KR20190108351A - Folr1에 특이적으로 결합하는 항체 및 그의 용도 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 FOLR1(folate receptor alpha)에 특이적으로 결합하여 FOLR1의 활성을 차단하는 항체에 관한 것으로, 기존 항체의 결합능을 향상시킴으로써 항원에 대한 결합능을 현저히 증가시킨 변형항체에 관한 것이다. 더욱 상세하게는 FOLR1에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 항체-약물 접합체 및 이를 포함하는 질병의 예방 또는 치료용 약학 조성물에 관한 것이다. 본 발명에 따른 변형항체는 모항체의 기본 구조를 보존하면서 모항체가 원래 가지고 있는 항원 결합 부위를 항원과 더 잘 결합하는 아미노산으로 치환된 서열을 제공하였으며, 이를 통해 항원과의 결합능을 높였다.
Description
본 발명은 FOLR1(folate receptor alpha)에 특이적으로 결합하여 FOLR1의 활성을 차단하는 항체에 관한 것으로, 기존 항체의 결합능을 향상시킴으로써 항원에 대한 결합능을 현저히 증가시킨 변형항체에 관한 것이다. 더욱 상세하게는 FOLR1에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 항체-약물 접합체 및 이를 포함하는 질병의 예방 또는 치료용 약학 조성물에 관한 것이다.
FOLR1(folate receptor alpha)은 정상 상피 세포에서는 저-중등도 양으로 발현되며, 다양한 암 종, 특히 난소암, 유방암, 폐암, 신장암, 결장 직장암, 자궁내막암과 같은 특정 상피 유래 암에서 과다 발현되는 단백질이며, 특히 난소암의 90% 이상에서 과발현되어 이를 표적으로 하는 암의 치료에 유용하다(Sudimack and Lee, Adv. Drug Deliv. Rev. 2000, 41, 147-162). 치료용 항체의 대표적인 예로 미국 특허 제2009/274697호(국제공개 제2005/080431호)에 기재된 farletuzumab(MORAb-003)은 FOLR1을 표적으로 하는 인간화된(humanized) 단일 클론항체이며 Morphotek Inc. 에서 개발하였으며, 난소암의 잠재적인 치료제로 보고되고 있다. Farletuzumab은 FOLR1와 결합 친화도가 대략 2 nM의 KD 값으로 FOLR1과 결합하는 것으로 알려져 있다(Grasso et al., Cancer Immun. 2007, 7, 6).
이러한 치료용 항체는 전형적으로 낮은 면역 원성(immunogenicity), 높은 친화도 및 특이성, 최적의 이펙터(effector) 기능 및 우수한 용해도 및 안정성과 같은 생물학적 및 물리 화학적 성질을 가지도록 광범위하게 조작된다. 특히, 항체 인간화(humanization) 및 친화성 성숙(affinity maturation)은 치료용 항체 후보 물질의 개발 중에 가장 빈번하게 적용되는 공정들이다. 항체 인간화 방법은 인간 이외의 동물 항체의 상보성 결정 영역(complementarity determining region, CDR)을 인간 항체의 CDR로 치환시키는 방법이다. 인간화 항체의 문제점은 비인간 동물 항체의 높은 면역원성, 낮은 이펙터 기능, 짧은 혈중 반감기 등의 마우스 항체 등이 갖는 문제들이다. 이러한 문제를 해결하여, 단일클론 항체를 의약품으로 개발하게 되었고, 이미 여러 가지 인간화 항체가 치료용 항체로써 허가를 받아 판매되고 있다. 이들 인간화 항체는 실제로 임상에 있어서 어느 정도의 효과를 보이고 있지만, 보다 효과가 높은 항체 의약품이 요구되고 있는 것도 사실이며, 본래 인간 항체에 비해 항원에 대한 결합능이 떨어지는 것도 사실이다. 이러한 문제는 인간 수용체 서열 상에 마우스의 CDR을 직접 이식함으로써 나타나는 친화성의 손실로 인해 발생할 수 있으므로 CDR이나 CDR 루프의 구조를 지지하는 프레임 워크 영역(Frame region, FR) 잔기의 돌연변이가 종종 필요하다.
이러한 측면에서 항체 효능 향상을 위한 항체공학기술의 응용이 요구된다. 그 중 항원에 대한 항체의 친화도를 성숙 시키는 affinity maturation 방법이 있다. Affinity maturation은 무작위 돌연변이를 항체 유전자에 도입하여 항원에 대한 항체의 결합친화성을 증가시키는 기술을 말하며, 효과적인 치료 및 진단용 항체 신약 개발에 매우 유용하게 사용될 수 있다. 시험관 내 affinity maturation을 위해, 일반적으로 3가지 접근 방법이 사용된다. 오류가 발생하기 쉬운 PCR, 퇴화된 올리고 뉴클레오타이드를 사용하는 표적 잔기의 랜덤화 및 사슬 셔플링(chain shuffling)을 포함한다. 표적 잔기로 선택할 수 있는 부분은 CDR로써 특히 CDR-H3와 CDR-L3이 항체-항원 상호작용을 지배하는 경향이 있으므로 무작위화를 위한 논리적 표적이 된다. 표적이 되는 항체 유전자 CDR 부위에 있는 아미노산을 변화시킴으로써 항체의 결합친화성을 높이는 것이다. 이 방법을 통해 AKA(tumor-associated glycoprotein 72와 결합하는 인간화 항체)의 CDR-H3에 있는 아미노산을 변화시켜 결합친화성을 22 배 증가시킨 보고가 있으며(Hong et al., J. Biol. Chem. 2006, 281, 6985-6992), Hepatitis B virus 항원에 대해 개발한 항체 또한 결합친화성을 6배까지 증가시킨 보고가 있다(Hong el al., J. Microbiol. 2007, 45, 528-533).
CDR 부위에 무작위로 배치된 아미노산을 가진 서열들의 모임을 라이브러리라고 말할 수 있으며, 라이브러리 내에 각각의 항체가 혼재해서 존재하게 되므로 이로부터 항체를 선별하는 작업이 필요하다. 라이브러리로부터 항체를 선별하는 방법으로 가장 효과적인 기술 중 하나는 파지 디스플레이(phage display) 기술이다. 이 기술은 파지 표현형과 그것의 캡슐화된 유전자형 사이의 직접적인 연관성을 기반으로 하며, 이는 파지 표면 상에 분자 라이브러리의 제시를 유도한다. 파지 디스플레이는 단백질-리간드 상호작용, 수용체 결합 부위 및 그들의 결합 파트너에 대한 단백질의 친화성을 개선 또는 변형시키는 데 이용된다.
파지 디스플레이는 유전자형 선택과 표현형을 연결하는 유전자 서열이 들어있는 파지 코트 단백질과의 융합을 통해 섬유상 파지 표면에서 선택된 단백질의 발현을 수반한다. 항체 라이브러리와 결합할 때, 파지 디스플레이는 항원 특이적 항체의 신속한 시험관 내 선택 및 상응하는 암호화 서열의 회수를 허용한다. 대규모 비 면역 및 합성 인간 라이브러리는 단일 개인 면역 레파토리 캡처를 기반으로 하는 보다 작은 면역 라이브러리와 함께 구축되었다. 완전히 체외 처리 과정은 동물 면역에 의해 얻을 수 없는 것들뿐만 아니라 면역 원성이 낮은 표적에 대한 항체의 분리를 허용하여 접근법의 유용성을 더욱 확대시켰다. 파지 항체 디스플레이는 항체 후보 물질에 대한 높은 처리량(high throughput) 스크리닝을 위해 초기에 개발된 방법이다. 최근에는 단일 B 세포 스크리닝, 차세대 게놈 시퀀싱 및 인간 배아 줄기 세포 B 형 간염 유전자를 가진 형질전환(transgenic) 마우스와 같은 완전 인간 치료용 항체의 생성을 위한 다른 방법이 개발되었다. 이들 각각은 특별한 이점을 가지고 있지만, 파지 디스플레이는 in vitro에서 수행되는 과정이라는 특성상, 스크리닝 방법의 용이성과 범용성이라는 측면에서 인간 항체 발견을 위한 핵심 방법으로 남아있다. 또한 파지 디스플레이를 이용하여 항체를 선별하는 방법인 패닝은 면역 튜브에 항원을 고정시킨 후 파지 표면에 발현된 항체 라이브러리를 면역 튜브에 첨가하고 세척과 용출과정을 통해 결합한 항체만을 선별하는 과정을 말한다. 항원과 결합하거나 결합하지 않는 Fab을 운반하는 파지는 세척을 반복함으로써 분리된다. 항원 결합 파지는 pH 변화 또는 프로테아제 분해를 통해 용출되고, 항원 결합 클론이 풍부한 새로운 라이브러리가 제조될 수 있는 대장균에 다시 감염된다. 이러한 과정의 여러 번 반복된 후, 항체 라이브러리는 충분하게 농축되어 개별 클론을 단일 클론 파지로 발현된 대장균으로부터 분리하고, 시험하고, 서열화하고, 특이적 항체를 발현시킬 수 있다.
이러한 기술적 배경하에서, 본 발명자들은 FOLR1에 대한 항체의 효능을 향상시키기 위해 결합능이 뛰어난 항체에 대한 개발이 절실히 요구되고 있음을 인식하고, 상보결정영역에 변이를 도입하여 FOLR1과의 결합능이 개선된 항체를 발명하였다. affinity maturation을 이용하여 모항체의 중쇄 및 경쇄 가변영역 내의 CDR 부위에 아미노산 변이를 유발시킨 항체 라이브러리를 제작하였으며, phage display 기술로 FOLR1에 대한 결합 친화도를 향상시킨 개별 항체를 선별함으로써 본 발명을 완성하였다.
본 배경기술 부분에 기재된 상기 정보는 오직 본 발명의 배경에 대한 이해를 향상시키기 위한 것이며, 이에 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가지는 자에게 있어 이미 알려진 선행기술을 형성하는 정보를 포함하지 않을 수 있다.
