KR102048474B1 - Egfr 표적 제제에 대한 저항성을 억제하기 위한 조성물 - Google Patents

Egfr 표적 제제에 대한 저항성을 억제하기 위한 조성물 Download PDF

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Abstract

본 발명은 뉴로필린 1(Neuropilin 1)에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 통해 EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하는 방법들에 관한 것이다. 또한, 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드가 EGFR 표적 항체에 융합된 융합 항체 및 EGFR 표적제제와 상기 펩타이드가 융합된 항체 중쇄불변부위와의 병용투여를 통한 EGFR 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하는 조성물에 관한 것이다. 또한, 본 발명에 따른 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드가 EGFR 표적 항체에 융합된 융합 항체는 췌장암에서 EGFR 표적항체에 대한 저항성을 극복한다. 또한, 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드가 EGFR 표적 항체에 융합된 융합 항체는 EGFR 표적 항체에 대한 저항성을 가지는 폐암에서도 EGFR 표적항체에 대한 저항성을 극복한다. 따라서, 본 발명에 따른 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 통해, EGFR 표적 제제에 대한 저항성을 가지는 다양한 종양의 치료에 높은 효과를 기대할 수 있다.

Description

EGFR 표적 제제에 대한 저항성을 억제하기 위한 조성물 {Composition for Inhibiting Tolerance Against Epidermal Growth Factor Receptor Targeting Inhibitor}
본 발명은 뉴로필린 1(Neuropilin 1, NRP1)에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 통해 EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하는 조성물에 관한 것으로, 구체적으로 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 포함하고, EGFR 표적 제제에 대한 저항성을 극복하여 암을 치료하기 위한 조성물에 관한 것이다.
EGFR은 세포의 성장, 생존 및 전이와 같은 세포 기능에 수반되는 세포 수용체의 일원이며, EGFR의 과발현 또는 변이는 종양을 유발한다. 이에 따라, EGFR을 표적하는 항체 및 소분자 타이로신 키나제 저해제들이 다수 개발되고 있다. 예를 들면, EGFR을 표적하는 항체에는, 세툭시맙 (Cetuximab), 파니투무맙 (Panitumumab), 잘루투무맙 (zalutumumab), 니모투주맙 (nimotuzumab), 마투주맙 (matuzumab)이 있고, 소분자 타이로신 키나제 저해제에는, 제피티닙 (Gefitinib), 에르로티닙 (Erlotinib)이 개발되었다. 이러한 EGFR 표적 제제들은 직장암, 비-소세포 폐암, 두경부암의 치료를 위해 쓰이고 있다. 그러나, 이들 단일 약물을 사용하는 암 치료법은 특정 종류의 종양 세포에만 효과를 나타내어 그 적응증에 한계가 있거나, 다양한 종류 또는 변이 종양에서 저항성을 보여 만족할 만한 치료효과를 나타내지 못하고 있는 실정이다. 따라서, 보다 효과적인 암 치료를 위해서는 2 또는 그 이상을 표적으로 하는 다중 병용 치료법의 개발이 요구되고 있다.
여러 암 종 중에서도, 췌장암은 매우 나쁜 예후를 나타내는 암이며, 60-80% 환자가 국소적 중증, 또는 전이성 질환을 나타낸다. 대부분의 췌장암들은 다양한 수용체 타이로신 키나제 중 EGFR과 이의 리간드가 과발현되어 그들의 성장 및 생존을 촉진하는데 주요 역할을 수행한다고 알려져 있다 (Oliveira-Cunha et al., 2011; Wheeler et al., 2010). 하지만, 현재까지의 EGFR 표적 제제들은 췌장암에서는 여전히 효과적이지 않다. 이는 다수의 췌장암이 EGFR 표적 제제에 대해 저항성을 나타내기 때문이다. 그에 따라, EGFR 표적 제제들은 항암화학요법인 젬시타빈 (Gemcitabine)과 조합하여 췌장암 치료에 널리 사용되어 왔지만, 상당한 독성을 나타내는 문제점이 있다 (Chong and Janne, 2013; Philip et al., 2010). 따라서, 췌장암에서 효과적인 EGFR 표적 치료법의 개발이 필요하다.
전세계적으로 암 사망의 주원인으로 알려진 폐암 역시 EGFR이 그들의 성장에 주요 인자로 알려져 있다 (Sharma et al., 2007; Morgillo Floriana et al., 2016). 따라서, 폐암을 치료하기 위하여 다양한 EGFR 표적 제제들이 개발되었으며, 특히, EGFR 표적 소분자 타이로신 키나제 저해제인 제피티닙 (Gefitinib)과 에르로티닙 (Erlotinib)이 대표적인 약물이다. 하지만, 이들 표적 제제들이 매우 유효한 약물임에도 불구하고, 실제로 폐암 환자들의 약 10% 만이 이들 약물에 반응성을 보이고 있다 (Socinski Mark A, 2007). 따라서, 폐암에서 역시 새로운 EGFR 표적 치료 대안이 절실히 요구된다.
EGFR 표적 제제들 중 항-EGFR 항체인 세툭시맙 (Cetuximab, Ctx)은 리간드들 (EGF, TGFα)에 의존적인 EGFR의 활성화를 억제시키고, 이의 하위 신호전달을 막는다. Ctx은 직장암, 두경부암에서 항암화학요법과의 병용투여로 FDA 승인을 받았지만, EGFR 표적 제제들에 대해 저항성을 가지는 췌장암 및 폐암에서는 승인받지 못하였다. 그러나, EGFR 표적 제제들에 대한 췌장암 및 폐암 세포의 저항성의 명확한 기작 및 이를 개선하기 위한 방안은 아직 개발된 바가 없다.
기존에 직장암과 두경부암에서 규명된 저항성 기작은 다음과 같다. 1) EGFR 유전자의 높은 copy number, 2) EGFR 유전자의 돌연변이, 3) KRAS 유전자 또는 BRAF 유전자의 돌연변이 등이 있다 (Oliveira-Cunha et al., 2011). 현재까지 췌장암에서 밝혀진 EGFR 표적 제제들에 대한 저항성 기작은 EGFR 패밀리 (EGFR, HER2, HER3)에 의한 비정상적인 PI3K-Akt 경로의 활성화와 연관되어 있다는 보고가 있지만, 이 또한 명확한 기작은 아직 불분명하다 (Larbouret et al., 2012; Wong et al., 2014). 폐암에서 역시, 인테그린 β3가 KRAS 유전자와 결합하여 KRAS-RalB-NFκB 경로의 신호를 활성화시킴으로써, EGFR 표적 제제에 대한 저항성을 유도한다는 것이 최근에서야 보고되고 있는 실정이다 (Laetitia Seguin, 2014). 췌장암 및 폐암에서의 효과적인 치료 약물의 부재는 환자의 높은 사망률과 관련되기 때문에 췌장암 및 폐암에 대한 저항성 기작을 정확히 규명할 필요가 있다.
뉴로필린1 (Neuropilin 1, NRP1)은 막투과성 당단백질 (transmembrane glycoprotein)으로서, VEGF 패밀리 리간드들과 세마포린 3계역 리간드 (class 3 semaphorins: Sema3A, Sema3B, Sema3C, Sema3D, Sema3E, Sema3F, Sema3G) 리간드와 결합한다 (Guo and Vander Kooi, 2015; Prud'homme and Glinka, 2012). NRP1은 정상세포에 매우 미약하게 발현되는 반면, 대부분의 종양혈관 내피세포, 고형암 세포, 혈액종양 세포에 과발현되어 종양성장 및 전이에 중요한 역할을 한다. 일부 제제, 작은 간섭 RNA, 펩타이드 억제제 또는 NRP1를 표적하는 항체가 NRP1의 기능을 방해함으로써, 암세포의 생장, 혈관생성 및 전이를 감소시킨다는 보고도 있다 (Berge et al., 2010; Hong et al., 2007).
또한, NRP1은 췌장암과 폐암에도 과발현되어 되어 종양 성장과 관련하여 역할을 수행한다. NRP1은 다양한 리간드의 공-수용체로서 역할을 하는데 특히, 췌장암에서는 인테그린 β1 (integrin β1)과 결합함으로써 인테그린 β1의 신호를 증폭시킨다. 인테그린 β1은 주로 Src/Akt 경로의 신호를 활성화시킴으로써 폐암에서 EGFR 표적 소분자 타이로신 키나제 저해제인 에르로티닙에 대한 저항성이 유도된다는 보고가 있다 (Kanda et al., 2013). 하지만, 췌장암에서 NRP1/인테그린 β1의 활성화와 EGFR 표적 제제에 대한 저항성의 관련성은 밝혀진 바가 없고, 저항성을 개선할 새로운 치료제 또한 현저히 필요하다.
이러한 기술적 배경하에서, 본 출원의 발명자들은 췌장암에서 EGFR 표적 제제에 대하여 선천적 저항성을 나타내는지 여부를 예측할 수 있는 마커를 확인하고, 이를 기초로 EGFR 표적 제제에 대한 저항성 여부를 판단하였으며, 특히 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 통해 저항성 관련 마커의 발현 조절 가능성 및 이의 기작을 규명하여 EGFR 표적 제제에 대한 저항성을 극복할 수 있음을 확인하였다. 또한, 췌장암뿐 아니라, EGFR 표적 제제에 대해 저항성을 가지는 폐암에서 역시 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 통해 EGFR 표적제제에 대한 저항성을 극복할 수 있음을 확인함으로써, 본 발명을 완성하였다.
본 배경기술 부분에 기재된 상기 정보는 오직 본 발명의 배경에 대한 이해를 향상시키기 위한 것이며, 이에 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가지는 자에게 있어 이미 알려진 선행기술을 형성하는 정보를 포함하지 않을 수 있다.
본 발명의 목적은 EGFR 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하여 암을 치료할 수 있는 조성물을 제공하는 데 있다.
본 발명의 다른 목적은 상기 EGFR 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하여 암을 치료할 수 있는 조성물을 포함하는 항암제 또는 항암 보조제를 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 EGFR 표적 제제와 병용하여 EGFR 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절함으로써 암을 치료할 수 있는 병용 투여 조성물을 제공하는 데 있다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 포함하고, 상기 펩타이드는 EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하는 것을 특징으로 하는 암 치료용 조성물을 제공한다.
본 발명은 또한, 상기 조성물을 포함하는 항암제를 제공한다.
본 발명은 또한, 상기 조성물을 포함하는 항암 보조제를 제공한다.
본 발명은 더욱이, 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드 및 EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) 표적 제제를 포함하고, 상기 펩타이드는 EGFR 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하는 것을 특징으로 하는 암 치료용 병용 투여 조성물을 제공한다.
본 발명에 따라 뉴로필린 1 (NRP1)에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 EGFR 표적 제제와 결합시키거나 또는 EGFR 표적 제제와 병용함으로써, 종양 세포의 NRP1에 작용하여 NRP1/활성 인테그린 β1의 세포 내 유입을 촉진하여 세포표면의 활성화 인테그린 β1의 발현양을 감소, 인테그린 β1에 의해 유도된 FAK, Src과 Akt의 인산화 수준을 감소시킨다. 이를 통해, 본 발명에 따른 조성물 또는 병용 제제를 통해 암에 대한 EGFR 표적하는 제제들의 선천적 저항성을 극복할 수 있는 바, 효과적인 항암제, 또는 항암 보조제 개발에 사용될 수 있다.
도 1은 Ctx에 대한 선천적 저항성 유무에 따른 췌장암 세포주의 특징을 나타낸 것이다.
도 1a는 Ctx에 대해 선천적 저항성을 가지는 (Cetuximab-resistant, CtxR) 췌장암 세포주 (BxPC-3, PANC-1, Capan-2, SW1990)와 가지지 않는 (Cetuximab-sensitive, CtxS) 췌장암 세포주 (Miapaca-2, AsPC-1)의 EGFR, NRP1 및 인테그린 β1의 세포 표면 발현 수준에 대한 유세포 분석기 (FACS) 분석 결과를 나타낸 도이다.
도 1b는 위의 췌장암 세포주들의 EGFR, NRP1 및 인테그린 β1의 발현 수준을 세포 표면 및 내부, 즉 총 발현 수준을 분석한 웨스턴 블롯 결과이다.
도 1c는 CtxS 및 CtxR 췌장암 세포주에서의 분자적 특성을 비교한 도이다. EGFR, Akt, Src 및 ERK의 총 발현 수준 및 인산화된 정도를 Ctx-무처리 및 처리된 수준에 대한 웨스턴 블롯 분석 결과이다.
도 2는 CtxR 췌장암 세포주에서 Ctx에 대한 저항성이 과발현된 인테그린 β1과 Src, Akt와 관련이 있는 지 확인하기 위한 각각의 siRNA (short interfering RNA)와 억제제 (Inhibitor)의 효과를 MTT 어세이로 확인한 결과이다.
도 2a는 대조군 siRNA와 인테그린 β1 siRNA 처리한 CtxR 세포주 (BxPC-3, PANC-1, SW1990)에 Ctx을 처리 후 세포증식을 확인한 그래프이다.
도 2b는 도 2a에서 사용한 인테그린 β1 siRNA가 인테그린 β1의 발현을 억제한 것을 웨스턴 블롯으로 확인한 결과이다.
도 2c는 PI3K-Akt 억제제 (LY294002), Src 억제제 (SU6656), Raf 억제제 (Sorafenib)을 Ctx과 함께 처리함에 따른 CtxR 세포주의 세포증식을 확인한 그래프이다.
도 3은 구축된 Ctx-TPP11의 모식도와 NRP1 및 EGFR에 동시 결합능을 확인한 결과이다.
도 3a는 TPP11 펩타이드가 15개 잔기 (G4S)3링커를 통하여 Ctx의 중쇄의 C-말단에 융합된 형태의 Ctx-TPP11의 모식도이다.
도 3b는 Fc-TPP11, Ctx과 비교하여 구축된 Ctx-TPP11이 EGFR과 NRP1-b1b2에 대해 동시 결합능을 보이는 지 확인한 sandwich ELISA (enzyme linked immunosorbent assay)를 결과이다.
도 4는 Ctx-TPP11가 NRP1를 발현하는 CtxR 췌장암 세포의 증식 억제 및 세포 사멸 (Apoptosis)을 촉진시킬 수 있음을 확인한 결과이다.
도 4a는 CtxS 및 CtxR 췌장암 세포주에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11의 농도별 처리에 따른 세포증식을 MTT 어세이를 통해 측정한 결과이다.
도 4b는 CtxS 및 CtxR 췌장암 세포주에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11의 처리에 따른 세포 사멸의 정도를 아넥신 V-FITC 검출 키트 (Annexin V-FITC apoptosis detection kit)를 이용하여 유세포 분석기 (FACS)로 분석한 결과이다.
도 4c는 도 4b에서 나타낸 dot plot에서 아넥신 V-FITC 염색이 된 세포 사멸 정도를 정량화한 그래프이다.
도 4d는 CtxR 췌장암 세포주에서 확인한 세포증식 억제능에 대한 NRP1, 인테그린 β1, cMet siRNA의 효과를 나타낸 결과이다.
도 4e 및 4f는 도 4d에서 사용한 NRP1, cMet siRNA가 NRP1과 cMet의 발현을 억제한 것을 웨스턴 블롯으로 확인한 결과이다.
도 5는 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11의 EGFR, Src, Akt 및 ERK1/2의 인산화에 대한 억제신호를 대조군 siRNA 및 인테그린 β1 siRNA에 따라 확인한 웨스턴 블롯 결과이다.
