KR20190135054A - 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지를 포함하는 여드름 치료용 조성물 - Google Patents
프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지를 포함하는 여드름 치료용 조성물 Download PDFInfo
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Abstract
본원에서는 특히 여드름 예방 또는 치료를 위한 조성물, 시스템, 및 방법을 제공한다. 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물, 조합, 시스템, 및 방법을 포함한다. 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 효소를 포함하는 조성물, 조합, 및 시스템 또한 포함한다. 여드름을 예방 또는 치료하는 방법 또한 제공한다.
Description
관련 출원에 대한 상호 참조
본 출원은 2017년 4월 21일 출원된 미국 가출원 제62/488,326호에 대한 우선권의 이익을 주장하며, 상기 가출원은 그 전문이 및/또는 모든 목적을 위해 본원에서 참조로 포함된다.
정부 지원
본 발명은 미국 국립 보건원(National Institutes of Health)의해 수여된 승인 번호 1R43AR068172 - 01 하에 정부 지원으로 이루어졌다. 정부는 본 발명에 소정의 권리를 가진다.
참조로서 서열 목록 포함
2018년 4월 20일 작성되었고, 그 크기는 101,782 바이트인, 파일명 "052004-503001WO_SequenceListing.TXT"의 텍스트 파일의 콘텐츠는 그 전문이 본원에서 참조로 포함된다.
배경
여드름은 전 세계 모든 사람 중 80%에서 발생하는 거의 보편적인 병태이다. 상기 만성 피부 병태는 복합적이지만, 주된 병원체는 그의 과도성장이 염증을 일으켜 여드름을 유발하는 것인 프로피오니박테리움 아크네스(Propionibacterium acnes)이다. 혁신이 확실히 요구됨에도 불구하고, 30년 동안 신규 여드름 약물은 없었다. 벤조일 퍼옥시드 및 항생제를 포함하는 현행 치료법은 매우 비효과적이며, 가장 효과적인 치료법인 이소트레티노인은 위험한 부작용(선천적 결손증, 간 손상, 및 자살)으로 인해 소규모 환자 세트로 제한된다.
여드름 치료를 위한 새로운 방법 및 조성물이 요구되고 있다.
간단한 요약
본원에서는 특히 여드름 예방 또는 치료를 위한 조성물, 조합, 시스템, 및 방법을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하거나, 본질적으로 그로 구성되거나, 또는 그로 구성된 조성물을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지, 1개 이하의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 1개 이하의 항여드름 화합물로 구성된 활성 성분, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물로서, 여기서, 조성물은 프로바이오틱 박테리아를 포함하지 않는 것인 조성물을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 효소를 포함하는 조성물을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물을 포함하거나, 본질적으로 그로 구성되거나, 또는 그로 구성된 조합으로서, 여기서, 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물은 각각 약학적으로 허용가능한 담체를 추가로 포함하는 조성물 중에 존재하는 것인 조합을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 효소을 포함하는 조합을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 유효량의, 본원에서 제공된 조성물 또는 조합을 투여하는 단계를 포함하는, 여드름 예방 또는 치료를 필요로 하는 피험체에서 여드름을 예방 또는 치료하는 방법을 제공한다.
도면의 간단한 설명
도 1. P. 아크네스(P. acnes)(여드름 유발, 플레이트 좌측 절반부) 또는 P. 그라누로섬(P. granulosum )(공생, 플레이트 우측 절반부) 박테리아를 RCM-아가 페트리 디쉬 상에 플레이팅하였다. 미노사이클린 또는 PHIT-101(107 pfu/mL) 중에 침지된 패드 절반부를 각 플레이트 상에 배치하였다. 37℃에서 3일 동안의 혐기성 인큐베이션 후, 사멸 영역(화살표 표시) 출현하였고, 이는 미노사이클린이 병원성 박테리아 및 공생 박테리아, 둘 모두를 사멸시킨 반면, PHIT-101은 공생 P. 그라누로섬은 방해하지 않으면서, 여드름 유발 박테리아를 사멸시킨다.
도 2. P. 아크네스, P. 그라누로섬, 및 P. 아비둠(P. avidum)을 포함하는 합성 피부 마이크로바이옴을 시험관에서 전면 생장시켰다. 이어서, PHIT-101의 존재 또는 부재하에서 48시간 동안 인큐베이션시켰다. 일루미나(Illumina) MiSeq 플랫폼을 사용하여, 세척된 박테리아 펠릿의 16S 앰플리콘의 NGS 서열분석에 의해 3개 종의 상대적인 비율을 정량화하였다. PHIT-101은 나머지 다른 두 공생 종의 성장에는 영향을 미치지 않으면서, 여드름 유발 P. 아크네스를 거의 완전히 전멸시킬 수 있었다.
도 3. P. 아크네스 균주 사이에서의 바이오필름 생산은 고도로 가변적이다. 96개의 P. 아크네스 균주를 96 웰 폴리스티렌 마이크로타이터 플레이트에서 성장시켜 바이오필름 생산을 자극시키고, 각 균주에 의해 생산된 바이오필름을 정량화하였다. 상기 균주 세트 내에서 입증된 가변성은 인간 모공에서 발견되는 것과 더욱 유사한 성장 조건하의 바이오필름 형성을 정량화하여야 할 필요가 있음을 나타낸다.
도 4. P. 아크네스 바이오필름을 분해할 수 있는 효소를 선별하기 위한 스크린. P. 아크네스를 폴리스티렌 마이크로타이터 플레이트에서 성장시켜 바이오필름 생산을 자극시켰다. 효소를 0.01 mg/mL로 웰에 첨가하고, 30℃에서 30 min 동안 인큐베이션시켰다. 분해된 바이오필름을 포스페이트 완충처리된 염수(PBS: phosphate buffered saline)로 세척하고, 각 웰 중의 잔류 바이오필름을 크리스털 바이올렛으로 염색하고, 590 nm에서의 흡광도를 기록하여 정량화하였다. 프로테아제, 예컨대, 프로테이나제 K 및 섭틸리신은 우수한 활성을 보였고, 디스퍼신은 시험된 것들 중에서 가장 우수한 글리코시드 데폴리머라제였다.
도 5. 바이오필름 분해 효소(BDE: biofilm degrading enzyme)를 이용한 파지 증진이 박테리아 사멸을 크게 증가시킨다. 고착성 P. 아크네스 세포를 PBS(비처리), PHIT-101, 또는 PHIT-101 및 디스퍼신과 함께 인큐베이션시켰다. 셀타이터-블루(CellTiter-Blue) 시약을 사용하여 세포 생존을 측정하고, 560Ex/590Em에서 형광을 기록하였다. PHIT-101은 액체 배양물 중에서와 같인 효과적으로 P. 아크네스를 사멸시킬 수는 없었지만, 바이오필름 분해 효소인 디스퍼신의 첨가가 박테리아 사멸을 액체 배양물과 유사한 수준으로까지 크기 증가시켰다.
도 6. 프로바이오틱 균주는 부착성(adherent) 배양물 중에서 저수준의 리파제를 생산한다. 유전자가 공지된 프로바이오틱 P. 아크네스 균주를 마이크로타이터 플레이트에서 바이오필름 조건하에서 성장시켰다. 72 hr 동안 성장시킨 후, 배양 상청액을 여과 멸균시키고, 37℃에서 4시간 동안 4-MU 팔미테이트 함께 인큐베이션시켜 세포외 리파제 생산을 측정하였다. 병원체와 비교하였을 때, 프로바이오틱 균주(Pr#X)의 리파제 생산은 매우 낮았으며, 이는 염증 잠재성이 더 낮다는 것을 시사하는 것이다.
도 7. 프로바이오틱 균주는 병원성 P. 아크네스보다 유의적으로 더 적게 상피 세포에 부착된다. 선택된 프로바이오틱 균주를 융합성 A-431 상피 세포(MOI 10)와 함께 인큐베이션시켰다. 웰을 세척한 후, 0.1% 트윈(Tween) 80 용액을 이용하여 세포를 리프팅하고, BHI 플레이트 사에 플레이팅하였다. 72시간 동안 혐기성 인큐베이션시킨 후, 콜로니를 계수하였다. 데이터는 프로바이오틱 균주가 상피 세포에 대하여 유의적으로 더 낮은 결합을 보였다는 것을 나타낸다(* p<0.05, ** p<0.005).
도 8a-8d. 마우스 귀 염증 모델에서의 프로바이오틱 균주의 더 낮은 염증 잠재성. CBA/J 마우스(코호트당 5마리의 마우스)에 P. 아크네스 균주를 주사하고, 5일째, 시토카인 분석을 수행하였다. 프로바이오틱 균주 Pr#C는 병원성 균주보다 유의적으로 더 낮은 수준의(* p<0.05, ** p<0.01, *** p<0.0001) 염증성 시토카인 IL-1β(도 8a), IL-6(도 8b), IL-17(도 8c), 및 TNFα(도 8d)를 보였다. Pr-C는 ProII 16S를 가진다.
도 9. P. 아크네스 균주는 플랑크톤성(planktonic) 및 고착성(sessile) 배양물 중에서 상이한 리파제 프로파일을 가진다. 한 세트의 2개의 병원성(Path-1, Path-2) 및 2개의 프로바이오틱(프로바이오틱(Pr-1 내지 Pr-6) P. 아크네스 균주를 플랑크톤성(회색 막대) 및 고착성(검은색 막대) 배양물 중에서의 리파제 생산에 대해 평가하였다. 프로바이오틱 균주의 리파제 생산은 액체(플랑크톤성) 배양물 중에서는 병원성 균주와 유의적으로 상이하지 않았지만, 부착성 배양물 중에서의 그의 리파제 생산량은 일관되게 상응하는 병원성 배양물보다 더 낮았다. 흥미롭게도, 프로바이오틱 균주들 사이에서 리파제 생산에 있어 가변성이 관찰되었다. 리파제 활성이 가장 낮은 균주를 선택하였다.
도 10은 예시적인 박테리오파지의 생활사를 도시한 것이다. 좌측 하단에서부터 시계 반대 방향으로: 파지 입자는 숙주 박테리아를 인식하고, 그의 표면 상에 흡착한다. 파지 게놈은 박테리아 내로 주입된다. 용원성 생활사에서, 상기 DNA는 박테리아 게놈 내로 통합되고, 그와 함께 수회의 생활사 동안 복제된다. 용균성 생활사에서, 게놈은 통합되지 않고, 계속 진행되어 숙주 기구를 하이재킹함으로써 그의 게놈 및 파지 구조 성물을 복제한다. 이어서, 완전히 조립된 파지는 전형적으로는 감염 후기 단계에서 엔도리신 및 홀린을 생산함으로써 세포를 용해시킨다. 이제, 유리된 파지는 또 다른 용균성 생활사를 개시하면서, 자유롭게 새로운 숙주 박테리아를 찾아낸다.
도 11은 예시적인 박테리아 바이오필름의 형성을 도시한 것이다. 박테리아 세포는 성장에 바람직한 조건을 가지는 표면에 이르게 되고, 그에 부착하게 된다. 특정 임계값의 세포 밀도(정족수)가 바이오필름 형성을 유발할 때까지 세포는 복제하여 콜로니를 형성한다. 바이오필름은 다양한 비율로 다당류, 단백질, DNA 및 지질의 혼합물을 포함한다. 바이오필름은 박테리아 콜로니를 거친 외부 조건으로부터 보호하고, 항생제, 독소 및 면역 세포에 대한 내성을 부여하는 물리적 장벽이다.
도 12는 협력하여 작용하는 3가지 성분의 실시양태를 도시한 것으로서; 상기 3가지 성분의 효과는 설명을 위해 순차적으로 기술되어 있다. 염증성 면포는 전형적으로 공생 피부 박테리아(B)와 함께 과성장한 P. 아크네스(A)에 의해 생산된 바이오필름으로 막혀 있는 상태이다. 바이오필름 분해 효소(볼트 표시)는 P. 아크네스 바이오필름을 분해하여 다른 성분에 더욱 잘 접근할 수 있게 한다. 이어서, 박테리오파지(육각형 표시)는 병원성 P. 아크네스를 편집하거나, 또는 특이적으로 사멸시키고, 감염을 제거한다. 마지막으로, 프로바이오틱 박테리아(C)는 모공에서 콜로니를 형성하고, 병원체의 니치를 점유하여 그가 다시 성장하지 못하게 막고, 마이크로바이옴을 건강한 상태로 재보정한다.
도 13은 비제한적인 프로바이오틱 박테리아 스크리닝 프로세스를 나타낸 카툰이다.
도 14는 병원성 균주가 PBS 대조군보다 유의적으로 더 높은 귀 염증을 일으키는 반면, 리드 프로바이오틱 균주 Pr-C는 PBS 대조군과 유의적인 차이를 보이지 않는 귀 염증을 유도한다는 것을 보여주는 그래프이다.
도 15는 파지가 저농도(0.5% w/v) 및 고농도(2% w/v)의 살리실산의 존재하에서 안정적인 상태 그대로 유지된다는 것을 보여주는 그래프이다.
도 16은 파지가 벤조일 퍼옥시드의 존재하에서 60일 동안에 걸쳐 그의 생존능을 상실한다는 것을 보여주는 그래프이다. 파지 생존능 손실률은 저농도(2.5% w/v)와 비교하였을 때, 고농도(10% w/v)일 때 더 크다.
도 1. P. 아크네스(P. acnes)(여드름 유발, 플레이트 좌측 절반부) 또는 P. 그라누로섬(P. granulosum )(공생, 플레이트 우측 절반부) 박테리아를 RCM-아가 페트리 디쉬 상에 플레이팅하였다. 미노사이클린 또는 PHIT-101(107 pfu/mL) 중에 침지된 패드 절반부를 각 플레이트 상에 배치하였다. 37℃에서 3일 동안의 혐기성 인큐베이션 후, 사멸 영역(화살표 표시) 출현하였고, 이는 미노사이클린이 병원성 박테리아 및 공생 박테리아, 둘 모두를 사멸시킨 반면, PHIT-101은 공생 P. 그라누로섬은 방해하지 않으면서, 여드름 유발 박테리아를 사멸시킨다.
도 2. P. 아크네스, P. 그라누로섬, 및 P. 아비둠(P. avidum)을 포함하는 합성 피부 마이크로바이옴을 시험관에서 전면 생장시켰다. 이어서, PHIT-101의 존재 또는 부재하에서 48시간 동안 인큐베이션시켰다. 일루미나(Illumina) MiSeq 플랫폼을 사용하여, 세척된 박테리아 펠릿의 16S 앰플리콘의 NGS 서열분석에 의해 3개 종의 상대적인 비율을 정량화하였다. PHIT-101은 나머지 다른 두 공생 종의 성장에는 영향을 미치지 않으면서, 여드름 유발 P. 아크네스를 거의 완전히 전멸시킬 수 있었다.
도 3. P. 아크네스 균주 사이에서의 바이오필름 생산은 고도로 가변적이다. 96개의 P. 아크네스 균주를 96 웰 폴리스티렌 마이크로타이터 플레이트에서 성장시켜 바이오필름 생산을 자극시키고, 각 균주에 의해 생산된 바이오필름을 정량화하였다. 상기 균주 세트 내에서 입증된 가변성은 인간 모공에서 발견되는 것과 더욱 유사한 성장 조건하의 바이오필름 형성을 정량화하여야 할 필요가 있음을 나타낸다.
도 4. P. 아크네스 바이오필름을 분해할 수 있는 효소를 선별하기 위한 스크린. P. 아크네스를 폴리스티렌 마이크로타이터 플레이트에서 성장시켜 바이오필름 생산을 자극시켰다. 효소를 0.01 mg/mL로 웰에 첨가하고, 30℃에서 30 min 동안 인큐베이션시켰다. 분해된 바이오필름을 포스페이트 완충처리된 염수(PBS: phosphate buffered saline)로 세척하고, 각 웰 중의 잔류 바이오필름을 크리스털 바이올렛으로 염색하고, 590 nm에서의 흡광도를 기록하여 정량화하였다. 프로테아제, 예컨대, 프로테이나제 K 및 섭틸리신은 우수한 활성을 보였고, 디스퍼신은 시험된 것들 중에서 가장 우수한 글리코시드 데폴리머라제였다.
도 5. 바이오필름 분해 효소(BDE: biofilm degrading enzyme)를 이용한 파지 증진이 박테리아 사멸을 크게 증가시킨다. 고착성 P. 아크네스 세포를 PBS(비처리), PHIT-101, 또는 PHIT-101 및 디스퍼신과 함께 인큐베이션시켰다. 셀타이터-블루(CellTiter-Blue) 시약을 사용하여 세포 생존을 측정하고, 560Ex/590Em에서 형광을 기록하였다. PHIT-101은 액체 배양물 중에서와 같인 효과적으로 P. 아크네스를 사멸시킬 수는 없었지만, 바이오필름 분해 효소인 디스퍼신의 첨가가 박테리아 사멸을 액체 배양물과 유사한 수준으로까지 크기 증가시켰다.
도 6. 프로바이오틱 균주는 부착성(adherent) 배양물 중에서 저수준의 리파제를 생산한다. 유전자가 공지된 프로바이오틱 P. 아크네스 균주를 마이크로타이터 플레이트에서 바이오필름 조건하에서 성장시켰다. 72 hr 동안 성장시킨 후, 배양 상청액을 여과 멸균시키고, 37℃에서 4시간 동안 4-MU 팔미테이트 함께 인큐베이션시켜 세포외 리파제 생산을 측정하였다. 병원체와 비교하였을 때, 프로바이오틱 균주(Pr#X)의 리파제 생산은 매우 낮았으며, 이는 염증 잠재성이 더 낮다는 것을 시사하는 것이다.
도 7. 프로바이오틱 균주는 병원성 P. 아크네스보다 유의적으로 더 적게 상피 세포에 부착된다. 선택된 프로바이오틱 균주를 융합성 A-431 상피 세포(MOI 10)와 함께 인큐베이션시켰다. 웰을 세척한 후, 0.1% 트윈(Tween) 80 용액을 이용하여 세포를 리프팅하고, BHI 플레이트 사에 플레이팅하였다. 72시간 동안 혐기성 인큐베이션시킨 후, 콜로니를 계수하였다. 데이터는 프로바이오틱 균주가 상피 세포에 대하여 유의적으로 더 낮은 결합을 보였다는 것을 나타낸다(* p<0.05, ** p<0.005).
도 8a-8d. 마우스 귀 염증 모델에서의 프로바이오틱 균주의 더 낮은 염증 잠재성. CBA/J 마우스(코호트당 5마리의 마우스)에 P. 아크네스 균주를 주사하고, 5일째, 시토카인 분석을 수행하였다. 프로바이오틱 균주 Pr#C는 병원성 균주보다 유의적으로 더 낮은 수준의(* p<0.05, ** p<0.01, *** p<0.0001) 염증성 시토카인 IL-1β(도 8a), IL-6(도 8b), IL-17(도 8c), 및 TNFα(도 8d)를 보였다. Pr-C는 ProII 16S를 가진다.
도 9. P. 아크네스 균주는 플랑크톤성(planktonic) 및 고착성(sessile) 배양물 중에서 상이한 리파제 프로파일을 가진다. 한 세트의 2개의 병원성(Path-1, Path-2) 및 2개의 프로바이오틱(프로바이오틱(Pr-1 내지 Pr-6) P. 아크네스 균주를 플랑크톤성(회색 막대) 및 고착성(검은색 막대) 배양물 중에서의 리파제 생산에 대해 평가하였다. 프로바이오틱 균주의 리파제 생산은 액체(플랑크톤성) 배양물 중에서는 병원성 균주와 유의적으로 상이하지 않았지만, 부착성 배양물 중에서의 그의 리파제 생산량은 일관되게 상응하는 병원성 배양물보다 더 낮았다. 흥미롭게도, 프로바이오틱 균주들 사이에서 리파제 생산에 있어 가변성이 관찰되었다. 리파제 활성이 가장 낮은 균주를 선택하였다.
도 10은 예시적인 박테리오파지의 생활사를 도시한 것이다. 좌측 하단에서부터 시계 반대 방향으로: 파지 입자는 숙주 박테리아를 인식하고, 그의 표면 상에 흡착한다. 파지 게놈은 박테리아 내로 주입된다. 용원성 생활사에서, 상기 DNA는 박테리아 게놈 내로 통합되고, 그와 함께 수회의 생활사 동안 복제된다. 용균성 생활사에서, 게놈은 통합되지 않고, 계속 진행되어 숙주 기구를 하이재킹함으로써 그의 게놈 및 파지 구조 성물을 복제한다. 이어서, 완전히 조립된 파지는 전형적으로는 감염 후기 단계에서 엔도리신 및 홀린을 생산함으로써 세포를 용해시킨다. 이제, 유리된 파지는 또 다른 용균성 생활사를 개시하면서, 자유롭게 새로운 숙주 박테리아를 찾아낸다.
도 11은 예시적인 박테리아 바이오필름의 형성을 도시한 것이다. 박테리아 세포는 성장에 바람직한 조건을 가지는 표면에 이르게 되고, 그에 부착하게 된다. 특정 임계값의 세포 밀도(정족수)가 바이오필름 형성을 유발할 때까지 세포는 복제하여 콜로니를 형성한다. 바이오필름은 다양한 비율로 다당류, 단백질, DNA 및 지질의 혼합물을 포함한다. 바이오필름은 박테리아 콜로니를 거친 외부 조건으로부터 보호하고, 항생제, 독소 및 면역 세포에 대한 내성을 부여하는 물리적 장벽이다.
도 12는 협력하여 작용하는 3가지 성분의 실시양태를 도시한 것으로서; 상기 3가지 성분의 효과는 설명을 위해 순차적으로 기술되어 있다. 염증성 면포는 전형적으로 공생 피부 박테리아(B)와 함께 과성장한 P. 아크네스(A)에 의해 생산된 바이오필름으로 막혀 있는 상태이다. 바이오필름 분해 효소(볼트 표시)는 P. 아크네스 바이오필름을 분해하여 다른 성분에 더욱 잘 접근할 수 있게 한다. 이어서, 박테리오파지(육각형 표시)는 병원성 P. 아크네스를 편집하거나, 또는 특이적으로 사멸시키고, 감염을 제거한다. 마지막으로, 프로바이오틱 박테리아(C)는 모공에서 콜로니를 형성하고, 병원체의 니치를 점유하여 그가 다시 성장하지 못하게 막고, 마이크로바이옴을 건강한 상태로 재보정한다.
도 13은 비제한적인 프로바이오틱 박테리아 스크리닝 프로세스를 나타낸 카툰이다.
도 14는 병원성 균주가 PBS 대조군보다 유의적으로 더 높은 귀 염증을 일으키는 반면, 리드 프로바이오틱 균주 Pr-C는 PBS 대조군과 유의적인 차이를 보이지 않는 귀 염증을 유도한다는 것을 보여주는 그래프이다.
도 15는 파지가 저농도(0.5% w/v) 및 고농도(2% w/v)의 살리실산의 존재하에서 안정적인 상태 그대로 유지된다는 것을 보여주는 그래프이다.
도 16은 파지가 벤조일 퍼옥시드의 존재하에서 60일 동안에 걸쳐 그의 생존능을 상실한다는 것을 보여주는 그래프이다. 파지 생존능 손실률은 저농도(2.5% w/v)와 비교하였을 때, 고농도(10% w/v)일 때 더 크다.
상세한 설명
본원에서는 특히, 여드름 치료 및 예방을 위한 조성물, 조합, 방법 및 시스템을 제공한다.
살리실산 및 벤조일 퍼옥시드는 처방전 없이 살 수 있는 일반 의약품(OTC: over-the-counter) 제품에서 가장 일반적으로 사용되는 항여드름제이다. 이들 항여드름제와 함께 조합된 파지의 안정성에 대해서는 알려진 바 없는데, 그 이유는 특히 파지는 외부 물리적 및 화학적 인자에 대한 그의 안정성 및 반응에 있어서 광범위하게 나누어지기 때문이다. 벤조일 퍼옥시드 및 황의 산화환원 특성이 잠재적으로는 파지의 단백질 코트의 분해를 유발할 수 있다. 이전 연구에서는 퍼옥시드에의 노출이 단백질을 불안정화시키고, 단백질분해에 대한 그의 감수성을 증가시킴으로써 단백질 분해율을 증가시킨다고 밝혀졌다(문헌 [Fligiel et al. Protein degradation following treatment with hydrogen peroxide. Am J Pathol 1984, 115 (3), 418-25]; [Kocha et al. Hydrogen peroxide-mediated degradation of protein: different oxidation modes of copper- and iron-dependent hydroxyl radicals on the degradation of albumin. Biochim Biophys Acta 1997, 1337 (2), 319-26]). 살리실산은 그의 단백질-결합 능력에 대해 주목되고 있고(문헌 [Lee et al. Protein binding of acetylsalicylic acid and salicylic acid in porcine and human serum. Vet Hum Toxicol 1995, 37 (3), 224-5]; [Verbeeck and Cardinal, Plasma protein binding of salicylic acid, phenytoin, chlorpromazine, propranolol and pethidine using equilibrium dialysis and ultracentrifugation. Arzneimittelforschung 1985, 35 (6), 903-6]), 캡시드 또는 테일 섬유의 단백질 코트에 대한 높은 친화도로 인해 파지는 생존불가능해질 수 있다.
놀랍게도, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지는 살리실산을 포함하는 조성물 중에서 안정적인 것으로 나타났다. 예를 들어, 도 15를 참조한다. 따라서, 살리실산은 파지가 그에 대해 우수한 내성을 가지고 있는 것으로 밝혀져 있으며, 복합 제제에 적합한 항여드름제이다. 실시양태에서, 살리실산의 항각질용해 활성은 파지의 더 깊은 심부 투과를 가능하게 하여 그의 사멸률을 증가시킴으로써 파지 활성을 보완해 준다. 실시양태에서, 본원에 기술된 파지는 여드름 예방 및 치료용 조성물에서 살리실산과 함께 조합될 수 있다.
벤조일 퍼옥시드는 예컨대, 수일 초과로 보관되는 제제용으로, 시험된 파지를 함께 포함하는 복합 제제에는 적합하지 않지만(도 16 참조), 벤조일 퍼옥시드는 항여드름 조합(예컨대, 키트)의 일부로서 파지 제품과 함께 사용될 수 있다. 실시양태에서, 벤조일 퍼옥시드는 파지 조성물/제제를 포함하는 것을 도포하기 이전에 피부에 도포되고, 세척되는 클렌저 중의 활성 성분이다. 실시양태에서, 벤조일 퍼옥시드의 항각질용해 및 일시적인 항박테리아 작용이 박테리오파지에 의한 P. 아크네스의 특이적인 더 깊은 심부 및 표적화된 사멸을 보완해 준다.
실시양태에서, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 항여드름 화합물(예컨대, 살리실산 및/또는 황)은 피험체의 피부에 국소적으로 투여되는 단일 조성물 중에 존재한다. 실시양태에서, (예컨대, 별개의 용기, 예컨대, 병 중에) 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 항여드름 화합물을 포함하는 키트를 제공한다. 실시양태에서, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지가 한 조성물 중에 존재하고, 항여드름 화합물(예컨대, 벤조일 퍼옥시드, 살리실산, 및/또는 황)이 또 다른 조성물 중에 존재하고, 각 조성물이 피험체의 피부에 국소적으로 투여된다. 실시양태에서, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지가 피험체에게 투여된 후, 항여드름 화합물이 피험체에게 투여된다. 실시양태에서, 항여드름 화합물이 피험체에게 투여된 후, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지가 피험체에게 투여된다. 실시양태에서, (어느 순서로든) 항여드름 화합물 및 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지를 피험체의 얼굴에 국소적으로 투여할 때, 그 사이에 피험체의 얼굴을 세척한다.
실시양태에서, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지와 함께 조합하여 사용될 때, 항여드름 화합물(예컨대, 벤조일 퍼옥시드, 살리실산, 또는 황)의 유효 용량은, 항여드름 화합물이 단독으로 사용되는 경우에 요구되는 용량보다 적다. 실시양태에서, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지와 함께 조합하여 사용될 때, 항여드름 화합물(예컨대, 벤조일 퍼옥시드, 살리실산, 또는 황)의 유효 용량은, 항여드름 화합물이 단독으로 사용되는 경우에 요구되는 용량보다 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 또는 10% 미만 더 적다.
정의
하기 정의는 본 발명의 주제를 이해시키고, 첨부된 특허 청구범위를 구성하기 위한 목적으로 포함된다. 본원에서 사용된 약어는 화학 및 생물 분야 내에서의 그의 통상적 의미를 가진다.
본 발명의 다양한 실시양태 및 측면이 본원에 제시되고, 기술되었지만, 상기 실시양태 및 측면은 단지 예로서 제공된다는 것이 당업자에게는 자명할 것이다. 이에, 당업자는 본 발명으로부터 벗어남 없이 다수의 변형, 변경, 및 치환을 생각해 낼 수 있을 것이다. 본 발명을 수행하는 데 있어 본원에 기술된 본 발명의 실시양태에 대한 다양한 대안을 사용할 수 있다는 것을 이해하여야 한다.
본원에 사용된 섹션의 표제는 단지 조직화 목적으로 사용된 것이며, 기술된 주제를 제한하는 것으로 해석되지 않아야 한다. 제한 없이, 특허, 특허 출원, 규약, 서적, 매뉴얼, 및 논문을 비롯한, 본 출원에서 인용된 모든 문헌, 또는 문헌의 일부는 그 전문이 임의 목적을 위해 명백하게 본원에서 참조로 포함된다.
달리 정의되지 않는 한, 본원에서 사용된 기술 용어 및 과학 용어는 당업계의 숙련가가 통상 이해하는 것과 동일한 의미를 가진다. 예컨대, 문헌 [Singleton et al., DICTIONARY OF MICROBIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY 2nd ed., J. Wiley & Sons (New York, NY 1994)]; [Sambrook et al., MOLECULAR CLONING, A LABORATORY MANUAL, Cold Springs Harbor Press (Cold Springs Harbor, NY 1989)]를 참조한다. 본원에 기술된 것과 유사하거나, 또는 등가인 임의의 방법, 장치, 및 물질이 본 발명을 실시하는 데 사용될 수 있다. 하기 정의는 본원에서 빈번하게 사용되는 특정 용어의 이해를 돕기 위해 제공되는 것이며, 본 발명의 범주를 제한하고자 하는 것은 아니다.
본원에서 사용되는 바, "프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지"는 P. 아크네스 세포를 감염시키고, 그 안에서 복제되고, 그를 사멸시키는 박테리오파지이다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 용균성 P. 아크네스 박테리오파지이다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 P. 아크네스 박테리아를 용해시킬 수 있고, P. 아크네스가 아닌 어떤 박테리아도 용해시키지 못한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 박테리아에서 용원성을 그대로 유지할 수 없다. 실시양태에서, P. 아크네스를 용해시킬 수 있지만, 용원성을 그대로 유지하지 못하는 박테리오파지를 사용하는 것은 박테리오파지가 박테리아 내에서 휴면 상태 그대로 잠복해 있을 수 없지만, 박테리아를 용해시키고, 그를 사멸시켜야 한다는 이점을 가진다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지에는 용원성을 그대로 유지하는 데 필요한 적어도 하나의 유전자를 발현할 수 있는 능력은 없다. "용원성을 그대로 유지하는 데 필요한 적어도 하나의 유전자를 발현할 수 있는 능력이 없다"라는 용어는 예를 들어, 하나 이상의 점 돌연변이, 또는 게놈의 완전한 또는 부분적 결실의 결과로서, P. 아크네스 박테리오파지에는 용원성을 그대로 유지하는 데 필요한 완전한 기능성 단백질 생성물을 생산할 수 있는 능력이 없다는 것을 나타내는 것으로 의도된다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 용원성을 그대로 유지하는 데 필요한 적어도 하나의 유전자 모두 또는 그 모두가 결여되어 있는 게놈을 가진다(예컨대, 인공적으로, 또는 천연적으로, 예컨대, 균주는 용원성을 그대로 유지하는 데 필요한 적어도 하나의 유전자 모두 또는 그 모두가 결여되어 있는 균주이거나, 또는 그러한 균주로부터 유래된 것이다). 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 비코딩 영역 중의 게놈에 포함되어 있음에도 불구하고 용원성을 그대로 유지할 수 있는 파지의 능력에 영향을 줄 수 있는 결함(예컨대, 돌연변이, 삽입 또는 결실)을 포함할 수 있으며, 예를 들어, 게놈 통합 부위(들)(예컨대, /att/부위) 중의, 또는 리프레서 결합 부위 중의 결함이 있다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 자연적으로 발생된 및 단리된 것이며, 인공 돌연변이는 박테리오파지 내로 도입될 필요가 없다는 추가 이점을 가진다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 복수의 P. 아크네스 박테리아 균주를 용해시킬 수 있다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 적어도 약 5, 10, 15, 20, 25, 30개 이상의 P. 아크네스 박테리아 균주를 용해시킬 수 있다. P. 아크네스 박테리오파지의 비제한적인 예는 본원에 개시되어 있다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 서열 번호 1과 적어도 약 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 95%, 99%, 99.1%, 99.2%, 99.3%, 99.4%, 99.5%, 99.6%, 99.7%, 99.8%, 99.9%의 서열 동일성을 가지는 게놈을 가진다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 서열 번호 1의 서열을 가지는 게놈을 가지거나, 또는 서열 번호 1의 서열을 포함한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지의 게놈은 서열 번호 1과 비교하여 삽입 또는 결실을 가지지 않는다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지의 게놈은 서열 번호 1과 비교하여 삽입 또는 결실을 가지지 않고, 오직 보존적 치환만을 가진다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 부다페스트 조약(Budapest Treaty)의 조항하에서 영국 국립 산업 식품 해양 박테리아 수장고(NCIMB: National Collection of Industrial, Marine and Food Bacteria: 영국 애버딘 AB21 9YA 벅스번 크라이브스톤 에스테이트 퍼거슨 빌딩 소재)에 하기 수탁 번호: 수탁 번호 NCIMB 41332(단리물 PA6); 수탁 번호 NCIMB 41334(단리물 1874); 수탁 번호 NCIMB 41333(단리물 1878); 수탁 번호 NCIMB 41335(단리물 1905); 수탁 번호 NCIMB 41349(단리물 1894); 수탁 번호 NCIMB 41350(단리물 103609); 수탁 번호 NCIMB 41351(단리물 103672)하에 기탁된 예시적인 P. 아크네스 박테리오파지 단리물 중 하나이다. 실시양태에서, 숙주 박테리아의 비제한적인 예인 AT1은 NCIMB 41336으로서 기탁된 것이다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 수탁 번호 NCIMB 41349하에 기탁된 박테리오파지의 게놈과 적어도 약 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 95%, 또는 99%의 서열 동일성을 가지는 게놈을 가진다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 수탁 번호 NCIMB 41350하에 기탁된 박테리오파지의 게놈과 적어도 87%의 서열 동일성을 가지는 게놈을 가진다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 수탁 번호 NCIMB 41351하에 기탁된 박테리오파지의 게놈과 적어도 88%의 서열 동일성을 가지는 게놈을 가진다. P. 아크네스 박테리오파지와 관련된 추가의 비제한적인 설명은 2015년 6월 30일 등록된 미국 특허 제9,068,159호 B2에 제공되어 있으며, 상기 특허의 전문이 본원에서 참조로 포함된다. "파지" 및 "박테리오파지"라는 용어는 본원에서 상호교환적으로 사용된다.
