KR20230161769A - 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머 및 이의 용도 - Google Patents
전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머 및 이의 용도 Download PDFInfo
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Abstract
본 발명은 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머에 관한 것이다. 본 발명에 따른 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머는 전립선특이막항원에 대한 결합 친화도가 높은 것을 확인하였다. 이는 본 발명의 압타머를 이용하여 표적 약물 전달이 가능함을 의미하는바, 본 발명의 압타머는 전립선 관련 질환의 치료 분야에서 다양하게 활용될 수 있다.
Description
본 발명은 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머에 관한 것이다.
전립선특이막항원(Prostate-specific membrane antigen, PSMA)는 전립선세포 표면에 주로 존재하는 단백질이다. 서구에서는 전립선암이 남성 암 발병률 1위이며, 국내에서도 발병률 4위에 해당한다. 남성호르몬 억제 치료가 시행되지만, 기존 약물에 내성이 생기는 경우 치료효과가 떨어지며 거세저항성전립선암 (castrate-resistant prostate cancer, CRPC)으로 변하게 된다. 거세저항성전립선암 환자를 대상으로 PSMA 표적치료가 효과적일 수 있다.
한편, 압타머(Aptamer)는 스템(stem), 루프(loop) 및 헤어핀(hairpin) 등의 구조를 갖는 안정된 삼차 구조를 이루는 단일 가닥 핵산(DNA, RNA 또는 변형 핵산) 물질로써, 표적 분자에 높은 친화성과 특이성으로 결합할 수 있는 특징을 가지고 있다. 이에, 압타머는 항체와 유사한 특징을 가지며, chemical antibody로 불린다. 압타머는 일반적으로 40 내지 120 mer로 구성되며, 고유의 높은 친화성(보통 pM 수준)과 특이성으로 표적 분자에 결합할 수 있다. 압타머는 임상 암 진단 분야와 암 치료분야에서 활발한 연구가 이루어지고 있는데 그 이유는 다음과 같다.
1) 생체내 면역거부반응이 일어나지 않는다.
2) 매우 작은 크기로 인해 생체내 이동 및 결합이 효율적이다.
3) 압타머는 화학적 합성 방법을 이용하기 때문에 단시간에 적은 비용으로 생산이 가능하다.
4) 압타머는 항체에 비해 안정성이 매우 높다. 압타머는 실온에서 보관이나 운반이 가능하며, 온도에 대한 안정성이 높기 때문에 특히 장시간 또 반복 사용이 요구되는 진단 분야에서의 응용이 매우 용이하다.
5) 압타머는 핵산 물질로서 다양한 변형이 가능하므로 다양한 연구 및 실험에 적용이 가능하다.
전술한 바와 같은 압타머의 장점으로 인해, 압타머는 임상 암 진단 분야와 암 치료분야에서 다양하게 적용될 수 있다. 첫 번째로 개발된 압타머 관련 약물은 2005년 미국 식약청에서 승인되었다.
이에 본 발명자들은 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 개발하고, 상기 압타머 및 이의 변형 서열을 갖는 압타머가 전립선특이막항원에 대한 결합 친화도가 현저히 높은 것을 확인함으로써 본 발명을 완성하게 되었다.
따라서 본 발명의 목적은, 서열번호 1의 염기서열로 표시되는 백본 서열(backbone sequence) 또는 이의 단편을 포함하는, 전립선특이막항원(prostate specific membrane antigen, PSMA)에 특이적으로 결합하는 압타머를 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은, 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는 전립선암 진단용 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은, 상기 전립선암 진단용 조성물을 포함하는 진단 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은, 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머와 생물학적 시료를 반응시키는 단계를 포함하는, 전립선 암 진단에 대한 정보제공 방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은, 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는 전립선암 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은, 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는, 전립선암 예방 또는 치료용 항암보조제 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은, 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는, 전립선 특이적 약물전달용 조성물을 제공하는 것이다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1의 염기서열로 표시되는 백본 서열(backbone sequence) 또는 이의 단편을 포함하는, 전립선특이막항원(prostate specific membrane antigen, PSMA)에 특이적으로 결합하는 압타머를 제공한다.
본 발명은 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는 전립선암 진단용 조성물을 제공한다.
본 발명은 상기 전립선암 진단용 조성물을 포함하는 진단 키트를 제공한다.
본 발명은 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머와 생물학적 시료를 반응시키는 단계를 포함하는, 전립선 암 진단에 대한 정보제공 방법을 제공한다.
본 발명은 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는 전립선암 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명은 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는, 전립선암 예방 또는 치료용 항암보조제 조성물을 제공한다.
본 발명은 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는, 전립선 특이적 약물전달용 조성물을 제공한다.
본 발명에 따른 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머는 전립선특이막항원에 대한 결합 친화도가 높은 것을 확인하였다. 이는 본 발명의 압타머를 이용하여 표적 약물 전달이 가능함을 의미하는바, 본 발명의 압타머는 전립선 관련 질환의 치료 분야에서 다양하게 활용될 수 있다.
도 1은 SELEX로 선별된 압타머의 PSMA에 대한 친화도를 분석한 결과를 나타낸 도이다.
