KR101582163B1 - 약독화된 뎅기 혈청형 2 균주 - Google Patents

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Abstract

본 발명은 PDK 세포 및 Vero 세포에서 계대 배양함으로써, 야생형 뎅기-2 균주 16681로부터 파생된 약독화된 신규한 VDV2(Vero-Derived Dengue serotype 2 virus) 생균주에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 VDV2 균주를 포함하는 백신 조성물에 관한 것이다.

Description

약독화된 뎅기 혈청형 2 균주{DENGUE SEROTYPE 2 ATTENUATED STRAIN}
본 발명은 PDK 세포에서 계대 배양하고 Vero 세포에서 위생처리한, 야생형 뎅기-2 균주 16681 유래의 약독화된 신규한 VDV2(Vero-Derived Dengue serotype 2 virus) 생균주에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 VDV2 균주를 포함하는 백신 조성물에 관한 것이다.
뎅기병은, 플라비바이러스(flavivirus) 속(Gubler, 1988)에 속하는, 항원성으로 구별되지만 매우 밀접하게 관련되어 있는 4가지 타입의 바이러스 혈청형에 의해 야기된다(Gubler, 1988; Kautner et al., 1997; Rigau-Perez et al., 1998; Vaughn et al., 1997). 뎅기 바이러스 혈청형에 감염되면, 비특이적인 바이러스성 증후군에서부터 치명적인 중증 출혈성 질환에 이르는 넓은 범위의 임상 질환이 발생할 수 있다. 뎅기열(DF)의 잠복기는 모기에 물린 후 평균적으로 4일(3-14일)이다. DF는 2상성 열(biphasic fever), 두통, 다양한 신체 부위의 통증, 쇠약, 발진, 림프절 병증(lymphadenopathy) 및 백혈구 감소증을 특징으로 한다(Kautner et al., 1997; Rigau-Perez et al., 1998). 바이러스 혈증의 기간(viremic period)은 열성 질환과 동일하다(Vaughn et al., 1997). DF로부터 완전히 회복되는데에는 통상 7 내지 10일이 소요되지만, 무력증이 장기간 계속되는 것이 일반적이다. 백혈구와 혈소판의 수 감소도 흔하게 나타난다.
출혈성 뎅기열(Dengue haemorrhagic fever, DHF)은 항상성의 이상과, 종종 심각한 내출혈을 동반한 저혈량증 및 저혈압(뎅기 쇼크 증후군, DSS)을 유도할 수 있는 혈관 투과성 증가를 특징으로 하는 중증 열성 질환이다. DHF의 치사율은 무치료시 10%로 높으며, 치료를 받는 경우에는 대부분 1% 미만일 수 있다(WHO Technical Guide, 1986).
뎅기 감염에 대한 일반적인 실험적 진단은 바이러스 분리 및/또는 뎅기 바이러스 특이적인 항체의 검출을 근거로 한다.
뎅기병은 말라리아 다음으로 두번째로 가장 중요한 열대성 감염 질환으로, 전세계 인구의 1/2 이상(25억)이 유행성 확산 위험성이 있는 지역에 살고 있다. 매년 뎅기병의 사례는 50,000,000 내지 100,000,000 건으로 추산되고 있으며, 이중 500,000건은 DHF로 입원하며, 25,000건은 사망한다. 뎅기는 아시아, 태평양, 아프리카, 라틴 아메리카 및 카리브해에 만연되어 있다. 100개국 이상의 열대 국가에는 풍토성의 뎅기 바이러스 감염증이 있으며, 이들 국가중 60개국 이상에서 DHF가 보고되었다(Gubler, 2002; Monath, 1994). 다음과 같은 특징적인 다수개의 인자들이 뎅기 감염증에 관여하는 것으로 보인다: 인구 증식(population growth), 특히 빈곤과 관련하여 무계획 및 무통제성 도시화, 비행기 이용 증가, 효과적인 모기 방제 부족, 및 위생 및 공공 건강 기반 시설의 퇴보(Gubler, 2002). 여행자 및 국외 거주자들 사이에서 뎅기에 대한 인식이 증가하고 있다(Shirtcliffe et al., 1998). 뎅기-유행성 열대지역에서 유행하는 기간동안에 미국 부대에서 발생되는 열병의 주된 원인은 뎅기인 것으로 입증되었다(DeFraites et al., 1994).
뎅기열 바이러스는 낮에 활동하는 인간 흡혈에 선호적인 가주성 모기인 이집트 숲 모기(Aedes aegypti) 및 인간과 연관된 사이클로 유지된다. 인간 감염은, 먼저 감염된 이집트 숲 모기가 흡혈하는 동안에 바이러스가 주입되어 개시된다. 타액의 바이러스는 혈관외 조직에 주로 머무른다. 주입된 후 감염되는 일차 세포 서브세트는 수지상 세포이며, 이후 유출성 림프절로 이동한다(Wu et al., 2000). 바이러스는 피부와 유출성 림프절에서 일차 복제된 후, 일반적으로 3 내지 5일간 급성 발열기 동안에 혈액에 출현한다.
단핵구 및 대식세포는 뎅기 바이러스의 일차 표적물 중에서도 수지상 세포와 함께 한다. 상동 기관의 재감염에 대한 방어는 완전하며 아마 평생 지속되지만, 뎅기 타입들 간의 교차 방어는 12주 미만으로 지속된다(Sabin, 1952). 그 결과, 개체는 다른 혈청형으로 이차 감염을 겪을 수 있다. 이차 뎅기 감염은 중증 뎅기병으로 발병할 수 있는 이론적인 위험 인자이다. 그러나, DHF는, 연루된 바이러스 균주 뿐만 아니라 환자의 연령, 면역 상태 및 유전적 소인을 포함하는, 다인자성 질환이다. 다음의 2가지 인자가 DHF 발생에 주된 역할을 한다: 높은 바이러스 혈증을 보이는 바이러스의 빠른 복제(질병의 심각성은 바이러스 혈증 정도와 관련있음)(Vaughn et al., 2000) 및 염증 매개체를 높은 수준으로 방출하는 중요한 염증 반응(Rothman and Ennis, 1999).
뎅기병에 대한 특이 치료제는 없는 실정이다. DF 처치는 침상 휴식, 해열제와 진통제에 의한 열 및 통증 통제, 및 적절한 수액 섭취로 이루어진다. DHF의 치료에는 체액 손실 보정, 응혈 인자의 대체 및 헤파린 주입이 요구된다.
현재 예방 조치들은 병원균 매개 동물의 방제와 개인적인 보호 조치에 의지하고 있지만, 이는 수행하기 어려우며 비용이 많이 든다. 현재, 승인된 뎅기 백신은 없다. 4가지 뎅기 혈청형이 전세계적으로 순환되고 있으며 DHF에 관여되는 것으로 보고되고 있기 때문에, 백신 접종은 이상적으로는 4가지 뎅기 바이러스 혈청형 모두에 대한 방어를 부여할 수 있어야 한다.
약독화된 생백신(Live attenuated vaccine, LAV)은 선천적인 면역성을 재생시키는 것으로, 뎅기와 동일한 종에 속하는 일부 바이러스를 포함하여, 수많은 질환에 대한 백신 개발에 사용되고 있다(예, 상업적으로 구입가능한 플라비바이러스 약독화된 생백신으로는 황열 및 일본 뇌염 백신이 있음). 약독화된 생바이러스 백신의 이점은 그것의 복제 능력과 체액성 및 세포성 면역 반응 둘다를 유도할 수 있는 능력이 있다는 것이다. 아울러, 전체 비리온 백신에 의해 유도된 바이러스의 여러가지 성분(구조 및 비구조 단백질)들에 대한 면역 반응은 자연적인 감염에 의해 유발되는 면역 반응을 재현한다는 것이다.
뎅기 백신 계획은 태국에 소재한 마히돌 대학의 과학기술 개발 기구인 백신 개발 센터에서 시작되었다. 약독화된 생백신에 대한 후보 백신이, PDK(primary dog kidney) 세포에서 뎅기 혈청형 1(균주 16007, 계대 13 = LAV1), 혈청형 2(균주 16681, 계대 53) 및 혈청형 4(균주 1036, 계대 48) 바이러스에 대해, 그리고, PGMK(Primary Green Monkey Kidney) 세포(계대 30) 및 FRhL(Fetal Rhesus Lung) 세포(계대 3)에서 혈청형 3(균주 16562)에 대해, 실험실 규모로 성공적으로 개발되었다. 이들 백신들은 태국의 지원자를 대상으로 1가(단일 혈청형), 2가(2종의 혈청형), 3가(3종의 혈청형) 및 4가(4종 모두의 혈청형) 백신으로서 테스트 되었다. 이들 백신들은 어린이 및 성인에서 안전하며 면역원성이 있는 것으로 확인되었다(Gubler, 1997). 이들 LAV 1-4 균주들은 마히돌 대학의 EP 1159968에 언급되어 있으며, 그 이전에 CNCM(CNCM I-2480; CNCM I-2481; CNCM I-2482 및 CNCM I-2483 각각)에 기탁되었다.
