KR101836392B1 - 사이클릭 펩타이드를 포함하는 백신 조성물, 사이클릭 펩타이드에 대한 항체 또는 이를 포함하는 항암 조성물 - Google Patents

사이클릭 펩타이드를 포함하는 백신 조성물, 사이클릭 펩타이드에 대한 항체 또는 이를 포함하는 항암 조성물 Download PDF

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Abstract

본 발명은 본 발명은 사이클릭 펩타이드를 포함하는 백신 조성물, 사이클릭 펩타이드에 대한 항체 또는 이를 포함하는 항암 조성물에 관한 것으로, 본 발명의 백신 조성물은 암 전이에 대한 저해활성을 나타내고, 본 발명의 항체는 종양특이항원 TM4SF5에 높은 친화력으로 결합하며, 이를 발현하는 암세포의 성장, 전이 및 침윤을 현저히 억제하므로, TM4SF5를 발현하는 다양한 암의 진단, 예방 또는 치료에 이용될 수 있다.

Description

사이클릭 펩타이드를 포함하는 백신 조성물, 사이클릭 펩타이드에 대한 항체 또는 이를 포함하는 항암 조성물{A vaccine composition comprising cyclic peptide, an antibody against the cyclic peptide and an anticancer compositions comprising the same}
본 발명은 사이클릭 펩타이드를 포함하는 백신 조성물, 사이클릭 펩타이드에 대한 항체 또는 이를 포함하는 항암 조성물에 관한 것이다.
인간 암에서 TM4SF5(transmembrane 4 superfamily member 5 protein)의 mRNA 발현은, 췌장암, 연부조직육종(soft tissue sarcoma), 위암, 십이지장 유두부 상피암(carcinoma of the papilla vateri) 및 대장암에서 관찰되었다(Muller-Pillasch F, et al. Gene 208,25-30(1998)). TM4SF5는 유도된 형태학적 신장 및 상피세포의 중간엽 세포로의 전환(epithelial-mesenchymal transition)을 통하여 간세포암(hepatocellular carcinoma, HCC) 형성에 중요한 역할을 하고, 인 비트로에서 비정상적인 세포 성장 및 인 비보에서 종양 형성을 야기한다(Lee SA, et al. J Clin Invest 118,1354-1366(2008); Lekishvili T, et al. J Cell Sci 121,685-694(2008)). TM4SF5과 인테그린 α2 사이의 세포 외 상호작용에 의한 콜라겐 타입 I 환경에서 인테그린 α2 기능을 억제하는 경우 TM4SF5 발현-유도된 조절되지 않은 세포 증식 및 신생혈관형성이 일어난다는 사실이 보고되었다(Lee SA, et al. Carcinogenesis 30,1872-1879(2009)). TM4SF5를 타겟팅 하는 합성 억제제인 TSAHC(4’-(p-toluenesulfonyl-amido)-4- hydroxychalcone)는 인 비트로 및 인 비보에서 HCC 성장 및 전이를 억제하였다(Lee SA, et al. Hepatology 49,1316-1325(2009)). 이러한 사실들은, HCC 형성에서 TM4SF5의 역할이 HCC 치료 약물 개발을 위한 신규한 분자적 타겟임을 보여준다.
HCC는 전 세계적으로 가장 흔한 암 중의 하나이고, 특히 아시아와 사하라 사막 이남의 아프리카(sub-Saharan Africa)에서 널리 발병하였다. 대부분의 HCC의 발달은 이형성 결절(dysplastic nodule), 초기 HCC, 고분화도 HCC, 및 중간 및 저분화도 HCC를 포함하는 다단계 과정인 것으로 알려져 있다(Forner A, et al. Lancet 379,1245-1255(2012)).
대장암은 전 세계에서 세 번째로 흔한 암이고, 개발도상국 보다 선진국에서 더 흔한 암이다. 대장암에서 가장 흔한 돌연변이 유전자는 Wnt-APC-β-카테닌 신호전달경로와 관련된 APC, β-카테닌, AXIN1, AXIN2, TCF7L2 또는 NKD1이다(Korinek V, et al. Science 275,1784-1787(1997); Khan NP, et al. Mol Cell Biochem 355,149-155(2011); Folsom AR, et al. Diabetes Care 31,905-909(2008); Guo J, et al. PLoS One 4, e7982(2009)).
한편, 생체에 의한 종양 세포와 바이러스 감염 세포 등의 배제는 세포성 면역, 특히 세포 독성 T 세포 (CTL라고 칭한다)가 중요한 역할을 하고 있다. 종양 세포의 배제의 경우, CTL은 종양 세포 상에 항원 펩티드(종양 항원 펩티드)와 MHC(Major Histocompatibility Complex) 클래스 I 항원(인간의 경우 HLA 클래스 I 항원이라 칭함)의 복합체를 인식하여 종양 세포를 공격 및 파괴한다. 즉, 종양 항원 펩티드는 종양에 특유의 단백질, 즉 종양 항원단백질이 세포 내에서 합성된 후, 프로테아제에 의해 세포 내에서 분해됨으로써 생성된다. 생성된 종양 항원 펩티드는 소포체 내에서 MHC 클래스 I 항원(HLA 클래스 I 항원)과 결합하여 복합체를 형성하여 세포 표면에 옮겨져 항원으로 제시된다. 이 항원 제시에 따른 복합체를 종양 특이적인 CTL이 인식하고 세포 독성 작용과 림포카인(lymphokine)의 생산을 통해 항 종양 효과를 나타낸다. 이러한 일련의 작용의 해명에 따라 종양 항원 단백질 또는 종양 항원 펩티드를 이른바 암 면역 요법제(암 백신)로 이용함으로써 암 환자의 체내의 암 특이적 CTL을 증강시키는 치료법이 개발되고 있다.
본 명세서 전체에 걸쳐 다수의 논문 및 특허문헌이 참조되고 그 인용이 표시되어 있다. 인용된 논문 및 특허문헌의 개시 내용은 그 전체로서 본 명세서에 참조로 삽입되어 본 발명이 속하는 기술 분야의 수준 및 본 발명의 내용이 보다 명확하게 설명된다.
[선행 특허 문헌]
대한민국 특허공개번호 제10-2015-0122159호
본 발명자들은 암을 진단, 예방 및 치료할 수 있는 백신 및 항체를 개발하기 위하여 연구 노력하였다. 그 결과, 종양특이항원인 TM4SF5의 펩타이드에 대하여 높은 친화력으로 결합하는 신규한 항체 및 그의 항원 결합 단편을 제조하고, 암세포의 성장, 전이 및 침윤에 대한 상기 항체의 우수한 억제 활성을 확인함으로써, 본 발명을 완성하였다.
따라서 본 발명의 목적은 사이클릭 펩타이드 백신조성물을 제공하는 데 있다.
본 발명의 다른 목적은 그 사이클릭 펩타이드에 대한 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 제공하는 데 있다.
본 발명의 다른 목적은 상기 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 중쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자를 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 경쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자를 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 암의 예방 또는 치료용 약제학적 조성물을 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 암 진단용 키트를 제공하는 데 있다.
본 발명의 다른 목적 및 이점은 하기의 발명의 상세한 설명, 청구범위 및 도면에 의해 보다 명확하게 된다.
상기의 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 서열목록 제1서열 내지 서열목록 제2서열로 구성된 군으로부터 선택되는 아미노산 서열로 이루어진 펩타이드;
또는 서열목록 제1서열 내지 서열목록 제2서열 중 3번째 시스테인과 26번째 시스테인 아미노산 간에 다이설파이드 결합으로 연결된 사이클릭 펩타이드로 구성된 군으로부터 선택되는 아미노산 서열로 이루어진 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 백신 조성물을 제공한다.
본 발명의 일 구현예에 있어서, 상기 펩타이드 백신 조성물은 면역자극 올리고뉴클레오타이드와 리포좀에 포집된 것이 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.
본 명세서에서 용어 "리포좀(liposome)"은 지질 이중막을 형성함으로서 제조되는 지질 운반체를 의미한다. 일반적으로, 리포좀은 생체 친화적이며 양쪽 친매성을 가지고 있어 내부의 친수성 물질을 포함한 채로 소수성 막을 통과할 수 있다. 리포좀의 직경은 일반적으로 20-2,000 nm이나 이에 제한되지 않고, 제조 방법 및 운반될 뉴클레오타이드의 길이에 따라 다양한 크기일 수 있다.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 리포좀은 CHEMS 및 DOPE의 혼합물이다. 본 발명에서 사용하는 리포좀 내에서의 DOPE:CHEMS의 몰 비율은 바람직하게는 7:3-3:7이고, 보다 바람직하게는 4.5:5.5-5.5:4.5이며, 가장 바람직하게는 5.0:5.0이다.
본 발명의 리포좀의 제조는 당업계에 공지된 다양한 방법을 통해 이루어질 수 있으며, 바람직하게는 유기용매-혼합 방법 또는 계면제-혼합 방법을 이용한다(미국 특허등록 제5,705,385호; 미국 특허출원 제08/660,025호).보다 바람직하게는, 리포좀은 DOPE 및 CHEMS를 혼합하고, 이를 질소가스와 함께 증발시켜 무용매(solventfree)지질 필름을 만든 후, 알코올 용액에서 용해시켜 최종적으로 수용성 뉴클레오타이드 혼합물과 혼합하는 과정을 통해 제조한다.
본 발명의 리포좀 제조를 유기용매 혼합을 통해 실시하는 경우, 이에 이용되는 유기용매는 클로로포름, 메탄올,에탄올, n-프로판올 또는 부탄올을 포함한다. 바람직하게는, 상기 유기용매는 에탄올이다.
본 명세서에서 용어 "포집(encapsulation)"은 효율적인 인 비보 운반을 위해 운반될 물질을 상대적으로 안정한 쉘 내로 가두는(enclosure) 것을 의미한다.
본 명세서에서 용어 "면역자극(immunostimulatory)"은 초기 면역반응을 유도하거나 또는 항원에 대한 기존의 면역반응을 측정 가능할 정도로 증가시키는 것을 의미한다.
본 발명에서 이용될 수 있는 면역자극 올리고뉴클레오타이드는 당업계에 공지된 어떠한 면역자극 올리고뉴클레오타이드도 포함한다. 예를 들어, 상기 면역자극 올리고뉴클레오타이드는 헤어핀 이차 구조를 형성하는 팰린드롬, CpG 모티프, CpT 모티프 또는 다중 G 도메인을 포함하는 올리고뉴클레오타이드 또는 다른 공지된 ISS(immunostimulatory sequence)일 수 있다. 예를 들어, 본 발명에서 이용되는 면역자극 올리고뉴클레오타이드는 미국 특허출원공개 제20080045473호, WO 2006/063152 또는 WO 1998/18810에 개시된 면역자극 올리고뉴클레오타이드를 포함한다.상기 CpG 모티프를 포함하는 면역자극 올리고뉴클레오타이드의 구체적인 예는 WO 2006/[0027] 080596에 개시된 본 발명자들에 의해 개발된 CpG 올리고뉴클레오타이드를 포함한다.
본 발명에서 유효성분으로 이용되는 면역자극 올리고뉴클레오타이드는 천연(natural-occurring)뉴클레오타이드, 백본(backbone)-변형된 뉴클레오타이드(예컨대, 펩타이드 핵산(PNA)(M. Egholm, et al.,Nature, 365: 566-568(1993)), 포스포로티오에이트 DNA, 포스포로디티오에이트 DNA, 포스포로아미데이트 DNA,아마이드-연결된 DNA, MMI-연결된 DNA, 2'-O-메틸 RNA, 알파-DNA 및 메틸포스포네이트 DNA, 당-변형된 뉴클레오타이드(예컨대, 2'-O-메틸 RNA, 2'-플루오로 RNA, 2'-아미노 RNA, 2'-O-알킬 DNA, 2'-O-알릴 DNA, 2'-O-알카이닐 DNA, 헥소오스 DNA, 피라노실 RNA 및 안히드로헥시톨 DNA), 및 염기-변형된 뉴클레오타이드(예컨대, C-5 치
환된 피리미딘(치환기는 플루오로-, 브로모-, 클로로-, 아이오도-, 메틸-, 에틸-, 비닐-, 포르밀-, 에티틸-, 프로피닐-, 알카이닐-, 티아조릴-, 이미다조릴- 및 피리딜- 포함), C-7 치환기를 갖는 7-데아자퓨린(치환기는 플루오로-, 브로모-, 클로로-, 아이오도-, 메틸-, 에틸-, 비닐-, 포르밀-, 알카이닐-, 알켄일-, 티아조릴-, 이미다조릴-, 피리딜- 포함), 이노신 및 디아미노퓨린)을 포함한다. 바람직하게는, 본 발명의 올리고뉴클레오타이드는 천연 뉴클레오타이드이다.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 면역자극 올리고뉴클레오타이드는 포스포로다이에스테르 백본또는 포스포로티오에이트 백본을 가진다.
본 발명에서 이용되는 면역자극 올리고뉴클레오타이드의 길이는 특별하게 제한되지 않으며, 바람직하게는 8-100뉴클레오타이드 길이이고, 보다 바람직하게는 15-50 뉴클레오타이드 길이이며, 가장 바람직하게는 약 13-25 뉴클레오타이드 길이이다. 바람직하게는, 본 발명의 면역자극 올리고뉴클레오타이드는 서열목록 제23서열의 올리고뉴클레오타이드이다.
본 명세서에서 용어 "에피토프(epitope)"는 항체와 상호작용하는 항원의 부위를 의미한다. 보다 자세하게는,에피토프는 면역글로블린(immunoglobulin) 또는 T-세포 수용체에 특이적으로 결합할 수 있는 단백질 결정부위(determinant)를 의미한다. 또한, 본 발명의 에피토프는 면역반응을 증가시킬 수 있는 어떠한 분자 또는 물질을 포함한다. 예를 들어, 본 발명의 에피토프는 펩타이드, 이들 펩타이드를 인코딩하는 핵산 및 당단백질을 포함하지만, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 명세서에서 용어 "펩타이드(peptide)"는 아미노산 잔기들 간의 펩타이드 결합에 의해 형성된 선형의 분자를 의미하고, 본 명세서에서 용어 "펩타이드 에피토프(peptide epitope)"는 B 세포 및/또는 T 세포의 특이적 반응을 유도할 수 있는 에피토프를 포함하는 펩타이드를 의미한다.
본 발명의 조성물에는 기타 약물 또는 다른 면역 보조제가 포함되어 추가적인 면역 자극 효과를 제공할 수 있다. 면역보강제의 종류들은 당 분야에 널리 공지되어 있다(Vaccine Design - The Subunit and Adjuvant Approach, 1995, Pharmaceutical Biotechnology, Volume 6, Eds. Powell, M.F., and Newman, M.J., Plenum Press, New York and London, ISBN 0-306-44867-X). 바람직하게는, 본 발명의 조성물에 포함되는 면역보강제는 알루미늄 염 또는 칼슘 염(예를 들어, 하이드록사이드 또는 포스페이트)을 포함한다.
바람직한 면역보강제의 구체적 예는 다음과 같다: 알루미늄염 또는 칼슘염(하이드록사이드 또는 포스페이트),수중유(oil-in-water) 에멀젼(WO 95/17210, EP 0 399 843) 또는 리포좀과 같은 미립성 캐리어(WO 96/33739),남아메리카 수목인 퀼라자 사포나리아 몰리나(Quillaja Saponaria Molina)로부터 유래된 면역학적으로 항원보강제 활성을 지닌 사포닌 분획(예를 들어, Quil A), 3 De-O-실화된 모노포스포릴 지질 A, 뮤라밀 디펩티드, 3DMPL(3-O-데아실화된 모노포스포릴 지질 A)을 포함하지만, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 백신 조성물은 다양한 상태 또는 질환의 치료에 적용될 수 있으며, 상기 상태 또는 질환의 예는 대장암,간암, 위암, 폐암, 유방암, 난소암, 간암, 기관지암, 비인두암, 후두암, 췌장암, 방광암, 결장암, 자궁경부암, 뇌암, 전립선암, 골암, 피부암, 갑상선암, 부갑상선암 및 요관암과 같은 암에 적용될 수 있다.
본 발명의 약제학적 조성물에 포함되는 약제학적으로 허용되는 담체는 제제시에 통상적으로 이용되는 것으로서,락토스, 덱스트로스, 수크로스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산 칼슘, 알기네이트, 젤라틴, 규산칼슘, 미세결정성 셀룰로스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로스, 메틸히드록시벤조에이트,프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 약제학적 조성물은 상기 성분들 이외에 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제,보존제 등을 추가로 포함할 수 있다. 적합한 약제학적으로 허용되는 담체 및 제제는 Remington's Pharmaceutical Sciences(19th ed., 1995)에 상세히 기재되어 있다.
본 발명의 약제학적 조성물은 경구 또는 비경구로 투여할 수 있고, 바람직하게는 비경구 투여이고, 비경구 투여인 경우에는 정맥내 주입, 피하 주입, 근육 주입, 복강 주입, 경피 투여 등으로 투여할 수 있다.
본 발명의 약제학적 조성물의 적합한 투여량은 제제화 방법, 투여 방식, 환자의 연령, 체중, 성, 병적 상태, 음식, 투여 시간, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하게 처방될 수 있다. 한편,본 발명의 약제학적 조성물의 경구 투여량은 바람직하게는 1일 당 0.001-10,000 mg/kg(체중)이다.
