-A1 y -A24 son usados en conjunción con los epitopes que llevan la superporción DR y/o epitopes DR3. Los epitopes de péptido de la superporción HLA clase I y que llevan la porción derivado de PSCA, son seleccionados tal que múltiples superporciones/porciones están representadas para asegurar la cobertura de población amplia. De manera similar, los epitopes HLA clase II son seleccionados del PSCA para proporcionar cobertura de población amplia, es decir, tanto epitopes que llevan la superporción de HLA DR-1-4-7 y epitopes que llevan la porción HLA DR-3 son seleccionados para la inclusión en la construcción del minigen. Los 355 epitopes CTL y HTL seleccionados son incorporados en un minigen para la expresión en un vector de expresión. Tal construcción adicionalmente puede incluir secuencias que dirigen los epitopes HTL al retículo endoplásmico. Por ejemplo, la proteína li puede ser fusionada a uno o más epitopes HTL como es descrito en la técnica, en donde la secuencia CLIP de la proteína li es removida y reemplazada con una secuencia de epítope HLA clase II de modo que el epítope HLA clase II es dirigido al retículo endoplásmico, donde el epítope enlaza a las molécula HLA clase II 11. Este ejemplo ilustra los métodos para ser utilizados para la construcción de un Plásmido de expresión que lleva minigen. Otros vectores de expresión que pueden ser utilizados para composiciones de minigen están disponibles y conocido para aquellos expertos en la técnica. El plásmido de minigen DNA de este ejemplo contiene una secuencia Kozak de consenso y una secuencia de señal de cadena ligera Ig kappa de murino de consenso seguido por los epitopes CTL y/o HTL seleccionados de acuerdo con los principios divulgados en la presente. La secuencia codifica una estructura de lectura abierta fusionada al fragmento de epítope de anticuerpo Myc y His codificado para el vector pcDNA 3.1 Myc-His. Los oligonucleótidos sobrepuestos que pueden promediar, por ejemplo, aproximadamente 70 nucleótidos en 356 longitud con sobreposociones de 15 nucleótidos, son sintetizados con la HPLC purificada. Los oligonucleótidos codifica los epitopes de péptido seleccionados asi como nucleótidos enlazadores apropiados, secuencia Kozak y secuencia de señal. El minigen de multiepítope final es ensamblado al extender los oligonucleótidos sobrepuestos entre estos conjuntos de reacciones usando PCR. Una máquina de PCR Perkin/Eimer 9600 es usada y un total de 30 ciclos son realizado usando las siguientes condiciones: 95 °C durante 15 sec, temperatura de templado (5o por debajo de la Tm calculada más baja de cada par de cebadores) durante 30 sec, y 72 °C durante 1 min. Por ejemplo, un minigen es preparado como sigue. Para una primera reacción de PCR, 5 µg de cada uno de dos oligonucleótidos son templados y extendidos: En un ejemplo usando ocho oligonucleótidos, es decir, cuatro pares de cebadores, oligonucleótidos 1+2, 3+4, 5+6 y 7+8 son combinados en reacciones de 100 µ? que contienen solución reguladora de polimerasa Pfu (lx = KCL 10 mM, (NH4)2S04 10 mM, Tris-Cloruro 20 mM, pH 8.75, MgS04 2 mM, Tritón X-100 0.1%, 100 g/ml de BS7A) , 0.25 mM de cada dNTP y 2.5 U de Pfu polimerasa. Los productos del dimero de longitud completa son purificados en gel, y dos reacciones que contienen el producto de 1+2 y 3+4 y el producto de 5+6 y 7+8 son mezclados, templados y extendidos juntos por 10 ciclos. La 357 mitad de las dos reacciones luego son mezclada, y 5 ciclos de templado y extensión llevados a cabo antes de que los cebadores flanqueantes sean adicionados para amplificar el producto longitud completa. El producto de longitud completa es purificado en gel y clonado en el despuntamiento de pCR (Invitrogen) y los clones individuales son clasificados mediante secuenciación. Ejemplo 23: La Construcción de Plásmido y el Grado al Cual Induce Inmunogenicidad. El grado al cual una construcción de plásmido, por ejemplo un plásmido construido de acuerdo con el Ejemplo previo, es capaz de inducir inmunogenicidad es confirmado in vitro al determinar la presentación de epitope mediante APC después de la transducción o transfección de la APC con una construcción de ácido nucleico que expresa el epitope. Tal estudio determina la "antigenicidad" y permite el uso de APC humano. El ensayo determina la habilidad del epitope que es presentado por el APC en un contexto que es reconocido por una célula T al cuantificar la densidad de complejos de epitope-HLA clase I sobre la superficie de la célula. La cuantificación puede ser realizada al medir directamente la cantidad de péptido diluido del APC (ver, por ejemplo, Sijts y colaboradores, J. Inmuno1. 156: 683-692, 1996; Demotz y colaboradores, Nature 342; o el número de complejos de péptido-HLA clase lyo puede ser estimado al medir la cantidad 358 lisis o liberación de linfocina inducida por las células objetivo enfermas o transíectadas , y luego al determinar la concentración de péptido necesario para obtener niveles equivalentes de lisis o liberación de linfocina (ver, por ejemplo, Kageyama y colaboradores, J. Inmuno1. 154:567-576, 1995) . Alternativamente, la inmunogenicidad es confirmada a través de inyecciones in vivo en ratones y subsecuente en la estimación in vitro de la actividad CTL y HTL, que son analizadas usando ensayos de citotoxicidad y proliferación, respectivamente, como es detallado, por ejemplo, en Alexander y colaboradores, Immunity 1:751-761, 1994. Por ejemplo, para confirmar la capacidad de una construcción de minigen de DNA que contiene por lo menos un péptido de superporción HLA-A2 para' inducir CTLs in vivo, ratones transgénicos HLA-A2.1/Kb, por ejemplo, son inmunizados intramuscularmente con 100 µg de cDNA desnudo. Como un medio para comparar el nivel de CTLs inducido por la inmunización de cDNA, un grupo de control de animales también es inmunizado con una composición de péptido actual que comprende múltiples epitopes sintetizados como un solo polipéptido como serian codificados por el minigen. Los esplenocitos de animales inmunizados son estimulados dos veces con cada una de las composiciones respectivas (epitopes de péptido codificados en el minigen o 359 el péptido poliepitópico) , luego analizados para la actividad citotóxica especifica de péptido en un ensayo de liberación de 51Cr. Los resultados indican la magnitud de la respuesta CTL dirigida contra el epitope A2-restringido, indicando de esta manera la inmunogenicidad in vivo de la vacuna de minigen y la vacuna poliepitópica . Por lo tanto, se encuentra que el minigen induce respuestas inmunes dirigidas hacia los epitopes de péptido de superporción HLA-A2 como lo hace la vacuna de péptido poliepitópica. Un análisis similar también es realizado usando otros modelos de ratón transgénicos HLA-A3 y HLA-B7 para estimar la inducción de CTL mediante los epitopes de porción o superporción HLA-A3 y HLA-B7, mediante lo cual también se encuentra que el minigen induce respuestas inmunes apropiadas dirigidas hacia los epitopes proporcionados. Para confirmar la capacidad de un minigen que codifica el epitope clase II para inducir HTLs in vivo, ratones transgénicos DR, o para esos . epitopes que reaccionan cruzadamente con la molécula MHC de ratón apropiada, ratones IA-b-restringidos por ejemplo, son inmunizados intramuscularmente con 100 µg de DNA de plásmido. Como un medio para comparar el nivel de HTLs inducido por la inmunización de DNA, un grupo de animales de control también es inmunizado con una composición de péptido actual emulsificada en adyuvante de Freund completo. Células T CD4 360 +, es decir HTLs, son purificadas de esplenocitos de animales inmunizados y estimuladas con cada una de las composiciones respectivas (péptidos codificados en el minigen) . La respuesta HTL es medida usando un ensayo de proliferación de incorporación de 3H-timidina, (ver, por ejemplo, Alexander y colaboradores, Immunity 1:751-761, 1994). Los resultados indican la magnitud de la respuesta HTL, asi demostrando la inmunogenicidad in vivo del minigen. Los minigenes de DNA, construidos como es. descrito en el Ejemplo previo, también pueden ser confirmados como una vacuna en combinación con un agente de refuerzo usando un protocolo de inicio y refuerzo. El agente de refuerzo puede consistir de proteínas recombinantes (por ejemplo, Barnett y colaboradores, Aids Res. and Human etroviruses 14, Supplement 3:S299-S309, 1998) o vaccinia recombinante, por ejemplo, expresado un minigen o DNA que codifica la proteina completa de interés (ver, por ejemplo, Hanke y colaboradores, Vaccine 16:439-445, 1998; Sedegah y colaboradores, Proc. Nati. Acad. Sci EUA 95:7648-53, 1998; Hanke y McMichael, Immunol. Letters 66:177-181, 1999; y Robinson y colaboradores, Nature Med. 5:526-34, 1999). Por ejemplo, la eficacia del minigen de DNA usado en un protocolo inicio y refuerzo es inicialmente evaluado en ratones transgénicos . En este ejemplo, los ratones transgénicos A2.1/K son inmunizados IM con 100 g de un 361 minigen de DNA que codifica los péptidos inmunogénicos incluyendo por lo menos un péptido que lleva la superporcion HLA-A2. Después que un periodo de incubación (que varia de 3-9 semanas) , los ratones son reforzados IP con 107 pfu/ratón de un virus de vaccinia recombinante que expresa la misma secuencia codificada por el minigen de DNA. Los ratones de control son inmunizados 100 µg de DNA o vaccinia recombinante sin la secuencia de minigen, o con DNA que codifica el minigen, pero sin el refuerzo de vaccinia. Después de un periodo de incubación adicional de dos semanas, los esplenocitos de los ratones son inmediatamente analizados para la actividad especifica de péptido en un ensayo ELISPOT. Adicionalmente, los esplenocitos son estimulados in vitro con los epitopes de péptido A2-restringido codificado en el minigen y la vaccinia recombinante, y luego analizados para la actividad especifica de péptido en una ELISA alfa, beta y/o gamma IFN. Se encuentra que el minigen utilizado en un protocolo de inicio-refuerzo induce respuestas inmunes más grande hacia los péptidos de superporcion HLA-A2 que con DNA sólo. Tal análisis también puede ser realizado usando modelos de ratón transgénicos HLA-All o HLA-B7 para estimar la inducción de CTL mediante los epitopes de porción o superporcion HLA-A3 o HLA-B7. El uso de los protocolos inicio y refuerzo es descrito enseguida en el Ejemplo intitulado 362 "Inducción de Respuestas CTL Usando un Protocolo de Inicio y Refuerzo". Ejemplo 24: Composiciones de Péptido para Usos Profilácticos Las composiciones de vacuna de la presente invención se pueden usar para prevenir la expresión de PSCA en personas quienes están en riesgo por tumores que llevan esta antigeno. Por ejemplo, una composición de epitope de péptido poliepitópico (o un ácido nucleico que comprende la misma) que contiene múltiples epitopes CTL y HTL tales como aquellos seleccionados en los Ejemplos anteriores, que también son seleccionados para la dirección mayor que 80% de la población, es administrado a individuos en riesgo para un tumor asociado con PSCA. Por ejemplo, una composición basada en péptido es proporcionada como un solo polipéptido que comprende múltiples epitopes. La vacuna es típicamente administrada en una solución fisiológica que comprende un adyuvante, tal como adyuvante Freund incompletos. La dosis de péptido para la inmunización inicial es de aproximadamente de 1 a aproximadamente 50,000 µg, generalmente 100-5,000 µg para un paciente de 70 kg. La administración inicial de la vacuna es seguida por dosificaciones de refuerzo en 4 semanas seguido por la evaluación de la magnitud de la respuesta inmune en el paciente, por técnicas que determinan la presencia de las poblaciones CTL específicas de epitope en una muestra PBMC. 363 Dosis de refuerzo adicionales son administradas como sea requerido. La composición se encuentra que es tanto segura como eficaz como una profilaxis contra la enfermedad asociada con PSCA. Alternativamente, una composición que comprende típicamente agentes de transfección es utilizada para la administración de una vacuna basada en ácido nucleico de acuerdo con las metodologías conocidas en la técnica y divulgadas en la presente. Ejemplo 25: Composiciones de Vacuna Poliepitópicas Derivadas de Secuencias de PSCA Nativas Una secuencia de poliproteína PSCA nativa es analizada, de preferencia usando algoritmos de computadora definidos para cada superporción o porción clase I y/o clase II, para identificar regiones "relativamente cortas" de la poliproteína que comprende múltiples epítopes . Las regiones "relativamente cortas" son de preferencia de menor longitud que un antígeno nativo completo. Esta secuencia relativamente corta que contiene múltiples epítopes distintos o sobrepuestos, "empalmado" pueden ser usados para generar un a construcción de minigen. La construcción es diseñada para expresar el péptido, que corresponde a la secuencia de proteína nativa. El péptido "relativamente corto" es generalmente de menos de 250 aminoácidos en longitud, frecuentemente menos de 100 aminoácidos en longitud, de 364 preferencia menos de 75 aminoácidos en longitud y más de preferencia menos de 50 aminoácidos en longitud. La secuencia de proteina de la composición de vacuna es seleccionada debido a que tiene el número máximo de epitopes contenidos dentro de la secuencia, es decir, tiene una alta concentración de epitopes. Como es mencionado en la presente, las porciones de epitope pueden ser empalmadas o sobrepuestas (es decir, estructura desplazada con relación entre si) . Por ejemplo, con epitopes sobrepuestos, dos epitopes de 9-mer y un epitope de 10-mer puede estar presente en un péptido de 10 aminoácidos. Tal composición de vacuna es administrada para propósitos terapéuticos o profilácticos. La composición de vacuna incluirá, por ejemplo, múltiples epitopes CTL del antigeno PSCA y por lo menos un epitope HTL. Esta secuencia nativa poliepitópica es administra ya sea como un péptido o como una secuencia de ácido nucleico que codifica el péptido. Alternativamente, un análogo se pueden hacer de esta secuencia nativa, mediante lo cual uno o más de los epitopes comprenden sustituciones que alteran la reactividad cruzada y/o las propiedades de afinidad de enlace del péptido poliepitópico . •La modalidad de este ejemplo proporciona la posibilidad de que todavía un aspecto no descubierto del procesamiento de sistema inmune aplicará la secuencia empalmada nativa y de esta manera facilitará la producción de composiciones de vacuna e inducción de respuesta inmune terapéuticas o profilácticas. Adicionalmente, tal modalidad proporciona la posibilidad de epitopes que llevan porción de una constitución de HLA que es actualmente desconocida. Además, esta modalidad (excluyendo una modalidad análoga) se dirige a la respuesta inmune para múltiples secuencias de péptido que son actualmente presentes en el PSCA nativo, evitando de esta manera la necesidad para evaluar cualquiera de los epitopes conjuncionales . Por último, la modalidad proporciona una economía de escala cuando se producen composiciones de vacuna de péptido o de ácido nucleico. Relacionado con esta modal'idad, los programas de computadora están disponibles en la técnica que pueden ser usados para identificar una secuencia objetivo, el número más grande de epitopes por longitud de secuencia. Ejemplo 26: Composiciones de Vacuna Poliepitópicas A partir de Múltiples Antígenos Los epitopes de péptido PSCA de la presente invención son utilizados en conjunción con epitopes de otros antígenos asociados con tumor objetivo, para crear una composición de vacuna que es útil para la prevención o tratamiento de cáncer que expresa PSCA y otros de tales antígenos. Por ejemplo, una composición de vacuna puede ser proporcionada como un solo polipéptido gue incorpora múltiples epitopes de PSCA así como antígenos asociados con tumor que son frecuentemente expresados con un cáncer objetivo asociado con la expresión de PSCA, o puede ser administrado como una composición que comprende un cóctel de uno o más epitopes discretos. Alternativamente, la vacuna puede ser administrada como una construcción de minigen o como células dendriticas que se han cargado con los epitopes de péptido in vitro. Ejemplo 27: Uso de péptidos para evaluar una respuesta inmune Los péptidos de la invención se pueden usar para analizar una respuesta inmune para la presencia de anticuerpos específicos, CTL o HTL dirigido a PSCA. Tal análisis puede ser realizado de una manera descrita por Ogg y colaboradores, Science 279:2103-2106, 1998. En este Ejemplo, los péptidos de acuerdo con la invención son utilizados como un reactivo para propósitos de diagnóstico o pronóstico, no como un inmunoge o . En este ejemplo los complejos tetraméricos de antígeno de leucocito humano altamente sensible ("tetrámeros") son utilizados para un análisis seccional cruzado de, por ejemplo, frecuencias de CTL específicas de HLA-A*0201 de PSCA de individuos positivos HLA-A*0201 en diferentes etapas de la enfermedad o después de la inmunización que comprenden un péptido PSCA que contiene una porción A*0201. Los complejos tetramétricos son sintetizados como es descrito (Musey y colaboradores, N. Engl . J. Med. 367 337:1267, 1997) . Brevemente, HLA purificado de cadena pesada (A*0201 en este ejemplo) y ß2 microglobulina son sintetizados por medio de un sistema de expresión procariótico . La cadena pesada es modificada mediante la supresión de la cola citosólica de transmembrana y la adición COOH-terminal de una secuencia que contiene un sitio de biotinilación enzimático BirA. La cadena pesada, p2-microglobulina y el péptido son replegados mediante dilución. El producto replegado de 45 kD es aislado mediante la cromatografía líquida de proteína rápida y luego biotinilado mediante BirA en la presencia de biotina (Sigma, S. Louis, isuri) , adenosina 5' trifosfato y magnesio. El conjugado estreptavidina-ficoeritrina se adicionan en una relación molar 1:4, y el producto tetramérico es concentrado a 1 mg/ml . El producto resultante es referido como tetrámero-ficoeritrina . Para el análisis de muestras de sangre de pacientes, aproximadamente un millón de PBMCs son centrifugadas en 300 g durante 5 minutos y resuspendidas en 50 µ? de solución salina regulada con fosfato fría. El análisis tri-color se realiza con el tetrámero- ficoeritrina, junto con anti-CD8-Trícolor y anti-CD38. Las PBMCs son incubadas con tetrámero y los anticuerpos sobre hielo durante para 30 a 60 min. y luego lavadas dos veces antes de la fijación con formaldehído . Compuertas son aplicadas para contener >99.98% de las muestras de control. Los controles 368 para los tetrámeros incluyen tanto individuos negativos de A*0201 y donadores no enfermos positivos de A*0201. El porcentaje de células manchadas con el tetrámero luego es determinado mediante la citometria de flujo. Los resultados indican el número de células en la muestra PBMC que contienen CTLs de epítope restringido, indicando de esta manera el grado de respuesta inmune al epitope PSCA, y asi el estado de exposición a PSCA, o exposición a una vacuna que induce una respuesta protectora o terapéutica. Ejemplo 28: Uso de Epltopes Péptido para Evaluar las Respuestas de Rellamamiento Los epltopes de péptido de la invención son usados como reactivos para evaluar las respuestas de la célula T, tal como las respuestas agudas o de rellamamiento, en pacientes. Tal análisis puede ser realizado en pacientes quienes se han recuperado de la enfermedad asociada con PSCA o quienes se han vacunado con una vacuna PSCA. Por ejemplo, la respuesta CTL restringida clase I de personas quienes se han vacunado puede ser analizada. La vacuna puede ser cualquier vacuna de PSCA. PBMC son recolectadas de individuos vacunados y del tipo de HLA. Los epltopes de péptido apropiados de la invención que, óptimamente, llevan superporciones para proporcionar reactividad cruzada con múltiples miembros de la familia del supertipo HLA, luego se utilizan para análisis de muestras 369 derivadas de individuos quienes llevan el tipo HLA. Las PBMC de individuos vacunados son separadas en gradientes densidad de Ficoll-Histopaque (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO) , lavadas tres veces en HBSS (GIBCO Laboratories) , resuspendidas en RPMI-1640 (GIBCO Laboratories) complementadas con L-glutamina (2 mM) , penicilina (50 U/ml) , estreptomicina (50 µq/tal) y Hepes (10 mM) que contiene suero AB humano inactivado con calor al 10% (RPMI completo) y colocadas usando formatos de microcultivo . Un péptido sintético que comprende un epitope de la invención es adicionado en 10 /p?1 a cada cavidad y el epitope 128-140 de núcleo HBV es adicionado en 1 µg/ml a cada cavidad como una fuente de célula T ayudante durante la primera semana de estimulación. En el formato de microcultivo, 4 x 105 PBMC son estimuladas con péptido en 8 cultivos duplicados en la placa de fondo redondo de 96 cavidades en 100 µ?/ cavidad de RPMI completo. En los días 3 y 10, 100 µ? de RPMI completo y 20 U/ml de concentración final de rIL-2 son adicionados a cada cavidad. En el día 7 los cultivos son transferidos en una placa de fondo plano de 96 cavidades y reestimulados con péptido, rIL-2 y 105 de células alimentadoras autologas irradiadas (3,000 rad) . Los cultivos son probados para la actividad citotóxica en el día 14. Una respuesta CTL positiva requiere dos o más de los ocho cultivos duplicados para 370 exhibir mayor que 10% de liberación de 51Cr especifica, basado en comparación con los sujetos de control no enfermos como es descrito previamente (Rehermann y colaboradores, Nature Med. 2:1104, 1108, 1996; Rehermann y colaboradores, J. Clin. Invest. 97:1655-1665, 1996; y Rehermann y colaboradores, J. Clin. Invest. 98:1432-1440, 1996). Las líneas de células objetivo son B-LCL transformada con EBV autologas y alogeneicas que son ya sea adquiridas de la American Society for Histocompatibility and Immunogenetics (ASHI, Boston, MA) o establecidas de la acumulación de pacientes como es descrito (Guilhot y colaboradores, J. Virol. 66:2670-2678, 1992) . Los ensayos de citotoxicidad son realizados de la siguiente manera. Células objetivo consisten de ya sea líneas de células linfoblastoides B transformadas con EBV autologas o igualadas con -HLA alogeneicas que son incubadas durante la noche con el epítope de péptido sintético de la invención en 10 µ?, y marcadas con 100 µ?? de 51Cr (Amersham S.a., Arlington Heights, IL) durante 1 hora después de lo cual son lavadas cuatro veces con HBSS. La actividad citolítica es determinada en un ensayo de liberación de 51Cr de cavidad dividida, 4 horas estándar usando placas de 96 cavidades de fondo en forma de U que contiene 3,000 objetivos/cavidad. Las PBMC estimuladas son probadas en relaciones de efector/ob etivo (E/T) de 20-50:1 371 en el dia 14. El por ciento citotoxicidad es determinado de la fórmula: 100 x [(liberación experimental-liberación-espontánea) /liberación máxima-liberación espontánea) ] . La liberación máxima es determinada por la lisis de los objetivos mediante detergente (Tritón X-100 al 10%; Sigma Chemical Co., St., Louis, MO) . La liberación espontánea <25% de liberación máxima para todos los experimentos. Los resultados de tal análisis indican el grado al cual las poblaciones HLA restringidas en CTL se han estimulado mediante la exposición previa a PSCA o una vacuna de PSCA. De manera similar, las respuestas HTL restringidas de Clase II también pueden ser analizadas. Las PBMC purificadas son cultivadas en una placa de fondo plano de 96 cavidades a una densidad de 1.5xl05 células/cavidad y son estimuladas con 10 µg/ml de péptido sintético de la invención, antigeno de PSCA completo o d. Las células son rutinariamente colocadas por duplicado en 4-6 cavidades para cada condición. Después que siete dias de cultivo, el medio es removido y reemplazado con medio fresco que contiene 10 U/ml de 11-2. Dos dias después, 1 µ£± de 3H-timidina es adicionada a cada cavidad y la incubación es continuada durante 18 horas adicionales. El DNA celular luego es recolectado sobre esterillas de fibra de vidrio y analizado para la incorporación de 3H-timidina. La proliferación de 372 célula T especificas de antigeno es calculada como la relación de incorporación de 3H-timidina en la presencia del antigeno dividido entre la incorporación de 3H-timídina en la ausencia de antigeno. Ejemplo 29: Inducción de la Respuesta CTL Especifica en Humanos Un experimento clínico humano para una composición inmunogénica que comprende epitopes CTL y HTL de la invención es ajustado como un estudio a escalación de dosis, IND fase I y llevado a cabo como un experimento de placebo controlado, doble ciego, aleatorizado . Tal experimento es designado, por ejemplo, como sigue: Un total de aproximadamente de 27 individuos son enrolados y divididos en 3 grupos: Grupo I: 3 sujetos son inyectados con placebo y 6 sujetos son inyectados con 5 µg de la composición de péptido; Grupo II: 3 sujetos son inyectados con placebo y 6 sujetos son inyectados con 50 µg de la composición de péptido; Grupo III: 3 sujetos son inyectados con placebo y 6 sujetos son inyectados con 500 µg de composición de péptido. Después de 4 semanas después de la primera inyección, todos los sujetos reciben una inoculación de refuerzo en la misma dosificación. Los puntos finales medidos en este estudio se 373 relacionan a la seguridad y tolerabilidad de la composición de péptido asi como su inmunogenicidad. Las respuestas inmunes celulares a la composición de péptido son un índice de la actividad intrínseca de esta composición de péptido, y por lo tanto puede ser visualizada como una medición de la eficacia biológica. Lo siguiente resume los datos clínicos y de laboratorio que relacionan con los puntos finales de seguridad y eficacia. Seguridad: La incidencia de eventos adversos es monitoreada en el placebo y el grupo de tratamiento de fármaco y estimado en términos del grado y reversibilidad. Evaluación de la Eficacia de la Vacuna: Para la evaluación de la eficacia de la vacuna, los sujetos son sangrados antes y después de la inyección. Las células mononucleares de sangre periféricas son aisladas de la sangre heparinizada fresca mediante la centrifugación de gradiente de densidad de Ficoll-Hypaque, formaas en alícuotas en el medio congelación y almacenadas en estado congelado. Las muestras son analizadas para la actividad CTL y HTL. La vacuna se encuentra que es tanto segura como eficaz. Ejemplo 30: Experimentos de Fase II en Pacientes que Expresan PSCA Los experimentos en fase II se realizan para estudiar el efecto de la administrar de las composiciones de péptido de CTL-HTL a pacientes que tienen cáncer que expresan 374 PSCA. Los objetivos principales del experimento son determinar una dosis efectiva y régimen para inducir CTLs en pacientes de cáncer que expresan PSCA, para establecer la seguridad de inducción de una respuesta de CTL y HTL en estos pacientes, y para observar que grado de activación de los CTLs mejora el cuadro clínico de. estos pacientes, como es manifestado, por ejemplo, por la reducción y/o contracción de las lesiones. Tal estudio es diseñado, por ejemplo, como sigue : Los estudios se realizan en múltiples centros. El diseño del experimento es un protocolo de escalacion de dosis no controlado, de etiqueta abierta en donde la composición de péptido es administrada como una sola dosis seguido por seis semanas después por un solo refuerzo de la misma dosis. Las dosificaciones son 50, 500 y 5,000 microgramos por inyección. Los efectos adversos asociados con el fármaco (severidad y reversibilidad) son registrados. Hay tres agrupamientos de pacientes. El primer grupo es inyectado con 50 microgramos de la composición de péptido y el segundo y tercero grupo con 500 y 5,000 microgramo de composición de péptido, respectivamente. Los pacientes dentro de cada grupo varían en edad de 21-65 y representan diversas antecedentes étnicos. Todos estos tienen un tumor que expresa PSCA. Las manifestaciones clínicas o las respuestas de la célula T especificas de antigeno son monitoreadas para estimar los efectos de la administración de las composiciones de péptido. La composición de vacuna se encuentra que es tanto segura como eficaz en el tratamiento de la enfermedad asociada con PSCA. Ejemplo 31: Inducción de Respuestas CTL Usando un Protocolo de Inicio y Refuerzo Un protocolo de inicio y refuerzo similar en su principio implícito aquel usado para confirmar la eficacia de una vacuna de DNA en ratones transgénicos , tal como es descrito anteriormente en el Ejemplo intitulado "La Construcción de Plásmido y el Grado al cual Induce la Inmunogenicidad" , también puede ser utilizado para la administración de la vacuna a humanos. Tal régimen de vacuna puede incluir una administración inicial de, por ejemplo, DNA desnudo seguido por un refuerzo usando virus recombinante que codifica la vacuna, o proteina/polipéptido recombinante o una mezcla de péptido administrado en un adyuvante. Por ejemplo, la inmunización inicial puede ser realizada usando un vector de expresión, tal como aquel construido en el Ejemplo intitulado "Construcción de Plásmidos de Multi Epítope de "Minigen" en la forma de ácido nucleico desnudo administrado IM (o SC o ID) en las cantidades de 0.5-5 mg en múltiples sitios. El ácido nucleico (0.1 a 1000 xg) también puede ser administrado usando una pistola génica. Después de un periodo de incubación de 3-4 semanas, una dosis de refuerzo luego es administrada. El refuerzo pueden ser el virus fowlpox recombinante administrado en una dosis de 5-107 a 5xl09 Pfu. Un virus recombinante alternativo, tal como un virus MVA, cañaripox, adenovirus o adeno-asociado, también puede ser usado para el refuerzo, o la proteina poliepitópica o una mezcla de los péptidos puede ser administrada. Para evaluación de la eficacia de la vacuna, muestras de sangre del paciente son obtenidas antes de la inmunización asi como en intervalos después de la administración de la vacuna inicial y las dosis de refuerzo de la vacuna. Las células mononucleares de sangre periférica son aisladas de la sangre paralizada fresca mediante la centrifugación de gradiente de densidad Ficoll-Hypaque, formado en alícuotas en medios de congelación y almacenadas en estado congelado. Las muestras son analizadas para la actividad de CTL y HTL. El análisis de los resultados indica que una magnitud de respuesta suficiente para lograr una inmunidad terapéutica o protectora contra PSCA es generado. Ejemplo 32: Administración de Composiciones de Vacuna Usando Células Dendríticas (PC) Las vacunas que comprenden epítopes de péptido de la invención pueden ser administradas usando APCs, o APCs "profesionales" tal como DC. En este ejemplo, el DC pulsado 377 con péptido son administradas a un paciente para estimular una respuesta CTL in vivo. En este método, las células dendríticas son aisladas, expandidas y pulsadas con una vacuna que comprende epítopes CTL y HTL de péptido de la invención. Las células dendríticas son infusionadas nuevamente en el paciente inducir las respuestas CTL y HTL in vivo. El CTL y HTL inducido luego destruyen o facilitan la destrucción, respectivamente, de las células objetivo que llevan la proteína PSCA de la cual se derivan los epítopes en la vacuna. Por ejemplo, un cóctel de péptidos que comprenden péptidos es administrado ex vivo a PBMC, o DC aisladas de las mismas . Una sustancia farmacéutica para facilitar la recolección de DC puede ser utilizada, tal como Progenipoietin™ (Monsanto, S. Louis, MO) o GM-CSF/IL-4. Después de la pulsación de las DC con péptidos, y antes de reinfusión en los pacientes, las DC son lavadas para remover los péptidos no enlazados. Como es apreciado clínicamente, y fácilmente determinado por un experto basado en los resultados clínicos, el número de DC reinfusionado en el paciente puede variar (ver, por ejemplo, Nature Med. 4:328, 1998; Nature Med. 2:52, 1996 and Prostate 32:272, 1997). Aunque 2-50 x 106 DC por paciente son típicamente administradas, el número más grande de DC, tal como 107 o 108 también puede ser proporcionado. 378 Tales poblaciones de células típicamente contiene entre 50-90% de DC. En algunas modalidades, las PBMC cargadas con péptido son inyectadas en pacientes sin purificación de las DC. Por ejemplo, PBMC generados después del tratamiento con un agente tal como Progenipoietin™ son inyectadas en pacientes sin purificación de las DC.-E1 número total de PBMC que son administradas frecuentemente varía de 108 a 1010. Generalmente, las dosis de células inyectadas en pacientes está basada en el porcentaje de DC en la sangre de cada paciente, como es determinado, por ejemplo, mediante el análisis de inmunofluorescencia con anticuerpos anti-DC específicos. Así, por ejemplo, si Progenipoietin™ moviliza 2% de DC en la sangre periférica de un paciente dado, y ese paciente está para recibir 5 x 106 DC, luego el paciente será inyectado con un total de 2.5 x 108 PBMC cargadas con péptido. El por ciento de DC movilizados por un agente tal como Progenipoietin™ es típicamente estimado que está entre 2-10%, pero puede variar como apreciado por uno experto en la técnica. Activación ex vivo de respuestas CTL/HTL Alternativamente, las respuestas CTL o HTL ex vivo a los antígenos PSCA pueden ser inducidas por incubación, en cultivo de tejido, los pacientes, o .las células precursoras CTL o HTL o genéticamente compatibles junto con una fuente de 379 APC, tal como DC y péptidos inmunogénicos . Después de un tiempo de incubación apropiados (de manera típica aproximadamente 7-28 días) , en la cual las células precursoras son activadas y expandidas en células efectoras, las células son infusionadas en el paciente, donde ellas destruirán (CTL) o facilitarán la destrucción (HTL) de sus células objetivo especificas, es decir, células de tumor. Ejemplo 33: Un Método Alternativo para Identificar y. . Confirmar los Péptidos que llevan Porción Otro método para identificar y confirmar péptidos que llevan porción es eluirlos de las células que llevan moléculas MHC definidas.. Por ejemplo, las lineas de células B transformadas con EBV usadas para el tipo de tejido se han caracterizado extensivamente para determinar que moléculas HLA ellas expresan. En ciertos casos estas células expresan solamente un solo tipo de molécula HLA. Estas células pueden ser transfectadas con ácidos nucleicos que expresan el antigeno de interés, por ejemplo PSCA. Los péptidos producidos por el procesamiento dé antigeno endógeno de péptidos producidos como un resultado de la transfección luego enlazarán a las moléculas HLA dentro de la célula y serán transportadas y exhibidas por la superficie de la célula. Los péptidos luego son eluidos de las moléculas HLA mediante la a exposición a condiciones ácidas moderadas y su secuencia de aminoácidos determina, por ejemplo, mediante el análisis espectral de masa (por ejemplo, Kubo y colaboradores, J. Immunol. 152:3913, 1994). Debido a que la mayoría de péptidos que enlazan una molécula HLA particular están llevando porción, esta es una modalidad alternativa para obtener los péptidos qüe llevan porciones correlacionadas con la molécula HLA particular expresada sobre la célula. Alternativamente, las líneas de células que no expresa moléculas HLA endógenas pueden ser transfectadas con una construcción de expresión que codifica un alelo HLA individual. Estas células luego pueden ser usadas como descrito, es decir, ellas pueden ser transfectadas con ácidos nucleicos que codifican PSCA para aislar péptidos correspondientes a PSCA que se han presentado sobre la superficie de la célula. Los péptidos obtenidos de tal análisis llevarán porción (es) que corresponden al enlace del alelo HLA individual que es expresado en la célula. Como es apreciado por un experto en la técnica, se puede realizar un análisis similar sobre una célula que lleva más de un alelo de HLA y subsecuentemente determinar los péptidos específicos para cada alelo HLA expresado. Por otro parte, un experto también reconocería- que medios diferentes a la transfección, tal como la carga con un antígeno de proteína, pueden ser usados para proporcionar una fuente de antígeno a la célula. 381 Ejemplo 34: Polinucleótidos Complementarios Las secuencias complementarias a las secuencias que codifican PSCA, o cualquiera de las partes de las mismas, son usadas para detectar, disminuir o inhibir la expresión de PCA que ocurre de manera natural . Aunque el uso de oligonucleótidos que comprenden de aproximadamente de 15 a 30 pares de base es descrito, esencialmente el mismo procedimiento es utilizado con fragmentos de secuencia más pequeñas o más grandes. Los oligonucleótidos apropiados son diseñados usando, por ejemplo, el software OLIGO 4.06 (National Biosciences) y la secuencia de codificación de PSCA. Para inhibir la transcripción, un oligonucleótido complementario es diseñado de la secuencia 5' más única y usado para prevenir el enlace del promotor a la secuencia de codificación. Para inhibir la traducción, un oligonucleótido complementario es diseñado para el prevenir el enlace ribosomal a una transcripción que codifica PSCA. Ejemplo 35: Purificación de PSCA que Ocurre de Manera Natural o Recombinante Usando Anticuerpos Específicos de PSCA El PSCA que ocurre de manera natural recombinante es sustancialmente purificado mediante la cromatografía de inmunoafinidad usando anticuerpos específicos para PSCA. Una columna de inmmunoafinidad es construida al acoplar covalentemente el anticuerpo anti-PSCA a una resina cromatográfica activada, tal como SEPHAROSE CNBr activadas 382 (Amersham Pharmacia biotech) . Después del acoplamiento, la resina es bloqueada y lavada de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Los medios que contienen PSCA son pasados sobre la columna de inmunoafinidad, y la columna es lavada bajo condiciones que permiten la absorbencia preferencial de PSCA (por ejemplo, soluciones reguladoras de alta concentración iónica en la presencia de detergentes) . La columna es uluida bajo condiciones que interrumpen el enlace de anticuerpo/PSCA (por ejemplo, una solución reguladora de pH 2 a pH 3, o una alta concentración de un caótropo, tal como urea o ión tiocianato) y GCR.P es recolectada. Ejemplo 36: Identificación de Moléculas que Interactúan con PSCA PSCA, o fragmentos biológicamente activos del mismo, son marcados son el reactivo 121 1 Bolton-Hunter .
