KR102638901B1 - 세포-결합제 및 세포독성 약물을 포함하는 콘주게이트 - Google Patents

세포-결합제 및 세포독성 약물을 포함하는 콘주게이트 Download PDF

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루크 비. 해리스
다니엘 타바레즈
링윈 루이
나단 엘리엇 피쉬킨
마나미 시즈카
마이클 루이스 밀러
라비 브이.제이. 차리
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이뮤노젠 아이엔씨
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Abstract

본 발명은 신규 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트에 관한 것이고, 상기 세포-결합제 (CBA)는 CBA 상의 2-하이드록시에틸아민 모이어티의 산화로부터 수득된 알데하이드 그룹을 통해 세포독성 약물에 공유 결합된다.본 발명은 또한 본 발명의 콘주게이트를 제조하는 방법을 제공한다.본 발명은 추가로, 본 발명의 콘주게이트를 사용하여 포유동물에서 비정상 세포 성장을 억제하거나 증식성 장애를 치료하는데 유용한 조성물 및 방법을 제공한다.

Description

세포-결합제 및 세포독성 약물을 포함하는 콘주게이트{CONJUGATES COMPRISING CELL-BINDING AGENTS AND CYTOTOXIC AGENTS}
관련 출원에 대한 참조
본원은 하기 하에서 35 U.S. C §119(e) 하의 출원일을 우선권으로 주장한다: U.S. 가출원 번호 62/045,264(2014년 9월 3일 출원), U.S. 가출원 번호 62/086,986(2014년 12월 3일 출원), U.S. 가출원 번호 62/149,379(2015년 4월 17일 출원), 및 U.S. 가출원 번호 62/186,235(2015년 6월 29일 출원) (모든 도면, 식, 명세서, 및 청구범위를 포함하는 각각의 전제 내용은 본 명세서에 참고로 편입되어 있음).
항체-약물 콘주게이트 (ADC) 및 세포 결합제-약물 콘주게이트는 광범위한 암에 대한 효능을 가진 강력한 부류의 항종양 제제로서 부상하고 있다. 세포 결합제-약물 콘주게이트 (예컨대 ADC)는 통상적으로 3개의 상이한 요소로 구성된다: 세포-결합제 (예를 들면, 항체); 링커; 및 세포독성 모이어티. 종래에, 세포독성 약물 모이어티는 항체 상의 라이신에 공유결합되어, 항체 분자 상의 상이한 위치에서 부착된 다양한 수의 약물을 갖는 ADC의 불균질 혼합물인 콘주게이트를 생성한다.
배경기술이 개시된 선행기술문헌
- 선행문헌 1: WO 93/06132 A1 (1993.04.01), 변형된 펩타이드 유도체
- 선행문헌 2: US 2013/295007 A1 (2013.11.07), 항-pmel17 항체 및 면역콘주게이트
- 선행문헌 3: US 2009/181037 A1 (2009.07.16), 반합성 GLP-1 펩타이드-FC 융합 구조물, 방법 및 용도
발명의 요약
세포 결합제, 예컨대 항체 상의 N-말단 세린 잔기의 2-하이드록시에틸아민 모이어티가 항체의 과-산화 없이 알데하이드 그룹으로 선택적으롤 산화될 수 있다는 것이 놀랍게도 발견되었다. 알데하이드 그룹을 갖는 수득한 항체는 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 세포독성 약물로 또는 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 링커 화합물을 통해 부위-특이적인 콘주게이션을 가능하게 한다. 수득한 항체-약물 콘주게이트 놀랍게도, 콘주게이션 부위가 항체의 N-말단에서 위치한다는 사실에도 불구하고 비접합된 항체와 유사한 항원 결합 친화도를 유지한다. 또한, 수득한 콘주게이트는 예상외로, 항체에 대해 연결된 단지 2개의 분자의 약물 부하를 가짐에도 불구하고 높은 효력을 나타내고, 라이신-연결된 콘주게이트와 비교하여 더 잘 용인된다.
특정 구현예에서, 세포 결합제, 예컨대 항체는 옥심 결합 (-C=N-O-)을 통해 세포독성 약물에 공유 결합된다. 놀랍게도, 하기의 최근 공개된 발견과는 반대도: (참고 Agarwal 등 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 110: 46-51, 2013), 옥심 결합은 생체내에서 크게 안정하다.
본 발명은 하기 구조식으로 나타낸 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 제공한다:
Figure 112023025074489-pat00001
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 식 중:
CBA는 JCB’ 그룹에 공유 결합된 세포-결합제이고;
JCB’는 CBA 상의 알데하이드 그룹과 그룹 L에 연결된 알데하이드 반응성 그룹을 반응시켜서 형성된 모이어티이고, 상기 알데하이드 그룹은 하기 구조식으로 나타낸 2-하이드록시에틸아민 모이어티의 산화로부터 유도되고:
Figure 112023025074489-pat00002
상기 2-하이드록시에틸아민 모이어티는 세린, 트레오닌, 하이드록실리신, 4-하이드록시오르니틴 또는 2,4-디아미노-5-하이드록시 발레르산 잔기의 일부이고;
L은 스페이서 또는 결합이고;
JD’는 상기 그룹 L을 갖는 세포독성 약물 D을 연결하는 연결 모이어티이거나, L이 결합일 때, 부재하고;
D는 상기 연결 모이어티 JD’를 통해 L에, 또는 L이 결합일 때 JCB’를 통해 CBA에 공유 결합된 세포독성 약물이고; 그리고
w는 1, 2, 3 또는 4임).
본 발명은 또한, 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부를 제공하고, 이것은 하기의 서열식별번호: 1의 아미노산 서열을 갖는 이종성 신호 펩타이드를 포함한다.
본 발명은 추가로, 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부를 제공하고, 이것은 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 신호 펩타이드의 마지막 잔기에 대한 바로 C-말단인 Ser 또는 Thr 잔기를 포함한다.
또한 중쇄, 경쇄, 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열 상에서 N-말단 Ser 또는 Thr를 갖는 항체로부터 산화된 변형된 항체가 제공되고, 상기 N-말단 Ser 또는 Thr는 변형된 항체에서 알데하이드 그룹으로 산화되었다.
본 발명은 또한, 본 명세서에서 기재된 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부를 인코딩하는 폴리뉴클레오타이드 및 본 명세서에서 기재된 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부를 생산하는 방법을 포함한다.
일 구현예에서, 본 발명은 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 제조하는 방법에 관한 것이고, 하기의 단계들을 포함한다:
세포-결합제의 2-하이드록시에틸아민 모이어티를 산화제로 산화시켜 알데하이드 그룹을 갖는 산화된 세포-결합제를 형성하는 단계로서; 상기 2-하이드록시에틸아민 모이어티는 세린, 트레오닌, 하이드록실리신, 4-하이드록시오르니틴 또는 2,4-디아미노-5-하이드록시 발레르산 잔기의 일부, 및는 하기 구조식으로 나타내는 단계:
Figure 112023025074489-pat00003
및
(b) 상기 산화된 세포-결합제를:
(i) 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 세포독성 약물-링커 화합물 또는 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 세포독성 약물과 접촉시켜 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계; 또는
(ii) 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 링커 화합물과 접촉시켜 링커를 결합한 변형된 항체 또는 그것의 변형된 항원-결합부를 형성하고, 그 다음 상기 변형된 항체 또는 상기 그것의 변형된 항원-결합부를 세포독성 약물과 반응시켜 상기 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계; 또는
(iii) 세포독성 약물과 접촉시키고, 그 다음 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 링커 화합물 및 상기 세포독성 약물과의 공유 결합을 형성할 수 있는 반응성 그룹을 부가하여 상기 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계.
일 구현예에서, 본 발명은 하기 식으로 나타낸 세포독성 화합물에 관한 것이다:
Figure 112023025074489-pat00004
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 식 중:
LD’, LD”, 및 LD”’ 중 1개는 하기 식으로 나타내고:
Figure 112023025074489-pat00005
그리고 다른 2개는 동일 또는 상이하고, -H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(OCH2CH2)n-Rc, 할로겐, 구아니디늄 [-NH(C=NH)NH2], -OR, -NR’R”, -NO2, -NR’COR”, -SR, -SOR’, -SO2R’, -SO3H, -OSO3H, -SO2NR’R”, 시아노, 아지도, -COR’, -OCOR’, 및 -OCONR’R”로부터 독립적으로 선택되고;
Zd1은 부재, -C(=O)-NR9- 또는 -NR9-C(=O)-이고;
P는 아미노산 잔기 또는 2 내지 20개의 아미노산 잔기를 함유하는 펩타이드이고;
Ra 및 Rb는, 각 경우에 대해, 독립적으로 -H, (C1-C3)알킬 또는 하전된 치환체 또는 이온화가능 그룹 Q이고;
r 및 r’는 독립적으로 1 내지 6의 정수이고;
N과 C 사이의 이중 선은 단일 결합 또는 이중 결합을 나타내고, 단, 그것이 이중 결합일 때 X는 부재이고 Y는 -H, 또는 1 내지 4개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬이고, 그리고 단일 결합일 때, X는 -H 또는 아민 보호 모이어티이고;
Y는 하기로부터 선택된 이탈 그룹이고: -OR, -OCOR’, -OCOOR’, -OCONR’R”, -NR’R”, -NR’COR”, -NR’NR’R”, 임의로 치환된 5- 또는 6-원 질소-함유 헤테로사이클 (예를 들면, 질소 원자를 통해 부착된 피페리딘, 테트라하이드로피롤, 피라졸, 모폴린, 등), -NR’(C=NH)NR’R”로 나타낸 구아니디늄, -NRCOP’으로 나타낸 아미노산, 또는 펩타이드, -SR, -SOR’, 할로겐, 시아노, 아지도, -OSO3H, 설파이트 (-SO3H 또는 -SO2H), 메타바이설파이트 (H2S2O5), 모노-, 디-, 트리-, 및 테트라- 티오포스페이트 (PO3SH3, PO2S2H2, POS3H2, PS4H2), 티오 포스페이트 에스테르 (RiO)2PS(ORi), RiS-, RiSO, RiSO2, RiSO3, 티오설페이트 (HS2O3), 디티오나이트 (HS2O4), 포스포로디티오에이트 (P(=S)(ORk’)(S)(OH)), 하이드록삼산 (Rk’C(=O)NOH), 및 포름알데하이드 설폭실레이트 (HOCH2SO2 -) 또는 이들의 혼합물, 여기서 Ri는 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬이고 -N(Rj)2, -CO2H, -SO3H, 및 -PO3H로부터 선택된 적어도 1개의 치환체로 치환되고; Ri는 본 명세서에서 기재된 알킬에 대한 치환체로 추가로 임의로 치환될 수 있고; Rj는 1 내지 6개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬이고; Rk는 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 아릴, 헤테로사이클릴 또는 헤테로아릴이고;
P’는 아미노산 잔기 또는 2 내지 20개의 아미노산 잔기를 함유하는 폴리펩타이드이고,
R은, 각 경우에 대해, -H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(CH2CH2O)n-Rc, 6 내지 18개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 아릴, 질소, 산소, 및 황으로부터 독립적으로 선택된 1종 이상의 헤테로원자를 함유하는 임의로 치환된 5- 내지 18-원 헤테로아릴 고리, 또는 O, S, N 및 P로부터 독립적으로 선택된 1 내지 6개의 헤테로원자를 함유하는 임의로 치환된 3- 내지 18-원 헤테로사이클릭 고리로 구성된 군으로부터 독립적으로 선택되고;
R’ 및 R” 각각은 -H, -OH, -OR, -NHR, -NR2, -COR, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(CH2CH2O)n-Rc, 및 O, S, N 및 P로부터 독립적으로 선택된 1 내지 6개의 헤테로원자를 갖는 임의로 치환된 3- 내지 18-원 헤테로사이클릭 고리로부터 독립적으로 선택되고;
Rc는 -H 또는 1 내지 4개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형 또는 분지형 알킬이고;
n은 1 내지 24의 정수이고;
X’는 -H, 아민-보호 그룹, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(CH2CH2O)n-Rc, 6 내지 18개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 아릴, 질소, 산소, 및 황으로부터 독립적으로 선택된 1종 이상의 헤테로원자를 함유하는 임의로 치환된 5- 내지 18-원 헤테로아릴 고리, 및 O, S, N 및 P로부터 독립적으로 선택된 1 내지 6개의 헤테로원자를 함유하는 임의로 치환된 3- 내지 18-원 헤테로사이클릭 고리로부터 선택되고;
Y’는 -H, 옥소 그룹, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 임의로 치환된 6- 내지 18-원 아릴, 질소, 산소, 및 황으로부터 독립적으로 선택된 1종 이상의 헤테로원자를 함유하는 임의로 치환된 5- 내지 18-원 헤테로아릴 고리, 1 내지 6개의 헤테로원자를 갖는 임의로 치환된 3- 내지 18-원 헤테로사이클릭 고리로부터 선택되고;
R1, R2, R3, R4, R1’, R2’, R3’ 및 R4’ 각각은 -H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(OCH2CH2)n-Rc, 할로겐, 구아니디늄 [-NH(C=NH)NH2], -OR, -NR’R”, -NO2, -NCO, -NR’COR”, -SR, -SOR’, -SO2R’, -SO3 -H, -OSO3H, -SO2NR’R”, 시아노, 아지도, -COR’, -OCOR’, 및 -OCONR’R”로 구성된 군으로부터 독립적으로 선택되고;
R6는 -H, -R, -OR, -SR, -NR’R”, -NO2, 또는 할로겐이고;
A 및 A’는 동일 또는 상이하고, -O-, 옥소 (-C(=O)-), -CRR’O-, -CRR’-, -S-, -CRR’S-, -NR5 및 -CRR’N(R5)-로부터 독립적으로 선택되고;
R5 및 R9 각각은 독립적으로 -H 또는 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형 또는 분지형 알킬이고;
JCB는 알데하이드 반응성 그룹이다.
식 (I)의 콘주게이트 또는 식 (D18’)-(D23’)의 세포독성 화합물 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염 및 약제학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 약제학적 조성물이 본 발명에서 또한 포함된다.
약제학적 조성물은 추가로, 제2 치료적 (예를 들면, 화학요법적) 제제를 포함할 수 있다.
본 발명은 또한, 비정상 세포 성장을 억제하거나 포유동물 (예를 들면, 인간)증식성 장애, 골 파괴 장애, 자가면역 장애, 이식편 대 숙주 질환, 이식 거부, 면역 결핍, 염증성 질환, 감염성 질환, 바이러스성 질환, 섬유성 질환, 신경퇴행성 장애, 췌장염, 또는 신장 질환을 치료하는 방법을 포함하고, 상기 방법은, 상기 포유동물에게 치료적 유효량의 콘주게이트 식 (I), 또는 식 (D18’)-(D23’)로 나타낸 세포독성 화합물 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염을 투여하는 것을 포함한다.
관련된 구현예에서, 상기에서 기재된 방법은 추가로, 상기 포유동물에게 순차적으로 또는 연속하여 제2 치료적 (예를 들면, 화학요법적) 제제를 투여하는 것을 포함한다.
도 1은 조작된 N-말단 Ser-함유 인간화된 단클론성 항체 huMOV19-NTS#2를 이용하여 huMOV19-NTS#2-링커1-화합물 A ADC를 합성하기 위한 반응식 1을 나타낸다.
도 2는 온전한 huMOV19-NTS#2-링커1-화합물 A의 Q-ToF 질량 분광분석법 (MS) 데이터이다. 상기 반응 생성물은 항체당 2개의 화합물 A 분자가 혼입된 균일한 ADC임이 분명하다.
도 3은 조작된 N-말단 Ser-함유 인간화된 단클론성 항체 huMOV19-NTS#2를 이용하여 huMOV19-NTS#2-아미노옥시-아세틸-MayNMA ADC를 합성하기 위한 반응식 2를 나타낸다.
도 4는 온전한 huMOV19-NTS#2-아미노옥시-아세틸-MayNMA의 Q-ToF 질량 분광분석법 (MS) 데이터이다. 반응 생성물은 항체당 2개의 MayNMA 분자가 혼입된 균일한 ADC임이 분명하다.
도 5는 조작된 N-말단 Ser-함유 인간화된 단클론성 항체 (예를 들면, huMOV19-NTS#1)를 이용하여 항체 (예컨대 huMOV19-NTS#1)-링커1-화합물 A ADC를 합성하기 위한 반응식 3을 나타낸다.
도 6은 온전한 huMOV19-NTS#1-링커1-화합물 A의 Q-ToF 질량 분광분석법 (MS) 데이터를 나타낸다.
도 7a는 N-말단 Ser-특이적 접합이 항원에의 항체 결합에 현저히 영향을 미치지 않는다는 것을 입증한다. huMOV19-NTS#2-MayNMA (또는 SeriMab-May) 및 huMOV19-NTS#2-화합물 A (또는 SeriMab-sDGN462) 모두는 조작된 N-말단 Ser 잔기를 통해 각각 메이탄시노이드 및 세포독성 화합물 A (또는 설폰화된 DGN462 (sDGN462))에 연결된 인간화된 I gG 단클론성 항체 huMOV19를 포함하는 ADC이다. T47D (즉, 표면 상의 FRα 항원) 및 ADC (또는 대조군 항체 또는 FACS 버퍼 대조군) 사이의 결합은 T47D 표면 상에서 임의의 ADC (또는 대조군 Ab)에 결합된 FITC-접합된 염소 항-인간-IgG-Fcγ 2차 항체의 FACS 검출에 의해 측정하였다.
도 7b는 FRα-항원을 발현하는 T47D 세포에 대한 huMOV19-NTS#2-링커1-화합물A의 FACS 결합 데이터를 나타낸다. 라이신-로딩된 huMOV19-sSPDB-화합물 A 및 N-말단 변형된 huMOV19-NTS#2-링커1-화합물 A 모두는 대등한 세포 결합을 가지며, 이는 또한 비접합된 원상태 huMOV19 및 조작된 huMOV19-NTS#2와 유사하다 (표의 EC50 값 참고).
도 8a는 N-말단 Ser-특이적 변형 또는 접합이 항원에의 항체 결합에 현저히 영향을 미치지 않는다는 것을 나타낸다. 상기 도 7a 및 7b에 나타난 바와 같이, 야생형 항-FRα 항체 huMOV19, 그의 N-말단 Ser 변형된 버전 huMOV19-NTS#2 (“SeriMab”), 및 그의 메이탄시노이드에의 각 접합체인 Ab-SMCC-DM1 (SMCC 링커를 통해 DM1에 Lys 잔기를 통해 연결된 야생형 huMOV19) 및 SeriMab-May (조작된 N-말단 Ser을 통해 메이탄시노이드에 연결된 huMOV19-NTS#2) 모두는 FACS에 의해 측정된 바와 같이 FRα-보유 T47D 세포에 대해 본질적으로 동일한 결합 친화도를 갖는다.
도 8b는 N-말단 Ser-특이적 변형 또는 접합이 항원에의 항체 결합에 현저히 영향을 미치지 않는다는 것을 나타낸다. 상기 도 7a 및 7b에 나타난 바와 같이, 야생형 항-FRα 항체 huMOV19, 그의 N-말단 Ser 변형된 버전 huMOV19-NTS#2 (“SeriMab”) 및 그의 세포독성 화합물 A에의 접합체 (SeriMab-sDGN462) 모두는 FACS에 의해 측정된 바와 같이 FRα-보유 T47D 세포에 대해 본질적으로 동일한 결합 친화도를 갖는다.
도 9a는 KB 자궁경부암 세포주에 대한 ADC 접합체 MOV19-NTS#2-링커1-화합물 A의 세포독성 평가 결과를 나타낸다. 상기 데이터는 상기 대상 부위-특이적인 N-말단 Ser 연결된 SERIMab-화합물 A 접합체가 라이신-접합된 sSPDB-화합물 A보다 항체 농도에 기초하여 약 3배 더 강력하고, 화합물 A 농도에 기초하여 약 5배 더 강력하다는 것을 나타낸다. 두 가지 접합체는 동일한 항원-독립적 활성을 갖는데, 1 μM 비접합된 huMOV19의 존재시 KB 세포 상의 항원 결합 부위를 차단하는 상기 2개의 시험된 접합체의 효력이 거의 동일하기 때문이다.
도 9b는 KB 자궁경부암 세포주에 대한 ADC 접합체 SeriMab-May의 세포독성 평가 결과를 나타낸다. 상기 데이터는 SeriMab-May 접합체가 더 높은 DAR (세포독성 화합물 대 항체 비)을 갖는 라이신-접합체 Ab-SMCC-DM1과 동일한 효력을 갖는다는 것을 나타낸다.
도 10 및 11은 본 발명의 접합체를 제조하는데 사용될 수 있는 예시적인 세포독성 화합물을 나타낸다.
도 12a-12d는 본 발명의 접합체를 제조하기 위한 예시적인 반응식을 나타낸다.
도 13은 NCI-H2110 보유 SCID 마우스에서 huMOV19-NTS#2-링커1-화합물 A 접합체에 대한 생체내 효능을 나타낸다.
도 14A는 디설파이드 링커를 갖는 SeriMab-sDGN462 접합체의 구조를 나타낸다. 점선은 관찰된 표적 세포 이화대사물을 야기하는 절단 부위의 위치를 가리킨다. 도 14B는 시험관내에서 KB 자궁경부암 세포에서 형성된 SeriMab-sDGN462 접합체로부터 이화대사물을 배양, 정제, 및 단리하기 위한 반응식을 나타낸다. LC-MS에 의해 확인된 4가지 이화대사물이, 계산 및 관찰된 m/z 비와 함께 나타나 있다.
도 15A는 비-절단가능 링커를 갖는 SeriMab-May 접합체의 구조를 나타낸다. 점선은 관찰된 표적 세포 이화대사물을 야기하는 절단 부위의 위치를 가리킨다. 도 15B는 시험관내에서 KB 자궁경부암 세포에서 형성된 SeriMab-May로부터 이화대사물을 배양, 정제, 및 단리하기 위한 반응식을 나타낸다. LC-MS에 확인된 2가지 이화대사물이, 계산 및 관찰된 m/z 비와 함께 나타나 있다.
도 16은 SeriMab-sDGN462 및 상응하는 Lys-연결된 접합된 Ab-sSPDB-sDGN462의 방관자 사멸 분석 (bystander killing assay) 결과를 나타낸다.
도 17은 조작된 N-말단 Ser-함유 인간화된 단클론성 항체를 사용하여 huCD123-sD8 접합체를 합성하기 위한 예시적인 반응식을 보여준다.
도 18은 링커 1 잔기를 갖는 huCD123-6-SeriMab-sD1 접합체를 합성하기 위한 예시적인 반응식을 나타낸다.
도 19는 링커 1 잔기를 갖는, 4 DAR을 갖는 huMOV19NTS2S3-SeriMab-DGN462 또는 -sDGN462 접합체 (huMov19NTS2S3-SeriMab-sDGN462)를 합성하기 위한 예시적인 반응식을 나타낸다.
도 20은 4 DAR을 갖는 huMOV19NTS2S3-SeriMab-sDGN462 접합체 (huMov19NTS2S3-SeriMab-sDGN462)의 Q-ToF 질량 분광분석법 (MS) 데이터를 나타낸다.
도 21a는 4 DAR을 갖는 huMOV19NTS2S3-SeriMab-MayNMA 접합체를 합성하기 위한 예시적인 반응식을 나타낸다. 도 21B는 4 DAR을 갖는 Ser-연결된 huMOV19-SeriMab-MayNMA 접합체의 Q-ToF 질량 분광분석법 (MS) 데이터를 나타낸다.
도 22a-22c는 huCD123-6의 SeriMab (huCD123-6Rv1.1S2-SeriMab-D8, 채워진 검정색 원)이 적어도 하기 세포주에서 동일한 항체의 라이신-연결된 접합체 (huCD123-6Rv1.1-D2, 채워진 하향 검정색 삼각형)만큼 활성임을 나타낸다: AML 세포주 SHI-1 (도 22a) 및 HNT-34 (도 22b), 뿐만 아니라 CML 세포주 MOLM-1 (도 22c). 각 도면에서 개방된 데이터 포인트를 연결하는 점선은 차단하는 농도 (500 nM)의 비접합된 huCD123-6 항체의 존재시 각 접합체의 활성을 나타낸다 (즉, huCD123-6Rv1.1S2-SeriMab-D8의 경우 개방된 원, 및 huCD123-6Rv1.1-D2의 경우 개방된 하향 삼각형). Lys-연결된 항체-D2 접합체의 구조는 실시예 28을 참고한다 (huMOV19-D2 구조가 나타나 있지만, huCD123-6Rv1.1-D2 접합체는 동일한 구조를 가짐).
도 23은 N-말단 Ser-특이적 변형 또는 접합이 항원에의 항체 결합에 현저히 영향을 미치지 않는다는 것을 나타낸다. 야생형 항-FRα huMOV19 항체, 그의 N-말단 Ser 변형된 버전 huMOV19-NTS2 (“huMOV19-SeriMab 항체”) 및 그의 세포독성 화합물 D8에의 접합체 (huMOV19-SeriMab-D8) 모두는 FACS에 의해 측정된 바와 같이 FRα-보유 T47D 세포에 대해 본질적으로 동일한 결합 친화도를 갖는다.
도 24는 huCD123-6Gv4.7S3-SeriMab-sD1 접합체 (도 18 참고)가 하기 세포에서 huCD123-6Gv4.7S2(또는 S3)-SeriMab-D8 접합체와 유사한 효력을 나타낸다는 것을 나타낸다: EOL-1 세포. Lys-연결된 huCD123-6Gv4.7S3-sSPDB-D1 및 huCD123-6Gv4.7S3-D2 접합체의 결과가 또한 나타나 있다.
도 25는 huCD123 항체를 갖는 Ser-연결된 DGN462 화합물이 더 높은 DAR을 갖는 라이신 연결된 버전보다 EOL-1 세포에 대해 3배 더 높은 항원-특이적 효력을 갖는다는 것을 나타낸다.
도 26A-26C는 SeriMab-D8 (huMOV19-NTS#2-SeriMab-D8) 접합체가 라이신 접합체 (huMOV19-D2)와 대등한 항원-특이적 효력 및 표적 결합을 갖는다는 것을 나타낸다.
도 27은 huMOV19-SeriMab-D8 및 상응하는 Lys-연결된 접합된 huMOV19-D2의 방관자 사멸 분석 결과를 나타낸다.
도 28은 huMOV19-NTS#2-아미노옥시-아세틸-MayNMA 접합체에서 옥심 연결의 생체내 안정성을 나타낸다.
도 29는 100 μg/kg 또는 150 μg/kg의 라이신-연결된 huMOV19-D2 접합체 또는 200 μg/kg huMOV19-SeriMab-D8로 처리된 암컷 CD-1 마우스의 개별적인 체중 퍼센트 변화를 나타낸다.
도 30은 본 발명의 접합체를 합성하기 위한 예시적인 반응식을 나타낸다.
도 31a 및 31b는 본 발명의 접합체를 합성하기 위한 예시적인 반응식을 나타낸다.
본 발명의 특정 구현예가 상세히 언급될 것이며, 이의 예는 첨부된 구조 및 식으로 예시된다. 본 발명이 열거된 구현예와 관련하여 기재될 것이지만, 이는 본 발명을 상기 구현예로 한정하고자 하는 것이 아님이 이해될 것이다. 그와 반대로, 본 발명은 청구범위에 의해 정의된 바와 같은 본 발명의 범위 내에 포함될 수 있는 모든 대안, 변형, 및 등가물을 포함하고자 하는 것이다. 당해 분야의 숙련가는 본 발명의 실시에 사용될 수 있는 본원에 기재된 것과 유사하거나 동등한 많은 방법 및 물질을 인식할 것이다.
본 발명의 상이한 측면 (예를 들면, 화합물, 접합체, 조성물, 제조 및 사용 방법) 및 명세서의 상이한 부분 (실시예에만 기재된 구현예 포함) 하에 기재된 것을 포함하는 본원에 기재된 구현예 중 어느 것은 명시적으로 부인되거나 부적절하지 않는 한 본 발명의 하나 이상의 다른 구현예와 조합될 수 있는 것으로 이해되어야 한다. 구현예의 조합은 다중 종속 청구항을 통해 청구된 특정 조합에 한정되지 않는다.
정의
“선형 또는 분지형 알킬”은, 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 1 내지 20개의 탄소 원자의 포화된 선형 또는 분지형-사슬 1가 탄화수소 라디칼을 의미한다. 알킬의 예는, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 메틸, 에틸, 1-프로필, 2-프로필, 1-부틸, 2-메틸-1-프로필, -CH2CH(CH3)2), 2-부틸, 2-메틸-2-프로필, 1-펜틸, 2-펜틸 3-펜틸, 2-메틸-2-부틸, 3-메틸-2-부틸, 3-메틸-1-부틸, 2-메틸-1-부틸, 1-헥실), 2-헥실, 3-헥실, 2-메틸-2-펜틸, 3-메틸-2-펜틸, 4-메틸-2-펜틸, 3-메틸-3-펜틸, 2-메틸-3-펜틸, 2,3-디메틸-2-부틸, 3,3-디메틸-2-부틸, 1-헵틸, 1-옥틸, 등. 바람직하게는, 알킬은 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는다. 더 바람직하게는, 알킬은 1 내지 4개의 탄소 원자를 갖는다.
“선형 또는 분지형 알케닐”은 불포화, 즉, 탄소-탄소, 이중 결합의 적어도 1개의 부위를 갖는 2 내지 20개의 탄소 원자의 선형 또는 분지형-사슬 1가 탄화수소 라디칼을 의미하고, 상기 알케닐 라디칼은 “시스” 및 “트랜스” 방향, 또는 대안적으로, “E” 및 “Z” 방향을 갖는 라디칼을 포함한다. 그 예는, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 에틸레닐 또는 비닐 (-CH=CH2), 알릴 (-CH2CH=CH2), 등. 바람직하게는, 알케닐은 2 내지 10개의 탄소 원자를 갖는다. 더 바람직하게는, 알킬은 2 내지 4개의 탄소 원자를 갖는다.
“선형 또는 분지형 알키닐”은 적어도 1종의 부위 of 불포화, 즉, 탄소-탄소, 삼중 결합의 적어도 1개의 부위를 갖는 2 내지 20개의 탄소 원자의 선형 또는 분지형 1가 탄화수소 라디칼을 의미한다. 그 예는, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 에티닐, 프로피닐, 1-부티닐, 2-부티닐, 1-펜티닐, 2-펜티닐, 3-펜티닐, 헥시닐, 등. 바람직하게는, 알키닐은 2 내지 10개의 탄소 원자를 갖는다. 더 바람직하게는, 알키닐은 2 내지 4개의 탄소 원자를 갖는다.
용어 “카보사이클,” “카보사이클릴” 및 “카보사이클릭 고리”는 3 내지 12개의 탄소 원자를 모노사이클릭 고리로서 또는 7 내지 12개의 탄소 원자를 바이사이클릭 고리로서 갖는 1가 비-방향족, 포화된 또는 부분적으로 불포화된 고리를 의미한다. 7 내지 12개의 원자를 갖는 바이사이클릭 카보사이클은, 예를 들면, 바이사이클로 [4,5], [5,5], [5,6], 또는 [6,6] 시스템으로서 배열될 수 있고, 9 또는 10개의 고리 원자를 갖는 바이사이클릭 카보사이클은 바이사이클로 [5,6] 또는 [6,6] 시스템으로서, 또는 브릿징된 시스템 예컨대 바이사이클로[2.2.1]헵탄, 바이사이클로[2.2.2]옥탄 및 바이사이클로[3.2.2]노난으로서 배열될 수 있다. 모노사이클릭 카보사이클의 예는, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 사이클로프로필, 사이클로부틸, 사이클로펜틸, 1-사이클로펜트-1-에닐, 1-사이클로펜트-2-에닐, 1-사이클로펜트-3-에닐, 사이클로헥실, 1-사이클로헥스-1-에닐, 1-사이클로헥스-2-에닐, 1-사이클로헥스-3-에닐, 사이클로헥사디에닐, 사이클로헵틸, 사이클로옥틸, 사이클로노닐, 사이클로데실, 사이클로운데실, 사이클로도데실, 등.
용어들 “사이클릭 알킬” 및 “사이클로알킬”은 상호교환적으로 사용될 수 있다. 상기는 1가 포화된 카보사이클릭 고리 라디칼을 의미한다. 바람직하게는, 사이클릭 알킬은 3 내지 7 원 모노사이클릭 고리 라디칼이다. 더 바람직하게는, 사이클릭 알킬은 사이클로헥실이다.
용어 “사이클릭 알케닐”은 고리 구조에서 적어도 1종의 이중 결합을 갖는 카보사이클릭 고리 라디칼을 의미한다.
용어 “사이클릭 알키닐”은 고리 구조에서 적어도 1종의 삼중 결합을 갖는 카보사이클릭 고리 라디칼을 의미한다.
“아릴”은 모 방향족 고리계의 단일 탄소 원자로부터 1 개의 수소 원자의 제거에 의해 유도된 6-18개의 탄소 원자의 1가 방향족 탄화수소 라디칼을 의미한다. 일부 아릴 그룹은 “Ar”로서 예시적인 구조로 나타낸다. 아릴은 포화된, 부분적으로 불포화된 고리, 또는 방향족 카보사이클릭 또는 헤테로사이클릭 고리에 융합된 방향족 고리를 포함하는 바이사이클릭 라디칼을 포함한다. 전형적인 아릴 그룹은, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 벤젠 (페닐), 치환된 벤젠, 나프탈렌, 안트라센, 인데닐, 인다닐, 1,2-디하이드로나프탈렌, 1,2,3,4-테트라하이드로나프틸, 등으로부터 유도된 라디칼. 바람직하게는, 아릴은 페닐 그룹이다.
용어들 “헤테로사이클,” “헤테로사이클릴,” 및 “헤테로사이클릭 고리”는 본 명세서에서 상호교환적으로 사용되고 3 내지 18개의 고리 원자의 포화된 또는 부분적으로 불포화된 (즉, 고리 내에 1개 이상의 이중 및/또는 삼중 결합을 가짐) 카보사이클릭 라디칼을 의미하고, 여기서, 적어도 1종의 고리 원자는 질소, 산소, 아인산, 및 황로부터 선택된 헤테로원자이고, 잔여 고리 원자는 C이고, 여기서 1개 이상의 고리 원자는 아래에서 기재된 1개 이상의 치환체 로 임의로 독립적으로 치환된다. 헤테로사이클은 하기일 수 있다: 3 내지 7개의 고리 멤버 (2 내지 6개의 탄소 원자 및 N, O, P, 및 S로부터 선택된 1 내지 4개의 헤테로원자)를 갖는 모노사이클 또는 7 내지 10개의 고리 멤버 (4 내지 9 탄소 원자 및 N, O, P, 및 S로부터 선택된 1 내지 6개의 헤테로원자)를 갖는 바이사이클, 예를 들면: 바이사이클로 [4,5], [5,5], [5,6], 또는 [6,6] 시스템. 헤테로사이클은 하기에서 기재되어 있다: Paquette, Leo A.;”Principles of Modern Heterocyclic Chemistry” (W.A.Benjamin, New York, 1968), 특히 Chapters 1, 3, 4, 6, 7, 및 9; “The Chemistry of Heterocyclic Compounds, A series of Monographs” (John Wiley & Sons, New York, 1950 내지 현지), 특히 Volumes 13, 14, 16, 19, 및 28; 및 J.Am.Chem.Soc.(1960) 82: 5566. ”헤테로사이클릴”은 또한, 라디칼을 포함하고, 여기서 헤테로사이클 라디칼는 포화된, 부분적으로 불포화된 고리, 또는 방향족 카보사이클릭 또는 헤테로사이클릭 고리에 융합된다. 헤테로사이클릭 고리의 예는, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 피롤리디닐, 테트라하이드로푸라닐, 디하이드로푸라닐, 테트라하이드로티에닐, 테트라하이드로피라닐, 디하이드로피라닐, 테트라하이드로티오피라닐, 피페리디노, 모폴리노, 티오모폴리노, 티옥사닐, 피페라지닐, 호모피페라지닐, 아제티딜, 옥세타닐, 티에타닐, 호모피페리디닐, 옥세파닐, 티에파닐, 옥사제피닐, 디아제피닐, 티아제피닐, 2-피롤리닐, 3-피롤리닐, 인돌리닐, 2H-피라닐, 4H-피라닐, 디옥사닐, 1,3-디옥솔라닐, 피라졸리닐, 디티아닐, 디티올라닐, 디하이드로피라닐, 디하이드로티에닐, 디하이드로푸라닐, 피라졸리디닐이미다졸리닐, 이미다졸리디닐, 3-아자바이사이클로[3.1.0]헥사닐, 3-아자바이사이클로[4.1.0]헵타닐, 및 아자바이사이클로[2.2.2]헥사닐. 스피로 모이어티는 이러한 정의 범위 내에 또한 포함된다. 고리 원자가 옥소 (=O) 모이어티로 치환되는 헤테로사이클릭 그룹의 예는 피리미디노닐 및 1,1-디옥소-티오모폴리닐이다.
용어 “헤테로아릴”은 1가 방향족 라디칼 of 5- 또는 6-원 고리를 의미하고 질소, 산소, 및 황으로부터 독립적으로 선택된 1종 이상의 헤테로원자를 함유하는, 5 내지 18개의 원자의 융합 고리계 (이것 중 적어도 1개는 방향족임)를 포함한다. 헤테로아릴 그룹의 예는 피리디닐 (예를 들면, 2-하이드록시피리디닐 포함), 이미다졸릴, 이미다조피리디닐, 피리미디닐 (예를 들면, 4-하이드록시피리미디닐 포함), 피라졸릴, 트리아졸릴, 피라지닐, 테트라졸릴, 퓨릴, 티에닐, 이속사졸릴, 티아졸릴, 옥사졸릴, 이소티아졸릴, 피롤릴, 퀴놀리닐, 이소퀴놀리닐, 인돌릴, 벤즈이미다졸릴, 벤조푸라닐, 신놀리닐, 인다졸릴, 인돌리지닐, 프탈라지닐, 피리다지닐, 트리아지닐, 이소인돌릴, 프테리디닐, 퓨리닐, 옥사디아졸릴, 트리아졸릴, 티아디아졸릴, 푸라자닐, 벤조푸라자닐, 벤조티오페닐, 벤조티아졸릴, 벤즈옥사졸릴, 퀴나졸리닐, 퀴녹살리닐, 나프티리디닐, 및 푸로피리디닐이다.
헤테로사이클 또는 헤테로아릴 그룹은 부착된 탄소 (탄소-연결된) 또는 질소 (질소-연결된)일 수 있고, 여기서 그와 같은 것이 가능하다. 예로써 및 비제한적으로, 탄소 결합된 헤테로사이클 또는 헤테로아릴은 하기에서 결합된다: 피리딘의 위치 2, 3, 4, 5, 또는 6, 피리다진의 위치 3, 4, 5, 또는 6, 피리미딘의 위치 2, 4, 5, 또는 6, 피라진의 위치 2, 3, 5, 또는 6, 푸란, 테트라하이드로푸란, 티오푸란, 티오펜, 피롤 또는 테트라하이드로피롤의 위치 2, 3, 4, 또는 5, 옥사졸, 이미다졸 또는 티아졸의 위치 2, 4, 또는 5, 이속사졸, 피라졸, 또는 이소티아졸의 위치 3, 4, 또는 5, 아지리딘의 위치 2 또는 3, 아제티딘의 위치 2, 3, 또는 4, 퀴놀린의 위치 2, 3, 4, 5, 6, 7, 또는 8 또는 이소퀴놀린의 위치 1, 3, 4, 5, 6, 7, 또는 8.
예로써 및 비제한적으로, 질소 결합된 헤테로사이클 또는 헤테로아릴은 하기에서 결합된다: 아지리딘, 아제티딘, 피롤, 피롤리딘, 2-피롤린, 3-피롤린, 이미다졸, 이미다졸리딘, 2-이미다졸린, 3-이미다졸린, 피라졸, 피라졸린, 2-피라졸린, 3-피라졸린, 피페리딘, 피페라진, 인돌, 인돌린, 1H-인다졸의 위치 1, 이소인돌, 또는 이소인돌린의 위치 2, 모폴린의 위치 4, 및 카바졸, 또는 O-카보린의 위치 9.
헤테로아릴 또는 헤테로사이클릴에서 존재하는 헤테로원자는 산화된 형태 예컨대 NO, SO, 및 SO2를 포함한다.
용어 “할로” 또는 “할로겐”은 F, Cl, Br 또는 I를 의미한다.
상기에서 기재된 알킬, 알케닐, 알키닐, 사이클릭 알킬, 사이클릭 알케닐, 사이클릭 알키닐, 카보사이클릴, 아릴, 헤테로사이클릴 및 헤테로아릴은 하기로 임의로 치환될 수 있다: 1개 초과 (예를 들면, 2, 3, 4, 5, 6 또는 그 초과 개의) 치환체.
치환체는 “치환된"으로서 기재된다면” 비-수소 치환체는 치환체의 탄소, 산소, 황 또는 질소에 대한 수소 치환체를 대신한다. 따라서, 예를 들면, 치환된 알킬 치환체는 알킬 치환체이고, 여기서 적어도 1종의 비-수소 치환체는 알킬 치환체에 대한 수소 치환체를 대신한다. 설명하기 위해, 모노플루오로알킬은 플루오로 치환체로 치환된 알킬이고 디플루오로알킬은 2개의 플루오로 치환체로 치환된 알킬이다. 치환체에 대한 1개 초과 개의 치환이 있다면, 각 비-수소 치환체는 (다르게 언급되지 않는 한) 동일 또는 상이할 수 있는 것으로 기술적으로 인식되어야 한다.
치환체가 “임의로 치환된”인 것으로 기재되면, 치환체는 (1) 치환되지 않거나, (2) 치환될 수 있다. 치환체의 탄소는 치환체의 목록 중 1개 이상으로 임의로 치환되는 것으로 기재되면, 탄소 상의 수소 중 1개 이상 (존재하는 정도까지)는 독립적으로 선택된 임의의 치환체로 별도로 및/또는 함께 치환될 수 있다. 치환체의 질소는 치환체의 목록 중 1개 이상으로 임의로 치환되는 것으로 기재되면, 질소 상의 수소 중 1개 이상 (존재하는 정도까지) 각각은 독립적으로 선택된 임의의 치환체로 치환될 수 있다. 하나의 예시적인 치환체는 -NR’R”로서 묘사될 수 있고, 여기서 R’ 및 R”는, 이들이 부착될 질소 원자와 함께, 헤테로사이클릭 고리를 형성할 수 있다. R’ 및 R”로부터 형성된 헤테로사이클릭 고리는, 이들이 부착될 질소 원자와 함께는 부분적으로 또는 완전 포화될 수 있다. 일 구현예에서, 헤테로사이클릭 고리는 3 내지 7개의 원자로 구성된다. 또 다른 구현예에서, 헤테로사이클릭 고리는 피롤릴, 이미다졸릴, 피라졸릴, 트리아졸릴, 테트라졸릴, 이속사졸릴, 피리딜 및 티아졸릴 로 구성된 군으로부터 선택된다.
본 명세서는 용어들 “치환체,” “라디칼,” 및 “그룹”을 상호교환적으로 사용한다.
치환체의 그룹이 치환체의 목록 중 1개 이상으로 임의로 치환된 것으로 집합적으로 기재된다면, 그룹은 하기를 포함할 수 있다: (1) 치환될 수 없는 치환체, (2) 선택적인 치환체에 의해 치환되지 않는 치환가능한 치환체, 및/또는 (3) 선택적인 치환체 중 1개 이상으로 치환되는 치환가능한 치환체.
치환체가 최대 특정한 수의 비-수소 치환체로 임의로 치환되는 것으로 기재되면, 상기 치환체는 (1) 치환되지 않을 수 있거나; 또는 (2) 최대 상기 특정한 수의 비-수소 치환체에 의해 또는 치환체 상의 최대 최대 수의 치환가능한 위치 중 더 적은 것에 의해 치환될 수 있다. 따라서, 예를 들면, 치환체가 최대 3개의 비-수소 치환체로 임의로 치환된 헤테로아릴 로서 기재되면, 그 다음 3개 미만의 치환가능한 위치를 갖는 임의의 헤테로아릴은 헤테로아릴이 치환가능한 위치를 갖는 만큼 많은 비-수소 치환체에 의해 임의로 치환된다. 그와 같은 치환체는, 비-제한적인 예에서, 하기로부터 선택될 수 있다: 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 아릴, 헤테로아릴, 헤테로사이클릴, 할로겐, 구아니디늄 [-NH(C=NH)NH2], -OR100, NR101R102, -NO2, -NR101COR102, -SR100, -SOR101로 나타낸 설폭사이드, -SO2R101 로 나타낸 설폰, 설포네이트 -SO3M, 설페이트 -OSO3M, -SO2NR101R102 로 나타낸 설폰아미드, 시아노, 아지도, -COR101, -OCOR101, -OCONR101R102 및 폴리에틸렌 글리콜 단위 (-OCH2CH2)nR101 여기서 M는 H 또는 양이온 (예컨대 Na+ 또는 K+); R101, R102 및 R103 각각은 H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 (-OCH2CH2)n-R104(여기서 n은 1 내지 24의 정수임), 6 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 아릴, 3 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 헤테로사이클릭 고리 및 5 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 헤테로아릴로부터 독립적으로 선택되고; 그리고 R104는 H 또는 1 내지 4개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬이고, 상기 R100, R101, R102, R103 및 R104로 나타낸 그룹 중 알킬, 알케닐, 알키닐, 아릴, 헤테로아릴 및 헤테로사이클릴은 하기 중 1개 이상으로 임의로 치환된다: (예를 들면, 할로겐, -OH, -CN, -NO2 및 1 내지 4개의 탄소 원자를 갖는 비치환된 선형 또는 분지형 알킬로부터 독립적으로 선택된 2, 3, 4, 5, 6 또는 그 초과) 치환체. 바람직하게는, 상기에서 기재된 임의로 치환된 알킬, 알케닐, 알키닐, 사이클릭 알킬, 사이클릭 알케닐, 사이클릭 알키닐, 카보사이클릴, 아릴, 헤테로사이클릴 및 헤테로아릴에 대한 치환체는 하기를 포함한다: 할로겐, -CN, -NR102R103, -CF3, -OR101, 아릴, 헤테로아릴, 헤테로cycycl, -SR101, -SOR101, -SO2R101 및 -SO3M.
