KR20220024684A - 프레보텔라를 사용하여 th2-매개 병태를 치료하기 위한 조성물 및 방법 - Google Patents

프레보텔라를 사용하여 th2-매개 병태를 치료하기 위한 조성물 및 방법 Download PDF

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KR20220024684A
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테일러 에이. 코맥
안드레아 이타노
홀리 포니크테라
크리티카 라마니
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에벨로 바이오사이언시즈, 인크.
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Abstract

본 명세서에는 예를 들어, TH2-매개 병태, 예컨대, 아토피 피부염 및/또는 음식 알레르기의 치료를 위한 치료제로서 유용할 수 있는 프레보텔라 박테리아와 관련된 조성물 및 방법이 제공된다.

Description

프레보텔라를 사용하여 TH2-매개 병태를 치료하기 위한 조성물 및 방법
관련 출원
본 출원은 미국 가출원 제62/864,886호(출원일: 2019년 6월 21일) 및 미국 가출원 제62/910,920호(출원일: 2019년 10월 4일)의 출원일의 우선권의 권리 및 이익을 주장하며, 이들 기초출원 둘 다는 전문이 참조에 의해 본 명세서에 원용된다.
헬퍼 T(TH) 세포(CD4+ T 세포라고도 지칭됨)는 B 세포, 다른 T 세포, 호산구, 호염기구, 비만 세포 및 대식세포를 포함하는 다른 면역 세포의 활성에 영향을 미치는 사이토카인의 분비를 통해서 후천성 면역 반응을 조정한다.
미경험 TH 세포가 활성화되는 경우, 그것은 다양한 TH 세포 하위세트 중 하나로 분화되며, 이들 각각은 특정 사이토카인 세트의 분비를 통해 면역 반응의 하나의 양태를 조정하는 역할을 한다. 예를 들어, TH1 세포는 IFN-γ를 분비하고, 바이러스 및 세포내 박테리아에 대한 세포-매개 면역 반응을 향상시키는 역할을 한다. 반면에, TH2 세포는 IL-4, IL-5, IL-9, IL-10, IL-13 및 IL-25를 분비하고, 특히 세포외 기생충, 예컨대, 연충(helminth)에 대한 체액성 면역 반응을 향상시키는 역할을 한다. TH17 세포는 IL-17을 분비하고, (다른 병원체 중에서) 진균에 대한 반응과 같은 염증 반응을 매개한다.
활성화 시 TH 세포가 분화하는 TH 하위세트는 부분적으로는 특정 분극화 사이토카인의 존재에 의해 결정된다. 예를 들어, 미경험 TH 세포가 IFN-γ의 존재 하에서 활성화되면, 그것은 TH1 세포로 분화될 가능성이 있을 것이다. 다른 한편, 미경험 TH 세포가 IL-4의 존재 하에서 활성화되면, 그것은 TH2 세포로 분화될 가능성이 있을 것이다. 따라서, 활성화된 TH1 세포에 의한 IFN-γ의 분비는 다른 TH 세포가 TH1 하위집합으로 분극되도록 할 수 있는 반면, 활성화된 TH2 세포에 의한 IL-4의 분비는 다른 TH 세포가 TH2 하위집합으로 분극되도록 할 수 있다. 이러한 케스케이딩 효과 때문에, TH 세포 분화는 인간의 전반적인 면역 반응에 광범위한 영향을 미칠 수 있다. 실제로, 다수의 질환 및 장애가 알레르기(예를 들어, 음식 알레르기, 곤충-유도 알레르기, 약물 알레르기 또는 알레르기 비염), 천식 및 아토피 피부염을 비롯한(그러나 이에 제한되지 않음) TH2 면역 반응과 연관되어 있다.
따라서, 이러한 TH2-매개 병태를 치료하기 위해 TH1 면역 반응을 촉진하고/하거나 TH2 면역 반응을 저해하기 위한 새로운 조성물 및 방법이 필요하다.
본 명세서에 개시된 바와 같이, 프레보텔라(Prevotella) 속의 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물은 치료 효과를 가지며, 하나 이상의 TH2-매개 병태의 치료 및/또는 예방(즉, 치료, 예방, 또는 치료와 예방 모두)에 유용하다. 이러한 TH2-매개 병태는 알레르기 비염, 천식, 아토피 피부염, 두드러기, 혈관부종, 알레르기(예컨대, 음식 알레르기, 곤충-유도 알레르기, 약물 알레르기), 아나필락시스(anaphylaxis) 및 호산구 증가증을 포함하지만 이들로 제한되지 않는다.
일부 양태에서, 본 명세서에는 대상체의 TH2-매개 병태를 치료 및/또는 예방하는 방법이 제공된다. 특정 구현예에서, 방법은 프레보텔라 속의 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서에는 하나 이상의 TH2-매개 병태의 치료 또는 예방에 유용한 프레보텔라 속의 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물이 제공된다. 따라서, 특정 양태에서, 본 명세서에는 TH2-매개 병태의 치료 또는 예방에 사용하기 위한, 프레보텔라 속의 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물이 제공된다.
특정 양태에서, 본 명세서에는 TH2-매개 병태의 치료 또는 예방을 위한 의약의 제조를 위한 프레보텔라 속의 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물의 용도가 제공된다.
특정 구현예에서, TH2-매개 병태는 알레르기, 아토피 피부염, 천식, 두드러기, 혈관부종, 아나필락시스, 호산구 증가증 또는 이들의 조합이다.
일부 구현예에서 TH2-매개 병태는 알레르기이다. 특정 구현예에서, 알레르기는 알레르기 비염, 음식 알레르기, 곤충-유도 알레르기 또는 약물 알레르기이다. 일부 구현예에서, 알레르기는 음식 알레르기이다. 일부 구현예에서, 음식 알레르기는 난류, 우유, 땅콩, 견과류(tree nut)(예를 들어, 호두), 생선, 조개류, 밀, 대두 또는 이들의 조합물에 대한 알레르기를 포함할 수 있다.
이들 양상 중 어느 하나의 일부 구현예에서, 대상체는 인간이다. 일부 구현예에서, 대상체는 비-인간 동물이다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물의 총 미생물 내용물 중 적어도 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 99%는 프레보텔라 속의 박테리아이거나 또는 프레보텔라 속의 박테리아로부터 유래된 생물학적 물질이다.
본 명세서에 개시된 양상 중 어느 하나의 특정 구현예에서, 프레보텔라 속의 박테리아는 서열번호 1 내지 41로부터 선택된 아미노산 서열을 갖는 적어도 하나의 단백질을 포함한다. 추가로 또는 개별적으로, 일부 구현예에서, 프레보텔라 속의 박테리아는 서열번호 42 내지 69로부터 선택된 아미노산 서열을 갖는 각각의 단백질 중 적어도 하나 이상이 실질적으로 존재하지 않는다.
본 명세서에 개시된 양태 중 어느 하나의 일부 구현예에서, 프레보텔라 속의 박테리아는 프레보텔라 알벤시스(Prevotella albensis), 프레보텔라 암니이(Prevotella amnii), 프레보텔라 버겐시스(Prevotella bergensis), 프레보텔라 비비아(Prevotella bivia), 프레보텔라 브레비스(Prevotella brevis), 프레보텔라 브리안티이(Prevotella bryantii), 프레보텔라 부카에(Prevotella buccae), 프레보텔라 부칼리스(Prevotella buccalis), 프레보텔라 코프리(Prevotella copri), 프레보텔라 덴탈리스(Prevotella dentalis), 프레보텔라 덴티콜라(Prevotella denticola), 프레보텔라 디시엔스(Prevotella disiens), 프레보텔라 히스티콜라(Prevotella histicola), 프레보텔라 인터메디아(Prevotella intermedia), 프레보텔라 마쿨로사(Prevotella maculosa), 프레보텔라 마시이(Prevotella marshii), 프레보텔라 멜라니노게니카(Prevotella melaninogenica), 프레보텔라 미칸스(Prevotella micans), 프레보텔라 멀티포르미스(Prevotella multiformis), 프레보텔라 니그레센스(Prevotella nigrescens), 프레보텔라 오랄리스(Prevotella oralis), 프레보텔라 오리스(Prevotella oris), 프레보텔라 오울로럼(Prevotella oulorum), 프레보텔라 팔렌스(Prevotella pallens), 프레보텔라 살리바에(Prevotella salivae), 프레보텔라 스터코레아(Prevotella stercorea), 프레보텔라 타너라에(Prevotella tannerae), 프레보텔라 티모넨시스(Prevotella timonensis), 프레보텔라 제주니(Prevotella jejuni), 프레보텔라 아우란티아카(Prevotella aurantiaca), 프레보텔라 바로니아에(Prevotella baroniae), 프레보텔라 콜로란스(Prevotella colorans), 프레보텔라 코포리스(Prevotella corporis), 프레보텔라 덴타시니(Prevotella dentasini), 프레보텔라 에노에카(Prevotella enoeca), 프레보텔라 팔세니이(Prevotella falsenii), 프레보텔라 푸스카(Prevotella fusca), 프레보텔라 헤파리놀리티카(Prevotella heparinolytica), 프레보텔라 로에쉐이이(Prevotella loescheii), 프레보텔라 멀티사카리보락스(Prevotella multisaccharivorax), 프레보텔라 난세이엔시스(Prevotella nanceiensis), 프레보텔라 오리자에(Prevotella oryzae), 프레보텔라 팔루디비벤스(Prevotella paludivivens), 프레보텔라 플레우리티디스(Prevotella pleuritidis), 프레보텔라 루미니콜라(Prevotella ruminicola), 프레보텔라 사카롤리티카(Prevotella saccharolytica), 프레보텔라 스코포스(Prevotella scopos), 프레보텔라 샤히이(Prevotella shahii), 프레보텔라 주글레오포르만스(Prevotella zoogleoformans), 프레보텔라 베로랄리스(Prevotella veroralis)의 종 또는 이들의 조합물의 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 속의 박테리아는 프레보텔라 히스티콜라 종의 박테리아를 포함할 수 있다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 속의 박테리아는 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(NRRL 수탁: B 50329)와 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 또는 적어도 99%(예를 들어, 적어도 99.1%, 적어도 99.2%, 적어도 99.3%, 적어도 99.4%, 적어도 99.5%, 적어도 99.6%, 적어도 99.7%, 적어도 99.8%, 적어도 99.9% 또는 100%) 게놈, 16S 리보솜 리보핵산 및/또는 클러스터링된 규칙적으로 사이에 공간이 있는 짧은 회문 반복부(clustered regularly interspaced short palindromic repeat) 서열 동일성을 갖는 균주를 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 속의 박테리아는 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(NRRL 수탁: B 50329)를 포함한다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 표 1에 열거된 단백질 및/또는 표 1에 열거된 단백질을 암호화하는 유전자를 포함하는 프레보텔라 박테리아의 균주이다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 표 2에 열거된 단백질 및/또는 표 2에 열거된 단백질을 암호화하는 유전자가 존재하지 않거나 실질적으로 존재하지 않는 프레보텔라 박테리아의 균주이다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 히스티콜라 박테리아는 표 1에 열거된 단백질 및/또는 표 1에 열거된 단백질을 암호화하는 유전자를 포함하는 프레보텔라 히스티콜라 박테리아의 균주이다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 히스티콜라 박테리아는 표 2에 열거된 단백질 및/또는 표 2에 열거된 단백질을 암호화하는 유전자가 존재하지 않거나 실질적으로 존재하지 않는 프레보텔라 히스티콜라 박테리아의 균주이다.
특정 구현예에서, 약제학적 조성물은 프레보텔라 박테리아의 단일 종을 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 복수의 종의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 2, 3, 4, 5종)를 포함한다. 특정 구현예에서, 약제학적 조성물은 프레보텔라 박테리아의 단일 균주를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 복수의 균주의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 2, 3, 4, 5개의 균주)를 포함한다. 특정 구현예에서, 약제학적 조성물은 프레보텔라 히스티콜라 박테리아의 단일 균주를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 복수의 균주의 프레보텔라 히스티콜라 박테리아(예를 들어, 2, 3, 4, 5개의 균주)를 포함한다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물의 프레보텔라 속의 박테리아의 박테리아는 살아있는 박테리아, 사멸된 박테리아 또는 약독화된 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물의 프레보텔라 속의 박테리아는 살아있는 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 감마-조사된, UV 조사된, 열 불활성화된(예를 들어, 50℃에서 2시간 동안, 90℃에서 2시간 동안), 산 처리된 또는 산소 살포된(예를 들어, 0.1 vvm에서 2시간 동안) 박테리아를 포함한다. 특정 구현예에서, 약제학적 조성물의 프레보텔라 속의 박테리아는 동결건조된 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 추가로 포함한다.
본 명세서에 개시된 양태 중 임의의 하나의 일부 구현예에서, 대상체에게 약제학적 조성물을 투여하는 것은 대상체에서(예를 들어, 이의 장간막 림프절 또는 경부 림프절에서) TH2-단백질의 수준 및/또는 TH2-단백질을 암호화하는 mRNA의 수준을 감소시킬 수 있다. 예를 들어, 특정 구현예에서, 약제학적 조성물의 투여 시, TH2-단백질 및/또는 TH2-단백질을 암호화하는 mRNA의 수준은 약제학적 조성물의 투여 전 TH2-단백질 및/또는 TH2-단백질을 암호화하는 mRNA의 수준과 비교할 때 대상체에서 더 낮아진다. 특정 구현예에서, TH2-단백질은 인터류킨-4(IL-4), 인터류킨-5, 인터류킨-13, 인터류킨-19, 인터류킨-21, 인터류킨-31, 인터류킨-33, 흉선 기질 림포포이에틴, 면역글로불린 G1, 면역글로불린 E, 면역글로불린 A 또는 이들의 조합물이다. 특정 구현예에서, TH2-단백질은 IL-4, IL-13, IL-5, IL-31, IL-33 또는 이들의 조합물이다. 특정 구현예에서, TH2-단백질은 IL-13, IL-5, IL-31 또는 이들의 조합물이다. 특정 구현예에서, TH2-단백질은 IL-13이다. 특정 구현예에서, TH2-단백질은 IL-31이다. 특정 구현예에서, TH2-mRNA는 Il4, Il5, IL31, Il33, Tslp, Ccl9, Ccr4 또는 이들의 조합물이다. 특정 구현예에서, TH2-mRNA는 Il4, Il5, Il33, Il17a, Il1b, Tslp 또는 이들의 조합물이다. 특정 구현예에서, TH2-mRNA는 Il4, Il5, Tslp, Ccr4, Il19 또는 이들의 조합물이다. 특정 구현예에서, TH2-mRNA는 Il5, Il31 Ccr4 또는 이들의 조합물이다. 특정 구현예에서, TH2-mRNA는 Il5이다.
본 명세서에 개시된 양태 중 임의의 하나의 일부 구현예에서, 대상체에게 약제학적 조성물을 투여하는 것은 대상체에서(예를 들어, 이의 공장에서) 비만 세포 관련 단백질 및/또는 비만 세포 관련 단백질을 암호화하는 mRNA의 수준을 감소시킬 수 있다. 특정 구현예에서, 비만 세포 mRNA는 Mcpt1이다. 예를 들어, 특정 구현예에서, 약제학적 조성물의 투여 시, 비만 세포 관련 단백질 및/또는 비만 세포 관련 단백질을 암호화하는 mRNA의 수준은 약제학적 조성물의 투여 전 비만 세포 관련 단백질 및/또는 비만 세포 관련 단백질을 암호화하는 mRNA의 수준과 비교할 때 대상체에서 더 낮아진다.
본 명세서에 개시된 양태 중 임의의 하나의 일부 구현예에서, 대상체에게 약제학적 조성물을 투여하는 것은 대상체에서(예를 들어, 이의 비장 또는 장간막 림프절에서) IL-10의 수준을 증가시킬 수 있다. 예를 들어, 특정 구현예에서, 약제학적 조성물의 투여 시, IL-10 및/또는 IL-10을 암호화하는 mRNA의 수준은 약제학적 조성물의 투여 전 IL-10 및/또는 IL-10을 암호화하는 mRNA의 수준과 비교할 때 대상체에서(예를 들어, 이의 비장 또는 장간막 림프절)에서 더 낮아진다.
본 명세서에 개시된 양태 중 임의의 하나의 일부 구현예에서, 추가 치료제는 대상체에게 투여된다. 일부 구현예에서, 추가 작용제는 항염증제이다. 특정 구현예에서 추가 치료제는 코르티코스테로이드, 항히스타민제, 비만 세포 안정화제, 충혈완화제(decongestant), 류카트리엔 수용체 길항제, 항체 또는 이들의 조합물이다. 예를 들어, 추가 치료제는 아크리바스틴, 알부테롤, 알리메마진, ANB020, 벤라리주맙, 안타졸린, AS1517499, AS1810722, 아스테미졸, 아자티오프린, AZD1981, 아젤라스틴, 베클로메타손, 베포타스틴, 베타메타손, BI671800, 빌라스틴, 브로마진, 브롬페니라민, 부데소니드, 부데소니드-포르모테롤, 카르비녹사민, 세티리진, 클로르시클리진, 클로로피라민, 클로르페나민, 시클레소니드, 시클로스포린, 시메티딘, 클레마스틴, 클레마스틴, 코르티손, 크리사보롤, 크로몰린, 시클리진, 시프로헵타딘, CYT003, 답손, 데슬로라타딘, 덱사메타손, 덱스브롬페니라민, 덱스클로르페니라민, 디멘히드리네이트, 디메틴덴, 디펜히드라민, 독실아민, 두필루맙, 에바스틴, 에페드린, 에피네프린, 파모티딘, 펙소페나딘, 플루니솔리드, 플루티카손, 플루티카손 푸로에이트, 플루티카손 프로피오네이트, 플루티카손-살메테롤, 포르모테롤, 포르모테롤-모메타손, GSK3772847, 히드록시클로로퀸, 히드록시진, 이미퀴모드, 인터페론감마-1b, 이프라트로피움, 케토티펜, 레브리키주맙, 레발부테롤, 레보카바스틴, 레보세티리진, 레보메탐페타민, 로라타딘, 메클리진, 메클로페나메이트 나트륨, 메폴리주맙, 메피라민, 메토트렉세이트, 메틸프레드니솔론, 미졸라스틴, MK-886, 모메타손, 몬테루카스트, 미코페놀레이트, 미코페놀레이트모페틸, 나파졸린, OC000459, 올로파타딘, 오말리주맙, 오르페나드린, 옥시메타졸린, 페니라민, 페닐에프린, 페닐프로판올아민, 피메크롤리무스, 프레드니솔론, 프레드니손, 프로메타진, 프로필헥세드린, 슈도에페드린, 퀴페나딘, 라니티딘, 레시퀴모드, 레술리주맙, RG6149/AMG282, 루파타딘, 살메테롤, SB010, 시롤리무스, 설파살라진, 시네프린, 타크롤리무스, 테르페나딘, 테트리졸린, 테오필린, 틱소코르톨, 트랄로키누맙, 트라마졸린, 트리암시놀론, 트리암시놀론 아세토니드, 트리펠렌아민, 트리프롤리딘, 비타민D, 자일로메타졸린, YM-341619, 자피르루카스트, 질류톤 또는 이들의 조합물일 수 있다. 특정 구현예에서, 추가 치료제는 약제학적 조성물의 일부로서 포함될 수 있거나 이것은 별도로 존재할 수 있다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 경구, 정맥내, 피부하, 피부내 또는 복강내 투여에 의해서 투여된다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 경구 투여에 의해서 투여된다.
특정 구현예에서, 약제학적 조성물은 적어도 5 ㎎(예를 들어, 적어도 10 ㎎, 20 ㎎, 30 ㎎, 40 ㎎, 50 ㎎, 60 ㎎, 70 ㎎, 80 ㎎, 90 ㎎, 100 ㎎, 110 ㎎, 120 ㎎, 130 ㎎, 140 ㎎, 150 ㎎, 160 ㎎, 170 ㎎, 180 ㎎, 190 ㎎, 200 ㎎, 210 ㎎, 220 ㎎, 230 ㎎, 240 ㎎, 250 ㎎, 260 ㎎, 270 ㎎, 280 ㎎, 290 ㎎, 300 ㎎, 310 ㎎, 320 ㎎, 330 ㎎, 340 ㎎, 350 ㎎, 360 ㎎, 370 ㎎, 380 ㎎, 390 ㎎, 400 ㎎, 410 ㎎, 420 ㎎, 430 ㎎, 440 ㎎, 450 ㎎, 460 ㎎, 470 ㎎, 480 ㎎, 490 ㎎, 500 ㎎, 510 ㎎, 520 ㎎, 530 ㎎, 540 ㎎, 550 ㎎, 560 ㎎, 570 ㎎, 580 ㎎, 590 ㎎, 600 ㎎, 610 ㎎, 620 ㎎, 630 ㎎, 640 ㎎, 650 ㎎, 660 ㎎, 670 ㎎, 680 ㎎, 690 ㎎, 700 ㎎, 710 ㎎, 720 ㎎, 730 ㎎, 740 ㎎, 750 ㎎, 760 ㎎, 770 ㎎, 780 ㎎, 790 ㎎, 800 ㎎, 810 ㎎, 820 ㎎, 830 ㎎, 840 ㎎, 850 ㎎, 860 ㎎, 870 ㎎, 880 ㎎, 890 ㎎, 또는 900 ㎎) 및 900 ㎎ 이하(예를 들어, 이하 890 ㎎, 880 ㎎, 870 ㎎, 860 ㎎, 850 ㎎, 840 ㎎, 830 ㎎, 820 ㎎, 810 ㎎, 800 ㎎, 790 ㎎, 780 ㎎, 770 ㎎, 760 ㎎, 750 ㎎, 740 ㎎, 730 ㎎, 720 ㎎, 710 ㎎, 700 ㎎, 690 ㎎, 680 ㎎, 670 ㎎, 660 ㎎, 650 ㎎, 640 ㎎, 630 ㎎, 620 ㎎, 610 ㎎, 600 ㎎, 590 ㎎, 580 ㎎, 570 ㎎, 560 ㎎, 550 ㎎, 540 ㎎, 530 ㎎, 520 ㎎, 510 ㎎, 500 ㎎, 490 ㎎, 480 ㎎, 470 ㎎, 460 ㎎, 450 ㎎, 440 ㎎, 430 ㎎, 420 ㎎, 410 ㎎, 400 ㎎, 390 ㎎, 380 ㎎, 370 ㎎, 360 ㎎, 350 ㎎, 340 ㎎, 330 ㎎, 320 ㎎, 310 ㎎, 300 ㎎, 290 ㎎, 280 ㎎, 270 ㎎, 260 ㎎, 250 ㎎, 240 ㎎, 230 ㎎, 220 ㎎, 210 ㎎, 200 ㎎, 190 ㎎, 180 ㎎, 170 ㎎, 160 ㎎, 150 ㎎, 140 ㎎, 130 ㎎, 120 ㎎, 110 ㎎, 100 ㎎, 90 ㎎, 80 ㎎, 70 ㎎, 60 ㎎, 50 ㎎, 40 ㎎, 30 ㎎, 20 ㎎ 또는 10 ㎎)의 총 단백질 양(예를 들어, 브래드포드(Bradford) 검정에 의해서 결정된 바와 같음 또는 BCA 검정에 의해서 결정된 바와 같음)을 포함할 수 있다. 특정 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 10 ㎎, 약 20 ㎎, 약 30 ㎎, 약 40 ㎎, 약 50 ㎎, 약 60 ㎎, 약 70 ㎎, 약 80 ㎎, 약 90 ㎎, 약 100 ㎎, 약 110 ㎎, 약 120 ㎎, 약 130 ㎎, 약 140 ㎎, 약 150 ㎎, 약 160 ㎎, 약 170 ㎎, 약 180 ㎎, 약 190 ㎎, 약 200 ㎎, 약 210 ㎎, 약 220 ㎎, 약 230 ㎎, 약 240 ㎎, 약 250 ㎎, 약 260 ㎎, 약 270 ㎎, 약 280 ㎎, 약 290 ㎎, 약 300 ㎎, 약 310 ㎎, 약 320 ㎎, 약 330 ㎎, 약 340 ㎎, 약 350 ㎎, 약 360 ㎎, 약 370 ㎎, 약 380 ㎎, 약 390 ㎎, 약 400 ㎎, 약 410 ㎎, 약 420 ㎎, 약 430 ㎎, 약 440 ㎎, 약 450 ㎎, 약 460 ㎎, 약 470 ㎎, 약 480 ㎎, 약 490 ㎎, 약 500 ㎎, 약 510 ㎎, 약 520 ㎎, 약 530 ㎎, 약 540 ㎎, 약 550 ㎎, 약 560 ㎎, 약 570 ㎎, 약 580 ㎎, 약 590 ㎎, 약 600 ㎎, 약 610 ㎎, 약 620 ㎎, 약 630 ㎎, 약 640 ㎎, 약 650 ㎎, 약 660 ㎎, 약 670 ㎎, 약 680 ㎎, 약 690 ㎎, 약 700 ㎎, 약 710 ㎎, 약 720 ㎎, 약 730 ㎎, 약 740 ㎎, 약 750 ㎎, 약 760 ㎎, 약 770 ㎎, 약 780 ㎎, 약 790 ㎎, 약 800 ㎎, 약 810 ㎎, 약 820 ㎎, 약 830 ㎎, 약 840 ㎎, 약 850 ㎎, 약 860 ㎎, 약 870 ㎎, 약 880 ㎎, 약 890 ㎎ 또는 약 900 ㎎의 총 단백질(예를 들어, 브래드포드 검정에 의해서 결정된 바와 같음 또는 BCA 검정에 의해서 결정된 바와 같음)을 포함할 수 있다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 적어도 5 ㎎(예를 들어, 적어도 6 ㎎, 적어도 7 ㎎, 적어도 8 ㎎, 적어도 9 ㎎, 적어도 10 ㎎, 적어도 11 ㎎, 적어도 12 ㎎, 적어도 13 ㎎, 적어도 14 ㎎, 적어도 15 ㎎, 적어도 16 ㎎, 적어도 17 ㎎, 적어도 18 ㎎, 적어도 19 ㎎ 또는 적어도 20 ㎎) 및 20 ㎎ 이하(예를 들어, 19 ㎎ 이하, 18 ㎎ 이하, 17 ㎎ 이하, 16 ㎎ 이하, 15 ㎎ 이하, 14 ㎎ 이하, 13 ㎎ 이하, 12 ㎎ 이하, 11 ㎎ 이하, 10 ㎎ 이하, 9 ㎎ 이하, 8 ㎎ 이하, 7 ㎎ 이하, 6 ㎎ 이하, 5 ㎎ 이하)(예를 들어, 브래드포드 검정에 의해서 결정된 바와 같음 또는 BCA 검정에 의해서 결정된 바와 같음)의 프레보텔라 속의 박테리아의 총량을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 5 ㎎, 약 6 ㎎, 약 7 ㎎, 약 8 ㎎, 약 9 ㎎, 약 10 ㎎, 약 11 ㎎, 약 12 ㎎, 약 13 ㎎, 약 14 ㎎, 약 15 ㎎, 약 16 ㎎, 약 17 ㎎, 약 18 ㎎, 약 19 ㎎ 또는 약 20 ㎎(예를 들어, 브래드포드 검정에 의해서 결정된 바와 같음 또는 BCA 검정에 의해서 결정된 바와 같음)의 프레보텔라 속의 박테리아의 총량을 포함할 수 있다.
특정 구현예에서, 약제학적 조성물(예를 들어, 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여되는 총 용량의 조성물)은 적어도 1×1010개의 총 세포(예를 들어, 적어도 1×1010개의 총 세포, 적어도 2×1010개의 총 세포, 적어도 3×1010개의 총 세포, 적어도 4×1010개의 총 세포, 적어도 5×1010개의 총 세포, 적어도 6×1010개의 총 세포, 적어도 7×1010개의 총 세포, 적어도 8×1010개의 총 세포, 적어도 9×1010개의 총 세포, 적어도 1×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 9×1011개 이하의 총 세포(예를 들어, 1×1010개 이하의 총 세포, 2×1010개 이하의 총 세포, 3×1010개 이하의 총 세포, 4×1010개 이하의 총 세포, 5×1010개 이하의 총 세포, 6×1010개 이하의 총 세포, 7×1010개 이하의 총 세포, 8×1010개 이하의 총 세포, 9×1010개 이하의 총 세포, 1×1011개 이하의 총 세포, 2×1011개 이하의 총 세포, 3×1011개 이하의 총 세포, 4×1011개 이하의 총 세포, 5×1011개 이하의 총 세포, 6×1011개 이하의 총 세포, 7×1011개 이하의 총 세포, 8×1011개 이하의 총 세포)의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 6×109개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 1.6×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 8×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 1.6×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 3.2×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 1.6×1010 내지 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 1.6×1010 내지 약 1.6×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 8×1010 내지 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 1.6×1011 내지 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다.
특정 구현예에서, 본 명세서에는 프레보텔라 박테리아를 포함하는 고체 투여 형태가 제공된다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 장용 코팅을 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 캡슐, 예를 들어, 장용 코팅된 캡슐이다. 일부 구현예에서, 각각의 캡슐은 약 8×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 캡슐이 대상체에게 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여된다. 일부 구현예에서, 1개의 캡슐(예를 들어, 약 8×1010개의 총 세포를 포함함)이 대상체에게 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여된다. 일부 구현예에서, 2개의 캡슐(예를 들어, 각각 약 8×1010개의 총 세포를 포함함)이 대상체에게 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여된다. 일부 구현예에서, 4개의 캡슐(예를 들어, 각각 약 8×1010개의 총 세포를 포함함)이 대상체에게 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여된다. 일부 구현예에서, 10개의 캡슐(예를 들어, 각각 약 8×1010개의 총 세포를 포함함)이 대상체에게 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여된다. 일부 구현예에서, 캡슐 내의 프레보텔라 박테리아는(예를 들어, 분말로) 동결건조된다.
