CN114245742A - 使用普雷沃菌属治疗th2介导的病症的组合物和方法 - Google Patents

Abstract

本文提供了与普雷沃菌属细菌有关的组合物和方法，其可用作治疗剂，例如用于治疗T_H2介导的病症，比如特应性皮炎和/或食物过敏。

Description

使用普雷沃菌属治疗TH2介导的病症的组合物和方法

相关申请的交叉引用

本申请要求于2019年6月21日提交的美国临时申请62/864,886和2019年10月4日提交的美国临时申请62/910,920的申请日的优先权和权益，二者通过引用以其整体并入本文。

背景技术

辅助性T(T_H)细胞(也称为CD4⁺T细胞)通过分泌影响其他免疫细胞(包括B细胞、其他T细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞、肥大细胞和巨噬细胞)活性的细胞因子来协调适应性免疫应答。

当幼稚T_H细胞被激活时，它会分化为各种T_H细胞亚群中的一个，每个亚群负责通过分泌一组特定的细胞因子来协调免疫应答的一个方面。例如，T_H1细胞分泌IFN-γ，并负责增强细胞介导的针对病毒和细胞内细菌的免疫应答。另一方面，T_H2细胞分泌IL-4、IL-5、IL-9、IL-10、IL-13和IL-25，尤其负责增强针对细胞外寄生虫(如蠕虫)的体液免疫应答。T_H17细胞分泌IL-17并介导炎症反应，如对真菌(以及其他病原体)的反应。

T_H细胞在激活后分化为的T_H亚群部分取决于某些极化细胞因子的存在。例如，如果幼稚T_H细胞在IFN-γ存在下被激活，它将可能分化为T_H1细胞。另一方面，如果幼稚的T_H细胞在IL-4存在下被激活，它将可能分化为T_H2细胞。因此，激活的T_H1细胞分泌的IFN-γ可导致其他T_H细胞极化为T_H1亚群，而激活的T_H2细胞分泌的IL-4可导致其他T_H细胞极化为T_H2亚群。由于这种级联效应，T_H细胞分化会对人的整体免疫应答产生广泛的影响。实际上，许多疾病和障碍已与T_H2免疫应答相关，包括(但不限于)过敏症(例如食物过敏、昆虫诱导的过敏、药物过敏或过敏性鼻炎)、哮喘和特应性皮炎。

因此，需要用于促进T_H1免疫应答和/或抑制T_H2免疫应答以治疗这种T_H2介导的病症的新的组合物和方法。

发明内容

如本文所公开的，包含普雷沃菌属(Prevotella)细菌的药物组合物具有治疗作用，并且可用于治疗和/或预防(即，用于治疗、预防、或者用于治疗和预防)一种或多种T_H2介导的病症。此类T_H2介导的病症包括但不限于过敏性鼻炎、哮喘、特应性皮炎、荨麻疹、血管性水肿、过敏(如食物过敏、昆虫诱导的过敏、药物过敏)、过敏性反应和嗜酸性粒细胞增多症。

在一些方面，本文提供了用于治疗和/或预防受试者的T_H2介导的病症的方法。在某些实施例中，该方法包括向受试者施用治疗有效量的药物组合物，该药物组合物包括普雷沃菌属细菌。

在某些方面，本文提供了包括普雷沃菌属细菌的药物组合物，该药物组合物可用于治疗或预防一种或多种T_H2介导的病症。因此，在某些方面，本文提供了包括普雷沃菌属细菌的药物组合物，用于治疗或预防T_H2介导的病症。

在某些方面，本文提供了包括普雷沃菌属细菌的药物组合物在制备用于治疗或预防T_H2介导的病症的药物中的用途。

在某些实施例中，该T_H2介导的病症是过敏、特应性皮炎、哮喘、荨麻疹、血管性水肿、过敏性反应、嗜酸性粒细胞增多症或其组合。

在一些实施例中，T_H2介导的病症是过敏。在某些实施例中，该过敏是过敏性鼻炎、食物过敏、昆虫诱导的过敏或药物过敏。在一些实施例中，该过敏是食物过敏。在一些实施例中，该食物过敏可包括对蛋、奶、花生、坚果(例如核桃)、鱼、贝类、小麦、大豆或其组合的过敏。

在这些方面中的任何一个的一些实施例中，该受试者是人类。在一些实施例中，该受试者是非人类动物。

在一些实施例中，该药物组合物的总微生物内容物的至少50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％或99％是普雷沃菌属细菌，或者是衍生自普雷沃菌属细菌的生物材料。

在本文公开的任何一个方面的某些实施例中，该普雷沃菌属细菌包括至少一种具有选自SEQ ID NO:1至41的氨基酸序列的蛋白质。另外地或单独地，在一些实施例中，这些普雷沃菌属细菌基本上不含至少一种或多种具有选自SEQ ID NO:42至69的氨基酸序列的各种蛋白质。

在本文公开的任何一个方面的一些实施例中，这些普雷沃菌属细菌包括以下物种的细菌：阿尔伯普雷沃菌(Prevotella albensis)、羊水普雷沃菌(Prevotella amnii)、卑尔根普雷沃菌(Prevotella bergensis)、二路普雷沃菌(Prevotella bivia)、短普雷沃菌(Prevotella brevis)、布氏普雷沃菌(Prevotella bryantii)、颊普雷沃菌(Prevotellabuccae)、口颊普雷沃菌(Prevotella buccalis)、粪便普雷沃菌(Prevotella copri)、牙普雷沃菌(Prevotella dentalis)、栖牙普雷沃菌(Prevotella denticola)、解糖胨普雷沃菌(Prevotella disiens)、栖组织普雷沃菌(Prevotella histicola)、中间普雷沃菌(Prevotella intermedia)、小斑点普雷沃菌(Prevotella maculosa)、马斯普雷沃菌(Prevotella marshii)、产黑普雷沃菌(Prevotella melaninogenica)、彩虹普雷沃菌(Prevotella micans)、多形普雷沃菌(Prevotella multiformis)、变黑普雷沃菌(Prevotella nigrescens)、口腔普雷沃菌(Prevotella oralis)、口普雷沃菌(Prevotellaoris)、龈炎普雷沃菌(Prevotella oulorum)、苍白普雷沃菌(Prevotella pallens)、唾液普雷沃菌(Prevotella salivae)、斯特塞拉普雷沃菌(Prevotella stercorea)、坦纳普雷沃菌(Prevotella tannerae)、蒂莫普雷沃菌(Prevotella timonensis)、空肠普雷沃菌(Prevotella jejuni)、橙色普雷沃菌(Prevotella aurantiaca)、保氏普雷沃菌(Prevotella baroniae)、着色普雷沃菌(Prevotella colorans)、人体普雷沃菌(Prevotella corporis)、丹塔普雷沃菌(Prevotella dentasini)、栖居普雷沃菌(Prevotella enoeca)、斐氏普雷沃菌(Prevotella falsenii)、深黑色普雷沃菌(Prevotella fusca)、解肝素普雷沃菌(Prevotella heparinolytica)、洛氏普雷沃菌(Prevotella loescheii)、嗜糖普雷沃菌(Prevotella multisaccharivorax)、南锡普雷沃菌(Prevotella nanceiensis)、稻普雷沃菌(Prevotella oryzae)、沼泽普雷沃菌(Prevotella paludivivens)、胸膜炎普雷沃菌(Prevotella pleuritidis)、栖瘤胃普雷沃菌(Prevotella ruminicola)、解糖普雷沃菌(Prevotella saccharolytica)、靶心普雷沃菌(Prevotella scopos)、赛赫普雷沃菌(Prevotella shahii)、动胶普雷沃菌(Prevotellazoogleoformans)、真空腔普雷沃菌(Prevotella veroralis)或其组合。在一些实施例中，这些普雷沃菌属细菌可以包括栖组织普雷沃菌物种的细菌。

在一些实施例中，这些普雷沃菌属细菌可以包括基因组、16S核糖体核糖核酸和/或成簇的规则间隔的短回文重复序列与栖组织普雷沃菌菌株B 50329(NRRL登录号：B50329)具有至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％(例如，至少99.1％、至少99.2％、至少99.3％、至少99.4％、至少99.5％、至少99.6％、至少99.7％、至少99.8％、至少99.9％或100％)同一性的菌株。在一些实施例中，普雷沃菌属细菌包括栖组织普雷沃菌菌株B 50329(NRRL登录号：B 50329)。

在一些实施例中，该普雷沃菌属细菌是包含表1中所列的蛋白质和/或编码表1中所列的蛋白质的基因的普雷沃菌属细菌的菌株。在一些实施例中，该普雷沃菌属细菌是不含或基本上不含表2中所列的蛋白质和/或编码表2中所列的蛋白质的基因的普雷沃菌属细菌的菌株。在一些实施例中，该栖组织普雷沃菌细菌是包含表1中所列的蛋白质和/或编码表1中所列的蛋白质的基因的栖组织普雷沃菌细菌的菌株。在一些实施例中，该栖组织普雷沃菌细菌是不含或基本上不含表2中所列的蛋白质和/或编码表2中所列的蛋白质的基因的栖组织普雷沃菌细菌的菌株。

在某些实施例中，该药物组合物包含普雷沃菌属细菌的单一物种。在一些实施例中，该药物组合物包含普雷沃菌属细菌的多个物种(例如2、3、4、5个物种)。在某些实施例中，该药物组合物包含普雷沃菌属细菌的单个菌株。在一些实施例中，该药物组合物包含普雷沃菌属细菌的多个菌株(例如2、3、4、5个菌株)。在某些实施例中，该药物组合物包含栖组织普雷沃菌属细菌的单个菌株。在一些实施例中，该药物组合物包含栖组织普雷沃菌属细菌的多个菌株(例如2、3、4、5个菌株)。

在一些实施例中，该药物组合物的普雷沃菌属细菌包括活的、杀死的或减毒的细菌。在一些实施例中，该药物组合物的普雷沃菌属细菌包括活细菌。在一些实施例中，该药物组合物包括经γ照射、UV照射、热灭活(例如，在50℃下两小时，在90℃下两小时)、酸处理或氧喷射(例如在0.1vvm下进行两小时)的细菌。在某些实施例中，该药物组合物的普雷沃菌属细菌包括冻干细菌。在一些实施例中，该药物组合物还包含药学上可接受的赋形剂。

在本文公开的任何一个方面的一些实施例中，向受试者施用该药物组合物可以引起受试者中(例如在其肠系膜淋巴结或颈淋巴结中)的T_H2-蛋白和/或编码T_H2-蛋白的mRNA的水平降低。例如，在某些实施例中，与施用该药物组合物之前的T_H2-蛋白和/或编码T_H2-蛋白的mRNA的水平相比，在施用该药物组合物后，受试者中的T_H2-蛋白和/或编码T_H2-蛋白的mRNA的水平变得更低。在某些实施例中，该T_H2-蛋白是白介素-4(IL-4)、白介素-5、白介素-13、白介素-19、白介素-21、白介素31、白介素33、胸腺基质淋巴细胞生成素、免疫球蛋白G1、免疫球蛋白E、免疫球蛋白A或其组合。在某些实施例中，该T_H2-蛋白是IL-4、IL-13、IL-5、IL-31、IL-33或其组合。在某些实施例中，该T_H2-蛋白是IL-13、IL-5、IL-31或其组合。在某些实施例中，该T_H2-蛋白是IL-13。在某些实施例中，该T_H2-蛋白是IL-31。在某些实施例中，该T_H2-mRNA是Il4、Il5、IL31、Il33、Tslp、Ccl9、Ccr4或其组合。在某些实施例中，该T_H2-mRNA是Il4、Il5、Il33、Il17a、Il1b、Tslp或其组合。在某些实施例中，该T_H2-mRNA是Il4、Il5、Tslp、Ccr4、Il19或其组合。在某些实施例中，该T_H2-mRNA是Il5、Il31和Ccr4或其组合。在某些实施例中，该T_H2-mRNA是Il5。

在本文公开的任何一个方面的一些实施例中，向受试者施用该药物组合物可以引起受试者中(例如在其空肠中)肥大细胞相关蛋白和/或编码肥大细胞相关蛋白的mRNA的水平降低。在某些实施例中，该肥大细胞mRNA是Mcpt1。例如，在某些实施例中，与施用该药物组合物之前的肥大细胞相关蛋白和/或编码肥大细胞相关蛋白的mRNA的水平相比，在施用该药物组合物后，受试者中的肥大细胞相关蛋白和/或编码肥大细胞相关蛋白的mRNA的水平变得更低。

在本文公开的任何一个方面的一些实施例中，向受试者施用该药物组合物可以引起受试者中(例如其脾脏或肠系膜淋巴结中)IL-10水平增加。例如，在某些实施例中，与施用该药物组合物之前的IL-10和/或编码IL-10的mRNA的水平相比，在施用该药物组合物后，受试者中(例如其脾脏或肠系膜淋巴结中)的IL-10和/或编码IL-10的mRNA的水平变得更高。

在本文公开的任何一个方面的一些实施例中，将另外的治疗剂施用于受试者。在一些实施例中，该另外的药剂是抗炎剂。在某些实施例中，该另外的治疗剂是皮质类固醇、抗组胺药、肥大细胞稳定剂、减充血剂、白三烯受体拮抗剂、抗体或其组合。例如，该另外的治疗剂可以是阿伐西汀、沙丁胺醇、阿利马嗪、ANB020和贝那利珠单抗、安他唑啉、AS1517499、AS1810722、阿司咪唑、硫唑嘌呤、AZD1981、氮卓斯汀、倍氯米松、倍他司汀、倍他米松、BI671800、比拉斯汀、溴马秦、溴苯那敏、布地奈德、布地奈德-福莫特罗、卡比沙明、西替利嗪、氯环嗪、氯吡拉敏、氯苯那敏、环索奈德、环孢素、西咪替丁、克立马丁、可的松、克立硼罗、色甘酸、赛克利嗪、赛庚啶、CYT003、氨苯砜、地氯雷他定、地塞米松、右溴苯那敏、右旋氯苯吡胺、茶苯海明、二甲茚定、苯海拉明、多西拉敏、度匹鲁单抗、依巴斯汀、麻黄碱、肾上腺素、法莫替丁、非索非那定、氟尼缩松、氟替卡松、糠酸氟替卡松、丙酸氟替卡松、氟替卡松-沙美特罗、福莫特罗、福莫特罗-莫美他松、GSK3772847、羟氯喹、羟嗪、咪喹莫特、干扰素γ-1b、异丙托铵、酮替芬、乐瑞吉珠单抗、左旋沙丁胺醇、左卡巴司汀、左西替利嗪、左甲苯丙胺、氯雷他定、氯苯甲嗪、甲氯芬那酸钠、美泊利珠单抗、美吡拉敏、甲氨蝶呤、甲基泼尼松龙、咪唑斯汀、MK-886、莫美他松、孟鲁司特、麦考酚酯、霉酚酸吗啉乙酯、萘甲唑林、OC000459、奥洛他定、奥马珠单抗、邻甲苯海明、羟甲唑啉、非尼拉敏、苯肾上腺素、苯丙醇胺、吡美莫司、泼尼松龙、泼尼松、异丙嗪、环己丙甲胺、伪麻黄碱、奎非那定、雷尼替丁、雷西莫特、瑞利珠单抗、RG6149/AMG282、卢帕他定、沙美特罗、SB010、西罗莫司、柳氮磺胺吡啶、辛弗林、他克莫司、特非那定、四氢唑啉、茶碱、硫氢可的松、曲洛单抗、曲马唑啉、曲安奈德、醋酸曲安奈德、曲吡那敏、曲普利定、维生素D、丁苄唑啉、YM-341619、扎鲁司特、齐留通或其组合。在某些实施例中，该另外的治疗剂可以作为药物组合物的一部分被包括在内或者可以是分开的。

在一些实施例中，该药物组合物通过口服、静脉内、皮下、皮内或腹膜内施用来施用。在一些实施例中，该药物组合物通过口服施用来施用。

在某些实施例中，该药物组合物可以包括至少5mg(例如，至少10mg、20mg、30mg、40mg、50mg、60mg、70mg、80mg、90mg、100mg、110mg、120mg、130mg、140mg、150mg、160mg、170mg、180mg、190mg、200mg、210mg、220mg、230mg、240mg、250mg、260mg、270mg、280mg、290mg、300mg、310mg、320mg、330mg、340mg、350mg、360mg、370mg、380mg、390mg、400mg、410mg、420mg、430mg、440mg、450mg、460mg、470mg、480mg、490mg、500mg、510mg、520mg、530mg、540mg、550mg、560mg、570mg、580mg、590mg、600mg、610mg、620mg、630mg、640mg、650mg、660mg、670mg、680mg、690mg、700mg、710mg、720mg、730mg、740mg、750mg、760mg、770mg、780mg、790mg、800mg、810mg、820mg、830mg、840mg、850mg、860mg、870mg、880mg、890mg或900mg)且不超过900mg(例如，不超过890mg、880mg、870mg、860mg、850mg、840mg、830mg、820mg、810mg、800mg、790mg、780mg、770mg、760mg、750mg、740mg、730mg、720mg、710mg、700mg、690mg、680mg、670mg、660mg、650mg、640mg、630mg、620mg、610mg、600mg、590mg、580mg、570mg、560mg、550mg、540mg、530mg、520mg、510mg、500mg、490mg、480mg、470mg、460mg、450mg、440mg、430mg、420mg、410mg、400mg、390mg、380mg、370mg、360mg、350mg、340mg、330mg、320mg、310mg、300mg、290mg、280mg、270mg、260mg、250mg、240mg、230mg、220mg、210mg、200mg、190mg、180mg、170mg、160mg、150mg、140mg、130mg、120mg、110mg、100mg、90mg、80mg、70mg、60mg、50mg、40mg、30mg、20mg或10mg)的总蛋白量(例如，如通过布拉德福德(Bradford)测定所确定的，如通过BCA测定所确定的)。在某些实施例中，该药物组合物可包括约10mg、约20mg、约30mg、约40mg、约50mg、约60mg、约70mg、约80mg、约90mg、约100mg、约110mg、约120mg、约130mg、约140mg、约150mg、约160mg、约170mg、约180mg、约190mg、约200mg、约210mg、约220mg、约230mg、约240mg、约250mg、约260mg、约270mg、约280mg、约290mg、约300mg、约310mg、约320mg、约330mg、约340mg、约350mg、约360mg、约370mg、约380mg、约390mg、约400mg、约410mg、约420mg、约430mg、约440mg、约450mg、约460mg、约470mg、约480mg、约490mg、约500mg、约510mg、约520mg、约530mg、约540mg、约550mg、约560mg、约570mg、约580mg、约590mg、约600mg、约610mg、约620mg、约630mg、约640mg、约650mg、约660mg、约670mg、约680mg、约690mg、约700mg、约710mg、约720mg、约730mg、约740mg、约750mg、约760mg、约770mg、约780mg约790mg、约800mg、约810mg、约820mg、约830mg、约840mg、约850mg、约860mg、约870mg、约880mg、约890mg或约900mg的总蛋白量(例如，如通过布拉德福德测定所确定的，或如通过BCA测定所确定的)。

在一些实施例中，该药物组合物可以包括总量为至少5mg(例如，至少6mg、至少7mg、至少8mg、至少9mg、至少10mg、至少11mg、至少12mg、至少13mg、至少14mg、至少15mg、至少16mg、至少17mg、至少18mg、至少19mg或至少20mg)且不超过20mg(例如，不超过19mg、不超过18mg、不超过17mg、不超过16mg、不超过15mg、不超过14mg、不超过13mg、不超过12mg、不超过11mg、不超过10mg、不超过9mg、不超过8mg、不超过7mg、不超过6mg、不超过5mg)的普雷沃菌属细菌(例如，如通过布拉德福德测定所确定的，或如通过BCA测定所确定的)。在一些实施例中，该药物组合物可以包括总量约5mg、约6mg、约7mg、约8mg、约9mg、约10mg、约11mg、约12mg、约13mg、约14mg、约15mg、约16mg、约17mg、约18mg、约19mg或约20mg的普雷沃菌属细菌(例如，如通过布拉德福德测定所确定的，或如通过BCA测定所确定的)。

在某些实施例中，该药物组合物(例如，每天一次或两次施用的总剂量的组合物)包含至少1x10¹⁰个总细胞(例如，至少1x10¹⁰个总细胞、至少2x10¹⁰个总细胞、至少3x10¹⁰个总细胞、至少4x10¹⁰个总细胞、至少5x10¹⁰个总细胞、至少6x10¹⁰个总细胞、至少7x10¹⁰个总细胞、至少8x10¹⁰个总细胞、至少9x10¹⁰个总细胞、至少1x10¹¹个总细胞)的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含不超过9x10¹¹个总细胞(例如，不超过1x10¹⁰个总细胞、不超过2x10¹⁰个总细胞、不超过3x10¹⁰个总细胞、不超过4x10¹⁰个总细胞、不超过5x10¹⁰个总细胞、不超过6x10¹⁰个总细胞、不超过7x10¹⁰个总细胞、不超过8x10¹⁰个总细胞、不超过9x10¹⁰个总细胞、不超过1x10¹¹个总细胞、不超过2x10¹¹个总细胞、不超过3x10¹¹个总细胞、不超过4x10¹¹个总细胞、不超过5x10¹¹个总细胞、不超过6x10¹¹个总细胞、不超过7x10¹¹个总细胞、不超过8x10¹¹个总细胞)的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约6x10⁹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约1.6x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约8x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约1.6x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约3.2x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约1.6x10¹⁰至约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约1.6x10¹⁰至约1.6x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约8x10¹⁰至约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约1.6x10¹¹至约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。

在某些实施例中，本文提供了包含普雷沃菌属细菌的固体剂型。在一些实施例中，该固体剂型包含肠溶衣。在一些实施例中，该固体剂型是胶囊，例如肠溶胶囊。在一些实施例中，每个胶囊包含约8x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，向受试者施用1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个胶囊，例如每天一次或两次。在一些实施例中，向受试者施用1个胶囊(例如，包含约8x10¹⁰个总细胞)，例如每天一次或两次。在一些实施例中，向受试者施用2个胶囊(例如，每个胶囊包含约8x10¹⁰个总细胞)，例如每天一次或两次。在一些实施例中，向受试者施用4个胶囊(例如，每个胶囊包含约8x10¹⁰个总细胞)，例如每天一次或两次。在一些实施例中，向受试者施用10个胶囊(例如，每个胶囊包含约8x10¹⁰个总细胞)，例如每天一次或两次。在一些实施例中，将胶囊中的普雷沃菌属细菌冻干(例如，以粉剂形式)。

在一些实施例中，该固体剂型包含胶囊。在一些实施例中，该胶囊是肠溶衣片剂。在一些实施例中，该胶囊包含约8x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个胶囊或多个胶囊的总剂量)。在一些实施例中，该胶囊包含约1.6x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个胶囊或多个胶囊的总剂量)。在一些实施例中，该胶囊包含约3.2x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个胶囊或多个胶囊的总剂量)。在一些实施例中，该胶囊包含约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个胶囊或多个胶囊的总剂量)。在一些实施例中，将胶囊中的普雷沃菌属细菌冻干(例如，以粉剂形式)。

