KR100915609B1 - 인간 원암유전자 및 이에 의해 코드되는 단백질 - Google Patents
인간 원암유전자 및 이에 의해 코드되는 단백질Info
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Abstract
본 발명은 원암유전자 및 이에 의해 코드되는 단백질에 관한 것으로, 본 발명의 원암유전자는 인간 암발생에 관여하며 자궁암, 백혈병, 악성림프종, 대장암, 폐암 및 피부암 등을 비롯한 암의 진단, 형질전환 동물의 제조, 항암유전자 치료에 효과적으로 이용될 수 있으며 동시에 암전이 (metastasis)를 유발하는 기능을 가지고 있다.
Description
본 발명은 암발생과 암전이 유발능을 나타내는 신규 원암유전자 및 이에 의해 코드되는 단백질에 관한 것이다.
인간을 포함한 고등동물들은 약 30,000개의 유전자들을 갖고 있으나 이들 중 약 15%만이 각각의 개체에서 발현된다. 따라서, 어떠한 유전자가 선택되어 발현되느냐에 따라서 생명의 모든 현상 즉, 발생, 분화, 항상성 (homeostasis), 자극에 대한 반응, 세포분열 주기조절, 노화 및 아폽토시스 (apoptosis; programmed cell death) 등이 결정된다 (Liang, P. and A. B. Pardee, Science 257: 967-971, 1992).
종양발생과 같은 병리학적 현상은 유전자 변이과정으로 유발되어 결국에는 유전자 발현의 변화를 유도하게 된다. 따라서, 상이한 세포들 사이에서 나타나는 유전자 발현들의 비교는 여러 생물학적 현상을 이해하는데 기본적이고 효과적인 접근방법이라고 할 수 있다. 예를 들면, 리앙과 파디 (Liang, P. and A. B. Pardee, Science 257: 967-971, 1992)에 의해 제안된 mRNA 감별전개 (differential display) 방법은 현재 종양억제 유전자나 세포분열 주기 (cell cycle)에 관련된 유전자 및 아폽토시스에 관련된 전사조절 유전자 (transcriptional regulatory gene) 등의 탐색에 효과적으로 이용되고 있으며, 또한 하나의 세포에서 일어나는 다양한 유전자들의 상호 관련성의 규명에도 다양하게 활용되고 있다.
종양발생에 대한 여러 연구결과들을 종합하여 보면 특정 염색체 부위의 소실 (loss of chromosomal heterozygosity), 원암유전자들의 활성화 및 p53 유전자를 포함한 다른 종양억제 유전자들의 불활성화 등과 같은 여러 가지 유전적 변화들이 종양조직에 축적되어 인간종양을 일으킨다고 보고되었다 (Bishop, J. M., Cell 64: 235-248, 1991; Hunter, T., Cell 64: 249-270, 1991). 또한, 암의 10 내지 30%는 원암유전자가 증폭됨으로써 활성화되어 일어난다고 보고되어 있어, 원암유전자의 활성화는 많은 암의 병인학 연구에 중요한 역할을 하며, 이를 밝히는 것이 요구되고 있다.
이에 본 발명자들은 자궁경부암의 발생기전을 원암유전자 수준에서 접근한 결과, 인간 세포 성장 유도 유전자 25 (human proliferation-inducing gene 25; 이하 'PIG25'로 지칭함) 및 인간 세포 성장 유도 유전자 60 (human proliferation-inducing gene 60; 이하 'PIG60'으로 지칭함)으로 명명된 원암유전자가 암세포에서만 특이하게 발현이 증가된다는 것을 밝혀내었다.
또한, 본 발명자들은 간암의 발생기전을 원암 유전자 수준에서 접근한 결과, 인간 세포 증식유도 유전자 61 (proliferation-inducing gene 61; 이하 'PIG61'로 지칭함)로 명명된 원암유전자가 암세포에서만 특이하게 발현이 증가된다는 것을 밝혀내었다. 이들 원암유전자는 자궁암, 백혈병, 림프종, 대장암, 폐암 및 피부암 등과 같은 다양한 암의 진단, 예방 및 치료에 효과적으로 사용될 수 있다.
본 발명의 목적은 신규 원암유전자 및 그의 단편을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 상기 원암유전자 또는 그의 단편을 포함하는 재조합 벡터 및 이에 의해 형질전환된 미생물을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 원암유전자에 의해 코드되는 단백질 및 그의 단편을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 원암유전자 또는 그의 단편을 포함하는 암 진단용 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 단백질 또는 그의 단편을 포함하는 암 진단용 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 원암유전자 또는 그의 단편으로부터 유도되는 mRNA에 상보적인 염기서열을 지닌 안티센스 또는 siRNA 유전자를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 안티센스 또는 siRNA 유전자를 포함하는 항암 및 항전이 조성물을 제공하는 것이다.
상기 목적에 따라, 본 발명에서는 서열번호: 1, 3 및 5로 구성된 군으로부터 선택되는 염기 서열을 갖는 원암유전자 또는 그의 단편을 제공한다.
상기 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 상기 원암유전자 또는 그의 단편을 포함하는 재조합 벡터 및 이에 의해 형질전환된 미생물을 제공한다.
상기 또 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 서열번호: 2, 4 또는 6으로 구성된 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 단백질 또는 그의 단편을 제공한다.
상기 또 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 상기 원암유전자 또는 그의 단편을 포함하는 암 진단용 키트를 제공한다.
상기 또 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 상기 원암단백질 또는 그의 단편을 포함하는 암 진단용 키트를 제공한다.
상기 또 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 상기 원암유전자 또는 그의 단편으로부터 전사되는 mRNA 서열의 전부 또는 일부와 상보적인 염기서열을 지니고, 상기 mRNA에 결합하여 상기 원암유전자 또는 단편의 발현을 억제하는 안티-센스 유전자 또는 siRNA 유전자를 제공한다.
상기 또 다른 목적에 따라, 본 발명에서는 상기 안티-센스 또는 siRNA 유전자를 활성성분으로 포함하는 항암 및 항전이 조성물을 제공한다.
이하 본 발명을 상세히 설명한다.
본 발명의 원암 (原癌) 유전자 (protooncogene)인 인간 세포 성장 유도 유전자 25 (human proliferation-inducing gene 25; PIG25)은 서열번호: 1로 기재되는 1740 bp 길이의 전체 염기서열을 가진다.
서열번호: 1의 염기서열에서, 뉴클레오티드 번호 631 내지 828 부위 (826-828: 종료코돈)에 해당하는 오픈 리딩 프레임 (open reading frame)은 전체 단백질 코딩 영역으로서 이로부터 유도되는 아미노산 서열은 서열번호: 2에 나타나 있으며 65개의 아미노산으로 이루어져 있다 (이후 "PIG25 단백질"로 지칭함).
서열번호: 1의 염기서열은 미국 국립보건원의 진뱅크(NIH GenBank) 데이터베이에 등록번호 제 EU219624 호로 2007년 10월 14일에 등록되었으며(공개예정일: 2008년 11월 1일) 염기서열 분석결과 이 데이터베이스에 등록된 제 NW927719.1 호인 Homo sapiens chromosome 2 genomic contig, alternate assembly (based on Celera assembly) 유전자와 유전자 염기서열이 유사함이 확인되었다. 이유전자는 유전자의 서열만 알려져있고 아직까지 그 기능이 보고된바가 없다. 그러나 금번 연구 결과 자궁암을 포함한 여러 인간 종양들에서는 발현이 높고 반면에 여러 정상조직들에서는 발현이 매우 낮은 PIG25 원암유전자를 발굴하게 되었다.
또한, 본 발명의 원암 (原癌) 유전자 (protooncogene)인 인간 세포 성장 유도 유전자 60 (human proliferation-inducing gene 60; PIG60)은 서열번호: 3으로 기재되는 1889 bp 길이의 전체 염기서열을 가진다.
서열번호: 3의 염기서열에서, 뉴클레오티드 번호 24 내지 1088 부위 (1086-1088: 종료코돈)에 해당하는 오픈 리딩 프레임 (open reading frame)은 전체 단백질 코딩 영역으로서 이로부터 유도되는 아미노산 서열은 서열번호: 4에 나타나 있으며 354개의 아미노산으로 이루어져 있다 (이후 "PIG60 단백질"로 지칭함).
서열번호: 3의 염기서열은 미국 국립보건원의 진뱅크(NIH GenBank) 데이터베이에 등록번호 제 AY947344 호로 등록되었으며(공개예정일: 2007년 10월 30일) 염기서열 분석결과 이 데이터베이스에 등록된 제 NM_014341 호인 Homo sapiens mitochondrial carrier homolog 1 (C. elegans) (MTCH1), nuclear gene encoding mitochondrial protein 유전자와 유전자 염기서열이 유사함이 확인되었다. 이유전자는 분비성 및 막투과성 인간단백질로 알려져있으며 (Clark, H. F. et al., Genome Res., 12, 2265-70 (2003)), 또한 세포사멸유도 미토콘드리아 단백질로도 알려져있다 (Xu, X. et al., J. Biol . Chem., 277, 48913-22 (2002)). 그러나 금번 연구 결과 자궁암을 포함한 여러 인간 종양들에서는 발현이 높고 반면에 여러 정상조직들에서는 발현이 매우 낮은 PIG60 원암유전자를 발굴하게 되었다.
그러나, 코돈의 축퇴성 (degeneracy)으로 인해서 또는 상기 원암유전자를 발현시키고자 하는 생물에서 선호되는 코돈을 고려하여 본 발명의 원암유전자는 코딩영역으로부터 발현되는 발암단백질의 아미노산 서열을 변화시키지 않는 범위 내에서 코딩영역에 다양한 변형이 이루어질 수 있고 코딩영역을 제외한 부분에서도 유전자의 발현에 영향을 미치지 않는 범위 내에서 다양한 변형 또는 수식이 이루어질 수 있으며, 그러한 변형 유전자 역시 본 발명의 범위에 포함된다. 따라서, 본 발명은 상기 서열번호: 1, 3 및 5의 원암유전자와 실질적으로 동일한 염기 서열을 갖는 폴리뉴클레오티드 및 상기 유전자의 단편을 역시 포함한다. 실질적으로 동일한 폴리뉴클레오티드란 서열번호: 2 또는 4 또는 6과 동일한 단백질 번역 생성물을 암호화하는 DNA로서 서열번호: 1 또는 3 또는 5와 80% 이상, 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것들을 의미한다.
본 발명의 원암유전자 PIG25로부터 발현되는 단백질은 65개의 아미노산으로 이루어져 있고 서열번호: 2로 기재되는 아미노산 서열을 가지며 크기는 약 7 kDa이다. 본 발명의 원암유전자 PIG60으로부터 발현되는 단백질은 354개의 아미노산으로 이루어져 있고 서열번호: 2로 기재되는 아미노산 서열을 가지며 크기는 약 38 kDa이다. 또한, 본 발명의 원암 유전자 PIG61로부터 발현되는 단백질은 1210개의 아미노산으로 이루어져 있고 서열번호: 2와 같은 서열을 가지며 크기는 약 134 kDa이다. 그러나, 상기 단백질의 아미노산 서열에서도 역시 단백질의 기능에 영향을 미치지 않는 범위 내에서 아미노산의 치환, 부가 또는 결실이 이루어질 수 있으며, 목적에 따라 단백질의 일부만이 사용될 수도 있다. 그러한 변형된 아미노산 서열 역시 본 발명의 범위에 포함된다. 따라서, 본 발명은 상기 발암 단백질과 실질적으로 동일한 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드 및 그의 단편을 역시 포함하며, 실질적으로 동일한 폴리펩티드란 80% 이상, 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것들을 의미한다.
본 발명의 원암유전자 및 단백질은 사람의 암 조직으로부터 분리하거나, 공지의 DNA 또는 펩타이드 합성 방법에 따라 합성할 수도 있다. 또한, 이렇게 제조된 유전자를 당 분야에 공지된 미생물 발현용 벡터에 삽입하여 발현벡터를 제조한 후 이를 적절한 숙주 세포, 예를 들어, 대장균 또는 효모 세포 등에 도입시킬 수 있다. 이와 같이 형질전환된 숙주를 이용하여 본 발명의 유전자의 DNA를 대량으로 복제하거나 단백질을 대량 생산할 수 있다.
벡터의 제작시에는, 상기 원암유전자 또는 단백질을 생산하고자 하는 숙주 세포의 종류에 따라 프로모터, 터미네이터 등과 같은 발현조절서열, 자가복제서열 및 분비 시그날 등을 적절히 선택하고 조합할 수 있다.
본 발명의 유전자는 노던 블롯 (northern blot) 등의 분석방법에서 정상 자궁경부 조직에서는 발현이 거의 확인되지 않은 반면 자궁경부암 조직, 전이 자궁암조직과 자궁암 세포주들에서는 그 과발현이 확인되므로 자궁암을 유발시키는 강력한 발암 유전자로 판단된다. 자궁경부암과 같은 상피성 조직외에도, 본 발명의 원암유전자는 백혈병, 림프종, 대장암, 폐암 및 피부암 등과 같은 많은 다른 암 종양들에서 높게 발현된다. 따라서, 본 발명의 원암유전자는 다양한 암의 발생에 공통된 발암유전자일 것으로 판단되며, 다양한 암과 암전이의 진단, 형질전환된 동물의 제조, 안티-센스 (anti-sense) 또는 siRNA 유전자 치료 등에 효과적으로 이용될 수 있다.