일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 캡슐을 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 장용 코팅된 정제이다. 일부 구현예에서, 캡슐은 약 8×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 캡슐 또는 복수의 캡슐의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 약 1.6×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 캡슐 또는 복수의 캡슐의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 약 3.2×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 캡슐 또는 복수의 캡슐의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 캡슐 또는 복수의 캡슐의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐 내의 프레보텔라 박테리아는(예를 들어, 분말로) 동결건조된다.
일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 정제를 포함한다. 일부 구현예에서, 정제는 장용 코팅된 정제이다. 일부 구현예에서, 장용 코팅된 정제는 5 ㎜ 내지 17 ㎜의 직경이다. 일부 구현예에서, 정제는 약 8×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 정제 또는 복수의 정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 정제는 약 1.6×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 정제 또는 복수의 정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 정제는 약 3.2×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 정제 또는 복수의 정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 정제는 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 정제 또는 복수의 정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 정제 내의 프레보텔라 박테리아는 동결건조된다.
일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 미니-정제를 포함한다. 일부 구현예에서, 미니-정제는 장용 코팅된다. 일부 구현예에서, 미니-정제는 1 ㎜ 내지 4 ㎜ 직경이다. 일부 구현예에서, 미니-정제(예를 들어, 장용 코팅된 미니-정제)는 1 ㎜ 미니-정제, 1.5 ㎜ 미니-정제, 2 ㎜ 미니-정제, 3 ㎜ 미니-정제 또는 4 ㎜ 미니-정제이다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 약 8×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함하는 미니-정제(예를 들어, 복수의 미니-정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 약 1.6×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함하는 미니-정제(예를 들어, 복수의 미니-정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 약 3.2×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함하는 미니-정제(예를 들어, 복수의 미니-정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함하는 미니-정제(예를 들어, 복수의 미니-정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 미니-정제 내의 프레보텔라 박테리아는 동결건조된다.
일부 구현예에서, 미니-정제(예를 들어, 장용 코팅된 미니-정제)는 캡슐 내에 함유된다. 일부 구현예에서, 캡슐은 크기 00, 크기 0, 크기 1, 크기 2, 크기 3, 크기 4 또는 크기 5 캡슐이다. 일부 구현예에서, 캡슐은 비-장용 코팅(예를 들어, HPMC(히드록실 프로필 메틸 셀룰로스) 또는 젤라틴)을 포함한다(예를 들어, 비-장용 코팅으로 코팅된다). 일부 구현예에서, 캡슐은 비-장용 코팅을 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 히드록실 프로필 메틸 셀룰로스(HPMC)를 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 젤라틴을 포함한다. 일부 구현예에서, 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함하는 미니-정제(예를 들어, 장용 코팅된 미니-정제)가 캡슐(들)에 함유되고, 여기서 선택적으로 캡슐은 HPMC를 포함한다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물은 (예를 들어, 재현탁을 위해서 또는 고체 투여 형태(예컨대, 캡슐)로의 사용을 위해서) 분말로서 또는 고체 투여 형태, 예컨대, 정제, 미니정제, 캡슐, 환제 또는 분말로서; 또는 이들 형태의 조합물(예를 들어, 캡슐에 포함된 미니정제)로서 제조된다. 특정 구현예에서, 분말은 동결건조된 박테리아를 포함할 수 있다.
본 명세서에 개시된 양태 중 어느 하나의 특정 구현예에서, 약제학적 조성물은 고체 투여 형태로서 제형화된다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 정제, 캡슐, 미니정제, 분말 또는 이들의 조합물로부터 선택된 투여 형태를 갖는다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 현탁액으로(예를 들어, PBS 중에) 제형화된다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 경구, 정맥내, 피부하, 피부내 및/또는 복강내 투여를 위해서 제형화된다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 경구 투여를 위해서 제형화된다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 동결건조된 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 특정 구현예에서, 동결건조된 프레보텔라 박테리아는 고체 투여 형태, 예컨대, 정제, 미니정제, 캡슐, 환제 또는 분말로 제형화된다. 일부 구현예에서, 동결건조된 프레보텔라 박테리아는 캡슐에 함유된다. 일부 구현예에서, 동결건조된 프레보텔라 박테리아는 용액으로 재현탁된다.
특정 구현예에서, 본 명세서에는 TH2-매개 병태를 갖는 대상체를 치료하는 방법이 제공되며, 이 방법은 대상체에게 본 명세서에 기재된 약제학적 조성물을 투여하는 단계를 포함한다.
특정 구현예에서, 본 명세서에는 아토피 피부염을 갖는 대상체를 치료하는 방법이 제공되며, 이 방법은 대상체에게 본 명세서에 기재된 약제학적 조성물을 투여하는 단계를 포함한다.
특정 구현예에서, 본 명세서에는 음식 알레르기를 갖는 대상체를 치료하는 방법이 제공되며, 이 방법은 대상체에게 본 명세서에 기재된 약제학적 조성물을 투여하는 단계를 포함한다.
일부 구현예에서, 본 명세서에 제공된 방법은 대상체에게 항생제를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 방법은 대상체에게 병태를 위한 1종 이상의 다른 요법을 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 방법은 또 다른 치료용 박테리아의 투여를 추가로 포함한다.
도 1a는 프레보텔라 히스티콜라의 경구 투여가 FITC-유도 접촉 과민증 모델에서 FITC 귀 시험감염 후 8시간에 귀 부종을 상당히 감소시켰다는 것을 나타낸 그래프이다. (일반 일원 ANOVA; 덱사메타손의 경우 p<0.001; 피. 히스티콜라의 경우 p: 0.0031)
도 1b는 프레보텔라 히스티콜라 치료가 귀에서 Il4, Il5, Il33, Il17a, Il1b Tslp에 대한 유전자 발현을 감소시켰다는 것을 나타낸 일련의 그래프이다.
도 2는 프레보텔라 히스티콜라의 경구 투여가 FITC-유도 접촉 과민증 모델에서 FITC 귀 시험감염 후 8시간에 귀 부종을 상당히 감소시켰다는 것을 나타낸 그래프이다. (일반 일원 ANOVA; 균주 1은 프레보텔라의 또 다른 종의 균주이고; 균주 2는 프레보텔라와 상이한 속의 균주이다.)
도 3a는 아토피 피부염-연관 음식 알레르기의 모델에 대한 연구 설계를 도시한다.
도 3b는 프레보텔라 히스티콜라의 경구 투여가 오브알부민(OVA) 음식 알레르겐 모델을 사용한 아토피 피부염-연관 음식 알레르기 모델에서 귀 염증을 상당히 감소시켰다는 것을 나타낸 그래프이다. (일반 일원 ANOVA; 토파시티닙의 경우 p: 0.0009; 피. 히스티콜라의 경우 p <0.0001; 균주 B의 경우 p: 0.0047; 균주 A는 프레보텔라와 상이한 속의 균주이고; 균주 B는 프레보텔라 히스티콜라의 또 다른 균주이다.)
도 3c는 오브알부민(OVA) 음식 알레르겐을 사용한 아토피 피부염-연관 음식 알레르기 모델에서 비히클, 토파시티닙, 프레보텔라 히스티콜라 또는 2개의 다른 박테리아 종("균주 A" 및 "균주 B")이 투여된 마우스에서 IgG1 및 IgE 수준을 도시한 한 쌍의 그래프이다(균주 A는 프레보텔라와 상이한 속의 균주이고; 균주 B는 프레보텔라 히스티콜라의 또 다른 균주이다).
도 3d는 오브알부민(OVA) 음식 알레르겐을 사용한 아토피 피부염-연관 음식 알레르기 모델에서 비히클, 토파시티닙, 프레보텔라 히스티콜라 또는 2개의 다른 박테리아 종("균주 A" 및 "균주 B")이 투여된 마우스에서 IL-4, IL-5, IL-13, IL-10, IL-31 및 IL-33 수준을 도시한 일련의 그래프이다(균주 A는 프레보텔라와 상이한 속의 균주이고; 균주 B는 프레보텔라 히스티콜라의 또 다른 균주이다).
도 4a는 음식 알레르겐으로서 오브알부민(OVA) 또는 CPE(완전 땅콩 추출물(complete peanut extract))를 사용한 아토피 피부염-연관 음식 알레르기 모델을 시험한 마우스 모델에 대한 연구 설계를 나타낸다.
도 4b는 프레보텔라 히스티콜라의 경구 투여가 OVA-유도 및 땅콩 알레르겐(CPE)-유도 아토피 피부염-연관 음식 알레르기 모델 둘 다에서 귀 염증을 상당히 감소시켰다는 것을 나타낸 그래프이다. (일반 일원 ANOVA; 토파시티닙의 경우 p: <0.0001; 항-IL-4의 경우 p: 0.0024; 균주 A의 경우 p: 0.0163; 피. 히스티콜라(OVA 군)의 경우 p<0.0001; CPE 군의 경우 p: <0.0001(비히클 대 피. 히스티콜라); 균주 A는 프레보텔라와 상이한 속의 균주이다.)
도 4c는 오브알부민(OVA) 음식 알레르겐을 사용한 아토피 피부염-연관 음식 알레르기 모델에서 비히클, 토파시티닙, 항-IL-4, 프레보텔라 히스티콜라 또는 또 다른 박테리아 종("균주 A")이 투여된 마우스에서 항-OVA IgG1 및 항-OVA IgE 수준을 나타낸 한 쌍의 그래프이다(균주 A는 프레보텔라와 상이한 속의 균주임).
도 4D는 오브알부민(OVA) 음식 알레르겐을 사용한 아토피 피부염-연관 음식 알레르기 모델에서 비히클, 토파시티닙, 항-IL-4, 프레보텔라 히스티콜라 또는 또 다른 박테리아 종("균주 A") 및 땅콩 알레르겐(CPE)-유도 접촉 과민증 모델에서 비히클 및 프레보텔라 히스티콜라가 투여된 마우스에서 IL-4, IL-5, IL-13, IL-10 및 IL-31 수준을 나타낸 일련의 그래프이다(균주 A는 프레보텔라와 상이한 속의 균주이다).
도 4E는 오브알부민(OVA) 음식 알레르겐을 사용한 아토피 피부염-연관 음식 알레르기 모델에서 비히클, 토파시티닙, 항-IL-4, 프레보텔라 히스티콜라 또는 또 다른 박테리아 종("균주 A") 및 음식 알레르겐으로서 땅콩 알레르겐(CPE)를 사용한 아토피 피부염-연관 음식 알레르기 모델에서 비히클 및 프레보텔라 히스티콜라가 투여된 마우스에서 귀 IL-4, IL-5, TSLP, CCR4 및 IL-19 RNA 수준을 나타낸 일련의 그래프이다(균주 A는 프레보텔라와 상이한 속의 균주이다).
도 5는 타입 2 피부 염증 및 음식 알레르기 유도의 MC903 모델을 나타낸다.
도 6a는 피부 감작 땅콩 알레르기 모델에 대한 연구 설계를 나타낸다.
도 6b는 피부 감작 땅콩 알레르기 모델에 대한 연구 설계를 나타낸다.
도 6c는 피부 감작 땅콩 알레르기 모델에 대한 연구 설계를 나타낸다.
도 6d는 프레보텔라 히스티콜라의 경구 투여가 피부 감작 땅콩 알레르기 모델에서 귀 부종을 상당히 감소시켰다는 것을 나타낸 그래프이다.
도 6e는 피부 감작 땅콩 알레르기 모델에서 비히클, 토파시티닙("tofa") 또는 프레보텔라 히스티콜라가 투여된 마우스에서 시험감염일에 총 IgE 및 항-땅콩 IgE 수준을 나타낸 한 쌍의 그래프이다.
도 6f는 피부 감작 땅콩 알레르기 모델에서 비히클, 토파시티닙("tofa") 또는 프레보텔라 히스티콜라가 투여된 마우스에서 시험감염일에 총 IgG1 및 항-땅콩 IgG1 수준을 나타낸 한 쌍의 그래프이다.
도 6g는 피부 감작 땅콩 알레르기 모델에서 비히클, 토파시티닙("tofa") 또는 프레보텔라 히스티콜라가 투여된 마우스에서 시험감염 2주 후에 총 IgE 및 항-땅콩 IgE 수준을 나타낸 한 쌍의 그래프이다.
도 6h는 피부 감작 땅콩 알레르기 모델에서 비히클, 토파시티닙("tofa") 또는 프레보텔라 히스티콜라가 투여된 마우스에서 시험감염 2주 후에 총 IgG1 및 항-땅콩 IgG1 수준을 나타낸 한 쌍의 그래프이다.
도 6i는 피부 감작 땅콩 알레르기 모델에서 비히클, 토파시티닙("tofa") 또는 프레보텔라 히스티콜라가 투여된 마우스에서 시험감염 2주 후에 총 IgA 및 항-땅콩 IgA 수준을 나타낸 한 쌍의 그래프이다.
도 7a는 FITC-CHS 모델 실험 설계를 나타낸 개략도이다.
도 7b는 FITC-CHS 모델에서 비히클, 덱사메타손 또는 프레보텔라 히스티콜라가 투여되었던 마우스로부터의 생체외에서 재자극된 장간막 림프절(mLN) 세포에서 IL-13, IL-4, IL-5, IL-31 및 IL-33 수준을 나타낸 일련의 그래프이다.
도 7c는 FITC-CHS 모델에서 비히클, 덱사메타손 또는 프레보텔라 히스티콜라가 투여되었던 마우스로부터의 생체외에서 재자극된 귀 드레이닝 경부 림프절(draining cervical lymph node)(cLN) 세포에서 IL-13, IL-4, IL-5, IL-31 및 IL-33 수준을 나타낸 일련의 그래프이다.
도 8a는 MC903 유도 아토피 피부염 모델 실험 설계를 나타낸 개략도이다.
도 8b는 MC903 유도 아토피 피부염 모델에서 비히클, 토파시티닙 또는 프레보텔라 히스티콜라로 처리된 마우스에서 시간에 따른 귀측 정치(좌측 패널) 및 14일에 귀 염증(우측 패널)을 나타낸 한 쌍의 그래프이다.
도 8c는 MC903 유도 아토피 피부염 모델에서 비히클, 토파시티닙 또는 프레보텔라 히스티콜라로 처리된 마우스로부터의 귀 조직에서 Tslp, Il5, Il31, Il4, Ccl19 및 Ccr4 전사체 수준을 나타낸 일련의 그래프이다.
도 8d는 MC903 유도 아토피 피부염 모델에서 비히클, 토파시티닙 또는 프레보텔라 히스티콜라로 처리된 마우스로부터의 공장에서 비만 세포 관련 유전자(Mcpt1) 전사체 수준을 나타낸 그래프이다.
도 8e는 MC903-유도 아토피 피부염 모델에서 비히클, 토파시티닙 또는 프레보텔라 히스티콜라로 처리된 마우스에서 장간막 림프절(좌측 패널) 및 비장(우측 패널)에서 IL-10 수준을 나타낸 한 쌍의 그래프이다.
본 명세서에 개시된 바와 같이, 프레보텔라 속의 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물은 치료 효과를 가지며, 하나 이상의 TH2-매개 병태의 치료 또는 예방(즉, 치료, 예방, 또는 치료와 예방 모두)에 유용하다. 이러한 TH2-매개 병태는 알레르기 비염, 천식, 아토피 피부염, 두드러기, 혈관부종, 알레르기(예를 들어, 음식 알레르기, 곤충-유도 알레르기 또는 약물 알레르기), 아나필락시스 및 호산구 증가증을 포함하지만 이들로 제한되지 않는다. 약제학적 조성물은 프레보텔라 히스티콜라 박테리아를 포함할 수 있다.
정의
"아주반트(adjuvant)" 또는 "아주반트 요법"은 대상체(예를 들어, 인간)에서 면역학적 또는 생리학적 반응에 영향을 미치는 작용제를 광범위하게 지칭한다. 예를 들어, 아주반트는 시간이 지남에 따라 또는 관심 영역으로 항원의 존재를 증가시키고, 항원 제시 세포 항원의 흡수를 돕고, 대식세포 및 림프구를 활성화시키고, 사이토카인의 생산을 지원할 수 있다. 면역 반응을 변화시킴으로써, 아주반트는 소량의 면역 상호작용제가 특정 용량의 면역 상호작용제의 효과 또는 안전성을 증가시키도록 허용할 수 있다. 예를 들어, 아주반트는 T 세포 고갈을 방지하여 특정 면역 상호작용제의 효과 또는 안전성을 증가시킬 수 있다.
"투여"는 대상체에 대한 조성물(예를 들어, 약제학적 조성물)의 투여 경로를 광범위하게 지칭한다. 투여 경로의 예는 경구 투여, 직장 투여, 국소 투여, 흡입(비강) 또는 주사를 포함한다. 주사 투여는 정맥내(IV), 근육내(IM) 및 피하(SC) 투여를 포함한다. 본 명세서에 기재된 약제학적 조성물은 경구, 비경구, 장내, 정맥내, 복강내, 국소, 경피(예를 들어, 임의의 표준 패치를 사용), 피내, 안구내, 비강내, 국소, 비경구, 예컨대, 에어로졸, 흡입, 피하, 근육내, 협측, 설하, (경)직장, 질, 동맥내 및 경막내, 점막내(예를 들어, 설하, 혀, (경)협측), (경)요도, 질(예를 들어, 경질내 및 질내), 이식, 방광내, 폐내, 십이지장내, 위내 및 기관지내를 포함하지만, 이에 제한되지 않는 임의의 효과적인 경로에 의해 임의의 형태로 투여될 수 있다. 바람직한 구현예에서, 본 명세서에 기재된 약제학적 조성물은 경구, 직장, 국소, 방광내, 배액 림프절 내로 또는 인접하여 주사에 의해, 정맥내, 흡입 또는 에어로졸에 의해, 또는 피하로 투여된다. 또 다른 바람직한 구현예에서, 본 명세서에 기재된 약제학적 조성물은 경구로 또는 정맥내로 투여된다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "항체"는 온전한 항체 및 이의 항원 결합 단편 둘 모두를 지칭할 수 있다. 온전한 항체는 디설파이드 결합에 의해 상호-연결된 적어도 2개의 중쇄(H) 및 2개의 경쇄(L)를 포함하는 당단백질이다. 각각의 중쇄는 중쇄 가변 영역(본 명세서에서 VH로 축약됨) 및 중쇄 불변 영역을 포함한다. 각각의 경쇄는 경쇄 가변 영역(본 명세서에서 VL로 축약됨) 및 경쇄 불변 영역을 포함한다. VH 영역 및 VL 영역은 프레임워크 영역(framework region: FR)으로 지칭되는 보다 보존된 영역들과 산재된 상보성 결정 영역(complementarity determining region: CDR)으로 지칭되는 초가변 영역으로 추가로 세분될 수 있다. 각각의 VH 및 VL은 3개의 CDR 및 4개의 FR로 구성되며, 하기의 순서로 아미노-말단에서 카르복시-말단으로 배열된다: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. 중쇄 및 경쇄의 가변 영역은 항원과 상호작용하는 결합 도메인을 함유한다. 용어 "항체"는 예를 들어, 단일클론 항체, 다중클론 항체, 키메라 항체, 인간화 항체, 인간 항체, 다중특이적 항체(예를 들어, 이중특이적 항체), 단일-쇄 항체 및 항원-결합 항체 단편을 포함한다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 항체의 "항원 결합 단편" 및 "항원-결합 부분"은 항원에 결합하는 능력을 유지하는 항체의 하나 이상의 단편을 지칭한다. 항체의 "항원-결합 단편"이라는 용어에 포함되는 결합 단편의 예는 Fab, Fab', F(ab')2, Fv, scFv, 디설파이드 결합 Fv, Fd, 디아바디, 단일-쇄 항체, NANOBODIES®, 단리된 CDRH3, 및 온전한 항체의 가변 영역의 적어도 일부를 보유하는 다른 항체 단편을 포함한다. 이들 항체 단편은 통상적인 재조합 및/또는 효소 기술을 사용하여 수득될 수 있으며, 온전한 항체와 동일한 방식으로 항원 결합에 대해 스크리닝될 수 있다.
"탄수화물"은 당 또는 당의 중합체를 지칭한다. 용어들 "당류", "다당류", "탄수화물" 및 "올리고당"은 상호교환적으로 사용될 수 있다. 대부분의 탄수화물은 많은 하이드록실기를 가진 알데히드 또는 케톤이며, 보통 분자의 각 탄소 원자에 하나씩 있다. 탄수화물은 일반적으로 분자식 CnH2nOn을 갖는다. 탄수화물은 단당류, 이당류, 삼당류, 올리고당 또는 다당류일 수 있다. 가장 기본적인 탄수화물은 단당류, 예컨대, 글루코스, 수크로스, 갈락토스, 만노스, 리보스, 아라비노스, 자일로스, 및 프룩토스이다. 이당류는 2개의 결합된 단당류이다. 예시적인 이당류는 수크로스, 말토스, 셀로비오스 및 락토스를 포함한다. 전형적으로, 올리고당은 3 내지 6개의 단당류 단위(예를 들어, 라피노스, 스타키오스)를 포함하고, 다당류는 6개 이상의 단당류 단위를 포함한다. 예시적인 다당류는 전분, 글리코겐 및 셀룰로스를 포함한다. 탄수화물은 수산기가 제거된 2'-데옥시리보스, 수산기가 불소로 대체된 2'-플루오로리보스, 또는 글루코스의 질소-함유 형태인 N-아세틸글루코사민과 같은 변형된 당류 단위(예를 들어, 2'-플루오로리보스, 데옥시리보스 및 헥소스)를 함유할 수 있다. 탄수화물은 많은 상이한 형태, 예를 들어, 컨포머(conformer), 환식 형태, 비환식 형태, 입체이성질체, 호변이성질체, 아노머 및 이성질체로 존재할 수 있다.
"세포 증대"는 조성물(예를 들어, 약제학적 조성물)의 투여 전에 환경에 실질적으로 존재하지 않고 조성물 자체에 존재하지 않는, 환경에서 세포의 유입 또는 세포의 확장을 광범위하게 지칭한다. 환경을 증대시키는 세포는 면역 세포, 간질 세포, 박테리아 및 진균 세포를 포함한다.
"분기군"은 계통수에서 통계적으로 유효한 노드의 하류에 있는 계통수의 OTU 또는 구성원을 지칭한다. 분기군은 상이한 단일계통 진화 단위이고 어느 정도의 서열 유사성을 공유하는 계통수에서의 말단 잎 세트를 포함한다.
2개 이상의 미생물 균주로부터의 미생물(예를 들어, 박테리아)의 "조합"은 동일한 물질 또는 생성물, 또는 물리적으로 연결된 생성물에서, 얻어진 미생물의 물리적 공존뿐만 아니라 2개 이상의 균주의 시간적 공동-투여 또는 공동-국재화를 포함한다. 일부 구현예에서, 균주 중 하나는 프레보텔라 박테리아, 예를 들어, 프레보텔라 히스티콜라 박테리아로부터 유래된다.
용어 "감소시키다" 또는 "고갈시키다"는 치료 전 상태와 비교할 때 치료 후, 상황에 따라 차이가 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 1/100, 1/1000, 1/10,000, 1/100,000, 1/1,000,000 또는 검출 불가가 되도록 하는 변화를 의미한다. 감소될 수 있는 특성은 면역 세포, 박테리아 세포, 기질 세포, 골수 유래 억제자 세포, 섬유모세포, 대사산물의 수; 사이토카인의 수준; 또는 또 다른 물리적 매개변수(예컨대, (예를 들어, DTH 동물 모델에서) 귀 두께 또는 (예를 들어, 동물 종양 모델에서) 종양 크기)를 포함한다.
용어 "생태학적 컨소시엄"은 개선된 효능을 위해 상보적인 숙주 경로를 활성화시켜 숙주 시너지를 유도하는 2개의 박테리아와 대조적으로, 대사물을 교환하고 서로 양성적으로 공동조절하는 박테리아의 그룹이다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "조작된 박테리아"는 인간 활동에 의해 그들의 자연 상태로부터 유전적으로 변경된 임의의 박테리아, 및 임의의 이러한 박테리아의 자손이다. 조작된 박테리아는 예를 들어, 표적화된 유전자 변형의 생성물, 무작위 돌연변이 유발 스크린의 생성물 및 유도 진화의 생성물을 포함한다.
용어 "에피토프"는 항체 또는 T 세포 수용체에 특이적으로 결합할 수 있는 단백질 결정인자를 의미한다. 에피토프는 일반적으로 아미노산 또는 당 측쇄와 같은 분자의 화학적 활성 표면 그룹으로 구성된다. 특정 에피토프는 항체가 결합할 수 있는 특정 아미노산 서열에 의해 정의될 수 있다.
용어 "유전자"는 생물학적 기능과 관련된 임의의 핵산을 지칭하기 위해 광범위하게 사용된다. 용어 "유전자"는 특정 게놈 서열뿐만 아니라 이 게놈 서열에 의해 암호화된 cDNA 또는 mRNA에도 적용된다.
2개의 핵산 분자의 핵산 서열 사이의 "동일성"은 예를 들어, 문헌[Pearson et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:2444]에서와 같은 기본 파라미터를 사용하여, "FASTA" 프로그램과 같은 공지된 컴퓨터 알고리즘을 사용하여 동일성 백분율로서 결정될 수 있다(다른 프로그램은 GCG 프로그램 패키지(문헌[Devereux, J., et al., Nucleic Acids Research 12(I):387 (1984)]), BLASTP, BLASTN, FASTA(문헌[Atschul, S. F., et al., J Molec Biol 215:403 (1990); 문헌[Guide to Huge Computers, Mrtin J. Bishop, ed., Academic Press, San Diego, 1994], 및 문헌[Carillo et al. (1988) SIAM J Applied Math 48:1073])를 포함함). 예를 들어, 미국 국립 생물공학 정보센터 데이터베이스의 BLAST 기능을 사용하여 동일성을 결정할 수 있다. 다른 상업적으로 또는 공개적으로 이용가능한 프로그램에는, DNAStar "MegAlign" 프로그램(Madison, Wis.) 및 위스콘신 대학교 Genetics Computer Group(UWG)의 "Gap" 프로그램(Madison Wis.)이 포함된다.
"면역요법"은 대상체의 면역계를 사용하여 질환(예를 들어, 면역 질환, 염증성 질환, 대사성 질환, 암)을 치료하는 치료법이며, 예를 들어 관문 저해제, 암 백신, 사이토카인, 세포 요법, CAR-T 세포 및 수지상 세포 요법을 포함한다.
용어 "증가하다"는 치료 전 상태와 비교할 때 치료 후, 상황에 따라 차이가 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 2배, 4배, 10배, 100배, 10^3배, 10^4배, 10^5배, 10^6배 및/또는 10^7배 더 크도록 되는 변화를 의미한다. 증가될 수 있는 특성은 면역 세포, 박테리아 세포, 기질 세포, 골수 유래 억제자 세포, 섬유모세포, 대사산물의 수; 사이토카인의 수준; 또는 또 다른 물리적 매개변수(예컨대, (예를 들어, DTH 동물 모델에서) 귀 두께 또는 (예를 들어, 동물 종양 모델에서) 종양 크기)를 포함한다.
"선천적 면역 작용제" 또는 "면역-아주반트"는 소분자, 단백질 또는 Toll-유사 수용체(TLR), NOD 수용체, RLR, C-타입 렉틴 수용체, STING-cGAS 경로 구성요소, 인플라마솜 복합체를 포함한 선천적 면역 수용체를 특이적으로 표적화하는 다른 제제이다. 예를 들어, LPS는 박테리아 유래 또는 합성된 TLR-4 작용제이며, 알루미늄은 면역 자극 아주반트로서 사용될 수 있다. 면역 아주반트는 특정 부류의 광범위한 아주반트 또는 아주반트 요법이다. STING 작용제의 예는 2'3'-cGAMP, 3'3'-cGAMP, c-di-AMP, c-di-GMP, 2'2'-cGAMP, 및 2'3'-cGAM(PS)2 (Rp/Sp)(2'3'-cGAMP의 비스-포스포로티오에이트 유사체의 Rp,Sp-이성질체)을 포함하지만, 이들로 제한되지 않는다. TLR 작용제의 예는 TLR1, TLR2, TLR3, TLR4, TLR5, TLR6, TLR7, TLR8, TLR9, TLR10 및 TLR11을 포함하지만, 이들로 제한되지 않는다. NOD 작용제의 예는 N-아세틸무라밀-L-알라닐-D-이소글루타민(무라밀디펩타이드(MDP)), 감마-D-글루타밀-메소-디아미노피멜산(iE-DAP) 및 데스무라밀펩타이드(DMP)를 포함하지만, 이들로 제한되지 않는다.
"내부 전사된 스페이서"또는 "ITS"는 진핵생물 종, 특히 진균의 동정에 종종 사용되는 공통 전구체 전사체 상의 구조적 리보솜 RNA(rRNA)들 사이에 위치한 비 기능적 RNA의 조각이다. 리보솜의 코어를 형성하는 진균의 rRNA는 신호 유전자로서 전사되고, 8S, 5.8S 및 28S 영역으로 구성되며, ITS4와 ITS5는 각각 8S와 5.8S 영역 사이, 그리고 5.8S와 28S 영역 사이에 위치한다. 18S와 5.8S 영역 및 5.8S와 28S 영역 사이의 이러한 두 시스트론내 세그먼트는 스플라이싱에 의해 제거되고, 이전에 기술된 바와 갚이 바코드 목적을 위하여 종 사이에 상당한 변이를 갖는다(문헌[Schoch et al Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi. PNAS 109:6241-6246. 2012]). 18S rDNA는 전통적으로 계통발생적 재구성에 사용되지만, ITS는 이것이 일반적으로 고도로 보존되지만 대부분의 진균의 속 및 종을 구분짓기에 충분한 뉴클레오티드 다양성을 보유하는 초가변 영역을 포함하므로 이 기능을 수행할 수 있다.
