KR102583332B1

KR102583332B1 - 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390이 과발현된 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성이 증진된 형질전환 식물체

Info

Publication number: KR102583332B1
Application number: KR1020200152332A
Authority: KR
Inventors: 서장균; 최시원
Original assignee: 서울대학교산학협력단
Priority date: 2020-11-13
Filing date: 2020-11-13
Publication date: 2023-09-25
Also published as: KR20220065611A

Abstract

본 발명은 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390이 과발현된 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성이 증진된 형질전환 식물체에 관한 것으로, Solyc07g043390이 과발현되어 잎말림 증상, 잎의 황화 증상, 식물체 위축 증상, 잎 크기 감소 증상, 과실 수확량 감소 증상 및/또는 과실 크기 감소 증상의 억제 효과를 나타내는 형질전환 식물체, 이의 종자, 상기 식물체의 제조방법을 제공한다.

Description

셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390이 과발현된 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성이 증진된 형질전환 식물체 {A transgenic plant in which cellulose synthase-like gene Solyc07g043390 is overexpressed with increased tolerance to tomato yellow leaf curl disease}

토마토 황화잎말림 바이러스(Tomato yellow leaf curl virus, TYLCV)는 제미니바이러스과 (Geminiviridae), 베고모바이러스 (Begomovirus) 속이며 바이러스 입자는 직경이 25nm의 쌍구형이다. 담배가루이에 의해 전염되는 바이러스이며, 세계적으로 58개국의 토마토 등 가지과 작물에 발생하여 문제가 되고 있는 바이러스이다. TYLCV는 2008년 5월 경상남도 통영지역 시설 재배 토마토에서 국내에서 처음으로 발생이 확인되었다. TYLCV 병징은 토마토 잎 가장자리가 황화되고 위쪽으로 오그라들고 작아지며, 식물체 전체가 위축되고 총생 되어 생육 초기에 감염되면 수확을 거의 할 수 없어 경제적 피해가 매우 크다.

이에 따라, TYLCV에 대한 저항성 유전자를 바탕으로 한 육종으로 저항성 품종들이 개발되고 있으나, 바이러스의 특성상 돌연변이의 잦은 출현으로 기존에 개발한 저항성 토마토 품종의 저항성이 단기간에 극복되고 있는 실정이다.

본 발명에서는 TYLCV 감염 시 현저하게 발현이 감소하는 유전자 중 하나인 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390를 토마토에 과발현시킴으로써 바이러스의 의한 병징 완화를 통한 내병성 향상 효과를 입증하였다.

본 발명은 상술한 과제를 해결하기 위해 안출된 것으로, 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390을 이용하여 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성이 증진된 형질전환 식물체 및 이의 종자를 제공하는 것을 목적으로 한다.

본 발명의 다른 목적은 전술한 형질전환 식물체의 제조방법을 제공하는 것이다.

상술한 과제를 해결하기 위해, 본 발명은 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390이 과발현된 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성이 증진된 형질전환 식물체를 제공한다.

본 발명의 바람직한 일실시예에 따르면, 상기 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390은 토마토 유래일 수 있다.

본 발명의 바람직한 다른 일실시예에 따르면, 상기 토마토 유래 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390는 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 것일 수 있다.

본 발명의 바람직한 또 다른 일실시예에 따르면, 상기 형질전환 식물체는 토마토 유래 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390를 포함하는, 카나마이신 저항성 선별 유전자와 꽃양배추 모자이크 바이러스 (CaMV) 35S 프로모터를 가진 pBl121 벡터로 식물세포를 형질전환하는 단계를 수행하여 제조될 수 있다.

본 발명의 바람직한 다른 일실시예에 따르면, 상기 식물체는 토마토 황화잎말림 바이러스의 기주식물일 수 있다.

본 발명의 바람직한 또 다른 일실시예에 따르면, 상기 토마토 황화잎말림 바이러스의 기주식물은 토마토일 수 있다.

본 발명의 바람직한 다른 일실시예에 따르면, 상기 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성은 다음의 a) 내지 f)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 특성을 나타낼 수 있다:

a) 잎말림 증상 억제; b) 잎의 황화 증상 억제; c) 식물체 위축 증상 억제; d) 잎 크기 감소 증상 억제; e) 과실 수확량 감소 증상 억제; 및 f) 과실 크기 감소 증상 억제.

본 발명은 또한, 전술한 형질전환 식물체의 종자를 제공한다.

나아가, 본 발명은 다음의 단계를 포함하는 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성이 증진된 형질전환 식물체의 제조방법을 제공한다:

a) 토마토 유래 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390를 포함하는, 카나마이신 저항성 선별 유전자와 꽃양배추 모자이크 바이러스 (CaMV) 35S 프로모터를 가진 pBl121 벡터로 식물세포를 형질전환시키는 단계; 및

b) 형질전환된 식물세포로부터 식물을 재분화하는 단계.

본 발명에 따른 Solyc07g043390 유전자가 과발현된 형질전환 식물체는 토마토 황화잎말림 바이러스 감염에 따른 잎말림 증상, 잎의 황화 증상, 식물체 위축 증상, 잎 크기 감소 증상, 과실 수확량 감소 증상, 및/또는 과실 크기 감소 증상이 억제되어, 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대해 증진된 내성을 나타낸다. 이에 따라, Solyc07g043390 유전자를 과발현시킨 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내병성 또는 저항성을 갖는 토마토 품종을 개발하여 토마토 생산성 증대에 기여할 수 있다.