(Ver, por ejemplo, Bolton y colaboradores, (1973) Biochem. J. 133:529). Las moléculas candidato previamente arregladas en las cavidades de una placa de múltiples cavidades son incubadas con el PSCA marcado, lavadas y cualquiera de las cavidades con el complejo PSCA marcado son analizadas. Los datos obtenidos usando diferentes concentraciones de PSCA son usados para calcular valores para el número, afinidad y asociación de PSCA con las moléculas candidato. Ejemplo 37: Ensayo In Vivo para la Promoción del Crecimiento 383 de Tumor con PSCA v.4 El efecto de la proteina PSCA v.4 sobre el crecimiento de la célula de tumor es evaluado in vivo al evaluar el desarrollo de tumor y el crecimiento de células que expresan o que carecen de PSCA v.4. Por ejemplo, los ratones SCID son inyectados subcutáneamente en cada flanco con 1 x 106 de ya sea lineas de células de cáncer 3T3, próstata (por ejemplo células PC3) , vejiga (por ejemplo células ÜM-UC3) o páncreas (por ejemplo células PANC1) que contiene el vector vacio tkNeo o PSCA v.4. Por lo menos dos estrategias pueden ser utilizadas: (1) la expresión PSCA v.4 constitutiva bajo la regulación de un promotor tal como un promotor constitutivo obtenido de los genomas de virus tal como el virus de polyoma, virus fowlpox (UK 2,211,504 publicada el 5 de Julio de 1989) , adenovirus (tal como Adenovirus 2) , virus de papiloma bovino, virus de sarcoma de aves, citomegalovirus, un retrovirus, virus de hepatitis B y Virus de Simio 40 (SV40) , o de promotores mamíferos heterólogos, por ejemplo, el 1 promotor de actina o un promotor de inmunoglobulina, con la condición de que tales promotores sean compatibles con los sistemas de células hospederas, y (2) expresión regulada bajo un control de un sistema de vector inducible, tal como_ ecdisona, tetraciclina, etc., con la condición de que tales promotores sean compatibles con los sistemas de células hospederas. El 384 volumen de tumor luego es monitoreado mediante la medición del calibre en la apariencia de tumores palpables y seguido a través del tiempo para determinar si las células que expresan PSCA v.4 crecen a una velocidad más rápida y si los tumores producidos por las células que expresan PSCA v.4 demuestran características de agresividad alteradas (por ejemplo metástasis incrementada, vascularización, responsividad reducida a los fármacos quimioterapéuticos) . Adicionalmente, los ratones pueden ser implantados con 1 x 105 de las mismas células ortotópicamente para determinar si el PSCA v.4 tiene un efecto sobre el crecimiento local en el páncreas, y si PSCA "v.4 afecta la habilidad de las células para la metástasis, específicamente a ganglios linfáticos, y el hueso (Miki T y colaboradores, Oncol Res. 2001; 12:209; Fu X y colaboradores, Int. J Cáncer. 1991, 49:938). El efecto del PSCA v.4 sobre la formación de tumor del hueso y el crecimiento puede ser estimado al inyectar las células tumor intratibialmente. El ensayo también es útil para determinar el efecto inhibitorio de PSCA v.4 de las composiciones terapéuticas, candidatas tales como, por ejemplo, intracuerpos PSCA v.4, moléculas antisentido PSCA v.4 y ribozimas. Ejemplo 38: Inhibición Mediada por el Anticuerpo Monoclonal PSCA v.4 de Tumores In Vivo La expresión significante de PSCA v.4 en tejidos de 385 cáncer, junto con su expresión restrictiva en tejidos normales hace el PSCA v.4 un buen objetivo para la terapia de anticuerpo. De manera similar, PSCA v.4 es un objetivo para la inmunoterapia basada en la célula T. Asi, la eficacia terapéutica del mAbs anti-PSCA v.4 en modelos de ratón de xenoinjerto de cáncer humano, incluyendo cánceres de próstata, vejiga y páncreas (por ejemplo células PANC1) y otros cánceres -PSCA v.4 listados en la tabla 1, es evaluado al usar lineas de células recombinantes tales como PC3-PSCA v.4, UM-UC3-PSCA v.4, PANC1-PSCA v.4 y 3T3-PSCA v.4 (ver, por ejemplo, aighn, M. E . , y colaboradores, Invest Urol, 1979, 17 (1) : 16-23) , asi como modelos de xenoinjertos humanos (Saffran y colaboradores, PNAS 1999, 10:1073-1078) . La eficacia del anticuerpo sobre el crecimiento del tumor y la formación de metástasis es estudiada, por ejemplo, en un ovario ortotópico de ratón, páncreas o modelos de xenoinjerto de cáncer de sangre. Los anticuerpos pueden ser no conjugados, como es discutido en el Ejemplo, o pueden ser conjugados con una modalidad terapéutica, como es apreciado en la técnica. mAbs anti-PSCA v.4 inhibe la formación de tumores en xenoinjertos de ratón. mAbs anti-PSCA v.4 también retarda el crecimiento de tumores ortotópicos establecidos y la supervivencia prolongada de ratones que llevan tumor. Estos resultados indican la utilidad de mAbs anti-PSCA v.4 en el tratamiento de etapas locales y avanzadas de varios 386 tumores sólidos. (Ver, por ejemplo, Saffran, D. y colaboradores, PNAS 10:1073-1078 o la red mundial URL pnas . org/cgi/doi/10.1073/pnas .051624698 ) . La administración de los mAbs anti-PSCA v.4 conduce al retardo del crecimiento de tumor ortotópico establecido y la inhibición de metástasis a sitios distantes, dando por resultado una prolongación significante a la supervivencia de los ratones que llevan tumor. Estos estudios indican que PSCA v.4 como un objetivo atractivo para la inmunoterapia y demuestra el potencial terapéutico del mAbs anti-PSCA v.4 para el tratamiento del cáncer local y metastático. Este ejemplo indica que los anticuerpos monoclonales PSCA v.4 no conjugados son efectivos para el inhibir el crecimiento de los xenoinjertos de tumor pancreático humano, ovárico y linfomas crecidos en ratones SCID; por consiguiente una combinación de tales anticuerpos monoclonales eficaces también es efectiva. Inhibición del tumor usando múltiples mAbs PSCA v.4 no conjugados Materiales y Métodos Anticuerpos Monoclonales PSCA v.4: Los anticuerpos monoclonales son cultivados contra PSCA v.4 como es descrito en el Ejemplo intitulado "Generación de Anticuerpos Monoclonales (mAbs) PSCA v.4". Los anticuerpos son caracterizados por ELISA, manchado de 387 Western, FACS e inmunoprecipitación para su capacidad para enlazar PSCA v.4. Los datos de mapeo del epitope para los mAbs anti-PSCA v.4, como es determinado por ELISA y análisis de Western, reconocen epitopes sobre la proteina PSCA v.4. El análisis inmunohistoquímico de los tejidos y células de cáncer con estos anticuerpos es realizado. Los anticuerpos monoclonales son purificados de ascites o sobrenadantes de cultivo de tejido de hibridoma mediante la cromatografía de Protein-G Sepharose, dializados contra PBS, esterilizados en filtro y almacenados a -20 °C. Las determinaciones de proteina son realizadas mediante un ensayo Bradford (Bio-Rad, Hercules, CA) . Un anticuerpo monoclonal terapéutico o un cóctel que comprende una mezcla de anticuerpos monoclonales individuales se preparado y usado para el tratamiento de ratones que reciben inyecciones subcutáneas u ortotópicas de xenoinjertos de tumor PC3 ÜM-UC3 CaKi y A427. Lineas de Células y Xenoijertos El xenoinjerto LAPC-9, que' expresa un receptor de andrógeno de tipo silvestre y produce antigeno especifico de próstata (PSA) , es pasado en ratones inmunodeficientes combinados de ICR-severas (SCID) machos de 6 a o semanas de edad (Taconic Cultiva) mediante el implante de trocar S. C. (Craft, N. y colaboradores, 1999, Cáncer Res. 59:5030-5036). Los xenoinjertos de riñon AGS-K3 y AGS-K6 también son pasados 388 mediante implantes subcutáneos en ratones SCID y de 6 a 8 semanas de edad. Las suspensiones de célula individual de células de tumor son preparadas como es descrito en Craft y colaboradores . Las lineas de células de cáncer de las lineas PC3, U -UC3 PANC1, asi como la linea de fibroblasto NIH 3T3 (American Type Culture Collection) . La linea de células de carcinoma de próstata PC3 es mantenida en RPMI complementado con L-glutamina y FBS al 10%, y las lineas de carcinoma de vejiga y de páncreas, UM-UC3 y PANC1, respectivamente son mantenidas en DMEM complementado con L-glutamina y FBS al 10%. Las poblaciones de células PC3-PSCA v.4, UM-ÜC3-PSCA v.4, PANC1-PSCA v.4 y 3T3-PSCA v.4 son generadas mediante la transferencia de gen retroviral como es descrito en Hubert, R. S. y colaboradores, Proc Nati. Acad. Sci E U A, 1999, 96 (25) : 14523. Modelos de Ratón de Xenoinjerto Tumores subcutáneos (s.c.) son generados mediante la inyección de 2 x 106 células de cáncer mezcladas en una dilución 1:1 con Matrigel (Collaborative Research) en el flanco derecho de ratones SCID machos. Para probar la eficacia del anticuerpo sobre la formación de tumor, es decir inyecciones de anticuerpo se iniciaron en el mismo dia como las inyecciones de célula de tumor. Como un control, los ratones se inyectaron con ya sea IgG de ratón purificado 389 (ICN) o PBS; o un anticuerpo monoclonal purificado que reconoce un antigeno irrelevante no expresado en células humanas. En estudios preliminares, no se encuentra diferencia entre el IgG de ratón o PBS en el crecimiento de tumor. Los 5 tamaño de tumor son determinados mediante mediciones del calibre, y el volumen de tumor es calculado como longitud x ancho x altura. Los ratones con tumores subcutáneos mayores que 1.5 cm en diámetro se sacrificaron. Las inyecciones ortotópicas se realiza bajo 10 anestesia al usar quetamina/xilazina . Para estudios ortotópicos de próstata, se hace una incisión a través de los músculos abdominales para exponer la vejiga y vesículas seminales, que luego son suministradas a través de la incisión por exponer la próstata dorsal. Las células LAPC-9 15 (5 x 105) mezcladas con Matrigel son inyectadas en cada lóbulo dorsal en un volumen de 10 µ?. Para monitorear el crecimiento del tumor, los ratones se sangraron en una base semanal para la determinación de los niveles de PSA. Para el modelo ortotópico de páncreas, se hace una incisión a través 20 de los músculos abdominales para exponer los tejidos mamarios y una sola suspensión de célula de células de cáncer de A páncreas es inyectado en la almohadilla mamaria. Para el * modelo ortotópico de vejiga, el tejido de cáncer de vejiga AGS-B1 es adherido sobre la pared de la vejiga. Después del 25 implante del tumor, los ratones son segregados en grupos para 390 los tratamientos apropiados, con anti-PSCA v.4 o mAbs de control que son inyectados i.p. Para monitorear el crecimiento del tumor, los ratones son palpados y la sangre es recolectada en una base semanal para medir los niveles de hCG. mAbs Anti-PSCA v.4 Inhiben el Crecimiento de los Tumores de Cáncer de Xenoinjerto que Expresan PSCA v.4 El efecto de los mAbs anti-PSCA v.4 en la formación del tumor es probado al usar la linea de células (por ejemplo PC3f UM-UC3 , PANC1 y 3T3) y los modelos ortotópicos de tumor derivados de pacientes. Como es comparado con el modelo de tumor s.c, el modelo ortotópico, que requiere la inyección de células de tumor directamente en el órgano del ratón dan por resultado un crecimiento de tumor local, desarrollo de metástasis en sitios distales, deterioro de la salud del ratón y muerte subsecuente (Saffran, D. y colaboradores, PNAS supra) . Las características hacen al modelo ' ortotópico más representativo de la progresión de enfermedad humana y permitió seguir el efecto terapéutico de mAbs sobre puntos finales clínicamente relevantes. Una mayor ventaja de los modelos de cáncer ortotópicos es la habilidad para estudiar el desarrollo de metástasis. La formación de metástasis en ratones que llevan tumores ortotópicos establecidos es estudiado mediante el análisis IHC sobre secciones de pulmón usando un anticuerpo 391 contra una proteina de superficie de célula especifica de tumor tal como anti-CK20 para cáncer de próstata (Lin S y colaboradores, Cáncer Detect Prev. 2001; 25:202). Otra ventaja de los modelos de cáncer de xenoinjerto es la habilidad para estudiar neovascularización y angiogénesis . El crecimiento del, tumor es parcialmente dependiente del desarrollo de nuevo bazo sanguíneo. Aunque el sistema capilar y la red sanguínea en desarrollo es del origen del hospedero, la iniciación y la arquitectura de la neovasculatura es regulada por el tumor de xenoinjerto (Davidoff AM y colaboradores, Clin Cáncer Res. 2001; 7:2870; Solesvik 0 y colaboradores, Eur. J Cáncer Clin Oncol. 1984, 20:1295). El efecto del anticuerpo y la molécula pequeña en la neovascularización es estudiada de acuerdo con procedimientos conocidos en la técnica, tal como mediante el análisis IHC de tejidos de tumor y su microambiente circundante. Los ratones que llevan tumores ortotópicos establecidos se les administraron inyecciones de 1000 µg de ya sea mAb anti-PSCA v.4 o PBS durante un periodo de 4 semanas. Los ratones en ambos grupos se dejan establecer una alta carga de tumor, para asegurar una alta frecuencia de formación de metástasis en los pulmones del ratón. Los ratones luego se sacrifican y sus vejigas, hígados, hueso y pulmones son analizados para la presencia de células de tumor 392 mediante el análisis de IHC. Estos .estudios demuestran una eficacia antitumoral amplia de los anticuerpos anti-PSCA v.4 en la iniciación y la progresión del cáncer de próstata en modelos de ratón de xenoinjerto. Los anticuerpos anti-PSCA v.4 inhiben la formación de tumor de los tumores asi como el retardo del crecimiento de tumores ya establecidos y prolonga la supervivencia de los ratones tratados. Además, mAbs anti-PSCA v.4 demuestra un efecto inhibitorio dramático sobre la dispersión del tumor de próstata local en sitios distales, aun en la presencia de una carga grande de tumor. Asi, los mAbs anti-PSCA v.4 son eficaces en puntos finales, clínicamente relevantes mayores (crecimiento de tumor) , prolongación de la supervivencia y la salud. Ejemplo 39: Uso Terapéutico y de Diagnóstico de los Anticuerpos Anti-PSCA en Humanos Los anticuerpos monoclonales antil-PSCA usados de manera segura y efectiva para propósitos de diagnóstico, profilácticos, pronóstico y/o terapéuticos en humanos. El manchado de Westhern y el inmunohistoquímico de tejidos de cáncer y xenoinjertos de cáncer con mAb anti-PSCA muestran fuerte manchado extensivo en el carcinoma pero significativamente menores o niveles indetectables en tejidos normales. La detección de PSCA en el carcinoma y en la enfermedad metastática demuestra la utilidad del mAb como un indicador de diagnóstico y/o de pronóstico. Los anticuerpos 393 anti-PSCA por lo tanto son utilizados en aplicaciones de diagnóstico tal como la inmunohistoquimica de especímenes de biopsia de riñon para detectar cáncer de pacientes sospechosos . Como es determinado mediante la citometría de flujo, mAb anti-PSCA específicamente enlaza las células de carcinoma. Así, los anticuerpos anti-PSCA son usados en el diagnóstico de aplicaciones de formación de imagen de cuerpo completo, tal como radioinmunoscintigrafía y radioinmunoterapia, (ver, por ejemplo, Potamianos S. y colaboradores, Anticancer Res 20 (2A) : 925-948 (2000)) para la detección de cánceres localizados y metastáticos que exhiben la expresión de PSCA. El derramamil nto o liberación de un dominio extracelular de PSCA en el medio extracelular, tal como aquel observado para fosfodiesterasa alcalina B10 (Meerson, N. R. , Hepatology 27:563-568 (1998)), permite la detección de diagnóstico de PSCA mediante los anticuerpos anti-PSCA en el suero y/o muestras de orina en pacientes sospechosos . Los anticuerpos anti-PSCA que específicamente enlazan PSCA son utilizados en aplicaciones terapéuticas para el tratamiento de cánceres que expresan PSCA. Los anticuerpos anti-PSCA son utilizados como una modalidad no conjugada y como forma conjugada en la cual los anticuerpos son unidos a una o varias modalidades terapéuticos o de formación de imagen bien conocidas en al técnica, tales como profármacos, enzimas o radioisótopos. En estudios pre-clinicos, los anticuerpos anti-PSCA no conjugados y conjugados son probados para la eficacia en la prevención del tumor y la inhibición del crecimiento en los modelos de xenoinjerto de cáncer de ratón SC1D, por ejemplo, los modelos de cáncer de riñon AGS-K3 y AGS-K6, (ver, por ejemplo, el Ejemplo intitulado "Inhibición Mediada por Anticuerpo Monoclonal PSCA de los Tumores de Vejiga y de Pulmón In Vivo") . Los anticuerpos anti-PSCA ya sea conjugados y no conjugados son utilizados como una modalidad terapéutica en experimentos clínicos humaos ya sea solos en combinación con otros tratamientos como es descrito en los siguientes Ejemplos. Ejemplo 40: Experimentos Clínicos Humanos para el Tratamiento y el Diagnóstico de Carcinomas Humanos a través del uso de Anticuerpos Anti-PSCA Humanos In vivo Los anticuerpos son usados de acuerdo con la presente invención que reconocen un epítope sobre PSCA, y son usados en el tratamiento de ciertos tumores tales como aquellos listados en la Tabla I. Basado en número de factores, incluyendo niveles de expresión de PSCA, los tumores tales como aquellos listados en la Tabla IL son actualmente indicaciones preferidas. En relación con cada una de estas indicaciones, tres procedimientos clínicos son conformados exitosamente. 395 I.) Terapia Adjunctiva: En la terapia adjunctiva, los pacientes son tratados con anticuerpos anti-PSCA en combinación con un agente quimioterapéutico o antineoplásico y/o la terapia de radiación. Los objetivos de cáncer primarios, tales como aquellos listados en la Tabla I, son tratados bajo protocolos estándares mediante la adición de anticuerpos anti-PSCA a la primera y segunda de terapia estándar. Los diseños de protocolo se dirigen la efectividad como es estimado por la reducción en la masa del tumor asi como la habilidad para reducir dosis usuales de quimioterapia estándar. Estas reducciones de dosificación permiten la terapia adicional y/o prolongada al reducir la toxicidad relacionada con la dosis del agente quimioterapéutico. Los anticuerpos anti-PSCA son utilizados en varios experimentos clínicos adjunctivos en combinación con los agentes quimioterapéuticos o antineoplásicos adriamicina (carcinoma de próstata avanzado) , cisplatin (carcinomas de cabeza y cuello y pulmón avanzados) , taxol (cáncer de pecho) y doxorubicina (pre-clínico) . II.) Monoterapia: En relación con el uso de los anticuerpos anti-PSCA en la monoterapia de tumores, los anticuerpos son administrados a pacientes sin un agente quimioterapéutico antineoplásico. En una modalidad, la monoterapia es conducida clínicamente en paciente de cáncer en etapa terminal con enfermedad metastática extensiva. Los 396 pacientes muestran alguna estabilización de la enfermedad. Los experimentos demuestran un efecto en los pacientes refractarios con tumores cancerosos. III.) Agente de Formación de Imagen: A través del enlace de un radionuclido (por ejemplo, yodo o itrio (I131, Y90) a los anticuerpos anti-PSCA, los anticuerpos radiomarcados son utilizados como agente de diagnóstico y/o de formación de imagen. En tal función, los anticuerpos marcados localizan a tanto los tumores sólidos, así como, las lesiones metastáticas de células que expresan .PSCA. En relación con el uso de los anticuerpos anti-PSCA como agentes de formación de imagen, los anticuerpos son usados como un adjunto al tratamiento quirúrgico de tumores sólidos, tanto como una clasificación pre-quirúrgica así como un seguimiento pos-operativo para determinar que tumor permanece y/o regresa. En una modalidad, un anticuerpo (1:L1In) -PSCA es utilizado como un agente de formación de imagen en el experimento clínico de fase I en pacientes que tienen carcinoma que expresa PSCA (por analogía ver, por ejemplo, Divgi y colaboradores, J. Nati. Cáncer Inst. 83:97-104 (1991) ) . Los pacientes son seguidos con una cámara gama, anterior y posterior estándar. Los resultados indican que las lesiones primarias y las lesiones metastáticas son identificadas. Dosis y Ruta de Administración 397 Como es apreciado por aquellos de habilidad ordinaria en la técnica, las consideraciones de dosificación pueden ser determinadas a través de la comparación con los productos análogos que están en la clínica. Así, los anticuerpos anti-PSCA pueden ser administrados con dosis en el intervalo de 5 a 400 mg/m2, con las dosis inferiores utilizadas, por ejemplo, en relación con estudios de seguridad. La afinidad de los anticuerpos anti-PSCA con relación a la afinidad de un anticuerpo conocido para su objetivo es un parámetro usado para aquellos expertos en la técnica para determinar regímenes de dosificación análogos. Además, los anticuerpos anti-PSCA que son completamente anticuerpos humanos, como es comprado con el anticuerpo quimérico, tienen evacuación más lenta; por consiguiente, la dosificación en pacientes con tales anticuerpos anti-PSCA completamente humanos puede ser menor, quizás en el intervalo de 50 a 300 mg/m2, y todavía permanece eficaz. La dosificación de mg/m2, como es opuesto a la medición convencional de dosis en mg/kg, es una medición basada en el área de superficie y es una medición de dosificación conveniente que es diseñada para incluir pacientes de todos los tamaños desde infantes a adultos. Tres procedimientos de suministro distintos son útiles para el suministro de anticuerpos anti-PSCA. El suministro intravenoso convencional es una técnica de 398 suministro estándar para muchos tumores. Sin embargo, en relación con tumores en la cavidad peritoneal, tales como tumores de los ovarios, conductos biliares, otros conductos y similares, la administración intraperitoneal se puede probar favorable para obtener alta dosis de anticuerpo en el tumor y para minimizar la evacuación del anticuerpo. De una manera similar, ciertos tumores sólidos poseen vasculatura que es apropiada para la perfusión regional. La perfusión regional permite una dosis alta de anticuerpo 'en el sitio de un tumor y minimiza la evacuación a corto plazo del anticuerpo. Plan de Desarrollo Clínico (CDP) Revisión: El CDP sigue y desarrolla tratamientos de anticuerpos anti-PSCA en relación con la terapia adjunctiva, monoterapia y como un agente de formación de imagen. Los experimentos inicialmente demuestran seguridad y después confirman la eficacia en dosis repetidas. Los experimentos son de etiqueta abierta comparando la quimioterapia estándar con la terapia estándar más anticuerpos anti-PSCA. Como será apreciado, un criterio que se pueden utilizar en relación con el enrolamiento de pacientes en los niveles de expresión de PSCA en sus tumores como es determinado por biopsia. Como con cualquier proteína o terapéutica basada en infusión de anticuerpo, los problemas de seguridad están relacionados principalmente con (i) síndrome de liberación de citoquina, es decir, hipotensión, fiebre, agitación, 399 escalofríos; (ii) el desarrollo de una respuesta inmunogénica al materia (es decir, desarrollo de anticuerpos humanos por el paciente al anticuerpo terapéutico o respuesta HAHA) ; y, (iii) toxicidad a las células normales que expresan PSCA. Las pruebas estándar y el seguimiento son utilizados para monitorear cada uno de estos problemas de seguridad. Los anticuerpos anti-PSCA son encontrados que son seguros en la administración humana. Ejemplo 41: Terapia Ajuntiva del Experimento Clínico Humano con Anticuerpo Anti-PSCA Humano y Agente Quimioterapéutico Un experimento clínico humano de fase I es iniciado para estimar la seguridad de seis dosis intravenosas de un anticuerpo anti-PSCA en relación con el tratamiento y un tumor sólido, por ejemplo, un cáncer de un tejido listado en la Tabla I. En el estudio, la seguridad de dosis individuales de anticuerpos anti-PSCA cuando es utilizado como una terapia adjunctiva a un agente antineoplásico o quimioterapéutico es definido en la presente, tal como, sin la limitación: cisplatin, topotecan, doxorubicina, adriamicina, taxol o los similares es estimado. El diseño del experimento incluye el suministro de seis dosis individuales de un anticuerpo anti-PSCA con la dosificación del anticuerpo que escala de aproximadamente de 25 mg/m2 a aproximadamente de 275 mg/m2 durante el curso del tratamiento de acuerdo con el siguiente4 programa : 400 Dia 0 Dia 7 Día Día Día Dia 14 21 28 35 Dosis mAb 25 75 125 175 225 275 rag/m2 mg/m2 mg/m2 mg/m2 mg/m2 mg/m2 Quimioterapia + + + + + + (dosis estándar) Los pacientes son estrechamente seguidos por una semana después de cada administración de anticuerpo y quimioterapia. En particular, los pacientes son estimados para los problemas de seguridad mencionados en lo anterior: (i) síndrome de liberación de citoquina, es decir, hipotensión, fiebre, " agitación, escalof íos; (ii) el desarrollo de una respuesta inmunogénica al materia (es decir, desarrollo de anticuerpos humanos por el paciente al anticuerpo terapéutico humano, o respuesta HAHA) ; y, (iii) toxicidad a células normales que expresan PSCA. Las pruebas estándares y el seguimiento son utilizados para monitorear cada uno de estos problemas de seguridad. Los pacientes también estimados para el efecto clínico, y particularmente la reducción en la masa del tumor como es evidenciado por MRI u otro medio de formación de imagen. Los anticuerpos anti-PSCA son demostrados que son seguros y eficaces, los experimentos de fase II confirman la eficacia y refinan la dosificación óptima. 401 Ejemplo 42: Experimento Clínico Humano: Monoterapia con Anticuerpo Anti-PSCA Humano Los anticuerpos anti-PSCA son seguros en relación con el experimento adjunctivo discutido en lo anterior, un experimento clínico humano de fase II confirma la eficacia y la dosificación óptima para la monoterapia. Tal experimento es realizado, y comprende los mismos análisis de seguridad y del efecto, al experimento adjunctivo descrito anteriormente con la excepción de que los pacientes no reciben la quimioterapia concurrentemente con la recepción de dosis anticuerpos anti-PSCA. Ejemplo 43: Experimento Clínico Humano: Formación de Imagen de Diagnóstico con Anticuerpo Anti-PSCA Una vez nuevamente, la terapia adjunctiva discutida anteriormente es segura dentro de los criterios de seguridad discutidos en lo anterior, un experimento clínico humano es conducido concerniente al uso de anticuerpos anti-PSCA como un agente de formación de imagen de diagnóstico. El protocolo es diseñado de una manera sustancialmente similar a aquellos descritos en la técnica, tal como en Divgi y colaboradores, J. Nati. Cáncer Inst. 83-97-104 (1991). Los anticuerpos se encuentran que son tanto seguros y eficaces cuando se usan como una modalidad de diagnóstico. 402 Ejemplo 44 Comparación de Homología de PSCA v.4 a Secuencias Conocidas : El gen PSCA v.4 codifica una proteína de 189 aa. La proteína PSCA v.4 humano exhibe un alto grado de homología al antígeno de célula madre de próstata humano (gi 27482160), que exhibe 98% de identidad a PSCA v.4 en el nivel de proteína (Figura 4) . El homólogo de ratón de PSCA v.4 no se ha identificado. La proteína PSCA v.4 tiene varias variantes (figura 11) . Estos incluyen 8 SNPs y una variante de empalme, referida como PSCA v.3. La proteína PSCA v.3 comprende la porción C-terminal de PSCA v.4 y corresponde a aa 94-189 de esa variante. El análisis de Bioinformática usando los programas de predicción de topología indica que el PSCA v.4 es una proteína soluble sin dominios de transmembrana (Tabla L) . El análisis de la porción reveló la presencia de dos porciones funcionales de proteína en la proteína PSCA v.4 (Tabla L) , específicamente una porción de cadherin y un dominio de granulin se ha identificado. Cadherins pertenece a una familia de moléculas de adhesión de células dependientes de calcio. Ellas son proteínas de transmembrana individuales que contienen dominios similares a la inmunoglobulina, y están implicadas en la adhesión celular y la clasificación (Shan y colaboradores, Biophys Chem 1999. 82:157). Para ejemplos, las cadherins median la adhesión la célula especifica del tejido de los linfocitos a la superficie de células epiteliales. Las cadherins se han mostrado que funcionan en la morfogénesis del tejido, adhesión celular, diferenciación celular, migración celular y metástasis de tumor (Yap AS, Kovacs EM. J Biol Chem 2003, 160:11; Vest eber D. Curr Opin Cell Biol 2002, 14:587; Bloom y colaboradores, Mol Biol Cell. 1999, 10:1521; Brodt P. Cáncer Met Rev 1991, 10:23). Las granulinas o epitelinas son factores de crecimiento originalmente purificadas de medios condicionados de células, mostrado que incrementa la proliferación de células (Xu, S. Q. y colaboradores, J. Biol. Chem. 1998. 273:20078). Las granulinas son expresadas en niveles elevados en varios cánceres, incluyendo gliomas y cáncer renal (Liau L y colaboradores, Cáncer Res. 60:1353, Donald, C. D y colaboradores, Anticancer Res. 21:3739) . Las porciones encontradas en PSCA v.4 indican que el PSCA v.4 puede participar en el crecimiento del tumor, y la progresión al regular la proliferación celular, comunicación celular, invasión y metástasis. Por consiguiente, cuando PSCA v.4 funciona como un regulador de establecimiento de tumor, el crecimiento de tumor, invasión de tumor, supervivencia o señalización celular, PSCA v.4 es usado para propósitos terapéuticos, de 404 diagnóstico, pronóstico y/o preventivo. Además, cuando una molécula, tal como una variante de empalme o SNP de PSCA v.4 es expresada en tejidos cancerosos, tales como aquellos listados en la Tabla I, y ellos son utilizados para propósitos terapéuticos, de diagnóstico, de pronóstico y/o preventivos . Ejemplo 45: Regulación de la Transcripción La localización mitocóndrica del PSCA v.4 acoplado a la presencia de los dominios de cadherin dentro de su secuencia indica que PSCA v.4 medula la regulación transcripcional de genes eucarióticos . La regulación de la expresión del gen es confirmada, por ejemplo, al estudiar la expresión del gen en células que expresan o que carecen PSCA v.4. Para este propósito, se realizan dos tipos de experimentos . En el primer conjunto de experimentos, RNA de célula parentales y que expresan PSCA v.4 son extraídas e hibridadas a arreglo de genes comercialmente disponibles (Clontech) (Smid-Koopman E y colaboradores, Br J. Cáncer 2000, 83:246). Las células en reposo así como células tratadas con FBS, andrógeno o factores de crecimiento son comparados. Los genes diferencialmente expresados son identificados de acuerdo con procedimientos conocidos en la técnica. Los genes diferencialmente expresados luego son mapeados a rutas biológicas (Chen K y colaboradores, Thyroid. 405 2001. 11:41) . En el segundo conjunto de experimentos, la activación de la ruta transcripcional especifica es evaluada usando construcciones de reportador de luciferaza comercialmente disponible (Stratagene) incluyendo: NFkB-luc, SRE-luc, ELKl-luc, ARE-luc, p53-luc y CRE-luc. Estos reportadores transcripcionales contienen sitios de enlace de consenso para factores de transcripción conocidos que se encuentran corriente abajo de las rutas de transducción de señal bien caracterizadas, y representan una buena herramienta para averiguar la activación de la ruta y clasificar los moduladores positivos y negativos de la activación de la ruta. Asi, PSCA v.4 desempeña" una función en la regulación del gen, y es usado como un objetivo para propósitos de diagnóstico, pronóstico, preventivos y/o terapéuticos . Ejemplo 46: Identificación y Confirmación de las Rutas de Transducción de Señal Potenciales Muchas proteínas de mamífero se han reportado que interactúan con las moléculas de señalización y que participan en la regulación de rutas de señalización. (Neurochem J. 2001; 76:217-223). las moléculas Cadherin se han asociado con la señalización Cdc42 y Rho (Kouklis J Biol Chem. 2003, 278:16230). Usando la inmunoprecipitación y las 406 técnicas de manchado de Western, las proteínas son identificadas que se asocian con PSCA v.4 y median los eventos de señalización. Varias rutas conocidas que desempeñan una función en la biología del cáncer pueden ser reguladas mediante PSCA v.4, incluyendo rutas de fosfolípido tales como PI3K, AKT, etc, las rutas de adhesión y de migración, incluyendo FAK, Rho, Rac-1, catenin, etc, así como la cascadas mitogénicas/supervivencia tal como ERK, p38, etc (Cell Growth Differ. 2000, 11:279; J Biol Chem. 1999, 274:801; Oncogene. 2000, 19:3003, J. Cell Biol. 1997, 138:913) . Con el fin de determinar si la expresión de PSCA v.4 es suficiente para regular las rutas de señalización específicas no activas de otra manera en las células de cáncer en reposo el efecto del PSCA v.4 sobre la activación de la cascada de señalización es investigado en las líneas de células de cáncer PA-1, Panel y Daudi. Las células de cáncer que establemente expresan PSCA v.4 o neo son estimuladas con el factor de crecimiento FBS u otras moléculas de activación. Los Usados de célula completa son analizados mediante el manchado de western. Para confirmar que el PSCA v.4 directamente o indirectamente activa las rutas de transducción de señal conocidas en células, los ensayos de reportador transcripcional basados en luciferasa (luc) son llevados a cabo en células que expresan genes individuales . Estos reportadores transcripcionales contienen sitios de enlace de consenso para factores de transcripción conocidos que se encuentran corriente abajo de las rutas de transducción de señal bien caracterizadas. Los reportadores y ejemplos de estos factores de transcripción asociados, rutas de transducción de señal y estímulos de activación son listados enseguida . 1. NFkB-luc, NFkB/Rel; Ik-quinasa/SAPK; crecimiento/apoptosis/estrés 2. SRE-luc, SRF/TCF/ELK1; MAPK/SAPK; crecimiento/diferenciación 3. AP-l-luc, FOS/JUN; MAPK/SAPK/PKC; crecimiento/apoptosis/estrés 4. ARE-luc, receptor de andrógeno; esteroides/MAPK; crecimiento/diferenciación/ poptosis 5. p53-luc, p53; SAPK; crecimiento/diferenciación/apoptosis 6. CRE-luc, CREB/ATF2; PKA/p38; crecimiento/apoptosis/estrés 7. TCF-luc, TCF/Lef; D-catenin, Adhesión/invasión Los efectos mediados por el gen pueden ser analizados por células que muestran la expresión de mRNA. Los plásmidos de reportador de Luciferasa pueden ser introducidos mediante la transfeccion mediada por lípido (Promega TFX-50) . 408 La actividad de Luciferasa, un indicador de la actividad transcripcional relativa, es medida mediante la incubación de extractos de células con substrato de luciferina y la luminiscencia de la reacción es monitoreada en un luminómetro . Las rutas de señalización activadas por PSCA v.4 son mapeadas y usadas para la identificación y validación de los objetivos terapéuticos. Cuando la PSCA v.4 está implicada en la señalización celular, este se utiliza como objetivo para propósitos de diagnóstico, pronóstico, preventivos y/o terapéuticos . Ejemplo 47: Involucramiento en la Progresión del Tumor Basado en la función de las porciones de granulin y cadherin en el crecimiento celular, la adhesión y las interacciones de proteina, el gen PSCA v.4 puede contribuir al crecimiento, adhesión, invasión y transformación de células de cáncer. La función del PSCA v.4 en el crecimiento del tumor es confirmada en una variedad de lineas de células primarias y transíectadas incluyendo lineas de célula de próstata, asi como células NIH 3T3 diseñadas para expresar establemente PSCA v.4. Las células parentales que carecen de PSCA v.4 y las células que expresan PSCA v.4 son evaluadas para el crecimiento celular usando un ensayo de proliferación bien documentado (Fraser SP, Grimes JA, Djamgoz MB. Prostate. 2000; 44:61, Johnson DE, Ochieng J, Evans SL. Anticancer 409 Drugs . 1996, 7 : 288) . Para confirmar la función de PSCA v.4 en el proceso de transformación, su efecto en los ensayos de formación de colonias es investigado. Las células NIH-3T3 parentales que carecen PSCA v.4 son comparadas a las células NIH-3T3 que expresan PSCA v.4, usando un ensayo de agar blando bajo condiciones severas y más permisivas ( (Song Z. y colaboradores, Cáncer Res. 2000; 60:6730) . Para confirmar la función de PSCA v.4 en la invasión y la metástasis de células de cáncer, es' utilizado en un ensayo bien establecido, por ejemplo, un ensayo del Sistema Transwell Insert (Becton Dickinson) (Cáncer Res. 1999; 59:6010). Las células de control, incluyendo las lineas de células de próstata, páncreas y riñon que carecen de PSCA v.4 son comparadas con las células que expresan PSCA v.4. Las células son cargadas con el tinte fluorescente, calceina y colocadas en la cavidad superior del inserto Transwell recubierto con el análogo de membrana basamento. La invasión es determinada mediante florescencia de las células en la cámara inferior con relación a la florescencia de la población de célula completa . PSCA v.4 también pueden desempeñar una función en el ciclo celular y la apoptosis. Las células parentales y las 410 células que expresan PSCA v.4 son comparadas para las diferencias en la regulación del ciclo celular usando un ensayo Brdü bien establecido (Abdel-Malek ZA. J Cell Physiol. 1988, 136:247). En breve, las células son cultivadas bajo condiciones tanto óptimas (suero completo) y limitativas (suero inferior) son marcadas con Brdü y manchadas con Ab anti-Brdu y yoduro de propidio. Las células son analizadas para la entrada en las fases Gl, S, y G2M del ciclo celular. Alternativamente, el efecto del estrés sobre la apoptosis es evaluado en células parentales de control y células que expresan PSCA v.4, incluyendo células de próstata normales y de tumor. Las células diseñadas y parentales son tratadas con varios agentes quimioterapéuticos, · tales como etoposido, taxol, etc., e inhibidores de síntesis de proteína, tal como cicloheximida . Las células son manchadas con annexin V-FITC y la muerte celular es medida mediante el análisis FACS . La modulación de la muerte celular mediante PSCA v.4 puede desempeñar una función crítica en regular la progresión del tumor y la carga del tumor . Cuando PSCA v.4 desempeña una función en el crecimiento celular, la transformación, la invasión o la apoptosis, este es utilizado como un objetivo para propósitos de diagnóstico, pronóstico, preventivos y/o terapéuticos. 411 Ejemplo 48: Involucramiento en la Angiogénesis La angiogénesis o nueva formación de vasos sanguíneos capilares es necesaria para el crecimiento del tumor (Hanahan D, Folkman J. Cell. 1996, 86:353; Folkman J. Endocrinology. 