도 2는 MFOLD 프로그램을 이용하여 압타머 PS202의 2차 구조를 예측한 결과를 나타낸 도이다.
도 3은 MFOLD 프로그램을 이용하여 압타머 PS202_L1a, PS202_L1b 및 PS202_S2a의 2차 구조를 예측한 결과를 나타낸 도이다.
도 4는 MFOLD 프로그램을 이용하여 압타머 PS202_3d8, PS202_1, PS202_2 및 PS202_3의 2차 구조를 예측한 결과를 나타낸 도이다.
도 5는 MFOLD 프로그램을 이용하여 압타머 PS202_5의 2차 구조를 예측한 결과를 나타낸 도이다.
도 6은 압타머 PS202_L1a, PS202_L1b 및 PS202_S2a의 PSMA에 대한 친화도를 분석한 결과를 나타낸 도이다.
도 7은 압타머 PS202_3d8, PS202_1, PS202_2 및 PS202_3의 PSMA에 대한 친화도를 분석한 결과를 나타낸 도이다.
도 8은 압타머 PS202_5의 PSMA에 대한 친화도를 분석한 결과를 나타낸 도이다.
도 2는 MFOLD 프로그램을 이용하여 압타머 PS202의 2차 구조를 예측한 결과를 나타낸 도이다.
도 3은 MFOLD 프로그램을 이용하여 압타머 PS202_L1a, PS202_L1b 및 PS202_S2a의 2차 구조를 예측한 결과를 나타낸 도이다.
도 4는 MFOLD 프로그램을 이용하여 압타머 PS202_3d8, PS202_1, PS202_2 및 PS202_3의 2차 구조를 예측한 결과를 나타낸 도이다.
도 5는 MFOLD 프로그램을 이용하여 압타머 PS202_5의 2차 구조를 예측한 결과를 나타낸 도이다.
도 6은 압타머 PS202_L1a, PS202_L1b 및 PS202_S2a의 PSMA에 대한 친화도를 분석한 결과를 나타낸 도이다.
도 7은 압타머 PS202_3d8, PS202_1, PS202_2 및 PS202_3의 PSMA에 대한 친화도를 분석한 결과를 나타낸 도이다.
도 8은 압타머 PS202_5의 PSMA에 대한 친화도를 분석한 결과를 나타낸 도이다.
이하, 본 발명을 상세히 설명한다.
본 발명의 양태에 따르면, 본 발명은 서열번호 1의 염기서열로 표시되는 백본 서열(backbone sequence) 또는 이의 단편을 포함하는, 전립선특이막항원(prostate specific membrane antigen, PSMA)에 특이적으로 결합하는 압타머를 제공한다.
본 발명에 있어서, “압타머(aptamer)”는 높은 친화성으로 타겟 물질을 특이적으로 인지할 수 있는 작은 단일가닥 올리고핵산을 의미한다. 이때, 상기 압타머가 RNA인 경우에는, 염기서열에 있어서 T는 U로 인식될 수 있다.
본 발명의 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머는 서열번호 1의 염기서열로 표시되는 백본 서열과 90% 이상의 동일성을 가진 핵산서열 또는 이의 단편을 포함하는 것이 바람직하며, 서열번호 1의 염기서열로 표시되는 백본 서열 또는 이의 단편을 포함하는 것이 가장 바람직하다. 상기 “90% 이상의 동일성을 가지는 핵산서열”이란 일 내지 수개의 뉴클레오티드가 추가, 결실 또는 치환되어 90% 이상 100% 미만의 서열에 공통성이 있는 것으로 유사한 전립선특이막항원 결합능을 보이는 핵산서열을 의미한다.
본 발명에 있어서, “뉴클레오타이드(nucleotide)”는 핵산을 이루는 단위체를 의미한다. 본 명세서에서 달리 명시하지 않는 한, 뉴클레오타이드 A, T(U), G 및 C는 각각 2’-데옥시아데노신( 2’-deoxyAdenosine), 2’-데옥시티미딘(2’-deoxyThymidine)(또는 2’-데옥시유리딘(2’-deoxyUridine)), 2’-데옥시구아노신(2’-deoxyGuanosine) 및 2’-데옥시시티딘(2’-deoxyCytidine)으로 정의된다. 또한 ‘N’은 화학식 1로 표시되고, 화학식 1의 핵염기(base)는 아데닌, 구아닌, 티민, 유라실, 사이토신이 될 수 있으며, 당의 2‘ 위치의 X는 수소 원자(-H), 하이드록실기(-OH), O-메틸기(-OCH3) 또는 플루오로(-F)로 대체될 수 있다.
[화학식 1]
본 발명의 구체예에서, 상기 압타머는 크기가 50 내지 90 mer인 것이 바람직하며, 이에 본 발명의 범위가 제한되지 않는다.
본 발명의 구체예에서, 상기 압타머는 하기 구조식 1의 형태로 작동 가능하게 연결된 것일 수 있다.
[구조식 1]
5'-제1뉴클레오티드(N1)-백본 서열(backbone sequence)-제2뉴클레오티드(N2)-3’
본 발명에 있어서, "작동 가능하게 연결(operably linked)"된다는 것은 적절한 분자가 발현 조절 서열에 결합할 때 유전자 발현을 가능하게 하는 방식으로 연결되는 것을 의미한다.