在一些实施例中，该固体剂型包含片剂。在一些实施例中，该片剂是肠溶衣片剂。在一些实施例中，该肠溶片剂的直径为5mm至17mm。在一些实施例中，该片剂包含约8x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个片剂或多个片剂的总剂量)。在一些实施例中，该片剂包含约1.6x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个片剂或多个片剂的总剂量)。在一些实施例中，该片剂包含约3.2x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个片剂或多个片剂的总剂量)。在一些实施例中，该片剂包含约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个片剂或多个片剂的总剂量)。在一些实施例中，将该片剂中的普雷沃菌属细菌冻干。

在一些实施例中，该固体剂型包含微型片剂。在一些实施例中，该微型片剂是肠溶衣包衣的。在一些实施例中，该微型片剂的直径为1mm至4mm。在一些实施例中，该微型片剂(例如，肠溶包衣的微型片剂)是1mm的微型片剂、1.5mm的微型片剂、2mm的微型片剂、3mm的微型片剂或4mm的微型片剂。在一些实施例中，该固体剂型包含微型片剂，该微型片剂包含约8x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，多个微型片剂的总剂量)。在一些实施例中，该固体剂型包含微型片剂，该微型片剂包含约1.6x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，多个微型片剂的总剂量)。在一些实施例中，该固体剂型包含微型片剂，该微型片剂包含约3.2x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，多个微型片剂的总剂量)。在一些实施例中，该固体剂型包含微型片剂，该微型片剂包含约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，多个微型片剂的总剂量)。在一些实施例中，将该微型片剂中的普雷沃菌属细菌冻干。

在一些实施例中，该微型片剂(例如，肠溶包衣的微型片剂)包含在胶囊中。在一些实施例中，该胶囊是00号、0号、1号、2号、3号、4号或5号胶囊。在一些实施例中，该胶囊包含非肠溶衣(例如，HPMC(羟丙基甲基纤维素)或明胶)(例如，用非肠溶衣包衣的)。在一些实施例中，该胶囊包含非肠溶衣。在一些实施例中，该胶囊包含羟丙基甲基纤维素(HPMC)。在一些实施例中，该胶囊包含明胶。在一些实施例中，该包含约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌的微型片剂(例如，肠溶包衣的微型片剂)包含在一个或多个胶囊中，其中任选地，该胶囊包含HPMC。

在一些实施例中，将包含普雷沃菌属细菌的药物组合物制备成粉剂(例如，用于重悬或用于以固体剂型(如胶囊)使用)或固体剂型，如片剂、微型片剂、胶囊、丸剂或粉剂；或这些形式的组合(例如，胶囊中包含的微型片剂)。在某些实施例中，该粉剂可包含冻干细菌。

在本文公开的任何一个方面的某些实施例中，该药物组合物被配制成固体剂型。在一些实施例中，该药物组合物具有选自片剂、胶囊、微型片剂、粉剂或其组合的剂型。在一些实施例中，该药物组合物被配制成悬浮液(例如在PBS中)。在一些实施例中，药物组合物被配制用于口服、静脉内、皮下、皮内和/或腹膜内施用。在一些实施例中，药物组合物被配制用于口服施用。

在一些实施例中，该药物组合物包含冻干的普雷沃菌属细菌。在某些实施例中，将冻干的普雷沃菌属细菌配制成固体剂型，如片剂、微型片剂、胶囊、丸剂或粉剂。在一些实施例中，该冻干的普雷沃菌属细菌包含在胶囊中。在一些实施方式中，该冻干的普雷沃菌属细菌重悬于溶液中。

在某些实施例中，本文提供治疗患有T_H2介导的病症的受试者的方法，该方法包括向受试者施用本文描述的药物组合物。

在某些实施例中，本文提供治疗患有特应性皮炎的受试者的方法，该方法包括向受试者施用本文描述的药物组合物。

在某些实施例中，本文提供治疗患有食物过敏的受试者的方法，该方法包括向受试者施用本文描述的药物组合物。

在一些实施例中，本文提供的方法进一步包括向受试者施用抗生素。在一些实施例中，该方法进一步包括向受试者施用该病症的一种或多种其他疗法。在一些实施例中，该方法进一步包括施用另一种治疗性细菌。

附图说明

图1A是如下的图，其显示在FITC驱动的接触性超敏反应模型中，口服施用栖组织普雷沃菌显著减少了FITC耳部激发后8小时的耳肿胀。(普通单因素ANOVA；地塞米松p<0.001；栖组织普雷沃菌p:0.0031。)

图1B是一系列图，其显示了栖组织普雷沃菌治疗减少了双耳中的Il4、Il5、Il33、Il17a、Il1b和Tslp的基因表达。

图2是如下的图，其显示在FITC驱动的接触性超敏反应模型中，口服施用栖组织普雷沃菌显著减少了FITC耳部激发后8小时的耳肿胀。(普通单因素ANOVA；菌株1是普雷沃菌属另一个物种的菌株；并且菌株2是与普雷沃菌属不同属的菌株。)

图3A显示了特应性皮炎相关食物过敏模型的研究设计。

图3B是如下的图，其显示使用卵白蛋白(OVA)食物过敏原模型在特应性皮炎相关食物过敏模型中口服施用栖组织普雷沃菌显著减少了耳部炎症。(普通单因素ANOVA；托法替尼p:0.0009；栖组织普雷沃菌p<0.0001；菌株B p:0.0047；菌株A是与普雷沃菌属不同属的菌株；并且菌株B是栖组织普雷沃菌的另一个菌株。)

图3C是一对图，其显示了在使用卵白蛋白(OVA)食物过敏原的特应性皮炎相关食物过敏模型中，在施用媒介物、托法替尼、栖组织普雷沃菌或两种其他细菌物种(“菌株A”和“菌株B”)的小鼠中IgG1和IgE的水平(菌株A是与普雷沃菌属不同属的菌株；并且菌株B是栖组织普雷沃菌的另一个菌株)。

图3D是一系列图，其显示了在使用卵白蛋白(OVA)食物过敏原的特应性皮炎相关食物过敏模型中，在施用媒介物、托法替尼、栖组织普雷沃菌或两种其他细菌物种(“菌株A”和“菌株B”)的小鼠中IL-4、IL-5、IL-13、IL-10、IL-31和IL-33的水平(菌株A是与普雷沃菌属不同属的菌株；并且菌株B是栖组织普雷沃菌的另一个菌株)。

图4A显示了小鼠模型的研究设计，使用卵白蛋白(OVA)或CPE(完整花生提取物)作为食物过敏原，测试了与特应性皮炎相关的食物过敏模型。

图4B是如下的图，其显示在OVA驱动的和花生过敏原(CPE)驱动的特应性皮炎相关的食物过敏模型中，口服施用栖组织普雷沃菌显著减少了耳部炎症。(普通单因素ANOVA；托法替尼p:<0.0001；抗IL-4p:0.0024；菌株A p:0.0163；栖组织普雷沃菌(OVA组)p<0.0001；CPE组p:<0.0001(媒介物对比栖组织普雷沃菌)；菌株A是与普雷沃菌属不同属的菌株。)

图4C是一对图，其显示了在使用卵白蛋白(OVA)食物过敏原的特应性皮炎相关食物过敏模型中，在施用媒介物、托法替尼、抗IL-4、栖组织普雷沃菌或另一细菌物种(“菌株A”)的小鼠中抗OVA IgG1和抗OVA IgE的水平(菌株A是与普雷沃菌属不同属的菌株)。

图4D是一系列图，其显示了在使用卵白蛋白(OVA)食物过敏原的特应性皮炎相关食物过敏模型中施用媒介物、托法替尼、抗IL-4、栖组织普雷沃菌或另一细菌物种(“菌株A”)的小鼠中和在花生过敏原(CPE)驱动的接触性超敏反应模型中施用媒介物和栖组织普雷沃菌的小鼠中的IL-4、IL-5、IL-13、IL-10和IL-31的水平(菌株A是与普雷沃菌属不同属的菌株)。

图4E是一系列图，其显示了在使用卵白蛋白(OVA)食物过敏原的特应性皮炎相关食物过敏模型中施用媒介物、托法替尼、抗IL-4、栖组织普雷沃菌或另一细菌物种(“菌株A”)的小鼠中和在使用花生过敏原(CPE)作为食物过敏原的特应性皮炎相关食物过敏模型中施用媒介物和栖组织普雷沃菌的小鼠中的IL-4、IL-5、TSLP、CCR4和IL-19RNA的水平(菌株A是与普雷沃菌属不同属的菌株)。

图5显示了2型皮肤炎症和食物过敏诱导的MC903模型。

图6A显示了皮肤致敏花生过敏模型的研究设计。

图6B显示了皮肤致敏花生过敏模型的研究设计。

图6C显示了皮肤致敏花生过敏模型的研究设计。

图6D是如下的图，其显示在皮肤致敏花生过敏模型中口服施用栖组织普雷沃菌显著减少了耳肿胀。

图6E是一对图，其显示了在皮肤致敏花生过敏模型中施用媒介物、托法替尼(“tofa”)或栖组织普雷沃菌的小鼠在激发当天的总IgE和抗花生IgE水平。

图6F是一对图，其显示了在皮肤致敏花生过敏模型中施用媒介物、托法替尼(“tofa”)或栖组织普雷沃菌的小鼠在激发当天的总IgG1和抗花生IgG1水平。

图6G是一对图，其显示了在皮肤致敏花生过敏模型中施用媒介物、托法替尼(“tofa”)或栖组织普雷沃菌的小鼠在激发后2周的总IgE和抗花生IgE水平。

图6H是一对图，其显示了在皮肤致敏花生过敏模型中施用媒介物、托法替尼(“tofa”)或栖组织普雷沃菌的小鼠在激发后2周的总IgG1和抗花生IgG1水平。

图6I是一对图，其显示了在皮肤致敏花生过敏模型中施用媒介物、托法替尼(“tofa”)或栖组织普雷沃菌的小鼠在激发后2周的总IgA和抗花生IgGA水平。

图7A是显示FITC-CHS模型实验设计的示意图。

图7B是一系列图，其显示了来自FITC-CHS模型中施用媒介物、地塞米松或栖组织普雷沃菌的小鼠的离体再刺激肠系膜淋巴结(mLN)细胞中的IL-13、IL-4、IL-5、IL-31和IL-33水平。

图7C是一系列图，其显示了来自FITC-CHS模型中施用媒介物、地塞米松或栖组织普雷沃菌的小鼠的离体再刺激耳引流颈部淋巴结(cLN)细胞中的IL-13、IL-4、IL-5、IL-31和IL-33水平。

图8A是显示MC903驱动的特应性皮炎模型实验设计的示意图。

图8B是一对图，其显示了在MC903驱动的特应性皮炎模型中，用媒介物、托法替尼或栖组织普雷沃菌治疗的小鼠随时间的耳部测量(左图)和第14天的耳部炎症(右图)。

图8C是一系列图，其显示了在MC903驱动的特应性皮炎模型中，用媒介物、托法替尼或栖组织普雷沃菌治疗的小鼠的耳组织中的Tslp、Il5、Il31、Il4、Ccl19和Ccr4转录物水平。

图8D是一系列图，其显示了在MC903驱动的特应性皮炎模型中，用媒介物、托法替尼或栖组织普雷沃菌治疗的小鼠的耳组织中肥大细胞相关基因(Mcpt1)转录物水平。

图8E是一对图，其显示了在MC903驱动的特应性皮炎模型中，用媒介物、托法替尼或栖组织普雷沃菌治疗的小鼠的肠系膜淋巴结(左图)和脾脏(右图)中的IL-10水平。

具体实施方式

如本文所公开的，包含普雷沃菌属(Prevotella)细菌的药物组合物具有治疗作用，并且可用于治疗或预防(即，用于治疗、预防、或者用于治疗和预防)一种或多种T_H2介导的病症。此类T_H2介导的病症包括但不限于过敏性鼻炎、哮喘、特应性皮炎、荨麻疹、血管性水肿、过敏(例如食物过敏、昆虫诱导的过敏、或药物过敏)、过敏性反应和嗜酸性粒细胞增多症。该药物组合物可以包括栖组织普雷沃菌属细菌。

定义

“佐剂”或“辅助疗法”在广义上是指影响受试者(例如人类)中的免疫学或生理学反应的药剂。例如，佐剂可增加抗原随时间或在目的区域中的存在，帮助吸收抗原呈递细胞抗原，激活巨噬细胞及淋巴细胞并且支持细胞因子的产生。通过改变免疫应答，佐剂可允许使用较小剂量的免疫相互作用剂以增加特定剂量的免疫相互作用剂的有效性或安全性。例如，佐剂可预防T细胞耗竭且由此增加特定免疫相互作用剂的有效性或安全性。

“施用”在广义上是指组合物(例如药物组合物)在受试者中的施用途径。施用途径的实例包含口服施用、直肠施用、局部施用、吸入(经鼻)或注射。注射施用包括静脉内(IV)、肌内(IM)及皮下(SC)施用。本文所述的药物组合物可以任一形式通过任一有效途径来施用，这些途径包括但不限于：口服、肠胃外、肠内、静脉内、腹膜内、局部、经皮(例如使用任一标准贴剂)、真皮内、眼部、经鼻(内)、局部、非经口(如气溶胶、吸入、皮下、肌内、经颊、舌下、(经)直肠、阴道、动脉内及鞘内)、经黏膜(例如舌下、经舌、(经)颊、(经)尿道、阴道(例如经阴道及经阴道周围)、膀胱内、肺内、十二指肠内、胃内及支气管内。在优选的实施例中，通过以下形式施用本文所述的药物组合物：经口、经直肠、经局部、经膀胱内、通过注射至引流淋巴结中或毗邻引流淋巴结处、经静脉内、通过吸入或气溶胶或经皮下。在另一个优选的实施例中，本文所述的药物组合物经口服或静脉内施用。

如本文所用，术语“抗体”可指完整抗体及其抗原结合片段二者。完整抗体是包含由二硫键相互连接的至少两条重(H)链及两条轻(L)链的糖蛋白。每条重链包含重链可变区(在本文中缩写为V_H)及重链恒定区。每条轻链包含轻链可变区(在本文中缩写为V_L)及轻链恒定区。V_H及V_L区可进一步细分成超变区(称为互补决定区(CDR))及更保守区(称为框架区(FR))，二者散布排列。每个V_H及V_L由三个CDR及四个FR构成，其自氨基-末端至羧基-末端按下列顺序排列：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。重链及轻链的可变区含有与抗原相互作用的结合结构域。术语“抗体”包含例如单克隆抗体、多克隆抗体、嵌合抗体、人源化抗体、人类抗体、多特异性抗体(例如双特异性抗体)、单链抗体及抗原结合抗体片段。

如本文所用，术语抗体的“抗原结合片段”及“抗原结合部分”是指抗体中保留结合抗原的能力的一个或多个片段。术语抗体的“抗原结合片段”内所涵盖结合片段的实例包含Fab、Fab'、F(ab')₂、Fv、scFv、二硫化物连接的Fv、Fd、双抗体、单链抗体、

经分离CDRH3及其他保留完整抗体的至少一部分可变区的抗体片段。这些抗体片段可使用常规重组和/或酶促技术来获得且可以与完整抗体相同的方式针对抗原结合进行筛选。

“碳水化合物”是指糖或糖聚合物。术语“糖”、“多糖”、“碳水化合物”及“寡糖”可互换使用。大部分碳水化合物是具有许多羟基的醛或酮，通常在分子的每一碳原子上具有一个羟基。碳水化合物通常具有分子式C_nH_2nO_n。碳水化合物可为单糖、二糖、三糖、寡糖或多糖。最基本的碳水化合物是单糖，例如葡萄糖、蔗糖、半乳糖、甘露糖、核糖、阿拉伯糖、木糖及果糖。二糖是两个接合的单糖。示例性二糖包含蔗糖、麦芽糖、纤维二糖及乳糖。通常，寡糖包含三至六个单糖单元(例如棉子糖、水苏糖)，且多糖包含六个或更多个单糖单元。示例性多糖包含淀粉、糖原及纤维素。碳水化合物可含有经修饰糖单元，例如2’-脱氧核糖，其中去除羟基，2’-氟核糖，其中羟基经氟代替；或N-乙酰基葡萄糖胺，其为葡萄糖的含氮形式(例如2’-氟核糖、脱氧核糖及己糖)。碳水化合物可以许多不同形式存在，例如构象异构体、环状形式、非环状形式、立体异构体、互变异构体、端基差向异构体及异构体。

“细胞增强”广泛地指细胞的流入或细胞在环境中的扩增，这些细胞在施用组合物(例如药物组合物)之前基本上不存在于该环境中且不存在于该组合物本身中。增强环境的细胞包括免疫细胞、基质细胞、细菌及真菌细胞。

“进化枝”指系统发育树的OTU或成员，它们是系统发育树中的统计有效节点的下游。进化枝包含系统发育树中的一组末端叶，其是不同的单系进化单元且在某种程度上共享序列相似性。

来自两个或更多个微生物菌株的微生物(例如细菌)的“组合”包括在相同材料或产品中或在物理连接的产品中获得这些微生物的物理共存，及两个或多个菌株的时间共施用或共定位。在一些实施例中，该菌株之一来自普雷沃菌属细菌，例如，栖组织普雷沃菌细菌。

术语“降低”或“消耗”意指变化，从而取决于治疗后状态与治疗前状态相比的差异为至少10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％、1/100、1/1000、1/10,000、1/100,000、1/1,000,000或不可检测。可降低的性质包含免疫细胞、细菌细胞、基质细胞、髓源性抑制细胞、成纤维细胞、代谢物的数量；细胞因子的水平；或另一物理参数(如耳厚度(例如，在DTH动物模型中)或肿瘤的大小(例如，在动物肿瘤模型中))。

术语“生态聚生体(ecological consortium)”是交换代谢物且彼此正性共调控的一组细菌，这与经由激活互补宿主通路来诱导宿主协同作用以改进功效的两种细菌形成对比。

如本文所用，“工程细菌”是通过人类活动已在遗传上自天然状态改变的任何细菌及任何这类细菌的子代。工程改造的细菌包括例如靶向遗传修饰的产物、随机诱变筛选的产物及定向演化的产物。

术语“表位”意指可特异性结合至抗体或T细胞受体的蛋白质决定子。表位通常由如氨基酸或糖侧链等分子的化学活性表面分组组成。某些表位可通过抗体能够结合的氨基酸的特定序列来定义。

术语“基因”在广义上用于指与生物功能有关的任一核酸。术语“基因”适用于特定基因组序列以及由该基因组序列编码的cDNA或mRNA。

两种核酸分子的核酸序列之间“同一性”可使用已知计算机算法(例如“FASTA”程序)使用例如Pearson等人(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA[美国国家科学院院刊]85:2444中的预设参数测定为同一性百分比(其他程序包含GCG程序包(Devereux,J.等人,NucleicAcids Research[核酸研究]12(I):387(1984))、BLASTP、BLASTN、FASTA Atschul,S.F.等人,J Molec Biol[分子生物学杂志]215:403(1990)；Guide to Huge Computers[巨型计算机指南],Mrtin J.Bishop编辑,Academic Press[学术出版社],San Diego[圣地亚哥],1994及Carillo等人(1988)SIAM J Applied Math[工业和应用数学学会应用数学杂志]48:1073)。例如，可使用国家生物技术信息中心数据库(National Center for BiotechnologyInformation database)的BLAST功能来测定同一性。其他可商业或公开获得的程序包含DNAStar“MegAlign”程序(威斯康星州麦迪逊市(Madison,Wis.))及威斯康星大学遗传学计算机集团(University of Wisconsin Genetics Computer Group)(UWG)“Gap”程序(威斯康星州麦迪逊市(Madison,Wis.))。

“免疫疗法”是使用受试者的免疫系统以治疗疾病(例如，免疫疾病、炎性疾病、代谢疾病、癌症)的治疗且包括例如检查点抑制剂、癌症疫苗、细胞因子、细胞疗法、CAR-T细胞及树突细胞疗法。

术语“增加”意指变化，从而取决于治疗后状态大于治疗前状态至少10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％、2倍、4倍、10倍、100倍、10^3倍、10^4倍、10^5倍、10^6倍和/或10^7倍的差别。可增加的性质包含免疫细胞、细菌细胞、基质细胞、髓源性抑制细胞、成纤维细胞、代谢物的数量；细胞因子的水平；或另一物理参数(如耳厚度(例如，在DTH动物模型中)或肿瘤的大小(例如，在动物肿瘤模型中))。

“先天免疫激动剂”或“免疫佐剂”是特异性靶向先天免疫受体(包括Toll样受体(TLR)、NOD受体、RLR、C型凝集素受体、STING-cGAS通路组分、发炎体复合物)的小分子、蛋白质或其他药剂。例如，LPS是细菌源的或合成的TLR-4激动剂且可使用铝作为免疫刺激佐剂。免疫佐剂是特定种类的较宽泛佐剂或辅助疗法。STING激动剂的实例包括但不限于2'3'-cGAMP、3'3'-cGAMP、c-di-AMP、c-di-GMP、2'2'-cGAMP及2'3'-cGAM(PS)2(Rp/Sp)(2'3'-cGAMP的双硫代磷酸酯类似物的Rp、Sp异构体)。TLR激动剂的实例包括但不限于TLRl、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10和TLRI l。NOD激动剂的实例包括但不限于N-乙酰基胞壁酰基-L-丙胺酰基-D-异谷氨酰胺(胞壁酰二肽(MDP))、γ-D-谷氨酰基-内消旋-二氨基庚二酸(iE-DAP)及去胞壁酰肽(desmuramylpeptide；DMP)。

“内转录间隔区”或“ITS”是位于通常用于识别真核物种(特别地，真菌)的共同前体转录本上的结构核糖体RNA(rRNA)之间的一段非功能性RNA。形成核糖体的核的真菌的rRNA经转录为信号基因且由8S、5.8S及28S区域及分别在8S与5.8S之间及5.8S与28S区域之间的ITS4及5组成。如先前描述，在18S与5.8S之间及5.8S与28S区域之间的这类两个双译基因嵌段(intercistronic segment)通过剪接移除且出于条形码的目的在物种之间含有显著变化(Schoch等人,Nuclear ribosomal internal transcribed spacer(ITS)region asauniversal DNA barcode marker for Fungi.[核糖体内转录间隔区(ITS)是真菌的通用DNA条形码标记]PNAS 109:6241-6246.2012)。18SrDNA传统上用于系统发育重建，然而ITS可发挥此功能，因为其通常是高度保守的，但含有高变区，这些高变区具有足够的核苷酸多样性来区分大多数真菌的属及物种。

术语“经分离”或“经富集”包含微生物或其他实体或物质已经(1)与最初产生(无论在自然中或在实验环境中)时与的相关联的至少一些组分分离，和/或(2)由人工产生、制备、纯化和/或制造。经分离微生物可与至少约10％、约20％、约30％、约40％、约50％、约60％、约70％、约80％、约90％或更多的其最初缔合的其他组分分离。在一些实施例中，经分离微生物是大于约80％、约85％、约90％、约91％、约92％、约93％、约94％、约95％、约96％、约97％、约98％、约99％或大于约99％纯的，例如，基本上不含其他组分。术语“纯化(purify、purifying及purified)”是指已与在最初产生或生成(例如不论在自然界中或在实验环境中)时或在其初始产生之后的任一时间期间与其缔合的至少一些组分分离的微生物或其他材料。如果在产生时或在产生之后诸如自含有微生物或微生物群体的材料或环境分离，则该微生物或微生物群体可视为经纯化，且经纯化微生物或微生物群体可含有最高约10％、约20％、约30％、约40％、约50％、约60％、约70％、约80％、约90％或高于约90％的其他材料且仍视为“经分离”。在一些实施例中，经纯化微生物或微生物群体是大于约80％、约85％、约90％、约91％、约92％、约93％、约94％、约95％、约96％、约97％、约98％、约99％或大于约99％纯的。在本文所提供微生物组合物的情况下，存在于该组合物中的一种或多种微生物类型可与独立于一种或多种产生和/或存在于含有该微生物类型的材料或环境中的其他微生物来纯化。通常自残余生境产物来纯化微生物组合物及其微生物组分。