용어 "단리된" 또는 "강화된"은 (1) 초기에 생산되었을 때(자연에서 또는 실험 설정에서) 관련된 성분들 중 적어도 일부로부터 분리된, 및/또는 (2) 인간의 손에 의해 생산, 제조, 정제 및/또는 제작된 미생물 또는 다른 개체 또는 물질을 포함한다. 단리된 미생물은 초기에 관련된 다른 성분들의 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 90%, 또는 그 이상으로부터 분리될 수 있다. 일부 구현예에서, 단리된 미생물은 약 80% 초과, 약 85%, 약 90%, 약 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99%, 또는 약 99% 초과 순수하고, 예를 들어, 다른 성분이 실질적으로 존재하지 않는다. 용어 "정제하다," "정제하는" 및 "정제된"은 초기에 생산 또는 생성되었을 때(예를 들어, 자연에서 또는 실험 설정에서), 또는 초기 생산 후 언제든지, 관련된 성분들 중 적어도 일부로부터 분리된 다른 물질 또는 미생물을 지칭한다. 미생물 또는 미생물 집단은 미생물 또는 미생물 집단을 함유하는 물질 또는 환경 등으로 생산 시 또는 생산 후에 단리된 경우 정제된 것으로 간주될 수 있으며, 정제된 미생물 또는 미생물 집단은 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 90% 이하, 또는 약 90% 초과의 다른 물질을 함유할 수 있으며, 여전히 "단리된" 것으로 간주된다. 일부 구현예에서, 정제된 미생물 또는 미생물 집단은 약 80% 초과, 약 85%, 약 90%, 약 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99%, 또는 약 99% 초과 순수하다. 본 명세서에 제공된 미생물 조성물의 경우에, 조성물에 존재하는 하나 이상의 미생물 유형은 미생물 유형을 함유하는 물질 또는 환경에서 생성되고/되거나 존재하는 하나 이상의 다른 미생물로부터 독립적으로 정제될 수 있다. 미생물 조성물 및 이의 미생물 성분은 일반적으로 잔류 서식지 생성물로부터 정제된다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "지질"은 지방, 오일, 트리글리세리드, 콜레스테롤, 인지질, 유리 지방산을 포함하는 임의의 형태의 지방산을 포함한다. 지방, 오일 및 지방산은 포화, 불포화(시스 또는 트랜스) 또는 부분 불포화(시스 또는 트랜스)일 수 있다.
용어 "LPS 돌연변이체 또는 리포폴리사카라이드 돌연변이체"는 광범위하게 LPS의 손실을 포함하는 선택된 박테리아를 지칭한다. LPS의 손실은 lpxA, lpxC lpxD와 같은 지질 A 생합성에 관여하는 유전자의 돌연변이 또는 파괴로 인한 것일 수 있다. LPS 돌연변이체를 포함하는 박테리아는 아미노글리코시드 및 폴리믹신(폴리믹신 B 및 콜리스틴)에 내성이 있을 수 있다.
본 명세서에서 사용된 바와 같은 "대사산물"은 임의의 세포 또는 미생물 대사 반응에서 기질로서 사용되거나 또는 임의의 세포 또는 미생물 대사 반응으로부터 생성물 화합물, 조성물, 분자, 이온, 보조 인자, 촉매 또는 영양소로서 생성되는 모든 분자 화합물, 조성물, 분자, 이온, 보조 인자, 촉매 또는 영양소를 지칭한다.
"미생물"은 고균(archaeaon), 기생충, 박테리아, 진균, 미세 조류, 원생동물, 및 유기체와 관련된 발달 단계 또는 생애주기 단계(예를 들어, 식물, 포자(포자 형성, 휴면 및 발아 포함), 잠복, 생물막)로 특징지어지는 임의의 천연 또는 조작된 유기체를 지칭한다. 일부 구현예에서, 미생물은 박테리아이다. 장내 미생물의 예는 다음을 포함한다: 악티노마이세스 그라에베닛치이(Actinomyces graevenitzii), 악티노마이세스 오도톨라이티쿠스(Actinomyces odontolyticus), 아커만시아 무시니필라(Akkermansia muciniphila), 박테로이데스 카카에(Bacteroides caccae), 박테로이데스 프라질리스(Bacteroides fragilis), 박테로이데스 푸트레디니스(Bacteroides putredinis), 박테로이데스 테타이오타오미크론(Bacteroides thetaiotaomicron), 박테로이데스 불타구스(Bacteroides vultagus), 비피도박테리움 아돌레센티스(Bifidobacterium adolescentis), 비피도박테리움 비피둠(Bifidobacterium bifidum), 빌로필라 와드스워시아(Bilophila wadsworthia), 블라우티아(Blautia), 부티리비브리오(Butyrivibrio), 캄필로박터 그라실리스(Campylobacter gracilis), 클로스트리디아 클러스터 III(Clostridia cluster III), 클로스트리디아 클러스터 IV, 클로스트리디아 클러스터 IX(애시드아미노코카세아(Acidaminococcaceae) 그룹), 클로스트리디아 클러스터 XI, 클로스트리디아 클러스터 XIII(펩토스트렙토코쿠스(Peptostreptococcus) 그룹), 클로스트리디아 클러스터 XIV, 클로스트리디아 클러스터 XV, 콜린셀라 아에로파시엔스(Collinsella aerofaciens), 코프로코쿠스(Coprococcus), 코리네박테리움 선스발렌세(Corynebacterium sunsvallense), 데술포모나스 피그라(Desulfomonas pigra), 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans), 도레아 론기카테나(Dorea longicatena), 에스케리치아 콜라이(Escherichia coli), 유박테리움 하드룸(Eubacterium hadrum), 유박테리움 렉테일(Eubacterium rectale), 패칼리박테리아 프라우스닛치이(Faecalibacteria prausnitzii), 게멜라(Gemella), 락토코쿠스(Lactococcus), 란크노스피라(Lanchnospira), 몰리쿠테스 클러스터 XVI(Mollicutes cluster) XVI, 몰리쿠테스 클러스터 XVIII, 프레보텔라, 로티아 무실라기노사(Rothia mucilaginosa), 루미노코쿠스 칼리두스(Ruminococcus callidus), 루미노코쿠스 그나부스(Ruminococcus gnavus), 루미노코쿠스 토르케스(Ruminococcus torques) 및 스트렙토코쿠스(Streptococcus).
"미생물군"은 광범위하게 대상체 또는 환자의 신체 부위에 또는 그 안에 존재하는 미생물을 지칭한다. 미생물군의 미생물은 박테리아, 바이러스, 진핵생물 미생물 및/또는 바이러스를 포함할 수 있다. 미생물군의 개별 미생물은 대사 활성, 휴면성, 잠복성일 수 있거나, 포자로서 존재할 수 있거나, 플랑크톤으로 또는 바이오 필름에 존재할 수 있거나, 지속 가능하거나 일시적인 방식으로 미생물군에 존재할 수 있다. 미생물군은 공생 또는 건강 상태 미생물군 또는 질환 상태 미생물군일 수 있다. 미생물군은 대상체 또는 환자에 고유할 수 있거나, 또는 건강 상태 또는 치료 조건의 변화(예를 들어, 항생제 치료, 상이한 미생물에 대한 노출)로 인해 미생물군의 성분이 조절, 도입 또는 고갈될 수 있다. 일부 양태에서, 미생물군은 점막 표면에서 발생한다. 일부 양태에서, 미생물군은 장 미생물군이다.
조직 또는 샘플의 "미생물군 프로파일" 또는 "미생물군 서명"은 미생물군의 박테리아 구성의 적어도 부분적인 특성화를 지칭한다. 일부 구현예에서, 미생물군 프로파일은 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100가지 이상의 박테리아 균주가 미생물군에 존재하는지 부재하는지를 나타낸다.
박테리아와 관련하여 "변형된"은 박테리아의 야생형으로부터 변화를 거친 박테리아를 광범위하게 지칭한다. 박테리아 변형은 박테리아를 조작함으로써 발생할 수 있다. 박테리아 변형의 예는 유전자 변형, 유전자 발현 변형, 표현형 변형, 제형화 변형, 화학적 변형 및 용량 또는 농축을 포함한다. 개선된 특성의 예는 본 명세서 전반에 걸쳐 기술되어 있으며, 예를 들어 약독화, 영양요구성, 회귀성 또는 항원성을 포함한다. 표현형 변형은, 예로서, 병독성을 증가시키거나 감소시키도록 박테리아의 표현형을 변형시키는 배지에서의 박테리아 성장을 포함할 수 있다.
"조작 분류 단위(operational taxonomic unit)" 및 "OTU(들)"는 계통수에서 말단 잎을 지칭하고, 핵산 서열, 예를 들어 전체 게놈 또는 특정 유전자 서열, 및 종 수준에서 이 핵산 서열에 대한 서열 동일성을 공유하는 모든 서열에 의해 정의된다. 일부 구현예에서, 특정 유전자 서열은 16S 서열 또는 16S 서열의 일부일 수 있다. 다른 구현예에서, 2개의 개체의 전체 게놈이 서열분석되고 비교된다. 또 다른 구현예에서, 다중 위치 서열 태그(MLST), 특정 유전자 또는 유전자 세트와 같은 선택된 영역은 유전자 비교될 수 있다. 16S의 경우, 전체 16S 또는 16S의 일부 가변 영역에 걸쳐 97% 이상의 평균 뉴클레오티드 동일성을 공유하는 OTU들은 동일한 OTU로 간주된다. 예를 들어, 문헌[Claesson MJ, Wang Q, O'Sullivan O, Greene-Diniz R, Cole JR, Ross RP, and O'Toole PW. 2010. Comparison of two next-generation sequencing technologies for resolving highly complex microbiota composition using tandem variable 16S rRNA gene regions. Nucleic Acids Res 38: e200]. 문헌[Konstantinidis KT, Ramette A, and Tiedje JM. 2006. The bacterial species definition in the genomic era. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci361: 1929-1940] 참조. 완전한 게놈의 경우, 95% 이상의 평균 뉴클레오티드 동일성을 공유하는 MLST, 16S 이외의 특정 유전자 또는 유전자 세트의 OTU들은 동일한 OTU로 간주된다. 예를 들어, 문헌[Achtman M, and Wagner M. 2008. Microbial diversity and the genetic nature of microbial species. Nat. Rev. Microbiol. 6. 431-440]. 문헌[Konstantinidis KT, Ramette A, and Tiedje JM. 2006. The bacterial species definition in the genomic era. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci361: 1929-1940] 참조. OTU는 흔히 유기체 간의 서열을 비교함으로써 정의된다. 일반적으로, 95% 미만의 서열 동일성을 갖는 서열은 동일한 OTU의 일부를 형성하는 것으로 간주되지 않는다. OTU는 또한 뉴클레오티드 마커 또는 유전자의 임의의 조합, 특히 고도로 보존된 유전자(예를 들어, "하우스-키핑(house-keeping)" 유전자)의 임의의 조합, 또는 이의 조합을 특징으로 할 수 있다. 예를 들어, 속, 종 및 계통발생적 분기군에 대한 분류학적 할당을 갖는 조작 분류 단위(OTU)가 본 명세서에 제공된다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 유전자가 동일한 조건 하에서 동일한 종의 야생형 박테리아에 의해 발현되는 것보다 적어도 일부 조건 하에서 조작된 박테리아에서 더 높은 수준으로 발현되는 경우, 유전자는 박테리아에서 "과발현"된다. 유사하게, 유전자가 동일한 조건 하에서 동일한 종의 야생형 박테리아에 의해 발현되는 것보다 적어도 일부 조건 하에서 조작된 박테리아에서 더 낮은 수준으로 발현되는 경우, 유전자는 박테리아에서 "저발현"된다.
용어들 "폴리뉴클레오티드" 및 "핵산"은 상호교환적으로 사용된다. 이들은 임의의 길이의 뉴클레오티드의 중합체 형태, 데옥시리보뉴클레오티드 또는 리보뉴클레오티드, 또는 이들의 유사체를 지칭한다. 폴리뉴클레오티드는 임의의 3차원 구조를 가질 수 있고, 임의의 기능을 수행할 수 있다. 하기는 폴리뉴클레오타이드의 비-제한적인 예이다: 유전자 또는 유전자 단편의 암호화 또는 비-암호화 영역, 연결 분석으로부터 정의된 유전자좌(유전자좌들), 엑손, 인트론, 메신저 RNA(mRNA), 마이크로 RNA(miRNA), 침묵 RNA(siRNA), 전이 RNA, 리보좀 RNA, 리보자임, cDNA, 재조합 폴리뉴클레오타이드, 분지형 폴리뉴클레오타이드, 플라스미드, 벡터, 임의의 서열의 단리된 DNA, 임의의 서열의 단리된 RNA, 핵산 프로브 및 프라이머. 폴리뉴클레오티드는 변형된 뉴클레오티드, 예컨대, 메틸화된 뉴클레오티드 및 뉴클레오티드 유사체를 포함할 수 있다. 존재하는 경우, 뉴클레오티드 구조에 대한 변형은 중합체의 조립 전 또는 후에 부여될 수 있다. 폴리뉴클레오티드는 예컨대, 표지화 성분과의 접합에 의해 추가로 변형될 수 있다. 본 명세서에 제공된 모든 핵산 서열에서, U 뉴클레오티드는 T 뉴클레오티드와 상호교환가능하다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "바이오마커"는 TH2-매개 경로로 인해서 수준이 증가하거나 감소한 분자(예를 들어, mRNA 또는 단백질)를 포함한다. 예를 들어, 하나 이상의 이러한 바이오마커의 수준은 건강한 대상체에서의 수준과 비교할 때 TH2-매개된 병태에서 증가할 수 있다. 이러한 단백질 바이오마커의 일부 예는 인터류킨-4, 인터류킨-5, 인터류킨-13, 인터류킨-19, 인터류킨-21, 인터류킨-31, 인터류킨-33, 흉선 기질 림포포이에틴, 면역글로불린 G1, 면역글로불린 E, 면역글로불린 A 및 이들의 조합물을 포함한다. 이러한 mRNA 바이오마커의 일부 예는 인터류킨-4, 인터류킨-5, 인터류킨-13, 인터류킨-19, 인터류킨-21, 인터류킨-31, 인터류킨-33, 흉선 기질 림포포이에틴 및 이들의 조합물을 포함한다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 물질은 다른 성분이 실질적으로 존재하지 않는 경우 "순수"하다. 용어 "정제하다," "정제하는" 및 "정제된"은 초기에 생산 또는 생성되었을 때(예를 들어, 자연에서 또는 실험 설정에서), 또는 초기 생산 후 언제든지, 관련된 성분들 중 적어도 일부로부터 분리된 프레보텔라 박테리아 제제 또는 다른 물질을 지칭한다. 프레보텔라 박테리아 제제 또는 조성물은 하나 이상의 다른 박테리아 성분으로부터와 같이 생산 시 또는 생산 후에 단리된 경우 정제된 것으로 간주될 수 있으며, 정제된 미생물 또는 미생물 집단은 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 90% 이하, 또는 약 90% 초과의 다른 물질을 함유할 수 있으며, 여전히 "단리된" 것으로 간주된다. 일부 구현예에서, 정제된 프레보텔라 박테리아는 약 80% 이상, 약 85%, 약 90%, 약 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99%, 또는 약 99% 초과 순수하다. 프레보텔라 박테리아 조성물 또는 제제는 예를 들어, 잔류 서식지 생성물로부터 정제된다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "정제된 프레보텔라 박테리아" 또는 "프레보텔라 박테리아 조성물"은 원료물질에서 발견된 적어도 하나의 관련된 물질로부터 분리된(예를 들어 적어도 하나의 다른 박테리아 균주로부터 분리된) 프레보텔라 박테리아 또는 제제를 생산하는 데 사용된 임의의 공정에서 프레보텔라 박테리아와 관련된 임의의 물질을 포함하는 제제를 지칭한다. 이는 또한 상당히 강화 또는 농축된 조성물을 지칭한다. 일부 구현예에서 프레보텔라 박테리아는 2배, 3배, 4배, 5배, 10배, 100배, 1000배, 10,000배 또는 10,000배 이상 농축된다. 특정 구현예에서, 프레보텔라 박테리아 조성물은 약제학적 조성물일 수 있다.
"잔류 서식지 산물"은 대상체 내에서 또는 대상체에서 미생물 군에 대한 서식지로부터 유래된 물질을 지칭한다. 예를 들어, 미생물의 발효 배양물은 오염물, 예를 들어, 다른 미생물 균주 또는 형태(예를 들어, 박테리아, 바이러스, 마이코플라즘(mycoplasm) 및/또는 진균)를 함유할 수 있다. 예를 들어, 예를 들어, 미생물은 위장관내 배설물, 피부 자체, 타액, 호흡기 점액 또는 비뇨생식관 분비물(즉, 미생물 군집과 관련된 생물학적 물질)에서 산다. 잔류 서식지 산물이 실질적으로 존재하지 않는다는 것은 미생물 조성물이 더 이상 배양물 또는 인간 또는 동물 대상체 상의 또는 내의 미생물 환경과 관련된 생물학적 물질을 더 이상 함유하지 않고, 미생물 군집과 관련된 임의의 오염 생물학적 물질이 100% 존재하지 않거나, 99% 존재하지 않거나, 98% 존재하지 않거나, 97% 존재하지 않거나, 96% 존재하지 않거나 또는 95% 존재하지 않음을 의미한다. 잔류 서식지 산물은 비 생물 물질(소화되지 않은 음식 포함)을 포함하거나, 원치 않는 미생물을 포함할 수 있다. 잔류 서식지 산물이 실질적으로 존재하지 않는다는 것은 또한, 미생물 조성물이 배양 오염물 또는 인간 또는 동물로부터 검출 가능한 세포를 함유하지 않으며, 미생물 세포만이 검출될 수 있음을 의미할 수 있다. 일 구현예에서, 잔류 서식지 산물이 실질적으로 존재하지 않는다는 것은 또한, 미생물 조성물이 검출가능한 바이러스(박테리아, 바이러스(예를 들어, 파지) 포함) 진균류, 마이코플라즈마 오염물을 함유하지 않음을 의미할 수 있다. 또 다른 구현예에서, 이는 미생물 세포와 비교하여 미생물 조성물내 생존가능 세포의 1×10-2%, 1×10-3%, 1×10-4%, 1×10-5%, 1×10-6%, 1×10-7%, 1×10-8% 미만이 인간 또는 동물임을 의미한다. 이 정도의 순도를 달성하는 방법에는 여러 가지가 있지만 그 중 어느 것도 제한적이지 않다. 따라서, 일련의 단일 콜로니로부터의 복제(예컨대, 2개, 이에 제한되지 않음) 줄무늬가 단일 콜로니 형태만을 나타낼 때까지 고체 배지에서 단일 콜로니로의 여러 단계의 스트리킹을 통해 원하는 성분을 단리함으로써 오염이 감소될 수 있다. 대안적으로, 예컨대, 다수의 10배 연속 희석을 통해, 단일의 원하는 세포를 다수 라운드의 일련의 희석(예를 들어, 10-8 또는 10-9의 희석)함에 의해 오염 감소가 달성될 수 있다. 이는 다수의 단리된 콜로니가 유사한 세포 형태 및 그람 염색 거동을 갖는 것을 보여줌으로써 추가로 확인할 수 있다. 적절한 순도를 확인하기 위한 다른 방법으로는 유전자 분석(예를 들어, PCR, DNA 서열분석), 혈청학 및 항원 분석, 효소 및 대사 분석, 및 원하는 성분을 오염물질과 구별하는 시약을 사용한 유세포 분석과 같은 계측을 사용하는 방법이 있다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "특이적 결합"은 항체가 소정의 항원에 결합하는 능력 또는 폴리펩티드가 그의 소정의 결합 파트너에 결합하는 능력을 지칭한다. 전형적으로, 항체 또는 폴리펩티드는 약 10-7 M 이하의 KD에 상응하는 친화도로 그의 소정의 항원 또는 결합 파트너에 특이적으로 결합하고, 비 특이적 및 관련되지 않은 항원/결합 파트너(예를 들어, BSA, 카세인)에 대한 결합에 대한 친화도보다 적어도 10배 적거나, 적어도 100배 적거나, 또는 적어도 1000배 적은 친화도(KD에 의해 표현됨)로 소정의 항원/결합 파트너에 결합한다. 대안적으로, 특이적 결합은 하나의 성분이 단백질, 지질 또는 탄수화물 또는 이들의 조합이며, 특이적인 방식으로 단백질, 지질, 탄수화물 또는 이들의 조합인 제2 성분과 결합하는 2개 성분 시스템에 보다 광범위하게 적용된다.
"균주"는 동일한 박테리아 종의 밀접하게 관련된 구성원과 구별될 수 있도록 유전자 서명을 갖는 박테리아 종의 구성원을 지칭한다. 유전자 서명은 적어도 하나의 유전자의 전부 또는 일부의 부재, 적어도 조절 영역(예를 들어, 프로모터, 종결자, 리보스위치, 리보솜 결합 부위)의 존재의 전부 또는 일부의 부재, 적어도 하나의 천연 플라스미드의 부재("경화"), 적어도 하나의 재조합 유전자의 존재, 적어도 하나의 돌연변이 유전자의 존재, 적어도 하나의 외래 유전자(다른 종으로부터 유래된 유전자)의 존재, 적어도 하나의 돌연변이 조절 영역(예를 들어, 프로모터, 종결자, 리보스위치, 리보솜 결합 부위), 적어도 하나의 비-천연 플라스미드의 존재, 적어도 하나의 항생제 내성 카세트의 존재 또는 이들의 조합일 수 있다. 상이한 균주 사이의 유전자 서명은 PCR 증폭에 이어, 임의로 관심 게놈 영역(들) 또는 전체 게놈의 DNA 서열분석에 의해 확인될 수 있다. (같은 종의 다른 균주와 비교하여) 하나의 균주가 항생제 내성을 얻거나 잃거나, 생합성 능력(예컨대, 영양요구성 균주)을 얻거나 잃어버린 경우, 균주는 각각 항생제 또는 영양소/대사산물을 사용한 선별 또는 역-선별에 의해 구별될 수 있다.
용어들 "대상체" 또는 "환자"는 임의의 포유동물을 지칭한다. "치료를 필요로 하는"으로 기재된 대상체 또는 환자는 질환의 치료(또는 예방)가 필요한 대상체를 지칭한다. 포유동물(즉, 포유류 동물)은 인간, 실험 동물(예를 들어, 영장류, 래트, 마우스), 가축(예를 들어, 소, 양, 염소, 돼지) 및 가정용 애완 동물(예를 들어, 개, 고양이, 설치류)을 포함한다. 대상체는 인간일 수 있다. 대상체는 개, 고양이, 소, 말, 돼지, 당나귀, 염소, 낙타, 마우스, 래트, 기니피그, 양, 라마, 원숭이, 고릴라 또는 침팬지를 포함하지만, 이에 제한되지 않는 비-인간 포유동물일 수 있다. 대상체는 건강할 수 있거나, 임의의 발달 단계에서 병태를 앓고 있을 수 있으며, 임의의 단계는 병태-연관 또는 원인 병원체에 의해 유발되거나 기회적으로 지지되거나, 또는 병태 발생 위험이 있거나, 또는 병태-연관 또는 병태-원인 병원체를 다른 것에게 전염시킬 위험이 있다. 일부 구현예에서, 대상체는 TH2-매개 병태를 갖는다. 일부 구현예에서, 대상체는 아토피 피부염을 갖는다. 일부 구현예에서, 대상체는 천식을 갖는다. 일부 구현예에서, 대상체는 음식 알레르기를 갖는다. 일부 구현예에서, 대상체는 이들의 병태를 위한 요법을 경험하였다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 대상체에서 질환을 "치료하는" 또는 병태를 갖는 또는 갖는 것으로 의심되는 대상체를 "치료하는"이라는 용어는 대상체에게 약제학적 치료(예를 들어, 약제학적 조성물), 예를 들어 하나 이상의 작용제(예를 들어, 약제학적 조성물)의 투여를 수행하여, 병태의 적어도 하나의 증상을 감소시키거나 증상이 악화되는 것을 방지하는 것을 지칭한다. 따라서, 일 구현예에서, "치료하는"은 특히 진행 지연, 완화 촉진, 완화 유도, 완화 증가, 회복 가속화, 대안 치료제의 효능 증가 또는 내성 감소, 또는 이들의 조합을 지칭한다.
박테리아
특정 양태에서, 본 명세서에는 TH2-매개 병태의 치료 및/또는 예방을 위한 박테리아 조성물, 예컨대, 특정 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물 및 이러한 박테리아 조성물, 예컨대, 약제학적 조성물을 사용하는 방법이 제공된다.
특정 구현예에서, 본 명세서에 제공된 약제학적 조성물은 프레보텔라 속의 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 속의 박테리아는 종 프레보텔라 알벤시스, 프레보텔라 암니이, 프레보텔라 버겐시스, 프레보텔라 비비아, 프레보텔라 브레비스, 프레보텔라 브리안티이, 프레보텔라 부카에, 프레보텔라 부칼리스, 프레보텔라 코프리, 프레보텔라 덴탈리스, 프레보텔라 덴티콜라, 프레보텔라 디시엔스, 프레보텔라 히스티콜라, 프레보텔라 멜라노제니카, 프레보텔라 인터메디아, 프레보텔라 마쿨로사, 프레보텔라 마시이, 프레보텔라 멜라니노게니카, 프레보텔라 미칸스, 프레보텔라 멀티포르미스, 프레보텔라 니그레센스, 프레보텔라 오랄리스, 프레보텔라 오리스, 프레보텔라 오울로럼, 프레보텔라 팔렌스, 프레보텔라 살리바에, 프레보텔라 스터코레아, 프레보텔라 타너라에, 프레보텔라 티모넨시스, 프레보텔라 제주니, 프레보텔라 아우란티아카, 프레보텔라 바로니아에, 프레보텔라 콜로란스, 프레보텔라 코포리스, 프레보텔라 덴타시니, 프레보텔라 에노에카, 프레보텔라 팔세니이, 프레보텔라 푸스카, 프레보텔라 헤파리놀리티카, 프레보텔라 로에쉐이이, 프레보텔라 멀티사카리보락스, 프레보텔라 난세이엔시스, 프레보텔라 오리자에, 프레보텔라 팔루디비벤스, 프레보텔라 플레우리티디스, 프레보텔라 루미니콜라, 프레보텔라 사카롤리티카, 프레보텔라 스코포스, 프레보텔라 샤히이, 프레보텔라 주글레오포르만스, 프레보텔라 베로랄리스 및/또는 이들의 조합물이다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 속의 박테리아는 프레보텔라 히스티콜라 종이다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 속의 박테리아는 프레보텔라 균주 B 50329의 뉴클레오티드 서열(예를 들어, 게놈 서열, 16S 서열 및/또는 CRISPR 서열)과 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 또는 적어도 99% 서열 동일성(예를 들어, 적어도 99.1% 서열 동일성, 적어도 99.2% 서열 동일성, 적어도 99.3% 서열 동일성, 적어도 99.4% 서열 동일성, 적어도 99.5% 서열 동일성, 적어도 99.6% 서열 동일성, 적어도 99.7% 서열 동일성, 적어도 99.8% 서열 동일성, 적어도 99.9% 서열 동일성)을 포함하는 균주이다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 속의 박테리아는 프레보텔라 균주 B 50329(NRRL 수탁 번호 B 50329)이다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "프레보텔라 균주 B 50329"는 NRRL 수탁 번호 B 50329 하에 기탁된 균주 및 기탁된 균주로부터 클로닝되고/되거나 유래된 균주 둘 다를 포함한다.
프레보텔라 히스티콜라 균주 B는 당업계에 공지된 방법에 따라 배양될 수 있다. 예를 들어, 프레보텔라 히스티콜라는 예를 들어, 문헌[Caballero et al., 2017. "Cooperating Co㎜ensals Restore Colonization Resistance to Vancomycin-Resistant Enterococcus faecium" Cell Host & Microbe 21:592-602]에 개시된 방법을 사용하여 ATCC 배지 2722, ATCC 배지 1490, 또는 기타 배지에서 성장할 수 있으며, 이는 본 명세서에 그 전문이 참조에 의해 포함된다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 표 1에 열거된 1종 이상(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35종 또는 그 초과)의 단백질 및/또는 표 1에 열거된 단백질을 암호화하는 1종 이상(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35종 또는 그 초과)의 유전자를 포함하는 프레보텔라 박테리아의 균주이다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 표 1에 열거된 모든 단백질 및/또는 표 1에 열거된 단백질을 암호화하는 모든 유전자를 포함한다.
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일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 표 2에 열거된 1종 이상(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25종 또는 그 초과)의 단백질 및/또는 표 2에 열거된 단백질을 암호화하는 1종 이상(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25종 또는 그 초과)의 유전자가 존재하지 않거나 실질적으로 존재하지 않는 프레보텔라 박테리아의 균주이다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 표 2에 열거된 모든 단백질 및/또는 표 2에 열거된 단백질을 암호화하는 모든 유전자가 존재하지 않는다.