본 발명의 바람직한 구체예에서, 상기 압타머는 제1뉴클레오티드가 서열번호 2, 4, 8, 10 및 13으로 이루어진 군에서 선택된 1 이상의 서열로 표시되는 뉴클레오티드이고, 제2뉴클레오티드가 서열번호 3, 5, 6, 7, 9, 11, 12 및 14로 이루어진 군에서 선택된 1 이상의 서열로 표시되는 뉴클레오티드인 것이 바람직하다. 더 바람직하게는 본 발명의 압타머는 예를 들어, 다음을 포함할 수 있다:
서열번호 2의 염기서열로 표시되는 제1뉴클레오티드 및 서열번호 3의 염기서열로 표시되는 제2뉴클레오티드;
서열번호 4의 염기서열로 표시되는 제1뉴클레오티드 및 서열번호 3의 염기서열로 표시되는 제2뉴클레오티드;
서열번호 2의 염기서열로 표시되는 제1뉴클레오티드 및 서열번호 5의 염기서열로 표시되는 제2뉴클레오티드;
서열번호 2의 염기서열로 표시되는 제1뉴클레오티드 및 서열번호 6의 염기서열로 표시되는 제2뉴클레오티드;
서열번호 2의 염기서열로 표시되는 제1뉴클레오티드 및 서열번호 7의 염기서열로 표시되는 제2뉴클레오티드;
서열번호 8의 염기서열로 표시되는 제1뉴클레오티드 및 서열번호 9의 염기서열로 표시되는 제2뉴클레오티드;
서열번호 10의 염기서열로 표시되는 제1뉴클레오티드 및 서열번호 11의 염기서열로 표시되는 제2뉴클레오티드;
서열번호 10의 염기서열로 표시되는 제1뉴클레오티드 및 서열번호 12의 염기서열로 표시되는 제2뉴클레오티드; 또는
서열번호 13의 염기서열로 표시되는 제1뉴클레오티드 및 서열번호 14의 염기서열로 표시되는 제2뉴클레오티드.
본 발명의 바람직한 구체예에서, 상기 압타머는 서열번호 15 내지 23으로 이루어진 군에서 선택된 1 이상의 염기서열로 표시되는 것이 바람직하다. 상기 압타머는 서열번호 15 내지 23으로 이루어진 군에서 선택된 1 이상의 염기서열의 변이체가 본 발명의 범위 내에 포함된다.
본 발명의 바람직한 구체예에서, 또한 상기 압타머는 서열번호 15의 염기서열과 90% 이상의 서열 동일성(identity)을 갖는 것일 수 있다. 구체적으로, 상기 압타머는 서열번호 15의 염기서열과 90% 이상, 더욱 바람직하게는 93% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 동일성을 가지는 것으로, 서열번호 15으로 표시되는 염기서열과 실질적으로 동질의 생리활성을 나타내는 서열을 의미한다. 폴리뉴클레오티드에 대한 "서열 동일성의 %"는 두 개의 최적으로 배열된 서열과 비교 영역을 비교함으로써 확인되며, 비교 영역에서의 폴리뉴클레오티드 서열의 일부는 두 서열의 최적 배열에 대한 참고 서열(추가 또는 삭제를 포함하지 않음)에 비해 추가 또는 삭제(즉, 갭)를 포함할 수 있다. 예를 들어, 상기 ‘서열번호 15의 염기서열과 90% 이상의 서열 동일성을 갖는 압타머’는 서열번호 16 내지 23으로 이루어진 군에서 선택된 1 이상의 염기서열로 표시되는 압타머이고, 이들은 전립선특이막항원에 대한 결합 친화도가 높은 특성을 가지고 있음을 실험적으로 확인하였다.
본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는 전립선암 진단용 조성물 및 상기 조성물을 포함하는 전립선암 진단 키트를 제공한다.
본 발명에 있어서, “진단”은 병리 상태의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미한다. 상기 진단은 발병 여부뿐만 아니라 예후, 암의 경과, 병기 등을 확인하는 것을 모두 포함하는 의미이다.
본 발명의 전립선암 진단용 조성물 및 전립선암 진단 키트를 이용하여, 생물학적 시료에서 전립선암특이막항원을 검출하여 전립선암의 존재 여부를 확인하고, 전립선암의 존재 여부 뿐만 아니라 예후, 경과, 병기 등을 확인할 수 있다.
본 발명에 있어서, “생물학적 시료”란 본 발명의 상기 유전자 또는 단백질의 발현이 검출될 수 있는 개체로부터 얻어지는 모든 시료를 의미한다. 상기 생물학적 시료는 전혈, 혈청, 혈장, 세포, 객담, 조직, 타액(saliva), 생검(biopsy), 액체 배양물, 분변 및 소변으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나이며, 특별히 이에 제한되지 않고, 본 발명의 기술 분야에서 통상적으로 사용되는 방법으로 처리하여 준비될 수 있다.