본 발명의 약제학적 조성물은 당해 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 약제학적으로 허용되는 담체 및/또는 부형제를 이용하여 제제화함으로써 단위 용량 형태로 제조되거나 또는 다용량 용기내에 내입시켜 제조될 수 있다. 이때 제형은 오일 또는 수성 매질중의 용액, 현탁액 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캅셀제 형태일 수도 있으며, 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수 있다.
또한 본 발명은 서열목록 제1서열 내지 서열목록 제2서열로 구성된 군으로부터 선택되는 아미노산 서열로 이루어진 펩타이드;또는 서열목록 제1서열 내지 서열목록 제2서열 중 3번째 시스테인과 26번째 시스테인 아미노산 간에 다이설파이드 결합으로 연결된 사이클릭 펩타이드로 구성된 군으로부터 선택되는 아미노산 서열로 이루어진 펩타이드에 대한 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 제공한다.
본 발명의 일 구현예에 있어서, 상기 항체는 서열목록 제3서열 또는 제4서열로 이루어진 CDRH1, 서열목록 제5서열 또는 제6서열로 이루어진 CDRH2 및 서열목록 제7서열 또는 제8서열로 이루어진 CDRH3의 중쇄 CDR(complementarity determining region) 아미노산 서열을 갖는 중쇄 가변영역; 및 제9서열 또는 제10서열로 이루어진 CDRL1, 서열목록 제11서열 또는 제12서열로 이루어진 CDRL2 및 서열목록 제13서열 또는 제14서열로 이루어진 CDRL3의 경쇄 CDR 아미노산 서열을 갖는 경쇄 가변영역을 포함하는 것이 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.
본 발명에서 본 발명자들은 TM4SF5의 EC2(extracellular domain 2)에 해당하는 사이클릭 펩타이드를 고안하고, 사이클릭 hTM4SF5 펩타이드 및 MB-ODN 4531(O)을 phosphatidyl-β-oleoyl-γ-palmitoyl ethanolamine (DOPE): cholesterol hemisuccinate (CHEMS) 복합체에 캡슐화 하고 면역화 후 마우스에서 사이크릭 펩타이드-특이적인 항체를 생산하였다. 전이 모델로, 마우스에 마우스 대장암 세포주 CT-26의 정맥내 주사로 폐에서 종양을 유도하였다. 펩타이드 백신으로 면역화된 마우스에서 생존률은 증가하였고, 전이된 폐 결절의 수 및 폐 종양의 성장은 감소하였고, 이것은 그 펩타이드 백신의 항-전이 효과를 시사하였다. 본 발명자들은 항원으로 TM4SF5의 사이클릭 펩타이드 유사 구조 모티프를 사용하였고, 낮은 오프 레이트(off rate)를 가지는 TM4SF5 단백질을 인지하는 단클론 항체를 성공적으로 분리하였다. 또 본 발명자들은 인간화된 항체를 제조하고 인 비트로 및 인 비보에서 그 반응성을 평가하였다. 중요하게도 본 발명자들은 본 발명의 인간화된 anti-TM4SF5 항체의 간암 및 대장암의 형성 및 성장에 대한 저해 효과를 발견하였다. 또한 정맥내 주사된 그 인간화된 anti-TM4SF5 항체는 마우스 전이 모델로 대장암 세포의 정맥내 주사에 의하여 확립된 폐 전이를 저해하였다.
따라서 본 발명의 주된 내용은,
i)TM4SF5가 간암 및 대장암등에 발현되어 암의 성장에 영향을 줌
ii)TM4SF5의 extracellular domain 2(EC2)에 해당되는 사이클릭 펩타이드를 합성하여 사이클릭 펩타이드-CpG-DNA-리포좀 복합체를 제조하여 마우스에 면역하면 사이클릭 펩타이드에 대한 항체가 생성
iii)사이클릭 펩타이드-CpG-DNA-리포좀 복합체를 백신으로 이용하여 대장암(CT-26세포 이용)의 전이 　대한 백신 효능 검증
iv)사이클릭 펩타이드-CpG-DNA-리포좀 복합체를 면역한 마우스의 비장세포를 융합하여 단일크론항체 제조
v)마우스 anti-TM4SF5 단클론 항체에 근거하여 인간화된 anti-TM4SF5 항체 제조
vi)인간화된 anti-TM4SF5 항체의 간암, 대장암 억제 효능 및 대장암의 전이억제 효능 평가에 관한 것이다.
이하, 본 발명을 상세하게 설명한다.
항- TM4SF5 인간화된 항체 및 그의 항원 결합 단편
본 발명의 항체는 TM4SF5에 대하여 특이적 결합능을 갖는다.
본 명세서에서, TM4SF5을 언급하면서 사용되는 용어, “항체”는 TM4SF5에 대한 특이 항체로서, TM4SF5의 특정 에피토프에 대해 특이적으로 결합하며, 완전한 항체 형태뿐만 아니라 항체 분자의 항원 결합 단편(항체 단편)을 포함한다.
용어 "인간화"는 항체가 전체적으로 또는 부분적으로 비-인간 기원의 것, 예를 들어 관심있는 항원으로 마우스를 면역화시켜 수득된 뮤린 항체 또는 그러한 뮤린 항체에 기반한 키메라 항체인 경우, 특히 중쇄 및 경쇄의 프레임워크 영역 및 불변 도메인에 있는 특정 아미노산을 대체시켜 인간에서 면역 반응을 회피하거나 최소화할 수 있다는 사실을 지칭한다. 모든 항체는 논의되고 있는 항체의 "인간화(humanness)" 정도와 어느 정도 관련되는 인간 항-항체 반응을 유도할 가능성을 지니는 것으로 알려져 있다. 비록 면역원성, 그리고 이에 의해 특정 항체의 인간 항-항체 반응을 정밀하게 예측할 수는 없지만, 비-인간 항체는 인간 항체보다 더욱 면역원성인 경향이 있다. 외래 (일반적으로 설치류) 불변 영역이 인간 기원의 서열로 대체된 키메라 항체는 완전한 외래 기원의 항체보다 일반적으로 덜 면역원성인 것으로 나타났고, 치료용 항체에서의 추세는 인간화 또는 완전한 인간 항체를 향하고 있다. 키메라 항체 또는 비-인간 기원의 그 밖의 항체의 경우, 그 결과로서, 이들을 인간화시켜 인간 항-항체 반응의 위험성을 감소시키는 것이 바람직하다.
항체 서열을 인간화하는 많은 방법이 당 분야에 공지되어 있다; 참조: 예컨대, Almagro & Fransson (2008) Front Biosci. 13: 1619-1633에 의해 개관됨. 한 가지 일반적으로 사용되는 방법은, 예컨대 뮤린-유래된 키메라 항체의 경우 뮤린 가변 영역 유전자에 대한 인간 생식세포 유전자 대응부를 동정하고 뮤린 CDR 서열을 이러한 프레임워크로 그래프트하는 것을 포함하는 CDR 그래프팅이다. CDR 그래프팅은 케이뱃 CDR 정의에 기반할 수 있으나, 보다 최근의 간행물 (Magdelaine-Beuzelin et al. (2007) Crit Rev.Oncol Hematol. 64: 210-225)은 IMGT® 정의 (the international ImMunoGeneTics information system®, www.imgt.org)가 인간화의 결과를 향상시킬 수 있음을 제안하였다 (Lefranc et al. (2003), IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor variable domains and Ig superfamily V-like domains, Dev. Comp Immunol. 27, 55-77 참조). CDR 그래프팅이 CDR 그래프트된 비-인간 항체의 결합 특이성 및 친화성, 및 이에 따라 생물학적 활성을 감소시킬 수 있으므로, 복귀 돌연변이 (때로 "프레임워크 복구"로 지칭됨)를, 전형적으로 프레임워크 영역에서 CDR 그래프트된 항체의 선택된 위치에 도입시켜 부모 항체의 결합 특이성 및 친화성을 재확립시킬 수 있다. 가능한 복귀 돌연변이를 위한 위치의 확인은 문헌 및 항체 데이터베이스에서 이용가능한 정보를 이용하여 수행될 수 있다. 복귀 돌연변이의 후보인 아미노산 잔기는 전형적으로 항체 분자의 표면에 위치한 것들인 반면, 숨겨지거나 낮은 정도의 표면 노출을 지니는 잔기는 일반적으로 변경되지 않을 것이다. CDR 그래프팅 및 복귀 돌연변이에 대안적인 인간화 기법은 비-인간 기원의 표면 노출되지 않은 잔기를 유지하는 한편 표면 잔기를 인간 잔기로 변경시키는 리서피싱(resurfacing)이다.
특정 경우에, 표적 에피토프에 대한 결합 친화성을 향상시키기 위해 하나 이상의 CDR 아미노산 잔기를 변경시키는 것이 또한 바람직할 수 있다. 이것은 "친화성 성숙화"로 알려져 있고, 예를 들어 항체의 인간화가 감소된 결합 특이성 또는 친화성을 초래하고 복귀 돌연변이 단독에 의해 결합 특이성 또는 친화성을 충분히 향상시킬 수 없는 상황에서, 임의로 인간화와 함께 수행될 수 있다. 다양한 친화성 성숙화 방법, 예를 들어 문헌[Burks et al. (1997) PNAS USA, vol. 94, pp. 412-417]에 기재된 시험관내 스캐닝 포화 돌연변이발생 방법 및 문헌[Wu et al. (1998) PNAS USA, vol. 95, pp. 6037-6042]의 단계식 시험관내 친화성 성숙화 방법이 당 분야에 공지되어 있다.
완전한 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2개의 전체 길이의 중쇄를 가지는 구조이며 각각의 경쇄는 중쇄와 다이설파이드 결합으로 연결되어 있다. 중쇄 불변영역은 감마(γ), 뮤(μ), 알파(α), 델타(δ) 및 엡실론(ε) 타입을 가지고 서브클래스로 감마1(γ1), 감마2(γ2), 감마3(γ3), 감마4(γ4), 알파1(α1) 및 알파2(α2)를 가진다. 경쇄의 불변영역은 카파(κ) 및 람다(λ) 타입을 가진다.
항체 분자의 항원 결합 단편 또는 항체 단편이란 항원 결합 기능을 보유하고 있는 단편을 의미하며, Fab, F(ab'), F(ab')2 및 Fv 등을 포함한다. 항체 단편 중 Fab는 경쇄 및 중쇄의 가변영역과 경쇄의 불변영역 및 중쇄의 첫 번째 불변영역(CH1)을 가지는 구조로 1개의 항원 결합 부위를 가진다. Fab'는 중쇄 CH1 도메인의 C-말단에 하나 이상의 시스테인 잔기를 포함하는 힌지 영역(hinge region)을 가진다는 점에서 Fab와 차이가 있다. F(ab')2 항체는 Fab'의 힌지 영역의 시스테인 잔기가 디설파이드 결합을 이루면서 생성된다. Fv는 중쇄 가변영역 및 경쇄 가변영역만을 가지고 있는 최소의 항체조각으로 Fv 단편을 생성하는 재조합 기술은 PCT 국제 공개특허출원 WO 88/10649, WO 88/106630, WO 88/07085, WO 88/07086 및 WO 88/09344에 개시되어 있다. 이중쇄 Fv(two-chain Fv)는 비공유 결합으로 중쇄 가변영역과 경쇄 가변영역이 연결되어 있고 단쇄 Fv(single-chain Fv)는 일반적으로 펩타이드 링커를 통하여 중쇄의 가변영역과 단쇄의 가변영역이 공유결합으로 연결되거나 또는 C-말단에서 바로 연결되어 있어서 이중쇄 Fv와 같이 다이머와 같은 구조를 이룰 수 있다. 이러한 항체 단편은 단백질 가수분해 효소를 이용해서 얻을 수 있고(예를 들어, 전체 항체를 파파인으로 제한 절단하면 Fab를 얻을 수 있고 펩신으로 절단하면 F(ab')2 단편을 얻을 수 있다), 유전자 재조합 기술을 통하여 제작할 수도 있다.
본 발명의 일구현예에 따르면, 본 발명에서 항체는 Fab 형태이거나 완전한 항체 형태이다. 또한, 중쇄 불변영역은 감마(γ), 뮤(μ), 알파(α), 델타(δ) 또는 엡실론(ε) 중의 어느 한 이소타입으로부터 선택될 수 있다. 하나의 특정예에서 불변영역은 감마1(IgG1), 감마2(IgG2), 감마 3(IgG3) 또는 감마 4(IgG4)이고, 다른 특정예에서 불변영역은 IgG2a 아이소타입이다. 경쇄 불변영역은 카파 또는 람다 형일 수 있다. 하나의 특정예에서 상기 경쇄 불변영역은 카파 형이다.
본 명세서에서 사용되는 용어, "중쇄"는 항원에 특이성을 부여하기 위한 충분한 가변영역 서열을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 가변영역 도메인 VH 및 3 개의 불변영역 도메인 CH1, CH2 및 CH3을 포함하는 전체길이 중쇄 및 이의 단편을 모두 의미한다. 또한, 본 명세서에서 사용되는 용어, "경쇄"는 항원에 특이성을 부여하기 위한 충분한 가변영역 서열을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 가변영역 도메인 VL 및 불변영역 도메인 CL을 포함하는 전체길이 경쇄 및 이의 단편을 모두 의미한다.
본 명세서에서, 용어 “CDR(complementarity determining region)”은 면역글로블린 중쇄 및 경쇄의 고가변 영역(hypervariable region)의 아미노산 서열을 의미한다(Kabat et al. Sequences of Proteins of Immunological Interest, 4th Ed., U.S. Department of Health and Human Services, National Institutes of Health (1987)). 중쇄(CDRH1, CDRH2 및 CDRH3) 및 경쇄(CDRL1, CDRL2 및 CDRL3)에는 각각 3개의 CDRs이 포함되어 있다. CDR은 항체가 항원 또는 에피토프에 결합하는 데 있어서 주요한 접촉 잔기를 제공한다.
본 발명의 항체 또는 항체 단편은, TM4SF5를 특이적으로 인식할 수 있는 범위 내에서 첨부한 서열목록에 기재된 아미노산 서열의 변이체를 포함할 수 있다. 예를 들면, 항체의 결합 친화도 및/또는 기타 생물학적 특성을 보다 더 개선시키기 위하여 항체의 아미노산 서열에 추가적인 변화를 줄 수 있다. 이러한 변형은, 예를 들어 항체의 아미노산 서열 잔기의 결실, 삽입 및/또는 치환을 포함한다. 이러한 아미노산 변이는 아미노산 곁사슬 치환체의 상대적 유사성, 예컨대, 소수성, 친수성, 전하, 크기 등에 기초하여 이루어진다. 아미노산 곁사슬 치환체의 크기, 모양 및 종류에 대한 분석에 의하여, 아르기닌, 라이신과 히스티딘은 모두 양전하를 띤 잔기이고; 알라닌, 글라이신과 세린은 유사한 크기를 갖으며; 페닐알라닌, 트립토판과 타이로신은 유사한 모양을 갖는다는 것을 알 수 있다. 따라서, 이러한 고려 사항에 기초하여, 아르기닌, 라이신과 히스티딘; 알라닌, 글라이신과 세린; 그리고 페닐알라닌, 트립토판과 타이로신은 생물학적으로 기능 균등물이라 할 수 있다.
변이를 도입하는 데 있어서, 아미노산의 소수성 인덱스(hydropathic index)가 고려될 수 있다. 각각의 아미노산은 소수성과 전하에 따라 소수성 인덱스가 부여되어 있다: 아이소루이신(+4.5); 발린(+4.2); 루이신(+3.8); 페닐알라닌(+2.8); 시스테인/시스타인(+2.5); 메티오닌(+1.9); 알라닌(+1.8); 글라이신(-0.4); 쓰레오닌(-0.7); 세린(-0.8); 트립토판(-0.9); 타이로신(-1.3); 프롤린(-1.6); 히스티딘 (-3.2); 글루타메이트(-3.5); 글루타민(-3.5); 아스파르테이트(-3.5); 아스파라긴 (-3.5); 라이신(-3.9); 및 아르기닌(-4.5).
단백질의 상호적인 생물학적 기능(interactive biological function)을 부여하는 데 있어서 소수성 아미노산 인덱스는 매우 중요하다. 유사한 소수성 인덱스를 가지는 아미노산으로 치환하여야 유사한 생물학적 활성을 보유할 수 있다는 것은 공지된 사실이다. 소수성 인덱스를 참조하여 변이를 도입시키는 경우, 일특정예에서는 ± 2 이내, 다른 특정예에서는 ± 1 이내, 또 다른 특정예에서는 ± 0.5 이내의 소수성 인덱스 차이를 나타내는 아미노산 사이에 치환을 한다.
한편, 유사한 친수성 값(hydrophilicity value)을 가지는 아미노산 사이의 치환이 균등한 생물학적 활성을 갖는 단백질을 초래한다는 것도 잘 알려져 있다. 미국 특허 제4,554,101호에 개시된 바와 같이, 다음의 친수성 값이 각각의 아미노산 잔기에 부여되어 있다: 아르기닌(+3.0); 라이신(+3.0); 아스팔테이트(+3.0± 1); 글루타메이트(+3.0±1); 세린(+0.3); 아스파라긴(+0.2); 글루타민(+0.2); 글라이신(0); 쓰레오닌(-0.4); 프롤린(-0.5±1); 알라닌(-0.5); 히스티딘(-0.5); 시스테인(-1.0); 메티오닌(-1.3); 발린(-1.5); 루이신(-1.8); 아이소루이신 (-1.8); 타이로신(-2.3); 페닐알라닌(-2.5); 트립토판(-3.4). 친수성 값을 참조하여 변이를 도입시키는 경우, 일특정예에서는 ± 2 이내, 다른 특정예에서는 ± 1 이내, 또 다른 특정예에서는 ± 0.5 이내의 친수성 값 차이를 나타내는 아미노산 사이에 치환을 한다.
