KR20220086791A - MS1-like 유전자를 교정하여 제조된 웅성불임 식물체 - Google Patents
MS1-like 유전자를 교정하여 제조된 웅성불임 식물체 Download PDFInfo
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Abstract
본 발명은 토마토 유래 ms1-like 유전자를 교정하여 제조된 웅성불임 식물체 및 이의 제조방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 웅성불임 토마토 품종을 활용하며, 교잡종자 생산비용을 절감할 수 있다.
Description
본 발명은 웅성불임 식물체 및 이의 제조방법에 관한 것이다. 구체적으로는 토마토 유래 ms1-like 유전자를 교정하여 제조된 웅성불임 식물체 및 이의 제조방법에 관한 것이다.
작물의 웅성불임은 인위적 혹은 자연적인 유전적 돌연변이를 통해 웅성능력을 상실하는 경우를 가리킨다. 이는 일종의 돌연변이로 웅성기관, 즉 수술의 결함으로 수정 능력이 있는 화분을 생산하지 못하는 현상이다.
웅성불임 종류는 화분 불임성, 웅애 불임성, 화분의 기능적 불임성 등으로 나눌 수 있으며, 이러한 웅성불임의 특징을 이용하여 일대 잡종 종자를 생산할 수 있다. 즉, 양성화 식물의 경우 교배에 앞서 수술을 제거하는 제웅 과정을 거쳐야 하는데 이러한 과정이 매우 번거롭고 노동력이 많이 드는 과정이다. 웅성불임성을 가지는 계통을 통해 모계로 하면 제웅을 하지 않고 그대로 인공수분을 하거나 자연 교배를 통해 일대 잡종 계통을 만들 수 있는 장점이 있다. 유전자적 웅성불임(GMS)은 꽃가루 생산에 관여하는 핵의 유전자에 열성돌연변이가 일어난 것으로, 불임성은 열성유전한다. 그러나 이러한 유전자적 웅성불임은 그 유지를 불임계에 이형접합체를 교배하여 가임과 불임이 분리되는 현상을 겪게 되는데 이에 대해 모계의 유지를 위해서 표현형을 관찰하여 제거해야 한다는 문제점이 있다.
한편, 토마토는 전 세계 주요 작물 중 하나로 세계적으로 가공용 토마토의 소비가 꾸준히 늘어 종자소요량이 증가하고 있다. 하지만, 종자생산 비용이 판매비 보다 높아 효율적인 종자생산체계 마련이 시급한 실정이다. 토마토는 다양한 유전자적 웅성불임을 갖고 있으나, 순수한 토마토의 웅성불임 계통을 유지하기 어려워서 상업적으로 활발하게 이용되지 못하고 있다.
토마토의 웅성불임에 대해 많은 연구가 진행되었다. 하지만 웅성불임에 있어서 화분의 발달에 영향을 미치는 여러 기초적인 메커니즘 및 유전자의 기능 연구 등은 매우 미약한 편이다. 재배종 토마토에서 유전자적 웅성불임은 일반적인 현상으로, 많은 돌연변이 개체들에서 하나의 열성 유전자에 의해 조절된다고 보고되었다. 토마토에서 화분의 웅성불임과 관련된 유전자는 대략 45 개 정도 존재하는 것으로 알려져 있다.
이에, 본 발명자들은 교잡종자 생산비용을 대폭 절감할 수 있는 토마토 웅성불임 활용체계 구축하여 웅성불임 토마토 생산하기 위해 노력한 결과, 토마토 ms1-like 유전자 변이에 의해 토마토 식물체에서 웅성불임이 유도됨을 확인함으로써, 본 발명을 완성하였다.
본 발명은 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열 내에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA를 포함하는 재조합 벡터로 유전체를 교정하여, 웅성불임인 것을 특징으로 하는 유전자 교정 식물체의 제공을 목적으로 한다.
또한, 본 발명은 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA 및 엔도뉴클레아제 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 웅성불임 식물체 제조용 재조합 벡터의 제공을 목적으로 한다.
또한, 본 발명은 상기 재조합 벡터를 포함하는 웅성불임 식물체 제조용 조성물의 제공을 목적으로 한다.
또한, 본 발명은 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열 내에서 특이적인 10 내지 30 개의 염기서열로 이루어진 가이드 RNA를 암호화하는 DNA 및 엔도뉴클레아제 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 재조합 벡터를 식물세포에 형질도입하는 단계를 포함하는 웅성불임 식물체의 제조방법의 제공을 목적으로 한다.