본 발명의 구체예에서, 전립선암 진단용 키트는 사용하는 방법에 따라 다양한 형태의 키트일 수 있으며, 예를 들어, PCR 키트, DNA 칩 키트, 단백질 칩 키트 또는 마이크로어레이 키트 등을 포함하나 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 전립선암 진단용 키트에는 상기 전립선막항원의 발현 수준을 측정하는 제제 뿐만 아니라, 면역학적 분석에 사용되는 당 분야에서 일반적으로 사용되는 도구, 시약 등이 포함될 수 있다. 상기 도구 또는 시약의 일 예로, 적합한 담체, 검출 가능한 신호를 생성할 수 있는 표지 물질, 발색단(chromophores), 용해제, 세정제, 완충제, 안정화제 등이 포함되나 이에 제한되지 않는다. 표지물질이 효소인 경우에는 효소 활성을 측정할 수 있는 기질 및 반응 정지제를 포함할 수 있다. 담체는 가용성 담체, 불용성 담체가 있고, 가용성 담체의 일 예로 당 분야에서 공지된 생리학적으로 허용되는 완충액, 예를 들어 PBS가 있고, 불용성 담체의 예로는 폴리스틸렌, 폴리에틸렌, 폴리프로필렌, 폴리에스테르, 폴리아크릴로니트릴, 불소 수지, 가교 덱스트란, 폴리사카라이드, 라텍스에 금속을 도금한 자성 미립자와 같은 고분자, 기타 종이, 유리, 금속, 아가로오스 및 이들의 조합일 수 있다.
본 발명의 키트는 상술한 조성물을 구성으로 포함하므로, 중복된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머와 생물학적 시료를 반응시키는 단계를 포함하는, 전립선 암 진단에 대한 정보제공 방법을 제공한다.
본 발명의 구체예에서, 상기 방법은 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머와 생물학적 시료를 반응시키고, 반응 정도(즉, 발현 정도)를 확인함으로써 전립선암의 진단에 대한 정보를 제공할 수 있다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는 전립선암 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명의 조성물이 약학적 조성물로 이용되는 경우, 본 발명의 약학적 조성물은 통상의 방법에 따라 다양한 형태로 제형화하여 사용될 수 있다. 예컨대, 산제, 과립제, 정제, 캡슐제, 현탁액, 에멀젼, 시럽 등의 경구형 제형으로 제형화할 수 있고, 외용제, 좌제 및 멸균 주사용액의 형태로 제형화하여 사용될 수 있다.
본 발명의 조성물은 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머와 함께 전립선암에 대하여 예방 또는 치료 효과를 갖는 공지의 유효성분을 1 종 이상 함유할 수 있다.
본 발명의 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 첨가제를 더 포함할 수 있으며, 이때 약제학적으로 허용 가능한 첨가제로는 전분, 젤라틴화 전분, 미결정셀룰로오스, 유당, 포비돈, 콜로이달실리콘디옥사이드, 인산수소칼슘, 락토스, 만니톨, 엿, 아라비아고무, 전호화전분, 옥수수전분, 분말셀룰로오스, 히드록시프로필셀룰로오스, 오파드라이, 전분글리콜산나트륨, 카르나우바납, 합성규산알루미늄, 스테아린산, 스테아린산마그네슘, 스테아린산알루미늄, 스테아린산칼슘, 백당 등이 사용될 수 있다. 본 발명에 따른 약제학적으로 허용 가능한 첨가제는 상기 조성물에 대해 0.1 ~ 90 중량부 포함되는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 조성물은 실제 임상투여 시에 경구 또는 비경구의 여러 가지 제형으로 투여될 수 있는데, 제제화할 경우에는 보통 사용하는 충진제, 증량제, 결합제, 습윤제, 붕해제, 계면활성제 등의 희석제 또는 부형제를 사용하여 조제할 수 있으며, 당해 기술 분야에 알려진 적합한 제제는 문헌(Remington's Pharmaceutical Science, 최근, Mack Publishing Company, Easton PA)에 개시되어 있는 것을 이용하는 것이 바람직하다.
상기 경구 투여를 위한 고형제제에는 정제, 환제, 산제, 과립제, 캡슐제 등이 포함되며, 이러한 고형제제는 적어도 하나 이상의 부형제 예를 들면, 전분, 칼슘 카보네이트(Calcium carbonate), 수크로스(Sucrose) 또는 락토오스(Lactose), 젤라틴 등을 섞어 조제된다. 또한 단순한 부형제 이외에 마그네슘 스티레이트 탈크 같은 윤활제들도 사용된다. 또한, 상기 경구 투여를 위한 액상제제로는 현탁제, 내용액제, 유제, 시럽제 등이 해당되는데 흔히 사용되는 단순희석제인 물, 리퀴드 파라핀 이외에 여러 가지 부형제, 예를 들면 습윤제, 감미제, 방향제, 보존제 등이 포함될 수 있다.