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일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 표 1에 열거된 단백질 중 하나 이상을 포함하고, 표 2에 열거된 1종 이상의 단백질이 존재하지 않거나 실질적으로 존재하지 않는 프레보텔라 박테리아의 균주로부터 유래된다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 표 1에 열거된 단백질 모두 및/또는 표 1에 열거된 단백질을 암호화하는 유전자 모두를 포함하고, 표 2에 열거된 단백질 모두 및/또는 표 2에 열거된 단백질을 암호화하는 유전자 모두가 존재하지 않는 프레보텔라 박테리아의 균주로부터 유래된다.
약제학적 조성물
특정 구현예에서, 본 명세서에는 예를 들어, TH2-매개 병태(예컨대, 아토피 피부염, 천식 및/또는 알레르기)의 치료 또는 예방 방법에 사용하기 위한 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 본 명세서에 기재된 프레보텔라 박테리아)를 포함하는 약제학적 조성물이 제공된다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아 조성물은 프레보텔라 박테리아 및/또는 본 명세서에 기재된 박테리아 균주의 조합물 및 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함한다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아 조성물은 본 명세서에 기재된 단일 프레보텔라 박테리아 균주 및 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함한다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 프레보텔라 박테리아 및 예를 들어, 프레보텔라 이외에 1종 이상(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10종 또는 그 초과)의 박테리아 균주 또는 종을 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 동결건조된 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 감마 조사된 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 살아있는 프레보텔라 박테리아를 포함한다.
일부 구현예에서, 박테리아 샘플에 존재하는 프레보텔라 박테리아의 수를 정량화하기 위해, 전자 현미경(예를 들어, 초박형 냉동 섹션의 EM)을 사용하여 박테리아를 가시화하고 이들의 상대 수를 계수할 수 있다. 대안적으로, 나노입자 추적 분석(nanoparticle tracking analysis: NTA), 쿨터 계수 또는 동적 광 산란(DLS) 또는 이들 기술의 조합이 사용될 수 있다. NTA와 쿨터 카운터는 입자를 계수하고, 그것들의 크기를 보여준다. DLS는 입자의 크기 분포를 제공하지만, 농도는 제공하지 않는다. 박테리아는 종종 직경이 1 내지 2 um(미크론)이다. 전체 범위는 0.2 내지 20 um이다. 쿨터 계수와 NTA의 조합된 결과는 주어진 샘플의 박테리아 수를 밝힐 수 있다. 쿨터 계수는 0.7 내지 10 um의 직경을 가진 입자의 수를 보여준다. 대부분의 박테리아 샘플의 경우, 쿨터 카운터만으로 박테리아 수를 밝힐 수 있다. NTA의 경우, Nanosight 기기는 Malvern Panalytical로부터 입수할 수 잇다. 예를 들어, NS300은 10 내지 2000 nm의 크기 범위의 현탁액 중의 입자를 가시화하고, 측정할 수 있다. NTA는 예를 들어, 직경이 50 내지 1000 nm인 입자의 수를 계산할 수 있게 한다. DLS는 대략 1 nm 내지 3 um의 범위 내의 상이한 직경의 입자들의 분포를 보여준다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 입자 계수치에 기초하여 정량화될 수 있다. 예를 들어, 프레보텔라 박테리아의 총 입자 함량은 NTA를 사용하여 측정될 수 있다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 총 세포 계수치(TCC)(예를 들어, 쿨터 카운터에 의해서 결정됨)에 기초하여 정량화될 수 있다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 (예를 들어, 박테리아의 연속 희석물을 생성시키고, 이것을 적합한 배지에서 성장하게 하고, 그 다음 콜로니의 수를 계수함으로써) 플레이트 계수 검정을 사용하여 정량화될 수 있다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 단백질, 지질 또는 탄수화물의 양에 기초하여 정량화될 수 있다. 예를 들어, 프레보텔라 박테리아 제제의 총 단백질 함량은 브래드포드 검정 또는 BCA 검정을 사용하여 측정될 수 있다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 예를 들어, 공급원 배양물의 1종 이상의 다른 박테리아 성분으로부터 단리된다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 다른 박테리아 성분 또는 균주를 추가로 포함한다.
특정 양태에서, 대상체(예를 들어, 인간 대상체)에게 투여하기 위한 약제학적 조성물이 제공된다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 최종 생성물을 생성하기 위해 추가의 활성 및/또는 비활성 물질과 조합되며, 이는 단일 투여 단위 또는 다중-용량 형식일 수 있다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 적어도 하나의 탄수화물을 포함한다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 적어도 1종의 지질을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 라우르산(12:0), 미리스트산(14:0), 팔미트산(16:0), 팔미톨레산(16:1), 마르가르산(17:0), 헵타데센산(17:1), 스테아르산(18:0), 올레산(18:1), 리놀레산(18:2), 리놀렌산(18:3), 옥타데카테트라엔산(18:4), 아라키드산(20:0), 에이코센산(20:1), 에이코사디엔산(20:2), 에이코사테트라엔산(20:4), 에이코사펜타엔산(20:5)(EPA), 도코산산(22:0), 도코센산(22:1), 도코사펜타엔산(22:5), 도코사헥사엔산(22:6)(DHA), 및 테트라코산산(24:0)으로부터 선택되는 적어도 하나의 지방산을 포함한다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 적어도 하나의 보충 미네랄 또는 미네랄 공급원을 포함한다. 미네랄의 예는 염화물, 나트륨, 칼슘, 철, 크롬, 구리, 요오드, 아연, 마그네슘, 망간, 몰리브덴, 인, 칼륨 및 셀레늄을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 상기 미네랄 중 임의의 미네랄의 적합한 형태는 가용성 미네랄 염, 약간 가용성인 미네랄 염, 불용성 미네랄 염, 킬레이트화된 미네랄, 미네랄 착물, 비-반응성 미네랄, 예컨대, 카르보닐 미네랄 및 환원된 미네랄, 및 이들의 조합을 포함한다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 적어도 하나의 보충 비타민을 포함한다. 적어도 하나의 비타민은 지용성 또는 수용성 비타민일 수 있다. 적합한 비타민은 비타민 C, 비타민 A, 비타민 E, 비타민 B12, 비타민 K, 리보플라빈, 니아신, 비타민 D, 비타민 B6, 엽산, 피리독신, 티아민, 판토텐산 및 비오틴을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 상기의 임의의 적합한 형태는 비타민의 염, 비타민의 유도체, 비타민의 동일하거나 유사한 활성을 갖는 화합물 및 비타민의 대사산물이다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 부형제를 포함한다. 적합한 부형제의 비-제한적인 예는 완충제, 보존제, 안정화제, 결합제, 압착제, 윤활제, 분산 증강제, 붕해제, 향미제, 감미제 및 착색제를 포함한다.
일부 구현예에서, 부형제는 완충제이다. 적합한 완충제의 비-제한적인 예는 시트르산 나트륨, 탄산 마그네슘, 중탄산 마그네슘, 탄산 칼슘 및 중탄산 칼슘을 포함한다.
일부 구현예에서, 부형제는 보존제를 포함한다. 적합한 보존제의 비-제한적인 예는 항산화제, 예컨대, 알파-토코페롤 및 아스코르베이트, 및 항균제, 예컨대, 파라벤, 클로로부탄올 및 페놀을 포함한다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 부형제로서 결합제를 포함한다. 적합한 결합제의 비-제한적인 예는 전분, 예비 젤라틴화 전분, 젤라틴, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로스, 메틸 셀룰로스, 나트륨 카르복시메틸 셀룰로스, 에틸셀룰로스, 폴리아크릴아미드, 폴리비닐옥소아졸리돈, 폴리비닐 알코올, C12-C18 지방산 알콜, 폴리에틸렌 글리콜, 폴리올, 당류 및 올리고당류 및 이들의 조합을 포함한다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 부형제로서 윤활제를 포함한다. 적합한 윤활제의 비-제한적인 예는 스테아르산 마그네슘, 스테아르산 칼슘, 스테아르산 아연, 수소화된 식물성 오일, 스테로텍스, 폴리옥시에틸렌 모노스테아레이트, 탤크, 폴리에틸렌글리콜, 나트륨 벤조에이트, 나트륨 라우릴 설페이트, 마그네슘 라우릴 설페이트 및 경질 미네랄 오일을 포함한다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 부형제로서 분산 증강제를 포함한다. 적합한 분산제의 비-제한적인 예는 전분, 알긴산, 폴리비닐피롤리돈, 구아검, 카올린, 벤토나이트, 정제된 목재 셀룰로스, 나트륨 전분 글리콜레이트, 이질동상 실리케이트 및 높은 HLB 유화제 계면활성제로서의 미세결정질 셀룰로스를 포함한다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 부형제로서 붕해제를 포함한다. 일부 구현예에서, 붕해제는 비-발포성 붕해제이다. 적합한 비-발포성 붕해제의 비-제한적인 예는 옥수수 전분, 감자 전분, 이의 예비젤라틴화 및 변형된 전분과 같은 전분, 감미제, 클레이, 예컨대, 벤토나이트, 미세결정질 셀룰로스, 알기네이트, 나트륨 전분 글리콜레이트, 검, 예컨대, 한천, 구아, 로커스트 빈, 카라야, 펙틴 및 트라가칸트를 포함한다. 일부 구현예에서, 붕해제는 발포성 붕해제이다. 적합한 발포성 붕해제의 비-제한적인 예는 시트르산과 조합된 중탄산 나트륨 및 타르타르산과 조합된 중탄산 나트륨을 포함한다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 식품(예를 들어, 음식 또는 음료), 예컨대, 건강 식품 또는 음료, 유아를 위한 음식 또는 음료, 임산부, 운동 선수, 노인 또는 기타 특정 그룹을 위한 음식 또는 음료, 기능성 식품, 음료, 특정 건강 용도를 위한 식품 또는 음료, 식이 보충제, 환자를 위한 식품 또는 음료, 또는 동물 사료이다. 음식 및 음료의 특정 예는 다양한 음료, 예컨대, 주스, 신선 음료, 차 음료, 드링크 제제, 젤리 음료 및 기능성 음료; 알코올 음료, 예컨대, 맥주; 탄수화물-함유 식품, 예컨대, 쌀 식품, 국수, 빵 및 파스타; 페이스트 제품, 예컨대, 생선 햄, 소시지, 해산물 페이스트 제품; 레토르트 파우치 제품, 예컨대, 카레, 진한 전분 소스를 드레싱한 음식 및 중국 수프; 수프; 유제품, 예컨대, 우유, 유제품 음료, 아이스크림, 치즈 및 요구르트; 발효 제품, 예컨대, 발효 대두 페이스트, 요구르트, 발효 음료 및 피클; 콩 제품; 비스킷, 쿠키 등을 포함한 다양한 제과 제품, 사탕, 츄잉 껌, 구미, 젤리를 포함한 차가운 디저트, 크림 카라멜 및 냉동 디저트; 인스턴트 식품, 예컨대, 인스턴트 수프 및 인스턴트 대두 수프; 전자레인지 식품; 등을 포함한다. 또한, 예들은 또한 분말, 과립, 정제, 캡슐제, 액체, 페이스트 및 젤리 형태로 제조된 건강 식품 및 음료를 포함한다.
일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 인간을 포함한 동물용 식품이다. 인간 이외의 동물은 특별히 제한되지 않으며, 상기 조성물은 다양한 가축, 가금류, 애완동물, 실험 동물 등에 사용될 수 있다. 동물의 특정 예는 돼지, 소, 말, 양, 염소, 닭, 야생 오리, 타조, 집오리, 개, 고양이, 토끼, 햄스터, 마우스, 래트, 원숭이 등을 포함하지만, 동물은 이에 제한되지 않는다.
투여 형태
예를 들어, TH2-매개 병태(예컨대, 아토피 피부염 및/또는 음식 알레르기)를 치료 또는 예방하기 위한 방법에 사용하기 위한, 프레보텔라 박테리아를 포함하는 투여 형태가 또한 본 명세서에 제공된다. 프레보텔라 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물은 예를 들어, 경구 투여를 위한 고체 투여 형태로서 제형화될 수 있다. 고체 투여 형태는 1종 이상의 부형제, 예를 들어, 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 포함할 수 있다. 고체 투여 형태의 프레보텔라 박테리아는 단리된 프레보텔라 박테리아일 수 있다. 선택적으로, 고체 투여 형태의 프레보텔라 박테리아는 동결건조될 수 있다. 선택적으로, 고체 투여 형태의 프레보텔라 박테리아는 살아있다. 선택적으로, 고체 투여 형태의 프레보텔라 박테리아는 감마 조사된다. 고체 투여 형태는 정제, 미니정제, 캡슐, 환제 또는 분말; 또는 이들 형태의 조합물(예를 들어, 캡슐에 포함된 미니정제)를 포함할 수 있다.
특정 구현예에서, 본 명세서에 제공된 약제학적 조성물은 프레보텔라 박테리아 및 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 고체 투여 형태로서 제조된다.
일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 캡슐을 포함한다. 캡슐은 장용 코팅을 포함할 수 있다. 캡슐은 크기 00, 크기 0, 크기 1, 크기 2, 크기 3, 크기 4 또는 크기 5 캡슐일 수 있다. 캡슐은 프레보텔라 박테리아 분말(예를 들어, 동결건조된 프레보텔라 박테리아)을 포함할 수 있다.
일부 구현예에서, 본 명세서에 기재된 고체 투여 형태는 예를 들어, 정제 또는 미니-정제일 수 있다. 일부 구현예에서, 복수의 미니-정제가 캡슐에 존재할 수 있다(예를 들어, 내부에 로딩될 수 있다).
일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 정제(4 ㎜ 초과)(예를 들어, 5 ㎜ 내지 17 ㎜)를 포함한다. 예를 들어, 정제는 5 ㎜, 6 ㎜, 7 ㎜, 8 ㎜, 9 ㎜, 10 ㎜, 11 ㎜, 12 ㎜, 13 ㎜, 14 ㎜, 15 ㎜, 16 ㎜ 또는 17 ㎜ 정제이다. 크기는 당업계에 공지된 바와 같이 정제의 직경을 지칭한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 정제의 크기는 장용 코팅의 적용 전의 정제의 크기를 지칭한다.
일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 미니-정제를 포함한다. 미니-정제는 1 ㎜ 내지 4 ㎜ 범위의 크기일 수 있다. 예를 들어, 미니-정제는 1 ㎜ 미니-정제, 1.5 ㎜ 미니-정제, 2 ㎜ 미니-정제, 3 ㎜ 미니-정제 또는 4 ㎜ 미니-정제일 수 있다. 크기는 당업계에 공지된 바와 같이 미니-정제의 직경을 지칭한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 미니-정제의 크기는 장용 코팅의 적용 전의 미니-정제의 크기를 지칭한다.
미니-정제는 캡슐로 존재할 수 있다. 캡슐은 크기 00, 크기 0, 크기 1, 크기 2, 크기 3, 크기 4 또는 크기 5 캡슐일 수 있다. 미니-정제를 함유하는 캡슐은 단일 층 코팅, 예를 들어, 비-장용 코팅 예컨대, HPMC(히드록실 프로필 메틸 셀룰로스) 또는 젤라틴을 포함할 수 있다. 미니-정제는 캡슐 내부에 존재할 수 있고: 캡슐 내부의 미니-정제의 수는 캡슐의 크기 및 미니-정제의 크기에 좌우될 것이다. 예로서, 크기 0 캡슐은 3 ㎜ 미니-정제인 미니-정제 31 내지 35(평균 33)개를 함유할 수 있다.
본 명세서에 기재된 고체 투여 형태(예를 들어, 정제 또는 미니-정제)는 장용 코팅될 수 있다.
고체 투여 형태는 코팅을 포함할 수 있다. 고체 투여 형태는 단일 층 코팅, 예를 들어, 장용 코팅, 예를 들어, Eudragit-기재 코팅, 예를 들어, EUDRAGIT L30 D-55, 트리에틸시트레이트 및 탤크를 포함할 수 있다. 고체 투여 형태는 2개의 코팅 층을 포함할 수 있다. 예를 들어, 내부 코팅은 예를 들어, EUDRAGIT L30 D-55, 트리에틸시트레이트, 탤크, 무수 시트르산 및 수산화나트륨을 포함할 수 있고, 외부 코팅은 예를 들어, EUDRAGIT L30 D-55, 트리에틸시트레이트 및 탤크를 포함할 수 있다. EUDRAGIT는 광범위한 폴리메타크릴레이트-기재 공중합체에 대한 브랜드명이다. 그것은 메타크릴산 및 메타크릴산/아크릴산 에스테르 또는 이들의 유도체 기재 음이온성, 양이온성 및 중성 공중합체를 포함한다. Eudragit은 9 내지 150℃ 초과의 유리 전이 온도를 갖는 비정질 중합체이다. Eudragit은 비-생물분해성, 비흡수성 및 비독성이다. 음이온성 Eudragit L은 6 초과의 pH에서 용해되고, 장용 코팅을 위해서 사용되는 반면, pH 7 초과에서 가용성인 Eudragit S는 결장 표적화를 위해서 사용된다. 4차 암모늄기를 갖는 Eudragit RL 및 RS는 수 불용성이지만, 지속 방출형 필름 코팅 적용에 적합한 팽윤성/투과성 중합체이다. pH 5 이상에서 불용성인 양이온성 Eudragit E는 타액에서 약물 방출을 방지할 수 있다.
고체 투여 형태(예를 들어, 캡슐)는 단일 층 코팅, 예를 들어, 비-장용 코팅 예컨대, HPMC(히드록실 프로필 메틸 셀룰로스) 또는 젤라틴을 포함할 수 있다.
프레보텔라 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물은 예를 들어, 경구 투여용 또는 주사용의 현탁액으로서 제형화될 수 있다. 주사 투여는 정맥내(IV), 근육내(IM) 및 피하(SC) 투여를 포함한다. 현탁액의 경우, 프레보텔라 박테리아는 완충제, 예를 들어, 약제학적으로 허용 가능한 완충제, 예를 들어, 식염수 또는 PBS에 존재할 수 있다. 현탁액은 1종 이상의 부형제, 예를 들어, 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 포함할 수 있다. 현탁액은 예를 들어, 수크로스 또는 글루코스를 포함할 수 있다. 현탁액의 프레보텔라 박테리아는 단리된 프레보텔라 박테리아일 수 있다. 선택적으로, 현탁액의 프레보텔라 박테리아는 동결건조될 수 있다. 선택적으로, 고체 투여 형태의 프레보텔라 박테리아는 살아있다. 선택적으로, 현탁액의 프레보텔라 박테리아는 감마 조사될 수 있다.
투여량
인간 대상체에 대한 경구 투여의 경우, 프레보텔라 박테리아의 용량은 예를 들어, 약 2×106 내지 약 2×1016개 입자일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 1×107 내지 약 1×1015, 약 1×108 내지 약 1×1014, 약 1×109 내지 약 1×1013, 약 1×1010 내지 약 1×1014 또는 약 1×108 내지 약 1×1012개 입자일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 2×106, 약 2×107, 약 2×108, 약 2×109, 약 1×1010, 약 2×1010, 약 2×1011, 약 2×1012, 약 2×1013, 약 2×1014 또는 약 1×1015개 입자일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 2×1014개 입자일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 2×1012개 입자일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 2×1010개 입자일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 1×1010개 입자일 수 있다. 입자 계수는 예를 들어, NTA에 의해서 결정될 수 있다.
인간 대상체에 대한 경구 투여의 경우, 프레보텔라 박테리아의 용량은 예를 들어, 총 단백질에 기초할 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 5 ㎎ 내지 약 900 ㎎의 총 단백질일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 20 ㎎ 내지 약 800 ㎎, 약 50 ㎎ 내지 약 700 ㎎, 약 75 ㎎ 내지 약 600 ㎎, 약 100 ㎎ 내지 약 500 ㎎, 약 250 ㎎ 내지 약 750 ㎎ 또는 약 200 ㎎ 내지 약 500 ㎎의 총 단백질일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 10 ㎎, 약 25 ㎎, 약 50 ㎎, 약 75 ㎎, 약 100 ㎎, 약 150 ㎎, 약 200 ㎎, 약 250 ㎎, 약 300 ㎎, 약 400 ㎎, 약 500 ㎎, 약 600 ㎎ 또는 약 750 ㎎의 총 단백질일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 10 ㎎의 총 단백질일 수 있다. 총 단백질은 예를 들어, 브래드포드 검정에 의해서 또는 BCA 검정에 의해서 결정될 수 있다.
주사(예를 들어, 정맥내 투여)에 의한 인간 대상체에 대한 투여의 경우, 프레보텔라 박테리아의 용량은 예를 들어, 약 1×106 내지 약 1×1016개 입자일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 1×107 내지 약 1×1015, 약 1×108 내지 약 1×1014, 약 1×109 내지 약 1×1013, 약 1×1010 내지 약 1×1014 또는 약 1×108 내지 약 1×1012개 입자일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 2×106, 약 2×107, 약 2×108, 약 2×109, 약 1×1010, 약 2×1010, 약 2×1011, 약 2×1012, 약 2×1013, 약 2×1014 또는 약 1×1015개 입자일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 1×1015개 입자일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 2×1014개 입자일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 2×1013개 입자일 수 있다. 입자 계수는 예를 들어, NTA에 의해서 결정될 수 있다.
주사(예를 들어, 정맥내 투여)에 의한 투여의 경우, 프레보텔라 박테리아의 용량은 예를 들어, 약 5 ㎎ 내지 약 900 ㎎의 총 단백질일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 20 ㎎ 내지 약 800 ㎎, 약 50 ㎎ 내지 약 700 ㎎, 약 75 ㎎ 내지 약 600 ㎎, 약 100 ㎎ 내지 약 500 ㎎, 약 250 ㎎ 내지 약 750 ㎎ 또는 약 200 ㎎ 내지 약 500 ㎎의 총 단백질일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 10 ㎎, 약 25 ㎎, 약 50 ㎎, 약 75 ㎎, 약 100 ㎎, 약 150 ㎎, 약 200 ㎎, 약 250 ㎎, 약 300 ㎎, 약 400 ㎎, 약 500 ㎎, 약 600 ㎎ 또는 약 750 ㎎의 총 단백질일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 700 ㎎의 총 단백질일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 350 ㎎의 총 단백질일 수 있다. 용량은 예를 들어, 약 175 ㎎의 총 단백질일 수 있다. 총 단백질은 예를 들어, 브래드포드 검정에 의해서 또는 BCA 검정에 의해서 결정될 수 있다.
특정 구현예에서, 약제학적 조성물(예를 들어, 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여되는 총 용량의 조성물)은 적어도 1×1010개의 총 세포 (예를 들어, 적어도 1×1010개의 총 세포, 적어도 2×1010개의 총 세포, 적어도 3×1010개의 총 세포, 적어도 4×1010개의 총 세포, 적어도 5×1010개의 총 세포, 적어도 6×1010개의 총 세포, 적어도 7×1010개의 총 세포, 적어도 8×1010개의 총 세포, 적어도 9×1010개의 총 세포, 적어도 1×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 9×1011개 이하의 총 세포(예를 들어, 1×1010개 이하의 총 세포, 2×1010개 이하의 총 세포, 3×1010개 이하의 총 세포, 4×1010개 이하의 총 세포, 5×1010개 이하의 총 세포, 6×1010개 이하의 총 세포, 7×1010개 이하의 총 세포, 8×1010개 이하의 총 세포, 9×1010개 이하의 총 세포, 1×1011개 이하의 총 세포, 2×1011개 이하의 총 세포, 3×1011개 이하의 총 세포, 4×1011개 이하의 총 세포, 5×1011개 이하의 총 세포, 6×1011개 이하의 총 세포, 7×1011개 이하의 총 세포, 8×1011개 이하의 총 세포)의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 6×109개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 1.6×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 8×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 1.6×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 3.2×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 1.6×1010 내지 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 1.6×1010 내지 약 1.6×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 8×1010 내지 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 약제학적 조성물은 약 1.6×1011 내지 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다.
특정 구현예에서, 본 명세서에는 프레보텔라 박테리아를 포함하는 고체 투여 형태가 제공된다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 장용 코팅을 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 캡슐, 예를 들어, 장용 코팅된 캡슐이다. 일부 구현예에서, 각각의 캡슐은 약 8×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함한다. 일부 구현예에서, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개 캡슐이 대상체에게 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여된다. 일부 구현예에서, 1개의 캡슐(예를 들어, 약 8×1010개의 총 세포를 포함함)이 대상체에게 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여된다. 일부 구현예에서, 2개의 캡슐(예를 들어, 약 8×1010개의 총 세포를 포함함) 각각이 대상체에게 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여된다. 일부 구현예에서, 4개의 캡슐(예를 들어, 약 8×1010개의 총 세포를 포함함) 각각이 대상체에게 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여된다. 일부 구현예에서, 10개의 캡슐(예를 들어, 약 8×1010개의 총 세포를 포함함) 각각이 대상체에게 예를 들어, 1일 1회 또는 2회 투여된다. 일부 구현예에서, 캡슐 내의 프레보텔라 박테리아는 (예를 들어, 분말로) 동결건조된다.
일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 캡슐을 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 장용 코팅된 정제이다. 일부 구현예에서, 캡슐은 약 8×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 캡슐 또는 복수의 캡슐의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 약 1.6×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 캡슐 또는 복수의 캡슐의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 약 3.2×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 캡슐 또는 복수의 캡슐의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 캡슐 또는 복수의 캡슐의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐 내의 프레보텔라 박테리아는 (예를 들어, 분말로) 동결건조된다.
일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 정제를 포함한다. 일부 구현예에서, 정제는 장용 코팅된 정제이다. 일부 구현예에서, 장용 코팅된 정제는 5 ㎜ 내지 17 ㎜의 직경이다. 일부 구현예에서, 정제는 약 8×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 정제 또는 복수의 정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 정제는 약 1.6×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 정제 또는 복수의 정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 정제는 약 3.2×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 정제 또는 복수의 정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 정제는 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 정제 또는 복수의 정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 정제 내의 프레보텔라 박테리아는 동결건조된다.
일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 미니-정제를 포함한다. 일부 구현예에서, 미니-정제는 장용 코팅된다. 일부 구현예에서, 미니-정제는 1 ㎜ 내지 4 ㎜ 직경이다. 일부 구현예에서, 미니-정제(예를 들어, 장용 코팅된 미니-정제)는 1 ㎜ 미니-정제, 1.5 ㎜ 미니-정제, 2 ㎜ 미니-정제, 3 ㎜ 미니-정제 또는 4 ㎜ 미니-정제이다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 약 8×1010개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함하는 미니-정제(예를 들어, 복수의 미니-정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 약 1.6×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함하는 미니-정제(예를 들어, 복수의 미니-정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 약 3.2×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함하는 미니-정제(예를 들어, 복수의 미니-정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 투여 형태는 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함하는 미니-정제(예를 들어, 복수의 미니-정제의 총 용량)를 포함한다. 일부 구현예에서, 미니-정제 내의 프레보텔라 박테리아는 동결건조된다. 일부 구현예에서, 미니-정제(예를 들어, 장용 코팅된 미니-정제)는 캡슐 내에 함유된다. 일부 구현예에서, 캡슐은 크기 00, 크기 0, 크기 1, 크기 2, 크기 3, 크기 4 또는 크기 5 캡슐이다. 일부 구현예에서, 캡슐은 비-장용 코팅(예를 들어, HPMC(히드록실 프로필 메틸 셀룰로스) 또는 젤라틴)을 포함한다(예를 들어, 비-장용 코팅으로 코팅된다). 일부 구현예에서, 캡슐은 비-장용 코팅을 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 히드록실 프로필 메틸 셀룰로스(HPMC)를 포함한다. 일부 구현예에서, 캡슐은 젤라틴을 포함한다. 일부 구현예에서, 약 8×1011개의 총 세포의 프레보텔라 박테리아를 포함하는 미니-정제(예를 들어, 장용 코팅된 미니-정제)가 캡슐(들)에 함유되고, 여기서 선택적으로 캡슐은 HPMC를 포함한다.
감마-조사
(예를 들어, 프레보텔라 박테리아의) 분말은 주변 온도에서 17.5 k㏉ 방사선 단위로 감마-조사될 수 있다.
(예를 들어, 프레보텔라 박테리아의) 동결된 바이오매스는 드라이 아이스의 존재 하에서 25 k㏉ 방사선 단위로 감마-조사될 수 있다.
Th2-매개 병태
프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)에 의해서 치료 및/또는 예방될 수 있는 TH2(타입 2)-매개 병태는 예를 들어, 질환의 발병 또는 과정 동안 인터류킨(IL)-4, IL-5, IL-13, IL-19, IL-21, IL-31, IL-33 및/또는 TSLP(흉선 기질 림포포이에틴) 수준(예를 들어, mRNA 또는 단백질 수준)의 증가와 연관된 병태를 포함한다.
프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)는 인터류킨(IL)-4, IL-5, IL-13, IL-19, IL-21, IL-31, IL-33 및/또는 TSLP(흉선 기질 림포포이에틴) 수준(예를 들어, mRNA 또는 단백질 수준)을 감소시킬 수 있고, 예를 들어, 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)는 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)의 투여의 부재 하에서의(또는 투여 전의) 수준과 비교할 때 감소를 초래한다. 약제학적 조성물은 그 수준을, 예를 들어, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80% 또는 약 90%만큼 감소시킬 수 있다.
프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)에 의해서 치료 및/또는 예방될 수 있는 TH2-매개 병태는 예를 들어, 질환의 발병 또는 과정 동안 IgG1, IgE 및/또는 IgA 수준(예를 들어, mRNA 또는 단백질 수준)의 증가와 연관된 병태를 포함한다.
