KR20220069969A - 인돌 카복사미드 화합물 및 마이코박테리아 감염 치료를 위한 이의 용도 - Google Patents
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Abstract
화학식 (I)의 화합물:
(I)
뿐만 아니라 그의 약학적으로 허용되는 염이 본원에 제공되며, 여기서 치환기는 명세서에 개시된 바와 같다. 이들 화합물, 및 이를 함유하는 약학적 조성물은 결핵 치료에 유용하다
뿐만 아니라 그의 약학적으로 허용되는 염이 본원에 제공되며, 여기서 치환기는 명세서에 개시된 바와 같다. 이들 화합물, 및 이를 함유하는 약학적 조성물은 결핵 치료에 유용하다
Description
본 발명은 예를 들어 하기 화학식 (I)의 화합물:
및 상기 화합물을 포함하는 약학적 조성물에 관한 것이다. 본원에 개시된 화합물 및 조성물은 항균제이고 결핵 및 기타 마이코박테리아 감염의 치료에 유용하다.
본 출원에 인용된 모든 간행물, 특허, 특허 출원 및 기타 참고 문헌은 각각의 개별 간행물, 특허, 특허 출원 또는 기타 참고 문헌이 구체적이고 개별적으로 표시된 것과 같은 정도로 모든 목적을 위해 그 전체가 참고로 여기에 통합된다. 여기에서 인용되는 참고 문헌은 그것이 본 발명에 대한 선행 기술임을 인정하는 것으로 해석되어서는 안 된다.
결핵균(Mycobacterium tuberculosis ("M. tb")은 치명적인 전염병인 결핵("TB")의 원인 병원체이다. 전 세계적으로 매년 약 2백만 명의 결핵 환자가 사망하는 것으로 추산된다. 약제-감수성 결핵의 치료는 40년 이상 전에 도입된 4가지 항생제인 이소니아지드(isoniazid), 리팜피신(rifampicin), 에탐부톨(ethambutol), 및 피라진아미드(pyrazinamide)가 현재 중심이다(Franz 2017). 결핵을 적절히 치료하지 않아서 Mtb에 전 세계적인 약물 내성이 발생하여 일부 약물이 효과가 없게 되었다. 따라서, TB를 치료하기 위한 새로운 화학 물질을 규명할 필요가 당업계에 존재한다.
발명의 요약
본 발명은 하기 화학식 (I)의 화합물에 관한 것이다:
본 발명은 또한 상기 화합물을 포함하는 약학적 조성물 및 결핵과 같은 마이코박테리아 감염의 치료에 관한 것이다.
아래에 설명된 도면은 단지 예시를 위한 것이며 본 발명의 범위를 제한하도록 의도되지 않는다.
도 1은 선택된 화합물의 심혈관 질환을 도시한다.
도 1은 선택된 화합물의 심혈관 질환을 도시한다.
본 명세서에 사용된 용어는 특정 구체예를 설명하기 위한 것이며 제한하려는 의도가 아님을 이해해야 한다. 또한, 본 명세서에 기재된 것과 유사하거나 균등한 임의의 방법, 장치 및 재료가 본 발명의 실시 또는 시험에 사용될 수 있지만, 이제 특정 방법, 장치 및 재료가 설명된다.
본 발명은 신규한 인돌 카르복사미드 화합물, 이의 제조, 및 결핵 및 기타 마이코박테리아 감염을 치료하기 위한 약물로서의 그것의 용도에 관한 것이다. 특정 구체예에서, 상기 화합물은 하기 일반 구조를 갖는다:
여기서:
R1은 수소, 저급 알킬, 또는 할로겐이고;
R2는 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 저급 알콕시, -OCH2CH2OCH3, 또는 카르복사미드이고;
R3은 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 저급 알콕시, -OCH2CH2OCH3, 또는 카르복사미드이고;
R4는 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 알콕시, -OCH2CH2OCH3, -(O(CH2)mm)nn-모르폴리닐, 피페리디닐, ((C1-C4)알킬)NH-, 또는 (페닐)NH- 이고, 여기서 mm은 1 또는 2이고 nn은 0 또는 1 또는 카르복사미드이고; 또는
R3 및 R4는 이들이 부착된 방향족 탄소 원자와 함께 융합된 1,3-디옥솔로를 형성하고;
R5는 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 알콕시, 또는 카르복사미드이고;
R6은
m은 1, 2 또는 3이고, n은 1, 2, 3, 또는 4이다.
m이 n과 같지 않은 경우, 아민 및 생성된 아미드에 입체중심(stereocenter)이 존재한다. 생성물은 혼합물이거나, 절대적인 입체 화학적 할당은 이루어지지 않는다 할지라도 아미드의 분리된(resolved) 개별 입체 이성질체일 수 있다. 이러한 경우 접미사 A 또는 B가 없는 숫자(MPL-xxx)는 라세미 혼합물을 의미하는 반면 접미사 A 및 B(예: MPL-xxxA 및 MPL-xxxB)는 절대적 구성이 각 엔안티오머에 할당된 것은 아니지만 분리된 엔안티오머를 의미한다. 입체 이성질체의 분리는 키랄 컬럼이 장착된 SFC(Super Fluid Chromatography)를 사용하여 가장 효과적으로 수행된다.
본 발명의 일 구체예에서, 본 발명의 화합물은 다른 항-TB 제제와 조합하여 TB를 치료할 수 있다. 상기 항-TB 제제는 리팜피신, 리파부틴, 리파펜텐, 이소니아지드, 에탐부톨, 카나마이신, 아미카신, 카프레오마이신, 클로파지민, 사이클로세린, 파라-아미노살리실산, 리네졸리드, 수테졸리드, 베다퀼린, 델라마니드, 프레토마니드, 목시플록사신, 및 레보플록사신을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
정의
본원에 사용된 용어 "알킬"은 단독으로 또는 다른 기와 조합하여 1 내지 20개의 탄소 원자, 일 구체예에서는 1 내지 16개의 탄소 원자, 다른 구체예에서는 1 내지 10개의 탄소 원자의 분지쇄 또는 직쇄 1가 포화 지방족 탄화수소 라디칼을 지칭한다.
용어 "저급 알킬"은 단독으로 또는 다른 기와 조합하여 1 내지 9개의 탄소 원자, 일 구체예에서 1 내지 6개의 탄소 원자, 또 다른 구체예에서 1 내지 4개의 탄소 원자, 추가 구체예에서 4 내지 6개의 탄소 원자의 탄소 원자의 분지쇄 또는 직쇄 알킬 라디칼을 지칭한다. 이 용어는 메틸, 에틸, n-프로필, 이소프로필, n-부틸, s-부틸, 이소부틸, t-부틸, n-펜틸, 3-메틸부틸, n-헥실, 2-에틸부틸 등과 같은 라디칼로 더욱 예시된다.
본원에 사용된 용어 "알콕시"는 알킬-O--를 의미하고; "알코일"은 알킬-CO--를 의미한다. 알콕시 치환기 또는 알콕시-함유 치환기는 예를 들어 하나 이상의 알킬 또는 할로기로 치환될 수 있다. 본원에 사용된 "저급 알콕시"는 앞서 정의된 "저급 알킬" 기를 갖는 알콕시 기를 나타낸다.
본원에 사용된 용어 "할로겐"은 불소, 염소, 브롬 또는 요오드 라디칼, 또는 일부 구체예에서는 불소, 염소 또는 브롬 라디칼을 의미한다.
용어 "아릴"은 하나 이상의 방향족 고리를 갖는 6 내지 12개의 탄소 원자의 방향족 모노- 또는 폴리카르보사이클릭 라디칼을 지칭한다. 이러한 기의 예는 페닐, 나프틸, 1,2,3,4-테트라히드로나프틸, 1,2-디히드로나프틸, 인다닐, 1H-인데닐 등을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
알킬, 저급 알킬 및 아릴 기는 치환 또는 비치환될 수 있다. 치환되는 경우, 일반적으로 예를 들어 1 내지 4개의 치환기가 존재할 것이다. 이들 치환기는 선택적으로 이들이 연결된 알킬, 저급 알킬 또는 아릴 기와 함께 고리를 형성할 수 있다. 치환기는 예를 들어 탄소 함유 기, 예를 들어 알킬, 아릴, 아릴알킬(예: 치환 및 비치환된 페닐, 치환 및 비치환된 벤질); 할로겐 원자 및 할로겐-함유 기, 예를 들어 할로알킬(예: 트리플루오로메틸); 산소-함유 기, 예를 들어 알코올(예: 히드록실, 히드록시알킬, 아릴(히드록실)알킬), 에테르(예: 알콕시, 아릴옥시, 알콕시알킬, 아릴옥시알킬, 다른 구체예에서는 예를 들어 메톡시 및 에톡시), 알데히드(예: 카르복스알데히드), 케톤(예: 알킬카르보닐, 알킬카르보닐알킬, 아릴카르보닐, 아릴알킬카르보닐, 아릴카르보닐알킬), 산(예: 카르복시, 카르복시알킬), 에스테르와 같은 산 유도체(예: 알콕시카르보닐, 알콕시카르보닐알킬, 알킬카르보닐옥시, 알킬카르보닐옥시알킬), 아미드(예: 아미노카르보닐, 모노- 또는 디-알킬아미노카르보닐, 아미노카르보닐알킬, 모노- 또는 디-알킬아미노카르보닐알킬, 아릴아미노카르보닐), 카바메이트(예: 알콕시카르보닐아미노, 아릴옥시카르보닐아미노, 아미노카르보닐옥시, 모노- 또는 디-알킬아미노카르보닐옥시, 아릴미노카르보닐옥시) 및 우레아(예: 모노- 또는 디-알킬아미노카르보닐아미노 또는 아릴아미노카르보닐아미노); 질소 함유 기, 예를 들어 아민(예: 아미노, 모노- 또는 디-알킬아미노, 아미노알킬, 모노- 또는 디-알킬아미노알킬), 아지드, 니트릴(예: 시아노, 시아노알킬), 니트로; 황-함유 기, 예를 들어 티올, 티오에테르, 술폭시드 및 술폰(예: 알킬티오, 알킬술피닐, 알킬술포닐, 알킬티오알킬, 알킬술피닐알킬, 알킬술포닐알킬, 아릴티오, 아리술피닐, 아리술포닐, 아리티오알킬, 아릴술피닐알킬, 아릴술포닐알킬); 및 하나 이상의 헤테로원자를 함유하는 헤테로사이클릭 기, (예: 티에닐, 푸라닐, 피롤릴, 이미다졸릴, 피라졸릴, 티아졸릴, 이소티아졸릴, 옥사졸릴, 옥사디아졸릴, 티아디아졸릴, 아지리디닐, 아제티디닐, 피롤리디닐, 피롤리닐, 이미다졸리디닐, 이미다졸리닐, 피라졸리디닐, 테트라히드로푸라닐, 피라닐, 피로닐, 피리딜, 피라지닐, 피리다지닐, 피페리딜, 헥사하이드로아제피닐, 피페라지닐, 모르폴리닐, 티아나프틸, 벤조푸라닐, 이소벤조푸라닐, 인돌릴, 옥시인돌릴, 이소인돌릴, 인다졸릴, 인돌리닐, 7-아자인돌일, 벤조피라닐, 쿰마리닐, 피리도피리딜, 벤족사지닐, 퀴녹살리닐, 크로메닐, 크로마닐, 이소크로마닐, 프탈라지닐 및 카르볼리닐)일 수 있다.
본 명세서에 제공된 개시내용으로부터 쉽게 이해되는 바와 같이, 일반 기(generic group)에 속하는 기에 대한 임의의 언급은 동일한 방식으로 치환되거나 치환되지 않을 수 있다. 예를 들어, 페닐기는 아릴기와 동일하게 치환될 수 있다. 용어 "헤테로아릴"은 N, O 및 S로부터 선택된 1, 2 또는 3개의 고리 헤테로원자를 함유하고 나머지 고리 원자는 C인 적어도 하나의 방향족 고리를 갖는 5 내지 12개의 원자로 이루어진 방향족 모노- 또는 폴리시클릭 라디칼을 지칭한다. 이러한 기의 예는 피리디닐, 피라지닐, 피리다지닐, 1,2,3-트리아지닐, 1,2,4-트리아지닐, 옥사졸릴, 티아졸릴 등을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다.
어떤 경우에는 용어 앞에 "(C# - C#)"이 붙는다. 본 명세서에서 제공된 개시내용으로부터 쉽게 이해될 수 있는 바와 같이, 이는 그 용어와 관련된 탄소 원자의 수를 정의한다. 예를 들어, (C1-C6)알킬은 분지형 또는 직쇄형 1가 포화 지방족 탄화수소 라디칼이 1 내지 6개의 탄소 원자를 갖는 알킬을 의미한다. 본 명세서에서 제공된 개시내용으로부터 쉽게 이해되는 바와 같이, 모든 치환 정의는 이러한 구조에 동일하게 적용된다. 예를 들어, (C1-C6)알킬은 알킬이 치환되는 것과 동일한 방식으로 치환될 수 있다.
본 명세서에 개시된 임의의 범위는 그 범위 내의 모든 정수 단위량이 본 발명의 일부로서 구체적으로 개시됨을 의미한다. 따라서 예를 들어 1에서 12까지의 단위는 1, 2, 3 ... 12개의 단위가 본 발명의 구체예로서 포함된다는 것을 의미한다.
본 명세서에 사용된 바와 같이, 다제내성결핵(MDR-TB)은 이소니아지드 및 리팜핀에 대한 내성을 갖고 다른 약물에 대한 내성이 있거나 없는 TB의 한 형태이다. 본 명세서에 사용된 바와 같이, 전-광범위 약물 내성(Pre-XDR-TB)은 이소니아지드 및 리팜핀 및 플루오로퀴놀론 또는 주사 가능한 약물 중 하나에 대한 내성을 갖지만 둘 다에 대한 내성은 갖지 않는 TB의 한 형태이다. 본 명세서에 사용된 바와 같이, 광범위 약물 내성 결핵(XDR-TB)은 이소니아지드, 리팜핀, 플루오로퀴놀론 및 적어도 하나의 주사 가능한 약물(예: 스트렙토마이신, 아미카신, 카나마이신, 카프레오마이신)에 내성을 갖는 TB의 한 형태이다.
본 발명의 화합물은 하나 이상의 비대칭 탄소 원자를 가질 수 있고 광학적으로 순수한 엔안티오머, 엔안티오머의 혼합물, 예를 들어 라세미체, 광학적으로 순수한 부분입체 이성질체(diastereoisomer), 부분입체 이성질체의 혼합물, 부분입체 이성질체 라세미체 또는 부분입체 이성질체 라세미체의 혼합물의 형태로 존재할 수 있다. 광학 활성 형태는 예를 들어 라세미체의 분리, 비대칭 합성 또는 비대칭 크로마토그래피(키랄 흡착제 또는 용리제를 사용한 크로마토그래피)에 의해 얻을 수 있다. 본 발명은 이러한 모든 형태를 포함한다.
일 구체예에서, 본 발명은 또한 본 발명의 화합물과 하나 이상의 다른 치료제의 조합 요법을 제공한다. 다른 제제는 개체를 치료하기 위한 요법에서 동시적, 개별적 또는 순차적 사용을 위해 준비될 수 있다.
본 발명의 방법의 실시에 있어서, 본 발명의 화합물 중 임의의 하나 또는 본 발명의 화합물 중 임의의 조합의 유효량을 당업계에 공지된 통상적이고 허용가능한 방법을 통해 단독으로 또는 조합하여 투여한다. 따라서, 화합물 또는 조성물은 예를 들어 눈으로, 경구로(예: 구강), 설하로, 비경구로(예: 근육내로, 정맥내로 또는 피하로), 직장으로(예: 좌약 또는 세척제에 의해), 경피로(예: 피부 전기천공) 또는 흡입(예: 에어로졸), 및 정제 및 현탁액을 포함하는 형태 또는 고체, 액체 또는 기체 투여량으로 투여할 수 있다. 투여는 연속 요법과 함께 단일 단위 투여 형태로 또는 임의의 단일 용량 요법으로 수행될 수 있다. 치료 조성물은 또한 파모산과 같은 친유성 염과 함께 오일 에멀젼 또는 분산액의 형태, 또는 피하 또는 근육내 투여를 위한 생분해성 지속-방출 조성물의 형태일 수 있다.
본 발명의 조성물의 제조에 유용한 약학적 담체는 고체, 액체 또는 기체일 수 있다. 따라서, 조성물은 정제, 환제, 캡슐, 좌약, 분말, 장용 코팅 또는 기타 보호된 제제(예: 이온 교환 수지에 대한 결합 또는 지질-단백질 소포 내 패키징), 지속 방출 제제, 용액, 현탁액, 엘릭시르, 에어로졸 등의 형태일 수 있다. 담체는 석유, 동물성, 식물성 또는 합성 기원의 오일을 비롯한 다양한 오일, 예를 들어 땅콩 오일, 대두 오일, 광유, 참기름 등으로부터 선택될 수 있다. 물, 식염수, 수성 덱스트로스, 및 글리콜은 특히(혈액과 등장성인 경우) 주사 용액의 경우 대표적인 액체 담체이다. 예를 들어, 정맥내 투여용 제제는 고체 활성 성분(들)을 물에 용해시켜 수용액을 생성하고 용액을 살균함으로써 제조된 활성 성분(들)의 살균 수용액을 포함한다. 적합한 약학적 부형제는 전분, 셀룰로오스, 활석, 포도당, 락토스, 탈크, 젤라틴, 맥아, 쌀, 밀가루, 백악, 실리카, 마그네슘 스테아레이트, 소듐 스테아레이트, 글리세롤 모노스테아레이트, 염화나트륨, 건조 탈지유, 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 물, 에탄올 등을 포함한다. 조성물은 보존제, 안정화제, 습윤제 또는 유화제, 삼투압 조절용 염, 완충제 등과 같은 통상적인 약학적 첨가제에 적용될 수 있다. 적합한 약학적 담체 및 이의 제형은 E.W.Martin의 Remington's Pharmaceutical Sciences에 설명되어 있다. 이러한 조성물은 어떠한 경우에도 수용자에게 적절한 투여를 위한 적절한 투여 형태를 제조하기 위해 적절한 담체와 함께 유효량의 활성 화합물을 함유할 것이다.