본원에서 사용되는 바, 바이오필름을 "분해하는"이라는 것은 (예컨대, 효소 활성에 의해) 바이오필름의 일부를 형성하는 적어도 하나의 화합물의 공유 결합을 절단하는 것을 의미한다. 바이오필름의 일부를 형성할 수 있는 화합물의 비제한적인 예로는 중합체, 글리코시드, 단백질, 다당류, 및 핵산을 포함한다. 본원에서 사용되는 바, "P. 아크네스 바이오필름 분해 효소"는 P. 아크네스 바이오필름의 일부를 형성하는 적어도 하나의 화합물을 분해하는 효소이다.
본원에서 제공된 효소는 효소 활성(예컨대, 천연 단백질과 비교하여 적어도 50%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 내의 활성)을 유지하는 임의의 자연적으로 발생된 형태, 호몰로그, 이소폼, 또는 변이체를 포함한다. 실시양태에서, 변이체는 자연적으로 발생된 형태와 비교하여 전체 서열 또는 서열 일부(예컨대, 50, 100, 150 또는 200개의 연속 아미노산 부분) 간에 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%의 아미노산 서열 동일성을 가진다.
박테리아 또는 박테리오파지에 적용될 때, "단리된"이라는 용어는 (1) (자연적으로든, 또는 실험 환경에서든 상관없이) 초기에 생산되었을 때 그와 함께 회합되어 있었던 성분들 중 적어도 일부로부터 분리되고/거나, (2) 예컨대, (제한하는 것은 아니지만) 예컨대, 플레이트 상에서 및/또는 발효기 중에서 성장시키는 인공 배양 조건을 사용하여 인공적으로 생산, 제조, 정제 및/또는 제작된 박테리아 또는 박테리오파지를 지칭한다. 단리된 박테리아는, 비록 상기 배양물이 단일배양물이 아닌 경우라도, 배양된 상기 박테리아를 포함한다. 실시양태에서, 단리된 박테리아는 (예컨대, 플레이트 상에서 또는 예컨대, 발효기 중 액체 배양물에서) 단일배양물로서 배양된 박테리아이다. 단리된 박테리아 및 박테리오파지는 초기에 회합되어 있었던 다른 성분의 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 90%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 99% 이상으로부터 분리될 수 있다(예컨대, 중량%로). 실시양태에서, 단리된 박테리아는 약 80%, 약 85%, 약 90%, 약 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99% 초과, 또는 약 99% 초과로 순수한다(예컨대, 중량%로). 실시양태에서, 단리된 박테리오파지는 약 80%, 약 85%, 약 90%, 약 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99% 초과, 또는 약 99% 초과로 순수한다(예컨대, 중량%로). 실시양태에서, 본원에서 제공된 조성물은 하나 이상의 단리된 박테리오파지를 포함한다. 실시양태에서, 본원에서 제공된 조성물은 단리된 박테리오파지를 포함한다. 실시양태에서, 투여되는 박테리오파지는 단리된 박테리오파지이다. 실시양태에서, 본원에서 제공된 조성물은 하나 이상의 단리된 박테리아를 포함한다. 실시양태에서, 본원에서 제공된 조성물은 단리된 박테리아를 포함한다. 실시양태에서, 투여되는 박테리아는 단리된 박테리아이다.
"대조군" 샘플 또는 값이란, 시험 샘플과의 비교를 위해 참조, 일반적으로, 공지된 참조로서의 역할을 하는 샘플을 지칭한다. 예를 들어, 시험 샘플을 예컨대, 시험 화합물(예컨대, 효소) 또는 파지 존재하에 시험 조건으로부터 취하고, 그를 예컨대, 시험 화합물, 파지, 또는 박테리아(음성 대조군)의 부재하에서, 또는 공지된 화합물, 파지, 또는 박테리아(양성 대조군)의 존재하에서의 공지된 조건으로부터 취한 샘플과 비교할 수 있다. 대조군은 또한 다수의 시험 또는 결과를 모아서 구한 평균값을 나타낼 수 있다. 대조군은 임의 개수의 파라미터의 사정을 위해 디자인될 수 있다는 것을 당업자는 이해할 것이다. 예를 들어, 대조군은 약리적 데이터(예컨대, 반감기, 바이오필름 또는 그의 성분의 분해, 또는 박테리아 세포 용해), 또는 치료 척도(예컨대, 부작용 비교)에 기초하여 치료적 이익을 비교하기 위해 고안될 수 있다. 어떤 대조군이 주어진 상황하에서 가치가 있는지, 및 대조군 값과의 비교에 기초하여 데이터를 분석할 수 있는지를 당업자를 이해할 것이다. 대조군은 또한 데이터의 유의도를 측정하는 데에도 가치가 있다. 예를 들어, 주어진 파라미터에 대한 값이 대조군에서 광범위하게 변화가 많다면, 시험 샘플에서의 변화는 유의적인 것으로 간주되지 않을 것이다.
"핵산"이란, 단일, 이중, 또는 다중 가닥 형태의 뉴클레오티드(예컨대, 데옥시리보뉴클레오티드 또는 리보뉴클레오티드) 및 그의 중합체, 또는 그의 상보체를 지칭한다. "폴리뉴클레오티드," "올리고뉴클레오티드," "올리고"라는 용어 등은 일반적인 통상의 의미에서 뉴클레오티드의 선형 서열을 지칭한다. 올리고뉴클레오티드의 길이는 전형적으로 약 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 15, 25, 30, 40, 50개 이상의 뉴클레오티드, 최대 약 100개의 뉴클레오티드 길이이다. 폴리뉴클레오티드는 더욱 긴 길이를 포함하는, 임의 길이의 중합체, 예컨대, 200, 300, 500, 1000, 2000, 3000, 5000, 7000, 10000, 20000, 30000, 40000개 길이 등의 중합체이다. 비록 일부 경우에서는 예컨대, 포스포라미데이트, 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 또는 O-메틸포스포로아미다이트 결합을 포함하는 대체 백본을 가질 수 있는 핵산 유사체가 포함되지만, 폴리뉴클레오티드 및 올리고뉴클레오티드는 일반적으로 포스포디에스테르 결합; 및 펩티드 핵산 백본 및 결합을 함유할 것이다. 다른 유사체 핵산은 미국 특허 제5,235,033호 및 제5,034,506호, 및 문헌 [Chapters 6 and 7, ASC Symposium Series 580, Carbohydrate Modifications in Antisense Research, Sanghui & Cook, eds]에 기술된 것을 비롯한, 양성 백본; 비이온성 백본, 및 비리보스 백본을 가지는 것을 포함한다. 하나 이상의 카보사이클릭 당을 함유하는 핵산 또한 핵산의 한 정의에 포함된다. 리보스-포스페이트 백본의 변형은 예컨대, 생리적 환경에서의 상기 분자의 안정성 및 반감기 증가를 위해, 또는 바이오칩 상에서의 프로브로서 작용할 수 있도록 하기 위한 것과 같은 다양한 이유에서 수행될 수 있다. 자연적으로 발생된 핵산 및 유사체의 혼합물이 제조될 수 있고; 대안적으로, 상이한 핵산 유사체의 혼합물, 및 자연적으로 발생된 핵산 및 유사체의 혼합물이 제조될 수 있다.
"bp"라는 용어 등은 일반적인 통상의 의미에서 명시된 염기쌍 개수를 지칭한다.
"서열 동일성(%)"은 비교창에 걸쳐 최적으로 정렬된 2종의 서열을 비교함으로써 측정되며, 여기서, 비교창 중의 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드 서열의 일부는 두 서열의 최적의 정렬을 위해 (부가 또는 결실을 포함하지 않는) 참조 서열과 비교하여 부가 또는 결실(즉, 갭)을 포함할 수 있다. 실시양태에서, 동일성(%)은 동일한 핵산 염기 또는 아미노산 잔기가 두 서열 모두에 존재하는 위치의 개수를 측정하여 매칭되는 위치의 개수를 구하고, 매칭되는 위치의 개수를 비교창 내의 위치의 총 개수로 나누고, 그 값에 100을 곱하여 서열 동일성(%)을 구함으로써 계산된다.
2종 이상의 핵산 또는 폴리펩티드 서열과 관련하여 "동일한" 또는 "동일성(%)"이라는 용어는 2종 이상의 핵산 또는 폴리펩티드 서열과 관련하여 "동일한" 또는 "동일성(%)"이라는 용어는 하기 서열 비교 알고리즘 중 하나를 사용함으로써, 또는 수동 정렬 및 시각적 검사에 의해 측정된 바, 비교창 또는 지정된 영역에 걸쳐 최대한 상응하도록 비교 및 정렬되었을 때, 2종 이상의 서열 또는 서브서열이 동일하거나, 또는 동일한 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드를 명시된 비율로 가진다는 것(즉, 예컨대, 전체 핵산 또는 폴리펩티드 서열, 또는 핵산 또는 폴리펩티드의 개별적인 일부부 또는 도메인의 명시된 영역에 걸쳐 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 이상의 동일성을 가진다는 것)을 지칭한다. 이어서, 상기 서열은 "실질적으로 동일하다"라고 언급된다. 상기 정의는 또한 시험 서열의 상보체를 지칭한다. 실시양태에서, 동일성은 길이가 약 20, 50, 100, 1000, 2500, 5000, 7500, 10000, 15000, 20000, 25000, 또는 30000개의 아미노산 또는 뉴클레오티드, 또는 적어도 약 20, 50, 100, 1000, 2500, 5000, 7500, 10000, 15000, 20000, 25000, 또는 30000개의 아미노산 또는 뉴클레오티드 내지 길이가 약 31000, 32000, 33000, 34000 또는 35000개의 아미노산 또는 뉴클레오티드, 약 31000, 32000, 33000, 34000 또는 35000개 미만의 아미노산 또는 뉴클레오티드, 또는 적어도 약 31000, 32000, 33000, 34000 또는 35000개의 아미노산 또는 뉴클레오티드인 영역에 걸쳐 존재한다. 임의적으로, 동일성은 길이가 적어도 약 10 내지 약 100, 약 20 내지 약 75, 약 30 내지 약 50개의 아미노산 또는 뉴클레오티드인 영역에 걸쳐 존재한다. 임의적으로, 동일성은 길이가 적어도 약 50개의 아미노산인 영역에 걸쳐, 또는 더욱 바람직하게, 길이가 100 내지 500, 또는 1000개 이상의 아미노산인 영역에 걸쳐 존재한다. 본원에서는 서열 번호 1, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 또는 27 중 임의의 것과 실질적으로 동일한 서열을 가지는 핵산(예컨대, 게놈 또는 그의 일부)을 포함하는 파지를 포함한다. 본원에서 제공된 파지의 비제한적인 예로는 서열 번호 1과 실질적으로 동일한 서열을 가지는 게놈을 포함한다.
서열 비교를 위해, 전형적으로는 한 서열이 시험 서열과 비교되는 참조 서열로서의 역할을 한다. 서열 비교 알고리즘을 사용할 경우, 시험 서열 및 참조 서열을 컴퓨터에 입력하고, 필요할 경우, 서브서열 좌표를 지정하고, 서열 알고리즘 프로그램 파라미터를 지정한다. 바람직하게, 디폴트 프로그램 파라미터를 사용할 수 있거나, 또는 대체 파라미터를 지정할 수 있다. 이어서, 서열 비교 알고리즘은 프로그램 파라미터에 기초하여 참조 서열과의 비교로 시험 서열에 대한 서열 동일성(%)을 계산한다.
본원에서 사용되는 바, "비교창"은 두 서열이 최적으로 정렬된 후, 서열이 같은 개수의 인접한 위치로 이루어진 참조 서열과 비교될 수 있는 것인, 인접한 위치의 개수 중 어느 하나로 이루어진 세그먼트를 언급하는 것을 포함한다. 실시양태에서, 비교창은 약 20, 50, 100, 1000, 2500, 5000, 7500, 10000, 15000, 20000, 25000, 또는 30000개 또는 적어도 약 20, 50, 100, 1000, 2500, 5000, 7500, 10000, 15000, 20000, 25000, 또는 30000개 내지 약 31000, 32000, 33000, 34000 또는 35000개, 약 31000, 32000, 33000, 34000 또는 35000개 미만, 또는 적어도 약 31000, 32000, 33000, 34000 또는 35000개의 인접한 위치를 포함한다. 실시양태에서, 비교창은 약 20개 또는 적어도 약 20개 내지 약 31000개, 약 31000개 미만, 또는 적어도 약 31000개의 인접한 위치를 포함한다. 실시양태에서, 비교창은 약 25000개 또는 적어도 약 25000개 내지 약 31000개, 약 31000개 미만, 또는 적어도 약 31000개의 인접한 위치를 포함한다. 실시양태에서, 비교창은 약 26000개 또는 적어도 약 26000개 내지 약 31000개, 약 31000개 미만, 또는 적어도 약 31000개의 인접한 위치를 포함한다. 실시양태에서, 비교창은 약 27000개 또는 적어도 약 27000개 내지 약 31000개, 약 31000개 미만, 또는 적어도 약 31000개의 인접한 위치를 포함한다. 실시양태에서, 비교창은 약 28000개 또는 적어도 약 28000개 내지 약 31000개, 약 31000개 미만, 또는 적어도 약 31000개의 인접한 위치를 포함한다. 실시양태에서, 비교창은 약 29000개 또는 적어도 약 29000개 내지 약 31000개, 약 31000개 미만, 또는 적어도 약 31000개의 인접한 위치를 포함한다. 실시양태에서, 비교창은 약 30000개 또는 적어도 약 30000개 내지 약 31000개, 약 31000개 미만, 또는 적어도 약 31000개의 인접한 위치를 포함한다. 실시양태에서, 비교창은 약 20개 내지 약 600개, 약 50개 내지 약 200개, 또는 약 100개 내지 약 150개의 인접한 위치를 포함한다. 실시양태에서, 비교창은 박테리오파지 게놈의 서열과 같은, 전장의 참조 서열이다. 비교를 위한 서열 정렬 방법은 당업계에 널리 공지되어 있다. 실시양태에서, 비교를 위한 서열의 최적의 정렬은 예컨대, 문헌 [Smith & Waterman, Adv. Appl. Math. 2:482 (1981)]의 국소적 상동성 알고리즘에 의해, 문헌 [Needleman & Wunsch, J. Mol. Biol. 48:443 (1970)]의 상동성 정렬 알고리즘에 의해, 문헌 [Pearson & Lipman, Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 85:2444 (1988)]의 유사성 방법에 대한 검색에 의해, 이들 알고리즘(위스콘신 제네틱스 소프트웨어 패키지(Wisconsin Genetics Software Package: 미국 위스콘신주 매디슨 사이언스 드라이브 575 제네틱스 컴퓨터 그룹)에서 GAP, BESTFIT, FASTA 및 TFASTA)의 컴퓨터화된 이행에 의해, 또는 수동 정렬 및 시각적 검사(예컨대, 문헌 [Current Protocols in Molecular Biology (Ausubel et al., eds. 1995 supplement)] 참조)에 의해 수행될 수 있다.
서열 동일성(%) 및 서열 유사성(%)을 측정하는 데 적합한 알고리즘에 관한 예로는 BLAST 및 BLAST 2.0 알고리즘이 있으며, 이는 각각 문헌 [Altschul et al., Nuc . Acids Res. 25:3389-3402 (1977)] 및 [Altschul et al., J. Mol . Biol. 215:403-410 (1990))에 기술되어 있다. 본 발명의 핵산 및 단백질에 대한 서열 동일성(%)을 측정하는 데 본원에 기술된 파라미터와 함께 BLAST 및 BLAST 2.0이 사용된다. 당업자가 이해하는 바와 같이, BLAST 분석 실행용 소프트웨어는 미국 국립 생명 공학 정보 센터(NCBI: National Center for Biotechnology Information)의 웹사이트를 통해 공개적으로 이용할 수 있다. 실시양태에서, 본원에 기술된 파라미터와 함께 BLAST 및 BLAST 2.0을 이용하여 핵산 및 단백질에 대한 서열 동일성(%)을 측정한다. 실시양태에서, BLAST 알고리즘은 먼저 데이터베이스 서열에서 동일한 길이의 워드와 함께 정렬되었을 때, 어느 정도의 양의 값의 임계값 점수 T에 매칭되거나, 그를 충족시키는 질의 서열에서 길이 W의 짧은 워드를 확인함으로써 높은 점수화 서열 쌍(HSP: high scoring sequence pair)을 확인하는 것을 포함한다. 실시양태에서, T는 근접 워드 점수 임계값으로 지칭된다(문헌 [Altschul et al. 상기 문헌 동일]). 실시양태에서, 이들 초기 근접 워드 히트는 이들을 함유하는 더 긴 HSP를 찾기 위한 탐색 개시용 시드로서 작용한다. 실시양태에서, 워드 히트는 누적 정렬 점수가 증가될 수 있는 한, 각각의 서열을 따라서 양 방향으로 연장된다. 실시양태에서, 누적 점수는 뉴클레오티드 서열의 경우, 파라미터 M(매칭되는 잔기의 쌍에 대한 보상 점수; 항상 >0) 및 N(미스매칭되는 잔기에 대한 패널티 점수; 항상<0)을 사용하여 계산된다. 실시양태에서, 아미노산 서열의 경우, 점수화 매트릭스를 사용하여 누적 점수를 계산한다. 실시양태에서, 각각의 방향에서 워드 히트의 연장은 누적 정렬 점수가 달성된 그의 최대값으로부터 양 X 만큼 떨어지거나; 누적 점수가 하나 이상의 음의 점수화 잔기 정렬의 누적으로 인하여 0 이하가 되거나; 또는 어느 한 서열의 말단에 도달한 경우에는 중지된다. 실시양태에서, BLAST 알고리즘 파라미터 W, T 및 X가 정렬의 감도 및 속도를 결정한다. 실시양태에서, NCBI BLASTN 또는 BLASTP 프로그램이 서열을 정렬하는 데 사용된다. 실시양태에서, BLASTN 또는 BLASTP 프로그램은 NCBI에 의해 사용되는 디폴트를 사용하였다. 실시양태에서, BLASTN 프로그램(뉴클레오티드 서열의 경우)은 디폴트로서 워드 길이 (W) 28; 예상 임계값 (E) 10; 질의 범위에서 최대 매치 0으로 설정; 매치/미스매치 점수 1, -2; 선형 갭 비용; 사용된 낮은 복작성 영역에 대한 필터; 및 오직 사용된 순람표에 대한 마스크를 사용한다. 실시양태에서, BLASTP 프로그램(아미노산 서열의 경우)은 디폴트로서 워드 길이 (W) 3; 예상 임계값 (E) 10; 질의 범위에서 최대 매치 0으로 설정; BLOSUM62 매트릭스 (문헌 [Henikoff & Henikoff, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:10915 (1992)] 참조); 존재 갭 비용: 11 및 연장 갭 비용: 1; 및 조건부 조성 점수 매트릭스 조정을 사용한다.
"폴리펩티드" "펩티드" 및 "단백질"이라는 용어는 본원에서 상호교환적으로 사용되며, 이는 아미노산 잔기의 중합체를 지칭한다. 상기 용어는 자연적으로 발생된 아미노산 중합체 및 비자연적으로 발생된 아미노산 중합체 뿐만 아니라, 하나 이상의 아미노산 잔기가 상응하는 자연적으로 발생된 아미노산의 인공 화학적 모방체인 아미노산 중합체에도 적용된다.
"아미노산"이라는 용어는 자연적으로 발생된 아미노산 및 합성 아미노산 뿐만 아니라, 자연적으로 발생된 아미노산과 유사한 방식으로 작용하는 아미노산 유사체 및 아미노산 모방체도 지칭한다. 자연적으로 발생된 아미노산은 유전자 코드에 의해 코딩된 것 뿐만 아니라, 추후에 변형되는 아미노산, 예컨대, 하이드록시프롤린, γ-카복시글루타메이트, 및 O-포스포세린이다. 아미노산 유사체란 자연적으로 발생된 아미노산과 동일한 기본 화학적 구조를 가지는, 즉, 수소에 결합된 α 탄소, 카복실 기, 아미노 기, 및 R 기를 가지는 화합물을 지칭하며, 예컨대, 호모세린, 노르류신, 메티오닌 술폭시드, 메티오닌 메틸 술포늄이 있다. 상기와 같은 유사체는 변형된 R 기(예컨대, 노르류신) 또는 변형된 펩티드 백본을 가지지만, 자연적으로 발생된 아미노산과 동일한 기본 화학적 구조를 보유한다. 아미노산 모방체란 아미노산의 일반 화학 구조와는 상이한 구조를 가지지만, 자연적으로 발생된 아미노산과 유사한 방식으로 작용하는 화학 화합물을 지칭한다.
본원에서 아미노산은 아미노산에 관해 보편적으로 알려져 있는 3문자 기호로 또는 IUPAC-IUB 생화학 명명법 위원회(IUPAC-IUB Biochemical Nomenclature Commission)에 의해 권고되는 1문자 기호로 나타낼 수 있다. 유사하게, 뉴클레오티드도 뉴클레오티드에 관해 보편적으로 허용되는 1문자 코드로 나타낼 수 있다.
"보존적으로 변형된 변이체"는 아미노산 및 핵산 서열, 둘 모두에 적용된다. 특정 핵산 서열과 관련하여, 보존적으로 변형된 변이체란 동일하거나, 또는 본질적으로 동일한 아미노산 서열을 코딩하는 핵산, 또는 핵산이 아미노산 서열을 코딩하지 않을 경우, 본질적으로 동일한 서열을 의미한다. 유전자 코드의 축퇴성에 기인하여, 다수의 작용상 동일한 핵산이 임의의 주어진 단백질을 코딩한다. 예를 들어, 코돈 GCA, GCC, GCG 및 GCU, 모두가 아미노산 알라닌을 코딩한다. 따라서, 코돈에 의해 알라닌으로 명시되는 모든 위치에서 코돈은 코딩되는 폴리펩티드는 변경시키지 않으면서, 기술된 상응하는 코돈 중 임의의 것으로 변경될 수 있다. 그러한 핵산 변이가 "침묵 변이"인데, 이는 보존적으로 변형된 변이 중의 한 종류이다. 폴리펩티드를 코딩하는 본원의 모든 핵산 서열 또한 핵산의 모든 가능한 침묵 변이를 설명한다. 핵산 중의 각 코돈(단, 보통 메티오닌에 대한 유일의 코돈인 AUG, 및 보통 트립토판에 대한 유일의 코돈인 TGG 제외)을 변형시킴으로써 작용상 동일한 분자를 수득할 수 있다는 것을 당업자는 이해할 것이다. 따라서, 폴리펩티드를 코딩하는 핵산의 각 침묵 변이는 실제 프로브 서열과는 상관없이, 발현 생성물과 관련하여 기술된 각 서열에 내재되어 있다.
아미노산 서열과 관련하여, 단일 아미노산을 변경시키는 펩티드, 폴리펩티드, 또는 단백질 서열에 대한 개별 치환은 변경으로 인해 아미노산이 화학적으로 유사한 아미노산으로 치환되는 "보존적으로 변형된 변이체"라는 것을 당업자는 이해할 것이다. 작용상 유사한 아미노산을 제공하는 보존적 치환 표는 당업계에 널리 공지되어 있다. 그러한 보존적으로 변형된 변이체는 추가로 본 발명의 다형태 변이체, 종간 상동체, 및 대립유전자를 포함하며, 배제시키지 않는다.
하기 8개의 군은 각각 서로 보존적 치환을 하는 아미노산을 포함한다: 1) 알라닌(A), 글리신(G); 2) 아스파르트산(D), 글루탐산(E); 3) 아스파라긴(N), 글루타민(Q); 4) 아르기닌(R), 리신(K); 5) 이소류신(I), 류신(L), 메티오닌(M), 발린(V); 6) 페닐알라닌(F), 티로신(Y), 트립토판(W); 7) 세린(S), 트레오닌(T); 및 8) 시스테인(C), 메티오닌(M)(예컨대, 문헌 [Creighton, Proteins (1984)] 참조).
"질환"이라는 용어는 포유동물의 정상적인 건강 상태로부터 벗어난 임의의 이탈을 지칭하며, 질환 증상이 존재할 때의 상태 뿐만 아니라, 이탈(예컨대, 장내 세균 불균형, 감염, 유전자 돌연변이, 유전적 결함 등)이 발생하기는 하였지만, 증상은 아직 나타나지 않은 상태를 포함한다. 실시양태에서, 질환은 여드름이다. 실시양태에서, 질환은 진피 장내 세균 불균형을 포함한다. 실시양태에서, 본원에서 제공된 방법, 조성물, 시스템, 파지, 및 프로바이오틱 박테리아는 제한 없이, 영장류(예컨대, 인간), 가축, 사역 동물, 및 가정 애완 동물(예컨대, 반려 동물)을 비롯한, 척추동물 강, 포유류의 구성원인 피험체에서 사용하기에 적합하다. 실시양태에서, 피험체는 인간 피험체이다. 본원에서 사용되는 바, 질환의 "증상"으로는 질환과 연관된 임상적 또는 실험실 소견을 포함하며, 피험체가 감지하거나, 또는 관찰할 수 있는 것으로 제한되지 않는다.
본원에서 사용되는 바, "진피 장내 세균 불균형"이라는 용어는 건강하거나, 또는 일반적인 집단과 비교하였을 때 보이는 피부 마이크로바이오타의 차이를 의미한다. 실시양태에서, 장내 세균 불균형은 피부 표면 상에, 피부 내에(예컨대, 피부 영역 또는 피부 세포층 내에), 선 내에, 및/또는 피부의 모공 내에 존재한다. 실시양태에서, 장내 세균 불균형은 땀 및/또는 피지 내에 존재한다. 실시양태에서, 피부는 얼굴 상의 피부이다(예컨대, 피험체의 이마, 하나 이상의 볼, 코, 또는 턱). 실시양태에서, 피부는 어깨, 흉부, 또는 등 상의 피부이다. 실시양태에서, 진피 장내 세균 불균형은 건강하거나, 또는 일반적인 집단과 비교하였을 때 보이는 마이크로바이오타 공생 종 다양성의 변화를 포함하고, 유익한 미생물의 감소 및/또는 잠재적인 장내 유해균(pathobiont)(병원성 또는 잠재적 병원성 미생물)의 증가 및/또는 전반적인 마이크로바이오타 종 다양성의 감소를 포함할 수 있다. (예컨대, 사춘기 동안의) 호르몬 변화, 저빈도로 씻기, 화장품 사용, 항생제 사용, 생리적 및 신체적 스트레스, 방사선, 및 식이 변화를 비롯한 다수의 인자가 장내 세균 불균형을 일으킬 수 있다.
실시양태에서, 조성물은 "치료적 유효 용량"으로 여드름을 앓는 피험체에게 투여된다. 본 용도에 효과적인 양은 질환의 중증도, 및 일반적인 환자의 건강 상태에 의존할 수 있다. 조성물의 단일 또는 다회 투여는 환자의 요구 및 허용에 따른 투여량 및 빈도에 의존하여 수행될 수 있다. "환자" 또는 "피험체"는 인간 및 다른 동물, 특히 포유동물, 둘 모두를 포함한다. 따라서, 본 방법은 인간 요법 및 수의적 적용, 둘 모두에 적용될 수 있다.
"약학적으로 허용가능한 부형제" 및 "약학적으로 허용가능한 담체"란, 활성제의 피험체에게로의 투여 및 피험체에 의한 흡수를 돕는 물질을 지칭하며, 이는 환자에게 유의적인 유해한 독성 효과를 일으키지 않으면서, 본 발명의 조성물 중에 포함될 수 있다. 약학적으로 허용가능한 부형제의 비제한적인 예로는 물, NaCl, 생리 식염수, 락테이트를 첨가한 링거액, 일반 수크로스, 일반 글루코스, 결합제, 충전제, 붕해제, 활택제, 코팅제, 감미제, 향미제, 염 용액(예컨대, 링거액), 알콜, 오일, 젤라틴, 탄수화물, 예컨대, 락토스, 아밀라제 또는 전분, 지방산 에스테르, 하이드록시메틸셀룰로스, 폴리비닐 피롤리딘, 및 착색제 등을 포함한다. 상기 제제는 멸균화될 수 있고, 원하는 경우, 본 발명의 박테리오파지, 프로바이오틱 박테리아, 및/또는 화합물과 유해하게 반응하지 않는 보조제, 예컨대, 활택제, 보존제, 안정제, 습윤화제, 유화제, 삼투압에 영향을 주는 염, 완충제, 착색제, 및/또는 방향족 물질 등과 함께 혼합될 수 있다. 당업자는 다른 약학 부형제도 본 발명에서 유용하다는 것을 이해할 것이다.
"접촉하는"이라는 용어는 2개의 종이 반응하거나, 상호작용하거나, 또는 물리적으로 닿을 수 있게 허용하는 것을 포함할 수 있고, 여기서, 2개의 종은 예를 들어, 본원에 기술된 효소, 및 효소의 기질을 포함하는 바이오필름일 수 있다. 또 다른 예에서, 2개의 종은 박테리오파지, 및 박테리오파지가 감염시키는 종의 세포일 수 있다. 실시양태에서, 접촉하는이라는 것은 예를 들어, 본원에 기술된 박테리오파지가 P. 아크네스 세포와 상호작용할 수 있게 하는 것을 포함한다. 실시양태에서, 접촉하는이라는 것은 예를 들어, 본원에 기술된 효소가 P. 아크네스 바이오필름과 상호작용할 수 있게 하는 것을 포함한다.
"환자" 또는 "그를 필요로 하는 피험체"란, 명시된 장애를 앓고 있거나, 또는 그를 앓을 수 있는 동물계의 살아있는 구성원을 지칭한다. 실시양태에서, 피험체는 천연적으로 질환을 앓고 있는 개체를 포함하는 종의 구성원이다. 실시양태에서, 피험체는 포유동물이다. 포유동물의 비제한적일 예로는 설치류(예컨대, 마우스 및 토끼), 영장류(예컨대, 여우원숭이, 갈라고원숭이, 원숭이, 유인원, 및 인간), 토끼, 개(예컨대, 반려견, 서비스 개, 또는 사역견, 예컨대, 경찰견, 군견, 경주용 개, 또는 쇼 개), 말(예컨대, 경주용 말 및 사역 말), 고양이(예컨대, 길들여진고양이), 가축(예컨대, 돼지, 소, 당나귀, 노새, 들소, 염소, 낙타, 및 양), 및 사슴을 포함한다. 실시양태에서, 피험체는 인간이다.
"피험체," "환자," "개체"라는 용어 등은 제한적인 것으로 의도되지 않고, 일반적으로 상호교환될 수 있다. 즉, "환자"로서 기술된 개체는 반드시 주어지 질환을 앓아야 하는 것이 아니라, 단지 의학적 자문만을 구할 수 있다.
본원에서 사용되는 바, 종에 대한 "종(sp.)"이라는 약어는 명시된 속의 적어도 하나의 종(예컨대, 1, 2, 3, 4, 5개 이상의 종)을 의미한다. "종(spp.)"이라는 약어는 명시된 속의 2개 이상의 종(예컨대, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10개 이상)을 의미한다. 실시양태에서, 본원에서 제공된 방법 및 조성물은 명시된 속 또는 명시된 속들 내의 단일 종, 또는 명시된 속 또는 명시된 속들 내의 2개 이상의 (예컨대, 2개 초과를 포함하는 복수의) 종들을 포함한다. 실시양태에서, 명시된 종 중 1, 2, 3, 4, 5개 이상 또는 그 모두 단리된 것이다. 실시양태에서, 명시된 종들은 함께 투여된다. 실시양태에서, 각각의 명시된 종들은 각 종을 포함하는 단일 조성물 중에 존재한다. 실시양태에서, 각 종은 예컨대, 서로 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 30, 또는 60, 1-5, 1-10, 1-30, 1-60, 또는 5-15초 또는 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 30, 또는 60, 1-5, 1-10, 1-30, 1-60, 또는 5-15분 이내로 공동으로 투여된다.
본 개시내용에서, "포함하다(comprises)," "포함하는(comprising)," "함유하는(containing)," 및 "가지는(having)" 등은 미국 특허법에서 그에 해당하는 의미를 가질 수 있고, "포함하다(includes)," "포함하는(including)" 등을 의미할 수 있다. 따라서, "포함하는(including)," "함유하는" 또는 "~을 특징으로 하는"이라는 것과 동의어인 "포함하는(comprising)"이라는 전환 용어는 포괄적이거나, 또는 확장 가능한 개방형이고, 추가의, 언급되지 않은 특징, 정수, 단계, 조작, 요소, 및/또는 성분을 배제하지는 않는다. "본질적으로 ~으로 구성된" 또는 "본질적으로 구성된다"라는 것은 유사하게 미국 특허법에서 해당되는 의미를 가지고, 상기 용어는 확장 가능한 개방형으로서, 언급된 것의 기본적인 또는 신규한 특징이 언급된 것보다 더 많이 존재하는 것에 의해 변경되지 않는 한, 언급된 것보다 더 많이 존재하는 것을 허용하지만, 선행 기술의 실시양태는 배제한다. 그에 반해, "~으로 구성된"이라는 전환 어구는 언급되지 않은 임의의 특징, 정수, 요소, 단계, 조작, 구성 성분, 및/또는 성분은 배제한다.
본원에서 사용되는 바, 수치 값 또는 범위와 관련하여 "약"이는 용어는 문맥상 더욱 제한된 범위를 요구하지 않는 한, 언급된 또는 청구된 수치 값 의 또는 범위의 ±10%를 의미한다.