1998, 139:441). Varios ensayos se han desarrollado para medir la angiogénesis in vítro e in vivo, tal como los ensayos de cultivo de tejido de la formación del tubo de célula endotelxal y la proliferación de células endoteliales . Usando estos ensayos así como la neo-vascularización in vitro, la función de PSCA v.4 en angiogénesis, incremento o inhibición, es confirmada . Por ejemplo, las células endoteliales diseñadas para expresar PSCA v.4 son evaluadas usando la formación de tubo y los ensayos de proliferación.. El efecto de PSCA v.4 también es confirmado en modelos de animales in vivo. Por ejemplo, las células ya sea que expresan o que carecen de PSCA v.4 son implantadas subcutáneamente en ratones inmunocomprometidos . La migración celular endotelial y la angiogénesis son evaluadas 5-15 días después usando técnicas de inmunohistoquímica . El PSCA v.4 afecta la angiogénesis, y es usado como un objetivo para propósitos de diagnóstico, pronóstico, preventivos y/o terapéuticos . Ejemplo 49: Involucramiento en las Interacciones de Proteína- 412 Proteína Las porciones de cadhesrin se han mostrado que median la interacción con otras proteínas. Usando técnicas de inmunoprecipitación así como dos sistemas de híbridos de levadura, las proteínas se identifican que se asocian con PSCA v.4. Los inmunoprecipitados de las células que expresan PSCA v.4 y células que carecen de PSCA v.4 son comparadas para las asociaciones específicas de proteína-proteína . Los estudios son realizados para confirmar el grado de asociación de PSCA v.4 con moléculas efectoras, tales como proteínas nucleares, factores de transcripción, quinasas, fosfatos, etc. Los estudios que comparan las células positivas de PSCA v.4 y negativas de PSCA v.4 así como estudios que comparan las células n estimuladas/en reposo y las células tratadas con activadores de células epiteliales, tales como citoquinas, factores de crecimiento, andrógeno y anti-integrina Ab revelan interacciones únicas . Además, las interacciones de proteína-proteína son confirmadas usando la metodología de híbrido de dos levaduras (Curr Opin Chem Biol. 1999, 3:64). Un vector que lleva una librería de proteínas fusionadas al dominio de activación de un factor de transcripción es introducido en la levadura que expresa una proteína de fusión de dominio de enlace de DNA de PSCA v.4 y una construcción reportadora. La interacción de proteina-proteina es detéctada mediante la actividad del reportador colorimétrico . La asociación especifica con moléculas efectoras y factores de transcripción dirige a un experto al modo de acción de PSCA v.4 y de esta manera identifica los objetivos terapéuticos, de pronóstico, preventivos y/o de diagnóstico para el cáncer. Este y ensayos similares también son utilizados para identificar y clasificar moléculas pequeñas que interactúan con PSCA v.4. Asi se encuentra que PSCA v.4 se asocia con proteínas y moléculas pequeñas. Por consiguiente, PSCA v.4 y estas proteínas y moléculas pequeñas son usadas para propósitos de diagnóstico, de pronóstico, preventivos y/o terapéuticos. Ejemplo 50: Involucramiento del PSCA v.4 en la comunicación de célula-célula La comunicación de célula-célula es esencial en mantener la integridad del órgano y la homeostasis, ambos de los cuales llegan a ser desrregulados durante la formación del tumor y la progresión. Basado en la presencia de una porción de cadhesrin en PSCA v.4, una porción conocida que está involucrada en la interacción de- la célula y la adhesión célula-célula, PSCA v.4 puede regular la comunicación celular. Las comunicaciones intercelulares pueden ser medidas 414 usando dos tipos de ensayos (J. Biol. Chem. 2000, 275:25207). En el primer ensayo, las células cargadas con un tinte fluorescente son incubadas en la presencia de células recipientes no marcadas y las poblaciones de célula son examinadas bajo microscopía fluorescente. Este ensayo cualitativo mide el intercambio del tinte entre células adyacentes. En el segundo sistema de ensayo, las poblaciones de células donadoras y recipientes son tratadas como antes y las mediciones cuantitativas de la población de célula recipiente son realizadas mediante el análisis FACS. Usando estos dos sistemas de ensayo, las células que expresan PSCA v.4 son comparados con los controles que no expresan PSCA v.4, y se encuentra que PSCA v.4 incrementa las comunicaciones celulares. Las moléculas pequeñas y/o anticuerpos que modulan la comunicación de célula-célula mediada por PSCA v.4 son utilizadas como terapéuticos para cánceres que expresan PSCA v.4. Cuando PSCA v.4 funciona en la comunicación de célula-célula ' y el transporte de molécula pequeña, es usado como un objetivo o marcador para propósitos de diagnóstico, de pronóstico, preventivos y/o terapéuticos . Por toda esta solicitud, varios contenidos de datos del sitio de red, publicaciones, solicitudes de patentes y patentes son . mencionadas. (Los sitios de la red son mencionados por sus direcciones de Uniform Resource Locator o 415 URL en la Red Mundial) . Las descripciones de cada una de estas referencias son incorporadas en la presente por referencia en la presente en sus totalidades. Además, esta solicitud se relaciona a la solicitud norteamericana número de serie 09/359,326, presentada el 20 de Julio de 1999; solicitud norteamericana número de serie 09/308,503, presentada el 25 de mayo de 1999; solicitud norteamericana número de serie 09/251,835 presentada el 17 de Febrero de 1999; solicitud norteamericana número de serie 09/203,939, presentada el 12 de Diciembre de 1998; solicitud norteamericana número de serie 09/038,261, presentada el 10 de Marzo de 1998; solicitud norteamericana número de serie 08/814,279, presentada el 10 de Marzo de 1997; solicitud norteamericana número de serie 60/071,141 presentada el 12 de Enero de 1998; solicitud norteamericana número de serie 60/074,675, presentada el 13 de Febrero de 1998; solicitud norteamericana número de serie 60/124,658, presentada el 16 Marzo de 1999; solicitud norteamericana número de serie 60/120,536 presentada el 17 de Febrero de 1999; y 60/113,230 presentada el 21 de Diciembre de 1998. Los contenidos de todas las solicitudes anteriores son incorporados completamente por referencia en la presente solicitud. La presente invención no va a ser limitada en el alcance por las modalidades divulgadas en la presente, que se 416 proponen como ilustraciones únicas de aspectos individuales de la invención, y cualquiera que son funcionalmente equivalentes están dentro del alcance de la invención. Varias modificaciones a los modelos y métodos de la invención, además de aquellos descritos en la presente, llegarán a ser evidentes para aquellos expertos en la técnica a partir de la descripción y las enseñanzas anteriores, y de manera similar se proponen que caen dentro del alcance de la invención. Tales modificaciones u otras modalidades pueden ser practicadas sin apartarse del alcance y espíritu verdadero de la invención .
TABLAS TABLA I: Tejidos que Expresan PSCA: a . Tejidos Malignos Próstata Páncreas Vej iga Riñon Colon Pulmón Ovario Pecho Tejidos Normales 417 TABLA. II : Abreviaciones de Aminoácidos LETRA UNICA TRES LETRAS NOMBRE COMPLETO F Phe fenilalanina L Leu leucina S Ser s'erina Y Tyr tirosina C Cys cisteina w Trp triptofano P Pro prolina H His histidina Q Gln glutamina R Arg arginina I lie isoleucina M Met metionina T Thr treonina N Asn Asparagina K Lys Lisina V Val Valina ? Ala alanina D Asp ácido aspártico E Glu ácido glutámico G Gly glicina 418 TABLA III: Matriz de Sustitución de Aminoácidos Adaptado del Software 9.0 de GCG de la matriz de sustitución de aminoácidos BLOSUM62 (matriz de sustitución de bloques) . Entre más alto es el valor, más probable se encuentra una sustitución en proteínas naturales relacionadas. (Ver la red mundial URL ikp. unibe . ch/manual/blosum62. html) A C D E F G H I K: . L M ' N ."· P Q R S T V W ¦ Y ..' 4 0 -2 -1 -2 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 1 0 0 -3 -2 A -4 -2 -3 -3 -1 -3 -1 -1 -3 -3 -3 -3 -1 -1 -1 -2 -2 C 2 -3 -1 -1 -3 -1 - -3 1 -1 0 - 0" -1 -3 -4 -3 D 5 -3 -2 0 -3 1 -3 -2 0 -1. 2 : 0. -.- o -1 -2 -3 -2 E 6 -3 -1 0 -3 Ó 0 -3 -4 -3. -3 ^2 -2 -1 1 3 F 6 -2 -4 -2 - -3 0 -2 -2 -2 :0 -2 -3 -2 -3 G 8 -3 -1 -3 -2 1 -2 0 0 -1 -2 -3 -2 2 H 4 -3 2 1 -3 -3 -3 •^3 -2 -1 3 -3 -1 I 5 -2 -1 0 -1 i 2 0 -1 -2 -3 -2 4 2 -3 -3 -2 -2 -2 -1 1 -2 -1 L 5 -2 -2 0 -i -1 -1 1 -1 -1 6 -2 0 0 1 0 -3 -4 -2 N 7 -i -2 -1 -1 -2 -4 -3 P 5 1 0 -1 -2 -2 -1 Q 5 -1 -1 -3 -3 -2 R .4 1 -2 -3 -2 S 5 0 -2 -2 T 4 -3 -1 V 11 2 W 7 Y TABLA IV: Porciones/Superporciones de HLA Clase I/II TABLA IV (A) : Superporciones/porciones de HLA Clase I 419 Los residuos en negritas son preferidos, los residuos en cursiva son menos preferidos: ün péptido se considera que lleva porción si este tiene fijadores primarios en cada posición de fijador primario para una porción o superporcion como es especificado en la tabla superior. TABLA IV (B) : Superporcion de HLA Clase II TABLA IV (C) : Porciones de HLA Clase II 420 PORCIONES . •J'fijador 1 2 3 4 5 "¡" fijador Q ~J {J .9 DR4 preferido FMYUVW M T I VSTCPAUM MH MH nocivo W R WDE DR1 preferido uy PAMQ VMATS /C M AVM nocivo C CH FD CWD GDE D DR7 preferido WUVWY M W A . IVMSACTRL M IV nocivo C G GRD N G DR3 PORCIONES 1° fijador 1 2 3 1° fijador - 5 ?° fijador 6 Porción a preferida UVMFY D Porción b preferida UVMFAY DNQEST KRH QJ¾ Superporción WUVWY VMSTACPU Los residuos en cursiva indican residuos menos preferidos o "tolerados" TABLA IV (D) : Superporciones de HLA Clase I Los residuos en cursiva indican residuos menos preferidos "tolerados" TABLA IV (E) : Porciones de HLA Clase I 421 1 2 3 4 5 6 7 8 9 C- 0 ¿[ GFY DEA YFW P DEQ YFW 9-mer STM Y DE RHKUVMP A G A Pfi GRH ASTCUVM 1 GSTC ASTC LIVM DE 9-mer DEAS Y A RHKDEPYFW DE PON RHK PG ' GP \ YFW 1 DEAQN A YFWQN PASTC GDE P 1 10- STM Y mer GP RHKGUVM DE RHK QNA RHKYFW RHK A fl¡¿\ YFW STCUVM *j A YFW PG G YFW 1 10- DEAS Y mer RHK RHKDEPYFW P G PRHK QN A2.1 YFW YFW STC YFW A P ? 9-mer IMIVQAT WMAT DEP DERKH RKH DERKH 1 2 3 4 5 6 7 8 9 c- A2.1 AYFW LVIM G G FYWL ? 10- LM/VQAT ViM WMAT mer DEP DE RKHA P RKH DERKHRKH RHK 1 Y \ft/ PRHKYF A YFW P LMVISATFCGD W KYRHFA DEP DE A YFVtf YFW A YFW YFW P 1 mer GDE Q RHK DE A QN DEA A3101Preferida RHK 1 YFW P YFW YFW AP ? MVTAUS RK DEP DE ADE DE DE DE ¦j YFW AYFW MVALF/ST RK GP DE YFWSTC "J YFWUV YFW P *J AVJMSU RK GP DEG RHK A B0702Preferida RHKFWY 1 ¡Í dor RHK RHK RHK RHK PA ? LMFWYAI 422 1 2 3 4 ' 6 6 7 8 9 C- GFYW 1 DEA YFW P DEQN YFW 1 9-mer STM Y DE RHKLIVMP A G A A*| GRHK ASTCLIV ¦j GSTC ASTC UVM DE 9-mer DEAS Y A HKDEPYFW DE PQN RHK PG GP DEQ P DEP DE DE GDE Q DE B3501Pceferida F YLIV l FWY FWY P LMFWYW A AGP G G B51 UV F Y ei or FWY STC FWY G FWY P. UWWYA M AGPDER DE G DEQN GDE HKSTC B5301 LM1FWY 1 FWY STC FWY UVMFWYFWY "f P I FWYAL V AGPQN G RHKQ DE B5401 R/Vy 1 FWYLIVM UV AUVM FWYA 1 P P ATiVÍJWF WY GPQNDE GDESTC RHKDE DE Q DGE DE TABLA IV (F) : Resumen de supertipos de HLA Frecuencias fenotipicas globales de los supertipos de HLA en diferentes poblaciones étnicas Especificidad Frecuencia fenotipica Supertipo Posición 2 C- Caucásico Negro Japonés Chino Hispánico Promedio Terminal N.A. B7 P AILMVFWY 43.2 55.1 57.1 43.0 49.3 49.5 A3 AILMVST R 37.5 42.1 45.8 52.7 43.1 44.2 A2 AILMVT AILMVT 45.8 39.0 42.4 45.9 43.0 42.2 A2 YF(WIVLMT) FI (YWLM) 23.9 38.9 58.6 40.1 38.3 40.0 423 TABLA IV (G) : Cobertura de población calculada, dada por diferentes combinaciones de supertipo de HLA Supertipos de HLA Frecuencia fenotip Las porciones indican los residuos que definen especificidades de supertipo. Las porciones incorporan residuos determinados en la base de los datos publicados que son conocidos por múltiples alelos dentro del supertipo. Los residuos dentro del corchete son residuos adicionales que también se predicen que son tolerados por múltiples alelos dentro del supertipo . 424 Tabla V: Porciones que Ocurren Frecuentemente Nombre % de identidad Descripción Función Potencial promedio zf-C2H2 34% Extensión de Zinc, tipo La proteina que C2H2 enlaza el ácido nucleico funciona como el factor de transcripción, probable localización nuclear citocromo_b_N 68% Citocromo Oxidasa enlazada a b (N.terminal)b6/petB la membrana, genera superóxido ig 19% dominio de Los dominios son de inmunoglobulina cien aminoácidos de largo e incluyen un enlace de disulfuro de intradominio conservado.
WD40 18% Dominio WD, repetición Las repeticiones en G-beta tándem de aproximadamente 40 residuos, cada uno que contiene una porción de Trp-As . 425 Función en la traducción de las señales e interacción de la proteina PDZ 23% Dominio de PDZ Puede funcionar en dirigir las moléculas de señalización a los sitios de sub- membranas LRR 28% Repetición Rica en Porciones de Leucina secuencia corta implicadas en las interacciones de proteina-proteina Pquinasa 23% Dominio de quinasa de Núcleo catalítico proteina conservado común a tanto la serina/trionina y las quinasas de proteina de tirosina que contienen un sitio de enlace de ATP y un sitio 426 ctalitico PH 16% Dominio de H Homología de pleckstrin implicada en la señalización extracelular o como constituyentes del citoesqueleto EGF 34% Dominio similar a EGF Longitud de 30-40 aminoácidos encontrada en el dominio extracelular de las proteínas enlazadas a membrana o en proteínas secretadas Rvt 49% Transcriptasa inversa (polimerasa de DNa dependiente de RNA) Ank 25% Repetición Ank Proteína citoplásmica, asocia las proteínas de membrana integral al citoesqueleto Oxidored ql 32% NADH- Membrana asociada. ubicuinona/plastoquinona Implicada en la 427 (comple o I) , varias translocalización de cadenas un protón a través de la membrana Efhand 24% EF hand Dominio de enlace de calcio, consiste de una espiral de 12 residuos flanqueada en ambos lados por un dominio alfa- helicoidal de 12 residuos . Rvp 79% Aspartil proteasa Aspartil o ácido retroviral proteasas, centrada en un residuo de aspartilo catalítico Colágeno 42% Repetición de triple Proteínas hélice de colágeno (20 estructurales copias) extracelulares implicadas en la formación del tejido conectivo . La secuencia consiste de G-X-Y y las cadenas de polipéptido forman 428 Tabla VI: Modificaciones post-traduccionales de PSCA v.4 Sitio de N-glicosilación 429 91-94 NASL (SEQ ID NO: 147) Fosforilación de la quinasa de proteina dependiente de cAMP cG P 10-13 RRTS (SEQ ID NO:148) Sitio de fosforilación de la quinasa C de proteina 2-4 THR 12-14 TSR 35-37 SLR 51-53 SYR Sitio de N-miristoilación 120-125 GSIDTD (SEQ ID NO: 149) Región rica en prolina 18-134 Tabla VII: Péptidos de Búsqueda variante m 1-123: 9-merSj 10-mers, 15-mers (SEQ ID N0:150) MKAVLLALLtí AGIALQPGTA LLCYSCKaQV SNEDCLQVEN CTQLGEQCWT ARIRA.VGLLT 60 VISKGCSLNC VDDSQDYYVG KKNITCCDTD LCNASGAHAL QPAAAILALL PALGLLLWGP 120 GQL 123 vA aa 1-189: 9-mers, 10-mers, 15-mers (SEQ ID NO:151) MTHRTTrWSR RTSRAVTPTC AIPAGPMPCS.RLPPSLRCSL HSACCSGDPA SYRI.WGAPBQ 60 PTLGWPQAS VPLLTHPAQW EPVLVPEAHP NASLTMYVCÁ PVPHPDPPMA LSRTPTRQIG 120 SIDTDPPADG PSNPLCCCFH GPAFSTLNPV LRHLFPQEAF PAHPIYDLSQ VWSWSPAPS 180 RGQALERAR 189 PSCAv.19 9- mers aa 25-41 GPMPCSRLLPSLRCSLH (SEQ ID NQ:152) 10- mers aa24-42 AGPMPCSRLLPSLRCSLHS (SEQ ID NO:153) 15-mers aa 19-47 TCATPAGPMPCSRLLPSLRCSLHSACCSG (SEQ ID N0:154) 430 PSCAv.20 9- mersaa 44-60 CCSGDPASSRLWGAPLQ (SEQID O: 55) 10- mersaa 43-61 ACCSGDPASSRLWGAPLQP [SEQ ID NO:156) 15-mersaa 38-66 CSLHSACCSGDPASSRLWGAPLQPTLGW (SEQ !D NCH57) PSCAv.21 9- mers aa 68-84 QASVPLLTDPAQWEPVL (SEQID NO:158) 10- mersaa 67-85 PQASVPLLTDPAQWEPVLV (SEQ ID N0.159) 15-mersaa 62-90 TLGWPO SVPLLTDPAQWEPVLVPEAHP (SEQ ID NO.160) PSCAvM/22 9- mersaa 69-84 ASVPLLTDLAQWEPVL (SEQ iD NO:161) 10- mersaa 68-85 QASVPLLTDIAQWEPVLV (SEQ1DN0:162) 15-mersaa 63-90 LGWPQASVPLLTDLAQWEPVLVPEAHP (SEQ ID N0.163) PSCAv.22 9- mersaa 69-85 ASVPLLTHIiAQWEPVLV (SEQID NO:164) 10- mersaa 68-86 QASVPILTHLAQ EPVLVP (SEQ ID NO: 165) 15-mers aa 63-91 LGWPQASVPLLIHLAQ EPVLVPEAHPN (SEQ !D NO:166) PSCAv.24 9-mersaa92-108 ASLTMYVCTPVPHPDP (SEQ ID NO:1S7) 10-mersaa 91-109 NASLTMYVCTPVPHPDPPM (SEQ ID NO:168) 15-mersaa 96-114 PEAHPNASLT YVCTPVPHPDPPMALSRT (SEQ ID N0.169) PSCAv.25 9- mersaa 112-128 SRTPTRQISSIDTDPPA (SEQ ID NO:170) 10- mersaa 111-129 LSRTPTRQISSIDTDPPAD (SEQ ID N .171) 15-mersaa 106-134 DPPMALSRTPTRQISSIDTDPPADGPSNP (SEQ ID NO:172) 431 PSCAv.25/26 9- mers aa 27-128 TPTRQISSSDTDPPA (SEQ ID NO:173) 10- mers aa 26-129 RTPTRQISSSDTDPPAD (SEQ !D NO:174) 15-mers aa 108-134 PMñLSRTPTRQISSSDTDPPADGPSNP (SEQ !D NO:175) PSCAv.26 9-mersaa 114-130 TPTRQIGSSDTDPPADG (SEQ ID NO:176) 10- mers aa 113-131 RTPTRQIGSSDTDPPADGP (SEQ ID NO:177) 15-mers aa 108-136 PMALSRTPTRQIGSSDTDPPADGPSNPLC (SEQ ID NQ178) PSCAv.27 9?ners aa 181-189 RGQALRRAQ (SEQ iD NO:179) 10-mers aa 180-189 SRGQ&IiRRAQ (SEQ ID NO:180) 15-mers aa 175-189 VSPAPSRGQALRRAQ {SEQ ID Nai8 ) Tablas VIII-XXI : TABLA VIII-VI-HLA-Al-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo o final para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 70 CVDDSQDYY 25.000 88 DTDLCNASG 2.500 44 LGEQCWTAR 2.250 74 SQDYYVGKK 1.500 37 QVENCTQLG 0.900 16 QPGTALLCY 0.625 432 73 DSQDYYVGK 0.600 69 NCVDDSQDY 0.500 86 CCDTDLCNA 0.500 56 VGLLTVISK 0.250 99 ALQPAAAIL 0.200 14 ALQPGTALL 0.200 19 TALLCYSCK 0.200 108 ALLPALGLL 0.100 30 VSNEDCLQV 0.075 85 TCCDTDLCN 0.050 107 LALLPALGL 0.050 2 KAVLLALLM 0.050 3 AVLLALLMA 0.050 104 AAILALLPA 0.050 71 VDDSQDYYV 0.050 18 GTALLCYSC 0.050 4 VLLALLMAG 0.050 32 NEDCLQVEN 0.050 7 ALLMAGLAL 0.050 109 LLPALGLLL 0.050 84 ITCCDTDLC 0.025 41 CTQLGEQCW 0.025 59 LTVISKGCS 0.025 31 SNEDCLQVE 0.022 433 22 LCYSCKAQV 0.020 106 ILALLPALG 0.020 8 LLMAGLALQ 0.020 TABLA VIII-V1-HLA-A1-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 91 LCNASGAHA 0.020 5 LLALLMAGL 0.020 98 HALQPAAAI 0.020 105 AILALLPAL 0.020 96 GAHALQPAA 0.020 93 NASGAHALQ ?.020 55 AVGLL VIS 0.020 114 GLLLWGPGQ 0.020 66 CSLNCVDDS 0.015 46 EQCWTARIR 0.015 101 QPAAAILAL 0.013 110 LPALGLLLW 0.013 58 LLTVISKGC 0.010 115 LLLWGPGQL 0.010 434 TABLA VIII-Vl-HLA-Al- MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es 435 la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 94 ASGAHALQP 0.007 100 LQPAAAILA 0.007 5 LQPGTALLC 0.007 47 QCWTARIRA 0.005 52 RIRAVGLLT 0.005 78 YVGKKNITC 0.005 111 PALGLL1WG 0.005 11 AGALQPGT 0.005 49 WTARIRAVG 0.005 103 AAAILALLP 0.005 24 YSCKAQVSN 0.003 39 ENCTQLGEQ 0.003 113 LGLLLWGPG 0.003 95 SGAHALQPA 0.003 9 LMAGLALQP 0.003 92 CNASGAHAL 0.003 53 IRAVGLLLTV 0.003 50 TARIRAVGL 0.002 102 PAAAILALL 0.002 65 GCSLNCVDD 0.002 42 TQLGEQCWT 0.002 28 AQVSNEDCL 0.002 436 TABLA VIII-V1-HLA-A1-9MERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos , y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 89 TDLCNASGA 0.001 TABLA VI11-V4-HLA-Al-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 437 INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 158 EAFPAHPIY 10.000 46 SGDPASYRL 2.500 104 HPDPPMALS 2.500 123 DTDPPADGP 1.250 44 CCSGDPASY 1.000 144 FSTLNPVLR 0.300 85 VPEAHPNAS 0.225 109 MALSRTPTR 0.200 136 CCCFHGPAF 0.200 173 SVVSPAPSR 0.200 131 PNSPLCCCF 0.150 45 CSGDPASYR 0.150 89 HPNASLTMY 0.125 21 ATPAGPMPC 0.125 13 RTPTRQIGS 0.125 145 STLNPVLRHl 0.125 83 VLVPEAHPN 0.100 31 RLPPSLRCS 0.100 87 EAHPNASLT 0.100 23 PAGPMPCSR 0.100 146 TLNPVLRHL 0.100 174 VVSPAPSRG 0.100 121 SIDTDPPAD 0.100 438 79 QWEPVLVPE 0.090 165 IYDLSQVWS 0.050 94 LTMYVCAPV 0.050 TABLA VIII—V4-HLA-A1- MER3-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 127 PADGPSNPL 0.050 102 VPHPDPPMA 0.050 55 WGAPLQPTL 0.050 68 QASVPLLTH 0'.050 120 GSIDTDPPA 0.030 92 ASLTMYVCA 0.030 168 LSQVWSWS 0.030 172 WSWSPAPS 0.030 105 PDPPMALSR 0.025 30 SRLPPSLRC 0.025 147 LNPVLRHLF 0.025 181 RGQALRRAR 0.025 176 SPAPSRGQA 0.025 16 VTPTCATPA 0.025 439 TABLA VIII—V4-HLA-Al-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición 440 de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 161 PAHPIYDLS 0.010 3 H TTTWARR 0.010 42 SACCSGDPA 0.010 19 TCATPAGPM 0.010 58 PLQPTLGW 0.010 14. RAVTPTCAT 0.010 64 GVVPQASVP 0.010 135 1CCCFHGPA 0.010 128 ADGPSNPLC 0.010 98 VCAPVPHPD 0.010 56 GAPLQPTLG 0.10 62 TLGVVPQAS 0.010 167 DLSQV SVV 0.010 39 SLHSACCSG 0.010 70 SVPLLTHPA 0.010 179 PSRGQALRR 0.008 66 VPQASVPLL 0.005 124 TDPPADGPS 0.005 139 FHGPAFSTL 0.005 63 LGVVPQASV 0.005 441 125 DPPADGPSN 0.005 22 TPAGPMPCS 0.005 76 HPAQWEPVL 0.005 17 TPTCATPAG 0.005 112 SRTPTRQIG 0.005 71 VPLLTHPAQ 0.005 160 FPAHPIYDL 0.005 152 RHLFPQEAF 0.005 60 QPTLGVVPQ 0.005 178 APSRGQALR 0.005 27 MPCSRLPPS 0.005 155 FPQEAFPAH 0.005 61 PTLGVVPQA 0.005 12 TSRAVTPTC 0.003 156 PQEAFPAHP 0.003 TABLA VIII—V4-HLA-A1-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 24 AGPMPCSRL 0.003 138 CFHGPAFST 0.003 442 TABLA VIII-V20-HLA-A1-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 443 TABLA VIII-V21-HLA-Al- MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos , y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 7 LTDPAQWEP 1.250 2 ASVPLLTDP 0.015 444 TABLA VIII-V21&22-HLA-Al-9MERS- SCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición dé extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 445 TABLA VIII—V24-HLA-A1-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 446 TABLA VIII—V25-HLA-A1-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 447 2 RTPTRQISS 0.125 9 SSIDTDPPA 0.030 1 SRTPTRQIS 0.005 5 TRQISSIDT 0.003 8 ISSIDTDPP 0.002 7 QISSIDTDP 0.001 3 TPTRQISSI 0.000 6 RQISSIDTD 0.000 4 PTRQISSID 0.000 TABLA VI11-V25 &26-HLA-A1—9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 7 SSSDTDPPA 0.030 6 ISSSDTDPP 0.002 5 QWISSSDTDP 0.001 3 TRQISSSDT 0.001 1 TPTRQISSS 0.000 4 RQISSSDTD 0.000 2 PTRQISSSD 0.000 448 TABLA VIII V27-HLA-A1— MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos , y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 2 RGQALRRAQ 0.003 1 SRGQALRRA 0.001 449 TABLA IX-V1-HLA-A1-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 18 GTALLCYSCK 0.500 69 NCVDDSQDYY 0.500 31 NCVDDSQDYY 0.450 44 LGEQCWTARI 0.450 37 QVENCTQLGE 0.450 450 15 LQPGTALLCY 0.375 73 DSQDYYVGKK 0.300 84 ITCCDTDLCN 0.125 68 LNCVDDSQDY 0.125 43 QLGEQCWTAR 0.100 74 SQDYYVGKKN ' 0.075 29 QVSNEDCLQV 0.050 3 AVLLALLMAG 0.050 103 AAAILALLPA 0.050 109 LLPALGLLLW 0.050 6 LALLMAGLAL 0.050 2 KAVLLALLMA 0.050 106 ILALLPALGL 0.050 71 VDDSQDYYVG 0.050 41 CTQLGEQCWT 0.025 32 NEDCLQVENC 0.025 59 LTVISKGCSL 0.025 4 VLLALLMAGL ?.020 72 DDSQDYYVGK 0.020 10 MAGLALQPGT 0.020 104 AAILALLPAL 0.020 21 LLCYSCKAQV 0.020 96 GAHALQPAAA 0.020 105 AILALLPALG 0.020 451 90 DLCNASGAHA 0.020 13 LALQPGTALL 0.020 98 HALQPAAAIL 0.020 7 ALLMAGLALQ 0.020 54 RAVGLLTVIS 0.020 94 ASGAHALQPA 0.015 TABLA IX-VI-HLA-A1-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 66 CSLNCVDDSQ 0.015 110 LPALGLLLWG 0.013 12 GLALQPGTAL 0.010 85 TCCDTDLCNA 0.010 20 ALLCYSCKAQ 0.010 22 LCYSCKAQVS 0.010 5 LLALLMAGLA 0.010 35 CLQVENCTQL 0.010 58 LLTVISKGCS 0.010 19 TALLCYSCKA 0.010 60 TVISKGCSLN 0.010 452 34 DCLQVENCTQ 0.010 114 GLLLWGPGQL 0.010 27 KAQVSNEDCL 0.010 112 ALGLLLWGPG 0.010 107 LALLPALGLL 0.010 65 GCSLNCVDDS 0.010 91 LCNASGAHAL 0.010 40 NCTQLGEQCW 0.010 57 GLLTVISKGC 0.010 83 NITCCDTDLC 0.010 46 EQCWTARIRA 0.007 100 LQPAAAILAL 0.007 61 VISKGCSLNC 0.005 92 CNASGAHALQ 0.005 95 SGAHALQPAA 0.005 45 GEQCWTARIR 0.005 52 RIRAVGLLTV 0.005 113 LGLLLWGPGQ 0.005 93 NASGAHALQP 0.005 49 WTARIRAVGL 0.005 8 LLMAGLALQP 0.005 9 LMAGLALQPG 0.005 101 QPAAAILALL 0.005 77 YYVGKKNITC 0.003 453 TABLA IX-V1-HLA-A1-10MERS^PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 82 KNITCCDTDL 0.003 11 AGLALQPGTA 0.003 16 QPGTALLCYS 0.003 1 MKAVLLALLM 0.003 56 VGLLTVISKG 0.003 39 ENCTQLGEQC 0.003 62 ISKGCSLNCV 0.002 30 VSNEDCLQVE 0.002 28 AQVSNEDCLQ 0.002 36 LQVENCTQLG 0.002 42 TQLGEQCWTA 0.002 48 C TARIRAVG 0.001 67 SLNCVDDSQD 0.001 78 YVGKKNITCC 0.001 87 CDTDLCNASG 0.001 97 AHALQPAAAI 0.001 47 QCWTARIRAV 0.001 23 CYSCKAQVSN 0.001 454 TABLA IX-V4-HLA-A1-10MERS--PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 121 SIDTDPPADG 1.000 146 TLNPVLRHLF 1.000 455 79 QWEPVLVPEA 0.900 20 CATPAGPMPC 0.500 87 EAHPNASLTM 0.500 153 HLFPQEAFPA 0.500 85 VPEAHPNASL 0.450 172 WSVVSPAPSR 0.300 5 TTTWARRTSR 0.250 74 LTHPAQWEPV 0.250 135 LCCCFHGPAF 0.200 64 G VPQASVPL 0.200 83 VLVPEAHPNA 0.200 69 ASVPLLTHPA 0.150 102 VPHPDPPMAL 0.125 31 RLPPSLRCSL 0.100 127 PADGPSNPLC 0.100 44 CCSGDPASYR 0.100 174 VVSPAPSRGQ 0.100 15 AVTPTCATPA 0.100 144 FSTLNPVLRH 0.075 157 QEAFPAHPIY 0.050 21 ATPAGPMPCS 0.050 158 EAFPAHPIYD 0.050 16 VTPTCATPAG 0.050 100 APVPHPDPPM 0.050 456 137 CCFHGPAFST 0.050 56 GAPLQPTLGV 0.050 161 PAHPIYDLSQ 0.050 45 CSGDPASYRL 0.030 88 AHPNASLT Y 0.025 145 STLNPVLRHL 0.025 4 RTTTWARRTS 0.025 130 GPSNPLCCCF 0.025 165 IYDLSQVWSV 0.025 TABLA IX-V4-HLA-A1—10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 1 MTHRTTTWAR 0.025 22 TPAGPMPCSR 0.025 113 RTPTRQIGSI 0.025 128 ADGPSNPLCC 0.025 175 SPAPSRGQAL 0.025 112 SRTPTRQIGS 0.025 55 WGAPLQPTLG - 0.025 42 SACCSGDPAS 0.020 457 167 DLSQVWSVVS 0.020 91 NASLTMYVCA 0.020 98 VCAPVPHPDP 0.020 136 CCCFHGPAFS 0.020 65 VVPQASVPLL 0.020 62 TLGVVPQASV 0.020 93 SLTMYVCAPV 0.020 177 PAPSRGQALR 0.020 70 SVPLLTHPAQ 0.020 131 PSNPLCCCFH 0.015 175 VSPAPSRGQA 0.015 38 CSLHSACCSG 0.015 41 HSACCSGDPA 0.015 156 PQEAFPAHPI 0.013 66 VPQASVPLLT 0.013 89 HPNASLTMYV 0.013 25 GPMPCSRLPP 0.013 132 SNPLCCCFHG 0.013 148 NPVLRHLFPQ 0.013 178 APSRGQALRR 0.013 37 RCSLHSACCS 0.010 95 TMYVCAPVPH 0.010 23 PAGPMPCSRL 0.010 84 LVPEAHPNAS 0.010 458 173 SVVSPAPSRG 0.010 143 AFSTLNPVLR 0.010 108 PMALSRTPTR 0.010 TABLA IX-V4-HLA-A1-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 124 TDPPADGPSN 0.010 109 MALSRTPTRQ 0.010 29 CSRLPPSLRC 0.008 76 HPAQWEPVLV 0.005 94 LTMYVCAPVP 0.005 119 IGSIDTDPPA 0.005 180 SRGQALRRAR 0.005 139 FHGPAFSTLN 0.005 11 RTSRAVTPTC 0.005 60 QPTLGVVPQA 0.005 27 MPCSRT.PPSL 0.005 71 VPLLTHPAQW 0.005 151 LRHLFPQEAF 0.005 30 SRLPPSLRCS 0.005 459 TABLA IX-V19-HLA-A1-10MERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos , y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO TAPJ.A IX-V19-HLA-A1-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve 460 INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 8 RLLPSLRCSL 0.100 10 LPSLRCSLHS 0.013 2 GPMPCSRLLP 0.013 9 LLPSLRCSLH 0.010 6 CSRLLPSLRC 0.008 4 MPCSRLLPSL 0.005 1 AGPMPCSRLL 0.003 3 PMPCSRLLPS 0.003 5 PCSRLLPSLR 0.001 7 SRLLPSLRCS 0.001 TABLA IX-V20-HLA-A1-1OMERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 4 SGDPASSRLW 1.250 2 CCSGDPASSR 0.100 1 ACCSGDPASS 0.020 3 CSGDPASSRL 0.015 8 ASSRLWGAPL 0.003 9 SSRLWGAPLQ 0.003 461 TABLA IX-V21&22-HLA-A1-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición 462 TABLA IX-V22-HLA-A1-10MERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 2 ASVPL1THLA 0.150 TABLA IX-V22-HLA-A1-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 463 TABLA IX-V24-HLA-A1-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 10 TPVPHPDPPM 0.050 1 NASLTMYVCT 0.020 8 VCTPVPHPDP 0.020 5 TMYVCTPVPH 0.010 3 SLTMYVCTPV 0.010 464 TABLA IX-V25&26-HLA-A1-10MERS-PSCA 465 TABLA IX-V26-HLA-A1-10MERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 9 SSDTDPPADG 1.500 1 RTPTRQIGSS 0.025 7 IGSSDTDPPA 0.005 466 TABLA IX-V27-HLA-Al-10 ERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 2 SRGQALRRAQ 0.001 1 PSRGQALRRA 0.000 TABLA X-VI-HLA-A0201- MERS-PSCA 467 TARTiA X-V1-HLA-A0201-9 ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 42 TQLGEQCWT 15.375 36 LQVENCTQL 15.096 99 ALQPAAAIL 8.759 58 LLTVISKGC 8.446 468 3 AVLLALLMA 3.699 30 VSNEDCLQV 3.165 83 NITCCDTDL 2.937 22 LCYSCK7AQV 2.470 78 YVGKKNITC 2.000 60 TVISKGCSL 1.869 107 LALLPALGL 1.866 13 LALQPGTAL 1.866 4 VLLALLMAG 1.078 28 AQVSNEDCL 1.061 15 LOPGTALLC 0.856 100 LQPAAAILA 0.856 12 GLALQPGTA 0.646 57 GLL ISKG 0.634 71 VDDSQDYYV 0.361 101 QPAAAILAL 0.321 47 QCWTARIRA 0.269 112 ALGLLLWGP 0.257 2 KAVLLALL 0.242 63 SKGCSLNCV 0.222 8 LLMAGLALQ 0.216 45 GEQCWTARI 0.203 11 AGLALQPGT 0.180 104 AAILALLPA 0.159 469 92 CNASGAHAL 0.139 54 RAVGLLTVI 0.137 106 ILALLPALG 0.127 27 AQVSNEDC 0.118 1 MKAVLLALL 0.116 52 RIRAVGLLT 0.078 95 SGAHALOPA 0.075 TABLA X-VI-HLA-A0201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 18 GTALLCYSC 0.069 96 GAHALQPAA 0.069 84 ITCCDTDLC 0.057 6 LALLMAGLA 0.056 114 GLLLWGPGQ 0.055 91 LCNASGAHA 0.055 53 IRAVGLLTV 0.038 81 KKNITCCDT 0.036 86 CCDTDLCNA 0.030 70 CVDDSQDYY 0.029 470 89 TDLCNASGA 0.026 21 LLCYSCKAQ 0.025 50 TARIRAVGL 0.023 9 LMAGLALQP 0.018 98 HALQPAAAI 0.018 61 VISKGCSLN 0.017 40 NCTQLGEQC 0.016 102 PAAAILALL 0.015 35 CLQVENCTO 0.015 34 DCLQVENCT 0.013 67 SLNCVDDSQ 0.007 48 CQTARIRAV 0.004 79 VGKKNITCC 0.004 10 MAGLALQPG 0.004 97 AHALQPAAA 0.003 55 AVGLLTVIS 0.003 24 YSCKAQVSN 0.002 66 CSLNCVDDS 0.002 85 TCCDTDLCN 0.002. 69 NCVDDSQDY 0.002 49 WTARIRAVG 0.002 77 YYVGKKNIT 0.002 62 ISKGCSLNC 0.002 110 LPALGLLLW 0.002 471 56 VGLL VISK 0.001 TABLA X-V1-HLA-A0201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 29 QVSNEDCLQ 0.001 19 TALLCYSCK 0.001 16 QPGTALLCY 0.001 111 PALGLLLWG 0.001 41 CTQLGEQCW 0.001 51 ARIRAVGLL 0.001 90 DLCNASGAH 0.001 113 LGLLLWGPG 0.001 33 EDCLQVENC 0.001 32 NEDCLQVEN 0.001 38 VENCTQLGE 0.000 87 CDTDLCNAS 0.000 37 QVENCTQLG 0.000 76 DYYVGKKNI 0.000 75 QDYYVGKKN 0.000 59 LTVISKGCS 0.000 103 AAAILALLP 0.000 472 TABLA X-V4-HLA-AO201-9MERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 84 LVPEAHPNA 3.030 473 57 APLQPTLGV 1.680 160 FPAHPIYDL 1.475 80 WEPVLVPE 1.022 35 SLRCSLHSA 0.868 63 LGWPQASV 0.772 1 MTHRTTTWA 0.645 55 WGAPLQPTL 0.641 66 VPQASVPLL 0.545 70 SVPLLTHPA 0.435 11 RTSRAVTPT 0.238 32 LPPSLRCSL 0.237 157 QEAFPAHPI 0.203 58 PLQPTLGVV 0.188 142 PAFSTLNPV 0.181 92 ASLTMYVCA 0.180 24 AGPMPCSRL 0.139 73 LLTHPAQWE 0.139 120 GSIDTDPPA 0.133 139 GHGPAFSTL 0.130 83 VLVPEAHPN 0.127 53 RLWGAPLQP 0.124 108 PMALSRTPT 0.118 16 VTPTCATPA 0.117 14 RAVTPTCAT 0.104 474 130 GPSNPLCCC 0.075 62 TLGVVPQAS 0.075 39 SLHSACCSG 0.075 21 A PAGPMPC 0.069 8 WARRTSRAV 0.068 91 NASLTMYVC 0.065 46 SGDPASYRL 0.056 102 VPHPDPPMA 0.055 90 PNASLTMYV 0.055 78 AQWEPVLVP 0.048 TABLA X-V4-HLA-A0201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 75 THPAQWEPV 0.040 163 HPIYDLSQV . 0.036 93 SLTMYVCAP 0.034 31 RLPPSLRCS 0.034 154 LFPQEAFPA 0.034 42 SACCSGDPA 0.034 37 RCSLHSACC 0.032 475 138 CFHGPAFST 0.030 135 LCCCFHGPA 0.027 49 PASYRLWGA 0.026 77 PAQWEPVLV 0.021 4 RTTTWARRT 0.021 114 TPTRQIGSI 0.020 155 FPQEAFPAH 0.017 67 PQASVPLLT 0.017 110 ALSRTPTRQ 0.015 95 TMYVCAPVP 0.014 97 YVCAPVPHP 0.014 61 PTLGVVPQA 0.013 174 VVSPAPSRG 0.011 133 NPLCCCFHG 0.010 153 HLFPQEAFP 0.010 137 CCFHGPAFS 0.010 101 PVPHPDPPM 0.010 86 PEAHPNASL 0.009 145 STLNPVLRH 0.009 106 DPPMALSRT 0.008 87 EAHPNASLT 0.008 128 ADGPSNPLC 0.007 177 PAPSRGQAL 0.007 143 AFSTLNPVL 0.006 476 72 PLLTHPAQW 0.006 151 LRHLFPQEA 0.004 176 SPAPSRGQA 0.004 19 TCATPAGPM 0.004 TABLA X-V4-HLA-A021-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SOBSECÜENCIA REGISTRO 54 LWGAPLQPT 0.004 150 VLRHLFPQE 0.004 169 SQVWSVVSP 0.003 88 AHPNASLTM 0.003 28 PCSRLPPSL 0.003 132 SNPLCCCFH 0.003 74 LTHPAQWEP 0.003 127 PADGPSNPL 0.003 30 SRLPPSLRC 0.003 12 TSRAVTPTC 0.002 129 DGPSNPLCC 0.002 68 QASVPLLTH 0.002 172 WSWSPAPS 0.002 477 TABLA X-V19-HLA-A0201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición 478 TABLA X-V20-HLA- 0201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 3 SGDPASSRL 0.056 6 PASSRLWGA 0.026 8 SSRLWGAPL 0.011 1 CCSGDPASS 0.000 2 CSGDPASSR 0.000 5 DPASSRLWG 0.000 7 ASSRLWGAP 0.000 4 GDPASSRLW 0.000 479 SRLWGAPLQ 0.000 TABLA X-V21-HPA-A0201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 6 .LLTDPAQWE 0.571 3 SVPLLTDPA 0.213 8 TDPAQWEPV 0.080 TABLA X-V21-HLA-A0201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SüBSECUENCIA REGISTRO 5 PLLTDPAQW 0.006 9 DPAQWEPVL 0.004 7 LTDPAQWEP 0.001 4 VPLLTDPAQ 0.001 1 QASVPLLTD 0.000 2 ASVPLLTDP 0.000 480 TABLA X-V22-HLA-A0201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 9 LAQWEPVLV 1.642 2 SVPLLTHLA 0.435 1 ASVPLLTHL 0.321 8 HLAQWEPVL 0.298 481 TABLA X-V24-HLA-A0201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 3 LTMYVCTPV 6.076 1 ASLTMYVCT 0.270 2 SLTMYVCTP 0.034 4 TMYVCTPVP 0.014 6 YVCTPVPHP 0.014 8 CTPVPHPDP 0.000 7 VCTPVPHPD 0.000 482 MYVCTPVPH 0.000 TABLA X-V25-HLA-AO201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 3 TPTRQISSI 0.157 9 SSIDTDPPA 0.133 7 QISSIDTDP 0.002 6 RQISSIDTD 0.002 5 TRQISSIDT 0.001 TABLA X-V25-HLA-A0201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 2 RTPTRQISS 0.001 8 ISSIDTDPP 0.000 1 SRTPTRQIS 0.000 4 PTRQISSID 0.000 483 TABLA X-V26-HLA-AO201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 7 GSSDTDPPA 0.133 5 Q1GSSDTDP 0.002 3 TRQIGSSDT 0.001 4 RQIGSSDTD 0.001 9 SDTDPPADG 0.000 484 TABLA X-V27-HLA-A0201-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 1 SRGQALRRA 0.000 2 RGQALRRAQ 0.000 TABLA XI-VI-HLA-A0201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es 485 la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 4 VLLALLMAGL 309.050 21 LLCYSCKAQV 118.238 108 ALLPALGLLL 79.041 70 CVDDSQDYYV 54.894 106 ILALLPALGL 36.316 35 CLQVENCTQL 21.362 12 GLALQPGTAL 21.362 57 GLLTVISKGC 18.382 42 TQLGEQCWTA 13.978 114 GLLLWGPGQL 10.275 100 LQPAAAILAL 8.469 29 QVSNEDCLQV 6.086 99 ALQPAAAILA 4.968 14 ALQPGTALLC 4.968 TABLA XI-V1-HLA-A0201-10 ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 78 YVGKKNITCC 4.599 486 6 LALLMAGLAL 1.866 13 LALQPGTALL 1.866 47 QCWTARIRAV 1.733 52 RIRAVGLLTV 1.672 49 TARIRAVGL 1.365 61 VISKGCSLNC 1.161 5 LLALLMAGLA 1.098 104 AAILALLPAL 0.682 41 CTQLGEQCWT 0.569 107 LALLPALGLL 0.558 2 KAVLLALLMA 0.555 27 KAQVSNEDCL 0.509 59 LTVISKGCSL 0.504 82 KNITCCDTDL 0.488 90 DLCNASGAHA 0.373 83 NITCCDTDLC 0.335 101 QPAAAILALL 0.321 85 TCCDTDLCNA 0.306 109 LLPALGLLLW 0.291 19 TALLCYSCKA 0.255 91 LCNASGAHAL 0.237 9 L AGLALQPG 0.210 10 MAGLALQPGT 0.176 103 AAAILALLPA 0.159 487 7 ALLMAGLALQ 0.127 43 QLGEQCWTAR 0.104 8 LLMAGLALQP 0.094 94 ASGAHALQPA 0.075 96 GAHALQPAAA 0.069 62 ISKGCSLNCV 0.062 3 AVLLALLMAG 0.055 20 ALLCYSCKAQ 0.055 36 LQVENCTQLG 0.053 75 QDYYVGKKNI 0.046 TABLA XI-V1-HLA-A0201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 32 NEDCLQVENC 0.044 105 AILALLPALG 0.038 46 EQCWTARIRA 0.038 95 SGAHALQPAA 0.032 15 LQPGTALLCY 0.030 112 ALGLLLWGPG 0.016 58 LLTVISKGCS 0.016 488 11 AGLALQPGTA 0.016 98 HALQPAAAIL 0.015 67 SLNCVDDSQD 0.015 1 MKAVLL7ALLM 0.012 110 LPALGLLLWG 0.010 44 LGEQCWTARI 0.007 97 AHALQPAAAI 0.007 56 VGLLTVISKG 0.007 50 TARIRAVGLL 0.007 60 VISKGCSLN 0.007 16 QPGTALLCYS 0.006 69 NCVDDSQDYY 0.005 26 CKAQVSNEDC 0.003 77 YYVGKKNITC 0.003 74 SQDYYVGKKN 0.003 55 AVGLLTVISK 0.002 53 IRAVGLLTVI 0.002 88 DTDLCNSGA 0.002 84 ITCCDTDLCN 0.002 28 AQVSNEDCLQ 0.001 39 ENCTQLGEQC 0.001 22 LCYSCKAQVS 0.001 51 ARIRAVGLLT 0.001 24 YSCKAQVSNE 0.001 489 68 LNCVDDSQDY 0.001 33 EDCLQVENCT 0.001 17 PGTALLCYSC 0.001 30 VSNEDCLQVE 0.001 TABLA XI-V1-HLA-A0201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y a posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 113 LGLLLWGPGQ 0.001 65 GCSLNCVDDS 0.001 40 NCTQLGEQCW 0.000 54 RAVGLLTVIS 0.000 87 CDTDLCNASG 0.000 80 CKKNITCCDT 0.000 64 GCSLNCVDD 0.000 18 GTALLCYSCK 0.000 111 PALGLLLWGP 0.000 93 NASGAHALQP 0.000 86 CCDTDLCNAS 0.000 66 CSLNCVDDSQ 0.000 38 VENCTQLGEQ 0.000 490 TABLA XI-V4-HLA-A0201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición 491 de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 169 SQVWSVVSPA 1.159 166 YDLSQVWSW 1.146 141 GPAFSTLNPV 1.044 137 CCFHGPAFST 1.044 56 GAPLQPTLGV 0.966 6 TTWARRTSRA 0.573 45 CSGDPASYRL 0.572 145 STLNPVLRHL 0.505 50 ASYRLWGAPL 0.446 15 AVTPTCATPA 0.435 35 SLRCSLHSAC 0.378 27 MPCSRLPPSL 0.237 102 VPHPDPPMAL 0.237 57 APLQPTLGW 0.206 73 LLTHPAQWEP 0.190 95 TMYVCAPVPH 0.172 176 SPAPSRGQAL 0.139 78 AQWEPVLVPE 0.118 165 IYDLSQVWSV 0.113 162 AHPIYDLSQV 0.111 492 91 NASLTMYVCA 0.104 89 HPNASLTMYV 0.085 66 VPQASVPLLT 0.083 60 QPTLGVVPQA 0.075 146 TLNPVLRHLF 0.075 20 CATPAGPMPC 0.069 11 RTSRAVTPTC 0.069 119 IGSIDTDPPA 0.055 134 PLCCCFHGPA 0.054 84 LVPEAHPNAS 0.045 113 RTPTRQIGSI 0.043 48 DPASYRLWGA 0.042 159 AFPAHPIYDL 0.034 69 ASVPLLTHPA 0.032 100 APVPHPDPPM 0.032 TABLA XI-V4-HLA-A0201-1OMERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 138 CFHGPAFSTL 0.028 164 PIYDLSQVWS 0.016 493 76 HPAQWEPVLV 0.015 85 VPEAHPNASL 0.015 39 SLHSACCSGD 0.015 8 WARR SRAVT 0.015 26 PPADGPSNPL 0.013 70 QVWS VSPAP 0.011 42 PAGSTLNPVL 0.010 01 RVPHPDPPMA 0.010 75 VSPAPSRGQA 0.007 55 GPQEAFPAHP 0.007 28 ADGPSNPLCC 0.007 72 PLLTHPAQWE 0.007 23 PAGPMPCSRL 0.007 73 S VSPADSRG 0.007 75 THPAQWEPVL 0.006 34 PSLRCSLHSA 0.006 97 YVCAPVPHPD 0.006 59 LQPTLGWPQ 0.006 29 DGPSNPLCCC 0.006 87 EAHPNASLTM 0.005 44 FSTLNPVLRH 0.005 54 LWGAPLQPTL 0.005 21 SIDTDPPADG 0.004 07 PPMALSRTPT 0.004 494 80 WEPVLVPEAH 0.003 86 PEAHPNASLT 0.003 71 VPL1THPAQW 0.003 132 SNPLCCCFHG 0.003 26 PMPCSRLPPS 0.003 136 CCCFHGPAFS 0.003 1 MTHRTTTWAR 0.003 12 TSRAVTPTCA 0.002 29 CSRLPPSLRC 00002 TABLA XI-V4-HLA-A0201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 10 RRTSRAVTPT 0.002 21 A PAGPMPCS 0.002 167 DLSQVWSWS 0.002 55 WGAPLQPTLG 0.002 7 TWARRTSRAV 0.002 38 CSLHSACCSG 0.002 16 VTPTCATPAG 0.002 160 FPAHPIYDLS 0.002 - 495 117 RQIGSIDTDP 0.002 156 PQEAFPAHPI 0.001 70 SVPLLTHPAQ 0.001 109 MALSRTPTRQ 0.001 148 NPVLRHLFPQ 0.001 36 LRCSLHSACC 0.001 13 SRAVTPTCAT 0.001 42 SACCSGDPAS 0.001 118 QIGSIDTDPP 0.001 147 LNPVLRHLFP 0.001 139 FHGPAFSTLN 0.001 TABLA XI-VI9-HLA-AO201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 am noácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 8 RLLPSLRCSL 79.041 4 MPCSRLLPSL 0.545 9 LLPSLRCSLH 0.?27 1 AGPMPCSRLL 0.028 3 PMPCSRLLPS 0.003 6 CSRLLPSLRC 0.002 496 TABLA XI-V19-HLA-A0201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 7 SRLLPSLRCS 0.000 5 PCSRLLPSLR 0.000 TABLA XI-V20-HLA-A0201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 3 CSGDPASSRL 0.572 8 ASSRLWGAPL 0.139 6 DPASSRLWGA 0.042 5 GDPASSRLWG 0.001 1 ACCSGDPASS 0.000 2 CCSGDPASSR 0.000 4 SGDPASSRLW 0.000 497 TABLA XI-V21-HLA-A0202-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 5 VPLLTDPAQS 0.003 4 SVPLLTDPAQ 0.001 498 TABLA XI-V22-HLA-A0201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 499 TABLA XI-V24-HLA-A0201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO SLTMYVCTPV 69.552 500 TABLA XI-V25-HLA-A0201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 501 TABLA X-V25&26-HLA-A0201-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 7 ISSSDTDPPA 0.055 1 RTPTRQISSS 0.002 5 RQISSSDTDP 0.002 6 QISSSDTDPP 0.001 8 SSSDTDPPAD 0.000 3 PTRQISSSDT 0.000 2 TPTRQISSSD 0.000 4 TRQISSSDTD 0.000 502 T BLA X-V27-HLA-A0201-10 ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 1 PSRGQALRRA 0.000 2 SRGQALRRAQ 0.000 503 TABLA XII-V1-HLA-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO T SUBSECÜENCIA REGISTRO 7 ALLMAGLAL 1.800 74 SQDYYVGKK 1.620 109 LLPALGLLL 1.200 5 LLALLMAGL 0.900 99 ALQPASSIL 0.900 14 ALQPGTALL 0.900 43 QLGEQCWTA 0.900 20 ALLCYSCKA 0.900 108 ALLPALGLL 0.608 70 CVDDSQDYY 0.400 19 TALLCYSCK 0.300 115 LLLWGPGQL 0.270 114 GLLL GPGQ 0.270 57 GLLTVISKG 0.203 56 VGLLTVISK 0.180 12 GLALQPGTA 0.180 58 LLTVISKGC 0.150 105 AILALLPAL 0.135 504 TABLA XII-V1-HLA-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO T SUBSECUENCIA REGISTRO 16 QPGTALLCY 0.120 112 ALGLLLWGP 0.090 4 VLLALLMAG 0.090 3 AVLLALLMA 0.090 60 TVISKGCSL 0.090 18 GTALLCYSC 0.090 73 DSQDYYVGK 0.090 83 NITCCDTDL 0.060 69 NCVDDSQDY 0.060 9 LMAGLALQP 0.060 8 LLMAGLALQ 0.045 36 LQVENCTQL 0.041 78 YVGKKNITC 0.030 52 RIRAVGLLT 0.030 67 SLNCVDDSQ 0.027 107 LALLPALGL 0.027 28 AQVSNEDCL 0.020 54 RAVGLLTVI 0.020 505 35 CLQVENCTQ 0.020 47 QC TARIRA 0.020 106 ILALLPALG 0.020 101 QPASSILAL 0.018 15 LQPGTALLC 0.018 2 KAVLLALLM 0.018 90 DLCNASGAH 0.018 45 GEQCWTARI 0.016 13 LALQPGTAL 0.013 98 HALQPAAAI 0.013 100 LQPAAAILA 0.012 41 CTQLGEQCW 0.010 84 ITCCDTDLC 0.010 21 LLCYSC AQ 0.010 22 LCYSCKAQV 0.010 104 AAILALLPA 0.010 TABLA XII-V1-HLA-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 42 TQLGEQCWT 0.007 506 110 LPALGLLLW 0.006 96 GAHALQPAA 0.006 27 KAQVSNEDC 0.006 50 TARIFAVGL 0.006 55 AVGLLTVIS 0.004 44 LGEQCWTAR 0.004 46 EQCWTARIR 0.004 30 VSNEDCLQV 0.003 62 ISKGCSLNC 0.003 86 CCDTDLCNA 0.003 40 NCTQLGEQC 0.002 37 QVENCTQLG 0.002 61 VISKGCSLN 0.002 91 LCNASGAHA 0.002 29 QVSNEDCLQ 0.002 49 WTARIRAVG 0.002 102 PAAAILALL 0.001 92 CNASGAHAL 0.001 1 MKVLLALL 0.001 59 LTVISKGCS 0.001 66 CSLNCVDDS 0.001 6 LALLMAGLA 0.001 51 ARRAVGLL 0.0001 34 DCLQVENCT 0.001 507 25 SCKAQVSNE 0.001 71 VDDSQDYYV 0.001 53 IRAVGLLTV 0.001 65 GCSLNCVDD 0.001 76 DYYVGKKNI 0.000 103 AAAILALLP 0.000 85 TCCDTDLCN 0.000 93 N7ASGAHALQ 0.000 10 MAGLALQPG 0.000 TABLA XII-V1-HLA-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 79 VGKKNITCC 0.000 81 KKNITCCDT 0.000 63 SKGCSLNCV 0.000 89 TDLCNASGA 0.000 88 DTDLCNASG 0.000 95 SGAHALQPA 0.000 77 YYVGKKNIT 0.000 97 AHALQPAAA . 