본 발명의 목적은 FOLR1에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편 및 상기 항체에 대해 항원과의 결합능이 더욱 개선된 항체를 제공하는 데 있다.
본 발명의 다른 목적은 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 약물이 접합된 항체-약물 접합체를 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 상기 항체-약물 접합체를 포함하는 질병의 예방 또는 치료용 조성물 및 치료 방법을 제공하는 데 있다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 folate receptor-α(FOLR1)에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다.
바람직하게는 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 6개의 상보성 결정 영역(CDR)을 포함하며, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 3의 중쇄 CDR1; 서열번호 4의 중쇄 CDR2; 서열번호 5 또는 서열번호 28의 중쇄 CDR3; 및 서열번호 6 또는 서열번호 29의 경쇄 CDR1; 서열번호 7 또는 서열번호 30의 경쇄 CDR2; 서열번호 8의 경쇄 CDR3를 포함하는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명은 또한, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 항체-약물 접합체를 제공한다.
본 발명은 또한, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 상기 항체-약물 접합체를 포함하는 질병의 예방 또는 치료용 약학 조성물 및 치료 방법을 제공한다.
본 발명에 따른 변형항체는 모항체의 기본 구조를 보존하면서 모항체가 원래 가지고 있는 항원 결합 부위를 항원과 더 잘 결합하는 아미노산으로 치환된 서열을 제공하였으며, 이를 통해 항원과의 결합능을 높였다.
도 1은 모항체와 변형항체의 중쇄 가변영역 서열 비교한 것으로, 서열 간 일치하는 부분은 별표로 표시되어 있으며, CDR-H3 영역의 서열 중 하나의 아미노산이 다른 것을 나타낸 도면이다.
도 2는 모항체와 변형항체의 경쇄 가변영역 서열 비교한 것으로, 서열 간 일치하는 부분은 별표로 표시되어 있으며, CDR-L1와 CDR-L2 영역의 서열 간 다른 아미노산으로 구성되어 있음을 나타낸 도면이다.
도 3은 친화성 수지 크로마토그래피를 이용하여 변형항체를 분리한 컬럼 정제 결과이며, 크로마토그램과 fraction 별 SDS-PAGE 분석 결과를 나타낸 도면이다(M: marker, LS: loading sample, H: heavy chain, L: light chain, R: reducing condition).
도 4는 모항체와 변형항체의 농도에 따른 FOLR1에 대한 결합능을 보여주는 ELISA 결과를 나타낸 도면이다.
도 5는 FOLR1에 대한 모항체와 변형항체의 결합능을 비교하기 위해 SPR로 분석한 결과를 나타낸 도면이다.
도 2는 모항체와 변형항체의 경쇄 가변영역 서열 비교한 것으로, 서열 간 일치하는 부분은 별표로 표시되어 있으며, CDR-L1와 CDR-L2 영역의 서열 간 다른 아미노산으로 구성되어 있음을 나타낸 도면이다.
도 3은 친화성 수지 크로마토그래피를 이용하여 변형항체를 분리한 컬럼 정제 결과이며, 크로마토그램과 fraction 별 SDS-PAGE 분석 결과를 나타낸 도면이다(M: marker, LS: loading sample, H: heavy chain, L: light chain, R: reducing condition).
도 4는 모항체와 변형항체의 농도에 따른 FOLR1에 대한 결합능을 보여주는 ELISA 결과를 나타낸 도면이다.
도 5는 FOLR1에 대한 모항체와 변형항체의 결합능을 비교하기 위해 SPR로 분석한 결과를 나타낸 도면이다.
다른 식으로 정의되지 않는 한, 본 명세서에서 사용된 모든 기술적 및 과학적 용어들은 본 발명이 속하는 기술분야에서 숙련된 전문가에 의해서 통상적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다. 일반적으로 본 명세서에서 사용된 명명법은 본 기술분야에서 잘 알려져 있고 통상적으로 사용되는 것이다.
항체의 항원 결합 단편 또는 항체 단편이란 항원 결합 기능을 보유하고 있는 단편을 의미하며, Fab, F(ab'), F(ab')2 및 Fv 등을 포함한다. 항체 단편 중 Fab는 경쇄 및 중쇄 가변영역과 경쇄의 불변영역 및 중쇄의 첫 번째 불변영역(CH1)을 가지는 구조로 1개의 항원 결합 부위를 가진다. Fab'는 중쇄 CH1 도메인의 C-말단에 하나 이상의 시스테인 잔기를 포함하는 힌지 영역(hinge region)을 가진다는 점에서 Fab와 차이가 있다. F(ab')2 항체는 Fab'의 힌지 영역의 시스테인 잔기가 디설파이드 결합을 이루면서 생성된다. Fv는 중쇄 가변영역 및 경쇄 가변영역만을 가지고 있는 최소의 항체조각으로 Fv 단편을 생성하는 재조합 기술은 PCT 국제 공개특허출원 WO88/10649, WO88/106630, WO88/07085, WO88/07086 및 WO88/09344에 개시되어 있다.
본 발명에서 사용한 항체의 가변영역은 항체의 중쇄 부분에 3개의 CDRs(CDR-H1, CDR-H2, 및 CDR-H3)이 있으며, 항체의 경쇄 부분에 3개의 CDRs(CDR-L1, CDR-L2, 및 CDR-L3)을 포함한다. 이들 모두 loop을 구성하고 있으며, 항원과 특이적으로 결합하는 부위이다.
본 발명은 일 관점에서, Folate receptor-α(FOLR1)에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 관한 것이다.
본 발명에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 folate receptor-α의 생물학적 활성을 억제하는 것을 특징으로 할 수 있다. 또한, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 folate receptor-α를 발현하는 세포의 antibody-dependent cellular cytotoxicity를 유도하는 것을 특징으로 할 수 있다. 또한, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 folate receptor-α에 대한 결합 분리 상수(dissociation constant)가 1x10-7 M 이하인 것을 특징으로 할 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어, "모항체"는 FOLR1에 특이적으로 결합하는 FOLR1의 항체로써 선행출원특허(US2005/0232919 A1)에서 출원된 항체를 이용하였다. 본 명세서의 "모항체"는 상기 선행출원특허에서 명기된 항체 중에서, 중쇄의 서열은 아래의 서열번호 1에 해당하며, 경쇄의 서열은 아래의 서열번호 2에 해당한다.
중쇄(서열번호 1)
EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCSASGFTFSGYGLSWVRQAPGKGLEWVAM
ISSGGSYTYYADSVKGRFAISRDNAKNTLFLQMDSLRPEDTGVYFCARHG
DDPAWFAYWGQGTPVTVSS
경쇄(서열번호 2)
DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCSVSSSISSNNLHWYQQKPGKAPKPWIY
GTSNLASGVPSRFSGSGSGTDYTFTISSLQPEDIATYYCQQWSSYPYMYT
FGQGTKVEIK
본 발명의 범위에는 FOLR1에 특이적으로 결합하는 완전한 항체 형태(full length IgG)뿐 아니라, 상기 항체 분자의 항원 결합 단편(fragmented IgG)도 포함된다. 본 발명에서 사용한 모항체는 서열번호 3 내지 8의 서열로 표시되는 CDRs을 포함한다.
따라서, 본 발명에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 3의 중쇄 CDR1; 서열번호 4의 중쇄 CDR2; 서열번호 5의 중쇄 CDR3; 및 서열번호 6의 경쇄 CDR1; 서열번호 7의 경쇄 CDR2; 서열번호 8의 경쇄 CDR3를 포함하는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명에서 모항체를 기반으로 하는 CDR 라이브러리는 PCT 국제 공개특허출원 WO16/114567DP 언급된 대로 제작하였으며, 제작된 라이브러리 유전자를 도입한 pComb3X vector는 phagemid vector로써 파지복제시작점(phage origin of replication)을 가지는 plasmid DNA로, phage 표면단백질인 pIII이 포함되어 있다. 라이브러리 유전자는 pIII 유전자의 5'말단에 ligation되어 E. coli에서 융합단백질로서 발현된다. VCSM13 helper phage는 phagemid가 phage 입자로 조립되도록 필요한 유전정보를 제공하는 phage이며, kanamycin인 항생제 내성 유전자를 포함하여 helper phage에 감염된 E. coli를 선택할 수 있도록 하고 있다.
또한 패닝은 파지 표면에 디스플레이된 항체 등 단백질의 라이브러리로부터 특정 분자에 결합하는 클론만을 선택적으로 증폭시키는 과정을 말하며, 표면에 고정된 표적분자에 파지 라이브러리를 가하여 결합을 유도하고 결합하지 않은 파지 클론을 세척하여 제거한 후, 결합된 파지 클론만을 용출하여 다시 E. coli에 감염시키고 helper phage를 이용하여 표적 결합 파지 클론들을 증폭하는 절차를 거친다. 이러한 과정을 반복하여 표면 고정된 표적분자에 대한 표적 결합 파지 클론의 결합력이 높은 클론들을 선별적으로 증폭시킨다.
본 발명에서 용어, "변형항체"는 "모항체"를 개변하여 만든 항체이며, 또한 본 발명은 변형항체를 분리 및 정제하는 방법을 제공한다. 상기 항체 단백질을 생산하는 조건에서 배양한 배양액을 원심분리하여 불순물을 제거하고, 그 결과물을 친화 크로마토그래피를 이용하여 정제할 수 있다.
또한, 본 발명의 변형항체는 FOLR1과 결합하는 결합력(binding affinity)을 갖는다. FOLR1 결합력은 ELISA법, SPR(표면 플라즈몬 공명법) 등을 이용하여 측정할 수 있다. 구체적으로는, 플레이트에 고정화된 FOLR1에 항체 조성물을 일정 농도 간격으로 반응시킨 후, 그 항체를 인식하는 표지 항체를 추가로 반응시켜, FOLR1에 결합된 항체 조성물의 결합 가능 농도를 계산함으로써 측정할 수 있다. 이를 통해 단일보다는 다중 CDR 라이브러리로부터 얻은 항체의 결합능이 더 많이 개선된 것을 확인할 수 있었다.