분자의 활성을 전체적으로 변경시키지 않는 단백질에서의 아미노산 교환은 당해 분야에 공지되어 있다(H. Neurath, R.L.Hill, The Proteins, Academic Press, New York, 1979). 가장 통상적으로 일어나는 교환은 아미노산 잔기 Ala/Ser, Val/Ile, Asp/Glu, Thr/Ser, Ala/Gly, Ala/Thr, Ser/Asn, Ala/Val, Ser/Gly, Thr/Phe, Ala/Pro, Lys/Arg, Asp/Asn, Leu/Ile, Leu/Val, Ala/Glu 및 Asp/Gly 간의 교환이다.
상술한 생물학적 균등 활성을 갖는 변이를 고려한다면, 본 발명의 항체 또는 이를 코딩하는 핵산 분자는 서열목록에 기재된 서열과 실질적인 동일성(substantial identity)을 나타내는 서열도 포함하는 것으로 해석된다. 상기의 실질적인 동일성은, 상기한 본 발명의 서열과 임의의 다른 서열을 최대한 대응되도록 얼라인 하고, 당업계에서 통상적으로 이용되는 알고리즘을 이용하여 얼라인 된 서열을 분석한 경우에, 최소 61%의 상동성, 일특정예에 따르면 70%의 상동성, 다른 특정예에 따르면 80%의 상동성, 또 다른 특정예에 따르면 90%의 상동성을 나타내는 서열을 의미한다. 서열비교를 위한 얼라인먼트 방법은 당업계에 공지되어 있다. 얼라인먼트에 대한 다양한 방법 및 알고리즘은 Smith and Waterman, Adv . Appl . Math. (1981) 2:482 Needleman and Wunsch, J. Mol . Bio. (1970) 48:443; Pearson and Lipman, Methods in Mol . Biol. (1988) 24: 307-31; Higgins and Sharp, Gene (1988) 73:237-44; Higgins and Sharp, CABIOS (1989) 5:151-3; Corpet et al. Nuc. Acids Res. (1988) 16:10881-90; Huang et al. Comp. Appl . BioSci. (1992) 8:155-65 및 Pearson et al. Meth . Mol . Biol. (1994) 24:307-31에 개시되어 있다. NCBI Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)(Altschul et al. J. Mol . Biol. (1990) 215:403-10)은 NBCI 등에서 접근 가능하며, 인터넷 상에서 blastp, blasm, blastx, tblastn 및 tblastx와 같은 서열 분석 프로그램과 연동되어 이용할 수 있다. BLSAT는 www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/에서 접속 가능하다. 이 프로그램을 이용한 서열 상동성 비교 방법은 www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/blast_help.html에서 확인할 수 있다.
본 발명의 일구현예에 따르면, 본 발명의 항체는 서열목록 제15서열 또는 제16서열의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 가변영역을 포함한다.
본 발명의 일구현예에 따르면, 본 발명의 항체는 서열목록 제17서열 또는 제18서열의 아미노산 서열을 갖는 경쇄 가변영역을 포함한다.
본 발명의 항체는 단일클론 항체, 다특이적 항체, 인간 항체, 인간화 항체, 키메라 항체, 단쇄 Fvs(scFV), 단쇄항체, Fab 단편, F(ab')단편, 다이설파이드-결합 Fvs(sdFV) 및 항-이디오타입(항-Id) 항체, 그리고 상기 항체들의 에피토프-결합 단편 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명에 따르면, 본 발명의 항체는 다양한 형태의 항체로 제조될 수 있다. 예를 들어, 하기의 실시예에 기재된 바와 같이, 본 발명의 항체는 Fab 항체로 제조될 수 있고, 또한 Fab 항체에 얻은 경쇄 및 중쇄 가변영역을 이용하여 사람 유래의 불변영역과 재조합함으로써 완전한(whole) 형태의 항체를 제공할 수도 있다.
본 발명의 일구현예에 따르면, 본 발명의 항체는 단일클론 항체이다. 용어 “단일클론 항체”는, 실질적으로 동일한 항체 집단에서 수득한 단일 분자 조성의 항체분자를 의미하며, 단일클론 항체는 특정 에피토프에 대해 단일 결합 특이성 및 친화도를 나타낸다.
본 발명의 항체는 종양특이항원으로 알려진 TM4SF5 단백질에 결합하여 이의 활성을 감소/억제/제거시킴으로써 암을 치료할 수 있다.
핵산 분자 및 재조합 벡터
본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상기 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 중쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자를 제공한다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상기 TM4SF5에 대한 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 경쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자를 제공한다.
본 명세서에서 사용되는 용어, "핵산 분자"는 DNA(gDNA 및 cDNA) 그리고 RNA 분자를 포괄적으로 포함하는 의미를 갖으며, 핵산 분자에서 기본 구성단위인 뉴클레오타이드는 자연의 뉴클레오타이드뿐만 아니라, 당 또는 염기 부위가 변형된 유사체(analogue)도 포함한다(Scheit, Nucleotide Analogs, John Wiley, New York(1980); Uhlman 및 Peyman, Chemical Reviews, (1990) 90:543-584). 본 발명의 중쇄 및 경쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자의 서열은 변형될 수 있다. 상기 변형은 뉴클레오타이드의 추가, 결실, 또는 비보존적 치환 또는 보존적 치환을 포함한다.
본 발명의 일구현예에 따르면, 상기 중쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자는 서열목록 제19서열 또는 제20서열의 뉴클레오타이드를 포함하며, 상기 경쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자는 서열목록 제21서열 또는 제22서열의 뉴클레이타이드를 포함한다.
본 발명의 핵산 분자는 상기한 뉴클레오타이드 서열에 대하여 실질적인 동일성을 나타내는 뉴클레오타이드 서열도 포함하는 것으로 해석된다. 상기의 실질적인 동일성은, 상기한 본 발명의 뉴클레오타이드 서열과 임의의 다른 서열을 최대한 대응되도록 얼라인하고, 당업계에서 통상적으로 이용되는 알고리즘을 이용하여 얼라인 된 서열을 분석한 경우에, 최소 80%의 상동성, 일 특정예에서는 최소 90%의 상동성, 다른 특정예에서는 최소 95%의 상동성을 나타내는 뉴클레오타이드 서열을 의미한다.
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 (a) 본 발명의 중쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자; 및 (b) 본 발명의 경쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자를 포함하는 재조합 벡터를 제공한다.
본 명세서에서 사용되는 용어, "벡터"는 숙주세포에서 목적 유전자를 발현시키기 위한 수단으로 플라스미드 벡터; 코즈미드 벡터; 그리고 박테리오파아지 벡터, 아데노바이러스 벡터, 레트로바이러스 벡터 및 아데노-연관 바이러스 벡터 같은 바이러스 벡터 등을 포함한다.
본 발명의 일구현예에 따르면, 본 발명의 벡터에서 경쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자 및 중쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자는 프로모터와 작동적으로 결합(operatively linked)되어 있다.
본 명세서에서 사용되는 용어, "작동적으로 결합된"은 핵산 발현조절서열(예: 프로모터, 시그널 서열, 또는 전사조절인자 결합 위치의 어레이)과 다른 핵산 서열사이의 기능적인 결합을 의미하며, 이에 의해 상기 조절서열은 상기 다른 핵산 서열의 전사 및/또는 해독을 조절하게 된다.
본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 재조합 벡터는 (a) 서열목록 제25서열의 중쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자; 및 (b) 서열목록 제26서열의 경쇄 가변영역을 코딩하는 핵산 분자를 포함한다.
본 발명의 재조합 벡터 시스템은 당업계에 공지된 다양한 방법을 통해 구축될 수 있으며, 이에 대한 구체적인 방법은 Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press(2001)에 개시되어 있으며, 이 문헌은 본 명세서에 참조로서 삽입된다.
본 발명의 벡터는 전형적으로 클로닝을 위한 벡터 또는 발현을 위한 벡터로서 구축될 수 있다. 또한, 본 발명의 벡터는 원핵 세포 또는 진핵 세포를 숙주로 하여 구축될 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 벡터가 발현 벡터이고, 원핵 세포를 숙주로 하는 경우에는, 전사를 진행시킬 수 있는 강력한 프로모터(예컨대, tac 프로모터, lac 프로모터, lacUV5 프로모터, lpp 프로모터, pLλ프로모터, pRλ프로모터, rac5 프로모터, amp 프로모터, recA 프로모터, SP6 프로모터, trp 프로모터 및 T7 프로모터 등), 해독의 개시를 위한 라이보좀 결합 자리 및 전사/해독 종결 서열을 포함하는 것이 일반적이다. 숙주세포로서 E. coli(예컨대, HB101, BL21, DH5α 등)가 이용되는 경우, E. coli 트립토판 생합성 경로의 프로모터 및 오퍼레이터 부위(Yanofsky, C. J. Bacteriol. 158:1018-1024(1984)) 그리고 파아지 λ의 좌향 프로모터(pLλ프로모터, Herskowitz, I. and Hagen, D. Ann. Rev. Genet. 14:399-445(1980))가 조절부위로서 이용될 수 있다. 숙주세포로서 바실러스 균이 이용되는 경우, 바실러스 츄린겐시스의 독소단백질 유전자의 프로모터(Appl. Environ. Microbiol. 64:3932-3938(1998); Mol . Gen. Genet. 250:734-741(1996)) 또는 바실러스균에서 발현 가능한 어떠한 프로모터라도 조절부위로 이용될 수 있다.
한편, 본 발명의 재조합 벡터는 당업계에서 종종 사용되는 플라스미드(예: pCL, pSC101, pGV1106, pACYC177, ColE1, pKT230, pME290, pBR322, pUC8/9, pUC6, pBD9, pHC79, pIJ61, pLAFR1, pHV14, pGEX 시리즈, pET 시리즈 및 pUC19 등), 파지(예: λgt4·λB, λ-Charon, λΔz1 및 M13 등) 또는 바이러스(예: SV40 등)를 조작하여 제작될 수 있다.
한편, 본 발명의 벡터가 발현 벡터이고, 진핵 세포를 숙주로 하는 경우에는, 포유동물 세포의 지놈으로부터 유래된 프로모터(예: 메탈로티오닌 프로모터, β-액틴 프로모터, 사람 헤로글로빈 프로모터 및 사람 근육 크레아틴 프로모터) 또는 포유동물 바이러스로부터 유래된 프로모터(예: 아데노바이러스 후기 프로모터, 백시니아 바이러스 7.5K 프로모터, SV40 프로모터, 사이토메갈로바이러스(CMV) 프로모터, HSV의 tk 프로모터, 마우스 유방 종양 바이러스(MMTV) 프로모터, HIV의 LTR 프로모터, 몰로니 바이러스의 프로모터 엡스타인바 바이러스(EBV)의 프로모터 및 로우스 사코마 바이러스(RSV)의 프로모터)가 이용될 수 있으며, 전사 종결 서열로서 폴리아데닐화 서열을 일반적으로 갖는다.
본 발명의 재조합 벡터는 그로부터 발현되는 항체의 정제를 용이하게 하기 위하여 다른 서열과 융합될 수도 있다. 융합되는 서열은, 예컨대 글루타티온 S-트랜스퍼라제(Pharmacia, USA); 말토스 결합 단백질(NEB, USA); FLAG(IBI, USA); 6x His(hexahistidine; Quiagen, USA), Pre-S1, c-Myc와 같은 태그 서열; OmpA, PelB와 같은 선도서열 등이 있다. 또한, 본 발명의 벡터에 의해 발현되는 단백질이 항체이기 때문에 정제를 위한 추가적인 서열 없이도, 발현된 항체는 단백질 A 컬럼 등을 통하여 용이하게 정제할 수 있다.
한편, 본 발명의 재조합 벡터는 선택표지로서 당업계에서 통상적으로 이용되는 항생제 내성 유전자를 포함하며, 예를 들어 암피실린, 겐타마이신, 카베니실린, 클로람페니콜, 스트렙토마이신, 카나마이신, 게네티신, 네오마이신 및 테트라사이클린에 대한 내성 유전자가 있다.
본 발명의 항체를 발현하는 벡터는, 경쇄와 중쇄가 하나의 벡터에서 동시에 발현되는 벡터 시스템이거나 또는 경쇄와 중쇄를 각각 별도의 벡터에서 발현시키는 시스템 모두 가능하다. 후자의 경우, 두 벡터는 동시 형질전환(co-transfomation) 및 표적 형질전환(targeted transformation)을 통하여 숙주세포로 도입된다. 동시 형질전환은 경쇄 및 중쇄를 코딩하는 각각의 벡터 DNA를 동시에 숙주세포로 도입한 뒤 경쇄와 중쇄를 모두 발현하는 세포를 선별하는 방법이다. 표적 형질전환은 경쇄(또는 중쇄)를 포함하는 벡터로 형질전환 된 세포를 선별하고 경쇄를 발현하는 선별된 세포를 중쇄(또는 경쇄)를 포함하는 벡터로 다시 형질전환 하여 경쇄 및 중쇄 모두를 발현하는 세포를 최종적으로 선별하는 방법이다. 하기의 실시예에서는, 경쇄(VL 및 CL)와 중쇄(VH 및 CH1)가 하나의 벡터에서 동시에 발현되는 벡터 시스템을 이용하여 항체를 제조하였다.
형질전환체
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 본 발명의 재조합 벡터로 형질전환 된 숙주세포를 제공한다.
본 발명의 벡터를 안정되면서 연속적으로 클로닝 및 발현시킬 수 있는 숙주 세포는 당업계에 공지되어 어떠한 숙주세포도 이용할 수 있으며, 예컨대, 에스케리치아 콜라이(Escherichia coli), 바실러스 서브틸리스 및 바실러스 츄린겐시스와 같은 바실러스 속 균주, 스트렙토마이세스(Streptomyces), 슈도모나스(Pseudomonas)(예를 들면, 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida)), 프로테우스 미라빌리스(Proteus mirabilis) 또는 스타필로코쿠스(Staphylococcus)(예를 들면, 스타필로코쿠스 카르노수스(Staphylocus carnosus))와 같은 원핵 숙주세포를 포함하나, 이로 제한되는 것은 아니다.
상기 벡터의 적합한 진핵세포 숙주세포는 아스페르길러스 속(Aspergillus species)과 같은 진균, 피치아 파스토리스(Pichia pastoris), 사카로마이세스 세르비시아(Saccharomyces cerevisiae), 쉬조사카로마세스(Schizosaccharomyces) 및 뉴로스포라 크라사(Neurospora crassa)와 같은 효모, 그 밖의 하등 진핵세포, 곤충-유래 세포와 같은 고등 진핵생물의 세포, 그리고 식물 또는 포유동물로부터 유래한 세포를 이용할 수 있다.
본 명세서에서, 숙주세포로의 "형질전환" 및/또는 "형질감염"은 핵산을 유기체, 세포, 조직 또는 기관에 도입하는 어떤 방법도 포함되며 당 분야에서 공지된 바와 같이 숙주 세포에 따라 적합한 표준 기술을 선택하여 수행할 수 있다. 이런 방법에는 전기충격유전자전달법(electroporation), 원형질 융합, 인산칼슘(CaPO4) 침전, 염화칼슘(CaCl2) 침전, 실리콘 카바이드 섬유 이용한 교반, 아그로 박테리아 매개된 형질전환, PEG, 덱스트란 설페이트, 리포펙타민 및 건조/억제 매개된 형질전환 방법 등이 포함되나, 이로 제한되지 않는다.
항- TM4SF5 항체 변이체 또는 그의 항원 결합 단편의 제조방법
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 (a) 본 발명의 재조합 벡터로 형질전환 된 숙주세포를 배양하는 단계; 및 (b) 상기 숙주세포에서 항-TM4SF5 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 발현시키는 단계를 포함하는 항-TM4SF5 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 제조방법을 제공한다.
상기 항체 제조에서 형질전환 된 숙주세포의 배양은 당업계에 알려진 적당한 배지와 배양조건에 따라 이루어질 수 있다. 이러한 배양과정은 당업자라면 선택되는 균주에 따라 용이하게 조정하여 사용할 수 있다. 이러한 다양한 배양 방법은 다양한 문헌(예를 들면, James M. Lee, Biochemical Engineering, Prentice-Hall International Editions, 138-176)에 개시되어 있다. 세포 배양은, 세포의 성장방식에 따라 현탁배양과 부착배양, 배양방법에 따라 회분식, 유가식 및 연속배양식의 방법으로 구분된다. 배양에 사용되는 배지는 특정한 균주의 요구조건을 적절하게 만족시켜야 하다.
동물세포 배양은 상기 배지는 다양한 탄소원, 질소원 및 미량원소 성분을 포함한다. 사용될 수 있는 탄소원의 예는, 포도당, 자당, 유당, 과당, 말토오스, 전분 및 셀룰로오스와 같은 탄수화물, 대두유, 해바라기유, 피마자유 및 코코넛유와 같은 지방, 팔미트산, 스테아린산 및 리놀레산과 같은 지방산, 글라이세롤 및 에탄올과 같은 알코올, 그리고 아세트산과 같은 유기산을 포함한다. 이들 탄소원은 단독 또는 조합되어 사용될 수 있다. 사용될 수 있는 질소원의 예는, 펩톤, 효모 추출물, 육즙, 맥아 추출물, 옥수수 침지액(CSL) 및 대두밀과 같은 유기 질소원 및 요소, 황산암모늄, 염화암모늄, 인산암모늄, 탄산암모늄 및 질산암모늄과 같은 무기 질소원을 포함한다. 이들 질소원은 단독 또는 조합되어 사용될 수 있다. 상기 배지에는 인원으로서, 인산이수소칼륨, 인산수소이칼륨 및 대응되는 소듐-함유 염이 포함될 수 있다. 또한, 황산마그네슘 또는 황산철과 같은 금속염을 포함할 수 있다. 그 외에, 아미노산, 비타민, 및 적절한 전구체 등이 포함될 수 있다.
