KR20240055865A - T 세포 관여 항체 구축물을 포함하는 저 pH 약제학적 조성물 - Google Patents

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KR20240055865A
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파반 개티벤카타리쉬나
제프 아벨
준 후
코넬리우스 펌프
세카르 카나푸람
마이클 트레우해이트
바라와지 자가나단
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암젠 리서치 (뮌헨) 게엠베하
암젠 인크
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Abstract

본 개시는 (a) 표적 세포 표면 항원에 결합하는 제1 도메인, 제2 항원에 결합하는 제2 도메인 및 바람직하게는 특이적 Fc 모달리티(modality)인 제3 도메인을 포함하는 항체 구축물, (b) 적어도 하나의 완충제, (c) 적어도 하나의 당류, 및 (d) 적어도 하나의 계면활성제를 포함하는 저 pH 약제학적 조성물을 제공하고, 여기에서 약제학적 조성물의 pH는 3.5 내지 6의 범위이다.

Description

T 세포 관여 항체 구축물을 포함하는 저 pH 약제학적 조성물{Low pH Pharmaceutical Composition Comprising T Cell Engaging Antibody Constructs}
단백질-기반 약제는 (전)임상 개발에서, 그리고 시판 제품으로서 가장 빠르게 성장하는 치료제 중의 하나이다. 소형 화학 약물과 비교하여, 단백질 약제는 비교적 낮은 농도에서 높은 특이성 및 활성을 갖고, 전형적으로 다양한 암, 자가-면역 질환, 및 대사 장애와 같이 부담이 큰 질환의 치료를 위해 제공된다(Roberts, Trends Biotechnol. 2014 Jul;32(7):372-80, Wang, Int J Pharm. 1999 Aug 20;185(2):129-88).
현재 재조합 단백질과 같은 단백질-기반 약제는 상업적 규모의 정제 공정의 진보 덕분에 최초 제조시 높은 순도로 얻어질 수 있다. 그러나, 단백질은 단지 미미하게 안정적이고 화학적 분해와 물리적 분해 둘 다에 매우 취약하다. 화학적 분해는 공유 결합, 예를 들어 탈아미드화, 산화, 새로운 이황화 가교의 형성 또는 절단, 가수분해, 이성질체화, 또는 탈글리코실화를 포함하는 변형을 지칭한다. 물리적 분해는 단백질 풀림, 표면에 대한 바람직하지 않은 흡착, 및 응집을 포함한다. 이들 물리적 및 화학적 불안정성을 처리하는 것은 단백질 약제의 개발에서 가장 어려운 과제 중 하나이다(Chi et al., Pharm Res, Vol. 20, No. 9, Sept 2003, pp. 1325-1336, Roberts, Trends Biotechnol. 2014 Jul;32(7):372-80).
관심 있는 단백질-기반 약제는 이중특이성 분자, 예를 들어 BiTE®(이중특이성 T 세포 관여자) 항체 구축물을 포함하는데, 이는 두 개의 유연하게 연결된 항체 유도 결합 도메인으로부터 만들어진 재조합 단백질 구축물이다. BiTE® 항체 구축물의 하나의 결합 도메인은 표적 세포 상의 선택된 종양-관련 표면 항원에 특이적이고; 제2 결합 도메인은 CD3, 즉, T 세포 상의 T 세포 수용체 복합체의 서브유닛에 대하여 특이적이다. 그들의 특정 설계에 의해 BiTE® 항체 구축물은 T 세포를 표적 세포와 일시적으로 연결하는 데 있어 특유의 적합성을 가지고, 동시에 표적 세포에 대한 T 세포의 고유한 세포용해 가능성을 강력하게 활성화시킨다. AMG 103 및 AMG 110으로서 임상으로 개발된 BiTE® 항체 구축물의 1세대의 중요한 추가적인 진전(WO 99/54440 및 WO 2005/040220 참조)은 CD3ε 쇄의 N-말단에서 맥락 독립적 에피토프에 대한 이중특이성 항체 구축물의 제공이었다(WO 2008/119567). 이 선택된 에피토프에 대한 BiTE® 항체 구축물 결합은 인간 및 코먼마모셋(Callithrix jacchus), 목화머리타마린(Saguinus oedipus) 또는 다람쥐 원숭이(Saimiri sciureus) CD3ε 쇄에 대한 교차종 특이성을 나타낼 뿐만 아니라, 이중특이성 T 세포 관여 분자에서 CD3 바인더에 대하여 이전에 기술된 에피토프 대신 이 특정 에피토프를 인식하는 것에 기인하여, 이전 세대 T 세포 관여 항체에 대해 관찰된 것과 동일한 정도로 T 세포를 비특이적으로 활성화시키지 않는다. 이러한 T 세포 활성화의 감소는 환자에서의 더 적거나 감소된 T 세포 재분포와 연관이 있고, 이는 부작용의 위험으로서 확인되었다.
WO 2008/119567에 기술된 바와 같은 항체 구축물은 신체로부터 신속하게 제거될 가능성이 있고; 따라서, 이들은 대부분의 신체 기관에 신속하게 도달할 수 있으며, 생성이 빠르고 다루기가 더 용이한 한편, 이들의 생체내 적용은 이들의 생체내에서의 짧은 지속성에 의해 제한될 수 있다. 이 작은 단일 쇄 분자의 짧은 생체내 반감기 때문에 지속적 정맥내 주입에 의한 장기간 투여가 치료적 효과를 달성하기 위해 사용되었다. 그러나, 이러한 지속적 정맥내 주입은 환자에 있어 불편함으로 분류되고, 따라서, 더 편리한 대안적인 치료 접근법에 있어, 각각의 질환의 치료에 대해 더 효율적인 것으로 입증된 화합물을 선택할 수 없게 한다. 따라서, 본 출원인은 유사한 치료 효능을 보유하고, 생산이 간단한 형식을 가지며, 더 긴 반감기를 포함해 바람직한 약동학적 특성을 갖는 이중특이성 치료제를 도입하였다.
증가된 반감기는 일반적으로 면역글로불린, 특히 항체 그리고 무엇보다도 작은 크기의 항체 단편의 생체내 적용에서 유용하다. 이러한 효과를 달성하기 위해 당업계에서 기술된 접근법은, 바람직하게는 BiTE® 항체 구축물의 치료 효과를 방해하지 않는, 소형 이중특이성 항체 구축물의 더 큰 단백질과의 융합을 포함한다. 이중특이성 T 세포 관여자의 이러한 추가적인 개발에 대한 예는, 예를 들어 US 2014/0302037, US 2014/0308285, WO 2014/144722, WO 2014/151910 및 WO 2015/048272에 기재된 이중특이성 Fc-분자를 포함한다.
단백질 응집은 단백질의 물리적 불안정성의 주요 사건을 나타내고, 용매와 소수성 단백질 잔기 간의 열역학적으로 선호되지 않는 상호작용을 최소화하는 내재적 경향으로 인해서 일어난다. 이는 재접힘, 정제, 멸균, 운송, 및 저장 과정 중에 통상적으로 접하는 것이기 때문에 특히 문제가 된다. 응집은 단백질 천연 상태가 열역학적으로 매우 선호하는 용액 조건(예를 들어, 중성 pH 및 37℃) 하에서, 그리고 스트레스 부재 중에도 일어날 수 있다(Chi et al., Pharm Res, Vol. 20, No. 9, Sept 2003, pp. 1325-1336, Roberts, Trends Biotechnol. 2014 Jul;32(7):372-80, Wang, Int J Pharm. 1999 Aug 20;185(2):129-88, Mahler J Pharm Sci. 2009 Sep; 98(9):2909-34.).
또한 Fc-분자와 같은 반감기 연장 모달리티를 포함하는 이중특이성 T 세포 관여자의 것과 같은 반감기 연장 항체 구축물은 단백질 응집 및/또는 다른 분해 사건에 대하여 보호받아야 한다. 단백질 응집은 치료 단백질의 생물학적 활성도를 손상시킬 수 있기 때문에 문제가 된다. 더욱이, 단백질의 응집은 약물 제품의 바람직하지 않은 미감으로 이어지고, 최종 생성물로부터 응집물을 제거하는 데 필요한 정교한 정제 단계로 인하여 생성물 수율을 저하시킨다. 보다 최근에는, (인간화 또는 완전 인간 단백질의 경우라 할지라도) 응집된 단백질의 존재는, 환자가 활성 단백질 단량체에 대한 면역 반응을 발달시킬 위험을 상당히 증가시켜, 중화 항체 및 약물 저항성 또는 다른 유해한 부작용을 초래할 수 있다는 우려 및 증거가 증가하고 있다(Mahler J Pharm Sci. 2009 Sep;98(9):2909-34).
일반적으로, 다양한 기전에 의한 단백질 응집을 최소화하기 위한 몇 가지 노력이 문헌에 보고되어 있다. 단백질은 이의 1차 구조를 변형시키고, 이에 의해 내부 소수성을 증가시키고 외부 소수성을 감소시킴으로써 안정화되어 응집물 형성 및 다른 화학적 변화로부터 보호될 수 있다. 그러나, 단백질의 유전자 조작은 손상된 기능성 및/또는 증가된 면역원성을 초래할 수 있다. 또 다른 접근법은 다양한 기전, 예를 들어 온도, 압력, pH 및 염을 사용함으로써 기능성 천연 단량체를 회복시키기 위해 응집물의 해리("비응집(disaggregation)"이라 지칭됨)에 초점을 맞춘다. 현재, 단백질 응집물은 주로 하류 가공의 폴리싱 단계에서 불순물로서 제거된다. 그러나, 높은 수준의 고분자량(HMW)의 경우, 상당한 양의 HMW를 제거하는 것은 실질적인 수율 손실을 초래할 뿐만 아니라 강력한 하류 가공의 설계를 어렵게 만든다(Chi et al., Pharm Res, Vol. 20, No. 9, Sept 2003, pp. 1325-1336).
생물학적 및 생명공학적 적용에서 단백질 안정성 및 활성을 보존하는 것은 심각한 도전을 제기한다. 치료 단백질의 향상된 안정성을 제공하고, 제형화, 충전, 운송, 저장 및 투여 중에 응집 및 변성 또는 분해를 감소시켜, 기능 손실 및 유해한 면역원성 반응을 예방하는 최적화된 약제학적 조성물이 당업계에 요구된다. 특히 Fc-분자와 같은 반감기 연장 모달리티를 포함하는 이중특이성 T 세포 관여자의 것과 같은 반감기 연장 항체 구축물과 관련하여, 이러한 요구에 순응하는 것이 본 발명의 목적이다.
2개(또는 2개 초과)의 상이한 항원에 동시에 결합하는 이중특이성(및/또는 다중특이성) 항체를 포함하는 단백질-기반 약제, 예를 들어 이중특이성 T 세포 관여 항체 구축물은 단백질 불안정성의 경향이 있다. 이것은 단일 쇄 Fc 형식(scFc로 지정됨), 헤테로 Fc(hetFc 또는 헤테로이량체 Fc, hFc로도 지정됨) 형식 및 인간 혈청 알부민(HSA 또는 hALB로도 지정됨)의 융합을 포함하는 반감기 연장 형식(HLE 형식)을 포함하는 이들 항체 구축물로 연장된다. 단백질 불안정성, 및 특히 단백질 응집은 생명공학 산업에서 증대되고 있는 과제로, 여기에서 응집은 재접힘, 정제, 멸균, 운송, 및 저장 공정 동안을 비롯하여, 치료 단백질의 수명 전체에 걸쳐 직면하게 된다. 따라서, 항체 구축물, 바람직하게는 반감기 연장 형식, 더욱 바람직하게는 T 세포 관여 항체 구축물을 포함하는 안정한 약제학적 조성물을 제공하는 것이 본 발명의 목적이다. 본 발명의 맥락에서, 바람직하게는 액체 조성물이거나 동결건조에 의해 얻어지는 고체 조성물일 수 있거나 재구성된 액체 조성물일 수 있는 약제학적 조성물은
(a) 적어도 3개의 도메인을 포함하는 항체 구축물, 여기에서:
제1 도메인은 표적 세포 표면 항원에 결합하고 4 내지 9.5 범위의 등전점(pI)을 갖고;
제2 도메인은 제2 항원에 결합하고; 8 내지 10, 바람직하게는 8.5 내지 9.0 범위의 pI를 갖고;
바람직하게는 제3 도메인은, 각각 힌지, CH2 도메인 및 CH3 도메인을 포함하는 2개의 폴리펩티드 단량체를 포함하는데, 여기에서 상기 2개의 폴리펩티드 단량체는 펩티드 링커를 통해 서로 융합되고;
(b) 적어도 하나의 완충제;
(c) 적어도 하나의 당류; 및
(d) 적어도 하나의 계면활성제를 포함하고;
여기에서 약제학적 조성물의 pH는 3.5 내지 6의 범위이다.
본 발명의 맥락에서 약제학적 조성물은 단일 쇄 항체 구축물인 항체 구축물을 포함하는 것으로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 상기 제3 도메인은 아미노로부터 카르복실 순서로: 힌지-CH2 도메인-CH3 도메인-링커-힌지-CH2 도메인-CH3 도메인을 포함하는 것으로 추가로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 본 발명에 따른 항체 구축물은 제3 도메인을 포함하는 것으로 특히 고려된다.
본 발명의 맥락에서 제1 도메인은 약 4.0 내지 약 9.5, 바람직하게는 약 4.5 내지 7.5, 또는 4.5 내지 6.5 범위의 pI를 갖는 것으로 또한 고려된다.
본 발명의 맥락에서 표적 세포 표면 항원은 종양 항원, 면역 장애에 특이적인 항원 또는 바이러스 항원인 것으로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 종양 항원은 CDH19, MSLN, DLL3, FLT3, EGFR, EGFRvIII, BCMA, PSMA, CD33, CD19, CD20, 및 CD70으로 구성되는 군으로부터 선택되는 것으로 추가로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 제2 도메인은 CD3인간 및/또는 마카카(Macaca) CD3ε 쇄의 세포외 에피토프인 것으로 또한 고려된다.
본 발명의 맥락에서 제2 도메인은 8.5 내지 9.0 범위의 pI를 갖는 것으로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 제3 도메인의 상기 폴리펩티드 단량체 각각은 서열번호: 17 내지 24로 구성되는 군으로부터 선택되는 서열과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖거나, 서열번호: 17 내지 24로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 것으로 추가로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 CH2 도메인은 도메인내 시스테인 이황화 가교를 포함하는 것으로 또한 고려된다.
본 발명의 맥락에서 제3 도메인은 5.5 내지 7.5, 바람직하게는 6.0 내지 7.0 범위의 pI를 갖는 것으로 고려된다.
본 발명의 맥락에서
(i) 제1 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하고 제2 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하거나;
(ii) 제1 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함하고 제2 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하거나;
(iii) 제1 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하고 제2 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함하거나;
(iv) 제1 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함하고 제2 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함하는 것으로 추가로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 항체 구축물은 바람직하게는 아미노로부터 카르복실 순서로:
(a) 제1 도메인;
(b) 서열번호: 1 내지 3으로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커;
(c) 제2 도메인;
(d) 서열번호: 1, 2, 3, 9, 10, 11 및 12로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커;
(e) 제3 도메인의 제1 폴리펩티드 단량체;
(f) 서열번호: 5, 6, 7 및 8로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커; 및
(g) 제3 도메인의 제2 폴리펩티드 단량체를 포함하는 것으로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 적어도 하나의 완충제는 아세테이트, 글루타메이트, 시트레이트, 숙시네이트, 타르트레이트, 푸마레이트, 말리에이트, 히스티딘, 포스페이트, 2-(N-모르폴리노)에탄술포네이트 또는 이의 조합으로 구성되는 군으로부터 선택되는 산인 것으로 또한 고려된다.
본 발명의 맥락에서 적어도 하나의 완충제는 5 내지 200 mM의 농도 범위, 더욱 바람직하게는 10 내지 50 mM의 농도 범위로 존재하는 것으로 추가로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 적어도 하나의 당류는 단당류, 이당류, 고리 다당류, 당 알코올, 선형 분지 덱스트란 또는 선형 비-분지 덱스트란으로 구성되는 군으로부터 선택되는 것으로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 이당류는 수크로오스, 트레할로오스 및 만니톨, 소르비톨, 및 이의 조합으로 구성되는 군으로부터 선택되는 것으로 또한 고려된다.
본 발명의 맥락에서 당 알코올은 소르비톨인 것으로 추가로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 적어도 하나의 당류는 1 내지 15%(m/V) 범위의 농도, 바람직하게는 9 내지 12%(m/V)의 농도 범위로 존재하는 것으로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 적어도 하나의 계면활성제는 폴리소르베이트 20, 폴리소르베이트 40, 폴리소르베이트 60, 폴리소르베이트 80, 폴록사머 188, 플루로닉 F68, 트리톤 X-100, 폴리옥시에틸렌, PEG 3350, PEG 4000 및 이의 조합으로 구성되는 군으로부터 선택되는 것으로 또한 고려된다.
본 발명의 맥락에서 적어도 하나의 계면활성제는 0.004 내지 0.5%(m/V) 범위, 바람직하게는 0.001 내지 0.01%(m/V) 범위의 농도로 존재하는 것으로 추가로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 조성물의 pH는 4.0 내지 5.0 범위, 바람직하게는 4.2인 것으로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 약제학적 조성물은 150 내지 500 mOsm 범위의 삼투압농도를 갖는 것으로 또한 고려된다.
본 발명의 맥락에서 약제학적 조성물은 하나 이상의 폴리올 및 하나 이상의 아미노산으로 구성되는 군으로부터 선택되는 부형제를 추가로 포함하는 것으로 추가로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 상기 하나 이상의 부형제는 0.1 내지 15%(w/V)의 농도 범위로 존재하는 것으로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 약제학적 조성물은
(a) 전술한 청구항 중 임의의 하나의 항체 구축물,
(b) 10 mM 글루타메이트 또는 아세테이트,
(c) 9%(m/V) 수크로오스 또는 6%(m/V) 수크로오스 및 6%(m/V) 하이드록시프로필-β-사이클로덱스트린,
(d) 0.01%(m/V) 폴리소르베이트 80를 포함하고
여기에서 액체 약제학적 조성물의 pH는 4.2인 것으로 또한 고려된다.
본 발명의 맥락에서 항체 구축물은 0.1 내지 8 mg/mL, 바람직하게는 0.2 내지 2.5 mg/mL, 더욱 바람직하게는 0.25 내지 1.0 mg/mL의 농도 범위로 존재하는 것으로 추가로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 본 발명의 약제학적 조성물은 액체인 것으로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 약제학적 조성물은 전술한 청구항 중 임의의 하나의 액체 약제학적 조성물의 동결건조에 의해 얻어질 수 있는 고체 약제학적 조성물인 것으로 또한 고려된다.
본 발명의 맥락에서 약제학적 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 액체와의 동결건조에 의해 얻어질 수 있는 고체 약제학적 조성물을 재구성하는 것에 의해 얻어질 수 있는 액체 약제학적 조성물인 것으로 추가로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 약제학적 조성물은 질환, 바람직하게는 증식성 질환, 면역 질환 또는 바이러스 질환의 치료에 사용하기 위한 것으로 고려된다.
본 발명의 맥락에서 조성물은 비경구로, 바람직하게는 주입 또는 주사에 의해 정맥내로 투여되는 것으로 또한 고려된다.
본 발명의 맥락에서 조성물은 매주 1, 2, 3, 4, 5, 6 또는 7회, 또는 2주마다 1, 2, 3, 4, 5 또는 6회, 또는 매달 1 또는 2회, 또는 2개월마다 1 또는 2회, 가장 바람직하게는 매주 1회 투여되는 것으로 추가로 고려된다.
도 1: a)는 본 발명의 항체 구축물의 일 구현예의 다이어그램을 보여준다. b)는 헤테로이량체 Fc 항체 구축물을 보여주고 c)는 당업계에 기술된 X-체(X-body) 구축물을 보여준다. 표시된 전하쌍은 헤테로이량체화를 시행하기 위해 도입된다. d)는 인간 혈청 알부민(HSA 또는 hALB)과 항체 구축물의 융합을 보여준다.
도 2: 대략 중성 pH에서 상이하게 하전되고 더 낮은 pH에서 유사하게 양으로 하전된 항체 구축물 도메인의 도식적 표현.
도 3: pH 4 및 pH 7에서 HLE가 없는 EGFRvIII 항체 구축물의 DSC 온도기록도. pH 4에서의 Tm은 pH 7에서의 Tm보다 5.5C 더 낮다.
도 4a는 pH 4 대 pH 6에서 측정된 CDH19 scFc 항체 구축물의 고분자량 종의 백분율을 보여준다. 더 낮은 pH 4.0에서 더 낮은 응집이 보인다; 도 4b는 4C(시점 T0, 2w, 4w), 25℃(T0, 1w, 2w, 4w) 및 37C(T0, 1w, 2w, 4w)에서 3개의 상이한 제형 - G4SuT, G4TrT 및 G4MSuT으로 SEC에 의해 측정된 CDH19 scFc BiTE의 주요 피크 백분율을 보여준다: G4SuT는 10 mM 글루타메이트, 9%(w/v) 수크로오스, 0.01% 폴리소르베이트 80을 포함하고, G4TrT는 10 mM 글루타메이트, 9%(w/v) 트레할로오스, 0.01% 폴리소르베이트 80을 포함하고, G4MSuT는 10 mM 글루타메이트, 4%(w/v) 만니톨, 2% 수크로오스, 0.01% 폴리소르베이트 80을 포함한다. 안정성은 pH 4에서 나타낸다. 도 4c는 -20℃(T0, 4w)에서 3개의 상이한 제형 - G4SuT, G4TrT 및 G4MSuT으로 SEC에 의해 측정된 CDH19 scFc BiTE의 주요 피크 백분율을 보여준다. 도 4d는 4C(T0, 2w, 4w), 25℃(T0, 1w, 2w, 4w) 및 37℃(T0, 1w, 2w, 4w)에서 3개의 상이한 제형: G4SuT, G4TrT 및 G4MSuT으로 SEC에 의해 측정된 CDH19 scFc BiTE의 고분자량(HMW) 피크 백분율을 보여준다. 도 4e는 -20℃(T0, 4w)에서 3개의 상이한 제형 - G4SuT, G4TrT 및 G4MSuT으로 SEC에 의해 측정된 CDH19 scFc BiTE의 HMW 피크 백분율을 보여준다. 도 4f는 4C(T0, 2w, 4w), 25C(T0, 1w, 2w, 4w) 및 37C(T0, 1w, 2w, 4w)에서 3개의 상이한 제형 - G4SuT, G4TrT 및 G4MSuT으로 SEC에 의해 측정된 CDH19 scFc BiTE의 저분자량 피크 백분율을 보여준다.
도 5: 6개월 후 측정된 pH 범위 4 내지 7의 다양한 완충액에서의 EGFRvIII 비-scFC 항체 구축물의 주요 피크 백분율. pH 4.0에서, 항체 구축물은 최고 주요 피크 백분율을 갖는다.
도 6a는 4℃에서 상이한 제형 중 상이한 농도에서의 CD33-scFc 항체 구축물의 주요 피크 백분율을 보여준다. "ccHFC"는 특이적으로 변형된 cys-클램 scFc 도메인을 나타낸다. 낮은 pH 제형은 일관적으로 더 높은 단량체 종을 갖는다. 도 6b는 25℃에서 상이한 제형 중 상이한 농도에서의 CD33-scFc 항체 구축물의 주요 피크 백분율을 보여준다. "ccHFC"는 특이적으로 변형된 cys-클램 scFc 도메인을 나타낸다. 낮은 pH 제형은 일관되게 더 높은 단량체 종을 갖는다.
도 7: T0, 7일, 14일 및 1개월에 pH의 함수로서 SEC에 의해 측정된 기본형(비-HLE) CD19xCD3 BiTE® 항체 구축물의 응집 백분율. 이 도면은 낮은 pH에서 응집의 양이 극적으로 더 낮은 것을 보여준다.
도 8: Statistica 소프트웨어(Statsoft)에 의해 생성된 제형 파라미터의 함수에서 예상된 값 및 바람직성에 대한 프로파일.
도 9: 제형의 함수에서 크기 배제 초고성능 크로마토그래피(SE-UPLC)에 의해 결정된 MSLN-scFc 제제에서의 고분자량 종(HMWS)의 함량 백분율에 대한 개요.
도 10: 제형의 함수에서 크기 배제 초고성능 크로마토그래피(SE-UPLC)에 의해 결정된 CD33cc-scFc 제제에서의 고분자량 종(HMWS)의 함량 백분율에 대한 개요.
현재의 치료용 생명공학 제품의 고품질 및 내인성 인간 단백질에 대한 항체와 재조합 인간 단백질의 유사성에도 불구하고, 단백질 불안정성은 중요한 관심사로 남아있다. 단백질 응집의 품질 관련 중요성, 예를 들어 단백질 활성도의 손실 가능성 및 약물 제품의 바람직하지 않은 미감에 더하여, 가용성 단백질 응집물은 상당한 세포독성 효과를 갖는 것으로 보고되었고, 중요하게는 단백질 제품에 대한 면역 반응의 발달에 대한 잠재적 위험 인자이다. 단백질 응집은 단백질의 수명 전체에 걸쳐, 발효, 재접힘, 정제, 충전, 운송, 저장 또는 투여를 비롯한 다양한 시점에서 일어날 수 있고, 다양한 환경 인자의 영향을 크게 받는다. 치료 단백질의 안정성을 증가시키고, 응집을 감소시키는 중대한 요구가 당업계에 존재하고; 최적화된 약제학적 제형이 이에 도움이 될 수 있다.
BiTE® 항체 구축물 분자와 같은 특이적 단백질-기반 약제는 장기간에 걸쳐 액체 제형에서 안정하지 않고 특히 가속 온도, 예를 들어 냉장 온도 4℃ 및 그 위에서 안정하지 않다. BiTE® 항체 구축물의 비-HLE 및 HLE 변이형 둘 다의 시차 주사 열량측정법에 의한 초기 시험에서는 전형적으로 산성 pH 값보다는 중성에서 더 높은 열 안정성을 나타내어, 예를 들어 pH 6 또는 pH 7에 대하여 pH 4에서 더 낮은 안정성을 보여준다). 따라서, 당업자는 이러한 항체 구축물의 용액 안정성이 저하될 것임을 제시할 것이다. 결론적으로, 당업자는 일반적으로 꺼려지는 불안정화된 scFv를 추정함에 따라 본 발명에 따른 항체 구축물에 대하여 저 pH 제형을 피할 수 있다. 따라서, 이와 반대로 본 발명에 따른 항체 구축물이 낮은 pH 값을 갖는 액체 약제학적 조성물에서 한층 더 안정하다는 것은 매우 놀라운 발견이었다.
본 발명의 기저를 이루는 일반적 개념은 본 발명에 따른 항체 구축물을 포함하는 액체 약제학적 조성물의 콜로이드 안정성이 낮은 pH에서 개선된다는 발견이다. 본 발명의 항체 구축물은 전형적으로 이들의 제1 및 제2 도메인에 대하여 상이한 등전점(pI) 값을 갖는다. 또한, 제3 도메인의 pI 또한 전형적으로 제2 도메인의 pI와 상이하다. 생리적 조건 하에서, 제1 및/또는 제3 도메인은 정상적으로 음으로 하전될 수 있는데 pI가 보다 산 쪽, 예를 들어 대략 4.0, 4.5, 5.0, 5.5, 6.0, 또는 6.5의 pI를 갖기 때문이다. 제1 도메인이 6.5 초과, 예를 들어 대략 7.0, 7.5, 8.0 또는 8.5의 pI를 가졌다 하더라도, 이 pI는 전형적으로 (정상적으로 8.0 내지 10.0, 더욱 전형적으로 대략 8.5 내지 9.5, 바람직하게는 대략 9.2의 pI를 갖는) 제2 도메인의 것보다 더 낮을 것이다. 또한, 제3 도메인은 정상적으로 6.0 내지 7.0의 약간 산성 pI를 갖는데, 이는 제1 도메인의 pI가 약간 염기성이라 하더라도 제2 도메인과 제3 도메인 사이에서 pI의 차이가 남아있다는 것을 의미한다. 결과적으로, 적어도 하나의 도메인이 산성 pI를 갖고 다른 도메인은 염기성 pI로서 임의의 pI 차이는, 쌍극자가 생리적 조건 하에 발생할 것인데, 상이한 도메인이 상이하게, 즉 반대로 하전되기 때문이다. 상기 반대 전하는 분자내 및 분자간 정전기 인력을 초래할 수 있고, 이는 차례로 응집을 초래할 수 있고, 따라서 원치 않는 고분자량(HMW) 종의 형성을 초래할 수 있다. 상기 형성은 용액의 안정성 또는 분산액의 콜로이드 안정성에 결정적인 영향을 미칠 수 있다. 그러나, 매질의 pH가 저하되면, 모든 도메인은 양성자화되고 정전기 척력이 발생한다(도 2 참조).
예를 들어, pH 7에서 CD19에 대한 제1 도메인 및 CD3에 대한 제2 도메인을 포함하는 항체 구축물은 T-세포 관여 도메인 상의 양전하와 CD19 도메인 상의 음전하로 인한 쌍극자를 형성하는 것으로 밝혀졌다. 이것은 인력을 야기하고 결과적으로 콜로이드 불안정성을 초래하는 응집을 야기한다. 대략 pH 4에서는 도메인 둘 다 양으로 하전되고 전하 반발이 콜로이드 안정성을 개선한다.
또한, 비록 제1 및 제2 도메인의 pI가 각각, 예를 들어 제1 도메인의 대략 8.0과 제2 도메인의 대략 8.5 또는 9.0 또는 9.5로 서로 가깝다 하더라도, 두 도메인은 8 미만의 pH 값에서 이미 양으로 하전되어 있다. 예를 들어, 대략 4의 더 낮은 pH에서도 2개의 도메인, 예를 들어 표적 및 T-세포 관여 도메인은 과도하게 양으로 하전되어 있다. 이것은 한층 증가된 전하-전하 반발을 초래하고, 결과적으로 명백하게 더 높은 콜로이드 안정성을 초래한다. 이 효과는 전형적으로 약간 산성 범위의 pI를 갖고, 따라서 pI에 대해서는 제2 도메인과 항상 상이한 제3 도메인의 존재로 보완된다. 요약하면, 본 발명에 따른 항체 구축물은 항상 낮은 pH, 예를 들어 6.0 이하, 또는 5.5 이하, 또는 5.0 이하, 또는 4.5 이하, 예를 들어 4.2의 pH를 갖는 매질에서 일반적으로 양성자화된 도메인을 갖는 것으로부터 혜택을 얻는다.
전형적으로 종양학 표적에 대한 scFv 도메인인 본 발명에 따른 항체 구축물의 제1 도메인은 보통, 전형적으로 항-CD3 도메인인 제2 도메인과 상이한 pI를 갖는다.
전형적으로 제2 도메인, 예를 들어, 항-CD3 도메인은 8 내지 10 범위, 바람직하게는 약 8.5 내지 9.5, 가장 바람직하게는 약 9.2의 pI를 갖는다.
제1 도메인이 항-CD19 또는 항-CD33 도메인인 경우 제1 도메인은 약 4.9 내지 5.3의 pI를 가질 수 있다. 제1 도메인이 항-DLL3 또는 항-EGFRvIII 도메인인 경우 제1 도메인은 약 6 내지 8 또는 약 9.0의 pI를 가질 수 있다. 제1 도메인이 항-CD70 도메인인 경우 제1 도메인은 약 8.0 내지 8.5의 pI를 가질 수 있다. 제1 도메인이 항-CDH19 도메인인 경우 제1 도메인은 약 7.0 내지 7.5의 pI를 가질 수 있다. 제1 도메인이 항-PSMA 도메인인 경우, 제1 도메인은 약 7.0 내지 7.5의 pI를 가질 수 있다. 제1 도메인이 항-MSLN 도메인인 경우 제1 도메인은 약 9.0 내지 9.5의 pI를 가질 수 있다. 제1 도메인이 항-Flt3 도메인인 경우 제1 도메인은 약 8.5 내지 9.5의 pI를 가질 수 있다.
본 발명의 맥락에서 상이한 pI의 도메인을 안정화하는 제형의 개념은 임의의 항체 구축물에 적용될 수 있는 것으로 고려된다. 본 발명의 맥락에서, 본원에 기술되는 제3 도메인을 포함하는 이중특이성 항체 구축물은 특히 본원에 기술되는 제형에 의해 안정화되는데 적합하다. 그러나, 예를 들어 제3 도메인이 없는 다른 이중특이성 항체 구축물도 본 발명에 따라 효과적으로 안정화될 수 있다. 예를 들어, 본 발명에 따른 항체 구축물은 서열번호 1954 내지 1956의 HCDR 및 서열번호 1958 내지 1960의 LCDR을 포함하는 제1 도메인을 가질 수 있는 것으로 고려된다. 본 발명에 따른 항체 구축물은 서열번호 1957의 VH 및 서열번호 1961의 VL을 포함하는 제1 도메인을 가질 수 있는 것으로 또한 고려된다. 본 발명에 따른 항체 구축물의 제1 도메인은 서열번호 1962에 따른 제1 도메인을 가질 수 있는 것으로 한층 더 고려된다. 본 발명에 따른 항체 구축물은 서열번호 1963에 따른 서열을 가질 수 있는 것으로 또한 고려된다.
그러나, 본 발명의 맥락에서, 약제학적 조성물의 안정화 효과는 상이한 pI의 (결합) 도메인을 갖는 항체 구축물로 제한되지 않는다. 따라서, 본 약제학적 조성물은, 이에 따라 본원에 기술되는 바와 같은 제형에 의해 안정화될 수 있는 상이한 pI의 모이어티가 제공되는 항체 구축물에 안정화 제형을 제공하는 것으로 또한 고려된다. 이러한 모이어티는, 이들이 본 발명의 맥락에서 약제학적 조성물에 따라 제공되는 추가적인 안정화를 요구하는 방식으로 결합 도메인 자체가 pI가 다르지 않는 경우에도, 이러한 항체 구축물의 결합 도메인을 마스킹하는 마스킹 모이어티를 포함할 수 있다. 전형적으로, 마스킹 모이어티를 포함하는 이러한 항체 구축물은 활성화 가능한 항체 구축물이다. 본 발명의 맥락에서, 이러한 활성화 가능한 항체 구축물은 바람직하게는 CDH19, MSLN, DLL3, FLT3, EGFR, EGFRvIII, BCMA, PSMA, CD33, CD19, CD20, 및 CD70으로 구성되는 군으로부터 선택되는, 종양 항원과 같은 임의의 표적 세포 표면 항원에 결합할 수 있다.
이러한 활성화 가능한 항체 구축물은 전형적으로 (i) 각각 중쇄 아미노산 서열 및 경쇄 아미노산 서열을 포함하는 적어도 2개의 결합 도메인, (ii) 비절단 상태에서 각각의 결합 도메인의 각각의 결합 파트너, 예를 들어 표적 세포 표면에 대한 결합을 저해하는 마스킹 모이어티, 및 (iii) (i)과 (ii) 사이에 위치한 절단 가능한 모이어티를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편일 수 있는데, 여기에서 절단 가능한 모이어티는, 예를 들어 프로테아제에 대한 기질로서 기능하는 폴리펩티드이다. 전형적으로, 비절단 상태에서 활성화 가능한 항체는 다음과 같은 N-말단으로부터 C-말단까지의 구조적 배열을 갖는다: 마스킹 모이어티 - 절단 가능한 모이어티 - 결합 도메인 또는 결합 도메인 - 절단 가능한 모이어티 - 마스킹 모이어티. 본 발명에 따른 약제학적 조성물은 적어도 2개의 결합 도메인의 적어도 2개의 마스킹 모이어티의 pI가 상이한 활성화 가능한 항체 구축물에 안정성을 부여하는데 특히 유익할 수 있다. 예를 들어, 하나의 마스킹 모이어티의 pI는 3 내지 5, 바람직하게는 3.5 내지 4.5, 더욱 바람직하게는 3.9 내지 4.5의 범위일 수 있는 한편, 다른 마스킹 모이어티의 pI는 5.0 내지 7.0, 바람직하게는 5.5 내지 6.0의 범위이다. 이러한 경우에, 본 발명에 따른 약제학적 조성물에서 이러한 항체 구축물을 제형화하여, 상기 항체 구축물의 응집은 상당히 감소될 수 있음이 전형적으로 발견된다. 전형적으로, 백분위 고분자량(HMW) 종의 측면에서 응집은, 본 발명에 따른 약제학적 조성물에서 부형제의 보충적인 안정화 기능 및 낮은 pH에서의 동일한 양성자화로 인해, 예를 들어 약 10% 내지 약 6, 5, 4%, 또는 심지어 4% 아래까지 상당히 감소될 수 있다. 4% 아래의 백분위 HMW 종은 약 4.2 내지 4.8의 pH를 갖는 본 발명에 따른 약제학적 조성물에서 전형적으로 발견된다.
바람직하게는, 본 발명에 따른 약제학적 조성물의 (용액) pH는, 도메인 간 반발 및 도메인 내 반발 둘 다를 생성하기 위해 도메인 둘 다에서 순 양전하를 생성하도록 본 발명에 따른 항체 구축물의 임의의 2개 또는 3개 도메인의 pI보다 더 낮아야 한다. 약 4.0 내지 5.5의 pH 값이 바람직하고, 4.2 내지 4.8의 pH 값이 더욱 바람직하다.
또한 놀랍게도 본 발명에 따른 약제학적 조성물은 본 발명에 따른 항체 구축물을 예상보다 더 높은 농도로 포함할 수 있는 것으로 밝혀졌다. 정상적으로, 본원에 기술되는 바와 같은 항체 구축물은 단지 약 1 mg/mL의 농도에서 액체 약제학적 조성물로 저장되고/되거나 이용된다. 더 높은 농도에서는, 응집 경향이 관찰된다. 그러나, 본원에서 설명한 바와 같이, 더 낮은 pH는 응집 위험을 감소시키는 분자간 및 분자내 정전기 척력에 기여하고, 더 높은 항체 구축물 농도, 예를 들어 1.5, 2.0, 2.5, 3.0, 3.5, 4.0, 4.5, 5.0, 5.5, 6.0, 6.5, 7.0. 7.5 또는 8.0 mg/mL를 (콜로이드) 불안정성 없이 허용할 수 있다.
추가로 본 발명의 약제학적 조성물은 염화나트륨과 같은 무기 음이온을 포함하는 염 또는 무기 음이온이 없어 바람직한 것으로 밝혀졌다. 본 발명의 약제학적 조성물의 장성은 스톡 키핑 유닛(stock keeping unit, SKU) 내에서 비이온성 부형제(예를 들어, 수크로오스)에 의해 바람직하게 조정된다. 이론에 얽매이지 않고, 그 이유는 본원에 기술되는 바와 같이 정전기 척력을 촉진하기 위해 분자의 등전점과 충분히 다른 제형 pH 값을 선택하는 것에 의해 단백질 제형이 물리적으로 안정화될 수 있다는 것이다. 그러나, 이들 척력은 제형에 존재하는 이온과의 상호작용을 통해 약화될 수 있다. 이온, 특히 무기 음이온은 단백질의 표면에서 전하를 최소화 또는 중화할 수 있고 분자내 척력의 감소로 인해 소수성 상호작용을 일으킬 수 있다. 따라서, 본 발명에 따른 약제학적 조성물은 바람직하게는 무기 음이온이 없다. 요구되는 완충 화합물은 바람직하게는 글루타메이트 및/또는 아세테이트와 같은 유기 음이온만을 포함한다. 따라서, 본 발명에 따른 약제학적 조성물은 바람직하게는 F-, Cl-, I- 및 Br-과 같은 무기 음이온이 없다. 특히, 본 발명에 따른 약제학적 조성물은 바람직하게는 NaCl이 없다.
본 발명에 따른 액체 제형에서 항체 구축물의 증가된 안정성은 저장 가능한 고체, 즉 건조 약제학적 조성물을 얻기 위한 고가이고 수고로운 동결건조의 단계를 피하는 데 기여할 수 있다. 또한, 저 pH 약제학적 조성물은 정맥내 투여에 적합할 수 있다. 그러나, 예를 들어 피하 또는 근육내 투여가 요구되거나 낮은 pH가 다른 의학적 이유로 허용 가능하지 않을 경우, 고체 약제학적 조성물이 본 발명에 따른 액체 약제학적 조성물로부터 여전히 얻어질 수 있다. 이와 같이 얻어진 동결건조물은 요구되는 투여의 형태 또는 개개의 의학적 요구에 적합한 약제학적으로 허용 가능한 매질에서 재구성될 수 있다. 또한, 낮은 pH에서 본 약제학적 조성물을 이용함으로써 Captisol®과 같은 추가의 안정화제를 피할 수 있다.
본원에 제시되는 약제학적 조성물은 제형화된 이중특이성 항체 구축물의 안정성을 가능하게 한다. 상이한 이중특이성 항체 구축물에서의 제형 파라미터의 영향의 평가에서는, 반감기 연장 모이어티, IEP 또는 표적 바인더에서 cys-클램프의 존재를 포함하지만 이에 한정되지 않는 분자 특성에 의존하여 제형이 최적화될 수 있음을 보여준다. 본원에 기술되는 바와 같이 최적 pH 및 염 함량의 주의 깊은 선택은 매우 중요하다. 안정성에 관련되는 한, 이전에 단클론 항체에 대해서도 나타낸 바와 같이, 연구되는 이중특이성 항체 구축물에 대한 안정성 예측 방법 및 가속 저장 조건에서 등온 장기간 안정성 연구를 관련시키는 것이 가능하다. 본원에 기술되는 바와 같은 이중특이성 항체 구축물은 30℃에서 장기간 저장 동안뿐만 아니라, 안정성 예측 방법 동안에서도 전반적으로 안정하여, 연구되는 파라미터의 일부는 매우 강력하여, 예를 들어 DLS 유체역학적 반경을 비롯하여 상관관계를 밝히는 것을 어렵게 만든다. 이 현상은 pH 및 이온 강도에서 제형 조건을 변경하는 것에 의해 보상되어, 저장 및 온도 스트레스에 대한 이중특이성 항체의 상이한 반응을 유도한다. 그러나, 안정성 예측 방법, 특히 온도-경사 나노DSF 및 온도-경사 DLS뿐만 아니라 소수성 상호작용 크로마토그래피가 있으며, 이의 파라미터는 등온 안정성 연구 동안 평가된 일부 파라미터, 예를 들어 육안으로 보이지 않는 입자 수, IF 비율 350 nm/330 nm 및 산성 차지 변이체(acidic charge variant)의 양에 대하여 매우 강력하고 이해할만한 상관관계를 보여준다. 그럼에도 불구하고, 응집의 예측은 과제에 직면하는데 장기간 안정성에 선형 분해 동역학을 적용하는 것은 어렵고, 따라서 동결 및 해동에 의해 유도되는 일차 가속화된 분해 및 지체 시간을 갖는 확률적 동역학을 배제하지 못하기 때문이다. 본원에서 사용되는 바와 같은 안정성 예측 기법은 본 발명에 따른 약제학적 조성물에서 이중특이성 항체 구축물의 안정성에 대한 유용한 예측을 제공한다.
본 발명 내에서, 용어 "안정성" 또는 "안정화"는 구체적으로 제형화, 충전, 운송, 저장 및 투여 동안 약제학적 조성물의 전체적인 안정성, 그리고 특히 활성 성분(즉, 이중특이성 단일 쇄 항체 구축물) 자체의 안정성에 관한 것이다. 용어 "안정성" 또는 "안정한"은 본 발명의 약제학적 조성물 및 이중특이성 단일 쇄 항체 구축물의 맥락에서 특별하게는 단백질 응집물(HMWS)의 형성의 방지 또는 감소를 지칭한다. 구체적으로, 용어 "안정성"은 또한 본원에 기술되는 약제학적 조성물 내에 포함되는 이중특이성 단일 쇄 항체 구축물의 콜로이드 안정성에 관한 것이다. "콜로이드 안정성"은 연장된 기간(수일 내지 수년) 동안 액체 중에 분산되어 유지되는 콜로이드 입자(예를 들어, 단백질)의 능력이다.
본원에서 사용되는 바와 같은 용어 "(단백질) 응집물"은 일반적으로 요망되는 정의된 종(예를 들어, 단량체) 대신에 "올리고머" 또는 "다량체"와 같이 더 높은 분자량의 단백질 종을 포함한다. 이 용어는 본원에서 용어 "고분자량 종" 및 "HMWS"와 상호 교환 가능하게 사용된다. 단백질 응집물은 일반적으로 크기(작은 조립체(이량체)로부터 큰 조립체(육안으로 보이지 않거나(subvisible) 심지어 눈에 보이는 입자)까지의 범위 및 직경이 나노미터로부터 마이크로미터까지의 범위), 형태학(대략 구체로부터 미소섬유형까지), 단백질 구조(천연 대 비천연/변성됨), 분자간 결합의 유형(공유 대 비공유), 가역성 및 용해성이 상이할 수 있다. 가용성 응집물은 대략 1 내지 100 nm의 크기 범위를 포함하고, 단백질 미립자는 육안으로 보이지 않는(약 0.1 내지 100 .m) 범위 및 가시적(100 .m 초과) 범위를 포함한다. 위에 언급된 유형의 단백질 응집물 모두는 일반적으로 이 용어에 의해서 포함된다. 용어 "(단백질) 응집물"은 이에 따라 2종 이상의 단백질 단량체의 모든 종류의 물리적으로 회합되거나 화학적으로 연결된 비천연 종을 지칭한다.
따라서 용어 "단백질 응집" 또는 "비천연 응집"은 단백질 분자가 단량체로 지칭된 개별 단백질과 함께, 2종 이상의 단백질로 구성된 복합체로 조립되는 공정(들)을 나타낸다. 온도, 기계적 스트레스, 예를 들어 진탕 및 교반, 펌핑, 동결 및/또는 해동 및 제형화를 비롯하여 매우 다양한 조건에 의해서 유도될 수 있는, 단백질 응집으로 이어지는 다수의 경로가 존재한다.
온도 증가는 단백질의 산화 및 탈아미드화와 같은 화학 반응을 가속화하는데, 이는 차례로 응집을 촉진할 수 있다. 더 높은 온도는 또한 4차, 3차, 및 2차 구조 수준에서 단백질의 입체 형태에 직접적으로 영향을 주고, 응집을 촉진할 수 있는 온도-유도 풀림으로 이어질 수 있다. 본원에서 지칭되는 온도는 전형적으로 정교한 단백질 기반 약제의 장기간 저장을 위한 심온 동결 온도(-70℃), 표준 동결 온도(-20℃), 냉장 온도(4℃), 실온(25℃) 및 생리적 온도(37℃)이다.
단백질 변성 및 응집은 새로운 얼음/용액 계면의 생성, 용기 표면에 대한 흡착, 단백질 및 용질의 저온농축(cryoconcentration) 및 완충제 구성 성분의 결정화로 인한 pH 변화와 같은 복잡한 물리적 및 화학적 변화로 인해 동결/해동 중에 일어날 수 있다.
단백질 농도의 증가는 또한 단백질 응집물의 형성을 증진시킬 수 있다. 높은 단백질 농도에서 거대분자 과밀이 일어나는데, 이 용어는 그 용액 중에서 각각의 거대분자 종의 거동에 대한 거대분자 용질의 높은 총 부피 점유의 효과를 기술하는 데 사용된다. 이러한 배제된 부피 이론에 따라서, 자가-조립 및 이에 따른 잠재적인 응집이 촉진될 수 있다.