본 발명의 일 실시예에서, 상기 변형항체는 모항체에서 변형된 서열번호 28의 중쇄 CDR3; 서열번호 29의 경쇄 CDR1; 또는 서열번호 30의 경쇄 CDR2를 포함하는 것을 특징으로 할 수 있다.
따라서, 본 발명에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 3의 중쇄 CDR1; 서열번호 4의 중쇄 CDR2; 서열번호 5 또는 서열번호 28의 중쇄 CDR3; 및 서열번호 6 또는 서열번호 29의 경쇄 CDR1; 서열번호 7 또는 서열번호 30의 경쇄 CDR2; 서열번호 8의 경쇄 CDR3를 포함하는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 1 또는 서열번호 31의 중쇄 가변영역; 및 서열번호 2 및 서열번호 32 내지 34로 구성된 군에서 선택된 경쇄 가변영역을 포함하는 것을 특징으로 할 수 있다. 바람직하게는, 서열번호 1의 중쇄 가변영역 및 서열번호 32의 경쇄 가변영역; 서열번호 1의 중쇄 가변영역 및 서열번호 33의 경쇄 가변영역; 서열번호 1의 중쇄 가변영역 및 서열번호 34의 경쇄 가변영역; 서열번호 31의 중쇄 가변영역 및 서열번호 2의 경쇄 가변영역; 또는 서열번호 31의 중쇄 가변영역 및 서열번호 32의 경쇄 가변영역을 포함하는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명은 다른 관점에서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 약물이 접합된 항체-약물 접합체(Antibody-drug conjugate, ADC)에 관한 것이다.
항체-약물 접합체(ADC)는 타겟 암세포로 항암 약물을 전달하기 전까지 항암 약물이 항체에 안정적으로 결합되어 있어야 한다. 타겟으로 전달된 약물은 항체로부터 유리되어 타겟 세포의 사멸을 유도해야 한다. 이를 위해서는 약물이 항체에 안정적으로 결합함과 동시에 타겟 세포에서 유리될 때는 타겟 세포의 사멸을 유도할 충분한 세포독성을 가져야 한다.
본 발명에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편과 항암제 등 약물을 포함하는 세포독성물질은 서로 결합(예컨대, 공유결합, 펩타이드 결합 등에 의함)되어 접합체(conjugate) 또는 융합 단백질(세포독성물질 및/또는 표지물질이 단백질인 경우)의 형태로 사용될 수 있다. 상기 세포독성물질은 암세포, 특히 고형암세포에 대하여 독성을 갖는 모든 물질일 수 있으며, 방사선동위원소, 세포 독소 화합물(small molecule), 세포 독성 단백질, 항암제 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 상기 세포 독소 단백질은 리신(ricin), 사포린(saporin), 젤로닌(gelonin), 모로딘(momordin), 데보가닌(debouganin), 디프테리아독소, 녹농균독소(pseudomonas toxin) 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 상기 방사선동위원소로는 131I, 188Rh, 90Y 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 상기 세포 독소 화합물은 듀오카마이신(duocarmycin), 모노메틸 아우리스타틴 E(monomethyl auristatin E; MMAE), 모노메틸 아우리스타틴 F(monomethyl auristatin F; MMAF), N2'-디아세틸-N2'-(3-머캅토-1-옥소프로필)메이탄신(N2'-deacetyl-N2'-(3-mercapto-1-oxopropyl)maytansine; DM1), PBD(Pyrrolobenzodiazepine) dimer 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 항체-약물 접합체는 본 발명이 속하는 기술분야에 잘 알려진 기술에 따른 것일 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 항체-약물 접합체는 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 링커를 통하여 약물과 결합되는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 링커는 절단성 링커 또는 비절단성 링커인 것을 특징으로 할 수 있다.
상기 링커는 항체와 약물 사이를 연결하는 부위로, 예를 들어 상기 링커는 세포내 조건에서 절단 가능한 형태 즉, 세포 내 환경에서 항체에서 약물이 링커의 절단을 통해 방출될 수 있도록 한다.
상기 링커는 세포 내 환경 예를 들어 리소좀 또는 엔도좀에 존재하는 절단제에 의해 절단될 수 있으며, 세포 내 펩티다아제 또는 프로테아제 효소 예를 들어 리소좀 또는 엔도좀 프로테아제에 의해 절단될 수 있는 펩타이드 링커일 수 있다. 일반적으로 펩타이드 링커는 적어도 2개 이상의 아미노산 길이를 가진다. 상기 절단제는 카텝신 B 및 카텝신 D, 플라스민을 포함할 수 있으며, 펩타이드를 가수분해 하여 약물을 표적 세포 내로 방출할 수 있도록 한다. 상기 펩타이드 링커는 티올 의존성 프로테아제 카텝신-B에 의해 절단될 수 있고, 이는 암 조직에서 고발현되며, 예를 들어 Phe-Leu 또는 Gly-Phe-Leu-Gly 링커가 사용될 수 있다. 또한, 상기 펩타이드 링커는 예를 들어 세포 내 프로테아제에 의해 절단될 수 있는 것으로, Val-Cit 링커이거나 Phe-Lys 링커일 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 절단성 링커는 pH 민감성으로, 특정 pH 값에서 가수분해에 민감할 수 있다. 일반적으로, pH 민감성 링커는 산성 조건에서 가수분해될 수 있음을 나타낸다. 예를 들어, 리소좀에서 가수분해될 수 있는 산성 불안정 링커 예를 들어, 하이드라존, 세미카바존, 티오세미카바존, 시스-아코니틱 아마이드(cis-aconitic amide), 오르쏘에스테르, 아세탈, 케탈 등일 수 있다.
상기 링커는 환원 조건에서 절단될 수도 있으며, 예를 들어 이황화 링커가 이에 해당할 수 있다. SATA(N-succinimidyl-S-acetylthioacetate), SPDP(N-succinimidyl-3-(2-pyridyldithio)propionate), SPDB(N-succinimidyl-3-(2-pyridyldithio)butyrate) 및 SMPT(N-succinimidyl-oxycarbonyl-alpha-methyl-alpha-(2-pyridyl-dithio)toluene)를 사용하여 다양한 이황화 결합이 형성될 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 약물 및/또는 약물-링커는 항체의 라이신을 통해 무작위로 접합되거나, 이황화 결합 사슬을 환원하였을 때 노출되는 시스테인을 통해 접합될 수 있다. 경우에 따라서, 유전공학적으로 제작된 태그 예를 들어, 펩타이드 또는 단백질에 존재하는 시스테인을 통해 링커-약물이 결합될 수 있다. 상기 유전공학적으로 제작된 태그 예를 들어, 펩타이드 또는 단백질은 예를 들어, 이소프레노이드 트랜스퍼라제에 의하여 인식될 수 있는 아미노산 모티프를 포함할 수 있다. 상기 펩타이드 또는 단백질은 펩타이드 또는 단백질의 카복시 말단에서 결실(deletion)을 가지거나, 펩타이드 또는 단백질의 카복시(C) 말단에 스페이서 유닛의 공유결합을 통한 부가를 갖는다. 상기 펩타이드 또는 단백질은 아미노산 모티프와 바로 공유결합 되거나, 스페이서 유닛과 공유결합 되어 아미노산 모티프와 연결될 수 있다. 상기 아미노산 스페이서 유닛은 1 내지 20개의 아미노산으로 구성되며, 그 중에서 글리신(glycine) 유닛이 바람직하다.
상기 링커는 리소좀에서 다수 존재하거나, 또는 몇몇 종양세포에서 과발현되는 베타-글루쿠로니데이즈(β-glucuronidase)에 의해 인식되어 가수분해 되는 베타-글루쿠로나이드 링커를 포함할 수 있다. 펩타이드 링커와는 달리 친수성(hydrophilicity)이 커서 소수성의 성질이 높은 약물과 결합시 항체-약물 복합체의 용해도를 증가시킬 수 있는 장점을 지닌다.
이와 관련하여, 본 발명에서는 대한민국 특허공개공보 제2015-0137015호에 개시된 베타-글루쿠로나이드 링커, 예를 들어 자가-희생기(self-immolative group)를 포함하는 베타-글루쿠로나이드 링커를 사용할 수 있다.
또한, 상기 링커는 예를 들어 비절단성 링커일 수 있으며, 항체 가수분해 한 단계만을 통해 약물이 방출되어, 예를 들어 아미노산-링커-약물 복합체를 생산한다. 이러한 유형의 링커는 티오에테르기 또는 말레이미도카프로일기(maleimidocaproyl)일 수 있고, 혈액 내 안정성을 유지할 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 약물은 화학요법제, 독소, 마이크로 RNA(miRNA), siRNA, shRNA 또는 방사성 동위원소인 것을 특징으로 할 수 있다. 상기 약물은 약리학적 효과를 나타내는 제제로 항체에 결합될 수 있다.
상기 화학요법제는 세포독성 제제 또는 면역억제제일 수 있다. 구체적으로 마이크로투불린 억제제, 유사분열 억제제, 토포이소머라아제 억제제, 또는 DNA 인터컬레이터로서 기능할 수 있는 화학요법제를 포함할 수 있다. 또한, 면역조절 화합물, 항암제, 항바이러스제, 항박테리아제, 항진균제, 구충제 또는 이들의 조합을 포함할 수 있다.