如本文所用，“脂质”包括脂肪、油、三酸甘油酯、胆固醇、磷脂质、任何形式的脂肪酸(包括游离脂肪酸)。脂肪、油及脂肪酸可为饱和、不饱和(顺式或反式)或部分不饱和(顺式或反式)。

术语“LPS突变体或脂多糖突变体”广泛地是指包括LPS损失的所选细菌。LPS的丢失可能是由于参与脂质A生物合成的基因(如lpxA、lpxC和lpxD)的突变或破坏引起的。包含LPS突变体的细菌可能对氨基糖苷类和多粘菌素(多粘菌素B和粘菌素)具有抗性。

如本文所用的“代谢物”是指在任何细胞或微生物代谢反应中用作底物或作为产物化合物、组合物、分子、离子、辅助因子、催化剂或营养素产生自任何细胞或微生物代谢反应的任何及所有分子化合物、组合物、分子、离子、辅助因子、催化剂或营养素。

“微生物”是指表征为古生菌、寄生虫、细菌、真菌、微观藻类、原生动物及与该生物体相关的发育阶段或生命周期阶段(例如，植物、孢子(包括孢子形成、休眠及萌发)、潜伏、生物膜)的任何天然或经改造的生物体。在一些实施例中，这些微生物是细菌。肠道微生物的实例包括：葛氏放线菌(Actinomyces graevenitzii)、龋齿放线菌(Actinomycesodontolyticus)、嗜黏蛋白阿克曼氏菌(Akkermansia muciniphila)、粪拟杆菌(Bacteroides caccae)、脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)、腐败拟杆菌(Bacteroidesputredinis)、多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)、普通拟杆菌(Bacteroidesvultagus)、青春双歧杆菌(Bifidobacterium adolescentis)、两歧双歧杆菌(Bifidobacterium bifidum)、对沃氏嗜胆菌(Bilophila wadsworthia)、布劳特氏菌属(Blautia)、丁酸弧菌属(Butyrivibrio)、纤细弯曲杆菌(Campylobacter gracilis)、梭菌群III(Clostridia cluster III)、梭菌群IV(Clostridia cluster IV)、梭菌群IX(Clostridia cluster IX)(氨基酸球菌科群(Acidaminococcaceae group))、梭菌群XI(Clostridia cluster XI)、梭菌群XIII(Clostridia cluster XIII)(消化链球菌群(Peptostreptococcus group))、梭菌群XIV(Clostridia cluster XIV)、梭菌群XV(Clostridia cluster XV)、产气柯林斯菌(Collinsella aerofaciens)、粪球菌属(Coprococcus)、桑氏棒状杆菌(Corynebacterium sunsvallense)、猪脱硫单胞菌(Desulfomonas pigra)、产甲酸多尔氏菌(Dorea formicigenerans)、长链多尔氏菌(Dorealongicatena)、大肠杆菌(Escherichia coli)、庞大真杆菌(Eubacterium hadrum)、直肠真杆菌(Eubacterium rectale)、普拉梭菌(Faecalibacteria prausnitzii)、孪生球菌属(Gemella)、乳球菌属(Lactococcus)、兰氏螺菌属(Lanchnospira)、柔膜细菌群XVI(Mollicutes cluster XVI)、柔膜细菌群XVIII(Mollicutes cluster XVIII)、普雷沃菌属(Prevotella)、黏滑罗氏菌(Rothia mucilaginosa)、伶俐瘤胃球菌(Ruminococcuscallidus)、活泼瘤胃球菌(Ruminococcus gnavus)、扭链瘤胃球菌(Ruminococcustorques)及链球菌属(Streptococcus)。

“微生物群系”广泛地指栖居于受试者或患者的身体部位上或中的微生物。微生物群系中的微生物可包括细菌、病毒、真核微生物和/或病毒。微生物群系中的个别微生物可以是代谢活性、休眠、潜伏或作为孢子存在，可以浮游形式存在或存在于生物膜中，或可以可持续或短暂的方式存在于该微生物群系中。该微生物群系可以是共生或健康状态微生物群系或疾病状态微生物群系。该微生物组对受试者或患者而言可以是天然的，或该微生物组的组分可因健康状态或处理条件(例如，抗生素治疗、暴露于不同微生物)的变化而经调整、引入或消耗。在一些方面，该微生物群系出现于黏膜表面。在一些方面，该微生物群系是肠道微生物群系。

组织或样品的“微生物群系概况(microbiome profile)”或“微生物群系签名(microbiome signature)”是指微生物群系的细菌组成的至少部分表征。在一些实施例中，微生物群系概况指示是否至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100或更多个细菌菌株存在于微生物群系中或不存在于微生物群系中。

关于细菌的“经修饰”广泛地指自野生型形式已经变化的细菌。细菌工程化可以导致细菌修饰。细菌修饰的实例包括遗传修饰、基因表达修饰、表型修饰、配制修饰、化学修饰及剂量或浓度。经改善的性质的实例描述于整个说明书中且包括例如减毒、营养缺陷、归巢或抗原性。表型修饰可包括(以实例说明的)细菌于修饰细菌的表型的培养基中生长使得其增加或降低毒力。

“运算分类单元”及“OTU”是指系统发生树中的末端叶且通过核酸序列(例如整个基因组或特定基因序列及所有与此核酸序列在物种层面共享序列同一性的序列)来定义。在一些实施例中，特定基因序列可为16S序列或16S序列的一部分。在其他实施例中，对两种实体的整个基因组进行测序并进行比较。在另一个实施例中，可以基因方式比较所选区域(例如多基因座序列标签(MLST)、特定基因或基因集)。对于16S而言，整个16S或一些16S可变区中共有≥97％平均核苷酸同一性的OTU可视为相同OTU。参见，例如，Claesson MJ,WangQ,O’Sullivan O,Greene-Diniz R,Cole JR,Ross RP及O’Toole PW.2010.Comparison oftwo next-generation sequencing technologies for resolving highlycomplexmicrobiota composition using tandem variable 16S rRNA gene regions[使用串联可变16S rRNA基因区解析高度复杂的微生物群组成的两种下一代测序技术的比较].Nucleic Acids Res[核酸研究]38:e200.Konstantinidis KT,Ramette A及TiedjeJM.2006.The bacterial species definition in the genomic era[基因组时代的细菌物种类定义].Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci[伦敦皇家学会B辑：生物科学哲学学报]361:1929-1940。对于完整基因组、MLST、特定基因(除16S外)或基因集而言，共有≥95％平均核苷酸同一性的OTU可视为相同OTU。例如参见Achtman M及Wagner M.2008.Microbialdiversity and the genetic nature of microbial species[微生物多样性和微生物物种的遗传性质].Nat.Rev.Microbiol.[微生物自然评论]6:431-440.Konstantinidis KT,Ramette A及Tiedje JM.2006.The bacterial species definition in the genomic era[基因组时代的细菌物种类定义].Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci[伦敦皇家学会B辑：生物科学哲学学报]361:1929-1940。通常通过比较生物体之间的序列来定义OTU。通常，具有小于95％序列同一性的序列并不视为形成相同OTU的一部分。还可通过核苷酸标志或基因、尤其高度保守基因(例如“管家”基因)或其组合的任一组合来表征OTU。本文提供可分配例如属、物种及系统发育进化枝的运算分类单元(OTU)。

如本文所用，如果基因在至少一些条件下在工程细菌中的表达水平高于相同物种的野生型细菌在相同条件下的表达水平，则该基因在细菌中“过度表达”。类似地，如果基因在至少一些条件下在工程改造的细菌中的表达水平低于相同物种的野生型细菌在相同条件下的表达水平，则该基因在细菌中“表达不足”。

术语“多核苷酸”及“核酸”可互换使用。它们是指任何长度的核苷酸的聚合形式(脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸)或其类似物。多核苷酸可具有任何三维结构，且可实施任何功能。多核苷酸的非限制性实例如下：基因或基因片段的编码或非编码区域、定义自连锁分析的基因座(loci)(基因座(locus))、外显子、内含子、信使RNA(mRNA)、微小RNA(miRNA)、沉默RNA(siRNA)、转移RNA、核糖体RNA、核糖酶、cDNA、重组多核苷酸、分支多核苷酸、质粒、载体、任何序列的经分离的DNA、任何序列的经分离的RNA、核酸探针及引子。多核苷酸可包括经修饰核苷酸，例如甲基化核苷酸及核苷酸类似物。如果存在，则可在组装聚合物之前或之后赋予对核苷酸结构的修饰。多核苷酸可通过如与标记组分缀合而经进一步修饰。在本文提供的所有核酸序列中，U核苷酸可与T核苷酸互换。

如本文所用，“生物标志物”包括由于T_H2介导的途径而使其水平增加或降低的分子(例如，mRNA或蛋白质)。例如，在T_H2介导的病症中一种或多种此类生物标志物的水平相比健康受试者中的水平可能会增加。此类蛋白质生物标志物的一些实例包括白介素4、白介素5、白介素13、白介素19、白介素21、白介素31、白介素33、胸腺基质淋巴细胞生成素、免疫球蛋白G1、免疫球蛋白E、免疫球蛋白A及其组合。此类mRNA生物标志物的一些实例包括白介素4、白介素5、白介素13、白介素19、白介素21、白介素31、白介素33、胸腺基质淋巴细胞生成素及其组合。

如本文所用，物质基本上不含其他组分时是“纯的”。术语“纯化(purify或purifying)”及“经纯化”是指普雷沃菌属细菌或其他材料已与最初产生或形成(例如，无论在自然中或在实验环境中)时或在初始产生后的任何时间期间与的相关的至少一些组分分离。若普雷沃菌属细菌制剂或组合物在产生时或产生后与如一种或多种其他细菌组分分离，则该普雷沃菌属细菌制剂或组合物可被视为经纯化，及经纯化的微生物或微生物群体可含有其他材料多达约10％、约20％、约30％、约40％、约50％、约60％、约70％、约80％、约90％或超过约90％且仍被视为“经纯化”。在一些实施例中，经纯化的普雷沃菌属细菌超过约80％、约85％、约90％、约91％、约92％、约93％、约94％、约95％、约96％、约97％、约98％、约99％或超过约99％纯。普雷沃菌属细菌组合物或制剂是，例如，从残余生境产物中纯化的。

如本文所用，术语“经纯化的普雷沃菌属细菌”或“普雷沃菌属细菌组合物”是指包括普雷沃菌属细菌的制剂，其中该普雷沃菌属细菌已与源材料或在用以产生该制剂的任何方法中与普雷沃菌属细菌相关的任何材料中发现的至少一种相关物质分离(例如，与至少一种其他细菌菌株分离)。它还指已经显著富集或浓缩的组合物。在一些实施例中，这些普雷沃菌属细菌经浓缩2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、100倍、1000倍、10,000倍或超过10,000倍。在某些实施例中，该普雷沃菌属细菌组合物可以是药物组合物。

“残余生境产物”是指自受试者内或受试者上的微生物群生境衍生的材料。例如，微生物的发酵培养物可以包含污染物，例如其他微生物菌株或形式(例如，细菌、病毒、支原体和/或真菌)。例如，微生物生存于胃肠道的粪便中、皮肤本身上、唾液中、呼吸道的黏液中或泌尿生殖道的分泌物中(即，与微生物群落相关联的生物物质)。基本上不含残余生境产物意指该微生物组合物不再含有与人类或动物受试者上或培养物中或人类或动物受试者中的微生物环境相关联的生物物质且是100％不含、99％不含、98％不含、97％不含、96％不含或95％不含与该微生物群落相关联的任何污染生物物质。残余生境产物可包括非生物材料(包括未经消化的食物)或其可包括非所需的微生物。基本上不含残余生境产物亦可意指该微生物组合物不含有来自培养物污染物或人类或动物的可检测细胞且意指仅微生物细胞是可检测的。在一项实施例中，基本上不含残余生境产物亦可意指该微生物组合物不含有可检测的病毒(包括细菌、病毒(例如，噬菌体))、真菌、支原体污染物。在另一个实施例中，这意味着与微生物细胞相比，该微生物组合物中少于1x10^-2％、1x10^-3％、1x10^-4％、1x10^-5％、1x10^-6％、1x10^-7％、1x10^-8％的有活力细胞是人或动物细胞。达到此纯度的方法有很多，这些方法中无任何一者是限制性的。因此，污染物可经由通过在固体培养基上对单菌落进行多个画线步骤，直至来自系列性单菌落的复制(诸如但不限于两个)画线已显示仅单一菌落形态来分离所需成分而减少。可替代地，污染物的减少可通过多轮连续稀释至单一所需细胞(例如，10^-8或10^-9的稀释)，诸如通过多个10倍连续稀释完成。此可通过显示多个经分离的菌落具有相似细胞形状及革兰氏染色行为进一步证实。用于证实足够的纯度的其他方法包括遗传分析(例如，PCR、DNA测序)、血清学及抗原分析、酶及代谢分析及使用仪器的方法，诸如使用自污染物区分所需成分的试剂的流式细胞术。

如本文所用，“特异性结合”是指抗体能够结合至预定抗原或多肽能够结合至其预定结合配偶体。通常，抗体或多肽以对应于约10^-7M或更小K_D的亲和力特异性结合至其预定抗原或结合配偶体，且以相对于结合至非特异性及不相关抗原/结合配偶体(例如BSA、酪蛋白)小至少10倍、小至少100倍或小至少1000倍的其亲和力的亲和力(如通过K_D所表示)结合至预定抗原/结合配偶体。可替代地，特异性结合更广泛地适用于二组分系统，其中一种组分是蛋白质、脂质或碳水化合物或其组合且与是蛋白质、脂质、碳水化合物或其组合的第二组分以特定方式接合。

“菌株”是指具有基因签名的细菌物种的成员，从而其可与相同细菌物种的密切相关成员区分开来。基因签名可为不存在至少一种基因的全部或一部分、不存在至少一个调控区(例如启动子、终止子、核糖开关、核糖体结合位点)的全部或一部分、不存在(“消除”)至少一种天然质粒、存在至少一种重组基因、存在至少一种突变基因、存在至少一种外来基因(衍生自另一物种的基因)、存在至少一种突变调控区(例如启动子、终止子、核糖开关、核糖体结合位点)、存在至少一种非天然质粒、存在至少一种抗生素抗性盒或其组合。可通过PCR扩增且任选地随后进行一个或多个目的基因组区域或全基因组的DNA测序来鉴别不同菌株之间的基因签名。如果一种菌株(与相同物种的另一种菌株相比)已获得或失去抗生素抗性或获得或失去生物合成能力(例如营养缺陷型菌株)，则可通过选择或反选择分别使用抗生素或营养物/代谢物来区分菌株。

术语“受试者”或“患者”是指任何哺乳动物。描述为“有需要”的受试者或患者是指需要治疗(或预防)疾病的人。哺乳动物(即哺乳类动物)包括人类、实验室动物(例如灵长类动物、大鼠、小鼠)、家畜(例如牛、绵羊、山羊、猪)及家庭宠物(例如狗、猫、啮齿类动物)。该受试者可以是人类。该受试者可为非人类哺乳动物，包括但不限于：狗、猫、牛、马、猪、驴、山羊、骆驼、小鼠、大鼠、天竺鼠、绵羊、骆马、猴、大猩猩或黑猩猩。该受试者可为健康的受试者，或可患有任一发展阶段的病症，其中任一阶段由病症相关或致病病原体引起或伺机性地支持该病原体，或受试者可处于发生病症或向其他受试者传播病症相关或病症致病病原体的风险中。在一些实施例中，受试者患有T_H2介导的病症。在一些实施例中，受试者患有特应性皮炎。在一些实施例中，受试者患有哮喘。在一些实施例中，受试者患有食物过敏。在一些实施例中，该受试者已接受对其病症的治疗。

如本文所用，术语“治疗”受试者的疾病或“治疗”患有或怀疑患有病症的受试者是指对受试者实施药物治疗(例如药物组合物)，例如施用一种或多种药剂(例如药物组合物)，从而减轻该病症的至少一种症状或预防其恶化。因此，在一个实施例中，“治疗”尤其是指延迟进展、促进缓解、诱导缓解、增大缓解、加速恢复、增加功效或降低替代治疗的抗性，或其组合。

细菌

在某些方面，本文提供了细菌组合物，如药物组合物，包括某些细菌以及使用此类细菌组合物(如药物组合物)来治疗和/或预防T_H2介导的病症的方法。

在某些实施例中，本文提供的药物组合物包含普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，这些普雷沃菌属细菌是以下物种：阿尔伯普雷沃菌、羊水普雷沃菌、卑尔根普雷沃菌、二路普雷沃菌、短普雷沃菌、布氏普雷沃菌、颊普雷沃菌、口颊普雷沃菌、粪便普雷沃菌、牙普雷沃菌、栖牙普雷沃菌、解糖胨普雷沃菌、栖组织普雷沃菌、产黑色素普雷沃菌、中间普雷沃菌、小斑点普雷沃菌、马斯普雷沃菌、产黑普雷沃菌、彩虹普雷沃菌、多形普雷沃菌、变黑普雷沃菌、口腔普雷沃菌、口普雷沃菌、龈炎普雷沃菌、苍白普雷沃菌、唾液普雷沃菌、斯特塞拉普雷沃菌、坦纳普雷沃菌、蒂莫普雷沃菌、空肠普雷沃菌、橙色普雷沃菌、保氏普雷沃菌、着色普雷沃菌、人体普雷沃菌、丹塔普雷沃菌、栖居普雷沃菌、斐氏普雷沃菌、深黑色普雷沃菌、解肝素普雷沃菌、洛氏普雷沃菌、嗜糖普雷沃菌、南锡普雷沃菌、稻普雷沃菌、沼泽普雷沃菌、胸膜炎普雷沃菌、栖瘤胃普雷沃菌、解糖普雷沃菌、靶心普雷沃菌、赛赫普雷沃菌、动胶普雷沃菌、真空腔普雷沃菌和/或其组合。

在一些实施例中，该普雷沃菌属细菌是物种栖组织普雷沃菌。

在一些实施例中，该普雷沃菌属细菌是包含与普雷沃菌菌株B50329的核苷酸序列(例如基因组序列、16S序列和/或CRISPR序列)具有至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％序列同一性(例如，至少99.1％序列同一性、至少99.2％序列同一性、至少99.3％序列同一性、至少99.4％序列同一性、至少99.5％序列同一性、至少99.6％序列同一性、至少99.7％序列同一性、至少99.8％序列同一性、至少99.9％序列同一性)的菌株。在一些实施例中，该普雷沃菌属细菌是普雷沃菌菌株B 50329(NRRL登录号B 50329)。如本文所用，术语“普雷沃菌菌株B 50329”既包括以NRRL登录号B 50329保藏的菌株，也包括从该保藏菌株克隆和/或衍生的菌株。

可以根据本领域已知的方法培养栖组织普雷沃菌菌株B。例如，可以使用例如在Caballero等人,2017中公开的方法，在ATCC培养基2722、ATCC培养基1490或其他培养基中培养栖组织普雷沃菌。“合作共生生物可恢复对耐万古霉素的粪肠球菌的定植抗性”CellHost&Microbe[细胞宿主与微生物]21：592-602，将其通过引用以其整体并入本文。

在一些实施例中，普雷沃菌属细菌是包含一种或多种(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35或更多种)表1中所列的蛋白质和/或一种或多种(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35或更多种)编码表1中所列的蛋白质的基因的普雷沃菌属细菌的菌株。在一些实施例中，普雷沃菌属细菌包含表1中所列的所有蛋白质和/或编码表1中所列的蛋白质的所有基因。

表1：示例性普雷沃菌蛋白

在一些实施例中，普雷沃菌属细菌是不含或基本上不含一种或多种(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25或更多种)表2中所列的蛋白质和/或一种或多种(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25或更多种)编码表2中所列的蛋白质的基因的普雷沃菌属细菌的菌株。在一些实施例中，普雷沃菌属细菌不含表2中所列的所有蛋白质和/或编码表2中所列的蛋白质的所有基因。

表2：其他普雷沃菌蛋白

在一些实施例中，这些普雷沃菌属细菌来自包含表1中所列的蛋白质中的一种或多种且不含或基本上不含表2中所列的一种或多种蛋白质的普雷沃菌属细菌的菌株。在一些实施例中，这些普雷沃菌属细菌来自包含表1中所列的所有蛋白质和/或编码表1中所列的蛋白质的所有基因，且不含表2中所列的所有蛋白质和/或编码表2中所列的蛋白质的所有基因的普雷沃菌属细菌的菌株。

药物组合物

在某些实施例中，本文提供了包含普雷沃菌属细菌(例如本文所述的普雷沃菌属细菌)的药物组合物，例如用于治疗或预防T_H2介导的病症(例如特应性皮炎、哮喘和/或过敏)的方法的药物组合物。在一些实施例中，该普雷沃菌属细菌组合物包含普雷沃菌属细菌和/或本文所述的细菌菌株与药学上可接受的载体的组合。在一些实施例中，该普雷沃菌属细菌组合物包含普本文所述的单个雷沃菌属细菌菌株和药学上可接受的载体。

在一些实施例中，该药物组合物包含普雷沃菌属细菌和一种或多种(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多种)细菌菌株或物种，例如除普雷沃菌属以外的菌株或物种。在一些实施例中，该药物组合物包含普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含冻干的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含γ照射的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含活的普雷沃菌属细菌。

在一些实施例中，为定量细菌样品中存在的普雷沃菌属细菌的数量，可使用电子显微术(例如，超薄冷冻切片的EM)以观测细菌并计数它们的相对数量。可替代地，可使用纳米颗粒跟踪分析(NTA)、库尔特计数或动态光散射(DLS)或这些技术的组合。NTA及库尔特计数器计数颗粒并显示它们的尺寸。DLS给出颗粒的粒度分布，而非浓度。细菌通常具有1至2um(微米)的直径。完整范围是0.2至20um。来自库尔特计数及NTA的组合结果可揭示给定样品中的细菌数量。库尔特计数揭示具有0.7至10um的直径的颗粒的数量。就大多数细菌样品而言，库尔特计数器单独可揭示细菌数量。对于NTA而言，可以从马尔文帕纳科公司(Malvern Panalytical)获得Nanosight仪器。例如，NS300可以观测并测量尺寸在10-2000nm范围内的悬浮颗粒。NTA允许对例如直径为50-1000nm的颗粒的数量进行计数。DLS揭示具有于1nm-3um的近似范围内的不同直径的颗粒的分布。

