KR870009024A - 폴리뉴클레오티드의 생산 방법 - Google Patents

폴리뉴클레오티드의 생산 방법 Download PDF

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KR870009024A
KR870009024A KR870002486A KR870002486A KR870009024A KR 870009024 A KR870009024 A KR 870009024A KR 870002486 A KR870002486 A KR 870002486A KR 870002486 A KR870002486 A KR 870002486A KR 870009024 A KR870009024 A KR 870009024A
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제프리즈 알렉죤
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원본미기재
임페리얼 케미칼 인더스트리즈 피엘씨
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Abstract

내용 없음

Description

폴리뉴클레오티드의 생산 방법
본 내용은 요부공개 건이므로 전문내용을 수록하지 않았음
제 1도 A는 DNA 지문으로부터 분체 g가 명시된 특이화된 초가변성 DNA의 겔전기영동 정제를 도시한 것이며 ;
제 1도 B는 클론화된 DNA의 억제지도에 의하여 DNA 분체 g를 조직화한 것이며 ;
제 2도는 초가변성 분체 g의 DNA 서열을 도시한 것으로서 특히 공통반복서열과 영국 특허 공고 제 2, 166, 445호의 "코어"서열과의 배치를 집중적으로 도시한 것이며 ;
제 3도는 pλg3에 의해 검출된 다형성 DNA분체의 멘델유전을 도시한 것이며;

Claims (40)

  1. 참고의 DNA를 식별할 수 있는 폴리뉴클레오티드프로브를 사용하여 게놈 DNA 분체를 하나이상의 다형성 미니새틀라이트부위 또는 초가변성 좌위에 혼성화시켜 식별된 DNA 분체를 클로닝하고; 이것으로부터 게놈중의 적어도 3(100)의 대립형질변이를 갖는 부위 도는 좌위에 특이한 미니새틀라이트를 포함하는 DNA 분체에 혼성화시킬 수 있는 폴리뉴클레오티드를 생산하는 방법으로 구성되어 게놈중에서 적어도 3(100)의 대립형질변이를 갖는 특이 부위 또는 좌위에 대하여 특이한 미니새틀라이트를 포함하는 DNA 분체에 혼성화 될 수 있는 폴리뉴클레오티드를 생산하는 방법.
  2. 제 1항에 있어서, 미니새틀라이트를 함유하는 상기 DNA 분체는 부위 또는 좌위가 적어도 3(500)의 대립형질 변이를 갖는 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위에서 얻은 미니새틀 라이트를 함유하는 것을 특징으로 하는 방법.
  3. 참고의 DNA를 식별할 수 있는 폴리뉴클레오티드프로브를 사용하여 게놈 DNA 분체를 하나이상의 대형성 미니새틀라이트부위 또는 초가변성 좌위에 완성화시켜 식별된 DNA분체를 클로닝하고, 이것으로부터 게놈중의 적어도 3의 대립형질변이를 갖는 부위 또는 좌위에 특이한 미니새틀 라이트를 포함하는 DNA 분체에 혼성화시킬 수 있는 폴리뉴클레오티드를 생산하는 방법으로 구성되어 게놈중에서 적어도 3의 대립형질변이를 갖는 특이 부위 또는 좌위에 대하여 특이한 미니새틀라이트를 포함하는 DNA 분체에 혼성화될 수 있는 폴리뉴클레오티드를 생산하는 방법.
  4. 전항중 어느 한 항에 있어서,
    폴리뉴클레오티드 프로브는 라벨된 또는 마커 성분의 도입과 함께 적어도 3개의 나란한 반복(리피트) 서열을 포함하며(모든 나란한 리피트 서열사이에는 평균 적어도 70%의 상동율이 존재한다), 이 서열은 억제 엔도뉴클레아제에 의하여 샘플 DNA를 분체화시켜 얻은 상응하는 DNA 분체에 프로브를 혼성화시킬 수 있을 정도로 게놈의 미니새틀라이트 부위와 동일하며, 여기서
    a) 리피트 각각은 서로 다른 게놈성 좌위로부터 다수의 미니새틀라이트 중에 존재하는 비슷한 길이의 공통 코어 부위와 적어도 70% 상동하는 각각의 코어를 지니고 있으며 ;
    b) 코어는 6-16뉴클레오티드 길이를 지니고 있다.
    c) 코어에 참여하지 않는 반복유니트내의 뉴클레오티드수를 15이하인 것을 특징으로 하는 방법.