도 5a는 3가지의 CtxR 췌장암 세포주 (BxPC-3, PANC-1, SW1990)에서 대조군 siRNA 처리 후, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11의 신호 억제 효과를 확인한 결과이다.
도 5b는 3가지의 CtxR 췌장암 세포주 (BxPC-3, PANC-1, SW1990)에서 인테그린 β1 siRNA 처리 후, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11의 신호 억제 효과를 확인한 결과이다.
도 6은 췌장암과 다르게, KRas 및 BRaf 야생형인 CtxS 대장암 세포주와 KRas 및 BRaf 돌연변이에 의해 Ctx에 대한 저항성을 가지는 대장암 세포주들에서의 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11에 의한 세포증식 억제능을 확인한 MTT 어세이 결과이다.
도 7는 CtxR BxPC-3, PANC-1에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1, 활성 인테그린 β1 (active integrin β1), 비활성 인테그린 β1 (inactive integrin β1)의 세포 내 유입능을 공초점 현미경 (confocal microscopy)으로 관찰한 결과이다.
도 7a는 CtxR BxPC-3에서의 관찰 결과이다.
도 7b는 CtxR PANC-1에서의 관찰 결과이다.
도 8은 CtxR BxPC-3에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1, EGFR, 활성 인테그린 β1, 비활성 인테그린 β1의 세포 내 유입능을 유세포 분석기로 분석한 결과이다.
도 8a는 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1, EGFR, 활성 인테그린 β1, 비활성 인테그린 β1의 세포 표면 발현량을 나타낸 히스토그램 그래프이다.
도 8b는 도 8a에서 나타낸 히스토그램의 평균형광강도 (Mean Fluorescence Intensity, MFI)를 나타낸 그래프이다.
도 9는 CtxR PANC-1에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1, EGFR, 활성 인테그린 β1, 비활성 인테그린 β1의 세포 내 유입능을 유세포 분석기 (FACS)로 분석한 결과이다.
도 9a는 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1, EGFR, 활성 인테그린 β1, 비활성 인테그린 β1의 세포 표면 발현양을 나타낸 유세포 분석기의 히스토그램 그래프이다.
도 9b는 도 9a에서 나타낸 히스토그램의 평균형광강도를 나타낸 그래프이다.
도 10은 CtxR BxPC-3, PANC-1에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 피브로넥틴 (Fibronectin, FN)에 대한 세포 부착능을 세포 부착 어세이 (Cell adhesion assay)를 통해 확인한 결과이다.
도 10a는 세포 부착능을 광학현미경을 통해 확인한 결과이다.
도 10b는 세포 부착 어세이 결과, FN에 부착된 세포의 수를 정량적 비교한 그래프이다.
도 11은 Ctx-TPP11의 마우스 생체 내에서 CtxR 췌장 종양 성장 억제 활성을 측정한 결과이다:
도 11a, 도 11b는 CtxR BxPC-3, PANC-1 이종이식 누드 마우스에서 Ctx, Ctx-TPP11, 또는 Ctx과 Fc-TPP11의 병용투여에 의한 종양 부피의 변화 (a), 투여 끝에 적출한 종양 무게 (b)를 나타낸 그래프이다.
도 11c는 상기 도 11a의 실험 과정에서 주기적으로 측정된 마우스 체중 변화를 나타낸 도이다.
도 12는 Ctx-TPP11의 마우스 생체 내에서 CtxS 췌장 종양 성장 억제 활성을 측정한 결과이다:
도 12a, 도 12b는 CtxS AsPC-1 이종이식 누드 마우스에서 Ctx, Ctx-TPP11, 또는 Ctx과 Fc-TPP11의 병용투여에 의한 종양 부피의 변화 (a), 투여 끝에 적출한 종양 무게 (b)를 나타낸 그래프이다.
도 12c는 상기 도 12a의 실험 과정에서 주기적으로 측정된 마우스 체중 변화를 나타낸 그래프이다.
도 13은 상기 도 11, 도 12에서 종양 억제능이 확인된 종양 조직을 면역조직화학 (Immunohistochemistry, IHC) 실험을 통해 조직의 성장 마커 및 세포사멸 마커의 정도를 비교한 결과이다.
도 13a는 상기 도 11, 12 실험의 종양을 적출하여 성장 마커인 Ki-67 및 세포사멸 마커인 TUNEL를 공초점 현미경으로 관찰한 결과이다.
도 13b는 도 13a의 Ki-67 및 TUNEL을 정량적으로 비교한 그래프이다.
도 14는 상기 도 11에서 종양 억제능이 확인된 CtxR 종양 조직을 적출하여 수행한 웨스턴 블롯 결과이다.
도 15는 CtxS and CtxR 폐암 세포주에서의 EGFR, NRP1 및 인테그린 β1의 세포 표면 발현 수준을 비교한 결과이다.
도 15a는 CtxS 폐암 세포주 2종 (Calu-3, H1975) 및 CtxR 폐암 세포주 11종 (H1299, A549, Calu-1, H358, H441, H2009, HCC44, HCC2108, SK-LU-1, H460, H522)의 EGFR, NRP1 및 인테그린 β1의 세포 표면 발현 수준에 대한 유세포 분석기 (FACS) 분석 결과를 히스토그램으로 나타낸 도이다.
도 15b는 도 15a에서 나타낸 히스토그램의 평균형광강도를 나타낸 그래프이다.
도 16은 CtxR 폐암 세포주에서 세포 표면의 어떤 수용체가 Ctx에 대한 저항성과 관련이 있는지 알기 위해, 다양항 세포 표면의 수용체 중에서 NRP1이 공-수용체로 작용하는 수용체들의 siRNA의 효과를 WST-1 어세이로 확인한 결과이다.
도 16a는 대조군 siRNA와 NRP1 siRNA, 인테그린 β1 siRNA, 인테그린 β3 siRNA, cMet siRNA, VEGFR1 siRNA, TGFβR2 siRNA를 각각 처리한 CtxR 폐암 세포주 2종 (A549, HCC44)에 Ctx을 처리 후 세포증식을 확인한 그래프이다.
도 16b는 도 16a에서 사용한 siRNA가 각각의 표적하는 단백질 발현을 특이적으로 억제한 것을 웨스턴 블롯으로 확인한 결과이다
도 17은 PI3K-Akt 억제제 (LY294002), Src 억제제 (SU6656), Raf 억제제 (Sorafenib)을 Ctx과 함께 처리함에 따른 CtxR 세포주의 세포증식을 확인한 그래프이다.
도 18은 Ctx-TPP11이 CtxR 폐암 세포의 증식을 억제할 수 있음을 확인한 결과이다.
도 18a는 NRP1을 발현하고 있는 CtxS 폐암 세포주 2종 (Calu-3, H1975) 및 CtxR 폐암 세포주 8종 (H1299, A549, Calu-1, H358, H441, H2009, HCC44, SK-LU-1)에서 Ctx, Ctx-TPP11의 농도별 처리에 따른 세포증식을 WST-1 어세이를 통해 측정한 결과이다.
도 18b는 NRP1을 발현하지 않는 CtxR 폐암 세포주 3종 (HCC2108, H460, H522)에서 Ctx, Ctx-TPP11의 농도별 처리에 따른 세포 증식을 WST-1 어세이를 통해 측정한 결과이다.
도 18c는 CtxR 폐암 세포주에서 확인한 Ctx-TPP11의 세포증식 억제능에 대한 NRP1 siRNA의 효과를 나타낸 결과이다.
도 19는 CtxR 폐암 세포주에서 NRP1, 인테그린 β3 및 KRAS의 상호관계를 확인하기 위해 면역침강분석 어세이 (Immunoprecipitation assay)를 진행한 결과이다.
도 19a는 CtxR 폐암 세포주 HCC44, A549에서 NRP1 항체를 이용하여 면역침강분석 어세이를 수행한 결과이다
도 19b는 대조군 siRNA를 처리한 A549와 인테그린 β3 siRNA을 처리한 A549에서 NRP1 항체를 이용하여 면역침강분석 어세이를 수행한 결과이다.
도 20은 CtxR HCC44, A549에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1, 인테그린 β3의 세포 내 유입능을 유세포 분석기로 분석한 결과이다.
도 20a는 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1, 인테그린 β3의 세포 표면 발현량을 나타낸 히스토그램 그래프이다.
도 20b는 도 20a에서 나타낸 히스토그램의 평균형광강도 (Mean Fluorescence Intensity, MFI)를 나타낸 그래프이다.
도 21는 Ctx 외에 EGFR 표적항체 중 파니투무맙 (Panitumumab, Pnm)에 TPP11을 융합한 Panitumumab-TPP11 (Pnm-TPP11)이 PnmR 폐암 세포의 증식을 억제할 수 있음을 확인한 결과이다.
도 21a는 TPP11 펩타이드가 15개 잔기 (G4S)3링커를 통하여 Pnm의 중쇄의 C-말단에 융합된 형태의 Pnm-TPP11의 모식도이다.
도 21b는 NRP1을 발현하고 있는 PnmS 및 PnmR 폐암 세포주에서 Pnm, Pnm-TPP11의 농도별 처리에 따른 세포증식을 WST-1 어세이를 통해 측정한 결과이다.
도 21c는 NRP1을 발현하지 않는 PnmR 폐암 세포주에서 Pnm, Pnm-TPP11의 농도별 처리에 따른 세포 증식을 WST-1 어세이를 통해 측정한 결과이다.
도 22은 CtxR 췌장암 및 폐암의 저항성 기작 및 Ctx-TPP11에 의한 CtxR 극복 기작을 나타낸 전반적인 모식도이다.
도 22a은 CtxR 췌장암의 저항성 기작 및 Ctx-TPP11에 의한 CtxR 극복 기작을 나타낸 전반적인 모식도이다.
도 22b는 CtxR 폐암의 저항성 기작 및 Ctx-TPP11에 의한 CtxR 극복 기작을 나타낸 전반적인 모식도이다.
다른 식으로 정의되지 않는 한, 본 명세서에서 사용된 모든 기술적 및 과학적 용어들은 본 발명이 속하는 기술분야에서 숙련된 전문가에 의해서 통상적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다. 일반적으로, 본 명세서에서 사용된 명명법은 본 기술분야에서 잘 알려져 있고 통상적으로 사용되는 것이다.
본 발명은 일 관점에서, 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 포함하고, 상기 펩타이드는 EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하는 것을 특징으로 하는 암 치료용 조성물에 관한 것이다.
본 발명은 또한, 치료적 유효량의 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 환자에 투여하는 단계를 포함하고, 상기 펩타이드는 EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하는 것을 특징으로 하는 암 치료방법, 특히 EGFR 표적 제제에 대한 저항성을 나타내는 암을 치료하는 방법에 관한 것이다.
상기 펩타이드는 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하며, 예를 들어 하기 서열번호 1 내지 3으로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 서열을 포함할 수 있다:
HTPGNSKPTRTPRR (TPP11, 서열번호 1),
HTPGNSNQFVLTSTRPPR (TPP1, 서열번호 2), 및
HTPGIATRTPR (TPP8, 서열번호 3).
상기 펩타이드는 i) 세포 표면에 발현된 활성 인테그린 β1의 발현양을 감소시켜, Src, Akt의 인산화를 억제하여, EGFR 표적제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하거나, 또는 ii) 세포표면에 발현된 NRP1 및 인테그린 β3의 발현을 조절하여, EGFR 표적제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절할 수 있다.
본 발명의 일 실시예에서는 상기 펩타이드가 췌장암에서 뉴로필린 1에 특이적으로 결합함에 따라, NRP1/활성 인테그린 β1 세포 내 유입을 통한 세포 표면의 활성 인테그린 β1의 발현을 감소시키는 것을 확인하였다. 또한, 상기 펩타이드에 의해 인테그린 β1-유도 FAK, Src 및 Akt의 인산화를 억제시킴을 확인하였다. 이에 따라, 본 발명에 따른 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 통해 암에서 EGFR 표적 제제, 예를 들어 세툭시맙 또는 파니투무맙과 같은 EGFR 표적 항체에 대한 저항성을 극복하고, 감수성을 증가시킬 수 있음을 확인하였다.
본 발명의 다른 실시예에서는 본 발명에 따른 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드가 폐암에서 세포표면에 발현된 NRP1 및 인테그린 β3의 발현을 조절하여 EGFR 표적 제제, 예를 들어 세툭시맙 또는 파니투무맙과 같은 EGFR 표적 항체에 대한 저항성을 극복하고, 감수성을 증가시킬 수 있음을 확인하였다.
상기 EGFR 표적 제제는 유전자의 발현 억제제 또는 활성 억제제일 수 있고, 그 형태에 제한이 있는 것은 아니나, 예를 들어 EGFR 발현 억제제 또는 활성 인테그린 β1 발현 및 FAK, Src, Akt의 발현 억제제일 수 있으며, 상기 발현 억제제는 단백질 유전자의 mRNA에 상보적으로 결합하는 안티센스 뉴클레오티드, 짧은 헤어핀 RNA (small hairpin RNA, shRNA), 작은 간섭 RNA (small interfering RNA, siRNA) 또는 리보자임 (ribozyme)일 수 있고, 상기 활성 억제제는 EGFR 활성 억제제 또는 인테그린 β1, FAK, Src, Akt의 활성 억제제일 수 있으며, 화합물, 펩타이드, 펩타이드 모방체, 기질 유사체, 앱타머, 항체, 또는 길항제일 수 있다.
일 실시예에서, 상기 EGFR 표적 제제는 예를 들어, EGFR 활성을 특이적으로 저해하는 화합물이거나, EGFR에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 단편일 수 있으며, 펩타이드는 항체 또는 항체 단편의 C 말단에 결합될 수 있다.
구체적으로, 상기 EGFR 표적 제제는 예를 들어, 세툭시맙 (Cetuximab), 파니투무맙 (panitumumab), 잘루투무맙 (zalutumumab), 니모투주맙 (nimotuzumab), 및 마투주맙 (matuzumab)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 항체, 또는 겔피티닙 (Gefitinib), 엘로티닙 (erlotinib), 및 라파티닙 (lapatinib)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 항체 단편은 항체의 중쇄 또는 경쇄 각 도메인 또는 이의 단편을 의미하며, 예를 들면, Fc, Fab, 항체의 중쇄 불변영역 절편 (CH1, CH2, 또는 CH3), 중쇄 가변영역 절편 (VH), 경쇄 불변영역 절편 (CL), 경쇄 가변영역 절편 (VL), 단일 사슬 항체 절편 (single chain variable fragment(scFv)) 또는 이들의 단편일 수 있다. 바람직하게, 상기 항체 단편은 항체의 경첩(hinge)-CH2-CH3로 이뤄진 중쇄 불변영역 (crystalizable fragment (Fc)) 절편일 수 있다.
Fab는 경쇄 및 중쇄의 가변영역과 경쇄의 불변영역 및 중쇄의 첫 번째 불변영역(CH1)을 가지는 구조로 1개의 항원 결합 부위를 가진다. Fab'는 중쇄 CH1 도메인의 C-말단에 하나 이상의 시스테인 잔기를 포함하는 힌지 영역(hinge region)을 가진다는 점에서 Fab와 차이가 있다. F(ab')2 항체는 Fab'의 힌지 영역의 시스테인 잔기가 디설파이드 결합을 이루면서 생성된다.
"Fv" 단편은 완전한 항체 인식 및 결합 부위를 함유하는 항체 단편이다. 이러한 영역은 1개의 중쇄 가변 도메 인과 1개의 경쇄 가변 도메인이, 예를 들어 scFv로 단단하게 사실상 공유적으로 연합된 이량체로 이루어진다.