상기의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열 내에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA를 포함하는 재조합 벡터로 유전체를 교정하여, 웅성불임인 것을 특징으로 하는 유전자 교정 식물체를 제공한다.
상기 재조합 벡터는 엔도뉴클레아제 단백질을 암호화하는 염기서열을 추가로 포함할 수 있다.
상기 식물체는 토마토일 수 있다.
상기 가이드 RNA 서열은 서열번호 2 내지 서열번호 18의 염기서열로 이루어진 군에서 선택되는 하나일 수 있다.
또한, 본 발명은 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA 및 엔도뉴클레아제 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 웅성불임 식물체 제조용 재조합 벡터를 제공한다.
상기 식물체는 토마토일 수 있다.
또한, 본 발명은 상기 재조합 벡터를 포함하는 웅성불임 식물체 제조용 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열 내에서 특이적인 10 내지 30 개의 염기서열로 이루어진 가이드 RNA를 암호화하는 DNA 및 엔도뉴클레아제 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 재조합 벡터를 식물세포에 형질도입하는 단계를 포함하는 웅성불임 식물체의 제조방법을 제공한다.
본 발명에 따르면, gRNA를 이용하여 토마토의 꽃가루 발달 관여하는 ms1-like 유전자를 교정하여 knock-out 시킴으로써 웅성불임 토마토 품종을 제공한다. 본 발명에 따른 웅성불임 토마토 품종을 활용하며, 교잡종자 생산비용을 절감할 수 있다.
도 1은 ms1-like 유전자 교정을 위한 gRNA 서열을 나타낸 것이다.
도 2는 토마토 유전자 교정체 제작을 위한 gRNA, CRISPR/Cas9 벡터 모식도를 나타낸 것이다.
도 3은 운반체 DNA(Cas9, NPTII)을 확인하고자, Cas9 특이적 프라이머(Cas9 F/R) 및 NPTⅡ 특이적 프라이머(Nos F, NPTⅡ R)를 제작하고 PCR한 결과의 일부이다.
도 4는 목표 유전자(ms1-like) 교정 부위에 대한 deep-seq 분석 결과이다.
도 5는 야생형과 ms1-like 유전자 교정체에서 표현형(꽃, 열매)을 비교한 사진이다.
도 6은 야생형과 ms1-like 유전자 교정체에서 전자현미경으로 꽃 수술기관(corn)을 촬영한 사진이다.
도 2는 토마토 유전자 교정체 제작을 위한 gRNA, CRISPR/Cas9 벡터 모식도를 나타낸 것이다.
도 3은 운반체 DNA(Cas9, NPTII)을 확인하고자, Cas9 특이적 프라이머(Cas9 F/R) 및 NPTⅡ 특이적 프라이머(Nos F, NPTⅡ R)를 제작하고 PCR한 결과의 일부이다.
도 4는 목표 유전자(ms1-like) 교정 부위에 대한 deep-seq 분석 결과이다.
도 5는 야생형과 ms1-like 유전자 교정체에서 표현형(꽃, 열매)을 비교한 사진이다.
도 6은 야생형과 ms1-like 유전자 교정체에서 전자현미경으로 꽃 수술기관(corn)을 촬영한 사진이다.
달리 정의되지 않는 한, 본 명세서에서 사용된 모든 기술적 및 과학적 용어들은 본 발명이 속하는 기술 분야에서 숙련된 전문가에 의해서 통상적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다. 일반적으로, 본 명세서에서 사용된 명명법 및 이하에 기술하는 실험 방법은 본 기술 분야에서 잘 알려져 있고 통상적으로 사용되는 것이다.
본 발명은 이에, 본 발명자들은 교잡종자 생산비용을 대폭 절감할 수 있는 토마토 웅성불임 활용체계 구축하여 웅성불임 토마토 생산하기 위해 노력한 결과, ms1-like 유전자를 교정용 가이드 RNA를 이용하여 ms1-like 유전자를 교정한 토마토가 웅성불임을 나타냄을 확인함으로써 완성되었다.
본 발명은 일 관점에서, 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열 내에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA를 포함하는 재조합 벡터로 유전체를 교정하여, 웅성불임인 것을 특징으로 하는 유전자 교정 식물체에 관한 것이다.
본 발명의 “ms1-like 유전자”는 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 유전자로, 구체적으로 ms1-like 유전자의 코딩 시퀸스 영역 (coding sequence, CDS)을 의미한다.
상기 ms1-like 유전자는 식물체의 꽃가루 발달에 관여하며, 토마토에서 유래된 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 “재조합 벡터“는 토마토 유전자, 구체적으로는 서열번호1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA를 포함하는 식물형질 전환용 벡터를 의미한다.