도 1은 Solyc07g043390 유전자가 과발현된 형질전환 토마토 제조에 사용 벡터 (pBI121m) 및 Solyc07g043390 유전자 과발현을 위한 클론 (pBI121m-Solyc07g043390)의 모식도를 나타낸 것이다.
도 2는 Solyc07g043390 유전자 과발현 형질전환 토마토 T2 세대 (OE#1 및 OE#2)의 표현형을 보여주는 사진이다.
도 3은 Solyc07g043390 유전자 과발현 형질전환 토마토 T2 세대 (OE#1 및 OE#2)에서의 Solyc07g043390 유전자의 상대적 발현량에 대한 qRT-PCR 분석 결과를 나타낸 것이다.
도 4a는 Solyc07g043390 유전자 과발현 형질전환 토마토 (OE#1)와 비형질전환 토마토(NT)의 TYLCV 감염에 따른 전신 병징을 비교한 사진이다.
도 4b는 Solyc07g043390 유전자 과발현 형질전환 토마토 (OE#1)와 비형질전환 토마토(NT)의 TYLCV 감염에 따른 잎에서의 병징을 비교한 사진이다.
도 4c는 Solyc07g043390 유전자 과발현 형질전환 토마토 (OE#1)와 비형질전환 토마토(NT)의 TYLCV 감염에 따른 Solyc07g043390 유전자 발현량의 qRT-PCR 분석 결과를 그래프로 나타낸 것이다.
도 4d는 Solyc07g043390 유전자 과발현 형질전환 토마토 (OE#1)와 비형질전환 토마토(NT)의 TYLCV 감염에 따른 TYLCV 축적량에 대한 qPCR 분석 결과를 그래프로 나타낸 것이다.
도 4e는 Solyc07g043390 유전자 과발현 형질전환 토마토 (OE#1)와 비형질전환 토마토(NT)의 TYLCV 감염에 따른 식물 생장 분석 결과를 그래프로 나타낸 것이다.
도 4f는 Solyc07g043390 유전자 과발현 형질전환 토마토 (OE#1)와 비형질전환 토마토(NT)의 TYLCV 감염에 따른 과실 수확량에 대한 분석 결과를 그래프로 나타낸 것이다.
도 4g는 Solyc07g043390 유전자 과발현 형질전환 토마토 (OE#1)와 비형질전환 토마토(NT)의 TYLCV 감염에 따른 과실 크기에 대한 분석 결과를 그래프로 나타낸 것이다.

상술한 바와 같이, TYLCV에 대한 저항성 유전자를 바탕으로 한 육종으로 저항성 품종들이 개발되고 있으나, 바이러스의 특성상 돌연변이의 잦은 출현으로 기존에 개발한 저항성 토마토 품종의 저항성이 단기간에 극복되고 있는 실정이다. 이에, 본 발명자들은 TYLCV 감염 시 현저하게 발현이 감소하는 유전자 중 하나인 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390를 과발현시킨 토마토가 TYLCV 감염에 의한 병징에 대해 증진된 내병성을 나타냄을 확인하고, 이를 이용한 형질전환 토마토를 제공함으로써 상술한 문제의 해결방안을 모색하였다.

따라서, 본 발명의 제1 측면은 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390이 과발현된 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성이 증진된 형질전환 식물체에 관한 것이다.

본 발명의 형질전환 식물체에 있어서, 상기 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390는 토마토 유래일 수 있다.

본 발명의 일 구현예에 따른 형질전환 식물체에서, 상기 Solyc07g043390 유전자는 토마토 품종 에일사 크레이그 (Ailsa Craig)로부터 증폭하여 사용하였으며, 구체적인 염기서열은 다음과 같다:

TGAAAGAGCAAGAGAGGGGAGAGGGAGTGCAGAGAGAAACCACACCATGAAAAAAACCATGGAGCTCAACAAAAGCACTGTTCCACAACCTATCACCACCGTATACCGACTCCACATGTTCATCCACTCAATAATCATGCTTGCATTAATATACTACCGTGTATCTAATTTGTTTAAATTCGAAAACATTCTCAGTTTACAAGCACTTGCTTGGGCGCTCATCACTTTTGGTGAATTTAGTTTCATTCTCAAGTGGTTCTTCGGACAAGGTACTCGTTGGCGCCCCGTTGAACGAGATGTTTTCCCTGAAAACATTACTTGCAAAGATTCCGATCTACCGCCAATTGACGTAATGGTATTCACTGCCAATCCTAAGAAAGAGCCAATTGTAGATGTCATGAACACTGTGATATCCGCAATGGCTCTTGATTATCCCACCGATAAATTGGCTGTGTATCTCGCTGATGATGGAGGATGTCCATTGTCGTTGTACGCCATGGAACAAGCGTGTTTGTTTGCAAAGCTATGGTTACCTTTCTGTAGAAACTATGGAATTAAAACGAGATGCCCAAAAGCATTTTTTTCTCCGTTAGGAGATGATGACCGTGTTCTTAAGAATGATGATTTTGCTGCTGAAATGAAAGAAATTAAATTGAAATATGAAGAGTTCCAGCAGAAGGTGGAACATGCTGGTGAATCTGGAAAAATCAATGGTAACGTAGTGCCTGATAGAGCTTCGCTTATTAAGGTAATAAACGAGAGGGAGAACGAAAAGAGTGTGGATGATATGACGAAAATGCCCTTGCTAGTTTATGTATCCCGTGAAAGAAGATTCAACCGTCTTCATCATTTCAAGGGTGGATCTGCAAATGCTCTACTTCGAGTTTCTGGAATAATGAGTAATGCCCCCTATGTACTGGTGTTAGATTGTGATTTCTTCTGTCATGATCCAATATCAGCTAGGAAGGCAATGTGTTTTCATCTTGATCCAAAGCTATCATCTGATTTAGCCTATGTTCAGTTCCCTCAAGTCTTTTACAATGTCAGCAAGTCAGATATTTATGATGTCAAAATTAGACAGGCTTACAAGACAATATGGCATGGAATGGATGGTATCCAAGGCCCAGTGTTATCTGGGACTGGTTATTTTCTCAAGAGGAAAGCGTTATACACAAGTCCAGGAGTAAAAGAGGCGTATCTTAGTTCACCGGAAAAGCATTTTGGAAGGAGTAAAAGGTTTCTTGCTTCATTAGAGGAGAAAAATGGTTATGTTAAGGCAGATAAAGTCATATCAGAAGATATCATAGAGGAAGCTAAGATGTTAGCTACTTGTGCATATGAGGATGGCACACATTGGGGTCAAGAGATTGGTTATTCATACGATTGTCATTTGGAGAGCACTTTTACTGGTTATCTATTACACTGCAAAGGGTGGACATCTACTTATTTGTATCCAGACAGGCCATCTTTCTTGGGTTGTGCCCCAGTTGATATGCAAGGTTTCTCATCACAGCTCATCAAATGGGTTGCTGCACTTACACAAGCTGGTTTATCACATCTCAATCCCATCACTTATGGTTTGAGTAGTAGGATGAGGACTCTCCAATGCATGTGCTATGCCTATTTGATGTATTTCACTCTTTATTCTTGGGGAATGGTTATGTATGCTAGTGTTCCTTCTATTGGCCTTTTGTTTGACTTCCAAGTCTATCCTGAGGTACATGATCCGTGGTTTGCAGTGTATGTGATTGCTTTCATATCGACAATTTTGGAGAATATGTCGGAGTCAATTCCAGAAGGGGGATCAGTTAAAACGTGGTGGATGGAATACAGGGCATTGATGATGATGGGAGTTAGCGCAATATGGTTAGGAGGATTGAAAGCTATATATGACAAGATAGTCGGAACACAAGGAGAGAAATTGTATTTGTCGGACAAGGCAATTGACAAGGAAAAGCTCAAGAAATACGAGAAGGGCAAATTTGATTTCCAAGGAATAGGGATACTTGCTCTGCCACTGATAGCATTTTCCGTGTTGAACCTCGTAGGCTTCATTGTTGGAGCTAATCATGTCTTTATTACTATGAACTACGCAGGCGTGCTGGGCCAACTCCTCGTATCATCGTTCTTCGTCTTTGTTGTCGTCACTGTTGTCATTGATGTTGTATCTTTCTTAAAGGTTTCTTAAACATCATTATGTAATTCTCTAGTATTTAGACAGACCTACTATGTTTATCTCTCTTCAATAATAAGGCCTTCCGTCGAATTATTCAATGAAACAAAATTGTCTCTTTTGTCCCCCCTTTTGA (서열번호 1)

상기 염기서열의 변이체 또한 본 발명의 범위 내에 포함된다. 구체적으로, 상기 유전자는 서열번호 1의 염기서열과 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 보다 바람직하게는 90% 이상, 보다 더 바람직하게는 95% 이상, 가장 바람직하게는 99% 이상의 서열 상동성을 나타내는 염기서열로서 Solyc07g043390과 실질적으로 동일한 활성을 가진 단백질을 발현할 수 있다면, 제한 없이 포함될 수 있다.

본 발명의 형질전환 식물체는 상기 Solyc07g043390 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 식물세포를 형질전환시키는 단계를 수행하여 제조될 수 있다.

본 발명에서, 용어 "벡터"는 적합한 숙주 내에서 목적 단백질을 발현시킬 수 있도록 적합한 조절 서열에 작동 가능하게 연결된 상기 목적 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 염기서열을 함유하는 DNA 제조물을 의미한다.

벡터는 적당한 숙주세포 내로 형질전환된 후, 숙주 게놈과 무관하게 복제되거나 기능할 수 있으며, 게놈 그 자체에 통합될 수 있다. 본 발명에 있어서 벡터는 세균 플라스미드, 파지 (phage), 파아지, 효모 플라스미드, 식물 세포 바이러스, 포유동물 세포 바이러스, 또는 다른 벡터를 의미하며, 대체로 숙주 내에서 복제 및 안정화될 수 있는 것이라면 임의의 플라스미드 및 벡터를 제한 없이 사용할 수 있다. 상기 벡터의 중요한 특성은 복제 원점, 프로모터, 마커 유전자 및 번역 조절 요소 (translation control element)를 가지는 것이다.

상기 Solyc07g043390 유전자는 서열 및 적당한 전사/번역 조절 신호를 포함하는 발현 벡터는 당업자에 주지된 방법에 의해 구축될 수 있다. 상기 방법은 시험관내 재조합 DNA 기술, DNA 합성 기술 및 생체 내 재조합 기술 등을 포함한다. 상기 DNA 서열은 mRNA 합성을 이끌기 위해 발현 벡터 내의 적당한 프로모터에 효과적으로 연결될 수 있다. 또한 발현 벡터는 번역 개시 부위로서 리보좀 결합 부위 및 전사 터미네이터를 포함할 수 있다.

