KR20090042036A - 인간 암 억제 유전자, 이에 의해 코딩되는 단백질, 이를포함하는 발현 벡터 및 이 벡터로 형질전환된 세포 - Google Patents

인간 암 억제 유전자, 이에 의해 코딩되는 단백질, 이를포함하는 발현 벡터 및 이 벡터로 형질전환된 세포 Download PDF

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Abstract

본 발명은 인간 암 억제 유전자, 이에 의해 코딩되는 단백질, 이를 포함하는 발현 벡터 및 이 벡터로 형질전환된 미생물에 관한 것으로, 본 발명의 유전자는 인간 암의 진단, 예방 및 치료에 유용하게 사용될 수 있다.
암 억제 유전자, 암 억제 단백질

Description

인간 암 억제 유전자, 이에 의해 코딩되는 단백질, 이를 포함하는 발현 벡터 및 이 벡터로 형질전환된 세포{HUMAN CANCER SUPPRESSOR GENE, PROTEIN ENCODED THEREIN, EXPRESSION VECTOR CONTAINING SAME, AND CELL TRANSFORMED BY SAID VECTOR}
본 발명은 인간 암 억제 유전자, 이에 의해 코딩되는 단백질, 이를 포함하는 발현 벡터 및 이 벡터로 형질전환된 세포에 관한 것이다.
암 억제 유전자(tumor suppressor gene) 산물은 정상 세포로부터 암 세포로의 형질전환을 억제하며, 이 기능이 상실되면 세포는 악성 형질전환에 이르게 된다(Klein, G., FASEB J., 7, 821-825 (1993)). 암세포가 암을 형성하기 위해서는 암 억제 유전자의 정상 카피수 기능이 상실되어야 한다. p53 암 억제 유전자의 코딩 서열내 변형이 인간 암에서 가장 일반적인 유전적 변화로 밝혀졌다(Bishop, J.M., Cell, 64, 235-248 (1991); 및 Weinberg, R.A., Science, 254, 1138-1146 (1991)). 그러나 자궁경부암에서 보고된 p53 변이는 2 % 내지 11 %의 범위에 불과하여(Crook, T. et al., Lancet, 339, 1070-1073 (1992); 및 Busby-Earle, R.M.C. et al., Br. j. Cancer, 69, 732-737 (1994)), 자궁경부암 조직의 일부만이 이러한 p53 변이를 보이는 것으로 생각된다. 이에 본 발명자들은, 정상 자궁경부 조직과 자궁경부암 사이에 차별적으로 발현되는 유전자를 보다 효율적으로 나타내는 mRNA 감별 전개법(mRNA differential display(DD) method)을 사용하여, 정상 자궁경부 조직에서 새로운 암 억제 유전자를 분리하고자 예의 연구하였다. 
또한, 간암의 경우에서 특히 아플라톡신 B1 (Aflatoxin B1)에 노출되거나 B 형 간염에 감염되는 빈도가 높은 지역에서 p53 변이는 무려 50% 이상에 이르며 주로 변이는 codon 249 에서 오인변이 (missense mutation)가 특징이다 (Montesano, R. et al ., J. Natl . Cancer Inst., 89, 1844-1851 (1997); Szymanska, K. & Hainaut, P. Acta Biochimica Polonica , 50, 231-238 (2003)). 그러나 미국이나 서부 유럽에서의 간암에서 p53 변이는 30% 정도에 불과하며 변이가 자주 일어나는 핫 스폿 (hot spot)도 없다 (Szymanska, K. & Hainaut, P. Acta Biochimica Polonica , 50, 231-238 (2003)). 이에 본 발명자들은, 정상 간 조직과 간암 사이에 차별적으로 발현되는 유전자를 보다 효율적으로 나타내는 mRNA 감별 전개법(mRNA differential display(DD) method) (Liang, P. and Pardee, A. B., Science, 257, 967-971 (1992); 및 Liang, P. et al., Cancer Res ., 52, 6966-6968 (1993))을 사용하여, 정상 간조직에서 새로운 암 억제 유전자를 분리하고자 예의 연구하였다.
한편, 유방암에서 보고된 p53 변이는 30%의 범위에 불과하여(Keen, J.C. & Davidson, N. E., Cancer, 97, 825-833 (2003)) 및 Borresen-Dale, A-L., Human Mutation, 21, 292-300 (2003)) 유방암 조직의 일부만이 이러한 p53 변이를 보이는 것으로 생각된다. 이에 본 발명자들은, 정상 유방 조직과 유방암 사이에 차별적으 로 발현되는 유전자를 보다 효율적으로 나타내는 mRNA 감별 전개법(mRNA differential display(DD) method) (Liang, P. and Pardee, A. B., Science, 257, 967-971 (1992); 및 Liang, P. et al., Cancer Res ., 52, 6966-6968 (1993))을 사용하여, 정상 유방조직에서 새로운 암 억제 유전자를 분리하고자 예의 연구하였다.
본 발명의 목적은 신규한 인간 암 억제 유전자를 제공하는 데 있다.
본 발명의 다른 목적은 상기 유전자에 의해 코딩되는 암 억제 단백질을 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 유전자를 포함하는 발현 벡터를 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 벡터로 형질전환된 세포를 제공하는 데 있다.
상기 목적에 따라, 본 발명에서는 서열번호: 1의 염기서열을 갖는 인간 암 억제 유전자(growth-inhibiting gene 6; GIG6로 명명함)를 제공한다.
상기 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 서열번호: 2의 아미노산 서열을 갖는 인간 암 억제 단백질을 제공한다.
상기 목적에 따라, 본 발명에서는 서열번호: 3의 염기서열을 갖는 인간 암 억제 유전자(growth-inhibiting gene 27; GIG27로 명명함)를 제공한다.
상기 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 서열번호: 4의 아미노산 서열을 갖는 인간 암 억제 단백질을 제공한다.
상기 목적에 따라, 본 발명에서는 서열번호: 5의 염기서열을 갖는 인간 암 억제 유전자(growth-inhibiting gene 37; GIG37로 명명함)를 제공한다.
상기 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 서열번호: 6의 아미노산 서열을 갖는 인간 암 억제 단백질을 제공한다.
상기 목적에 따라, 본 발명에서는 서열번호: 7의 염기서열을 갖는 인간 암 억제 유전자(growth-inhibiting gene 45; GIG45로 명명함)를 제공한다.
상기 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 서열번호: 8의 아미노산 서열을 갖는 인간 암 억제 단백질을 제공한다.
상기 또 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 상기 유전자를 포함하는 발현 벡터를 제공한다.
상기 또 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 상기 벡터로 형질전환된 세포를 제공한다.
이하 본 발명을 상세히 설명한다.
1. GIG6
본 발명의 GIG6 유전자는 서열번호: 1의 염기서열을 갖는 인간 암 억제 유전자 6으로서, 서열번호: 1의 염기서열은 미국 국립보건원의 진뱅크(NIH GenBank) 데이터베이스에 등록번호 제 EU219623 호로 2007년 10월 14일에 등록되었으며(공개예정일: 2008년 11월 1일) 이 데이터베이스에 등록된 제 NW_927128.1호인 Homo sapiens chromosome 1 genomic contig, alternate assembly (based on Celera assembly) 유전자와 서열이 유사한 유전자이다. 이유전자의 기능에 대하여서는 아직까지 밝혀진 바가 없다. 그러나, GIG6 유전자는 인간의 각종 암화 과정에 깊이 관련되어 있는 것으로 본 발명자들의 연구결과 밝혀졌다. 연구 결과 자궁암을 포함 한 여러 인간 종양들에서는 오히려 발현이 아주 약하거나 없는 반면에 여러 정상조직들에서는 발현이 매우 증가된 GIG6 종양억제 유전자를 발굴하게 되었다.
서열번호: 1의 염기서열에는 염기번호 2386 내지 2598(염기번호 2596-2598은 종료코돈임)에 해당하는 하나의 오픈 리딩 프레임이 포함되어 있다. 또한, 그러나, 코돈의 축퇴성(degeneracy)으로 인해서 또는 상기 유전자를 발현시키고자 하는 생물에서 선호되는 코돈을 고려하여 본 발명의 유전자는 코딩 영역으로부터 발현되는 단백질의 아미노산 서열을 변화시키지 않는 범위 내에서 코딩 영역에 다양한 변형이 이루어질 수 있고 코딩 영역을 제외한 부분에서도 유전자의 발현에 영향을 미치지 않는 범위 내에서 다양한 변형 또는 수식이 이루어질 수 있으며, 그러한 변형 유전자 역시 본 발명의 범위에 포함된다. 따라서, 본 발명은 상기 유전자와 실질적으로 동일한 염기서열을 갖는 폴리뉴클레오티드 및 상기 유전자의 단편을 역시 포함한다. 실질적으로 동일한 폴리뉴클레오티드란 80% 이상, 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것들을 의미한다.
본 발명의 GIG6 유전자로부터 발현되는 단백질은 70 개 아미노산 잔기로 이루어져 있고 서열번호: 2의 아미노산 서열을 가지며 크기는 약 8 kDa이다. 그러나 상기 단백질의 아미노산 서열에서도 역시 단백질의 기능에 영향을 미치지 않는 범위 내에서 아미노산의 치환, 부가 또는 결실이 이루어질 수 있으며, 목적에 따라 단백질의 일부만이 사용될 수도 있다. 그러한 변형된 아미노산 서열 역시 본 발명의 범위에 포함된다. 따라서 본 발명은 상기 단백질과 실질적으로 동일한 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드 및 그의 단편을 역시 포함하며, 실질적으로 동일한 폴 리펩티드란 80% 이상, 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것들을 의미한다.
본 발명의 유전자 및 단백질은 인간 조직으로부터 분리하거나, 공지의 DNA 또는 펩티드 합성 방법에 따라 합성할 수도 있다. 예를 들어, 본 발명의 GIG6 유전자는 서열번호: 1의 염기서열 정보를 토대로 통상적인 방법에 따라 스크리닝 및 클로닝하여 얻을 수 있다. 다른 예로는 정상 조직과, 암 조직 또는 세포주로부터 추출한 총 RNA에 대해 서열번호: 9의 임의 프라이머 H-AP38 (5'-AAGCTTCCAGTGC-3'및 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머(anchored oligo-dT primer) (5'-AAGCTTTTTTTTTTTG-3'를 사용하여 역전사 중합효소 연쇄 반응(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)을 수행하여 암 조직 또는 세포주에서는 발현되지 않으면서 정상 조직에서만 차별적으로 발현되는 315 bp cDNA 단편을 얻고 (2413bp-2727bp 에 해당), 이 단편을 프로브로 사용하여 cDNA 라이브러리와 플라크 혼성화시켜 전장(full length) cDNA 클론을 얻을 수 있다.
이렇게 제조된 유전자를 당 분야에 공지된 미생물 또는 동물 세포 발현용 벡터에 삽입하여 발현 벡터를 제조한 후 이를 적절한 숙주 세포, 예를 들어, 대장균 또는 HeLa 세포주 등에 도입시킴으로써 상기 유전자의 DNA를 대량으로 복제하거나 단백질을 대량 생산할 수 있다. 벡터의 제작시에는, 상기 유전자 또는 단백질을 생산하고자 하는 숙주 세포의 종류에 따라 프로모터, 터미네이터 등과 같은 발현 조절서열, 자가복제서열 및 분비 시그날 등을 적절히 선택하고 조합할 수 있다.
본 발명의 GIG6 유전자는 정상 조직, 바람직하게는 자궁, 심장 및 간에서 과 발현되어 발암을 억제하는 것으로 보인다. 이 조직들에서 본 발명의 유전자는 대부분이 약 2.4 kb의 mRNA 전사물로 과발현된다. 특히, 본 발명의 유전자는 정상 조직에서만 차별적으로 발현되는데, 예를 들어 자궁암 조직 및 자궁암 세포주들의 암 조직 및 세포에서는 발현되지 않거나 약하게 발현이 되며 정상 자궁 조직에서만 높게 차별적으로 발현된다.
본 발명의 GIG6 유전자가 도입된 자궁암 세포주는 높은 사멸률을 보이므로, 본 발명의 유전자는 암의 예방 및 치료에 유용하게 사용될 수 있다.
2. GIG27
본 발명의 GIG27 유전자는 서열번호: 3의 염기서열을 갖는 인간 암 억제 유전자 27로서, 서열번호: 4의 염기서열은 미국 국립보건원의 진뱅크(NIH GenBank) 데이터베이스에 등록번호 제 DQ088979 호로 등록되었으며(공개예정일: 2007년 10월 30일) 이 등록된 유전자는 데이터베이스에 등록된 제 NM_001014986호인 Homo sapiens folate hydrolase (prostate-specific membrane antigen) 1 (FOLH1), transcript variant 2 유전자와 제 NM_004476 호인 Homo sapiens folate hydrolase (prostate-specific membrane antigen) 1 (FOLH1), transcript variant 1 유전자와 유전자서열이 유사한 것으로 나타났다. 이유전자의 기능은 아직 알려져 있지 않으나, 이 유전자는 M28 peptidase family 에 속한 type II transmembrane glycoprotein을 encoding 하며 prostate, central and peripheral nervous system 과 신장에서 발현이 되고 있다고 보고되고 있다 (Israeli, R. S. et al ., Cancer Res., 53, 227-30 (1993); Israeli, R. S. et al., Cancer Res., 54, 1807-11 (1994); Troyer, J. K. et al., Int . J. Cancer, 5, 552-8 (1995)).