상기 벡터는 목적하는 유전자의 발현 억제 또는 유전자의 발현이 증진될 수 있도록, 발현조절 서열과 기능적으로 연결될 수 있다. 예를 들어, 벡터는 프로모터, 오퍼레이터, 개시코돈, 종결코돈, 폴리아데닐화 시그널, 인핸서 같은 발현 조절 요소 외에도 막 표적화 또는 분비를 위한 신호 서열 또는 리더 서열을 포함하며 목적에 따라 다양하게 제조될 수 있다. 또한, 벡터는 선택성 마커를 포함할 수 있으며, 벡터는 자가 복제하거나 숙주 DNA에 통합될 수 있다.
본 발명의 벡터는 당해 기술 분야에서 잘 알려진 유전자 재조합 기술을 이용하여 제조할 수 있으며, 부위-특이적 DNA 절단 및 연결은 당해 기술 분야에서 일반적으로 알려진 효소 등을 사용할 수 있다.
본 발명에 따른 재조합 벡터는 서열번호1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA를 포함하여 ms1-like 유전자를 교정용으로 사용된다.
유전자 교정 기술로는 유전자 가위 (engineered nuclease)가 있으며, 유전자 가위의 종류로 CRISPR-Cas9이 있다.
본 발명에서 "CRISPR-Cas9"이란 미생물의 면역체계로 알려진 CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) 시스템을 이용해 원하는 유전자 염기서열을 절단하도록 고안된 것으로서, 고정적 구성요소로서 Cas9 단백질을 포함하고, 가변적 구성요소로서 타겟 유전자에 특이적인 가이드 RNA를 포함한다.
본 발명의 "가이드 RNA(guide RNA, gRNA)"란 RNA (ribonucleic acid)의 한 종류로, 인간이나 동식물의 특정 유전자를 교정하는 유전자 교정(genome editing)에서 교정하려는 DNA를 인식하여 찾아내는 RNA를 의미한다.
가이드 RNA는 타겟 유전자 부위와 3’ 말단에 프로토스페이서 인접 모티프(Protospacer adjacent motif, PAM) 서열이 존재한다. 가이드 RNA가 타겟 유전자를 인식하면 가이드 RNA에 Cas9 단백질이 결합하여 뉴클레아제로 작용하여 타겟 유전자 부위중 PAM 서열로부터 상위 3-4bp 사이를 절단함으로써 DNA 이중가닥 손상(DNA double strand break, DSB)을 유발한다. 이중가닥 손상으로 인해 염기서열의 교정이 발생할 수 있다.
본 발명에서 가이드 RNA는 ms1-like 유전자 (서열번호 1)의 618번째 내지 2037번째 염기서열에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열, 구체적으로 연속되는 20 개의 염기서열을 표적으로 한다.
본 발명의 일실시예에서 ms1-like 유전자를 교정을 통해 ms1-like 유전자를 불활성화(knock-out) 시킨 식물체(토마토)에서 웅성불임이 나타남을 확인하였다. 구체적으로, 토마토 유래 ms1-like 유전자를 교정(knock-out) 하고자, 서열번호 1의 618 번째 내지 2037 번째 염기서열 (하늘색 표시)을 타겟으로 하는 가이드 RNA(gRNA)를 표 3 (서열번호 2 내지 서열번호 18)와 같이 디자인하였다.
따라서 상기 가이드 RNA는 구체적으로 서열번호 2 내지 서열번호 18의 염기서열로 이루어진 군에서 선택되는 하나일 수 있으며, 구체적으로 서열번호2의 염기서열일 수 있다.
본 발명에 따른 벡터는 Cas9 단백질을 암호화하는 염기서열을 더 포함할 수 있다.
본 발명의 실시예에서 Cas9 단백질로 화농성연쇄상구균 (Streptococcus pyogenes) 유래 Cas9 (SpCas9)을 사용하였는바, 구체적으로 상기 Cas9 단백질은 화농성연쇄상구균 (Streptococcus pyogenes) 유래 Cas9 (SpCas9) 일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 일실시예에서 Cas9 단백질로 화농성연쇄상구균 (Streptococcus pyogenes) 유래 Cas9 (SpCas9)을 사용하고자, 가이드 RNA(gRNA)는 3’ 말단에 프로토스페이서 인접 모티프(Protospacer adjacent motif, PAM)으로 ‘NGG’를 포함하도록 디자인하였다.
본 발명에서 Cas9 단백질로 화농성연쇄상구균 (Streptococcus pyogenes) 유래 Cas9 (SpCas9)을 사용하는 경우, 상기 가이드 RNA는 3’말단에 PAM 서열인 “ NGG ”을 포함한다.