항미생물성 보존제, 예를 들어 벤질 알코올 및 페놀은 종종 이의 저장 수명 동안 멸균성을 보장하기 위해 단백질 액체 제형에서 요구되며, 또한 다회용량 제형 및 특정 약물 전달 시스템, 예를 들어 주사 펜, 미니펌프 및 국소 적용에서 요구된다. 다수의 보존제가 단백질 응집을 유도하는 것으로 보고되어 있지만, 근본적인 기전은 잘 이해되지 않고 있다. 보존제는 응집되기 쉬운 풀린 단백질 상태에 결합하고 이를 채우는 것으로 제안되어 있다.
유리하게는, 본 발명의 약제학적 조성물은 스트레스, 특히 열 스트레스, 저장, 표면-유도 스트레스(예를 들어, 동결/해동 주기, 발포), 농축(한외여과 및 투석여과에 의함)을 받거나 항미생물성 보존제와 같은 유기 화합물과 혼합되는 경우에도 안정한 것으로, 즉, 단백질 응집물이 존재하지 않거나 실질적으로 존재하지 않게 유지되는 것으로 고려된다. 바람직하게는, 약제학적 조성물은 첨부된 실시예에서 평가된 낮은 pH를 갖는 조성물과 비교하여 유사하거나 심지어 개선된 특성을 가질 수 있다. 본 발명의 약제학적 조성물은 분산되고 바람직하게는 단량체 이중특이성 항체 구축물과 같은 단백질 기반 약제의 바람직하게는 균질 용액이다.
본 발명의 맥락에서 2개(또는 2개 초과)의 상이한 항원에 동시에 결합하는 이중특이성(및/또는 다중특이성) 항체에 적합한 제형을 제공하는 것이 고려된다. 특정 구현예에서 이중특이성 항체는 제1 표적 항원에 결합하는 한편, 제2 항원은 주효 세포, 즉 하나 이상의 FcR(예를 들어, FcγRIII)을 발현하고 항체의 Fc 영역에 기인하는 하나 이상의 효과기 기능을 수행하는 백혈구 상에 존재하는 세포 표면 분자이다. 효과기 기능의 예는 Clq 결합 및 보체 의존성 세포독성(CDC), Fc 수용체 결합, 항체-의존성 세포-매개 세포독성(ADCC), 식세포작용, 세포 표면 수용체의 하향 조절, 및 B 세포 활성화를 포함하지만, 이로 한정되지 않는다. ADCC에 연루되는 주효 세포의 예는 세포독성 T 세포, 말초 혈액 단핵구 세포(PBMC), 천연 살해자(NK) 세포, 단핵구, 및 호중구를 포함하지만, 이로 한정되지 않는다.
당업자는 약제학적 조성물이 효과적으로 활성 성분의 안정화를 제공(즉, 이중특이성 항체 구축물의 단백질 응집물의 형성을 감소 또는 억제)하지만, 약제학적 조성물의 전체 유용성을 실질적으로 손상시키지 않으면서, 일부 응집물 또는 이형태체가 가끔 형성될 수 있다는 것을 인정할 것이다. 이러한 맥락에서, 응집물이 "실질적으로 존재하지 않는" 것은, 예를 들어 첨부된 실시예에서 평가된 바와 같이, 특히 환경 스트레스를 받는 경우에도, 응집물의 양이 10%, 9%, 8%, 7%, 6%, 5%, 4%, 3%, 2% 또는 1%(w/v) 미만으로 유지되는 것을 의미한다.
가용성 및 불용성 단백질 응집물의 존재를 결정하는 방법은, 그 중에서도 Mahler et al., J Pharm Sci. 2009 Sep;98(9):2909-34에 의해 검토되어 있다. 가용성 단백질 응집물의 형성은 첨부된 실시예에 기술된 바와 같이 크기 배제 초고성능 액체 크로마토그래피(SE-UPLC)에 의해 평가될 수 있다. SEC는 단백질 응집물의 검출 및 정량화를 위한 가장 많이 사용되는 분석 방법 중 하나이다. SEC 분석은 응집물의 크기 분석 및 이들의 정량화 둘 다를 가능하게 한다. SEQ-UPLC는 약 5 내지 1000 kDa의 분자량 범위에서 이들의 형상 및 크기(유체역학적 반경)를 기준으로 거대분자의 선택적이고 신속한 분리를 가능하게 한다.
단백질 용액은 유광(opalescence) 또는 탁도(turbidity)로 지칭되는 광학 특성을 보여준다. 용액의 광학 특성은 광을 산란 및 흡수하는 존재 입자의 함수이다. 단백질은 천연 콜로이드이고, 수성 제형의 탁도는 단백질 농도, 비용해된 입자의 존재, 입자 크기 및 단위 용적 당 입자 수에 의존된다. 탁도는 340 내지 360 nm 범위에서의 광학 밀도로서 UV-Vis 분광학에 의해서 측정될 수 있고, 가용성 및 불용성 응집물 둘 다를 검출하는 데 사용될 수 있다.
더욱이, 시각적 수단에 의한 샘플의 조사는 여전히 단백질 응집물을 평가하는 중요한 양태이다. 가시적 응집물의 존재 또는 부재에 대한 시각적 평가는 바람직하게는 독일약전(Deutscher Arzneimittel Codex, DAC) 시험법 5에 따라 수행된다.
본원의 별항에 제시된 바와 같이, 본 발명의 약제학적 조성물은 -주로 낮은 pH 및 선택적으로 그 안에 포함되는 추가의 안정화제의 작용에 의한 것으로 보이는- 이중특이성 항체 구축물의 증가된 콜로이드 안정성을 촉진하고, 이에 따라 액체-액체 상 분리(LLPS)의 감소 또는 심지어 부재를 나타내는 것으로 고려된다. LLPS는 균질한 단백질 용액이 온도 저하에 따라 단백질-부족 상(통상적으로 상부 층) 및 단백질-풍부 상(통상적으로 하부 층)으로 분리되는 열역학적 유래의 사건이다. LLPS는 전형적으로 단순히 두 상을 혼합하고 용액의 온도를 상승시키는 것에 의해 완전히 가역적이다. LLPS의 발생은 짧은 범위의 유인성 단백질-단백질 상호작용에 기인한다(이는 단백질-단백질 인력의 강도의 척도가 됨). 본 발명에 따른 β-사이클로덱스트린을 포함하는 약제학적 조성물은 β-사이클로덱스트린을 포함하지 않는 약제학적 조성물과 비교하여, LLPS 단백질-부족 상에서 더 높은 농도의 이중특이성 항체 구축물을 포함하는 것으로 밝혀졌다. 따라서, 본 발명의 약제학적 조성물은 대조와 비교할 때, 감소된 LLPS를 나타내거나 전혀 LLPS를 나타내지 않고, 따라서 본 발명의 이중특이성 항체 구축물의 증가된 콜로이드 안정성을 촉진하는 것으로 고려된다. LLPS는 유도될 수 있고 상이한 상의 단백질 함량은 첨부된 실시예에 기술된 바와 같이 조사될 수 있다.
환경 스트레스는, 특히 열 및/또는 화학적 변성으로 인해, 입체 형태 변화로 이어질 수도 있는데, 이는 차례로 응집을 촉진할 수 있다. 놀랍게도, 본 발명자들은 방향족 아미노산의 고유 형광 방출 강도를 측정함으로써 평가되는 바와 같이 이중특이성 항체 구축물이 또한 입체 형태 변화와 관련하여 안정화된다는 것을 발견하였다. 따라서 본 발명의 약제학적 조성물은 또한 바람직하게는 이형태체(즉, 비천연, 비정상적으로 접힌 단백질 종)의 형성을 감소시키거나 억제한다.
앞서 설명한 바와 같이, 본 발명의 안정한 약제학적 조성물은 제1 결합 도메인을 통해 표적 세포 표면 항원에 결합하고, 제2 결합 도메인을 통해 T 세포 표면 항원 CD3에 결합하는 이중특이성 항체 구축물을 포함한다.
용어 "항체 구축물"은 구조 및/또는 기능이 항체의, 예를 들어, 전장 또는 전체 면역글로불린 분자의 구조 및/또는 기능을 기반으로 하고/하거나 항체 또는 이의 단편의 가변 중쇄(VH) 및/또는 가변 경쇄(VL) 도메인으로부터 유도되는 분자를 지칭한다. 따라서 항체 구축물은 이의 특이적 표적 또는 항원에 결합할 수 있다. 더 나아가, 본 발명에 따른 항체 구축물의 결합 도메인은 표적 결합을 허용하는 항체의 최소 구조적 요구를 포함한다. 이러한 최소 요구는, 예를 들어 적어도 3개의 경쇄 CDR(즉, VL 영역의 CDR1, CDR2 및 CDR3) 및/또는 3개의 중쇄 CDR(즉, VH 영역의 CDR1, CDR2 및 CDR3), 바람직하게는 6개의 CDR 모두의 존재에 의해 정의될 수 있다. 항체의 최소 구조 요구를 정의하기 위한 대안적인 접근법은 특정 표적 구조 내의, 즉, 각각 에피토프 영역을 구성하는 표적 단백질의 단백질 도메인(에피토프 클러스터) 또는 정의된 항체의 에피토프와 경쟁하는 특정 항체에 대한, 항체의 에피토프의 정의이다. 본 발명에 따른 구축물이 기반으로 하는 항체는, 예를 들어, 단클론, 재조합, 키메라, 탈면역화, 인간화 및 인간 항체를 포함한다.
본 발명에 따른 항체 구축물의 결합 도메인은, 예를 들어 위에 언급된 CDR의 군을 포함할 수 있다. 바람직하게는, 이들 CDR은 항체 경쇄 가변 영역(VL) 및 항체 중쇄 가변 영역(VH)의 프레임워크에 포함되지만; 둘 다를 포함할 필요는 없다. Fd 단편은, 예를 들어, 2개의 VH 영역을 갖고, 종종 온전한 항원-결합 도메인의 일부 항원-결합 기능을 보유한다. 항체 단편, 항체 변이체 또는 결합 도메인의 형식에 대한 추가적인 예는 (1) Fab 단편, 즉, VL, VH, CL 및 CH1 도메인을 갖는 1가 단편; (2) F(ab')2 단편, 즉, 힌지 영역에서 이황화 가교에 의해 연결된 2개의 Fab 단편을 갖는 2가 단편; (3) 2개의 VH 및 CH1 도메인을 갖는 Fd 단편; (4) 항체의 단일 암(arm)의 VL 및 VH 도메인을 갖는 Fv 단편, (5) VH 도메인을 갖는 dAb 단편(Ward et al., (1989) Nature 341:544-546); (6) 분리된 상보성 결정 영역(CDR), 및 (7) 단일 쇄 Fv(scFv)을 포함하며, 후자가 바람직하다(예를 들어, scFV-라이브러리로부터 유래됨). 본 발명에 따른 항체 구축물의 구현예에 대한 예는, 예를 들어 WO 00/006605, WO 2005/040220, WO 2008/119567, WO 2010/037838, WO 2013/026837, WO 2013/026833, US 2014/0308285, US 2014/0302037, WO 2014/144722, WO 2014/151910, 및 WO 2015/048272에 기술되어 있다.
대안적인 이중특이성 항원-결합 형식은, 예를 들어 본원에 참조로 포함되는 미국 특허 출원 공개 번호 2011/0054151에 기술되어 있다. 예를 들어, 이중특이성 항원-결합 단백질은 mAb-Fv 형식을 포함할 수 있는데, 여기에서 IgG 항체는 C-말단에서 Fv 단편과 융합된다. 대안적으로, IgG 항체가 C-말단에서 Fab와 융합된 mAb-Fab 형식이 사용될 수 있다. mAb-Fab 구축물은 CH 및 CL 불변 도메인 C-말단을 C-말단 Fv 융합으로 포함하는 한편, mAb-Fv는 그렇지 않다. 미국 특허 출원 공개 번호 2011/0054151의 도 8 참조. 선택적으로, mAb-Fv 및 mAb-Fab 구축물의 N-말단 결합 영역은 경쇄 및 CH1 도메인이 결여된다(즉, 단일 도메인 VHH 영역을 포함한다). mAb-Fv 및 mAb-Fab 구축물은 3개의 가변 영역을 포함하여, 이들이 제1 항원에 이가로 결합하고 제2 항원은 일가로 결합한다. 적합한 이중특이성 항원-결합 형식은 또한, 미국 특허 출원 공개 번호 2011/0054151에 기술된 Fab-Fv 및 Fab-Fab 구축물을 포함한다. Fab-Fv 및 Fab-Fab 면역글로불린은 제1 항원에 결합하는 N-말단 Fab 단편을 포함하고 C-말단 Fv 또는 Fab 단편은 제2 항원에 결합한다.
헤테로이량체 항체는 바람직하게는 IgG 클래스의 것으로, 이는 IgG1, IgG2, IgG3, 및 IgG4를 포함하지만, 이로 한정되지 않는 몇 개의 서브클래스를 갖고, 단 IgM, IgD, IgG, IgA, 및 IgE 또한 고려된다. 항체는 또한 이소형 및/또는 서브클래스의 하이브리드를 포함할 수 있음이 이해되어야 한다. 예를 들어, 참조로 포함되는 미국 특허 공개 번호 2009/0163699에서 보여주는 IgG1/G2 하이브리드의 pI 공학은 본 개시의 일부로서 고려된다.
VH, VHH, VL, (s)dAb, Fv, Fd, Fab, Fab', F(ab')2 또는 "r IgG"("절반 항체")와 같은 전장 항체의 단편 또한 "결합 도메인" 또는 "결합하는 도메인"의 정의 내이다. 본 발명에 따른 항체 구축물은 또한 항체 변이체로도 불리는 항체의 변형된 단편, 예를 들어 scFv, 다이-scFv 또는 바이(s)-scFv, scFv-Fc, scFv-지퍼, scFab, Fab2, Fab3, 다이어바디, 단일 쇄 다이어바디, 탠덤(tandem) 다이어바디(Tandab), 탠덤 다이-scFv, 탠덤 트라이-scFv, "멀티바디", 예를 들어 트라이어바디 또는 테트라바디, 및 단일 도메인 항체, 예를 들어, 나노바디 또는, 다른 V 영역 또는 도메인과 독립적으로 항원 또는 에피토프에 특이적으로 결합하는, VHH, VH 또는 VL일 수 있는 단지 하나의 가변 도메인을 포함하는 단일 가변 도메인 항체를 포함할 수 있다.
본원에서 사용되는 용어 "단일-쇄 Fv," "단일-쇄 항체" 또는 "scFv"는 중쇄와 경쇄 둘 다로부터의 가변 영역을 포함하지만, 불변 영역이 없는 단일 폴리펩티드 쇄 항체 단편을 지칭한다. 일반적으로, 단일-쇄 항체는 VH 도메인과 VL 도메인 사이에 폴리펩티드 링커를 추가로 포함하는데, 이는 항원 결합을 허용하는 요망되는 구조를 형성할 수 있도록 한다. 단일 쇄 항체는 Pluckthun에 의해 The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds. Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994)에 상세하게 논의되어 있다. 단일 쇄 항체를 생성하는 다양한 방법은 미국 특허 번호 4,694,778 및 5,260,203; 국제 특허 출원 공개 번호 WO 88/01649; Bird (1988) Science 242:423-442; Huston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883; Ward et al. (1989) Nature 334:54454; Skerra et al. (1988) Science 242:1038-1041에 기술된 것들을 비롯하여 알려져 있다. 구체적인 구현예에서, 단일-쇄 항체는 또한 이중특이성, 다중특이성, 인간, 및/또는 인간화 및/또는 합성일 수 있다.
더 나아가, 용어 "항체 구축물"의 정의는 1가, 2가 및 다가/다중가 구축물을 포함하고, 따라서, 단지 2개의 항원 구조에 특이적으로 결합하는 이중특이성 구축물뿐만 아니라 별개의 결합 도메인을 통해 2개 초과의 항원 구조, 예를 들어 3개, 4개 이상에 특이적으로 결합하는 다특이성/다중특이성 구축물을 포함한다. 게다가, 용어 "항체 구축물"의 정의는 단지 하나의 폴리펩티드 쇄로 구성되는 분자뿐만 아니라 하나 초과의 폴리펩티드 쇄로 구성되는 분자를 포함하며, 이 쇄는 동일하거나(호모이량체, 호모삼량체 또는 호모 올리고머) 상이할 수 있다(헤테로이량체, 헤테로삼량체 또는 헤테로올리고머). 위의 확인된 항체 및 이의 변이체 또는 유도체에 대한 예는 그 중에서도 Harlow and Lane, Antibodies a laboratory manual, CSHL Press (1988) 및 Using Antibodies: a laboratory manual, CSHL Press (1999), Kontermann and Dbel, Antibody Engineering, Springer, 2nd ed. 2010 및 Little, Recombinant Antibodies for Immunotherapy, Cambridge University Press 2009에 기술되어 있다.
본원에서 사용되는 용어 "이중특이성"은 "적어도 이중특이성"인 항체 구축물을 지칭하는데, 즉, 이는 적어도 제1 결합 도메인 및 제2 결합 도메인을 포함하고, 여기에서 제1 결합 도메인은 하나의 항원 또는 표적(여기에서: 표적 세포 표면 항원)에 결합하고, 제2 결합 도메인은 다른 항원 또는 표적(예를 들어, CD3)에 결합한다. 따라서, 본 발명에 따른 항체 구축물은 적어도 2개의 상이한 항원 또는 표적에 대한 특이성을 포함한다. 예를 들어, 제1 도메인은 바람직하게는 본원에 기재된 바와 같은 하나 이상의 종의 CD3ε의 세포외 에피토프에 결합하지 않는다. 용어 "표적 세포 표면 항원"은 세포에 의해 발현되고, 본원에 기재된 바와 같은 항체 구축물에 접근 가능하도록 세포 표면에 존재하는 항원 구조를 지칭한다. 이는 단백질, 바람직하게는 단백질의 세포외 부분, 또는 탄수화물 구조, 바람직하게는 단백질의 탄수화물 구조, 예를 들어 당단백질일 수 있다. 이는 바람직하게는 종양 항원이다. 본 발명의 용어 "이중특이성 항체 구축물"은 또한 다중특이성 항체 구축물, 예를 들어 삼중특이성 항체 구축물을 포함하며, 후자는 3개의 결합 도메인을 포함하거나, 구축물이 3개 초과의(예를 들어, 4, 5...) 특이성을 갖는다.
본원에서 이해되는 바와 같이 이중특이성 항체 및/또는 항체 구축물은 종래의 이중특이성 면역글로불린(예를 들어, BsIgG), 첨부된 항원-결합 도메인을 포함하는 IgG(예를 들어, 경쇄 또는 중쇄의 아미노 또는 카르복시 말단은 부가적인 항원-결합 도메인, 예를 들어 단일 도메인 항체 또는 쌍을 이룬 항체 가변 도메인(예를 들어, Fv 또는 scFv)에 연결됨), BsAb 단편(예를 들어, 이중특이성 단일 쇄 항체), 이중특이성 융합 단백질(예를 들어, 효과기 모이어티에 융합된 항원 결합 도메인), 및 BsAb 접합체를 포함하지만, 이로 한정되지 않는다. 예를 들어, 다양한 이중특이성 형식을 기술하고 이에 참조로 포함되는 Spiess et al., Molecular Immunology 67(2) Part A: 97-106 (2015) 참조. 이중특이성 구축물의 예는 다이아바디, 단일 쇄 다이아바디, 탠덤 scFv, 이중특이성 T 세포 관여자(BiTE) 형식(링커에 의해 연결되는 2개의 단일-쇄 가변 단편(scFv)으로 구성되는 융합 단백질), 및 Fab2 이중특이체뿐만 아니라, 전장 항체를 포함하는 조작된 구축물을 포함하지만, 이로 한정되지 않는다. 예를 들어, 모두 본원에 명백히 포함되는 Chames & Baty, 2009, mAbs 1[6]:1-9; 및 Holliger & Hudson, 2005, Nature Biotechnology 23[9]:1126-1136; Wu et al., 2007, Nature Biotechnology 25[11]:1290-1297; Michaelson et al., 2009, mAbs 1[2]:128-141; 국제 특허 공개 번호 2009032782 및 2006020258; Zuo et al., 2000, Protein Engineering 13[5]:361-367; 미국 특허 출원 공개 번호 20020103345; Shen et al., 2006, J Biol Chem 281[16]:10706-10714; Lu et al., 2005, J Biol Chem 280[20]:19665-19672; 및 Kontermann, 2012 MAbs 4(2):182 참조.
본 발명에 따른 항체 구축물이 (적어도) 이중특이성이라는 것을 고려하면, 이들은 천연적으로 존재하지 않고, 천연적으로 존재하는 생성물과 현저하게 상이하다. 따라서 "이중특이성" 항체 구축물 또는 면역글로불린은 상이한 특이성을 갖는 적어도 2개의 별개의 결합 측을 갖는 인공 하이브리드 항체 또는 면역글로불린이다. 이중특이성 항체 구축물은 하이브리도마의 융합 또는 Fab' 단편의 연결을 포함하는 다양한 방법에 의해 생산될 수 있다. 예를 들어, Songsivilai & Lachmann, Clin. Exp. Immunol. 79:315-321 (1990) 참조.
본 발명의 항체 구축물의 적어도 2개의 결합 도메인 및 가변 도메인(VH/VL)은 펩티드 링커(스페이서 펩티드)를 포함할 수 있거나 포함하지 않을 수도 있다. 용어 "펩티드 링커"는 본 발명에 따르면 본 발명의 항체 구축물의 하나의(가변 및/또는 결합) 도메인 및 다른(가변 및/또는 결합) 도메인의 아미노산 서열이 서로 연결되는 아미노산 서열을 포함한다. 펩티드 링커는 또한 본 발명의 항체 구축물의 다른 도메인에 제3 도메인을 융합시키기 위해 사용될 수 있다. 이러한 펩티드 링커의 필수적인 기술적 특징은 그것이 임의의 중합 활성을 포함하지 않는다는 것이다. 적합한 펩티드 링커 중에는 미국 특허 4,751,180 및 4,935,233 또는 WO 88/09344호에 기술된 것들이 있다. 펩티드 링커는 또한 본 발명의 항체 구축물에 다른 도메인 또는 모듈 또는 영역(예를 들어, 반감기 연장 도메인)을 부착시키기 위해 사용될 수 있다.
본 발명의 항체 구축물은 바람직하게는 "시험관내 생성된 항체 구축물"이다. 이 용어는 위의 정의에 따른 항체 구축물을 지칭하는데, 여기에서 가변 영역의 모두 또는 일부(예를 들어, 적어도 하나의 CDR)는 비면역 세포 선택, 예를 들어, 시험관내 파지 디스플레이, 단백질 칩 또는 후보 서열이 항원에 결합하는 그들의 능력에 대해 시험될 수 있는 임의의 다른 방법으로 생성된다. 따라서, 이 용어는 바람직하게는 동물에서 면역 세포의 게놈 재배열에 의해서만 생성되는 서열을 제외한다. "재조합 항체"는 재조합 DNA 기술 또는 유전 공학의 사용을 통해 만들어진 항체이다.
본원에서 사용되는 용어 "단클론 항체"(mAb) 또는 단클론 항체 구축물은 실질적으로 균질한 항체의 집단으로부터 얻어지는 항체를 지칭하는데, 즉, 집단을 포함하는 개개 항체는 소량으로 존재할 수 있는 가능한 천연 유래 돌연변이 및/또는 번역후 변형(예를 들어, 이성질체화, 아미드화)을 제외하고 동일하다. 단클론 항체는 고도로 특이적으로, 상이한 결정기(또는 에피토프)에 대하여 유도된 상이한 항체를 전형적으로 포함하는 통상적인 (다클론) 항체 제제와 대조적으로, 항원에서 단일 항원 측 또는 결정기에 대해 유도된다. 이들의 특이성에 더하여, 단클론 항체는 하이브리도마 배양에 의해 합성되어, 다른 면역글로불린에 의해 오염되지 않는다는 점에서 유리하다. 변형어 "단클론성"은 실질적으로 균질한 항체 집단으로부터 얻어지는 항체의 특징을 나타내며, 임의의 특정 방법에 의한 항체의 생산을 필요로 하는 것으로 해석되어서는 안 된다.
단클론 항체의 제조를 위해, 연속적 세포주 배양에 의해 생산되는 항체를 제공하는 임의의 기법이 사용될 수 있다. 예를 들어, 사용되는 단클론 항체는 Koehler et al., Nature, 256: 495 (1975)에 의해 최초로 기술된 하이브리도마 방법에 의해 만들어질 수 있거나, 재조합 DNA 방법에 의해 만들어질 수 있다(예를 들어, 미국 특허 번호 4,816,567 참조). 인간 단클론 항체를 생산하기 위한 추가적인 기법의 예는 트라이오마 기법, 인간 B-세포 하이브리도마 기법(Kozbor, Immunology Today 4 (1983), 72) 및 EBV-하이브리도마 기법(Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, Inc. (1985),77-96)을 포함한다.
다음에 하이브리도마는 구체화된 항원과 특이적으로 결합하는 항체를 생산하는 하나 이상의 하이브리도마를 확인하기 위해 표준 방법, 예를 들어 효소-결합 면역흡착 분석(ELISA) 및 표면 플라스몬 공명(BIACORE™) 분석을 사용하여 선별될 수 있다. 관련 항원의 임의 형태가 면역원, 예를 들어, 재조합 항원, 천연 유래 형태, 임의의 변이체 또는 이의 단편뿐만 아니라 이의 항원 펩티드로서 사용될 수 있다. 비아코어(BIAcore) 시스템에서 이용되는 표면 플라스몬 공명은 표적 세포 표면 항원의 에피토프에 결합하는 파지 항원의 효율을 증가시키기 위해 사용될 수 있다(Schier, Human Antibodies Hybridomas 7 (1996), 97-105; Malmborg, J. Immunol. Methods 183 (1995), 7-13).
단클론 항체를 제조하는 다른 예시적인 방법은 단백질 발현 라이브러리, 예를 들어, 파지 디스플레이 또는 리보솜 디스플레이 라이브러리 선별을 포함한다. 파지 디스플레이는, 예를 들어 Ladner et al., 미국 특허 번호 5,223,409; Smith (1985) Science 228:1315-1317, Clackson et al., Nature, 352: 624-628 (1991) 및 Marks et al., J. Mol. Biol., 222: 581-597 (1991)에 기술되어 있다.
디스플레이 라이브러리의 사용에 더하여, 비인간 동물, 예를 들어, 설치류(예를 들어, 마우스, 햄스터, 토끼 또는 래트)를 면역화하기 위해 관련 항원이 사용될 수 있다. 일 구현예에서, 비인간 동물은 인간 면역글로불린 유전자의 적어도 일부를 포함한다. 예를 들어, 인간 Ig(면역글로불린) 좌위의 큰 단편을 가지고 마우스 항체 생산이 결핍된 마우스 혈통을 조작하는 것이 가능하다. 하이브리도마 기법을 사용하여, 요망되는 특이성을 갖는 유전자로부터 유래된 항원-특이적 단클론 항체가 생산되고 선택될 수 있다. 예를 들어, XENOMOUSE™, Green et al. (1994) Nature Genetics 7:13-21, US 2003-0070185, WO 96/34096, 및 WO 96/33735 참조.
단클론 항체는 또한 비인간 동물로부터 얻어질 수 있고, 이어서, 당업계에 공지된 재조합 DNA 기법을 사용하여 변형, 예를 들어 인간화, 탈면역화, 키메라 등으로 될 수 있다. 변형된 항체 구축물의 예에는 비인간 항체의 인간화 변이체, "친화성 성숙(affinity matured)" 항체(예를 들어, Hawkins et al. J. Mol. Biol. 254, 889-896 (1992) 및 Lowman et al., Biochemistry 30, 10832- 10837 (1991) 참조) 및 변경된 효과기 기능(들)을 갖는 항체 돌연변이체(예를 들어, 미국 특허 5,648,260, 인용된 Kontermann and (2010) 및 인용된 Little (2009) 참조)가 포함된다.
면역학에서, 친화성 성숙은 B 세포가 면역 반응의 과정 동안 항원에 대해 증가된 친화성을 갖는 항체를 생산하는 과정이다. 동일한 항원에 대한 반복적인 노출로, 숙주는 연속적으로 더 큰 친화성의 항체를 생산할 것이다. 천연 표현형과 마찬가지로, 시험관내 친화성 성숙은 돌연변이 및 선택의 원칙을 기반으로 한다. 시험관내 친화성 성숙은 항체, 항체 구축물, 및 항체 단편을 최적화하기 위해 성공적으로 사용된다. CDR 내부의 무작위 돌연변이는 방사선, 화학적 돌연변이원 또는 오류-성향 PCR을 사용하여 도입된다. 추가로, 유전적 다양성은 쇄 셔플링에 의해 증가될 수 있다. 파지 디스플레이와 같은 디스플레이 방법을 사용하는 2 또는 3회 라운드의 돌연변이 및 선택은 보통 낮은 나노몰 범위의 친화성을 갖는 항체 단편을 초래한다.
항체 구축물의 아미노산 치환 변이의 바람직한 유형은 모 항체(예를 들어, 인간화 또는 인간 항체)의 하나 이상의 초가변 영역 잔기를 치환시키는 것을 포함한다. 일반적으로, 추가적인 개발을 위해 선택되는 생성된 변이체(들)는 이들이 생성된 모 항체에 비해 개선된 생물학적 특성을 가질 것이다. 이러한 치환 변이체를 생성하기 위한 편리한 방식은 파지 디스플레이를 사용한 친화성 성숙을 포함한다. 간략하게는, 몇 개의 초가변 영역 측(예를 들어, 6 내지 7개 측)이 각각의 측에서 모든 가능한 아미노산 치환을 생성하도록 돌연변이가 된다. 이렇게 생성된 항체 변이체는 각각의 입자 내에서 패키징된 M13의 유전자 III 산물에 대한 융합으로서의 섬유상 파지 입자로부터 1가 방식으로 디스플레이된다. 이어서, 파지-디스플레이된 변이체는 본원에 개시된 바와 같이 그들의 생물학적 활성(예를 들어, 결합 친화성)에 대해 선별된다. 변형을 위한 후보 초가변 영역 측을 확인하기 위해, 항원 결합에 상당히 기여하는 초가변 영역 잔기를 확인하도록 알라닌 스캐닝 돌연변이 유발이 수행될 수 있다. 대안적으로, 또는 추가적으로, 결합 도메인과, 예를 들어 인간 표적 세포 표면 항원 사이의 접점을 확인하기 위해 항원-항체 복합체의 결정 구조를 분석하는 것이 유리할 수 있다. 이러한 접촉 잔기 및 이웃하는 잔기는 본원에서 상술한 기법에 따른 치환에 대한 후보이다. 일단 이러한 변이체가 생성되면, 변이체의 패널은 본원에 기술되는 바와 같이 선별을 받고, 하나 이상의 관련 분석에서 우수한 특성을 갖는 항체가 추가 개발을 위해 선택될 수 있다.
본 발명의 단클론 항체 및 항체 구축물은 구체적으로, 중쇄 및/또는 경쇄의 일부가 특정 종으로부터 유래되거나 특정 항체 클래스 또는 서브클래스에 속하는 항체에서의 상응하는 서열과 동일하거나 이와 상동성인 한편, 이들이 요망되는 생물학적 활성을 나타내는 한, 쇄(들)의 나머지가 다른 종으로부터 유래되거나 다른 항체 클래스 또는 서브클래스에 속하는 항체뿐만 아니라 이러한 항체의 단편에서의 상응하는 서열과 동일하거나 이와 상동성인, "키메라" 항체(면역글로불린)를 포함한다(미국 특허 번호 4,816,567; Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 6851-6855(1984)). 본원에서 관심 대상의 키메라 항체는 비인간 영장류(예를 들어, 긴 꼬리 원숭이, 유인원 등) 및 인간 불변 영역 서열로부터 유래된 가변 도메인 항원-결합 서열을 포함하는 "영장류화된" 항체를 포함한다. 키메라 항체를 제조하기 위한 다양한 접근법이 기술되어 있다. 예를 들어, Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci U.S.A. 81:6851, 1985; Takeda et al., Nature 314:452, 1985, Cabilly et al., 미국 특허 번호 4,816,567; Boss et al., 미국 특허 번호 4,816,397; Tanaguchi et al., EP 0171496; EP 0173494; 및 GB 2177096 참조.
항체, 항체 구축물, 항체 단편 또는 항체 변이체는 또한, 예를 들어 WO 98/52976 또는 WO 00/34317에 개시된 방법으로 인간 T 세포 에피토프의 특정 결실("탈면역화"로 불리는 방법)에 의해 변형될 수 있다. 간략하게, 항체의 중쇄 및 경쇄 가변 도메인은 MHC 클래스 II에 결합하는 펩티드에 대해 분석될 수 있고; 이들 펩티드는 잠재적 T 세포 에피토프를 나타낸다(WO 98/52976 및 WO 00/34317에 나타낸 바와 같음). 잠재적 T 세포 에피토프의 검출을 위해, "펩티드 스레딩(threading)"으로 지칭되는 컴퓨터 모델링 접근법이 적용될 수 있고, 추가로 인간 MHC 클래스 II 결합 펩티드의 데이터베이스를 WO 98/52976 및 WO 00/34317에 기술된 바와 같이 VH 및 VL 서열에 존재하는 모티프에 대해 검색할 수 있다. 이들 모티프는 임의의 18개 주요 MHC 클래스 II DR 알로타입에 결합하고, 따라서 잠재적 T 세포 에피토프를 구성한다. 검출된 잠재적 T 세포 에피토프는 가변 도메인에서 소수의 아미노산 잔기를 치환함으로써, 또는 바람직하게는, 단일 아미노산 치환에 의해 제거될 수 있다. 전형적으로, 보존적 치환이 이루어진다. 종종, 배타적으로는 아니지만, 인간 생식계열 항체 서열 내 위치에 공통적인 아미노산이 사용될 수 있다. 인간 생식계열 서열은, 예를 들어 Tomlinson, et al. (1992) J. MoI. Biol. 227:776-798; Cook, G.P. et al. (1995) Immunol. Today Vol. 16 (5): 237-242; 및 Tomlinson et al. (1995) EMBO J. 14: 14:4628-4638에 개시되어 있다. V BASE 디렉토리는 인간 면역글로불린 가변 영역 서열의 포괄적인 디렉토리를 제공한다(Tomlinson, LA. et al.에 의해 편집, MRC Centre for Protein Engineering, Cambridge, UK). 이들 서열은 인간 서열, 예를 들어, 프레임워크 영역 및 CDR에 대한 공급원으로서 사용될 수 있다. 예를 들어, 미국 특허 번호 6,300,064에 기술된 바와 같이, 콘센서스 인간 프레임워크 영역이 또한 사용될 수 있다.
"인간화된" 항체, 항체 구축물, 변이체 또는 이의 단편(예를 들어 Fv, Fab, Fab', F(ab')2 또는 항체의 다른 항원 결합 하위서열)은 비인간 면역글로불린으로부터 유래된 최소 서열(들)을 포함하는 대부분 인간 서열의 항체 또는 면역글로불린이다. 대부분의 경우, 인간화된 항체는 수용자의 초가변 영역(또한 CDR)으로부터의 잔기가 요망되는 특이성, 친화성 및 능력을 갖는 비인간(예를 들어, 설치류) 종(공여자 항체), 예를 들어 마우스, 래트, 햄스터 또는 토끼의 초가변 영역으로부터의 잔기로 교체되는 인간 면역글로불린(수용자 항체)이다. 일부 예에서, 인간 면역글로불린의 Fv 프레임워크 영역(FR) 잔기가 상응하는 비인간 잔기로 교체된다. 더 나아가, 본원에 사용되는 바와 같은 "인간화된 항체"는 또한 수용자 항체에서도 공여자 항체에서도 발견되지 않는 잔기를 포함할 수 있다. 이들 변형은 항체 성능을 추가로 개선하고 최적화하기 위해 이루어진다. 인간화된 항체는 또한, 전형적으로 인간 면역글로불린의 것인, 면역글로불린 불변 영역(Fc)의 적어도 일부를 포함할 수 있다. 더 상세한 것은 Jones et al., Nature, 321: 522-525 (1986); Reichmann et al., Nature, 332: 323-329 (1988); 및 Presta, Curr. Op. Struct. Biol., 2: 593-596 (1992)을 참조한다.
인간화된 항체 또는 이의 단편은 항원 결합에 직접적으로 수반되지 않는 Fv 가변 도메인의 서열을 인간 Fv 가변 도메인으로부터의 동등한 서열로 교체함으로써 생성될 수 있다. 인간화된 항체 또는 이의 단편을 생성하는 예시적인 방법은 Morrison (1985) Science 229:1202-1207; Oi et al. (1986) BioTechniques 4:214; 그리고 US 5,585,089; US 5,693,761; US 5,693,762; US 5,859,205; 및 US 6,407,213에 의해 제공된다. 이들 방법은 중쇄 또는 경쇄 중 적어도 하나로부터의 면역글로불린 Fv 가변 도메인의 전부 또는 일부를 암호화하는 핵산 서열을 분리하고, 조작하고 발현시키는 것을 포함한다. 이러한 핵산은 위에 기술한 바와 같이, 사전 결정된 표적에 대해서뿐만 아니라 다른 공급원으로부터의 항체를 생산하는 하이브리도마로부터 얻을 수 있다. 다음에, 인간화된 항체 분자를 암호화하는 재조합 DNA는 적절한 발현 벡터로 클로닝될 수 있다.
인간화된 항체는 또한 인간 중쇄 및 경쇄 유전자를 발현하지만, 내인성 마우스 면역글로불린 중쇄 및 경쇄 유전자를 발현할 수 없는 마우스와 같은 유전자이식 동물을 사용하여 생산될 수 있다. 윈터(Winter)는 본원에 기술되는 인간화된 항체를 제조하기 위해 사용될 수 있는 예시적인 CDR 접합 방법을 기술한다(미국 특허 번호 5,225,539). 특정 인간 항체의 모든 CDR은 비인간 CDR의 적어도 일부로 교체될 수 있거나, 단지 일부의 CDR이 비인간 CDR로 교체될 수 있다. 단지 사전 결정된 항원에 대한 인간화된 항체의 결합에 요구되는 수의 CDR을 교체하는 것이 필요하다.
인간화된 항체는 보존적 치환, 공통 서열 치환, 생식계열 치환 및/또는 복귀 돌연변이의 도입에 의해 최적화될 수 있다. 이와 같이 변경된 면역글로불린 분자는 당업계에 공지된 임의의 몇 가지 기법에 의해 제조될 수 있다(예를 들어, Teng et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 80: 7308-7312, 1983; Kozbor et al., Immunology Today, 4: 7279, 1983; Olsson et al., Meth. Enzymol., 92: 3-16, 1982, 및 EP 239 400).
용어 "인간 항체", "인간 항체 구축물" 및 "인간 결합 도메인"은, 예를 들어 Kabat et al. (1991)(앞서의 인용 문헌)에 의해 기술된 것을 포함하는, 당업계에 공지된 인간 생식계열 면역글로불린 서열에 실질적으로 상응하는 가변 및 불변 영역 또는 도메인과 같은 항체 영역을 갖는 항체, 항체 구축물 및 결합 도메인을 포함한다. 본 발명의 인간 항체, 항체 구축물 또는 결합 도메인은, 예를 들어 CDR에서, 그리고 특히 CDR3에서 인간 생식계열 면역글로불린 서열에 의해 암호화되지 않은 아미노산 잔기(예를 들어, 시험관내 무작위 또는 부위-특이적 돌연변이유발에 의하거나 생체내 체세포 돌연변이에 의해 도입되는 돌연변이)를 포함할 수 있다. 인간 항체, 항체 구축물 또는 결합 도메인은 인간 생식계열 면역글로불린 서열에 의해 암호화되지 않는 아미노산 잔기로 교체되는 적어도 1, 2, 3, 4, 또는 5개 이상의 위치를 가질 수 있다. 그러나, 본원에서 사용되는 인간 항체, 항체 구축물 및 결합 도메인의 정의는 또한, 제노마우스(Xenomouse)와 같은 기술 또는 시스템을 사용함으로써 유도될 수 있는 것으로서 항체의 비인공 및/또는 유전적으로 변경된 인간 서열만을 포함하는 "완전 인간 항체"를 고려한다. 바람직하게는, "완전 인간 항체"는 인간 생식계열 면역글로불린 서열에 의해 암호화되지 않는 아미노산 잔기를 포함하지 않는다.
일부 구현예에서, 본 발명의 항체 구축물은 "분리된" 또는 "실질적으로 순수한" 항체 구축물이다. 본원에 개시되는 항체 구축물을 기술하기 위해 사용될 때, "분리된" 또는 "실질적으로 순수한"은 이의 생산 환경의 구성요소로부터 확인, 분리 및/또는 회수된 항체 구축물을 의미한다. 바람직하게는, 항체 구축물은 이의 생산 환경으로부터의 모든 다른 구성요소와 관련이 없거나 실질적으로 없다. 이의 생산 환경의 오염물 구성요소, 예를 들어 재조합 형질감염 세포로부터 초래된 것은 폴리펩티드에 대한 진단 또는 치료 용도를 전형적으로 방해할 물질이고, 효소, 호르몬 및 다른 단백질성 또는 비단백질성 용질을 포함할 수 있다. 항체 구축물은 주어진 샘플에서, 예를 들어 총 단백질의 적어도 약 5 중량%, 또는 적어도 약 50 중량%를 구성할 수 있다. 분리된 단백질은 환경에 따라 총 단백질 함량의 5 내지 99.9 중량%를 구성할 수 있다. 폴리펩티드는 그것이 증가된 농도 수준으로 만들어지도록 유도성 프로모터 또는 고발현 프로모터의 사용을 통해 상당히 더 높은 농도로 만들어질 수 있다. 본 정의는 당업계에 공지된 매우 다양한 유기체 및/또는 숙주 세포에서의 항체 구축물의 생산을 포함한다. 바람직한 구현예에서, 항체 구축물은 (1) 스피닝 컵 서열분석장치(sequenator)의 사용에 의해 N-말단의 또는 내부 아미노산 서열의 적어도 15개 잔기를 얻기에 충분한 정도로, 또는 (2) 쿠마시 블루 또는, 바람직하게는 은 염색을 사용하는 비환원 또는 환원 조건 하에서의 SDS-PAGE에 의한 균질성 정도로 정제될 것이다. 그러나, 보통 분리된 항체 구축물은 적어도 하나의 정제 단계에 의해 제조될 것이다.
용어 "결합 도메인"은 본 발명과 관련하여 각각 표적 분자(항원), 예를 들어 CD33 및 CD3에서 주어진 표적 에피토프 또는 주어진 표적 측에 (특이적으로) 결합하고/이와 상호작용하고/이를 인식하는 도메인을 특성화한다. 제1 결합 도메인(예를 들어, CD33을 인식)의 구조 및 기능, 그리고 바람직하게는 또한 제2 결합 도메인(CD3을 인식)의 구조 및/또는 기능은 항체의, 예를 들어, 전장 또는 전체 면역글로불린 분자의 구조 및/또는 기능을 기반으로 하고/하거나 항체 또는 이의 단편의 가변 중쇄(VH) 및/또는 가변 경쇄(VL) 도메인으로부터 유도된다. 바람직하게는, 제1 결합 도메인은 3개의 경쇄 CDR(즉, VL 영역의 CDR1, CDR2 및 CDR3) 및/또는 3개의 중쇄 CDR(즉, VH 영역의 CDR1, CDR2 및 CDR3)의 존재를 특징으로 한다. 제2 결합 도메인은 바람직하게는 또한, 표적 결합을 허용하는 항체의 최소 구조적 요건을 포함한다. 더욱 바람직하게는, 제2 결합 도메인은 적어도 3개의 경쇄 CDR(즉, VL 영역의 CDR1, CDR2 및 CDR3) 및/또는 3개의 중쇄 CDR(즉, VH 영역의 CDR1, CDR2 및 CDR3)을 포함한다. 제1 및/또는 제2 결합 도메인은 이미 존재하는 (단클론) 항체로부터의 CDR 서열을 스캐폴드에 접합시키기보다는 파지-디스플레이 또는 라이브러리 선별 방법에 의해 생산되거나 얻어질 수 있을 것으로 고려된다.
본 발명에 따르면, 결합 도메인은 하나 이상의 폴리펩티드의 형태이다. 이러한 폴리펩티드는 단백질 부분 및 비단백질 부분(예를 들어, 글루타르알데히드와 같은 화학적 링커 또는 화학적 가교제)을 포함할 수 있다. (보통 30개 미만의 아미노산을 갖는 이의 단편, 바람직하게는 생물학적으로 활성인 단편 및 펩티드를 포함하는) 단백질은 공유 펩티드 결합을 통해 서로 결합되는 2개 이상의 아미노산을 포함한다(아미노산 쇄를 초래함).
본원에서 사용되는 용어 "폴리펩티드"는 통상적으로 30개 초과의 아미노산으로 구성되는 분자의 군을 기술한다. 폴리펩티드는 추가로 다량체, 예를 들어 이량체, 삼량체 및 더 고차의 올리고머를 형성할 수 있고, 즉, 하나 초과의 폴리펩티드 분자로 구성된다. 이러한 이량체, 삼량체 등을 형성하는 폴리펩티드 분자는 동일하거나 동일하지 않을 수 있다. 이러한 다량체의 상응하는 더 고차의 구조는, 결과적으로 호모- 또는 헤테로이량체, 호모- 또는 헤테로삼량체 등으로 지칭된다. 헤테로다량체의 예는, 이의 천연적으로 존재하는 형태에서 2개의 동일한 폴리펩티드 경쇄 및 2개의 동일한 폴리펩티드 중쇄로 구성되는 항체 분자이다. 용어 "펩티드", "폴리펩티드" 및 "단백질"은 또한 천연적으로 변형된 펩티드/폴리펩티드/단백질을 지칭하는데, 여기에서 변형은, 예를 들어 글리코실화, 아세틸화, 인산화 등과 같은 번역후 변형에 의해 시행된다. "펩티드", "폴리펩티드" 또는 "단백질"은 본원에서 지칭될 때 페길화(pegylated)와 같이 화학적으로 변형될 수도 있다. 이러한 변형은 당업계에 잘 알려져 있고, 본원에서 다음에 기술된다.
바람직하게는 표적 세포 표면 항원에 결합하는 결합 도메인 및/또는 CD3ε에 결합하는 결합 도메인은 인간 결합 도메인이다. 적어도 하나의 인간 결합 도메인을 포함하는 항체 및 항체 구축물은 설치류(예를 들어, 뮤린, 래트, 햄스터 또는 토끼)와 같은 비인간 가변 및/또는 불변 영역을 갖는 항체 또는 항체 구축물와 관련된 일부 문제를 피할 수 있다. 이러한 설치류 유래 단백질의 존재는 항체 또는 항체 구축물의 신속한 제거를 야기할 수 있거나 환자에 의한 항체 또는 항체 구축물에 대한 면역 반응의 생성을 초래할 수 있다. 설치류 유래 항체 또는 항체 구축물의 사용을 피하기 위해, 인간 또는 완전 인간 항체/항체 구축물은 설치류가 완전 인간 항체를 생산하도록 설치류에 인간 항체 기능을 도입하는 것을 통해 생성될 수 있다.
YAC에서 메가베이스-크기 인간 좌위를 클로닝 및 재구성하고, 이들을 마우스 생식계열로 도입하는 능력은 매우 크거나 조잡하게 매핑된 좌위의 기능적 구성요소를 설명하는 것뿐만 아니라 인간 질환의 유용한 모델을 생성하는 것에 대한 강력한 접근법을 제공한다. 더 나아가, 마우스 좌위를 이들의 인간 동등물로 치환하기 위해 이러한 기술을 사용하는 것은 개발 중 인간 유전자 산물의 발현 및 조절, 이들의 다른 시스템과의 통신, 그리고 질환 유도 및 진행에서 이들의 연루에 대한 독특한 통찰을 제공할 수 있을 것이다.
