KR102320656B1 - 아세틴 화합물의 생물학적 제조 방법 - Google Patents
아세틴 화합물의 생물학적 제조 방법 Download PDFInfo
- Publication number
- KR102320656B1 KR102320656B1 KR1020190134943A KR20190134943A KR102320656B1 KR 102320656 B1 KR102320656 B1 KR 102320656B1 KR 1020190134943 A KR1020190134943 A KR 1020190134943A KR 20190134943 A KR20190134943 A KR 20190134943A KR 102320656 B1 KR102320656 B1 KR 102320656B1
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- amino acid
- phe
- position corresponding
- leu
- acetyl transferase
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/24—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a carbonyl group
- C12P7/26—Ketones
- C12P7/28—Acetone-containing products
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1025—Acyltransferases (2.3)
- C12N9/1029—Acyltransferases (2.3) transferring groups other than amino-acyl groups (2.3.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1025—Acyltransferases (2.3)
- C12N9/1029—Acyltransferases (2.3) transferring groups other than amino-acyl groups (2.3.1)
- C12N9/1033—Chloramphenicol O-acetyltransferase (2.3.1.28)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/62—Carboxylic acid esters
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y101/00—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1)
- C12Y101/01—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1) with NAD+ or NADP+ as acceptor (1.1.1)
- C12Y101/01008—Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD+) (1.1.1.8)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y203/00—Acyltransferases (2.3)
- C12Y203/01—Acyltransferases (2.3) transferring groups other than amino-acyl groups (2.3.1)
- C12Y203/01079—Maltose O-acetyltransferase (2.3.1.79)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y301/00—Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
- C12Y301/03—Phosphoric monoester hydrolases (3.1.3)
- C12Y301/03021—Glycerol-1-phosphatase (3.1.3.21)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
- C12R2001/185—Escherichia
- C12R2001/19—Escherichia coli
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y203/00—Acyltransferases (2.3)
- C12Y203/01—Acyltransferases (2.3) transferring groups other than amino-acyl groups (2.3.1)
- C12Y203/01028—Chloramphenicol O-acetyltransferase (2.3.1.28)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y301/00—Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
- C12Y301/01—Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
- C12Y301/01006—Acetylesterase (3.1.1.6)
Abstract
본 발명은 O-아세틸 전이효소를 이용해서 글리세롤에 아세틸기를 전이시켜서 모노아세틴, 다이아세틴, 트리아세틴을 생물학적으로 제조하는 방법에 관한 것으로서, 지속가능하고 환경오염을 유발하지 않으며 안전하고 더 좋은 품질의 아세틴을 얻을 수 있는 제조 방법 및 제조용 조성물에 관한 것이다.
Description
본 발명은 아세틴 화합물의 제조 방법 및 아세틴 제조용 조성물에 관한 것이다.
아세틴(acetins)은 글리세롤(glycerol)의 수산기(-OH)에 초산기(acetyl group)가 에스터(ester) 결합을 하고 있는 물질로, 결합된 초산기의 수에 따라서 1 개가 붙은 모노아세틴(monoacetin), 2 개가 붙은 다이아세틴(diacetin), 3 개가 붙은 트리아세틴(triacetin)으로 구분한다. 트리아세틴은 글리세린 트리아세테이트(glycerin triacetate) 또는 트리글리세라이드 1,2,3-트라아세톡시프로페인(triglyceride 1,2,3-triacetoxypropane)으로도 알려져 있다.
아세틴은 향료 용매와 습윤제 등의 식품첨가물로 사용되고, 제약산업에서 보습제, 가소제 및 용제로 사용된다. 트리아세틴은 또한 가솔린의 엔진 노킹(engine knocking)을 줄이는 항노크제(antiknock agent)와 바이오디젤의 저온 및 점도 특성을 개선 할 수 있는 연료 첨가제로 사용될 수 있다. 바이오디젤 생산공정에서 다량의 부산물로 발생하는 폐글리세롤을 이용해서 바이오디젤의 연료첨가제로 활용될 수 있는 아세틴을 만드는 것은 최근 바이오리파이너리 산업분야에서 화두가 되고 있는 폐기물 또는 부산물의 발생을 줄이거나 재활용을 하는 제로-웨이스트(Zero-Wastes)의 개념을 실현할 수 있는 기술을 제공하는 것이다. 5 대 담배 회사가 발표 한 1994년 보고서에서 따르면 트리아세틴은 담배 제조 첨가물의 하나로 담배필터 제조 공정의 가소제로도 사용된다. 또한 긴 우주비행 임무를 수행하는 우주비행사들의 인공 우주식품에서 비행사들에게 필요한 에너지의 절반 이상을 공급하는 중요한 재료로 활용되고 있다. 미국 식품의약국(FDA)은 매우 안전한 식품첨가물(Generally Recognized as Safe: GRAS)로 인정하고 있다.
한편, 아세틴 물질은 점성을 갖는 무색, 무취의 액체이다. 기존의 아세틴 물질은 글리세롤에 초산 또는 무수초산을 화학반응을 통해 결합시킨 인공 화학 합성 물질이다.
기존에 생물학적으로 아세틴을 제조하는 방식이 없었으나, 생물학적인 방법을 통해서 아세틴 물질을 생산함으로써 지속가능하고 환경오염을 유발하지 않으며 안전하고 더 좋은 품질의 아세틴 물질의 생산 방법에 대한 요구가 꾸준히 있었다.
본 발명자들은 아세틴 화합물들은 글리세롤 또는 글리세롤의 유도체들에 초산기를 에스테르화 반응을 통해서 결합시키는 효소들에 의해서 생물학적인 방식으로 제조될 수 있다는 것을 밝혀냈고, 자연계에 글리세롤을 탄소원으로 이용하는 장내세균(엔테로박테리아속, Enterobacteriaceae)의 일부에서 미량의 모노아세틴이 생성되는 것 또한 밝혀내었다.
이에 따라 본 발명자들은 글리세롤 또는 포도당을 출발기질로 해서 모노아세틴, 다이아세틴, 트리아세틴을 생산할 수 있는 재조합 미생물을 만들어서, 본 발명을 완성하기에 이르렀다(도 1, 도 2).
본 발명은 아세틴 화합물의 생물학적 제조 방법 및 아세틴 화합물의 제조용 조성물을 제공하는 것을 목적으로 한다.
1. 제1 O-아세틸 전이효소(O-acetyl transferase) 존재 하에 아세틸-CoA와 글리세롤을 반응시켜 모노아세틴 또는 다이아세틴을 얻는 단계;를 포함하는 아세틴의 제조 방법.
2. 위 1에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 말토오스 O-아세틸 전이효소인, 아세틴의 제조 방법.
3. 위 1에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 70에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파르트산(ASP)이고, 위치 84에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파라긴(ASN)이고, 위치 114에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)이고, 위치 126에 상응하는 위치의 아미노산이 글루탐산(GLU)인, 아세틴의 제조 방법.
4. 위 3에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 15에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR) 또는 페닐알라닌(PHE)이고, 위치 26에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 글루타민(GLN)이고, 위치 30에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 리신(LYS)이고, 위치 71에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR)이고, 위치 82에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 티로신(TYR)인 아세틴의 제조 방법.
5. 위 1에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 1 내지 6 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴의 제조 방법.
6. 위 1에 있어서, 제2 O-아세틸 전이효소 존재 하에 상기 반응 생성물인 다이아세틴을 아세틸-CoA와 반응시켜 트리아세틴을 얻는 단계;를 더 포함하는, 아세틴의 제조 방법.
7. 위 6에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7의 아미노산 서열의 위치 31에 상응하는 위치의 아미노산이 시스테인(CYS) 또는 류신(LEU)이고, 위치 102에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 이소류신(ILE)이고, 위치 143에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 166에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 170에 상응하는 위치의 아미노산이 발린(VAL), 이소류신(ILE), 또는 류신(LEU)이고, 위치 193에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)인 아세틴의 제조 방법.
8. 위 6에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7 내지 10 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴의 제조 방법.
9. 제1 O-아세틸 전이효소(O-acetyl transferase)를 코딩하는 유전자를 발현하는 미생물을 글리세롤을 포함하는 배지 중에서 배양하는 단계;를 포함하는 아세틴의 제조 방법.
10. 위 9에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 말토오스 O-아세틸 전이효소인, 아세틴의 제조 방법.
11. 위 9에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 70에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파르트산(ASP)이고, 위치 84에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파라긴(ASN)이고, 위치 114에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)이고, 위치 126에 상응하는 위치의 아미노산이 글루탐산(GLU)인, 아세틴의 제조 방법.
12. 위 9에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 15에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR) 또는 페닐알라닌(PHE)이고, 위치 26에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 글루타민(GLN)이고, 위치 30에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 리신(LYS)이고, 위치 71에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR)이고, 위치 82에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 티로신(TYR)인, 아세틴의 제조 방법.
13. 위 9에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 16 내지 21의 서열 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴의 제조 방법.
14. 위 9에 있어서, 상기 미생물은 다이아세틴에 아세틸기를 전이하는 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자를 더 발현하는 것인, 아세틴의 제조 방법.
15. 위 14에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7의 아미노산 서열의 위치 31에 상응하는 위치의 아미노산이 시스테인(CYS) 또는 류신(LEU)이고, 위치 102에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 이소류신(ILE)이고, 위치 143에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 166에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 170에 상응하는 위치의 아미노산이 발린(VAL), 이소류신(ILE), 또는 류신(LEU)이고, 위치 193에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)인, 아세틴의 제조 방법.
16. 위 14에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 24 내지 27 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴의 제조 방법.
17. 위 9에 있어서, 상기 미생물은 아세틸에스테라제(acetylesterase)를 코딩하는 유전자가 감쇄 또는 결실된 것인, 아세틴의 제조 방법.
18. 위 9에 있어서, 상기 미생물은 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자를 더 발현하고, 상기 배지는 포도당을 포함하는 것인, 아세틴의 제조 방법.
19. 제1 O-아세틸 전이효소(O-acetyl transferase)를 코딩하는 유전자를 발현하는 미생물을 포함하는 아세틴 제조용 조성물.
20. 위 19에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 말토오스 O-아세틸 전이효소인, 아세틴 제조용 조성물.
21. 위 19에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 70에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파르트산(ASP)이고, 위치 84에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파라긴(ASN)이고, 위치 114에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)이고, 위치 126에 상응하는 위치의 아미노산이 글루탐산(GLU)인, 아세틴 제조용 조성물.
22. 위 19에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 15에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR) 또는 페닐알라닌(PHE)이고, 위치 26에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 글루타민(GLN)이고, 위치 30에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 리신(LYS)이고, 위치 71에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR)이고, 위치 82에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 티로신(TYR)인, 아세틴 제조용 조성물.
23. 위 19에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 16 내지 21 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴 제조용 조성물.
24. 위 19에 있어서, 상기 미생물은 다이아세틴에 아세틸기를 전이하는 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자를 더 발현하는 것인, 아세틴 제조용 조성물.
25. 위 24에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7의 아미노산 서열의 위치 31에 상응하는 위치의 아미노산이 시스테인(CYS) 또는 류신(LEU)이고, 위치 102에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 이소류신(ILE)이고, 위치 143에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 166에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 170에 상응하는 위치의 아미노산이 발린(VAL), 이소류신(ILE), 또는 류신(LEU)이고, 위치 193에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)인, 아세틴 제조용 조성물.
26. 위 24에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 24 내지 27 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴 제조용 조성물.
27. 위 19에 있어서, 상기 미생물은 아세틸에스테라제(acetylesterase)를 코딩하는 유전자가 감쇄 또는 결실된 것인, 아세틴 제조용 조성물.
28. 위 19에 있어서, 상기 미생물은 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자를 더 발현하는 것인, 아세틴 제조용 조성물.
본 발명에 따르면 생물학적인 방법을 통해서 아세틴 물질을 제조함으로써 지속가능하고 환경오염을 유발하지 않으며 안전하고 더 좋은 품질의 아세틴 물질을 제조하는 방법을 제공한다.
도 1은 세포 내로 유입된 글리세롤이 모노아세틴, 다이아세틴, 트리아세틴으로 전환되는 경로를 나타낸 것이다.
도 2는 세포 내로 유입된 포도당이 모노아세틴, 다이아세틴, 트리아세틴으로 전환되는 경로를 나타낸 것이다.
도 3의 (A)는 모노아세틴과 다이아세틴을 생산하기 위해서 글리세롤에 아세틸기를 전이할 수 있는 대장균 내의 O-acetyltransferases 후보 유전자들을 선별하고 각 유전자들을 pTrc99A 발현벡터에 클로닝해서 만들어진 플라스미드 pMD1 - pMD8의 구조 도면 이고, (B)는 (A)의 플라스미드들로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MD1 - DH-MD8에서의 모노아세틴과 다이아세틴 생산성을 비교한 도면이며(DH-MD0는 공벡터인 pTrc99A로 형질전환 된 재조합 대장균을 나타냄.), (C)는 대장균 maltose O-acetyltransferase (Maa)의 구조와 아미노산 서열을 근거로 글리세롤에 아세틸기를 전이할 것으로 추정되는 다른 미생물 유래의 후보 유전자들을 선별하고 각 유전자들을 pTrc99A 발현벡터에 클로닝해서 만들어진 플라스미드 pMD9 - pMD13의 구조 도면이고, (D)는 이 플라스미드들로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MD9 - DH-MD13에서의 모노아세틴과 다이아세틴 생산성을 비교한 도면이다.
도 4의 (A)는 모노아세틴과 다이아세틴 생산성이 가장 좋았던 B. subtilis의 Maa 유전자(Bs-maa)를 pTrc99A, pET28a, pSTV28 발현벡터에 클로닝해서 만들어진 플라스미드 pMD13, pMD14, pMDT1의 구조 도면이고, (B)는 상기 플라스미드들로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MD13, DH-MD14, DH-MDT1에서의 모노아세틴, 다이아세틴, 트리아세틴 생산성을 비교한 도면이며, (C)는 각 재조합 대장균의 균체 증식을 비교한 도면이다.
도 5의 (A)는 모노아세틴(1), 다이아세틴(2), 트리아세틴(3)의 혼합 표준화합물(STD)과 재조합 대장균 DH-MD06, DH-MD8, DH-MDT1의 배양액을 에틸아세테이트로 추출한 후 GC로분석한 가스크로마토그램 도면이고, (B)는 GC-MS로 각 시료에서 얻어진 모노아세틴, 다이아세틴, 트리아세틴의 질량분석을 표준화합물(STD)의 질량분석과 비교한 도면이다.
도 6의 (A)는 다이아세틴을 트리아세틴으로 전환하는 chloramphenicol-O-acetyltransferase 유전자(cat)와 B. subtilis의 Maa 유전자(Bs-maa)를 pTrc99A 발현벡터에 클로닝해서 만들어진 플라스미드 pMDT2의 구조 도면이고, (B)와 (C)는 상기 플라스미드로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MDT2의 아세틴 복합물의 생산성과 조성을 대조구인 DH-MDT1와 비교한 도면이며, (D)는 재조합 대장균 DH-MDT2에서의 아세틴 복합물의 배양시간에 따른 생산 변화를 나타낸 도면이다.
도 7의 (A)는 Chloramphenicol O-acetyltransferase의 구조와 아미노산 서열을 근거로 다이아세틴에 아세틸기를 전이할 것으로 추정되는 후보 유전자들을 다양한 미생물들에서 발견하고 플라스미드 pMD13에 클로닝 해서 만들어진 플라스미드 pMDT2 - pMDT7의 구조 도면이고, (B)는 상기 플라스미드로 형질전환 된 재조합균주 DH-MDT2 - DH-MDT7의 아세틴 복합물 생산량 비교한 도면이며, (C)는 상기 재조합 균주들의 균체 증식을 비교한 도면이다.
도 8은 대장균 균종과 글리세롤 농도에 따른 아세틴 복합물의 생산성을 비교한 것으로서, (A)는 대장균 DH5α, AceCo, BW25113, W3110, MG1655를 플라스미드 pMDT2로 형질전환 한 재조합 대장균 DH-MDT2, AC-MDT2, BW-MDT2, W3-MDT2, MG-MDT2를 배양해서 아세틴 복합물 생산성을 비교한 것이며, (B)는 상기 재조합 대장균들의 균체 증식을 비교한 것이고, (C)는 재조합 균주 MG-MDT2의 배양에서 글리세롤 농도에 따른 아세틴 복합물 생산성을 나타낸 것이며, (D)는 상기 균주의 글리세롤 농도에 따른 균체 증식을 비교한 것이다.
도 9 는 대장균 BW25113에서 acetylesterase 유전자(aes)의 증폭 및 결손을 통한 아세틴 화합물의 변화를 관찰한 것으로서, (A)와 (B)는 대장균 BW25113에 pTrc99A와 pTAes로 각각 형질전환 한 재조합균주 BW-Empty와 BW-Aes를 15 g/L의 트리아세틴 표준화합물이 첨가된 2YT 배지에 접종하고 트리아세틴의 분해 양상을 관찰한 것이며, (C)는 BW25113과 aes 유전자가 결손된 JW0465 균주를 플라스미드 pMDT2로 형질전환 시킨 재조합균주 BW-MDT2와 BW-MDT2(Daes)를 10% (v/v) 글리세롤이 첨가된 2YT 배지에서 배양해서 아세틴 복합물 생산성을 비교한 것이며, (D)는 상기 재조합 균주들의 균체 증식을 비교한 것이다.
도 10의 (A)는 포도당으로부터 아세틴 복합물 생산을 위해서 사카라마이세스 세레비지애 유래 글리세롤 생산 유전자인 Sc-gpd1과 Sc-gpp2를 pMDT2 플라스미드에 클로닝해서 만들어진 플라스미드 pMDT8의 구조 도면이고, (B)는 상기 플라스미드로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MDT8의 포도당으로부터의 아세틴 복합물 생산, (C)는 상기 대장균들의 균체 증식, (D)는 배양액의 pH변화를 나타낸 것이다.
도 11은 BsMAA 말토오스 아세틸전이효소의 기질 결합 부위 구조를 도시한 것이다. 글리세롤 아세틸화 반응의 핵심잔기는 아미노산 서열의 위치 70의 아스파르트산(ASP), 위치 84의 아스파라긴(ASN), 위치 114의 히스티딘(HIS), 위치 126의 글루탐산(GLU) 이다.
도 12는 Bacillus subtilis MAA-like enzymes의 서열 정렬(alignment) 결과이다.
도 13은 CAT 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소(Chloramphenicol-O-acetyltransferase)의 기질결합 부위 구조를 도시한 것이다. 다이아세틴 아세틸화 반응의 핵심잔기는 아미노산 서열의 위치 102의 페닐알라닌(PHE), 위치 143의 페닐알라닌(PHE), 위치 193의 히스티딘(HIS)이다. 서열의 위치 102와 143의 잔기는 유사한 성질의 아미노산인 이소류신(ILE)과 티로신(TYR)으로 각각 대체될 수 있다. 이것은 제2 O-아세틸 전이효소들의 아미노산 서열 정렬 비교 도면 14에서 알 수 있다.
도 14는 CAT-like enzymes의 서열 정렬 결과이다.
도 2는 세포 내로 유입된 포도당이 모노아세틴, 다이아세틴, 트리아세틴으로 전환되는 경로를 나타낸 것이다.
도 3의 (A)는 모노아세틴과 다이아세틴을 생산하기 위해서 글리세롤에 아세틸기를 전이할 수 있는 대장균 내의 O-acetyltransferases 후보 유전자들을 선별하고 각 유전자들을 pTrc99A 발현벡터에 클로닝해서 만들어진 플라스미드 pMD1 - pMD8의 구조 도면 이고, (B)는 (A)의 플라스미드들로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MD1 - DH-MD8에서의 모노아세틴과 다이아세틴 생산성을 비교한 도면이며(DH-MD0는 공벡터인 pTrc99A로 형질전환 된 재조합 대장균을 나타냄.), (C)는 대장균 maltose O-acetyltransferase (Maa)의 구조와 아미노산 서열을 근거로 글리세롤에 아세틸기를 전이할 것으로 추정되는 다른 미생물 유래의 후보 유전자들을 선별하고 각 유전자들을 pTrc99A 발현벡터에 클로닝해서 만들어진 플라스미드 pMD9 - pMD13의 구조 도면이고, (D)는 이 플라스미드들로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MD9 - DH-MD13에서의 모노아세틴과 다이아세틴 생산성을 비교한 도면이다.
도 4의 (A)는 모노아세틴과 다이아세틴 생산성이 가장 좋았던 B. subtilis의 Maa 유전자(Bs-maa)를 pTrc99A, pET28a, pSTV28 발현벡터에 클로닝해서 만들어진 플라스미드 pMD13, pMD14, pMDT1의 구조 도면이고, (B)는 상기 플라스미드들로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MD13, DH-MD14, DH-MDT1에서의 모노아세틴, 다이아세틴, 트리아세틴 생산성을 비교한 도면이며, (C)는 각 재조합 대장균의 균체 증식을 비교한 도면이다.
도 5의 (A)는 모노아세틴(1), 다이아세틴(2), 트리아세틴(3)의 혼합 표준화합물(STD)과 재조합 대장균 DH-MD06, DH-MD8, DH-MDT1의 배양액을 에틸아세테이트로 추출한 후 GC로분석한 가스크로마토그램 도면이고, (B)는 GC-MS로 각 시료에서 얻어진 모노아세틴, 다이아세틴, 트리아세틴의 질량분석을 표준화합물(STD)의 질량분석과 비교한 도면이다.
도 6의 (A)는 다이아세틴을 트리아세틴으로 전환하는 chloramphenicol-O-acetyltransferase 유전자(cat)와 B. subtilis의 Maa 유전자(Bs-maa)를 pTrc99A 발현벡터에 클로닝해서 만들어진 플라스미드 pMDT2의 구조 도면이고, (B)와 (C)는 상기 플라스미드로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MDT2의 아세틴 복합물의 생산성과 조성을 대조구인 DH-MDT1와 비교한 도면이며, (D)는 재조합 대장균 DH-MDT2에서의 아세틴 복합물의 배양시간에 따른 생산 변화를 나타낸 도면이다.
도 7의 (A)는 Chloramphenicol O-acetyltransferase의 구조와 아미노산 서열을 근거로 다이아세틴에 아세틸기를 전이할 것으로 추정되는 후보 유전자들을 다양한 미생물들에서 발견하고 플라스미드 pMD13에 클로닝 해서 만들어진 플라스미드 pMDT2 - pMDT7의 구조 도면이고, (B)는 상기 플라스미드로 형질전환 된 재조합균주 DH-MDT2 - DH-MDT7의 아세틴 복합물 생산량 비교한 도면이며, (C)는 상기 재조합 균주들의 균체 증식을 비교한 도면이다.