본 발명의 재조합 벡터의 바람직한 예는 아그로박테리움 투머파시엔스와 같은 적당한 숙주에 존재할 때 그 자체의 일부, 소위 T-영역을 식물 세포로 전이시킬 수 있는 Ti-플라스미드 벡터이다. 다른 유형의 Ti-플라스미드 벡터 (EP 0 116 718 B1호 참조)는 현재 식물 세포, 또는 잡종 DNA를 식물의 게놈 내에 적당하게 삽입시키는 새로운 식물이 생산될 수 있는 원형질체로 잡종 DNA 서열을 전이시키는데 이용되고 있다. Ti-플라스미드 벡터의 특히 바람직한 형태는 EP 0 120 516 B1호 및 미국 특허 제4,940,838호에 청구된 바와 같은 소위 바이너리(binary) 벡터이다. 본 발명에 따른 DNA를 식물 숙주에 도입시키는데 이용될 수 있는 다른 적합한 벡터는 이중 가닥 식물 바이러스(예를 들면, CaMV) 및 단일 가닥 바이러스, 게미니 바이러스 등으로부터 유래될 수 있는 것과 같은 바이러스 벡터, 예를 들면 비완전성 식물 바이러스 벡터로부터 선택될 수 있다. 그러한 벡터의 사용은 특히 식물 숙주를 적당하게 형질전환하는 것이 어려울 때 유리할 수 있다.

본 발명에 있어서 "형질전환"은 목적 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터를 식물체 내에 도입하여 식물체 내에서 상기 폴리뉴클레오티드가 코딩하는 단백질이 발현할 수 있도록 하는 것을 의미한다. 형질전환된 폴리뉴클레오티드는 식물체 내에서 발현될 수 있기만 한다면, 식물체의 염색체 내에 삽입되어 위치하거나 염색체 외에 위치하거나 상관없이 이들 모두를 포함할 수 있다. 또한, 상기 폴리뉴클레오티드는 목적 단백질을 코딩하는 DNA 및 RNA를 포함한다. 상기 폴리뉴클레오티드는 식물체 내로 도입되어 발현될 수 있는 것이면, 어떠한 형태로 도입되는 것이든 상관없다. 예를 들면, 상기 폴리뉴클레오티드는 자체적으로 발현되는데 필요한 모든 요소를 포함하는 유전자 구조체인 발현 카세트 (expression cassette)의 형태로 식물체에 도입될 수 있다. 상기 발현 카세트는 통상 상기 폴리뉴클레오티드에 작동 가능하게 연결되어 있는 프로모터, 전사 종결신호, 리보좀 결합부위 및 번역 종결신호를 포함할 수 있다. 상기 발현 카세트는 자체 복제가 가능한 발현 벡터 형태일 수 있다. 또한, 상기 폴리뉴클레오티드는 그 자체의 형태로 식물체에 도입되어 식물체에서 발현에 필요한 서열과 작동 가능하게 연결되어 있는 것일 수도 있으며, 이에 한정되지 않는다. 상기 목적 단백질은 구체적으로 Solyc07g043390에 의해 코딩되는 셀룰로오스 합성효소 패밀리 단백질이다.

발현 벡터는 바람직하게는 하나 이상의 선택성 마커를 포함한다. 상기 마커는 통상적으로 화학적인 방법으로 선택될 수 있는 특성을 갖는 핵산 서열로, 형질전환된 세포를 비형질전환 세포로부터 구별할 수 있는 모든 유전자가 이에 해당된다. 그 예로는 글리포세이트 (glyphosate) 또는 포스피노트리신 (phosphinothricin)과 같은 제초제 저항성 유전자, 카나마이신 (kanamycin), G418, 블레오마이신 (Bleomycin), 하이그로마이신 (hygromycin), 클로람페니콜 (chloramphenicol)과 같은 항생제 내성 유전자, aadA 유전자 등이 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.

본 발명의 재조합 벡터에서, 프로모터는 CaMV 35S, 액틴, 유비퀴틴, pEMU, MAS, 히스톤 프로모터 또는 Clp 프로모터일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. "프로모터"란 용어는 구조 유전자로부터의 DNA 업스트림의 영역을 의미하며 전사를 개시하기 위하여 RNA 폴리머라아제가 결합하는 DNA 분자를 말한다. "식물 프로모터"는 식물 세포에서 전사를 개시할 수 있는 프로모터이다. "구성적 (constitutive) 프로모터"는 대부분의 환경 조건 및 발달 상태 또는 세포 분화 하에서 활성이 있는 프로모터이다. 형질전환체의 선택이 각종 단계에서 각종 조직에 의해서 이루어질 수 있기 때문에 구성적 프로모터가 본 발명에서 바람직할 수 있다. 따라서, 구성적 프로모터는 선택 가능성을 제한하지 않는다.

본 발명의 재조합 벡터에서, 통상의 터미네이터를 사용할 수 있으며, 그 예로는 노팔린 신타아제 (NOS), 벼 α-아밀라아제 RAmy1 A 터미네이터, 파세올린 (phaseoline) 터미네이터, 아그로박테리움 투메파시엔스 (Agrobacterium tumefaciens)의 옥토파인 (Octopine) 유전자의 터미네이터, 대장균의 rrnB1/B2 터미네이터 등이 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.

본 발명의 바람직한 일 구현예에 따른 형질전환 식물체는 토마토 유래 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390를 포함하는, 카나마이신 저항성 선별 유전자와 꽃양배추 모자이크 바이러스 (CaMV) 35S 프로모터를 가진 pBl121 벡터로 식물세포를 형질전환하는 단계를 수행하여 제조된다. 상기 형질전환은 예를 들면, 아그로박테리움 튜머파시엔스 (Agrobacterium tumefiaciens)에 의해 매개될 수 있다.