용어 “화합물” 또는 “세포독성 화합물,” “세포독성 이량체” 및 “세포독성 이량체 화합물”은 상호교환적으로 사용된다. 상기는, 구조 또는 식 또는 임의의 그것의 유도체가 본 발명 또는 구조 또는 식 또는 참고로 편입되었던 임의의 그것의 유도체에서 개시된 화합물을 포함하는 것을 의도된다. 용어는 또한, 본 발명에서 개시된 모든 식의 화합물의 입체이성질체, 기하 이성질체, 호변이성질체, 용매화물, 대사물, 염 (예를 들면, 약제학적으로 허용가능한 염) 및 전구약물, 및 전구약물 염을 포함한다. 용어은 또한, 전술한 것 중 임의의 것의 임의의 용매화물, 수화물, 및 다형체를 포함한다. 본원에서 기재된 본 발명의 특정 측면에서, “입체이성질체,” “기하 이성질체,” “호변이성질체,” “용매화물,” “대사물,” “염” “전구약물,” “전구약물 염,” “콘주게이트,” “콘주게이트 염,” “용매화물,” “수화물,” 또는 “다형체”의 특정 설명은 본 발명의 다른 측면에서 이들 형태의 의도된 누락으로서 행성되어서는 안 되고, 여기서 용어 “화합물”는 이들 다른 형태의 설명 없이 사용된다.
용어 “면역접합체” 또는 “콘주게이트”는, 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 세포 결합제 (즉, 항-CD123/IL-3Rα 항체 또는 항-FRα 항체, 또는 그것의 단편)에 연결된 화합물 또는 그것의 유도체를 의미하고 일반식에 의해 정의된다: A-L-C, 여기서 C = 세포독소, L = 링커, 및 A = 세포 결합제 (CBA), 예컨대 항-CD123/IL-3Rα 또는 항-FRα 항체 또는 항체 단편.면역접합체는 또한, 역순으로 일반식에 의해 정의될 수 있다: C-L-A.
용어 “세포 결합제에 연결가능한”이란, 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 본 명세서에서 기재된 화합물 또는 그것의 유도체를 의미하고, 이것은 이들 화합물 또는 그것의 유도체를 세포 결합제에 결합시키는데 적합한 적어도 1종의 연결 기 또는 그것의 전구체를 포함한다.
주어진 그룹의 용어 “전구체”는 임의의 탈보호, 화학 변형, 또는 커플링 반응에 의해 그룹으로 유도될 수 있는 임의의 그룹을 의미한다.
용어 “ 세포 결합제에 연결된”이란, 세포독성 약물 화합물 또는 본 명세서에서 기재된 세포독성 약물-링커 화합물 (예를 들면, 식 (D1’)-(D29’)의 화합물 및 식 (II)의 세포독성 약물-링커 화합물), 또는 적합한 연결 기를 통해 통해 세포 결합제에 결합된 그것의 유도체 또는 그것의 전구체 중 하나 이상을 포함하는 콘주게이트 분자를 의미한다.
용어 “키랄”은 거울상 파트너의 비-포개짐의 특성을ㄹ 갖는 분자를 의미하고, 한편, 용어 “비키랄”는 그것의 거울상 파트너 상에 겹쳐 놓을 수 있는 분자를 의미한다.
용어 “입체이성질체”는 동일한 화학 구성 및 연결성을 갖지만 회전 약 단일 결합 관해 회전에 의해 상호전환될 수 없는 공간에서 원자의 상이한 방향을 갖는 화합물을 의미한다.
“부분입체이성질체”는 키랄성의 2개 이상의 중심을 갖는 입체이성질체를 의미하고, 그것의 분자는 서로 거울상이 아니다. 부분입체이성질체는 상이한 물리적 특성, 예를 들면 용융점, 비점, 스펙트럼 특성, 및 반응성을 갖는다. 부분입체이성질체의 혼합물은 고해상도 분석적 절차 예컨대 결정화, 전기영동 및 크로마토그래피 하에서 분리될 수 있다.
“거울상이성질체”는 서로 포갤 수 없는 거울상의 화합물의 2개의 입체이성질체를 의미한다.
일반적으로 본 명세서에서 사용된 입체화학적 정의 및 규약은 하기와 같다. P.Parker, Ed.,McGraw-Hill Dictionary of Chemical Terms (1984) McGraw-Hill Book Company, New York; 및 Eliel, E. 및 Wilen, S.,”Stereochemistry of Organic Compounds,” John Wiley & Sons, Inc.,New York, 1994.본 발명의 화합물은 비대칭 또는 키랄 중심을 함유할 수 있고, 따라서 상이한 입체이성질체 형태로 존재한다. 부분입체이성질체, 거울상이성질체 및 회전장애이성질체, 뿐만 아니라 이들의 혼합물 예컨대 라세미 혼합물을 비제한적으로 포함하는 모든 입체이성질체 형태의 본 발명의 화합물은 본 발명의 일부를 형성하는 것으로 의도된다. 많은 유기 화합물은 광학 활성 형태로 존재하고, 즉, 평면-편광의 면을 회전시키는 능력을 갖는다. 광학 활성 화합물의 기재 시, 접두어 D 및 L, 또는 R 및 S는, 그것의 키랄 중심(들)에 관한 분자의 절대 배열을 나타내기 우이해 사용된다. 접두어 d 및 I 또는 (+) 및 (-)는 화합물에 의한 평면-편광의 회전의 부호를 나타내기 위해 이용되고, (-) 또는 1은, 본 화합물이 좌측회전성이라는 것을 의미한다. (+) 또는 d를 갖는 화합물은 우측회전성이다. 주어진 화학 구조에 대해, 이들 입체이성질체는 동일하고, 단, 거울상이다. 특정 입체이성질체는 또한, 거울상이성질체로 불릴 수 있고, 그와 같은 이성질체의 혼합물은 종종 소위 거울상이성질체성 혼합물이다. 거울상이성질체의 50: 50 혼합물은, 화학 반응 또는 과정에서 입체선택 또는 입체특이성이 없는 경우에 생길 수 있는 라세미 혼합물 또는 라세미체로 불린다. 용어들 “라세미 혼합물” 및 “라세미체”는 광학적 활성이 없는 2개의 거울상이성질체성 종의 등몰 혼합물을 의미한다.
용어 “호변이성질체” 또는 “호변이성질체 형태”는 낮은 에너지 장벽을 통해 상호전환가능한 상이한 에너지의 구조 이성질체를 의미한다. 예를 들면, 양성자 호변이성질체 (로도 공지된다 양성자성 호변이성질체)는 양성자의 이동을 통한 상호전환, 예컨대 케노-에놀 및 이민-엔아민 이성질체화를 포함한다. 원자가 호변이성질체는 결합 전자의 일부의 재편에 의한 상호전환을 포함한다.
본원에서 사용된 용어 “전구약물”은 효소적으로 또는 가수분해적으로 활성화되거나 더 많은 활성 모 형태로 전환될 수 있는 본 발명의 화합물의 전구체 또는 유도체 형태를 의미한다. 참고, 예를 들면, Wilman, “Prodrugs in Cancer Chemotherapy,” Biochemical Society Transactions, 14: 375-382, 615th Meeting Belfast (1986); 및 Stella 등,”Prodrugs: A Chemical Approach to Targeted Drug Delivery,” Directed Drug Delivery, Borchardt 등,(eds.), pp.247-267, Humana Press (1985). 본 발명의 전구약물은, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 에스테르-함유 전구약물, 포스페이트-함유 전구약물, 티오포스페이트-함유 전구약물, 설페이트-함유 전구약물, 펩타이드-함유 전구약물, D-아미노산-변형된 전구약물, 당화된 전구약물, β-락탐-함유 전구약물, 임의로 치환된 페녹시아세트아미드-함유 전구약물, 임의로 치환된 페닐아세트아미드-함유 전구약물, 5-플루오로시토신 및 다른 5-플루오로우리딘 전구약물 (이것은 더 많은 활성 세포독성 유리 약물로 전환될 수 있음). 본 발명에서 사용하기 위해 전구약물 형태로 유도될 수 있는 세포독성 약물의 예는, 비제한적으로, 상기에서 기재된 바와 같은 본 발명의 화합물 및 화학치료제를 포함한다.
용어 “전구약물”은 또한, 생물학적 조건 (시험관내 또는 생체내) 하에서 가스분해하고, 산화하거나 반응하여 본 발명의 화합물을 제공할 수 있는 화합물의 유도체를 포함하는 것을 의미한다. 전구약물은 생물학적 조건 하에서 그와 같은 반응시에만 활성이 있을 수 있거나, 그것의 미반응된 형태에서 활성을 가질 수 있다. 본 발명에서 고려된 전구약물의 예는, 생가수분해성 모이어티 예컨대 생가수분해성 아미드, 생가수분해성 에스테르, 생가수분해성 카바메이트, 생가수분해성 카보네이트, 생가수분해성 우레이드, 및 생가수분해성 포스페이트 유사체를 포함하는, 본 명세서에서 개시된 식 중 임의의 하나의 화합물의 유사체 또는 유도체를 비제한적으로 포함한다. 전구약물의 다른 예는 -NO, -NO2, -ONO, 또는 -ONO2 모이어티를 포함하는, 본 명세서에서 개시된 식 중 임의의 하나의 화합물의 유도체를 포함한다. 전구약물은 공지된 방법, 예컨대 하기에 의해 기재된 것들을 사용하여 전형적으로 제조될 수 있다: Burger’s Medicinal Chemistry and Drug Discovery (1995) 172-178, 949-982 (Manfred E.Wolff ed.,5th ed.); 또한 하기를 참조한다: Goodman 및 Gilman’s, The Pharmacological basis of Therapeutics, 8th ed.,McGraw-Hill, Int.Ed.1992, “Biotransformation of Drugs. ”
하나의 바람직한 형태의 본 발명의 전구약물은 (임의의 링커 그룹을 갖거나 없는) 화합물 및 화합물 / 콘주게이트의 이민 결합과 이민 반응성 시약 사이에 형성된 부가물을 포함하는 본 발명의 콘주게이트를 포함한다. 또 다른 바람직한 형태의 본 발명의 전구약물은 화합물 예컨대 식 (I) - (IV) (여기서 N과 C 사이의 이중 선이 단일 결합을 나타낼 때, X는 H 또는 아민 보호 그룹임)의 것들을 포함하고, 상기 화합물은 전구약물이 된다. 본 발명의 전구약물은 본 명세서에서 기재된 전구약물 (예를 들면, 화합물 / 콘주게이트의 이민 결과 이민 반응성 시약 사에서 형셩된 부가물을 함유하고/거나 X가 -H일 때 Y 이탈 그룹을 함유함)의하나 또는 둘 모두 형태를 함유할 수 있다.
용어 “이민 반응성 시약”은 이민 그룹과 반응할 수 있는 시약을 의미한다. 이민 반응성 시약의 예는, 비제한적으로, 하기를 포함하고: 설파이트 (H2SO3, H2SO2 또는 양이온으로 형성된 HSO3 -, SO3 2- 또는 HSO2-의 염), 메타바이설파이트 (H2S2O5 또는 양이온으로 형성된 S2O5 2-의 염), 모노, 디, 트리, 및 테트라- 티오포스페이트 (PO3SH3, PO2S2H3, POS3H3, PS4H3 또는 양이온으로 형성된 PO3S3-, PO2S2 3-, POS3 3- 또는 PS4 3-의 염), 티오 포스페이트 에스테르 ((RiO)2PS(ORi), RiSH, RiSOH, RiSO2H, RiSO3H), 다양한 아민 (하이드록실 아민 (예를 들면, NH2OH), 하이드라진 (예를 들면, NH2NH2), NH2O-Ri, Ri’NH-Ri, NH2-Ri), NH2-CO-NH2, NH2-C(=S)-NH2 , 티오설페이트 (H2S2O3 또는 양이온으로 형성된 S2O3 2-의 염), 디티오나이트 (H2S2O4 또는 양이온으로 형성된 S2O4 2-의 염), 양이온으로 형성된 포스포로디티오에이트 (P(=S)(ORk)(SH)(OH) 또는 그것의 염), 양이온으로 형성된 하이드록삼산 (RkC(=O)NHOH 또는 염), 하이드라자이드 (RkCONHNH2), 포름알데하이드 설폭실레이트 (HOCH2SO2H 또는 양이온으로 형성된 HOCH2SO2 -의 염, 예컨대 HOCH2SO2 -Na+), 당화 뉴클레오타이드 (예컨대 GDP-만노스), 플루다라빈 또는 이들의 혼합물, 여기서 Ri 및 Ri’ 각각은 독립적으로 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬이고, -N(Rj)2, -CO2H, -SO3H, 및 -PO3H 로부터 선택된 적어도 1개의 치환체로 치환되고; Ri 및 Ri’는 본 명세서에서 기재된 알킬에 대한 치환체로 추가로 임의로 치환될 수 있고; Rj는 1 내지 6개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬이고; 그리고 Rk는 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 아릴, 헤테로사이클릴 또는 헤테로아릴이다 (바람직하게는, Rk는 1 내지 4개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬이고; 더 바람직하게는, Rk는 메틸, 에틸 또는 프로필임). 바람직하게는, 양이온은 1가 양이온, 예컨대 Na+ 또는 K+이다. 바람직하게는, 이민 반응성 시약은 설파이트, 하이드록실 아민, 우레아 및 하이드라진으 로부터 선택된다. 더 바람직하게는, 이민 반응성 시약은 NaHSO3 또는 KHSO3이다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이 그리고 다르게 명시되지 않는 한, 용어들 “생가수분해성 아미드,” “생가수분해성 에스테르,” “생가수분해성 카바메이트,” “생가수분해성 카보네이트,” “생가수분해성 우레이드” 및 “생가수분해성 포스페이트 유사체”는 아미드, 에스테르, 카바메이트, 카보네이트, 우레이드, 또는 포스페이트 유사체, 각각이 하기인 것을 나타낸다: 1) 화합물의 생물학적 활성을 파괴하지 않고 생체내 화합물의 유리한 특성, 예컨대 흡수, 작용의 지속시간, 또는 작용의 개시를 부여하거나; 또는 2)는 자체로 생물학적으로 불활성이지만, 생체내에서 생물학적 활성 화합물로 전환됨. 생가수분해성 아미드의 예는, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 저급 알킬 아미드, α-아미노산 아미드, 알콕시아실 아미드, 및 알킬아미노알킬카보닐 아미드. 생가수분해성 에스테르의 예는, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 저급 알킬 에스테르, 알콕시아실옥시 에스테르, 알킬 아실아미노 알킬 에스테르, 및 콜린 에스테르. 생가수분해성 카바메이트의 예는, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 저급 알킬아민, 치환된 에틸렌디아민, 아미노산, 하이드록시알킬아민, 헤테로사이클릭 및 헤테로방향족 아민, 및 폴리에테르 아민.특히 선호되는 전구약물 및 전구약물 염은 하기인 것이다:
그와 같은 화합물이 포유동물에게 투여될 때 본 발명의 화합물의 생체이용률의 증가.
어구 “약제학적으로 허용가능한 염”은 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 본 발명의 화합물의 약제학적으로 허용가능한 유기 또는 무기 염을 의미한다. 예시적인 염은, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 설페이트, 시트레이트, 아세테이트, 옥살레이트, 클로라이드, 브로마이드, 아이오다이드, 니트레이트, 바이설페이트, 포스페이트, 산 포스페이트, 이소니코티네이트, 락테이트, 살리실레이트, 산 시트레이트, 타르트레이트, 올레이트, 탄네이트, 판토테네이트, 바이타르트레이트, 아스코르베이트, 석시네이트, 말레에이트, 겐티시네이트, 푸마레이트, 글루코네이트, 글루쿠로네이트, 사카레이트, 포르메이트, 벤조에이트, 글루타메이트, 메탄설포네이트 “메실레이트,” 에탄설포네이트, 벤젠설포네이트, p-톨루엔설포네이트, 파모에이트 (즉, 1,1’-메틸렌-비스-(2-하이드록시-3-나프토네이트)) 염, 알칼리 금속 (예를 들면, 나트륨 및 칼륨) 염, 알칼리토 금속 (예를 들면, 마그네슘) 염, 그리고 암모늄 염. 약제학적으로 허용가능한 염은 또 다른 분자 예컨대 아세테이트 이온, 석시네이트 이온 또는 다른 반대 이온의 봉입체를 수반할 수 있다. 반대 이온은 모 화합물 상에서 전하를 안정시키는 임의의 유기 또는 무기 모이어티일 수 있다. 더욱이, 약제학적으로 허용가능한 염은 그것의 구조에서 1개 초과의 하전된 원자를 가질 수 있다. 다중 하전된 원자가 약제학적으로 허용가능한 염의 일부인 사례는 다중 반대 이온을 가질 수 있다. 그러므로, 약제학적으로 허용가능한 염은 1종 이상의 하전된 원자 및/또는 1종 이상의 반대 이온을 가질 수 있다.
본 발명의 화합물이 염기이면, 원하는 약제학적으로 허용가능한 염은 당해 기술에서 이용가능한 임의의 적합한 방법, 예를 들면, 유리 염기의 무기 산, 예컨대 염산, 브롬화수소산, 황산, 질산, 메탄설폰산, 인산 등에 의한, 또는 유기 산, 예컨대 아세트산, 말레산, 석신산, 만델산, 푸마르산, 말론산, 피루브산, 옥살산, 글라이콜산, 살리실산, 피라노시딜 산, 예컨대 글루쿠론산 또는 갈락투론산, 알파 하이드록시 산, 예컨대 시트르산 또는 타르타르산, 아미노산, 예컨대 아스파르트산 또는 글루탐산, 방향산, 예컨대 벤조산 또는 신남산, 설폰산, 예컨대 p-톨루엔설폰산 또는 에탄설폰산, 등에 의한 처리에 의해 제조될 수 있다.
본 발명의 화합물이 산이면, 원하는 약제학적으로 허용가능한 염은 임의의 적합한 방법, 예를 들면, 유리 산의, 무기 또는 유기 염기, 예컨대 아민 (1차, 2차 또는 3차), 알칼리 금속 수산화물 또는 알칼리토 금속 수산화물, 등에 의한 처리에 의해 제조될 수 있다. 적합한 염의 예증적인 예는, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 아미노산, 예컨대 글리신 및 아르기닌으로부터 유도된 유기 염, 암모니아, 1차, 2차, 및 3차 아민, 및 사이클릭 아민, 예컨대 피페리딘, 모폴린 및 피페라진, 및 나트륨, 칼슘, 칼륨, 마그네슘, 망간, 철, 구리, 아연, 알루미늄 및 리튬으로부터 유도된 무기 염.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 “용매화물”은 화학양론적 또는 비-화학양론적 양의 용매 예컨대 비-공유 분자간 힘에 의해 결합된 물, 이소프로판올, 아세톤, 에탄올, 메탄올, DMSO, 에틸 아세테이트, 아세트산, 및 에탄올아민 디클로로메탄, 2-프로판올, 등을 추가로 포함하는 화합물을 의미한다. 본 화합물의 용매화물 또는 수화물은 적어도 1 몰 당량의 하이드록실 용매 예컨대 메탄올, 에탄올, 1-프로판올, 2-프로판올 또는 물을 이민 모이어티의 용매화 또는 수화를 야기하는 화합물에 부가하여 쉽게 제조된다.
용어들 “비정상 세포 성장” 및 “증식성 장애”는 본원에서 상호교환적으로 사용된다. “비정상 세포 성장”은, 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 다르게 명시되지 않는 한, 정상 조절 기전 (예를 들면, 접촉 저해의 손실)과 독립적인 세포 성장을 의미한다. 이것은, 예를 들면, 하기의 비정상 성장을 포함한다: (1) 돌연변이된 티로신 키나제의 발현 또는 수용체 티로신 키나제의 과발현에 의해 증식하는 종양 세포 (종양); (2) 비정상적인 티로신 키나제 활성화가 일어나는 o 다른 증식성 질환의 양성 및 악성 세포; (3) 수용체 티로신 키나제에 의해 증식하는 임의의 종양; (4) 비정상적인 세린/트레오닌 키나제 활성화에 의해 증식하는 임의의 종양; 및 (5) 비정상적인 세린/트레오닌 키나제 활성화가 일어나는 다른 증식성 질환의 양성 및 악성 세포.
용어들 “암” 및 “암성”은 조절되지 않은 세포 성장을 전형적으로 특징으로 하는 포유동물에서 생리적 조건을 의미하거나 그것을 기재한다. “종양”은 1종 이상의 암성 세포, 및/또는 양성 또는 전-암성 세포를 포함한다.
“치료제”는 생물 제제 둘 모두 예컨대 항체, 펩타이드, 단백질, 효소 또는 화학치료제를 포함한다.
“화학치료제”는 암의 치료에서 유용한 화합물이다.
“대사물”은 명시된 화합물, 그것의 유도체, 또는 그것의 콘주게이트, 또는 그것의 염의 신체에서의 대사을 통해 생산된다. 화합물, 그것의 유도체, 또는 그것의 콘주게이트의 대사물은, 당해 기술에서 공지된 일상적인 기술을 사용하여 확인될 수 있고, 그것의 활성은 시험 예컨대 본 명세서에서 기재된 것을 사용하여 결정될 수 있다. 그와 같은 생성물은 예를 들면 투여된 화합물의 산화, 하이드록실화, 환원, 가수분해, 아미드화, 탈아미드화, 에스테르화, 탈에스테르화, 효소 절단, 등으로부터 생길 수 있다. 따라서, 본 발명은 본 발명의 화합물, 그것의 유도체, 또는 그것의 콘주게이트를, 그것의 대사성 생성물을 생성하는데 충분한 기간 동안 포유동물과 접촉시키는 것을 포함하는 과정으로 생산된 화합물, 그것의 유도체, 또는 그것의 콘주게이트를 포함하는 본 발명의 화합물, 그것의 유도체, 또는 그것의 콘주게이트의 대사물을 포함한다.
어구 “약제학적으로 허용가능한”은, 서브스턴스 또는 조성물이 제형을 포함하는 다른 성분 및/또는 치료될 포유동물과 화학적으로 및/또는 독물학적으로 양립가능해야 한다는 것을 나타낸다.
용어 “보호 그룹” 또는 “보호 모이어티”는 화합물, 그것의 유도체, 또는 그것의 콘주게이트 상의 다른 작용기와 반응하면서 특정한 작용기를 차단 또는 보호하기 위해 통상적으로 이용된 치환체를 의미한다. 예를 들면, “아민-보호 그룹” 또는 “아미노-보호 모이어티”는 화합물에서 아미노 작용기를 차단 또는 보호하느느 아미노 그룹에 부착된 치환체이다. 그와 같은 그룹은 당해 기술에서 잘 알려져 있다 (참고 예를 들면 P.Wuts 및 T.Greene, 2007, Protective Groups in Organic Synthesis, Chapter 7, J.Wiley & Sons, NJ), 하기에 의해 예시된다: 카바메이트 예컨대 메틸 및 에틸 카바메이트, FMOC, 치환된 에틸 카바메이트, 카바메이트 절단된 by 1,6-β-제거 (또한 일명 “자기 희생”), 우레아, 아미드, 펩타이드, 알킬 및 아릴 유도체. 적합한 아미노-보호 그룹은 아세틸, 트리플루오로아세틸, t-부톡시카보닐 (BOC), 벤질옥시카보닐 (CBZ) 및 9-플루오레닐메틸엔옥시카보닐 (Fmoc)를 포함한다. 보호 그룹 및 그것의 용도의 일반적인 설명에 대해, 참고 P.G.M.Wuts & T.W.Greene, Protective Groups in Organic Synthesis, John Wiley & Sons, New York, 2007.
용어 “이탈 그룹”은 치환 또는 변위 동안에 이탈하는 하전된 또는 비하전된 모이어티의 그룹을 의미한다. 그와 같은 이탈 그룹은 당해 기술에서 잘 알려져 있고, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 할로겐, 에스테르, 알콕시, 하이드록실, 토실레이트, 트리플레이트, 메실레이트, 니트릴, 아자이드, 카바메이트, 디설파이드, 티오에스테르, 티오에테르 및 디아조늄 화합물.
용어 “이작용성 가교결합제,” “이작용성 링커” “가교결합제” 또는 “링커 화합물”은 2개의 반응성 그룹을 보유하는 변형제를 의미하고; 이들 중 하나는 세포 결합제와 반응할 수 있고, 한편 while 다른 하느는 세포독성 화합물과 반응하여 2개의 모이어티를 함께 연결한다. 그와 같은 이작용성 가교결합제는 당해 기술에서 잘 알려져 있다 (참고, 예를 들면, Isalm 및 Dent in ioconjugation, chapter 5, p218-363, Groves Dictionaries Inc. New York, 1999). 예를 들면, 티오에테르 결합을 통해 연결할 수 있는 이작용성 가교결합제는 말레이미도 그룹을 도입하기 위해 N-석신이미딜-4-(N-말레이미도메틸)-사이클로헥산-1-카복실레이트 (SMCC)을 포함하거나, 아이오도아세틸 그룹을 도입하기 위해 N-석신이미딜-4-(아이오도아세틸)-아미노벤조에이트 (SIAB)을 포함한다. 말레이미도 그룹 또는 할로아세틸 그룹을 세포 결합제에 도입하는 다른 이작용성 가교결합제는 당해 기술에서 잘 알려져 있고 (참고 US 특허 출원 2008/0050310, 20050169933, Pierce Biotechnology Inc.P.O.Box 117, Rockland, IL 61105, USA로부터 이용가능), 비제한적으로, 하기를 포함한다: 비스-말레이미도폴리에틸렌글리콜 (BMPEO), BM(PEO)2, BM(PEO)3, N-(β-말레이미도프로필옥시)석신이미드 에스테르 (BMPS), -말레이미도부티르산 N-석신이미딜 에스테르 (GMBS), γ-말레이미도카프로산 N-하이드록시석신이미드 에스테르 (EMCS), 5-말레이미도발레르산 NHS, HBVS, N-석신이미딜-4-(N-말레이미도메틸)-사이클로헥산-1-카복시-(6-아미도카프로에이트) (이것은 SMCC의 “장쇄” 유사체 (LC-SMCC)임), m-말레이미도벤조일-N-하이드록시석신이미드 에스테르 (MBS), 4-(4-N-말레이미도페닐)-부티르산 하이드라자이드 또는 HCl 염 (MPBH), N-석신이미딜 3-(브로모아세트아미도)프로피오네이트 (SBAP), N-석신이미딜 아이오도아세테이트 (SIA), κ-말레이미도운데카노산 N-석신이미딜 에스테르 (KMUA), N-석신이미딜 4-(p-말레이미도페닐)-부티레이트 (SMPB), 석신이미딜-6-(-말레이미도프로피온아미도)헥사노에이트 (SMPH), 석신이미딜-(4-비닐설포닐)벤조에이트 (SVSB), 디티오비스-말레이미도에탄 (DTME), 1,4-비스-말레이미도부탄 (BMB), 1,4 비스말레이미딜-2,3-디하이드록시부탄 (BMDB), 비스-말레이미도헥산 (BMH), 비스-말레이미도에탄 (BMOE), 설포석신이미딜 4-(N-말레이미도-메틸)사이클로헥산-1-카복실레이트 (설포-SMCC), 설포석신이미딜(4-아이오도-아세틸)아미노벤조에이트 (설포-SIAB), m-말레이미도벤조일-N-하이드록시설포석신이미드 에스테르 (설포-MBS), N-(γ-말레이미도부트릴옥시)설포석신이미드 에스테르 (설포-GMBS), N-(ε-말레이미도카프로일옥시)설포석신이미도 에스테르 (설포-EMCS), N-(κ-말레이미도운데카노일옥시)설포석신이미드 에스테르 (설포-KMUS), 및 설포석신이미딜 4-(p-말레이미도페닐)부티레이트 (설포-SMPB).
이종이중작용성 가교결합제는 2개의 상이한 반응성 그룹을 갖는 이작용성 가교결합제이다. 아민-반응성 N-하이드록시석신이미드 그룹 (NHS 그룹) 및 카보닐-반응성 하이드라진 그룹 둘 모두를 함유하는 이종이중작용성 가교결합제는 또한, 세포-결합제 (예를 들면, 항체)을 갖는 본 명세서에서 기재된 세포독성 화합물을 연결하기 위해 사용될 수 있다. 그와 같은 상업적으로 이용가능한 이종이중작용성 가교결합제의 예는 하기를 포함한다: 석신이미딜 6-히드라지노니코틴아미드 아세톤 하이드라존 (SANH), 석신이미딜 4-히드라지도테레프탈레이트 하이드로클로라이드 (SHTH) 및 석신이미딜 하이드라지늄 니코티네이트 하이드로클로라이드 (SHNH). 산-불안정한 연결을 보유하고 있는 콘주게이트는 또한, 본 발명의 하이드라진-보유 벤조디아제핀 유도체를 사용하여 제조될 수 있다. 사용될 수 있는 이작용성 가교결합제의 예는 석신이미딜-p-포르밀 벤조에이트 (SFB) 및 석신이미딜-p-포르밀페녹시아세테이트 (SFPA)을 포함한다.
디설파이드 결합을 통해 세포 결합제를 세포독성 화합물과 연결할 수 있는 이작용성 가교결합제는 당해 기술에 공지되어 있고 디티오피리딜 그룹을 도입하기 위해 N-석신이미딜-3-(2-피리딜디티오)프로피오네이트 (SPDP), N-석신이미딜-4-(2-피리딜디티오)펜타노에이트 (SPP), N-석신이미딜-4-(2-피리딜디티오)부타노에이트 (SPDB), N-석신이미딜-4-(2-피리딜디티오)2-설포 부타노에이트 (설포-SPDB)를 포함한다. 디설파이드 그룹을도입하기 위해 사용될 수 있는 다른 이작용성 가교결합제는 당해 기술에 공지되어 있고 아래에서 개시되어 있다: U.S. 특허 6,913,748, 6,716,821 및 US 특허 공개 20090274713 및 20100129314(이들 모두는 본 명세서에 참고로 편입되어 있음). 대안적으로, 가교결합제 예컨대 티올 그룹을 도입하는2-이미노티올란, 호모시스테인 티오락톤 또는 S-아세틸석신산 무수물이 또한 사용될 수 있다.
“링커,” “링커 모이어티,” 또는 “연결 기”는 본 명세서에서 정의된 바와 같이 2개의 그룹, 예컨대 세포 결합제 및 세포독성 화합물을 함께 연결하는 모이어티를 의미한다. 전형적으로, 링커는, 연결되고 있는 2개의 그룹이 연결되는 조건 하에서 실질적으로 불활성이다. 이작용성 가교결합제는 링커 모이어티의 각 말단에서 2개의 반응성 그룹을 포함할 수 있고, 이로써, 1개의 반응성 그룹은 세포독성 화합물과 먼저 반응되어 링커 모이어티 및 제2 반응성 그룹을 보유하는 화합물을 제공할 수 있고, 그 다음 이것은 세포 결합제와 반응될 수 있다. 대안적으로, 이작용성 가교결합제의 1개의 말단은 먼저 세포 결합제와 반응되어 링커 모이어티 및 제2 반응성 그룹을 보유하는 세포 결합제을 제공할 수 있고, 이것은 그 다음 세포독성 화합물과 반응될 수 있다. 연결 모이어티는 특정한 부위에서 세포독성 모이어티의 방출을 허용하는 화학 결합을 함유할 수 있다. 적합한 화학 결합은 당해 기술에서 잘 알려져 있고 하기를 포함한다: 디설파이드 결합, 티오에테르 결합, 산 불안정한 결합, 광불안정한 결합, 펩티다아제 불안정한 결합 및 에스테라제 불안정한 결합 (참고 예를 들면 US 특허 5,208,020; 5,475,092; 6,441,163; 6,716,821; 6,913,748; 7,276,497; 7,276,499; 7,368,565; 7,388,026 및 7,414,073). 바람직한 것은 디설파이드 결합, 티오에테르 및 펩티다아제 불안정한 결합이다. 본 발명에서 사용될 수 있는 다른 링커는 비-절단가능 링커, 예컨대 하기에서 상세히 기재된 것들: U.S. 공보 번호 20050169933, 또는 충전된 링커 또는 친수성 링커를 포함하고 하기에서 기재되어 있다: US 2009/0274713, US 2010/01293140 및 WO 2009/134976(이들 각각은 본 명세서에 참고로 명확히 편입되어 있고, 이들 각각은 본 명세서에 참고로 명확히 편입되어 있음).
용어 “아미노산”은 천연 발생 아미노산 또는 비-천연 발생 아미노산을 의미한다. 상기는 NH2-C(Raa’Raa)-C(=O)OH로 나타낼 수 있고, 여기서 Raa 및 Raa’ 각각은 독립적으로 H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 아릴, 헤테로아릴 또는 헤테로사이클릴이거나, 또는 Raa 및 N-말단 질소 원자는 함께, 헤테로사이클릭 고리 (예를 들면, in 프롤린에서 )를 형성할 수 있다. 용어 “아미노산 잔기”는, 1 개의 수소 원자가아미노산의 아민 및/또는 카복시 말단, 예컨대 -NH-C(Raa’Raa)-C(=O)O-로부터 제거될 때 상응하는 잔기를 의미한다.
용어 “양이온”은 양전하를 갖는 이온을 의미한다. 양이온은 하기일 수 있다: 1가 (예를 들면, Na+, K+, 등.), 2-가 (예를 들면, Ca2+, Mg2+, 등.) 또는 다가 (예를 들면, Al3+ 등). 바람직하게는, 양이온은 1가이다.
용어 “치료적으로 유효한 양”은 대상체에서 원하는 생물학적 반응을 유도하는 활성 화합물 또는 콘주게이트의 양을 의미한다. 그와 같은 반응은 치료될 질환 또는 장애의 증상의 완화, 질환의 증상 또는 질환 자체의 재발의 예방, 저해 또는 지연, 치료의 부재와 비교된 상기 대상체의 장수의 증가, 또는 질환의 증상 또는 질환 자체의 진행의 예방, 저해 또는 지연으르 포함한다. 유효한 양의 결정은, 특히 본 명세서에서 제공된 상세한 개시내용에 비추어 당해 분야의 숙련가의 능력 내에 있다. 화합물 I의 독성 및 치료적 효능은 세포 배양물에서 그리고 실험적인 동물에서 표준 약제학적 절차에 의해 결정될 수 있다. 대상체에게 투여될 유효량의 본 발명의 화합물 또는 콘주게이트 또는 다른 치료제는 다발성 골수종의 단계, 카테고리 및 상태 및 대상체의 특징, 예컨대 일반적인 건강, 연령, 성별, 체중 및 약물 내성에 좌우될 것이다. 투여될 유효량의 본 발명의 화합물 또는 콘주게이트 또는 다른 치료제는 투여 경로 및 복용 형태에 또한 좌우될 것이다. 투약량 및 간격는 원하는 치료 효과를 유지하는데 충분한 활성 화합물의 혈장 수준을 제공하기 위해 개별적으로 조정될 수 있다.
용어 “인간화된 항체”는 형태의 비-인간 (예를 들면, 쥣과) 항체를 의미하고, 이것은 최소 비-인간 (예를 들면, 쥣과) 서열을 함유하는 특이적 면역글로불린 사슬, 키메라성 면역글로불린, 또는 그것의 단편이다. 전형적으로, 인간화된 항체는 인간 면역글로불린이고, 여기서, 상보적 결정 영역 (CDR)로부터의 잔기는 원하는 특이성, 친화도, 및 능력을 갖는 비-인간 종 (예를 들면, 마우스, 랫트, 토끼, 햄스터)의 CDR로부터의 잔기에 의해 치환된다 (Jones 등, Nature 321: 522-525, 1986; Riechmann 등, Nature 332: 323-327, 1988; Verhoeyen 등, Science 239: 1534-1536, 1988).
일부 사례에서, 인간 면역글로불린의 Fv 프레임워크 영역 (FR) 잔기는 원하는 특이성, 친화도, 및 능력을 갖는 비-인간 종으로부터 항체에서 상응하는 잔기로 치환된다. 인간화된 항체는 항체 특이성, 친화도, 및/또는 능력을 정제하고 최적화하기 위해 Fv 프레임워크 영역에서 및/또는 치환된 비-인간 잔기 내에서 추가의 잔기의 치환에 의해 추가로 변형될 수 있다. 일반적으로, 인간화된 항체는 비-인간 면역글로불린에 해당하는 모든 또는 실질적으로 모든 CDR 영역을 함유하는 가변 도멘인 중 적어도 1개, 및 전형적으로 2개 또는 3개 중 모두를 실질적으로 포함할 것이고, 반면에 모든 또는 실질적으로 모든 FR 영역은 인간 면역글로불린 공통 서열의 것이다. 인간화된 항체는 또한, 면역글로불린 불변 영역 또는 도메인 (Fc)의 적어도 부분, 전형적으로 인간 면역글로불린의 부분을 포함할 수 있다. 인간화된 항체를 생성하기 위해 사용된 방법의 예는 하기에서 기재되어 있다: U.S. 특허5,225,539 및 5,639,641, Roguska 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91(3): 969-973, 1994; 및 Roguska 등, Protein Eng. 9(10): 895-904, 1996 (모두는 본 명세서에 참고로 편입되어 있음). 일부 구현예에서, “인간화된 항체”는 재표면화된 항체이다. 일부 구현예에서, “인간화된 항체”는 CDR-이식된 항체이다.
세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트
본 발명은 디설파이드 링커, 티오에테르 링커, 아미드 결합된 링커, 산-불안정한 링커, 및 에스테라제-불안정한 링커를 비제한적으로 포함하는 다양한 링커를 통해 본 발명의 세포독성 약물의 1종 이상의 분자에 공유 결합된 본 명세서에서 기재된 세포-결합제를 포함하는 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 제공한다.
제1 구현예에서, 본 발명은 구조식 (I)의 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 제공한다:
Figure 112023025074489-pat00006
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 식 중:
CBA는 JCB’ 그룹에 공유 결합된 세포-결합제이고;
JCB’는 CBA 상의 알데하이드 그룹과 그룹 L에 연결된 알데하이드 반응성 그룹을 반응시켜서 형성된 모이어티이고, 상기 알데하이드는 하기 구조식으로 나타낸 2-하이드록시에틸아민 모이어티의 산화로부터 유도되고:
Figure 112023025074489-pat00007
상기 2-하이드록시에틸아민 모이어티는 세린, 트레오닌, 하이드록실리신, 4-하이드록시오르니틴 또는 2,4-디아미노-5-하이드록시 발레르산 잔기의 일부이고;
L은 스페이서 또는 결합이고;
JD’는 그룹 L을 갖는 세포독성 약물 D를 연결하는 연결 모이어티이고;
D는, L이 결합일 때, 상기 연결 모이어티 JD’를 통해 L에 또는 JCB’를 통해 CBA에 공유 결합된 세포독성 약물이고; 그리고
w는 1, 2, 3 또는 4임).
임의의 알데하이드 반응성 그룹은 본 발명에서 사용될 수 있다. 예시적인 알데하이드 반응성 그룹은, 비제한적으로, 하기에서 기재된 것들을 포함한다: R.C.Larock, 1999, Comprehensive Organic Transformations, 제2 Ed. Wiley-VCH.
일 구현예에서, 알데하이드 반응성 그룹은 하이드라진, 하이드라자이드 또는 하이드록실아민이다.
또 다른 구현예에서, 알데하이드 반응성 그룹은 하기로부터 선택된다:
Figure 112023025074489-pat00008
Figure 112023025074489-pat00009
및
Figure 112023025074489-pat00010
식 중: Xa는 CH2, O 또는 NCH3이고; U’는 NH, O, S 또는 CH2이고; U는 H 또는 전자 공여 그룹이고; Xb 및 Xb’ 각각은 독립적으로 -OH, -SH 또는 -NH2이고; RZ 및 RZ’ 각각은 독립적으로 H 또는 알킬 (바람직하게는 -Me)이고; RZ”는 H 또는 알킬이고; 그리고 Xc는 N 또는 CH이다. 더 구체적으로, 알데하이드 반응성 그룹
Figure 112023025074489-pat00011
또는
Figure 112023025074489-pat00012
이다.
제1 특정 구현예에서, 구조식 (I)의 콘주게이트 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염에 대해, JCB’는 하기 구조식 중 하나로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00013
Figure 112023025074489-pat00014
또는
Figure 112023025074489-pat00015
또는
Figure 112023025074489-pat00016
식 중: Xa는 CH2, O 또는 NCH3이고; U’는 NH, O, S 또는 CH2이고; U는 H 또는 전자 공여 그룹이고; Xb1 및 Xb1’ 각각은 독립적으로 -O-, -S- 또는 -NH-이고; RZ 및 RZ’ 각각은 독립적으로 H 또는 알킬 (바람직하게는 -Me)이고; 그리고 RZ”는 H 또는 알킬이고; s1은 세포-결합제에 공유 결합된 부위이고; 그리고 s2는 그룹 L에 공유 결합된 부위이다. 더 구체적으로, JCB’는
Figure 112023025074489-pat00017
Figure 112023025074489-pat00018
또는
Figure 112023025074489-pat00019
이다.
제2 특정 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염에 대해, -L-JD’-는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00020
식 중:
s3는 그룹 JCB’에 공유 결합된 부위이고;
s4는 그룹 D에 공유 결합된 부위이고;
Za1은 부재, -SO2NR9-, -NR9SO2-, -C(=O)-NR9-, -NR9-C(=O)-, -(CH2CH2)p’ NR9-C(=O)-,-C(=O)-NR9(CH2CH2)p’, -(CH2CH2)p’-C(=O)NR9-, -NR9C(=O)(CH2CH2)p’-, -C(=O)-O-, 또는 -O-C(=O)-이고;
Za2는 부재, -SO2NR9-, -NR9SO2-, -C(=O)-NR9-, -NR9-C(=O)-, -C(=O)-O-, -O-C(=O)-, -C(=O)-NR9-(CH2CH2O)p-, -NR9-C(=O)-(CH2CH2O)p-, -(OCH2CH2)p-C(=O)NR9-, 또는 -(OCH2CH2)p-NR9-C(=O)-이고;
R9는 H 또는 임의로 치환된 알킬이고;
p 및 p’ 각각은 독립적으로 1 내지 10의 정수이고;
Q는 H, 하전된 치환체 또는 이온화가능 그룹이고;
Ra1, Ra2, Ra3, Ra4는, 각 경우에 대해, 독립적으로 H 또는 임의로 치환된 알킬이고;
q1 및 r1 각각은 독립적으로 0 내지 10의 정수이고, 단, q1 및 r1 둘 모두가 0은 아니고; 그리고 잔여 변수는 본 명세서에서 기재된 제1 구현예 또는 제1 특정 구현예 또는 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
일 구현예에서, Q는 i) H; ii) -SO3H, -Z’-SO3H, -OPO3H2, -Z’-OPO3H2, -PO3H2, -Z’-PO3H2, -CO2H, -Z’-CO2H, -NR11R12, 또는 -Z’-NR11R12, 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염; 또는, iii) -N+R14R15R16X- 또는 -Z’-N+R14R15R16X-이고; Z’는 임의로 치환된 알킬렌, 임의로 치환된 사이클로알킬렌 또는 임의로 치환된 페닐렌이고; R14 내지 R16 각각은 독립적으로 임의로 치환된 알킬이고; X-는 약제학적으로 허용가능한 음이온니도; 드이도 잔여 변수는 제2 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, Q는 -SO3H 또는 -CO2H 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염이다.
또 다른 구현예에서, Za1은 부재이고; Za2는 -C(=O)-NR9- 또는 -NR9-C(=O)-이고; 그리고 잔여 변수는 제2 특정 구현예의 임의의 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, R9는 H이다.
또 다른 구현예에서, Za1 및 Za2 둘 모두는 부재이고; 그리고 잔여 변수는 제2 특정 구현예의 임의의 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
또 다른 구현예에서, Ra1, Ra2, Ra3 및 Ra4 모두는 -H이고; q 및 r 각각은 독립적으로 0 내지 4의 정수이고; 그리고 잔여 변수는 제2 특정 구현예의 임의의 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
또 다른 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염에 대해, -L-JD’-는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00021
Figure 112023025074489-pat00022
또는
Figure 112023025074489-pat00023
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염; 그리고 잔여 변수는 본 명세서에서 기재된 제1 구현예 또는 제1 특정 구현예 또는 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
제3 특정 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염에 대해, -L-JD’-는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00024
식 중:
s3는 그룹 JCB’에 공유 결합된 부위 그룹이고;
s4는 그룹 D에 공유 결합된 부위이고;
Zb1 및 Zb2 각각은 독립적으로 부재, -SO2NR9-, -NR9SO2-, -C(=O)-NR9-, -NR9-C(=O)-, -C(=O)-O-, -O-C(=O)-, -CH2-O-, -O-CH2-, -(CH2CH2O)p- 또는 -(OCH2CH2)p’-, -NR9-C(=O)-CH2-, 또는 -CH2-C(=O)-NR9-이고, 여기서 p 및 p’는 독립적으로 1 내지 1000의 정수이고;
E1 및 E2 중 1개는 -C(=O)-이고, 그리고 다른 것은 -NR9-이거나; 또는 E1 및 E2 중 1개는 -C(=O)- 또는 -NR9-이고, 그리고 다른 것은 부재이고;
R9는 H 또는 임의로 치환된 알킬이고;
P는 [XX]1-10이고, 여기서 각 XX는 독립적으로 선택된 아미노산의 잔기이거나, 또는 P는 -(NRm-CH2CH2)s-이고;
s는 1 내지 5의 정수이고;
Rm은 H, 또는 하전된 치환체 또는 이온화가능 그룹으로 임의로 치환된 알킬이고;
Rb1, Rb2, Rb3, Rb4, Rb5 및 Rb6 각각은, 각 경우에 대해, 독립적으로 H 또는 임의로 치환된 알킬이고;
m1 및 n1은, 각 경우에 대해, 독립적으로 0 내지 10의 정수이고; 그리고 잔여 변수는 본 명세서에서 기재된 제1 구현예 또는 제1 특정 구현예 또는 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
일 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염에 대해, -L-JD’-는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00025
식 중:
Zb1 및 Zb2 둘 모두는 부재이거나, 또는 Zb1 및 Zb2 중 1개는 부재이고 다른 것은 -CH2-O- 또는 -O-CH2-이고;
n1은 1 내지 6의 정수이고; 그리고 잔여 변수는 본 명세서에서 기재된 제1 구현예 또는 제1 특정 구현예 또는 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, Rb1 및 Rb2 둘 모두는 H이다.