그러나, 본 발명자들은 간암을 포함한 여러 인간 종양들에서는 오히려 발현이 전무하고 반면에 간 정상조직에서는 발현이 매우 증가된 GIG27 종양억제 유전자를 발굴하게 되었다.
서열번호: 3의 염기서열에는 염기번호 124내지 2283(염기번호 2281-2283은 종료코돈임)에 해당하는 하나의 오픈 리딩 프레임이 포함되어 있다. 그러나, 코돈의 축퇴성(degeneracy)으로 인해서 또는 상기 유전자를 발현시키고자 하는 생물에서 선호되는 코돈을 고려하여 본 발명의 유전자는 코딩 영역으로부터 발현되는 단백질의 아미노산 서열을 변화시키지 않는 범위 내에서 코딩 영역에 다양한 변형이 이루어질 수 있고 코딩 영역을 제외한 부분에서도 유전자의 발현에 영향을 미치지 않는 범위 내에서 다양한 변형 또는 수식이 이루어질 수 있으며, 그러한 변형 유전자 역시 본 발명의 범위에 포함된다. 따라서, 본 발명은 상기 유전자와 실질적으로 동일한 염기서열을 갖는 폴리뉴클레오티드 및 상기 유전자의 단편을 역시 포함한다. 실질적으로 동일한 폴리뉴클레오티드란 80% 이상, 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것들을 의미한다.
본 발명의 GIG27 유전자로부터 발현되는 단백질은 719 개 아미노산 잔기로 이루어져 있고 서열번호: 4의 아미노산 서열을 가지며 크기는 약 81 kDa이다. 그러나 상기 단백질의 아미노산 서열에서도 역시 단백질의 기능에 영향을 미치지 않는 범위내에서 아미노산의 치환, 부가 또는 결실이 이루어질 수 있으며, 목적에 따라 단백질의 일부만이 사용될 수도 있다. 그러한 변형된 아미노산 서열 역시 본 발명의 범위에 포함된다. 따라서 본 발명은 상기 단백질과 실질적으로 동일한 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드 및 그의 단편을 역시 포함하며, 실질적으로 동일한 폴리펩티드란 80% 이상, 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것들을 의미한다.
본 발명의 유전자 및 단백질은 인간 조직으로부터 분리하거나, 공지의 DNA 또는 펩티드 합성 방법에 따라 합성할 수도 있다. 예를 들어, 본 발명의 유전자는 서열번호: 3의 염기서열 정보를 토대로 통상적인 방법에 따라 스크리닝 및 클로닝하여 얻을 수 있다. 다른 예로는 정상 조직과, 암 조직 또는 세포주로부터 추출한 총 RNA에 대해 서열번호: 11의 임의 프라이머 H-AP8 (5'-AAGCTTTTACCGC-3' 및 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머(anchored oligo-dT primer) (5'-AAGCTTTTTTTTTTTG-3'를 사용하여 역전사 중합효소 연쇄 반응(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)을 수행하여 암 조직 또는 세포주에서는 발현되지 않으면서 정상 조직에서만 차별적으로 발현되는 356 bp cDNA 단편을 얻고, 이 단편을 프로브로 사용하여 cDNA 라이브러리와 플라크 혼성화시켜 전장(full length) cDNA 클론을 얻을 수 있다.
이렇게 제조된 유전자를 당 분야에 공지된 미생물 또는 동물 세포 발현용 벡터에 삽입하여 발현 벡터를 제조한 후 이를 적절한 숙주 세포, 예를 들어, 대장균 또는 HepG2 세포주 등에 도입시킴으로써 상기 유전자의 DNA를 대량으로 복제하거나 단백질을 대량 생산할 수 있다. 벡터의 제작시에는, 상기 유전자 또는 단백질을 생산하고자 하는 숙주 세포의 종류에 따라 프로모터, 터미네이터 등과 같은 발현 조절서열, 자가복제서열 및 분비 시그날 등을 적절히 선택하고 조합할 수 있다. 본 발명자들은 GIG27 전장 cDNA를 발현 벡터 pBAD/Thio-Topo (Invitrogen, USA)에 삽입한 후 대장균 DH5α에 형질전환시켰으며 얻어진 형질전환체를 대장균 DH5α/GIG27/pBAD/Thio-Topo로 명명하였다.
본 발명의 GIG27 유전자는 정상 조직, 바람직하게는 간조직에서 과발현되어 발암을 억제하는 것으로 보인다. 또한, 백혈병, 자궁암, 악성림프종, 대장암, 폐암 및 피부암에서도 발현이 억제되어 암발생을 억제하는 것으로 보인다. 이 조직들에서 본 발명의 유전자는 대부분이 약 5.0 kb의 mRNA 전사물로 과발현된다. 또한 동시에 약 2.0 kb의 mRNA 전사물도 발현된다. 특히, 본 발명의 유전자는 정상 조직에서만 차별적으로 발현되는데, 예를 들어 간암 조직 및 간암 세포주 HepG2 등의 암 조직 및 세포에서는 거의 발현되지 않으며 정상 간 조직에서만 차별적으로 발현된다.
본 발명의 유전자가 도입된 암 세포주는 높은 사멸률을 보이므로, 본 발명의 유전자는 암의 예방 및 치료에 유용하게 사용될 수 있다.
3. GIG 37
본 발명의 GIG37 유전자는 서열번호: 5의 염기서열을 갖는 인간 암 억제 유전자 37로서, 서열번호: 5의 염기서열은 미국 국립보건원의 진뱅크(NIH GenBank) 데이터베이스에 등록번호 제 EU219622 호로 2007년 10월 14일 등록되었으며(공개예정일: 2008년 11월 1일) 이 데이터베이스에 등록된 제 NM_021117 호인 Homo sapiens cryptochrome 2 (photolyase-like) (CRY2)와는 서열이 유사한 유전자이다. 이 유전자는 그 기능이 인간의 24시간 주기 (circadian rhythms) 에 관여하는 것으로 알려져 있다 (van der Horst, G.T., et al ., Nature 398, 627-630 (1999)). 그러나 기 보고된 바와는 달리, 본 발명자들은 유방암을 포함한 여러 인간 종양들에서는 발현이 전혀 없는 반면, 여러 정상조직들에서는 발현이 매우 증가된 GIG37 종양억제 유전자를 발굴하게 되었다.
서열번호: 5의 염기서열에는 염기번호 9 내지 1790(염기번호 1788-1790은 종료코돈임)에 해당하는 하나의 오픈 리딩 프레임이 포함되어 있다. 그러나, 코돈의 축퇴성(degeneracy)으로 인해서 또는 상기 유전자를 발현시키고자 하는 생물에서 선호되는 코돈을 고려하여 본 발명의 유전자는 코딩 영역으로부터 발현되는 단백질의 아미노산 서열을 변화시키지 않는 범위 내에서 코딩 영역에 다양한 변형이 이루어질 수 있고 코딩 영역을 제외한 부분에서도 유전자의 발현에 영향을 미치지 않는 범위 내에서 다양한 변형 또는 수식이 이루어질 수 있으며, 그러한 변형 유전자 역시 본 발명의 범위에 포함된다. 따라서, 본 발명은 상기 유전자와 실질적으로 동일한 염기서열을 갖는 폴리뉴클레오티드 및 상기 유전자의 단편을 역시 포함한다. 실질적으로 동일한 폴리뉴클레오티드란 80% 이상, 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것들을 의미한다.
본 발명의 GIG37 유전자로부터 발현되는 단백질은 593 개 아미노산 잔기로 이루어져 있고 서열번호: 6의 아미노산 서열을 가지며 크기는 약 67 kDa이다. 그러나 상기 단백질의 아미노산 서열에서도 역시 단백질의 기능에 영향을 미치지 않는 범위 내에서 아미노산의 치환, 부가 또는 결실이 이루어질 수 있으며, 목적에 따라 단백질의 일부만이 사용될 수도 있다. 그러한 변형된 아미노산 서열 역시 본 발명의 범위에 포함된다. 따라서 본 발명은 상기 단백질과 실질적으로 동일한 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드 및 그의 단편을 역시 포함하며, 실질적으로 동일한 폴리펩티드란 80% 이상, 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것들을 의미한다.
본 발명의 GIG37 유전자 및 단백질은 인간 조직으로부터 분리하거나, 공지의 DNA 또는 펩티드 합성 방법에 따라 합성할 수도 있다. 예를 들어, 본 발명의 유전자는 서열번호: 5의 염기서열 정보를 토대로 통상적인 방법에 따라 스크리닝 및 클로닝하여 얻을 수 있다. 다른 예로는 정상 조직과, 암 조직 또는 세포주로부터 추출한 총 RNA에 대해 서열번호: 12의 임의 프라이머 H-AP29 (5'-AAGCTTAGCAGCA-3'및 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머(anchored oligo-dT primer) (5'-AAGCTTTTTTTTTTTC-3'를 사용하여 역전사 중합효소 연쇄 반응(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)을 수행하여 암 조직 또는 세포주에서는 발현되지 않으면서 정상 조직에서만 차별적으로 발현되는 534 bp cDNA 단편을 얻고, 이 단편을 프로브로 사용하여 cDNA 라이브러리와 플라크 혼성화시켜 전장(full length) cDNA 클론을 얻을 수 있다.
이렇게 제조된 유전자를 당 분야에 공지된 미생물 또는 동물 세포 발현용 벡터에 삽입하여 발현 벡터를 제조한 후 이를 적절한 숙주 세포, 예를 들어, 대장균 또는 MCF-7 세포주 등에 도입시킴으로써 상기 유전자의 DNA를 대량으로 복제하거나 단백질을 대량 생산할 수 있다. 벡터의 제작시에는, 상기 유전자 또는 단백질을 생산하고자 하는 숙주 세포의 종류에 따라 프로모터, 터미네이터 등과 같은 발현 조절서열, 자가복제서열 및 분비 시그날 등을 적절히 선택하고 조합할 수 있다.
본 발명자들은 GIG37 전장 cDNA를 발현 벡터 pBAD/Thio-Topo (Invitrogen, USA)에 삽입한 후 대장균 DH5α에 형질전환시켰으며, 얻어진 형질전환체를 대장균 DH5α/GIG37/pBAD/Thio-Topo로 명명하였다.
본 발명의 GIG37 유전자는 정상 조직, 바람직하게는 유방, 심장, 골격근,및 간조직들에서 과발현되어 발암을 억제하는 것으로 보인다. 이 조직들에서 본 발명의 유전자는 대부분이 약 1.5 kb의 mRNA 전사물과 약 4.5 kb의 mRNA 전사물로 과발현된다. 특히, 본 발명의 유전자는 정상 조직에서만 차별적으로 발현되는데, 예를 들어 유방암 조직 및 유방암 세포주 MCF-7 등의 암 조직 및 세포에서는 발현되지 않으며 정상 유방 조직에서만 차별적으로 발현된다.
본 발명의 유전자가 도입된 암 세포주는 높은 사멸률을 보이므로, 본 발명의 유전자는 암의 예방 및 치료에 유용하게 사용될 수 있다.
4. GIG45
본 발명의 유전자는 서열번호: 7의 염기서열을 갖는 인간 암 억제 유전자 45로서, 서열번호: 7의 염기서열은 미국 국립보건원의 진뱅크(NIH GenBank) 데이터베이스에 등록번호 제 뗘219621 호로 2007년 10월 14일 등록되었으며(공개예정일: 2008년 11월 1일) 이 데이터베이스에 등록된 제 NM_019105 호인 Homo sapiens tenascin XB (TNXB), transcript variant XB 유전자와 서열이 유사한 유전자이다. 이 유전자는 세포외 기질 단백질 (extracellular matrix proteins)인 tenascin family를 coding 하며 비유착성기능 (anti-adhesive effect)를 갖는다고 보고된 것 외에 다른 기능은 알려져 있지 않다 (Egging,D., et al., Arch . Dermatol . Res., 298, 389-396 (2007)). 그러나 기 보고된 바와 같은 기능과는 달리 GIG45는 인간의 각종 암화과정에 깊숙히 관련되어 있는 것으로 본 발명자들에 의하여 밝혀졌다. 연구 결과 유방암을 포함한 여러 인간 종양들에서는 오히려 발현이 전혀 없는 반면, 여러 정상조직들에서는 발현이 매우 증가된 GIG45 종양억제 유전자를 발굴하였다.