도 8은 대장균 균종과 글리세롤 농도에 따른 아세틴 복합물의 생산성을 비교한 것으로서, (A)는 대장균 DH5α, AceCo, BW25113, W3110, MG1655를 플라스미드 pMDT2로 형질전환 한 재조합 대장균 DH-MDT2, AC-MDT2, BW-MDT2, W3-MDT2, MG-MDT2를 배양해서 아세틴 복합물 생산성을 비교한 것이며, (B)는 상기 재조합 대장균들의 균체 증식을 비교한 것이고, (C)는 재조합 균주 MG-MDT2의 배양에서 글리세롤 농도에 따른 아세틴 복합물 생산성을 나타낸 것이며, (D)는 상기 균주의 글리세롤 농도에 따른 균체 증식을 비교한 것이다.
도 9 는 대장균 BW25113에서 acetylesterase 유전자(aes)의 증폭 및 결손을 통한 아세틴 화합물의 변화를 관찰한 것으로서, (A)와 (B)는 대장균 BW25113에 pTrc99A와 pTAes로 각각 형질전환 한 재조합균주 BW-Empty와 BW-Aes를 15 g/L의 트리아세틴 표준화합물이 첨가된 2YT 배지에 접종하고 트리아세틴의 분해 양상을 관찰한 것이며, (C)는 BW25113과 aes 유전자가 결손된 JW0465 균주를 플라스미드 pMDT2로 형질전환 시킨 재조합균주 BW-MDT2와 BW-MDT2(Daes)를 10% (v/v) 글리세롤이 첨가된 2YT 배지에서 배양해서 아세틴 복합물 생산성을 비교한 것이며, (D)는 상기 재조합 균주들의 균체 증식을 비교한 것이다.
도 10의 (A)는 포도당으로부터 아세틴 복합물 생산을 위해서 사카라마이세스 세레비지애 유래 글리세롤 생산 유전자인 Sc-gpd1과 Sc-gpp2를 pMDT2 플라스미드에 클로닝해서 만들어진 플라스미드 pMDT8의 구조 도면이고, (B)는 상기 플라스미드로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MDT8의 포도당으로부터의 아세틴 복합물 생산, (C)는 상기 대장균들의 균체 증식, (D)는 배양액의 pH변화를 나타낸 것이다.
도 11은 BsMAA 말토오스 아세틸전이효소의 기질 결합 부위 구조를 도시한 것이다. 글리세롤 아세틸화 반응의 핵심잔기는 아미노산 서열의 위치 70의 아스파르트산(ASP), 위치 84의 아스파라긴(ASN), 위치 114의 히스티딘(HIS), 위치 126의 글루탐산(GLU) 이다.
도 12는 Bacillus subtilis MAA-like enzymes의 서열 정렬(alignment) 결과이다.
도 13은 CAT 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소(Chloramphenicol-O-acetyltransferase)의 기질결합 부위 구조를 도시한 것이다. 다이아세틴 아세틸화 반응의 핵심잔기는 아미노산 서열의 위치 102의 페닐알라닌(PHE), 위치 143의 페닐알라닌(PHE), 위치 193의 히스티딘(HIS)이다. 서열의 위치 102와 143의 잔기는 유사한 성질의 아미노산인 이소류신(ILE)과 티로신(TYR)으로 각각 대체될 수 있다. 이것은 제2 O-아세틸 전이효소들의 아미노산 서열 정렬 비교 도면 14에서 알 수 있다.
도 14는 CAT-like enzymes의 서열 정렬 결과이다.
이하 본 발명을 상세히 설명한다.
본 발명은 제1 O-아세틸 전이효소(O-acetyl transferase) 존재 하에 아세틸-CoA와 글리세롤을 반응시켜 모노아세틴 또는 다이아세틴을 얻는 단계;를 포함하는 아세틴의 제조 방법에 관한 것이다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소는 상기 아세틸-CoA에서 O-아세틸을 글리세롤로 전이시킬 수 있고, 예를 들면 말토오스 O-아세틸 전이효소일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소는 생물로부터 유래된 것이거나, 합성된 것일 수 있다.
또한, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 제1 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자를 가진 미생물에서 발현되는 것일 수 있고, 상기 미생물 내 제1 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 해당 미생물에 내재된 것일 수 있고, 유전자공학기술로 외부에서 미생물 내로 도입된 것일 수 있으며, 이 경우 글리세롤과 아세틸-CoA는 미생물 내에서 반응되는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 아세틴은 모노아세틴(monoacetin), 다이아세틴(diacetin) 또는 트리아세틴(triacetin)을 포함할 수 있고, 이들의 복합물일 수 있다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소는 글리세롤과 아세틸-CoA의 반응에서 촉매로 작용하여 모노아세틴이 생성될 수 있고, 모노아세틴은 제1 O-아세틸 전이효소 존재 하에 아세틸-CoA와 한 번 더 반응하여 다이아세틴을 생성할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 70에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파르트산(ASP)이고, 위치 84에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파라긴(ASN)이고, 위치 114에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)이고, 위치 126에 상응하는 위치의 아미노산이 글루탐산(GLU)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 15에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR) 또는 페닐알라닌(PHE)이고, 위치 26에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 글루타민(GLN)이고, 위치 30에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 리신(LYS)이고, 위치 71에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR)이고, 위치 82에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 티로신(TYR)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소의 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 15에 상응하는 위치의 아미노산인 티로신(TYR) 또는 페닐알라닌(PHE), 위치 26에 상응하는 위치의 아미노산인 아르기닌(ARG) 또는 글루타민(GLN), 위치 30에 상응하는 위치의 아미노산인 아르기닌(ARG) 또는 리신(LYS), 위치 71에 상응하는 위치의 아미노산인 티로신(TYR) 및 위치 82에 상응하는 위치의 아미노산인 페닐알라닌(PHE) 또는 티로신(TYR)은 기질결합포켓(substrate binding pocket)을 형성하는 잔기로서, 상대적으로 보존이 잘 되어있으며, 아세틴을 제조하는 데 중요한 역할을 하는 아미노산 잔기에 해당한다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소의 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 70에 상응하는 위치의 아미노산인 아스파르트산(ASP), 위치 84에 상응하는 위치의 아미노산인 아스파라긴(ASN) 및 위치 126에 상응하는 위치의 아미노산인 글루탐산(GLU)은 글리세롤을 안정화시키는 아미노산 잔기로서, 상대적으로 보존이 잘 되어있으며, 아세틴을 제조하는 데 중요한 역할을 하는 아미노산 잔기에 해당한다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소의 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 114에 상응하는 위치의 아미노산인 히스티딘(HIS)은 촉매 역할을 하는 잔기로서, 상대적으로 보존이 잘 되어있으며, 아세틴을 제조하는 데 중요한 역할을 하는 아미노산 잔기에 해당한다.
또한, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 그 아미노산 서열이 서열번호 5의 아미노산 서열과 상동성이 50% 이상일 수 있다.
상기 말토오스 O-아세틸 전이효소는 예를 들어, 에셰리키아 콜라이(Escherichia coli)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 1), 스타필로코커스 카노수스(Staphylococcus carnosus)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 2), 할알칼리코커스 젓갈리(Halalkalicoccus jeotgali)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 3), 락토바실러스 브레비스(Lactobacillus brevis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 4), 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 5) 또는 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 6)일 수 있고, 바람직하게는 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
에셰리키아 콜라이(Escherichia coli)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 1) 아미노산 서열은 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 5) 아미노산 서열과 상동성이 65%이고, 스타필로코커스 카노수스(Staphylococcus carnosus)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 2) 아미노산 서열은 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 5) 아미노산 서열과 상동성이 58%이고, 할알칼리코커스 젓갈리(Halalkalicoccus jeotgali)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 3) 아미노산 서열은 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 5) 아미노산 서열과 상동성이 53%이고, 락토바실러스 브레비스(Lactobacillus brevis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 4) 아미노산 서열은 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 5) 아미노산 서열과 상동성이 55%이고, 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 6) 아미노산 서열은 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소(서열번호 5) 아미노산 서열과 상동성이 50%이다.
또한, 본 발명의 아세틴의 제조 방법은 제2 O-아세틸 전이효소 존재 하에 상기 반응 생성물인 다이아세틴을 아세틸-CoA와 반응시키는 단계;를 더 포함할 수 있다.
상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7의 아미노산 서열의 위치 31에 상응하는 위치의 아미노산이 시스테인(CYS) 또는 류신(LEU)이고, 위치 102에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 이소류신(ILE)이고, 위치 143에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 166에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 170에 상응하는 위치의 아미노산이 발린(VAL), 이소류신(ILE), 또는 류신(LEU)이고, 위치 193에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
제2-아세틸 전이효소는 다이아세틴에 아세틸기를 전이해 트리아세틴을 생성할 수 있고, 예를 들면 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소(Chloramphenicol-O-acetyltransferase)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
클로람페니콜-O-아세틸 전이효소는 예를 들면 서열번호 7의 아미노산 서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 서열번호 7의 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소(서열번호 7)는 예를 들어, 클로람페니콜 저항성 항생제 마커를 갖는 pSTV28 벡터에서 발현되는 것일 수 있고, 클로람페니콜 저항성 항생제 마커를 갖는 미생물에서 발현되는 것일 수 있고, pSTV28 벡터를 선천적 또는 후천적으로 갖는 미생물에서 발현되는 것일 수 있고, 합성에 의해 제조될 수도 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소 및 상기 제2 O-아세틸 전이효소 존재 하에 상기 글리세롤과 아세틸-CoA가 반응하는 경우, 모노아세틴, 다이아세틴, 트리아세틴의 복합물이 생성될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 제2 O-아세틸 전이효소는 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소이거나, 그와 유사한 단백질 서열 및 구조를 가져, 다이아세틴에 아세틸기를 전이시켜 트리아세틴을 생성할 수 있다.
상기 제2 O-아세틸 전이효소는 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자를 가진 미생물에서 발현되는 것일 수 있고, 상기 미생물 내 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 해당 미생물에 내재된 것일 수 있고, 유전자공학기술로 외부에서 미생물 내로 도입된 것일 수 있으며, 이 경우 글리세롤과 아세틸-CoA는 미생물 내에서 반응되는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 제2 O-아세틸 전이효소는 생물로부터 유래된 것이거나, 합성된 것일 수 있다.
상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7의 아미노산 서열의 위치 31에 상응하는 위치의 아미노산이 시스테인(CYS) 또는 류신(LEU)이고, 위치 93에 상응하는 위치의 아미노산인 트레오닌(THR) 또는 프롤린(PRO), 위치 102에 상응하는 위치의 아미노산인 페닐알라닌(PHE) 또는 이소류신(ILE), 위치 143에 상응하는 위치의 아미노산인 페닐알라닌(PHE) 또는 티로신(TYR) , 위치 166에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR) 및 위치 170에 상응하는 위치의 아미노산인 발린(VAL), 이소류신(ILE) 및 류신(LEU) 중 어느 하나는 기질결합포켓(substrate binding pocket)을 형성하는 잔기로서, 상대적으로 보존이 잘 되어있으며, 아세틴을 제조하는 데 중요한 역할을 하는 아미노산 잔기에 해당한다.
상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7의 아미노산 서열의 위치 193에 상응하는 위치의 아미노산인 히스티딘(HIS)은 촉매 역할을 하는 잔기로서, 상대적으로 보존이 잘 되어있으며, 아세틴을 제조하는 데 중요한 역할을 하는 아미노산 잔기에 해당한다.
또한, 상기 제2 O-아세틸 전이효소는 그 아미노산 서열이 서열번호 7의 아미노산 서열과 상동성이 32% 이상일 수 있다.
상기 제2 O-아세틸 전이효소는 구체적으로는, 서열번호 7의 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소, 바실러스 세레우스(Bacillus cereus)의 O-아세틸 전이효소(서열번호 8), 슈도모나스 애루기노사(Pseudomonas aeruginosa)의 O-아세틸 전이효소(서열번호 9) 또는 클로스트리디움 아세토부틸리쿰(Clostridium acetobutylicum)의 O-아세틸 전이효소(서열번호 10)일 수 있고, 바람직하게는 바실러스 세레우스(Bacillus cereus)의 O-아세틸 전이효소일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
바실러스 세레우스(Bacillus cereus)의 O-아세틸 전이효소(서열번호 8) 아미노산 서열은 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소(서열번호 7) 아미노산 서열과 상동성이 43% 이상이고, 슈도모나스 애루기노사(Pseudomonas aeruginosa)의 O-아세틸 전이효소(서열번호 9) 아미노산 서열은 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소(서열번호 7) 아미노산 서열과 상동성이 62%이고, 클로스트리디움 아세토부틸리쿰(Clostridium acetobutylicum)의 O-아세틸 전이효소(서열번호 10) 아미노산 서열은 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소(서열번호 7) 아미노산 서열과 상동성이 32%이다.
또한, 본 발명의 아세틴의 제조 방법은 포도당을 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)와 순차적으로 반응시켜 상기 글리세롤을 얻는 단계;를 더 포함할 수 있다.
상기 글리세롤의 경우 포도당으로부터 효소와 반응시키는 생합성을 통해 얻을 수 있고, 이의 구체적인 예로서, 포도당을 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase, GPD1) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase, GPP2)와 순차적으로 반응시켜 상기 글리세롤을 얻는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)는 화학적으로 합성될 수 있다.
또한, 상기 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)는 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자를 가진 미생물에서 발현되는 것일 수 있고, 상기 미생물 내 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자는 해당 미생물에 내재된 것일 수 있고, 유전자공학기술로 외부에서 미생물 내로 도입된 것일 수 있으며, 이 경우 포도당으로부터 글리세롤을 얻는 것은 미생물 내에서 이루어지는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase)는 미생물 종류에 따라 다른 아미노산 서열을 가질 수 있고, 해당 미생물에서 해당경로의 중간대사물질인 글리세론 인산(glycerone phosphate, DHAP)을 글리세롤 3-인산(glycerol-3-phosphate, G3P)으로 전환할 수 있는 것이면 족하다. 예를 들어, 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 경우, 서열번호 14의 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase, GPD1)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)는 미생물 종류에 따라 다른 아미노산 서열을 가질 수 있고, 해당 미생물에서 해당경로의 중간대사물질인 글리세롤 3-인산(glycerol-3-phosphate, G3P)을 글리세롤(glycerol)로 전환할 수 있는 것이면 족하며, 예를 들어, 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 경우, 서열번호 15의 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase, GPP2)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 포도당은 해당경로(Embden-Meyerhof pathway)를 통해 중간대사물질인 글리세론 인산(glycerone phosphate, DHAP)을 형성하고, 상기 글로세론 인산은 글리세롤 3-인산 탈수소효소와 반응하여 글리세롤 3-인산으로 전환될 수 있고, 상기 글리세롤 3-인산(glycerol-3-phosphate, G3P)은 글리세롤 3-탈인산효소와 반응하여 글리세롤(glycerol)이 제조될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명은 제1 O-아세틸 전이효소(O-acetyl transferase)를 코딩하는 유전자를 발현하는 미생물을 글리세롤을 포함하는 배지 중에서 배양하는 단계;를 포함하는 아세틴의 제조 방법에 관한 것이다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 70에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파르트산(ASP)이고, 위치 84에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파라긴(ASN)이고, 위치 114에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)이고, 위치 126에 상응하는 위치의 아미노산이 글루탐산(GLU)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 15에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR) 또는 페닐알라닌(PHE)이고, 위치 26에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 글루타민(GLN)이고, 위치 30에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 리신(LYS)이고, 위치 71에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR)이고, 위치 82에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 티로신(TYR)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 그 아미노산 서열이 서열번호 5의 아미노산 서열과 상동성이 50% 이상일 수 있다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 예를 들어, 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자일 수 있고, 상기 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 예를 들어, 에셰리키아 콜라이(Escherichia coli)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(maa , 서열번호 16), 스타필로코커스 카노수스(Staphylococcus carnosus)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Sc-maa, 서열번호 17), 할알칼리코커스 젓갈리(Halalkalicoccus jeotgali)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Hj-maa, 서열번호 18), 락토바실러스 브레비스(Lactobacillus brevis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Lb-maa, 서열번호 19), 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Bs-maa, 서열번호 20) 또는 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Pp-maa, 서열번호 21)일 수 있고, 바람직하게는 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 미생물은 배지 내에서 배양되어 제1 O-아세틸 전이효소를 발현할 수 있고, 상기 제1 O-아세틸 전이효소가 글리세롤과 아세틸-CoA의 반응을 촉매하여 모노아세틴을 생성할 수 있고, 상기 모노아세틴과 아세틸-CoA의 반응을 한 번 더 촉매하여 다이아세틴을 생성할 수 있다.
상기 미생물은 제1 O-아세틸 전이 효소를 발현하는 미생물이라면 제한없이 사용가능하며, 예를 들어, 원핵 세포, 진핵 세포, 또는 분리된 동물세포로 액체 배지에서 배양될 수 있는 것일 수 있다. 상기 미생물은 예를 들면, 박테리아, 곰팡이, 또는 이들의 조합일 수 있다. 박테리아는 그람 양성 박테리아, 그람 음성 박테리아, 또는 이들의 조합일 수 있다. 그람 음성 박테리아는 에세리키아 (Escherichia) 속일 수 있다. 그람 양성 박테리아는 바실러스 속, 코리네박테리움 속, 유산균 등 또는 이들의 조합일 수 있다. 곰팡이는 사카라마이세스 세레비지애, 클루베로마이세스 등 또는 이들의 조합일 수 있다. 상기 미생물은 구체적으로 대장균(E.coli)일 수 있고, 보다 구체적으로 DH5α, DH5α(DE3), AceCo, BW25113, W3110 또는 MG1655일 수 있다. 상기 미생물은 대장균 중 생산성 측면에서 바람직하게는 DH5α(DE3), BW25113, W3110 또는 MG1655일 수 있고, 보다 바람직하게는 MG1655일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 미생물은 제1 O-아세틸 전이효소(O-acetyl transferase)를 코딩하는 유전자를 선천적으로 보유하는 미생물일 수 있고, 형질전환, 형질도입 등의 생명공학적 기술 등에 의해 상기 유전자를 후천적으로 보유하는 미생물일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 형질전환은 재조합 플라스미드를 상기 미생물 내부에 도입함으로써 이루어질 수 있고, 상기 재조합 플라스미드는 벡터에 상기 제1 O-아세틸 전이효소(O-acetyl transferase)를 코딩하는 유전자가 삽입된 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 벡터는 예를 들어, pTrc99A(서열번호 78), pET28a(서열번호 79) 또는 pSTV28(서열번호 77)일 수 있고, 바람직하게는 pSTV28일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 유전자 삽입 시, 상기 벡터와 상기 유전자를 제한효소로 자르고 ligase로 연결되어 클로닝되는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 배지는 상기 미생물의 증식, 또는 배양을 목적으로 미생물이 일반적으로 생존하고 번식하는 자연 환경과 유사한 영양 상태를 유지 하도록 고안된 물질로서 자라는데 필요한 모든 영양소를 첨가하여 만든 액체 및 고체의 물질로서, 글리세롤 뿐만 아니라 아세틸-CoA를 포함하는 배지일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명의 상기 미생물은 다이아세틴에 아세틸기를 전이하는 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자를 더 발현하는 것일 수 있다.
상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7의 아미노산 서열의 위치 31에 상응하는 위치의 아미노산이 시스테인(CYS) 또는 류신(LEU)이고, 위치 102에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 이소류신(ILE)이고, 위치 143에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 166에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 170에 상응하는 위치의 아미노산이 발린(VAL), 이소류신(ILE), 또는 류신(LEU)이고, 위치 193에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS) 일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 미생물은 배지 내 배양되며, 제1 O-아세틸 전이효소 외에 추가적으로 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소 또는 2 O-아세틸 전이효소를 더 발현할 수 있다.
상기 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소(서열번호 7)를 코딩하는 유전자(cat, 서열번호 24)는 클로람페니콜 저항성 항생제 마커를 갖는 벡터에 존재할 수 있고, 상기 벡터는 예를 들어 pSTV28 벡터일 수 있고, 해당 벡터는 미생물이라면 제한없이 도입되어 해당 미생물로부터 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소가 발현될 수 있고, 예를 들어 대장균에 상기 벡터가 도입되어 대장균으로부터 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소가 발현될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 예를 들어, 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(cat, 서열번호 24), 바실러스 세레우스(Bacillus cereus)의 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Bc-Oat, 서열번호 25), 슈도모나스 애루기노사(Pseudomonas aeruginosa)의 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Pa-Oat, 서열번호 26) 또는 클로스트리디움 아세토부틸리쿰(Clostridium acetobutylicum)의 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Ca-Oat, 서열번호 27)일 수 있고, 바람직하게는 바실러스 세레우스(Bacillus cereus)의 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 제2 O-아세틸 전이효소는 그 아미노산 서열이 서열번호 7의 아미노산 서열과 상동성이 32% 이상일 수 있다.
또한, 본 발명의 상기 미생물은 아세틸에스테라제(acetylesterase)를 코딩하는 유전자가 감쇄 또는 결실된 것일 수 있다.
에스터 화합물인 아세틴은 에스터 결합 분해 효소(esterases)에 의해서 글리세롤과 아세테이트로 분해될 수 있고, 상기 아세틴을 분해하는 에스터 결합 분해 효소는 예를 들어 아세틸에스테라제일 수 있다.
상기 아세틸에스테라제를 코딩하는 유전자가 감쇄 또는 결실된 미생물의 경우 아세틸에스테라제를 발현하지 않아, 아세틴의 생산량이 증가될 수 있다.
상기 아세틸에스테라제는 미생물 종류에 따라 다른 서열을 가질 수 있고, 이를 코딩하는 유전자도 마찬가지로 다른 서열을 가질 수 있는 바, 해당 미생물에서 아세틸에스테라제를 코딩하는 유전자(aes)가 감쇄 또는 결실된 것일 수 있다. 예를 들어, 대장균의 경우, 서열번호 13의 아세틸에스테라제를 코딩하는 서열번호 30의 유전자가 감쇄 또는 결실된 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 미생물은 제1 O-아세틸 전이 효소를 발현하는 미생물이라면 제한없이 사용가능하며, 전술한 범위 내의 미생물일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명의 상기 미생물의 본 배양 시 초기 균체 농도가 OD600nm에서 0.05 내지 0.15일 때, 상기 배지에 포함된 글리세롤의 농도는 3%(v/v) 내지 13%(v/v)일 수 있으며, 바람직하게는 초기 균체 농도가 OD600nm에서 0.08 내지 0.12일 때, 글리세롤의 농도는 5%(v/v) 내지 11%(v/v)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 글리세롤 농도를 가지는 배지에서 상기 균체의 농도로 미생물을 배양할 경우, 아세틴이 다량 생성될 수 있다.
상기 글리세롤의 농도가 13%(v/v) 초과인 경우, 과도한 삼투압 증가의 영향으로 균체 증식과 아세틴 생산이 모두 감소할 수 있으며, 농도가 3%(v/v) 미만인 경우, 기질의 농도가 적어서 아세틴의 생산량이 적을 수 있다.