또 다른 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염에 대해, -L-JD’-는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00026
식 중:
Zb1 및 Zb2 각각은 독립적으로 부재, -CH2-O-, -O-CH2-, -NR9-C(=O)-CH2-, 또는 -CH2-C(=O)-NR9-이고;
n1 및 m1 각각은 독립적으로 1 내지 6의 정수이고; 그리고
잔여 변수는 본 명세서에서 기재된 제1 구현예 또는 제1 특정 구현예 또는 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
더 많은 특정 구현예에서, 상기의 임의의 구현예에서 기재된 식 (L2)에 대해, Zb1 및 Zb2 둘 모두는 부재이다. 또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 상기에서 기재된 식 (L2)에 대해, Zb1는 -CH2-O-이고; 그리고 Zb2는 부재이다. 대안적으로, 상기에서 기재된 식 (L2)에 대해, Zb1은 -CH2-C(=O)-NR9-이고; 그리고 Zb2는 -O-CH2- 또는 부재이다. 더욱더 구체적으로, R9는 -H이다.
일 구현예에서, 상기의 임의의 구현예에서 기재된 식 (L2)에 대해, P는 [XX]2-4이다. 또 다른 특정 구현예에서, 상기의 임의의 구현예에서 기재된 식 (L2)에 대해, P는 [XX]2 또는 [XX]3이다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이 각 XX는 독립적으로 선택된 아미노산의 잔기이다.
또 다른 구현예에서, 상기의 임의의 구현예에서 기재된 식 (L2)에 대해, P는 프로테아제에 의해 전달가능한 펩타이드이다. 더 구체적으로, P는 종양 조직에서 발현된 프로테아제에 의해 절단가능한 프로테아제이다. 또 다른 더 많은 특정 구현예에서, P는 리소좀 프로테아제에 의해 절단가능한 펩타이드이다.
또 다른 구현예에서, 상기의 임의의 구현예에서 기재된 식 (L2)에 대해, P는 하기로 구성된 군으로부터 선택된다: Val-Cit, Val-Lys, Phe-Lys, Lys-Lys, Ala-Lys, Phe-Cit, Leu-Cit, Lle-Cit, Trp, Cit, Phe-Ala, Phe-N9-토실-Arg, Phe-N9-니트로-Arg, Phe-Phe-Lys, D-Phe-Phe-Lys, Gly-Phe-Lys, Leu-Ala-Leu, Ile-Ala-Leu, Val-Ala-Val, Ala-Leu-Ala-Leu (서열식별번호: 17), β-Ala-Leu-Ala-Leu (서열식별번호: 18), Gly-Phe-Leu-Gly (서열식별번호: 19), Val-Arg, Arg-Val, Arg-Arg, Val-D-Cit, Val-D-Lys, Val-D-Arg, D-Val-Cit, D-Val-Lys, D-Val-Arg, D-Val-D-Cit, D-Val-D-Lys, D-Val-D-Arg, D-Arg-D-Arg, Ala-Ala, Ala-D-Ala, D-Ala-Ala, 및 D-Ala-D-Ala.,Gly-Gly-Gly, Ala-Ala-Ala, d-Ala-Ala-Ala, Ala-d-Ala-Ala, Ala-Ala-d-Ala, Ala-Val-Cit, 및 Ala-Val-Ala이다. 더 구체적으로, P는 Gly-Gly-Gly, Ala-Ala-Ala, d-Ala-Ala-Ala, Ala-d-Ala-Ala, Ala-Val-Ala, Gly-Gly 또는 Ala-Ala이다.
또 다른 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염에 대해, -L-JD’-는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00027
Figure 112023025074489-pat00028
또는
Figure 112023025074489-pat00029
그리고 잔여 변수는 본 명세서에서 기재된 제1 구현예 또는 제1 특정 구현예 또는 임의의 더 많은 특정 구현예에서 기재된 바와 같다.
제4 특정 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염에 대해, -L-JD’-는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00030
s3는 그룹 JCB’에 공유 결합된 부위이고;
s4는 그룹 D에 공유 결합된 부위이고;
Zc1은 부재, -SO2NR9-, -NR9SO2-, -C(=O)-NR9-, -NR9-C(=O)-, -C(=O)-O-, -O-C(=O)-, -CH2-O-, -O-CH2-, -(CH2CH2O)p- 또는 -(OCH2CH2)p’-이고,
여기서 p 및 p’는 독립적으로 1 내지 1000의 정수이고;
JD’는
Figure 112023025074489-pat00031
Figure 112023025074489-pat00032
또는
Figure 112023025074489-pat00033
이고, 여기서 s1’는 세포독성 약물 D에 공유 결합된 부위이고, s2’는 그룹 A’에 공유 결합된 부위이고;
A 및 A’ 각각은 독립적으로 임의로 치환된 알킬렌, 임의로 치환된 알케닐렌, 임의로 치환된 알키닐렌, 임의로 치환된 사이클로알킬렌, 임의로 치환된 사이클로알케닐렌 또는 임의로 치환된 사이클로알키닐렌이고;
Q는 -Z1-P-Z2-이고;
Q’는 -Z1’-P’-Z2’-이고;
Z1 및 Z2 중 1개는 -C(=O)-이고, 그리고 다른 것은 -NRh-이고;
Z1’ 및 Z2’ 중 1개는 -C(=O)-이고, 그리고 다른 것은 -NRh’-이고;
P 및 P’ 각각은 독립적으로 부재, 임의로 치환된 알킬렌, -(CH2-CH2-O)j-, -(O-CH2-CH2)j-, 또는 [XX]1-10이고, 여기서 각 XX는 독립적으로 선택된 아미노산의 잔기이고;
j는 1 내지 500의 정수이고;
k는 0 또는 1이고;
L은 -(CR5R6)v-, -(CR7R8)q-N(Rg)-(CR9R10)r-, -(CR7R8)q-C(Ra)(Rg)-(CR9R10)r 또는 -(CR11R12)s-N(Rg)-(CR13R14)t-N(Rg’)-(CR15R16)u-이고;
Rg 및 Rg’ 각각은 독립적으로 -(CR17R18)p-Z-V이고;
p는 1 내지 5의 정수이고;
V는 H, 하전된 치환체 또는 이온화가능 그룹이고;
Z는 부재, -C(=O)NRh-알킬렌- 또는 -NRh-C(=O)-알킬렌-이고;
Rh 및 Rh’는, 각 경우에 대해, 독립적으로 H 또는 임의로 치환된 알킬이고;
R5 내지 R18는, 각 경우에 대해, 독립적으로 H 또는 임의로 치환된 알킬이고;
q, r, s, t, u 및 v 각각은 독립적으로 0 내지 10의 정수이고; 그리고 잔여 변수는 본 명세서에서 기재된 제1 구현예 또는 제1 특정 구현예 또는 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
일 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염에 대해, -L-JD’-는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00034
또는
Figure 112023025074489-pat00035
식 중:
R19 내지 R22는, 각 경우에 대해, 독립적으로 H 또는 임의로 치환된 알킬이고;
m 및 n 각각은 독립적으로 0 내지 10이고; 그리고 잔여 변수는 제1 구현예 또는 제1 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, R19 내지 R22 각각은 H이고; R5 및 R6 각각은 H이고; R7 내지 R10 각각은 H이고; 그리고 R11 내지 R16 각각은 H이다.
일 구현예에서, 식 (L4)-(L11)에 대해, P 및 P’는, 각 경우에 대해, 독립적으로 [XX]1-10.더 구체적으로, P 및 P’는, 각 경우에 대해, 독립적으로 [XX]2-5이고; 그리고 잔여 변수는 상기에서 기재된 바와 같다.
또 다른 구현예에서, 식 (L4)-(L11)에 대해, P 및 P’ 각각은 프로테아제에 의해 전달가능한 펩타이드이다. 또 다른 구현예에서, P 및 P’ 각각은 종양 조직에서 발현된 프로테아제에 의해 절단가능한 프로테아제이다. 대안적으로, P 및 P’ 각각은 리소좀 프로테아제에 의해 절단가능한 펩타이드이다.
또 다른 구현예에서, 식 (L4)-(L11)에 대해, P 및 P’ 각각은 하기로 구성된 군으로부터 선택된다: Val-Cit, Val-Lys, Phe-Lys, Lys-Lys, Ala-Lys, Phe-Cit, Leu-Cit, Lle-Cit, Trp, Cit, Phe-Ala, Phe-N9-토실-Arg, Phe-N9-니트로-Arg, Phe-Phe-Lys, D-Phe-Phe-Lys, Gly-Phe-Lys, Leu-Ala-Leu, Ile-Ala-Leu, Val-Ala-Val, Ala-Leu-Ala-Leu (서열식별번호: 17), β-Ala-Leu-Ala-Leu (서열식별번호: 18), Gly-Phe-Leu-Gly (서열식별번호: 19), Val-Arg, Arg-Val, Arg-Arg, Val-D-Cit, Val-D-Lys, Val-D-Arg, D-Val-Cit, D-Val-Lys, D-Val-Arg, D-Val-D-Cit, D-Val-D-Lys, D-Val-D-Arg, D-Arg-D-Arg, Ala-Ala, Ala-D-Ala, D-Ala-Ala, 및 D-Ala-D-Ala.,Gly-Gly-Gly, Ala-Ala-Ala, D-Ala-Ala-Ala, Ala-D-Ala-Ala, Ala-Ala-D-Ala, Ala-Val-Cit, Ala-Val-Ala, 및 β-Ala-Gly-Gly-Gly이다. 더 구체적으로, P 및 P’ 각각은 Gly-Gly-Gly, Ala-Ala-Ala, D-Ala-Ala-Ala, Ala-D-Ala-Ala, Ala-Val-Ala, 또는 β-Ala-Gly-Gly-Gly이다.
특정 구현예에서, 상기에서 기재된 임의의 구현예 중 [XX]는, 각 경우에 대해, 하기로부터 독립적으로 선택된 아미노산의 잔기이다: 천연 발생 아미노산, 합성 아미노산, 아미노산 유사체, 또는 천연 발생 아미노산과 유사한 방식으로 기능하는 아미노산 모방체.
특정 구현예에서, 상기에서 기재된 임의의 구현예 중 [XX]는, 각 경우에 대해, 하기로 구성된 군으부터 독립적으로 선택된 아미노산의 잔기이다: 히스티딘, 알라닌, 이소류신, 아르기닌, 류신, 아스파라긴, 라이신, 아스파르트산, 메티오닌, 시스테인, 페닐알라닌, 글루탐산, 트레오닌, 글루타민, 트립토판, 글리신, 발린, 프롤린, 세린, 티로신, N-메틸-히스티딘, N-메틸-알라닌, N-메틸-이소류신, N-메틸-아르기닌, N-메틸-류신, N-메틸-아스파라긴, N-메틸-라이신, N-메틸-아스파르트산, N-메틸-메티오닌, N-메틸-시스테인, N-메틸-페닐알라닌, N-메틸-글루탐산, N-메틸-트레오닌, N-메틸-글루타민, N-메틸-트립토판, N-메틸-글리신, N-메틸-발린, N-메틸-프롤린, N-메틸-세린, N-메틸-티로신, 하이드록시프롤린, γ-카복시글루타메이트, 셀리노시스테인, O-포스포세린, 호모세린, 노르류신, 메티오닌 설폭사이드, 메티오닌 메틸 설포늄, 시트룰린, 오르니틴, 시스테인 설폰산, 시스테인 설핀산, 3-아미노알라닌, 3-디메틸아미노알라닌, 2-아미노-4-(디메틸아미노)부탄산, 2,4-디아미노부탄산, 2-아미노-6-(디메틸아미노)헥산산, 2-아미노-5-(디메틸아미노)펜탄산로 구성된 군으부터 독립적으로 선택된 아미노산의 잔기이고, 그리고 β-알라닌, 각각은 독립적으로 L 또는 D 이성질체로서 존재하는, 콘주게이트.더 구체적으로, 각 XX는 독립적으로 글리신 또는 알라닌의 잔기이다.
제5 특정 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트에 대해, D는 메이탄시노이드이고; 그리고 잔여 변수는 제1 구현예 또는 제1, 제2, 제3 또는 제4 구현예 또는 본 명세서에서 기재된 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
더 많은 특정 구현예에서, D는 메이탄시노이드 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00036
식 중:
RM, RM’, 및 RM”는, 각 경우에 대해, 독립적으로 H 또는 임의로 치환된 알킬이고;
R1’, R2’, R3’ 및 R4’는, 각 경우에 대해, 독립적으로 H, 임의로 치환된 임의로 치환된 알킬, 임의로 치환된 알케닐, 임의로 치환된 사이클로알킬, 임의로 치환된 헤테로사이클릴, 임의로 치환된 아릴, 또는 임의로 치환된 헤테로아릴이고;
i는 0 내지 15의 정수이고; 그리고
s5는 그룹 JD’에 공유 결합된 부위이고;
-L-JD’- 는 제1 구현예, 또는 제2 또는 제4 특정 구현예 또는 본 명세서에서 기재된 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
더 구체적으로, D는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00037
또는
Figure 112023025074489-pat00038
또 다른 특정 구현예에서, D는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00039
식 중: RM, RM’, 및 RM”는, 각 경우에 대해, 독립적으로 H 또는 임의로 치환된 알킬이고; s5는 그룹 JD’에 공유 결합된 부위이고; 그리고 -L-JD’-는 제1 구현예, 또는 제3 특정 구현예 또는 임의의 본 명세서에서 기재된 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
더 구체적으로, D는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00040
제6 특정 구현예에서, D는 벤조디아제핀 화합물; 그리고 잔여 변수는 제1 구현예 또는 제1, 제2, 제3 또는 제4 구현예 또는 본 명세서에서 기재된 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다. 예시적인 벤조디아제핀 화합물은, 비제한적으로 하기에서 기재된 것들을 포함한다: US 특허 번호 8,765,740, 8,426,402, US2014/0088089, WO2011/130613, WO2011/130616, WO2010/091150, 및 WO2009/016516.이들 참조문헌의 전체 교시는 본 명세서에서 참고로 편입되어 있다.
더 많은 특정 구현예에서, D는 하기 구조식으로 나타낸 벤조디아제핀 화합물이다:
Figure 112023025074489-pat00041
Figure 112023025074489-pat00042
식 중:
N과 C 사이의 이중 선은 단일 결합 또는 이중 결합을 나타내고, 단, 그것이 이중 결합일 때, X는 부재이고 Y는 -H이고, 그리고 단일 결합일 때, X는 -H, 그것에 결합된 반응성 그룹을 갖는 연결 기, 또는 아민 보호 그룹 (바람직하게는 X는 -H임)로부터 선택되고;
Y는 -H, -OR, -OCOR’, -SR, -NR’R,” -SO3M, -SO2M 또는 -OSO3M으로부터 선택되고, 여기서 M는 -H 또는 양이온 예컨대 Na+ 또는 K+이고;
R은 -H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐 또는 PEG 그룹 -(CH2CH2O)n-Rc이고, 여기서 n은 1 내지 24의 정수이고, 그리고 Rc는 1 내지 4개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬이고;
R’ 및 R”는 동일 또는 상이하고, -H, -OH, -OR, -NRRg’, -COR, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 6 내지 18개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 아릴, O, S, N 및 P로부터 선택된 1 내지 6개의 헤테로원자를 갖는 임의로 치환된 3- 내지 18-원 헤테로사이클릭 고리, PEG 그룹 -(CH2CH2O)n-Rc 로부터 선택되고, 여기서 n은 1 내지 24의 정수이고, 바람직하게는 n은 2, 4 또는 8이고; 그리고 Rg’는 -H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐 또는 PEG 그룹 -(CH2CH2O)n-Rc이고;
X’는 -H, -OH, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 치환된 또는 비치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 페닐, 및 아민-보호 그룹으로 구성된 군으로부터 선택되고;
Y’는 -H, 옥소 그룹, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 치환된 또는 비치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐 로 구성된 군으로부터 선택되고;
A 및 A’는 -O- 및 -S-로부터 선택되고;
W’는 부재이거나, 또는 -O-, -N(Re)-, -N(Re)-C(=O)-, -N(C(=O)Re)-, -S- 또는 -CH2-S-, -CH2NRe-로부터 선택되고;
Rx는 부재하거나 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬로부터 선택되고;
Re는 -H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐 또는 -(CH2-CH2-O)n-Rk이고, 여기서 Rk는 -H, 1 내지 6개의 탄소 원자를 가지고 있는 선형, 분지형 사이클릭 알킬 (이것은, 임의로 2차 아미노 (예를 들면, -NHR101) 또는 3차 아미노 (-NR101R102) 그룹을 보유함) 또는 헤테로사이클, 예컨대 피페리딘 또는 모폴린을 함유하는 5- 또는 6-원 질소이고, 여기서 R101 및 R102 각각은 독립적으로 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 선형, 분지형, 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐이고; 그리고
G는 -CH- 또는 -N-로부터 선택되고;
X” 및 X’”는 동일 또는 상이하고, -(CH2)n’-, -NR’-, -CO-, -BH-, -SO- 또는 -SO2-로부터 독립적으로 선택되고;
Y” 및 Y’”는 동일 또는 상이하고, -O, -(CH2)n’-, -NR’- 또는 -S-로부터 독립적으로 선택되고;
Z” 및 Z”’는 동일 또는 상이하고, -(CH2)n’-, -CR7’R8’-, -NR9’-, -O-, 및 -S-로부터 독립적으로 선택되고;
n’는 0, 1, 2 및 3으로부터 선택되고;
R7’ 및 R8’는 동일 또는 상이하고, 각각은 -H, -OH, -SH, -COOH, -NHR’, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(OCH2CH2)n-, 아미노산, 2 내지 6개의 아미노산을 보유하는 펩타이드 단위, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬로부터 독립적으로 선택되고;
R9’는 -H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(OCH2CH2)n-로부터 독립적으로 선택되고;
RA, RA’, RB 및 RB’는 동일 또는 상이하고, -H, 할라이드, 또는 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 분지형, 선형 또는 사이클릭 알킬로 구성된 군으로부터 독립적으로 선택되거나; 또는 RA 및 RA’ 및/또는 RB 및 RB’는 함께, 그룹 =B 및 =B’ 각각을 함유하는 이중 결합을 형성하고;
=B 및 =B’는 동일 또는 상이하고, 임의로 치환된 분지형 또는 선형 알케닐 또는 카보닐 그룹으로부터 독립적으로 선택되고;
QA는 QA1-Ar-QA2이고;
QA’는 QA1’-Ar’-QA2’이고;
QA1 및 QA1’ 각각은 독립적으로 부재, 1 내지 6개의 탄소 원자의 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬 또는 -CH=CH 단위이고;
Ar 및 Ar’ 각각은 독립적으로 부재이거나, 아릴 그룹을 나타내고;
QA2 및 QA2’ 각각은 -H, 그것에 결합된 반응성 그룹을 갖는 연결 기, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 치환된 또는 비치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -Rc’-(OCH2CH2)n-Rc, 또는 할로겐, 구아니디늄 [-NH(C=NH)NH2], -OR, -NR’R”, -NO2, -NCO, -NR’COR”, -SR, -SOR’로 나타낸 설폭사이드, -SO2R’로 나타낸 설폰, 설포네이트 -SO3M, 설페이트 -OSO3M, SO2NR’R”로 나타낸 설폰아미드, 시아노, 아지도, -COR’, -OCOR’ 또는 -OCONR’R”로부터 선택된 치환체로부터 독립적으로 선택되고; 그리고
Rc’는 부재하거나 1 내지 5개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬, 알케닐 또는 알키닐로부터 선택된다.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, D는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00043
Figure 112023025074489-pat00044
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 여기서 RA” 및 RB”는 동일 또는 상이하고, -H 및 -Me로부터 선택되고; 그리고 잔여 변수는 상기에서 기재된 바와 같다.
특정 구현예에서, 식 (D6)-(D17)에 대해, N과 C 사이의 이중 선은 단일 결합 또는 이중 결합을 나타내고, 단, 그것이 이중 결합일 때 X는 부재이고 Y는 -H이고, 그리고 단일 결합일 때, X는 -H이고; Y는 -OH 또는 -SO3M이고;
M는 -H 또는 약제학적으로 허용가능한 양이온 (예를 들면, Na+)이고;
X’ 및 Y’ 둘 모두는 -H이고;
A 및 A’ 둘 모두는 -O-이고;
R6는 -OMe이고; 그리고
Rx는 1 내지 6개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬인, 콘주게이트.
더 많은 특정 구현예에서, D는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00045
Figure 112023025074489-pat00046
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 여기서 Y는 -H 또는 -SO3M이고, 그리고 M은 H+ 또는 양이온이다. 더욱더 구체적으로, Y는 -SO3M이고, 그리고 M은 H+, Na+ 또는 K+이다.
제7 특정 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트에 대해, -L-JD’-는 결합이고; 그리고 D는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00047
Figure 112023025074489-pat00048
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 식 중:
L’, L”, 및 L”’ 중 1개는 하기 식으로 나타내고:
Figure 112023025074489-pat00049
그리고 다른 2개는 동일 또는 상이하고, -H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(OCH2CH2)n-Rc, 할로겐, 구아니디늄 [-NH(C=NH)NH2], -OR, -NR’R”, -NO2, -NR’COR”, -SR, -SOR’, -SO2R’, -SO3H, -OSO3H, -SO2NR’R”, 시아노, 아지도, -COR’, -OCOR’, 및 -OCONR’R”로부터 독립적으로 선택되고;
Zd1은 부재, -C(=O)-NR9- 또는 -NR9-C(=O)-이고;
P는 아미노산 잔기 또는 2 내지 20개의 아미노산 잔기를 함유하는 펩타이드이고;
Ra 및 Rb는, 각 경우에 대해, 독립적으로 -H, (C1-C3)알킬 또는 하전된 치환체 또는 이온화가능 그룹 Q이고;
r 및 r’는 독립적으로 1 내지 6의 정수이고;
N과 C 사이의 이중 선은 단일 결합 또는 이중 결합을 나타내고, 단, 그것이 이중 결합일 때 X는 부재이고 Y는 -H, 또는 1 내지 4개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬이고, 그리고 단일 결합일 때, X는 -H 또는 아민 보호 모이어티이고;
Y는 하기로부터 선택된 이탈 그룹이고: -OR, -OCOR’, -OCOOR’, -OCONR’R”, -NR’R”, -NR’COR”, -NR’NR’R”, 임의로 치환된 5- 또는 6-원 질소-함유 헤테로사이클 (예를 들면, 질소 원자를 통해 부착된 피페리딘, 테트라하이드로피롤, 피라졸, 모폴린, 등), -NR’(C=NH)NR’R”로 나타낸 구아니디늄, -NRCOP’으로 나타낸 아미노산, 또는 펩타이드, -SR, -SOR’, 할로겐, 시아노, 아지도, -OSO3H, 설파이트 (-SO3H 또는 -SO2H), 메타바이설파이트 (H2S2O5), 모노-, 디-, 트리-, 및 테트라- 티오포스페이트 (PO3SH3, PO2S2H2, POS3H2, PS4H2), 티오 포스페이트 에스테르 (RiO)2PS(ORi), RiS-, RiSO, RiSO2, RiSO3, 티오설페이트 (HS2O3), 디티오나이트 (HS2O4), 포스포로디티오에이트 (P(=S)(ORk’)(S)(OH)), 하이드록삼산 (Rk’C(=O)NOH), 및 포름알데하이드 설폭실레이트 (HOCH2SO2 -) 또는 이들의 혼합물, 여기서 Ri는 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬이고 -N(Rj)2, -CO2H, -SO3H, 및 -PO3H로부터 선택된 적어도 1개의 치환체로 치환되고; Ri는 본 명세서에서 기재된 알킬에 대한 치환체로 추가로 임의로 치환될 수 있고; Rj는 1 내지 6개의 탄소 원자를 갖는 선형 또는 분지형 알킬이고; Rk’는 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 아릴, 헤테로사이클릴 또는 헤테로아릴이고;
P’는 아미노산 잔기 또는 2 내지 20개의 아미노산 잔기를 함유하는 폴리펩타이드이고,
R은, 각 경우에 대해, -H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(CH2CH2O)n-Rc, 6 내지 18개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 아릴, 질소, 산소, 및 황으로부터 독립적으로 선택된 1종 이상의 헤테로원자를 함유하는 임의로 치환된 5- 내지 18-원 헤테로아릴 고리, 또는 O, S, N 및 P로부터 독립적으로 선택된 1 내지 6개의 헤테로원자를 함유하는 임의로 치환된 3- 내지 18-원 헤테로사이클릭 고리로 구성된 군으로부터 독립적으로 선택되고;
R’ 및 R” 각각은 -H, -OH, -OR, -NHR, -NR2, -COR, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(CH2CH2O)n-Rc, 및 O, S, N 및 P로부터 독립적으로 선택된 1 내지 6개의 헤테로원자를 갖는 임의로 치환된 3- 내지 18-원 헤테로사이클릭 고리로부터 독립적으로 선택되고;
Rc는 -H 또는 1 내지 4개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형 또는 분지형 알킬이고;
n은 1 내지 24의 정수이고;
X’는 -H, 아민-보호 그룹, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(CH2CH2O)n-Rc, 6 내지 18개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 아릴, 질소, 산소, 및 황으로부터 독립적으로 선택된 1종 이상의 헤테로원자를 함유하는 임의로 치환된 5- 내지 18-원 헤테로아릴 고리, 및 O, S, N 및 P로부터 독립적으로 선택된 1 내지 6개의 헤테로원자를 함유하는 임의로 치환된 3- 내지 18-원 헤테로사이클릭 고리로부터 선택되고;
Y’는 -H, 옥소 그룹, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 임의로 치환된 6- 내지 18-원 아릴, 질소, 산소, 및 황으로부터 독립적으로 선택된 1종 이상의 헤테로원자를 함유하는 임의로 치환된 5- 내지 18-원 헤테로아릴 고리, 1 내지 6개의 헤테로원자를 갖는 임의로 치환된 3- 내지 18-원 헤테로사이클릭 고리로부터 선택되고;
R1, R2, R3, R4, R1’, R2’, R3’ 및 R4’ 각각은 -H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(OCH2CH2)n-Rc, 할로겐, 구아니디늄 [-NH(C=NH)NH2], -OR, -NR’R”, -NO2, -NCO, -NR’COR”, -SR, -SOR’, -SO2R’, -SO3 -H, -OSO3H, -SO2NR’R”, 시아노, 아지도, -COR’, -OCOR’, 및 -OCONR’R”로 구성된 군으로부터 독립적으로 선택되고;
R6는 -H, -R, -OR, -SR, -NR’R”, -NO2, 또는 할로겐이고;
A 및 A’는 동일 또는 상이하고, -O-, 옥소 (-C(=O)-), -CRR’O-, -CRR’-, -S-, -CRR’S-, -NR5 및 -CRR’N(R5)-로부터 독립적으로 선택되고; 그리고
R5 및 R9 각각은 독립적으로 -H 또는 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형 또는 분지형 알킬이고; 그리고 잔여 변수는 제1 구현예 또는 제1 특정 구현예 또는 임의의 본 명세서에서 기재된 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
더 많은 특정 구현예에서, 식 (D18)-(D23)에 대해, L’는 식 (A)로 나타내고 L” 및 L”’ 둘 모두는 -H이다.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 식 (D18)-(D23)에 대해:
N과 C 사이의 이중 선은 단일 결합 또는 이중 결합을 나타내고, 단, 그것이 이중 결합일 때 X는 부재이고 Y는 -H이고, 그리고 단일 결합일 때, X는 -H이고, Y는 -OH 또는 -SO3M이고;
R1, R2, R3, R4, R1’, R2’, R3’ 및 R4’ 모두는 -H이고;
R6는 -OMe이고;
X’ 및 Y’ 둘 모두는 -H이고;
A 및 A’는 -O-이고; 그리고
M는 H+, Na+ 또는 K+; 그리고 잔여 변수는 제7 특정 구현예 또는 상기에서 기재된 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 식 (D18)-(D23)에 대해, Ra 및 Rb 둘 모두는 H이고; 그리고 잔여 변수는 제7 특정 구현예 또는 상기에서 기재된 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 식 (D18)-(D23)에 대해, R5 및 R9 각각은 독립적으로 H 또는 Me이고; 그리고 잔여 변수는 제7 특정 구현예 또는 상기에서 기재된 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, R5 및 R9 둘 모두는 H이다.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 식 (D18)-(D23)에 대해, P는 2 내지 10개의 아미노산 잔기를 함유하는 펩타이드이고; 그리고 잔여 변수는 제7 특정 구현예에서 또는 상기에서 기재된 임의의 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, P는 2 내지 5개의 아미노산 잔기를 함유하는 펩타이드이다. 더욱더 구체적으로, P는 하기로부터 선택된다: Gly-Gly-Gly, Ala-Val, Val-Ala, Val-Cit, Val-Lys, Phe-Lys, Lys-Lys, Ala-Lys, Phe-Cit, Leu-Cit, Lle-Cit, Trp, Cit, Phe-Ala, Phe-N9-토실-Arg, Phe-N9-니트로-Arg, Phe-Phe-Lys, D-Phe-Phe-Lys, Gly-Phe-Lys, Leu-Ala-Leu, Ile-Ala-Leu, Val-Ala-Val, Ala-Leu-Ala-Leu (서열식별번호: 17), β-Ala-Leu-Ala-Leu (서열식별번호: 18) 및 Gly-Phe-Leu-Gly (서열식별번호: 19), Val-Arg, Arg-Val, Arg-Arg, Val-D-Cit, Val-D-Lys, Val-D-Arg, D-Val-Cit, D-Val-Lys, D-Val-Arg, D-Val-D-Cit, D-Val-D-Lys, D-Val-D-Arg, D-Arg-D-Arg, Ala-Ala, Ala-D-Ala, D-Ala-Ala, 및 D-Ala-D-Ala.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트에 대해, -L-JD’-D는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00050
Figure 112023025074489-pat00051
Figure 112023025074489-pat00052
또는
Figure 112023025074489-pat00053
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 여기서 Y는 H 또는 -SO3M이고, 그리고 M은 H+, Na+ 또는 K+이다.
제8 특정 구현예에서, 식 (I)의 콘주게이트는 하기 구조식으로 나타낸다.
Figure 112023025074489-pat00054
Figure 112023025074489-pat00055
Figure 112023025074489-pat00056
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또는
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상기에서 기재된 구현예 중 임의의 하나, 예컨대 제1 구현예 또는 제1 내지 8th 특정 구현예 또는 임의의 본 명세서에서 기재된 더 많은 특정 구현예의 콘주게이트 중 CBA는, 본 명세서에서 기재된 임의의 세포-결합제, 예컨대 아래의 제2 구현예에서 기재된 것들일 수 있다.
특정 구현예에서, 상기에서 기재된 구현예 중 임의의 하나, 예컨대 제1 구현예 또는 제1 내지 8th 특정 구현예 또는 임의의 본 명세서에서 기재된 더 많은 특정 구현예의 콘주게이트는, 세포-결합제 (예를 들면, 항체) 분자에 대해 결합된1 내지 4개의 세포독성 약물 분자를 포함할 수 있다. 특정 구현예에서, 콘주게이트는 세포-결합제 분자 당 2 또는 4개의 세포독성 약물 분자를 포함할 수 있다. 세포-결합제 (예를 들면, 항체) 분자에 대해 결합된 세포독성 약물 분자의 수는 메이탄시노이드 화합물에 대한 280 nm 및 252 nm에서 흡광도의 비, 및 벤조디아제핀 화합물에 대한 280 nm 및 330 nm에서 흡광도의 비를 측정하여 분광적으로 결정될 수 있다. 대안적으로, 세포-결합제 (예를 들면, 항체) 분자에 대해 결합된 세포독성 약물 분자의 수는 질량 분광분석법에 의해 결정될 수 있다.
본 발명은 추가로, 상기에서 기재된 구현예 중 임의의 하나, 예컨대 제1 구현예 또는 제1 내지 8th 특정 구현예 또는 임의의 본 명세서에서 기재된 더 많은 특정 구현예의 콘주게이트를 포함하는 조성물을 제공한다. 특정 구현예에서, 본 조성물 중 콘주게이트의 적어도 약 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 99%, 99.5%, 99.9% 이상은 각 CBA에 공유결합된 2 또는 4개의 세포독성 약물을 갖는다. 특정 구현예에서, 상기에서 기재된 조성물에서, 콘주게이트의 약 20%, 15%, 10%, 9%, 8%, 7%, 6%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1%, 0.5% 또는 0.1% 이하는 각 CBA에 공유결합된 단 1개의 세포독성 약물을 갖는다.
세포 결합제
제2 구현예에서, 본 발명은 본 명세서에서 기재된 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트을 제조하기 위해 세포-결합제 (CBA)를 제공한다. 그와 같은 CBA은 단백질 (예를 들면, 자연에서 발견된 단백질, 또는 조작된 또는 재조합 단백질), 예컨대 항체, 그것의 항원-결합부 (이것은 항체 유도체를 포함할 수 있음), 또는 항체 모방체 단백질일 수 있다. 그와 같은 단백질성 CBA의 N-말단은 세린, 트레오닌, 하이드록실리신, 4-하이드록시오르니틴 또는 2,4-디아미노-5-하이드록시 발레르산 잔기의 일부일 수 있는 2-하이드록시에틸아민 모이어티를 포함할 수 있다. 2-하이드록시에틸아민 모이어티는 알데하이드 그룹이 되도록 본 발명의 방법을 사용하여 산화될 수 있고, 그 다음 알데하이드 반응성 그룹과 반응하여 상기 대상 콘주게이트를 형성할 수 있다.
관련된 측면에서, 본 발명은 또한, 어떤 조작된 단백질성 CBA, 예컨대 조작된 항체, 그것의 항원-결합부 (또는 항체 유도체), 또는 항체 모방체 단백질을 제공하고, 이것은 그와 같은 항체, 그것의 항원-결합부 (또는 항체 유도체), 또는 항체 모방체 단백질의 비-Ser, 비-Thr 천연 서열과는 대조적으로 Ser 또는 Thr를 N-말단 잔기로서 가질 수 있다.
N-말단 Ser / Thr 신호 펩타이드 서열 직후에 Ser / Thr 코돈을 삽입하여 부가될 수 있다. 그와 같은 신호 펩타이드 서열은 항체, 그것의 항원-결합부 (또는 항체 유도체), 또는 항체 모방체 단백질에 대한 천연 신호 펩타이드일 수 있거나, 항체, 그것의 항원-결합부 (또는 항체 유도체), 또는 항체 모방체 단백질의 성숙한 가공된 서열 에 N-말단으로 융합된 이종성 신호 펩타이드일 수 있다.
여기서, “성숙한 가공된 서열 (예를 들면, 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부)”는 어떤 분비된 단백질 - 예컨대 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 가공된 서열을 의미하고 - 상기 분비된 단백질은 N-말단 신호 펩타이드 (천연 발생의 것, 또는 재조합 기술을 사용하는 이종성 1개의 융합된 N-말단)으로 합성된다. 신호 펩타이드의 절단으르 포함하는 정상 성숙 과정 후, 수득한 성숙한 가공된 서열은 일반적으로 모든 신호 펩타이드 서열이 없다.
서열식별번호: 1 및 6은 그와 같은 천연 또는 이종성 신호 펩타이드로서 사용될 수 있다. 항체, 그것의 항원-결합부 (또는 항체 유도체), 또는 항체 모방체 단백질의 성숙한 가공된 서열에서 N-말단 잔기에 대한 추가 서열 변화는 신호 펩타이드 절단 후 N-말단 잔기가 Ser/Thr인 한 존재할 수 있다.
구체적으로, N-말단 Ser / Thr는 쥣과 항-FOLR1 항체 FR1-2.1 (ATCC(2013년 4월 16일)에 수탁되고 하기의 ATCC 수탁 번호를 갖는 하이브리도마에 의해 생산됨)의 경쇄 신호 펩타이드에 의해 수득된 특정 신호 펩타이드 서열을 사용하여 부가될 수 있다: PTA-120197), 상기 신호 펩타이드는 하기의 서열식별번호: 1로 나타낸다. 그것은 놀랍게도, 이러한 신호 펩타이드 서열이 단백질의 성숙한 가공된 서열의 N-말단 잔기로서 그것의 마지막 Ser를 남기도록 독특하게 가공된다는 것을 발견했다.
N-말단 Ser/Thr이 CBA에서 자연적으로 현존하거나 본 명세서에서 기재된 재조합 기술 중 임의의 것을 사용하여 조작되는 지와는 무관하게, 본 발명의 또 다른 측면은 추가로, 변형된 CBA (예를 들면, 변형된 항체, 그것의 항원-결합부 (또는 항체 유도체), 또는 항체 모방체 단백질)를 제공하고, 여기서, 그것의 N-말단 Ser/Thr은 알데하이드 그룹으로 산화되었다. 특정 구현예에서, 알데하이드는 항체 또는 그것의 항원-결합부의 중쇄에 대한 N-말단 Ser/Thr의 산화로부터 유도된다. 산화는 본 명세서에서 기재된 본 발명의 방법 중 임의의 것을 사용하여 수행될 수 있다. 그와 같은 변형된 CBA는 알데하이드 반응성 그룹 (예컨대 본 명세서에서 기재된 것)를 보유하는 링커와 반응하여 본 발명의 콘주게이트를 형성할 수 있다.
따라서 본 발명은 또한, 본 발명의 변형된 CBA (예를 들면, 항체, 그것의 항원-결합부 (또는 항체 유도체), 또는 항체 모방체 단백질)을 사용하여 본 명세서에서 기재된 본 발명의 콘주게이트를 제조하는 방법을 제공한다. 본 발명은 추가로, N-말단 Ser/Thr을 갖는 CBA의 성숙한 가공된 서열을 생산하는 조작된 CBA (예를 들면, 항체, 그것의 항원-결합부 (또는 항체 유도체), 또는 항체 모방체 단백질) 중 임의의 것 를 인코딩하는 폴리뉴클레오타이드를 제공한다.
특정 구현예에서, 알데하이드 그룹은 단백질성 CBA (예를 들면, 항체 또는 그것의 항원-결합부)의 N-말단에서 위치한다. 예를 들면, N-말단 알데하이드 그룹은 N-말단 세린 또는 트레오닌의 산화 로부터 유도될 수 있다.
일 구현예에서, N-말단 세린 또는 트레오닌은 단백질성 CBA (예를 들면, 항체 또는 그것의 항원-결합부)에서 자연적으로 현존할 수 있다. 예를 들면, 항체 또는 그것의 항원-결합부는 하기를 포함할 수 있다: 서열식별번호: 3의 경쇄 서열: 또는 서열식별번호: 1의 신호 펩타이드를 인코딩하는 동일한 마우스 생식 계열 서열로부터 유도된 경쇄 서열. 관련된 구현예에서, 항체 또는 그것의 항원-결합부는 서열식별번호: 3의 경쇄 서열, 또는 서열식별번호: 1의 신호 펩타이드를 인코딩하는 동일한 마우스 생식 계열 서열로부터 유도된 경쇄 서열을 포함하는 쥣과 항체 또는 그것의 항원-결합부의 키메라성, 인간화된, 또는 인간 항체 또는 그것의 항원-결합부이다.
유사하게, 항체 또는 그것의 항원-결합부는 하기를 포함할 수 있다: 쥣과 IGKV6-32*01 서열로부터 유도된 경쇄 서열 (즉, SIVMTQTPKFLLVSAGDRVTITCKASQSVSNDVAWYQQKPGQSPKLLIYYASNRYTGVPDRFTGSGYGTDFTFTISTVQAEDLAVYFCQQDYSSP, 서열식별번호: 20). 관련된 구현예에서, 항체 또는 그것의 항원-결합부는 하기의 서열식별번호의 쥣과 IGKV6-32*01 서열로부터 유도된 경쇄 서열을 포함하는 쥣과 항체 또는 그것의 항원-결합부의 키메라성, 인간화된, 또는 인간 항체 또는 그것의 항원-결합부이다: 20.
또한, 항체 또는 그것의 항원-결합부는 하기를 포함할 수 있다: 하기에서 열거된 V 유전자 서열의 인간 람다 V3 패밀리 중 임의의 하나로부터 유도된 경쇄 서열 (즉, 서열식별번호: 21-41). 관련된 구현예에서, 항체 또는 그것의 항원-결합부는 하기를 포함하는 쥣과 항체 또는 그것의 항원-결합부의 키메라성, 인간화된, 또는 인간 항체 또는 그것의 항원-결합부이다: 하기에서 열거된 V 유전자 서열의 인간 람다 V3 패밀리 중 임의의 하나로부터 유도된 경쇄.
V 유전자 서열의 인간 람다 V3 패밀리
IGLV3-1*01
SYELTQPPSVSVSPGQTASITCSGDKLGDKYACWYQQKPGQSPVLVIYQDSKRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISGTQAMDEADYYCQAWDSSTA (서열식별번호: 21)
IGLV3-10*01
SYELTQPPSVSVSPGQTARITCSGDALPKKYAYWYQQKSGQAPVLVIYEDSKRPSGIPERFSGSSSGTMATLTISGAQVEDEADYYCYSTDSSGNHX (서열식별번호: 22)
IGLV3-10*02
SYELTQPPSVSVSPGQTARITCSGDALPKKYAYWYQQKSGQAPVLVIYKDSKRPSGIPERFSGSSSGTMATLTISGAQVEDEDDYYCYSADYSGN (서열식별번호: 23)
IGLV3-12*01
SYELTQPHSVSVATAQMARITCGGNNIGSKAVHWYQQKPGQDPVLVIYSDSNRPSGIPERFSGSNPGNTTTLTISRIEAGDEADYYCQVWDSSSDHP (서열식별번호: 24)
IGLV3-12*02
SYELTQPHSVSVATAQMARITCGGNNIGSKAVHWYQQKPGQDPVLVIYSDSNRPSGIPERFSGSNPGNTATLTISRIEAGDEADYYCQVWDSSSDHP (서열식별번호: 25)
IGLV3-13*01
SYELTQPPAVSVSPGQTARISCSGDVLRDNYADWYPQKPGQAPVLVIYKDGERPSGIPERFSGSTSGNTTALTISRVLTKGGADYYCFSGD*NNL (서열식별번호: 26)
IGLV3-16*01
SYELTQPPSVSVSLGQMARITCSGEALPKKYAYWYQQKPGQFPVLVIYKDSERPSGIPERFSGSSSGTIVTLTISGVQAEDEADYYCLSADSSGTYP (서열식별번호: 27)
IGLV3-19*01
SSELTQDPAVSVALGQTVRITCQGDSLRSYYASWYQQKPGQAPVLVIYGKNNRPSGIPDRFSGSSSGNTASLTITGAQAEDEADYYCNSRDSSGNHL (서열식별번호: 28)
IGLV3-21*01
SYVLTQPPSVSVAPGKTARITCGGNNIGSKSVHWYQQKPGQAPVLVIYYDSDRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRVEAGDEADYYCQVWDSSSDHP (서열식별번호: 29)
IGLV3-21*02
SYVLTQPPSVSVAPGQTARITCGGNNIGSKSVHWYQQKPGQAPVLVVYDDSDRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRVEAGDEADYYCQVWDSSSDHP (서열식별번호: 30)
IGLV3-21*03
SYVLTQPPSVSVAPGKTARITCGGNNIGSKSVHWYQQKPGQAPVLVVYDDSDRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRVEAGDEADYYCQVWDSSSDHP (서열식별번호: 31)
IGLV3-22*01
SYELTQLPSVSVSPGQTARITCSGDVLGENYADWYQQKPGQAPELVIYEDSERYPGIPERFSGSTSGNTTTLTISRVLTEDEADYYCLSGDEDNP (서열식별번호: 32)
IGLV3-25*01
SYELMQPPSVSVSPGQTARITCSGDALPKQYAYWYQQKPGQAPVLVIYKDSERPSGIPERFSGSSSGTTVTLTISGVQAEDEADYYCQSADSSGTYP (서열식별번호: 33)
IGLV3-25*02
SYELTQPPSVSVSPGQTARITCSGDALPKQYAYWYQQKPGQAPVLVIYKDSERPSGIPERFSGSSSGTTVTLTISGVQAEDEADYYCQSADSSGTYP (서열식별번호: 34)
IGLV3-25*03
SYELTQPPSVSVSPGQTARITCSGDALPKQYAYWYQQKPGQAPVLVIYKDSERPSGIPERFSGSSSGTTVTLTISGVQAEDEADYYCQSADSSG (서열식별번호: 35)
IGLV3-27*01
SYELTQPSSVSVSPGQTARITCSGDVLAKKYARWFQQKPGQAPVLVIYKDSERPSGIPERFSGSSSGTTVTLTISGAQVEDEADYYCYSAADNNL (서열식별번호: 36)
IGLV3-31*01
SSELSQEPAVSVALG*TARITCQGDSIEDSVVNWYKQKPSQAPGLVI*LNSVQSSGIPKKFSGSSSGNMATLTITGIQVEDKADYYCQSWDSSRTHS (서열식별번호: 37)
IGLV3-31*02
SSELSQEPAVSVSLG*TARITCQGDSIEDSVVNWYKQKPSQAPGLVI*LNSVQSSGIPKKFSGSSSGNMATLTITGIQVEDKADYYCQSWDSSRTHS (서열식별번호: 38)
IGLV3-32*01
SSGPTQVPAVSVALGQMARITCQGDSMEGSYEHWYQQKPGQAPVLVIYDSSDRPSRIPERFSGSKSGNTTTLTITGAQAEDEADYYYQLIDNHAT (서열식별번호: 39)
IGLV3-9*01
SYELTQPLSVSVALGQTARITCGGNNIGSKNVHWYQQKPGQAPVLVIYRDSNRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRAQAGDEADYYCQVWDSSTA (서열식별번호: 40)
IGLV3-9*02
SYELTQPLSVSVALGQAARITCGGNNLGYKSVHWYQQKPGQAPVLVIYRDNNRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRAQAGDEADYYCQVWDSSTAHP (서열식별번호: 41)
인간화된 항체 또는 그것의 항원-결합부는 재표면화된 또는 CDR 이식된 항체 또는 그것의 항원-결합부일 수 있다.