본원 설명에서 및 청구범위에서, 예컨대, "~중 "적어도 하나" 또는 "~중 하나 이상"라는 어구 다음에는 요소 또는 특징으로 이루어진 목록이 연결될 수 있다. "및/또는"이라는 용어는 또한 2개 이상의 요소 또는 특징으로 이루어진 목록에 존재할 수 있다. 그가 사용되는 문맥상 암묵적으로 또는 명백하게 모순되지 않는 한, 상기 어구는 열거된 요소 또는 특징 중 임의의 것을 개별적으로, 또는 언급된 요소 또는 특징 중 임의의 것과 다른 언급된 요소 또는 특징 중 임의의 것과의 조합을 의미하는 것으로 의도된다. 예를 들어, "A 및 B 중 적어도 하나;" "A 및 B 중 하나 이상;" 및 "A 및/또는 B"라는 어구는 각각 "A 단독, B 단독, 또는 A 및 B 함께"라는 것을 의미하는 것으로 의도된다. 3개 이상의 항목을 포함하는 목록의 경우에도 또한 유사하게 해석되는 것으로 의도된다. 예를 들어, "A, B, 및 C 중 적어도 하나;" "A, B, 및 C 중 하나 이상;" 및 "A, B, 및/또는 C"라는 어구는 각각 "A 단독, B 단독, C 단독, A 및 B 함께, A 및 C 함께, B 및 C 함께, 또는 A 및 B 및 C 함께"라는 것을 의미하는 것으로 의도된다. 추가로, 본원에서 및 청구범위에서 "~에 기초하여"라는 용어를 사용하는 것은 "적어도 부분적으로 ~에 기초하여"라는 것을 의미하는 것으로 의도되며, 이로써, 언급되지 않은 특징 또는 요소도 또한 허용된다.
파라미터 범위가 제공되는 경우, 상기 범위 내의 모든 정수, 및 그의 1/10 또한 본 발명에 의해 제공된다. 예를 들어, "0.2-5 mg"은 0.2 mg, 0.3 mg, 0.4 mg, 0.5 mg, 0.6 mg 등 최대 5.0 mg까지로, 5.0 mg을 포함하는 값의 개시내용이다.
본원 설명에서 및 하기 청구범위 전역에 걸쳐 사용되는 바, "하나"("a," "an") 및 "그"라는 의미는 문맥상 달리 명백하게 명시되지 않는 한, 복수의 지시대상을 포함한다.
본원에서 사용되는 바, 병태, 질환 또는 장애, 또는 병태, 질환 또는 장애와 연관된 증상의 "치료하는" 또는 "치료"란, 임상 결과를 비롯한, 유익한 또는 원하는 결과를 얻기 위한 접근법을 지칭한다. 유익한 또는 원하는 임상 결과로는 하나 이상의 증상 또는 병태의 완화 또는 호전, 병태, 장애 또는 질환 정도의 감소, 병태, 장애 또는 질환의 상태 안정화, 병태, 장애 또는 질환 발생 예방, 병태, 장애 또는 질환 확산 예방, 병태, 장애 또는 질환 진행의 지연 또는 저속화, 병태, 장애 또는 질환 발병의 지연 또는 저속화, 병태, 장애 또는 질환 상태의 호전 또는 경감, 및 부분적 또는 완전한 관해를 포함할 수 있지만, 이에 제한되지 않는다. "치료하는"이라는 것은 또한 병태, 장애 또는 질환 진행 억제, 일시적으로 병태, 장애 또는 질환의 진행 저속화를 포함할 수 있고, 비록 일부 경우에서 그러하지만, 병태, 장애 또는 질환의 진행을 영구적으로 중단시키는 것을 포함한다. 여드름 치료의 경우, 상기 용어는 예컨대, 진피 장내 세균 불균형 및/또는 낭포성 병변, 화이트헤드(닫힌 상태의 막힌 모공), 블랙헤드(열린 상태의 막힌 모공 ― 공기에 노출된 오일이 어두운 색, 예컨대, 갈색 또는 검은색을 띠는 경우), 몰 레드(mall red), 부드러운 돌기(구진), 여드름(농포; 그 끝에 고름이 있는 구진), 피부 표면 아래의 단단하고, 통증이 있는 덩어리(결절)의 개수 또는 크기 감소를 지칭할 수 있다.
본원에서 사용되는 바, "치료하다" 및 "예방하다"라는 용어는 절대적인 용어인 것으로 의도되지 않는다. 실시양태에서, 치료란, 확립된 질환, 병태, 또는 질환 또는 병태의 증상의 중증도가 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 또는 100% 감소되는 것을 지칭할 수 있다. 실시양태에서, 질환을 치료하는 방법은 대조군과 비교하여 피험체에서 질환의 하나 이상의 증상이 10% 감소하였다면, 치료법인 것으로 간주된다. 따라서, 감소는 자연 또는 대조군 수준과 비교하여 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, 또는 10% 내지 100% 사이의 임의 비율의 감소일 수 있다. 치료란, 질환, 병태, 또는 질환 또는 병태의 증상을 반드시 치유하거나, 또는 완전히 제거하는 것을 지칭하는 것은 아님을 이해한다. 실시양태에서, 하락시키는, 감소시키는, 또는 억제시키는이라고 언급하는 것은 대조군 수준과 비교하여 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 이상의 변화를 일으키는 것을 포함하고, 상기 용어는 완전한 제거를 포함할 수는 있지만, 반드시 포함하는 것은 아니다. 치료란, 증상 발병의 임의 지연, 증상 호전, 환자 피부 외관 개선 등을 지칭할 수 있다. 치료 효과는 치료를 받지 않은 개체 또는 개체 풀과, 또는 치료 이전의, 또는 치료 동안 다른 시점의 동일 환자와 비교될 수 있다. 실시양태에서, 질환의 중증도는 예컨대, 투여 이전의 개체와 비교하여, 또는 치료를 받지 않은 대조군 개체와 비교하여 적어도 10%만큼 감소된다. 일부 측면에서, 질환의 중증도는 적어도 25%, 50%, 75%, 80%, 또는 90%만큼 감소되거나, 또는 일부 경우에서, 표준 진단 기술을 이용해서는 더 이상 검출이 불가능해진다. 실시양태에서, 치료는 여드름의 적어도 하나의 증상을 감소시키는 데 효과적이다. 실시양태에서, 치료는 피험체의 얼굴, 이마, 흉부, 등, 및/또는 어깨 상의 여드름(농포) 수준을 감소시키는 데 효과적이다. 실시양태에서, 치료는 피험체의 얼굴, 이마, 흉부, 등, 및/또는 어깨 상의 화이트헤드(닫힌 상태의 막힌 모공) 수준을 감소시키는 데 효과적이다. 실시양태에서, 치료는 피험체의 얼굴, 이마, 흉부, 등, 및/또는 어깨 상의 블랙헤드(열린 상태의 막힌 모공) 수준을 감소시키는 데 효과적이다. 실시양태에서, 치료는 피험체의 얼굴, 이마, 흉부, 등, 및/또는 어깨 상의 구진 수준을 감소시키는 데 효과적이다. 실시양태에서, 치료는 피험체의 얼굴, 이마, 흉부, 등, 및/또는 어깨 상의 피부 표면 아래의 단단하고, 통증이 있는 덩어리(결절) 수준을 감소시키는 데 효과적이다. 실시양태에서, 치료는 피험체의 얼굴, 이마, 흉부, 등, 및/또는 어깨 상의 낭포성 병변 수준을 감소시키는 데 효과적이다. 실시양태에서, 수준(예컨대, 개수)은 치료 시작 전과 비교하여 감소된다. 실시양태에서, 수준(예컨대, 개수)은 여드름을 앓고 있지만, 치료는 받지 않은 상응하는 피험체와 비교하여 감소된다. 실시양태에서, 수준(예컨대, 개수)은 여드름을 앓고 있지만, 박테리오파지를 포함하는 치료는 받지 않은 상응하는 피험체와 비교하여 감소된다.
"유효량," "유효 용량," "치료적 유효량"이라는 용어 등은 본원에 기술된 바와 같은 장애를 호전시키는 데 충분한 작용제의 양을 지칭한다. 예를 들어, 주어진 파라미터에 대해, 치료적 유효량은 적어도 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 40%, 50%, 60%, 75%, 80%, 90%, 또는 적어도 100%의 증가 또는 감소를 보일 것이다. 치료 효능은 또한 "배" 증가 또는 감소로 표현될 수 있다. 예를 들어, 치료적 유효량은 대조군과 비교하여 적어도 1.2배, 1.5배, 2배, 5배 이상의 효과를 보일 수 있다.
"진단"이라는 용어는 피험체가 주어진 대사 장애를 앓을 상대적 확률을 지칭한다. 증상 및 진단 기준은 본원에 요약되어 있다. 유사하게, "예후"라는 용어는 특정의 추후 결과가 피험체에서 발생할 수 있는 상대적 확률을 지칭한다. 예를 들어, 본 발명과 관련하여, 예후란, 개체에서 여드름이 발생할 가능성을 지칭할 수 있다. 예후란, 질환의 예상 중증도(예컨대, 증싱의 중증도, 기능 감소 속도 등) 또한 지칭할 수 있다. 의학 진단 분야의 숙련가가 이해하는 바와 같이, 용어는 절대적 용어로 의도되지 않는다.
박테리오파지를 포함하는 조성물 및
조합
한 측면에서, 본원에서는 적어도 하나의 P. 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하거나, 본질적으로 그로 구성되거나, 또는 그로 구성된 조성물을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지, 1개 이하의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 1개 이하의 항여드름 화합물로 구성된 활성 성분, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 적어도 하나의 P. 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물로서, 여기서, 조성물은 프로바이오틱 박테리아를 포함하지 않는 것인 조성물을 제공한다.
실시양태에서, 적어도 하나의 항여드름 화합물은 벤조일 퍼옥시드이다. 실시양태에서, 벤조일 퍼옥시드는 2.5% 내지 10% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 벤조일 퍼옥시드는 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 또는 2% 초과이되, 2.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 벤조일 퍼옥시드는 2.5% 내지 10%, 예컨대, 약 2.5%, 3%, 3.5%, 4%, 4.5%, 5%, 5.5%, 6%, 6.5%, 7%, 7.5%, 8%, 8.5%, 9%, 9.5%, 또는 10% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 벤조일 퍼옥시드는 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 또는 2% 초과이되, 2.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재한다.
실시양태에서, 적어도 하나의 항여드름 화합물은 살리실산이다. 실시양태에서, 살리실산은 0.5% 내지 2% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 살리실산은 약 0.1% 초과이되, 0.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 살리실산은 0.5% 내지 2%, 예컨대, 약 0.5%, 0.6%, 0.7%, 0.8%, 0.9%, 1%, 1.1%, 1.2%, 1.3%, 1.4%, 1.5%, 1.6%, 1.7%, 1.8%, 1.9%, 또는 2% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 살리실산은 약 0.1% 초과이되, 0.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재한다.
실시양태에서, 적어도 하나의 항여드름 화합물은 황이다. 실시양태에서, 황은 3% 내지 10% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 황은 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 2%, 또는 2.5% 초과이되, 3% (중량/부피) 미만의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 황은 3% 내지 10%, 예컨대, 약 3%, 3.5%, 4%, 4.5%, 5%, 5.5%, 6%, 6.5%, 7%, 7.5%, 8%, 8.5%, 9%, 9.5%, 또는 10% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 황은 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 2%, 또는 2.5% 초과이되, 3% (중량/부피) 미만의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 레조르시놀은 2% (중량/부피)의 농도로 존재하고, 황은 3% 내지 8% (예컨대, 약 2.5%, 3%, 3.5%, 4%, 4.5%, 5%, 5.5%, 6%, 6.5%, 7%, 7.5%, 또는 8% (중량/부피)의 농도로 존재한다.
실시양태에서, 적어도 하나의 항여드름 화합물은 레조르시놀 및 황이다. 실시양태에서, 레조르시놀은 2% (중량/부피)의 농도로 존재하고, 황은 3% 내지 8% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 레조르시놀은 2% (중량/부피)의 농도로 존재하고, 황은 3% 내지 8% (예컨대, 약 2.5%, 3%, 3.5%, 4%, 4.5%, 5%, 5.5%, 6%, 6.5%, 7%, 7.5%, 또는 8% (중량/부피)의 농도로 존재한다.
실시양태에서, 적어도 하나의 항여드름 화합물은 레조르시놀 모노아세테이트 및 황이다. 실시양태에서, 레조르시놀 모노아세테이트는 3% (중량/부피)의 농도로 존재하고, 황은 3% 내지 8% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 레조르시놀 모노아세테이트는 3% (중량/부피)의 농도로 존재하고, 황은 3% 내지 8% (예컨대, 약 2.5%, 3%, 3.5%, 4%, 4.5%, 5%, 5.5%, 6%, 6.5%, 7%, 7.5%, 또는 8% (중량/부피)의 농도로 존재한다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 약 1x106, 2x106, 3x106, 4x106, 5x106, 6x106, 7x106, 8x106, 9x106, 1x107, 2x107, 3x107, 4x107, 5x107, 6x107, 7x107, 8x107, 9x107, 1x108, 2x108, 3x108, 4x108, 5x108, 6x108, 7x108, 8x108, 9x108, 1x109, 2x109, 3x109, 4x109, 5x109, 6x109, 7x109, 8x109, 9x109, 1x1010, 2x1010, 3x1010, 4x1010, 5x1010, 6x1010, 7x1010, 8x1010, 9x1010, 또는 1x1011 플라크 형성 단위(pfu: plaque forming unit)의 양으로 존재한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 약 1x106 내지 1x1011 pfu의 양으로 존재한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 약 1x106 내지 1x108, 약 1x108 내지 1x109, 약 1x109 내지 1x1010, 약 1x109 내지 1x1011 또는 약 1x1010 내지 1x1011 pfu의 양으로 존재한다.
실시양태에서, 프로바이오틱 박테리아는 약 1x106, 2x106, 3x106, 4x106, 5x106, 6x106, 7x106, 8x106, 9x106, 1x107, 2x107, 3x107, 4x107, 5x107, 6x107, 7x107, 8x107, 9x107, 1x108, 2x108, 3x108, 4x108, 5x108, 6x108, 7x108, 8x108, 9x108, 1x109, 2x109, 3x109, 4x109, 5x109, 6x109, 7x109, 8x109, 9x109, 1x1010, 2x1010, 3x1010, 4x1010, 5x1010, 6x1010, 7x1010, 8x1010, 9x1010, 또는 1x1011 콜로니 형성 단위(cfu: colony forming unit)의 양으로 존재한다. 실시양태에서, 프로바이오틱 박테리아는 약 1x106 내지 1x1011 cfu의 양으로 존재한다. 실시양태에서, 프로바이오틱 박테리아는 약 1x106 내지 1x108, 약 1x108 내지 1x109, 약 1x109 내지 1x1010, 약 1x109 내지 1x1011 또는 약 1x1010 내지 1x1011 cfu의 양으로 존재한다.
실시양태에서, 항여드름 화합물은 항생제, 레티노이드, 또는 알파-하이드록시산이다.
한 측면에서, 본원에서 P. 아크네스 박테리오파지 및 효소를 포함하는 조성물을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서 적어도 하나의 P. 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물을 포함하거나, 본질적으로 그로 구성되거나, 또는 그로 구성된 조합으로서, 여기서, 적어도 하나의 P. 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물은 각각 약학적으로 허용가능한 담체를 추가로 포함하는 조성물 중에 존재하는 것인 조합을 제공한다.
한 측면에서, 본원에서는 P. 아크네스 박테리오파지 및 효소를 포함하는 조합을 제공한다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 선형 이중 가닥 DNA 게놈을 가진다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 박테리오파지 패밀리 시포비리다(Siphoviridae) 내에 있다.
실시양태에서, 박테리오파지는 야생형 박테리오파지이다. 실시양태에서, 박테리오파지는 야생형 P. 아크네스 박테리오파지의 게놈 서열과 적어도 약 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.1%, 99.2%, 99.3%, 99.4%, 99.5%, 99.6%, 99.7%, 99.8%, 또는 99.9% 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함하는 게놈을 가진다. 야생형 P. 아크네스 박테리오파지에 대한 게놈 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
실시양태에서, 박테리오파지는 수탁 번호 NCIMB 41349, 41350, 또는 41351하에 기탁된 박테리오파지이다. 실시양태에서, 박테리오파지는 수탁 번호 NCIMB 41349하에 기탁된 박테리오파지의 게놈과 적어도 약 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.1%, 99.2%, 99.3%, 99.4%, 99.5%, 99.6%, 99.7%, 99.8%, 또는 99.9% 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함하는 게놈을 가진다. 실시양태에서, 박테리오파지는 수탁 번호 NCIMB 41350하에 기탁된 박테리오파지의 게놈과 적어도 약 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.1%, 99.2%, 99.3%, 99.4%, 99.5%, 99.6%, 99.7%, 99.8%, 또는 99.9% 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함하는 게놈을 가진다. 실시양태에서, 박테리오파지는 수탁 번호 NCIMB 41351하에 기탁된 박테리오파지의 게놈과 적어도 약 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.1%, 99.2%, 99.3%, 99.4%, 99.5%, 99.6%, 99.7%, 99.8%, 또는 99.9% 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함하는 게놈을 가진다.
실시양태에서, 박테리오파지는 서열 번호 1의 뉴클레오티드 서열과 적어도 약 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.1%, 99.2%, 99.3%, 99.4%, 99.5%, 99.6%, 99.7%, 99.8%, 또는 99.9% 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함하는 게놈을 가진다. 실시양태에서, 박테리오파지는 서열 번호 1의 뉴클레오티드 서열과 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함하는 게놈을 가진다.
실시양태에서, 박테리오파지의 게놈은 5' 단부에서 3' 단부 순으로 작은 터미나제, 큰 터미나제, 포털 단백질, gp4, 스캐폴드 단백질, 메이저 헤드 단백질, gp7, gp8, gp9, gp10, 메이저 테일 단백질, gp12, gp13, 테이프 줄자 단백질, 마이너 테일 서브유니트, 임의적으로, 프로테아제, gp17, gp18, 테일 단백질, 아미다제, 홀린, gp22, gp23, 시그마 인자, gp25, gp26, gp27, gp28, gp29, gp30, DNA 프리마제, DNA 프리마제 2, gp33, DNA 헬리카제, gp35, gp36, 엑소뉴클레아제, gp38, gp39, gp40, gp41, gp42, gp43, gp44, gp45, gp46, gp47, 및 gp48을 코딩한다.
실시양태에서, 조성물은 P. 아크네스 바이오필름 분해 효소를 추가로 포함한다.
실시양태에서, 효소는 항노화 효소이다. 실시양태에서, 항노화 효소는 슈퍼옥시드 디스뮤타제 또는 퍼옥시다제이다.
실시양태에서, 효소는 P. 아크네스 바이오필름 분해 효소이다. 실시양태에서, 효소는 글리코시다제, 프로테아제, DNA아제, 또는 제한 엔도뉴클레아제이다. 실시양태에서, 효소는 글리코시다제이다. 실시양태에서, 글리코시다제는 글리코시드 하이드롤라제이다. 실시양태에서, 효소는 N-아세틸-D-글루코사민의 선형 중합체의 가수분해를 촉진한다. 실시양태에서, 효소는 β-헥소사미니다제이다. 실시양태에서, 효소는 아세틸글루코사민 중합체의 β-1,6-글리코시드 결합을 가수분해한다. 실시양태에서, 효소는 DN아제 I, 제한 엔도뉴클레아제, 파파인, 브로멜라인, 트립신, 프로테이나제 K, 섭틸리신, 세라티오펩티다제, 디스퍼신, 알기네이트 리아제, 아밀라제, 또는 셀룰라제이다. 실시양태에서, 효소는 디스퍼신 B이다. 실시양태에서, 효소는 프로테아제이고, 프로테아제는 프로테이나제 K 또는 섭틸리신이다.
실시양태에서, 효소는 디스퍼신이다. 실시양태에서, 효소는 디스퍼신 B이다. 실시양태에서, 효소는 효소 활성(예컨대, 천연 단백질과 비교하여 적어도 50%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 내의 활성)을 유지하는 디스퍼신(예컨대, 디스퍼신 B)의 자연적으로 발생된 형태, 호몰로그, 이소폼, 또는 변이체이다. 실시양태에서, 변이체는 자연적으로 발생된 형태와 비교하여 전체 서열 또는 서열의 일부(예컨대, 50, 100, 150 또는 200개의 연속 아미노산 부분) 간에 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%의 아미노산 서열 동일성을 가진다. 디스퍼신 B를 코딩하는 DNA 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
디스퍼신 B 아미노산 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
실시양태에서, 효소는 알기네이트 리아제이다. 실시양태에서, 효소는 알기네이트 리아제의 효소 활성(예컨대, 천연 단백질과 비교하여 적어도 50%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 내의 활성)을 유지하는 알기네이트 리아제의 자연적으로 발생된 형태, 호몰로그, 이소폼, 또는 변이체이다. 실시양태에서, 변이체는 자연적으로 발생된 형태와 비교하여 전체 서열 또는 서열의 일부(예컨대, 50, 100, 150 또는 200개의 연속 아미노산 부분) 간에 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%의 아미노산 서열 동일성을 가진다. 알기네이트 리아제를 코딩하는 DNA 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
알기네이트 리아제 아미노산 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
실시양태에서, 효소는 아밀라제이다. 실시양태에서, 효소는 아밀라제의 효소 활성(예컨대, 천연 단백질과 비교하여 적어도 50%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 내의 활성)을 유지하는 아밀라제의 자연적으로 발생된 형태, 호몰로그, 이소폼, 또는 변이체이다. 실시양태에서, 변이체는 자연적으로 발생된 형태와 비교하여 전체 서열 또는 서열의 일부(예컨대, 50, 100, 150 또는 200개의 연속 아미노산 부분) 간에 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%의 아미노산 서열 동일성을 가진다. 아밀라제를 코딩하는 DNA 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
아밀라제 아미노산 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
실시양태에서, 효소는 셀룰라제이다. 실시양태에서, 효소는 셀룰라제의 효소 활성(예컨대, 천연 단백질과 비교하여 적어도 50%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 내의 활성)을 유지하는 셀룰라제의 자연적으로 발생된 형태, 호몰로그, 이소폼, 또는 변이체이다. 실시양태에서, 변이체는 자연적으로 발생된 형태와 비교하여 전체 서열 또는 서열의 일부(예컨대, 50, 100, 150 또는 200개의 연속 아미노산 부분) 간에 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%의 아미노산 서열 동일성을 가진다. 셀룰라제를 코딩하는 DNA 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
셀룰라제 아미노산 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
실시양태에서, 효소는 프로테이나제 K이다. 실시양태에서, 효소는 프로테이나제 K의 효소 활성(예컨대, 천연 단백질과 비교하여 적어도 50%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 내의 활성)을 유지하는 프로테이나제 K의 자연적으로 발생된 형태, 호몰로그, 이소폼, 또는 변이체이다. 실시양태에서, 변이체는 자연적으로 발생된 형태와 비교하여 전체 서열 또는 서열의 일부(예컨대, 50, 100, 150 또는 200개의 연속 아미노산 부분) 간에 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%의 아미노산 서열 동일성을 가진다. 프로테이나제 K를 코딩하는 DNA 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
프로테이나제 K 아미노산 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
실시양태에서, 효소는 섭틸리신이다. 실시양태에서, 효소는 섭틸리신의 효소 활성(예컨대, 천연 단백질과 비교하여 적어도 50%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 내의 활성)을 유지하는 섭틸리신의 자연적으로 발생된 형태, 호몰로그, 이소폼, 또는 변이체이다. 실시양태에서, 변이체는 자연적으로 발생된 형태와 비교하여 전체 서열 또는 서열의 일부(예컨대, 50, 100, 150 또는 200개의 연속 아미노산 부분) 간에 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%의 아미노산 서열 동일성을 가진다. 섭틸리신을 코딩하는 DNA 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
섭틸리신 아미노산 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
실시양태에서, 효소는 트립신이다. 실시양태에서, 효소는 트립신의 효소 활성(예컨대, 천연 단백질과 비교하여 적어도 50%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 내의 활성)을 유지하는 트립신의 자연적으로 발생된 형태, 호몰로그, 이소폼, 또는 변이체이다. 실시양태에서, 변이체는 자연적으로 발생된 형태와 비교하여 전체 서열 또는 서열의 일부(예컨대, 50, 100, 150 또는 200개의 연속 아미노산 부분) 간에 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%의 아미노산 서열 동일성을 가진다. 트립신을 코딩하는 DNA 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
트립신 아미노산 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
실시양태에서, 효소는 세라티오펩티다제이다. 실시양태에서, 효소는 세라티오펩티다제의 효소 활성(예컨대, 천연 단백질과 비교하여 적어도 50%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 내의 활성)을 유지하는 세라티오펩티다제의 자연적으로 발생된 형태, 호몰로그, 이소폼, 또는 변이체이다. 실시양태에서, 변이체는 자연적으로 발생된 형태와 비교하여 전체 서열 또는 서열의 일부(예컨대, 50, 100, 150 또는 200개의 연속 아미노산 부분) 간에 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%의 아미노산 서열 동일성을 가진다. 세라티오펩티다제를 코딩하는 DNA 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
세라티오펩티다제 아미노산 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
실시양태에서, 효소는 DN아제이다. 실시양태에서, 효소는 DN아제의 효소 활성(예컨대, 천연 단백질과 비교하여 적어도 50%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 내의 활성)을 유지하는 DN아제의 자연적으로 발생된 형태, 호몰로그, 이소폼, 또는 변이체이다. 실시양태에서, 변이체는 자연적으로 발생된 형태와 비교하여 전체 서열 또는 서열의 일부(예컨대, 50, 100, 150 또는 200개의 연속 아미노산 부분) 간에 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%의 아미노산 서열 동일성을 가진다. 실시양태에서, 효소는 DN아제 I이다. 실시양태에서, DN아제 I는 소 췌장 DN아제 I이다. 소 췌장 DN아제 I를 코딩하는 DNA 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
소 췌장 DN아제 I 아미노산 서열의 비제한적인 예는 하기와 같다:
실시양태에서, 조성물 또는 조합은 프로바이오틱 박테리아를 포함한다.
실시양태에서, 프로바이오틱 박테리아는 프로바이오틱 P. 종, 스타필로코커스 종(Staphylococcus sp.), 및/또는 코리네박테리움 종(Corynebacterium sp.) 박테리아이다.
실시양태에서, 프로바이오틱 박테리아는 클래스 베타프로테오박테리아(Betaproteobacteria) 내의 박테리아이다.
실시양태에서, 프로바이오틱 박테리아는 프로바이오틱 P. 아크네스 박테리아이다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 (a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T992C 돌연변이를 포함하는 16S 리보솜 DNA(rDNA: ribosomal) 서열을 가지고/거나; (b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T838C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C1322T 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C986T 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (e) 서열 번호 3의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (f) 서열 번호 4의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (g) 선형 플라스미드를 포함하지 않고/거나; (h) 병독성 인자를 가지는 플라스미드를 포함하지 않고/거나; (i) 염색체외 리파제 및/또는 밀착 부착 병독성 인자를 코딩하는 플라스미드를 가지지 않는다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 (a) 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 1%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% 또는 95% 미만을 생산하고/거나; (b) 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 1%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% 또는 95% 미만을 생산하고/거나; (c) 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 50% 적게 상피 세포에 부착되고/거나; (d) 병원성 P. 아크네스 균주보다 염증성이 더 적다.
실시양태에서, 조합 또는 조성물은 적어도 하나의 추가 프로바이오틱 박테리아를 포함한다. 실시양태에서, 적어도 하나의 추가 프로바이오틱 박테리아는 프로피오니박테리움 그라누로섬(Propionibacterium granulosum) 및/또는 프로피오니박테리움 아비둠(Propionibacterium avidum)을 포함한다.
실시양태에서, 병원성 P. 아크네스 균주는 (a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1058C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1058C 및 A1201C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G529A 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1004A 및 T1007C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (e) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1268A 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (f) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T554C 및 G1058C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (g) 서열 번호 5의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (h) 서열 번호 6의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (i) 서열 번호 7의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (j) 서열 번호 8의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (k) 서열 번호 9의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (l) 서열 번호 10의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가진다.
실시양태에서, 조합 또는 조성물은 적어도 하나의 추가 P. 아크네스 박테리오파지를 추가로 포함한다.
실시양태에서, 조성물 또는 조합은 약학적으로 허용가능한 담체를 포함한다. 실시양태에서, 약학적으로 허용가능한 담체는 에멀젼을 포함한다. 실시양태에서, 에멀젼은 수중유 에멀젼 또는 유중수 에멀젼이다. 실시양태에서, 조합(들)은 크림, 로션, 현탁제, 또는 수성 액제를 포함하거나, 또는 그러한 형태이다.
실시양태에서, 박테리오파지를 포함하는 조성물을 제공한다. 실시양태에서, 조성물은 피부에의 국소 도포용으로 제제화된다(즉, 조성물은 국소용 조성물이다). 실시양태에서, 조성물은 약학 조성물이다.
한 측면에서, 야생형 P. 아크네스 박테리오파지 및 단리된 프로바이오틱 P. 아크네스 박테리아를 포함하는 약학 조성물을 제공한다. 실시양태에서, 조성물은 약학적으로 허용가능한 담체를 추가로 포함한다.
한 측면에서, 박테리오파지 및/또는 단리된 프로바이오틱 P. 아크네스 박테리아 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 약학 조성물을 제공한다.
실시양태에서, 약학 조성물은 피부에의 국소 투여용으로 제제화된다. 실시양태에서, 약학적으로 허용가능한 담체는 에멀젼을 포함한다. 실시양태에서, 에멀젼은 수중유 에멀젼 또는 유중수 에멀젼이다. 실시양태에서, 약학 조성물은 크림, 로션, 현탁제, 또는 수성 액제 형태이다.
실시양태에서, 조성물 또는 조합은 적어도 약 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 P. 아크네스 박테리오파지를 포함한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 1 초과의 P. 아크네스 박테리오파지 타입을 포함한다.
실시양태에서, 단리된 프로바이오틱 P. 아크네스 박테리아를 포함하는 조합 또는 조성물은 적어도 하나의 추가 박테리아를 추가로 포함할 수 있다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T992C, T838C, C1322T, 및/또는 C986T 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가진다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T838C 및 C1322T 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 ProI 균주이다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C986T 및 T992C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 ProII 균주이다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 (a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T992C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T838C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C1322T 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C986T 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (e) 서열 번호 3의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (f) 서열 번호 4의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (g) 선형 플라스미드를 포함하지 않고/거나; (h) 병독성 인자를 포함하는 플라스미드를 포함하지 않고/거나; (i) 염색체외 리파제 및/또는 밀착 부착 병독성 인자를 코딩하는 플라스미드를 포함하지 않는다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 서열 번호 3 또는 4의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가진다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 (a) 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 1%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% 또는 95% 미만을 생산하고/거나; (b) 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 1%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% 또는 95% 미만을 생산하고/거나; (c) 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 50% 적게 상피 세포에 부착되고/거나; (d) 병원성 P. 아크네스 균주보다 염증성이 더 적다. 실시양태에서, 병원성 P. 아크네스 균주는 (a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1058C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1058C 및 A1201C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G529A 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1004A 및 T1007C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (e) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1268A 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (f) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T554C 및 G1058C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (g) 서열 번호 5의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (h) 서열 번호 6의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (i) 서열 번호 7의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (j) 서열 번호 8의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (k) 서열 번호 9의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (l) 서열 번호 10의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가진다.
서열 번호 2는 KPA171202 타입 균주에 대한 16S rDNA 서열이고, 이는 하기와 같다:
서열 번호 3은 ProI 프로바이오틱 균주에 대한 16S rDNA 서열이고, 이는 하기와 같다:
뉴클레오티드 838.838
ProI 돌연변이 T838C
뉴클레오티드 1322.1322
ProI 돌연변이 C1322T
서열 번호 4는 ProII 프로바이오틱 균주에 대한 16S rDNA 서열이고, 이는 하기와 같다:
뉴클레오티드 986.986
ProII 돌연변이 C986T
뉴클레오티드 992.992
ProII 돌연변이 T992C
실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 1%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% 또는 95% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 1-5%, 1-10%, 1-20%, 1-30%, 5-50%, 5-40%, 5-30%, 5-20%, 5-10%, 10-50%, 10-40%, 10-30%, 10-20%, 20-50%, 20-40%, 또는 20-30%를 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 5% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 10% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 20% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 30% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 40% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 50% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 1%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% 또는 95% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 5% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 10% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 20% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 30% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 40% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 50% 미만을 생산한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 1-5%, 1-10%, 1-20%, 1-30%, 5-50%, 5-40%, 5-30%, 5-20%, 5-10%, 10-50%, 10-40%, 10-30%, 10-20%, 20-50%, 20-40%, 또는 20-30%를 생산한다. 실시양태에서, 리파제는 세포외 리파제이다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리아(예컨대, 예로서, 비교를 위한 프로바이오틱 또는 병원성 P. 아크네스 박테리아)에 의해 생산되는 리파제 수준은 배양 상청액 중의 리파제 수준이다. 실시양태에서, 배양 상청액은 여과된 것이다. 실시양태에서, 배양 상청액은 액체 (플랑크톤성) 배양물로부터의 것이다. 실시양태에서, 배양 상청액은 부착성 배양물로부터의 것이다. 리파제 수준을 검출하는 방법의 비제한적인 예로는 흡광도, 브래드퍼드(Bradford) 단백질 검정법, 뷰렛(Biuret) 시험 도출 검정법, 플루오레사민, 아미도 블랙, 콜로이드성 금, 질소 검출, 고성능 액체 크로마토그래피(HPLC: High-performance liquid chromatography), 액체 크로마토그래피-질량 분석법(LC/MS: Liquid chromatography-mass spectrometry), 효소 결합 면역흡착 검정법(ELISA: enzyme-linked immunosorbent assay), 단백질 면역침강, 면역전기영동, 및 웨스턴 블롯을 포함한다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 약 1%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% 또는 95% 적게 상피 세포에 부착된다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 약 50% 적게 상피 세포에 부착된다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 약 60% 적게 상피 세포에 부착된다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 약 70% 적게 상피 세포에 부착된다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 약 80% 적게 상피 세포에 부착된다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 약 90% 적게 상피 세포에 부착된다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 1-5%, 1-10%, 1-20%, 1-30%, 5-50%, 5-40%, 5-30%, 5-20%, 5-10%, 10-50%, 10-40%, 10-30%, 10-20%, 20-50%, 20-40%, 20-30%, 50-60, 50-70, 50-80, 50-90, 60-80, 70-90 적게 상피 세포에 부착된다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리아(예컨대, 예로서, 비교를 위한 프로바이오틱 또는 병원성 P. 아크네스 박테리아)의 상피 세포에의 부착은 A-432 상피 세포를 사용하여 측정된다. 실시양태에서, 상피 세포는 조직 배양 플레이트 또는 플라스크 상에 융합성 상태이다. 실시양태에서, 부착은 배양된 상피 세포에 부착된 P. 아크네스 박테리아에 의해 형성된 콜로니의 개수를 측정함으로써 검출된다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 병원성 P. 아크네스 균주보다 염증성이 더 적다.