이러한 전략의 중요한 실용적인 적용은 마우스 체액 면역계의 "인간화"이다. 내인성 Ig 유전자가 불활성화된 마우스 내로 인간 면역글로불린(Ig) 좌위를 도입하는 것은 프로그래밍된 항체의 발현 및 조립의 기저를 이루는 기전뿐만 아니라 B-세포 발생에서 이들의 역할을 연구하는 기회를 제공한다. 더 나아가, 이러한 전략은 완전 인간 단클론 항체(mAb)의 생산 - 인간 질환에서 항체 요법의 가능성 충족을 향한 중요한 단계를 위한 이상적인 공급원을 제공할 수 있을 것이다. 완전 인간 항체 또는 항체 구축물은 마우스 또는 마우스-유도체화된 mAb에 대한 고유의 면역원성 및 알레르기 반응을 최소화하고, 따라서 투여된 항체/항체 구축물의 효능 및 안전성을 증가시킬 것으로 예상된다. 완전 인간 항체 또는 항체 구축물의 사용은 반복된 화합물 투여가 필요한 만성 및 재발성 인간 질환, 예를 들어 염증, 자가면역, 및 암의 치료에서 실질적인 이점을 제공할 것으로 예상될 수 있다.
이 목적을 향한 하나의 접근법은 마우스 항체의 부재 중에 이러한 마우스가 인간 항체의 큰 레퍼토리를 생산하도록 기대하면서, 인간 Ig 좌위의 큰 단편을 가지고 마우스 항체 생산이 결핍된 마우스 혈통을 조작하는 것이었다. 큰 인간 Ig 단편은 큰 가변 유전자 다양성뿐만 아니라 항체 생산 및 발현의 적절한 조절을 보존할 것이다. 항체 다양화 및 선택을 위한 마우스 기작 및 인간 단백질에 대한 면역학적 용인의 결여를 이용함으로써, 이들 마우스 혈통에서 복제된 인간 항체 레퍼토리는 인간 항원을 포함하는 임의의 관심 대상 항원에 대해 고친화성 항체를 산출할 것이다. 하이브리도마 기술을 사용하여, 요망되는 특이성을 갖는 항원-특이적 인간 mAb가 쉽게 생산 및 선택될 수 있다. 이러한 전반적 전략은 최초 제노마우스(XenoMouse) 마우스 혈통의 생성과 관련하여 입증되었다(Green et al. Nature Genetics 7:13-21 (1994) 참조). 제노마우스 혈통은 코어 가변 및 불변 영역 서열을 포함하는, 각각 인간 중쇄 좌위 및 카파 경쇄 좌위의 245 kb 및 190 kb-크기 생식계열 배열 단편을 포함하는 효모 인공 염색체(YAC)를 가지고 조작되었다. 인간 Ig를 포함하는 YAC는 항체의 재배열과 발현 둘 다를 위한 마우스 시스템에 적합한 것으로 입증되었고, 비활성화된 마우스 Ig 유전자를 치환할 수 있었다. 이는 B 세포 발생을 유도하고, 완전 인간 항체의 성인-유사 인간 레퍼토리를 생산하고, 항원-특이적 인간 mAb를 생성하는 이들의 능력에 의해 입증되었다. 이들 결과는 또한 더 많은 수의 V 유전자, 추가적인 조절 요소, 및 인간 Ig 불변 영역을 포함하는 인간 Ig 좌위의 더 큰 부분의 도입이, 감염 및 면역화에 대한 인간 체액성 반응을 특징으로 하는 실질적으로 완전한 레퍼토리를 개괄할 수 있을 것임을 시사하였다. Green 등의 작업은 최근에 각각 인간 중쇄 좌위 및 카파 경쇄 좌위의 메가베이스 크기의, 생식계열 배열 YAC 단편의 도입을 통해 인간 항체 레퍼토리의 대략 80%보다 더 큰 도입으로 확장되었다. Mendez et al. Nature Genetics 15:146-156 (1997) 및 미국 특허 출원 번호 08/759,620 참조.
제노마우스(XenoMouse) 마우스의 생산은 미국 특허 출원 번호 07/466,008, 07/610,515, 07/919,297, 07/922,649, 08/031,801, 08/112,848, 08/234,145, 08/376,279, 08/430,938, 08/464,584, 08/464,582, 08/463,191, 08/462,837, 08/486,853, 08/486,857, 08/486,859, 08/462,513, 08/724,752, 및 08/759,620; 그리고 미국 특허 번호 6,162,963; 6,150,584; 6,114,598; 6,075,181, 및 5,939,598 그리고 일본 특허 번호 3 068 180 B2, 3 068 506 B2, 및 3 068 507 B2에 추가로 논의되고 기술되어 있다. 또한, Mendez et al. Nature Genetics 15:146-156 (1997) 및 Green and Jakobovits J. Exp. Med. 188:483-495 (1998), EP 0 463 151 B1, WO 94/02602, WO 96/34096, WO 98/24893, WO 00/76310, 및 WO 03/47336 참조.
대안의 접근법에서, 젠팜 인터네셔날 인코포레이티드(GenPharm International, Inc.)를 포함하는 다른 것들은 "미니좌위(minilocus)" 접근법을 이용하였다. 미니좌위 접근법에서, 외인성 Ig 좌위는 Ig 좌위로부터의 조각(개개 유전자)의 포함을 통해 모방된다. 따라서, 하나 이상의 VH 유전자, 하나 이상의 DH 유전자, 하나 이상의 JH 유전자, 뮤 불변 영역, 및 제2 불변 영역(바람직하게는 감마 불변 영역)은 동물 내로의 삽입을 위한 구축물로 형성된다. 이 접근법은 미국 특허 번호 5,545,807(Surani 등) 및 미국 특허 번호 5,545,806; 5,625,825; 5,625,126; 5,633,425; 5,661,016; 5,770,429; 5,789,650; 5,814,318; 5,877,397; 5,874,299; 및 6,255,458(각각 Lonberg 및 Kay), 미국 특허 번호 5,591,669 및 6,023.010(Krimpenfort 및 Berns), 미국 특허 번호 5,612,205; 5,721,367; 및 5,789,215(Berns 등), 및 미국 특허 번호 5,643,763(Choi 및 Dunn), 그리고 GenPharm International의 미국 특허 출원 번호 07/574,748, 07/575,962, 07/810,279, 07/853,408, 07/904,068, 07/990,860, 08/053,131, 08/096,762, 08/155,301, 08/161,739, 08/165,699, 08/209,741에 기술되어 있다. 또한, EP 0 546 073 B1, WO 92/03918, WO 92/22645, WO 92/22647, WO 92/22670, WO 93/12227, WO 94/00569, WO 94/25585, WO 96/14436, WO 97/13852, 및 WO 98/24884 및 미국 특허 번호 5,981,175 참조. 추가로 Taylor et al. (1992), Chen et al. (1993), Tuaillon et al. (1993), Choi et al. (1993), Lonberg et al. (1994), Taylor et al. (1994), 및 Tuaillon et al. (1995), Fishwild et al. (1996) 참조.
기린(Kirin)은 또한, 마이크로셀 융합을 통해 거대 조각의 염색체 또는 전체 염색체가 도입된 마우스로부터의 인간 항체의 생성을 입증하였다. 유럽 특허 출원 번호 773 288 및 843 961 참조. 제네렉스 바이오사이언시즈(Xenerex Biosciences)는 인간 항체의 잠재적 생성을 위한 기술을 개발 중에 있다. 이 기술에서, SCID 마우스는 인간 림프 세포, 예를 들어, B 및/또는 T 세포로 재구성된다. 이어서, 마우스는 항원으로 면역화되고 이 항원에 대한 면역 반응을 생성할 수 있다. 미국 특허 번호 5,476,996; 5,698,767; 및 5,958,765 참조.
인간 항-마우스 항체(HAMA) 반응은 키메라 또는 달리 인간화된 항체를 제조하기 위한 산업으로 이어졌다. 그러나, 특정 인간 항-키메라 항체(HACA) 반응이 특히 항체의 만성 또는 다회 용량 이용에서 관찰될 것으로 예상된다. 따라서, HAMA 또는 HACA 반응의 우려 및/또는 영향을 떨어뜨리기 위해 표적 세포 표면 항원에 대한 인간 결합 도메인 및 CD3ε에 대한 인간 결합 도메인을 포함하는 항체 구축물을 제공하는 것이 바람직할 것이다.
용어 "에 (특이적으로) 결합하다", (특이적으로) 인식하다", "로 (특이적으로) 지시되다", 및 "와 (특이적으로) 반응하다"는 본 발명에 따르면 결합 도메인이 표적 분자(항원)(여기에서: 각각 표적 세포 표면 항원 및 CD3ε)에서 주어진 에피토프 또는 주어진 표적 측과 상호작용하거나 특이적으로 상호작용하는 것을 의미한다.
용어 "에피토프"는 결합 도메인, 예를 들어 항체 또는 면역글로불린, 또는 항체 또는 면역글로불린의 유도체, 단편 또는 변이체가 특이적으로 결합하는 항원 측을 지칭한다. "에피토프"는 항원성이며, 따라서 용어 에피토프는 때때로 본원에서 "항원 구조" 또는 "항원 결정기"로도 지칭된다. 따라서, 결합 도메인은 "항원 상호작용 측"이다. 상기 결합/상호작용은 또한 "특이적 인식"을 정의하는 것으로 이해된다.
"에피토프"는 인접 아미노산 또는 단백질의 3차 접힘에 의해 나란히 놓이는 비인접 아미노산 둘 다에 의해 형성될 수 있다. "선형 에피토프"는 아미노산 1차 서열이 인식된 에피토프를 포함하는 에피토프이다. 선형 에피토프는 독특한 서열에서 전형적으로 적어도 3 또는 적어도 4, 그리고 보통 적어도 5 또는 적어도 6 또는 적어도 7, 예를 들어, 약 8 내지 약 10개의 아미노산을 포함한다.
선형 에피토프와 대조적으로 "입체형태 에피토프"는 에피토프를 포함하는 아미노산의 1차 서열이 인식된 에피토프를 유일하게 정의하는 구성요소가 아닌 에피토프(예를 들어, 아미노산의 1차 서열이 결합 도메인에 의해 반드시 인식되지는 않는 에피토프)이다. 전형적으로 입체형태 에피토프는 선형 에피토프에 비해 증가된 수의 아미노산을 포함한다. 입체형태 에피토프의 인식에 대해서는, 결합 도메인이 항원, 바람직하게는 펩티드 또는 단백질 또는 이의 단편의 3차원 구조를 인식한다(본 발명의 맥락에서, 결합 도메인 중 하나에 대한 항원 구조는 표적 세포 표면 항원 단백질 내에 포함됨). 예를 들어, 단백질 분자가 3차원 구조를 형성하기 위해 접힐 때, 입체형태 에피토프를 형성하는 특정 아미노산 및/또는 폴리펩티드 골격은 항체가 에피토프를 인식하는 것을 가능하게 하도록 나란히 놓이게 된다. 에피토프의 입체형태를 결정하는 방법은 x-선 결정학, 2차원 핵 자기 공명(2D-NMR) 분광학 및 부위 지정 스핀 표지법 및 전자 상자성 공명(electron paramagnetic resonance: EPR) 분광학을 포함하지만, 이로 한정되지 않는다.
에피토프 매핑을 위한 방법은 다음에 기술된다: 인간 표적 세포 표면 항원 단백질에서 영역(인접 아미노산 스트레치(stretch))이 비인간 및 비영장류 표적 세포 표면 항원(예를 들어, 마우스 표적 세포 표면 항원, 그러나 닭, 래트, 햄스터, 토끼 등과 같은 다른 것들이 또한 예상 가능할 수 있음)의 이의 상응하는 영역으로 교환/교체될 때, 사용된 비인간, 비영장류 표적 세포 표면 항원과 결합 도메인이 교차-반응성이지 않는 한, 결합 도메인의 결합 저하가 일어날 것으로 예상된다. 상기 저하는 바람직하게는 인간 표적 세포 표면 항원 단백질에서 각각의 영역에 대한 결합에 비해 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 또는 50%; 더욱 바람직하게는 적어도 60%, 70%, 또는 80%, 그리고 가장 바람직하게는 90%, 95% 또는 심지어 100%이고, 이에 의해 인간 표적 세포 표면 항원 단백질에서 각각의 영역에 대한 결합은 100%로 설정된다. 전술한 인간 표적 세포 표면 항원/비인간 표적 세포 표면 항원 키메라는 CHO 세포에서 발현되는 것으로 고려된다. 또한, 인간 표적 세포 표면 항원/비인간 표적 세포 표면 항원 키메라는 EpCAM과 같은 상이한 막-결합 단백질의 막관통 도메인 및/또는 세포질 도메인과 융합되는 것으로 고려된다.
에피토프 매핑을 위한 대안의 또는 추가적인 방법에서, 결합 도메인에 의해 인식되는 특정 영역을 결정하기 위해 인간 표적 세포 표면 항원 세포외 도메인의 몇 가지 절단된 형태가 생성될 수 있다. 이들 절단된 형태에서, 상이한 세포외 표적 세포 표면 항원 도메인/하위-도메인 또는 영역은 N-말단으로부터 시작해서 단계적으로 결실된다. 절단된 표적 세포 표면 항원 형태는 CHO 세포에서 발현될 수 있는 것으로 고려된다. 또한, 절단된 표적 세포 표면 항원 형태는 EpCAM과 같은 상이한 막-결합 단백질의 막관통 도메인 및/또는 세포질 도메인과 융합될 수 있는 것으로 고려된다. 또한, 절단된 표적 세포 표면 항원 형태는 이들의 N-말단에서 신호 펩티드 도메인, 예를 들어 마우스 IgG 중쇄 신호 펩티드로부터 유래된 신호 펩티드를 포함할 수 있는 것으로 고려된다. 더 나아가, 절단된 표적 세포 표면 항원 형태는 이들의 N-말단에서 (신호 펩티드 다음) 세포 표면에서의 이들의 정확한 발현을 입증하는 것을 허용하는 v5 도메인을 포함할 수 있는 것으로 고려된다. 결합의 저하 또는 손실은 결합 도메인에 의해 인식되는 표적 세표 표면 항원 영역을 더 이상 포함하지 않는 이들 절단된 표적 세포 표면 항원 형태에서 일어나는 것으로 예상된다. 결합의 저하는 바람직하게는 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 50%; 더욱 바람직하게는 적어도 60%, 70%, 80%, 그리고 가장 바람직하게는 90%, 95% 또는 심지어 100%이며, 이에 의해 전체 인간 표적 세포 표면 항원 단백질(또는 이의 세포외 영역 또는 도메인)에 대한 결합은 100로 설정된다.
항체 구축물 또는 결합 도메인에 의한 인식에 대한 표적 세포 표면 항원의 특정 잔기의 기여도를 결정하는 추가의 방법은 알라닌 스캐닝(예를 들어, Morrison KL & Weiss GA. Cur Opin Chem Biol. 2001 Jun;5(3):302-7 참조)으로, 여기에서 분석되는 각각의 잔기는, 예를 들어 부위-지정 돌연변이유발을 통해 알라닌으로 교체된다. 알라닌은 부피가 크지 않고, 화학적으로 불활성인, 메틸 작용기(그럼에도 불구하고 다수의 다른 아미노산이 갖는 2차 구조 기준을 모방하는)라는 점에서 사용된다. 때때로, 발린 또는 류신과 같이 부피가 큰 아미노산은 돌연변이 잔기의 크기 보존이 요망되는 경우에 사용될 수 있다. 알라닌 스캐닝은 긴 기간 동안 사용되어온 성숙한 기술이다.
결합 도메인과 에피토프 또는 에피토프를 포함하는 영역 사이의 상호작용은 결합 도메인이 특정 단백질 또는 항원(여기에서: 각각 표적 세포 표면 항원 및 CD3)에서 에피토프/에피토프를 포함하는 영역에 대한 주목할 만한 친화성을 나타내고, 일반적으로, 표적 세포 표면 항원 또는 CD3 이외의 단백질 또는 항원과 유의미한 반응성을 나타내지 않음을 시사한다. "주목할 만한 친화성"은 약 10-6 M(KD) 또는 더 강한 친화성으로 결합하는 것을 포함한다. 바람직하게는, 결합 친화성이 약 10-12 내지 10-8 M, 10-12 내지 10-9 M, 10-12 내지 10-10 M, 10-11 내지 10-8 M, 바람직하게는 약 10-11 내지 10-9 M일 때 결합이 특이적인 것으로 고려된다. 결합 도메인이 특이적으로 표적과 반응하거나 표적에 결합하는지 여부는, 그 중에서도 상기 결합 도메인과 표적 단백질 또는 항원과의 반응을, 상기 결합 도메인과 표적 세포 표면 항원 또는 CD3 이외의 단백질 또는 항원과의 반응과 비교함으로써 용이하게 시험할 수 있다. 바람직하게는, 본 발명의 결합 도메인은 표적 세포 표면 항원 또는 CD3 이외의 단백질 또는 항원에 본질적으로 또는 실질적으로 결합하지 않는다(즉, 제1 결합 도메인은 표적 세포 표면 항원 이외의 단백질에 결합할 수 없고, 제2 결합 도메인은 CD3 이외의 단백질에 결합할 수 없다). 다른 HLE 형식에 비해 우수한 친화성 특징을 갖는 것이 본 발명에 따른 항체 구축물의 예상되는 특징이다. 결과적으로, 이러한 우수한 친화성은 생체내 연장된 반감기를 시사한다. 본 발명에 따른 항체 구축물의 더 긴 반감기는 전형적으로 개선된 환자 순응도에 기여하는 투여의 지속기간 및 빈도를 감소시킬 수 있다. 본 발명의 항체 구축물은 매우 쇠약하거나 심지어 다중질환(multimorbid) 암 환자에 대해 특히 유리하기 때문에 이것은 특히 중요하다.
용어 "본질적으로/실질적으로 결합하지 않는" 또는 "결합할 수 없는"은 본 발명의 결합 도메인이 표적 세포 표면 항원 또는 CD3 이외의 단백질 또는 항원에 결합하지 않고, 즉 표적 세포 표면 항원 또는 CD3 이외의 단백질 또는 항원과 30% 이하, 바람직하게는 20% 이하, 더욱 바람직하게는 10% 이하, 특히 바람직하게는 9%, 8%, 7%, 6% 또는 5% 이하의 반응성을 나타내고, 이에 의해 각각 표적 세포 표면 항원 또는 CD3에 대한 결합이 100%로 설정되는 것을 의미한다.
특이적 결합은 결합 도메인 및 항원의 아미노산 서열에서 특이적 모티프에 의해 수행될 것으로 여겨진다. 따라서, 결합은 이들의 1차, 2차 및/또는 3차 구조의 결과뿐만 아니라 상기 구조의 2차 변형의 결과로서 달성된다. 항원-상호작용-측과 이의 특이적 항원의 특이적 상호작용은 항원에 대한 상기 측의 단순한 결합을 초래할 수 있다. 게다가, 항원-상호작용-측과 이의 특이적 항원의 특이적 상호작용은 대안적으로 또는 추가적으로, 예를 들어, 항원의 입체형태 변화, 항원의 올리고머화 등의 유도에 기인하여 신호의 개시를 초래할 수 있다.
용어 "가변"은 이들의 서열에서 가변성을 나타내고 특정 항체의 특이성 및 결합 친화성을 결정하는 데 연루되는 항체 또는 면역글로불린 도메인의 일부(즉, "가변 도메인(들)")를 지칭한다. 가변 중쇄(VH) 및 가변 경쇄(VL)의 쌍은 함께 단일 항원 결합 측을 형성한다.
가변성은 항체의 가변 도메인 전체에 걸쳐 균일하게 분포되지 않으며; 이는 각각의 중쇄 및 경쇄 가변 영역의 하위-도메인에 집중된다. 이들 하위-도메인은 "초가변 영역" 또는 "상보성 결정 영역"(CDR)으로 불린다. 가변 도메인의 더 보존된(즉, 비-초가변) 부분은 "프레임워크" 영역(FRM 또는 FR)으로 불리고, 항원-결합 표면을 형성하기 위한 3차원 공간에서 6개의 CDR에 대한 스캐폴드를 제공한다. 천연적으로 존재하는 중쇄 및 경쇄의 가변 도메인은 각각, 루프 연결을 형성하고, 일부 경우에 β-시트 구조의 부분을 형성하는, 3개의 초가변 영역에 의해 연결되는 β-시트 배열을 주로 채택하는 4개의 FRM 영역(FR1, FR2, FR3, 및 FR4)을 포함한다. 각각의 쇄에서 초가변 영역은 FRM에 의해 근위에서, 그리고 다른 쇄로부터의 초가변 영역과 함께 유지되고, 항원-결합 측의 형성에 기여한다(앞서 인용한 Kabat et al., 참조).
용어 "CDR" 및 이의 복수 "CDR들"은 상보성 결정 영역을 지칭하는데, 이중 3개는 경쇄 가변 영역의 결합 특징을 구성하고(CDR-L1, CDR-L2 및 CDR-L3), 3개는 중쇄 가변 영역의 결합 특징을 구성한다(CDR-H1, CDR-H2 및 CDR-H3). CDR은 항체와 항원의 특이적 상호작용에 책임이 있는 잔기의 대부분을 포함하고, 따라서 항체 분자의 기능적 활성에 기여하고; 이들은 항원 특이성의 주된 결정기이다.
정확한 정의의 CDR 경계 및 길이는 상이한 분류 및 넘버링 시스템의 대상이다. 따라서 CDR은 카바트(Kabat), 코티아(Chothia), 접촉 또는 본원에 기재된 넘버링 시스템을 포함하는 임의의 다른 경계 정의에 의해 지칭될 수 있다. 경계를 달리함에도 불구하고, 각각의 이들 시스템은 가변 서열 내에서 소위 "초가변 영역"을 구성하는 것과 어느 정도의 중복을 갖는다. 따라서 이들 시스템에 따른 CDR 정의는 인접 프레임워크 영역에 대해 길이 및 경계 면적이 다를 수 있다. 예를 들어 카바트(교차종 서열 가변성을 기반으로 하는 접근법), 코티아(항원-항체 복합체의 결정학적 연구를 기반으로 하는 접근법), 및/또는 맥컬럼(MacCallum)(앞서 인용한 Kabat et al.,; Chothia et al., J. MoI. Biol, 1987, 196: 901-917; 및 MacCallum et al., J. MoI. Biol, 1996, 262: 732) 참조. 항원 결합 측을 특성화하기 위한 또 다른 표준은 옥스포드 분자 AbM 항체 모델링 소프트웨어(Oxford Molecular's AbM antibody modeling software)에 의해 사용되는 AbM 정의이다. 예를 들어, Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains. In: Antibody Engineering Lab Manual (Ed.: Duebel, S. and Kontermann, R., Springer-Verlag, Heidelberg) 참조. 2개의 잔기 확인 기법이 동일한 영역은 아니지만, 중복 영역을 정의할 정도까지, 이들은 하이브리드 CDR을 정의하도록 조합될 수 있다. 그러나, 소위 말하는 카바트 시스템에 따른 넘버링이 바람직하다.
전형적으로, CDR은 기본형 구조로서 분류될 수 있는 루프 구조를 형성한다. 용어 "기본형(canonical) 구조"는 항원 결합(CDR) 루프에 의해 채택되는 주된 쇄 입체형태를 지칭한다. 비교 구조 연구로부터, 6개의 항원 결합 루프 중 5개는 이용 가능한 입체형태의 제한된 레퍼토리만을 가지는 것으로 밝혀졌다. 각각의 기본형 구조는 폴리펩티드 골격의 비틀림 각도에 의해 특성화될 수 있다. 따라서, 항체 사이의 대응 루프는, 대부분의 루프에서의 높은 아미노산 서열 가변성에도 불구하고, 매우 유사한 3차원 구조를 가질 수 있다(Chothia and Lesk, J. Mol. Biol., 1987, 196: 901; Chothia et al., Nature, 1989, 342: 877; Martin and Thornton, J. Mol. Biol, 1996, 263: 800). 더 나아가, 채택된 루프 구조와 그것을 둘러싸는 아미노산 서열 사이에는 관련성이 있다. 특정 기본형 부류의 입체형태는 루프의 길이 및 루프 내에서뿐만 아니라 보존된 프레임워크 내에서(즉, 루프 외부) 핵심 위치에 존재하는 아미노산 잔기에 의해 결정된다. 따라서 특정 기본형 부류에 대한 배치는 이들 핵심 아미노산 잔기의 존재를 기반으로 하여 이루어질 수 있다.
용어 "기본형 구조"는 또한, 예를 들어, 카바트에 의해 목록이 만들어진 항체의 선형 서열에 관한 고려 사항을 포함할 수 있다(위에 인용한 Kabat et al.). 카바트 넘버링 계획(시스템)은 일치되는 방식으로 항체 가변 도메인의 아미노산 잔기를 넘버링하기 위해 널리 채택되는 표준이고, 본원의 다른 곳에 또한 언급된 바와 같이 본 발명에 적용된 바람직한 계획이다. 추가의 구조적 고려 사항은 또한 항체의 기본형 구조를 결정하기 위해 사용될 수 있다. 예를 들어, 카바트 넘버링에 의해 완전히 반영되지 않는 이들 차이는 코티아 등의 넘버링 시스템에 의해 기술될 수 있고/있거나 다른 기법, 예를 들어, 결정학 및 2차원 또는 3차원 컴퓨터 모델링에 의해 밝혀질 수 있다. 따라서, 주어진 항체 서열은, 다른 것들 중에서도, (예를 들어, 라이브러리에서 다양한 기본형 구조를 포함하기 위한 요망을 기반으로 하여) 적절한 새시 서열의 확인을 허용하는 기본형 부류에 놓일 수 있다. 항체 아미노산 서열의 카바트 넘버링 및 코티아 등(위에 인용됨)에 의해 기술된 바와 같은 구조적 고려 사항 및 항체 구조의 기본형 측면을 해석하기 위한 이들의 암시는 문헌에 기술되어 있다. 상이한 부류의 면역글로불린의 서브유닛 구조 및 3차원 입체배치는 당업계에 잘 공지되어 있다. 항체 구조의 검토를 위해서는, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, eds. Harlow et al., 1988을 참조한다.
경쇄의 CDR3 및, 특히 중쇄의 CDR3은 경쇄 및 중쇄 가변 영역 내의 항원 결합에서 가장 중요한 결정기를 구성할 수 있다. 일부 항체 구축물에서, 중쇄 CDR3은 항원과 항체 사이의 주된 접촉 면적을 구성하는 것으로 나타난다. CDR3만이 다른 시험관내 선택 계획은 항체의 결합 특성을 달리 하거나 어느 잔기가 항원 결합에 기여하는지를 결정하기 위해 사용될 수 있다. 따라서, CDR3은 전형적으로 항체-결합 측 내에서 분자 다양성의 가장 큰 공급원이다. 예를 들어, H3은 2개의 아미노산 잔기만큼 짧거나 26개 아미노산보다 클 수 있다.
고전적 전장 항체 또는 면역글로불린에서, 각각의 경쇄(L)는 하나의 공유적 이황화 결합에 의해 중쇄(H)에 연결되는 반면, 2개의 H 쇄는 H 쇄 이소형에 따라 하나 이상의 이황화 결합에 의해 서로 연결된다. VH에 가장 근접한 CH 도메인은 보통 CH1으로 지정된다. 불변("C") 도메인은 항원 결합에 직접적으로 연루되지 않지만, 다양한 효과기 기능, 예를 들어 항체-의존적, 세포-매개 세포독성 및 보체 활성화를 나타낸다. 항체의 Fc 영역은 중쇄 불변 도메인 내에 포함되며, 예를 들어, 세포 표면에 위치된 Fc 수용체와 상호작용할 수 있다.
항체 유전자의 서열은 조립 및 체세포 돌연변이 후에 크게 달라지고, 이들 달라진 유전자는 1010개의 상이한 항체 분자를 암호화하는 것으로 추정된다(Immunoglobulin Genes, 2nd ed., eds. Jonio et al., Academic Press, San Diego, CA, 1995). 따라서, 면역계는 면역글로불린의 레퍼토리를 제공한다. 용어 "레퍼토리"는 적어도 하나의 면역글로불린을 암호화하는 적어도 하나의 서열로부터 전체적으로 또는 부분적으로 유래된 적어도 하나의 뉴클레오티드 서열을 지칭한다. 서열(들)은 중쇄의 V, D 및 J 분절, 및 경쇄의 V 및 J 분절의 생체내 재배열에 의해 생성될 수 있다. 대안적으로, 서열(들)은 재배열이 일어나는, 예를 들어 시험관내 자극에 반응하여 세포로부터 생성될 수 있다. 대안적으로, 서열(들)의 일부 또는 전부는 DNA 스플라이싱, 뉴클레오티드 합성, 돌연변이유발, 및 기타 방법에 의해 얻어질 수 있으며, 예를 들어, 미국 특허 5,565,332를 참조한다. 레퍼토리는 단지 하나의 서열을 포함할 수 있거나 유전적으로 다양한 무리에서 하나를 포함하는 복수의 서열을 포함할 수 있다.
용어 "Fc 부분" 또는 "Fc 단량체"는 본 발명과 관련하여 CH2 도메인의 기능을 갖는 적어도 하나의 도메인 및 면역글로불린 분자의 CH3 도메인의 기능을 갖는 적어도 하나의 도메인을 포함하는 폴리펩티드를 의미한다. "Fc 단량체"라는 용어로부터 명백하게, 이들 CH 도메인을 포함하는 폴리펩티드는 "폴리펩티드 단량체"이다. Fc 단량체는 중쇄의 제1 불변 영역 면역글로불린 도메인(CH1)을 제외하지만, 하나의 CH2 도메인의 적어도 기능적 부분 및 하나의 CH3 도메인의 기능적 부분을 유지하는 면역글로불린의 불변 영역의 적어도 단편을 포함하는 폴리펩티드일 수 있는데, 여기에서 CH2 도메인은 CH3 도메인에 대해 아미노 말단이다. 이 정의의 바람직한 양태에서, Fc 단량체는 Ig-Fc 힌지 영역의 일부, CH2 영역 및 CH3 영역을 포함하는 폴리펩티드 불변 영역일 수 있는데, 여기에서 힌지 영역은 CH2 도메인에 대해 아미노 말단이다. 본 발명의 힌지 영역은 이량체화를 촉진하는 것으로 고려된다. 이러한 Fc 폴리펩티드 분자는, 제한하는 것이 아닌 예를 들어, 면역글로불린 영역의 파파인 분해에 의해 얻어질 수 있다(물론 2개의 Fc 폴리펩티드의 이량체를 초래함). 본 정의의 다른 양태에서, Fc 단량체는 일부의 CH2 영역 및 CH3 영역을 포함하는 폴리펩티드 영역일 수 있다. 이러한 Fc 폴리펩티드 분자는, 제한하는 것이 아닌 예를 들어, 면역글로불린 분자의 펩신 분해에 의해 얻어질 수 있다. 일 구현예에서, Fc 단량체의 폴리펩티드 서열은 IgG1 Fc 영역, IgG2 Fc 영역, IgG3 Fc 영역, IgG4 Fc 영역, IgM Fc 영역, IgA Fc 영역, IgD Fc 영역 및 IgE Fc 영역의 Fc 폴리펩티드 서열과 실질적으로 유사하다.(예를 들어, Padlan, Molecular Immunology, 31(3), 169-217 (1993) 참조). 면역글로불린 사이에 일부 변이가 있기 때문에, 그리고 단지 명확성을 위해, Fc 단량체는 IgA, IgD 및 IgG의 마지막 2개의 중쇄 불변 영역 면역글로불린 도메인, 및 IgE 및 IgM의 마지막 3개의 중쇄 불변 영역 면역글로불린 도메인을 지칭한다. 언급한 바와 같이, Fc 단량체는 또한 이들 도메인에 대해 가요성 힌지 N-말단을 포함할 수 있다. IgA 및 IgM의 경우, Fc 단량체는 J 쇄를 포함할 수 있다. IgG의 경우, Fc 부분은 면역글로불린 도메인 CH2 및 CH3, 및 제1의 2개 도메인과 CH2 사이의 힌지를 포함한다. Fc 부분의 경계는 다를 수 있지만, 기능성 힌지, CH2 및 CH3 도메인을 포함하는 인간 IgG 중쇄 Fc 부분에 대한 예는, 예를 들어, (힌지 도메인의 - 이하의 표 1의 D234에 대응) 잔기 D231 내지 P476, CH3 도메인의 카르복실-말단의 L476(IgG4의 경우)을 각각 포함하는 것으로 정의될 수 있는데, 여기에서 넘버링은 카바트에 따른다. 펩티드 링커를 통해 서로 융합되는 2개 Fc 부분 또는 Fc 단량체는, scFc 도메인으로서 정의될 수도 있는, 본 발명의 항체 구축물의 제3 도메인을 정의한다.
본 발명의 일 구현예에서, 본원에 개시된 바와 같은 scFc 도메인, 각각 서로 융합된 Fc 단량체는 항체 구축물의 제3 도메인에만 포함되는 것으로 고려된다.
본 발명과 관련하여, IgG 힌지 영역은 표 1에 제시된 바와 같은 카바트 넘버링을 사용하여 유추에 의해 확인될 수 있다. 위와 관련하여, 본 발명의 힌지 도메인/영역은 카바트 넘버링에 따라 D234 내지 P243의 IgG1 서열 스트레치에 상응하는 아미노산 잔기를 포함하는 것으로 고려된다. 마찬가지로 본 발명의 힌지 도메인/영역은 IgG1 힌지 서열 DKTHTCPPCP(서열번호: 1449)(아래 표 1에 나타낸 스트레치 D234 내지 P243에 상응함 - 힌지 영역이 여전히 이량체화를 촉진한다면 상기 서열의 변이 또한 고려됨)를 포함하거나 이로 구성되는 것으로 고려된다. 본 발명의 바람직한 구현예에서, 항체 구축물의 제3 도메인에서 CH2 도메인의 카바트 위치 314에서 글리코실화 부위는 N314X 치환에 의해 제거되는데, X는 Q를 제외한 임의의 아미노산이다. 상기 치환은 바람직하게는 N314G 치환이다. 더욱 바람직한 구현예에서, 상기 CH2 도메인은 다음의 치환(카바트에 따른 위치) V321C 및 R309C를 추가로 포함한다(이들 치환은 카바트 위치 309 및 321에서 도메인내 시스테인 이황화 가교를 도입함).
또한, 본 발명의 항체 구축물의 제3 도메인은 아미노에서 카르복실 순서로 다음을 포함하거나 이로 구성되는 것으로 고려된다: DKTHTCPPCP(서열번호: 1449)(즉, 힌지) -CH2-CH3-링커- DKTHTCPPCP(서열번호: 1449)(즉, 힌지) -CH2-CH3. 전술한 항체 구축물의 펩티드 링커는 바람직한 구현예에서 아미노산 서열 Gly-Gly-Gly-Gly-Ser, 즉 Gly4Ser(서열번호: 1), 또는 이의 중합체, 즉 (Gly4Ser)x를 특징으로 하는데, 여기에서 x는 5 이상의 정수(예를 들어 5, 6, 7, 8 등 또는 초과)이고, 6이 바람직하다((Gly4Ser)6). 상기 구축물은 추가로 전술한 치환 N314X, 바람직하게는 N314G, 및/또는 추가의 치환 V321C 및 R309C를 포함할 수 있다. 본원에서 앞서 정의한 바와 같은 본 발명의 항체 구축물의 바람직한 구현예에서, 제2 도메인은 인간 및/또는 마카카 CD3ε 쇄의 세포외 에피토프에 결합하는 것으로 고려된다.
본 발명의 추가의 구현예에서, 힌지 도메인/영역은 IgG2 서브타입 힌지 서열 ERKCCVECPPCP(서열번호: 1450), IgG3 서브타입 힌지 서열 ELKTPLDTTHTCPRCP(서열번호: 1451) 또는 ELKTPLGDTTHTCPRCP(서열번호: 1458), 및/또는 IgG4 서브타입 힌지 서열 ESKYGPPCPSCP(서열번호: 1452)를 포함하거나 이로 구성된다. IgG1 서브타입 힌지 서열은 다음의 것 EPKSCDKTHTCPPCP(표 1에 나타낸 바와 같고 서열번호: 1459)일 수 있다. 따라서 이들 코어 힌지 영역도 본 발명의 맥락에서 고려된다.
IgG CH2 및 IgG CD3 도메인의 위치 및 서열은 표 2에 제시된 바와 같이 카바트 넘버링을 사용하여 유추에 의해 확인될 수 있다:
본 발명의 일 구현예에서, 제1 또는 둘 다의 Fc 단량체의 CH3 도메인에서 강조된 볼드체 아미노산 잔기는 결실된다.
제3 도메인의 폴리펩티드 단량체("Fc 부분" 또는 "Fc 단량체")가 이에 의해 서로 융합되는 펩티드 링커는 바람직하게는 적어도 25개의 아미노산 잔기(25, 26, 27, 28, 29, 30개 등)를 포함한다. 더욱 바람직하게는, 이 펩티드 링커는 적어도 30개의 아미노산 잔기(30, 31, 32, 33, 34, 35개 등)를 포함한다. 링커가 40개까지의 아미노산 잔기, 더욱 바람직하게는 35개까지의 아미노산 잔기, 가장 바람직하게는 정확히 30개의 아미노산 잔기를 포함하는 것도 바람직하다. 이러한 펩티드 링커의 바람직한 구현예는 아미노산 서열 Gly-Gly-Gly-Gly-Ser, 즉 Gly4Ser(서열번호: 1), 또는 이의 중합체, 즉 (Gly4Ser)x를 특징으로 하고, 여기에서 x는 5 이상의 정수(예를 들어 6, 7 또는 8)이다. 바람직하게는, 정수는 6 또는 7이고, 더욱 바람직하게는 정수는 6이다.
제2 도메인에 제1 도메인을, 또는 제3 도메인에 제1 또는 제2 도메인을 융합시키기 위해 링커가 사용되는 경우, 이 링커는 바람직하게는 각각의 제1 및 제2 도메인이 서로 독립적으로 이들의 차별된 결합 특이성을 보유할 수 있음을 보장하기에 충분한 길이 및 서열을 갖는다. 본 발명의 항체 구축물에서 적어도 2개의 결합 도메인(또는 2개의 가변 도메인)을 연결하는 펩티드 링커에서, 이들 펩티드 링커는 단지 소수의 아미노산 잔기, 예를 들어 12개 이하의 아미노산 잔기를 포함하는 것이 바람직하다. 따라서, 12, 11, 10, 9, 8, 7, 6 또는 5개 아미노산 잔기의 펩티드 링커가 바람직하다. 5개 미만의 아미노산을 갖는 고려되는 펩티드 링커는 4, 3, 2 또는 1개의 아미노산(들)을 포함)을 포함하는데, 여기에서는 Gly-풍부 링커가 바람직하다. 제1 도메인과 제2 도메인의 융합을 위한 펩티드 링커의 바람직한 구현예는 서열번호: 1에 도시된다. 제2 도메인과 제3 도메인의 융합을 위한 펩티드 링커의 바람직한 링커 구현예는 (Gly)4-링커, 각각 G4-링커이다.
위에 기술된 "펩티드 링커" 중 하나의 맥락에서 특히 바람직한 "단일" 아미노산은 Gly이다. 따라서, 상기 펩티드 링커는 단일 아미노산 Gly로 구성될 수 있다. 본 발명의 바람직한 구현예에서 펩티드 링커는 아미노산 서열 Gly-Gly-Gly-Gly-Ser, 즉 Gly4Ser(서열번호: 1), 또는 이의 중합체, 즉 (Gly4Ser)x를 특징으로 하는데, 여기에서 x는 1 이상의 정수(예를 들어 2 또는 3)이다. 바람직한 링커는 서열번호: 1 내지 12에 도시된다. 2차 구조의 촉진의 부재를 포함하는 상기 펩티드 링커는 당업계에 알려져 있고, 예를 들어 Dall'Acqua et al.(Biochem. (1998) 37, 9266-9273), Cheadle et al.(Mol Immunol (1992) 29, 21-30) 및 Raag and Whitlow(FASEB (1995) 9(1), 73-80)에 기술되어 있다. 더 나아가 임의의 2차 구조를 촉진하지 않는 펩티드 링커가 바람직하다. 상기 도메인의 서로에 대한 연결은 실시예에서 기술되는 바와 같이, 예를 들어 유전 공학에 의해 제공될 수 있다. 융합되고 작동 가능하게 연결된 이중특이성 단일 쇄 구축물을 제조하고 포유류 세포 또는 박테리아에서 이들을 발현시키는 방법은 당업계에 잘 공지되어 있다(예를 들어, WO 99/54440 또는 Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 2001).
본 발명의 항체 구축물의 바람직한 구현예에서, 제1 및 제2 도메인은 (scFv)2, scFv-단일 도메인 mAb, 다이어바디 및 임의의 이들 형식의 올리고머로 구성되는 군으로부터 선택되는 형식의 항체 구축물을 형성한다.
특히 바람직한 구현예에 따라, 그리고 첨부된 실시예에서 입증되는 바와 같이, 본 발명의 항체 구축물의 제1 및 제2 도메인은 "이중특이성 단일 쇄 항체 구축물", 더욱 바람직하게는 이중특이성 "단일 쇄 Fv"(scFv)이다. Fv 단편의 2개의 도메인, 즉 VL 및 VH는 별개의 유전자에 의해 암호화되지만, 이들은 VL과 VH 영역이 1가 분자를 형성하도록 쌍을 이루는 단일 단백질 쇄로서 이들이 생성되는 것을 가능하게 하는 -전술한 바와 같은- 합성 링커에 의해 재조합 방법을 사용하여 결합될 수 있다; 예를 들어, Huston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci USA 85:5879-5883 참조). 이들 항체 단편은 당업자에게 공지된 통상적인 기법을 사용하여 얻어지며, 단편은 전체 또는 전장 항체와 동일한 방식으로 기능에 대해 평가된다. 따라서 단일-쇄 가변 단편(scFv)은 보통 약 10 내지 약 25개 아미노산, 바람직하게는 약 15 내지 20개 아미노산의 짧은 링커 펩티드와 연결되는 면역글로불린의 중쇄(VH) 및 경쇄(VL)의 가변 영역의 융합 단백질이다. 링커는 보통 가요성을 위해 글리신뿐만 아니라 용해성을 위해 세린 또는 트레오닌이 풍부하고, VH의 N-말단을 VL의 C-말단과 연결하거나, 또는 그 반대일 수 있다. 이 단백질은 불변 영역의 제거 및 링커의 도입에도 불구하고, 본래의 면역글로불린의 특이성을 보유한다.
이중특이성 단일 쇄 항체 구축물은 당업계에 알려져 있고 WO 99/54440, Mack, J. Immunol. (1997), 158, 3965-3970, Mack, PNAS, (1995), 92, 7021-7025, Kufer, Cancer Immunol. Immunother., (1997), 45, 193-197, , Blood, (2000), 95, 6, 2098-2103, , Immunol., (2001), 166, 2420-2426, Kipriyanov, J. Mol. Biol., (1999), 293, 41-56에 기술되어 있다. 단일 쇄 항체의 생산에 대해 기술된 기법(그 중에서도, 미국 특허 4,946,778, 위에 인용된 Kontermann and (2010) 및 위에 인용된 Little(2009) 참조)은 선택된 표적(들)을 특이적으로 인식하는 단일 쇄 항체 구축물을 생산하는 데 적합할 수 있다.
2가(이가로도 불림) 또는 이중특이성 단일-쇄 가변 단편((scFv)2 형식을 갖는 바이-scFv 또는 다이-scFv)은 2개의 scFv 분자를 (예를 들어, 전술한 바와 같은 링커로) 연결하는 것에 의해 조작될 수 있다. 이들 2개의 scFv 분자가 동일한 결합 특이성을 갖는 경우, 생성된 (scFv)2 분자는 바람직하게는 2가로 불릴 것이다(즉, 동일한 표적 에피토프에 대해 2개의 수가(valence)를 가짐). 2개의 scFv 분자가 상이한 결합 특이성을 갖는 경우, 생성된 (scFv)2 분자는 바람직하게는 이중특이성으로 불릴 것이다. 2개의 VH 영역 및 2개의 VL 영역을 갖는 단일 펩티드 쇄를 생산하여, 탠덤 scFv를 수득함으로써 연결이 행해질 수 있다(예를 들어, Kufer P. et al., (2004) Trends in Biotechnology 22(5):238-244 참조). 다른 가능성은 2개의 가변 영역이 함께 접히기에 너무 짧아서 scFv가 이량체화되게 하는 링커 펩티드(예를 들어, 약 5개의 아미노산)를 갖는 scFv 분자의 생성이다. 이 유형은 다이어바디로 알려져 있다(예를 들어, Hollinger, Philipp et al., (July 1993) Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 90 (14): 6444-8 참조).
본 발명과 관련하여, 제1 도메인, 제2 도메인 또는 제1 및 제2 도메인은, 각각 단일 도메인 항체의 가변 도메인 또는 적어도 CDR인 단일 도메인 항체를 포함할 수 있다. 단일 도메인 항체는 다른 V 영역 또는 도메인과 독립적으로 특이적 항체에 선택적으로 결합할 수 있는 단지 하나의(단량체) 항체 가변 도메인을 포함한다. 제1 단일 도메인 항체는 낙타과에서 발견된 중쇄 항체로부터 조작되었고, 이들은 VHH 단편으로 불린다. 연골어류는 또한 VNAR 단편으로 불리는 단일 도메인 항체가 얻어질 수 있는 중쇄 항체(IgNAR)를 갖는다. 대안의 접근법은 공통 면역글로불린으로부터의, 예를 들어 인간 또는 설치류로부터의 이량체 가변 도메인을 단량체로 분할하고, 이에 따라 단일 도메인 Ab로서 VH 또는 VL을 얻는 것이다. 단일 도메인 항체로의 대부분의 연구는 현재 중쇄 가변 도메인을 기반으로 하지만, 경쇄로부터 유래된 나노바디가 또한 표적 에피토프에 특이적으로 결합하는 것을 보여주었다. 단일 도메인 항체의 예는 sdAb, 나노바디 또는 단일 가변 도메인 항체로 지칭된다.
(단일 도메인 mAb)2는 따라서 VH, VL, VHH 및 VNAR를 포함하는 군으로부터 개별적으로 선택되는 (적어도) 2개의 단일 도메인 단클론 항체로 구성되는 단클론 항체 구축물이다. 링커는 바람직하게는 펩티드 링커의 형태이다. 유사하게, "scFv-단일 도메인 mAb"는 위에 기술된 바와 같은 적어도 하나의 단일 도메인 및 위에 기술된 바와 같은 하나의 scFv 분자로 구성되는 단클론 항체 구축물이다. 또한, 링커는 바람직하게는 펩티드 링커의 형태이다.
항체 구축물이 다른 주어진 항체 구축물와의 결합에 경쟁하는지 여부는 경쟁적 ELISA 또는 세포 기반 경쟁 분석과 같은 경쟁 분석으로 측정될 수 있다. 아비딘-커플링된 마이크로입자(비드)가 또한 사용될 수 있다. 아비딘-코팅된 ELISA 플레이트와 유사하게, 비오틴 결합 단백질과 반응할 때, 각각의 이들 비드는 분석이 수행될 수 있는 기질로서 사용될 수 있다. 항원은 비드 상에 코팅되고, 다음에 제1 항체로 사전 코팅된다. 제2 항체가 첨가되며, 임의의 추가적인 결합이 결정된다. 판독을 위한 가능한 수단은 유동세포분석을 포함한다.