또 다른 구현예에서, N-말단 세린 또는 트레오닌은 단백질성 CBA (예를 들면, 항체 또는 그것의 항원-결합부) 로 조작될 수 있다. 예를 들면, 항체 또는 이것의 항체-결합부는 본 명세서에서 기재된 본 발명의 재조합 항체 중 임의의 하나일 수 있다 (아래 참고).
특정 구현예에서, N-말단 알데하이드 그룹은 항체 또는 그것의 항원-결합부의 하나 또는 둘 모두의 중쇄, 또는 항체 또는 그것의 항원-결합부의 하나 또는 둘 모두의 경쇄, 또는 이들의 조합 상에 위치한다.
특정 구현예에서, CBA는 항체 또는 그것의 항원-결합부이다. 특정 구현예에서, 항원-결합 부분은 Fab, F(ab)2, F(ab’), F(ab’)2, F(ab’)3, Fd, Fv, 디설파이드 연결된 Fv, dAb 또는 sdAb (또는 나노바디), CDR, scFv, (scFv)2, 디-scFv, 바이-scFv, tascFv (탠덤 scFv), 아비바디 (예를 들면, 디아바디, 트리아바디, 테트라바디), T-세포 연관체 (BiTE), scFv-Fc, Fcab, mAb2, 작은 모듈러 면역약물 (SMIP), 젠맙 / 유니바디 또는 듀오바디, V-NAR 도메인, IgNAR, 미니바디, IgGΔCH2, DVD-Ig, 프로바디, 인트라바디, 또는 다중특이성 항체일 수 있다. 어떤 특정 구현예에서, 항원-결합 부분은 단일 도메인 항체 (sdAb) 또는 나노바디일 수 있다.
특정 구현예에서, CBA는 항체 모방체, 예컨대 DARPin, 센타이린, 아피바디, 아필린, 아피틴, 안티칼린, 아비머, 파미노머, 쿠니츠 도메인 펩타이드, 모노바디 (또는 아드넥틴), 트리바디, 또는 나노피틴이다. 어떤 특정 구현예에서, CBA는 DARPin이다. 다른 특정 구현예에서, CBA는 센타이린이다. 또 다른 특정 구현예에서, CBA는 모노바디 또는 아드넥틴이다. 특정 구현예에서, CBA는 하기이다: 이중 수용체 재표적화 (DART) 분자 (P.A.Moore 등,Blood, 2011; 117(17): 4542-4551; Veri MC 등,Arthritis Rheum.,2010 Mar 30; 62(7): 1933-43; Johnson, S 등,　J.Mol.Biol.,2010 Apr 9;399(3): 436-49) 또는 세포 침투 초하전된 단백질 ( Methods in Enzymol.502, 293-319 (2012).
또 다른 측면에서, 본 발명은 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부를 제공하고, 이것은 서열식별번호: 1의 아미노산 서열을 갖는 이종성 신호 펩타이드를 포함한다.
본 발명의 이러한 측면은 하기인 놀라운 발견을 부분적으로 기반으로 한다: 서열식별번호: 1, 항체 FR1-2.1의 경쇄 신호 펩타이드는, 하기의 서열식별번호: 1에서 마지막 Ser 직전에 자연적으로 절단될 수 있고, 따라서 수득한 가공된 폴리펩타이드 (예를 들면, 하기로 발현된 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부에서 N-말단 세린을 남긴다: 서열식별번호: 1, 신호 펩타이드로서). 따라서 하기의 서열식별번호의 신호 펩타이드: 1은 이종성 폴리펩타이드 (예를 들면, 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부)에 재조합으로 융합될 수 있고, N-말단 Ser을 갖는 폴리펩타이드를 생산하기 위해 일반적인 접근법으로 사용될 수 있다.
특정 구현예에서, 이종성 신호 펩타이드는 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열의 N-말단에 융합된다.
특정 구현예에서, 이종성 신호 펩타이드는 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열의 N-말단의 제2 아미노산 잔기에 융합된다. 따라서 이 구현예에서, 가공된 폴리펩타이드 서열식별번호: 1로부터의 N-말단 Ser로 인해 1개의 추가의 아미노산 잔기를 갖지 않는다. 다른 관련된 구현예에서, 이종성 신호 펩타이드는 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열의 N-말단부의 임의의 잔기 (예를 들면, 제3, 제4, 제5, 등.)에 융합되고, 이로써 1종 이상의 N-말단 잔기가 “결실”되고, 단, 항체 또는 그것의 항원-결합부의 결합 능력은 실질적으로 영향을 받지 않는다. 대안적으로 또는 추가로, 1개 이상의 추가의 잔기는 N-말단 Ser 후에 부가될 수 있고, 단 N-말단 잔기는 Ser, 예컨대 하기의 마지막 잔기로부터의 Ser이다: 서열식별번호: 1.
관련된 측면에서, 본 발명은 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부를 제공하고, 이것은 (천연) 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 신호 펩타이드의 마지막 잔기에 대해 바로 C-말단의 Ser 또는 Thr 잔기를 포함한다. 이것은 천연 신호 펩타이드에 대한 코딩 서열 직후 Ser 또는 Thr의 코돈을 삽입하여 달성될 수 있다. 예를 들면, Ser 잔기는 하기를 만들기 위해 단클론성 항체 huMov19 경쇄 또는 중쇄의 천연 신호 펩타이드 서열 직후 삽입될 수 있다: 서열
Figure 112023025074489-pat00071
(서열식별번호: 42). 천연 신호 펩타이드 서열의 자연 처리(절단) 후, 수득한 N-말단 잔기는 Ser인 것으로 기대된다.
예를 들면, 특정 구현예에서, Ser 또는 Thr 잔기는 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열의 제1 잔기에 대한 바로 N-말단일 수 있다.
또 다른 구현예에서, Ser 또는 Thr 잔기는 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열의 1종 이상의 N-말단 아미노산 잔기(들)를 치환한다. 대안적으로 또는 추가로, 추가의 아미노산 잔기는 부가, 결실 또는 치환될 수 있고, 단, 신호 펩타이드 가공 후 수득한 폴리펩타이드의 제1 잔기가 Ser/Thr이다.
예시적인 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부는, 하기의 서열을 가질 수 있다: 서열식별번호: 10 또는 14. 다른 것은 서열식별번호: 42를 포함하는 것들을 포함할 수 있다.
본 발명의 또 다른 측면은 본 명세서에서 기재된 본 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부 중 임의의 하나로부터 유도된 중쇄, 경쇄, 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열을 포함하는 재조합 항체를 제공한다.
예를 들면, 재조합 항체는 Fab, F(ab)2, F(ab’), F(ab’)2, F(ab’)3, Fd, Fv, 디설파이드 연결된 Fv, dAb 또는 sdAb (또는 나노바디), CDR, scFv, (scFv)2, 디-scFv, 바이-scFv, tascFv (탠덤 scFv), 아비바디 (예를 들면, 디아바디, 트리아바디, 테트라바디), T-세포 연관체 (BiTE), scFv-Fc, Fcab, mAb2, 작은 모듈러 면역약물 (SMIP), 젠맙 / 유니바디 또는 듀오바디, V-NAR 도메인, IgNAR, 미니바디, IgGΔCH2, DVD-Ig, 프로바디, 인트라바디, 또는 다중특이성 항체이거나 그것을 포함할 수 있다. 어떤 특정 구현예에서, 항원-결합 부분은 단일 도메인 항체 (sdAb) 또는 나노바디일 수 있다.
특정 구현예에서, 재조합 항체는 중쇄, 경쇄, 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열 중 1, 2, 3, 또는 4개를 포함할 수 있고, 이들 각각은 본 명세서에서 기재된 본 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부 중 임의의 하나로부터 유도된다.
특정 구현예에서, 재조합 항체는 제1 중쇄 폴리펩타이드 및 제2 중쇄 폴리펩타이드를 포함하는 이종이량체 항체일 수 있고, 상기 제1 중쇄 폴리펩타이드의 Fc 영역 및 제2 중쇄 폴리펩타이드의 Fc 영역은 인터페이스에서 만아고, 제2 중쇄 폴리펩타이드의 Fc 영역의 인터페이스는 제1 중쇄 폴리펩타이드의 Fc 영역의 인터페이스 중 공동에서 위치할 수 있는 돌출부를 포함한다. 특정 구현예에서, 이중특이적 항체에서 중쇄의 특이적 짝짓기를 촉진하는 노브-인투-홀 기술은 하기 예를 수행하여 예를 들면, Genentech / Roche의 CrossMab 기술을 기반으로 추가로 개선될 수 있고, 예를 들면, 경쇄 짝짓기오류를 추가로 감소시키거나 제거하기 위해 CH1 및 카파 불변 영역을 스와핑함.
대안적으로, 유사한 결과는 또한, LC 이종이량체, 예컨대 Zymeworks Azymetric™ 이종이량체 IgG1 경쇄 플랫폼 기술을 사용하여 달성될 수 있고, 상기 기술은 완전히 이중특이적 항체의 발단에서 공통의 경쇄, 도메인 항체, 및 단일 사슬 포맷을 포함하는 다중 다른 생물제제 접근법을 완전히 보완한다.
특정 구현예에서, 제2 중쇄 폴리펩타이드의 Fc 영역은 돌출부를 인코팅하기 위해 템플레이트/최초 폴리펩타이드로부터 변경되었거나, 제1 중쇄 폴리펩타이드의 Fc 영역은 공동, 또는 둘 모두를 인코딩하기 위해 템플레이트/최초 폴리펩타이드로부터 변경되었다.
특정 구현예에서, 돌출부 및 공동 각각은 천연 발생 아미노산 잔기를 포함한다.
특정 구현예에서, 돌출부를 포함하는 제2 중쇄 폴리펩타이드의 Fc 영역은 템플레이트/최초 폴리펩타이드의 인터페이스로부터의 최초 잔기를 최초 잔기보다 더 큰 측쇄 용적을 갖는 도입 잔기로 치환하여 생성된다.
특정 구현예에서, 돌출부를 포함하는 제2 중쇄 폴리펩타이드의 Fc 영역은, 상기 폴리펩타이드의 인터페이스로부터의 최초 잔기를 인코딩하는 핵산이 최초보다 더 큰 측쇄 용적을 갖는 도입 잔기를 인코딩하는 핵산으로 치환되는 단계를포함하는 방법에 의해 생성된다.
본 발명의 또 다른 측면은 중쇄, 경쇄, 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열 상에서 N-말단 Ser 또는 Thr를 갖는 항체로부터 산화된 변형된 항체를 제공하고, 상기 N-말단 Ser 또는 Thr는 변형된 항체에서 알데하이드 그룹으로 산화되었다.
특정 구현예에서, 항체는 하기를 포함하는 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부로부터 유도된다: (1) 서열식별번호: 1의 아미노산 서열을 갖는 이종성 신호 펩타이드; (2) 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열의 제1 잔기에 대한 바로 N-말단인 Ser 또는 Thr 잔기; 또는 (3) 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열의 1종 이상의 N-말단 아미노산 잔기(들)을 치환하는 Ser 또는 Thr 잔기.
특정 구현예에서, 항체는 서열식별번호: 3의 경쇄 서열을 포함하는 쥣과 항체 또는 그것의 항원-결합부이다.
특정 구현예에서, 항체는 서열식별번호: 3의 경쇄 서열을 포함하는 쥣과 항체 또는 그것의 항원-결합부의 키메라성, 인간화된, 또는 인간 항체 또는 그것의 항원-결합부이다. 인간화된 항체 또는 그것의 항원-결합부는 재표면화된 또는 CDR 이식된 항체 또는 그것의 항원-결합부일 수 있다.
본 발명의 또 다른 측면은 본 명세서에서 기재된 대상 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부를 인코딩하는 폴리뉴클레오타이드를 제공한다.
특정 구현예에서, 폴리뉴클레오타이드는 포유동물 발현 시스템에서 발현에 대해 코돈-최적화된다.
본 발명의 또 다른 측면은 대상 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부를 생산하는 방법을 제공하고, 상기 방법은 in 발현 시스템, 예컨대 포유동물 발현 시스템에서 본 명세서에서 기재된 상기 대상 폴리뉴클레오타이드를 발현시키는 것을 포함한다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 “세포-결합제” 또는 “CBA”는 (예를 들면, 세포-표면 리간드 상의) 세포에 결합하거나 바람직하게는 특이적 방식으로 세포과 관련되거나 그것에 근접한 리간드에 결합할 수 있는 화합물을 의미한다. 특정 구현예에서, 세포 상의 또는 그 근처의 세포 또는 리간드에의 결합은 특이적이다. CBA는 펩타이드 및 비-펩타이드를 포함할 수 있다. 단백질 본성의 CBA에 대해, 천연 N-말단 잔기가 Ser 또는 Thr이 아니면, N-말단 잔기는 하기에 의해 조작될 수 있다: 본 명세서에서 기재된 재조합 방법 중 임의의 것 사용, 예를 들면, 이종성 서열식별번호: 1의 신호 펩타이드의 사용, 또는 N-말단 잔기를 코딩하기 위해 Ser/Thr 코돈을 삽입함.
적절한 세포-결합제의 선택은 표적화될 특정한 세포 집단에 부분적으로 좌우되는 선택의 일이지만, 많은 (전부 아님) 사례에서, 인간화된 단클론성 항체는, 적절한 것이 이용가능하면 양호한 선택이다. 예를 들면, 단클론성 항체 MY9는 CD33 항원에 특이적으로 결합하는 쥣과 IgG1 항체이고 (J.D.Griffin 등, Leukemia Res., 8: 521 (1984)), 표적 세포가 급성 골수성 백혈병 (AML)의 질환에서 와 같이 CD33를 발현시킨다면 사용될 수 있다.
특정 구현예에서, 세포-결합제는 단백질이 아니다. 예를 들면, 특정 구현예에서, 세포 결합제는 비타민 수용체, 예컨대 세포-표면 수용체에 결합하는 비타민일 수 있다. 이와 관련하여, 비타민 A는 레티놀-결합 단백질 (RBP)에 결합하여 복합체를 형성하고, 이 복합체는 차례로 binds STRA6 수용체에 높은 친화도로 결합하고 비타민 A 섭취를 증가시킨다. 또 다른 예에서, 엽산 / 폴레이트 / 비타민 B9는 높은 친화도로 세포-표면 엽산 수용체 (FR), 예를 들면, FRα에 결합한다. FRα에 결합하는 엽산 또는 항체는 난소 및 다른 종양(비-소세포 폐암 (NSCLC)를 포함하는, FRα를 과-발현시키는 고형 종양을 포함함) 상에서 발현된 엽산 수용체를 표적으로 하기 위해 사용될 수 있다. 또한, 비타민 D 및 그것의 유사체는 비타민 D 수용체에 결합한다.
다른 구현예에서, 세포-결합제는 항체, 비-항체 단백질, 또는 폴리펩타이드를 포함하여 단백질 또는 폴리펩타이드, 또는 단백질 또는 폴리펩타이드를 포함하는 화합물를 포함한다.
예를 들면, 골수 세포에 결합하는 GM-CSF, 리간드 / 성장 인자는 급성 골수성 백혈병로부터 이환 세포에 대한 세포-결합제로서 사용될 수 있다. 활성화된 T-세포에 결합하는 IL-2는 이식편 거부의 예방, 이식편 대 숙주 질환의 치료 및 예방, 및 급성 T-세포 백혈병의 치료를 위해 사용될 수 있다. 멜라닌세포에 결합하는 MSH 는, 흑색종에 대한 항체와 마찬가지로 흑색종의 치료를 위해 사용될 수 있다. 표피 성장 인자는 편평상피암, 예컨대 폐 및 두경부를 표적으로 하기 위해 사용될 수 있다. 소마토스타틴는 신경교세포종 및 다른 종양 유형을 표적으로 하기 위해 사용될 수 있다. 에스트로겐 (또는 에스트로겐 유사체)는 유방암을 표적으로 하기 위해 사용될 수 있다. 안드로겐 (또는 안드로겐 유사체)는 고환을 표적으로 하기 위해 사용될 수 있다.
따라서 특정 구현예에서, 세포-결합제는 림포카인, 호르몬, 성장 인자, 집락 자극 인자, 또는 영양소-수송 분자일 수 있다.
특정 구현예에서, 세포-결합제는 항체 모방체, 예컨대 안키린 반복 단백질, C엔티린, 또는 아드넥틴 / 모노바디이다.
다른 구현예에서, 세포-결합제는 항체, 단일 사슬 항체, 항체 단편(표적 세포에 특이적으로 결합함), 단클론성 항체, 단일 사슬 단클론성 항체, 단클론성 항체 단편 (또는 “항원-결합 부분”) (표적 세포에 특이적으로 결합함), 키메라성 항체, 키메라성 항체 단편 (또는 “항원-결합 부분”) (표적 세포에 특이적으로 결합함), 도메인 항체 (예를 들면, sdAb), 또는 도메인 항체 단편 표적 세포에 특이적으로 결합하는 이다. 특정 구현예에서, 세포-결합제는 인간화된 항체, 인간화된 단일 사슬 항체, 또는 인간화된 항체 단편 (또는 “항원-결합 부분”)이다.
또 다른 구현예에서, 세포-결합제는 항-CD33 항체 또는 그것의 단편, 예컨대 하기에서 기재된 항체 또는 그것의 단편이다: U.S. 특허7,557,189, 7,342,110, 8,119,787 및 8,337,855 및 WO2004/043344(이것은 참고로 편입되어 있음). 특정 구현예에서, 인간화된 항체는 huMy9-6 또는 또 다른 관련된 항체이고, 이것은 하기에서 기재되어 있다: U.S. 특허번호 7,342,110 및 7,557,189. 또 다른 구현예에서, 항-CD33 항체는 huMy9-6 항체이다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 이중 밑줄친 서열은 중쇄 또는 경쇄 서열의 가변 영역 (즉, 중쇄 가변 영역 또는 HCVR, 및 경쇄 가변 영역 또는 LCVR)을 나타내고, 한편 볼드체 서열은 CDR 영역 (즉, N-말단에서 C-말단으로, CDR1, CDR2, 및 CDR3, 각각, 중쇄 또는 경쇄 서열)을 나타낸다.
일 구현예에서, 항-CD33 항체는 하기를 포함한다: 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 중쇄 영역:
QVQLQQPGAEVVKPGASVKMSCKASGYTFTSYYIHWIKQTPGQGLEWVGVIYPGNDDISYNQKFQGKATLTADKSSTTAYMQLSSLTSEDSAVYYCAREVRLRYFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (서열식별번호: 43), 및 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 경쇄 영역 EIVLTQSPGSLAVSPGERVTMSCKSSQSVFFSSSQKNYLAWYQQIPGQSPRLLIYWASTRESGVPDRFTGSGSGTDFTLTISSVQPEDLAIYYCHQYLSSRTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열식별번호: 44).
또 다른 구현예에서, 항-CD33 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호의 중쇄 CDR1-CDR3: 43, 및/또는 하기의 서열식별번호의 경쇄 CDR1-CDR3: 44, 및 바람직하게는 특이적으로 CD33에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 항-CD33 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 중쇄 가변 영역 (HCVR) 서열: 43, 및/또는 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 경쇄 가변 영역 (LCVR) 서열: 44, 및 바람직하게는 특이적으로 CD33에 결합한다.
또 다른 특정 구현예에서, 인간화된 항체는 본 명세서에서 기재된 항엽산제 수용체 항체이다. 또 다른 특정 구현예에서 항체는 항엽산제 수용체 항체 하기에서 기재되어 있다: U.S. 특허 번호 8,577,966). 더 구체적으로, 항엽산제 수용체 항체는 인간화된 항체 또는 그것의 항원 결합 단편이고, 이것은 인간 엽산 수용체 1 에 특이적으로 결합한다. 용어들 "인간 엽산 수용체 1," "FOLR1," 또는 "엽산 수용체 알파 (FR-α)”는, 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 다르게 명시되지 않는 한 임의의 원상태 인간 FOLR1을 의미한다. 따라서, 모든 이들 용어들은 본 명세서에서 지적된 바와 같이 단백질 또는 핵산 서열을 의미할 수 있다. 용어 "FOLR1"는 "전장," 미가공된 FOLR1 뿐만 아니라 세포 내의 가공으로부터 생긴 임의의 형태의 FOLR1을 포함한다. FOLR1 항체 하기를 포함한다: (a) 하기를 포함하는 중쇄 CDR1: GYFMN (서열식별번호: 45); 하기를 포함하는 중쇄 CDR2: RIHPYDGDTFYNQXaa1FXaa2Xaa3 (서열식별번호: 46); 및 하기를 포함하는 중쇄 CDR3: YDGSRAMDY (서열식별번호: 47); 및 (b) 하기를 포함하는 경쇄 CDR1: KASQSVSFAGTSLMH (서열식별번호: 48); 하기를 포함하는 경쇄 CDR2: RASNLEA (서열식별번호: 49); 및 하기를 포함하는 경쇄 CDR3: QQSREYPYT (서열식별번호: 50); 여기서 Xaa1은 K, Q, H, 및 R로부터 선택되고; Xaa2는 Q, H, N, 및 R로부터 선택되고; 그리고 Xaa3는 G, E, T, S, A, 및 V 로부터 선택된다. 바람직하게는, 중쇄 CDR2 서열은 하기를 포함한다: RIHPYDGDTFYNQKFQG (서열식별번호: 51).
또 다른 구현예에서, 항엽산제 수용체 항체는 인간화된 항체 또는 그것의 항원 결합 단편이고, 이것은 하기의 아미노산 서열을 갖는 중쇄를 포함하는 인간 엽산 수용체 1에 특이적으로 결합한다:
QVQLVQSGAEVVKPGASVKISCKASGYTFTGYFMNWVKQSPGQSLEWIGRIHPYDGDTFYNQKFQGKATLTVDKSSNTAHMELLSLTSEDFAVYYCTRYDGSRAMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (서열식별번호: 52).
또 다른 구현예에서, 항엽산제 수용체 항체는 하기에 기탁된 플라스미드 DNA에 의해 인코딩된 인간화된 항체 또는 그것의 항원 결합 단편이다: ATCC(2010년 4월 7일) 및 ATCC 수탁 번호, 즉PTA-10772 및 PTA-10773 또는 PTA-10774.
또 다른 구현예에서, 항엽산제 수용체 항체는 인간화된 항체 또는 그것의 항원 결합 단편이고, 이것은 하기를 포함하는 인간 엽산 수용체 1에 특이적으로 결합한다: 하기의 아미노산 서열을 갖는 경쇄:
DIVLTQSPLSLAVSLGQPAIISCKASQSVSFAGTSLMHWYHQKPGQQPRLLIYRASNLEAGVPDRFSGSGSKTDFTLNISPVEAEDAATYYCQQSREYPYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열식별번호: 53); 또는
DIVLTQSPLSLAVSLGQPAIISCKASQSVSFAGTSLMHWYHQKPGQQPRLLIYRASNLEAGVPDRFSGSGSKTDFTLTISPVEAEDAATYYCQQSREYPYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열식별번호: 54).
또 다른 구현예에서 항엽산제 수용체 항체는 인간화된 항체 또는 그것의 항원 결합 단편이고, 이것은 하기를 포함하는 인간 엽산 수용체 1에 특이적으로 결합한다: 하기의 서열식별번호의 아미노산 서열을 갖는 중쇄: 52, 및 하기의 서열식별번호의 아미노산 서열을 갖는 경쇄: 53 또는 서열식별번호: 54. 바람직하게는, 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호의 아미노산 서열을 갖는 중쇄: 52 및 하기의 서열식별번호의 아미노산 서열을 갖는 경쇄: 54 (hu FOLR1).
또 다른 구현예에서, 항엽산제 수용체 항체는 하기에 기탁된 플라스미드 DNA에 의해 인코딩된 인간화된 항체 또는 그것의 항원 결합 단편이다: ATCC(2010년 4월 7일) 및 ATCC 수탁 번호, 즉PTA-10772 및 PTA-10773 또는 10774.
또 다른 구현예에서, 항엽산제 수용체 항체는 인간화된 항체 또는 그것의 항원 결합 단편이고, 이것은 인간 엽산 수용체 1에 특이적으로 결합하고 하기를 포함한다: 하기와 적어도 약 90%, 95%, 99% 또는 100% 동일한 중쇄 가변 도메인: QVQLVQSGAEVVKPGASVKISCKASGYTFTGYFMNWVKQSPGQSLEWIGRIHPYDGDTFYNQKFQGKATLTVDKSSNTAHMELLSLTSEDFAVYYCTRYDGSRAMDYWGQGTTVTVSS (서열식별번호: 55), 및 하기와 적어도 약 90%, 95%, 99% 또는 100% 동일한 경쇄 가변 도메인: DIVLTQSPLSLAVSLGQPAIISCKASQSVSFAGTSLMHWYHQKPGQQPRLLIYRASNLEAGVPDRFSGSGSKTDFTLNISPVEAEDAATYYCQQSREYPYTFGGGTKLEIKR (서열식별번호: 56); 또는 DIVLTQSPLSLAVSLGQPAIISCKASQSVSFAGTSLMHWYHQKPGQQPRLLIYRASNLEAGVPDRFSGSGSKTDFTLTISPVEAEDAATYYCQQSREYPYTFGGGTKLEIKR (서열식별번호: 57).
또 다른 구현예에서, 항엽산제 수용체 항체는 huMov19 또는 M9346A 이다 (참고, 예를 들면, U.S. 특허 번호 8,709,432, U.S. 특허 번호 8,557,966, 및 WO2011106528(모두는 본 명세서에 참고로 편입되어 있음).
특정 구현예에서 인간화된 항체는 하기에 기재되어 있는 항-CD37 항체 (예를 들면, 항-CD37-3)이다: U.S. 특허 번호 8,765,917. 또 다른 구현예에서, 세포-결합제는 항-CD37 항체 또는 이것의 항체 단편, 예컨대 하기에서 기재된 것들이다: US 특허 번호 8,765,917 및 WO 2011/112978(이것은 참고로 편입되어 있음). 일 구현예에서, 항-CD37 항체는 huCD37-3 항체이다.
일 구현예에서, 본 항-CD37 항체는 하기를 포함한다: 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 경쇄 영역
DIQMTQSPSSLSVSVGERVTITCRASENIRSNLAWYQQKPGKSPKLLVNVATNLADGVPSRFSGSGSGTDYSLKINSLQPEDFGTYYCQHYWGTTWTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열식별번호: 58) 및 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 중쇄 영역:
QVQVQESGPGLVAPSQTLSITCTVSGFSLTTSGVSWVRQPPGKGLEWLGVIWGDGSTNYHPSLKSRLSIKKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKGGYSLAHWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (서열식별번호: 59), 또는 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 중쇄 영역:
QVQVQESGPGLVAPSQTLSITCTVSGFSLTTSGVSWVRQPPGKGLEWLGVIWGDGSTNYHSSLKSRLSIKKDHSKSQVFLKLNSLTAADTATYYCAKGGYSLAHWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (서열식별번호: 60)
또 다른 구현예에서, 본 항-CD37 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호 에서 제시된 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 경쇄 영역: 58 및 하기의 서열식별번호 에서 제시된 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 중쇄 영역: 59.
또 다른 구현예에서, 본 항-CD37 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호 에서 제시된 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 경쇄 영역: 58 및 하기의 서열식별번호 에서 제시된 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 중쇄 영역: 60.
또 다른 구현예에서, 본 항-CD37 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호의 중쇄 CDR1-CDR3: 59 또는 60, 및/또는 하기의 서열식별번호의 경쇄 CDR1-CDR3: 58, 및 바람직하게는 특이적으로 CD37에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 본 항-CD37 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 중쇄 가변 영역 (HCVR) 서열: 59 또는 60, 및/또는 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 경쇄 가변 영역 (LCVR) 서열: 58, 및 바람직하게는 특이적으로 CD37에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 본 항-CD37 항체는 하기를 포함한다: 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 경쇄 영역
EIVLTQSPATMSASPGERVTMTCSATSSVTYMHWYQQKPGQSPKRWIYDTSNLPYGVPARFSGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCQQWSDNPPTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열식별번호: 61) 및 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 중쇄 영역:
QVQLQESGPGLLKPSQSLSLTCTVSGYSITSGFAWHWIRQHPGNKLEWMGYILYSGSTVYSPSLKSRISITRDTSKNHFFLQLNSVTAADTATYYCARGYYGYGAWFAYWGQGTLVTVSAASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (서열식별번호: 62).
또 다른 구현예에서, 본 항-CD37 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호의 중쇄 CDR1-CDR3: 62, 및/또는 하기의 서열식별번호의 경쇄 CDR1-CDR3: 61, 및 바람직하게는 특이적으로 CD37에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 본 항-CD37 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 중쇄 가변 영역 (HCVR) 서열: 62, 및/또는 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 경쇄 가변 영역 (LCVR) 서열: 61, 및 바람직하게는 특이적으로 CD37에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 항-CD37 항체는 huCD37-50 항체이다.
특정 구현예에서, 인간화된 항체는 하기에서 기재된 항-EGFR 항체이다: U.S. 특허 번호 8,790,649. 또 다른 구현예에서, 항체는 항-EGFR 항체이다. 일 구현예에서, 항-EGFR 항체는, 예를 들면, 하기에서 기재된 항체를 포함하는 비-길항제 항체이다: WO2012058592(이것은 참고로 편입되어 있음). 또 다른 구현예에서, 항-EGFR 항체는 비-기능적 항체, 예를 들면, 인간화된 ML66 또는 EGFR-8이다. 더 구체적으로, 항-EGFR 항체는 huML66이다. 모든 이들 출원의 교시는 본 명세서에 그 전체가 참고로 편입되어 있다.
또 다른 구현예에서, 항-EGFR 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호의 아미노산 서열을 갖는 중쇄: 63, 및 하기의 서열식별번호의 아미노산 서열을 갖는 경쇄: 64.
Figure 112023025074489-pat00072
또 다른 구현예에서, 본 항-EGFR 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호의 중쇄 CDR1-CDR3: 63, 및/또는 하기의 서열식별번호의 경쇄 CDR1-CDR3: 64, 및 바람직하게는 특이적으로 EGFR에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 항-EGFR 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 중쇄 가변 영역 (HCVR) 서열: 63, 및/또는 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 경쇄 가변 영역 (LCVR) 서열: 64, 및 바람직하게는 특이적으로 EGFR에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 항-EGFR 항체는 하기에서 기재된 항체이다: 8,790,649 및 WO 2012/058588(이것은 참고로 편입되어 있음). 일 구현예에서, 항-EGFR 항체는 huEGFR-7R 항체이다.
일 구현예에서, 항-EGFR 항체는 하기를 포함한다: 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 중쇄 영역:
QVQLVQSGAEVAKPGASVKLSCKASGYTFTSYWMQWVKQRPGQGLECIGTIYPGDGDTTYTQKFQGKATLTADKSSSTAYMQLSSLRSEDSAVYYCARYDAPGYAMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (서열식별번호: 65) 및 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 경쇄 영역
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDINNYLAWYQHKPGKGPKLLIHYTSTLHPGIPSRFSGSGSGRDYSFSISSLEPEDIATYYCLQYDNLLYTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열식별번호: 66), 또는 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 경쇄 영역
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDINNYLAWYQHKPGKGPKLLIHYTSTLHPGIPSRFSGSGSGRDYSFSISSLEPEDIATYYCLQYDNLLYTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열식별번호: 67).
또 다른 구현예에서, 항-EGFR 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호 에서 제시된 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 중쇄 영역: 65 및 하기의 서열식별번호 에서 제시된 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 경쇄 영역: 66.
또 다른 구현예에서, 항-EGFR 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호 에서 제시된 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 중쇄 영역: 65 및 하기의 서열식별번호 에서 제시된 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 경쇄 영역: 67.
또 다른 구현예에서, 본 항-EGFR 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호의 중쇄 CDR1-CDR3: 65, 및/또는 하기의 서열식별번호의 경쇄 CDR1-CDR3: 66 또는 67, 및 바람직하게는 특이적으로 EGFR에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 항-EGFR 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 중쇄 가변 영역 (HCVR) 서열: 65, 및/또는 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 경쇄 가변 영역 (LCVR) 서열: 66 또는 67, 및 바람직하게는 특이적으로 EGFR에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 세포-결합제는 항-CD19 항체, 예컨대 하기에서 기재된 것들이다: U.S. 특허 번호 8,435,528 및 WO2004/103272(이것은 참고로 편입되어 있음). 일 구현예에서, 항-CD19 항체는 하기를 포함한다: 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 중쇄 영역:
QVQLVQPGAEVVKPGASVKLSCKTSGYTFTSNWMHWVKQAPGQGLEWIGEIDPSDSYTNYNQNFQGKAKLTVDKSTSTAYMEVSSLRSDDTAVYYCARGSNPYYYAMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (서열식별번호: 68) 및 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 경쇄 영역
EIVLTQSPAIMSASPGERVTMTCSASSGVNYMHWYQQKPGTSPRRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTDYSLTISSMEPEDAATYYCHQRGSYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열식별번호: 69).
또 다른 구현예에서, 항-CD19 항체는 huB4 항체.
또 다른 구현예에서, 항-CD19 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호의 중쇄 CDR1-CDR3: 68, 및/또는 하기의 서열식별번호의 경쇄 CDR1-CDR3: 69, 및 바람직하게는 특이적으로 CD19에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 항-CD19 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 중쇄 가변 영역 (HCVR) 서열: 68, 및/또는 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 경쇄 가변 영역 (LCVR) 서열: 69, 및 바람직하게는 특이적으로 CD19에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 세포-결합제는 항-Muc1 항체, 예컨대 하기에서 기재된 것들: U.S. 특허 번호 7,834,155, WO 2005/009369 및 WO 2007/024222(이것은 참고로 편입되어 있음). 일 구현예에서, 항-Muc1 항체는 하기를 포함한다: 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 중쇄 영역:
QAQLVQSGAEVVKPGASVKMSCKASGYTFTSYNMHWVKQTPGQGLEWIGYIYPGNGATNYNQKFQGKATLTADTSSSTAYMQISSLTSEDSAVYFCARGDSVPFAYWGQGTLVTVSAASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (서열식별번호: 70) 및 하기의 아미노산 서열을 갖는 면역글로불린 경쇄 영역
EIVLTQSPATMSASPGERVTITCSAHSSVSFMHWFQQKPGTSPKLWIYSTSSLASGVPARFGGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCQQRSSFPLTFGAGTKLELKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열식별번호: 71).
또 다른 구현예에서, 항-Muc1 항체는 huDS6 항체이다.
또 다른 구현예에서, 항-Muc1 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호의 중쇄 CDR1-CDR3: 70, 및/또는 하기의 서열식별번호의 경쇄 CDR1-CDR3: 71, 및 바람직하게는 특이적으로 Muc1에 결합한다.
또 다른 구현예에서, 항-Muc1 항체는 하기를 포함한다: 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 중쇄 가변 영역 (HCVR) 서열: 70, 및/또는 하기의 서열식별번호 와 적어도 약 90%, 95%, 97%, 99%, 또는 100% 동일한 경쇄 가변 영역 (LCVR) 서열: 71, 및 바람직하게는 특이적으로 Muc1에 결합한다.
특정 구현예에서, 세포-결합제는 재표면화된 항체, 재표면화된 단일 사슬 항체, 재표면화된 항체 단편 (또는 “항원-결합 부분”), 또는 이중특이적 항체이다.
특정 구현예에서, 세포-결합제는 미니바디, 아비바디, 디아바디, 트리바디, 테트라바디, 나노바디, 프로바디, 도메인 항체, 또는 유니바디이다.
환언하면, 예시적인 세포 결합제는 하기를 포함할 수 있다: 항체, 단일 사슬 항체, 항체 단편 표적 세포에 특이적으로 결합하는, 단클론성 항체, 단일 사슬 단클론성 항체, 단클론성 항체 단편(표적 세포에 특이적으로 결합함), 키메라성 항체, 키메라성 항체 단편(표적 세포에 특이적으로 결합함), 이중특이적 항체, 도메인 항체, 도메인 항체 단편(표적 세포에 특이적으로 결합함), 인터페론, 림포카인 (예를 들면, IL-2, IL-3, IL-4, 및 IL-6), 호르몬 (예를 들면, 인슐린, 타이로트로핀 방출 호르몬, 멜라닌세포-자극 호르몬, 및 스테로이드 호르몬 (예를 들면, 안드로겐 및 에스트로겐)), 비타민 (예를 들면, 폴레이트), 성장 인자 (예를 들면, EGF, TGF-알파, FGF, VEGF), 집락 자극 인자, 영양소-수송 분자 (예를 들면, 트랜스페린; 참고 O'Keefe 등이다. (1985) J. Biol. Chem.260: 932-937(이것은 본 명세서에 참고로 편입되어 있음), 센타이린 (파이브로넥틴 유형 III (FN3) 반복체의 공통 서열을 기반으로 하는 단백질 스캐폴드; 참고 U.S. 특허 공개 2010/0255056, 2010/0216708 및 2011/0274623(이것은 본 명세서에 참고로 편입됨)), 안키린 반복 단백질 (예를 들면, DARPin로서 공지된 설계된 안키린 반복 단백질; 참고 U.S. 특허 공개 번호 2004/0132028, 2009/0082274, 2011/0118146, 및 2011/0224100(이것은 본 명세서에 참고로 편입됨), 및 또한 참고 C. Zahnd 등.,Cancer Res.(2010) 70:1595-1605; Zahnd 등.,J. Biol. Chem.(2006) 281(46): 35167-35175; 및 Binz, H. K., Amstutz, P. & Pluckthun, A.,Nature Biotechnology (2005) 23: 1257-1268(이것은 본 명세서에 참고로 편입되어 있음), 안키린-유사 반복체 단백질 또는 합성 펩타이드 (참고 예를 들면, U.S. 특허 공개 제2007/0238667호; U.S. 특허 번호 7,101,675; WO 2007/147213; 및 WO 2007/062466(이것은 본 명세서에 참고로 편입되어 있음), 아드넥틴 (파이브로넥틴 도메인 스캐폴드 단백질; 참고 US 특허 공개 번호 2007/0082365; 2008/0139791(이것은 본 명세서에 참고로 편입되어 있음), 아비바디 (디아바디, 트리아바디, 및 테트라바디 포함; 참고 U.S. 공보2008/0152586 및 2012/0171115), 및 다른 세포-결합 분자 또는 서브스턴스.
특정 구현예에서, 세포-결합제는 표적 세포 상의 모이어티에 결합하는 리간드, 예컨대 세포-표면 수용체일 수 있다. 예를 들면, 리간드는 성장 인자 수용체에 결합하는 성장 인자 또는 그것의 단편일 수 있거나; 사이토카인 수용체에 결합하는 사이토카인 또는 그것의 단편일 수 있다. 특정 구현예에서, 성장 인자 수용체 또는 사이토카인 수용체는 세포-표면 수용체이다.
특정 구현예에서, 상기 세포-결합제는 항체 또는 그것의 항원-결합부 (항체 유도체 포함), 또는 어떤 항체 모방체, CBA는 표적 세포 상의 리간드, 예컨대 세포-표면 수용체를 포함하는 세포-표면 리간드에 결합될 수 있다.
특정 예시적인 항원 또는 리간드는 하기를 포함할 수 있다: 레닌; 성장 호르몬 (예를 들면, 인간 성장 호르몬 및 소 성장 호르몬); 성장 호르몬 방출 인자; 부갑상선 호르몬; 갑상선 자극 호르몬; 지질단백질; 알파-1-항트립신; 인슐린 A-사슬; 인슐린 B-사슬; 프로인슐린; 여포자극 호르몬; 칼시토닌; 황체형성 호르몬; 글루카곤; 응고 인자 (예를 들면, 인자 vmc, 인자 IX, 조직 인자, 및 폰빌레브란트 인자); 항-응고 인자 (예를 들면, 단백질 C); 심방나트륨 이뇨 인자; 폐 표면활성제; 플라스미노겐 활성제 (예를 들면, 우로키나제, 인간 소변 또는 조직-유형 플라스미노겐 활성제); 봄베신; 트롬빈; 조혈 성장 인자; 종양 괴사 인자-알파 및 -베타; 엔케팔리나제; RANTES (즉, 활성화시 정상적으로 발현되고 분비된 T-세포); 인간 대식세포 염증성 단백질-1-알파; 혈청 알부민 (인간 혈청 알부민); 뮐러관 억제 서브스턴스; 릴락신 A-사슬; 릴락신 B-사슬; 프로릴락신; 마우스 성선자극호르몬-관련된 펩타이드; 미생물 단백질 (베타-락타마제); DNase; IgE; 세포독성 T-림프구 관련된 항원 (예를 들면, CTLA-4); 인히빈; 액티빈; 혈관 내피 성장 인자; 호르몬 또는 성장 인자에 대한 수용체; 단백질 A 또는 D; 류마티스성 인자; 신경친화성 인자(예를 들면, 골-유도된 신경친화성 인자, 뉴로트로핀-3, -4, -5, 또는 -6), 신경 성장 인자 (예를 들면, NGF-β); 혈소판-유도된 성장 인자; 섬유아세포 성장 인자 (예를 들면, aFGF 및 bFGF); 섬유아세포 성장 인자 수용체 2; 표피 성장 인자; 형질전환 성장 인자 (예를 들면, TGF-알파, TGF-β1, TGF-β2, TGF-β3, TGF-β4, 및 TGF-β5); 인슐린-유사 성장 인자-I 및 -II; des(1-3)-IGF-I (뇌 IGF-I); 인슐린-유사 성장 인자 결합 단백질; 멜라노트랜스페린; EpCAM; GD3; FLT3; PSMA; PSCA; MUC1; MUC16; STEAP; CEA; TENB2; EphA 수용체; EphB 수용체; 엽산 수용체; FOLR1; 메소텔린; 크립토; 알파v베타6; 인테그린; VEGF; VEGFR; EGFR; 트랜스페린 수용체; IRTA1; IRTA2; IRTA3; IRTA4; IRTA5; CD 단백질 (예를 들면, CD2, CD3, CD4, CD5, CD6, CD8, CD11, CD14, CD19, CD20, CD21, CD22, CD25, CD26, CD28, CD30, CD33, CD36, CD37, CD38, CD40, CD44, CD52, CD55, CD56, CD59, CD70, CD79, CD80.CD81, CD103, CD105, CD123, CD134, CD137, CD138, 및 CD152), 1종 이상의 종양-관련된 항원 또는 세포-표면 수용체 (참고 US 공개 번호 20080171040 또는 US 공개 번호 20080305044, 편입된 그 전체가 참고로); 에리트로포이에틴; 골유도성 인자; 면역독소; 골 형성 단백질; 인터페론 (예를 들면, 인터페론-알파, -베타, 및 -감마); 집락 자극 인자 (예를 들면, M-CSF, GM-CSF, 및 G-CSF); 인터류킨 (예를 들면, IL-1 내지 IL-10); 슈퍼옥사이드 디스무타제; T-세포 수용체; 표면 막 단백질; 붕괴 촉진 인자; 바이러스 항원 (예를 들면, HIV 엔빌로프의 일부); 수송 단백질, 귀소 수용체; 아드레신; 조절 단백질; 인테그린 (예를 들면, CD11a, CD11b, CD11c, CD18, ICAM, VLA-4, 및 VCAM;) 종양 관련된 항원 (예를 들면, HER2, HER3 및 HER4 수용체); 엔도글린; c-Met; c-키트; 1GF1R; PSGR; NGEP; PSMA; PSCA; TMEFF2; LGR5; B7H4; 및 상기-열거된 폴리펩타이드 중 임의의 것의 단편.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 “항체”은 면역글로불린 (Ig) 분자를 포함한다. 특정 구현예에서, 항체는 디설파이드 결합에 의해 상호-연결된 4 개의 폴리펩타이드 사슬, 즉 2개의 중쇄 (HC) 및 2개의 경쇄 (LC)를 포함하는 전장 항체이다. 각 중쇄는 중쇄 가변 영역 (HCVR 또는 VH) 및 중쇄 불변 영역 (CH)를 포함한다. 중쇄 불변 영역은 3 개의 도메인, CH1, CH2, 및 CH3을 포함한다. 각 경쇄는 경쇄 가변 영역 (LCVR 또는 VL) 및 경쇄 불변 영역 (이것은 1개의 도메인, CL을 포함함)을 포함한다. VH 및 VL 영역은 상보성 결정 영역 (CDR)으로 불리는 초가녕성의 영역으로 추가로 세분될 수 있다. 그와 같은 영역으로 산재된 것은 더 보존된 프레임워크 영역 (FR)이다. 각 VH 및 VL은 3개의 CDR 및 4개의 FR로 구성되고, 이것은 하기의 순서로 아미노-말단으로부터 카복시-말단으로 배열된: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, 및 FR4.
특정 구현예에서, 항체는 IgG, IgA, IgE, IgD, 또는 IgM이다. 특정 구현예에서, 항체는 IgG1, IgG2, IgG3, 또는 IgG4; 또는 IgA1 또는 IgA2이다.
특정 구현예에서, 세포-결합제는, 항체와의 항원-결합에 중요한 서열을 공유하는 단클론성 항체의 “항원-결합 부분”이다 (예컨대 하기에서 기재되어 있는 huMy9-6 또는 그것의 관련된 항체: U.S. 특허번호 7,342,110 및 7,557,189(이것은 본 명세서에 참고로 편입되어 있음).