"단일쇄 Fv" 또는 "scFv" 항체 단편은 항체의 VH 및 VL 도메인을 포함하는데, 이들 도메인은 단일 폴리펩티드 쇄 내에 존재한다. Fv 폴리펩티드는 scFv가 항원 결합을 위해 목적하는 구조를 형성할 수 있도록 하는 VH 도메인과 VL 도메인 사이에 폴리펩티드 링커를 추가로 포함할 수 있다.
단쇄 Fv(single-chain Fv, scFv)는 일반적으로 펩타이드 링커를 통하여 중쇄의 가변영역과 경쇄의 가변영역이 공유결합으로 연결되거나 또는 C-말단에서 바로 연결되어 있다. 이러한 항체 단편은 단백질 가수분해 효소를 이용해서 얻을 수 있고(예를 들어, 전체 항체를 파파인으로 제한 절단하면 Fab를 얻을 수 있고 펩신으로 절단하면 F(ab')2 단편을 얻을 수 있다), 유전자 재조합 기술을 통하여 제작할 수도 있다.
중쇄 불변영역은 감마(γ), 뮤(μ), 알파(α), 델타(δ) 또는 엡실론(ε) 중의 어느 한 이소타입으로부터 선택될 수 있다. 서브클래스로 감마1(γ1), 감마2(γ2), 감마3(γ3), 감마4(γ4), 알파1(α1) 및 알파2(α2)를 가진다. 경쇄 불변영역은 카파 또는 람다 형일 수 있다.
"중쇄"는 항원에 특이성을 부여하기 위한 충분한 가변영역 서열을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 가변영역 도메인 VH 및 3 개의 불변영역 도메인 CH1, CH2 및 CH3을 포함하는 전체길이 중쇄 및 이의 단편을 모두 의미한다. 또한, "경쇄"는 항원에 특이성을 부여하기 위한 충분한 가변영역 서열을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 가변영역 도메인 VL 및 불변영역 도메인 CL을 포함하는 전체길이 경쇄 및 이의 단편을 모두 의미한다.
또한, 상기 항체의 단편은 단량체 (monomer), 이량체 (dimer) 또는 다량체일 수 있다. 상기 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드는 EGFR에 특이적인 항체의 중쇄 불변부위(Fc) 단편에 결합될 수 있으며, 바람직하게는 Fc의 C-말단에 결합할 수 있다.
본 발명의 실시예에 따르면, EGFR에 특이적으로 결합하는 항체인 항-EGFR 항체 세툭시맙 (Ctx)과 파니투무맙 (Pnm)의 중쇄 C-말단에 NRP1 특이적 결합 펩타이드인 TPP11이 결합되어, NRP1와 EGFR을 동시 표적하는 전략을 제공함으로써 EGFR 표적 항체에 대한 저항성을 극복할 수 있음을 제시하였다.
상기 "결합"은 기능 또는 구조가 다르거나 같은 두 분자를 일체화하는 것으로, "융합"과 혼용하여 사용할 수 있다. 상기 펩타이드가 결합할 수 있는 모든 물리, 화학적 또는 생물학적 방법에 의한 결합 또는 융합일 수 있다.
경우에 따라서, 상기 펩타이드는 링커를 추가로 포함하여 EGFR 표적 제제에 연결될 수 있으며, 일 실시예에서 링커는 펩타이드 링커이고, EGFR 표적 항체에 펩타이드 링커 예를 들어, (GGGGS)n의 서열을 포함하고, n은 1-20의 정수인 링커를 연결하여 EGFR 표적 항체와 결합할 수 있다.
본 발명에 따른 조성물은 당해 당업자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 약학적으로 허용되는 담체 및/또는 부형제를 이용하여 제제화함으로써 단위 용량 형태로 제조되거나 또는 다용량 용기 내에 내입시켜 제조될 수 있다. 이 때 제형은 오일 또는 수성 매질중의 용액, 현탁액, 시럽제 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 산제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캅셀제 형태일 수도 있으며, 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수 있다. 한편, 상기 조성물은 항체 또는 항원 결합 단편을 포함하므로, 면역 리포좀으로 제형화될 수 있다. 항체를 포함하는 리포좀은 당업계에 널리 알려진 방법에 따라 제조될 수 있다. 상기 면역 리포좀은 포스파티딜콜린, 콜레스테롤 및 폴리에틸렌글리콜-유도체화된 포스파티딜에탄올아민을 포함하는 지질 조성물로서 역상 증발법에 의해 제조될 수 있다. 예를 들어, 항체의 Fab' 단편은 디설파이드-교체 반응을 통해 리포좀에 접합될 수 있다. 독소루비신과 같은 화학치료제가 추가로 리포좀 내에 포함될 수 있다.
본 발명에 따른 조성물은 약학 조성물일 수 있고, 경구 또는 비경구로 투여할 수 있다. 비경구 투여인 경우에는 정맥내 주입, 피하 주입, 근육 주입, 복강 주입, 내피 투여, 국소 투여, 비내 투여, 폐내 투여 및 직장내 투여 등으로 투여할 수 있다. 경구 투여시, 단백질 또는 펩타이드는 소화가 되기 때문에 경구용 조성물은 활성 약제를 코팅하거나 위에서의 분해로부터 보호되도록 제형화 되어야 한다. 또한, 상기 조성물은 활성 물질이 표적 세포로 이동할 수 있는 임의의 장치에 의해 투여될 수 있다.
일 실시예에서, 본 발명은 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 포함하는 조성물을 치료를 필요로 하는 개체에 투여하여, EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하는 것을 포함하는 암 치료방법에 관한 것이다.
상기 조성물의 적합한 투여량은 제제화 방법, 투여 방식, 환자의 연령, 체중, 성, 병적 상태, 음식, 투여 시간, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하게 처방될 수 있다. 상기 조성물의 바람직한 투여량은 성인 기준으로 0.001-100㎎/kg 범위 내이다. 용어 "약학적 유효량"은 암을 예방 또는 치료하는 데, 또는 혈관신생으로 인한 질환의 예방 또는 치료하는 데 충분한 양을 의미한다.
본 발명에 따른 조성물 또는 치료방법은 암에 적용되는데, 상기 암은 EGFR 표적 항암제에 의하여 치료될 수 있는 암으로서, 그 종류를 제한하지 않으며, 예를 들어, ACTH 생성 종양, 급성 림프구성 또는 림프아구성 백혈병, 급성 또는 만성의 림포구성 백혈병, 급성 비림프구성 백혈병, 방광암, 뇌종양, 유방암, 경관암, 만성 골수성 백혈병, 장암, T-존 림프종, 자궁내막증, 식도암, 담즙 방광암, 에윙스 육종(Ewing's sarcoma), 두 및 목암, 설암, 홉킨스 림프종, 카포시스 육종, 신장암, 간암, 폐암, 중피종, 다발성 골수종, 신경아세포종, 비홉킨 림프종, 골육종, 난소암, 신경아세포종, 유선암, 경관암, 전립선암, 췌장암, 대장암, 페니스암, 레티노블라스토마, 피부암, 위암, 갑상선암, 자궁암, 고환암, 윌름스 종양, 또는 트로포블라스토마 등의 암일 수 있다. 가장 바람직하게는 상기 암은 췌장암 또는 폐암일 수 있다.
하나의 실시예에서, 상기 암은 NRP1이 발현되는 것일 수 있으며, 본 발명의 실시예에서는 종양세포에서 EGFR 및 NRP1의 발현을 확인하였으며, NRP1이 발현되지 않은 세포주에서는 상기 NRP1에 특이적으로 결합하는 펩타이드가 EGFR 표적 항체의 저항성을 개선하지 못함을 확인하였다. 이에 따라, NRP1에 특이적으로 결합하는 펩타이드가 EGFR 표적 항체의 저항성을 개선하기 위해서는 NRP1의 발현이 전제되어야 함을 확인하였다.
다른 관점에서, 본 발명은 상기 조성물을 포함하는 항암제 또는 항암 보조제에 관한 것이다. 상기 조성물은 본 발명에 따른 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 포함하는 조성물 (예를 들어, 펩타이드 자체 또는 Fc 결합)을 통해 항암 효과를 직접 나타내거나, 기타 항암제 (예를 들어, EGFR 표적 항체 Ctx 또는 Pnm)의 저항성을 개선하고 감수성을 증가시키는 항암 보조제로 사용될 수 있다.
본 발명은 또 다른 관점에서 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드 및 EGFR 표적 제제를 포함하고, 상기 펩타이드는 EGFR 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하는 것을 특징으로 하는 암 치료용 병용 투여 조성물에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 포함하는 조성물을 EGFR 표적 제제와 병용 투여하는 단계를 포함하는 암 치료방법으로, 상기 펩타이드에 의해 EGFR 표적 제제에 대한 저항성 또는 감수성을 조절하는 것을 특징으로 하는 암 치료방법에 관한 것이다. 본 발명은 특히, 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 포함하는 조성물을 EGFR 표적 제제와 병용 투여하여, EGFR 표적 제제에 대한 저항성을 나타내는 암을 치료하는 방법에 관한 것이다.
상기 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드와 EGFR 표적 제제를 병용 투여함으로써, 상기 펩타이드가 감작의 역할을 함으로써 EGFR 표적 제제에 대한 저항성을 억제하고, 감수성을 향상시킴으로써 암 치료 효과를 개선시킬 수 있다.
상기 병용 투여 조성물은 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드를 포함하고, 이와 관련된 구성은 앞서 설명한 조성물 및 치료방법에 포함된 구성과 동일하므로 각 구성에 대한 설명은 병용 투여를 통한 암 치료방법에서도 동일하게 적용된다.
"병용"은 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드와 EGFR 표적 제제 각각이 동시, 순차적, 또는 역순으로 투여될 수 있음을 의미하는 것으로, 당업자의 범위 내 적절한 유효량의 조합으로 투여될 수 있다. 예를 들어, 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 펩타이드와 EGFR 표적 제제가 각각 별도의 용기에 보관된 후 동시, 순차적 또는 역순으로 병용 투여될 수 있다.
실시예
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지는 않는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
실시예 1. 췌장암 세포주의 Ctx에 대한 선천적 저항성 유무에 따른 특성 분석.
본 발명에서 사용된 췌장암 세포주들의 Ctx에 대한 선천적 저항성 유무에 따른 특징을 분석하였다. 이는 췌장암에서 Ctx에 대한 선천적 저항성 여부를 예측하는 중요한 마커가 될 수 있다.
도 1a는 Ctx에 대해 선천적 저항성을 가지는 췌장암 세포주 4종 (BxPC-3, PANC-1, Capan-2, SW1990)과 가지지 않는 췌장암 세포주 2종 (Miapaca-2, AsPC-1)의 EGFR, NRP1 및 인테그린 β1의 세포 표면 발현 수준에 대한 유세포분석기 분석 결과이다.
구체적으로는, 각 샘플 당 2x105 개의 Miapaca-2, AsPC-1, BxPC-3, PANC-1, Capan-2, SW1990 세포를 준비하였다. 세포를 PBS로 세척한 후, NRP1을 인지하는 항체 (R&D System) 및 EGFR, 인테그린 β1을 각각 인지하는 FITC 결합된 항체 (e-Bioscience)를 4℃에서 1시간 반응시켰다. 추가적으로 세포에 결합된 NRP1 항체를 FITC 결합된 항체로 염색한 후, PBS로 세척 후, 유세포 분석기기인 FACS Calibur (BD Bioscience)로 분석하였다.
도 1b는 도 1a에서 사용한 세포주들의 세포 전체에서의 EGFR, NRP1 및 인테그린 β1 발현 수준을 확인한 웨스턴 블롯 결과이다.
구체적으로는, 6 웰 플레이트에 각 웰 당 6 x 105개의 Miapaca-2, AsPC-1, BxPC-3, PANC-1, Capan-2, SW1990 세포를 10% FBS가 포함된 배지 1 ml로 넣어 24시간 동안 5 % CO2, 37℃ 조건에서 배양했다. 배양 후 세포 용해물을 얻기 위해 용해 버퍼 (10 mM Tris-HCl pH 7.4, 100mM NaCl, 1% SDS, 1mM EDTA, Inhibitor cocktail(sigma))를 넣어준다. 세포 용해물은 BCA protein assay kit (Pierce) 를 이용하여 정량하였다. SDS-PAGE를 수행한 겔을 PVDF 막(membrane)에 옮기고 각각 NRP1, EGFR, 인테그린 β1 항체 및 β-actin을 인지하는 항체(SantaCruz)와 25℃에서 2시간 반응시키고, HRP가 결합된 이차 항체 (SantaCruz)를 25℃ 1시간 반응시킨 후 검출하였다. 분석은 ImageQuant LAS4000 mini(GE Healthcare)를 이용하였다.
분석한 결과, 도 1a, 1b를 통해 CtxS 췌장암 세포주에 비해, CtxR 췌장암 세포주에서 세포 표면 및 세포 전체에서의 NRP1, EGFR과 달리, 높은 인테그린 β1의 발현 수준을 보임을 확인할 수 있다.
도 1c는 CtxS and CtxR 췌장암 세포주에서 Ctx을 농도 별로 처리 후, EGFR, FAK, Src, Akt, 및 ERK의 총 발현 수준 및 인산화된 정도를 비교한 웨스턴 블롯 분석 결과이다.
도 1b와 같이, 6 웰 플레이트에 각 웰 당 4 x 105개의 Miapaca-2, AsPC-1, BxPC-3, PANC-1, SW1990 세포를 10% FBS가 포함된 배지에서 12시간 배양 후, Ctx을 1 μM, 0.1 μM 농도로 10 % FBS가 포함된 배지 1 ml에 희석하여 24시간 동안 5% CO2, 37℃ 조건에서 배양하였다. 배양 후, 차가운 PBS로 세포를 세척한 후, 세포 용해물을 얻기 위해 용해 버퍼 (10 mM Tris-HCl pH 7.4, 100mM NaCl, 1% SDS, 1mM EDTA, Inhibitor cocktail(sigma))를 넣어준다. 웨스턴 블롯 분석을 위해, 각각 pEGFR (Y1173), EGFR, pFAK, FAK, pSrc, Src, pAkt, Akt, pERK1/2, ERK1/2 및 β-actin을 인지하는 항체와 4℃에서 12시간동안 반응시키고, HRP가 결합된 이차 항체 (SantaCruz) 을 25℃ 1시간 반응시킨 후 분석하였다.
그 결과, CtxS 췌장암 세포주와 달리, CtxR 췌장암 세포주들은 Ctx 처리하여도 높은 FAK, Src, Akt의 인산화가 유지된다. 반면, EGFR (Y1173), ERK1/2의 인산화는 CtxS 췌장암 세포주와 CtxR 췌장암 세포주에서 차이가 없음을 보인다.
실시예 2. 인테그린 β1 발현 억제 및 Src, Akt의 인산화를 억제가 췌장암에서 Ctx에 대한 저항성에 미치는 영향 확인.
CtxR 췌장암 세포주들이 CtxS 세포주에 비해, 인테그린 β1 높은 발현 수준과 Src, Akt의 높은 인산화 수준을 가지는 특징이 있음을 확인하였다. 실제로, CtxR 췌장암 세포주에서 Ctx에 대한 저항성이 과발현된 인테그린 β1과 Src, Akt와 관련이 있는지 확인하였다.
도 2a는 대조군 siRNA와 인테그린 β1 siRNA 처리한 CtxR 세포주 (NRP1을 발현하고 있는 세포주 BxPC-3, PANC-1 와 NRP1을 발현하고 있지 않은 세포주 SWI990)에 Ctx을 처리 후 세포증식을 확인한 것이다.