상기 원암유전자를 이용한 암의 진단 방법은, 예를 들어, 상기 원암유전자의 전부 또는 일부를 프로브로 사용하여 대상자의 체액으로부터 분리한 핵산과 혼성화한 후 당 분야에 공지된 다양한 방법으로 이를 검출하므로써 대상자가 본 발명의 원암유전자를 가지고 있는지를 판단하는 과정을 포함한다. 상기 프로브를 방사선 동위원소 또는 효소 등으로 표지하면 용이하게 유전자의 존재를 확인할 수 있다. 따라서, 본 발명에서는 상기 원암유전자의 전부 또는 일부를 포함하는 암 진단용 키트를 역시 제공한다.
형질전환 동물은 본 발명의 원암유전자를 포유동물, 예를 들어, 래트 등의 설치류 동물에 도입함으로써 제조할 수 있으며, 이 유전자를 적어도 8세포기 이전의 수정란 단계에서 도입하는 것이 바람직하다. 이렇게 제조된 형질전환 동물은 발암성 물질 또는 항산화제와 같은 항암성 물질의 탐색 등에 유용하게 사용될 수 있다.
본 발명은 또한 유전자 치료에 효과적인 안티-센스 유전자를 제공한다. 본원에서, "안티센스 유전자 (anti-sense gene)"는 서열번호: 1, 3 및 5로 구성되는 군으로부터 선택되는 원암유전자 또는 그의 일부로부터 전사되는 mRNA의 일부 또는 전부와 상보적인 서열을 가지는 폴리뉴클레오티드로서, 상기 mRNA의 단백질 결합부위에 결합하여 원암유전자의 오픈 리딩 프레임 (open reading frame; ORF)을 파괴할 수 있는 서열을 갖는 DNA 서열을 환자의 체내로 도입함으로써 상기 원암유전자의 발현으로 인한 암을 예방 또는 치료할 수 있다.
본 발명은 또한 그 범위 내에 본 발명의 안티센스 유전자의 치료 효과량을 환자에게 투여하여 암 또는 암 전이를 치료 또는 예방하는 방법을 포함한다.
본 발명의 안티센스 유전자 치료에서, 본 발명의 안티센스 유전자는 통상적인 방법으로 환자에게 투여되어 원암유전자의 발현을 예방한다. 예를 들면, 문헌 (J. S. Kim et al., J. Controlled Release 53: 175-182, 1998)의 방법에 따라 안티센스 올리고데옥시뉴클레오티드 (ODN)를 폴리-L-리신 유도체와 정전기적 인력에 의하여 혼합시키고, 이 혼합체를 환자에게 정맥투여한다.
본 발명의 범위에는 또한, 약학적으로 허용가능한 담체, 부형제 또는 경우에 따라 다른 첨가제와 함께 본 발명의 안티센스 유전자를 활성성분으로 포함하는 항암조성물을 포함한다. 본 발명의 약학 조성물을 주사제로 제제화하는 것이 바람직하다.
실제로 투여되는 안티센스 유전자의 양은 치료되는 증상, 투여 경로, 환자의 연령 및 체중, 증상의 중증도와 같은 다양한 관련되는 인자를 고려하여 결정한다.
본 발명은 또한 유전자 치료에 효과적인 RNAi 유전자를 제공한다. RNA interference 는 double stranded RNA 가 세포내로 들어갔을 때, 그와 상동 되는 염기 서열을 가진 mRNA 만을 post-transcriptional level에서 분해하는 현상을 말한다. RNA interference는 곤충에서 일어나는 현상을 보고한 이래로 초파리, 생쥐, trypanosome, planaria 등의 몇몇 동물에서 보고 되었고, 식물에서는 genetic silencing 에 관여한다고 보고 되고 있다 (Sharp, P. A. et . al., Genes Dev., 13,139-41 (1999)). 최근에는 포유 동물 에서도 double stranded RNA가 21개 내지는 22개의 작은 크기로 processing 되었을 경우에는 세포내에서 interferon에 의한 protein kinase 활성화를 통해 분해 되는 것을 피함으로서RNA interference가 일어날 수 있음을 알게 하였고, 이에 질병의 발병에 관련된 많은 gene을 silencing 시키는 연구가 활발히 진행되고 있다. (Elbashir, S. M. et . al ., Nature, 411, 494-8 (2001); Elbashir, S. M. et . al ., Genes Dev ., 15, 188-200 (2001) Rosel, K. F. & Georg, S. Nucleic acids Res., 31, 4417-4424 (2003); Judy, L., et al., Trends Mol Med., 9, 397-403 (2003); Michael, B.M., et al., Methods, 30, 287-8 (2003)). 그러나 이러한RNA interference (RNAi) 현상은 포유동물세포에서는 심각한 세포독성 (cytotoxic) 반응을 유발시키는 것으로 알려졌으며 이러한 부작용은short (19-22nt) interfering RNA (siRNA)를 사용할 경우 피할 수 있으며 그 유전자 발현의 억제 작용이 매우 크며 특이적임이 알려져 있다 (Elbashir, S. M. et . al ., Nature, 411, 494-8 (2001); Elbashir, S. M. et. al ., Genes Dev ., 15, 188-200 (2001)).
본 발명의 원암유전자로부터 유도되는 단백질은 진단 도구로서 항체를 생산하는데 유용하게 사용될 수 있다. 본 발명의 항체는, 본 발명의 원암유전자로부터 발현된 서열번호: 2, 4 및 6으로 구성되는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 단백질 또는 그의 단편을 이용하여 당 분야에 공지된 통상의 방법에 따라 모노클로날 항체 또는 폴리클로날 항체로서 제조할 수 있으며, 이러한 항체들을 이용하여 당분야에 공지된 효소 면역측정법 (enzyme linked immunosorbent assay; ELISA), 방사선면역측정법 (radioimmunoassay; RIA), 샌드위치 측정법 (sandwich assay), 폴리아크릴아미드 겔상의 웨스턴 블롯 또는 면역 블롯 등의 방법에 의해 대상자의 체액 시료 중에 상기 단백질이 발현되었는지를 확인함으로써 암을 진단할 수 있다.
또한, 본 발명의 원암유전자를 이용하여 지속적으로 증식할 수 있는 암 세포주를 확립할 수 있으며, 이러한 세포주는 예를 들어, 상기 원암유전자가 형질도입된 섬유모세포를 이용하여 누드 마우스 등에 형성시킨 종양조직으로부터 제조할 수 있다. 이러한 암 세포주는 항암제 등의 탐색에 유용하게 이용될 수 있다.
본 발명의 원암유전자는 인간 암발생에 관여하며 동시에 암전이 (metastasis) 유발능을 나타내는 유전자로서 자궁암, 백혈병, 림프종, 대장암, 폐암 및 피부암 등을 비롯한 암의 진단, 형질전환 동물의 제조, 항암 유전자 치료등에 효과적으로 이용될 수 있다.
도 1은 정상 자궁경부 조직, 자궁경부 종양조직, 전이 임파절 종양조직 및 CUMC-6 암세포에서 CC224bcd DNA 단편의 발현여부를 확인한 감별전개 역전사 중합효소 연쇄반응 (DDRT-PCR)의 결과를 나타낸 것이고,
도 2a는 정상 자궁경부 조직, 자궁암 조직, 자궁경부 전이 임파절조직 및 자궁경부암 세포주들에서 본 발명의 PIG25 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이고,
도 2b는 도 2a와 동일한 샘플들을 β-액틴으로 혼성화시켜 얻은 결과를 나타낸 것이고,
도 3a는 정상 인간 12-열 다중 조직에서 본 발명의 PIG25원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이고,
도 3b는 도 3a와 동일한 샘플을 β-액틴으로 혼성화시켜 얻은 결과를 나타낸 것이고,
도 4a는 인간 암 세포주들에서 본 발명의 PIG25 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이고,
도 4b는 도 4a와 동일한 샘플을 β-액틴으로 혼성화시켜 얻은 결과를 나타낸 것이고,
도 5는 본 발명의 PIG25 원암유전자를 대장균에 형질도입시킨 후 엘 아라비노즈 (L-Arabinose) 유도 이전 및 이후에 발현되는 단백질의 크기를 소디움 도데실 설페이트-폴리아크릴아마이드 겔 (SDS-PAGE)에서 전기영동한 결과이다.
도 6은 정상 자궁경부 조직, 자궁경부 종양조직, 전이 임파절 종양조직 및 CUMC-6 암세포에서 CC212b DNA 단편의 발현여부를 확인한 감별전개 역전사 중합효소 연쇄반응 (DDRT-PCR)의 결과를 나타낸 것이고,
도 7a는 정상 자궁경부 조직, 자궁암 조직, 자궁경부 전이 임파절조직 및 자궁경부암 세포주들에서 본 발명의 PIG60 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이고,
도 7b는 도 7a와 동일한 샘플들을 β-액틴으로 혼성화시켜 얻은 결과를 나타낸 것이고,
도 8a는 정상 인간 12-열 다중 조직에서 본 발명의 PIG60 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이고,
도 8b는 도 8a와 동일한 샘플을 β-액틴으로 혼성화시켜 얻은 결과를 나타낸 것이고,
도 9a는 인간 암 세포주들에서 본 발명의 PIG60 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이고,
도 9b는 도 9a와 동일한 샘플을 β-액틴으로 혼성화시켜 얻은 결과를 나타낸 것이고,
도 10은 본 발명의 PIG60 원암유전자를 대장균에 형질도입시킨 후 엘 아라비노즈 (L-Arabinose) 유도 이전 및 이후에 발현되는 단백질의 크기를 소디움 도데실 설페이트-폴리아크릴아마이드 겔 (SDS-PAGE)에서 전기영동한 결과이다.
도 11은 정상 자궁경부 조직, 자궁경부 종양조직, 전이 임파절 종양조직 및 CUMC-6 암세포에서 CC212b DNA 단편의 발현여부를 확인한 감별전개 역전사 중합효소 연쇄반응 (DDRT-PCR)의 결과를 나타낸 것이고,
도 12a는 정상 자궁경부 조직, 자궁암 조직, 자궁경부 전이 임파절조직 및 자궁경부암 세포주들에서 본 발명의 PIG60 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이고,
도 12b는 도 12a와 동일한 샘플들을 β-액틴으로 혼성화시켜 얻은 결과를 나타낸 것이고,
도 13a는 정상 인간 12-열 다중 조직에서 본 발명의 PIG60 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이고,
도 13b는 도 13a와 동일한 샘플을 β-액틴으로 혼성화시켜 얻은 결과를 나타낸 것이고,
도 14a는 인간 암 세포주들에서 본 발명의 PIG60 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이고,
도 14b는 도 14a와 동일한 샘플을 β-액틴으로 혼성화시켜 얻은 결과를 나타낸 것이고,
도 15는 본 발명의 PIG60 원암유전자를 대장균에 형질도입시킨 후 엘 아라비노즈 (L-Arabinose) 유도 이전 및 이후에 발현되는 단백질의 크기를 소디움 도데실 설페이트-폴리아크릴아마이드 겔 (SDS-PAGE)에서 전기영동한 결과이다.
이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다.
단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.
<실시예 1> 종양세포의 배양 및 총 RNA의 분리
1.
PIG25
및
PIG60
(단계 1) 종양세포의 배양
mRNA의 감별 전개를 위하여, 자궁적출술 (hysterectomy)을 받은 자궁근종 환자로부터 정상자궁경부 (exocervical) 조직, 그리고 이전에 항암요법과 방사선치료를 받지 않은 자궁암 환자로부터 수술시에 원발성 자궁경부 종양조직 및 전이 임파절 종양조직을 취하였다. 감별 전개법에는 인간 자궁경부암 세포주로 CUMC-6 (Kim, J. W. et al., Gynecol. Oncol. 62: 230-240, 1996)을 사용하였다.
상기 수득된 조직 및 CUMC-6 세포주로부터 얻은 세포를 2 mM 글루타민, 100 IU/㎖ 페니실린, 100 ㎍/㎖ 스트렙토마이신 및 10% 우태아 혈청 (Gibco, USA)이 함유된 웨이마우쓰 (Waymouth's) MB 752/1 배양액 (Gibco)에서 증식시켰다. 실험에 사용한 배양 세포들은 지수적 증식 과정의 세포들로서 트리판 블루 (trypan blue) 염색에 의해 95% 이상의 생존도를 보이는 세포를 이용하였다 (Freshney, "Culture of Animal Cells: A Manual of Basic Technique" 2nd Ed., A. R. Liss, New York, 1987).
(단계 2) RNA의 분리 및 mRNA의 감별 전개법
상업적으로 판매되는 시스템인 RNeasy 총 RNA 키트 (Qiagen Inc., 독일)를 사용하여 단계 1에서 얻은 정상 자궁경부 조직, 원발성 자궁경부 종양조직, 전이 임파절 종양조직 및 CUMC-6 세포로부터 총 RNA를 추출하였다. 메시지 클린 키트 (Message clean kit, GenHunter Corp., Brookline, MA)를 사용하여 RNA로부터 DNA 오염원을 제거하였다.
2.