在一些实施例中，可以基于颗粒计数来定量普雷沃菌属细菌。例如，可以使用NTA测量普雷沃菌属细菌的总颗粒含量。

在一些实施例中，可以基于总细胞计数(TCC)(例如，由库尔特计数器确定)对普雷沃菌属细菌进行定量。

在一些实施例中，可以使用平板计数测定(例如，通过产生细菌的连续稀释液，使它们在合适的培养基上生长，然后计数菌落数量)对普雷沃菌属细菌进行定量。

在一些实施例中，可以基于蛋白质、脂质或碳水化合物的量来对普雷沃菌属细菌进行定量。例如，可以使用布拉德福德测定或BCA测定来测量普雷沃菌属细菌制剂的总蛋白含量。

在一些实施例中，将普雷沃菌属细菌与(例如源培养物的)一种或多种其他细菌组分进行分离。在一些实施例中，该药物组合物进一步包含其他细菌组分或菌株。

在某些方面，提供了用于向受试者(例如，人类受试者)施用的药物组合物。在一些实施例中，这些药物组合物与另外的活性和/或非活性材料组合以产生最终产品，其可呈单剂量单位或以多剂量形式。

在一些实施例中，该药物组合物包括至少一种碳水化合物。

在一些实施例中，该药物组合物包括至少一种脂质。在一些实施例中，脂质包括至少一种选自以下的脂肪酸：月桂酸(12:0)、肉豆蔻酸(14:0)、棕榈酸(16:0)、棕榈油酸(16:1)、珍珠酸(17:0)、十七碳烯酸(17:1)、硬脂酸(18:0)、油酸(18:1)、亚油酸(18:2)、亚麻酸(18:3)、十八碳四烯酸(18:4)、花生酸(20:0)、二十碳烯酸(20:1)、二十碳二烯酸(20:2)、二十碳四烯酸(20:4)、二十碳五烯酸(20:5)(EPA)、二十二烷酸(22:0)、二十二碳烯酸(22:1)、二十二碳五烯酸(22:5)、二十二碳六烯酸(22:6)(DHA)及二十四烷酸(24:0)。

在一些实施例中，该药物组合物包括至少一种补充矿物质或矿物质源。矿物质的实例包括但不限于：氯化物、钠、钙、铁、铬、铜、碘、锌、镁、锰、钼、磷、钾及硒。任一前述矿物质的合适形式包含可溶性矿物质盐、微溶性矿物质盐、不溶性矿物质盐、螯合矿物质、矿物质复合物、非反应性矿物质(例如羰基矿物质及经还原矿物质)及其组合。

在一些实施例中，该药物组合物包括至少一种补充维生素。至少一种维生素可为脂肪可溶性或水可溶性维生素。合适维生素包括但不限于维生素C、维生素A、维生素E、维生素B12、维生素K、核黄素、烟酸(niacin)、维生素D、维生素B6、叶酸、吡哆醇(pyridoxine)、硫胺素、泛酸及生物素。任一前述物质的合适形式是维生素盐、维生素衍生物、与维生素具有相同或类似活性的化合物及维生素代谢物。

在一些实施例中，该药物组合物包括赋形剂。合适赋形剂的非限制性实例包含缓冲剂、防腐剂、稳定剂、粘合剂、压实剂、润滑剂、分散增强剂、崩解剂、矫味剂、甜味剂及着色剂。

在一些实施例中，赋形剂是缓冲剂。合适缓冲剂的非限制性实例包含柠檬酸钠、碳酸镁、碳酸氢镁、碳酸钙及碳酸氢钙。

在一些实施例中，赋形剂包括防腐剂。合适防腐剂的非限制性实例包含抗氧化剂(例如α-生育酚及抗坏血酸盐)及抗微生物剂(例如对羟基苯甲酸酯、氯丁醇及苯酚)。

在一些实施例中，该药物组合物包含作为赋形剂的黏合剂。合适粘合剂的非限制性实例包含淀粉、预胶凝淀粉、明胶、聚乙烯基吡咯烷酮、纤维素、甲基纤维素、羧甲基纤维素钠、乙基纤维素、聚丙烯酰胺、聚乙烯基噁唑烷酮、聚乙烯醇、C₁₂-C₁₈脂肪酸醇、聚乙二醇、多元醇、糖、寡糖及其组合。

在一些实施例中，该药物组合物包含作为赋形剂的润滑剂。合适润滑剂的非限制性实例包含硬脂酸镁、硬脂酸钙、硬脂酸锌、氢化植物油、sterotex(氢化蓖麻油)、聚氧乙烯单硬脂酸酯、滑石粉、聚乙二醇、苯甲酸钠、月桂基硫酸钠、月桂基硫酸镁及轻质矿物油。

在一些实施例中，该药物组合物包括分散增强剂作为赋形剂。合适分散剂的非限制性实例包含淀粉、海藻酸、聚乙烯基吡咯烷酮、瓜尔胶、高岭土、膨润土、经纯化木质纤维素、羟乙酸淀粉钠、同晶型硅酸盐及微晶纤维素(作为高HLB乳化剂表面活性剂)。

在一些实施例中，该药物组合物包含作为赋形剂的崩解剂。在一些实施例中，崩解剂是非泡腾崩解剂。合适非泡腾崩解剂的非限制性实例包含淀粉(例如玉米淀粉、马铃薯淀粉、其预胶凝及改性淀粉)、甜味剂、黏土(例如膨润土)、微晶纤维素、海藻酸盐、羟乙酸淀粉钠、树胶(例如琼脂、瓜尔胶、刺槐豆胶、刺梧桐胶、果胶及黄蓍胶)。在一些实施例中，崩解剂是泡腾崩解剂。合适泡腾崩解剂的非限制性实例包含碳酸氢钠与柠檬酸的组合，以及碳酸氢钠与酒石酸的组合。

在一些实施例中，该药物组合物是食品(例如食物或饮料)，例如健康食物或饮料、婴儿用食物或饮料、用于孕妇、运动员、老年人或其他特定人群的食物或饮料、功能食物、饮料、用于指定健康应用的食物或饮料、膳食补充剂、患者用食物或饮料或动物饲料。食物及饮料的具体实例包含多种饮料，例如果汁、清凉饮料、茶饮料、饮料制剂、果冻饮料及功能饮料；酒精性饮料，例如啤酒；含有碳水化合物的食物，例如大米食品、面条、面包及面团；膏产品，例如鱼火腿、香肠、海鲜膏产品；蒸煮袋产品，例如咖喱、敷有厚淀粉酱的食品及中国炖汤；汤；乳制产品，例如乳液、乳制饮料、冰激凌、奶酪及酸乳；发酵产品，例如发酵豆瓣酱膏、酸乳、发酵饮料及泡菜；豆产品；多种糖果产品，包含饼干、曲奇等；冰糖、口香糖、软糖；冷甜点，包含果胶、焦糖布丁及速冻点心；速熟食物，例如速溶汤料及速溶大豆汤料；可微波食物；等等。另外，实例还包含以粉剂、粒剂、锭剂、胶囊、液体、膏及果胶的形式制得的健康食物及饮料。

在一些实施例中，该药物组合物是用于动物(包括人类)的食品。除人类外的动物无特定限制，且该组合物可用于各种牲畜、家禽、宠物、实验动物，及类似物。动物的具体实例包括猪、牛、马、绵羊、山羊、鸡、野鸭、鸵鸟、家鸭、狗、猫、兔、仓鼠、小鼠、大鼠、猴，及类似物，但这些动物不限于此。

剂型

本文还提供了包含普雷沃菌属细菌的剂型，例如，用于治疗或预防T_H2介导的病症(例如特应性皮炎和/或食物过敏)的方法。可以将包含普雷沃菌属细菌的药物组合物配制成固体剂型，例如用于口服施用。该固体剂型可包含一种或多种赋形剂，例如药学上可接受的赋形剂。该固体剂型的普雷沃菌属细菌可以为分离的普雷沃菌属细菌。任选地，该固体剂型的普雷沃菌属细菌可以为冻干的细菌。任选地，该固体剂型的普雷沃菌属细菌是活的细菌。任选地，该固体剂型的普雷沃菌属细菌是γ照射的细菌。该固体剂型可以包含片剂、微型片剂、胶囊、丸剂或粉剂；或这些形式的组合(例如，胶囊中包含的微型片剂)。

在某些实施例中，本文提供的药物组合物被制备为包含普雷沃菌属细菌和药学上可接受的载体的固体剂型。

在一些实施例中，该固体剂型包含胶囊。该胶囊可以包含肠溶衣。该胶囊可以是00号、0号、1号、2号、3号、4号或5号胶囊。该胶囊可包含普雷沃菌属细菌粉剂(例如冻干的普雷沃菌属细菌)。

在一些实施例中，本文所述的固体剂型可以是，例如片剂或微型片剂。在一些实施例中，多个小片剂可以在胶囊中(例如，装入其中)。

在一些实施例中，该固体剂型包含片剂(>4mm)(例如5mm-17mm)。例如，该片剂是5mm、6mm、7mm、8mm、9mm、10mm、11mm、12mm、13mm、14mm、15mm、16mm或17mm片剂。如本领域中已知的，该尺寸是指片剂的直径。如本文所用，该片剂的尺寸是指在应用肠溶衣之前的片剂的尺寸。

在一些实施例中，该固体剂型包含微型片剂。该微型片剂的尺寸范围为1mm-4mm。例如，该微型片剂可以是1mm微型片剂、1.5mm米微型片剂、2mm微型片剂、3mm微型片剂或4mm微型片剂。如本领域中已知的，该尺寸是指微型片剂的直径。如本文所用，该微型片剂的尺寸是指在应用肠溶衣之前的微型片剂的尺寸。

该微型片剂可以是在胶囊中。该胶囊可以是00号、0号、1号、2号、3号、4号或5号胶囊。包含微型片剂的胶囊可以包含单层包衣，例如非肠溶衣，如HPMC(羟丙基甲基纤维素)或明胶。该微型片剂可以放在胶囊内：胶囊内的微型片剂的数量将取决于胶囊的尺寸和微型片剂的尺寸。例如，0号胶囊可容纳31-35(平均33)个3mm的微型片剂。

本文所述的固体剂型(例如片剂或微型片剂)可以是肠溶包衣的。

该固体剂型可以包含包衣。该固体剂型可以包含单层包衣，例如肠溶衣，例如基于Eudragit的包衣，例如EUDRAGIT L30 D-55、柠檬酸三乙酯和滑石粉。该固体剂型可包含两层包衣。例如，内包衣可以包含例如EUDRAGIT L30 D-55、柠檬酸三乙酯、滑石粉、无水柠檬酸和氢氧化钠，而外包衣可以包含例如EUDRAGIT L30 D-55、柠檬酸三乙酯和滑石粉。EUDRAGIT是各种基于聚甲基丙烯酸酯的共聚物的商标名称。它包括基于甲基丙烯酸和甲基丙烯酸/丙烯酸酯或其衍生物的阴离子、阳离子和中性共聚物。Eudragit是玻璃化转变温度在9℃至>150℃之间的非晶态聚合物。Eudragit是不可生物降解、不可吸收和无毒的。阴离子Eudragit L在pH>6时溶解并用于肠溶衣，而在pH>7时可溶解的Eudragit S用于结肠靶向。具有季铵基团的Eudragit RL和RS是不溶于水但可膨胀/可渗透的聚合物，适用于缓释膜包衣应用。在pH≥5时不溶的阳离子Eudragit E可防止药物在唾液中释放。

固体剂型(例如胶囊)可包含单层包衣，例如非肠溶衣，如HPMC(羟丙基甲基纤维素)或明胶。

可以将包含普雷沃菌属细菌的药物组合物配制成悬浮液，例如用于口服施用或注射。注射施用包括静脉内(IV)、肌内(IM)及皮下(SC)施用。对于悬浮液，普雷沃菌属细菌可以在缓冲液中，例如药学上可接受的缓冲液，例如盐水或PBS中。该悬浮液可包含一种或多种赋形剂，例如药学上可接受的赋形剂。该悬浮液可包含，例如蔗糖或葡萄糖。该悬浮液中的普雷沃菌属细菌可以为分离的普雷沃菌属细菌。任选地，该悬浮液中的普雷沃菌属细菌可以为冻干的细菌。任选地，该固体剂型的普雷沃菌属细菌是活的细菌。任选地，该悬浮液中的普雷沃菌属细菌可以经γ照射。

剂量

对于向人类受试者口服施用，普雷沃菌属细菌的剂量可以是，例如约2x10⁶至约2x10¹⁶个颗粒。该剂量可以是，例如约1x10⁷至约1x10¹⁵、约1x10⁸至约1x10¹⁴、约1x10⁹至约1x10¹³、约1x10¹⁰至约1x10¹⁴或约1x10⁸至约1x10¹²个颗粒。该剂量可以是，例如约2x10⁶、约2x10⁷、约2x10⁸、约2x10⁹、约1x10¹⁰、约2x10¹⁰、约2x10¹¹、约2x10¹²、约2x10¹³、约2x10¹⁴或约1x10¹⁵个颗粒。该剂量可以是例如约2x10¹⁴个颗粒。该剂量可以是例如约2x10¹²个颗粒。该剂量可以是例如约2x10¹⁰个颗粒。该剂量可以是例如约1x10¹⁰个颗粒。颗粒计数可以，例如通过NTA确定。

对于向人类受试者口服施用，普雷沃菌属细菌的剂量可以，例如基于总蛋白。该剂量可以是例如约5mg至约900mg总蛋白。该剂量可以是例如约20mg至约800mg、约50mg至约700mg、约75mg至约600mg、约100mg至约500mg、约250mg至约750mg或约200mg至约500mg总蛋白。该剂量可以是，例如约10mg、约25mg、约50mg、约75mg、约100mg、约150mg、约200mg、约250mg、约300mg、约400mg、约500mg、约600mg或约750mg的总蛋白。该剂量可以是，例如约10mg总蛋白。总蛋白可以，例如通过布拉德福德测定或通过BCA测定来确定。

对于通过注射(例如静脉内施用)向人类受试者施用，普雷沃菌属细菌的剂量可以是，例如约1x10⁶至约1x10¹⁶个颗粒。该剂量可以是，例如约1x10⁷至约1x10¹⁵、约1x10⁸至约1x10¹⁴、约1x10⁹至约1x10¹³、约1x10¹⁰至约1x10¹⁴或约1x10⁸至约1x10¹²个颗粒。该剂量可以是，例如约2x10⁶、约2x10⁷、约2x10⁸、约2x10⁹、约1x10¹⁰、约2x10¹⁰、约2x10¹¹、约2x10¹²、约2x10¹³、约2x10¹⁴或约1x10¹⁵个颗粒。该剂量可以是例如约1x10¹⁵个颗粒。该剂量可以是例如约2x10¹⁴个颗粒。该剂量可以是例如约2x10¹³个颗粒。颗粒计数可以，例如通过NTA确定。

对于通过注射施用(例如静脉内施用)，普雷沃菌属细菌的剂量可以是，例如约5mg至约900mg总蛋白。该剂量可以是例如约20mg至约800mg、约50mg至约700mg、约75mg至约600mg、约100mg至约500mg、约250mg至约750mg或约200mg至约500mg总蛋白。该剂量可以是，例如约10mg、约25mg、约50mg、约75mg、约100mg、约150mg、约200mg、约250mg、约300mg、约400mg、约500mg、约600mg或约750mg的总蛋白。该剂量可以是，例如约700mg总蛋白。该剂量可以是，例如约350mg总蛋白。该剂量可以是，例如约175mg总蛋白。总蛋白可以，例如通过布拉德福德测定或通过BCA测定来确定。

在某些实施例中，该药物组合物(例如，每天一次或两次施用的总剂量的组合物)包含至少1x10¹⁰个总细胞(例如，至少1x10¹⁰个总细胞、至少2x10¹⁰个总细胞、至少3x10¹⁰个总细胞、至少4x10¹⁰个总细胞、至少5x10¹⁰个总细胞、至少6x10¹⁰个总细胞、至少7x10¹⁰个总细胞、至少8x10¹⁰个总细胞、至少9x10¹⁰个总细胞、至少1x10¹¹个总细胞)的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含不超过9x10¹¹个总细胞(例如，不超过1x10¹⁰个总细胞、不超过2x10¹⁰个总细胞、不超过3x10¹⁰个总细胞、不超过4x10¹⁰个总细胞、不超过5x10¹⁰个总细胞、不超过6x10¹⁰个总细胞、不超过7x10¹⁰个总细胞、不超过8x10¹⁰个总细胞、不超过9x10¹⁰个总细胞、不超过1x10¹¹个总细胞、不超过2x10¹¹个总细胞、不超过3x10¹¹个总细胞、不超过4x10¹¹个总细胞、不超过5x10¹¹个总细胞、不超过6x10¹¹个总细胞、不超过7x10¹¹个总细胞、不超过8x10¹¹个总细胞)的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约6x10⁹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约1.6x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约8x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约1.6x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约3.2x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约1.6x10¹⁰至约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约1.6x10¹⁰至约1.6x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约8x10¹⁰至约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，该药物组合物包含约1.6x10¹¹至约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌。

在某些实施例中，本文提供了包含普雷沃菌属细菌的固体剂型。在一些实施例中，该固体剂型包含肠溶衣。在一些实施例中，该固体剂型是胶囊，例如肠溶胶囊。在一些实施例中，每个胶囊包含约8x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌。在一些实施例中，向受试者施用1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个胶囊，例如每天一次或两次。在一些实施例中，向受试者施用1个胶囊(例如，包含约8x10¹⁰个总细胞)，例如每天一次或两次。在一些实施例中，向受试者施用2个胶囊(例如，每个胶囊包含约8x10¹⁰个总细胞)，例如每天一次或两次。在一些实施例中，向受试者施用4个胶囊(例如，每个胶囊包含约8x10¹⁰个总细胞)，例如每天一次或两次。在一些实施例中，向受试者施用10个胶囊(例如，每个胶囊包含约8x10¹⁰个总细胞)，例如每天一次或两次。在一些实施例中，将胶囊中的普雷沃菌属细菌冻干(例如，以粉剂形式)。

在一些实施例中，该固体剂型包含胶囊。在一些实施例中，该胶囊是肠溶衣片剂。在一些实施例中，该胶囊包含约8x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个胶囊或多个胶囊的总剂量)。在一些实施例中，该胶囊包含约1.6x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个胶囊或多个胶囊的总剂量)。在一些实施例中，该胶囊包含约3.2x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个胶囊或多个胶囊的总剂量)。在一些实施例中，该胶囊包含约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个胶囊或多个胶囊的总剂量)。在一些实施例中，将胶囊中的普雷沃菌属细菌冻干(例如，以粉剂形式)。

在一些实施例中，该固体剂型包含片剂。在一些实施例中，该片剂是肠溶衣片剂。在一些实施例中，该肠溶片剂的直径为5mm至17mm。在一些实施例中，该片剂包含约8x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个片剂或多个片剂的总剂量)。在一些实施例中，该片剂包含约1.6x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个片剂或多个片剂的总剂量)。在一些实施例中，该片剂包含约3.2x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个片剂或多个片剂的总剂量)。在一些实施例中，该片剂包含约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，一个片剂或多个片剂的总剂量)。在一些实施例中，将该片剂中的普雷沃菌属细菌冻干。

在一些实施例中，该固体剂型包含微型片剂。在一些实施例中，该微型片剂是肠溶衣包衣的。在一些实施例中，该微型片剂的直径为1mm至4mm。在一些实施例中，该微型片剂(例如，肠溶包衣的微型片剂)是1mm的微型片剂、1.5mm的微型片剂、2mm的微型片剂、3mm的微型片剂或4mm的微型片剂。在一些实施例中，该固体剂型包含微型片剂，该微型片剂包含约8x10¹⁰个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，多个微型片剂的总剂量)。在一些实施例中，该固体剂型包含微型片剂，该微型片剂包含约1.6x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，多个微型片剂的总剂量)。在一些实施例中，该固体剂型包含微型片剂，该微型片剂包含约3.2x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，多个微型片剂的总剂量)。在一些实施例中，该固体剂型包含微型片剂，该微型片剂包含约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌(例如，多个微型片剂的总剂量)。在一些实施例中，将该微型片剂中的普雷沃菌属细菌冻干。在一些实施例中，该微型片剂(例如，肠溶包衣的微型片剂)包含在胶囊中。在一些实施例中，该胶囊是00号、0号、1号、2号、3号、4号或5号胶囊。在一些实施例中，该胶囊包含非肠溶衣(例如，HPMC(羟丙基甲基纤维素)或明胶)(例如，用非肠溶衣包衣的)。在一些实施例中，该胶囊包含非肠溶衣。在一些实施例中，该胶囊包含羟丙基甲基纤维素(HPMC)。在一些实施例中，该胶囊包含明胶。在一些实施例中，该包含约8x10¹¹个总细胞的普雷沃菌属细菌的微型片剂(例如，肠溶包衣的微型片剂)包含在一个或多个胶囊中，其中任选地，该胶囊包含HPMC。

γ-照射

粉剂(例如普雷沃菌属细菌的粉剂)可以在环境温度下以17.5kGy辐射单位进行γ照射。

冷冻生物量(例如普雷沃菌属细菌的冷冻生物量)可以在干冰存在下以25kGy辐射单位进行γ照射。

Th2介导的病症

可以通过普雷沃菌属细菌(例如，其药物组合物)治疗和/或预防的T_H2(2型)介导的病症包括涉及白介素(IL)-4、IL-5、IL-13、IL-19、IL-21、IL-31、IL-33和/或TSLP(胸腺基质淋巴细胞生成素)水平(例如，mRNA或蛋白质水平)增加的病症，例如在该疾病发作期间或病程中。

普雷沃菌属细菌(例如其药物组合物)可以降低白介素(IL)-4、IL-5、IL-13、IL-19、IL-21、IL-31、IL-33和/或TSLP(胸腺基质淋巴细胞生成素)水平(例如，mRNA或蛋白质水平)，例如，普雷沃菌属细菌(例如其药物组合物)造成与不施用(或施用之前)普雷沃菌属细菌(例如其药物组合物)的情况下的水平相比的降低。该药物组合物可将这些水平降低，例如降低约20％、降低约30％、降低约40％、降低约50％、降低约60％、降低约70％、降低约80％或降低约90％。

可以通过普雷沃菌属细菌(例如，其药物组合物)治疗和/或预防的T_H2介导的病症包括涉及IgG1、IgE和/或IgA水平(例如，mRNA或蛋白质水平)增加的病症，例如，在该疾病发作期间或病程中。

普雷沃菌属细菌(例如其药物组合物)可以降低白介素IgG1、IgE和/或IgA水平(例如，mRNA或蛋白质水平)，例如，普雷沃菌属细菌(例如其药物组合物)造成与不施用(或施用之前)普雷沃菌属细菌(例如其药物组合物)的情况下的水平相比的降低。该药物组合物可将这些水平降低，例如降低约20％、降低约30％、降低约40％、降低约50％、降低约60％、降低约70％、降低约80％或降低约90％。

T_H2介导的病症可包括哮喘、特应性皮炎、嗜酸性粒细胞性疾病或过敏(例如季节性过敏、宠物过敏或食物过敏)。该过敏可包括食物过敏、季节性过敏性鼻炎或宠物过敏。该食物过敏可包括花生过敏。该食物过敏可包括牛奶、鸡蛋、鱼、甲壳类水生动物、坚果、小麦或大豆过敏。该食物过敏可包括对食物抗原的过敏。该食物抗原可包括花生抗原。该食物过敏可包括对食物抗原的过敏，该食物抗原可包括牛奶、鸡蛋、鱼、甲壳类水生动物、坚果、小麦或大豆抗原。