실시양태에서, 병원성 P. 아크네스 균주의 박테리아, 또는 병원성 P. 아크네스 균주의 박테리아에 의해 생산된 화합물과 비교하여, P. 아크네스 박테리아, 또는 P. 아크네스 박테리아에 의해 생산된 화합물과 접촉한 면역 세포에 의해 방출된 염증성 시토카인의 수준이 더 낮다면(예컨대, 적어도 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 또는 90% 더 적다면), P. 아크네스 박테리아는 병원성 P. 아크네스 균주보다 염증성이 더 적은 것이다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아와 접촉한 조직(예컨대, 피부 조직)에서 더 낮은 수준의 염증성 시토카인이 방출되었다면, P. 아크네스 박테리아는 병원성 P. 아크네스 균주보다 염증성이 더 적은 것이다. 실시양태에서, 조직은 피부 조직이다. 실시양태에서, 조직은 귀 조직, 예컨대, 마우스의 귀 조직이다. 실시양태에서, 염증성 시토카인은 IL-1β, IL-6, IL-17, 또는 TNFα, 또는 그의 임의 조합이다.
실시양태에서, 병원성 P. 아크네스 균주는 (a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1058C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1058C 및 A1201C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G529A 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1004A 및 T1007C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (e) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1268A 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (f) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T554C 및 G1058C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (g) 서열 번호 5의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (h) 서열 번호 6의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (i) 서열 번호 7의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (j) 서열 번호 8의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (k) 서열 번호 9의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가지고/거나; (l) 서열 번호 10의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 가진다.
서열 번호 5는 하기와 같다(타입 균주 KPA171202의 16S 서열과 비교하여 돌연변이는 밑줄로 표시되어 있다):
서열 번호 6은 하기와 같다(타입 균주 KPA171202의 16S 서열과 비교하여 돌연변이는 밑줄로 표시되어 있다):
서열 번호 7은 하기와 같다(타입 균주 KPA171202의 16S 서열과 비교하여 돌연변이는 밑줄로 표시되어 있다):
서열 번호 8은 하기와 같다(타입 균주 KPA171202의 16S 서열과 비교하여 돌연변이는 밑줄로 표시되어 있다):
서열 번호 9는 하기와 같다(타입 균주 KPA171202의 16S 서열과 비교하여 돌연변이는 밑줄로 표시되어 있다):
서열 번호 10은 하기와 같다(타입 균주 KPA171202의 16S 서열과 비교하여 돌연변이는 밑줄로 표시되어 있다):
실시양태에서, 적어도 하나의 추가 박테리아는 프로바이오틱 박테리아를 포함하거나, 본질적으로 그로 구성되거나, 또는 그로 구성된다. 실시양태에서, 적어도 하나의 박테리아는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 박테리아 균주 및/또는 종, 약 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 또는 2개 미만의 박테리아 균주 및/또는 종, 또는 1-10, 2-10, 3-10, 4-10, 5-10, 1-5, 2-5, 3-5, 또는 4-5개의 박테리아 균주 및/또는 종을 포함한다. 실시양태에서, 적어도 하나의 박테리아는 복수의 박테리아 균주 및/또는 종, 예컨대, 적어도 약 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10개의 박테리아 균주 및/또는 종을 포함한다. 실시양태에서, 적어도 하나의 박테리아는 단리된 프로피오니박테리움 그라누로섬 박테리아, 단리된 프로피오니박테리움 아비둠 박테리아, 단리된 스타필로코쿠스 에피더미디스(Staphylococcus epidermidis) 박테리아, 단리된 스타필로코쿠스 아우레우스(Staphylococcus aureus) 박테리아, 및/또는 단리된 코리네박테리움 제이케이움(Corynebacterium jeikeium) 박테리아를 포함한다. 실시양태에서, 적어도 하나의 박테리아는 단리된 프로피오니박테리움 그라누로섬 박테리아, 단리된 프로피오니박테리움 아비둠 박테리아, 단리된 스타필로코쿠스 에피더미디스 박테리아, 단리된 스타필로코쿠스 아우레우스 박테리아, 및/또는 단리된 코리네박테리움 제이케이움 박테리아 중 1개, 2개(의 임의 조합), 3개(의 임의 조합), 4개(의 임의 조합), 또는 5개를 포함한다.
실시양태에서, 본원에서 제공된 조성물 또는 조합은 증진 펩티드 또는 효소를 포함한다. 실시양태에서, 증진 펩티드 또는 효소는 하기 특성: 바이오필름 분해, 피부 투과 개선, 항박테리아, (예컨대, 피부의) 염증 감소, (예컨대, 피부의) 자극 감소, (예컨대, 피부의) 발적 감소, 피부 탄력 보강, 주름 제거, 또는 다르게는 (예컨대, 피부의) 외관 개선 중 하나 이상, 또는 그의 임의 조합을 가진다.
한 측면에서, P. 아크네스 박테리오파지 및 항여드름 화합물을 포함하는 조성물을 제공한다. 실시양태에서, 조성물은 약학적으로 허용가능한 담체를 포함한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지의 용량은 안정성을 위해 조정된다(예컨대, 증가 또는 감소된다). 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지의 용량은 항여드름 화합물과의 조합시 그의 안정성을 위해 조정하는 항여드름 화합물에 의존하여 상향 또는 하향 조정된다.
한 측면에서, P. 아크네스 박테리오파지 및 하나 이상의 항여드름 화합물을 포함하는 조합 또는 시스템을 제공한다. 한 예에서, 박테리오파지는 한 조성물 내에(예컨대, 한 베쓸, 예컨대, 병, 튜브, 또는 다른 용기 내에) 있고, 하나 이상의 항여드름 화합물은 별개의 조성물 중에 (또 다른 베쓸, 예컨대, 병, 튜브, 또는 다른 용기 내에) 있다. 실시양태에서, 박테리오파지를 포함하는 조성물은 약학적으로 허용가능한 담체를 포함한다. 실시양태에서, 항여드름 화합물을 포함하는 조성물은 약학적으로 허용가능한 담체를 포함한다. 실시양태에서, 추가의 하나 이상의 화합물(예컨대, 효소, 수화 화합물, 자외선 방사 흡수 또는 차단 화합물 등)은 박테리오파지를 포함하는 조성물, 하나 이상의 항여드름 화합물을 포함하는 조성물, 또는 (제3 베쓸, 예컨대, 병, 튜브, 또는 다른 용기 내의) 제3의 별개의 조성물 중에 존재한다. 실시양태에서, 하나 이상의 프로바이오틱 박테리아는 박테리오파지를 포함하는 조성물, 하나 이상의 항여드름 화합물을 포함하는 조성물, 또는 (제3 베쓸, 예컨대, 병, 튜브, 또는 다른 용기 내의) 제3의 별개의 조성물 중에 존재한다. 실시양태에서, 조합 또는 시스템은 투여 설명서를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 조합 또는 시스템은 적어도 약 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 P. 아크네스 박테리오파지를 포함한다.
한 측면에서, P. 아크네스 박테리오파지 및 하나 이상의 프로바이오틱 박테리아 및/또는 하나 이상의 화합물(예컨대, 하나 이상의 효소 또는 항여드름 화합물)을 포함하는 조합 또는 시스템을 제공한다. 한 예에서, 박테리오파지는 한 조성물 내에(예컨대, 한 베쓸, 예컨대, 병, 튜브, 또는 다른 용기 내에) 있고, 하나 이상의 프로바이오틱 박테리아는 별개의 조성물 중에 (또 다른 베쓸, 예컨대, 병, 튜브, 또는 다른 용기 내에) 있고, 임의적으로, 추가의 하나 이상의 화합물은 박테리오파지를 포함하는 조성물, 하나 이상의 프로바이오틱 박테리아를 포함하는 조성물, 또는 (제3 베쓸, 예컨대, 병, 튜브, 또는 다른 용기 내의) 제3의 별개의 조성물 중에 존재한다. 실시양태에서, 조합 또는 시스템은 투여 설명서를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 조합 또는 시스템은 적어도 약 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 P. 아크네스 박테리오파지를 포함한다.
실시양태에서, 시스템, 조합, 또는 조성물은 효소, 예컨대, 바이오필름 분해 효소 또는 항노화 효소를 포함한다. 바이오필름 분해 효소의 비제한적인 예로는 DN아제(예컨대, DN아제 I), 프로테아제(예컨대, 파파인, 브로멜라인, 트립신, 프로테이나제 K, 섭틸리신, 또는 세라티오펩티다제), 글리코시다제(예컨대, 디스퍼신, 알기네이트 리아제, 아밀라제, 또는 셀룰라제)를 포함한다. 항노화 효소의 비제한적인 예로는 슈퍼옥시드 디스뮤타제, 및 퍼옥시다제를 포함한다.
실시양태에서, 시스템, 조합, 또는 조성물은 국소용 레티노이드, 항생제, 및/또는 알파-하이드록시산을 포함한다. 실시양태에서, 시스템 또는 조성물은 국소용 레티노이드를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 시스템 또는 조성물은 항생제를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 시스템 또는 조성물은 알파-하이드록시산을 추가로 포함한다. 실시양태에서, 시스템 또는 조성물은 벤조일 퍼옥시드, 살리실산, 황, 레조르시놀, 레조르시놀 모노아세테이트, 또는 그의 임의 조합을 추가로 포함한다. 실시양태에서, 벤조일 퍼옥시드는 2.5% 내지 10%, 예컨대, 약 2.5%, 3%, 3.5%, 4%, 4.5%, 5%, 5.5%, 6%, 6.5%, 7%, 7.5%, 8%, 8.5%, 9%, 9.5%, 또는 10 (중량/부피)%의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 벤조일 퍼옥시드는 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 또는 2% 초과이되, 2.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 살리실산은 0.5% 내지 2%, 예컨대, 약 0.5%, 0.6%, 0.7%, 0.8%, 0.9%, 1%, 1.1%, 1.2%, 1.3%, 1.4%, 1.5%, 1.6%, 1.7%, 1.8%, 1.9%, 또는 2% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 살리실산은 약 0.1% 초과이되, 0.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 황은 3% 내지 10%, 예컨대, 약 3%, 3.5%, 4%, 4.5%, 5%, 5.5%, 6%, 6.5%, 7%, 7.5%, 8%, 8.5%, 9%, 9.5%, 또는 10% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 황은 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 2%, 또는 2.5% 초과이되, 3% (중량/부피) 미만의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 레조르시놀은 2% (중량/부피)의 농도로 존재하고, 황은 3% 내지 8% (예컨대, 약 2.5%, 3%, 3.5%, 4%, 4.5%, 5%, 5.5%, 6%, 6.5%, 7%, 7.5%, 또는 8% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 레조르시놀 모노아세테이트는 3% (중량/부피)의 농도로 존재하고, 황은 3% 내지 8% (예컨대, 약 2.5%, 3%, 3.5%, 4%, 4.5%, 5%, 5.5%, 6%, 6.5%, 7%, 7.5%, 또는 8% (중량/부피)의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 레조르시놀은 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5% 초과이되, 2% (중량/부피) 미만의 농도로 존재한다. 실시양태에서, 레조르시놀 모노아세테이트는 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 2%, 또는 2.5% 초과이되, 3% (중량/부피) 미만의 농도로 존재한다.
실시양태에서, 본원에서 제공된 조성물은 보습제를 포함한다.
여드름 치료 방법
한 측면에서, 본원에서는 유효량의 본원에서 제공된 조성물 또는 조합을 투여하는 단계를 포함하는 여드름 예방 또는 치료를 필요로 하는 피험체에서 여드름을 예방 또는 치료하는 방법을 제공한다. 실시양태에서, 적어도 하나의 P. 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체 를 포함하거나, 본질적으로 그로 구성되거나, 또는 그로 구성된 유효량의 조성물이 피험체에게 투여된다. 실시양태에서, 적어도 하나의 P. 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물 및 약학적으로 허용가능한 담체는 포함하는 유효량의 조성물로서, 여기서, 조성물은 프로바이오틱 박테리아는 포함하지 않는 것인 조성물이 피험체에게 투여된다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지 및 효소를 포함하는 유효량의 조성물이 피험체에게 투여된다.
실시양태에서, 그의 실시양태를 비롯한, 본원에 기술된 바와 같이 박테리오파지를 포함하는 유효량의 조성물이 피험체에게 투여된다. 실시양태에서, 박테리오파지는 야생형 박테리오파지이다.
실시양태에서, 박테리오파지는 국소적으로 투여된다. 실시양태에서, 박테리오파지는 약학적으로 또는 화장적으로 허용가능한 담체를 추가로 포함하는 조성물(예컨대, 약학 또는 화장 조성물) 중에 존재한다.
실시양태에서, 본 방법은 프로바이오틱 박테리아를 피험체에게 투여하는 단계를 추가로 포함한다.
한 측면에서, 여드름 치료를 필요로 하는 피험체에서 여드름을 치료하는 방법을 제공한다. 본 방법은 유효량의 프로바이오틱 P. 아크네스 박테리아를 피험체에게 투여하는 단계를 포함한다. 실시양태에서, 본 방법은 박테리오파지를 피험체에게 투여하는 단계를 추가로 포함한다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T992C, T838C, C1322T, 및/또는 C986T 돌연변이 를 포함하는 16S rDNA 서열을 가진다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T838C 및 C1322T 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 ProI 균주이다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C986T 및 T992C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함한다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 ProII 균주이다.
실시양태에서, P. 아크네스 박테리아는 (a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T992C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T838C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C1322T 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C986T 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (e) 서열 번호 3의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (g) 서열 번호 4의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나; (h) 선형 플라스미드를 포함하지 않고/거나; (i) 병독성 인자를 포함하는 플라스미드를 포함하지 않고/거나; (j) 염색체외 리파제 및/또는 밀착 부착 병독성 인자를 코딩하는 플라스미드를 포함하지 않는다.
실시양태에서, 본 방법은 적어도 하나의 추가 프로바이오틱 박테리아를 피험체에게 투여하는 단계를 추가로 포함한다.
실시양태에서, 적어도 하나의 추가 박테리아는 프로바이오틱 박테리아를 포함하거나, 본질적으로 그로 구성되거나, 또는 그로 구성된다. 실시양태에서, 적어도 하나의 박테리아는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 박테리아 균주 및/또는 종, 약 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 또는 2개 미만의 박테리아 균주 및/또는 종, 또는 1-10, 2-10, 3-10, 4-10, 5-10, 1-5, 2-5, 3-5, 또는 4-5개의 박테리아 균주 및/또는 종을 포함한다. 실시양태에서, 적어도 하나의 박테리아는 복수의 박테리아 균주 및/또는 종, 예컨대, 적어도 약 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10개의 박테리아 균주 및/또는 종을 포함한다. 실시양태에서, 적어도 하나의 박테리아는 프로피오니박테리움 종, 스타필로코커스 종, 및/또는 코리네박테리움 종의 박테리아를 포함한다. 실시양태에서, 적어도 하나의 박테리아는 클래스 베타프로테오박테리아 내의 박테리아를 포함한다. 실시양태에서, 적어도 하나의 박테리아는 단리된 프로피오니박테리움 그라누로섬 박테리아, 단리된 프로피오니박테리움 아비둠 박테리아, 단리된 스타필로코쿠스 에피더미디스 박테리아, 단리된 스타필로코쿠스 아우레우스 박테리아, 및/또는 단리된 코리네박테리움 제이케이움 박테리아를 포함한다. 실시양태에서, 적어도 하나의 박테리아는 단리된 프로피오니박테리움 그라누로섬 박테리아, 단리된 프로피오니박테리움 아비둠 박테리아, 단리된 스타필로코쿠스 에피더미디스 박테리아, 단리된 스타필로코쿠스 아우레우스 박테리아, 및/또는 단리된 코리네박테리움 제이케이움 박테리아 중 1, 2, 3, 4, 또는 5개를 포함한다.
실시양태에서, 피험체는 그의 실시양태를 비롯한, 본원에 기술된 바와 같이 박테리오파지를 투여받는다.
실시양태에서, 피험체는 P. 아크네스를 사멸시키는 항생체를 투여받는다. 실시양태에서, 항생제는 클린다마이신, 독시사이클린, 에리트로마이신, 또는 테트라사이클린, 또는 클린다마이신, 독시사이클린, 에리트로마이신, 또는 테트라사이클린의 유도체이다.
실시양태에서, 항생제는 클린다마이신, 독시사이클린, 에리트로마이신, 또는 테트라사이클린, 또는 클린다마이신, 독시사이클린, 에리트로마이신, 또는 테트라사이클린의 유도체이다.
실시양태에서, 본 방법은 피험체에게 효소, 예컨대, 바이오필름 분해 효소 또는 항노화 효소를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 바이오필름 분해 효소의 비제한적인 예로는 DN아제(예컨대, DN아제 I), 제한 엔도뉴클레아제, 프로테아제(예컨대, 파파인, 브로멜라인, 트립신, 프로테이나제 K, 섭틸리신, 또는 세라티오펩티다제), 글리코시다제(예컨대, 디스퍼신, 알기네이트 리아제, 아밀라제, 또는 셀룰라제)를 포함한다. 항노화 효소의 비제한적인 예로는 슈퍼옥시드 디스뮤타제, 및 퍼옥시다제를 포함한다.
실시양태에서, 본 방법은 국소용 레티노이드, 항생제, 및/또는 알파-하이드록시산을 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 본 방법은 국소용 레티노이드를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 본 방법은 항생제를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 본 방법은 알파-하이드록시산을 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 본 방법은 피험체에게 벤조일 퍼옥시드, 살리실산, 황, 레조르시놀, 및/또는 레조르시놀 모노아세테이트를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 본 방법은 벤조일 퍼옥시드를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 본 방법은 살리실산을 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 본 방법은 황을 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 본 방법은 레조르시놀 및/또는 황을 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 본 방법은 레조르시놀 및/또는 레조르시놀 모노아세테이트를 투여하는 단계를 추가로 포함한다.
실시양태에서, 본 방법은 증진 펩티드 또는 효소를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 증진 펩티드 또는 효소는 하기 특성: 바이오필름 분해, 피부 투과 개선, 항박테리아, (예컨대, 피부의) 염증 감소, (예컨대, 피부의) 자극 감소, (예컨대, 피부의) 발적 감소, 피부 탄력 보강, 주름 제거, 또는 다르게는 (예컨대, 피부의) 외관 개선 중 하나 이상, 또는 그의 임의 조합을 가진다.
실시양태에서, 적어도 약 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 P. 아크네스 박테리오파지가 피험체에게 투여된다. 실시양태에서, P. 아크네스 박테리오파지는 1 초과의 P. 아크네스 박테리오파지 유형을 포함한다.
여드름 치료를 위한 예시적인 방법 및 조성물
한 측면에서, 본원에서는 박테리오파지를 포함하는 조성물을 제공한다. 실시양태에서, 박테리오파지는 조성물, 예컨대, 치료 또는 화장 조성물 중에 존재한다. 실시양태에서, 조성물은 프로바이오틱 박테리아 균주를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 조성물은 인간 피부 모공 내 또는 그 위의 박테리아 바이오필름(예컨대, 그의 성분)을 분해하는 효소를 추가로 포함한다. 실시양태에서, 효소는 박테리오파지 및/또는 프로바이오틱 박테리아의 투과를 증진시킨다. 실시양태에서, 박테리오파지("파지")는 유익한 피부 박테리아는 사멸시키지 않으면서, 고도의 특이성 및 효능으로 여드름 유발 (즉, 병원성) P. 아크네스 균주를 파괴시킨다. 실시양태에서, 바이오필름 분해 효소는 바이오필름을 용해시켜 (예컨대, 숙주 세포에의 병원체 부착을 감소시킴으로써, 및/또는 박테리오파지의 병원성 세포에의 접근을 증가시킴으로써) 병원체의 감수성을 증가시킨다. 실시양태에서, 프로바이오틱 박테리아는 박테리오파지에 면역성을 띤다(예컨대, 박테리아에는 박테리오파지가 특이적으로 결합하는 세포 수용체가 존재하지 않는다). 실시양태에서, 프로바이오틱 박테리아는 사멸된 P. 아크네스 병원성 균주에 의해 남겨진 니치를 점유한다. 실시양태에서, 프로바이오틱 박테리아는 생존한 병원성 박테리아에 의한 피험체의 피부(예컨대, 모공)에서의 재콜로니 형성 또는 성장을 감소시키거나, 또는 방해한다.
한 측면에서, 피부 질환 여드름의 치료적 처치를 위한 조성물을 제공한다. 실시양태에서, 조성물은 활성 성분의 투과를 증가시키기 위한 애주번트로서 용균성 P. 아크네스 박테리오파지, 및 임의적으로, 건강한 피부로부터 수득된 프로바이오틱 박테리아, 및/또는 임의적으로 바이오필름 분해 효소를 조성물 중에 포함한다.
실시양태에서, 용균성 P. 아크네스 박테리오파지는 피부 면포에서 병독성 P. 아크네스를 감염시킨다. 실시양태에서, 박테리오파지는 P. 아크네스 내에서 복제되고, 용해한다. 실시양태에서, P. 아크네스가 용해할 때, 이는 새로운 비리온을 방출한다. 실시양태에서, 효소는 차단된 면포의 막힘을 뚫고, P. 아크네스 바이오필름을 용해시키고, P. 아크네스에의 비리온의 접근을 증가시킨다. 실시양태에서, 용균성 P. 아크네스 파지의 지수적 증식은 유익한 피부 공생 박테리아의 성장은 방해하지 않으면서, 고도의 특이성으로 P. 아크네스를 빠르게 사멸시킨다. 실시양태에서, 이어서, P. 아크네스에 의해 빈 상태로 남겨진 니치는 프로바이오틱 박테리아에 의해 충전된다. 실시양태에서, 박테리아는 건강한 피부로부터 수득되고, 확장되어 니치를 점유함으로써 임의의 생존한 P. 아크네스 박테리아가 다시 성장하지 못하게 막는다. 실시양태에서, 이러한 전략법은 피험체에서 피부 마이크로바이옴의 균형을 맞추는 데 도움을 주며, 그의 마이크로바이옴을 건강한 피부 박테리아 군집이 되도록 재보정한다. 실시양태에서, 바이오필름 분해 효소는 차단된 면포의 막힘을 뚫고, 파지 및 프로바이오틱 박테리아의 모공에의 접근을 증가시키는 데 도움을 주는 애주번트로서 제제 중에 존재한다.
한 측면에서, 박테리오파지, 프로바이오틱 박테리아, 및 (임의적으로) 박테리오파지의 투과를 증진시키는 효소를 포함하는 조합을 제공한다. 실시양태에서, 병원체는 사멸되고, 프로바이오틱 박테리아가 병원체를 대신한다. 실시양태에서, "사멸 및 대체" 접근법은 여드름을 치료하는 데 사용된다. 실시양태에서, 여드름을 유발하는 병원성 박테리아를 선택적으로 사멸시키는 생물제가 피험체에게 투여된다. 실시양태에서, 사멸된 병원체의 니치를 점유하도록 건강한 피부로부터 수득된 프로바이오틱 박테리아를 도포함한다. 실시양태에서, 상기 접근법을 통해 항생제와 연관된 만연한 약물 내성의 문제를 피할 수 있다. 실시양태에서, 활발하게 분열하는 프로바이오틱 박테리아 존재는 임의의 병원체가 다시 성장하는 것을 허용하지 않으면서 재발을 막는다. 실시양태에서, 피험체 피부 상의 장내 세균 불균형이 치료된다. 실시양태에서, 여드름과 연관된 마이크로바이옴은 건강한 상태로 재보정된다.
실시양태에서, 박테리오파지는 자연적으로 발생된 P. 아크네스 박테리오파지이다.
박테리오파지와 함께 공동 투여될 수 있는 효소의 비제한적인 예로는 바실러스 리체니포르미스(Bacillus licheniformis)로부터의 BL00275; DN아제 I; 제한 엔도뉴클레아제; 데옥시리보뉴클레아제(예컨대, 스타필로코쿠스 아우레우스 로부터의 써모뉴클레아제, B. 리체니포르미스 NucB, DN아제 1L2); 글리코시드 하이드롤라제(예컨대, 디스퍼신 B, 알기네이트 리아제, 아밀라제, 셀룰라제, 글리카나제); 및 프로테아제(예컨대, 섭틸리신, 프로테이나제 K, 트립신, 세라티오펩티다제)를 포함한다.
시스템 또는 조성물로 투여될 수 있거나, 그 중에 존재할 수 있는 프로바이오틱 박테리아의 비제한적인 예로는 하기 박테리아 종: 프로피오니박테리움 아크네스, 프로피오니박테리움 그라누로섬, 프로피오니박테리움 아비둠, 스타필로코쿠스 에피더미디스, 스타필로코쿠스 아우레우스, 및 코리네박테리움 제이케이움 중 하나 이상, 또는 그의 임의 조합을 포함한다. 실시양태에서, 프로바이오틱 박테리아 균주는 (a) 낮은 리파제 활성 및 인간 각질세포에의 부착 감소를 특징으로 하는, 유해한 면역 반응을 유도하지 않고, 피부를 콜로니화할 수 있고; (b) 프로피오니박테리움 아크네스와 유사한 니치를 점유할 수 있는 그의 능력에 기초하여 선택될 수 있다.
실시양태에서, 바이오필름 분해 효소는 제제 중에 존재하고, 활성 성분(예컨대, 박테리오파지)의 효능을 증가시키는 애주번트로서 작용한다. 실시양태에서, 효소는 시험관내에서 P. 아크네스 바이오필름을 분해할 수 있는 능력을 가진다.
실시양태
실시양태 및 실시예는 본 발명을 더욱 완전히 쉽게 이해할 수 있도록 하기 위해 하기에 제공된다. 하기 실시양태 및 실시예는 본 발명의 제조 및 실시에 관한 예시적인 모드를 예를 들어 설명한다. 그러나, 대안적 방법을 사용하여 유사한 결과를 얻을 수 있는 바, 이에 본 발명의 범주는 이러한 실시양태 및 실시예에 개시된 특정 실시양태로 제한되는 것이 아니고, 이는 단지 예시를 목적으로 한 것이다.
실시양태는 하기 실시양태 P1 내지 P56을 포함한다:
실시양태 P1. 본질적으로 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체로 구성된 조성물.
실시양태 P2. 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물로서, 여기서, 조성물은 프로바이오틱 박테리아를 포함하지 않는 것인 조성물.
실시양태 P3. 실시양태 P2에 있어서, 조성물이 P. 아크네스 바이오필름 분해 효소를 추가로 포함하는 것인 조성물.
실시양태 P4. 실시양태 P1 내지 P3 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 벤조일 퍼옥시드인 조성물.
실시양태 P5. 실시양태 P4에 있어서, 벤조일 퍼옥시드가 2.5% 내지 10% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 P6. 실시양태 P4에 있어서, 벤조일 퍼옥시드가 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 또는 2% 초과이되, 2.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 P7. 실시양태 P1 내지 P3 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 살리실산인 조성물.
실시양태 P8. 실시양태 P7에 있어서, 살리실산이 0.5% 내지 2% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 P9. 실시양태 P7에 있어서, 살리실산이 약 0.1% 초과이되, 0.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 P10. 실시양태 P1 내지 P3 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 황인 조성물.
실시양태 P11. 실시양태 P10에 있어서, 황이 3% 내지 10% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 P12. 실시양태 P10에 있어서, 황이 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 2%, 또는 2.5% 초과이되, 3% (중량/부피) 미만의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 P13. 실시양태 P1 내지 P3 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 레조르시놀 및 황인 조성물.
실시양태 P14. 실시양태 P13에 있어서, 레조르시놀이 2%의 농도로 존재하고, 황이 3% 내지 8% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 P15. 실시양태 P1 내지 P3 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 레조르시놀 모노아세테이트 및 황을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 P16. 실시양태 P15에 있어서, 레조르시놀 모노아세테이트가 3%의 농도로 존재하고, 황이 3% 내지 8% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 P17. 실시양태 P1 내지 P3 중 어느 한 실시양태에 있어서, 항여드름 화합물이 항생제, 레티노이드, 또는 알파-하이드록시산인 조성물.
실시양태 P18. 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 효소를 포함하는 조성물.
실시양태 P19. 실시양태 P1 내지 P18 중 어느 한 실시양태에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지가 용균성 P. 아크네스 박테리오파지인 조성물.
실시양태 P20. 실시양태 P1 내지 P19 중 어느 한 실시양태에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지가 선형 이중 가닥 DNA 게놈을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 P21. 실시양태 P1 내지 P20 중 어느 한 실시양태에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지가 박테리오파지 패밀리 시포비리다 내에 있는 것인 조성물.
실시양태 P22. 실시양태 P1 내지 P21 중 어느 한 실시양태에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지의 게놈이 서열 번호 1의 뉴클레오티드 서열과 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 P23. 실시양태 P18 내지 P21 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 P. 아크네스 바이오필름 분해 효소인 조성물.
실시양태 P24. 실시양태 P3 또는 실시양태 P18 내지 P23 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 글리코시다제, 프로테아제, DN아제, 또는 제한 엔도뉴클레아제인 조성물.
실시양태 P25. 실시양태 P3 또는 실시양태 P18 내지 P24 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 글리코시다제인 조성물.
실시양태 P26. 실시양태 P25에 있어서, 글리코시다제가 글리코시드 하이드롤라제인 조성물.
실시양태 P27. 실시양태 P26에 있어서, 효소가 N-아세틸-D-글루코사민의 선형 중합체의 가수분해를 촉진하는 것인 조성물.
실시양태 P28. 실시양태 P27에 있어서, 효소가 β-헥소사미니다제인 조성물.
실시양태 P29. 실시양태 P28에 있어서, 효소가 아세틸글루코사민 중합체의 β-1,6-글리코시드 결합을 가수분해하는 것인 조성물.
실시양태 P30. 실시양태 P3 또는 실시양태 P18 내지 P24 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 DN아제 I, 제한 엔도뉴클레아제, 파파인, 브로멜라인, 트립신, 프로테이나제 K, 섭틸리신, 세라티오펩티다제, 디스퍼신, 알기네이트 리아제, 아밀라제, 또는 셀룰라제인 조성물.
실시양태 P31. 실시양태 P3 또는 실시양태 P18 내지 P24 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 디스퍼신 B인 조성물.
실시양태 P32. 실시양태 P3 또는 실시양태 P18 내지 P24 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 프로테아제이고, 프로테아제가 프로테이나제 K 또는 섭틸리신인 조성물.
실시양태 P33. 실시양태 P18 내지 P22 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 항노화 효소인 조성물.
실시양태 P34. 실시양태 P33에 있어서, 항노화 효소가 슈퍼옥시드 디스뮤타제 또는 퍼옥시다제인 조성물.
실시양태 P35. 실시양태 P18 내지 P34 중 어느 한 실시양태에 있어서, 프로바이오틱 박테리아를 추가로 포함하는 조성물.
실시양태 P36. 실시양태 P35에 있어서, 프로바이오틱 박테리아가 프로바이오틱 P. 종, 스타필로코커스 종, 및/또는 코리네박테리움 종 박테리아인 조성물.
실시양태 P37. 실시양태 P35에 있어서, 프로바이오틱 박테리아가 클래스 베타프로테오박테리아 내의 박테리아인 조성물.
실시양태 P38. 실시양태 P36에 있어서, 프로바이오틱 박테리아가 프로바이오틱 P. 아크네스 박테리아인 조성물.
실시양태 P39. 실시양태 P38에 있어서, P. 아크네스 박테리아가
(a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S DNA 서열과 비교하여 T992C 돌연변이를 포함하는 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S DNA 서열과 비교하여 T838C 돌연변이를 포함하는 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S DNA 서열과 비교하여 C1322T 돌연변이를 포함하는 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S DNA 서열과 비교하여 C986T 돌연변이를 포함하는 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(e) 서열 번호 3의 서열과 동일한 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(f) 서열 번호 4의 서열과 동일한 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(g) 선형 플라스미드를 포함하지 않고/거나;
(h) 병독성 인자를 포함하는 플라스미드를 포함하지 않고/거나;
(i) 염색체외 리파제 및/또는 밀착 부착 병독성 인자를 코딩하는 플라스미드를 포함하지 않는 것인 조성물.
실시양태 P40. 실시양태 P38에 있어서, P. 아크네스 박테리아가
(a) 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 20% 미만을 생산하고/거나;
(b) 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 10% 미만을 생산하고/거나;
(c) 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 50% 적게 상피 세포에 부착되고/거나;
(d) 병원성 P. 아크네스 균주보다 염증성이 더 적은 것인 조성물.
실시양태 P41. 실시양태 P35 내지 P40 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 추가 프로바이오틱 박테리아를 추가로 포함하는 조성물.
실시양태 P42. 실시양태 P41에 있어서, 상기 적어도 하나의 추가 프로바이오틱 박테리아가 프로피오니박테리움 그라누로섬 및/또는 프로피오니박테리움 아비둠을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 P43. 실시양태 P40에 있어서, 상기 병원성 P. 아크네스 균주가
(a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S DNA 서열과 비교하여 G1058C 돌연변이를 포함하는 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S DNA 서열과 비교하여 G1058C 및 A1201C 돌연변이를 포함하는 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S DNA 서열과 비교하여 G529A 돌연변이를 포함하는 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S DNA 서열과 비교하여 G1004A 및 T1007C 돌연변이를 포함하는 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(e) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S DNA 서열과 비교하여 G1268A 돌연변이를 포함하는 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(f) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S DNA 서열과 비교하여 T554C 및 G1058C 돌연변이를 포함하는 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(g) 서열 번호 5의 서열과 동일한 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(h) 서열 번호 6의 서열과 동일한 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(i) 서열 번호 7의 서열과 동일한 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(j) 서열 번호 8의 서열과 동일한 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(k) 서열 번호 9의 서열과 동일한 16S DNA 서열을 포함하고/거나;
(l) 서열 번호 10의 서열과 동일한 16S DNA 서열을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 P44. 실시양태 P18 내지 P43 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 추가 P. 아크네스 박테리오파지를 추가로 포함하는 조성물.
실시양태 P45. 실시양태 P1 내지 P44 중 어느 한 실시양태에 있어서, 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물.