상기 약물에는 예를 들어, 마이탄시노이드, 오리스타틴, 아미노프테린, 악티노마이신, 블레오마이신, 탈리소마이신, 캄프토쎄신, N8-아세틸 스퍼미딘, 1-(2 클로로에틸)-1,2-다이메틸 술포닐 하이드라자이드, 에스퍼라마이신, 에토포사이드, 6-머캅토퓨린, 돌라스타틴, 트리코테센, 칼리케아미신, 탁솔(taxol), 탁산, 파클리탁셀(paclitaxel), 도세탁셀(docetaxel), 메토트렉세이트, 빈크리스틴, 빈블라스틴, 독소루비신, 멜팔란, 미토마이신 A, 미토마이신 C, 클로람부실, 듀오카마이신, L-아스파라기나제(L-asparaginase), 머캡토퓨린(mercaptopurine), 티오구아닌(thioguanine), 하이드록시우레아(hydroxyurea), 시타라빈(cytarabine), 사이클로포스파미드(cyclophosphamide), 이포스파미드(ifosfamide), 니트로소우레아(nitrosourea), 시스플라틴(cisplatin), 카보플라틴(carboplatin), 미토마이신(mitomycin), 다카바진(dacarbazine), 프로카바진(procarbazine), 토포테칸(topotecan), 질소 머스터드(nitrogen mustard), 사이톡산(cytoxan), 에토포시드(etoposide), 5-플루오로우라실(5-fluorouracil), CNU(bischloroethylnitrosourea), 이리노테칸(irinotecan), 캄포토테신(camptothecin), 블레오마이신(bleomycin), 이다루비신(idarubicin), 다우노루비신(daunorubicin), 닥티노마이신(dactinomycin), 플리카마이신(plicamycin), 미톡산트론(mitoxantrone), 아스파라기나제(asparaginase), 비노렐빈(vinorelbine), 클로로람부실(chlorambucil), 멜파란(melphalan), 카르무스틴(carmustine), 로무스틴(lomustine), 부설판(busuLfan), 트레오설판(treosulfan), 데카바진(decarbazine), 에토포시드(etoposide), 테니포시드(teniposide), 토포테칸(topotecan), 9-아미노캠프토테신(9-aminocamptothecin), 크리스나톨(crisnatol), 미토마이신 C(mitomycin C), 트리메트렉세이트(trimetrexate), 마이코페놀산(mycophenolic acid), 티아조퓨린(tiazofurin), 리바비린(ribavirin), EICAR(5-ethynyl-1-beta-Dribofuranosylimidazole-4-carboxamide), 하이드록시우레아(hydroxyurea), 데프록사민(deferoxamine), 플룩수리딘(floxuridine), 독시플루리딘(doxifluridine), 랄티트렉세드(raltitrexed), 시타라빈(cytarabine(ara C)), 시토신 아라비노시드(cytosine arabinoside), 플루다라빈(fludarabine), 타목시펜(tamoxifen), 라록시펜(raloxifene), 메게스트롤(megestrol), 고세렐린(goserelin), 류프롤리드 아세 테이트(leuprolide acetate), 플루타미드(flutamide), 바이칼루타마이드(bicalutamide), EB1089, CB1093, KH1060, 베르테포르핀(verteporfin), 프탈로시아닌(phthalocyanine), 광감작제 Pe4(photosensitizer Pe4), 데메톡시-하이포크레린 A(demethoxy-hypocrellin A), 인터페론-α(Interferon-α), 인터페론-γ(Interferon-γ), 종양 괴사 인자(tumor necrosis factor), 겜사이타빈(Gemcitabine), 벨케이드(velcade), 레발미드(revamid), 탈라미드(thalamid), 로바스타틴(lovastatin), 1-메틸-4-페닐피리디늄 이온(1-methyl-4-phenylpyridiniumion), 스타우로스포린(staurosporine), 악티노마이신 D(actinomycin D), 닥티노마이신(dactinomycin), 블레오마이신 A2(bleomycin A2), 블레오마이신 B2(bleomycinB2), 페플로마이신(peplomycin), 에피루비신(epirubicin), 피라루비신(pirarubicin), 조루비신(zorubicin), 마이토산트론(mitoxantrone), 베라파밀(verapamil) 및 탑시가르긴(thapsigargin), 핵산 분해 효소 및 세균이나 동식물 유래의 독소로 구성된 군에서 선택된 하나 이상일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 약물은 링커 및 링커 시약 상의 친전자성 기와 공유결합을 형성하기 위해 반응할 수 있는 아민, 티올, 히드록실, 히드라지드, 옥심, 히드라진, 티오세미카바존, 히드라진 카르복실레이트, 및 아릴히드라지드기로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 친핵기를 포함할 수 있다.
본 발명은 또 다른 관점에서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 상기 항체-약물 접합체를 포함하는 질병의 예방 및/또는 치료용 약학 조성물에 관한 것이다.
본 발명에 따른 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 항체-약물 접합체를 포함하는 약학 조성물은 유효 성분으로서의 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 항체-약물 접합체만을 포함하는 것이어도 되지만, 통상은 약리학적으로 허용되는 하나 이상의 담체와 함께 혼합하고, 제제학의 기술 분야에서 공지된 임의의 방법에 의해 제조한 의약 제제로서 제공하는 것이 바람직하다.
본 발명의 약학 조성물은 단독으로 사용해도 되고, 상술한 방사성 동위원소, 저분자의 약제, 고분자의 약제, 단백질 또는 항체 의약 중 적어도 하나의 치료약을 병용해도 된다. 또한, 상기 약학 조성물은 종래의 치료제와 병용하여 사용하는 용도로 사용될 수 있다. 즉, 본 발명에 따른 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 이를 포함하는 약학적 조성물은 기존의 항암제 등의 치료제와 동시에 투여되거나, 순차적으로 투여되는 용도로 사용될 수 있다.
투여 경로는 치료 시에 가장 효과적인 것을 사용하는 것이 바람직하고, 경구 투여, 또는 구강 내, 기도 내, 직장 내, 피하, 근육 내 또는 정맥 내 등의 비경구 투여를 들 수 있고, 바람직하게는 정맥 내 투여를 들 수 있다.
투여 형태로서는, 예를 들어 분무제, 캡슐제, 정제, 산제, 과립제, 시럽제, 유제, 좌제, 주사제, 연고 또는 테이프제 등을 들 수 있다.
투여량 또는 투여 횟수는 목적으로 하는 치료 효과, 투여 방법, 치료 기간, 연령 및 체중 등에 따라 상이한데, 통상 성인 1일당 10μg/kg 내지 10mg/kg이다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지 않는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.
실시예
1: 라이브러리 클론 선별
FOLR1에 대한 결합능 개선을 위한 최적 서열을 확보하기 위하여 Fab 단편을 이용하여 모항체를 기반으로 CDR 라이브러리를 구축하였다.
실시예
1-1:
모항체
Fab
주형 제작
모항체의 light chain과 heavy chain에서 각각 variable region을 합성하고, pComb3X-TT로부터 constant region을 합성하였다. PCR 조건은 94℃에서 2분간 pre-denaturation하고 94℃ 30초, 56℃ 30초, 72℃ 30초로 25 cycles 반응한 뒤 72℃에서 7분간 반응하였다. PCR 반응의 주형이 하나일 경우 100 ng을 사용하였고 둘 일 경우 각각 3 μL씩 섞은 mixture를 사용하여 primer는 20 pM 농도로 3 μL씩 사용하였고 dNTP는 0.05 mM, Taq 중합효소는 0.5 μL(2.6 unit), 반응 부피는 100 μL이다. 반응 완료 후, 증폭의 유무는 1% agarose gel 전기영동으로 확인하였고 Qiagen 겔 추출 kit를 이용하여 정제하고 2차와 3차 PCR은 상기 증폭된 부분을 주형으로하여 다음 overlapping PCR을 실시하였다. PCR 반응 산물은 Qiagen 겔 추출 kit를 이용하여 agarose gel에서 DNA를 정제하고 SfiI 제한효소로 절단한 다음 다시 겔 추출(gel extraction)을 하였다. SfiI 절단된 항체 유전자 153 ng과 SfiI 절단된 pComb3X vector 136 ng을 혼합한 후 10X T4 DNA ligation buffer와 ligase 10 unit를 첨가하고 실온에서 3시간동안 반응한 후 E. coli DH5α cell에 42℃에서 45초간 heat-shock을 주고 37 ℃에서 1.5시간 배양하는 방법으로 형질전환하여 얻은 colony로부터 50 kDa 크기를 가지는 Fab 단편으로 된 항체 라이브러리 제작용 주형을 확보하였다.
실시예
1-2: 항체 라이브러리 제작
상보성 결정 영역에 인위적으로 다양성을 도입하여 라이브러리를 제작하였으며, (http://www.bioinf.org.uk/abs/)에 기술된 내용에 따라 소정의 항체의 CDR 및 FR을 확인할 수 있다.
실시예 1-1에서 제작된 주형을 토대로 모항체의 CDR 서열들을 랜덤화시킨 라이브러리를 제작하였으며, 모항체의 6개 CDR 중 CDR-H2은 다른 CDR에 비해 길이가 길어서 실험에 다루기 어려우므로 제외하기로 하였다. 모항체의 CDR 서열은 표 1과 같다.
CDR | 앞에 위치한 잔기 | 서열 | 뒤에 위치한 잔기 | 서열번호 |
CDR-H1 | Cys-x-x-x | GFTFSGYGLS | Trp-Val | 3 |
CDR-H2 | Leu-Gln-Trp-Val-Ala | MISSGGSYTYYADSV | Lys | 4 |
CDR-H3 | Cys-Ala-Arg | HGDDPAWFAY | Trp-Gly-Gln-Gly | 5 |
CDR-L1 | Cys | SVSSSISSNNLH | Trp | 6 |
CDR-L2 | Ile-Tyr | GTSNLAS | Gly | 7 |
CDR-L3 | Cys | QQWSSYPYMYT | Phe-Gly-Gln-Gly | 8 |
항원과의 결합 영역 내 특정 위치를 랜덤화시키기 위해 Mix base code를 이용하여 프라이머를 제작하였다(표 2). Mix base code는 degenerated 프라이머로 염기서열상의 유사성을 고려하여 유사한 염기서열에 결합할 수 있도록 하나의 위치에 두 개 이상의 base가 존재하는 oligo를 말한다. 프라이머를 제작하기에 앞서, 랜덤화 시킬 특정 위치를 결정하기 위해 모항체의 CDR 서열 분석을 통해 conserved 잔기들을 확인하였으며, 이 잔기들을 제외한 부분의 codon 다양화를 시키기 위하여 mix base code를 사용한 프라이머를 제작하였다.