서열번호: 7의 염기서열에는 염기번호 287 내지 1894(염기번호 1892-1894은 종료코돈임)에 해당하는 하나의 오픈 리딩 프레임이 포함되어 있다. 그러나, 코돈의 축퇴성(degeneracy)으로 인해서 또는 상기 유전자를 발현시키고자 하는 생물에서 선호되는 코돈을 고려하여 본 발명의 유전자는 코딩 영역으로부터 발현되는 단백질의 아미노산 서열을 변화시키지 않는 범위 내에서 코딩 영역에 다양한 변형이 이루어질 수 있고 코딩 영역을 제외한 부분에서도 유전자의 발현에 영향을 미치지 않는 범위 내에서 다양한 변형 또는 수식이 이루어질 수 있으며, 그러한 변형 유전자 역시 본 발명의 범위에 포함된다. 따라서, 본 발명은 상기 유전자와 실질적으로 동일한 염기서열을 갖는 폴리뉴클레오티드 및 상기 유전자의 단편을 역시 포함한다. 실질적으로 동일한 폴리뉴클레오티드란 80% 이상, 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것들을 의미한다.
본 발명의 GIG45 유전자로부터 발현되는 단백질은 535 개 아미노산 잔기로 이루어져 있고 서열번호: 8의 아미노산 서열을 가지며 크기는 약 59 kDa이다. 그러나 상기 단백질의 아미노산 서열에서도 역시 단백질의 기능에 영향을 미치지 않 는 범위 내에서 아미노산의 치환, 부가 또는 결실이 이루어질 수 있으며, 목적에 따라 단백질의 일부만이 사용될 수도 있다. 그러한 변형된 아미노산 서열 역시 본 발명의 범위에 포함된다. 따라서 본 발명은 상기 단백질과 실질적으로 동일한 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드 및 그의 단편을 역시 포함하며, 실질적으로 동일한 폴리펩티드란 80% 이상, 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것들을 의미한다.
본 발명의 GIG45 유전자 및 단백질은 인간 조직으로부터 분리하거나, 공지의 DNA 또는 펩티드 합성 방법에 따라 합성할 수도 있다. 예를 들어, 본 발명의 유전자는 서열번호: 7의 염기서열 정보를 토대로 통상적인 방법에 따라 스크리닝 및 클로닝하여 얻을 수 있다. 다른 예로는 정상 조직과, 암 조직 또는 세포주로부터 추출한 총 RNA에 대해 서열번호: 13의 임의 프라이머 H-AP32 (5'-AAGCTTCCTGCAA-3'및 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머(anchored oligo-dT primer) (5'-AAGCTTTTTTTTTTTC-3'를 사용하여 역전사 중합효소 연쇄 반응(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)을 수행하여 암 조직 또는 세포주에서는 발현되지 않으면서 정상 조직에서만 차별적으로 발현되는 325 bp cDNA 단편을 얻고, 이 단편을 프로브로 사용하여 cDNA 라이브러리와 플라크 혼성화화시켜 전장(full length) cDNA 클론을 얻을 수 있다.
이렇게 제조된 유전자를 당 분야에 공지된 미생물 또는 동물 세포 발현용 벡터에 삽입하여 발현 벡터를 제조한 후 이를 적절한 숙주 세포, 예를 들어, 대장균 또는 MCF-7 세포주 등에 도입시킴으로써 상기 유전자의 DNA를 대량으로 복제하거나 단백질을 대량 생산할 수 있다. 벡터의 제작시에는, 상기 유전자 또는 단백질을 생산하고자 하는 숙주 세포의 종류에 따라 프로모터, 터미네이터 등과 같은 발현 조절서열, 자가복제서열 및 분비 시그날 등을 적절히 선택하고 조합할 수 있다.
본 발명자들은 GIG45 전장 cDNA를 발현 벡터 pBAD/Thio-Topo (Invitrogen, USA)에 삽입한 후 대장균 DH5α에 형질전환시켰으며, 얻어진 형질전환체를 대장균 DH5α/GIG45/pBAD/Thio-Topo로 명명하였다.
본 발명의 유전자는 정상 조직, 바람직하게는 유방, 간 등에서 과발현되어 발암을 억제하는 것으로 보인다. 이 조직들에서 본 발명의 유전자는 대부분이 약 2.2 kb의 mRNA 전사물로 과발현된다. 특히, 본 발명의 유전자는 정상 조직에서만 차별적으로 발현되는데, 예를 들어 유방암 조직 및 유방암 세포주 MCF-7 등의 암 조직 및 세포에서는 발현되지 않으며 정상 유방 조직에서만 차별적으로 발현된다.
본 발명의 유전자가 도입된 암 세포주는 높은 사멸률을 보이므로, 본 발명의 유전자는 암의 예방 및 치료에 유용하게 사용될 수 있다.
본 발명의 GIG6 유전자는 인간 암의 진단, 예방 및 치료에 유용하게 사용될 수 있다.
이하 본 발명을 하기 실시예에 의하여 더욱 상세하게 설명하고자 한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것일 뿐, 본 발명의 범위가 이들만으로 한정되는 것은 아니다.
참조예 : 총 RNA 의 분리
신선한 조직 또는 배양된 세포로부터 총 RNA 분리 키트(RNeasy total RNA kit, Qiagen Inc., 독일)를 사용하여 총 RNA를 분리한 후, 메시지 클린 키트(message clean kit, GenHunter Corp., MA, 미국)를 사용하여 RNA에 오염된 DNA를 제거하였다.
실시예 1: 총 RNA 의 분리 및 mRNA 감별 전개
정상 자궁경부 조직, 원발성 자궁경부암 조직 및 자궁경부암 세포주에서 유전자 발현의 차별 패턴을 다음과 같이 조사하였다.  자궁 근종 환자로부터 자궁적출술(hysterectomy) 중에 정상 자궁경부(exocervical) 조직 시료를 얻었으며, 수술적 처치전에 방사선 또는 항암 치료를 받지 않은 환자의 근치 자궁절제술(radical hysterectomy) 중에 원발성 자궁경부암 조직 및 전이성 장골 림프절 조직 시료를 얻었다.  인간 자궁경부암 세포주로는 CUMC-6(Kim, J.W. et al., Gynecol . Oncol ., 62, 230-240 (1996))을 사용하였다.  이들 조직 및 세포로부터 각각 참조예의 방법과 동일하게 실시하여 총 RNA를 분리하였다.
각 조직 및 세포의 총 RNA 시료를 사용하여 문헌(Liang, P. and Pardee, A. B., Science, 257, 967-971 (1992); 및 Liang, P. et al., Cancer Res ., 52, 6966-6968 (1993))의 방법을 일부 변형하여 다음과 같이 RT-PCR을 수행하였다. 0.2 ㎍의 총 RNA를 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머와 함께 키트(RNAimage kit, GenHunter)를 사용하여 역전사한 후, 동일한 고정 올리고-dT 프라이머 및, 서열번호: 9의 5' 13mer 임의 프라이머인 H-AP38(RNAimage primer set 5, GenHunter Corporation, 미국)를 사용하여 0.5mM [α-35S]-표지된 dATP(1,200 Ci/mmol)의 존재하에서 PCR을 수행하였다. PCR은 95 ℃에서 40 초, 40 ℃에서 2 분, 72 ℃에서 40 초로 이루어진 반응을 모두 40 회 반복한 후 72 ℃에서 5 분 동안 반응시켰다. 증폭된 단편을 6 % 폴리아크릴아미드 염기서열 겔에서 전기영동시킨 후 오토래디오 그래피하였다.
도 1은 서열번호: 9의 5' 13mer 임의 프라이머 H-AP38과 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머를 사용한 PCR 결과이다. 도 1에서 제1열은 정상 자궁경부 조직이며, 제2열은 자궁경부암 조직이고, 제3열은 전이성 장골 림프절 조직이며, 제4열은 자궁경부암 세포주 CUMC-6이다.  도 1에서 보는 바와 같이, 자궁경부암 조직, 전이성 장골 림프절 조직 및 자궁경부암 세포주 CUMC-6에서는 발현되지 않고 정상 자궁경부 조직에서만 차별적으로 발현된 256 bp cDNA 단편이 확인되었다.  이 cDNA 단편을 HP116로 명명하였다. 
건조된 겔로부터 HP116 단편인 315 bp 밴드를 잘라내고 15 분 동안 끓여 cDNA를 용출시킨 후, [α-35S]-표지된 dATP 및 20 μM dNTP를 사용하지 않는 상태에서 상기와 동일한 프라이머 쌍을 사용하여 동일한 조건하에서 PCR을 수행하여 재증폭시켰다. 재증폭된 cDNA 단편 CC321a을 클로닝 시스템(TA cloning system, Promega)을 사용하여 발현 벡터 pGEM-T Easy에 클로닝하였으며, 염기서열 결정 키트(Sequenase Version 2.0 DNA Sequencing System, United States Biochemical Co.)를 사용하여 염기서열을 결정하였다. cDNA 단편 CC321a은 서열번호: 14의 염 기서열을 나타내었다.
서열번호: 14의 염기서열을 BLAST 및 FASTA 프로그램을 이용하여 미국 국립보건원의 진뱅크(NIH GenBank) 데이터베이스에서 검색한 결과, 이 데이터베이스에 등록된 제 NW_927128.1호인 Homo sapiens chromosome 1 genomic contig, alternate assembly (based on Celera assembly) 유전자와 서열이 유사한 유전자이다.
실시예 2: cDNA 라이브러리 스크리닝
실시예 1에서 얻은 cDNA 단편 CC321a을 문헌(Feinberg, A.P. and Vogelstein, B., Anal . Biochem ., 132, 6-13 (1983))의 방법에 따라 표지하여 32P-표지된 CC321a cDNA 프로브를 얻고, 이를 박테리오파지 λgt11 인간 폐 배 섬유아세포(human lung embryonic fibroblast) cDNA 라이브러리(Miki, T. et al., Gene, 83, 137-146 (1989))와 문헌(Sambrook, J. et al., Molecular Cloning : A Laboratory mannual , New York: Cold Spring Harbor Laboratory (1989))의 방법에 따라 플라크 하이브리드화시켜, 인간 암 억제 유전자 GIG6의 전장 cDNA 클론을 얻었다.
이 전장 cDNA의 염기서열을 결정하였으며, 그 결과는 서열번호: 1과 같았다. 이 염기서열은 70 개 아미노산 잔기를 코딩하는 오픈 리딩 프레임을 포함하며, 이로부터 유추된 아미노산 서열은 서열번호: 2와 같다. 또한 유추된 단백질의 분자량은 약 8 kDa이었다.
얻어진 GIG6전장 cDNA 클론을 원핵생물 발현용 벡터 pBAD/thio-Topo 벡터 (Invitrogen, USA)의 다중-클로닝 부위 내에 삽입한 후, 생성된 pBAD/thio-Topo/GIG6 벡터를 대장균 Top10 (Invitrogen, USA)에 형질감염시켰다.  pBAD/thio-Topo 벡터의 다중-클로닝 부위의 앞부위에는 발현 단백질들인 HT-Thioredoxin 이 삽입되어 있다.  형질감염된 대장균을 LB 브로쓰에서 진탕 배양한 후, 이를 1/100로 희석시켜 다시 3시간 동안 배양하였다.  여기에 0.5 mM의 엘 아라비노즈 (L-Arabinose, Sigma)를 첨가하여 단백질 생산을 유도하였다. 엘 아라비노즈 유도 전후의 배양액 중의 대장균 세포를 초음파 분쇄한 후, 12% 나트륨 도데실설페이트-폴리아크릴아미드 겔에서 전기영동하였다 (SDS-PAGE). 도 2는 pBAD/thio-Topo/GIG6 벡터로 형질감염된 대장균 Top10 균주의 단백질의 발현 양상을 SDS-PAGE로 확인한 결과로서, 엘 아라비노즈 유도 후에 약 23 kDa의 융합 단백질 밴드가 뚜렷하게 관찰되었다. 이 23 kDa 융합단백질은 pBAD/thio-Topo/GIG6 벡터에 삽입되어 있는 약 15 kDa 크기의 HT-thioredoxin 단백질과 약 8 kDa의 GIG6 단백질을 함유하고 있는 것이다.
도 2는 GIG6 단백질의 SDS-PAGE 분석 결과를 나타내는 사진이다. 도 2에서 제1열은 엘아라비노즈 에 의한 유도 전의 단백질 시료이고, 제2열은 엘 아라비노즈에 의해 GIG6 유전자의 발현을 유도한 후의 단백질 시료이다
실시예 3: GIG6 유전자의 노던 블랏
GIG6 유전자의 발현 수준을 조사하기 위해, 노던 블랏을 다음과 같이 실시하였다.