Den-2 균주 16681은 1964년 방콕에서 DFH(Dengue Hemorrhagic Fever) 환자의 혈청에서 회수되었다(Halstead et al., 1970). 바이러스 혈증을 보이는 최초 혈청은 BSC-1 세포(African Green Monkey kidney cell)에서 4번 계대 배양되었고, LLC-MK2 세포(Rhesus Monkey kidney cell)에서 5번 계대 배양되었다. 1977년에, 바이러스는 감수성 원숭이(Macaca Mulatta)에서 1회 생체내 계대 증폭되었고, 다시 LLC-MK2 세포에서 계대 배양되었다. 1980년에는 모기(Toxorhynchites amboinensis)에서 2번의 계대 증폭이 수행되었다. 바이러스 약독화는 PDK 세포(primary dog kidney cell)에서 32 ℃로 계대 배양에 의해 수행되었다. 균주의 약독화는 시험관내 및 생체내 마커 수종에 의해 체크되었다. 50회의 계대 배양시 이러한 약독화 기준을 모두 만족시켰으며, 53회 계대 배양물이 백신 생산용 마스터 종균(1982)으로서 선정되었다. DEN-2 PDK53 백신 후보물질은 인간에서 평가되었으며, 면역성이 높으며 원하지 않는 임상적인 신호나 증상은 없는 것으로 확인되었다.
약독화된 뎅기 2 바이러스 생균주(LAV2)의 전체 서열은 2001년에 R. Kinney 등(CDC, Fort Collins)에 의해 확립되었다. 모균주 DEN-2 16681(서열번호 3)과 LAV2(서열번호 38) 균주들 간의 서열 차이는 표 1에 나타낸다. 이에, 야생형 바이러스 균주인 16681과 LAV2 균주의 유전자를 비교한 결과, LAV2 약독화와 연결지을 수 있는 9개의 점 돌연변이 세트가 확인되었다.
DEN-2 16681 및 DEN-2 16681/PDK53(LAV2)의 서열 차이
Figure 112014006104976-pat00001
해당 코돈을 변형시키는 뉴클레오티드 변화는 볼드체로 나타낸다.
1983년에 최초로 확립된 LAV2 균주는, 또한 가능성 있는 백신 후보로 신속하게 확정되었다(Bhamarapravati and Yoksan, 1997).
그러나, 그 당시에 포유류 배양물을 통한 해면상 뇌염(Spongiform Encephalitis)의 인간 전파가 위험한 것으로 인지되지 않았으며, 바이러스는 통상 PDK(Primary Dog Kidney) 세포에서 유지되었다. 더욱이, 이 LAV2 균주는 혼성(heterogeneous) 개체이다. 이러한 혼성(heterogeneity)은 조성물에 존재하는 하나의 균주의 시험관내 또는 생체내 선별 가능성이 있어, 추가적인 위험이 있음을 의미한다.
이러한 우려가 증가되어, 출원인은 이러한 위험으로부터 벗어나기 위한 위생 공정을 확립하기로 결심하였다. LAV2 백신 균주를 PDK에서 Vero 세포로 먼저 이동시킨 다음 LAV2의 정제된 게놈 RNA를 Vero 세포에 형질감염시키고, 2번의 연속적인 바이러스의 플러그 정제 단계를 실시하여, 출원인은 신규한 Vero-유래 혈청형 2 바이러스(VDV2)를 만들었다.
Vero 세포로 전이되어 생물학적으로 클로닝됨으로써 파생된 신규한 VDV2 균주는, 서열, 동질적인 플라그 크기 및 온도 민감성이 LAV2 균주와 다르지만, 예컨대 감퇴 스팟(attenuation spot), 작은 플라그 표현형, 고온에서의 증식 제한과 같은 LAV2의 일부 표현형 및 유전자형 특징들이 보존되어 있으며, LAV2 균주의 면역원 특징들도 보존되어 있다는 점에서 중요하다. 이러한 특징들로 인하여, 상기 신규 균주는 예방 측면에서 인간을 면역화시키는 유용한 백신 후보물이 될 수 있다.
본 발명은 PDK 세포 및 Vero 세포에서 계대 배양함으로써, 야생형 뎅기-2 균주 16681로부터 파생된 약독화된 신규한 VDV2(Vero-Derived Dengue serotype 2 virus) 생균주 및 VDV2 균주를 포함하는 백신 조성물을 제공한다.
정의
"뎅기 바이러스"는 플라비리다에(flaviridae) 과의 플라비바이러스 속에 속하는, (+) 단일가닥 RNA이다. 뎅기 혈청형2(DEN-2) 균주 16681의 경우, 전체 서열은 10723개의 뉴클레오티드(서열번호 3)로 이루어져 있다. RNA 게놈에는 5'말단에 타입 1 캡(cap)이 있으며, 3'-말단 폴리(A)-테일(tail)은 없다. 유전자 구성은 5'-비코딩부(NCR), 구조 단백질(캡시드(C), 프리멤브레인/멤브레인(prM/M), 엔벨로프(E)), 비구조 단백질(NS1-NS2A-NS2B-NS3-NS4A-NS4B-NS5), 및 3' NCR이다. 바이러스 RNA 게놈은 C 단백질과 조합되어 뉴클레오캡시드(20면체 대칭)를 형성하고 있다. 다른 플라비바이러스와 같이, DEN 바이러스 게놈은 하나의 폴리단백질로 번역되는, 연속적인 오픈 리딩 프래임(ORF)을 코딩하고 있다.
뎅기-2의 병원성(질병을 유발하는) 균주를 수회 계대 배양하면, "살아있는 약독화"된, 즉 감염성은 있지만 질병은 유발하지 못하는, 변형된 바이러스 분리물이 생긴다. 이렇게 변형된 바이러스는 일반적으로 원숭이에서 테스트하여, 이들의 약독성을 평가한다. 그러나, 인간은 임상 질환의 증상을 나타내는 유일한 영장류이다. 테스트한 인간 대부분에서 (즉, 긍정적인 효과/위험 비로 표시되는, 규제하기 위한 측면에서 허용가능한) 중간 내지 낮은 효과를 유발하거나, 또는 부차적인 효과(즉, 전신 현상 및/또는 생물학적인 비정상성 및/또는 국부 반응)를 유발하지 않지만, 여전히 감염성을 보이며 면역 반응을 유도하는 바이러스를 "약독화된 생" 바이러스라고 한다.
용어 "LAV"는 약독화된 뎅기 생바이러스 균주를 나타낸다. 본 발명에서, "LAV"는 PDK 세포에서의 계대 배양에 의해 뎅기 혈청형 2(DEN-2) 균주 16681로부터 최초로 파생된 약독화된 생균주이다. 예컨대, "LAV2/PDK53"은 PDK 세포에서 균주 16681을 53회 계대 배양한 후 확립한 약독화된 균주이다(또한, DEN-2 16681/PDK53이라 명명됨). "LAV2/PDK50"은 PDK 세포에서 균주 16681을 50회 계대 배양한 후 확립한 약독화된 균주이다(DEN-2 16681/PDK50). LAV2/PDK53의 뉴클레오티드 서열은 서열번호 38에 나타낸다.
"VDV2"는 본 발명에 개시된 위생 처리 공정에 의해 수득가능한 LAV를 의미한다. 따라서, VDV2는 영장류, 특히 인간에서 중화 항체를 포함하여, 특이적인 체액성 면역 반응을 유도할 수 있는, 생물학적 클론(동일한) Vero-순응된 뎅기 혈청형2 바이러스이다. 본 발명의 VDV2 균주는 개시된 VDV2 서열로부터 출발하여 직접 쉽게 재구축할 수 있다. 특이적인 체액성 면역 반응의 유도는 ELISA 분석에 의해 용이하게 측정할 수 있다. 백신을 접종받은 개체의 혈청내 중화 항체의 존재는 섹션 4.1.1.2.2.에 언급된 바와 같이 플라그 감소 중화 테스트(plaque reduction neutralization test)로 평가한다. 그 결과 결정된 중화 항체의 역가가 1:10 보다 높거나 또는 1:10이면, 혈청은 중화 항체의 존재에 대해 양성인 것으로 간주된다.
용어 "돌연변이"는 유전적 물질, 예컨대 DNA, RNA, cDNA 또는 모든 과정, 기작의 검출가능한 모든 변화 또는 그러한 변화의 결과를 의미하다. 돌연변이는 한개 이상의 뉴클레오티드의 치환을 포함한다. 본 발명에서, 뎅기-2 바이러스 게놈 서열 또는 폴리단백질에서 확인된 돌연변이는 Dunnen 및 Antonarakis(2000)의 명명법에 준하여 명명된다. Dunnen 및 Antonarakis에 의해 정의된 바와 같이, 핵산 수준에서 치환은 ">"로 표시되며, 예로, "31A>G"는 기준 서열의 31번 뉴클레오티드가 A에서 G로 변경됨을 나타낸다.