一些特定的T_H2介导的病症在下文进一步详述。

过敏性鼻炎

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括过敏性鼻炎(即花粉热)。过敏性鼻炎发生在当过敏原引起鼻子炎症时。潜在的过敏原类型单独地或组合地包括花粉、宠物毛、皮屑、尘螨、霉菌、烟和香水。过敏性鼻炎的症状可单独地或组合地包括流鼻涕或鼻塞；眼睛、口腔、喉咙或皮肤发痒；打喷嚏；咳嗽；以及疲劳。

哮喘

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括哮喘(例如过敏性哮喘)。哮喘发生在当气道(例如肺部)发炎时。与本文公开内容有关的病症中包括的一种类型的哮喘是特应性哮喘。哮喘的症状可单独地或组合地包括咳嗽、喘息、呼吸急促和胸闷。

特应性皮炎

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括特应性皮炎(即湿疹)。特应性皮炎发生在当皮肤发炎时。它可以与过敏性鼻炎和/或哮喘一起发生。其症状可单独地或组合地包括皮肤干燥、发红、瘙痒、皮疹和长疮。

荨麻疹

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括荨麻疹(即麻疹)。荨麻疹发生在当皮肤出现红肿伤痕时。该病症可能是由归因于组胺的血浆渗漏出血管(例如由于过敏反应)引起的。荨麻疹的症状可单独地或组合地包括成批的伤痕、瘙痒和肿胀。

血管性水肿

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括血管性水肿(即，深部组织肿胀)。当肿胀在皮肤下时，其他方面与荨麻疹相似的病症可以归类为血管性水肿。该病症可能是由归因于组胺的血浆渗漏出血管(例如由于过敏反应)引起的。血管性水肿的症状可单独地或组合地包括眼睛、口腔、手、脚或喉咙的肿胀；呼吸有困难；和胃痉挛。

食物过敏

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括食物过敏。食物过敏发生在当食物(例如其过敏原)引起异常的免疫应答时。可能引起反应的典型食物类型包括蛋、奶、花生、坚果(例如核桃)、鱼、甲壳类水生动物、小麦和大豆。另外，种子(例如芝麻、芥末)、水果和大米也可能引起食物过敏。症状可单独地或组合地包括口腔瘙痒；麻疹；身体部位如面部肿胀；呼吸困难；腹部不适；和头晕。

昆虫诱导的过敏

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括昆虫诱导的过敏。由昆虫诱导的过敏发生在当免疫系统对昆虫的刺痛或叮咬作出反应时。可能引起这种反应的昆虫的典型类型包括黄蜂、蜜蜂、大黄蜂、胡蜂、蚂蚁、蚊子、臭虫、跳蚤和壁虱。

药物过敏

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括药物过敏。药物过敏是作为暴露于药物后的不良反应发生。可能引起这种反应的一些类型的药物包括青霉素、磺酰胺、抗惊厥药、阿司匹林和化学治疗药物。药物过敏症状可单独地或组合地包括发热、瘙痒、荨麻疹、皮疹、肿胀和呼吸急促。

过敏性反应

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括过敏性反应。过敏性反应发生在对食物、昆虫毒液或药物的反应严重时。它会影响整个身体，并且会改变呼吸、血压和心率。

嗜酸性粒细胞增多症

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括嗜酸性粒细胞增多症(例如原发性嗜酸性粒细胞增多症)。嗜酸性粒细胞增多症发生在当嗜酸性粒细胞计数在特定部位或外周血中超过一定阈值时。

对于这些T_H2介导的病症中的每一种，本文所述的用于治疗或预防此类病症的方法可导致所治疗的特定T_H2介导的病症的症状减轻、稳定或另一种改善，这些症状包括本文所述的那些。

另外的治疗剂

在某些方面，本文提供的方法包括单独或与另一种治疗剂组合向受试者施用本文所述的细菌和/或细菌组合物(例如，含有普雷沃菌属细菌的药物组合物)，例如用于治疗或预防T_H2介导的病症(如特应性皮炎和/或食物过敏)。该包含普雷沃菌属细菌的药物组合物可以，例如与抗炎剂组合施用。该抗炎剂可以是抗组胺药(例如西替利嗪、非索非那定或苯海拉明)、肾上腺素、皮质类固醇(口服或局部用)(戊酸倍他米松、氢化可的松或泼尼松)、钙调神经磷酸酶抑制剂(例如他克莫司或吡美莫司)、环孢菌素、干扰素γ-1b或度匹鲁单抗。可以使用的局部用皮质类固醇包括：二丙酸阿氯米松、二丙酸倍他米松、戊酸倍他米松、丙酸氯倍他索、地奈德、去羟米松、醋酸氟轻松、氟轻松、丙酸氟替卡松、丙酸乌倍他索、氢化可的松、丁酸氢化可的松、戊酸氢化可的松、糠酸莫美他松、醋酸曲安奈德和二醋酸曲安奈德。

在一些实施例中，可以以任何顺序将含普雷沃菌属细菌的药物组合物和其他疗法施用于受试者。在一些实施例中，含普雷沃菌属细菌的药物组合物和其他疗法联合施用。

在一些实施例中，在施用另外的治疗剂之前(例如之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小时或之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天之前)向受试者施用含普雷沃菌属细菌的药物组合物。在一些实施例中，在施用另外的治疗剂之后(例如之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小时或之后至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天之后)向受试者施用含普雷沃菌属细菌的药物组合物。在一些实施例中，向受试者同时或几乎同时(例如施用在彼此一小时内进行)施用含普雷沃菌属细菌的药物组合物和该另外的治疗剂。在一些实施例中，在施用含普雷沃菌属细菌的药物组合物之前(例如，至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小时之前或至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天之前)向受试者施用抗生素。在一些实施例中，在施用含普雷沃菌属细菌的药物组合物之后(例如，至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小时之后或至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天之后)向受试者施用抗生素。在一些实施例中，向受试者同时或几乎同时(例如施用在彼此一小时内进行)施用含普雷沃菌属细菌的药物组合物和抗生素。

在某些实施例中，受试者可经受手术。手术类型包括但不限于预防性手术、诊断性或分期性手术、治愈性手术及姑息性手术。

在一些实施例中，额外治疗剂是抗生素。“抗生素”在广义上是指能够抑制或预防细菌感染的化合物。抗生素可以诸多方式(包含根据其用于特定感染的用途、其作用机制、其生物可用性或其靶微生物范围(例如革兰氏阴性细菌对革兰氏阳性细菌、好氧细菌对厌氧细菌等))进行分类且可使用这些方式来杀死宿主的特定区域(“生态位”)中的特定细菌(Leekha等人,2011.General Principles of Antimicrobial Therapy[抗微生物疗法的一般原则].Mayo Clin Proc.[梅欧医院院刊]86(2):156-167)。在某些实施例中，可使用抗生素来选择性靶向特定生态位的细菌。在一些实施例中，在细菌治疗之后施用抗生素。在一些实施例中，在细菌治疗之后施用抗生素以去除植入。

在一些方面，可基于杀细菌或细菌抑制性质来选择抗生素。杀细菌抗生素包含破坏细胞壁(例如β-内酰胺)、细胞膜(例如达托霉素(daptomycin))或细菌DNA(例如氟喹诺酮(fluoroquinolone))的作用机制。细菌抑制剂抑制细菌复制且包含磺酰胺、四环素(tetracycline)及巨环内酯并通过抑制蛋白质合成来发挥作用。另外，尽管一些药物可在某些生物体中具有杀细菌性且在其他生物体中具有细菌抑制性，但知晓靶生物体使得本领域技术人员可选择具有适当性质的抗生素。在某些治疗条件中，细菌抑制抗生素抑制杀细菌抗生素的活性。因此，在某些实施例中，并不组合杀细菌抗生素及细菌抑制抗生素。

抗生素包括但不限于氨基糖苷、安莎霉素(ansamycin)、碳头孢烯(carbacephem)、碳青霉烯(carbapenem)、头孢菌素(cephalosporin)、糖肽、林可酰胺(lincosamide)、脂肽、巨环内酯、单酰胺菌素(monobactam)、硝基呋喃、噁唑烷酮、青霉素(penicillin)、多肽抗生素、喹诺酮(quinolone)、氟喹诺酮、磺酰胺、四环素及抗分枝杆菌化合物及其组合。

氨基糖苷包括但不限于阿米卡星(Amikacin)、庆大霉素(Gentamicin)、卡那霉素(Kanamycin)、新霉素(Neomycin)、奈替米星(Netilmicin)、妥布霉素(Tobramycin)、巴龙霉素(Paromomycin)及大观霉素(Spectinomycin)。氨基糖苷可有效抵抗例如革兰氏阴性细菌(例如大肠杆菌、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)及土伦病弗朗西斯氏菌(Francisella tularensis))且抵抗某些好氧细菌，但对于专性/兼性厌氧菌具有较小有效性。据信，氨基糖苷结合至细菌30S或50S核糖体亚基，由此抑制细菌蛋白合成。

安莎霉素包括但不限于格尔德霉素(Geldanamycin)、除莠霉素(Herbimycin)、利福霉素(Rifamycin)及曲张链菌素(Streptovaricin)。据信，格尔德霉素及除莠霉素抑制或改变热休克蛋白90的功能。

碳头孢烯包括但不限于氯碳头孢(Loracarbef)。据信，碳头孢烯抑制细菌细胞壁合成。

碳青霉烯包括但不限于厄他培南(Ertapenem)、多尼培南(Doripenem)、亚胺培南(Imipenem)/西司他丁(Cilastatin)及美罗培南(Meropenem)。碳青霉烯作为宽谱抗生素对革兰氏阳性细菌及革兰氏阴性细菌均具有杀细菌性。据信，碳青霉烯抑制细菌细胞壁合成。

头孢菌素包括但不限于头孢羟氨苄(Cefadroxil)、头孢唑啉(Cefazolin)、头孢噻吩(Cefalotin)、头孢金素(Cefalothin)、头孢氨苄(Cefalexin)、头孢克洛(Cefaclor)、头孢孟多(Cefamandole)、头孢西丁(Cefoxitin)、头孢丙烯(Cefprozil)、头孢呋辛(Cefuroxime)、头孢克肟(Cefixime)、头孢地尼(Cefdinir)、头孢托仑(Cefditoren)、头孢哌酮(Cefoperazone)、头孢噻肟(Cefotaxime)、头孢泊肟(Cefpodoxime)、头孢他啶(Ceftazidime)、头孢布烯(Ceftibuten)、头孢唑肟(Ceftizoxime)、头孢曲松(Ceftriaxone)、头孢吡肟(Cefepime)、头孢他洛林酯(Ceftaroline fosamil)及头孢比普(Ceftobiprole)。所选头孢菌素可效抵抗例如革兰氏阴性细菌及革兰氏阳性细菌(包含假单胞菌(Pseudomonas))，某些头孢菌素可有效抵抗甲氧西林(methicillin)抗性金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)(MRSA)。据信，头孢菌素通过破坏细菌细胞壁的肽聚糖层的合成来抑制细菌细胞壁合成。

糖肽包括但不限于替考拉宁(Teicoplanin)、万古霉素(Vancomycin)及特拉万星(Telavancin)。糖肽可有效抵抗例如好氧及厌氧革兰氏阳性细菌，包扩MRSA和艰难梭菌(Clostridium difficile)。据信，糖肽通过破坏细菌细胞壁的肽聚糖层的合成来抑制细菌细胞壁合成。

林可酰胺包括但不限于克林达霉素(Clindamycin)及林可霉素(Lincomycin)。林可酰胺可有效抵抗例如厌氧细菌以及葡萄球菌属(Staphylococcus)及链球菌属(Streptococcus)。据信，林可酰胺结合至细菌50S核糖体亚基，由此抑制细菌蛋白合成。

脂肽包括但不限于达托霉素。脂肽可有效抵抗例如革兰氏阳性细菌。据信，脂肽结合至细菌膜并引起快速去极化。

巨环内酯包括但不限于阿奇霉素(Azithromycin)、克拉霉素(Clarithromycin)、地红霉素(Dirithromycin)、红霉素(Erythromycin)、罗红霉素(Roxithromycin)、醋竹桃霉素(Troleandomycin)、泰利霉素(Telithromycin)及螺旋霉素(Spiramycin)。巨环内酯可有效抵抗例如链球菌属及支原体属(Mycoplasma)。据信，巨环内酯结合至细菌或50S核糖体亚基，由此抑制细菌蛋白合成。

单酰胺菌素包括但不限于胺曲南(Aztreonam)。单酰胺菌素可有效抵抗例如革兰氏阴性细菌。据信，单酰胺菌素通过破坏细菌细胞壁的肽聚糖层的合成来抑制细菌细胞壁合成。

硝基呋喃包括但不限于呋喃唑酮(Furazolidone)及呋喃妥因(Nitrofurantoin)。

噁唑烷酮包括但不限于利奈唑胺(Linezolid)、泼斯唑来(Posizolid)、雷得唑来(Radezolid)及特地唑胺(Torezolid)。据信，噁唑烷酮是蛋白质合成抑制剂。

青霉素包括但不限于阿莫西林(Amoxicillin)、氨苄西林(Ampicillin)、阿洛西林(Azlocillin)、羧苄青霉素(Carbenicillin)、氯噻青霉素(Cloxacillin)、二氯噻青霉素(Dicloxacillin)、氟氯西林(Flucloxacillin)、美洛西林(Mezlocillin)、甲氧西林、萘夫西林(Nafcillin)、苯唑西林(Oxacillin)、青霉素G、青霉素V、哌拉西林(Piperacillin)、替莫西林(Temocillin)及替卡西林(Ticarcillin)。青霉素可有效抵抗例如革兰氏阳性细菌、兼性厌氧菌(例如链球菌属、包柔氏螺旋体属(Borrelia)及密螺旋体属(Treponema))。据信，青霉素通过破坏细菌细胞壁的肽聚糖层的合成来抑制细菌细胞壁合成。

青霉素组合包括但不限于阿莫西林/克拉维酸盐(clavulanate)、氨苄西林/舒巴坦(sulbactam)、哌拉西林/三唑巴坦(tazobactam)及替卡西林/克拉维酸盐。

多肽抗生素包括但不限于杆菌肽(Bacitracin)、黏菌素(Colistin)及多黏菌素(Polymyxin)B及E。多肽抗生素可有效抵抗例如革兰氏阴性细菌。据信，某些多肽抗生素抑制涉及细菌细胞壁的肽聚糖层的合成的焦磷酸异戊二烯基酯，而其他多肽抗生素通过置换细菌相对离子来去稳定细菌外膜。

喹诺酮及氟喹诺酮包括但不限于环丙沙星(Ciprofloxacin)、依诺沙星(Enoxacin)、加替沙星(Gatifloxacin)、吉米沙星(Gemifloxacin)、左氧氟沙星(Levofloxacin)、洛美沙星(Lomefloxacin)、莫西沙星(Moxifloxacin)、萘啶酮酸(Nalidixic acid)、诺氟沙星(Norfloxacin)、氧氟沙星(Ofloxacin)、曲伐沙星(Trovafloxacin)、格帕沙星(Grepafloxacin)、司帕沙星(Sparfloxacin)及替马沙星(Temafloxacin)。喹诺酮/氟喹诺酮可有效抵抗例如链球菌属及奈瑟菌属(Neisseria)。据信，喹诺酮/氟喹诺酮抑制细菌DNA旋转酶或拓扑异构酶IV，由此抑制DNA复制及转录。

磺酰胺包括但不限于磺胺米隆(Mafenide)、磺胺醋酰(Sulfacetamide)、磺胺嘧啶(Sulfadiazine)、磺胺嘧啶银、磺胺地索辛(Sulfadimethoxine)、磺胺甲噻二唑(Sulfamethizole)、磺胺甲噁唑(Sulfamethoxazole)、磺胺亚胺基(Sulfanilimide)、柳氮磺胺吡啶(Sulfasalazine)、磺胺异噁唑(Sulfisoxazole)、甲氧苄啶-磺胺甲噁唑(Trimethoprim-Sulfamethoxazole)(复方磺胺甲噁唑(Co-trimoxazole))及磺酰胺基柯衣汀(Sulfonamidochrysoidine)。据信，磺酰胺通过竞争性抑制二氢蝶酸合成酶来抑制叶酸合成，由此抑制核酸合成。

四环素类包括但不限于地美环素(Demeclocycline)、强力霉素(Doxycycline)、米诺环素(Minocycline)、土霉素(Oxytetracycline)及四环素。四环素可有效抵抗例如革兰氏阴性细菌。据信，四环素结合至细菌30S核糖体亚基，由此抑制细菌蛋白合成。

抗分枝杆菌化合物包括但不限于氯法齐明(Clofazimine)、胺苯砜(Dapsone)、卷曲霉素(Capreomycin)、环丝氨酸(Cycloserine)、乙胺丁醇(Ethambutol)、乙硫异烟酰胺(Ethionamide)、异烟酸肼(Isoniazid)、吡嗪酰胺(Pyrazinamide)、利福平(Rifampicin)、利福布汀(Rifabutin)、利福喷丁(Rifapentine)及链霉素(Streptomycin)。

合适的抗生素还包含胂凡纳明(arsphenamine)、氯霉素(chloramphenicol)、磷霉素(fosfomycin)、夫西地酸(fusidic acid)、甲硝唑(metronidazole)、莫匹罗星(mupirocin)、平板霉素(platensimycin)、奎奴普汀(quinupristin)/达福普汀(dalfopristin)、替吉环素(tigecycline)、替硝唑(tinidazole)、甲氧苄啶-阿莫西林(trimethoprim amoxicillin)/克拉维酸盐、氨苄西林/舒巴坦、安福霉素-利托菌素(amphomycin ristocetin)、阿奇霉素、杆菌肽、卜福林(buforin)II、卡波霉素(carbomycin)、杀菌肽(cecropin)Pl、克拉霉素、红霉素、呋喃唑酮、夫西地酸、夫西地钠、短杆菌素(gramicidin)、亚胺培南、吲哚菌素(indolicidin)、交沙霉素(josamycin)、马盖纳尼(magainan)II、甲硝唑(metronidazole)、硝基咪唑、米卡霉素(mikamycin)、变链素(mutacin)B-Ny266、变链素B-JHl 140、变链素J-T8、乳链球菌素(nisin)、乳链球菌素A、新生霉素(novobiocin)、竹桃霉素(oleandomycin)、奥斯立星(ostreogrycin)、哌拉西林/三唑巴坦、普那霉素(pristinamycin)、雷莫拉宁(ramoplanin)、牛蛙皮肤抗菌肽(ranalexin)、罗伊氏素(reuterin)、利福昔明(rifaximin)、蔷薇霉素(rosamicin)、罗沙米星(rosaramicin)、大观霉素、螺旋霉素、葡萄霉素(staphylomycin)、链霉杀阳素(streptogramin)、链霉杀阳素A、协同菌素(synergistin)、牛磺罗定(taurolidine)、替考拉宁、泰利霉素、替卡西林/克拉维酸(clavulanic acid)、三乙酰基竹桃霉素(triacetyloleandomycin)、泰洛星(tylosin)、短杆菌酪肽(tyrocidin)、短杆菌素(tyrothricin)、万古霉素、维马霉素(vemamycin)及维吉霉素(virginiamycin)。

在一些实施例中，该另外的疗法包括向受试者施用治疗性细菌(例如普雷沃菌属细菌)和/或治疗性细菌组合，从而可在受试者中重构健康微生物群系。在一些实施例中，治疗性细菌是益生菌细菌。

下面将进一步详细介绍一些特定的另外的疗法。

过敏性鼻炎

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括过敏性鼻炎，并且该另外的疗法包括可用于治疗过敏性鼻炎的药剂。此类药剂单独地或组合地包括皮质类固醇(例如泼尼松、甲基泼尼松龙、醋酸曲安奈德、倍他米松)、抗组胺药(例如阿伐西汀、阿利马嗪、安他唑啉、阿司咪唑、氮卓斯汀、贝托斯汀、比拉斯汀、溴马秦、溴苯那敏、卡比沙明、西替利嗪、氯环嗪、氯吡拉敏、氯苯那敏、克立马丁、赛克利嗪、赛庚啶、地氯雷他定、右溴苯那敏、右旋氯苯吡胺、茶苯海明、二甲茚定、苯海拉明、多西拉敏、依巴斯汀、非索非那定、羟嗪、酮替芬、左旋沙丁胺醇、左卡巴司汀、氯雷他定、氯苯甲嗪、美吡拉敏、咪唑斯汀、奥洛他定、邻甲苯海明、非尼拉敏、异丙嗪、奎非那定、卢帕他定、特非那定、曲吡那敏、曲普利定)、肥大细胞稳定剂(例如克罗莫林)、减充血剂(例如倍氯米松、布地奈德、环索奈德、地塞米松、麻黄素、氟尼松、氟替卡松、糠酸氟替卡松、丙酸氟替卡松、左甲苯丙胺、莫美他松、萘甲唑林、羟甲唑啉、苯肾上腺素、苯丙醇胺、泼尼松龙、环己丙甲胺、伪麻黄碱、辛弗林、四氢唑啉、硫氢可的松、曲马唑啉、曲安西龙、醋酸曲安西龙、丁苄唑啉)、白三烯受体拮抗剂(例如孟鲁司特、扎鲁司特、齐留通、MK-886、甲氯芬那酸钠)以及免疫治疗剂(例如含有过敏原本身的形式，含有抗体形式，如奥马珠单抗)。这些试剂通常也可以用于其他类型的过敏，这些过敏可以作为单一类型的过敏发生，或者可以与其他类型的过敏组合发生。

哮喘

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括哮喘(例如过敏性哮喘)，并且该另外的疗法包括可用于治疗哮喘的药剂。这些试剂单独地或组合地包括皮质类固醇、减充血剂(其中一些也是皮质类固醇)、肥大细胞稳定剂、白三烯修饰剂和本文提供的用于治疗过敏性鼻炎的免疫治疗剂。此外，对于哮喘，这些药剂还单独地或组合地包括β-激动剂(例如沙美特罗、福莫特罗、沙丁胺醇、左旋沙丁胺醇)、某些皮质酮&β-激动剂组合(例如氟替卡松-沙美特罗、布地奈德-福莫特罗、福莫特罗-莫美他松)、另外的免疫治疗剂(例如美泊利单抗、度匹鲁单抗、瑞利珠单抗和贝那利珠单抗)和某些其他药物(例如茶碱、异丙托铵)。这些试剂可以通过使用吸入器，作为注射剂(例如用于抗体形式)或作为药丸(例如作为用于过敏原免疫疗法的舌下片剂)来提供。

特应性皮炎

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括特应性皮炎，并且该另外的疗法包括可用于治疗特应性皮炎的药剂。此类药剂单独地或组合地包括本文提供的用于治疗过敏性鼻炎或哮喘的皮质类固醇(例如，泼尼松)和免疫治疗剂(例如，度匹鲁单抗)。此外，对于特应性皮炎，这些药剂还包括钙调神经磷酸酶抑制剂(例如他克莫司、吡美莫司)、某些补充剂(例如维生素D)、免疫抑制剂(例如环孢素、甲氨蝶呤、干扰素γ-1b、吗替麦考酚酯、硫唑嘌呤)和其他药物(例如，沙丁胺醇)。