실시양태 P46. 실시양태 P45에 있어서, 약학적으로 허용가능한 담체가 에멀젼을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 P47. 실시양태 P46에 있어서, 에멀젼이 수중유 에멀젼 또는 유중수 에멀젼인 조성물.
실시양태 P48. 실시양태 P1 내지 P47 중 어느 한 실시양태에 있어서, 크림, 로션, 현탁제, 또는 수성 액제 형태인 조성물.
실시양태 P49. 본질적으로 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지, 및 적어도 하나의 항여드름 화합물로 구성된 조합으로서, 여기서, 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물은 각각 약학적으로 허용가능한 담체를 추가로 포함하는 조성물 중에 존재하는 것인 조합.
실시양태 P50. 실시양태 P49에 있어서, 적어도 하나의 P. 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물이 별개의 조성물 내에 존재하는 것인 조합.
실시양태 P51. 실시양태 P50에 있어서, 적어도 하나의 P. 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물이 별개의 용기 내에 존재하는 것인 조합.
실시양태 P52. 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 효소를 포함하는 조합.
실시양태 P53. 실시양태 P52에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지 및 효소가 별개의 조성물 내에 존재하는 것인 조합.
실시양태 P54. 실시양태 P53에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지 및 효소가 별개의 용기 내에 존재하는 것인 조합.
실시양태 P55. 여드름 치료를 필요로 하는 피험체에게 유효량의 실시양태 P1 내지 P46 중 어느 한 실시양태의 조성물, 또는 실시양태 P49 내지 P54 중 어느 한 실시양태의 조합을 투여하는 단계를 포함하는, 여드름 치료를 필요로 하는 피험체에서 여드름을 치료하는 방법.
실시양태 P56. 실시양태 P55에 있어서, 조성물을 국소적으로 투여하는 것인 방법.
추가 실시양태는 하기 실시양태 1 내지 55를 포함한다:
실시양태 1. 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물.
실시양태 2. 실시양태 1에 있어서, 프로바이오틱 박테리아를 포함하지 않는 조성물.
실시양태 3. 실시양태 1 또는 2에 있어서, 조성물이 P. 아크네스 바이오필름 분해 효소를 추가로 포함하는 것인 조성물.
실시양태 4. 실시양태 1 내지 3 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 살리실산인 조성물.
실시양태 5. 실시양태 4에 있어서, 살리실산이 0.5% 내지 2% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 6. 실시양태 5에 있어서, 살리실산이 약 0.1% 초과이되, 0.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 7. 실시양태 1 내지 3 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 황인 조성물.
실시양태 8. 실시양태 7에 있어서, 황이 3% 내지 10% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 9. 실시양태 7에 있어서, 황이 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 2%, 또는 2.5% 초과이되, 3% (중량/부피) 미만의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 10. 실시양태 1 내지 3 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 레조르시놀 및 황인 조성물.
실시양태 11. 실시양태 10에 있어서, 레조르시놀이 2%의 농도로 존재하고, 황이 3% 내지 8% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 12. 실시양태 1 내지 3 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 레조르시놀 모노아세테이트 및 황을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 13. 실시양태 12에 있어서, 레조르시놀 모노아세테이트가 3%의 농도로 존재하고, 황이 3% 내지 8% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
실시양태 14. 실시양태 1 내지 3 중 어느 한 실시양태에 있어서, 항여드름 화합물이 항생제, 레티노이드, 또는 알파-하이드록시산인 조성물.
실시양태 15. 실시양태 1 내지 14 중 어느 한 실시양태에 있어서, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지가 자연적으로 발생된 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지인 조성물.
실시양태 16. 실시양태 1 내지 15 중 어느 한 실시양태에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지가 용균성 P. 아크네스 박테리오파지인 조성물.
실시양태 17. 실시양태 1 내지 16 중 어느 한 실시양태에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지가 선형 이중 가닥 DNA 게놈을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 18. 실시양태 1 내지 17 중 어느 한 실시양태에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지가 박테리오파지 패밀리 시포비리다 내에 있는 것인 조성물.
실시양태 19. 실시양태 1 내지 19 중 어느 한 실시양태에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지의 게놈이 서열 번호 1의 뉴클레오티드 서열과 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 20. 실시양태 3 내지 19 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 P. 아크네스 바이오필름 분해 효소인 조성물.
실시양태 21. 실시양태 3 내지 20 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 글리코시다제, 프로테아제, DN아제, 또는 제한 엔도뉴클레아제인 조성물.
실시양태 22. 실시양태 3 내지 21 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 글리코시다제인 조성물.
실시양태 23. 실시양태 22에 있어서, 글리코시다제가 글리코시드 하이드롤라제인 조성물.
실시양태 24. 실시양태 23에 있어서, 효소가 N-아세틸-D-글루코사민의 선형 중합체의 가수분해를 촉진하는 것인 조성물.
실시양태 25. 실시양태 24에 있어서, 효소가 β-헥소사미니다제인 조성물.
실시양태 26. 실시양태 25에 있어서, 효소가 아세틸글루코사민 중합체의 β-1,6-글리코시드 결합을 가수분해하는 것인 조성물.
실시양태 27. 실시양태 3 내지 20 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 DN아제 I, 제한 엔도뉴클레아제, 파파인, 브로멜라인, 트립신, 프로테이나제 K, 섭틸리신, 세라티오펩티다제, 디스퍼신, 알기네이트 리아제, 아밀라제, 또는 셀룰라제인 조성물.
실시양태 28. 실시양태 3 내지 20 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 디스퍼신 B인 조성물.
실시양태 29. 실시양태 3 내지 20 중 어느 한 실시양태에 있어서, 효소가 프로테아제이고, 프로테아제가 프로테이나제 K 또는 섭틸리신인 조성물.
실시양태 30. 실시양태 1 내지 29 중 어느 한 실시양태에 있어서, 항노화 효소를 추가로 포함하는 조성물.
실시양태 31. 실시양태 30에 있어서, 항노화 효소가 슈퍼옥시드 디스뮤타제 또는 퍼옥시다제인 조성물.
실시양태 32. 실시양태 1 내지 31 중 어느 한 실시양태에 있어서, 프로바이오틱 박테리아를 추가로 포함하는 조성물.
실시양태 33. 실시양태 32에 있어서, 프로바이오틱 박테리아가 프로바이오틱 P. 종, 스타필로코커스 종, 및/또는 코리네박테리움 종 박테리아인 조성물.
실시양태 34. 실시양태 32에 있어서, 프로바이오틱 박테리아가 클래스 베타프로테오박테리아 내의 박테리아인 조성물.
실시양태 35. 실시양태 33에 있어서, 프로바이오틱 박테리아가 프로바이오틱 P. 아크네스 박테리아인 조성물.
실시양태 36. 실시양태 35에 있어서, P. 아크네스 박테리아가
(a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T992C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T838C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C1322T 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C986T 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(e) 서열 번호 3의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(f) 서열 번호 4의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(g) 선형 플라스미드를 포함하지 않고/거나;
(h) 병독성 인자를 포함하는 플라스미드를 포함하지 않고/거나;
(i) 염색체외 리파제 및/또는 밀착 부착 병독성 인자를 코딩하는 플라스미드를 포함하지 않는 것인 조성물.
실시양태 37. 실시양태 35 또는 36에 있어서, P. 아크네스 박테리아가
(a) 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 20% 미만을 생산하고/거나;
(b) 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 10% 미만을 생산하고/거나;
(c) 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 50% 적게 상피 세포에 부착되고/거나;
(d) 병원성 P. 아크네스 균주보다 염증성이 더 적은 것인 조성물.
실시양태 38. 실시양태 32 내지 37 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 추가 프로바이오틱 박테리아를 추가로 포함하는 조성물.
실시양태 39. 실시양태 38에 있어서, 상기 적어도 하나의 추가 프로바이오틱 박테리아가 프로피오니박테리움 그라누로섬 및/또는 프로피오니박테리움 아비둠을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 40. 실시양태 37에 있어서, 상기 병원성 P. 아크네스 균주가
(a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1058C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1058C 및 A1201C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G529A 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1004A 및 T1007C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(e) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1268A 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(f) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T554C 및 G1058C 돌연변이를 포함하는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(g) 서열 번호 5의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(h) 서열 번호 6의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(i) 서열 번호 7의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(j) 서열 번호 8의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(k) 서열 번호 9의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(l) 서열 번호 10의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 41. 실시양태 1 내지 40 중 어느 한 실시양태에 있어서, 적어도 하나의 추가 P. 아크네스 박테리오파지를 추가로 포함하는 조성물.
실시양태 42. 실시양태 1 내지 41 중 어느 한 실시양태에 있어서, 약학적으로 허용가능한 담체가 에멀젼을 포함하는 것인 조성물.
실시양태 43. 실시양태 42에 있어서, 에멀젼이 수중유 에멀젼 또는 유중수 에멀젼인 조성물.
실시양태 44. 실시양태 1 내지 44 중 어느 한 실시양태에 있어서, 크림, 로션, 현탁제, 또는 수성 액제 형태인 조성물.
실시양태 45. 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물을 포함하는 조합으로서, 여기서, 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물은 각각 약학적으로 허용가능한 담체를 추가로 포함하는 조성물 중에 존재하는 것인 조합.
실시양태 46. 실시양태 45에 있어서, 적어도 하나의 P. 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물이 별개의 조성물 내에 존재하는 것인 조합.
실시양태 47. 실시양태 46에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 벤조일 퍼옥시드인 조합.
실시양태 48. 실시양태 47에 있어서, 벤조일 퍼옥시드가 2.5% 내지 10% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조합.
실시양태 49. 실시양태 47에 있어서, 벤조일 퍼옥시드가 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 또는 2% 초과이되, 2.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재하는 것인 조합.
실시양태 50. 여드름 치료를 필요로 하는 피험체에게 유효량의 실시양태 1 내지 44 중 어느 한 실시양태의 조성물을 투여하는 단계를 포함하는, 여드름 치료를 필요로 하는 피험체에서 여드름을 치료하는 방법.
실시양태 51. 실시양태 50에 있어서, 조성물을 국소적으로 투여하는 것인 방법.
실시양태 52. 여드름 치료를 필요로 하는 피험체에게 유효량의 실시양태 45 내지 49 중 어느 한 실시양태의 조합을 투여하는 단계를 포함하는, 여드름 치료를 필요로 하는 피험체에서 여드름을 치료하는 방법.
실시양태 53. 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 효소를 포함하는 조성물.
실시양태 54. 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 효소를 포함하는 조합.
실시양태 55. 본질적으로 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체로 구성된 조성물.
실시예
하기 실시예는 본 발명의 특정의 구체적인 실시양태를 예시하는 것이고, 본 발명의 범주를 제한하고자 하는 것은 아니다.
본원의 실시양태는 하기 실시예 및 상세한 프로토콜에 의해 추가로 예시된다. 그러나, 실시예는 단지 실시양태를 예시하는 것으로 의도된 것이며, 본원의 범주를 제한하는 것으로 해석되지 않아야 한다. 본 출원 전역에 걸쳐 인용된 모든 참고문헌 및 공개 특허 및 특허 출원의 내용은 본원에서 참조로 포함된다.
실시예 1. P. 아크네스 박테리오파지 PHIT-101은 선택적으로 및 효율적으로 P. 아크네스를 사멸시킨다.
P. 아크네스 박테리오파지는 유전적으로 고도로 유사하고, 다중의 P. 아크네스 균주에 대해 광범위한 다양성을 보이는 것으로 나타났다. 본 실험을 위해 리드 박테리오파지(PHIT-101)를 사용하였다. PHIT-101은 시험된 모든 P. 아크네스 균주 타입을 사멸시킨 단일 용균성 파지이다(데이터는 제시되지 않음). PHIT-101은 서열 번호 1의 서열을 가진다. 상기 파지의 효능 및 특이성을 보여주기 위해, 하기와 같이 플레이트 검정법을 수행하였다. P. 아크네스 KPA171202 및 P. 그라누로섬(밀접한 관계가 있지만, 양성인 피부 박테리아)을 별개의 BHI-아가 플레이트 상에 플레이팅하였다. 멸균 면 패드를 각 플레이트 상에 배치하였다. 여드름 치료에 일반적으로 사용되는 항생제인 미노사이클린, 또는 2 x 107 pfu/mL 역가로 파지 용액 중에 멸균 면 패드를 침지시켰다. 37℃에서 3일 동안 혐기 방식으로 플레이트를 인큐베이션시킨 후, 미노사이클린 패드는, 여드름 유발 P. 아크네스 및 공생 P. 그라누로섬, 둘 모두에 사멸 영역을 보이면서, 무차별적으로 박테리아를 사멸시켰다(도 1). 그에 반해, PHIT-101은 유익한 P. 그라누로섬의 성장은 방해하지 않으면서, 오직 P. 아크네스만을 사멸시켰다.
합성 피부 마이크로바이옴 검정법에서 선택적으로 사멸시킬 수 있는 PHIT-101의 능력에 관한 추가 증거를 얻었다. 피부 모공 중의 마이크로바이오타 중 60-80%를 차지하는 3개의 피부 박테리아인 P. 아크네스, P. 그라누로섬, 및 P. 아비둠을 포함하는 합성 피부 마이크로바이옴을 제제화하였다(문헌 [Science (2009) 324:1190-1192]). 상기 합성 피부 마이크로바이옴을 PHIT-101(최종 농도 5 x 105 pfu/mL)의 존재 또는 부재하에서 혐기 방식으로 성장시켰다. 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션시킨 후, 세포를 펠릿화하고, 세척하고, 일루미나 MiSeq에서 16S 앰플리콘 차세대 서열분석(NGS: next-generation sequencing)을 사용하여 3개 종의 상대적인 비율을 측정하였다. 도 2의 결과는, PHIT-101이 공생 P. 그라누로섬 및 P. 아비둠의 성장에는 부정적인 영향을 미치지 않으면서, P. 아크네스를 거의 완전히 사멸시킬 수 있다는 것을 나타낸다.
P. 아크네스 바이오필름을 파괴하는 바이오필름 분해 효소(
BDE
) 스크리닝
최근 수개의 보고(문헌 [Exp Dermatol (2014) 23:687, Br J Dermatol (2015) 172:13])를 통해 P. 아크네스가 피부 모공에서 상당량의 바이오필름을 생산하고, 이는 항생제 투과를 방해하고, 불량한 치료 결과를 초래한다고 확립되었다. 이를 입증하기 위해, 수개의 P. 아크네스 균주의 바이오필름 생산을 정량화하였다. 도 3은 단일 피험체의 마이크로바이오타로부터 단리된 다중 균주의 부착성 배양물이 유사한 조건하에서 현저히 다른 수준의 바이오필름을 생산한다는 것을 보여준다. 따라서, 플랑크톤성 세포를 이용한 이전의 개념 증명은 P. 아크네스의 피부 상에서 성장이 이루어진 실제 조건을 반영하지 못했다.
어떤 과학 이론으로도 제한하지 않으면서, 본 발명자들은 바이오필름이 고착성 P. 아크네스 세포의 파지 사멸에 대한 유의적인 장벽을 제공할 수 있다는 가설을 세웠다. 상기 가설은 플랑크톤성 P. 아크네스(99% 사멸, 도 2)와 달리, PHIT-101은 오직 바이오필름에 둘러싸인 P. 아크네스 세포 중 약 50%를 사멸시킬 수 있었던 것으로 나타난 세포 생존 검정법(도 5)에서 입증되었다. 바이오필름 분해가 파지 사멸을 개선시키는지 여부를 측정하기 위해, 다수의 효소를 스크리닝하여 P. 아크네스에 특이적인 BDE를 찾았다. 스크린은 바이오필름 중에서 발견될 수 있는 물질 타입: DNA, 다당류 및 단백질을 분해할 수 있는 3개 부류의 효소를 포함하였다. 도 4는 스크린에서, DN아제가 중간 정도의 활성을 보인 반면, 가장 우수한 바이오필름 분해율은 프로테아제, 및 아그레가티박터 악티노마이세텀코미탄스(Aggregatibacter actinomycetemcomitans)로부터의 글리코시드 하이드롤라제인 디스퍼신에서 관찰되었다.
파지와 쌍을 형성하는 데 BDE를 선택하는 데 있어서, 디스퍼신은 하기 2가지 이유에서 선택되었다: 먼저, 글리코시드 하이드롤라제로서, 이는 파지 그 자체의 단백질 코트를 공격할 가능성은 없고, 이로써, 가능한 파지 분해를 피할 수 있었기 때문이다. 두번째로, P. 아크네스는 스타필로코쿠스 아우레우스와 함께 강건한 바이오필름을 공동 형성하고(문헌 [Anaerobe (2016) 40:63-67]), 디스퍼신은 상기 두 유기체 모두로부터의 바이오필름에 대해 활성을 띠기 때문이다. 디스퍼신 첨가가 고착성 P. 아크네스에서 파지 사멸의 효능을 증가시키는지 여부를 측정하였다. 도 5는 파지에 ~99% 사멸률을 복구시키면서, PHIT-101의 박테리아 사멸이 디스퍼신의 존재하에서 증진되었다는 것을 보여준다.
실시예 2. 프로바이오틱 박테리아
프로바이오틱
균주의 유전자형
특징화
병원성 균주 타입 및 프로바이오틱 균주 타입으로의 계통발생적 분류를 유도하는 16S rDNA 서열 중 점 돌연변이, 및 병독성 인자를 보유하는 병원성 균주에서 발견되는 선형 플라스미드의 부재에 기초하여 P. 아크네스 균주를 특징화하였다. 16S-특이적 프라이머를 이용하여, 각 아크네스 균주의 전장의 16S rDNA 서열을 증폭시키고, 생어-서열분석하였다. 프로바이오틱 균주는 ProI 또는 ProII의 리보서열(RS: ribosequenc)을 가지는 것으로 확인되었다. ProI 균주는 KPA171202 타입 균주의 16S rDNA 서열(NIH 수탁 번호 NC_006085.1)과 비교하여 T838C 및 C1322T 돌연변이를 가진다. ProII 균주는 KPA171202 서열과 비교하여 C986T 및 T992C 돌연변이를 가진다. 추가로, 특이적 프라이머 쌍을 이용하여 각 균주 내의 선형 플라스미드의 존재 또는 부재를 측정하였다. 염색체외 리파제 뿐만 아니라, Tad (밀착 부착) 병독성 인자를 보유하는 상기 플라스미드가 프로바이오틱 균주에는 없는 것으로 확인되었다.
실시양태에서, 프로바이오틱 균주는 주로 서열 번호 3 및 서열 번호 4와 같은, 그의 16S 서열에 의해 특징화된다. 실시양태에서, 프로바이오틱 균주는 병독성 인자, 예컨대, 염색체외 리파제 및 Tad 유전자좌를 보유하는 플라스미드의 부재에 의해 유전자형에 의해 확인될 수 있다.
프로바이오틱 균주 코호트를 그의 면역원성 잠재성에 대하여 추가로 특징화하였다. 낮은 리파제 생산, 및 상피 세포에의 더 적은 밀착 부착이라는 2가지 인자에 기초한 리드 프로바이오틱 후보. 프로바이오틱 리드 후보 선별에 있어서 상기 특징의 표현형 입증이 중요하였다.
프로바이오틱
P. 아크네스 균주의 면역원성 잠재성 시험:
리파제
활성.
리파제는 피지 트리글리세리드를 가수분해시키고, 모피지낭에서 자극성 유리 지방산을 방출함으로써 여드름의 발병에서 중요한 역할을 한다. 리파제는 강력한 화학주성 및 염증유발성 항원이다. 그러므로, 리파제는 항여드름 약물용 약리학적 표적으로서 높은 관심의 대상이 된다. 실시양태에서, 전반적인 전략법은 높은 수준의 리파제를 분비하는 병원성 P. 아크네스를 저분비성 프로바이오틱 P. 아크네스로 대체시키는 것이다. 본 발명자들의 패널에서 각 균주에 대한 리파제 발현 표현형을 정량화하기 위해, 프로바이오틱 P. 아크네스 균주의 리파제 생산을 형광성 리파제 활성 검정법을 이용하여 병원성 P. 아크네스 균주와 비교하였다.
가장 큰 관심의 대상이 된 관찰결과 중 하나는 플랑크톤성 배양물 대 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 각 균주는 상이한 양의 리파제를 분비하였다는 것이다. 이는 이전에 P. 아크네스 균주에서 보고된 바 있다(문헌 [Res Microbiol, (2007) 158:386-392]). 추가로, 본 데이터에서는 상기 균주가 액체 배양물 중에서 성장되었을 때에는 병원성 균주와 프로바이오틱 균주의 리파제 생산량 사이에서 유의적인 차이는 없었던 것으로 나타났다. 그러나, 상기 균주가 바이오필름 조건하에서 성장되었을 때에는 흥미로운 변화가 관찰되었다. 균주 사이의 생산 가변성이 여전히 관찰될 수 있지만, 수개의 프로바이오틱 균주는 병원성 균주보다 유의적으로 더 적은 리파제 활성을 가졌다(도 11). 흥미롭게도, 프로바이오틱 코호트 내의 모든 균주가 낮은 리파제 활성을 가지는 것은 아니었다. 예를 들어, 균주 Pr-1 및 Pr-5의 리파제 생산은 프로바이오틱 균주에 대한 임계값을 초과하였고, 추가로 개발하지 않았다. 따라서, 고착성 P. 아크네스 세포에서의 리파제 생산을 정량화함으로써, 프로바이오틱 균주를 스크리닝하고, 가장 일관되게 낮은 수준의 리파제 활성을 가지는 상기 리드 후보를 선별할 수 있었다.
따라서, 병원성 균주 및 프로바이오틱 균주는 플랑크톤성 배양물에서는 유사한 양의 리파제를 분비하였지만, 프로바이오틱 균주는 부착성 배양물 중에서는 병원성 균주보다 훨씬 더 적은 리파제를 분비하였다. 도 8은 병원성 균주와 비교하여 상위 프로바이오틱 후보가 낮은 리파제 프로파일을 가졌다는 것을 보여준다.
프로바이오틱
P. 아크네스 균주의 면역원성 잠재성 시험: 세포 부착.
이용가능한 병원성 균주가 다른 포유동물 병원체의 병독성에서 중요한 역할을 하는 밀착 부착(tad) 유전자좌를 가지는 것으로 확인되었다(문헌 [J Bacteriol (2000) 182:6169-6176]; [Nat Rev Microbiol (2007) 5:363-375]; [PNAS (2003) 100:7295-7300]). 숙주 세포에의 부착이 클수록 병독성을 증가시킬 수 있거나, 염증성 숙주 반응을 유도할 수 있다. 프로바이오틱 균주는 이전에 유전자형 분석에 의해 tad 유전자좌를 함유하지 않는 것으로 입증되었으며, 따라서, 상피 세포에 더 적게 밀착 부착되는 것으로 예측되었다. 부착에 있어 주목할 만한 차이가 있는지 여부를 사정하기 위해 A-431 진피 상피 세포에의 병원성 균주 및 프로바이오틱 균주의 부착을 비교하였다. 도 9는 상위 3개의 프로바이오틱 후보가 병원성 균주보다 더 적게 상피 세포에 밀착 부착되었다는 것을 보여주는 것이다. 흥미롭게도, 상이한 P. 아크네스 과의 균주 사이에 세포 부착에 있어서 미묘하지만, 지속적인 차이가 다시 한번 발견되었다. 따라서, ProI 리보서열을 가지는 P. 아크네스 균주는 약간 더 높은 세포 부착을 보인 반면(도 9에서 Pr-2), ProII 균주는 더 적게 세포에 밀착 부착되었다(도 9에서, Pr-B, Pr-C).
마우스 귀 염증 모델에서의 병원성 및
프로바이오틱
P. 아크네스 비교
프로바이오틱 균주는 더 적게 리파제를 생산하였고, 상피 세포에 더 적게 밀착 부착되었음을 보여주는 프로바이오틱 균주의 낮은 면역원성 잠재성을 입증할 때, 상기 균주의 염증성 반응을, 여드름과 관련하여 P. 아크네스의 염증 잠재성을 평가하는 데 잘 확립되어 있고, 이전부터 사용되어 온 마우스 귀 염증 모델에서 시험하였다. 병원성 균주 및 프로바이오틱 균주의 염증 잠재성을 하기 연구에서 비교하였다: 1010 cfu의 균주를 CBA/J 마우스 귀에 주사하였다. 5마리의 마우스로 이루어진 코호트를 각 균주에 배정하였다. 5일 후, 귀를 절제하고, 염증에 대해 시험하였다. 여러 염증성 시토카인(IL-1β, IL-6, IL-17, TNFα)의 수준을 측정하였고, 조직 절편을 조직학적 방법에 의해 조사하였다. 도 10은 프로바이오틱 균주와 비교하여 병원성 균주가 유의적으로 더 높은 수준으로 IL-1β, IL-6, IL-17, TNFα를 가졌다는 것을 보여준다.
미니돼지 피부 모델에서
프로바이오틱
균주의 급성 진피 안전성 및 독성.
미니돼지 모델을 사용하여 프로바이오틱 균주를 피부 자극에 대해 시험하였다. 돼지는 중개 연구에서 사용되는 주요 동물 중 하나미여, 돼지 피부는 생리적으로, 해부학적으로, 생화학적으로 및 면역학적으로 인간 피부와 유사하다. 미니돼지는 특히 일반적으로 여드름과 같은 인간의 진피 질환 및 병태를 모델링하는 데 사용된다(문헌 [Vet Pathol (2012) 49:344-356]). 프로바이오틱 균주를 구분된 피부 부위에 두 용량 - 108 cfu 및 109 cfu로 3마리의 별개의 미니돼지 피부에 도포하였다. 임상 징후에 대하여 매일 동물을 관찰하였고, 투약 부위의 피부를 드레이즈 스코어링 시스템(Draize Scoring System)를 사용하여 투약 이전, 투약 실행 후 0.5, 1, 4, 8, 및 24시간째에 점수화하였다. 전 기간 동안 리드 프로바이오틱 균주와 연관된 홍반 또는 부종은 없었고, 전 기간 동안 드레이즈 점수는 0인 것으로 관찰되었다. 이는 동물 피부 모델에서 본 발명자들의 프로바이오틱 균주의 급성 노출에 대한 안전성을 입증한다.
실시예 3. 항여드름 화합물을 포함하는 조성물 중의 박테리오파지 안정성
파지가 살리실산 또는 벤조일 퍼옥시드(BPO)를 포함하는 복합 제제에서 안정적인지 여부를 측정하기 위해, 파지를 저농도 및 고농도의 상기 작용제와 함께 공동 인큐베이션시켰다. 처방전 없이 살 수 있는 일반 의약품 사용에 관한 미국 식품 의약 관리국(FDA: Food and Drug Administration)의 여드름 논문에 명시된 상기 작용제의 허용 농도에 의해 농도 범위를 결정하였다. 살리실산의 경우, 농도 범위는 0.5% (w/v) 내지 2% (w/v)인 반면, BPO의 경우, 범위는 2.5% (w/v) 내지 10% (w/v)이다. 완충처리된 파지 용액을 상기 작용제에 첨가하였고, 4℃에서의 그의 안정성을 60-90일 동안에 걸쳐 시험하였다. 도 15는 파지가 저용량 및 고용량의 살리실산 존재, 둘 모두에서 안정적이라는 것을 보여준다. 그에 반해, 도 16은 벤조일 퍼옥시드가 파지를 탈안정화시키고, 관찰된 파지 생존능 감소율은 더 높은 고농도의 BPO에서 더욱 급격하다.
실시예 4 (예측). 살리실산과 박테리오파지의 조합을 이용한 치료
프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 살리실산을 포함하는 조성물에 대한 이중 맹검, 위약 대조군 연구를 수행하여 상기 치료와 위약, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 단독, 및 살리실산 단독과의 비교 효능을 측정한다. 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 존재 및 그의 부재하에서 부재하에 0.5% (w/v) 및 2% (w/v) 농도의 살리실산을 투여한다. 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지를 포함하는 모든 조건에서, 파지는 용량당 109 pfu(플라크 형성 단위)인 용량으로 존재하다. 비교적 중증인 여드름을 가지는 10명의 피험체를 각각의 하기 군으로 치료한다:
(i) 위약 (활성제 무함유)
(ii) 단일 활성제로서 0.5% 살리실산
(iii) 단일 활성제로서 2% 살리실산
(iv) 단일 활성제로서 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지
(v) (단일 조성물 중) 0.5% 살리실산 및 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 조합
(vi) (단일 조성물 중) 2% 살리실산 및 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 조합.
살리실산과 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 조합은 여드름 치료에 있어서 상가 효과보다 큰 효과를 달성하고, 즉, 시너지 효과 (박테리오파지 및 살리실산의 조합 효과가 박테리오파지 및 살리실산을 각각 별개로 사용하였을 때의 그의 효과의 총합보다 더 크다)를 달성한다. 치료 효과는 병변 개수 및 IGA(시험자의 전반적 평가: investigator global assessment) 점수를 이용하여 측정한다.
실시예 5 (예측). 황과 박테리오파지의 조합을 이용한 치료
프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 황을 포함하는 조성물에 대한 이중 맹검, 위약 대조군 연구를 수행하여 상기 치료와 위약, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 단독, 및 황 단독과의 비교 효능을 측정한다. 3% (w/v) 및 10% (w/v) 농도의 황을 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 존재 및 그의 부재하에서 투여한다. 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지를 포함하는 모든 조건에서, 파지는 용량당 109 pfu인 용량으로 존재하다. 비교적 중증인 여드름을 가지는 10명의 피험체를 각각의 하기 군으로 치료한다:
(i) 위약 (활성제 무함유)
(ii) 단일 활성제로서 3% 황
(iii) 단일 활성제로서 10% 황
(iv) 단일 활성제로서 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지
(v) (단일 조성물 중) 3% 황 및 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 조합
(vi) (단일 조성물 중) 10% 황 및 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 조합.
황과 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 조합은 여드름 치료에 있어서 상가 효과보다 큰 효과를 달성하고, 즉, 시너지 효과 (박테리오파지 및 황의 조합 효과가 박테리오파지 및 황을 각각 별개로 사용하였을 때의 그의 효과의 총합보다 더 크다)를 달성한다. 치료 효과는 병변 개수 및 IGA(시험자의 전반적 평가) 점수를 이용하여 측정한다.
실시예 6 (예측). 벤조일 퍼옥시드와 박테리오파지의 조합을 이용한 치료
프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 BPO를 포함하는 조성물에 대한 이중 맹검, 위약 대조군 연구를 수행하여 상기 치료와 위약, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 단독, 및 BPO 단독과의 비교 효능을 측정한다. 2.5% (w/v) 및 10% (w/v) 농도의 BPO를 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 존재 및 그의 부재하에서 투여한다. 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지를 포함하는 모든 조건에서, 파지는 용량당 109 pfu인 용량으로 존재하다. 비교적 중증인 여드름을 가지는 10명의 피험체를 각각의 하기 군으로 치료한다:
(i) 위약 (활성제 무함유)
(ii) 단일 활성제로서 2.5% BPO
(iii) 단일 활성제로서 10% BPO
(iv) 단일 활성제로서 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지
(v) (단일 조성물 중) 2.5% BPO 및 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 조합
(vi) (단일 조성물 중) 10% BPO 및 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 조합.
BPO와 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 조합은 여드름 치료에 있어서 상가 효과보다 큰 효과를 달성하고, 즉, 시너지 효과 (박테리오파지 및 BPO의 조합 효과가 박테리오파지 및 BPO를 각각 별개로 사용하였을 때의 그의 효과의 총합보다 더 크다)를 달성한다. 치료 효과는 병변 개수 및 IGA(시험자의 전반적 평가) 점수를 이용하여 측정한다.
실시예 7 (예측). 벤조일 퍼옥시드와 박테리오파지의 조합을 이용한 검정법
플랑크톤성 및 고착성 병원성 P. 아크네스 박테리아를 사멸시키는 데 있어서 (i) BPO; (ii) 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지; 또는 (iii) 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 + BPO의 효능을 측정하는 시험관내 연구를 수행한다.
BPO와 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지의 조합은 고착성 병원성 P. 아크네스 박테리아를 사멸시키는 데 있어서 상가 효과보다 큰 효과를 달성하고, 즉, 시너지 효과 (박테리오파지 및 BPO의 조합 효과가 박테리오파지 및 BPO를 각각 별개로 사용하였을 때의 그의 효과의 총합보다 더 크다)를 달성한다. (살리실산 및 레티노이드와 유사한) BPO의 각질용해 작용은 피부 모공을 투과하여 모공 내의 심부로 접근할 수 있도록 하는 데 파지를 지원한다.
SEQUENCE LISTING
<110> Phi Therapeutics Inc.