T 세포 또는 T 림프구는 세포-매개 면역에서 중심 역할을 하는 림프구 유형(자체가 백혈구 유형)이다. 각각 별개의 기능을 갖는 T 세포의 몇 개의 서브세트가 존재한다. T 세포는 세포 표면에서 T 세포 수용체(TCR)의 존재에 의해 B 세포 및 NK 세포와 같은 다른 림프구와 구별될 수 있다. TCR은 주조직적합성 복합체(MHC) 분자에 결합된 항원 인식의 원인이 되고 두 개의 상이한 단백질 쇄로 구성된다. T 세포의 95%에서, TCR은 알파(α) 및 베타(β) 쇄로 구성된다. TCR이 항원 펩티드 및 MHC(펩티드/MHC 복합체)와 맞물릴 때, T 림프구는 연관된 효소, 공동-수용체, 전문화된 어댑터 분자, 및 활성화되거나 방출된 전사 인자에 의해 매개되는 일련의 생화학적 사건을 통해 활성화된다.
CD3 수용체 복합체는 단백질 복합체이며, 4개의 쇄로 구성된다. 포유류에서, 복합체는 CD3γ(감마) 쇄, CD3δ(델타) 쇄, 및 2개의 CD3ε(엡실론) 쇄를 포함한다. 이들 쇄는 T 세포 수용체(TCR) 및 소위 말하는 ζ(제타) 쇄와 회합되어 T 세포 수용체 CD3 복합체를 형성하고, T 림프구에서 활성화 신호를 생성한다. CD3γ(감마), CD3δ(델타), 및 CD3ε(엡실론) 쇄는 단일 세포외 면역글로불린 도메인을 포함하는 면역글로불린 슈퍼패밀리의 고도로 관련된 세포 표면 단백질이다. CD3 분자의 세포내 꼬리는 TCR의 신호전달 능력에 필수적인 면역수용체 티로신-기반 활성화 모티프 또는 축약하여 ITAM으로 알려진 단일 보존 모티프를 포함한다. CD3 엡실론 분자는 인간에서 염색체 11 상에 있는 CD3E 유전자에 의해 암호화된 폴리펩티드이다. CD3 엡실론의 가장 바람직한 에피토프는 인간 CD3 엡실론 세포외 도메인의 아미노산 잔기 1 내지 27 내에 포함된다. 본 발명에 따른 항체 구축물은 전형적으로 그리고 유리하게는 특정 면역요법에서 요망되지 않는 비특이적 T 세포 활성화를 더 적게 나타내는 것으로 고려된다. 이는 부작용의 감소된 위험으로 전환된다.
다중특이성, 적어도 이중특이성 항체 구축물에 의한 T 세포의 동원을 통한 표적 세포의 용해 재지시는 세포용해 시냅스 형성 및 퍼포린과 그랜자임의 전달을 수반한다. 관여 T 세포는 일련의 표적 세포 용해를 가능하게 하고, 펩티드 항원 가공 및 제시, 또는 클론의 T 세포 분화를 방해하는 면역 회피 기전에 의해 영향을 받지 않는다; 예를 들어, WO 2007/042261 참조.
본 발명의 항체 구축물에 의해 매개되는 세포독성은 다양한 방법으로 측정될 수 있다. 주효 세포는, 예를 들어, 자극된 강화 (인간) CD8 양성 T 세포 또는 비자극된 (인간) 말초 혈액 단핵구 세포(PBMC)일 수 있다. 표적 세포가 마카크 유래이거나, 제1 도메인에 의해 결합되는 마카크 표적 세포 표면 항원을 발현하거나 이로 형질감염되는 경우, 주효 세포는 또한 마카크 T 세포주, 예를 들어 4119LnPx와 같은 마카크 유래의 것일 것이다. 표적 세포는 표적 세포 표면 항원, 예를 들어 인간 또는 마카크 표적 세포 표면 항원(의 적어도 세포외 도메인)을 발현할 것이다. 표적 세포는, 표적 세포 표면 항원, 예를 들어 인간 또는 마카크 표적 세포 표면 항원으로 안정적이거나 일시적으로 형질감염된 세포주(예를 들어, CHO)일 수 있다. 대안적으로, 표적 세포는 표적 세포 표면 항원 양성 천연 발현자(expresser) 세포주일 수 있다. 보통 EC50 값은 세포 표면에서 더 높은 수준의 표적 세포 표면 항원을 발현하는 표적 세포주에서 더 낮은 것으로 예상된다. 효과기 대 표적 세포(E:T) 비는 보통 약 10:1이지만, 다를 수도 있다. 표적 세포 표면 항원xCD3 이중특이성 항체 구축물의 세포독성 활성은 51Cr-방출 분석(약 18시간의 인큐베이션 시간) 또는 FACS-기반 세포독성 분석(약 48시간의 인큐베이션 시간)으로 측정될 수 있다. 분석 인큐베이션 시간(세포독성 반응)의 변형이 또한 가능하다. 세포독성을 측정하는 다른 방법은 당업자에게 잘 공지되어 있고, MTT 또는 MTS 분석, 생물발광 분석을 포함하는 ATP-기반 분석, 술포로다민 B(SRB) 분석, WST 분석, 클론원성 분석 및 ECIS 기술을 포함한다.
본 발명의 표적 세포 표면 항원xCD3 이중특이성 항체 구축물에 의해 매개되는 세포독성 활성은 바람직하게는 세포-기반 세포독성 분석으로 측정된다. 이는 또한 51Cr-방출 분석으로 측정될 수 있다. 이는 절반 최대 유효 농도(기준선과 최대값 사이에서 절반의 세포독성 반응을 유도하는 항체 구축물의 농도)에 상응하는 EC50 값으로 나타낸다. 바람직하게는, 표적 세포 표면 항원xCD3 이중특이성 항체 구축물의 EC50 값은 ≤5000 pM 또는 ≤4000 pM, 더욱 바람직하게는 ≤3000 pM 또는 ≤2000 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤1000 pM 또는 ≤500 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤400 pM 또는 ≤300 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤200 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤100 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤50 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤20 pM 또는 ≤10 pM, 그리고 가장 바람직하게는 ≤5 pM이다.
위에 주어진 EC50 값은 상이한 분석으로 측정될 수 있다. 당업자는 비자극된 PBMC와 비교하여, 자극된/농축된 CD8+ T 세포가 주효 세포로서 사용될 때 EC50 값이 더 낮아질 것으로 예상될 수 있음을 인식한다. 추가로 EC50 값은, 낮은 표적 발현 래트와 비교하여, 표적 세포가 높은 수의 표적 세포 표면 항원을 발현할 때 더 낮은 것으로 예상될 수 있다. 예를 들어, 자극된/농축된 인간 CD8+ T 세포가 주효 세포로서 사용될 때(그리고 표적 세포 표면 항원 형질감염 세포, 예를 들어 CHO 세포 또는 표적 세포 표면 항원 양성 인간 세포주가 표적 세포로서 사용됨), 표적 세포 표면 항원xCD3 이중특이성 항체 구축물의 EC50 값은 바람직하게는 ≤1000 pM, 더욱 바람직하게는 ≤500 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤250 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤100 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤50 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤10 pM, 그리고 가장 바람직하게는 ≤5 pM이다. 인간 PBMC가 주효 세포로서 사용될 때, 표적 세포 표면 항원xCD3 이중특이성 항체 구축물의 EC50 값은 바람직하게는 ≤5000 pM 또는 ≤4000 pM(특히 표적 세포가 표적 세포 표면 항원 양성 인간 세포주일 때), 더욱 바람직하게는 ≤2000 pM(특히 표적 세포가 표적 세포 표면 항원 형질감염 세포, 예를 들어 CHO 세포일 때), 더욱 바람직하게는 ≤1000 pM 또는 ≤500 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤200 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤150 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤100 pM, 그리고 가장 바람직하게는 ≤50 pM, 또는 더 낮다. LnPx4119와 같은 마카크 T 세포주가 주효 세포로서 사용되고, 마카크 표적 세포 표면 항원 형질감염 세포주, 예를 들어 CHO 세포가 표적 세포주로서 사용될 때, 표적 세포 표면 항원xCD3 이중특이성 항체 구축물의 EC50 값은 바람직하게는 ≤2000 pM 또는 ≤1500 pM, 더욱 바람직하게는 ≤1000 pM 또는 ≤500 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤300 pM 또는 ≤250 pM, 한층 더 바람직하게는 ≤100 pM, 그리고 가장 바람직하게는 ≤50 pM이다.
바람직하게는, 본 발명의 표적 세포 표면 항원xCD3 이중특이성 항체 구축물은 용해를 유도/매개하지 않거나 CHO 세포와 같은 표적 세포 표면 항원 음성 세포의 용해를 본질적으로 유도/매개하지 않는다. 용어 "용해를 유도하지 않는다", "용해를 본질적으로 유도하지 않는다", "용해를 매개하지 않는다" 또는 "용해를 본질적으로 매개하지 않는다"는 본 발명의 항체 구축물이 표적 세포 표면 항원 음성 세포의 용해를 30% 이하, 바람직하게는 20% 이하, 더욱 바람직하게는 10% 이하, 특히 바람직하게는 9%, 8%, 7%, 6% 또는 5% 이하로 유도하거나 매개하여, 이에 의해 표적 세포 표면 항원 양성 인간 세포주의 용해가 100%로 설정되는 것을 의미한다. 이는 보통 500 nM까지의 항체 구축물의 농도에 적용된다. 당업자는 추가적인 노고 없이 세포 용해를 측정하는 방법을 알고 있다. 게다가, 본 명세서에서는 세포 용해를 측정하는 특정 지침을 교시한다.
개개의 표적 세포 표면 항원xCD3 이중특이성 항체 구축물의 단량체와 이량체 이소형 사이에서 세포독성 활성의 차이는 "효력 갭(potency gap)"으로서 지칭된다. 이 효력 갭은, 예를 들어 분자의 단량체와 이량체 형태의 EC50 값 사이의 비로서 계산될 수 있다. 본 발명의 표적 세포 표면 항원xCD3 이중특이성 항체 구축물의 효력 갭은 바람직하게는 ≤5, 더욱 바람직하게는 ≤4, 한층 더 바람직하게는 ≤3, 한층 더 바람직하게는 ≤2, 그리고 가장 바람직하게는 ≤1이다.
본 발명의 항체 구축물의 제1 및/또는 제2 (또는 임의의 추가적인) 결합 도메인(들)은 바람직하게는 영장류 목의 포유류 구성원에 대해 교차종 특이적이다. 교차종 특이적 CD3 결합 도메인은, 예를 들어, WO 2008/119567에 기술되어 있다. 일 구현예에 따르면, 제1 및/또는 제2 결합 도메인은 인간 표적 세포 표면 항원 및 인간 CD3 각각에 대한 결합에 추가하여, 또한 신세계 영장류(예를 들어, 코먼마모셋(Callithrix jacchus), 목화머리타마린(Saguinus Oedipus) 또는 다람쥐 원숭이(Saimiri sciureus)), 구세계 영장류(예를 들어 개코원숭이 및 마카크), 긴팔 원숭이, 및 비인간 사람아과를 포함하는(그러나, 이로 한정되지 않는) 영장류의 표적 세포 표면 항원/CD3에 결합할 것이다.
본 발명의 항체 구축물의 일 구현예에서 제1 도메인은 인간 표적 세포 표면 항원에 결합하고 추가로 마카크 표적 세포 표면 항원, 예를 들어 필리핀 원숭이(Macaca fascicularis)의 표적 세포 표면 항원, 그리고 더욱 바람직하게는, 표면 마카크 세포에서 발현되는 마카크 표적 세포 표면 항원에 결합한다. 마카크 표적 세포 표면 항원에 대한 제1 결합 도메인의 친화성은 바람직하게는 ≤15 nM, 더욱 바람직하게는 ≤10 nM, 한층 더 바람직하게는 ≤5 nM, 한층 더 바람직하게는 ≤1 nM, 한층 더 바람직하게는 ≤0.5 nM, 한층 더 바람직하게는 ≤0.1 nM, 그리고 가장 바람직하게는 ≤0.05 nM 또는 심지어 ≤0.01 nM이다.
바람직하게는 본 발명에 따른 항체 구축물의 마카크 표적 세포 표면 항원 대 인간 표적 세포 표면 항원[ma 표적 세포 표면 항원:hu 표적 세포 표면 항원]에 결합하는 친화성 갭(예를 들어, 비아코어(BiaCore)에 의하거나 스캐차드(Scatchard) 분석에 의해 측정되는)은 <100, 바람직하게는 <20, 더욱 바람직하게는 <15, 더욱 바람직하게는 <10, 한층 더 바람직하게는 <8, 더욱 바람직하게는 <6, 그리고 가장 바람직하게는 <2이다. 본 발명에 따른 항체 구축물의 마카크 표적 세포 표면 항원 대 인간 표적 세포 표면 항원에 결합하는 친화성 갭의 바람직한 범위는 0.1 내지 20, 더욱 바람직하게는 0.2 내지 10, 한층 더 바람직하게는 0.3 내지 6, 한층 더 바람직하게는 0.5 내지 3 또는 0.5 내지 2.5, 그리고 가장 바람직하게는 0.5 내지 2 또는 0.6 내지 2이다.
본 발명의 항체 구축물의 제2 (결합) 도메인은 인간 CD3 엡실론 및/또는 마카카 CD3 엡실론에 결합한다. 바람직한 구현예에서 제2 도메인은 추가로 코먼마모셋, 목화머리타마린 또는 다람쥐 원숭이 CD3 엡실론에 결합한다. 코먼마모셋과 목화머리타마린은 둘 다 비단원숭이과(Callitrichidae)에 속하는 신세계 영장류인 반면, 다람쥐 원숭이는 꼬리감는원숭이과(Cebidae)에 속하는 신세계 영장류이다.
본 발명의 항체 구축물에서 인간 및/또는 마카카(Macaca) CD3 엡실론 쇄의 세포외 에피토프에 결합하는 제2 도메인은 다음으로부터 선택되는 CDR-L1, CDR-L2 및 CDR-L3을 포함하는 VL 영역을 포함하는 것이 바람직하다:
(a) WO 2008/119567의 서열번호: 27에 도시된 바와 같은 CDR-L1, WO 2008/119567의 서열번호: 28에 도시된 바와 같은 CDR-L2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 29에 도시된 바와 같은 CDR-L3;
(b) WO 2008/119567의 서열번호: 117에 도시된 바와 같은 CDR-L1, WO 2008/119567의 서열번호: 118에 도시된 바와 같은 CDR-L2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 119에 도시된 바와 같은 CDR-L3; 및
(c) WO 2008/119567의 서열번호: 153에 도시된 바와 같은 CDR-L1, WO 2008/119567의 서열번호: 154에 도시된 바와 같은 CDR-L2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 155에 도시된 바와 같은 CDR-L3.
본 발명의 항체 구축물의 또한 바람직한 구현예에서, 인간 및/또는 마카카(Macaca) CD3 엡실론 쇄의 세포외 에피토프에 결합하는 제2 도메인은 다음으로부터 선택되는 CDR-H1, CDR-H2 및 CDR-H3을 포함하는 VH 영역을 포함한다:
(a) WO 2008/119567의 서열번호: 12에 도시된 바와 같은 CDR-H1, WO 2008/119567의 서열번호: 13에 도시된 바와 같은 CDR-H2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 14에 도시된 바와 같은 CDR-H3;
(b) WO 2008/119567의 서열번호: 30에 도시된 바와 같은 CDR-H1, WO 2008/119567의 서열번호: 31에 도시된 바와 같은 CDR-H2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 32에 도시된 바와 같은 CDR-H3;
(c) WO 2008/119567의 서열번호: 48에 도시된 바와 같은 CDR-H1, WO 2008/119567의 서열번호: 49에 도시된 바와 같은 CDR-H2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 50에 도시된 바와 같은 CDR-H3;
(d) WO 2008/119567의 서열번호: 66에 도시된 바와 같은 CDR-H1, WO 2008/119567의 서열번호: 67에 도시된 바와 같은 CDR-H2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 68에 도시된 바와 같은 CDR-H3;
(e) WO 2008/119567의 서열번호: 84에 도시된 바와 같은 CDR-H1, WO 2008/119567의 서열번호: 85에 도시된 바와 같은 CDR-H2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 86에 도시된 바와 같은 CDR-H3;
(f) WO 2008/119567의 서열번호: 102에 도시된 바와 같은 CDR-H1, WO 2008/119567의 서열번호: 103에 도시된 바와 같은 CDR-H2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 104에 도시된 바와 같은 CDR-H3;
(g) WO 2008/119567의 서열번호: 120에 도시된 바와 같은 CDR-H1, WO 2008/119567의 서열번호: 121에 도시된 바와 같은 CDR-H2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 122에 도시된 바와 같은 CDR-H3;
(h) WO 2008/119567의 서열번호: 138에 도시된 바와 같은 CDR-H1, WO 2008/119567의 서열번호: 139에 도시된 바와 같은 CDR-H2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 140에 도시된 바와 같은 CDR-H3;
(i) WO 2008/119567의 서열번호: 156에 도시된 바와 같은 CDR-H1, WO 2008/119567의 서열번호: 157에 도시된 바와 같은 CDR-H2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 158에 도시된 바와 같은 CDR-H3; 및
(j) WO 2008/119567의 서열번호: 174에 도시된 바와 같은 CDR-H1, WO 2008/119567의 서열번호: 175에 도시된 바와 같은 CDR-H2 및 WO 2008/119567의 서열번호: 176에 도시된 바와 같은 CDR-H3.
본 발명의 항체 구축물의 바람직한 구현예에서 VL CDR의 위에 기술한 3개의 그룹은, 각각 CDR-L 1 내지 3 및 CDR-H 1 내지 3을 포함하는 (30) 그룹을 형성하도록, 제2 결합 도메인 내에서 VH CDR의 위에 기술한 10개 그룹과 조합된다.
본 발명의 항체 구축물에서 CD3에 결합하는 제2 도메인은 WO 2008/119567의 서열번호: 17, 21, 35, 39, 53, 57, 71, 75, 89, 93, 107, 111, 125, 129, 143, 147, 161, 165, 179 또는 183에 도시되거나 서열번호: 13에 도시된 VL 영역으로 구성되는 군으로부터 선택되는 VL 영역을 포함하는 것이 바람직하다.
CD3에 결합하는 제2 도메인은 WO 2008/119567의 서열번호: 15, 19, 33, 37, 51, 55, 69, 73, 87, 91, 105, 109, 123, 127, 141, 145, 159, 163, 177 또는 181에 도시되거나 서열번호: 14에 도시된 VH 영역으로 구성되는 군으로부터 선택되는 VH 영역을 포함하는 것이 또한 바람직하다.
더욱 바람직하게는, 본 발명의 항체 구축물은 다음으로 구성되는 군으로부터 선택되는 VL 영역 및 VH 영역을 포함하는 CD3에 결합하는 제2 도메인을 특징으로 한다:
(a) WO 2008/119567의 서열번호: 17 또는 21에 도시된 VL 영역 및 WO 2008/119567의 서열번호: 15 또는 19에 도시된 VH 영역;
(b) WO 2008/119567의 서열번호: 35 또는 39에 도시된 VL 영역 및 WO 2008/119567의 서열번호: 33 또는 37에 도시된 VH 영역;
(c) WO 2008/119567의 서열번호: 53 또는 57에 도시된 VL 영역 및 WO 2008/119567의 서열번호: 51 또는 55에 도시된 VH 영역;
(d) WO 2008/119567의 서열번호: 71 또는 75에 도시된 VL 영역 및 WO 2008/119567의 서열번호: 69 또는 73에 도시된 VH 영역;
(e) WO 2008/119567의 서열번호: 89 또는 93에 도시된 VL 영역 및 WO 2008/119567의 서열번호: 87 또는 91에 도시된 VH 영역;
(f) WO 2008/119567의 서열번호: 107 또는 111에 도시된 VL 영역 및 WO 2008/119567의 서열번호: 105 또는 109에 도시된 VH 영역;
(g) WO 2008/119567의 서열번호: 125 또는 129에 도시된 VL 영역 및 WO 2008/119567의 서열번호: 123 또는 127에 도시된 VH 영역;
(h) WO 2008/119567의 서열번호: 143 또는 147에 도시된 VL 영역 및 WO 2008/119567의 서열번호: 141 또는 145에 도시된 VH 영역;
(i) WO 2008/119567의 서열번호: 161 또는 165에 도시된 VL 영역 및 WO 2008/119567의 서열번호: 159 또는 163에 도시된 VH 영역; 및
(j) WO 2008/119567의 서열번호: 179 또는 183에 도시된 VL 영역 및 WO 2008/119567의 서열번호: 177 또는 181에 도시된 VH 영역.
본 발명의 항체 구축물와 관련하여, 서열번호: 13에 도시된 VL 영역 및 서열번호: 14에 도시된 VH 영역을 포함하는 CD3에 결합하는 제2 도메인이 또한 바람직하다.
본 발명의 항체 구축물의 바람직한 구현예에 따르면, 제1 및/또는 제2 도메인은 다음의 형식을 갖는다: VH 영역 및 VL 영역의 쌍은 단일 쇄 항체(scFv)의 형식이다. VH 및 VL 영역은 VH-VL 또는 VL-VH의 순서로 배열된다. VH-영역은 링커 서열의 N-말단에 위치하고, VL-영역은 링커 서열의 C-말단에 위치하는 것이 바람직하다.
위에 기술된 본 발명의 항체 구축물의 바람직한 구현예는 WO 2008/119567의 서열번호: 23, 25, 41, 43, 59, 61, 77, 79, 95, 97, 113, 115, 131, 133, 149, 151, 167, 169, 185 또는 187로 구성되는 군으로부터 선택되거나 서열번호: 15로 도시된 아미노산 서열을 포함하는 CD3에 결합하는 제2 도메인을 특징으로 한다.
항체 구축물의 공유적 변형 또한 본 발명의 범주 내에 포함되고, 일반적으로, 항상은 아니지만, 번역 후에 행해진다. 예를 들어, 항체 구축물의 몇 가지 유형의 공유적 변형은 항체 구축물의 특정 아미노산 잔기를 선택된 측쇄나 N- 또는 C-말단 잔기와 반응시킬 수 있는 유기 유도체화제와 반응시킴으로써 분자 내로 도입된다.
시스테인일 잔기는 α-할로아세테이트(및 상응하는 아민), 예를 들어 클로로아세트산 또는 클로로아세트아미드와 가장 통상적으로 반응하여, 카르복시메틸 또는 카르복시아미도메틸 유도체를 제공한다. 시스테인일 잔기는 또한 브로모트리플루오로아세톤, α-브로모-β-(5-이미도조일)프로피온산, 클로로아세틸 포스페이트, N-알킬말레이미드, 3-니트로-2-피리딜 디설파이드, 메틸 2-피리딜 디설파이드, p-클로로머큐리벤조에이트, 2-클로로머큐리-4-니트로페놀, 또는 클로로-7-니트로벤조-2-옥사-1,3-디아졸과의 반응에 의해 유도체화된다.
히스티딜 잔기는 pH 5.5 내지 7.0에서 디에틸피로카르보네이트와의 반응에 의해 유도체화되는데, 이 작용제가 히스티딜 측쇄에 비교적 특이적이기 때문이다. 파라-브로모펜아실 브로마이드가 또한 유용하고; 반응은 바람직하게는 pH 6.0에서 0.1M 카코딜산나트륨 중에서 수행된다. 리신일 및 아미노 말단 잔기는 숙신산 또는 다른 카르복실산 무수물과 반응한다. 이들 작용제와의 유도체화는 리신일 잔기의 전하를 역전시키는 효과를 갖는다. 알파-아미노 함유 잔기를 유도체화하는 다른 적합한 시약은 이미도에스테르, 예를 들어 메틸 피콜린이미데이트; 피리독살 포스페이트; 피리독살; 클로로보로하이드라이드; 트리니트로벤젠술폰산; O-메틸이소우레아; 2,4-펜탄디온; 및 글리옥실레이트와의 트랜스아미나아제-촉매 반응을 포함한다.
아르기닐 잔기는 페닐글리옥살, 2,3-부탄디온, 1,2-사이클로헥산디온, 및 닌히드린 중의 하나 또는 몇 개의 통상적인 시약과의 반응에 의해 변형된다. 아르기닌 잔기의 유도체화는 구아니딘 작용기의 높은 pKa 때문에 반응이 알칼리성 조건에서 수행되는 것을 필요로 한다. 더 나아가, 이들 시약은 리신의 기뿐만 아니라 아르기닌 엡실론-아미노기와 반응할 수 있다.
티로실 잔기의 특정 변형은 스펙트럼 표지를 방향족 디아조늄 화합물 또는 테트라니트로메탄과의 반응에 의해 티로실 잔기로 도입하는 데 특히 관심을 갖고 이루어질 수 있다. 가장 통상적으로, N-아세틸이미다졸 및 테트라니트로메탄은 각각 O-아세틸 티로실 종 및 3-니트로 유도체를 형성하기 위해 사용된다. 티로실 잔기는 방사면역측정법에서 사용하기 위한 표지 단백질을 제조하기 위해 125I 또는 131I를 사용하여 요오드화되며, 위에 기술된 클로라민 T 방법이 적합하다.
카르복실 측기(아스파르틸 또는 글루타밀)는 카르보디이미드(R'―N=C=N--R')와의 반응에 의해 선택적으로 변형되는데, 여기에서 R 및 R'는 선택적으로 상이한 알킬기, 예를 들어 1-사이클로헥실-3-(2-모르폴리닐-4-에틸) 카르보디이미드 또는 1-에틸-3-(4-아조니아-4,4-디메틸펜틸) 카르보디이미드이다. 더 나아가, 아스파르틸 및 글루타밀 잔기는 암모늄 이온과의 반응에 의해 아스파라기닐 및 글루타미닐 잔기로 전환된다.
이작용성 작용제로의 유도체화는 다양한 방법에서 사용하기 위한 수불용성 지지체 기질 또는 표면에 본 발명의 항체 구축물을 가교시키는 데 유용하다. 통상적으로 사용되는 가교제는, 예를 들어, 1,1-비스(디아조아세틸)-2-페닐에탄, 글루타르알데히드, N-하이드록시숙신이미드 에스테르, 예를 들어, 4-아지도살리실산과의 에스테르, 디숙신이미딜 에스테르, 예를 들어 3,3'-디티오비스(숙신이미딜프로피오네이트)를 포함하는 호모이작용성 이미도에스테르, 및 이작용성 말레이미드, 예를 들어 비스-N-말레이미도-1,8-옥탄을 포함한다. 유도체화제, 예를 들어 메틸-3-[(p-아지도페닐)디티오]프로피오이미데이트는 광의 존재 중에 가교를 형성할 수 있는 광활성 가능한 중간체를 산출한다. 대안적으로, 미국 특허 번호 3,969,287; 3,691,016; 4,195,128; 4,247,642; 4,229,537; 및 4,330,440에 기술된 바와 같은 반응성 수-불용성 매트릭스, 예를 들어 브롬화시안-활성화 탄수화물 및 반응성 기질이 단백질 부동화에 이용된다.
글루타미닐 및 아스파라기닐 잔기는 각각 상응하는 글루타밀 및 아스파르틸 잔기로 빈번하게 탈아미드화된다. 대안적으로, 이들 잔기는 온화한 산성 조건 하에 탈아미드화된다. 이들 잔기 중 어느 하나의 형태는 본 발명의 범주 내에 속한다.
다른 변형에는 프롤린 및 리신의 하이드록실화, 세릴 또는 트레오닐 잔기의 하이드록실기의 포스포릴화, 리신, 아르기닌, 및 히스티딘 측쇄의 α-아미노기의 메틸화(T. E. Creighton, Proteins: Structure and Molecular Properties, W. H. Freeman & Co., San Francisco, 1983, pp. 79-86), N-말단 아민의 아세틸화, 및 임의의 C-말단 카르복실기의 아미드화가 포함된다.
본 발명의 범주 내에 포함되는 항체 구축물의 공유적 변형의 다른 유형은 단백질의 글리코실화 패턴을 변경시키는 것을 포함한다. 당업계에 공지된 바와 같이, 글리코실화 패턴은 단백질의 서열(예를 들어, 이하에 논의되는 특정 글리코실화 아미노산 잔기의 존재 또는 부재), 또는 단백질이 생산되는 숙주 세포 또는 유기체 둘 다에 의존할 수 있다. 특정 발현 시스템은 이하에 논의된다.
폴리펩티드의 글리코실화는 전형적으로 N-연결되거나 O-연결된다. N-연결은 아스파라긴 잔기의 측쇄에 대한 탄수화물 모이어티의 부착을 지칭한다. 트리-펩티드 서열 아스파라긴-X-세린 및 아스파라긴-X-트레오닌(여기에서, X는 프롤린을 제외한 임의의 아미노산임)은 아스파라긴 측쇄에 대한 탄수화물 모이어티의 효소적 부착을 위한 인식 서열이다. 따라서, 폴리펩티드에서 이들 트리-펩티드 서열 중 어느 하나의 존재는 잠재적 글리코실화 부위를 생성한다. O-연결 글리코실화는, 5-하이드록시프롤린 또는 5-하이드록시리신이 또한 사용될 수 있지만, 하이드록시아미노산, 가장 통상적으로는 세린 또는 트레오닌에 대한 당 N-아세틸갈락토사민, 갈락토오스, 또는 자일로스 중 하나의 부착을 지칭한다.
항체 구축물에 대한 글리코실화 부위의 첨가는, 그것이 위에 기술된 트리-펩티드 서열 중 하나 이상을 포함하도록, 아미노산 서열을 변경함으로써 편리하게 달성된다(N-연결 글리코실화 부위의 경우). 변경은 또한 출발 서열에 하나 이상의 세린 또는 트레오닌 잔기의 첨가, 또는 이에 의한 치환에 의해 이루어질 수 있다(O-연결 글리코실화 부위의 경우). 용이성을 위해서, 항체 구축물의 아미노산 서열은 DNA 수준의 변화를 통해, 특히 요망되는 아미노산으로 번역될 코돈이 생성되도록 사전 선택된 염기에서 폴리펩티드를 암호화하는 DNA를 돌연변이시킴으로써 바람직하게 변경된다.
항체 구축물에서 탄수화물 모이어티 수를 증가시키는 다른 수단은 단백질에 대한 글리코시드의 화학적 또는 효소적 결합에 의한다. 이들 절차는 N- 및 O-연결 글리코실화를 위한 글리코실화 능력을 갖는 숙주 세포에서 단백질의 생산을 필요로 하지 않는다는 점에서 유리하다. 사용되는 결합 방식에 따라, 당(들)은 (a) 아르기닌 및 히스티딘, (b) 유리 카르복실기, (c) 유리 설프히드릴기, 예를 들어 시스테인의 설프히드릴기, (d) 유리 하이드록실기, 예를 들어 세린, 트레오닌 또는 하이드록시프롤린의 하이드록실기, (e) 방향족 잔기, 예를 들어 페닐알라닌, 티로신 또는 트립토판의 방향족 잔기, 또는 (f) 글루타민의 아미드기에 부착될 수 있다. 이들 방법은 WO 87/05330, 및 Aplin and Wriston, 1981, CRC Crit. Rev. Biochem., pp. 259-306에 기술되어 있다.
출발 항체 구축물에 존재하는 탄수화물 모이어티의 제거는 화학적으로 또는 효소적으로 달성될 수 있다. 화학적 탈글리코실화는 트리플루오로메탄술폰산 화합물, 또는 동등한 화합물에 대한 단백질의 노출을 필요로 한다. 이 처리는 연결 당(N-아세틸글루코사민 또는 N-아세틸갈락토사민)을 제외한 대부분 또는 모든 당의 절단을 초래하는 한편, 폴리펩티드는 그대로 남겨 둔다. 화학적 탈글리코실화는 Hakimuddin et al., 1987, Arch. Biochem. Biophys. 259:52 및 Edge et al., 1981, Anal. Biochem. 118:131에 의해 기술되어 있다. 폴리펩티드에서 탄수화물 모이어티의 효소적 절단은 Thotakura et al., 1987, Meth Enzymol. 138:350에 의해 기술된 바와 같이 다양한 엔도- 및 엑소-글리코시다아제의 사용에 의해 달성될 수 있다. 잠재적 글리코실화 부위에서의 글리코실화는 Duskin et al., 1982, J Biol. Chem. 257:3105에 의해 기술된 바와 같이 튜니카마이신 화합물의 사용에 의해 방지될 수 있다. 튜니카마이신은 단백질-N-글리코시드 연결의 형성을 차단한다.
항체 구축물의 다른 변형이 또한 본원에서 고려된다. 예를 들어, 항체 구축물의 공유적 변형의 다른 유형은 미국 특허 번호 4,640,835; 4,496,689; 4,301,144; 4,670,417; 4,791,192 또는 4,179,337에 제시된 방식으로 다양한 폴리올, 예를 들어 폴리에틸렌 글리콜, 폴리프로필렌 글리콜, 폴리옥시알킬렌, 또는 폴리에틸렌 글리콜과 폴리프로필렌 글리콜의 공중합체를 포함하지만, 이로 한정되지 않는 다양한 비-단백질성 중합체에 항체 구축물을 연결하는 것을 포함한다. 추가로, 당업계에 공지된 바와 같이, 아미노산 치환은 항체 구축물 내의 다양한 위치에서, 예를 들어, PEG와 같은 중합체의 첨가를 용이하게 하기 위해 이루어질 수 있다.
일부 구현예에서, 본 발명의 항체 구축물의 공유적 변형은 하나 이상의 표지의 첨가를 포함한다. 표지 그룹은 잠재적 입체 장애를 감소시키기 위해 다양한 길이의 스페이서 암을 통해 항체 구축물에 결합될 수 있다. 단백질을 표지하는 다양한 방법은 당업계에 공지되어 있으며, 본 발명을 수행하는 데 사용될 수 있다. 용어 "표지" 또는 "표지 그룹"은 임의의 검출 가능한 표지를 지칭한다. 일반적으로, 표지는 이들이 검출되는 분석에 따라 다양한 부류에 속하며 - 다음의 예를 포함하지만, 이로 제한되지 않는다:
a) 방사성 동위원소 또는 방사성 핵종과 같은 방사성 또는 중 동위원소일 수 있는 동위원소 표지(예를 들어, 3H, 14C, 15N, 35S, 89Zr, 90Y, 99Tc, 111In, 125I, 131I)
b) 자성 표지(예를 들어, 자성 입자)
c) 산화환원 활성 모이어티
d) 광학 염료(발색단, 인광체 및 형광체를 포함하지만, 이로 한정되지 않음), 예를 들어 형광기(예를 들어, FITC, 로다민, 란탄족 인광체), 화학발광기, 및 "소분자" 형광 또는 단백질성 형광 중 하나일 수 있는 형광단
e) 효소기(예를 들어, 호스래디쉬 퍼옥시다아제, β-갈락토시다아제, 루시페라아제, 알칼리 포스파타아제)
f) 비오틴이 결합된 기
g) 2차 리포터에 의해 인식되는 사전 결정된 폴리펩티드 에피토프(예를 들어, 류신 지퍼 쌍 서열, 2차 항체에 대한 결합 측, 금속 결합 도메인, 에피토프 태그 등)
"형광 표지"는 이의 고유 형광 특성을 통해 검출될 수 있는 임의의 분자를 의미한다. 적합한 형광 표지는 플루오레세인, 로다민, 테트라메틸로다민, 에오신, 에리트로신, 쿠마린, 메틸-쿠마린, 피렌, 말라카이트 그린(Malacite green), 스틸벤, 루시퍼 옐로(Lucifer Yellow), 캐스케이드 블루제이(Cascade BlueJ), 텍사스 레드(Texas Red), 이아에단스(IAEDANS), 에단스(EDANS), 보디피 FL(BODIPY FL), LC 레드 640, Cy 5, Cy 5.5, LC 레드 705, 오리건 그린(Oregon green), 알렉사-플루오르(Alexa-Fluor) 염료(알렉사 플루오르 350, 알렉사 플루오르 430, 알렉사 플루오르 488, 알렉사 플루오르 546, 알렉사 플루오르 568, 알렉사 플루오르 594, 알렉사 플루오르 633, 알렉사 플루오르 660, 알렉사 플루오르 680), 캐스케이드 블루, 캐스케이드 옐로 및 R-피코에리트린(PE)(Molecular Probes, Eugene, OR), FITC, 로다민 및 텍사스 레드(Pierce, Rockford, IL), Cy5, Cy5.5, Cy7(Amersham Life Science, Pittsburgh, PA)을 포함하지만, 이로 한정되지 않는다. 형광단을 포함하는 적합한 광학 염료는 Richard P. Haugland에 의해 Molecular Probes Handbook에 기술되어 있다.
적합한 단백질성 형광 표지는 또한, 레닐라(Renilla), 프틸로사르쿠스(Ptilosarcus), 또는 에어쿠오레아(Aequorea) 종의 GFP(Chalfie et al., 1994, Science 263:802-805), EGFP(Clontech Laboratories, Inc., Genbank Accession Number U55762)를 포함하는 녹색 형광 단백질, 청색 형광 단백질(BFP, Quantum Biotechnologies, Inc. 1801 de Maisonneuve Blvd. West, 8th Floor, Montreal, Quebec, Canada H3H 1J9; Stauber, 1998, Biotechniques 24:462-471; Heim et al., 1996, Curr. Biol. 6:178-182), 향상된 황색 형광 단백질(EYFP, Clontech Laboratories, Inc.), 루시페라아제(Ichiki et al., 1993, J. Immunol. 150:5408-5417), β 갈락토시다아제(Nolan et al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85:2603-2607) 및 레닐라(WO92/15673, WO95/07463, WO98/14605, WO98/26277, WO99/49019, 미국 특허 번호 5,292,658; 5,418,155; 5,683,888; 5,741,668; 5,777,079; 5,804,387; 5,874,304; 5,876,995; 5,925,558)를 포함하지만, 이로 한정되지 않는다.
본 발명의 항체 구축물은 또한, 예를 들어, 분자의 분리에 도움을 주거나 분자의 적당한 약동학적 프로파일에 관련된 추가적인 도메인을 포함할 수 있다. 항체 구축물의 분리를 돕는 도메인은 분리 방법, 예를 들어 분리 칼럼에서 포획될 수 있는 펩티드 모티브 또는 2차적으로 도입된 모이어티로부터 선택될 수 있다. 이러한 추가적인 도메인의 비제한적 구현예는 Myc-태그, HAT-태그, HA-태그, TAP-태그, GST-태그, 키틴 결합 도메인(CBD-태그), 말토오스 결합 단백질(MBP-태그), 플래그-태그, 스트렙-태그 및 이의 변이체(예를 들어, 스트렙II-태그) 및 His-태그로서 알려진 펩티드 모티브를 포함한다. 확인된 CDR을 특징으로 하는 본원에 개시된 모든 항체 구축물은 분자의 아미노산 서열에서 연속 His 잔기, 바람직하게는 5개, 더욱 바람직하게는 6개의 His 잔기(헥사-히스티딘)의 반복부로서 일반적으로 알려진 His-태그 도메인을 포함할 수 있다. His-태그는, 예를 들어, 항체 구축물의 N-말단 또는 C-말단에 위치할 수 있고, 바람직하게는 C-말단에 위치한다. 가장 바람직하게는, 헥사-히스티딘 태그(HHHHHH)(서열번호: 16)가 본 발명에 따른 항체 구축물의 C-말단에 펩티드 결합을 통해 연결된다. 추가적으로, PLGA-PEG-PLGA의 접합체 시스템은 지속적 방출 적용 및 개선된 약동학적 프로파일을 위해 폴리-히스티딘 태그와 조합될 수 있다.
본원에 기술된 항체 구축물의 아미노산 서열 변형이 또한 고려된다. 예를 들어, 항체 구축물의 결합 친화성 및/또는 다른 생물학적 특성을 개선하는 것이 바람직할 수 있다. 항체 구축물의 아미노산 서열 변이체는 항체 구축물 핵산에 적절한 뉴클레오티드 변화를 도입함으로써, 또는 펩티드 합성에 의해 제조된다. 이하에 기술되는 아미노산 서열 변형 모두는 비변형 모 분자의 요망되는 생물학적 활성(표적 세포 표면 항원에 대한, 그리고 CD3에 대한 결합)을 여전히 보유하는 항체 구축물을 초래하여야 한다.
용어 "아미노산" 또는 "아미노산 잔기"는 변형, 합성 또는 희귀 아미노산이 원하는 대로 사용될 수 있지만, 전형적으로는 당업계에서 인식되는 정의를 갖는 아미노산, 예를 들어, 알라닌(Ala 또는 A); 아르기닌(Arg 또는 R); 아스파라긴(Asn 또는 N); 아스파르트산(Asp 또는 D); 시스테인(Cys 또는 C); 글루타민(Gln 또는 Q); 글루탐산(Glu 또는 E); 글리신(Gly 또는 G); 히스티딘(His 또는 H); 이소류신(He 또는 I): 류신(Leu 또는 L); 리신(Lys 또는 K); 메티오닌(Met 또는 M); 페닐알라닌(Phe 또는 F); 프롤린(Pro 또는 P); 세린(Ser 또는 S); 트레오닌(Thr 또는 T); 트립토판(Trp 또는 W); 티로신(Tyr 또는 Y); 및 발린(Val 또는 V)으로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산을 지칭한다. 일반적으로, 아미노산은 비극성 측쇄를 갖는 것(예를 들어, Ala, Cys, He, Leu, Met, Phe, Pro, Val); 음으로 하전된 측쇄를 갖는 것(예를 들어, Asp, Glu); 양으로 하전된 측쇄를 갖는 것(예를 들어, Arg, His, Lys); 또는 비하전 극성 측쇄를 갖는 것(예를 들어, Asn, Cys, Gln, Gly, His, Met, Phe, Ser, Thr, Trp 및 Tyr)으로 그룹화될 수 있다.
아미노산 변형은, 예를 들어, 항체 구축물의 아미노산 서열 내의 잔기로부터의 결실, 및/또는 잔기로의 삽입, 및/또는 잔기의 치환을 포함한다. 결실, 삽입, 및 치환의 임의의 조합은 최종 구축물이 요망되는 특성을 갖는 경우에만, 최종 구축물에 도달하도록 이루어진다. 아미노산 변화는 또한, 글리코실 부위의 개수 또는 위치를 변화시키는 것과 같이, 항체 구축물의 번역 후 가공을 변경시킬 수 있다.
예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6개의 아미노산이 각각의 CDR에서 삽입, 치환 또는 결실될 수 있는(물론, 그들의 길이에 의존함) 한편, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 또는 25개의 아미노산이 각각의 FR에서 삽입, 치환 또는 결실될 수 있다. 바람직하게는, 항체 구축물로의 아미노산 서열 삽입은 길이가 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 잔기로부터 100개 이상의 잔기를 포함하는 폴리펩티드까지의 범위에 있는 아미노- 및/또는 카르복실-말단 융합뿐만 아니라 단일 또는 다중 아미노산 잔기의 서열내 삽입을 포함한다. 상응하는 변형은 또한 본 발명의 항체 구축물의 제3 도메인 내에서 수행될 수 있다. 본 발명의 항체 구축물의 삽입 변이체는 효소의 항체 구축물의 N-말단 또는 C-말단에 대한 융합 또는 폴리펩티드에 대한 융합을 포함한다.
치환 돌연변이유발의 가장 큰 관심 대상 부위는 중쇄 및/또는 경쇄의 CDR, 특히 초가변 영역을 포함하지만(그러나 이로 한정되지 않음), 중쇄 및/또는 경쇄에서의 FR 변형이 또한 고려된다. 치환은 바람직하게는 본원에 기술된 바와 같은 보존적 치환이다. 바람직하게는, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 아미노산이 CDR에서 치환될 수 있는 한편, CDR 또는 FR의 길이에 따라 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 또는 25개의 아미노산이 프레임워크 영역(FR)에서 치환될 수 있다. 예를 들어, CDR 서열이 6개의 아미노산을 포함하는 경우, 이들 아미노산 중 1, 2 또는 3개가 치환되는 것으로 고려된다. 유사하게, CDR 서열이 15개의 아미노산을 포함하는 경우, 이들 아미노산 중 1, 2, 3, 4, 5 또는 6개가 치환되는 것으로 고려된다.
돌연변이유발을 위한 바람직한 위치인 항체 구축물의 특정 잔기 또는 영역의 확인을 위한 유용한 방법은 Cunningham 및 Wells에 의해 Science, 244: 1081-1085 (1989)에 기술된 "알라닌 스캐닝 돌연변이유발"로 불린다. 여기에서, 항체 구축물 내의 잔기 또는 표적 잔기의 군이 확인되고(예를 들어, arg, asp, his, lys, 및 glu와 같은 하전된 잔기), 중성 또는 음으로 하전된 아미노산(가장 바람직하게는 알라닌 또는 폴리알라닌)으로 교체되어 아미노산과 에피토프의 상호작용에 영향을 미친다.
이어서, 치환에 대한 작용 민감성을 보여주는 이들 아미노산 위치는 치환 부위에서 또는 치환 부위에 대해 추가적인 또는 다른 변이체를 도입함으로써 개선된다. 따라서, 아미노산 서열 변화를 도입하기 위한 부위 또는 영역은 사전 결정되지만, 돌연변이의 성질 그 자체는 사전 결정될 필요가 없다. 예를 들어, 주어진 부위에서 돌연변이의 성능을 분석하거나 최적화하기 위해, 알라닌 스캐닝 또는 무작위 돌연변이유발이 표적 코돈 또는 영역에서 수행될 수 있고, 발현된 항체 구축물 변이체는 요망되는 활성의 최적 조합을 위해 선별된다. 공지된 서열을 갖는 DNA의 사전 결정된 부위에서 치환 돌연변이를 생성하기 위한 기법은 잘 알려져 있고, 예를 들어, M13 프라이머 돌연변이유발 및 PCR 돌연변이유발이 있다. 돌연변이체의 선별은 표적 세포 표면 항원 또는 CD3 결합과 같은 항원 결합 활성의 분석을 사용하여 행하여진다.
일반적으로, 아미노산이 중쇄 및/또는 경쇄의 하나 이상 또는 모든 CDR에서 치환되는 경우, 그때 얻어지는 "치환된" 서열은 "본래의" CDR 서열에 대해 적어도 60% 또는 65%, 더욱 바람직하게는 70% 또는 75%, 한층 더 바람직하게는 80% 또는 85%, 그리고 특히 바람직하게는 90% 또는 95% 동일한 것이 바람직하다. 이는 "치환된" 서열과 동일한 정도가 CDR의 길이에 의존한다는 것을 의미한다. 예를 들어, 5개의 아미노산을 갖는 CDR은 적어도 하나의 아미노산이 치환되도록 그의 치환된 서열과 바람직하게는 80% 동일하다. 따라서, 항체 구축물의 CDR은 그들의 치환된 서열에 대해 상이한 정도의 동일성을 가질 수 있고, 예를 들어, CDRL1은 80%를 가질 수 있는 반면, CDRL3은 90%를 가질 수 있다.
바람직한 치환(또는 교체)은 보존적 치환이다. 그러나, 항체 구축물이 제1 도메인을 통해 표적 세포 표면 항원에, 그리고 제2 도메인을 통해 CD3, 각각 CD3 엡실론에 결합하는 그의 능력을 보유하고/하거나 그의 CDR이 그때 치환된 서열에 대해 동일성("본래의" CDR 서열에 대해 적어도 60% 또는 65%, 더욱 바람직하게는 70% 또는 75%, 한층 더 바람직하게는 80% 또는 85%, 그리고 특히 바람직하게는 90% 또는 95% 동일함)을 갖는 한, 임의의 치환(이하의 표 3에 수록된 "예시적인 치환"으로부터의 하나 이상 또는 비보존적 치환을 포함)이 고려된다.