PIG61
(단계 1) 종양세포 배양
mRNA의 감별 전개를 위하여, 간 조직생검 (liver biopsy)을 받은 환자로부터 정상간 조직, 그리고 이전에 항암요법과 방사선치료를 받지않은 간암 환자로부터 조직생검시에 원발성 간 종양조직을 취하였다. 감별 전개법에는 인간 간암 세포주로 HepG2 (American Type Culture Collection) 간암세포주를 사용하였다. 실험에 사용한 배양 세포들은 지수적 증식 도중의 세포들로서 트리판 블루(trypan blue) 염료로 염색할 때 95% 이상의 생존도를 보이는 세포를 이용하였다(프레쉬니(Freshney), "Culture of Animal Cells: A Manual of Basic Technique" 2nd Ed., A. R. Liss, New York(1987) 참조).
(단계 2) RNA의 분리 및 mRNA의 감별 전개법
상업적으로 판매되는 시스템인 RNeasy 총 RNA 키트(Qiagen Inc., 독일)을 사용하여 단계 1에서 얻은 정상 간 조직, 원발성 간암조직, 및 HepG2 세포로부터 총 RNA를 추출하였다. 메시지 클린 키트(Message clean kit)(GenHunter Corp., Brookline, MA)를 사용하여 RNA로부터 DNA 오염원을 제거하였다.
<실시예 2> 감별 전개 역전사 중합효소 연쇄반응 (differential display reverse transcription-PCR)
감별전개 역전사는 상기 리앙과 파디에 의해 기술된 역전사-중합효소 연쇄반응 (RT-PCR)을 약간 변형하여 수행하였다.
1.
PIG25
및
PIG60
먼저, 실시예 1의 단계 1에서 얻은 총 RNA 0.2 ㎍씩에 고정된 올리고-dT 프라이머로서 서열번호: 7로 기재되는 염기서열을 갖는 H-T11C 고정 프라이머 (5‘-AAGCTTTTTTTTTTTC-3', RNAimage kit, Genhunter, Cor., MA, USA)를 사용하여 역전사를 수행하였다.
이어서, 0.5 mM [α-35S] dATP (1200 Ci/mmole) 존재 하에, 동일한 고정 프라이머 및 무작위 5' 11 프라이머 (RNAimage primer sets 1-5) H-AP 1 내지 40 중 서열번호: 8로 기재되는 염기서열을 갖는 H-AP33 프라이머 (5'-AAGCTTGCTGCTC-3')를 사용하여 PCR을 수행하였다. PCR 반응의 조건은 95℃에서 40초 반응 후 40℃에서 2분, 72℃에서 40초를 40회 반응시키며 최종 연장 (final extension)을 위하여 72℃에서 5분간 더 반응시켰다.
PCR로 증폭된 단편을 6% 폴리아크릴아미드 시퀀싱 겔에 용해시킨 후, 방사능 사진을 이용하여 서로 다른 발현 (differentially expressed) 정도를 보이는 밴드의 위치를 확인하였다.
건조된 겔로부터 243 염기쌍 (bp) 크기의 밴드, CC224bcd cDNA (서열번호: 1의 787-1029 bp) 및 411 염기쌍 (bp) 크기의 밴드, CC212b cDNA (서열번호: 3의 778-1188 bp)를 각각 도려내었다. 15분간 가열하여 CC224bcd cDNA 및 CC212b cDNA를 각각 용출시킨 후, [α-35S] 표지된 dATP (1200 Ci/mmole) 및 20 μM dNTP를 사용하지 않는 것을 제외하고는 상기와 동일한 프라이머 및 동일한 조건 하에서 PCR을 수행하여 재증폭시켰다.
2.
PIG61
실시예 1의 단계 1에서 얻은 총 RNA 0.2㎍ 씩에 고정된 올리고-dT 프라이머로서 서열번호 : 7의 H-T11C 고정 프라이머 (5'-AAGCTTTTTTTTTTTC-3')(RNAimage kit, Genhunter, Cor., MA, USA)를 사용하여 역전사를 수행하였다.
이어서, 0.5mM [α-35S] dATP(1200 Ci/mmole) 존재하에, 동일한 고정 프라이머 및 무작위 5‘ 13프라이머(RNAimage primer sets 1-5, H-AP 1-40들중 H-AP23 프라이머(서열번호: 9) (5'-AAGCTTGGCTATG-3')를 사용하여 PCR을 수행하였다. PCR 반응의 조건은 95℃에서 40초 반응 후 40℃에서 2분, 72℃에서 40초를 40회 반응시키며 최종 연장(final extension)을 위하여 72℃에서 5 분간 더 반응시켰다.
PCR-증폭된 단편을 6% 폴리아크릴아미드 시퀀싱 겔에 용해시킨 후, 방사능 사진을 이용하여 서로 다른 발현(differentially expressed) 정도를 보이는 밴드의 위치를 확인하였다.
건조된 겔로부터 332 염기쌍(bp) 크기의 밴드, HP80 cDNA (서열번호: 5의 3364-3695 bp)를 도려내었다. 15분간 가열하여 HP80 cDNA를 용출시킨후, [α-35S] 표지된 dATP(1200 Ci/mmole) 및 20μM dNTP를 사용하지 않는 것을 제외하고는 상기와 동일한 프라이머 및 동일한 조건하에서 PCR을 수행하여 재증폭시켰다.
<실시예 3> 클로닝
상기에서 얻은 재증폭된 CC224bcd, CC212b 및 HP80 PCR 산물을 각각 TA 클로닝 시스템 (Promega, USA)을 사용하여 제조사의 방법에 따라 pGEM-T EASY 벡터에 삽입하였다.
(단계 1) 연결반응
실시예 2에서 얻은 재증폭된 CC224bcd PCR 산물 중 어느 하나 2 ㎕, pGEM-T EASY 벡터 (50 ng) 1 ㎕, T4 DNA 연결효소 10X 완충액 1 ㎕ 및 T4 DNA 연결효소 (3 weiss units/㎕; T4 DNA ligase, Promega) 1 ㎕를 0.5 ㎖ 시험관에 넣은 후, 증류수를 가하여 최종 부피가 10 ㎕가 되도록 하였다. 연결 반응 혼합물은 14℃에서 밤새 배양하였다.
실시예 2에서 얻은 재증폭된 CC212b 및 HP80 PCR 산물에 대하여도 각각 동일하게 수행하였다.
(단계 2) TA 클로닝 형질전환
대장균 JM109 (Promega, WI, USA)를 10 ㎖의 LB 브로쓰 (박토-트립톤 10 g, 박토-효모 추출물 5 g, NaCl 5 g) 중에서 600 ㎚에서의 광학밀도 값이 약 0.3 내지 0.6이 될 때까지 배양하였다. 배양 혼합물을 얼음에 약 10분간 방치한 후, 4℃에서 10분간 4000 rpm으로 원심분리하여 상청액을 버리고 세포를 수집하였다. 수집한 세포 펠릿을 10 ㎖의 빙냉 0.1 M CaCl2에 30분 내지 1시간 가량 노출시켜 컴피턴트 (competent) 세포를 제조하였다. 결과물을 4℃, 4000 rpm에서 10분 동안 다시 원심분리하여 상청액을 버리고 세포를 모아서 2 ㎖의 빙냉 0.1 M CaCl2에 현탁시켰다.
컴피턴트 세포 현탁액 200 ㎕를 새로운 마이크로퓨즈 (microfuge) 튜브에 옮기고, 여기에 단계 1에서 제조한 연결 반응 산물 2 ㎕를 가하였다. 혼합물을 42℃의 수욕 (water bath)에서 90초간 배양시킨 후, 0℃에서 급냉시켰다. 여기에, SOC 배지 (박토-트립톤 2.0 g, 박토-효모 추출물 0.5 g, 1 M NaCl 1 ㎖, 1 M KCl 0.25 ㎖, TDW 97 ㎖, 2 M Mg2+ 1 ㎖, 2 M 글루코스 1 ㎖) 800 ㎕를 첨가하고, 혼합물을 37℃에서 220 rpm의 회전진탕 배양기에서 45분간 배양시켰다.
37℃ 배양기에 미리 넣어둔, 앰피실린이 첨가된 LB 플레이트에 X-gal (40 ㎎/㎖ 디메틸포름아미드에 저장) 25 ㎕를 유리봉으로 확산시킨 후, 여기에 25 ㎕의 형질전환된 세포를 넣어서 다시 유리봉으로 확산시키고 37℃에서 밤새 배양하였다. 배양 후 형성된 백색 콜로니를 3-4개 선택하여 앰피실린이 첨가된 LB 플레이트에 각각의 선택된 클론들을 심었다. 플라스미드를 제조하기 위하여 이들 중 삽입이 확인된 콜로니, 즉, 형질전환된 대장균 JM109/CC224bcd를 선택하여 10 ㎖의 테리픽 브로쓰 (terrific broth; TDW 900 ㎖, 박토-트립톤 12 g, 박토-효모 추출물 24 g, 글리세롤 4 ㎖, 0.17 M KH2PO4, 0.72 N K2HPO4 100 ㎖)에서 배양하였다.
<실시예 4> 재조합 플라스미드 DNA의 분리
위저드 플러스 미니프렙스 DNA 정제 키트 (WizardTM Plus Minipreps DNA Purificatin Kit, Promega, USA)를 사용해서 제조사의 지시에 따라 형질전환된 대장균으로부터 CC224bcd 플라스미드 DNA, CC212b 플라스미드 DNA 및 HP80 플라스미드 DNA를 각각 따로 분리하였다.
분리된 플라스미드 DNA의 일부를 ECoRI 효소로 처리한 후, 2% 겔에서 전기영동을 실시하여 CC224bcd 부분서열이 플라스미드에 삽입되었음을 확인하였다. CC212b 및 HP80의 부분서열이 플라스미드에 삽입되었음을 동일한 방법으로 확인하였다.
<실시예 5> DNA 염기서열 분석
1.
PIG25
실시예 2에서 수득한 CC224bcd PCR 산물을 통상적인 방법에 따라 증폭시킨 후, 클로닝하고 재증폭시킨 CC224bcd PCR 단편을 시쿼나제 버전 2.0 DNA 서열분석 키트 (Sequenase version 2.0 DNA Sequencing kit; United States Biochemical, Cleveland, OH, USA)를 이용하여 디데옥시 쇄 종결법 (dideoxy chain termination)에 따라 서열 분석을 실시하였다.
상기 DNA의 염기 서열은 서열번호: 1의 뉴클레오티드 번호 787 내지 1029에 해당하며, 본 발명에서는 "CC224bcd"로 지칭하였다.
5' 무작위 프라이머 H-AP33 및 3' H-T11C 고정 프라이머를 사용하여 상기에서 수득한 243 bp cDNA 단편, 즉, CC224bcd 를 감별전개 역전사 중합효소 연쇄반응 (DDRT-PCR)시키고, 전기 영동으로 확인하였다.
도 1에 나타낸 바와 같이, 정상 자궁경부 조직, 전이 임파절 조직 및 CUMC-6 세포에서 DD에 의한 유전자 발현이 상이한 것으로 확인되었다. 도 1에서 알 수 있는 바와 같이, 243 bp cDNA 단편인 CC224bcd는 자궁경부암, 전이 임파절 조직 및 CUMC-6 암세포에서는 발현되었으나, 정상 조직에서는 발현이 매우 약하였다.
2.
PIG60
실시예 2에서 수득한 CC212b PCR 산물을 통상적인 방법에 따라 증폭시킨 후, 클로닝하고 재증폭시킨 CC212b PCR 단편을 시쿼나제 버전 2.0 DNA 서열분석 키트 (Sequenase version 2.0 DNA Sequencing kit; United States Biochemical, Cleveland, OH, USA)를 이용하여 디데옥시 쇄 종결법 (dideoxy chain termination)에 따라 서열 분석을 실시하였다.
상기 DNA의 염기 서열은 서열번호: 3의 뉴클레오티드 번호 778 내지 1188에 해당하며, 본 발명에서는 "CC212b"로 지칭하였다.
5' 무작위 프라이머 H-AP33 및 3' H-T11C 고정 프라이머를 사용하여 상기에서 수득한 411 bp cDNA 단편, 즉, CC212b 를 감별전개 역전사 중합효소 연쇄반응 (DDRT-PCR)시키고, 전기 영동으로 확인하였다.
도 6에 나타낸 바와 같이, 정상 자궁경부 조직, 전이 임파절 조직 및 CUMC-6 세포에서 DD에 의한 유전자 발현이 상이한 것으로 확인되었다. 도 6에서 알 수 있는 바와 같이, 441 bp cDNA 단편인 CC212b는 자궁경부암, 전이 임파절 조직 및 CUMC-6 암세포에서는 발현되었으나, 정상 조직에서는 발현이 매우 약하였다.
3.
PIG61
실시예 2에서 수득한 HP80 PCR 산물을 통상적인 방법에 따라 PCR시킨 후, 클로닝되고 재증폭된 HP80 PCR 단편을 시쿼나제 버전 2.0 DNA 서열분석 키트(Sequenase version 2.0 DNA Sequencing kit; United States Biochemical, Cleveland, OH, USA)를 이용하여 디데옥시 쇄 종결법(dideoxy chain termination)에 따라 서열 분석을 실시하였다.
상기 DNA의 염기 서열은 서열번호: 5의 뉴클레오티드 번호 3364 내지 3695에 해당하며, 본원에서 "HP80"으로 지칭하였다.