배양 중에 수산화암모늄, 수산화칼륨, 암모니아, 인산 및 황산과 같은 화합물을 배양물에 적절한 방식으로 첨가하여, 배양물의 pH를 조정할 수 있다. 또한, 배양 중에는 지방산 폴리글리콜 에스테르와 같은 소포제를 사용하여 기포 생성을 억제할 수 있다. 또한, 배양물의 호기상태를 유지하기 위하여, 배양물 내로 산소 또는 산소-함유 기체(예, 공기)를 주입한다. 배양물의 온도는 보통 20℃ 내지 45℃, 바람직하게는 25℃ 내지 40℃이다.
형질전환된 숙주세포를 배양하여 수득한 항체는 정제하지 않은 상태로 사용될 수 있으며 추가로 다양한 통상의 방법, 예를 들면 투석, 염 침전 및 크로마토그래피 등을 이용하여 고순도로 정제하여 사용될 수 있다. 그 중에서 크로마토그래피를 이용하는 방법이 가장 많이 사용되며, 컬럼의 종류와 순서는 항체의 특성, 배양방법 등에 따라 이온교환 크로마토그래피, 크기배제 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피 등에서 선택할 수 있다.
암의 예방 또는 치료용 약제학적 조성물
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 (a) 본 발명의 TM4SF5에 대한 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 약제학적 유효량; 및 (b) 약제학적으로 허용되는 담체를 포함하는 암의 예방 또는 치료용 약제학적 조성물을 제공한다.
상기 항체는 TM4SF5에 높은 친화도로 결합하여 TM4SF5를 발현하는 암의 성장, 침윤 및 전이를 억제할 수 있으므로 항체 단독 또는 통상의 약제학적으로 허용되는 담체와 함께 암의 예방 및 치료에 사용가능하다.
본 명세서에서 사용되는 용어, "예방"은 본 발명의 조성물의 투여로 암을 억제시키거나 진행을 지연시키는 모든 행위를 의미하며, "치료"는 암의 발전의 억제, 암의 경감 또는 암의 제거를 의미한다.
본 발명의 일구현예에 따르면, 본 발명의 조성물에 적용되는 질환인 암은 TM4SF5를 발현하는 암이고, 이러한 암의 예로는 간암, 대장암, 췌장암, 폐암, 위암, 직장암, 연부조직육종(soft-tissue sarcoma), 결장암, 십이지장 유두부 상피암(carcinoma of the papilla vateri), 비내분비 폐종양(nonendocrine lung tumor) 및 기관지 유암종(bronchial carcinoid tumor) 등을 들 수 있다.
본 발명의 약제학적 조성물에 포함되는 약제학적으로 허용되는 담체는 제제시에 통상적으로 이용되는 것으로서, 락토스, 덱스트로스, 수크로스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산 칼슘, 알기네이트, 젤라틴, 규산 칼슘, 미세결정성 셀룰로스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 약제학적 조성물은 상기 성분들 이외에 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제, 보존제 등을 추가로 포함할 수 있다. 적합한 약제학적으로 허용되는 담체 및 제제는 Remington's Pharmaceutical Sciences (19th ed., 1995)에 상세히 기재되어 있다.
본 발명의 약제학적 조성물은 경구 또는 비경구로 투여할 수 있고, 비경구 투여인 경우에는 정맥내 주입, 피하 주입, 근육 주입, 복강 주입, 내피 투여, 국소 투여, 비내 투여, 폐내 투여 및 직장내 투여 등으로 투여할 수 있다. 경구 투여시, 단백질 또는 펩타이드는 소화가 되기 때문에 경구용 조성물은 활성 약제를 코팅하거나 위에서의 분해로부터 보호되도록 제형화 되어야 한다. 또한 약제학적 조성물은 활성 물질이 표적 세포로 이동할 수 있는 임의의 장치에 의해 투여될 수 있다.
본 발명의 약제학적 조성물의 적합한 투여량은 제제화 방법, 투여 방식, 환자의 연령, 체중, 성, 병적 상태, 음식, 투여 시간, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하며, 보통으로 숙련된 의사는 소망하는 치료 또는 예방에 효과적인 투여량을 용이하게 결정 및 처방할 수 있다. 본 발명의 일구현예에 따르면, 본 발명의 약제학적 조성물의 1일 투여량은 0.0001-100 ㎎/㎏이다. 본 명세서에서 용어, "약제학적 유효량"은 암을 예방 또는 치료하는 데 충분한 양을 의미한다.
본 발명의 약제학적 조성물은 당해 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 약제학적으로 허용되는 담체 및/또는 부형제를 이용하여 제제화 함으로써 단위 용량 형태로 제조되거나 또는 다용량 용기 내에 내입시켜 제조될 수 있다. 이때 제형은 오일 또는 수성 매질중의 용액, 현탁액 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 산제, 좌제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캅셀제 형태일 수도 있으며, 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수 있다.
본 발명의 조성물은 개별 치료제로 투여하거나 다른 치료제와 병용하여 투여될 수 있고 종래의 치료제와는 순차적 또는 동시에 투여될 수 있다.
항체는 항체-치료제 결합체 형태로 생체내로 투입하여 암의 치료에 이용할 수 있다. 치료제는 화학치료제, 방사성핵종, 면역치료제, 사이토킨, 케모킨, 독소, 생물작용제 및 효소 저해물질 등을 포함한다. 본 발명의 항체 또는 그의 단편과 커플링 시키기기에 바람직한 기능성 분자는 화학물질, 사이토킨 또는 케모킨이다. 상기 화학물질은 항암제이고, 예를 들면 아시바이신, 아클라루비신, 아코다졸, 아크로나이신, 아도젤레신, 알라노신, 알데스루킨, 알로푸리놀 소듐, 알트레타민, 아미노글루테티미드, 아모나파이드, 암플리겐, 암사크린, 안드로겐스, 안구이딘, 아피디콜린 글리시네이트, 아사레이, 아스파라기나아제, 5-아자시티딘, 아자티오프린, 바실러스 칼메테-구에린(BCG), 베이커스 안티폴, 베타-2-디옥시티오구아노신, 비스안트렌 HCl, 블레오마이신 설페이트, 불서판, 부티오닌 설폭시민, BWA773U82, BW 502U83/HCl, BW 7U85 메실레이트, 세라세미드, 카르베티머, 카르보플라틴, 카르무스틴, 클로람부실, 클로로퀴녹살린-설포나미드, 클로로조토신, 크로모마이신 A3, 시스플라틴, 클라드리빈, 코르티코스테로이드, 코리너박테리움 파르붐, CPT-11, 크리스나톨, 사이클로사이티딘, 사이클로포스파미드, 사이타라빈, 사이템베나, 다비스 말리에이트, 데카르바진, 닥티노마이신, 다우노루바이신 HCl, 디아자유리딘, 덱스라족산, 디언하이드로 갈락티톨, 디아지쿠온, 디브로모둘시톨, 디데민 B, 디에틸디티오카르바메이트, 디클라이코알데하이드, 다이하이드로-5-아자사이틴, 독소루비신, 에치노마이신, 데다트렉세이트, 에델포신, 에플롤니틴, 엘리옷스 용액, 엘사미트루신, 에피루비신, 에소루비신, 에스트라머스틴 포스페이트, 에스트로겐, 에타니다졸, 에티오포스, 에토포사이드, 파드라졸, 파자라빈, 펜레티나이드, 필그라스팀, 피나스테라이드, 플라본 아세트산, 플록스유리딘, 플루다라빈 포스페이트, 5'-플루오로우라실, Fluosol™, 플루타미드, 갈륨 나이트레이트, 겜사이타빈, 고세레린 아세테이트, 헤프설팜, 헥사메틸렌 비스아세트아미드, 호모하링토닌, 하이드라진 설페이트, 4-하이드록시안드로스테네디온, 하이드로지우레아, 이다루비신 HCl, 이포스파미드, 4-이포메아놀, 이프로플라틴, 이소트레티노인, 류코보린 칼슘, 류프로라이드 아세테이트, 레바미솔, 리포좀 다우노루비신, 리포좀 포집 독소루비신, 로머스틴, 로니다민, 마이탄신, 메클로레타민 하이드로클로라이드, 멜팔란, 메노가릴, 메르바론, 6-머캅토푸린, 메스나, 바실러스 칼레테-구에린의 메탄올 추출물, 메토트렉세이트, N-메틸포름아미드, 미페프리스톤, 미토구아존, 마이토마이신-C, 미토탄, 미톡산트론 하이드로클로라이드, 모노사이트/마크로파아지 콜로니-자극 인자, 나빌론, 나폭시딘, 네오카르지노스타틴, 옥트레오타이드 아세테이트, 오르마플라틴, 옥살리플라틴,파크리탁셀, 팔라, 펜토스타틴, 피페라진디온, 피포브로만, 피라루비신, 피리트렉심, 피록산트론 하이드로클로라이드, PIXY-321, 플리카마이신, 포르피머 소듐, 프레드니무스틴, 프로카르바진, 프로게스틴스, 파이라조푸린, 라족산, 사르그라모스팀, 세무스틴, 스피로게르마늄, 스피로무스틴, 스트렙토나이그린, 스트렙토조신, 술로페너르, 수라민 소듐, 타목시펜, 탁소레레, 테가푸르, 테니포사이드, 테레프탈아미딘, 테록시론, 티오구아닌, 티오테파, 티미딘 인젝션, 티아조푸린, 토포테칸, 토레미펜, 트레티노인, 트리플루오페라진 하이드로클로라이드, 트리플루리딘, 트리메트렉세이트, TNF(tumor necrosis factor), 우라실 머스타드, 빈블라스틴 설페이트, 빈크리스틴 설페이트, 빈데신, 비노렐빈, 빈졸리딘, Yoshi 864, 조루비신, 사이토신아라비노시드, 에토포시드, 멜파란, 탁소텔, 탁솔 및 이들의 혼합물이나, 이에 한정되지 않는다.
암 진단용 조성물
본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 상기 본 발명의 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 포함하는 암 진단용 키트를 제공한다.
본 발명의 항체는, 생물학적 시료에 적용되어 암의 발병 여부를 진단할 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어, “생물학적 시료”란 조직, 세포, 전혈, 혈청, 혈장, 조직 부검 시료(뇌, 피부, 림프절, 척수 등), 세포 배양 상등액, 파열된 진핵세포 및 세균 발현계 등을 들 수 있지만, 이에 제한되지는 않는다. 이들 생물학적 시료를 조작하거나 조작하지 않은 상태로 본 발명의 항체와 반응시켜서 암의 발병여부를 확인할 수 있다.
상기한 항원-항체 복합체의 형성은 비색법(colormetric method), 전기화학법(electrochemical method), 형광법(fluorimetric method), 발광법(luminometry), 입자계수법(particle counting method), 육안측정법(visual assessment) 또는 섬광계수법(scintillation counting method)으로 검출할 수 있다. 본 명세서상의 “검출”은 항원-항체 복합체를 검출하기 위한 것으로 여러 가지 표지체를 사용하여 실시할 수 있다. 표지체의 구체적인 예로는 효소, 형광물, 리간드, 발광물, 미소입자 또는 방사성 동위원소를 포함한다.
검출 표지체로서 사용되는 효소로는 아세틸콜린에스테라제, 알칼라인 포스파타제, β-D-갈락토시다제, 호스래디쉬 퍼옥시다제 및 β-라타마제 등을 포함하며, 형광물로는 플루오레세인, Eu3 +, Eu3 + 킬레이트 또는 크립테이트 등을 포함하며, 리간드로는 바이오틴 유도체 등을 포함하며, 발광물로는 아크리디늄 에스테르 및 이소루미놀 유도체 등을 포함하며, 미소입자로는 콜로이드 금 및 착색된 라텍스 등을 포함하며, 방사성 동위원소로는 57Co, 3H, 125I 및 125I-볼톤(Bonton) 헌터(Hunter) 시약 등을 포함한다.
본 발명의 일구현예에 따르면, 항원-항체 복합체를 효소면역흡착법(ELISA) 을 이용하여 검출할 수 있다. 효소면역흡착법에는 고체 지지체에 부착된 항원을 인지하는 표지된 항체를 이용하는 직접적 ELISA, 고체 지지체에 부착된 항원을 인지하는 항체의 복합체에서 포획 항체를 인지하는 표지된 이차항체를 이용하는 간접적 ELISA, 고체 지지체에 부착된 항체와 항원의 복합체에서 항원을 인지하는 표지된 또 다른 항체를 이용하는 직접적 샌드위치 ELISA, 고체 지지체에 부착된 항체와 항원의 복합체에서 항원을 인지하는 또 다른 항체와 반응시킨 후 이 항체를 인지하는 표지된 2차 항체를 이용하는 간접적 샌드위치 ELISA 등 다양한 ELISA 방법을 포함한다. 본 발명의 항체는 검출 표지를 가질 수 있으며, 검출표지를 가지지 않을 경우는 본 발명의 항체를 포획할 수 있고 검출 표지를 가지는 또 다른 항체를 처리하여 확인할 수 있다.
본 발명을 통하여 알 수 있는 바와 같이, 사이클릭 펩타이드 백신의 면역화 및 TM4SF5-특이적인 항체로 주사는 마우스 모델에서 대장암에 대한 항-전이 효과를 가지고, 또한 그 인간화된 항체는 환자의 치료를 위한 적용을 위한 시작 플랫폼으로 사용될 수 있다.
도 1은 TM4SF5 사이클릭 펩타이드 백신으로 면역화된 마우스에서 항체의 유도. (A) TM4SF5 타겟 부위의 서열. (B) 본 발명에 사용된 펩타이드의 서열. hTM4SF5EC2-C 및 mTM4SF5EC2-C은 다이설파이드 결합으로 연결된 hTM4SF5EC2 및 mTM4SF5EC2의 사이클릭 펩타이드를 나타냄. (C) BALB/c 마우스를 10일 간격으로 3회 PBS 또는 hTM4SF5EC2-C 펩타이드 및 Lipoplex(O) 복합체를 주사(n=5/ 그룹). 혈청 내 항체의 타이터 및 반응성은 기재된 펩타이드를 사용하여 ELISA로 측정. (D) hTM4SF5EC2-C 펩타이드에 대해 반응하는 항체들의 이소타입을 이소타이핑을 위하여 ELISA로 규명함.
도 2는 이형이식 대장암 모델에서 TM4SF5 사이클릭 펩타이드 백신으로 면역화에 의한 폐 전이의 저해. BALB/c 마우스에 10일 간격으로 3회 PBS, Lipoplex(O), hTM4SF5EC2-C 펩타이드 및 DOPE:CHEMS 내 캡슐화된 CpG-DNA(Lipoplex(O)) 복합체를 주사((PBS 대조군 n=8, 대장암 세포 군n=15). 전이 모델은 처리된 BALB/c 마우스에 CT-26 세포를 이식하여 확립하고 마우스의 체중 및 생존률을 조사. (A) 실험 스케쥴. (B) 체중은 CT-26 세포 이식 후 20 일간 2일마다 측정. (C) CT-26 세포 이식 후 면역화된 마우스의 생존. (D) 52일에 조사된 폐의 거시적 모습. (E) 52일에 마우스 폐의 무게. *P<0.05. (F) 폐 조직의 조직학적 조사. 스케일 바, 100 μm.
도 3은 이형이식 대장암 모델에서 TM4SF5 사이클릭 펩타이드 백신으로 면역화에 의한 폐 결절 수의 감소: BALB/c 마우스를 10일 간격으로 3회 PBS 또는 hTM4SF5EC2-C 펩타이드 및 Lipoplex(O) 복합체를 주사(n=8/ 그룹). 전이 모델은 처리된 BALB/c 마우스에 CT-26 세포를 이식하여 확립하고 종양 성장을 46 또는 50일간 모니터. (A) 실험 스케쥴. (B) 46일 (CT-26 군) 및 50일 (PBS 대조군, Lipoplex(O)+hTM4SF5EC2-C 펩타이드/CT-26 군(n=4/각 군)에 조사된 폐의 거시적 모습 및 폐 중량. (C) 46일 (CT-26 군) 및 50일 (PBS 대조군, Lipoplex(O)+hTM4SF5EC2-C 펩타이드/CT-26 군(n=4/각 군)에 폐 결절의 수. **P<0.01.
도 4는 TM4SF5 사이클릭 펩타이드를 인지하는 anti-TM4SF5 단클론 항체를 생산하는 HAT 배지에서 하이브리도마 클론의 스크리닝. (A) 세 BALB/c 마우스를 10일 간격으로 4회 DOPE:CHEMS 복합체에 동시캡슐화된 hTM4SF5EC2-C 펩타이드 및 MB-ODN 4531(O)로 i.p.(복강에) 면역화하고, 그 혈청을 모아서 전체 IgG를 ELISA 키트를 사용하여 어세이. (B, C) hTM4SF5EC2-C 펩타이드 면역화된 마우스의 지라세포를 사용한 HAT 배지에서 세포-융합 실험의 초기 스크리닝으로부터 유래한 ELISA 결과들. (D) HEK 293F-EV (empty vector) 및 HEK 293F-TM4SF5 세포의 단백질들을 SDS-PAGE로 분리하여 하이브리도마 클론(B의 1H1 클론) 배양 상등액, anti-Myc 항체를 사용한 웨스턴 블럿으로 분석.