보존적 치환은 "바람직한 치환"의 표제 하에 표 3에 나타낸다. 이러한 치환이 생물학적 활성에서 변화를 초래할 경우, 표 3에서 "예시적인 치환"으로 명명되거나, 아미노산 부류에 대해 이하에 추가로 기재하는 바와 같은 더 실질적인 변화가 도입될 수 있고, 생성물은 요망되는 특징에 대해 선별될 수 있다.
본 발명의 항체 구축물의 생물학적 특성의 실질적인 변형은 (a) 예를 들어, 시트 또는 나선 입체형태로서, 치환 영역에서 폴리펩티드 골격의 구조, (b) 표적 부위에서 분자의 전하 또는 소수성, 또는 (c) 측쇄의 큰 규모를 유지하는 데 대한 이들의 영향이 상당히 다른 치환을 선택함으로써 달성된다. 천연적으로 존재하는 잔기는 통상적인 측쇄 특성을 기반으로 하여 다음 군으로 나누어진다: (1) 소수성: 노르류신, met, ala, val, leu, ile; (2) 중성 친수성: cys, ser, thr, asn, gln; (3) 산성: asp, glu; (4) 염기성: his, lys, arg; (5) 쇄 배향에 영향을 미치는 잔기: gly, pro; 및 (6) 방향족: trp, tyr, phe.
비보존적 치환은 이들 부류 중 하나의 구성원을 다른 부류로 교환하는 것을 수반할 것이다. 분자의 산화적 안정성을 개선하고 비정상 가교를 방지하기 위해 항체 구축물의 적절한 입체형태를 유지하는 데 관여하지 않는 임의의 시스테인 잔기는 일반적으로 세린으로 치환될 수 있다. 대조적으로, 시스테인 결합(들)은 이의 안정성을 개선하기 위해 항체에 부가될 수 있다(특히, 항체가 Fv 단편과 같은 항체 단편인 경우).
아미노산 서열에서, 서열 동일성 및/또는 유사성은 Smith and Waterman, 1981, Adv. Appl. Math. 2:482의 국소 서열 동일성 알고리즘, Needleman and Wunsch, 1970, J. Mol. Biol. 48:443의 서열 동일성 정렬 알고리즘, Pearson and Lipman, 1988, Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 85:2444의 유사성 검색 방법, 이들 알고리즘의 컴퓨터화된 실행(위스콘신 제네틱스 소프트웨어 패키지(Wisconsin Genetics Software Package)의 GAP, BESTFIT, FASTA, 및 TFASTA, Genetics Computer Group, 575 Science Drive, Madison, Wis.), Devereux et al., 1984, Nucl. Acid Res. 12:387-395에 의해 기술된 Best Fit 서열 프로그램을 포함하지만, 이로 한정되지 않는 당업계에 알려진 표준 기법을 사용하는 것에 의해, 바람직하게는 디폴트 설정을 사용하거나, 검사에 의해 결정된다. 바람직하게는, 동일성 백분율은 다음 파라미터를 기반으로 하여 FastDB에 의해 계산된다: 미스매치 페널티 1; 갭 페널티 1; 갭 크기 페널티 0.33; 및 결합 페널티 30, "Current Methods in Sequence Comparison and Analysis," Macromolecule Sequencing and Synthesis, Selected Methods and Applications, pp 127-149 (1988), Alan R. Liss, Inc.
유용한 알고리즘의 예는 PILEUP이다. PILEUP은 진행성, 쌍별 정렬을 사용하여 관련된 서열의 군으로부터 다중 서열 정렬을 생성한다. 또한, 정렬을 생성하기 위해 사용되는 클러스터링 관계를 나타내는 트리를 플로팅할 수 있다. PILEUP은 Feng & Doolittle, 1987, J. Mol. Evol. 35:351-360의 진행성 정렬 방법의 단순화를 사용하는데; 이 방법은 Higgins and Sharp, 1989, CABIOS 5:151-153에 의해 기술된 것과 유사하다. 유용한 PILEUP 파라미터는 디폴트 갭 가중 3.00, 디폴트 갭 길이 가중 0.10, 및 가중 단부 갭을 포함한다.
유용한 알고리즘의 다른 예는 Altschul et al., 1990, J. Mol. Biol. 215:403-410; Altschul et al., 1997, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402; 및 Karin et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90:5873-5787에 기술된 BLAST 알고리즘이다. 특히 유용한 BLAST 프로그램은 Altschul et al., 1996, Methods in Enzymology 266:460-480으로부터 얻어진 WU-BLAST-2 프로그램이다. WU-BLAST-2에서는 대부분 디폴트 값으로 설정된 몇 가지 검색 파라미터를 사용한다. 조절 가능한 파라미터는 다음의 값으로 설정된다: 중복 스팬=1, 중복 분율=0.125, 단어 역치(T)=II. HSP S 및 HSP S2 파라미터는 동적인 값이고 관심 대상의 서열이 검색되는 특정 데이터베이스의 조성 및 특정 서열의 조성에 따라 프로그램 자체에 의해 확립되지만; 값은 감도를 높이기 위해 조정될 수 있다.
추가의 유용한 알고리즘은 Altschul et al., 1993, Nucl. Acid Res. 25:3389-3402에 의해 보고된 갭 BLAST이다. 갭 BLAST는 BLOSUM-62 치환 스코어; 9로 설정된 역치 T 파라미터; 갭이 없는 연장을 촉발시키기 위한 2-히트 방법, k의 갭 길이에 10+k을 부과; 16으로 설정된 Xu, 그리고 데이터베이스 검색 단계에 대해 40 및 알고리즘의 산출 단계에 대해 67로 설정된 Xg를 사용한다. 갭 정렬은 약 22 비트에 상응하는 스코어에 의해 촉발된다.
일반적으로, 개개 변이체 CDR 또는 VH / VL 서열 사이의 아미노산 상동성, 유사성, 또는 동일성은 본원에 도시된 서열에 대해 적어도 60%이고, 더 전형적으로 바람직하게는 적어도 65% 또는 70%, 더욱 바람직하게는 적어도 75% 또는 80%, 한층 더 바람직하게는 적어도 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 및 거의 100%의 상동성 또는 동일성으로 증가한다. 유사한 방식으로, 본원에서 확인되는 결합 단백질의 핵산 서열에 대해 "핵산 서열 동일성 백분율(%)"은, 항체 구축물의 암호화 서열에서 뉴클레오티드 잔기와 동일한 후보 서열에서의 뉴클레오티드 잔기의 백분율로서 정의된다. 구체적인 방법은 디폴트 파라미터로 설정된 WU-BLAST-2의 BLASTN 모듈을 이용하며, 중복 스팬 및 중복 분율은 각각 1 및 0.125로 설정된다.
일반적으로, 개개 변이체 CDR 또는 VH / VL 서열을 암호화하는 뉴클레오티드 서열과 본원에 도시된 뉴클레오티드 서열 사이의 핵산 서열 상동성, 유사성 또는 동일성은 적어도 60%이고, 더 전형적으로 바람직하게는 적어도 65%, 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99%, 및 거의 100%의 상동성 또는 동일성으로 증가한다. 따라서, "변이체 CDR" 또는 "변이체 VH / VL 영역"은 본 발명의 모 CDR / VH / VL에 대해 구체화된 상동성, 유사성 또는 동일성을 갖는 것이고, 모 CDR 또는 VH / VL의 특이성 및/또는 활성의 적어도 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99%를 포함하지만, 이로 한정되지 않는 생물학적 기능을 공유한다.
일 구현예에서, 본 발명에 따른 항체 구축물의 인간 생식계열에 대한 동일성의 백분율은 ≥70% 또는 ≥75%, 더욱 바람직하게는 ≥80% 또는 ≥85%, 한층 더 바람직하게는 ≥90%, 그리고 가장 바람직하게는 ≥91%, ≥92%, ≥93%, ≥94%, ≥95% 또는 심지어 ≥96%이다. 인간 항체 생식계열 유전자 산물에 대한 동일성은 치료 동안 환자에서 약물에 대한 면역 반응을 유발하는 치료 단백질의 위험을 감소시키기 위한 중요한 특징인 것으로 생각된다. Hwang & Foote ("Immunogenicity of engineered antibodies"; Methods 36 (2005) 3-10)는 약물 항체 구축물의 비인간 부분의 감소가 치료 동안 환자에서 항-약물 항체를 유도할 위험의 감소를 야기한다는 것을 입증한다. 임상적으로 평가된 항체 약물의 고갈된 수와 각각의 면역원성 데이터를 비교함으로써, 변경되지 않은 비인간 V 영역을 갖는 항체(평균 23.59%의 환자)보다 항체의 V-영역의 인간화가 단백질을 덜 면역원성(평균 5.1%의 환자)으로 만드는 경향을 보여준다. 따라서, 인간 서열에 대한 더 높은 정도의 동일성이 항체 구축물 형태의 V-영역 기반 단백질 치료제에서 바람직하다. 생식계열 동일성을 결정하는 이 목적을 위해, VL의 V-영역은 Vector NTI 소프트웨어 및 동일한 아미노산 잔기를 VL의 총 아미노산 잔기의 수로 나눈 백분율로 계산되는 아미노산 서열을 사용하여 인간 생식계열 V 분절 및 J 분절의 아미노산 서열과 정렬될 수 있다 (http://vbase.mrc-cpe.cam.ac.uk/). VH CDR3이 그의 높은 다양성 및 존재하는 인간 생식계열 VH CDR3 정렬 상대의 결여에 기인하여 배제될 수 있다는 것을 제외하면, VH 분절에 대해서 동일할 수 있다(http://vbase.mrc-cpe.cam.ac.uk/). 이어서, 인간 항체 생식계열 유전자에 대한 서열 동일성을 증가시키기 위해 재조합 기법이 사용될 수 있다.
추가의 구현예에서, 본 발명의 이중특이성 항체 구축물은, 예를 들어, 표준 2단계 정제 공정에서 표준 연구 규모 조건 하에 높은 단량체 수율을 나타낸다. 바람직하게는 본 발명에 따른 항체 구축물의 단량체 수율은 ≥0.25 mg/L 상등액, 더욱 바람직하게는 ≥0.5 mg/L, 한층 더 바람직하게는 ≥1 mg/L, 그리고 가장 바람직하게는 ≥3 mg/L 상등액이다.
마찬가지로, 이량체 항체 구축물 이소형의 수율 및 이에 따른 항체 구축물의 단량체 백분율(즉, 단량체:(단량체+이량체))이 결정될 수 있다. 단량체 및 이량체 항체 구축물의 생산성 및 계산된 단량체 백분율은, 예를 들어, 롤러 보틀에서 표준화된 연구-규모 생산으로부터의 배양 상등액의 SEC 정제 단계에서 얻어질 수 있다. 일 구현예에서, 항체 구축물의 단량체 백분율은 ≥80%, 더욱 바람직하게는 ≥85%, 한층 더 바람직하게는 ≥90%, 그리고 가장 바람직하게는 ≥95%이다.
일 구현예에서, 항체 구축물은 ≤5 또는 ≤4, 더욱 바람직하게는 ≤3.5 또는 ≤3, 한층 더 바람직하게는 ≤2.5 또는 ≤2, 그리고 가장 바람직하게는 ≤1.5 또는 ≤1의 바람직한 혈장 안정성(혈장이 있는 EC50 대 혈장이 없는 EC50의 비)을 갖는다. 항체 구축물의 혈장 안정성은 37℃에서 24시간 동안 인간 혈장 중에서 구축물의 인큐베이션에 이어 51크로뮴 방출 세포독성 분석에서의 EC50 결정에 의해 시험할 수 있다. 세포독성 분석에서 주효 세포는 자극된 농축 인간 CD8 양성 T 세포일 수 있다. 표적 세포는, 예를 들어 인간 표적 세포 표면 항원으로 형질감염된 CHO 세포일 수 있다. 효과기 대 표적 세포(E:T) 비는 10:1로서 선택될 수 있다. 이 목적을 위해 사용되는 인간 혈장 풀은 EDTA 코팅 주사기에 의해 수집되는 건강한 공여자의 혈액으로부터 유래된다. 세포 성분은 원심분리에 의해 제거되고, 상부 혈장 상이 수집되고 그 뒤에 모아진다. 대조로서, 항체 구축물은 RPMI-1640 배지에서 세포독성 분석 직전에 희석된다. 혈장 안정성은 EC50(혈장 인큐베이션 후) 대 EC50(대조)의 비로서 계산한다.
더 나아가 본 발명의 항체 구축물의 단량체로부터 이량체로의 전환은 낮은 것이 바람직하다. 전환은 상이한 조건 하에 측정될 수 있고, 고성능 크기 배제 크로마토그래피에 의해 분석될 수 있다. 예를 들어, 항체 구축물의 단량체 이소형의 인큐베이션은 인큐베이터 내에서 37℃로, 그리고 예를 들어, 100 μg/mL 또는 250 μg/mL의 농도로 7일 동안 수행될 수 있다. 이들 조건 하에서, 본 발명의 항체 구축물은 ≤5%, 더욱 바람직하게는 ≤4%, 한층 더 바람직하게는 ≤3%, 한층 더 바람직하게는 ≤2.5%, 한층 더 바람직하게는 ≤2%, 한층 더 바람직하게는 ≤1.5%, 그리고 가장 바람직하게는 ≤1% 또는 ≤0.5% 또는 심지어 0%인 이량체 백분율을 나타내는 것이 바람직하다.
또한, 본 발명의 이중특이성 항체 구축물은 다수의 냉동/해동 주기 후에 매우 낮은 이량체 전환으로 존재하는 것이 바람직하다. 예를 들어, 항체 구축물 단량체는, 예를 들어, 포괄적 제형 완충제에서 250 μg/mL의 농도로 조정되고, 3회의 냉동/해동 주기(-80℃에서 30분 동안 냉동한 다음에 실온에서 30분 동안 해동)에 이어서, 고성능 SEC를 받아, 이량체 항체 구축물로 전환되었던 초기 단량체 항체 구축물의 백분율을 결정한다. 바람직하게는 이중특이성 항체 구축물의 이량체 백분율은, 예를 들어, 3회의 냉동/해동 주기 후에 ≤5%, 더욱 바람직하게는 ≤4%, 한층 더 바람직하게는 ≤3%, 한층 더 바람직하게는 ≤2.5%, 한층 더 바람직하게는 ≤2%, 한층 더 바람직하게는 ≤1.5%, 그리고 가장 바람직하게는 ≤1% 또는 심지어 ≤0.5%이다.
본 발명의 이중특이성 항체 구축물은 바람직하게는 응집 온도 ≥45℃ 또는 ≥50℃, 더욱 바람직하게는 ≥52℃ 또는 ≥54℃, 한층 더 바람직하게는 ≥56℃ 또는 ≥57℃, 그리고 가장 바람직하게는 ≥58℃ 또는 ≥59℃로 유리한 열안정성을 나타낸다. 열 안정성 파라미터는 하기와 같이 항체 응집 온도와 관련하여 결정될 수 있다: 250 μg/mL 농도에서 항체 용액은 일회용 큐벳에 전달되고, 동적 광산란(DLS) 장치에 놓인다. 샘플은 측정된 반경을 일정하게 획득하면서 0.5℃/분의 가열 속도로 40℃로부터 70℃까지 가열된다. 단백질의 용융 및 응집을 나타내는 반경의 증가는 항체의 응집 온도를 계산하기 위해 사용된다.
대안적으로, 용융 온도 곡선은 항체 구축물의 고유한 생물물리학적 단백질 안정성을 결정하기 위해 시차 주사 열량측정법(DSC)에 의해 결정될 수 있다. 이들 실험은 MicroCal LLC(Northampton, MA, U.S.A.) VP-DSC 장치를 사용하여 수행된다. 항체 구축물을 함유하는 샘플의 에너지 흡수는 제형 완충제만을 함유하는 샘플과 비교하여 20℃로부터 90℃까지 기록된다. 항체 구축물은, 예를 들어 SEC 실행 완충제에서 250 μg/mL의 최종 농도로 조정된다. 각각의 용융 곡선의 기록을 위해, 전체 샘플 온도는 단계적으로 증가된다. 각각의 온도에서, 샘플 및 제형 완충제 기준의 T 에너지 흡수가 기록된다. 샘플의 에너지 흡수 Cp(kcal/몰/℃) 빼기 기준의 에너지 흡수의 차이는 각각의 온도에 대해 플로팅된다. 용융 온도는 에너지 흡수의 처음 최대값에서의 온도로서 정의된다.
본 발명의 표적 세포 표면 항원xCD3 이중특이성 항체 구축물은 또한 ≤0.2, 바람직하게는 ≤0.15, 더욱 바람직하게는 ≤0.12, 한층 더 바람직하게는 ≤0.1, 그리고 가장 바람직하게는 ≤0.08의 탁도(정제된 단량체 항체 구축물을 2.5 mg/mL까지 농축하고 밤새 인큐메이션한 후 OD340에 의해 측정함)를 갖는 것으로 고려된다.
추가 구현예에서 본 발명에 따른 항체 구축물은 산성 pH에서 안정하다. 항체 구축물이 비생리적 pH, 예를 들어 pH 5.5(예를 들어, 양이온 교환 크로마토그래피를 실행하는 데 요구되는 pH) 이하, 예를 들어 pH 4.0 내지 5.5에서 더 잘 견딜수록, 부하된 단백질의 전체 양에 대해 이온 교환 칼럼으로부터 용출되는 항체 구축물의 회수율이 더 높다. pH 5.5에서 이온(예를 들어, 양이온) 교환 칼럼으로부터의 항체 구축물의 회수율은 바람직하게는 ≥30%, 더욱 바람직하게는 ≥40%, 더욱 바람직하게는 ≥50%, 한층 더 바람직하게는 ≥60%, 한층 더 바람직하게는 ≥70%, 한층 더 바람직하게는 ≥80%, 한층 더 바람직하게는 ≥90%, 한층 더 바람직하게는 ≥95%, 그리고 가장 바람직하게는 ≥99%이다.
더 나아가 본 발명의 이중특이성 항체 구축물은 치료적 효능 또는 항종양 활성을 나타내는 것으로 고려된다. 이는, 예를 들어 진행된 병기의 인간 종양 이종이식 모델의 다음의 예에서 개시되는 바와 같은 연구에서 평가될 수 있다:
당업자는 이 연구의 특정 파라미터, 예를 들어 주입된 종양 세포의 수, 주사 부위, 이식한 인간 T 세포의 수, 투여되는 이중특이성 항체 구축물의 양, 및 시각표를 변형하거나 조정하는 한편, 여전히 의미 있고 재현 가능한 결과에 도달하는 방법을 안다. 바람직하게는, 종양 성장 억제 T/C[%]는 ≤70 또는 ≤60, 더욱 바람직하게는 ≤50 또는 ≤40, 한층 더 바람직하게는 ≤30 또는 ≤20, 그리고 가장 바람직하게는 ≤10 또는 ≤5 또는 심지어 ≤2.5이다.
본 발명의 항체 구축물의 바람직한 구현예에서 항체 구축물은 단일 쇄 항체 구축물이다.
또한 본 발명의 항체 구축물의 바람직한 구현예에서, 상기 제3 도메인은 아미노에서 카르복실 순서로 다음을 포함한다:
힌지-CH2-CH3-링커-힌지-CH2-CH3.
본 발명의 일 구현예에서 제3 도메인의 상기 폴리펩티드 단량체 각각은 서열번호: 17 내지 24로 구성되는 군으로부터 선택되는 서열에 대해 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖는다. 본 발명의 바람직한 구현예에서 상기 폴리펩티드 단량체 각각은 서열번호: 17 내지 24로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는다.
또한 본 발명의 일 구현예에서, 제3 도메인의 폴리펩티드 단량체 중 하나 또는 바람직하게는 각각(둘 다)의 CH2 도메인은 도메인내 시스테인 이황화 가교를 포함한다. 당업계에 알려진 바와 같이 용어 "시스테인 이황화 가교"는 일반 구조식 R -S-S- R을 갖는 작용기를 지칭한다. 연결은 또한 SS-결합 또는 이황화 가교로 불리며 시스테인 잔기의 2개 티올기의 결합에 의해 유래된다. 본 발명의 항체 구축물은 성숙 항체 구축물에서 시스테인 이황화 가교를 형성하는 시스테인이 309 및 321(카바트 넘버링)에 상응하는 CH2 도메인의 아미노산 서열에 도입되는 것이 특히 바람직하다.
본 발명의 일 구현예에서, CH2 도메인의 카바트 위치 314에서 글리코실화 부위는 제거된다. 이러한 글리코실화 부위의 제거는 N314X 치환(여기에서 X는 Q를 제외한 임의의 아미노산임)에 의해 달성되는 것이 바람직하다. 상기 치환은 바람직하게는 N314G 치환이다. 더욱 바람직한 구현예에서, 상기 CH2 도메인은 추가로 다음의 치환(카바트에 따른 위치) V321C 및 R309C(이들 치환은 카바트 위치 309 및 321에서 도메인내 시스테인 이황화 가교를 도입함)을 포함한다.
예를 들어, 당업계에 공지된 이중특이성 헤테로Fc 항체 구축물와 비교하여 본 발명의 항체 구축물의 바람직한 특징은(도 1b), 그 중에서도 CH2 도메인에서 위에 기술한 변형의 도입과 관련될 수 있는 것으로 추정된다. 따라서, 본 발명의 구축물에서는, 본 발명의 항체 구축물의 제3 도메인에서 CH2 도메인이 카바트 위치 309 및 321에서 도메인내 시스테인 이황화 가교를 포함하고/하거나 카바트 위치 314에서 글리코실화 부위가 위와 같이 N314X 치환에 의해, 바람직하게는 N314G 치환에 의해 제거되는 것이 바람직하다.
본 발명의 추가적인 바람직한 구현예에서, 본 발명의 항체 구축물의 제3 도메인에서 CH2 도메인은 카바트 위치 309 및 321에서 도메인내 시스테인 이황화 가교를 포함하고, 카바트 위치 314에서 글리코실화 부위는 N314G 치환에 의해 제거된다. 가장 바람직하게는, 본 발명의 항체 구축물의 제3 도메인의 폴리펩티드 단량체는 서열번호: 17 및 18로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는다.
일 구현예에서, 본 발명은 항체 구축물을 제공하는데, 여기에서:
(i) 제1 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하고, 제2 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하거나;
(ii) 제1 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함하고, 제2 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하거나;
(iii) 제1 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하고, 제2 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함하거나;
(iv) 제1 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함하고, 제2 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함한다.
따라서, 제1 및 제2 도메인은 각각 2개의 항체 가변 도메인, 예를 들어 VH 및 VL 도메인을 포함하는 결합 도메인일 수 있다. 2개의 항체 가변 도메인을 포함하는 이러한 결합 도메인의 예는 본원에서 위에 기술되고, 예를 들어, 본원에서 위에 기술된 Fv 단편, scFv 단편 또는 Fab 단편을 포함한다. 대안적으로 이들 결합 도메인 중 하나 또는 둘 다는 단일 가변 도메인만을 포함할 수 있다. 이러한 단일 도메인 결합 도메인에 대한 예는 본원에서 위에 기술되고, 예를 들어, 다른 V 영역 또는 도메인과 독립적으로 항원 또는 에피토프에 특이적으로 결합하는, VHH, VH 또는 VL일 수 있는, 하나의 가변 도메인만을 포함하는 단일 가변 도메인 항체 또는 나노바디를 포함한다.
본 발명의 항체 구축물의 바람직한 구현예에서, 제1 및 제2 도메인은 펩티드 링커를 통해 제3 도메인에 융합된다. 바람직한 펩티드 링커는 본원에서 위에 기술되고 아미노산 서열 Gly-Gly-Gly-Gly-Ser, 즉 Gly4Ser(서열번호: 1), 또는 이의 중합체, 즉 (Gly4Ser)x를 특징으로 하는데, 여기에서 x는 1 이상의 정수(예를 들어 2 또는 3)이다. 제3 도메인에 대한 제1 및 제2 도메인의 융합을 위해 특히 바람직한 링커는 서열번호: 1에 도시된다.
바람직한 구현예에서 본 발명의 항체 구축물은 아미노에서 카르복실 순서로 다음을 포함하는 것을 특징으로 한다:
(a) 제1 도메인;
(b) 서열번호: 1 내지 3으로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커;
(c) 제2 도메인;
(d) 서열번호: 1, 2, 3, 9, 10, 11 및 12로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커;
(e) 제3 도메인의 제1 폴리펩티드 단량체;
(f) 서열번호: 5, 6, 7 및 8로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커; 및
(g) 제3 도메인의 제2 폴리펩티드 단량체.
본 발명의 일 양태에서 제1 도메인에 의해 결합되는 표적 세포 표면 항원은 종양 항원, 면역 장애에 특이적인 항원 또는 바이러스 항원이다. 본원에서 사용되는 용어 "종양 항원"은 종양 세포에서 제시되는 이들 항원으로서 이해될 수 있다. 이들 항원은 종종 분자의 막관통 및 세포질 부분과 조합되는 세포외 부분을 갖는 세포 표면에 제시될 수 있다. 이들 항원은 때때로 종양 세포에 의해서만 제시될 수 있고 정상 세포에 의해서는 제시될 수 없다. 종양 항원은 종양 세포에서 독점적으로 발현될 수 있거나 정상 세포와 비교하여 종양 특이적 돌연변이를 나타낼 수 있을 것이다. 이 경우, 이들은 종양-특이적 항원으로 불린다. 더 흔한 것은 종양 세포 및 정상 세포에 의해 제시되는 항원이고, 이들은 종양-연관 항원으로 불린다. 이들 종양-연관 항원은 정상 세포와 비교하여 과발현될 수 있거나, 정상 세포와 비교하여 종양 조직의 덜 밀집한 구조로 인해 종양 세포에서 항체 결합을 위해 접근 가능하다. 본원에서 사용되는 종양 항원의 비-제한적 예는 CDH19, MSLN, DLL3, FLT3, EGFRvIII, CD33, CD19, CD20, 및 CD70이다.
본 발명의 항체 구축물의 바람직한 구현예에서 종양 항원은 CDH19, MSLN, DLL3, FLT3, EGFRvIII, CD33, CD19, CD20, CD70, PSMA 및 BCMA로 구성되는 군으로부터 선택된다.
본 발명의 일 양태에서, 항체 구축물은 아미노에서 카르복실 순서로 다음을 포함한다:
(a) 서열번호: 52, 70, 58, 76, 88, 106, 124, 94, 112, 130, 142, 160, 178, 148, 166, 184, 196, 214, 232, 202, 220, 238, 250, 266, 282, 298, 255, 271, 287, 303, 322, 338, 354, 370, 386, 402, 418, 434, 450, 466, 482, 498, 514, 530, 546, 327, 343, 359, 375, 391, 407, 423, 439, 455, 471, 487, 503, 519, 353, 551, 592, 608, 624, 640, 656, 672, 688, 704, 720, 736, 752, 768, 784, 800, 816, 832, 848, 864, 880, 896, 912, 928, 944, 960, 976, 992, 1008, 1024, 1040, 1056, 1072, 1088, 1104, 1120, 1136, 1152, 1168, 1184, 597, 613, 629, 645, 661, 677, 693, 709, 725, 741, 757, 773, 789, 805, 821, 837, 853, 869, 885, 901, 917, 933, 949, 965, 981, 997, 1013, 1029, 1045, 1061, 1077, 1093, 1109, 1125, 1141, 1157, 1173, 1189, 1277, 1289, 1301, 1313, 1325, 1337, 1349, 1361, 1373, 1385, 1397, 1409, 1421, 1433, 1445로 구성되는 군으로부터 선택되고; 서열번호 1460 내지 1518; 및 PSMA와 관련된 50, 56, 68, 74, 86, 92, 104, 110, 122, 128, 140, 146, 158, 164, 176, 182, 194, 200, 212, 218, 230, 236, 248, 254, 266, 272, 284, 290, 302, 308(여기에서 전술한 서열번호: 50 내지 308은 각각 보충 서열 표 12에서 상응하는 수를 얻도록 41과 동일한 값으로 빼야 함), 및 보충 서열 표 12에서 PSMA와 관련된 서열번호 320, 335, 350, 365, 380, 395, 410, 425, 440, 455, 및 470에 포함되는 BCMA에 대하여 지시되는 서열로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 제1 도메인;
(b) 서열번호: 1 내지 3으로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커;
(c) 서열번호: WO 2008/119567의 서열번호: 23, 25, 41, 43, 59, 61, 77, 79, 95, 97, 113, 115, 131, 133, 149, 151, 167, 169, 185 또는 187 또는 서열번호: 15로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 제2 도메인;
(d) 서열번호: 1, 2, 3, 9, 10, 11 및 12로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커;
(e) 서열번호: 17 내지 24로 구성되는 군으로부터 선택되는 폴리펩티드 서열을 갖는 제3 도메인의 제1 폴리펩티드 단량체;
(f) 서열번호: 5, 6, 7 및 8로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커; 및
(g) 서열번호: 17 내지 24로 구성되는 군으로부터 선택되는 폴리펩티드 서열을 갖는 제3 도메인의 제2 폴리펩티드 단량체.
이 바람직한 구현예와 관련하여 펩티드 링커를 통해 단일 쇄 폴리펩티드에 융합되는 제1 및 제2 도메인은 다음으로 구성되는 군으로부터 선택되는 서열을 포함한다:
(a) 서열번호: 53 및 59; CD33
(b) 서열번호: 71 및 77; EGFRvIII
(c) 서열번호: 89, 107, 125, 95, 113, 및 131; MSLN
(d) 서열번호: 143, 161, 179, 149, 167, 및 185; CDH19
(e) 서열번호: 197, 215, 233, 203, 221, 및 239; DLL3
(f) 서열번호: 251, 267, 283, 299, 256, 272, 288, 및 304; CD19
(g) 서열번호: 323, 339, 355, 371, 387, 403, 419, 435, 451, 467, 483, 499, 515, 531, 547, 328, 344, 360, 376, 392, 408, 424, 440, 456, 472, 488, 504, 520, 536, 및 552; FLT3
(h) 서열번호: 593, 609, 625, 641, 657, 673, 689, 705, 721, 737, 753, 769, 785, 801, 817, 833, 849, 865, 881, 897, 913, 929, 945, 961, 977, 993, 1009, 1025, 1041, 1057, 1073, 1089, 1105, 1121, 1137, 1153, 1169, 1185, 598, 614, 630, 646, 662, 678, 694, 710, 726, 742, 758, 774, 790, 806, 822, 838, 854, 870, 886, 902, 918, 934, 950, 966, 982, 998, 1014, 1030, 1046, 1062, 1078, 1094, 1110, 1126, 1142, 1158, 1174, 및 1190; CD70
(i) 서열번호: 1268; 및 CD20
(j) 서열번호: 1278, 1290, 1302, 1314, 1326, 1338, 1350, 1362, 1374, 1386, 1398, 1410, 1422, 1434, 1446. CD19
(k) 서열번호: 1472, 1478, 1491, 1497, 1509, 1515에 포함되는 각각의 서열 BCMA
(l) 서열번호: 1527, 1533, 1545, 1551, 1563, 1569, 1581, 1587, 1599, 1605, 1617, 1623, 1635, 1641, 1653, 1659, 1671, 1677, 1689, 1695, 1707, 1713, 1725, 1731, 1743, 1749, 1761 1767, 1779, 1785, 1797, 1812, 1827, 1842, 1857, 1872, 1887, 1902, 1917, 1927, 1937, 1947, 1962 PSMA
일 양태에서 본 발명의 항체 구축물은 다음으로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 것을 특징으로 한다:
(a) 서열번호: 54, 55, 60, 및 61; CD33
(b) 서열번호: 72, 73, 78, 및 79; EGFRvIII
(c) 서열번호: 90, 91, 96, 97, 108, 109, 114, 및 115; MSLN
(d) 서열번호: 144, 145, 150, 151, 162, 163, 168, 169, 180, 181, 186, 및 187; CDH19
(e) 서열번호: 198, 199, 204, 205, 216, 217, 222, 223, 234, 235, 240, 및 241; DLL3
(f) 서열번호: 252, 306, 257, 307, 268, 308, 273, 309, 284, 310, 289, 311, 300, 312, 305, 및 313; CD19
(g) 서열번호: 324, 554, 329, 555, 340, 556, 345, 557, 356, 558, 361, 559, 372, 560, 377, 561, 388, 562, 393, 563, 404, 564, 409, 565, 420, 566, 425, 567, 436, 568, 441, 569, 452, 570, 457, 571, 468, 572, 473, 573, 484, 574, 489, 575, 500, 576, 505, 577, 516, 578, 521, 579, 532, 580, 537, 581, 548, 582, 553, 및 583; FLT3
(h) 서열번호: 594, 610, 626, 642, 658, 674, 690, 706, 722, 738, 754, 77, 786, 802, 818, 834, 850, 866, 882, 898, 914, 930, 946, 962, 978, 994, 1010, 1026, 1042, 1058, 1074, 1090, 1106, 1122, 1138, 1154, 1170, 1186, 599, 615, 631, 647, 663, 679, 695, 711, 727, 743, 759, 775, 791, 807, 823, 839, 855, 871, 887, 903, 919, 935, 951, 967, 983, 999, 1015, 1031, 1047, 1063, 1079, 1095, 1111, 1127, 1143, 1159, 1175, 1191, 및 1192 내지 1267; CD70
(i) 서열번호: 43; CD20
(j) 서열번호: 1279, 1280, 1291, 1292, 1303, 1304, 1315, 1316, 1327, 1328, 1339, 1340, 1351, 1352, 1363, 1364, 1375, 1376, 1387, 1388, 1399, 1400, 1411, 1412, 1423, 1424, 1435, 1436, 1447, 1448. CD19
(k) 서열번호: 1473, 1474, 1475, 1479 1480, 1481, 1492, 1493, 1494, 1498, 1499, 1500, 1510, 1511, 1512, 1516, 1517, 1518 BCMA
(l) 1528, 1529, 1530, 1534, 1535, 1536, 1546, 1547, 1548, 1552, 1553, 1554, 1564, 1565, 1566, 1570, 1571, 1572, 1582, 1583, 1584, 1588, 1589, 1590, 1600, 1601, 1602, 1606, 1607, 1608, 1618, 1619, 1620, 1624, 1625, 1626, 1636, 1637, 1638, 1642, 1643, 1644, 1654, 1655, 1656, 1660, 1661, 1662, 1672, 1673, 1674, 1678, 1679, 1680, 1690, 1691, 1692, 1696, 1697, 1698, 1708, 1709, 1710, 1714, 1715, 1716, 1726, 1727, 1728, 1732, 1733, 1734, 1744, 1745, 1746, 1750, 1751, 1752, 1762, 1763, 1764, 1768, 1769, 1770, 1774, 1775, 1776, 1786, 1787, 1788, 1798, 1799, 1800, 1801, 1802, 1803, 1813, 1814, 1815, 1816, 1817, 1818, 1828, 1829, 1830, 1831, 1832, 1833, 1843, 1844, 1845, 1846, 1847, 1848, 1858, 1859, 1860, 1861, 1862, 1863, 1873, 1874, 1875, 1876, 1877, 1878, 1888, 1889, 1890, 1891, 1892, 1893, 1903, 1904, 1905, 1906, 1907, 1908, 1918, 1919, 1920, 1921, 1922, 1923, 1933, 1934, 1935, 1936, 1937, 1938, 1948, 1949, 1950, 1951, 1952, 1953, 및 1963 PSAM
본 발명은 추가로 본 발명의 항체 구축물을 암호화하는 폴리뉴클레오티드/핵산 분자를 제공한다. 폴리뉴클레오티드는 쇄에서 공유 결합된 13개 이상의 뉴클레오티드 단량체로 구성되는 생물고분자이다. DNA(예를 들어 cDNA) 및 RNA(예를 들어 mRNA)는 별개의 생물학적 기능을 갖는 폴리뉴클레오티드의 예이다. 뉴클레오티드는 DNA 또는 RNA와 같은 핵산 분자의 단량체 또는 서브유닛으로서 작용하는 유기 분자이다. 핵산 분자 또는 폴리뉴클레오티드는 이중 가닥 및 단일 가닥, 선형 및 원형일 수 있다. 이는 바람직하게는 숙주 세포에 포함된 벡터에 바람직하게 포함된다. 상기 숙주 세포는, 예를 들어 본 발명의 벡터 또는 폴리뉴클레오티드로 형질전환 또는 형질감염 후에 항체 구축물을 발현할 수 있다. 이 목적을 위해, 폴리뉴클레오티드 또는 핵산 분자는 대조 서열과 작동 가능하게 연결된다.
유전 암호는 유전 물질(핵산) 내에 암호화된 정보가 단백질로 번역되는 규칙의 세트이다. 살아있는 세포에서의 생물학적 해독(decoding)은, tRNA를 사용하여 아미노산을 운반하고 mRNA 3개의 뉴클레오티드를 한 번에 판독하도록 mRNA에 의해 특정된 순서로 아미노산을 연결하는 리보솜에 의해 달성된다. 이 암호는 코돈으로 불리는 이들 뉴클레오티드 트리플렛의 서열이 어느 아미노산이 단백질 합성 동안 다음에 부가되는지를 지정하는 방법을 정의한다. 일부를 제외하고, 핵산 서열 내 3개의 뉴클레오티드 코돈은 단일 아미노산을 지정한다. 대다수의 유전자는 정확히 동일한 암호에 의해 암호화되기 때문에, 이 특정 암호는 종종 기본형 또는 표준 유전자 암호로서 지칭된다. 유전자 암호는 주어진 암호 영역에 대한 단백질 서열을 결정하지만, 다른 게놈 영역이 이들 단백질이 생산되는 시기 및 장소에 영향을 미칠 수 있다.
추가로, 본 발명은 본 발명의 폴리뉴클레오티드/핵산 분자를 포함하는 벡터를 제공한다. 벡터는 (외래) 유전 물질을 세포 내로 이동시키는 비히클로서 사용되는 핵산 분자이다. 용어 "벡터"는 플라스미드, 바이러스, 코스미드 및 인공 염색체를 포함하지만, 이로 제한되지 않는다. 일반적으로, 조작된 벡터는 복제 기점, 다중클로닝 부위 및 선택 가능한 마커를 포함한다. 벡터 자체는 일반적으로, 인서트(이식유전자) 및 벡터의 "골격"으로서 작용하는 더 큰 서열을 포함하는 통상적으로 DNA 서열인 뉴클레오티드 서열이다. 현대의 벡터는 이식유전자 인서트 및 골격 이외의 추가적인 특징: 프로모터, 유전자 마커, 항생제 저항성, 리포터 유전자, 표적화 서열, 단백질 정제 태그를 포함할 수 있다. 발현 벡터(발현 구축물)로 불리는 벡터는 구체적으로 표적 세포에서 이식유전자의 발현을 위한 것이며, 일반적으로 제어 서열을 갖는다.
용어 "제어 서열"은 특정 숙주 유기체에서 작동 가능하게 연결된 암호 서열의 발현에 필요한 DNA 서열을 지칭한다. 원핵생물에 적합한 제어 서열은, 예를 들어, 프로모터, 선택적으로 오퍼레이터 서열, 및 리보솜 결합 측을 포함한다. 진핵생물 세포는 프로모터, 폴리아데닐화 신호 및 인핸서를 이용하는 것으로 알려져 있다.
핵산은 다른 핵산 서열과 기능적 관계에 놓일 때 "작동 가능하게 연결된다". 예를 들어, 전서열 또는 분비 리더에 대한 DNA는 폴리펩티드의 분비에 참여하는 전단백질로서 발현되는 경우 폴리펩티드에 대한 DNA에 작동 가능하게 연결되거나; 프로모터 또는 인핸서는 서열의 전사에 영향을 미치는 경우 암호 서열에 작동 가능하게 연결되거나; 리보솜 결합 측은 번역을 용이하게 하기 위해 위치되는 경우 암호 서열에 작동 가능하게 연결된다. 일반적으로, "작동 가능하게 연결된"은 연결되는 DNA 서열이 인접해 있고, 분비 리더의 경우, 인접하면서 리딩 단계에 있다는 것을 의미한다. 그러나, 인핸서는 인접할 필요가 없다. 연결은 편리한 제한 부위에서의 결찰에 의해 달성된다. 이러한 부위가 존재하지 않는 경우, 합성 올리고뉴클레오티드 어댑터 또는 링커가 관례에 따라 사용된다.
"형질감염"은 핵산 분자 또는 폴리뉴클레오티드(벡터를 포함)를 표적 세포 내로 의도적으로 도입하는 과정이다. 이 용어는 대부분 진핵 세포에서 비-바이러스 방법을 위해 사용된다. 형질도입은 종종 핵산 분자 또는 폴리뉴클레오티드의 바이러스-매개 전달을 기술하기 위해 사용된다. 동물 세포의 형질감염은 전형적으로 세포 막에서 일시적 기공 또는 "구멍"의 개방을 수반하여, 물질의 흡수를 허용한다. 형질감염은 인산칼슘을 사용하여, 전기천공법에 의해, 세포 압착에 의해, 또는 세포막과 융합하고 내부에 그들의 화물을 놓는 리포솜을 생성하는 물질과 양이온성 지질을 혼합하는 것에 의해 실시될 수 있다.
용어 "형질전환"은 핵산 분자 또는 폴리뉴클레오티드(벡터를 포함)의 박테리아 내로의, 그리고 또한 식물 세포를 포함하는 비동물 진핵 세포 내로의 비바이러스 전달을 기술하기 위해 사용된다. 따라서, 형질전환은 그 주위로부터의 세포 막(들)을 통한 직접적 흡수 및 차후의 외인성 유전 물질(핵산 분자)의 혼입으로부터 초래되는 박테리아 또는 비동물 진핵 세포의 유전적 변경이다. 형질전환은 인공 수단에 의해서 행해질 수 있다. 형질전환이 일어나기 위해서는, 세포 또는 박테리아가 기아 및 세포 밀도와 같은 환경 조건에 대한 시간-제한된 반응으로서 일어날 수 있는 기능 상태에 있어야 한다.
게다가, 본 발명은 본 발명의 폴리뉴클레오티드/핵산 또는 벡터로 형질전환되거나 형질감염된 숙주 세포를 제공한다. 본원에서 사용되는 용어 "숙주 세포" 또는 "수용자 세포"는 벡터, 외인성 핵산 분자, 및 본 발명의 항체 구축물을 암호화하는 폴리뉴클레오티드의 수용자; 및/또는 항체 구축물 자체의 수용자일 수 있거나 수용자였던 임의의 개개 세포 또는 세포 배양물을 포함하고자 한다. 세포 내로의 각각의 물질의 도입은 형질전환, 형질감염 등에 의해 실시된다. 용어 "숙주 세포"는 또한 단일 세포의 자손 또는 잠재적 자손을 포함하고자 한다. 특정 변형이 자연적, 우연적 또는 의도적인 돌연변이에 기인하거나 환경적 영향에 기인하여 다음 세대에서 일어날 수 있기 때문에, 이러한 자손은 사실 (형태학적으로나 게놈 또는 총 DNA 보체에 있어) 모 세포와 완전히 동일하지 않을 수도 있지만, 본원에서 사용되는 용어의 범주 내에 여전히 포함된다. 적합한 숙주 세포는 원핵 또는 진핵 세포를 포함하고, 또한 박테리아, 효모 세포, 진균 세포, 식물 세포, 및 동물 세포, 예를 들어 곤충 세포 및 포유류 세포, 예를 들어, 뮤린, 래트, 마카크 또는 인간을 포함하지만, 이로 한정되지 않는다.
본 발명의 항체 구축물은 박테리아에서 생산될 수 있다. 발현 후, 본 발명의 항체 구축물은 가용성 분획에서 대장균(E. coli) 세포 페이스트로부터 분리되고, 예를 들어, 친화성 크로마토그래피 및/또는 크기 배제를 통해 정제될 수 있다. 최종 정제는, 예를 들어 CHO 세포에서 발현된 항체를 정제하기 위한 공정과 유사하게 실시될 수 있다.
원핵생물에 추가로, 진핵 미생물, 예를 들어 사상 진균 또는 효모는 본 발명의 항체 구축물에 대해 적합한 클로닝 또는 발현 숙주이다. 사카로마이세스 세레비시애(Saccharomyces cerevisiae), 또는 일반 제빵 효모가 하등 진핵생물 숙주 미생물 중에서 가장 일반적으로 사용된다. 그러나, 다수의 다른 속, 종, 및 균주, 예를 들어 쉬조사카로마이세스 폼베(Schizosaccharomyces pombe), 클루이베로마이세스(Kluyveromyces) 숙주, 예를 들어 K. 락티스(K. lactis), K. 프라길리스(K. fragilis)(ATCC 12424), K. 불가리쿠스(K. bulgaricus)(ATCC 16045), K. 위케라미이(K. wickeramii)(ATCC 24178), K. 왈티이(K. waltii)(ATCC 56500), K. 드로소필라룸(K. drosophilarum)(ATCC 36906), K. 써모톨레란스(K. thermotolerans), 및 K. 막시아누스(K. marxianus); 야로위아(yarrowia)(EP 402 226); 피치아 파스토리스(Pichia pastoris)(EP 183 070); 칸디다; 트리코더마 레시아(Trichoderma reesia)(EP 244 234); 뉴로스포라 크라사(Neurospora crassa); 슈와니오마이세스(Schwanniomyces), 예를 들어 슈와니오마이세스 옥시덴탈리스(Schwanniomyces occidentalis); 및 사상 진균, 예를 들어 뉴로스포라(Neurospora), 페니실륨(Penicillium), 톨리포클라듐(Tolypocladium) 및 아스퍼길러스(Aspergillus) 숙주, 예를 들어 A. 니둘란스(A. nidulans) 및 A. 니거(A. niger)는 통상적으로 이용 가능하고, 본원에서 유용하다.
본 발명의 글리코실화된 항체 구축물의 발현을 위해 적합한 숙주 세포는 다세포 유기체로부터 유래된다. 무척추 세포의 예는 식물 및 곤충 세포를 포함한다. 스포돕테라 프루기페르다(Spodoptera frugiperda)(애벌레), 이집트 숲모기(Aedes aegypti)(모기), 흰줄숲모기(Aedes albopictus)(모기), 노랑초파리(Drosophila melanogaster)(초파리), 및 누에나방(Bombyx mori)과 같은 숙주로부터의 수많은 바큘로바이러스 균주 및 변이체 및 상응하는 허용 곤충 숙주 세포가 확인되어 있다. 형질감염을 위한 다양한 바이러스 균주, 예를 들어, 오토그라파 캘리포니카(Autographa californica) NPV의 L-1 변이체 및 누에나방(Bombyx mori) NPV의 Bm-5 균주는 공개적으로 이용 가능하며, 이러한 바이러스는 본 발명에 따라 본원에서 바이러스로서, 특히 스포돕테라 프루기페르다(Spodoptera frugiperda) 세포의 형질감염을 위해 사용될 수 있다.
목화, 옥수수, 감자, 대두, 페튜니아, 토마토, 애기장대 및 담배의 식물 세포 배양물이 또한 숙주로서 사용될 수 있다. 식물 세포 배양물에서 단백질의 생산에 유용한 클로닝 및 발현 벡터는 당업자에게 공지되어 있다. 예를 들어, Hiatt et al., Nature (1989) 342: 76-78, Owen et al. (1992) Bio/Technology 10: 790-794, Artsaenko et al. (1995) The Plant J 8: 745-750, 및 Fecker et al. (1996) Plant Mol Biol 32: 979-986 참조.