본 발명의 “유전자 교정 식물체”는 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열 내에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA를 포함하는 재조합 벡터로 유전체를 교정한 것으로, 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열 선택되는 1개 이상의 염기가 교정 (결실, 치환, 또는 삽입) 되어 웅성불임인 것을 특징으로 한다.
본 발명에서 "식물체"는, 성숙한 식물체뿐만 아니라 성숙한 식물로 발육할 있는 식물 세포, 식물 조직 및 식물의 종자 등을 모두 포함하는 의미로서 이해된다.
본 발명에서 상기 식물체는 토마토, 애기장대, 배추, 무, 고추, 딸기, 수박, 오이, 양배추, 참외, 호박, 파, 양파 또는 당근을 포함하는 채소 작물류; 벼, 밀, 보리, 옥수수, 콩, 감자, 밀, 팥, 귀리 또는 수수를 포함하는 식량 작물류; 인삼, 담배, 목화, 참깨, 사탕수수, 사탕무우, 들깨, 땅콩 또는 유채를 포함하는 특용작물류; 사과나무, 배나무, 대추나무, 복숭아, 양다래, 포도, 감귤, 감, 자두, 살구 또는 바나나를 포함하는 과수류; 장미, 글라디올러스, 거베라, 카네이션, 국화, 백합 또는 튤립을 포함하는 화훼류; 및 라이그라스, 레드클로버, 오차드그라스, 알파알파, 톨페스큐 또는 페레니얼라이그라스를 포함하는 사료작물류로 이루어진 군으로부터 선택된 어느 하나이며, 구체적으로는 토마토, 애기장대, 배추, 무, 고추, 딸기, 수박, 오이, 양배추, 참외, 호박, 파, 양파 또는 당근을 포함하는 채소 작물류, 더욱 구체적으로는 토마토일 수 있다.
본 발명의 일실시예에서 서열번호 2의 가이드 RNA(gRNA)를 암호화하는 DNA 및 SpCas9 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 재조합 벡터로 아그로박테리움 투메파시엔스(Agrobacterium tumefaciens)에 형질전환 후 토마토 자엽에 감염시켜 토마토 유전자 교정체를 제조하였다. 다음으로, 토마토 형질전환체의 T0 세대에서는 유전자 교정을 위해 운반체 유전자가 존재하는 형질전환 개체를 선발하였고, T1 세대 이후에는 운반체 DNA가 제거된 개체를 선발하였으며, 선발된 개체에서 PCR하여 NGS 장비를 이용, deep-seq 분석을 수행하여 ms1-like 교정된 개체(3종)를 확보하였다 (도 4). 구체적으로 ms1-like 유전자의 가이드 RNA 타겟 위치에 1bp(G)가 삽입된 헤테로(hetero) 1개체, 1bp(T)가 삽입된 호모(homo) 1개체, 마지막으로 2 대립형질(biallelic)로 1bp(A) 및 다른 염기서열의 1bp(T)가 삽입된 1개체를 확보하였다.
또한, 표현형 분석결과, 야생형 (WT, 대조구)의 열매가 불임이 없이 열리며, 채종시 자가 종자를 수확할 수 있으나, ms1-like 유전자 교정체는 꽃은 피지만 꽃 수술기관(corn)의 형태가 야생형에 비해 작고 쭈그러진 형태를 띄며 열매를 맺지 못하는 불임성을 가짐을 확인하였다 (도 5). 또한, 전자현미경 관찰시에도 ms1-like 유전자 교정체의 경우, 450 배율로 확대시 수술기관(corn) 내부에 화분이 없음을 확인하였다(도 6).
즉, 서열번호 1의 ms1-like 유전자를 618번째 내지 2037번째 염기서열에서 23개 (PAM 서열 포함)의 염기서열에 특이적인 서열번호 2의 가이드 RNA을 암호화하는 DNA 및 SpCas9를 암호화하는 염기서열을 포함하는 재조합 벡터로 형질전환하여 ms1-like 유전자를 교정한 토마토가 웅성불임을 나타냄을 확인하였다.
본 발명의 다른 관점에서, 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA 및 Cas9 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 웅성불임 식물체 제조용 재조합 벡터에 관한 것이다.
본 발명에서 ms1-like 유전자, 가이드 RNA, Cas9 단백질 및 식물체에 관한 설명은 전술한 바와 같다.
본 발명의 “재조합 벡터“는 토마토 유전자, 구체적으로는 서열번호1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA 및 Cas9 단백질 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 식물형질 전환용 벡터를 의미한다.