또한, 본 발명의 상기 미생물은 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자를 더 발현하고, 상기 배지는 포도당을 포함하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
전술한 바와 같이 상기 미생물은 글리세롤 3-인산 탈수소효소 및 글리세롤 3-탈인산효소를 발현하며, 포도당은 해당경로를 통해 글리세론 인산으로 변환된 후 상기 효소들을 통해 글리세롤로 변환될 수 있다.
상기 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase)를 코딩하는 유전자(Gpd1)는 미생물 종류에 따라 다른 염기 서열을 가질 수 있고, 해당 미생물에서 해당경로의 중간대사물질인 글리세론 인산(glycerone phosphate, DHAP)을 글리세롤 3-인산(glycerol-3-phosphate, G3P)으로 전환할 수 있는 것이면 족하다. 예를 들어, 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 경우, 서열번호 31의 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase)를 코딩하는 유전자(Sc-gpd1)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자(Gpp2)는 미생물 종류에 따라 다른 염기 서열을 가질 수 있고, 해당 미생물에서 해당경로의 중간대사물질인 글리세롤 3-인산(glycerol-3-phosphate, G3P)을 글리세롤(glycerol)로 전환할 수 있는 것이면 족하다. 예를 들어, 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 경우, 서열번호 32의 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자(Sc-gpp2)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 글리세롤은 전술한 제1 O-아세틸 전이효소 및 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소 또는 제2 O-아세틸 전이효소 등에 의해 아세틴 복합물로 변환될 수 있다.
또한, 본 발명은 제1 O-아세틸 전이효소(O-acetyl transferase)를 코딩하는 유전자를 발현하는 미생물을 포함하는 아세틴 제조용 조성물에 관한 것이다.
상기 조성물은 글리세롤과 접촉하는 경우 전술한 범위 및 방법으로 아세틴을 제조할 수 있다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 70에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파르트산(ASP)이고, 위치 84에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파라긴(ASN)이고, 위치 114에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)이고, 위치 126에 상응하는 위치의 아미노산이 글루탐산(GLU)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 15에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR) 또는 페닐알라닌(PHE)이고, 위치 26에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 글루타민(GLN)이고, 위치 30에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 리신(LYS)이고, 위치 71에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR)이고, 위치 82에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 티로신(TYR)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 그 아미노산 서열이 서열번호 5의 아미노산 서열과 상동성이 50% 이상일 수 있다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소는 말토오스 O-아세틸 전이효소일 수 있고, 보다 구체적으로는 에셰리키아 콜라이(Escherichia coli), 스타필로코커스 카노수스(Staphylococcus carnosus), 할알칼리코커스 젓갈리(Halalkalicoccus jeotgali), 락토바실러스 브레비스(Lactobacillus brevis), 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 또는 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida)의 말토오스 O-아세틸 전이효소일 수 있고, 바람직하게는 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 제1 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 예를 들어, 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자일 수 있고, 상기 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 예를 들어, 에셰리키아 콜라이(Escherichia coli)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(maa , 서열번호 16), 스타필로코커스 카노수스(Staphylococcus carnosus)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Sc-maa, 서열번호 17), 할알칼리코커스 젓갈리(Halalkalicoccus jeotgali)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Hj-maa, 서열번호 18), 락토바실러스 브레비스(Lactobacillus brevis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Lb-maa, 서열번호 19), 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Bs-maa, 서열번호 20) 또는 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자(Pp-maa, 서열번호 21)일 수 있고, 바람직하게는 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 말토오스 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 미생물은 다이아세틴에 아세틸기를 전이하는 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자를 더 발현하는 것일 수 있다.
상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7의 아미노산 서열의 위치 31에 상응하는 위치의 아미노산이 시스테인(CYS) 또는 류신(LEU)이고, 위치 102에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 이소류신(ILE)이고, 위치 143에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 166에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 170에 상응하는 위치의 아미노산이 발린(VAL), 이소류신(ILE), 또는 류신(LEU)이고, 위치 193에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 클로람페니콜 저항성 항생제 마커를 갖는 벡터에 존재할 수 있고, 예를 들어 pSTV28 벡터일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 예를 들어, 바실러스 세레우스(Bacillus cereus), 슈도모나스 애루기노사(Pseudomonas aeruginosa) 또는 클로스트리디움 아세토부틸리쿰(Clostridium acetobutylicum)의 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자일 수 있고, 바람직하게는 바실러스 세레우스(Bacillus cereus)의 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 제2 O-아세틸 전이효소는 그 아미노산 서열이 서열번호 7의 아미노산 서열과 상동성이 32% 이상일 수 있다.
또한, 상기 미생물은 아세틸에스테라제(acetylesterase)를 코딩하는 유전자가 감쇄 또는 결실된 것일 수 있다.
에스터 화합물인 아세틴은 에스터 결합 분해 효소(esterases)에 의해서 글리세롤과 아세테이트로 분해될 수 있고, 상기 아세틴을 분해하는 에스터 결합 분해 효소는 예를 들어 아세틸에스테라제일 수 있다.
상기 아세틸에스테라제를 코딩하는 유전자(aes)가 감쇄 또는 결실된 미생물의 경우 아세틸에스테라제를 발현하지 않아, 아세틴의 생산량을 증가시킬 수 있다.
상기 아세틸에스테라제는 미생물 종류에 따라 다른 서열을 가질 수 있고, 이를 코딩하는 유전자도 마찬가지로 다른 서열을 가질 수 있는 바, 해당 미생물에서 아세틸에스테라제를 코딩하는 유전자가 감쇄 또는 결실된 것일 수 있다. 예를 들어, 대장균의 경우, 서열번호 13의 아세틸에스테라제를 코딩하는 서열번호 30의 유전자가 감쇄 또는 결실된 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 미생물은 전술한 바와 같으나, 구체적으로 대장균(E.coli)일 수 있고, 보다 구체적으로는 DH5α, DH5α(DE3), AceCo, BW25113, W3110 또는 MG1655일 수 있고, 바람직하게는 MG1655일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 미생물은 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자를 더 발현하는 것일 수 있다.
전술한 바와 같이 상기 미생물은 글리세롤 3-인산 탈수소효소 및 글리세롤 3-탈인산효소를 발현하며, 포도당은 해당경로 및 상기 효소들을 통해 글리세롤로 변환될 수 있다.
상기 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase)를 코딩하는 유전자(Gpd1)는 미생물 종류에 따라 다른 염기 서열을 가질 수 있고, 해당 미생물에서 해당경로의 중간대사물질인 글리세론 인산(glycerone phosphate, DHAP)을 글리세롤 3-인산(glycerol-3-phosphate, G3P)으로 전환할 수 있는 것이면 족하다. 예를 들어, 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 경우, 서열번호 31의 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase)를 코딩하는 유전자(Sc-gpd1)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자(Gpp2)는 미생물 종류에 따라 다른 염기 서열을 가질 수 있고, 해당 미생물에서 해당경로의 중간대사물질인 글리세롤 3-인산(glycerol-3-phosphate, G3P)을 글리세롤(glycerol)로 전환할 수 있는 것이면 족하다. 예를 들어, 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 경우, 서열번호 32의 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae)의 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자(Sc-gpp2)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 글리세롤은 전술한 O-아세틸 전이효소 및 클로람페니콜-O-아세틸 전이효소 등에 의해 아세틴 복합물로 변환될 수 있다.
이하, 본 발명을 구체적으로 설명하기 위해 실시예를 들어 상세하게 설명하기로 한다. 하기 실시예에 사용된 플라스미드와 균주는 표 1에, PCR primer들은 표 2에 정리하였다.
Names | Descriptions | Sources |
Plasmids | ||
pSTV28 | P lac expression vector, pACYC184 origin, lacZα, Cmr | Takara Co., Ltd |
pTrc99A | P trc expression vector, pBR322 origin, lacIq, Ampr | Amersham Bioscience |
pET28a (+) | PT7 expression vector, pBR322 origin, lacI, and Kanr | Novagen |
pMD1 | pTrc99A vector containing lacA from E. coli | - |
pMD2 | pTrc99A vector containing cysE from E. coli | - |
pMD3 | pTrc99A vector containing yjgM from E. coli | - |
pMD4 | pTrc99A vector containing yjaB from E. coli | - |
pMD5 | pTrc99A vector containing yiiD from E. coli | - |
pMD6 | pTrc99A vector containing wecH from E. coli | - |
pMD7 | pTrc99A vector containing nhoA from E. coli | - |
pMD8 | pTrc99A vector containing maa from E. coli | - |
pMD9 | pTrc99A vector containing maa from S. carnosus | - |
pMD10 | pTrc99A vector containing maa from H. jeotgali | - |
pMD11 | pTrc99A vector containing maa from L. brevis | - |
pMD12 | pTrc99A vector containing maa from P. putida | - |
pMD13 | pTrc99A vector containing maa from B. subtilis | - |
pMD14 | pET28a vector containing maa from B. subtilis | - |
pT-CAT | pTrc99A vector containing cat from pSTV28 | - |
pMDT1 | pSTV28 vector containing maa from B. subtilis | - |
pMDT2 | pTrc99A vector containing cat from pSTV28 and maa from B. subtilis | - |
pMDT3 | pTrc99A vector containing oat from B. cereus and maa from B. subtilis | - |
pMDT4 | pTrc99A vector containing oat from P. aeruginosa and maa from B. subtilis | - |
pMDT5 | pTrc99A vector containing oat from C. acetobutylicum and maa from B. subtilis | - |
pMDT6 | pTrc99A vector containing oat from M. abscessus and maa from B. subtilis | - |
pMDT7 | pTrc99A vector containing oat from L. brevis and maa from B. subtilis | - |
pMDT8 | pMDT2 containing gpd1 and gpp2 from S. cerevisiae | - |
Strains | ||
MG1655 | E. coli K-12; F- lambda-, ilvG-, rfb-50, rph-1 | ATCC 700926 |
DH5α | E. coli K-12; F-, Φ80lacZ△M15, △(lacZYA-argF)U169, deoR, recA1, endA1, hsdR17(rK-, mK+) phoA, supE44, λ-, thi-1 | ATCC98040 |
BW25113 | △(araD-araB)567, △lacZ4787(::rrnB-3), lambda - , rph-1, △(rhaD-rhaB)568, hsdR514 | NBRP, NIG |
AceCo | MG1655 △ackA-pta, poxB, ldhA, dld, adhE, pps, atoDA | Ref. 1 |
W3110 | E. coli K-12; F-, λ- IN (rrnD-rrnE)1 | ATCC27325 |
DH5α (DE3) | E. coli K-12; F-, Φ80lacZ△M15, △(lacZYA-argF)U169, deoR, recA1, endA1, hsdR17(rK-, mK+) phoA, supE44, λ-, thi-1, λ(DE3) | - |
JW0465 | BW25113 △aes | NBRP, NIG |
DH-MD0 | E. coli DH5α harboring pTrc99A | - |
DH-MD1 | E. coli DH5α harboring pMD1 | - |
DH-MD2 | E. coli DH5α harboring pMD2 | - |
DH-MD3 | E. coli DH5α harboring pMD3 | - |
DH-MD4 | E. coli DH5α harboring pMD4 | - |
DH-MD5 | E. coli DH5α harboring pMD5 | - |
DH-MD6 | E. coli DH5α harboring pMD6 | - |
DH-MD7 | E. coli DH5α harboring pMD7 | - |
DH-MD8 | E. coli DH5α harboring pMD8 | - |
DH-MD9 | E. coli DH5α harboring pMD9 | - |
DH-MD10 | E. coli DH5α harboring pMD10 | - |
DH-MD11 | E. coli DH5α harboring pMD11 | - |
DH-MD12 | E. coli DH5α harboring pMD12 | - |
DH-MD13 | E. coli DH5α harboring pMD13 | - |
DH-MD14 | E. coli DH5α(DE3) harboring pMD14 | - |
DH-MDT1 | E. coli DH5α harboring pMDT1 | - |
DH-EMPT | E. coli DH5α harboring pTrc99A | - |
DH-CAT | E. coli DH5α harboring pT-CAT | - |
DH-MDT2 | E. coli DH5α harboring pMDT2 | - |
DH-MDT3 | E. coli DH5α harboring pMDT3 | - |
DH-MDT4 | E. coli DH5α harboring pMDT4 | - |
DH-MDT5 | E. coli DH5α harboring pMDT5 | - |
DH-MDT6 | E. coli DH5α harboring pMDT6 | - |
DH-MDT7 | E. coli DH5α harboring pMDT7 | - |
AC-MDT2 | E. coli AceCo harboring pMDT2 | - |
BW-MDT2 | E. coli BW25113 harboring pMDT2 | - |
W3-MDT2 | E. coli W3110 harboring pMDT2 | - |
MG-MDT2 | E. coli MG1655 harboring pMDT2 | - |
BW-Empty | E. coli BW25113 harboring pTrc99A | - |
BW-Aes | E. coli BW25113 harboring pT-Aes | - |
BW-MDT2 (Daes) | E. coli JW0465 harboring pMDT2 | - |
DH-MDT8 | E. coli DH5α harboring pMDT8 | - |
Ref. 1. Kim, J.-H. et al. Isoprene production by Escherichia coli through the exogenous mevalonate pathway with reduced formation of fermentation byproducts. Microbial Cell Factories 15, 214 (2016).
Primers a, b, c | Descriptions (5'-> 3') | 서열번호 |
Ec-lacA-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGGAACATGCCAATGACCG | 33 |
Ec-lacA-R | GTTTCTAGATTAAACTGACGATTCAACTTTATAATC | 34 |
Ec-cysE-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGTCGTGTGAAGAACTGGAAATTG | 35 |
Ec-cysE-R | GTTTCTAGATTAGATCCCATCCCCATACTC | 36 |
Ec-yjgm-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGAATAACATTGCGCCGC | 37 |
Ec-yjgM-R | GTTTCTAGATTAGAGTTCGCGCAACATCC | 38 |
Ec-yjaB-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGGTTATTAGTATTCGCCGCTC | 39 |
Ec-yjaB-R | GTTTCTAGATTACGCCCCCACATACGC | 40 |
Ec-yiiD-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGAGCCAGCTTCCAGGG | 41 |
Ec-nhoA-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGACGCCCATTCTGAATCAC | 42 |
Ec-nhoA-R | GTTTCTAGATTATTTTCCCGCCTCCGGG | 43 |
Ec-wecH-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGCAGCCCAAAATTTACTGG | 44 |
Ec-WecH-R | GTTTCTAGATTAACTCACTAATCTGTTTCTGTCG | 45 |
Ec-yiiD-R | GTTTCTAGATTACTCTTCTTCGTTCCCGC | 46 |
Ec-maa-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGAGCACAGAAAAAGAAAAGATG | 47 |
Ec-maa-R | GTTTCTAGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTG | 48 |
Sc-maa-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGACCACCGAGAAGGAAAAAATG | 49 |
Sc-maa-R | GTTTCTAGATTAATCCAGCGGCACTTCAC | 50 |
Hj-maa-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGACCAGCGAGAAGGAACG | 51 |
Hj-maa-R | GTTTCTAGATTAATCAACGTCCTTCAGCACA | 52 |
Lb-maa-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGGACAAGAGCGAGAAGG | 53 |
Lb-maa-R | GTTTCTAGATTATTTCAGCGGCTTAATCAC | 54 |
Pp-maa-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGAGCCTGAGCGAGAAGCAC | 55 |
Pp-maa-R | GTTTCTAGATTATTGACCCTGATCCGGCTG | 56 |
Bs-maa-F | CTGGATCC AGGAGGTAATAAAATGCTGCGTACCGAGAAGG | 57 |
Bs-maa-R | GTTTCTAGATTACAGTTGTTTCAGAATACGCGC | 58 |
Cat-F | CTAGGAGCTC AGGAGAAATATAATGGAGAAAAAAATCACTGGATATAC | 60 |
Cat-R | CTGGATCCTTACGCCCCGCCCTGCC | 61 |
Trc-Bs.maa-F | AGATCTGAGTCGACAGTATCGGCGGG | 62 |
Trc-Bs.maa-R | TATATTTCTCCTGAGGATCCCCGGGTACCG | 63 |
Bc-Oat-F | CTCGGTACCCGG GGATCC TC AGGAGAAATATAATGGACTTCCACCAGATC | 64 |
Bc-Oat-R | CCCGCCGATACT GTCGACAGATCTTACAGCCATTCCTCAAAG | 65 |
Ca-Oat-F | CTCGGTACCCGG GGATCC TC AGGAGAAATATAATGAACAGCAACTTCCAC | 66 |
Ca-Oat-R | CCCGCCGATACT GTCGACAGATCTTAACGAATCCACTCTTTC | 67 |
Lb-Oat-F | CTCGGTACCCGG GGATCC TC AGGAGAAATATAATGACCGAGCTGAACACCC | 68 |
Lb-Oat-R | CCCGCCGATACT GTCGACAGATCTTACGCGGTCAGCCACAG | 69 |
Ma-Oat-F | CTCGGTACCCGG GGATCC TC AGGAGAAATATAATGCCGGCGGAGCACGCG | 70 |
Ma-Oat-R | CCCGCCGATACT GTCGACAGATCTTAATCACGAACCCAATCCGGGTCCG | 71 |
Pa-Oat-F | CTCGGTACCCGG GGATCC TC AGGAGAAATATAATGAGCTACACCCGTGTTG | 72 |
Pa-Oat-R | CCCGCCGATACT GTCGACAGATCTTAGCCACCCGCTTCATC | 73 |
Ec-aes-F | CTGGATCCGTCACCCAACCCTTTATGAAGCCGGAAAACAAACTACC | 74 |
Ec-aes-R | TATCGTCGACTTAAAGCTGAGCGGTAAAGAACTG | 75 |
Sc-gpd1-F | GCGGATCC AGGAGGTAATAAAATGTCTGCTGCTGCTGATAGATTAAAC | 76 |
Sc-gpd1-R | AATGCTGCAGTTAATCTTCATGTAGATCTAATTCTTCAATC | 59 |
Sc-gpp2-F | TGCTGCAG AGGAGGTAATTTATATGGGATTGACTACTAAACCTCTATC | 22 |
Sc-gpp2-R | CCCAAGCTTACCATTTCAACAGATCGTCC | 23 |
aRestriction enzyme sites are underlined.bRBS sequences are italic.
cThe overlapping sequences are bolded.
실시예
1. 대장균 유래 O-acetyltransferases 효소들을 이용한 모노아세틴과 다이아세틴 생산
모노아세틴과 다이아세틴을 생산하기 위해서 글리세롤에 아세틸기를 전이할 수 있는 대장균 내의 O-acetyltransferases 후보 유전자들을 8종 선별하고 각 유전자들을 pTrc99A 발현벡터(서열번호 78)에 클로닝해서 플라스미드 pMD1 - pMD8를 구축하였다. 후보 유전자들은 galactoside O-acetyltransferase, maltose O-acetyltransferase(서열번호 1), serine acetyltransferase, O-acetyltransferase WecH, arylamine N-acetyltransferase를 각각 코딩하는 lacA(서열번호 80), maa(서열번호 16), cysE(서열번호 81), wecH(서열번호 82), nhoA(서열번호 83)와 3종의 O-acetyltransferase 추정 유전자 yjgm(서열번호 84), yjaB(서열번호 85), yiiD(서열번호 86)를 대장균 MG1655의 염색체를 주형으로 해서 PCR 증폭을 통해서 얻었다. 이 때 사용한 PCR primer들은 Ec-lacA-F(서열번호 33)/Ec-lacA-R(서열번호 34), Ec-maa-F(서열번호 47)/Ec-maa-R(서열번호 48), Ec-cysE-F(서열번호 35)/Ec-cysE-R(서열번호 36), Ec-wecH-F(서열번호 44)/Ec-wecH-R(서열번호 45), Ec-nhoA-F(서열번호 42)/Ec-nhoA-R(서열번호 43), Ec-yjgm-F(서열번호 37)/Ec-yjgM-R(서열번호 38), Ec-yjaB-F(서열번호 39)/Ec-yjaB-R(서열번호 40), Ec-yiiD-F(서열번호 41)/Ec-yiiD-R(서열번호 46)이다. 상기 PCR 반응산물은 BamHI과 XbaI을 이용해서 pTrc99A 벡터에 클로닝 되었다. 이렇게 구축한 플라스미드 pDM1 - pDM8로 대장균 DH5α를 형질전환해서 재조합균주 DH-MD1 ~ DH-MD8을 만들고 모노아세틴 및 다이아세틴 생성을 분석하였다(도 3).
종 배양은 LB 복합배지(10 g tryptone, 5 g yeast extract and 10 g sodium chloride per liter)를 이용해서 37℃에서 약 12시간 진탕 배양을 했다. 본 배양은 M9 최소배지(Na2HPO4·7H2O, 12.8 g/L; KH2PO4, 3g/L; NaCl, 0.5 g/L; NH4Cl, 1 g/L; MgSO4, 1mM; CaCl2, 100 mM)에 5 g/L의 yeast extract와 2% (v/v)의 glycerol을 첨가하고, 배양온도 37℃와 진탕속도 250rpm에서 48시간 동안 진행했다. 재조합균주에 도입된 플라스미드의 항생제 마커에 따라서 100 mg/L ampicillin, 50 mg/L chloramphenicol, 또는 50 mg/L kanamycin 항생제를 첨가했다. 본 배양의 초기 균체 농도는 OD600nm에서 0.1이 되게 하였고, 플라스미드에 도입한 유전자들의 발현을 위해서 0.5 mM Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside (IPTG)를 배양 초기에 첨가하였다.
아세틴 화합물의 분석은 HP-INNOVAX column (19091N-133, 30 m in length, 0.250 mm in internal diameter and 0.25 μm film thicknesses)이 장착된 GC (Agilent Technologies 7890A, 미국)와 GC-MS (GC-MS-QP2010, SHIMADZU, 일본)를 이용했다. 아세틴 표준화합물은 Sigma (미국)에서 구입하였다. 본 배양에서 생산된 아세틴 복합물은 ethyl acetate 용매를 이용해서 배양액으로부터 추출하고, 추출 시료의 1 μL를 GC 또는 GC-MS에 주입하였다. GC의 오븐 온도는 50℃에서 시작해서 20℃/min의 속도로 90℃까지, 15℃/min의 속도로 150℃까지, 20℃/min의 속도로 190℃까지, 15℃/min의 속도로 230℃까지 올리고, 2 분간 유지하였다. 불꽃 이온 검출기(FID)의 온도는 280℃로 유지했다. 상기 분석방법에 따른 분석결과는 도 5에 나타내었다.
도 3의 재조합균주 DH-MD1 ~ DH-MD8의 배양결과에 따르면 pMD8 플라스미드로 형질전환된 DH-MD8 균주에서만 모노아세틴과 다이아세틴이 생산되었다. 이것은 대장균 유래 8종의 O-acetyltransferases 후보 유전자들 중에서 maltose O-acetyltransferase 유전자(maa)만이 글리세롤에 아세틸기를 전이할 수 있는 능력이 있다는 것이다.