실시예 1에서 얻은 정상 자궁경부 조직 시료 3개, 원발성 자궁경부암 조직 시료 3개 및 자궁경부암 세포주 시료 2개의 총 RNA 20 ㎍을 각각 변성시킨 후 1% 포름알데히드 아가로스 겔에 전기영동한 다음 나일론 막(Boehringer-Mannheim, Germany)에 전이시켰다.  이어서 나일론 막을, 실시예 1에서 얻은 GIG6 전장 cDNA를 사용한 32P-표지 무작위 프라임 프로브와 42 ℃에서 하룻밤 동안 하이브리드화시켰다.  노던 블랏 과정을 동일하게 2회 반복하여 하나는 덴시토미터로 정량하였으며, 다른 하나는 β-액틴 프로브와 하이브리드화시켜 mRNA 총량을 확인하였다. 
도 3a는 정상 자궁경부 조직, 원발성 자궁경부암 조직 및 자궁경부암 세포주에서 GIG6 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 3b는 β-액틴의 발현을 보여주는 노던 블랏 결과이다.  도 3a 및 3b에서, 제1열 내지 제3열은 정상 자궁경부 조직 시료이며, 제4열 내지 제6열은 자궁경부암 조직 시료이고, 제7열은 자궁경부암 세포주 HeLa 시료이며, 제8열은 자궁경부암 세포주 CUMC-6 시료이다.  도 3a 및 3b에서 보듯이, GIG6 유전자의 발현 수준은 정상 자궁경부 조직 시료 3개 모두에서 높게 나타났으며, 자궁경부암 조직 시료 3개에서는 그 발현 정도가 정상 조직에 비하여 매우 낮았고, 자궁경부암 세포주 시료 2개에서는 나타나지 않았다. 
도 4a는 여러 정상 조직에서 GIG6 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이며 도 4b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 하이브리드화한 노던 블랏 결과이다. 도 4a에서 보듯이 심장 및 간들에서 약 2.4 kb의 우점(dominant) GIG6 mRNA 전사물이 과발현되었다.
도 5a는 여러 암세포주들에서 GIG6 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 5b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 하이브리드화한 노던 블랏 결과이다. 도 5a에서 보듯이, 전 골수성 백혈병 HL-60, HeLa 자궁경부암 세포, 만성 골수성 백혈병 세포주 K-562, 림프아세포 백혈병 MOLT-4, 버킷 림프종 라지, SW480 결장암 세포, A549 폐암 세포 및 G361 흑색종 세포주에서는 GIG6 유전자의 발현은 전혀 나타나지 않았다. 이러한 결과로부터 본 발명의 GIG6 유전자는 정상 자궁경부, 심장, 및 간들에서 종양 억제자(tumor suppresser) 기능을 가짐을 알 수 있다.
실시예 4: 발현 벡터의 제작 및 형질 감염
GIG6 유전자의 코딩 영역을 포함하는 발현 벡터를 다음과 같이 제작하였다. 먼저 실시예 2에서 얻은 GIG6 전장 cDNA 클론을 진핵생물 발현용 벡터 pcDNA3.1 (Invitrogen, 미국) 부위에 삽입하여 발현 벡터 pcDNA3.1/GIG6을 얻었다. 이 발현 벡터를 리포펙타민(lipofectamine, Gibco BRL)을 사용하여 HeLa 자궁경부암 세포주(ATCC CCL-2)에 형질감염시킨 후 0.6 ㎎/㎖의 G418(Gibco)이 포함된 DMEM 배지 중에서 배양하여 형질감염된 세포를 선별하였다. 이때 대조군으로는 GIG6 cDNA가 포함되지 않은 발현 벡터 pcDNA3.1로 형질감염된 HeLa 세포를 사용하였다.
실시예 5: GIG6 유전자로 형질감염된 자궁암 세포의 성장 곡선
GIG6 유전자가 자궁경부암 세포의 성장에 미치는 영향을 조사하기 위해,  1 x 105개의 정상 HeLa 세포, 실시예 4에서 얻은 GIG6 유전자로 형질감염된 HeLa 자궁 경부암 세포 및 pCDNA3.1(Invitrogen)으로 형질감염된 HeLa 세포를 각각 RPMI 배지에서 9일 동안 배양하였다.  각 배양액에서 플라스크에 부착된 세포를 트립신(Sigma) 처리하여 유리시킨 후 생존한 세포를 트립판 블루 염색 배제법(trypan blue dye exclustion, Freshney, I.R., Culture of Animal Cells, 2nd Ed. A.R. Liss, New York (1987))에 따라 1일, 3일, 5일, 7일 및 9일째에 계수하였다.
도 6은 정상 HeLa 세포, 실시예 4에서 얻은 GIG6 유전자로 형질감염된 HeLa 자궁경부암 세포 및 pCDNA3.1으로 형질감염된 HeLa 세포의 성장 곡선이다.  도 6에서 보듯이, GIG6 유전자로 형질감염된 HeLa 자궁경부암 세포의 사멸률은 pCDNA3.1으로 형질감염된 HeLa 세포 및 정상 HeLa 세포의 경우보다 높게 나타났다.  배양 후 9일째에는 정상 HeLa 세포와 비교할 때 GIG6로 형질감염된 HeLa 자궁경부암 세포의 50%만이 생존하였다.  이러한 결과로부터, GIG6 유전자는 자궁경부암 세포의 성장을 억제함을 알 수 있다. 
실시예 6: 간 조직 총 RNA 의 분리 및 mRNA 감별 전개
정상 간 조직, 원발성 간암 조직 및 간암 세포주에서 유전자 발현의 차별 패턴을 다음과 같이 조사하였다.
간암 환자로부터 조직 생검(biopsy) 중에 정상 간 및 간암 조직 시료를 얻었으며, 인간 간암 세포주로는 HepG2 (American Type Culture Collection; ATCC Number HB-8065) 간암세포주를 사용하였다. 이들 조직 및 세포로부터 각각 참조예의 방법과 동일하게 실시하여 총 RNA를 분리하였다.
각 조직 및 세포의 총 RNA 시료를 사용하여 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머 및 서열번호: 11의 5‘13mer 임의 프라이머인 H-AP8(RNAimage primer set 1, GenHunter Corporation, 미국)을 사용한 점을 제외하고는 실시예 1의 방법과 동일하게 RT-PCR을 수행하였다. 증폭된 단편을 6 % 폴리아크릴아미드 염기서열 겔에서 전기영동시킨 후 오토래디오 그래피하였다.
도 7은 서열번호: 11의 5’13mer 임의 프라이머 H-AP8과 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머를 사용한 PCR 결과이다. 도 7에서 제1, 제2, 제3열은 정상 간 조직이며, 제 4, 제5, 제6열은 간암 조직이고, 제7열은 간암 세포주 HepG2이다. 도 7에서 보듯이, 간암 조직과 간암 세포주에서는 발현이 약하거나 거의 발현이 되지 않고 정상 간 조직에서만 차별적으로 발현된 356 bp cDNA 단편이 확인되었다 (GIG27 전장 유전자서열의 2132bp에서부터 2487bp 까지 임). 이 cDNA 단편을 HP116로 명명하였다.
건조된 겔로부터 HP116 단편인 356 bp 밴드를 잘라내고 15 분 동안 끓여 cDNA를 용출시킨 후, [α-35S]-표지된 dATP 및 20 μM dNTP를 사용하지 않는 상태에서 상기와 동일한 프라이머 쌍을 사용하여 동일한 조건하에서 PCR을 수행하여 재증폭시켰다. 재증폭된 cDNA 단편 HP116를 클로닝 시스템(TA cloning system, Promega)을 사용하여 발현 벡터 pGEM-T Easy에 클로닝하였으며, 염기서열 결정 키트(Sequenase Version 2.0 DNA Sequencing System, United States Biochemical Co.)를 사용하여 염기서열을 결정하였다. cDNA 단편 HP116은 서열번호: 15의 염기서열을 나타내었다.
실시예 7: cDNA 라이브러리 스크리닝
실시예 6에서 얻은 cDNA 단편 HP116을 실시예 2의 방법과 유사하게 플라크 혼성화시켜, 인간 암 억제 유전자 GIG27의 전장 cDNA 클론을 얻었다.
이 전장 cDNA의 염기서열을 결정하였으며, 그 결과는 서열번호: 3과 같았다. 이 염기서열은 719 개 아미노산 잔기를 코딩하는 오픈 리딩 프레임을 포함하며, 이로부터 유추된 아미노산 서열은 서열번호: 4와 같다. 또한 유추된 단백질의 분자량은 약 81 kDa이었다. 얻어진 GIG27 전장 cDNA 클론을 원핵생물 발현용 벡터 pBAD/Thio-Topo (Invitrogen, USA)에 삽입한 후 대장균 DH5α에 형질전환시켰으며, 얻어진 형질전환체를 대장균 DH5α/GIG27/pBAD/Thio-Topo로 명명하였다.
형질전환된 대장균을 LB 브로쓰에서 배양한 후 1mM의 이소프로필-β-D-티오갈락토피라노사이드(IPTG)를 배양액에 첨가하여 37℃에서 3 시간 동안 반응시킴으로써 GIG27 유전자를 발현시켰다. 이 배양액으로부터 문헌(Sambrook, J. et al., Molecular Cloning : A Laboratory mannual , New York: Cold Spring Harbor Laboratory (1989))의 방법에 따라 단백질 시료를 얻어 SDS-PAGE를 실시하였다.
도 8은 GIG27 단백질의 SDS-PAGE 분석 결과를 보여주는 사진이다. 도 8에서 제1열은 IPTG에 의한 유도 전의 단백질 시료이고, 제2열은 IPTG에 의해 GIG27 유전자의 발현을 유도한 후의 단백질 시료이다. 도 8에서 보듯이, 발현된 GIG27 단백질의 크기는 약 81 kDa으로서 이는 염기서열로부터 유추된 것과 일치한다.
실시예 3: GIG27 유전자의 노던 블랏
GIG27 유전자의 발현 수준을 조사하기 위해, 노던 블랏을 다음과 같이 실시 하였다.
실시예 6에서 얻은 정상 간 조직 시료 3개, 원발성 간암 조직 시료 3개 및 간암 세포주 HepG2의 총 RNA 20 ㎍씩을 각각 변성시킨 후 1% 포름알데히드 아가로스 겔에 전기영동한 다음 나일론 막(Boehringer-Mannheim, Germany)에 전이시켰다. 이어서 나일론 막을, 레디프라임 II(Rediprime II) 무작위 프라임 표지 시스템(Amersham, 영국)을 사용하여 GIG27 전장 cDNA로부터 제조한 32P-표지 무작위 프라임 프로브와 42℃에서 하룻밤 동안 혼성화시켰다. 노던 블랏 과정을 동일하게 2회 반복하여 하나는 덴시토미터로 정량하였으며, 다른 하나는 β-액틴 프로브와 하이브리드화시켜 mRNA 총량을 확인하였다.
도 9a는 정상 간조직, 원발성 간암 조직 및 간암 세포주에서 GIG27 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 9b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 하이브리드화한 노던 블랏 결과이다. 도 9a 및 9b에서 보듯이, GIG27 유전자의 발현 수준은 정상 간 조직 시료 3개 모두에서 높게 나타났으며, 간암 조직 시료 3개에서는 그 발현 정도가 정상 조직에 비하여 매우 낮았고, 간암 세포주 시료 1개에서는 나타나지 않았다.
정상 인간 다중 조직(Clontech)과 인간 암 세포주(Clontech)에 대해 노던 블랏을 수행하였다. 즉, 정상 조직으로는 정상 뇌, 심장, 골격근, 결장, 흉선, 비장, 신장, 간, 소장, 태반, 폐 및 말초 혈액 백혈구 조직과, 암 세포주로서는 전 골수성 백혈병 HL-60, HeLa 자궁경부암 세포, 만성 골수성 백혈병 세포주 K-562, 림프아세포 백혈병 MOLT-4, 버킷 림프종 Raji, SW480 결장암 세포, A549 폐암 세포 및 G361 흑색종 세포들로부터 추출된 총 RNA 시료가 전이된 블랏(blot)들을 클론테크사(Clontech, 미국)로부터 구입하여 동일한 방법으로 혼성화하여 노던 블랏을 실시하였다.
도 10a는 여러 정상 조직에서 GIG27 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이며 도 10b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 하이브리드화한 노던 블랏 결과이다. 도 10a에서 보듯이 간 조직에서 약 5.0 kb의 우점(dominant) GIG27 mRNA 전사물이 과발현되었다. 또한 동시에 약 2.0 kb의 GIG27 mRNA 전사물도 발현되었다.
도 11a는 여러 암세포주들에서 GIG27 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 11b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 하이브리드화한 노던 블랏 결과이다. 도 11a에서 보듯이, 전 골수성 백혈병 HL-60, HeLa 자궁경부암 세포, 만성 골수성 백혈병 세포주 K-562, 림프아세포 백혈병 MOLT-4, 버킷 림프종 라지, SW480 결장암 세포, A549 폐암 세포 및 G361 흑색종 세포주에서는 GIG27 유전자가 전혀 발현되지 않았다. 이러한 결과로부터 본 발명의 GIG27 유전자는 정상 간조직에서 종양 억제자(tumor suppresser) 기능을 가짐을 알 수 있다. 동시에 백혈병, 자궁암, 악성림프종, 대장암, 폐암 및 피부암등에서도 발현이 억제되어 종양 형성을 유도하는 것으로 보아 종양 억제자(tumor suppresser) 기능을 가짐을 알 수 있다.