그러나, 척추동물 세포가 가장 유력하게 여겨져 왔으며, 배양물(조직 배양물)에서 척추동물 세포의 증식은 통상적인 절차가 되었다. 유용한 포유류 숙주 세포주의 예는 SV40에 의해 형질전환된 원숭이 신장 CV1 세포주(COS-7, ATCC CRL 1651); 인간 배아 신장 세포주(현탁 배양에서의 성장을 위해 서브클로닝된 293 또는 293 세포, Graham et al., J. Gen Virol. 36: 59 (1977)); 베이비 햄스터 신장 세포(BHK, ATCC CCL 10); 중국 햄스터 난소 세포/-DHFR(CHO, Urlaub et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77: 4216 (1980)); 마우스 세르톨리 세포(TM4, Mather, Biol. Reprod. 23: 243-251 (1980)); 원숭이 신장 세포(CVI ATCC CCL 70); 아프리카 녹색 원숭이 신장 세포(VERO-76, ATCC CRL1587); 인간 자궁경부 암종 세포(HELA, ATCC CCL 2); 개 신장 세포(MDCK, ATCC CCL 34); 버팔로 래트 간 세포(BRL 3A, ATCC CRL 1442); 인간 폐 세포(W138, ATCC CCL 75); 인간 간 세포(Hep G2,1413 8065); 마우스 유방 종양(MMT 060562, ATCC CCL5 1); TRI 세포(Mather et al., Annals N. Y Acad. Sci. (1982) 383: 44-68); MRC 5 세포; FS4 세포; 및 인간 간세포주(Hep G2)이다.
추가의 구현예에서 본 발명은 본 발명의 항체 구축물의 생산 방법을 제공하는데, 상기 방법은 본 발명의 항체 구축물의 발현을 허용하는 조건 하에서 본 발명의 숙주 세포를 배양하고 생산된 항체 구축물을 배양물로부터 회수하는 단계를 포함한다.
본원에서 사용되는 용어 "배양"은 배지에서 적합한 조건 하에 세포의 시험관내 유지, 분화, 성장, 증식 및/또는 전파를 지칭한다. 용어 "발현"은 전사, 전사후 변형, 번역, 번역후 변형 및 분비를 포함하지만, 이로 한정되지 않는 본 발명의 항체 구축물의 생산에 연루된 임의의 단계를 포함한다.
재조합 기법을 사용할 때, 항체 구축물은 주변 세포질 공간에서 세포내 생산될 수 있거나, 배지로 직접 분비될 수 있다. 항체 구축물이 제1 단계로서 세포내 생산되는 경우, 숙주 세포 또는 용해된 단편 중 하나인 미립자 파편은, 예를 들어 원심분리 또는 한외여과에 의해 제거된다. Carter et al., Bio/Technology 10: 163-167 (1992)에서는 대장균(E. coli)의 주변세포질 공간으로 분비되는 항체를 분리하는 절차를 기술한다. 간략하게, 세포 페이스트를 약 30분에 걸쳐 아세트산나트륨(pH 3.5), EDTA 및 페닐메틸술포닐플루오라이드(PMSF)의 존재 중에 해동한다. 세포 파편은 원심분리에 의해 제거될 수 있다. 항체가 배지로 분비되는 경우, 이러한 발현 시스템으로부터의 상등액은 일반적으로 처음에 상업적으로 입수 가능한 단백질 농축 필터, 예를 들어, 아미콘(Amicon) 또는 밀리포어(Millipore) 펠리콘(Pellicon) 한외여과 유닛을 사용하여 농축된다. PMSF와 같은 프로테아제 억제제는 단백질 분해를 억제하기 위해 전술한 임의의 단계에 포함될 수 있고, 항생제는 우발적 오염물의 성장을 방지하기 위해 포함될 수 있다.
숙주 세포로부터 제조된 본 발명의 항체 구축물은, 예를 들어, 하이드록시아파타이트 크로마토그래피, 겔 전기영동, 투석 및 친화성 크로마토그래피를 사용하여 회수되거나 정제될 수 있다. 회수되는 항체에 따라 단백질 정제를 위한 다른 기법, 예를 들어 이온 교환 칼럼에서의 분별, 에탄올 침전, 역상 HPLC, 실리카에서의 크로마토그래피, 헤파린 세파로오스(SEPHAROSE™)에서의 크로마토그래피, 음이온 또는 양이온 교환 수지(예를 들어, 폴리아스파르트산 칼럼)에서의 크로마토그래피, 크로마토-포커싱, SDS-PAGE, 및 황산암모늄 침전이 또한 이용 가능하다. 본 발명의 항체 구축물이 CH3 도메인을 포함하는 경우, 베이커본드(Bakerbond) ABX 수지(J.T. Baker, Phillipsburg, NJ)가 정제에 유용하다.
친화성 크로마토그래피는 바람직한 정제 기법이다. 친화성 리간드가 부착되는 기질은 가장 흔하게는 아가로오스이지만, 다른 기질도 이용 가능하다. 기계적으로 안정한 기질, 예를 들어 제어된 기공 유리 또는 폴리(스티렌디비닐)벤젠은 아가로오스로 달성될 수 있는 것보다 더 빠른 유속 및 더 짧은 처리 시간을 허용한다.
게다가, 본 발명은 본 발명의 항체 구축물 또는 본 발명의 방법에 따라 생산된 항체 구축물을 포함하는 약제학적 조성물을 제공한다. 본 발명의 약제학적 조성물에서 항체 구축물의 동질성은 ≥80%, 더욱 바람직하게는 ≥81%, ≥82%, ≥83%, ≥84%, 또는 ≥85%, 더욱 바람직하게는 ≥86%, ≥87%, ≥88%, ≥89%, 또는 ≥90%, 한층 더 바람직하게는 ≥91%, ≥92%, ≥93%, ≥94%, 또는 ≥95%, 그리고 가장 바람직하게는 ≥96%, ≥97%, ≥98% 또는 ≥99%이다.
본원에서 사용되는 용어 "약제학적 조성물"은 환자, 바람직하게는 인간 환자에 대한 투여에 적합한 조성물에 관한 것이다. 본 발명의 특히 바람직한 약제학적 조성물은 하나 또는 복수의 본 발명의 항체 구축물(들)을, 바람직하게는 치료적 유효량으로 포함한다. 바람직하게는, 약제학적 조성물은 추가로 하나 이상의 (약제학적으로 효과적인) 담체, 안정화제, 부형제, 희석제, 용해제, 계면활성제, 유화제, 보존제 및/또는 보조제의 적합한 제형을 포함한다. 조성물의 허용 가능한 구성 성분은 바람직하게는 이용되는 투여량 및 농도에서 수용자에게 비독성이다. 본 발명의 약제학적 조성물은 액체, 동결 및 동결건조 조성물을 포함하지만, 이로 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함할 수 있다. 일반적으로, 본원에서 사용되는 "약제학적으로 허용 가능한 담체"는 약제학적 투여에 적합한, 특히 비경구 투여에 적합한 임의의 및 모든 수성 및 비수성 용액, 멸균 용액, 용매, 완충제, 예를 들어, 인산염 완충 식염수(PBS) 용액, 물, 현탁액, 에멀션, 예를 들어 오일/물 에멀션, 다양한 유형의 습윤제, 리포솜, 분산매 및 코팅제를 의미한다. 약제학적 조성물에서 이러한 매질 및 작용제의 용도는 당업계에 잘 알려져 있고, 이러한 담체를 포함하는 조성물은 잘 알려진 통상적인 방법에 의해 제형화될 수 있다.
특정 구현예는 본 발명의 항체 구축물 및 추가적인 1종 이상의 부형제, 예를 들어 본원의 이 부문 및 다른 곳에 예시적으로 기술된 것들을 포함하는 약제학적 조성물을 제공한다. 부형제는 본 발명에서 이와 관련하여 매우 다양한 목적, 예를 들어 제형의 물리적, 화학적 또는 생물학적 특성의 조정, 예를 들어 점도의 조정, 그리고 또는 유효성을 개선하고 또는, 예를 들어 제조, 운송, 저장, 사용전 제제, 투여 동안 그리고 그 이후에 일어나는 스트레스에 기인하는 분해 및 손상에 대하여 이러한 제형 및 공정을 안정화시키도록 본 발명의 공정을 위해 사용될 수 있다.
특정 구현예에서, 약제학적 조성물은, 예를 들어, pH, 삼투압, 점도, 투명도, 색상, 등장성, 냄새, 멸균성, 안정성, 용출 또는 방출 속도, 조성물의 흡수 또는 침투를 변형시키거나, 유지하거나 보존하는 목적을 위한 제형화 물질을 함유할 수 있다(REMINGTON'S PHARMACEUTICAL SCIENCES, 18" Edition, (A.R. Genrmo, ed.), 1990, Mack Publishing Company 참조). 이러한 구현예에서, 적합한 제형화 물질은 하기를 포함할 수 있지만, 이로 한정되지 않는다:
하전된 아미노산, 바람직하게는 리신, 리신 아세테이트, 아르기닌, 글루타메이트 및/또는 히스티딘을 비롯한 아미노산, 예를 들어 글리신, 알라닌, 글루타민, 아스파라긴, 트레오닌, 프롤린, 2-페닐알라닌,
항미생물제, 예를 들어 항균제 및 항진균제
항산화제, 예를 들어 아스코르브산, 메티오닌, 아황산나트륨 또는 아황산수소나트륨;
조성물을 약 4.0 내지 6.5, 바람직하게는 4.2 내지 4.8의 산성 pH로 유지하기 위해 사용되는 완충제, 완충 시스템 및 완충 작용제; 완충제의 예는 보레이트, 시트레이트, 포스페이트 또는 다른 유기산, 숙시네이트, 포스페이트, 히스티딘 및 아세테이트; 또는 예를 들어 대략 pH 4.0 내지 5.5의 아세테이트 완충액임;
비-수성 용매, 예를 들어 프로필렌 글리콜, 폴리에틸렌 글리콜, 식물유 예를 들어 올리브유, 및 주사 가능한 유기 에스테르, 예를 들어 에틸 올리에이트;
식염수 및 완충 매질을 포함하는, 물, 알코올성/수성 용액, 에멀션 또는 현탁액을 포함하는 수성 담체;
생분해성 중합체, 예를 들어 폴리에스테르;
증량제, 예를 들어 만니톨 또는 글리신;
킬레이트제, 예를 들어 에틸렌디아민 테트라아세트산(EDTA);
등장화제 및 흡수 지연제;
착화제, 예를 들어 카페인, 폴리비닐피롤리돈, 베타-사이클로덱스트린 또는 하이드록시프로필-베타-사이클로덱스트린;
충전제;
단당류; 이당류; 및 다른 탄수화물(예를 들어 글루코오스, 만노오스 또는 덱스트린); 탄수화물은 비환원 당, 바람직하게는 트레할로오스, 수크로오스, 옥타설페이트, 소르비톨, 또는 자일리톨일 수 있음;
(저분자량) 단백질, 폴리펩티드 또는 단백질성 담체, 예를 들어 인간 또는 소 혈청 알부민, 젤라틴 또는 면역글로불린, 바람직하게는 인간 기원의 것;
착색제 및 향미제;
황 함유 환원제, 예를 들어 글루타티온, 티옥산, 티오글리콜산나트륨, 티오글리세롤, [알파]-모노티오글리세롤 및 티오황산나트륨
희석제;
유화제;
친수성 중합체, 예를 들어 폴리비닐피롤리돈;
염-형성 반대-이온, 예를 들어 나트륨;
보존제, 예를 들어 항미생물제, 항산화제, 킬레이트제, 불활성 기체 등; 예로는 염화벤잘코늄, 벤조산, 살리실산, 티메로살, 페네틸 알코올, 메틸파라벤, 프로필파라벤, 클로르헥시딘, 소르브산, 또는 과산화수소가 있음;
금속 복합체, 예를 들어 Zn-단백질 복합체;
용매 및 공용매(예를 들어 글리세린, 프로필렌 글리콜 또는 폴리에틸렌 글리콜);
당 및 당 알코올, 예를 들어, 트레할로오스, 수크로오스, 옥타설페이트, 만니톨, 소르비톨 또는 자일리톨 스타키오스, 만노오스, 소르보오스, 자일로오스, 리보오스, 미오이니시토오스, 갈락토오스, 락티톨, 리비톨, 미오이니시톨, 갈락티톨, 글리세롤, 사이클리톨(예를 들어, 이노시톨), 폴리에틸렌 글리콜; 및 다가 당 알코올;
현탁제;
계면활성제 또는 습윤제, 예를 들어 플루로닉스, PEG, 소르비탄 에스테르, 폴리소르베이트, 예를 들어 폴리소르베이트 20, 폴리소르베이트, 트리톤, 트로메타민, 레시틴, 콜레스테롤, 틸록사팔; 계면활성제는 바람직하게는 분자량 >1.2 KD인 세제 및/또는 바람직하게는 분자량 >3 KD인 폴리에테르일 수 있고; 바람직한 세제의 비제한적 예는 트윈 20, 트윈 40, 트윈 60, 트윈 80 및 트윈 85이며; 바람직한 폴리에테르의 비제한적 예는 PEG 3000, PEG 3350, PEG 4000 및 PEG 5000임;
안정성 향상제, 예를 들어 수크로오스 또는 소르비톨;
장성 향상제, 예를 들어 알칼리금속 할로겐화물, 바람직하게는 염화나트륨 또는 염화칼륨, 만니톨 소르비톨;
염화나트륨 용액, 링거(Ringer's) 덱스트로오스, 덱스트로오스 및 염화나트륨, 젖산 링거 또는 고정유를 포함하는 비경구 전달 비히클;
유체 및 영양 보충제, 전해질 보충제를 포함하는 정맥내 전달 비히클(예를 들어, 링거 덱스트로오스를 기반으로 하는 것).
약제학적 조성물의 상이한 구성 성분(예를 들어, 위에 열거한 것들)은 상이한 효과를 가질 수 있고, 예를 들어, 아미노산은 완충제, 안정화제 및/또는 항산화제로서 작용할 수 있으며; 만니톨은 증량제 및/또는 장성 향상제로서 작용할 수 있고; 염화나트륨은 전달 비히클 및/또는 장성 향상제로서 작용할 수 있는 것 등은 당업자에게 명백하다.
본 발명의 조성물은, 본원에서 정의되는 본 발명의 폴리펩티드에 추가로, 조성물의 의도된 용도에 따라 추가적인 생물학적으로 활성인 작용제를 포함할 수 있을 것으로 고려된다. 이러한 작용제는 위장관계에 작용하는 약물, 세포정지제로서 작용하는 약물, 고요산혈증을 예방하는 약물, 면역반응을 억제하는 약물(예를 들어, 코르티코스테로이드), 염증 반응을 조절하는 약물, 순환계에 작용하는 약물 및/또는 당업계에 공지된 사이토카인과 같은 작용제일 수 있다. 또한, 본 발명의 항체 구축물은 공동 요법으로, 즉, 다른 항암 약제와 조합으로 적용되는 것이 고려된다.
특정 구현예에서, 최적의 약제학적 조성물은, 예를 들어, 의도된 투여 경로, 전달 형식 및 요망되는 투여량에 따라 당업자에 의해 결정될 것이다. 예를 들어, 위의 REMINGTON'S PHARMACEUTICAL SCIENCES 참조. 특정 구현예에서, 이러한 조성물은 본 발명의 항체 구축물의 물리적 상태, 안정성, 생체내 방출 속도 및 생체내 제거에 영향을 미칠 수 있다. 특정 구현예에서, 약제학적 조성물 중의 1차 비히클 또는 담체는 성질이 수성 또는 비수성일 수 있다. 예를 들어, 적합한 비히클 또는 담체는 가능하게는 비경구 투여용 조성물에서 통상적인 다른 물질로 보충된 주사용수, 생리 식염수 용액 또는 인공 뇌척수액일 수 있다. 중성 완충 식염수 또는 혈청 알부민과 혼합된 식염수는 추가의 예시적인 비히클이다. 특정 구현예에서, 본 조성물의 항체 구축물은 요망되는 순도를 갖는 선택된 조성물을 선택적 제형화제와 혼합함으로써(위의 REMINGTON'S PHARMACEUTICAL SCIENCES 참조) 동결건조 케이크 또는 수용액의 형태로 저장을 위해 제조될 수 있다. 추가로, 특정 구현예에서, 본 발명의 항체 구축물은 수크로오스와 같은 적절한 부형제를 사용하여 동결건조물로서 제형화될 수 있다.
비경구 투여가 고려될 때, 본 발명에서 사용하기 위한 치료 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 비히클 중에 요망되는 본 발명의 항체 구축물을 포함하는 무 발열원, 비경구로 허용 가능한 수용액의 형태로 제공될 수 있다. 비경구 주사에 특히 적합한 비히클은 멸균 증류수로, 본 발명의 항체 구축물이 적절하게 보존된 멸균, 등장 용액으로서 제형화된다. 특정 구현예에서, 제제는 데포 주사를 통해 전달될 수 있는 산물의 제어 또는 지속 방출을 제공할 수 있는 작용제, 예를 들어 주사 가능한 마이크로스피어, 생분해성 입자, 중합체 화합물(예를 들어, 폴리락트산 또는 폴리글리콜산), 비드 또는 리포솜과 요망되는 분자의 제형화를 수반할 수 있다. 특정 구현예에서, 순환에서 지속 기간을 촉진하는 효과를 갖는 히알루론산이 또한 사용될 수 있다. 특정 구현예에서, 이식 가능한 약물 전달 기구가 요망되는 항체 구축물을 도입하기 위해 사용될 수 있다.
지속 또는 제어 전달/방출 제형에서 본 발명의 항체 구축물을 포함하는 제형을 포함하는 추가적인 약제학적 조성물은 당업자에게 명백할 것이다. 다양한 다른 지속 또는 제어 전달 수단, 예를 들어 리포솜 담체, 생분해성 마이크로입자 또는 다공성 비드 및 데포 주사를 제형화하기 위한 기법이 또한 당업자에게 공지되어 있다. 예를 들어, 약제학적 조성물의 전달을 위한 다공성 중합체 마이크로입자의 제어 방출을 기술하는 국제 특허 출원 번호 PCT/US93/00829 참조. 지속 방출 제제는 성형된 물품의 형태, 예를 들어 필름 또는 마이크로캡슐로 반투과성 중합체 기질을 포함할 수 있다. 지속 방출 기질은 폴리에스테르, 하이드로겔, 폴리락티드(미국 특허 번호 3,773,919 및 유럽 특허 출원 공개 번호 EP 058481에 기술된 바와 같은), L-글루탐산과 감마 에틸-L-글루타메이트의 공중합체(Sidman et al., 1983, Biopolymers 2:547-556), 폴리(2-하이드록시에틸-메타크릴레이트)(Langer et al., 1981, J. Biomed. Mater. Res. 15:167-277 및 Langer, 1982, Chem. Tech. 12:98-105), 에틸렌 비닐 아세테이트(위의 Langer et al., 1981) 또는 폴리-D(-)-3-하이드록시부티르산(유럽 특허 출원 공개 번호 EP 133,988)을 포함할 수 있다. 지속 방출 조성물은 또한 당업계에 공지된 임의의 몇 가지 방법에 의해 제조될 수 있는 리포솜을 포함할 수 있다. 예를 들어, Eppstein et al., 1985, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82:3688-3692; 유럽 특허 출원 공개 번호 EP 036,676; EP 088,046 및 EP 143,949 참조.
항체 구축물은 또한, 예를 들어 코아세르베이션 기법에 의하거나 계면 중합에 의해 제조된 마이크로캡슐(예를 들어, 각각 하이드록시메틸셀룰로오스 또는 젤라틴-마이크로캡슐 및 폴리(메틸메타크릴레이트) 마이크로캡슐)에, 콜로이드 약물 전달 시스템(예를 들어, 리포솜, 알부민 마이크로스피어, 마이크로에멀션, 나노입자 및 나노캡슐)에, 또는 마크로에멀션에 포집될 수 있다. 이러한 기법은 Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th edition, Oslo, A., Ed., (1980)에 개시되어 있다.
생체내 투여를 위해 사용되는 약제학적 조성물은 전형적으로 멸균 제제로서 제공된다. 멸균은 멸균 여과막을 통한 여과에 의해 달성될 수 있다. 조성물이 동결건조될 때, 이 방법을 사용하는 멸균은 동결건조 및 재구성 전 또는 후에 수행될 수 있다. 비경구 투여를 위한 조성물은 동결건조 형태로 또는 용액으로 저장될 수 있다. 비경구 조성물은 일반적으로 멸균 접근 포트를 갖는 용기, 예를 들어 정맥내 용액 백(bag) 또는 피하 주사 바늘에 의해 천공될 수 있는 마개를 갖는 바이알에 놓인다.
본 발명의 다른 양태는 국제 특허 출원 WO 06138181A2(PCT/US2006/022599)에 기술된 바와 같은 약제학적 조성물로서 사용될 수 있는 본 발명 제형의 자기-완충 항체 구축물을 포함한다. 단백질 안정화 및 제형화 물질 및 이와 관련하여 유용한 방법에 대한 다양한 설명이 이용 가능하며, 예를 들어 Arakawa et al., "Solvent interactions in pharmaceutical formulations," Pharm Res. 8(3): 285-91 (1991); Kendrick et al., "Physical stabilization of proteins in aqueous solution" in: RATIONAL DESIGN OF STABLE PROTEIN FORMULATIONS: THEORY AND PRACTICE, Carpenter and Manning, eds. Pharmaceutical Biotechnology. 13: 61-84 (2002), 및 Randolph et al., "Surfactant-protein interactions", Pharm Biotechnol. 13: 159-75 (2002), 특히 본 발명에 따라 자기-완충 단백질 제형을 위한 이의 부형제 및 공정과 관련된 부분, 특히 수의학 및/또는 인간 의약 용도를 위한 단백질 약제학적 산물 및 공정에 관한 부분 참조.
예를 들어, 제형의 이온 강도 및/또는 등장성을 조정하기 위해, 그리고/또는 본 발명에 따른 조성물의 단백질 또는 다른 성분의 용해성 및/또는 물리적 안정성을 개선하기 위해 본 발명의 특정 구현예에 따라 염이 사용될 수 있다. 잘 알려진 바와 같이, 이온은 단백질의 표면에서 하전된 잔기에 결합함으로써, 그리고 단백질에서 하전 및 극성 기를 차폐하고 이들의 정전기적 상호작용, 끌어당기고 반발하는 상호작용을 감소시킴으로써 단백질의 천연 상태를 안정화시킬 수 있다. 이온은 또한, 특히 단백질의 변성 펩티드 연결(--CONH)에 대한 결합에 의해 단백질의 변성 상태를 안정화시킬 수 있다. 더 나아가, 단백질에서 하전 및 극성 기와의 이온성 상호작용은 또한 분자간 정전기적 상호작용을 감소시킬 수 있고, 이에 의해 단백질 응집 및 불용성을 방지하거나 감소시킬 수 있다.
이온 종은 단백질에 대한 그들의 영향이 상당히 다르다. 본 발명에 따라 약제학적 조성물을 제형화하는 데 사용될 수 있는, 많은 범주형 순위의 이온 및 이들의 단백질에 대한 영향이 개발되었다. 일 예는 용액에서 단백질의 입체형태 안정성에 대한 그들의 영향에 의해 이온성 및 극성 비이온성 용질을 평가하는 호프마이스터(Hofmeister) 시리즈이다. 용질 안정화는 "코스모트로픽(kosmotropic)"으로서 지칭된다. 용질 탈안정화는 "카오트로픽(chaotropic)"으로서 지칭된다. 코스모트로프는 용액로부터 단백질을 침전시키기 위해("염석") 일반적으로 고농도(예를 들어, >1 몰 황산암모늄)에서 사용된다. 카오트로프는 통상적으로 단백질을 변성 및/또는 가용화("염용")하기 위해 사용된다. "염용" 및 "염석"에 대한 이온의 상대적 유효성은 호프마이스터 시리즈에서 그들의 위치를 정의한다.
유리 아미노산은 본 발명의 다양한 구현예에 따라 본 발명 제형의 항체 구축물에서 증량제, 안정화제, 및 항산화제뿐만 아니라 다른 표준 용도로서 사용될 수 있다. 리신, 프롤린, 세린, 및 알라닌은 제형에서 단백질을 안정화시키기 위해 사용될 수 있다. 글리신은 정확한 케이크 구조 및 특성을 보장하기 위해 동결건조에서 유용하다. 아르기닌은 액체 및 동결건조 제형 둘 다에서 단백질 응집을 억제하는 데 유용할 수 있다. 메티오닌은 항산화제로서 유용하다.
폴리올은 당, 예를 들어, 만니톨, 수크로오스, 및 소르비톨 및, 예를 들어 글리세롤 및 프로필렌 글리콜과 같은 다가 알코올, 그리고 본원에서 논의의 목적을 위해, 폴리에틸렌 글리콜(PEG) 및 관련 물질을 포함한다. 폴리올은 코스모트로픽이다. 그들은 물리적 그리고 화학적 분해 공정으로부터 단백질을 보호하기 위한 액체 및 동결건조 제형 둘 다에서 유용한 안정화제이다. 폴리올은 또한 제형의 장성을 조정하기에 유용하다. 폴리올 중에서 본 발명의 선택 구현예에서 유용한 것은, 동결건조 제형에서 케이크의 구조적 안정성을 보장하기 위해 통상적으로 사용되는 만니톨이다. 이는 케이크에 대한 구조적 안정성을 보장한다. 이는 일반적으로 동결건조보호제, 예를 들어, 수크로오스와 함께 사용된다. 장성을 조정하기 위한 바람직한 작용제 중에, 그리고 제조 공정 동안 벌크의 제조 또는 운송 동안 냉동-해동 스트레스에 대해 보호하기 위한 안정화제로서 소르비톨 및 수크로오스가 있다. 환원당(유리 알데히드 또는 케톤 기를 포함함), 예를 들어 글루코오스 및 락토오스는 표면 리신 및 아르기닌 잔기를 당화시킬 수 있다. 따라서, 이들은 일반적으로 본 발명에 따라 사용하기에 바람직한 폴리올 중에 있지 않다. 추가로, 산성 조건 하에서 프룩토오스 및 글루코오스로 가수분해되고, 결과적으로 당화를 발생하게 하는 수크로오스와 같은 이러한 반응성 종을 형성하는 당은 또한 이와 관련하여 본 발명의 바람직한 폴리올 중에 있지 않다. PEG는 단백질을 안정화하는데, 그리고 동결보호제로서 유용하고, 이와 관련하여 본 발명에서 사용될 수 있다.
본 제형의 항체 구축물의 구현예는 계면활성제를 추가로 포함한다. 단백질 분자는 표면에서의 흡착 및 변성이 용이할 수 있고, 그 결과 공기-액체, 고체-액체, 및 액체-액체 계면에서의 응집이 용이할 수 있다. 이들 영향은 일반적으로 단백질 농도와 역으로 증감된다. 이들 유해 상호작용은 일반적으로 단백질 농도와 역으로 증감되고, 전형적으로 제품의 운송 및 처리 동안 생성되는 것과 같은 물리적 교반에 의해 악화된다. 계면활성제는 통상적으로 표면 흡착을 방지하거나, 최소화하거나, 감소시키기 위해 사용된다. 이와 관련하여 본 발명에서 유용한 계면활성제는 폴리소르베이트 20, 폴리소르베이트 80, 소르비탄 폴리에톡실레이트의 다른 지방산 에스테르, 및 폴록사머(poloxamer) 188을 포함한다. 계면활성제는 또한 단백질 입체형태 안정성을 제어하기 위해 통상적으로 사용된다. 이와 관련하여 계면활성제의 사용은 단백질-특이적인데, 임의의 주어진 계면활성제는 전형적으로 일부 단백질을 안정화하고, 다른 것을 탈안정화할 것이기 때문이다.
폴리소르베이트는 산화적 분해가 용이하고 종종, 공급되는 바와 같이, 단백질 잔기 측쇄, 특히 메티오닌의 산화를 야기하기에 충분한 양의 과산화물을 함유한다. 결과적으로, 폴리소르베이트는 주의하여 사용되어야 하며, 사용시에는 이들의 최저 유효 농도로 이용되어야 한다. 이와 관련하여, 폴리소르베이트는 부형제가 그들의 최저 유효 농도로 사용되어야 할 일반적 규칙을 예시한다.
본 발명 제형의 항체 구축물의 구현예는 1종 이상의 항산화제를 추가로 포함한다. 어느 정도까지 단백질의 유해 산화는 적절한 수준의 주위 산소 및 온도를 유지함으로써, 그리고 광에 대한 노출을 회피함으로써 약제학적 제형에서 방지될 수 있다. 항산화제 부형제는 단백질의 산화적 분해를 방지하기 위해서도 사용될 수 있다. 이와 관련하여 유용한 항산화제 중에 환원제, 산소/유리-라디칼 스캐빈저, 및 킬레이트제가 있다. 본 발명에 따른 치료 단백질 제형에서 사용하기 위한 항산화제는 바람직하게는 수용성이며, 제품의 저장 수명 내내 그들의 활성을 유지한다. EDTA는 이와 관련하여 본 발명에 따른 바람직한 항산화제이다. 항산화제는 단백질을 손상시킬 수 있다. 예를 들어, 특히 글루타티온과 같은 환원제는 분자내 이황화 연결을 파괴할 수 있다. 따라서, 본 발명에 사용하기 위한 항산화제는, 다른 것들 중에서도, 제형에서 그 자체가 단백질을 손상시킬 가능성을 제거하거나 충분히 감소시키도록 선택된다.
본 발명에 따른 제형은 단백질 공동인자이고, 단백질 배위 착물을 형성하는 데 필요한 금속 이온, 예를 들어 특정 인슐린 현탁액을 형성하는 데 필요한 아연을 포함할 수 있다. 금속 이온은 또한 단백질을 분해하는 일부 과정을 억제할 수 있다. 그러나, 금속 이온은 또한 단백질을 분해하는 물리적 및 화학적 과정에 촉매 작용을 한다. 마그네슘 이온(10 내지 120 mM)은 아스파르트산의 이소아스파르트산으로의 이성질체화를 억제하기 위해 사용될 수 있다. Ca+2 이온(100 mM까지)은 인간 데옥시리보뉴클레아제의 안정성을 증가시킬 수 있다. 그러나, Mg+2, Mn+2, 및 Zn+2는 rhDNase를 탈안정화시킬 수 있다. 유사하게, Ca+2 및 Sr+2은 인자 VIII을 안정화시킬 수 있고, 이는 Mg+2, Mn+2 및 Zn+2, Cu+2 및 Fe+2에 의해 탈안정화될 수 있으며, 이의 응집은 Al+3 이온에 의해 증가될 수 있다.
본 발명 제형의 항체 구축물의 구현예는 1종 이상의 보존제를 추가로 포함한다. 보존제는 동일 용기로부터 1회 초과의 추출을 수반하는 다회 용량 비경구 제형을 개발할 때 필요하다. 이들의 1차 기능은 약물 제품의 사용 기간 또는 저장 수명 내내 미생물 성장을 억제하고 제품 멸균성을 보장하는 것이다. 일반적으로 사용되는 보존제는 벤질 알코올, 페놀 및 m-크레졸을 포함한다. 보존제는 소분자 비경구제와 함께 오랜 사용의 역사를 갖지만, 보존제를 포함하는 단백질 제형의 개발은 난관일 수 있다. 보존제는 거의 항상 단백질에 대한 탈안정화 효과(응집)를 가지며, 이것은 다회 용량 단백질 제형에서의 이들의 사용을 제한하는 주된 인자가 되고 있다. 지금까지, 대부분의 단백질 약물은 일회용으로만 제형화되었다. 그러나, 다회 용량 제형이 가능할 때, 이들은 환자의 편의성 및 증가된 시장성을 가능하게 하는 부가적인 이점을 갖는다. 좋은 예는 보존된 제형의 개발이 더 편리한, 다회용 주사 펜 제시의 상업화로 이어진 인간 성장 호르몬(hGH)의 경우이다. hGH의 보존된 제형을 포함하는 적어도 4개의 이러한 펜 기구는 현재 시중에서 입수 가능하다. 노르디트로핀(액체, Novo Nordisk), 뉴트로핀 AQ(액체, Genentech) 및 제노트로핀(동결건조된--이중 챔버 카트리지, Pharmacia & Upjohn)은 페놀을 함유하는 한편, 소마트로프(Eli Lilly)는 m-크레졸로 제형화된다. 보존된 투약 형태의 제형화 및 개발 동안 몇 가지 양태가 고려될 필요가 있다. 약물 제품에서 유효한 보존제 농도는 최적화되어야 한다. 이는 단백질 안정성을 손상시키지 않고 항미생물 유효성을 부여하는 농도 범위로 투약 형태에서 주어진 보존제를 시험하는 것을 요구한다.
예상할 수 있는 바와 같이, 보존제를 함유하는 액체 제형의 개발은 동결건조 제형보다 더 어렵다. 동결건조 제품은 보존제 없이 동결건조될 수 있고, 사용 시 보존제 함유 희석제로 재구성될 수 있다. 이는 보존제가 단백질과 접촉하는 시간을 단축시키고, 관련된 안정성 위험을 상당히 최소화한다. 액체 제형에서는, 보존제 유효성 및 안정성이 전체 제품 저장 수명(약 18 내지 24개월)에 걸쳐 유지되어야 한다. 언급하는 중요한 점은 보존제 유효성이 활성 약물 및 모든 부형제 구성 성분을 함유하는 최종 제형에서 입증되어야 한다는 것이다.
본원에 개시된 항체 구축물은 또한 면역-리포솜으로서 제형화될 수 있다. "리포솜"은 포유류에 대한 약물의 전달에 유용한 다양한 유형의 지질, 인지질 및/또는 계면활성제로 구성된 작은 소포이다. 리포솜의 구성 성분은 생물학적 막의 지질 배열과 유사한 이중층 형성으로 통상 배열된다. 항체 구축물을 포함하는 리포솜은 Epstein et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82: 3688 (1985); Hwang et al., Proc. Natl Acad. Sci. USA, 77: 4030 (1980); 미국 특허 번호 4,485,045 및 4,544,545; 및 W0 97/38731에 기술된 바와 같은, 당업계에 공지된 방법에 의해 제조된다. 향상된 순환 시간을 갖는 리포솜은 미국 특허 번호 5,013,556에 개시되어 있다. 특히 유용한 리포솜은 포스파티딜콜린, 콜레스테롤 및 PEG-유도체화된 포스파티딜에탄올아민(PEG-PE)을 포함하는 지질 조성물을 사용하는 역상 증발 방법에 의해 생성될 수 있다. 리포솜을 정의된 기공 크기의 필터를 통해 압출하여 요망되는 직경을 갖는 리포솜을 수득한다. 본 발명의 항체 구축물의 Fab' 단편은 Martin et al. J. Biol. Chem. 257: 286-288 (1982)에 기술된 바와 같이 이황화물 교환 반응을 통해 리포솜에 접합될 수 있다. 화학요법제는 선택적으로 리포솜 내에 함유된다. Gabizon et al. J. National Cancer Inst. 81 (19) 1484 (1989) 참조.
일단 약제학적 조성물이 제형화되면, 이는 용액, 현탁액, 겔, 에멀션, 고체, 결정으로서, 또는 탈수되거나 동결건조된 분말로서 멸균 바이알에 저장될 수 있다. 이러한 제형은 바로 사용 가능한 형태 또는 투여 전에 재구성되는 (예를 들어, 동결건조된) 형태로 저장될 수 있다.
본원에 정의되는 약제학적 조성물의 생물학적 활성은, 예를 들어 다음의 실시예, WO 99/54440 또는 Schlereth 등(Cancer Immunol. Immunother. 20 (2005), 1-12)에 의해 기재된 바와 같이, 세포독성 분석에 의해 결정될 수 있다. 본원에서 사용되는 바와 같은 "효능" 또는 "생체내 효능"은, 예를 들어 표준화된 NCI 반응 기준을 사용하여 본 발명의 약제학적 조성물에 의한 요법에 대한 반응을 지칭한다. 본 발명의 약제학적 조성물을 사용하는 요법의 성공 또는 생체내 효능은 의도된 목적을 위한 조성물의 유효성, 즉 이의 요망되는 효과, 즉 병리 세포, 예를 들어 종양 세포의 고갈을 야기하는 조성물의 능력을 지칭한다. 생체내 효능은 백혈구 계수, 감별, 형광 활성화 세포 분류, 골수 흡인을 포함하지만, 이로 한정되지 않는 각각의 질환 개체에 대해 확립된 표준 방법에 의해 모니터링될 수 있다. 추가로, 다양한 질환 특이적 임상 화학적 파라미터 및 기타 확립된 표준 방법이 사용될 수 있다. 나아가, 컴퓨터-보조 단층 촬영, X-선, 핵 자기 공명 단층 촬영(예를 들어, 국립 암 연구소-기준 기반의 반응 평가[Cheson BD, Horning SJ, Coiffier B, Shipp MA, Fisher RI, Connors JM, Lister TA, Vose J, Grillo-Lopez A, Hagenbeek A, Cabanillas F, Klippensten D, Hiddemann W, Castellino R, Harris NL, Armitage JO, Carter W, Hoppe R, Canellos GP. 비-호지킨 림프종에 대한 반응 기준을 표준화하기 위한 국제 워크숍 보고서. NCI Sponsored International Working Group. J Clin Oncol. 1999 Apr;17(4):1244]), 양전자-방출 단층 촬영 스캐닝, 백혈구 계수, 감별, 형광 활성화 세포 분류, 골수 흡인, 림프절 생검/조직학, 및 다양한 림프종 특이적 임상 화학적 파라미터(예를 들어, 락테이트 데하이드로게나아제) 및 기타 확립된 표준 방법이 사용될 수 있다.
본 발명의 약제학적 조성물과 같은 약물의 개발에서 다른 주된 과제는 약동학적 특성의 예측 가능한 조절이다. 이 목적을 위하여, 약물 후보의 약동학적 프로파일, 즉 주어진 병태를 치료하기 위한 특정 약물의 능력에 영향을 미치는 약동학적 파라미터의 프로파일이 확립될 수 있다. 특정 질환 개체를 치료하기 위한 약물의 능력에 영향을 미치는 약물의 약동학적 파라미터는 반감기, 분포 용적, 간 초회-통과 대사 및 혈청 결합의 정도를 포함하지만, 이로 한정되지 않는다. 주어진 약물 작용제의 효능은 위에 언급한 각각의 파라미터에 의해 영향을 받을 수 있다.
"반감기"는 투여된 약물의 50%가 생물학적 과정, 예를 들어 대사, 배설 등을통해 제거되는 시간을 의미한다. "간 초회-통과 대사"는 간과의 초회 접촉에서, 즉 간을 통한 초회 통과 동안 대사되는 약물의 경향을 의미한다. "분포 용적"은, 예를 들어 세포내 및 세포외 공간, 조직 및 기관 등과 같은 신체의 다양한 구획 전체에 걸친 약물의 체류 정도, 및 이들 구획 내의 약물의 분포를 의미한다. "혈청 결합의 정도"는 알부민과 같은 혈청 단백질과 상호작용하고 이에 결합하여 약물의 생물학적 활성의 감소 또는 손실을 야기하는 약물의 경향을 의미한다.
약동학적 파라미터는 또한 투여되는 약물의 주어진 양에 대한 생물학적 이용가능성, 지체 시간(Tlag), Tmax, 흡수율, 더 많은 개시 및/또는 Cmax를 포함한다. "생물학적 이용가능성"은 혈액 구획에서의 약물의 양을 의미한다. "지체 시간"은 약물의 투여와 혈액 또는 혈장에서 이의 검출 및 측정 가능성 사이의 시간 지연을 의미한다. "Tmax"는 약물의 최대 혈중 농도에 도달한 후의 시간이며, "Cmax"는 주어진 약물에 의해 최대로 얻어진 혈중 농도이다. 생물학적 효과를 위해 요구되는 약물의 혈액 또는 조직 농도에 도달하는 시간은 모든 파라미터에 의해 영향을 받는다. 위에 약술한 바와 같은 비침팬지 영장류에서의 전임상 동물 시험에서 결정될 수 있는 교차종 특이성을 나타내는 이중특이성 항체 구축물의 약동학적 파라미터는 또한, 예를 들어 Schlereth 등에 의한 간행물에 제시된다(Cancer Immunol. Immunother. 20 (2005), 1-12).
본 발명의 바람직한 양태에서 약제학적 조성물은 약 -20℃에서 적어도 4주 동안 안정하다. 첨부된 실시예로부터 명백한 바와 같이, 본 발명의 항체 구축물의 품질 대 상응하는 상태의 업계 항체 구축물의 품질은 상이한 시스템을 사용하여 시험할 수 있다. 이들 시험은 "ICH Harmonised Tripartite Guideline: Stability Testing of Biotechnological/Biological Products Q5C and Specifications: Test procedures and Acceptance Criteria for Biotech Biotechnological/Biological Products Q6B"에 따른 것으로 이해되고, 따라서 제품의 확인, 순도 및 효능에서의 변화가 검출되는 확실성을 제공하는 안정성-표시 프로파일을 제공하도록 선택된다. 용어 순도는 상대적 용어인 것으로 잘 수용된다. 글리코실화, 탈아미드화, 또는 다른 이질성의 영향에 기인하여, 생명공학적/생물학적 제품의 절대 순도는 전형적으로 한 가지 초과의 방법에 의해 평가되어야 하며, 얻어지는 순도 값은 방법-의존적이다. 안정성 시험의 목적을 위해, 순도에 대한 시험은 분해 산물의 결정을 위한 방법에 중점을 두어야 한다.
본 발명의 항체 구축물을 포함하는 약제학적 조성물의 품질에 대한 평가를 위해서는, 예를 들어 용액에서의 가용성 응집물 함량(크기 배제 당 HMWS)을 분석함으로써 분석될 수 있다. 약 -20℃에서 적어도 4주 동안의 안정성은 1.5% 미만 HMWS, 바람직하게는 1% 미만 HMWS의 함량을 특징으로 하는 것이 바람직하다.
약제학적 조성물로서 항체 구축물의 바람직한 제형은 위에 구체적으로 제시된다. 그러나, 정확한 다음 제형은 덜 바람직할 수 있고, 이에 따라 청구되지 않는다:
제형 A:
20 mM 인산칼륨, 150 mM L-아르기닌 염산염, 6%(w/V) 트레할로오스 이수화물, 0.01%(w/V) 폴리소르베이트 80, pH 6.0
제형 B:
10 mM 글루타메이트, 4%(w/V) 만니톨, 2%(w/V) 수크로오스, 0.01%(w/V) 폴리소르베이트 80, pH 4.0
약제학적 조성물 형태인 본 발명의 항체 구축물의 안정성 평가를 위한 다른 예는 첨부되는 실시예 4 내지 12에서 제공된다. 이들 실시예에서, 본 발명의 항체 구축물의 구현예를 상이한 약제학적 제형에서 상이한 스트레스 조건에 대하여 시험하고 결과를 당업계에 공지된 이중특이성 T 세포 관여 항체 구축물의 다른 반감기 연장(HLE) 형식과 비교한다. 일반적으로, 본 발명에 따른 특이적 Fc 모달리티를 구비한 항체 구축물은 전형적으로, 상이한 HLE 형식을 구비한 항체 구축물 및 임의의 HLE 형식이 없는 항체 구축물(즉, "기본형" 항체 구축물) 둘 다와 비교하여, 온도 및 광 스트레스와 같은 광범위한 스트레스 조건에 걸쳐 더 안정한 것으로 고려된다. 상기 온도 안정성은 저하된(냉동을 포함하여 실온 아래) 온도 및 증가된(체온까지나 체온 위의 온도를 포함하여 실온 위) 온도 둘 다에 관한 것일 수 있다. 당업자가 인정하는 바와 같이, 임상 실무에서 거의 회피할 수 없는 스트레스에 대하여 이렇게 개선된 안정성은 항체 구축물을 더 안전하게 만드는데, 임상 실무에서 더 적은 분해 생성물이 생길 것이기 때문이다. 결과적으로, 상기 증가된 안정성은 증가된 안전성을 의미한다.
일 구현예는 증식성 질환, 종양 질환, 바이러스 질환 또는 면역 장애의 예방, 치료 또는 개선에 사용하기 위한 본 발명의 항체 구축물, 또는 본 발명의 방법에 따라 생산된 항체 구축물을 제공한다.
본원에 기재된 제형은 본원에 기술되는 바와 같은 병리적 의학적 병태의 치료, 개선 및/또는 예방에서 이를 필요로 하는 환자에 약제학적 조성물로서 유용하다. 용어 "치료"는 치료적 처치와 예방적 또는 방지적 조치 둘 다를 지칭한다. 치료는 질환, 질환의 증상, 또는 질환에 대한 소인을 치료하거나, 치유하거나, 경감하거나, 완화하거나, 변경하거나, 교정하거나, 좋아지게 하거나, 개선하거나, 영향을 미치기 위한 목적으로 질환/장애, 질환/장애의 증상, 또는 질환/장애에 대한 소인을 갖는 환자로부터의 신체, 분리된 조직, 또는 세포에 대한 제형의 적용 또는 투여를 포함한다.
본원에서 사용되는 용어 "개선"은 본 발명에 따른 항체 구축물을 이를 필요로 하는 대상에 투여하는 것에 의한, 본원에서 이하에 명시된 바와 같은 종양 또는 암 또는 전이성 암을 갖는 환자의 질환 상태의 임의의 개선을 지칭한다. 이러한 개선은 또한 환자의 종양 또는 암 또는 전이성 암의 진행의 둔화 또는 중단으로서 보일 수 있다. 본원에서 사용되는 용어 "예방"은 본 발명에 따른 항체 구축물을 이를 필요로 하는 대상에 투여하는 것에 의한, 본원에서 이하에 명시된 바와 같은 종양 또는 암 또는 전이성 암을 갖는 환자의 발생 또는 재발의 회피를 의미한다.
용어 "질환"은 본원에서 기술되는 항체 구축물 또는 약제학적 조성물에 의한 치료로부터 혜택을 받을 임의의 병태를 지칭한다. 이는 포유류를 문제의 질환에 취약하게 만드는 이들 병리적 병태를 포함하는 만성 및 급성 장애 또는 질환을 포함한다.
"신생물"은 항상은 아니지만 보통 덩어리를 형성하는 조직의 비정상적 성장이다. 또한 덩어리를 형성할 때, 그것은 일반적으로 "종양"으로 지칭된다. 신생물 또는 종양은 양성, 잠재적으로 악성(전암성) 또는 악성일 수 있다. 악성 신생물은 통상적으로 암으로 불린다. 이들은 보통 주변 조직을 침윤하고 파괴하며, 전이를 형성할 수 있어, 즉 이들은 신체의 다른 부분, 조직 또는 기관으로 퍼진다. 따라서, 용어 "전이성 암"은 본래의 종양의 것이 아닌 다른 조직 또는 기관으로의 전이를 포함한다. 림프종 및 백혈병은 림프성 신생물이다. 본 발명의 목적에서, 이들은 또한 용어 "종양" 또는 "암"에 포함된다.
용어 "바이러스 질환"은 대상의 바이러스 감염의 결과인 질환을 기술한다.
본원에서 사용되는 용어 "면역 장애"는 이 용어의 통상적인 정의와 관련하여 자가면역 질환, 과민증, 면역 결핍증과 같은 면역 장애를 기술한다.
일 구현예에서 본 발명은 본 발명의 항체 구축물, 또는 본 발명의 방법에 따라 생산된 항체 구축물을 이를 필요로 하는 대상에 투여하는 단계를 포함하는, 증식성 질환, 종양 질환, 바이러스 질환 또는 면역 장애의 치료 또는 개선을 위한 방법을 제공한다.
용어 "필요로 하는 대상" 또는 "치료를 필요로 하는" 대상은 이미 장애가 있는 대상뿐만 아니라 장애가 예방될 대상을 포함한다. 필요로 하는 대상 또는 "환자"는 예방적 또는 치료적 처치를 받는 인간 및 다른 포유류 대상을 포함한다.
본 발명의 항체 구축물은 일반적으로 투여의 특정 경로 및 방법에 대해, 특정 투약량 및 투여 빈도에 대해, 특정 질환의 특정 치료에 대해, 다른 것들 중에서도 생물학적 이용가능성 및 지속성의 범위를 갖고 설계될 것이다. 조성물의 재료는 바람직하게는 투여의 부위에 허용 가능한 농도로 제형화된다.