CDR | 프라이머 | 서열(5' -> 3') | 서열번호 |
CDR-H1 | Farl-H1-random-f | GCC TCT GGC TTC ACT TTC AGT RRT TAC GVT MTG ART TGG GTG AGA CAG GCA CCT G | 9 |
Farl-H1-b | ACT GAA AGT GAA GCC AGA GGC | 10 | |
CDR-H3 | Farl-H3-random1-f | GGG GTC TAT TTT TGT GCA AGA NNK NNK GAC GAT CCA GCA TGG TTT GMT TAC TGG GGC CAA GGG ACC | 11 |
Farl-H3-random2-f | GGG GTC TAT TTT TGT GCA AGA CAC NNK NNK GAT CCA GCA TGG TTT GMT TAC TGG GGC CAA GGG ACC | 12 | |
Farl-H3-random3-f | GGG GTC TAT TTT TGT GCA AGA CAC GGT NNK NNK CCA GCA TGG TTT GMT TAC TGG GGC CAA GGG ACC | 13 | |
Farl-H3-random4-f | GGG GTC TAT TTT TGT GCA AGA CAC GGT GAC NNK NNK GCA TGG TTT GMT TAC TGG GGC CAA GGG ACC | 14 | |
Farl-H3-random5-f | GGG GTC TAT TTT TGT GCA AGA CAC GGT GAC GAT NNK NNK TGG TTT GMT TAC TGG GGC CAA GGG ACC | 15 | |
Farl-H3-random6-f | GGG GTC TAT TTT TGT GCA AGA CAC GGT GAC GAT CCA NNK NNK TTT GMT TAC TGG GGC CAA GGG ACC | 16 | |
Farl-H3-b | TCT TGC ACA AAA ATA GAC CCC | 17 | |
CDR-L1 | Farl-L1-random-f | AC AGA GTC ACC ATC ACA TGC AGK GYT TCC TCC RGT VTT AGT TCA ARC WAT CTG MAC TGG TAT CAG CAG AAG CCC G | 18 |
Farl-L1-b | GCA TGT GAT GGT GAC TCT GT | 19 | |
CDR-L2 | Farl-L2-random-f | C CCA AAG CCC TGG ATC TAC GVT RCC TCT AVT CKG GMA AST GGG GTG CCT TCA AGG TTC A | 20 |
Farl-L2-b | GTA GAT CCA GGG CTT TGG G | 21 | |
CDR-L3 | Farl-L3-random-f | GCA ACT TAC TAT TGC CAG CAG NNK BMT WAT TWT CCA YMT NNK YMC ACC TTC GGT CAG GGC AC | 22 |
Farl-L3-b | CTG CTG GCA ATA GTA AGT TGC | 23 | |
All CDRs | pC3X-f | GCA CGA CAG GTT TCC CGAC | 24 |
pC3X-b | AAC CAT CGA TAG CAG CAC CG | 25 | |
CDR-L3H3 | Lead-b | GGC CAT GGC TGG TTG GGC | 26 |
Lead-VH | GCC CAA CCA GCC ATG GCC | 27 |
모항체 CDR-L1, L2, L3, H1, H2 부분의 codon 랜덤화는 PCR을 통하여 증폭하고, 이를 역시 PCR 증폭된 CDR 부위 DNA와 overlap extension PCR을 통하여 연결함으로써 하나의 CDR에만 다양성을 가지는 단일 CDR 라이브러리와 두 개의 CDR에 다양성을 가지는 다중 라이브러리들을 제작하였다. PCR 조건은 94℃에서 2분간 pre-denaturation하고 94℃ 30초, 56℃ 30초, 72℃ 30초로 25 cycles 반응한 뒤 72℃에서 7분간 반응하였다. 다만 72℃에서의 연장 시간은 예측되는 DNA 절편 결과물의 길이에 따라 1분 30초 혹은 2분으로 조정하였다. 구체적으로 예측되는 길이가 500에서 1,500 bp 사이인 경우에는 1분 30초, 1,500에서 2,000 bp사이인 경우에는 2분의 연장 시간을 사용하였다. 이 과정들에 사용한 주형(template), primer와 product 이름들을 표 3에 정리하였다. 제작된 단일 혹은 다중 CDR 라이브러리는 1% 아가로즈 젤 전기영동을 통해 분리 정제하였고, 이를 SfiI 제한효소로 50℃에서 12시간 이상 처리하여 절단하고, 같은 방식으로 pComb3X 파지미드 벡터 또한 SfiI 제한효소로 절단하였다.
단일 CDR 라이브러리 | PCR | 주형 | 프라이머 서열번호 | 산출물 |
CDR-L1 | 1차 | pFAR-FabC3 | 19,24 | FAR-L1-F |
18,25 | FAR-L1-R | |||
2차 | FAR-L1-F, FAR-L1-R | 24,25 | FAR-CDR-L1 | |
CDR-L2 | 1차 | pFAR-FabC3 | 21,24 | FAR-L2-F |
20,24 | FAR-L2-R | |||
2차 | FAR-L2-F, FAR-L2-R | 24,25 | FAR-CDR-L2 | |
CDR-L3 | 1차 | pFAR-FabC3 | 23,24 | FAR-L3-F |
22,25 | FAR-L3-R | |||
2차 | FAR-L3-F, FAR-L3-R | 24,25 | FAR-CDR-L3 | |
CDR-H1 | 1차 | pFAR-FabC3 | 10,24 | FAR-H1-F |
9,25 | FAR-H1-R | |||
2차 | FAR-H1-F, FAR-H1-R | 24,25 | FAR-CDR-H1 | |
CDR-H3 | 1차 | pFAR-FabC3 | 17,24 | FAR-H3-F |
11~16,25 | FAR-H3-R | |||
2차 | FAR-H3-F, FAR-H3-R | 24,25 | FAR-CDR-H3 | |
다중 CDR 라이브러리 | PCR | 주형 | 프라이머 서열번호 | 생산물 |
CDR-L3H3 | 1차 | pFAR CDR-L3 | 24,26 | FAR-L3 |
pFAR-CDR-H3 | 25,27 | FAR-H3 | ||
2차 | FAR-L3, FAR-H3 | 24,25 | FAR-CDR-L3H3 |
Ligation은 SfiI 절단된 vector와 insert을 동량 섞어 상온에서 밤샘 반응시켰다. Ligation product volume이 형질전환 하기에 많다면, EtOH 침전을 이용하여 ligation product volume을 줄일 수 있으며, 방법은 다음과 같다. 50 μL의 ligation product에 5 μL(1/10)의 3 M sodium acetate(pH 5.2)와 110 μL(2배)의 100% EtOH을 넣고 -20℃에서 2시간 이상 DNA를 침전시켰다. 침전된 DNA를 12,000 rpm으로 15분간 원심분리 후 1 ml의 70% EtOH로 세척하고 같은 조건으로 원심분리하여 pellet을 건조시킨 후, 10 μL의 deionized water로 녹였다. 형질전환은 electroporation 방법으로 하게 되며, ligation product 10 μL와 E. coli TG1 competent cell 50 μL을 혼합한 후 냉각하여 준비된 0.2 cm 큐벳에 넣고 electroporator에 위치시킨 뒤 2.5 kV에서 4~5 msec 동안 pulse를 주었다. Pulse 후 즉시 37℃로 준비된 2 mL의 recovery media를 첨가한 뒤 37℃에서 1시간동안 배양한 후 그 중 1 μL를 SB 배지로 1000배 희석하여 10 μL와 100 μL을 LB agar plate에 분주하여 라이브러리 크기 확인용으로 준비하고 나머지는 한 plate에 모두 분주하여 37℃에서 밤샘 배양하였다. 다음 날, 희석하여 분주한 plate 내 colony 수를 확인하여 라이브러리 size를 확인하였으며, 희석하지 않고 모두 분주한 plate에 5 mL의 SB 배지를 첨가하여 spreader를 이용하여 cell을 모두 모은 후 0.5 volume의 50% glycerol를 첨가하여 deep freezer(-75℃)에 보관하였다.
CDR 라이브러리 | 라이브러리 크기 |
CDR-L1 | 4.56 x 106 |
CDR-L2 | 2.94 x 107 |
CDR-L3 | 6.22 x 107 |
CDR-H1 | 4.78 x 106 |
CDR-H3 | 1.30 x 108 |
CDR-L3H3 | 8.82 x 107 |
획득한 라이브러리의 size는 transformation 효율이며, individual clone 수를 의미한다. 결과적으로 라이브러리 size 정도의 항원 결합 다양성이 존재한다고 말할 수 있다. 즉, CDR-L1 라이브러리는 106, CDR-L2는 107, CDR-L3는 107, CDR-H1는 106, CDR-H3는 108, CDR-L3H3는 107인 다양성을 가진 라이브러리를 제조하였다(표 4).
실시예
1-3:
Phage
disply를
통한
패닝
후 ELISA를 통한 선별
인간 FOLR1와 결합하는 라이브러리 클론을 선별하기 위해 패닝을 수행하였으며, 패닝 횟수를 거듭할수록 결합능이 향상된 클론을 얻을 수 있었다.