  5. 전항중 어느 한 항에 있어서, 폴리뉴클티오드프로브는 하기(1) 또는 (2)의 나란한 적어도 3개의 반복서열(상보적 서열포함)을 포함하며 나란한 모든 반복서열 사이에는 평균적으로 적어도 70%의 상동율이 존재하는 것을 특징으로 하는 방법.
    (A) AGGGCTGGAGG 1
    (상기식에서 T를 T 또는 U,(A)는 존재하거나 또는 존재하지 않을 수 있다).
    AGAGGTGGGCAGGTGG 2
    (상기식에서 T는 T 또는 U이다.)
  6. 제 5항에 있어서, 폴리뉴클레오티드 프로브는 하기 중에서 선택된 하나의 서열 또는 이것의 나란한 반복서열 또는 이것에 상보적인 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
    AGGAATAGAAAGGCGGGYGGTGTGGGCAGGGAGRGGC 3
    GTGGAYAGG 4
    TGGGAGGTGGRYAGTGTCTG 5
    GAATGGAGCAGGYGRCCAGGGGTGACTCA 6
    GGGCTGGGGAGATGGTGGAGGAGGTGTTGG 7
    AGGCTGGGGAGATGGTGGAGGAAGAGTAC 8
    TGTGTGTAATGGGTATAGGGAGGGCCCCGGGAAGGGGGTGTGGYX 9
    (상기식에서 Y는 C, T 또는 U, X는 G 또는 C, R은 A 또는 G, T는 T 또는 U이다).
  7. 제 1항 내지 제 5항 중 어느 한 항에 있어서, 부위 또는 좌위가 상기식(3) 서열 또는 이것의 나란한 반복 서열, 또는 이것의 반복서열, 이것에 상보적인 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드프로브에 의해 검출될 수 있는 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위로부터 얻은 미니새틀라이트를 상기 DNA 분체가 포함하며, 상기 방법은 단일 좌위를 식별할 수 있는 혼성화 조건하에서 시행되는 것을 특징으로 하는 방법.
  8. 제 1항 내지 제 5항 중 어느 한 항에 있어서, 부위 또는 좌위가 상기식(4-9) 서열 또는 이것의 나란한 반복 서열, 또는 이것의 상보적인 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드프로브에 의해 검출될 수 있는 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위로부터 얻은 미니새틀라이트를 상기 DNA 분체가 포함하며, 상기 방법은 단일 좌위를 식별할 수 있는 혼성화 조건하에서 시행되는 것을 특징으로 하는 방법.
  9. 전항중 어느 한 항에 있어서, 뉴클레오티드 서열은 뉴클레오티드 서열은 혼성화할 수 있을 정도로 DNA 분체를 함유하는 미니새틀라이트와 상동한 것을 특징으로 하는 방법.
  10. 분리된 형태 또는 클론화된 형태의 폴리뉴클레오티드가 제공되며 이것은 1개의 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위에 대하여 특이한 뉴클레오티드 서열을 포함하며 이 서열은 억제 엔도뉴클레아제로 샘플 게놈성 DNA를 분체화시켜 얻은 상응하는 DNA 분체(미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위의 미니새틀라이트를 함유한다)에 뉴클레오티드 서열을 혼성화시킬 수 있을 정도로 미니새틀라이트와 상동하는 서열이며,
    여기서 1) 상술된 부위 또는 좌위는 적어도 3(100)개의 대립 형질 변이를 지니며 ; 2) 적어도 3개의 나란한 하기의 반복서열(상보 서열 포함)을 포함하는 폴리뉴클레오티드 프로브에 의해 상술된 부위 또는 좌위는 검출될 수 있는 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드.
    (A) AGGGCTGGAGG 1
    (상기식에서 T를 T 또는 U,(A)는 존재하거나 또는 존재하지 않을 수 있다).
    AGAGGTGGGCAGGTGG 2
    (상기식에서 T는 T 또는 U이다.)
  11. 제 10항에 있어서, 좌위 또는 부위가 적어도 3(500)의 대립형질 변이를 갖는 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위에서 얻은 미니새틀라이트를 DNA 분체가 포함하는 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드.