상기 비경구 투여를 위한 제제에는 멸균된 수용액, 비수성용제, 현탁제, 유제, 동결건조제제, 좌제가 포함된다. 비수성용제, 현탁용제로는 프로필렌글리콜(Propylene glycol), 폴리에틸렌 글리콜, 올리브 오일과 같은 식물성 기름, 에틸올레이트와 같은 주사 가능한 에스테르 등이 사용될 수 있다. 좌제의 기제로는 위텝솔(witepsol), 마크로골, 트윈(tween) 61, 카카오지, 라우린지, 글리세로제라틴 등이 사용될 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물의 투여량은 상기 약학적 조성물의 제제화 방법, 투여 방식, 투여 시간 및/또는 투여 경로 등에 의해 다양해질 수 있으며, 상기 약학적 조성물의 투여로 달성하고자 하는 반응의 종류와 정도, 투여 대상이 되는 개체의 종류, 연령, 체중, 일반적인 건강 상태, 질병의 증세나 정도, 성별, 식이, 배설, 해당 개체에 동시 또는 이시에 함께 사용되는 약물 기타 조성물의 성분 등을 비롯한 여러 인자 및 의약 분야에서 잘 알려진 유사 인자에 따라 다양해질 수 있으며, 당해 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자는 목적하는 치료에 효과적인 투여량을 용이하게 결정하고 처방할 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물의 투여 경로 및 투여 방식은 각각 독립적일 수 있으며, 그 방식에 있어 특별히 제한되지 아니하며, 목적하는 해당 부위에 상기 약학적 조성물이 도달할 수 있는 한 임의의 투여 경로 및 투여 방식에 따를 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물은 전립선암의 예방 또는 치료를 위하여 단독으로, 또는 수술, 방사선 치료, 호르몬 치료, 화학 치료 및 생물학적 반응 조절제를 사용하는 방법들과 병용하여 사용할 수 있다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는, 전립선암 예방 또는 치료용 항암보조제 조성물을 제공한다.
본 발명의 항암보조제 조성물은 약학적 조성물 형태일 수 있으며, 보다 구체적으로는 항암 약학적 보조제일 수 있다.
본 발명에 있어서, “항암보조제”는 당업계에서 일반적으로 사용되는 암치료제의 효과를 증진시키기 위하여 보조적으로 사용될 수 있는 제제를 말하며, 본 발명에 의한 보조제를 사용함으로써 암 치료제 또는 항암치료의 효과를 증진시킬 수 있다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는, 전립선 특이적 약물전달용 조성물을 제공한다.
상기 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머는 높은 친화도로, 전립선 세포의 표면에 존재하는 전립선특이막항원에 특이적으로 결합한다. 이를 이용하여, 전립암이 발병한 부위에 항암제와 같은 약물을 전달할 수 있다.
중복되는 내용은 본 명세서의 복잡성을 고려하여 생략하며, 본 명세서에서 달리 정의되지 않은 용어들은 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상적으로 사용되는 의미를 갖는 것이다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지는 않는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
실시예 1. DNA 압타머 선택 및 서열 분석
1-1. SELEX
전립선특이막항원(prostate specific membrane antigen, PSMA)에 특이적으로 결합하는 DNA 압타머는 SELEX 법을 이용하여 제작했다. 표적 물질로서 인간 PSMA (Acrobiosystems)를 이용했다.
최초의 라운드에서 이용한 DNA 압타머 라이브러리는, 화학 합성에 의해서 얻어진 DNA를 이용했다. DNA 압타머 라이브러리는 Murphy 등의 서열 (Murphy, Michael B et al, Nucleic acids research vol. 31, 18, 2003)을 참고하여 40개 뉴클레오티드의 랜덤 서열과 양단에 프라이머 서열을 지닌 길이 78개 뉴클레오티드의 DNA를 이용했다.
| 뉴클레오티드 서열 (5’->3’) | |
| DNA 압타머 라이브러리 (서열번호 24) |
GGT ATT GAG GGT CGC ATC (N 40) GAT GGC TCT AAC TCT CCT CT |
| 프라이머 Fwd (서열번호 25) |
GGT ATT GAG GGT CGC ATC |
| 프라이머 Rev (서열번호 26) |
AGA GGA GAG TTA GAG CCA TC |
| * N은 A, G, C 또는 T 중 어느 하나를 나타낸다. | |
| Round | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 |
| DNA : Protein | 10 : 1 | 20 : 1 | 40 : 1 | 80 : 1 | |||||||||
| 결합시간 | 60 분 | 30 분 | |||||||||||
| 버퍼 조성 | 50 mM Tris-HCl(pH7.4), 150 mM NaCl, 1 mM MgCl2, 0.05% Tween 20, 14.3mM β-ME, 0.005% BSA | ||||||||||||
SELEX의 스트린전시 (stringency)를 높여주기 위해 상기와 같은 조건으로 압타머와 결합하는 타겟의 농도를 감소시키고 타겟에 대한 압타머의 결합시간을 감소시켜 SELEX를 13 라운드 진행하여 압타머 라이브러리를 얻었다.