荨麻疹

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括荨麻疹，并且该另外的疗法包括可用于治疗荨麻疹的药剂。此类药剂单独地或组合地包括本文提供的用于治疗过敏性鼻炎或哮喘的抗组胺药(例如苯海拉明、氯雷他定、非索非那定、西替利嗪、地氯雷他定)、皮质类固醇(例如泼尼松)、白三烯受体拮抗剂和免疫治疗剂(例如奥马珠单抗)。此外，对于荨麻疹，这些药物还可以包括其他抗组胺药(例如雷尼替丁、西咪替丁、法莫替丁)、免疫抑制剂(例如环孢素、他克莫司、西罗莫司、麦考酚酯)、消炎药(例如氨苯砜、柳氮磺胺吡啶、羟氯喹)、皮质类固醇(例如可的松)和激素(例如肾上腺素)。

血管性水肿

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括血管性水肿，并且另外的疗法包括可用于治疗血管性水肿的药剂。此类药剂单独地或组合地包括本文提供的用于治疗过敏性鼻炎或哮喘的抗组胺药(例如苯海拉明、氯雷他定、非索非那定、西替利嗪、地氯雷他定)、皮质类固醇(例如泼尼松)、白三烯受体拮抗剂和免疫治疗剂(例如奥马珠单抗)。此外，对于血管性水肿，这些药物还可以包括其他抗组胺药(例如雷尼替丁、西咪替丁、法莫替丁)、免疫抑制剂(例如环孢素、他克莫司、西罗莫司、麦考酚酯)、消炎药(例如氨苯砜、柳氮磺胺吡啶、羟氯喹)、皮质类固醇(例如可的松)和激素(例如肾上腺素)。

食物过敏

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括食物过敏，并且该另外的疗法包括可用于治疗食物过敏的药剂。此类药剂单独地或组合地包括肾上腺素、抗组胺药、糖皮质激素类固醇、免疫治疗剂(例如含有过敏原本身的形式，含有抗体形式，如奥马珠单抗)。

昆虫诱导的过敏

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括昆虫诱导的过敏，并且该另外的疗法包括可用于治疗昆虫诱导的过敏的药剂。此类试剂包括抗组胺药。

药物过敏

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括药物过敏，并且该另外的疗法包括可用于治疗药物过敏的药剂。此类药剂单独地或组合地包括抗组胺药(例如苯海拉明)和皮质类固醇。

过敏性反应

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括过敏性反应，并且另外的疗法包括可用于治疗过敏性反应的药剂。此类试剂包括可用于治疗因食物、昆虫毒液引起的过敏的相同试剂，或可用于治疗过敏性反应的药物(例如肾上腺素)。

嗜酸性粒细胞增多症

在一些实施例中，该T_H2介导的病症包括嗜酸性粒细胞增多症(例如原发性嗜酸性粒细胞增多症)，并且该另外的疗法包括可用于治疗嗜酸性粒细胞增多症的药剂。此类药剂包括皮质类固醇(例如，泼尼松)。

对于这些T_H2介导的病症中的每一种，在一些实施例中，除了这些提供的另外的疗法中的一种或多种之外，还可以施用所公开的药物组合物。例如，可以将该药物组合物和另外的疗法的药剂共施用。

在下调涉及T_H2细胞激活的途径中可能有用的另外的药剂包括美泊利单抗、乐瑞吉珠单抗、曲妥珠单抗、GSK3772847、RG6149/AMG282、ANB020、OC000459、BI 671800、AZD1981、AS1517499、YM-341619、AS1810722、SB010、雷西莫特、咪喹莫特和CYT003。

施用

在某些方面中，本文提供向受试者递送本文描述的含有普雷沃菌属细菌的药物组合物的方法。在本文提供的方法的一些实施例中，该组合物与另外的治疗剂(例如，抗炎剂)的施用结合施用。在一些实施例中，将普雷沃菌属细菌与另外的治疗剂共配制于药物组合物中。在一些实施例中，将普雷沃菌属细菌(例如，其药物组合物)与另外的治疗剂共施用。在一些实施例中，在施用普雷沃菌属细菌(例如，其药物组合物)之前(例如约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50或55分钟之前，约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22或23小时之前，或约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14天之前)，向受试者施用另外的治疗剂。在一些实施例中，在施用普雷沃菌属细菌(例如，其药物组合物)之后(例如约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50或55分钟之后，约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22或23小时之后，或约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14天之后)，向受试者施用另外的治疗剂。在一些实施例中，使用相同递送模式来递送普雷沃菌属细菌(例如，其药物组合物)和另外的治疗剂。在一些实施例中，使用不同递送模式来施用普雷沃菌属细菌(例如，其药物组合物)和另外的治疗剂。例如，在一些实施例中，普雷沃菌属细菌(例如，其药物组合物)经口施用，而另外的治疗剂经由注射施用(例如，静脉内和/或肌内注射)。

在某些实施例中，本文所述的药物组合物和剂型可以与任何其他常规治疗结合施用。这些治疗可在需要和/或指示时应用且可发生于施用本文所述的药物组合物和剂型之前、同时或之后。

剂量方案可为各种方法及量中的任一者，且可通过本领域技术人员根据已知临床因素来确定。如医学技术中已知，任一患者的剂量可取决于许多因素，包含受试者物种、大小、体表面积、年龄、性别、免疫活性及总体健康状况、有待施用的特定微生物、持续时间及施用途径、疾病种类及阶段及其他化合物(例如同时施用的药物)。除上述因素外，这些水平可受微生物感染性及微生物性质影响，如可由本领域技术人员所测定。可根据剂型、施用途径、病症的程度或阶段等来适当地设定或调节本文所述药物组合物的剂量。例如，药剂的一般有效剂量范围可为0.01mg/kg体重/天至1000mg/kg体重/天、0.1mg/kg体重/天至1000mg/kg体重/天、0.5mg/kg体重/天至500mg/kg体重/天、1mg/kg体重/天至100mg/kg体重/天或5mg/kg体重/天至50mg/kg体重/天。有效剂量可为0.01、0.05、0.1、0.5、1、2、3、5、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、200、500或1000mg/kg体重/天或更高，但剂量并不限于此。

在一些实施例中，施用于受试者的剂量足以预防病症、延迟其发作、或减慢或停止其进展或预防病症的复发。本领域技术人员将认识到，剂量将取决于多种因素，包含所采用特定化合物的强度以及受试者的年龄、物种、病症及体重。还根据以下因素来确定剂量大小：施用途径、时机及频率以及可伴随施用特定化合物的任何不良副作用的存在、性质及程度及期望的生理学效果。

可通过本领域技术人员已知的常规范围探测技术来确定合适的剂量及剂量方案。通常，以较小剂量开始治疗，该剂量小于化合物的最佳剂量。然后，以小增量增加剂量直至达到该状况下的最佳效果为止。有效剂量及治疗方案可通过常规及常规方式来确定，例如，其中在实验室动物中以低剂量开始且然后增加剂量，同时监测效果，且还系统地改变剂量方案。通常使用动物研究来测定每公斤重量的生物活性药剂的最大可耐受剂量(“MTD”)。本领域技术人员通常在其他物种(包含人类)中外推剂量以达到功效，同时避免毒性。

根据上文，在治疗应用中，与影响所选剂量的其他因素相比，用于本发明的活性剂的剂量尤其取决于以下因素有所变化：活性剂、年龄、体重及接受患者的临床状况及施用疗法的临床医师或从业人员的经历及判断。通常，该剂量应足以导致病症进展减慢，并优选地引起病症的消退。

分开施用可包含两次或更多次施用(例如剂量)中的任一数量，包含2、3、4、5或6次施用。根据监测治疗方法技术中已知的方法及本文提供的其他监测方法，本领域技术人员可易于确定有待实施的施用数量或实施一个或多个额外施用的需求性。在一些实施例中，这些剂量可相隔至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天或1、2、3、或4周。因此，本文提供的方法包含向受试者提供一个或多个细菌施用的方法，其中可通过监测受试者且基于监测结果测定是否提供一个或多个额外施用来测定施用数量。可基于各种监测结果来决定是否提供一个或多个额外施用，包括但不限于受试者的抗细菌抗体效价受试者的整体健康状况和/或受试者体重。

施用间的时间段可为各个时间段中的任一者。施用间的时间段可随各种因素中的任一者而变化，包含监测步骤(如关于施用数量所描述)、受试者建立免疫应答的时间段和/或受试者自正常组织或自肠道清除细菌的时间段。在一个实例中，时间段可随受试者建立免疫应答的时间段而变化；例如，时间段可大于受试者建立免疫应答的时间段，例如大于约一周、大于约10天、大于约两周或大于约一个月；在另一个实例中，时间段可小于受试者建立免疫应答的时间段，例如小于约一周、小于约十天、小于约两周或小于约一个月。在另一个实例中，时间段可随受试者自正常组织或自肠道清除细菌的时间段而变化；例如，时间段可大于受试者自正常组织或自肠道清除细菌的时间段，例如大于约一天、大于约两天、大于约三天、大于约五天或大于约一周。

在一些实施例中，另外的治疗剂与本文描述的普雷沃菌属细菌(例如其药物组合物)的组合递送减少了该另外的治疗剂的不良反应和/或改善该另外的治疗剂的功效。

本文描述的额外治疗剂的有效剂量是针对特定患者(例如受试者)、组合物及施用模式有效达成所需治疗剂反应且对患者的毒性最小的治疗剂的量。可使用本文所述的方法来鉴别有效剂量水平且将取决于多种药物动力学因素，包含所施用特定组合物的活性、施用途径、施用时间、所采用特定化合物的排泄速率、治疗持续时间、与所采用特定组合物组合使用的其他药物、化合物和/或材料、所治疗患者的年龄、性别、体重、病症、总体健康状况及先前医学史以及医学技术中熟知的类似因素。一般而言，另外的疗法的有效剂量将是治疗剂的量，其为有效产生治疗效应的最低剂量。通常这样的有效剂量将取决于上文所述的这些因素。

额外治疗的毒性是受试者在治疗期间及治疗之后经受的不利效应的水平。与治疗毒性相关的不良事件包括但不限于：腹痛、酸消化不良、酸回流、过敏反应、秃发、全身性过敏性反应、贫血、焦虑、食欲不振、关节痛、乏力、运动失调、氮质血症、失去平衡、骨痛、出血、血凝块、低血压、血压升高、呼吸困难、支气管炎、淤血、白血球计数降低、红血球计数降低、血小板计数降低、心脏毒性、膀胱炎、出血性膀胱炎、心律不整、心瓣膜疾病、心肌病、冠状动脉疾病、白内障、中枢神经毒性、认知障碍、意识模糊、结膜炎、便秘、咳嗽、痉挛、膀胱炎、深层静脉栓塞、脱水、抑郁、腹泻、眩晕、口干、皮肤干燥、消化不良、呼吸困难(dyspnea)、水肿、电解质不平衡、食道炎、疲乏、生育力丧失、发烧、胃肠积气、面红、胃逆流、胃食道逆流病、生殖器疼痛、粒细胞减少症、男子女乳症、青光眼、脱发、手足综合征、头痛、听觉损失、心脏衰竭、心悸、胃灼热、血肿、出血性膀胱炎、肝毒性、高淀粉酶血症、高钙血症、高氯血症、高糖血症、高钾血症、高脂血症、高镁血症、高钠血症、高磷酸盐血症、色素过多、高三酸甘油酯血症、高尿酸血症、低白蛋白血症、低钙血症、低氯血症、低血糖症、低钾血症、低镁血症、低钠血症、低磷酸盐血症、阳萎、感染、注射部位反应、失眠、缺铁、瘙痒、关节痛、肾衰竭、白细胞减少症、肝功能障碍、失忆、闭经、口疮、黏膜炎、肌肉痛、肌痛、骨髓抑制、心肌炎、嗜中性白血球减少性发热、恶心、肾毒性、嗜中性白血球减少症、流鼻血、麻木、耳毒性、疼痛、手足综合征(palmar-plantar erythrodysesthesia)、全部血球减少症、心包炎、周边神经病变、咽炎、畏光、光敏感、肺炎(pneumonia)、局限性肺炎(pneumonitis)、蛋白尿、肺血栓、肺性纤维化、肺毒性、皮疹、心跳加快、直肠出血、坐立不安、鼻炎、癫痫、呼吸短促、鼻窦炎、血小板减少症、耳鸣、泌尿道感染、阴道出血、阴道干燥、眩晕、水滞留(water retention)、无力、体重减轻、体重增加及口干症(xerostomia)。一般而言，如果经由疗法所达到的受试者益处胜过受试者因疗法所经历的不良事件，则毒性是可接受的。

在一些实施例中，普雷沃菌属细菌(例如，其药物组合物)的施用治疗该病症。

如本文所述，待治疗的病症可以包括T_H2介导的病症，如特应性皮炎和/或食物过敏。

实例

实例1：栖组织普雷沃菌在FITC驱动的接触性超敏反应模型中的效果。

皮肤暴露于抗原会随时间导致对该抗原的过敏反应，例如以皮肤过敏的形式(例如皮炎或特应性皮炎或湿疹)和/或食物过敏的形式(参见例如Han等人,The atopicmarch:current insights into skin barrier dysfunction and epithelial cell-derived cytokines[特应性进展：皮肤屏障功能障碍与上皮细胞源性细胞因子的当前视角].Immunol.Rev.[免疫学评论]2017年7月；278(1):116-130.Doi:10.1111/imr.12546；Kawasaki等人,Skin inflammation exacerbates food allergy symptoms inepicutaneously sensitized mice[皮肤炎症加剧了皮肤致敏小鼠的食物过敏症状].Allergy[过敏].2018年6月；73(6):1313-1321.Doi:10.1111/all.13404；Martel等人,Translational animal models of atopic dermatitis for preclinical studies[用于临床前研究的特应性皮炎转化动物模型].Yale J.Biol.Med.[耶鲁大学生物医学杂志]2017年9月；90(3):389-402；Jin等人,Animal models of atopic dermatitis[特应性皮炎的动物模型].J.Invest.Dermatol[皮肤病学研究杂志].2009年1月:129(1):31-40.Doi10.1038/jid.2008.106)。

在异硫氰酸荧光素(FITC)驱动的接触性超敏反应模型中研究了栖组织普雷沃菌菌株B 50329的效果(参见例如Li等人,T-helper type-2contact hypersensitivity ofBalb/c mice aggravated by dibutyl phthalate via long-term dermal exposure[经皮肤长期暴露于邻苯二甲酸二丁酯加重Balb/c小鼠T辅助细胞2型接触性超敏反应].2014年2月3日.https://doi.org/10.1371/journal.pone.0087887；Imai等人,Effects ofphthalate esters on the sensitization phase of contact hypersensitivityinduced by fluorescein isothiocyanate[邻苯二甲酸酯对异硫氰酸荧光素诱导的接触性超敏反应的致敏阶段的影响].Clin Exp Allergy[临床与实验过敏].2006年11月；36(11):1462-8；Dearman等人,Role of CD4+T helper 2-type cells in cutaneousinflammatory responses induced by fluorescein isothiocynate[CD4+T辅助细胞2型细胞在异硫氰酸荧光素诱导的皮肤炎症反应中的作用].Immunology[免疫学].2000年12月；101(4):442-451.Doi:10.1046/j.1365-2567.2000.01126.x)。

通过经口管饲法施用栖组织普雷沃菌菌株B 50329，并使用各种读出分析栖组织普雷沃菌对炎症的影响。

使用由粉剂(例如，冻干形式)重构的微生物进行研究。使用蔗糖作为重构的媒介物。

每天管饲，从冰箱中收集一小瓶栖组织普雷沃菌菌株B 50329和一小瓶厌氧蔗糖。用厌氧蔗糖将适当的细菌稀释液制备到无菌试管中。例如，将800ul蔗糖添加到80mg的栖组织普雷沃菌菌株B 50329中。为了确保适当地重悬，将重悬粉剂的小瓶涡旋，以使没有粉剂粘附到小瓶上。涡旋后(在粉剂沉淀下来之前)立即用每只小鼠100μl的量的重悬粉剂给小鼠管饲，然后丢弃剩余的粉剂混合物(每次必须使用新鲜制备的稀释液)。每天对阴性对照小鼠经口管饲100ul媒介物。

FITC驱动的超敏反应研究方案：

在实验开始前，从泰康利(Taconic)购买小鼠并使其适应生态动物园至少1周。将小鼠以每个笼子5只动物(或更少)圈养，每个笼子构成不同的治疗组。

在第0天，用异氟烷麻醉小鼠(一次一只)并剃光其背部。

在第1天，将0.5％FITC(w/v)的溶液溶于佐剂(邻苯二甲酸二丁酯(DBP))和丙酮(1:1)中。为了制备0.5％FITC，将250mg FITC溶于25ml丙酮中。完全溶解后，加入25ml的DBP并通过涡旋混合。

在第1天和第2天，通过用移液管施加μl 0.5％FITC溶液致敏小鼠背部。厌氧蔗糖用作阴性对照。地塞米松用作阳性对照(地塞米松储备液通过将25mg地塞米松(西格玛公司(Sigma))重悬于1.6ml96％乙醇中来制备)。

在第1-6天，根据以下研究设计对小鼠经口管饲媒介物(阴性对照，组1)或栖组织普雷沃菌菌株B 50329(组3)，或腹膜内(ip)注射地塞米松(阳性对照，组2)：

DS＝药品(冻干)

除了日常管饲(组1和3)和腹膜内注射(组2)，小鼠在第6天进行如下激发：在第6天，用异氟烷麻醉每只小鼠，并使用卡尺获得基线左耳测量，然后将20μl 0.5％FITC溶液应用于左耳(20μl 0.5％FITC(w/v)DBP:丙酮(1:1)(“耳部激发”或“FITC激发”)。

在第7天，使用卡尺获得了耳激发后8小时测量。对小鼠施以安乐死，并按照制造商的说明使用TaqMan RNA-to-CT一步试剂盒(应用生物系统公司(Applied Biosystems)，赛默飞世尔科技公司(ThermoFisher Scientific)目录号4392653)收集耳部以进行下游mRNA分析。

结果显示于图1A和1B中。

在FITC耳部激发后8小时，口服施用栖组织普雷沃菌菌株B50329(在图1A-1B中标记为“栖组织普雷沃菌”)显著减少耳肿胀(图1A)。

与媒介物组相比，栖组织普雷沃菌菌株B 50329处理降低了耳部中IL-4、IL-5、IL-33、IL-17a和TSLP的基因表达(图1B)。

实例2：栖组织普雷沃菌在FITC驱动的接触性超敏反应模型中的效果。

测试了在FITC驱动的接触性超敏反应模型中栖组织普雷沃菌菌株B 50329对两种其他菌株(菌株1和2菌株)的影响，其中菌株1是除栖组织普雷沃菌以外的普雷沃菌属物种的菌株，菌株2是菌株2，是与普雷沃菌属不同属的菌株。

如实例1中所述，在第0天，用异氟烷麻醉小鼠，并剃光其背部。在第1天和第2天，通过用移液管施加400μl 0.5％FITC溶液致敏小鼠背部。在1-6天，给小鼠经口管饲媒介物(蔗糖)或所测试的细菌菌株，或腹膜内(i.p.)注射地塞米糖(阳性对照)。

如实例1中所述，在第6天，用异氟烷麻醉每只小鼠，并使用卡尺获得基线左耳测量。然后，向小鼠左耳应用20μl 0.5％FITC溶液进行FITC激发。

在第7天，激发后刚好八(8)小时，对小鼠实施安乐死，以使用卡尺获得激发后的耳部测量。

结果显示于图2中。口服施用栖组织普雷沃菌菌株B 50329(在图2中标记为“栖组织普雷沃菌”)显著降低FITC激发后8小时的耳肿胀，而两种其他细菌菌株(菌株1和2)则没有(图2)。栖组织普雷沃菌菌株B 50329和菌株1(普雷沃菌属另一物种的菌株)之间的耳肿胀差异无统计学意义，而栖组织普雷沃菌菌株B 50329和菌株2(除普雷沃菌属以外的另一属的菌株)之间的耳肿胀差异有统计学意义。

实例3：在皮炎相关食物过敏的MC903模型中栖组织普雷沃菌对蛋清蛋白卵白蛋白 (OVA)的影响。

使用皮炎相关食物过敏的小鼠模型来评估细菌菌株在调节过敏反应中的功效。

维生素D3类似物MC903会诱导炎症，并已用于特应性皮炎模型中(参见例如Hussain等人,Basophil-derived IL-4promotes epicutaneous antigen sensitizationconcomitant with the development of food allergy[嗜碱性粒细胞衍生的IL-4会伴随食物过敏的发展而促进表皮抗原致敏作用].2017年.American Academy of Allergy,Asthma&Immunol[美国过敏、哮喘和免疫学会].http://dx.doi.org/10.1016/j.jaci.2017.02.035；Moosbrugger-Martinz等人A mouse model for atopic dermatitisusing topical application of Vitamin D3 or of its analog MC903[使用维生素D3或其类似物MC903局部应用的特应性皮炎小鼠模型].Methods Mol.Biol.[分子生物学方法]2017；1559:91-106；Li等人,Topical vitamin D3 and low-calcemic analogs inducethymic stromal lymphopoietin in mouse keratinocytes and trigger an atopicdermatitis[局部维生素D3和低钙血症类似物诱导小鼠角质形成细胞中的胸腺基质淋巴细胞生成素并触发特应性皮炎].PNAS.2006年8月1日.第103(31)卷:11736-11741))。

MC903可用于使小鼠对目的抗原产生皮肤致敏作用，从而导致以TSLP和IL-4产生为典型代表的皮肤致敏作用(参见例如Noti等人,Exposure to food allergens throughinflamed skin promotes intestinal food allergy via the TSLP-basophil axis[通过发炎的皮肤暴露于食物过敏原会通过TSLP-嗜碱性粒细胞轴促进肠道食物过敏].J.Allergy Clin.Immunol.[过敏临床免疫杂志]2014年5月；133(5):1390-1399.e6)。皮炎相关食物过敏的MC903模型的研究设计显示于图3A中。可以从诸如英杰公司(Invivogen)或西格玛公司的供应商处获得待测试的过敏原(例如OVA)。

材料和方法

雌性BALB/c小鼠(6-8周龄)从泰康利农场(Taconic Farms)购买。将动物以无特定病原体的条件圈养在生态动物园中(每个笼子5只小鼠或少于5只小鼠)，并且所有实验均在机构动物护理和使用委员会(IACUC)批准的方案和指南下进行。在实验开始之前，让小鼠适应生态动物园一周。提供PicoLab Rodent Diet 20，并通过吸管瓶提供高压灭菌水，随意饮用并每天检查。

为了诱导模仿鸡蛋食物过敏的小鼠模型，将小鼠连续14天(第1-14天)每天暴露于MC903(托克瑞斯公司(Tocris))和100μg卵白蛋白(OVA)。用移液管将20μL 100％乙醇中的45μM MC903应用到一只耳部上，耳部干燥后，应用100μg的PBS中的OVA。将20μL乙醇应用于媒介物对照组的耳部上。

对于日常的经口管饲治疗(第1-17天)，阴性对照小鼠接受媒介物(冷冻蔗糖)，并且阳性对照小鼠接受托法替尼(100ul/小鼠，0.5％甲基纤维素(口服)中20mg/kg；托克瑞斯公司)。一组小鼠每天接受10mg的栖组织普雷沃菌菌株B 50329(3.13E+09TCC/剂)，而其他组接受10mg的菌株A(1.23E+10TCC/剂)或菌株B(7.83E+09TCC/剂)(非栖组织普雷沃菌菌株B 50329的细菌菌株——菌株A是除普雷沃菌属以外的另一属的菌株，并且菌株B是栖组织普雷沃菌的另一个菌株)。在第15天，通过经口管饲法(口服，也称为胃内(i.g.))用50mg的OVA激发小鼠。