단백질에서의 변이는 돌연변이의 결과를 나타내며, 하기와 같이 기재된다. 정지 코돈은 X로 명기된다(예, R97X는 Agr96의 종결 코돈으로의 변경을 나타냄). 아미노산 치환은 예컨대, 9번 Ser이 Gly으로 치환됨을 의미하는 "S9G"로 표시된다.
ero 유래 혈청형 2의 뎅기 바이러스( VDV2 )
기존에 개발된 뎅기-2 백신 후보체 LAV2의 조성물을 위생처리 공정에 의해 개량하였다.
본원에 개시된 Vero-유래 혈청형 2의 뎅기 바이러스(VDV2)는 PDK 세포에서의 연속적인 계대 배양에 의해 약독화된 DEN-2 16681 바이러스를 이용한다. VDV2는 약독화된 DEN-2 생바이러스의 전체 게놈 서열을 포함하고 있으며, 인간을 대상으로 테스트한 LAV2 원균주와 같이 약독화로 연결되는 동일한 스팟을 가지고 있다.
LAV2 백신 후보체의 위생 처리는 단백질 제거 단계 및 정제된 바이러스 게놈 물질만을 Vero 세포에 도입하는 단계에 의해 수행되었다. 보다 상세하게는, 균주의 위생 처리는 정제 단계 및 바이러스 RNA의 Vero 세포로의 형질전환시키는 단계로 수행되었다. 방법은 하기 단계를 포함한다:
a) 플라그-정제한 LVA2 균주, 예컨대 DEN-2 16681/PDK50 바이러스에서 바이러스 RNA를 추출 및 정제하는 단계;
b) 정제한 RNA를 양이온성 지질과 효과적으로 조합시키는 단계;
c) Vero 세포, 특히 Vero 세포 LS10에 형질감염시키는 단계;
d) 신규-합성된 바이러스를 회수하는 단계; 및
e) 플라그 정제에 의해 VDV 균주를 정제하고, 선택적으로 숙주 세포, 특히 Vero 세포에서 이를 증폭시키는 단계.
Vero 세포 기법은 여러가지 상업적인 제품(주사용 및 경구 폴리오 백신, 광견병 백신)에 사용되는 잘 알려져 있는 기법이다. 본 발명에서 이롭게는 외래 물질(adventitious agent)이 존재할 어떠한 위험도 없음을 보장하기 위해, 검증된(qualified) Vero 세포를 사용하였다. 본 발명에서, "검증된 Vero 세포"는, 배양 조건이 알려져 있는 세포 또는 세포주를 의미하며, 상기 세포는 임의 외래 물질이 없는 것이다. 이것으로는, 예컨대 Sanofi Pasteur의 Vero 세포 LS10이 있다.
그에 따라 분리된 VDV 균주는 동결 조성물 또는 동결건조 산물 형태 중 어느 한가지 형태로 관행에 따라 보관된다. 이를 위해, VDV는 희석제, 통상적으로 당 알코올 및 안정화제와 같은 동결보존성 화합물을 포함하는 완충화된 수용액과 혼합될 수 있다. 동결 또는 동결건조하기 전 pH는, 실온에서 pH 측정기로 측정시, 6 내지 9, 예컨대 pH 7.5 + 0.2와 같이 약 7로 설정하는 것이 좋다. 사용하기 전에, 동결건조된 산물은, 멸균 NaCl 4‰ 용액과 같은 약제학적인 희석제 또는 부형제와 혼합되어, 면역원성 액체 조성물 또는 백신으로 재구성된다.
LAV2 백신 균주의 NS3-250 위치의 Glu 변이체를 형질감염 및 클로닝하면서 선별하였으며, 또한 LAV2 백신의 약독화에 대한 기준으로서 동정된 5'NC-57 및 NS1-53 역시 VDV2 서열에서도 모두 보존되어 있었다.
형질감염한 후 회수된 바이러스의 약독화-특이 부위를 서열분석하였으나, 서열번호 38과 비교하여 어떠한 돌연변이도 확인되지 않았다. 생물학적으로 클로닝된 VDV2 바이러스는, 특히 약독화 표현형의 보존으로부터 유출할 수 있는 것처럼, 이의 LAV2 모균주와 상동한 플라그 표현형과 상당한 유전적 안정성을 갖는다.
VDV2 균주(11회 계대)를 서열 분석하였고, 혈청형 2 뎅기의 약독화된 생바이러스(LAV2) 균주의 서열(서열번호 38)과 비교하였다. M 및 Env 구조 펩티드와 또한 비구조 펩티드 NS3 및 NS5에 위치된 6개의 아미노산 치환을 촉발시키는 10개의 뉴클레오티드 차이가 확인되었다. 이러한 차이는 LAV2의 약독화 위치 중 어디에도 있지 않았다.
LAV2/PDK53 및 VDV2의 11회 계대 배양 균주 간의 서열 비교
뉴클레오티드 아미노산
위치 LAV2 VDV2 부위 위치 LAV2 VDV2
736
1619
1638
2520
4723
5062
9191
9222
10063
10507
G C
G A
A G
G A
T A
G C
G A
A G
T A
A G
M 9
E 228
E 234
NS1 33
NS3 69
NS3 181
NS5 541
NS5 551
NS5 832
3'nc -
G R
G E
K K
K K
S T
D H
R K
E E
S T
- -
회색 음영: 구조 단백질에서의 차이; 볼드체: 비구조 단백질에서의 차이
따라서, 본 발명은 PDK 세포에서 연속 계대 배양하고, 이후 Vero 세포에서 위생처리함으로써, 약독화된 야생형 DEN-2 16681 바이러스로부터 수득된 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주를 제공한다. 특히, 본 발명의 약독화된 균주는 야생형 DEN-2 16681 및 LAV2/PDK53 균주의 뉴클레오티드 서열 또는 폴리단백질 서열을 기준으로, 확인된 하나 이상의 서열 돌연변이(무-침묵 및 선택적으로 침묵)를 포함한다.
따라서, 본 발명은 LAV2/PDK53 균주(서열번호 38)의 서열을 포함하는, 또는 상기 서열로 구성된, 분리된 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주에 관한 것으로, 상기 서열에서 736, 1619, 4723, 5062, 9191, 10063 및 10507번, 그리고 선택적으로 1638, 2520, 9222 및 10361번의, 뉴클레오티드 중 한 개 이상은 돌연변이되어 있으며, 단, 57, 524, 2055, 2579, 4018, 5547, 6599 및 8571번의 뉴클레오티드는 돌연변이 되어 있지 않다. 바람직하기로는, 돌연변이는 치환이다. 바람직하기로는, 736번의 뉴클레오티드는 C이고, 1619번의 뉴클레오티드는 A이고, 4723번의 뉴클레오티드는 A이고, 5062번의 뉴클레오티드는 A이고, 9191번의 뉴클레오티드는 A이고, 10063번의 뉴클레오티드는 A이고, 10507번의 뉴클레오티드는 G이다.
5270번의 뉴클레오티드는 A 또는 T이며, 바람직하기로는, A이다.
더 바람직하기로는, 본 발명에 따라 분리된 균주는 돌연변이 736 G>C, 1619 G>A, 4723 T>A, 5062 G>C, 9191 G>A, 10063 T>A 및 10507 A>G와, 선택적으로 1638 A>G, 2520 G>A 및/또는 9222 A>G를 포함하는, 서열번호 38의 서열을 포함한다.
이에, 본 발명에 따른 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주는, 57 C>T, 524 A>T, 736 G>C, 1619 G>A, 2055 C>T, 2579 G>A, 4018 C>T, 4723 T>A, 5062 G>C, 5547 T>C, 6599 G>C, 8571 C>T, 9191 G>A, 10063 T>A 및 10507 A>G 중 한가지 이상의 돌연변이를 포함하는, 야생형 뎅기-2 균주 16681(서열번호 3)의 서열을 포함하거나, 또는 상기 서열로 구성될 수 있다. 바람직하기로는, 본 발명에 따른 약독화된 생균주는 야생형 균주 16681의 뉴클레오티드 서열(서열번호 3)을 기준으로 1638 A>G, 2520 G>A 및/또는 9222 A>G 돌연변이를 더 포함한다.
본 발명에 따른 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주는, 전술한 바와 같이, 736, 1619, 4723, 5062, 9191, 10063 및 10507번이 돌연변이된 서열번호 3의 서열을 포함하고 있으며, 해당 코돈 위치에서 코딩하고 있는 아미노산을 변이시키지 않고서 그 코돈 위치에 하나 이상의 뉴클레오티드 치환을 더 포함하고 있는 변이체 균주이다.