0.000 508 94 ASGAHALQP 0.000 82 KNITCCDTD 0.000 33 EDCLQVENC 0.000 11 AGLALQPGT 0.000 111 PALGLLLWG 0.000 38 VENCTQLGE 0.000 TABLA XII-V4-HLA-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 6 TTQARRTSR 1.000 173 SVVSPAPSR 0.900 170 QVWSVVSPA 0.450 53 RLWGAPLQP 0.300 35 SLRCSLHSA 0.300 146 TLNPVLRHL 0.203 93 SLTMYVCAP 0.180 153 HLFPQEAFP 0.150 145 STLNPVLRH 0.135 95 TMYVCAPVP 0.100 158 EAFPAHPIY 0.090 509 167 DLSQVWSVV 0.090 TABLA XII-V4-HLA-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 44 CCSGDPASY 0.060 150 VLRHLFPQE 0.060 89 HPNASLTMY 0.060 65 WPQASVPL 0.060 62 TLGVVPQAS 0.060 109 MALSRTPTR 0.060 83 VLVPEAHPN 0.045 78 AQWEPVLVP 0.041 160 FPAHPIYDL 0.041 178 APSRGQALR 0.040 29 CSRLPPSLR 0.030 84 LVPEAHPNA 0.030 72 PLLTHPAQW 0.030 45 CSGDPASYR 0.030 73 LLTHPAQWE 0.030 94 LTMYVCAPV 0.022 510 TABLA XII-V4-HLA-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de. extremo para cada péptido es 511 la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 155 FPQEAFPAH 0.009 57 APLQPTLGV 0.009 97 YVCAPVPHP 0.009 68 QASVPLLTH 0.009 31 RLPPSLRCS 0.009 23 PAGPMPCSR 0.006 179 PSRGQALRR 0.006 134 PLCCCFHGP 0.006 32 LPPSLRCSL 0.006 152 RHLFPQEAF 0.005 120 GSIDTDPPA 0.005 163 HPIYDLSQV 0.005 74 LTHPAQWEP 0.005 147 LNPVLRHLF 0.004 113 RTPTRQIGS 0.004 3 HRTTTWARR 0.004 26 PMPCSRLPP 0.004 101 PVPHPDPPM 0.003 174 WSPAPSRG 0.003 118 QIGSIDTDP 0.003 15 AVTPTCATP 0.003 102 VPHPDPMA 0.003 512 46 SGDPASYRL 0.003 139 FHGPAFSTL 0.003 166 YDLSQVWSV 0.003 169 SQVWSVVSP 0.003 114 TPTRQIGSI 0.003 157 QEAFPAHPI 0.003 14 RAVTPTCAT 0.002 117 RQIGSIDTD 0.002 37 RCSLHSACC 0.002 121 SIDTDPPAD 0.002 42 SACCSGDPA 0.002 137 CCFHGPAFS 0.002 51 SYRLWGAPL 0.002 TABLA XII-V4-HLA-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 135 LCCFHGPA 0.002 80 WEPVLVPEA 0.002 131 PSNPLCCCF 0.002 4 RTTTWARRT 0.002 513 142 MFSTLNPV 0.002 92 ASLTMYVCA 0.002 12 TSRAVTPTC 0.002 22 PAGPMPCS 0.001 104 HPDPPMALS 0.001 30 SRLPPSLRC 0.001 149 PVLRHLFPQ 0.001 127 PADGPSNPL 0.001 81 EPVLVPEAH 0.001 141 GPAFSTLNP 0.001 105 PDPPMALSR 0.001 49 PASYRLWGA 0.001 55 WGAPLQPTL 0.001 24 AGPMPCSRL 0.001 TABLA XII-V19-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUR-SECUENCIA REGISTRO 8 LLPSLRCSL 0.600 5 CSRLLPSLR 0.020 7 RLLPSLRCS 0.013 514 TABLA XII-V21-HLA-A3-9MERS-PSCA 515 TABLA XII-V21&22-HLA-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 8 DLAQWEPVL 0.540 4 PLLTDLAQW 0.045 5 LLTDLAQWE 0.020 2 SVPLLTDLA 0.020 516 TABLA XII-V24-HLA-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 517 • TABLA XII-V25-HLA-A3-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 3 TPTRQISSI 0.009 2 RTPTRQISS 0.004 7 QISSIDTDP 0.003 9 SSIDTDPPA 0.002 6 RQISSIDTD 0.001 5 TRQISSIDT 0.000 518 TABLA XII-V26-HLA-A3-9MERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 7 GSSDTDPPA 0.003 519 TABLA XII- 27-HLA-A3-9MERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 1 SRGQALRRA 0.000 2 RGQALRRAQ 0.000 520 TABLA XIII-V1-HLA-A3-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 35 CLQVENCTQL 0.600 521 99 ALQPAAAILA 0.600 15 LQPGTALLCY 0.540 21 LLCYSCKAQV 0.200 73 DSQDYYVGKK 0.081 90 DLCNASGAHA 0.060 69 NCVDDSQDYY 0.060 8 LLMAGLALQP 0.060 52 RIRAVGLLTV 0.060 5 LLALLMAGLA 0.060 70 CVDDSQDYYV 0.060 100 LQPAAAILAL 0.054 59 LTVISKGCSL 0.045 7 ALLMAGLALQ 0.045 9 LMAGLALQPG 0.045 42 TQLGEQCWTA 0.041 61 VISKGCSLNC 0.040 29 QVSNEDCLQV 0.040 49 WTARIRAVGL 0.030 78 YVGKK ITCC 0.030 2 KAVLLALLMA 0.027 83 NTTCCDTDLC 0.020 67 SLNCVDDSQD 0.020 72 DDSQDYYVGK 0.018 6 LALLMAGLAL 0.018 522 27 KAQVSNEDCL 0.018 20 ALLCYSCKAQ 0.015 104 AAILALLPAL 0.013 101 QPAAAILALL 0.013 58 LLTVISKGCS 0.012 13 LALQPGTALL 0.009 19 TALLCYSCKA 0.009 98 HALQPAAAIL 0.009 3 AVLLALLMAG 0.009 68 LNCVDDSQDY 0.008 112 ALGLLWGPG 0.008 TABLA XIII-V1-HLA-A3-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 96 GAHALQPAAA 0.006 103 AAILALLPA 0.006 91 LCNASGAHAL 0.006 82 KNITCCDTDL 0.005 50 TARIRAVGLL 0.005 41 CTQLGEQCWT 0.005 523 107 LALLPALGLL 0.004 37 QVENCTQLGE 0.004 65 GCSLNCVDDS 0.004 45 GEQCWTARIR 0.004 46 EQCWTARIRA 0.004 88 DTDLCNASGA 0.003 105 AILALLPALG 0.003 60 TVISKGCSLN 0.003 85 TCCDTDLCNA 0.003 62 ISKGCSLNCV 0.002 84 ITCCDTDLCN 0.002 22 LCYSCKAQVS 0.002 40 NCTQLGEQCW 0.002 44 LGEQCWTARI 0.002 32 NEDCLQVENC 0.002 75 QDYYVGKKNI 0.002 47 QCWTARIRAV 0.002 94 ASGAHALQPA 0.002 36 LQVENCTQLG 0.001 10 MAGLALQPGT 0.001 97 AHALQPAAAI 0.001 53 IRAVGLLTVI 0.001 77 YYVGKKNITC 0.001 28 AQVSNEDCLQ 0.001 524 54 RAVGLLTVIS 0.001 93 NASGAHALQP 0.001 110 LPALGLLLWG 0.001 16 QPGTALLCYS 0.001 51 ARIRAVGLLT 0.000 74 SQDYYVGKKN 0.000 TABLA XIII-V1-HLA-A3-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 1 MKAVLLALLM 0.000 86 CCDTDLCNAS 0.000 80 GKKNITCCDT 0.000 25 SCKAQVSNED 0.000 24 YSCKAQVSNE 0.000 30 VSNEDCLQVE 0.000 66 CSLNCVDDSQ 0.000 111 PALGLLLWGP 0.000 26 CKAQVSNEDC 0.000 95 SGAHALQPAA 0.000 76 DYYVGKKNIT 0.000 525 39 ENCTQLGEQC 0.000 113 LGLLLWGPGQ 0.000 89 TDLCNASGAH 0.000 11 AGLALQPGTA 0.000 34 DCLQVENCTQ 0.000 56 VGLLTVISKG 0.000 TABLA XIII-V4-HLA-A3-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueveocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 153 HLGPQEAFPA 4.500 146 TLNPVLRHLG 3.000 53 RLWGAPLQPT 1.688 95 T YVCAPVPH 1.000 31 RLPPSLRCSL 0.900 1 MTHRTTTWAR 0.600 150 VLRHLFPQEA 0.600 83 VLVPEAHPNA 0.450 64 GVVPQASVPL 0.105 108 P ALSRTPTR 0.400 93 SLTMYVCAPV 0.300 526 TABLA XIII-V4-HLA-A3-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8 cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 62 TLGVVPQASV 0.300 5 TTTWARRTSR 0.200 35 SLRCS1HSAC 0.200 65 VVPQASVPLL 0.180 104 HPDPPMALSR 0.120 44 CCSGDPASYR 0.090 110 ALSRTPTRQI 0.090 178 APSRGQALRR 0.080 73 LLTHPAQ EP 0.060 22 TPAGPMPCSR 0.060 130 GPSNPLCCCF 0.060 6 TTWARRTSRA 0.050 172 SVVSPAPSR 0.045 50 ASYRLWGAPL 0.045 169 SQVWSVVSPA 0.041 43 ACCSGDPASY 0.040 167 DLSQVWSWS 0.036 15 AVTPTCATPA 0.030 527 TABLA XIII-V4-HLA-A2-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve 528 INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 45 CSGDPASYRL 0.009 100 APVPHPDPPM 0.007 88 AHPNASLTMY 0.006 28 PCSRLPPSLR 0.006 20 CATPAGPMPC 0.006 27 MPCSRLPPSL 0.006 84 LVPEAHPNAS 0.006 26 PMPCSRLPPS 0.006 72 PLLCSRLPPS 0.005 21 ATPAGPMPCS 0.005 159 AFPAHPIYDL 0.004 2 THRTTTWARR 0.004 143 AFSTKBOVLR 0.004 89 HPNASLTMYV 0.004 177 PAPSRGQALR 0.004 151 LRHLFPQEAF 0.003 142 PAFSTLNPVL 0.003 66 VPQASVPLLT 0.003 173 SVVSPAPSRG 0.003 163 HPIYDLSQVW 0.003 71 VPLLTHPAQW 0.003 29 CSRLPPSLRC 0.003 97 YVCAPVPHPD 0.003 529 121 SIDTDPPADG 0.003 58 PLQPTLGVVP 0.003 156 PQEAFPAHPI 0.003 25 GPMPCSRLPP 0.003 138 CFHGPAFSTL 0.003 67 PQASVPLLTH 0.003 48 DPASYRLWGA 0.003 69 ASVPLLTHPA 0.002 117 RQIGS1DTDP 0.002 91 NASLTMYVCA 0.002 101 PVPHPDPPMA 0.002 32 LPPSLRCSLH 0.002 70 SVPLLTHPAQ 0.002 TABLA XII-V4-HLA-A3MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 76 HPAQWEPVLV 0.002 118 QIGSIDTDPP 0.002 164 PIYDLSQVWS 0.002 165 IYDLSQVWSV 0.002 530 75 THPAQWEPVL 0.002 59 LQPTLGWPQ 0.002 87 EAHPNASLTM 0.002 94 LTMYVCAPVP 0.002 92 ASLTMYVCAP 0.001 148 NPVLRHLFPQ 0.001 23 PAGPMPCSRL 0.001 57 APLQPTLGW 0.001 16 VTPTCATPAG 0.001 41 HSACCSGDPA 0.001 115 PTRQIGSIDT 0.001 12 TSRAVTPTCA 0.001 8 WARRTSRAVT 0.001 ABLA XI11-VI9-HLA-A3-1OMERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 8 RLLPSLRCSL 1.350 9 LLPSLRCSLH 0.200 3 PMPCSRLLPS 0.012 4 MPCSRLLPSL 0.009 531 5 PCSRLLPSLR 0.004 6 CSRLLPSLRC 0.003 2 GPMPCSRLLP 0.003 10 LPSLRCSLHS 0.001 1 AGPMPCSRLL 0.000 7 SRLLPSLRCS 0.000 TABLA XIII-V20-HLA-A3-1O ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 2 CCSGDPASSR 0.090 8 ASSRLWGAPL 0.009 3 CSGDPASSRL 0.003 6 DPASSRLWGA 0.003 1 ACCSGDPASS 0.000 5 GDPASSRLWG 0.000 9 SSRLWGAPLQ 0.000 10 SRLWGAPLQP 0.000 4 SGDPASSRLW 0.000 7 PASSRLWGAP 0.000 532 TABLA XIII-V22-HLA-A3-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 9 HLAQWEPVLV 0.200 6 LLTHLAQWEP 0.060 7 LTHLAQWEPV 0.010 533 1 QASVPLLTHL 0.009 4 VPLLTHLAQW 0.005 3 SVPLLTHLAQ 0.004 5 PLLTHLAQWE 0.003 8 THLAQWEPVL 0.003 2 ASVPLLTHLA 0.002 10 LAQWEPVLVP 0.002 TABLA XIII-V24-HLA-A3-1OMERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 5 TMYVCTPVPH 1.000 3 SLTMYVCTPV 0.300 10 TPVPHPDPPM 0.007 7 YVCTPVPHPD 0.003 4 LTMYVCTPVP 0.002 2 ASLTMYVCTP 0.001 9 CTPVPHPDPP 0.001 1 MASLTMYVCT 0.001 8 VCTPVPHPDP 0.000 6 MYVCTPVPHP 0.000 534 TABLA XIII-V25-HLA-A3-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 5 PTRQISSIDT 0.001 4 TPTRQISSID 0.000 1 LSRTPTRQIS 0.000 10 SSIDTDPPAD 0.000 2 SRTPTRQISS 0.000 6 TRQISSIDTD 0.000 535 ABLA XI11-V26-HLA-A3-10 ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 6 QIGSSDTDPP 0.002 5 RQIGSSDTDP 0.001 1 RTPTRQIGSS 0.001 3 PTRQIGSSDT 0.001 536 T BLA XIII-V27-HLA-A3-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos , y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 1 PSRGQALRRA 0.000 2 SRGQALRRAQ 0.000 TABLA XIV-V1-HLA-A101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho ' INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 74 SQDYYVGKK 0.600 19 TALLCYSCK 0.300 56 VGLLTVISK 0.060 537 3 AVLLALLMA 0.060 60 TVISKGCSL 0.030 70 CVDDSQDYY 0.020 2 AVLLALLM 0.018 12 GLALQPGTA 0.012 7 ALLMAGLAL 0.012 100 LQPAAAILA 0.012 41 CTQLGEQCW 0.010 36 LQVENCTQL 0.009 28 AQVSNEDCL 0.009 54 RAVGLLTVI 0.009 47 QC TARIRA 0.008 43 QLGEQCWTA 0.008 TABLA XI -VI-HLA-A1101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 109 LLPALGLLL 0.008 108 ALLPALGLL 0.006 73 DSQDYYVGK 0.006 115 LLLWGPGQL 0.006 538 107 LALLPALGL 0.006 104 AAILALLPA 0.006 20 ALLCYSCKA 0.006 96 GAHALQPAA 0.006 18 GTALLCYSC 0.006 105 AILALLPAL 0.006 5 LLALLMAGL 0.004 44 LGEQCWTAR 0.004 83 NITCCDTDL 0.004 22 LCYSCKAQV 0.004 110 LPALGLLLW 0.004 99 ALQPAAAIL 0.004 101 QPAAAILAL 0.004 78 YVGKKNITC 0.004 14 ALQPGTALL 0.004 16 QPGTALLCY 0.004 46 EQCWTARIR 0.004 13 LALQPGTAL 0.003 6 LALLMAGLA 0.003 69 NCVDDSQDY 0.003 98 HALQPAAAI 0.003 52 RIRAVGLLT 0.002 29 QVSNEDCLQ 0.002 91 LCNASGAHA 0.002 539 50 TARIRAVGL 0.002 55 AVGLLTVIS 0.002 37 QVENCTQLG 0.002 86 CCDTDLCNA 0.002 57 GLLTVISKG 0.002 114 GLLLWGPGQ 0.002 ABLA XIV-VI-HLA- l101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 45 GEQCWTARI 0.002 59 LTVISKGCS 0.002 4 VLLALLMAG 0.001 15 LQPGTALLC 0.001 90 DLCNASGAH 0.001 76 DYYVGKKNI 0.001 84 ITCCDTDLC 0.001 49 TARIRAVG 0.001 42 TQLGEQCWT 0.001 112 ALGLLLWGP 0.001 9 LMAGLALQP 0.001 540 8 LLMAGLALQ 0.001 77 YYVGKK IT 0.001 65' GCSLNCVDD 0.001 27 KAQVSNEDC 0.001 30 VSNEDCLQV 0.000 35 CLQVENCTQ 0.000 71 VDDSQDYYV 0.000 61 VISKGCSLN 0.000 106 ILALLPALG 0.000 85 TCCDTDLCN 0.000 92 CNASGAHAL 0.000 53 IRAVGLLTV 0.000 23 CYSSCKAQVS 0.000 67 SLNCVDDSQ 0.000 103 AAAILALLP 0.000 89 TDLCNASGA 0.000 88 DTDLCNASG 0.000 51 ARIRAVGLL 0.000 58 LLTVISKGC 0.000 40 NCTQLGEQC 0.000 63 SKGCSLNCV 0.000 . 93 NASGAHALQ 0.000 10 MAGLALQPG 0.000 541 TABLA XIV-V4-HLA-A1101-9MERS-PSCA 542 TABLA XIV-V4-HLA-A1101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 70 SVPLLTHPA 0.020 16 VTPTCATPA 0.010 1 MTHRTTTWA 0.010 64 GVVPQASVP 0.009 543 2 THRTTTWAR 0.008 154 LFPQEAFPA 0.006 113 RTPTRQIGS 0.006 57 APXQPTLGV 0.006 96 MYVCAPVPH 0.006 53 RLWGAPLQP 0.005 3 HRTTTWARR 0.004 68 QASVPLLTH 0.004 160 FPAHPIYDL 0.004 51 SYRLWGAPL 0.004 29 CSRLPPSLR 0.004 23 PAGPMPCSR 0.004 45 CSGDPASYR 0.004 144 GSTLNPVLR 0.004 35 SLRCSLHSA 0.004 11 RTSRAVTPT 0.003 163 HPIYDLSQV 0.003 117 RQIGSIDTD 0.003 78 AQWEPVLVP 0.002 114 TPTRQIGSI 0.002 15 AVTPTCATP 0.002 19 TCATPAGPM 0.002 32 LPPSLRCSL 0.002 97 YVCAPVPHP 0.002 544 66 VPQASVPLL 0.002 42 SACCSGDPA 0.002 74 LTHPAQWEP 0.002 143 AFSTLNPVL 0.002 102 VPHPDPPMA 0.002 89 HPNASLTMY 0.002 • TABLA XIV-V4-HLA-A1101-9 ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 176 SPAPSRGQA 0.002 101 PVPHPDPPM 0.002 76 HPAQWEPVL 0.002 135 LCCCFHGPA 0.002 44 CCSGDPASY 0.002 21 ATPAGPMPC 0.002 136 CCCFHGPAF 0.002 155 FPQEAFPAH 0.002 174 VVSPAPSRG 0.002 61 PTLGVVPQA 0.002 181 RGQALRRAR 0.001 545 141 GPAFSTLNP 0.001 158 EAFPAHPIY 0.001 167 DLSQVWSVV 0.001 120 GSIDTDPPA 0.001 152 RHLFPQEAF 0.001 133 NPLCCCFHG 0.001 169 SQVWSVVSP 0.001 14 RAVTPTCAT 0.001 149 PVLRHLFPQ 0.001 81 EPVLVPEAH 0.001 105 PDPPMALSR 0.001 179 PSRGQALRR 0.001 164 PIYDLWQVW 0.001 95 TMYVCAPVP 0.001 153 HLFPQEAFP 0.001 56 GAPLQPTLG 0.001 83 VLVPEAHPN 0.001 59 LQPTLGVVP 0.001 166 YDLSQVWSV 0.001 72 PLLTHPAQW 0.001 130 GPSNPLCCC 0.001 37 RCSLHSACC 0.001 148 NPVLRHLFP 0.001 546 TABLA XIV-V4-HLA-Al101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SOBSECUENCIA REGISTRO 138 CFHGPAFST 0.001 80 WEPVLVPEA 0.001 157 QEAFPAHPI 0.001 91 NASLTMYVC 0.000 121 SIDTDPPAD 0.000 150 VLRHLFPQE 000 147 LNPVLRHLF 0.000 137 CCFHGPAFS 0.000 39 SLHSACCSG 0.000 118 QIGSIDTDP 0.000 46 SGDPASYRL 0.000 132 SNPLCCCFH 0.000 110 ALSRTPTRQ 0.000 93 SLTMYVCAP 0.000 159 AFPAHPIYD 0.000 58 PLQPTLGVV 0.000 62 TLGVVPQAS 0.000 146 TLNPVLRHL 0.000 547 TABLA XIV-V19-HLA-A1101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 9 LPSLRCSLH 0.002 1 GPMPCSRLL 0.001 3 MPCSRLLPS 0.000 4 PCSRLLPSL 0.000 548 TABLA XIV-V21-HLA-A1101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 549 TABLA XIV-V21&22-HLA-Al101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO SVPLLTDLA 0.020 550 TABLA XIV-V22-HLA-A1101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos , y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 9 LAQWEPVLV 0.002 6 LTHLAQWEP 0.002 551 TABLA XIV-V25-HLA-Al101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 552 TABLA XIV-V25&26-HLA-Al101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 553 TABLA XIV-V26-HLA-A1101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de nicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO QIGSSDTDP 0.000 554 1 TPTRQIGSS 0.000 2 PTRQIGSSD 0.000 6 IGSSDTDPP 0.000 8 SSDTDPPAD 0.000 3 TRQIGSSDT 0.000 9 SDTDPPADG 0.000 TABLA XIV-V27-HLA-A1101-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 1 SRGQALRRA 0.000 2 RGQALRRAQ 0.000 TABLA XV-V1-HLA-A1101-1OMERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 55 AVGLLTVISK 0. 18 GTALLCYSCK 0. 43 QLGEQCWTAR 0. 555 29 QVSNEDCLQV 0· 70 CVDDSQDYYV 0. 52 RIRAVGLLTV 0.
TABLA XV-V1-HLA-A1101-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 114 GLLLWGPGQL 0.018 2 KAVLLALLMA 0.018 42 TQLGEQCWTA 0.018 59 LTVISKGCSL 0.015 12 GLALQPGTAL 0.012 100 I.QPAAAILAL 0.012 108 ALLPALGLLL 0.012 15 LQPGTALLCY 0.012 49 WTARIRAVGL 0.010 106 ILALLPALGL 0.008 99 ALQPAAAILA 0.008 109 LLPALGLLL 0.008 27 KAQVSNEDCL 0.006 73 DSQDYYVGKK 0.006 556 ABLA XV-VI-HLA- l101-1O ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 557 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 84 ITCCDTDLCN 0.002 91 LCNASGAHAL 0.002 85 TCCDTDLCNA 0.002 50 TARIRAVGLL 0.002 78 YVGKKNITCC 0.002 101 QPAAAILALL 0.002 40 NCTQLGEQCW 0.002 82 KNITCCDTDL 0.002 8 LLMAGLALQP 0.002 77 YYVGKKNITC 0.001 90 DLCNASGAHA 0.001 41 CTQLGEQCWT 0.001 28 AQVSNEDCLQ 0.001 54 RAVGLLTVIS 0.001 36 LQVENCTQLG 0.001 57 GLLTVISKGC 0.001 14 ALQPGTALLC 0.001 61 VISKGCSLNC 0.001 65 GCSLNCVDDS 0.001 105 AILALLPALG 0.001 7 ALLMAGLALQ 0.001 558 83 NITCCDTDLC 0.000 47 QCWTARIRAV 0.000 68 LNCVDDSQDY 0.000 1 MKAVLLALLM 0.000 110 LPALGLLLWG 0.000 9 LMAGLALQPG 0.000 22 LCYSCKAQVS 0.000 23 CYSCKAQVSN 0.000 67 SLNCVDDSQD 0.000 112 ALGLLL GPG 0.000 58 LLTVISKGCS 0.?00 93 NASGAHALQP 0.000 TABLA XV-VI-HLA-Al101-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 20 ALLCYSCKAQ 0.000 74 SQDYYVGKKN 0.000 11 AGLALQPGTA 0.000 89 TDLCNASGAH 0.000 76 DYYVG K IT 0.000 559 BLA XV-V4-HLA-A1101-1OMERS-PSCA 560 Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 1 MTHRTTTWAR 0.400 5 TTTWARRTSR 0.200 64 GVVPQASVPL 0.090 178 APSRGQALRR 0.080 104 HPDPPMALSR 0.080 143 AFSTLNPVLR 0.040 44 CCSGDPASYR 0.040 22 TPAGPMPCSR 0.040 113 RTPTRQIGSI 0.030 153 HLFPQEAFPA 0.024 15 AVTPTCATPA 0.020 6 TTWARRTSRA 0.020 65 VVPQASVPLL 0.020 31 RLPPSLRCSL 0.012 56 GAPLQPTLGV · 0.012 74 LTHPAQWEPV 0.010 169 SQVWSVVSPA 0.009 95 TMYVCAPVPH 0.008 108 PMALSRTPTR 0.008 561 TABLA XV-V4-HLA-A1101-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 562 100 APVPHPDPPM 0.003 173 SVVSPAPSRG 0.003 57 APLQPTLGW 0.003 11 RTSRAVTPTC 0.003 71 VPLLTHPAQW 0.003 117 RQIGSIDTDP 0.003 25 GPMPCSRLPP 0.002 53 RLWGAPLQPT 0.002 70 SVPLLTHPAQ 0.002 43 ACCSGDPASY 0.002 91 NASLTMYVCA 0.002 94 LTMYVCAPVP 0.002 97 YVCAPVPHPD 0.002 84 LVPEAHPNAS 0.002 76 HPAQWEPVLV 0.002 32 LPPSLRCSLH 0.002 60 QPTLGVVPQA 0.002 85 VPEAHPNASL 0.002 27 MPCSRLPPSL 0.002 101 PVPHPDPPMA 0.002 154 LFPQFAFPAH 0.002 176 SPAPSRGQAL 0.002 138 CFHGPAFSTL 0.002 135 LCCCGHGPAF . 0.002 563 145 STLNPVLRHL 0.002 137 CCFHGPAFST 0.001 67 PQASVPLLTH 0.001 78 AQWEPVLVPE 0.001 87, EAHPNASLTM 0.001 48 DPASYRLWGA 0.001 21 ATPAGPMPCS 0.001 16 VTPTCATPAG 0.001 18 PTCA PAGPM 0.001 148 NPVLRHLFPQ 0.001 TABLA XV-V4-HLA-Al101-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 14 RAVTPTCATP 0.001 73 LLTHPAQWEP 0.001 96 MYVCAPVPHP 0.001 59 LQPTLG PQ 0.001 37 RCSLHSACCS 0.001 156 PQEAFPAHPI 0.001 80 WEPVLVPEAH 0.001 564 157 QEAGPAHPIY 0.001 180 SRGQALRRAR 0.000 121 SIDTDPPADG 0.000 134 PLCCCGHGPA 0.000 66 VPQASVPLLT 0.000 144 FSTLNPVLRH 0.000 20 · CATPAGPMPC 0.000 118 QIGSIDTDPP 0.000 142 PAFSTLNPVL 0.000 35 SLRCSLHSAC 0.000 51 SYRLWGAPLQ 0.000 50 ASYRLWGAPL 0.000 39 SLHSACCSGD 0.000 110 ALSRTPTRQI 0.000 45 • CSGDPASYRL 0.000 69 ASVPLLTHPA 0.000 4 RTTTWARRTS 0.000 123 DTDPPADGPS 0.000 166 YDLSQVWSW 0.000 82 PVLVPEAHPN 0.000 133 NPLCCCFHGP 0.000 149 PVLRHLFPQE 0.000 109 MALSRTPTRQ 0.000 565 TABLA XV-V20-HLA-A1101-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 2 CCSGDPASSR 0.040 6 DPASSRLWGA 0.001 566 8 ASSRLWGAPL 0.000 1 ACCSGDPASS 0.000 3 CSGDPASSRL 0.000 5 GDPASSRLWG 0.000 10 SRLWGAPLQP 0.000 4 SGDPASSRLW 0.000 7 PASSRLWGAP 0.000 9 SSRLWGAPLQ 0.000 TABLA XV-V21-HLA-Al101-1OMERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 8 LTDPAQWEPV s. oio 5 VPLLTDPAQW 0.003 4 SVPLLTDPAQ 0.002 7 LLTDPAQWEP 0.001 10 DPAQWEPVLV 0.001 3 ASVPLLTDPA 0.000 9 TDPAQWEPVL 0.000 2 QASVPLLTDP 0.000 1 PQASVPLLTD 0.000 567 PLLTDPAQWE 0.000 TABLA XV-V22-HLA-A1101-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO LTHLAQWEPV 0.010 568 TABLA XV-V24-HLA-Al101-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 5 TMYVCTPVPH 0.008 3 SLTMYVCTPV 0.004 569 10 TPVPHPDPPM 0.003 4 LTMYVCTPVP 0.002 7 YVCTPVPHPD 0.002 9 CTPVPHPDDPP 0.001 6 MYVCTPVPHP 0.001 8 VCTPVPHPDP 0.000 1 NASLTMYVCT 0.000 2 ASLTMYVCTP 0.000 TABLA XV-V25-HLA-A1101-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 3 RTPTRQISSI 0.030 7 RQISSIDTDP 0.000 8 QISSIDTDPP 0.000 9 ISSIDTDPPA 0.000 5 PTRQISSIDT 0.000 4 TPTRQISSID 0.000 2 SRTPTRQISS 0.000 10 SSIDTDPPAD 0.000 6 TRQISSIDTD 0.000 570 LSRTPTRQIS 0.000 TABLA XV-V25&26-HLA-A1101-10 ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 1 RTPTRQISSS 0.003 5 RQISSSDTDP 0.003 6 QISSSDTDPP 0.000 7 ISSSDTDPPA 0.000 2 TPTRQISSSD 0.000 3 PTRQISSSDT 0.000 4 TRQISSSDTD 0.000 8 SSSDTDPPAD 0.000 TABLA XV-V26-HLA-A1101-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 1 RTPTRQISSS 0.003 5 RQISSSDTDP 0.003 571 TABLA XV-V27-HLA-Al101-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos , y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 2 SRGQALRRAQ 0.000 1 PSRGQALRRA 0.000 TABLA XVI- I-HLA-A24- MERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 76 DYYVGKKNI 50.000 77 YYVGKK IT 9.000 36 LQVENCTQL 7.200 572 TABLA XVI-VI-HLA-A24- MERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 573 54 RAVGLLTVI 3.600 2 KAVLLALLM 1.800 98 HALQPAAAI 1.500 51 ARIRAVGLL 0.600 102 ¦ PAAAILALL 0.560 1 MKAVLLALL 0.480 27 KAQVSNEDC 0.300 52 RIRAVGLLT 0.280 34 DCLQVENCT 0.252 69 NCVDDSQDY 0.216 41 CTQLGEQCW 0.180 30 VSNEDCLQV 0.180 11 AGLALQPGT 0.180 20 ALLCYSCKA 0.165 45 GEQCWTARI 0.150 6 LALLMAGLA 0.150 42 TQLGEQCWT 0.050 3 AVLLALLMA 0.150 59 LTVISKGCS 0.150 100 LQPAAAILA 0.150 15 LQPGTALLC 0.150 66 CSLNCVDDS 0.150 104 AAILALLPA 0.150 91 LCNASGAHA 0.150 574 58 LLTVISKGC 0.140 55 AVGLLTVIS 0.120 85 TCCDTDLCN 0.120 43 QLGEQCWTA 0.120 18 GTALLCYSC 0.120 40 NCTQLGEQC 0.120 96 GAHALQPAA 0.120 70 CVDDSQDYY 0.120 95 SGAHALQPA 0.120 22 LCYSCKAQV 0.100 61 VISKGCSLN 0.100 TABLA XVI-VI-HLA-A24-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 47 QCWTARIRA 0.100 16 QPGTALLCY 0.100 78 YVG KNITC 0.100 84 ITCCDTDLC 0.100 86 CCDTDLCNA 0.100 24 YSCKAQVSN 0.100 575 48 CWTARIRAV 0.100 110 LPALGLLLW 0.100 62 ISKGCSLNC 0.100 79 VGKK ITCC 0.100 12 GLALQPGTA 0.100 82 KKNITCCDT 0.030 81 KKNITCCDT 0.030 64 KGCSLNCVD 0.024 57 GLLTVISKG 0.023 31 SNEDCLQVE 0.022 67 SLNCVDDSQ 0.021 113 LGLLLWGPG 0.018 37 QVENCTQLG 0.18 4 VLLALLMAG 0.018 73 DSQDYYVGK 0.018 87 CDTDLCNAS 0.017 75 QDYYVGKKN 0.015 44 LGEQCWTAR 0.015 19 TALLCYSCK 0.015 114 GLLLWGPGQ 0.015 89 TDLCNASGA 0.015 8 LLMAGLALQ 0.015 56 VGLLTVISK 0.015 35 CLQVENCTQ 0.015 576 TABLA XVI-V -HLA-A2 -9 ERS-PSCA 577 TABLA XVI-HLA-A24-9MERS-PSCA 578 Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 96 MYVCAPVPH 0.750 177 PAPSRGQAL 0.720 152 RHLFPQEAF 0.600 139 FHGPAFSTL 0.576 138 CFHGPAFST 0.500 19 TCA PAGPM 0.500 28 PCSRLPPSL 0.480 127 PADGPSNPL 0.480 131 PSNPLCCCF 0.432 31 RLPPSLRCS 0.360 113 RTPTRQIGS 0.300 14 RAVTPTCAT 0.300 94 LTMYVCAPV 0.210 11 RTSRAVTPT 0.200 4 RTTTWARRT 0.200 37 RCSLHSACC 0.200 84 LVPEAHPNA 0.180 83 VLVPEAHPN 0.180 85 VPEAHPNAS 0.180 579 70 SVPLLTHPA 0.180 120 GSIDTDPPA 0.180 62 TLGVVPQAS 0.168 57 APLQPTLGV 0.150 21 ATPAGPMPC 0.150 168 LSQVWSVVS 0.150 63 LGVVPQASV 0.150 172 WSVVSPAPS 0.150 163 HPIYDLSQV 0.150 129 DGPSNPLCC 0.150 140 HGPAFSTLN 0.150 106 DPPMALSRT 0.150 89 HPASLTMY 0.150 125 DPPADGPSN 0.150 38 CSLHSACCS 0.150 16 VTPTCATPA 0.150 TABLA XVI-V4-HLA-A24-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 92 ASLTMYVCA 0.150 580 170 QVWSVVSPA 0.140 167 DLSQVWSVV 0.140 12 TSRAVTPTC 0.140 87 EAHPNASLT 0.120 104 HPDPPMALS 0.120 158 EAFPAHPIY 0.120 176 VPHPDPPMA 0.120 102 LWGAPLQPT 0.120 54 LWGAPLQPT 0.120 35 SLRCSLHSA 0.100 27 MPCSRLPPS 0.100 7 TWARRTSRA 0.100 42 SACCSGDPA 0.100 91 NASLTMYVC 0.100 22 TPAGPMPCS 0.100 8 WARRTSRAV 0.100 43 ACCSGDPAS 0.100 5 TTTWARRTS 0.100 1 MTHRTTTWA 0.100 130 GPSNPLCCC 0.100 44 CCSGDPASY 0.100 135 LCCGHGPA 0.100 137 CCFHGPAFS 0.100 157 QEAFPAHP1 0.100 581 88 AHPNASLTM 0.075 159 AFPAHPIYD 0.075 101 PVPHPDPPM 0.075 103 PHPDPPMAL 0.072 86 PEAHPNASL 0.040 181 RGQALRRAR 0.036 117 RQIGSIDTD 0.030 79 QWEPVLVPE 0.025 69 ASVPLLTHP 0.022 155 FPQEAFPAH 0.022 TABLA XVI-V4-HLA-A24-9 ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 61 PTLGVVPQA 0.021 81 EPVLVPEAH 0.021 53 RLWGAPLQP 0.020 80 WEPVLVPEA 0.020 124 TDPPADGPS 0.018 58 PLQPTLWW 0.018 30 SRLPPSLRC 0.018 582 TABLA XVI-V20-HLA-A24-9MERS-PSCA 583 TABLA XVI—V21-HLA-A24-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 9 DPAQWEPVL 4.000 3 SVPLLTDPA 0.180 2 . ASVPLLTDP 0.022 8 TDPAQWEPV 0.015 584 TABLA XVI-V21&22-HLA-A2 -9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO ASVPLLTDL 8.640 TABLA XVI-V21&22-HLA-A24-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho ¦ INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 8 DLAQWEPVL 4.000 2 SVPLLTDLA 0.180 5 LLTDLAQWE 0.017 7 TDLAQWEPV 0.015 3 VPLLTDLAQ 0.015 585 TABLA XVI-V24-HLA-A24-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 586 TABLA XVI-V25-HLA-A24-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de in cio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 3 TPTRQISSI 1.000 2 RTPTRQISS 0.300 9 SSIDTDPPA 0.180 587 TABLA XVI-V25&26-HLA-A24-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 3 TRQISSSDT 0.015 6 ISSSDTDPP 0.010 588 TABLA XVI-V27-HLA-A24- MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 589 2 RGQALRRAQ 0.036 1 SRGQALRRA 0.010 TABLA XVII-V1-HLA-A24-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 82 KNITCCDTDL 12.000 27 KAQVSNEDCL 12.000 108 ALLPALGLLL 8.640 77 YYVGLLMOTC 7.500 4 VLLALLMAGL 7.200 104 AAILALLPAL 6.000 98 HALQPAAAIL 6.000 76 DYYVGKKNIT 6.000 6 LALLMAGLAL 6.000 91 LCNASGAHAL 6.000 35 CLQVENCTQL 6.000 100 LQPAAAILAL 6.000 59 LTVISKGCSL 6.000 13 LALQPGTALL 6.000 114 GLLLWGPGQL 6.000 590 TABLA XVII-VI-HLA-A24-10MERS-PSCA 591 Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 41 CTQLGEQCWT 0.150 11 AGLALQPGTA 0.150 86 CCDTDLCNAS 0.144 85 TCCDTDLCNA 0.120 62 ISKGCSLNCV 0.120 70 CVDDSQDYYV 0.120 39 ENCTQLGEQC 0.120 68 LNCVDDSQDY 0.120 40 NCTQLGEQCW 0.120 53 IRAVGLLTVI 0.120 94 ASGAHALQPA 0.120 95 SGAHALQPAA 0.120 22 LCYSCKAQVS 0.120 16 QPGTALLCYS 0.120 10 AGLALQPGT 0.120 47 QCWTARIRAV 0.100 61 VISKGCSLNC 0.100 97 AHALQPAAAI 0.100 88 DTDLCNASGA 0.100 592 78 YVGKKNITCC 0.100 5 LLALLMAGLA 0.100 75 QDYYVGKKNI 0.100 84 ITCCDTDLCN 0.100 83 NITCCDTDLC 0.100 90 DLCNASGAHA 0.100 58 LLTVISKGCS 0.100 65 GCSLNCVDDS 0.100 103 AAAILALLPA 0.100 21 LLCYSCKAQV 0.100 46 EQCWTARIRA 0.100 96 GAHALQPAAA 0.100 29 QVSNEDCLQV 0.100 1 KAVLLALLM 0.060 56 VGLLTVISKG 0.023 36 LQVENCTQLG 0.022 TABLA XVII-V1-HLA-A24-1O ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 30 VSNEDCLQVE 0.022 593 51 ARIRAVGLLT 0.021 66 CSLNCVDDSQ 0.021 64 KGCSLNCVDD 0.020 73 DSQDYYVGKK • 0.020 25 SCKAQVSNED 0.018 8 LLMAGLALQP 0.018 3 AVLLALLMAG 0.018 105 AILALLPALG 0.018 33 EDCLQVENCT 0.017 20 ALLCYSCKAQ 0.015 28 AQVSNEDCLQ 0.015 67 SLNCVDDSQD 0.015 113 LGLLLWGPGQ 0.015 34 DCLQVENCTQ 0.015 37 QVENCTQLGE 0.015 7 ALLMAGLALQ 0.015 48 C TARIRAVG 0.014 79 VGKKNITCCD 0.014 112 ALGLLLWGPG 0.012 17 PGTALLCYSC 0.012 43 QLGEQCWTAR 0.012 9 L AGLALQPG 0.012 110 LPALGLLLWG 0.012 32 NEDCLQVENC 0.010 594 93 NASGAHALQP 0.010 92 CNASGAHALQ' 0.010 80 GKKNITCCDR 0.010 TABLA XVII-V4-HLA-A24-1OMERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 159 AFPAHPIYDL 30.000 138 CFHGPAFSTL 24.000 31 RLPPSLRCSL 17.280 145 STLNPVLRHL 8.400 64 G VPQASVPL 7.200 85 VPEAHPNASL 6.000 65 WPQASVPLL 6.000 176 SPAPSRGQAL 5.760 165 IYDLSQVWSV 5.000 102 VPHPDPPMAL 4.800 27 MPCSRLPPSL 4.800 45 CSGDPASYRL 4.800 54 LWGAP1QPTL 4.800 146 TLNPVLRHLF 4.320 595 50 ASYRLWGAPL 4.000 113 RTPTRQIGSI 3.000 130 GPSNPLCCCF 2.400 135 LCCCFHGPAF 2.000 110 ALSRTPTRQI 1.000 100 APVPHPDPPM 0.900 96 MYVCAPVPHP 0.750 75 TGOAQWEOVL 0.600 87 EAHPNASLTM 0.600 126 PPADGPSNPL 0.576 51 SYRLWGAPLQ 0.500 142 PAFSTLNPVL 0.480 23 PAGPMPCSRL 0.480 11 RTSRAVTPTC 0.280 53 RLWGAPLQPT 0.240 79 QWEPVLVPEQ 0.238 84 LVPEQAHPNAS 0.216 69 ASVPLLTHPA 0.216 163 HPIYDLSQVW 0.216 66 VPQASVPLLT 0.210 169 SQVWSVVSPA 0.210 4 RTTTWARRTS 200 37 RCSLHSACCS 200 151 LRHLFPQEAF 200 596 TABLA XVII-V4-HLA-A-1OMERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 56 GAPLQPTLGV 0.150 156 PQEAFPAHPI 0.150 57 APLQPTLGW 0.150 129 DGPSNPLCCC 0.150 21 ATPAGPMPCS 0.150 175 VSPAPSRGQA 0.150 60 QPTLGVVPQA 0.140 93 SLTMYVCAPV 0.140 160 FPAHPIYDLS 0.140 150 VLRHLFPQEA 0.132 46 SGDPASYRLW 0.120 123 DTDPPADGPS 0.120 35 SLRCSLHSAC 0.120 15 AVTPTCATPA 0.120 597 TABLA XVII-V4-HLA-A24-1OMERS-PSCA Cada péptldo es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición 598 de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 154 LFPQEAFPAH 0.090 18 PTCATPAGPM 0.050 143 AFSTLNPVLR 0.050 117 RQIGSIDTDP 0.042 14 RAVTPTCATP 0.030 61 PTLGVVPQAS 0.025 166 YDLSQVWSW 0.021 10 RRTSRAVTPT 0.020 124 TDPPADGPSN 0.018 30 SRLPPSLRCS 0.018 25 GPMPCSRLPP 0.018 155 PPQEAFPAH 0.018 106 DPPMALSRTP 0.018 133 NPLCCCFHGP 0.017 120 GSIDTDPPAD 0.015 78 AQWEPVLVPE 0.015 101 PVPHPDPPMA 0.015 24 AGPMPCSRLP 0.015 94 LTMYVCAPVP 0.015 99 CAPVPHPDPP 0.015 599 ????,? XVII-VI9-HLA-A24-1OMERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 6 CSRLLPSLRC 0.100 10 LPSLRCSLHS 0.100 2 GPMPCSRLLP 0.018 7 SRLLPSLRCS 0.015 600 TABLA XVII-V21-HLA-A24-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 601 TABLA XVII-V21&22-HLA-A24-10 ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es 602 la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 1 QASVPLLTDL 4.800 8 TDLAQWEPVL 0.600 2 AS PLLTDLA 0.216 4 VPLLTDLAQW 0.150 7 LTDLAQWEPV 0.100 9 DLAQWEPVLV 0.100 3 SVPLLTDLAQ 0.015 6 LLTDLAQWEP 0.013 5 PLLTDLAQWE 0.002 TABLA XVII-V22-HLA-A24-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 1 QASVPLLTHL 4.800 8 THLAQWEPVL 0.600 2 ASVPLLTHTA 0.216 4 VPLLTHLAQW 0.150 7 LTHLAQ EPV 0.100 9 HLAQWEPVLV 0.100 603 TABLA XVII-V25-HLA-A24-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición 604 TABLA XVII-V26-HLA-A24-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 605 TABLA XVII-V27-HLA-A24-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO:; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO PSRGQALRRA 0.010 TABLA XVII-V27-HLA-A24-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve 606 INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 2 SRGQALRRAQ 0.001 TABLA XVIII-V1-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 50 TARIRAVGL 120.000 101 QPAAAILAL 80.000 60 TVIS GCSL 120.000 13 LALQPGTAL 18.000 107 LALLPALGL 18.000 28 AQVSNEDCL 12.000 105 AILALLPAL 12.000 108 ALLPALGLL 12.000 99 ALQPAAAIL 12.000 7 ALLMAGLAL 12.000 14 ALQPGTALL 12.000 92 CNASGAHAL 4.000 36 LQVENCTQL 4.000 83 NITCCDTDL 4.000 109 LLPALGLLL 4.000 607 5 LLALLMAGL 4.000 115 LLLWGPGQL 4.000 2 KAVLLALLM 3.000 98 HALQPAAAI 1.800 3 " AVLLALLMA 1.500 102 PAAAILALL 1.200 54 RAVGLLTVI 1.200 51 ARIRAVGLL 1.200 TABLA XVIII-V1-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 52 RIRAVGLLT 1.000 104 AAILALLPA 0.900 78 YVG KNITC 0.500 16 QPGTALLCY 0.400 110 LPALGLLLW 0.400 1 MKAVLLALL 0.400 55 AVGLLTVIS 0.300 96 GAHALQPAA 0.300 11 AGLALQPGT 0.300 608 20 ALLCYSCKA 0.300 · 6 LALLMAGLA 0.300 27 KAQVSNEDC 0.300 22 LCYSCKAQV 0.200 30 VSNEDCLQV 0.200 47 QCWTARIRA 0.150 34 DCLQVENCT 0.100 18 GTALLCYSC 0.100 15 LQPGTALLC 0.100 62 ISKGCSLNC 0.100 95 SGAHALQPA 0.100 79 VGKKNITCC 0.100 40 NCTQLGEQC 0.100 43 QLGEQCWTA 0.100 100 LQPAAAILA 0.100 84 ITCCDTDLC 0.100 91 LCNASGAHA 0.100 42 TQLGEQCWT 0.100 12 GLALQPGTA 0.1000 58 LLTVISKGC 0.100 103 AAAILALLP 0.090 29 QVSNEDCLQ 0.050 45 GEQCWTARI 0.040 76 DYYVGKKNI 0.040 609 94 ASGAHALQP 0.030 TABLA XVIII-V1-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 112 ALGLLLWGP 0.030030 97 AHALQPAAA 0.030 70 CVDDSQDYY 0.030 8 LL AGLALQ 0.030. 10 MAGLALQPG 0.030 93 NASGAHALQ 0.030 19 TALLCYSCK 0.030 86 CCDTDLCNA 0.030 69 NCVDDSQDY 0.020 63 SKGCSLNCV 0.020 41 CTQLGEQCW 0.020 59 LTVISKGCS 0.020 85 TCCDTDLCN 0.020 61 VISKGCSLN 0.020 66 CSLNCVDDS 0.020 53 IRAVGLLTV 0.020 610 TABLA XVIII-V1-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada peptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 611 INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 9 L AGLALQP 0.010 25 SCKAQVSNE 0.010 68 LNCVDDSQD 0.010 106 ILALLPALG 0.010 89 TDLCNASGA 0.010 77 YYVGKKNIT 0.010 4 VLLALLMAG 0.010 56 VGLL VISK 0.010 82 KNITCCDTD 0.010 TABLA XVIII-V4-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición do inicio más ocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 32 LPPSLRCSL 120.000 160 FPAHPIYDL 120.000 66 VPQASVPLL 80.000 76 HPAQWEPVL 80.000 65 WPQASVPL 20.000 57 APLQPTLGV 18.000 24 AGPMPCSRL 18.000 612 114 TPTRQIGSI 8.000 111 LSRTPTRQI 6.000 8 WARRTSRAV 3.000 163 HPIYDLSQV 4.000 146 TLNPVLRHL 4.000 51 SYRLWGAPL 4.000 55 WGAPLQPTL 4.000 130 GPSNPLCCC 3.000 176 SPAPSRGQA 3.000 102 VPHPDPPMA 2.000 TABLA XVIII-V4-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SOBSECUENCIA REGISTRO 106 DPP ALSRT 2.000 19 TCATPAGPM 1.500 177 PAPSRGQAL 1.200 46 SGDPASYRL 1.200 143 AFSTLNPVL 1.200 12 TSRAVTPTC 1.000 35 SLRCSLHSA 1.000 613 101 PVPHPDPPM 0.750 25 GPMPCSRLP 0.600 22 TPAGPMPCS 0.600 94 LT YVCAPV 0.600 178 APSRGQALR 0.600 100 APVPHPDPP 0.600 127 PADGPSNPL 0.540 84 LVPEAHPNA 0.500 170 QVWS VSPA 0.500 70 SVPLLTHPA 0.500 9 ARRTSRAVT 0.450 14 RAVTPTCAT 0.450 28 PCSRLPPSL 0.400 89 HPNASLTMY 0.400 125 DPPADGPSN 0.400 27 MPCSRLPPS 0.400 139 FHGPAFSTL 0.400 88 AHPNASLTM 0.300 42 SACCSGDPA 0.300 48 DPASYRLWG 0.300 21 ATPAGPMPC 0.300 63 LGWPQASV 0.300 92 ASLTMYVCA 0.300 87 EAHPNASLT 0.300 614 91 NASLTMYVC 0.300 148 NPVLRHLFP 0.200 167 DLSQVWSVV 0.200 81 EPVLVPEAH 0.200 TABLA XVIII-V4-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 60 QPTLGVVPQ 0.200 133 NPLCCCFHG 0.200 155 FPQEAFPAH 0.200 17 TPTCATPAG 0.200 71 VPLLTHPAQ 0.200 141 GPAFSTLNP 0.200 104 NPDPP ALS 0.180 29 CSRLPPSLR 0.150 15 AVTPTCATP 0.150 85 VPEAHPNAS 0.120 11 RTSRAVTPT 0.100 129 DGPSNPLCC 0.100 16 VTPTCATPA 0.100 615 TABLA XVIII-V4-HLA-B7-9MERS-PSCA 616 TABLA XVIII-VI9-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 617 1 GPMPCSRLL 240.000 8 LLPSLRCSL 6.000 3 PCSRLLPS 0.400 4 PCSRLLPSL 0.400 9 LPSLRCSLH 0.200 5 CSRLLPSLR 0.100 7 RLLPSLRCS 0.020 6 SRLLPSLRC 0.015 2 PMPCSRLLP 0.002 TABLA XVI11-V20-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio _es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 8 SSRLWGAPL 40.000 3 SGDPASSRL 1.200 5 DPASSRL G 0.300 6 PASSRLWGA 0.030 7 ASSRLWGAP 0.030 1 CCSGDPASS 0.020 2 CSGDPASSR 0.015 4 GDPASSRLW 0.002 618 SRLWGAPLQ 0.001 TABLA XVI11-V21&22-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO ASVPLLTDL 12.000 619 8 DLAQWEPVL 4.000 2 SVPLLTDLA 0.500 3 VPLLTDLAQ 0.200 7 TDLAQWEPV 0.020 5 LL DLAQWE 0.010 6 LTDLAQWEP 0.003 4 PLLTDLAQW 0.002 TABLA XVIII-V22-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 1 ASVPLLTHL 12.000 8 HLAQWEPVL 4.000 9 LAQWEPVLV 0.600 2 SVPLLTHLA 0.500 3 VPLLTHLAQ 0.200 7 THLAQWEPV 0.020 6 LTHLAQWEP 0.010 5 LLTHLAQWE 0.010 4 PLLTHLAQW 0.002 620 TABLA XVIII-V24-HLA-B7-9MERS- SCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho TABLA XVIII-V25HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 621 TABLA XVI11-V25&26-HLA-b7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 1 TPTRQISS 0.400 7 SSSDTDPPA 0.100 5 QISSSDTDP 0.010 6 ISSSDTDPP 0.010 3 TRQISSSDT 0.010 622 TABLA XVI11-V27-HLA-B7-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 623 TABLA XIX-V1-HLA-B7-10 ERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 27 KAQVSNEDCL 12.000 13 LALQPGTALL 12.000 624 106 ILALLPALGL 6.000 12 GLALQPGTAL 6.000 35 CLQVENCTQL 4.000 59 LTVISKGCSL 4.000 91 LCNASGAHAL 4.000 114 GLLLWGPGQL 4.000 100 LQPAAAILAL 4.000 49 WTARIRAVGL 4.000 4 VLLALLMAGL 4.000 82 KNITCCDTDL 4.000 52 RIRAVGLLTV 2.000 29 QVSNEDCLQV 1.000 103 AAAILALLPA 0.900 78 YVGKKNITCC 0.500 16 QPGTALLCYS 0.400 70 CVDDSQDYYV 0.300 11 AGLALQPGTA 0.300 99 ALQPAAAILA 0.300 10 MAGLALQPGT 0.300 96 GAHALQPAAA 0.300 94 ASGAHALQPA 0.300 2 KAVLLALLMA 0.300 19 TALLCYSCKA 0.300 14 ALQPGTALLC 0.300 625 62 ISKGCSLNCV 0.200 110 LPALGLLLWG 0.200 21 LLCYSCKAQV 0.200 47 QCWTARIRAV 0.200 97 AHALQPAAAI 0.180 3 AVLLALLMAG 0.150 46 EQCWTARIRA 0.150 55 AVGLLTVISK 0.150 44 LGEQCWTARI 0.120 41 CTQLGEQCWT 0.100 TABLA XIX-V1-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 60 TVISKGCSLN 0.100 57 GLLTVISKGC 0.100 61 VISKGCSLNC 0.100 5 LLALLMAGLA 0.100 90 DLCNASGAHA 0.100 42 TQLGEQCWTA 0.100 39 ENCTQLGEQC 0.100 626 1 MKAVLLALLM 0.100 95 SGAHALQPAA 0.100 83 NITCCDTDLC 0.100 85' TCCDTDLCNA 0.100 54 RAVGLL VIS 0.060 75 QDYYVGKKNI 0.040 53 IRAVGLLTVI 0.040 51 ARIRAVGLLT 0.030 105 AILALLPALG 0.030 112 ALGLLLWGPG 0.030 8 LLMAGLALQP 0.030 28 AQVSNEDCLQ 0.030 93 NASGAHALQP 0.030 20 ALLCYSCKAQ 0.030 7 ALLMAGLALQ 0.030 88 DTDLCNASGA 0.030 69 NCVDDSQDYY 0.020 58 LLTVISKGCS • 0.020 65 GCSLNCVDDS 0.020 68 LNCVDDSQDY 0.020 40 NCTQLGEQCW 0.020 109 LLPALGLLLW 0.020 84 ITCCDTDLCN ¦ 0.020 22 LCYSCKAQVS 0.020 627 15 LQPGTALLCY 0.020 37 QVENCTQLGE 0.015 34 DCLQVENCTQ 0.010 33 EDCLQVENCT 0.010 25 SCKAQVSNED 0.010 TABLA XIX-V1-HLA-B7-10 ERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 79 VGKKNITCCD 0.010 73 KGCSLNCVDD 0.010 26 DSQDYYVGKK 0.010 92 CKAQVSNEDC 0.010 67 SLNCVDDSQD 0.010 80 GKK ITCCDT 0.010 66 CSLNCVDDSQ 0.010 76 DYYVGKKNIT 0.010 77 YYVGKKNITC 0.010 30 VSNEDCLQVE 0.010 24 YSCKAQVSNE 0.010 17 PGTALLCYSC 0.010 628 TABLA XIX-V4-HLA-B7-10MERS-PSCA 629 Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 126 PPADGPSNPL 12.000 50 ASYRLWGAPL 12.000 57 APLQPTLGVV 12.000 31 RLPPSLRCSL 6.000 8 WARRTSRAVT 4.500 141 GPAFSTLNPV 4.000 89 HPNASLTMYV 4.000 45 CSGDPASYRL 4.000 76 HPAQWEPVLV 4.000 145 STLNPVLRHL 4.000 87 EAHPNASLTM 3.000 60 QPTLGVVPQA 2.000 66 VPQASVPLLT 2.000 48 DPASYRLWGA 2.000 159 AFPAHPIYDL 1.800 23 PAGPMPCSRL 1.800 110 ALSRTPTRQI 1.800 15 AVTPTCATPA 1.500 29 CSRLPPSLRC 1.500 630 TABLA XIX-V4-HLA-B7-10MERS -PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos , y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 631 62 TLGVVPQASV 0.300 20 CATPAGPMPC 0.300 91 NASLTMYVCA 0.300 69 ASVPLLTHPA 0.300 125 DPPADGPSNP 0.200 32 LPPSLRCSLH 0.200 22 TPAGPMPCSR 0.200 148 NPVLRHLFPQ 0.200 106 DPPMALSRTP 0.200 155 FPQEAFPAHP 0.200 17 TPTCATPAGP 0.200 133 NPLCCCFHGP 0.200 93 SLTMYVCAPV 0.200 114 TPTRQIGSID 0.200 74 LTHPAQWEPV 0.200 53 RLWGAPLQPT 0.150 111 LSRTPTRQIG 0.150 137 CCGHGPAFST 0.150 129 DGPSNPLCCC 0.150 175 VSÑAÑSRGQA 0.150 18 PTCATPAGP 0.150 179 PSRGQALRRA 0.100 153 HLFPQEAFPA 0.100 11 RTSRAVTPTC 0.100 632 6 TTWARRTSRA 0.100 83 VLVPEAHPNA 0.100 119 IGSIDTDPPA 0.100 84 LVPEAHPNAS 0.100 169 SQWVSWSPA 0.100 115 PTRQIGSIDT 0.100 41 HSACCSGDPA 0.100 21 ATPAGPMPCS 0.090 174 VVSPAPSRGQ - 0.075 104 HPDPPMALSR 0.060 162 AHPIYDLSQV 0.060 42 SACCSGDPAS 0.060 TABLA XIX-V4-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 43 ACCSGDPASY 0.060 101 PVPHPDPP A 0.050 70 SVPLLTHPAQ 0.050 173 SVVSPAPSRG 0.050 97 YVCAPVPHPD 0.050 633 170 QVWSVVSPAP 0.050 33 PPSLRCSLHS 0.040 24 AGPMPCSRLP 0.030 146 TLNPVLRHLF 0.030 94 LTMYVCAPVP 0.030 92 ASLTMYVCAP 0.030 128 ADGPSNPLCC 0.030 68 QASVPLLTHP . 