구체적으로는, 6 웰 플레이트에 플레이트에 각 웰 당 3 x 105개의 BxPC-3, PANC-1, SW1990 세포를 배양 후, siRNA를 일시적 트랜스펙션(transient transfection)한다. 일시적 트랜스펙션할 표적능이 없는 대조군 siRNA와 인테그린 β1 발현 억제를 표적하는 siRNA 각각 100 nM을 튜브 상에서 Opti-MEM media (Gibco) 500 ㎕, RNAiMax (Invitrogen, USA) 3.5㎕와 함께 15분 동안 상온에서 반응시킨 후 각 웰에 첨가하였다. 추가적으로 항생제가 없는 DMEM media 500㎕ 을 넣고 6시간 동안 37도, 5% CO2에서 배양 후, 10% FBS가 포함된 DMEM 배지 1 ml로 교환하였다. 24시간 배양 후, 96웰 플레이트에 각 웰 당 7 x 103 개의 세포를 넣어 12시간 배양했다. 그리고 Ctx을 2 μM 농도로 10 % FBS가 포함된 배지에 희석하여 48시간동안 배양 후, 세포 증식 assay를 위해 MTT 시약 (Sigma)을 20 ㎕을 각 웰에 첨가한 후, 37℃에서 2시간 반응시키고, DMSO로 형성된 Formazan을 녹여 570 nm에서 흡광도를 마이크로플레이트 리더 (Molecular Devices)를 이용하여 측정하였다.
도 2b는 도 2a에서 일시적 트랜스펙션을 수행 후, 세포 용해물을 얻어, 웨스턴 블롯을 통해 인테그린 β1의 발현이 특이적으로 억제되었음을 확인한 결과이다.
도 2c는 PI3K-Akt 억제제 (LY294002), Src 억제제 (SU6656), Raf 억제제 (Sorafenib)을 Ctx과 함께 처리함에 따른 CtxR 세포주의 세포증식을 확인한 것이다.
구체적으로는, 96 웰 플레이트에 각 웰 당 7 x 103개의 BxPC-3, PANC-1 세포를 10 % FBS가 포함된 배지에서 12시간 배양 후, LY294002 50 μM, SU6656 5 μM, sorafenib 2.5 μM 을 각각 Ctx 2 μM와 함께 희석하여 72시간동안 배양 후, 세포증식을 MTT 어세이로 확인하였다.
분석 결과, 췌장암에서 NRP1의 발현과 관계없이, 인테그린 β1의 발현을 억제시키거나, Src, Akt의 인산화를 억제시키는 것은 Ctx의 저항성을 극복시킴을 확인할 수 있었다. 반면, Raf의 인산화를 억제시켰을 때는 Ctx의 저항성을 극복시킬 수 없었다. 이러한 확인은 KRas-BRaf의 신호경로와 독립적으로 인테그린 β1와 Src 및 Akt 신호 경로가 Ctx 저항성의 주요 마커가 될 수 있음을 알 수 있다.
표 1은 본 발명에서 사용한 췌장암 세포주들의 특성을 분석한 결과를 정리한 표이다. 세포 표면 발현 수준은 도 1a에서 확인한 FACS 결과의 MFI값을 이용하여 분류하여 나타낸 것이다. (+: 낮은 발현 수준, ++: 중간 발현 수준, +++: 높은 발현 수준)
[표 1]
Figure 112017029446030-pat00001
실시예 3. Ctx - TPP11의 발현 및 정제.
Ctx-TPP11이 CtxR 췌장암 세포의 증식을 억제할 수 있는지 확인하기 위해, Ctx-TPP11을 발현, 정제하였다.
구체적으로는, TPP11 펩타이드와 항체의 중쇄불변부위 (Fc)가 융합된 단백질을 생산하기 위한 벡터에서 BsrGI과 HindIII 제한효소를 처리하여 얻은 항체의 중쇄불변부위 CH3에서 TPP11이 융합된 부분의 DNA (AA 서열은 서열번호 4 및 DNA 서열은 서열번호 5)를 야생형 Ctx 중쇄를 인코딩 (AA 서열은 서열번호 6, DNA 서열은 서열번호 7)하는 벡터에 클로닝하였다. 경쇄를 코딩하는 DNA (AA 서열은 서열번호 8, DNA 서열은 서열번호 9)는 야생형 Ctx 경쇄 발현 벡터를 동일하게 사용하였다.
[표 2]
Figure 112017029446030-pat00002
Figure 112017029446030-pat00003
Figure 112017029446030-pat00004
Figure 112017029446030-pat00005
Figure 112017029446030-pat00006
Figure 112017029446030-pat00007
경쇄, 중쇄 발현 벡터를 일시적 트랜스펙션(transient transfection)을 이용하여 단백질을 발현 및 정제하였다. 진탕 플라스크에서, 무혈청 FreeStyle 293 발현 배지(Invitrogen)에서 부유 성장하는 HEK293-F 세포(Invitrogen)를 플라스미드 및 폴리에틸렌이민 (Polyethylenimine, PEI) (Polyscience)의 혼합물로 트랜스펙션하였다. 진탕 플라스크 (Corning)에 200mL 트랜스펙션 시, HEK293-F 세포를 2 X 106 세포/ml의 밀도로 배지 100ml에 파종하여, 130 rpm, 8 % CO2에서 배양하였다. 각각의 단일클론항체 생산하기 위해 알맞은 중쇄와 경쇄 플라스미드를 10ml FreeStyle 293 발현 배지 (Invitrogen)에 중쇄 125μg, 경쇄 125μg 총 250μg (2.5 μg/ml)으로 희석하여, PEI 750 μg (7.5 μg/ml)을 희석한 10ml의 배지와 혼합하여 실온에서 10분 동안 반응시켰다. 그 후, 반응시킨 혼합배지를 앞서 100ml로 파종한 세포에 넣어 4시간 동안 150 rpm, 8% CO2에서 배양 후, 나머지 100 ml의 FreeStyle 293 발현 배지를 추가하여 7일동안 배양했다. 표준 프로토콜을 참조하여 채취한 세포 배양 상등액으로부터 단백질을 정제하였다. 단백질 A 세파로오스 컬럼 (Protein A Sepharose column) (GE healthcare)에 항체를 적용하고 PBS (pH 7.4)로 세척하였다. 0.1 M 글라이신 완충액을 이용하여 pH 3.0에서 항체를 용리한 후 1M Tris 완충액을 이용하여 샘플을 즉시 중화하였다. 용리한 항체 분획은 투석방법을 통해 PBS (pH 7.4)로 완충액을 교환하며 농축을 진행하였다. 정제된 단백질은 280nm 파장에서 흡광도와 흡광계수를 이용하여 정량하였다.
실시예 4. Ctx - TPP11의 NRP1과 EGFR의 동시 결합능 평가.
실시예 2에서 발현, 정제한 Ctx-TPP11이 EGFR과 NRP1-b1b2에 대한 결합능을 야생형 항체 Ctx과 비교 분석하였다.
도 3b는 Fc-TPP11, Ctx과 비교하여 구축된 Ctx-TPP11이 EGFR과 NRP1-b1b2에 대해 동시 결합능을 보이는 것을 확인한 sandwich ELISA 결과이다.
구체적으로는, 96-웰 플레이트 (SPL, Korea)에 EGFR (0.5 μg/well)을 1시간동안 코팅한 후, Fc-TPP11, Ctx 및 Ctx-TPP11 (10 nM)를 25℃에서 1시간 동안 반응시켰다. TBST (TBS with 0.1% Tween-20)으로 세척 후, 연속적으로 희석된 비오틴화된 NRP1- b1b2 (1 μM-1 pM)를 25℃에서 1시간 동안 반응시킨 후, AP가 결합된 염소 항-비오틴항체를 25℃에서 1시간 동안 결합시켰다. 그 후, p-nitrophenyl phosphate의 기질(Sigma-Aldrich)을 이용하여 결합된 비오틴화된 단백질을 검출하기 위해, 마이크로플레이트 리더를 이용하여 405 nm에서의 흡광도를 측정하였다.
표 3은 Fc-TPP11, Ctx과 비교하여, Ctx-TPP11의 NRP1-b1b2와 EGFR에 대한 결합력을 더 정량적으로 분석하기 위하여 Biacore2000 기기 (GE healthcare)를 이용하여 SPR (Surface plasmon resonance)를 수행한 결과를 나타낸다.
구체적으로는, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 단백질 각각을 CM5 센서칩 (GE healthcare, USA)에 약 1,000 response units (RUs)의 수준으로 고정화하였다. HBS-EP 완충액[10 mM Hepes, 3 mM ethylenediaminetetraacetic acid, 0.005% surfactant P20(pH 7.6), GE Healthcare]을 30㎕/min 유속으로 분석하였으며, NRP1-b1b2 단백질을 처리하여 분석하였다. 결합, 해리 분석 후 CM5칩의 재생(regeneration)은 완충액(20mM NaOH, 1M NaCl, pH10.0)을 30 ㎕/min 유속으로 2분간 흘려주어 시행되었다. 결합 3분, 해리 6분으로 얻어진 각 센서그램 (sensorgram)은 공백 칸(Blank cell)과 비교하여 정상화(normalization) 및 절감(Subtraction)하여 친화도를 계산하였다.
[표 3]
Figure 112017029446030-pat00008
표 3에서 나타낸 바와 같이, EGFR에 대한 결합능은 TPP11이 융합된 Ctx-TPP11과 야생형 항체 Ctx과 동일하였고, NRP1-b1b2에 대한 결합능 역시, Ctx-TPP11과 Fc-TPP11이 동일한 수준으로 확인되었다. 분석시, 적어도 5개의 센서그램을 이용하여 분석하였으며, 3회 수행하여 얻은 결과를 통계처리 하였다. ±는 독립적은 실험의 결과의 표준편차 값을 나타내었다.
실시예 5. Ctx-TPP11의 Ctx R 췌장암 세포주에서의 세포 성장 억제능 평가.
NRP1과 EGFR을 표적하는 Ctx-TPP11이 NRP1을 발현하는 CtxR 췌장암 세포의 증식을 억제할 수 있는지 여러 세포주에서 세포 성장 어세이를 진행하였다.
도 4a는 CtxS (Miapaca-2, AsPC-1) 및 CtxR (BxPC-3, PANC-1, Capan-2, SW1990) 췌장암 세포주에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11의 농도별 처리에 따른 세포증식을 MTT 어세이를 통해 측정한 결과이다.
구체적으로, 실시예 2와 동일하게 췌장암 세포주를 준비하여 세포가 안정화되면, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11을 농도별로 (0, 1, 2, 4 μM) 48시간마다 2번 처리하여 총 96시간 배양하였다. 또한, NRP1와 EGFR의 동시 표적에 의한 것인지 확인하기 위해, Fc-TPP11와 Ctx을 동일한 농도로 병용 처리 후, 배양하였다. 실시예 2와 같은 방법으로 MTT 시약 (Sigma) 20 ㎕을 각 웰에 첨가한 후, 37℃에서 2시간 반응시키고, DMSO로 형성된 Formazan을 녹여 570 nm에서 흡광도를 마이크로플레이트 리더 (Molecular Devices)를 이용하여 측정하였다. CtxS (Miapaca-2, AsPC-1) 췌장암 세포주에서는 Ctx와 Ctx-TPP11이 동일한 세포성장 억제능을 보였고, 3종의 CtxR (BxPC-3, PANC-1, Capan-2) 췌장암 세포주에서는 Ctx와 다르게, Ctx-TPP11와 Fc-TPP11, Ctx의 병용 처리군에서만 세포 성장 억제능을 보였다. 반면, 실시예 1에서 확인하였듯이, NRP1을 발현하고 있지 않은 1종의 CtxR 췌장암 세포주인, SW1990에서는 Ctx-TPP11이 효능을 보이지 않았다. 이는 Ctx-TPP11이 표적하는 NRP1에 특이적으로 효능을 보임을 확인한 결과이다.
또한, Ctx-TPP11이 CtxR 췌장암 세포의 증식을 억제하는 것이 세포 사멸 (Apoptosis) 유도 작용에 의한 것인지 알기 위해, 세포 사멸 분석 어세이를 진행하였다.
도 4b, c는 CtxS (Miapaca-2, AsPC-1) 및 CtxR (BxPC-3, PANC-1) 췌장암 세포주에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11에 따른 세포 사멸을 아넥신 V-FITC 검출 키트 (Annexin V-FITC apoptosis detection kit, BD Biscience)를 통해 분석한 결과이다.
구체적으로, 12 웰 플레이트에 플레이트에 각 웰 당 2 x 105개의 Miapaca-2, AsPC-1, BxPC-3, PANC-1 세포를 배양 후, 세포가 안정화되면, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11을 4 μM로 처리하여 총 48시간 배양하였다. 그 후, 차가운 PBS로 세척하고, 각 샘플 당 1 x 106개의 세포를 준비한 후, 아넥신 V-FITC 5 μl와 프로피디엄 아이오다이드 (Propidium iodide, PI) 5 μl을 첨가하여 25℃에서 15분간 반응시켰다. 그 후, 각 샘플에 400 μl의 1X 결합 버퍼를 첨가한 후, 유세포 분석기기인 FACS Calibur (BD Bioscience)로 분석하였다. 위와 같은 실험 프로토콜은 제조사 프로토콜에 따라 수행하였다.
분석 후, 각각의 샘플에 대한 dot plot을 도 4b에 나타내었고, dot plot을 통해 아넥신 V만 염색된 사멸된 세포들의 수를 전체 세포 수에 대한 백분율 (%)로 나타낸 그래프를 도 4c에 정량적으로 나타내었다.
CtxS (Miapaca-2, AsPC-1) 췌장암 세포주에서는 Ctx와 Ctx-TPP11이 동일하게 세포사멸을 유도하였고, CtxR (BxPC-3, PANC-1) 췌장암 세포주에서는 Ctx와 다르게, Ctx-TPP11와 Fc-TPP11, Ctx의 병용 처리군에서만 세포 사멸을 유도하였다. 이는 Ctx-TPP11이 CtxR 췌장암 세포의 증식을 억제하는 것이 세포 사멸 (Apoptosis) 유도 작용에 의한 것임을 확인한 결과이다.
도 4d는 CtxR 췌장암 세포주에서 확인한 세포증식 억제능에 대한 NRP1, 인테그린 β1, cMet siRNA의 효과를 나타낸 결과이다.
구체적으로는, 실시예 2와 동일하게, 췌장암 세포주를 준비하고, siRNA를 일시적 트랜스펙션(transient transfection)한다. 일시적 트랜스펙션할 표적능이 없는 대조군 siRNA 와 NRP1, 인테그린 β1, cMet 발현 억제를 표적하는 각각의 siRNA 100 nM을 튜브 상에서 Opti-MEM media (Gibco) 500 ㎕, RNAiMax (Invitrogen, USA) 3.5㎕와 함께 15분 동안 상온에서 반응시킨 후 각 웰에 첨가하였다. 추가적으로 항생제가 없는 DMEM media 500㎕ 을 넣고 6시간 동안 37℃, 5% CO2에서 배양 후, 10% FBS가 포함된 DMEM 배지 1 ml로 교환하였다. 24시간 배양 후, 96 웰 플레이트에 각 웰 당 7 x 103 개의 세포를 넣어 12시간 배양하였다. 그리고 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11을 2 μM 농도로 10 % FBS가 포함된 배지에 희석하여 48시간 동안 배양 후, 세포 증식 assay를 위해 MTT 시약 (Sigma)을 20 ㎕ 을 각 웰에 첨가한 후, 570 nm에서 흡광도를 마이크로플레이트 리더 (Molecular Devices)를 이용하여 측정하였다. NRP1 발현을 억제하였을 때, Ctx-TPP11의 세포성장 억제능은 사라지지만, Ctx은 여전히 저항성을 보인다. 또한, cMet 의 발현억제는 Ctx의 저항성을 극복시킬 수 없었다. 반면, 도 2a에서처럼 인테그린 β1의 발현을 억제시키면 Ctx의 저항이 극복되었다.