프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)는 IgG1, IgE 및/또는 IgA 수준(예를 들어, mRNA 또는 단백질 수준)을 감소시킬 수 있고, 예를 들어, 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)는 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)의 투여의 부재 하에서의(또는 투여 전의) 수준과 비교할 때 감소를 초래한다. 약제학적 조성물은 그 수준을, 예를 들어, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80% 또는 약 90%만큼 감소시킬 수 있다.
TH2-매개 병태는 천식, 아토피 피부염, 호산구성 질환 또는 알레르기(예를 들어, 계절성 알레르기, 애완동물 알레르기 또는 음식 알레르기)를 포함할 수 있다. 알레르기는 음식 알레르기, 계절성 알레르기 비염 또는 애완동물 알레르기를 포함할 수 있다. 음식 알레르기는 땅콩 알레르기를 포함할 수 있다. 음식 알레르기는 우유, 계란, 생선, 갑각류 조개류, 견과류, 밀 또는 대두 알레르기를 포함할 수 있다. 음식 알레르기는 음식 항원에 대한 알레르기를 포함할 수 있다. 음식 항원은 땅콩 항원을 포함할 수 있다. 음식 알레르기는 음식 항원에 대한 알레르기를 포함할 수 있고, 음식 항원은 우유, 계란, 생선, 갑각류 조개류, 견과류, 밀, 또는 대두 항원을 포함할 수 있다.
특정 TH2-매개 병태 중 일부는 하기에 추가로 상세히 기재되어 있다.
알레르기 비염
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 알레르기 비염(즉, 고초열)을 포함한다. 알레르기 비염은 알레르겐이 코에서 염증을 유발하는 경우 발생한다. 잠재적인 알레르겐 유형은 개별적으로 또는 조합하여 꽃가루, 애완동물 털, 비듬, 먼지 진드기, 곰팡이, 연기 및 향수를 포함한다. 알레르기 비염의 증상은 개별적으로 또는 조합하여 콧물 또는 코막힘; 가려운 눈, 입, 목 또는 피부; 재채기; 기침; 및 피로를 포함한다.
천식
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 천식(예를 들어, 알레르기 천식)을 포함한다. 천식은 예를 들어, 폐의 기도에 염증이 생길 때 발생한다. 본 명세서의 개시내용과 관련된 병태에 포함되는 천식의 유형은 아토피성 천식이다. 천식의 증상은 개별적으로 또는 조합하여 기침, 쌕쌕거림, 숨가쁨 및 가슴 답답함을 포함할 수 있다.
아토피 피부염
일부 실시양태에서, TH2-매개 병태는 아토피 피부염(즉, 습진)을 포함한다. 아토피 피부염은 피부에 염증이 생겼을 때 발생한다. 이것은 알레르기 비염 및/또는 천식과 함께 발생할 수 있다. 이의 증상은 개별적으로 또는 조합하여 피부 건조, 발적, 가려움증, 발진 및 궤양을 포함할 수 있다.
두드러기
일부 실시양태에서, TH2-매개 병태는 두드러기(urticaria)(즉, 두드러기(hives))를 포함한다. 두드러기는 피부가 부어오른 붉은 반점이 생길 때 발생한다. 이 병태는 예를 들어, 알레르기 반응의 결과로 히스타민으로 인해 혈관으로부터 혈장이 누출되어 발생할 수 있다. 두드러기의 증상은 개별적으로 또는 조합하여 일련의 자국(batches of welt), 가려움증 및 부종을 포함할 수 있다.
혈관부종
일부 실시양태에서, TH2-매개 병태는 혈관부종(즉, 심조직 부종)을 포함한다. 부종이 피부 아래에 있는 경우, 두드러기와 달리 유사한 병태를 혈관부종으로 분류할 수 있다. 이 병태는 예를 들어, 알레르기 반응의 결과로 히스타민으로 인해 혈관으로부터 혈장이 누출되어 발생할 수 있다. 혈관부종의 증상은 개별적으로 또는 조합하여 눈, 입, 손, 발 또는 목의 부종; 호흡 곤란; 및 위경련을 포함할 수 있다.
음식 알레르기
일부 실시양태에서, TH2-매개 병태는 음식 알레르기를 포함한다. 음식 알레르기는 음식(예를 들어, 이의 알레르겐)이 비정상적인 면역 반응을 일으킬 때 발생한다. 반응을 일으킬 수 있는 전형적인 식품 유형은 난류, 우유, 땅콩, 견과류(예를 들어, 호두), 생선, 조개류, 밀 및 대두를 포함한다. 또한 씨앗(예를 들어, 참깨, 겨자), 과일, 쌀이 또한 음식 알레르기를 유발할 수 있다. 증상은 개별적으로 또는 조합하여 구강 가려움증; 두드러기; 얼굴과 같은 신체 일부의 부종; 호흡 곤란; 복부 불편감; 현기증을 포함할 수 있다.
곤충-유도 알레르기
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 곤충-유도 알레르기를 포함한다. 곤충-유도 알레르기는 면역 체계가 곤충 쏘임 또는 물림에 반응할 때 발생한다. 이러한 반응을 일으킬 수 있는 전형적인 곤충 유형은 벌(wasp), 꿀벌(bee), 말벌(hornet), 땅벌(yellow-jacket), 개미, 모기, 빈대, 벼룩 및 진드기를 포함한다.
약물 알레르기
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 약물 알레르기를 포함한다. 약물 알레르기는 약물에 노출될 때 부작용으로 발생한다. 이러한 반응을 유발할 수 있는 일부 약물 유형은 페니실린, 설폰아미드, 항경련제, 아스피린 및 화학요법 약물을 포함한다. 약물 알레르기 증상은 개별적으로 또는 조합하여 열, 가려움증, 두드러기, 발진, 부종 및 숨가쁨을 포함할 수 있다.
아나필락시스
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 아나필락시스를 포함한다. 아나필락시스는 음식, 곤충 독 또는 약물에 대한 반응이 심할 때 발생한다. 이것은 전신에 영향을 미칠 수 있으며, 호흡, 혈압 및 심박수를 변경할 수 있다.
호산구 증가증
일부 실시양태에서, TH2-매개 병태는 호산구 증가증(예를 들어, 원발성 호산구 증가증)을 포함한다. 호산구 증가증은 호산구 수치가 특정 부위 또는 말초 혈액에서 특정 역치를 초과할 때 발생한다.
이러한 TH2-매개 병태 각각에 대해, 이러한 병태를 치료 또는 예방하기 위해 본 명세서에 기재된 방법은 치료될 특정 TH2-매개 병태의 증상의 경감, 안정화 또는 또 다른 개선을 초래할 수 있고, 이러한 증상은 본 명세서에 기재된 증상을 포함한다.
추가 치료제
특정 양태에서, 본 명세서에 제공된 방법은 대상체에게 본 명세서에 기재된 박테리아 및/또는 박테리아 조성물(예를 들어, 프레보텔라 박테리아-함유 약제학적 조성물)을 단독으로 또는 또 다른 치료제와 조합하여 투여하여, 예를 들어, TH2-매개 병태(예컨대, 아토피 피부염 및/또는 음식 알레르기)를 치료 또는 예방하는 것을 포함한다. 프레보텔라 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물은 예를 들어, 항염증제와 조합하여 투여될 수 있다. 항염증제는 항-히스타민제(예컨대, 세티리진, 펙소페나딘 또는 디펜히드라민), 에피네프린, 코르티코스테로이드(경구 또는 국소)(예컨대, 베타메타손 발레레이트, 히드로코르티손 또는 프레드니손), 칼시뉴린 저해제(예컨대, 타크롤리무스 또는 피메크롤리무스), 시클로스포린, 인터페론 감마-1b 또는 두필루맙일 수 있다. 사용될 수 있는 국소 코르티코스테로이드는 하기를 포함한다: 알클로메타손 디프로피오네이트, 베타메타손 디프로피오네이트, 베타메타손 발러레이트, 클로베타솔 프로피오네이트, 데소니드, 데속시메타손 플루오시놀론 아세토니드, 플루오시노니드, 플루티카손 프로피오네이트, 할로베타솔 프로피오네이트, 히드로코르티손, 히드로코르티손 부티레이트, 히드로코르티손 발러레이트, 모메타손 푸로에이트, 트리암시놀론 아세토니드 및 트리암시놀론 디아세테이트.
일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아-함유 약제학적 조성물 및 다른 요법은 임의의 순서로 대상체에게 투여될 수 있다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아-함유 약제학적 조성물 및 다른 요법은 공동으로 투여된다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아-함유 약제학적 조성물은 추가 치료제가 투여되기 전(예를 들어, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 또는 24시간 전 또는 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 또는 30일 전)에 대상체에게 투여된다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아-함유 약제학적 조성물은 추가 치료제가 투여된 후(예를 들어, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 또는 24시간 후 또는 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 또는 30일 후)에 대상체에게 투여된다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아-함유 약제학적 조성물 및 추가 치료제는 대상체에게 동시에 또는 거의 동시에 투여된다(예를 들어, 투여는 서로 1시간 이내에 일어난다). 일부 구현예에서, 대상체는 프레보텔라 박테리아-함유 약제학적 조성물이 대상체에게 투여되기 전(예를 들어, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 또는 24시간 전 또는 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 또는 30일 전)에 항생제가 투여된다. 일부 구현예에서, 대상체는 프레보텔라 박테리아-함유 약제학적 조성물이 대상체에게 투여된 후(예를 들어, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 또는 24시간 전 또는 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 또는 30일 후)에 항생제가 투여된다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아-함유 약제학적 조성물 및 항생제는 대상체에게 동시에 또는 거의 동시에 투여된다(예를 들어, 투여는 서로 1시간 이내에 일어난다).
특정 구현예에서, 대상체는 수술을 받을 수 있다. 수술 유형은 예방, 진단 또는 병기 결정, 치료 및 완화 수술을 포함하지만, 이들로 제한되지 않는다.
일부 구현예에서, 추가 치료제는 항생제이다. "항생제"는 광범위하게 박테리아 감염을 저해 또는 예방할 수 있는 화합물을 지칭한다. 항생제는 특정 감염에 대한 사용, 작용 기전, 이의 생체이용률 또는 표적 미생물의 스펙트럼(예를 들어, 그람-음성 박테리아 대 그람-양성 박테리아, 호기성 박테리아 대 혐기성 박테리아, 등)을 포함하는 다양한 방법으로 분류될 수 있으며, 이들은 숙주의 특정 영역("환경")에서 특정 박테리아를 사멸시키는 데 사용될 수 있다(문헌[Leekha, et al 2011. General Principles of Antimicrobial Therapy. Mayo Clin Proc. 86(2): 156-167]). 특정 구현예에서, 항생제는 특정 환경의 박테리아를 선택적으로 표적화하는 데 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, 항생제는 박테리아 치료 후에 투여된다. 일부 구현예에서, 항생제는 박테리아 치료 후 생착을 제거하기 위해 투여된다.
일부 양태에서, 항생제는 살균 또는 정균 특성에 기초하여 선택될 수 있다. 살균 항생제는 세포벽(예를 들어, β-락탐), 세포막(예를 들어, 답토마이신) 또는 박테리아 DNA(예를 들어, 플루오로퀴놀론)를 파괴하는 작용 기전을 포함한다. 정균제는 박테리아 복제를 저해하고, 설폰아미드, 테트라사이클린 및 마크로리드를 포함하고, 단백질 합성을 저해함으로써 작용한다. 또한, 일부 약물은 특정 유기체에서 살균 가능하고 다른 유기체에서는 정균제일 수 있지만, 표적 유기체를 아는 것은 당업자가 적절한 특성을 갖는 항생제를 선택할 수 있게 한다. 특정 치료 조건에서, 정균 항생제는 살균 항생제의 활성을 저해한다. 따라서, 특정 구현예에서, 살균 및 정균 항생제는 조합되지 않는다.
항생제는 아미노글리코시드, 안사마이신, 카르바세펨, 카르바페넴, 세팔로스포린, 글리코펩티드, 린코사미드, 리포펩티드, 마크로라이드, 모노박탐, 니트로푸란, 옥사졸리도논, 페니실린, 폴리펩티드 항생제, 퀴놀론, 플루오로퀴놀론, 설폰아미드, 테트라사이클린, 및 항-마이코박테리아 화합물, 및 이들의 조합들을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다.
아미노글리코시드는 아미카신, 겐타미신, 카나마이신, 네오마이신, 네틸미신, 토브라마이신, 파로모마이신 및 스펙티노마이신을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 아미노글리코시드는, 예를 들어, 그람-음성 박테리아, 예컨대, 에스케리치아 콜라이, 클렙시엘라, 슈도모나스 애루기노사 및 프란시셀라 툴라렌시스에 대해 효과적이며, 특정 호기성 박테리아에 대해서는 효과적이지만, 완전/조건 혐기성 미생물에 대해서는 덜 효과적이다. 아미노글리코시드는 박테리아 30S 또는 50S 리보좀 서브유닛에 결합하여 박테리아 단백질 합성을 저해하는 것으로 여겨진다.
안사마이신은 겔다나마이신, 허비마이신, 리파마이신 및 스트렙토바리신을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 겔다나마이신 및 허비마이신은 열충격 단백질 90의 기능을 저해 또는 변경시키는 것으로 생각된다.
카바세펨은 로라카르베프를 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 카바세펨은 박테리아 세포벽 합성을 저해하는 것으로 생각된다.
카바페넴은 에르타페넴, 도리페넴, 이미페넴/실라스타틴 및 메로페넴을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 카르바페넴은 광범위한 항생제로서 그람-양성 및 그람-음성 박테리아 모두에 대해 살균성이다. 카바페넴은 박테리아 세포벽 합성을 저해하는 것으로 생각된다.
세팔로스포린은 세파드록실, 세파졸린, 세팔로틴, 세팔로신, 세팔렉신, 세파클로르, 세파만돌, 세폭시틴, 세프프로질, 세푸록심, 세픽심, 세프디니르, 세프디토렌, 세포페라존, 세포탁심, 세프포독심, 세프타지딤, 세프티부텐, 세프티족심, 세프트리악손, 세페핌, 세프타롤린 포사밀 및 세프토비프롤을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 선택된 세팔로스포린은 예를 들어 그람-음성 박테리아 및 슈도모나스를 포함한 그람-양성 박테리아에 대해 효과적이며, 특정 세팔로스포린은 메티실린-내성 스타필로코쿠스 아우레우스(MRSA)에 효과적이다. 세팔로스포린은 박테리아 세포벽의 펩티도글리칸 층의 합성을 방해함으로써 박테리아 세포벽 합성을 저해하는 것으로 여겨진다.
글리코펩티드는 테이코플라닌, 반코마이신 및 텔라반신을 포함하지만, 이들로 제한되지 않는다. 글리코펩티드는 예를 들어 MRSA 및 클로스트리디움 디피실레를 포함하는 호기성 및 혐기성 그람-양성 박테리아에 효과적이다. 글리코펩티드는 박테리아 세포벽의 펩티도글리칸 층의 합성을 방해함으로써 박테리아 세포벽 합성을 저해하는 것으로 여겨진다.
린코사미드는 클린다마이신 및 린코마이신을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 린코사미드는 예를 들어 혐기성 박테리아뿐만 아니라 스타필로코쿠스 및 스트렙토코쿠스에 대해 효과적이다. 린코사미드는 박테리아 50S 리보좀 서브유닛에 결합하여 박테리아 단백질 합성을 저해하는 것으로 여겨진다.
리포펩티드는 답토마이신을 포함하지만, 이들로 제한되지 않는다. 리포펩티드는 예를 들어 그람-양성 박테리아에 효과적이다. 리포펩티드는 박테리아 막에 결합하여 급속한 탈분극을 유발하는 것으로 여겨진다.
마크로라이드는 아지쓰로마이신, 클라리쓰로마이신, 디리쓰로마이신, 에리쓰로마이신, 록시쓰로마이신, 트롤레안도마이신, 텔리쓰로마이신 및 스피라마이신을 포함하지만, 이들로 제한되지 않는다. 마크로라이드는 예를 들어 스트렙토코커스 및 마이코플라스마에 효과적이다. 마크로라이드는 박테리아 또는 50S 리보솜 서브유닛에 결합하여 박테리아 단백질 합성을 저해하는 것으로 여겨진다.
모노박탐은 아즈트레오남을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 모노박탐은 예를 들어, 그람-음성 박테리아에 대해 효과적이다. 모노박탐은 박테리아 세포벽의 펩티도글리칸 층의 합성을 방해함으로써 박테리아 세포벽 합성을 저해하는 것으로 여겨진다.
니트로푸란은 푸라졸리돈 및 니트로푸란토인을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다.
옥사졸리도논은 리네졸리드, 포시졸리드, 라데졸리드 및 토레졸리드를 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 옥사졸리도논은 단백질 합성 저해제인 것으로 여겨진다.
페니실린은 아목시실린, 암피실린, 아즐로실린, 카르베니실린, 클록사실린, 디클록사실린, 플루클록사실린, 메즐로실린, 메티실린, 나프실린, 옥사실린, 페니실린 G, 페니실린 V, 피페라실린, 테모실린 및 티카르실린을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 페니실린은 예를 들어 그람-양성 박테리아, 조건 혐기성 박테리아, 예를 들어 스트렙토코커스, 보렐리아 및 트레포네마에 효과적이다. 페니실린은 박테리아 세포벽의 펩티도글리칸 층의 합성을 방해함으로써 박테리아 세포벽 합성을 저해하는 것으로 여겨진다.
페니실린 조합물은 아목시실린/클라불라네이트, 암피실린/설박탐, 피페라실린/타조박탐 및 티카실린/클라불라네이트를 포함하지만, 이에 제한되지 않는다.
폴리펩티드 항생제는 바시트라신, 콜리스틴 및 폴리믹신 B 및 E를 포함하지만, 이들로 제한되지 않는다. 폴리펩티드 항생제는 예를 들어 그람-음성 박테리아에 효과적이다. 특정 폴리펩티드 항생제는 박테리아 세포벽의 펩티도글리칸 층의 합성에 관여하는 이소프레닐 피로포스페이트를 저해하는 반면, 다른 폴리펩티드 항생제는 박테리아 반대-이온을 대체함으로써 박테리아 외막을 불안정화시키는 것으로 여겨진다.
퀴놀론 및 플루오로퀴놀론은 시프로플록사신, 에녹사신, 가티플록사신, 게미플록사신, 레보플록사신, 로메플록사신, 목시플록사신, 날리딕시산, 노르플록사신, 오플록사신, 트로바플록사신, 그레파플록사신, 스파르플록사신 및 테마플록사신을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 퀴놀론/플루오로퀴놀론은 예를 들어, 스트렙토코쿠스 및 나이세리아에 대해 효과적이다. 퀴놀론/플루오로퀴놀론은 박테리아 DNA 기라제 또는 토포이소머라제 IV를 저해함으로써 DNA 복제 및 전사를 저해하는 것으로 여겨진다.
설폰아미드는 마페니드, 설파세타미드, 설파디아진, 은 설파디아진, 설파디메톡신, 설파메티졸, 설파메톡사졸, 설파닐이미드, 설파살라진, 술피속사졸, 트리메토프림-설파메톡사졸(코-트리목사졸) 및 설폰아미도크리소이딘을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 설폰아미드는 디하이드로프테로에이트 신테타제의 경쟁적 저해에 의해 폴레이트 합성을 저해함으로써 핵산 합성을 저해하는 것으로 여겨진다.
테트라사이클린은 데메클로사이클린, 독시사이클린, 미노사이클린, 옥시테트라사이클린 및 테트라사이클린을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 테트라사이클린은 예를 들어, 그람-음성 박테리아에 대해 효과적이다. 테트라사이클린은 박테리아 30S 리보좀 서브유닛에 결합하여 박테리아 단백질 합성을 저해하는 것으로 여겨진다.
항-마이코박테리아 화합물은 클로파지민, 답손, 카프레오마이신, 사이클로세린, 에탐부톨, 에티온아미드, 이소니아지드, 피라진아미드, 리팜피신, 리파부틴, 리파펜틴 및 스트렙토마이신을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다.
적합한 항생제는 또한 아르스페나민, 클로람페니콜, 포스포마이신, 푸시드산, 메트로니다졸, 무피로신, 플라텐시마이신, 퀴누프리스틴/달포프리스틴, 티게사이클린, 티니다졸, 트리메토프림 아목시실린/클라불라네이트, 암피실린/술박탐, 암포마이신 리스토세틴, 아지쓰로마이신, 바시트라신, 부포린 II, 카르보마이신, 세크로핀 Pl, 클라리쓰로마이신, 에리쓰로마이신, 푸라졸리돈, 푸리드산, Na 푸시데이트, 그라미시딘, 이미페넴, 인돌리시딘, 조사마이신, 마가이난 II, 메트로니다졸, 니트로이미다졸, 미카마이신, 뮤타신 B-Ny266, 뮤타신 B-JHl 140, 뮤타신 J-T8, 니신, 니신 A, 노보비오신, 올레안도마이신, 오스트레오그리신, 피페라실린/타조박탐, 프리스티나마이신, 라모플라닌, 라날렉신, 류테린, 리팍시민, 로사미신, 로사라미신, 스펙티노마이신, 스피라마이신, 스타필로마이신, 스트렙토그라민, 스트렙토그라민 A, 시너기스틴, 타우롤리딘, 테이코플라닌, 텔리스로마이신, 티카르실린/클라불란산, 트리아세틸로레안도마이신, 틸로신, 티로시딘, 티로스리신, 반코마이신, 베마마이신, 및 버지니아마이신을 포함한다.
일부 구현예에서, 추가 요법은 치료 박테리아(예를 들어, 프레보텔라 박테리아) 및/또는 박테리아의 치료 조합물을 대상체에게 투여하여 건강한 미생물군이 대상체에서 재구성될 수 있도록 하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 치료 박테리아는 프로바이오틱 박테리아이다.
특정 추가 요법 중 일부는 하기에 추가로 상세히 기재되어 있다.
알레르기 비염
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 알레르기 비염을 포함하고, 추가 요법은 알레르기 비염을 치료하는 데 사용될 수 있는 작용제를 포함한다. 이러한 작용제는 개별적으로 또는 조합하여 코르티코스테로이드(예를 들어, 프레드니손, 메틸프레드니솔론, 트리암시놀론 아세토니드, 베타메타손), 항히스타민제(예를 들어, 아크리바스틴, 알리메마진, 안타졸린, 아스테미졸, 아젤라스틴, 베포타스틴, 빌라스틴, 브로마진, 브롬페니라민, 카비녹사민, 세티리진, 클로르시클리진, 클로로피라민, 클로르페나민, 클레마스틴, 시클리진, 시프로헵타딘, 데슬로라타딘, 덱스브롬페니라민, 덱스클로르페니라민, 디멘히드리네이트, 디메틴덴, 디펜히드라민, 독실아민, 에바스틴, 펙소페나딘, 히드록시진, 케토티펜, 레보카바스틴, 레보세티리진, 로라타딘, 메클리진, 메피라민, 미졸라스틴, 올로파타딘, 오르페나드린, 페니라민, 프로메타진, 퀴페나딘, 루파타딘, 테르페나딘, 트리펠렌아민, 트리프롤리딘), 비만 세포 안정화제(예를 들어, 크로몰릴), 충혈완화제(예를 들어, 베클로메타손, 부데소니드, 시클레소니드, 덱사메타손, 에페드린, 플루니솔리드, 플루티카손, 플루티카손 푸로에이트, 플루티카손 프로피오네이트, 레보메타암페타민, 모메타손, 나파졸린, 옥시메타졸린, 페닐에프린, 페닐프로판올아민, 프레드니솔론, 프로필헥세드린, 슈도에페드린, 시네프린, 테트리졸린, 틱소코르톨, 트라마졸린, 트리암시놀론, 트리암시놀론아세토니드, 자일로메타졸린), 류카트리엔 수용체 길항제(예를 들어, 몬테루카스트, 자피르루카스트, 질류톤, MK-886, 메클로페나메이트 나트륨) 및 면역치료제(예를 들어, 알레르겐 자체의 형태를 함유함, 항체, 예컨대, 오말리주맙의 형태를 함유함)를 포함한다. 이들 작용제는 일반적으로 다른 유형의 알레르기를 위해서 사용될 수 있으며, 이러한 알레르기는 단일 유형의 알레르기로서 발생할 수 있거나 다른 유형의 알레르기와 조합하여 일어날 수 있다.
천식
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 천식(예를 들어, 알레르기 천식)을 포함하고, 추가 요법은 천식을 치료하는 데 사용될 수 있는 작용제를 포함한다. 이러한 작용제는 개별적으로 또는 조합하여 코르티코스테로이드, 충혈완화제(이들 중 일부는 또한 코르티코스테로이드임), 비만 세포 안정화제, 류코트리엔 변형제 및 알레르기 비염의 치료를 위한 본 명세서에 제공된 면역치료제를 포함한다. 또한, 천식의 경우, 작용제는 또한 개별적으로 또는 조합하여 베타-효능제(예를 들어, 살메테롤, 포르모테롤, 알부테롤, 레발부테롤), 특정 코르티코스테론 및 베타-효능제 조합물(예를 들어, 플루티카손-살메테롤, 부데소니드-포르모테롤, 포르모테롤-모메타손), 추가 면역치료제(예를 들어, 메폴리주맙, 두필루맙, 레술리주맙 및 벤랄리주맙) 및 특정 다른 약물(예를 들어, 테오필린, 이프라트로피움)을 포함한다. 이들 작용제는 흡입기(inhaler)의 사용을 통해서, (예를 들어, 항체 형태의 경우) 주사로서 또는 환제로서(예를 들어, 알레르겐 면역요법의 경우 설하 정제로서) 제공될 수 있다.
아토피 피부염
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 아토피 피부염을 포함하고, 추가 요법은 아토피 피부염을 치료하는 데 사용될 수 있는 작용제를 포함한다. 이러한 작용제는 개별적으로 또는 조합하여, 코르티코스테로이드(예를 들어, 프레드니손) 및 알레르기 비염 또는 천식의 치료를 위한 본 명세서에 제공된 바와 같은 면역치료제(예를 들어, 두필루맙)을 포함한다. 또한, 아토피 피부염의 경우, 작용제는 또한 칼시뉴린 저해제(예를 들어, 타크롤리무스, 피메크롤리무스), 특정 보충제(예를 들어, 비타민 D), 면역억제제(예를 들어, 시클로스포린, 메토트렉세이트, 인터페론 감마-1b, 미코페놀레이트 모페틸, 아자티오프린) 및 다른 약물(예를 들어, 크리사보롤)을 포함한다.
두드러기
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 두드러기를 포함하고, 추가 요법은 두드러기를 치료하는 데 사용될 수 있는 작용제를 포함한다. 이러한 작용제는 개별적으로 또는 조합하여, 항히스타민제(예를 들어, 디펜히드라민, 로라타딘, 펙소페나딘, 세티리진, 데슬로라타딘), 코르티코스테로이드(예를 들어, 프레드니손), 류카트리엔 수용체 길항제 및 알레르기 비염 또는 천식의 치료를 위한 본 명세서에 제공된 바와 같은 면역치료제(예를 들어, 오말리주맙)을 포함한다. 또한, 두드러기의 경우, 작용제는 또한 다른 항히스타민제(예를 들어, 라니티딘, 시메티딘, 파모티딘), 면역억제제(예를 들어, 시클로스포린, 타크롤리무스, 시롤리무스, 미코페놀레이트), 항염증제(예를 들어, 답손, 설파살라진, 히드록시클로로퀸), 코르티코스테로이드(예를 들어, 코르티손) 및 호르몬(예를 들어, 에피네프린)을 포함한다.
혈관부종
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 혈관부종을 포함하고, 추가 요법은 혈관부종을 치료하는 데 사용될 수 있는 작용제를 포함한다. 이러한 작용제는 개별적으로 또는 조합하여, 항히스타민제(예를 들어, 디펜히드라민, 로라타딘, 펙소페나딘, 세티리진 및 데슬로라타딘), 코르티코스테로이드(예를 들어, 프레드니손), 류카트리엔 수용체 길항제 및 알레르기 비염 또는 천식의 치료를 위한 본 명세서에 제공된 바와 같은 면역치료제(예를 들어, 오말리주맙)을 포함한다. 또한, 혈관부종의 경우, 작용제는 또한 다른 항히스타민제(예를 들어, 라니티딘, 시메티딘, 파모티딘), 면역억제제(예를 들어, 시클로스포린, 타크롤리무스, 시롤리무스, 미코페놀레이트), 항염증제(예를 들어, 답손, 설파살라진, 히드록시클로로퀸), 코르티코스테로이드(예를 들어, 코르티손) 및 호르몬(예를 들어, 에피네프린)을 포함한다.
음식 알레르기
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 음식 알레르기를 포함하고, 추가 요법은 음식 알레르기를 치료하는 데 사용될 수 있는 작용제를 포함한다. 이러한 작용제는 개별적으로 또는 조합하여, 에피네프린, 항히스타민제, 글루코코르티코이드 스테로이드, 면역치료제(예를 들어, 알레르겐 자체의 형태를 함유함, 항체, 예컨대, 오말리주맙의 형태를 함유함)를 포함한다.
곤충-유도 알레르기
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 곤충-유도 알레르기를 포함하고, 추가 요법은 곤충-유도 알레르기를 치료하는 데 사용될 수 있는 작용제를 포함한다. 이러한 작용제는 항히스타민제를 포함한다.