본 발명의 전술한 실시예에서 서열번호 1의 ms1-like 유전자를 618번째 내지 2037번째 염기서열에서 연속되는 23개(PAM 서열 포함)의 염기서열에 특이적인 서열번호 2의 가이드 RNA을 암호화하는 DNA 및 SpCas9를 암호화하는 염기서열을 포함하는 재조합 벡터로 형질전환하여 ms1-like 유전자를 교정한 토마토가 웅성불임을 나타냄을 확인하였는바, 본 발명의 재조합 벡터는 웅성불임 식물체 제조용으로 활용 가능하다.
본 발명의 또 다른 관점에서, 상기 재조합 벡터를 포함하는, 웅성불임 식물체 제조용 조성물을 제공한다.
본 발명에서 재조합 벡터 및 식물체에 관한 설명은 전술한 바와 같다.
본 발명의 조성물은 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA 및 Cas9 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 웅성불임 식물체 제조용 재조합 벡터를 포함한다.
본 발명의 또 다른 관점에서, 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열 내에서 특이적인 10 내지 30 개의 염기서열로 이루어진 가이드 RNA를 암호화하는 DNA 및 엔도뉴클레아제 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 재조합 벡터를 식물세포에 형질도입하는 단계를 포함하는 웅성불임 식물체의 제조방법을 제공한다.
본 발명의 웅성불임 식물체의 제조방법은 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열 내에서 특이적인 10 내지 30 개의 염기서열로 이루어진 가이드 RNA를 암호화하는 DNA 및 Cas9 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 재조합 벡터를 식물세포에 형질도입하는 단계를 포함한다.
본 발명에서 식물체, ms1-like, 가이드 RNA, 재조합 벡터에 관한 설명은 전술한 바와 같다.
본 발명에서 “형질전환”은, 유전물질인 DNA를 다른 계통의 살아 있는 세포에 주입했을 때, DNA가 그 세포에 들어가 유전형질(遺傳形質)을 변화시키는 현상으로, 형질변환, 형전환, 또는 형변환 이라고도 한다.
본 발명에서 상기 벡터로 식물체를 "형질전환"하는 것은 당업자에게 공지된 형질전환기술에 의해 수행될 수 있다. 구체적으로는, 아그로박테리움을 이용한 형질전환방법, 미세사출법(microprojectile bombardment), 일렉트로포레이션(electroporation), PEG-매개 융합법(PEG-mediated fusion), 미세주입법(microinjection), 리포좀 매개법(liposome-mediated method), 인-플란타 형질전환법(In planta transformation), 진공 침윤법(Vacuum infiltration method), 화아침지법(floral meristem dipping method), 및 아그로박테리아 분사법(Agrobacteria spraying method)을 이용할 수 있다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것으로, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지 않는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
[실시예 1] 토마토 꽃가루 발달 관련 유전자 선별
토마토 유래 꽃가루 발달 관련 유전자 중, 하기 표 1의 서열번호 1의 ms1-like CDS 서열(2037 bp, 서열번호 1)를 선별하였다.
[실시예 2] 토마토 유전자 교정체 제작을 위한 gRNA 선정
유전자 교정 가이드 RNA의 프로토스페이서 인접 모티프 (Protospacer adjacent motif, PAM)로 사용하는 엔도뉴클레아제의 종류에 따라 결정된다. 표 2는 Cas9 엔도뉴클레아제의 종류에 따른 PAM 서열을 나타낸 것이다. 본 실시예에서는 화농성연쇄상구균(Streptococcus pyogenes) 유래 Cas9 (SpCas9)를 사용하고자, PAM 서열로 ‘NGG’를 이용하였다.
다음으로 토마토 유래 ms1-like 유전자를 교정(knock-out) 하고자, 서열번호 1의 618 번째 내지 2037 번째 염기서열 (하늘색 표시)을 타겟으로 하는 gRNA(가이드 RNA)를 표 3와 같이 디자인하였다. 이중 서열번호 2의 gRNA를 제조하여 토마토 유전자 교정에 이용하였다(표 3, 도 1).