실시예 9: 발현 벡터의 제작 및 형질 감염
GIG27 유전자의 코딩 영역을 포함하는 발현 벡터를 다음과 같이 제작하였다. 먼저 실시예 7에서 얻은 GIG27 전장 cDNA 클론을 진핵생물 발현용 벡터 pcDNA3.1 (Invitrogen, 미국) 부위에 삽입하여 발현 벡터 pcDNA3.1/GIG27를 얻었다. 이 발현 벡터를 리포펙타민(lipofectamine, Gibco BRL)을 사용하여 HepG2 간암 세포주에 형질감염시킨 후 0.6 ㎎/㎖의 G418(Gibco)이 포함된 DMEM 배지 중에서 배양하여 형질감염된 세포를 선별하였다. 이때 대조군으로는 GIG27 cDNA가 포함되지 않은 발현 벡터 pcDNA3.1로 형질감염된 HepG2 세포를 사용하였다.
실시예 10: GIG27 유전자로 형질감염된 간암 세포의 성장 곡선
GIG27 유전자가 간암 세포의 성장에 미치는 영향을 조사하기 위해, 1 x 105개의 야생형 HepG2 세포, 실시예 9에서 얻은 벡터 pcDNA3.1/GIG27로 형질감염된 HepG2 간암 세포 및 벡터 pcDNA3.1로만 형질감염시킨 HepG2 세포를 각각 DMEM 배지에서 9일 동안 배양하였다. 각 배양액에서 플라스크에 부착된 세포를 트립신(Sigma) 처리하여 유리시킨 후 생존한 세포를 트립판 블루 염색 배제법(trypan blue dye exclusion, Freshney, I.R., Culture of Animal Cells, 2nd Ed. A.R. Liss, New York (1987))에 따라 1일, 3일, 5일, 7일 및 9일째에 계수하였다.
도 12는 야생형 HepG2 세포, 실시예 9에서 얻은 벡터 pcDNA3.1/GIG27로 형질감염된 HepG2 간암 세포 및 벡터 pcDNA3.1로만 형질감염시킨 HepG2 세포의 성장 곡선이다. 도 12에서 보듯이, 벡터 pcDNA3.1/GIG27로 형질감염된 HepG2 간암 세포의 사멸률은 벡터 pcDNA3.1으로 형질감염된 HepG2 세포 및 야생형 HepG2 세포의 경우 보다 높게 나타났다. 배양 후 9일째에는 야생형 HepG2 세포와 비교할 때 벡터 pcDNA3.1/GIG27로 형질감염된 HepG2 간암 세포의 약 60%만이 생존하였다. 이러한 결과로부터, GIG27 유전자는 간암 세포의 성장을 억제함을 알 수 있다.
실시예 11: 유방조직 총 RNA 의 분리 및 mRNA 감별 전개
정상 유방 조직, 원발성 유방암 조직 및 유방암 세포주에서 유전자 발현의 차별 패턴을 다음과 같이 조사하였다.
유방암 환자로부터 유방적출술(mastectomy) 중에 정상 유방 조직 시료를 얻었으며, 수술적 처치전에 방사선 또는 항암 치료를 받지 않은 환자의 근치 유방절제술(radical mastectomy) 중에 원발성 유방 암조직 시료를 얻었다. 인간 유방암 세포주로는 MCF-7 (American Type Culture Collection; ATCC Number HTB-22) 유방암세포주를 사용하였다. 이들 조직 및 세포로부터 각각 참조예의 방법과 동일하게 실시하여 총 RNA를 분리하였다.
각 조직 및 세포의 총 RNA 시료를 사용하여 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머 및 서열번호: 12의 5' 13mer 임의 프라이머인 H-AP29(RNAimage primer set 1, GenHunter Corporation, 미국)를 사용한 점을 제외하고는 실시예 1의 방법과 동일하게 PCR을 수행하였다. 증폭된 단편을 6 % 폴리아크릴아미드 염기서열 겔에서 전기영동시킨 후 오토래디오 그래피하였다.
도 13은 서열번호: 12의 5' 13mer 임의 프라이머 H-AP29와 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머를 사용한 PCR 결과이다. 도 13에서 제1, 제2, 제3열은 정상 유방 조직이며, 제 4, 제5, 제6열은 유방암 조직이고, 제7열은 유방암 세포주 MCF-7이다. 도 13에서 보듯이, 유방암 조직 및 유방암 세포주에서는 발현되지 않고 정상 유방 조직에서만 차별적으로 발현된 534 bp cDNA 단편이 확인되었다 (GIG37 전장 유전자서열의 1755bp에서부터 2288bp 까지 임). 이 cDNA 단편을 FC17로 명명하였다.
건조된 겔로부터 FC17 단편인 534 bp 밴드를 잘라내고 15 분 동안 끓여 cDNA를 용출시킨 후, [α-35S]-표지된 dATP 및 20 μM dNTP를 사용하지 않는 상태에서 상기와 동일한 프라이머 쌍을 사용하여 동일한 조건하에서 PCR을 수행하여 재증폭시켰다. 재증폭된 cDNA 단편 FC17을 클로닝 시스템(TA cloning system, Promega)을 사용하여 발현 벡터 pGEM-T Easy에 클로닝하였으며, 염기서열 결정 키트(Sequenase Version 2.0 DNA Sequencing System, United States Biochemical Co.)를 사용하여 염기서열을 결정하였다. cDNA 단편 FC17은 서열번호: 16의 염기서열을 나타내었다.
서열번호: 16의 염기서열을 BLAST 및 FASTA 프로그램을 이용하여 미국 국립보건원의 진뱅크(NIH GenBank) 데이터베이스에서 검색한 결과, 이 데이터베이스에 등록된 제 NM_021117 호인 Homo sapiens cryptochrome 2 (photolyase-like) (CRY2)와는 서열이 유사한 유전자이다.
실시예 12: cDNA 라이브러리 스크리닝
실시예 11에서 얻은 cDNA 단편 FC17 를 문헌(Feinberg, A.P. and Vogelstein, B., Anal . Biochem ., 132, 6-13 (1983))의 방법에 따라 표지하여 32P- 표지된 FC17 cDNA 프로브를 얻고, 이를 박테리오파지 λgt11 인간 폐 배 섬유아세포(human lung embryonic fibroblast) cDNA 라이브러리(Miki, T. et al., Gene, 83, 137-146 (1989))와 문헌(Sambrook, J. et al., Molecular Cloning: A Laboratory mannual , New York: Cold Spring Harbor Laboratory (1989))의 방법에 따라 플라크 하이브리드화시켜, 인간 암 억제 유전자 GIG37의 전장 cDNA 클론을 얻었다.
이 전장 cDNA의 염기서열을 결정하였으며, 그 결과는 서열번호: 5와 같았다. 이 염기서열은 593 개 아미노산 잔기를 코딩하는 오픈 리딩 프레임을 포함하며, 이로부터 유추된 아미노산 서열은 서열번호: 6과 같다. 또한 유추된 단백질의 분자량은 약 67 kDa이었다.
얻어진 GIG37 전장 cDNA 클론을 원핵생물 발현용 벡터 pBAD/Thio-Topo (Invitrogen, USA)에 삽입한 후 대장균 DH5α에 형질전환시켰으며, 얻어진 형질전환체를 대장균 DH5α/GIG37/pBAD/Thio-Topo로 명명하였다.
형질전환된 대장균을 LB 브로쓰에서 배양한 후 1mM의 이소프로필-β-D-티오갈락토피라노사이드(IPTG)를 배양액에 첨가하여 37℃에서 3 시간 동안 반응시킴으로써 GIG37 유전자를 발현시켰다. 이 배양액으로부터 문헌(Sambrook, J. et al., Molecular Cloning : A Laboratory mannual , New York: Cold Spring Harbor Laboratory (1989))의 방법에 따라 단백질 시료를 얻어 SDS-PAGE를 실시하였다.
도 14는 GIG37 단백질의 SDS-PAGE 분석 결과를 보여주는 사진이다. 도 14에서 제1열은 IPTG에 의한 유도 전의 단백질 시료이고, 제2열은 IPTG에 의해 GIG37 유전자의 발현을 유도한 후의 단백질 시료이다. 도 14에서 보듯이, 발현된 GIG37 단백질의 크기는 약 67 kDa으로서 이는 염기서열로부터 유추된 것과 일치한다.
실시예 13: GIG37 유전자의 노던 블랏
GIG37 유전자의 발현 수준을 조사하기 위해, 노던 블랏을 다음과 같이 실시하였다.
실시예 11에서 얻은 정상 유방 조직 시료 3개, 원발성 유방암 조직 시료 3개 및 유방암 세포주 MCF-7의 총 RNA 20 ㎍씩을 각각 변성시킨 후 1% 포름알데히드 아가로스 겔에 전기영동한 다음 나일론 막(Boehringer-Mannheim, Germany)에 전이시켰다. 이어서 나일론 막을, 레디프라임 II(Rediprime II) 무작위 프라임 표지 시스템(Amersham, 영국)을 사용하여 GIG37 전장 cDNA로부터 제조한 32P-표지 무작위 프라임 프로브와 42℃에서 하룻밤 동안 혼성화시켰다. 노던 블랏 과정을 동일하게 2회 반복하여 하나는 덴시토미터로 정량하였으며, 다른 하나는 β-액틴 프로브와 혼성화시켜 mRNA 총량을 확인하였다.
도 15a는 정상 유방 조직, 원발성 유방암 조직 및 유방암 세포주에서 GIG37 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 15b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다. 도 15a 및 15b에서 보듯이, GIG37 유전자의 발현 수준은 정상 유방 조직 시료 3개 모두에서 높게 나타났으며, 유방암 조직 시료 3개에서는 그 발현 정도가 정상 조직에 비하여 매우 낮았고, 유방암 세포주 시료 1개에서는 나타나지 않았다.
정상 인간 다중 조직(Clontech)과 인간 암 세포주(Clontech)에 대해 노던 블랏을 수행하였다. 즉, 정상 조직으로는 정상 뇌, 심장, 골격근, 결장, 흉선, 비장, 신장, 간, 소장, 태반, 폐 및 말초 혈액 백혈구 조직과, 암 세포주로서는 전 골수성 백혈병 HL-60, HeLa 자궁경부암 세포, 만성 골수성 백혈병 세포주 K-562, 림프아세포 백혈병 MOLT-4, 버킷 림프종 Raji, SW480 결장암 세포, A549 폐암 세포 및 G361 흑색종 세포들로부터 추출된 총 RNA 시료가 전이된 블랏(blot)들을 클론테크사(Clontech, 미국)로부터 구입하여 동일한 방법으로 혼성화하여 노던 블랏을 실시하였다.
도 16a는 여러 정상 조직에서 GIG37 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이며 도 16b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다. 도 16a에서 보듯이 심장, 골격근, 및 간 조직에서 약 1.5 kb의 우점(dominant) GIG37 mRNA 전사물이 과발현되었으며 동시에 약 4.5 kb의 GIG37 mRNA 전사물도 발현되었다.
도 17a는 여러 암세포주들에서 GIG37 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 17b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다. 도 17a에서 보듯이, 전 골수성 백혈병 HL-60, HeLa 자궁경부암 세포, 만성 골수성 백혈병 세포주 K-562, 림프아세포 백혈병 MOLT-4, 버킷 림프종 라지, SW480 결장암 세포, A549 폐암 세포 및 G361 흑색종 세포주에서는 GIG37 유전자가 발현되지 않았다. 이러한 결과로부터 본 발명의 GIG37 유전자는 정상 유방, 심장, 골격근, 간 조직에서 종양 억제자(tumor suppresser) 기능을 가짐을 알 수 있다.
실시예 14: 발현 벡터의 제작 및 형질 감염
GIG37 유전자의 코딩 영역을 포함하는 발현 벡터를 다음과 같이 제작하였다. 먼저 실시예 12에서 얻은 GIG37 전장 cDNA 클론을 진핵생물 발현용 벡터 pcDNA3.1 (Invitrogen, 미국) 부위에 삽입하여 발현 벡터 pcDNA3.1/GIG37을 얻었다. 이 발현 벡터를 리포펙타민(lipofectamine, Gibco BRL)을 사용하여 MCF-7 유방암 세포주에 형질감염시킨 후 0.6 ㎎/㎖의 G418(Gibco)이 포함된 DMEM 배지 중에서 배양하여 형질감염된 세포를 선별하였다. 이때 대조군으로는 GIG37 cDNA가 포함되지 않은 발현 벡터 pcDNA3.1로 형질감염된 MCF-7 세포를 사용하였다.