본 발명의 벡터를 숙주세포 내로 주입하는 방법은 미세주입법, 칼슘포스페이트 침전법, 전기천공법, 리포좀-매개 형질감염법, DEAE-덱스트란 처리법, 및 유전자 밤바드먼트 (Bombardment) 등이 있다.

보다 구체적으로, 바이너리 벡터를 사용하는 경우, 식물체에 상기 재조합 벡터를 도입하기 위한 형질전환용 균주로는 아그로박테리움을 사용하며(Agrobacterium-mediated transformation), 이때 아그로박테리움 튜마파시엔스 (Agrobacterium tumefaciens) 또는 아그로박테리움 라이조게네스 (Agrobacterium rhizogenes)를 사용할 수 있다.

그밖에 T-DNA 부위를 포함하지 않는 벡터를 이용하는 경우에는, 전기천공법(electroporation), 입자 총법(microparticle bombardment), 폴리에틸렌 글리콜 침전법(polyethylene glycol-mediated uptake) 등이 재조합 플라스미드를 식물체로 도입하는데 이용될 수 있다.

본 발명의 바람직한 일 구현예에 따른 형질전환 식물체는 상기 형질전환된 식물세포로부터 형질전환 식물을 재분화하는 단계를 추가로 수행하여 제조된다. 형질전환 식물 세포로부터 형질전환 식물을 재분화하는 방법은 당업계에 공지된 임의의 방법을 이용할 수 있다.

형질전환된 식물세포는 전식물로 재분화되어야 한다. 캘러스 또는 원형질체 배양으로부터 성숙한 식물의 재분화를 위한 기술은 수많은 여러 가지 종에 대해서 당업계에 주지되어 있다(Handbook of Plant Cell Culture, 1-5권, 1983-1989 Momillan, N.Y.).

본 발명에서, 용어 "식물체"는 "식물" 또는 "작물"과 혼용될 수 있으며, 전체 식물, 생장 영양기관/구조(잎, 줄기 및 덩이줄기), 뿌리, 꽃 및 꽃 기관/구조 (예를 들어, 포, 꽃받침, 꽃잎, 수술, 심피, 꽃밥 및 배주), 종자 (배, 배유 및 종피), 과실, 식물 조직(유관속조직, 기본조직) 및 식물 세포(공변세포, 난세포 등)를 모두 포함하는 것일 수 있다. 구체적으로, 본 발명에서 상기 식물체는 토마토 황화잎말림 바이러스의 기주식물일 수 있으며, 바람직하게는 토마토일 수 있다.

본 발명의 바람직한 일 구현예에 따른 Solyc07g043390 과발현 형질전환 식물체는 비형질전환 식물체와 비교하여 TYLCV 감염 시 적어도 약 5배, 바람직하게는 약 6.3배 가량의 Solyc07g043390 유전자가 과발현되어, 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내병성을 나타낸다.

도 4d에서 확인되는 바와 같이, Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토와 비형질전환 토마토의 TYLCV 감염에 따른 TYLCV의 축적량은 서로 유사한 수준을 나타내어 바이러스 증식 정도에 차이가 없음을 알 수 있다. 그러나, TYLCV 감염에 따른 전신 병징, 잎에서의 병징, 식물 생장, 과실 수확량 및 과실 크기 등을 분석한 결과, 도 4a, 4b 및 4e 내지 4g에 확인되는 바와 같이, Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토는 비형질전환 토마토에 비해 위축 증상, 잎 크기 감소, 잎말림 및 잎의 황화 증상이 눈에 띄게 감소하고, 과실 크기 및 수확량도 현저하게 증가하였음을 알 수 있다. 결과적으로, Solyc07g043390 과발현을 통해 TYLCV의 증식을 억제하지는 못하지만, 바이러스 감염에 따른 병징은 효과적으로 억제하여 내병성이 향상되었음을 알 수 있다.

본 발명의 제2 측면은 전술한 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390이 과발현된 형질전환 식물체의 종자에 관한 것이다.

본 발명의 바람직한 일 구현예에 따른 Solyc07g043390 유전자 과발현 형질전환 식물체의 종자는 구체적으로 다음과 같은 방법으로 수득될 수 있다:

a) 토마토 유래 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390를 포함하는, 카나마이신 저항성 선별 유전자와 꽃양배추 모자이크 바이러스 (CaMV) 35S 프로모터를 가진 pBl121 벡터를 아그로박테리움 튜마파시엔스 LBA4404에 형질전환한다.

b) 형질전환용 균주 배양액에 토마토 떡잎 절편을 2시간 동안 담근 후 이틀간 MS 배지에서 공생배양한 후 카나마이신 배지에 옮겨 배양하며 캘러스 형성을 유도한다. 형성된 캘러스를 조직배양 방법에 따라 줄기 유도 배지 및 뿌리 유도 배지에서 순차적 배양하여, 개체를 형성하고 토양에 이식하여 1세대 종자를 수득한다.

c) 1세대 종자를 발아하여 목표 유전자의 발현량을 분석하고 발현량이 높은 개체로부터 2세대 종자를 수득한다.

본 발명의 제3 측면은 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성이 증진된 형질전환 식물체의 제조방법에 관한 것이다.

구체적으로, 상기 제조방법은 다음의 단계를 포함할 수 있다:

b) 형질전환된 식물세포로부터 식물을 재분화하는 단계.

본 발명의 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성이 증진된 형질전환 식물체의 제조방법에 있어서, 상기 a) 및 b)의 단계에 대한 구체적인 설명은 본 발명의 제1 측면에서 기술한 바와 동일하므로, 그 기재를 생략한다.