도 5는 TM4SF5 사이클릭 펩타이드를 인지하는 anti-TM4SF5 단클론 항체를 생산하는 HT 배지에서 하이브리도마 클론의 스크리닝.(A, B) 도 5 유래 한 하이브리도마 클론을 단클론 항체의 생산을 위해 선택하여 리미팅 희석 방법을 사용하여 서브클로닝을 함. (C) 사이클릭 펩타이드 hTM4SF5EC2-C 에 대한 하이브리도마 클론 배양 상등액을 ELISA를 사용하여 분석. (D) HEK 293F-EV (empty vector) 및 HEK 293F-TM4SF5 세포의 단백질들을 SDS-PAGE로 분리하여 하이브리도마 클론 배양 상등액을 사용한 웨스턴 블럿으로 분석.
도 6은 TM4SF5 사이클릭 펩타이드를 인지하는 마우스 anti-TM4SF5 단클론 항체의 정제 및 특성. (A) 도 5 유래 한 하이브리도마 클론(2A10 clone)을 i.p. 강에 주사하여 BALB/c 마우스에서 복수를 생산. Anti-TM4SF5 단클론 항체를 protein-A agarose 컬럼 크로마토그래피를 사용하여 정제하고 그 정제된 항체를 SDS-PAGE 및 Coomassie blue 염색으로 동정. (B) 적정 곡선을 정제된 단클론 항체를 사용하여 얻어서 아이소타입을 결정. (C) ELISA를 사용한 사이클릭 펩타이드 hTM4SF5EC2-C에 대한 단클론 항체 결합 친화도의 결정. (D) Reichert Analytical Instruments SPR 7500DC (Reichert)를 사용한 사이클릭 펩타이드 hTM4SF5EC2-C에 대한 단클론 항체 결합 친화도의 결정. 바이오틴화된 펩타이드를 streptavidin 칩에 고정화하고 항체의 양을 증가시킴. 결합 반응의 Kinetic 파라미터를 sensorgrams 하에서 나타냄. (E) HEK 293F-EV (empty vector) 및 HEK 293F-TM4SF5 세포의 단백질들을 SDS-PAGE로 분리하여 anti-TM4SF5 단클론 항체(mEC2-C), anti-Myc 항체 또는 anti-β-actin 항체를 사용한 웨스턴 블럿으로 분석. HEK 293F-EV 및 HEK 293F-TM4SF5 세포의 단백질을 mEC2-C로 면역침전하고 anti-Myc 항체를 사용한 웨스턴 블럿으로 분석. 이 결과들은 적어도 3회 독립적인 실험의 대표값.
도 7은 이종이식 마우스 모델에서 대장암 성장에 대한 anti-TM4SF5 단클론 항체의 치료 효과. 마우스 종양 모델을 HT-29 세포를 BALB/cAnNCri-nu/nu 마우스에 이식하여 확립. PBS 또는 anti-TM4SF5 단클론 항체를 종양 크기가 직경 5 mm에 도달할 때 마우스에 주사하고 그 종양 성장을 31일 동안 모니터함(각 n=6). (A) 실험 스케쥴. (B) 대장암 조직의 거시적 모습. (C) 종양 부피(width2 x length/2). (D) 종양 중량. (E) 체중.
도 8은 하이브리도마 세포 클론으로부터 분리된 중쇄 및 경쇄의 가변 영역의 cDNA 서열. (A) 중쇄 가변 도메인의 서열. (B) 경쇄 가변 도메인의 서열. 예측된 아미노산 서열을 cDNA 서열 하단에 표시.
도 9는 인간화 항체의 구축을 위한 서열 분석 및 본 발명의 인간화 항체인 hEC2-C-1, hEC2-C-2, 야생형 마우스 유래 항체인 mEC2-C, 인간화 항체 구축에 사용된 인간 VH3-Vk1 subtype 골격을 가지는 Herceptin 항체의 아미노산 서열을 가변중쇄와 가변경쇄로 나누어 일직선으로 정렬한 도이다. 대괄호 ([])는 각각의 CDR 구역을 나타내고, 밑줄은 베르니에 구역에 해당하는 아미노산을 나타내며, 별표(*)는 친화도의 유지를 위하여 마우스 mEC2-C 야생형 항체에서 유래한 아미노산으로 역치환한 부분을 나타낸다. 이 때, CDR 구역은 Kabat numbering을 따라 정의하였다.
도 10은 CDR 이식 후 구조 변화를 보기 위해 도 9에 나타낸 mEC2-C, hEC2-C-1, hEC2-C-2 항체의 가변 부위 (Fv)를 각각 컴퓨터 모델링하여 Pymol software 내에서 중첩시킨 결과를 정면에서 바라본 구조와 위에서 바라본 구조로 나타낸 도이다. 골격 부위 (FR)는 흑백으로, 각 항체의 CDR은 도면 내 표시된 색깔과 같은 색깔로 나타내었으며 중쇄의 각 CDR은 HCDR1/2/3로, 경쇄의 각 CDR은 LCDR1/2/3로 나타내었다.
도 11은 TM4SF5 사이클릭 펩타이드를 인지하는 인간화된 anti-TM4SF5 단클론 항체의 정제 및 특성. (A) 인간화된 Anti-TM4SF5 항체를 protein-A agarose 컬럼 크로마토그래피를 사용하여 정제하고 그 정제된 항체를 SDS-PAGE 및 Coomassie blue 염색으로 동정. (B) ELISA를 사용하여 사이클릭 펩타이드 hTM4SF5EC2-C에 대한 인간화된 항체 의 결합 친화도를 분석. (C) Reichert Analytical Instruments SPR 7500DC (Reichert)를 사용하여 사이클릭 펩타이드 hTM4SF5EC2-C에 대한 인간화 항체 결합 친화도를 분석. (D) HEK 293F-EV 및 HEK 293F-TM4SF5 세포의 단백질들을 SDS-PAGE로 분리하여 anti-TM4SF5 항체(hEC2-C-2) 또는 anti-β-actin 항체를 사용한 웨스턴 블럿으로 분석. HEK 293F-EV 및 HEK 293F-TM4SF5 세포의 단백질 파쇄액을 hEC2-C-2 로 면역침전하고 anti-Myc 항체를 사용한 웨스턴 블럿으로 분석.
도 12는 대장암 세포의 이동에 대한 인간화된 anti-TM4SF5 단클론 항체의 효과. (A) 이동 어세이. 스케일 바, 100 μm. (B) 상처 치유 어세이. 스케일 바, 300 μm. CT-26 및 HCT-116 세포의 이동 특성을 PBS, 정상 인간 IgG, 또는 hEC2-C-2 항체로 처리한 후 비교. 이 결과들은 적어도 3회 독립적인 실험의 대표값. *P<0.05, ***P<0.001.
도 13은 흡착(adhesion) 분자들의 발현에 대한 인간화된 anti-TM4SF5 항체의 효과. (A) CT-26 및 HCT-116 세포를 PBS, 정상 인간 IgG, 또는 hEC2-C-2 항체로 처리하고 E-cadherin 및 β-catenin의 발현을 anti-E-cadherin 및 anti-β-catenin 항체를 사용하여 공초점 현미경법으로 분석 스케일 바, 20 μm. (B) 웨스턴 블럿 분석. β-actin 발현 레벨을 로딩 대조군으로 사용. E-cadherin 및 β-catenin의 발현을 anti-E-cadherin 및 anti-β-catenin 항체를 사용하여 결정. 밴드 강도를 측정하고 정량적 변화를 그래프로 나타냄. 이 결과들은 적어도 3회 독립적인 실험의 대표값.
도 14는 이종이식 마우스 모델에서 HCC 종양 성장에 대한 주사된 인간화된 anti-TM4SF5 단클론 항체의 치료 효과. 마우스 종양 모델을 Huh-7 세포를 BALB/cAnNCri-nu/nu 마우스에 이식하여 확립. PBS 또는 인간화된 anti-TM4SF5 항체를 종양 크기가 직경 5 mm에 도달할 때 마우스에 주사하고 그 종양 성장을 44일 동안 모니터함(각 n=6). (A) 실험 스케쥴. (B) HCC 종양 조직의 거시적 모습. (C) 종양 부피(width2 x length/2). (D) 종양 중량. (E) 체중.
도 15는 이종이식 마우스 모델에서 대장암 성장에 대한 인간화된 anti-TM4SF5 단클론 항체의 치료 효과. 마우스 종양 모델을 HT-29 세포를 BALB/cAnNCri-nu/nu 마우스에 이식하여 확립. PBS 또는 인간화된 anti-TM4SF5 항체를 종양 크기가 직경 5 mm에 도달할 때 마우스에 주사하고 그 종양 성장을 28일 동안 모니터함(각 n=6). (A) 실험 스케쥴. (B) 대장암 조직의 거시적 모습. (C) 종양 부피(width2 x length/2). (D) 종양 중량. (E) 체중.
도 16은 동종이식 대장암 모델에서 인간화된 anti-TM4SF5 단클론 항체에 의한 폐 전이의 생존률. CT-26 세포를 BALB/c 마우스에 정맥내 이식하여 주사. PBS, 인간 IgG 또는 hEC2-C-2를 마우스에 정맥내 주사하고 종양 성장을 22일 동안 모니터함 (PBS 대조군 n=8, 암 세포 군 각 n=12). (A) 실험 스케쥴. (B) 체중은 2일 간격으로 20일 동안 측정. (C) CT-26 세포의 이식 후 인간화된 anti-TM4SF5 항체-주사된 마우스의 생존.
도 17은 동종 이식 대장암 모델에서 인간화된 anti-TM4SF5 단클론 항체에 의한 폐 전이의 저해. CT-26 세포를 BALB/c 마우스에 정맥내 이식하여 주사. PBS, 인간 IgG 또는 hEC2-C-2를 마우스에 정맥내 주사하고 종양 성장을 19일 후 모니터함 (PBS 대조군 n=8, 암 세포 군 각 n=12). (A) 실험 스케쥴. (B) 19일에 폐의 모양을 조사. (C) 19일에 마우스의 폐 중량. **P<0.01. (D) 폐 조직의 조직학적 조사. 스케일 바: 100X, 100 μm; 400X, 25 μm.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.
실시예 1:CpG -DNA 및 hTM4SF5EC2의 사이클릭 펩타이드의 합성
세 CpG 모티프를 가지는 20 베이스로 구성된 천연 CpG-DNA, MB-ODN 4531(O)(Kwon S, Kim D, Park BK, Cho S, Kim KD, Kim YE, Park CS, Ahn HJ, Seo JN, Choi KC, Kim DS, Lee Y, Kwon HJ. PLoS One. 2012;7(3):e331214)를 삼천리 제약으로 제공받음. MB-ODN 4531은 세 CpG 모티프를 가지는 20 베이스로 구성: AGCAGCGTTCGTGTCGGCCT(서열번호 23). 본 발명자들은 인간 TM4SF5의 세포외 도메인2를 미미킹한 사이클릭 펩타이드(hTM4SF5EC2-C, 도 1B)를 고안하여 펩트론으로부터 화학적으로 합성된 사이클릭 펩타이드 및 대조군 펩타이드들을 구입하였다.
실시예 2:TM4SF5 타겟팅 펩타이드 백신으로 사이클릭 펩타이드 epitope 및 CpG -DNA를 동시 캡슐화한 리포좀 복합체의 제조
리포좀 복합체는 DOPE:CHEMS (Lipoplex(O))와 동시 캡슐화된 TM4SF5 사이클릭 펩타이드 (hTM4SF5EC2-C) 및 CpG-DNA로 구성되고, Kwon S, Kim D, Park BK, Cho S, Kim KD, Kim YE, Park CS, Ahn HJ, Seo JN, Choi KC, Kim DS, Lee Y, Kwon HJ. PLoS One. 2012;7(3):e331214에 보고된 것과 같이 제조하였다.
실시예 3:동물
암컷 BALB/c 마우스 및 BALB/cAnNCri-nu/nu 마우스(4 주령)를 Nara Biotech, Inc로부터 구입하여 그 마우스를 무특이 병원 조건 하에서 20-25℃, 32-37% 습도에서 유지하였다. 모든 동물 실험 과정은 국립수의과학검역원의 실험동물 사용관리 가이드에 따랐고, 한림대의 동물실험 관리 위원회의 승인을 받고 수행하였다. 본 발명자들은 isoflurane 흡입하에서 마우스를 희생시켰고, 고통을 최소화하기 위한 모든 노력을 수행하였다.
실시예 4:항원 -특이적 Ig enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA)
각 투여 전 및 최종 투여 10일 후에 마우스를 희생시켜 혈청을 얻었다. 전체 IgG 타이터 및 양을 확인하기 위하여, 96-웰 면역플레이트(Nalgen Nunc International)를 5 ㎍/㎖ hTM4SF5EC2-C 사이클릭 펩타이드로 코팅하고, 1% BSA를 함유하는 0.05% PBST로 두 시간 동안 블락하였다. 블락킹 용액을 제거한 후, 배양 상청액 100 ㎕를 첨가하고 상온에서 두 시간 동안 인큐베이션 한 다음 PBST로 세척하고, HRP(horseradish peroxidase)-결합된 항-IgG 항체와 같은 검출항체와 함께 2시간 동안 인큐베이션 하였다. TMB 기질 용액으로 비색분석법을 개발하고, Spectra Max 250 마이크로플레이트 리더를 사용하여 450 nm에서 흡광도를 측정하였다.
IgG 아이소타입을 측정하기 위하여, 96-well 면역플레이트를 hTM4SF5EC2-C 펩타이드로 코팅하고, 혈청과 반응한 후 HRP-conjugated anti-mouse IgG (각 아이소타입) 항체(BD Biosciences)로 배양하였다.
실시예 5:대장암의 폐 전이 모델에서 항- 전이제로서 TM4SF5 펩타이드 백신의 평가
CpG-DNA를 포함하는 DOPE:CHEMS (Lipoplex(O))와 동시 캡슐화된 TM4SF5 사이클릭 펩타이드 (hTM4SF5EC2-C) 로 구성돤 리포좀 복합체를 BALB/c 마우스에 10일 간격으로 3회 면역화하였다. 대조군 마우스를 PBS 또는 Lipoplex(O)로 주사하였다. 전이성 암 동물 실험을 위하여, 마우스를 1 X 105 세포의 CT-26 마우스 대장암 세포주(PBS 대조군 n=8, 대장암 세포 군 n=15)를 30일째에 정맥내 주사하였다. 체중을 2일 간격으로 측정하였다. CT-26 세포 주사 후 22일째에, 마우스를 희생하고 폐 중량을 측정하였다.
실시예 6:폐 결절의 조사
BALB/c 마우스를 상기와 같이 면역화하고 CT-26 세포로 주사하였다. CT-26 세포 주사 후 20일째, 마우스를 희생하고, 기관에 20-gauge 케이터러(caterer)로 캐뉼러를 삽입하고 1 ml의 India ink (Parker, PBS로 1:16 희석)를 폐에 주사하였다. 폐를 추출하고 Fekete's 용액에 담궈서 탈색한 후 전이성 결절을 카운트하였다(Larive RM, Moriggi G, Nat Commun. 2014; 5:3881).
실시예 7:TM4SF5에 특이적인 마우스 단클론 항체의 생산
인간 TM4SF5 (hTM4SF5) 단백질의 hTM4SF5EC2-C 사이클릭 펩타이드 (131TACAYLLNRTLWDRCEAPPRVVPWNCT157)는 펩트론에서 자동화된 펩타이드 synthesizer (Peptron III-R24, Peptron)로 제조하였다.
암컷 BALB/c 마우스에 10일 간격으로 4차례 CpG-DNA를 포함하는 DOPE:CHEMS 복합체와 동시 캡슐화된 hTM4SF5EC2-C 사이클릭 펩타이드를 복강 내 투여하였다. 면역화된 비장으로부터 지라세포(Splenocytes)를 얻은 후, 표준 하이브리도마 기술(Yokoyama WM, et al. Curr Protoc Immunol Chapter 2, Unit 2.5(2006))에 따라 40% (w/v) 폴리에틸렌글리콜의 존재 하에서 HAT-sensitive SP2/0 마우스 골수종 세포와 융합하였다. 하이브리도마 세포의 배양 상청액을 hTM4SF5EC2-C 사이클릭 펩타이드에 대한 결합을 확인하기 위하여 ELISA로 테스트하고, 양성 하이브리도마 세포를 스크리닝 하였다. ELISA-양성 하이브리도마 세포군을 서브클로닝 한 다음, 복수를 생성시키기 위하여 BALB/c 마우스 복강에 주사하였다. 단백질 A 컬럼 크로마토그래피(Amersham Pharmacia Biotech)를 사용하여 anti-TM4SF5 단클론 항체(mEC2-C)를 복수액으로부터 정제하였다.
실시예 8:SPR (Surface plasmon resonance) 분석
hTM4SF5EC2-C 사이클릭 펩타이드에 결합하는 anti-hTM4SF5 단클론 항체(mEC2-C) 및 인간화된 anti-TM4SF5 항체(hEC2-C-2)의 친화도를 Reichert SPR 시스템을 사용하여 25℃에서 측정하였다. 스트렙토아비딘이 코팅된 센서 칩의 각 흐르는 세포 표면에서 비오틴화 펩타이드를 포획(capture)하였다. 비오틴을 음성 대조군으로 사용하였다. anti-hTM4SF5 단클론 항체(mEC2-C) 및 인간화된 anti-TM4SF5 항체를 30 ㎖/분의 유동속도로 주입하였다. 데이터는 Reichert SPR 평가 소프트웨어를 사용하여 평가하였다.