약물 알레르기
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 약물 알레르기를 포함하고, 추가 요법은 약물 알레르기를 치료하는 데 사용될 수 있는 작용제를 포함한다. 이러한 작용제는 개별적으로 또는 조합하여, 항히스타민제(예를 들어, 디펜히드라민) 및 코르티코스테로이드를 포함한다.
아나필락시스
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 아나필락시스를 포함하고, 추가 요법은 아나필락시스를 치료하는 데 사용될 수 있는 작용제를 포함한다. 이러한 작용제는 음식, 곤충 독으로 인한 알레르기를 치료하는 데 사용될 수 있는 동일한 작용제 또는 아나필락시스를 치료하는 데 사용될 수 있는 약물(예를 들어, 에피네프린)을 포함한다.
호산구 증가증
일부 구현예에서, TH2-매개 병태는 호산구 증가증(예를 들어, 원발성 호산구 증가증)을 포함하고, 추가 요법은 호산구 증가증을 치료하는 데 사용될 수 있는 작용제를 포함한다. 이러한 작용제는 코르티코스테로이드(예를 들어, 프레드니손)를 포함한다.
이들 TH2-매개 병태 각각의 경우에, 일부 구현예에서, 이러한 제공된 추가 요법 중 하나 이상 이외에 개시된 약제학적 조성물이 투여될 수 있다. 예를 들어, 약제학적 조성물 및 추가 요법의 작용제가 공동 투여될 수 있다.
TH2 세포 활성화에 관여하는 경로를 하향조절하는 데 유용할 수 있는 추가 작용제는 메폴리주맙, 레브리키주맙, 트랄로키누맙, GSK3772847, RG6149/AMG282, ANB020, OC000459, BI 671800, AZD1981, AS1517499, YM-341619, AS1810722, SB010, 레시퀴모드, 이미퀴모드 및 CYT003을 포함한다.
투여
특정 양태에서, 본 명세서에 기재된 프레보텔라 박테리아-함유 약제학적 조성물을 대상체에게 전달하는 방법이 본 명세서에 제공된다. 본 명세서에 제공된 방법의 일부 구현예에서, 조성물은 추가 치료제(예를 들어, 항염증제)의 투여와 함께 투여된다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아는 추가 치료제와 함께 약제학적 조성물에서 공동 제형화된다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)는 추가 치료제와 함께 공동 투여된다. 일부 구현예에서, 추가 치료제는 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)의 투여 전(예를 들어, 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50 또는 55분 전, 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22 또는 23시간 전, 또는 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 또는 14일 전)에 대상체에게 투여된다. 일부 구현예에서, 추가 치료제는 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)의 투여 후(예를 들어, 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50 또는 55분 후, 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22 또는 23시간 후, 또는 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 또는 14일 후)에 대상체에게 투여된다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물) 및 추가 치료제 둘 모두를 전달하기 위해 동일한 전달 방식이 사용된다. 일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물) 및 추가의 치료제를 투여하기 위해 상이한 전달 방식이 사용된다. 예를 들어, 일부 구현예에서 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)는 경구로 투여되는 반면, 추가의 치료제는 주사(예를 들어, 정맥내 및/또는 근육내 주사)를 통해 투여된다.
특정 구현예에서, 본 명세서에 기재된 약제학적 조성물 및 투여 형태는 임의의 다른 통상적인 치료와 함께 투여될 수 있다. 이들 치료는 필요에 따라 및/또는 지시된 바와 같이 적용될 수 있고, 본 명세서에 기재된 약제학적 조성물 및 투여 형태의 투여 전, 투여와 동시에, 또는 투여 후에 수행될 수 있다.
투여 요법은 임의의 다양한 방법 및 양일 수 있으며, 공지된 임상 인자에 따라 당업자에 의해 결정될 수 있다. 의학 분야에 공지된 바와 같이, 임의의 한 환자에 대한 투여량은 대상체의 종, 크기, 체표면적, 연령, 성별, 면역능력 및 일반적인 건강, 투여될 특정 미생물, 투여 지속 기간 및 투여경로, 질환의 종류 및 단계 및 동시에 투여되는 약물과 같은 다른 화합물을 비롯한 많은 인자에 따라 다를 수 있다. 상기 인자 이외에, 이러한 수준은 당업자의 결정에 따라 미생물의 감염성 및 미생물의 성질에 의해 영향을 받을 수 있다. 본 명세서에 기재된 약제학적 조성물의 용량은 투여 형태, 투여 경로, 병태의 정도 또는 단계 등에 따라 적절히 설정되거나 조정될 수 있다. 예를 들어, 제제의 일반적인 유효 용량은 0.01 ㎎/㎏ 체중/일 내지 1000 ㎎/㎏ 체중/일, 0.1 ㎎/㎏ 체중/일 내지 1000 ㎎/㎏ 체중/일, 0.5 ㎎/㎏ 체중/일 내지 500 ㎎/㎏ 체중/일, 1 ㎎/㎏ 체중/일 내지 100 ㎎/㎏ 체중/일, 또는 5 ㎎/㎏ 체중/일 내지 50 ㎎/㎏ 체중/일의 범위일 수 있다. 유효 용량은 0.01, 0.05, 0.1, 0.5, 1, 2, 3, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 500, 또는 1000 ㎎/㎏ 체중/일 이상일 수 있지만, 용량은 이에 제한되지 않는다.
일부 구현예에서, 대상체에게 투여되는 용량은 병태를 예방하거나, 발병을 지연시키거나, 진행을 늦추거나 중단시키거나 또는 병태의 재발을 예방하기에 충분하다. 당업자는 투여량이 대상체의 연령, 종, 상태 및 체중뿐만 아니라 사용된 특정 화합물의 강도를 포함하는 다양한 인자에 따라 달라질 것임을 인식할 것이다. 투여량의 크기는 또한 투여 경로, 시기 및 빈도뿐만 아니라 특정 화합물의 투여에 수반될 수 있는 임의의 부작용 및 원하는 생리적 효과의 존재, 성질 및 정도에 의해 결정될 것이다.
적합한 용량 및 투여용량 요법은 당업자에게 공지된 통상적인 범위-지정 기술에 의해 결정될 수 있다. 일반적으로, 치료는 화합물의 최적 용량보다 적은 소량으로 개시된다. 그 후에, 투여용량은 상황 하에서 최적의 효과에 도달할 때까지 소량씩 증가된다. 효과적인 투여량 및 치료 프로토콜은 예를 들어 실험실 동물에서 낮은 용량으로 시작한 다음 효과를 모니터링하면서 투여용량을 증가시키고, 투여량 요법을 체계적으로 변화시키는, 일상적이고 통상적인 수단에 의해 결정될 수 있다. 동물 연구는 일반적으로, 킬로그램 중량 당 생물활성제의 최대 허용 용량("MTD")을 결정하기 위해 사용된다. 당업자는 인간을 포함한 다른 종에서 독성을 피하면서 효능에 대한 용량을 정기적으로 추정한다.
상기에 따르면, 치료적 적용에서, 본 발명에 따라 사용되는 활성제의 용량은 선택된 투여용량에 영향을 미치는 다른 요인들 중에서, 활성제, 수혜 환자의 연령, 체중 및 임상 상태, 요법을 투여하는 임상의 또는 개업의의 경험 및 판단에 따라 변한다. 일반적으로, 용량은 병태의 진행을 둔화시키고, 바람직하게는 퇴행시키기에 충분해야 한다.
개별 투여는 2회, 3회, 4회, 5회 또는 6회 투여를 포함하여 임의의 수의 2회 이상의 투여(예를 들어, 용량)를 포함할 수 있다. 당업자는 치료 방법을 모니터링하기 위해 당 업계에 공지된 방법 및 본 명세서에 제공된 다른 모니터링 방법에 따라 수행할 투여 횟수 또는 하나 이상의 추가 투여를 수행하는 것이 바람직하다는 것을 쉽게 결정할 수 있다. 일부 구현예에서, 용량은 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 또는 30일 또는 1, 2, 3 또는 4주씩 떨어져 있을 수 있다. 따라서, 본 명세서에 제공된 방법은 대상체에게 박테리아의 하나 이상의 투여를 제공하는 방법(여기서 투여 횟수는 대상체를 모니터링함으로써 결정될 수 있음) 및 모니터링의 결과에 기초하여 하나 이상의 추가 투여를 제공할지 여부를 결정하는 방법을 포함한다. 하나 이상의 추가 투여를 제공할 것인지의 여부의 결정은 대상체의 항-박테리아 항체 역가, 대상체의 전반적인 건강 및/또는 대상체의 체중을 포함하지만, 이에 제한되지 않는 다양한 모니터링 결과에 기초할 수 있다.
투여 사이의 기간은 임의의 다양한 기간일 수 있다. 투여 사이의 기간은 투여 횟수, 대상체가 면역 반응을 일으키는 기간 및/또는 대상체가 정상적인 조직 또는 소화관으로부터 박테리아를 제거하는 기간과 관련하여 기술된 바와 같이 모니터링 단계를 포함하는 임의의 다양한 인자의 함수일 수 있다. 일례에서, 기간은 대상체가 면역 반응을 일으키는 시간의 함수일 수 있으며; 예를 들어, 기간은 약 1주일 초과, 약 10일 초과, 약 2주 초과, 또는 약 1개월 초과와 같은, 대상체가 면역 반응을 일으키는 기간보다 길 수 있거나; 다른 예에서, 기간은 약 1주일 미만, 약 10일 미만, 약 2주 미만, 또는 약 1개월 미만과 같은, 대상체가 면역 반응을 일으키는 기간보다 짧을 수 있다. 또 다른 예에서, 기간은 대상체가 박테리아를 정상 조직 또는 소화관으로부터 제거하는 기간의 함수일 수 있으며; 예를 들어, 기간은 대상체가 정상 조직 또는 소화관으로부터 박테리아를 제거하는 시간보다 길 수 있으며, 예컨대, 약 1일 초과, 약 2일 초과, 약 3일 초과, 약 5일 초과, 또는 약 1주일 초과이다.
일부 구현예에서, 본 명세서에 기재된 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)과 조합된 추가의 치료제의 전달은 부작용을 감소시키고/시키거나 추가의 치료제의 효능을 향상시킨다.
본 명세서에 기재된 추가의 치료제의 유효 용량은 환자에게 독성이 가장 적은, 특정 환자(예를 들어, 대상체), 투여 조성물 및 투여 방식에 대한 원하는 치료 반응을 달성하는데 효과적인 치료제의 양이다. 유효 투여량 수준은 본 명세서에 기재된 방법을 사용하여 확인될 수 있으며, 투여되는 특정 조성물의 활성, 투여 경로, 투여시간, 사용되는 특정 화합물의 배출 속도, 치료 기간, 사용된 특정 조성물과 함께 사용되는 다른 약물, 화합물 및/또는 물질, 치료되는 환자의 연령, 성별, 체중, 상태, 일반적인 건강 및 이전 의학적 이력, 및 의학 분야에서 잘 알려진 유사 인자를 포함하는 다양한 약동학적 인자에 따라 달라질 것이다. 일반적으로, 추가의 요법의 유효 용량은 치료 효과를 생성하는데 효과적인 최저 용량인 치료제의 양일 것이다. 이러한 유효 용량은 일반적으로, 상기 기재된 인자에 따라 달라질 것이다.
추가의 요법의 독성은 치료 동안 및 치료 후에 대상체가 경험하는 부작용의 수준이다. 요법 독성과 관련된 부작용은 복통, 위산과다, 위산 역류, 알레르기 반응, 탈모증, 아나필락시스, 빈혈, 불안, 식욕 부진, 관절통, 무력증, 운동 실조증, 무증상, 균형 상실, 뼈 통증, 출혈, 혈전, 저혈압, 고혈압, 호흡 곤란, 기관지염, 멍, 적은 백혈구 수, 적은 적혈구 수, 적은 혈소판 수, 심장독성, 방광염, 출혈성 방광염, 부정맥, 심장 판막 질환, 심근병증, 관상 동맥 질환, 백내장, 중추 신경독성, 인지 장애, 혼동, 결막염, 변비, 기침, 경련, 방광염, 심부정맥 혈전증, 탈수, 우울증, 설사, 현기증, 구강 건조, 건조한 피부, 소화불량, 호흡곤란, 부종, 전해질 불균형, 식도염, 피로, 생식능력 상실, 열, 속이 부글거림, 홍조, 위 역류, 위식도 역류 질환, 생식기 통증, 과립구감소증, 여성형 유방, 녹내장, 탈모, 손발 증후군, 두통, 난청, 심부전, 심계항진, 속쓰림, 혈종, 출혈성 방광염, 간독성, 고아밀라아제혈증, 고칼슘혈증, 고염소혈증, 고혈당증, 고칼륨혈증, 고지혈증, 고마그네슘혈증, 고나트륨혈증, 고인산혈증, 과다색소침착, 고중성지방혈증, 고요산혈증, 저알부민혈증, 저칼슘혈증, 저염소혈증, 저혈당증, 저칼륨혈증, 저마그네슘혈증, 저나트륨혈증, 저인산혈증, 발기부전, 감염, 주사 부위 반응, 불면증, 철 결핍증, 가려움증, 관절통, 신부전, 백혈구감소증, 간기능부전증, 기억 상실, 폐경, 구강 염증, 점막염, 근육통증, 근육통, 골수억제, 심근염, 호중구 발열, 메스꺼움, 신독성, 호중구감소증, 코피, 마비, 이독성, 통증, 손발바닥 홍반성 감각이상, 범혈구감소증, 심막염, 말초신경병증, 인두염, 광선공포증, 감광성, 폐렴, 간질성 폐렴, 단백뇨, 폐색전증, 폐섬유증, 폐 독성, 발진, 빠른 심장 박동, 직장 출혈, 안절부절, 비염, 발작, 호흡 곤란, 부비동염, 혈소판감소증, 이명, 요로 감염, 질 출혈, 질 건조, 현기증, 물 정체, 쇠약, 체중 감소, 체중 증가 및 구강건조증을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 일반적으로, 요법을 통해 달성된 대상체에 대한 이익이 요법으로 인해 대상체가 경험한 부작용보다 더 클 경우 독성이 허용 가능하다.
일부 구현예에서, 프레보텔라 박테리아(예를 들어, 이의 약제학적 조성물)의 투여는 병태를 치료한다.
본 명세서에 기재된 바와 같이, 치료될 병태는 TH2-매개 병태, 예컨대, 아토피 피부염 및/또는 음식 알레르기를 포함할 수 있다.
실시예
실시예 1: FITC-유도 접촉 과민증 모델에서 프레보텔라 히스티콜라의 효과.
항원에 대한 피부 노출은 시간 경과에 따라서 예를 들어, 피부 알레르기(예를 들어, 피부염 또는 아토피 피부염 또는 습진)의 형태 및/또는 음식 알레르기의 형태의 그 항원에 대한 알레르기 반응으로 이어질 수 있다(예를 들어, 문헌[Han et al. The atopic march: current insights into skin barrier dysfunction and epithelial cell-derived cytokines. Immunol. Rev. 2017. July;278(1):116-130. Doi: 10.1111/imr.12546]; 문헌[Kawasaki et al. Skin inflammation exacerbates food allergy symptoms in epicutaneously sensitized mice. Allergy. 2018. June;73(6):1313-1321. Doi: 10.1111/all.13404]; 문헌[Martel et al. Translational animal models of atopic dermatitis for preclinical studies. Yale J. Biol. Med. 2017. Sept;90(3):389-402]; 문헌[Jin et al. Animal models of atopic dermatitis. J. Invest. Dermatol. 2009. Jan: 129(1):31-40. Doi 10.1038/jid.2008.106] 참고).
프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329의 효과는 플루오레세인 아이소티오사이아네이트(FITC)-유도 접촉 과민증 모델에서 연구되었다(예를 들어, 문헌[Li et al. T-helper type-2 contact hypersensitivity of Balb/c mice aggravated by dibutyl phthalate via long-term dermal exposure. Feb. 3, 2014. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0087887]; 문헌[Imai et al. Effects of phthalate esters on the sensitization phase of contact hypersensitivity induced by fluorescein isothiocyanate. Clin. Exp. Allergy. 2006 Nov; 36(11): 1462-8]; 문헌[Dearman et al. Role of CD4+ T helper 2-type cells in cutaneous inflammatory responses induced by fluorescein isothiocynate. Immunology. 2000 Dec; 101(4):442-451. Doi: 10.1046/j.1365-2567.2000.01126.x] 참고).
프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329를 경구 위관 영양법에 의해서 투여하였고, 염증에 대한 프레보텔라 히스티콜라의 효과를 다양한 판독치를 사용하여 분석하였다.
분말(예를 들어, 동결건조 형태)로부터 재구성된 미생물을 사용하여 연구를 수행하였다. 수크로스를 재구성용 비히클로서 사용하였다.
매일 위관 영양법, 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329 바이알 1개 및 혐기성 수크로스 바이알 1개를 냉장고에서 꺼냈다. 혐기성 수크로스를 사용하여 멸균 튜브 내에서 적절한 박테리아 희석물을 제조하였다. 예를 들어, 800 ul의 수크로스를 80 ㎎의 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329에 첨가하였다. 적절한 재현탁을 보장하기 위해서, 재현탁된 분말의 바이알을 와동시켜 분말이 바이알에 들러붙지 않게 하였다. 와동 직후(분말이 가라앉기 전)에 마우스당 100 ㎕의 양의 재현탁된 분말을 사용하여 마우스에게 위관 영양법을 수행하고, 나머지 분말 혼합물을 버렸다(새로 준비된 희석물을 매번 사용해야 함). 음성 대조군 마우스에게 1일당 100 ul의 비히클을 사용하여 경구 위관 영양법을 수행하였다.
FITC-유도 과민증 연구 프로토콜:
마우스를 Taconic로부터 구입하고, 실험 시작 전 적어도 1주일 동안 사육장에 적응시켰다. 마우스를 케이지당 5마리(또는 더 적게) 동물로 수용하였고, 각각의 케이지는 상이한 처리군을 구성하였다.
제0일에, 마우스를 이소플루란으로 마취시키고(한번에 한마리씩), 등을 면도하였다.
제1일에, 0.5% FITC (w/v)의 용액을 아주반트(디부틸 프탈레이트(DBP)) 및 아세톤(1:1)에 용해시켰다. 0.5% FITC를 제조하기 위해서, 250 ㎎의 FITC를 25 ㎖ 아세톤에 용해시켰다. 완전히 용해되면, 25 ㎖의 DBP를 첨가하고, 와동에 의해 혼합하였다.
제1일 및 제2일에, 피펫으로 0.5% FITC 용액 ㎕를 적용함으로써 마우스의 등을 감작시켰다. 혐기성 수크로스를 음성 대조군(비히클)으로 제공하였다. 덱사메타손을 양성 대조군으로 제공하였다(25 ㎎의 덱사메타손(Sigma)을 1.6 ㎖의 96% 에탄올에 재현탁시킴으로써 덱사메타손 스톡 용액을 제조하였다).
제1일 내지 제6일에, 하기 연구 설계에 따라서 마우스에게 비히클(음성 대조군, 군 1) 또는 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(군 3)를 사용하여 경구 위관 영양법을 수행하거나 덱사메타손(양성 대조군, 군 2)을 복강내(i.p.) 주사하였다.
Figure pct00022
매일 위관 영양법(군 1 및 군 3) 및 i.p. 주사(군 2)에 더하여, 하기와 같이 제6일에 마우스를 FITC-시험감염시켰다: 제6일에, 각각의 마우스를 이소플루란으로 마취시키고, 캘리퍼를 사용하여 기준선 왼쪽 귀 측정치를 얻고, 그 다음 20 ㎕의 0.5% FITC 용액을 왼쪽 귀에 적용하였다(20 ㎕의 0.5% FITC (w/v) DBP:아세톤(1:1)("귀 시험감염" 또는 "FITC 시험감염").
제7일에, 귀 시험감염 8시간 후에 캘리퍼를 사용하여 측정치를 얻었다. 마우스를 안락사시키고, 제조사의 지침에 따라서 TaqMan RNA-to-CT 1-Step Kit(Applied Biosystems, ThermoFisher Scientific 카탈로그 번호 4392653)를 사용하여 하류 mRNA 분석을 위해서 귀를 수집하였다.
결과를 도 1a 도 1b에 도시한다.
프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(도 1a 및 도 1b에서 "프레보텔라 히스티콜라"로 표지됨)의 경구 투여는 FITC 귀 시험감염 8시간 후 귀 부종을 상당히 감소시켰다(도 1a).
비히클 군과 비교할 때, 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329 처리는 귀에서 IL-4, IL-5, IL-33, IL-17a 및 TSLP에 대한 유전자 발현을 감소시켰다(도 1b).
실시예 2: FITC-유도 접촉 과민증 모델에서 프레보텔라 히스티콜라의 효과.
FITC-유도 접촉 과민증 모델에서 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329의 효과를 2개의 다른 균주인 균주 1 및 균주 2에 대해서 시험하였는데, 균주 1은 히스티콜라가 아닌 프레보텔라 종의 균주이고, 균주 2는 프레보텔라와 상이한 속의 균주이다.
실시예 1에 기재된 바와 같이, 제0일에, 마우스를 이소플루란으로 마취시키고, 등을 면도하였다. 제1일 및 제2일에, 피펫으로 400 ㎕의 0.5% FITC 용액을 적용함으로써 마우스의 등을 감작시켰다. 제1일 내지 제6일에, 마우스에게 비히클(수크로스) 또는 시험 박테리아 균주를 사용하여 경구 위관 영양법을 수행하거나 또는 덱사메타손(양성 대조군)을 복강내(i.p.) 주사하였다.
실시예 1에 기재된 바와 같이, 제6일에, 각각의 마우스를 이소플루란으로 마취시키고, 캘리퍼를 사용하여 기준선 왼쪽 귀 측정치를 얻었다. 그 다음 20 ㎕의 0.5% FITC 용액을 왼쪽 귀에 적용하여 마우스를 FITC-시험감염시켰다.
제7일에, 시험감염 후 8시간에, 마우스를 캘리퍼를 사용한 시험감염 후 귀 측정을 위해서 안락사시켰다.
결과를 도 2에 도시한다. 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(도 2에서 "프레보텔라 히스티콜라"로 표지됨)의 경구 투여는 FITC 시험감염 8시간 후 귀 부종을 상당히 감소시킨 반면, 2개의 다른 박테리아 균주(균주 1 및 균주 2)는 귀 부종을 감소시키지 않았다(도 2). 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329와 균주 1(프레보텔라의 또 다른 종의 균주) 사이의 귀 부종에서의 차이는 통계학적으로 유의하지 않았지만, 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329와 균주 2(프레보텔라가 아닌 또 다른 속의 균주) 사이의 귀 부종에서의 차이는 통계학적으로 유의하였다.
실시예 3: 난백 단백질 오브알부민(OVA)에 대한 피부염-연관 음식 알레르기의 MC903 모델에서 프레보텔라 히스티콜라의 효과.
피부염-연관 음식 알레르기의 마우스 모델을 사용하여 알레르기 반응을 조절하는 데 있어서 박테리아 균주의 효능을 평가하였다.
비타민 D3 유사체인 MC903은 염증을 유도하여, 아토피 피부염의 모델로 사용되어 왔다(문헌[Hussain et al. Basophil-derived IL-4 promotes epicutaneous antigen sensitization concomitant with the development of food allergy. 2017. American Academy of Allergy, Asthma & Immunol. http://dx.doi.org/10.1016/j.jaci.2017.02.035]; 문헌[Moosbrugger-Martinz et al. A mouse model for atopic dermatitis using topical application of Vitamin D3 or of its analog MC903. Methods Mol. Biol. 2017;1559:91-106]; 문헌[Li et al. Topical vitamin D3 and low-calcemic analogs induce thymic stromal lymphopoietin in mouse keratinocytes and trigger an atopic dermatitis. PNAS. Aug. 1, 2006. Vol. 103(31): 11736-11741)] 참고).
MC903을 사용하여 관심 항원에 대해서 마우스의 피부를 감작시켜, TSLP 및 IL-4 생산으로 대표되는 피부 감작을 유발할 수 있다(문헌[Noti et al. Exposure to food allergens through inflamed skin promotes intestinal food allergy via the TSLP-basophil axis. J. Allergy Clin. Immunol. 2014 May; 133(5): 1390-1399.e6] 참고). 피부염-연관 음식 알레르기에 대한 MC903 모델에 대한 연구 설계를 도 3a에 도시한다. 처리될 알레르겐(예를 들어, OVA)은 공급업체, 예컨대, Invivogen 또는 Sigma로부터 얻을 수 있다.
물질 및 방법
암컷 BALB/c 마우스(6 내지 8주령)를 Taconic Farms에서 구입하였다. 동물을 사육장(케이지당 5마리 또는 5마리 미만)의 특정 병원체가 없는 조건에 수용하였고, 모든 실험은 기관 동물 관리 및 사용 위원회(Institutional Animal Care and Use Committee: IACUC) 승인 프로토콜 및 지침에 따라 수행하였다. 실험 시작 전 일주일 동안 마우스를 사육장에 적응시켰다. PicoLab Rodent Diet 20을 제공하고, 시퍼병을 통해 오토클레이브수를 자유식으로 제공하고, 매일 확인한다.
계란 음식 알레르기를 모방한 마우스 모델을 유도하기 위해서, 마우스를 연속 14일(1 내지 14일) 동안 매일 MC903(Tocris) 및 100 ㎍ 오브알부민(OVA)에 노출시켰다. 100% 에탄올 20 ㎕ 중의 MC903 45 μM을 피펫으로 한쪽 귀에 적용하고, 귀가 건조되면 PBS 중의 OVA 100 ㎍을 적용하였다. 20 ㎕ 에탄올을 비히클 대조군의 귀에 적용하였다.
매일 경구 위관 영양법 치료(1 내지 17일)를 위해 음성 대조군 마우스에게 비히클(냉동 수크로스)을 제공하였고, 양성 대조군 마우스에게 토파시티닙(0.5% 메틸셀룰로스 중의 100 ul/마우스의 20 ㎎/㎏(p.o.); Tocris)을 제공하였다. 하나의 군의 마우스에게 매일 10 ㎎의 프레보텔라 히스티콜라 B 50329(3.13E+09 TCC/용량)를 제공하였고, 다른 군에게 10 ㎎의 균주 A(1.23E+10 TCC/용량) 또는 균주 B(7.83E+09 TCC/용량)(프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329가 아닌 박테리아 균주 - 균주 A는 프레보텔라가 아닌 또 다른 속의 균주이고, 균주 B는 프레보텔라 히스티콜라의 또 다른 균주임)를 제공하였다. 제15일에, 마우스를 50 ㎎의 OVA로 경구 위관 영양법(p.o., 위내(i.g.)라고도 지칭됨)으로 시험감염시켰다.
제17.5일에, 마우스를 50 ㎎의 OVA로 두 번째 경구 시험감염시켰다. 귀 염증을 두 번째 시험감염 후 캘리퍼를 사용하여 측정하였다.
제18일에 귀 염증을 도 3b에 도시한다(두 번째 OVA 시험감염 후 12시간). 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(도 3b 내지 도 3d에서 "피. 히스티콜라"로 표지)를 사용한 치료는 음성 대조군과 비교할 때 귀 염증을 상당히 감소시켰다.
제18일에, 두 번째 OVA 시험감염 12시간 후, 마우스를 안락사시켰다. 혈액(혈청용) 및 조직(예를 들어, 비장, 드레이닝 경부 림프절, 장간막 림프절 및 귀)을 생체외 처리를 위해 수집하였다.
혈청을 Chondrex, Inc. Mouse Anti-OVA IgG1 Antibody Assay Kit(카탈로그 번호 3013) 및 Mouse Anti-OVA IgE Antibody Assay Kit(카탈로그 번호 3010)를 사용하여 항-OVA IgG1, 항-OVA IgE에 대해서 ELISA에 의해서 분석하였다. 결과를 도 3c에 도시한다.
사이토카인 검출을 위해 귀를 균질화시켰다. 비장, 장간막 림프절(mLN) 및 경부 림프절(cLN)을 시험관내 PMA 자극 및 상청액 수집 후 사이토카인 발현에 대해 분석하였다. 조직의 단일 세포 현탁액을 제조하고, 계수하고, 200,000개 세포/웰로 플레이팅하고, 제조업체의 지침에 따라 PMA/Ionomycin(eBiosciences Cell Stimulation cocktail 카탈로그 번호 00-4975)으로 48시간 동안 재자극시켰다. 상청액을 수집하고, 하류 멀티플렉스 ELISA를 위해서 사용하여 Meso Scale Discovery(MSD) 키트(카탈로그 번호 K15068L-2)를 사용하여 사이토카인 수준을 결정하였다. 또한, 귀를 Halt Protease(Thermo Scientific 카탈로그 번호 78444)를 함유하는 250 ul T-PER 완충제(Thermo Scientific 카탈로그 번호 78510)에서 해리시키고, BCA 키트(Thermo Scientific 카탈로그 번호 23227)를 사용하여 단백질 농도를 정량화하였다. 100 ug의 단백질을 사용하여 MSD 키트(카탈로그 번호 K15068L-2)를 사용하여 사이토카인 수준을 정량화하였다. 결과를 도 3d에 도시한다.
실시예 4: OVA 및 완전 땅콩 단백질(CPE)에 대한 음식 알레르기에서 타입 2(Th2) 면역 반응의 MC903 모델에서의 프레보텔라 히스티콜라의 효과.
계란 음식 알레르기 및 땅콩 알레르기를 모방한 마우스 모델을 유도하기 위해, 마우스를 실시예 3에 기재된 바와 같고 도 4a에 도시된 바와 같이 음식 알레르겐에 대해서 감작시켰다.