이롭게는, 본 발명에 따른 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주는 서열번호 1에서 한정된 수의 돌연변이, 예컨대 5개 이하, 바람직하기로는 2개 이하의 돌연변이가 있는, 서열을 포함한다.
바람직하기로는, 본 발명에 따른 뎅기-2 바이러스의 게놈 서열은 서열번호 1의 뉴클레오티드 서열로 구성된다.
또한, 본 발명은 세포, 특히 Vero 세포에서의 추가적인 계대 배양에 의해 서열번호 1의 서열을 가진 VDV2 균주로부터 파생될 수 있는, 약독화된 뎅기-2 생균주에 관한 것이다.
또한, 본 발명은 서열번호 1의 DNA 서열 또는 이의 등가 RNA 서열을 포함하거나, 또는 서열로 구성되는 분리된 핵산에 관한 것이다.
"핵산 분자"는, 단일가닥 형태 또는 이중가닥 나선형의, 리보뉴클레오시드(아데노신, 구아노신, 우리딘 또는 시티딘; "RNA 분자") 또한 데옥시리보뉴클레오시드(데옥시아데노신, 데옥시구아노신, 데옥시티미딘 또는 데옥시시티딘; "DNA 분자")의 포스페이트 에스테르 폴리머형, 또는 포스포로티오에이트 및 티오에스테르와 같은 이의 모든 포스포에스테르 유사체이다.
본원에서, 서열번호 1의 RNA 서열 "등가체"는 서열번호 1에서 데옥시티미딘이 우리딘으로 치환된 것을 의미한다. 서열번호 1은 VDV2 cDNA 서열을 구성하므로, 따라서 이의 RNA 등가 서열은 VDV2의 (+) RNA 가닥에 해당된다.
본 발명은 또한 서열번호 2의 서열을 포함하는 폴리단백질 및 이의 단편에 관한 것이다. 서열번호 2는 서열번호 1에 의해 엔코딩된 폴리단백질 서열이다.
기준 단백질의 "단편"은 기준 단백질의 보존적인 아미노산 체인을 포함하는 서열의 폴리펩티드이다. 단편의 아미노산 길이는 8개 이상, 12개 이상 또는 20개 이상일 수 있다.
서열번호 2의 폴리단백질의 단편은 적어도 M 단백질의 9번(서열번호 2의 214번)에 아르기닌, 및/또는 E 단백질의 228번(서열번호 2의 508번)에 글루탐산, 및/또는 NS3 단백질의 69번(서열번호 2의 1543번)에 트레오닌, NS3 단백질의 181번(서열번호 2의 1656번)에 히스티딘, 및/또는 NS5 단백질의 541번(서열번호 2의 1725번)에 라이신, 및/또는 NS5 단백질의 832번(서열번호 2의 3032번)에 트레오닌을 포함한다.
예로, 서열번호 1에 의해 엔코딩되는 폴리단백질의 단편은 M 단백질, E 단백질, NS3 단백질 및/또는 NS5 단백질이거나 또는 이를 포함한다.
면역성 및 백신 조성물
또한, 본 발명은 본 발명에 따른 VDV2 균주를 포함하는, 백신으로서 사용하기에 적합한, 면역성 조성물에 관한 것이다.
본 발명에 따른 면역성 조성물은 중화 항체를 포함하는 뎅기 바이러스에 대해 특이적인 체액성 면역 반응을 도출한다.
바람직하기로는, 면역성 조성물은 백신이다.
예로, 면역성 조성물은 일가 조성물이며, 즉, 이 조성물은 뎅기-2 바이러스에 대해서만 특이적인 면역 반응을 나타내거나/나타내고, 방어를 부여한다.
다른 예로, 본 발명은 다가 뎅기 면역성 조성물에 관한 것이다. 이러한 다가 면역성 조성물 또는 백신은 개별적인 일가 뎅기 백신들을 조합함으로써 수득할 수도 있다. 면역성 조성물 또는 백신 조성물은 다른 혈청형의 약독화된 뎅기 생바이러스 하나 이상을 추가적으로 포함할 수 있다. 특히, 면역성 조성물 또는 백신 조성물은, 본 발명에 따른 VDV2를, 혈청형 1, 3 및 4로 이루어진 군으로부터 선택된 한가지 이상의 약독화된 뎅기 생바이러스와 조합하여, 포함할 수 있다.
바람직하기로는, 면역성 조성물 또는 백신 조성물은, 4가 뎅기 백신 조성물, 즉 본 발명에 따른 VDV2를 약독화된 뎅기-1 바이러스 생균주, 약독화된 뎅기-3 바이러스 생균주 및 약독화된 뎅기-4 바이러스 생균주와 조합하여 포함하는 백신 조성물일 수 있다.
약독화된 뎅기-1, 뎅기-3 및 뎅기-4 바이러스 생균주는 이미 개시되어 있다. 뎅기 혈청형1(16007 균주, 13회 계대 배양; LAV1) 및 혈청형 4(1036 균주, 48회 계대 배양, LAV4) 바이러스를 PDK(Primary Dog Kidney) 세포에서, 혈청형 3(16562 균주)을 PGMK(Primary Green Monkey Kidney) 세포(30회 계대 배양) 및 FRhL(Fetal Rhesus Lung) 세포(3회 계대 배양)(LAV3)에서, 계대 배양하여 얻어진, 마히돌 대학에서 개발한 약독화된 생 백신을 참조할 수 있다. LAV1(서열번호 40), LAV3(서열번호 41) 및 LAV4(서열번호 42)의 뉴클레오티드 서열들은 첨부한 서열목록에 나타나있다.
이롭게는, 약독화된 뎅기-1 생균주는, 마히돌 대학에서 개발한 LAV1 균주를 Vero 세포에서의 위생 처리 공정에 의해 수득한 VDV1 균주일 수 있다. 특히, 약독화된 뎅기-1 생균주(VDV1)는 서열번호 39의 서열을 포함할 수 있으며, 이롭게는 상기 서열로 구성될 수 있다.
백신을 포함한 면역성 조성물은 액체 용액, 현탁액 또는 유제일 수 있는 주사제로서 제조할 수 있다. 활성 면역성 성분을 이와 혼용가능한 약제학적으로 허용가능한 부형제와 혼합할 수 있다.
본 발명에 따른 면역성 조성물 또는 백신은 당업자에게 공지된 모든 통상적인 방법을 이용하여 제조할 수 있다. 통상적으로, 본 발명에 따른 항원을 물 또는 포스페이트 인산화된 염수 용액, 습윤제, 충진제, 유화제, 안정화제와 같은 약제학적으로 허용가능한 희석제 또는 부형제와 혼합한다. 부형제 또는 희석제는 투여 방법과 경로, 그리고 약학 실무에 따라 선택되는 약학 형태에 따라, 선택될 것이다. 적합한 부형제 또는 희석제, 그리고 약학 제형의 요건은 약학 분야의 참고 도서인 Remington's Pharmaceutical Sciences에 기재되어 있다.
바람직하기로는, 면역성 조성물 또는 백신은 예컨대 pH(실온에서 pH 측정기로 측정하는) 6 내지 9를 유지하도록 완충화된 수용액을 포함하는, 주사 조성물이다.
본 발명에 따른 조성물은 보강제, 즉 VDV2 균주에 의해 도출되는 면역 반응을 개선 또는 강화하는 물질을 더 포함할 수 있다. 인간 백신에 일반적으로 사용되는 약제학적으로 허용가능한 보강제 또는 보강제 혼합물을 상기한 목적으로 사용할 수도 있다.
본 발명에 따른 면역성 조성물 또는 백신은, 본 발명에서 비경구(예, 진피내, 피하, 근육내) 경로와 같이, 인간 백신 분야에서 일반적으로 사용되는 통상적인 경로로 투여할 수 있으며, 면역성 조성물 또는 백신은 바람직하기로는 어깨 삼각근에 피하 투여되는 주사 조성물이다.
면역화 방법
본 발명은 본 발명에 따른 면역성 조성물 또는 백신을 면역유효량으로 숙주에게 투여하는 단계를 포함하는, 면역화를 필요로 하는 숙주에 뎅기 감염을 면역화시키는 방법을 제공한다.
"면역화를 필요로 하는 숙주"는 뎅기 감염 위험이 있는 사람, 즉 뎅기 바이러스 감염이 유행중인 지역으로 여행하는 사람과 그 지역의 거주자이다.
투여 경로는 백신 분야에서 통상적으로 사용되는 모든 경로이다. 투여 경로의 선택은 선택되는 제형에 따라 결정된다. 바람직하기로는, 면역성 조성물 또는 백신은 이롭게는 삼각근에 피하 경로를 통해 투여되는 주사용 조성물이다.