0.030 9 ARRTSRAVTP 0.030 78 AQWEPVLVPE 0.030 14 RAVTPTCATP 0.030 99 CAPVPHPDPP 0.030 109 MALSRTPTRQ 0.030 4 RTTTWARRTS 0.030 158 EAFPAHPIYD 0.030 166 YDLSQVWSW 0.020 TABLA XIX-V19-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 4 MPCSRLLPSL 80.000 634 TABLA XIX-V20-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 8 ASSRLWGAPL 12.000 3 CSGDPASSRL 4.000 635 6 DPASSRLWGA 2.000 9 SSRLWGAPLQ 0.100 1 ACCSGDPASS 0.060 2 CCSGDPASSR 0.015 4 SGDPASSRLW 0.006 7 PASSRLWGAP 0.003 5 GDPASSRLWG 0.002 10 SRLWGAPLQP 0.001 TABLA XIX-V21-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO:; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 10 DPAQWEPVLV 4.000 9 TDPAQWEPVL 0.400 5 VPLL DPAQW 0.400 3 ASVPLLTDPA 0.300 8 LTDPAQWEPV 0.060 4 SVPLLTDPAQ 0.050 2 QASVPLLTDP 0.030 7 LLTDPAQWEP 1.010 636 TABLA XIX-V21-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SDBSECUENCIA REGISTRO 6 PLLTDPAQWE 0.002 1 PQASVPLLTD 0.002 TABLA XIX-V21&22-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 1 QASVPLLTHL 12.000 8 THLAQWEPVL 0.400 4 VPLLTHLAQW 0.300 2 ASVPLLTDLA 0.200 9 DLAQWEPVLV 0.200 7 LTDLAQWEPV 0.050 3 SVPLLTDLAQ 0.045 6 LLTDLAQWEP 0.010 5 PLLTDLAQ E 0.001 637 TABLA XIX-V24-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posic ón de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 10 TPVPHPDPPM 30.000 1 NASLTMYVCT 0.300 638 3 SLTMYVCTPV 0.200 7 YVCTPVPHPD 0.050 2 ASLTMYVCTP 0.030 4 LTMYVCTPVP 0.030 8 VCTPVPHPDP 0.015 9 CTPVPHPDPP 0.010 5 TMYVCTPVPH 0.010 6 YVCTPVPHP 0.002 TABLA XIX-V25-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECÜENCIA REGISTRO 3 RTPTRQISSI 0.400 1 LSRTPTRQIS 0.300 4 TPTRQISSID 0.200 9 ISSIDTDPPA 0.100 5 PTRQISSIDT 0.100 10 SSIDTDPPAD 0.010 7 RQISSIDTDP 0.010 8 QISSIDTDPP 0.010 2 SRTPTRQISS 0.002 639 TRQI SSIDTD 0.001 TABLA XIX-V25&26-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO TABLA XIX-V25&26-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 2 TPTRQISSSD 0.200 ' 7 ISSSDTDPPA 0.100 3 PTRQISSSDT 0.100 1 TRPTRQISSS 0.020 8 SSSDTDPPAD 0.010 6 QISSSDTDPP 0.010 5 RQISSSDTDP 0.010 4 TRQISSSDTD 0.001 640 TABLA XIX-V27-HLA-B7-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 1 PSRGQALRRA 0.100 2 SRGQALRRAQ 0.002 641 TABLA XX-V1-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 16 QPGTALLCY 40.000 101 QPAAAILAL 20.000 2 KAVLLALLM 12.000 110 LPALGLLLW 10.000 50 TARIRAVGL 9.000 69 NCVDDSQDY 6.000 107 LALLPALGL 3.000 30 VSNEDCLQV 3.000 13 LALQPGTAL 3.000 54 RAVGLLTVI 2.400 36 LQVENCTQL 2.000 62 ISKGCSLNC 1.500 70 CVDDSQDYY 1.200 98 HALQPAAAI 1.200 60 TVISKGCSL 1.000 99 ALQPAAAIL 1.0001.000 108 ALLPALGLL 1.000 105 AILALLPAL 1.000 642 TABLA XX-V1-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 643 INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 85 TCCDTDLCN 0.200 43 QLGEQCWTA 0.200 22 LCYSCKAQV 0.200 42 TQÑGEQCWT 0.200 84 ITCCDTDLC 0.150 100 LQPAAAILA 0.100 59 LTVISKGCS 0.100 78 YVGKKNITC 0.100 12 GLALQPGTA 0.100 73 DSQDYYVGK 0.100 47 QCWTARIRA 0.100 18 GTALLCYSC 0.100 61 VISKGCSLN 0.100 15 LQPGTALLC 0.100 55 AVGLLTVIS 0.100 3 AVLLALLMA 0.100 1 MKAVLLALL 0.100 51 ARIRAVGLL 0.100 95 SGAHALQPA 0.100 91 LCNASGHA 0.100 20 ALLCYSCKA 0.100 58 LLTVISKGC 0.100 34 DCLQVENCT 0.100 644 40 NCTQLGEQC 0.100 11 AGLALQPGT 0.100 94 ASGAHALQP 0.050 86 CCDTDLCNA 0.045 45 GEQCWTARI 0.040 76 DYYVGKKNI 0.030 25 SCKAQVSNE 0.030 19 TALLCYSCK 0.030 93 NASGAHALQ 0.030 103 AAAILALLP 0.030 10 MAGLALQPG 0.030 64 KGCSLNCVD 0.020 63 SKGCSLNCV 0.020 TABLA XX-V1-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 82 KNITCCDTn 0.020 87 CDTDLCNAS 0.020 53 IRAVGLLTV 0.020 81 KKNITCCDT 0.020 645 48 CWTARIRAV 0.020 29 QVSNEDCLQ 0.015 68 LNCVDDSQD 0.015 35 CLQVENCTQ 0.015 113 LGLLL GPG 0.010 90 DLCNASGAH 0.010 114 GLLL GPGQ 0.010 33 EDCLQVENC 0.010 21 LLCYSCKAQ 0.010 67 SLNCVDDSQ 0.010 57 GLLTVISKG 0.010 23 CYSCKAQVS 0.010 112 ALGLLLWGP 0.010 17 PGTALLCYS 0.010 56 VGLLTVISK 0.010 49 WTARIRAVG 0.010 9 LMAGLALQP 0.010 39 ENCTQLGEQ 0.010 65 GCSLNCVDD 0.010 97 AHALQPAAA 0.010 106 ILALLPALG 0.010 8 LL AGLALQ 0.010 46 EQCWTARIR 0.010 89 DLCNASGA 0.010 646 TABLA XX-V4-HLA-B3501-9ME S-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO TABLA XX-V4-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 89 HPNASLTMY 40.000 76 HPAQWEPVL 20.000 32 LPPSLRCSL 20.000 160 FPAHPIYDL 20.000 66 VPQASVPLL 20.000 114 TPTRQIGSI 8.000 163 HPIYDLSQV 6.000 158 EAFPAHPIY 6.000 111 LSRTPTRQI 6.000 57 APLQPTLGV 4.000 125 DPPADGPSN 3.000 102 VPHPDPPMA 3.000 647 44 CCSGDPASY 2.000 130 GPSNPLCCC 2.000 27 MPCSRLPPS 2.000 176 SPAPSRGQA 2.000 22 TPAGPMPCS 2.000 19 TCATPAGPM 2.000 106 DPP ALSRT 2.000 8 WARRTSRAV 1.800 12 TSRAVT TC 1.500 147 LNPVLRHLF 1.000 146 TLNPVLRHL 1.000 65 VPQASVPL 1.000 120 GSIDTDPPA 1.000 55 WGAPLQPTL 1.000 24 AGPMPCSRL 1.000 36 CCCFHGPAF 1.000 104 HPDPPMALS 0.600 85 VPEAHPNAS 0.600 14 RAVTPTCAT 0.600 131 PSNPLCCCF 0.500 92 ASLTMYVCA 0.500 38 CSLHSACCS 0.500 172 WSWSPAPS 0.500 168 LSQVWSVVS 0.500 648 TABLA XX-V4-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 155 FPQEAFPAH 0.400 35 SLRCSLHSA 0.300 91 NASLTMYVC 0.300 87 EAHPNASLT 0.300 177 PAPSRGQAL 0.300 46 SGDPASYRL 0.300 42 SACCSGDPA 0.300 51 SYRLWGAPL 0.300 152 RHLFPQEAF 0.200 71 VPLLTHPAQ 0.200 113 RTPTRQIGS 0.200 63 LGVVPQASV 0.200 11 RTSRAVTPT 0.200 133 NPLCCCFHG 0.200 167 DLSQV SVV 0.200 81 EPVLVPEAH 0.200 . 148 NPVLRHLFP 0.200 25 GPMPCSRLP 0.200 649 TABLA XX-V4-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID N08 : ; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 650 INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 135 LCCCFHGPA 0.100 1 MTHRTTTWA 0.100 139 FHGPAFSTL 0.100 45 CSGDPASYR 0.100 28 CSGDPASYR 0.100 5 TTTWARRTS 0.100 164 PIYDLSQVW 0.100 70 SVPLLTHPA 0.100 43 ACCSGDPAS 0.100 62 TLGWPQAS 0.100 170 QVWSWSPA 0.100 129 DGPSNPLCC 0.100 137 CCFHGPAFS 0.100 140 HGPAFSTLN 0.100 127 PADGPSNPL 0.090 77 PAQWEPVLV 0.090 142 PAFSTLNPV 0.060 69 ASVPLLTHP 0.050 144 FSTLNPVLR 0.050 72 PI,T,THPAQW 0.050 175 VSPAPSRGQ 0.050 47 GDPASYRLW 0.050 34 PSLRCSLHS 0.050 651 TABLA XX- 20-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición 652 TABLA XX-V19-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECÜENCIA REGISTRO 9 DPAQWEPVL 20.000 4 VP1LTDPAQ 0.200 3 SVPLLTDPA 0.100 5 PLLTDPAQW 0.075 2 ASVPLLTDP 0.050 653 TABLA XX-V22-HLA-V3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 654 TABLA XX-V24-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8 ; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido 655 TABLA XX-V25-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 3 TPTRQISSI 8.000 9 SSIDTDPPA 1.000 2 RTPTRQISS 0.200 8 ISSIDTDPP 0.075 6 RQISSIDTD 0.020 7 QISSIDTDP 0.010 5 TRQISSIDT 0.010 1 SRTPTRQIS 0.010 4 PTRQISSID 0.003 656 TABLA XX-V25&26-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO PTRQISSSD 0.003 TABLA XX-V26-HLA-B3501-9MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada 657 TABLA XXI-V1-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada 658 péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 101 QPAAAILALL 20.000 50 TARIRAVGLL 9.000 27 KAQVSNEDCL 6.000 69 NCVDDSQDYY 4.000 54 RAVGLLTVIS 3.000 6 LALLMAGLAL 3.000 62 ISKGCSLNCV 3.000 104 AAILALLPAL 3.000 107 LALLPALGLL 3.000 13 LALQPGTALL 3.000 68 LNCVDDSQDY 3.000 82 KNITCCDTDL 2.000 16 QPGTALLCYS 2.000 15 LQPGTALLCY 2.000 52 RIRAVGLLTV 1.200 100 LQPAAAILAL 1.000 108 ALLPALGLL 1.000 114 GLLLWGPGQL 1.000 59 LTVISKGCSL 1.000 106 ILALLPALGL 1.000 4 VLLALLMAGL 1.000 49 WTARIRAVGL 1.000 659 91 LCNASGAHAL 1.000 12 GLALQPGTAL 1.000 35 CLQVENCTQL 1.000 54 RAVGLLTVIS 0.600 2 KAVLLALLMA 0.600 109 - LLPALGLLLW 0.500 94 ASGAHALQPA 0.500 40 NCTQLGEQCW 0.500 10 MAGLALQPGT 0.300 19 TALLCYSCKA 0. 0 96 GAHALQPAAA 0.300 103 AAAILALLPA 0.300 85 TCCDTDLCNA 0.300 29 QVSNEDCLQV 0.300 TABLA XXI-V1-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 21 LLCYSCKAQV 0.200 1 MKAVLLALLM 0.200 47 QCWTARIRAV 0.200 660 110 LPALGLLLWG 0.200 41 CTQLGEQCWT 0.150 83 NITCCDTDLC 0.150 44 LGEQCWTARI 0.120 70 CVDDSQDYYV 0.120 14 ALQPGTALLC 0.100 58 LLTVISKGCS 0.100 73 DSQDYYVG K 0.100 5 LLALLMAGLA 0.100 42 TQLGEQCWTA 0.100 84 ITCCDTDLCN 0.100 61 VISKGCSLNC 0.100 65 GCSLNCVDDS 0.100 22 LCYSCKAQVS 0.100 95 SGAHALQPAA 0.100 78 YVGKKNITCC 0.100 90 DLCNASGAHA 0.100 46 EQCWTARIRA 0.100 30 VSNEDCLQVE 0.100 99 ALQPAAAILA 0.100 57 GLLTVISKGC 0.100 60 TVISKGCSLN 0.100 39 ENCTQLGEQC 0.100 11 AGLALQPGTA 0.100 661 31 SNEDCLQVEN 0.060 24 YSCKAQVSNE 0.050 66 CSLNCVDDSQ 0.050 97 AHALQPAAAI 0.040 75 QDYYVGKKNI 0.040 53 IRAVGLLTVI 0.040 25 SCKAQVSNED 0.030 79 VGKKNITCCD 0.030 93 NASGAHALQP 0.030 TABLA XXI-V1—HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 80 GKK I CCDT 0.030 74 SQDYYVGKKN 0.030 86 CCDTDLCNAS 0.030 88 DTDLCNASGA 0.030 36 LQVENCTQLG 0.020 64 GCSLNCVDD 0.020 43 QLGEQCWTAR 0.020 28 AQVSNEDCLQ 0.015 662 TABLA XXI-V4-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido 663 e 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SÜBSECUENCIA REGISTRO 100 APVPHPDPPM 40.000 130 GPSNPLCCCF 20.000 176 SPAPSRGQAL 20.000 27 MPCSRLPPSL 20.000 102 VPHPDPP AL 20.000 45 CSGDPASYRL 10.000 163 HPIYDLSQVW 10.000 71 VPLLTHPAQW 10.000 85 VPEAHPNASL 6.000 87 EAHPNASLTM 6.000 76 HPAQWEPVLV 6.000 50 ASYRLWGAPL 5.000 141 GPAFSTLNPV 4.000 57 APLQPTLGVV 4.000 89 HPNASLT YV 4.000 126 PPADGPSNPL 4.000 43 ACCSGDPASY 3.000 60 QPTLGVVPQA 2.000 66 VPQASVPLLT 2.000 31 RLPPSLRCSL 2.000 160 FPAHPIYDLS 2.000 664 48 DPASYRLWGA 2.000 12 TSRAV PTCA 1.500 29 CSRLPPSLRC 1.500 135 LCCCFHGPAF 1.000 65 WPQASVPLL 1.000 146 TLNPVLRHLF 1.000 64 GWPQASVPL 1.000 145 STLNPVLRHL 1.000 8 WARRTSRAVT 0.900 113 RTPTRQIGSI 0.800 56 GAPLQPTLGV 0.600 69 ASVPLLTHPA 0.500 175 VSPAPSRGQA 0.500 41 HSACCSGDPA 0.500 155 FPQEAFPAHP 0.400 TABLA XXI-V4-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 110 ALSRTPTRQI 0.400 35 SLRCSLHSAC 0.300 665 20 CATPAGPMPC 0.300 91 NASLTMYVCA 0.300 142 PAFSTLNPVL 0.300 150 VLRHLFPQEA 0.300 42 SACCSGDPAS 0.300 23 PAGPMPCSRL 0.300 53 RLWGAPLQPT 0.200' 32 LPPSLRCSLH 0.200 125 DPPADGPSNP 0.200 74 LTHPAQWEPV 0.200 11 RTSRAVTPTC 0.200 148 NPVLRHLFPQ 0.200 18 PTCATPAGPM 0.200 81 EPVLVPEAHP 0.200 84 LVPEAHPNAS 0.200 106 DPPMALSRTP 0.200 25 GPMPCSRLPP 0.200 33 PPSLRCSLHS 0.200 178 APSRGQALRR 0.200 22 TPAGPMPCSR 0.200 4 RTTTWARRTS 0.200 17 TPTCATPAGP 0.200 93 SLTMYVCAPV 0.200 37 RCSLHSACCS 0.200 666 133 NPLCCCFHGP 0.200 62 TLGVVPQASV 0.200 157 QEAFPAHPIY 0.200 88 AHPNASLTMY 0.200 107 PPMALSRTPT 0.200 114 TPTRQIGSID 0.200 120 GSIDTDPPAD 0.150 46 SGDPASYRLW 0.150 111 LSRTPTRQIG 0.150 153 HLFPQEAFPA 0.150 TABLA XXI-V4-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 179 PSRGQALRRA 0.150 15 AVTPTCATPA 0.100 119 IGSIDTDPPA 0.100 83 VLVPEAHPNA 0.100 6 TTWARRTSRA 0.100 151 LRHLFPQEAF 0.100 54 LWGAPLQPTL 0.100 667 TABLA XXI-VI9-HLA-B3501-1OMERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO 668 TABLA XXI-V20-HLA—B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 3 CSGDPASSRL 10.000 8 ASSRL GAPL 5.000 6 DPASSRLWGA 2.000 9 SSRLWGAPLQ 0.150 669 TABLA XXI-V21-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve 670 BLA XXI-V22-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido 671 TABLA XXI-V24-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada 672 TABLA XXI-V25-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 1 LSRTPTRQIS 1.500 3 RTPTRQISSI 0.800 9 ISSIDTDPPA 0.500 4 TPTRQISSID 0.200 10 SSIDTDPPAD 0.150 673 TABLA XXI-V25-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO TRQISSIDTD 0.001 TABLA XXI-V25&26-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve INICIO SUBSECUENCIA REGISTRO 7 ISSSDTDPPA 0.500 1 RTPTRQISSS 0.200 2 TPTRQISSSD 0.200 8 SSSDTDPPAD 0.150 3 PTRQISSIDT 0.030 5 RQISSSDTDP 0.020 674 TABLA XXI-V27-HLA-B3501-10MERS-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve 675 TABLA XXII-V4-HLA-Al-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 676 Pos 123456789 Registro 123 DTDPPADGP 21 158 EAFPAHPIY 19 104 HPDPPMALS 17 44 CCSGDPASY 16 46 SGDPASYRL 16 79 QWEPVLVPE 16 89 HPNASLTMY 16 145 STLNPVLRH 16 30 SRLPPSLRC 13 179 PSRGQALRR 13 121 SIDTDPPAD 12 127 PADGPSNPL 12 85 VPEAHPNAS 11 34 PSLRCSLHS 10 61 PTLGVVPQA 10 TABLA XXII-V4-HLA-Al-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 67 PQASVPLLT 10 677 TABLA XXII-V20-HLA-Al-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 678 TABLA XXII-V22-HLA-Al-9mers-PSCA 679 TABLA XXII-V25-HLA-Al-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada 680 TABLA XXII-V26-HLA-A1- 9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada 681 TABLA XXI11-VI-HLA-AO201-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 14 ALQPGTALL 30 108 ALLPALGLL 30 105 AILALLPAL 29 682 5 LLALLMAGL 28 7 ALLMAGLAL 26 99 ALQPAAAIL 26 115 LLLWGPGQL 26 109 LLPALGLLL 24 53 IRAVGLLTV 23 8 LLMAGLALQ 21 20 ALLCYSCKA 21 107 LALLPALGL 21 13 LALQPGTAL 20 1 MKAVLLALL 19 4 VLLALLMAG 19 12 GLALQPGTA 19 54 RAVGLLTVI 19 57 GLLTVISKG 19 60 TVIS GCSL 19 102 PAAAILALL 19 43 QLGEQCWTA 18 51 ARIRAVGLL 18 98 HALQPAAAI 18 101 QPAAAILAL 18 112 ALGLLLWGP 18 3 AVLLALLMA 17 50 TARIRAVGL 17 683 63 SKGCSLNCV 17 83 NITCCDTDL 17 104 AAILALLPA 17 106 ILALLPALG •17 9 LMAGLALQP 16 92 CNASGAHAL 16 22 LCYSCKAQV 15 30 VSNEDCLQV 15 67 SLNCVDDSQ 15 TABLA XXI11-VI-HLA-A0201-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 114 GLLLWGPGQ 15 36 LQVENCTQL 14 48 CWTARIRAV 14 46 SGDPASYRL 15 127 PADGPSNPL 1 139 FHGPAFSTL 15 153 HLFPQEAFP 15 163 HPIYDLSQV 15 684 TABLA XXIII-V4-HLA-A0201-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 685 146 TLNPVLRHL 27 35 SLRCSLHSA 23 58 PLQPTLG V 23 166 YDLSQVWSV 20 57 APLQPTIGV 19 160 FPAHPIYDL 19 167 DLSQVWSW 19 55 WGAPLQPTL 18 94 LTMYVCAPV 18 63 LGWPQASV 17 65 VVPQASVPL 17 93 SLTMYVCAP 17 142 PAFSTLNPV 17 31 RLPPSLRCS 16 66 VPQASVPLL 16 8 WARRTSRAV 15 32 LPPSLRCSL 15 46 SGDPASYRL 15 127 PADGPSNPL 15 139 FHGPAFSTL 15 153 HLFPQEAFP 15 163 HPIYDLSQV 15 39 SLHSACCSG 14 51 SYRLWGAPL 14 686 TABLA XXIII-V19-HLA-A02Ól-9mers-PSCA 687 TABLA XXIII-V21-HLA-A0201-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada 688 péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 3 SVPLLTDPA 13 6 LLTDPAQWE 13 1 QASVPLLTD 12 9 DPAQWEPVL 12 5 PLLTHPAQW 11 7 LTDPAQWEP 10 8 TDPAQWEPV 10 2 ASVPLLTDP 9 TABLA XXI11-V21&22-HLA- 0201-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 8 DLAQWEPVL 22 1 AS PLLTDL 19 4 PLLTDLAQ 15 2 SVPLLTDLA 13 5 LLTDLAQWE 13 7 TDLAQWEPV 12 689 TABLA XXIII-V22-HLA-A0201-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro HLAQWEPVL 23 TABLA XXIII-V24-HLA-AO201-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada 690 TABLA XXIII-V25-HLA-A0201-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro QISSIDTDP 691 TABLA X III-V25&26-HLA-A0201-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 5 QISSSDTDP 8 7 SSSDTDPPA 8 1 TPTRQISSS 5 3 TRQISSSDT 4 4 RQISSSDTD 4 6 ISSSDTDPP 4 2 PTRQISSSD 3 T BLA XXIII-V26-HLA-A0201-9ners-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 5 QIGSSDTDP 8 7 GSSDTDPPA 7 3 TRQIGSSDT 6 692 TABLA XXIII-V27-HLA-AO201-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro SRGQALRRA 10 TABLA XXIV-VI-HLA-AO203-9mers-PSCA Pos 123456789 Registro Resultados no Encontrados 693 TABLA XXIV-V4-HLA-A02O3-9mers-PSCA 123456789 Registro Resultados no Encontrados TABLA XXIV-V19-HLA--A0203-9mers--PSCA 12345E 5789 Registro Resultados no Encontrados TABLA XXIV-V22-HLA-A0203-9mers- PSCA 123456789 Registro Resultados no Encontrados 694 TABLA XXV-Vl-HLA-A3-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 52 RIRAVGLLTV 24 695 TABLA XXV-Vl-HLA-A3-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 7 ALLMAGLAL 22 99 ALQPAAAIL 22 14 ALQPGTALL 21 3 AVLLALLMA 20 60 TVISKGCSL 19 108 ALLPALGLL 19 115 LLLWGPGQL 19 12 GLALQPGTA 18 55 AVGLLTVIS 18 106 HALLPALG 18 109 LLPALGLLL 18 8 LLMAGLALQ 17 43 QLGEQCWTA 17 70 CVDDSQDYY 17 90 DLCNASGAH 17 4 VLLALLMAG 16 19 TALLCYSCK 16 57 GLLTVISKG 16 696 TABLA XXV-Vl-HLA-A3-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 697 53 IRAVGLLTV 12 74 SQDYYVGKK 12 16 QPGTALLCY 11 21 LLCYSCKAQ 11 54 RAVGLLTVI 11 103 AAAILALLP 11 TABLA XXV-V4-HLA-A3-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 15 AVTPTCATP 23 53 RLWGAPLQP 23 64 GVVPQASVP 23 173 SVVSPAPSR 20 72 PLLTHPAQW 19 58 PLQPTLGW 18 110 ALSRTPTRQ 18 167 DLSQVWSVV 18 10 RRTSRAVTP 17 31 RLPPSLRCS 17 164 PIYDLSQVW 17 698 174 VVSPAPSRG 17 35 SLRCSLHSA 16 83 VLVPEAHPN 16 150 VLRHLFPQE 16 153 HLFPQEAFP 16 170 QVWSVVSPA 16 82 PVLVPEAHP 15 105 PDPPMALSR 15 TABLA XXV-V4-HLA-A3-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 149 PVLRHLFPQ 15 178 APSRGQALR 15 179 PSRGQALRR 15 9 ARRTSRAVT 14 44 CCSGDPASY 14 65 VVPQASVPL 14 73 LLTHPAQWE 14 146 TL PVLRHL 14 39 SLHSACCSG 13 699 TABLA XXV-V19-HLA-A3-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada 700 TABLA XXV-V21-HLA~A3-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada 701 TABLA XXV-V22-HLA-A3-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 702 TABLA XXV-V25-HLA-A3-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro RQISSIDTD 11 703 7 QISSIDTDP 11 2 RTPTRQISS 8 3 TPTRQISSI 8 4 PTRQISSID 6 1 SRTPTRQIS 5 9 SSIDTDPPA 5 TABLA XXV-V25&26-HLA-A3-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 4 RQISSSD D 11 5 Q1SSSDTDP 11 1 TPTRQISSS 8 2 PTRQISSSD 8 TABLA XXV-V26-HLA-A3-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 4 RQIGSSDTD 13 704 PTRQIGSSD 11 TABLA XXV-V27-HLA-A3~9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro RGQALRRAQ TABLA XXVi-Vl-HLA-A26-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada 705 péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 60 TVISKGCSL 27 70 CVDDSQDYY 21 105 AILALLPAL 18 51 ARIRAVGLL 17 88 DTDLCNASG 17 3 AVLLALLMA 16 , 36 LQVENCTQL 16 16 QPGTALLCY 15 39 ENCTQLGEQ 15 TABLA XXVi-Vl-HLA-A26-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 69 NCVDDSQDY 15 28 AQVSNEDCL 14 33 EDCLQVENC 14 101 QPAAAILAL 14 102 PAAAILALL 14 108 ALLPALGLL 14 706 - 1 M AVLLALL 13 59 LTVISKGCS 13 78 YVGKKNITC 13 83 NITCCDTDL 13 TABLA XXVi-V4-HLA-A26-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 158 EAFPAHPIY 25 65 VVPQASVPL 18 123 DTDPPADGP 17 173 SVVSPAPSR 17 64 GWPQASVP 16 170 QVWSWSPA 16 81 EPVLVPEAH 15 89 HPNASLTMY 15 97 YVCAPVPHP 14 145 STLNPVLRH 14 146 TLNPVLRHL 14 149 PVLRHLFPQ 14 15 AVTPTCATP 13 707 TABLA XXVi-VI9-HLA-A26-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro PCSRLLPSL 14 708 TABLA XXVÍ-V20-HLA-A26-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 3 SGDPASSRL 11 5 DPASSRLWG 10 8 SSRL GAPL 10 6 PASSRL GA 5 TABLA XXVi- 21-HLA-A26- mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 9 DPAQWEPVL 16 3 SVPLLTDPA 12 2 ASVPLLTDP 10 7 LTDPAQWEP 9 709 TABLA XXVi-V24~HLA-A26-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido 710 TABLA XXVi-V25&26-HLA-A26-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada 711 TABLA XXVi-V25&26-HLA-A26-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro QISSSDTDP TABLA XXVi-V27-HLA-A26- me s-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada 712 TABLA XXVII-Vl-HLA-B0702-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 101 QPAAAILAL 25 7 ALLMAGLAL 16 13 LALQPGTAL 16 14 LALQPGTAL 15 105 AILALLPAL 15 107 LALLPALGL 15 50 TARIRAVGL 14 99 ALQPAAAIL 14 109 LLPALGLLL 14 16 QPGTALLCY 13 51 ARIRAVGLL 13 52 RIRAVGLLT 13 102 PAAAILALL 13 713 TABLA XXVII-V4-HLA-B0702-9me s-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 714 176 SPAPSRGQA 19 102 VPHPDPPMA 18 22 TPAGPMPCS 17 127 PADGPSNPL 17 104 HPDPPMALS 16 106 DPPMALSRT 16 114 TPTRQIGSI 16 143 AFSTLNPVL 16 163 HPIYDLSQV 16 24 AGPMPCSRL 15 51 SYRLWGAPL 15 86 PEAHPNASL 15 130 GPSNPLCCC 15 178 APSRGQALR 15 48 DPASYRLWG 14 60 QPTLGWPQ 14 100 APVPHPDPP 14 103 PHPDPPMAL 14 141 GPAFSTLNP 14 9 ARR SRAVT 13 17 TPTCATPAG 13 28 PCSRLPPSL 13 55 WGAPLQPTL 13 65 VVPQASVPL 13 715 125 DPPADGPSN 13 139 FHGPAFSTL 13 148 NPVLRHLFP 13 155 FPQEAFPAH 13 11 RTSRAVTPT 12 14 RAVTPTCAT 12 25 GP PCSRLP 12 27 MPCSRLPPS 12 33 PPSLRCSLH 12 46 SGDPASYRL 12 54 L GAPLQPT 12 TABLA XXVII-V4-HLA-B0702-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 71 VPLLTHPAQ 12 81 EPVLVPEAH 12 85 VPEAHPNAS 12 89 HPNASLTMY 12 107 PP ALSRTP 12 111 LSRTPTRQI 12 716 TABLA XXVII-V20-HLA-B0702- mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada 717 TABLA XXVII-V21&22-HLA-B0702~9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 1 ASVPLLTDL 14 3 VPLLTDLAQ 13 8 DLAQWEPVL 13 718 T BLA XXV11-V24-HLA-B0702-9mers-PSCA -Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más' ocho Pos 123456789 Registro 1 ASLTMYVCT 10 3 LTMYVCTPV 9 6 YVCTPVPHP 5 719 TABLA XXVII-V26-HLA-B0702-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido 720 TABLA XXVII-V27-HL -B0702-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro SRGQALRRA TABLA XXVIII-Vl-HLA-B08-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 50 TARIRAVGL 29 60 TVISKGCSL 20 721 101 QPAAAILAL 18 5 LLALLMAGL 17 7 ALL AGLAl 17 14 ALQPGTALL 16 99 ALQPAAAIL 16 108 ALLPALGLL 16 109 LLPALGLL1 16 115 LLLWGPGQL 16 13 LALQPGTAL 15 105 AILALLPAL 15 107 LALLPALGL 15 83 NITCCDTDL 14 102 PAAAILALL 14 TABLA XXVIII-V4-HLA-B08-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 177 PAPSRGQAL 23 51 SYRLWGAPL 19 66 VPQASVPLL 18 160 FPAHPIYDL 18 722 76 HPAQWEPVL 17 32 LPPSLRCSL 16 146 TLNPVLRHL 16 33 PPSLRCSLH 15 148 NPVLRHLFP 15 27 MPCSRLPPS 14 35 SLRCSLHSA 14 127 PADGPSNPL 14 TABLA XXVIII-V4-HLA-B08-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 49 PASYRLWGA 13 114 TPTRQIGSI 13 150 VLRHLFPQE 13 46 SGDPASYRL 12 65 VVPQASVPL 12 109 " MALSRTPTR 12 111 LSRTPTRQI 12 8 ARRTSRAV 11 86 PEAHPNASL 11 723 TABLA XXVIII-Vl9-HLA-B08-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 1 GPMPCSRLL 17 8 LLPSLRCSL 16 9 LPSLRCSLh 15 3 MPCSRLLPS 14 4 PCSRLLPSL 10 TABLA XXVIII-V20-HLA- B08-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 8 SSRLWGAPL 19 3 SGDPASSRL 12 724 PASSRLWGA 12 TABLA XXVI11-V22-HLA-B08-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada 725 TABLA XXVIII-V24-HLA-B08-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro SLTMYVCTP TABLA XXVIII-V25&26-HLA-B08-9mers-PSCA 726 TABLA XXVI11-V27-HLA-B08-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8 ; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 727 TABLA XXIX-Vl-HLA-B1510-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 728 Pos 123456789 Registro 99 ALQPAAAIL 12 105 AILALLPAL 12 108 ALLPALGLL 12 115 LLLWGPGQL • 12 7 ALLMAGLAL 11 28 AQVSNEDCL 11 51 ARIRAVGLL 11 60 TVISKGCSL 11 102 PAAAILALL 11 107 LALLPA1GLL 11 83 NITCCDTDL 10 109 LLPALGLLL 10 2 KAVLLALLM 6 53 IRAVGLLTV 6 TABLA XXIX-V4-HLA-B1510-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 103 PHPDPPMAL 24 139 FHGPAFSTL 23 729 152 RHLFRQEAF 18 88 AHPNASLT 17 55 WGAPLQPTL 15 76 HPAQWEPVL 15 146 T1NPVLRHL 15 46 SGDPASYRL 14 143 AFSTLNPVL 14 24 AGPMPCSRL 13 28 PCSRLPPSL 13 TABLA XX!X-V4-HLA-B1510-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 65 VVPQASVPL 13 160 FPAHPIYDL 13 2 THRTTTWAR 12 66 VPQASVPLL 12 86 PEAHPNASL 12 127 PADGPSNPL 12 32 LPPSLRCSL 11 40 LHSACCSGD 11 730 TABLA XXIX-V21-HLA-B1510-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido 731 TABLA XXIX-V24-HLA-B1510-9mers-PSCA 732 TABLA XXIX-V25-HLA-B1510-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 1 SRTPTRQIS 3 8 ISSIDTDPP 3 3 TPTRQISSI 2 6 RQISSIDTD 2 9 SSIDTDPPA 2 4 PTRQISSID 1 733 TABLA XXIX-V26-HLA-B1510-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 7 GSSDTDPPA 4 6 IGSSDTDPP 3 734 TABLA XXX-VI-HLA-B2705-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 51 ARIRAVGLL 24 54 RAVGLLTVI 18 13 LALQPGTAL 17 735 53 IRAVGLLTV 16 56 VGLLTVISK 16 105 AILALLPAL 16 107 LALLPALGL 16 2 AVLLALLM 15 14 ALQPGTALL 15 36 LQVENCTQL 15 108 ALLPALGLL 15 115 LLLWGPGQL 15 7 ALLMAGLAL 14 19 TALLCYSC 14 44 LGEQCWTAR 14 60 TVISKGCSL 14 99 ALQPAAAIL 14 101 QPAAAILAL 14 1 MKAVLLALL 13 5 LLALLMAGL 13 74 SQDYYVGKK 13 76 DYYVGKKNI 13 83 NITCCDTDL 13 92 CNASGAHAL 13 98 HALQPAAAI 13 102 PAAAILALL 13 28 AQVSNEDCL 12 736 45 GEQCWTARI 12 50 TARIRAVGL .12 57 GLLTVISKG 12 109 LLPALGLLL 12 46 EQCWTARIR 11 70 CVDDSQDYY 11 73 DSQDYYVG 11 TABLA XXX-V4-HLA-B2705-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 3 HRTTTWARR 23 152 RHLFPQEAF 19 30 SRLPPSLRC 18 • 10 RRTSRAVTP 17 52 YRLWGAPLQ 16 55 WGAPLQPTL 16 178 APSRGQALR 16 179 PSRGQALRR 16 24 AGP PCSRL 15 46 SGDPASYRL 15 737 127 PADGPSNPL 15 143 AFSTLNPVL 15 145 ' STLNPVLRH 15 160 FPAHPIYDL 15 ' 173 SVVSPAPSR 15 180 SRGQALRRA 15 181 RGQALRRAR 15 9 ARRTSRAVT 14 65 WPQASVPL 14 76 HPAQWEPVL 14 86 PEAHPNASL 14 105 PDPPMALSR 14 109 MALSRTPTR 14 116 TRQIGSIDT 14 6 TT ARRTSR 13 28 PCSRLPPSL 13 29 CSRLPPSLR 13. 45 CSGDPASYR 13 66 VPQASVPLL 13 117 RQIGSIDTD 13 139 FHGPAFSTL 13 146 TLNPVLRHL 13 158 EAFPAHPIY 13 13 SRAVTPTCA 12 738 23 PAGPMPCSR 12 32 LPPSLRCSL 12 TABLA XXX-V4-HLA-B2705-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 36 LRCSLHSAC 12 44 CCSGDPASY 12 51 SYRLWGAPL 12 68 QASVPLLTH 12 88 AHPNASLTM 12 89 HPNASLTMY 12 103 PHPDPPMAL 12 131 PSNPLCCCF 12 144 FSTLNPVLR 12 151 LRHLFPQEA 12 2 THRTTTWAR 11 81 EPVLVPEAH 11 101 PVPHPDPPM 11 112 SRTPTRQIG 11 136 CCCFHGPAF 11 739 147 LNPVLRHLF 11 TABLA XXX-VI9-HLA-B2705-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 6 SRLLPSLRC 18 1 GPMPCSRLL 15 4 PCSRLLPSL 14 5 CSRLLPSLR 13 8 LLPSLRCSL 12 9 LLPSLRCSLH 10 7 RLLPSLRCS 9 TABLA XXX-V20-HLA-B2705-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 9 SRLWGAPLQ 16 3 SGDPASSRL 15 2 CSGDPASSR 14 740 SSRLWGAPL 12 TABLA XXX-V22~HLA-B2705-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho 741 TABLA XXX-V25-HLA-B2705-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 5 TRQISSIDT 13 1 TRQISSIDT 11 3 TPTRQISSI 11 6 RQISSIDTD 11 2 RTPTRQISS 8 742 TABLA XXX-V27-HLA-B2705-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 743 SRGQALRRA 15 TABLA XXXl-Vl-HLA-B2709-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 51 ARIRAVGLL 23 53 JRAVGLLTV 20 7 ALLMAGLAL 14 105 AILALLPAL 14 107 LALLPALGL 14 108 ALLPALGLL 14 2 KAVLLALLM 13 28 AQVSNEDCL 13 54 RAVGLLTVI 13 99 ALQPAAAIL 13 115 L1LWGPGQL 13 13 LALQPGTAL 12 14 ALQPGTATiT, 12 22 LCYSCKAQV 12 36 LQVENCTQL 12 45 GEQCWTARI 12 744 50 TARIRAVGL 12 60 TVISKGCSL 12 92 CNASGAHAL 12 30 VSNEDCLQV 11 76 DYYVGKKNI 11 83 NITCCDTDL 11 98 HALQPAAAI 11 101 QPAAAILAL 11 102 PAAAILALL 11 109 LLPALGLLL 11 TABLA XXXl-V4-HLA-B2709-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 10 RRTSRAVTP 18 30 SRLPPSLRC 15 52 YRLWGAPLQ 14 152 RHLFPQEAF 14 46 SGDPASYRL 13 3 HRTTTWARR 12 24 AGPMPCSRL 12 745 55 WGAPLQPTL 12 57 APLQPTLGV 12 66 VPQASVPLL 12 112 SRTPTRQIG 12 143 AFSTLNPVL 12 166 YDLSQVWSV 12 9 ARRTSRAVt 11 28 PCSRLPPSL 11 32 LPPSLRCSL 11 36 LRCSLHSAC 11 65 WPQASVPL 11 76 HPAQWEPVL 11 139 FHGPAFSTL 11 142 PAFSTLNPV 11 146 TLNPVLRHL 11 160 FPAHPIYDL 11 163 HPIYDLSQV 11 177 PAPSRGQAL 11 180 SRGQALRRA 11 13 SRAVTPTCA 10 51 SYRLWGAPL 10 86 PEAHPNASL 10 88 AHPNASLTM 10 103 PHPDPPMAL 10 746 116 TRQIGSIDT 10 127 PADGPSNPL 10 151 LRHLFPQEA 10 .19 TCATPAGPM 9 58 PLQPTLGW 9 63 LGVVPQASV 9 77 PAQWEPVLV 9 90 PNASLTMYV 9 101 PVPHPDPPM 9 111 LSRTPTRQI 9 114 TPTRQIGSI 9 131 PSNPLCCCF 9 TABLA XXXl-V4-HLA-B2709-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 136 CCCFHGPAF 9 157 QEAFPAHPI 9 8 WARRTSRAV 8 75 THPAQWEPV 8 94 LTMYVCAPV 8 747 TABLA XXXl-V20-HLA-B2709-9msrs-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 9 SRLWGAPLQ 14 3 SGDPASSRL 12 8 SSRL GAPL 10 748 TABLA XXXl-V22-HLA-B2709-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 749 TABLA XXXl-V25-HLA-B2709-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 1 SRTPTRQIS 12 5 TRQISSIDT 10 3 TPTRQISSI 9 6 RQISSIDTD 6 750 TABLA XXXI-V27-HLA-B2709-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 751 SRGQALRRA 11 TABLA XXXII-Vl-HLA-B24402-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 45 GEQCWTARI 19 51 ARIRAVGLL 19 108 ALLPALGLL 19 14 ALQPGTALL 18 7 ALLMAGLAL 17 99 ALQPAAAIL 17 105 AILALLPAL 17 101 QPAAAILAL 16 28 AQVSNEDCL 14 92 CNASGAHAL 14 107 LALLPALGL 14 110 LPALGLLLW 14 3 LALQPGTAL 13 16 QPGTALLCY 13 32 NEDCLQVEN 13 50 TARIRAVGL 13 752 60 TVISKGCSL 13 102 PAAAILALL 13 TABLA XXXII-V1-HLA-B4402- mers- SCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 109 LLPALGLLL 13 115 LLL GPGQL 13 1 MKAVLLALL 12 36 LQVENCTQL 12 69 NCVDDSQDY 12 70 CVDDSQDYY 12 98 HALQPAAAI 12 5 LLALLMAGL 11 38 VENCTQLGE 11 41 CTQLGEQCW 11 54 RAVGLLTVI 11 83 NITCCDTDL 11 76 DYYVGKKNI 10 104 AAILALLPA 9 753 TABLA XXXII-V4-HLA-B4402-9mers-PSCA Cada péptido es una- porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 147 LNPVLRHLF 14 754 TABLA XXXII-V19-HLA-B4402-9mers-PSCA Cada peptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada 755 TABLA XXXII-V21-HLA-B4402-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro PLLTHPAQW 14 756 TABLA XXXII-V24-HLA-B4402-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada 757 TABLA XXXII-V25&26-HLA-B 402-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido 758 TABLA XXXII-V27-HLA-B4402-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido 759 TABLA XXXIII-Vl-HLA-B5101-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 54 RAVGLLTVI 26 98 HALQPAAAI 23 107 LALLPALGL 22 13 LALQPGTAL 21 50 TARIRAVGL 19 7ß DYYVGKKNI 19 101 QPAAAILAL 19 102 PAAAILALL 18 6 LALLMAGLA 16 111 PALGLLLWG 15 22 LCYSCKAQV 14 53 IRAVGLLTV 14 110 LPALGLLL 14 760 TABLA XXXIII-Vl9-HLA-B5101-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada 761 TABLA XXXI11-V21-HLA-B5101-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro 9 DPAQWEPVL 23 1 QASVPLLTD 14 4 VPLLTHPAQ 14 8 TDPAQWEPV 11 762 TABLA XXXIII-V24-HLA-B5101-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada 763 TABLA XXXIII-V25-HLA-B5101-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro TPTRQISSI 22 T BLA XXXIII-V25&26-HLA-B5101-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 9 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más ocho Pos 123456789 Registro TPTRQISSS 12 TABLA XXXIII-V26-HLA-B5101-9mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido 764 TABLA XXXIV-VI-HLA-Al-1Omers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 Registro 15 LQPGTALLCY 22 37 QVENCTQLGE 16 88 DTDLCNASGA 16 68 LNCVDDSQDY 15 765 69 NCVDDSQDYY 15 74 SQDYYVGKKN 15 108 ALLPALGLLL 15 14 ALQPGTALLC 14 31 S EDCLQVEN 12 71 VDDSQDYYVG 12 84 ITCCDTDLNC 12 99 ALQPAAAILA 12 32 NEDCLQVENC 11 44 LGEQCWTARI 10 51 ARIRAVGLLT 10 70 CVDTDLCNAS 10 86 CCDTDLCNAS 10 Tabla XXXIV-V4-HLA-Al-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 104 HPDPPMALSR 20 123 DTDPPADGPS 20 46 SGDPASYRLW 18 88 AHPNASLTMY 17 766 43 ACCSGDPASY 16 79 QWEPVLVPEA 15 157 QEAFPAHPIY 15 127 PADGPSNPLC 14 85 VPEAHP ASL 12 121 SIDTDPPADG 12 144 FSTLNPVLRH 12 Tabla XXXIV-V4-HLA-Al-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 25 GPMPCSRLPP 11 128 ADGPSNPLCC 11 165 IYDLSQVWSV 11 29 CSRLPPSLRC 10 74 L GPAQWEPV 10 87 EAHPNASLTM 10 112 SRTPTRQIGS 10 115 PTTQIGSIDT 10 156 PQEAFPAHPI 10 161 PAGPIYDLSQ 10 767 Tabl a XXXIV-V20-HLA-Al-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro Tabla XXXIV-V20-HLA-Al-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 768 Tabla XXXIV-V21-HLA-Al-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos , y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 8 LTDPAQWEPV 20 3 ASVPLLTDPA 9 abla XXXIV-V2&22-HL -Al-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 7 LTDLAQWEPV 16 2 ASVPLLTDLA 11 3 SVPLLTDLAQ 8 769 Tabla XXXIV-V22-HLA-Al-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8 cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro Tabla XXXIV-V24-HLA-Al-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro LTMYVCTPVP 770 Tabla XXXIV-V25&26-HLA-Al-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 771 Tabla XXXIV-26-HLA-Al-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro SSDTDPPADG 16 Tabla XXXIV-V27-HLA-Al-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro PSRGQALRRA SRGQALRRAQ Tabla XXXV-Vl-HLA-A0201-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 772 aminoácidos , y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 108 ALLPALGLLL 27 Tabla XXXV-Vl-HLA-A0201-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 4 VLLALLMAGL 26 106 ILALLOALGL 26 52 RIRAVGLLTV 25 12 GLALQPGTAL 24 104 AAUKALLPAL 24 21 LLCYSCKAQV 23 114 GLLLWGPGQL 23 107 KAKKOALGLL 22 6 KAKKNAGLAL 20 7 ALLMAGLALQ 20 13 LALQPGTALL 20 35 CLQVENCTQL 20 49 WTARIRAVGL 19 773 Tabla XXXV~Vl-HLA-A0201-10mers-PSCA 774 Tabla XXXV-V4-HLA-A0201-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especif ada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 31 RLPPSLRCSL 24 62 TLGVVPQASV 24 93 SLTMYVCAPV 23 145 STLNPVLRHL 21 53 RLWGAPLQPT 21 65 WPQASVPLL 20 775 110 ALSRTPTRQI 20 64 GWPQASVPL 18 57 APLQPTLGW 18 74 LTHPAQWEPV 18 83 VLVPEAHPNA 18 113 RTPTRQIGSI 18 165 IYDLSQVWSV 18 56 GAPLQPTLGV 17 141 GPAFSTLNPV 17 150 VLRHLFPQEA 17 153 HLFPQEAFPA 17 159 AFPAHPIYDL 17 176 SPAPSRGQAL 17 Tabla XXV-V4-HLA-A0201-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 162 AHPIYDLSQV 16 50 ASYRLWGAPL 15 54 LWGAPLQPTL 15 76 HPAQWEPVLV 14 776 85 VPEAHPNASL 14 102 VPHPDPPMAL 14 138 CFHGPAFSTL 14 146 TLNPVLRHLF 14 166 YDLWQVWSW 14 7 TWARRTSRAV 13 23 PAGPMPCSRL 13 27 PAGPMPCSRL 13 35 SLRCSLHSAC 13 39 SLHSACCSGD 13 73 LLTHPAQWEP 13 142 PAFSTLNPVL 13 45 CSGDPASYRL 12 79 QWEPVLVPEA 12 121 SIDTDPPADG 12 15 AVTPTCATPA 11 58 PLQPTLGVVP 11 75 THPAQWEPVL 11 78 THPAQWEPVL 11 89 HPNASLTMYV 11 95 TMYVCAPVPH 11 126 PPADGPSNPL 11 134 PLCCCFHGPA 11 167 DLSQVWSVVS 11 777 Tabla XXXV-V21-HLA-A201-10mers--PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO :8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 778 Tabla XXXV-V21&22-HLA-A0201-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 9 DLAQWEPVLV 23 1 QASVPLLTDL 18 7 LTDLAQWEPV 16 6 LLTDLAQWEP 14 8 DLAQWEPVL 13 779 Tabla XXXV-V2 -HLA-AO20110mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 3 SLTMYVCTPV 21 5 TMYVCTPVPH 11 1 NASLTMYVCT 10 2 ASLTMYVCTP 10 780.
Tabla XXXV-V26-HLA-A0201-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es 781 Tabla XXXVI-VI-HLA-A0203-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve 782 Pos 1234567890 registro 96 GAHALQPAAA 27 95 SGAHALQPAA 19 90 DLCNASGAHA 18 97 AHALQPAAAI 17 Tabla XXXVI-V4-HLA-A0203-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 6 TTWARRTSRA 10 12 TSRAVTPTCA 10 15 AVTPTCATPA 10 34 PSLRCSLHSA 10 41 HSACCSGDPA 10 48 DPASYRLWGA 10 60 QPTLGVVPQA 10 69 ASVPLLTHPA 10 79 QWEPVLVPEA 10 83 VLVPEAHPNA 10 91 NASLTMYVCA 10 101 PVPHPDPPMA 10 783 119 IGSIDTDPPA 10 134 PLCCCFHGPA 10 150 VLRHLFPQEA 10 153 HLFPQEAFPA 150 Tabla XXXVI-V4-HLA-A0203-1Orners-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 169 SQVWSVVSPA 10 175 VSPAPSRGQA 10 179 PSRGQALRRA 10 1 MTHRTTTWAR 9 7 TWARRTSRAV 9 13 SRAV PTCAT 9 16 VTPTCA PAG 9 35 SLRCSLHSAC 9 42 SACCSGDPAS 9 49 PASYRL GAP 9 61 PTLGVVPQAS 9 70 SVPLLTHPAQ 9 80 EPVLVPEAH 9 784 Tabla XXXVI-V -HLA-A0203-10mers-PSCA 785 Tabla XXXVI-V20-HLA-A0203-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 6 DPASSRLWGA 10 7 PASSRLWGAP 9 786 Tabla XXXVI-V21-HLA-A0203-10itiers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro ASVPLLTDPA 10 SVPLLTDPAQ Tabla XXXVI-V21-HLA-A0203-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro VPLLTDPAQW Tabla XXXVI-V21&22-HLA-A0203-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve 787 Tabla XXXVI-V25-HLA-A0203-lOmers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve 788 Tabla XXXVI-V27-HLA-A0203-10mers-PSCA 789 Tabla XXXVII-Vl-HLA-A3-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 55 AVGLLTVISK 26 52 RIRAVGLLTV 24 108 ALSPALGLLL 24 14 ALQPGTALLC 22 8 LL AGLALQP 21 106 ILALLPALGL 20 29 QVSNEDCLQV 19 43 QLGEQCWTAR 19 99 ALQPAAAILA 19 105 AILALLPALG 19 3 AVLLALLMAG 18 790 Tabla XXXVII-V -HLA-A3-lOmers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición 791 de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 58 PLQPTLGVVP 24 15 AVTPTCATPA 20 31 RLPPSLRCSL 20 110 ALSRTPTRQI 19 35 SLRCSLHSAC 18 146 TLNPVLRHLF 18 149 PVLRHLFPQE 18 164 PIYDLWQVWS 18 167 DLSQVWSVVS 18 9 ARRTSRAVTP 18 64 GVVPQASVPL 17 50 ASYRLWGAPL 16 53 RLWGAPLQPT 16 72 PLLTHPAQWE 16 153 HLFPQEAFPA 16 178 APSRGQALRR 16 43 ACCSGDPASY 15 62 TLGVVPQASV 15 82 PVLVPEAHPN 15 104 HPDPPMALSR 15 792 Ta 1a XXXVII-V4-HLA-A3-10mers-PSCA Cada peptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 793 Tabla XXXVII-V20-HLA-A3-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 2 CCSGDPASSR 14 8 ASSRLWGAPL 12 10 SRLWGAPLQP 10 794 Tabla XXXVII-V21&22-HLA-A3-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 3 SVPLLTDLAQ 16 5 PLLTDLAQWE 16 9 DLAQWEPVLV 16 795 Tabla XXXVI-V24-HLA-A0203-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro TMYVCTPVPH 13 796 Tabla XXXVI-V25&26-HLA-A203-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 797 Tabla XXXVII-V27-HLA-A3-1Omers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro PSRGQALRRA 798 Tabla XXXVIII-Vl-HLA-A26-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especi icada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 73 DSQDYYVGKK 15 799 Tabla XXXVIII-V4-HLA-A26-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es 800 la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 64 GVVPQASVPL 23 65 VVPQASVPLL 22 145 STLNPVLRHL 21 123 DTDPPADGPS 18 173 SVVSPAPSRG 17 158 EAFPAHPIYD 16 Tabla XXXVIII-V4-HLA-A26-10mers-PSCA Cada peptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 88 AHPNASLTMY 15 81 EPVLVPEAHP 14 113 RTPTRQIGSI 14 48 DPASYRLWGA 13 84 LVPEAHPNAS 13 87 EAHPNASLTM 13 129 DGPSNPLCCC 13 142 PAFSTLNPVL 13 15 AVTPTCATPA 12 801 Tabla XXXVIII- 20-HLA-A26-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve 802 Tabla XXXVIII-V21&22-HLA-A26-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro SVPLLTDLAQ 13 803 Tabla XXXVIII-V24-HLA-A26-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 7 YVCTPVPHPD 10 4 LTMYVCTPVP 8 6 MYVCTPVPHP 8 804 Tabla XXXVI11-V25&26-HLA-A26-1Omers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 1 RTPTRQISSS 14 3 PTRQISSSDT 9 805 abla XXXVI11-V26-HLA-A26-1Orners-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro RTPTRQIGSS 14 PTRQIGSSDT Tabla XXXVIII-V27-HLA-A26-1Orners-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro PSRGQALRRA SRGQALRRAQ Tabla XXXIX-Vl-HLA-B0702-10ners-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 101 QPAAAILALL 23 806 108 ALLPALGLLL. 