도 4e, f는 도 4d에서 일시적 트랜스펙션을 수행 후, 세포 용해물을 얻어, 웨스턴 블롯을 통해 NRP1, cMet siRNA가 NRP1과 cMet의 발현을 억제한 것을 웨스턴 블롯으로 확인한 결과이다.
실시예 6. Ctx - TPP11의 Ctx R 억제 신호 평가
Ctx-TPP11이 CtxR 극복하는 효능이 실제로 실시예 1에서 밝힌 저항성 마커인 인테그린 β1 발현 및 이의 하위 신호인자인 FAK, Src, Akt의 인산화를 억제하기 때문인지 확인하기 위해, 대조군 siRNA 및 인테그린 β1 siRNA에 따른 Ctx-TPP11에 의한 신호 억제 효과를 확인하였다.
도 5a, b는 CtxR 췌장암 세포주에서 대조군 siRNA와 인테그린 β1 siRNA 처리 후, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11의 신호 억제 효과를 확인한 웨스턴 블롯 결과이다.
구체적으로는, 실시예 1와 동일하게 세포를 준비하고, siRNA를 일시적 트랜스펙션(transient transfection)한다. 일시적 트랜스펙션할 표적능이 없는 대조군 siRNA 와 인테그린 β1 발현 억제를 표적하는 각각의 siRNA 100 nM을 튜브 상에서 Opti-MEM media (Gibco) 500 ㎕, RNAiMax (Invitrogen, USA) 3.5㎕와 함께 15분 동안 상온에서 반응시킨 후 각 웰에 첨가하였다. 추가적으로 항생제가 없는 DMEM media 500㎕을 넣고 6시간 동안 37℃, 5% CO2에서 배양 후, 10% FBS가 포함된 DMEM 배지 1 ml로 교환하였다. 12시간 배양 후, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 2 μM을 10% FBS가 포함된 배지 1 ml에 희석하여 24시간 동안 5% CO2, 37℃ 조건에서 배양했다. 배양 후, 차가운 PBS로 세포를 세척한 후, 세포 용해물을 얻기 위해 용해 버퍼 (10 mM Tris-HCl pH 7.4, 100mM NaCl, 1% SDS, 1mM EDTA, Inhibitor cocktail(sigma))를 넣어주었다. 그 후, 실시예 1에서와 동일하게 웨스턴 블롯 분석을 수행하였다.
그 결과, NRP1이 발현되지 않은 CtxR SW1990 세포도 BxPC-3, PANC-1와 동일한 Ctx 저항성 기작을 가지지만, Fc-TPP11 및 Ctx-TPP11에 의한 효능은 보이지 않았다. 또한, Ctx-TPP11의 세포 성장 억제효능이 실시예 1에서 밝힌 Ctx 저항성 마커인 인테그린 β1 및 이의 하위신호 인자인 FAK, Src, Akt의 인산화를 억제하기 때문임을 확인하였다. 인테그린 β1의 발현을 억제하였을 때 저항성 마커인 FAK, Src, Akt의 인산화를 억제함을 확인하였다. 이를 통해, 인테그린 β1이 FAK, Src, Akt의 인산화 경로의 상위 분자임을 알 수 있다. 반면, Ctx-TPP11은 인테그린 β1의 전체적인 발현 자체는 감소시키지 못하였다.
실시예 7. Ctx R 대장암 세포주에서의 Ctx - TPP11의 세포증식 억제능 평가.
췌장암과 다르게, 대부분의 대장암에서의 Ctx에 대한 저항성 기작은 KRas 및 BRaf 돌연변이이다. 다른 저항성 기작에 대해서도 Ctx-TPP11이 저항성을 극복하는지 확인하기 위해, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11에 의한 세포증식 억제능을 확인하였다.
도 6은 KRas 및 BRaf 야생형인 CtxS 대장암 세포주와 KRas 및 BRaf 돌연변이에 의해 Ctx에 대한 저항성을 가지는 대장암 세포주들에서의 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11에 의한 세포증식 억제능을 확인한 MTT 어세이 결과이다.
구체적으로는, 실시예 2에서와 동일하게 세포를 준비하고, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 0.2, 1 μM을 10 % FBS가 포함된 배지 1 ml에 희석하여 72시간 동안 5 % CO2, 37℃ 조건에서 배양 후, MTT 어세이를 수행하였다. 분석 결과, Ctx-TPP11 및 Ctx와 Fc-TPP11의 병용처리는 KRas 및 BRaf 돌연변이 저항 기작을 가지는 대장암 세포주에서는 저항성을 극복하지 못하였다.
실시예 8. NRP1 표적을 통한 활성화 (active) 인테그린 β1의 하향조절 기작 평가.
Ctx-TPP11은 NRP1 표적을 통해, Ctx 저항성 마커인 EGFR (Y1101), FAK, Src, Akt의 인산화는 억제하였지만, 과발현된 인테그린 β1의 전체 양은 감소시키지 못하였다. 인테그린 β1의 경우, 신호를 보낼 수 있는 길게 펴진 형태인 (extended form) 활성 (active) 인테그린 β1과 신호를 보낼 수 없는 구부러진 형태 (bent form)인 비활성 (inactive) 인테그린 β1으로 구분되어 존재한다. 따라서, Ctx-TPP11이 세포 표면의 실제 신호를 보낼 수 있는 활성 인테그린 β1의 발현을 감소시켜 인테그린 β1의 신호를 하향 조절하는 것인지 확인하기 위해, Ctx-TPP11 처리에 따른 활성 인테그린 β1의 세포 내 유입능을 확인하였다.
도 7a, b는 CtxR BxPC-3, PANC-1에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1, 활성 인테그린 β1, 비활성 인테그린 β1의 세포 내 유입 능을 공초점 현미경 (confocal microscopy)으로 관찰한 결과이다.
구체적으로는, 24 웰 플레이트에 커버슬립을 넣고 각 웰 당 2.5 x 104개의 BxPC-3, PANC-1 세포를 10 % FBS가 포함된 배지 0.5 ml로 넣어 12시간 동안 5 % CO2, 37℃ 조건에서 배양하였다. 세포가 안정화 되면, 혈청에 의한 효과를 없애기 위해 무혈청 배지로 4시간 동안 혈청 결핍을 시킨 후, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 2 μM을 무혈청 배지 0.5 ml에 희석하여 1 시간 동안 37℃ 조건에서 처리 후, 차가운 PBS로 세 번 세척하고, 4% 파라포름알데히드 첨가 후 25℃ 조건으로 10분간 세포를 고정하였다. 이후 PBS로 세척하고, PBS에 0.1% 사포닌, 0.1% 아지드화 나트륨, 1% BSA가 첨가되어있는 완충액으로 25℃, 10분간 배양하여 세포막에 구멍을 형성하는 과정을 거쳤다. 다시 PBS로 세척 후, 비특이적 결합을 억제하기 위해 PBS에 2% BSA가 첨가된 완충액으로 25℃에서 1시간 동안 반응시켰다. 그 다음, NRP1, 활성 인테그린 β1 (항체 클론명: HUTS-21, BD Bioscience) 및 비활성 인테그린 β1 (항체 클론명: mAb13, BD Bioscience)을 각각 인지하는 일차 항체를 25℃에서 1시간 30분동안 반응시켰다. 각각의 일차 항체를 인지하는 TRITC (적색형광) 또는 FITC (녹색형광)이 연결된 이차 항체를 25℃에서 1시간 반응시키고, Hoechst 33342를 이용하여 핵을 염색(청색형광)하여 공초점 현미경으로 관찰했다. NRP1은 활성 인테그린 β1와만 중첩됨으로써, NRP1은 활성 인테그린 β1과만 특이적으로 결합함을 확인하였다.
도 8, 9는 CtxR BxPC-3, PANC-1에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1, EGFR, 활성 인테그린 β1, 비활성 인테그린 β1의 세포 내 유입 능을 유세포 분석기로 분석한 결과이다.
구체적으로는, 실시예 1과 동일하게 세포를 준비하고, 세포가 안정화 되면, 혈청에 의한 효과를 없애기 위해 무혈청 배지로 4시간 동안 혈청 결핍을 시킨 후, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 2 μM을 무혈청 배지 1 ml에 희석하여 시간 별로 (0,5, 15, 30, 60 분) 37℃ 조건에서 처리 후, 차가운 PBS로 세척하고, 각 샘플 당 2x105 개의 BxPC-3, PANC-1 세포를 준비하였다. NRP1, 활성 인테그린 β1 및 비활성 인테그린 β1을 각각 인지하는 일차 항체를 4℃에서 1시간 반응시켰다. 각각의 일차 항체를 인지하는 FITC이 연결된 이차 항체를 4℃에서 30분간 반응시키고 PBS로 세척 후, 유세포 분석기기인 FACS Calibur (BD Bioscience)로 분석하였다. 분석 후, 각각의 샘플에 대한 히스토그램 그래프를 얻고, 히스토그램의 평균형광강도를 이용하여 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1, EGFR, 활성 인테그린 β1, 비활성 인테그린 β1의 세포 내 유입 후, 남아있는 세포 표면의 수용체의 양을 도 8b, 9b에서 정량적으로 나타내었다.
분석 결과, NRP1에 결합하는 Fc-TPP11과 Ctx-TPP11의 경우, NRP1의 세포 내 유입을 증가시키고, NRP1과 결합하고 있는 활성 인테그린 β1의 세포 내 유입도 함께 증가시켰다. 또한, Ctx과 Ctx-TPP11의 경우, EGFR의 세포 내 유입을 증가시켰다. 따라서, Ctx-TPP11은 NRP1에 결합하여, NRP1과 활성 인테그린 β1의 세포 표면 발현양을 선택적으로 감소시킨다.
실시예 9. Ctx-TPP11의 활성 인테그린 β1의 세포 부착 억제능 평가.
세포 표면에 발현된 활성 인테그린 β1는 세포가 세포외기질 (Extracellular matrix, ECM)과 결합하는데 중요한 역할을 한다. 특히, 세포외기질 단백질들 중에서 FN과 가장 결합력이 높다. 이에 따라, Ctx-TPP11이 활성 인테그린 β1의 발현을 감소시킴으로써, 세포의 FN에 대한 부착능이 억제되었는지 분석하였다.
도 10a는 CtxR BxPC-3, PANC-1에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 FN에 대한 세포 부착능을 세포 부착 어세이를 통해 광학현미경으로 확인한 결과이다.
구체적으로, 12 웰 무코팅 플레이트에 FN (Sigma)를 10 μg/ml 농도로 PBS 0.5 ml에 희석하여 30 분간 37℃에서 플레이트를 코팅했다. Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 100 nM을 37℃에서 30분간 전처리한 BxPC-3와 PANC-1 세포를 FN이 코팅된 플레이트에 3 x 105개의 BxPC-3, 1 x 105개의 PANC-1 세포로 넣었다. BxPC-3는 1시간, PANC-1은 6시간 동안 37℃에서 배양시킨 후, PBS로 세포를 세척했다. 세척 후, 4% 파라포름알데히드 첨가 후 25℃에서 10분간 세포를 고정하고, PBS로 세척하고, 0.5% 크리스탈 바이올렛을 무게/부피로 20% 에탄올에 희석하여 25℃에서 15분간 FN에 부착된 세포를 염색하였다. 염색된 부착세포들을 광학현미경으로 분석하였다. 한 웰 당 10장의 사진을 찍어 부착된 세포의 수를 계산하여 도 10b에 정량적으로 비교하였다. Fc-TPP11과 Ctx-TPP11은 Ctx과 다르게, FN에 대한 CtxR 세포의 접착능을 감소시켰다. 이는 Fc-TPP11과 Ctx-TPP11은 세포 표면의 활성 인테그린 β1의 발현양을 감소시킴으로써 FN과의 활성 인테그린 β1의 결합능을 감소시킨 것이다.
실시예 10. Ctx-TPP11의 생체 내 종양성장 억제능 평가
실시예 5에서 Ctx-TPP11의 CtxR 췌장암 세포주에서의 시험관 내 세포 성장 억제능을 확인하였다. Ctx-TPP11의 동일한 효과가 생체 내에서도 나타나는지 확인하였다.
도 11, 12은 Ctx-TPP11의 마우스 생체 내에서 종양 성장 억제 활성을 측정한 결과이다.
구체적으로, 3주령의 암컷 BALB/c 누드 마우스 (NARA Biotech, Korea)에 BxPC-3 세포 (5 x 106 세포/마우스), PANC-1 (1 x 107 세포/마우스), AsPC-1 (5 x 106 세포/마우스) 세포를 150 μL PBS와 150 μL 마트리겔 (BD Biosciences)을 1:1로 섞어서 마우스 피하에 이식하였다. 유사한 크기의 종양(평균 부피 100~120 mm3)을 가진 마우스를 처리집단으로 무작위로 배정하고, 각각의 항체 (Ctx, Ctx-TPP11, 그리고 Fc-TPP11와 Ctx의 병용투여)를 꼬리정맥을 통하여 정맥주사 하였다. 종양은 일주일에 최소 1회 측정하고, 종양의 부피 (V)를 V=길이x폭2/2로 계산하였다.
도 11a,b에서 나타난 바와 같이, 대조군인 PBS에 비해, Ctx-TPP11 투여 또는 Fc-TPP11과 Ctx의 병용 투여 했을 때, CtxR BxPC-3와 PANC-1의 종양 성장을 억제하였다. 반면, Ctx은 저항성을 나타냄을 확인하였다. 도 12a,b에서는 CtxS AsPC-1에서 Ctx와 Ctx-TPP11의 종양 성장 억제능이 유사함을 확인하였다. 또한, 도 11c, 12c에서 PBS와 비교하여 Ctx, Ctx-TPP11 및 Fc-TPP11과 Ctx의 병용 투여 시 마우스의 체중 변화가 거의 없는 것을 확인하였으며, 이에 따라 독성은 없는 것으로 판단되었다.
도 13은 도 11, 12의 Ctx-TPP11의 종양 억제능이 확인된 종양 조직을 면역조직화학 실험을 통해 조직의 성장 마커 및 세포사멸 마커의 정도를 비교한 결과이다.
구체적으로는, 도 11, 12에서의 마지막 항체 투여 후 5시간 뒤, 종양 조직을 적출하였다. 적출한 종양 조직은 4% 파라포름알데히드로 4℃에서 24시간 고정화하고, 30% 수크로스 버퍼 내에 4℃에서 24시간 동안 넣어두었다. 그 후, 동결 절편 (frozen section) 방법으로 20 μm의 두께로 잘라, 종양 절편을 1시간동안 25℃에서 Ki-67 항체(Abcam)와 이를 인지하는 TRITC-접합된 2차 항체로 성장 마커인 Ki-67을 염색했다. 또한, 세포사멸을 확인하기 위하여, 종양 조직을 DeadEnd™ Colorimetric TUNEL System (Promega)으로 염색하고, Hoechst 33342를 이용하여 핵을 염색(청색형광)하여 공초점 현미경으로 관찰했다. 종양 성장 억제능을 보인 Ctx-TPP11의 조직에서 감소된 성장 마커 및 증가된 세포사멸 마커의 양을 확인하였다.