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 항체의 “항원-결합 부분” (또는 때때로 상호교환적으로 “항체 단편”으로 지칭됨)은 항원에 특이적으로 결합하는 능력을 보유하는 항체의 하나 이상의 단편을 포함한다. 항체의 항원-결합 기능은 전장 항체의 특정 단편에 의해 수행될 수 있는 것으로 나타났다. 용어 항체의 “항원-결합 부분”에 포함되는 결합 단편의 예는 (비제한적으로): (i) VL, VH, CL 및 CH1 도메인으로 이루어지는 1가 단편인 Fab 단편 (예를 들면, 파파인에 의해 절단된 항체는 하기 3개의 단편을 생성한다: 2개의 항원-결합 Fab 단편, 및 항원에 결합하지 않는 1개의 Fc 단편); (ii) 힌지 영역에 있는 디설파이드 브릿지에 의해 연결된 2개의 Fab 단편을 포함하는 2가 단편인 F(ab’) 2 단편 (예를 들면, 펩신에 의해 절단된 항체는 하기 2개의 단편을 생성한다: 2가 항원-결합 F(ab’)2 단편, 및 항원에 결합하지 않는 pFc’ 단편) 및 그의 관련된 F(ab’) 1가 단위; (iii) VH 및 CH1 도메인으로 이루어진 Fd 단편 (즉, Fab에 포함된 중쇄의 상기 부분); (iv) 항체의 단일 팔 (arm)의 VL 및 VH 도메인으로 이루어지는 Fv 단편, 및 관련된 디설파이드 연결된 Fv; (v) VH 도메인으로 이루어지는, dAb (도메인 항체) 또는 sdAb (단일 도메인 항체) 단편 (Ward 등 Nature 341: 544-546, 1989); 및 (vi) 단리된 상보성 결정 영역 (CDR)을 포함한다. 특정 구현예에서, 항원-결합 부분은 sdAb (단일 도메인 항체)이다.
특정 구현예에서, 항원-결합 부분은 또한 자연적으로 존재하는 항체에서 발견되지 않을 수 있는 요소 또는 서열 외에도, 항원에 특이적으로 결합하는 능력을 보유하는 항체의 하나 이상의 단편을 또한 포함하는 어떤 조작된 또는 재조합 유도체 (또는 “유도체 항체”)를 포함한다.
예를 들면, Fv 단편의 2개의 도메인, VL 및 VH는 별도의 유전자에 의해 코딩되지만, 이들은 VL 및 VH 영역이 쌍을 이뤄 1가 분자를 형성하는 단일 단백질 사슬로서 제조되는 것을 가능하게 하는 합성 링커에 의해 표준 재조합 방법을 이용하여 연결될 수 있다 (단일 사슬 Fv (scFv)로 공지됨; 예를 들면, Bird 등 Science 242: 423-426, 1988: 및 Huston 등,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 5879-5883, 1988).
본원에 기재된 모든 구현예에서, scFv의 N-말단은 VH 도메인 (즉, N-VH-VL-C), 또는 VL 도메인 (즉, N-VL-VH-C)일 수 있다.
2가 단일-사슬 가변 단편 (디-scFvs, 바이-scFvs)은 2개의 scFV를 연결함으로써 조작될 수 있다. 이것은 2개의 VH 및 2개의 VL 영역을 갖는 단일 펩타이드 사슬을 생산하여, 탠덤 scFv (tascFv)를 산출한다. 더 많은 탠덤 반복, 예컨대 트리-scFv가 3개 이상의 scFv를 헤드-투-테일 방식으로 연결함으로써 유사하게 생산될 수 있다.
특정 구현예에서, scFv는 2개의 가변 영역이 함께 접혀 scFv를 이합체화하고 디아바디 를 형성하게 하기에 너무 짧은 (약 5개의 아미노산) 링커 펩타이드를 통해 연결될 수 있다 (예를 들면, Holliger 등,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448, 1993; Poljak 등, Structure 2: 1121-1123, 1994 참고). 디아바디는 이중특이적 또는 단일특이적일 수 있다. 디아바디는 상응하는 scFv보다 최대 40배 더 낮은 해리 상수를 갖는 것으로 나타났으며, 즉, 표적에 대해 훨씬 높은 친화도를 갖는 것으로 나타났다.
훨씬 더 짧은 링커 (1 또는 2개의 아미노산)는 삼량체, 또는 이른바 트리아바디 또는 트리바디의 형성을 야기한다. 테트라바디 역시 유사하게 생산되었다. 이들은 디아바디보다 그의 표적에 대해 훨씬 더 높은 친화도를 나타낸다. 디아바디, 트리아바디, 및 테트라바디는 때때로 “아비바디 TM ” 세포 결합제 (또는 축약하여 “아비바디”)로 총칭된다. 즉, 2개, 3개, 또는 4개의 표적 결합 영역 (TBR)을 갖는 아비바디는 통상적으로 디아-, 트리아- 및 테트라-바디로서 공지되어 있다. 참고, 예를 들면, U.S. 공보제2008/0152586호 및 제2012/0171115호를 참고하며, 이들의 전체 교시는 본 명세서에 참고로 통합되어 있다.
이들 포맷 모두는 2개 이상의 상이한 항원에 대해 특이성을 갖는 가변 단편으로부터 구성될 수 있고, 이 경우 이들은 이중- 또는 다중-특이적 항체의 유형이다. 예를 들면, 어떤 이중특이적 탠덤 디-scFv는 이중특이적 T-세포 연관체 (BiTEs)로 공지되어 있다.
특정 구현예에서, 탠덤 scFv 또는 디아바디 / 트리아바디 / 테트라바디에서의 각 scFv는 동일하거나 상이한 결합 특이성을 가질 수 있고, 각각은 독립적으로 N-말단 VH 또는 N-말단 VL을 가질 수 있다.
단일 사슬 Fv (scFv)는 또한 IgG-유사 특성을 얻기 위해 Fc 모이어티, 예컨대 인간 IgG Fc 모이어티에 융합될 수 있지만, 그럼에도 불구하고 이들은 여전히 단일 유전자에 의해 인코딩된다. 포유동물에서 그러한 scFv-Fc 단백질의 일시적 생산이 밀리그램 양을 쉽게 달성할 수 있으므로, 이 유도체 항체 포맷은 많은 연구 적용에 특히 적합하다.
Fcab는 항체의 Fc 불변 영역으로부터 조작된 항체 단편이다. Fcab는 가용성 단백질로서 발현될 수 있거나, 또는 이들은 전장 항체, 예컨대 IgG로 다시 조작되어 mAb2를 생성할 수 있다. mAb2는 정상적인 Fc 영역 대신에 Fcab을 갖는 전장 항체이다. 이러한 추가의 결합 부위를 이용하여, mAb2 이중특이적 단클론성 항체는 2개의 상이한 표적에 동시에 결합할 수 있다.
특정 구현예에서, 조작된 항체 유도체는 기능에 비-필수적인 것으로 간주되는 도메인을 제거함으로써 생산된 항원-결합 Ig-유도된 재조합 단백질의 크기를 감소시켰다 (“소형화된” 전체-크기 mAb). 가장 좋은 한 가지 예는 SMIP이다.
작은 조절 면역약물, 또는 SMIP는 주로 항체 (면역글로불린)의 부분으로부터 만들어진 인공 단백질이며, 이는 약제학적 약물로서 사용하기 위한 것이다. SMIP는 항체와 유사한 생물학적 반감기를 가지지만, 항체보다 작으므로, 더 나은 조직 침투 특성을 가질 수 있다. SMIP는 1개의 결합 영역, 연결기로서 1개의 힌지 영역, 및 1개의 효과기 도메인을 포함하는 단일-사슬 단백질이다. 결합 영역은 변형된 단일-사슬 가변 단편 (scFv)을 포함하고, 상기 단백질의 나머지는 항체, 예컨대 IgG1의 Fc (예컨대 효과기 도메인로서 CH2, 및 CH3) 및 힌지 영역으로부터 제작될 수 있다. 유전적으로 변형된 세포는 실제 항체보다 약 30% 더 작은 항체-유사 이량체로서 SMIP를 생산한다.
그러한 조작된 소형화된 항체의 또 다른 예는 IgG4 분자에서 힌지 영역이 제거된 “유니바디”이다. IgG4 분자는 불안정하며, 경쇄-중쇄 이종이량체를 서로 교환할 수 있다. 힌지 영역의 결실은 중쇄-중쇄 쌍형성을 완전히 막아, 생체내 안정성 및 반감기를 보장하는 Fc 영역을 유지하면서 매우 특이적인 1가 가벼운 / 무거운 이종이량체를 남긴다.
단일-도메인 항체 (비제한적으로 Ablynx사의 나노바디로 불리는 것을 포함하는 sdAb)는 단일 모노머성 가변 항체 도메인으로 이루어지는 항체 단편이다. 전체 항체와 마찬가지로, 그것은 특정 항원에 선택적으로 결합할 수 있지만, 단지 12-15 kDa의 분자량 때문에 훨씬 더 작다. 특정 구현예에서, 단일-도메인 항체는 중쇄 항체 (hcIgG)로부터 조작된다. 첫 번째 상기 sdAb는 VHH 단편으로 불리는, 낙타과에서 발견되는 hcIgG에 기초하여 조작되었다. 특정 구현예에서, 단일-도메인 항체는 VNAR 단편을 이용하여 IgNAR (“면역글로불린 신규 항원 수용체,” 하기 참고)로부터 조작된다. 연골 어류 (예컨대 상어)는 그러한 중쇄 IgNAR 항체를 갖는다. 특정 구현예에서, sdAb는 일반적인 면역글로불린 G (IgG)로부터의 이량체성 가변 도메인, 예컨대 인간 또는 마우스 유래의 것을 모노머로 분리시킴으로써 조작된다. 특정 구현예에서, 나노바디는 중쇄 가변 도메인으로부터 유래된다. 특정 구현예에서, 나노바디는 경쇄 가변 도메인으로부터 유래된다. 특정 구현예에서, sdAb는 표적 항원에 대한 결합제를 위해 단일 도메인 중쇄 서열 (예를 들면, 인간 단일 도메인 HC)의 라이브러리를 스크리닝함으로써 수득된다.
단일 가변 신규 항원 수용체 도메인 항체 단편 (V NAR s, 또는 V NAR 도메인)은 연골 어류 (예를 들면, 상어) 면역글로불린 신규 항원 수용체 항체 (IgNARs)로부터 유래된다. 가장 작은 공지된 면역글로불린-기반 단백질 스캐폴드 중 하나인 상기 단일 도메인 단백질은 유리한 크기 및 숨겨진 에피토프 인식 특성을 나타낸다. 성숙한 IgNAR 항체는 1개의 가변 신규 항원 수용체 (VNAR) 도메인 및 5개의 불변 신규 항원 수용체 (CNAR) 도메인의 동종이량체로 이루어진다. 이 분자는 매우 안정하며, 효율적인 결합 특징을 갖는다. 그의 고유한 안정성은 (i) 쥣과 항체에서 발견되는 종래의 항체 VH 및 VL 도메인에 비해 상당히 많은 수의 전하를 띠는 친수성 표면 노출된 잔기를 제공하는, 기저 Ig 스캐폴드; 및 (ii) 루프내 디설파이드 브릿지 및 루프내 수소 결합의 패턴을 포함하는 상보적 결정 영역 (CDR) 루프에서의 안정화시키는 구조적 특징 모두에 기인할 수 있다.
미니바디는 CH 도메인, 예컨대 CH3γ1 (IgG1의 CH3 도메인) 또는 CH4ε (IgE의 CH4 도메인)에 연결된 scFv를 포함하는 조작된 항체 단편이다. 예를 들면, 암배아 항원 (CEA)에 특이적인 scFv는 CH3γ1에 연결되어 미니바디를 생성하였고, 이는 이전에 생체내 빠른 제거와 결합된 탁월한 종양 표적화를 갖는 것으로 입증되었다 (Hu 등,Cancer Res. 56: 3055-3061, 1996). scFv는 N-말단 VH 또는 VL을 가질 수 있다. 연결은 비-공유성의 힌지가 없는 미니바디를 야기하는 짧은 펩타이드 (예를 들면, 2개의 아미노산 링커, 예컨대 ValGlu)일 수 있다. 대안적으로, 연결은 공유성의 힌지-미니바디를 생산하는 IgG1 힌지 및 GlySer 링커 펩타이드일 수 있다.
천연 항체는 단일-특이적이지만, 2개의 동일한 항원-결합 도메인을 발현한다는 점에서 2가이다. 그에 반해, 특정 구현예에서, 어떤 조작된 항체 유도체는 각각 상이한 표적 특이성을 갖는 2개 이상의 상이한 항원-결합 도메인을 갖는 이중- 또는 다중-특이적 분자이다. 이중특이적 항체는 각각 상이한 특이성을 갖는 2개의 항체-생산 세포를 융합합으로써 생성될 수 있다. 이들 “쿼드로마 (quadroma)”는 다수의 분자종을 생산하였는데, 2개의 구별되는 경쇄 및 2개의 구별되는 중쇄가 다수의 배열로 쿼드로마로 자유롭게 재조합될 수 있기 때문이다. 이후, 이중특이적 Fab, scFv 및 전체-크기 mAb가 다양한 기술 (상기 참고)을 이용하여 생성되었다.
이중 가변 도메인 면역글로불린 (DVD-Ig) 단백질은 2개의 항원 / 에피토프를 동시에 표적화하는 이중-특이적 IgG의 유형이다 (DiGiammarino 등 Methods Mol Biol.899: 145-56, 2012). 상기 분자는 종래의 IgG와 유사한 배열로 Fc 영역 및 불변 영역을 함유한다. 그러나, DVD-Ig 단백질은 상기 분자의 각 팔이 2개의 가변 도메인 (VD)을 함유한다는 점에서 독특하다. 팔 내의 VD는 일렬로 연결되고 상이한 결합 특이성을 가질 수 있다.
DuoBody® 은 이중특이적 변형된 IgG1 항체 이종이량체이다. IgG1 힌지 영역은 일반적으로 (i) CPPC 서열을 함유하고 생체내에서 Fab 팔 교환을 허용하지 않는 안정한 힌지 영역 및 (ii) 생체내에서 Fab 팔을 허용하게 하는, F405L 및 K409R 잔기를 함유하도록 변형된 IgG4-유사 CH3 도메인을 포함한다. (예를 들면, 제WO2008119353호 및 제WO2011131746호를 참고).
삼중특이적 항체 유도체 분자는 또한, 예를 들면, 2개의 구별되는 Fab 및 Fc를 갖는 이중특이적 항체를 발현시킴으로써 생성될 수 있었다. 한 가지 예는 마우스 IgG2a 항-Ep-CAM, Ep-CAM을 발현하는 종양 세포의 공동-국재화를 허용하는 것으로 여겨지는 BiUII로 불리는 랫트 IgG2b 항-CD3 쿼드로마, CD3을 발현하는 T 세포, 및 FCγRI를 발현하는 대식세포이며, 따라서 면역 세포의 공동자극 및 항종양 기능을 강화시킨다.
프로바디는 건강한 조직에서 불활성을 유지하지만, 질환 미세환경에서 특이적으로 활성화되는 (예를 들면, 질환 미세환경에서 풍부하거나 특이적인 프로테아제에 의한 프로테아제 절단을 통해) 완전한 재조합, 마스킹된 단클론성 항체이다. 문헌[Desnoyers 등,Sci.Transl.Med.,5: 207ra144, 2013]을 참고한다. 본원에 기재된 항체 또는 이의 항원-결합 부분 중 어느 것을 위해 유사한 마스킹 기술이 사용될 수 있다.
인트라바디는 세포내 항원에 결합하기 위해 세포내에서 작용하는 세포내 국재화를 위해 변형된 항체이다. 인트라바디는 세포질에서 유지될 수 있거나, 또는 핵 국재화 신호를 가질 수 있거나, 또는 ER 표적화를 위한 KDEL 서열을 가질 수 있다. 인트라바디는 단일-사슬 항체 (scFv), 초안정성을 갖는 변형된 면역글로불린 VL 도메인, 더 환원시키는 세포내 환경에 대해 내성이 있는 선택된 항체이거나, 또는 말토오스 결합 단백질 또는 다른 안정한 세포내 단백질을 갖는 융합 단백질로서 발현될 수 있다. 그러한 최적화는 인트라바디의 안정성 및 구조를 개선하였고, 본원에 기재된 항체 또는 이의 항원-결합 부분 중 어느 것에 일반적으로 적용될 수 있다.
본 발명의 항원-결합 부분 또는 유도체 항체는 이들이 유래되고 / 조작된 항체와 비교하여, 실질적으로 동일하거나 또는 동일한 (1) 경쇄 및/또는 중쇄 CDR3 영역; (2) 경쇄 및/또는 중쇄 CDR1, CDR2, 및 CDR3 영역; 또는 (3) 경쇄 및/또는 중쇄 영역을 가질 수 있다. 이들 영역 내의 서열은 CDR 영역 내의 치환을 포함하는, 보존적 아미노산 치환을 함유할 수 있다. 특정 구현예에서, 1, 2, 3, 4, 또는 5개 이내의 보존적 치환이 있다. 대안으로, 항원-결합 부분 또는 유도체 항체는 이들이 유래되고 / 조작된 항체와 적어도 약 90%, 95%, 99% 또는 100% 동일한 경쇄 영역 및/또는 중쇄 영역을 갖는다. 이들 항원-결합 부분 또는 유도체 항체는 항체와 비교하여 표적 항원에 대해 실질적으로 동일한 결합 특이성 및/또는 친화도를 가질 수 있다. 특정 구현예에서, 항원-결합 부분 또는 유도체 항체의 Kd 및/또는 k off 값은 본원에 기재된 항체의 10배 (높거나 낮음), 5배 (높거나 낮음), 3배 (높거나 낮음), 또는 2배 (높거나 낮음) 이내이다.
특정 구현예에서, 항원-결합 부분 또는 유도체 항체는 완전 인간 항체, 인간화된 항체, 또는 키메라성 항체로부터 유래되고 / 조작될 수 있으며, 당업계에 인식된 방법에 따라 생산될 수 있다.
단클론성 항체 기술은 특이적 단클론성 항체의 형태의 매우 특이적인 세포-결합제의 생산을 가능하게 한다. 마우스, 랫트, 햄스터 또는 임의의 다른 포유동물을 관심있는 항원, 예컨대 온전한 표적 세포, 표적 세포로부터 단리된 항원, 전체 바이러스, 약화된 전체 바이러스, 및 바이러스 단백질, 예컨대 바이러스 코트 단백질로 면역화함으로써 생산된 단클론성 항체를 생성하기 위한 기술이 특히 당업계에 널리 알려져 있다. 민감화된 인간 세포가 또한 사용될 수 있다. 단클론성 항체를 생성하는 또 다른 방법은 scFv (단일 사슬 가변 영역), 특히 인간 scFv의 파아지 라이브러리를 사용하는 것이다 (예를 들면, Griffiths 등,U.S. 특허제5,885,793호 및 제5,969,108호; McCafferty 등,WO 제92/01047호; Liming 등,WO 제99/06587호 참고). 또한, U.S. 특허 번호 제5,639,641호에 개시된 재표면화된 항체가 또한, 키메라성 항체 및 인간화된 항체와 마찬가지로 사용될 수 있다.
세포-결합제는 또한 하기로부터 유래된 펩타이드일 수 있다: 파아지 디스플레이 (예를 들면, Wang 등,Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2011) 108(17), 6909-6914 참고) 또는 펩타이드 라이브러리 기술 (예를 들면, Dane 등,Mol.Cancer.Ther.(2009) 8(5): 1312-1318 참고).
특정 구현예에서, 본 발명의 CBA는 또한 항체 모방체, 예컨대 DARPin, 아피바디, 아필린, 아피틴, 안티칼린, 아비머, 파이노머, 쿠니츠 도메인 펩타이드, 모노바디, 또는 나노피틴을 포함한다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어들 “DARPin” 및 “(설계된) 안키린 반복 단백질”은 전형적으로 우선적인 (때때로 특이적인) 표적 결합을 나타내는 특정 유전적으로 조작된 항체 모방체 단백질을 지칭하기 위해 상호교환적으로 사용된다. 표적은 단백질, 탄수화물, 또는 다른 화학 독립체일 수 있고, 결합 친화도는 상당히 높을 수 있다. DARPin은 천연 안키린 반복-함유 단백질로부터 유래될 수 있고, 바람직하게는 이들 단백질의 적어도 3개, 보통 4개 또는 5개 안키린 반복 모티프 (전형적으로 각 안키린 반복 모티프 내에 약 33개의 잔기)로 이루어진다. 특정 구현예에서, DARPin은 약 4개- 또는 5개-반복을 함유하고, 각각 약 14 또는 18 kDa의 분자량을 가질 수 있다. 1012 변이체가 넘는 다양한 무작위화된 잠재적인 표적 상호작용 잔기를 갖는 DARPin의 라이브러리는 다양한 기술, 예컨대 리보솜 디스플레이 또는 신호 인식 입자 (SRP) 파아지 디스플레이를 이용하여, 피코몰 친화도 및 특이성으로 원하는 표적에 결합하는 (예를 들면, 수용체 효능제 또는 길항제, 역효능제, 효소 저해제, 또는 간단한 표적 단백질 결합제로서 작용하는) DARPin을 선택하는데 사용하기 위해, DNA 수준에서 생성될 수 있다. 참고, 예를 들면, DARPin 제제에 대한 U.S. 특허 공개 번호 제2004/0132028호, 제2009/0082274호, 제2011/0118146호, 및 제2011/0224100호, WO 제02/20565호 및 WO 제06/083275호 (이것의 전체 교시는 본 명세서에 참고로 편입되어 있음)를 참고하며, 또한 C. Zahnd 등 (2010) Cancer Res., 70:1595-1605; Zahnd 등 (2006) J. Biol. Chem.,281(46): 35167-35175; 및 Binz, H. K., Amstutz, P. & Pluckthun, A.(2005) Nature Biotechnology, 23: 1257-1268 (모두 본 명세서에 참고로 편입되어 있음)을 참고한다. 또한 관련된 안키린-유사 반복 단백질 또는 합성 펩타이드에 대해 U.S. 특허 공개 제2007/0238667호; U.S. 특허 번호 제7,101,675호; WO 제2007/147213호; 및 WO 제2007/062466호 (이것의 전체 교시는 본 명세서에 참고로 편입되어 있음)를 참고한다.
아피바디 분자는 높은 친화도로 다수의 표적 단백질 또는 펩타이드에 결합하도록 조작된 작은 단백질이며, 따라서 단클론성 항체를 모방한다. 아피바디는 58개 아미노산을 갖는 3개의 알파 나선으로 이루어지며 약 6 kDa의 몰 질량을 갖는다. 이들은 고온 (90 ℃) 또는 산성 및 알칼리성 조건 (pH 2.5 또는 pH 11)을 견디는 것으로 나타났고, 서브-나노몰 범위 이하의 친화도를 갖는 결합제가 순수한 라이브러리 선택으로부터 수득되었고, 피코몰 친화도를 갖는 결합제가 친화도 성숙 이후에 수득되었다. 특정 구현예에서, 아피바디는 표적에 공유적으로 결합하기 위해 약한 친전자체에 접합된다.
모노바디 (아드넥틴으로도 공지됨)는 항원에 결합할 수 있는 유전적으로 조작된 항체 모방체 단백질이다. 특정 구현예에서, 모노바디는 94개 아미노산으로 이루어지고 약 10 kDa의 분자량을 갖는다. 이들은 인간 파이브로넥틴의 구조, 더 구체적으로 항체 가변 도메인과 유사한 구조를 갖는 그의 10번째 세포외 유형 III 도메인에 기초하며, 7개의 베타 시트는 배럴을 형성하고 각 측면 상의 3개의 노출된 루프는 3개의 상보성 결정 영역에 상응한다. 상이한 단백질에 대해 특이성을 갖는 모노바디는 루프 BC (두 번째 및 세 번째 베타 시트 사이) 및 FG (6번째 및 7번째 시트 사이)를 변형함으로써 조정될 수 있다.
트리바디는 마우스 및 인간 연골 매트릭스 단백질 (CMP)의 C-말단 코일된 코일 영역에 기초하여 설계된 자기 조립 항체 모방체로서, 이는 병렬 삼량체 복합체로 자기 조립된다. 이는 특이적 표적-결합 모이어티를 CMP로부터 유래된 삼량체화 도메인과 융합시킴으로써 생성된 매우 안정한 삼량체 표적화 리간드이다. 수득한 융합 단백질은 높은 안정성을 갖는 잘 정의된 병렬 호모삼량체로 효율적으로 자기 조립될 수 있다. 삼량체 표적 리간드의 표면 플라즈몬 공명 (SPR) 분석은 상응하는 모노머에 비해 현저히 향상된 표적 결합 강도를 입증하였다. 세포성-결합 연구는 상기 트리바디가 그의 각 수용체에 대하여 우수한 결합 강도를 갖는다는 것을 확인하였다.
센타이린은 공통 FN3 도메인 서열의 프레임워크 상에 제작된 라이브러리를 이용하여 수득될 수 있는 또 다른 항체 모방체이다 (Diem 등,Protein Eng.Des.Sel.,2014). 이 라이브러리는 FN3 도메인의 C-가닥, CD-루프, F-가닥 및 FG-루프 내에 다양한 위치를 이용하며, 높은-친화도 센타이린 변이체는 특정 표적에 대해 선택될 수 있다.
N-말단 Ser/Thr을 도입하고 이후 알데하이드 반응기와 반응하기 위한 알데하이드기로 산화시키는 모든 방법이 항체인 세포-결합제 및 예를 들면, 센타이린, 다르핀, 아비바디, 아드넥틴, 항체 단편, 미니바디, 디아바디, 트리바디, 테트라바디, 나노바디, 프로바디, 듀오바디, 도메인 바디 또는 유니바디, 등을 포함하는 항체가 아닌 세포-결합제에 적용가능하다.
하기의 특정 예는 다양한 인간화된 항-CD123 항체를 지칭하며, 상기 항체의 명칭은 여기에 간략하게 기재되어 있다. huCD123-6 항체의 한 가지 부류는 쥣과 항-CD123 항체 muCD123-6의 중쇄 및 경쇄의 6개 CDR을 접목함으로써 인간화된다. 상기 항체에서, 클론 명칭 (즉, huCD123-6) 바로 다음에 문자 “G”가 나오고, 이어서 차례로 인간 경쇄 및 중쇄 가변 영역 서열의 기원을 나타내는 버전 번호 가 뒤따른다. 따라서 huCD123-6Gv4.6은 상응하는 muCDR123-6 항체 유래의 6개의 CDR 영역을 인간 경쇄 가변 영역 Gv4 및 중쇄 가변 영역 Gv6에 접목하는 것 (“G”)에 기초한 인간화된 CD123 항체를 지칭한다. 유사하게, -Gv4.7는 인간 경쇄 가변 영역 Gv4 및 중쇄 가변 영역 Gv7을 포함한다.
huCD123-6 항체의 또 다른 부류는 재표면화에 의해 인간화된다. 재표면화된 중쇄 서열 huCD123-6rhv1.1 및 재표면화된 경쇄 서열 huCD123-6rlv1.0을 갖는 재표면화된 항체는 huCD123-6Rv1.1이다.
본원에 사용된 바와 같이, NTS#2 또는 “S2”는 요약하여 중쇄의 N-말단에 조작된 Ser을 갖는 항체를 지칭한다. 따라서 huCD123-6Gv4.7 항체의 S2 변이체는 huCD123-6Gv4.7S2로 지정된다. 마찬가지로, NTS#3 또는 “S3”는 요약하여 경쇄의 N-말단에 조작된 Ser을 갖는 항체를 지칭한다. huCD123-6Gv4.7 항체의 S3 변이체는 huCD123-6Gv4.7S3으로 지정된다.
조작된 N-말단 Ser (S2 또는 S3)를 포함하는 항체가 산화된 N-말단 Ser을 통해 세포독성 약물 / 제제와 접합되는 경우, 접합체 명칭은 “SeriMab” 표시를 포함할 수 있다. 예를 들면, huCD123-6Gv4.7S3-SeriMab-D8은 경쇄 상의 산화된 N-말단을 통한, D8 (D8 또는 sD8 구조에 대해 도 17 참고) 및 인간화된 CD123 항체 huCD123-6Gv4.7S3 간의 접합체를 지칭한다.
실시예 23-30, 및 도 17, 18, 22A-24, 26A-26C, 및 29에서 사용된 세포독성 약물, 예컨대 “D8” 및 그의 설폰화된 버전 “sD8” 및 관련된 “D2,” “D1” 및 그의 설폰화된 버전 “sD1”은 대상 접합체에서 약물 분자 “D”의 일반식을 따르지 않을 수도 있지만, 이들 세포독성 약물의 구조는 관련된 도면 및 본문에 나타나 있다.
특정 인간화된 항-CD123 항체는 U.S. 가출원 번호 제62/186,161호 (2015년 6월 29일자로 출원됨, 명칭 “ANTI-CD123 ANTIBODIES AND CONJUGATES AND DERIVATIVES THEREOF”)에 기재되어 있으며, 모든 단백질 (예를 들면, 항체 및 CDR, HCVR, LCVR, 이의 전장 HC 및 LC 서열) 및 핵산 서열 및 관련된 서열번호, 특히 하나 이상의 조작된 N-말단 Ser/Thr 잔기를 갖는 CD123-SeriMab의 것을 포함하는, 제62/186,161호의 전체 교시는 그 전체가 참고로 본원에 편입되어 있다.
세포독성 약물
제3 구현예에서, 본 발명은 본 명세서에서 기재된 세포-결합제에 공유결합되어 본 발명의 콘주게이트를 형성할 수 있는 세포독성 약물 (D’로 나타냄)를 제공한다.
일 구현예에서, 세포독성 약물은 메이탄시노이드이다. 더 구체적으로, 세포독성 약물 D’는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00073
상기 변수는 제1 구현예의 제5 특정 구현예에서 식 (D1)에 대해 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, 세포독성 약물 D’는 DM1 (D2’) 또는 DM4 (D3’)이다:
Figure 112023025074489-pat00074
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 세포독성 약물 D’는 하기 식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00075
상기 변수는 제1 구현예의 제5 특정 구현예에서 식 (D4) 에 대해 상기에서 기재된 바와 같다.
또 다른 특정 구현예에서, 세포독성 약물 D’는 하기 식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00076
또 다른 특정 구현예에서, 세포독성 약물 D’는 세포-결합제에 직접적으로 연결될 수 있는 알데하이드 반응성 그룹을 포함하는 메이탄시노이드 화합물이다. 더 구체적으로, 메이탄시노이드 화합물은 하기 식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00077
또 다른 구현예에서, 세포독성 약물은 벤조디아제핀 화합물이다. 예시적인 벤조디아제핀 화합물은, 비제한적으로 하기에서 기재된 것들을 포함한다: US 특허 번호 8,765,740, 8,426,402, US2014/0088089, WO2011/130613, WO2011/130616, WO2010/091150, 및 WO2009/016516.
더 많은 특정 구현예에서, 세포독성 약물 D’는 하기 구조식으로 나타낸 벤조디아제핀 화합물이다:
Figure 112023025074489-pat00078
Figure 112023025074489-pat00079
Figure 112023025074489-pat00080
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 상기 변수는 제1 구현예의 제6 특정 구현예에서 식 (D6)-(D17)에 대해 상기에서 기재된 바와 같다.
더 많은 특정 구현예에서, D’는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00081
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 여기서 Y는 -H 또는 -SO3M이고, 그리고 M은 H+ 또는 양이온이다. 더욱더 구체적으로, Y는 -SO3M이고, 그리고 M은 H+, Na+ 또는 K+이다.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 세포독성 약물 D’는 세포-결합제에 직접적으로 연결될 수 있는 알데하이드 반응성 그룹을 포함하는 벤조디아제핀 화합물이다. 더 구체적으로, 벤조디아제핀 화합물은 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00082
Figure 112023025074489-pat00083
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 식 중:
LD’, LD”, 및 LD”’ 중 1개는 하기 식으로 나타내고:
Figure 112023025074489-pat00084
그리고 다른 2개는 동일 또는 상이하고, -H, 1 내지 10개의 탄소 원자를 갖는 임의로 치환된 선형, 분지형 또는 사이클릭 알킬, 알케닐 또는 알키닐, 폴리에틸렌 글리콜 단위 -(OCH2CH2)n-Rc, 할로겐, 구아니디늄 [-NH(C=NH)NH2], -OR, -NR’R”, -NO2, -NR’COR”, -SR, -SOR’, -SO2R’, -SO3H, -OSO3H, -SO2NR’R”, 시아노, 아지도, -COR’, -OCOR’, 및 -OCONR’R”로부터 독립적으로 선택되고;
JCB는 제1 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같은 알데하이드 반응성 그룹이고; 그리고 잔여 변수는 제1 구현예의 제7 특정 구현예에서 및 임의의 본 명세서에서 기재된 더 많은 특정 구현예에서 구조식 (D18)-(D23)에 대해 상기에서 기재된 바와 같다.
더 구체적으로, 식 (D18’)-(D23’)에 대해, JCB는
Figure 112023025074489-pat00085
또는
Figure 112023025074489-pat00086
이다.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 식 (D18’)-(D23’)에 대해, L’는 식 (A)로 나타내고 L” 및 L”’ 둘 모두는 -H이고; 그리고 잔여 변수는 상기의 임의의 구현예에서 기재된 바와 같다.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 식 (D18’)-(D23’)에 대해:
N과 C 사이의 이중 선은 단일 결합 또는 이중 결합을 나타내고, 단, 그것이 이중 결합일 때 X는 부재이고 Y는 -H이고, 그리고 단일 결합일 때, X는 -H이고, Y는 -OH 또는 -SO3M이고;
R1, R2, R3, R4, R1’, R2’, R3’ 및 R4’ 모두는 -H이고;
R6는 -OMe이고;
X’ 및 Y’ 둘 모두는 -H이고;
A 및 A’는 -O-이고; 그리고
M는 H+, Na+ 또는 K+; 그리고 잔여 변수는 상기의 임의의 구현예에서 기재된 바와 같다.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 식 (D18’)-(D23’)에 대해, Ra 및 Rb 둘 모두는 H이고; 그리고 잔여 변수는 상기의 임의의 구현예에서 기재된 바와 같다.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 식 (D18’)-(D23’)에 대해, R5 및 R9 각각은 독립적으로 H 또는 Me이고; 그리고 잔여 변수는 상기의 임의의 구현예에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, R5 및 R9 둘 모두는 H이다.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 식 (D18’)-(D23’)에 대해, P는 2 내지 10개의 아미노산 잔기를 함유하는 펩타이드이고; 그리고 잔여 변수는 상기의 임의의 구현예에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, P는 2 내지 5개의 아미노산 잔기를 함유하는 펩타이드이다. 더욱더 구체적으로, P는 하기로부터 선택된다: Gly-Gly-Gly, Ala-Val, Val-Ala, Val-Cit, Val-Lys, Phe-Lys, Lys-Lys, Ala-Lys, Phe-Cit, Leu-Cit, Lle-Cit, Trp, Cit, Phe-Ala, Phe-N9-토실-Arg, Phe-N9-니트로-Arg, Phe-Phe-Lys, D-Phe-Phe-Lys, Gly-Phe-Lys, Leu-Ala-Leu, Ile-Ala-Leu, Val-Ala-Val, Ala-Leu-Ala-Leu (서열식별번호: 17), β-Ala-Leu-Ala-Leu (서열식별번호: 18) 및 Gly-Phe-Leu-Gly (서열식별번호: 19), Val-Arg, Arg-Val, Arg-Arg, Val-D-Cit, Val-D-Lys, Val-D-Arg, D-Val-Cit, D-Val-Lys, D-Val-Arg, D-Val-D-Cit, D-Val-D-Lys, D-Val-D-Arg, D-Arg-D-Arg, Ala-Ala, Ala-D-Ala, D-Ala-Ala, 및 D-Ala-D-Ala.
또 다른 더 많은 특정 구현예에서, 세포독성 약물 D’는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00087
Figure 112023025074489-pat00088
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 여기서 Y는 H 또는 -SO3M이고, 그리고 M은 H+, Na+ 또는 K+이다.
세포독성 약물-링커 화합물
제4 구현예에서, 본 발명은 본 명세서에서 기재된 세포-결합제에 공유결합될 수 있는 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 세포독성 약물-링커 화합물을 제공한다.
특정 구현예에서, 세포독성 약물-링커 화합물은 하기 식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00089
여기서 JCB는 제1 구현예에서 기재된 알데하이드 반응성 그룹이고; 그리고 잔여 변수는 제1 구현예 또는 제1 구현예의 제2 내지 제6 특정 구현예 또는 임의의 본 명세서에서 기재된 더 많은 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
더 구체적으로, JCB는 하이드라진, 하이드라자이드 또는 하이드록실아민이다.
또 다른 구현예에서, JCB는 하기로부터 선택되고:
Figure 112023025074489-pat00090
Figure 112023025074489-pat00091
및
Figure 112023025074489-pat00092
식 중: Xa는 CH2, O 또는 NCH3이고; U’는 NH, O, S 또는 CH2이고; U는 H 또는 전자 공여 그룹이고; Xb 및 Xb’ 각각은 독립적으로 -OH, -SH 또는 -NH2이고; RZ 및 RZ’ 각각은 독립적으로 H 또는 알킬 (바람직하게는 -Me)이고; RZ”는 H 또는 알킬이고; 그리고 Xc는 N 또는 CH이다. 더 구체적으로, 알데하이드 반응성 그룹은
Figure 112023025074489-pat00093
또는
Figure 112023025074489-pat00094
이다.
일 구현예에서, 세포독성 약물-링커 화합물은 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00095
Figure 112023025074489-pat00096
Figure 112023025074489-pat00097
Figure 112023025074489-pat00098
Figure 112023025074489-pat00099
Figure 112023025074489-pat00100
; 또는
Figure 112023025074489-pat00101
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 그리고 Y는 H 또는 -SO3M이고, 그리고 M은 H+, Na+ 또는 K+이다.
변형된 세포-결합제
제5 구현예에서, 본 발명은 본 명세서에서 기재된 세포-결합제를 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 링커 화합물과 반응시켜 형성된 변형된 세포-결합제를 제공한다.
특정 구현예에서, 변형된 세포-결합제는 하기 식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00102
여기서 JD는 상기 세포독성 약물 D’와의 공유 결합을 형성할 수 있는 반응성 그룹이고; 그리고 잔여 변수는 제1 구현예 또는 본 명세서에서 기재된 임의의 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
제1 특정 구현예에서, 구조식 (III)의 변형된 세포-결합제 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염에 대해, JCB’는 하기 구조식 중 하나로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00103
Figure 112023025074489-pat00104
또는
Figure 112023025074489-pat00105
또는
Figure 112023025074489-pat00106
식 중: Xa는 CH2, O 또는 NCH3이고; U’는 NH, O, S 또는 CH2이고; U는 H 또는 전자 공여 그룹이고; Xb1 및 Xb1’ 각각은 독립적으로 -O-, -S- 또는 -NH-이고; RZ 및 RZ’ 각각은 독립적으로 H 또는 알킬 (바람직하게는 -Me)이고; 그리고 RZ”는 H 또는 알킬이고; s1은 세포-결합제에 공유 결합된 부위이고; 그리고 s2는 그룹 L에 공유 결합된 부위이다. 더 구체적으로, JCB’는,
Figure 112023025074489-pat00107
Figure 112023025074489-pat00108
또는
Figure 112023025074489-pat00109
이다.
제2 특정 구현예에서, 식 (III)에 대해, -L-JD는 하기 식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00110
여기서 JD는 -SH, -SSRd 또는 -SC(=O)Rg이고, 여기서 Rd는 페닐, 니트로페닐, 디나이트로페닐, 카복시니트로페닐, 피리딜 또는 니트로피리딜이고; 그리고 Rg는 알킬이고; JCB’는 제1 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같고; 그리고 잔여 변수는 제 1 구현예의 제2 특정 구현예 및 임의의 본 명세서에서 기재된 더 많은 특정 구현예에서 식 (L1)에 대해 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, JD는 -SH 또는 -SSRd이다.
더 많은 특정 구현예에서, -L-JD는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00111
또는
Figure 112023025074489-pat00112
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 여기서 JCB’ 및 JD는 제2 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, JD는 -SH 또는 -SSRd이다.
제3 특정 구현예에서, 식 (III)에 대해, -L-JD는 하기 식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00113
여기서 JD는 -OH 또는 할로겐이고; 또는 -C(=O)-JD는 반응성 에스테르이고; JCB’는 제1 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같고; 그리고 잔여 변수는 제1 구현예의 제3 특정 구현예 또는 임의의 본 명세서에서 기재된 더 많은 특정 구현예에서 식 (L2) 및 (L3)에 대해 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, -C(=O)-JD는 N-하이드록시석신이미드 에스테르이다.
더 많은 특정 구현예에서, -L-JD는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00114
Figure 112023025074489-pat00115
또는
Figure 112023025074489-pat00116
여기서 JCB’ 및 JD는 제3 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, -C(=O)-JD는 N-하이드록시석신이미드 에스테르이다.
제4 특정 구현예에서, 식 (III)에 대해, -L-JD는 하기 식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00117
여기서 JD는 말레이미드, X’-CRbRc-C(=O)-, X’-CRbRc-C(=O)-NRe-,
Figure 112023025074489-pat00118
Figure 112023025074489-pat00119
또는
Figure 112023025074489-pat00120
이고; X’는 할로겐이고; JCB’는 제1 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같고; 그리고 잔여 변수는 제1 구현예의 제4 특정 구현예 및 임의의 본 명세서에서 기재된 더 많은 특정 구현예에서 구조식 (L4)에 대해 상기에서 기재된 바와 같다.
특정 구현예에서, 상기의 구현예 중 임의의 하나에서 기재된 식 (III)에 대해, 예컨대 제5 구현예에서 또는 제5 구현예의 제1 내지 제4 특정 구현예, 또는 본 명세서에서 기재된 임의의 더 많은 특정 구현예에서, CBA는 제2 구현예에서 기재된 임의의 세포-결합제일 수 있다.
이작용성 가교결합제 (또는 링커 화합물)
제6 구현예에서, 본 발명은 이작용성 가교결합제 (즉, 링커 화합물)을 제공하고, 이것은 알데하이드 그룹 및 상기에서 기재된 세포독성 약물과의 공유 결합을 형성할 수 있는 반응성 그룹을 갖는다.
일 구현예에서, 링커 화합물은 하기 식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00121
상기 변수는 상기 식 (I), (II) 및 (III)에서 기재된 바와 같다.
일 구현예에서, 링커 화합물은 하기 식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00122
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 여기서 JCB는 제1 구현예에서 기재된 알데하이드 반응성 그룹이고; 그리고 잔여 변수는 구조식 (L1’) 에 대해 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, JD는 -SH 또는 -SSRd이다. 더욱더 구체적으로, JCB는
Figure 112023025074489-pat00123
또는
Figure 112023025074489-pat00124
이다.
더 많은 특정 구현예에서, 이작용성 가교결합제는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00125
또는
Figure 112023025074489-pat00126
또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 여기서 JCB 및 JD는 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, JD는 -SH 또는 -SSRd이다. 더욱더 구체적으로, JCB는
Figure 112023025074489-pat00127
또는
Figure 112023025074489-pat00128
이다.
또 다른 구현예에서, 링커 화합물은 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00129
여기서 JCB는 제1 구현예에서 기재된 알데하이드 반응성 그룹이고; 그리고 잔여 변수는 구조식 (L2’) 및 (L3’) 에 대해 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, -C(=O)-JD는 N-하이드록시석신이미드 에스테르이다. 더욱더 구체적으로, JCB는
Figure 112023025074489-pat00130
또는
Figure 112023025074489-pat00131
이다.
더 많은 특정 구현예에서, 이작용성 가교결합제는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00132
Figure 112023025074489-pat00133
또는
Figure 112023025074489-pat00134
여기서 JCB 및 JD는 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, -C(=O)-JD는 N-하이드록시석신이미드 에스테르이다. 더욱더 구체적으로, JCB는
Figure 112023025074489-pat00135
또는
Figure 112023025074489-pat00136
이다.
또 다른 구현예에서, 이작용성 가교결합제는 하기 구조식으로 나타낸다:
Figure 112023025074489-pat00137
여기서 JD는 말레이미드, X’-CRbRc-C(=O)-, X’-CRbRc-C(=O)-NRe-,
Figure 112023025074489-pat00138
Figure 112023025074489-pat00139
또는
Figure 112023025074489-pat00140
이고; X’는 할로겐이고; 그리고 잔여 변수는 구조식 (L4’) 에 대해 상기에서 기재된 바와 같다. 더 구체적으로, JD는 말레이미드이다. 더욱더 구체적으로, JCB는
Figure 112023025074489-pat00141
또는
Figure 112023025074489-pat00142
이다.
세포-결합제-약물 콘주게이트의 생성
제7 구현예에서, 본 발명은 본 명세서에서 기재된 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 제조하는 방법을 제공한다.
일 구현예에서, 본 발명은 하기의 단계들을 포함하는, 본 명세서에서 기재된 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 제조하는 방법을 제공한다:
(a) 세포-결합제의 2-하이드록시에틸아민 모이어티를 산화제로 산화시켜 알데하이드 그룹을 갖는 산화된 세포-결합제를 형성하는 단계로서; 상기 2-하이드록시에틸아민 모이어티는 세린, 트레오닌, 하이드록실리신, 4-하이드록시오르니틴 또는 2,4-디아미노-5-하이드록시 발레르산 잔기의 일부, 및는 하기 구조식으로 나타내는 단계:
Figure 112023025074489-pat00143
및
(b) 상기 산화된 세포-결합제를:
(i) 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 세포독성 약물-링커 화합물 또는 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 세포독성 약물과 접촉시켜 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계; 또는
(ii) 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 링커 화합물과 접촉시켜 링커를 결합한 변형된 항체 또는 그것의 변형된 항원-결합부를 형성하고, 그 다음 상기 변형된 항체 또는 상기 그것의 변형된 항원-결합부를 세포독성 약물과 반응시켜 상기 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계; 또는
(iii) 세포독성 약물과 접촉시키고, 그 다음 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 링커 화합물 및 상기 세포독성 약물과의 공유 결합을 형성할 수 있는 반응성 그룹을 부가하여 상기 세포-결합제-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계.