2. 대장균 Maa 유사 효소들을 이용한 모노아세틴 생산
대장균에서 발굴된 Maa 보다 더 우수한 활성을 갖는 O-acetyl transferases를 발굴하기 위해서 대장균 Maa의 아미노산 서열로 BLAST 검색을 하고, Staphylococcus carnosus, Halalkalicoccus jeotgali, Lactobacillus brevis, Bacillus subtilis, Pseudomonas putida 미생물로부터 추가로 5종의 maltose O-acetyl transferases(Sc-mOat(서열번호 2), Hj-mOat(서열번호 3), Lb-mOat(서열번호 4), Bs-mOat(서열번호 5), Pp-mOat(서열번호 6))를 확보하고 이들을 대장균에 발현 한 후에 모노아세틴과 다이아세틴 생산성을 비교했다(도 3).
상기 미생물 유래 유전자들은 숙주인 대장균에서의 발현을 최적화하기 위해서 GenScript (미국)에서 대장균 코돈 이용도에 맞춰서 합성을 했다. 상기 합성한 유전자들을 Sc-maa-F(서열번호 49)/Sc-maa-R(서열번호 50), Hj-maa-F(서열번호 51)/Hj-maa-R(서열번호 52), Lb-maa-F(서열번호 53)/Lb-maa-R(서열번호 54), Pp-maa-F(서열번호 55)/Pp-maa-R(서열번호 56), Bs-maa-F(서열번호 57)/Bs-maa-R(서열번호 58)의 PCR primers를 이용해서 증폭하여 얻은 Sc-maa(서열번호 17), Hj-maa(서열번호 18), Lb-maa(서열번호 19), Pp-maa(서열번호 21), Bs-maa(서열번호 20) 유전자를 BamHI과 XbaI을 이용해서 pTrc99A 벡터에 클로닝 하였다. 이렇게 구축한 플라스미드 pMD9 - pMD13로 대장균 DH5α를 형질전환해서 재조합균주 DH-MD9 ~ DH-MD13을 만들고 모노아세틴과 다이아세틴 생산성을 비교하였다(도 3).
비교 결과 B. subtilis의 Maa (Bs-maa)가 가장 높은 모노아세틴과 다이아세틴 생산성을 보인 것을 확인하였다. 배양방법과 분석방법은 실시예 1과 동일하다.
3. Chloramphenicol-O-acetyltransferase를 이용한 트리아세틴 생산
모노아세틴과 다이아세틴 생산성이 가장 좋았던 B. subtilis의 Maa 유전자(Bs-maa)의 발현 최적화를 위해서 pTrc99A(서열번호 78), pET28a(서열번호 79), pSTV28(서열번호 77) 등의 다양한 발현벡터에 클로닝해서 pMD13, pMD14, pMDT1) 플라스미드를 구축하고, 이 플라스미드들로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MD13, DH-MD14, DH-MDT1를 만들었다. T7 프로모터를 갖는 pMD14의 형질전환 숙주 균주로는 대장균 DH5α(DE3)를 이용했다. DH5α(DE3) 균주는 Novagen 회사(미국)의 λDE3 Lysogenization Kit를 이용해서 대장균 DH5α로부터 만들었다. DH-MDT1 균주에서 모노아세틴과 다이아세틴 생산성이 가장 높았을 뿐만 아니라 트리아세틴의 생산까지 관찰되었다(도 4).
이것은 pSTV28 벡터의 항생제 마커인 chloramphenicol-O-acetyltransferase (CAT, 서열번호 7)에 의한 것으로 추정된다. CAT은 광범위한 기질특이성을 갖고 있어서 다양한 기질들에 아세틸기를 전이시키는 것으로 알려져 있다. 모노아세틴과 다이아세틴에 추가적인 아세틸기 전이를 통해 트리아세틴(triacetin)을 생산하는 CAT 효소 유전자(cat, 서열번호 24)의 발현을 강화하기 위해서 pMD13 플라스미드의 Bs-maa 유전자 앞에 도입한 pMDT2 플라스미드를 구축하였다(도 6).
이를 위해서 Cat-F(서열번호 60)/Cat-R(서열번호 61)의 PCR primers를 이용해서 pSTV28로부터 cat 유전자를 PCR 증폭하고, SacI과 BamHI으로 절단해서 pMD13의 해당 제한효소 부위로 도입하였다. pMDT2로 형질전환 된 DH-MDT2 제조합균주의 모노아세틴, 다이아세틴, 트리아세틴의 복합물 생산량과 트리아세틴의 비율이 모두 DH-MDT1 균주에 비해서 크게 증가했다. 배양방법과 분석방법은 실시예 1과 동일하다.
4. CAT 유사 효소들을 이용한 트리아세틴 화합물 생산
모노아세틴과 다이아세틴을 트리아세틴으로 전환하는 효소들을 추가로 발굴하기 위해서 CAT 효소의 아미노산 서열로 BLAST 검색을 실시하였다. 이 검색을 통해서 상동성이 높은 5종의 O-acetyltransferases (OAT, Bc-OAT(서열번호 8), Pa-OAT(서열번호 9), Ca-OAT(서열번호 10), Ma-OAT(서열번호 11), Lb-OAT(서열번호 12))를 Bacillus cereus, Pseudomonas aeruginosa, Clostridium acetobutylicum, Mycobacterium abscessus, Lactobacillus brevis에서 도출하고 숙주인 대장균에서의 발현을 최적화하기 위해서 GenScript 회사(미국)에서 대장균 코돈 이용도에 맞춰서 합성을 했다.
상기 미생물 유래 OAT 합성 유전자들(Bc-Oat(서열번호 25), Pa-Oat(서열번호 26), Ca-Oat(서열번호 27), Ma-Oat(서열번호 28), Lb-Oat(서열번호 29))을 Bc.Oat-F(서열번호 64)/Bc.Oat-R(서열번호 65), Pa.Oat-F(서열번호 72)/Pa.Oat-R(서열번호 73), Ca.Oat-F(서열번호 66)/Ca.Oat-R(서열번호 67), Ma.Oat-F(서열번호 70)/Ma.Oat-R(서열번호 71), Lb.Oat-F(서열번호 68)/Lb.Oat-R(서열번호 69)의 PCR primers를 이용해서 증폭한다.
이렇게 증폭한 각 유전자들의 단편은 pMD13 기반의 플라스미드 골격과 HiFi DNA assembly 방법으로 연결해서 플라스미드 pMDT3 ~ pMDT7을 구축하였다(도 7).
HiFi DNA assembly는 NEB 회사(미국)의 HiFi DNA assembly kit를 이용했고, 상기 pMD13 기반의 플라스미드 골격은 pMD13을 주형으로 Trc-Bs.maa-F(서열번호 62)와 Trc-Bs.maa-R(서열번호 63)를 PCR primer로 PCR을 수행해서 얻었다. pMDT3 ~ pMDT7 플라스미드로 형질전환 된 재조합균주 DH-MDT2 ~ DH-MDT7의 아세틴 복합물 생산량을 비교하였다(도 7).
그 결과 OAT 유전자 종류에 따라서 아세틴 복합물의 생산량에 큰 차이가 있었고, L. brevis와 M. abscessus 유래의 O-acetyltransferase는 트리아세틴 생산 능력이 없었고, B. cereus, P. aeruginosa, C. acetobutylicum의 유래의 O-acetyltransferase는 트리아세틴을 생산했지만 pSTV28의 항생제 마커인 CAT에 비해서는 생산성이 낮았다. 배양방법과 분석방법은 실시예 1과 동일하다.
5. 대장균 균종 및 글리세롤 첨가량에 따른 아세틴 복합물 생성량 변화
앞의 실시예들에서 숙주로 대장균 DH5α를 이용했다. 대장균의 종류에 따른 아세틴 화합물의 생산성을 비교하기 위해서 본 실시예에서는 숙주로 대장균 AceCo, BW25113, W3110, MG1655를 플라스미드 pMDT2로 형질전환 한 재조합 대장균 DH-MDT2, AC-MDT2, BW-MDT2, W3-MDT2, MG-MDT2를 배양해서 아세틴 복합물 생산성을 비교했다(도 8A, 8B).
재조합균주 MG-MDT2에서 아세틴 복합물 생산성이 가장 높았기 때문에 대장균 MG1655가 아세틴 화합물 생산에 가장 적합한 숙주라는 것을 알았다. 배양방법과 분석방법은 실시예 1과 동일하다.
가장 높은 아세틴 화합물 생산성을 보인 재조합균주 MG-MDT2에서 기질인 글리세롤 첨가량에 따른 아세틴 화합물 생산성을 고찰하기 위해서 모든 배양조건과 분석방법은 실시예1과 동일하고 다만 첨가하는 글리세롤의 농도를 2 ~ 15% (v/v)로 변화시켰다(도 8C, 8D).
아세틴 복합물의 생산량은 출발기질인 글리세롤의 첨가량이 증가할수록 높아졌으나, 15% 이상의 과도한 글리세롤 첨가의 경우에는 과도한 삼투압 증가의 영향으로 균체 증식과 아세틴 생산이 모두 감소하는 결과를 얻었다.
6. 아세틴 화합물을 분해하는 효소 유전자 제거를 통한 생산성 향상
에스터 화합물인 아세틴은 에스터 결합 분해 효소(esterases, 서열번호 13)에 의해서 글리세롤과 아세테이트로 분해될 수 있기 때문에 대장균의 acetylesterase 효소 유전자(aes, 서열번호 30)의 증폭 또는 결손의 영향을 고찰했다(도 9).
Aes 유전자 단편은 대장균 MG1655의 염색체를 주형으로 Ec-aes-F(서열번호 74)와 Ec-aes-R(서열번호 75)을 프라이머로 이용해서 PCR 증폭해서 얻었고, BamHI과 SalI 제한효소로 pTrc99A에 클로닝 해서 플라스미드 pTAes를 구축하였다. Aes 효소에 의한 트리아세틴의 분해를 관찰하기 위해서 대장균 BW25113을 공벡터 pTrc99A와 플라스미드 pTAes로 형질전환한 재조합균주 BW-Empty와 BW-Aes를 제조하고, 트리아세틴 표준화합물 15 g/L가 첨가된 배지에서 배양하였다. 배양조건은 상기 실시 예들에서 이용한 아세틴 복합물 생산조건과 동일하게 수행하였다(도 9A, 9B).
BW-Empty와 BW-Aes 균주에서 모두 트리아세틴 표준화합물의 분해가 일어났지만 분해의 정도는 aes 유전자를 과발현시킨 BW-Aes에서 훨씬 더 큰 것을 확인했다. 트리아세틴의 분해로 배양액에는 소량의 다이아세틴이 측정되었지만 모노아세틴은 검출되지 않았다. 이것은 모노아세틴의 분해가 더 빠르게 일어나기 때문인 것으로 추정된다.
Aes가 아세틴 화합물을 분해한다는 상기 결과로부터 유전자 aes가 결손된 JW0465와 야생형 균주인 BW25113을 pMDT2로 형질전환 해서 재조합균주 BW-MDT2와 BW-MDT2(Daes)를 제조하고, 이들 재조합 균주들에서의 아세틴 복합물 생산과 균체 증식을 비교했다(도 9C, 9D).
JW0465 균주는 BW25113 균주에서 aes 유전자가 결손된 균주로 NBRP (NIG, 일본)에서 분양을 받았다. 기질인 글리세롤을 10% (v/v) 첨가한 2YT 복합배지(16 g tryptone, 10 g yeast extract, and 5 g sodium chloride per liter)에서 배양을 했고, 기타 배양 및 분석조건은 상기 실시 예들과 동일하게 실시하였다.
Aes가 결손된 BW-MDT2(Daes) 균주에서 아세틴의 분해가 차단됨으로써 아세틴 복합물 생산량이 BW-MDT2 균주에 비해서 약 2배 이상 높은 것을 확인했다. 반면에 두 재조합 균주의 균체 증식에서는 차이가 없었다. 이 결과로부터 Aes가 아세틴 화합물의 분해에 관련되고, 이 유전자를 결손하면 아세틴 복합물의 생산성을 향상시킬 수 있다는 것을 알았다.
7. 포도당을 기질로 이용한 아세틴 화합물의 생산
도 2에 제시한 바와 같이 해당경로(Embden-Meyerhof pathway)의 중간 대사산물인 글리세론 인산(glycerone phosphate, DHAP)은 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase)와 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)에 의해 글리세롤 3-인산을 거쳐서 글리세롤로 전환될 수 있다. 따라서 포도당을 출발기질로 하는 아세틴 복합물의 생산도 글리세롤 3-인산 탈수소효소와 글리세롤 3-탈인산효소의 추가 과발현을 통해서 가능하다. 글리세롤 3-인산 탈수소효소와 글리세롤 3-탈인산효소로 사카라마이세스 세레비지애(Saccharomyces cerevisiae) 유래의 Gpd1(서열번호 14)과 Gpp2(서열번호 15)를 이용했다.
도 10은 포도당으로부터 아세틴 복합물 생산을 위해서 사카라마이세스 세레비지애 유래 글리세롤 생산 유전자인 Sc-gpd1(서열번호 31)과 Sc-gpp2(서열번호 32)를 pMDT2 플라스미드에 클로닝해서 만들어진 플라스미드 pMDT8의 구조 도면(A)과 이 플라스미드로 형질전환 된 재조합 대장균 DH-MDT8의 포도당으로부터의 아세틴 복합물 생산과 균체 증식, 배양액의 pH변화를 대조구인 DH-MDT2와 비교한 도면(B), 도면(C), 도면(D)를 나타내고 있다.
사카라마이세스 세레비지애의 염색체를 주형으로 Sc-gpd1-F(서열번호 76)와 Sc-gpd1-R(서열번호 59)을 프라이머로 이용해서 Sc-gpd1을 PCR 증폭하고, Sc-gpp2-F(서열번호 22)와 Sc-gpp2-R(서열번호 23)을 프라이머로 이용해서 Sc-gpp2을 PCR 증폭해서, 전자는 BamHI과 PstI 제한효소로, 후자는 PstI과 HindIII 제한효소로 절단해서 pMDT2 플라스미드의 해당 제한효소 부위로 도입해서 플라스미드 pMDT8를 구축했다. 배양은 재조합균주 DH-MDT2와 DH-MDT8을 글리세롤 대신에 포도당 1% (w/v)를 첨가한 2YT 복합배지에서 접종해서 48시간 동안 진행했다. 기타 배양 및 분석조건은 상기 실시 예와 동일하게 수행했다.
두 재조합 균주 중에서 유전자 Sc-gpd1과 Sc-gpp2가 발현된 DH-MDT8 균주에서만 아세틴 복합물이 생산되었고, 균체 증식 및 배양액의 pH는 유사했다.
<110> GYEONGSANG NATIONAL UNIVERSITY OFFICE OF ACADEMY AND INDUSTRY COLLABORATION
KYUNGPOOK NATIONAL UNIVERSITY INDUSTRY-ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION
<120> A BIOLOGICAL METHOD FOR PREPARING ACETINS
<130> 18P01058
<150> KR 10-2018-0129090
<151> 2018-10-26
<160> 86
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
<211> 183
<212> PRT
<213> Escherichia coli
<400> 1
Met Ser Thr Glu Lys Glu Lys Met Ile Ala Gly Glu Leu Tyr Arg Ser
1 5 10 15
Ala Asp Glu Thr Leu Ser Arg Asp Arg Leu Arg Ala Arg Gln Leu Ile
20 25 30
His Arg Tyr Asn His Ser Leu Ala Glu Glu His Thr Leu Arg Gln Gln
35 40 45
Ile Leu Ala Asp Leu Phe Gly Gln Val Thr Glu Ala Tyr Ile Glu Pro
50 55 60
Thr Phe Arg Cys Asp Tyr Gly Tyr Asn Ile Phe Leu Gly Asn Asn Phe
65 70 75 80
Phe Ala Asn Phe Asp Cys Val Met Leu Asp Val Cys Pro Ile Arg Ile
85 90 95
Gly Asp Asn Cys Met Leu Ala Pro Gly Val His Ile Tyr Thr Ala Thr
100 105 110
His Pro Ile Asp Pro Val Ala Arg Asn Ser Gly Ala Glu Leu Gly Lys
115 120 125
Pro Val Thr Ile Gly Asn Asn Val Trp Ile Gly Gly Arg Ala Val Ile
130 135 140
Asn Pro Gly Val Thr Ile Gly Asp Asn Val Val Val Ala Ser Gly Ala
145 150 155 160
Val Val Thr Lys Asp Val Pro Asp Asn Val Val Val Gly Gly Asn Pro
165 170 175
Ala Arg Ile Ile Lys Lys Leu
180
<210> 2
<211> 185
<212> PRT
<213> Staphylococcus carnosus
<400> 2
Met Thr Thr Glu Lys Glu Lys Met Leu Ser Gly Gln Leu Tyr Asn Ser
1 5 10 15
Arg Asp Pro Gln Leu Val Lys Glu Arg His Lys Ala Arg His Ala Thr
20 25 30
Lys Ala Ile Asn Asn Ala Phe Ser Ile Lys Glu Arg His Phe Leu Leu
35 40 45
Arg Gln Ser Ile Gly His Cys Gly Asp Asn Val Phe Ile Glu Pro Asp
50 55 60
Ile His Phe Asp Tyr Gly Tyr Asn Ile Ser Leu Gly Asn His Phe Tyr
65 70 75 80
Ala Asn Phe Asn Pro Val Met Leu Asp Val Ala Pro Ile Thr Ile Gly
85 90 95
Asn His Val Leu Leu Gly Pro Asn Val Gln Leu Ile Thr Ala Thr His
100 105 110
Pro Leu Asn Pro Ala Glu Arg Ala Ser Gly Leu Glu Leu Ala Phe Pro
115 120 125
Ile Met Ile Gly Asp His Val Trp Ile Gly Ala Gly Ala Ile Val Leu
130 135 140
Pro Gly Val Thr Ile Gly Asp Asn Val Val Val Gly Ala Gly Ser Val
145 150 155 160
Val Thr Lys Asp Ile Pro Asp Asn Gln Val Val Ala Gly Asn Pro Ala
165 170 175
Arg Phe Ile Arg Glu Val Pro Leu Asp
180 185
<210> 3
<211> 184
<212> PRT
<213> Unknown
<220>
<223> Halalkalicoccus jeotgali
<400> 3
Met Thr Ser Glu Lys Glu Arg Met Leu Arg Gly Glu Pro Tyr Asp Ala
1 5 10 15
Ser Asp Ser Glu Leu Val Ala Glu Arg Gln His Ala Arg Glu Leu Thr
20 25 30
Arg Lys Tyr Asn Arg Thr Thr Ala Thr Glu Ser Asp Arg Arg Glu Arg
35 40 45
Leu Leu Glu Glu Leu Phe Gly Ser Val Glu Asp Ala Thr Val Glu Pro
50 55 60
Pro Ile Arg Cys Asp Tyr Gly Tyr Asn Val His Val Gly Glu Asn Phe
65 70 75 80
Tyr Ala Asn Phe Asp Cys Val Ile Leu Asp Val Arg Arg Val Glu Phe
85 90 95
Gly Thr Arg Cys Leu Leu Gly Pro Gly Val His Val Tyr Thr Ala Thr
100 105 110
His Pro Leu Asp Ala Glu Glu Arg Ala Ala Gly Leu Glu Ser Gly Ala
115 120 125
Pro Val Thr Val Gly Asp Asp Val Trp Ile Gly Gly Arg Ala Val Leu
130 135 140
Asn Ser Gly Val Ser Val Gly Asp Gly Ser Val Ile Ala Ser Gly Ala
145 150 155 160
Val Val Thr Glu Asp Val Pro Ala Gly Ala Leu Val Gly Gly Asn Pro
165 170 175
Ala Arg Val Leu Lys Asp Val Asp
180
<210> 4
<211> 187
<212> PRT
<213> Lactobacillus brevis
<400> 4
Met Asp Lys Ser Glu Lys Glu Lys Met Ile Thr Gly Glu Leu Phe Asn
1 5 10 15
Val Tyr Asp Pro Glu Leu Val Ala Glu Arg Gly Ala Ala Arg Gln Gln
20 25 30
Val Glu Ala Leu Asn Glu Leu Gly Glu Gln Asp Pro Glu Lys Ser Gln
35 40 45
Gln Leu Val Lys Arg Leu Phe Gly Ala Thr Gly Asp Gln Val Glu Val
50 55 60
His Ala Thr Phe Arg Cys Asp Tyr Gly Tyr Asn Ile Tyr Val Gly Glu
65 70 75 80
Asn Phe Phe Ala Asn Tyr Asp Cys Thr Ile Leu Asp Val Ala Pro Ile
85 90 95
Arg Ile Gly Lys His Cys Leu Leu Gly Pro Lys Val Gln Ile Tyr Ser
100 105 110
Val Asn His Pro Ala Glu Pro Glu Leu Arg Arg Asn Gly Ala Met Gly
115 120 125
Ile Gly Lys Pro Val Thr Leu Gly Asp Asp Val Trp Val Gly Gly Gly
130 135 140
Ala Ile Ile Cys Pro Gly Val Thr Leu Gly Asp Asn Val Ile Val Ala
145 150 155 160
Ala Gly Ala Val Val Thr Lys Ser Phe Gly Ser Asn Val Val Leu Gly
165 170 175
Gly Asn Pro Ala Arg Val Ile Lys Pro Leu Lys
180 185
<210> 5
<211> 184
<212> PRT
<213> Bacillus subtilis
<400> 5
Met Leu Arg Thr Glu Lys Glu Lys Met Ala Ala Gly Glu Leu Tyr Asn
1 5 10 15
Ser Glu Asp Gln Gln Leu Leu Leu Glu Arg Lys His Ala Arg Gln Leu
20 25 30
Ile Arg Gln Tyr Asn Glu Thr Pro Glu Asp Asp Ala Val Arg Thr Lys
35 40 45
Leu Leu Lys Glu Leu Leu Gly Ser Val Gly Asp Gln Val Thr Ile Leu
50 55 60
Pro Thr Phe Arg Cys Asp Tyr Gly Tyr His Ile His Ile Gly Asp His
65 70 75 80
Thr Phe Val Asn Phe Asp Cys Val Ile Leu Asp Val Cys Glu Val Arg
85 90 95
Ile Gly Cys His Cys Leu Ile Ala Pro Gly Val His Ile Tyr Thr Ala
100 105 110
Gly His Pro Leu Asp Pro Ile Glu Arg Lys Ser Gly Lys Glu Phe Gly
115 120 125
Lys Pro Val Thr Ile Gly Asp Gln Val Trp Ile Gly Gly Arg Ala Val
130 135 140
Ile Asn Pro Gly Val Thr Ile Gly Asp Asn Ala Val Ile Ala Ser Gly
145 150 155 160
Ser Val Val Thr Lys Asp Val Pro Ala Asn Thr Val Val Gly Gly Asn
165 170 175
Pro Ala Arg Ile Leu Lys Gln Leu
180
<210> 6
<211> 188
<212> PRT
<213> Pseudomonas putida
<400> 6
Met Ser Leu Ser Glu Lys His Lys Met Leu Thr Gly Gln Leu Tyr His
1 5 10 15
Ala Gly Cys Pro Glu Leu Gln Ala Glu Gln Ile Ala Asn Lys His Trp
20 25 30
Met His Arg Tyr Asn Asn Ser Val Glu Leu Leu Asn Asp Ala Arg His
35 40 45
Gly Leu Leu Val Glu His Phe Gly Gln Val Gly Glu Gly Ala Val Ile
50 55 60
Arg Pro Pro Phe Tyr Cys Asp Tyr Gly Tyr Asn Ile Ser Val Gly Arg
65 70 75 80
Asn Thr Phe Met Asn Phe Asn Cys Val Ile Leu Asp Val Val Pro Val
85 90 95
Arg Ile Gly Asp Asp Cys Gln Ile Gly Pro Asn Val Gln Ile Tyr Thr
100 105 110
Ala Asp His Pro Leu Asp Pro Glu Val Arg Arg Ser Gly Leu Glu Ser
115 120 125
Gly Arg Thr Val Thr Ile Gly Asp Asn Val Trp Ile Gly Gly Ala Ala
130 135 140
Ile Ile Leu Pro Gly Val Thr Ile Gly Asp Asn Ala Ile Val Gly Ala
145 150 155 160
Gly Ser Val Val Thr Arg Asp Val Pro Ala Gly Ala Thr Val Val Gly
165 170 175
Asn Pro Ala Arg Val Arg Gln Pro Asp Gln Gly Gln
180 185
<210> 7
<211> 219
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pSTV28 VECTOR
<400> 7
Met Glu Lys Lys Ile Thr Gly Tyr Thr Thr Val Asp Ile Ser Gln Trp
1 5 10 15
His Arg Lys Glu His Phe Glu Ala Phe Gln Ser Val Ala Gln Cys Thr
20 25 30
Tyr Asn Gln Thr Val Gln Leu Asp Ile Thr Ala Phe Leu Lys Thr Val
35 40 45
Lys Lys Asn Lys His Lys Phe Tyr Pro Ala Phe Ile His Ile Leu Ala
50 55 60
Arg Leu Met Asn Ala His Pro Glu Phe Arg Met Ala Met Lys Asp Gly
65 70 75 80
Glu Leu Val Ile Trp Asp Ser Val His Pro Cys Tyr Thr Val Phe His
85 90 95
Glu Gln Thr Glu Thr Phe Ser Ser Leu Trp Ser Glu Tyr His Asp Asp
100 105 110
Phe Arg Gln Phe Leu His Ile Tyr Ser Gln Asp Val Ala Cys Tyr Gly
115 120 125
Glu Asn Leu Ala Tyr Phe Pro Lys Gly Phe Ile Glu Asn Met Phe Phe
130 135 140
Val Ser Ala Asn Pro Trp Val Ser Phe Thr Ser Phe Asp Leu Asn Val
145 150 155 160
Ala Asn Met Asp Asn Phe Phe Ala Pro Val Phe Thr Met Gly Lys Tyr
165 170 175
Tyr Thr Gln Gly Asp Lys Val Leu Met Pro Leu Ala Ile Gln Val His
180 185 190
His Ala Val Cys Asp Gly Phe His Val Gly Arg Met Leu Asn Glu Leu
195 200 205
Gln Gln Tyr Cys Asp Glu Trp Gln Gly Gly Ala
210 215
<210> 8
<211> 215
<212> PRT
<213> Bacillus cereus
<400> 8
Met Asp Phe His Gln Ile Asp Ile Asp Arg Trp Asn Arg Lys Pro Tyr
1 5 10 15
Phe Glu His Tyr Ile Lys Glu Gly Lys Cys Ser Tyr Ser Val Thr Ala
20 25 30
Asn Leu Asn Val Thr Ala Leu Leu Asn Gly Leu Arg Lys Lys Asn Met
35 40 45
Lys Leu Tyr Pro Ala Phe Ile Tyr Met Ile Ser Arg Val Val Asn Ser
50 55 60
His Ile Glu Phe Arg Thr Ala Phe Asn Asp Lys Gly Gln Leu Gly Tyr
65 70 75 80
Trp Glu Gln Met Val Pro Thr Tyr Thr Ile Phe His Lys Glu Asp Lys
85 90 95
Thr Phe Ser Ala Met Trp Thr Glu Tyr Ser Ser Asp Phe Ser Leu Phe
100 105 110
Tyr Lys Asn Tyr Leu Gln Asp Ile Asp Arg Tyr Gly Asp Lys Lys Gly
115 120 125
Leu Trp Val Lys Glu Asn Val Pro Ala His Thr Phe Ser Ile Ser Ala
130 135 140
Leu Pro Trp Val Ser Phe Thr Gly Phe Gln Leu Asn Leu Tyr Asn Gly
145 150 155 160
Glu Tyr Leu Leu Pro Ile Ile Thr Leu Gly Lys Tyr Phe Ser Asp Gly
165 170 175
Glu Thr Val Cys Leu Pro Ile Ser Leu Gln Val His His Ala Val Cys
180 185 190
Asp Gly Tyr His Val Ser Met Phe Ile Asn Glu Leu Gln Lys Leu Ala
195 200 205
Asp Ser Phe Glu Glu Trp Leu
210 215
<210> 9
<211> 212
<212> PRT
<213> Pseudomonas aeruginosa
<400> 9
Met Ser Tyr Thr Arg Val Asp Ile Ser Ser Trp Asn Arg Arg Glu His
1 5 10 15
Phe Glu Ile Phe Arg Gly Asp Gly Gln Cys Thr Phe Ser Gln Thr Val
20 25 30
Gln Leu Asp Ile Thr Arg Leu Leu Asp Phe Thr Arg Ser Arg Gly Tyr