본 발명의 화합물의 투여량은 예를 들어 투여 방식, 개체의 연령 및 체중, 및 치료할 개체의 상태와 같은 여러 요인에 따라 달라지며, 궁극적으로 담당의사 또는 수의사가 결정한다. 주치의 또는 수의사에 의해 결정된 활성 화합물의 이러한 양은 본원 및 청구범위에서 "치료적 유효량"으로 지칭된다. 예를 들어, 본 발명의 화합물의 투여량은 전형적으로 1일 약 1 내지 약 1000 mg의 범위이다. 일 구체예에서, 치료적 유효량은 1일 약 10 mg 내지 약 500 mg의 양이다.
본 발명의 화합물은 생체내에서 모 화합물로 다시 전환될 수 있는 유도체를 제공하기 위해 작용기에서 유도체화될 수 있음이 이해될 것이다. 생체 내에서 화학식 I의 모 화합물을 생성할 수 있는 생리학적으로 허용되고 대사적으로 불안정한 유도체도 본 발명의 범위 내에 있다.
본 발명의 화합물은 상업적으로 입수가능한 출발 물질로 시작하여 당업자에게 공지된 일반적인 합성 기술 및 절차를 이용하여 제조될 수 있다. 예를 들어, WO 2014/03137968에 개시된 일반적인 합성 기술은 당업자에게 알려져 있다. 화학 물질은 예를 들어 Aldrich, Argonaut Technologies, VWR 및 Lancaster와 같은 회사에서 구입할 수 있다. 크로마토그래피 용품 및 기기는 예를 들어 AnaLogix, Inc., Burlington, Wis.; Biotage AB, Charlottesville, Va.; Analytical Sales and Services, Inc., Pompton Plains, N.J.; Teledyne Isco, Lincoln, Nebr.; VWR International, Bridgeport, N.J.; Varian Inc., Palo Alto, Calif., 및 Multigram II Mettler Toledo Instrument Newark, Del. Biotage, ISCO와 같은 회사에서 구입할 수 있고 Analogix 컬럼은 표준 크로마토그래피에 사용되는 미리 포장된 실리카겔 컬럼이다.
본 발명의 대표적인 화합물의 합성
본 발명의 화합물은 일반적인 방법 A 및 B를 나타내는 하기 반응식에 따라 제조할 수 있다:
실시예
본 개시내용은 하기 구체예에 의해 추가로 예시되며, 이는 본 개시내용을 본 명세서에 기재된 특정 절차에 대한 범위 또는 사상으로 제한하는 것으로 해석해서는 안 된다. 실시예는 특정 구체예를 예시하기 위해 제공되며 이에 의해 본 개시내용의 범위에 제한이 없음을 이해해야 한다. 추가로, 본 개시내용의 사상 및/또는 첨부된 청구범위의 범위를 벗어나지 않으면서 당업자에게 제안될 수 있는 다양한 다른 구체예, 수정 및 균등물에 의지할 수 있음을 이해해야 한다.
사용된 약어: ABPR, 자동 배압 조절기; ACN, 아세토니트릴; aq., 수성; CDI, 1,1'-카르보닐 디이미다졸; m-CPBA, 메타-클로로퍼벤조산; DCM, 디클로로메탄; DEA, 디에틸 아민; DME, 디메톡시에탄; DMF, 디메틸포름아미드; DMSO, 디메틸설폭사이드; EDCI, 1-에틸-3-(3-디메틸아미노프로필)카르보디이미드; ESI, 전자분무 이온화; EtOAc, 에틸 아세테이트; eq., 등가; FA, 포름산; HOBt, 1-하이드록시벤조니트릴; HPLC, 고성능 액체 크로마토그래피; IPA, 이소프로필 알코올; LAH, 리튬 알루미늄 하이드라이드; LCMS 또는 LC-MS, 액체 크로마토그래피-질량 분석법; LDA, 리튬 디이소프로필아미드; min, 분; m/z, 질량 대 전하 비율; NCS, N-클로로숙신이미드; nm, 나노미터; NMR, 핵자기공명; 1H NMR, 양성자 NMR; Pd(dppf)Cl2, 1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]디클로로팔라듐(II); prep-HPLC, 분취 HPLC; prep-TLC, 분취 TLC; psi, 평방 인치당 파운드; sat., 포화된; SFC, 초임계 유체 크로마토그래피; TBAF, 테트라-n-부틸암모늄 플루오라이드; TEA, 트리에틸아민; THF, 테트라히드로푸란: TLC, 박층 크로마토그래피; TMEDA, 테트라메틸에틸렌디아민; TMS, 트리메틸실릴; TMSCl, 클로로(트리메틸)실란; Tos, p-톨릴설포닐; TosCl, 4-톨루엔설포닐 클로라이드; TOsOH, p-톨루엔 설폰산 ; μl, 마이크로리터; μmol, 마이크로몰; μm, 마이크로미터; δ, ppm의 화학적 이동.
TLC 또는 LCMS로 반응을 모니터링하고 화합물을 LCMS 및/또는 NMR로 특성화했다. Shimadzu LC20-MS2010 또는 LC20-MS2020을 LC/MS 분석에 사용했다. NMR 측정에는 Varian 400MHz, Varian 500MHz 또는 Bruker 500MHz를 사용하였다.
prep-HPLC 정제를 위한 일반 조건: 기기: Gilson GX281; 유속: 25mL/min; 검출기: UV 220 및 UV 254
"[물(X)-Y]; B%: J%-K%, Lmin"은 이동상 A: 수중 X; B: Y; 구배: L분에 걸쳐 J%-K% B를 나타낸다. 예를 들어, '[물(0.225%FA)-ACN];B%: 36%-66%, 11min'은 이동상: A: 수 중 0.025% 포름산, B: 아세토니트릴; 구배: 11분에 걸쳐 36%-66% B를 의미한다.
실시예 1, MPL-196
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-메톡시-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(2 mL) 중 6-플루오로-4-메톡시-1H-인돌-2-카복실산(160 mg, 764.91 μmol, 1 eq) 및 CDI(148.84 mg, 917.90 μmol, 1.2 eq)의 용액을 0.5시간 동안 25℃에서 교반하였다. 1,1-디메틸실리난-4-아민(131.54 mg, 917.90 μmol, 1.2 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 11.5시간 동안 교반하였다. LCMS는 출발 물질을 나타내지 않았다. TLC는 하나의 스팟이 관찰되었음을 보여주었다. 반응 혼합물을 물(20 ml)에 첨가하고, 여과하고, 필터 케이크를 10 mL의 물로 세척하고, 진공에서 건조시켜 생성물을 얻었다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르/EtOAc=1:0 내지 10:1)로 정제하였다. 잔류물을 ACN(5mL) 및 H2O(20mL)로 희석한 다음 동결건조시켰다. 생성물 N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-메톡시-1H-인돌-2-카르복사미드(141.9 mg, 421.30 μmol, 55.08% 수율, 99.3% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS (ESI) m/z 335.2 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 11.57 (s, 1H), 8.13 (d, J=8.1 Hz, 1H), 7.22 (d, J=1.7 Hz, 1H), 6.71 (dd, J=1.3, 9.5 Hz, 1H), 6.45 (dd, J=1.8, 12.1 Hz, 1H), 3.88 (s, 3H), 3.75 - 3.64 (m, 1H), 2.00 - 1.92 (m, 2H), 1.62 - 1.52 (m, 2H), 0.76 (br d, J=14.5 Hz, 2H), 0.59 (dt, J=4.7, 14.2 Hz, 2H), 0.08 (s, 3H), 0.03 (s, 3H).
실시예 2, MPL-203
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(4mL) 중 4,6-디클로로-1H-인돌-2-카르복실산(150mg, 652.04μmol, 1eq)의 용액에 CDI(137.45mg, 847.65μmol, 1.3eq)를 첨가했다. 혼합물을 20℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 이어서, 1,1-디메틸실리난-4-아민(121.47 mg, 847.65 μmol, 1.3 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 11.5시간 동안 교반하였다. LCMS는 출발 물질이 없음을 보여주었다. 반응물을 H2O(20mL)에 적가하였다. 필터에 의해 수집된 많은 침전물이 있었다. 케이크를 EtOAc(30 mL)로 희석하고, 무수 MgSO4로 건조하고, 여과하였다. 여액을 진공에서 농축하였다. 잔류물을 ACN(5mL) 및 H2O(20mL)로 희석한 다음, 추가 정제 없이 동결건조시켰다. 화합물 4, 6-디클로로-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-1H-인돌-2-카르복사미드(127.3 mg, 351.09 μmol, 53.85% 수율, 98.001% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS (ESI), m/z 355.2[M+H] +
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ= 12.03 (br s, 1H), 8.44 (br d, J=8.2 Hz, 1H), 7.41 (s, 1H), 7.29 (s, 1H), 7.21 (d, J=1.5 Hz, 1H), 3.77 - 3.67 (m, 1H), 2.03-1.95 (m, 2H), 1.65 - 1.54 (m, 2H), 0.77 (br d, J=14.5 Hz, 2H), 0.61 (dt, J=4.7, 14.2 Hz, 2H), 0.11 - 0.01 (m, 6H).
실시예 3, MPL-204
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(40mL) 중 4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카복실산(2g, 10.15mmol, 1eq)의 용액에 CDI(1.81g, 11.16mmol, 1.1eq)를 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 그 다음, 1,1-디메틸실리난-4-아민(1.60g, 11.16mmol, 1.1eq)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 11.5시간 동안 교반하였다. LCMS는 출발 물질이 없음을 보여주었다. 반응물을 H2O(300mL)에 적가하였다. 필터에 의해 수집된 많은 침전물이 있었다. 케이크를 바닥 플라스크로 옮겼다. 조 생성물을 30℃에서 45분 동안 ACN(20mL)으로 분쇄(triturate)하였다. 화합물 N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드 (2.74 g, 8.15 mmol, 80.29% 수율, 95.752% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS (ESI), m/z 323[M+H] +
1H NMR (400MHz, DMSO-d6) d = 11.94 (br s, 1H), 8.30 (br d, J=8.1 Hz, 1H), 7.25 (s, 1H), 7.01 (br d, J=8.4 Hz, 1H), 6.90 - 6.83 (m, 1H), 3.77 - 3.64 (m,1H), 2.05 - 1.93 (m, 2H), 1.65 - 1.52 (m, 2H), 0.83 - 0.73 (m, 2H), 0.61 (dt, J=4.6, 14.1 Hz, 2H), 0.09 (s, 3H), 0.03 (s, 3H).
실시예 4, MPL-251
4,6-디플루오로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1 mL) 중 4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복실산(50 mg, 253.63 μmol, 1 eq)의 용액에 CDI(49.35 mg, 304.36 μmol, 1.2 eq)를 첨가했다. 그 다음 혼합물을 30℃에서 0.5시간 동안 교반하고 그런 다음 5-실라스피로[4.5]데칸-8-아민(51.54mg, 304.36μmol, 1.2eq)을 첨가했다. 혼합물을 30℃에서 11.5시간 동안 교반하였다. LC-MS는 출발 물질이 완전히 소모되었음을 보여주었다. 반응 혼합물을 물(20mL)에 첨가한 다음, 여과하고, 필터 케이크를 5mL의 물로 세척하고, 진공에서 건조시켜 생성물을 얻었다. 조 생성물을 EtOAc(10 ml)로 희석하고 감압 하에 농축하여 잔류물을 얻었다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르:EtOAc=1:0 내지 10:1)로 정제하였다. 잔류물을 ACN(1mL) 및 H2O(10mL)로 희석한 다음 동결건조시켰다. 생성물 4,6-디플루오로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드(39 mg, 107.50 μmol, 42.39% 수율, 96.052% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS (ESI) m/z 349.1 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d 6) δ = 11.94 (br s, 1H), 8.30 (br d, J=8.2 Hz, 1H), 7.26 (s, 1H), 7.01 (br d, J=9.0 Hz, 1H), 6.87 (br t, J=10.2 Hz, 1H), 3.76 (br d, J=8.4 Hz, 1H), 2.06 (br d, J=10.2 Hz, 2H), 1.64 - 1.51 (m, 6H), 0.84 - 0.70 (m, 4H), 0.64 - 0.58 (m, 2H), 0.57 - 0.51 (m, 2H).
실시예 5, MPL-252
4,6-디클로로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(10mL) 중 4,6-디클로로-1H-인돌-2-카르복실산(0.4g, 1.74mmol, 1eq)의 용액에 5-실라스피로[4.5]데칸-8-아민(357.84mg, 1.74mmol, 1당량, HCl), HOBt(352.41mg, 2.61mmol, 1.5eq), EDCI(499.98mg, 2.61mmol, 1.5eq) 및 TEA(439.87mg, 4.35mmol, 605.04μL, 2.5eq)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. TLC는 반응이 완료된 것으로 나타났다. 혼합물을 물(30 mL)에 붓고 5분 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하였다. 필터 케이크를 ACN(15mL)으로 희석하고 10분 동안 교반했다. 혼합물을 다시 여과하였다. 필터 케이크를 감압 하에 건조시켜 생성물을 얻었다. 화합물 4,6-디클로로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드(455 mg, 1.14 mmol, 65.60% 수율, 95.6% 순도)를 베이지색 고체로 얻었다.
LCMS (ESI) m/z 381.0 [M+H]+
1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ =7.41 (s, 1H), 7.20 (s, 1H), 7.10 (d, J=1.5 Hz, 1H), 3.81 (br t, J=11.4 Hz, 1H), 2.24 - 2.14 (m, 2H), 1.71 - 1.58 (m,6H), 0.87 - 0.77 (m, 4H), 0.68 (t, J=6.9 Hz, 2H), 0.58 (br t, J=6.9 Hz, 2H).
실시예 6, MPL-262
N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(0.5mL) 중 4,6-디메틸-1H-인돌-2-카복실산(30mg, 158.55μmol, 1eq)의 용액에 1,1-디메틸실레판-4-아민(50mg, 317.81 μmol, 2eq)을 첨가하였다. DMF(0.5 mL) 중 HOBt(32.14 mg, 237.83 μmol, 1.5 eq) 및 EDCI(45.59 mg, 237.83 μmol, 1.5 eq)의 혼합물을 첨가한 다음 TEA(48.13 mg, 475.63 μmol, 66.21μL, 3eq)을 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 2시간 동안 교반하였다. LCMS는 출발 물질이 없고 주요 목적 화합물이 있음을 보여주었다. 반응물을 ACN(3 mL)에 희석하고 pre. HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: [물(0.225%FA)-ACN]; B%: 67%-92%, 11분)로 정제하였다. 화합물 N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드 (30 mg, 91.14 μmol, 57.49% 수율, 99.81% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS (ESI) m/z 329.1 [M+H]+
1H NMR (500MHz, CHLOROFORM-d) δ = 9.14 (br s, 1H), 7.06 (s, 1H), 6.78 (br d, J=8.6 Hz, 2H), 6.09 (br d, J=6.7 Hz, 1H), 4.09 (br d, J=8.6 Hz, 1H), 2.52(s, 3H), 2.43 (s, 3H), 2.15 - 2.01 (m, 2H), 1.85 (br d, J=8.6 Hz, 1H), 1.76 - 1.66 (m, 1H), 1.59 - 1.46 (m, 2H), 0.83 - 0.65 (m, 4H), 0.06 (d, J=2.3 Hz, 6H).
실시예 7, MPL-264
반응식:
1 단계. 에틸 4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
Dean-Stark 트랩이 장착된 플스크에 Tol.(150 mL) 중 (3,5-디메틸페닐)히드라진(15g, 86.88mmol, 1당량, HCl), 에틸 2-옥소프로파노에이트(10.09g, 86.88mmol, 9.61mL, 1eq) 및 TosOH(29.92g, 173.76mmol, 2eq)을 140℃에서 12시간 동안 환류 가열하였다. TLC(석유 에테르:EtOAc = 1:1, Rf = 0.8)는 출발 물질이 없었고 극성이 더 낮은 하나의 주요 새로운 스폿이 있음을 보여주었다. 혼합물을 감압하에 농축시켰다. 조 생성물을 실리카겔 컬럼 크로마토그래피(0~20% EtOAc의 용리액: 석유 에테르 구배, 80g 실리카겔 컬럼)로 정제하였다. TLC(석유 에테르:EtOAc = 5:1, Rf = 0.3)에 의해 생성물을 함유하는 것으로 밝혀진 모든 분획을 합하고 증발시켰다. 화합물 에틸 4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(8g, 34.98 mmol, 40.26% 수율, 95% 순도)를 TLC로 확인한 백색 고체로서 얻었다.
2 단계. 4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
EtOH(40mL) 및 H2O(40mL) 중 에틸 4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(8g, 36.82mmol, 1eq)의 용액에 LiOH.H2O(4.64g, 110.47mmol, 3eq)를 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 12시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르: EtOAc = 3:1)는 출발 물질이 없었고 극성이 더 높은 하나의 주요 새로운 스폿이 감지되었음을 보여주었다. 혼합물을 감압하에 농축시켰다. 잔류물을 H2O(50mL)로 희석하였다. 혼합물을 1N HCl을 사용하여 pH=4로 조정하였다. 필터에 의해 수집된 많은 침전물이 있었다. 케이크를 EtOAc(30mL)에 희석하고 무수 MgSO4로 건조하고 여과하였다. 여액을 진공에서 농축하였다. 잔류물을 추가 정제 없이 다음 단계에 직접 사용하였다. 화합물 4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복실산(5.9g, 29.62mmol, 80.45% 수율, 95% 순도)을 LCMS 및 1HNMR로 확인한 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 190.1 [M+H]+
3단계. 4,6-디메틸-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(0.5mL) 중 4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복실산(30mg, 158.55μmol, 1eq)의 용액에 5-실라스피로[4.5]데칸-8-아민(35.89mg, 174.41μmol, 1.1당량, HCl 염)을 첨가하였다. DMF(0.5 mL) 중 EDCI(45.59 mg, 237.83 μmol, 1.5 eq) 및 HOBt(32.14 mg, 237.83 μmol, 1.5 eq)의 혼합물을 첨가한 다음 TEA(48.13 mg, 475.66 μmol, 66.21μL, 33 eq)를 첨가했다. 혼합물을 30℃에서 2시간 동안 교반하였다. LCMS는 출발 물질이 없었고 하나의 주요 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 반응물을 H2O(20mL)에 적가하였다. 필터에 의해 수집된 많은 침전물이 있었다. 케이크를 H2O(20mL)로 세척한 다음 감압하에 건조시켰다. 잔류물을 추가 정제 없이 전달하였다. 화합물 4,6-디메틸-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드(49.7 mg, 141.55 μmol, 89.28% 수율, 96.99% 순도)를 LCMS 및 1HNMR에 의해 확인된 백색 고체로서 얻었다.