실시예 9:세포 배양
Huh7과 같은 인간 HCC 세포주, 및 HT-29, 및 HCT116과 같은 인간 대장암 세포주, 및 마우스 대장암 세포주 CT-26은 한국세포주은행에서 얻었다. CT-26 세포를 10% 소태아혈청(FBS; Hyclone), 2 mM 글루타민, 100 U/㎖ 페니실린 및 100 ㎍/㎖ 스트렙토마이신이 함유된 DMEM에서 관리하였다. 다른 세포주들은 10% FBS, 25 mM HEPES, 100 U/㎖ 페니실린 및 100 ㎍/㎖ 스트렙토마이신이 함유된 RPMI 1640 배지에서 관리하였다. 모든 세포들을 95% 공기 및 5% CO2에서 37℃의 온도로 배양하였다.
실시예 10:재조합 인간 TM4SF5 발현
인간 TM4SF5 cDNA를 Huh-7 mRNA로부터 RT-PCR를 하기 프라이머 세트를 사용하여 증폭하였다: hTM4SF5 5' primer, 5'-CTCGAGATGTGTACGGGAAAATGTGCC-3'; hTM4SF5 3' primer, 5'-AAGCTTTTGTGAGGTGTGTCCTGTTTTTT-3'. 그 cDNA 절편을 발현 벡터 pcDNA-3.1/Myc-His(-)B (Invitrogen)로 클로닝하였다. hTM4SF5를 발현하는 안정한 세포주의 생성을 위하여, HEK 293F 세포(1 X 106 세포/ml)를 2.5 μg/ml의 hTM4SF5/pcDNA 및 7.5 μg/ml의 Polyethylenimine (PEI, Polysciences)로 트랜스팩션시키고 그 트랜스팩션된 세포를 14일 동안 500 ㎍/ml G418 (Calbiochem)를 사용하여 수집하였다. Myc-tagged hTM4SF5의 발현을 anti-Myc-tag 항체를 사용한 Western blot 분석에 의하여 확인하였다.
실시예 11:Western blot 및 면역침전법 분석
anti-TM4SF5 단클론 항체 및 인간화된 anti-TM4SF5 항체의 특이성을 분석하기 위하여, TM4SF5-과발현 세포 파쇄액을 SDS-PAGE 상에서 분리하고 Western blot 및 면역침전 어세이를 Kwon S, Kim D, Rhee JW, Park JA, Kim DW, Kim DS, Lee Y, Kwon HJ. BMC Biol. 2010; 8:23에 기재된 것과 같이 수행하였다. E-cadherin 및 β-catenin의 발현을 인간화된 anti-TM4SF5 항체-처리된 세포에서 동정하기 위하여, 세포 파쇄액을 Kwon S, Choi KC, Kim YE, Ha YW, Kim D, Park BK, Wu G, Kim DS, Lee Y, Kwon HJ. Cancer Res. 2014; 74(14):3844-3856에 기재된 것과 같이 SDS-PAGE 및 웨스턴 블럿팅으로 분석하였다.
실시예 12:마우스 anti- TM4SF5 단클론 항체에 대한 대장암 마우스(이종이식) 모델
12마리의 BALB/cAnNCri-nu/nu 마우스의 등 오른쪽 측면에 50% 마트리젤(BD biosciences)을 함유하는 5 x 106 HT-29 세포를 피하주사 하였다. 종양 직경이 5 mm에 도달했을 때, 마우스를 PBS, 및 anti-TM4SF5 단클론 항체(mEC2-C)의 두 개의 처리 그룹(6마리 마우스/각 그룹)으로 임의적으로 분류하였다. 항체(25 mg/kg)를 주마다 두 번씩 꼬리 정맥에 주사하였다. 암세포 주입 후 30일 동안 3일 또는 4일 간격으로 종양 직경을 측정하고, 종양 부피를 폭2 x 길이/2의 식에 따라 계산하였다. 종양 크기가 +600mm3에 도달했을 때 BALB/cAnNCri-nu/nu 마우스를 희생시키고, 종양 무게를 측정하였다.
실시예 13:anti - TM4SF5 단클론 항체의 가변 중쇄 및 경쇄(Fab)의 클로닝
anti-TM4SF5 단클론 항체(mEC2-C)를 생산하는 하이브리도마 세포를 배양하고, 전체 RNA를 하이브리도마 세포로부터 추출하고, cDNA를 역전사로 합성하였다. anti-TM4SF5 단클론 항체의 Fab 서열을 클로닝하기 위하여, 생성된 cDNA를 Vent 폴리머라아제(NEB) 및 다음의 프라이머를 사용하여 증폭하였다. : 중쇄 primers, IGG3 : GGAAGATCTAGGGACCAAGGGATAGACAGATGG, 5'MH2 : CTTCCGGAATTCSARGTNMAGCTGSAGSAGTCWGG; Kappa chain primers, 3'Kc : GGTGCATGCGGATACAGTTGGTGCAGCATC, 5'Mk : GGGAGCTCGAYATTGTGMTSACMCARWCTMCA. 표준 PCR 반응을 25사이클 실시하였다. PCR 생산물을 pGEM-T 이지 벡터(Promega)로 직접 라이게이션 하였다. 클로닝 된 마우스 Ig 삽입물을 DNA 염기서열 분석법으로 분석하였다.
실시예 14:가변 절편( Fv )의 서열 분석 및 분자 모델링
mEC2-C의 면역글로불린 가변 도메인 서열은 IgBLAST (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)로 분석하였다(Ye J, Ma N, Madden TL, Ostell JM. IgBLAST: Nucleic Acids Res. 2013; 41(Web Server issue):W34-4027). 여섯 CDRs(complementarity determining regions)을 Kabat 넘버링(Kabat EA, Wu TT. J Immunol. 1991; 147(5):1709-171928)에 의하여 결정하였고, mEC2-C mAb의 일부 골격(FR) 잔기들을 인간 VH3-Vk1 서브패밀리로 접목시켰으며, 이 경우에는 Herceptin 골격. 마우스 및 인간화된 EC2-C Fv 아미노산 서열의 3차원 구조를 web 모델링 프로그램, ROSIE을 사용하여 시물레이션하였다(Lyskov S, Chou FC, Conchuir SO, Der BS, Drew K, Kuroda D, Xu J, Weitzner BD, Renfrew PD, Sripakdeevong P, Borgo B, Havranek JJ, Kuhlman B, et al. PLoS One. 2013; 8(5):e6390629). 이 프로그램은 중쇄 및 경쇄의 FRs 및 CDRs에 대한 대부분의 호모로고스 템플레이트를 동정하고 이 템플레이트 구조를 최적화된 모델로 조합한다. 그 결과 모델 구조는 리본 모델에 의하여 Pymol 소프트웨어(DeLano Scientific LLC)를 사용하여 수퍼임포즈되었다.
실시예 15: EC2-C 펩타이드 항원에 대한 인간화 항체 구축
비인간(마우스) 유래 항체의 CDRs 결정
인간화를 하기 위해서는 가장 먼저 항체의 CDRs을 결정하는 것이 필요하다. CDRs을 결정하는 방법에는 아미노산 서열의 다양성을 기준으로 하는 Kabat numbering, 루프 지역의 구조를 기준으로 하는 Chothia numbering (James 등, Jan;42:D1140-6, 2014), 가변 부위 구조의 높은 보존정도를 기준으로 하는 IMGT numbering (Lefranc MP 등, Front Immunol., 5;5:22, 2001) 등이 있는데, 가장 널리 사용되는 것이 Kabat numbering이다. Kabat numbering에 따라 EC2-C 펩타이드 항원에 대한 마우스 유래 항체의 CDRs을 결정하였다(도 8, 9 참조).
인간화 항체 구축에 적합한 인간 항체 골격의 선정 및 야생형 항체의 CDR 부위 이식
인간 항체의 가변 부위는 아미노산 서열에 따라서 크게 중쇄는 7가지 subtype (VH1,VH2,VH3,VH4,VH5,VH6,VH7), 경쇄는 17가지 subtype (κ1,κ2,κ3,κ4,κ5,κ6,λ1,λ2,λ3,λ4,λ5,λ6,λ7,λ8,λ9,λ10,λ11)로 나뉜다. 각각의 subtype은 아미노산 서열이 서로 다르기 때문에 생물리학적 구조가 다르고 그에 따라 안정성도 서로 다르며 이에 따라 자연적인 인간 항체 repertoire에서 사용되는 빈도 수도 다르다 (Tiller T 등, MAbs, 5(3):445-70, 2013). 일반적으로 CDR 이식법을 이용하여 인간화 항체를 제작할 때에는 최대한 CDR의 구조를 유지시키기 위해 야생형 비인간 유래 항체와 서열 상동성이 매우 높은 인간 골격으로 옮기게 되는데, 이 경우에 옮겨지는 인간화 항체의 subtype이 자연적으로 안정성이나 빈도 수가 낮은 subtype일 경우, 인간화 후에 안정성이 낮은 항체가 얻어질 수 있는 가능성이 있다.
hTM4SF5EC2-C 펩타이드 항원에 대한 마우스 유래의 항체의 인간화에 적합한 인간 골격을 결정하기 위해 Igblast(URL:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)를 통하여 기존 야생형 항체와 가장 서열 상동성이 높은 인간 항체 가변 부위의 subtype을 검색하였고, 그 결과 인간 항체의 VH4, Vk4 subtype과 가장 상동성이 높은 것을 확인하였다. 하지만 참고문헌에 따르면 위 2 개의 subtype은 각각 자연적으로 발생하는 인간 항체 repertoire에서 발견되는 빈도 수와 안정성이 매우 낮다. 따라서 본 발명에서는 항원에 대한 친화도 및 그 기능은 유지하면서 안정성이 높은 인간화 항체를 구축하기 위해 VH3-Vk1 subtype의 인간 항체 골격에 항원 결합 부위를 이식하였다. VH3-Vk1 subtype은 상업화된 치료용 항체 (Herceptin)의 골격으로, 그 열역학적 안정성 및 발현 수율이 기존 연구 결과들에 의해 충분히 증명되어왔으며, 특히 다양한 마우스 항체의 인간화에 성공적으로 사용되어 왔다(Carter 등, Proc Natl Acad Sci U S A 89:4285-4289 1992; Presta 등, Cancer Res 57:4593-4599 1997;).
야생형 마우스 항체의 CDR 부위 이식 및 친화도의 유지를 위한 추가적인 보존 아미노산의 선정
앞서 언급하였듯이, 단순한 CDR 이식법에 의해 구축된 인간화 항체가 야생형 비인간 유래 항체와 비교하였을 때 그 기능이 감소하는 경우가 종종 발생하기 때문에, EC2-C 펩타이드 항원에 대한 인간화는 면역원성 문제를 줄이기 위해 단순히 CDR만 이식한 클론(hEC2-C-1)과 기능의 상실을 우려하여 CDR 이식과 동시에 항체 골격에 위치하면서 CDR 루프 구조에 영향을 줄 수 있는 베르니에 구역에 위치하는 아미노산을 추가적으로 역치환한 클론(hEC2-C-2), 2 개로 진행하였다. 베르니에 구역에 위치하는 아미노산은 가변 부위 내 총 30 개로 가변중쇄 부위에 16개, 가변경쇄 부위에 14개가 존재하며, 야생형 마우스 항체와 선정된 VH3-Vk1 인간 항체 골격 subtype간의 서열 분석을 통하여 전체 30개의 베르니에 구역의 아미노산 중 가변 중쇄 부위에 9개 (28,29,30,48,49,67,71,73,93), 가변 경쇄 부위에 2개 (49,66) 아미노산의 서열이 다름을 확인하였다 (도 9 참조). 특히, 가변 중쇄 부위 내 26-30번 4개 아미노산들은 문헌 상에서 CDR1과 CDR2 내 상호작용을 통한 canonical 구조의 유지에 중요한 역할을 한다 (Foote J 등, J Mol Biol., 224(2):487-99, 1992). 따라서 이식된 야생형 항체의 CDR의 구조를 안정화 시켜줄 것으로 예상되므로 기존 마우스 항체의 서열을 이용하는 것이 바람직하다. 중쇄 가변 부위 내 71번 아미노산 또한 마찬가지로 CDR1과 2의 배치를 결정하는 데 중요한 역할을 하는데, 이 위치에 부피가 큰 잔기를 가지는 아미노산 (리신 혹은 아르기닌) 혹은 작은 잔기를 가진 아미노산 (발린, 알라닌) 중 어떤 것이 오느냐에 따라 CDR의 특성이 결정된다. 야생형 마우스 항체는 중쇄 내 71번에 아르기닌을 가지고 있는데, 이는 인간 VH3 subtype 골격 내 71번 알라닌과 반대의 특성을 가지고 있으므로 역치환 해주었다.
서열 분석을 위한 인간 VH3-Vk1 subtype의 염기 및 아미노산서열은 위 subtype의 골격을 가지고 있으면서 면역원성이나 발현량에 큰 문제가 없이 상업화된 항체, Herceptin의 것을 사용하였다.
베르니에 구역 이외에도 안정성에 영향을 주는 VH/VL 인터페이스 아미노산은 그 잔기가 항체의 표면이 아닌 내부를 향하고 있어 가변 중쇄부위 및 경쇄 부위의 결합을 안정화시켜 항체 전체의 안정성에 영향을 주는 지역이고, 이러한 이유로 대부분의 항체가 동일한 아미노산 잔기로 이루어져있다. 위 항체의 경우에도 기존의 마우스 항체와 인간항체의 아미노산 잔기가 동일함을 확인하였고, 인간화 시에 큰 영향을 끼치지 않을 것으로 생각되어 변형을 주지 않았다.
구축된 항 hTM4SF5EC2-C 인간화 항체의 중쇄 가변영역의 염기서열과 아미노산 서열은 각각 서열번호 20 및 16으로 나타내었으며, 경쇄 가변영역의 염기서열과 아미노산 서열은 각각 서열번호 22 및 18로 나타내었다. 위 인간화 항체 구축을 위한 클론은 아미노산 서열 뿐만 아니라 컴퓨터 모델링을 통한 구조 데이터의 분석도 함께 병행하였다. 먼저 아미노산 서열 분석을 통해 1차적으로 얻어진 후보 클론 및 야생형 마우스 항체의 가변 부위 서열을 모델링 온라인 서버 (URL : http://rosie.rosettacommons.org/; Lyskov S 등, PLosOne, (5):e63906, 2013)내 항체 모델링 파트에 각각 입력하여 예측된 구조를 얻었다. 얻어진 각각의 구조는 CDR 루프의 구조적 변화를 관찰하기 위하여 단백질의 구조를 볼 수 있는 Pymol 소프트웨어를 이용하여 중첩시켰다. 도 10에 그 구조를 나타내었다. 중첩 구조 상에서 이식된 6개의 CDRs이 야생형 마우스 항체의 CDRs과 비교하였을 때 크게 벗어나지 않는 구조를 가짐을 확인하였고, 특히 항원 결합에 영향을 줄 수 있는 CDR 루프 내의 아미노산 잔기의 방향이 대부분 일치함을 확인하였다.
실시예 16:인간화된 hEC2 -C 항체의 구축 및 발현
intact IgG 포맷을 가지는 인간화된 IgG1 Ab를 얻기 위하여, VH 및 Vk 코딩 유전자를 5' 및 3' 말단 모두에 제한 효소 자리를 포함하게 합성하였다(Bioneer, Korea). 이 유전자들을 HEK 293F 세포에서 포유류 세포 발현을 위하여 인간 IgG1 고정 부위 (CH1-hinge-CH2-CH3) 또는 인간 카파 체인 고정 부위(CL)를 운반하는 변형된 pcDNA 3.4 발현 벡터(Invitrogen)에 삽입하였다. 그 인간화된 EC2-C mAb를 Choi HJ, Kim YJ, Lee S, Kim YS. Mol Cancer Ther. 2013; 12(12):2748-2759 및 Choi DK, Bae J, Shin SM, Shin JY, Kim S, Kim YS. MAbs. 2014; 6(6):1402-1414에 기재된 것과 같이 HEK 293F 발현 시스템을 사용하여 생산하고 5-7일 배양 후 제조업자의 프로토콜에 따라 Protein A 친화 크로마토그래피를 사용하여 정제하였다. 마우스 패런트 및 인간화된 항체를 SDS-PAGE 분석에 의하여 그것의 순도를 평가하였다.
실시예 17: IgG 형태의 인간화 항체 유전자 제작
설계된 인간화 항체의 염기 서열은 기본적으로 상업화된 고수율의 치료용 항체 Herceptin의 염기서열을 따르되, 그와 다른 부분은 코돈의 사용빈도를 고려(Sequences of Proteins of Immunological Interest, US Dept. Health and Human Services, 1991)하여 염기서열로 변환하고, 인간화 항체의 중쇄 가변영역 및 경쇄 가변영역의 아미노산 서열을 암호화하는 염기서열을 설계한다 설계한 염기 서열은 5'과 3' 양쪽 말단에 동물세포 발현 벡터로의 클로닝을 위한 제한효소의 인식 서열을 도입하여 합성하였다(Bioneer, 한국). 합성된 유전자는 Bioneer사에서 제공하는 기본벡터인 pBHA 벡터에 클로닝된 상태로 받을 수 있는데, 완전한 IgG 형태로의 발현을 위해 중쇄 불변영역, 경쇄 불변영역이 각각 들어가있는 동물발현벡터에 합성 시 도입하였던 제한효소 인식 서열을 이용하여 클로닝하였다. 이 때, 중쇄 및 경쇄의 불변영역의 아미노산 및 염기 서열은 마찬가지로 치료용 항체 Herceptin의 염기서열을 따른다.