라이브러리 증폭 및 Fab 발현하는 박테리오파지를 회수하기 위하여, 100 uL의 라이브러리가 형질전환된 TG1 stock을 20 mL의 SB/Amp+2% glucose 배양 배지에 접종하여 37 ℃에서 220 rpm으로 1.5-2시간동안 라이브러리를 E. coli TG1 cell에 발현시켰다. 배양액을 3500 rpm으로 15분동안 원심분리하여 상등액을 제거하고 pellet은 20 ml의 SB/Amp 배양배지로 resuspension 시켰다. 여기에 0.5 mL의 helper phage VCSM13(약 1011 pfu)을 첨가하여 37 ℃에서 120 rpm으로 1시간동안 배양하여 감염시킨 후, 70 ㎍/mL 되도록 kanamycin(50 mg/mL)을 첨가하여 30℃에서 200 rpm으로 16시간 배양하였다. 배양액을 원심분리하여 phage가 포함된 상층액에 5 mL의 5X PEG 농축 solution을 첨가하여 ice에서 30분동안 농축하였다. 이를 12,000 rpm으로 15분동안 원심분리하여 상등액 제거하고 phage pellet을 0.3 mL의 PBS로 resuspension하여 라이브러리 phage 확보하였다(보관할 경우, 50% glycerol을 0.5 volume 첨가하여 -75℃에 보관).
확보한 라이브러리 phage를 증폭시키기 위하여, E. coli TG1 cell stock에 10 mL SB 배지에 접종하여 37℃ incubator에서 220 rpm으로 약 4-5시간 배양하여 mid-log phase(OD600=0.5~1.0)까지 배양하여 competent cell을 준비하고, 사용 전까지 4℃ 보관하였다. 다음의 방법으로 패닝을 실시하였다. FOLR1을 immunotube에 1 ㎍/mL로 coating 후 blocking solution(3% skim milk)으로 1시간동안 37 ℃에서 blocking하고 라이브러리 phage 0.5 mL에 blocking solution 1:1 비율로 0.5 mL 첨가하여 blocking한 후 고정된 항원과 반응시켰다. 1시간 이상 반응 시킨 후 PBS-Tween20 buffer로 washing step을 통해 결합하지 않거나 약하게 결합된 phage를 제거하고 강하게 결합된 phage를 1 mL의 TEA(100 mM)로 10분동안 용출시킨 후 0.5 mL의 Tris-HCl(1 M, pH 7.4)로 중성화시켰다. 8.5 mL의 competent cell에 1.5 mL의 용출된 phage를 넣어 37℃ 배양기에서 120 rpm로 1시간동안 감염 시킨 후, 라이브러리 크기를 확인하기 위해 2 mL 반응액 중 1 uL를 1,000배와 10,000배 희석하여 plating하고 나머지는 한 plate에 모두 plating하여 37 ℃에서 밤샘 배양하였다.
형질전환된 대장균 라이브러리를 배양하고 VCSM13 helper phage로 감염시켜 Fab 클론이 표면 제시된 항체 phage 라이브러리를 얻었다. 이 라이브러리를 immune-tube 표면에 흡착된 FOLR1에 대하여 3~5회 panning을 통해 FOLR1과 강하게 결합하는 phage 클론만을 선별하였다. 이 과정을 통해 FOLR1과 약하게 결합하거나 합성된 CDR 서열 내 결함이 생겨 FOLR1과 결합하지 않은 클론들은 제거되므로 결과적으로 결함이 없고 기존 서열보다 더 최적화된 CDR 서열들을 선별할 수 있었다. CDR-L1, CDR-L2 라이브러리는 5차, CDR-L3, CDR-H3, CDR-L3H3 라이브러리는 4차, CDR-H1 라이브러리는 3차에 걸쳐 panning을 실시하였고 각 panning 단계마다 panning에 사용한 phage(input phage)에 대한 용출된 phage(output phage) 의 비(ratio, O/I ratio)를 계산하여 % Bound로 표 5에 나타내었다. Panning 횟수가 거듭되어도 % Bound가 유사한 값이 나타나는 것은 FOLR1에 대한 결합능이 포화상태에 이르렀음을 말한다(표 5). 이와 같은 결과가 나타나면 panning은 더 이상 진행하지 않고 용출된 phage로 다음 단계를 진행한다. 패닝 결과의 항체 phage 라이브러리의 기능성을 검증하기 위해 각 CDR 라이브러리로부터 94개의 클론을 ELISA로 스크리닝하였다. 배경신호 대비 3배 이상의 결합신호를 보이는 ELISA 양성 클론들은 각각 CDR-L1은 92개, CDR-L2는 66개, CDR-L3는 19개, CDR-H1는 94개, CDR-H3는 48개, CDR-L3H3는 63개 확인하였으며, 이 중 각 8개를 서열 분석하였다(표 6).
Phage 라이브러리 | 패닝 회차 | Phage input(c.f.u) | Phage output(c.f.u) | % Bound | 세척 횟수 | 항원의 양 |
CDR-L1 | 1 | 3.6 x 10 10 | 5.1 x 10 8 | 1.4 | 3 | 1.0 ㎍ |
2 | ~10 10 | 8.5 x 10 8 | 8.5 | 5 | 0.5 ㎍ | |
3 | ~10 10 | 1.1 x 10 9 | 11 | 10 | 0.1 ㎍ | |
4 | ~10 10 | 5.9 x 10 8 | 5.9 | 10 | 0.1 ㎍ | |
5 | ~10 10 | 4.3 x 10 8 | 4.3 | 10 | 0.1 ㎍ | |
CDR-L2 | 1 | 2.5 x 10 10 | 6.8 x 10 8 | 2.7 | 3 | 1.0 ㎍ |
2 | ~10 10 | 7.5 x 10 8 | 7.5 | 5 | 0.5 ㎍ | |
3 | ~10 10 | 8.0 x 10 8 | 8.0 | 10 | 0.1 ㎍ | |
4 | ~10 10 | 3.2 x 10 8 | 3.2 | 10 | 0.1 ㎍ | |
5 | ~10 10 | 3.1 x 10 8 | 3.1 | 10 | 0.1 ㎍ | |
CDR-L3 | 1 | 1.4 x 10 9 | 4.3 x 10 6 | 0.3 | 3 | 1.0 ㎍ |
2 | 3.7 x 10 8 | 1.0 x 10 5 | 2.7 x 10 -2 | 5 | 0.5 ㎍ | |
3 | 1.7 x 10 9 | 7.2 x 10 7 | 4.2 | 5 | 0.5 ㎍ | |
4 | 5.8 x 10 9 | 8.0 x 10 7 | 1.4 | 10 | 0.1 ㎍ | |
CDR-H1 | 1 | 5.5 x 10 10 | 4.9 x 10 8 | 0.9 | 3 | 1.0 ㎍ |
2 | ~10 10 | 6.2 x 10 8 | 6.2 | 5 | 0.5 ㎍ | |
3 | ~10 10 | 6.5 x 10 8 | 6.5 | 10 | 0.1 ㎍ | |
CDR-H3 | 1 | 1.9 x 10 9 | 2.2 x 10 7 | 1.2 | 3 | 1.0 ㎍ |
2 | 3.5 x 10 8 | 1.0 x 10 5 | 2.9 x 10 -2 | 5 | 0.5 ㎍ | |
3 | 1.8 x 10 9 | 8.6 x 10 7 | 4.8 | 5 | 0.5 ㎍ | |
4 | 4.4 x 10 9 | 1.1 x 10 8 | 2.5 | 10 | 0.1 ㎍ | |
CDR-L3H3 | 1 | 8.9 x 10 8 | 1.0 x 10 8 | 11.2 | 3 | 1.0 ㎍ |
2 | 6.0 x 10 8 | 1.0 x 10 5 | 1.7 x 10 -2 | 5 | 0.5 ㎍ | |
3 | 1.8 x 10 9 | 2.6 x 10 7 | 1.4 | 5 | 0.5 ㎍ | |
4 | 3.2 x 10 9 | 4.0 x 10 7 | 1.3 | 10 | 0.1 ㎍ |
CDR | 클론 | 서열 분석 결과 |
CDR-L1 | WT | SVSSSISSNNLH |
C6, E6 | SASSGLSSSYLH | |
C7 | SASSSLSSSYLH | |
D5 | RVSSGISSNNLH | |
D7 | RASSGLSSNNLH | |
F3 | RASSGVSSNNLH | |
H1 | SASSSISSSYLH | |
H7 | SVSSSLSSSNLH | |
CDR-L2 | WT | GTSNLAS |
B1 | ATSSRAT | |
C1 | GTSSRAS | |
C3 | ATSNRES | |
C10 | ATSSLAT | |
E9, G6 | GASSLAT | |
G3 | ATSNLAS | |
H2 | TASSRAS | |
CDR-H3 | WT | HGDDPAW |
B4, B8, C4, C6, C10, G5 | HGDDVAW | |
C8 | HGDDIAW | |
CDR-L3H3 | WT | HGDDPAW |
A3, A8, A10, F8, H4, H6, H10 | HGDDVAW | |
G8 | HGDDISW |
실시예
1-4: 단백질 발현 균주
TOP10F
'을 이용한
Fab
생산 및 정제
선별한 클론들의 FOLR1에 대한 결합능을 비교하기 위해 각각 정제를 수행하였다. 정제를 수행하기 앞서 Fab 부분만 발현시키기 위해 host strain을 TG1에서 TOP10F' cell로 바꿨다.
4 mL SB/Ampicillin 배양 배지에 선별한 클론에 해당하는 콜로니를 접종하여 37℃에서 밤샘 배양하였다. 다음 날, 400 mL SB/Ampicillin 배양 배지에 O/N 배양한 배양액 4 ml 접종하여 OD600이 0.5~1.0 되는 시점까지 37℃ 배양기에서 약 3~4시간 배양한 후 클론의 발현을 위해 최종 농도 1 mM이 되도록 IPTG를 처리한 후 30℃에서 밤샘 배양하였다. 단, 발현 확인만 할 경우, SB/Ampicillin 배양 배지 20 mL만 배양하였다.