이하 본 발명을 실시예를 통해 보다 상세하게 설명한다. 단, 본 발명은 다양한 변경을 가할 수 있고 여러 가지 형태를 가질 수 있는바, 이하에서 기술하는 특정 실시예 및 설명은 본 발명의 이해를 돕기 위한 것일 뿐, 본 발명을 특정한 개시 형태에 대해 한정하려는 것이 아니다. 본 발명의 범위는 본 발명의 사상 및 기술 범위에 포함되는 모든 변경, 균등물 내지 대체물을 포함하는 것으로 이해되어야 한다.

Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토 제작

1-1. Solyc07g043390 유전자 클로닝

Solyc07g043390 과발현 토마토 형질전환을 위한 바이너리 벡터 (binary vector)로 pBI121m 벡터를 이용하였다 (도 1A). pBI121m 벡터는 T-DNA의 LB (left border)와 RB (right border) 및 CaMV의 35S 프로모터 (P35S) 하에 다중 클로닝 부위 (MCS; XbaI, KpnI, SacI)와 NOS 종결자 (NOSt) 포함하고 있으며, NOS 프로모터 (Pnos) 하에 네오마이신 포스포트랜스페라아제 (neomycin phosphotransferase II, NPTII) 유전자를 발현하여 카나마이신에 대한 저항성을 부여할 수 있어, 아그로박테리움 (agrobacterium) 매개 식물 형질전환에 이용할 수 있다.

Solyc07g043390 유전자는 토마토 품종 에일사 크레이그 (Ailsa Craig)로부터 고성능 DNA 중합효소 (High-Fidelity DNA polymerase) (NEB, USA) 및 표 1의 프라이머 쌍을 이용하여 PCR 증폭하였다. 상기 Solyc07g043390 유전자의 염기서열은 서열번호 1에 나타낸 바와 같다. 증폭된 유전자 단편은 pBI121m 벡터 (ThermoFisher, USA)의 XbaI과 KpnI 제한효소 사이트를 이용하여 클로닝 하였다. 제작한 클론은 pBI121-Solyc07g043390이라 명명하였다 (도 1).

프라이머 이름	서열 (5'→3')	서열번호
3390-Fw-XbaI	GCTCTAGATGAAAGAGCAAGAGAGGGGA	2
3390-Rv-KpnI	CAGAGGTACCTTAAGAAACCTTTAAGAAAGATACA	3

1-2. 아그로박테리움-매개 침투

실시예 1-1에서 제작된 클론 pBI121-Solyc07g043390을 동결 융해법 (freeze-thaw method)으로 아그로박테리움 균주 (Agrobacterium strain) LBA4404에 형질전환시킨 후, 카나마이신 (100 μg/μl)을 포함하는 LB 아가 플레이트 (Luria Bertani agar plate) (1.5%) 상에서 28℃에서 이틀 동안 선별되었다.

1-3. Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토 제작

상기 선별된 균주를 에일사 크레이그 (Ailsa Craig) 품종의 토마토에 형질전환시켰다. 형질전환 식물체의 제조는 공지의 아그로박테리아 형질전환법 (Tomato Transformation; Cold Spring Harb. Protoc.; 2008; doi:10.1101/pdb.prot5084)을 이용하였다. 멸균 조건에서 생장한 토마토의 떡잎 절편을 pBI121-Solyc07g043390가 형질전환된 아그로박테리움 균주의 현탁액에 2시간 동안 담근 후 물기를 빼고 MS 배지로 옮겨 이틀간 공생배양하였다. 떡잎 절편을 카나마이신 MS 배지로 옮겨 캘러스 형성을 유도하였다. 형성된 캘러스를 조직배양 방법에 따라 줄기 유도 배지 및 뿌리 유도 배지에서 순차적 배양하여, 개체를 형성하고 토양에 이식하여 1세대 종자를 얻었다. 1세대 종자를 발아하여 목표 유전자의 발현량을 분석하고 발현량이 높은 개체로부터 2세대 종자를 수득하였다. 2세대 종자를 발아하여 동형으로 형질전환된 T2 세대(OE #1 및 OE #2)를 선발하여 이 식물체를 대상으로 이후 실험을 진행하였다.

1-4. Solyc07g043390 유전자 발현량 분석

실시예 1-3에서 수득된 형질전환 토마토 (OE#1)에서의 Solyc07g043390 유전자의 발현량을 정량 분석하기 위해 qRT-PCR을 다음과 같이 수행하였다.

PureLink RNA 미니 키트 (Invitrogen, USA)를 사용하여 식물체의 하부에서 4~5 절간 (internode)의 잎으로부터 총 RNA를 분리하였으며 DNase I (NEB, UK)을 처리하였다. 첫 번째 가닥의 cDNA를 M-MulV 역전사 효소 (NEB, USA)를 사용하여 1 μg의 총 RNA로부터 합성하였다. 총 RNA는 65℃에서 5분 동안 10 μM 역방향 프라이머로 변성되었다. 역전사 반응은 42℃에서 1 시간 동안 배양되었다. qRT-PCR은 2X 실시간 PCR 스마트 믹스 (Solgent, Korea)를 사용하여 20 μl(2 μl의 희석된 cDNA, 10 μl의 실시간 믹스, 1 μl 20X EvaGreen 및 1 μM의 프라이머 쌍)의 반응 부피에서 수행되었으며, 프라이머 정보는 표 2에 나타내었다. 모든 qRT-PCR 반응은 3회 반복 수행하였으며, 데이터는 레퍼런스 유전자로 β-액틴을 사용하여 정규화하였다.