면역성 조성물 또는 백신내 LAV 또는 VDV, 특히 VDV2의 양은 바이러스 플라그 형성 단위(PFU) 또는 세포 배양 감염량 50%(Cell Culture Infectious Dose 50%, CCID50)의 투여량 형태로 일반적으로 표현할 수 있으며, 통례적인 약학 기법을 이용하여 측정할 수 있다. 예로, 본 발명에 따른 조성물은 10 내지 106 CCID50, 또는 103 내지 105 CCID50의 LAV 또는 VDV를 포함하는 투약 형태로 제조할 수 있으며, 예로, 일가 조성물의 경우 VDV2 균주 4 + 0.5 log10의 CCID50을 포함할 수 있다. 조성물이 다가 조성물일 경우, 바이러스 간섭 가능성을 낮추고 그에 따라 안정된 면역 반응(즉, 조성물에 포함된 모든 혈청형에 대한 면역 반응)을 달성하기 위하여, 투여된 백신에 존재되는 여러가지 뎅기 혈청형 각각의 양은 동등하지 않을 수 있다.
"면역유효량"은 섹션 4.1.1.2.2에 개시한 바와 같이 플라그 감소 중화 테스트 평가에 따라, 백신 접종자의 혈청내 중화 항체를 포함하여 특이적인 체액성 면역 반응을 유도할 수 있는 함량이며; 그에 따라 측정된 중화 항체 역가가 1:10 이상이거나 또는 1:10일 경우 혈청에는 중화 항체가 있는 것으로 간주된다.
투여 부피는 투여 경로에 따라 변경될 수 있다. 피하 주사제의 부피는 약 0.1 ml 내지 1.0 ml, 바람직하기로는 0.5 ml일 수 있다.
조성물의 최적 투여 시간은 뎅기 바이러스에 최초 노출되기 전 약 1달 내지 3달이다. 본 발명의 백신은 뎅기 감염 위험성이 있는 성인이나 어린이를 대상으로 예방제로서 투여될 수 있다. 따라서, 표적이 되는 집단은 뎅기 바이러스에 대해 무경험자 및 경험자를 포함한다. 본 발명의 백신은 단회 투여로 투여될 수 있으며, 또는 선택적으로, 투여는 당업자가 적합하게 결정한 바에 따라 일차 접종하 다음 예컨대 2-6달 후 추가(booster) 접종으로 이루어질 수 있다.
본 발명은 하기 도면 및 실시예를 들어 보다 상세히 설명된다.
본 발명은 PDK 세포 및 Vero 세포에서 계대 배양함으로써, 야생형 뎅기-2 균주 16681로부터 파생된 약독화된 신규한 VDV2(Vero-Derived Dengue serotype 2 virus) 생균주 및 VDV2 균주를 포함하는 백신 조성물을 제공한다.
도 1은 VDV2 프리-마스터(pro-master) 종균의 역사를 종합한 것이다.
도 2는 FILLED Product(일가) "즉시 사용가능한(ready to use)" 투약제를 만드는 개발 제조 경로를 요약한 플로우 차트이다.
도 3은 VDV2 게놈 맵을 개략적으로 표시한 것이다. 상위 화살 표시는 폴리단백질의 코딩 서열이다. 하위 화살 표시는 성숙형 펩티드의 코딩 서열이다. 수직 바는 야생형 뎅기 2 균주 16681과 LAV2 균주 간의 뉴클레오티드 차이를 나타낸 것이다. 별 표시는 LAV2와 VDV2 간의 뉴클레오티드 차이를 나타낸다.
도 4는 뎅기-2 바이러스 LAV2, VDV2, 및 균주 16681을 37 ℃에서 7일간 배양한 후 플라그 크기를 분석한 것이다.
도 5는 뎅기-2 바이러스 LAV2, VDV2 및 균주 16681에 대한 플라그 크기 분포를 나타낸 그래프 분석도이다.
도 6은 플라비바이러스를 경험하지 않은 건강한 성인을 대상으로 VDV2 일가의 안전성을 평가하기 위한 실험 설계를 요약한 것이다.
실시예 1: 위생 처리
1.1 바이러스 RNA 정제
RNA 정제 및 형질감염 과정은 하기와 같이 수행하였다. DEN-2/PDK50 현탁액을 0.5 ml의 물에 재현하고, ml 당 바이러스가 적어도 3 x 104 에서 최대 3 x 107 TCID50 또는 PFU로 함유되도록 희석하였다. DNA 또는 RNA 분자를 세포성 물질에서 분해시키기 위해, 윌리암 배지 0.01 ml에 희석시킨 벤조나제 1 unit을 바이러스 0.5 ml에 첨가하고, 이 용액을 교반기에서 2 시간동안 4℃에서 배양하였다. 배양 단계 후, 구아니듐 클로라이드, 용제(SDS) 및 베타-머캅토에탄올(RTL-bmercaptoethanol buffer, RNeasy Mini kit내 제공, Qiagen Ref. 74104)을 포함하는 변성 완충액 0.65 ml을 첨가하고, 페놀/클로로포름(1/1)(v/v) 1번, 클로로포름(v/v)으로 1번 단백질을 추출한 다음, 실온에서 5분간 14,000 rpm으로 원심분리하였다. 각 추출 후, 경계면의 물질(백색 침전물)을 취하지 않도록 조심스럽게 수상을 모아, 깨끗한 1 ml 에펜도르프(eppendorf) 튜브로 이동시켰다. 이후, 잔류 용매를 제거하기 위해 제조사의 권고안에 따라 RNA 용액을 QIAgen 컬럼(RNeasy minikit, QIAgen)에 적용한 다음 0.06 ml의 뉴클레오티드 결핍성 물로 용출시켰다. 바이러스 RNA의 존재는 함량을 알고 있는 바이러스로 확립한 기준 곡선을 이용하여 정량적인 RT-PCR로 TCID50/ml로 확인하였다.
1.2 정제한 RNA Vero 세포 형질감염
형질감염은 전하 상호작용을 통해 RNA에 조합하여, 세포 막 융합에 의해 복합체를 세포질내로 전이시키는 양이온성 지질들의 혼합물인 리포펙타민(LF2000 Reagent, Life Technologies)을 이용하여 수행하였다. LF2000 시약의 최적량은, 리포펙타민의 양을 증가시키면서(5 내지 20 ㎕), 16 내지 24시간 전에 접종한 Vero 세포의 배양(0.3- 0.5 x 106 세포/웰, 6웰 플레이트)에 의한 예비 실험으로 결정하였다. 이후, 세포를 4 - 5 시간동안 32℃ 및 5% CO2에서 배양하고, 배지를 FCS 무첨가한 새로운 배양 배지로 교체한 다음, 32℃에서 계속하여 철야 배양하였다. 독성(둥근 세포, 굴절성 세포 또는 부유성 세포, 세포 단일층의 동질성)을 도립 현미경으로 48시간동안 규칙적으로 체크하였다. 이러한 조건에서 무독한 리포펩타민의 최대량은 10 ㎕이었으며, 이를 RNA 형질감염에 사용 수치로 선택하였다.
RNA 조제물의 1/4(약 2 x 104 log eqTCID50, qRT-PCR)을 사용하여 4세트의 형질전환을 동시에 수행하였다. 바이러스 RNA 용액 25 ㎕을 15 ㎕의 LF2000 시약(전하 상호작용을 통해 RNA와 조합하여, 세포 막 융합에 의해 복합체를 세포질내로 전이시키는 양이온성 지질들의 혼합물)을 포함하는 500 ㎕의 OptiMEM 배지 (GIBCO)로 희석하였다. 효소 tRNA 200 ng을 4개의 반응물중 2개에 담체로서 첨가하였다.
4개의 형질감염 혼합물을 10분간 실온에서 침강되게 둔 다음 컨플루언트 Vero 세포가 있는 6웰 플레이트에 첨가하고, 32℃에서 배양하였다. 4시간 후, 형질감염 혼합물은 버리고 세포를 PBS로 한번 헹구었다. 형질감염 후 배지(Williams, GIBCO) 3 ml을 첨가하여, 32℃에서 5일간 연속 배양하였다. 배양 배지는 뎅기 감염 배지(10 mM MgSO4이 첨가된 Williams) 3 ml로 교체하였다.
tRNA의 존재하에 형질감염시킨 2개 웰 중 1개의 웰에서, 형질감염 8일 후에, 전형적인 세포 변성 효과가 있는 세포(둥근, 굴절성 세포)가 검출되었다. 이 세포의 상층액내 바이러스 분비는 qRT-PCR로 확인하였다. 형질감염 11일 후에, 단지 상기 웰에서만 현저한 세포 변성 효과가 검출되었으며, 나머지 3개의 형질감염을 수행한 웰의 상층액에서는 검출되지 않았다.