在第17.5天，用50mg的OVA第二次对小鼠进行口服激发。在第二次激发后，用卡尺测量耳部炎症。

图3B显示了第18天的耳部炎症(第二次OVA激发后12小时)。与阴性对照组相比，用栖组织普雷沃菌菌株B 50329(在图3B-3D中标记为“栖组织普雷沃菌”)治疗显著减少了耳部炎症。

在第18天，在第二次OVA激发后12小时，对小鼠施以安乐死。收集血液(用于获得血清)和组织(例如脾脏、引流颈淋巴结、肠系膜淋巴结和耳部)进行离体处理。

使用春德雷克斯公司(Chondrex)小鼠抗OVA IgG1抗体测定试剂盒(目录号3013)和小鼠抗OVA IgE抗体测定试剂盒(目录号3010)通过ELISA分析血清中的抗OVA IgG1和抗OVA IgE。结果显示于图3C中。

将耳部进行均质处理以用于细胞因子检测。在体外PMA刺激和上清液收集之后，分析脾脏、肠系膜淋巴结(mLN)和颈部淋巴结(cLN)的细胞因子表达。按照制造商的说明，准备组织的单细胞悬液，计数并以200,000个细胞/孔接种，并用PMA/离子霉素(电子生物科学公司(eBiosciences)细胞刺激混合液目录号00-4975)重新刺激48小时。收集上清液，并使用Meso Scale Discovery(MSD)试剂盒(目录号K15068L-2)将其用于下游多重ELISA，以确定细胞因子水平。另外，将耳部在含有Halt蛋白酶(赛默科技公司目录号78444)的250ul T-PER缓冲液(赛默科技公司目录号78510)中解离，并使用BCA试剂盒(赛默科技公司目录号23227)对蛋白质浓度进行定量。使用MSD试剂盒(目录号K15068L-2)，将100ug蛋白质用于定量细胞因子水平。结果显示于图3D中。

实例4：MC903模型中栖组织普雷沃菌对OVA中2型(Th2)免疫应答及对完整花生蛋 白(CPE)食物过敏的影响。

为了诱导模仿鸡蛋食物过敏和花生过敏的小鼠模型，如实例3中所述和图4A所描绘使小鼠对食物过敏原产生致敏作用。

按所示将MC903在EtOH中制备，每天应用(第1天到第14天)。

将一些小鼠连续14天每天暴露于MC903和100ug的PBS中的OVA。将其他小鼠连续14天每天暴露于MC903和100ug完整花生蛋白(CPE)。除应用抗原(例如OVA或CPE)外，还对小鼠管饲蔗糖媒介物(阴性对照)、托法替尼(阳性对照)、细菌菌株A(10mg/剂)或栖组织普雷沃菌菌株B 50329(10mg/剂)。菌株A是除普雷沃菌属以外的另一属的菌株。

在第15天，通过经口管饲法用50mg OVA或50mg花生粉激发小鼠。

在第17.5天，用50mg OVA或50mg完整花生粉(CPE)进行口服管饲法来第二次激发小鼠。

在第18天，最后一次抗原激发后12小时，测量了耳厚度。如实例3中所述对小鼠施以安乐死并收集血清和组织。

如图4B中所示，在OVA和花生过敏(CPE)组中，与媒介物对照组相比，栖组织普雷沃菌菌株B 50329(在图4B-4D中标记为“栖组织普雷沃菌”)显著减少了耳部炎症。如实例3中所述进行抗体分析(抗OVA IgG1和抗OVA IgE)，并且结果显示于图4C。如实例3中所述进行细胞因子分析，并在图4D中显示。如实例1中所述测量耳部RNA，结果显示于图4E中。

实例5：MC903驱动的特应性皮炎和过敏性反应。

为了诱导模仿鸡蛋食物过敏、花生过敏和/或其他目的过敏原的小鼠模型，如实例3中所述和图5所描绘，使小鼠对食物过敏原产生致敏作用。

按所示将MC903在EtOH中制备，每天应用(第1天到第14天)。

将一些小鼠连续长达30天每天暴露于MC903和100ug的PBS中的CPE。除了应用模型抗原(例如CPE)外，还对小鼠管饲蔗糖媒介物(阴性对照)、托法替尼(阳性对照；每天口服100μl)、细菌菌株A(10mg/剂)或栖组织普雷沃菌菌株B 50329(10mg/剂)或200μg/小鼠抗IL-4(第3、6、9和12天腹膜内；BioXcell)(第1-17天或长达1-30天)。

在第30天，用500ug CPE腹膜内激发小鼠，并观察过敏性反应。CPE激发后三十分钟，使用直肠温度计测量体温。

在第31天，处死小鼠并测量耳部炎症。使用实例1和3中描述的方法分析脾脏、耳部和淋巴组织细胞因子。

实例6：胶带剥离花生过敏模型。

如上所述，存在用于研究食物过敏的各种动物模型。这些模型中的一些通过皮肤屏障缺陷诱导过敏原(例如抗原)的致敏作用(参见例如Ohsaki等人,Maternal IgG immunecomplexes induce food allergen-specific tolerance in offspring[母体IgG免疫复合物诱导后代对食物过敏原的特异性耐受].J Exp Med[实验医学杂志].2018.215:91-113；Kanagaratham等人,Experimental models for studying food allergy[研究食物过敏的实验模型].Cell Mol Gastroenterol Hepatol[细胞与分子胃肠病学与肝病学].2018.6(3):356-369.e1.Doi:10.1016/j.jcmgh.2018.05.010)。在一些模型中，通过在剃毛后对皮肤进行重复胶带剥离来诱导皮肤屏障缺陷，并将过敏原应用于因此而受损的皮肤上。在对过敏原的这种“皮肤致敏作用”之后，在某个时间点对过敏原进行胃内激发。例如，可以在第1、2和3天(耳部致敏)或第0、3和6天(背部致敏)用胶带剥离并暴露于花生抗原来使小鼠在耳部或背部产生致敏作用，如图6A所示。对于耳部致敏组，仅在第0天对小鼠进行胶带剥离，而背部致敏组在第0、3和6天进行胶带剥离。可在第21天对小鼠进行激发，此后不久，观察和/或处死小鼠以获得各种读出，包括但不限于测量血清花生特异性IgE、IgG1和IgA以及总IgE、IgG1和IgA、体温、过敏性反应评分、腹泻评分和/或肠系膜淋巴结(MLN)离体再刺激以评估各种细胞因子(包括IL-4、IL-5和TSLP)。可替代地，可以在第35天收集血清(见图6B)，并且在其他情况下，研究可以持续长达65天(见图6C)。如表3和表4所示，可以分别对小鼠进行过敏性反应和腹泻评分。

表3：过敏性反应评分

表4：腹泻评分

评分	描述
		0	无变化
1	柔软但形成良好
		2	柔软；未形成
3	液状腹泻发作一次
		4	液状腹泻发作至少两次

从泰康利农场购买雌性BALB/c小鼠，并在机构动物护理和使用委员会(IACUC)批准的方案和指南下进行所有实验。

在实验开始之前，让小鼠适应生态动物园一周。将所有小鼠以每个笼子5只或更少圈养，笼子单独放在通风处并带有标准垫料和丰容。提供PicoLab Rodent Diet 20，并通过吸管瓶提供高压灭菌水，随意饮用并每天检查。

实验设计

按如下给动物分组(5只小鼠/组)：

1)幼稚小鼠(无致敏，未花生激发)；

2)幼稚小鼠(无致敏，第21天花生激发)；

3)耳部致敏(第1、2和3天致敏)(未激发)；

4)耳部致敏(第1、2和3天致敏)(第21天花生激发)；

5)耳部致敏(第1、2和3天致敏)(托法替尼20mg/kg)(第21天花生激发)；

6)耳部致敏(第1、2和3天致敏)(栖组织普雷沃菌10mg)(第21天花生激发)；

7)背部致敏(第0、3和6天致敏)(未激发)；

8)背部致敏(第0、3和6天致敏)(第21天花生激发)；

9)背部致敏(第0、3和6天致敏)(托法替尼20mg/kg)(第21天花生激发)；以及

10)背部致敏(第0、3和6天致敏)(栖组织普雷沃菌菌株B 5032910mg)(第21天花生激发)。

在第0天，用异氟烷逐一麻醉小鼠。对于耳部致敏组，每只小鼠的耳部用玻璃纸胶带反复进行胶带剥离(约7-8次)。对于背部致敏组，将背部剃毛并用玻璃纸胶带进行胶带剥离(约7至8次)。

对于耳部致敏组，在第0天对小鼠进行胶带剥离。在第1、2和3天，用棉签将25μl花生蛋白溶液(PBS中4mg/ml花生蛋白)应用到两只耳部上。

对于背部致敏组，在第0、3和6天对小鼠进行胶带剥离，并应用100μg花生蛋白。每次用新的防水绷带覆盖致敏区域。

对于栖组织普雷沃菌菌株B 50329组，在第1至21天给小鼠经口管饲10mg细菌。

在第21天，用管饲100mg花生蛋白激发来自第2、4、5、6、8和9组的小鼠。花生蛋白激发后一小时，将所有组的小鼠脸颊放血，并针对总IgE、花生特异性IgE、总IgG1、花生特异性IgG1、总IgA和花生特异性IgA ELISA(春德雷克斯公司，根据制造商的说明)收集血液。

炎症结果显示于图6D中。对于耳部组和背部组，栖组织普雷沃菌菌株B 50329(在图6D-6I中标记为“栖组织普雷沃菌”)减少了炎症。

自激发当天起的总的和花生特异性血清IgE和IgG1水平分别显示于图6E和6F中。

自激发后2周起的总的和花生特异性血清IgE、IgG1和IgA水平分别显示于图6G、6H和6I中。

实例7：FITC-CHS模型。

如图7A所示，在FITC-CHS模型中测试了栖组织普雷沃菌菌株B 50329。测试的剂量为4.69E+09TCC。

在第7天检查了栖组织普雷沃菌菌株B 50329对TH2细胞因子(IL-13、IL-4、IL-5、IL-31和IL-33)的影响。如图7B中所示，栖组织普雷沃菌菌株B 50329(在图7B-7C中标记为“栖组织普雷沃菌”)显著降低了肠引流肠系膜淋巴结中IL-13、IL-5和IL-31的水平。通过MSD确定细胞因子水平，如实例3所述进行实验。如图7C所示，栖组织普雷沃菌菌株B 50329的治疗显著降低了耳引流颈部淋巴结中IL-13的水平。如实例3所述进行实验。

该实例证明了栖组织普雷沃菌菌株B 50329的治疗显著降低了来自肠引流肠系膜淋巴结和耳引流颈部淋巴结的PMA/离子霉素离体再刺激细胞中的Th2细胞因子分泌。

实例8：MC903驱动的特应性皮炎。

如图8A中所示，在MC903驱动的特应性皮炎模型中测试了栖组织普雷沃菌菌株B50329。

简而言之，从泰康利实验室(Taconic Labs)购买小鼠，并在实验开始前使其于生态动物园中适应于1周。将小鼠以每个笼子5只圈养，笼子单独放在通风处并带有标准垫料和丰容。随意提供标准普瑞纳啮齿动物饮食(5001)和高压灭菌水，并每天检查。

在第1天，麻醉小鼠，并进行基线耳部测量。在麻醉的同时，然后通过将总计20uL的溶液吸到耳部的背侧和腹侧，用45nM卡泊三醇(MC903)致敏耳部。每天致敏耳部，持续14天。

从第1天到第14天，将小鼠每天以4.69E+09TCC剂量经口管饲栖组织普雷沃菌菌株B 50329或阳性对照(托法替尼)，QD。

在整个研究过程中均进行了耳部测量，以追踪随时间和第14天的厚度变化，以确定耳厚度自基线的变化。

在第17天进行了离体实验。

MC903制备方案：将10mg卡泊三醇粉剂溶于10mL 99％乙醇中，以制成1mg/mL储备液。将储备液在99％乙醇中稀释至0.01856mg/mL。在-20℃下，将稀释后的溶液等分到日常使用的遮光管中。

阳性对照-托法替尼制剂：托法替尼在0.5％(w/v)甲基纤维素中制备。将纯化水放在搅拌/加热板上煮沸。称出适量的甲基纤维素粉剂。搅拌沸水，并添加甲基纤维素粉剂。继续搅拌直至将粉剂掺入水中。使混合物在4℃冷却过夜，同时在搅拌板上搅拌。将50mg托法替尼储备液重悬于0.5％MC中(混合物形成悬浮液)。将托法替尼口服施用，每只小鼠100uL。

结果：

如图8B所示，栖组织普雷沃菌菌株B 50329(在图8B-8E中标记为“栖组织普雷沃菌”)处理导致MC903驱动的特应性皮炎中耳部炎症减少，如通过随时间的耳部测量(左图)和第14天的耳部炎症(右图)所确定的。

在第17天检查了栖组织普雷沃菌菌株B 50329对耳部组织中TH2细胞因子转录物水平(Tslp、Il5、Il31、Il4、Ccl19和Ccr4)的影响。如图8C所示，如通过qPCR所确定的，栖组织普雷沃菌菌株B50329处理显著降低了耳组织中的Il5、Il31和Ccr4转录物水平。

在第17天检查了栖组织普雷沃菌菌株B 50329对空肠中肥大细胞相关基因转录物水平(Mcpt1)的影响。图8D中的结果证明，如通过qPCR所确定的，在MC903驱动的特应性皮炎模型中，栖组织普雷沃菌菌株B 50329显著降低了小鼠空肠中Mcpt1转录物水平。

在第17天检查了栖组织普雷沃菌菌株B 50329对肠系膜淋巴结和脾脏中IL-10水平的影响。如图8E所示，如通过MSD所确定的，在从MC903驱动的特应性皮炎模型分离的组织中，用PMA/离子霉素进行离体再刺激后，栖组织普雷沃菌菌株B 50329处理导致小鼠肠系膜淋巴结和脾脏IL-10水平显著增加。如实例3所述进行实验。

该实例中的结果证明，与媒介物处理的小鼠相比，栖组织普雷沃菌菌株B 50329处理显著降低了MC903驱动的特应性皮炎中的耳部炎症。

栖组织普雷沃菌菌株B 50329处理显示，耳组织中TH2细胞因子的转录物减少，空肠中肥大细胞相关的转录物(Mcpt1)减少。

在用PMA/离子霉素进行离体再刺激后，栖组织普雷沃菌菌株B50329处理显示肠引流肠系膜淋巴结和脾细胞中的IL-10水平增加。

通过引用并入

在本文中提及的所有出版物、专利申请都通过引用以其全文特此并入，如同各个单独的出版物或专利申请被确切地并且单独地指明为通过引用并入。如果出现冲突，则以本申请(包含本文的任何定义)为准。

等效形式

本领域技术人员仅使用常规实验将认识到或能确定本文所述本发明的具体实例的许多等效形式。此类等效形式旨在为下列权利要求所涵盖。

Claims (235)

1.一种在受试者中治疗或预防T_H2介导的病症的方法，该方法包括向该受试者施用包含治疗有效量的普雷沃菌属(Prevotella)细菌的药物组合物。

2.如权利要求1所述的方法，其中该受试者是人类受试者。

3.如权利要求1或权利要求2所述的方法，其中该药物组合物的微生物衍生的内容物的至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％衍生自普雷沃菌属细菌。

4.如权利要求1至3中任一项所述的方法，其中该方法治疗该T_H2介导的病症。

5.如权利要求1至4中任一项所述的方法，其中该T_H2介导的病症是哮喘、特应性皮炎、嗜酸性粒细胞性疾病和/或过敏。

6.如权利要求5所述的方法，其中该T_H2介导的病症是过敏，并且该过敏是食物过敏、季节性过敏性鼻炎和/或宠物过敏。

7.如权利要求5所述的方法，其中该T_H2介导的病症是特应性皮炎。

8.如权利要求5所述的方法，其中该T_H2介导的病症是食物过敏。

9.如权利要求8所述的方法，其中该食物过敏是花生、牛奶、鸡蛋、鱼、甲壳类水生动物、坚果、小麦或大豆过敏。

10.如权利要求8所述的方法，其中该食物过敏是花生过敏。

11.如权利要求8所述的方法，其中食物过敏是对食物抗原的过敏。

12.如权利要求11所述的方法，其中该食物抗原是花生抗原、牛奶抗原、鸡蛋抗原、鱼抗原、甲壳类水生动物抗原、树坚果抗原、小麦抗原或大豆抗原。

13.如权利要求11所述的方法，其中该食物抗原是花生抗原。

14.如权利要求1至13中任一项所述的方法，其中该方法导致该受试者中的白介素(IL)-4水平降低。

15.如权利要求14所述的方法，其中该IL-4水平是IL-4蛋白水平或IL-4mRNA水平。

16.如权利要求1至15中任一项所述的方法，其中该方法导致该受试者中的白介素(IL)-5水平降低。

17.如权利要求16所述的方法，其中该IL-5水平是IL-5蛋白水平或IL-5mRNA水平。

18.如权利要求1至17中任一项所述的方法，其中该方法导致该受试者中的白介素(IL)-13水平降低。

19.如权利要求18所述的方法，其中该IL-13水平是IL-13蛋白水平或IL-13mRNA水平。

20.如权利要求1至19中任一项所述的方法，其中该方法导致该受试者中的白介素(IL)-19水平降低。

21.如权利要求20所述的方法，其中该IL-19水平是IL-19蛋白水平或IL-19mRNA水平。

22.如权利要求1至21中任一项所述的方法，其中该方法导致该受试者中的白介素(IL)-21水平降低。

23.如权利要求22所述的方法，其中该IL-21水平是IL-21蛋白水平或IL-21mRNA水平。

24.如权利要求1至23中任一项所述的方法，其中该方法导致该受试者中的白介素(IL)-31水平降低。

25.如权利要求24所述的方法，其中该IL-31水平是IL-31蛋白水平或IL-31mRNA水平。

26.如权利要求1至25中任一项所述的方法，其中该方法导致该受试者中的白介素(IL)-33水平降低。

27.如权利要求26所述的方法，其中该IL-33水平是IL-33蛋白水平或IL-33mRNA水平。

28.如权利要求1至27中任一项所述的方法，其中该方法导致该受试者中的胸腺基质淋巴细胞生成素(TSLP)水平降低。

29.如权利要求28所述的方法，其中该TSLP水平是TSLP蛋白水平或TSLP mRNA水平。

30.如权利要求1至29中任一项所述的方法，其中该方法导致该受试者中的IgG1水平降低。

31.如权利要求30所述的方法，其中该IgG1水平是IgG1蛋白水平或IgG1 mRNA水平。

32.如权利要求1至31中任一项所述的方法，其中该方法导致该受试者中的IgE水平降低。

33.如权利要求32所述的方法，其中该IgE水平是IgE蛋白水平或IgE mRNA水平。

34.如权利要求1至33中任一项所述的方法，其中该方法导致该受试者中的IgA水平降低。

35.如权利要求34所述的方法，其中该IgA水平是IgA蛋白水平或IgA mRNA水平。

36.如权利要求1至35中任一项所述的方法，其中这些普雷沃菌属细菌是阿尔伯普雷沃菌(Prevotella albensis)、羊水普雷沃菌(Prevotella amnii)、卑尔根普雷沃菌(Prevotella bergensis)、二路普雷沃菌(Prevotella bivia)、短普雷沃菌(Prevotellabrevis)、布氏普雷沃菌(Prevotella bryantii)、颊普雷沃菌(Prevotella buccae)、口颊普雷沃菌(Prevotella buccalis)、粪便普雷沃菌(Prevotella copri)、牙普雷沃菌(Prevotella dentalis)、栖牙普雷沃菌(Prevotella denticola)、解糖胨普雷沃菌(Prevotella disiens)、栖组织普雷沃菌(Prevotella histicola)、中间普雷沃菌(Prevotella intermedia)、小斑点普雷沃菌(Prevotella maculosa)、马斯普雷沃菌(Prevotella marshii)、产黑普雷沃菌(Prevotella melaninogenica)、彩虹普雷沃菌(Prevotella micans)、多形普雷沃菌(Prevotella multiformis)、变黑普雷沃菌(Prevotella nigrescens)、口腔普雷沃菌(Prevotella oralis)、口普雷沃菌(Prevotellaoris)、龈炎普雷沃菌(Prevotella oulorum)、苍白普雷沃菌(Prevotella pallens)、唾液普雷沃菌(Prevotella salivae)、斯特塞拉普雷沃菌(Prevotella stercorea)、坦纳普雷沃菌(Prevotella tannerae)、蒂莫普雷沃菌(Prevotella timonensis)、空肠普雷沃菌(Prevotella jejuni)、橙色普雷沃菌(Prevotella aurantiaca)、保氏普雷沃菌(Prevotella baroniae)、着色普雷沃菌(Prevotella colorans)、人体普雷沃菌(Prevotella corporis)、丹塔普雷沃菌(Prevotella dentasini)、栖居普雷沃菌(Prevotella enoeca)、斐氏普雷沃菌(Prevotella falsenii)、深黑色普雷沃菌(Prevotella fusca)、解肝素普雷沃菌(Prevotella heparinolytica)、洛氏普雷沃菌(Prevotella loescheii)、嗜糖普雷沃菌(Prevotella multisaccharivorax)、南锡普雷沃菌(Prevotella nanceiensis)、稻普雷沃菌(Prevotella oryzae)、沼泽普雷沃菌(Prevotella paludivivens)、胸膜炎普雷沃菌(Prevotella pleuritidis)、栖瘤胃普雷沃菌(Prevotella ruminicola)、解糖普雷沃菌(Prevotella saccharolytica)、靶心普雷沃菌(Prevotella scopos)、赛赫普雷沃菌(Prevotella shahii)、动胶普雷沃菌(Prevotellazoogleoformans)和/或真空腔普雷沃菌(Prevotella veroralis)。

37.如权利要求36所述的方法，其中这些普雷沃菌属细菌是栖组织普雷沃菌。

38.如权利要求1至37中任一项所述的方法，其中这些普雷沃菌属细菌是包含与普雷沃菌属菌株B 50329(NRRL登录号B 50329)的核苷酸序列有至少95％基因组、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。

39.如权利要求38所述的方法，其中这些普雷沃菌属细菌是包含与该普雷沃菌属菌株B50329(NRRL登录号B 50329)的核苷酸序列有至少99％基因组、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。

40.如权利要求39所述的方法，其中这些普雷沃菌属细菌是普雷沃菌属菌株B 50329(NRRL登录号B 50329)。

41.如权利要求1至40中任一项所述的方法，其中这些普雷沃菌属细菌是普雷沃菌属细菌的菌株，该菌株包含一种或多种表1中所列的蛋白质。

42.如权利要求1至41中任一项所述的方法，其中这些普雷沃菌属细菌是基本上不含表2所列的蛋白质的普雷沃菌属菌株。

43.如权利要求1至42中任一项所述的方法，其中该药物组合物包含活的、杀死的或减毒的细菌。

44.如权利要求1至42中任一项所述的方法，其中这些普雷沃菌属细菌经γ照射、UV照射、热灭活、酸处理和/或氧喷射。

45.如权利要求44所述的方法，其中这些普雷沃菌属细菌在50℃加热灭活两小时或在90℃加热灭活两小时。

46.如权利要求44所述的方法，其中这些普雷沃菌属细菌在0.1vvm下氧喷射两小时。

47.如权利要求1至46中任一项所述的方法，其中这些普雷沃菌属细菌是冻干的普雷沃菌属细菌。

48.如权利要求47所述的方法，其中该组合物进一步包含药学上可接受的赋形剂。

49.如权利要求1至48中任一项所述的方法，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自同一物种。