15 Tabla XXXIX-Vl-HLA-B0702-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 100 LQPAAAILAL 14 104 AAILALLPAL 14 106 ILALLPALGL 14 6 LALLMAGLAL 13 12 GLALQPGTAL 13 49 WTARIRAVGL 13 50 TARIRAVGLL 13 110 LPALGTJ.LWG 13 4 VLLALLMAGL 12 13 LALQPGTALL 12 52 RIRAVGLLTV 12 82 KNITCCDTDL 12 91 LCNASGAHAÑ 12 103 AAAILALLPA 12 16 QPGTALLCYS 11 27 KAQVSNEDCL 11 807 Tabla XXXIX-V4-HLA-B0702-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 107 PPMALSRTPT 21 808 57 APLQPTLGVV 19 66 VPAQSVPLLT 19 76 HPAQWEPVLV 19 60 QPTLG VPAQ 18 89 HPNASLTMYV 18 130 GPSNPLCCCF 18 141 GPAFSTLNPV 18 48 DPASYRLWGA 17 24 GPMPCSRLPP 16 178 APSRGQALRR 16 33 PPSLRCSLHS 14 50 ASYRLWGAPL 14 64 G VPQASVPL 14 104 HPDPPMALSR 14 22 TPAGPMPCSR 13 31 RLPPSLRCSL 13 54 LWGAPLQPTL 13 75 THPAQWEPVL 13 138 CFHGPAFSTL 13 159 AFPAHPIYDL 13 23 PAGPMPCSRL 12 65 VVPQASVPLL 12 81 EPVLVPEAHP 12 142 PAFSTLNPVL 12 809 Tabla XXXIX-V19-HLA-B0702-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición 810 Tabla XXXIX-V21-HLA-B0702-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve 811 Tabla XXXIX-V22-HLA-B0702-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve 812 Tabla XXXIX-V25-HLA-B0702-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 9 ISSIDTDPPA 11 4 TPTRQISSID 10 5 PTRQISSIDT 8 813 Tabla XXXIX-V27-HLA-B0702-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 814 aminoácidos , y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 1 PSRGQALRRA 10 Tabla XL-VI-HLA-B08-1Omers -PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XL-V4-HLA-B08-1Omers -PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XL-V19-HLA-B08-10mers-PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XL-V20-HLA-B08-10mers-PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XL-V21-HLA-B08-10mers-PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados 815 Tabla XL-V21&22-HLA-B08-10mers- PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XL-V24-HLA-B08-10mers-PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XL-V25-HLA-B08-10mers-PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XL-V25&26~HLA-B8-10mers-PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XL-V26-HLA-B08-10mers-PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados 816 Tabla XLI-Vl-HLA-B1510-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLI-V4-HLA-B1510-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLI-V19-HLA-Bl510-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLI-V20-HLA-B1510-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLI-V21-HLA-Bl510-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLI-V21&22-HLA-B1510-10mers--PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados 817 Tabla XLI-V22-HLA-B1510-10mers- PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLI-V24-HLA-B1510-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLI-V25-HLA-B1510-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLI-V26-HLA-B1510-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLII-V1-HLA-B2705-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados 818 Tabla XLII-V4-HLA-B2705-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLII-V19-HLA-B2705-10mers -PSCA 123456 7890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLII-V22-HLA-B2705-10mers- PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados 819 Tabla XLIII-V4-HLA-B2709-10mers- PSCA 1234567890 registro , Resultados No Encontrados 820 Tabla XLIII-V21&22-HLA-B2709-10mers -PSCA s 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLIII-V24-HLA-B2709-10mers- PSCA s 1234567890 registro Resultados No Encontrados 821 Tabla XLVIII-V25-HLA-B2709-10mers -PSCA Pos 1234567890 | registro Resultados No Encontrados Tabla XLIV-Vl-HLA-B4402-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 104 AAILALLPAL 20 108 ALLPALGLLL 19 100 LQPAAAILAL 17 6 LALLMAGLAL 15 82 KNITCCDTD1 15 97 AHALQPAAAI 15 822 Tabla XLIV-Vl-HLA-B4 02-10mers-PSCA 823 Tabla XLIV-V4-HLA-B4 02-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 157 QEAFPAHPIY 20 46 SGDPASYRLW 17 159 ADPAHPIYDL 17 88 AHPNASLTMY 16 102 VPHPDPPMAL 16 110 ALSRTPTRQI 16 146 TLNPVLRHLF 16 824 176 SPAPSRGQAL 16 31 RLPPSLRCSL 15 145 STLNPVLRHL 15 43 ACCSGDPASY 14 50 ASYRLWGAPL 14 64 GVVPAQSVPL 14 71 VPLLTHPAQW 14 80 WEPVLVPEAH 14 163 HPIYDLWQVW 14 23 PAGPMPCSRL 13 65 VVPQASVPLL 13 113 RTPTRQIGSI 13 138 CFHGPAFSTL 13 Tabla XLIV-V4-HLA-B 402-10msrs-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 142 PAFSTLNPVL 13 151 LRHLFPQEAF 13 75 THPAQWEPVL 12 86 PEAHPNASLT 12 825 Tabla XLIV-V20-HLA-B4402-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 826 Tabla XLIV-V21-HLA-B4402-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 5 VPLLTDPAQW 14 9 TDPAQWEPVL 12 3 ASVPLLTDPA 7 Tabla XLIV-V21&22-HLA-B4402-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y -la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 4 VPLLTDLAQW 14 1 QASVPLLTDL 12 827 Tabla XLIV-V24-HLA-B4402-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 2 ASLTMYVCTP 7 1 NASLTMYVCT 4 4 LTMYVCTPVP 3 828 Tabla XLIV-V25-HLA-B4402-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 3 RTPTRQISSI 13 10 SSIDTDPPAD 8 Tabla XLIV-V26-HLA-B4402-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro 8 SSSDTDPPAD 6 1 RTPTRQISñS 5 5 RQISSSDTDP 3 6 QISSSDTDPP 2 829 Tabla XLIV-V27-HLA-B4402-10mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más nueve Pos 1234567890 registro SRGQALRRAQ PSRGQALRRA Tabla XLV-Vl-HLA-B5101-10mers-PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados 830 Tabla XLV-V4-HLA-B5101-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLV-Vl9-HLA-B5101-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLV-V21-HLA-B5101-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLV-V22-HLA-B5101-10mers-PSCA 1234567890 registro Resultados No Encontrados 831 Tabla XLV-V24-HLA-B5101-10mers-PSCA Pos 1234567890 Registro Resultados No Encontrados Tabla XLV-V25-HLA-B5101-10mers-PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLV-V26-HLA-B5101-10iners-PSCA Pos 1234567890 registro Resultados No Encontrados Tabla XLVI-Vl-HLA-DRBl-0101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 104 AAILALLPALGLLLW 35 3 AVLLALLMAGLALQP 33 832 10 MAGLALQPGTALLCY 32 2 KAVLLALLMAGLALQ 26 50 TARIRAVGLLTVISK 25 6 LAL1MAGLALQPGTA 24 Tabla XLVI-Vl-HLA-DRBl-0101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 47 QCWTARIRAVGLLTV 24 88 DTDLCNASGAHALQP 24 97 AHALQPAAAILALLP 24 106 ILALLPALGLLLWGP 24 4 VLLALLMAGLALQPG 23 52 RIRAVGLLTVISKGC 23 55 AVGLLTVISKGCSLN 23 56 VGLLTVISKGCSLNC 23 95 SGAHALQP AAILAL 23 9 LMAGLALQPGTALLC 22 94 ASGAHALQPAAAILA 22 100 LQPAAAILALLPALG 22 103 AAAILALLPALGLLL 22 833 Tabla XLVI-V4-HLA-DRB1-0101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición 834 de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 13 SRAVTPTCATPAGPM 26 5 TTTWARRTSRAVTPT 25 48 DPASYRLWGAPLQPT 24 56 GAPLQPTLGWPQAS 24 77 PAQWEPVLVPEAHPN 24 141 GPAFSTLNPVLRHLF 24 162 AHP1YDLSQVWSVVS 24 10 RRTSRAVTPTCATPA 23 . 54 LWGAPLQPTLGWPQ 23 67 PQASVPLLTHPAQ E 23 108 PMALSRTPTRQIGSI 23 144 FSTLNPVLRHLFPQE 23 49 PASYRL GAPLQPTL 22 60 QPTLGVVPQASVPLL 22 82 PVLVPEAHPNASLTM 22 92 AS1TMYVCAPVPHPD 22 99 CAPVPHPDPPMALSR 22 59 LQPTLGWPQASVPL 20 94 LTMYVCAPVPHPDPP . 19 120 GSIDTDPPADGPSNP 19 835 163 HPIYDLSQVWSVVSP 19 7 TWARRTSRAVTPTCA 18 52 YRLWGAPLQPTLGW 18 91 NASLTMYVCAPVPHP 18 136 CCCFHGPAFSTLNPV 18 157 QEAFPAHPIYDLSQV 18 15 AVTPTCATPAGPMPC 17 35 SLRCSLHSACSSGDP 17 61 PTLGVVPQASVPLLT 17 68 QASVPLLTHPAQWEP 17 71 VPLLTHPAQWEPVLV 17 80 WEPVLVPEAHPNASL 17 81 EPVLVPEAHPNASLT 17 172 WSVVSPAPSRGQALR 17 16 VTPTCATPAGPMPCS 16 17 TPTCATPAGPMPCSR 16 Tabla XLVI-V4-HLA-DRB1-0101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 22 TPAGPMPCSRLPPSL 16 836 Tabla XLVI-V19-HLA-DRBl-0101-15mers-PSCA 837 Tabla XLVI-V19-HLA-DRBl-0101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 13 RLLPSLRCSLHSACC 15 3 ATPAGPMPCSRLLPS 14 8 PMPCSRLLPSLRCSL 14 10 PCSRLLPSLRCSLHS 10 15 LPSLRCSLHSACCSG 10 1 TCATPAGPMPCSRLL 8 5 PAGPMPCSRLLPSLR 8 7 GPMPCSRLLPSLRCS 8 838 14 LLPSLRCSLHSACCS Tabla XLVI-V20-HLA-DRB10101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 11 DPASSRLWGAPLQPT 24 15 SRLWGAPLQPTLGVV 18 2 SLHSACCSGDPASSR 16 1 CSLHSACCSGDPASS 14 4 HSACCSGDPASSRLW 14 6 ACCSGDPASSRLWGA 14 13 ASSRLWGAPLQPTLG 14 12 PASSRLWGAPLQPTL 12 Tabla XLVI-V21-HLA-DRBl-0101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 1 TLGVVPQASVPLLTD 29 6 PQASVPLLTDPAQWE 23 839 Tabla XLVI-V22-HLA-DRB1-0101-15me s-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 840 Tabla XLVI-V24-HLA-DRBl-0101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 14 CTPVPHPDPPMALSR 22 7 ASLTMYVCTPVPHPD 20 6 NASLTMYVCTPVPHP 19 9 LTMYVCTPVPHPDPP 19 2 EAHPNASLTMYVCTP 15 11 MYVCTPVPHPDPPMA 15 841 Tabla XLVI-V25&26-HLA-DRBl-0101-15rrters-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce 842 Tabla XLVI-V27-HLA-DRBl-0101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce 843 Tabla XLVII-Vl-HLA-DRBl-0301-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce 844 Pos 123456789012345 registro 5 LLALL AGLALQPGT 16 1 MKAVLLALLMAGLAL 15 103 AAAILALLPALGLLL 15 18 GTALLCYSCKAQVSN 14 25 SCKAQVSNEDCLQVE 14 58 LLTVISKGCSLNCVD 14 4 VLLALLMAGLALQPG 13 11 AGLALQPGTALLCYS 13 12 GLALQPGTALLCYSC 13 50 TARIRAVGLLTVISK 13 84 ITCCDTDLCNASGAH 13 107 LALLPALGLLLWGPG 13 3 AVLLALLMAGLALQP 12 6 LALLMAGLALQPGTA 12 28 AQVSNEDCLQVENCT 12 41 CTQLGEQCWTARIRA 12 55 AVGLLTVISKGCSLN 12 59 LTVISKGCSLNCVDD 12 81 KKNITCCDDTDLCNAS 12 88 DTDLCNASGAHALQP 12 97 AHALQPAAAILALLP 12 102 AAILALLPALGLL 12 105 AILALLPALGLLLWG 12 845 Tabla XLVII-V4-HLA-DRBl-0301-15mers-PSCA Tabla XLVII-V4-HLA-DRBl-0301-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 63 LGVVPQASVPLLTHP 20 60 QPTLGWPQASVPLL 18 162 AHPIYDLSQVWSWS 18 71 VPLLTHPAQ EPVLV 17 149 PVLRHLFPQEAFPAH 17 157 QEAFPAHPIYDLSQV 17 83 VLVPEAHPNASLTMY 16 846 Tabla XLVII-V20-HLA-DRl-0301-15mers-PSCA 847 Tabla XLVII-V21-HLA-DRl-0301-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 9 SVPLLTDPAQWEPVL 24 1 TLGVVPQASVPLLTD 21 2 LGVVPQASVPLLTDP 20 10 VPLLTDPAQWEPVLV 17 12 LLTDPAQWEPVLVPE 14 7 QASVPLLTDPAQWEP 12 848 Tabla XLVII-V22—HLA-DRl-0301-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 1 LGVVPQASVPLLTHL 20 9 VPLLTHLAQWEPVLV 17 11 LLTHLAQWEPVLVPE 16 8 SVPLLTHLAQWEPVL 14 6 QASVPLLTHLAQWEP 13 12 LTHLAQWEPVLVPEA 13 849 VPQASVPLLTHLAQ Tabla XLVII-V24-HLA-DRl-0301-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de ir icio más catorce Pos 123456789012345 registro 15 TPVPHPDPPMALSRT 21 6 NASLTMYVCTPVPHP 12 8 SLTMYVCTPVPHPDP 11 10 TMYVCTPVPHPDPPM 10 14 CTPVPHPDPPMALSR 10 Tabla XLVII-V25-HLA-DRl-0301-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 14 ISSIDTDPPADGPSN 22 1 DPP ALSRTPTRQIS 11 3 P ALSRTPTRQISSI 11 11 TRQISSIDTDPPADG 11 12 RQISSIDTDPPADGP 10 850 Tabla XLVII-V26-HLA-DRl-0301-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 12 IGSSDTDPPADGPSN 12 1 PMALSRTPTRQIGSS 11 9 TRQIGSSDTDPPADG 11 10 RQIGSSDTDPPADGP 11 2 MALSRTPTRQIGSSD 8 851 ALSRTPTRQIGSSDT Tabla XLVIII-Vl-HLA-DRl-0401-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 2 KAVLLALLMAGLALQ 20 3 AVLLALLMAGL LQP 20 5 LLALLMAGLALQPGT 20 27 KAQVSNEDCLQVENC 20 33 EDCLQVENCTQLGEQ 20 50 TARIRAVGLLTV1SK 20 53 IRAVGLL VISKGCS 20 55 AVGLLTVISKGCSLN 20 852 56 VGLLTVISKGCSLNC 20 88 DTDLCNASGAHALQP 20 97 AHALQPAAAILALLP 20 104 AAILALLPALGLLLW 20 106 ILALLPALGLLLWGP 20 8 LLMAGLALQPGTALL 18 32 NEDCLQVENCTQLGE 18 52 RIRAVGLLTVISKGC 18 93 NASGAHALQPAAAIL 18 21 LLCYSCKAQVSNEDC 17 74 SQDYYVGKKNITCCD 16 1 MKAVLLALLMAGLAL 14 7 ALLMAGLALQPGTAL 14 10 MAGLALQPGTALLCY 14 18 GTALLCYSCKAQVSN 14 19 TALLCYSCKAQVSNE 14 35 CLQVENCTQLGEQCW 14 59 LTVISKGCSLNCVDD 14 65 GCSLNCVDDSQDYYV 14 68 LNCVDDSQDYYVGKK 14 81 KKNITCCDTDLCNAS 14 103 AAAILALPALGLLL 14 107 LALLPALGLLLWGPG 14 9 LMAGLALQPGTALLC 12 853 11 AGLALQPGTALLCYS 12 14 ALQPGTALLCYSCKA 12 16 QPGTALLCYSCKAQV 12 17 PGTALLCYSCKAQVS 12 24 YSCKAQVSNEDCLQV 12 29 . QVSNEDCLQVENCTQ 12 39 ENCTQLGEQCWTARI 12 40 NCTQLGEQCWTARIR 12 42 TQLGEQCWTARIRAV 12 44 LGEQCWTARIRAVGL 12 45 GEQCWTARIRAVGLL 12 Tabla XLVI11-Vl-HLA-DRl-0401-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 47 QCWTARIRAVGLLTV 12 49 WTARIRAVGLLTVIS 12 66 CSLNCVDDSQDYYVG 12 67 SLNCVDDSQDYYVGK 12 70 CVDDSQDYYVGKKNI 12 73 DSQDYYVGK NITCC 12 854 78 YVGKKNITCCDTDLC 12 82 KNITCCDTDLCNASG 12 84 ITCCDTDLCNASGAH 12 85 TCCDTDLCNASGAHA 12 90 DLCNASGAHALQPAA 12 94 ASGAHALQPAAAILA 12 98 HALQPAAAILALLPA 12 99 ALQPAAAILALL AL 12 101 QPAAAILALLPALGL 12 102 PAAAILALLPALGLL 12 46 EQC TARI AVGLLT 11 75 QDYYVGKKNITCCDT 11 58 LLTVISKGCSLNCVD 9 Tabla XLVIII-V4-HLA-DRl-0401~15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 60 QPTLGVVPQASVPLL 26 68 QASVPLLTHPAQ EP 26 81 EPVLVPEAHPNASLT 26 162 AHPIYDLSQVWSWS 26 855 165 IYDLSQVWSWSPAP 26 172 WSWSPAPSRGQALR 26 52 YRLWGAPLQPTLGVV 22 77 PAQWEPVLVPEAHPN 22 169 SQVWSWSPAPSRGQ 22 Tabla XLVIII-V4-HLA-DRl-0401-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 29 CSRLPPSLRCSLHSA 20 51 SYRLWGAPLQPTLGV 20 62 TLGVVPQASVPL1TH 20 63 LGVVPQASVPLLTHP 20 82 PVLVPEAHPNASLTM 20 108 PMALSRTPTRQIGSI 20 116 TRQIGSIDTDPPADG 20 132 SNPLCCCFHGPAFST 20 144 FSTLNPVLRHLFPQE 20 148 NPVLRHLFPQEAFPA 20 168 LSQVWSWSPAPSRG 20 67 PQASVPLLTHPAQWE 18 856 105 PDPPMALSRTPTRQI 18 113 RTPTRQIGSIDTDPP 18 137 CCFHGPAFSTLNPVL 18 5 TTTWARRTSRAVTPT 17 49 PASYRLWGAPLQPTL 16 94 LTMYVCAPVPHPDPP 16 136 CCFHGPAFSTLNPV 16 141 GPAFSTLNPVLRHLF 16 152 RHLFPQEAFPAHPIY 16 157 QEAFPAHPIYDLWQV 16 163 HPIYDLSQVWSVVSP 16 13 SRAVTPTCATPAGPM 14 24 AGPMPCSRLPPSLRC 14 33 PPSLRCSLHSACCSG 14 37 RCSLHSACCSGDPAS 14 71 VPLLTHPAQWEPVLV 14 80 WEPVLVPEAHPNASL 14 91 NASLTMYVCAPVPHP 14 99 CAPVPHPDPPMALSR 14 106 DPPMALSRTPTRQIG 14 119 IGSIDTDPPADGPSN 14 151 LRHLRPQEAFPAHPI 14 2 THRTTWARRTSRAV 12 3 HRTTTWARRTSRAVT 12 857 Tabla XLVIII-V4-HLA-DRl-0401~15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 6 TTWARRTSRAVTPTC 12 9 ARRTSRAVTPTCATP 12 10 RRTSRAVTPTCATPA 12 11 RTSRAVTPTCATPAG 12 34 PSLRCSLHSACCSGD 12 43 ACCSGDPASYRLWGA 12 48 DPASYRLWGAPLQPT 12 54 LWGAPLQPTLGWPQ 12 57 APLQPTLGWPQASV 12 59 LQPTLGWPQASVPL 12 72 PLLTHPAQWEPVLVP 12 83 VLVPEAHPNASLTMY 12 85 VPEAHPNASLTMYVC 12 87 EAHPNASLTMYVCAP 12 96 MYVCAPVPHPDPPMA 12 100 APVPHPDPPMALSRT 12 104 HPDPPMALSRTPTRQ 12 110 ASLRTPTRQIGSIDT 12 858 117 RQIGSIDTDPPADGP 12 122 IDTDPPADGPSNPLC 12 124 TDPPADGPSNPLCCC 12 138 CFHGPAFSTLNPVLR 12 140 HGPAFSTLNPVLRHL 12 145 STLNPVLRHLFPQEA 12 149 PVLRHLFPQEAFPAH 12 154 LFPQEAFPAHPIYDL . 12 159 AFPAHPIYDLSQV S 12 161 PAHPIYDLWQVWSW 12 173 SWSPAPSRGQALRR 12 Tabla XLVI11-Vi9-HLA-DR1-0401-15mers-PSCA Cada peptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 11 CSRLLPSLRCSLHSA 20 6 AGPMPCSRLLPSLRC 14 12 SRLLPSLRCSLHSAC 14 15 LPSLRCSLHSACCSG 14 4 TPAGPMPCSRLLPSL 12 9 MPCSRLLPSLRCSLH 12 859 Tabla XLVIII-V21-HLA~DRl-0401-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 1 TLGWPQASVPLLTD 20 2 LGVVPQASVPLLTDP 20 7 QASVPLLTDPAQWEP 20 6 PQASVPLLTDPAQWE 18 9 SVPLLTDPAQWEPVL 14 10 VPLLTDPAQ EPVLV 14 11 PLLTDPAQWEPVLVP 12 860 Tabla XLVIII-V21&22-HLA-DRl-0401~15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro Tabla XLVIII-V22-HLA-DRl-0401-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es 861 Tabla XLVIII-V24-HLA-DRl-0401-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición 862 Tabla XLVIII-V25-HLA-DRl-0401-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 3. PMALSRTPTRQISSI 20 11 TRQISSIDTDPPADG 20 8 RTPTRQISSIDTDPP 18 1 DPPMALSRTPTRQIS 14 14 ISSITDPPADGPSN 14 4 MALSRTPTRQISSID 12 863 Tabla XLVIII-V26-HLA-DRl-0401-15mers-PSCA 864 Tabla XLVIII-V27-HLA-DRl-0 01-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro VVSPAPSRQQALRRA 12 Tabla XLIV-Vl-HLA-DRBl-1101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 2; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce 865 Tabla XLIX-V4-HLA-DRBl-1101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 9; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 10 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 registro 866 Tabla XLIX-V4-HLA-DRBl-1101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce 867 Pos 123456789012345 Registro 29 CSRLPPSLRCSLHSA 14 33 PPSLRCSLHSACCSG 14 45 CSGDPASYRLWGAPL 14 59 LQPTLGVVPQASVPL 14 71 VPLLTHPAQWEPVLV 14 105 PDPPMALSRTPTRQI 14 171 VWS VSPAPSRGQAL 14 173 SWSPAPSRGQALRR 14 53 RLWGAPLQPTLGVVP 13 56 GAPLQPTLGWPQAS 13 60 QPTLGVVPQASVPLL 13 92 ASLTMYVCAPVPHPD 13 151 LRHLFPQEAFPAHPI 13 10 RRTSRAVTPTCATPA 12 24 AGPMPCSRLPPSLRC 12 67 PQASVPLLTHPAQWE 12 79 QWEPVLVPEAHPNAS 12 82 PVLVPEAHPNASLTM 12 90 PNASLTMYVCAPVPH 12 99 CAPVPHPDPPMALSR 12 119 IGSIDTDPPADGPSN 12 5 TTTWARRTSRAVTPT 11 49 PASYRLWGAPLQPTL 11 868 Tabla XLVIX-V20-HLA-DRBl-1101-15mers-PSCA 869 Tabla XLIX-V20-HLA-DRBl-1101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 10 VPLLTDPAQWEPVLV 14 6 PQASVPLLTDPAQWE 12 870 Tabla XLIX-V20-HLA DRBl-1101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 7 QASVPLLTDPAQWEP 12 2 LGVVPQASVPLLTDP 7 5 VPQASVPLLTDPAQW 7 14 TDPAQ EPVLVPEAH 7 1 TLGWPQASVPLLTD 6 4 WPQASVPLLTDPAQ 6 9 SVPLLTDPAQWEPVL 6 Tabla XLIX-V21&22-HLA-DRBl-1101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 9 VPLLTDLAQWEPVLV 20 5 PQASVPLLTDLAQWE 13 6 QASVPLLTDLAQ EP 12 871 Tabla XLIX-V24-HLA-DRBl-1101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 11 MYVCTPVPHPDPPMA 22 9 LTMYVCTPVPHPDPP 16 7 ASLTMYVCTPVPHPD 13 5 PNASLTMYVCTPVPH 12 14 CTPVPHPDPPMALSR 12 6 NASLTMYVCTPVPHP 10 872 Tabla XLIX-V25&26-HLA-DRBl-1101-15mers-PSCA Cada péptido es una porción de la SEQ ID NO: 8; cada posición de inicio es especificada, la longitud del péptido es de 15 aminoácidos, y la posición de extremo para cada péptido es la posición de inicio más catorce Pos 123456789012345 Registro 2 MALSRTPTRQISSSD 15 9 TRQISSSDTDPPADG 12 3 ALSRTPTRQISSSDT 8 13 SSSDTDPPADGPSNP 8 1 PMALSRTPTRQISSS 7 873 Tabla L: Características de la Proteina de PSCA PSCAv.4 Programa de URL Resultado Bioinformática ORF Buscador de ORF 570 bp . Longitud de la Proteína 189aa Región de Transmembrana TM Pred http.'/www.cli.enibnetois/' noTM HMMTop BO Sosui soluble TMHMM DO TM Péptido de Señal Signal P ninguno ?? pBMWtool pI 8.87 Peso Molecular pI MWtool 20.3kDa Localización PSORT 50% mitocondrios PSORTH 78% mitocondrios Porciones Pfem sin porción Prints indicación de cadherin Blocks Granulin PSCA vi Programa de URL Resultado Bioinformática ORF Buscador de ORF 372 bp Longitud de la Proteína 123aa Región de Transmembrana TMPred http://www.ch.einbnet.org/ l TM, aa 99-118 HMMTop lTM,aa 103-121 Sosui membrana de proteína aa 100-122 TMHMM http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM noTM Péptido de Señal Signal P bt^-V ww bs.dhLdl.'servíces SigDalP si, aa 1-15 pl pl MWtool http://www.exp_sy.ch/tools/ pI 5.01 Peso Molecular pI MWtool http://www.expasy.cli/tools 12.9 kDa Localización PSORT http^soitnibb.ac.jp 91% membrana de plasma PSORT 11 34% membrana de plasma, 34% extracelular Tabla LI : Limites de exón del PSCA .1 de trancripción Exón Número Inicio Final Longitud 1 10 69 60 2 70 177 108 3 178 985 808 874 Tabla LII (a) . Secuencia de nucleótidos de la variante de transcripción PSCA v.2 (SEQ ID NO: 6527) tttgaggcca tataaagtca cctgaggccc tctccaccac agcccaccag tgaccatgaa 60 ggctgtgctg cttgccctgt tgatggcagg cttggccctg cagccaggca ctgccctgct 120 gtgctactcc tgcaaagccc aggtgagcaa cgaggactgc ctgcaggtgg agaactgcac 180 ccagctgggg gagcagtgct ggaccgcgcg catccgcgca gttggcctcc tgaccgtcat 240 cagcaaaggc tgcagcttga actgcgtgga tgactcacag gactactacg tgggcaagaa 300 gaacatcacg tgctgtgaca ccgacttgtg caacgccagc ggggcccatg ccctgcagcc 360 ggctgccgcc atccttgcgc tgctccctgc actcggcctg ctgctctggg gacccggcca 420 gctataggct ctggggggcc ccgctgcagc ccacactggg tgtggtgccc caggcctctg 480 tgccactcct cacacacccg gcccagtggg agcctgtcct ggttcctgag gcacatccta 540 acgcaagtct gaccatgtat gtctgcgccc ctgtccccca ccctgaccct cccatggccc 600 tctccaggac tcccacccgg cagatcggct ctattgacac agatccgcct gcagatggcc 660 cctccaaccc tctctgctgc tgtttccatg gcccagcatt ctccaccctt aaccctgtgc 720 tcaggcacct cttcccccag gaagccttcc ctgcccaccc catctatgac ttgagccagg 780 tctggtccgt ggtgtccccc gcacccagca ggggacaggc actcaggagg gcccggtaaa 840 ggctgagatg aagtggactg agtagaactg gaggacagga gtcgacgtga gttcctggga 900 gtctccagag atggggcctg gaggcctgga ggaaggggcc aggcctcaca ttcgtggggc 960 tccctgaatg gcagcctcag cacagcgtag gcccttaata aacacctgtt ggataagcca 1020 Tabla LUI (a) . Alineación de secuencias de nucleótidos de PSCA v.2 (SEQ ID NO: 6528) y PSCA v.l (SEQ ID NO: 6529) v.2 16 agtcacctgaggccctctccaccacagcccaccagtgaccatgaaggctg 65 II..1 lili I I 11 ! II 11111 II 111 ! v.l 1 aggga gagg cagtgaccatgaaggctg 27 v.2 66 tgctgcttgccctgttgatggcaggcttggccctgcagccaggcactgcc 115 1 ! 111 M 11111111 ! 1 I i 1111 ! 11 I 1 ) 11 I 1111 i 111111111111 f v.l 28 tgctgcttgccctgttgatggcaggcttggccctgcagccaggcactgcc 77 v.2 116 ctgctgtgctactcctgcaaagcccaggtgagcaacgaggactgcctgca · 165 N 11111111 ¡ 111 I I M 111111111 N U 1 H 111111 ! 11 ' ¡ M 1 I I v.l 78 ctgctgtgctactcctgcaaagcccaggtgagcaacgaggactgcctgca 127 v.2 166 ggtggagaactgcacccagctgggggagcagtgctggaccgcgcgcatcc 215 i : i II N M 1111111 I : II 1 II M II 11111111 I I i 1 ¡ 11 II 1 I 1111 v.l 128 ggtggagaactgcacccagctgggggagcagtgctggaccgcgcgcatcc 177 v.2 216 gcgcagttggcetcctgaccgtcatcagcaaaggctgcagcttgaactgc 265 1 II 11 II 1111111111 i 1111111 i 1111111111111111111 i 1 I I 1 v.l 178 gcgcagttggcctcctgaccgtcatcagcaaaggctgcagcttgaactgc 227 v.2 266 gtggatgactcacaggactactacgtgggcaagaagaacatcacgtgctg 315 immmmimimmmimmiimmiimi n v.l 228 gtggatgactcacaggactactacgtgggcaagaagaacatcacgtgctg 277 v.2 316 tgacaccgacttgtgcaacgccagcggggcccatgccctgcagccggctg 365 iimiiiiiimiiiiiiiiiiiiiiiiiim mniinimii v.l 278 tgacaccgacttgtgcaacgccagcggggcccatgccctgcagccggctg 327 v.2 366 ccgccatccttgcgctgctccctgcactcqgcctgctgctctggggaccc 415 1 II I I I I I I 1 I II I I I I I I I I I I 1 I I I I N I I ! I I I I 11 I 1 I I I ! I I I I I 875 v.l 328 ccgccatccttgcgctgctccctgcactcggcctgctgctctggggaccc 377 v.2 416 ggccagctataggctctggggggccccgctgcagcccacactgggtgtgg 465 v.l 378 ggccagotataggctctggggggccccgotgcagcooacactgggtgtgg 427 v.2 466 tgccccaggcctctgtgccactcetcaca-cacccggcccagtgggagcc 514 v.l 428 tgccccaggcctttgtgccactcctcacagaacctggcccagtgggagcc 477 v.2 515 tgtcctggttcctgaggcaoatoctaacgcaagtctgaooatgtatgtot 564 v.l 478 tgtcctggttcefcgaggcacatcetaacgcaagtttgaccatgtatgttt 527 v.2 565 gcgcccctgfcccccc—accctgaccctcccat-ggccctctooaggact 611 ??,????-?.???? II II III 11-11 II II v.l 528 gcaccccttttccocnaaccctgaccttcccatgggccttttccaggatt 577 v.2 612 cccacccggcagatcggctctattgacacagatccgcctgcagatggccc 661 v.l 578 cccacocggoaga'tcagttttagtgacacagatccgcctgcagatggccc 627 v.2 662 ctocaaccctctctgctgotgtttcca ggcccagcattctccaccctta 711 lililí llll.llll.il Illll lililí II III II III -II II lililí v.l 628 ctccaaccctttotgttgotgtttccatggoccagoattttccaccctta 677 v.2 712 accctgtgcteaggcacctcttcccccaggaagccttccctgcccacccc 761 mimi.iiiimi.nmmniiiiinmmmiiim v.l 678 accctgtgttcaggcacttcttcccccaggaagacttccctgcccacccc 727 v.2 762 atctatgacttgagooaggtctggtocgtggtgtcccccgcaoccagcag 811 ii.mii.miimm-nmmmmiiimimimi v.l 728 atttatgaattgagccaggtttggtccgtggtgtcccccgcacccagcag 777 v.2 812 gggacaggcactcaggagggcccggtaaaggctgagatgaagtggactga 861 v.l 778 gggacaggcaatcaggagggcccagtaaaggctgagatgaagtggaotga 827 v.2 862 gtagaactggaggacaggagtcgacgtgagttcotgggagtctccagaga 911 v.l 828 gtagaactggaggacaagagttgacgtgagttcctgggagtttccagaga 877 v.2 312 tggggcctggaggcctggaggaaggggcoaggectcacattcgtggggct 961 ????????????????????????????????????????-??????! v.l 878 tggggcctggaggcctggaggaaggggccaggcctcacatttgtggggct 927 v.2 962 ccotgaatggcagcctcagcacagcgtaggcccttaataaacacctgttg 1011 III II Illll III 11-11 III INI lililí II líl 11 III v.l 928 coc-gaa-tggcagcctgagcacagcgtaggcccttaataaacacctgttg 976 v.2 1012 gataagcca 1020 v.l S77 gataagcoa 985 Tabla LIV(a) . Secuencias de péptidos de la proteina codificada por PSCA v.2 (SEQ ID NO: 6530) MKAVLLALLM AGLñLQPGTA LLCYSCKAQV SNEDCLQVEN CTQLGEQCWT ARIRAVGLLT 60 VISKGCSLNC VDDSQDYYVG KKNITCCDTD LCNASGAHAL QEHñAILñLL PALGLLLWGP 120 GQL 876 Tabla LV(a) . Alineación, de secuencias de aminoácidos de PSCA v.2 (S EQ ID NO: 6531) y PSCA v.l (SEQ ID NO: 6532) v.2 51 100 v.l 51 100 v.2 101 QPSÍUUIiMiPALGLLLWGPGQL miiiimmimiiiiii v.l 101 QpaaaiL ipaiói.iJi G GQL Tabla LII (b) . Secuencia de nucleótidos de la variante de transcripción PSCA v.3 (SEQ ID NO: 6533) tttgaggcca tataaagtca cctgaggccc tctccaccac agcccaccag tgaccatgaa 60 ggctgtgctg cttgccctgt tgatggcagg cttggccctg cagccaggca ctgccctgct 120 gtgctactcc tgcaaagccc aggcgcagtt ggcctcctga ccgtcatcag caaaggctgc 180 agcttgaáet gcgtggatga ctcacaggac tactacgtgg gcaagaagaa catcacgtgc 240 tgtgacaccg acttgtgcac tcggcctgct gctctgggga cccggccagc tataggctct 300 ggggggcccc gctgcagccc acactgggtg tggtgcccca ggcctctgtg ccactcctca 360 cacacccggc ccagtgggag cctgtcctgg ttcctgaggc acatcctaac gcaagtctga 420 ccatgtatgt ctgcgcccct gtcccccacc ctgaccctcc catggccctc tccaggactc 480 ccacccggca gatcggctct attgacacag atccgcctgc agatggcccc tccaaccctc 540 tctgctgctg tttccatggc ccagcattct ccacccttaa ccctgtgctc aggcacctct 600 tcccccagga agccttccct gcccacccca tctatgactt gagccaggtc tggtccgtgg 660 tgtcccccgc acccagcagg ggacaggcac tcaggagggc ccggtaaagg ctgagatgaa 720 gtggactgag tagaactgga ggacaggagt cgacgtgagt tcctgggagt ctccagagat 780 ggggcctgga ggcctggagg aaggggccag gcctcacatt cgtggggctc cctgaatggc 840 agcctcagca cagcgtaggc ccttaataaa cacctgttgg ataagcca 888 Tabla LUI (b) . Alineación de secuencias de nucleótidos de PSCA v.2 (SEQ ID NO: 6534) y PSCA v.3 (SEQ ID NO: 6535) v.2 1 tttgaggccatataaagtcacctgaggccctctccaccacagcccaccag 11] IllllItllMIlM Il t!li lM! IIIlll lll IMMIlill v.3 1 ttfcgaggccatataaagtcacctgaggccctctccaccacagcccaccag v.2 51 100 iiiimiiimiiimiiiiiiimimimiimimiin v.3 51 100 v.2 101 150 iiiiiiiiiimmiiimimimimmmn v.3 101 142 v.2 1S1 200 v.3 143 142 v.2 201 ggaccgcgcgcatccgcgcagttggcctcctgaccgtcatcagcaaaggc 250 II ilMMllüItlUMllllM M f !!lll II v.3 143 gcgcagttggcctcctgaccgtcatcagcaaaggc 177 v.2 251 tgcagcfctgaactgcgtggatgactcacaggactactacgtgggcaagaa 300 MÍ nimmnmiMiimim mi mu mi miini v.3 178 tgcagcttgaactgcgtggatgactcacaggactactacg-fcgggcaagaa 227 v.2 301 gaacatcacgtgctgtgacaccgacttgtgcaacgccagcggggcccatg 350 ll!l llll !IMIIIII l!IEllll!IE 877 v.3 228 gaacatcacg gctgtgacaccgacttg-^ : : 255 v.2 351 ccctgcagccggctgccgccatccttgcgotgctccctgcactcggcctg 400 v.3 256 - · tgcactcggcctg 268 v.2 401 ctgctctggggacccggccagctataggctctggggggccccgctgcagc 450 v.3 269 ctgctctggggacccggccagctataggctctggggggccccgctgcagc 318 v.2 451 ccacactgggtgtggtgccccaggcctctgtgccactcctcacacacccg 500 v.3 . 319 ccacactgggtgtggtgccccaggcctctgtgccactcctcacacacccg 368 v.2 501 gcccagtgggagcctgtcctggttcctgaggcacatcctaacgcaagtct 550 v.3 369 gcccagtgggagcctgtcctggttcctgaggcacatcctaacgcaagtct 418 v.2 551 gaccatgtatgtctgcgcccctgtcccccaccctgaccctcccatggccc 600 111 ¡ i 111111111111111111111 i 11111111 I i 1111111 ! 11111 v.3 419 gaccatgtatgtctgcgcccctgtcccccaccctgaccctcccatggccc 468 v.2 601 tctccaggactcccacccggcagatcggctctattgacacagatccgcct 650 lmmimiHinmimiiiiumii!immmim v.3 469 tcteeaggactcccacccggcagateggatctattgacacagatccgcat 518 v.2 651 gcagatggcccctccaaccctctctgctgctgtttccatggcccagcatt 700 U 11111111 I 1 i i III I 11 I I I II 11! i I II i I I ! I ! I I I I I I 11 I 11 I v.3 519 gcagatggcccctccaaccctctctgctgctgtttccatggcccagcatt 568 v.2 701 ctccacccttaaccctgtgctcaggcacctcttcccccaggaagccttcc 750 imiimiimimimiimiiiiimmiimiiimi v.3 569 ctccacccttaaccctgtgctcaggcacctcttcccccaggaagccttcc 618 v.2 751 ctgcccaccccatctatgacttgagccaggtctggtccgtggtgtccccc 800 111111111111111 II 1111111111 II 1.1 II 1111111111111 II 11 v.3 619 ctgcccaccccatctatgacttgagccaggtctggtccgtggtgtccccc 668 v.2 801 gcacccagcaggggacaggcactcaggagggcccggtaaaggctgagatg' 850 imiiiimiiniiiimiimiiiiiimiiimiiiiim v.3 669 gcacccagcaggggacaggcactcaggagggcccggtaaaggctgagatg 718 v.2 851 aagtggactgagtagaactggaggacaggagtcgacgtgagttcctggga 900 v.3 719 aagtggactgagtagaactggaggacaggagtcgacgtgagttcctggga 768 v.2 901 gtctccagagatggggcctggaggcctggaggaaggggccaggcctcaca 950 I 11111 II I 11 II 1111 I I I 111 I I 11 I I I 1111 I I I 111.11 I I I I 111 I v.3 769 gtctccagagatggggcctggaggcctggaggaaggggccaggcctcaca 818 v.2 951 ttcgtggggctccctgaatggcagcctcagcacagcgtaggcccttaata 1000 III II lllll ????? III ????????? III II III II III II III III v.3 819 ttcgtggggctccctgaatggeagcctcagcacagcgtaggcccttaata 868 v.2 1001 aacacctgttggataagcca 1020 v.3 869 aacacctgttggataagcca 888 878 Tabla LIV(b) . Secuencias de péptidos de la proteína codificada por PSCA v.3 (SEQ ID NO: 6536) MYVCAPVPHP DPPMALSRTP TRQIGSIDTD PPADGPSNPL CCCFHGPAFS TLNPVL HLF 60 PQEAPPAHPI YDLSQVWSW SPAPS GQAL RRAR 94 Tabla LV(b) . Alineación de secuencias de aminoácidos de PSCA v.2 y PSCA v.3 NADA DE HOMOLOGIA SIGINIFICANTE Tabla LII (c) . Secuencia de nucleótidos de la variante de transcripción PSCA v.4 (SEQ ID NO: 6537) gacagtgaac cctgcgctga aggcgttggg gctcctgcag ttctggggca gccacaggcg 60 cccagggttt cgtgccgatc agcccaggac ggtcttcccg gtgcagtttc tgatgcgggg 120 agggcagtgc tgccttccgg tcaccaggac cag gctcag cccgcctgct tgaccccctt 180 acttagctgg ggtccaatcc atacccaatt tagatgattc agacgatggg atttgaaact 240 tttgaactgg gtgcgactta agcactgccc tgctgtgcta ctcctgcaaa gcccaggtga 300 gcaacgagga ctgcctgcag gtggagaact gcacccagct gggggagcag tgctggaccg 360 cgcgeatccg cgcagttggc ctcctgaccg tcatcagcaa aggctgcagc ttgaactgcg. 420 tggatgactc acaggactac tacg gggca agaagaacat cacgtgctgt gacaccgact 480 tgtgcaacgc cagcggggcc catgccctgc agccggctgc cgccatcctt gcgctgctcc 540 ctgcactcgg cctgctgctc tggggacccg gccagc ata ggctctgggg ggccccgctg 600 cagcccacac tgggtgtggt gccccaggcc tctgtgccac tcctcacaca cccggcccag 660 tgggagcctg tcctggttcc tgaggcacat cctaacgcaa gtctgaccat gtatgtcfcgc 720 gcccctgtcc cccaccctga ccctcccatg gccctctcca ggac cccac ccggcagatc 780 ggctatattg acacagatcc gcctgcagat ggccccfccca accctctctg ctgctgfctfcc 840 catggcccag cattctccac ccttaaccct gtgctcaggc acctcfctccc ccaggaagcc 900 ttccctgccc accccatcta tgacttgagc caggtctggt ccgtggtgtc ccccgcaccc 960 agcaggggac aggcactcag gagggcccgg taaaggctga gatgaagtgg actgagtaga 1020 actggaggac aggagtcgac gtgagttcct gggagtctcc agagatgggg cctggaggcc 1080 tggaggaagg ggccaggcct cacattcgtg gggctccctg aatggcagcc tcagcacagc 1140 gtaggccctt aataaacacc tgttggataa gcca 1174 Tabla LUI (c) . Alineación de secuencias de nucleótidos de PSCA v.2 (SEQ ID NO: 6538) y PSCA v.4 (SEQ ID NO: 6539) 1 fcfcfcgaggccatatHaagtcacefeg^ggccctcrfcccacca—¦ —-— 39 I- 11-111. . 11-111 1113-1 II) v.4 42 tcfcggggc agccac aggcgc ccaggg ttcgtgc 75 v.2 40 cagccca ¦ ccag gacca tgaag 61 III II II 11-111 II .11.1 v.4 76 cgatcagcccaggacggtcttcccggtg—cagtttctgatgcggggagg 123 v.2 62 gctgtgctg-cttgccctgt tgatggcag ge 91 I I- 111111 I II 11-11 I 1 - 1 III II v.4 124 gcagtgctgcctt—ccggtcaccaggaccagtgct— agcccgcotgc 169 v.2 92 ttggccc tg 100 III. III I-v.4 170 ttgaoccccttacttagctggggtccaatcoataoccaatttagatgatt 219 v.2 101 cagee aggcactgcc 115 III. I v.4 220 cagacgatgggatttgaaacttttgaactgggtgcgacttaagcactgcc 269 v.2 116 ctgctgtgotactcctgoaaagcccaggtgagcaacgaggactgcctgca 165 1 lili lili II II 1111 II I 1111111111111 I ] I 111 II 1111 II 111 v.4 270 ctgctgtgctactcctgcaaagcccagcrtgagcaacgaggactgcctgca 319 v.2 166 ggtggagaactgcacccagctgggggagcagtgctggaccgcgcgcatco 215 v.4 320 ggtggagaactgcaeccagctgggggagcag gctggaccgcgcgcatcc 369 879 v.2 216 gcgcagttggcctcctgaccgtcatcagcaaaggctgcagcttgaactgc 265 ni uiiiimuumuuuiiuiuuuiuiuu nuil v.4 370 gcgcagttggcctcctgaccgtcatcagcaaaggctgcagcttgaactgc 19 v.2 266 gtggatgactcacaggactactacgtgggcaagaagaacatcacgtgctg 315 liiimi ii ii ii m iimi m imm mi imim im i v.4 420 gtggatgactcacaggactactacgtgggcaagaagaacatcacgtgctg 69 v.2 " 316 365 i 11111111111111111111 II I 1111 II I I I II II 11 I 1111 I I 111 I v.4 470 519 v.2 366 415 mimiimmmimmiiiniiiiinumimmi V.4 520 ccgccatccttgcgctgctccctgcactcggcctgctgctctggggaccc 569 v.2 416 ggccagctataggctctggggggccccgctgcagcccacactgggtgtgg 465 I lililí lili III III II 11)11 II HUI II II 11)111 v.4 570 ggccagctataggctctggggggccccgctgcagcccacactgggtgtgg 619 v.2 466 tgccccaggcctctgtgccactcctcacaeacccggcccagtgggagcct 515 111111111111111 II 11111111111111111 ti 111111 ? 11 II 11 v.4 620 tgccccaggcctctgtgccactcctcacacacccggcccagtgggagcct 669 v.2 516 gtcctggttcc gaggcacatcctaacgcaagtctgaocatgtatgtctg 565 iiiimtiiiiiiiiimiiiiiiiiiiiiiimiiiiiimiiii v.4 670 gtcctggttcctgaggcacatcctaacgcaagtctgaccatgtatgtctg 719 v.2 566 cgcccctgtcccccaccctgaccctcccatggccctctccaggactccca 615 v.4 720 cgcccctgtcccccaccctgaccctcccatggccctctccaggactccca 769 v.2 616 cccggcagatcggctctattgacacagatccgcctgcagatggcccctoc 665 v.4 770 cccggcagatcggctctattgacacagatccgcctgcagatggcccct.ee 819 v.2 666 aaccctctctgctgctgtttccatggcccagcattctccacccttaaccc 715 I 11111111111111111111 I 111111111111111111111111 I 11 I v.4 820 aaccctctctgctgctgtttccatggcccagcattctccacccttaaccc 869 v.2 716 tgtgct'caggcacctcttcccccaggaagccttccctgcccaccccatct 765 iiiiiiiiiniiiiiiiiiniiiiiiiimiuiiiiiiiiniiii v.4 870 tgtgctcaggcacctcttcccucaggaagccttccctgcccaccccatct 919 v.2 766 815 mimiiimimiimiiiiimiimiiiiiimimii v.4 920 969 v.2 ^816 865 mmmimmiinmimiimiiiiimmiiiii v.4 970 1019 vv..22 886666 aactggaggacaggagtcgacgtgagttectgggagtctccagagatggg 915 I II II 11111111111111111111111111111111111111111111 v.4 1020 ictggaggacaggagtcgacgtgagttcctgggagtctccagagafcggg 1069 v.2 916 ;ctggaggcctggaggaaggggccaggcctcacattcgtggggctccct 965 v.4 1070 gcctggaggcctggaggaaggggccaggcctcacattcgtggggctccct 1119 v.2 966 gaatggcagectcagcacagcgtaggcccttaataaacacctgttggata 1015 lI lllll ll llll lll llll ll lIlII III II IMI Il v.4 1120 gaatggcagcctcagcacagcgtaggcccttaataaacacctgttggata 1169 v.2 1016 ageca 1020 MUI v.4 1170 ageca 1174 880 Tabla LIV(c) . Secuencias de péptidos de la proteína codificada por PSCA v.4 (SEQ ID NO: 6540) MTHRTTTWAR RTSRAVTPTC ATPAGPMPCS RLPPSLRCSL HSACCSGDPA SYRLWGAPLQ 60 PTLGWPQAS VPLLTHPAQW EPVLVPEAHP NASLTMYVCA PVPHPDPPMA LSRTPTRQIG 120 SIDTDPPADG PSNPLCCCFH GPAFSTLKPV LRHLFPQEAF PAHPIYDLSQ VWSWSPAPS 180 RGQALRRA Tabla LV(c) . Alineación de secuencias de aminoácidos de PSCA v.2 y PSCA v.4 NADA DE HOMOLOGIA SIGNIFICANTE Tabla LII (d) . Secuencia de nucleótidos de la variante de transcripción PSCA v.5 (SEQ ID NO: 6541) gacagtgaac cctgcgctga aggcgtggg gctcctgcag ttctggggca gccacaggcg 60 cccagggttt cgtgccgatc agcccaggac ggtcttcccg gtgcagtttc tgatgcgggg 120 agggcagtgc tgccttccgg tcaccaggac cagtgctcag cccgcctgct tgaccccctt 180 acttagctgg ggccaatcc atacccaatt tagatgattc agacgatggg atttgaaact 240 tttgaactgg gtgcgactta agcactgccc tgctgtgota ctcctgcaaa gcccaggtga 300 gcaacgagga cfcgcctgcag gtggagaact gcacccagct gggggagcag tgctggaccg 360 cgcgcatccg tgagtggggg gacgacagcc gccaggccta ggtctctgco actgaactat 420 taatctttct ggocatctgt ccgcatctgt g gctgtttt ccttccacct gtccccgacc 480 cgtcccgcac ctgcaccccc aacaatcacc cagcatctgt ccctccagcc atcctcctcc 540 atctgccact cctccactca tctgtccctc cccatcctcc atcttccact cctccaccca 600 tctgfeccctc cccatccctg agctcactta ctcactcacc ccatttctga cgctcagcgg 660 gtggtccatc tgcctcggac atctggatag ggctgagaco agggccgaga ccaggccctc 720 gcactgcttg caatcctgag gccagcccag ggggactcta gagcattagg cagggtggga 780 caggaggagg cctggggcag gtcaggcagg tgagcacaca gggcagccoc atccccggat 840 occgotgctc cccaggcgca gttggcctcc tgaccgtcat oagcaaaggc tgcagcttga 900 actgcgtgga tgactcacag gactactacg tgggcaagaa gaaoatcacg tgctgtgaca 960 ccgacttgtg caacgccagc ggggcccatg ccctgcagcc ggctgccgcc atccttgcgc 1020 tgctccctgc actcggcctg ctgctctggg gacccggcca gctataggct ctggggggcc 1080 ccgctgcagc ccacactggg tgtggtgccc caggcctctg tgccactcct cacacacccg 1140 gcccagtggg agcctgtcct ggttcctgag gcacatccta acgcaagtct gaccatgtat 1200 gtctgcgccc ctgtccccca ccctgaccct cccatggccc tctccaggac tcccacccgg 1260 cagatcggct ctattgacac agatccgcct gcagatggcc cctccaaccc tctctgctgc 1320 tgtttccatg gcccagcatt ctccaccctt aaccctgtgc tcaggcacct cttcccccag 1380 gaagccttcc ctgcccaccc catctatgac ttgagccagg tctggtccgt ggtgtccccc 1440 gcacccagca ggggacaggc actcaggagg gcccggtaaa ggctgagatg aagtggactg 1500 agtagaactg gaggacagga gtcgacgtga gttcctggga gtctccagag atggggcctg 1560 gaggcctgga ggaaggggcc aggcctcaca ttcgtggggc tccctgaatg gcagcctcag 1620 cacagcgtag gcccttaata aacacctgtt ggataagcca 1660 Tabla LUI (d) . Alineación de secuencias de nucleótidos de PSCA v.2 (SEQ ID NO: 6542) y PSCA v.5 (SEQ ID NO: 6543) v.2 1 tttgaggccatataaagtcacctgaggccctctccacca 39 I . . I I I n . i i t i m . i t u v.5 42 tetggggc agccac aggcgc ccagggtttcgtgc 75 v.2 40 cagccca ccagtgacca tgaag 61 l l l l l l l 11.1 1 1 I I .1 1 .1 v.5 76 cgatcagcccaggacggtcttcccggtg—cagtttctgatgcggggagg 123 881 v.2 62 gctgtgctg-cttgccctgt tgatggcag gc 91 I I - i 11111 III I I- I I ll . l II I I I v.5 124 gcagtgctgcctt—ccggtcaccaggaccagtgct—cagcccgcctgc 169 v.2 92 ttggccc tg 100 I II. I II I. v.5 170 ttgacccccttacttagctggggtccaatccatacccaatttagatgatt 219 v.2 101 cagcc aggcactgcc 115 I I 1-1 l.l l l ll ll l v.5 220 cagacgatgggatttgaaacttttgaactgggtgcgacttaagcactgcc 269 v.2 116 ctgctgtgctactcctgcaaagcccaggtgagcaacgaggactgcctgca 165 I llliniil I M I I N I I M M i N I I ! I I lili N I M M I M I ! I I I v.5 270 ctgctgtgctactcctgcaaagcccaggtgagcaacgaggactgcctgca 319 v.2 166 ggtggagaactgcacccagctgggggagcagtgctggaccgcgcgcatcc 215 im iiini ni M i i i i i i i i i i i i i i i i i i i M i i i i i i N i n m v.5 320 ggtggagaactgcacccagctgggggagcagtgctggaccgcgcgcatcc 369 v.2 216 215 v.5 370 gtgagtggggggacgacagccgccaggcctaggtctctgccactgaacta 419 v.2 216 215 v.5 420 ttaatctttctggccatctgtccgcatctgtgtgctgttttccttccacc 469 v.2 216 215 v.5 470 tgtccccgacccgtcccgcacctgcacccccaacaatcacccagcatctg 519 v.2 216 215 v.5 520 tccctccagccatcctcctccatctgccactcctccactcatctgtccct 569 v.2 216 215 v.5 570 ccccatcctccatcttccactcctccacccatctgtccctccccatccct 619 ' v.2 216 215 v.5 620 gagctcacttactcactcaccceatttctgacgctcagcgggtggtccat 669 v.2 216 215 v.5 670 ctgcctcggacatctggatagggctgagaccagggccgagaccaggccct 719 v.2 216 ; 215 v.5 720 cgcactgcttgcaatcctgaggccagcccagggggactctagagcattag 769 v.2 216 215 v.5 770 gcagggtgggacaggaggaggcctggggcaggtcaggcaggtgagcacac 819 v.2 216 gcgcagttggcctc 229 11111111111111 882 vv..55 8 82200 agggcagccccatccccggatcccgctgctccccaggcgcagttggcctc 869 v.2 230 ctgaccgtcatcagcaaaggetgcagcttgaac gcgtggatgactcaca 279 iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiimiimiiiiiimniimi v.5 870 ctgaccgtcatcagpaaaggatgcagcttgaac gcg ggatgactcaca 919 V.2 280 ggactactaogtgggcaagaagaacatcacg gctgtgacaccgacttgt 329 v.5 920 ggactactaagtgggcaagaagaacatcacgtgctgtgacaccgacttgt 969 v.2 330 gcaacgccagoggggccoatgcoctgcagccggctgocgcoatccttgcg 3 9 mimmmmiiimimiiiimimiiiimiimi v.5 970 1019 v.2 380 ctgctccctgcactcggcctgctgctotggggacccggccagctataggc 429 iiiiimiiiimiiiimiiimiiiimiiiimimim v.5 1020 ctgctccctgcactcggcctgctgctctggggacccggccagctataggc 1069 v.2 430 tctggggggcGccgctgoagcccacactgggtg ggtgcocoaggoctct 479 mimimimiiiiimiiiiiimiiiimimimii! v.5 1070 tctggggggccccgctgcagcccacatrtgggtgtggtgccccaggcctct 1119 v.2 480 gtgccactcctcacacacccggcccagtgggagcctgtcetggttcctga '529 íimiimmimiiiiiiiiiimmiiiimimijmi v.5 1120 gtgccactcctcacacacccggcccagtgggagectgtectggttcctga 1169 vv..22 5 53300 ggcacatoctaacgoaagtctgaocatgtatgtctgcgcccotgtcccce 579 I ll ilinn ll l ll l lll ll l l il! v.5 1170 aacaoatoctaacctoaaatctqaooatqtatcrtctqcgcccctrtccccc 1219 v.2 580 acoctgaccotcooatggccototccaggaotcooacocggcagatcggc iiiimiiiiiiiiiiimiiiimiiiiiiiiiiMmiiiim v.5 1220 1269 v.2 630 tctattgacacagatccgcctgcagatggcccctccaaccctctctgctg 679 i ii ii imi i i ii iiiii iiiiiiiim n iM ii immmi ii v.5 1270 totattgacacagatcogoctgcagatggcccctccaaccctctctgctg 1319 v.2 680 ctgtttccatggcccagoattctccacecttaaccctgtgctcaggcacc 729 nniiiiiiiimiiiiiiimiiiiiiiiiiiiniiiiiiiiiii . v.5 1320 ctgtttccatggcccagcattctccacccttaaccctgtgctcaggcacc 1369 v.2 730 tcttccccoaggaagccttcoctgccoaooccatctatgaottgagccag 779 l!MMI!l)HiMIII))l llll)illll)!))l ] l ]l lll)l]llll v.5 1370 tcttcccccaggaagccttccctgcccacocaatctatgacttgagccag 1419 v.2 780 g ctgg ccg ggtgtccoocgcaoccagcaggggaoaggcactcaggag 829 l l l llll imill llll milM l ll Ill v.5 1420 gtctggtccgtggtgtococcgcacccagcaggggacaggoactcaggag 1469 v.2 830 ggcocggtaaaggctgagatgaagtggactgagtagaactggaggacagg 879 v.5 1470 ggcccggtaaaggctgagatgaagtggactgagtagaactggaggaoagg 1519 v.2 880 agtogacgtgagttoctgggagtctcoagagatggggcctggaggcctgg 929 vv..55 11552200 agtogacgtgagttoctgggagtctooagagatggggcctggaggcctgg 1569 v.2 9 93300 aggaaggggcoaggoctcacattcgtggggotocotgaatggcagcctca 979 11111111111111111111111111 I I 111.1 I I 1111111111111111 1570 aggaaggggccaggcctcacattcgtggggctccctgaatggcagcctca 980 gcacagcgtaggcccttaataaacacctgttggataagcca 1020 I I 11111! 11 i 11 I 11- i I I I I 11 I I i I 1111 I f I ! 111111 1620 gcacagcgtaggcccttaataaacacctgttggataagcca 1660 883 Tabla LIV(d) . Secuencias de péptidos de la proteina codificada por PSCA v.5 (SEQ ID NO: 6544) MTHRTTTWAR RTSRAVTPTC ATPAGPMPCS RLPPSLRCSL HSACCSGDPA SYRLWGAPLQ 60 PTLGWPQAS VPLLTHPAQW EPVLVPEAHP NASLTMYVCA PVPHPDPPMA LSRTPTRQIG 120 SIDTDPPADG PSNPLCCCFH GPAFSTLNPV LRHLFPQEAF PAHPIYDLSQ VWSWSPAPS 180 RGQALRRAR Tabla LV(d) . Alineación de secuencias de aminoácidos de PSCA v.2 y PSCA v.5 NADA DE HOMOLOGIA SIGNIFICANTE Tabla LVI . SNP y cambios de codón en PSCA v.2 y v.4 *AA: Aminoácido **_: No aminoácido codificado