제1 특정 구현예에서, 세포 결합-제제는 항체 또는 그것의 항원 결합부이고, 상기 방법은 하기의 단계들을 포함한다:
(a) 항체 또는 그것의 항원-결합부의 2-하이드록시에틸아민 모이어티를 산화제로 산화하여 알데하이드 그룹을 갖는 산화된 항체 또는 그것의 산화된 항원-결합부를 형성하는 단계,
Figure 112023025074489-pat00144
(상기 2-하이드록시에틸아민 모이어티는 N-말단 세린, 트레오닌, 하이드록실리신, 4-하이드록시오르니틴 또는 2,4-디아미노-5-하이드록시 발레르산 잔기의 일부임); 및
(b) 상기 산화된 항체 또는 상기 그것의 산화된 항원-결합부를 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 세포독성 약물-링커 화합물 또는 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 세포독성 약물과 반응시켜 상기 항체-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계
Figure 112023025074489-pat00145
또는
식 중:
Ab는 본 명세서에서 기재된 항체 또는 그것의 항원 결합부이고;
JCB는 상기에서 기재된 바와 같은 알데하이드 반응성 그룹이고;
L은 상기에서 기재된 바와 같은 스페이서 또는 결합이고;
JD’는 상기 그룹 L을 갖는 세포독성 약물 D를 연결하는 연결 모이어티이거나, L이 결합일 때 부재하고;
D는 상기 연결 모이어티 JD’를 통해 공유 결합된 세포독성 약물이고; 그리고
w는 1, 2, 3 또는 4임).
특정 구현예에서, 상기의 제1 특정 구현예에서 기재된 방법에 대해, 상기의 제4 구현예에서 기재된 임의의 세포독성 약물-링커 화합물 또는 제3 구현예에서 기재된 세포독성 약물이 사용될 수 있다.
특정 구현예에서, 상기의 제1 특정 구현예에서 기재된 방법에 대해, 이민 작용기 (-C=N-)을 갖는 세포독성 약물 또는 세포독성 약물-링커 화합물은 이민-반응성 시약과 반응하여 변형된 세포독성 약물-링커 화합물 또는 변형된 세포독성 약물을 형성한 후, 단계 (b)에서 산화된 항체 또는 그것의 산화된 항원-결합부와 반응한다. 일 구현예에서, 변형된 세포독성 약물-링커 화합물 또는 변형된 세포독성 약물은 원위치 생성되고, 정제 없이 산화된 항체 또는 그것의 산화된 항원-결합부과 반응된다.
제2 특정 구현예에서, 세포 결합-제제는 항체 또는 그것의 항원 결합부이고, 상기 방법은 하기의 단계들을 포함한다:
(a) 항체 또는 그것의 항원-결합부의 N-말단 2-하이드록시에틸아민 모이어티를 산화제로 산화하여 N-말단 알데하이드 그룹을 갖는 산화된 항체 또는 그것의 산화된 항원-결합부를 형성하는 단계,
Figure 112023025074489-pat00147
(상기 2-하이드록시에틸아민 모이어티는 N-말단 세린, 트레오닌, 하이드록실리신, 4-하이드록시오르니틴 또는 2,4-디아미노-5-하이드록시 발레르산 잔기의 일부임); 및
(b) 상기 산화된 항체 또는 그것의 산화된 항원-결합부을 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 링커 화합물과 반응시켜 링커를 결합한 변형된 항체 또는 그것의 변형된 항원-결합부를 형성하고, 그 다음 상기 변형된 항체 또는 상기 그것의 변형된 항원-결합부를 세포독성 약물과 반응시켜 상기 항체-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계;
Figure 112023025074489-pat00148
여기서 D’는 세포독성 약물이고; JD는 상기 세포독성 약물 D’와의 공유 결합을 형성할 수 있는 반응성 그룹이고; 그리고 잔여 변수는 제1 특정 구현예에서 기재된 바와 같다.
특정 구현예에서, 상기 제2 특정 구현예에서 기재된 방법에 대해, 상기의 제6 구현예에서 기재된 임의의 링커 화합물이 사용될 수 있다.
특정 구현예에서, 제2 특정 구현예에서 기재된 방법에 대해, 이민 기능적 이민 작용기 (-C=N-)를 세포독성 약물은 이민-반응성 시약고과 반응하여 변형된 세포독성 약물을 형성한 후, 단계 (b)에서 링커를 결합한 변형된 항체 또는 그것의 변형된 항원-결합부와 반응한다. 일 구현예에서, 변형된 세포독성 약물은 원위치에서 생성되고 링커를 결합한 변형된 항체 또는 그것의 변형된 항원-결합부와 반응하기 전에 정제되지 않는다.
제3 특정 구현예에서, 세포 결합-제제는 항체 또는 그것의 항원 결합부이고, 상기 방법은 하기의 단계들을 포함한다:
(a) 항체 또는 그것의 항원-결합부의 N-말단 2-하이드록시에틸아민 모이어티를 산화제로 산화하여 N-말단 알데하이드 그룹을 갖는 산화된 항체 또는 그것의 산화된 항원-결합부를 형성하는 단계,
Figure 112023025074489-pat00149
(상기 2-하이드록시에틸아민 모이어티는 N-말단 세린, 트레오닌, 하이드록실리신, 4-하이드록시오르니틴 또는 2,4-디아미노-5-하이드록시 발레르산 잔기의 일부임); 및
(b) 상기 산화된 항체 또는 상기 그것의 산화된 항원-결합부를 세포독성 약물과 접촉시키고, 그 다음 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 링커 화합물을 부가하여 상기 항체-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계;
Figure 112023025074489-pat00150
상기 변수는 제1 및 제2 특정 구현예에서 상기에서 기재된 바와 같다.
특정 구현예에서, 상기에서 제3 특정 구현예에서 기재된 방법에 대해, 제6 구현예에서 기재된 임의의 링커 화합물 및 제3 구현예에서 기재된 세포독성 약물이 사용될 수 있다.
임의의 적합한 산화제는 상기에서 기재된 방법의 단계 (a) 에서 사용될 수 있다. 특정 구현예에서, 산화제는 퍼아이오데이트이다. 더 구체적으로, 산화제는 나트륨 퍼아이오데이트이다.
세포-결합제 (예를 들면, 항체)에 대한 과잉의 몰 당량의 산화제 가 사용될 수 있다. 특정 구현예에서, 약 2-100, 5-80, 10-50, 1-10 또는 5-10 몰 당량의 산화제가 사용될 수 있다. 특정 구현예에서, 약 10 또는 약 50 당량의 산화제가 사용될 수 있다. 다량의 산화제는 사용될 때, 짧은 반응 시간은 과-산화를 피하기 위해 사용된다. 예를 들면, 50 당량의 산화제가 사용될 때, 산화 반응는 약 5 내지 약 60 분 동안 수행된다. 대안적으로, 10 당량의 산화제가 사용될 때, 상기 반응은 약 30 분 내지 약 24 시간 동안 수행된다. 일 구현예에서, 5-10 몰 당량의 산화제가 사용되고 산화 반응는 약 5 내지 약 60 분 (예를 들면, 약 10 내지 약 30 분, 약 20 내지 약 30 분) 동안 수행된다.
특정 구현예에서, 산화 반응 유의미한 비-표적화된 산화를 유발하지 않는다. 예를 들면, 유의 양 (예를 들면, 20% 미만, 10% 미만, 5% 미만, 3% 미만, 2% 또는 1% 미만)의 메티오닌 및/또는 글리칸은 N-말단 알데하이드 그룹을 갖는 산화된 CD123/IL-3Rα-결합제를 생성하기 위해 N-말단 세린의 산화 과정 동안에 산화되지 않는다.
특정 구현예에서, 촉매는 상기에서 기재된 방법에서 단계 (b)에서의 반응에서 존재한다. 당해 기술에서 임의의 적합한 촉매가 사용될 수 있다. 일 구현예에서, 촉매는 아닐린 또는 치환된 아닐린이다. 예시적인 아닐린 촉매는, 비제한적으로, 하기를 포함한다: 아닐린, o-페닐렌디아민, m-페닐렌디아민, 3,5-디아미노벤조산, p-페닐렌디아민, 2-메틸-p-페닐렌디아민, N-메틸-p-페닐렌디아민, o-아미노페놀, m-아미노페놀, p-아미노페놀, p-메톡시아닐린, 5-메톡시-안트라닐산, o-아미노벤조 산, 및 4-아미노펜에틸알코올.일 구현예에서, 촉매는 4-아미노펜에틸알코올이다. 특정 구현예에서, 단계 (b)의 반응은 pH 약 5.0 내지 약 6.5에서 수행된다. 특정 구현예에서, 단계 (b)의 반응은 pH 약 5.0에서 수행된다.
특정 구현예에서, 본 명세서에서 기재된 방법의 단계 (b)에 대해, 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 화합물 (예를 들면, 세포독성 약물-링커 화합물, 세포독성 약물, 또는 링커 본 명세서에서 기재된 화합물)는 산화된 세포-결합제 (예를 들면, 산화된 항체 또는 산화된 항원 결합부)에 대해 몰 과잉으로 사용된다. 특정 구현예에서, 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 화합물 대 산화된 세포-결합제의 비는 약 10:1 내지 약 1.1: 1, 약 5: 1 내지 약 2: 1이다. 일 구현예에서, 비는 약 4: 1이다.
특정 구현예에서, 상기에서 기재된 방법, 예컨대 제3 또는 제1 내지 제3 특정 구현예에서의 것들에 대해, 세포-결합제, 예컨대 항체 또는 그것의 항원 결합부는, 본 명세서에서 기재된 임의의 방법에 의해 수득될 수 있다.
제4 특정 구현예에서, 본 발명은 하기의 단계들을 포함하는, 항체-세포독성 약물 콘주게이트를 제조하는 방법을 제공한다:
(a) 항체 또는 그것의 항원-결합부의 N-말단 세린 또는 트레오닌 잔기의 2-하이드록시에틸아민 모이어티를, 산화제로 산화시켜 N-말단 알데하이드 그룹을 갖는 산화된 항체 또는 그것의 산화된 항원-결합부를 형성하는 단계로서, 상기 2-하이드록시에틸아민 모이어티는 구조식
Figure 112023025074489-pat00151
으로 나타내는 단계:, 및
(b) 산화된 항체 또는 그것의 산화된 항원-결합부를: (i) 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 세포독성 약물-링커 화합물과 접촉시켜 항체-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계; 또는 (ii) 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 링커 화합물과 접촉시켜 링커를 결합한 변형된 항체 또는 그것의 변형된 항원-결합부을 형성하고, 그 다음 상기 변형된 항체 또는 상기 그것의 변형된 항원-결합부를 세포독성 약물과 반응시켜 상기 항체-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계; 또는 (iii) 세포독성 약물 그 다음 알데하이드 반응성 그룹을 갖는 링커 화합물 및 상기 세포독성 약물과의 공유 결합을 형성할 수 있는 반응성 그룹을 부가하여 항체-세포독성 약물 콘주게이트를 형성하는 단계.
특정 구현예에서, 상기에서 기재된 임의의 방법, 예컨대 제7 구현예 또는 제1 내지 제4 특정 구현예 또는 임의의 더 많은 특정 구현예의 것들에 대해, 항체 또는 그것의 항원-결합부는 하기를 포함하는 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부를 인코딩하는 폴리뉴클레오타이드를 발현시킴으로써 수득된다: (1) 서열식별번호: 1의 아미노산 서열을 갖는 이종성 신호 펩타이드; (2) 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열의 제1 잔기에 대한 바로 N-말단인 Ser 또는 Thr 잔기; 또는 (3) 재조합 항체 중쇄 (HC), 경쇄 (LC), 또는 그것의 항원-결합부의 성숙한 가공된 서열의 1종 이상의 N-말단 아미노산 잔기(들)을 치환하는 Ser 또는 Thr 잔기.
특정 구현예에서, 상기에서 기재된 임의의 방법에 대해, 예컨대 제7 구현예 또는 제1 내지 제4 특정 구현예 또는 임의의 더 많은 특정 구현예의 것들, 항체 또는 그것의 항원-결합부는 서열식별번호: 3의 경쇄 서열을 포함한다.
특정 구현예에서, 상기에서 기재된 임의의 방법, 예컨대 제7 구현예 또는 제1 내지 제4 특정 구현예 또는 임의의 더 많은 특정 구현예의 것들에 대해, 항체 또는 그것의 항원-결합부는 서열식별번호: 3의 경쇄 서열을 포함하는 쥣과 항체 또는 그것의 항원-결합부의 키메라성, 인간화된, 또는 인간 항체 또는 그것의 항원-결합부이다. 인간화된 항체 또는 그것의 항원-결합부는 재표면화된 또는 CDR 이식된 항체 또는 그것의 항원-결합부일 수 있다.
특정 구현예에서, 상기에서 기재된 임의의 방법에 따라 제조된 콘주게이트는 그 다음 정제될 수 있다. 임의의 정제 당해 분야에서 공지된 방법은 본 발명의 콘주게이트를 정제하기 위해 사용될 수 있다 (참고, 예를 들면, Bioconjugate Techniques, 2nd Edition by Greg T.Hermanson, Academic Press, Inc. 공개,2008). 일 구현예에서, 본 발명의 콘주게이트는 접선 유동 여과 (TFF), 비-흡착 크로마토그래피, 흡착 크로마토그래피, 흡착 여과, 선택적 침전, 고성능 액체 크로마토그래피 (HPLC), 투석 또는 임의의 다른 적합한 정제 공정, 뿐만 아니라 이들의 조합을 사용하여 정제될 수 있다.
임의의 적합한 TFF 시스템은 정제를 위해 이용될 수 있고, 하기를 포함한다: Pellicon 유형 시스템 (Millipore, Billerica, MA), Sartocon Cassette 시스템 (Sartorius AG, Edgewood, NY), 및 Centrasette 유형 시스템 (Pall Corp.,East Hills, NY).
임의의 적합한 흡착 크로마토그래피 수지는 정제를 위해 이용될 수 있다. 바람직한 흡착 크로마토그래피 수지는 하기를 포함한다: 수산화인회석 크로마토그래피, 소수성 전하 유도 크로마토그래피 (HCIC), 소수성 상호작용 크로마토그래피 (HIC), 이온 교환 크로마토그래피, 혼합된 방식 이온 교환 크로마토그래피, 고정된 금속 친화성 크로마토그래피 (IMAC), 염료 리간드 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피, 역상 크로마토그래피, 및 이들의 조합. 적합한 수산화인회석 수지의 예는 하기를 포함한다: 세라믹 수산화인회석 (CHT Type I and Type II, Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA), HA Ultrogel 수산화인회석 (Pall Corp.,East Hills, NY), 및 세라믹 플루오로인회석 (CFT Type I and Type II, Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA). 적합한 HCIC 수지의 예는 하기이다: MEP Hypercel 수지 (Pall Corp.,East Hills, NY). 적합한 HIC 수지의 예는 하기를 포함한다: 부틸-세파로오스, 헥실-세파로오스, 페닐-세파로오스, 및 옥틸 세파로오스 수지 (GE Healthcare, Piscataway, NJ로부터의 모든 것), 뿐만 아니라 매크로-prep 메틸 및 매크로-Prep t-부틸 수지 (Biorad 실험실, Hercules, CA). 적합한 이온교환수지의 예는 하기를 포함한다: SP-세파로오스, CM-세파로오스, 및 Q-세파로오스 수지 (GE Healthcare, Piscataway, NJ로부터의 모든 것), 및 Unosphere S 수지 (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA). 적합한 혼합된 방식 이온 교환기의 예는 하기를 포함한다: Bakerbond ABx 수지 (JT Baker, Phillipsburg NJ). 적합한 IMAC 수지의 예는 하기를 포함한다: 킬레이트화 세파로오스 수지 (GE Healthcare, Piscataway, NJ) 및 Profinity IMAC 수지 (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA). 적합한 염료 리간드 수지의 예는 하기를 포함한다: 청색 세파로오스 수지 (GE Healthcare, Piscataway, NJ) 및 Affi-gel Blue 수지 (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA). 적합한 친화도 수지의 예는 하기를 포함한다: 단백질 A 세파로오스 수지 (예를 들면, MabSelect, GE Healthcare, Piscataway, NJ), His-Tag 금속 친화도 수지, 항-FLAG 친화도 수지, 및 렉틴 친화도 수지, 예를 들면렌틸l 렉틴 세파로오스 수지 (GE Healthcare, Piscataway, NJ), 여기서 항체는 적절한 렉틴 결합 부위를 보유한다. 적합한 역상 수지의 예는 C4, C8, 및 C18 수지 (Grace Vydac, Hesperia, CA)를 포함한다.
임의의 적합한 비-흡착 크로마토그래피 수지는 정제를 위해 이용될 수 있다. 예를 들면, 크기-배제 크로마토그래피는 본 발명의 콘주게이트를 정제하기 위해 사용될 수 있다. 적합한 비-흡착 크로마토그래피 수지의 예는, 비제한적으로, 하기를 포함한다: SEPHADEX™ G-10, G-25, G-50, G-100, SEPHACRYL™ 수지 (예를 들면, S-200 및 S-300), SUPERDEX™ 수지 (예를 들면, SUPERDEX™ 75 및 SUPERDEX™ 200), BIO-GEL® 수지 (예를 들면, P-6, P-10, P-30, P-60, 및 P-100), 및 당해 분야의 숙련가에게 공지된 기타.
일 구현예에서, 세포-결합제가 에피토프-태그된 아비바디일 때, 콘주게이트는 하기를 사용하여 정제될 수 있다: 하이드록실 인회석 크로마토그래피, 크기-배제 크로마토그래피, 접선 유동 여과, 겔 전기영동, 투석, 및 친화성 크로마토그래피, 바람직하게는 친화성 크로마토그래피, 더 바람직하게는 His-Tag 금속 친화성 크로마토그래피 및 항-FLAG M2 친화성 크로마토그래피 (참고, 예를 들면, US 2008/0152586 및 US 2012/0171115).
또 다른 구현예에서, 세포-결합제는 센터이린일 때, 콘주게이트는 하기를 사용하여 정제될 수 있다: 단백질 A 정제, 암모늄 설페이트 또는 에탄올 침전, 산 추출, 음이온 또는 양이온 교환 크로마토그래피, 포스포셀룰로오스 크로마토그래피, 소수성 상호작용 크로마토그래피, 크기-배제 크로마토그래피, 접선 유동 여과, 친화성 크로마토그래피, 하이드록실인회석 크로마토그래피 및 렉틴 크로마토그래피.대안적으로, 콘주게이트는 HPLC을 사용하여 정제될 수 있다. 바람직하게는, 콘주게이트는 친화성 크로마토그래피, 더 바람직하게는 His-Tag 금속 친화성 크로마토그래피 를 사용하여 정제될 수 있다. 참고, 예를 들면, US 특허 공개 번호 US 2010/0255056, US 2010/0216708 및 US 2011/0274623.
또 다른 구현예에서, 세포-결합제가 DARPin일 때, 콘주게이트는 하기에 의해 정제될 수 있다: 친화성 크로마토그래피, 크기 배제 크로마토그래피, 하이드록실인회석 크로마토그래피, 접선 유동 여과, 바람직하게는 친화성 크로마토그래피, 더 바람직하게는 His-Tag 친화성 크로마토그래피.참고, 예를 들면, U.S. 특허 공개 번호 20040132028, 2009/0082274, 2011/0118146, 및 2011/0224100, WO 02/20565 및 WO 06/083275.
세포 독성의 시험관내 평가
본 발명의 세포독성 화합물 및 세포-결합제-약물 콘주게이트는 시험관내 다양한 암 세포주의 증식을 억제하기 위해 그것의 능력에 대해 평가될 수 있다. 평가될 세포는 1 내지 5일 동안 화합물 또는 콘주게이트에 노출될 수 있고 세포의 생존 분획은 공지된 방법에 의해 직접적인 검정으로 측정된다. IC50 값은 그 다음 검정의 결과로부터 계산될 수 있다. 대안적으로 또는 추가로, 시험관내 세포주 민감성 스트린, 예컨대 하기에 의해 기재된 것: U.S. 국립 암 협회 (참고 Voskoglou-Nomikos 등., 2003, Clinical Cancer Res. 9: 42227-4239(이것은 본 명세서에 참고로 편입되어 있음)는 본 발명의 화합물 또는 콘주게이트에 의한 치료에 민감할 수 있는 암의 유형을 결정하기 위해 안내 중의 하나로서 사용될 수 있다.
조성물 및 사용 방법
본 발명은 조성물 (예를 들면, 약제학적 조성물)을 포함하고, 이 조성물은 본 명세서에서 기재된 신규 벤조디아제핀 화합물 (예를 들면, 인돌리노벤조디아제핀 또는 옥사졸리디노벤조디아제핀), 그것의 유도체, 또는 그것의 콘주게이트, (및/또는 그것의 용매화물, 수화물 및/또는 염) 및 담체 (약제학적으로 허용가능한 담체)를 포함한다. 본 발명은 또한, 조성물 (예를 들면, 약제학적 조성물)을 포함하고, 이 조성물은 본 명세서에서 기재된 신규 벤조디아제핀 화합물, 그것의 유도체, 또는 그것의 콘주게이트, (및/또는 그것의 용매화물, 수화물 및/또는 염) 및 담체 (약제학적으로 허용가능한 담체)를 포함하고, 제2 치료제를 추가로 포함한다. 본 조성물은 포유동물 (예를 들면, 인간)에서 비정상 세포 성장을 억제하거나 증식성 장애를 억제하는 유용하다. 본 조성물은 또한, 포유동물 (예를 들면, 인간) 우울증, 불안, 스트레스, 공포증, 공황, 불괘감, 정신과 장애, 통증, 및 염증성 질환을 치료하는데 유용하다.
본 발명은 포유동물 (예를 들면, 인간)에서 비정상 세포 성장을 억제하거나 증식성 장애를 치료하는 방법을 포함하고, 상기 방법은 상기 포유동물에게 치료적 유효량의 본 명세서에서 기재된 신규 벤조디아제핀 화합물 (예를 들면, 인돌리노벤조디아제핀 또는 옥사졸리디노벤조디아제핀), 그것의 유도체, 또는 그것의 콘주게이트, (및/또는 용매화물 및 그것의 염) 또는 그것의 조성물을, 단독으로 또는 제2 치료제와 함께 투여하는 것을 포함한다.
일 구현예에서, 증식성 장애는 암이다. 암은 혈액 암 또는 고형 종양을 포함할 수 있다. 더 구체적으로, 상기 암은 백혈병 (예를 들면, 급성 골수 백혈병 (AML), 급성 단구성 백혈병, 전골수구 백혈병, 호산구 백혈병, 급성 림프아구성 백혈병 (ALL) 예컨대 급성 B 림프아구성 백혈병 (B-모든), 만성적 골수성 백혈병 (CML), 만성적 림프구성 백혈병 (CLL)) 또는 림프종 (예를 들면, 비-호지킨 림프종), 골수이형성 증후군 (MDS), 흑색종, 폐암 (예를 들면, 비-소세포 폐암 (NSCLC)), 난소암, 자궁내막 암, 복막 암, 췌장암, 유방암, 전립선암, 두경부의 편평상피 세포 암종, 및 자궁경부암이다.
본 발명은 또한, 치료 유효량의 상기에서 기재된 콘주게이트 중 임의의 것를 치료가 필요한 대상체에게 투여하는 것을 포함하는 치료 방법을 제공한다. 유사하게, 본 발명은 선택된 세포 집단에서 세포사를 유도하는 방법을 제공하고, 상기 방법은 표적 세포 또는 표적 세포를 함유하는 조직을, 유효량의, 본 발명의 세포독성 화합물-세포-결합제 (예를 들면, 세포 결합제에 연결된 인돌리노벤조디아제핀 또는 옥사졸리디노벤조디아제핀 이량체) 중 임의의 것을 포함하는 세포독성 약물, 그것의 염 또는 용매화물과 접촉시키는 것을 포함한다. 표적 세포는, 세포-결합제가 결합할 수 있는 세포이다.
원한다면, 다른 활성제, 예컨대 다른 항종양 제제는, 콘주게이트와 함께 투여될 수 있다.
적합한 약제학적으로 허용가능한 담체, 희석제, 및 부형제는 잘 알려져 있고 임상 상황 보증으로서 당해 분야의 숙련가에 의해 결정될 수 있다.
적합한 담체, 희석제 및/또는 부형제의 예는 하기를 포함하고: (1) 약 1 mg/mL 내지 25 mg/mL 인간 혈청 알부민을 함유하거나 함유하지 않는 둘베코 포스페이트 완충된 염수(pH 약 7.4), (2) 0.9% 염수 (0.9% w/v NaCl), 및 (3) 5% (w/v) 덱스트로오스; 및 또한, 항산화제 예컨대 트립타민 및 안정제 예컨대 Tween 20를 함유할 수 있다.
선택된 세포 집단에서 세포사를 유도하는 방법은 시험관내, 생체내, 또는 생체외에서 실시될 수 있다.
시험관내 사용의 예는 하기를 포함한다: 이환 또는 악성 세포를 사멸시키기 위해 동일한 환자로의 그것의 이식 전의 자가조직 골수의 처리; 능숙한 T 세포를 사멸시키고 이식편 대 숙주-질환 (GVHD)를 예방하기 위해 그것의 이식 전의 골수의 처리; 표적 항원을 발현시키지 않는 원하는 변이체를 제외하고 모든 세포를 사멸시키거나; 또는 원하지 않는 항원을 발현시키는 변이체를 사멸시키기 위해 세포 배양물의 처리.비-임상 시험관내 사용의 조건은 당해 분야의 숙련가에 의해 쉽게 결정된다.
임상 생체외 사용의 예는 자가조직 이식 in 암 치료 또는 자가면역 질환의 치료에서 자가 조직 이식 전에 골수로부터 종양 세포 또는 림프양 세포를 제거하거나, GVHD를 예방하기 위해 이식 전에 자가조직 또는 동종 골수 또는 조직으로부터 T 세포 및 다른 림프양 세포를 제거하는 것이다. 치료는 아래와 같이 수행될 수 있다. 골수는 환자 또는 다른 개체로부터 수확되고, 그 다음 본 발명의 세포독성 약물을 부가한 혈청 함유 배지에서 인큐베이션되고, 농도는 약 30 분 내지 약 48 시간 동안 약 37 ℃에서 약 10 μM 내지 1 pM의 범위이다. 인큐베이션의 농도 및 시간의 정확한 조건, 즉, 용량은, 당해 분야의 숙련가에 의해 쉽게 결정된다. 인큐베이션 후, 골수 세포는 혈청 함유 배지로 세정되고 공지된 방법에 따라 정맥내로 환자에게 되돌아간다. 환자가 다른 치료 예컨대 절제 화학요법의 과정 또는 골수의 수확 시간과 처리된 세포 재주입 사이의 총-신체 조사를 받은 상황에서, 처리된 골수 세포는 표준 의료 장비를 사용하여 액체 질소에서 냉동 보관된다.
임상 생체내 사용에 대해, 본 발명의 세포독성 약물은 멸균에 대해 그리고 내독소 수준에 대해 시험된 용액 또는 동결건조된 분말로서 공급될 것이다. 콘주게이트 투여의 적합한 프로토골의 예는 아래와 같다. 콘주게이트는 매주 정맥내 볼러스로서 4 주 동안 매주 주어진다. 볼러스 용량은 5 내지 10 mL의 인간 혈청 알부민이 부가될 수 있는 50 내지 1000 mL의 생리 식염수로 주어진다. 복용량은 정맥내로 투여 당 10 μg 내지 2000 mg일 것이다 (100 ng 내지 20 mg/kg / 1일의 범위). 치료 4 주 후, 환자는 일주일 단위로 치료를 계속 받을 수 있다. 투여 경로, 부형제, 희석제, 복용량, 시간, 등에 관한 특정 임상 프로토콜은, 임상 상황 보증으로서 당해 분야의 숙련가에 의해 결정될 수 있다.
선택된 세포 집단에서 세포사를 유도하는 생체내 또는 생체외 방법에 따라 치료되리 수 있는 의료 병태의 예는 하기 예를 포함하는 임의의 유형의 악성종양을 포함한다: 암; 자가면역 질환, 예컨대 전신 낭창, 류마티스성 관절염, 그리고 다발성 경화증; 이식 거부, 예컨대 신장 이식 거부, 간 이식 거부, 폐 이식 거부, 심장 이식 거부, 및 골수 이식 거부; 이식편 대 숙주 질환; 바이러스성 감염, 예컨대 CMV 감염, HIV 감염, AIDS, 등.; 및 기생충 감염, 예컨대 람블편모충증, 아메바증, 주혈흡충증, 및 당해 분야의 숙련가에 의해 결정된 기타.
암 요법 및 그것의 복용량, 투여 경로 및 권고된 용법은 당해 기술에 공지되어 있고 Physician's Desk Reference (PDR)와 같은 문헌에 기재되었다. PDR은 다양한 암의 치료에 사용되었던 제제의 복용량을 개시한다. 치료적으로 유효한 이들 상기 언급된 화학치료 약물의 투약 레지멘 및 복용량은 치료될 특정한 암, 질환의 정도 및 당해 기술의 의사에게 익숙한 다른 인자에 좌우될 것이고 의사에 의해 결정될 수 있다. PDR의 내용은 그 전체가 참고로 본 명세서에 명확히 편입되어 있다. 당해 분야의 숙련가는 본 발명의 교시에 따라 사용될 수 있는 화학치료제 및 콘주게이트의 투약 레지멘 및 복용량을 결정하기 위해 하기 파라미터 중 하나 이상을 사용하여 PDR를 검토할 수 있다. 이들 파라미터는 하기를 포함한다:
ㆍ 포괄적인 지수
ㆍ 제조자에 의해
ㆍ 생성물 (회사 또는 상표명 약물 명칭에 의해)
ㆍ 카테고리 지수
ㆍ 포괄적인/화학 지수 (비-상표명 공통의 약물 명칭)
ㆍ 약물의 색상 이미지
ㆍ FDA 라벨링과 일치된 제품 정보
ㆍ 화학 정보
ㆍ 기능/작용
ㆍ 징후 및 사용금지사유
ㆍ 시험 연구, 부작용, 경고
유사체 및 유도체
본 명세서에서 기재된 각각의 세포독성 약물은, 수득한 화합물이 개시 화합물의 특이성 및/또는 활성을 여전히 보유하는 방식으로 변형될 수 있다는 것을 세포독성 약물의 당해 분야의 숙련가는 쉽게 이해할 것이다. 숙련가는 또한, 많은 이들 화합물이 본 명세서에서 기재된 세포독성 약물 대신에 사용될 수 있는 것으로 이해될 것이다. 따라서, 본 발명의 세포독성 약물은 본 명세서에서 기재된 화합물의 유사체 및 유도체를 포함한다.
뒤따르는 본 명세서 및 실시예에서 모든 참조문헌은 그것의 전체가 참고로 명확히 편입되어 있다.
실시예
실시예 1 N-말단 Ser / Thr을 갖는 재조합 항체의 작제
쥣과 항엽산제 수용체 알파 항체 FR1-2.1 경쇄 (LC)의 서열은 N-말단 세린으로 이전에 기재되었다 (미국 특허 출원 번호: 61/872,407(2013년 8월 30일 출원); 61/875,475(2013년 9월 9일 출원); 및 61/940,184(2014년 2월 14일 출원); 및 이들의 우선권 출원 WO 2015/031815, 모두는 참고로 편입됨). 이러한 N-말단 SeR은 하기의 신호 펩타이드에서 통상적인 절단 부위를 이용하는 신호 펩티다아제의 결과이다: IGKV1-99*01 쥣과 생식계열 서열 (수탁 번호 CAB46122; 서열식별번호: 2) (FR1-2.1 경쇄가 유도됨). 항체 발현 동안 절단시 완전히 제거되는 전형적인 항체 신호 펩타이드와는 달리, IGKV1-99* 신호 펩타이드 (카밧 위치 -1)의 최종 세린은 FR1-2.1 경쇄의 N 말단에서 남아 있다. 본 명세서에서 기재된 세린 산화 변형 방법을 평가하기 위한 유용한 도구로서 증명된 FR1-2.1 항체, 및 또한, FR1-2.1 신호 펩타이드 (표 1; 서열식별번호: 1)은 그것의 경쇄 또는 중쇄 N 말단에서 세린을 갖는 재조합 항체을 생성하기 위하 가능한 기전을 제공한다. N-말단 세린을 편입하기 위한 원상태 항체 신호 펩타이드의 사용은 비-천연 작제물로부터 생길 수 있는 발현 문제 및 절단 부위 이종성을 비제한적으로 포함하는 항체 공악의 잠재적인 부정적 결과의 회피를 허용한다.
FR1-2.1 신호 펩타이드가 형질감염된 포유동물 세포주에서 발현된 재조합 항체의 N-말단에서 세린 잔기를 남긴다는 것을 입증하기 위해, 신규 항체 발현 작제물은 FR1-2.1 경쇄 신호 펩타이드를 이용하여 합성되었다. 하기에서 앞서 기재된 인간화된 Mov19 경쇄 (LC)에 대한 가변 영역 아미노산 서열: U.S. 특허 번호 8,557,966 (표 1: 서열식별번호: 3)은, 하기 대신에 FR1-2.1 신호 펩타이드와 조합되어: 표준 항체 신호 펩타이드 (서열식별번호: 6) 하기를 생성했다: huMov19 LC NTS1 서열 (서열식별번호: 10). 경쇄 서열은 그 다음 Blue Heron Biotechnology에 제공되었고, 여기서 그것을 코돈-최적화되고, 합성되고, 인간 카파 불변 영역 서열를 함유하는 pAbKZeo 포유동물 발현 플라스미드의 EcoRI 및 BsiWI 부위로 클로닝되었다.
N 말단에서 세린을 갖는 재조합 항체 / 트레오닌 잔기를 생성하는 대안적인 접근법은 N-말단 잔기 (카밧 위치 +1)을 세린 또는 트레오닌으로 치환하는 것이다. 이러한 방법을 입증하기 위해, 인간화된 Mov19 중쇄 (HC) (서열식별번호: 8) N-말단 잔기 (글루타민)는 하기를 생성하기 위해 세린으로 치환된다: huMov19 HC NTS2 서열 (서열식별번호: 11). 중쇄 서열은, 그 다음 코돈-최적화되고, 합성되고, PAbG1Neo 플라스미드의 HindIII 및 Apa1 부위에서 인간 IgG1 불변 영역을 갖는 프레임에서 Blue Heron Biotechnology에 의해 클로닝된다.
상기에서 기재된 N-말단 세린 부가 및 N-말단 세린 치환 도식의 다양한 조합이 사용되어 최대 4 N-말단 세린을 갖는 추가의 재조합 항체를 생성한다 (예를 들면, 중쇄 상에 2개 및 경쇄 상에 2개). 상기에서 기재된 작제물의 반대는, 인간화된 Mov19 경쇄 (LC)가 하기에 의해 치환된 그것의 N-말단 아스파르테이트를 갖도록 합성되고: 세린 (huMov19LC NTS3, 서열식별번호: 12) 또는 반대로, 인간화된 Mov19 중쇄는 하기를 부가하기 위해 FR1-2.1 신호 펩타이드로 합성된다: N 말단 세린 (huMov19HC NTS4; 서열식별번호: 14). 또한, 이들 경쇄 및 중쇄 작제물은 항체 당 총 4 N-말단 세린에 대한 N-말단 둘 모두에서 세린을 갖는 재조합 항체를 생성하기 위해 함께 혼합될 수 있다 (예를 들면, huMov19HC NTS4를 갖는 huMov19LC NTS3). 이들 작제물은 2 (단일 사슬 N 말단 세린) 또는 4 (N 말단 세린을 갖는 2개의 사슬 모두) 편입 부위로 제한되지만, 이종이량체 항체 기술, 예컨대 “크놉 인 홀(Knob in Hole)” 돌연변이로 제한된다 (WO 2005/063816 A2, 참고로 편입됨). 1 또는 3 N 말단 세린에 의한 항체의 작제가 또한 가능하다.
마지막으로, 다중-아미노산 N-말단 부속기 또는 N-말단 절단과 같이 N-말단 세린을 갖는 재조합 항체를 생성하는 추가의 접근법이 뒤따르지만, 기재된 방법은 중요한 항체 속성 예컨대 결합 특이성 또는 구조적 완전성에 덜 영향을 미칠 것이라는 부가된 이점을 제공한다.
세린에 추가하여, 재조합 항체는 본 명세서에서 기재된 방법에 의해 이들 항체를 접합하기 위해 N 말단 잔기 (카밧 위치 +1)를 트레오닌으로 간단히 치환하여 그것의 N-말단에서 트레오닌 잔기로 생성될 수 있다. 예를 들면, 인간화된 Mov19 경쇄 (LC) N 말단 아스파르테이트는 하기로 치환되고: 트레오닌 (huMov19 LC NTT1, 서열식별번호: 15), 또는 인간화된 Mov19 중쇄 (HC) N-말단 글루타민는 하기로 치환된다: 트레오닌 (huMov19 HC NTT2, 서열식별번호: 16). 그 다음 이들 작제물은 상기에서 기재된 바와 같 각 포유동물 발현 플라스미드로 클로닝된다.
표 1. 선택된 서열
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Figure 112023025074489-pat00153
Figure 112023025074489-pat00154
실시예 1A N-말단 Ser / Thr을 갖는 재조합 항체의 제작
상기 실시예 1에 기재된 것과 실질적으로 동일한 방법을 이용하여, 서열번호: 6을 그의 천연 huMov19 LC 및 HC에 대한 신호 펩타이드로서 사용하거나, 또는 Ser 또는 Thr 잔기가 서열번호: 6 바로 이후에 삽입되어 신호 펩타이드의 절단을 처리한 후, 삽입된 Ser/Thr이 LC 또는 HC의 성숙한 가공된 서열에서 첫 번째 (N-말단) 잔기가 되도록 하는 변형을 갖는 이종 LC 또는 HC에 대한 신호 펩타이드로서 사용한다.
실시예 2 재조합 항체 발현
키메라 및 인간화된 항체 작제물을 진탕 플라스크에서 변형된 PEI 절차를 이용하여, 현탁액-적응된 HEK-293T 세포에서 일시적으로 생산하였다 (Durocher Y, Perret S, & Kamen A High-level and high-throughput recombinant protein production by transient transfection of suspension-growing human 293-EBNA1 cells. Nucleic Acids Res. 2002 Jan 15;30(2): E9). HEK-293T 세포를 Freestyle 293 (Invitrogen)에서 성장시키고, PEI-DNA 복합체의 첨가 후에 배양 부피가 희석되지 않은 채로 남아있는 것을 제외하고, PEI 일시적 형질감염을 이전에 기재된 바와 같이 수행하였다 (전술한 Durocher). 부착성 및 현탁액 일시적 형질감염 모두를 1주 동안 배양한 다음, 청징된 상청액을 단백질 A 컬럼 후 하기에 기재된 바와 같은 CM 컬럼 이온 교환 크로마토그래피에 의해 정제하였다.
실시예 3 재조합 항체 정제
항체를 표준 방법, 예컨대, 단백질 A 또는 G 크로마토그래피 (HiTrap 단백질 A 또는 G HP, 1 mL, Amersham Biosciences)를 이용하여 청징된 세포 배양 상청액으로부터 정제하였다. 요약하면, 1/10 부피의 1 M Tris/HCl 버퍼, pH 8.0을 첨가하여 상청액을 크로마토그래피용으로 제조하였다. 상기 pH-조정된 상청액을 0.22 μm 필터 막을 통해 여과하고 결합 버퍼 (PBS, pH 7.3)로 평형화된 컬럼 상에 로딩하였다. 컬럼을 280 nm에서 흡광도 없이 안정한 베이스라인이 얻어질 때까지 결합 버퍼로 세척하였다. 항체를 0.5 mL/분의 유속을 이용하여 0.15 M NaCl, pH 2.8을 함유하는 0.1 M 아세트산 버퍼로 용출시켰다. 약 0.25 mL의 분획을 수집하고 1/10 부피의 1M Tris/HCl, pH 8.0을 부가하여 중화시켰다. 피크 분획(들)을 밤새 1× PBS에 대해 2회 투석하고, 0.2 μm 필터 막을 통해 여과시켜 멸균하였다. 정제된 항체를 A280에서의 흡광도에 의해 정량화하였다.
단백질 A 정제된 분획을 카복시메틸 (CM) 크로마토그래피와 함께 이온 교환 크로마토그래피 (IEX)를 이용하여 추가 정제하였다. 요약하면, 단백질 A 정제로부터의 샘플을 시작 버퍼 (10 mM 인산칼륨, 10 mM 염화나트륨, pH 7.5)로 버퍼 교환하고 0.22 μm 필터를 통해 여과하였다. 그리고 나서, 상기 제조된 샘플을 120 cm/시간의 유속으로 시작 버퍼로 평형화된 CM 빠른 흐름 수지 (GE Lifesciences) 상에 로딩하였다. 컬럼 크기는 샘플 내의 모든 항체에 결합하는 충분한 용량을 갖도록 선택하였다. 이후, 컬럼을 280 nm에서 흡광도 없이 안정한 베이스라인이 얻어질 때까지 결합 버퍼로 세척하였다. 항체를 20 컬럼 부피 (CV)에서 10 mM부터 500 mM까지 염화나트륨의 구배를 개시함으로써 용출시켰다. 50 mAu의 주요 피크를 초과하는 UV 판독을 갖는 분획을 수집하였다. 순도 (모노머 및 가용성 고분자량 응집물의 백분율)를 Agilent HPLC 1100 시스템 (Agilent, Santa Clara, CA)을 이용하여 SWXL 가드 컬럼, 6.0 × 40 mm을 갖는 TSK 겔 G3000SWXL, 7.8 × 300 mm (Tosoh Bioscience, Montgomeryville, PA) 상에서 크기 배제 크로마토그래피 (SEC)로 평가하였다. 원하는 순도 (>95%)를 갖는 분획을 모으고, TFF 시스템을 이용하여 PBS (pH 7.4)로 버퍼 교환하고, 0.2 μm 필터 막을 통해 여과하여 멸균시켰다. 정제된 항체를 SEC에 의해 그의 순도에 대해 추가 시험하였고 IgG 농도를 1.47의 흡광 계수를 사용하여 280 nm에서의 흡광도 측정에 의해 결정하였다. 필요한 경우 희석하였다. 대안적으로, 세라믹 하이드록시아파타이트 (CHT)를 사용하여 쥣과 및 인간화된 항체 모두를 개선된 선택성을 갖도록 개선시킬 수 있다. 40 μm 입자 크기를 갖는 유형 II CHT 수지 (Bio-Rad Laboratories)를 IEX 크로마토그래피와 유사한 프로토콜로 항체를 개선하는데 적용하였다. CHT에 대한 시작 버퍼는 20 mM 나트륨 포스페이트, pH 7.0이었고 항체를 20 CV에 대해 20-160 mM 인산나트륨의 구배로 용출시켰다.
실시예 4 N-말단 항체 접합 - 2단계 접근법
중쇄 상의 N-말단 세린으로 조작된 huMOV19-NTS#2 항체 (도 1에 나타낸 바와 같은 반응식 1의 [1]; PBS, pH7.4 중의 3mg/mL)를 5 mM 수성 과요오드산나트륨 (50 당량, 25 ℃, 30분)으로 처리하였다. 그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 통해 아세트산나트륨 버퍼, pH5.0로 버퍼 교환하였다.
수득한 용액을 10% v/v DMA (N,N-디메틸아세트아미드) 공용매를 함유한 반응 용기에서 4-아미노펜에틸 알코올 (DMA [N,N-디메틸아세트아미드]에서 100 mM)로 10 mM 농도로 처리하였다. 이후, 링커1 (반응식 1의 [3]; 4 또는 5 당량)을 도입하고, 반응 용기를 밀봉하고, 37 ℃에서 24시간 동안 배양하였다.
그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 통해 HEPES (4-(2-하이드록시에틸)-1-피페라진 에탄설폰산), pH8.5 버퍼로 버퍼 교환하였다. 그리고 나서, 상기 용액을 DMA (N,N-디메틸아세트아미드) 공용매 (10% v/v)를 이용하여 조정하고, 화합물 A (또는 설폰화된 DGN462 (sDGN462) 또는 설폰화된 D1 (또는 sD1)) (반응식 1의 [5]; 유리 티올; 5 당량)으로 25 ℃에서 6시간 동안 처리하였다.
수득한 접합체를 NAP 여과 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 이용하여 pH 6.2에서 250 mM 글리신, 10 mM 히스티딘, 1% 수크로오스, 0.01% Tween-20, 50 μM 중아황산나트륨 제형 버퍼로 버퍼 교환하였다. 투석을 Slide-a-Lyzer 투석 카세트 (ThermoScientific 10,000 MWCO)를 이용하여 25 ℃에서 4시간 동안 동일한 버퍼에서 수행하였다.
상기 정제된 접합체 (반응식 1의 [6])는 항체당 2개의 화합물 A 분자가 연결된 균질 평균 (Q-ToF 질량 분광분석법을 통해, 도 2), >98% 모노머 (크기 배제 크로마토그래피를 통해), <2% 유리 약물 (아세톤 침전된 역상 HPLC 분석을 통해), 및 0.14 mg/mL의 최종 단백질 농도 (huMOV19-NTS#2 항체에 대한 몰 흡광 계수 ε280=201400 M-1cm-1를 이용하는 UV-Vis를 통해)를 갖는 것으로 나타났다.
실시예 5 N-말단 항체 접합 - DMx 직접 연결
조작된 N-말단 Ser-함유 huMOV19-NTS#2 항체 (도 3, 반응식 2의 [1]; PBS, pH7.4 중의 3mg/mL)를 25 ℃에서 30분 동안 5 mM 수성 과요오드산나트륨 (50 몰 당량)으로 처리하였다. 그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 통해 아세트산나트륨 버퍼, pH5.0로 버퍼 교환하였다.