형질감염 후 회수한 바이러스 용액은 (16681 PDK50/Vero-2 대신) TV100이라 명명하였으며, 냉동보호제가 포함된 완충화된 수용액(pH = 7.5)로 1/2 희석한 후의 감염 역가는 5.8 log TCID50/ml이다.
1.3 형질감염 후 회수한 바이러스의 특정화
약독화에 중효한 특이 부위의 점 서열분석을 R. Kinney(CDC, Fort Collins)에서 수행하였다. 그 결과는 표 3에 나타낸다.
형질감염된 바이러스의 약독화 특이 위치의 서열분석
바이러스 5'NC-57
Nt57
NS1-53
Nt2579(aa)
NS3-250
Nt 5270(aa)
DEN-2 16681 C G(Gly) A(Glu)
DEN-2 PDK53 T A(Asp) T/A(Val/Glu)
TV100 T A(Asp) A(Glu)
VDV2는 5'NC-57 및 NS1-53에 중요한 약독화 부위와, PDK53 백신에서 NS3-250-Glu 변이체의 야생형 16681 부위를 유지하고 있다. PDK53 백신에서 NS3-250- Glu/Val 혼합은 계대 배양물 PDK45 및 PDK53 간에 안정적인 것으로 관찰되어, Vero 세포에서 선택되는 것으로 제안되었다. 백신 접종자의 혈청으로부터 분리된 DEN-2 백신의 사전 분석으로, 이러한 선별 역시 인간에서 이루어질 수 있는 것으로 입증되었다.
바이러스 플라그의 직경은 Vero 세포에서 측정하였다. 간략하게, Vero 세포를 FBS를 4% 포함하는 배양 배지중에 밀도 1,000,000 cells/cm2로 접종하였다. 철야 배양한 후, 배지를 제거하고, 세포에 바이러스 2배 또는 5배 연속 희석물을 감염시켰다. 1.5시간동안 37℃, 5% CO2에서 배양한 후, 접종원을 제거하고, 세포를 1.26% 메틸셀룰로스 및 10% FBS가 포함된 최소 이글 배지(MEM)에서 37℃, 5% CO2에서 배양하였다. 11일간 배양한 후, 플레이트는 -20℃의 차가온 아세톤내에 20분간 방치하고, 2.5 ㎍/ml으로 희석시킨 플라비바이러스 특이 mAb를 이용하여 면역발색시켰다. 바이러스 플라그는 이미지 분석 소프트웨어(Saisam/Microvision)를 이용하여 측정하였다.
VDV2를 LAV2 16681/PDK50 종균과 비교하였고(표 4), 이는 1-3 mm 직경의 유사한 동질적인 소형 플라그를 나타내었다.
LAV2 16681/PDK50 및 VDV2의 플라그 크기
단계 바이러스 LP/MP SP
형질감염 전 LAV2 PDK50
형질감염 후 클로닝되지 않은 VDV2
0 319
0 183
LP/MP: 6웰에서 대형/중형 플라그의 수
SP: 6웰에서 소형 플라그의 수
1.4 플라그 -정제
추가적인 3회 증폭 계대 배양(P2 -> P4)를 형질감염 후 회수한 바이러스를 대상으로 수행하였다. 플라그-정제에 의한 생물학적 클로닝을 P3 및 P4 계대 배양한 바이러스(각각 LST 003 및 LST 007이라 명함)를 대상으로 수행하였다.
간략하게는, Vero 세포를 6웰 플레이트에 접종하고, 플레이트에 1 내지 20개의 플라그를 얻기 위해 바이러스 연속 희석물을 감염시켰다. 37℃, 5% CO2에서 1.5 시간 후에, 접종원을 제거하고 세포를 42℃에서 미리 열처리된 MEM-10% FCS로 이루어진 고형 배지를 42℃의 용해된 2% 아가와 즉시 혼합한 배지 3 ml하에서 배양하였다. 배지는 실온에서 플로우 후드 하에서 30분간 굳게 두었고, 플레이트는 뒤집은 상태로 10일간 32℃ - 5% CO2에서 배양하였다. 0.01% 중성 레드가 보충된 동일 배지의 두번째 층을 적층한 다음, 플레이트를 32℃에서 하룻밤 더 배양하였다. 잘 고립되어 있는 작은 플라그 6개를 0.1 ml 팁이 장착된 마이크로파이펫을 이용하여 멸균 조건하에서 취하여, 0.2 ml의 MEM-4% FCS가 있는 멸균 튜브로 옮겼다: P3 계대에서 3개(클론 31, 32 및 33)과 P4 계대에서 3개(클론 71, 72 및 73). 이를 동일 배지로 연속 희석하여 혼합함으로써 현탁액을 균질하게 한 다음, 이를 바로 Vero 세포의 6-웰 플레이트 감염에 사용하였다. 프로토콜을 반복하여, 2개의 SP를 클론 32, 33, 71 및 72에서, 하나의 SP를 클론 31에서 두번째로 취하였다. 취한 각각의 플라그는 배지 1 ml에 희석하고, T25 cm2 플라스크에서 Vero 세포 증폭을 수행하였다. 감염 6일째에 배양 배지를 취하여, 동량의 냉동보호제가 함유된 완충화된 수용액(pH 7.5)으로 희석하고, -70℃로 냉동시켰다. 상기 단계 모두 32℃에서 수행하였다.
플라그-정제된 바이러스는 각각 311, 321, 322, 331, 332, 341, 342, 351, 352, 711, 712, 721 및 722라고 명명하였다.
감염 역가는 1차 증폭이 끝난 시점에 Vero 세포에서 결정하였다(하기 참조):
클론 311: 3.95 LogCCID50/ml
클론 321: 5.20 LogCCID50/ml 클론 322: 5.45 LogCCID50/ml
클론 331: 5.55 LogCCID50/ml 클론 332: 4.95 LogCCID50/ml
클론 341: 2.80 LogCCID50/ml 클론 342: 4.85 LogCCID50/ml
클론 351: 5.35 LogCCID50/ml 클론 352: 5.50 LogCCID50/ml
클론 711: 5.45 LogCCID50/ml 클론 712: 5.65 LogCCID50/ml
클론 721: 5.30 LogCCID50/ml 클론 722: 5.60 LogCCID50/ml
Vero 세포에서의 이차 증폭을 3개의 클론: 클론 331, 352 및 722로 수행하였다. 배양 상층액을 형질감염 8일 후에 모아 냉동보호제가 포함된 완충화된 수용액(pH7.5)로 1/2 희석하여, TV331, TV352 및 TV722라고 명하였다.
1.5 클로닝된 바이러스의 특정화
1차 증폭 후, 증폭된 바이러스 모두 동일한 플라그 크기 표현형을 보였으며, (현저하게 낮은 크론 311 및 341을 제외하고는) 5 logCCID50/ml 또는 그 이상의 역가를 나타내었다. 1차 증폭한 6개의 클론(클론 321, 331, 351, 352, 711, 721)과 2차 증폭한 클론 3개를 대상으로, 약독화-특이 위치에 대한 서열분석을 수행하였으나, 돌연변이는 발견되지 않았다.
클론들간에도 어떠한 현저한 차이가 없어, VDV2 백신 후보 균주를 제조하기 위해, TV722를 선택하여 Vero 세포에서 증폭시켰다.
DEN-2 바이러스의 약독화 특이 위치의 서열분석
5'-UTR prM E NS1 NS2a NS3 NS4A NS5
단계/세포 바이러스 57 524 2055 2579 4018 5270 5547 6599 8571
야생형/PGMK 16681 C A C G C A T G C
백신/PDK PDK53 T T T A T A/T C C T
이차 플라그 정제/Vero TV321 T T T A T A C C T
TV331 T T T A T A C C T
TV342 T T T A T A C C T
TV352 T T T A T A C C T
TV711 T T T A T A C C T
TV722 T T T A T A C C T
2차 증폭/Vero TV722PM T T T A T A C C T
뉴클레오티드 위치는 각 유전자 하기에 나타내며, DEN-2 16681 균주의 공개된 서열을 참조한다.
결론적으로, Vero 세포에서 순응된 DEN-2 16681/PDK50의 생물학적 클론을 수득하는데에는 총 11번의 계대 배양이 필요하였다.
또한, VDV2의 11회 계대 배양주의 전체 서열을 결정하고 표현형을 확인하여, 특정화를 수행하였다.
실시예 2: 서열분석
하기 전략에 따라 바이러스의 전체 서열을 제조하였다. 바이러스 게놈 RNA를 정제하였다. 전체 게놈은 16번의 중첩성 RT-PCR 반응에 의해 증폭하였다. 각 PCR은 서열분석 테그가 각 DNA 가닥에 부가되도록 설계하였다. 이는 보편적인 서열분석 프라이머 한쌍에 의해 수행되는 간단한 서열 반응을 가능하게 한다. 각 PCR 산물을 양쪽 DNA 가닥에 대해 먼저 서열분석하였다. 모든 결과를 조합하여, 전체 VDV2 게놈을 재구축하였다.