실시예 15: GIG37 유전자로 형질감염된 유방암 세포의 성장 곡선
GIG37 유전자가 유방암 세포의 성장에 미치는 영향을 조사하기 위해, 1 x 105개의 야생형 MCF-7 세포, 실시예 4에서 얻은 벡터 pcDNA3.1/GIG37으로 형질감염된 MCF-7 유방암 세포 및 벡터 pcDNA3.1로만 형질감염시킨 MCF-7 세포를 각각 DMEM 배지에서 9일 동안 배양하였다. 각 배양액에서 플라스크에 부착된 세포를 트립신(Sigma) 처리하여 유리시킨 후 생존한 세포를 트립판 블루 염색 배제법(trypan blue dye exclusion, Freshney, I.R., Culture of Animal Cells, 2nd Ed. A.R. Liss, New York (1987))에 따라 1일, 3일, 5일, 7일 및 9일째에 계수하였다.
도 18은 야생형 MCF-7 세포, 실시예 14에서 얻은 벡터 pcDNA3.1/GIG37으로 형질감염된 MCF-7 유방암 세포 및 벡터 pcDNA3.1로만 형질감염시킨 MCF-7 세포의 성장 곡선이다. 도 18에서 보듯이, 벡터 pcDNA3.1/GIG37로 형질감염된 MCF-7 유방 암 세포의 사멸률은 벡터 pcDNA3.1으로 형질감염된 MCF-7 세포 및 야생형 MCF-7 세포의 경우보다 높게 나타났다. 배양 후 9일째에는 야생형 MCF-7 세포와 비교할 때 벡터 pcDNA3.1/GIG37으로 형질감염된 MCF-7 유방암 세포의 50%만이 생존하였다. 이러한 결과로부터, GIG37 유전자는 유방암 세포의 성장을 억제함을 알 수 있다.
실시예 16: 총 RNA 의 분리 및 mRNA 감별 전개
실시예 11과 동일한 방법으로 정상 유방 조직, 원발성 유방암 조직 및 유방암 세포주에서 시료를 얻었다.
각 조직 및 세포의 총 RNA 시료를 사용하여, 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머 및, 서열번호: 13의 5' 13mer 임의 프라이머인 H-AP32(RNAimage primer set 1, GenHunter Corporation, 미국)를 사용한 것을 제외하고는 실시예 11과 동일한 방법으로 RT-PCR을 수행하였다. 증폭된 단편을 6 % 폴리아크릴아미드 염기서열 겔에서 전기영동시킨 후 오토래디오 그래피하였다.
도 19는 서열번호: 13의 5' 13mer 임의 프라이머 H-AP32와 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머를 사용한 PCR 결과이다. 도 19에서 제1, 제2, 제3열은 정상 유방 조직이며, 제 4, 제5, 제6열은 유방암 조직이고, 제7열은 유방암 세포주 MCF-7이다. 도 19에서 보듯이, 유방암 조직 및 유방암 세포주에서는 발현되지 않고 정상 유방 조직에서만 차별적으로 발현된 325 bp cDNA 단편이 확인되었다 (GIG45 전장 유전자서열의 1612bp에서부터 1936bp 까지 임). 이 cDNA 단편을 FC89으로 명명하였다.
건조된 겔로부터 FC89 단편인 325 bp 밴드를 잘라내고 15 분 동안 끓여 cDNA 를 용출시킨 후, [α-35S]-표지된 dATP 및 20 μM dNTP를 사용하지 않는 상태에서 상기와 동일한 프라이머 쌍을 사용하여 동일한 조건하에서 PCR을 수행하여 재증폭시켰다. 재증폭된 cDNA 단편 FC89을 클로닝 시스템(TA cloning system, Promega)을 사용하여 발현 벡터 pGEM-T Easy에 클로닝하였으며, 염기서열 결정 키트(Sequenase Version 2.0 DNA Sequencing System, United States Biochemical Co.)를 사용하여 염기서열을 결정하였다. cDNA 단편 FC89는 서열번호: 17의 염기서열을 나타내었다.
서열번호: 17의 염기서열을 BLAST 및 FASTA 프로그램을 이용하여 미국 국립보건원의 진뱅크(NIH GenBank) 데이터베이스에서 검색한 결과, 이 데이터베이스에 등록된 제 NM_019105호인 Homo sapiens tenascin XB (TNXB), transcript variant XB 유전자와 유전자 서열이 유사한 유전자이며, 이유전자의 기능은 아직 암과 관련하여 밝혀져 있지 않다.
실시예 17: cDNA 라이브러리 스크리닝
실시예 16에서 얻은 cDNA 단편 FC89을 실시예 12와 유사한 방법을 사용하여 표지하여 32P-표지된 FC89 cDNA 프로브를 얻고, 실시예 12에서와 유사하게, 인간 암 억제 유전자 GIG45의 전장 cDNA 클론을 얻었다.
이 전장 cDNA의 염기서열을 결정하였으며, 그 결과는 서열번호: 7과 같았다. 이 염기서열은 535 개 아미노산 잔기를 코딩하는 오픈 리딩 프레임을 포함하며, 이로부터 유추된 아미노산 서열은 서열번호: 8와 같다. 또한 유추된 단백질의 분자량 은 약 59 kDa이었다.
얻어진 GIG45전장 cDNA 클론을 원핵생물 발현용 벡터 pBAD/Thio-Topo (Invitrogen, USA)에 삽입한 후 대장균 DH5α에 형질전환시켰으며, 얻어진 형질전환체를 대장균 DH5α/GIG45/pBAD/Thio-Topo로 명명하였다.
형질전환된 대장균을 LB 브로쓰에서 배양한 후 1mM의 이소프로필-β-D-티오갈락토피라노사이드(IPTG)를 배양액에 첨가하여 37℃에서 3 시간 동안 반응시킴으로써 GIG45 유전자를 발현시켰다. 이 배양액으로부터 문헌(Sambrook, J. et al., Molecular Cloning : A Laboratory mannual , New York: Cold Spring Harbor Laboratory (1989))의 방법에 따라 단백질 시료를 얻어 SDS-PAGE를 실시하였다.
도 20은 GIG45 단백질의 SDS-PAGE 분석 결과를 보여주는 사진이다. 도 20에서 제1열은 IPTG에 의한 유도 전의 단백질 시료이고, 제2열은 IPTG에 의해 GIG45 유전자의 발현을 유도한 후의 단백질 시료이다. 도 20에서 보듯이, 발현된 GIG45 단백질의 크기는 약 59 kDa으로서 이는 염기서열로부터 유추된 것과 일치한다.
실시예 18: GIG45 유전자의 노던 블랏
GIG45 유전자의 발현 수준을 조사하기 위해, 노던 블랏을 다음과 같이 실시하였다.
실시예 16에서 얻은 정상 유방 조직 시료 3개, 원발성 유방암 조직 시료 3개 및 유방암 세포주 MCF-7의 총 RNA 20 ㎍씩을 각각 변성시킨 후 1% 포름알데히드 아가로스 겔에 전기영동한 다음 나일론 막(Boehringer-Mannheim, Germany)에 전이시켰다. 이어서 나일론 막을, 레디프라임 II(Rediprime II) 무작위 프라임 표지 시 스템(Amersham, 영국)을 사용하여 GIG45 전장 cDNA의 부분서열인 FC89 cDNA로부터 제조한 32P-표지 무작위 프라임 프로브와 42℃에서 하룻밤 동안 혼성화시켰다. 노던 블랏 과정을 동일하게 2회 반복하여 하나는 덴시토미터로 정량하였으며, 다른 하나는 β-액틴 프로브와 혼성화시켜 mRNA 총량을 확인하였다.
도 21a는 정상 유방 조직, 원발성 유방암 조직 및 유방암 세포주에서 GIG45 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 21b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 하이브리드화한 노던 블랏 결과이다. 도 21a 및 21b에서 보듯이, GIG45 유전자의 발현 수준은 정상 유방 조직 시료 3개 모두에서 높게 나타났으며, 유방암 조직 시료 3개에서는 그 발현 정도가 정상 조직에 비하여 매우 낮았고, 유방암 세포주 시료 1개에서는 나타나지 않았다.
정상 인간 다중 조직(Clontech)과 인간 암 세포주(Clontech)에 대해 노던 블랏을 수행하였다. 즉, 정상 조직으로는 정상 뇌, 심장, 골격근, 결장, 흉선, 비장, 신장, 간, 소장, 태반, 폐 및 말초 혈액 백혈구 조직과, 암 세포주로서는 전 골수성 백혈병 HL-60, HeLa 자궁경부암 세포, 만성 골수성 백혈병 세포주 K-562, 림프아세포 백혈병 MOLT-4, 버킷 림프종 Raji, SW480 결장암 세포, A549 폐암 세포 및 G361 흑색종 세포들로부터 추출된 총 RNA 시료가 전이된 블랏(blot)들을 클론테크사(Clontech, 미국)로부터 구입하여 동일한 방법으로 혼성화하여 노던 블랏을 실시하였다.
도 22a는 여러 정상 조직에서 GIG45 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노 던 블랏 결과이며 도 22b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다. 도 22a에서 보듯이 간에서 약 2.2 kb의 우점(dominant) GIG12 mRNA 전사물이 과발현되었다.
도 23a는 여러 암세포주들에서 GIG45 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 23b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 하이브리드화한 노던 블랏 결과이다. 도 23a에서 보듯이, 전 골수성 백혈병 HL-60, HeLa 자궁경부암 세포, 만성 골수성 백혈병 세포주 K-562, 림프아세포 백혈병 MOLT-4, 버킷 림프종 라지, SW480 결장암 세포, A549 폐암 세포 및 G361 흑색종 세포주에서는 GIG45 유전자가 발현되지 않았다. 이러한 결과로부터 본 발명의 GIG45 유전자는 정상 유방, 간에서 종양 억제자(tumor suppresser) 기능을 가짐을 알 수 있다.
실시예 19: 발현 벡터의 제작 및 형질 감염
GIG45 유전자의 코딩 영역을 포함하는 발현 벡터를 다음과 같이 제작하였다. 먼저 실시예 17에서 얻은 GIG45 전장 cDNA 클론을 진핵생물 발현용 벡터 pcDNA3.1 (Invitrogen, 미국) 부위에 삽입하여 발현 벡터 pcDNA3.1/GIG45를 얻었다. 이 발현 벡터를 리포펙타민(lipofectamine, Gibco BRL)을 사용하여 MCF-7 유방암 세포주에 형질감염시킨 후 0.6 ㎎/㎖의 G418(Gibco)이 포함된 DMEM 배지 중에서 배양하여 형질감염된 세포를 선별하였다. 이때 대조군으로는 GIG45 cDNA가 포함되지 않은 발현 벡터 pcDNA3.1로 형질감염된 MCF-7 세포를 사용하였다.
실시예 20: GIG45 유전자로 형질감염된 유방암 세포의 성장 곡선
GIG45 유전자가 유방암 세포의 성장에 미치는 영향을 조사하기 위해, 1 x 105개의 야생형 MCF-7 세포, 실시예 19에서 얻은 벡터 pcDNA3.1/GIG45로 형질감염된 MCF-7 유방암 세포 및 벡터 pcDNA3.1로만 형질감염시킨 MCF-7 세포를 각각 DMEM 배지에서 9일 동안 배양하였다. 각 배양액에서 플라스크에 부착된 세포를 트립신(Sigma) 처리하여 유리시킨 후 생존한 세포를 트립판 블루 염색 배제법(trypan blue dye exclusion, Freshney, I.R., Culture of Animal Cells, 2nd Ed. A.R. Liss, New York (1987))에 따라 1일, 3일, 5일, 7일 및 9일째에 계수하였다.
도 24는 야생형 MCF-7 세포, 실시예 19에서 얻은 벡터 pcDNA3.1/GIG45로 형질감염된 MCF-7 유방암 세포 및 벡터 pcDNA3.1로만 형질감염시킨 MCF-7 세포의 성장 곡선이다. 도 24에서 보듯이, 벡터 pcDNA3.1/GIG45로 형질감염된 MCF-7 유방암 세포의 사멸률은 벡터 pcDNA3.1으로 형질감염된 MCF-7 세포 및 야생형 MCF-7 세포의 경우보다 높게 나타났다. 배양 후 9일째에는 야생형 MCF-7 세포와 비교할 때 벡터 pcDNA3.1/GIG45로 형질감염된 MCF-7 유방암 세포의 50%만이 생존하였다. 이러한 결과로부터, GIG45 유전자는 유방암 세포의 성장을 억제함을 알 수 있다.
도 1은 서열번호: 9의 5' 13mer 임의 프라이머 H-AP38과 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머를 사용한 PCR 결과를 보여주는 겔 사진이다.
도 2는 본 발명의 GIG6 유전자 산물의 SDS-PAGE 분석 결과를 보여주는 사진이다.