LCMS (ESI) m/z 341.1 [M+H]+
1H NMR (500MHz, CHLOROFORM-d) δ = 9.04 (br s, 1H), 7.06 (s, 1H), 6.79 (s, 1H), 6.78 - 6.75 (m, 1H), 6.77 (s, 1H), 6.05 - 5.98 (m, 1H), 3.96 (br d, J=7.8Hz, 1H), 2.52 (s, 3H), 2.43 (s, 3H), 2.26 (br d, J=11.0 Hz, 2H), 1.67 - 1.60 (m, 6H), 0.87 - 0.80 (m, 4H), 0.66 - 0.56 (m, 4H).
실시예 8, MPL-265
4,6-디메틸-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(0.5mL) 중 4,6-디메틸-1H-인돌-2-카복실산(30mg, 158.55μmol, 1eq)의 용액에 6-실라스피로[5.5]운데칸-3-아민(38.34mg, 174.41μmol, 1.1eq, HCl 염)을 첨가하였다. DMF(0.5 mL) 중 EDCI(45.59 mg, 237.83 μmol, 1.5 eq)와 HOBt(32.14 mg, 237.83 μmol, 1.5 eq)의 혼합물을 첨가한 다음 TEA(48.13 mg, 475.66 μmol, 66.21μL, 3eq)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 2시간 동안 교반하였다. LCMS는 출발 물질이 없음과 주요 목적 화합물을 보여주었다. 반응물을 H2O(20mL)에 적가하였다. 필터에 의해 수집된 많은 침전물이 있었다. 케이크를 H2O(20 mL)로 세척한 다음, 감압 하에 농축하였다. 잔류물을 추가 정제 없이 전달하였다. 화합물 4,6-디메틸-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드(57.2 mg, 154.99 μmol, 97.75% 수율, 96.07% 순도)를 LCMS 및 1HNMR에 의해 확인된 백색 고체로서 얻었다.
LCMS (ESI) m/z 355.1 [M+H]+
1H NMR (500MHz, CHLOROFORM-d) δ = 8.96 (br s, 1H), 7.06 (s, 1H), 6.80 - 6.77 (m, 1H), 6.76 (d, J=1.4 Hz, 1H), 6.00 (br d, J=8.4 Hz, 1H), 3.96 - 3.89(m, 1H), 2.52 (s, 3H), 2.43 (s, 3H), 2.22 - 2.16 (m, 2H), 1.73 - 1.64 (m, 4H), 1.63 - 1.57 (m, 2H), 1.46 - 1.39 (m, 2H), 0.91 (br d, J=14.6 Hz, 2H), 0.74 - 0.67(m, 4H), 0.65 - 0.61 (m, 2H).
실시예 9, MPL-286
N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(0.5 mL) 중 EDCI(72.93 mg, 380.44 μmol, 1.5 eq) 및 HOBt(51.41 mg, 380.44 μmol, 1.5 eq)의 용액을 교반하면서 DMF(0.5mL) 중 4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복실산(50mg, 253.63μmol, 1eq) 및 1,1-디메틸실레판-4-아민(98.30mg, 507.26μmol, 2당량, HCl)의 용액에 첨가했다. 그런 다음 TEA(76.99 mg, 760.89 μmol, 105.91 μL, 3 eq)를 상기 용액에 첨가했다. 혼합물을 25℃에서 2시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: [물(0.225%FA)-ACN]; B%: 65%-92%, 11분)로 정제했다. 화합물 N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드 (31 mg, 91.29 μmol, 35.99% 수율, 99.082% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI), m/z 337.1[M+H]+
1H NMR(500MHz, DMSO-d6) δ = 11.88(br s, 1H), 8.27(br d, J=8.1Hz, 1H), 7.23(s, 1H), 6.97(br d, J=9.3Hz, 1H ), 6.88 - 6.75(m, 1H), 3.91 - 3.80(m,1H), 1.95 - 1.71(m, 3H), 1.69 - 1.57(m, 1H), 1.52 - 1.38(m, 0.67 - 0.74), (m, 2H), 0.62 - 0.47(m, 2H), 0.00(d, J=11.1Hz, 6H).
실시예 10, MPL-296, MPL-296A 및 MPL-296B
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드, N-[(3R)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드; 및 N-[(3S)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성.
DMF(1.5 mL) 중 4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복실산(30 mg, 158.55 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실로란-3-아민(26.28 mg, 158.55 umol, 1 eq, HCl)의 용액에 DMF(1 mL) 중 EDCI(91.18 mg, 475.66 umol, 3 eq) 및 HOBt(64.27 mg, 475.66 umol, 3 eq)의 용액을 첨가한 후 TEA(48.13 mg, 475.66umol, 66.21uL, 3eq)을 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 1시간 동안 교반하였다. LC-MS는 원하는 생성물을 보여주었다. 혼합물을 여과하고 여액을 prep-HPLC(YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN; 구배: 60%-90% B 11분 동안)에 의해 정제하였다. 화합물 N-(1,1-디메틸실롤란-3-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드 (28.8 mg, 95.39 umol, 60.16% 수율, 99.52% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z: 301.1 [M+H]+
1H NMR (500MHz, CHLOROFORM-d) δ = 9.16 (br s, 1H), 7.11 - 7.00 (m, 1H), 6.82 - 6.71 (m, 2H), 6.07 (br d, J=7.5 Hz, 1H), 4.23 (dq, J=6.9, 11.3 Hz, 1H), 2.55 - 2.47 (m, 3H), 2.46 - 2.39 (m, 3H), 2.29 (dddd, J=2.4, 5.3, 7.5, 10.0 Hz, 1H), 1.46 - 1.30 (m, 2H), 0.86 (ddd, J=2.4, 7.2, 15.0 Hz, 1H), 0.66 (ddd, J=8.0, 11.8, 15.0 Hz, 1H), 0.54 (dd, J=10.9, 14.1 Hz, 1H), 0.21 (d, J=2.0 Hz, 6H).
반응은 또한 528.5 umol에서 수행되었다. prep-HPLC 정제로부터의 생성물(MPL-296)을 prep-SFC(Waters Prep SFC 80Q, 컬럼: DAICEL CHIRALPAK AD(250mm*30mm, 10um); 이동상: A: EtOH 중 0.1% NH3H2O, B CO2, 구배: 등용매 15% B, 유속: 60mL/분)로 분리했다. 2개의 피크(2개의 엔안티오머), N-[(3R)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드 및 N-[(3S)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드를 얻었다.
피크 1(MPL-296A): 38.5 mg, 127.05 umol, 24.04% 수율, 99.158% 순도, 백색 고체.
LCMS m/z: 301.0 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 11.30 (s, 1H), 8.18 (d, J=7.8 Hz, 1H), 7.12 (d, J=1.4 Hz, 1H), 7.01 (s, 1H), 6.65 (s, 1H), 4.03 (dq, J=6.8, 11.7 Hz, 1H), 2.43 (s, 3H), 2.36 - 2.29 (m, 3H), 2.08 - 1.98 (m, 1H), 1.43 (dq, J=7.2, 12.2 Hz, 1H), 1.10 (ddd, J=1.8, 6.7, 14.2 Hz, 1H), 0.86 - 0.76 (m, 1H), 0.65 (dd, J=11.2, 14.1 Hz, 1H), 0.53 (ddd, J=8.0, 12.7, 14.5 Hz, 1H), 0.23 - 0.12 (m, 6H).
피크 2(MPL-296B): 38.2 mg, 127.13 umol, 24.06% 수율, 100% 순도, 백색 고체.
LCMS m/z: 301.0 [M+H]+
1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ = 11.30 (br s, 1H), 8.18 (br d, J=7.8 Hz, 1H), 7.11 (d, J=1.2 Hz, 1H), 7.01 (s, 1H), 6.65 (s, 1H), 4.03 (br dd, J=7.2, 11.4 Hz,1H), 2.43 (s, 3H), 2.33 (s, 3H), 2.02 (br d, J=5.1 Hz, 1H), 1.43 (dq, J=7.5, 12.1 Hz, 1H), 1.16 - 1.05 (m, 1H), 0.80 (br dd, J=6.0, 14.5 Hz, 1H), 0.65 (dd, J=11.4, 14.1 Hz, 1H), 0.59 - 0.46 (m, 1H), 0.18 (s, 6H).
MPL-296A 및 MPL-296B도 분석 SFC로 분석했다.
조건:
기기: PDA 검출기가 있는 Waters UPCC
컬럼: 키랄셀 OJ-3 150mm x 4.6mm, 3um 입자 크기
이동상: A: CO2, B: 에탄올 중 0.05% DEA
구배: 5분에 5% 내지 40% B, 0.5분에 40% 내지 5% B, 1.5분 동안 5% B 유지
유속: 2.5mL/분
컬럼 온도: 35℃
ABPR: 1500psi
MPL-296A: 체류 시간 2.84분, 99.8% ee
MPL-296B: 체류 시간 2.98분, 87.7% ee
실시예 11, MPL-303
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1.5 mL) 중 4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복실산(32.78 mg, 173.23 umol, 1.2 eq) 및 1,1-디메틸실로칸-5-아민(30 mg, 144.36 umol, 1 eq, HCl)의 용액에 DMF(1 mL) 중 EDCI(83.02 mg, 433.08 umol, 3 eq) 및 HOBt(58.52 mg, 433.08 umol, 3 eq) 용액을 첨가한 후 TEA(87.65 mg, 866.15umol, 120.56 uL, 6 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. LC-MS는 원하는 매스(mass)가 감지되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 여과하였다. 여액을 prep-HPLC(YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN; 구배: 11분에 걸쳐 75%-100% B)로 정제했다. 생성물을 prep-SFC(Berger MG II, 컬럼: DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10um); 이동상: A: EtOH 중 0.1% NH3H2O, B: CO2, 구배: 25% B, 등용매, 유속: 60mL/분)으로 더 정제하였다. 화합물 N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드 (13.3 mg, 38.83 umol, 26.90% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS m/z: 343.1 [M+1]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 11.31 (s, 1H), 8.20 (d, J=8.2 Hz, 1H), 7.12 (s, 1H), 7.01 (s, 1H), 6.65 (s, 1H), 4.04 (br d, J=5.8 Hz, 1H), 2.45 (br s, 1H), 2.43 (s, 3H), 2.33 (s, 3H), 1.77 - 1.51 (m, 8H), 0.81 - 0.64 (m, 4H), 0.08 - -0.04 (m, 6H).
실시예 12, MPL-317
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(10mL) 중 4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복실산(2.30g, 12.13mmol, 1eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(2.40g, 13.34mmol, 1.1당량, HCl 염)의 용액에 DMF(20mL) 중 HOBt(4.92g, 36.39mmol, 3eq) 및 EDCI(6.98g, 36.39mmol, 3eq)의 용액을 교반하면서 첨가한 다음, TEA(6.14 g, 60.65mmol, 8.44mL, 5eq)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 25℃에서 2시간 동안 교반하였다. LCMS는 출발 물질이 완전히 소모되었음을 보여주었다. 잔류물을 NaHCO3용액(포화 NaHCO3:H2O=2:1, 270mL)에 붓고 침전물이 형성되었다. 혼합물을 25℃에서 10분 동안 교반한 다음, 여과하였다. 케이크를 물(20mL x 5)로 세척하고 수집한 다음, 25℃에서 30분 동안 물(50mL)로 분쇄하고 여과하였다. 수집된 케이크를 물(20mL x 3)로 세척한 다음 CH3CN(50mL)으로 25℃에서 30분 동안 분쇄한 다음 여과하였다. 케이크를 CH3CN(20mL x 3)으로 세척하고 수집했다. 화합물 N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드 (3.960 g, 12.56 mmol, 86.31% 수율, 99.78% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 315.2 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 11.30 (s, 1H), 8.12 (d, J=8.2 Hz, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.01 (s, 1H), 6.65 (s, 1H), 3.70 (dt, J=8.2, 11.2 Hz, 1H), 2.43 (s, 3H), 2.37 - 2.30 (m, 3H), 1.98 (br d, J=9.6 Hz, 2H), 1.65 - 1.52 (m, 2H), 0.77 (br d, J=14.5 Hz, 2H), 0.61 (dt, J=4.7, 14.2 Hz, 2H), 0.09 (s, 3H), 0.06 - 0.00 (m, 3H).
실시예 13, MPL-324
N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(0.5 mL) 중 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산(30 mg, 100.96 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실레판-4-아민(23.48 mg, 121.15 umol, 1.2 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(0.5 mL) 중 EDCI(58.06 mg, 302.88 umol, 3 eq) 및 HOBt(40.93 mg, 302.88 umol, 3 eq) 용액을 첨가한 후 TEA(51.08) mg, 504.80 umol, 70.26 uL, 5 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 1시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 prep-HPLC(YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 11분에 걸쳐 75%-100% B 구배)에 의해 정제하였다. 화합물 N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드 (20.7 mg, 47.43 umol, 46.98% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI), m/z 437.1[M+H]+
1H NMR (500 MHz, DMSO-d 6) δ = ppm 12.53 (br s, 1 H) 8.63 (d, J=7.93 Hz, 1 H) 7.97 (s, 1 H) 7.61 (s, 1 H) 7.47 (s, 1 H) 3.79 - 3.95 (m, 1 H) 1.72 - 1.93 (m, 3 H) 1.58 - 1.69 (m, 1 H) 1.36 - 1.51 (m, 2 H) 0.65 - 0.79 (m, 2 H) 0.52 - 0.62 (m, 2 H) -0.01 (d, J=12.66 Hz, 6 H).
실시예 14, MPL-325
N-(1,1-디메틸실로칸-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(0.5 mL) 중 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산(30 mg, 100.96 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실로칸-4-아민(20.98 mg, 100.96 umol, 1 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(0.5 mL) 중 EDCI(58.06 mg, 302.88 umol, 3 eq) 및 HOBt(40.93 mg, 302.88 umol, 3 eq) 용액을 첨가한 후 TEA(51.08 mg, 504.80 umol, 70.26 uL, 5 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 1시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 11분에 걸쳐 75%-100% B 구배)로 정제했다. 화합물 N-(1,1-디메틸실로칸-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드 (21.8 mg, 47.72 umol, 47.27% 수율, 98.615% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI), m/z 451.0 [M+H]+; 1H NMR (500 MHz, DMSO-d 6) δ = 12.58 (s, 1 H) 8.61 (d, J=7.93 Hz, 1 H) 8.01 (s, 1H) 7.65 (s, 1 H) 7.53 (s, 1 H) 3.90 - 4.12 (m, 1 H) 1.31 - 1.94 (m, 8 H) 0.46 - 0.89 (m, 4 H) -0.12 - 0.16 (m, 6 H).
실시예 15, MPL-326
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1 mL) 중 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산(50 mg, 168.26 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실로칸-5-아민(28.83 mg, 168.26 umol, 1 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(1 mL) 중 EDCI(96.77 mg, 504.79 umol, 3 eq) 및 HOBt(68.21 mg, 504.79 umol, 3 eq)의 용액을 첨가한 후 TEA(85.13 mg, 841.32 umol, 117.10 uL, 5 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 1시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 구배: 11분에 걸쳐 78%-100% B)로 정제했다. prep-HPLC의 생성물은 prep-SFC(Sepiatec Prep SFC 100, 컬럼: DAICEL CHIRALPAK AD-H(250mm*30mm,5um); 이동상: A: IPA 중 0.1% NH3H2O; B: CO2, 구배: 15% B, 등용매)에 의해 더 정제하였다. 화합물 N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드(13.4 mg, 29.35 umol, 17.44% 수율, 98.656% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI), m/z 451.1 [M+H]+; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) ) δ = 0.24 - 0.23 (m, 6 H) 0.58 - 0.91 (m, 4 H) 1.65 (br s, 8 H) 4.07 (br s, 1 H) 7.50 (br s, 1 H) 7.65 (s, 1 H) 8.02 (s, 1 H) 8.71 (br d, J=7.82 Hz, 1 H) 12.58 (br s, 1 H).
실시예 16, MPL-327
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1 mL) 중 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산(30 mg, 100.96 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실로란-3-아민(16.73 mg, 100.96 umol, 1 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(1 mL) 중 EDCI(58.06 mg, 302.87 umol, 3 eq) 및 HOBt(40.92 mg, 302.87 umol, 3 eq) 용액을 첨가한 후 TEA(51.08 mg, 504.79 umol, 70.26 uL, 5 eq)를 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 1시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 구배: 11분에 걸쳐 66%-94% B)로 정제했다. 화합물 N-(1,1-디메틸실롤란-3-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드 (17.1 mg, 41.79 umol, 41.39% 수율, 99.81% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI), m/z 409.0 [M+H]+
1H NMR (500 MHz, DMSO-d 6) δ = 12.43 (br s, 1 H) 8.54 (br d, J=7.32 Hz, 1 H) 7.85 (br s, 1 H) 7.49 (br s, 1 H) 7.33 (br s, 1 H) 3.89 (br d, J=5.19 Hz, 1 H) 1.89 (br s, 1 H) 1.20 - 1.35 (m, 1 H) 0.96 (br dd, J=13.66, 6.03 Hz, 1 H) 0.64 (br dd, J=14.19, 6.56 Hz, 1 H) 0.49 (br t, J=12.74 Hz, 1 H) 0.30 - 0.41 (m, 1 H) 0.00 (s, 6 H).