35 40 45
Arg Phe Tyr Pro Val Phe Ile His Ser Ile Ala Lys Val Val Asn Arg
50 55 60
Phe Pro Glu Tyr Arg Met Ala Met Lys Gly Asp Glu Leu Ile Val Trp
65 70 75 80
Asp Cys Val His Pro Asn Tyr Thr Thr Phe His Pro Asp Thr Glu Thr
85 90 95
Phe Ser Ser Phe Trp Ser His Tyr His Asp Asp Leu Ala Arg Phe Leu
100 105 110
Ala Glu Tyr Ser Met Asp Arg Glu Lys Tyr Arg Asn Asp His Ser Tyr
115 120 125
Phe Pro Lys Gly Phe Ile Glu Asn Val Phe Tyr Val Ser Ala Asn Pro
130 135 140
Trp Val Ser Phe Thr Ser Phe Asp Phe Asn Phe Ala Ser Ala Asn Asn
145 150 155 160
Phe Phe Ala Pro Leu Phe Thr Val Gly Lys Tyr Tyr Ser Gln Ala Gly
165 170 175
Lys Thr Leu Val Pro Leu Ala Val Gln Val His His Ala Val Cys Asp
180 185 190
Gly Phe His Ala Ala Arg Leu Val Thr Glu Leu Gln Lys Leu Cys Asp
195 200 205
Glu Ala Gly Gly
210
<210> 10
<211> 220
<212> PRT
<213> Clostridium acetobutylicum
<400> 10
Met Asn Ser Asn Phe His Ala Ile Asp Met Asn Thr Tyr Pro Arg Ala
1 5 10 15
His Thr Tyr Asn Tyr Phe Thr Lys Thr Val Ser Thr Leu Ile Tyr Ser
20 25 30
Ile Asn Ile Thr Leu Asp Val Thr Ile Leu Arg Ala Thr Leu Lys Asn
35 40 45
Lys Gly Leu Lys Phe Phe Pro Ala Tyr Val Tyr Leu Val Thr Arg Ala
50 55 60
Ile Gly Arg His Gln Glu Phe Leu Met Ala Ile Gln Asn Asp Met Leu
65 70 75 80
Gly Tyr Trp Asp Cys Arg Thr Pro Phe Tyr Pro Ile Phe His Glu Asp
85 90 95
Asp Lys Thr Ile Thr Phe Leu Trp Thr Glu Tyr Asn Glu Asp Phe Glu
100 105 110
Val Phe Tyr Lys Asn Tyr Ile Ser Asp Ile Arg Glu Tyr Gly Asn Asn
115 120 125
His Gly Ile Met Leu Ser Lys Asp Ala Pro Pro Ser Asn Asn Tyr Ile
130 135 140
Ile Ser Cys Ile Pro Trp Phe Ser Phe Asn Ser Leu Ser Met Gln Leu
145 150 155 160
Gln Asn Ala Lys Asn Tyr Tyr Ala Pro Ile Phe Glu Ala Gly Arg Phe
165 170 175
Thr Glu Thr Asn Gly Ile Ile Thr Leu Pro Leu Ser Ile Thr Val Asn
180 185 190
His Ala Thr Val Asp Gly Tyr His Ile Lys Leu Leu Leu Asp Glu Leu
195 200 205
Gln Trp Ser Met Ser His Pro Lys Glu Trp Ile Arg
210 215 220
<210> 11
<211> 229
<212> PRT
<213> Mycobacterium abscessus
<400> 11
Met Pro Ala Glu His Ala Leu Leu Val Val Met Ala Thr Phe Glu Pro
1 5 10 15
Leu Asp Leu Gln Gln Trp Pro Arg Arg Glu Trp Phe Glu His Tyr Leu
20 25 30
Asp Arg Cys Pro Thr Tyr Tyr Ser Met Thr Val Asp Leu Asp Ile Thr
35 40 45
Asn Leu Arg Ala Ala Val Asp Ala Ser Gly Arg Lys Thr Tyr Pro Thr
50 55 60
Gln Ile Trp Ala Leu Ala Thr Val Val Asn Arg His Pro Glu Phe Arg
65 70 75 80
Met Ala Leu Asp Asp Gln Gly Asn Pro Gly Val Trp Asp Val Val Asp
85 90 95
Pro Ala Phe Thr Val Phe Asn Pro Asp Arg Glu Thr Phe Ala Gly Ile
100 105 110
Ser Ala Arg Tyr Thr Pro Asp Phe Asp Ala Phe His Ser Glu Ala Ala
115 120 125
Glu Leu Leu Ser Glu Tyr Arg Asn Ala Ser Thr Leu Phe Pro Gln Gly
130 135 140
Ala Pro Arg Pro Arg Asn Val Phe Asp Ile Ser Ser Ile Pro Trp Thr
145 150 155 160
Arg Phe Thr Gly Phe Thr Leu Thr Ile Ala Pro Gly Trp Ala His Leu
165 170 175
Ala Pro Ile Phe Thr Ile Gly Lys Phe Tyr Glu Gln Glu Gly Arg Thr
180 185 190
Met Met Pro Leu Ala Leu Gln Ile His His Ala Ala Ala Asp Gly Tyr
195 200 205
His Ser Ala Arg Leu Val Glu Glu Leu Arg Gln Ile Ile Ala Asp Pro
210 215 220
Asp Trp Val Arg Asp
225
<210> 12
<211> 222
<212> PRT
<213> Lactobacillus brevis
<400> 12
Met Thr Glu Leu Asn Thr His Ala Thr Pro Ile Asp Gln Thr Thr Trp
1 5 10 15
Ala Arg Arg Glu Tyr Phe Tyr Tyr Phe Thr Lys Met Met Pro Thr Gly
20 25 30
Phe Thr Leu Asn Val Asp Met Asp Ile Thr Ala Thr Lys Ala Trp Leu
35 40 45
Thr Lys His Asp Arg Lys Phe Asn Pro Ala Tyr Leu Tyr Leu Val Thr
50 55 60
Lys Leu Ile Thr Lys His Pro Glu Phe Arg Val Gly Gln Val Asp Gly
65 70 75 80
Gln Leu Val Glu Tyr Asp Val Leu His Pro Ser Tyr Ser Thr Phe His
85 90 95
Gly Asp Asp Leu Thr Ile Ser Asn Leu Trp Thr Ala Tyr Asp Pro Ser
100 105 110
Phe Glu Gln Phe His Gln Asn Tyr Leu Ala Asp Gln Ala Thr Tyr Gly
115 120 125
Asp Gln His Thr Pro Met Pro Lys Ala Pro Gln Gly Ala Asn Thr Tyr
130 135 140
Met Ile Gly Ser Ile Pro Trp Thr His Phe Asn Ser Tyr Thr Pro Leu
145 150 155 160
Pro Phe Thr Pro Leu Asn Thr Phe Phe Pro Val Ile Gln Ala Gly Arg
165 170 175
Phe Thr Phe Lys Asp Gly Gln Trp Leu Met Pro Leu Ser Phe Thr Ile
180 185 190
His His Ala Val Ala Asp Gly Tyr His Val Ser Gln Phe Phe Asn Glu
195 200 205
Leu Gln Arg Val Phe Asp His Pro Glu Leu Trp Leu Thr Ala
210 215 220
<210> 13
<211> 319
<212> PRT
<213> Escherichia coli
<400> 13
Met Lys Pro Glu Asn Lys Leu Pro Val Leu Asp Leu Ile Ser Ala Glu
1 5 10 15
Met Lys Thr Val Val Asn Thr Leu Gln Pro Asp Leu Pro Pro Trp Pro
20 25 30
Ala Thr Gly Thr Ile Ala Glu Gln Arg Gln Tyr Tyr Thr Leu Glu Arg
35 40 45
Arg Phe Trp Asn Ala Gly Ala Pro Glu Met Ala Thr Arg Ala Tyr Met
50 55 60
Val Pro Thr Lys Tyr Gly Gln Val Glu Thr Arg Leu Phe Cys Pro Gln
65 70 75 80
Pro Asp Ser Pro Ala Thr Leu Phe Tyr Leu His Gly Gly Gly Phe Ile
85 90 95
Leu Gly Asn Leu Asp Thr His Asp Arg Ile Met Arg Leu Leu Ala Ser
100 105 110
Tyr Ser Gln Cys Thr Val Ile Gly Ile Asp Tyr Thr Leu Ser Pro Glu
115 120 125
Ala Arg Phe Pro Gln Ala Ile Glu Glu Ile Val Ala Ala Cys Cys Tyr
130 135 140
Phe His Gln Gln Ala Glu Asp Tyr Gln Ile Asn Met Ser Arg Ile Gly
145 150 155 160
Phe Ala Gly Asp Ser Ala Gly Ala Met Leu Ala Leu Ala Ser Ala Leu
165 170 175
Trp Leu Arg Asp Lys Gln Ile Asp Cys Gly Lys Val Ala Gly Val Leu
180 185 190
Leu Trp Tyr Gly Leu Tyr Gly Leu Arg Asp Ser Val Thr Arg Arg Leu
195 200 205
Leu Gly Gly Val Trp Asp Gly Leu Thr Gln Gln Asp Leu Gln Met Tyr
210 215 220
Glu Glu Ala Tyr Leu Ser Asn Asp Ala Asp Arg Glu Ser Pro Tyr Tyr
225 230 235 240
Cys Leu Phe Asn Asn Asp Leu Thr Arg Glu Val Pro Pro Cys Phe Ile
245 250 255
Ala Gly Ala Glu Phe Asp Pro Leu Leu Asp Asp Ser Arg Leu Leu Tyr
260 265 270
Gln Thr Leu Ala Ala His Gln Gln Pro Cys Glu Phe Lys Leu Tyr Pro
275 280 285
Gly Thr Leu His Ala Phe Leu His Tyr Ser Arg Met Met Lys Thr Ala
290 295 300
Asp Glu Ala Leu Arg Asp Gly Ala Gln Phe Phe Thr Ala Gln Leu
305 310 315
<210> 14
<211> 391
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 14
Met Ser Ala Ala Ala Asp Arg Leu Asn Leu Thr Ser Gly His Leu Asn
1 5 10 15
Ala Gly Arg Lys Arg Ser Ser Ser Ser Val Ser Leu Lys Ala Ala Glu
20 25 30
Lys Pro Phe Lys Val Thr Val Ile Gly Ser Gly Asn Trp Gly Thr Thr
35 40 45
Ile Ala Lys Val Val Ala Glu Asn Cys Lys Gly Tyr Pro Glu Val Phe
50 55 60
Ala Pro Ile Val Gln Met Trp Val Phe Glu Glu Glu Ile Asn Gly Glu
65 70 75 80
Lys Leu Thr Glu Ile Ile Asn Thr Arg His Gln Asn Val Lys Tyr Leu
85 90 95
Pro Gly Ile Thr Leu Pro Asp Asn Leu Val Ala Asn Pro Asp Leu Ile
100 105 110
Asp Ser Val Lys Asp Val Asp Ile Ile Val Phe Asn Ile Pro His Gln
115 120 125
Phe Leu Pro Arg Ile Cys Ser Gln Leu Lys Gly His Val Asp Ser His
130 135 140
Val Arg Ala Ile Ser Cys Leu Lys Gly Phe Glu Val Gly Ala Lys Gly
145 150 155 160
Val Gln Leu Leu Ser Ser Tyr Ile Thr Glu Glu Leu Gly Ile Gln Cys
165 170 175
Gly Ala Leu Ser Gly Ala Asn Ile Ala Thr Glu Val Ala Gln Glu His
180 185 190
Trp Ser Glu Thr Thr Val Ala Tyr His Ile Pro Lys Asp Phe Arg Gly
195 200 205
Glu Gly Lys Asp Val Asp His Lys Val Leu Lys Ala Leu Phe His Arg
210 215 220
Pro Tyr Phe His Val Ser Val Ile Glu Asp Val Ala Gly Ile Ser Ile
225 230 235 240
Cys Gly Ala Leu Lys Asn Val Val Ala Leu Gly Cys Gly Phe Val Glu
245 250 255
Gly Leu Gly Trp Gly Asn Asn Ala Ser Ala Ala Ile Gln Arg Val Gly
260 265 270
Leu Gly Glu Ile Ile Arg Phe Gly Gln Met Phe Phe Pro Glu Ser Arg
275 280 285
Glu Glu Thr Tyr Tyr Gln Glu Ser Ala Gly Val Ala Asp Leu Ile Thr
290 295 300
Thr Cys Ala Gly Gly Arg Asn Val Lys Val Ala Arg Leu Met Ala Thr
305 310 315 320
Ser Gly Lys Asp Ala Trp Glu Cys Glu Lys Glu Leu Leu Asn Gly Gln
325 330 335
Ser Ala Gln Gly Leu Ile Thr Cys Lys Glu Val His Glu Trp Leu Glu
340 345 350
Thr Cys Gly Ser Val Glu Asp Phe Pro Leu Phe Glu Ala Val Tyr Gln
355 360 365
Ile Val Tyr Asn Asn Tyr Pro Met Lys Asn Leu Pro Asp Met Ile Glu
370 375 380
Glu Leu Asp Leu His Glu Asp
385 390
<210> 15
<211> 250
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 15
Met Gly Leu Thr Thr Lys Pro Leu Ser Leu Lys Val Asn Ala Ala Leu
1 5 10 15
Phe Asp Val Asp Gly Thr Ile Ile Ile Ser Gln Pro Ala Ile Ala Ala
20 25 30
Phe Trp Arg Asp Phe Gly Lys Asp Lys Pro Tyr Phe Asp Ala Glu His
35 40 45
Val Ile Gln Val Ser His Gly Trp Arg Thr Phe Asp Ala Ile Ala Lys
50 55 60
Phe Ala Pro Asp Phe Ala Asn Glu Glu Tyr Val Asn Lys Leu Glu Ala
65 70 75 80
Glu Ile Pro Val Lys Tyr Gly Glu Lys Ser Ile Glu Val Pro Gly Ala
85 90 95
Val Lys Leu Cys Asn Ala Leu Asn Ala Leu Pro Lys Glu Lys Trp Ala
100 105 110
Val Ala Thr Ser Gly Thr Arg Asp Met Ala Gln Lys Trp Phe Glu His
115 120 125
Leu Gly Ile Arg Arg Pro Lys Tyr Phe Ile Thr Ala Asn Asp Val Lys
130 135 140
Gln Gly Lys Pro His Pro Glu Pro Tyr Leu Lys Gly Arg Asn Gly Leu
145 150 155 160
Gly Tyr Pro Ile Asn Glu Gln Asp Pro Ser Lys Ser Lys Val Val Val
165 170 175
Phe Glu Asp Ala Pro Ala Gly Ile Ala Ala Gly Lys Ala Ala Gly Cys
180 185 190
Lys Ile Ile Gly Ile Ala Thr Thr Phe Asp Leu Asp Phe Leu Lys Glu
195 200 205
Lys Gly Cys Asp Ile Ile Val Lys Asn His Glu Ser Ile Arg Val Gly
210 215 220
Gly Tyr Asn Ala Glu Thr Asp Glu Val Glu Phe Ile Phe Asp Asp Tyr
225 230 235 240
Leu Tyr Ala Lys Asp Asp Leu Leu Lys Trp
245 250
<210> 16
<211> 552
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 16
atgagcacag aaaaagaaaa gatgattgct ggtgagttgt atcgctcggc agatgagacg 60
ttatctcgcg atcgcctgcg cgctcgtcag cttattcacc gatacaatca ttccctggcg 120
gaagagcaca cattacgcca gcaaattctc gctgatctat tcggtcaggt gacagaggct 180
tatattgagc caacgtttcg ctgtgactat ggctataaca tttttctcgg taataatttt 240
ttcgccaact tcgattgcgt gatgcttgat gtctgcccta ttcgcatcgg tgataactgt 300
atgttggcac caggcgttca tatctacacg gcaacacatc ccatcgaccc tgtagcacgt 360
aatagcggtg ctgaactggg gaaacccgtc accatcggta ataacgtctg gattggcgga 420
cgcgcggtca ttaaccctgg tgtgaccatt ggtgataacg tcgtggtagc ctcaggtgca 480
gttgtcacaa aagatgtccc ggacaacgtt gtcgtgggcg gtaatccagc cagaataatt 540
aaaaaattgt aa 552
<210> 17
<211> 547
<212> DNA
<213> Staphylococcus carnosus
<400> 17
atgaccaccg agaaggaaaa aatgctgagc ggtcagctgt acaacagccg tgacccgcaa 60
ctggttaagg agcgtcacaa agcgcgtcac gcgaccaagg cgatcaacaa cgcgttcagc 120
attaaaacgt cactttctgc tgcgtcagag catcggtcac tgcggcgaca acgtgttcat 180
cgagccggaa ttcacttcga ttacggttac aacattagcc tgggcaacca cttctatgcg 240
aactttaacc cgttagctgg atgtggcgcc gatcaccatt ggtaaccacg ttctgctggg 300
cccgaacgtg caactgatcc cgcgacccac ccgctgaacc cggcggagcg tgcgagcggt 360
ctggaactgg cgttcccgat catattggcg accacgtttg gattggtgcg ggtgcgattg 420
ttctgccggg tgtgaccatt gcgataactg gttgtgggtg cgggcagcgt tgtgaccaag 480
gacatcccgg ataaccaggt tgtgcgggca accggcgcgt tttattcgtg aagtgccgct 540
ggattaa 547
<210> 18
<211> 554
<212> DNA
<213> Unknown
<220>
<223> Halalkalicoccus jeotgali
<400> 18
atgaccagcg agaaggaacg tatgctgcgt ggtgagccgt acgacgcgag cgatagcgag 60
ctggttgcgg aacgtcagca cgcgcgtgaa ctgacccgta aatataaccg taccaccgcg 120
accgagagcg accgtcgtga acgtctgctg gaggaactgt tcggtagcgt ggaggacgcg 180
accgttgaac cgccgatccg ttgcgattac ggttataacg ttcacgttgg cgagaacttc 240
tacgcgaact ttgactgcgt tattctggat gtgcgtcgtg ttgaatttgg cacccgttgc 300
ctgctgggtc cgggtgttca cgtttatacc gcgacccacc cgctggatgc ggaggaacgt 360
gcggcgggtc tggagagcgg tgcgccggtg accgttggtg acgatgtgtg gatcggtggc 420
cgtgcggttc tgaacagcgg cgtgagcttg gtgacggcag cgtgattgcg agcggtgcgg 480
tggttaccga agatgttccg gcgggcgcgc tggttggtgg caacccggcg cgtgtgctga 540
aggacgttga ttaa 554
<210> 19
<211> 563
<212> DNA
<213> Lactobacillus brevis
<400> 19
atggacaaga gcgagaagga aaaaatgatc accggcgagc tgttcaacgt gtacgatccg 60
gagctgttgc ggaacgtggc gcggcgcgtc agcaagtgga ggcgctgaac gagctgggtg 120
aacaggaccc ggaaaagagc cagcaactgg ttaaacgtct gttcggcgcg accggtgacc 180
aagttgaggt tcacgcgacc tttcgttgcg attacggcta taacatctac gtgggtgaaa 240
acttctttgc gaactatgac tgcaccattc tggatgttgc gccgatccgt attggcaagc 300
actgcctgct gggtccgaaa gtgcagattt acagcgttaa ccatccggcg gagccggaac 360
tgcgtcgtaa cggcgcgatg ggcattggca agccggtgac cctgggtgac gatgtgtggg 420
ttggtggcgg tgcgatcatc tgtccgggtg tgaccctggg tgataacgtg atcgttgcgg 480
cgggcgcggt ggttaccaag agcttcggta gcaacgtggt tctgggcggt aacccggcgc 540
gtgtgattaa gccgctgaaa taa 563
<210> 20
<211> 554
<212> DNA
<213> Bacillus subtilis
<400> 20
atgctgcgta ccgagaagga aaaaatggcg gcgggtgagc tgtacaacag cgaagaccag 60
caactgctgc tggagcgtaa gcacgcgcgt cagctgatcc gtcaatataa cgaaaccccg 120
gaagacgatg cggtgcgtac caagctgctg aaagaactgc tgggtagcgt gggcgatcag 180
gttaccatcc tgccgacctt ccgttgcgac tacggttatc acatccacat tggcgatcac 240
accttcgtga actttgactg cgttattctg gatgtgtgcg aggttcgtat cggctgccac 300
tgcctgattg cgccgggtgt tcacatctac accgcgggcc acccgctgga cccgattgag 360
cgtaagagcg gtaaagaatt tggcaaaccg gtgaccattg gtgatcaggt ttggatcggt 420
ggccgtgcgg tgattaatcc gggtgtgacc atcggcgaca acgcggtgat tgcgagcggc 480
agcgtggtta ccaaggatgt tccggcgaac accgggttgg tggcaacccg gcgcgtattc 540
tgaaacaact gtaa 554
<210> 21
<211> 563
<212> DNA
<213> Pseudomonas putida
<400> 21
atgagcctga gcgagaagca caaaatgctg accggtcaac tgtatcatgc gggttgcccg 60
gagctgcaag cggaacaaat tgcgaacaag cactggatgc accgttataa caacagcgtg 120
gaactgtgaa cgacgcgcgt cacggtctgc tggttgagca cttcggccaa gtgggtgaag 180
gcgcggttat tcgtccgccg ttttactgcg actacggtta taacatcagc gtgggccgta 240
acaccttcat gaacttaact gcgtgatcct ggatgtggtt ccggttcgta tcggtgacga 300
ttgccagatt ggcccgaacg gcaaatctat accgcggacc acccgctgga cccggaagtg 360
cgtcgtagcg gtctggaaag cggccgtacc gtgaccattg gtgacaacgt ttggatcggt 420
ggcgcggcga tcattctgcc gggtgtgacc atcggcgaca acgcgattgt tggtgcgggc 480
agcgtggtta cccgtgatgt tccggcgggg cgaccgtggt tggtaacccg gcgcgtgttc 540
gtcagccgga tcagggtcaa taa 563
<210> 22
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Sc-gpp2-F
<400> 22
tgctgcagag gaggtaattt atatgggatt gactactaaa cctctatc 48
<210> 23
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Sc-gpp2-R
<400> 23
cccaagctta ccatttcaac agatcgtcc 29
<210> 24
<211> 660
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pSTV28 VECTOR
<400> 24
atggagaaaa aaatcactgg atataccacc gttgatatat cccaatggca tcgtaaagaa 60
cattttgagg catttcagtc agttgctcaa tgtacctata accagaccgt tcagctggat 120
attacggcct ttttaaagac cgtaaagaaa aataagcaca agttttatcc ggcctttatt 180
cacattcttg cccgcctgat gaatgctcat ccggaatttc gtatggcaat gaaagacggt 240
gagctggtga tatgggatag tgttcaccct tgttacaccg ttttccatga gcaaactgaa 300
acgttttcat cgctctggag tgaataccac gacgatttcc ggcagtttct acacatatat 360
tcgcaagatg tggcgtgtta cggtgaaaac ctggcctatt tccctaaagg gtttattgag 420
aatatgtttt tcgtctcagc caatccctgg gtgagtttca ccagttttga tttaaacgtg 480
gccaatatgg acaacttctt cgcccccgtt ttcaccatgg gcaaatatta tacgcaaggc 540
gacaaggtgc tgatgccgct ggcgattcag gttcatcatg ccgtctgtga tggcttccat 600
gtcggcagaa tgcttaatga attacaacag tactgcgatg agtggcaggg cggggcgtaa 660
660
<210> 25
<211> 636
<212> DNA
<213> Bacillus cereus
<400> 25
atggacttcc accagatcga cattgatcgt tggaaccgta agccgtactt tgagcactat 60
atcaaggggt aagtgcagct acagcgtgac cgcgaacctg aacgttaccg cgctgctgaa 120
cggcctgcta aaaaaacatg aagctgtacc cggcgttcat ctatatgatt agccgtgtgg 180
ttaacagcca catcgagtcc gtaccgcgtt taacgataag ggtcagctgg gctactggga 240
acaaatggtg ccgacctata cattttccac aaagaggaca aaacctttag cgcgatgtgg 300
accgaataca gcagcgattt cagccttttt acaagaacta cctgcaagac atcgatcgtt 360
atggtgacaa gaaaggcctg tgggtgaaag gaacgttccg gcgcacacct tcagcattag 420
cgcgctgccg tgggttagct tcaccggttt tcaacgaacc tgtacaacgg cgagtatctg 480