실시예 18: 항체의 발현 및 정제
구축된 항 hTM4SF5EC2-C 인간화 항체의 발현은 경쇄, 중쇄 발현 벡터와 폴리에틸렌이민 (Polyethylenimine,PEI) (Polyscience)의 혼합물을 HEK293-F(Invitrogen) 세포에 일시적 트랜스펙션(transient transfection)하여 무혈청 FreeStyle 293 발현 배지(Invitrogen)가 들어있는 진탕 플라스크에서 배양함으로써 이루어진다. 자세한 방법은 다음과 같다.
진탕 플라스크(Corning)에 200 mL 트랜스펙션 시, HEK293-F 세포를 2.0 x 106 세포/ml의 밀도로 배지 100 ml에 파종하여, 150 rpm, 8 % CO2에서 배양하였다. 각각의 인간화 항체를 생산하기 위해 그에 따른 중쇄 및 경쇄 플라스미드를 10 ml FreeStyle 293 발현 배지 (Invitrogen)에 중쇄 125μg, 경쇄 125μg 총 250μg (2.5μg/ml)으로 희석하여, PEI 750 μg (7.5μg/ml)을 희석한 10 ml의 배지와 혼합하여 실온에서 10분 동안 반응시켰다. 그 후, 반응시킨 혼합배지를 앞서 100 ml로 파종한 세포에 넣어 4시간 동안 150 rpm, 8% CO2에서 배양 후, 나머지 100 ml의 FreeStyle 293 발현 배지를 추가하여 짧게는 5일에서 길게는 7일동안 배양하게 되면, 세포가 생산한 단백질 즉, IgG 형태의 인간화 항체는 세포에 의해 세포 바깥으로 분비되어 배지에 쌓이게 된다. 때문에 인간화 항체는 세포 배양 후 2500 rpm에서 20 분간 원심분리하여 채취한 세포 배양 상등액으로부터 단백질 A 세파로오스 컬럼 (protein A Sepharose column, GE healthcare)을 이용하여 정제하였다. 이 때, 정제방법은 단백질 A 컬럼 회사에서 제공하는 표준 프로토콜을 참조하였으며, 정제된 단백질은 BCA protein assay kit (Thermo)내 용액을 이용하여 562 nm 파장에서 흡광도를 측정하고 그려진 표준 곡선에 따라 그 양을 정량하였다. 정제된 항체의 크기 및 순도는 환원성 SDS-PAGE로 분석하였다. 도 11에 나타낸 바와 같이, 본 발명의 항 mEC2-C 인간화 항체인 hEC2-C-2 IgG는 약 150 kDa의 분자량을 가지며, 99 %이상의 순도로 정제됨을 확인하였다.
실시예 19:공초점 이미지
E-cadherin 및 β-catenin 발현에 대한 인간화된 anti-TM4SF5 항체의 효과를 동정하기 위하여, CT-26 세포 및 HCT-116 세포를 배양하고 대조군 IgG 또는 인간화된 anti-TM4SF5 항체 (10 ug/ml)로 처리하였다. 3일 후, 세포에서 E-cadherin 및 β-catenin 발현을 Kim YE, Kwon S, Wu G, Kim D, Park BK, Park JA, Choi KC, Kim DS, Kwon HJ, Lee Y. Oncotarget. 2014; 5(18):8402-8415에 따라 분석하였다.
실시예 20:인 비트로 세포 이동 분석
8 ㎛ 공극을 갖는 트랜스-웰 챔버(Corning Costar)를 분석에 사용하였다. 이동 분석을 위하여, 트랜스-웰 챔버 막의 아래쪽 면을 10 ㎍/㎖의 젤라틴으로 코팅하였다. 대장 세포를 인간 IgG 대조군 또는 인간화된 anti-TM4SF5 항체 (hEC2-C-2 Ab)가 포함된 무혈청 배지에서 현탁하고(1 x 105 세포/㎖), 트랜스-웰의 맨 위에 분주하였다. 10% FBS를 함유하는 RPMI 배지를 아래쪽 챔버에 놓았다. 공극을 통하여 세포가 이동하는 세포를 필터의 낮은 표면에 위치하고 24시간 후, 고정하고, 크리스탈 바이올렛으로 30분 동안 염색한 다음 현미경(Eclipse E-200, Nikon)으로 세포수를 카운팅 하였다.
실시예 21:인 비트로 상처 치료(Wound-healing) 분석
상처 치료 분석을 위하여, 1 x 106 세포(Huh-7, 및 CT-26)를 6-웰 플레이트에 분주하고, 혈청 포함 배지에서 하룻밤 동안 배양한 다음 피펫 끝을 이용하여 단일층에 상처를 유발하였다. PBS, 인간 IgG 대조군, 또는 인간화된 anti-TM4SF5 항체 (hEC2-C-2 Ab) (10 ug/ml)를 그 배지에 첨가하였다. 지시된 시점에서 세포를 4% 파라포름알데히드로 30분 동안 고정하고, 김자액으로 30분 동안 염색하였다. 상처 부위로 이동된 세포 수를 실험 처리 당 세 웰 및 각 웰당 세 상처에서 카운트하였다.
실시예 22:간암 마우스 모델
12마리의 BALB/cAnNCri-nu/nu 마우스의 등 오른쪽 측면(dorsal right flank)에 50% 마트리젤(BD biosciences)을 포함하는 5 x 106 Huh-7 세포를 피하주사 하였다. 종양 직경이 5 mm에 도달했을 때, 마우스를 PBS, 및 인간화된 anti-TM4SF5 항체 (hEC2-C-2 Ab)의 두 개의 처리 그룹(6마리 마우스/각 그룹)으로 임의적으로 분류하였다. 항체(25 mg/kg)를 주마다 두 번씩 꼬리 정맥에 주사하였다. 암세포 주입 후 44일 동안 4일 간격으로 종양 직경을 측정하고, 종양 부피를 폭2 x 길이/2의 식에 따라 계산하였다. 종양 크기가 2000 mm3에 도달했을 때 BALB/cAnNCri-nu/nu 마우스를 희생시키고, 종양 무게를 측정하였다.
실시예 23:인간화된 anti- TM4SF5 항체에 대한 대장암 마우스 모델(이종 이식)
12마리의 BALB/cAnNCri-nu/nu 마우스의 등 오른쪽 측면에 50% 마트리젤(BD biosciences)을 함유하는 5 x 106 HT-29 세포를 피하주사 하였다. 종양 직경이 5 mm에 도달했을 때, 마우스를 PBS, 및 anti-TM4SF5 단클론 항체(mEC2-C)의 두 개의 처리 그룹(6마리 마우스/각 그룹)으로 임의적으로 분류하였다. 항체(25 mg/kg)를 주마다 두 번씩 꼬리 정맥에 주사하였다. 암세포 주입 후 30일 동안 3일 또는 4일 간격으로 종양 직경을 측정하고, 종양 부피를 폭2 x 길이/2의 식에 따라 계산하였다. 종양 크기가 800mm3에 도달했을 때 BALB/cAnNCri-nu/nu 마우스를 희생시키고, 종양 무게를 측정하였다.
실시예 24:대장암의 폐 전이 모델에서 항- 전이제로 인간화된 anti- TM4SF5 항체의 평가
BALB/c 마우스에 1 x 105 세포의 마우스 CT-26 대장암 세포주(PBS 대조군 n=8, 대장암 세포 n=36)로 꼬리 정맥에 주사하였다. 1일째에, 암 세포 주사된 마우스를 PBS, 인간 IgG 대조군 및 인간화된 anti-TM4SF5 항체 (hEC2-C-2 Ab)과 같은 세 처리 군으로 나누었다(n=12 /각 군). 항체(25 mg/kg)를 꼬리 정맥에 주 2회 주사하고 체중을 2일 간격으로 측정하였다. 마우스의 생존을 22일까지 모니터하였다 (도 16).
동일한 세팅을 가지는 또 다른 실험을 폐의 상태를 조사하기 위하여 준비하였다(n=12/ 각 군). 19일 째에, 마우스를 희생하고 폐를 중량하였다(도 17).
실시예 25:조직학(Histology)
조직병리학적 검사를 위하여 종양 및 폐를 제거하고, 4% 포르말린 용액에서 하룻밤 동안 고정하고 파라핀에 포매한 다음, 5 ㎛ 두께의 섹션으로 절단하였다. 탈파라핀화 섹션들을 H&E(hematoxylin and eosin)로 염색하였다. 그 후 샘플을 hematoxylin로 카운터염색하고 모든 이미지들을 Nikon Eclipse E-200 현미경(Nikon)을 사용하여 조사하였다.
상기의 실시예 결과는 하기와 같다.
TM4SF5 펩타이드 백신으로 면역화 및 TM4SF5의 사이클릭 펩타이드에 특이적인 항체의 생산(도 1)
타이트한 결합을 유지하면서 구조적 에피토프를 인지하는 항체를 얻기 위하여, 본 발명자들은 TM4SF5 EC2(extracellular domain 2)를 미미킹한 사이클릭 펩타이드의 구조적 모티프를 고안하였다. 도 1A 및 B에 나타낸 것과 같이, 본 발명자들은 글라이신 133 및 발린 156을 시스테인으로 대체하여 돌연변이 펩타이드 hTM4SF5EC2를 만들었다. 펩타이드의 화학적 변형을 통하여, 본 발명자들은 시스테인 잔기 사이에 다이설파이드 결합을 가지는 사이클릭 펩타이드 hTM4SF5EC2-C를 생산하였다. 본 발명자들은 hTM4SF5EC2-C 펩타이드 및 CpG-DNA를 동시 캡슐화한 phosphatidyl-β-oleoyl-γ-palmitoyl ethanolamine (DOPE): cholesterol hemisuccinate (CHEMS)를 포함하는 리포좀 복합체(Lipoplex(O))로 마우스를 면역화하고 3번째 부스팅 후 hTM4SF5EC2-C 사이클릭 펩타이드를 인지하는 항체의 생산을 확인하였다(도 1C). 항체는 해당하는 마우스 cyclic 펩타이드 (mTM4SF5EC2-C)와 교차반응을 하였고 hTM4SF5EC2 및 mTM4SF5EC2와 같은 선형 펩타이드들에 대한 활성은 사이클릭 펩타이드들보다 더 낮았다. 그 항체는 hTM4SF5R2-3 또는 마우스 해당 에피토프 mTM4SF52-3를 인지하지 못하였고, 이것은 그 생산된 항체는 컨퍼메이셔널 에피토프를 인지한다는 것을 시사한다. 도 1D에 나타낸 것과 같이, 그 생산된 항체는 주로 IgG2a이었다.
마우스 폐 전이 모델에서 M4SF5 펩타이드 백신으로 면역화로 대장 종양의 성장 저해(도 2, 도 3)
마우스에서 대장암의 전이를 조절하는 타겟으로 TM4SF5의 중요성을 평가하기 위하여, 본 발명자들은 먼저 BALB/c 마우스를 사이클릭 TM4SF5 펩타이드 (hTM4SF5EC2-C) 및 Lipoplex(O)로 구성된 TM4SF5 펩타이드 백신으로 면역화하였다. 그 다음에 TM4SF5 펩타이드 백신의 효과를 CT-26 세포의 주사에 의하여 유도된 폐 종양의 성장에 대하여 결정하였다(도 2A). CT-26 세포 주사된 마우스는 세포 주사 12일 후 체중이 감량되었다. 그러나 TM4SF5 펩타이드 백신으로 면역화된 마우스는 비처리된 대조군 마우스와 비슷한 패턴을 나타내었다(도 2B). 마우스의 생존은 도 2C에 나타낸 것과 같이, PBS 대조군과 비교하여 펩타이드 백신에 의하여 크게 증가되었다( 52일에 80% 배 0%). 펩타이드 없는 CpG-DNA-liposome 복합체(Lipoplex(O))로 면역화는 비특이적 면역촉진 효과로 인하여 부분적인 보호 효과를 유도하였다(52일에 27%). 종양 부피 및 중량을 사용하여 본 발명자들은 펩타이드 백신으로 면역화는 PBS 또는 Lipoplex(O) 대조군과 비교하여 폐 전이 종양의 진행을 감소시켰다는 것을 관찰하였다(도 2D-2E). 조직학적 조사는 적절하게 백신화된 마우스의 폐 조직은 정상 마우스의 것과 유사한 형태를 나타내었다(도 2F). 펩타이드 백신의 항-전이 효과를 확인하기 위하여, 본 발명자들은 유사한 실험을 반복하였고 폐에서 전이성 결절을 체크하였다. 펩타이드 백신으로 면역화는 PBS 대조군과 비교하여 폐 결절의 수를 현저하게 감소시켰다(도 3). 이들 결과들은 TM4SF5 펩타이드 백신으로 면역화는 마우스 syngeneic 모델에서 대장 종양의 폐 전이를 감소시킬 수 있다는 것을 시사한다.
TM4SF5 사이클릭 펩타이드에 특이적인 단클론 항체의 생성
hTM4SF5EC2-C 펩타이드 및 CpG-DNA를 동시 캡슐화한 DOPE:CHEMS를 포함하는 리포좀 복합체로 4회 면역화 이후, 마우스 혈청에서 사이클릭 TM4SF5 펩타이드 (hTM4SF5EC2-C)에 대한 항체의 적정 곡선을 ELISA로 얻었다(도 4A). 최종 부스터 3일 후, 가장 높은 항체 타이터(hTM4SF5EC2-C)를 가지는 지라를 얻었고 그 지라 세포를 SP2/0 myeloma 세포와 통상적인 하이브리도마 기술을 통하여 융합하였다. 14일 후, 상등액을 ELISA 방법으로 분석하여 hTM4SF5EC2-C 펩타이드에 대한 특정한 항체를 분비하는 하이브리도마 세포를 스크리닝하였다. 스크리닝 과정을 통하여 본 발명자들은 hTM4SF5EC2-C 펩타이드와 반응하는 한 하이브리도마 세포(1H1)을 분리하였다. (도 4B, 4C). 본 발명자들은 TM4SF5를 과발현하는 HEK293F-TM4SF4 세포를 사용하여 웨스턴 블럿 분석을 수행하였고 그 항체가 재조합 TM4SF5 단백질을 인지하는 것을 증명하였다(도 4D).
그 한 하이브리도마 세포를 리미팅 희석 방법에 의한 서브 클로닝 후 단클론 항체의 생성을 분석하였다(도 5A, 5B). 네 하이브리도마 클론들(네 1H1 유도체들)을 선택하였고 TM4SF5를 과발현하는 HEK293F-TM4SF4 세포를 사용하여 웨스턴 블럿 분석을 수행하였고 그 항체가 재조합 TM4SF5 단백질을 인지한다는 것을 증명하였다(도 5D). 결론적으로 한 하이브리도마 클론(2A10)을 단클론 항체 (mEC2-C)의 생성을 위하여 선택하였다(도 5D).
TM4SF5 사이클릭 펩타이드에 특이적인 단클론 항체의 특성
본 발명자들은 하이브리도마 세포주(2A10)를 스크리닝하고 hTM4SF5EC2-C 펩타이드를 인지하는 단클론 항체를 성공적으로 분리하였다. anti-TM4SF5 단클론 항체 (mEC2-C)를 protein A column 크로마토그래피로 복수액으로부터 정제하고 그 순도를 99% 이상으로 측정되었다(도 6A). 본 발명자들은 생성된 단클론 항체는 IgG3이다고 발견하였다(도 6B). 본 발명자들은 그 단클론 항체를 mEC2-C로 명명하고 사이클릭 펩타이드 hTM4SF5EC2-C 에 대한 그것의 특이적인 결합을 ELISA로 확인하였다(도 6C). 도 6D에 나타낸 것과 같이, hTM4SF5EC2-C 펩타이드에 대한 항체의 결합 친화도를 SPR(surface plasmon resonance) 분석에 의하여 측정하였다. 그 항체의 평형 해리 상수(K d )는 ~ 0.48 nM이었다. 그 항체의 오프 rate (kd)는 10-5/sec이었다. 따라서 본 발명자들은 이 항체가 임상적 적용에 더 유용할 수 있다고 결론을 내렸다. 본 발명자들은 TM4SF5를 과발현하는 HEK293F-TM4SF4 세포 및 HEK293F 대조군 세포를 사용하여 면역침전 및 웨스턴 불럿을 수행하였고, 그 항체가 Myc-태그된 재조합 TM4SF5 단백질을 인지한다는 것을 증명하였다(도 6E).