실시예 17, MPL-334
반응식
1 단계. 에틸 4,6-디클로로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
EtOH(5 mL) 중 (3,5-디클로로페닐)히드라진(1 g, 4.68 mmol, 1 eq, HCl 염) 및 메틸 2-옥소부타노에이트(543.88 mg, 4.68 mmol, 1 eq)의 용액을 감압 하에 증발시켰다. EtOH(4.5 mL) 및 H2SO4(12 M, 0.5 mL, 98% 순도, 1.28 eq)를 첨가하고 혼합물을 80℃에서 24시간 동안 교반하였다. LCMS는 출발 물질이 완전히 소모되었음을 보여주었다. 반응물을 실온으로 냉각시키고 에틸 아세테이트(100mL)와 물(200mL) 사이에 분배하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100mL)로 추출하였다. 합한 유기 층을 포화 중탄산나트륨 용액으로 세척하고, 여과하고, 진공에서 농축하였다. 에틸 4,6-디클로로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(1.2g, 조 물질)를 갈색 고체로서 얻었고, 이를 추가 정제 없이 다음 단계에 사용하였다. 1H NMR을 기록하였다.
2 단계. 4,6-디클로로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
THF(12mL) 및 H2O(12mL) 중 에틸 4,6-디클로로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(1.2g, 4.41mmol, 1eq)의 용액에 LiOH.H2O(740.19mg, 17.64mmol, 4eq)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 50℃에서 12시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 진공에서 농축하고, 생성된 잔류물을 수성 HCl(6 M)을 사용하여 pH 4로 조정한 다음, 여과하였다. 케이크를 25℃에서 30분 동안 물(30mL)로 세척하고 여과하였다. 케이크를 수집하고 석유 에테르(20mL)로 세척했다. 4,6-디클로로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실산 (740 mg, 2.88 mmol, 65.32% 수율, 95% 순도)을 황색 고체로서 얻었다.
1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ = 13.298 (br, s, 1H), 11.855 (s, 1H), 7.365 (s, 1H), 7.134 (s, 1H), 2.764 (s, 3H).
3단계. 4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-3-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(3 mL) 중 4,6-디클로로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실산(100 mg, 409.71 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(88.38 mg, 491.65 umol, 1.2eq, HCl 염)의 용액에 DMF(3 mL) 중 HOBt(83.04 mg, 614.57 umol, 1.5 eq) 및 EDCI(117.81 mg, 614.57 umol, 1.5 eq) 용액을 첨가한 후 TEA(207.29 mg, 2.05 mmol, 285.13 uL, 5 eq)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 25℃에서 30분 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 반응 혼합물을 진공에서 농축하였다. 잔류물을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 11분에 걸쳐 85%-100% B 구배)로 정제했다. 4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-3-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드(25.7 mg, 69.58 umol, 16.98% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 369.1 [M+H]+
1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ = 11.64 (s, 1H), 7.94 (br d, J=7.8 Hz, 1H), 7.37 (d, J=1.7 Hz, 1H), 7.10 (d, J=1.7 Hz, 1H), 3.71 (dt, J=7.9, 10.7 Hz, 1H),2.65 (s, 3H), 2.01 (br d, J=10.0 Hz, 2H), 1.66 - 1.56 (m, 2H), 0.78 (br d, J=14.7 Hz, 2H), 0.60 (dt, J=4.6, 13.8 Hz, 2H), 0.07 (s, 6H).
실시예 18, MPL-335
반응식
1 단계. 에틸 4,6-디플루오로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
EtOH(2 mL) 중 (3,5-디플루오로페닐)히드라진(1 g, 5.54 mmol, 1 eq, HCl 염) 및 메틸 2-옥소부타노에이트(643.00 mg, 5.54 mmol, 1 eq)의 용액을 감압 하에 증발시켰다. EtOH(4.5mL) 및 H2SO4(12M, 0.5mL, 98% 순도, 1.08eq)를 첨가하고 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. LCMS는 출발 물질이 완전히 소모되었음을 보여주었다. 잔류물을 물(15 mL)에 붓고 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(10mL x 3)로 추출하였다. 합한 유기상을 염수(10mL x 2)로 세척하고, 무수 Na2SO4로 건조하고, 여과하고, 진공에서 농축하였다. 잔류물을 실리카겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 5:1)로 정제하였다. 에틸 4,6-디플루오로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(680 mg, 2.79 mmol, 50.31% 수율, 98% 순도)를 백색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
2 단계. 4,6-디플루오로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
THF(7 mL) 및 H2O(7 mL) 중 에틸 4,6-디플루오로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(680 mg, 2.84 mmol, 1 eq)의 용액에 LiOH.H2O(715.71mg, 17.06mmol, 6eq)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 50℃에서 12시간 동안 교반하였다. LCMS는 출발 물질이 완전히 소모되었음을 보여주었다. 용액을 진공에서 농축시켰다. 수성 HCl(6M)을 pH가 4가 될 때까지 잔류물에 첨가하였다. 혼합물을 여과하고 케이크를 수집하였다. 조 생성물을 25℃에서 30분 동안 물(30mL)로부터 재결정화에 의해 정제한 다음, 25℃에서 30분 동안 석유 에테르(20mL)로부터 재결정화에 의해 추가로 정제하였다. 4,6-디플루오로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실산(500 mg, 2.37 mmol, 83.30% 수율, 100% 순도)을 백색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
3단계. N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(2mL) 중 4,6-디플루오로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복실산(100 mg, 473.56 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(102.15 mg, 568.28 umol, 1.2eq, HCl)의 용액에 DMF(3mL) 중 HOBt(95.98mg, 710.35umol, 1.5eq) 및 EDCI(136.17mg, 710.35umol, 1.5eq)의 용액을 첨가한 후 TEA(239.60mg, 2.37mmol, 329.57uL, 5eq)를 첨가했다. 반응 혼합물을 25℃에서 5시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 반응 혼합물을 진공에서 농축하였다. 잔류물을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: ACN; 구배: 11분에 걸쳐 70%-97% B)로 정제했다. N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드(119.1 mg, 353.99 umol, 74.75% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 337.1 [M+H]+
1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ = 11.51 (s, 1H), 7.76 (br d, J=7.8 Hz, 1H), 7.00 (dd, J=2.0, 9.3 Hz, 1H), 6.83 - 6.75 (m, 1H), 3.74 - 3.66 (m, 1H), 2.56 (s,3H), 2.01 (br d, J=10.3 Hz, 2H), 1.65 - 1.54 (m, 2H), 0.77 (br d, J=14.7 Hz, 2H), 0.60 (dt, J=4.8, 13.9 Hz, 2H), 0.06 (d, J=17.1 Hz, 6H).
실시예 19, MPL-336
반응식
1 단계. N-[3,5-비스(트리플루오로메틸)페닐]-2,2-디메틸-프로판아미드의 합성
DCM(100mL) 중 3,5-비스(트리플루오로메틸)아닐린(10.49g, 45.78mmol, 7.09mL, 1eq) 및 TEA(9.27g, 91.57mmol, 12.74mL, 2eq)의 용액에 2,2-디메틸프로파노일 클로라이드(8.28g, 68.68mmol, 8.45mL, 1.5eq)를 0℃에서 적가하였다. 혼합물을 20℃에서 30분 동안 교반하였다. TLC는 출발 물질이 소모되었음을 보여준다. 반응을 포화 NaHCO3(200mL)로 켄칭하고 DCM(150mL x 2)으로 추출하였다. 유기층을 Na2SO4로 건조시키고 여과하고 감압하에 농축시켰다. 생성된 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-10% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 N-[3,5-비스(트리플루오로메틸)페닐]-2,2-디메틸-프로판아미드(14 g, 42.46 mmol, 92.74% 수율, 95% 순도)는 황색 고체로서 수득되었다. 1H NMR을 기록하였다.
2 단계. N-[2-요오도-3,5-비스(트리플루오로메틸)페닐]-2,2-디메틸-프로판아미드의 합성
THF(80mL) 중 N-[3,5-비스(트리플루오로메틸)페닐]-2,2-디메틸-프로판아미드(8g, 25.54mmol, 1eq) 및 TMEDA(5.94g, 51.08mmol, 7.71mL, 2eq)의 용액에 n-BuLi(n-헥산 중 2.5M, 25.54mL, 2.5eq)를 -78℃에서 N2하에 첨가하였다. 혼합물을 -78℃에서 30분 동안 교반하였다. 이어서, THF(20mL) 중 I2(7.78g, 30.65mmol, 6.17mL, 1.2eq)의 용액을 -78℃에서 30분 동안 교반하면서 첨가하였다. TLC는 출발 물질이 남아 있고 하나의 새로운 스폿이 형성되었음을 보여주었다. 혼합물을 포화 NH4Cl(200mL)로 켄칭하였다. 수성상을 EtOAc(100mL x 2)로 추출하였다. 합한 유기층을 Na2SO4로 건조시키고 여과하고 감압하에 농축하였다. 생성된 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-10% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 N-[2-요오도-3,5-비스(트리플루오로메틸)페닐]-2,2-디메틸-프로판아미드 (4.4 g, 9.52 mmol, 31.06% 수율, 95% 순도)를 황색 고체로서 얻었다.
3 단계. N-[3,5-비스(트리플루오로메틸)-2-(2-트리메틸실릴에티닐)페닐]-2,2-디메틸-프로판아미드의 합성
THF(60mL) 중 N-[2-요오도-3,5-비스(트리플루오로메틸)페닐]-2,2-디메틸-프로판아미드(4.4g, 10.02mmol, 1eq) 및 에티닐(트리메틸)실란(9.84g, 100.20 mL, 14.34 eq)의 용액에 THF(60mL) 및 TEA(14.54g, 143.69mmol, 20mL, 14.34eq)을 가하고 N2하에서 Pd(PPh3)2Cl2(703.28mg, 1.00mmol, 0.1eq) 및 CuI(190.83 mg, 1.00 mmol, 0.1 eq)를 가하였다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. TLC는 원하는 제품을 보여주었다. 혼합물을 여과하고 여액을 감압 하에 농축하였다. 생성된 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-10% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 N-[3,5-비스(트리플루오로메틸)-2-(2-트리메틸실릴에티닐)페닐]-2,2-디메틸-프로판아미드(2.8 g, 6.50 mmol, 64.84% 수율, 95% 순도)를 갈색 액체로서 얻었다. 화합물 N-[2-에티닐-3,5-비스(트리플루오로메틸)페닐]-2,2-디메틸-프로판아미드(500 mg, 1.41 mmol, 14.06% 수율, 95% 순도)를 갈색 액체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
4 단계. 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌의 합성
THF(28mL) 중 N-[3,5-비스(트리플루오로메틸)-2-(2-트리메틸실릴에티닐)페닐]-2,2-디메틸-프로판아미드(2.8g, 6.84mmol, 1eq)의 용액에 N2하에서 TBAF(THF 중 1M, 20.52mL, 3eq)를 첨가했다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. TLC는 출발 물질이 소모되었음을 보여주었다. 혼합물을 감압하에 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-20% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌(1.7 g, 6.38 mmol, 93.29% 수율, 95% 순도)을 황색 액체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
5 단계. 1-(p-톨릴설포닐)-4,6-비스(트리플루오로메틸)인돌의 합성
THF(10mL) 중 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌(1g, 3.95mmol, 1eq)의 용액에 NaH(237.00mg, 5.93mmol, 60% 순도, 1.5eq)를 0℃에서 30분 동안 교반하면서 첨가한 다음, TosCl(903.74 mg, 4.74 mmol, 1.2 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 0℃에서 30분 동안 교반하였다. TLC는 출발 물질이 소모되었음을 보여주었다. 혼합물을 포화 NH4Cl(20mL)에 붓고 EtOAc(20mL x 2)로 추출하였다. 합한 유기층을 Na2SO4로 건조시킨 후, 여과하고 감압하에 농축하였다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-100% 에틸 아세테이트)로 정제했다. 화합물 1-(p-톨릴설포닐)-4,6-비스(트리플루오로메틸)인돌(600 mg, 1.40 mmol, 35.42% 수율, 95% 순도)을 황색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
6 단계. 메틸 1-(p-톨릴술포닐)-4,6-비스(트리플루오로메틸)인돌-2-카르복실레이트의 합성
THF(10mL) 중 1-(p-톨릴설포닐)-4,6-비스(트리플루오로메틸)인돌(600mg, 1.47mmol, 1eq)의 용액에 LDA(2M, 1.10mL, 1.5eq)를 -60 ℃에서 N2 하에서 적가하였다. 혼합물을 -60℃에서 30분 동안 교반하였다. 이어서, 메틸 카르보노클로리데이트(694.55 mg, 7.35 mmol, 569.31 uL, 5 eq)(0.860 g)를 -60℃에서 30분 동안 교반하면서 상기 용액에 적가하였다. TLC는 출발 물질이 소모되었음을 보여주었다. 혼합물을 포화 NH4Cl(30mL)에 붓고 EtOAc(30mL x 2)로 추출하였다. 합한 유기층을 Na2SO4로 건조시키고 여과하고 감압하에 농축하였다. 생성된 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-10% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 메틸 1-(p-톨릴설포닐)-4,6-비스(트리플루오로메틸)인돌-2-카복실레이트(300 mg, 644.65 umol, 43.85% 수율)를 백색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
7단계. 메틸 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
THF(5 mL) 중 메틸 1-(p-톨릴설포닐)-4,6-비스(트리플루오로메틸)인돌-2-카르복실레이트(300 mg, 644.65 umol, 1 eq) 및 TBAF(THF 중 1 M, 773.59 uL, 1.2 eq)의 용액을 30℃에서 2시간 동안 교반하였다. TLC는 출발 물질이 소모되었음을 보여주었다. 혼합물을 감압 하에 농축하여 THF를 제거하였다. 잔류물을 30분 동안 초음파 처리하면서 물(10mL)에 부었다. 현탁액을 여과하였다. 필터 케이크를 물(10mL)로 세척하고 수집했다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-20% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 메틸 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트(100 mg, 321.36 umol, 49.85% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ = 9.47 (br, s, 1H), 7.95 (s, 1H), 7.71 (s, 1H), 7.45 (s, 1H), 4.01 (s, 3H).
8 단계. 메틸 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
THF(2.5mL) 중 메틸 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트(100mg, 321.36umol, 1eq)의 용액에 H2O(2.5mL) 중 LiOH.H2O(134.84mg, 3.21mmol, 10eq)의 용액을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. TLC는 출발 물질이 소모되었음을 보여주었다. 혼합물을 감압 하에 농축하여 THF를 제거하였다. 수용액을 수성 HCl(6 M)로 pH 2로 조정한 다음, 여과하여 고체를 수집하였다. 화합물 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산 (90 mg, 조 물질)을 백색 고체로서 수득하였다. 조 생성물을 정제 없이 다음 단계에 사용하였다.
9단계. N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(0.5 mL) 중 4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산(30 mg, 100.96 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(21.78 mg, 121.15 umol, 1.2 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(0.5 mL) 중 EDCI(58.06 mg, 302.87 umol, 3 eq) 및 HOBt(40.93 mg, 302.87 umol, 3 eq) 용액을 첨가한 후 TEA(51.08 mg, 504.79 umol, 70.26 uL, 5 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 1시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 구배: 11분에 걸쳐 70%-100% B)로 정제했다. 화합물 N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드 (24.1 mg, 57.05 umol, 56.51% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI), m/z 423.1[M+H]+
1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ = 12.51 (s, 1 H) 8.57 (d, J=8.24 Hz, 1 H) 7.93 (s, 1 H) 7.57 (s, 1 H) 7.41 (s, 1 H) 3.57 - 3.72 (m, 1 H) 1.86 - 2.01 (m, 2 H) 1.44 - 1.62 (m, 2 H) 0.68 (br d, J=14.50 Hz, 2 H) 0.53 (td, J=14.27, 4.73 Hz, 2 H) -0.12 - 0.05 (m, 6 H).
실시예 20, MPL-337
반응식
1 단계. 에틸 (Z)-2-아지도-3-(2-브로모-4-메틸-페닐)프로프-2-에노에이트의 합성
NaH(602.82 mg, 15.07 mmol, 60% 순도, 3 eq)를 N2 하에 배치(batch)로 EtOH(10 mL)에 첨가하였다. 혼합물을 투명한 용액이 형성될 때까지 20℃에서 교반한 다음 -10℃로 냉각시켰다. 이어서, THF(10mL) 중 2-브로모-4-메틸-벤즈알데히드(1g, 5.02mmol, 1eq) 및 에틸 2-아지도아세테이트(1.95g, 15.07mmol, 2.12mL, 3eq)의 용액을 적가하였다. 반응 혼합물을 -10℃ ~ 0℃에서 2시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르: 에틸 아세테이트=5:1)는 반응물이 소모되었고 하나의 주요 새로운 스폿이 형성되었음을 나타내었다. 반응을 포화 NH4Cl(30mL)로 켄칭한 다음, EtOAc(20mL x 2)로 추출하였다. 합한 유기 층을 염수(20mL x 2)로 세척하고, Na2SO4로 건조하고, 여과하고, 감압 하에 농축하였다. 생성된 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-10% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 에틸 (Z)-2-아지도-3-(2-브로모-4-메틸-페닐)프로프-2-에노에이트 (404 mg, 1.30 mmol, 25.93% 수율)를 황색 오일로서 얻었다.
2 단계. 에틸 4-브로모-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
크실렌(2 mL) 중 에틸 (Z)-2-아지도-3-(2-브로모-4-메틸-페닐)프로프-2-에노에이트(404 mg, 1.30 mmol, 1 eq)의 혼합물을 140℃에서 30분간 교반하였다. LCMS는 원하는 매스가 감지되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 감압하에 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-7% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 에틸 4-브로모-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(117 mg, 393.96 umol, 30.24% 수율, 95% 순도)를 황색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z: 283.9 [M+H]+
1H NMR을 기록하였다.
3 단계. 4-브로모-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
THF(2 mL) 중 에틸 4-브로모-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(117 mg, 414.70 umol, 1 eq)의 용액에 H2O(2mL) 중 LiOH.H2O(104.41mg, 2.49mmol, 6eq) 용액을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 매스가 감지되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 감압하에 농축하여 THF를 제거하였다. 수성 잔류물을 수성 HCl(1 N)로 pH를 3-4로 조정한 다음, 여과하였다. 필터 케이크를 석유 에테르(15 mL)로 세척하고 감압 하에 건조시켰다. 화합물 4-브로모-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실산(73 mg, 258.58 umol, 62.35% 수율, 90% 순도)을 백색 고체로서 얻었다. 조 생성물을 추가 정제 없이 다음 단계에 사용하였다.