ctgccgatca ttaccctggg caagtacttt agcgatggca aaccgtgtgc ctgccgatca 540
gcctgcaagt tcaccacgcg gtttgcgacg gttatcacgt tagagttcat taacgaactg 600
caaaaactgg cggatagctt tgaggaatgg ctgtaa 636
<210> 26
<211> 633
<212> DNA
<213> Pseudomonas aeruginosa
<400> 26
atgagctaca cccgtgttga catcagcagc tggaaccgtc gtgagcactt tgaaattttc 60
cgtggtatgg ccaatgcacc tttagccaga ccgttcaact ggacatcacc cgtctgctgg 120
atttcacccg taccgtggtt accgttttta tccggtgttc atccacagca ttgcgaaggt 180
ggttaaccgt ttcccgggta ccgtatggcg atgaaaggcg acgaactgat tgtgtgggat 240
tgcgttcacc cgaactatac cacctttcac ccggacaccg aaacctttag cagcttctgg 300
agccactacc acgacgatct ggcgcgttcc tggcggagta tagcatggac cgtgaaaagt 360
accgtaacga tcacagctat tttccgaaag gttcatcgaa aacgtgtttt atgttagcgc 420
gaacccgtgg gttagcttca ccagcttcga ttttaacttc gcgagcgcga acaacttctt 480
tgcgccgctg tttaccgtgg gcaagtacta tagccaagcg ggtaaaaccc tggtgccgct 540
ggcggtgcaa gttcaccatg cggtttgcga tggttttcat gcggccgtct ggtgaccgag 600
ctgcaaaagc tgtgcgatga agcgggtggc taa 633
<210> 27
<211> 655
<212> DNA
<213> Clostridium acetobutylicum
<400> 27
atgaacagca acttccacgc gatcgacatg aacacctacc cgcgtgcgca cacctacaac 60
tattttacaa gaccgtgagc accctgatct atagcatcaa cattaccctg gatgttacca 120
ttctgcgtgc gacctgaaga acaaaggtct gaaattcttt ccggcgtacg tgtatctggt 180
tacccgtgcg atcggtcgca ccaggagttc ctgatggcga ttcaaaacga catgctgggc 240
tactgggatt gccgtacccc gtctatccga tctttcacga ggacgataag accattacct 300
ttctgtggac cgagtacaac gaagactcga ggtgttttac aagaactaca tcagcgatat 360
tcgtgaatac ggtaacaacc acggcatcat gcgagcaagg acgctccgcc gagcaacaac 420
tacatcatta gctgcattcc gtggttcagc tttaacacct gagcatgcag ctgcaaaacg 480
cgaaaaacta ctatgcgccg atcttcgaag cgggtcgttt taccgaaacc aacggcatca 540
ttaccctgcc gctgagcatc accgtgaacc acgcgaccgt tgacgctacc acattaagct 600
gctgctggat gagctgcaat ggagcatgag ccacccgaaa gagtggattc gttaa 655
<210> 28
<211> 680
<212> DNA
<213> Mycobacterium abscessus
<400> 28
atgccggcgg agcacgcgct gctggttgtg atggcgacct tcgaaccgct ggacctgcaa 60
caatgccgcg tcgtgagtgg tttgaacact acctggatcg ttgcccgacc tactatagca 120
tgaccgtgga ctggacatca ccaacctgcg tgcggcggtt gacgcgagcg gtcgtaagac 180
ctatccgacc cagattgggc gctggcgacc gtggttaacc gtcacccgga gttccgtatg 240
gcgctggacg atcaaggtat ccgggtgtgt gggacgtggt tgatccggcg ttcaccgttt 300
ttaacccgga ccgtgaaacc ttgcgggtat cagcgcgcgt tacaccccgg acttcgatgc 360
gtttcacagc gaggcggcgg aactgcgagc gaatatcgta acgcgagcac cctgttcccg 420
cagggcgcgc cgcgtccgcg taacgtgttg acatcagcag cattccgtgg acccgtttca 480
ccggttttac cctgaccatt gcgccgggtt ggggcacctg gcgccgatct tcaccattgg 540
taaattttac gagcaggaag gccgtaccat gatgccgcgg cgctgcaaat tcaccatgcg 600
gcggcggacg gctatcacag cgcgcgtctg gtggaggaac tcgtcaaatc attgcggacc 660
cggattgggt tcgtgattaa 680
<210> 29
<211> 663
<212> DNA
<213> Lactobacillus brevis
<400> 29
atgaccgagc tgaacaccca tgcgaccccg attgaccaga ccacctgggc gcgtcgtgaa 60
tacttcacta cttcaccaag atgatgccga ccggtttcac cctgaacgtg gacatggaca 120
tcaccgcgac caaagcgtgg ctgaccaagc acgatcgtaa attcaacccg gcgtacctgt 180
atctggttac caagctatta ccaaacaccc ggagtttcgt gtgggtcagg ttgacggcca 240
actggtggaa tacgatgttc tgcacccgag ctatagcacc tttcacggtg acgatctgac 300
cattagcaac ctgtggaccg cgtatacccg agcttcgagc agtttcacca aaactacctg 360
gcggaccagg cgacctatgg cgatcaacat accccgatgc cgaaggcgcc gcaaggtgcg 420
aacacctaca tgatcggcag cattccgtgg acccacttca acagctatac cccgctgccg 480
tttaccccgc tgaacacctt ctttccggtg atccaggcgg tcgtttcacc tttaaagatg 540
gccaatggct gatgccgctg agcttcacca ttcaccacgc ggtgcggacg gctaccacgt 600
tagccagttc tttaacgagc tgcaacgtgt ttttgatcac ccggaacttg gctgaccgcg 660
taa 663
<210> 30
<211> 960
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 30
atgaagccgg aaaacaaact acctgttctg gaccttattt ctgctgaaat gaagaccgtt 60
gtgaatactc ttcagccgga tttaccgccc tggcccgcaa cgggaacgat tgctgagcaa 120
cgacagtatt acacgcttga gcgccgattc tggaatgcgg gcgctccaga aatggcaacc 180
agagcttaca tggttccaac aaaatatggg caggtggaaa cacgtctctt ttgtccgcag 240
ccagatagcc cagcgacgct attttatttg catggaggcg gttttattct cggcaatctc 300
gatacccacg atcgcatcat gcgcctgctg gcaagctaca gccaatgtac ggtgattggt 360
attgattaca ccctttcacc tgaagcgcgt tttccgcaag cgatagagga aattgtggct 420
gcttgttgtt atttccacca gcaggcggag gattatcaaa tcaatatgtc ccgcattggc 480
tttgccggtg attccgcagg tgccatgctg gcgctcgcca gtgcgttgtg gttgcgtgat 540
aaacagatcg attgcggtaa agttgcgggc gttttgctgt ggtatgggct ttacggatta 600
cgggattccg tgactcgtcg tctgttgggc ggtgtctggg atggcttaac gcaacaggat 660
ttgcagatgt acgaagaggc atatttaagc aacgacgcgg accgcgagtc gccgtattac 720
tgtctgttta ataatgatct cactcgcgaa gttccgccct gttttattgc cggggcggag 780
ttcgatccgc tgctggatga cagccgtctg ctttaccaga cgttagcggc gcatcagcag 840
ccctgtgagt tcaaactcta cccaggcacg ctgcacgcct ttttgcatta ttcacggatg 900
atgaaaaccg ccgacgaggc tcttcgcgac ggcgctcagt tctttaccgc tcagctttaa 960
960
<210> 31
<211> 1176
<212> DNA
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 31
atgtctgctg ctgctgatag attaaactta acttccggcc acttgaatgc tggtagaaag 60
agaagttcct cttctgtttc tttgaaggct gccgaaaagc ctttcaaggt tactgtgatt 120
ggatctggta actggggtac tactattgcc aaggtggttg ccgaaaattg taagggatac 180
ccagaagttt tcgctccaat agtacaaatg tgggtgttcg aagaagagat caatggtgaa 240
aaattgactg aaatcataaa tactagacat caaaacgtga aatacttgcc tggcatcact 300
ctacccgaca atttggttgc taatccagac ttgattgatt cagtcaagga tgtcgacatc 360
atcgttttca acattccaca tcaatttttg ccccgtatct gtagccaatt gaaaggtcat 420
gttgattcac acgtcagagc tatctcctgt ctaaagggtt ttgaagttgg tgctaaaggt 480
gtccaattgc tatcctctta catcactgag gaactaggta ttcaatgtgg tgctctatct 540
ggtgctaaca ttgccaccga agtcgctcaa gaacactggt ctgaaacaac agttgcttac 600
cacattccaa aggatttcag aggcgagggc aaggacgtcg accataaggt tctaaaggcc 660
ttgttccaca gaccttactt ccacgttagt gtcatcgaag atgttgctgg tatctccatc 720
tgtggtgctt tgaagaacgt tgttgcctta ggttgtggtt tcgtcgaagg tctaggctgg 780
ggtaacaacg cttctgctgc catccaaaga gtcggtttgg gtgagatcat cagattcggt 840
caaatgtttt tcccagaatc tagagaagaa acatactacc aagagtctgc tggtgttgct 900
gatttgatca ccacctgcgc tggtggtaga aacgtcaagg ttgctaggct aatggctact 960
tctggtaagg acgcctggga atgtgaaaag gagttgttga atggccaatc cgctcaaggt 1020
ttaattacct gcaaagaagt tcacgaatgg ttggaaacat gtggctctgt cgaagacttc 1080
ccattatttg aagccgtata ccaaatcgtt tacaacaact acccaatgaa gaacctgccg 1140
gacatgattg aagaattaga tctacatgaa gattag 1176
<210> 32
<211> 753
<212> DNA
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 32
atgggattga ctactaaacc tctatctttg aaagttaacg ccgctttgtt cgacgtcgac 60
ggtaccatta tcatctctca accagccatt gctgcattct ggagggattt cggtaaggac 120
aaaccttatt tcgatgctga acacgttatc caagtctcgc atggttggag aacgtttgat 180
gccattgcta agttcgctcc agactttgcc aatgaagagt atgttaacaa attagaagct 240
gaaattccgg tcaagtacgg tgaaaaatcc attgaagtcc caggtgcagt taagctgtgc 300
aacgctttga acgctctacc aaaagagaaa tgggctgtgg caacttccgg tacccgtgat 360
atggcacaaa aatggttcga gcatctggga atcaggagac caaagtactt cattaccgct 420
aatgatgtca aacagggtaa gcctcatcca gaaccatatc tgaagggcag gaatggctta 480
ggatatccga tcaatgagca agacccttcc aaatctaagg tagtagtatt tgaagacgct 540
ccagcaggta ttgccgccgg aaaagccgcc ggttgtaaga tcattggtat tgccactact 600
ttcgacttgg acttcctaaa ggaaaaaggc tgtgacatca ttgtcaaaaa ccacgaatcc 660
atcagagttg gcggctacaa tgccgaaaca gacgaagttg aattcatttt tgacgactac 720
ttatatgcta aggacgatct gttgaaatgg taa 753
<210> 33
<211> 41
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-lacA-F
<400> 33
ctggatccag gaggtaataa aatggaacat gccaatgacc g 41
<210> 34
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-lacA-R
<400> 34
gtttctagat taaactgacg attcaacttt ataatc 36
<210> 35
<211> 46
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-cysE-F
<400> 35
ctggatccag gaggtaataa aatgtcgtgt gaagaactgg aaattg 46
<210> 36
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-cysE-R
<400> 36
gtttctagat tagatcccat ccccatactc 30
<210> 37
<211> 40
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-yjgm-F
<400> 37
ctggatccag gaggtaataa aatgaataac attgcgccgc 40
<210> 38
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-yjgM-R
<400> 38
gtttctagat tagagttcgc gcaacatcc 29
<210> 39
<211> 44
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-yjaB-F
<400> 39
ctggatccag gaggtaataa aatggttatt agtattcgcc gctc 44
<210> 40
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-yjaB-R
<400> 40
gtttctagat tacgccccca catacgc 27
<210> 41
<211> 39
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-yiiD-F
<400> 41
ctggatccag gaggtaataa aatgagccag cttccaggg 39
<210> 42
<211> 42
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-nhoA-F
<400> 42
ctggatccag gaggtaataa aatgacgccc attctgaatc ac 42
<210> 43
<211> 28
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-nhoA-R
<400> 43
gtttctagat tattttcccg cctccggg 28
<210> 44
<211> 42
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-wecH-F
<400> 44
ctggatccag gaggtaataa aatgcagccc aaaatttact gg 42
<210> 45
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-WecH-R
<400> 45
gtttctagat taactcacta atctgtttct gtcg 34
<210> 46
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-yiiD-R
<400> 46
gtttctagat tactcttctt cgttcccgc 29
<210> 47
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-maa-F
<400> 47
ctggatccag gaggtaataa aatgagcaca gaaaaagaaa agatg 45
<210> 48
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-maa-R
<400> 48
gtttctagat tacaattttt taattattct ggctg 35
<210> 49
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Sc-maa-F
<400> 49
ctggatccag gaggtaataa aatgaccacc gagaaggaaa aaatg 45
<210> 50
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Sc-maa-R
<400> 50
gtttctagat taatccagcg gcacttcac 29
<210> 51
<211> 41
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Hj-maa-F
<400> 51
ctggatccag gaggtaataa aatgaccagc gagaaggaac g 41
<210> 52
<211> 31
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Hj-maa-R
<400> 52
gtttctagat taatcaacgt ccttcagcac a 31
<210> 53
<211> 40
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Lb-maa-F
<400> 53
ctggatccag gaggtaataa aatggacaag agcgagaagg 40
<210> 54
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Lb-maa-R
<400> 54
gtttctagat tatttcagcg gcttaatcac 30
<210> 55
<211> 42
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pp-maa-F
<400> 55
ctggatccag gaggtaataa aatgagcctg agcgagaagc ac 42
<210> 56
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pp-maa-R
<400> 56
gtttctagat tattgaccct gatccggctg 30
<210> 57
<211> 40
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Bs-maa-F
<400> 57
ctggatccag gaggtaataa aatgctgcgt accgagaagg 40
<210> 58
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Bs-maa-R
<400> 58
gtttctagat tacagttgtt tcagaatacg cgc 33
<210> 59
<211> 41
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Sc-gpd1-R
<400> 59
aatgctgcag ttaatcttca tgtagatcta attcttcaat c 41
<210> 60
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Cat-F
<400> 60
ctaggagctc aggagaaata taatggagaa aaaaatcact ggatatac 48
<210> 61
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Cat-R
<400> 61
ctggatcctt acgccccgcc ctgcc 25
<210> 62
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Trc-Bs.maa-F
<400> 62
agatctgagt cgacagtatc ggcggg 26
<210> 63
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Trc-Bs.maa-R
<400> 63
tatatttctc ctgaggatcc ccgggtaccg 30
<210> 64
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Bc-Oat-F
<400> 64
ctcggtaccc ggggatcctc aggagaaata taatggactt ccaccagatc 50
<210> 65
<211> 42
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Bc-Oat-R
<400> 65
cccgccgata ctgtcgacag atcttacagc cattcctcaa ag 42
<210> 66
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ca-Oat-F
<400> 66
ctcggtaccc ggggatcctc aggagaaata taatgaacag caacttccac 50
<210> 67
<211> 42
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ca-Oat-R
<400> 67
cccgccgata ctgtcgacag atcttaacga atccactctt tc 42
<210> 68
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Lb-Oat-F
<400> 68
ctcggtaccc ggggatcctc aggagaaata taatgaccga gctgaacacc c 51
<210> 69
<211> 41
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Lb-Oat-R
<400> 69
cccgccgata ctgtcgacag atcttacgcg gtcagccaca g 41
<210> 70
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ma-Oat-F
<400> 70
ctcggtaccc ggggatcctc aggagaaata taatgccggc ggagcacgcg 50
<210> 71
<211> 49
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ma-Oat-R
<400> 71
cccgccgata ctgtcgacag atcttaatca cgaacccaat ccgggtccg 49
<210> 72
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pa-Oat-F
<400> 72
ctcggtaccc ggggatcctc aggagaaata taatgagcta cacccgtgtt g 51
<210> 73
<211> 41
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pa-Oat-R
<400> 73
cccgccgata ctgtcgacag atcttagcca cccgcttcat c 41
<210> 74
<211> 46
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-aes-F
<400> 74
ctggatccgt cacccaaccc tttatgaagc cggaaaacaa actacc 46
<210> 75
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Ec-aes-R
<400> 75
tatcgtcgac ttaaagctga gcggtaaaga actg 34
<210> 76
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Sc-gpd1-F
<400> 76
gcggatccag gaggtaataa aatgtctgct gctgctgata gattaaac 48
<210> 77
<211> 2999
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pSTV28 VECTOR
<400> 77
aaattccgga tgagcattca tcaggcgggc aagaatgtga ataaaggccg gataaaactt 60
gtgcttattt ttctttacgg tctttaaaaa ggccgtaata tccagctgaa cggtctggtt 120
ataggtacat tgagcaactg actgaaatgc ctcaaaatgt tctttacgat gccattggga 180
tatatcaacg gtggtatatc cagtgatttt tttctccatt ttagcttcct tagctcctga 240
aaatctcgat aactcaaaaa atacgcccgg tagtgatctt atttcattat ggtgaaagtt 300
ggaacctctt acgtgccgat caacgtctca ttttcgccaa aagttggccc agggcttccc 360
ggtatcaaca gggacaccag gatttattta ttctgcgaag tgatcttccg tcacaggtat 420
ttattcggcg caaagtgcgt cgggtgatgc tgccaactta ctgatttagt gtatgatggt 480
gtttttgagg tgctccagtg gcttctgttt ctatcagctg tccctcctgt tcagctactg 540
acggggtggt gcgtaacggc aaaagcaccg ccggacatca gcgctagcgg agtgtatact 600
ggcttactat gttggcactg atgagggtgt cagtgaagtg cttcatgtgg caggagaaaa 660
aaggctgcac cggtgcgtca gcagaatatg tgatacagga tatattccgc ttcctcgctc 720
actgactcgc tacgctcggt cgttcgactg cggcgagcgg aaatggctta cgaacggggc 780
ggagatttcc tggaagatgc caggaagata cttaacaggg aagtgagagg gccgcggcaa 840
agccgttttt ccataggctc cgcccccctg acaagcatca cgaaatctga cgctcaaatc 900
agtggtggcg aaacccgaca ggactataaa gataccaggc gtttcccctg gcggctccct 960
cgtgcgctct cctgttcctg cctttcggtt taccggtgtc attccgctgt tatggccgcg 1020
tttgtctcat tccacgcctg acactcagtt ccgggtaggc agttcgctcc aagctggact 1080
gtatgcacga accccccgtt cagtccgacc gctgcgcctt atccggtaac tatcgtcttg 1140
agtccaaccc ggaaagacat gcaaaagcac cactggcagc agccactggt aattgattta 1200
gaggagttag tcttgaagtc atgcgccggt taaggctaaa ctgaaaggac aagttttggt 1260
gactgcgctc ctccaagcca gttacctcgg ttcaaagagt tggtagctca gagaaccttc 1320
gaaaaaccgc cctgcaaggc ggttttttcg ttttcagagc aagagattac gcgcagacca 1380
aaacgatctc aagaagatca tcttattaat cagataaaat atttctagat ttcagtgcaa 1440
tttatctctt caaatgtagc acctgaagtc agccccatac gatataagtt gtaattctca 1500
tgtttgacag cttatcatcg ataagctcat tcgccattca ggctgcgcaa ctgttgggaa 1560
gggcgatcgg tgcgggcctc ttcgctatta cgccagctgg cgaaaggggg atgtgctgca 1620
aggcgattaa gttgggtaac gccagggttt tcccagtcac gacgttgtaa aacgacggcc 1680
agtgccaagc ttgcatgcct gcaggtcgac tctagaggat ccccgggtac cgagctcgaa 1740