<120> COMPOSITIONS COMPRISING PROPIONIBACTERIUM ACNES BACTERIOPHAGES
FOR TREATING ACNE
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<400> 1
agtgaaatac ctcccttttg tggttttgtc tgtttgtcga ctttttgtgt tggtggtgag 60
tgttgtgcag cctgagcttc ctgagtctcg tgagtggtgt ggggagacgc gtcgttggtg 120
gcgtgtgtgg ggtgaggata gtcgcgcgcc gtatgtgtct gatgaggagt ggttgtttct 180
tatggatgct gcggtgattc atgattgtgt gtggcgtgag ggtcgcgcgg atttggtggc 240
ttcgcttcgt gcgcatgtga aggcttttat gggcatgttg gataggtatt cggttgatgt 300
ggcgtctggt ggccgtggtg ggggttctgc tgtggcgatg attgaccggt ataggaagcg 360
taggggggct tgagtaggtg tctggtgttg ttgggtctca ggttcctcgt caccgtgtgg 420
ctgcggcgta ttcggtgtct gctgggggtg atgctgggga gcttggtcgt gcgtatgggt 480
tgacgcctga tccgtggcag cagcaggtgt tggatgattg gctggctgtc ggtagcaatg 540
gcaggcttgc ttctggtgtg tgtggggtgt ttgttccgcg gcagaatggc aagaatgcta 600
ttttggagat tgtggagttg tttaaggcga ctattcaggg tcgccgtatt ttgcatacgg 660
ctcacgagtt gaagtcggct cgtaaggcgt ttatgcggtt gaggtcgttt tttgagaatg 720
agcggcagtt tcctgacttg tatcgtatgg tgaagtcgat tcgtgcgacg aatggtcagg 780
aggctattgt gttgcatcat ccggattgtg ccacttttga gaagaagtgt ggctgcagcg 840
gttggggttc ggttgagttt gtggctcgta gccggggttc ggctcgcggg tttacggttg 900
atgatttggt gtgtgatgag gctcaggagt tgtcggatga gcagttggag gctttgcttc 960
ctacggtaag tgctgccccg tctggtgatc cgcagcagat tttccttggt acgccgcctg 1020
ggccgttggc tgatggttct gtggtgttgc gtttgcgtgg gcaggcgctt ggtggcggta 1080
aaaggtttgc gtggacggag ttttcgattc ctgacgagtc tgatccggat gatgtgtcgc 1140
ggcagtggcg gaagttggcg ggggatacga atccggcgtt ggggcgtcgc ctgaattttg 1200
ggaccgtaag cgatgagcat gagtcgatgt ctgctgccgg ttttgctcgg gagcggcttg 1260
gctggtggga tcgtggccag tctgctgcgt ctgtggttcc tgctgataag tgggctcagt 1320
ctgcggtgga tgaggcgagt ctggttggcg ggaaagtgtt tggtgtctcg ttttctcgtt 1380
ctggggatcg ggttgctttg gcgggtgccg gcaagactga tgctggggtt catgttgagg 1440
ttattgatgg gctgtcggga acgattgttg atggtgtggg ccggttggct gactggttgg 1500
cggttcgttg gggtgatact gaccggatca tggttgccgg gtctggtgcg gtgttgttgc 1560
agaaggcgtt gacggatcgt ggtattccgg gccgtggcgt ggtggttgct gatactggcg 1620
tttatgtgga ggcttgtcag gcgtttcttg agggtgtcag gtcgggtgtg atcagtcatc 1680
ctcgtgctga ttctcgccgt gacatgttgg atattgctgt gaggtcggct gtgcagaagc 1740
gtaaggggtc tgcgtggggt tggggttcct cgtttaagga tggttctgag gttcctttgg 1800
aggctgtgtc tttggcgttt ttgggggcta aacgtgttcg tcgtggccgt cgggagcgta 1860
gtggtaggaa gcgggtgtct gtggtatgaa ctcggatgag ttggctctga ttgagggcat 1920
gtacgatcgt atccaaaggt tgtcttcgtg gcattgttgt attgagggct actatgaggg 1980
ctctaatcgg gtgcgtgacc ttggtgtggc tattccgccg gagttgcagc gtgtgcagac 2040
tgtggtgtcg tggcctggta tagctgtgga tgctttggag gagcgtctgg attggcttgg 2100
ctggactaat ggtgacggct acggccttga tggtgtgtat gctgcgaatc ggcttgctac 2160
ggcgtcgtgt gatgtgcatt tggatgcgct gatttttggg ttgtcgtttg ttgcgatcat 2220
tcctcatggt gatggtacgg tgtcggttcg tccgcagtca ccaaagaatt gtacgggcaa 2280
gttttcggct gacgggtctc gtttggatgc gggtttggtg gtgcagcaga cgtgtgatcc 2340
tgaggttgtt gaggctgagc ttttgcttcc tgatgtgatt gttcaggtgg agcggcgggg 2400
ttcgcgtgaa tgggttgagg tggatcgtat accgaatgtg ttgggtgcgg ttccgttggt 2460
gcctattgtg aatcgtcgcc gtacttctag gattgatggc cgttcggaga ttacgaggtc 2520
tattagggct tacacggatg aggctgtgcg cacactgttg gggcagtctg tgaatcgtga 2580
tttttatgcg tatcctcagc gttgggtgac tggcgtgagc gcggatgagt tttcgcagcc 2640
tggctgggtc ctgtcgatgg cttctgtgtg ggctgtggat aaggatgatg acggtgacac 2700
tccgaatgtg gggtcgtttc ctgtcaatag tcctacaccg tattcggatc agatgagact 2760
gttggcgcag ttgactgcgg gtgaggcggc tgttccggaa cgctatttcg ggtttatcac 2820
gtctaaccca cctagtgggg aggctttggc tgccgaggaa tctcggcttg tgaagcgtgc 2880
tgagcggcgt caaacgtcgt ttggtcaggg ttggctgtcg gttggttttt tggctgccaa 2940
ggcgttggat tctcgtgttg atgaggccga tttttttggt gatgttggtt tgcgttggcg 3000
tgatgcttcg acgcctaccc gggcggctac ggctgatgct gtgacgaagc ttgttggtgc 3060
cggtattttg cctgctgatt ctcgtacggt gttggagatg ttggggcttg atgatgtgca 3120
ggttgaggct gtgatgcgtc atcgtgctga gtcgtctgac ccgttggcgg tgcttgctgg 3180
ggctatatcg cgtcaaacta acgaggtatg ataggcgatg gcttcggggg ttgaggcgag 3240
gcttgcggcg actgagtatc agcgtgaggc ggtcaggttt gctgggaagt atgcgggcta 3300
ttattctgag cttggtcgtt tgtggcgtgc cggcaggatg agtgacacgc agtatgtgcg 3360
tttgtgtgtg gagttggagc gtgccggcca tgatggttcg gcatcgttgg ctgccaggtt 3420
tgtgtcggat tttcgccggt tgaatggtgt ggatccgggt ttgattgtgt atgacgagtt 3480
tgatgctgcg gcggctttgg ctaggtctat ttcgaccacg aagattcttg agagtgaccc 3540
ggatagggcg aatgacacga ttgatgcgat ggcggcgggt tttgatcggg ctgttatgaa 3600
tgctggccgt gacacggttg agtggtctgc gggtgcgcag ggtaggtcgt ggcgtcgggt 3660
gacggatggt gatccgtgtg ctttttgtgc catgttggct acgaggtcgg attatacgac 3720
aaaagagagg gcacttacta ctggacatac tcggcgtcat aagcgtggtg gtaagcgtcc 3780
gtttggttcg aagtatcatg atcattgtgg ttgtacggtg gttgaggttg ttggcccttg 3840
ggaaccaaat agggctgatg ccgagtatca gaggacgtat gagaaggcct gtgagtgggt 3900
tgatgatcat gggttgcagc aatcgcctgg caatattttg aaggctatgc gtactgttgg 3960
cgacatgaga taatttgatg tggtttccgg ttgtgcgccg ccggttattg gtgcacaggg 4020
ttgtctcccg cacgggggtc aacaatattg tgttgttttc cgcaaggagt gtagggttag 4080
gctatggccg atcagagtgt tgaggaacag aatgttgaca atgatgttgt ggagtccgga 4140
aaggataacg gcattgttga tacagtaaaa gacgatggcg ggcaggaggt agccgacaat 4200
cagttgaaga atgaaggcga gggtaaatcg ccggggactg attggaaggc tgaggcccgt 4260
aagtgggagt ctcgtgctaa aagtaatttt gccgagttgg agaagcttcg cgcctcggat 4320
ggtgatgcgg ggtctacgat tgatgagctt cgccgcaaga atgaggaact cgaagaccgg 4380
atcaatgggt ttgttcttga gggtgtgaag cgcgaggtgg ctgccgagtg tggcctgtcg 4440
ggtgatgctg tcgctttctt gtcgggtggc gataaggagt cgcttgccga gtctgcgaaa 4500
gctttgaagg gtttgatcga ccatagtagt ggtggcgcgg gtgtgcgccg tcttgcgggg 4560
agtgcccccg ttgatgatgt taaacgacgt gagggtgtcg cgtttgtgga tgctcttgtc 4620
aataattcta ggagatgatt tgtgatggct gacgattttc tttctgcagg gaagcttgag 4680
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aagctttcgc cggagcagcc gactattttc gggcctgtga agggtgccgt gtttagtggt 4800
gttcctcgcg ccaagattgt tggtgagggc gaggttaagc cttccgcgtc tgttgatgtt 4860
tcggcgttta ctgcgcagcc tatcaaggtt gtgactcagc agcgtgtctc ggatgagttt 4920
atgtgggctg atgctgatta ccgtctgggt gtgcttcagg atctgatttc cccggctctt 4980
ggtgcttcga ttggtcgcgc cgtggatctg attgctttcc atggtattga tcctgccact 5040
ggtaaagcgg cttccgctgt gcatacttcg ctgaataaga cgaagaatat tgttgatgcc 5100
acggattctg ctacggctga tcttgttaag gctgtcggcc tgattgctgg tgctggtttg 5160
caggttccta acggggttgc tttggatccg gcgttctcgt ttgcgctgtc tactgaggtg 5220
tatccgaagg ggtctccgct tgccggtcag cctatgtatc ctgccgccgg gtttgccggt 5280
ttggataatt ggcgcgggct gaatgttggt gcttcttcga ctgtttctgg cgccccggag 5340
atgtcgcctg cctctggcgt taaggctatt gttggtgatt tctctcgtgt tcattggggt 5400
ttccagcgta acttcccgat cgagcttatc gagtatggtg acccggatca gactgggcgt 5460
gacttgaagg gccataatga ggttatggtt cgtgccgagg ctgtcctgta tgttgcgatt 5520
gagtcgcttg attcgtttgc tgttgtgaag gagaaggctg ccccgaagcc taatccgccg 5580
gccgagaact gattcatttg ttgcggtgat gttttctatg tgcagggggt ggtgttgatg 5640
ggtatcattt tgaagcctga ggatattgag cctttcgccg atattcctag agagaagctt 5700
gaggcgatga ttgccgatgt ggaggctgtg gctgtcagtg tcgccccctg tatcgctaaa 5760
ccggatttca aatacaagga tgccgctaag gctattctgc gcagggccct gttgcgctgg 5820
aatgataccg gggtttcggg tcaggtgcag tacgagtctg cgggcccgtt tgctcagact 5880
acacggtcga atactcccac gaatttgttg tggccttctg agattgccgc gttgaagaag 5940
ttgtgtgagg gtgatggtgg ggctggtaaa gcgttcacta ttacaccgac catgaggagt 6000
agtgtgaatc attctgaggt gtgttccacg gtgtggggtg agggttgctc gtgcggatct 6060
gatattaacg gctatgctgg ccctttgtgg gagatatgat atgaccggtt ttccttacgg 6120
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cgggttggtg gtcgatgatt ttttgtacgg atctgcctgt ttctccgttg gggagtgtcc 19200
attcggagat gcgtgtgcgg cgtacggtgc cgtttgcgag atcatcgcag atggtgtctg 19260
cttcgctatc gtggttggct agctgggtga gtagccggtc tatgttgtct atcactgggt 19320
atcctcttct tgcggggtgg tgttggcttg tttgcggcgg tagtctttta taacggtggc 19380
ggagatgggg tatcctgcct gggtgagctg ttttgctagc catgaggcgg ggatggtttt 19440
gtcggcgagc acgtcggcag ccttgttgcc gtagcgttgg atgagtgttt cagttttggt 19500
tgccatggtg tcctatcggt tgtgtggtgg gctgccatcc tgtgcggcag tcgccgtcgt 19560
ggcctggttt gcgtgtgcac cacgatacgg ttctgtctgt gtggttgagt gttttgccgc 19620
acatgacgtt ttgtagatgc tctggcagtg cgccgtcacc ctggttgctg gtttgtgtgt 19680
cgaagagtgt tttctggttg gtgaaatgct cggacacggt gccattatgt acgggtagta 19740
tccatgtttt ccattgttgt tgtagccggg tgttccagtg gaattgtttt gctgcgttcg 19800
tggcttgttt gatggttttg tagtagccga cgaggatgcg ctggtgttca ctgtcgggag 19860
ggttttggcc tcgccagtat tgtgccgcca cggcgtagcg gttgctggct gtgaaggcgt 19920
cccagcagta ttcaataatg tgttgtagta cactatcggg catgtctcgt acttggtttt 19980
cgtcgagcca cgcgtcgaca atgatgttgc gtatggcgcg tttgtctttg gtggtgggtt 20040
tgaatgcgat gctcacagta cgggcctgtc gtcttgcatg aaatcattaa aggatgattc 20100
gcttgcgcgg cgtgcttgtg tgatttgctg gtcagaccag tcggggtgtt gctgtttcag 20160
atagtaccag tggcacgcat tgtaggtttc gtcttgtagc cgggtgagat ggttttcggt 20220
gatgatttgt ttccacatag tccatgacac gtcgagccgg tccaatattt ccattgctgg 20280
aatgttgaac tggttcagga agagtatttc gtgggtgtag tattccttct cgtactggtc 20340
ccatccactt cggtgcctgt tgggctggtt tttggggtag gcttcccggc atactttgtg 20400
caaatgtttg gccatgtcgt cgggtagttt aatgtcaggg ttggcgcgga tcatggatcg 20460
catcccatca taggtggtgc cccaggtgtg catgatgtag gtggggtctt caccatcagc 20520
ccatttttct gcacagatgg cgaggcggat gcgtctcctg gctgattggc tggtgttgcg 20580
ccggttgggg atggggcacg tgtcgagggg atccatgatg ttttggtgta cctttcttgg 20640
tttaggttgc ttgtgtggtt ttattgtagc actgtgtcta gtgcttgtgt caaccctgtt 20700
ttgccggcct gaaggtaggt gtctgtgaca tcccccaggg tgaggggcac atgggtggct 20760
tgggggagtg cggcctggag tgtttgggcc atctggtggc ccgccttgtc tgggtctgac 20820
cagatgtaga tgtggtcgta gccttcaaaa aatttggtcc aaaaagtttg ccacgaggtt 20880
gcgccgggta gggctacggc tggccatccg cattgttcga ggatcatgga gtcgaattcg 20940
ccttcgcaaa tgtgcatttc ggctgccggg ttggccatgg cggccatgtt gtagatggag 21000
cctgtgtctc ctgccggggt tagatatttg gggtggttgt gggttttgca atcatgttgg 21060
agtgagcagc ggaaacgcat ttttcgtatt tcggctggcc cttcccagac ggggtacatg 21120
tatgggatgg tgatgcactg gttgtagttt tcgtggcctt ggatggggtc attgtcgatg 21180
tatccaaggt ggtggtagcg ggctgtttct tcgctgatgc ctcttgccga gagcaggtcg 21240
agtatgtttt cgaggtgggt ttcgtagcgg gctgaggctt tctggattcg gcggcgttcc 21300
gcaatgttgt aggggcgtat gctgtcgtac attcgggttt tcttcctcta atcgttgttt 21360
cagtttgtgg agtccgcctc cgataccgca tgtgtggcag taccagacgc ccttgtcgag 21420
gttgatgctc atggagggct ggtggtcgtc gtggaacggg cagaggatgt gttgctcgtt 21480
ccgtgacggg ttgtagcgta tctggtgggc gtctaggagg cggcaggtgt cagaggtgtg 21540
ggaggagctc gttgagggtt gataccacat aggcttcgct ccagggtttg ttgcgctgtt 21600
tcatgatgac gagtccgatg gtggattggt tttcgcggtt tcggtgtgtt tcgtagttgc 21660
gtgcctcccg gctggcttgt ttcacgaatt cggctaggtg tgcctgtcct gctttggctt 21720
cgatcacata ggttttgttg ccggttgtga ggatgaggtc gccttcgtct tctttaccgt 21780
tgaggtggag gcgttctata tcatagccgg tgtcgcgtag ctggtggagg agtcttgttt 21840
cccattcggc gccggctcgg cggttgcgtg cctgttgtgt tgacatgata gtcctttatg 21900
ttcttgtgtc atgttccagg gctgtttttc tactaggggc ccgaagaatg tgtattcggg 21960
gtaggctcgt agtcgttcgt attttgttcc gtctgggctg gatttgccgg ttctctgttt 22020
caggacggcg atgcgtgcct cggcggggat ggtgaggccg ttgccgttgt cttcgccacc 22080
atacagggag actcccaata tgagttgtgg tttttcggag aggccgtttt tgatttcccg 22140
cctagctggg gggtgttcga tgtcggtgcc ggttttgtcg gttgcgtggt gggtgacgat 22200
gatggtggag ccagtatctc tacctaaggc tgtgatccat tgcatggctt cttgctgtgc 22260
ctgatagtcg gattcgcagt cttggatgtc catcaggttg tctataacaa taatgggtgg 22320
gaaggtgttc cacatttcca tgtaggcttg cagttccatg gtgatgtctg tccatgtgat 22380
gggtgactgg aatgagaagg tgatgtgtcc gccgtggtgg atgctgtctc gatagtattc 22440
tggcccgtag ttgtcgatgt tgtgttgtat ctgttgggtg gtgtgttggg tgttgagtga 22500
gatgattcgt gtggaggcct cccagggtgt catgtcccct gatatgtaga gggctggctg 22560
gttgagcatc gcggtgatga acatggctag ccctgatttt tggctgccgg accgccccgc 22620
gatcatgacc aaatcccctt tgtggatgtg catgtccagg ttgtcataca agggtgctag 22680
ttggggtatg cggggcagtt cggcggctgt ttgggaggcc ctctcgaagg atctttggag 22740
agagagcatc gggaccttaa tctatctgtt ggttgggtgt gttttggtgg tcagatggag 22800
tcgatgtcga tgtcagcatc ggcgggggct gtggtgtcgt ctagctggcc gttgtcgcgt 22860
ttgtctacat attcggcaac cttatcgtag atggcgtcgt cgaggggttt gaggacgacc 22920
gcgttgaacc cgtttttggt gcgcacggtg gcaagtttga aggcttgttc ttcgccgaga 22980
tatgcttcta ggtcgcggat catggagtgt gggcggtcgt tgttgccgcg tgctttttcg 23040
atgatggcgt tggggatggt ttctggggtg ccgttgttga gatcctggag ggtgtggaag 23100
attgtgacat cagcgtagat gcggtctgcg acctgtccac cgtagccttc ggtgttgtgt 23160
tctacgtcgc ggattttgaa ggcgatggcg gtggcgtcct ggtttcggga ggggttgaag 23220
aaggtgctgt tgctgttgtt gtggtagttg gcgagtgcca tgattgtgtt atcctttact 23280
gttgtgtctg tttttgttgt cttatattgg tttatcgggt gaggctgttt cgtttgctgc 23340
ggaaagcctc ggaaacgtca ctgttactgg tgatggtctt cttgtactgt ttgagtaggt 23400
ctgctagctg tgtcttgctg gtggctttgt ttatccggtc gatgatgatg tcgttttcct 23460
gtgatgcgat tttgttgacg tagtctttgg cggctttatc gtatcggtct tgaagcagga 23520
ttgctgcgct agcgatgagg gttgcgagat cccagtcttt ggatacggtt tcgtctttca 23580
atcctcctag cagatcaata atggattgtt tgatgtcttc tgcggtgtct ccgcggatga 23640
ctgtccatgg ggcggcatag tcgccaccgt atttgagtgt gatagttagt tttccgctgt 23700
ctgtggtgtg ctcgtcggtc acgtgttttc cttttcgttg ttttcggctt ctggtggctg 23760
tacggtggtt tctatcgggt atctgtaggc gtctttcccg ttgacggccc agcaggcgtc 23820
cttgacgggg catcctttgc agagtgtggt gacgtggggt acgaagatgc cttggctgat 23880
tcctttcatt gcttgactgt acatggatga tacatgccgg taggtgttgt tgtcaagatc 23940
aatgagttcg gttgctgtgc cctgctcgac tgattgctcg tctcccttgg tggtggcggg 24000
tgtccaaaac atgcctttcg tcacatggat gccgtgttgg gcgagcatgt accggtatgt 24060
gtgcagctgc atactgtctg cgggtaggcg tccggttttg aggtccaaaa tgaaggtttc 24120
gccggtgtcg gtgtcggtga atacccggtc aatatatccg actatttttg tgtcatcgtc 24180
gagggtggtt tctaccgggt attcgatgcc tggctggccg tcaataacag cggtggcgta 24240
ttctgggtgg ttgcgcctcc atgttttcca gcggtccaca aaggtggggc cgtacatcat 24300
ccaccaattg tagtctttct tgtgtggccc gcctgactcg cacatgtttt tgcatattct 24360
gccggagggc tttatgtttg tgccttcgga ttcggcgagg gcgatttggg tgtcgaaaat 24420
gtttgtgaag gatgagagtt tgtctggcag tgcagggtat tcggcggggt tgtacaggtg 24480
taggtcgtat tgttcggtga tgtggtgtat ggcgcttccg gcgatggtgg cgtaccaggt 24540
gtggtgttgg gcgtggtagc cgtgtgctag gcgccatttt tcgccgcatt cggcccactg 24600
tgtgagtgaa ctgtaggaga tgtggcctgg atggttgatg gttttcgggt attgtgctag 24660
gggcattact tgtcgccttt gtgggtgttc catgggttgc gggtgtcttt gccggcgtgg 24720
tgttgctggt aggcgaggag tgcgaggcag tgccaggcag cgtgtgccag atgcggcaaa 24780
tgtgattcgt tgtcgaggtt gttgccttgc tgccatgata acaggtgccg gtagagggcg 24840
tcgacactgt ggctccacgg gtatcctccg gtccagttgt tgtcgccgta cttggtggca 24900
ccgtagcctg ccacggagcc tagggcgtgc aaggctgcgg ggtcgatgag ggagagcctg 24960
cagagtttca attcttttcg ggcaccgctg ttggggtcgg tgtacatgct ggtgggctca 25020
tccatggtgt gtgtgctcct taagcgtggg ttactggtta ttgtcgtggg cgagtgctac 25080
ggcgagaata atgatggcga gggtttcagc gatcagtatg ggtgttgtga tcatttagtg 25140
tctcggggat tattggtgag tgttgatgca cctaggaggg tggcgagggc gcatgcggcg 25200
atggtggcga gggctgcctt gtgtggggtg ccggttgcgt acatccatgt gatgatgccg 25260
ccttggatcc aggctagact ggtgaagaac gtttcgtaac tgtgtagctc aatgttgttg 25320
ttgggtgtgt tcatgcttgc tcctgaagaa tggtgttgat ggttttataa atgttgtaca 25380
ggtcggtttc gatagataac agttggttga tttggtggtc gagatcaatg tctgggttga 25440
gggtgtcgat gcgggcggcg atatcggtgg cggtgcgtag gcttactgct gcaccgtgga 25500
tgatgtggca catgtcggtg aggccgactt tggcgatata gtgtgacatg agaggcataa 25560
taggtgtgct gtctttctgg tcagcgtgaa gggttgatgg acatatcctc tacctgtggt 25620
ttgtcttcgg tgccggagac ttggcagaag actttcacat gcgtcttgga tgctccggcc 25680
tgtttggcgg tggcaccgta ggcgatagta aaggtgtctt tgtgggcgcc gatgactttg 25740
tgtaggaaga ggtcgatgtc ggggttgccg ttccatttga caccgttttc tgcggctgtc 25800
tgggtggctt tctgattgca ggcgtgtgcg gcggtgatca tggtgagacc cttgctggtt 25860
tcttcacccc ttgcttgggc ttgccggtgg gctttggcct gctcggcttg tagggagcgg 25920
actgctgcgg cctggcgggc cttcttctca gccttgcgct gctggacggt tttgggtgtc 25980
cattcggtgt tggctgtggt tacctgtggt gcgggttgtg aggcgagtgg cggattgtcg 26040
tctggggctg gcatgaagga tgctgcggca ataatggcga ctgtggcgcc tgcgatggtg 26100
tagcctgttt tcttgttcat gattttatgt tcccctttcc ggggtgttgt tcgttgctga 26160
catggttaat actttcagcg gctgggccca ctgtcaaggc tgcgctcagt ttgtgtgagc 26220
gtttcttgtg tggctagggg tgatggcttc tttcgcccaa taggatgtgc caccgctggt 26280
ccagtatccg agtttgttgc gctgcatgcc cttggcgtcc atctcgtcga tagtgaggca 26340
cctgcggcga ttggggcctg tcttgacccc gtggtcgcct gtccggtgca tgtcgcctga 26400
ggtggtactc gtgaatgttt catggcagat ggtacagtgc tctggtcgat atccggtgat 26460
tgtgctatcg cacttgtggc atgtccattc catgattgct cctattttcc attataagac 26520
ttcctgtagt gccattttag cgccttgcgg gtcttggggg tacaactata taggtcaggt 26580
gtttctaggc gattctaggc tcattgtgtg tggctggggt tttatcgggc acacagggtg 26640
agcaggtggc caacattgat gcgggtcaca ttccagtaga gttgcgtggc ttccccactg 26700
gtgagcggct tccactcgtc atggctgaac acggtgccat cggatgcgat gaacgtgttg 26760
gggcgtagct tgtggagttc ggcttccacg ctctgccggt aggcttcggc gaggccctca 26820
aaatccatgt ggtcgcaggg gaggttttcg aggcgtgtca ggtcgaaggg tgtggggcag 26880
tcgtagctgg cgggggtgta gagctgggtg aagtggttgg cgatcttctg catcatgatt 26940
ccttttctga tgatggtgtg ttgagggttt atcgggtgga tgcgacaagg atggcgtcta 27000
catcgatcat gtcgatgaga tcgtggagtt cctcggcctc gttctcagtg agtggctgcc 27060
aggcgtagtc gccgtatacg gcgccgtcga gggtgacagt ccacgggggc cggatgagtc 27120
gtatggcttc ttgtacttta gcgtggtaca tgcggcgcac catatccaga tcgatgtcgt 27180
ctgaatggtt tccggtgagg ctgtggaggc tgagcgggtc gatgtctgtc tgcctgtaga 27240
gggatgtgaa ggatggggtg atgagtgtgc catccatgag tgtgctcctt tcggtggttg 27300
taggggttgt tgtggtttct agagtgtgcg ggctgcgacc ccacagtcaa ggtgtcgctc 27360
aaactcagtg agcgtttcat atgggtgtgt tgggtgtgac agatgtcact taagccttga 27420
tggcctctct cagcgcctca aatcttctag gggtaggatt atgaagggtt ggccctgctg 27480
atcgattcta ggccccatac agggcgtctg aggggtgtgt ctgagtgata gtgggtgtgg 27540
cagatgatct agcgagtcaa ggtgccgagc tgagacataa gatctatcat ctaggtgtgt 27600
gagatgtatc acatcctccc ggcttggtgt gcaccctcaa ggccacccag tcgatctgac 27660
gtggagggtg tagcccagaa atactgttta aagccttcac acggcgccta ggagcgcctt 27720
acagggtggg ggctaggtat ttataccccc agcacattct gatcgattct agacgcctac 27780
aggagcccga tacacgatca gccatccaga cgcagatcat cagcacctat catggttagc 27840
taagcctcaa ctatgtggac agtgttggtt actgtggggg aagaaggaca cggtaaaaga 27900
aagaggggga gtatcagctt taaagcctta aggtcttagc gcttagcacc gatggtctta 27960
gcagttagca ccgagccccc tcaagggctc ggcatcagcc cgaacaggca cagccatgaa 28020
aggagtacac gccatcaggg aaggctttcg agtacgagga gcctcagcga cgagtactcg 28080
aaagcctgag ggaacaccca tcagcactga tgagcctagc gtattcggaa aggacacaag 28140
agtgaagtgt gacagctgtc cgggagtgaa ccccgttctg actaggggtt tcagccttaa 28200
ccaccctcaa aggttacaag actctaagaa aatttaagga aaagtttagg tttaattttt 28260
ggacctttac taccaaaaac acccgtttac agccctcaaa cccgcctata gagccaaaac 28320
caccagtttg actcatccca ggtggggtat gataggctgg acaggtagcc agctggacgc 28380
aaggccggaa agtgctaacg cactttccaa cctcgcttac catcagtcta ccaaacactt 28440
aaagacctaa gggcttagcg ctaaggtgct gatagcttag caccgagccc cctcaagggc 28500
tcggcatcag tcttaaagcc ttaaatactt aaagtaacta taaaacttta aaagcttaac 28560
acttaaggat ataaacttta catcagtgtt taagacttaa aaacttaaaa taactattaa 28620
gacttaaagt aactataaaa cattaaagac cttaagtact taaagttaac catcagtctt 28680
aaactttact atgataacct ataagtctta aagcttatag gtataataat ataatataag 28740
tattaaagct tataagttat aaaagtttta gaagagttaa agggttaact tctttacttc 28800
tcttctctct ttggttcttt ctctcttctc ttcttttctt catcggggga gaagaggaac 28860
ctttaacgtc aacgctgatg gacttttcgc cgtgtgtctc gtgtgcttct ggtcgcaagc 28920
tcccatcgca cactccccac actctttcac ctgtgtccct ttcaggctta gcgtgttcag 28980
ctgaaggcgt acagcgtgtc acgcttaaac ccttaacacc aggtaagact taaagtgcat 29040
attataagta gaagacttta aaaccttaag ggtgttcctg cttagcctgt gtcctttaac 29100
gctaggcgct aagccgtgaa acgtgaacac ccatccaccc ctcttctttt taccgtgtcc 29160
ttcttctttt gacaccgctg gggggcgatg tgatcttttt aacatgccag ggggtgcggg 29220
tagaaaacaa ccaccccacc acaaacagaa caccccctca aacgcacaaa acagccccca 29280
ggatcgatga acagggcaag ggcaaggtat tcataccccc agacgattcc aggccgttag 29340
agaggcaaat aagacccgta cagggctagg tgaggaatag acacatcatg gcacgcacca 29400
atcgcacagc tagccaagcc caccgacgct ggcggcaacg actcatcacc caagcccaac 29460
aacaaggcca aaccgaatgc ccactctgcg gagtcaccat cacctgggac acacacgacc 29520
taccaaccag ccccgaagcc gaccacatca cacccgtcag caggggagga ctcaacaccc 29580
tcgacaacgg gcaaatcatc tgcagaacat gcaacagaag caaaggcaat cgcagcgaac 29640
caaacatcaa attccaacaa caaaccacaa aaacattgat tccatggtga caaacccgcc 29700
aacccccacc ggggacaccc cctgcacagg cgtgcaagac ctcgtacggc tt 29752
<210> 2
<211> 1537
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 16S DNA sequence for the KPA171202 type strain
<400> 2
tttttcattg gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat 60
gcaagtcgaa cggaaaggcc ctgcttttgt ggggtgctcg agtggcgaac gggtgagtaa 120
cacgtgagta acctgccctt gactttggga taacttcagg aaactggggc taataccgga 180
taggagctcc tgctgcatgg tgggggttgg aaagtttcgg cggttgggga tggactcgcg 240
gcttatcagc ttgttggtgg ggtagtggct taccaaggct ttgacgggta gccggcctga 300
gagggtgacc ggccacattg ggactgagat acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt 360
ggggaatatt gcacaatggg cggaagcctg atgcagcaac gccgcgtgcg ggatgacggc 420
cttcgggttg taaaccgctt tcgcctgtga cgaagcgtga gtgacggtaa tgggtaaaga 480
agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtgatacgt agggtgcgag cgttgtccgg 540
atttattggg cgtaaagggc tcgtaggtgg ttgatcgcgt cggaagtgta atcttggggc 600
ttaaccctga gcgtgctttc gatacgggtt gacttgagga aggtagggga gaatggaatt 660
cctggtggag cggtggaatg cgcagatatc aggaggaaca ccagtggcga aggcggttct 720
ctgggccttt cctgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggct tagataccct 780
ggtagtccac gctgtaaacg gtgggtacta ggtgtggggt ccattccacg ggttccgtgc 840
cgtagctaac gctttaagta ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag 900
gaattgacgg ggccccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg caacgcgtag 960
aaccttacct gggtttgaca tggatcggga gtgctcagag atgggtgtgc ctcttttggg 1020
gtcggttcac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt 1080
cccgcaacga gcgcaaccct tgttcactgt tgccagcacg ttatggtggg gactcagtgg 1140
agaccgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat 1200
gtccagggct tcacgcatgc tacaatggct ggtacagaga gtggcgagcc tgtgagggtg 1260
agcgaatctc ggaaagccgg tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga cctcatgaag 1320
tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cggggcttgt 1380
acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagttgg taacacccga agccggtggc ctaaccgttg 1440
tgggggagcc gtcgaaggtg ggactggtga ttaggactaa gtcgtaacaa ggtagccgta 1500
ccggaaggtg cggctggatc acctcctttc taaggag 1537
<210> 3
<211> 1537
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 16S DNA sequence for the ProI probiotic strain
<400> 3
tttttcattg gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat 60
gcaagtcgaa cggaaaggcc ctgcttttgt ggggtgctcg agtggcgaac gggtgagtaa 120
cacgtgagta acctgccctt gactttggga taacttcagg aaactggggc taataccgga 180
taggagctcc tgctgcatgg tgggggttgg aaagtttcgg cggttgggga tggactcgcg 240
gcttatcagc ttgttggtgg ggtagtggct taccaaggct ttgacgggta gccggcctga 300
gagggtgacc ggccacattg ggactgagat acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt 360
ggggaatatt gcacaatggg cggaagcctg atgcagcaac gccgcgtgcg ggatgacggc 420
cttcgggttg taaaccgctt tcgcctgtga cgaagcgtga gtgacggtaa tgggtaaaga 480
agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtgatacgt agggtgcgag cgttgtccgg 540
atttattggg cgtaaagggc tcgtaggtgg ttgatcgcgt cggaagtgta atcttggggc 600
ttaaccctga gcgtgctttc gatacgggtt gacttgagga aggtagggga gaatggaatt 660
cctggtggag cggtggaatg cgcagatatc aggaggaaca ccagtggcga aggcggttct 720
ctgggccttt cctgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggct tagataccct 780
ggtagtccac gctgtaaacg gtgggtacta ggtgtggggt ccattccacg ggttccgcgc 840
cgtagctaac gctttaagta ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag 900
gaattgacgg ggccccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg caacgcgtag 960
aaccttacct gggtttgaca tggatcggga gtgctcagag atgggtgtgc ctcttttggg 1020
gtcggttcac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt 1080
cccgcaacga gcgcaaccct tgttcactgt tgccagcacg ttatggtggg gactcagtgg 1140
agaccgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat 1200
gtccagggct tcacgcatgc tacaatggct ggtacagaga gtggcgagcc tgtgagggtg 1260
agcgaatctc ggaaagccgg tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga cctcatgaag 1320
ttggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cggggcttgt 1380
acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagttgg taacacccga agccggtggc ctaaccgttg 1440
tgggggagcc gtcgaaggtg ggactggtga ttaggactaa gtcgtaacaa ggtagccgta 1500
ccggaaggtg cggctggatc acctcctttc taaggag 1537
<210> 4
<211> 1537
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 16S DNA sequence for the ProII probiotic strain
<400> 4
tttttcattg gagagtttga tcctggctca ggacgaacgc tggcggcgtg cttaacacat 60