| gRNA 명칭 | 서열번호 | RGEN Target (5' to 3') |
| ms1-like gRNA1 | 서열번호 2 | 5’-AGACACGAAGTACTTCCTCAAGG-3’ |
| ms1-like gRNA2 | 서열번호 3 | 5’-CATTAGCCTATGGTGAGCCATGG-3’ |
| ms1-like gRNA3 | 서열번호 4 | 5’-AGAGATATCTCAACAAAGAAAGG-3’ |
| ms1-like gRNA4 | 서열번호 5 | 5’-GAGATATCTCAACAAAGAAAGGG-3’ |
| ms1-like gRNA5 | 서열번호 6 | 5’-TATCTCAACAAAGAAAGGGATGG-3’ |
| ms1-like gRNA6 | 서열번호 7 | 5’-CAAAGAAAGGGATGGATCTAAGG-3’ |
| ms1-like gRNA7 | 서열번호 8 | 5’-CTACTCAACACATTAGCCTATGG-3’ |
| ms1-like gRNA8 | 서열번호 9 | 5’-GCCTATGGTGAGCCATGGTTTGG-3’ |
| ms1-like gRNA9 | 서열번호 10 | 5’-ACCAAACCATGGCTCACCATAGG-3’ |
| ms1-like gRNA10 | 서열번호 11 | 5’-GTGAGCCATGGTTTGGTCGATGG-3’ |
| ms1-like gRNA11 | 서열번호 12 | 5’-TGAGCCATGGTTTGGTCGATGGG-3’ |
| ms1-like gRNA12 | 서열번호 13 | 5’-GAGCCATGGTTTGGTCGATGGGG-3’ |
| ms1-like gRNA13 | 서열번호 14 | 5’-TAACCCCATCGACCAAACCATGG-3’ |
| ms1-like gRNA14 | 서열번호 15 | 5’-GGTCGATGGGGTTACAAATTTGG-3’ |
| ms1-like gRNA15 | 서열번호 16 | 5’-GTCGATGGGGTTACAAATTTGGG-3’ |
| ms1-like gRNA16 | 서열번호 17 | 5’-TGGGGTTACAAATTTGGGCGTGG-3’ |
| ms1-like gRNA17 | 서열번호 18 | 5’-GGGGTTACAAATTTGGGCGTGGG-3’ |
[실시예 3] CRISPR/Cas9 벡터 제작 및 토마토 유전자 교정체 제작
상기 표 2의 gRNA를 이용하여 Golden gateway 방법을 이용하여 CRISPR/Cas9 vector를 제조하였다. 벡터의 제조는 상기 제작한 gRNA로 먼저 엔트리 벡터를 만들고, 이를 Cas9 서열(NCBI Reference Sequence: WP_012560673.1) 및 NPTII 서열(GenBank:QGV13007.1)과 함께 커트 및 라이게이션(cut and ligation) 반응을 통해 목표벡터(destination vector)인 pAGM4723에 삽입하였다. 토마토 유전자 교정체 제작을 위한 gRNA, CRISPR/Cas9 벡터 모식도를 도 2에 나타내었다.
도 2를 참조하면 표 3의 gRNA1 또는 gRNA2가 각 단독으로 벡터에 포함(one gene-one target CRISPR vector) 될 수 있으며, gRNA1 및 gRNA2가 하나의 벡터(one gene-two target 및 two gene-target CRISPR vector)에 동시에 들어갈 수 있다.
하나의 벡터에 1 내지 8개의 가이드 유전자를 포함할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
1개 이상의 가이드 RNA를 포함하는 경우, 각 가이드 RNA는 동일한 유전자를 타겟으로 하거나, 또는 서로 다른 유전자를 타겟으로 할 수 있다.
ms1-like gRNA1 (서열번호 2)를 포함하는 one gene-one target CRISPR 벡터를 제조하였으며, 제작된 CRISPR/Cas9 벡터를 아그로박테리움 투메파시엔스(Agrobacterium tumefaciens)에 형질전환 후 토마토 자엽에 감염시켜 토마토 유전자 교정체를 제작하고 온실에서 배양하였다. 온실의 온도는 25±2℃이며, 16시간 빛 조건 및 8시간 암 조건의 온실에서 배양하였다.
[실시예 4] 토마토 유전자 교정체 유전자형 및 표현형 분석
4.1 유전형 분석을 목표 유전자 교정 개체의 선별
토마토 형질전환체에서 운반체 DNA 존재여부 확인하기 위해 Cas9 및 NPTⅡ에 특이적인 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하였다 (도 3).
T0 세대에서는 유전자 교정을 위해 운반체 유전자가 존재하는 형질전환 개체를 선발하였고, T1 세대 이후에는 운반체 DNA가 제거된 개체를 선발하였다.
선발된 T1 또는 T2 세대에서 분리한 유전자에서 목표 유전자 부위 (서열번호 2의 gRNA 타겟 위치)를 PCR하여 NGS 장비를 이용, deep-seq를 수행한 결과, ms1-like 교정 개체가 3종을 확보하였다.