수득한 용액을 10% v/v DMA (N,N-디메틸아세트아미드) 공용매를 함유한 반응 용기에서 4-아미노펜에틸 알코올 (DMA [N,N-디메틸아세트아미드]에서 100 mM)로 10 mM 농도로 처리하였다. 그리고 나서, 아미노옥시-아세틸-MayNMA (반응식 2의 [3]; 4 또는 5몰 당량)를 도입하고, 반응 용기를 밀봉하고, 37 ℃에서 24시간 동안 배양하였다.
그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA 등급, GE Healthcare)을 통해 pH 6.2에서 250 mM 글리신, 10 mM 히스티딘, 1% 수크로오스 버퍼로 버퍼 교환하였다. 투석을 Slide-a-Lyzer 투석 카세트 (ThermoScientific 10,000 MWCO)을 이용하여 25 ℃에서 4시간 동안 동일한 버퍼에서 수행하였다.
정제된 접합체 ([4], 반응식 2)는 항체당 2개의 MayNMA 분자가 연결된 균질 평균 (Q-ToF 질량 분광분석법을 통해, 도 4), >98% 모노머 (크기 배제 크로마토그래피를 통해), <2% 유리 약물 (HISEP 역상 HPLC 분석을 통해), 및 0.31 mg/mL의 최종 단백질 농도 (huMov19-NTS#2 항체에 대한 몰 흡광 계수 ε280=201400 M-1cm-1을 이용하는 UV-Vis를 통해)를 갖는 것으로 나타났다.
실시예 6 N-말단 항체 접합 - MOV19-NTS#1에 대한 2단계 프로토콜
리더 펩타이드 서열을 통해 경쇄 상의 N-말단 세린으로 조작된 huMov19-NTS#1 항체 (도 5의 반응식 3의 [1]; PBS, pH7.4 중의 3mg/mL)를 25 ℃에서 30분 동안 5 mM 수성 과요오드산나트륨 (50 몰 당량)으로 처리하였다. 그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 통해 아세트산나트륨 버퍼, pH5.0로 버퍼 교환하였다.
수득한 용액을 10% v/v DMA (N,N-디메틸아세트아미드) 공용매를 함유한 반응 용기에서 4-아미노펜에틸 알코올 (DMA [N,N-디메틸아세트아미드]에서 100 mM)로 10 mM 농도로 처리하였다. 이후, 링커1 (반응식 3의 [3]; 4 또는 5몰 당량)을 도입하고, 반응 용기를 밀봉하고, 37 ℃에서 24시간 동안 배양하였다.
그 다음 혼합물은 NAP 탈염 칼럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA GRADE, GE Healthcare)를 통해 PH8.5 버퍼의 HEPES(4-(2-하이드록시에틸)-1-피페라진 에탄설폰산)로 교환된 버퍼였다. 그리고 나서, 상기 용액을 DMA (N,N-디메틸아세트아미드) 공용매 (10% v/v)로 조절하고, 화합물 A (반응식 3의 [5]; 유리 티올; 5몰 당량)로 25 ℃에서 6시간 동안 처리하였다.
수득한 콘주게이트는 NAP 여과 칼럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA GRADE, GE Healthcare)을 사용하여 pH 6.2에서 250 mM 글리신, 10 mM 히스티딘, 1% 수크로오스, 0.01% Tween-20, 50 μM 중아황산나트륨 제형 버퍼로 교환된 버퍼였다. 투석을 Slide-a-Lyzer 투석 카세트 (ThermoScientific 10,000 MWCO)을 이용하여 25 ℃에서 4시간 동안 동일한 버퍼에서 수행하였다.
상기 정제된 접합체 (반응식 3의 [6])는 항체당 1.4 분자의 화합물 A가 연결된 평균 (Q-ToF 질량 분광분석법을 통해, 도 6), >98% 모노머 (크기 배제 크로마토그래피를 통해), <2% 유리 약물 (아세톤 침전된 역상 HPLC 분석을 통해), 및 0.14 mg/mL의 최종 단백질 농도 (huMov19-NTS#1 항체에 대한 몰 흡광 계수 ε280=201400 M-1cm-1을 이용하여 UV-Vis를 통해)를 갖는 것으로 나타났다.
실시예 7 T47D 세포상의 N-말단 Ser 접합체의 결합은 대조군과 대등하다
N-말단 Ser-약물 접합체 (SERIMab ADC)의 결합 친화도를 이전에 세포당 ~ 1×105 엽산 수용체 알파 (FR-α) 항원이 결합된 것으로 나타난, T47D 세포를 이용하여 분석하였다. 인간화된 단클론성 항체 huMOV19는 FRα에 특이적으로 결합한다.
결합 친화도를 평가하기 위해, 약 100 μl/웰의 ADC 또는 대조군 항체 (예를 들면, 비접합된 원상태 huMOV19, 또는 M9346A)를 2반복으로 약 3×10-8 M의 개시 농도로 96-웰 플레이트 (Falcon, 둥근바닥)에서 FACS 버퍼 (1% BSA, 1× PBS)에서 희석한 다음, 4 ℃에서 FACS 버퍼에서 연속 3배 희석하였다. 인간 유방암 세포주 T47D 세포를 열-불활성화된 10% FBS (Life Technologies), 0.1 mg/mL 겐타마이신 (Life Technologies) 및 0.2 IU 소 인슐린/mL (Sigma)이 보충된 RPMI-1640 (Life Technologies)에서 성장시키고, PBS에서 1회 세척한 후, 베르센 (Versene; Life Technologies)으로 제거하였다. 그리고 나서, T47D 세포를 성장 배지 (상기 참고)에 재현탁시켜 트립신을 중화시키고, 쿨터 계수기 상에서 계수하였다. 그리고 나서, 세포를 차가운 FACS 버퍼에서 2회 세척하고, 세척 사이에 1200 rpm에서 5분 동안 원심분리하였다.
약 100 μl/mL의 2×104 세포/웰을 ADC, 항체 또는 FACS 버퍼만을 함유하는 웰에 부가하고, 4 ℃에서 2시간 동안 배양하였다. 배양 후, 세포를 이전과 같이 원심분리하고 200 μL/웰 차가운 FACS 버퍼에서 1회 세척하였다. 그리고 나서, 세포를 4 ℃에서 40분 동안 200 μL/웰 FITC-접합된 염소 항-인간-IgG-Fcγ 2차 항체 (포함된 대조군은 염색되지 않은 세포 및 2차 항체만으로 염색된 세포였음)로 염색하고, 원심분리하고, 200 μL/웰 차가운 PBS-D에서 1회 세척하였다. 세포를 200 μL/웰 1% 포름알데하이드/ PBS-D에서 고정시키고 4 ℃에서 보관하였다.
보관 후, 접합체 또는 항체의 세포 표면 염색을 FACS Calibur (BD Biosciences) 상에서 유세포측정을 이용하여 검출하였다. 기하 평균을 그래프패드 프리즘을 사용하여 ADC 또는 항체의 로그 농도에 대해 플롯팅하고 EC50을 비-선형 4-파라미터 로지스틱 회귀 분석을 통해 계산하였다. 도 8을 참고한다.
또한 (1) Ab당 평균 2개 분자의 화합물 A를 갖는 huMOV19-NTS#2-링커1-화합물 A (“SeriMab-sDGN462”로도 알려짐); (2) huMOV19 당 2.4개 분자의 화합물 A의 평균을 갖는, huMOV-19 상의 라이신 잔기의 ε-아미노 그룹에 설포-SPDB 링커를 통해 연결된 huMOV19-sSPDB-화합물 A; (3) 비접합된 원상태 huMOV19 항체 (M9346A); 및 (4) 조작된 N-말단 Ser을 갖는 비접합된 조작된 huMOV19-NTS#2 항체를 이용하여 유사한 실험을 수행하였다. 도 7a를 참고한다.
도 7a 및 7b에 나타난 바와 같이, SERIMAb ADC(들)는 비접합된 항체 (M9346A) 대조군과 유사하게 표적 항원을 발현하는 T47D 세포의 표면에 결합하였다. 예를 들면, 도 7b의 EC50 값을 참고한다. 도 8A 및 8B에 나타난 유사한 실험에서 실질적으로 동일한 결과가 얻어졌다. 이들 실험은 항원 결합이 N-말단 세린 잔기에서의 접합 과정에 의해 영향을 받지 않는다는 것을 입증한다.
유사한 결과가 또한 huMOV19-NTS#2-D8 접합체에 대해 관찰되었다. 상기 접합체는 비접합된 대조군 (M9346A 항체) 및 비접합된 조작된 huMOV19-NTS#2 항체 (또는 SeriMab)와 유사하게 표적 항원을 발현하는 T47D 세포의 표면에 결합하였다. 도 23을 참고한다.
실시예 8 KB 자궁경부암 세포주의 huMOV19NTS#2-링커1-화합물 A의 세포독성 평가
이 실험은 조작된 N-말단 Ser에의 부위-특이적 항체 접합이 항체당 예측가능하고 신뢰할 수 있는 약물 부하를 제공할뿐만 아니라 놀랍게도 Lys 측쇄에 연결된 항체를 갖는 접합체에 비해 상기 수득된 ADC 접합체에게 더 높은 효력을 부여한다.
100 μl/웰의 각 ADC를 3반복으로 3.5x10-9 M 내지 3.5x10-8 M의 시작 농도로 96-웰 플레이트 (Corning, 편평한 바닥)에서 열-불활성화된 10% FBS (Life Technologies) 및 0.1 mg/ml 겐타마이신 (Life Technologies)이 보충된 RPMI-1640 (Life Technologies)에서 희석하고 주위 온도에서 상기 배지에서 3배 연속 희석하였다. 열-불활성화된 10% FBS (Life Technologies) 및 0.1 mg/ml 겐타마이신 (Life Technologies)이 보충된 EMEM (ATCC)에서 성장한 KB 세포 (구강 상피성 종양)를 PBS에서 1회 세척하고, 0.05% 트립신-EDTA (Life Technologies)를 이용하여 제거하였다. 시험한 다른 세포는 열-불활성화된 10% FBS (Life Technologies) 및 0.1 mg/ml 겐타마이신 (Life Technologies)이 보충된 RPMI-1640 (Life Technologies)에서 성장한 NCI-H2110 (NSCLC) 및 T47D (유방 상피성)였다. T47D 배지는 또한 0.2 IU/ml 소 인슐린이 보충되었다. 모든 세포를 성장 배지 (상기 참고)에 재현탁시켜 트립신을 중화시키고 쿨터 계수기 상에서 계수하였다. 100 μl/ml의 1000-2000 세포/웰을 ADC 또는 배지만을 함유하는 웰에 부가하고 1 μM 차단 huMOV19 항체와 함께 그리고 상기 항체 없이 5일간 5% CO2를 갖는 37 ℃ 배양기에서 배양하였다. 총 부피는 200 μl/웰이다. 배양 후, 20 μl/웰 WST-8 (Dojindo)을 부가하여 세포 생존력을 분석하고 2시간 동안 발달시켰다. 흡광도를 450 및 620 nm에서 플레이트 판독기 상에서 판독하였다. 620 nm에서의 흡광도를 450 nm에서의 흡광도에서 차감하였다. 배지만을 함유하는 웰에서의 백그라운드를 보정된 흡광도로부터 추가로 차감하였고 처리되지 않은 세포의 생존 분획 (SF)을 엑셀로 계산하였다. ADC 농도 (M) 대SF의 XY 그래프를 그래프 패드 프리즘을 이용하여 생성하였다.
도 9a의 데이터는 화합물 A가 조작된 N-말단 Ser에 연결될 수 있고, 항체 분자 당 정확히 2분자의 화합물 A를 갖는 ADC를 산출한다는 것을 보여준다. 그에 반해, Lys 측쇄를 통해 동일한 huMOV19 항체에 연결된 화합물 A는 항체당 2.4개 분자의 화합물 A의 평균을 갖는 ADC를 산출하였고, 이는 상이한 수의 연결된 화합물 A를 갖는 ADC의 상대적으로 불균질한 집단을 시사한다.
도 7a 및 7b는 사용된 연결 (조작된 N-말단 Ser를 통해, 또는 천연 Lys 측쇄를 통해)과 관계없이, 수득한 ADC가 비접합된 항체와 비교하여 항원에 대해 본질적으로 동일한 결합 친화도를 갖는다는 것을 앞서 보여주었다.
그러나, Lys-접합된 ADC에서의 더 높은 약물 부하에도 불구하고 (즉, 2.4 대2.0 화합물 A), N-말단 Ser 연결을 갖는 ADC는 항체 농도에 기초하여 라이신-접합된 ADC보다 약 3배 더 강력하며, 화합물 A 농도에 기초하여 약 5배 더 강력하다. 도 9a의 측정된 IC50 값을 참고한다.
더욱이, 과잉의 (1 μM) 비접합된 huMOV19의 부가는 관찰된 사멸 효과를 차단할 수 있는데, 이는 관찰된 세포독성이 특이적이며 표적 세포 상의 그의 항원에 결합하는 huMOV19에 좌우된다는 것을 제시할 뿐만 아니라 두 가지 ADC가 표적 세포에 대해 동일한 항원-독립적 활성을 갖는다는 것을 제시한다.
유사한 결과가 또한 huMOV19에 접합된 상이한 세포독소 및 N-말단 Ser 접합을 갖는 그의 조작된 버전에 대해서 얻어졌다. 도 9b의 메이탄시노이드 접합체를 참고한다. N-말단 Ser 연결을 갖는 ADC는, Lys-접합된 ADC가 더 높은 약물 부하를 가진다는 사실에도 불구하고, Lys-접합된 ADC와 유사한 효력을 갖는다 (3.5 대2).
huMOV19에 대하여 상기 기재된 바와 같은 유사한 결과가 또한 관련없는 항체에 대해 관찰되었다.
실시예 9.
DM4-SPDB-하이드라자이드 및 DM4-설포-SPDB-하이드라자이드는 DM4-SPDB 또는 DM4-설포-SPDB를 상기에 나타낸 바와 같은 하이드라진과 반응시킴으로써 제조될 것이다.
실시예 10.
앞서 기재된 설포-SPDB (US 특허 번호 8,236,319)는 하이드라진과 반응되어 설포-SPDB-하이드로진 링커를 얻을 수 있다.
DMA 중 하이드라진 (0.015 ml, 0.242 mmol)의 0.24M 용액을 DMA 중 1-((2,5-디옥소피롤리딘-1-일)옥시)-1-옥소-4-(피리딘-2-일디설파닐)부탄-2-설폰산 (25.9 mg, 0.0635 mmol)의 0.06M 용액을, 급속 교반하면서 실온에서 적가했다. 40 min 동안 아르곤 하에서 50 ºC에서 교반한 후, 조 반응 혼합물을, 30 min에 걸쳐 아세토니트릴 구배 5-25%을 사용하여 0.1% 포름산을 함유하는 탈이온수로 용출하는 역상 HPLC (C18, 21.2 x 250mm)로 정제했다. 원하는 생성물을 함유하는 분획을 조합하고, 냉동시키고 동결건조하여 3.1 mg (15% 수율)의 원하는 생성물을 백색 고형물로서 얻었다. MS (M+1)+ 실측치; 324.05, 계산치: 324.01.1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 2.13 - 2.26 (m, 2H), 2.82 - 2.91 (m, 2H), 3.52 (t, J = 7.8, 6.1 Hz, 1H), 7.24 (t, J = 7.3, 4.7 Hz, 1H), 7.76 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.83 (t, 1H), 8.45 (d, J = 3.5, 2.0 Hz, 1H).
수득한 화합물은 알데하이드 또는 케톤-보유 세포 결합제와 반응될 수 있고 그 다음 하이드라자이드 연결은 임의로 환원될 수 있다. 수득한 링커는 알데하이드 또는 케톤-보유 세포 결합제와 반응될 수 있고 그 다음 티올 보유 메이탄시노이드 예컨대 DM1 또는 DM4와 반응되어 콘주게이트를 얻는다.
대안적으로 링커가 세포 결합제와 반응되면 수득한 분자의 반응성 디설파이드는 시약 예컨대 디티오트레이톨 또는 TCEP을 사용하여 환원되어 티올을 얻을 수 있고, 이것은 메이탄시노이드-보유 반응성 디설파이드 예컨대 PyS-DM1 또는 PyS-DM4 와 반응될 수 있다.
실시예 11.
Figure 112023025074489-pat00157
Boc-하이드록실 아민은 1,3-디브로모프로판과 그 다음 티오아세트산과 반응될 것이다. 티올 및 아민은 NaOH 그 다음 HCl에 의한 처리로 탈보호될 것이고 그 다음 티올 모이어티는 2,2’-디피리딜디설파이드와 반응되어 W1을 얻을 것이다. DM4는 W1와 반응되어 W2를 얻을 것이다. 1,3-디브로모프로판는 다른 대칭 디브로마이드에 의해 치환되어 DM과 디설파이드 모이어티 사이의 다른 길이의 스페이서를 얻을 수 있다.
링커 W1은 또한, 케톤 또는 알데하이드-보유 세포 결합제를 유도하기 위해 사용되어 반응성 디설파이드를 도입할 수 있다. 옥심은 임의로 또한 환원될 수 있다. 방법은 티올 보유 메이탄시노이드 예컨대 DM1 또는 DM4의 완벽한 콘주게이션에의 부가를 허용할 것이다.
실시예 12.
Figure 112023025074489-pat00158
하기에서 앞서 기재된 바와 같이 제조된 알콕시 아미노아세틸-Cys(S-2-NO2-페닐)--OH (1 mg, 2.88 μmol): Org. Biomol. Biochem. 2006, 4: 1313 - 1419) 및 DM4 (6 mg, 7.7 μmol)을 DMF (250 μL) 및 탈이온수 (25 μL) 에서 용해시키고 자석으로 1시간 동안 교반했다. 반응 혼합물을, 30 min에 걸쳐 20 mL/min에서 95% 0.1% 포름산을 함유하는 탈이온수 및 5% - 95%의 아세토니트릴 구배를 갖는 21 x 150 mm C18 칼럼을 사용하여 HPLC 정제했다. 원하는 생성물을 수집하고, 냉동시키고 동결건조하여 대략 0.25 mg (9 % 수율)의 원하는 생성물을 백색 고형물로서 얻었다. MS (M + H)+ 실측치 972.5; 계산치972.3; MS (M - 1) 실측치 970.4; 계산치970.3.
실시예 13.
설포-SPDB-하이드라진 (1 mg, 3.1 μmol) 및 DM4 (4 mg, 5.1 μmol)을 DMF (300 μL) 및 1/4th 포화된 수성 중탄산나트륨 (100 μL) 에서 용해시키고 자석으로 1시간 동안 교반했다. 반응 혼합물을, 30 min에 걸쳐 20 mL/min에서 95% 0.1% 포름산을 함유하는 탈이온수 및 5% - 95%의 아세토니트릴 구배를 갖는 21 x 150 mm C18 칼럼을 사용하여 HPLC 정제했다. 원하는 생성물을 수집하고, 냉동시키고 동결건조하여 대략 1 mg (19% 수율)의 원하는 생성물을 백색 고형물로서 얻었다. MS (M + H)+ 실측치 992.6, 계산치992.3; MS (M -1) 실측치 990.5, 계산치990.3.
실시예 14.
Boc 보호된 Ala-Ala-Ala-OH (화합물 25) 은 N-하이드록시석신이미드 및 EDC 커플링제와의 반응, 그 다음 하이드라진와의 반응에 활성화될 수 있다. 수득한 하이드라자이드 (화합물 26) 은 FMoc-Cl와의 반응에 의해 보호된 FMoc일 수 있고 Boc 보호 그룹는 희석 HCl 와의 반응에 의해 제거될 수 있다. 수득한 화합물 27 은 DIPEA의 존재에서 1,4-디옥산-2,6-디온와 반응되어 화합물 28을 얻을 수 있다. DM’는 EDC을 사용하여 화합물 28에 커플링될 수 있고 FMoc 보호 그룹는 모폴린과의 반응에 의해 제거되어 원하는 화합물 29을 얻을 수 있다.
반응식는 Boc-Ala-Ala-Ala-OH (화합물 25)을 Boc 보호된 아미노 산 또는 펩타이드로 치환하여 일반화될 수 있고 글루타르산 무수물은 또한, 상이한 사이클릭 무수물에 의해 또는 모노 보호된 이산으로 치환되어 DM’과 펩타이드 모이어티 사이의 다른 스페이서를 얻을 수 있다.
실시예 15.
Boc 보호된 H-Gly-Gly-Gly-OH (화합물 8) 은 9-플루오렌메탄올 DIC 커플링제 및 디메틸아미노피리딘 (DMAP) 와의 반응에 의해 보호될 수 있다. 수득한 화합물 30 은 트리플루오로아세트산으로 Boc 탈보호되어 화합물 31을 얻을 수 있고, 이것은 1,4-디옥산-2,6-디온와 반응되고, 그 다음 DIC 및 DMAP의 존재에서 트리메틸실릴에탄올와 보호 반응되어 화합물 32를 얻을 수 있다. 그 다음 화합물 32은 모폴린으로 처리되어 9-플루오렌메탄 에스테르을 탈보호하여 화합물 33을 얻을 수 있다. 그 다음 DM’은 EDC 커플링제 및 HOBT로 화합물 33에 커플링되어 화합물 34를 얻을 수 있다. 화합물 34의 트리메틸 실릴에탄 에스테르는 테트라부틸 암모늄 플루오라이드에 의한 처리로 제거될 수 있고, 그 다음 N-하이드록시 석신이미드로 반응하여 카복실산 그룹을 활성화하고, 그 다음 하이드라진과 반응하여 원하는 화합물 35을 얻을 수 있다.
상기 방법은 Boc-Gly-Gly-Gly-OH을 선택된 Boc-보호된 아미노 산 또는 펩타이드로 치환하여 일반화될 수 있다. 1,4-디옥산-2,6-디온은 또한, 상이한 사이클릭 무수물에 의해 또는 모노 트리메틸실릴에탄 보호된 이산로 치환되어 DM’과 펩타이드 모이어티 사이의 다른 스페이서를 갖는 본 발명의 다른 화합물을 얻을 수 있다.
실시예 16.
Boc 보호된 Ala-Ala-Ala-OH (화합물 25)는 N-하이드록시석신이미드 (NHS) 및 EDC와의 반응으로, 그 다음 1,2-디아미노에탄과의 반응으로 활성화되어 화합물 36을 얻을 수 있다. 화합물 36은 EDC 커플링제의 존재에서 FMoc-아미녹시아세트산으로 처리되고 그 다음 희석 HCl에 의한 Boc 탈보호될 수 있다. 수득한 화합물 37은 1,4-디옥산-2,6-디온과 반응되어 화합물 38을 얻을 수 있다. EDC의 존재에서 DM’과 화합물 38과의 커플링 그 다음 모폴린에 의한하이드록실 아민 탈보호로 최종 생성물, 화합물 39을 얻을 것이다.
유사한 방법는 Boc 보호된 아미노 산 또는 Boc 보호된 펩타이드와 함께 사용되어 상이한 펩타이드 측쇄를 갖는 본 발명의 화합물을 얻을 수 있다. 1,4-디옥산-2,6-디온은 또한, 상이한 사이클릭 무수물에 의해 또는 모노 보호된 이산으로 치환되어 DM’과 펩타이드 모이어티 사이의 다른 스페이서를 얻을 수 있다.
실시예 17.
Figure 112023025074489-pat00163
화합물 36b 의 합성
Figure 112023025074489-pat00164
Boc-Gly3-OH (25b, 6 g, 20.7 mmol)을 DMF(40 mL) 에서 용해시키고 이것에, 자석 교반 막대를 수용하는 플라스크에서 N-하이드록시석신이미드 (2.4 g, 20.7 mmol) 및 EDC (4 g, 20.7 mmol)을 부가했다. 반응을 자석으로 1시간 동안 교반하고, 그 다음 실온에서 격렬한 자석 교반과 함께 DMF (20 mL) 중 에틸렌 디아민 (8 g, 133 mmol)의 자석 교반된 용액에 서서히 부었다. 디에틸 에테르 (200 mL)을 부가하면 고형물이 침전되었다. 플라스크를 그 다음 와동시키고 초음파처리 배쓰에서 15분 동안 정치했다. 물질을 진공 여과하고, 그 다음 실온에서 진공 하에서 건조시키고 그 다음 DMF (20 mL) 에서 용해시키고 하기를 사용하여 3회 정제했다: 5 % 아세토니트릴의 구배로 첫 번째 5 min 동안 그 다음 5 % - 95% 아세토니트릴의 선형 구배로 5 내지 32 min 동안, 100 mL/min에서 0.2% 포름산 및 아세토니트릴을 함유하는 탈이온수로 용출하는 220 nm 검출을 갖는 50 mm x 220 mm 부하 및 락(lock) C18 칼럼 상에서 대략 동등 주입 용량. 순수한 원하는 생성물을 함유하는 분획을 조합하고, 냉동시키고 동결건조하여 4.5 g (65% 수율)의 원하는 생성물 36b을 얻었다.
화합물 36c의 합성
Figure 112023025074489-pat00165
Fmoc 아미녹시아세트산 (187 mg, 0.60 mmol)을 무수 DMF (1 mL) 에서 용해시키고 이것에 TBTU (243 mg, 0.76 mmol) 및 DIPEA (95 μL, 0.54 mmol)을 부가하고 3 min 동안 자석 교반했다. 무수 DMF (1 mL) 중 Boc-Gly3NH-(CH2)2-NH2 (200 mg, 0.54 mmol)의 용액을 그 다음 자석 교반과 함께 부가했다. 1 h 후, 반응을, 10% 아세토니트릴의 구배로 첫 번째 5 min 동안 그 다음 10% - 95% 아세토니트릴의 선형 구배로 5 내지 32 min 동안, 0.2% 포름산 및 아세토니트릴을 함유하는 탈이온수로 용출하는 254 nm 검출로 27 mm x 220 mm 부하 및 락(lock) C18 칼럼 40 mL/min 상에서 직접적으로 정제했다. 순수한 원하는 생성물을 함유하는 분획을 조합하고, 냉동시키고 동결건조하여 60 mg (17 % 수율)의 원하는 생성물 36c을 얻었다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 1.37 (s, 9H), 3.15 (dt, J = 10.0, 5.6 Hz, 4H), 3.58 (d, J = 6.0 Hz, 2H), 3.67 (d, J = 5.8 Hz, 2H), 3.74 (d, J = 5.6 Hz, 2H), 4.16 (s, 2H), 4.26 (t, J = 6.7 Hz, 1H), 4.43 (d, J = 6.7 Hz, 2H), 7.01 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 7.33 (td, J = 7.4, 1.2 Hz, 2H), 7.42 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 7.68 (d, J = 7.4 Hz, 2H), 7.85 (d, J = 6.0 Hz, 1H), 7.89 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 7.97 (d, J = 5.7 Hz, 1H), 8.05 (t, J = 5.6 Hz, 1H), 8.10 (t, J = 6.0 Hz, 1H). HRMS 계산치649.2592, 실측치 649.2588.
화합물 37b의 합성
Figure 112023025074489-pat00166
25 mL 둥근바닥 플라스크에 Boc-Gly3-NH(CH2)2NHCOCH2-O-NH-FMoc (76 mg, 0.122 mmol)을 충전하고 물 (10 mL) 중 95/5 트리플루오로아세트산의 용액에서 용해시켰다. 반응을 실온에서 1시간 동안 자석으로 교반했다. 반응 용적을 진공에서 감소시키고 조 잔류물을 메틸렌 클로라이드 및 톨루엔 (10 mL)의 1: 1 혼합물에서 재용해시키고 그 다음 진공에서 농축했다. 공증발을 3회 반복하고 수득한 생성물 (37b)을 추가 정제없이 사용했다. MS (m + H+) 실측치; 527.4, 계산치527.2; (m-1).
화합물 38b의 합성
Figure 112023025074489-pat00167
10 mL 둥근바닥 플라스크에 t-부틸 탈보호된 H-Gly3-NH(CH2)2NHCOCH2ONH-Fmoc (64 mg, 0.122 mmol) 및 DMF (3 mL)을 충전했다. 용액을 디글라이콜산 무수물 (15.52 mg, 0.134 mmol)으로서 교반하고 N,N-디이소프로필에틸아민 (0.042 mL, 0.243 mmol)을 순차적으로 부가했다. 플라스크에 격막을 구비하고 실온에서 1시간 동안 자석으로 교반했다. 원하는 생성물을 0.1% 포름산을 함유하는 탈이온수 및 아세토니트릴 5 - 95%의 선형 구배로 용출하는 세미-분취 C18 HPLC으로 25 min에 걸쳐 단리했다. 생성물 함유 분획을 조합하고 진공에서 농축하고 40 mg (0.062 mmol, 51.2% 수율)의 원하는 생성물 (38b)을 백색 잔류물로서 얻었다. MS (m + H+) 실측치; 643.4, 계산치643.2; (m-1) 실측치; 641.2, 계산치: 641.2.
화합물 38c의 합성
Figure 112023025074489-pat00168
10 mL 둥근바닥 플라스크에 에틸 아세테이트 (1.500 mL) 중 May-NMA (5.06 mg, 7.78 μmol)의 용액을 충전했다. N-(3-디메틸아미노프로필)-N′-에틸카보디이미드 하이드로클로라이드 (EDC, 3.73 mg, 0.019 mmol) 및 N,N-디이소프로필에틸아민 (3.39 μl, 0.019 mmol)을, 그 다음 N,N-디메틸포름아미드 (1.5 mL) 중 HOCOCH2OCH2CO-Gly3NH(CH2)2NHCOCH2ONH-FMoc(10 mg, 0.016 mmol)의 용액을 부가했다. 반응을 1시간 동안 실온에서 교반했다. 반응 용적을 진공에서 반까지 감소시키고 생성물을 0.1% 포름산을 함유하는 탈이온수 및 아세토니트릴 5 - 95%의 선형 구배로 용출하는 세미-분취 C18 HPLC으로 25 min에 걸쳐 단리했다. 생성물 함유 분획을 조합하고, 냉동시키고 동결건조하여 원하는 생성물 (38c) 1.4 mg (13 % 수율)을 백색 고형물로서 얻었다. MS (m + Na+) 실측치; 1296.7, 계산치: 1296.5.
화합물 39b 의 합성
Figure 112023025074489-pat00169
May-NMA-COCH2OCH2CO-Gly3NH(CH2)2NHCH2ONH-Fmoc (1.4 mg, 1.098 μmol)을 N,N-디메틸포름아미드 (1.5 mL) 에서 용해시키고 교반 바가 구비된 3 mL 유리 바이알로 이동시켰다. 용액을 20% v/v 모폴린 (300 μL, 3.44 mmol)을 부가하면서 교반했다. 반응은, 완료된 것으로 결정될 때까지 실온에서 교반하면서 진행된다. 조 반응 혼합물을 3회 주사에 걸쳐 세미-분취 C18 HPLC로 정제했다. 생성물 함유 분획을 조합하고, 신틸레이션 바이알로 이동시키고, 드라이아이스 및 아세톤의 배쓰에서 냉동시키고 동결건조하여 1.1 mg (95% 수율)의 원하는 생성물 (39b)을 얻었다. MS (m + Na+) 실측치; 1074.7, 계산치: 1074.4; 고-분해 MS (m+H)+ 실측치; 1052.4331, 계산치: 1052.4338; (m + Cl-) 실측치; 1086.5, 계산치: 1086.4.
실시예 18.
Figure 112023025074489-pat00170
Fmoc-Gly 3 -MayNMA
100 mL 플라스크에 에틸 아세테이트 (19 mL) MayNMA (200mg, 0.308mmol)의 용액을 충전했다. 반응 플라스크를 진공에서 농축하여 EtOAC를 제거했다. 물질을 DMSO (10 mL) 에서 재-용해시키고, FMoc-Gly3-OH (165 mg, 0.400mmol), HOBT (12.25mg, 0.080mmol), EDC (77mg, 0.400mmol) 및 DIPEA (53.7μL, 0.308mmol) 으로 처리했다. 반응을 실온에서 아르곤 하에서 진행되도록 했다. 1 시간 후, 반응을, 35 mL/min에서 C18 고성능 Gold 30g 칼럼을 사용하는 Combiflash Rf 200i를 사용하여 정제했다. 20 min에 걸쳐 0.1% 포름산을 함유하는 탈이온수 및 5 - 95%의 아세토니트릴 구배로 용출했다. 원하는 생성물을 함유하는 분획을 조합하고, 냉동시키고 동결건조하여 원하는 생성물 296 mg (93% 수율)을 얻었다. MS (M)+ 실측치 1043.4, 계산치: 1043.4
Figure 112023025074489-pat00171
H-Gly 3 -MayNMA
FMoc-Gly3-MayNMA (37.7mg, 0.036mmol)을 DMSO (5 mL) 중 20% 모폴린 에서 용해시키고 자석으로 1시간 동안 교반했다. 반응을, 35 mL/min에서 C18 고성능 Gold 30 g 칼럼을 사용하는 Combiflash Rf 200i를 사용하여 정제했다. 25 min에 걸쳐 아세토니트릴 구배 2-95%와 함께 0.1% 포름산을 함유하는 탈이온수로 용출했다. 원하는 생성물을 함유하는 분획을 조합하고, 냉동시키고 동결건조하여 원하는 생성물 20 mg (75 % 수율)을 얻었다. LRMS (M)+ 실측치 821.40, 계산치: 821.34
Figure 112023025074489-pat00172
Fmoc-아미녹시-Gly 3 -MayNMA
H-Gly3-MayNMA (15 mg, 0.018mmol)을 DMSO (2 mL) 에서 용해시키고, 이것에 FMoc-아미녹시아세트산 (11.44mg, 0.037mmol), DIPEA (3.19μL, 0.018mmol) 및 EDC (7.0mg, 0.037mmol)을 부가했다. 1 시간 후, 조 물질을, 21.2mL/min의 유속으로 XB-C18 21.2x150mm, 5μm 칼럼을 사용하는 세미-분취 C18 HPLC로 정제했다. 0.1% 포름산을 함유하는 탈이온수 및 3 min 동안 5% 아세토니트릴 그 다음5 - 25 min 동안 5% - 95% 아세토니트릴의 선형 구배로 용출했다. 원하는 생성물을 함유하는 분획을 조합하고, 냉동시키고 동결건조하여 2 mg (8% 수율)의 원하는 생성물을 얻었다. MS (M+Na)+ 실측치 1138.6, 계산치: 1138.4
Figure 112023025074489-pat00173
아미녹시-Gly 3 -MayNMA
FMoc-아미녹시-Gly3-MayNMA (2 mg, 18 μmol)을, 실온에서 2시간 동안 자석 교반과 함께 DMSO (1 mL) 중 20% 모폴린의 용액으로 처리했다. 반응을, 21.2 mL/min의 유속으로 XB-C18 21.2x150mm, 5μm 칼럼을 사용하는 세미-분취 C18 HPLC로 정제했다. 0.1% 포름산을 함유하는 탈이온수 및 5분 동안 5% 아세토니트릴 그 다음 5 min - 25 min 동안 아세토니트릴 5% - 95%의 선형 구배로 용출했다. 원하는 생성물을 함유하는 분획을 즉시 수집하고, 냉동시키고 동결건조하여 아미녹시-Gly3-MayNMA (0.2mg, 0.224μmol)을 얻었다. LRMS (M+Na)+ 실측치 916.60, 계산치: 916.36; HRMS (M+Na)+ 실측치; 916.3466; 계산치: 916.3466.
실시예 19.
Figure 112023025074489-pat00174
FMoc 보호된 아미녹시 MayNMA
100mL 플라스크에 에틸 아세테이트 (35 mL) 중 MayNMA (150mg, 0.231mmol)을 충전했다. 반응 플라스크를 진공에서 농축하여 EtOAC를 제거했다. 물질을 DMF (5 mL) 에서 재-용해시키고, 자석 교반과 함께 FMoc-아미녹시아세트산 (72.3 mg, 0.231 mmol) 그 다음 EDC (44.2 mg, 0.231 mmol) 으로 처리했다. 반응을 아르곤 하에서 실온에서 4시간 동안 진행되도록 하고 그 다음 21.2mL/min의 유속으로 XB-C18 21.2x150mm, 5μm 칼럼을 사용하는 세미-분취 C18 HPLC로 정제했다. 0.1% 포름산을 함유하는 탈이온수 및 첫 번째 5 min 동안 5%의 아세토니트릴 구배 그 다음 5 min 내지 25 동안 5% - 95%로 용출했다. 원하는 생성물을 함유하는 분획을 조합된 냉동시키고 동결건조하여 24.2mg (11 % 수율)의 원하는 생성물을 얻었다. LRMS (M)+ 실측치 945.35, 계산치: 945.36
Figure 112023025074489-pat00175
아미녹시-MayNMA
FMoc 보호된 아미녹시 MayNMA (24.2mg, 0.026mmol)을 DMF (2 mL) 중 20% 모폴린으로 처리했다. 1 시간 후, 자석 교반과 함께 반응을, 21.2mL/min의 유속으로 XB-C18 21.2x150mm, 5μm 칼럼을 사용하는 세미-분취 C18 HPLC로 정제했다. 0.1% 포름산을 함유하는 탈이온수 및 5분 동안 5%의 아세토니트릴 구배 그 다음25 min에 걸쳐 5% - 95%의 선형 구배로 용출했다. 원하는 생성물을 함유하는 분획을 조합하고, 냉동시키고 동결건조하여 10mg (54.0% 수율)의 원하는 생성물을 얻었다. MS (M)+ 실측치; 723.3, 계산치: 723.3; 고-분해 MS 실측치; 723.2995; 계산된: 723.3003.
실시예 20. 암컷 SCID 마우스에서 NCI-H2110 NSCLC 이종이식에 대한 단일-용량 SeriMab 부위-특이적인 huMOV19NTS#2-링커1-화합물 A의 항종양 활성
암컷 CB.17 SCID 마우스(6 주령)을 Charles River Laboratories로부터 받았다. 마우스를, 오른쪽 옆구리에서 피하 주사에 의해 0.1 ml 50% 매트리겔/무혈청 배지에서 현탁된 1 x 107 NCI-H2110 종양 세포로 예방접촉했다. .종양 부피가 대략 100 mm3 (접종 후 7일)에 도달했을 때, 동물을 6 마리 마우스 각각의 4개의 그룹으로 중양 부피에 따라 무작위했다. 마우스는 1 일째 (접종 후 8일)에 화합물 A 농도를 기준으로 한 10, 25 또는 50 μg/kg에서 비히클 대조군 (0.2 ml/마우스) 또는 huMOV19NTS#2-링커1-화합물 A ([6], 반응식 1) 콘주게이트 단일 IV 투여를 수용했다.
종양 크기는 캘리퍼스를 사용하여 3차원에서 매주 2회 내지 3회 측정되었다. 종양 부피는 식 V = 길이 × 폭 × 높이 × ½를 사용하여 mm3로 표현되었다. 마우스는 종양 부피가 50% 이상까지 감소되었을 때 부분 퇴행 (PR), 촉지가능한 종양기 검출되지 않았을 때 완벽한 종양 퇴화 (CR)를 갖는 것으로 간주되었다. 종양 부피는 StudyLog 소프트웨어로 결정되었다.
종양 성장 저해 (T/C 값)는 하기 식을 사용하여 결정되었다:
T/C (%) = 처리된 것의 중앙 종양 부피 / 대조군의 중앙 종양 부피 × 100.
종양 부피은, 비히클 대조군의 종양 부피가 1000 mm3의 예정된 크기에 도달했을 때 처리된 것 (T) 및 비히클 대조군 (C) 그룹에 대해 동시에 결정되었다. 무종양 마우스 (0 mm3)를 포함하여 각 처리된 그룹의 매일 중앙 종양 부피가 결정되었다. NCI 표준에 따라, T/C ≤ 42%는 항종양 활성의 최소 수준이다. T/C <10%는 높은 항종양 활성 수준으로 간주되었다.
도 13, 콘주게이트는 25 μg/kg 및 50 μg/kg 용량에서 고활성이다.
실시예 21. 단백질 A 수지를 갖는 친화도 포착에 의한 이화대사물 풍부
엽산 수용체 α (FRα)를 발현시키는 KB 세포를 5 x T150 조직 배양판에서 배양했다. 포화 양의 FRα표적화 huMOV19NTS#2-링커1-화합물 A (또는 SeriMab-sDGN462) 콘주게이트를 24시간 동안 37 ℃에서 5% CO2로 완충된 가습된 인큐베이터에서 KB 세포와 함께 인큐베이션했다. 24 시간 후, 세포-유출 이화대사물을 함유하는 배지를 수확하고 하기 검정을 위해 풀링했다.
포화 양의 항-인돌리노벤조디아제핀 화합물 항체를 4 ℃에서 밤새 인큐베이션에 의해 단백질 A 수지의 슬러리에 결합했다. 1 mL의 전-결합된 단백질 A/항-벤조디제핀 화합물 항체 복합체를 말단간 회전자 상의 25 mL의 배지로 몇 시간 동안 인큐베이션했다. 수지를 1000 rpm에서 부드럽게 원심분리하고, 상청액을 경사분리했다. IGN 이화대사물에 결합된 단백질-A/항-IGN 항체 수지를 PBS (5x)로 세정하여 배지 구성요소를 제거했다. 이화대사물을 아세톤 추출로 유기상에 방출했다. 이화대사물을 유기 용액이 완전히 증발될 때까지 밤새 진공-건조했다. 이화대사물을 물 중 20% 아세토니트릴로 재구성하고, LC-MS로 분석했다.
엽산 수용체 α (FRα)를 발현시키는 KB 세포를 5 x T150 조직 배양판에서 배양했다. huMOV19-NTS#2-아미노옥시-아세틸-MayNMA (“SeriMab-May”로도 공지됨) 콘주게이트를 표적으로 하는 포화 양의 FRα를 하기 조건에서 KB 세포로 인큐베이션했다: 24시간 동안 37 ℃에서 5% CO2로 완충된 가습된 인큐베이터에서 .24 시간 후, 세포-유출 이화대사물을 함유하는 배지를 수확하고 하기 검정을 위해 풀링했다.
포화 양의 항-메이탄신 항체를 밤새 4 ℃에서 인큐베이션에 의해 단백질 A 수지의 슬러리에 결합했다. 1 mL의 전-결합된 단백질 A/항-메이탄신 항체 복합체를 몇 시간 동안 말단간 회전자 상의 20 mL의 배지로 인큐베이션했다. 수지를 1000 rpm에서 부드럽게 원심분리하고, 상청액을 경사분리했다. 메이탄시노이드 이화대사물에 결합된 단백질-A/항-메이탄신 항체 수지를 PBS (5x)로 세정하여 배지 구성요소를 제거했다. 이화대사물을 아세톤 추출로 유기상에 방출했다. 이화대사물을 유기 용액이 완전히 증발될 때까지 밤새 진공-건조했다. 이화대사물을 물 중 20% 아세토니트릴로 재구성하고, LC-MS로 분석했다.
MS 분석
huMOV19-NTS#2 콘주게이트의 약물 분포 프로파일을, Waters LCT ESI-TOF을 사용하여 온전한 질량 분석으로 특성화했다. 콘주게이트의 트립신분해 펩타이드 맵핑을 Waters QTOF을 사용하여 LC/MS/MS로 수행했다 (샘플은 감소되고, 알킬화되고, 그 다음 트립신 소화됨). 세포 이화대사물은 Q-Exactive 고해상도 질량 spec (Thermo)을 사용하는 UHPLC/MS/MS로 확인되었다. 추출된 이온-크로마토그램 (XIC)을 사용하여 표적 세포 이화대사물을 확인 및 특성화했다. 특징적인 메이신 (547 m/z) 및 DGN (286 m/z) 질량 서명을 함유하는 모든 이화대사물 종이 확인되었다.
SeriMab-sDGN462 및 SeriMab-May 콘주게이트 둘 모두는 24 h 처리 후 표적 세포로부터 유출된 이화대사물을 생산했다. 말단 카복실산 함유 DGN 및 메이탄시노이드 대사물은 항체 중쇄 상의 N-말단 세린 또는 인접한 발린 잔기의 단백질분해와 일치한다. 이들 이화대사물은, 시스테인 또는 라이신 콘주게이션으로부터의 기대된 대사물은 그 본성이 쯔비터이온이기 때문에 SeriMab 콘주게이션 플랫폼에 대해 특이적이다. sDGN462 콘주게이트는 티올 그룹 (DGN-아닐린)의 디설파이드 절단 (sDGN462) 및 자기-희생와 일치된 추가의 이화대사물을 생성했다. 이들 대사물은 또한, 라이신 연결된 DGN462 콘주게이트로부터 생성된다.
실시예 22. 방관자 활성
50 μl/웰의 콘주게이트 각각을, 섹터플리케이트에서 1 e-10 M 및 4 e-10 M의 농도에서 96-웰 플레이트 (Falcon, 둥근바닥)에서 열-불활성화된 10% FBS (Life Technologies), 0.1 mg/ml 겐타마이신 (Life Technologies) 및 βME (Life Technologies)로 보강된 RPMI-1640 (Life Technologies)에서 희석했다. 재조합 FOLR1(FR1#14) 또는 노(no) 발현 벡터 (친계)을 발현시키는300.19 세포 (마우스) 둘 모두를 혈구계산기에서 카운트했다. 50 μl/ml의 1000 FR1#14 세포/웰을 ADC 또는 배지 단독으르 함유하는 웰들에 부가하고, 50 μl/ml의 2000 친계 세포/웰을 ADC 또는 배지 단독을 함유하는 웰들에 부가하고 FR1#14 및 친계 세포 둘 모두를 ADC 또는 배지 단독을 함유하는 웰들에 함께 부가했다. 모든 플레이트를 37 ℃ 인큐베이터에서 5% CO2로 4 일 동안 인큐베이션했다. 총 용적은 150 μl/웰였다. 인큐베이션 후, 세포 생존력을 75 μl/웰 세포 Titer Glo (Promega)의 부가로 분석하고 30분 동안 발달되도록 했다. 발광을 발광분석기에서 판독하고 배지 단독을 함유하는 웰들에서 백그라운드를 모든 값으로부터 공제했다. 각 세포 치료의 평균의 막대 그래프를 Graph Pad Prism를 사용하여 그래프화했다.