LCMS(ESI) m/z: 255.9 [M+H]+
1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ = 13.11 (br s, 1H), 12.01 (br s, 1H), 7.27 - 7.06 (m, 2H), 6.92 (d, J=1.2 Hz, 1H), 2.39 (s, 3H).
4 단계. 4-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(2mL) 중 4-브로모-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실산(73 mg, 287.31 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(61.98 mg, 344.77 umol, 1.2 eq, HCl 염)에 DMF(1mL) 중 EDCI(165.23mg, 861.93umol, 3eq) 및 HOBt(116.47mg, 861.93umol, 3eq)의 용액을 첨가한 다음 TEA(174.44mg, 1.72mmol, 239.94uL, 6eq)를 첨가했다. 혼합물을 25℃에서 1시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 매스가 감지되었음을 나타내었다. 혼합물을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 구배: 11분에 걸쳐 75%-100% B)로 정제했다. 화합물 4-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드(32.3 mg, 85.14 umol, 29.63% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z: 381.0 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 11.76 (br s, 1H), 8.35 (br d, J=8.1 Hz, 1H), 7.20 (s, 1H), 7.12 (br d, J=10.1 Hz, 2H), 3.71 (br d, J=8.7 Hz, 1H), 2.37 (s, 3H), 1.98 (br d, J=10.2 Hz, 2H), 1.66 - 1.51 (m, 2H), 0.77 (br d, J=14.3 Hz, 2H), 0.61 (dt, J=4.0, 14.0 Hz, 2H), 0.13 - 0.04 (m, 6H).
실시예 21, MPL-338
반응식
1 단계. 에틸 (Z)-2-아지도-3-(4-브로모-2-메틸-페닐)프로프-2-에노에이트의 합성
NaH(1.81g, 45.22mmol, 60% 순도, 3eq)를 EtOH(20mL)에 배치로 첨가하였다. 혼합물을 투명한 용액이 형성될 때까지 30℃에서 교반한 다음 -10℃로 냉각시켰다. EtOH(20mL) 중 4-브로모-2-메틸-벤즈알데히드(3g, 15.07mmol, 1eq) 및 에틸 2-아지도아세테이트(5.84g, 45.22mmol, 6.35mL, 3eq)의 용액을 적가하였다. 반응 혼합물을 -10℃ ~ 0℃에서 2시간 동안 교반하였다. TLC는 하나의 새로운 스폿이 감지되었음을 보여주었다. 반응을 포화 NH4Cl(30 mL)로 켄칭한 다음, EtOAc(50 mL x 2)로 추출하였다. 합한 유기 층을 염수(50mL x 2)로 세척하고, Na2SO4로 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 화합물 에틸 (Z)-2-아지도-3-(4-브로모-2-메틸-페닐)프로프-2-에노에이트 (4 g, 조 물질)를 황색 고체로서 수득하였다. 조 생성물을 추가 정제 없이 다음 단계에 사용하였다.
2 단계. 에틸 6-브로모-4-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
크실렌(10 mL) 중 에틸(Z)-2-아지도-3-(4-브로모-2-메틸-페닐)프로프-2-에노에이트(4 g, 12.90 mmol, 1 eq)를 150℃에서 20분간 교반하였다. 이어서, 상기 혼합물을 실온으로 냉각시키고, 여과하여 케이크를 수집하였다. 화합물 에틸 6-브로모-4-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(990 mg, 3.33 mmol, 25.85% 수율, 95% 순도)를 황색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
3단계. 6-브로모-4-메틸-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
THF(2 mL) 중 에틸 6-브로모-4-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(100 mg, 354.44 umol, 1 eq)의 용액에 H2O(2 mL) 중 LiOH.H2O(59.49 mg, 1.42 mmol, 4 eq)를 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. TLC는 반응물이 완전히 소모되었고 하나의 새로운 스폿이 형성되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 감압하에 농축하여 THF를 제거하였다. 수성 잔류물을 수성 HCl(6M)을 사용하여 pH 2로 조정한 다음, 여과하였다. 필터 케이크를 감압 하에 건조시켰다. 화합물 6-브로모-4-메틸-1H-인돌-2-카르복실산(88 mg, 329.03 umol, 92.83% 수율, 95% 순도)을 백색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다. 조 생성물을 추가 정제 없이 다음 단계에 사용하였다.
4단계. 6-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1mL) 중 6-브로모-4-메틸-1H-인돌-2-카르복실산(88 mg, 346.35 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(74.71 mg, 415.62 umol, 1.2 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(1mL) 중 에 DMF(2mL) 중 HOBt(140.40mg, 1.04mmol, 3eq) 및 EDCI(199.19mg, 1.04mmol, 3eq)의 용액을 25℃에서 첨가한 다음, TEA(175.23mg, 1.73mmol, 241.04uL, 5eq)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 화합물이 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 구배: 11분에 걸쳐 70%-95% B)로 정제했다. . 화합물 6-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드(72.7 mg, 191.64 umol, 55.33% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 379.0 [M+H]+
1H NMR (500MHz, CHLOROFORM-d) δ = 9.55 (br s, 1H), 7.47 (s, 1H), 7.07 (s, 1H), 6.78 (d, J=1.5 Hz, 1H), 6.05 (br d, J=7.9 Hz, 1H), 4.04 - 3.84 (m, 1H), 2.62 - 2.46 (m, 3H), 2.22 (td, J=3.8, 9.4 Hz, 2H), 1.67 - 1.57 (m, 2H), 0.89 - 0.68 (m, 4H), 0.09 (d, J=17.4 Hz, 6H).
실시예 22, MPL-339
반응식
1 단계. 에틸 (Z)-2-아지도-3-[2-브로모-4-(트리플루오로메틸)페닐]프로프-2-에노에이트의 합성
NaH(1.58g, 39.52mmol, 60% 순도, 5eq)를 EtOH(30mL)에 배치로 첨가하였다. 혼합물을 투명한 용액이 형성될 때까지 교반한 다음, -10℃로 냉각시켰다. 2-브로모-4-(트리플루오로메틸)벤즈알데히드(2g, 7.90mmol, 1eq) 및 에틸 2-아지도아세테이트(5.10g, 39.52mmol, 5.55mL, 5eq)의 혼합물을 0℃ 미만의 온도에서 적가하였다. 혼합물을 0℃에서 2시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 매스를 보여주었다. TLC(석유 에테르:EtOAc = 20:1)는 출발 물질이 완전히 소모되었음을 나타내었다. 혼합물을 빙냉된 포화 NH4Cl(100mL)에 붓고, EtOAc(100mL x 2)로 추출하였다. 합한 유기층을 Na2SO4로 건조시키고, 여과하고, 농축하여 잔류물을 얻었고, 이를 플래시 실리카겔 크로마토그래피(석유 에테르 중 0-5% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 에틸 (Z)-2-아지도-3-[2-브로모-4-(트리플루오로메틸)페닐]프로프-2-에노에이트 (1.2 g, 1.98 mmol, 25.02% 수율, 60% 순도)를 밝은 황색 오일로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
2 단계. 에틸 4-브로모-6-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
크실렌 (10 mL) 중 에틸 (Z)-2-아지도-3-[2-브로모-4-(트리플루오로메틸)페닐]프로프-2-에노에이트 (1.2 g, 3.30 mmol, 1 eq)의 용액을 교반하고 150℃에서 0.5 시간 동안 환류하였다. TLC(석유 에테르: EtOAc = 10:1)는 반응이 지저분한 것으로 나타났다. 반응 용액을 서서히 10℃로 냉각시켰다. 반응 혼합물을 플래시 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르 중 0-15% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 에틸 4-브로모-6-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트(110 mg, 261.82 umol, 7.94% 수율, 80% 순도)를 밝은 황색 고체로 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
3단계. 4-브로모-6-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
EtOH(1 mL) 중 에틸 4-브로모-6-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트(110 mg, 327.28 umol, 1 eq)의 용액에 H2O(1 mL) 중 LiOH(47.03 mg, 1.96 mmol, 6 eq)의 용액을 첨가하였다. 혼합물을 60℃에서 12시간 동안 교반하였다. LCMS는 반응물 4가 완전히 소모되었음을 보여주었다. TLC(석유 에테르: EtOAc = 5:1)는 기준선에서 한 스폿을 보여주었다. 반응 혼합물을 감압하에 농축시켰다. 생성된 잔류물을 물(5 mL)로 희석하고 HCl(물 중 6M)로 pH를 3으로 조정하였다. 고체를 여과에 의해 수집하고 물(5 mL)로 세척하였다. 화합물 4-브로모-6-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산 (65 mg, 200.45 umol, 61.25% 수율, 95% 순도)을 연황색 고체로서 얻었다.
1H NMR (500 MHz, DMSO-d 6) δ = 12.54 (br s, 1H), 7.76 (s, 1H), 7.58 (s, 1H), 7.00 (s, 1H).
4단계. 4-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1 mL) 중 4-브로모-6-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산(60 mg, 194.77 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(42.01 mg, 233.72 umol, 1.2eq, HCl 염)의 용액에 DMF(1 mL) 중 EDCI(74.68 mg, 389.54 umol, 2 eq) 및 HOBt(52.64 mg, 389.54 umol, 2 eq) 용액을 첨가한 다음 TEA(78.83 mg, 779.08 umol, 108.44 uL, 4 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 2시간 동안 교반하였다. LCMS는 반응물 5가 완전히 소모되었고 원하는 매스를 갖는 하나의 주요 피크를 보여주었다. 혼합물을 맑은 용액이 형성될 때까지 MeOH(1.5mL)로 희석하고 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 구배: 11분에 걸쳐 75%-100% B)에 의해 정제하였다. 화합물 4-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드(29 mg, 66.52 umol, 34.15% 수율, 99.4% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 433.1 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 12.32 (s, 1H), 8.50 (d, J=8.2 Hz, 1H), 7.66 (s, 1H), 7.46 (s, 1H), 7.25 (s, 1H), 3.69 - 3.58 (m, 1H), 1.95 - 1.84 (m, 2H), 1.60 - 1.45 (m, 2H), 0.69 (br d, J=14.5 Hz, 2H), 0.53 (dt, J=4.7, 14.2 Hz, 2H), 0.00 (s, 3H), -0.06 (s, 3H).
실시예 23, MPL-340
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1 단계. 에틸 6-시아노-4-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
DMF(5 mL) 중 에틸 6-브로모-4-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(100 mg, 354.44 umol, 1 eq)의 혼합물에 Zn(CN)2 (62.43 mg, 531.66 umol, 33.75uL, 1.5eq)을 첨가하였다. 혼합물을 N2로 퍼지하고 이후 Pd(PPh3)4 (81.92 mg, 70.89 umol, 0.2 eq)를 N2하에 첨가하였다. 혼합물을 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 화합물이 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 여과하였다. 케이크를 EtOAc(10 mL x 2)로 세척하였다. 합한 여액을 EtOAc(20 mL)로 희석하고 수 중 3% LiCl(20 mL x 3)로 추출하였다. 합한 유기층을 염수(20mL x 3)로 세척하고, Na2SO4로 건조시킨 다음, 여과하고 감압 하에 농축하였다. 생성된 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-20% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 에틸 6-시아노-4-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(40 mg, 162.98 umol, 45.98% 수율, 93% 순도)를 백색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
2 단계. 6-시아노-4-메틸-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
THF(1 mL) 중 에틸 6-시아노-4-메틸-1H-인돌-2-카복실레이트(40 mg, 175.25 umol, 1 eq)의 용액에 H2O(1mL) 중 LiOH.H2O(44.12mg, 1.05mmol, 6eq)의 용액을 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. TLC는 극성이 더 높은 하나의 주요 새로운 스폿을 보여주었다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축하여 THF를 제거한 다음, HCl(물 중 6 M)로 pH를 2로 조정하고 여과하였다. 필터 케이크를 감압 하에 건조시켰다. 화합물 6-시아노-4-메틸-1H-인돌-2-카복실산(30 mg, 134.87 umol, 76.96% 수율, 90% 순도)을 백색 고체로서 얻었다. 조 생성물을 추가 정제 없이 다음 단계에 사용하였다.
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 13.49 - 13.27 (m, 1H), 12.32 (s, 1H), 7.71 (s, 1H), 7.24 (s, 1H), 7.21 (s, 1H), 2.56 - 2.53 (m, 3H)
3단계. 6-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1mL) 중 6-시아노-4-메틸-1H-인돌-2-카르복실산(30 mg, 149.86 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(29.63 mg, 164.84 umol, 1.1 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(1mL) 중 HOBt(60.75mg, 449.57umol, 3eq) 및 EDCI(86.18mg, 449.57umol, 3eq)의 용액을 교반하면서 첨가한 다음 TEA(75.82 mg, 749.28 umol, 104.29 uL, 5 eq)를 첨가했다. 혼합물을 25℃에서 2시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 화합물이 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 구배: 11분에 걸쳐 60%-90% B)로 정제했다. 화합물 6-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드(37.1 mg, 113.99 umol, 76.06% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 326.0 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d 6) δ = 12.05 (s, 1H), 8.44 (d, J=8.2 Hz, 1H), 7.68 (s, 1H), 7.32 (d, J=1.2 Hz, 1H), 7.17 (s, 1H), 3.80 - 3.65 (m, 1H), 2.52 (s, 3H), 2.05 - 1.93 (m, 2H), 1.67 - 1.52 (m, 2H), 0.78 (br d, J=14.5 Hz, 2H), 0.62 (dt, J=4.7, 14.1 Hz, 2H), 0.12 - 0.00 (m, 6H).
실시예 24, MPL-344
반응식
1 단계. 에틸 4-시아노-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
DMF(3 mL) 중 에틸 4-브로모-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(357mg, 1.27mmol, 1eq) 및 Zn(CN)2 (237.74mg, 2.02mmol, 128.51uL, 1.6eq)의 혼합물을 탈기하고 N2로 3회 퍼징한 다음, Pd(PPh3)4 (292.44 mg, 253.07 umol, 0.2 eq)를 첨가했다. 혼합물을 N2 분위기 하에 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르:에틸 아세테이트=5:1)는 반응물 1이 완전히 소모되었고 하나의 새로운 스폿이 형성되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 여과하여 여액을 얻었다. 잔류물을 에틸 아세테이트(30mL)로 희석하고 H2O(30mL x 2) 및 수 중 3% LiCl(30mL x 2)로 세척했다. 합한 유기층을 염수(30mL x 2)로 세척하고, Na2SO4로 건조시킨 다음, 여과하고 감압 하에 농축하였다. 생성된 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-100% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 에틸 4-시아노-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(84 mg, 349.62 umol, 27.63% 수율, 95% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
2 단계. 4-시아노-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
THF(2 mL) 중 에틸 4-시아노-6-메틸-1H-인돌-2-카복실레이트(84 mg, 368.02 umol, 1 eq)의 용액에 H2O(2mL) 중 LiOH.H2O(92.66mg, 2.21mmol, 6eq)의 용액을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 매스를 보여주었다. 반응 혼합물을 감압 하에서 농축하여 THF를 제거한 다음, HCl(수 중 6 N)로 pH를 3-4로 조정하고 여과하였다. 필터 케이크를 석유 에테르(15 mL)로 세척하고 감압 하에 건조시켰다. 화합물 4-시아노-6-메틸-1H-인돌-2-카복실산(57 mg, 256.25 umol, 69.63% 수율, 90% 순도)을 백색 고체로서 얻었다. 조 생성물을 추가 정제 없이 다음 단계에 사용하였다.
LCMS(ESI) m/z: 201.1 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 13.32 (br s, 1H), 12.30 (s, 1H), 7.56 (s, 1H), 7.50 (s, 1H), 7.06 (d, J=1.1 Hz, 1H), 2.44 (s, 3H).
3단계. 4-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(2 mL) 중 4-시아노-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실산(57 mg, 284.73 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(48.96 mg, 341.67 umol, 1.2 eq, HCl 염)에 DMF(0.5 mL) 중 EDCI(163.75 mg, 854.18 umol, 3 eq) 및 HOBt(115.42 mg, 854.18 umol, 3 eq)의 용액을 첨가한 후 TEA(172.87 mg, 1.71mmol, 237.78uL, 6eq)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 매스가 감지되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 여과하여 여액을 얻었고, 이를 prep-HPLC(컬럼: Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4um; 이동상: A: 수 중 0.05% HCl, B: CH3CN, 구배: 62%-82% B로 9분 동안))로 정제했다. 화합물 4-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드(12.3 mg, 37.79 umol, 13.27% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z: 326.1 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 12.04 (s, 1H), 8.43 (d, J=8.2 Hz, 1H), 7.53 (s, 1H), 7.43 (s, 1H), 7.35 (d, J=1.4 Hz, 1H), 3.77 - 3.67 (m, 1H), 2.42 (s, 3H), 2.04 - 1.95 (m, 2H), 1.65 - 1.54 (m, 2H), 0.78 (br d, J=14.5 Hz, 2H), 0.61 (dt, J=4.7, 14.2 Hz, 2H), 0.09 (s, 3H), 0.03 (s, 3H).
실시예 25, MPL-360
반응식
1 단계. 4-트리메틸실릴부트-3-인-2-온의 합성
AlCl3 (3.91g, 29.34mmol, 1.60mL, 1eq)를 DCM(30mL)에 현탁시키고 빙욕에서 냉각시켰다. DCM(60mL) 중 트리메틸(2-트리메틸실릴에티닐)실란(5g, 29.34mmol, 6.65mL, 1eq) 및 아세틸 클로라이드(2.30g, 29.34mmol, 2.09mL, 1eq)의 용액을 상기 현탁액에 40분에 걸쳐 추가 깔때기로부터 적가하였다. 암갈색-적색 용액을 0℃에서 30분 동안 교반하였다. 그 다음, 빙욕을 제거하였다. 혼합물을 15℃에서 50분 동안 교반하였다. TLC는 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 반응물을 0℃로 냉각시키고 수(75mL) 중 1N HCl을 천천히 첨가하여 켄칭하였다. 산성 용액을 DCM(2 x 150mL)으로 추출하였다. 합한 유기층을 Na2SO4로 건조시키고 여과하고 감압하에 농축하였다. 화합물 4-트리메틸실릴부트-3-인-2-온(4g, 27.09mmol, 92.33% 수율, 95% 순도)을 갈색 액체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
2 단계. 4-트리메틸실릴부탄-2-온의 합성
펜탄(10mL) 중 4-트리메틸실릴부트-3-인-2-온(1g, 7.13mmol, 1eq)의 용액에 Pd/C(0.1g, 93.97umol, 10% 순도, 1.32e-2 eq)를 N2 하에서 첨가하였다. 상기 현탁액을 진공하에 탈기하고 H2로 여러 번 퍼징하였다. 혼합물을 H2(15psi) 하에 10℃에서 12시간 동안 교반하였다. 1H NMR은 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 반응 혼합물을 여과하였다. 필터 케이크를 MeOH(10 mL)로 세척하였다. 여액을 합하였다. 화합물 4-트리메틸실릴부탄-2-온(1.03g, 조 물질)을 MeOH 및 펜탄에서 황색 액체로서 얻었고, 이를 다음 단계에 직접 사용했다.