구체적으로 도 3에서 20-1-da1은 T1 세대로, 이 라인의 20-1-da1-4와 8은 운반체 DNA가 제거된 개체를 확보하였다.
20-2-da1 및 20-2-da9은 T2 세대로, 20-2-da1 라인의 20-2-da1-2,5,13 및 18에서 운반체 DNA가 제거된 개체임을 확보하였고 20-2-da9 라인의 경우 3에서 운반체 DNA가 제거된 개체를 확보하였다.
구체적으로 1bp(G)가 삽입된 헤테로(hetero) 1개체, 1bp(T)가 삽입된 호모(homo) 1개체, 마지막으로 2대립형질(biallelic)로 1bp(A) 및 다른 염기서열의 1bp(T)가 삽입된 1개체를 확보하였다 (도 4).
4.2 표현형 분석을 통한 웅성불임 개체 확인
ms1-like 유전자 교정체에서 웅성불임성을 확인하고자 표현형 조사(열매유무, 전자현미경 관찰)를 수행하였다.
열매유무 분석결과, 야생형(WT, 대조구)의 열매가 불임이 없이 열리며, 채종시 자가 종자를 수확한 반면에 교정 개체의 경우에는 꽃은 피지만 꽃 수술기관(corn)의 형태가 야생형에 비해 작고 쭈그러진 형태를 띄며 열매를 맺지 못하는 불임성을 가짐을 확인하였다 (도 5).
전자현미경 관찰시에도 교정체의 경우, 450 배율로 확대시 수술기관(corn) 내부에 화분이 없음을 확인하였다 (도 6).
이는 ms1-like 유전자의 기능적 측면을 확인할 수 있는 부분으로, 화분을 보호하고 있는 약(anther)의 내부에 있는 세포층으로 화분립이 성숙할 때 흡수되는 세포인 약벽 세포(Tapetal cell)의 발달에 관여하는 유전자가 knock-out 됨으로서 제 기능을 못해 화분이 성숙하지 못했기 때문으로 판단하였다.
<110> REPUBLIC OF KOREA(MANAGEMENT : RURAL DEVELOPMENT ADMINISTRATION
<120> Male sterile plants produced by editing MS1-like gene
<130> DP20200290
<160> 18
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
<211> 2037
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> MS1 like CDS
<400> 1
atgtcgactt tagatctgag cggatcgaag aaaaggaaga ggaataataa tgagagggta 60
tcatttaagt tcaagaattt tggtgaacaa gggtttccta tagagttcat tgggtgcaat 120
tttgaccaaa atgttaaact tcttttggaa tttgcacaac aagaaaatgg gagtatttgg 180
tcatttcaat tggaagttca tagacatcca ccaatgcatg tgttcctatt tgttgttgaa 240
gaacaagttg aattgtcact caatcctcat tgcaaacatt gtcaatacat aggatggggc 300
aacaatttga tgtgcaacaa gaagtaccat tttctattgg cttcaaagga cacaattgga 360
gcttgtgtag aaggaggaaa tggacaaaaa tacaaatata aaacagatgt taataatatt 420
attggtggag aaataattaa aagtaagtta aatttgatag aaatagaagg tcatatgatg 480
catggtgtgt ttcattctaa tggttttggg catttgattt gtgtcaatgg atcattggaa 540
actcctactt cttctgactt gcctggtcac tcaattatgg acttttggga tcgactttgc 600
attggacttc gtgctaggaa agtaagctta agagatatct caacaaagaa agggatggat 660
ctaaggctac tcaacacatt agcctatggt gagccatggt ttggtcgatg gggttacaaa 720
tttgggcgtg ggagctttgg tgttacacaa gaaacatatc aaagtgcaat taatgcctta 780
caaaacatgc cattagcttt attagcacat catcatcacc atatagggat tataaatatt 840
aatgagatat taatagtgtt atcaaggtac caaatgttat ctggtcactc attagtcaca 900
ctttgtgatg cctttcattt catgttggag ctcaaatcaa ggatcccaaa ggaaaacaat 960
aatcttacct catgttatcc agggctatta gttgacacaa cttgtagatg gtcacctaaa 1020
cgcgttgaaa tggctattag ggttgttgtg gaagccctaa aaggggctaa atcgcgatgg 1080
gtgtctaggc aagaggttcg tgatgctgct cgtgcttata ttggtgatac agggttgctt 1140
gatttcgttc tcaagtcatt agggaatcat attgttggta agtatctggt tcgtcgatgc 1200
ttaaatccag tgactaaagt tttggaatat tgtttagagg atatatctaa agcatttcct 1260
aaacaagatc aaggttttag ggtcaatgac tcaaaaggga aacaacaata caaaatcaca 1320
ttggcgcaac ttatgaagga catacatttc ttgtacaaca atattctaaa agagcataag 1380
ggattaatgt caaattatac gggcgtcttt gctacaatcc caacagcttc tagaataatc 1440
ctagacacga agtacttcct caaggaatac agagaggtat cagagccaga tacaagaatt 1500
gaaccagata aatccaagat ttattgcgcg attatgttgg caatcaagga tggatttggt 1560
gttgaagaaa aagtaatgac cccatttgag tgtttcttaa tgagaaaaga tgtgacattt 1620
gatgagctaa aaattgaagt tgaaaaggct tttggggata tttatttggg attaaggaac 1680