Claims (46)

  1. 884
  2. REIVINDICACIONES 1. Una composición, caracterizada porque comprende, consiste esencialmente de, o consiste de: a) un péptido de ocho, nueve, diez u once aminoácidos contiguos de una proteína de la Figura 2; b) un péptido de las Tablas VIII-XXI; c) un péptido de las Tablas XXII a XLV; o, d) un péptido de las Tablas XLVI a XLIX. 2. Una composición de conformidad con la reivindicación 1, caracterizada porque comprende una proteína relacionada con una proteína de la Figura 2.
  3. 3. Una proteína de conformidad con la reivindicación 2, caracterizada porque es por lo menos 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 o 99% homologa a una secuencia de aminoácidos completa mostrada en la Figura 2.
  4. 4. Una composición de conformidad con la reivindicación 1, caracterizada porque la sustancia comprende un polipéptido CTL o un análogo del mismo, de la secuencia de aminoácidos de una proteína de la Figura 2.
  5. 5. Una composición de conformidad con la reivindicación 4, caracterizada porque además es limitada por una condición de que el epítope no es una secuencia de aminoácidos completa de la Figura 2.
  6. 6. Una composición de conformidad con la reivindicación 1, caracterizada porque además es limitada por una condición de que el polipéptido no es una secuencia de aminoácidos completa de una proteina de la Figura 2.
  7. 7. Una composición de conformidad con la reivindicación 1, caracterizada porque comprende un epitope de polipéptido de anticuerpo de una secuencia de aminoácidos de la Figura 2.
  8. 8. Una composición de conformidad con la reivindicación 7, caracterizada porque además es limitada por una condición de que el epitope no es una secuencia de aminoácidos completa de la Figura 2.
  9. 9. Una composición de conformidad con la reivindicación 7, caracterizada porque el epitope de anticuerpo comprende una región de péptido de por lo menos 5 aminoácidos de la Figura 2 en cualquier incremento de número entero hasta el final del péptido, en donde el epitope comprende una posición de aminoácido seleccionada de: a) una posición de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Hidrofilicidad de la Figura 5; b) una posición de aminoácido que tiene un valor menor que 0.5 en el perfil de Hidropaticidad de la Figura 6; c) una posición de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Por ciento de Residuos Accesibles de la Figura 7; d) una posición de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil de Flexibilidad Promedio de la 886 Figura 8; e) una posición de aminoácido que tiene un valor mayor que 0.5 en el perfil Beta-turn de la Figura 9; f) una combinación de por lo menos dos de a) hasta e) ; g) una combinación de por lo menos tres de a) hasta e) ; h) una combinación de por lo menos cuatro de a) hasta e) ; i) una combinación de por lo menos cinco de a) hasta e) .
  10. 10. Un polinucleótido, caracterizado porque codifica a una proteina de la reivindicación 1.
  11. 11. ün polinucleótido de conformidad con la reivindicación 10, caracterizado porque comprende una molécula de ácido nucleico expuesta en la Figura 2.
  12. 12. Un polinucleótido de conformidad con la reivindicación 10, caracterizado porque además es limitado por una condición de que la proteina codificada no es una secuencia de aminoácidos completa de la Figura 2.
  13. 13. Una composición de conformidad con la reivindicación 11, caracterizada porque la sustancia comprende un polinucleótido que comprende una secuencia de codificación de una secuencia de ácido nucleico de la Figura 2. 887
  14. 14. Un polinucleótido de conformidad con la reivindicación 11, caracterizado porque además comprende una secuencia de nucleótidos adicional que codifica un péptido adicional de la reivindicación 1.
  15. 15. Una composición, caracterizada porque comprende un polinucleótido que es completamente complementario a un polinucleótido de la reivindicación 10.
  16. 16. Un método para generar una respuesta inmune en un mamífero dirigida a una proteína de la Figura 2, el método caracterizado porque comprende: exponer células del sistema inmune del mamífero a una porción de a) una proteína relacionada con PSCA y/o b) una secuencia de nucleótidos que codifica la proteína, mediante lo cual se genera una respuesta inmune a la proteína .
  17. 17. Un método para generar una respuesta inmune de conformidad con la reivindicación 16, el método caracterizado porque comprende : proporcionar una proteína relacionada con PSCA que comprende por lo menos una célula T o por lo menos un epítope de célula B; y, poner en contacto el epítope con una célula T o célula B del sistema inmune del mamífero respectivamente, 888 mediante lo cual la célula T o la célula B es activada.
  18. 18. Un método de conformidad con la reivindicación 17, caracterizado porque la célula del sistema inmune es una célula B, mediante lo cual la célula B inducida genera anticuerpos que específicamente enlazan a la proteína relacionada con PSCA.
  19. 19. Un método de conformidad con la reivindicación 17, caracterizado porque la célula del sistema inmune es una célula T, que es una célula T citotóxica (CTL) , mediante lo cual la CTL activada extermina una célula autóloga que expresa la proteína relacionada con PSCA.
  20. 20. Un método de conformidad con la reivindicación 17, caracterizado porque la célula del sistema inmune es una célula T, que es una célula T ayudante (HTL) , mediante lo cual la HTL activada secreta citoquinas que facilitan la actividad citotóxica de una célula T citotóxica (CTL) o la actividad que produce anticuerpo de una célula B.
  21. 21. Un método para detectar, en una muestra, la presencia de una proteína relacionada con · PSCA o un polinucleótido relacionado con PSCA, caracterizado porque comprende las etapas de: poner en contacto la muestra con una sustancia que específicamente enlaza a la proteína relacionada con PSCA o al polinucleótido relacionado con PSCA, respectivamente; y determinar que hay un complejo de la sustancia con 889 la proteína relacionada con PSCA o la sustancia con el polinucleótido relacionado con PSCA, respectivamente.
  22. 22. Un método de conformidad con la reivindicación 21, para detectar la presencia de una proteina relacionada con PSCA en una muestra, caracterizado porque comprende las etapas de: poner en contacto la muestra con un anticuerpo o fragmento del mismo, cualquiera de los cuales específicamente enlaza a la proteína relacionada con PSCA; y determinar que hay un complejo del anticuerpo o fragmento del mismo y la proteína relacionada con PSCA, respectivamente .
  23. 23. Un método de conformidad con la reivindicación 21, caracterizado porgue además comprende una etapa de: tomar la muestra de un paciente quien tiene o quien se sospecha de tener cáncer.
  24. 24. Un método de conformidad con la reivindicación 21, para detectar la presencia de una proteína de mRNA de la Figura 2 en una muestra, caracterizado porque comprende: producir cDNA de la muestra mediante la transcripción inversa usando por lo menos un cebador; amplificar el cDNA así producido usando polinucleótidos PSCA como cebadores de sentido y antisentido, en donde los polinucleótidos PSCA usados como los cebadores de sentido y antisentido sirven para amplificar un cDNA de PSCA; y detectar la presencia del cDNA de PSCA amplificado.
  25. 25. Un método de conformidad con la reivindicación 21, para monitorear uno o más productos de gen PSCA en una muestra biológica de un paciente quien tiene o quien se sospecha de tener cáncer, el método caracterizado porque comprende : determinar el estado de uno o más productos de gen PSCA expresados por las células en una muestra de tejido de un individuo; comparar el estado asi determinado con el estado de uno o más productos de gen PSCA en una muestra normal correspondiente; e identificar la presencia de uno o más productos de gen aberrantes de PSCA en la muestra con relación a la muestra normal .
  26. 26. El método de conformidad con la reivindicación 25, caracterizado porque además comprende una etapa de determinar si hay uno o más productos de gen elevados de un mRNA de PSCA o una proteína de PSCA, mediante lo cual la presencia de uno o más productos de gen elevados en la muestra de prueba con relación a la muestra de tejido normal indica la presencia o estado de un cáncer.
  27. 27. Un método de conformidad con la reivindicación' 26, caracterizado porque el cáncer ocurre en un tejido 891 expuesto en la Tabla I.
  28. 28. Una composición, caracterizada porque comprende : una sustancia que a) modula el estado de una proteina de la Figura 2, o b) una molécula que es modulada por una proteina de la Figura 2, mediante lo cual el estado de una célula que expresa una proteina de la Figura 2 es modulado.
  29. 29. Una composición de conformidad con la reivindicación 28, caracterizado porque además comprende un portador fisiológicamente aceptable.
  30. 30. Una composición farmacéutica, caracterizada porque comprende la composición de la reivindicación 28 en una forma de dosis unitaria humana.
  31. 31. Una composición de conformidad con la reivindicación 28, caracterizada porque la sustancia comprende un anticuerpo o fragmento del mismo que específicamente enlaza a una proteína de la Figura 2.
  32. 32. Un anticuerpo o fragmento del mismo de conformidad con la reivindicación 31, caracterizado porque es monoclonal .
  33. 33. Un anticuerpo de conformidad con la reivindicación 31, caracterizado porque es un anticuerpo humano, un anticuerpo humanizado o un anticuerpo quimérico.
  34. 34. Un animal transgénico no humano, caracterizado 892 porque produce un anticuerpo de la reivindicación 31.
  35. 35. Un hibridoma, caracterizado porque produce un anticuerpo de la reivindicación 32.
  36. 36. Un método para suministrar un agente citotóxico o un agente de diagnóstico a una célula que expresa una proteina de la Figura 2, el método caracterizado porque comprende : proporcionar el agente citotóxico o el agente de diagnóstico conjugado con un anticuerpo o fragmento del mismo de la reivindicación 4; y exponer la célula al conjugado de anticuerpo-agente o fragmento-agente.
  37. 37. üna composición de conformidad con la reivindicación 28, caracterizada porque la sustancia comprende un polinucleótido que codifica un anticuerpo o fragmento del mismo, cualquiera de los cuales inmunoespecíficamente enlaza a una proteína de la Figura 2.
  38. 38. Una composición de conformidad con la reivindicación 28, caracterizada porque la sustancia comprende a) una ribozima que segmenta un polinucleótido que tiene una secuencia de codificación de PSCA, o b) una molécula de ácido nucleico que codifica la ribozima, y un portador fisiológicamente aceptable.
  39. 39. Una composición de conformidad con la reivindicación 28, caracterizada porque la sustancia comprende ' células T humanas, en donde las células T específicamente reconocen una subsecuencia de péptido PCSA en el contexto de una molécula HLA particular.
  40. 40. Un método para inhibir el crecimiento de células cancerosas que expresan una proteína de la Figura 2, el método caracterizado porque comprende: administrar a las células la composición de la reivindicación 28.
  41. 41. Un método de conformidad con la reivindicación 40 para inhibir el crecimiento de células cancerosas que expresan una proteína de la Figura 2, el método caracterizado porque comprende las etapas de: administrar a las células un anticuerpo o fragmento del mismo, cualquiera de los cuales específicamente enlaza a una proteína relacionada con PSCA.
  42. 42. Un método de conformidad con la reivindicación 40 para inhibir el crecimiento de células cancerosas que expresan una proteína de la Figura 2, el método caracterizado porque comprende las etapas de: administrar a las células una proteína relacionada con PSCA.
  43. 43. Un método de conformidad con la reivindicación 40 para inhibir el crecimiento de células cancerosas que expresan una proteína de la Figura 2, el método caracterizado porque comprende las etapas de: 894 administrar a las células un polinucleótido que comprende una secuencia de codificación para una proteína relacionada con PSCA o que comprende un polinucleótido complementario a una secuencia de codificación para una proteína relacionada con PSCA.
  44. 44. Un método de conformidad con la reivindicación 40 para inhibir el crecimiento de células cancerosas que expresan una proteína de la Figura 2, el método caracterizado porque comprende las etapas de: administrar a las células una ribozima que segmenta un polinucleótido que codifica una proteína de la Figura 2.
  45. 45. Un método de conformidad con la reivindicación 40 para inhibir el crecimiento de células cancerosas que expresan una proteína de la Figura 2 y una molécula HLA particular, el método caracterizado porque comprende las etapas de: administrar células T humanas a las células cancerosas, en donde las células T específicamente reconocen una subsecuencia de péptido de una proteína de la Figura 2 mientras que la subsecuencia está en el contexto de la molécula HLA particular.
  46. 46. Un método de conformidad con la reivindicación 40, el método caracterizado porque comprende las etapas de: administrar un vector que suministra un nucleótido que codifica un anticuerpo monoclonal de cadena individual, mediante lo cual el anticuerpo de cadena individual codificado es expresado intracelularmente dentro de las células cancerosas que expresan una proteina de la Figura 2.
MXPA05012957A 2003-05-30 2004-05-28 Variantes del antigeno de celula madre de prostata (psca) y subsecuencias del mismo. MXPA05012957A (es)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US47506403P 2003-05-30 2003-05-30
PCT/US2004/017231 WO2005014780A2 (en) 2003-05-30 2004-05-28 Prostate stem cell antigen (psca) variants and subsequences thereof