배양액 400 mL로부터 periplasm을 회수하기 위해 배양액을 원심분리하여 상층액 제거 후, 4℃로 유지한 16 mL의 1X TES 용액을 처리하여 4℃에서 1시간 동안 정치함으로써 세포를 용해시켰다. 추가로 24 mL의 0.2X TES 용액을 처리하여 1시간 동안 정치한 후, 원심분리하여 상층액 회수하고, EDTA를 제거하고자 5 mM MgCl2을 첨가하였다. 시료를 loading하기 전에 Ni-NTA His-Bind® resin 0.5 mL을 packing한 column에 elution buffer(300 mM Imidazole in PBS, pH 7.4) 20 CV로 세척 후, PBS로 20 CV 흘려주었다. 시료를 column에 loading하여 flow-through를 모으고, loading을 마치면 wash buffer(20 mM Imidazole in PBS, pH 7.4) 20 CV로 흘려서 washing through를 모은 후, elution buffer 10 CV 흘려주어 eluent를 모았다. 정제 과정 동안 단계별로 모은 시료를 12% SDS-PAGE에 well 당 15 μL씩 loading하여 전기영동(150 V, 1시간)하였다. Coomassie blue 염색을 통해 band를 확인하였다.
실시예
1-5:
FOLR1에
선별한 클론의
농도 별
직접 결합양상 확인
1차 선별한 클론들의 결합능을 상대적으로 비교할 목적으로 ELISA를 클론 농도 별로 수행하였으며, 방법은 다음과 같다. FOLR1을 1 ㎍/mL로 25 μL씩 96-well plate에 분주하여 RT에서 1시간동안 coating한 후 3% skim milk 180 μL로 RT에서 1시간동안 blocking 시켰다. Blocking 하는 동안 1차 항체로 사용할 시료를 준비하였다. 1차 항체로는 스크리닝으로 선별한 시료들을 사용하였으며, 0.1~100 nM(0, 0.1, 0.3, 1, 3, 10, 30, 100 nM)로 희석하여 준비하여 사용 전까지 냉장보관 하였다. Blocking 후 3% skim milk를 제거하고, 1차 항체를 25 μL씩 첨가하여 RT에서 1시간 이상 반응시켰다. 반응이 끝난 후 PBS-Tween20(0.1%) buffer로 3번 wash 해주고 2차 항체로 HA-HRP을 3% skim milk로 3,000배 희석하여 25 μL씩 첨가하고 RT에서 1시간 이상 반응시켰다. 반응이 끝난 후 PBS-Tween20(0.1%) buffer로 3번 wash 해주고 substrate TMB을 25 μL씩 첨가하여 발색을 확인하였다. 약 5분 경과 후 1 M H2SO4를 25 μL씩 첨가하여 반응을 멈추고 450 nm의 파장에서 흡광도를 측정하였다. 측정 결과는 GraphPad Prism 7 program을 통하여 EC(Effector concentration) 값을 구하였다.
선별한 클론과 FOLR1과의 결합친화도를 측정하기 위하여 Biacore3000을 이용하여 SPR 측정을 수행하였다. 시료를 주입하기 전에 CM5 sensor chip을 0.1 M NHS/0.4 M EDC로 activation 시킨 후, FOLR1(20 ㎍/mL in 10 mM acetate pH 5.0)로 고정화시킨 후, 반응하지 않은 NHS는 1 M ethanolamine으로 비활성화 시켰다. 시료들은 1, 2, 5, 10, 20, 40 nM로 250 μL씩 준비하여 30 ㎕/min으로 흘려주면서 결합과 해리 sensorgram을 확인하였고, 10 mM glycine(pH 2.1)로 sensor chip을 재생하였다. 얻어진 sensorgram은 BIAevaluation software를 이용하여 분석하여 KD값을 계산하였다.
실시예
1-6: 항체 라이브러리 서열 분석
Phage 라이브러리의 ELISA를 통해서 선별한 클론의 랜덤화시킨 상보성 결정 영역의 서열을 규명하였다. 96-well plate에 배양한 클론 중 선별한 각 클론의 배양액 1 uL를 주형으로 pC3X-f와 pC3X-b primer를 사용하여 94℃에서 2분간 pre-denaturation하고 94℃ 30초, 56℃ 30초, 72℃ 2분으로 25 cycles 반응한 뒤 72℃에서 7분간 반응하였다. 증폭의 유무는 1% agarose gel 전기영동으로 확인하고, 증폭된 PCR 산물을 QIAvac 96을 이용하여 DW로 정제하여 서열 분석을 의뢰하였다. Vector 내 leader sequence를 이용하여 상보성 결정 영역의 서열을 규명하였다.
실시예
2:
변형항체
(
vAb
) 제작
항체 라이브러리 제작 방법과 동일하게 최종 클론 pvAb를 제작하였으며, 사용한 주형과 프라이머는 표 7에, vAb 항체 서열 정보는 표 8 내지 표 10에 정리하였다.
클론 | PCR | 주형 | 프라이머 | 생산물 |
pvAb | 1차 | pCDR-L1#C6 | pC3X-f, Farl-L2-b | CDR-L1 |
pCDR-L2#C1 | Farl-L2-f, Lead-b | CDR-L2 | ||
CDR-L3H3#A3 | Lead-VH, pC3X-b | CDR-H3 | ||
2차 | CDR-L2, CDR-H3 | Farl-L2-f, pC3X-b | CDR-L2H3 | |
3차 | CDR-L1, CDR-L2H3 | pC3X-f, pC3X-b | CDR-L1L2H3 |
CDR 분류 | 모항체 CDR 서열 | 서열 위치 | 모항체의 아미노산 | 변이후의 아미노산 | 변형항체 CDR 서열 |
CDR-H3 | HGDDPAWFAY(서열번호 5) | 103 | P | V | HGDDVAWFAY(서열번호 28) |
CDR-L1 | SVSSSISSNNLH(서열번호 6) | 25 | V | A | SASSGLSSSYLH(서열번호 29) |
28 | S | G | |||
29 | I | L | |||
32 | N | S | |||
33 | N | Y | |||
CDR-L2 | GTSNLAS(서열번호 7) | 54 | N | S | GTSSRAS(서열번호 30) |
55 | L | R |
위에서 찾아낸 CDR 서열의 combination을 통해서 변형항체 vAb1, vAb2, vAb3, vAb4, vAb5를 제작하였다. vAb1은 CDR-H3와 CDR-L1, CDR-L2가 모두 반영된 변형항체이며, vAb2는 CDR-L1과 CDR-L2, vAb3는 CDR-L1, vAb4는 CDR-L2, vAb5는 CDR-H3가 반영된 변형항체이다.
구분 | 서열 | 서열번호 |
HC | EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCSASGFTFSGYGLSWVRQAPGKGLEWVAMISSGGSYTYYADSVKGRFAISRDNAKNTLFLQMDSLRPEDTGVYFCARHGDDPAWFAYWGQGTPVTVSS | 1 |
LC | DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCSVSSSISSNNLHWYQQKPGKAPKPWIYGTSNLASGVPSRFSGSGSGTDYTFTISSLQPEDIATYYCQQWSSYPYMYTFGQGTKVEIK | 2 |
HC | EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCSASGFTFSGYGLSWVRQAPGKGLEWVAMISSGGSYTYYADSVKGRFAISRDNAKNTLFLQMDSLRPEDTGVYFCARHGDDVAWFAYWGQGTPVTVSS | 31 |
LC | DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCSASSGLSSSYLHWYQQKPGKAPKPWIYGTSSRASGVPSRFSGSGSGTDYTFTISSLQPEDIATYYCQQWSSYPYMYTFGQGTKVEIK | 32 |
LC | DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCSASSGLSSSYLHWYQQKPGKAPKPWIYGTSNLASGVPSRFSGSGSGTDYTFTISSLQPEDIATYYCQQWSSYPYMYTFGQGTKVEIK | 33 |
LC | DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCSVSSSISSNNLHWYQQKPGKAPKPWIYGTSSRASGVPSRFSGSGSGTDYTFTISSLQPEDIATYYCQQWSSYPYMYTFGQGTKVEIK | 34 |
변형항체 | HC | LC |
vAb1 | 서열번호 31 | 서열번호 32 |
vAb2 | 서열번호 1 | 서열번호 32 |
vAb3 | 서열번호 1 | 서열번호 33 |
vAb4 | 서열번호 1 | 서열번호 34 |
vAb5 | 서열번호 31 | 서열번호 2 |
실시예
3:
변형항체
(
vAb
) 항체 발현 및 정제
변형항체(vAb)를 생산하고자, expiCHO 세포에 변형항체(vAb) 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 벡터(pc 3.4-vAbL, pc 3.4-vAbH)를 형질감염시켜 배양하고, 친화성 크로마토그래피(affinity chromatography)를 이용하여 정제하였다. 친화성 수지인 MabSelect SuReTM(GE Healthcare)를 XK16 컬럼에 충진하고 버퍼 A(25 mM Tris, pH 7.0, 25 mM NaCl)를 흘려주어 컬럼을 평형화한 후, 배양액을 흘려주어 친화성 수지와 결합시키고 버퍼 B(25 mM citric acid, pH 3.5)로 변형항체(vAb) 단백질을 용출 시켰다. 정제가 끝난 컬럼은 0.5 M NaOH로 세척한 후, 20% ethanol로 채우고 냉장 보관하였다. 용출된 시료에 1 M의 Tris(pH 9.0)를 적정량 첨가하여 시료의 pH를 6.0으로 조절하였다. 시료의 상태는 10% SDS-PAGE를 통해 확인하였다. 이를 통해 수득한 변형항체(vAb) 단백질은 10 mM sodium succinate, 30 mM sucrose pH 6.0의 조성을 가진 버퍼로 dialysis를 통해 버퍼 교환을 수행하였다.