  12. 분리된 형태 또는 클론화된 형태의 폴리뉴클레오티드는 1개의 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위에 관하여 특이한 뉴클레오티드 서열을 포함하며 이 서열은 억제 엔도뉴클레아제로 샘플 게놈성 DNA를 분체화시켜 얻은 상응하는 DNA 분체(미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위의 미니새틀라이트를 함유한다)에 뉴클레오티드 서열을 혼성화시킬 수 있을 정도로 미니새틀라이트와 상동하는 서열이며 여기서 1) 상술된 부위 또는 좌위는 적어도 3개의 대립형질변이를 지니며 ; 2) 적어도 3개의 나란한 하기의 반복서열(상보 서열 포함)을 포함하는 폴리뉴클레오티드프로브에 의해 상술된 부위 또는 좌위는 검출될 수 있는 것을 특징으로 하는 분리된 형태 또는 정제된 형태의 폴리뉴클레오티드.
    (A) AGGGCTGGAGG 1
    (상기식에서 T를 T 또는 U,(A)는 존재하거나 또는 존재하지 않을 수 있다).
    AGAGGTGGGCAGGTGG 2
    (상기식에서 T는 T 또는 U이다.)
  13. 제 10항 내지 제 13항 중 어느 한 항에 있어서, 좌위 또는 부위가 다음에서 선택한 하나의 서열 또는 이것의 나란한 반복 서열 또는 이것에 상보적인 서열을 함유하는 폴리뉴클레오티드 프로브에 의해 특이적으로 식별될 수 있는 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위의 미니새틀라이트를 DNA 분체가 함유하는 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드.
    AGGAATAGAAAGGCGGGYGGTGTGGGCAGGGAGRGGC 3
    GTGGAYAGG 4
    TGGGAGGTGGRYAGTGTCTG 5
    GAATGGAGCAGGYGRCCAGGGGTGACTCA 6
    GGGCTGGGGAGATGGTGGAGGAGGTGTTGG 7
    AGGCTGGGGAGATGGTGGAGGAAGAGTAC 8
    TGTGTGTAATGGGTATAGGGAGGGCCCCGGGAAGGGGGTGTGGYX 9
  14. 제 10항 내지 제 12항 주 어느 한 항에 있어서, 좌위 또는 부위가 상기 식(3) 서열 또는 이것의 나란한 반복 서열을 함유하는 폴리뉴클레오티드 프로브에 의해 검출될 수 있는 미니새틀라이트부위 또는 초가변성 좌위의 미니새틀라이트를 DNA 분체가 함유하는 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드.
  15. 제 10항 내지 제 12항 중 어느 한 항에 있어서, 좌위 또는 부위가 식(4-9) 서열로부터 선택된 하나의 나란한 반복 서열을 함유하는 폴리뉴클레오티드프로브에 의해 검출될 수 있는 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위의 미니새틀라이트를 상기 DNA분체가 함유하는 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드.
  16. 제 10항 내지 제 15항 중 어느 한 항에 있어서, 뉴클레오티드 서열은 뉴클레오티드 서열을 혼성화시킬수 있을 정도로 DNA의 미니새틀라이트와 상동하는 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드.
  17. 제 14항에 있어서, 뉴클레오티드 서열은 식(3) 서열 또는 이것의 나란한 반복서열(모든 나란한 반복 서열 사이에는 적어도 평균 70%의 상동률이 존재한다)을 포함하는 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드.
  18. 제 15항에 있어서, 뉴클레오티드 서열은 식(4-9)에서 선택된 서열 또는 나란한 반복서열(모든 나란한 반복 서열 사이에는 적어도 평균 70%의 상동률이 존재한다) 또는 이것에 상보적인 서열로 구성된 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드.
  19. 제 17항 또는 제 18항에 있어서 모든 나란한 반복서열 사이에는 적어도 평균 80%의 상동율이 존재하는 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드.
  20. 제 19항에 있어서, 모든 나란한 반복 서열 사이에는 적어도 평균 90%의 상동율이 존재하는 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드.
  21. 제 20항에 있어서, 나란히 반복되는 서열은 정밀히 반복되는 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드.
  22. 클론화된 물질의 미생물학적 번식을 포함하여 제 1항 내지 제 9항 중 어느 한 항에 의해 정의된 방법으로 첫 번째로 제조한 폴리뉴클레오티드를 생산하거나 또는 제 10항 내지 21항 중 어느 한 항에 의해 정의된 폴리뉴클레오티드를 생산하는 방법.