50.如权利要求1至48中任一项所述的方法，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自同一菌株。

51.如权利要求1至48中任一项所述的方法，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自不同物种。

52.如权利要求1至49中任一项所述的方法，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自不同菌株。

53.如权利要求1至52中任一项所述的方法，其中该药物组合物与另外的治疗剂组合施用。

54.如权利要求53所述的方法，其中该另外的治疗剂是抗炎剂。

55.如权利要求1至54中任一项所述的方法，其中该药物组合物被配制成固体剂型。

56.如权利要求55所述的方法，其中该固体剂型是片剂、微型片剂、胶囊、丸剂、或粉剂或其组合。

57.如权利要求55或56所述的方法，其中该固体剂型进一步包含药学上可接受的赋形剂。

58.如权利要求55至57中任一项所述的方法，其中该固体剂型包含肠溶衣。

59.如权利要求55至58中任一项所述的方法，其中该固体剂型被配制用于口服施用。

60.如权利要求1至54中任一项所述的方法，其中该药物组合物被配制成悬浮液。

61.如权利要求60所述的方法，其中该悬浮液被配制用于口服施用。

62.如权利要求60或61所述的方法，其中该悬浮液包含PBS，以及任选地蔗糖或葡萄糖。

63.如权利要求60所述的方法，其中该悬浮液被配制用于静脉内施用。

64.如权利要求60所述的方法，其中该悬浮液被配制用于腹膜内施用。

65.如权利要求63或64所述的方法，其中该悬浮液包含PBS。

66.如权利要求60所述的方法，其中该药物组合物是静脉内施用的。

67.如权利要求60所述的方法，其中该药物组合物是通过注射，例如皮下、皮内或腹膜内注射施用的。

68.如权利要求60至67中任一项所述的方法，其中该悬浮液进一步包含药学上可接受的赋形剂。

69.如权利要求60至68中任一项所述的方法，其中该悬浮液进一步包含缓冲液。

70.如权利要求69所述的方法，其中该缓冲液是PBS。

71.如权利要求1至70中任一项所述的方法，其中该药物组合物进一步包含一种或多种另外的治疗剂。

72.如权利要求71所述的方法，其中该一种或多种其他治疗剂是一种或多种抗炎剂。

73.如权利要求1至62或68至72中任一项所述的方法，其中该药物组合物是口服施用的。

74.如权利要求1至73中任一项所述的方法，其中该药物组合物包含如通过布拉德福德测定或BCA测定所确定的约5mg至约900mg的总蛋白。

75.如权利要求1至74中任一项所述的方法，其中该药物组合物包含如通过布拉德福德测定或BCA测定所确定的约10mg的普雷沃菌属细菌。

76.如权利要求1至75中任一项所述的方法，该方法进一步包括向该受试者施用另外的治疗剂。

77.如权利要求76所述的方法，其中该另外的治疗剂是抗炎剂。

78.如权利要求76所述的方法，其中该另外的治疗剂是皮质类固醇、抗组胺药、肥大细胞稳定剂、减充血剂、白三烯受体拮抗剂、抗体、或其组合。

79.如权利要求76或77所述的方法，其中该药物组合物包含该另外的治疗剂。

80.如权利要求76所述的方法，其中该另外的治疗剂是抗生素剂。

81.一种包含治疗有效量的普雷沃菌属细菌的药物组合物，用于治疗或预防受试者中的T_H2介导的病症。

82.如权利要求81所述的药物组合物，其中该受试者是人类受试者。

83.如权利要求81或权利要求82所述的药物组合物，其中该药物组合物的微生物衍生的内容物的至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％衍生自普雷沃菌属细菌。

84.如权利要求81至83中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物治疗该T_H2介导的病症。

85.如权利要求81至84中任一项所述的药物组合物，其中该T_H2介导的病症是哮喘、特应性皮炎、嗜酸性粒细胞性疾病和/或过敏。

86.如权利要求85所述的药物组合物，其中该T_H2介导的病症是过敏，并且该过敏是食物过敏、季节性过敏性鼻炎和/或宠物过敏。

87.如权利要求85所述的药物组合物，其中该T_H2介导的病症是特应性皮炎。

88.如权利要求85所述的药物组合物，其中该T_H2介导的病症是食物过敏。

89.如权利要求88所述的药物组合物，其中该食物过敏是花生、牛奶、鸡蛋、鱼、甲壳类水生动物、坚果、小麦或大豆过敏。

90.如权利要求88所述的药物组合物，其中该食物过敏是花生过敏。

91.如权利要求88所述的药物组合物，其中食物过敏是对食物抗原的过敏。

92.如权利要求91所述的药物组合物，其中该食物抗原是花生抗原、牛奶抗原、鸡蛋抗原、鱼抗原、甲壳类水生动物抗原、树坚果抗原、小麦抗原或大豆抗原。

93.如权利要求91所述的药物组合物，其中该食物抗原是花生抗原。

94.如权利要求81至93中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-4水平降低。

95.如权利要求94所述的药物组合物，其中该IL-4水平是IL-4蛋白水平或IL-4mRNA水平。

96.如权利要求81至95中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-5水平降低。

97.如权利要求96所述的药物组合物，其中该IL-5水平是IL-5蛋白水平或IL-5mRNA水平。

98.如权利要求81至97中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-13水平降低。

99.如权利要求98所述的药物组合物，其中该IL-13水平是IL-13蛋白水平或IL-13mRNA水平。

100.如权利要求81至99中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-19水平降低。

101.如权利要求100所述的药物组合物，其中该IL-19水平是IL-19蛋白水平或IL-19mRNA水平。

102.如权利要求81至101中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-21水平降低。

103.如权利要求102所述的药物组合物，其中该IL-21水平是IL-21蛋白水平或IL-21mRNA水平。

104.如权利要求81至103中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-31水平降低。

105.如权利要求104所述的药物组合物，其中该IL-31水平是IL-31蛋白水平或IL-31mRNA水平。

106.如权利要求81至105中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-33水平降低。

107.如权利要求106所述的药物组合物，其中该IL-33水平是IL-33蛋白水平或IL-4mRNA水平。

108.如权利要求81至107中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的胸腺基质淋巴细胞生成素(TSLP)水平降低。

109.如权利要求108所述的药物组合物，其中该TSLP水平是TSLP蛋白水平或TSLP mRNA水平。

110.如权利要求81至109中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的IgG1水平降低。

111.如权利要求110所述的药物组合物，其中该IgG1水平是IgG1蛋白水平或IgG1 mRNA水平。

112.如权利要求81至111中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的IgE水平降低。

113.如权利要求112所述的药物组合物，其中该IgE水平是IgE蛋白水平或IgE mRNA水平。

114.如权利要求81至113中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的IgA水平降低。

115.如权利要求114所述的药物组合物，其中该IgA水平是IgA蛋白水平或IgA mRNA水平。

116.如权利要求81至115中任一项所述的药物组合物，其中这些普雷沃菌属细菌是阿尔伯普雷沃菌、羊水普雷沃菌、卑尔根普雷沃菌、二路普雷沃菌、短普雷沃菌、布氏普雷沃菌、颊普雷沃菌、口颊普雷沃菌、粪便普雷沃菌、牙普雷沃菌、栖牙普雷沃菌、解糖胨普雷沃菌、栖组织普雷沃菌、中间普雷沃菌、小斑点普雷沃菌、马斯普雷沃菌、产黑普雷沃菌、彩虹普雷沃菌、多形普雷沃菌、变黑普雷沃菌、口腔普雷沃菌、口普雷沃菌、龈炎普雷沃菌、苍白普雷沃菌、唾液普雷沃菌、斯特塞拉普雷沃菌、坦纳普雷沃菌、蒂莫普雷沃菌、空肠普雷沃菌、橙色普雷沃菌、保氏普雷沃菌、着色普雷沃菌、人体普雷沃菌、丹塔普雷沃菌、栖居普雷沃菌、斐氏普雷沃菌、深黑色普雷沃菌、解肝素普雷沃菌、洛氏普雷沃菌、嗜糖普雷沃菌、南锡普雷沃菌、稻普雷沃菌、沼泽普雷沃菌、胸膜炎普雷沃菌、栖瘤胃普雷沃菌、解糖普雷沃菌、靶心普雷沃菌、赛赫普雷沃菌、动胶普雷沃菌和/或真空腔普雷沃菌。

117.如权利要求116所述的药物组合物，其中这些普雷沃菌属细菌是栖组织普雷沃菌。

118.如权利要求81至117中任一项所述的药物组合物，其中这些普雷沃菌属细菌是包含与该普雷沃菌属菌株B 50329(NRRL登录号B 50329)的核苷酸序列有至少95％基因组、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。

119.如权利要求118所述的药物组合物，其中这些普雷沃菌属细菌是包含与该普雷沃菌属菌株B 50329(NRRL登录号B 50329)的核苷酸序列有至少99％基因组、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。

120.如权利要求119所述的药物组合物，其中这些普雷沃菌属细菌是普雷沃菌属菌株B50329(NRRL登录号B 50329)。

121.如权利要求81至120中任一项所述的药物组合物，其中这些普雷沃菌属细菌是普雷沃菌属细菌的菌株，该菌株包含一种或多种表1中所列的蛋白质。

122.如权利要求81至121中任一项所述的药物组合物，其中这些普雷沃菌属细菌是基本上不含表2所列的蛋白质的普雷沃菌属菌株。

123.如权利要求81至122中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物包含活的、杀死的或减毒的细菌。

124.如权利要求81至122中任一项所述的药物组合物，其中这些普雷沃菌属细菌经γ照射、UV照射、热灭活、酸处理和/或氧喷射。

125.如权利要求124所述的药物组合物，其中这些普雷沃菌属细菌在50℃加热灭活两小时或在90℃加热灭活两小时。

126.如权利要求124所述的药物组合物，其中这些普雷沃菌属细菌在0.1vvm下氧喷射两小时。

127.如权利要求81至126中任一项所述的药物组合物，其中这些普雷沃菌属细菌是冻干的普雷沃菌属细菌。

128.如权利要求127所述的药物组合物，其中该药物组合物进一步包含药学上可接受的赋形剂。

129.如权利要求81至128中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自同一物种。

130.如权利要求81至128中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自同一菌株。

131.如权利要求81至128中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自不同物种。

132.如权利要求81至129中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自不同菌株。

133.如权利要求81至132中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物是与另外的治疗剂组合施用的。

134.如权利要求133所述的药物组合物，其中该另外的治疗剂是抗炎剂。

135.如权利要求81至134中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物被配制成固体剂型。

136.如权利要求135所述的药物组合物，其中该固体剂型是片剂、微型片剂、胶囊、丸剂、或粉剂或其组合。

137.如权利要求135或136所述的药物组合物，其中该固体剂型进一步包含药学上可接受的赋形剂。

138.如权利要求135至137中任一项所述的药物组合物，其中该固体剂型包含肠溶衣。

139.如权利要求135至138中任一项所述的药物组合物，其中该固体剂型被配制用于口服施用。

140.如权利要求81至134中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物被配制成悬浮液。

141.如权利要求140所述的药物组合物，其中该悬浮液被配制用于口服施用。

142.如权利要求140或141所述的药物组合物，其中该悬浮液包含PBS，以及任选地蔗糖或葡萄糖。

143.如权利要求140所述的药物组合物，其中该悬浮液被配制用于静脉内施用。

144.如权利要求140所述的药物组合物，其中该悬浮液被配制用于腹膜内施用。

145.如权利要求143或144所述的药物组合物，其中该悬浮液包含PBS。

146.如权利要求140所述的药物组合物，其中该药物组合物是静脉内施用的。

147.如权利要求140所述的药物组合物，其中该药物组合物是通过注射，例如皮下、皮内或腹膜内注射施用的。

148.如权利要求140至147中任一项所述的药物组合物，其中该悬浮液进一步包含药学上可接受的赋形剂。

149.如权利要求140至148中任一项所述的药物组合物，其中该悬浮液进一步包含缓冲液。

150.如权利要求149所述的药物组合物，其中该缓冲液是PBS。

151.如权利要求81至150中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物进一步包含一种或多种另外的治疗剂。

152.如权利要求151所述的药物组合物，其中该一种或多种其他治疗剂是一种或多种抗炎剂。

153.如权利要求81至142或148至152中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物是口服施用的。

154.如权利要求81至153中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物包含如通过布拉德福德测定或BCA测定所确定的约5mg至约900mg的总蛋白。

155.如权利要求81至154中任一项所述的药物组合物，其中该药物组合物包含如通过布拉德福德测定或BCA测定所确定的约10mg的普雷沃菌属细菌。

156.如权利要求81至155中任一项所述的药物组合物，其中将该药物组合物与另外的治疗剂一起施用于该受试者。

157.如权利要求156所述的药物组合物，其中该另外的治疗剂是抗炎剂。

158.如权利要求156所述的药物组合物，其中该另外的治疗剂是皮质类固醇、抗组胺药、肥大细胞稳定剂、减充血剂、白三烯受体拮抗剂、抗体或其组合。

159.如权利要求156或157所述的药物组合物，其中该药物组合物包含该另外的治疗剂。

160.如权利要求156所述的药物组合物，其中该另外的治疗剂是抗生素剂。

161.包含治疗有效量的普雷沃菌属细菌的药物组合物在制造用于治疗或预防受试者中的T_H2介导的病症的药物中的用途。

162.如权利要求161所述的用途，其中该受试者是人类受试者。

163.如权利要求161或权利要求162所述的用途，其中该药物组合物的微生物衍生的内容物的至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％衍生自普雷沃菌属细菌。

164.如权利要求161至163中任一项所述的用途，其中该用途治疗该T_H2介导的病症。

165.如权利要求161至164中任一项所述的用途，其中该T_H2介导的病症是哮喘、特应性皮炎、嗜酸性粒细胞性疾病和/或过敏。

166.如权利要求165所述的用途，其中该T_H2介导的病症是过敏，并且该过敏是食物过敏、季节性过敏性鼻炎和/或宠物过敏。

167.如权利要求165所述的用途，其中该T_H2介导的病症是特应性皮炎。

168.如权利要求165所述的用途，其中该T_H2介导的病症是食物过敏。

169.如权利要求168所述的用途，其中该食物过敏是花生、牛奶、鸡蛋、鱼、甲壳类水生动物、坚果、小麦或大豆过敏。

170.如权利要求168所述的用途，其中该食物过敏是花生过敏。

171.如权利要求168所述的用途，其中食物过敏是对食物抗原的过敏。

172.如权利要求171所述的用途，其中该食物抗原是花生抗原、牛奶抗原、鸡蛋抗原、鱼抗原、甲壳类水生动物抗原、树坚果抗原、小麦抗原或大豆抗原。

173.如权利要求171所述的用途，其中该食物抗原是花生抗原。

174.如权利要求161至173中任一项所述的用途，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-4水平降低。

175.如权利要求174所述的用途，其中该IL-4水平是IL-4蛋白水平或IL-4mRNA水平。

176.如权利要求161至175中任一项所述的用途，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-5水平降低。

177.如权利要求176所述的用途，其中该IL-5水平是IL-5蛋白水平或IL-5mRNA水平。

178.如权利要求161至177中任一项所述的用途，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-13水平降低。

179.如权利要求178所述的用途，其中该IL-13水平是IL-13蛋白水平或IL-13mRNA水平。

180.如权利要求161至179中任一项所述的用途，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-19水平降低。

181.如权利要求180所述的用途，其中该IL-19水平是IL-19蛋白水平或IL-19mRNA水平。

182.如权利要求161至181中任一项所述的用途，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-21水平降低。

183.如权利要求182所述的用途，其中该IL-21水平是IL-21蛋白水平或IL-21mRNA水平。

184.如权利要求161至183中任一项所述的用途，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-31水平降低。

185.如权利要求184所述的用途，其中该IL-31水平是IL-31蛋白水平或IL-31mRNA水平。

186.如权利要求161至185中任一项所述的用途，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的白介素(IL)-33水平降低。

187.如权利要求186所述的用途，其中该IL-33水平是IL-33蛋白水平或IL-4mRNA水平。

188.如权利要求161至187中任一项所述的用途，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的胸腺基质淋巴细胞生成素(TSLP)水平降低。

189.如权利要求188所述的用途，其中该TSLP水平是TSLP蛋白水平或TSLP mRNA水平。

190.如权利要求161至189中任一项所述的用途，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的IgG1水平降低。

191.如权利要求190所述的用途，其中该IgG1水平是IgG1蛋白水平或IgG1 mRNA水平。

192.如权利要求161至191中任一项所述的用途，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的IgE水平降低。

193.如权利要求192所述的用途，其中该IgE水平是IgE蛋白水平或IgE mRNA水平。

194.如权利要求161至193中任一项所述的用途，其中该药物组合物的施用导致该受试者中的IgA水平降低。

195.如权利要求194所述的用途，其中该IgA水平是IgA蛋白水平或IgA mRNA水平。

196.如权利要求161至195中任一项所述的用途，其中这些普雷沃菌属细菌是阿尔伯普雷沃菌、羊水普雷沃菌、卑尔根普雷沃菌、二路普雷沃菌、短普雷沃菌、布氏普雷沃菌、颊普雷沃菌、口颊普雷沃菌、粪便普雷沃菌、牙普雷沃菌、栖牙普雷沃菌、解糖胨普雷沃菌、栖组织普雷沃菌、中间普雷沃菌、小斑点普雷沃菌、马斯普雷沃菌、产黑普雷沃菌、彩虹普雷沃菌、多形普雷沃菌、变黑普雷沃菌、口腔普雷沃菌、口普雷沃菌、龈炎普雷沃菌、苍白普雷沃菌、唾液普雷沃菌、斯特塞拉普雷沃菌、坦纳普雷沃菌、蒂莫普雷沃菌、空肠普雷沃菌、橙色普雷沃菌、保氏普雷沃菌、着色普雷沃菌、人体普雷沃菌、丹塔普雷沃菌、栖居普雷沃菌、斐氏普雷沃菌、深黑色普雷沃菌、解肝素普雷沃菌、洛氏普雷沃菌、嗜糖普雷沃菌、南锡普雷沃菌、稻普雷沃菌、沼泽普雷沃菌、胸膜炎普雷沃菌、栖瘤胃普雷沃菌、解糖普雷沃菌、靶心普雷沃菌、赛赫普雷沃菌、动胶普雷沃菌和/或真空腔普雷沃菌。

197.如权利要求196所述的用途，其中这些普雷沃菌属细菌是栖组织普雷沃菌。

198.如权利要求161至197中任一项所述的用途，其中这些普雷沃菌属细菌是包含与该普雷沃菌属菌株B 50329(NRRL登录号B50329)的核苷酸序列有至少95％基因组、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。

199.如权利要求198所述的用途，其中这些普雷沃菌属细菌是包含与该普雷沃菌属菌株B 50329(NRRL登录号B 50329)的核苷酸序列有至少99％基因组、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。

200.如权利要求199所述的用途，其中这些普雷沃菌属细菌是普雷沃菌属菌株B 50329(NRRL登录号B 50329)。

201.如权利要求161至200中任一项所述的用途，其中这些普雷沃菌属细菌是普雷沃菌属细菌的菌株，该菌株包含一种或多种表1中所列的蛋白质。

202.如权利要求161至201中任一项所述的用途，其中这些普雷沃菌属细菌是基本上不含表2所列的蛋白质的普雷沃菌属菌株。

203.如权利要求161至202中任一项所述的用途，其中该药物组合物包含活的、杀死的或减毒的细菌。

204.如权利要求161至202中任一项所述的用途，其中这些普雷沃菌属细菌经γ照射、UV照射、热灭活、酸处理和/或氧喷射。

205.如权利要求204所述的用途，其中这些普雷沃菌属细菌在50℃加热灭活两小时或在90℃加热灭活两小时。

206.如权利要求204所述的用途，其中这些普雷沃菌属细菌在0.1vvm下氧喷射两小时。

207.如权利要求161至206中任一项所述的用途，其中这些普雷沃菌属细菌是冻干的普雷沃菌属细菌。

208.如权利要求207所述的用途，其中该组合物进一步包含药学上可接受的赋形剂。

209.如权利要求161至208中任一项所述的用途，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自同一物种。

210.如权利要求161至208中任一项所述的用途，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自同一菌株。

211.如权利要求161至208中任一项所述的用途，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自不同物种。

212.如权利要求161至209中任一项所述的用途，其中该药物组合物中的普雷沃菌属细菌来自不同菌株。

213.如权利要求161至212中任一项所述的用途，其中该药物组合物是与另外的治疗剂组合施用的。

214.如权利要求213所述的用途，其中该另外的治疗剂是抗炎剂。

215.如权利要求161至214中任一项所述的用途，其中该药物组合物被配制成固体剂型。

216.如权利要求215所述的用途，其中该固体剂型是片剂、微型片剂、胶囊、丸剂、或粉剂或其组合。

217.如权利要求215或216所述的用途，其中该固体剂型进一步包含药学上可接受的赋形剂。

218.如权利要求215至217中任一项所述的用途，其中该固体剂型包含肠溶衣。

219.如权利要求215至218中任一项所述的用途，其中该固体剂型被配制用于口服施用。

220.如权利要求161至214中任一项所述的用途，其中该药物组合物被配制成悬浮液。

221.如权利要求220所述的用途，其中该悬浮液被配制用于口服施用。

222.如权利要求220或221所述的用途，其中该悬浮液包含PBS，以及任选地蔗糖或葡萄糖。

223.如权利要求220所述的用途，其中该悬浮液被配制用于静脉内施用。

224.如权利要求220所述的用途，其中该悬浮液被配制用于腹膜内施用。

225.如权利要求223或224所述的用途，其中该悬浮液包含PBS。

226.如权利要求220所述的用途，其中该药物组合物是静脉内施用的。

227.如权利要求220所述的用途，其中该药物组合物是通过注射，例如皮下、皮内或腹膜内注射施用的。

228.如权利要求220至227中任一项所述的用途，其中该悬浮液进一步包含药学上可接受的赋形剂。

229.如权利要求220至228中任一项所述的用途，其中该悬浮液进一步包含缓冲液。

230.如权利要求229所述的用途，其中该缓冲液是PBS。

231.如权利要求161至230中任一项所述的用途，其中该药物组合物进一步包含一种或多种另外的治疗剂。

232.如权利要求231所述的用途，其中该一种或多种其他治疗剂是一种或多种抗炎剂。

233.如权利要求161至222或228至232中任一项所述的用途，其中该药物组合物是口服施用的。

234.如权利要求161至233中任一项所述的用途，其中该药物组合物包含如通过布拉德福德测定或BCA测定所确定的约5mg至约900mg的总蛋白。

235.如权利要求161至234中任一项所述的用途，其中该药物组合物包含如通过布拉德福德测定或BCA测定所确定的约10mg的普雷沃菌属细菌。

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