Publications (1)

Publication Number Publication Date
MXPA05012957A true MXPA05012957A (es) 2006-06-27

Family

ID=34135042

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
MXPA05012957A MXPA05012957A (es) 2003-05-30 2004-05-28 Variantes del antigeno de celula madre de prostata (psca) y subsecuencias del mismo.

Country Status (24)

Country Link
US (4) US7622564B2 (es)
EP (2) EP2319524B1 (es)
JP (1) JP2007525196A (es)
KR (1) KR101291787B1 (es)
CN (1) CN101090729B (es)
AT (1) ATE541052T1 (es)
AU (2) AU2004263823B2 (es)
BR (1) BRPI0410842B8 (es)
CA (1) CA2526274C (es)
CY (1) CY1113044T1 (es)
DK (2) DK1629088T3 (es)
ES (1) ES2384622T3 (es)
HK (1) HK1088635A1 (es)
IL (1) IL171966A (es)
IS (1) IS2900B (es)
MX (1) MXPA05012957A (es)
NO (1) NO20055508L (es)
NZ (3) NZ572940A (es)
PL (1) PL1629088T3 (es)
PT (1) PT1629088E (es)
RU (1) RU2005141341A (es)
SI (1) SI1629088T1 (es)
WO (1) WO2005014780A2 (es)
ZA (1) ZA200509606B (es)

Families Citing this family (39)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6541212B2 (en) * 1997-03-10 2003-04-01 The Regents Of The University Of California Methods for detecting prostate stem cell antigen protein
CN101090729B (zh) 2003-05-30 2014-07-23 艾更斯司股份有限公司 前列腺干细胞抗原(psca)变体及其序列
US7541442B2 (en) * 2003-05-30 2009-06-02 Agensys, Inc. Antibodies and related molecules that bind to PSCA proteins
US7595379B2 (en) * 2003-05-30 2009-09-29 Agensys, Inc. Antibodies and related molecules that bind to PSCA proteins
JP2008527001A (ja) * 2005-01-13 2008-07-24 ザ ジョンズ ホプキンス ユニバーシティー 前立腺幹細胞抗原ワクチンおよびその使用
CN101223191B (zh) * 2005-04-14 2012-09-05 阿根西斯公司 与psca蛋白结合的抗体和相关分子
US20090180958A1 (en) * 2005-04-26 2009-07-16 Karyon-Ctt Ltd. Diagnostic and therapeutic agents
KR20080090406A (ko) * 2005-11-28 2008-10-08 젠맵 에이/에스 재조합 1가 항체 및 그의 제조 방법
WO2007086932A2 (en) * 2006-01-13 2007-08-02 The Johns Hopkins University Prostate stem cell antigen vaccines and uses thereof
US8940871B2 (en) 2006-03-20 2015-01-27 The Regents Of The University Of California Engineered anti-prostate stem cell antigen (PSCA) antibodies for cancer targeting
MX2009003968A (es) * 2006-10-16 2009-06-01 Nokia Corp Sistema y método para usar segmentos decodificables paralelamente para codificación de video de vistas múltiples.
JP6126773B2 (ja) 2007-09-04 2017-05-10 ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア 癌のターゲッティングおよび検出のための高親和性抗前立腺幹細胞抗原(psca)抗体
CN101970498A (zh) * 2007-10-25 2011-02-09 维文蒂阿生物技术公司 针对变体HnRNPG的癌相关表位的抗体及其应用
US20100069616A1 (en) * 2008-08-06 2010-03-18 The Regents Of The University Of California Engineered antibody-nanoparticle conjugates
CN102272599B (zh) * 2008-11-11 2015-01-14 密执安大学评议会 抗cxcr1组合物和方法
ES2712732T3 (es) 2009-02-17 2019-05-14 Cornell Res Foundation Inc Métodos y kits para el diagnóstico de cáncer y la predicción de valor terapéutico
EP2506876B1 (en) 2009-12-02 2016-10-12 Imaginab, Inc. J591 minibodies and cys-diabodies for targeting human prostate specific membrane antigen (psma) and methods for their use
KR101335203B1 (ko) * 2010-03-26 2013-11-29 숙명여자대학교산학협력단 혈관신생촉진용 펩타이드 및 이의 용도
US8449512B2 (en) 2010-04-09 2013-05-28 Davinci Biomedical Research Products Inc. Stoma stabilitating device and method
JP6077450B2 (ja) * 2010-11-12 2017-02-08 ザ トラスティーズ オブ ザ ユニバーシティ オブ ペンシルバニア コンセンサス前立腺抗原、それをコードする核酸分子、ならびにそれを含むワクチンおよび用途
AU2015261742B2 (en) * 2010-11-12 2017-10-26 Inovio Pharmaceuticals, Inc. Consensus prostate antigens nucleic acid molecule encoding the same and vaccine and uses comprising the same
US8928126B2 (en) * 2012-11-07 2015-01-06 United Microelectronics Corp. Epitaxial layer
BR112016008806A2 (pt) 2013-11-01 2017-10-03 Pfizer Vetores para expressão de antígenos associados à próstata
US9616114B1 (en) 2014-09-18 2017-04-11 David Gordon Bermudes Modified bacteria having improved pharmacokinetics and tumor colonization enhancing antitumor activity
US11497767B2 (en) 2015-02-18 2022-11-15 Enlivex Therapeutics R&D Ltd Combination immune therapy and cytokine control therapy for cancer treatment
IL284985B2 (en) 2015-02-18 2023-03-01 Enlivex Therapeutics R& D Ltd Combined immunotherapy and cytokine control therapy for cancer treatment
US11304976B2 (en) 2015-02-18 2022-04-19 Enlivex Therapeutics Ltd Combination immune therapy and cytokine control therapy for cancer treatment
US11596652B2 (en) 2015-02-18 2023-03-07 Enlivex Therapeutics R&D Ltd Early apoptotic cells for use in treating sepsis
US11000548B2 (en) 2015-02-18 2021-05-11 Enlivex Therapeutics Ltd Combination immune therapy and cytokine control therapy for cancer treatment
US11318163B2 (en) 2015-02-18 2022-05-03 Enlivex Therapeutics Ltd Combination immune therapy and cytokine control therapy for cancer treatment
KR20170138534A (ko) 2015-04-21 2017-12-15 엔리벡스 테라퓨틱스 리미티드 치료적 혼주된 혈액 아폽토시스 세포 제제 및 이의 용도
EP4137158A1 (en) 2015-08-07 2023-02-22 Imaginab, Inc. Antigen binding constructs to target molecules
EP3416661A4 (en) 2016-02-18 2020-03-04 Enlivex Therapeutics Ltd. COMBINATION OF IMMUNOTHERAPY AND CYTOKINE CONTROL THERAPY FOR THE TREATMENT OF CANCER
US11180535B1 (en) 2016-12-07 2021-11-23 David Gordon Bermudes Saccharide binding, tumor penetration, and cytotoxic antitumor chimeric peptides from therapeutic bacteria
US11129906B1 (en) 2016-12-07 2021-09-28 David Gordon Bermudes Chimeric protein toxins for expression by therapeutic bacteria
CN106749674A (zh) * 2016-12-23 2017-05-31 四川大学 一种新型哮喘多肽疫苗及其制备方法
WO2018147960A1 (en) 2017-02-08 2018-08-16 Imaginab, Inc. Extension sequences for diabodies
CN111951887B (zh) * 2020-07-27 2024-06-28 深圳市新合生物医疗科技有限公司 基于深度学习的白细胞抗原与多肽结合亲和力预测方法
CN112307622B (zh) * 2020-10-30 2024-05-17 中国兵器科学研究院 一种用于计算机生成兵力的自主规划系统及规划方法

Family Cites Families (107)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US142A (en) 1837-03-11 Cooking apparatus
US28883A (en) 1860-06-26 James
US337A (en) 1837-07-31 Mode of constructing railroad-frogs
US5506A (en) 1848-04-11 Jackson stjtton
US5736A (en) 1848-08-29 Machinery fob dressing axes
US4179337A (en) 1973-07-20 1979-12-18 Davis Frank F Non-immunogenic polypeptides
US4235871A (en) 1978-02-24 1980-11-25 Papahadjopoulos Demetrios P Method of encapsulating biologically active materials in lipid vesicles
JPS6023084B2 (ja) 1979-07-11 1985-06-05 味の素株式会社 代用血液
US4640835A (en) 1981-10-30 1987-02-03 Nippon Chemiphar Company, Ltd. Plasminogen activator derivatives
US4722848A (en) 1982-12-08 1988-02-02 Health Research, Incorporated Method for immunizing animals with synthetically modified vaccinia virus
US4870009A (en) 1982-11-22 1989-09-26 The Salk Institute For Biological Studies Method of obtaining gene product through the generation of transgenic animals
US4501728A (en) 1983-01-06 1985-02-26 Technology Unlimited, Inc. Masking of liposomes from RES recognition
US4496689A (en) 1983-12-27 1985-01-29 Miles Laboratories, Inc. Covalently attached complex of alpha-1-proteinase inhibitor with a water soluble polymer
US4736866A (en) 1984-06-22 1988-04-12 President And Fellows Of Harvard College Transgenic non-human mammals
US5430136A (en) 1984-10-16 1995-07-04 Chiron Corporation Oligonucleotides having selectably cleavable and/or abasic sites
US5019369A (en) 1984-10-22 1991-05-28 Vestar, Inc. Method of targeting tumors in humans
EP0206448B1 (en) 1985-06-19 1990-11-14 Ajinomoto Co., Inc. Hemoglobin combined with a poly(alkylene oxide)
US4791192A (en) 1986-06-26 1988-12-13 Takeda Chemical Industries, Ltd. Chemically modified protein with polyethyleneglycol
US4837028A (en) 1986-12-24 1989-06-06 Liposome Technology, Inc. Liposomes with enhanced circulation time
US5359100A (en) 1987-10-15 1994-10-25 Chiron Corporation Bifunctional blocked phosphoramidites useful in making nucleic acid mutimers
US5124246A (en) 1987-10-15 1992-06-23 Chiron Corporation Nucleic acid multimers and amplified nucleic acid hybridization assays using same
GB8724885D0 (en) 1987-10-23 1987-11-25 Binns M M Fowlpox virus promotors
US5254678A (en) 1987-12-15 1993-10-19 Gene Shears Pty. Limited Ribozymes
US5010175A (en) 1988-05-02 1991-04-23 The Regents Of The University Of California General method for producing and selecting peptides with specific properties
CA1340323C (en) 1988-09-20 1999-01-19 Arnold E. Hampel Rna catalyst for cleaving specific rna sequences
US5225538A (en) 1989-02-23 1993-07-06 Genentech, Inc. Lymphocyte homing receptor/immunoglobulin fusion proteins
JPH04503957A (ja) 1989-03-07 1992-07-16 ジェネンテク,インコーポレイテッド 脂質とオリゴヌクレオチドの共有結合コンジュゲート
US5703055A (en) 1989-03-21 1997-12-30 Wisconsin Alumni Research Foundation Generation of antibodies through lipid mediated DNA delivery
WO1991004753A1 (en) 1989-10-02 1991-04-18 Cetus Corporation Conjugates of antisense oligonucleotides and therapeutic uses thereof
AU625013B2 (en) 1989-11-03 1992-06-25 Vanderbilt University Method of in vivo delivery of functioning foreign genes
US6673986B1 (en) 1990-01-12 2004-01-06 Abgenix, Inc. Generation of xenogeneic antibodies
DE69133566T2 (de) 1990-01-12 2007-12-06 Amgen Fremont Inc. Bildung von xenogenen Antikörpern
US6150584A (en) 1990-01-12 2000-11-21 Abgenix, Inc. Human antibodies derived from immunized xenomice
US5279833A (en) 1990-04-04 1994-01-18 Yale University Liposomal transfection of nucleic acids into animal cells
US5204253A (en) 1990-05-29 1993-04-20 E. I. Du Pont De Nemours And Company Method and apparatus for introducing biological substances into living cells
IE66205B1 (en) 1990-06-14 1995-12-13 Paul A Bartlett Polypeptide analogs
US5723286A (en) 1990-06-20 1998-03-03 Affymax Technologies N.V. Peptide library and screening systems
CA2064555A1 (en) 1990-06-27 1991-12-28 Arnold J. Levine Probes for detecting mutant p53
US5650489A (en) 1990-07-02 1997-07-22 The Arizona Board Of Regents Random bio-oligomer library, a method of synthesis thereof, and a method of use thereof
SE9002480D0 (sv) 1990-07-23 1990-07-23 Hans Lilja Assay of free and complexed prostate-specific antigen
US5733731A (en) 1991-10-16 1998-03-31 Affymax Technologies N.V. Peptide library and screening method
US5573905A (en) 1992-03-30 1996-11-12 The Scripps Research Institute Encoded combinatorial chemical libraries
US5541061A (en) 1992-04-29 1996-07-30 Affymax Technologies N.V. Methods for screening factorial chemical libraries
IL105914A0 (en) 1992-06-04 1993-10-20 Univ California Methods and compositions for in vivo gene therapy
DE69334076D1 (de) 1992-08-07 2006-11-30 Pharmexa Inc Hla bindepeptide und ihre verwendungen
US5288514A (en) 1992-09-14 1994-02-22 The Regents Of The University Of California Solid phase and combinatorial synthesis of benzodiazepine compounds on a solid support
EP0604289B1 (fr) 1992-12-17 1997-09-24 Valeo Systemes D'essuyage Procédé et dispositif d'alimentation d'un moteur électrique d'entrainement d'un bras d'essuie-glace de véhicule automobile
US5576220A (en) 1993-02-19 1996-11-19 Arris Pharmaceutical Corporation Thin film HPMP matrix systems and methods for constructing and displaying ligands
CA2157510A1 (en) 1993-03-05 1994-09-15 Howard M. Grey Hla-a2.1 binding peptides and their uses
WO1994026877A1 (en) 1993-05-17 1994-11-24 The Regents Of The University Of California Ribozyme gene therapy for hiv infection and aids
US5837501A (en) 1993-07-09 1998-11-17 Akzo Nobel N.V. Nucleic acid quantitation by co-amplification of target with multiple internal controls
US5804566A (en) 1993-08-26 1998-09-08 The Regents Of The University Of California Methods and devices for immunizing a host through administration of naked polynucleotides with encode allergenic peptides
US5679647A (en) 1993-08-26 1997-10-21 The Regents Of The University Of California Methods and devices for immunizing a host against tumor-associated antigens through administration of naked polynucleotides which encode tumor-associated antigenic peptides
JP3926839B2 (ja) 1993-09-14 2007-06-06 エピミューン,インコーポレイティド 万能dr−結合性ペプチドを用いる免疫応答の改変
US5681697A (en) 1993-12-08 1997-10-28 Chiron Corporation Solution phase nucleic acid sandwich assays having reduced background noise and kits therefor
CH686982A5 (fr) 1993-12-16 1996-08-15 Maurice Stroun Méthode pour le diagnostic de cancers.
US5519134A (en) 1994-01-11 1996-05-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Pyrrolidine-containing monomers and oligomers
US5593853A (en) 1994-02-09 1997-01-14 Martek Corporation Generation and screening of synthetic drug libraries
US5539083A (en) 1994-02-23 1996-07-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Peptide nucleic acid combinatorial libraries and improved methods of synthesis
US5739118A (en) 1994-04-01 1998-04-14 Apollon, Inc. Compositions and methods for delivery of genetic material
US5525735A (en) 1994-06-22 1996-06-11 Affymax Technologies Nv Methods for synthesizing diverse collections of pyrrolidine compounds
US5549974A (en) 1994-06-23 1996-08-27 Affymax Technologies Nv Methods for the solid phase synthesis of thiazolidinones, metathiazanones, and derivatives thereof
DK0773952T3 (da) 1994-07-20 2004-03-22 Inst Genetics Llc Interaktionsfældesystemer til påvisning af proteininteraktioner
US5597909A (en) 1994-08-25 1997-01-28 Chiron Corporation Polynucleotide reagents containing modified deoxyribose moieties, and associated methods of synthesis and use
US5580731A (en) 1994-08-25 1996-12-03 Chiron Corporation N-4 modified pyrimidine deoxynucleotides and oligonucleotide probes synthesized therewith
US5681702A (en) 1994-08-30 1997-10-28 Chiron Corporation Reduction of nonspecific hybridization by using novel base-pairing schemes
US5919652A (en) 1994-11-09 1999-07-06 The Regents Of The University Of California Nucleic acid molecules comprising the prostate specific antigen (PSA) promoter and uses thereof
US5736524A (en) 1994-11-14 1998-04-07 Merck & Co.,. Inc. Polynucleotide tuberculosis vaccine
US5962428A (en) 1995-03-30 1999-10-05 Apollon, Inc. Compositions and methods for delivery of genetic material
ATE352638T1 (de) 1995-04-11 2007-02-15 Gen Hospital Corp REVERSE ßTWO-HYBRIDß-SYSTEME
US5922687A (en) 1995-05-04 1999-07-13 Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Intracellular delivery of nucleic acids using pressure
US5585639A (en) 1995-07-27 1996-12-17 Hewlett-Packard Company Optical scanning apparatus
US5569588A (en) 1995-08-09 1996-10-29 The Regents Of The University Of California Methods for drug screening
CU22559A1 (es) 1996-01-17 1999-05-03 Ct Ingenieria Genetica Biotech Sistema de expresión de antígenos heterologos en e. coli como proteínas de fusión
JP2001504799A (ja) 1996-03-11 2001-04-10 エピミューン インコーポレイテッド Hla分子への結合アフィニティーが増加したペプチド
ES2183166T3 (es) 1996-04-26 2003-03-16 Massachusetts Inst Technology Ensayo de cribado por triple hibrido.
US5856136A (en) 1996-07-03 1999-01-05 Incyte Pharmaceuticals, Inc. Human stem cell antigens
WO1998004720A1 (en) 1996-07-26 1998-02-05 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research Method and reagents for genetic immunization
US5925523A (en) 1996-08-23 1999-07-20 President & Fellows Of Harvard College Intraction trap assay, reagents and uses thereof
US6365797B1 (en) 1997-10-15 2002-04-02 The Regents Of The University Of California Mice models of human prostate cancer progression
WO1998016628A1 (en) 1996-10-15 1998-04-23 The Regents Of The University Of California Animal models of human prostate cancer progression
US5846722A (en) 1996-10-16 1998-12-08 Terrapin Technologies, Inc. System to detect small molecule/peptide interaction
US5840501A (en) 1996-10-25 1998-11-24 Bayer Corporation Determination of cPSA
EP2314625B1 (en) 1996-12-03 2014-05-07 Amgen Fremont Inc. Transgenic mammals having human Ig loci including plural VH and Vkappa regions and antibodies produced therefrom
US6258939B1 (en) 1997-03-10 2001-07-10 The Regents Of The University Of California PSCA antibodies and hybridomas producing them
EP2343085B1 (en) * 1997-03-10 2014-12-10 The Regents of The University of California Antibody against prostate stem cell antigen (PSCA)
US6541212B2 (en) 1997-03-10 2003-04-01 The Regents Of The University Of California Methods for detecting prostate stem cell antigen protein
WO1998051824A1 (en) 1997-05-15 1998-11-19 Abbott Laboratories Reagents and methods useful for detecting disease of the urinary tract
US6890749B2 (en) * 1997-05-15 2005-05-10 Abbott Laboratories Reagents and methods useful for detecting diseases of the prostate
US20020192659A1 (en) * 1997-09-17 2002-12-19 Genentech, Inc. Secreted and transmembrane polypeptides and nucleic acids encoding the same
US20030092002A1 (en) 1997-09-17 2003-05-15 Genentech, Inc. Secreted and transmembrane polypeptides and nucleic acids encoding the same
ATE447583T1 (de) * 1997-09-17 2009-11-15 Genentech Inc Polypeptide und dafür kodierende nukleinsäure
IL141535A0 (en) * 1998-09-16 2002-03-10 Genentech Inc Secreted and transmembrane polypeptides and nucleic acids encoding the same
AU2883900A (en) * 1999-07-07 2001-01-30 Genentech Inc. Secreted and transmembrane polypeptides and nucleic acids encoding the same
DE60039448D1 (de) * 1999-10-29 2008-08-21 Genentech Inc Gegen das prostata-stammzellantigen (psca) gerichtete antikörper und deren verwendung
US6824780B1 (en) * 1999-10-29 2004-11-30 Genentech, Inc. Anti-tumor antibody compositions and methods of use
EP1432724A4 (en) 2002-02-20 2006-02-01 Sirna Therapeutics Inc RNA inhibition mediated inhibition of MAP KINASE GENES
EP1499353A4 (en) * 2002-04-15 2006-04-05 Human Genome Sciences Inc SPECIFIC TO TL5 BINDING ANTIBODIES
US7541442B2 (en) * 2003-05-30 2009-06-02 Agensys, Inc. Antibodies and related molecules that bind to PSCA proteins
US7595379B2 (en) * 2003-05-30 2009-09-29 Agensys, Inc. Antibodies and related molecules that bind to PSCA proteins
CN101090729B (zh) * 2003-05-30 2014-07-23 艾更斯司股份有限公司 前列腺干细胞抗原(psca)变体及其序列
HN2004000285A (es) * 2003-08-04 2006-04-27 Pfizer Prod Inc ANTICUERPOS DIRIGIDOS A c-MET
PL1753871T3 (pl) * 2004-05-28 2016-01-29 Agensys Inc Przeciwciała i powiązane cząsteczki, które wiążą się z antygenem komórek macierzystych prostaty (PSCA)
EP1874822A1 (en) 2005-04-14 2008-01-09 Agensys, Inc. Antibodies and related molecules that bind to psca proteins
JO3421B1 (ar) 2011-06-20 2019-10-20 H Lundbeck As طريقة لإعطاء 1-((1ار.3س)-6-كلورو-3-فينيل-اندان-1-ايل)-1.2.2-ترايميثيل- بيبيرازين واملاجها لمعالجة انفصام الشخصية
WO2013037693A2 (de) 2011-09-15 2013-03-21 Convergent Information Technologies Gmbh System und verfahren zur automatisierten erstellung von roboterprogrammen
US9804664B2 (en) 2014-05-27 2017-10-31 Qualcomm Incorporated Adaptive control of RF low power modes in a multi-rate wireless system using MCS value

Also Published As

Publication number Publication date
AU2008258185A1 (en) 2009-01-15
US8278424B2 (en) 2012-10-02
BRPI0410842A (pt) 2006-07-04
BRPI0410842B8 (pt) 2021-05-25
CA2526274C (en) 2015-12-01
PL1629088T3 (pl) 2012-06-29
US7622564B2 (en) 2009-11-24
EP2319524A1 (en) 2011-05-11
US20060029940A1 (en) 2006-02-09
IL171966A0 (en) 2006-04-10
IL171966A (en) 2015-09-24
US8853364B2 (en) 2014-10-07
SI1629088T1 (sl) 2012-08-31
EP1629088B1 (en) 2012-01-11
IS8148A (is) 2005-11-24
JP2007525196A (ja) 2007-09-06
ZA200509606B (en) 2009-05-27
ATE541052T1 (de) 2012-01-15
CY1113044T1 (el) 2016-04-13
DK1629088T3 (da) 2012-05-07
EP1629088A2 (en) 2006-03-01
KR101291787B1 (ko) 2013-08-07
IS2900B (is) 2014-10-15
WO2005014780A3 (en) 2007-04-05
AU2008258185B2 (en) 2011-12-08
KR20060021871A (ko) 2006-03-08
HK1088635A1 (en) 2006-11-10
US20110262968A1 (en) 2011-10-27
AU2004263823B2 (en) 2008-09-18
US20130041138A1 (en) 2013-02-14
BRPI0410842B1 (pt) 2019-09-24
DK2319524T3 (da) 2013-11-11
ES2384622T3 (es) 2012-07-10
EP2319524B1 (en) 2013-08-21
RU2005141341A (ru) 2006-06-10
US20100055120A1 (en) 2010-03-04
NZ572940A (en) 2010-04-30
NZ578591A (en) 2011-01-28
PT1629088E (pt) 2012-04-10
NO20055508D0 (no) 2005-11-22
AU2004263823A1 (en) 2005-02-17
CA2526274A1 (en) 2005-02-17
NZ543840A (en) 2009-09-25
CN101090729B (zh) 2014-07-23
WO2005014780A2 (en) 2005-02-17
CN101090729A (zh) 2007-12-19
EP1629088A4 (en) 2008-04-02
NO20055508L (no) 2006-02-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20190092874A1 (en) Nucleic acid and corresponding protein entitled 161p2f10b useful in treatment and detection of cancer
US7622564B2 (en) Prostate stem cell antigen (PSCA) variants and subsequences thereof
CA2493923C (en) Nucleic acids and corresponding proteins entitled 191p4d12(b) useful in treatment and detection of cancer
AU2010226920B2 (en) Nucleic acid and corresponding protein entitled 161P2F10B useful in treatment and detection of cancer
AU2002361610A1 (en) Nucleic acid and corresponding protein entitled 161P2F10B useful in treatment and detection of cancer
CA2522994C (en) Nucleic acids and corresponding proteins entitled 109p1d4 useful in treatment and detection of cancer
CA2503346A1 (en) Nucleic acid and corresponding protein entitled 24p4c12 useful in treatment and detection of cancer
CA2496566A1 (en) Nucleic acid and corresponding protein entitled 98p4b6 useful in treatment and detection of cancer

Legal Events

Date Code Title Description
FG Grant or registration