1-2. DNA 압타머 선택
상기 실시예 1-1의 13라운드에서 증폭된 압타머 라이브러리중에서 PSMA에 친화력이 높은 압타머를 ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay) 방식으로 선별하였다. 구체적으로, PSMA (5 pmol) 를 코팅한 96 well 플레이트 (Thermo) 에 5 % BSA 와 20 μg/ml Sperm DNA 를 함유한 PBS 용액을 첨가하여 상온에서 1시간 동안 블로킹시킨 후 PBS로 3번 세척하였다. 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 1 mM MgCl2, 및 0.005 % BSA를 함유한 용액에 포함된 압타머를 첨가하여 37℃ 에서 1시간 동안 반응시킨 후 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 1 mM MgCl2, 및 0.005% BSA 를 함유한 용액으로 3번 세척하였다. 결합한 압타머의 5’ 말단에 존재하는 비오틴 (biotin) 부위를 활용해 겨자무과산화효소 (horseradish peroxidase : HRP) 가 연결된 스트렙타아비딘 (Streptavidin) 을 첨가하여 상온에서 1시간 동안 반응시킨 후 PBS 용액으로 3번 세척하였다. 이후 HRP 와 반응하는 기질 (enhanced chemiluminescent : ECL) 을 첨가하여 발광 반응을 측정하였다. 본 실험의 음성 대조군은 스크램블드 압타머 (scrambled aptamer)이다. PSMA에 대한 압타머의 친화도를 분석한 결과는 도 1에 나타내었다.
도 1에 나타낸 바와 같이, 압타머 라이브러리 중 압타머 PS202가 PSMA에 대한 친화도가 가장 높은 것을 확인하였다. 상기 압타머 PS202는 서열번호 15의 염기서열로 표시되며, 하기와 같은 구조식 1과 같이 구성된다.
[구조식 1]
5'-제1뉴클레오티드(N1)-백본 서열(backbone sequence)-제2뉴클레오티드(N2)-3’
구체적으로, 선별된 압타머 PS202는 백본 서열은 서열번호 1의 염기서열로 표시되며, 상기 N1 및 N2는 각각 서열번호 2 및 3의 염기서열로 표시된다.
MFOLD 프로그램을 이용하여 선별된 압타머 PS202의 2차 구조를 예측한 결과는 도 2에 나타내었다.
도 2에 나타낸 바와 같이, 압타머 PS202는 External Loop 1개, Loop 2개 및 Stem 2개로 구성된다.
1-3. 변형된 압타머(modified aptamer) 구축
추가 분석을 통해 상기 실시예 1-2에서 선별된 압타머 PS202의 External Loop 및 Stem의 mismatch base pair modification (74번째 T를 C로 변형)은 친화력을 유지시키고, Loop의 Pyrimidine 계열 또는 서열번호 23의 5’말단과 3’말단에 2’OMe-modified nucleotide 친화력을 감소시킨다는 것을 확인하였다.
상기 압타머 PS202의 분석 결과에 기초하여, 변형된 압타머 라이브러리를 구축하였다. 본 실시예에서 구축된 압타머 라이브러리 또한 상기 실시예 1-2의 구조식 1과 같이 구성되며, 백본 서열은 서열번호 1의 염기서열로 표시된다. 압타머 PS202에 기초하여 구축된 압타머 라이브러리의 N1, N2 및 전체 서열은 표 3에 나타내었다.
| Set | 명칭 | 제1뉴클레오티드 (N1) |
서열 번호 |
제2뉴클레오티드 (N2) |
서열 번호 |
압타머 전체 서열 | 서열 번호 |
크기 (mer) |
압타머 PS202와의 서열 동일성 (identity) (%) |
| backbone sequence | TGGAGCCATCGGGCGGGTAGTATTCGAGGTGGGGGTGGGTGGTGGGGATGGCTC | 1 | 54 | - | |||||
| PS202 | GGTATTGAGGGTCGCATCT | 2 | TAACTCTCCTCT | 3 | GGTATTGAGGGTCGCATCTTGGAGCCATCGGGCGGGTAGTATTCGAGGTGGGGGTGGGTGGTGGGGATGGCTCTAACTCTCCTCT | 15 | 85 | - | |
| 1 | PS202_1a | TTGAGGGTCGCATCT | 4 | TAACTCTCCTCT | 3 | TTGAGGGTCGCATCTTGGAGCCATCGGGCGGGTAGTATTCGAGGTGGGGGTGGGTGGTGGGGATGGCTCTAACTCTCCTCT | 16 | 81 | 100 |
| PS202_1b | GGTATTGAGGGTCGCATCT | 2 | TAACTCTCCTCAA | 5 | GGTATTGAGGGTCGCATCTTGGAGCCATCGGGCGGGTAGTATTCGAGGTGGGGGTGGGTGGTGGGGATGGCTCTAACTCTCCTCAA | 17 | 86 | 100 | |