5' 무작위 프라이머 H-AP23 및 3' H-T11C 고정 프라이머를 사용하여 상기에서 수득한 332 bp cDNA 단편, 즉, HP80을 감별전개 역전사 중합효소 연쇄반응(DDRT-PCR)시키고, 전기 영동으로 확인하였다. 도 11에 나타낸 바와 같이, 정상 간 조직, 간암 조직 및 HepG2 세포에서 DD에 의한 유전자 발현이 상이한 것으로 확인되었다. 도 11에서 알 수 있는 바와 같이, 332 bp cDNA 단편인 HP80은 간암, 및 HepG2 암 세포에서는 발현되었으나, 정상 조직에서는 발현이 매우 약하였다.
<실시예 6> 원암유전자의 전체 cDNA 서열 분석
1.
PIG25
32P-표지된 CC224bcd를 프로브로 사용하여 박테리오파지 λgt11 인간 폐 태아 섬유모세포 cDNA 라이브러리 (Miki, T. et al ., Gene 83: 137-146, 1989)를 스크리닝하였다. 상기 인간 폐 태아 섬유모세포 cDNA 라이브러리로부터 pCEV-LAC 벡터 중에 1740 bp가 삽입된 전체 PIG25 cDNA 클론을 얻고, 이를 2007년 10월 14일자로 등재번호 제EU219624호로 미국 진뱅크 (GeneBank)에 등록하였다 (공개예정일: 2008년 11월 1일).
파지로부터 λpCEV 벡터에 삽입된 PIG25 클론을 NotI 절단에 의해 앰피실린 내성 pCEV-LAC 파지미드 (phagemid) 벡터 형태로 분리하였다 (Miki, T. et al ., Gene 83: 137-146, 1989).
상기 PIG25 유전자를 함유하는 pCEV-LAC 벡터를 T4 DNA 리게이즈로 연결시켜 PIG25 플라스미드 DNA를 제조하고, 연결된 클론으로 대장균 DH5α를 형질전환시켰다.
1740 bp로 이루어진 PIG25의 전체 염기서열은 서열번호: 1에 나타내었다.
서열번호: 1의 염기서열에서, 본 발명의 원암유전자의 전체 오픈 리딩 프레임 (open reading frame)은 뉴클레오티드 번호 631 내지 828에 해당하며, 서열번호: 2의 65개의 아미노산으로 이루어진 단백질을 코드하는 것으로 예측된다.
2.
PIG60
32P-표지된 CC212b를 프로브로 사용하여 박테리오파지 λgt11 인간 폐 태아 섬유모세포 cDNA 라이브러리 (Miki, T. et al., Gene 83: 137-146, 1989)를 스크리닝하였다. 상기 인간 폐 태아 섬유모세포 cDNA 라이브러리로부터 pCEV-LAC 벡터 중에 1889 bp가 삽입된 전체 PIG60 cDNA 클론을 얻고, 이를 2005년 2월 28일자로 등재번호 제AY947344호로 미국 진뱅크 (GeneBank)에 등록하였다 (공개예정일: 2007년 10월 31일).
파지로부터 λpCEV 벡터에 삽입된 PIG60 클론을 NotI 절단에 의해 앰피실린 내성 pCEV-LAC 파지미드 (phagemid) 벡터 형태로 분리하였다 (Miki, T. et al., Gene 83: 137-146, 1989).
상기 PIG60 유전자를 함유하는 pCEV-LAC 벡터를 T4 DNA 리게이즈로 연결시켜 PIG60 플라스미드 DNA를 제조하고, 연결된 클론으로 대장균 DH5α를 형질전환시켰다.
1889 bp로 이루어진 PIG60의 전체 염기서열은 서열번호: 3에 나타내었다.
서열번호: 3의 염기서열에서, 본 발명의 원암유전자의 전체 오픈 리딩 프레임 (open reading frame)은 뉴클레오티드 번호 24 내지 1088에 해당하며, 서열번호: 4의 354개의 아미노산으로 이루어진 단백질을 코드하는 것으로 예측된다.
3.
PIG61
32P-표지된 HP80을 프로브로 사용하여 박테리오파지 λgt11 인간 폐 태아 섬유모세포 cDNA 라이브러리(Miki, T. et al ., Gene , 83: 137-146(1989))를 스크리닝하였다. 상기 인간 폐 태아 섬유모세포 cDNA 라이브러리로부터 pCEV-LAC 벡터 중에 3735 bp가 삽입된 전체 PIG61 cDNA 클론을 얻고, 이를 2005년 6월 8일자로 DQ088980 호로 미국 진뱅크(GeneBank)에 등록하였다(공개예정일: 2007년 10월 30일). DQ088980 유전자는 이 데이터베이스에 등록된 제 NM_005228 호인 Homo sapiens epidermal growth factor receptor (erythroblastic leukemia viral (v-erb-b) oncogene homolog, avian) (EGFR), transcript variant 1 유전자 및 제 NM_201284 호인 Homo sapiens epidermal growth factor receptor (erythroblastic leukemia viral (v-erb-b) oncogene homolog, avian) (EGFR), transcript variant 4 유전자들과는 서열이 유사한 유전자이나 단백질은 일부 유전자이다. 이들 유전자들의 기능은 암과 관련하여 일부 밝혀져 있지 않다 (Huang, P.H. et al., Proc . Natl . Acad. Sci . USA , 104, 12867-72 (2007); Suehisa, H. et al., J. Clin . Oncol., 25, 3952-7 (2007)). 그러나 기 보고된 바와 같은 기능과는 달리 DQ088980 유전자는 특히 간암을 포함한 인간의 각종 암화과정에 깊숙히 관련되어 있는 것으로 금번 연구결과 밝혀졌다. 연구 결과 간조직을 포함한 여러 인간 정상 조직들에서는 발현이 약하고 반면에 간암을 포함한 여러 암조직들에서는 발현이 매우 증가된 PIG61 원암유전자를 발굴하게 되었다.
3735 bp로 이루어진 PIG61의 전체 서열은 서열번호: 5에 나타내었다.
서열번호: 5의 염기서열에서, 본 발명의 원암유전자의 전체 오픈 리딩 프레임(open reading frame)은 뉴클레오티드 번호 47 내지 3679에 해당하며, 서열번호: 6의 1210개의 아미노산으로 이루어진 단백질을 코드하는 것으로 예측된다.
<실시예 7> 다양한 세포에서의 원암 유전자의 노던 블롯 분석
1. PIG25 유전자
실시예 1에서와 같이, 정상 자궁경부 조직, 자궁경부암 조직, 자궁암 전이 임파절조직 및 자궁경부암 세포주 CaSki (ATCC CRL 1550), CUMC-6으로부터 총 RNA를 추출하였다.
PIG25 유전자 발현 정도를 결정하기 위하여, 각각의 조직 및 세포주로부터 추출한 변성된 총 RNA 20 ㎍씩을 1% 포름알데히드 아가로즈 겔에서 전기영동한 후 나일론 막 (Boehringer-Mannheim, 독일)으로 옮겼다. 레디프라임 II (Rediprime II) 무작위 프라임 표지 시스템 (Amersham, 영국)을 사용하여 제조한 32P-표지된 무작위 프라임된 PIG25 전체 cDNA 프로브로 블롯을 혼성화시켰다. 노던 블롯 분석을 2회 반복 실시하였으며, 그 결과는 농도계 (densitometry)를 사용하여 정량화하였고, β-액틴 (actin)으로 표준화시켰다.
도 2a는 정상 자궁경부 조직, 자궁경부암 조직, 자궁경부암 전이 임파절 조직 및 자궁경부암 세포주 (CaSki 및 CUMC-6)들에서 PIG25 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이다. 도 2a에서 알 수 있는 바와 같이, PIG25 원암유전자는 자궁경부암 조직, 자궁경부암 전이조직 및 자궁경부암 세포주인 CaSki와 CUMC-6 세포주들에서는 유전자 발현이 증가되었으며 즉 약 1.4 kb의 우점(dominant) PIG25 mRNA 전사물이 과발현되었다, 도 2에서, 정상 (Normal)열은 정상 자궁 경부 조직을, 암 (Cancer)열은 자궁경부암 조직을, 전이 (metastasis)열은 자궁경부암 전이 임파절 조직을, 그리고 CaSki열 및 CUMC-6열은 각각 자궁암 세포주를 나타낸다. 도 2b는 동일한 시료를 β-액틴 프로브로 혼성화시켜 mRNA의 존재를 확인한 것이다.
도 3a는 정상 인간 12-열 다중 조직 (Clontech), 뇌, 심장, 횡문근, 대장, 흉선, 비장, 신장, 간, 소장, 태반, 폐 및 말초 혈액 백혈구 조직에서 PIG25 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이다. 도 3b는 동일한 시료를 β-액틴 프로브로 혼성화시켜 mRNA의 존재를 확인한 것이다. 도 3a에서 알 수 있는 바와 같이, PIG25 mRNA (약 1.4 kb의 우점(dominant) PIG25 mRNA 전사물)는 정상 뇌, 심장과 정상근육, 대장, 흉선, 비장, 콩팥, 간, 소장, 태반, 폐 및 말초 혈액 백혈구 조직들에서는 발현이 전혀 없었다.
도 4a는 인간 암 세포주, HL-60, HeLa, K-562, MOLT-4, Raji, SW480, A549 및 G361 (Clontech)에서 PIG25 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이다. 도 4b는 동일한 시료를 β-액틴 프로브로 혼성화시켜 mRNA의 존재를 확인한 것이다. 도 4a에서 알 수 있는 바와 같이, PIG25 mRNA (약 1.4 kb의 우점(dominant) PIG25 mRNA 전사물)는 HL-60 전골수세포 백혈병세포주, HeLa 자궁암 세포주, 만성 골수 백혈병 세포주 K-562, 임파구 백혈병 세포주 MOLT-4, 버키트 (Burkitt) 림프종 세포주 Raji, 대장암 세포주 SW480, 폐암세포주 A549 및 피부암세포주 G361 들에서 증가된 수준으로 발현되었다. 또한, 3.5 kb와 2.2 kb 크기의 PIG25 mRNA 전사물도 동시에 발현이 되는 것으로 관찰되었다.
2. PIG60
실시예 1에서와 같이, 정상 자궁경부 조직, 자궁경부암 조직, 자궁암 전이 임파절조직 및 자궁경부암 세포주 CaSki (ATCC CRL 1550), CUMC-6으로부터 총 RNA를 추출하였다.
PIG60 유전자 발현 정도를 결정하기 위하여, 각각의 조직 및 세포주로부터 추출한 변성된 총 RNA 20 ㎍씩을 1% 포름알데히드 아가로즈 겔에서 전기영동한 후 나일론 막 (Boehringer-Mannheim, 독일)으로 옮겼다. 레디프라임 II (Rediprime II) 무작위 프라임 표지 시스템 (Amersham, 영국)을 사용하여 제조한 32P-표지된 무작위 프라임된 PIG60 전체 cDNA 프로브로 블롯을 혼성화시켰다. 노던 블롯 분석을 2회 반복 실시하였으며, 그 결과는 농도계 (densitometry)를 사용하여 정량화하였고, β-액틴 (actin)으로 표준화시켰다.
도 7a는 정상 자궁경부 조직, 자궁경부암 조직, 자궁경부암 전이 임파절 조직 및 자궁경부암 세포주 (CaSki 및 CUMC-6)들에서 PIG60 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이다. 도 7a에서 알 수 있는 바와 같이, PIG60 원암유전자는 자궁경부암 조직, 자궁경부암 전이조직 및 자궁경부암 세포주인 CaSki와 CUMC-6 세포주들에서는 유전자 발현이 증가되었으며 즉 약 1.5 kb의 우점(dominant) PIG60 mRNA 전사물이 과발현되었다. 도 7에서 정상 (Normal)열은 정상 자궁 경부 조직을, 암 (Cancer)열은 자궁경부암 조직을, 전이 (metastasis)열은 자궁경부암 전이 임파절 조직을, 그리고 CaSki열 및 CUMC-6열은 각각 자궁암 세포주를 나타낸다. 도 7b는 동일한 시료를 β-액틴 프로브로 혼성화시켜 mRNA의 존재를 확인한 것이다.
도 8a는 정상 인간 12-열 다중 조직 (Clontech), 뇌, 심장, 횡문근, 대장, 흉선, 비장, 신장, 간, 소장, 태반, 폐 및 말초 혈액 백혈구 조직에서 PIG60 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이다. 도 8b는 동일한 시료를 β-액틴 프로브로 혼성화시켜 mRNA의 존재를 확인한 것이다. 도 8a에서 알 수 있는 바와 같이, PIG60 mRNA (약 1.5 kb의 우점(dominant) PIG60 mRNA 전사물)는 정상 뇌, 심장과 정상근육, 대장, 흉선, 비장, 콩팥, 간, 소장, 태반, 폐 및 말초 혈액 백혈구 조직들에서는 아주 약하게 발현이 되거나 발현이 없었다.
도 9a는 인간 암 세포주, HL-60, HeLa, K-562, MOLT-4, Raji, SW480, A549 및 G361 (Clontech)에서 PIG60 원암유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이다. 도 9b는 동일한 시료를 β-액틴 프로브로 혼성화시켜 mRNA의 존재를 확인한 것이다. 도 9a에서 알 수 있는 바와 같이, PIG60 mRNA (약 1.5 kb의 우점(dominant) PIG60 mRNA 전사물)는 HL-60 전골수세포 백혈병세포주, HeLa 자궁암 세포주, 만성 골수 백혈병 세포주 K-562, 임파구 백혈병 세포주 MOLT-4, 버키트 (Burkitt) 림프종 세포주 Raji 들에서 매우 증가된 수준으로 발현이 되었으며, 대장암 세포주 SW480, 폐암세포주 A549 및 피부암세포주 G361 들에서 증가된 수준으로 발현되었다.