프라이머 이름	서열 (5'→3')	서열번호
3390-1390-Fw-qRT	ACATTGGGGTCAAGAGGCAA	4
3390-1529-Rv-qRT	TGGGGCACAACCCAAGAAAG	5
SlACT-Fw-qRT	GGGATGGAGAAGTTTGGTGGTGG	6
SlACT-Rv-qRT	CTTCGACCAAGGGATGGTGTAGC	7

분석 결과, 도 3에 나타난 바와 같이 비형질전환 (non-transgenic, NT) 대조구에 비하여 약 1.5배 가량 Solyc07g043390 유전자가 과발현됨을 확인할 수 있었다.

Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토의 TYLCV 내병성 향상 효과 검정

Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토의 TYLCV에 대한 내병성 향상 효과를 검정하기 위해 T2 세대 형질전환 토마토 (OE#1)에 TYLCV를 접종하였다. 바이러스 접종 후 병징의 세기, Solyc07g043390 유전자의 상대적 발현수준, 바이러스의 증식 정도 (TYLCV 축적량), 식물의 생장, 과실의 크기 및 수확량 등을 대조구와 비교 분석하였으며, 분석 결과를 도 4a 내지 4g에 나타내었다.

도 4a는 Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토 (OE #1)와 비형질전환 토마토(NT)의 TYLCV 감염 여부에 따른 전신 병징을 비교한 것으로, NT 토마토의 경우 심한 위축 증상이 나타난 반면 Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토는 TYLCV 감염 후에도 식물체 전체적인 위축 증상이 거의 나타나지 않음을 확인하였다. 도 4b는 잎에서의 병징을 비교한 것으로, NT 토마토의 경우 TYLCV 감염 후 심한 잎 크기의 감소, 잎말림, 잎의 황화 증상을 나타낸 반면, Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토는 TYLCV 감염 후에도 잎 크기가 거의 감소하지 않고, 잎의 황화 증상 잎말림 증상 또한 NT 토마토에 비해 매우 약한 수준으로 나타남을 확인하였다.

도 4c는 Solyc07g043390 발현량의 qRT-PCR 분석 결과를 비교한 것이다. qRT-PCR은 실시예 1-4와 동일하게 수행하였다. 분석 결과, NT 토마토의 경우 TYLCV 감염 후 Solyc07g043390 발현량이 현저하게 감소하였으나, Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토는 비감염 NT 토마토 (NT healthy)와 유사한 수준의 Solyc07g043390 발현 수준을 나타내었다.

도 4d는 TYLCV 축적량에 대한 qPCR 분석 결과를 비교한 것이다. TYLCV 축적량을 검출하기 위해, TYLCV DNA를 Q5 DNA 중합효소 (NEB, UK) 및 프라이머를 사용하여 PCR 증폭하였다. PCR 증폭은 95℃, 3분 변성 후, 95℃, 30초; 58℃, 30초; 및 72℃, 30초의 35 사이클을 포함한다. 프라이머 정보는 표 3에 나타내었다. 유전자 발현은 AriaMX 실시간 PCR 시스템 (Agilent, USA)으로 결정되었다.

프라이머 이름	서열 (5'→3')	서열번호
TYLCV-Fw	GGATTTCGTTGTATGTTAGC	8
TYLCV-Rv	ATGATTATATCGCCTGGTC	9

분석 결과, 도 4d에서 확인되는 바와 같이 NT 토마토와 Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토는 TYLCV 감염 시 바이러스 증식 정도에 있어서 유의미한 차이를 보이지 않았다.

도 4e는 식물 생장을 비교한 것으로, NT 토마토의 경우 TYLCV 감염 후 식물 생장이 현저하게 감소하였으나, Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토는 TYLCV 감염 후에도 식물 생장의 감소가 거의 나타나지 않음을 확인하였다.

도 4f와 4g는 토마토 수확량과 크기를 비교한 것으로, NT 토마토의 경우 TYLCV 감염 후 수확량과 크기가 모두 현저하게 감소하였으나, Solyc07g043390 과발현 형질전환 토마토는 TYLCV 감염 후에도 비감염 개체(OE#1 healthy)와 유사한 수준의 과실 수확량 및 크기를 나타내었다.

종합하면, Solyc07g043390 과발현을 통해 바이러스의 증식을 억제하지는 못하였으나, 병징의 억제를 통한 내병성 향상 효과가 유도되었음을 확인하였다.