  23. 직접합성에 의해 제 1항 내지 제 9항 중 어느 한 항에 의해 정의된 방법에 따라 첫 번째로 생산된 폴리뉴클레오티드 또는 제 10항 내지 제 21항 중 어느 한 항에 의해 정의된 폴리뉴클레오티드를 생산하는 방법.
  24. 제 10항 내지 제 21항 중 어느 한 항에서 정의된 라벨된 성분 또는 마커성분을 갖는 폴리뉴클레오티드 또는 제 1항 내지 9항 중 어느 한 항에서 정의된 방법에 따라 생산된 라벨된 성분 또는 마커성분을 갖는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 폴리뉴클레오티드 프로브.
  25. 제 24항에 있어서, 폴리뉴클레오티드는 전체가 일본 쇄인 것을 특징으로 하는 폴리뉴클레오티드 프로브.
  26. 제 10항 내지 제 21항 중 어느 한 항에서 청구된 폴리뉴클레오티드 또는 제 1항 내지 제 9항 중 어느 한 항에서 정의된 방법으로 생산된 폴리뉴클레오티드를 라벨링하거나 또는 마킹하는 것을 특징으로 하여 제 24항 또는 제 25항의 폴리뉴클레오티드 프로브를 생산하는 방법.
  27. 하나 이상의 다형성 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위에 대하여 참고의 DNA를 구별할 수 있는 프로브를 만들 수 있는 혼성화 조건하에서 참고의DNA를 식별할 수 있는 폴리뉴클레오티드 프로브를 사용하여 게놈DNA분체를 하나이상의 다형성 미니새틀라이트부위 또는 초가변성 좌위에 혼성화시켜 식별된 DNA 분체를 클로닝하고 ;
    이것으로부터 게놈중의 적어도 3(100)의 대립형질 변이를 갖는 부위 또는 좌위에 특이한 미니새틀라이트를 포함하는 DNA 분체에 혼성화시킬 수 있는 폴리뉴클레오티드를 제조하는 것으로 구성되어 게놈 중에서 적어도 3(100)의 대립형질변이를 갖는 특이부위 또는 좌위에 대하여 특이한 미니새틀라이트를 포함하는 DNA 분체에 혼성화될 수 있는 폴리뉴클레오티드를 제조하는 방법.
  28. 분리된 형태 또는 클론화된 형태의 폴리뉴클레오티드는 1개의 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위에 관하여 특이한 뉴클레오티드 서열을 포함하며 이 서열은 억제엔도뉴클레아제로 샘플 게놈성 DNA를 분체화시켜 얻은 상응하는 DNA분체(미니새틀라이트부위 또는 초가변성 좌위의 미니새틀라이트를 함유한다)에 뉴클레오티드 서열을 혼성화시킬 수 있을 정도로 미니새클라이트와 상동하는 서열이며, 여기서 1) 상술된 부위 또는 좌위는 적어도 3(100)개의 대립형질변이를 가지며, 2) 상기 좌위 또는 부위는 제 24항 또는 제 25항에서 청구된 폴리뉴클레오티드 또는 제 26항의 방법에 의해 제조된 폴리뉴클레오티드에 의해 검출될 수 있는 것을 특징으로 하는 분리된 형태 또는 클론화된 형태의 폴리뉴클레오티드.
  29. 상기부위 또는 좌위가 적어도 3개의 다형도를 갖는 제 28항에서 청구된 폴리뉴클레오티드 또는 제 28항에서 정의된 방법의 변형.
  30. 나란한 리피트에 상응하는 서열을 적당한 크기로 절단하지 않는 하나 또는 그 이상의 억제 효소로 샘플 DNA를 분체화시키고, DNA분체를 폴리뉴클레오티드 또는 폴리뉴클레오티드 프로브를 사용하여 DNA 분체를 프로브시키고(여기서 폴리뉴클레오티드 및 이것의 프로브는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 이 서열은 단일 미니 새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위에 대하여 특이하며, 상기 단일의 미니새틀라이트부위 또는 초가변성 좌위의 미니새틀라이트를 함유하는 상응하는 DNA분체에 뉴틀레오티드 서열을 혼성화시킬 수 있을 정도로 미니새틀라이트 부위와 상동하다), DNA의 혼성화된 분체를 검출하고, 상기 대조물과 혼성화된 분체를 비교하며 여기서 1) 상기 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위는 적어도 3(100)개의 대립형질 변이를 가지며, 2) 상기 부위 또는 좌위는 참고의 DNA를 하나 이상의 다형성 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위에 대하여 구별할 수 있는 폴리뉴클레오티드 프로브에 의해 검출되는 것을 특징으로 하며 하나 또는 그 이상의 대조물에 대하여 참고의 게놈성 DNA테스트 샘플을 특성화하는 방법.