MC903을 EtOH에서 제조하고, 표시된 대로 매일 적용하였다(제1일부터 제14일까지).
일부 마우스를 연속 14일 동안 매일 PBS 중의 MC903 및 100 ug OVA에 노출시켰다. 다른 마우스를 연속 14일 동안 매일 MC903 및 100 ug의 완전 땅콩 단백질(CPE)에 노출시켰다. 항원(예를 들어, OVA 또는 CPE)의 적용에 추가하여, 수크로스 비히클(음성 대조군), 토파시티닙(양성 대조군), 박테리아 균주 A(10㎎/용량) 또는 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(10 ㎎/용량)를 사용하여 마우스에게 위관 영양법을 수행하였다. 균주 A는 프레보텔라가 아닌 또 다른 속의 균주이다.
제15일에, 마우스를 50 ㎎의 OVA 또는 50 ㎎의 땅콩 분말을 사용하여 경구 위관 영양법에 의해서 시험감염시켰다.
제17.5일에, 마우스를 50 ㎎의 OVA 또는 50 ㎎의 완전 땅콩 분말(CPE)을 사용하여 경구 위관 영양법에 의해서 두 번째로 시험감염시켰다.
최종 항원 공격 12시간 후인 제18일에, 귀 두께를 측정하였다. 마우스를 안락사시키고, 실시예 3에 기재된 바와 같이 혈청 및 조직을 수집하였다.
도 4b에 도시된 바와 같이, 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(도 4b 내지 도 4d에서 "피. 히스티콜라"로 표지됨)는 OVA 및 땅콩 알레르기(CPE) 군 둘 다에서 비히클 대조군과 비교할 때 귀 염증을 상당히 감소시켰다. 항체 분석(항-OVA IgG1 및 항-OVA IgE)을 실시예 3에 기재된 바와 같이 수행하였고, 결과를 도 4c에 나타내었다. 사이토카인 분석을 실시예 3에 기재된 바와 같이 수행하였고, 도 4d에 나타낸다. 실시예 1에 기재된 바와 같이 귀 RNA를 측정하였고, 결과를 도 4e에 나타낸다.
실시예 5: MC903-유도 아토피 피부염 및 아나필락시스.
계란 음식 알레르기, 땅콩 알레르기 및/또는 다른 관심 알레르겐을 모방한 마우스 모델을 유도하기 위해, 마우스를 실시예 3에 기재된 바와 같고 도 5에 도시된 바와 같이 음식 알레르겐에 대해서 감작시킨다.
MC903을 EtOH에서 제조하고, 표시된 대로 매일 적용한다(1일부터 14일까지).
일부 마우스를 최대 연속 30일 동안 매일 PBS 중의 MC903 및 100 ug CPE에 노출시킨다. 모델 항원(예를 들어, CPE)의 적용에 추가하여, 수크로스 비히클(음성 대조군), 토파시티닙(양성 대조군; 100 ㎕ 경구, 매일), 박테리아 균주 A(10 ㎎/용량) 또는 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(10 ㎎/용량) 또는 200 ㎍/마우스 항-IL-4(i.p. 제3일, 제6일, 제9일 및 제12일; BioXcell)(1 내지 17일 또는 1 내지 30일만큼 오랫동안)를 사용하여 마우스에게 위관 영양법을 수행한다.
제30일에, 마우스를 500 ug CPE i.p.를 사용하여 시험감염시키고, 아나필락시스를 관찰한다. CPE 시험감염 30분 후, 직장 온도계를 사용하여 체온을 측정한다.
제31일에, 마우스를 희생시키고, 귀 염증을 측정한다. 비장, 귀 및 림프 조직 사이토카인을 실시예 1 및 실시예 3에 기재된 방법을 사용하여 분석한다.
실시예 6: 테이프-스트리핑(stripping) 땅콩 알레르기 모델.
상기에 기재된 바와 같이, 음식 알레르기를 연구하기 위한 다양한 동물 모델이 존재한다. 이러한 모델 중 일부는 피부 장벽 결함을 통해 알레르겐(예를 들어, 항원)의 감작을 유도한다(예를 들어, 문헌[Ohsaki et al. Maternal IgG immune complexes induce food allergen-specific tolerance in offspring. J Exp Med. 2018. 215:91-113; 문헌[Kanagaratham et al. Experimental models for studying food allergy. Cell Mol Gastroenterol Hepatol. 2018. 6(3):356-369.e1. Doi: 10.1016/j.jcmgh.2018.05.010] 참고). 일부 모델에서, 털을 깎은 후 피부의 반복적인 테이프-스트리핑에 의해서 피부 장벽 결함을 유도하고, 그 결과 손상된 피부에 알레르겐을 적용한다. 알레르겐에 대한 이러한 "표피내(epicutaneous) 감작"은 일부 시점에서 알레르겐에 대한 위내 공격으로 이어진다. 예를 들어, 도 6a에 도시된 바와 같이, 제1일, 제2일, 제3일(귀 감작) 또는 제0일, 제3일, 제6일(등 감작)에 테이프-스트리핑을 사용하고, 땅콩 항원에 노출시켜 마우스의 귀 또는 등을 감작시킬 수 있다. 귀 감작 군의 경우, 마우스는 제0일에만 테이프-스트리핑되지만, 등 감작 군은 제0일, 제3일 및 제6일에 테이프-스트리핑된다. 마우스를 제21일에 시험감염시키고, 그 직후 관찰하고, 및/또는 혈청 땅콩-특이적 IgE, IgG1 및 IgA뿐만 아니라 총 IgE, IgG1 및 IgA, 체온, 아나필락시스 점수, 설사 점수 및/또는 장간막 림프절(MLN) 세포의 생체외 재자극의 측정을 포함하지만 이들로 제한되지 않는 다양한 판독을 위해서 희생시켜 다양한 사이토카인(IL-4, IL-5 및 TSLP 포함)을 평가하였다. 대안적으로, 혈청을 제35일에 수집할 수 있고(도 6b 참고), 다른 경우에는 연구를 65일 동안 길게 지속할 수 있다(도 6c 참고). 마우스를 각각 표 3 및 표 4에 나타낸 바와 같이 아나필락시스 및 설사에 대해 점수를 매길 수 있다.
Figure pct00023
Figure pct00024
암컷 BALB/c 마우스를 Taconic Farms에서 구입하였고, 모든 실험은 기관 동물 관리 및 사용 위원회(IACUC) 승인 프로토콜 및 지침에 따라 수행하였다.
실험 시작 전 일주일 동안 마우스를 사육장에 적응시켰다. 모든 마우스를 케이지당 5마리 미만의 동물로 수용하고, 표준 침구와 보강과 함께 케이지를 개별적으로 통풍시킨다. PicoLab Rodent Diet 20을 제공하고, 시퍼병을 통해 오토클레이브수를 임의로 제공하고, 매일 확인하였다.
실험 설계
동물 군을 하기와 같이 분리하였다(5마리 마우스/군):
1) 미경험 마우스(감작 없음, 땅콩 시험감염 없음);
2) 미경험 마우스(감작 없음, 제21일에 땅콩 시험감염);
3) 귀 감작(제1일, 제2일 및 제3일에 감작)(시험감염 없음);
4) 귀 감작(제1일, 제2일 및 제3일에 감작)(제21일에 땅콩 시험감염);
5) 귀 감작(제1일, 제2일 및 제3일에 감작)(토파시티닙 20 ㎎/㎏)(제21일에 땅콩 시험감염);
6) 귀 감작(제1일, 제2일 및 제3일에 감작)(피. 히스티콜라 10 ㎎)(제21일에 땅콩 시험감염);
7) 등 감작(제0일, 제3일 및 제6일에 감작)(시험감염 없음);
8) 등 감작(제0일, 제3일 및 제6일에 감작)(제21일에 땅콩 시험감염);
9) 등 감작(제0일, 제3일 및 제6일에 감작)(토파시티닙 20 ㎎/㎏)(제21일에 땅콩 시험감염); 및
10) 등 감작(제0일, 제3일 및 제6일에 감작)(프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329 10 ㎎)(제21일에 땅콩 시험감염).
제0일에, 마우스를 한마리씩 이소플루란으로 마취시켰다. 귀 감작 군의 경우, 각각의 마우스의 귀를 셀로판 테이프를 사용하여 반복적으로 테이프-스트리핑(대략 7 내지 8회)하였다. 등 감작 군의 경우, 등을 면도하고, 셀로판 테이프를 사용하여 테이프-스트리핑(대략 7 내지 8회)하였다.
귀 감작 군의 경우, 마우스를 제0일에 테이프-스트리핑하였다. 제1일, 제2일 및 제3일에, 25 ㎕의 땅콩 단백질 용액(PBS 중의 땅콩 단백질 4 ㎎/㎖)을 면봉으로 양쪽 귀에 적용하였다.
등 감작 군의 경우, 제0일, 제3일, 제6일에, 마우스를 테이프-스트리핑하고, 100 ㎍의 땅콩 단백질을 적용하였다. 감작된 영역을 매번 새로운 방수 붕대로 감쌌다.
프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329 군의 경우, 제1일에서 제21일 사이에 마우스에게 10 ㎎ 박테리아를 경구 위관 영양법으로 공급하였다.
제21일에, 군 2, 4, 5, 6, 8 및 9의 마우스를 100 ㎎ 땅콩 단백질의 위관 영양법으로 시험감염시켰다. 땅콩 단백질 시험감염 1시간 후 모든 군으로부터의 마우스의 뺨에서 채혈하고, 총 IgE, 땅콩-특이적 IgE, 총 IgG1, 땅콩-특이적 IgG1, 총 IgA 및 땅콩-특이적 IgA ELISA(Chondrex, 제조사의 지침에 따름)를 위해 혈액을 수집하였다.
염증 결과를 도 6d에 나타낸다. 귀 군 및 등 군 둘 다의 경우, 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(도 6d 내지 도 6i에서 "피. 히스티콜라"로 표지됨)는 염증을 감소시켰다.
시험감염일의 총 및 땅콩-특이적 혈청 IgE 및 IgG1 수준을 각각 도 6e 및 도 6f에 나타낸다.
시험감염 2주 후 총 및 땅콩-특이적 혈청 IgE, IgG1 및 IgA 수준을 각각 도 6g, 도 6h 및 도 6i에 나타낸다.
실시예 7: FITC-CHS 모델.
프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329를 도 7a에 도시된 바와 같이 FITC-CHS 모델로 시험하였다. 시험된 용량은 4.69E+09 TCC였다.
TH2 사이토카인(IL-13, IL-4, IL-5, IL-31 및 IL-33)에 대한 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329의 효과를 제7일에 조사하였다. 도 7b에 나타난 바와 같이, 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(도 7b 및 도 7c에서 "프레보텔라 히스티콜라"로 표지됨)는 위장관 드레이닝 장간막 림프절에서 IL-13, IL-5 및 IL-31 수준을 상당히 낮췄다. 사이토카인 수준을 실시예 3에 기재된 바와 같이 수행된 실험과 함께 MSD에 의해 결정하였다. 도 7c에 나타난 바와 같이, 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329 처리는 귀 드레이닝 경부 림프절에서 IL-13의 수준을 상당히 낮췄다. 실험을 실시예 3에 기재된 바와 같이 수행하였다.
본 실시예는 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329 처리가 위장관 드레이닝 장간막 림프절 및 귀 드레이닝 경부 림프절로부터의 PMA/이오노마이신 생체외 재자극된 세포에서 TH2 사이토카인 분비를 상당히 낮췄다는 것을 입증한다.
실시예 8: MC903 유도 아토피 피부염.
프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329를 도 8a에 도시된 바와 같이 MC903 유도 아토피 피부염 모델로 시험하였다.
이러한 실험을 위해, 마우스를 Taconic Labs로부터 구입하고, 실험 시작 전 1주일 동안 사육장에 적응시켰다. 마우스는 케이지 당 5마리의 동물을 수용하였고, 표준 침구와 보강과 함께 케이지를 개별적으로 통풍시켰다. 표준 퓨리나(Purina) 설치류 식이(5001) 및 오토클레이브수를 자유식으로 제공하고, 매일 확인하였다.
제1일에 마우스를 마취시키고, 기준선 귀 측정을 수행하였다. 마취 동안, 그 다음 귀를 귀의 등쪽과 복부 양쪽에 총 20 uL의 용액을 피펫팅하여 45 nM의 칼시피트리올(MC903)로 감작시켰다. 귀를 14일 동안 매일 감작시켰다.
제1일부터 제14일까지, 마우스에게 4.69E+09 TCC 또는 양성 대조군(토파시티닙), QD의 용량으로 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329를 매일 경구 위관 영양법으로 공급하였다.
연구 전반에 걸쳐 귀 측정을 수행하여 시간 경과에 따른 두께 변화 그리고 제14일에 두께 변화를 추적하여 기준선으로부터 귀 두께의 변화를 결정하였다.
제17일에 생체외 실험을 수행하였다.
MC903 제조 프로토콜: 10 ㎎의 칼시피트리올 분말을 99% 에탄올 10 ㎖에 용해시켜 1 ㎎/㎖ 스톡을 생성하였다. 스톡을 99% 에탄올에서 0.01856 ㎎/㎖로 희석시켰다. 희석된 용액을 -20℃에서 매일 사용하는 광 보호 튜브에 분취하였다.
양성 대조군 - 토파시티닙 제제: 토파시티닙을 0.5%(w/v) 메틸셀룰로스에서 제조하였다. 정제수를 교반/가열판에서 끓였다. 적당량의 분말 메틸셀룰로스를 칭량하였다. 끓는 물을 교반하고, 분말 메틸셀룰로스를 첨가하였다. 분말이 물에 혼입될 때까지 교반을 계속하였다. 혼합물을 교반 플레이트에서 교반하면서 4℃에서 밤새 냉각되도록 하였다. 50 ㎎의 토파시티닙 스톡을 0.5% MC에 재현탁시켰다(혼합물이 현탁액을 형성함). 토파시티닙을 마우스당 100 uL씩 p.o.로 투여하였다.
결과:
도 8b에 도시된 바와 같이, 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329(도 8b 내지 도 8e에서 "프레보텔라 히스티콜라"로 표지됨) 처리는 시간 경과에 따른 귀 측정(좌측 패널) 및 제14일의 귀 염증(우측 패널)에 의해 결정된 바와 같이 MC903 유도 아토피 피부염에서 귀 염증을 감소시켰다.
귀 조직에서 TH2 사이토카인 전사체 수준(Tslp, Il5, Il31, Il4, Ccl19,Ccr4)에 대한 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329의 효과를 제17일에 조사하였다. 도 8c에 나타난 바와 같이, 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329 처리는 qPCR에 의해 결정된 바와 같이 귀 조직에서 Il5, Il31Ccr4 전사체의 수준을 상당히 낮췄다.
공장에서 비만 세포 관련 유전자 전사체 수준(Mcpt1)에 대한 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329의 효과를 제17일에 조사하였다. 도 8d의 결과는 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329가 qPCR에 의해 결정된 바와 같이, MC903-유도 아토피 피부염 모델에서 마우스의 공장에서 Mcpt1 전사체 수준을 상당히 감소시켰다는 것을 입증한다.
장간막 림프절 및 비장에서 IL-10 수준에 대한 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329의 효과를 제17일에 조사하였다. 도 8e에 나타난 바와 같이, 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329 처리는 MSD에 의해서 결정된 바와 같이, MC903-유도 아토피 피부염 모델로부터 단리된 조직에서 PMA/이오노마이신으로 생체외 재자극 시 마우스의 장간막 림프절 및 비장에서 IL-10 수준을 상당히 증가시켰다. 실험을 실시예 3에 기재된 바와 같이 수행하였다.
본 실시예의 결과는 MC903-유도 아토피 피부염에서 귀 염증이 비히클 처리된 마우스에 비해서 프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329 처리에 의해서 상당히 감소되었다는 것을 입증한다.
프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329 치료는 귀 조직에서 TH2 사이토카인 전사체의 감소 및 공장에서 비만 세포 관련 전사체(Mcpt1)의 감소를 나타내었다.
프레보텔라 히스티콜라 균주 B 50329 치료는 PMA/이오노마이신으로의 생체외 재자극 시 위장관 드레이닝 장간막 림프절 및 비장 세포에서 IL-10의 증가된 수준을 나타내었다.
참고문헌에 의한 통합
본 명세서에 언급된 모든 공보 특허 출원은 각각의 개별 공보 또는 특허 출원이 구체적이고 개별적으로 참고에 의해 통합된 것으로 표시된 것처럼 그의 전문이 본 명세서에 참조에 의해 통합된다. 상충되는 경우, 본 명세서의 임의의 정의를 비롯하여 본 출원이 우선될 것이다.
등가물
당업자는 본 명세서에 기재된 본 발명의 특정 구현예와 많은 등가물을 일상적인 실험을 사용하여 인식하거나 확인할 수 있을 것이다. 이러한 등가물은 하기 청구범위에 의해 포함되는 것으로 의도된다.
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Gly Asn His Asp Ile Glu Thr Gly His Lys Val Tyr 115 120 125 Asp Lys Trp Phe Lys Glu Leu Lys Phe Pro Ile Leu Gly Ala Asn Ile 130 135 140 Ile Asp Thr Lys Thr Asn Lys Pro Tyr Ile Leu Pro Tyr Tyr Thr Ile 145 150 155 160 Lys Lys Lys Asn Gly Ile Lys Val Cys Val Ile Gly Met Leu Thr Pro 165 170 175 Ala Ile Pro Asn Trp Leu Lys Glu Ser Ile Trp Ser Gly Leu Arg Phe 180 185 190 Glu Glu Met Val Ser Cys Ala Lys Arg Thr Met Ala Glu Val Lys Thr 195 200 205 Gln Glu Lys Pro Asp Val Ile Val Gly Leu Phe His Ser Gly Trp Asp 210 215 220 Gly Gly Ile Lys Thr Pro Glu Tyr Asp Glu Asp Ala Ser Lys Lys Val 225 230 235 240 Ala Lys Glu Val Pro Gly Phe Asp Ile Val Phe Phe Gly His Asp His 245 250 255 Thr Pro His Ser Ser Ile Glu Lys Asn Ile Val Gly Lys Asp Val Ile 260 265 270 Cys Leu Asp Pro Ala Asn Asn Ala Gln Arg Val Ala Ile Ala Thr Leu 275 280 285 Thr Leu Arg Pro Lys Thr Val Lys Gly Lys Arg Gln Tyr Thr Val Thr 290 295 300 Lys Ala Thr Gly Glu Leu Val Asp Val Lys Glu Leu Lys Ala Asp Asp 305 310 315 320 Ala Phe Ile Gln His Phe Gln Pro Glu Ile Asp Ala Val Lys Ala Trp 325 330 335 Ser Asp Gln Val Ile Gly Arg Phe Glu Asn Thr Ile Tyr Ser Lys Asp 340 345 350 Ser Tyr Phe Gly Asn Ser Ala Phe Asn Asp Leu Ile Leu Asn Leu Glu 355 360 365 Leu Glu Ile Thr Lys Ala Asp Ile Ala Phe Asn Ala Pro Leu Leu Phe 370 375 380 Asn Ala Ser Ile Lys Ala Gly Pro Ile Thr Val Ala Asp Met Phe Asn 385 390 395 400 Leu Tyr Lys Tyr Glu Asn Asn Leu Cys Thr Met Arg Leu Thr Gly Lys 405 410 415 Glu Ile Arg Lys His Leu Glu Met Ser Tyr Asp Leu Trp Cys Asn Thr 420 425 430 Met Lys Ser Pro Glu Asp His Leu Leu Leu Leu Ser Ser Thr Gln Asn 435 440 445 Asp Ala Gln Arg Leu Gly Phe Lys Asn Phe Ser Phe Asn Phe Asp Ser 450 455 460 Ala Ala Gly Ile Asp Tyr Glu Val Asp Val Thr Lys Pro Asp Gly Gln 465 470 475 480 Lys Val Arg Ile Leu Arg Met Ser Asn Gly Glu Pro Phe Asp Glu Asn 485 490 495 Lys Trp Tyr Thr Val Ala Val Asn Ser Tyr Arg Ala Asn Gly Gly Gly 500 505 510 Glu Leu Leu Thr Lys Gly Ala Gly Ile Pro Arg Asp Ser Leu Lys Ser 515 520 525 Arg Ile Ile Trp Glu 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Gly Val Thr Val Asp Ala Lys Val Gly 145 150 155 160 Arg Ala Glu Phe Asp Gly Tyr Val Phe Asn Leu Val Asp Leu Pro Gly 165 170 175 Thr Tyr Ser Leu Ser Ala Tyr Ser Pro Glu Glu Leu Tyr Val Arg Lys 180 185 190 Gln Leu Val Asp Lys Thr Pro Asp Val Val Ile Asn Val Ile Asp Ser 195 200 205 Ser Asn Leu Glu Arg Asn Leu Tyr Leu Thr Thr Gln Leu Ile Asp Met 210 215 220 His Ile Arg Met Val Cys Ala Leu Asn Met Phe Asp Glu Thr Glu Gln 225 230 235 240 Arg Gly Asp His Ile Asp Ala Gln Lys Leu Ser Glu Leu Phe Gly Val 245 250 255 Pro Met Ile Pro Thr Val Phe Thr Asn Gly Arg Gly Val Lys Glu Leu 260 265 270 Phe Arg Gln Ile Ile Ala Val Tyr Glu Gly Lys Glu Asp Glu Ser Leu 275 280 285 Gln Phe Arg His Ile His Ile Asn His Gly His Glu Ile Glu Asn Gly 290 295 300 Ile Lys Glu Met Gln Glu His Leu Lys Lys Tyr Pro Glu Leu Cys His 305 310 315 320 Arg Tyr Ser Thr Arg Tyr Leu Ala Ile Lys Leu Leu Glu His Asp Lys 325 330 335 Asp Val Glu Gln Leu Val Ser Pro Leu Gly Asp Ser Ile Glu Ile Phe 340 345 350 Asn His Arg Asp Thr Ala Ala 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Met Ile Thr Gly Ser Phe Phe Ala Leu 565 570 575 Lys Tyr Arg Ser Leu Ala Met Leu Ser Leu Tyr Ile Ile Gly Val Leu 580 585 590 Met Ala Val Ala Met Ser Arg Leu Phe Ser Ala Phe Val Val Lys Gly 595 600 605 Glu Asp Thr Pro Phe Val Met Glu Leu Pro Pro Tyr Arg Phe Pro Thr 610 615 620 Trp Lys Ala Ile Gly Arg His Thr Trp Glu Lys Gly Lys Gln Tyr Leu 625 630 635 640 Lys Lys Met Gly Gly Ile Ile Leu Val Ala Ser Ile Ile Val Trp Ala 645 650 655 Leu Gly Tyr Phe Pro Leu Pro Asp Asp Pro Asn Met Asp Asn Gln Ala 660 665 670 Arg Gln Glu Gln Ser Tyr Ile Gly Arg Ile Gly Lys Ala Val Glu Pro 675 680 685 Val Phe Arg Pro Gln Gly Phe Asn Trp Lys Leu Asp Val Gly Leu Leu 690 695 700 Ser Gly Met Gly Ala Lys Glu Ile Val Ala Ser Thr Met Gly Val Leu 705 710 715 720 Tyr Ser Asn Asp Gly Ser Phe Ser Asp Asp Asn Gly Tyr Ser Ser Glu 725 730 735 Thr Gly Lys Tyr Ser Lys Leu His Asn Leu Ile Thr Lys Asp Val Ala 740 745 750 Thr Met His His Ile Ser Tyr Glu Glu Ala Glu Pro Ile Ala Thr Leu 755 760 765 Thr Ala Phe Ser Phe Leu Leu Phe 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Claims (235)

  1. 대상체에서 TH2-매개 병태를 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 대상체에게 치료적 유효량의 프레보텔라(Prevotella) 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물을 투여하는 단계를 포함하는, 방법.
  2. 제1항에 있어서, 상기 대상체는 인간 대상체인, 방법.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 미생물-유래 내용물 중 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95% 또는 적어도 99%는 프레보텔라 박테리아로부터 유래되는, 방법.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 TH2-매개 병태를 치료하는, 방법.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 TH2-매개 병태는 천식, 아토피 피부염, 호산구성 질환 및/또는 알레르기인, 방법.
  6. 제5항에 있어서, TH2-매개 병태는 알레르기이고, 상기 알레르기는 음식 알레르기, 계절성 알레르기 비염 및/또는 애완동물 알레르기인, 방법.
  7. 제5항에 있어서, 상기 TH2-매개 병태는 아토피 피부염인, 방법.
  8. 제5항에 있어서, 상기 TH2-매개 병태는 음식 알레르기인, 방법.
  9. 제8항에 있어서, 상기 음식 알레르기는 땅콩, 우유, 계란, 생선, 갑각류 조개류(crustacean shellfish), 견과류(tree nut), 밀 또는 대두 알레르기인, 방법.
  10. 제8항에 있어서, 상기 음식 알레르기는 땅콩 알레르기인, 방법.
  11. 제8항에 있어서, 음식 알레르기는 음식 항원에 대한 알레르기인, 방법.
  12. 제11항에 있어서, 상기 음식 항원은 땅콩 항원, 우유 항원, 계란 항원, 생선 항원, 갑각류 조개류 항원, 견과류 항원, 밀 항원 또는 대두 항원인, 방법.
  13. 제11항에 있어서, 상기 음식 항원은 땅콩 항원인, 방법.
  14. 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-4 수준을 감소시키는, 방법.
  15. 제14항에 있어서, 상기 IL-4 수준은 IL-4 단백질 수준 또는 IL-4 mRNA 수준인, 방법.
  16. 제1항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-5 수준을 감소시키는, 방법.
  17. 제16항에 있어서, 상기 IL-5 수준은 IL-5 단백질 수준 또는 IL-5 mRNA 수준인, 방법.
  18. 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-13 수준을 감소시키는, 방법.
  19. 제18항에 있어서, 상기 IL-13 수준은 IL-13 단백질 수준 또는 IL-13 mRNA 수준인, 방법.
  20. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-19 수준을 감소시키는, 방법.
  21. 제20항에 있어서, 상기 IL-19 수준은 IL-19 단백질 수준 또는 IL-19 mRNA 수준인, 방법.
  22. 제1항 내지 제21항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-21 수준을 감소시키는, 방법.
  23. 제22항에 있어서, 상기 IL-21 수준은 IL-21 단백질 수준 또는 IL-21 mRNA 수준인, 방법.
  24. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-31 수준을 감소시키는, 방법.
  25. 제24항에 있어서, 상기 IL-31 수준은 IL-31 단백질 수준 또는 IL-31 mRNA 수준인, 방법.
  26. 제1항 내지 제25항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-33 수준을 감소시키는, 방법.
  27. 제26항에 있어서, 상기 IL-33 수준은 IL-33 단백질 수준 또는 IL-33 mRNA 수준인, 방법.
  28. 제1항 내지 제27항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 대상체에서 흉선 기질 림포포이에틴(Thymic Stromal Lymphopoietin: TSLP) 수준을 감소시키는, 방법.
  29. 제28항에 있어서, 상기 TSLP 수준은 TSLP 단백질 수준 또는 TSLP mRNA 수준인, 방법.
  30. 제1항 내지 제29항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 대상체에서 IgG1 수준을 감소시키는, 방법.
  31. 제30항에 있어서, 상기 IgG1 수준은 IgG1 단백질 수준 또는 IgG1 mRNA 수준인, 방법.
  32. 제1항 내지 제31항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 대상체에서 IgE 수준을 감소시키는, 방법.
  33. 제32항에 있어서, 상기 IgE 수준은 IgE 단백질 수준 또는 IgE mRNA 수준인, 방법.
  34. 제1항 내지 제33항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법은 상기 대상체에서 IgA 수준을 감소시키는, 방법.
  35. 제34항에 있어서, 상기 IgA 수준은 IgA 단백질 수준 또는 IgA mRNA 수준인, 방법.
  36. 제1항 내지 제35항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 알벤시스(Prevotella albensis), 프레보텔라 암니이(Prevotella amnii), 프레보텔라 버겐시스(Prevotella bergensis), 프레보텔라 비비아(Prevotella bivia), 프레보텔라 브레비스(Prevotella brevis), 프레보텔라 브리안티이(Prevotella bryantii), 프레보텔라 부카에(Prevotella buccae), 프레보텔라 부칼리스(Prevotella buccalis), 프레보텔라 코프리(Prevotella copri), 프레보텔라 덴탈리스(Prevotella dentalis), 프레보텔라 덴티콜라(Prevotella denticola), 프레보텔라 디시엔스(Prevotella disiens), 프레보텔라 히스티콜라(Prevotella histicola), 프레보텔라 인터메디아(Prevotella intermedia), 프레보텔라 마쿨로사(Prevotella maculosa), 프레보텔라 마시이(Prevotella marshii), 프레보텔라 멜라니노게니카(Prevotella melaninogenica), 프레보텔라 미칸스(Prevotella micans), 프레보텔라 멀티포르미스(Prevotella multiformis), 프레보텔라 니그레센스(Prevotella nigrescens), 프레보텔라 오랄리스(Prevotella oralis), 프레보텔라 오리스(Prevotella oris), 프레보텔라 오울로럼(Prevotella oulorum), 프레보텔라 팔렌스(Prevotella pallens), 프레보텔라 살리바에(Prevotella salivae), 프레보텔라 스터코레아(Prevotella stercorea), 프레보텔라 타너라에(Prevotella tannerae), 프레보텔라 티모넨시스(Prevotella timonensis), 프레보텔라 제주니(Prevotella jejuni), 프레보텔라 아우란티아카(Prevotella aurantiaca), 프레보텔라 바로니아에(Prevotella baroniae), 프레보텔라 콜로란스(Prevotella colorans), 프레보텔라 코포리스(Prevotella corporis), 프레보텔라 덴타시니(Prevotella dentasini), 프레보텔라 에노에카(Prevotella enoeca), 프레보텔라 팔세니이(Prevotella falsenii), 프레보텔라 푸스카(Prevotella fusca), 프레보텔라 헤파리놀리티카(Prevotella heparinolytica), 프레보텔라 로에쉐이이(Prevotella loescheii), 프레보텔라 멀티사카리보락스(Prevotella multisaccharivorax), 프레보텔라 난세이엔시스(Prevotella nanceiensis), 프레보텔라 오리자에(Prevotella oryzae), 프레보텔라 팔루디비벤스(Prevotella paludivivens), 프레보텔라 플레우리티디스(Prevotella pleuritidis), 프레보텔라 루미니콜라(Prevotella ruminicola), 프레보텔라 사카롤리티카(Prevotella saccharolytica), 프레보텔라 스코포스(Prevotella scopos), 프레보텔라 샤히이(Prevotella shahii), 프레보텔라 주글레오포르만스(Prevotella zoogleoformans) 및/또는 프레보텔라 베로랄리스(Prevotella veroralis)인, 방법.