도 14는 도 11에서 종양 억제능이 확인된 CtxR 종양 조직을 적출하여 수행한 웨스턴 블롯 결과이다.
구체적으로는, 도 11, 12에서의 마지막 항체 투여 후 5시간 뒤, 종양 조직을 적출하여 실시예에서 사용한 세포 용해 버퍼를 이용하여 조직을 균질화시킨 후, 웨스턴 블롯을 수행하였다. 도 14에 나타난 바와 같이, CtxR 종양 조직에서 Ctx-TPP11 및 Ctx와 Fc-TPP11의 처리군에서는 시험관 내에서의 신호 억제효과와 동일하게, Ctx 저항성 마커인 FAK, Src, Akt의 인산화를 억제함을 확인하였다.
실시예 11. 폐암 세포주의 EGFR, NRP1 및 인테그린 β1의 세포 표면 발현양 분석.
실시예 1에서 나타낸 바와 같이, 췌장암에서는 CtxS 췌장암 세포주에 비해, CtxR 췌장암 세포주에서 세포 표면 및 세포 전체에서의 높은 인테그린 β1의 발현 수준을 보인다. 폐암에서도 Ctx에 대한 저항성 기작이 인테그린 β1의 발현양과 상관관계가 있는지 확인하기 위해, 폐암 세포주의 EGFR, NRP1 및 인테그린 β1의 세포 표면 발현양을 분석하였다.
도 15a는 CtxS (Calu-3, H1975) 및 CtxR (H1299, A549, Calu-1, H358, H441, H2009, HCC44, HCC2108, SK-LU-1, H460, H522) 폐암 세포주의 EGFR, NRP1 및 인테그린 β1의 세포 표면 발현 수준에 대한 유세포분석기 분석 결과이다.
구체적으로는, 실시예 1과 동일하게 폐암 세포주를 준비하고, 세포를 PBS로 세척한 후, NRP1을 인지하는 항체 (R&D System) 및 EGFR, 인테그린 β1을 각각 인지하는 FITC 결합된 항체 (e-Bioscience)를 4℃에서 1시간 반응시켰다. 추가적으로 세포에 결합된 NRP1 항체를 FITC 결합된 항체로 염색한 후, PBS로 세척 후, 유세포 분석기기인 FACS Calibur (BD Bioscience)로 분석하였다.
도 15b는 도 15a에서 나타낸 히스토그램의 평균형광강도를 정량적으로 나타낸 그래프이다.
분석한 결과, 췌장암과 달리, 폐암 세포주에서는 Ctx에 대한 저항성과 세포 표면의 인테그린 β1의 발현양이 특별한 상관관계를 보이지 않았다.
실시예 12. 다양한 세포표면 수용체들의 발현 억제 및 Akt, Src의 인산화 억제가 폐암에서 Ctx R 에 미치는 영향 확인.
실시예 11에서 설명하였듯이, 췌장암과 다르게 폐암에서는 인테그린 β1의 발현양이 Ctx에 대한 저항성과 특별한 상관관계를 보이지 않았다. 따라서, 먼저 세포 표면의 어떤 수용체가 Ctx에 대한 저항성과 관련이 있는지 알기 위해, 다양항 세포 표면의 수용체 중에서 NRP1이 공-수용체로 작용하는 수용체들의 siRNA의 효과를 확인하였다.
도 16a는 대조군 siRNA와 NRP1 siRNA, 인테그린 β1 siRNA, 인테그린 β3 siRNA, cMet siRNA, VEGFR1 siRNA, TGFβR2 siRNA를 각각 처리한 CtxR 폐암 세포주 A549, HCC44 (NRP1을 발현하고 있는 CtxR 세포주)에 Ctx을 처리 후 세포증식을 확인한 것이다.
구체적으로는, 6웰 플레이트에 플레이트에 각 웰 당 2 x 105개의 A549, HCC44 세포를 배양 후, siRNA를 일시적 트랜스펙션(transient transfection)한다. 일시적 트랜스펙션할 표적능이 없는 대조군 siRNA 100 nM 및 NRP1, 인테그린 β1, 인테그린 β3, cMet, VEGFR1, TGFβR2을 표적하는 각각의 siRNA 100 nM을 튜브 상에서 Opti-MEM media (Gibco) 500 ㎕, RNAiMax (Invitrogen, USA) 3.5㎕와 함께 15분 동안 상온에서 반응시킨 후 각 웰에 첨가하였다. 추가적으로 항생제가 없는 RPMI 배지 500㎕ 을 넣고 6시간 동안 37도, 5% CO2에서 배양 후, 10% FBS와 1% 항생제가 포함된 RPMI 배지 2 ml로 교환하였다. 24시간 배양 후, 96웰 플레이트에 각 웰 당 5 x 103 개의 세포를 넣어 12시간 배양했다. 그리고 Ctx을 2 μM 농도로 10% FBS가 포함된 배지에 희석하여 48시간동안 배양 후, 세포증식을 WST-1 어세이로 확인하였다.
도 16b는 도 16a에서 일시적 트랜스펙션을 수행한 후, 세포 용해물을 얻어, 웨스턴 블롯을 통해 각각의 siRNA가 표적하는 단백질 발현이 특이적으로 억제되었음을 확인한 결과이다.
분석 결과, 실험한 폐암 세포주 2종에서는 NRP1의 발현 및 인테그린 β3의 발현을 억제시키는 것은 Ctx의 저항성을 극복시킴을 확인할 수 있었다.
또한, NRP1 및 인테그린 β3의 발현 외에 어떤 하위 신호인자가 Ctx에 대한 저항성과 관련이 있는지 알기 위해, PI3K-Akt, Src, Raf 억제제의 효과를 확인하였다.
도 17은 PI3K-Akt 억제제 (LY294002), Src 억제제 (SU6656), Raf 억제제 (Sorafenib)을 Ctx과 함께 처리함에 따른 CtxR 폐암 세포주의 세포증식을 확인한 것이다.
구체적으로는, 96 웰 플레이트에 각 웰 당 5 x 103개의 A549, HCC44 세포를 10 % FBS가 포함된 배지에서 12시간 배양 후, LY294002 50, 20, 10 μM, SU6656 5, 2, 1 μM, sorafenib 5, 2, 1 μM 을 각각 Ctx 2 μM와 함께 희석하여 48시간동안 배양 후, 세포증식을 WST-1 어세이로 확인하였다.
분석 결과, 폐암 세포주 HCC44, A549에서는 NRP1의 발현 및 인테그린 β3의 발현을 억제시키거나, Akt, Src의 인산화를 억제시키는 것은 Ctx의 저항성을 극복시킴을 확인할 수 있었다. 반면, 인테그린 β1, cMet, VEGFR1, TGFβR2의 발현을 억제시키거나, Raf의 인산화를 억제시켰을 때는, Ctx의 저항성을 극복시킬 수 없었다.
표 4는 본 발명에서 사용한 폐암 세포주들의 특성을 분석한 결과를 정리한 표이다.
[표 4]
Figure 112017029446030-pat00009
도 15a와 표 4에서 보면, EGFR이 발현되어 있지 않아, Ctx에 대해 저항성을 보이는 H522를 제외하고는, EGFR 또는 BRAF 돌연변이가 아닌, RAS 돌연변이 여부에 따라 Ctx에 대한 저항성이 관찰된다. 이러한 확인은 췌장암과 다르게 폐암 세포주에서는 Ctx에 대한 저항성이 NRP1, 인테그린 β3 및 KRAS 돌연변이와 밀접한 연관성을 보임을 시사해준다.
실시예 13. Ctx R 폐암 세포주에서의 Ctx-TPP11의 세포증식 억제능 평가.
췌장암에서의 결과와 같이, Ctx에 대해 저항성을 가지는 폐암에서도 Ctx-TPP11이 Ctx에 대한 저항성을 극복하는지 확인하기 위해, CtxS 폐암 세포주와 CtxR 폐암 세포주에서 Ctx, Ctx-TPP11에 의한 세포 증식 억제능을 확인하였다.
도 18은 Ctx-TPP11이 NRP1을 발현하는 CtxR 폐암 세포의 증식을 억제할 수 있는 지 총 13종의 폐암 세포주에서 세포 성장 어세이를 진행하였다.
도 18a, b는 NRP1을 발현하는 CtxS (Calu-3, H1975) 및 CtxR (H1299, A549, Calu-1, H358, H441, H2009, HCC44, SK-LU-1) 폐암 세포주와 NRP1을 발현하지 않는 CtxR (HCC2108, H460, H522) 폐암 세포주에서 Ctx, Ctx-TPP11의 농도별 처리에 따른 세포증식을 WST-1 어세이를 통해 측정한 결과이다.
구체적으로, 96 웰 플레이트에 각 웰 당 5 x 103개의 폐암 세포주를 10 % FBS가 포함된 배지에서 12시간 배양 후, Ctx, Ctx-TPP11을 농도별로 (0, 1, 2, 4 μM) 48시간동안 배양시킨 후, Cyto-X 시약 (LPS Solution)을 10 ㎕을 각 웰에 첨가한 후, 37℃에서 1시간에서 2시간동안 반응시키고, 450 nm에서 흡광도를 마이크로플레이트 리더 (Molecular Devices)를 이용하여 측정하였다. CtxS (Calu-3, H1975) 폐암 세포주에서는 Ctx와 Ctx-TPP11이 동일한 세포성장 억제능을 보였고, 8종의 CtxR (H1299, A549, Calu-1, H358, H441, H2009, HCC44, SK-LU-1) 폐암 세포주에서는 Ctx와 다르게, Ctx-TPP11 처리군만 세포 성장 억제능을 보였다. 반면, NRP1을 발현하고 있지 않은 3종의 CtxR 폐암 세포주인 HCC2108, H460, H522에서는 Ctx-TPP11이 효능을 보이지 않았다. 이는 Ctx-TPP11이 표적하는 NRP1에 특이적으로 효능을 보임을 확인한 결과이다.
도 18c는 CtxR 폐암 세포주에서 확인한 Ctx-TPP11의 세포증식 억제능에 대한 NRP1 siRNA의 효과를 나타낸 결과이다.
구체적으로는, 도 17a와 같이 세포를 준비하여, 일시적 트랜스펙션을 한 후, 96웰 플레이트에 각 웰 당 5 x 103 개의 세포를 넣어 12시간 배양했다. 그리고 Ctx과 Ctx-TPP11을 2 μM 농도로 10% FBS가 포함된 배지에 희석하여 48시간동안 배양 후, 세포증식을 WST-1 어세이로 확인하였다.
그 결과, NRP1 siRNA로 NRP1의 발현을 억제하였을 때, Ctx-TPP11의 세포성장 억제능이 사라짐을 확인하였다. 이는 도 18b의 결과와 같이, Ctx-TPP11이 표적하는 NRP1에 특이적으로 효능을 보임을 확인한 결과이다.
실시예 14. Ctx R 폐암 세포주에서의 NRP1, 인테그린 β3 및 KRAS의 상호관계 확인.
실시예 11-12를 통해, 폐암 세포주에서는 Ctx에 대한 저항성이 NRP1, 인테그린 β3 및 KRAS 돌연변이와 밀접한 연관성이 있음을 확인하였고, 이러한 CtxR 폐암 세포주에서 Ctx-TPP11이 NRP1에 특이적으로 효능을 보임을 확인하였다. 따라서, 폐암 세포주에서는 왜 Ctx-TPP11이 Ctx에 대한 저항성을 극복할 수 있는지 알기 위해, 면역침강분석 어세이 (Immunoprecipitation assay)을 통해 NRP1이 인테그린 β3 및 KRAS와 어떤 상호작용을 하고 있는지 확인하였다.
도 19a는 CtxR 폐암 세포주 HCC44, A549에서 NRP1 항체를 이용하여 면역침강분석 어세이를 수행한 결과이다.
구체적으로는, 100 mm3 플레이트에 웰당 2 x 106 개의 CtxR 폐암 세포주 HCC44, A549 (NRP1과 인테그린 β3를 발현하는 세포주)를 각각 10 % FBS가 포함된 배지에서 12시간 배양 후, 세포 용해물을 얻기 위해 용해 버퍼 (50 mM Tris-HCl pH 7.4, 150mM NaCl, 1% NP-40, 0.5% SDC, 0.1% SDS, 100x Protease inhibitor)를 넣어, 4℃에서 30분 반응시킨 후, 세포 잔해물을 침전시켜 제거한다. 이후, 세포 용해물은 BCA protein assay kit (Pierce) 를 이용하여 정량 후, 각각 0.5 mg의 세포 용해물과 항 NRP1 항체 (Abacm) 5 μg을 4℃에서 12시간 반응시킨다. 그 후, Protein A/G 아가로스를 첨가하여 4℃에서 2시간 반응시킨 후, 항체를 침강시킨다. 이 후 항 NRP1 항체, 항 EGFR 항체, 항 인테그린 β3 항체, 항 인테그린 β1 항체, 항 KRAS 항체를 이용하여 웨스턴 블롯을 수행하였다. 분석 결과, HCC44, A549에서 NRP1을 면역침강법을 이용하여 침강시켰을 때, EGFR, 인테그린 β3, 그리고 KRAS가 함께 관찰되었다. 이는 CtxR 폐암 세포주 HCC44, A549에서 NRP1이 EGFR, 인테그린 β3 및 KRAS와 상호작용함을 확인하였다. 반면, 인테그린 β1의 경우에는 HCC44에서는 NRP1과의 상호작용이 관찰되었지만, A549에서는 관찰되지 않았다.
도 19b는 NRP1과 KRAS의 상호작용이 인테그린 β3에 의한 것인지 알기 위해, 대조군 siRNA을 처리한 A549와 인테그린 β3 siRNA을 처리한 A549에서 NRP1 항체를 이용하여 면역침강분석 어세이를 수행한 결과이다.
구체적으로, 100 mm3 플레이트에 웰당 1 x 106 개의 A549 세포주를 각각 10 % FBS가 포함된 배지에서 12시간 배양 후, 대조군 siRNA와 인테그린 β3 siRNA를 실시예 12와 동일하게 처리한다. 그 후, 상기 도 19a의 방법과 동일하게 세포 용해물을 준비하여 면역침강 어세이를 수행하였다. 그 결과, 대조군 siRNA을 처리하여 인테그린 β3를 발현하고 있는 A549에서는 NRP1과 함께 EGFR, 인테그린 β3 및 KRAS이 모두 관찰되었다. 하지만, 인테그린 β3 siRNA을 이용하여 인테그린 β3의 발현이 억제된 A549에서는 NRP1과 함께 EGFR과 인테그린 β3는 관찰되었지만, KRAS는 관찰되지 않았다. 이는 NRP1과 KRAS가 직접적인 상호작용은 하고 있지 않고, 인테그린 β3를 통한 NRP1과 KRAS의 복합체 형성이 이루어짐을 확인한 결과이다.
실시예 15. NRP1 표적을 통한 인테그린 β3의 세포 표면 발현양 감소 기작 평가.
실시예 8에서 설명하였듯이, 췌장암에서 Ctx-TPP11은 NRP1 표적을 통해, 세포 표면의 활성 인테그린 β1의 발현을 감소시켜 인테그린 β1의 신호를 하향 조절함을 확인하였다. 폐암에서는 NRP1이 인테그린 β3와 상호작용함을 확인하였기에, NRP1 표적을 통해 세포 표면의 인테그린 β3 발현양을 감소시킬 수 있는지 확인하고자 하였다.