  31. 나란한 리피트에 상응하는 서열을 적당한 크기로 절단하지 않는 하나 또는 그 이상의 억제효소로 샘플 DNA를 분체화시키고, DNA분체를 폴리클레오티드 또는 폴리뉴클레오트드프로브를 사용하여 DNA 분체를 프로브시키고(여기서 폴리뉴클레오티드 및 이것의 프로브는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 이 서열은 단일 미니새틀라이트부위 또는 초가변성 좌위에 대하여 특이하며, 상기 단일의 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위의 미니새틀라이트를 함유하는 상응하는 DNA분체에 뉴틀레오티드 서열을 혼성화시킬 수 있을 정도로 미니새틀라이트부위와 상동하다), DNA의 혼성화된 분체를 검출하고, 상기 대조물과 혼성화된 분체를 비교하며 여기서 1)상기 미니새틀라이트 부위 또는 초가변성 좌위는 적어도 3개의 대립형질변이를 가지며 2) 상기 부위 또는 좌위는 참고의 DNA를 하나 이상의 다형성 미니새틀라이트부위 또는 초가변성 좌위에 대하여 구별할 수 있는 폴리뉴클레오티드 프로브에 의해 검출되는 것을 특징으로 하여 하나 또는 그 이상의 대조물에 대하여 참고의 게놈성 DNA테스트 샘플을 특성화하는 방법.
  32. 제 30항 내지 31항에 있어서 사용된 폴리뉴클레오티드 또는 폴리뉴클레오티드 프로브는 제 10항 내지 제 21항중 어느 한 항에서 정의된 것이나 또는 제 1항 내지 9항중 어느 한 항에서 생산된 것을 특징으로 하는 방법.
  33. 제 30항 내지 제 32항 중 어느 한 항에 있어서, 샘플 DNA는 인간 DNA인 것을 특징으로 하는 방법.
  34. 제 30항 내지 제 33항 중 어느 한 항에 있어서, 테스트 샘플 공급체와 하나 또는 그 이상의 대조샘플 공급체를 식별하는 방법이 제공되는데 대조샘플은 비슷하게 분체화되며 각 샘플로부터 혼성화된 분체의 비교가 나타나는 것을 특징으로 하는 방법.
  35. 제 30항 내지 제 33항 중 어느 한항에 있어서, 테스트 샘플 공급체와 하나 또는 그 이상의 대조샘플 공급체 사이에 일족(一族) 관계를 정립하는 방법이 제공되는데 대조샘플은 비슷하게 분체화되며 각 샘플로부터 혼성화된 분체 비교가 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
  36. 제 30항 내지 제 35항 중 어느 한 항에 있어서, 상기프로브 혼합물을 사용하는 단일테스트 또는 연속테스트시에 제 24항 또는 제 25항에서 청구된 적어도 두 개의 폴리뉴클레오티드 프로브를 사용하여 프로빙을 수행하는 것을 특징으로 하는 방법.
  37. 제 30항 또는 제 31항 중 어느 한 항에 있어서, 제 22항 또는 제 33항에서 청구된 적어도 하나의 폴리뉴클레오티드 프로브(라벨된 성분 또는 마커성분을 운반할 필요가 없는 프로브는 특이유전병, 유전적 기형 또는 유전적 특이체질과 연관되어 있다.)테스트 샘플을 프로빙하여 유전병, 유전적기형 또는 유전적 특이체질을 진단하는 방법.
  38. 실시예중의 어느 하나에 기재된 폴리뉴클레오티드.
  39. pλg3, λMS1, λMS31, λMS32, λMS8(1), λMS32, λMS(1), λMS8(2) 및 λMS43 중 하나로 기재된 폴리뉴클레오티드프로브.
  40. 상술된 것처럼 유전적 특성을 실질적으로 부여하는 방법.
    ※ 참고사항 : 최초출원 내용에 의하여 공개하는 것임.
KR870002486A 1986-03-19 1987-03-18 폴리뉴클레오티드의 생산 방법 KR870009024A (ko)

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