따라서 제형 및 조성물은 임의의 적합한 투여 경로에 의한 전달을 위해 본 발명에 따라 설계될 수 있다. 본 발명의 맥락에서, 투여 경로는 하기를 포함하지만, 이로 한정되지 않는다:
국소 경로(예를 들어, 표피, 흡입, 비강, 안과, 청각/귀, 질, 점막);
장 경로(예를 들어, 경구, 위장관, 설하, 구순하, 협측, 직장); 및
비경구 경로(예를 들어, 정맥내, 동맥내, 골내, 근육내, 뇌내, 뇌실내, 경막외, 척추강내, 피하, 복막내, 양막외, 관절내, 심장내, 피내, 병소내, 자궁내, 방광내, 유리체내, 경피, 비강내, 경점막, 활막내, 관내).
본 발명의 약제학적 조성물 및 항체 구축물은, 예를 들어 일회분 주사와 같은 주사에 의하거나, 연속적 주입과 같은 주입에 의한 비경구 투여, 예를 들어, 피하 또는 정맥내 전달에 특히 유용하다. 약제학적 조성물은 의료 기구를 사용하여 투여될 수 있다. 약제학적 조성물을 투여하기 위한 의료 기구의 예는 미국 특허 번호 4,475,196; 4,439,196; 4,447,224; 4,447,233; 4,486,194; 4,487,603; 4,596,556; 4,790,824; 4,941,880; 5,064,413; 5,312,335; 5,312,335; 5,383,851; 및 5,399,163에 기술되어 있다.
특히, 본 발명은 적합한 조성물의 중단되지 않는 투여를 제공한다. 비제한적 예로서, 중단되지 않는, 또는 실질적으로 중단되지 않는, 즉, 연속적 투여는 환자의 신체 내로 치료제의 유입을 계량하기 위해 환자가 착용하는 소형 펌프 시스템에 의해 실현될 수 있다. 본 발명의 항체 구축물을 포함하는 약제학적 조성물은 상기 펌프 시스템을 사용함으로써 투여될 수 있다. 이러한 펌프 시스템은 일반적으로 당업계에 공지되어 있으며, 주입되는 치료제를 함유하는 카트리지의 주기적 교환에 통상적으로 의존한다. 이러한 펌프 시스템에서 카트리지를 교환할 때, 다르게는 중단되지 않는 치료제의 환자 신체 내로의 흐름의 일시적 중단이 뒤따를 수 있다. 이러한 경우에, 카트리지 교체 전의 투여 단계 및 카트리지 교체 후의 투여 단계는 약제학적 수단의 의미 내에서 여전히 고려될 것이고 본 발명의 방법은 함께 이러한 치료제의 한 번의 "중단되지 않는 투여"를 구성한다.
본 발명의 항체 구축물의 연속적 또는 중단되지 않는 투여는, 저장소 밖으로 유체를 구동하기 위한 유체 구동 기전 및 구동 기전을 작동시키기 위한 작동 기전을 포함하는 유체 전달 기구 또는 소형 펌프 시스템에 의한 정맥내 또는 피하일 수 있다. 피하 투여를 위한 펌프 시스템은 환자의 피부를 관통하고 환자의 신체로 적합한 조성물을 전달하기 위한 바늘 또는 삽입관을 포함할 수 있다. 상기 펌프 시스템은 정맥, 동맥 또는 혈관과 독립적으로 환자의 피부에 직접 고정되거나 부착될 수 있고, 이에 의해 펌프 시스템과 환자의 피부 사이에 직접적인 접촉을 허용한다. 펌프 시스템은 24시간 동안 며칠까지 환자의 피부에 부착될 수 있다. 펌프 시스템은 작은 용량을 위한 저장소를 갖는 소형 크기의 것일 수 있다. 비제한적 예로서, 투여되는 적합한 약제학적 조성물을 위한 저장소의 용량은 0.1 내지 50 mL일 수 있다.
연속적 투여는 또한 피부에 착용하고 간격을 두고 교체되는 패치에 의한 경피적일 수 있다. 당업자는 이 목적에 적합한 약물 전달을 위한 패치 시스템을 인지한다. 경피 투여는 특히 중단되지 않는 투여를 잘 처리하는데, 첫 번째 다 쓴 패치의 교환이, 예를 들어 첫 번째 다 쓴 패치에 바로 인접한 피부의 표면에서, 그리고 첫 번째 다 쓴 패치의 제거 직전에 새로운 두 번째 패치의 교환과 동시에 유리하게 달성될 수 있기 때문이다. 유동 중단 또는 동력 전지 고장의 문제는 생기지 않는다.
약제학적 조성물이 동결건조된 경우, 동결건조된 물질은 투여 전에 적절한 액체에서 먼저 재구성된다. 동결건조된 물질은, 예를 들어 정균성 주사용수(BWFI), 생리 식염수, 인산염 완충 식염수(PBS)에서, 또는 동결건조 전에 단백질이 있었던 동일 제형으로 재구성될 수 있다.
본 발명의 조성물은 예를 들어, 비침팬지 영장류, 예를 들어, 마카크에 대해 본원에 기술되는 교차종 특이성을 나타내는 본 발명의 항체 구축물의 증가된 용량의 투여에 의한 용량 증가 연구에 의해 결정될 수 있는 적합한 용량으로 대상에 투여될 수 있다. 위에 제시한 바와 같이, 본원에 기술되는 교차종 특이성을 나타내는 본 발명의 항체 구축물은 비침팬지 영장류에서의 전임상 시험에서와 동일한 형태로, 그리고 인간에서의 약물로서 유리하게 사용될 수 있다. 투약량 요법은 담당 의사 및 임상 인자에 의해 결정될 것이다. 의학 분야에 잘 알려진 바와 같이, 임의의 한 명의 환자에 대한 투약량은 환자의 크기, 체표면적, 연령, 투여되는 특정 화합물, 성별, 투여 시간 및 경로, 일반적 건강상태, 및 동시에 투여되는 다른 약물을 포함하는 많은 인자에 의존한다.
용어 "유효 용량" 또는 "유효 투약량"은 요망되는 효과를 달성하거나 적어도 부분적으로 달성하기에 충분한 양으로서 정의된다. 용어 "치료적 유효 용량"은 이미 질환이 있는 환자에서 질환 및 이의 합병증을 치유하거나 적어도 부분적으로 저지하기에 충분한 양으로서 정의된다. 이 용도에 유효한 양 또는 용량은 치료되는 병태(적응증), 전달되는 항체 구축물, 치료 상황 및 목적, 질환의 중증도, 사전 요법, 환자의 임상 이력 및 치료제에 대한 반응, 투여의 경로, 크기(체중, 체표면 또는 기관 크기) 및/또는 환자의 병태(연령 및 일반적 건강상태), 및 환자 자신의 면역계의 일반적 상태에 의존할 것이다. 적절한 용량은 1회 또는 일련의 투여에 걸쳐 환자에 투여될 수 있도록, 그리고 최적의 치료 효과를 얻기 위해 담당 의사의 판단에 따라 조정될 수 있다.
전형적인 투약량은 위에 언급한 인자에 따라 약 0.1 μg/kg 내지 약 30 mg/kg 이상까지의 범위일 수 있다. 구체적인 구현예에서, 투약량은 1.0 μg/kg 내지 약 20 mg/kg, 선택적으로 10 μg/kg 내지 약 10 mg/kg 또는 100 μg/kg 내지 약 5 mg/kg의 범위일 수 있다.
본 발명의 항체 구축물의 치료적 유효량은 바람직하게는 질환 증상의 중증도 저하, 질환 무-증상 시기의 빈도 또는 기간의 증가 또는 질환 고통으로 인한 손상 또는 장애의 예방을 초래한다. 표적 세포 항원-발현 종양의 치료를 위해, 치료적 유효량의 본 발명의 항체 구축물, 예를 들어 항-표적 세포 항원/항-CD3 항체 구축물은 세포 성장 또는 종양 성장을 치료받지 않는 환자에 비해서, 바람직하게는 적어도 약 20%, 적어도 약 40%, 적어도 약 50%, 적어도 약 60%, 적어도 약 70%, 적어도 약 80%, 또는 적어도 약 90% 억제한다. 종양 성장을 억제하는 화합물의 능력은 효능을 예측하는 동물 모델에서 평가될 수 있다.
약제학적 조성물은 단독 치료제로서, 또는 필요하다면 추가적인 치료제, 예를 들어 항암 요법, 예를 들어, 다른 단백질성 및 비단백질성 약물과 조합으로 투여될 수 있다. 이들 약물은 본원에서 정의되는 바와 같은 본 발명의 항체 구축물을 포함하는 조성물과 동시에, 또는 시기적절하게 정의된 간격 및 용량으로 상기 항체 구축물의 투여 전 또는 후에 별개로 투여될 수 있다.
본원에서 사용되는 용어 "유효 및 비독성 용량"은 주된 독성 효과가 없거나 본질적으로 없이 병적 세포의 고갈, 종양 제거, 종양 수축 또는 질환의 안정화를 야기하기에 충분히 높은 본 발명의 항체 구축물의 용인 가능한 용량을 지칭한다. 이러한 유효 및 비독성 용량은, 예를 들어 당업계에 기술된 용량 증가 연구에 의해 결정될 수 있고, 중증의 유해 부작용(용량 제한 독성, DLT)을 유도하는 용량 아래이어야 한다.
본원에서 사용되는 용어 "독성"은 유해 사건 또는 중증의 유해 사건으로 나타나는 약물의 독성 영향을 지칭한다. 이들 부작용은 일반적으로 약물 내약성의 결여 및/또는 투여 후 국소 내약성의 결여를 지칭할 수 있을 것이다. 독성은 또한 약물에 의해 야기되는 기형 유발성 또는 발암성 영향을 포함할 수 있을 것이다.
본원에서 사용되는 용어 "안전성", "생체내 안전성" 또는 "내약성"은 투여 직후(국소 내약성) 및 약물의 더 장기간의 적용 동안 중증의 유해 사건을 유도하지 않는 약물의 투여를 정의한다. "안전성", "생체내 안전성" 또는 "내약성"은, 예를 들어 치료 및 후속 기간 동안 규칙적 간격으로 평가될 수 있다. 측정은 임상적 평가, 예를 들어, 기관 징후, 및 실험실 이상의 선별을 포함한다. 임상적 평가가 수행될 수 있으며, 정상 소견에 대한 편차는 NCI-CTC 및/또는 MedDRA 표준에 따라 기록/암호화된다. 기관 징후는, 예를 들어 유해 사건에 대한 통상의 용어 기준 v3.0(Common Terminology Criteria for adverse events v3.0)(CTCAE)에 제시된 바와 같이, 알레르기/면역학, 혈액/골수, 심장 부정맥, 응고 등과 같은 기준을 포함할 수 있다. 시험할 수 있는 실험실 파라미터는, 예를 들어 혈액학, 임상 화학, 응고 프로파일 및 소변 분석, 그리고 혈청, 혈장, 림프구 또는 척수액, 리큐어 등과 같은 기타 체액의 검사를 포함한다. 따라서 안전성은, 예를 들어 신체 검사, 영상화 기법(즉, 초음파, x-선, CT 스캔, 자기 공명 영상화(MRI), 기술적 기구에 의한 기타 측정(즉, 심전도), 활력 징후에 의해, 실험실 파라미터를 측정하고 유해 사건을 기록함으로써 평가될 수 있다. 예를 들어, 본 발명에 따른 용도 및 방법에서 비-침팬지 영장류에서의 유해 사건은 조직병리학적 및/또는 조직화학적 방법에 의해 검사할 수 있다.
위의 용어는 또한, 예를 들어, 생명공학-유래 약제 S6의 전임상 안전성 평가; ICH 조화 3국 지침; 1997년 7월 16일자 ICH 운영 위원회 회의(Preclinical safety evaluation of biotechnology-derived pharmaceuticals S6; ICH Harmonised Tripartite Guideline; ICH Steering Committee meeting on July 16, 1997)에 언급된다.
최종적으로, 본 발명은 본 발명의 항체 구축물 또는 본 발명의 방법에 따라 생산된 항체 구축물, 본 발명의 약제학적 조성물, 본 발명의 폴리뉴클레오티드, 본 발명의 벡터 및/또는 본 발명의 숙주 세포를 포함하는 키트를 제공한다.
본 발명의 맥락에서, 용어 "키트"는 용기, 수용기 또는 기타에 함께 포장된 2종 이상의 성분 - 이중 하나는 본 발명의 항체 구축물, 약제학적 조성물, 벡터 또는 숙주 세포에 해당함 - 을 의미한다. 따라서 키트는 단일 단위로서 시판될 수 있는, 특정 목표를 달성하기에 충분한 제품 및/또는 기구의 세트로서 기술될 수 있다.
키트는 투여를 위한 적절한 투약량으로(위 참조) 본 발명의 항체 구축물 또는 약제학적 조성물을 함유하는 임의의 적절한 형상, 크기 및 물질(바람직하게는 방수, 예를 들어, 플라스틱 또는 유리)의 하나 이상의 수용기(예를 들어, 바이알, 앰플, 용기, 시린지, 병, 백(bag))를 포함할 수 있다. 키트는 추가적으로 사용을 위한 지침(예를 들어, 전단 또는 설명서 매뉴얼의 형태로), 본 발명의 항체 구축물을 투여하기 위한 수단, 예를 들어, 시린지, 펌프, 주입기 등, 본 발명의 항체 구축물을 재구성하기 위한 수단 및/또는 본 발명의 항체 구축물을 희석하기 위한 수단을 포함할 수 있다.
본 발명은 또한 단일-용량 투여 단위를 위한 키트를 제공한다. 본 발명의 키트는 또한 건조/동결건조된 항체 구축물을 포함하는 제1 수용기 및 수성 제형을 포함하는 제2 수용기를 포함할 수 있다. 본 발명의 특정 구현예에서, 단일-챔버 및 다중-챔버의 사전 충전된 시린지(예를 들어, 액체 시린지 및 라이오시린지)를 포함하는 키트가 제공된다.
본 발명의 약제학적 조성물은 인산칼륨, 아세트산/아세트산나트륨, 시트르산/시트르산나트륨, 숙신산/숙신산나트륨, 타르타르산/타르타르산나트륨, 히스티딘/히스티딘 HCl, 글리신, 트리스(Tris), 글루타메이트, 아세테이트 및 이의 혼합물로 구성되는 군으로부터, 그리고 특히 인산칼륨, 시트르산/시트르산나트륨, 숙신산, 히스티딘, 글루타메이트, 아세테이트 및 이의 조합으로부터 선택될 수 있는 완충제를 추가로 포함한다.
적합한 완충제 농도는 약 200 mM 이하, 예를 들어 약 190, 180, 170, 160, 150, 140, 130, 120, 110, 100, 80, 70, 60, 50, 40, 30, 20, 10 또는 5 mM의 농도를 포함한다. 당업자는 본원에 기술되는 바와 같은 약제학적 조성물의 안정성을 제공하기 위해 완충제 농도를 용이하게 조정할 수 있을 것이다. 본 발명의 약제학적 조성물에서 고려되는 완충제 농도는 구체적으로 약 5 내지 약 200 mM, 바람직하게는 약 5 내지 약 100 mM, 그리고 더욱 바람직하게는 약 10 내지 약 50 mM 범위이다.
본원에서 사용되는 바와 같이, 용어 "약제학적 조성물"은 이를 필요로 하는 대상에 대한 투여에 적합한 조성물에 관한 것이다. 용어 "대상" 또는 "개인" 또는 "동물" 또는 "환자"는 본 발명의 약제학적 조성물의 투여가 요망되는 임의의 대상, 특히 포유류 대상을 지칭하기 위해 본원에서 상호 교환 가능하게 사용된다. 포유류 대상은 인간, 비인간 영장류, 개, 고양이, 기니피그, 토끼, 래트, 마우스, 말, 소, 젖소 등을 포함하고, 인간이 바람직하다. 본 발명의 약제학적 조성물은 안정하고, 약제학적으로 허용 가능한, 즉 약제학적 조성물이 투여되는 대상에서 임의의 바람직하지 않은 국소 또는 전신 효과를 야기하지 않으면서 요망되는 치료 효과를 이끌어낼 수 있다. 본 발명의 약제학적으로 허용 가능한 조성물은 특히 멸균될 수 있고/있거나 약제학적으로 불활성일 수 있다. 구체적으로, 용어 "약제학적으로 허용 가능한"은 동물에서, 그리고 보다 특별하게는 인간에서 사용하기 위해 규제 기관 또는 다른 일반적으로 인식되는 약전에 의해서 승인된 것을 의미할 수 있다.
본 발명의 약제학적 조성물은, 바람직하게는 치료적 유효량의 하나 또는 복수의 본원에 기술되는 이중특이성 단일 쇄 항체 구축물(들), β-사이클로덱스트린 및 완충제를 포함한다. "치료적 유효량"은 요망되는 치료 효과를 이끌어내는 상기 구축물의 양을 의미한다. 치료 효능 및 독성, 예를 들어 ED50(집단의 50%에서 치료적으로 유효한 용량) 및 LD50(집단의 50%에서 치명적인 용량)은 세포 배양물 또는 실험 동물에서 표준 약제학적 절차에 의해 결정될 수 있다. 치료 효과와 독성 효과 사이의 용량비는 치료 지수이고, 이는 ED50/LD50 비로서 표현될 수 있다. 큰 치료 지수를 나타내는 약제학적 조성물이 일반적으로 바람직하다.
조성물은 앞서 기술한 완충제 및 β-사이클로덱스트린을 포함할 수 있다. 약제학적 조성물은 본원에서 기술된 이의 유리한 특성, 그리고 특히 이의 안정성을 감소 또는 없애지 않는 한 하나 이상의 추가의 부형제를 선택적으로 포함할 수 있다.
부형제는 본 발명에서 매우 다양한 목적, 예를 들어 제형의 물리적, 화학적, 또는 생물학적 특성을 조정하는 것, 예를 들어 점도의 조정, 그리고 또는 유효성을 추가로 개선하고 또는, 예를 들어 제조, 운송, 저장, 사용전 제제, 투여 동안 그리고 그 이후에 일어나는 스트레스에 기인하는 분해 및 손상에 대하여 이러한 제형 및 공정을 안정화시키도록 본 발명의 공정을 위해 사용될 수 있다. 용어 "부형제"는 일반적으로 충전제, 결합제, 붕해제, 코팅제, 흡수제, 접착방지제, 활택제, 보존제, 항산화제, 향료, 착색제, 감미제, 용매, 공용매, 완충제, 킬레이트제, 점도 부여제, 표면 활성제, 희석제, 보습제, 담체, 희석제, 보존제, 유화제, 안정화제 및 장성 개질제를 포함한다.
약제학적 조성물의 상이한 부형제(예를 들어, 위에 열거한 것들)는 상이한 효과를 가질 수 있고, 예를 들어, 아미노산은 완충제, 안정화제 및/또는 항산화제로서 작용할 수 있으며; 만니톨은 증량제 및/또는 장성 향상제로서 작용할 수 있고; 염화나트륨은 전달 비히클 및/또는 장성 향상제 등으로서 작용할 수 있는 것; 등은 당업자에게 명백하다.
폴리올은 물리적 및 화학적 분해 과정으로부터 단백질을 보호하기 위해 액체 제형 및 동결건조 제형 둘 다에서 유용한 안정화제이고, 또한 제형의 장성을 조정하기에 유용하다. 폴리올은 당, 예를 들어, 만니톨, 수크로오스, 및 소르비톨 및, 예를 들어 글리세롤 및 프로필렌 글리콜과 같은 다가 알코올, 그리고 본원에서 논의의 목적을 위해, 폴리에틸렌 글리콜(PEG) 및 관련된 물질을 포함한다. 동결건조 제형에서 케이크의 구조적 안정성을 보장하기 위해 만니톨이 통상적으로 사용된다. 이는 케이크에 대한 구조적 안정성을 보장한다. 이는 일반적으로 동결건조보호제, 예를 들어, 수크로오스와 함께 사용된다. 소르비톨 및 수크로오스는 장성을 조절하기 위해, 그리고 제조 공정 동안 벌크의 제조 또는 운송 동안 냉동-해동 스트레스에 대해 보호하기 위한 안정화제로서 일반적으로 사용되는 작용제이다. PEG는 단백질을 안정화하는 데, 그리고 동결보호제로서 유용하다.
계면활성제는 통상적으로 표면 흡착을 방지하거나, 최소화하거나, 감소시키기 위해 사용된다. 단백질 분자는 표면에서의 흡착 및 변성이 용이할 수 있고, 그 결과 공기-액체, 고체-액체, 및 액체-액체 계면에서의 응집이 용이할 수 있다. 이들 영향은 일반적으로 단백질 농도와 역으로 증감된다. 이들 유해 상호작용은 일반적으로 단백질 농도와 역으로 증감되고, 전형적으로 제품의 운송 및 처리 동안 생성되는 것과 같은 물리적 교반에 의해 악화된다. 통상적으로 사용되는 계면활성제는 폴리소르베이트 20, 폴리소르베이트 80, 소르비탄 폴리에톡실레이트의 다른 지방산 에스테르, 및 폴록사머(poloxamer) 188을 포함한다. 계면활성제는 또한 단백질 입체형태 안정성을 제어하기 위해 통상적으로 사용된다. 이와 관련하여 계면활성제의 사용은 단백질-특이적인데, 임의의 주어진 계면활성제는 전형적으로 일부 단백질을 안정화하고, 다른 것은 탈안정화할 것이기 때문이다.
폴리소르베이트는 산화적 분해가 용이하고 종종, 공급되는 바와 같이, 단백질 잔기 측쇄, 특히 메티오닌의 산화를 야기하기에 충분한 양의 과산화물을 함유한다. 결과적으로, 폴리소르베이트는 주의하여 사용되어야 하며, 사용시에는 이들의 최저 유효 농도로 이용되어야 한다.
항산화제는 적절한 수준의 주위 산소 및 온도를 유지함으로써, 그리고 광에 대한 노출을 피함으로써 약제학적 제형에서 단백질의 유해 산화를 -어느 정도까지- 방지할 수 있다. 항산화제 부형제는 단백질의 산화적 분해를 방지하기 위해서도 사용될 수 있다. 이와 관련하여 유용한 항산화제 중에 환원제, 산소/유리-라디칼 스캐빈저, 및 킬레이트제가 있다. 치료 단백질 제형에서 사용하기 위한 항산화제는 바람직하게는 수용성이며, 제품의 저장 수명 내내 그들의 활성을 유지한다. EDTA가 유용한 예이다.
금속 이온은 단백질 공동인자로서 작용할 수 있고, 단백질 배위 착물의 형성을 가능하게 한다. 금속 이온은 또한 단백질을 분해하는 일부 과정을 억제할 수 있다. 그러나, 금속 이온은 또한 단백질을 분해하는 물리적 및 화학적 과정에 촉매 작용을 한다. 마그네슘 이온(10 내지 120 mM)은 아스파르트산의 이소아스파르트산으로의 이성질체화를 억제하기 위해 사용될 수 있다. Ca+2 이온(100 mM까지)은 인간 데옥시리보뉴클레아제의 안정성을 증가시킬 수 있다. 그러나, Mg+2, Mn+2, 및 Zn+2는 rhDNase를 탈안정화시킬 수 있다. 유사하게, Ca+2 및 Sr+2는 인자 VIII을 안정화시킬 수 있고, 이는 Mg+2, Mn+2 및 Zn+2, Cu+2 및 Fe+2에 의해 탈안정화될 수 있으며, 그의 응집은 Al+3 이온에 의해 증가될 수 있다.
보존제는 약물 제품의 사용 기간 또는 저장 수명 내내 미생물 성장을 억제하고 제품 멸균성을 보장하는 1차 기능을 갖고, 특히 다회 용량 제형에 필요하다. 통상적으로 사용되는 보존제는 벤질 알코올, 페놀 및 m-크레졸을 포함한다. 보존제는 소분자 비경구제와 함께 오랜 사용의 역사를 갖지만, 보존제를 포함하는 단백질 제형의 개발은 어려울 수 있다. 보존제는 거의 항상 단백질에 대한 탈안정화 효과(응집)를 가지며, 이것은 단백질 제형에서의 이들의 사용을 제한하는 주된 인자가 되고 있다. 지금까지, 대부분의 단백질 약물은 일회용으로만 제형화되었다. 그러나, 다회 용량 제형이 가능할 때, 이들은 환자의 편의성 및 증가된 시장성을 가능하게 하는 부가적인 이점을 갖는다. 좋은 예는 보존된 제형의 개발이 더 편리한, 다회용 주사 펜 제시의 상업화로 이어진 인간 성장 호르몬(hGH)의 경우이다.
예상할 수 있는 바와 같이, 보존제를 함유하는 액체 제형의 개발은 동결건조 제형보다 더 어렵다. 동결건조 제품은 보존제 없이 동결건조될 수 있고, 사용 시 보존제 함유 희석제로 재구성될 수 있다. 이는 보존제가 단백질과 접촉하는 시간을 단축시키고, 관련된 안정성 위험을 상당히 최소화한다. 액체 제형에서는, 보존제 유효성 및 안정성이 전체 제품 저장 수명(약 18 내지 24개월)에 걸쳐 유지되어야 한다. 언급하는 중요한 점은 보존제 유효성이 활성 약물 및 모든 부형제 구성 성분을 함유하는 최종 제형에서 입증되어야 한다는 것이다.
예를 들어, 약제학적 제형의 이온 강도 및/또는 등장성을 조정하기 위해, 그리고/또는 항체 구축물 또는 다른 성분의 용해성 및/또는 물리적 안정성을 추가로 개선하기 위해 본 발명에 따라 염이 사용될 수 있다. 잘 알려진 바와 같이, 이온은 단백질의 표면에서 하전된 잔기에 결합함으로써, 그리고 단백질에서 하전 및 극성 기를 차폐하고 그들의 정전기적 상호작용, 끌어당기고 반발하는 상호작용을 감소시킴으로써 단백질의 천연 상태를 안정화시킬 수 있다. 이온은 또한, 특히 단백질의 변성 펩티드 연결(--CONH)에 대한 결합에 의해 단백질의 변성 상태를 안정화시킬 수 있다. 더 나아가, 단백질에서 하전 및 극성 기와의 이온성 상호작용은 또한 분자간 정전기적 상호작용을 감소시킬 수 있고, 이에 의해 단백질 응집 및 불용성을 방지하거나 감소시킬 수 있다. 이온 종은 단백질에 대한 이들의 영향이 상당히 다르다. 본 발명에 따라 약제학적 조성물을 제형화하는 데 사용될 수 있는, 많은 범주형 순위의 이온 및 이들의 단백질에 대한 영향이 개발되었다. 일 예는 용액에서 단백질의 입체형태 안정성에 대한 이들의 영향에 의해 이온성 및 극성 비이온성 용질을 평가하는 호프마이스터(Hofmeister) 시리즈이다. 용질 안정화는 "코스모트로픽(kosmotropic)"으로서 지칭된다. 용질 탈안정화는 "카오트로픽(chaotropic)"으로서 지칭된다. 코스모트로프는 용액로부터 단백질을 침전시키기 위해("염석") 일반적으로 고농도(예를 들어, >1 몰 황산암모늄)에서 사용된다. 카오트로프는 통상적으로 단백질을 변성 및/또는 가용화("염용")하기 위해 사용된다. "염용" 및 "염석"에 대한 이온의 상대적 유효성은 호프마이스터 시리즈에서 그들의 위치를 정의한다.
유리 아미노산은 약제학적 조성물에서 증량제, 안정화제, 및 항산화제뿐만 아니라 다른 표준 용도로서 사용될 수 있다. 리신, 프롤린, 세린, 및 알라닌은 제형에서 단백질을 안정화시키기 위해 사용될 수 있다. 글리신은 정확한 케이크 구조 및 특성을 보장하기 위해 동결건조에서 유용하다. 아르기닌은 액체 및 동결건조 제형 둘 다에서 단백질 응집을 억제하는 데 유용할 수 있다. 메티오닌은 항산화제로서 유용하다.
약제학적 조성물을 제형화하는 데 특히 유용한 부형제는 수크로오스, 트레할로오스, 만니톨, 소르비톨, 아르기닌, 리신, 폴리소르베이트 20, 폴리소르베이트 80, 폴록사머 188, 플루로닉 및 이의 조합을 포함한다. 상기 부형제는, 조성물이 본원에 예시되는 바와 같은 바람직한 특성을 나타내고, 특히 함유된 이중특이성 단일 쇄 항체 구축물의 안정화를 촉진하는 한, 약제학적 조성물에서 상이한 농도로 존재할 수 있다. 예를 들어, 수크로오스는 약제학적 조성물에서 2%(w/v) 내지 12%(w/v)의 농도로, 즉 12%(w/v), 11%(w/v), 10%(w/v), 9%(w/v), 8%(w/v), 7%(w/v), 6%(w/v), 5%(w/v), 4%(w/v), 3%(w/v) 또는 2%(w/v)의 농도로 존재할 수 있다. 바람직한 수크로오스 농도는 4%(w/v) 내지 10%(w/v), 그리고 더욱 바람직하게는 6%(w/v) 내지 10%(w/v) 범위이다. 폴리소르베이트 80은 약제학적 조성물에서 0.001%(w/v) 내지 0.5%(w/v)의 농도로, 즉 0.5%(w/v), 0.2%(w/v), 0.1%(w/v), 0.08%(w/v), 0.05%(w/v), 0.02%(w/v), 0.01%(w/v), 0.008%(w/v), 0.005%(w/v), 0.002%(w/v) 또는 0.001%(w/v)의 농도로 존재할 수 있다. 바람직한 폴리소르베이트 80 농도는 0.002%(w/v) 내지 0.5%(w/v), 그리고 바람직하게는 0.005%(w/v) 내지 0.02%(w/v) 범위이다.
약제학적 조성물의 제형화에 유용한 보존제는 일반적으로 항미생물제(예를 들어, 항균제 또는 항진균제), 항산화제, 킬레이트제, 불활성 기체 등을 포함하고; 예는 염화벤잘코늄, 벤조산, 살리실산, 티메로살, 페네틸 알코올, 메틸파라벤, 프로필파라벤, 클로르헥시딘, 소르브산, 또는 과산화수소이다. 항미생물성 보존제는 미생물 증식을 감소시킴으로써 의약의 저장 수명을 연장시키기 위해 사용되는 물질이다. 본 발명의 약제학적 조성물을 제형화하는 데 특히 유용한 보존제는 벤질 알코올, 클로로부탄올, 페놀, 메타-크레졸, 메틸파라벤, 페녹시에탄올, 프로필파라벤 티메로살을 포함한다. 이들 보존제의 구조 및 전형적인 사용 농도는 Meyer et al. J Pharm Sci. 96(12), 3155의 표 1에 기술되어 있다.
전술한 보존제는 약제학적 조성물에서 상이한 농도로 존재할 수 있다. 예를 들어, 벤질 알코올은 0.2 내지 1.1%(v/v) 범위의 농도로, 클로로부탄올은 0.3 내지 0.5%(v/v) 범위의 농도로, 페놀은 0.07 내지 0.5%(v/v) 범위의 농도로, 메타-크레졸은 0.17 내지 0-32%(v/v) 범위의 농도로, 또는 티메로살은 0.003 내지 0.01%(v/v) 범위의 농도로 존재할 수 있다. 메틸파라벤에 대한 바람직한 농도는 0.05 내지 0.5%(v/v) 범위이고, 페녹시에탄올의 경우에는 0.1 내지 3%(v/v) 범위이고, 프로필파라벤의 경우에는 0.05 내지 0.5%(v/v) 범위이다.
그러나, 약제학적 조성물이 임의의 보존제를 포함하지 않는 것도 예상 가능하다. 특히, 본 발명은 그 중에서도, 약 6.0의 pH에서 약 0.5 mg/mL 농도의 이중특이성 단일 쇄 항체 구축물, 약 1%(w/v) 농도의 술포부틸에테르-β-사이클로덱스트린 나트륨염, 및 약 10 mM 농도의 인산칼륨, 그리고 추가로 약 8%(w/v) 농도의 수크로오스 및 약 0.01%(w/v) 농도의 폴리소르베이트 80을 포함하는, 보존제가 존재하지 않는 약제학적 조성물을 제공한다.
본 발명의 약제학적 조성물은 다양한 형태, 예를 들어, 고체, 액체, 동결물, 기체 또는 동결건조된 형태로 제형화될 수 있고, 그 중에서도 연고, 크림, 경피 패치, 겔, 분말, 정제, 용액, 에어로졸, 과립, 환제, 현탁액, 에멀션, 캡슐, 시럽, 액체, 엘릭서, 추출물, 팅크제(tincture) 또는 유체 추출물의 형태일 수 있다.
일반적으로, 그 중에서도 의도된 투여 경로, 전달 형식 및 요망되는 투약량에 따라, 다양한 저장 및/또는 투약 형태가 본 발명의 약제학적 조성물에 대해서 예상될 수 있다(예를 들어, Remington's Pharmaceutical Sciences, 22nd edition, Oslo, A., Ed., (2012) 참고). 당업자는 이러한 특정 투약 형태의 선택이, 예를 들어 본 발명의 항체 구축물의 물리적 상태, 안정성, 생체내 방출 속도 및 생체내 제거 속도에 영향을 줄 수 있다는 것을 인지할 것이다.
예를 들어, 약제학적 조성물에서 1차 비히클 또는 담체는 성질이 수성 또는 비수성일 수 있다. 적합한 비히클 또는 담체는 가능하게는 비경구 투여용 조성물에서 통상적인 다른 물질로 보충된 주사용수, 생리 식염수 용액 또는 인공 뇌척수액일 수 있다. 중성 완충 식염수 또는 혈청 알부민과 혼합된 식염수는 추가의 예시적인 비히클이다.
비경구 투여가 고려될 때, 본 발명의 치료 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 비히클 중에 요망되는 항체 구축물을 포함하는 무 발열원, 비경구로 허용 가능한 수용액의 형태로 제공될 수 있다. 비경구 주사에 특히 적합한 비히클은 멸균 증류수로, 항체 구축물이 적절하게 보존된 멸균, 등장 용액으로서 제형화된다. 제제는 데포 주사를 통해 전달될 수 있는 산물의 제어 또는 지속 방출을 제공할 수 있는 작용제, 예를 들어 주사 가능한 마이크로스피어, 생분해성 입자, 중합체 화합물(예를 들어, 폴리락트산 또는 폴리글리콜산), 비드 또는 리포솜과 요망되는 분자의 제형화를 수반할 수 있다. 순환에서 지속 기간을 촉진하는 효과를 갖는 히알루론산이 또한 사용될 수 있다. 이식 가능한 약물 전달 기구가 요망되는 항체 구축물을 도입하기 위해 사용될 수 있다.
지속 또는 제어 전달/방출 제형이 또한 본원에서 고려된다. 다양한 다른 지속 또는 제어 전달 수단, 예를 들어 리포솜 담체, 생분해성 마이크로입자 또는 다공성 비드 및 데포 주사를 제형화하기 위한 기법이 또한 당업자에게 공지되어 있다. 예를 들어, 약제학적 조성물의 전달을 위한 다공성 중합체 마이크로입자의 제어 방출을 기술하는 국제 특허 출원 번호 PCT/US93/00829 참조. 지속 방출 제제는 성형된 물품의 형태, 예를 들어 필름 또는 마이크로캡슐로 반투과성 중합체 기질을 포함할 수 있다. 지속 방출 기질은 폴리에스테르, 하이드로겔, 폴리락티드(미국 특허 번호 3,773,919 및 유럽 특허 출원 공개 번호 EP 058481에 기술된 바와 같은), L-글루탐산과 감마 에틸-L-글루타메이트의 공중합체(Sidman et al., 1983, Biopolymers 2:547-556), 폴리(2-하이드록시에틸-메타크릴레이트)(Langer et al., 1981, J. Biomed. Mater. Res. 15:167-277 및 Langer, 1982, Chem. Tech. 12:98-105), 에틸렌 비닐 아세테이트(위의 Langer et al., 1981) 또는 폴리-D(-)-3-하이드록시부티르산(유럽 특허 출원 공개 번호 EP 133,988)을 포함할 수 있다. 지속 방출 조성물은 또한 당업계에 공지된 임의의 몇 가지 방법에 의해 제조될 수 있는 리포솜을 포함할 수 있다. 예를 들어, Eppstein et al., 1985, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82:3688-3692; 유럽 특허 출원 공개 번호 EP 036,676; EP 088,046 및 EP 143,949 참조. 항체 구축물은 또한, 예를 들어 코아세르베이션 기법에 의하거나 계면 중합에 의해 제조된 마이크로캡슐(예를 들어, 각각 하이드록시메틸셀룰로오스 또는 젤라틴-마이크로캡슐 및 폴리(메틸메타크릴레이트) 마이크로캡슐)에, 콜로이드 약물 전달 시스템(예를 들어, 리포솜, 알부민 마이크로스피어, 마이크로에멀션, 나노입자 및 나노캡슐)에, 또는 마크로에멀션에 포집될 수 있다. 이러한 기법은 Remington's Pharmaceutical Sciences, 22nd edition, Oslo, A., Ed., (2012)에 개시되어 있다.
생체내 투여를 위해 사용되는 약제학적 조성물은 전형적으로 멸균 제제로서 제공된다. 멸균은 멸균 여과막을 통한 여과에 의해 달성될 수 있다. 조성물이 동결건조될 때, 이 방법을 사용하는 멸균은 동결건조 및 재구성 전 또는 후에 수행될 수 있다. 비경구 투여를 위한 조성물은 동결건조 형태로 또는 용액으로 저장될 수 있다. 비경구 조성물은 일반적으로 멸균 접근 포트를 갖는 용기, 예를 들어 정맥내 용액 백(bag) 또는 피하 주사 바늘에 의해 천공될 수 있는 마개를 갖는 바이알에 놓인다.
본원에 개시되는 항체 구축물은 또한 면역-리포솜으로서 제형화될 수 있다. "리포솜"은 포유류에 대한 약물의 전달에 유용한 다양한 유형의 지질, 인지질 및/또는 계면활성제로 구성된 작은 소포이다. 리포솜의 구성 성분은 생물학적 막의 지질 배열과 유사한 이중층 형성으로 통상 배열된다. 항체 구축물을 포함하는 리포솜은 Epstein et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82: 3688 (1985); Hwang et al., Proc. Natl Acad. Sci. USA, 77: 4030 (1980); 미국 특허 번호 4,485,045 및 4,544,545; 및 W0 97/38731에 기술된 바와 같은, 당업계에 공지된 방법에 의해 제조된다. 향상된 순환 시간을 갖는 리포솜은 미국 특허 번호 5,013,556에 개시되어 있다. 특히 유용한 리포솜은 포스파티딜콜린, 콜레스테롤 및 PEG-유도체화된 포스파티딜에탄올아민(PEG-PE)을 포함하는 지질 조성물을 사용하는 역상 증발 방법에 의해 생성될 수 있다. 리포솜을 정의된 기공 크기의 필터를 통해 압출하여 요망되는 직경을 갖는 리포솜을 수득한다. 본 발명의 항체 구축물의 Fab' 단편은 Martin et al. J. Biol. Chem. 257: 286-288 (1982)에 기술된 바와 같이 이황화물 교환 반응을 통해 리포솜에 접합될 수 있다. 화학요법제는 선택적으로 리포솜 내에 함유될 수 있다. Gabizon et al. J. National Cancer Inst. 81 (19) 1484 (1989) 참조.
본 발명의 조성물은, 본원에서 정의되는 이중특이성 단일 쇄 항체 구축물에 더하여, 조성물의 의도된 용도에 따라 추가적인 생물학적으로 활성인 작용제를 포함할 수 있을 것으로 고려된다. 이러한 작용제는 특히 종양 및/또는 악성 세포에 작용하는 약물일 수 있지만, 약제학적 조성물의 의도된 용도에 따라 위장관계에 작용하는 약물, 면역반응을 억제하는 약물(예를 들어, 코르티코스테로이드), 염증 반응을 조절하는 약물, 순환계에 작용하는 약물 및/또는 당업계에 공지된 사이토카인과 같은 작용제를 포함하는 다른 작용제가 또한 예상될 수 있다. 또한, 본 발명의 약제학적 조성물은 공동 요법으로, 즉, 다른 항암 약제와 조합으로 적용되는 것이 고려된다.
일단 약제학적 조성물이 제형화되면, 이는 용액, 현탁액, 겔, 에멀션, 고체, 결정으로서, 또는 탈수되거나 동결건조된 분말로서 멸균 바이알에 저장될 수 있다. 이러한 제형은 바로 사용 가능한 형태 또는 투여 전에 재구성되는 (예를 들어, 동결건조된) 형태로 저장될 수 있다. 예를 들어, 동결건조된 조성물은, 예를 들어 주사용 정균수(BWFI), 생리 식염수, 인산염 완충 식염수(PBS), 또는 동결건조 전에 단백질이 있었던 동일한 제형에서 재구성될 수 있다.
본 발명의 약제학적 조성물은 일반적으로 임의의 적합한 투여 경로에 의한 전달을 위해 제형화될 수 있다. 본 발명의 맥락에서, 투여 경로는 국소 경로(예를 들어, 표피, 흡입, 비강, 안과, 청각/귀, 질, 점막); 장 경로(예를 들어, 경구, 위장관, 설하, 구순하, 협측, 직장); 및 비경구 경로(예를 들어, 정맥내, 동맥내, 골내, 근육내, 뇌내, 뇌실내, 경막외, 척추강내, 피하, 복막내, 양막외, 관절내, 심장내, 피내, 병소내, 자궁내, 방광내, 유리체내, 경피, 비강내, 경점막, 활막내, 관내)를 포함하지만, 이로 한정되지 않는다.
본원에서 기술되는 약제학적 조성물은, 예를 들어 일회분 주사와 같은 주사에 의하거나, 연속적 주입과 같은 주입에 의한 비경구 투여, 예를 들어, 피하 또는 정맥내 전달에 특히 유용하다. 약제학적 조성물은 의료 기구를 사용하여 투여될 수 있다. 약제학적 조성물을 투여하기 위한 의료 기구의 예는 미국 특허 번호 4,475,196; 4,439,196; 4,447,224; 4,447,233; 4,486,194; 4,487,603; 4,596,556; 4,790,824; 4,941,880; 5,064,413; 5,312,335; 5,312,335; 5,383,851; 및 5,399,163에 기술되어 있다.
본 발명의 약제학적 조성물은 또한 중단되지 않고 투여될 수 있다. 비제한적 예로서, 중단되지 않는, 또는 실질적으로 중단되지 않는, 즉, 연속적 투여는 환자의 신체 내로 항체 구축물의 유입을 계량하기 위해 환자가 착용하는 소형 펌프 시스템에 의해 실현될 수 있다. 약제학적 조성물은 상기 펌프 시스템을 사용함으로써 투여될 수 있다. 이러한 펌프 시스템은 일반적으로 당업계에 공지되어 있으며, 주입되는 치료제를 함유하는 카트리지의 주기적 교환에 통상적으로 의존한다. 이러한 펌프 시스템에서 카트리지를 교환할 때, 다르게는 중단되지 않는 치료제의 환자 신체 내로의 흐름의 일시적 중단이 뒤따를 수 있다. 이러한 경우에, 카트리지 교체 전의 투여 단계 및 카트리지 교체 후의 투여 단계는 약제학적 수단의 의미 내에서 여전히 고려될 것이고 본 발명의 방법은 함께 이러한 치료제의 한 번의 "중단되지 않는 투여"를 구성한다.
본 발명의 약제학적 조성물의 연속적 또는 중단되지 않는 투여는, 저장소 밖으로 유체를 구동하기 위한 유체 구동 기전 및 구동 기전을 작동시키기 위한 작동 기전을 포함하는 유체 전달 기구 또는 소형 펌프 시스템에 의한 정맥내 또는 피하일 수 있다. 피하 투여를 위한 펌프 시스템은 환자의 피부를 관통하고 환자의 신체로 적합한 조성물을 전달하기 위한 바늘 또는 삽입관을 포함할 수 있다. 상기 펌프 시스템은 정맥, 동맥 또는 혈관과 독립적으로 환자의 피부에 직접 고정되거나 부착될 수 있고, 이에 의해 펌프 시스템과 환자의 피부 사이에 직접적인 접촉을 허용한다. 펌프 시스템은 24시간 동안 며칠까지 환자의 피부에 부착될 수 있다. 펌프 시스템은 작은 용량을 위한 저장소를 갖는 소형 크기의 것일 가질 수 있다. 비제한적 예로서, 투여되는 적합한 약제학적 조성물을 위한 저장소의 용량은 0.1 내지 50 mL일 수 있다.
연속적 투여는 또한 피부에 착용하고 간격을 두고 교체되는 패치에 의한 경피적일 수 있다. 당업자는 이 목적에 적합한 약물 전달을 위한 패치 시스템을 인지한다. 경피 투여는 특히 중단되지 않는 투여를 잘 처리하는데, 첫 번째 다 쓴 패치의 교환이, 예를 들어 첫 번째 다 쓴 패치에 바로 인접한 피부의 표면에서, 그리고 첫 번째 다 쓴 패치의 제거 직전에 새로운 두 번째 패치의 교환과 동시에 유리하게 달성될 수 있기 때문이다. 유동 중단 또는 동력 전지 고장의 문제는 생기지 않는다.
당업자는 본 발명의 약제학적 조성물이 안정하고 바람직하게는 첨부된 실시예에서 평가된 β-사이클로덱스트린을 포함하는 약제학적 조성물과 동일한 유리한 특성을 나타내는 한, 일반적으로 전술한 부형제, 또는 추가적인 활성제 중 임의의 것을 포함할 수 있거나, 임의의 적합한 형태로 제공될 수 있다는 것을 용이하게 이해할 것이다. 당업자는 안정한, 즉 바람직하게는 포함된 이중특이성 단일 쇄 항체 단편의 응집물 및/또는 이형태체가 실질적으로 존재하지 않는 약제학적 조성물을 제공하도록 다양한 구성 성분을 용이하게 조정할 수 있을 것이다.
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본원에서 사용되는 바와 같이, 단수 형태("a", "an", 및 "the")는 문맥에서 명백히 달리 나타내지 않는 한 복수의 언급 대상을 포함하는 것에 주목해야 한다. 따라서, 예를 들어, "시약"에 대한 언급은 하나 이상의 이러한 상이한 시약을 포함하고, "방법"에 대한 언급은 본원에 기술된 방법에 대해 변형되거나 대체될 수 있는 당업자에게 공지된 동등한 단계 및 방법에 대한 언급을 포함한다.
달리 지시되지 않는 한, 일련의 요소 앞의 용어 "적어도"는 일련의 모든 요소를 지칭하는 것으로 이해될 것이다. 당업자는 본원에 기술된 본 발명의 구체적 구현예에 대한 많은 균등물을 인식하거나, 통상적 실험만으로도 확인할 수 있을 것이다. 이러한 균등물은 본 발명에 포함시키고자 한다.
용어 "및/또는"은 본원에서 어디에 사용되거나 "및", "또는" 및 "상기 용어에 연결되는 요소의 모든 임의의 다른 조합"의 의미를 포함한다.
본원에서 사용되는 용어 "약" 또는 "대략"은 주어진 값 또는 범위의 20% 이내, 바람직하게는 10% 이내, 그리고 더욱 바람직하게는 5% 이내를 의미한다. 그러나, 이는 또한 명수(concrete number)를 포함하는데, 예를 들어, 약 20은 20을 포함한다.
용어 "미만" 또는 "보다 큰"은 명수를 포함한다. 예를 들어, 20 미만은 그 이하를 의미한다. 유사하게, 보다 많은 또는 보다 큰은 각각 많거나 같은 것, 또는 크거나 같은 것을 의미한다.