도 3a는 정상 자궁경부 조직, 원발성 자궁암 조직 및 자궁암 세포주에서 GIG6 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 3b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 4a는 여러 정상 조직에서 GIG6 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이며, 도 4b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 5a는 여러 암세포주들에서 GIG6 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 5b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 6은 야생형 HeLa 세포, 본 발명의 GIG6 유전자로 형질감염된 HeLa 자궁암 세포 및 발현 벡터 pcDNA3.1로 형질감염된 HeLa 세포의 성장 곡선이다.
도 7은 서열번호: 11의 5' 13mer 임의 프라이머 H-AP8과 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머를 사용한 PCR 결과를 보여주는 겔 사진이다.
도 8은 본 발명의 GIG27 유전자 산물의 SDS-PAGE 분석 결과를 보여주는 사진이다.
도 9a는 정상 간 조직, 원발성 간암 조직 및 간암 세포주에서 GIG27 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 9b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 10a는 여러 정상 조직에서 GIG27 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이며, 도 10b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 11a는 여러 암세포주들에서 GIG27 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 11b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 12는 야생형 HepG2 간암세포주, 본 발명의 GIG27 유전자로 형질감염된 HepG2 간암 세포 및 발현 벡터 pcDNA3.1로 형질감염된 HepG2 세포의 성장 곡선이다.
도 13은 서열번호: 12의 5' 13mer 임의 프라이머 H-AP29와 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머를 사용한 PCR 결과를 보여주는 겔 사진이다.
도 14는 본 발명의 GIG37 유전자 산물의 SDS-PAGE 분석 결과를 보여주는 사진이다.
도 15a는 정상 유방 조직, 원발성 유방암 조직 및 유방암 세포주에서 GIG37 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 15b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 16a는 여러 정상 조직에서 GIG37 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노 던 블랏 결과이며, 도 16b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 17a는 여러 암세포주들에서 GIG37 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 17b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 18은 야생형 MCF-7 세포, 본 발명의 GIG37 유전자로 형질감염된 MCF-7 유방암 세포 및 발현 벡터 pcDNA3.1로 형질감염된 MCF-7 세포의 성장 곡선이다.
도 19는 서열번호: 13의 5' 13mer 임의 프라이머 H-AP32와 서열번호: 10의 고정 올리고-dT 프라이머를 사용한 PCR 결과를 보여주는 겔 사진이다.
도 20은 본 발명의 GIG45 유전자 산물의 SDS-PAGE 분석 결과를 보여주는 사진이다.
도 21a는 정상 유방 조직, 원발성 유방암 조직 및 유방암 세포주에서 GIG45 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 21b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 22a는 여러 정상 조직에서 GIG45 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이며, 도 22b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 23a는 여러 암세포주들에서 GIG45 유전자의 차별 발현 수준을 나타내는 노던 블랏 결과이고, 도 23b는 동일 블랏을 β-액틴 프로브로 혼성화한 노던 블랏 결과이다.
도 24는 야생형 MCF-7 세포, 본 발명의 GIG45 유전자로 형질감염된 MCF-7 유방암 세포 및 발현 벡터 pcDNA3.1로 형질감염된 MCF-7 세포의 성장 곡선이다.
<110> KIM, Hyun-Kee <120> HUMAN CANCER SUPPRESSOR GENE, PROTEIN ENCODED THEREIN, EXPRESSION VECTOR CONTAINING SAME, AND CELL TRANSFORMED BY SAID VECTOR <160> 17 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 2820 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (2386)..(2595) <400> 1 aatattggca gctgagaggt aatcatacat gagatcttag atcaggaagg ggaacatgag 60 acaaaatata tatcactagc tggaaagaga tgtatccttc agtaagctcc tcacgaaaat 120 acctacatca tttgtgttgg ggatgtaggt atagaggctg atataatgat acataaatta 180 ctctagaaaa aatagcccaa aagattgatg agaatgacca gtattacaaa gactaacaat 240 taagataatt ttatactaaa gaatgacaac tcagtgggac agagtagttc agaaacagat 300 gcaaatactc acggaaatta aaagatgata aagatctttt gaagtaatga aatgaaaaat 360 aatttaataa atgacattag taccatggac aagctatttg gggggaaatg ataaaaatgg 420 atgccaacct tgctttttaa ataaaaataa attctgaaat gagcatattt taatgcaata 480 agaaggaata atcacaagac agaatttgat gccttaaata atagtaatac tcatttttac 540 atggagaacg gtctgagtat gacataaaac tcaggatcta tgaaagcata aacattattt 600 gaaaaaagag caactataaa 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Ala Ile Met Lys Met Ala Lys Glu Ala Gly Val Glu 130 135 140 gta gtg acg gag aat tct cat acc ctc tat gac ctg gac agg atc att 482 Val Val Thr Glu Asn Ser His Thr Leu Tyr Asp Leu Asp Arg Ile Ile 145 150 155 gag ctg aat ggg cag aag cca ccc ctt aca tac aag cgc ttt cag gcc 530 Glu Leu Asn Gly Gln Lys Pro Pro Leu Thr Tyr Lys Arg Phe Gln Ala 160 165 170 atc atc agc cgc atg gag ctg ccc aag aag cca gtg ggc ttg gtg acc 578 Ile Ile Ser Arg Met Glu Leu Pro Lys Lys Pro Val Gly Leu Val Thr 175 180 185 190 agc cag cag atg gag agc tgc agg gcc gag atc cag gag aac cac gac 626 Ser Gln Gln Met Glu Ser Cys Arg Ala Glu Ile Gln Glu Asn His Asp 195 200 205 gag acc tac ggc gtg ccc tcc ctg gag gag ctg ggg ttc ccc act gaa 674 Glu Thr Tyr Gly Val Pro Ser Leu Glu Glu Leu Gly Phe Pro Thr Glu 210 215 220 gga ctt ggt cca gct gtc tgg cag gga gga gag aca gaa gct ctg gcc 722 Gly Leu Gly Pro Ala Val Trp Gln Gly Gly Glu Thr Glu Ala Leu Ala 225 230 235 cgc ctg gat aag cac ttg gaa cgg aag gcc tgg gtt gcc aac tat gag 770 Arg Leu Asp Lys His Leu Glu Arg Lys Ala Trp Val Ala Asn Tyr Glu 240 245 250 aga ccc cga atg aac gcc aac tcc ctc ctg gcc agc ccc aca ggc ctc 818 Arg Pro Arg Met Asn Ala Asn Ser Leu Leu Ala Ser Pro Thr Gly Leu 255 260 265 270 agc ccc tac ctg cgc ttt ggt tgt ctc tcc tgc cgc ctc ttc tac tac 866 Ser Pro Tyr Leu Arg Phe Gly Cys Leu Ser Cys Arg Leu Phe Tyr Tyr 275 280 285 cgc ctg tgg gac ctg tat aaa aag gtg aag cgg aac agc aca cct ccc 914 Arg Leu Trp Asp Leu Tyr Lys Lys Val Lys Arg Asn Ser Thr Pro Pro 290 295 300 ctc tcc cta ttt ggg caa ctc cta tgg cga gag ttc ttc tac acg gca 962 Leu Ser Leu Phe Gly Gln Leu Leu Trp Arg Glu Phe Phe Tyr Thr Ala 305 310 315 gct acc aac aac ccc agg ttt gac cgc atg gag ggg aac ccc atc tgc 1010 Ala Thr Asn Asn Pro Arg Phe Asp Arg Met Glu Gly Asn Pro Ile Cys 320 325 330 atc cag atc ccc tgg gac cgc aat cct gag gcc ctg gcc aag tgg gct 1058 Ile Gln Ile Pro Trp Asp Arg Asn Pro Glu Ala Leu Ala Lys Trp Ala 335 340 345 350 gag ggc aag aca ggc ttc cct tgg att gat gcc atc atg acc caa ctg 1106 Glu Gly Lys Thr Gly Phe Pro Trp Ile Asp Ala Ile Met Thr Gln Leu 355 360 365 agg cag gag ggc tgg atc cac cac ctg gcc cgg cat gcc gtg gcc tgc 1154 Arg Gln Glu Gly Trp Ile His His Leu Ala Arg His Ala Val Ala Cys 370 375 380 ttc ctg acc cgc ggg gac ctc tgg gtc agc tgg gag agc ggg gtc cgg 1202 Phe Leu Thr Arg Gly Asp Leu Trp Val Ser Trp Glu Ser Gly Val Arg 385 390 395 gta ttt gat gag ctg ctc ctg gat gca gat ttc agc gtg aac gca ggc 1250 Val Phe Asp Glu Leu Leu Leu Asp Ala Asp Phe Ser Val Asn Ala Gly 400 405 410 agc tgg atg tgg ctg tcc tgc agt gct ttc ttc cag cag ttc ttc cac 1298 Ser Trp Met Trp Leu Ser Cys Ser Ala Phe Phe Gln Gln Phe Phe His 415 420 425 430 tgc tac tgc cct gtg ggc ttt ggc cgt cgc acg gac ccc agt ggg gac 1346 Cys Tyr Cys Pro Val Gly Phe Gly Arg Arg Thr Asp Pro Ser Gly Asp 435 440 445 tac atc agg cga tac ctg ccc aaa ttg aaa gcg ttc ccc tct cga tac 1394 Tyr Ile Arg Arg Tyr Leu Pro Lys Leu Lys Ala Phe Pro Ser Arg Tyr 450 455 460 atc tat gag ccc tgg aat gcc cca gag tca att cag aag gca gcc aag 1442 Ile Tyr Glu Pro Trp Asn Ala Pro Glu Ser Ile Gln Lys Ala Ala Lys 465 470 475 tgc atc att ggt gtg gac tac cca cgg ccc atc gtc aac cat gcc gag 1490 Cys Ile Ile Gly Val Asp Tyr Pro Arg Pro Ile Val Asn His Ala Glu 480 485 490 acc agc cgg ctt aac att gaa cga atg aag cag att tac cag cag ctt 1538 Thr Ser Arg Leu Asn Ile Glu Arg Met Lys Gln Ile Tyr Gln Gln Leu 495 500 505 510 tcg cgc tac cgg gga ctc tgt cta ctg gca tct gtc cct tcc tgt gtg 1586 Ser Arg Tyr Arg Gly Leu Cys Leu Leu Ala Ser Val Pro Ser Cys Val 515 520 525 gaa gac ctc agt cac cct gtg gca gag ccc agc tcg agc cag gct ggc 1634 Glu Asp Leu Ser His Pro Val Ala Glu Pro Ser Ser Ser Gln Ala Gly 530 535 540 agc atg agc agt gca ggc cca aga cca cta ccc agt ggc cca gca tcc 1682 Ser Met Ser Ser Ala Gly Pro Arg Pro Leu Pro Ser Gly Pro Ala Ser 545 550 555 ccc aaa cgc aag ctg gaa gca gcc gag gaa cca cct ggt gaa gaa ctc 1730 Pro Lys Arg Lys Leu Glu Ala Ala Glu Glu Pro Pro Gly Glu Glu Leu 560 565 570 agc aaa cgg 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gctgagggca ccacagggct ggctcctgct ggtcagacct cagaggagtc 120 aaggccccgc ctgtcccagc tgtctgtgac tgacgtgacc accagttcac tgaggctcaa 180 ctgggaggcc ccaccggggg ccttcgactc cttcctgctc cgctttgggg ttccatcacc 240 aagcactctg gagccgcatc cgcgtccact gctgcagcgc gagctg atg gtg ccg 295 Met Val Pro 1 ggg acg cgg cac tcg gcc gtg ctc cgg gac ctg cgt tcc ggg act ctg 343 Gly Thr Arg His Ser Ala Val Leu Arg Asp Leu Arg Ser Gly Thr Leu 5 10 15 tac agc ctg aca ctg tat ggg ctg cga gga ccc cac aag gcc gac agc 391 Tyr Ser Leu Thr Leu Tyr Gly Leu Arg Gly Pro His Lys Ala Asp Ser 20 25 30 35 atc cag gga acc gcc cgc acc ctc agc cca gtt ctg gag agc ccc cgt 439 Ile Gln Gly Thr Ala Arg Thr Leu Ser Pro Val Leu Glu Ser Pro Arg 40 45 50 gac ctc caa ttc agt gaa atc agg gag acc tca gcc aag gtc aac tgg 487 Asp Leu Gln Phe Ser Glu Ile Arg Glu Thr Ser Ala Lys Val Asn Trp 55 60 65 atg ccc cca cca tcc cgg gcg gac agc ttc aaa gtc tcc tac cag