gcaagtcgaa cggaaaggcc ctgcttttgt ggggtgctcg agtggcgaac gggtgagtaa 120
cacgtgagta acctgccctt gactttggga taacttcagg aaactggggc taataccgga 180
taggagctcc tgctgcatgg tgggggttgg aaagtttcgg cggttgggga tggactcgcg 240
gcttatcagc ttgttggtgg ggtagtggct taccaaggct ttgacgggta gccggcctga 300
gagggtgacc ggccacattg ggactgagat acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt 360
ggggaatatt gcacaatggg cggaagcctg atgcagcaac gccgcgtgcg ggatgacggc 420
cttcgggttg taaaccgctt tcgcctgtga cgaagcgtga gtgacggtaa tgggtaaaga 480
agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtgatacgt agggtgcgag cgttgtccgg 540
atttattggg cgtaaagggc tcgtaggtgg ttgatcgcgt cggaagtgta atcttggggc 600
ttaaccctga gcgtgctttc gatacgggtt gacttgagga aggtagggga gaatggaatt 660
cctggtggag cggtggaatg cgcagatatc aggaggaaca ccagtggcga aggcggttct 720
ctgggccttt cctgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggct tagataccct 780
ggtagtccac gctgtaaacg gtgggtacta ggtgtggggt ccattccacg ggttccgtgc 840
cgtagctaac gctttaagta ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag 900
gaattgacgg ggccccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg caacgcgtag 960
aaccttacct gggtttgaca tggattggga gcgctcagag atgggtgtgc ctcttttggg 1020
gtcggttcac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt 1080
cccgcaacga gcgcaaccct tgttcactgt tgccagcacg ttatggtggg gactcagtgg 1140
agaccgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tgccccttat 1200
gtccagggct tcacgcatgc tacaatggct ggtacagaga gtggcgagcc tgtgagggtg 1260
agcgaatctc ggaaagccgg tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga cctcatgaag 1320
tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cggggcttgt 1380
acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagttgg taacacccga agccggtggc ctaaccgttg 1440
tgggggagcc gtcgaaggtg ggactggtga ttaggactaa gtcgtaacaa ggtagccgta 1500
ccggaaggtg cggctggatc acctcctttc taaggag 1537
<210> 5
<211> 1525
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 16S DNA sequence
<400> 5
agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac 60
ggaaaggccc tgcttttgtg gggtgctcga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa 120
cctgcccttg actttgggat aacttcagga aactggggct aataccggat aggagctcct 180
gctgcatggt gggggttgga aagtttcggc ggttggggat ggactcgcgg cttatcagct 240
tgttggtggg gtagtggctt accaaggctt tgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg 300
gccacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg 360
cacaatgggc ggaagcctga tgcagcaacg ccgcgtgcgg gatgacggcc ttcgggttgt 420
aaaccgcttt cgcctgtgac gaagcgtgag tgacggtaat gggtaaagaa gcaccggcta 480
actacgtgcc agcagccgcg gtgatacgta gggtgcgagc gttgtccgga tttattgggc 540
gtaaagggct cgtaggtggt tgatcgcgtc ggaagtgtaa tcttggggct taaccctgag 600
cgtgctttcg atacgggttg acttgaggaa ggtaggggag aatggaattc ctggtggagc 660
ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac cagtggcgaa ggcggttctc tgggcctttc 720
ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggctt agataccctg gtagtccacg 780
ctgtaaacgg tgggtactag gtgtggggtc cattccacgg gttccgtgcc gtagctaacg 840
ctttaagtac cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg 900
gccccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgtaga accttacctg 960
ggtttgacat ggatcgggag tgctcagaga tgggtgtgcc tcttttgggg tcggttcaca 1020
ggtggtgcat gcctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080
cgcaaccctt gttcactgtt gccagcacgt tatggtgggg actcagtgga gaccgccggg 1140
gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcctcat gccccttatg tccagggctt 1200
cacgcatgct acaatggctg gtacagagag tggcgagcct gtgagggtga gcgaatctcg 1260
gaaagccggt ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac ctcatgaagt cggagtcgct 1320
agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc ggggcttgta cacaccgccc 1380
gtcaagtcat gaaagttggt aacacccgaa gccggtggcc taaccgttgt gggggagccg 1440
tcgaaggtgg gactggtgat taggactaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc 1500
ggctggatca cctcctttct aagga 1525
<210> 6
<211> 1525
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 16S Sequence
<400> 6
agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac 60
ggaaaggccc tgcttttgtg gggtgctcga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa 120
cctgcccttg actttgggat aacttcagga aactggggct aataccggat aggagctcct 180
gctgcatggt gggggttgga aagtttcggc ggttggggat ggactcgcgg cttatcagct 240
tgttggtggg gtagtggctt accaaggctt tgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg 300
gccacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg 360
cacaatgggc ggaagcctga tgcagcaacg ccgcgtgcgg gatgacggcc ttcgggttgt 420
aaaccgcttt cgcctgtgac gaagcgtgag tgacggtaat gggtaaagaa gcaccggcta 480
actacgtgcc agcagccgcg gtgatacgta gggtgcgagc gttgtccgga tttattgggc 540
gtaaagggct cgtaggtggt tgatcgcgtc ggaagtgtaa tcttggggct taaccctgag 600
cgtgctttcg atacgggttg acttgaggaa ggtaggggag aatggaattc ctggtggagc 660
ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac cagtggcgaa ggcggttctc tgggcctttc 720
ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggctt agataccctg gtagtccacg 780
ctgtaaacgg tgggtactag gtgtggggtc cattccacgg gttccgtgcc gtagctaacg 840
ctttaagtac cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg 900
gccccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgtaga accttacctg 960
ggtttgacat ggatcgggag tgctcagaga tgggtgtgcc tcttttgggg tcggttcaca 1020
ggtggtgcat gcctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080
cgcaaccctt gttcactgtt gccagcacgt tatggtgggg actcagtgga gaccgccggg 1140
gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat gccccttatg tccagggctt 1200
cacgcatgct acaatggctg gtacagagag tggcgagcct gtgagggtga gcgaatctcg 1260
gaaagccggt ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac ctcatgaagt cggagtcgct 1320
agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc ggggcttgta cacaccgccc 1380
gtcaagtcat gaaagttggt aacacccgaa gccggtggcc taaccgttgt gggggagccg 1440
tcgaaggtgg gactggtgat taggactaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc 1500
ggctggatca cctcctttct aagga 1525
<210> 7
<211> 1525
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 16S Sequence
<400> 7
agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac 60
ggaaaggccc tgcttttgtg gggtgctcga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa 120
cctgcccttg actttgggat aacttcagga aactggggct aataccggat aggagctcct 180
gctgcatggt gggggttgga aagtttcggc ggttggggat ggactcgcgg cttatcagct 240
tgttggtggg gtagtggctt accaaggctt tgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg 300
gccacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg 360
cacaatgggc ggaagcctga tgcagcaacg ccgcgtgcgg gatgacggcc ttcgggttgt 420
aaaccgcttt cgcctgtgac gaagcgtgag tgacggtaat gggtaaagaa gcaccggcta 480
actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcgagc gttgtccgga tttattgggc 540
gtaaagggct cgtaggtggt tgatcgcgtc ggaagtgtaa tcttggggct taaccctgag 600
cgtgctttcg atacgggttg acttgaggaa ggtaggggag aatggaattc ctggtggagc 660
ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac cagtggcgaa ggcggttctc tgggcctttc 720
ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggctt agataccctg gtagtccacg 780
ctgtaaacgg tgggtactag gtgtggggtc cattccacgg gttccgtgcc gtagctaacg 840
ctttaagtac cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg 900
gccccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgtaga accttacctg 960
ggtttgacat ggatcgggag tgctcagaga tgggtgtgcc tcttttgggg tcggttcaca 1020
ggtggtgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080
cgcaaccctt gttcactgtt gccagcacgt tatggtgggg actcagtgga gaccgccggg 1140
gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat gccccttatg tccagggctt 1200
cacgcatgct acaatggctg gtacagagag tggcgagcct gtgagggtga gcgaatctcg 1260
gaaagccggt ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac ctcatgaagt cggagtcgct 1320
agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc ggggcttgta cacaccgccc 1380
gtcaagtcat gaaagttggt aacacccgaa gccggtggcc taaccgttgt gggggagccg 1440
tcgaaggtgg gactggtgat taggactaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc 1500
ggctggatca cctcctttct aagga 1525
<210> 8
<211> 1525
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 16S Sequence
<400> 8
agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac 60
ggaaaggccc tgcttttgtg gggtgctcga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa 120
cctgcccttg actttgggat aacttcagga aactggggct aataccggat aggagctcct 180
gctgcatggt gggggttgga aagtttcggc ggttggggat ggactcgcgg cttatcagct 240
tgttggtggg gtagtggctt accaaggctt tgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg 300
gccacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg 360
cacaatgggc ggaagcctga tgcagcaacg ccgcgtgcgg gatgacggcc ttcgggttgt 420
aaaccgcttt cgcctgtgac gaagcgtgag tgacggtaat gggtaaagaa gcaccggcta 480
actacgtgcc agcagccgcg gtgatacgta gggtgcgagc gttgtccgga tttattgggc 540
gtaaagggct cgtaggtggt tgatcgcgtc ggaagtgtaa tcttggggct taaccctgag 600
cgtgctttcg atacgggttg acttgaggaa ggtaggggag aatggaattc ctggtggagc 660
ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac cagtggcgaa ggcggttctc tgggcctttc 720
ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggctt agataccctg gtagtccacg 780
ctgtaaacgg tgggtactag gtgtggggtc cattccacgg gttccgtgcc gtagctaacg 840
ctttaagtac cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg 900
gccccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgtaga accttacctg 960
ggtttgacat ggatcggaag cgctcagaga tgggtgtgcc tcttttgggg tcggttcaca 1020
ggtggtgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080
cgcaaccctt gttcactgtt gccagcacgt tatggtgggg actcagtgga gaccgccggg 1140
gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat gccccttatg tccagggctt 1200
cacgcatgct acaatggctg gtacagagag tggcgagcct gtgagggtga gcgaatctcg 1260
gaaagccggt ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac ctcatgaagt cggagtcgct 1320
agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc ggggcttgta cacaccgccc 1380
gtcaagtcat gaaagttggt aacacccgaa gccggtggcc taaccgttgt gggggagccg 1440
tcgaaggtgg gactggtgat taggactaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc 1500
ggctggatca cctcctttct aagga 1525
<210> 9
<211> 1525
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 16S Sequence
<400> 9
agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac 60
ggaaaggccc tgcttttgtg gggtgctcga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa 120
cctgcccttg actttgggat aacttcagga aactggggct aataccggat aggagctcct 180
gctgcatggt gggggttgga aagtttcggc ggttggggat ggactcgcgg cttatcagct 240
tgttggtggg gtagtggctt accaaggctt tgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg 300
gccacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg 360
cacaatgggc ggaagcctga tgcagcaacg ccgcgtgcgg gatgacggcc ttcgggttgt 420
aaaccgcttt cgcctgtgac gaagcgtgag tgacggtaat gggtaaagaa gcaccggcta 480
actacgtgcc agcagccgcg gtgatacgta gggtgcgagc gttgtccgga tttattgggc 540
gtaaagggct cgtaggtggt tgatcgcgtc ggaagtgtaa tcttggggct taaccctgag 600
cgtgctttcg atacgggttg acttgaggaa ggtaggggag aatggaattc ctggtggagc 660
ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac cagtggcgaa ggcggttctc tgggcctttc 720
ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggctt agataccctg gtagtccacg 780
ctgtaaacgg tgggtactag gtgtggggtc cattccacgg gttccgtgcc gtagctaacg 840
ctttaagtac cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg 900
gccccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgtaga accttacctg 960
ggtttgacat ggatcgggag tgctcagaga tgggtgtgcc tcttttgggg tcggttcaca 1020
ggtggtgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080
cgcaaccctt gttcactgtt gccagcacgt tatggtgggg actcagtgga gaccgccggg 1140
gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat gccccttatg tccagggctt 1200
cacgcatgct acaatggctg gtacagagag tggcgagcct atgagggtga gcgaatctcg 1260
gaaagccggt ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac ctcatgaagt cggagtcgct 1320
agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc ggggcttgta cacaccgccc 1380
gtcaagtcat gaaagttggt aacacccgaa gccggtggcc taaccgttgt gggggagccg 1440
tcgaaggtgg gactggtgat taggactaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc 1500
ggctggatca cctcctttct aagga 1525
<210> 10
<211> 1525
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 16S Sequence
<400> 10
agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac 60
ggaaaggccc tgcttttgtg gggtgctcga gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa 120
cctgcccttg actttgggat aacttcagga aactggggct aataccggat aggagctcct 180
gctgcatggt gggggttgga aagtttcggc ggttggggat ggactcgcgg cttatcagct 240
tgttggtggg gtagtggctt accaaggctt tgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg 300
gccacattgg gactgagata cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg 360
cacaatgggc ggaagcctga tgcagcaacg ccgcgtgcgg gatgacggcc ttcgggttgt 420
aaaccgcttt cgcctgtgac gaagcgtgag tgacggtaat gggtaaagaa gcaccggcta 480
actacgtgcc agcagccgcg gtgatacgta gggtgcgagc gttgcccgga tttattgggc 540
gtaaagggct cgtaggtggt tgatcgcgtc ggaagtgtaa tcttggggct taaccctgag 600
cgtgctttcg atacgggttg acttgaggaa ggtaggggag aatggaattc ctggtggagc 660
ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac cagtggcgaa ggcggttctc tgggcctttc 720
ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc gaacaggctt agataccctg gtagtccacg 780
ctgtaaacgg tgggtactag gtgtggggtc cattccacgg gttccgtgcc gtagctaacg 840
ctttaagtac cccgcctggg gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg 900
gccccgcaca agcggcggag catgcggatt aattcgatgc aacgcgtaga accttacctg 960
ggtttgacat ggatcgggag tgctcagaga tgggtgtgcc tcttttgggg tcggttcaca 1020
ggtggtgcat gcctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080
cgcaaccctt gttcactgtt gccagcacgt tatggtgggg actcagtgga gaccgccggg 1140
gtcaactcgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat gccccttatg tccagggctt 1200
cacgcatgct acaatggctg gtacagagag tggcgagcct gtgagggtga gcgaatctcg 1260
gaaagccggt ctcagttcgg attggggtct gcaactcgac ctcatgaagt cggagtcgct 1320
agtaatcgca gatcagcaac gctgcggtga atacgttccc ggggcttgta cacaccgccc 1380
gtcaagtcat gaaagttggt aacacccgaa gccggtggcc taaccgttgt gggggagccg 1440
tcgaaggtgg gactggtgat taggactaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaaggtgc 1500
ggctggatca cctcctttct aagga 1525
<210> 11
<211> 1089
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA sequence that encodes Dispersin B
<400> 11
atgaattgtt gcgtaaaagg caattccata tatccgcaaa aaacaagtac caagcagacc 60
ggattaatgc tggacatcgc ccgacatttt tattcacccg aggtgattaa atcctttatt 120
gataccatca gcctttccgg cggtaatttt ctgcacctgc atttttccga ccatgaaaac 180
tatgcgatag aaagccattt acttaatcaa cgtgcggaaa atgccgtgca gggcaaagac 240
ggtatttata ttaatcctta taccggaaag ccattcttga gttatcggca acttgacgat 300
atcaaagcct atgctaaggc aaaaggcatt gagttgattc ccgaacttga cagcccgaat 360
cacatgacgg cgatctttaa actggtgcaa aaagacagag gggtcaagta ccttcaagga 420
ttaaaatcac gccaggtaga tgatgaaatt gatattacta atgctgacag tattactttt 480
atgcaatctt taatgagtga ggttattgat atttttggcg acacgagtca gcattttcat 540
attggtggcg atgaatttgg ttattctgtg gaaagtaatc atgagtttat tacgtatgcc 600
aataaactat cctacttttt agagaaaaaa gggttgaaaa cccgaatgtg gaatgacgga 660
ttaattaaaa atacttttga gcaaatcaac ccgaatattg aaattactta ttggagctat 720
gatggcgata cgcaggacaa aaatgaagct gccgagcgcc gtgatatgcg ggtcagtttg 780
ccggagttgc tggcgaaagg ctttactgtc ctgaactata attcctatta tctttacatt 840
gttccgaaag cttcaccaac cttctcgcaa gatgccgcct ttgccgccaa agatgttata 900
aaaaattggg atcttggtgt ttgggatgga cgaaacacca aaaaccgcgt acaaaatact 960
catgaaatag ccggcgcagc attatcgatc tggggagaag atgcaaaagc gctgaaagac 1020
gaaacaattc agaaaaacac gaaaagttta ttggaagcgg tgattcataa gacgaatggg 1080
gatgagtga 1089
<210> 12
<211> 362
<212> PRT
<213> Aggregatibacter actinomycetemcomitans
<400> 12
Met Asn Cys Cys Val Lys Gly Asn Ser Ile Tyr Pro Gln Lys Thr Ser
1 5 10 15
Thr Lys Gln Thr Gly Leu Met Leu Asp Ile Ala Arg His Phe Tyr Ser
20 25 30
Pro Glu Val Ile Lys Ser Phe Ile Asp Thr Ile Ser Leu Ser Gly Gly
35 40 45
Asn Phe Leu His Leu His Phe Ser Asp His Glu Asn Tyr Ala Ile Glu
50 55 60
Ser His Leu Leu Asn Gln Arg Ala Glu Asn Ala Val Gln Gly Lys Asp
65 70 75 80
Gly Ile Tyr Ile Asn Pro Tyr Thr Gly Lys Pro Phe Leu Ser Tyr Arg
85 90 95
Gln Leu Asp Asp Ile Lys Ala Tyr Ala Lys Ala Lys Gly Ile Glu Leu
100 105 110
Ile Pro Glu Leu Asp Ser Pro Asn His Met Thr Ala Ile Phe Lys Leu
115 120 125
Val Gln Lys Asp Arg Gly Val Lys Tyr Leu Gln Gly Leu Lys Ser Arg
130 135 140
Gln Val Asp Asp Glu Ile Asp Ile Thr Asn Ala Asp Ser Ile Thr Phe
145 150 155 160
Met Gln Ser Leu Met Ser Glu Val Ile Asp Ile Phe Gly Asp Thr Ser
165 170 175
Gln His Phe His Ile Gly Gly Asp Glu Phe Gly Tyr Ser Val Glu Ser
180 185 190
Asn His Glu Phe Ile Thr Tyr Ala Asn Lys Leu Ser Tyr Phe Leu Glu
195 200 205
Lys Lys Gly Leu Lys Thr Arg Met Trp Asn Asp Gly Leu Ile Lys Asn
210 215 220
Thr Phe Glu Gln Ile Asn Pro Asn Ile Glu Ile Thr Tyr Trp Ser Tyr
225 230 235 240
Asp Gly Asp Thr Gln Asp Lys Asn Glu Ala Ala Glu Arg Arg Asp Met
245 250 255
Arg Val Ser Leu Pro Glu Leu Leu Ala Lys Gly Phe Thr Val Leu Asn
260 265 270
Tyr Asn Ser Tyr Tyr Leu Tyr Ile Val Pro Lys Ala Ser Pro Thr Phe
275 280 285
Ser Gln Asp Ala Ala Phe Ala Ala Lys Asp Val Ile Lys Asn Trp Asp
290 295 300
Leu Gly Val Trp Asp Gly Arg Asn Thr Lys Asn Arg Val Gln Asn Thr
305 310 315 320
His Glu Ile Ala Gly Ala Ala Leu Ser Ile Trp Gly Glu Asp Ala Lys
325 330 335
Ala Leu Lys Asp Glu Thr Ile Gln Lys Asn Thr Lys Ser Leu Leu Glu
340 345 350
Ala Val Ile His Lys Thr Asn Gly Asp Glu
355 360
<210> 13
<211> 1103
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA sequence that encodes an alginate lyase
<400> 13
atgaaaacgt cccacctgat ccgtatcgcc ctgcccggtg ccctcgccgc ggcattgctc 60
gccagccagg tcagccaggc cgccgacctg gtacccccgc ccggctacta cgcggcggtc 120
ggcgagcgca agggcagcgc cggcagctgc cccgcggtgc cgccgccgta taccggcagc 180
ctggtcttca ccagcaagta cgaaggctcc gattcggcgc gggcgaccct caacgtcaag 240
gcggagaaga ccttccgctc gcagatcaag gacatcaccg acatggagcg cggcgccacc 300
aagctggtca cccagtacat gcgcagcggc cgcgacggcg acctggcctg cgcactgaac 360
tggatgagcg cctgggcccg cgccggcgcc ctgcagagcg acgacttcaa ccacaccggc 420
aagtccatgc gcaaatgggc gctgggcagc ctctccggcg cctacatgcg cctgaagttc 480
tccagctcgc ggccgctcgc ggcccacgcc gagcagagcc gggaaatcga ggactggttc 540
gcccggctcg gcacccaggt agtccgcgac tggagcggcc tgccgctgaa gaagatcaac 600
aaccattcct actgggcggc ctggtcggtg atgtccaccg cggtggtgac caaccgccgc 660
gacctcttcg actgggcggt gagcgagttc aaggtcgccg ccaaccaggt cgacgagcag 720
ggcttcctgc ccaacgaact caagcgccgc cagcgcgccc tcgcctacca caactatgcg 780
ctgccaccgc tggcgatgat cgccgcgttc gcccaggtca acggcgtcga cctgcgccag 840
gagaaccacg gcgccctgca gcgcctggcc gagcgggtga tgaagggagt cgacgacgag 900
gaaaccttcg aggagaagac cggcgaggac caggacatga ccgacctcaa ggtcgacaac 960
aagtacgcct ggctggagcc ctactgcgcc ctctaccgct gcgagccgaa gatgctcgag 1020
gcgaagaagg accgcgagcc gttcaacagt ttccgcctcg gcggcgaagt gacgcgggtg 1080
ttcagccgcg aagggggaag ttg 1103
<210> 14
<211> 367
<212> PRT
<213> Flavobacterium multivorum
<400> 14
Met Lys Thr Ser His Leu Ile Arg Ile Ala Leu Pro Gly Ala Leu Ala
1 5 10 15
Ala Ala Leu Leu Ala Ser Gln Val Ser Gln Ala Ala Asp Leu Val Pro
20 25 30
Pro Pro Gly Tyr Tyr Ala Ala Val Gly Glu Arg Lys Gly Ser Ala Gly
35 40 45
Ser Cys Pro Ala Val Pro Pro Pro Tyr Thr Gly Ser Leu Val Phe Thr
50 55 60
Ser Lys Tyr Glu Gly Ser Asp Ser Ala Arg Ala Thr Leu Asn Val Lys
65 70 75 80
Ala Glu Lys Thr Phe Arg Ser Gln Ile Lys Asp Ile Thr Asp Met Glu
85 90 95
Arg Gly Ala Thr Lys Leu Val Thr Gln Tyr Met Arg Ser Gly Arg Asp
100 105 110
Gly Asp Leu Ala Cys Ala Leu Asn Trp Met Ser Ala Trp Ala Arg Ala
115 120 125
Gly Ala Leu Gln Ser Asp Asp Phe Asn His Thr Gly Lys Ser Met Arg
130 135 140
Lys Trp Ala Leu Gly Ser Leu Ser Gly Ala Tyr Met Arg Leu Lys Phe
145 150 155 160
Ser Ser Ser Arg Pro Leu Ala Ala His Ala Glu Gln Ser Arg Glu Ile
165 170 175
Glu Asp Trp Phe Ala Arg Leu Gly Thr Gln Val Val Arg Asp Trp Ser
180 185 190
Gly Leu Pro Leu Lys Lys Ile Asn Asn His Ser Tyr Trp Ala Ala Trp
195 200 205
Ser Val Met Ser Thr Ala Val Val Thr Asn Arg Arg Asp Leu Phe Asp
210 215 220
Trp Ala Val Ser Glu Phe Lys Val Ala Ala Asn Gln Val Asp Glu Gln
225 230 235 240
Gly Phe Leu Pro Asn Glu Leu Lys Arg Arg Gln Arg Ala Leu Ala Tyr
245 250 255
His Asn Tyr Ala Leu Pro Pro Leu Ala Met Ile Ala Ala Phe Ala Gln
260 265 270
Val Asn Gly Val Asp Leu Arg Gln Glu Asn His Gly Ala Leu Gln Arg
275 280 285
Leu Ala Glu Arg Val Met Lys Gly Val Asp Asp Glu Glu Thr Phe Glu
290 295 300
Glu Lys Thr Gly Glu Asp Gln Asp Met Thr Asp Leu Lys Val Asp Asn
305 310 315 320
Lys Tyr Ala Trp Leu Glu Pro Tyr Cys Ala Leu Tyr Arg Cys Glu Pro
325 330 335
Lys Met Leu Glu Ala Lys Lys Asp Arg Glu Pro Phe Asn Ser Phe Arg
340 345 350
Leu Gly Gly Glu Val Thr Arg Val Phe Ser Arg Glu Gly Gly Ser
355 360 365
<210> 15
<211> 1539
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA sequence that encodes an amylase
<400> 15
atgaaacaac aaaaacggct ttacgcccga ttgctgacgc tgttatttgc gctcatcttc 60
ttgctgcctc attctgcagc agcggcggca aatcttaatg ggacgctgat gcagtatttt 120
gaatggtaca tgcccaatga cggccaacat tggaagcgtt tgcaaaacga ctcggcatat 180
ttggctgaac acggtattac tgccgtctgg attcccccgg catataaggg aacgagccaa 240
gcggatgtgg gctacggtgc ttacgacctt tatgatttag gggagtttca tcaaaaaggg 300
acggttcgga caaagtacgg cacaaaagga gagctgcaat ctgcgatcaa aagtcttcat 360
tcccgcgaca ttaacgttta cggggatgtg gtcatcaacc acaaaggcgg cgctgatgcg 420
accgaagatg taaccgcggt tgaagtcgat cccgctgacc gcaaccgcgt aatttcagga 480
gaacacctaa ttaaagcctg gacacatttt cattttccgg ggcgcggcag cacatacagc 540
gattttaaat ggcattggta ccattttgac ggaaccgatt gggacgagtc ccgaaagctg 600
aaccgcatct ataagtttca aggaaaggct tgggattggg aagtttccaa tgaaaacggc 660
aactatgatt atttgatgta tgccgacatc gattatgacc atcctgatgt cgcagcagaa 720
attaagagat ggggcacttg gtatgccaat gaactgcaat tggacggttt ccgtcttgat 780
gctgtcaaac acattaaatt ttcttttttg cgggattggg ttaatcatgt cagggaaaaa 840
acggggaagg aaatgtttac ggtagctgaa tattggcaga atgacttggg cgcgctggaa 900
aactatttga acaaaacaaa ttttaatcat tcagtgtttg acgtgccgct tcattatcag 960
ttccatgctg catcgacaca gggaggcggc tatgatatga ggaaattgct gaacggtacg 1020
gtcgtttcca agcatccgtt gaaatcggtt acatttgtcg ataaccatga tacacagccg 1080
gggcaatcgc ttgagtcgac tgtccaaaca tggtttaagc cgcttgctta cgcttttatt 1140
ctcacaaggg aatctggata ccctcaggtt ttctacgggg atatgtacgg gacgaaagga 1200
gactcccagc gcgaaattcc tgccttgaaa cacaaaattg aaccgatctt aaaagcgaga 1260
aaacagtatg cgtacggagc acagcatgat tatttcgacc accatgacat tgtcggctgg 1320
acaagggaag gcgacagctc ggttgcaaat tcaggtttgg cggcattaat aacagacgga 1380
cccggtgggg caaagcgaat gtatgtcggc cggcaaaacg ccggtgagac atggcatgac 1440
attaccggaa accgttcgga gccggttgtc atcaattcgg aaggctgggg agagtttcac 1500
gtaaacggcg ggtcggtttc aatttatgtt caaagatag 1539
<210> 16
<211> 512
<212> PRT
<213> Bacillus licheniformis
<400> 16
Met Lys Gln Gln Lys Arg Leu Tyr Ala Arg Leu Leu Thr Leu Leu Phe
1 5 10 15
Ala Leu Ile Phe Leu Leu Pro His Ser Ala Ala Ala Ala Ala Asn Leu
20 25 30
Asn Gly Thr Leu Met Gln Tyr Phe Glu Trp Tyr Met Pro Asn Asp Gly
35 40 45
Gln His Trp Lys Arg Leu Gln Asn Asp Ser Ala Tyr Leu Ala Glu His
50 55 60
Gly Ile Thr Ala Val Trp Ile Pro Pro Ala Tyr Lys Gly Thr Ser Gln
65 70 75 80
Ala Asp Val Gly Tyr Gly Ala Tyr Asp Leu Tyr Asp Leu Gly Glu Phe
85 90 95
His Gln Lys Gly Thr Val Arg Thr Lys Tyr Gly Thr Lys Gly Glu Leu
100 105 110
Gln Ser Ala Ile Lys Ser Leu His Ser Arg Asp Ile Asn Val Tyr Gly
115 120 125
Asp Val Val Ile Asn His Lys Gly Gly Ala Asp Ala Thr Glu Asp Val
130 135 140
Thr Ala Val Glu Val Asp Pro Ala Asp Arg Asn Arg Val Ile Ser Gly
145 150 155 160
Glu His Leu Ile Lys Ala Trp Thr His Phe His Phe Pro Gly Arg Gly
165 170 175
Ser Thr Tyr Ser Asp Phe Lys Trp His Trp Tyr His Phe Asp Gly Thr
180 185 190
Asp Trp Asp Glu Ser Arg Lys Leu Asn Arg Ile Tyr Lys Phe Gln Gly
195 200 205
Lys Ala Trp Asp Trp Glu Val Ser Asn Glu Asn Gly Asn Tyr Asp Tyr
210 215 220
Leu Met Tyr Ala Asp Ile Asp Tyr Asp His Pro Asp Val Ala Ala Glu
225 230 235 240
Ile Lys Arg Trp Gly Thr Trp Tyr Ala Asn Glu Leu Gln Leu Asp Gly
245 250 255
Phe Arg Leu Asp Ala Val Lys His Ile Lys Phe Ser Phe Leu Arg Asp
260 265 270
Trp Val Asn His Val Arg Glu Lys Thr Gly Lys Glu Met Phe Thr Val
275 280 285
Ala Glu Tyr Trp Gln Asn Asp Leu Gly Ala Leu Glu Asn Tyr Leu Asn
290 295 300
Lys Thr Asn Phe Asn His Ser Val Phe Asp Val Pro Leu His Tyr Gln
305 310 315 320
Phe His Ala Ala Ser Thr Gln Gly Gly Gly Tyr Asp Met Arg Lys Leu
325 330 335
Leu Asn Gly Thr Val Val Ser Lys His Pro Leu Lys Ser Val Thr Phe
340 345 350
Val Asp Asn His Asp Thr Gln Pro Gly Gln Ser Leu Glu Ser Thr Val
355 360 365
Gln Thr Trp Phe Lys Pro Leu Ala Tyr Ala Phe Ile Leu Thr Arg Glu
370 375 380
Ser Gly Tyr Pro Gln Val Phe Tyr Gly Asp Met Tyr Gly Thr Lys Gly
385 390 395 400
Asp Ser Gln Arg Glu Ile Pro Ala Leu Lys His Lys Ile Glu Pro Ile
405 410 415
Leu Lys Ala Arg Lys Gln Tyr Ala Tyr Gly Ala Gln His Asp Tyr Phe