ttcgtaatca tggtcatagc tgtttcctgt gtgaaattgt tatccgctca caattccaca 1800
caacatacga gccggaagca taaagtgtaa agcctggggt gcctaatgag tgagctaact 1860
cacattaatt gcgttgcgct cactgcccgc tttccagtcg ggaaacctgt cgtgccagct 1920
gcattaatga atcggccaac gcgcggggag aggcggtttg cgtattggaa cgccatgagc 1980
ggcctcattt cttattctga gttacaacag tccgcaccgc tgtccggtag ctccttccgg 2040
tgggcgcggg gcatgactat cgtcgccgca cttatgactg tcttctttat catgcaactc 2100
gtaggacagg tgccggcagc gcccaacagt cccccggcca cggggcctgc caccataccc 2160
acgccgaaac aagcgccctg caccattatg ttccggatct gcatcgcagg atgctgctgg 2220
ctaccctgtg gaacacctac atctgtatta acgaagcgct aaccgttttt atcaggctct 2280
gggaggcaga ataaatgatc atatcgtcaa ttattacctc cacggggaga gcctgagcaa 2340
actggcctca ggcatttgag aagcacacgg tcacactgct tccggtagtc aataaaccgg 2400
taaaccagca atagacataa gcggctattt aacgaccctg ccctgaaccg acgaccgggt 2460
cgaatttgct ttcgaatttc tgccattcat ccgcttatta tcacttattc aggcgtagca 2520
ccaggcgttt aagggcacca ataactgcct taaaaaaatt acgccccgcc ctgccactca 2580
tcgcagtact gttgtaattc attaagcatt ctgccgacat ggaagccatc acaaacggca 2640
tgatgaacct gaatcgccag cggcatcagc accttgtcgc cttgcgtata atatttgccc 2700
atggtgaaaa cgggggcgaa gaagttgtcc atattggcca cgtttaaatc aaaactggtg 2760
aaactcaccc agggattggc tgagacgaaa aacatattct caataaaccc tttagggaaa 2820
taggccaggt tttcaccgta acacgccaca tcttgcgaat atatgtgtag aaactgccgg 2880
aaatcgtcgt ggtattcact ccagagcgat gaaaacgttt cagtttgctc atggaaaacg 2940
gtgtaacaag ggtgaacact atcccatatc accagctcac cgtctttcat tgccatacg 2999
<210> 78
<211> 4176
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pTrc99A VECTOR
<400> 78
gtttgacagc ttatcatcga ctgcacggtg caccaatgct tctggcgtca ggcagccatc 60
ggaagctgtg gtatggctgt gcaggtcgta aatcactgca taattcgtgt cgctcaaggc 120
gcactcccgt tctggataat gttttttgcg ccgacatcat aacggttctg gcaaatattc 180
tgaaatgagc tgttgacaat taatcatccg gctcgtataa tgtgtggaat tgtgagcgga 240
taacaatttc acacaggaaa cagaccatgg aattcgagct cggtacccgg ggatcctcta 300
gagtcgacct gcaggcatgc aagcttggct gttttggcgg atgagagaag attttcagcc 360
tgatacagat taaatcagaa cgcagaagcg gtctgataaa acagaatttg cctggcggca 420
gtagcgcggt ggtcccacct gaccccatgc cgaactcaga agtgaaacgc cgtagcgccg 480
atggtagtgt ggggtctccc catgcgagag tagggaactg ccaggcatca aataaaacga 540
aaggctcagt cgaaagactg ggcctttcgt tttatctgtt gtttgtcggt gaacgctctc 600
ctgagtagga caaatccgcc gggagcggat ttgaacgttg cgaagcaacg gcccggaggg 660
tggcgggcag gacgcccgcc ataaactgcc aggcatcaaa ttaagcagaa ggccatcctg 720
acggatggcc tttttgcgtt tctacaaact ctttttgttt atttttctaa atacattcaa 780
atatgtatcc gctcatgaga caataaccct gataaatgct tcaataatat tgaaaaagga 840
agagtatgag tattcaacat ttccgtgtcg cccttattcc cttttttgcg gcattttgcc 900
ttcctgtttt tgctcaccca gaaacgctgg tgaaagtaaa agatgctgaa gatcagttgg 960
gtgcacgagt gggttacatc gaactggatc tcaacagcgg taagatcctt gagagttttc 1020
gccccgaaga acgttttcca atgatgagca cttttaaagt tctgctatgt ggcgcggtat 1080
tatcccgtgt tgacgccggg caagagcaac tcggtcgccg catacactat tctcagaatg 1140
acttggttga gtactcacca gtcacagaaa agcatcttac ggatggcatg acagtaagag 1200
aattatgcag tgctgccata accatgagtg ataacactgc ggccaactta cttctgacaa 1260
cgatcggagg accgaaggag ctaaccgctt ttttgcacaa catgggggat catgtaactc 1320
gccttgatcg ttgggaaccg gagctgaatg aagccatacc aaacgacgag cgtgacacca 1380
cgatgcctac agcaatggca acaacgttgc gcaaactatt aactggcgaa ctacttactc 1440
tagcttcccg gcaacaatta atagactgga tggaggcgga taaagttgca ggaccacttc 1500
tgcgctcggc ccttccggct ggctggttta ttgctgataa atctggagcc ggtgagcgtg 1560
ggtctcgcgg tatcattgca gcactggggc cagatggtaa gccctcccgt atcgtagtta 1620
tctacacgac ggggagtcag gcaactatgg atgaacgaaa tagacagatc gctgagatag 1680
gtgcctcact gattaagcat tggtaactgt cagaccaagt ttactcatat atactttaga 1740
ttgatttaaa acttcatttt taatttaaaa ggatctaggt gaagatcctt tttgataatc 1800
tcatgaccaa aatcccttaa cgtgagtttt cgttccactg agcgtcagac cccgtagaaa 1860
agatcaaagg atcttcttga gatccttttt ttctgcgcgt aatctgctgc ttgcaaacaa 1920
aaaaaccacc gctaccagcg gtggtttgtt tgccggatca agagctacca actctttttc 1980
cgaaggtaac tggcttcagc agagcgcaga taccaaatac tgtccttcta gtgtagccgt 2040
agttaggcca ccacttcaag aactctgtag caccgcctac atacctcgct ctgctaatcc 2100
tgttaccagt ggctgctgcc agtggcgata agtcgtgtct taccgggttg gactcaagac 2160
gatagttacc ggataaggcg cagcggtcgg gctgaacggg gggttcgtgc acacagccca 2220
gcttggagcg aacgacctac accgaactga gatacctaca gcgtgagcta tgagaaagcg 2280
ccacgcttcc cgaagggaga aaggcggaca ggtatccggt aagcggcagg gtcggaacag 2340
gagagcgcac gagggagctt ccagggggaa acgcctggta tctttatagt cctgtcgggt 2400
ttcgccacct ctgacttgag cgtcgatttt tgtgatgctc gtcagggggg cggagcctat 2460
ggaaaaacgc cagcaacgcg gcctttttac ggttcctggc cttttgctgg ccttttgctc 2520
acatgttctt tcctgcgtta tcccctgatt ctgtggataa ccgtattacc gcctttgagt 2580
gagctgatac cgctcgccgc agccgaacga ccgagcgcag cgagtcagtg agcgaggaag 2640
cggaagagcg cctgatgcgg tattttctcc ttacgcatct gtgcggtatt tcacaccgca 2700
tatggtgcac tctcagtaca atctgctctg atgccgcata gttaagccag tatacactcc 2760
gctatcgcta cgtgactggg tcatggctgc gccccgacac ccgccaacac ccgctgacgc 2820
gccctgacgg gcttgtctgc tcccggcatc cgcttacaga caagctgtga ccgtctccgg 2880
gagctgcatg tgtcagaggt tttcaccgtc atcaccgaaa cgcgcgaggc agcagatcaa 2940
ttcgcgcgcg aaggcgaagc ggcatgcatt tacgttgaca ccatcgaatg gtgcaaaacc 3000
tttcgcggta tggcatgata gcgcccggaa gagagtcaat tcagggtggt gaatgtgaaa 3060
ccagtaacgt tatacgatgt cgcagagtat gccggtgtct cttatcagac cgtttcccgc 3120
gtggtgaacc aggccagcca cgtttctgcg aaaacgcggg aaaaagtgga agcggcgatg 3180
gcggagctga attacattcc caaccgcgtg gcacaacaac tggcgggcaa acagtcgttg 3240
ctgattggcg ttgccacctc cagtctggcc ctgcacgcgc cgtcgcaaat tgtcgcggcg 3300
attaaatctc gcgccgatca actgggtgcc agcgtggtgg tgtcgatggt agaacgaagc 3360
ggcgtcgaag cctgtaaagc ggcggtgcac aatcttctcg cgcaacgcgt cagtgggctg 3420
atcattaact atccgctgga tgaccaggat gccattgctg tggaagctgc ctgcactaat 3480
gttccggcgt tatttcttga tgtctctgac cagacaccca tcaacagtat tattttctcc 3540
catgaagacg gtacgcgact gggcgtggag catctggtcg cattgggtca ccagcaaatc 3600
gcgctgttag cgggcccatt aagttctgtc tcggcgcgtc tgcgtctggc tggctggcat 3660
aaatatctca ctcgcaatca aattcagccg atagcggaac gggaaggcga ctggagtgcc 3720
atgtccggtt ttcaacaaac catgcaaatg ctgaatgagg gcatcgttcc cactgcgatg 3780
ctggttgcca acgatcagat ggcgctgggc gcaatgcgcg ccattaccga gtccgggctg 3840
cgcgttggtg cggatatctc ggtagtggga tacgacgata ccgaagacag ctcatgttat 3900
atcccgccgt taaccaccat caaacaggat tttcgcctgc tggggcaaac cagcgtggac 3960
cgcttgctgc aactctctca gggccaggcg gtgaagggca atcagctgtt gcccgtctca 4020
ctggtgaaaa gaaaaaccac cctggcgccc aatacgcaaa ccgcctctcc ccgcgcgttg 4080
gccgattcat taatgcagct ggcacgacag gtttcccgac tggaaagcgg gcagtgagcg 4140
caacgcaatt aatgtgagtt agcgcgaatt gatctg 4176
<210> 79
<211> 5369
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pET28a (+) VECTOR
<400> 79
atccggatat agttcctcct ttcagcaaaa aacccctcaa gacccgttta gaggccccaa 60
ggggttatgc tagttattgc tcagcggtgg cagcagccaa ctcagcttcc tttcgggctt 120
tgttagcagc cggatctcag tggtggtggt ggtggtgctc gagtgcggcc gcaagcttgt 180
cgacggagct cgaattcgga tccgcgaccc atttgctgtc caccagtcat gctagccata 240
tggctgccgc gcggcaccag gccgctgctg tgatgatgat gatgatggct gctgcccatg 300
gtatatctcc ttcttaaagt taaacaaaat tatttctaga ggggaattgt tatccgctca 360
caattcccct atagtgagtc gtattaattt cgcgggatcg agatctcgat cctctacgcc 420
ggacgcatcg tggccggcat caccggcgcc acaggtgcgg ttgctggcgc ctatatcgcc 480
gacatcaccg atggggaaga tcgggctcgc cacttcgggc tcatgagcgc ttgtttcggc 540
gtgggtatgg tggcaggccc cgtggccggg ggactgttgg gcgccatctc cttgcatgca 600
ccattccttg cggcggcggt gctcaacggc ctcaacctac tactgggctg cttcctaatg 660
caggagtcgc ataagggaga gcgtcgagat cccggacacc atcgaatggc gcaaaacctt 720
tcgcggtatg gcatgatagc gcccggaaga gagtcaattc agggtggtga atgtgaaacc 780
agtaacgtta tacgatgtcg cagagtatgc cggtgtctct tatcagaccg tttcccgcgt 840
ggtgaaccag gccagccacg tttctgcgaa aacgcgggaa aaagtggaag cggcgatggc 900
ggagctgaat tacattccca accgcgtggc acaacaactg gcgggcaaac agtcgttgct 960
gattggcgtt gccacctcca gtctggccct gcacgcgccg tcgcaaattg tcgcggcgat 1020
taaatctcgc gccgatcaac tgggtgccag cgtggtggtg tcgatggtag aacgaagcgg 1080
cgtcgaagcc tgtaaagcgg cggtgcacaa tcttctcgcg caacgcgtca gtgggctgat 1140
cattaactat ccgctggatg accaggatgc cattgctgtg gaagctgcct gcactaatgt 1200
tccggcgtta tttcttgatg tctctgacca gacacccatc aacagtatta ttttctccca 1260
tgaagacggt acgcgactgg gcgtggagca tctggtcgca ttgggtcacc agcaaatcgc 1320
gctgttagcg ggcccattaa gttctgtctc ggcgcgtctg cgtctggctg gctggcataa 1380
atatctcact cgcaatcaaa ttcagccgat agcggaacgg gaaggcgact ggagtgccat 1440
gtccggtttt caacaaacca tgcaaatgct gaatgagggc atcgttccca ctgcgatgct 1500
ggttgccaac gatcagatgg cgctgggcgc aatgcgcgcc attaccgagt ccgggctgcg 1560
cgttggtgcg gatatctcgg tagtgggata cgacgatacc gaagacagct catgttatat 1620
cccgccgtta accaccatca aacaggattt tcgcctgctg gggcaaacca gcgtggaccg 1680
cttgctgcaa ctctctcagg gccaggcggt gaagggcaat cagctgttgc ccgtctcact 1740
ggtgaaaaga aaaaccaccc tggcgcccaa tacgcaaacc gcctctcccc gcgcgttggc 1800
cgattcatta atgcagctgg cacgacaggt ttcccgactg gaaagcgggc agtgagcgca 1860
acgcaattaa tgtaagttag ctcactcatt aggcaccggg atctcgaccg atgcccttga 1920
gagccttcaa cccagtcagc tccttccggt gggcgcgggg catgactatc gtcgccgcac 1980
ttatgactgt cttctttatc atgcaactcg taggacaggt gccggcagcg ctctgggtca 2040
ttttcggcga ggaccgcttt cgctggagcg cgacgatgat cggcctgtcg cttgcggtat 2100
tcggaatctt gcacgccctc gctcaagcct tcgtcactgg tcccgccacc aaacgtttcg 2160
gcgagaagca ggccattatc gccggcatgg cggccccacg ggtgcgcatg atcgtgctcc 2220
tgtcgttgag gacccggcta ggctggcggg gttgccttac tggttagcag aatgaatcac 2280
cgatacgcga gcgaacgtga agcgactgct gctgcaaaac gtctgcgacc tgagcaacaa 2340
catgaatggt cttcggtttc cgtgtttcgt aaagtctgga aacgcggaag tcagcgccct 2400
gcaccattat gttccggatc tgcatcgcag gatgctgctg gctaccctgt ggaacaccta 2460
catctgtatt aacgaagcgc tggcattgac cctgagtgat ttttctctgg tcccgccgca 2520
tccataccgc cagttgttta ccctcacaac gttccagtaa ccgggcatgt tcatcatcag 2580
taacccgtat cgtgagcatc ctctctcgtt tcatcggtat cattaccccc atgaacagaa 2640
atccccctta cacggaggca tcagtgacca aacaggaaaa aaccgccctt aacatggccc 2700
gctttatcag aagccagaca ttaacgcttc tggagaaact caacgagctg gacgcggatg 2760
aacaggcaga catctgtgaa tcgcttcacg accacgctga tgagctttac cgcagctgcc 2820
tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg gagacggtca 2880
cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg tcagcgggtg 2940
ttggcgggtg tcggggcgca gccatgaccc agtcacgtag cgatagcgga gtgtatactg 3000
gcttaactat gcggcatcag agcagattgt actgagagtg caccatatat gcggtgtgaa 3060
ataccgcaca gatgcgtaag gagaaaatac cgcatcaggc gctcttccgc ttcctcgctc 3120
actgactcgc tgcgctcggt cgttcggctg cggcgagcgg tatcagctca ctcaaaggcg 3180
gtaatacggt tatccacaga atcaggggat aacgcaggaa agaacatgtg agcaaaaggc 3240
cagcaaaagg ccaggaaccg taaaaaggcc gcgttgctgg cgtttttcca taggctccgc 3300
ccccctgacg agcatcacaa aaatcgacgc tcaagtcaga ggtggcgaaa cccgacagga 3360
ctataaagat accaggcgtt tccccctgga agctccctcg tgcgctctcc tgttccgacc 3420
ctgccgctta ccggatacct gtccgccttt ctcccttcgg gaagcgtggc gctttctcat 3480
agctcacgct gtaggtatct cagttcggtg taggtcgttc gctccaagct gggctgtgtg 3540
cacgaacccc ccgttcagcc cgaccgctgc gccttatccg gtaactatcg tcttgagtcc 3600
aacccggtaa gacacgactt atcgccactg gcagcagcca ctggtaacag gattagcaga 3660
gcgaggtatg taggcggtgc tacagagttc ttgaagtggt ggcctaacta cggctacact 3720
agaaggacag tatttggtat ctgcgctctg ctgaagccag ttaccttcgg aaaaagagtt 3780
ggtagctctt gatccggcaa acaaaccacc gctggtagcg gtggtttttt tgtttgcaag 3840
cagcagatta cgcgcagaaa aaaaggatct caagaagatc ctttgatctt ttctacgggg 3900
tctgacgctc agtggaacga aaactcacgt taagggattt tggtcatgaa caataaaact 3960
gtctgcttac ataaacagta atacaagggg tgttatgagc catattcaac gggaaacgtc 4020
ttgctctagg ccgcgattaa attccaacat ggatgctgat ttatatgggt ataaatgggc 4080
tcgcgataat gtcgggcaat caggtgcgac aatctatcga ttgtatggga agcccgatgc 4140
gccagagttg tttctgaaac atggcaaagg tagcgttgcc aatgatgtta cagatgagat 4200
ggtcagacta aactggctga cggaatttat gcctcttccg accatcaagc attttatccg 4260
tactcctgat gatgcatggt tactcaccac tgcgatcccc gggaaaacag cattccaggt 4320
attagaagaa tatcctgatt caggtgaaaa tattgttgat gcgctggcag tgttcctgcg 4380
ccggttgcat tcgattcctg tttgtaattg tccttttaac agcgatcgcg tatttcgtct 4440
cgctcaggcg caatcacgaa tgaataacgg tttggttgat gcgagtgatt ttgatgacga 4500
gcgtaatggc tggcctgttg aacaagtctg gaaagaaatg cataaacttt tgccattctc 4560
accggattca gtcgtcactc atggtgattt ctcacttgat aaccttattt ttgacgaggg 4620
gaaattaata ggttgtattg atgttggacg agtcggaatc gcagaccgat accaggatct 4680
tgccatccta tggaactgcc tcggtgagtt ttctccttca ttacagaaac ggctttttca 4740
aaaatatggt attgataatc ctgatatgaa taaattgcag tttcatttga tgctcgatga 4800
gtttttctaa gaattaattc atgagcggat acatatttga atgtatttag aaaaataaac 4860
aaataggggt tccgcgcaca tttccccgaa aagtgccacc tgaaattgta aacgttaata 4920
ttttgttaaa attcgcgtta aatttttgtt aaatcagctc attttttaac caataggccg 4980
aaatcggcaa aatcccttat aaatcaaaag aatagaccga gatagggttg agtgttgttc 5040
cagtttggaa caagagtcca ctattaaaga acgtggactc caacgtcaaa gggcgaaaaa 5100
ccgtctatca gggcgatggc ccactacgtg aaccatcacc ctaatcaagt tttttggggt 5160
cgaggtgccg taaagcacta aatcggaacc ctaaagggag cccccgattt agagcttgac 5220
ggggaaagcc ggcgaacgtg gcgagaaagg aagggaagaa agcgaaagga gcgggcgcta 5280
gggcgctggc aagtgtagcg gtcacgctgc gcgtaaccac cacacccgcc gcgcttaatg 5340
cgccgctaca gggcgcgtcc cattcgcca 5369
<210> 80
<211> 612
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 80
atgaacatgc caatgaccga aagaataaga gcaggcaagc tatttaccga tatgtgcgaa 60
ggcttaccgg aaaaaagact tcgtgggaaa acgttaatgt atgagtttaa tcactcgcat 120
ccatcagaag ttgaaaaaag agaaagcctg attaaagaaa tgtttgccac ggtaggggaa 180
aacgcctggg tagaaccgcc tgtctatttc tcttacggtt ccaacatcca tataggccgc 240
aatttttatg caaatttcaa tttaaccatt gtcgatgact acacggtaac aatcggtgat 300
aacgtactga ttgcacccaa cgttactctt tccgttacgg gacaccctgt acaccatgaa 360
ttgagaaaaa acggcgagat gtactctttt ccgataacga ttggcaataa cgtctggatc 420
ggaagtcatg tggttattaa tccaggcgtc accatcgggg ataattctgt tattggcgcg 480
ggtagtatcg tcacaaaaga cattccacca aacgtcgtgg cggctggcgt tccttgtcgg 540
gttattcgcg aaataaacga ccgggataag cactattatt tcaaagatta taaagttgaa 600
tcgtcagttt aa 612
<210> 81
<211> 822
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 81
atgtcgtgtg aagaactgga aattgtctgg aacaatatta aagccgaagc cagaacgctg 60
gcggactgtg agccaatgct ggccagtttt taccacgcga cgctactcaa gcacgaaaac 120
cttggcagtg cactgagcta catgctggcg aacaagctgt catcgccaat tatgcctgct 180
attgctatcc gtgaagtggt ggaagaagcc tacgccgctg acccggaaat gatcgcctct 240
gcggcctgtg atattcaggc ggtgcgtacc cgcgacccgg cagtcgataa atactcaacc 300
ccgttgttat acctgaaggg ttttcatgcc ttgcaggcct atcgcatcgg tcactggttg 360
tggaatcagg ggcgtcgcgc actggcaatc tttctgcaaa accaggtttc tgtgacgttc 420
caggtcgata ttcacccggc agcaaaaatt ggtcgcggta tcatgcttga ccacgcgaca 480
ggcatcgtcg ttggtgaaac ggcggtgatt gaaaacgacg tatcgattct gcaatctgtg 540
acgcttggcg gtacgggtaa atctggtggt gaccgtcacc cgaaaattcg tgaaggtgtg 600
atgattggcg cgggcgcgaa aatcctcggc aatattgaag ttgggcgcgg cgcgaagatt 660
ggcgcaggtt ccgtggtgct gcaaccggtg ccgccgcata ccaccgccgc tggcgttccg 720
gctcgtattg tcggtaaacc agacagcgat aagccatcaa tggatatgga ccagcatttc 780
aacggtatta accatacatt tgagtatggg gatgggatct aa 822
<210> 82
<211> 996
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 82
atgcagccca aaatttactg gattgataac ctgcgaggga tagcgtgttt aatggtggtg 60
atgattcaca ccactacctg gtatgtgacc aatgctcata gtgttagccc cgtcacatgg 120