SEQUENCE LISTING <110> Seoul National University R&DB Foundation <120> A transgenic plant in which cellulose synthase-like gene Solyc07g043390 is overexpressed with increased tolerance to tomato yellow leaf curl disease <130> 1068134 <160> 9 <170> PatentIn version 3.2 <210> 1 <211> 2309 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> cellulose synthase-like gene Solyc07g043390 <400> 1 tgaaagagca agagagggga gagggagtgc agagagaaac cacaccatga aaaaaaccat 60 ggagctcaac aaaagcactg ttccacaacc tatcaccacc gtataccgac tccacatgtt 120 catccactca ataatcatgc ttgcattaat atactaccgt gtatctaatt tgtttaaatt 180 cgaaaacatt ctcagtttac aagcacttgc ttgggcgctc atcacttttg gtgaatttag 240 tttcattctc aagtggttct tcggacaagg tactcgttgg cgccccgttg aacgagatgt 300 tttccctgaa aacattactt gcaaagattc cgatctaccg ccaattgacg taatggtatt 360 cactgccaat cctaagaaag agccaattgt agatgtcatg aacactgtga tatccgcaat 420 ggctcttgat tatcccaccg ataaattggc tgtgtatctc gctgatgatg gaggatgtcc 480 attgtcgttg tacgccatgg aacaagcgtg tttgtttgca aagctatggt tacctttctg 540 tagaaactat ggaattaaaa cgagatgccc aaaagcattt ttttctccgt taggagatga 600 tgaccgtgtt cttaagaatg atgattttgc tgctgaaatg aaagaaatta aattgaaata 660 tgaagagttc cagcagaagg tggaacatgc tggtgaatct ggaaaaatca atggtaacgt 720 agtgcctgat agagcttcgc ttattaaggt aataaacgag agggagaacg aaaagagtgt 780 ggatgatatg acgaaaatgc ccttgctagt ttatgtatcc cgtgaaagaa gattcaaccg 840 tcttcatcat ttcaagggtg gatctgcaaa tgctctactt cgagtttctg gaataatgag 900 taatgccccc tatgtactgg tgttagattg tgatttcttc tgtcatgatc caatatcagc 960 taggaaggca atgtgttttc atcttgatcc aaagctatca tctgatttag cctatgttca 1020 gttccctcaa gtcttttaca atgtcagcaa gtcagatatt tatgatgtca aaattagaca 1080 ggcttacaag acaatatggc atggaatgga tggtatccaa ggcccagtgt tatctgggac 1140 tggttatttt ctcaagagga aagcgttata cacaagtcca ggagtaaaag aggcgtatct 1200 tagttcaccg gaaaagcatt ttggaaggag taaaaggttt cttgcttcat tagaggagaa 1260 aaatggttat gttaaggcag ataaagtcat atcagaagat atcatagagg aagctaagat 1320 gttagctact tgtgcatatg aggatggcac acattggggt caagagattg gttattcata 1380 cgattgtcat ttggagagca cttttactgg ttatctatta cactgcaaag ggtggacatc 1440 tacttatttg tatccagaca ggccatcttt cttgggttgt gccccagttg atatgcaagg 1500 tttctcatca cagctcatca aatgggttgc tgcacttaca caagctggtt tatcacatct 1560 caatcccatc acttatggtt tgagtagtag gatgaggact ctccaatgca tgtgctatgc 1620 ctatttgatg tatttcactc tttattcttg gggaatggtt atgtatgcta gtgttccttc 1680 tattggcctt ttgtttgact tccaagtcta tcctgaggta catgatccgt ggtttgcagt 1740 gtatgtgatt gctttcatat cgacaatttt ggagaatatg tcggagtcaa ttccagaagg 1800 gggatcagtt aaaacgtggt ggatggaata cagggcattg atgatgatgg gagttagcgc 1860 aatatggtta ggaggattga aagctatata tgacaagata gtcggaacac aaggagagaa 1920 attgtatttg tcggacaagg caattgacaa ggaaaagctc aagaaatacg agaagggcaa 1980 atttgatttc caaggaatag ggatacttgc tctgccactg atagcatttt ccgtgttgaa 2040 cctcgtaggc ttcattgttg gagctaatca tgtctttatt actatgaact acgcaggcgt 2100 gctgggccaa ctcctcgtat catcgttctt cgtctttgtt gtcgtcactg ttgtcattga 2160 tgttgtatct ttcttaaagg tttcttaaac atcattatgt aattctctag tatttagaca 2220 gacctactat gtttatctct cttcaataat aaggccttcc gtcgaattat tcaatgaaac 2280 aaaattgtct cttttgtccc cccttttga 2309 <210> 2 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> 3390-Fw-XbaI <400> 2 gctctagatg aaagagcaag agagggga 28 <210> 3 <211> 35 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> 3390-Rv-KpnI <400> 3 cagaggtacc ttaagaaacc tttaagaaag ataca 35 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> 3390-1390-Fw-qRT <400> 4 acattggggt caagaggcaa 20 <210> 5 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> 3390-1529-Rv-qRT <400> 5 tggggcacaa cccaagaaag 20 <210> 6 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> SlACT-Fw-qRT <400> 6 gggatggaga agtttggtgg tgg 23 <210> 7 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> SlACT-Rv-qRT <400> 7 cttcgaccaa gggatggtgt agc 23 <210> 8 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> TYLCV-Fw <400> 8 ggatttcgtt gtatgttagc 20 <210> 9 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> TYLCV-Rv <400> 9 atgattatat cgcctggtc 19

Claims

토마토 유래 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390이 과발현된 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성이 증진된 형질전환 식물체로서,
상기 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성은 다음의 a) 및 b)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 특성을 나타내는 것인 형질전환 식물체:
a) 과실 수확량 감소 증상 억제; 및 b) 과실 크기 감소 증상 억제.
삭제
제1항에 있어서, 상기 토마토 유래 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390은 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 것인, 형질전환 식물체.
제1항에 있어서, 토마토 유래 셀룰로오스 합성 유전자 Solyc07g043390를 포함하는, 카나마이신 저항성 선별 유전자와 꽃양배추 모자이크 바이러스 (CaMV) 35S 프로모터를 가진 pBl121 벡터로 식물세포를 형질전환하는 단계를 수행하여 제조되는, 형질전환 식물체.
제1항에 있어서, 상기 식물체는 토마토인, 형질전환 식물체.
제1항에 있어서, 상기 토마토 황화잎말림 바이러스병에 대한 내성은 다음의 c) 내지 f)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 특성을 추가로 나타내는 것인, 형질전환 식물체:
c) 잎말림 증상 억제; d) 잎의 황화 증상 억제; e) 식물체 위축 증상 억제; 및 f) 잎 크기 감소 증상 억제.
제1항 및 제3항 내지 제6항 중 어느 한 항에 따른 형질전환 식물체의 종자.