3. PIG61
실시예 1에서와 같이, 정상 간조직, 간암 조직, 및 간암 세포주 HepG2로부터 총 RNA를 추출하였다.
PIG61 유전자 발현 정도를 결정하기 위하여, 각각의 조직 및 세포주로부터 추출한 변성된 총 RNA 20 ㎍씩을 1% 포름알데히드 아가로즈 겔에서 전기영동한 후 나일론 막(Boehringer-Mannheim, 독일)으로 옮겼다. 레디프라임 II(Rediprime II) 무작위 프라임 표지 시스템(Amersham, 영국)을 사용하여 제조한 32P-표지된 무작위 프라임된 HP80 cDNA 프로브로 블롯을 하이브리드시켰다. 노던 블롯 분석을 2회 반복 실시하였으며, 그 결과는 농도계(densitometry)를 사용하여 정량화하였고, β-액틴(actin)으로 표준화시켰다.
도 12a는 정상 간조직, 간암조직 및 간암 세포주(HepG2)들에서 PIG61 원암 유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸다. 도 12a에서 알 수 있는 바와 같이, 간암 조직 및 간암 세포주인 HepG2 세포주들에서는 현저한 유전자 발현이 관찰되었으나, 정상조직에서는 발현이 되지 않거나 약하였다. 도 12b는 동일한 시료를 β-액틴 프로브로 하이브리드시켜 mRNA의 존재를 확인한 것이다.
도 13a는 정상 인간 12-열 다중 조직(Clontech), 뇌, 심장, 횡문근, 대장, 흉선, 비장, 신장, 간, 소장, 태반, 폐 및 말초 혈액 백혈구 조직에서 PIG61 원암 유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이다. 도 13b는 동일한 시료를 β-액틴 프로브로 하이브리드시켜 mRNA의 존재를 확인한 것이다. 도 13a에서 알 수 있는 바와 같이, PIG61 mRNA(약 9.8 kb)은 정상 간조직에서와 같이 여러 다른 정상조직들에서도 발현이 되지 않았고 단지 정상 태반에서만 낮은 수준으로 발현되었다. 또한 정상 태반에서는 약 5.5 kb의 PIG61 mRNA도 아주 약하게 발현되었다. 도 14a는 인간 암 세포주, HL-60, HeLa, K-562, MOLT-4, Raji. SW480, A549 및 G361 (Clontech)에서 PIG61 원암 유전자의 발현여부를 확인한 노던 블롯 분석 결과를 나타낸 것이다. 도 14b는 동일한 시료를 β-액틴 프로브로 하이브리드시켜 mRNA의 존재를 확인한 것이다. 도 14a에서 알 수 있는 바와 같이, PIG61는 HeLa 자궁암 세포주, 대장암세포주 SW480, 및 폐암세포주 A549, 및 피부암세포주 G361 들에서는 발현이 강하였다. 동시에 약 5.5 kb의 PIG61 mRNA도 발현되었다.
<실시예 8> PIG25 원암유전자를 대장균에 형질감염시킨 후 발현되는 단백질의 크기 결정
1. PIG25
서열번호: 1의 PIG25 원암유전자 전체를 pBAD/thio-Topo 벡터 (Invitrogen, USA)의 다중-클로닝 부위 내에 삽입한 후, 생성된 pBAD/thio-Topo/PIG25 벡터를 대장균 Top10 (Invitrogen, USA)에 형질감염시켰다. pBAD/thio-Topo 벡터의 다중-클로닝 부위의 앞부위에는 발현 단백질들인 HT-Thioredoxin 이 삽입되어 있다. 형질감염된 대장균을 LB 브로쓰에서 진탕 배양한 후, 이를 1/100로 희석시켜 다시 3시간 동안 배양하였다. 여기에 0.5 mM의 엘 아라비노즈 (L-Arabinose, Sigma)를 첨가하여 단백질 생산을 유도하였다.
엘 아라비노즈 유도 전후의 배양액 중의 대장균 세포를 초음파 분쇄한 후, 12% 나트륨 도데실설페이트-폴리아크릴아미드 겔에서 전기영동하였다 (SDS-PAGE). 도 5는 pBAD/thio-Topo/PIG25 벡터로 형질감염된 대장균 Top10 균주의 단백질의 발현 양상을 SDS-PAGE로 확인한 결과로서, 엘 아라비노즈 유도 후에 약 22 kDa의 융합 단백질 밴드가 뚜렷하게 관찰되었다. 이 22 kDa 융합단백질은 pBAD/thio-Topo/PIG25 벡터에 삽입되어 있는 약 15 kDa 크기의 HT-thioredoxin 단백질과 약 7 kDa의 PIG25 단백질을 함유하고 있는 것이다.
2. PIG60
서열번호: 3의 PIG60 원암유전자 전체를 pBAD/thio-Topo 벡터 (Invitrogen, USA)의 다중-클로닝 부위 내에 삽입한 후, 생성된 pBAD/thio-Topo/PIG60 벡터를 대장균 Top10 (Invitrogen, USA)에 형질감염시켰다. pBAD/thio-Topo 벡터의 다중-클로닝 부위의 앞부위에는 발현 단백질들인 HT-Thioredoxin 이 삽입되어 있다. 형질감염된 대장균을 LB 브로쓰에서 진탕 배양한 후, 이를 1/100로 희석시켜 다시 3시간 동안 배양하였다. 여기에 0.5 mM의 엘 아라비노즈 (L-Arabinose, Sigma)를 첨가하여 단백질 생산을 유도하였다.
엘 아라비노즈 유도 전후의 배양액 중의 대장균 세포를 초음파 분쇄한 후, 12% 나트륨 도데실설페이트-폴리아크릴아미드 겔에서 전기영동하였다 (SDS-PAGE). 도 10은 pBAD/thio-Topo/PIG60 벡터로 형질감염된 대장균 Top10 균주의 단백질의 발현 양상을 SDS-PAGE로 확인한 결과로서, 엘 아라비노즈 유도 후에 약 53 kDa의 융합 단백질 밴드가 뚜렷하게 관찰되었다. 이 53 kDa 융합단백질은 pBAD/thio-Topo/PIG60 벡터에 삽입되어 있는 약 15 kDa 크기의 HT-thioredoxin 단백질과 약 38 kDa의 PIG60 단백질을 함유하고 있는 것이다.
3. PIG61
서열번호: 5의 PIG61 원암유전자 전체를 pBAD/thio-Topo 벡터 (Invitrogen, USA)의 다중-클로닝 부위 내에 삽입한 후, 생성된 pBAD/thio-Topo/PIG61 벡터를 대장균 Top10 (Invitrogen, USA)에 형질감염시켰다. pBAD/thio-Topo 벡터의 다중-클로닝 부위의 앞부위에는 발현 단백질들인 HT-Thioredoxin 이 삽입되어 있다. 형질감염된 대장균을 LB 브로쓰에서 진탕 배양한 후, 이를 1/100로 희석시켜 다시 3시간 동안 배양하였다. 여기에 0.5 mM의 엘 아라비노즈 (L-Arabinose, Sigma)를 첨가하여 단백질 생산을 유도하였다. 엘 아라비노즈 유도 전후의 배양액 중의 대장균 세포를 초음파 분쇄한 후, 12% 나트륨 도데실설페이트-폴리아크릴아미드 겔에서 전기영동하였다 (SDS-PAGE). 도 15는 pBAD/thio-Topo/PIG61 벡터로 형질감염된 대장균 Top10 균주의 단백질의 발현 양상을 SDS-PAGE로 확인한 결과로서, 엘 아라비노즈 유도 후에 약 149 kDa의 융합 단백질 밴드가 뚜렷하게 관찰되었다. 이 149 kDa 융합단백질은 pBAD/thio-Topo/PIG61 벡터에 삽입되어 있는 약 15 kDa 크기의 HT-thioredoxin 단백질과 약 134 kDa의 PIG61 단백질을 함유하고 있는 것이다.
<110> KIM, Hyun-Kee
<120> HUMAN PROTOONCOGENE AND PROTEIN ENCODED THEREIN
<130> 08P-517M
<140> 10-2007-0107895
<141> 2007-10-25
<160> 8
<170> KopatentIn 1.71
<210> 1
<211> 1740
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> CDS
<222> (631)..(825)
<400> 1
ttctccccat cagtataatt atttattcta tcctataata taccccaaat agtttcagat 60
tgtgacacga gttctagtat tgaattgtta ttaatactat ttcagttagt tttctatgcc 120
cttcatgatg ataatctgtc agccattcat ttccttaagt aattactgaa ttcaggatag 180
caaatgcctt ccatcttcgg tccataatta agagtaattc agatgttgta cagccttgtc 240
tttagagatc tagatctaat tccctggcct acagagaagg ccaaagattt ctcccttttg 300
cttctgcaag ctcctggtag tttccttcat tgaaaataat tctgcacaca ctgcaccctg 360
gcaaggagac tcatagccct tcaagattcc cccacatggc cagacacagt ggctcatgcc 420
tgtaatccca gcactctggg aggccaaggc gggcagatca cttgaggtca ggagttcaag 480
accagcctgg ccaacatggc aaaaccccgt ctctacaaaa atacaaaaat tatccgagca 540
tggtggcatg cacttgtagt cccagctact caggaggctg aagcacgaga attgcttgag 600
cccaggaggc agaggctgca gtgagccaag atg cca ccg cac tcc agc ctg ggc 654
Met Pro Pro His Ser Ser Leu Gly
1 5
aac aga gta aga ctc tgc ctc gaa aaa aaa aaa aag gaa aaa aaa atc 702
Asn Arg Val Arg Leu Cys Leu Glu Lys Lys Lys Lys Glu Lys Lys Ile
10 15 20
ccc caa atc atc tct tgc aga gat ttc aca aac cag gca tat ttt gct 750
Pro Gln Ile Ile Ser Cys Arg Asp Phe Thr Asn Gln Ala Tyr Phe Ala
25 30 35 40
gac aac ttc cca gga att atg gta gaa gga ata aca gcg caa att cac 798
Asp Asn Phe Pro Gly Ile Met Val Glu Gly Ile Thr Ala Gln Ile His
45 50 55
agc tct cac aaa aac agt cag caa cac tgatc tcaaaagagc ccccagccac 850
Ser Ser His Lys Asn Ser Gln Gln His
60 65
acctcattgt ggcatttctt tattggtctt tcagctcatc tcagtatcat gctctccttc 910
ccgctgtttt tttcctcctc ttccttccct ctcctttctc catttaggat caaaatgcac 970
cattcttctc ctctgtcaag cagggcaacc tcctcctctg aagctttgtt caaggcattc 1030
ttagaacaaa gacagccttc ttcctaagaa aaattacagt gaataaaatt tcctctgcct 1090
tattacacat acaagggttg ggatcttttt aaagtgaggt catttataaa ctacaaagaa 1150
gtacctgcaa aattccctca agaggagttt ctccattgat tcagctaatg tccctcagaa 1210
ccaggtcacc agatggctca agctgcctag gatctttcta cttctggacc ccccagcttc 1270
cagagccacc tcctcaagtc ctcacgacct ctactgttct ctcttcatca cagacaaatg 1330
agctcatcca aatttcctcc agctaagcag caaccacccc gtgctccctc ccaggacacc 1390
agccaagggc cctgggagga aaacagtatt tatgagccat ggtctgtgga ctgactccag 1450
cattgagggg gagcctggcc ctcccagtgc cccacagctc atcgggaggg actcagaggc 1510
ctctaatttc ccattgcatt gatggagatg accttgctaa ataacctgcc tagacgagag 1570
ccaatgagga gtatggccgc tatcttgctt gcccagaggt cccattcatg gcccttccag 1630
agtttgtgga gcctagaaga tcttctgttg gcagaagctt tcaaaaaggc cagcaggtag 1690
tcctggaaac aatccccaac tggggtacag tggggaggag aagtgcagat 1740
<210> 2
<211> 65
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 2
Met Pro Pro His Ser Ser Leu Gly Asn Arg Val Arg Leu Cys Leu Glu
1 5 10 15
Lys Lys Lys Lys Glu Lys Lys Ile Pro Gln Ile Ile Ser Cys Arg Asp
20 25 30
Phe Thr Asn Gln Ala Tyr Phe Ala Asp Asn Phe Pro Gly Ile Met Val
35 40 45
Glu Gly Ile Thr Ala Gln Ile His Ser Ser His Lys Asn Ser Gln Gln
50 55 60
His
65
<210> 3
<211> 1889
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> CDS
<222> (24)..(1085)
<400> 3
gggctcgcgg cggtgccgcg ggg atg gcg gga gcc gga gct gga gcc 47
Met Ala Gly Ala Gly Ala Gly Ala
1 5
gga gct cgc ggc gga gcg gcg gcg ggg gtc gag gct cga gct cgc gat 95
Gly Ala Arg Gly Gly Ala Ala Ala Gly Val Glu Ala Arg Ala Arg Asp
10 15 20
cca ccg ccc gcg cac cgc gca cat cct cgc cac cct cgg cct gcg gct 143
Pro Pro Pro Ala His Arg Ala His Pro Arg His Pro Arg Pro Ala Ala
25 30 35 40
cag ccc tcg gcc cgc agg atg gat ggc ggg tca ggg ggc ctg ggg tct 191
Gln Pro Ser Ala Arg Arg Met Asp Gly Gly Ser Gly Gly Leu Gly Ser
45 50 55
ggg gac aac gcc ccg acc act gag gct ctt ttc gtg gca ctg ggc gcg 239
Gly Asp Asn Ala Pro Thr Thr Glu Ala Leu Phe Val Ala Leu Gly Ala
60 65 70
ggc gtg acg gcg ctc agc cat ccc ctg ctc tac gtg aag ctg ctc atc 287
Gly Val Thr Ala Leu Ser His Pro Leu Leu Tyr Val Lys Leu Leu Ile
75 80 85
cag gtg ggt cat gag ccg atg ccc ccc acc ctt ggg acc aat gtg ctg 335
Gln Val Gly His Glu Pro Met Pro Pro Thr Leu Gly Thr Asn Val Leu
90 95 100
ggg agg aag gtc ctc tat ctg ccg agc ttc ttc acc tac gcc aag tac 383
Gly Arg Lys Val Leu Tyr Leu Pro Ser Phe Phe Thr Tyr Ala Lys Tyr
105 110 115 120
atc gtg caa gtg gat ggt aag ata ggg ctg ttc cga ggc ctg agt ccc 431
Ile Val Gln Val Asp Gly Lys Ile Gly Leu Phe Arg Gly Leu Ser Pro
125 130 135
cgg ctg atg tcc aac gcc ctc tct act gtg act cgg ggt agc atg aag 479
Arg Leu Met Ser Asn Ala Leu Ser Thr Val Thr Arg Gly Ser Met Lys