도 20은 CtxR HCC44, A549에서 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1, 인테그린 β3의 세포 내 유입 능을 유세포 분석기로 분석한 결과이다.
구체적으로는, 실시예 8과 동일하게 세포를 준비하고, 세포가 안정화 되면, 혈청에 의한 효과를 없애기 위해 무혈청 배지로 4시간 동안 혈청 결핍을 시킨 후, Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 2 μM을 무혈청 배지 1 ml에 희석하여 15분, 37℃ 조건에서 처리 후, 차가운 PBS로 세척하고, 각 샘플 당 1x105 개의 HCC44, A549 세포를 준비하였다. NRP1 및 인테그린 β3을 각각 인지하는 일차 항체를 4℃에서 1시간 반응시켰다. 각각의 일차 항체를 인지하는 FITC이 연결된 이차 항체를 4℃에서 30분간 반응시키고 PBS로 세척 후, 유세포 분석기기인 FACS Calibur (BD Bioscience)로 분석하였다. 분석 후, 각각의 샘플에 대한 히스토그램 그래프를 얻고, 히스토그램의 평균형광강도를 이용하여 Fc-TPP11, Ctx, Ctx-TPP11 처리에 따른 NRP1 및 인테그린 β3의 세포 내 유입 후, 남아있는 세포 표면의 수용체의 양을 도 20b에서 정량적으로 나타내었다.
분석 결과, NRP1에 결합하는 Fc-TPP11과 Ctx-TPP11의 경우, NRP1의 세포 내 유입을 증가시키고, NRP1과 결합하고 있는 인테그린 β3의 세포 내 유입도 함께 증가시켰다. 따라서, Ctx-TPP11은 NRP1에 결합하여, NRP1과 인테그린 β3의 세포 표면 발현양을 선택적으로 감소시킨다.
실시예 16. Pnm-TPP11의 발현 및 정제.
실시예 1-13에서는 EGFR 표적 항체 중 Ctx에 대해 저항성을 가지는 세포주들에 대해 설명하였다. 추가적으로, EGFR 표적 항체 중 파니투무맙 (Panitumumab, Pnm)에 TPP11을 융합한 Pnm-TPP11이 PnmR 폐암 세포의 증식을 억제할 수 있는지 확인하기 위해, Pnm-TPP11을 발현, 정제하였다.
도 21a는 TPP11 펩타이드가 15개 잔기 (G4S)3링커를 통하여 Pnm의 중쇄의 C-말단에 융합된 형태의 Pnm-TPP11의 모식도이다.
구체적으로는, Pnm의 중쇄 (AA 서열은 서열번호 12, DNA 서열은 서열번호 13)의 C말단과 (G4S)3 링커 및 TPP11을 지시하는 역방향 프라이머와 신호 펩타이드를 지시하는 정방향 프라이머를 이용하여 중합효소 연쇄 반응(Polymerase chain reaction)을 수행하였으며, 신호 펩타이드, Pnm 중쇄, (G4S)3 링커, TPP11 및 종결 코돈의 순서대로 지시하는 DNA 절편을 확보하였다. 그 다음으로 1% 아가로스 젤과 전기영동법을 이용하여 DNA를 회수하였고, NotI과 BamHI 제한효소를 이용하여 외가닥말단 (cohesive end)을 생성되게 하였다. 이후, T4 리가아제를 이용하여 pcDNA3.4 벡터에 클로닝하여 Pnm-TPP11 중쇄를 동물세포에서 발현시킬 수 있는 벡터를 구축하였다 (AA서열은 서열번호 10, DNA서열은 서열번호 11). 경쇄를 코딩하는 DNA (AA 서열은 서열번호 14, DNA 서열은 서열번호 15)는 야생형 Pnm 경쇄 발현 벡터를 동일하게 사용하였다.
[표 5]
Figure 112017029446030-pat00010
Figure 112017029446030-pat00011
Figure 112017029446030-pat00012
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Figure 112017029446030-pat00015
경쇄, 중쇄 발현 벡터를 일시적 트랜스펙션(transient transfection)을 이용하여 단백질을 발현 및 정제하였다. 진탕 플라스크에서, 무혈청 FreeStyle 293 발현 배지(Invitrogen)에서 부유 성장하는 HEK293-F 세포(Invitrogen)를 플라스미드 및 폴리에틸렌이민 (Polyethylenimine, PEI) (Polyscience)의 혼합물로 트랜스펙션하였다. 진탕 플라스크 (Corning)에 200mL 트랜스펙션 시, HEK293-F 세포를 2 X 106 세포/ml의 밀도로 배지 100ml에 파종하여, 130 rpm, 8 % CO2에서 배양하였다. 각각의 단일클론항체 생산하기 위해 알맞은 중쇄와 경쇄 플라스미드를 10ml FreeStyle 293 발현 배지 (Invitrogen)에 중쇄 125μg, 경쇄 125μg 총 250μg (2.5 μg/ml)으로 희석하여, PEI 750 μg (7.5 μg/ml)을 희석한 10ml의 배지와 혼합하여 실온에서 10분 동안 반응시켰다. 그 후, 반응시킨 혼합배지를 앞서 100ml로 파종한 세포에 넣어 4시간 동안 150 rpm, 8% CO2에서 배양 후, 나머지 100 ml의 FreeStyle 293 발현 배지를 추가하여 7일 동안 배양했다. 표준 프로토콜을 참조하여 채취한 세포 배양 상등액으로부터 단백질을 정제하였다. 단백질 A 세파로오스 컬럼 (Protein A Sepharose column) (GE healthcare)에 항체를 적용하고 PBS (pH 7.4)로 세척하였다. 0.1 M 글라이신 완충액을 이용하여 pH 3.0에서 항체를 용리한 후 1M Tris 완충액을 이용하여 샘플을 즉시 중화하였다. 용리한 항체 분획은 투석방법을 통해 PBS (pH 7.4)로 완충액을 교환하며 농축을 진행하였다. 정제된 단백질은 280nm 파장에서 흡광도와 흡광계수를 이용하여 정량하였다.
실시예 17. Pnm-TPP11의 Pnm R 폐암 세포주에서의 세포 성장 억제능 평가.
Pnm-TPP11 또한 Ctx-TPP11과 같이, NRP1을 발현하는 PnmR 폐암 세포의 증식을 억제할 수 있는지 여러 폐암 세포주에서 세포 성장 어세이를 진행하였다.
도 21b,c는 NRP1을 발현하는 PnmS (Calu-3, A549, Calu-1, HCC44) 및 PnmR (H441, SK-LU-1, H1299) 폐암 세포주와 NRP1을 발현하지 않는 PnmR (H460) 폐암 세포주에서 Pnm, Pnm-TPP11의 농도별 처리에 따른 세포증식을 WST-1 어세이를 통해 측정한 결과이다.
구체적으로, 실시예 11와 동일하게 폐암 세포주를 준비하여, 세포가 안정화되면, Pnm, Pnm-TPP11을 농도별로 (0, 1, 2, 4 μM) 48시간동안 배양시킨 후, Cyto-X 시약 (LPS Solution)을 10 ㎕을 각 웰에 첨가한 후, 37℃에서 1시간에서 2시간동안 반응시키고, 450 nm에서 흡광도를 마이크로플레이트 리더 (Molecular Devices)를 이용하여 측정하였다. PnmS (Calu-3, A549, Calu-1, HCC44) 폐암 세포주에서는 Pnm와 Pnm-TPP11이 동일한 세포성장 억제능을 보였고, 3종의 PnmR (H441, SK-LU-1, H1299) 폐암 세포주에서는 Pnm와 다르게, Pnm-TPP11 처리군만 세포 성장 억제능을 보였다. 반면, NRP1을 발현하고 있지 않은 PnmR 폐암 세포주인 H460에서는 Pnm-TPP11이 효능을 보이지 않았다. 이는 Pnm-TPP11이 표적하는 NRP1에 특이적으로 효능을 보임을 확인한 결과이다.
이상으로 본 발명의 내용의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서, 이러한 구체적 기술은 단지 바람직한 실시양태일 뿐이며, 이에 의해 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백할 것이다. 따라서, 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항들과 그것들의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
<110> Ajou University Industry Academic Cooperation Foundation <120> Composition for Inhibiting Tolerance Against Epidermal Growth Factor Receptor Targeting Inhibitor <130> 043 <150> KR 16/037,876 <151> 2016-03-29 <160> 15 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> NRP1 Peptide <400> 1 His Thr Pro Gly Asn Ser Lys Pro Thr Arg Thr Pro Arg Arg 1 5 10 <210> 2 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> NRP1 Peptide <400> 2 His Thr Pro Gly Asn Ser Asn Gln Phe Val Leu Thr Ser Thr Arg Pro 1 5 10 15 Pro Arg <210> 3 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> NRP1 Peptide <400> 3 His Thr Pro Gly Ile Ala Thr Arg Thr Pro Arg 1 5 10 <210> 4 <211> 497 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Cetuximab-TPP11 VH <400> 4 Met Gly Trp Ser Cys Ile Ile Leu Phe Leu Val Ala Thr Ala Thr Gly 1 5 10 15 Val His Ser Gln Val Gln Leu Lys Gln Ser Gly Pro Gly Leu Val Gln 20 25 30 Pro Ser Gln Ser Leu Ser Ile Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu 35 40 45 Thr Asn Tyr Gly Val His Trp Val Arg Gln Ser Pro Gly Lys Gly Leu 50 55 60 Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Ser Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Thr 65 70 75 80 Pro Phe Thr Ser Arg Leu Ser Ile Asn Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln 85 90 95 Val Phe Phe Lys Met Asn Ser Leu Gln Ser Asn Asp Thr Ala Ile Tyr 100 105 110 Tyr Cys Ala Arg Ala Leu Thr Tyr Tyr Asp Tyr Glu Phe Ala Tyr Trp 115 120 125 Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala Ala Ser Thr Lys Gly Pro 130 135 140 Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr 145 150 155 160 Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr 165 170 175 Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro 180 185 190 Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr 195 200 205 Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn 210 215 220 His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser 225 230 235 240 Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu 245 250 255 Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu 260 265 270 Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser 275 280 285 His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu 290 295 300 Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr 305 310 315 320 Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn 325 330 335 Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro 340 345 350 Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln 355 360 365 Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val 370 375 380 Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val 385 390 395 400 Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro 405 410 415 Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr 420 425 430 Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val 435 440 445 Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu 450 455 460 Ser Pro Gly Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly 465 470 475 480 Gly Gly Ser His Thr Pro Gly Asn Ser Lys Pro Thr Arg Thr Pro Arg 485 490 495 Arg <210> 5 <211> 1434 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cetuximab-TPP11 VH <400> 5 caggtgcagc tgaaacagag cggcccgggc ctggtgcagc cgagccagag cctgagcatt 60 acctgcaccg tgagcggctt tagcctgacc aactatggcg tgcattgggt gcgccagagc 120 ccgggcaaag gcctggaatg gctgggcgtg atttggagcg gcggcaacac cgattataac 180 accccgttta ccagccgcct gagcattaac aaagataaca gcaaaagcca ggtgtttttt 240 aaaatgaaca gcctgcagag caacgatacc gcgatttatt attgcgcgcg cgcgctgacc 300 tattatgatt atgaatttgc gtattggggc cagggcaccc tggtgaccgt gagcgcggcc 360 tccaccaagg gcccatcggt cttccccctg gcaccctcct ccaagagcac ctctgggggc 420 acagcggccc tgggctgcct ggtcaaggac tacttccccg aaccggtgac ggtgtcgtgg 480 aactcaggcg ccctgaccag cggcgtgcac accttcccgg ctgtcctaca gtcctcagga 540 ctctactccc tcagcagcgt ggtgaccgtg ccctccagca gcttgggcac ccagacctac 600 atctgcaacg tgaatcacaa gcccagcaac accaaggtgg acaagaaagt tgagcccaaa 660 tcttgtgaca aaactcacac atgcccaccg tgcccagcac ctgaactcct ggggggaccg 720 tcagtcttcc tcttcccccc aaaacccaag gacaccctca tgatctcccg gacccctgag 780 gtcacatgcg tggtggtgga cgtgagccac gaagaccctg aggtcaagtt caactggtac 840 gtggacggcg tggaggtgca taatgccaag acaaagccgc gggaggagca gtacaacagc 900 acgtaccgtg tggtcagcgt cctcaccgtc ctgcaccagg actggctgaa tggcaaggag 960 tacaagtgca aggtctccaa caaagccctc ccagccccca tcgagaaaac catctccaaa 1020 gccaaagggc agccccgaga accacaggtg tacaccctgc ccccatcccg ggatgagctg 1080 accaagaacc aggtcagcct gacctgcctg gtcaaaggct tctatcccag cgacatcgcc 1140 gtggagtggg agagcaatgg gcagccggag aacaactaca agaccacgcc tcccgtgctg 1200 gactccgacg gctccttctt cctctacagc aagctcaccg tggacaagag caggtggcag 1260 caggggaacg tcttctcatg ctccgtgatg catgaggctc tgcacaacca ctacacgcag 1320 aagagcctct ccctgtcccc gggtaaaggt ggaggaggat ctggaggagg aggaagtgga 1380 ggtggaggat cacatactcc tggaaatagc aaaccaacac gcacaccaag gcgt 1434 <210> 6 <211> 468 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Cetuximab VH <400> 6 Met Gly Trp Ser Cys Ile Ile Leu Phe Leu Val Ala Thr Ala Thr Gly 1 5 10 15 Val His Ser Gln Val Gln Leu Lys Gln Ser Gly Pro Gly Leu Val Gln 20 25 30 Pro Ser Gln Ser Leu Ser Ile Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu 35 40 45 Thr Asn Tyr Gly Val His Trp Val Arg Gln Ser Pro Gly Lys Gly Leu 50 55 60 Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Ser Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Thr 65 70 75 80 Pro Phe Thr Ser Arg Leu Ser Ile Asn Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln 85 90 95 Val Phe Phe Lys Met Asn Ser Leu Gln Ser Asn Asp Thr Ala Ile Tyr 100 105 110 Tyr Cys Ala Arg Ala Leu Thr Tyr Tyr Asp Tyr Glu Phe Ala Tyr Trp 115 120 125 Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala Ala Ser Thr Lys Gly Pro 130 135 140 Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr 145 150 155 160 Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr 165 170 175 Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro 180 185 190 Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr 195 200 205 Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn 210 215 220 His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser 225 230 235 240 Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu 245 250 255 Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu 260 265 270 Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser 275 280 285 His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu 290 295 300 Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr 305 310 315 320 Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn 325 330 335 Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro 340 345 350 Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln 355 360 365 Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val 370 375 380 Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val 385 390 395 400 Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro 405 410 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ggtgaccgtg ccctccagca gcttgggcac ccagacctac 600 atctgcaacg tgaatcacaa gcccagcaac accaaggtgg acaagaaagt tgagcccaaa 660 tcttgtgaca aaactcacac atgcccaccg tgcccagcac ctgaactcct ggggggaccg 720 tcagtcttcc tcttcccccc aaaacccaag gacaccctca tgatctcccg gacccctgag 780 gtcacatgcg tggtggtgga cgtgagccac gaagaccctg aggtcaagtt caactggtac 840 gtggacggcg tggaggtgca taatgccaag acaaagccgc gggaggagca gtacaacagc 900 acgtaccgtg tggtcagcgt cctcaccgtc ctgcaccagg actggctgaa tggcaaggag 960 tacaagtgca aggtctccaa caaagccctc ccagccccca tcgagaaaac catctccaaa 1020 gccaaagggc agccccgaga accacaggtg tacaccctgc ccccatcccg ggatgagctg 1080 accaagaacc aggtcagcct gacctgcctg gtcaaaggct tctatcccag cgacatcgcc 1140 gtggagtggg agagcaatgg gcagccggag aacaactaca agaccacgcc tcccgtgctg 1200 gactccgacg gctccttctt cctctacagc aagctcaccg tggacaagag caggtggcag 1260 caggggaacg tcttctcatg ctccgtgatg catgaggctc tgcacaacca ctacacgcag 1320 aagagcctct ccctgtcccc gggtaaa 1347 <210> 8 <211> 233 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Cetuximab VL <400> 8 Met Gly Trp Ser Cys Ile Ile Leu Phe Leu Val Ala Thr Ala Thr Gly 1 5 10 15 Val His Ser Asp Ile Leu Leu Thr Gln Ser Pro Val Ile Leu Ser Val 20 25 30 Ser Pro Gly Glu Arg Val Ser Phe Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile 35 40 45 Gly Thr Asn Ile His Trp Tyr Gln Gln Arg Thr Asn Gly Ser Pro Arg 50 55 60 Leu Leu Ile Lys Tyr Ala Ser Glu Ser Ile Ser Gly Ile Pro Ser Arg 65 70 75 80 Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Ser Ile Asn Ser 85 90 95 Val Glu Ser Glu Asp Ile Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Gln Asn Asn Asn 100 105 110 Trp Pro Thr Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Arg Thr 115 120 125 Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu 130 135 140 Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro 145 150 155 160 Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly 165 170 175 Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr 180 185 190 Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His 195 200 205 Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val 210 215 220 Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys 225 230 <210> 9 <211> 645 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cetuximab VL <400> 9 gatattctgc tgacccagag cccggtgatt ctgagcgtga gcccgggcga acgcgtgagc 60 tttagctgcc gcgcgagcca gagcattggc accaacattc attggtatca gcagcgcacc 120 aacggcagcc cgcgcctgct gattaaatat gcgagcgaaa gcattagcgg cattccgagc 180 cgctttagcg gcagcggcag cggcaccgat tttaccctga gcattaacag cgtggaaagc 240 gaagatattg cggattatta ttgccagcag aacaacaact ggccgaccac ctttggcgcg 300 ggcaccaaac tggaactgaa acgtacggtg gctgcaccat ctgtcttcat cttcccgcca 360 tctgatgagc agttgaaatc tggaactgcc tctgttgtgt gcctgctgaa taacttctat 420 cccagagagg ccaaagtaca gtggaaggtg gataacgccc tccaatcggg taactcccag 480 gagagtgtca cagagcagga cagcaaggac agcacctaca gcctcagcag caccctgacg 540 ctgagcaaag cagactacga gaaacacaaa gtctacgcct gcgaagtcac ccatcagggc 600 ctgagctcgc ccgtcacaaa gagcttcaac aggggagagt gttga 645 <210> 10 <211> 474 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Pnm-TPP11 Heavy Chain <400> 10 Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu 1 5 10 15 Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Val Ser Ser Gly 20 25 30 Asp Tyr Tyr Trp Thr Trp Ile Arg Gln Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Ile Gly His Ile Tyr Tyr Ser Gly Asn Thr Asn Tyr Asn Pro Ser 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Ile Asp Thr Ser Lys Thr Gln Phe 65 70 75 80 Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr 85 90 95 Cys Val Arg Asp Arg Val Thr Gly Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly 100 105 110 Thr Met Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe 115 120 125 Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu 130 135 140 Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp 145 150 155 160 Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu 165 170 175 Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser 180 185 190 Ser Asn Phe Gly Thr Gln Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro 195 200 205 Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Thr Val Glu Arg Lys Cys Cys Val Glu 210 215 220 Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Pro Val Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu 225 230 235 240 Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu 245 250 255 Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln 260 265 270 Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys 275 280 285 Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu 290 295 300 Thr Val Val His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys 305 310 315 320 Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys 325 330 335 Thr Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser 340 345 350 Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys 355 360 365 Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln 370 375 380 Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly 385 390 395 400 Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln 405 410 415 Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn 420 425 430 His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys Gly Gly Gly 435 440 445 Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser His Thr Pro Gly 450 455 460 Asn Ser Lys Pro Thr Arg Thr Pro Arg Arg 465 470 <210> 11 <211> 1422 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Pnm-TPP11 Heavy Chain <400> 11 caggtgcagc tgcaggagtc cggccccggc ctggtgaagc cctccgagac cctgtccctg 60 acctgcaccg tgtccggcgg ctccgtgtcc tccggcgact actactggac ctggattcgg 120 cagtcccccg gcaagggcct ggagtggatc ggccacatct actactccgg caacaccaac 180 tacaacccct ccctgaagtc ccggctgacc atctccatcg acacctccaa gacccagttc 240 tccctgaagc tgtcctccgt gaccgccgcc gacaccgcca tctactactg cgtgcgggac 300 cgggtgaccg gcgccttcga catctggggc cagggcacca tggtgaccgt gtcctccgcc 360 tccaccaagg gcccatcggt cttccccctg gcgccctgct ccaggagcac ctccgagagc 420 acagcggccc tgggctgcct ggtcaaggac tacttccccg aaccggtgac ggtgtcgtgg 480 aactcaggcg ctctgaccag cggcgtgcac accttcccag ctgtcctaca gtcctcagga 540 ctctactccc tcagcagcgt ggtgaccgtg ccctccagca acttcggcac ccagacctac 600 acctgcaacg tagatcacaa gcccagcaac accaaggtgg acaagacagt tgagcgcaaa 660 tgttgtgtcg agtgcccacc gtgcccagca ccacctgtgg caggaccgtc agtcttcctc 720 ttccccccaa aacccaagga caccctcatg atctcccgga cccctgaggt cacgtgcgtg 780 gtggtggacg tgagccacga agaccccgag gtccagttca actggtacgt ggacggcgtg 840 gaggtgcata atgccaagac aaagccacgg gaggagcagt tcaacagcac gttccgtgtg 900 gtcagcgtcc tcaccgttgt gcaccaggac tggctgaacg gcaaggagta caagtgcaag 960 gtctccaaca aaggcctccc agcccccatc gagaaaacca tctccaaaac caaagggcag 1020 ccccgagaac cacaggtgta caccctgccc ccatcccggg aggagatgac caagaaccag 1080 gtcagcctga cctgcctggt caaaggcttc taccccagcg acatcgccgt ggagtgggag 1140 agcaatgggc agccggagaa caactacaag accacacctc ccatgctgga ctccgacggc 1200 tccttcttcc tctacagcaa gctcaccgtg gacaagagca ggtggcagca ggggaacgtc 1260 ttctcatgct ccgtgatgca tgaggctctg cacaaccact acacgcagaa gagcctctcc 1320 ctgtccccgg gtaaaggtgg aggaggatct ggaggaggag gaagtggagg tggaggatca 1380 catactcctg gaaatagcaa accaacacgc acaccaaggc gt 1422 <210> 12 <211> 445 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Pnm Heavy Chain <400> 12 Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu 1 5 10 15 Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Val Ser Ser Gly 20 25 30 Asp Tyr Tyr Trp Thr Trp Ile Arg Gln Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Ile Gly His Ile Tyr Tyr Ser Gly Asn Thr Asn Tyr Asn Pro Ser 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Ile Asp Thr Ser Lys Thr Gln Phe 65 70 75 80 Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr 85 90 95 Cys Val Arg Asp Arg Val Thr Gly Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly 100 105 110 Thr Met Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe 115 120 125 Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu 130 135 140 Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp 145 150 155 160 Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu 165 170 175 Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser 180 185 190 Ser Asn Phe Gly Thr Gln Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro 195 200 205 Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Thr Val Glu Arg Lys Cys Cys Val Glu 210 215 220 Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Pro Val Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu 225 230 235 240 Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu 245 250 255 Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln 260 265 270 Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys 275 280 285 Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu 290 295 300 Thr Val Val His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys 305 310 315 320 Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys 325 330 335 Thr Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser 340 345 350 Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys 355 360 365 Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln 370 375 380 Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly 385 390 395 400 Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln 405 410 415 Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn 420 425 430 His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys 435 440 445 <210> 13 <211> 1335 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Pnm Heavy Chain <400> 13 caggtgcagc tgcaggagtc cggccccggc ctggtgaagc cctccgagac cctgtccctg 60 acctgcaccg tgtccggcgg ctccgtgtcc tccggcgact actactggac ctggattcgg 120 cagtcccccg gcaagggcct ggagtggatc ggccacatct actactccgg caacaccaac 180 tacaacccct ccctgaagtc ccggctgacc atctccatcg acacctccaa gacccagttc 240 tccctgaagc tgtcctccgt gaccgccgcc gacaccgcca tctactactg cgtgcgggac 300 cgggtgaccg gcgccttcga catctggggc cagggcacca tggtgaccgt gtcctccgcc 360 tccaccaagg gcccatcggt cttccccctg gcgccctgct ccaggagcac ctccgagagc 420 acagcggccc tgggctgcct ggtcaaggac tacttccccg aaccggtgac ggtgtcgtgg 480 aactcaggcg ctctgaccag cggcgtgcac accttcccag ctgtcctaca gtcctcagga 540 ctctactccc tcagcagcgt ggtgaccgtg ccctccagca acttcggcac ccagacctac 600 acctgcaacg tagatcacaa gcccagcaac accaaggtgg acaagacagt tgagcgcaaa 660 tgttgtgtcg agtgcccacc gtgcccagca ccacctgtgg caggaccgtc agtcttcctc 720 ttccccccaa aacccaagga caccctcatg atctcccgga cccctgaggt cacgtgcgtg 780 gtggtggacg tgagccacga agaccccgag gtccagttca actggtacgt ggacggcgtg 840 gaggtgcata atgccaagac aaagccacgg gaggagcagt tcaacagcac gttccgtgtg 900 gtcagcgtcc tcaccgttgt gcaccaggac tggctgaacg gcaaggagta caagtgcaag 960 gtctccaaca aaggcctccc agcccccatc gagaaaacca tctccaaaac caaagggcag 1020 ccccgagaac cacaggtgta caccctgccc ccatcccggg aggagatgac caagaaccag 1080 gtcagcctga cctgcctggt caaaggcttc taccccagcg acatcgccgt ggagtgggag 1140 agcaatgggc agccggagaa caactacaag accacacctc ccatgctgga ctccgacggc 1200 tccttcttcc tctacagcaa gctcaccgtg gacaagagca ggtggcagca ggggaacgtc 1260 ttctcatgct ccgtgatgca tgaggctctg cacaaccact acacgcagaa gagcctctcc 1320 ctgtccccgg gtaaa 1335 <210> 14 <211> 214 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Pnm Light Chain <400> 14 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr 20 25 30 Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Glu Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln His Phe Asp His Leu Pro Leu 85 90 95 Ala Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala 100 105 110 Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly 115 120 125 Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala 130 135 140 Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln 145 150 155 160 Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser 165 170 175 Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr 180 185 190 Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser 195 200 205 Phe Asn Arg Gly Glu Cys 210 <210> 15 <211> 642 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Pnm Light Chain <400> 15 gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60 atcacttgcc aggcgagtca ggacatcagc aactatttaa attggtatca gcagaaacca 120 gggaaagccc ctaaactcct gatctacgat gcatccaatt tggaaacagg ggtcccatca 180 aggttcagtg gaagtggatc tgggacagat tttactttca ccatcagcag cctgcagcct 240 gaagatattg caacatattt ctgccaacac tttgatcatc tcccgctcgc tttcggcgga 300 gggaccaagg tggagatcaa acgtacggtg gctgcaccat ctgtcttcat cttcccgcca 360 tctgatgagc agttgaaatc tggaactgcc tctgttgtgt gcctgctgaa taacttctat 420 cccagagagg ccaaagtaca gtggaaggtg gataacgccc tccaatcggg taactcccag 480 gagagtgtca cagagcagga cagcaaggac agcacctaca gcctcagcag caccctgacg 540 ctgagcaaag cagactacga gaaacacaaa gtctacgcct gcgaagtcac ccatcagggc 600 ctgagctcgc ccgtcacaaa gagcttcaac aggggagagt gt 642

Claims (16)

  1. 뉴로필린 1(Neuropilin 1)에 특이적으로 결합하는 서열번호 1의 서열을 포함하는 펩타이드가 융합된 EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) 표적 항체를 포함하는, EGFR 표적 항체의 단독 사용에 대한 저항성을 나타내고 뉴로필린 1을 발현하는 암을 치료하기 위한 조성물.
  2. 삭제
  3. 제1항에 있어서, 상기 펩타이드는
    i) 세포 표면에 발현된 활성 인테그린 β1의 발현양을 감소시켜, Src, Akt의 인산화를 억제하여, EGFR 표적 항체에 대한 저항성을 극복하거나, 또는
    ii) 세포표면에 발현된 NRP1 및 인테그린 β3의 발현양을 감소시켜, EGFR 표적 항체에 대한 저항성을 극복하는 것을 특징으로 하는 조성물.
  4. 제1항에 있어서, 상기 EGFR 표적 항체는 세툭시맙 (Cetuximab), 파니투무맙 (panitumumab), 잘루투무맙 (zalutumumab), 니모투주맙 (nimotuzumab), 마투주맙 (matuzumab)으로 구성된 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 조성물.
  5. 제1항에 있어서, 상기 암은 췌장암 또는 폐암인 것을 특징으로 하는 조성물.
  6. 삭제
  7. 제1항에 있어서, 상기 펩타이드는 항체의 C 말단에 결합되는 것을 특징으로 하는 조성물.
  8. 제7항에 있어서, 상기 펩타이드에 링커를 추가로 포함하여 항체의 C 말단에 결합되는 것을 특징으로 하는 조성물.
  9. 제8항에 있어서, 상기 링커는 (GGGGS)n의 서열을 포함하고, n은 1-20의 정수인 것을 특징으로 하는 조성물.
  10. 삭제
  11. 제1항에 있어서, 상기 펩타이드는 항체 Fc의 C 말단에 결합되는 것을 특징으로 하는 조성물.
  12. 제1항, 제3항 내지 제5항, 제7항 내지 제9항 및 제11항 중 어느 한 항에 따른 조성물을 포함하는, EGFR 표적 항체의 단독 사용에 대한 저항성을 나타내고 뉴로필린 1을 발현하는 암을 치료하기 위한 제제.
  13. 제1항, 제3항 내지 제5항, 제7항 내지 제9항 및 제11항 중 어느 한 항에 따른 조성물을 포함하는, EGFR 표적 항체의 단독 사용에 대한 저항성을 나타내고 뉴로필린 1을 발현하는 암을 치료하기 위한 보조제.
  14. 뉴로필린 1에 특이적으로 결합하는 서열번호 1의 서열을 포함하는 펩타이드가 융합된 Fc 및 EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) 표적 항체를 포함하는, EGFR 표적 항체의 단독 사용에 대한 저항성을 나타내고 뉴로필린 1을 발현하는 암을 치료하기 위한 병용 투여 조성물.
  15. 제14항에 있어서, 상기 EGFR 표적 항체는 세툭시맙 (Cetuximab), 파니투무맙 (panitumumab), 잘루투무맙 (zalutumumab), 니모투주맙 (nimotuzumab), 마투주맙 (matuzumab)으로 구성된 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 병용 투여 조성물.
  16. 제14항에 있어서, 상기 암은 췌장암 또는 폐암인 것을 특징으로 하는 병용 투여 조성물.
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