  37. 제36항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 히스티콜라인, 방법.
  38. 제1항 내지 제37항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 균주 B 50329(NRRL 수탁 번호 B 50329)의 뉴클레오티드 서열과 적어도 95% 게놈, 16S 및/또는 CRISPR 서열 동일성을 포함하는 균주인, 방법.
  39. 제38항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 균주 B 50329(NRRL 수탁 번호 B 50329)의 뉴클레오티드 서열과 적어도 99% 게놈, 16S 및/또는 CRISPR 서열 동일성을 포함하는 균주인, 방법.
  40. 제39항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 균주 B 50329(NRRL 수탁 번호 B 50329)인, 방법.
  41. 제1항 내지 제40항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 표 1에 열거된 1종 이상의 단백질을 포함하는 프레보텔라 박테리아의 균주인, 방법.
  42. 제1항 내지 제41항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 표 2에 열거된 단백질이 실질적으로 존재하지 않는 프레보텔라의 균주인, 방법.
  43. 제1항 내지 제42항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 살아있는 박테리아, 사멸된 박테리아 또는 약독화된 박테리아를 포함하는, 방법.
  44. 제1항 내지 제42항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 감마 조사, UV 조사, 열 불활성화, 산 처리 및/또는 산소 살포된, 방법.
  45. 제44항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 50℃에서 2시간 동안 또는 90℃에서 2시간 동안 열 불활성화된, 방법.
  46. 제44항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 0.1 vvm에서 2시간 동안 산소 살포된, 방법.
  47. 제1항 내지 제46항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 동결건조된 프레보텔라 박테리아인, 방법.
  48. 제47항에 있어서, 상기 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 더 포함하는, 방법.
  49. 제1항 내지 제48항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 동일한 종으로부터 유래되는, 방법.
  50. 제1항 내지 제48항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 동일한 균주로부터 유래되는, 방법.
  51. 제1항 내지 제48항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 상이한 종으로부터 유래되는, 방법.
  52. 제1항 내지 제49항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 동일한 균주로부터 유래되는, 방법.
  53. 제1항 내지 제52항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 추가 치료제와 조합되어 투여되는, 방법.
  54. 제53항에 있어서, 상기 추가 치료제는 항염증제인, 방법.
  55. 제1항 내지 제54항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 고체 투여 형태로 제형화되는, 방법.
  56. 제55항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 정제, 미니정제, 캡슐, 환제 또는 분말 또는 이들의 조합인, 방법.
  57. 제55항 또는 제56항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 더 포함하는, 방법.
  58. 제55항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 장용 코팅을 포함하는, 방법.
  59. 제55항 내지 제58항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 경구 투여용으로 제형화되는, 방법.
  60. 제1항 내지 제54항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 현탁액으로 제형화되는, 방법.
  61. 제60항에 있어서, 상기 현탁액은 경구 투여용으로 제형화되는, 방법.
  62. 제60항 또는 제61항에 있어서, 상기 현탁액은 PBS 및 선택적으로, 수크로스 또는 글루코스를 포함하는, 방법.
  63. 제60항에 있어서, 상기 현탁액은 정맥내 투여용으로 제형화되는, 방법.
  64. 제60항에 있어서, 상기 현탁액은 복강내 투여용으로 제형화되는, 방법.
  65. 제63항 또는 제64항에 있어서, 상기 현탁액은 PBS를 포함하는, 방법.
  66. 제60항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 정맥내로 투여되는, 방법.
  67. 제60항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 주사, 예를 들어, 피부하, 피부내 또는 복강내 주사에 의해서 투여되는, 방법.
  68. 제60항 내지 제67항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 현탁액은 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 더 포함하는, 방법.
  69. 제60항 내지 제68항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 현탁액은 완충제를 더 포함하는, 방법.
  70. 제69항에 있어서, 상기 완충제는 PBS인, 방법.
  71. 제1항 내지 제70항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 1종 이상의 추가 치료제를 더 포함하는, 방법.
  72. 제71항에 있어서, 상기 1종 이상의 추가 치료제는 1종 이상의 항염증제인, 방법
  73. 제1항 내지 제62항 또는 제68항 내지 제72항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 경구 투여되는, 방법.
  74. 제1항 내지 제73항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 브래드포드(Bradford) 검정 또는 BCA 검정에 의해서 결정되는 바와 같은 약 5 ㎎ 내지 약 900 ㎎의 총 단백질을 포함하는, 방법.
  75. 제1항 내지 제74항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 브래드포드 검정 또는 BCA 검정에 의해서 결정되는 바와 같은 약 10 ㎎의 프레보텔라 박테리아를 포함하는, 방법.
  76. 제1항 내지 제75항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체에게 추가 치료제를 투여하는 단계를 더 포함하는, 방법.
  77. 제76항에 있어서, 상기 추가 치료제는 항염증제인, 방법.
  78. 제76항에 있어서, 상기 추가 치료제는 코르티코스테로이드, 항히스타민제, 비만 세포 안정화제, 충혈완화제(decongestant), 류카트리엔 수용체 길항제, 항체 또는 이들의 조합물인, 방법.
  79. 제76항 또는 제77항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 상기 추가 치료제를 포함하는, 방법.
  80. 제76항에 있어서, 상기 추가 치료제는 항생제인, 방법.
  81. 대상체에서 TH2-매개 병태를 치료 또는 예방하는 데 사용하기 위한 치료적 유효량의 프레보텔라 박테리아를 포함하는, 약제학적 조성물.
  82. 제81항에 있어서, 상기 대상체는 인간 대상체인, 약제학적 조성물.
  83. 제81항 또는 제82항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 미생물-유래 내용물 중 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95% 또는 적어도 99%는 프레보텔라 박테리아로부터 유래되는, 약제학적 조성물.
  84. 제81항 내지 제83항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 상기 TH2-매개 병태를 치료하는, 약제학적 조성물.
  85. 제81항 내지 제84항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 TH2-매개 병태는 천식, 아토피 피부염, 호산구성 질환 및/또는 알레르기인, 약제학적 조성물.
  86. 제85항에 있어서, TH2-매개 병태는 알레르기이고, 상기 알레르기는 음식 알레르기, 계절성 알레르기 비염 및/또는 애완동물 알레르기인, 약제학적 조성물.
  87. 제85항에 있어서, 상기 TH2-매개 병태는 아토피 피부염인, 약제학적 조성물.
  88. 제85항에 있어서, 상기 TH2-매개 병태는 음식 알레르기인, 약제학적 조성물.
  89. 제88항에 있어서, 상기 음식 알레르기는 땅콩, 우유, 계란, 생선, 갑각류 조개류, 견과류, 밀 또는 대두 알레르기인, 약제학적 조성물.
  90. 제88항에 있어서, 상기 음식 알레르기는 땅콩 알레르기인, 약제학적 조성물.
  91. 제88항에 있어서, 음식 알레르기는 음식 항원에 대한 알레르기인, 약제학적 조성물.
  92. 제91항에 있어서, 상기 음식 항원은 땅콩 항원, 우유 항원, 계란 항원, 생선 항원, 갑각류 조개류 항원, 견과류 항원, 밀 항원 또는 대두 항원인, 약제학적 조성물.
  93. 제91항에 있어서, 상기 음식 항원은 땅콩 항원인, 약제학적 조성물.
  94. 제81항 내지 제93항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-4 수준을 감소시키는, 약제학적 조성물.
  95. 제94항에 있어서, 상기 IL-4 수준은 IL-4 단백질 수준 또는 IL-4 mRNA 수준인, 약제학적 조성물.
  96. 제81항 내지 제95항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-5 수준을 감소시키는, 약제학적 조성물.
  97. 제96항에 있어서, 상기 IL-5 수준은 IL-5 단백질 수준 또는 IL-5 mRNA 수준인, 약제학적 조성물.
  98. 제81항 내지 제97항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-13 수준을 감소시키는, 약제학적 조성물.
  99. 제98항에 있어서, 상기 IL-13 수준은 IL-13 단백질 수준 또는 IL-13 mRNA 수준인, 약제학적 조성물.
  100. 제81항 내지 제99항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-19 수준을 감소시키는, 약제학적 조성물.
  101. 제100항에 있어서, 상기 IL-19 수준은 IL-19 단백질 수준 또는 IL-19 mRNA 수준인, 약제학적 조성물.
  102. 제81항 내지 제101항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-21 수준을 감소시키는, 약제학적 조성물.
  103. 제102항에 있어서, 상기 IL-21 수준은 IL-21 단백질 수준 또는 IL-21 mRNA 수준인, 약제학적 조성물.
  104. 제81항 내지 제103항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-31 수준을 감소시키는, 약제학적 조성물.
  105. 제104항에 있어서, 상기 IL-31 수준은 IL-31 단백질 수준 또는 IL-31 mRNA 수준인, 약제학적 조성물.
  106. 제81항 내지 제105항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-33 수준을 감소시키는, 약제학적 조성물.
  107. 제106항에 있어서, 상기 IL-33 수준은 IL-33 단백질 수준 또는 IL-4 mRNA 수준인, 약제학적 조성물.
  108. 제81항 내지 제107항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 흉선 기질 림포포이에틴(TSLP) 수준을 감소시키는, 약제학적 조성물.
  109. 제108항에 있어서, 상기 TSLP 수준은 TSLP 단백질 수준 또는 TSLP mRNA 수준인, 약제학적 조성물.
  110. 제81항 내지 제109항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 IgG1 수준을 감소시키는, 약제학적 조성물.
  111. 제110항에 있어서, 상기 IgG1 수준은 IgG1 단백질 수준 또는 IgG1 mRNA 수준인, 약제학적 조성물.
  112. 제81항 내지 제111항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 IgE 수준을 감소시키는, 약제학적 조성물.
  113. 제112항에 있어서, 상기 IgE 수준은 IgE 단백질 수준 또는 IgE mRNA 수준인, 약제학적 조성물.
  114. 제81항 내지 제113항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 IgA 수준을 감소시키는, 약제학적 조성물.
  115. 제114항에 있어서, 상기 IgA 수준은 IgA 단백질 수준 또는 IgA mRNA 수준인, 약제학적 조성물.
  116. 제81항 내지 제115항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 알벤시스, 프레보텔라 암니이, 프레보텔라 버겐시스, 프레보텔라 비비아, 프레보텔라 브레비스, 프레보텔라 브리안티이, 프레보텔라 부카에, 프레보텔라 부칼리스, 프레보텔라 코프리, 프레보텔라 덴탈리스, 프레보텔라 덴티콜라, 프레보텔라 디시엔스, 프레보텔라 히스티콜라, 프레보텔라 인터메디아, 프레보텔라 마쿨로사, 프레보텔라 마시이, 프레보텔라 멜라니노게니카, 프레보텔라 미칸스, 프레보텔라 멀티포르미스, 프레보텔라 니그레센스, 프레보텔라 오랄리스, 프레보텔라 오리스, 프레보텔라 오울로럼, 프레보텔라 팔렌스, 프레보텔라 살리바에, 프레보텔라 스터코레아, 프레보텔라 타너라에, 프레보텔라 티모넨시스, 프레보텔라 제주니, 프레보텔라 아우란티아카, 프레보텔라 바로니아에, 프레보텔라 콜로란스, 프레보텔라 코포리스, 프레보텔라 덴타시니, 프레보텔라 에노에카, 프레보텔라 팔세니이, 프레보텔라 푸스카, 프레보텔라 헤파리놀리티카, 프레보텔라 로에쉐이이, 프레보텔라 멀티사카리보락스, 프레보텔라 난세이엔시스, 프레보텔라 오리자에, 프레보텔라 팔루디비벤스, 프레보텔라 플레우리티디스, 프레보텔라 루미니콜라, 프레보텔라 사카롤리티카, 프레보텔라 스코포스, 프레보텔라 샤히이, 프레보텔라 주글레오포르만스 및/또는 프레보텔라 베로랄리스인, 약제학적 조성물.
  117. 제116항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 히스티콜라인, 약제학적 조성물.
  118. 제81항 내지 제117항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 균주 B 50329(NRRL 수탁 번호 B 50329)의 뉴클레오티드 서열과 적어도 95% 게놈, 16S 및/또는 CRISPR 서열 동일성을 포함하는 균주인, 약제학적 조성물.
  119. 제118항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 균주 B 50329(NRRL 수탁 번호 B 50329)의 뉴클레오티드 서열과 적어도 99% 게놈, 16S 및/또는 CRISPR 서열 동일성을 포함하는 균주인, 약제학적 조성물.
  120. 제119항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 균주 B 50329(NRRL 수탁 번호 B 50329)인, 약제학적 조성물.
  121. 제81항 내지 제120항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 표 1에 열거된 1종 이상의 단백질을 포함하는 프레보텔라 박테리아의 균주인, 약제학적 조성물.
  122. 제81항 내지 제121항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 표 2에 열거된 단백질이 실질적으로 존재하지 않는 균주인, 약제학적 조성물.
  123. 제81항 내지 제122항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 살아있는 박테리아, 사멸된 박테리아 또는 약독화된 박테리아를 포함하는, 약제학적 조성물.
  124. 제81항 내지 제122항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 감마 조사, UV 조사, 열 불활성화, 산 처리 및/또는 산소 살포된, 약제학적 조성물.
  125. 제124항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 50℃에서 2시간 동안 또는 90℃에서 2시간 동안 열 불활성화된, 약제학적 조성물.
  126. 제124항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 0.1 vvm에서 2시간 동안 산소 살포된, 약제학적 조성물.
  127. 제81항 내지 제126항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 동결건조된 프레보텔라 박테리아인, 약제학적 조성물.
  128. 제127항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 더 포함하는, 약제학적 조성물.
  129. 제81항 내지 제128항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 동일한 종으로부터 유래되는, 약제학적 조성물.
  130. 제81항 내지 제128항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 동일한 균주로부터 유래되는, 약제학적 조성물.
  131. 제81항 내지 제128항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 상이한 종으로부터 유래되는, 약제학적 조성물.
  132. 제81항 내지 제129항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 동일한 균주로부터 유래되는, 약제학적 조성물.
  133. 제81항 내지 제132항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 추가 치료제와 조합되어 투여되는, 약제학적 조성물.
  134. 제133항에 있어서, 상기 추가 치료제는 항염증제인, 약제학적 조성물.
  135. 제81항 내지 제134항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 고체 투여 형태로서 제형화되는, 약제학적 조성물.
  136. 제135항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 정제, 미니정제, 캡슐, 환제 또는 분말 또는 이들의 조합물인, 약제학적 조성물.
  137. 제135항 또는 제136항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 더 포함하는, 약제학적 조성물.
  138. 제135항 내지 제137항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 장용 코팅을 포함하는, 약제학적 조성물.
  139. 제135항 내지 제138항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 경구 투여용으로 제형화되는, 약제학적 조성물.
  140. 제81항 내지 제134항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 현탁액으로서 제형화되는, 약제학적 조성물.
  141. 제140항에 있어서, 상기 현탁액은 경구 투여용으로 제형화되는, 약제학적 조성물.
  142. 제140항 또는 제141항에 있어서, 상기 현탁액은 PBS, 및 선택적으로, 수크로스 또는 글루코스를 포함하는, 약제학적 조성물.
  143. 제140항에 있어서, 상기 현탁액은 정맥내 투여용으로 제형화되는, 약제학적 조성물.
  144. 제140항에 있어서, 상기 현탁액은 복강내 투여용으로 제형화되는, 약제학적 조성물.
  145. 제143항 또는 제144항에 있어서, 상기 현탁액은 PBS를 포함하는, 약제학적 조성물.
  146. 제140항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 정맥내로 투여되는, 약제학적 조성물.
  147. 제140항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 주사, 예를 들어, 피부하, 피부내 또는 복강내 주사에 의해서 투여되는, 약제학적 조성물.
  148. 제140항 내지 제147항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 현탁액은 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 더 포함하는, 약제학적 조성물.
  149. 제140항 내지 제148항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 현탁액은 완충제를 더 포함하는, 약제학적 조성물.
  150. 제149항에 있어서, 상기 완충제는 PBS인, 약젝학적 조성물.
  151. 제81항 내지 제150항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 1종 이상의 추가 치료제를 더 포함하는, 약제학적 조성물.
  152. 제151항에 있어서, 상기 1종 이상의 추가 치료제는 1종 이상의 항염증제인, 약제학적 조성물.
  153. 제81항 내지 제142항 또는 제148항 내지 제152항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 경구로 투여되는, 약제학적 조성물.
  154. 제81항 내지 제153항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 브래드포드 검정 또는 BCA 검정에 의해서 결정되는 바와 같은 약 5 ㎎ 내지 약 900 ㎎의 총 단백질을 포함하는, 약제학적 조성물.
  155. 제81항 내지 제154항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 브래드포드 검정 또는 BCA 검정에 의해서 결정되는 바와 같은 약 10 ㎎의 프레보텔라 박테리아를 포함하는, 약제학적 조성물.
  156. 제81항 내지 제155항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 추가 치료제와 함께 상기 대상체에게 투여되는, 약제학적 조성물.
  157. 제156항에 있어서, 상기 추가 치료제는 항염증제인, 약제학적 조성물.
  158. 제156항에 있어서, 상기 추가 치료제는 코르티코스테로이드, 항히스타민제, 비만 세포 안정화제, 충혈완화제, 류카트리엔 수용체 길항제, 항체 또는 이들의 조합물인, 약제학적 조성물.
  159. 제156항 또는 제157항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 상기 추가 치료제를 포함하는, 약제학적 조성물.
  160. 제156항에 있어서, 상기 추가 치료제는 항생제인, 약제학적 조성물.
  161. 대상체에서 TH2-매개 병태를 치료 또는 예방하기 위한 의약의 제조를 위한, 치료적 유효량의 프레보텔라 박테리아를 포함하는 약제학적 조성물의 용도.
  162. 제161항에 있어서, 상기 대상체는 인간 대상체인, 용도.
  163. 제161항 또는 제162항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 미생물-유래 내용물 중 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95% 또는 적어도 99%는 프레보텔라 박테리아로부터 유래되는, 용도.
  164. 제161항 내지 제163항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 용도는 상기 TH2-매개 병태를 치료하는 것인, 용도.
  165. 제161항 내지 제164항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 TH2-매개 병태는 천식, 아토피 피부염, 호산구성 질환 및/또는 알레르기인, 용도.
  166. 제165항에 있어서, TH2-매개 병태는 알레르기이고, 상기 알레르기는 음식 알레르기, 계절성 알레르기 비염 및/또는 애완동물 알레르기인, 용도.
  167. 제165항에 있어서, 상기 TH2-매개 병태는 아토피 피부염인, 용도.
  168. 제165항에 있어서, 상기 TH2-매개 병태는 음식 알레르기인, 용도.
  169. 제168항에 있어서, 상기 음식 알레르기는 땅콩, 우유, 계란, 생선, 갑각류 조개류, 견과류, 밀 또는 대두 알레르기인, 용도.
  170. 제168항에 있어서, 상기 음식 알레르기는 땅콩 알레르기인, 용도.
  171. 제168항에 있어서, 음식 알레르기는 음식 항원에 대한 알레르기인, 용도.
  172. 제171항에 있어서, 상기 음식 항원은 땅콩 항원, 우유 항원, 계란 항원, 생선 항원, 갑각류 조개류 항원, 견과류 항원, 밀 항원 또는 대두 항원인, 용도.
  173. 제171항에 있어서, 상기 음식 항원은 땅콩 항원인, 용도.
  174. 제161항 내지 제173항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-4 수준을 감소시키는, 용도.
  175. 제174항에 있어서, 상기 IL-4 수준은 IL-4 단백질 수준 또는 IL-4 mRNA 수준인, 용도.
  176. 제161항 내지 제175항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-5 수준을 감소시키는, 용도.
  177. 제176항에 있어서, 상기 IL-5 수준은 IL-5 단백질 수준 또는 IL-5 mRNA 수준인, 용도.
  178. 제161항 내지 제177항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-13 수준을 감소시키는, 용도.
  179. 제178항에 있어서, 상기 IL-13 수준은 IL-13 단백질 수준 또는 IL-13 mRNA 수준인, 용도.
  180. 제161항 내지 제179항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-19 수준을 감소시키는, 용도.
  181. 제180항에 있어서, 상기 IL-19 수준은 IL-19 단백질 수준 또는 IL-19 mRNA 수준인, 용도.
  182. 제161항 내지 제181항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-21 수준을 감소시키는, 용도.
  183. 제182항에 있어서, 상기 IL-21 수준은 IL-21 단백질 수준 또는 IL-21 mRNA 수준인, 용도.
  184. 제161항 내지 제183항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-31 수준을 감소시키는, 용도.
  185. 제184항에 있어서, 상기 IL-31 수준은 IL-31 단백질 수준 또는 IL-31 mRNA 수준인, 용도.
  186. 제161항 내지 제185항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 인터류킨(IL)-33 수준을 감소시키는, 용도.
  187. 제186항에 있어서, 상기 IL-33 수준은 IL-33 단백질 수준 또는 IL-4 mRNA 수준인, 용도.
  188. 제161항 내지 제187항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 흉선 기질 림포포이에틴(TSLP) 수준을 감소시키는, 용도.
  189. 제188항에 있어서, 상기 TSLP 수준은 TSLP 단백질 수준 또는 TSLP mRNA 수준인, 용도.
  190. 제161항 내지 제189항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 IgG1 수준을 감소시키는, 용도.
  191. 제190항에 있어서, 상기 IgG1 수준은 IgG1 단백질 수준 또는 IgG1 mRNA 수준인, 용도.
  192. 제161항 내지 제191항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 IgE 수준을 감소시키는, 용도.
  193. 제192항에 있어서, 상기 IgE 수준은 IgE 단백질 수준 또는 IgE mRNA 수준인, 용도.
  194. 제161항 내지 제193항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물의 투여는 상기 대상체에서 IgA 수준을 감소시키는, 용도.
  195. 제194항에 있어서, 상기 IgA 수준은 IgA 단백질 수준 또는 IgA mRNA 수준인, 용도.
  196. 제161항 내지 제195항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 알벤시스, 프레보텔라 암니이, 프레보텔라 버겐시스, 프레보텔라 비비아, 프레보텔라 브레비스, 프레보텔라 브리안티이, 프레보텔라 부카에, 프레보텔라 부칼리스, 프레보텔라 코프리, 프레보텔라 덴탈리스, 프레보텔라 덴티콜라, 프레보텔라 디시엔스, 프레보텔라 히스티콜라, 프레보텔라 인터메디아, 프레보텔라 마쿨로사, 프레보텔라 마시이, 프레보텔라 멜라니노게니카, 프레보텔라 미칸스, 프레보텔라 멀티포르미스, 프레보텔라 니그레센스, 프레보텔라 오랄리스, 프레보텔라 오리스, 프레보텔라 오울로럼, 프레보텔라 팔렌스, 프레보텔라 살리바에, 프레보텔라 스터코레아, 프레보텔라 타너라에, 프레보텔라 티모넨시스, 프레보텔라 제주니, 프레보텔라 아우란티아카, 프레보텔라 바로니아에, 프레보텔라 콜로란스, 프레보텔라 코포리스, 프레보텔라 덴타시니, 프레보텔라 에노에카, 프레보텔라 팔세니이, 프레보텔라 푸스카, 프레보텔라 헤파리놀리티카, 프레보텔라 로에쉐이이, 프레보텔라 멀티사카리보락스, 프레보텔라 난세이엔시스, 프레보텔라 오리자에, 프레보텔라 팔루디비벤스, 프레보텔라 플레우리티디스, 프레보텔라 루미니콜라, 프레보텔라 사카롤리티카, 프레보텔라 스코포스, 프레보텔라 샤히이, 프레보텔라 주글레오포르만스 및/또는 프레보텔라 베로랄리스인, 용도.
  197. 제196항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 히스티콜라인, 용도.
  198. 제161항 내지 제197항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 균주 B 50329(NRRL 수탁 번호 B 50329)의 뉴클레오티드 서열과 적어도 95% 게놈, 16S 및/또는 CRISPR 서열 동일성을 포함하는 균주인, 용도.
  199. 제198항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 균주 B 50329(NRRL 수탁 번호 B 50329)의 뉴클레오티드 서열과 적어도 99% 게놈, 16S 및/또는 CRISPR 서열 동일성을 포함하는 균주인, 용도.
  200. 제199항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 프레보텔라 균주 B 50329(NRRL 수탁 번호 B 50329)인, 용도.
  201. 제161항 내지 제200항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 표 1에 열거된 1종 이상의 단백질을 포함하는 프레보텔라 박테리아의 균주인, 용도.
  202. 제161항 내지 제201항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 표 2에 열거된 단백질이 실질적으로 존재하지 않는 프레보텔라의 균주인, 용도.
  203. 제161항 내지 제202항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 살아있는 박테리아, 사멸된 박테리아 또는 약독화된 박테리아를 포함하는, 용도.
  204. 제161항 내지 제202항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 감마 조사, UV 조사, 열 불활성화, 산 처리 및/또는 산소 살포된, 용도.
  205. 제204항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 50℃에서 2시간 동안 또는 90℃에서 2시간 동안 열 불활성화된, 용도.
  206. 제204항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 0.1 vvm에서 2시간 동안 산소 살포된, 용도.
  207. 제161항 내지 제206항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 프레보텔라 박테리아는 동결건조된 프레보텔라 박테리아인, 용도.
  208. 제207항에 있어서, 상기 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 더 포함하는, 용도.
  209. 제161항 내지 제208항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 동일한 종으로부터 유래되는, 용도.
  210. 제161항 내지 제208항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 동일한 균주로부터 유래되는, 용도.
  211. 제161항 내지 제208항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 상이한 종으로부터 유래되는, 용도.
  212. 제161항 내지 제209항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물 중의 상기 프레보텔라 박테리아는 동일한 균주로부터 유래되는, 용도.
  213. 제161항 내지 제212항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 추가 치료제와 조합되어 투여되는, 용도.
  214. 제213항에 있어서, 상기 추가 치료제는 항염증제인, 용도.
  215. 제161항 내지 제214항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 고체 투여 형태로서 제형화되는, 용도.
  216. 제215항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 정제, 미니정제, 캡슐, 환제 또는 분말 또는 이들의 조합물인, 용도.
  217. 제215항 또는 제216항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 더 포함하는, 용도.
  218. 제215항 내지 제217항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 장용 코팅을 포함하는, 용도.
  219. 제215항 내지 제218항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 고체 투여 형태는 경구 투여용으로 제형화되는, 용도.
  220. 제161항 내지 제214항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 현탁액으로서 제형화되는, 용도.
  221. 제220항에 있어서, 상기 현탁액은 경구 투여용으로 제형화되는, 용도.
  222. 제220항 또는 제221항에 있어서, 상기 현탁액은 PBS, 및 선택적으로, 수크로스 또는 글루코스를 포함하는, 용도.
  223. 제220항에 있어서, 상기 현탁액은 정맥내 투여용으로 제형화되는, 용도.
  224. 제220항에 있어서, 상기 현탁액은 복강내 투여용으로 제형화되는, 용도.
  225. 제223항 또는 제224항에 있어서, 상기 현탁액은 PBS를 포함하는, 용도.
  226. 제220항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 정맥내로 투여되는, 용도.
  227. 제220항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 주사, 예를 들어, 피부하, 피부내 또는 복강내 주사에 의해서 투여되는, 용도.
  228. 제220항 내지 제227항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 현탁액은 약제학적으로 허용 가능한 부형제를 더 포함하는, 용도.
  229. 제220항 내지 제228항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 현탁액은 완충제를 더 포함하는, 용도.
  230. 제229항에 있어서, 상기 완충제는 PBS인, 용도.
  231. 제161항 내지 제230항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 1종 이상의 추가 치료제를 더 포함하는, 용도.
  232. 제231항에 있어서, 상기 1종 이상의 추가 치료제는 1종 이상의 항염증제인, 용도.
  233. 제161항 내지 제222항 또는 제228항 내지 제232항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 경구로 투여되는, 용도.
  234. 제161항 내지 제233항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 브래드포드 검정 또는 BCA 검정에 의해서 결정되는 바와 같은 약 5 ㎎ 내지 약 900 ㎎의 총 단백질을 포함하는, 용도.
  235. 제161항 내지 제234항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 약제학적 조성물은 브래드포드 검정 또는 BCA 검정에 의해서 결정되는 바와 같은 약 10 ㎎의 프레보텔라 박테리아를 포함하는, 용도.
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