140 145 150
aag gtt ttc cct cca gat gag att gag cag gtt tcc aac aag gat gat 527
Lys Val Phe Pro Pro Asp Glu Ile Glu Gln Val Ser Asn Lys Asp Asp
155 160 165
atg aag act tcc ctg aag aaa gtt gtg aag gag acc tcc tac gag atg 575
Met Lys Thr Ser Leu Lys Lys Val Val Lys Glu Thr Ser Tyr Glu Met
170 175 180
atg atg cag tgt gtg tcc cgc atg ttg gcc cac ccc ctg cat gtc atc 623
Met Met Gln Cys Val Ser Arg Met Leu Ala His Pro Leu His Val Ile
185 190 195 200
tca atg cgc tgc atg gtc cag ttt gtg gga cgg gag gcc aag tac agt 671
Ser Met Arg Cys Met Val Gln Phe Val Gly Arg Glu Ala Lys Tyr Ser
205 210 215
ggt gtg ctg agc tcc att ggg aag att ttc aaa gag gaa ggg ctg ctg 719
Gly Val Leu Ser Ser Ile Gly Lys Ile Phe Lys Glu Glu Gly Leu Leu
220 225 230
gga ttc ttc gtt gga tta atc cct cac ctc ctg ggc gat gtg gtt ttc 767
Gly Phe Phe Val Gly Leu Ile Pro His Leu Leu Gly Asp Val Val Phe
235 240 245
ttg tgg ggc tgt aac ctg ctg gcc cac ttc atc aat gcc tac ctg gtg 815
Leu Trp Gly Cys Asn Leu Leu Ala His Phe Ile Asn Ala Tyr Leu Val
250 255 260
gat gac agc ttc agc cag gcc ctg gcc atc cgg agc tat acc aag ttc 863
Asp Asp Ser Phe Ser Gln Ala Leu Ala Ile Arg Ser Tyr Thr Lys Phe
265 270 275 280
gtg atg ggg att gca gtg agc atg ctg acc tac ccc ttc ctg cta gtt 911
Val Met Gly Ile Ala Val Ser Met Leu Thr Tyr Pro Phe Leu Leu Val
285 290 295
ggc gac ctc atg gct gtg aac aac tgc ggg ctg caa gct ggg ctc ccc 959
Gly Asp Leu Met Ala Val Asn Asn Cys Gly Leu Gln Ala Gly Leu Pro
300 305 310
cct tac tcc cca gtg ttc aaa tcc tgg att cac tgc tgg aag tac ctg 1007
Pro Tyr Ser Pro Val Phe Lys Ser Trp Ile His Cys Trp Lys Tyr Leu
315 320 325
agt gtg cag ggc cag ctc ttc cga ggc tcc agc ctg ctt ttc cgc cgg 1055
Ser Val Gln Gly Gln Leu Phe Arg Gly Ser Ser Leu Leu Phe Arg Arg
330 335 340
gtg tca tca gga tca tgc ttt gcc ctg gag taacc tgaatcatct 1100
Val Ser Ser Gly Ser Cys Phe Ala Leu Glu
345 350
aaaaaacacg gtctcaacct ggccaccgtg ggtgaggcct gaccaccttg ggacacctgc 1160
aagacgactc caacccaaca acaaccagat gtgctccagc ccagccgggc ttcagttcca 1220
tatttgccat gtgtctgtcc agatgtgggg ttgagcgggg gtggggctgc acccagtgga 1280
ttgggtcacc cggcagacct agggaaggtg aggcgaggtg gggagttggc agaatcccca 1340
tacctcgcag atttgctgag tctgtcttgt gcagagggcc agagaatggc ttatgggggc 1400
ccaggttgga tggggaaagg ctaatggggt cagaccccac cccgtctacc cctccagtca 1460
gcccagcgcc catcctgcag ctcagctggg agcatcattc tcctgctttg tacatagggt 1520
gtggtcccct ggcacgtggc caccatcatg tctaggccta tgctaggagg caaatggcca 1580
ggctctgcct gtgtttttct caacactact tttctgatat gagggcagca cctgcctctg 1640
aatgggaaat catgcaacta ctcagaatgt gtcctcctca tctaatgctc atctgtttaa 1700
tggtgatgcc tcgcgtacag gatctggtta cctgtgcagt tgtgaatacc cagaggttgg 1760
gcagatcagt gtctctagtc ctacccagtt ttaaagttca tggtaagatt tgacctcatc 1820
tcccgcaaat aaatgtattg gtgatttgga aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1880
aaaaaaaaa 1889
<210> 4
<211> 354
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 4
Met Ala Gly Ala Gly Ala Gly Ala Gly Ala Arg Gly Gly Ala Ala Ala
1 5 10 15
Gly Val Glu Ala Arg Ala Arg Asp Pro Pro Pro Ala His Arg Ala His
20 25 30
Pro Arg His Pro Arg Pro Ala Ala Gln Pro Ser Ala Arg Arg Met Asp
35 40 45
Gly Gly Ser Gly Gly Leu Gly Ser Gly Asp Asn Ala Pro Thr Thr Glu
50 55 60
Ala Leu Phe Val Ala Leu Gly Ala Gly Val Thr Ala Leu Ser His Pro
65 70 75 80
Leu Leu Tyr Val Lys Leu Leu Ile Gln Val Gly His Glu Pro Met Pro
85 90 95
Pro Thr Leu Gly Thr Asn Val Leu Gly Arg Lys Val Leu Tyr Leu Pro
100 105 110
Ser Phe Phe Thr Tyr Ala Lys Tyr Ile Val Gln Val Asp Gly Lys Ile
115 120 125
Gly Leu Phe Arg Gly Leu Ser Pro Arg Leu Met Ser Asn Ala Leu Ser
130 135 140
Thr Val Thr Arg Gly Ser Met Lys Lys Val Phe Pro Pro Asp Glu Ile
145 150 155 160
Glu Gln Val Ser Asn Lys Asp Asp Met Lys Thr Ser Leu Lys Lys Val
165 170 175
Val Lys Glu Thr Ser Tyr Glu Met Met Met Gln Cys Val Ser Arg Met
180 185 190
Leu Ala His Pro Leu His Val Ile Ser Met Arg Cys Met Val Gln Phe
195 200 205
Val Gly Arg Glu Ala Lys Tyr Ser Gly Val Leu Ser Ser Ile Gly Lys
210 215 220
Ile Phe Lys Glu Glu Gly Leu Leu Gly Phe Phe Val Gly Leu Ile Pro
225 230 235 240
His Leu Leu Gly Asp Val Val Phe Leu Trp Gly Cys Asn Leu Leu Ala
245 250 255
His Phe Ile Asn Ala Tyr Leu Val Asp Asp Ser Phe Ser Gln Ala Leu
260 265 270
Ala Ile Arg Ser Tyr Thr Lys Phe Val Met Gly Ile Ala Val Ser Met
275 280 285
Leu Thr Tyr Pro Phe Leu Leu Val Gly Asp Leu Met Ala Val Asn Asn
290 295 300
Cys Gly Leu Gln Ala Gly Leu Pro Pro Tyr Ser Pro Val Phe Lys Ser
305 310 315 320
Trp Ile His Cys Trp Lys Tyr Leu Ser Val Gln Gly Gln Leu Phe Arg
325 330 335
Gly Ser Ser Leu Leu Phe Arg Arg Val Ser Ser Gly Ser Cys Phe Ala
340 345 350
Leu Glu
<210> 5
<211> 3735
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> CDS
<222> (47)..(3676)
<400> 5
ccagtattga tcgggagagc cggagcgagc tcttcgggga gcagcg atg cga ccc 55
Met Arg Pro
1
tcc ggg acg gcc ggg gca gcg ctc ctg gcg ctg ctg gct gcg ctc tgc 103
Ser Gly Thr Ala Gly Ala Ala Leu Leu Ala Leu Leu Ala Ala Leu Cys
5 10 15
ccg gcg agt cgg gct ctg gag gaa aag aaa gtt tgc caa ggc acg agt 151
Pro Ala Ser Arg Ala Leu Glu Glu Lys Lys Val Cys Gln Gly Thr Ser
20 25 30 35
aac aag ctc acg cag ttg ggc act ttt gaa gat cat ttt ctc agc ctc 199
Asn Lys Leu Thr Gln Leu Gly Thr Phe Glu Asp His Phe Leu Ser Leu
40 45 50
cag agg atg ttc aat aac tgt gag gtg gtc ctt ggg aat ttg gaa att 247
Gln Arg Met Phe Asn Asn Cys Glu Val Val Leu Gly Asn Leu Glu Ile
55 60 65
acc tat gtg cag agg aat tat gat ctt tcc ttc tta aag acc atc cag 295
Thr Tyr Val Gln Arg Asn Tyr Asp Leu Ser Phe Leu Lys Thr Ile Gln
70 75 80
gag gtg gct ggt tat gtc ctc att gcc ctc aac aca gtg gag cga att 343
Glu Val Ala Gly Tyr Val Leu Ile Ala Leu Asn Thr Val Glu Arg Ile
85 90 95
cct ttg gaa aac ctg cag atc atc aga gga aat atg tac tac gaa aat 391
Pro Leu Glu Asn Leu Gln Ile Ile Arg Gly Asn Met Tyr Tyr Glu Asn
100 105 110 115
tcc tat gcc tta gca gtc tta tct aac tat gat gca aat aaa acc gga 439
Ser Tyr Ala Leu Ala Val Leu Ser Asn Tyr Asp Ala Asn Lys Thr Gly
120 125 130
ctg aag gag ctg ccc atg aga aat tta cag gaa atc ctg cat ggc gcc 487
Leu Lys Glu Leu Pro Met Arg Asn Leu Gln Glu Ile Leu His Gly Ala
135 140 145
gtg cgg ttc agc aac aac cct gcc ctg tgc aac gtg gag agc atc cag 535
Val Arg Phe Ser Asn Asn Pro Ala Leu Cys Asn Val Glu Ser Ile Gln
150 155 160
tgg cgg gac ata gtc agc agt gac ttt ctc agc aac atg tcg atg gac 583
Trp Arg Asp Ile Val Ser Ser Asp Phe Leu Ser Asn Met Ser Met Asp
165 170 175
ttc cag aac cac ctg ggc agc tgc caa aag tgt gat cca agc tgt ccc 631
Phe Gln Asn His Leu Gly Ser Cys Gln Lys Cys Asp Pro Ser Cys Pro
180 185 190 195
aat ggg agc tgc tgg ggt gca gga gag gag aac tgc cag aaa ctg acc 679
Asn Gly Ser Cys Trp Gly Ala Gly Glu Glu Asn Cys Gln Lys Leu Thr
200 205 210
aaa atc atc tgt gcc cag cag tgc tcc ggg cgc tgc cgt ggc aag tcc 727
Lys Ile Ile Cys Ala Gln Gln Cys Ser Gly Arg Cys Arg Gly Lys Ser
215 220 225
ccc agt gac tgc tgc cac aac cag tgt gct gca ggc tgc aca ggc ccc 775
Pro Ser Asp Cys Cys His Asn Gln Cys Ala Ala Gly Cys Thr Gly Pro
230 235 240
cgg gag agc gac tgc ctg gtc tgc cgc aaa ttc cga gac gaa gcc acg 823
Arg Glu Ser Asp Cys Leu Val Cys Arg Lys Phe Arg Asp Glu Ala Thr
245 250 255
tgc aag gac acc tgc ccc cca ctc atg ctc tac aac ccc acc acg tac 871
Cys Lys Asp Thr Cys Pro Pro Leu Met Leu Tyr Asn Pro Thr Thr Tyr
260 265 270 275
cag atg gat gtg aac ccc gag ggc aaa tac agc ttt ggt gcc acc tgc 919
Gln Met Asp Val Asn Pro Glu Gly Lys Tyr Ser Phe Gly Ala Thr Cys
280 285 290
gtg aag aag tgt ccc cgt aat tat gtg gtg aca gat cac ggc tcg tgc 967
Val Lys Lys Cys Pro Arg Asn Tyr Val Val Thr Asp His Gly Ser Cys
295 300 305
gtc cga gcc tgt ggg gcc gac agc tat gag atg gag gaa gac ggc gtc 1015
Val Arg Ala Cys Gly Ala Asp Ser Tyr Glu Met Glu Glu Asp Gly Val
310 315 320
cgc aag tgt aag aag tgc gaa ggg cct tgc cgc aaa gtg tgt aac gga 1063
Arg Lys Cys Lys Lys Cys Glu Gly Pro Cys Arg Lys Val Cys Asn Gly
325 330 335
ata ggt att ggt gaa ttt aaa gac tca ctc tcc ata aat gct acg aat 1111
Ile Gly Ile Gly Glu Phe Lys Asp Ser Leu Ser Ile Asn Ala Thr Asn