| PS202_S2a | GGTATTGAGGGTCGCATCT | 2 | CAACTCTCCTCT | 6 | GGTATTGAGGGTCGCATCTTGGAGCCATCGGGCGGGTAGTATTCGAGGTGGGGGTGGGTGGTGGGGATGGCTCCAACTCTCCTCT | 18 | 85 | 98.82 | |
| 2 | PS202_3d8 | GGTATTGAGGGTCGCATCT | 2 | TAAC | 7 | GGTATTGAGGGTCGCATCTTGGAGCCATCGGGCGGGTAGTATTCGAGGTGGGGGTGGGTGGTGGGGATGGCTCTAAC | 19 | 77 | 100 |
| PS202_1 | ATTGAGGGTCGCATCT | 8 | CAACTCTCCTCAA | 9 | ATTGAGGGTCGCATCTTGGAGCCATCGGGCGGGTAGTATTCGAGGTGGGGGTGGGTGGTGGGGATGGCTCCAACTCTCCTCAA | 20 | 83 | 98.77 | |
| PS202_2 | ATTGAGGGTCGCATCC | 10 | CAGCTCTCCTCAA | 11 | ATTGAGGGTCGCATCCTGGAGCCATCGGGCGGGTAGTATTCGAGGTGGGGGTGGGTGGTGGGGATGGCTCCAGCTCTCCTCAA | 21 | 83 | 96.30 | |
| PS202_3 | ATTGAGGGTCGCATCC | 10 | CAGCTCACCTCAA | 12 | ATTGAGGGTCGCATCCTGGAGCCATCGGGCGGGTAGTATTCGAGGTGGGGGTGGGTGGTGGGGATGGCTCCAGCTCACCTCAA | 22 | 83 | 95.06 | |
| 3 | PS202_5 | GCC | 13 | CAGGC | 14 | GCCTGGAGCCATCGGGCGGGTAGTATTCGAGGTGGGGGTGGGTGGTGGGGATGGCTCCAGGC | 23 | 62 | 100 |
MFOLD 프로그램을 이용하여 상기 표 3의 압타머 라이브러리 2차 구조를 예측한 결과는 도 3 내지 5에 나타내었다. 도 3 내지 5에서 압타머 PS202 대비 변경된 부분은 별표(*)로 표시하였다.
실시예 2. PSMA에 대한 압타머의 친화도 측정
상기 표 3에 기재된 압타머의 PSMA에 대한 친화도 측정은 ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay) 반응을 통해 확인하였다. 상기 ELISA 반응은 실시예 1-2의 방법과 동일하게 수행하였고, 압타머를 다양한 농도(0.125 pmol, 0.5 pmol 및 2 pmol)로 처리하였다. 압타머 라이브러리 set 1 내지 3의 PSMA에 대한 친화도를 분석한 결과는 각각 도 6 내지 8에 나타내었다.
도 6에 나타낸 바와 같이, 압타머 라이브러리 set1(PS202_L1a, PS202_L1b 및 PS202_S2a)는 스크렘블드 압타머(scrambled aptamer)에 비해 PSMA에 대한 결합 친화도가 현저히 높은 것을 확인하였다. 특히, 압타머 라이브러리 set 1은 압타머 PS202보다 PSMA에 대한 결합 친화도가 개선되었다.
도 7에 나타낸 바와 같이, 압타머 라이브러리 set 2(PS202_3d8, PS202_1, PS202_2 및 PS202_3)는 스크렘블드 압타머에 비해 PSMA에 대한 결합 친화도가 현저히 높은 것을 확인하였다. 특히, 압타머 라이브러리 set 2는 압타머 PS202보다 PSMA에 대한 결합 친화도가 개선되었다.
도 8에 나타낸 바와 같이, 압타머 라이브러리 set 3(PS202_5)은 음성대조군인 스크렘블드 압타머보다 PSMA에 대한 결합 친화도가 높은 것을 확인하였다.
종합적으로 본 발명자들은 SELEX 기법을 통해 전립선특이막항원에 대한 결합 친화도가 높은 압타머 PS202를 개발하였다. 또한 상기 압타머 PS202의 최적화를 통해 변형된 압타머 라이브러리를 구축하였다. 압타머 PS202 및 변형된 압타머 라이브러리는 백본 서열(서열번호 1)이 동일하며, 백본 서열에 작동 가능하게 연결된 제1 및 제2 뉴클레오티드를 포함한다. 또한 실험을 통해 상기 압타머 PS202 및 변형된 압타머 라이브러리가 전립선특이막항원에 대한 결합 친화도가 높은 것을 확인하였다. 이는 본 발명의 압타머를 이용하여 표적 약물 전달이 가능함을 의미하는바, 본 발명의 압타머는 전립선 관련 질환의 치료 분야에서 다양하게 활용될 수 있다.
이상, 본 발명내용의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서, 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 실시양태일 뿐이며, 이에 의해 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백할 것이다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항들과 그것들의 등가물에 의해 정의된다고 할 것이다.