Anti- TM4SF5 단클론 항체 ( mEC2 -C)는 이종이식 마우스 모델에서 대장암의 성장을 저해함
본 발명자들은 이종이식 마우스 모델을 사용한 인 비보 대장암 세포의 성장에 대한 TM4SF5-타겟된 단클론 항체의 효과를 관찰하였다. 먼저 본 발명자들은 HT-29 세포를 누드 마우스 등에 피하 주사하여 종양을 성장시켰다. 종양 크기가 직경 5 mm에 도달하였을 때, 본 발명자들은 일 주일에 2회 anti-TM4SF5 단클론 항체 (mEC2-C)를 꼬리정맥에 주사하였다. 종양 부피와 무게에 기초하여, anti-TM4SF5 단클론 항체 (mEC2-C)는 PBS 대조군과 비교하여 대장암의 진행을 약화하였다(도 7B-D). 그 항체처리는 실험 동안 체중에 영향이 없었다(도 7E). 이종이식 실험의 분석은 대장 종양 세포를 타겟하는 anti-TM4SF5 단클론 항체는 인 비보에서 종양 성장을 감소시킬 수 있다는 것을 나타내었다.
anti- TM4SF5 단클론 항체의 가변 도메인의 클로닝
중쇄 및 경쇄의 가변 도메인(VH 및 VL)을 코딩하는 cDNA 서열을 통상적인 중쇄 및 경쇄 프라이머를 사용하여 anti-TM4SF5 단클론 항체를 생산하는 하이브리도마 세포(mEC2-C)로부터 클로닝하였다. DNA 시퀀싱에 의하여 확인된 서열들을 도 8에 나타내었다. 그 서열들을 IgBLAST 프로그램을 사용하여 공지된 서열과 호모로지를 분석하였다(Ye J, Ma N, Madden TL, Ostell JM. IgBLAST: Nucleic Acids Res. 2013; 41(Web Server issue):W34-40).
인간화된 단클론 항체의 생산 및 특성
임상에 단클론 항체의 적용을 위해서 그 항체들을 인간에서 면역원성을 감소시키는 인간화 작업을 수행하여야 한다. 따라서 본 발명자들은 얻어진 단클론 항체 mEC2-C의 면역글로불린 가변 도메인 서열을 IgBLAST program (Ye J, Ma N, Madden TL, Ostell JM. IgBLAST: Nucleic Acids Res. 2013; 41(Web Server issue):W34-40)을 사용하여 분석하고 그 가변 도메인 서브타입이 마우스 VH2-Vk8에 속한다는 것을 발견하였다. mEC2-C mAb의 인간화를 위하여, 본 발명자들은 VH3-Vk1 골격을 이 골격이 가장 공통적으로 인간 생식 계열(germ line) 레퍼토리에서 관찰된다는 사실(Caravella JA, Wang D, Glaser SM, Lugovskoy A. Curr Comput Aided Drug Des. 2010; 6(2):128-138)을 참고하여 선택하였다. 본 발명자들은 인간 VH3-Vk1 골격에 일부 골격 서열 이 경우에는 Herceptin 골격과 CDR 부위를 통상적으로 확립된 방법으로 접목하였다(Kabat EA, Wu TT. J Immunol. 1991; 147(5):1709-1719). mEC2-2 및 인간화된 단클론 항체 (hEC2-C-2) 유래 구조들을 모델화하고 비교하였고, 그들은 서로 동일하지 않지만 유사하다는 것을 나타내었다(도 9, 10).
본 발명자들은 재조합 인간화된 단클론 항체 (hEC2-C-2)를 HEK 293F 세포를 사용하여 생산하였고(도 11A) 그것의 반응성을 평가하였다 (도 11B-D). 그 인간화된 항체는 ELISA에 기반하여 사이클릭 펩타이드 hTM4SF5EC2-C에 대해서는 특이적으로 반응하지만 hTM4SF5R2-3에는 그러하지 않았다(도 11B). 그 항체의 평형 해리 상수(K d )는 ~ 22.7 pM이었고, 그것은 원래 마우스 단클론 항체 mEC2-C에 비하여 약 20배 더 낮았다 (도 11C). 그 인간화된 항체는 웨스턴 블럿 및 면역침전 분석에 기반하여 TM4SF5 단백질을 TM4SF5를 과발현하는 HEK 293F 세포에서 검출할 수 있었다(도 11D).
따라서 본 발명자들은 그 인간화된 항체가 TM4SF5 단백질에 완전하게 반응하며 원래 단클론 항체과 비교하여 더 높은 친화도를 가진다고 결론을 얻을 수 있다.
인간화된 anti- TM4SF5 항체의 대장암 세포의 β- catenin 발현 및 이동에 대한 효과
TM4SF5는 종양 세포 전이 및 세포 이동/침습에 중요한 인테그린 매개 신호 경로를 활성화한다(Lee SA, Kim TY, Kwak TK, Kim H, Kim S, Lee HJ, Kim SH, Park KH, Kim HJ, Cho M, Lee JW. J Cell Biochem. 2010; 111(1):59-66;Jung O, Choi S, Jang SB, Lee SA, Lim ST, Choi YJ, Kim HJ, Kim DH, Kwak TK, Kim H, Kang M, Lee MS, Park SY, et al. J Cell Sci. 2012; 125(Pt 24):5960-5973). 따라서 본 발명자들은 인간화된 anti-TM4SF5 항체의 CT-26 세포 및 HCT-116 세포를 사용한 세포 이동에 대한 인 비트로 효과를 평가하였다. 도 12A에 나타낸 것과 같이, 본 발명자들은 인간화된 anti-TM4SF5 항체의 첨가는 CT-26 세포의 이동을 저해하였지만 PBS 또는 인간 IgG는 그러하지 않았다. 대조적으로 그 항체는 TM4SF5를 발현하지 않는 HCT-116 세포의 이동에는 효과가 없었다. 또한 본 발명자들은 인 비트로에서 상처 치유 어세이를 수행하였다. 도 12B에 나타낸 것과 같이, 상처 부위로 CT-26 세포의 이동은 PBS 또는 인간 IgG 대조 군과 비교하여 크게 저해되었지만, HCT-116 세포에서 상처 치유 능력에는 PBS, 인간 IgG 대조군, 또는 anti-TM4SF5 사이에 차이가 없었다.
anti-TM4SF5 항체의 세포 상호작용 특성에 대한 효과를 규명하기 위하여 본 발명자들은 E-cadherin 및 β-catenin의 발현을 CT-26 세포 및 HCT-116 세포에서 체크하였다(도 13). 공초점 이미지 데이터는 β-catenin 발현이 인간화된 anti-TM4SF5 항체에 대하여 CT-26 세포에서 크게 증가하였다(도 13A). E-cadherin의 발현은 처리에도 불구하고 CT-26 세포에서 관찰되지 않았고 E-cadherin의 기본 발현이 CT-26 세포에서 매우 낮다는 것을 시사한다. 대조적으로, E-cadherin 및 β-catenin의 발현은 인간화된 anti-TM4SF5 항체로 처리한 후 HCT-116 세포에서 변화가 없었다. 웨스턴 블럿 분석은 동일한 결과들을 나타내었다(도 13B). 따라서 인간화된 anti-TM4SF5 항체는 TM4SF5 발현하는 세포에서 이동 능력을 감소시키고 세포-세포 상호작용을 증가시킨다.
인간화된 anti- TM4SF5 항체는 이종이식 마우스 모델에서 HCC 종양 성장을 저해함
본 발명자들은 이종이식 마우스 모델을 사용하여 TM4SF5-타겟된 인간화된 항체의 HCC 세포의 성장에 대한 효과를 조사하였다. 먼저 본 발명자들은 Huh-7 세포를 마우스 등에 피하 주사하여 종양을 성장시켰다. 종양 크기가 직경 5 mm에 도달할 때, 본 발명자들은 PBS 또는 인간화된 anti-TM4SF5 항체를 일 주일에 2회 꼬리 정맥에 투여하였다. 종양 부피와 무게에 의하면, 인간화된 anti-TM4SF5 항체는 HCC 종양의 진행을 PBS 대조군과 비교할 때 약화시켰다(도 14B-E). 이종이식 실험의 분석은 HCC 종양 세포를 타겟하는 인간화된 anti-TM4SF5 항체는 인 비보에서 종양 성장을 감소시키는데 충분한 것을 나타내었다.
인간화된 anti- TM4SF5 항체는 이종이식 마우스 모델에서 대장암 성장을 저해함
본 발명자들은 이종이식 마우스 모델을 사용한 인 비보 대장암 세포의 성장에 대한 TM4SF5-타겟된 인간화된 항체의 효과를 관찰하였다. 먼저 본 발명자들은 HT-29 세포를 누드 마우스 등에 피하 주사하여 종양을 성장시켰다. 종양 크기가 직경 5 mm에 도달할 때, 본 발명자들은 일 주일에 2회 PBS 또는 인간화된 anti-TM4SF5 항체를 꼬리 정맥에 투여하였다. 종양 부피와 무게에 의하면, 인간화된 anti-TM4SF5 항체는 대장 종양의 진행을 PBS 대조군과 비교하여 약화시켰다(도 15B-D). 그 항체 처리는 실험 동안 체중에 영향이 없었다(도 15E). 이종이식 실험의 분석은 대장암을 타겟하는 인간화된 anti-TM4SF5 항체는 인 비보에서 종양 성장을 감소시킬 수 있다는 것을 나타내었다.
인간화된 anti- TM4SF5 항체는 마우스 폐 전이 모델에서 대장 종양의 성장을 저해함
TM4SF5 펩타이드 백신으로 마우스의 면역화는 CT-26 세포의 주사에 의한 폐 종양 조직의 성장을 저해하기 때문에, 면역화에 의해 유도된 TM4SF5-특이적인 항체가 항-전이 효과에 직접적으로 기여한다고 가설화될 수 있다.
따라서 다음으로 본 발명자들은 도 16A에 나타낸 것과 같은 실험 스케쥴에 따라 폐 전이에 대한 인간화된 anti-TM4SF5 항체의 효과를 조사하였다. CT-26 세포의 주사 1일 후, 본 발명자들은 정상 IgG 또는 인간화된 항체 hEC2-C-2를 꼬리정맥에 주사하고 마우스에서 그 항체의 효과를 체크하였다. 대조군 마우스는 CT-26 세포 주사 약 16일 후 체중이 감량되었다. 그러나 인간화된 항체 hEC2-C-2로 주사된 마우스는 비처리된 대조군 마우스와 비슷한 체중을 나타내었다(도 16B). 마우스의 생존은 도 16C에 나타낸 것과 같이 인간 IgG 대조군과 비교하여 인간화된 anti-TM4SF5 항체에 의하여 크게 증가하였다(75% 대 0%).
인간화된 anti-TM4SF5 항체의 항-전이 효과를 확인하기 위하여, 본 발명자들은 유사한 실험을 반복하고 폐 전이를 체크하였다. 인간화된 항체 hEC2-C-2로 주사된 마우스는 PBS 대조군과 비교하여 폐 전이된 종양의 형성과 성장을 현저하게 감소시켰다(도 17). 종양 부피 및 중량의 변화를 고려하면, anti-TM4SF5 항체는 인간 IgG과 비교하여 폐 전이 종양의 성장을 감소시켰다(도 17B-D). 따라서 본 발명자들은 인간화된 anti-TM4SF5 단클론 항체가 마우스 syngeneic 모델에서 대장 종양의 폐 전이를 완화시킬 수 있다는 결론을 얻을 수 있다.
이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는 바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현 예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서, 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
<110> Industry Academic Cooperation Foundation, Hallym University <120> A vaccine composition comprising cyclic peptide, an antibody against the cyclic peptide and an anticancer compositions comprising the same <130> P16-0263HS <160> 23 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 27 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Thr Ala Cys Ala Tyr Leu Leu Asn Arg Thr Leu Trp Asp Arg Cys Glu 1 5 10 15 Ala Pro Pro Arg Val Val Pro Trp Asn Cys Thr 20 25 <210> 2 <211> 27 <212> PRT <213> mouse <400> 2 Thr Glu Cys Ala Tyr Leu Arg Asn Asp Thr Leu Trp Asn Leu Cys Glu 1 5 10 15 Ala Pro Pro His Val Val Pro Trp Asn Cys Thr 20 25 <210> 3 <211> 10 <212> PRT <213> mouse <400> 3 Gly Phe Ser Leu Thr Ser Tyr Gly Val Thr 1 5 10 <210> 4 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> humanized <400> 4 Gly Phe Ser Leu Thr Ser Tyr Gly Val Thr 1 5 10 <210> 5 <211> 16 <212> PRT <213> mouse <400> 5 Val Ile Trp Ser Asp Gly Ser Thr Asn Tyr Gln Ser Ala Leu Ile Ser 1 5 10 15 <210> 6 <211> 16 <212> PRT <213> Artificial 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humanized <400> 18 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Phe Asp Arg 20 25 30 Arg Thr Arg Lys Thr Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys 35 40 45 Ala Pro Lys Leu Leu Ile Ser Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val 50 55 60 Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr 65 70 75 80 Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Lys Gln 85 90 95 Ser Tyr Asn Leu Phe Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 110 <210> 19 <211> 399 <212> DNA <213> mouse <400> 19 caggttcagc tggaggagtc aggacctggc ctggtggcgc cctcacagag cctgtccatc 60 atatgcactg tctcaggatt ctccttaacc agctatggtg taacctgggt tcgccagcct 120 ccaggaaagg gtctggagtg gctgggagta atatggagtg acgggagcac aaattatcag 180 tcagctctca tatccagact gaccatcagc agggataact ccaagagcca agctttctta 240 aaactgaaca gtctgcaaac tgatgacaca gccacgtact actgtgccag acctagtaac 300 tactactact ttgactactg gggccaaggc accactctca cagtctcctc agctacaaca 360 acagccccat ctgtctatcc cttggtccct agatcttcc 399 <210> 20 <211> 351 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> humanized <400> 20 gaggtgcagc tggtggagtc tggcggtggc ctggtgcagc cagggggctc actccgtttg 60 tcctgtgcag cttctggctt ctccttaacc agctatggtg taacctgggt gcgtcaggcc 120 ccgggtaagg gcctggaatg gctgggagta atatggagtg acgggagcac aaattatcag 180 tcagctctca tatccagact gactataagc agggacaact ccaaaaacac agcctacctg 240 cagatgaaca gcctgcgtgc tgaggacact gccgtctatt attgtgccag acctagtaac 300 tactactact ttgactactg gggtcaagga accctggtca ccgtctcctc g 351 <210> 21 <211> 372 <212> DNA <213> mouse <400> 21 gatattgtga tgacacagtc tccatcctcc ctggctgtgt cagcaggaga gagggtcact 60 ttgagctgca aatccagtca gagtctgttc gacagaagaa cccgaaagac ctacttggct 120 tggtaccagc agaaaccagg gcagtctcct aaactgctga tctcctgggc atccactagg 180 gaatctgggg tccctgatcg cttcacaggc agtggatctg ggacagattt cactctcacc 240 atcagcagtg tgcaggctga agacctggca gtttattatt gcaaacaatc ttataatctg 300 ttcacgttcg gaggggggac caagctggaa ataaaacggg ctgatgctgc accaactgta 360 tccgcatgca cc 372 <210> 22 <211> 336 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> humanized <400> 22 gatatccaga tgacccagtc cccgagctcc ctgtccgcct ctgtgggcga tagggtcacc 60 atcacctgca aatccagtca gagtctgttc gacagaagaa cccgaaagac ctacttggct 120 tggtatcaac agaaaccagg aaaagctccg aagctactga tttcctgggc atccactagg 180 gaatctggag tcccttctcg tttctctgga tcgggatctg ggacggattt cactctgacc 240 atcagcagtc tgcagccgga agacttcgca acttattact gtaaacaatc ttataatctg 300 ttcacgttcg gacagggtac caaggtggag atcaaa 336 <210> 23 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CpG oligonucleotide <400> 23 agcagcgttc gtgtcggcct 20

Claims (15)

  1. 삭제
  2. 삭제
  3. 서열번호 3, 5, 및 7을 포함하는 중쇄 가변영역 및 서열번호 9, 11, 및 13을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는 항체; 또는 서열번호 4, 6, 및 8을 포함하는 중쇄 가변 영역 및 서열번호 10, 12, 및 14를 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는 항체.
  4. 제 3 항에 있어서, 상기 항체는 서열목록 제15서열로 이루어진 중쇄 가변영역 및 서열목록 제17서열로 이루어진 경쇄 가변 영역을 포함하거나, 제16서열의 아미노산 서열로 이루어진 중쇄 가변영역 및 서열목록 제18서열로 이루어진 경쇄 가변 영역을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체.
  5. 삭제
  6. 삭제
  7. 제 3 항 또는 제4항의 항체의 중쇄 가변영역을 코딩하는 서열목록 제19서열 또는 제20서열의 뉴클레오타이드 서열로 이루어진 핵산 분자.
  8. 삭제
  9. 제 3 항 또는 제 4 항의 항체의 경쇄 가변영역을 코딩하는 서열목록 제21서열 또는 제22서열의 뉴클레오타이드 서열로 이루어진 핵산분자.
  10. 삭제
  11. (a) 제 3 항 또는 제 4 항의 항체의 약제학적 유효량; 및 (b) 약제학적으로 허용되는 담체를 포함하는 암의 예방 또는 치료용 약제학적 조성물.
  12. 제 11 항에 있어서, 상기 암은 간암, 대장암, 췌장암, 폐암, 위암, 직장암, 연부조직육종(soft-tissue sarcoma), 결장암, 십이지장 유두부 상피암(carcinoma of the papilla vateri), 비내분비 폐종양(nonendocrine lung tumor) 및 기관지 유암종(bronchial carcinoid tumor)으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 약제학적 조성물.
  13. 제 11 항에 있어서, 상기 조성물은 암세포의 전이 또는 암세포의 침윤을 억제하는 것을 특징으로 하는 조성물.
  14. 제 3 항 또는 제 4 항의 항체를 포함하는 암 진단용 키트.
  15. 제 14 항에 있어서, 상기 암은 간암, 대장암, 췌장암, 폐암, 위암, 직장암, 연부조직육종(soft-tissue sarcoma), 결장암, 십이지장 유두부 상피암(carcinoma of the papilla vateri), 비내분비 폐종양(nonendocrine lung tumor) 및 기관지 유암종(bronchial carcinoid tumor)으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 진단용 키트.

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