도 16, 라이신 또는 N-말단 세린를 통해 접합된 디설파이드 연결된 sDGN462 ADC는 근위 항원 음성 세포의 강력한 방관자 사멸을 보여준다.
유사한 결과는 세린-연결된 D8 콘주게이트 에 대해 관측되었다. 참고 도 27.
실시예 23. 화합물 D8의 합성
Figure 112023025074489-pat00176
단계 1: tert-부틸 하이드록시카바메이트 (1.490 g, 11.19 mmol)을 무수 DMF (22.38 mL) 에서 용해시켰다. 2-(3-브로모프로필)이소인돌린-1,3-디온 (3g, 11.19 mmol) 및 탄산칼륨 (3.09 g, 22.38 mmol)을 부가하고 반응을 밤새 실온에서 교반했다. 그것을 냉수로 희석하고 EtOAc로 추출했다. 유기물을 염수로 세정하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고 조 잔류물을 실리카겔 플래시 크로마토그래피 (EtOAc/Hex, 구배, 0% 내지 45%)로 정제하여 화합물 8a을 점착성 고형물 (2.41g, 67% 수율)로서 얻었다. LCMS = 4.99 min (8 min 방법). 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.86-7.83 (m, 2H), 7.73-7.77 (m, 2H), 7.28 (bs, 1H), 3.92 (t, 2H, J = 6.0 Hz), 3.82 (t, 2H, 6.9Hz), 2.05-1.98 (m, 2H), 1.47 (s, 9H).
Figure 112023025074489-pat00177
단계 2: 화합물 8a (2.41g, 7.52 mmol)을 무수 DCM (18.81 mL) 에서 용해시키고 빙욕에서 0 ℃로 냉각했다. DCM (9.40 ml) 및 TFA (9.40 ml)의 새롭게 혼합된 용액을 부가하고 빙욕을 제거했다. 반응을 실온에서 1시간 동안 교반하고 DCM으로 희석하고 포화된 중탄산나트륨으로 세정했다. 유기 층을 염수로 세정하고, 건조시키고, 여과하고 농축하여 화합물 8b (1.32g, 80% 수율)을 얻었다. 조 물질을 추가 정제없이 사용했다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.85-7.82 (m, 2H), 7.72-7.69 (m, 2H), 3.78 (t, 2H, J = 7.0 Hz), 3.72 (t, 2H, 6.0Hz), 1.99-1.93 (m, 2H).
Figure 112023025074489-pat00178
단계 3: 화합물 8b (100mg, 0.454 mmol)을 무수 DCM (4.5 mL) TEA (127 μl, 0.908 mmol) 에서 용해시키고 2,5-디옥소피롤리딘-1-일 (2-(트리메틸실릴)에틸) 카보네이트 (177 mg, 0.681 mmol)을 부가하고 반응을 실온에서 밤새 교반했다. 반응을 DCM으로 희석하고, 염수로 세정하고, 건조시키고, 여과하고, 그리고 증발시켰다. 조 잔류물을 실리카겔 플래시 크로마토그래피 (EtOAc/Hex, 구배, 0% 내지 40%)로 정제하여 화합물 8c (148mg, 89% 수율)을 얻었다. LCMS = 5.91 min (8 min 방법). 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.86-7.83 (m, 2H), 7.73-7.69 (m, 2H), 7.39 (bs, 1H), 4.26-4.20 (m, 2H), 3.94 (t, 2H, J = 6.0 Hz), 3.83 (t, 2H, 6.9Hz), 2.06-1.98 (m, 2H), 1.05-0.98 (m, 2H), 0.04 (s, 9H).
Figure 112023025074489-pat00179
단계 4: 화합물 8c (148mg, 0.406 mmol)을 에탄올 (2.7mL) 에서 용해시키고 완전히 가용성이 될 때까지 교반했다. 하이드라진 (63.7 μl, 2.030 mmol)을 부가하고 반응을, 백색 침전물이 1 시간 내에 급속히 형성될 때까지 실온에서 교반했다. 반응을 셀라이트를 통해 여과하고 추가의 에탄올 로 린스했다. 여과물을 증발시키고 실리카겔 플래시 크로마토그래피 (A= MeOH, B= EtOAc 구배, 100% 내지 10%)로 정제했다. 생성물 분획을 질량으로 검출하고 증발시켜 화합물 8d을 점착성 고형물 (67.5mg, 71% 수율)로서 얻었다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 4.27-4.21 (m, 2H), 3.98 (t, 2H, J = 5.9 Hz), 2.92-2.87 (m, 2H), 1.85-1.77 (m, 2H), 1.06-0.99 (m, 2H), 0.04 (s, 9H).
Figure 112023025074489-pat00180
단계 5: (S)-2-(((벤질옥시)카보닐)아미노)프로판산 (5 g, 22.40 mmol) 및 (S)-tert-부틸 2-아미노프로파노에이트 하이드로클로라이드 (4.48 g, 24.64 mmol)을 무수 DMF (44.8 mL) 에서 용해시켰다. EDC·HCl (4.72 g, 24.64 mmol), HOBt (3.43 g, 22.40 mmol), 및 DIPEA (9.75 mL, 56.0 mmol)을 부가했다. 반응을 아르곤 하에서, 실온에서, 밤새 교반했다. 반응 혼합물을 디클로로메탄으로 희석하고 그 다음 포화된 염화암모늄, 포화된 중탄산나트륨, 물, 및 염수로 세정했다. 유기 층을 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축했다. 원유을 실리카겔 크로마토그래피 (헥산/에틸 아세테이트)를 통해 정제하여 화합물 2a (6.7 g, 85% 수율)을 얻었다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.38-7.31 (m, 5H), 6.53-6.42 (m, 1H), 5.42-5.33 (m, 1H), 5.14 (s, 2H), 4.48-4.41 (m, 1H), 4.32-4.20 (m, 1H), 1.49 (s, 9H), 1.42 (d, 3H, J = 6.8 Hz), 1.38 (d, 3H, J = 7.2 Hz).
Figure 112023025074489-pat00181
단계 6: 화합물 2a (6.7 g, 19.12 mmol)을 메탄올 (60.7 mL) 및 물 (3.03 mL) 에서 용해시켰다. 용액을 아르곤으로 5 분 동안 퍼지했다. 탄소상 팔라듐 (습성, 10%) (1.017 g, 0.956 mmol)을 서서히 부가했다. 반응을 밤새 수소 분위기 하에서 교반했다. 용액을 셀라이트를 통해 여과하고, 메탄올로 린스하고 농축했다. 그것을 메탄올 및 아세토니트릴과 함께 공비증류하고 수득한 오일을 직접적으로 고진공 상에서 두어서 화합물 2b (4.02 g, 97% 수율)을 얻었고, 이것을 직접적으로 다음 단계에서 사용했다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.78-7.63 (m, 1H), 4.49-4.42 (m, 1H), 3.55-3.50 (m, 1H), 1.73 (s, 2H), 1.48 (s, 9H), 1.39 (d, 3H, J = 7.2 Hz), 1.36 (d, 3H, J = 6.8 Hz).
Figure 112023025074489-pat00182
단계 7: 화합물 2b (4.02 g, 18.59 mmol) 및 모노 메틸아디페이트 (3.03 mL, 20.45 mmol)을 무수 DMF (62.0 mL) 에서 용해시켰다. EDC·HCl (3.92 g, 20.45 mmol), HOBt (2.85 g, 18.59 mmol) 및 DIPEA (6.49 mL, 37.2 mmol)을 부가했다. 혼합물을 밤새 실온에서 교반했다. 반응을 디클로로메탄/메탄올 (150 mL, 5: 1) 로 희석하고 포화된 염화암모늄, 포화된 중탄산나트륨, 및 염수로 세정했다. 그것을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 제거했다. 화합물을 아세토니트릴 (5x)과 함께 공비증류하고, 그 다음 고진공 상에서 35 ℃에서 펌핑하여 화합물 2c (6.66 g, 100% 수율)을 얻었다. 조 물질을 다음 단계에서 정제 없이 사용했다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 6.75 (d, 1H, J = 6.8 Hz), 6.44 (d, 1H, J = 6.8 Hz), 4.52-4.44 (m, 1H), 4.43-4.36 (m, 1H), 3.65 (s, 3H), 2.35-2.29 (m, 2H), 2.25-2.18 (m, 2H), 1.71-1.60 (m, 4H), 1.45 (s, 9H), 1.36 (t, 6H, J = 6.0 Hz).
Figure 112023025074489-pat00183
단계 8: 화합물 2c (5.91 g, 16.5 mmol)을 TFA (28.6 mL, 372 mmol) 및 탈이온수 (1.5 mL)에서 실온에서 3 시간 동안 교반했다. 반응 혼합물을 아세토니트릴과 함께 농축하고 고진공 하에서 두어서 조물질 화합물 2d을 점착성 고형물 (5.88 g, 100% 수율)로서 얻었다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.21 (d, 1H, J = 6.8 Hz), 6.81 (d, 1H, J = 7.6 Hz), 4.69-4.60 (m, 1H), 4.59-4.51 (m, 1H), 3.69 (s, 3H), 2.40-2.33 (m, 2H), 2.31-2.24 (m, 2H), 1.72-1.63 (m, 4H), 1.51-1.45 (m, 3H), 1.42-1.37 (m, 3H).
Figure 112023025074489-pat00184
단계 9: 화합물 2d (5.6 g, 18.52 mmol)을 무수 디클로로메탄 (118 mL) 및 무수 메탄올 (58.8 mL) 에서 용해시켰다. (5-아미노-1,3-페닐렌)디메탄올 (2.70 g, 17.64 mmol) 및 EEDQ (8.72 g, 35.3 mmol)을 부가하고 반응을 실온에서, 밤새 교반했다. 용매를 제거하고 에틸 아세테이트를 부가했다. 수득한 슬러리를 여과하고, 에틸 아세테이트로 세정하고 진공/N2 하에서 건조시켜 화합물 2e (2.79 g, 36% 수율)을 얻었다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 9.82 (s, 1H), 8.05, (d, 1H, J = 9.2 Hz), 8.01 (d, 1H, J = 7.2 Hz), 7.46 (s, 2H), 6.95 (3, 1H), 5.21-5.12 (m, 2H), 4.47-4.42 (m, 4H), 4.40-4.33 (m, 1H), 4.33-4.24 (m, 1H), 3.58 (s, 3H), 2.33-2.26 (m, 2H), 2.16-2.09 (m, 2H), 1.54-1.46 (m, 4H), 1.30 (d, 3H, J = 7.2 Hz), 1.22 (d, 3H, J = 4.4 Hz).
Figure 112023025074489-pat00185
단계 10: 화합물 2e (0.52 g, 1.189 mmol) 및 탄소 테트라브로마이드 (1.183 g, 3.57 mmol)을 무수 DMF (11.89 mL) 에서 용해시켰다. 트리페닐포스핀 (0.935 g, 3.57 mmol)을 부가하고 반응을 아르곤 하에서 4 시간 동안 교반했다. 반응 혼합물을 DCM/MeOH (10:1)로 희석하고 물 및 염수로 세정하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 그리고 농축했다. 조 물질을 실리카겔 크로마토그래피 (DCM/MeOH)로 정제하여 화합물 2f (262 mg, 39% 수율)을 얻었다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 10.01 (s, 1H), 8.11 (d, 1H, J = 6.8 Hz), 8.03 (d, 1H, J = 6.8 Hz), 7.67 (s, 2H), 7.21 (s, 1H), 4.70-4.64 (m, 4H), 4.40-4.32 (m, 1H), 4.31-4.23 (m, 1H), 3.58 (s, 3H), 2.34-2.26 (m, 2H), 2.18-2.10 (m, 2H), 1.55-1.45 (m, 4H), 1.31 (d, 3H, J = 7.2 Hz), 1.21 (d, 3H, J = 7.2 Hz).
Figure 112023025074489-pat00186
단계 11: 디브로마이드 화합물 2f nd IGN 모노머 화합물 I-1을 DMF에서 용해시켰다. 탄산칼륨을 부가하고 RT에서 밤새 교반했다. 물을 반응 혼합물에 부가하여 생성물을 침전시켰다. 슬러리를 RT에서 5분 동안 교반하고 그 다음 여과하고 진공/N2 하에서 1시간 동안 건조시켰다. 조 물질을 실리카겔 크로마토그래피 (디클로로메탄/메탄올)로 정제하여 화합물 2g (336 mg, 74% 수율)을 얻었다. LCMS = 5.91 min (15 min 방법). MS (m/z): 990.6 (M + 1)+.
Figure 112023025074489-pat00187
단계 12: 디이민 화합물 2g을 1,2-디클로로에탄에서 용해시켰다. NaBH(OAc)3을 반응 혼합물에 부가하고 RT에서 1시간 동안 교반했다. 반응을 CH2Cl2 로 희석하고 포화 aq NH4Cl 용액 으로 켄칭했다. 층들을 분리하고 염수로 세정하고, Na2SO4 상에서 건조시키고 농축했다. 조 물질을 RPHPLC (C18 칼럼, 아세토니트릴/물)을 통해 정제하여 화합물 2h (85.5 mg, 25% 수율)을 얻었다. LCMS =6.64 min (15 min 방법). MS (m/z): 992.6 (M + 1)+.
Figure 112023025074489-pat00188
단계 13: 메틸에스테르 화합물 2h을 1,2-디클로로에탄 에서 용해시켰다. 트리메틸스탄난올을 반응 혼합물에 부가하고 80 ℃에서 밤새 가열했다. 반응 혼합물을 rt로 냉각하고 물로 희석했다. 수성 층을 1 M HCl 로 pH ~ 4로 산성화했다. 혼합물을 CH2Cl2/MeOH (10:1, 3 x 20 mL) 로 추출했다. 조합된 유기 층들을 염수로 세정하고 Na2SO4 상에서 건조시키고 농축했다. 조 물질을 실리카 플러그를 통과시켜서 화합물 2i (48.8 mg, 80% 수율)을 얻었다. LCMS = 5.89 min (15 min 방법). MS (m/z): 978.6 (M + 1)+.
Figure 112023025074489-pat00189
단계 14: 화합물 2i (30mg, 0.031 mmol)을 무수 DCM (613 μl) 에서 현탁시켰다. 무수 DMF을, 용액이 맑아질 때가지 적가했다. 화합물 8d (21.57 mg, 0.092 mmol), EDC·HCl (29.4 mg, 0.153 mmol), 및 DMAP (0.749 mg, 6.13 μmol)을 부가하고 반응을 실온에서 1시간 동안 교반했다. 그것을 DCM/MeOH 10:1 로 희석하고 그 다음 물로 세정했다. 수성 층을 DCM/MeOH 10:1로 추출하고 조합된 유기물을 건조시키고 농축하여 화합물 8e (49mg)을 얻었고, 이것을 추가 정제없이 사용했다. LCMS = 5.94 min (8 min 방법). MS (m/z): 1194.4 (M + 1)+.
Figure 112023025074489-pat00190
단계 15: 화합물 8e (49mg, 0.041 mmol)을 THF (820 μl) 에서 용해시키고 반응을 빙욕에서 0 ℃로 냉각했다. TBAF (205 μl, 0.205 mmol)을 부가하고 반응을 15분 동안 교반한 후, 빙욕을 제거했다. 완료시까지 실온에서 교반했다. 반응을 0 ℃로 냉각하고, 포화된 염화암모늄으로 켄칭하고 DCM/MeOH 10:1 로 추출했다. 유기물을 염수로 세정하고, 황산나트륨으로 건조시키고 증발시켰다. 조 물질을 RPHPLC (C18 칼럼, 아세토니트릴/물)을 통해 정제하여 화합물 D8 (17.6 mg, 54% 수율, 2 단계에 걸쳐)을 얻었다. LCMS =5.1 min (8 min 방법). MS (m/z): 1050.4 (M + 1)+.
실시예 24. 화합물 D9의 합성
Figure 112023025074489-pat00191
단계 1: 화합물 9a (17mg, 0.016 mmol)을 DCM (328 μl) 에서 용해시켰다. 화합물 8d (5.76 mg, 0.025 mmol) 및 DIPEA (5.71 μl, 0.033 mmol)을 실온에서 부가하고 반응을 완료시까지 교반했다. 그것을 10:1 DCM: MeOH로 희석하고 염수로 세정했다. 유기물을 건조시키고 농축하여 화합물 9b을 얻었고, 이것을 직접적으로 사용했다.
단계 2: 화합물 D9을 실시예 23에서 화합물 D8 와 유사하게 제조했다. 조 물질을 RPHPLC (C18 칼럼, 아세토니트릴/물)을 통해 정제하여 화합물 D9 (5 mg, 31% 수율, 2 단계에 걸쳐)을 얻었다. LCMS = 5.68 min (8 min 방법). MS (m/z): 1012.5 (M + 1)+.
실시예 25. huCD123-6 항체의 SeriMab 콘주게이트의 제조
a) N-말단 항체 콘주게이션 - 2-단계 접근법
huCD123-6Gv4.6/7S3 항체 ([1] (하기 도에서 보여진 반응식 3 에서 ): 5; PBS 중 3mg/mL, pH7.4)을 5 mM 수성 나트륨 퍼아이오데이트로 처리했다 (50 당량, 25 ℃, 30 분). 그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 통해 아세트산나트륨 버퍼, pH5.0로 버퍼 교환하였다.
수득한 용액을 4-아미노펜에틸 알코올 (DMA [N,N-디메틸아세트아미드] 중 100 mM) 내지 10% v/v 공용매로 처리했다. 이종이중작용성 링커1 ([3] in 반응식 3; 5 당량)을 그 뒤에 도입하고, 반응 용기를 밀봉하고 37 ℃에서 24시간 동안 인큐베이션했다.
그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 통해 HEPES (4-(2-하이드록시에틸)-1-피페라진 에탄설폰산), pH8.5 버퍼로 버퍼 교환하였다. 그 다음 용액을 DMA (N,N-디메틸아세트아미드) 공용매 (10% v/v)로 조정하고, 설폰화된 DGN462 (sDGN462) ([5], 반응식 3; 유리 티올; 5 당량)으로 25 ℃에서 6시간 동안 처리했다.
수득한 접합체를 NAP 여과 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 이용하여 pH 6.2에서 250 mM 글리신, 10 mM 히스티딘, 1% 수크로오스, 0.01% Tween-20, 50 μM 중아황산나트륨 제형 버퍼로 버퍼 교환하였다. 투석을 Slide-a-Lyzer 투석 카세트 (ThermoScientific 10,000 MWCO)를 이용하여 25 ℃에서 4시간 동안 동일한 버퍼에서 수행하였다.
정제된 콘주게이트 ([6], 반응식 3)은 하기를 갖는 것으로 발견되었다: 항체 당 연결된 2개의 DGN462 분자의 균질 평균 (Q-ToF 질량 분광분석법을 통해), >98% 모노머 (크기 배제 크로마토그래피를 통해), <2% 유리 약물 (아세톤 침전된 역상 HPLC 분석을 통해), 및 0.18 mg/mL의 최종 단백질 농도 (huCD123-6Gv4.6/7S3 항체 에 대해 몰 소멸 계수 ε280=213320 M-1cm-1을 사용하는 UV-Vis를 통해).
b) N-말단 항체 콘주게이션 - IGN 직접적인 연결
조작된 N-말단 Ser-함유 huCD123-6Gv4.7S2 항체 (이것은 중쇄상 N-말단 세린으로 조작됨) (반응식 4 중 [1], 도 17; PBS 중 3mg/mL, pH7.4)을 5 mM 수성 나트륨 퍼아이오데이트 (50 몰 당량)으로 25 ℃에서 30분 동안 처리했다. 그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 통해 아세트산나트륨 버퍼, pH5.0로 버퍼 교환하였다.
수득한 용액을 p-페닐렌디아민 (DMA [N,N-디메틸아세트아미드] 중 100 mM) 내지 10% v/v 공용매으로 처리했다. 그 다음, 원위치 설폰화된-D8 (또는 sD8) ([3], 반응식 4; 5 몰 당량)을 그 뒤에 도입하고, 반응 용기를 밀봉하고 37 ℃에서 24시간 동안 인큐베이션했다.
그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA 등급, GE Healthcare)을 통해 pH 6.2에서 250 mM 글리신, 10 mM 히스티딘, 1% 수크로오스 버퍼로 버퍼 교환하였다. 투석을 Slide-a-Lyzer 투석 카세트 (ThermoScientific 10,000 MWCO)을 이용하여 25 ℃에서 4시간 동안 동일한 버퍼에서 수행하였다.
정제된 콘주게이트 ([4], 반응식 4)은 하기를 갖는 것으로 발견되었다: 항체에 대해 연결된 2개의 D8 분자의 균일한 평균 (Q-ToF 질량 분광분석법을 통해), >96% 모노머 (크기 배제 크로마토그래피를 통해), <3% 유리 약물 (HISEP 역상 HPLC 분석을 통해), 및 1.4 mg/mL의 최종 단백질 농도 (huCD123-6Gv4.7S2 항체 에 대해 몰 소멸 계수 ε280=213320 M-1cm-1을 사용하는 UV-Vis를 통해).
상기에서 기재된 원위치 설폰화된-D8 (또는 sD8)을 하기 절차에 따라 제조했다: 동결건조된, 백색 고형물로서 D8 시약을 DMA (N,N-디메틸아세트아미드)에서 용해시켜서 10-20 mM 모액 농도 용액을 얻었다. 신선한 중아황산나트륨 (물 중 500mM 용액, 5 몰 당량)을 부가하고 수득한 용액 4-6 시간 동안 25 oC에서 반응시킨 후 15 시간 4 ℃에서 보유했다. 추가 분취량의 신선한 중아황산나트륨 (물 중 500mM 용액, 2 몰 당량)을 도입하고 4시간 동안 25 oC에서 반응되도록 한 후, 추가 사용시까지 -80 ℃에서 보관했다.
c) N-말단 항체 콘주게이션 - CD123-6Gv4.7S3 또는 S2에 대한 2-단계 프로토콜
huCD123-6Gv4.7S3 (또는 S2 - Ab의 개략도는 S3에 대한 것이지만, 반응식은 S2에 또한 적용된다) 항체 (이것은 경쇄상 N-말단 세린으로 조작됨) (반응식 5 중 [1], 도 18; PBS 중 3mg/mL, pH7.4)을 5 mM 수성 나트륨 퍼아이오데이트 (50 몰 당량)으로 25 ℃에서 30분 동안 처리했다. 그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 통해 아세트산나트륨 버퍼, pH5.0로 버퍼 교환하였다.
수득한 용액을 4-아미노펜에틸 알코올 (DMA [N,N-디메틸아세트아미드] 중 100 mM) 내지 10% v/v 공용매로 처리했다. 이종이중작용성 링커1 ([3], 반응식 5; 5 몰 당량)을 그 뒤에 도입하고, 반응 용기를 밀봉하고 37 ℃에서 24시간 동안 인큐베이션했다.
그 다음 혼합물은 NAP 탈염 칼럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA GRADE, GE Healthcare)를 통해 PH8.5 버퍼의 HEPES(4-(2-하이드록시에틸)-1-피페라진 에탄설폰산)로 교환된 버퍼였다. 그 다음 용액을 DMA (N,N-디메틸아세트아미드) 공용매 (10% v/v)로 조정하고, 25 ℃에서 6시간 동안 설폰화된-D1 (또는 sD1) ([5], 반응식 5; 유리 티올; 5 몰 당량)로 처리했다.
수득한 콘주게이트는 NAP 여과 칼럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA GRADE, GE Healthcare)을 사용하여 pH 6.2에서 250 mM 글리신, 10 mM 히스티딘, 1% 수크로오스, 0.01% Tween-20, 50 μM 중아황산나트륨 제형 버퍼로 교환된 버퍼였다. 투석을 Slide-a-Lyzer 투석 카세트 (ThermoScientific 10,000 MWCO)을 이용하여 25 ℃에서 4시간 동안 동일한 버퍼에서 수행하였다.
정제된 콘주게이트 ([6], 반응식 5)은 하기를 갖는 것으로 발견되었다: 항체에 대해 연결된 sD1의 2.0 분자의 평균 (Q-ToF 질량 분광분석법을 통해), >96% 모노머 (크기 배제 크로마토그래피를 통해), <3% 유리 약물 (아세톤 침전된 역상 HPLC 분석을 통해), 및 0.4 mg/mL의 최종 단백질 농도 (huCD123-6Gv4.7S3 항체에 대해 몰 소멸 계수 ε280=213320 M-1cm-1을 사용하는 UV-Vis를 통해).
실시예 26 4DAR을 갖는 접합체를 제조하기 위한 N-말단 항체 접합
(a) 2단계 접근법
중쇄 및 경쇄 상의 N-말단 세린으로 조작된 huMOV19-NTS2S3 항체 (도 19에 나타난 바와 같은 반응식 6의 [1]; PBS, pH7.4 중의 3mg/mL)를 5 mM 수성 과요오드산나트륨 (50 당량, 25 ℃, 30분)으로 처리하였다. 그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 통해 아세트산나트륨 버퍼, pH5.0로 버퍼 교환하였다.
수득한 용액을 10% v/v DMA (N,N-디메틸아세트아미드) 공용매를 함유한 반응 용기에서 4-아미노펜에틸 알코올로 10 mM 농도로 처리하였다. 이후, 링커1 (반응식 6의 [3]; 10 당량)을 도입하고, 반응 용기를 밀봉하고, 37 ℃에서 24시간 동안 배양하였다.
그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 통해 HEPES (4-(2-하이드록시에틸)-1-피페라진 에탄설폰산), pH8.5 버퍼로 버퍼 교환하였다. 그리고 나서, 상기 용액을 DMA (N,N-디메틸아세트아미드) 공용매 (10% v/v)로 조절하고, 화합물 A (또는 설폰화된 DGN462 (sDGN462)) (반응식 6의 [5]; 유리 티올; 10 당량)로 25 ℃에서 6시간 동안 처리하였다.
수득한 접합체를 NAP 여과 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 이용하여 pH 6.2에서 250 mM 글리신, 10 mM 히스티딘, 1% 수크로오스, 0.01% Tween-20, 50 μM 중아황산나트륨 제형 버퍼로 버퍼 교환하였다. 투석을 Slide-a-Lyzer 투석 카세트 (ThermoScientific 10,000 MWCO)를 이용하여 25 ℃에서 4시간 동안 동일한 버퍼에서 수행하였다.
상기 정제된 접합체 (반응식 6의 [6])는 항체당 4개의 화합물 분자가 연결된 균질 평균 (Q-ToF 질량 분광분석법을 통해, 도 20), >93% 모노머 (크기 배제 크로마토그래피를 통해), <2% 유리 약물 (아세톤 침전된 역상 HPLC 분석을 통해), 및 0.1 mg/mL의 최종 단백질 농도 (huMOV19-NTS2S3 항체에 대한 몰 흡광 계수 ε280=201400 M-1cm-1를 이용하는 UV-Vis를 통해)를 갖는 것으로 나타났다.
(b) DMx 직접 연결
조작된 N-말단 Ser-함유 huMOV19-NTS2S3 항체 (도 21A의 <g1>반응식 7</g1>의 <g0>[1]</g0>; PBS, pH7.4 중의 3mg/mL)를 25 ℃에서 30분 동안 5 mM 수성 과요오드산나트륨 (50몰 당량)으로 처리하였다. 그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA Grade, GE Healthcare)을 통해 아세트산나트륨 버퍼, pH5.0로 버퍼 교환하였다.
수득한 용액을 10% v/v DMA (N,N-디메틸아세트아미드) 공용매를 함유한 반응 용기에서 4-아미노펜에틸 알코올로 10 mM 농도로 처리하였다. 그리고 나서, 아미노옥시-아세틸-MayNMA (반응식 7의 [3]; 10몰 당량)를 이후에 도입하고, 반응 용기를 밀봉하고 37 ℃에서 24시간 동안 배양하였다.
그리고 나서, 상기 혼합물을 NAP 탈염 컬럼 (Illustra Sephadex G-25 DNA 등급, GE Healthcare)을 통해 pH 6.2에서 250 mM 글리신, 10 mM 히스티딘, 1% 수크로오스 버퍼로 버퍼 교환하였다. 투석을 Slide-a-Lyzer 투석 카세트 (ThermoScientific 10,000 MWCO)을 이용하여 25 ℃에서 4시간 동안 동일한 버퍼에서 수행하였다.
상기 정제된 접합체 (반응식 7의 [4])는 항체 당 4개의 MayNMA 분자가 연결된 균질 평균 (Q-ToF 질량 분광분석법을 통해, 도 21B), >95% 모노머 (크기 배제 크로마토그래피를 통해), <2% 유리 약물 (HISEP 역상 HPLC 분석을 통해), 및 0.2 mg/mL의 최종 단백질 농도 (huMov19-NTS2S3 항체에 대한 몰 흡광 계수 ε280=201400 M-1cm-1를 이용하는 UV-Vis를 통해)를 갖는 것으로 나타났다.
실시예 27 huCD123-6 항체의 부위-특이적인 접합체의 시험관내 세포독성
다양한 IGN 화합물을 갖는 huCD123-6의 부위 특이적 접합체 (huCD123-6Rv1.1S2-SeriMab-D8)의 그의 세포 표면 상에 CD123을 발현하는 세포를 사멸하는 능력을 시험관내 세포독성 분석을 이용하여 일치하는 항체 및 탑재물을 함유하는 라이신-연결된 접합체 (huCD123-6Rv1.1-D2)와 비교하였다. 세포독성 분석을 수행하고 하기에 기재된 바와 같이 분석하였다.
세포주를 세포 공급자 (ATCC 또는 DSMZ)의 권고대로 배양 배지에서 배양하였다. 100 μl의 배양 배지 중의 2,000 내지 10,000개의 세포를 편평한 바닥 96-웰 플레이트의 각 웰에 부가하였다. 세포 표면 상의 Fc 수용체를 차단하기 위해, 배양 배지에 100 nM chKTI 항체 (동일한 아이소타입의 항체)를 보충하였다. 접합체를 3배 희석 시리즈를 이용하여 배양 배지로 희석하고, 웰당 100 μL를 부가하였다. CD123-독립적인 세포독성의 기여를 결정하기 위해, CD123 차단 항체 (100 nM의 chCD123-6 항체)를 접합체를 시험하기 전에 일부 웰에 부가하였다. 세포 및 배지를 함유하지만 접합체가 없는 대조군웰뿐만 아니라 배지만을 함유하는 웰을 각 분석 플레이트에 포함시켰다. 분석은 각 데이터 포인트에 대해 3반복으로 수행하였다. 플레이트를 4 내지 7일 동안 가습된 6% CO2 배양기에서 37 ℃에서 배양하였다. 그리고 나서, 각 웰에서의 생존 세포의 상대적인 수를 WST-8 기반 세포 계수 키트-8 (Dojindo Molecular Technologies, Inc.,Rockville, MD)을 이용하여 결정하였다. 배지 백그라운드 흡광도를 먼저 보정한 다음 각 값을 대조군 웰 (비-처리된 세포)에서의 값의 평균으로 나눔으로써 각 웰에서 세포의 분명한 생존 분획을 계산하였다. 세포의 생존 분획을 반-로그 플롯에서 접합체 농도에 대해 플롯팅하였다.
huCD123-6Rv1.1S2-SeriMab-D8 접합체는 표적 (CD123) 결합을 유지하였고, 다수의 세포주에서 적어도 라이신-연결된 huCD123-6Rv1.1-D2 접합체만큼 활성이었다. AML 세포주 SHI-1 및 HNT-34, 뿐만 아니라 CML 세포주 MOLM-1을 이용한 세포독성 분석의 몇 가지 예가 각각 도 22a-22C에 나타나 있다. 두 가지 접합체는 SHI-1 세포, HNT-34 세포, 및 MOLM-1 세포에 대해 각각 약 0.01 nM, 0.002 nM, 및 0.03 nM의 IC50 값으로 용량-의존적 방식으로 세포를 사멸하였다. 상기 접합체가 CD123 항원이 비접합된 huCD123-6 항체에 의해 차단되었을 때 상기 세포에 대해 적어도 100배 독성이 낮았기 때문에 상기 사멸은 CD123-의존적이었다.
또 다른 실험에서, 링커 1 잔기를 갖는 huCD123-6-Gv4.7S3-SeriMab-sD1 접합체 (도 18 참고)는 EOL-1 세포에서 huCD123-6Gv4.7S2(또는 S3)-SeriMab-D8 접합체와 유사한 효력을 나타낸다 (도 24).
또 다른 실험에서, huCD123 항체를 갖는 Ser-연결된 DGN462 화합물은 EOL-1 세포에 대해 더 높은 DAR을 갖는 라이신 연결된 버전보다 3배 더 높은 항원-특이적 효력을 갖는 것으로 나타났다 (도 25 참고). 라이신-연결된 접합체는 2.9의 DAR을 갖는 반면; Ser-연결된 접합체는 2.0의 DAR을 갖는다. 그에 반해, 항원-음성 Namalwa 세포가 사용되었을 때, 라이신-연결된 접합체 및 세린-연결된 접합체 모두는 유의미하게 낮은 활성을 나타내며, 이는 EOL-1 세포에서의 항원-특이적 활성을 나타낸다.
실시예 28.SeriMab-D8 접합체의 시험관내 효력
SeriMab-D8 접합체 (huMOV19-NTS#2-SeriMab-D8)의 시험관내 효력을 실시예 8에 기재된 것과 유사한 분석 프로토콜을 이용하여 KB 세포 (도 26A), Ishikawa 세포 (인간 자궁내막 선암종 세포) (도 26B), 및 HEC-1B 세포 (인간 자궁내막 선암종 세포) (도 26C) 상에서 시험하였다.
도 26A-26C에 나타난 바와 같이, SeriMab-D8 접합체는 라이신 접합체 (huMOV19-D2)와 대등한 항원-특이적 효력 및 표적 결합을 갖는다.
Figure 112023025074489-pat00192
실시예 29. 옥심 결합을 갖는 SeriMab 접합체의 생체내 안정성
친화도 포착 LC-MS
상업적으로 이용가능한 xMag-스트렙타비딘 미립자 (Biochain, CA)를 세척 버퍼 (50 mM Tris·HCl, 0.15 M NaCl, pH 8.0)로 2회 세척하고 동일한 버퍼에 그의 원래 부피로 재현탁시켰다. 그리고 나서, 바이오티닐화된 Fc-FRα (2.6 바이오틴/Fc-FRα; ~114 μg)을 스트렙타비딘 입자 (200 μL)에 부가하고 실온에서 2시간 동안 회전시켰다. 상기 비드를 세척 버퍼로 3회 세척하고 0.4% 트윈 20을 갖는 세척 버퍼에서 그의 원래 부피로 재현탁시켰다.
혈장 샘플을 2분, 1일, 및 3일에 10 mg/kg huMOV19-NTS#2-아미노옥시-아세틸-MayNMA 접합체가 투여된 CD-1 마우스로부터 수집하고, 최종 20% 세척 버퍼 및 0.2% 트윈-20과 함께 스트렙타비딘-바이오틴-FRα-Fc 입자 (샘플당 200 μL)에 부가하였다. 실온에서 2시간 동안 부드럽게 교반한 후, 수지를 1 mL 세척 버퍼로 3회 세척하고 50 μL의 0.1 M 시트르산/나트륨 시트레이트, pH 3.0, 50% 에틸렌 글리콜을 이용하여 용출시켰다. 정제된 huMOV19 접합된 종을 함유하는 용출물을 9 μL의 1 M Tris·HCl, pH 8.5로 즉시 중화시킨 다음, 앞서 기재된 바와 같이 SEC 또는 SEC-LC/MS에 의해 분석하였다(Lazar, Wang 등 2005).
도 28에 나타난 바와 같이, 옥심 결합은 마우스 순환에서 3일간 안정하다. D2로 표시된 피크는 온전한 접합체에 해당한다. A 및 B로 표시된 피크는 옥심 가수분해 및 메이신 제거로부터의 절단 생성물이다. 소량의 메이탄신 제거가 또한 라이신-연결된 Ab-SMCC-DM1 접합체로 관찰된 약 17일의 반감기로 관찰되었다.
실시예 30. 생체내 내성 연구
암컷 CD-1 마우스 (7주령)를 찰스 리버 실험실로부터 얻었다. 수령시, 동물을 연구 개시전 8일간 관찰하였다. 동물은 도착시 또는 처리 전에 질환이나 병의 징후를 보이지 않았다.
마우스를 체중별로 3개의 그룹으로 무작위추출하였다. 체중은 25.6 내지 24.1 그램 범위였고, 평균 25 그램이었다. 8마리의 마우스에게 100 및 150 μg/kg (D2 약물 용량)의 huMOV19-D2를 투여하고 2마리의 마우스에게 각각의 체중에 기초하여 200 μg/kg (D8 약물 용량)의 huMOV19-SeriMab-D8을 투여하였다. 모든 접합체는 27 게이지, ½ 인치 바늘이 장착된 1.0 ml 주사기를 이용하여 정맥내로 투여하였다. 개별적인 체중을 도 29에 표시된 시점에 측정하고 % 변화를 시간 (일)에 대해 그래프로 나타내었다. 각 선은 하나의 마우스의 체중 변화를 나타낸다. 빈사 상태이거나 또는 >20%의 체중 감소를 경험한 동물은 희생시켰는데, 이는 참을 수 없는 용량으로서 정의되기 때문이다.
도 29에 나타난 바와 같이, 라이신-연결된 huMOV19-D2는 ~ 100 μg/kg의 최대 내성 용량 (MTD)을 갖는 반면; 세린-연결된 접합체 huMOV19-SeriMab-D8는 2주 동안 체중 감소의 징후가 거의 없이 200 μg/kg에서 잘 용인되었다.
실시예 31. 화합물 D11의 합성
Figure 112023025074489-pat00193
NHS 에스테르 11a (10.5 mg, 9.47 μmol)를 DMF (0.316 mL)에 용해시켰다. 하이드라진 (1.2 μL, 38 μmol)을 실온에서 상기 용액에 부가하고 2시간 동안 교반하였다. 상기 조 반응 혼합물을 RPHPLC (C18 컬럼, CH3CN/H2O, 구배, 40% 내지 55%)에 의해 직접 정제하여 백색 고체로서 하이드라자이드 D11을 수득하였다 (6.5 mg, 68% 수율). LCMS = 4.923 분 (8분 방법). 관찰된 질량 (ESI+): 992.70 (M+H).
실시예 32.
sD11 또는 sD1을 갖는 huMOV19NTS2 항체의 접합체는 실시예 25에 기재된 유사한 절차를 이용하여 제조될 수 있다 (도 30, 31A 및 31B 참고).
본원에 인용된 모든 간행물, 특허, 특허 출원, 인터넷 사이트, 및 수탁 번호 /데이터베이스 서열 (폴리뉴클레오타이드 및 폴리펩타이드 서열 모두 포함)은 각 개별적인 간행물, 특허, 특허 출원, 인터넷 사이트, 또는 수탁 번호 /데이터베이스 서열이 구체적으로 그리고 개별적으로 참고로 포함되는 것으로 표시된 것과 동일한 정도로 모든 목적을 위해 그 전체가 참고로 포함된다.
SEQUENCE LISTING <110> ImmunoGen, Inc. <120> CONJUGATES COMPRISING CELL-BINDING AGENTS AND CYTOTOXIC AGENTS <130> 121162-02020 <150> 62/045,264 <151> 2014-09-03 <150> 62/086,986 <151> 2014-12-03 <150> 62/149,379 <151> 2015-04-17 <150> 62/186,235 <151> 2015-06-29 <160> 71 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> FR1-2.1 antibody light chain signal peptide (NCBI CAB46122) <400> 1 Met Lys Leu Pro Val Leu Leu Val Val Leu Leu Leu Phe Thr Ser Pro 1 5 10 15 Ala Ser Ser Ser 20 <210> 2 <211> 120 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> IGKV1-99*01 Accession CAB46122 <400> 2 Met Lys Leu Pro Val Leu Leu Val Val Leu Leu Leu Phe Thr Ser Pro 1 5 10 15 Ala Ser Ser Ser Asp Val Val Leu Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro 20 25 30 Val Asn Ile Gly Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Lys Ser Thr Lys Ser 35 40 45 Leu Leu Asn Ser Asp Gly Phe Thr Tyr Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys 50 55 60 Pro Gly Gln Ser Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Leu Val Ser Asn Arg Phe 65 70 75 80 Ser Gly Val Pro Asp 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130 135 140 Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln 145 150 155 160 Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser 165 170 175 Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr 180 185 190 Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser 195 200 205 Phe Asn Arg Gly Glu Cys 210 <210> 67 <211> 214 <212> PRT <213> artificial <220> <223> anti-EGFR antibody immunoglobulin light chain <400> 67 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Asp Ile Asn Asn Tyr 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln His Lys Pro Gly Lys Gly Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 His Tyr Thr Ser Thr Leu His Pro Gly Ile Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Arg Asp Tyr Ser Phe Ser Ile Ser Ser Leu Glu Pro 65 70 75 80 Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Leu Gln Tyr Asp Asn Leu Leu Tyr 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala 100 105 110 Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly 115 120 125 Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala 130 135 140 Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln 145 150 155 160 Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser 165 170 175 Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr 180 185 190 Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser 195 200 205 Phe Asn Arg Gly Glu Cys 210 <210> 68 <211> 450 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> anti-CD19 antibody immunoglobulin heavy chain <400> 68 Gln Val Gln Leu Val Gln Pro Gly Ala Glu Val Val Lys Pro Gly Ala 1 5 10 15 Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Thr Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Asn 20 25 30 Trp Met His Trp Val Lys Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile 35 40 45 Gly Glu Ile Asp Pro Ser Asp Ser Tyr Thr Asn Tyr Asn Gln Asn Phe 50 55 60 Gln Gly Lys Ala Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Met Glu Val Ser Ser Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala 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His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys 435 440 445 <210> 71 <211> 213 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> anti-Muc1 antibody immunoglobulin light chain <400> 71 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Met Ser Ala Ser Pro Gly 1 5 10 15 Glu Arg Val Thr Ile Thr Cys Ser Ala His Ser Ser Val Ser Phe Met 20 25 30 His Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Thr Ser Pro Lys Leu Trp Ile Tyr 35 40 45 Ser Thr Ser Ser Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Gly Gly Ser 50 55 60 Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Ser Met Glu Ala Glu 65 70 75 80 Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Arg Ser Ser Phe Pro Leu Thr 85 90 95 Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro 100 105 110 Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr 115 120 125 Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys 130 135 140 Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu 145 150 155 160 Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser 165 170 175 Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala 180 185 190 Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe 195 200 205 Asn Arg Gly Glu Cys 210

Claims (26)

  1. 하기 구조식으로 나타내는, 세포독성 화합물:

    또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염,
    식 중:
    LD" 및 LD"' 둘 모두는 -H이고, LD'는 하기 식으로 나타내고:

    Zd1은 부재, -C(=O)-NR9- 또는 -NR9-C(=O)-이고;
    P는 아미노산 잔기 또는 2 내지 5개의 아미노산 잔기를 함유하는 펩타이드이고, 여기서 P는 Gly-Gly-Gly, Ala-Val, Val-Ala, Val-Cit, Val-Lys, Phe-Lys, Lys-Lys, Ala-Lys, Phe-Cit, Leu-Cit, Lle-Cit, Trp-Cit, Phe-Ala, Phe-N9-토실-Arg, Phe-N9-니트로-Arg, Phe-Phe-Lys, D-Phe-Phe-Lys, Gly-Phe-Lys, Leu-Ala-Leu, Ile-Ala-Leu, Val-Ala-Val, Ala-Leu-Ala-Leu (서열식별번호: 17), β-Ala-Leu-Ala-Leu (서열식별번호: 18), Gly-Phe-Leu-Gly (서열식별번호: 19), Val-Arg, Arg-Val, Arg-Arg, Val-D-Cit, Val-D-Lys, Val-D-Arg, D-Val-Cit, D-Val-Lys, D-Val-Arg, D-Val-D-Cit, D-Val-D-Lys, D-Val-D-Arg, D-Arg-D-Arg, Ala-Ala, Ala-D-Ala, D-Ala-Ala, 및 D-Ala-D-Ala으로부터 선택되고;
    Ra 및 Rb는, 각 경우에 대해, 독립적으로 -H, (C1-C3)알킬, 또는 하전된 치환체, 또는 이온화가능 그룹 Q이며, 여기서 Q는 -SO3H 또는 -CO2H 또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염이고;
    r 및 r'는 독립적으로 1 내지 6의 정수이고;
    N과 C 사이의 이중 선 은 단일 결합 또는 이중 결합을 나타내고, 단, 그것이 이중 결합일 때 X는 부재이고 Y는 -H, 그리고 단일 결합일 때, X는 -H 및 Y는 -OH 또는 -SO3M이고;
    R1, R2, R3, R4, R1', R2', R3' 및 R4'은 모두 -H이고;
    R5 및 R9 각각은 독립적으로 -H 또는 Me이고;
    R6는 -OMe이고;
    X' 및 Y' 둘 모두는 -H이고;
    A 및 A'는 -O-이고;
    M은 H+, Na+ 또는 K+이고;
    JCB는 으로부터 선택된다.
  2. 제1항에 있어서, Ra 및 Rb 둘 모두는 H인, 화합물.
  3. 제1항에 있어서, R5 및 R9 둘 모두는 H인, 화합물.
  4. 제1항에 있어서, P는 Gly-Gly-Gly, Ala-Val, Ala-Ala, Ala-D-Ala, D-Ala-Ala, 및 D-Ala-D-Ala인, 화합물.
  5. 제1항에 있어서, 화합물은 하기 구조식으로 나타내는, 화합물:


    또는 그것의 약제학적으로 허용가능한 염, 여기서 Y는 H 또는 -SO3M이고, 그리고 M은 H+, Na+ 또는 K+이다.
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