본 명세서 및 다음의 청구범위 전체에 걸쳐, 문맥에서 달리 요구되지 않는 한, 단어 "포함하다(comprise)", 그리고 "포함하다(comprises)" 및 "포함하는(comprising)"과 같은 변형은 언급된 정수 또는 단계 또는 정수나 단계의 군을 포함하는 것을 나타내는 것으로 이해될 것이지만, 임의의 다른 정수 또는 단계 또는 정수나 단계의 군을 제외하지는 않는다. 본원에서 사용될 때 용어 "포함하는(comprising)"은 용어 "함유하는(containing)" 또는 "포함하는(including)" 또는 때때로 본원에서 사용되는 용어 "갖는(having)"으로 대체될 수 있다.
본원에서 사용될 때, "구성되는(consisting of)"은 청구범위 요소에 명시되지 않은 임의의 요소, 단계, 또는 성분을 배제한다. 본원에서 사용될 때, "필수적으로 구성되는"은 청구범위의 기본적이고 신규인 특징에 실질적으로 영향을 주지 않는 재료 또는 단계를 배제하지 않는다.
본원의 각 경우에, 임의의 용어 "포함하는", "필수적으로 구성되는" 및 "구성되는"은 다른 두 용어 중 어느 하나로 교체될 수 있다.
본 발명은 본원에 기술되는 특정 방법론, 프로토콜, 재료, 시약 및 물질 등으로 한정되지 않고, 이와 같이 달라질 수 있는 것으로 이해되어야 한다. 본원에서 사용되는 용어는 단지 특정 구현예를 기술하려는 목적을 위해서이고, 청구범위에 의해서만 정의되는 본 발명의 범주를 제한하지 않고자 한다.
이상이든 이하이든 간에, 본 명세서의 내용 전체에 걸쳐 인용되는 모든 간행물 및 특허(모든 특허, 특허 출원, 과학 간행물, 제조자의 설명서, 지침서 등을 포함함)는 그 전체가 본원에 참고로 포함된다. 본원에서의 어느 것도 본 발명이 선행 발명에 의한 이러한 개시보다 선행할 권리가 없다는 인정으로 해석되지 않을 것이다. 참고로 포함된 자료가 본 명세서와 모순되거나 일치하지 않을 경우, 본 명세서가 임의의 이러한 자료를 대체할 것이다.
본 발명 및 이의 이점의 더 양호한 이해는, 단지 예시적인 목적을 위해 제공되는 하기 실시예로부터 얻어질 것이다. 실시예는 어떤 방식으로도 본 발명의 범주를 제한하지 않고자 한다.
실시예
실시예 1:
기본형 EGFRvIII BiTE® 항체 구축물을 pH 7.0이거나 pH 4.0인 완충액에 제공하고 각각 DSC를 받도록 하였다. 항체 구축물의 DSC 용융 온도를 1회의 용융 이벤트로서 얻었다. pH 7에서 Tm은 65℃인 반면, pH 4에서 Tm은 59.5℃로, 즉 중성 매질에서보다 더 낮았다(도 3의 온도기록도 참조). 일반적으로, 더 높은 Tm은 화합물의 더 높은 안정성을 나타낸다.
실시예 2:
각각 CDH19, EGFRvIII, CD33 및 CD19에 대한 제1 표적 도메인을 갖는 정제된 기본형 또는 scFc-제공 BiTE 항체 구축물을 포함하는 사전 제형화된 약물 물질을, 10 kDa의 분자량 컷-오프(MWCO)의 막을 사용하여 한외여과/투석여과를 통해 완충제 교환하였다. 농축된 저장 용액을 첨가함으로써 최종 제형을 달성하였다. 각각의 구축물에 대하여 생성된 제형은 pH 6.0에서 20 mM 인산칼륨, 150 mM L-아르기닌 염산염, 6%(w/V) 트레할로오스 이수화물, 0.01%(w/V) 폴리소르베이트 80으로 구성되는 K60RTrT 및 pH 4.0에서 10 mM 글루타메이트, 4%(w/V) 만니톨, 2%(w/V) 수크로오스, 0.01%(w/V) 폴리소르베이트 80으로 구성되는 G40MSuT이다. 단백질 농도는 총 1.0 mg/mL였다. 1950 μL의 각각의 시험 용액을 50 μL의 1000 ppm 규소 표준 용액(AlfaAesar로부터의 Specpure, Art.No. 38717)으로 스파이킹하여 25 ppm 스파이크를 생성하였다. 스파이킹되지 않은 시험 용액은 대조 샘플로서 작용하였다. 스파이킹된 시험 용액뿐만 아니라 대조 샘플을 3cc I형 유리 바이알에 채우고 37℃에서 24시간 동안 인큐베이션하였다. HMWS의 양을 정량화하기 위해 모든 샘플을 SE-UPLC로 분석하였다. 결과적으로, 도 4a는 pH 4 대 pH 6에서 측정된 CDH19 scFc 항체 구축물의 고분자량 종의 백분율을 보여준다. 더 낮은 pH 4.0에서 더 낮은 응집이 보인다. 도 4b는 4℃(시점 T0, 2w, 4w), 25℃(T0, 1w, 2w, 4w) 및 37C(T0, 1w, 2w, 4w)에서 3개의 상이한 제형 - G4SuT, G4TrT 및 G4MSuT으로 SEC에 의해 측정된 CDH19 scFc BiTE의 주요 피크 백분율을 보여준다: G4SuT는 10 mM 글루타메이트, 9%(w/v) 수크로오스, 0.01% 폴리소르베이트 80을 포함하고, G4TrT는 10 mM 글루타메이트, 9%(w/v) 트레할로오스, 0.01% 폴리소르베이트 80을 포함하고, G4MSuT는 10 mM 글루타메이트, 4%(w/v) 만니톨, 2% 수크로오스, 0.01% 폴리소르베이트 80을 포함한다. 안정성은 pH 4에서 확인되었다. 각각의 항체 구축물 제형을 안정성 모니터링을 위해 다양한 조건에서 저장하였다. 도 4c는 -20℃(T0, 4w)에서 3개의 상이한 제형 - G4SuT, G4TrT 및 G4MSuT으로 SEC에 의해 측정된 CDH19 scFc BiTE의 주요 피크 백분율을 보여준다. 도 4d는 4C(T0, 2w, 4w), 25℃(T0, 1w, 2w, 4w) 및 37℃(T0, 1w, 2w, 4w)에서 3개의 상이한 제형: G4SuT, G4TrT 및 G4MSuT으로 SEC에 의해 측정된 CDH19 scFc BiTE의 고분자량(HMW) 피크 백분율을 보여준다. 도 4e는 -20℃(T0, 4w)에서 3개의 상이한 제형 - G4SuT, G4TrT 및 G4MSuT으로 SEC에 의해 측정된 CDH19 scFc BiTE의 HMW 피크 백분율을 보여준다. 도 4f는 4C(T0, 2w, 4w), 25C(T0, 1w, 2w, 4w) 및 37C(T0, 1w, 2w, 4w)에서 3개의 상이한 제형 - G4SuT, G4TrT 및 G4MSuT으로 SEC에 의해 측정된 CDH19 scFc BiTE의 저분자량 피크 백분율을 보여준다. 도 5는 6개월 후 측정된 pH 범위 4 내지 7의 다양한 완충액에서의 EGFRvIII 비-scFC 항체 구축물의 주요 피크 백분율을 보여준다. pH 4.0에서, 항체 구축물은 최고 주요 피크 백분율을 갖는다. 도 6a는 4℃에서 상이한 제형으로 상이한 농도에서의 CD33-scFc 항체 구축물의 주요 피크 백분율을 보여준다. "ccHFC"는 특이적으로 변형된 cys-클램 scFc 도메인을 나타낸다. 낮은 pH 제형은 일관되게 더 높은 단량체 종을 갖는다. 도 6b는 25℃에서 상이한 제형으로 상이한 농도에서의 CD33-scFc 항체 구축물의 주요 피크 백분율을 보여준다. "ccHFC"는 특이적으로 변형된 cys-클램 scFc 도메인을 나타낸다. 낮은 pH 제형은 일관되게 더 높은 단량체 종을 갖는다. 도 7: T0, 7일, 14일 및 1개월에 pH의 함수로서 SEC에 의해 측정된 기본형(비-HLE) CD19xCD3 BiTE® 항체 구축물의 응집 백분율. 이 도면은 낮은 pH에서 응집의 양이 극적으로 더 낮은 것을 보여준다.
실시예 3: EGFRvIII BiTE® 항체 구축물을 부동화 금속 친화성 크로마토그래피(IMAC)를 사용한 다음 크기 배제 크로마토그래피(SEC)에 의해 정제하였다. SEC 용출물은 pH 5.0에서 20 mM 시트르산 및 2%(w/v) 트레할로오스 이수화물 중 0.43 mg/mL EGFRvIII를 함유하였다. 물질을 3개 분획으로 분할하였다. 최초 분획을 pH 5.0에서 유지하였다. 다른 분획의 pH를 각각 6.0 및 7.0으로 조정하였다. 모든 분획을 기공 크기 0.2 μm를 갖는 필터를 통해 여과하였다. 각각의 분획을 최종적으로 농축된 부형제 저장 용액으로 스파이킹하여 제형화하였다. 최종 제형에 대한 개요를 표 4에 제공한다. 각각의 제형에서 EGFRvIII 농도는 0.1 mg/mL이었다. 제형을 2R I형 유리 바이알에 1.0 mL까지 충전하고, 이것을 부틸 고무 마개 및 알루미늄 플립 오프 시일(aluminum flip off seal)로 닫았다.
제형을 25℃에서 4일 동안 저장한 다음 350 nm에서 광학 밀도 측정, 크기 배제 초고성능 크로마토그래피 및 약한 양이온 교환(WCX) 크로마토그래피에 의해 분석하였다. 350 nm에서의 광학 밀도는 96-웰 플레이트에서 Tecan으로부터의 Tecan Infinite M1000 플레이트 판독기를 사용하여 측정하였다. 응집 계수(AI)는 다음 방정식을 사용하여 계산하였다:
AI = OD350nm / (OD280nm - OD350nm)
SEC는 스트레스 이후 각각의 제형에서 고분자량 종(HMWS)의 함량 백분율 및 단백질 농도를 결정하기 위해 적용되었다. 어퀴티(Acquity) UPLC BEH200 SEC 150 mm 칼럼(Waters)을 사용하여 어퀴티 H-클래스 UPLC 시스템(Waters)에서 SE-UPLC를 수행하였다. 칼럼 온도는 25℃로 설정하였다. 크기 변이체의 분리는 유속 0.4 mL/분으로 등용매 방법을 적용하여 달성하였다. 이동상은 100 mM 인산나트륨, 250 mM NaCl pH 6.8로 구성되었다. 실행 시간은 총 6.0분이다. 샘플을 분석 시까지 오토샘플러 내에서 8℃로 유지하였다. 총량 3 μg 단백질을 주입하였다. 캐리 오버(carry over)를 피하기 위해 각각의 샘플에 대한 주입 이후 40% ACN으로 중간 주입을 수행하였다. 검출은 HMWS의 정량화를 위해 형광(여기 280 nm, 방출 325 nm)을 기반으로 하였다. 단백질 농도의 결정을 위해 280 nm에서 광다이오드 어레이(PDA)를 통한 검출을 사용하였다. 피크 통합은 Empower® 소프트웨어를 사용하여 수행하였다. HMWS의 곡선 하 상대 면적을 기록하였다.
WCX 크로마토그래피는 어퀴티 H-클래스 UPLC 시스템(Waters)에서 단백질-팩(Protein-Pak) Hi Res CM 7μm 칼럼(Waters. cat No. 186004929)을 사용하여 수행하였다. 칼럼 온도는 30℃로 설정하였다. 전하 변이체의 분리는 표 5에 나타낸 구배 방법을 적용하여 유속 0.65 mL/분을 사용하여 달성하였다. 이동상 A 및 B는 20 mM 인산나트륨 pH 6.5 및 20 mM 인산나트륨으로 구성되었다.
샘플을 분석 시까지 오토샘플러 내에서 8℃로 유지하였다. 5 μg의 단백질을 칼럼으로 주입하였다. 샘플을 이동상 A로 사전 희석하였다. 캐리 오버(carry over)를 피하기 위해 각각의 샘플에 대한 주입 이후 40% ACN으로 중간 주입을 수행하였다. 검출은 형광(Ex 280 nm, Ex 325 nm)을 기반으로 하였다. 피크 통합은 Empower® 소프트웨어를 사용하여 수행하였다. 주요 피크(천연 종)의 곡선 하 상대 면적(AUC)을 기록하였다.
Statistica 소프트웨어(Statsoft)를 사용하여 측정된 응집 계수, HMWS의 함량 백분율, 단백질 농도, 및 WCX 주요 피크의 존재도에 대한 위 제형 파라미터의 영향을 통계적으로 평가하였다. 예상된 값 및 바람직성에 대한 프로파일은 도 8에 나타낸다. 최적 제형은 낮은 응집 계수, 낮은 HMWS, 높은 단백질 농도, 및 높은 주요 피크 백분율을 추구한다. 도 8에 나타낸 바와 같이, 바람직성은 L-아르기닌, 높은 PS 80 농도 및 낮은 pH 값의 제형을 사용함으로써 극대화된다.
실시예 4
메소텔린(MSLN)-scFc BiTE 항체 구축물을 단백질 A, 양이온 교환(CEX), 및 하이드록시아파타이트(HA) 크로마토그래피를 사용하여 정제하였다. 다음에 HA 용출물을 한외여과/투석여과(UFDF)를 사용하여 사전 제형화하였다. 최종 제형화는 농축된 부형제 저장 용액으로 스파이킹함으로써 달성하였다. 시험 제형에 대한 개요를 표 6에 제공한다.
위 제형을 2R I형 유리 바이알에 1.3 mL까지 충전하고, 이것을 부틸 고무 마개 및 알루미늄 플립 오프 시일로 닫았다. 제형을 -20, 25, 및 37℃에서 4주까지, 그리고 2 내지 8℃에서 15주까지 저장하였다. 샘플을 지정된 시점에 빼냈다. 추가로 샘플에 5 연속 동결 해동 주기(0.3 K/분으로 20℃ -> -50℃ ->20℃, 목표 온도에서 1시간 유지)를 적용했다. 샘플을 크기-배제 초고성능 크로마토그래피(SE-UPLC) 및 펩티드 매핑(비 스트레스 샘플 및 37℃에서 저장한 샘플에서만)에 의해 분석하였다.
어퀴티(Acquity) UPLC BEH200 SEC 150 mm 칼럼(Waters)를 사용하여 어퀴티 H-클래스 UPLC 시스템(Waters)에서 SE-UPLC를 수행하였다. 칼럼 온도는 25℃로 설정하였다. 크기 변이체의 분리는 유속 0.4 mL/분으로 등용매 방법을 적용하여 달성하였다. 이동상은 100 mM 인산나트륨, 250 mM NaCl pH 6.8로 구성되었다. 실행 시간은 총 6.0분이다. 샘플을 분석 시까지 오토샘플러 내에서 8℃로 유지하였다. 총량 3 μg 단백질을 주입하였다. 캐리 오버(carry over)를 피하기 위해 각각의 샘플에 대한 주입 이후 40% ACN으로 중간 주입을 수행하였다. 검출은 형광(여기 280 nm, 방출 325 nm)을 기반으로 하였다. 피크 통합은 Empower® 소프트웨어를 사용하여 수행하였다. HMWS의 곡선 하 상대 면적을 기록하였다(도 9).
열 스트레스(37℃에서 인큐베이션)에 대한 화학적 변형의 존재도를 펩티드 매핑에 의해 모니터링하였다. 단백질 샘플을 효소적으로 분해하고, 생성된 펩티드를 역상 크로마토그래피를 사용하여 분리하였다. 펩티드의 확인 및 정량화를 위해 칼럼 용출물을 질량 분광계의 이온 공급원으로 직접 주입하였다.
최대 범위를 달성하기 위해, 1회는 트립신 그리고 1회는 키모트립신으로 2회의 별개의 효소 분해를 수행하였다. 각각의 경우, 단백질을 염화구아니듐으로 변성시키고, 다음에 디티오트레이톨(DTT)로 환원시켰다. DTT에서 인큐베이션시킨 후, 유리 시스테인 잔기를 요오도아세트산의 첨가에 의해 알킬화하였다. 다음에, 분해를 위해 샘플을 50 mM 트리스 pH 7.8로 완충제 교환하였다. 트립신 및 키모트립신을 각각 1:10(샘플:효소)의 비율로 별개의 반응 관에 첨가하였다. 샘플을 37℃에서 30분 동안 분해시키고, 트리플루오로아세트산을 첨가함으로써 반응을 퀀칭하였다.
각각의 분해물 5 μg의 양을 0.1%(V/V) 포름산(FA)으로 평형화한 조르박스(Zorbax) SB-C18(Agilent #859700-902) 역상 칼럼으로 별개로 주입하였다. 0.1% FA를 함유하는 90% 아세토니트릴까지의 156분 구배를 사용하여 Q-Exactive Plus 질량 분광계(Thermo Scientific)의 전기분무 이온 공급원으로 펩티드를 직접 용출시켰다. 풀 스캔(해상도 70 000; 스캔 범위 200 내지 2000 m/z) 다음에 12종의 가장 함유량이 높은 이온의 고에너지 충돌 해리(HCD)(해상도 17 500)가 이어지는, 상위 12 방법을 사용하여 데이터 의존적 방식으로 데이터를 수집하였다.
자체적인 소프트웨어를 사용하여 정확한 질량 및 탠덤 질량 스펙트럼을 기반으로 펩티드를 확인하였다. 확인은 수동으로 검증되었다. Pinpoint 소프트웨어(Thermo Scientific)를 사용하여 이온 존재도를 기반으로 변형 및 비변형 펩티드의 상대적 양을 계산하였다.
상보성 결정 영역(CDR) 및 반감기 연장 부분의 화학적 변형의 백분율은 Fehler! Verweisquelle konnte nicht gefunden werden.7에 의해 주어진다.
도 9에서 입증되는 바와 같이 HMWS의 존재도는 MSLN-scFc가 pH 4.0에서 제형화될 때 pH 6.0 또는 7.0에서의 제형화와 비교하여 유의미하게 감소된다. 표 7은 37℃에서 2주 동안 저장 후 제형의 기능에서의 화학적 변형의 개요를 제공한다.
표 7에 개괄한 바와 같이, MLSN-scFc는 pH 6.0 및 7.0과 비교하여 pH 4.0에서 제형화될 때 화학적 변형에 덜 취약하다.
실시예 5
CD33cc-scFc BiTE 항체 구축물을 단백질 A, 양이온 교환(CEX), 및 하이드록시아파타이트(HA) 크로마토그래피를 사용하여 정제하였다. 다음에 HA 용출물을 한외여과/투석여과(UFDF)를 사용하여 사전 제형화하였다. 최종 제형화는 농축된 부형제 저장 용액으로 스파이킹함으로써 달성되었다. 시험 제형에 대한 개요를 표 8에 제공한다.
위 제형을 2R I형 유리 바이알에 1.3 mL까지 충전하고, 이것을 부틸 고무 마개 및 알루미늄 플립 오프 시일로 닫았다. 제형을 -20, 2-8, 25, 및 37℃에서 4주까지 저장하였다. 샘플을 지정된 시점에 빼냈다. 추가로 샘플에 5 연속 동결 해동 주기(0.3 K/분으로 20℃ -> -50℃ ->20℃, 목표 온도에서 1시간 유지)를 적용했다. 샘플을 크기-배제 초고성능 크로마토그래피(SE-UPLC) 및 펩티드 매핑(비 스트레스 샘플 및 37℃에서 저장한 샘플에서만)에 의해 분석하였다.
어퀴티(Acquity) UPLC BEH200 SEC 150 mm 칼럼(Waters)를 사용하여 어퀴티 H-클래스 UPLC 시스템(Waters)에서 SE-UPLC를 수행하였다. 칼럼 온도는 25℃로 설정하였다. 크기 변이체의 분리는 유속 0.4 mL/분으로 등용매 방법을 적용하여 달성하였다. 이동상은 100 mM 인산나트륨, 250 mM NaCl pH 6.8로 구성되었다. 실행 시간은 총 6.0분이다. 샘플을 분석 시까지 오토샘플러 내에서 8℃로 유지하였다. 총량 3 μg 단백질을 주입하였다. 캐리 오버(carry over)를 피하기 위해 각각의 샘플에 대한 주입 이후 40% ACN으로 중간 주입을 수행하였다. 검출은 형광(여기 280 nm, 방출 325 nm)을 기반으로 하였다. 피크 통합은 Empower® 소프트웨어를 사용하여 수행하였다. HMWS의 곡선 하 상대 면적을 기록하였다(도 10).
열 스트레스(37℃에서 인큐베이션)에 대한 화학적 변형의 존재도를 펩티드 매핑에 의해 모니터링하였다. 단백질 샘플을 효소적으로 분해하고, 생성된 펩티드를 역상 크로마토그래피를 사용하여 분리하였다. 펩티드의 확인 및 정량화를 위해 칼럼 용출물을 질량 분광계의 이온 공급원으로 직접 주입하였다.
최대 범위를 달성하기 위해, 1회는 트립신 그리고 1회는 키모트립신으로 2회의 별개의 효소 분해를 수행하였다. 각각의 경우, 단백질을 염화구아니듐으로 변성시키고, 다음에 디티오트레이톨(DTT)로 환원시켰다. DTT에서 인큐베이션시킨 후, 유리 시스테인 잔기를 요오도아세트산의 첨가에 의해 알킬화하였다. 다음에, 분해를 위해 샘플을 50 mM 트리스 pH 7.8로 완충제 교환하였다. 트립신 및 키모트립신을 각각 1:10(샘플:효소)의 비율로 별개의 반응 관에 첨가하였다. 샘플을 37℃에서 30분 동안 분해시키고, 트리플루오로아세트산을 첨가함으로써 반응을 퀀칭하였다.
각각의 분해물 5 μg의 양을 0.1%(V/V) 포름산(FA)으로 평형화한 조르박스(Zorbax) SB-C18(Agilent #859700-902) 역상 칼럼으로 별개로 주입하였다. 0.1% FA를 함유하는 90% 아세토니트릴까지의 156분 구배를 사용하여 Q-Exactive Plus 질량 분광계(Thermo Scientific)의 전기분무 이온 공급원으로 펩티드를 직접 용출시켰다. 풀 스캔(해상도 70 000; 스캔 범위 200 내지 2000 m/z) 다음에 12종의 가장 함유량이 높은 이온의 고에너지 충돌 해리(HCD)(해상도 17 500)가 이어지는, 상위 12 방법을 사용하여 데이터 의존적 방식으로 데이터를 수집하였다.
자체적인 소프트웨어를 사용하여 정확한 질량 및 탠덤 질량 스펙트럼을 기반으로 펩티드를 확인하였다. 확인은 수동으로 검증되었다. Pinpoint 소프트웨어(Thermo Scientific)를 사용하여 이온 존재도를 기반으로 변형 및 비변형 펩티드의 상대적 양을 계산하였다.
상보성 결정 영역(CDR) 및 반감기 연장 부분의 화학적 변형의 백분율은 Fehler! Verweisquelle konnte nicht gefunden werden.9에 의해 주어진다.
도 10에서 입증되는 바와 같이 HMWS의 존재도는 CD33cc-scFc가 pH 4.0에서 제형화될 때 pH 6.0 또는 7.0에서의 제형화와 비교하여 유의미하게 감소된다. 표 7은 37℃에서 2주 동안 저장 후 제형의 기능에서의 화학적 변형의 개요를 제공한다.
표 9에 개괄한 바와 같이, CD33cc-scFc는 pH 6.0 및 7.0과 비교하여 pH 4.0에서 제형화될 때 화학적 변형에 덜 취약하다.
실시예 6:
각각 정제된 MSLN-hALB, MSLN-hFc, 및 MSLN-scFc를 포함하는 사전 제형화된 약물 물질을 10 kDa의 분자량 컷-오프(MWCO)를 갖는 막을 사용한 한외여과/투석여과를 통해 완충제 교환하였다. 농축된 저장 용액을 첨가함으로써 최종 제형을 달성하였다. 각각의 구축물에 대하여 생성된 제형은 pH 6.0에서 20 mM 인산칼륨, 150 mM L-아르기닌 염산염, 6%(w/V) 트레할로오스 이수화물, 0.01%(w/V) 폴리소르베이트 80으로 구성되는 K60RTrT 및 pH 4.0에서 10 mM 글루타메이트, 4%(w/V) 만니톨, 2%(w/V) 수크로오스, 0.01%(w/V) 폴리소르베이트 80으로 구성되는 G40MSuT이다. MSLN-hALB는 K60RTrT에서 제형화하였고 MSLN-scFc는 K60RTrT 및 G40MSuT에서 제형화하였다. 단백질 농도는 총 1.0 mg/mL였다. 1950 μL의 각각의 시험 용액을 50 μL의 1000 ppm 규소 표준 용액(AlfaAesar로부터의 Specpure, Art.No. 38717)으로 스파이킹하여 25 ppm 스파이크를 생성하였다. 스파이킹되지 않은 시험 용액은 대조 샘플로서 작용하였다. 스파이킹된 시험 용액뿐만 아니라 대조 샘플을 3cc I형 유리 바이알에 채우고 37℃에서 24시간 동안 인큐베이션하였다. HMWS의 양을 정량화하기 위해 실시예 4에서 기술된 방법에 따라 모든 샘플을 SE-UPLC로 분석하였다(표 10). K60RTrT에서 제형화하는 경우, MSLN-hALB 및 MSLN-scFc는 규소 스파이킹 시 HMWS에서 유사한 증가를 나타내었다. scFc 구축물의 경우, 이러한 증가를 제형 pH를 4.0까지 낮춤으로써 감소시킬 수 있다는 것을 보여줄 수 있었다. 예비 실험에 따르면, 이러한 접근법은 MLSN-hALB에 대해서는 실현 가능하지 않았는데, 5.0 이하의 제형 pH 값에서는 단편화가 일어난다는 사실이 밝혀졌기 때문이다.
scFc 구축물의 경우, 원치 않는 고분자량 종의 증가를 제형 pH를 4.0까지 낮춤으로써 감소시킬 수 있다는 것을 보여줄 수 있었다. 예비 실험에 따르면, 이러한 접근법은 MLSN-hALB에 대해서는 실현 가능하지 않았는데, 5.0 이하의 제형 pH 값에서는 단편화가 이루어진다는 사실이 밝혀졌기 때문이다. 따라서, 밝혀진 유리한 제형은 본 발명에 따른 항체 구축물, 예를 들어 제3 도메인으로서의 scFc에 특히 적합하다.
실시예 7:
반감기 연장 모이어티가 면제된 EGFRvIII 표적 비-HLE(반감기 연장) BiTE® 항체 구축물(BiTE® A)을 pH 4.8에서 20 mM 시트르산 일수화물, 100 mM L-아르기닌 일염산염으로 제형화하였다. 이 용액의 분획을 4M 저장 용액을 사용하여 0, 100, 및 200 mM 염화나트륨으로 스파이킹하였다. 각 분획의 농도는 mL 당 0.8 mg BiTE A로 조정하였다. 최종 용액을 사용 준비된 10R I형 유리 바이알에 2.5 mL로 분액으로 하고, 이를 부틸 고무 마개 및 알루미늄 플립 오프 시일로 닫았다. 이들 용액을 30℃에서 12주 동안 저장하고 상이한 분석 방법을 사용하여 안정성을 평가하였다.
단백질 농도를 결정하기 위해, 바이오 샘플 매니저(Bio Sample Manager)-FTN, 바이오 4기 용매 매니저(Bio Quaternary Solvent Manager), 및 광 다이오드 어레이(PDA) 검출기로 구성된 어퀴티(ACQUITY) UPLC H-클래스 바이오 시스템(Waters, Milford, MA, USA)에서 SE-UPLC를 수행하였다. 크로마토그래피 분리는 어퀴티 UPLC 단백질 BEH 200 SEC 칼럼(패킹 1.7 μm, 4.6 x 150 mm)(Waters, Milford, MA, USA)을 사용하여 실시하였다. 칼럼 온도는 25℃에서 유지하였다. 100 μL의 각 샘플 용액을 PTFE/규소 중격을 갖는 글라스 스크류 넥 바이알(Waters, Milford, MA, USA)로 충전하였다. 오토샘플러의 온도는 8℃로 조절되었다.
샘플을 실행 당 약 0.8 mg/mL의 단백질 농도에서 주입량 3.8 μL에 상응하는 3 μg/샘플로 칼럼에 로딩하여 2회 측정하였다. 샘플 용출은 이동상 100 mM 인산나트륨 완충액, pH 6.8에 추가의 250 mM 염화나트륨 완충액을 사용하여 0.4 mL/분의 유속에서 등용매 조건 하에 수행하였다. 실행 완충액은 채널 A로 로딩되는 500 mM 일염기성 인산나트륨, 채널 B로 로딩되는 500 mM 이염기성 인산나트륨, 채널 C로 로딩되는 1M 염화나트륨 및 채널 D로 로딩되는 HPLC 등급 물과 시스템에 의해 자동으로 사전 혼합되었다. 샘플 실행 사이에 10 μL의 40% 아세토니트릴을 주입하였다. 각 분석의 시작, 중간 및 종결시 단백질 표준을 측정하여 시스템 적합성을 확보하였다. 실행 시간은 6분으로 설정하였다.
용출된 샘플은 UV 흡수에 의해 검출되었고 280 nm의 파장에서 결정되었다. 크로마토그램의 습득 및 통합은 Empower 소프트웨어(Waters, Milford, MA, USA)를 사용하여 수행되었다. 크로마토그램을 샘플의 농도 결정을 위한 곡선 하 면적(AUC)에 대하여 분석하였다. 값은 상응하는 표준 편차를 갖는 독립 샘플 3회의 평균값으로서 주어진다.
단백질 농도는 다음 방정식을 사용하여 계산하였다:
방정식: mAU*s에서의 곡선 하 면적(AUC) 값으로부터 샘플 농도 mg/mL의 계산. 파라미터는 표 11에 요약되어 있다.
제형 및 저장 시간의 함수로서의 BiTE® A 제제의 단백질 농도는 표 12에 주어진다. 단백질 농도는 염화나트륨 부재시 시간 경과에 따라 일정하게 유지되지만, 염 함유 제제에서는 유의미한 단백질 손실이 관찰되었다. 단백질 손실은 200 mM 염화나트륨을 갖는 제형에서 가장 현저하였다.
BiTE® A 제제 내에서 10 및 25 μm 초과의 육안으로 보이지 않는 입자의 양을 측정하기 위해 광 엄폐를 적용하였다. 광 엄폐 측정은 HRLD 150 센서가 장착된 HIAC 9703+ 액체 입자 계수 시스템(Beckmann Coulter, Brea, CA, USA)에서 수행되었다. 데이터 습득 및 분석은 상응하는 PharmSpec 3 소프트웨어를 사용하여 수행되었다. 샘플 분석 전에 EZYTM-Cal 입자 크기 표준 5 μm(Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA) 및 EZYTM-Cal 입자 크기 표준 15 μm(Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA)의 측정에 의해 시스템 적합성을 검증하였다.
각각의 샘플에 대하여, 0.2 mL 샘플 용적의 4회 측정을 10 mL/분의 유속에서 수행하였다. 최초 실행을 폐기하였으므로, 입자 농도는 마지막 3회 측정으로부터의 평균으로서 주어졌다. 샘플 측정 전과 사이에 공시험을 수행하였다. 입자가 없는 물의 입자 농도를 결정하여 2 μm 이상 입자 10 개/mL 및 10 μm 이상 입자 1 개/mL의 최대량을 보장하였다. 10 및 25 μm 초과 입자에 대한 육안으로 보이지 않는 입자 농도는 독립적인 3회의 평균 값으로서 주어진다.
표 13은 제형 및 저장 시간의 함수로서 BiTE® A 함유 제제에서의 육안으로 보이지 않는 입자 수의 개요를 서술한다. 육안으로 보이지 않는 입자 수는 염화나트륨의 부재시 최저였고 시간 경과에 따라 단지 미미하게 변화한다. 염화나트륨의 첨가는 비슷한 초기 입자 수를 초래하였다. 그러나, 육안으로 보이지 않는 입자의 양은 염의 존재시 시간 경과에 따라 유의미하게 증가하였다. 이는 제제의 콜로이드 안정성이 염화나트륨의 부재시 개선되는 것을 입증한다.
BiTE® A 함유 제제를 나노 시차 주사 열량측정법(나노DSF)에 의해 열적으로 분석하였다. 상이하게 제형화된 BiTE® A 제제의 풀림 및 응집 거동을 Prometheus NT.48 기기(NanoTemper Technologies, Munich, Germany) 및 상응하는 PRThermControl 소프트웨어(NanoTemper Technologies, Munich, Germany)를 사용하여 모니터링하였다. 단백질 풀림 온도 Tm의 분석 및 응집 온도 Tagg의 검출을 위해, 샘플 당 10 μL를 Prometheus NT.48 표준 모세관(NanoTemper Technologies, Munich, Germany)으로 모관력에 의해 충전하고 기기에 놓았다. 샘플은 3회 측정하였다. 온도 경사는 1℃/분의 가열 속도로 20℃로부터 95℃까지로 정의하였다.
데이터 분석은 Prometheus PRThermControl 소프트웨어(NanoTemper Technologies, Munich, Germany)를 사용하여 수행하였다. 열 풀림 실험의 경우 각각 이의 1차 도함수 형광비(F350 nm/F330 nm)를 온도에 대하여 도시하였다. 응집 검출의 경우, 각각 이의 1차 도함수 산란된 광 강도를 온도에 대하여 도시하였다.
단백질 풀림 온도(Tm) 및 응집 온도(Tagg)는 표 14에 3회로부터 계산된 표준 편차와 평균값으로서 주어진다. 풀림(Tm) 및 단백질 응집(Tagg)은 염화나트륨의 부재시 더 높은 온도에서 일어났음이 입증되었다. 이는 염의 면제시 제형의 향상된 입체형태 및 콜로이드 안정성을 나타낸다.
실시예 8:
C-말단에 단일-쇄 Fc 도메인을 포함하고 BCMA에 대하여 유도된 도메인에서 추가의 cys-클램프가 있는 것(BiTE® F) 및 없는 것(BiTE® E)의 2개 BCMA 표적 BiTE® 항체 구축물을 pH 4.8에서 10 mM L-글루탐산, 9%(w/v) 수크로오스로 제형화하였다. 이 용액의 분획을 4M 저장 용액을 사용하여 0, 100, 및 200 mM 염화나트륨으로 스파이킹하였다. 각 분획의 농도를 mL 당 0.8 mg BiTE®로 조정하였다. 최종 용액을 사용 준비된 10R I형 유리 바이알에 2.5 mL로 분액으로 하고, 이를 부틸 고무 마개 및 알루미늄 플립 오프 시일로 닫았다. 이들 용액을 30℃에서 12주 동안 저장하고 상이한 분석 방법을 사용하여 안정성을 평가하였다.
실시예 7에 기술된 바와 같이 SE-UPLC를 수행하였다. 검출은 280 nm의 여기 파장을 사용하여 325 nm에서 형광 방출 강도를 측정함으로써 실시하였다. 저분자량 종(LMWS)에 기인하는 곡선 하 상대 면적(AUC). 표 15에 나타낸 바와 같이 시간 경과에 따른 LMWS의 형성은 염화나트륨의 부재시 덜 현저하고 염 부재 제제의 개선된 안정성을 나타낸다.
광 엄폐는 실시예 7에 기술된 바와 같이 수행하였다. 제형 및 저장의 함수로서 BiTE® E 및 BiTE® F 제제에서 육안으로 보이지 않는 입자의 존재도는 표 16에 주어진다. 육안으로 보이지 않는 입자는 저장 시간과 무관하게 염을 함유하는 제제와 비교하여 염화나트륨의 부재시 덜 현저하였다. 이는 염 면제 제형에서 BiTE® E 및 BiTE® F의 개선된 콜로이드 안정성을 나타낸다.
BiTE® E 및 BiTE® F 제제를 실시예 7 하에 기술된 방법을 사용하여 나노 시차 주사 열량측정법(나노DSF)에 의해 열적으로 분석하였다. 단백질 풀림 온도(Tm) 및 응집 온도(Tagg)는 표 17에 3회로부터 계산된 표준 편차와 평균값으로서 주어진다. 풀림(Tm)은 0 또는 100 mM 염화나트륨을 함유하는 제제와 비교하여 200 mM NaCl의 존재시 더 높은 온도에서 일어났다. 단백질 응집은 시험한 온도 범위에서 염 부재 제제에서는 검출되지 않았다. 대조적으로, 단백질 응집이 염화나트륨을 함유하는 제제에서 관찰되었다. 응집 온도는 더 높은 염 농도에서 저하되었다. 위의 발견은 염의 면제시 제형의 향상된 입체형태 및 콜로이드 안정성을 나타낸다.
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<213> Artificial Sequence <220> <223> PM76B10-HL <400> 1962 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Glu 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr 20 25 30 Tyr Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Ile Ile Ser Asp Gly Gly Tyr Tyr Thr Tyr Tyr Ser Asp Ile Ile 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Gly Phe Pro Leu Leu Arg His Gly Ala Met Asp Tyr Trp Gly 100 105 110 Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly 115 120 125 Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro 130 135 140 Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys 145 150 155 160 Ala Ser Gln Asn Val Asp Thr Asn Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro 165 170 175 Gly Gln Ala Pro Lys Ser Leu Ile Tyr Ser Ala Ser Tyr Arg Tyr Ser 180 185 190 Asp Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser 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Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys 145 150 155 160 Ala Ser Gln Asn Val Asp Thr Asn Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro 165 170 175 Gly Gln Ala Pro Lys Ser Leu Ile Tyr Ser Ala Ser Tyr Arg Tyr Ser 180 185 190 Asp Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Ala Ser Gly Thr Asp Phe Thr 195 200 205 Leu Thr Ile Ser Ser Val Gln Ser Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys 210 215 220 Gln Gln Tyr Asp Ser Tyr Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu 225 230 235 240 Glu Ile Lys Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Gln Leu Val Glu Ser 245 250 255 Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala 260 265 270 Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Lys Tyr Ala Met Asn Trp Val Arg Gln 275 280 285 Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala Arg Ile Arg Ser Lys Tyr 290 295 300 Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Asp Arg Phe Thr 305 310 315 320 Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gln Met Asn Asn 325 330 335 Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Val Arg His Gly Asn 340 345 350 Phe Gly Asn Ser Tyr Ile Ser Tyr Trp Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 355 360 365 Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 370 375 380 Gly Gly Gly Gly Ser Gln Thr Val Val Thr Gln Glu Pro Ser Leu Thr 385 390 395 400 Val Ser Pro Gly Gly Thr Val Thr Leu Thr Cys Gly Ser Ser Thr Gly 405 410 415 Ala Val Thr Ser Gly Asn Tyr Pro Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly 420 425 430 Gln Ala Pro Arg Gly Leu Ile Gly Gly Thr Lys Phe Leu Ala Pro Gly 435 440 445 Thr Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Leu Leu Gly Gly Lys Ala Ala Leu 450 455 460 Thr Leu Ser Gly Val Gln Pro Glu Asp Glu Ala Glu Tyr Tyr Cys Val 465 470 475 480 Leu Trp Tyr Ser Asn Arg Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr 485 490 495 Val Leu

Claims (33)

  1. (a) 적어도 3개의 도메인을 포함하는 항체 구축물, 여기에서:
    제1 도메인은 표적 세포 표면 항원에 결합하고 4 내지 9.5 범위의 등전점(pI)을 갖고;
    제2 도메인은 제2 항원에 결합하고; 8 내지 10, 바람직하게는 8.5 내지 9.5 범위의 pI를 갖고;
    제3 도메인은, 각각 힌지, CH2 도메인 및 CH3 도메인을 포함하는 2개의 폴리펩티드 단량체를 포함하고, 여기에서 상기 2개의 폴리펩티드 단량체는 펩티드 링커를 통해 서로 융합되고;
    (b) 적어도 하나의 완충제;
    (c) 적어도 하나의 당류; 및
    (d) 적어도 하나의 계면활성제를 포함하는 액체 약제학적 조성물로서, 약제학적 조성물의 pH는 3.5 내지 6의 범위인 액체 약제학적 조성물.
  2. 제1항에 있어서, 항체 구축물은 단일 쇄 항체 구축물인 액체 약제학적 조성물.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 제3 도메인은 아미노로부터 카르복실 순서로: 힌지-CH2 도메인-CH3 도메인-링커-힌지-CH2 도메인-CH3 도메인을 포함하는 액체 약제학적 조성물.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 제1 도메인은 약 4.5 내지 6.5 범위의 pI를 갖는 액체 약제학적 조성물.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 표적 세포 표면 항원은 종양 항원, 면역 장애에 특이적인 항원 또는 바이러스 항원인 액체 약제학적 조성물.
  6. 제5항에 있어서, 종양 항원은 CDH19, MSLN, DLL3, FLT3, EGFR, EGFRvIII, BCMA, PSMA, CD33, CD19, CD20, 및 CD70으로 구성되는 군으로부터 선택되는 액체 약제학적 조성물.
  7. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 제2 도메인은 CD3인간 및/또는 마카카(Macaca) CD3ε 쇄의 세포외 에피토프인 약제학적 조성물.
  8. 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 제2 도메인은 8.5 내지 9.0 범위의 pI를 갖는 약제학적 조성물.
  9. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 제3 도메인의 상기 폴리펩티드 단량체 각각은 서열번호: 17 내지 24로 구성되는 군으로부터 선택되는 서열과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 갖거나, 서열번호: 17 내지 24로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 약제학적 조성물.
  10. 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, CH2 도메인은 도메인내 시스테인 이황화 가교를 포함하는 약제학적 조성물.
  11. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 제3 도메인은 5.5 내지 7.5, 바람직하게는 6.0 내지 7.0 범위의 pI를 갖는 약제학적 조성물.
  12. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서,
    (i) 제1 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하고 제2 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하거나;
    (ii) 제1 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함하고 제2 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하거나;
    (iii) 제1 도메인은 2개의 항체 가변 도메인을 포함하고 제2 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함하거나;
    (iv) 제1 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함하고 제2 도메인은 1개의 항체 가변 도메인을 포함하는 약제학적 조성물.
  13. 제1항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 항체 구축물은 바람직하게는 아미노로부터 카르복실 순서로:
    (a) 제1 도메인;
    (b) 서열번호: 1 내지 3으로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커;
    (c) 제2 도메인;
    (d) 서열번호: 1, 2, 3, 9, 10, 11 및 12로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커;
    (e) 제3 도메인의 제1 폴리펩티드 단량체;
    (f) 서열번호: 5, 6, 7 및 8로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 펩티드 링커; 및
    (g) 제3 도메인의 제2 폴리펩티드 단량체를 포함하는 액체 약제학적 조성물.
  14. 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 적어도 하나의 완충제는 아세테이트, 글루타메이트, 시트레이트, 숙시네이트, 타르트레이트, 푸마레이트, 말리에이트, 히스티딘, 포스페이트, 2-(N-모르폴리노)에탄술포네이트 또는 이의 조합으로 구성되는 군으로부터 선택되는 산인 액체 약제학적 조성물.
  15. 제14항에 있어서, 적어도 하나의 완충제는 5 내지 200 mM의 농도 범위, 더욱 바람직하게는 10 내지 50 mM의 농도 범위로 존재하는 약체 약제학적 조성물.
  16. 제1항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서, 적어도 하나의 당류는 단당류, 이당류, 고리 다당류, 당 알코올, 선형 분지 덱스트란 또는 선형 비-분지 덱스트란으로 구성되는 군으로부터 선택되는 액체 약제학적 조성물.
  17. 제16항에 있어서, 이당류는 수크로오스, 트레할로오스 및 만니톨, 소르비톨, 및 이의 조합으로 구성되는 군으로부터 선택되는 액체 약제학적 조성물.
  18. 제16항에 있어서, 당 알코올은 소르비톨인 액체 약제학적 조성물.
  19. 제1항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서, 적어도 하나의 당류는 1 내지 15%(m/V) 범위의 농도, 바람직하게는 9 내지 12%(m/V)의 농도 범위로 존재하는 액체 약제학적 조성물.
  20. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서, 적어도 하나의 계면활성제는 폴리소르베이트 20, 폴리소르베이트 40, 폴리소르베이트 60, 폴리소르베이트 80, 폴록사머 188, 플루로닉 F68, 트리톤 X-100, 폴리옥시에틸렌, PEG 3350, PEG 4000 및 이의 조합으로 구성되는 군으로부터 선택되는 액체 약제학적 조성물.
  21. 제1항 내지 제20항 중 어느 한 항에 있어서, 적어도 하나의 계면활성제는 0.004 내지 0.5%(m/V) 범위, 바람직하게는 0.001 내지 0.01%(m/V) 범위의 농도로 존재하는 액체 약제학적 조성물.
  22. 제1항 내지 제21항 중 어느 한 항에 있어서, 조성물의 pH는 4.0 내지 5.0 범위, 바람직하게는 4.2인 액체 약제학적 조성물.
  23. 제1항 내지 제22항 중 어느 한 항에 있어서, 150 내지 500 mOsm 범위의 삼투압농도를 갖는 액체 약제학적 조성물.
  24. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 하나 이상의 폴리올 및 하나 이상의 아미노산으로 구성되는 군으로부터 선택되는 부형제를 추가로 포함하는 액체 약제학적 조성물.
  25. 제24항에 있어서, 상기 하나 이상의 부형제는 0.1 내지 15%(w/V)의 농도 범위로 존재하는 액체 약제학적 조성물.
  26. 제1항 내지 제25항 중 어느 한 항에 있어서, 조성물에 무기 음이온이 존재하지 않는 액체 약제학적 조성물.
  27. 제1항 내지 제26항 중 어느 한 항에 있어서, 조성물은
    (a) 제1항 내지 제26항 중 어느 한 항의 하나의 항체 구축물,
    (b) 10 mM 글루타메이트 또는 아세테이트,
    (c) 9%(m/V) 수크로오스 또는 6%(m/V) 수크로오스 및 6%(m/V) 하이드록시프로필-β-사이클로덱스트린,
    (d) 0.01%(m/V) 폴리소르베이트 80를 포함하고
    액체 약제학적 조성물의 pH는 4.2인 액체 약제학적 조성물.
  28. 제1항 내지 제27항 중 어느 한 항에 있어서, 항체 구축물은 0.1 내지 8 mg/mL, 바람직하게는 0.2 내지 2.5 mg/mL, 더욱 바람직하게는 0.25 내지 1.0 mg/mL의 농도 범위로 존재하는 액체 약제학적 조성물.
  29. 제1항 내지 제28항 중 어느 한 항의 액체 약제학적 조성물의 동결건조에 의해 얻어질 수 있는 고체 약제학적 조성물.
  30. 제29항의 고체 약제학적 조성물을 약제학적으로 허용 가능한 액체로 재구성하는 것에 의해 얻어질 수 있는 액체 약제학적 조성물.
  31. 제1항 내지 제30항 중 어느 한 항에 있어서, 질환, 바람직하게는 증식성 질환, 면역 질환 또는 바이러스 질환의 치료에 사용하기 위한 조성물.
  32. 제31항에 있어서, 조성물은 비경구로, 바람직하게는 주입 또는 주사에 의해 정맥내로 투여되는 조성물.
  33. 제31항에 있어서, 조성물은 매주 1, 2, 3, 4, 5, 6 또는 7회, 또는 2주마다 1, 2, 3, 4, 5 또는 6회, 또는 매달 1 또는 2회, 또는 2개월마다 1 또는 2회, 가장 바람직하게는 매주 1회 투여되는 조성물.
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