실시예
4: ELISA 방법을 이용한
변형항체
(
vAb
)
결합능
확인
실시예 2에서 제조한 변형항체(vAb)의 결합능을 모항체와 비교할 목적으로 ELISA를 항체 농도 0.006~6250 ng/mL 조건으로 수행하였으며 방법은 실시예 1-5에 기술한 내용과 같다. 측정 결과, 변형항체인 vAb1 ~ vAb5는 모항체 대비 4.48 ~ 1.42배 더 강하게 FOLR1과 결합하는 것으로 측정되었다(표 11). 각각의 측정은 모항체 대비하여 서로 다른 실험에서 얻은 측정값이다.
Coating | Sample | EC50 | Relative Potency | R2 |
ng/mL | ||||
FOLR1-Fc | 모항체 | 10.99 | 1.00 | 0.997 |
vAb1 | 2.45 | 4.48 | ||
FOLR1-Fc | 모항체 | 11.85 | 1.00 | 0.972 |
vAb2 | 3.94 | 3.04 | ||
FOLR1-Fc | 모항체 | 3.04 | 1.00 | 0.996 |
vAb3 | 0.77 | 3.99 | ||
vAb4 | 1.59 | 1.94 | ||
vAb5 | 2.17 | 1.42 |
실시예
5:
SPR
방법을 이용한
변형항체
(
vAb
)
결합능
확인
FOLR1에 대한 실시예 2에서 제조한 변형항체인 vAb1의 결합친화도를 측정하기 위하여 Biacore3000을 이용하여 SPR 방법을 수행하였다. 수행 방법은 실시예 1-5에 기술한 내용과 같다. 결과는 BIAevaluation software를 이용하여 sensorgram 분석하여 KD값을 계산하였다. 변형항체 vAb1은 0.24 nM의 KD 값으로 모항체에 비해 4배 더 높은 결합친화도를 보였다(표 12). 이는 ELISA를 이용하여 얻은 값의 상대적 비와 유사하다.
Ligand | FOLR1 | ka (1/Ms) | kd (1/s) | KA (1/M) | KD (nM) | Relative Potency | Chi2 |
Analyte | 모항체 | 4.19E+05 | 4.01E-04 | 1.05E+09 | 0.96 | 1 | 4.90 |
변형항체vAb1 | 6.12E+05 | 1.47E-04 | 4.17E+09 | 0.24 | 4 | 4.86 |
이상으로 본 발명 내용의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적 기술은 단지 바람직한 실시 양태일 뿐이며, 이에 의해 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백할 것이다. 따라서, 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항들과 그것들의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
<110> Alteogen, Inc.
<120> Antibody specifically binding to FOLR1 and Use thereof
<130> P18-B054
<160> 34
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HC
<400> 1
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ser Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gly Tyr
20 25 30
Gly Leu Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Met Ile Ser Ser Gly Gly Ser Tyr Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ala Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Phe
65 70 75 80
Leu Gln Met Asp Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Gly Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Arg His Gly Asp Asp Pro Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Pro Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 2
<211> 110
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> LC
<400> 2
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Ser Val Ser Ser Ser Ile Ser Ser Asn
20 25 30
Asn Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Pro Trp
35 40 45
Ile Tyr Gly Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln
65 70 75 80
Pro Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Ser Ser Tyr Pro
85 90 95
Tyr Met Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 3
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H1
<400> 3
Gly Phe Thr Phe Ser Gly Tyr Gly Leu Ser
1 5 10
<210> 4
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H2
<400> 4
Met Ile Ser Ser Gly Gly Ser Tyr Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
1 5 10 15
<210> 5
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H3
<400> 5
His Gly Asp Asp Pro Ala Trp Phe Ala Tyr
1 5 10
<210> 6
<211> 12
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L1
<400> 6
Ser Val Ser Ser Ser Ile Ser Ser Asn Asn Leu His
1 5 10
<210> 7
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L2
<400> 7
Gly Thr Ser Asn Leu Ala Ser
1 5
<210> 8
<211> 11
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L3
<400> 8
Gln Gln Trp Ser Ser Tyr Pro Tyr Met Tyr Thr
1 5 10
<210> 9
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 9
gcctctggct tcactttcag trrttacgvt mtgarttggg tgagacaggc acctg 55
<210> 10
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 10
actgaaagtg aagccagagg c 21
<210> 11
<211> 66
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 11
ggggtctatt tttgtgcaag annknnkgac gatccagcat ggtttgmtta ctggggccaa 60
gggacc 66
<210> 12
<211> 66
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 12
ggggtctatt tttgtgcaag acacnnknnk gatccagcat ggtttgmtta ctggggccaa 60
gggacc 66
<210> 13
<211> 66
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 13
ggggtctatt tttgtgcaag acacggtnnk nnkccagcat ggtttgmtta ctggggccaa 60
gggacc 66
<210> 14
<211> 66
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 14
ggggtctatt tttgtgcaag acacggtgac nnknnkgcat ggtttgmtta ctggggccaa 60
gggacc 66
<210> 15
<211> 66
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 15
ggggtctatt tttgtgcaag acacggtgac gatnnknnkt ggtttgmtta ctggggccaa 60
gggacc 66
<210> 16
<211> 66
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 16
ggggtctatt tttgtgcaag acacggtgac gatccannkn nktttgmtta ctggggccaa 60
gggacc 66
<210> 17
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 17
tcttgcacaa aaatagaccc c 21
<210> 18
<211> 75
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 18
acagagtcac catcacatgc agkgyttcct ccrgtvttag ttcaarcwat ctgmactggt 60
atcagcagaa gcccg 75
<210> 19
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 19
gcatgtgatg gtgactctgt 20
<210> 20
<211> 59
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 20
cccaaagccc tggatctacg vtrcctctav tckggmaast ggggtgcctt caaggttca 59
<210> 21
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 21
gtagatccag ggctttggg 19
<210> 22
<211> 62
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 22
gcaacttact attgccagca gnnkbmtwat twtccaymtn nkymcacctt cggtcagggc 60
ac 62
<210> 23
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 23
ctgctggcaa tagtaagttg c 21
<210> 24
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 24
gcacgacagg tttcccgac 19
<210> 25
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 25
aaccatcgat agcagcaccg 20
<210> 26
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 26
ggccatggct ggttgggc 18
<210> 27
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 27
gcccaaccag ccatggcc 18
<210> 28
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H3
<400> 28
His Gly Asp Asp Val Ala Trp Phe Ala Tyr
1 5 10
<210> 29
<211> 12
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L1
<400> 29
Ser Ala Ser Ser Gly Leu Ser Ser Ser Tyr Leu His
1 5 10
<210> 30
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L2
<400> 30
Gly Thr Ser Ser Arg Ala Ser
1 5
<210> 31
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HC
<400> 31
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ser Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gly Tyr
20 25 30
Gly Leu Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Met Ile Ser Ser Gly Gly Ser Tyr Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ala Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Phe
65 70 75 80
Leu Gln Met Asp Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Gly Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Arg His Gly Asp Asp Val Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Pro Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 32
<211> 110
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> LC
<400> 32
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Ser Ala Ser Ser Gly Leu Ser Ser Ser
20 25 30
Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Pro Trp
35 40 45
Ile Tyr Gly Thr Ser Ser Arg Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln
65 70 75 80
Pro Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Ser Ser Tyr Pro
85 90 95
Tyr Met Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 33
<211> 110
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> LC
<400> 33
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Ser Ala Ser Ser Gly Leu Ser Ser Ser
20 25 30
Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Pro Trp
35 40 45
Ile Tyr Gly Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln
65 70 75 80
Pro Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Ser Ser Tyr Pro
85 90 95
Tyr Met Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 34
<211> 110
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> LC
<400> 34
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Ser Val Ser Ser Ser Ile Ser Ser Asn
20 25 30
Asn Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Pro Trp
35 40 45
Ile Tyr Gly Thr Ser Ser Arg Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln
65 70 75 80
Pro Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Ser Ser Tyr Pro
85 90 95
Tyr Met Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Claims (11)
- Folate receptor-α(FOLR1)에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
- 제1항에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 folate receptor-α의 생물학적 활성을 억제하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
- 제1항에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 folate receptor-α를 발현하는 세포의 antibody-dependent cellular cytotoxicity를 유도하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
- 제1항에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 folate receptor-α에 대한 결합 분리 상수(dissociation constant)가 1x10-7 M 이하인 것을 특징으로 하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
- 제1항에 있어서,
서열번호 3의 중쇄 CDR1; 서열번호 4의 중쇄 CDR2; 서열번호 5 또는 서열번호 28의 중쇄 CDR3; 및
서열번호 6 또는 서열번호 29의 경쇄 CDR1; 서열번호 7 또는 서열번호 30의 경쇄 CDR2; 서열번호 8의 경쇄 CDR3를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
- 제1항에 있어서,
서열번호 1 또는 서열번호 31의 중쇄 가변영역; 및 서열번호 2 및 서열번호 32 내지 34로 구성된 군에서 선택된 경쇄 가변영역을 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
- 제6항에 있어서,
서열번호 1의 중쇄 가변영역 및 서열번호 32의 경쇄 가변영역;
서열번호 1의 중쇄 가변영역 및 서열번호 33의 경쇄 가변영역;
서열번호 1의 중쇄 가변영역 및 서열번호 34의 경쇄 가변영역;
서열번호 31의 중쇄 가변영역 및 서열번호 2의 경쇄 가변영역; 또는
서열번호 31의 중쇄 가변영역 및 서열번호 32의 경쇄 가변영역을 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
- 제1항의 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 약물이 접합된 항체-약물 접합체.
- 제8항에 있어서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 링커를 통하여 약물과 결합되는 것을 특징으로 하는 항체-약물 접합체.
- 제8항에 있어서, 상기 약물은 화학요법제, 독소, 마이크로 RNA(miRNA), siRNA, shRNA 또는 방사성 동위원소인 것을 특징으로 하는 항체-약물 접합체.
- 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항의 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 제8항 내지 제10항 중 어느 한 항의 항체-약물 접합체를 포함하는 질병의 예방 또는 치료용 약학 조성물.
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