ctg 535 Met Pro Pro Pro Ser Arg Ala Asp Ser Phe Lys Val Ser Tyr Gln Leu 70 75 80 gcg gac gga 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ctc cac acc aac tac acc gcc aca gtg cgt ggc ctg cgg ggc ccc aac 919 Leu His Thr Asn Tyr Thr Ala Thr Val Arg Gly Leu Arg Gly Pro Asn 200 205 210 ctc act tcc cca gcc agc atc acc ttc acc aca ggg cta gag gcc cct 967 Leu Thr Ser Pro Ala Ser Ile Thr Phe Thr Thr Gly Leu Glu Ala Pro 215 220 225 cgg gac ttg gag gcc aag gaa gtg acc ccc cgc acc gcc ctg ctc act 1015 Arg Asp Leu Glu Ala Lys Glu Val Thr Pro Arg Thr Ala Leu Leu Thr 230 235 240 tgg act gag ccc cca gtc cgg ccc gca ggc tac ctg ctc agc ttc cac 1063 Trp Thr Glu Pro Pro Val Arg Pro Ala Gly Tyr Leu Leu Ser Phe His 245 250 255 acc cct ggt gga cag aac cag gag atc ctg ctc cca gga ggg atc aca 1111 Thr Pro Gly Gly Gln Asn Gln Glu Ile Leu Leu Pro Gly Gly Ile Thr 260 265 270 275 tct cac cag ctc ctt ggc ctc ttt ccc tcc acc tcc tac aat gca cgg 1159 Ser His Gln Leu Leu Gly Leu Phe Pro Ser Thr Ser Tyr Asn Ala Arg 280 285 290 ctc cag gcc atg tgg ggc cag agc ctc ctg ccg ccc gtg tcc acc tct 1207 Leu Gln Ala Met Trp Gly Gln Ser Leu Leu Pro Pro Val Ser Thr 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Arg Ala Gly Asp Glu Ala 405 410 415 gtg ttc gcc cag tac gac tcc ttc cac gta gac tcg gct gcg gag tac 1591 Val Phe Ala Gln Tyr Asp Ser Phe His Val Asp Ser Ala Ala Glu Tyr 420 425 430 435 tac cgc ctc cac ttg gag ggc tac cac ggc acc gca ggg gac tcc atg 1639 Tyr Arg Leu His Leu Glu Gly Tyr His Gly Thr Ala Gly Asp Ser Met 440 445 450 agc tac cac agc ggc agt gtc ttc tct gcc cgt gat cgg gac ccc aac 1687 Ser Tyr His Ser Gly Ser Val Phe Ser Ala Arg Asp Arg Asp Pro Asn 455 460 465 agc ttg ctc atc tcc tgc gct gtc tcc tac cga ggg gcc tgg tgg tac 1735 Ser Leu Leu Ile Ser Cys Ala Val Ser Tyr Arg Gly Ala Trp Trp Tyr 470 475 480 agg aac tgc cac tac gcc aac ctc aac ggg ctc tac ggg agc aca gtg 1783 Arg Asn Cys His Tyr Ala Asn Leu Asn Gly Leu Tyr Gly Ser Thr Val 485 490 495 gac cat cag gga gtg agc tgg tac cac tgg aag ggc ttc gag ttc tcg 1831 Asp His Gln Gly Val Ser Trp Tyr His Trp Lys Gly Phe Glu Phe Ser 500 505 510 515 gtg ccc ttc acg gaa atg aag ctg aga cca aga aac ttt cgc tcc cca 1879 Val Pro Phe Thr Glu Met Lys Leu Arg Pro Arg Asn Phe Arg Ser Pro 520 525 530 gcg ggg gga ggc tgagctgct gcccacctct ctcgcacccc agtatgactg 1930 Ala Gly Gly Gly 535 ccgagcactg aggggtcgcc ccgagagaag agccagggtc cttcaccacc cagccgctgg 1990 aggaagcctt ctctgccagc 2010 <210> 8 <211> 535 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 8 Met Val Pro Gly Thr Arg His Ser Ala Val Leu Arg Asp Leu Arg Ser 1 5 10 15 Gly Thr Leu Tyr Ser Leu Thr Leu Tyr Gly Leu Arg Gly Pro His Lys 20 25 30 Ala Asp Ser Ile Gln Gly Thr Ala Arg Thr Leu Ser Pro Val Leu Glu 35 40 45 Ser Pro Arg Asp Leu Gln Phe Ser Glu Ile Arg Glu Thr Ser Ala Lys 50 55 60 Val Asn Trp Met Pro Pro Pro Ser Arg Ala Asp Ser Phe Lys Val Ser 65 70 75 80 Tyr Gln Leu Ala Asp Gly Gly Glu Pro Gln Ser Val Gln Val Asp Gly 85 90 95 Gln Ala Arg Thr Gln Lys Leu Gln Gly Leu Ile Pro Gly Ala Arg Tyr 100 105 110 Glu Val Thr Val Val Ser Val Arg Gly Phe Glu Glu Ser Glu Pro Leu 115 120 125 Thr Gly Phe Leu Thr Thr Val Pro Asp Gly Pro Thr Gln Leu Arg Ala 130 135 140 Leu Asn Leu Thr Glu Gly Phe Ala Val Leu His Trp Lys Pro Pro Gln 145 150 155 160 Asn Pro Val Asp Thr Tyr Asp Val Gln Val Thr Ala Pro Gly Ala Pro 165 170 175 Pro Leu Gln Ala Glu Thr Pro Gly Ser Ala Val Asp Tyr Pro Leu His 180 185 190 Asp Leu Val Leu His Thr Asn Tyr Thr Ala Thr Val Arg Gly Leu Arg 195 200 205 Gly Pro Asn Leu Thr Ser Pro Ala Ser Ile Thr Phe Thr Thr Gly Leu 210 215 220 Glu Ala Pro Arg Asp Leu Glu Ala Lys Glu Val Thr Pro Arg Thr Ala 225 230 235 240 Leu Leu Thr Trp Thr Glu Pro Pro Val Arg Pro Ala Gly Tyr Leu Leu 245 250 255 Ser Phe His Thr Pro Gly Gly Gln Asn Gln Glu Ile Leu Leu Pro Gly 260 265 270 Gly Ile Thr Ser His Gln Leu Leu Gly Leu Phe Pro Ser Thr Ser Tyr 275 280 285 Asn Ala Arg Leu Gln Ala Met Trp Gly Gln Ser Leu Leu Pro Pro Val 290 295 300 Ser Thr Ser Phe Thr Thr Gly Gly Leu Arg Ile Pro Phe Pro Arg Asp 305 310 315 320 Cys Gly Glu Glu Met Gln Asn Gly Ala Gly Ala Ser Arg Thr Ser Thr 325 330 335 Ile Phe Leu Asn Gly Asn Arg Glu Arg Pro Leu Asn Val Phe Cys Asp 340 345 350 Met Glu Thr Asp Gly Gly Gly Trp Leu Val Phe Gln Arg Arg Met Asp 355 360 365 Gly Gln Thr Asp Phe Trp Arg Asp Trp Glu Asp Tyr Ala His Gly Phe 370 375 380 Gly Asn Ile Ser Gly Glu Phe Trp Leu Gly Asn Glu Ala Leu His Ser 385 390 395 400 Leu Thr Gln Ala Gly Asp Tyr Ser Met Arg Val Asp Leu Arg Ala Gly 405 410 415 Asp Glu Ala Val Phe Ala Gln Tyr Asp Ser Phe His Val Asp Ser Ala 420 425 430 Ala Glu Tyr Tyr Arg Leu His Leu Glu Gly Tyr His Gly Thr Ala Gly 435 440 445 Asp Ser Met Ser Tyr His Ser Gly Ser Val Phe Ser Ala Arg Asp Arg 450 455 460 Asp Pro Asn Ser Leu Leu Ile Ser Cys Ala Val Ser Tyr Arg Gly Ala 465 470 475 480 Trp Trp Tyr Arg Asn Cys His Tyr Ala Asn Leu Asn Gly Leu Tyr Gly 485 490 495 Ser Thr Val Asp His Gln Gly Val Ser Trp Tyr His Trp Lys Gly Phe 500 505 510 Glu Phe Ser Val Pro Phe Thr Glu Met Lys Leu Arg Pro Arg Asn Phe 515 520 525 Arg Ser Pro Ala Gly Gly Gly 530 535 <210> 9 <211> 13 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 9 aagcttccag tgc 13 <210> 10 <211> 16 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> anchored oligo-dT primer <400> 10 aagctttttt tttttg 16 <210> 11 <211> 13 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer H-AP8 <400> 11 aagcttttac cgc 13 <210> 12 <211> 13 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer H-AP29 <400> 12 aagcttagca gca 13 <210> 13 <211> 13 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer H-AP32 <400> 13 aagcttcctg caa 13 <210> 14 <211> 315 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 14 cttgtagatt ttttttattt gtcaagtgct tatatagcac ttggctataa atgctattgt 60 cccaggcatt gtctcaagag ctttacaaat attaactcag tagtctccta ccaactttct 120 gctgcaggtt ggcactgcta tcattcccat tttacagatg aggaaactga gctaccaaga 180 gtttgagtaa cttgtcataa gtcacacagt taggaagagg tgacactctt caaccagtac 240 tctaagttac actacctcac agatagtaac ttcattcatg cttctgtcat taattttagt 300 gctattttta tacca 315 <210> 15 <211> 217 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 15 caggggagtc attcccagga atttatgatg ctctgtttga tattgaaagc aaagtggacc 60 cttccaaggc ctggggagaa gtgaagagac agatttatgt tgcagccttc acagtgcagg 120 cagctgcaga gactttgagt gaagtagcct aagaggattc tttagagaat ccgtattgaa 180 tttgtgtggt atgtcactca gaaagaatcg taatggg 217 <210> 16 <211> 534 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 16 ttgccaaccc cagagctgcc gagcaaggat gcctgagact gcagagccct tgctccgtga 60 gcaaagcctg ggtgcccaag cagccaccgc agcagcagag tacaacctgc agagaagctg 120 atcaccgggc agagatagag cgagcatgtg tgtgtgtgtg cgcgtgtgca gaggagggag 180 tggtgtgcct gtttgtgtgt gcatgcatct gttgacactc atgattctga atgttgcctg 240 ggctggggga gtacctgtag cacgccagtg ctgtttcccg gcctccagac acaaggctcg 300 aggttatggc agtgactttc agctgagacc tgttcctgca agccagctgc cttgtctgaa 360 cagaacgtag tggtaggacc ctagctggga ttctggcatc tgcctcccta gacctccttc 420 cctccctcct cacgtcaggc tgtggagcag gagcacagca gttctggctg ttgtccaaag 480 catgggattc tggaggcagc cagagccctg ctgagttcct gctttctgac ctgg 534 <210> 17 <211> 325 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 17 ctaccacggc accgcagggg actccatgag ctaccacagc ggcagtgtct tctctgcccg 60 tgatcgggac cccaacagct tgctcatctc ctgcgctgtc tcctaccgag gggcctggtg 120 gtacaggaac tgccactacg ccaacctcaa cgggctctac gggagcacag tggaccatca 180 gggagtgagc tggtaccact ggaagggctt cgagttctcg gtgcccttca cggaaatgaa 240 gctgagacca agaaactttc gctccccagc ggggggaggc tgagctgctg cccacctctc 300 tcgcacccca gtatgactgc cgagc 325

Claims (9)

  1. 서열번호: 1, 서열번호: 3, 서열번호: 5 및 서열번호: 7로 구성된 군으로부터 선택되는 염기서열을 갖는 인간 암 억제 유전자.
  2. 제 1 항의 유전자에 의해 암호화되는 아미노산 서열을 갖는 인간 암 억제 단백질.
  3. 제 2 항에 있어서, 아미노산 서열은 서열번호: 2, 서열번호: 4, 서열번호: 6 및 서열번호: 8로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 인간 암 억제 단백질.
  4. 제 1 항의 유전자를 포함하는 발현 벡터.
  5. 제 4 항의 벡터로 형질전환된 숙주세포.
  6. 제 5 항에 있어서, 숙주세포는 미생물 또는 동물세포인 것을 특징으로 하는 숙주세포.
  7. 제 1 항에 있어서, 유전자는 서열번호: 1의 염기서열을 가지며, 상기 암은 자궁, 뇌, 심장, 골격근, 비장, 콩팥, 간, 태반, 폐 및 말초백혈구 조직으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 인간 암 억제 유전자.
  8. 제 1 항에 있어서, 유전자는 서열번호: 3의 염기서열을 가지며, 상기 암은 간암, 백혈병, 자궁암, 악성림프종, 대장암, 폐암, 피부암으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 인간 암 억제 유전자.
  9. 제 1 항에 있어서, 유전자는 서열번호: 5 또는 서열번호: 7의 염기서열을 가지며, 상기 암은 유방, 심장, 골격근, 신장, 폐, 대장, 소장, 간, 태반, 흉선 및 비장 조직으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 인간 암 억제 유전자.
KR1020070107905A 2007-10-25 2007-10-25 인간 암 억제 유전자, 이에 의해 코딩되는 단백질, 이를포함하는 발현 벡터 및 이 벡터로 형질전환된 세포 KR20090042036A (ko)

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