340 345 350 355
att aaa cac ttc aaa aac tgc acc tcc atc agt ggc gat ctc cac atc 1159
Ile Lys His Phe Lys Asn Cys Thr Ser Ile Ser Gly Asp Leu His Ile
360 365 370
ctg ccg gtg gca ttt agg ggt gac tcc ttc aca cat act cct cct ctg 1207
Leu Pro Val Ala Phe Arg Gly Asp Ser Phe Thr His Thr Pro Pro Leu
375 380 385
gat cca cag gaa ctg gat att ctg aaa acc gta aag gaa atc aca ggg 1255
Asp Pro Gln Glu Leu Asp Ile Leu Lys Thr Val Lys Glu Ile Thr Gly
390 395 400
ttt ttg ctg att cag gct tgg cct gaa aac agg acg gac ctc cat gcc 1303
Phe Leu Leu Ile Gln Ala Trp Pro Glu Asn Arg Thr Asp Leu His Ala
405 410 415
ttt gag aac cta gaa atc ata cgc ggc agg acc aag caa cat ggt cag 1351
Phe Glu Asn Leu Glu Ile Ile Arg Gly Arg Thr Lys Gln His Gly Gln
420 425 430 435
ttt tct ctt gca gtc gtc agc ctg aac ata aca tcc ttg gga tta cgc 1399
Phe Ser Leu Ala Val Val Ser Leu Asn Ile Thr Ser Leu Gly Leu Arg
440 445 450
tcc ctc aag gag ata agt gat gga gat gtg ata att tca gga aac aaa 1447
Ser Leu Lys Glu Ile Ser Asp Gly Asp Val Ile Ile Ser Gly Asn Lys
455 460 465
aat ttg tgc tat gca aat aca ata aac tgg aaa aaa ctg ttt ggg acc 1495
Asn Leu Cys Tyr Ala Asn Thr Ile Asn Trp Lys Lys Leu Phe Gly Thr
470 475 480
tcc ggt cag aaa acc aaa att ata agc aac aga ggt gaa aac agc tgc 1543
Ser Gly Gln Lys Thr Lys Ile Ile Ser Asn Arg Gly Glu Asn Ser Cys
485 490 495
aag gcc aca ggc cag gtc tgc cat gcc ttg tgc tcc ccc gag ggc tgc 1591
Lys Ala Thr Gly Gln Val Cys His Ala Leu Cys Ser Pro Glu Gly Cys
500 505 510 515
tgg ggc ccg gag ccc agg gac tgc gtc tct tgc cgg aat gtc agc cga 1639
Trp Gly Pro Glu Pro Arg Asp Cys Val Ser Cys Arg Asn Val Ser Arg
520 525 530
ggc agg gaa tgc gtg gac aag tgc aac ctt ctg gag ggt gag cca agg 1687
Gly Arg Glu Cys Val Asp Lys Cys Asn Leu Leu Glu Gly Glu Pro Arg
535 540 545
gag ttt gtg gag aac tct gag tgc ata cag tgc cac cca gag tgc ctg 1735
Glu Phe Val Glu Asn Ser Glu Cys Ile Gln Cys His Pro Glu Cys Leu
550 555 560
cct cag gcc atg aac atc acc tgc aca gga cgg gga cca gac aac tgt 1783
Pro Gln Ala Met Asn Ile Thr Cys Thr Gly Arg Gly Pro Asp Asn Cys
565 570 575
atc cag tgt gcc cac tac att gac ggc ccc cac tgc gtc aag acc tgc 1831
Ile Gln Cys Ala His Tyr Ile Asp Gly Pro His Cys Val Lys Thr Cys
580 585 590 595
ccg gca gga gtc atg gga gaa aac aac acc ctg gtc tgg aag tac gca 1879
Pro Ala Gly Val Met Gly Glu Asn Asn Thr Leu Val Trp Lys Tyr Ala
600 605 610
gac gcc ggc cat gtg tgc cac ctg tgc cat cca aac tgc acc tac gga 1927
Asp Ala Gly His Val Cys His Leu Cys His Pro Asn Cys Thr Tyr Gly
615 620 625
tgc act ggg cca ggt ctt gaa ggc tgt cca acg aat ggg cct aag atc 1975
Cys Thr Gly Pro Gly Leu Glu Gly Cys Pro Thr Asn Gly Pro Lys Ile
630 635 640
ccg tcc atc gcc act ggg atg gtg ggg gcc ctc ctc ttg ctg ctg gtg 2023
Pro Ser Ile Ala Thr Gly Met Val Gly Ala Leu Leu Leu Leu Leu Val
645 650 655
gtg gcc ctg ggg atc ggc ctc ttc atg cga agg cgc cac atc gtt cgg 2071
Val Ala Leu Gly Ile Gly Leu Phe Met Arg Arg Arg His Ile Val Arg
660 665 670 675
aag cgc acg ctg cgg agg ctg ctg cag gag agg gag ctt gtg gag cct 2119
Lys Arg Thr Leu Arg Arg Leu Leu Gln Glu Arg Glu Leu Val Glu Pro
680 685 690
ctt aca ccc agt gga gaa gct ccc aac caa gct ctc ttg agg atc ttg 2167
Leu Thr Pro Ser Gly Glu Ala Pro Asn Gln Ala Leu Leu Arg Ile Leu
695 700 705
aag gaa act gaa ttc aaa aag atc aaa gtg ctg ggc tcc ggt gcg ttc 2215
Lys Glu Thr Glu Phe Lys Lys Ile Lys Val Leu Gly Ser Gly Ala Phe
710 715 720
ggc acg gtg tat aag gga ctc tgg atc cca gaa ggt gag aaa gtt aaa 2263
Gly Thr Val Tyr Lys Gly Leu Trp Ile Pro Glu Gly Glu Lys Val Lys
725 730 735
att ccc gtc gct atc aag gaa tta aga gaa gca aca tct ccg aaa gcc 2311
Ile Pro Val Ala Ile Lys Glu Leu Arg Glu Ala Thr Ser Pro Lys Ala
740 745 750 755
aac aag gaa atc ctc gat gaa gcc tac gtg atg gcc agc gtg gac aac 2359
Asn Lys Glu Ile Leu Asp Glu Ala Tyr Val Met Ala Ser Val Asp Asn
760 765 770
ccc cac gtg tgc cgc ctg ctg ggc atc tgc ctc acc tcc acc gtg cag 2407
Pro His Val Cys Arg Leu Leu Gly Ile Cys Leu Thr Ser Thr Val Gln
775 780 785
ctc atc acg cag ctc atg ccc ttc ggc tgc ctc ctg gac tat gtc cgg 2455
Leu Ile Thr Gln Leu Met Pro Phe Gly Cys Leu Leu Asp Tyr Val Arg
790 795 800
gaa cac aaa gac aat att ggc tcc cag tac ctg ctc aac tgg tgt gtg 2503
Glu His Lys Asp Asn Ile Gly Ser Gln Tyr Leu Leu Asn Trp Cys Val
805 810 815
cag atc gca aag ggc atg aac tac ttg gag gac cgt cgc ttg gtg cac 2551
Gln Ile Ala Lys Gly Met Asn Tyr Leu Glu Asp Arg Arg Leu Val His
820 825 830 835
cgc gac ctg gca gcc agg aac gta ctg gtg aaa aca ccg cag cat gtc 2599
Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Val Leu Val Lys Thr Pro Gln His Val
840 845 850
aag atc aca gat ttt ggg ctg gcc aaa ctg ctg ggt gcg gaa gag aaa 2647
Lys Ile Thr Asp Phe Gly Leu Ala Lys Leu Leu Gly Ala Glu Glu Lys
855 860 865
gaa tac cat gca gaa gga ggc aaa gtg cct atc aag tgg atg gca ttg 2695
Glu Tyr His Ala Glu Gly Gly Lys Val Pro Ile Lys Trp Met Ala Leu
870 875 880
gaa tca att tta cac aga atc tat acc cac cag agt gat gtc tgg agc 2743
Glu Ser Ile Leu His Arg Ile Tyr Thr His Gln Ser Asp Val Trp Ser
885 890 895
tac ggg gtg acc gtt tgg gag ttg atg acc ttt gga tcc aag cca tat 2791
Tyr Gly Val Thr Val Trp Glu Leu Met Thr Phe Gly Ser Lys Pro Tyr
900 905 910 915
gac gga atc cct gcc agc gag atc tcc tcc atc ctg gag aaa gga gaa 2839
Asp Gly Ile Pro Ala Ser Glu Ile Ser Ser Ile Leu Glu Lys Gly Glu
920 925 930
cgc ctc cct cag cca ccc ata tgt acc atc gat gtc tac atg atc atg 2887
Arg Leu Pro Gln Pro Pro Ile Cys Thr Ile Asp Val Tyr Met Ile Met
935 940 945
gtc aag tgc tgg atg ata gac gca gat agt cgc cca aag ttc cgt gag 2935
Val Lys Cys Trp Met Ile Asp Ala Asp Ser Arg Pro Lys Phe Arg Glu
950 955 960
ttg atc atc gaa ttc tcc aaa atg gcc cga gac ccc cag cgc tac ctt 2983
Leu Ile Ile Glu Phe Ser Lys Met Ala Arg Asp Pro Gln Arg Tyr Leu
965 970 975
gtc att cag ggg gat gaa aga atg cat ttg cca agt cct aca gat tcc 3031
Val Ile Gln Gly Asp Glu Arg Met His Leu Pro Ser Pro Thr Asp Ser
980 985 990 995
aac ttc tac cgt gcc ctg atg gat gaa gaa gac atg gac gac gtg gtg 3079
Asn Phe Tyr Arg Ala Leu Met Asp Glu Glu Asp Met Asp Asp Val Val
1000 1005 1010
gat gcc gac gag tac ctc atc cca cag cag ggc ttc ttc agc agc ccc 3127
Asp Ala Asp Glu Tyr Leu Ile Pro Gln Gln Gly Phe Phe Ser Ser Pro
1015 1020 1025
tcc acg tca cgg act ccc ctc ctg agc tct ctg agt gca acc agc aac 3175
Ser Thr Ser Arg Thr Pro Leu Leu Ser Ser Leu Ser Ala Thr Ser Asn
1030 1035 1040
aat tcc acc gtg gct tgc att gat aga aat ggg ctg caa agc tgt ccc 3223
Asn Ser Thr Val Ala Cys Ile Asp Arg Asn Gly Leu Gln Ser Cys Pro
1045 1050 1055
atc aag gaa gac agc ttc ttg cag cga tac agc tca gac ccc aca ggc 3271
Ile Lys Glu Asp Ser Phe Leu Gln Arg Tyr Ser Ser Asp Pro Thr Gly
1060 1065 1070 1075
gcc ttg act gag gac agc ata gac gac acc ttc ctc cca gtg cct gaa 3319
Ala Leu Thr Glu Asp Ser Ile Asp Asp Thr Phe Leu Pro Val Pro Glu
1080 1085 1090
tac ata aac cag tcc gtt ccc aaa agg ccc gct ggc cct gtg cag aat 3367
Tyr Ile Asn Gln Ser Val Pro Lys Arg Pro Ala Gly Pro Val Gln Asn
1095 1100 1105
cct gtc tat cac aat cag cct ctg aac ccc gcg ccc agc aga gac cca 3415
Pro Val Tyr His Asn Gln Pro Leu Asn Pro Ala Pro Ser Arg Asp Pro
1110 1115 1120
cac tac cag gac ccc cac agc act gca gtg ggc aac ccc gag tat ctc 3463
His Tyr Gln Asp Pro His Ser Thr Ala Val Gly Asn Pro Glu Tyr Leu
1125 1130 1135
aac act gtc cag ccc acc tgt gtc aac agc aca ttc gac agc cct gcc 3511
Asn Thr Val Gln Pro Thr Cys Val Asn Ser Thr Phe Asp Ser Pro Ala
1140 1145 1150 1155
cac tgg gcc cag aaa ggc agc cac caa att agc ctg gac aac cct gac 3559
His Trp Ala Gln Lys Gly Ser His Gln Ile Ser Leu Asp Asn Pro Asp
1160 1165 1170
tac cag cag gac ttc ttt ccc aag gaa gcc aag cca aat ggc atc ttt 3607
Tyr Gln Gln Asp Phe Phe Pro Lys Glu Ala Lys Pro Asn Gly Ile Phe
1175 1180 1185
aag ggc tcc aca gct gaa aat gca gaa tac cta agg gtc gcg cca caa 3655
Lys Gly Ser Thr Ala Glu Asn Ala Glu Tyr Leu Arg Val Ala Pro Gln
1190 1195 1200
agc agt gaa ttt att gga gca tgac cacggaggat agtatgagcc ctaaaaatcc 3710
Ser Ser Glu Phe Ile Gly Ala