2.1 재료
2.1.1 바이러스
본원에서 참조되는 바이러스는 DEN-2 16681; LAV-2/PDK53; VDV2이며, 이들의 서열은 첨부된 서열 목록에 기재되어 있다.
이들 바이러스의 전체 게놈 서열은 10723개의 뉴클레오티드로 이루어져 있다.
2.1.2 프라이머
모든 프라이머는 프라이머 디자인 모듈인 Seqweb bioinformatics package (Accelrys)로 설계하였다(표 6)
RT-PCR 및 프라이머 서열 리스트
Figure 112014006104976-pat00002
2.2 방법
2.2.1 바이러스 RNA 정제
이전의 실험에서, 다음 단계에서 RT-PCR 양성 반응을 얻는데에는 최소 1000 DICC50이 필요하였다. 이는, 바이러스 최소 역가 104 DICC50/mL이 필요하다는 것을 의미한다. 바이러스 게놈 RNA를 제조사의 권고안에 따라 QIAamp 바이러스 RNA 미니 키트(Qiagen)로 정제하였다. 간략하게는, 바이러스 조 샘플 중 140 ㎕을 라이시스 용액 존재하에 배양하여, 키트 컬럼에 주입하였다. 세정한 다음, RNAse 저해제(RNAse Out, Sigma) 1 ㎕(40 units)가 함유된, 뉴클레아제 결핍성 멸균수 60 ㎕로, 정제된 바이러스 RNA를 용리시켰다.
2.2.2 역전사
바이러스 RNA를 ABGene사의 역전사효소(reverse iT)를 사용하여 cDNA로 역 전사하였다. 즉, 10 ㎕의 정제된 RNA를 최종 반응 부피 20 ㎕로 표준 조작 조건을 적용하였다. 반응은 (-) 가닥 프라이머의 혼성화로 개시하였다. PCR 당 한번의 RT 반응을 수행하였다. cDNA 합성은, 47℃에서 45분간 인큐베이션하여 수득하였다.
2.2.3 PCR
모든 PCR은 표 6의 16쌍의 프라이머 (+) 및 (-)를 이용하여 연장된 고정확성 PCR 시스템(Expand High Fidelity PCR system, Roche diagnostics)으로 수행하였다:
RT 2㎕
10x 완충액 2.5㎕
dNTP mix (10mM) 2㎕
프라이머 각 0.8㎕
물 16.4㎕
효소 0.5㎕
PCR 프로그램
변성: 94℃, 2 분 -> (변성: 94℃, 15 초 -> 혼성화: 55℃, 30 초 -> 연장: 68℃, 1 분): 40회 -> 연장: 68℃, 5 분
모든 PCR 산물은 아가로즈 젤상에서의 전기영동으로 관리되었다.
2.2.4 서열분석
서열분석 반응 대부분은 Genome Express 사에서 실시하였다. 게놈 양극단, 모호한 부분, 일부 인터-PCR 정션 및 기술적인 이유로 Genome Express에서 분석되지 않는 영역은 사내에서 수행하였다.
- Genome Express에서의 서열분석: PCR 산물은 +4℃에서 취급하였고, 서열분석 결과는 서열 정보 파일로 수득하였다. 텍스트 파일, 정성 파일 및 크로마토그램은 각 개별 서열에 대해 이용가능하다. 서열 정렬을 수행한 후, 크로마토그램상에서 일치되지 않는 부분을 모두 체크하고, 서열 알고리즘 에러로 파악되는 것은 보정하였다.
- 사내 서열분석: 서열 반응은 Sequitherm Excell II LC kit (Epicentre)를 이용하여 써모사이클러 PTC-200(MJ Research)으로 수행하였다. 각 PCR 산물은 단일 반응으로 독립적으로 양쪽 가닥을 서열 분석하였다. 반응물은 서열 전기영동 젤에 로딩하였다. 전개 및 서열 분석은 자동 서열분석기인 Gene ReadIR 4200 (Li-Cor)에서 수행하였다.
- 서열분석 반응물
DNA 최대 200/250 ng
반응 완충액 7.2㎕
프라이머(1-2 pM) 각 1.5㎕
효소 1㎕
물 최종 부피 20㎕으로 잔량 첨가
PCR 프로그램
변성: 92℃, 2분 -> (변성: 92℃, 15 초 -> 혼성화: 50℃, 30 초 -> 연장: 70℃, 1 분): 30회 -> 연장: 70℃, 10 초
변성/로딩 완충액 3 ㎕을 첨가한다.
샘플의 변성은 95℃에서 3분간 수행하고 샘플 로딩 전까지 얼음에서 냉각시킨다.
-서열분석을 위한 전기영동
전기영동 파라미터:
전압 1500 V
전류 35 mA
전력 40 W
수행 시간 9시간
젤 파라미터:
젤의 길이 41 cm
젤의 두께 0.2 mm
온도 45℃
스캔 속도 3
2.3 결과
모든 PCR 단편은 테일이 부가된 일반 PCR, 즉 모든 프라이머의 5' 말단에 부가된 특이적인 모티프를 이용하여 양 말단으로부터 서열분석하였다.
5' 프라이머: M13SEQ-GTTTTCCCAGTCACGAC (서열번호 36)
3' 프라이머: M13REV-AACAGCTATGACCATG (서열번호 37)
M13-SEQ 및 -REV 서열은 보편적인 M13 프라이머 모티프(New England Biolabs references)에 상응한다.
마지막 단편 조립(contig assembly)을 위해, ContigExpress module (Informax)의 Vector NTi에서 신속한 분석을 수행하였다. LAV2 기준 서열을 각 서열분석 결과 모두와 비교하였다. 그 결과, 일부 영역에 단편 조립이 여전히 없을 경우에도 모든 결과는 전체 게놈에서 우측으로 정렬되었으며, 이는 전체 게놈 정렬을 신속하게 보여준다.
2.3.1 완전한 VDV2 서열 조립
최종 서열 정렬을 Vector NTi, AlignX module (Informax)에서 수행하였다. 고전적인 다중 서열 정력 알고리즘 ClustalW(Thompson et al., 1994)을 소프트웨어로 구동하여, 전체를 정렬하였다. 모든 서열 결과를 LAV2 기준 서열과 함께 정렬하였고, 그 결과 게놈을 보다 잘 재구축할 수 있었다. 기준 서열에 대해 나타나는 모든 서열 차이는 다른 독립적인 서열 반응으로 검증하여야 한다. VDV2의 전체 서열은 서열번호 1로 나타낸다.
일부 모호한 부분이 단일 서열, 특히 양 말단 근처 서열에서 나타났다. 이는 PCR 단편의 양 말단에서의 일부 반응 불량이 본래 있는 곳이다. 이러한 정성적으로 불량한 서열은, 다른 2가지 서열 반응을 다른 PCR 산물로부터 입수가능할때까지, 정렬에서 제외시켰다. 적어도 2개 이상의 독립적인 다른 PCR 서열에서 일치되는 것으로 확인되지 않는 경우에는, 기준 서열과의 차이나는 부분은 최종 정렬에 참작하지 않았다. 역으로, 2개의 독립 서열에서 확인된 모든 차이는 최종 서열에 나타내었다.
표 7은 각 개별 서열 반응의 특징을 총괄한 것으로, 개시부, 종결부 및 길이를 표시하고 있다. 인접한 PCR 산물간의 중첩과 기준 서열과의 차이를 마지막 열에 나타낸다.
뎅기 VDV2의 개별 서열 특징
명칭 개시 종결 크기 중첩 코멘트
Figure 112014006104976-pat00003
cDNA 합성 및 PCR DNA 반응에 게놈 말단에 상보적인 올리고뉴클레오티드가 필요하기 때문에, 게놈의 양 말단은 PCR 증폭으로 서열분석할 수 없었다. 증폭 단계 동안에, 이들 올리고뉴클레오티드를 PCR 단편으로 병합하였다. 서열 결과는 합성 올리고뉴클레오티드의 결과이며, 바이러스 그 자체의 서열 결과는 아니다. 바이러스 게놈의 양 말단으로부터의 PCR은 적절하게 수행되었는데, 이는, 바이러스 서열이 올리고뉴클레오티드 서열과 크게 다르지 않음을 시사한다(크게 다를 경우, PCR 증폭은 실패하거나 적어도 불량하게 수행된다). 본 발명자들은 이들을 다른 PCR 증폭산물과 구별할 수 없었다. 그래서, 재구축한 게놈에서, 게놈의 양쪽 말단을 올리고뉴클레오티드 서열과 동일한 것으로 간주하였다(그리고, 기준 서열과 동일한 것으로 간주함). 5' 말단의 서열은 뉴클레오티드 1 - 32이다. 3' 말단의 서열은 뉴클레오티드 10695-10723이다.