3단계. 4-트리메틸실릴부탄-2-아민의 합성
NH3·MeOH(7 M, 10.20 mL, 5 eq)를 이전 단계로부터의 MeOH 및 펜탄 중 4-트리메틸실릴부탄-2-온(2.06 g, 14.28 mmol, 1 eq) 용액에 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서, NaBH(OAc)3(6.05g, 28.55mmol, 2eq)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. TLC는 새로운 스폿이 형성되었음을 보여주었다. 혼합물을 빙수(20 mL)로 켄칭하고 감압 하에 농축하여 유기 용매를 제거하였다. 수용액을 DCM과 MeOH의 혼합 용매(10:1, 20mL x 2)로 추출하였다. 합한 유기층을 Na2SO4로 건조시키고 여과하였다. MeOH 중 HCl(4 M, 20 mL)을 여액에 첨가하고 감압 하에 농축하여 용매를 제거하였다. 생성된 잔류물을 초음파 처리하면서 30분 동안 EtOAc(20 mL)로 분쇄(triturate)하였다. 화합물 4-트리메틸실릴부탄-2-아민(400 mg, 2.09 mmol, 14.64% 수율, 95% 순도, HCl)을 백색 고체로서 얻었다.
1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ=-0.07-0.09 (m, 9H), 0.41-0.56 (m, 2H), 1.16-1.18 (m, 3H), 1.35-1.50 (m, 1H), 1.53-1.68 (m, 1H), 2.51 (br s, 4H), 3.03 (sxt, J=6.47 Hz, 1H), 8.03 (br s, 3H)
단계 4: 4,6-디클로로-N-(1-메틸-3-트리메틸실릴-프로필)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(0.5 mL) 중 4,6-디클로로-1H-인돌-2-카르복실산(50 mg, 217.35 umol, 1 eq) 및 4-트리메틸실릴부탄-2-아민(37.90 mg, 260.82 umol, 1.2 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(0.5 mL) 중 EDCI(62.50 mg, 326.02 umol, 1.5 eq) 및 HOBt(44.05 mg, 326.02 umol, 1.5 eq)의 용액을 첨가한 다음 TEA(131.96 mg, 1.30mmol, 181.51uL, 6eq)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 생성물이 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 여과하고 여액을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 구배: 80%-100% B 11분 동안). 화합물 4,6-디클로로-N-(1-메틸-3-트리메틸실릴-프로필)-1H-인돌-2-카르복사미드(38.7 mg, 107.11 umol, 49.28% 수율, 98.9% 순도)를 황색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI), m/z 357.1[M+H]+
1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ ppm 0.00 (s, 9 H) 0.37 - 0.63 (m, 2 H) 1.17 (d, J=6.56 Hz, 3 H) 1.36 - 1.65 (m, 2 H) 3.96 (dt, J=14.08, 7.08 Hz, 1 H) 7.24 (d, J=1.37 Hz, 1 H) 7.32 (s, 1 H) 7.42 (s, 1 H) 8.39 (d, J=8.39 Hz, 1 H) 12.07 (br s, 1 H).
실시예 26, MPL-383
반응식
1 단계. 4-플루오로-2-이소프로폭시-벤즈알데히드의 합성
DMF(20mL) 중 4-플루오로-2-하이드록시-벤즈알데히드(2g, 14.27mmol, 1eq)의 용액에 K2CO3(3.95g, 28.55mmol, 2eq) 및 2-브로모프로판(3.51g, 28.55mmol, 2.68mL, 2eq)을 첨가하였다. 상기 혼합물을 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르:에틸 아세테이트=5:1)는 새로운 스폿이 형성된 것으로 나타났다. 혼합물을 물과 EtOAc(100mL)의 혼합물에 부었다. 수성층과 유기층을 분리하였다. 수성 층을 EtOAc(2 x 50 mL)로 추출하였다. 합한 유기층을 Na2SO4로 건조시킨 다음, 여과하고 농축하였다. 생성된 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-3% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 4-플루오로-2-이소프로폭시-벤즈알데히드(2.23g, 11.62mmol, 81.42% 수율, 95% 순도)를 백색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
2 단계. 에틸 (Z)-2-아지도-3-(4-플루오로-2-이소프로폭시-페닐)프로프-2-에노에이트의 합성
NaH(1.51g, 37.87mmol, 60% 순도, 3eq)를 N2 하에 배치로 EtOH(10mL)에 첨가하였다. 혼합물을 투명한 용액이 형성될 때까지 20℃에서 교반한 다음 -10℃로 냉각시켰다. 이어서, THF(20mL) 중 4-플루오로-2-이소프로폭시-벤즈알데히드(2.3g, 12.62mmol, 1eq) 및 에틸 2-아지도아세테이트(4.89g, 37.87mmol, 5.32mL, 3eq)의 용액을 적가하였다. 반응 혼합물을 -10℃ ~ 0℃에서 2시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르:에틸 아세테이트=3:1)는 화합물 3이 완전히 소모되었고 하나의 새로운 스폿이 형성된 것으로 나타났다. 반응을 HCl(수 중 1N, 60mL)로 켄칭한 다음, EtOAc(50mL x 2)로 추출했다. 합한 유기 층을 염수(30mL x 2)로 세척하고, Na2SO4로 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 생성된 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-10% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 에틸(Z)-2-아지도-3-(4-플루오로-2-이소프로폭시-페닐)프로프-2-에노에이트(2.4g, 4.09mmol, 32.41% 수율, 50% 순도)를 황색 고체로서 얻었는데, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 사용했다.
3단계. 에틸 6-플루오로-4-이소프로폭시-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
크실렌(5 mL) 중 에틸(Z)-2-아지도-3-(4-플루오로-2-이소프로폭시-페닐)프로프-2-에노에이트(945.66 mg, 3.22 mmol, 1 eq)의 용액을 150℃에서 30분간 교반하였다. LCMS는 원하는 매스를 보여주었다. 반응 혼합물을 감압하에 농축하여 용매를 제거하였다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르 중 0-2% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 에틸 6-플루오로-4-이소프로폭시-1H-인돌-2-카르복실레이트(602 mg, 2.16 mmol, 66.86% 수율, 95% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z: 266.1 [M+H]+
1H NMR을 기록하였다.
4단계. 6-플루오로-4-이소프로폭시-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
THF(3 mL) 중 에틸 6-플루오로-4-이소프로폭시-1H-인돌-2-카르복실레이트(600 mg, 2.26 mmol, 1 eq)의 용액에 H2O(3mL) 중 LiOH.H2O(569.47mg, 13.57mmol, 6eq)의 용액을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 가열하였다. LCMS는 원하는 매스를 보여주었다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축하여 THF를 제거한 다음, HCl(수 중 6 N)로 pH를 3-4로 조정하고 여과하였다. 필터 케이크를 석유 에테르(30 mL)로 세척하고 및 감압 하에 건조하였다. 화합물 6-플루오로-4-이소프로폭시-1H-인돌-2-카르복실산(480 mg, 1.92 mmol, 84.99% 수율, 95% 순도)을 백색 고체로서 얻었는데, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 사용했다.
LCMS(ESI) m/z: 238.1 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 12.84 (br s, 1H), 11.79 (br s, 1H), 6.98 (d, J=1.5 Hz, 1H), 6.68 (d, J=8.4 Hz, 1H), 6.48 (dd, J=1.7, 12.2 Hz, 1H), 4.74 (spt, J=6.0 Hz, 1H), 1.33 (d, J=6.1 Hz, 6H).
5단계. N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-이소프로폭시-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(2mL) 중 6-플루오로-4-이소프로폭시-1H-인돌-2-카르복실산(50 mg, 210.77 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(45.47 mg, 252.92 umol, 1.2 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(1mL) 중 EDCI(121.21mg, 632.31umol, 3eq) 및 HOBt(85.44mg, 632.31umol, 3eq)의 용액을 첨가한 다음 TEA(127.96mg, 1.26mmol, 176.02uL, 6eq)를 첨가했다. 혼합물을 25℃에서 1시간 동안 교반하였다. LCMS는 원하는 매스를 보여주었다. 반응 혼합물을 여과하여 여액을 얻었고, 이를 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 구배: 11분에 걸쳐 62%-92% B)로 정제했다. 화합물 N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-이소프로폭시-1H-인돌-2-카르복사미드(47.1 mg, 129.93 umol, 61.64% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z: 363.1 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 11.52 (s, 1H), 8.19 (d, J=8.2 Hz, 1H), 7.19 (d, J=1.8 Hz, 1H), 6.68 (dd, J=1.4, 9.5 Hz, 1H), 6.44 (dd, J=1.8, 12.3 Hz, 1H), 4.75 (spt, J=6.0 Hz, 1H), 3.73 - 3.61 (m, 1H), 2.01 - 1.90 (m, 2H), 1.63 - 1.51 (m, 2H), 1.33 (d, J=6.0 Hz, 6H), 0.76 (br d, J=14.6 Hz, 2H), 0.59 (dt, J=4.7, 14.2 Hz, 2H), 0.12 - -0.02 (m, 6H).
실시예 27, MPL-384
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1 단계. 4-플루오로-2-(2-메톡시에톡시)벤즈알데히드의 합성
DMF(6mL) 중 4-플루오로-2-히드록시-벤즈알데히드(0.5g, 3.57mmol, 1eq) 용액에 K2CO3(1.48g, 10.71mmol, 3eq)를 첨가한 다음 1-브로모-2-메톡시-에탄(744.00mg, 5.35mmol, 502.70uL, 1.5eq)을 첨가하였다. 혼합물을 60℃에서 24시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르: EtOAc = 5:1)는 반응물 1이 완전히 소모되었고 하나의 새로운 스폿이 형성된 것으로 나타났다. 혼합물을 물(50mL)에 붓고 EtOAc(20mL x 3)로 추출하였다. 합한 유기층을 LiCl(수 중 3%, 20mL x 2)로 세척하고, Na2SO4로 건조하고, 여과하고, 감압하에 농축하여 잔류물을 얻었고, 이를 플래시 실리카겔 크로마토그래피(석유 에테르 중 0-25% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 4-플루오로-2-(2-메톡시에톡시)벤즈알데히드(695 mg, 3.33 mmol, 93.35% 수율, 95% 순도)를 무색 오일로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
2 단계. 에틸 (Z)-2-아지도-3-[4-플루오로-2-(2-메톡시에톡시)페닐]프로프-2-에노에이트의 합성
EtOH(10mL)를 N2로 퍼징된 온도계가 장착된 잘 건조된 3구 플라스크에 넣고 NaH(701.28mg, 17.53mmol, 60% 순도, 5eq)를 배치로 첨가했다. 혼합물을 투명한 용액이 형성될 때까지 교반하였다. 이어서, 혼합물을 -10℃로 냉각하고, THF(2 mL) 중 4-플루오로-2-(2-메톡시에톡시)벤즈알데히드(695 mg, 3.51 mmol, 1 eq) 및 에틸 2-아지도아세테이트(2.26 g, 17.53 mmol, 2.46 mL, 5 eq)의 용액을 0℃ 미만의 온도에서 적가하였다. 반응 용액을 0℃에서 2시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르: EtOAc = 5:1)는 하나의 새로운 스폿이 형성되었음을 나타내었다. 혼합물을 포화 NH4Cl(30mL)에 부은 다음, EtOAc(15mL x 2)로 추출하였다. 합한 유기 층을 Na2SO4로 건조시킨 다음, 여과하고 감압 하에 농축하여 잔류물을 수득하고 이를 플래시 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르 중 0-15% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 에틸 (Z)-2-아지도-3-[4-플루오로-2-(2-메톡시에톡시)페닐]프로프-2-에노에이트 (720 mg, 2.21 mmol, 63.06% 수율, 95% 순도)를 밝은 황색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
3단계. 에틸 6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
크실렌(10 mL) 중 에틸 (Z)-2-아지도-3-[4-플루오로-2-(2-메톡시에톡시)페닐]프로프-2-에노에이트(720 mg, 2.33 mmol, 1 eq)의 용액을 150 ℃에서 20분간 가열하였다. TLC(석유 에테르:EtOAc = 5:1)는 출발 물질이 완전히 소모되었고 하나의 새로운 스폿이 형성되었음을 보여주었다. 반응 혼합물을 서서히 20℃로 냉각시킨 후, 여과하였다. 필터 케이크를 크실렌(5mL x 2)으로 세척하고 수집했다. 화합물 에틸 6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복실레이트(400 mg, 1.35 mmol, 58.03% 수율, 95% 순도)를 백색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
4단계. 6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
EtOH(3 mL) 중 에틸 6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복실레이트(400 mg, 1.42 mmol, 1 eq)의 용액에 NaOH(3 M, 2.85 mL, 6.01 eq) (eq.)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르: EtOAc = 5:1)는 출발 물질이 완전히 소모되었고 하나의 새로운 스폿이 형성된 것으로 나타났다. 혼합물을 감압 하에 농축하여 EtOH를 제거한 다음, HCl(수 중 3N)을 첨가하여 pH를 4로 조정하였다. 생성물을 여과에 의해 수집하였다. 화합물 6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복실산 (290 mg, 1.09 mmol, 76.51% 수율, 95% 순도)을 백색 고체로서 얻었다.
1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) = 12.90 (br s, 1H), 11.85 (br s, 1H), 7.01 (d, J=1.5 Hz, 1H), 6.73 (d, J=9.5 Hz, 1H), 6.50 (dd, J=1.9, 12.1 Hz, 1H), 4.29 - 4.19 (m, 2H), 3.74 (dd, J=3.7, 5.3 Hz, 2H), 3.36 (s, 3H).
5단계. N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1 mL) 중 6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복실산(70 mg, 276.43 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(59.63 mg, 331.72 umol, 1.2 eq, HCl)의 용액에 DMF(1 mL) 중 EDCI(105.99 mg, 552.87 umol, 2 eq) 및 HOBt(74.70 mg, 552.87 umol, 2 eq) 용액을 첨가한 후 TEA (111.89 mg, 1.11 mmol, 153.90 uL, 4 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 2시간 동안 교반하였다. LCMS는 반응물 7이 완전히 소모되었고 원하는 매스를 갖는 하나의 주요 피크가 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 여과하여 불용성 물질을 제거하였다. 여액을 prep-HPLC(컬럼: Phenomenex luna C18 100*40mm*3 um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 구배: 11분에 걸쳐 52%-82% B)로 정제했다. 화합물 N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복사미드(71.3 mg, 187.54 umol, 67.84% 수율, 99.56% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 379.3 [M+H]+
1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) = 11.48 (d, J=1.5 Hz, 1H), 8.14 (d, J=8.3 Hz, 1H), 7.15 (d, J=1.8 Hz, 1H), 6.63 (dd, J=1.4, 9.6 Hz, 1H), 6.37 (dd, J=1.9, 12.1 Hz, 1H), 4.17 - 4.08 (m, 2H), 3.67 - 3.55 (m, 3H), 3.26 (br s, 3H), 1.94 - 1.82 (m, 2H), 1.56 - 1.42 (m, 2H), 0.68 (br d, J=14.5 Hz, 2H), 0.51 (dt, J=4.8, 14.1 Hz, 2H), 0.02 - -0.08 (m, 6H).
실시예 28, MPL-399, MPL-399A 및 MPL-399B
4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드; (R)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실롤란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드 및 (S)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실롤란 -3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1 mL) 중 4,6-디클로로-1H-인돌-2-카르복실산(30 mg, 130.41 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실로란-3-아민(23.77 mg, 143.45 umol, 1.1 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(1 mL) 중 EDCI(50.00 mg, 260.82 umol, 2 eq) 및 HOBt(35.24 mg, 260.82 umol, 2 eq) 용액을 첨가한 후 TEA(52.78 mg, 521.63 umol, 72.60uL, 4eq)을 첨가하였다. 상기 혼합물을 20℃에서 2시간 동안 교반하였다. LC-MS는 원하는 매스를 가진 하나의 주요 피크를 보여주었다. 혼합물을 MeOH(2 mL)로 희석하고 여과하여 불용성 물질을 제거하였다. 여액을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN; 구배: 11분에 걸쳐 70%-100% B)로 정제했다. 화합물 4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드(24.3 mg, 69.92 umol, 53.62% 수율, 98.213% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 340.9 [M+H]+
1H NMR (400MHz, DMSO-d 6) δ = 11.86 (br s, 1H), 8.33 (d, J=7.6 Hz, 1H), 7.23 (d, J=0.7 Hz, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.04 (d, J=1.7 Hz, 1H), 3.93 - 3.79 (m, 1H), 1.90 - 1.80 (m, 1H), 1.26 (dq, J=7.2, 12.2 Hz, 1H), 0.98 - 0.89 (m, 1H), 0.69 - 0.58 (m, 1H), 0.48 (dd, J=11.4, 14.1 Hz, 1H), 0.41 - 0.29 (m, 1H), 0.00 (s, 6H).
동일한 반응을 나중에 347.75 umol 규모로 수행하였다. 라세미체 MPL-399는 SFC(Berger MG II, 컬럼: Phenomenex-Cellulose-2(250mm*30mm,5um), 이동상: A: EtOH 중 0.1% NH3H2O, B CO2, 구배 15% B, 등용매 , 유속: 60mL/분)로 정제하여 2개의 피크(2개의 엔안티오머), (R)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실롤란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드 및 (S)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드를 제공하였다.
피크 1 (MPL-399A): 30.2 mg, 88.48 umol, 25.44% 수율, 100% 순도.