<110> Nuclixbio
<120> Aptamer that specifically bind to prostate-specific membrane
antigen and uses thereof
<130> 1-7
<160> 26
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
<211> 54
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> backbone sequence
<400> 1
tggagccatc gggcgggtag tattcgaggt gggggtgggt ggtggggatg gctc 54
<210> 2
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N1
<400> 2
ggtattgagg gtcgcatct 19
<210> 3
<211> 12
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N2
<400> 3
taactctcct ct 12
<210> 4
<211> 15
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N1
<400> 4
ttgagggtcg catct 15
<210> 5
<211> 13
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N2
<400> 5
taactctcct caa 13
<210> 6
<211> 12
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N2
<400> 6
caactctcct ct 12
<210> 7
<211> 4
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N2
<400> 7
taac 4
<210> 8
<211> 16
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N1
<400> 8
attgagggtc gcatct 16
<210> 9
<211> 13
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N2
<400> 9
caactctcct caa 13
<210> 10
<211> 16
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N1
<400> 10
attgagggtc gcatcc 16
<210> 11
<211> 13
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N2
<400> 11
cagctctcct caa 13
<210> 12
<211> 13
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N2
<400> 12
cagctcacct caa 13
<210> 13
<211> 3
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N1
<400> 13
gcc 3
<210> 14
<211> 5
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> N2
<400> 14
caggc 5
<210> 15
<211> 85
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PS202
<400> 15
ggtattgagg gtcgcatctt ggagccatcg ggcgggtagt attcgaggtg ggggtgggtg 60
gtggggatgg ctctaactct cctct 85
<210> 16
<211> 81
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PS202_1a
<400> 16
ttgagggtcg catcttggag ccatcgggcg ggtagtattc gaggtggggg tgggtggtgg 60
ggatggctct aactctcctc t 81
<210> 17
<211> 86
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PS202_1b
<400> 17
ggtattgagg gtcgcatctt ggagccatcg ggcgggtagt attcgaggtg ggggtgggtg 60
gtggggatgg ctctaactct cctcaa 86
<210> 18
<211> 85
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PS202_S2a
<400> 18
ggtattgagg gtcgcatctt ggagccatcg ggcgggtagt attcgaggtg ggggtgggtg 60
gtggggatgg ctccaactct cctct 85
<210> 19
<211> 77
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PS202_3d8
<400> 19
ggtattgagg gtcgcatctt ggagccatcg ggcgggtagt attcgaggtg ggggtgggtg 60
gtggggatgg ctctaac 77
<210> 20
<211> 83
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PS202_1
<400> 20
attgagggtc gcatcttgga gccatcgggc gggtagtatt cgaggtgggg gtgggtggtg 60
gggatggctc caactctcct caa 83
<210> 21
<211> 83
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PS202_2
<400> 21
attgagggtc gcatcctgga gccatcgggc gggtagtatt cgaggtgggg gtgggtggtg 60
gggatggctc cagctctcct caa 83
<210> 22
<211> 83
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PS202_3
<400> 22
attgagggtc gcatcctgga gccatcgggc gggtagtatt cgaggtgggg gtgggtggtg 60
gggatggctc cagctcacct caa 83
<210> 23
<211> 62
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PS202_5
<400> 23
gcctggagcc atcgggcggg tagtattcga ggtgggggtg ggtggtgggg atggctccag 60
gc 62
<210> 24
<211> 78
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA aptamer library
<400> 24
ggtattgagg gtcgcatcnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnga 60
tggctctaac tctcctct 78
<210> 25
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> forward primer
<400> 25
ggtattgagg gtcgcatc 18
<210> 26
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> reverse primer
<400> 26
agaggagagt tagagccatc 20
Claims (13)
- 서열번호 1의 염기서열로 표시되는 백본 서열(backbone sequence) 또는 이의 단편을 포함하는, 전립선특이막항원(prostate specific membrane antigen, PSMA)에 특이적으로 결합하는 압타머.
- 제1항에 있어서,
상기 압타머는 크기가 50 내지 90 mer인, 압타머.
- 제1항에 있어서,
상기 압타머는 하기 구조식 1의 형태로 작동 가능하게 연결된 것인, 압타머.
[구조식 1]
5'-제1뉴클레오티드(N1)-백본 서열(backbone sequence)-제2뉴클레오티드(N2)-3’
- 제3항에 있어서,
상기 제1뉴클레오티드는 서열번호 2, 4, 8, 10 및 13으로 이루어진 군에서 선택된 1 이상의 서열로 표시되는 뉴클레오티드이고,
상기 제2뉴클레오티드는 서열번호 3, 5, 6, 7, 9, 11, 12 및 14로 이루어진 군에서 선택된 1 이상의 서열로 표시되는 뉴클레오티드인, 압타머.
- 제3항에 있어서,
상기 압타머는 서열번호 15 내지 23으로 이루어진 군에서 선택된 1 이상의 서열로 표시되는 것인, 압타머. - 제3항에 있어서,
상기 압타머는 서열번호 15의 염기서열과 90% 이상의 서열 동일성(identity)을 갖는 것인, 압타머.
- 제1항의 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는 전립선암 진단용 조성물.
- 제7항의 전립선암 진단용 조성물을 포함하는 전립선암 진단 키트.
- 제8항에 있어서,
상기 키트는 PCR 키트, DNA 칩 키트, 단백질 칩 키트 또는 마이크로어레이 키트인, 전립선암 진단 키트.
- 제1항의 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머와 생물학적 시료를 반응시키는 단계를 포함하는, 전립선 암 진단에 대한 정보제공 방법.
- 제1항의 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는 전립선암 예방 또는 치료용 약학적 조성물.
- 제1항의 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는, 전립선암 예방 또는 치료용 항암보조제 조성물.
- 제1항의 전립선특이막항원에 특이적으로 결합하는 압타머를 포함하는, 전립선 특이적 약물전달용 조성물.
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- 2022-05-19 KR KR1020220061537A patent/KR20230161769A/ko unknown
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