420 425 430
Asp His His Asp Ile Val Gly Trp Thr Arg Glu Gly Asp Ser Ser Val
435 440 445
Ala Asn Ser Gly Leu Ala Ala Leu Ile Thr Asp Gly Pro Gly Gly Ala
450 455 460
Lys Arg Met Tyr Val Gly Arg Gln Asn Ala Gly Glu Thr Trp His Asp
465 470 475 480
Ile Thr Gly Asn Arg Ser Glu Pro Val Val Ile Asn Ser Glu Gly Trp
485 490 495
Gly Glu Phe His Val Asn Gly Gly Ser Val Ser Ile Tyr Val Gln Arg
500 505 510
<210> 17
<211> 996
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA sequence that encodes a cellulase
<400> 17
atgaagtttc agagcacttt gcttcttgcc gccgcggctg gttccgcgtt ggctgtgcct 60
catggctccg gacataagaa gagggcgtct gtgtttgaat ggttcggatc gaacgagtct 120
ggtgctgaat ttgggaccaa tatcccaggc gtctggggaa ccgactacat cttccccgac 180
ccctcgacca tctctacgtt gattggcaag ggaatgaact tcttccgcgt ccagttcatg 240
atggagaggt tgcttcctga ctcgatgact ggttcatacg acgaggagta tctggccaac 300
ttgacgactg tggtgaaagc ggtcacggat ggaggcgcgc atgcgctcat cgaccctcat 360
aactatggca gatacaacgg ggagatcatc tccagtacat cggatttcca gactttctgg 420
cagaatctgg cgggccagta caaagataac gacttggtca tgtttgatac caacaacgaa 480
tactacgaca tggaccagga tctcgtgctg aatctcaacc aagcagccat taacggcatc 540
cgcgctgcag gtgcaagcca gtacattttc gtcgaaggca actcctggac cggagcttgg 600
acatgggtcg atgtcaacga taatatgaag aatttgaccg acccagaaga caagatcgtc 660
tatgaaatgc accagtacct agactccgac ggttccggca cttcggagac ctgtgtctcc 720
gggacaatcg gaaaggagcg gatcactgat gctacacagt ggctcaagga caataagaag 780
gtcggcttca tcggcgaata tgccgggggg tccaatgatg tgtgtcggag tgccgtgtcc 840
gggatgctag agtacatggc gaacaacacc gacgtatgga agggtgcgtc gtggtgggca 900
gccgggccat ggtggggaga ctacattttc agcctggagc ccccagatgg aactgcttac 960
acgggtatgc tggatatcct ggagacgtat ctctga 996
<210> 18
<211> 331
<212> PRT
<213> Aspergillus niger
<400> 18
Met Lys Phe Gln Ser Thr Leu Leu Leu Ala Ala Ala Ala Gly Ser Ala
1 5 10 15
Leu Ala Val Pro His Gly Ser Gly His Lys Lys Arg Ala Ser Val Phe
20 25 30
Glu Trp Phe Gly Ser Asn Glu Ser Gly Ala Glu Phe Gly Thr Asn Ile
35 40 45
Pro Gly Val Trp Gly Thr Asp Tyr Ile Phe Pro Asp Pro Ser Thr Ile
50 55 60
Ser Thr Leu Ile Gly Lys Gly Met Asn Phe Phe Arg Val Gln Phe Met
65 70 75 80
Met Glu Arg Leu Leu Pro Asp Ser Met Thr Gly Ser Tyr Asp Glu Glu
85 90 95
Tyr Leu Ala Asn Leu Thr Thr Val Val Lys Ala Val Thr Asp Gly Gly
100 105 110
Ala His Ala Leu Ile Asp Pro His Asn Tyr Gly Arg Tyr Asn Gly Glu
115 120 125
Ile Ile Ser Ser Thr Ser Asp Phe Gln Thr Phe Trp Gln Asn Leu Ala
130 135 140
Gly Gln Tyr Lys Asp Asn Asp Leu Val Met Phe Asp Thr Asn Asn Glu
145 150 155 160
Tyr Tyr Asp Met Asp Gln Asp Leu Val Leu Asn Leu Asn Gln Ala Ala
165 170 175
Ile Asn Gly Ile Arg Ala Ala Gly Ala Ser Gln Tyr Ile Phe Val Glu
180 185 190
Gly Asn Ser Trp Thr Gly Ala Trp Thr Trp Val Asp Val Asn Asp Asn
195 200 205
Met Lys Asn Leu Thr Asp Pro Glu Asp Lys Ile Val Tyr Glu Met His
210 215 220
Gln Tyr Leu Asp Ser Asp Gly Ser Gly Thr Ser Glu Thr Cys Val Ser
225 230 235 240
Gly Thr Ile Gly Lys Glu Arg Ile Thr Asp Ala Thr Gln Trp Leu Lys
245 250 255
Asp Asn Lys Lys Val Gly Phe Ile Gly Glu Tyr Ala Gly Gly Ser Asn
260 265 270
Asp Val Cys Arg Ser Ala Val Ser Gly Met Leu Glu Tyr Met Ala Asn
275 280 285
Asn Thr Asp Val Trp Lys Gly Ala Ser Trp Trp Ala Ala Gly Pro Trp
290 295 300
Trp Gly Asp Tyr Ile Phe Ser Leu Glu Pro Pro Asp Gly Thr Ala Tyr
305 310 315 320
Thr Gly Met Leu Asp Ile Leu Glu Thr Tyr Leu
325 330
<210> 19
<211> 1155
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA sequence that encodes proteinase K
<400> 19
atgcgtttgt ctgttcttct gagtcttctt cccctcgctc tcggcgctcc tgccgttgag 60
cagcgctccg aggctgctcc tctgatcgag gcccgcggcg agatggttgc caacaagtac 120
attgtcaagt tcaaggaggg tagcgctctt tctgctctcg atgctgccat ggagaagatt 180
tctggcaagc ccgaccacgt ctacaagaac gtcttcagtg gtttcgctgc gacccttgac 240
gagaacatgg ttcgggttct ccgcgcccat cccgatgttg agtacattga gcaggatgct 300
gttgtcacca tcaacgctgc gcagaccaac gctccctggg gccttgctcg catctccagc 360
accagccccg gtacctctac ttactactat gacgaatctg ccggccaagg ctcctgcgtc 420
tacgtgattg acaccggtat cgaggcatcg caccccgagt ttgagggtcg tgcccagatg 480
gtcaagacct actactactc cagtcgcgac ggtaacggtc acggcactca ctgcgctggt 540
accgttggct cccgaaccta cggtgtcgcc aagaagaccc agctctttgg tgtcaaggtc 600
ctcgatgaca acggcagtgg ccagtactcc accatcatcg ccggtatgga ctttgttgcc 660
agcgacaaga acaaccgcaa ctgccccaaa ggtgtcgttg cctccttgtc ccttggcggt 720
ggttactcct cctccgtgaa cagcgccgct gccaggctcc agagctctgg tgtcatggtc 780
gccgtcgctg ccggtaacaa caacgctgac gcccgcaact actcccctgc ttctgagccc 840
tcggtctgca ctgtcggtgc ttctgaccgc tacgacagac gctccagctt ctccaactac 900
ggcagcgttt tggacatctt tggccctggt accagcattc tctccacctg gatcggcggc 960
agcacccgct ccatctctgg aacttccatg gctactcccc acgttgccgg tctcgctgcc 1020
tacctcatga ctcttggaaa gactaccgcc gccagcgctt gccgatacat tgccgacacc 1080
gccaacaagg gcgacttgag caacattccc ttcggcactg tcaacctgct tgcctacaac 1140
aactaccagg cttaa 1155
<210> 20
<211> 384
<212> PRT
<213> Parengyodontium album
<400> 20
Met Arg Leu Ser Val Leu Leu Ser Leu Leu Pro Leu Ala Leu Gly Ala
1 5 10 15
Pro Ala Val Glu Gln Arg Ser Glu Ala Ala Pro Leu Ile Glu Ala Arg
20 25 30
Gly Glu Met Val Ala Asn Lys Tyr Ile Val Lys Phe Lys Glu Gly Ser
35 40 45
Ala Leu Ser Ala Leu Asp Ala Ala Met Glu Lys Ile Ser Gly Lys Pro
50 55 60
Asp His Val Tyr Lys Asn Val Phe Ser Gly Phe Ala Ala Thr Leu Asp
65 70 75 80
Glu Asn Met Val Arg Val Leu Arg Ala His Pro Asp Val Glu Tyr Ile
85 90 95
Glu Gln Asp Ala Val Val Thr Ile Asn Ala Ala Gln Thr Asn Ala Pro
100 105 110
Trp Gly Leu Ala Arg Ile Ser Ser Thr Ser Pro Gly Thr Ser Thr Tyr
115 120 125
Tyr Tyr Asp Glu Ser Ala Gly Gln Gly Ser Cys Val Tyr Val Ile Asp
130 135 140
Thr Gly Ile Glu Ala Ser His Pro Glu Phe Glu Gly Arg Ala Gln Met
145 150 155 160
Val Lys Thr Tyr Tyr Tyr Ser Ser Arg Asp Gly Asn Gly His Gly Thr
165 170 175
His Cys Ala Gly Thr Val Gly Ser Arg Thr Tyr Gly Val Ala Lys Lys
180 185 190
Thr Gln Leu Phe Gly Val Lys Val Leu Asp Asp Asn Gly Ser Gly Gln
195 200 205
Tyr Ser Thr Ile Ile Ala Gly Met Asp Phe Val Ala Ser Asp Lys Asn
210 215 220
Asn Arg Asn Cys Pro Lys Gly Val Val Ala Ser Leu Ser Leu Gly Gly
225 230 235 240
Gly Tyr Ser Ser Ser Val Asn Ser Ala Ala Ala Arg Leu Gln Ser Ser
245 250 255
Gly Val Met Val Ala Val Ala Ala Gly Asn Asn Asn Ala Asp Ala Arg
260 265 270
Asn Tyr Ser Pro Ala Ser Glu Pro Ser Val Cys Thr Val Gly Ala Ser
275 280 285
Asp Arg Tyr Asp Arg Arg Ser Ser Phe Ser Asn Tyr Gly Ser Val Leu
290 295 300
Asp Ile Phe Gly Pro Gly Thr Ser Ile Leu Ser Thr Trp Ile Gly Gly
305 310 315 320
Ser Thr Arg Ser Ile Ser Gly Thr Ser Met Ala Thr Pro His Val Ala
325 330 335
Gly Leu Ala Ala Tyr Leu Met Thr Leu Gly Lys Thr Thr Ala Ala Ser
340 345 350
Ala Cys Arg Tyr Ile Ala Asp Thr Ala Asn Lys Gly Asp Leu Ser Asn
355 360 365
Ile Pro Phe Gly Thr Val Asn Leu Leu Ala Tyr Asn Asn Tyr Gln Ala
370 375 380
<210> 21
<211> 1140
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA sequence that encodes subtilisin
<400> 21
atgatgagga aaaagagttt ttggcttggg atgctgacgg ccttcatgct cgtgttcacg 60
atggcattca gcgattccgc ttctgctgct caaccggcga aaaatgttga aaaggattat 120
attgtcggat ttaagtcagg agtgaaaacc gcatctgtca aaaaggacat catcaaagag 180
agcggcggaa aagtggacaa gcagtttaga atcatcaacg cggcaaaagc gaagctagac 240
aaagaagcgc ttaaggaagt caaaaatgat ccggatgtcg cttatgtgga agaggatcat 300
gtggcccatg ccttggcgca aaccgttcct tacggcattc ctctcattaa agcggacaaa 360
gtgcaggctc aaggctttaa gggagcgaat gtaaaagtag ccgtcctgga tacaggaatc 420
caagcttctc atccggactt gaacgtagtc ggcggagcaa gctttgtggc tggcgaagct 480
tataacaccg acggcaacgg acacggcaca catgttgccg gtacagtagc tgcgcttgac 540
aatacaacgg gtgtattagg cgttgcgcca agcgtatcct tgtacgcggt taaagtactg 600
aattcaagcg gaagcggaac ttacagcggc attgtaagcg gaatcgagtg ggcgacgaca 660
aacggcatgg atgttatcaa catgagtctt ggaggaccat caggctcaac agcgatgaaa 720
caggcggttg acaatgcata tgcaagaggg gttgtcgttg tggcggctgc tgggaacagc 780
ggatcttcag gaaacacgaa tacaatcggc tatcctgcga aatacgactc tgtcatcgca 840
gttggcgcgg tagactctaa cagcaacaga gcttcatttt ccagcgtcgg agcagagctt 900
gaagtcatgg ctcctggcgc aggcgtgtac agcacttacc caaccagcac ttatgcaaca 960
ttgaacggaa cgtcaatggc ttctcctcat gtagcgggag cagcagcttt gatcttgtca 1020
aaacatccga acctttcagc ttcacaagtc cgcaaccgtc tctccagtac ggcgacttat 1080
ttgggaagct ccttctacta tggaaaaggt ctgatcaatg tcgaagctgc cgctcaataa 1140
<210> 22
<211> 379
<212> PRT
<213> Bacillus licheniformis
<400> 22
Met Met Arg Lys Lys Ser Phe Trp Leu Gly Met Leu Thr Ala Phe Met
1 5 10 15
Leu Val Phe Thr Met Ala Phe Ser Asp Ser Ala Ser Ala Ala Gln Pro
20 25 30
Ala Lys Asn Val Glu Lys Asp Tyr Ile Val Gly Phe Lys Ser Gly Val
35 40 45
Lys Thr Ala Ser Val Lys Lys Asp Ile Ile Lys Glu Ser Gly Gly Lys
50 55 60
Val Asp Lys Gln Phe Arg Ile Ile Asn Ala Ala Lys Ala Lys Leu Asp
65 70 75 80
Lys Glu Ala Leu Lys Glu Val Lys Asn Asp Pro Asp Val Ala Tyr Val
85 90 95
Glu Glu Asp His Val Ala His Ala Leu Ala Gln Thr Val Pro Tyr Gly
100 105 110
Ile Pro Leu Ile Lys Ala Asp Lys Val Gln Ala Gln Gly Phe Lys Gly
115 120 125
Ala Asn Val Lys Val Ala Val Leu Asp Thr Gly Ile Gln Ala Ser His
130 135 140
Pro Asp Leu Asn Val Val Gly Gly Ala Ser Phe Val Ala Gly Glu Ala
145 150 155 160
Tyr Asn Thr Asp Gly Asn Gly His Gly Thr His Val Ala Gly Thr Val
165 170 175
Ala Ala Leu Asp Asn Thr Thr Gly Val Leu Gly Val Ala Pro Ser Val
180 185 190
Ser Leu Tyr Ala Val Lys Val Leu Asn Ser Ser Gly Ser Gly Ser Tyr
195 200 205
Ser Gly Ile Val Ser Gly Ile Glu Trp Ala Thr Thr Asn Gly Met Asp
210 215 220
Val Ile Asn Met Ser Leu Gly Gly Ala Ser Gly Ser Thr Ala Met Lys
225 230 235 240
Gln Ala Val Asp Asn Ala Tyr Ala Lys Gly Val Val Val Val Ala Ala
245 250 255
Ala Gly Asn Ser Gly Ser Ser Gly Asn Thr Asn Thr Ile Gly Tyr Pro
260 265 270
Ala Lys Tyr Asp Ser Val Ile Ala Val Gly Ala Val Asp Ser Asn Ser
275 280 285
Asn Arg Ala Ser Phe Ser Ser Val Gly Ala Glu Leu Glu Val Met Ala
290 295 300
Pro Gly Ala Gly Val Tyr Ser Thr Tyr Pro Thr Asn Thr Tyr Ala Thr
305 310 315 320
Leu Asn Gly Thr Ser Met Ala Ser Pro His Val Ala Gly Ala Ala Ala
325 330 335
Leu Ile Leu Ser Lys His Pro Asn Leu Ser Ala Ser Gln Val Arg Asn
340 345 350
Arg Leu Ser Ser Thr Ala Thr Tyr Leu Gly Ser Ser Phe Tyr Tyr Gly
355 360 365
Lys Gly Leu Ile Asn Val Glu Ala Ala Ala Gln
370 375
<210> 23
<211> 669
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA sequence that encodes trypsin
<400> 23
atcgtcgggg gctacacctg cgcagagaat tccgtccctt accaggtgtc cctgaatgct 60
ggctaccact tctgcggggg ctccctcatc aatgaccagt gggtggtgtc cgcggctcac 120
tgctaccagt accacatcca ggtgaggctg ggagaataca acattgatgt cttggagggt 180
ggtgagcagt tcatcgatgc gtccaagatc atccgccacc ccaagtacag cagctggact 240
ctggacaatg acatcctgct gatcaaactc tccacgcctg cggtcatcaa tgcccgggtg 300
tccaccttgc tgctgcccag tgcctgtgct tccgcaggca cagagtgcct catctccggc 360
tggggcaaca ccctgagcag tggcgtcaac tacccggacc tgctgcaatg cctggtggcc 420
ccgctgctga gccacgccga ctgtgaagcc tcataccctg gacagatcac taacaacatg 480
atctgcgctg gcttcctgga aggaggcaag gattcctgcc agggtgactc tggcggccct 540
gtggcttgca acggacagct ccagggcatt gtgtcctggg gctacggctg tgcccagaag 600
ggcaagcctg gggtctacac caaggtctgc aactacgtgg actggattca ggagaccatc 660
gccgccaac 669
<210> 24
<211> 223
<212> PRT
<213> Bos taurus
<400> 24
Ile Val Gly Gly Tyr Thr Cys Gly Ala Asn Thr Val Pro Tyr Gln Val
1 5 10 15
Ser Leu Asn Ser Gly Tyr His Phe Cys Gly Gly Ser Leu Ile Asn Ser
20 25 30
Gln Trp Val Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Lys Ser Gly Ile Gln Val
35 40 45
Arg Leu Gly Glu Asp Asn Ile Asn Val Val Glu Gly Asn Glu Gln Phe
50 55 60
Ile Ser Ala Ser Lys Ser Ile Val His Pro Ser Tyr Asn Ser Asn Thr
65 70 75 80
Leu Asn Asn Asp Ile Met Leu Ile Lys Leu Lys Ser Ala Ala Ser Leu
85 90 95
Asn Ser Arg Val Ala Ser Ile Ser Leu Pro Thr Ser Cys Ala Ser Ala
100 105 110
Gly Thr Gln Cys Leu Ile Ser Gly Trp Gly Asn Thr Lys Ser Ser Gly
115 120 125
Thr Ser Tyr Pro Asp Val Leu Lys Cys Leu Lys Ala Pro Ile Leu Ser
130 135 140
Asp Ser Ser Cys Lys Ser Ala Tyr Pro Gly Gln Ile Thr Ser Asn Met
145 150 155 160
Phe Cys Ala Gly Tyr Leu Glu Gly Gly Lys Asp Ser Cys Gln Gly Asp
165 170 175
Ser Gly Gly Pro Val Val Cys Ser Gly Lys Leu Gln Gly Ile Val Ser
180 185 190
Trp Gly Ser Gly Cys Ala Gln Lys Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Lys
195 200 205
Val Cys Asn Tyr Val Ser Trp Ile Lys Gln Thr Ile Ala Ser Asn
210 215 220
<210> 25
<211> 1464
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA sequence that encodes serratiopeptidase
<400> 25
atgcaatcta ctaaaaaggc aattgaaatt actgaatcca gcctcgctgc cgcgacaacc 60
ggttacgatg ctgtagacga cctgctgcat tatcatgagc ggggtaacgg gattcagatt 120
aatggcaagg attcattttc taacgagcaa gctgggctgt ttattacccg tgagaaccaa 180
acctggaacg gttacaaggt atttggccag ccggtcaaat taaccttctc gttcccggac 240
tataagttct cttccaccaa cgtcgccggc gacaccgggc tgagcaagtt cagcgcggaa 300
cagcagcagc aggctaagct gtcgctgcag tcctgggccg acgtcgccaa tatcaccttc 360
accgaagtgg cggccggtca aaaggccaat atcaccttcg gcaactacag ccaggatcgt 420
cccggccact atgattacgg cacccaggcc tacgccttcc tgccgaacac catttggcag 480
ggccaggatt tgggcggcca gacttggtac aacgtaaacc aatccaacgt gaagcatccg 540
gcgaccgaag actacggccg ccagacgttc acccatgaga ttggccatgc gctgggcctg 600
agccacccgg gcgactacaa cgccggtgag ggcaacccga cctatagaga tgtcacctat 660
gcggaagata cccgccagtt cagcctgatg agctactgga gtgaaaccaa taccggtggc 720
gacaacggcg gtcactatgc cgcggctccg ctgctggatg acattgccgc cattcagcat 780
ctgtatggcg ccaacctgtc gacccgcacc ggcgacaccg tgtacggctt taactccaat 840
accggtcgtg acttcctcag caccaccagc aactcgcaga aagtgatctt tgcggcctgg 900
gatgcgggcg gcaacgatac cttcgacttc tccggttaca ccgctaacca gcgcatcaac 960
ctgaacgaga aatggttctc cgacgtgggc ggcctgaagg gcaacgtgtc gatcgccgcc 1020
ggtgtgacca ttgagaacgc cattggcggt tccggcaacg acgtgatcgt cggcaacgcg 1080
gccaataacg tgctgaaagg cggcgcgggt aacgacgtgc tgttcggcgg cggcggggcg 1140
gatgaattgt ggggcggtgc cggcaaagac atcttcgtgt tctctgccgc cagcgattcc 1200
gcaccgggcg cttcagactg gatccgcgac ttccagaaag ggatcgacaa gatcgacctg 1260
tcgttcttca ataaagaagc gcagagcagc gatttcattc acttcgtcga tcacttcagc 1320
ggcacggccg gtgaggcgct gctgagctac aacgcgtcca gcaacgtgac cgatttgtcg 1380
gtgaacatcg gtgggcatca ggcgccggac ttcctggtga aaatcgtcgg ccaggtagac 1440
gtcgccacgg actttatcgt gtaa 1464
<210> 26
<211> 487
<212> PRT
<213> Serratia sp
<400> 26
Met Gln Ser Thr Lys Lys Ala Ile Glu Ile Thr Glu Ser Ser Leu Ala
1 5 10 15
Ala Ala Thr Thr Gly Tyr Asp Ala Val Asp Asp Leu Leu His Tyr His
20 25 30
Glu Arg Gly Asn Gly Ile Gln Ile Asn Gly Lys Asp Ser Phe Ser Asn
35 40 45
Glu Gln Ala Gly Leu Phe Ile Thr Arg Glu Asn Gln Thr Trp Asn Gly
50 55 60
Tyr Lys Val Phe Gly Gln Pro Val Lys Leu Thr Phe Ser Phe Pro Asp
65 70 75 80
Tyr Lys Phe Ser Ser Thr Asn Val Ala Gly Asp Thr Gly Leu Ser Lys
85 90 95
Phe Ser Ala Glu Gln Gln Gln Gln Ala Lys Leu Ser Leu Gln Ser Trp
100 105 110
Ala Asp Val Ala Asn Ile Thr Phe Thr Glu Val Ala Ala Gly Gln Lys
115 120 125
Ala Asn Ile Thr Phe Gly Asn Tyr Ser Gln Asp Arg Pro Gly His Tyr
130 135 140
Asp Tyr Gly Thr Gln Ala Tyr Ala Phe Leu Pro Asn Thr Ile Trp Gln
145 150 155 160
Gly Gln Asp Leu Gly Gly Gln Thr Trp Tyr Asn Val Asn Gln Ser Asn
165 170 175
Val Lys His Pro Ala Thr Glu Asp Tyr Gly Arg Gln Thr Phe Thr His
180 185 190
Glu Ile Gly His Ala Leu Gly Leu Ser His Pro Gly Asp Tyr Asn Ala
195 200 205
Gly Glu Gly Asn Pro Thr Tyr Arg Asp Val Thr Tyr Ala Glu Asp Thr
210 215 220
Arg Gln Phe Ser Leu Met Ser Tyr Trp Ser Glu Thr Asn Thr Gly Gly
225 230 235 240
Asp Asn Gly Gly His Tyr Ala Ala Ala Pro Leu Leu Asp Asp Ile Ala
245 250 255
Ala Ile Gln His Leu Tyr Gly Ala Asn Leu Ser Thr Arg Thr Gly Asp
260 265 270
Thr Val Tyr Gly Phe Asn Ser Asn Thr Gly Arg Asp Phe Leu Ser Thr
275 280 285
Thr Ser Asn Ser Gln Lys Val Ile Phe Ala Ala Trp Asp Ala Gly Gly
290 295 300
Asn Asp Thr Phe Asp Phe Ser Gly Tyr Thr Ala Asn Gln Arg Ile Asn
305 310 315 320
Leu Asn Glu Lys Trp Phe Ser Asp Val Gly Gly Leu Lys Gly Asn Val
325 330 335
Ser Ile Ala Ala Gly Val Thr Ile Glu Asn Ala Ile Gly Gly Ser Gly
340 345 350
Asn Asp Val Ile Val Gly Asn Ala Ala Asn Asn Val Leu Lys Gly Gly
355 360 365
Ala Gly Asn Asp Val Leu Phe Gly Gly Gly Gly Ala Asp Glu Leu Trp
370 375 380
Gly Gly Ala Gly Lys Asp Ile Phe Val Phe Ser Ala Ala Ser Asp Ser
385 390 395 400
Ala Pro Gly Ala Ser Asp Trp Ile Arg Asp Phe Gln Lys Gly Ile Asp
405 410 415
Lys Ile Asp Leu Ser Phe Phe Asn Lys Glu Ala Gln Ser Ser Asp Phe
420 425 430
Ile His Phe Val Asp His Phe Ser Gly Thr Ala Gly Glu Ala Leu Leu
435 440 445
Ser Tyr Asn Ala Ser Ser Asn Val Thr Asp Leu Ser Val Asn Ile Gly
450 455 460
Gly His Gln Ala Pro Asp Phe Leu Val Lys Ile Val Gly Gln Val Asp
465 470 475 480
Val Ala Thr Asp Phe Ile Val
485
<210> 27
<211> 783
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DNA sequence that encodes a bovine pancreatic DNAse I
<400> 27
ttgaagattg ctgctttcaa cattagaact ttcggtgaaa ctaaaatgtc taacgctact 60
ttggcatctt acatcgttag aattgtcaga agatatgata tcgttttaat tcaagaagtt 120
agagactctc acttggttgc agttggtaaa ttgttagact acttgaacca agatgaccca 180
aacacttacc actacgttgt ttctgaacca ttgggtagaa actcttacaa agaaagatac 240
ttattcttgt tcagaccaaa caaagtttca gttttggata cttaccaata cgacgacggt 300
tgcgaatctt gtggtaacga ttctttctcc agagaacctg ctgttgttaa attctcatca 360
cactctacca aggttaaaga gttcgctatc gttgctttgc attctgctcc ttctgacgct 420
gttgctgaaa ttaactcttt gtacgacgtt tacttagatg ttcaacagaa atggcacttg 480
aacgacgtca tgttgatggg tgactttaac gctgattgct cttatgttac ttcttctcaa 540
tggtcttcaa ttagattgag aacatcttca actttccaat ggttaattcc tgattccgct 600
gataccactg ctactagtac caactgtgct tacgatagaa tcgttgttgc tggatcatta 660
ttgcaatctt ctgttgtccc aggttcagcg gcccctttcg atttccaagc tgcatatggt 720
ttgtctaatg aaatggcttt agccatttct gatcactacc cagttgaagt cacattgaca 780
taa 783
<210> 28
<211> 260
<212> PRT
<213> Bos taurus
<400> 28
Leu Lys Ile Ala Ala Phe Asn Ile Arg Thr Phe Gly Glu Thr Lys Met
1 5 10 15
Ser Asn Ala Thr Leu Ala Ser Tyr Ile Val Arg Ile Val Arg Arg Tyr
20 25 30
Asp Ile Val Leu Ile Gln Glu Val Arg Asp Ser His Leu Val Ala Val
35 40 45
Gly Lys Leu Leu Asp Tyr Leu Asn Gln Asp Asp Pro Asn Thr Tyr His
50 55 60
Tyr Val Val Ser Glu Pro Leu Gly Arg Asn Ser Tyr Lys Glu Arg Tyr
65 70 75 80
Leu Phe Leu Phe Arg Pro Asn Lys Val Ser Val Leu Asp Thr Tyr Gln
85 90 95
Tyr Asp Asp Gly Cys Glu Ser Cys Gly Asn Asp Ser Phe Ser Arg Glu
100 105 110
Pro Ala Val Val Lys Phe Ser Ser His Ser Thr Lys Val Lys Glu Phe
115 120 125
Ala Ile Val Ala Leu His Ser Ala Pro Ser Asp Ala Val Ala Glu Ile
130 135 140
Asn Ser Leu Tyr Asp Val Tyr Leu Asp Val Gln Gln Lys Trp His Leu
145 150 155 160
Asn Asp Val Met Leu Met Gly Asp Phe Asn Ala Asp Cys Ser Tyr Val
165 170 175
Thr Ser Ser Gln Trp Ser Ser Ile Arg Leu Arg Thr Ser Ser Thr Phe
180 185 190
Gln Trp Leu Ile Pro Asp Ser Ala Asp Thr Thr Ala Thr Ser Thr Asn
195 200 205
Cys Ala Tyr Asp Arg Ile Val Val Ala Gly Ser Leu Leu Gln Ser Ser
210 215 220
Val Val Pro Gly Ser Ala Ala Pro Phe Asp Phe Gln Ala Ala Tyr Gly
225 230 235 240
Leu Ser Asn Glu Met Ala Leu Ala Ile Ser Asp His Tyr Pro Val Glu
245 250 255
Val Thr Leu Thr
260
Claims (55)
- 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스(Propionibacterium acnes) 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물.
- 제1항에 있어서, 프로바이오틱 박테리아를 포함하지 않는 조성물.
- 제1항에 있어서, P. 아크네스(P. acnes) 바이오필름 분해 효소를 추가로 포함하는 조성물.
- 제1항에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 살리실산인 조성물.
- 제4항에 있어서, 살리실산이 0.5% 내지 2% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
- 제5항에 있어서, 살리실산이 약 0.1% 초과이되, 0.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재하는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 황인 조성물.
- 제7항에 있어서, 황이 3% 내지 10% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
- 제7항에 있어서, 황이 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 2%, 또는 2.5% 초과이되, 3% (중량/부피) 미만의 농도로 존재하는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 레조르시놀 및 황인 조성물.
- 제10항에 있어서, 레조르시놀이 2%의 농도로 존재하고, 황이 3% 내지 8% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 레조르시놀 모노아세테이트 및 황을 포함하는 것인 조성물.
- 제12항에 있어서, 레조르시놀 모노아세테이트가 3%의 농도로 존재하고, 황이 3% 내지 8% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, 항여드름 화합물이 항생제, 레티노이드, 또는 알파-하이드록시산인 조성물.
- 제1항에 있어서, 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지가 자연적으로 발생된 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지인 조성물.
- 제1항에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지가 용균성 P. 아크네스 박테리오파지인 조성물.
- 제1항에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지가 선형 이중 가닥 DNA 게놈을 포함하는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지가 박테리오파지 패밀리 시포비리다(Siphoviridae) 내에 있는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, P. 아크네스 박테리오파지의 게놈이 서열 번호 1의 뉴클레오티드 서열과 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것인 조성물.
- 제3항에 있어서, 효소가 P. 아크네스 바이오필름 분해 효소인 조성물.
- 제20항에 있어서, 효소가 글리코시다제, 프로테아제, DN아제, 또는 제한 엔도뉴클레아제인 조성물.
- 제20항에 있어서, 효소가 글리코시다제인 조성물.
- 제22항에 있어서, 글리코시다제가 글리코시드 하이드롤라제인 조성물.
- 제23항에 있어서, 효소가 N-아세틸-D-글루코사민의 선형 중합체의 가수분해를 촉진하는 것인 조성물.
- 제24항에 있어서, 효소가 β-헥소사미니다제인 조성물.
- 제25항에 있어서, 효소가 아세틸글루코사민 중합체의 β-1,6-글리코시드 결합을 가수분해하는 것인 조성물.
- 제20항에 있어서, 효소가 DN아제 I, 제한 엔도뉴클레아제, 파파인, 브로멜라인, 트립신, 프로테이나제 K, 섭틸리신, 세라티오펩티다제, 디스퍼신, 알기네이트 리아제, 아밀라제, 또는 셀룰라제인 조성물.
- 제20항에 있어서, 효소가 디스퍼신 B인 조성물.
- 제20항에 있어서, 효소가 프로테아제이고, 프로테아제가 프로테이나제 K 또는 섭틸리신인 조성물.
- 제1항에 있어서, 항노화 효소를 추가로 포함하는 조성물.
- 제30항에 있어서, 항노화 효소가 슈퍼옥시드 디스뮤타제 또는 퍼옥시다제인 조성물.
- 제1항에 있어서, 프로바이오틱 박테리아를 추가로 포함하는 조성물.
- 제32항에 있어서, 프로바이오틱 박테리아가 프로바이오틱 P. 종, 스타필로코커스 종(Staphylococcus sp.), 및/또는 코리네박테리움 종(Corynebacterium sp.) 박테리아인 조성물.
- 제32항에 있어서, 프로바이오틱 박테리아가 클래스 베타프로테오박테리아(Betaproteobacteria) 내의 박테리아인 조성물.
- 제33항에 있어서, 프로바이오틱 박테리아가 프로바이오틱 P. 아크네스 박테리아인 조성물.
- 제35항에 있어서, P. 아크네스 박테리아가
(a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T992C 돌연변이를 갖는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T838C 돌연변이를 갖는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C1322T 돌연변이를 갖는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 C986T 돌연변이를 갖는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(e) 서열 번호 3의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(f) 서열 번호 4의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(g) 선형 플라스미드를 포함하지 않고/거나;
(h) 병독성 인자를 포함하는 플라스미드를 포함하지 않고/거나;
(i) 염색체외 리파제 및/또는 밀착 부착 병독성 인자를 코딩하는 플라스미드를 포함하지 않는 것인 조성물. - 제35항에 있어서, P. 아크네스 박테리아가
(a) 플랑크톤성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 20% 미만을 생산하고/거나;
(b) 부착성 배양물 중에서 성장되었을 때, 병원성 P. 아크네스 균주에 의해 생산되는 리파제 수준의 약 10% 미만을 생산하고/거나;
(c) 병원성 P. 아크네스 균주보다 적어도 50% 적게 상피 세포에 부착되고/거나;
(d) 병원성 P. 아크네스 균주보다 염증성이 더 적은 것인 조성물. - 제35항에 있어서, 적어도 하나의 추가 프로바이오틱 박테리아를 추가로 포함하는 조성물.
- 제38항에 있어서, 상기 적어도 하나의 추가 프로바이오틱 박테리아가 프로피오니박테리움 그라누로섬(Propionibacterium granulosum) 및/또는 프로피오니박테리움 아비둠(Propionibacterium avidum)을 포함하는 것인 조성물.
- 제37항에 있어서, 상기 병원성 P. 아크네스 균주가
(a) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1058C 돌연변이를 갖는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(b) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1058C 및 A1201C 돌연변이를 갖는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(c) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G529A 돌연변이를 갖는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(d) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1004A 및 T1007C 돌연변이를 갖는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(e) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 G1268A 돌연변이를 갖는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(f) 서열 번호 2로 기재된 KPA171202 타입 균주 16S rDNA 서열과 비교하여 T554C 및 G1058C 돌연변이를 갖는 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(g) 서열 번호 5의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(h) 서열 번호 6의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(i) 서열 번호 7의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(j) 서열 번호 8의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(k) 서열 번호 9의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하고/거나;
(l) 서열 번호 10의 서열과 동일한 16S rDNA 서열을 포함하는 것인 조성물. - 제1항에 있어서, 적어도 하나의 추가 P. 아크네스 박테리오파지를 추가로 포함하는 조성물.
- 제1항에 있어서, 약학적으로 허용가능한 담체가 에멀젼을 포함하는 것인 조성물.
- 제42항에 있어서, 에멀젼이 수중유 에멀젼 또는 유중수 에멀젼인 조성물.
- 제1항에 있어서, 크림, 로션, 현탁제, 또는 수성 액제 형태인 조성물.
- 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물을 포함하는 조합으로서, 여기서, 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물은 각각 약학적으로 허용가능한 담체를 추가로 포함하는 조성물 중에 존재하는 것인 조합.
- 제45항에 있어서, 적어도 하나의 P. 아크네스 박테리오파지 및 적어도 하나의 항여드름 화합물이 별개의 조성물 내에 존재하는 것인 조합.
- 제46항에 있어서, 적어도 하나의 항여드름 화합물이 벤조일 퍼옥시드인 조합.
- 제47항에 있어서, 벤조일 퍼옥시드가 2.5% 내지 10% (중량/부피)의 농도로 존재하는 것인 조합.
- 제47항에 있어서, 벤조일 퍼옥시드가 약 0.1%, 0.5%, 1%, 1.5%, 또는 2% 초과이되, 2.5% (중량/부피) 미만의 농도로 존재하는 것인 조합.
- 여드름 치료를 필요로 하는 피험체에게 유효량의 제1항의 조성물을 투여하는 단계를 포함하는, 여드름 치료를 필요로 하는 피험체에서 여드름을 치료하는 방법.
- 제50항에 있어서, 조성물을 국소적으로 투여하는 것인 방법.
- 여드름 치료를 필요로 하는 피험체에게 유효량의 제45항의 조합을 투여하는 단계를 포함하는, 여드름 치료를 필요로 하는 피험체에서 여드름을 치료하는 방법.
- 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 효소를 포함하는 조성물.
- 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지 및 효소를 포함하는 조합.
- 본질적으로 적어도 하나의 프로피오니박테리움 아크네스 박테리오파지, 적어도 하나의 항여드름 화합물, 및 약학적으로 허용가능한 담체로 구성된 조성물.
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