LCMS(ESI) m/z 341.1 [M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 12.03 (br s, 1H), 8.50 (d, J=7.8 Hz, 1H), 7.44 - 7.38 (m, 1H), 7.29 (s, 1H), 7.22 (d, J=1.7 Hz, 1H), 4.10 - 3.97 (m, 1H), 2.09 - 1.99 (m, 1H), 1.44 (dq, J=7.1, 12.1 Hz, 1H), 1.16 - 1.06 (m, 1H), 0.86 - 0.76 (m, 1H), 0.66 (dd, J=11.3, 14.2 Hz, 1H), 0.59 - 0.47 (m, 1H), 0.18 (s, 6H).
피크 2 (MPL-399B): 31.8 mg, 91.31 umol, 26.26% 수율, 98% 순도.
LCMS(ESI) m/z 341.1 [M+H]+; 1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ = 12.03 (s, 1H), 8.50 (d, J=7.8 Hz, 1H), 7.41 (d, J=0.8 Hz, 1H), 7.29 (d, J=1.5 Hz, 1H), 7.22 (d, J=1.7 Hz, 1H), 4.10 - 3.97 (m, 1H), 2.09 - 1.99 (m, 1H), 1.44 (dq, J=7.2, 12.2 Hz, 1H), 1.17 - 1.06 (m, 1H), 0.81 (dd, J=6.5, 14.0 Hz, 1H), 0.66 (dd, J=11.3, 14.2 Hz, 1H), 0.53 (ddd, J=7.9, 12.7, 14.5 Hz, 1H), 0.22 - 0.13 (m, 6H).
MPL-399A 및 MPL-399B도 분석 SFC로 분석했다.
조건:
기기: PDA 검출기가 있는 Waters UPCC
컬럼: 셀룰로오스 2 150mm x 4.6mm, 5 um 입자 크기.
이동상: A: CO2, B: IPA 중 0.05% DEA
구배: 5분 동안 B의 5% 내지 40% 및 2.5분 동안 40% B를 유지한 다음, 2.5분 동안 5% B 유지.
유속: 2.5mL/분.
컬럼 온도: 35℃
ABPR: 1500psi
MPL-399A: 체류 시간, 4.13분; 100%ee; MPL-399B: 체류 시간, 4.35분; 89.4%ee
실시예 29, MPL-400
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1 mL) 중 4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복실산(30 mg, 152.18 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실로란-3-아민(27.74 mg, 167.40 umol, 1.1 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(1 mL) 중 EDCI(58.34 mg, 304.36 umol, 2 eq) 및 HOBt(41.12 mg, 304.36 umol, 2 eq) 용액을 첨가한 후 TEA(61.60 mg, 608.71 umol, 84.73uL, 4eq)을 첨가하였다. 상기 혼합물을 20℃에서 2시간 동안 교반하였다. LC-MS는 반응물 1이 완전히 소모되었고 원하는 매스를 갖는 하나의 주요 피크가 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 MeOH(2 mL)로 희석하고 여과하여 불용성 물질을 제거하였다. 여액을 prep-HPLC(컬럼: YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN, 구배: 11분에 걸쳐 62%-92% B)로 정제했다. 화합물 N-(1,1-디메틸실롤란-3-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드 (33.2 mg, 106.75 umol, 70.15% 수율, 99.158% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 309.0 [M+H]+
1H NMR (400MHz, DMSO-d 6) δ = 11.76 (br s, 1H), 8.17 (br d, J=7.6 Hz, 1H), 7.08 (d, J=1.2 Hz, 1H), 6.84 (dd, J=1.3, 9.4 Hz, 1H), 6.69 (dt, J=2.1, 10.5 Hz,1H), 3.85 (dq, J=6.6, 11.7 Hz, 1H), 1.92 - 1.81 (m, 1H), 1.26 (dq, J=7.2, 12.1 Hz, 1H), 0.98 - 0.87 (m, 1H), 0.68 - 0.58 (m, 1H), 0.47 (dd, J=11.2, 14.2 Hz, 1H), 0.41 - 0.30 (m, 1H), 0.00 (d, J=1.0 Hz, 6H).
실시예 30, MPL-385
반응식
1 단계. 메틸 (Z)-2-아지도-3-[4-브로모-2-(트리플루오로메틸)페닐]프로프-2-에노에이트의 합성
NaH(3.95g, 98.81mmol, 60% 순도, 5eq)를 0℃에서 MeOH(30mL)의 용액에 첨가하였다. 반응 혼합물을 0℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 이어서, THF(20mL) 중 4-브로모-2-(트리플루오로메틸) 벤즈알데히드(5g, 19.76mmol, 1eq) 및 에틸 2-아지도아세테이트(12.76g, 98.81mmol, 13.87mL, 5eq)의 용액을 첨가하였다. 반응 혼합물을 0℃에서 1시간 동안 교반하였다. TLC는 극성이 낮은 하나의 주요 새로운 스폿을 보여주었다. 반응 혼합물을 0℃에서 포화 NH4Cl(50) mL로 켄칭한 다음, EtOAc(50 mL x 2)로 추출하였다. 합한 유기층을 Na2SO4로 건조시킨 후, 여과하고 감압하에 농축하였다. 잔류물을 플래시 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르 중 0-30% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 메틸 (Z)-2-아지도-3-[4-브로모-2-(트리플루오로메틸)페닐]프로프-2-에노에이트 (6.9 g, 조물질)를 황색 오일로서 수득하였다.
2 단계. 메틸 6-브로모-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
크실렌(20mL) 중 메틸(Z)-2-아지도-3-[4-브로모-2-(트리플루오로메틸)페닐]프로프-2-에노에이트(6.9g, 19.71mmol, 1eq)의 혼합물을 탈기하고 N2로 3회 퍼징한 후, N2 분위기에서 150℃에서 1시간 동안 교반하였다. TLC는 극성이 더 높은 하나의 주요 새로운 스폿을 보여주었다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시키고 여과하였다. 여액을 플래시 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르 중 0-20% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 메틸 6-브로모-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트(230 mg, 678.41 umol, 3.44% 수율, 95% 순도)를 황색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
3단계. 메틸 6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
디옥산(10 mL) 및 H2O(0.1mL) 중 메틸 6-브로모-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트(230 mg, 714.11 umol, 1eg) 및 메틸보론산(128.24 mg, 2.14 umol, 3eg)의 용액에 Pd(dppf)Cl2(104.50mg, 142.82umol, 0.2eq) 및 K2CO3(296.09mg, 2.14mmol, 3eq)를 첨가했다. 혼합물을 N2하에 110℃에서 12시간 동안 교반하였다. LC-MS는 원하는 매스가 감지되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 감압하에 농축시켰다. 잔류물을 플래시 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르 중 0-30% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 메틸 6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트(120 mg, 443.22 umol, 62.07% 수율, 95% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z: 258.0 [M+H]+
1H NMR (500MHz, METHANOL-d4) δ = 7.51 (s, 1H), 7.30 (s, 1H), 7.20 (d, J=1.5 Hz, 1H), 3.96 (s, 3H).
4단계. 6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
THF(3 mL) 중 메틸 6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실레이트(120 mg, 466.55 umol, 1 eq)의 용액에 H2O(3mL) 중 LiOH.H2O(156.62mg, 3.73mmol, 8eq) 용액을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 5시간 동안 교반하였다. LC-MS는 원하는 매스가 감지되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 20 ml의 H2O로 희석하고 수 중 3 M HCl로 pH를 4로 조정한 다음, EtOAc mL(30 mL x 2)로 추출하였다. 합한 유기층을 Na2SO4로 건조시킨 후, 여과하고 감압하에 농축하였다. 화합물 6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산 (90 mg, 296.08 umol, 63.46% 수율, 80% 순도)을 황색 고체로서 얻었다. 조 생성물을 정제 없이 다음 단계에 사용하였다.
LCMS(ESI) m/z: 244.1 [M+H]+
5단계. N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(2mL) 중 6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산(90 mg, 370.09 umol, 1 eq), 1,1-디메틸실리난-4-아민(66.53 mg, 370.09 umol, 1eq, HCl 염)의 용액에 HOBt(150.02mg, 1.11mmol, 3eq) 및 EDCI(212.84mg, 1.11mmol, 3eq) 및 TEA(224.70mg, 2.22mmol, 309.07당량, 6 eq)를 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 16시간 동안 교반하였다. LC-MS는 원하는 매스가 감지되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 prep-HPLC(컬럼: Phenomenex Synergi C18 150x30mmx4um; 이동상: A: 수 중 0.05% HCl, B: CH3CN; 구배: 9분에 걸쳐 69%-89% B)에 의해 정제하였다. 화합물 N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드 (23.1 mg, 61.30 umol, 16.56% 수율, 97.78% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z: 369.1 [M+H]+
1H NMR (400 MHz, METHANOL-d 4) δ = 7.43 (s, 1H), 7.19 (s, 2H), 3.74 (br t, J=11.5 Hz, 1H), 2.14 - 2.02 (m, 2H), 1.71 - 1.55 (m, 2H), 0.86 - 0.74 (m, 2H), 0.72 - 0.59 (m, 2H), 0.08 (s, 3H), 0.00 (s, 3H).
실시예 31, MPL-386
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(2 mL) 중 6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복실산(50 mg, 205.61 umol, 1.42 eq), 1,1-디메틸실로칸-5-아민(30 mg, 144.36 umol, 1 eq, HCl 염)의 용액에 HOBt(58.52 mg, 433.08 umol, 3 eq) 및 EDCI(83.02 mg, 433.08 umol, 3 eq) 및 TEA(87.65 mg, 866.15,56 umol, 120.56μl, 6eq)를 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 1시간 동안 교반하였다. LC-MS는 원하는 매스가 감지되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 H2O(30 mL)로 희석하고 EtOAc mL(30 mL x 3)로 추출하였다. 합한 유기층을 포화 NaHCO3(30mL x 2) 및 5% LiCl(30mL x 2)로 세척하고, Na2SO4로 건조시킨 다음, 여과하고 감압 하에 농축하였다. 잔류물을 prep-HPLC(컬럼: Phenomenex Synergi C18 150 x 30mm x 4um; 이동상: A: 수 중 0.05% HCl, B: CH3CN, 구배: 9분에 걸쳐 78%-98% B)에 의해 정제하였다. prep-HPLC에서 분리된 생성물은 SFC(Sepiatec Prep SFC 100, 컬럼: DAICEL CHIRALPAK AD-H(250mm*30mm, 5um), 이동상: IPA 중 0.1%NH3H2O, B: CO2, 25% B 등용매 ; 유속: 60mL/분). 화합물 N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드 (7.7 mg, 19.40 umol, 15.39% 수율, 99.923% 순도)를 다음과 같이 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z: 397.1 [M+H]+
1H NMR (400 MHz, METHANOL-d 4) δ = 7.49 (s, 1H), 7.24 (br s, 2H), 4.21 (br s, 1H), 2.49 (s, 3H), 1.90 - 1.66 (m, 8H), 0.82 (br s, 4H), 0.04 (d, J=6.3 Hz, 6H).
실시예 32, MPL-470
반응식
1 단계. 에틸 (Z)-2-아지도-3-(2-플루오로-4-메틸-페닐)프로프-2-에노에이트의 합성
NaH(434.30 mg, 10.86 mmol, 60% 순도, 5 eq)를 EtOH(8 mL)에 배치로 첨가하였다. 혼합물을 투명한 용액이 형성될 때까지 교반한 다음, -10℃로 냉각시켰다. EtOH(2 mL) 중 2-플루오로-4-메틸-벤즈알데히드(300 mg, 2.17 mmol, 1 eq) 및 에틸 2-아지도아세테이트(1.40 g, 10.86 mmol, 1.52 mL, 5 eq)의 용액을 0℃ 미만인 온도에서 적가하고, 혼합물을 -10℃ ~ 0℃에서 3시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르: EtOAc = 5:1)는 출발 물질이 완전히 소모되어 하나의 새로운 스폿이 형성된 것으로 나타났다. 혼합물을 포화 NH4Cl(30mL)에 부은 다음, EtOAc(25mL)로 추출하였다. 유기층을 염수(10 mL)로 세척하고, Na2SO4로 건조시킨 후, 여과하고 감압하에 농축하였다. 잔류물을 플래시 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르 중 0-10% 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 화합물 에틸 (Z)-2-아지도-3-(2-플루오로-4-메틸-페닐)프로프-2-에노에이트 (400 mg, 1.52 mmol, 70.20% 수율, 95% 순도)를 황색 오일로서 얻었다. 1H NMR을 기록하였다.
2 단계. 에틸 4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트의 합성
크실렌(14mL) 중 에틸(Z)-2-아지도-3-(2-플루오로-4-메틸-페닐)프로프-2-에노에이트(700mg, 2.81mmol, 1eq)의 용액을 150℃에서 10분간 교반하였다. TLC(석유 에테르: EtOAc = 10:1)는 반응물 3이 완전히 소모되었고 몇 개의 새로운 스폿이 형성된 것으로 나타났다. 용액을 25℃로 냉각시키고, 5시간 후에 침전물이 있었고 이를 여과에 의해 수집하였다. 케이크를 석유 에테르(5 mL)로 세척한 다음, 플래시 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르 중 0-10% 에틸 아세테이트)로 정제했다. 화합물 에틸 4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(152 mg, 652.72 umol, 23.24% 수율, 95% 순도)를 황색 고체로서 얻었다. 1H NMR을 수집하였다.
3 단계. 4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실산의 합성
EtOH(7.5mL) 중 에틸 4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실레이트(150mg, 678.04umol, 1eq)의 용액에 NaOH(수 중 3M, 7.5mL, 33.18eq)를 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르: EtOAc = 10:1)는 반응물 4가 완전히 소모되었고 더 높은 극성을 갖는 하나의 주요 새로운 스폿이 형성되었음을 나타내었다. EtOH를 감압하에 제거하였다. 생성된 혼합물을 HCl(수 중 6 N)을 사용하여 pH 약 5로 산성화하였다. 현탁액을 여과에 의해 수집하였다. 케이크를 물(5mL)로 세척하고 동결건조기로 건조시켰다. 화합물 4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실산(90 mg, 442.61 umol, 65.28% 수율, 95% 순도)을 백색 고체로서 얻었다.
1H NMR(400MHz, DMSO-d6) δ = 11.99 - 11.89(m, 1H), 7.07 - 7.01(m, 2H), 6.70(d, J = 11.3Hz, 1H), 2.39(s, 3H)
단계 4: N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1 mL) 중 4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복실산(45 mg, 232.95 umol, 1 eq) 및 1,1-디메틸실리난-4-아민(50.25 mg, 279.54 umol, 1.2 eq, HCl 염)의 용액에 DMF(1 mL) 중 HOBt(62.95 mg, 465.90 umol, 2 eq) 및 EDCI(89.31 mg, 465.90 umol, 2 eq)의 용액을 첨가한 다음 TEA(94.29 mg, 931.80 umol, 129.69 uL, 4 eq)를 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 2시간 동안 교반하였다. LC-MS는 반응물 5가 완전히 소모되었고 원하는 매스를 갖는 하나의 주요 피크가 검출되었음을 보여주었다. 혼합물을 여과하였다. 여액을 prep-HPLC(Phenomenex luna C18 100*40mm*3 um; 이동상: A: 수 중 0.225% 포름산, B: CH3CN; 구배: 15분에 걸쳐 65%-95% B)로 정제했다. 화합물 N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드(55.6 mg, 174.59 umol, 74.95% 수율, 100% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 319.3 [M+H]+
1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ = 11.69 (br s, 1H), 8.24 (d, J=8.1 Hz, 1H), 7.17 (d, J=1.5 Hz, 1H), 7.04 (s, 1H), 6.65 (d, J=11.4 Hz, 1H), 3.78 - 3.65 (m,1H), 2.37 (s, 3H), 2.05 - 1.92 (m, 2H), 1.66 -1.52 (m, 2H), 0.83 - 0.72 (m, 2H), 0.61 (dt, J=4.8, 14.1 Hz, 2H), 0.12 - 0.00 (m, 6H).
실시예 33, MPL-256
4,6-디플루오로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1.5 mL) 중 4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복실산(50 mg, 253.63 umol, 1 eq)의 용액에 CDI(49.35 mg, 304.36 umol, 1.2 eq)를 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 이어서, 6-실라스피로[5.5]운데칸-3-아민(55.81 mg, 304.36 umol, 1.2 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 11.5시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 5:1)는 약간의 출발 물질이 있음을 보여주었다. 반응물을 H2O(20mL)에 적가하였다. 침전물을 여과하여 수집하고 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르:에틸 아세테이트 = 5:1)로 정제하였다. 화합물 4,6-디플루오로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드(47 mg, 128.08 umol, 50.50% 수율, 98.781% 순도)를 백색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 363.1[M+H]+
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) d = 11.94 (br s, 1H), 8.30 (br d, J=8.1 Hz, 1H), 7.25 (s, 1H), 7.01 (br d, J=9.0 Hz, 1H), 6.87 (br t, J=10.2 Hz, 1H), 3.76 - 3.67(m, 1H), 2.00 (br d, J=8.9 Hz, 2H), 1.70 - 1.51 (m, 6H), 1.38 (br s, 2H), 0.90 (br d, J=14.6 Hz, 2H), 0.72 - 0.67 (m, 2H), 0.63 - 0.54 (m, 4H).
실시예 34, MPL-257
4,6-디클로로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드의 합성
DMF(1.5 mL) 중 4,6-디클로로-1H-인돌-2-카르복실산(50 mg, 217.35 umol, 1 eq)의 용액에 CDI(42.29 mg, 260.82 umol, 1.2 eq)를 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 이어서, 6-실라스피로[5.5]운데칸-3-아민(47.82 mg, 260.82 umol, 1.2 eq)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 11.5시간 동안 교반하였다. TLC(석유 에테르:EtOAc = 1:1, Rf = 0.5)는 약간의 출발 물질과 더 높은 극성을 가진 하나의 주요한 새로운 스폿이 있음을 보여주었다. 반응물을 H2O(20mL)에 적가하였다. 침전물을 여과하여 수집한 후 컬럼 크로마토그래피(SiO2, 석유 에테르:에틸 아세테이트 = 1:0 ~ 1:1)로 정제하였다. 화합물 4,6-디클로로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드(10 mg, 24.91 umol, 11.46% 수율, 98.49% 순도)를 황색 고체로서 얻었다.