gatatcgcca atgttctgaa ttctgcctct cgtgtcagcg tgccgctatt tttcatgatt 180
tccggctatc tcttttttgg cgaacgcagc gcccagccgc gccatttctt gcgtatcggc 240
ttatgtctga ttttttatag cgcaatcgca ctgctctaca ttgcgctgtt tacctccatc 300
aatatggagt tagcgctgaa aaacctgctg caaaagccag tgttttacca cttgtggttt 360
ttcttcgcga ttgcggtgat ttatctggtt tcaccgctga ttcaggtgaa gaacgtcggc 420
ggaaaaatgt tgctggtgct aatggcggtg attggcatta tcgctaaccc aaacacagtg 480
ccgcagaaaa ttgacggttt tgaatggctg ccaattaact tatatatcaa tggcgatact 540
ttttactaca ttctgtatgg catgttgggc cgcgctatag ggatgatgga cacacagcat 600
aaagcactgt cgtgggtgag cgccgcgctg tttgcgacgg gggtttttat tatctctcgc 660
gggacattat atgaattgca gtggcgcgga aattttgccg atacctggta tctttactgt 720
gggccgatgg tttttatctg cgcaatcgcg ctattgactc tggttaaaaa cacgctggat 780
acgcgtacca ttcgcggact tggcttaatc tcccgccatt cattgggtat atacggattc 840
cacgccttga ttatccatgc gctgcgcacc cggggaattg agcttaaaaa ttggccaata 900
ctggatatta tttggatctt ttgcgcgacg ttggcagcga gtttgttact ttctatgctg 960
gtacaacgaa tcgacagaaa cagattagtg agttaa 996
<210> 83
<211> 846
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 83
atgacgccca ttctgaatca ctattttgcc cgtattaact ggtcgggagc tgctgcggtc 60
aatattgata cgcttcgtgc attgcacctg aaacacaatt gcaccattcc gtttgaaaac 120
ctcgacgttt tgctgccgag ggaaatacag cttgataatc aatcgccgga agagaaactg 180
gtgatagccc gtcgtggcgg ttactgtttt gagcagaatg gcgtgtttga gcgggtgtta 240
cgcgagctgg ggtttaacgt tcgcagcttg ttagggcgcg tagtgttatc aaatccgcca 300
gcattaccgc cgcgcaccca tcgtttgctg ttggtggaac tggaagagga aaaatggatt 360
gctgatgtcg gtttcggtgg gcagacgcta accgcgccga ttcgtttagt ttccgatctc 420
gtgcagacca cgccacacgg agagtatcgg ttgttgcagg agggtgatga ttgggtgttg 480
cagtttaatc atcatcagca ttggcagtcg atgtaccgtt ttgatctctg cgagcagcaa 540
caaagcgatt atgtgatggg caatttctgg tcggcgcact ggccgcagtc gcattttcgc 600
catcatttgc tgatgtgccg ccatttgccg gacggcggca agctgacact gaccaatttt 660
cattttaccc attatgaaaa tgggcacgcg gtggagcagc gaaatctacc ggatgtggcg 720
tcattatatg ctgtgatgca agaacagttt ggtctgggcg tggatgatgc gaaacatggc 780
tttaccgtgg atgagttagc gctggtgatg gcggcgtttg atacgcaccc ggaggcggga 840
aaataa 846
<210> 84
<211> 504
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 84
atgaataaca ttgcgccgca atcacctgta atgcgtcgcc tgacgctgca ggataatcct 60
gctatcgccc gcgtcattcg tcaggtatcc gccgaatacg gtcttaccgc tgataaaggc 120
tacaccgtcg ccgatccgaa tcttgacgag ctgtatcaag tatatagtca gcctggccat 180
gcatattggg tcgttgagta cgagggtgaa gtggtcggcg gcggtgggat agcgccatta 240
accgggagtg agtcggatat ttgcgaactg caaaagatgt attttcttcc ggctatccgc 300
ggcaaagggc tggcaaaaaa actggcctta atggcgatgg agcaggcgcg agagatgggt 360
ttcaaacgct gctatctgga aacgaccgct tttttaaagg aagccattgc gctttatgag 420
catttgggct ttgagcatat cgactatgcg cttggctgca cgggccatgt cgattgtgaa 480
gtgcggatgt tgcgcgaact ctaa 504
<210> 85
<211> 444
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 85
atggttatta gtattcgccg ctcacggcat gaggaagggg aggaactcgt tgcgatttgg 60
tgtcgttctg tcgatgccac tcacgatttt ctatcagcag agtatcggac cgagctggag 120
gacctagttc gttccttcct gccggaagcg ccgttgtggg tcgcggttaa tgagcgggat 180
cagccggttg gatttatgtt gctaagtggg cagcatatgg atgcgctgtt tatcgatcct 240
gatgtgcgcg gctgcggcgt aggtcgggtg ctggtggagc atgcgctctc gatggcaccg 300
gaactgacaa ccaacgttaa tgagcaaaat gagcaggcgg ttgggttcta taagaaggtg 360
ggttttaagg ttacgggacg ctctgaggtg gacgatttgg ggaaaccgta tccgttgctg 420
aatctggcgt atgtgggggc gtaa 444
<210> 86
<211> 990
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 86
atgagccagc ttccagggtt gtcacgggaa acaagagaga gtatcgctat gtatcacctt 60
cgggttccac aaacagaaga agaattagag cgttactatc agtttcgctg ggaaatgttg 120
cgtaagcccc tgcatcaacc aaaaggttcg gaacgcgacg cgtgggatgc gatggcgcat 180
caccagatgg tcgtcgacga gcagggtaat ctggtggcgg taggccgact gtatattaat 240
gccgacaatg aagcgtccat tcgctttatg gccgttcatc ccgacgtgca ggacaaaggg 300
ttaggcacgc tgatggcgat gaccctggag tcggtggcgc gtcaggaagg cgttaagcgc 360
gtgacctgta gcgcccgtga agacgcggtg gagtttttcg ccaagctggg gtttgttaat 420
cagggagaaa tcaccacgcc aaccaccacg ccgattcgcc attttttgat gattaagccc 480
gtcgccactc tggatgacat tctgcatcgc ggcgactggt gcgcgcagct gcaacaggcg 540
tggtacgaac atatcccgct tagtgaaaaa atgggcgtgc gcattcagca atataccggg 600
caaaaattta tcactaccat gccagaaacc ggcaatcaga atccgcacca tacgctgttt 660
gccgggagtt tattctcact ggcgacgctc actggttggg gacttatctg gctgatgctg 720
cgtgaacgcc acctcggcgg aacgattatt cttgcggatg cgcatatccg ctacagcaag 780
ccgattagcg gtaaacctca tgcggtagcc gacctcggtg ccttaagcgg cgatctcgac 840
cgtctggcgc gcggacgaaa agcacgggtg cagatgcagg tcgaaatctt tggcgacgag 900
acgccgggtg cagtgtttga aggcacgtat atcgttctgc ccgcgaagcc atttggcccg 960
tatgaagagg gcgggaacga agaagagtaa 990
Claims (28)
- 아세틸-CoA에서 O-아세틸을 글리세롤에 전이하는 제1 O-아세틸 전이효소(O-acetyl transferase) 존재 하에 아세틸-CoA와 글리세롤을 반응시켜 모노아세틴 또는 다이아세틴을 얻는 단계;를 포함하는 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 1에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 말토오스 O-아세틸 전이효소인, 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 1에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 70에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파르트산(ASP)이고, 위치 84에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파라긴(ASN)이고, 위치 114에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)이고, 위치 126에 상응하는 위치의 아미노산이 글루탐산(GLU)인, 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 3에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 15에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR) 또는 페닐알라닌(PHE)이고, 위치 26에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 글루타민(GLN)이고, 위치 30에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 리신(LYS)이고, 위치 71에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR)이고, 위치 82에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 티로신(TYR)인 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 1에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 1 내지 6 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴의 제조 방법.
- 아세틸-CoA에서 O-아세틸을 다이아세틴에 전이하는 제2 O-아세틸 전이효소 존재 하에 다이아세틴을 아세틸-CoA와 반응시켜 트리아세틴을 얻는 단계;를 포함하는, 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 6에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7의 아미노산 서열의 위치 31에 상응하는 위치의 아미노산이 시스테인(CYS) 또는 류신(LEU)이고, 위치 102에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 이소류신(ILE)이고, 위치 143에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 166에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 170에 상응하는 위치의 아미노산이 발린(VAL), 이소류신(ILE), 또는 류신(LEU)이고, 위치 193에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)인, 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 6에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7 내지 10 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴의 제조 방법.
- 아세틸-CoA에서 O-아세틸을 글리세롤에 전이하는 제1 O-아세틸 전이효소(O-acetyl transferase)를 코딩하는 유전자를 발현하는 미생물을 글리세롤을 포함하는 배지 중에서 배양하는 단계;를 포함하는 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 9에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 말토오스 O-아세틸 전이효소인, 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 9에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 70에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파르트산(ASP)이고, 위치 84에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파라긴(ASN)이고, 위치 114에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)이고, 위치 126에 상응하는 위치의 아미노산이 글루탐산(GLU)인, 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 9에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 15에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR) 또는 페닐알라닌(PHE)이고, 위치 26에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 글루타민(GLN)이고, 위치 30에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 리신(LYS)이고, 위치 71에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR)이고, 위치 82에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 티로신(TYR)인, 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 9에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 16 내지 21의 서열 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴의 제조 방법.
- 아세틸-CoA에서 O-아세틸을 다이아세틴에 전이하는 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자를 발현하는 미생물을 다이아세틴을 포함하는 배지 중에서 배양하는 단계를 포함하는, 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 14에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7의 아미노산 서열의 위치 31에 상응하는 위치의 아미노산이 시스테인(CYS) 또는 류신(LEU)이고, 위치 102에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 이소류신(ILE)이고, 위치 143에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 166에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 170에 상응하는 위치의 아미노산이 발린(VAL), 이소류신(ILE), 또는 류신(LEU)이고, 위치 193에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)인, 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 14에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 24 내지 27 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 9에 있어서, 상기 미생물은 아세틸에스테라제(acetylesterase)를 코딩하는 유전자가 감쇄 또는 결실된 것인, 아세틴의 제조 방법.
- 청구항 9에 있어서, 상기 미생물은 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자를 더 발현하고, 상기 배지는 포도당을 포함하는 것인, 아세틴의 제조 방법.
- 아세틸-CoA에서 O-아세틸을 글리세롤에 전이하는 제1 O-아세틸 전이효소(O-acetyl transferase)를 코딩하는 유전자를 발현하는 미생물을 포함하는 아세틴 제조용 조성물.
- 청구항 19에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 말토오스 O-아세틸 전이효소인, 아세틴 제조용 조성물.
- 청구항 19에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 70에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파르트산(ASP)이고, 위치 84에 상응하는 위치의 아미노산이 아스파라긴(ASN)이고, 위치 114에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)이고, 위치 126에 상응하는 위치의 아미노산이 글루탐산(GLU)인, 아세틴 제조용 조성물.
- 청구항 19에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소는 서열번호 5의 아미노산 서열의 위치 15에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR) 또는 페닐알라닌(PHE)이고, 위치 26에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 글루타민(GLN)이고, 위치 30에 상응하는 위치의 아미노산이 아르기닌(ARG) 또는 리신(LYS)이고, 위치 71에 상응하는 위치의 아미노산이 티로신(TYR)이고, 위치 82에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 티로신(TYR)인, 아세틴 제조용 조성물.
- 청구항 19에 있어서, 상기 제1 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 16 내지 21 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴 제조용 조성물.
- 아세틸-CoA에서 O-아세틸을 다이아세틴에 전이하는 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자를 발현하는 미생물을 포함하는, 아세틴 제조용 조성물.
- 청구항 24에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소는 서열번호 7의 아미노산 서열의 위치 31에 상응하는 위치의 아미노산이 시스테인(CYS) 또는 류신(LEU)이고, 위치 102에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 이소류신(ILE)이고, 위치 143에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 166에 상응하는 위치의 아미노산이 페닐알라닌(PHE) 또는 타이로신(TYR)이고, 위치 170에 상응하는 위치의 아미노산이 발린(VAL), 이소류신(ILE), 또는 류신(LEU)이고, 위치 193에 상응하는 위치의 아미노산이 히스티딘(HIS)인, 아세틴 제조용 조성물.
- 청구항 24에 있어서, 상기 제2 O-아세틸 전이효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 24 내지 27 중 어느 하나의 서열로 이루어진 것인, 아세틴 제조용 조성물.
- 청구항 19에 있어서, 상기 미생물은 아세틸에스테라제(acetylesterase)를 코딩하는 유전자가 감쇄 또는 결실된 것인, 아세틴 제조용 조성물.
- 청구항 19에 있어서, 상기 미생물은 글리세롤 3-인산 탈수소효소(glycerol-3-phosphate dehydrogenase) 및 글리세롤 3-탈인산효소(DL-glycerol-3-phosphatase)를 코딩하는 유전자를 더 발현하는 것인, 아세틴 제조용 조성물.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR20180129090 | 2018-10-26 | ||
KR1020180129090 | 2018-10-26 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20200047437A KR20200047437A (ko) | 2020-05-07 |
KR102320656B1 true KR102320656B1 (ko) | 2021-11-02 |
Family
ID=70331532
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020190134943A KR102320656B1 (ko) | 2018-10-26 | 2019-10-28 | 아세틴 화합물의 생물학적 제조 방법 |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20220112527A1 (ko) |
KR (1) | KR102320656B1 (ko) |
CN (1) | CN112912510A (ko) |
DE (1) | DE112019005312T5 (ko) |
WO (1) | WO2020085879A1 (ko) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN114686547A (zh) * | 2020-12-30 | 2022-07-01 | 中国医学科学院药物研究所 | 一种以双醋瑞因为供体的酶促合成乙酰辅酶a的方法 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2008245600A (ja) * | 2007-03-30 | 2008-10-16 | National Institute Of Advanced Industrial & Technology | 新規細菌及び該細菌を用いたグリセロールからのモノアセチンの製造方法 |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5601839A (en) | 1995-04-26 | 1997-02-11 | Theratech, Inc. | Triacetin as a penetration enhancer for transdermal delivery of a basic drug |
KR100531671B1 (ko) * | 2003-12-04 | 2005-11-28 | 씨제이 주식회사 | 서로 다른 두 개의 유기체의 공동배양을 통한 발효가능한탄소원으로부터 1,3-프로판디올의 생산방법 |
CN102030614A (zh) * | 2010-11-15 | 2011-04-27 | 上海大学 | 生物柴油副产物甘油的提纯及合成三醋酸甘油酯的方法 |
US10465174B2 (en) * | 2012-12-20 | 2019-11-05 | Dsm Ip Assets B.V. | Acetyl transferases and their use for producing carotenoids |
KR102636395B1 (ko) * | 2016-06-10 | 2024-02-13 | 경상국립대학교산학협력단 | 터펜 알코올 또는 그 유도체의 제조 방법 |
-
2019
- 2019-10-28 WO PCT/KR2019/014256 patent/WO2020085879A1/ko active Application Filing
- 2019-10-28 US US17/288,761 patent/US20220112527A1/en active Pending
- 2019-10-28 CN CN201980070706.6A patent/CN112912510A/zh active Pending
- 2019-10-28 KR KR1020190134943A patent/KR102320656B1/ko active IP Right Grant
- 2019-10-28 DE DE112019005312.4T patent/DE112019005312T5/de active Pending
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2008245600A (ja) * | 2007-03-30 | 2008-10-16 | National Institute Of Advanced Industrial & Technology | 新規細菌及び該細菌を用いたグリセロールからのモノアセチンの製造方法 |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
GENBANK: EDS05563.1 |
GENBANK: EXF54498.1 |
TSOU, M. F. 등, Microbios, 1998, 94권, 379호, 페이지 133-143* |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20220112527A1 (en) | 2022-04-14 |
KR20200047437A (ko) | 2020-05-07 |
CN112912510A (zh) | 2021-06-04 |
WO2020085879A1 (ko) | 2020-04-30 |
DE112019005312T5 (de) | 2021-09-16 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU2021204038B2 (en) | Mutant microorganisms resistant to lactose killing | |
CN110951741B (zh) | 一种基于CRISPR Cpf1的枯草芽孢杆菌多基因编辑和表达调控系统 | |
KR101106253B1 (ko) | 사이코스 3-에피머라제 효소를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 대장균 및 그를 이용하여 사이코스를 생산하는 방법 | |
US11875298B2 (en) | Sensor for NADP (H) and development of alcohol dehydrogenases | |
CN111235080B (zh) | 基因重组大肠杆菌及5-羟色胺的生产方法 | |
KR20130014445A (ko) | 미생물로부터 레티노이드를 생산하는 방법 | |
CN111154707B (zh) | 基因工程化大肠杆菌及褪黑素的生产方法 | |
KR102320656B1 (ko) | 아세틴 화합물의 생물학적 제조 방법 | |
CN107988250B (zh) | 一种通用型衣藻外源基因表达载体构建方法 | |
CN110241098B (zh) | 酿脓链球菌的CRISPR核酸酶SpCas9的截短型高特异性变异体及其应用 | |
CN104278031A (zh) | 一种受黄嘌呤调控的启动子a及其重组表达载体和应用 | |
KR102636404B1 (ko) | 터펜 알코올 또는 그 유도체의 제조 방법 | |
CN111909914B (zh) | 核酸内切酶SpCas9的高PAM兼容性截短型变异体txCas9及其应用 | |
CN110272881B (zh) | 核酸内切酶SpCas9高特异性截短变异体TSpCas9-V1/V2及其应用 | |
KR102636395B1 (ko) | 터펜 알코올 또는 그 유도체의 제조 방법 | |
CN112553237A (zh) | 一种新型mariner转座子系统、应用和构建枯草芽孢杆菌插入突变株文库 | |
CN112662697B (zh) | 一种莱茵衣藻tctn1表达质粒及其构建方法和应用 | |
CN109136228A (zh) | 长链非编码rna-nkila在骨组织损伤修复中的应用 | |
KR20120088062A (ko) | 파네솔 생산성이 향상된 에세리키아 속 미생물 및 그를 이용하여 파네솔을 생산하는 방법 | |
CN111254104B (zh) | 基因工程化大肠杆菌及吲哚-3-乙酸的制备方法 | |
CN111254105B (zh) | 基因工程大肠杆菌及制备方法和吲哚-3-乙酸的生产方法 | |
TW201109441A (en) | Method for preparing optically active hydroxy acid esters | |
KR101878801B1 (ko) | 클로스트리디움의 유전체 조작 방법 | |
KR20110107209A (ko) | 지방산 생합성 경로의 과발현용 형질전환 대장균의 제조방법 및 상기 제조방법으로 제조된 형질전환 대장균 | |
KR20120055169A (ko) | 말로닐?CoA와 말로닐?[acp]를 이용한 지방산 생합성 경로 과발현용 형질전환 대장균 및 그의 제조방법 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
E902 | Notification of reason for refusal | ||
E701 | Decision to grant or registration of patent right | ||
GRNT | Written decision to grant |