1205 1210
agactctttc gatacccagg accaa 3735
<210> 6
<211> 1210
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 6
Met Arg Pro Ser Gly Thr Ala Gly Ala Ala Leu Leu Ala Leu Leu Ala
1 5 10 15
Ala Leu Cys Pro Ala Ser Arg Ala Leu Glu Glu Lys Lys Val Cys Gln
20 25 30
Gly Thr Ser Asn Lys Leu Thr Gln Leu Gly Thr Phe Glu Asp His Phe
35 40 45
Leu Ser Leu Gln Arg Met Phe Asn Asn Cys Glu Val Val Leu Gly Asn
50 55 60
Leu Glu Ile Thr Tyr Val Gln Arg Asn Tyr Asp Leu Ser Phe Leu Lys
65 70 75 80
Thr Ile Gln Glu Val Ala Gly Tyr Val Leu Ile Ala Leu Asn Thr Val
85 90 95
Glu Arg Ile Pro Leu Glu Asn Leu Gln Ile Ile Arg Gly Asn Met Tyr
100 105 110
Tyr Glu Asn Ser Tyr Ala Leu Ala Val Leu Ser Asn Tyr Asp Ala Asn
115 120 125
Lys Thr Gly Leu Lys Glu Leu Pro Met Arg Asn Leu Gln Glu Ile Leu
130 135 140
His Gly Ala Val Arg Phe Ser Asn Asn Pro Ala Leu Cys Asn Val Glu
145 150 155 160
Ser Ile Gln Trp Arg Asp Ile Val Ser Ser Asp Phe Leu Ser Asn Met
165 170 175
Ser Met Asp Phe Gln Asn His Leu Gly Ser Cys Gln Lys Cys Asp Pro
180 185 190
Ser Cys Pro Asn Gly Ser Cys Trp Gly Ala Gly Glu Glu Asn Cys Gln
195 200 205
Lys Leu Thr Lys Ile Ile Cys Ala Gln Gln Cys Ser Gly Arg Cys Arg
210 215 220
Gly Lys Ser Pro Ser Asp Cys Cys His Asn Gln Cys Ala Ala Gly Cys
225 230 235 240
Thr Gly Pro Arg Glu Ser Asp Cys Leu Val Cys Arg Lys Phe Arg Asp
245 250 255
Glu Ala Thr Cys Lys Asp Thr Cys Pro Pro Leu Met Leu Tyr Asn Pro
260 265 270
Thr Thr Tyr Gln Met Asp Val Asn Pro Glu Gly Lys Tyr Ser Phe Gly
275 280 285
Ala Thr Cys Val Lys Lys Cys Pro Arg Asn Tyr Val Val Thr Asp His
290 295 300
Gly Ser Cys Val Arg Ala Cys Gly Ala Asp Ser Tyr Glu Met Glu Glu
305 310 315 320
Asp Gly Val Arg Lys Cys Lys Lys Cys Glu Gly Pro Cys Arg Lys Val
325 330 335
Cys Asn Gly Ile Gly Ile Gly Glu Phe Lys Asp Ser Leu Ser Ile Asn
340 345 350
Ala Thr Asn Ile Lys His Phe Lys Asn Cys Thr Ser Ile Ser Gly Asp
355 360 365
Leu His Ile Leu Pro Val Ala Phe Arg Gly Asp Ser Phe Thr His Thr
370 375 380
Pro Pro Leu Asp Pro Gln Glu Leu Asp Ile Leu Lys Thr Val Lys Glu
385 390 395 400
Ile Thr Gly Phe Leu Leu Ile Gln Ala Trp Pro Glu Asn Arg Thr Asp
405 410 415
Leu His Ala Phe Glu Asn Leu Glu Ile Ile Arg Gly Arg Thr Lys Gln
420 425 430
His Gly Gln Phe Ser Leu Ala Val Val Ser Leu Asn Ile Thr Ser Leu
435 440 445
Gly Leu Arg Ser Leu Lys Glu Ile Ser Asp Gly Asp Val Ile Ile Ser
450 455 460
Gly Asn Lys Asn Leu Cys Tyr Ala Asn Thr Ile Asn Trp Lys Lys Leu
465 470 475 480
Phe Gly Thr Ser Gly Gln Lys Thr Lys Ile Ile Ser Asn Arg Gly Glu
485 490 495
Asn Ser Cys Lys Ala Thr Gly Gln Val Cys His Ala Leu Cys Ser Pro
500 505 510
Glu Gly Cys Trp Gly Pro Glu Pro Arg Asp Cys Val Ser Cys Arg Asn
515 520 525
Val Ser Arg Gly Arg Glu Cys Val Asp Lys Cys Asn Leu Leu Glu Gly
530 535 540
Glu Pro Arg Glu Phe Val Glu Asn Ser Glu Cys Ile Gln Cys His Pro
545 550 555 560
Glu Cys Leu Pro Gln Ala Met Asn Ile Thr Cys Thr Gly Arg Gly Pro
565 570 575
Asp Asn Cys Ile Gln Cys Ala His Tyr Ile Asp Gly Pro His Cys Val
580 585 590
Lys Thr Cys Pro Ala Gly Val Met Gly Glu Asn Asn Thr Leu Val Trp
595 600 605
Lys Tyr Ala Asp Ala Gly His Val Cys His Leu Cys His Pro Asn Cys
610 615 620
Thr Tyr Gly Cys Thr Gly Pro Gly Leu Glu Gly Cys Pro Thr Asn Gly
625 630 635 640
Pro Lys Ile Pro Ser Ile Ala Thr Gly Met Val Gly Ala Leu Leu Leu
645 650 655
Leu Leu Val Val Ala Leu Gly Ile Gly Leu Phe Met Arg Arg Arg His
660 665 670
Ile Val Arg Lys Arg Thr Leu Arg Arg Leu Leu Gln Glu Arg Glu Leu
675 680 685
Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly Glu Ala Pro Asn Gln Ala Leu Leu
690 695 700
Arg Ile Leu Lys Glu Thr Glu Phe Lys Lys Ile Lys Val Leu Gly Ser
705 710 715 720
Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys Gly Leu Trp Ile Pro Glu Gly Glu
725 730 735
Lys Val Lys Ile Pro Val Ala Ile Lys Glu Leu Arg Glu Ala Thr Ser
740 745 750
Pro Lys Ala Asn Lys Glu Ile Leu Asp Glu Ala Tyr Val Met Ala Ser
755 760 765
Val Asp Asn Pro His Val Cys Arg Leu Leu Gly Ile Cys Leu Thr Ser
770 775 780
Thr Val Gln Leu Ile Thr Gln Leu Met Pro Phe Gly Cys Leu Leu Asp
785 790 795 800
Tyr Val Arg Glu His Lys Asp Asn Ile Gly Ser Gln Tyr Leu Leu Asn
805 810 815
Trp Cys Val Gln Ile Ala Lys Gly Met Asn Tyr Leu Glu Asp Arg Arg
820 825 830
Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Val Leu Val Lys Thr Pro
835 840 845
Gln His Val Lys Ile Thr Asp Phe Gly Leu Ala Lys Leu Leu Gly Ala
850 855 860
Glu Glu Lys Glu Tyr His Ala Glu Gly Gly Lys Val Pro Ile Lys Trp
865 870 875 880
Met Ala Leu Glu Ser Ile Leu His Arg Ile Tyr Thr His Gln Ser Asp
885 890 895
Val Trp Ser Tyr Gly Val Thr Val Trp Glu Leu Met Thr Phe Gly Ser
900 905 910
Lys Pro Tyr Asp Gly Ile Pro Ala Ser Glu Ile Ser Ser Ile Leu Glu
915 920 925
Lys Gly Glu Arg Leu Pro Gln Pro Pro Ile Cys Thr Ile Asp Val Tyr
930 935 940
Met Ile Met Val Lys Cys Trp Met Ile Asp Ala Asp Ser Arg Pro Lys
945 950 955 960
Phe Arg Glu Leu Ile Ile Glu Phe Ser Lys Met Ala Arg Asp Pro Gln
965 970 975
Arg Tyr Leu Val Ile Gln Gly Asp Glu Arg Met His Leu Pro Ser Pro
980 985 990
Thr Asp Ser Asn Phe Tyr Arg Ala Leu Met Asp Glu Glu Asp Met Asp
995 1000 1005
Asp Val Val Asp Ala Asp Glu Tyr Leu Ile Pro Gln Gln Gly Phe Phe
1010 1015 1020
Ser Ser Pro Ser Thr Ser Arg Thr Pro Leu Leu Ser Ser Leu Ser Ala
1025 1030 1035 1040
Thr Ser Asn Asn Ser Thr Val Ala Cys Ile Asp Arg Asn Gly Leu Gln
1045 1050 1055
Ser Cys Pro Ile Lys Glu Asp Ser Phe Leu Gln Arg Tyr Ser Ser Asp
1060 1065 1070
Pro Thr Gly Ala Leu Thr Glu Asp Ser Ile Asp Asp Thr Phe Leu Pro
1075 1080 1085
Val Pro Glu Tyr Ile Asn Gln Ser Val Pro Lys Arg Pro Ala Gly Pro
1090 1095 1100
Val Gln Asn Pro Val Tyr His Asn Gln Pro Leu Asn Pro Ala Pro Ser
1105 1110 1115 1120
Arg Asp Pro His Tyr Gln Asp Pro His Ser Thr Ala Val Gly Asn Pro
1125 1130 1135
Glu Tyr Leu Asn Thr Val Gln Pro Thr Cys Val Asn Ser Thr Phe Asp
1140 1145 1150
Ser Pro Ala His Trp Ala Gln Lys Gly Ser His Gln Ile Ser Leu Asp
1155 1160 1165
Asn Pro Asp Tyr Gln Gln Asp Phe Phe Pro Lys Glu Ala Lys Pro Asn
1170 1175 1180
Gly Ile Phe Lys Gly Ser Thr Ala Glu Asn Ala Glu Tyr Leu Arg Val
1185 1190 1195 1200
Ala Pro Gln Ser Ser Glu Phe Ile Gly Ala
1205 1210
<210> 7
<211> 16
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> anchored oligo-dT primer H-T11C
<400> 7
aagctttttt tttttc 16
<210> 8
<211> 13
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer H-AP33
<400> 8
aagcttgctg ctc 13
Claims (17)
- 서열번호: 2, 서열번호: 4 및 서열번호: 6으로 구성된 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 갖는 인간 원암단백질.
- 제 1 항의 원암단백질을 암호화하는 인간 원암유전자.
- 제 2 항에 있어서, 서열번호: 1의 염기서열을 갖는 것을 특징으로 하는 인간 원암유전자.
- 제 3 항에 있어서, 서열번호: 1의 염기 번호 631 내지 828에 해당되는 염기서열은 서열번호 2의 아미노산 서열을 갖는 인간 원암단백질을 코딩하는 것인 인간 원암유전자.
- 제 2 항에 있어서, 서열번호: 3의 염기서열을 갖는 것을 특징으로 하는 인간 원암유전자.
- 제 5 항에 있어서, 서열번호: 3의 염기 번호 24 내지 1088에 해당되는 염기서열은 서열번호 4의 아미노산 서열을 갖는 인간 원암단백질을 코딩하는 것인 인간 원암유전자.
- 제 2 항에 있어서, 서열번호: 5의 염기서열을 갖는 것을 특징으로 하는 인간 원암유전자.
- 제 7 항에 있어서, 서열번호: 5의 염기 번호 47 내지 3679에 해당되는 염기서열은 서열번호 6의 아미노산 서열을 갖는 인간 원암단백질을 코딩하는 것인 인간 원암유전자.
- 제 2 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항의 원암유전자를 포함하는 벡터.
- 제 9 항의 벡터에 의해 형질전환된 미생물.
- 제 10 항의 미생물을 이용하여 서열번호: 2의 아미노산 서열을 갖는 단백질을 제조하는 방법.
- 제 1항의 원암단백질을 포함하는 암 진단용 키트.
- 제 2 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항의 원암유전자를 포함하는 암 진단용 키트.
- 제 2 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항의 원암유전자로부터 전사되는 mRNA 서열의 전부 또는 일부와 상보적인 염기서열을 지니고, 상기 mRNA에 결합하여 상기 원암유전자의 발현을 억제하는 안티-센스 올리고뉴클레오티드.
- 제 2 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항의 원암유전자로부터 전사되는 mRNA 서열의 전부 또는 일부와 상보적인 염기서열을 지니고, 상기 mRNA에 결합하여 상기 원암유전자의 발현을 억제하는 siRNA를 암호화하는 유전자.
- 제 14항의 안티-센스 올리고뉴클레오티드를 활성성분으로 포함하는 항암 및 항전이 조성물.
- 제 15항의 siRNA를 암호화하는 유전자를 활성성분으로 포함하는 항암 및 항전이 조성물.
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KR1020070107895A KR100915609B1 (ko) | 2007-10-25 | 2007-10-25 | 인간 원암유전자 및 이에 의해 코드되는 단백질 |
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KR100689283B1 (ko) * | 2006-07-24 | 2007-03-08 | 김현기 | 인간 원암 유전자, 이에 의해 코드되는 단백질, 이를포함하는 발현벡터 및 이 벡터로 형질전환된 세포 |
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