LCMS(ESI) m/z 395.0 [M+H]+
1H NMR (500MHz, CHLOROFORM-d) d = 10.18 (br s, 1H), 7.41 (s, 1H), 7.16 (s, 1H), 6.86 (br s, 1H), 6.13 (br d, J=8.2 Hz, 1H), 3.95 (br d, J=9.6 Hz, 1H),2.21 (br s, 2H), 1.68 (br d, J=6.4 Hz, 6H), 1.42 (br s, 2H), 0.93 (br d, J=14.6 Hz, 2H), 0.77 - 0.69 (m, 4H), 0.64 (br s, 2H).
실시예 35
NITD-304 및 NITD-349는 Mtb의 약물 민감성 및 다제내성 임상 단리물(isolates) 모두에 대해 강력한 활성을 보였고 Rao et al.에 의해 주요 후보로 확인되었다(2013). 그러나 출원인은 각각의 hERG IC50 값이 50μM보다 컸음에도 불구하고 NITD-304 및 NITD-349를 모두 가진 개에서 극적으로 수정된 QT(QTc) 연장을 관찰했다(표 1 및 도 1). QTc 연장은 심혈관 질환과 연관되어 있다(Beinart 2014). NITD-304와 NITD-349 모두 hKCNQ1 채널을 억제한다는 것이 발견되었다(표 2). 출원인은 표 3에 도시된 MPL-203 및 MPL-204와 같은 아민 모이어티 내에 규소 원자를 갖는 화합물이 hKCNQ1 채널을 억제하지 않는다는 것을 발견하였다.
*QT 연장은 다중 채널 효과로 인한 것일 수 있다.
표 2: 5개 이온 채널의 시험관 내 평가
NITD-349 및 NITD-304는 강력한 hKCNQ1 억제를 나타냈다.
표 3: 시클로알킬 치환의 효과
디메틸 실라시클로헥실(Dimethyl silacyclohexyl)은 심장 채널에 유의한 효과가 있음을 보여주었다.
실시예 36
항결핵제의 MIC(Minimum Inhibitory Concentration) 측정. M.tb H37Rv에 대한 각 화합물의 항결핵 활성을 녹색 형광 단백질 리포터 분석에 의해 측정하였다(CTollins 1998). 간단히 말해서, 화합물을 초기에 디메틸설폭사이드(DMSO)에 용해시키고 DMSO에 2배 희석하였다. 화합물 용액의 각 희석의 동일한 양을 마이크로플레이트 내의 7H9 브로쓰에 첨가하였다. Middlebrook 7H9 배지에서 성장시킨 Mtb H37Rv-GFP의 2 X 105 CFU/ml의 초기 접종물을 10일 동안 화합물에 노출시켰다. 형광성은 Fluostar Optima microplate fluorometer(BMG Labtech, Germany)로 측정하였으며, MIC는 세균만의 웰의 형광과 비교하여 형광을 90% 억제한 화합물의 최저 농도로 정의하였다. CFU = 식민지 형성 단위. 표 4의 1열 및 3열은 본 발명의 대표적인 화합물의 항-마이코박테리움 투베르쿨로시스 활성을 나타낸다. Collins 1997에 설명된 절차를 사용하여 1열에 표시된 데이터를 생성했다. Cho 2007에 설명된 절차를 사용하여 3열에 표시된 데이터를 생성했다.
Falzari 2005에 설명된 절차를 사용하여 표 4의 2열에 표시된 데이터를 생성했다.
표 4 및 표 5의 컬럼 5는 본 발명의 대표적인 화합물의 항-마이코박테리움 압세수스 활성을 나타낸다. Franz 2017에 설명된 절차를 사용하여 표 4 및 표 5의 5열에 표시된 데이터를 생성했다.
키(Key): MIC: 최소 억제 농도; MABA: 마이크로플레이트 기반 Alamar Blue 어세이; LORA: 저산소 회수 분석; Mab: Mycobacterium abscessus; ATCC: American Type Culture Collection. ND: 미 결정.
요약하면, 본 발명의 화합물은 (마이코박테리움 투베르쿨로시스 및 비-결핵 마이코박테리움 감염에 대해) 강력한 항-마이코박테리움 활성을 나타내고 공지된 화합물에 의해 나타나는 바람직하지 않은 심혈관 부작용이 적다.
참조
Beinart, Roy, et al. "The QT Interval Is Associated with Incident Cardiovascular Events in the Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis." Journal of the American College of Cardiology, vol. 64, no. 20, Nov. 2014, pp. 2111-19. PubMed Central, doi:10.1016/j.jacc.2014.08.039.
Cho, Sang Hyun, et al. "Low-Oxygen-Recovery Assay for High-Throughput Screening of Compounds against Nonreplicating Mycobacterium Tuberculosis." Antimicrobial Agents and Chemotherapy, vol. 51, no. 4, Apr. 2007, pp. 1380-85. PubMed Central, doi:10.1128/AAC.00055-06.
Collins, L. Torrero M.. and Franzblau, S. Antimicrob. Agents Chemother. 1998, 42, 344-347.
Collins, L., and S. G. Franzblau. "Microplate Alamar Blue Assay versus BACTEC 460 System for High-Throughput Screening of Compounds against Mycobacterium Tuberculosis and Mycobacterium Avium." Antimicrobial Agents and Chemotherapy, vol. 41, no. 5, May 1997, pp. 1004-09.
Falzari, Kanakeshwari, et al. "In Vitro and in Vivo Activities of Macrolide Derivatives against Mycobacterium Tuberculosis." Antimicrobial Agents and Chemotherapy, vol. 49, no. 4, Apr. 2005, pp. 1447-54. PubMed, doi:10.1128/AAC.49.4.1447-1454.2005.
Franz, Nicholas D., et al. "Design, Synthesis and Evaluation of Indole-2-Carboxamides with Pan Anti-Mycobacterial Activity." Bioorganic & Medicinal Chemistry, vol. 25, no. 14, 15 2017, pp. 3746-55. PubMed, doi:10.1016/j.bmc.2017.05.015.
Kondreddi, Ravinder Reddy, et al. "Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Indole-2-Carboxamides: A Promising Class of Antituberculosis Agents." Journal of Medicinal Chemistry, vol. 56, no. 21, Nov. 2013, pp. 8849-59. PubMed, doi:10.1021/jm4012774.
Rao Srinivasa P. S., et al. "Indolcarboxamide Is a Preclinical Candidate for Treating Multidrug-Resistant Tuberculosis." Science Translational Medicine, vol. 5, no. 214, Dec. 2013, p. 214ra168. PubMed, doi:10.1126/scitranslmed.3007355.
Stec, Jozef, et al. "Indole-2-Carboxamide-Based MmpL3 Inhibitors Show Exceptional Antitubercular Activity in an Animal Model of Tuberculosis Infection." Journal of Medicinal Chemistry, vol. 59, no. 13, July 2016, pp. 6232-47. ACS Publications, doi:10.1021/acs.jmedchem.6b00415.
* * *
특정 구체예의 변형이 이루어질 수 있고 첨부된 청구범위의 범위 내에 여전히 속하기 때문에, 본 발명은 위에서 설명된 본 발명의 특정 구체예로 제한되지 않는다는 것을 이해해야 한다.
본 발명은 다음의 번호가 매겨진 단락에 의해 제한 없이 추가로 설명될 것이다:
1. 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염:
여기서:
R1은 수소, 저급 알킬, 또는 할로겐이고;
R2는 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 저급 알콕시, -OCH2CH2OCH3, 또는 카르복사미드이고;
R3은 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 저급 알콕시, -OCH2CH2OCH3, 또는 카르복사미드이고;
R4는 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 알콕시, -OCH2CH2OCH3, -(O(CH2)mm)nn-모르폴리닐, 피페리디닐, 카르복사미드, ((C1-C4)알킬)NH-, 또는 (페닐)NH- 이고, 여기서 mm은 1 또는 2이고 nn은 0 또는 1이고; 또는
R3 및 R4는 이들이 부착된 방향족 탄소 원자와 함께 융합된 1,3-디옥솔로를 형성하고;
R5는 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 알콕시, 또는 카르복사미드이고;
R6은
m은 1, 2 또는 3이고,
n은 1, 2, 3, 또는 4이고; 또는
R6은 
이고, m은 1 또는 2이다.
2. 단락 1에 있어서, R1이 수소 또는 메틸인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
3. 단락 2에 있어서, R1이 수소인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
4. 단락 1 내지 3 중 어느 하나에 있어서, R2가 수소, 메틸, 할로겐, 시아노, 트리플루오로메틸, 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
5. 단락 4에 있어서, R2가 메틸, 할로겐, 시아노 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
6. 단락 1 내지 5 중 어느 하나에 있어서, R3이 수소, 메틸, 할로겐, 시아노, 트리플루오로메틸 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
7. 단락 1 내지 5 중 어느 하나에 있어서, R3이 수소, 메틸, 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
8. 단락 7에 있어서, R3이 수소인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
9. 단락 1 내지 8 중 어느 하나에 있어서, R4가 수소, 메틸, 할로겐, 시아노, 트리플루오로메틸 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
10. 단락 9에 있어서, R4가 메틸 또는 할로겐인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
11. 단락 1 내지 8 중 어느 하나에 있어서, R4가 수소, 메틸, 할로겐, 시아노, 트리플루오로메틸, 메톡시, -(O(CH2)mm)nn-모르폴리닐, 피페리디닐, ((C1-C4)알킬)NH-, 또는 (페닐)NH-이고, 여기서 mm은 1 또는 2이고 nn은 0 또는 1인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
12. 단락 1 내지 8 중 어느 하나에 있어서, R4가 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 알콕시, 또는 카르복사미드인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
13. 단락 1 내지 12 중 어느 하나에 있어서, R5가 수소, 메틸, 할로겐, 시아노, 트리플루오로메틸 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
14. 단락 13에 있어서, R5가 수소인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
15. 단락 1 내지 14 중 어느 하나에 있어서, R6이 
또는 
인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
16. 단락 1 내지 14 중 어느 하나에 있어서, R6이 
또는 
인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
17. 단락 1 내지 14 중 어느 하나에 있어서, R6NH가 
, 
, 
,
, 
, 
, 또는 
인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
18. 단락 1에 있어서,
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-메톡시-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디플루오로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디메틸-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디메틸-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
에틸 N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-[(3R)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-[(3S)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-3-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
메틸N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
6-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
6-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(1-메틸-3-트리메틸실릴-프로필)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-이소프로폭시-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
(R)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
(S)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디플루오로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드; 또는
4,6-디클로로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
19. 단락 1에 있어서,
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-메톡시-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디플루오로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디메틸-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디메틸-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-[(3R)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-[(3S)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-3-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
6-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
6-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
(R)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
(S)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디플루오로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드; 또는
4,6-디클로로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
20. 단락 1 내지 19 중 어느 하나에 따른 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염, 및 하나 이상의 약학적으로 허용되는 담체 및/또는 첨가제를 포함하는 약학적 조성물.
21. 단락 20에 있어서, 하나 이상의 추가적인 항감염제를 더 포함하는 약학적 조성물.
22. 단락 21에 있어서, 상기 추가적인 항감염제가 리팜피신, 리파부틴, 리파펜텐, 이소니아지드, 에탐부톨, 카나마이신, 아미카신, 카프레오마이신, 클로파지민, 시클로세린, 파라-아미노살리실산, 리네졸리드, 수테졸리드, 베다퀼린, 델라마니드, 프레토마니드, 목시플록사신 또는 레보플록사신, 또는 이들의 조합인 것인 약학적 조성물.
23. 치료 유효량의 단락 1 내지 19 중 어느 하나에 따른 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염을 이를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 마이코박테리아 감염의 치료 방법.
24. 단락 23에 있어서, 상기 마이코박테리아 감염이 마이코박테리움 투베르쿨로시스(Mycobacterium tuberculosis), 마이코박테리움 아비움(Mycobacterium avium), 마이코박테리움 칸사시(Mycobacterium kansasii), 마이코박테리움 앱세서스(Mycobacterium abscessus) 또는 마이코박테리움 첼로네(Mycobacterium chelonae)에 의한 것인 방법.
25. 단락 23에 있어서, 상기 마이코박테리아 감염이 마이코박테리움 투베르쿨로시스에 의한 것인 방법.
26. 단락 23 내지 25 중 어느 하나에 있어서, 상기 환자는 결핵(TB), 다제내성 결핵(MDR-TB), 전범위 약제내성 결핵(Pre-XDR-TB) 또는 광범위 약제내성결핵(XDR-TB)을 앓고 있는 것인 방법.
특정 구체예의 변형이 이루어지고 첨부된 청구범위의 범위 내에 여전히 속할 수 있기 때문에, 본 발명은 위에서 설명된 본 발명의 특정 구체예로 제한되지 않는다는 것을 이해해야 한다.
Claims (26)
- 화학식 (I)의 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염:
(I)
여기서:
R1은 수소, 저급 알킬, 또는 할로겐이고;
R2는 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 저급 알콕시, -OCH2CH2OCH3, 또는 카르복사미드이고;
R3은 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 저급 알콕시, -OCH2CH2OCH3, 또는 카르복사미드이고;
R4는 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 알콕시, -OCH2CH2OCH3, -(O(CH2)mm)nn-모르폴리닐, 피페리디닐, ((C1-C4)알킬)NH-, 또는 (페닐)NH- 이고, 여기서 mm은 1 또는 2이고 nn은 0 또는 1 또는 카르복사미드이고; 또는
R3 및 R4는 이들이 부착된 방향족 탄소 원자와 함께 융합된 1,3-디옥솔로를 형성하고;
R5는 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 알콕시, 또는 카르복사미드이고;
R6은
,
또는
이고
m은 1, 2 또는 3이고, n은 1, 2, 3, 또는 4이다. - 청구항 1에 있어서, R1이 수소 또는 메틸인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 2에 있어서, R1이 수소인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 1에 있어서, R2가 수소, 메틸, 할로겐, 시아노, 트리플루오로메틸, 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 4에 있어서, R2가 메틸, 할로겐, 시아노 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 1에 있어서, R3이 수소, 메틸, 할로겐, 시아노, 트리플루오로메틸 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 6에 있어서, R3이 수소, 메틸, 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 7에 있어서, R3이 수소인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 1에 있어서, R4가 수소, 메틸, 할로겐, 시아노, 트리플루오로메틸 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 9에 있어서, R4가 메틸 또는 할로겐인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 1에 있어서, R4가 수소, 메틸, 할로겐, 시아노, 트리플루오로메틸, 메톡시, -(O(CH2)mm)nn-모르폴리닐, 피페리디닐, ((C1-C4)알킬)NH-, 또는 (페닐)NH-이고, 여기서 mm은 1 또는 2이고 nn은 0 또는 1인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 1에 있어서, R4가 수소, 저급 알킬, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 할로-저급 알킬, 디-할로-저급 알킬, 알콕시, 또는 카르복사미드인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 1에 있어서, R5가 수소, 메틸, 할로겐, 시아노, 트리플루오로메틸 또는 메톡시인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 13에 있어서, R5가 수소인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 1에 있어서, R6이또는
인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 1에 있어서, R6이
또는인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 1에 있어서, R6NH가,
,
,
,
,
, 또는
인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염.
- 청구항 1에 있어서,
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-메톡시-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디플루오로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디메틸-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디메틸-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
에틸 N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-[(3R)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-[(3S)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-3-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-3-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
메틸N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
6-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
6-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(1-메틸-3-트리메틸실릴-프로필)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-이소프로폭시-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
(R)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
(S)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디플루오로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드; 또는
4,6-디클로로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염. - 청구항 1에 있어서,
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-메톡시-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디플루오로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디메틸-N-(5-실라스피로[4.5]데칸-8-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디메틸-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-[(3R)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-[(3S)-1,1-디메틸실로란-3-일]-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-디메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실레판-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로칸-5-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-3-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4,6-비스(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
6-브로모-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
6-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4-시아노-N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-플루오로-4-(2-메톡시에톡시)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-6-메틸-4-(트리플루오로메틸)-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
(R)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
(S)-4,6-디클로로-N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실로란-3-일)-4,6-디플루오로-1H-인돌-2-카르복사미드;
N-(1,1-디메틸실리난-4-일)-4-플루오로-6-메틸-1H-인돌-2-카르복사미드;
4,6-디플루오로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드; 또는
4,6-디클로로-N-(6-실라스피로[5.5]운데칸-3-일)-1H-인돌-2-카르복사미드인 것인 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염. - 청구항 1에 따른 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염, 및 하나 이상의 약학적으로 허용되는 담체 및/또는 첨가제를 포함하는 약학적 조성물.
- 청구항 20에 있어서, 하나 이상의 추가적인 항감염제를 더 포함하는 약학적 조성물.
- 청구항 21에 있어서, 상기 추가적인 항감염제가 리팜피신, 리파부틴, 리파펜텐, 이소니아지드, 에탐부톨, 카나마이신, 아미카신, 카프레오마이신, 클로파지민, 시클로세린, 파라-아미노살리실산, 리네졸리드, 수테졸리드, 베다퀼린, 델라마니드, 프레토마니드, 목시플록사신 또는 레보플록사신, 또는 이들의 조합인 것인 약학적 조성물.
- 치료 유효량의 청구항 1에 따른 화합물 또는 그의 약학적으로 허용되는 염을 이를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 마이코박테리아 감염의 치료 방법.
- 청구항 23에 있어서, 상기 마이코박테리아 감염이 마이코박테리움 투베르쿨로시스(Mycobacterium tuberculosis), 마이코박테리움 아비움(Mycobacterium avium), 마이코박테리움 칸사시(Mycobacterium kansasii), 마이코박테리움 앱세서스(Mycobacterium abscessus) 또는 마이코박테리움 첼로네(Mycobacterium chelonae)에 의한 것인 방법.
- 청구항 23에 있어서, 상기 마이코박테리아 감염이 마이코박테리움 투베르쿨로시스에 의한 것인 방법.
- 청구항 23에 있어서, 상기 환자는 결핵(TB), 다제내성 결핵(MDR-TB), 전범위 약제내성 결핵(Pre-XDR-TB) 또는 광범위 약제내성결핵(XDR-TB)을 앓고 있는 것인 방법.
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