tttaccacaa gatcaattaa caacttgata agcccaatta gtggaataga attggtgttt 1740
aatgtggtga aaccaggaag caagattgtt ttaggagggg taataatgtc aaataatgat 1800
gatattaata ttattaataa tggagggata tttgaaggaa ttaagaataa taatattatt 1860
atggattgta tttgtgggac taaagatgaa gatggtgaaa ggatgatttg ttgtgatatt 1920
tgtgaagttt ggcaacacac taggtgtgtt aatataccaa atcatgaagc aattccagat 1980
atatttcttt gtaataagtg tgagcaagat atcttacaat ttccttcatt accttag 2037
<210> 2
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA1
<400> 2
agacacgaag tacttcctca agg 23
<210> 3
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA2
<400> 3
cattagccta tggtgagcca tgg 23
<210> 4
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA3
<400> 4
agagatatct caacaaagaa agg 23
<210> 5
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA4
<400> 5
gagatatctc aacaaagaaa ggg 23
<210> 6
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA5
<400> 6
tatctcaaca aagaaaggga tgg 23
<210> 7
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA6
<400> 7
caaagaaagg gatggatcta agg 23
<210> 8
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA7
<400> 8
ctactcaaca cattagccta tgg 23
<210> 9
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA8
<400> 9
gcctatggtg agccatggtt tgg 23
<210> 10
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA9
<400> 10
accaaaccat ggctcaccat agg 23
<210> 11
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA10
<400> 11
gtgagccatg gtttggtcga tgg 23
<210> 12
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA11
<400> 12
tgagccatgg tttggtcgat ggg 23
<210> 13
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA12
<400> 13
gagccatggt ttggtcgatg ggg 23
<210> 14
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA13
<400> 14
taaccccatc gaccaaacca tgg 23
<210> 15
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA14
<400> 15
ggtcgatggg gttacaaatt tgg 23
<210> 16
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA15
<400> 16
gtcgatgggg ttacaaattt ggg 23
<210> 17
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA16
<400> 17
tggggttaca aatttgggcg tgg 23
<210> 18
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ms1-like gRNA17
<400> 18
ggggttacaa atttgggcgt ggg 23
Claims (8)
- 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열 내에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA를 포함하는 재조합 벡터로 유전체를 교정하여, 웅성불임인 것을 특징으로 하는, 유전자 교정 식물체.
- 제 1항에 있어서,
상기 재조합 벡터는 엔도뉴클레아제 단백질을 암호화하는 염기서열을 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는, 유전자 교정 식물체. - 제 1항에 있어서,
상기 식물체는 토마토인 것을 특징으로 하는, 유전자 교정 식물체. - 제 1항에 있어서,
상기 가이드 RNA 서열은 서열번호 2 내지 서열번호 18의 염기서열로 이루어진 군에서 선택되는 하나인 것을 특징으로 하는, 유전자 교정 식물체. - 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열에서 연속되는 10 내지 30 개의 염기서열에 특이적인 가이드 RNA를 암호화하는 DNA 및 엔도뉴클레아제 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 웅성불임 식물체 제조용 재조합 벡터.
- 제 5항에 있어서,
상기 식물체는 토마토인 것을 특징으로 하는, 재조합 벡터. - 제 5항의 재조합 벡터를 포함하는, 웅성불임 식물체 제조용 조성물.
- 서열번호 1의 ms1-like 유전자의 618번째 내지 2037번째 염기서열 내에서 특이적인 10 내지 30 개의 염기서열로 이루어진 가이드 RNA를 암호화하는 DNA 및 엔도뉴클레아제 단백질을 암호화하는 염기서열을 포함하는 재조합 벡터를 식물세포에 형질도입하는 단계를 포함하는,
웅성불임 식물체의 제조방법.
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