2.3.2 서열 비교
모균주 LAV2 게놈 서열에 대해 10개의 뉴클레오티드가 상이한 것으로 확인되었다. VDV2 백신 균주는 바이러스 위생 처리 및 개에서 원숭이 세포로의 계대 배양을 통해 LAV2로부터 파생된 것이다.
LAV2과 VDV2 간의 차이 발생에는 여러가지 이유가 있을 수 있다. 첫째, 클로닝 단계에서, LAV2에서 이미 검출된 다수의 서열과 100% 동일하지 않는 바이러스 하위집단이 선정될 수 있다. 둘째로, LAV2는 PDK 세포에서 생산되지만, VDV2는 Vero 세포에서 만들어진다. 이러한 개에서 원숭이 세포로의 계대 배양은 새로운 세포주에 순응하도록 바이러스 변화를 선호적으로 유도한다. 세번째로, 모든 RNA 바이러스의 경우, 정확성(fidelity)이 보다 낮은 바이러스의 RNA 중합효소는 DNA 중합효소에 비해 게놈에 돌연변이를 일으킬 확률이 더 높다.
LAV2 바이러스의 약독화와 연결되어 있는 9개의 뉴클레오티드 위치 모두, 서열이 VDV2 계대 배양 11 균주에 보존되어 있었다.
또한, VDV2 계대 배양 9회 균주 및 11회 세대 배양 균주간의 서열 비교로, 11회 계대 배양주 및 9회 계대 배양주 간에, 표현형, 바이러스 혈증 및 면역성 차이와 연결된 2개의 돌연변이가 확인되었다.
LAV2/PDK53 균주와 VDV2 11회 계대 배양주 및 9회 계대 배양주 간의 서열 비교
뉴클레오티드 아미노산
위치 LAV2 VDV
9회 계대 11회 계대
부위 위치 LAV2 VDV
9회 계대 11회 계대
Figure 112014006104976-pat00004
볼드체: VDV 9회 계대와 11회 계대 균주간에 서열이 상이한 부분
이용가능한 모든 Genbank 혈청형 2의 뎅기 게놈 서열들간에 서열 정렬을 수행한 경우, 단지 2곳만 다른 뎅기 2 균주(1638 및 2520)와 공유되며, 이 2곳 모두 아미노산 수준에서는 침묵으로 나타난다(표 8). 아미노산 변동과 관련하여, 비구조 펩티드에서의 4개의 변동은 생화학적 관점으로는 비교적 보존적으로 것으로 보이나, M 및 엔벨로프에서의 2개의 변동은 전하 및 소수성 모두에 변화를 가져올 것으로 보인다.
실시예 3: 특정화
본 연구의 목적은 계대 배양을 통해 약독화 마커에 변화가 있는지를 분석하기 위한 것이었다.
도 2에 나타낸 플로우 차트는 Filled Product(일가), "즉시 사용가능한" 투약제를 만드는 개발된 제조 공정을 요약한 것이다.
간략하게, VDV2 8회 계대 배양 균주를 Vero 세포에서 2회 연속 계대 배양한 후, 해당 사용(working) 종균을 수득하였다. 최종 바이러스 배양은, Vero 세포 현탁물의 감염에 의해 수행되었다. 생산된 바이러스를 회수하였다. 데옥시리보뉴클레산(DNA)를 효소 처리로 분해시켰다. 불순물은 초여과로 제거하였다. 감염 역가는 농축 단계에 의해 증가시켰다. 냉동보호제를 포함하는 완충화된 수용액(pH= 7.5)을 첨가하고, 이 0.22 ㎛ 여과한 혼합물을 동일 용액내 표적 투여량으로 희석하였다. 이후, 활성 물질은 유리 바이얼에 넣고, 냉동 건조하여, 사용전까지 보관하였다.
3.1 표현형 마커
표 9는 DEN-2 16681 wt 균주, DEN-2 16681/PDK53 백신 균주, VDV2 9회 계대 배양 균주 및 VDV2 11회 계대 배양 균주(최종 순응된 계대)를 대상으로 실시한 3번의 표현형 분석의 결과를 나타낸다: 온도-민감성(Ts), 원숭이(Vero) 및 모기(C6/36) 세포에서의 증식 곡선 및 마우스 신생아에서의 신경 독성(CDC에서 수득한 결과). 마우스 신경 독성 감소(사망율 감소 및 평균 생존 시간(AST) 연장), 39 ℃에서의 제한적인 증식 및 C6/36에서의 제한적인 복제는, 뎅기 바이러스에 대한 약독화 기준으로서 과학계에서 현재 수용하고 있다. Vero-순응된 계대 균주는 명확한 Ts 프로파일을 나타내며, DEN2/PDK53 보다 더욱 제한적이다. 최종적으로 순응된 계대 균주는 본 분석에서 약 3 log로 제한된다. 온도 민감성 역시 바이러스 증식 곡선으로 검증되었다. Vero 세포에서 테스트한 모든 바이러스에서, 유사한 복제율이 관찰되었다. 모기 세포에서는, Vero-순응된 바이러스의 증식은 wt DEN2에 비해 명확하게 제한되었으며, DEN2-PDK53과 비교하여 약간 제한적(약 0.5 log)이었다. 놀랍게도, Vero-순응된 바이러스의 마우스 신경독성은 wt DNE2의 신경독성에 가까웠고, DEN2/PDK53 백신의 신경독성 보다 현저하게 높았다. 이러한 데이타는, 바이러스 균주의 약독화 측면에서 이의 예측치가 낮음을 의미한다(임상 데이타와 비교).
VDV2 9회 및 11회 계대 균주, DEN2/PDK53 및 wtDEN2의 플라그 크기 분포를 도 5에서 비교하였다. wt DEN2는 플라그의 95%가 사이즈가 동질하며 플라그 다수 집단(81%)의 크기가 < 0.6mm이고, 소수(12%)가 1-2 mm인, 혼성 프로파일을 보인다. 이러한 프로파일은 DEN2/PDK53의 프로파일에 가깝지만, 구별되었다. 순응의 중간 계대 균주인 VDV2 P9는 다수 집단(70%)의 플라그 크기가 1-2 mm이고 소수(25%)가 < 0.6 mm인, 혼성 프로파일을 보인다. 이들 데이타는, VDV2 균주가 P9에서 완전히 순응되지 않았음을 나타내며, Vero 세포에서 안정적으로 복제되는 동질적인 집단을 수득하기 위해서는 2번의 부가적인 계대 배양이 필요함을 의미한다.
DEN-2 바이러스의 표현형 요약
  온도 민감성
(39℃에서의 역가 감소율%)Fold - reduction
증식 곡선(peak log10 pfu/ml)
Vero-LS10
신생 Swiss Webster 마우스에 대한 신경독성
바이러스 스코어 3일 4일 5일 6일 역가 일 사망율n AST(S.D.)
D2-16681 + n.d. 92.7 13.7 n.d. 92.2 12.8 7.5 8 100.0%16 12.2(1.5)
D2-PDK53 + n.d. 96.6 29.4 n.d. 99.7 333.3 7.3 8-10 43.75%16 16.0(2.4)
VDV2 P9 + n.d. 99.94 1666.7 n.d. 99.97 3333.3 7.5 8-10 100.0%16 10.9(0.7)
VDV2 P11 + n.d. 99.92 1250.0 n.d. 99.88 833 7.5 10 100.0%16 10.9(0.6)
*n: 동물의 수
실시예 4: 원숭이에서의 면역성, 바이러스 혈증 및 독성
원숭이에게서 수득할 수 있는 대부분의 실제 수많은 데이타는 면역성 및 바이러스 혈증에 대한 것이다. 특히, 바이러스 혈증은 인간에서의 유독성 및 질환 중증도과 관련있는 인자들중 하나로서 식별되고 있으며, 고려할 중요 파라미터이다. 명확하게는, 면역성은 백신 테스트시 중요한 파라미터이다.
본 발명자들은 바이러스 혈증 및 면역성에 대한 최저/최대값을 확립하였다.
플라그 분석에 의해 Vero 또는 LLC-MK2 세포에서 측정된 바에 따른, 원숭이에서 뎅기 백신 후보물질에 의해 유도된 반응에 대한 최소 요건(이들 세포는 이러한 분석에서 등가로 간주됨)
바이러스 혈증의 평균 지속 기
(일)
(모든 혈청형을 고려함)
바이러스 혈증의 평균 최고 역가
(log 10 pfu)
(모든 혈청형을 고려함)
평균 중화 역가
30 일
(각 혈청형에 대해)
PRNT 50
≤ 3 일 ≤ 1.5-2 ≥ 80
pfu: 플라그 형성 단위
PRNT 50: 플라그 감소 중화 역가 50(플라그 갯수의 50%를 감소시키는 역가)
4.1 동물에서의 전-임상 약리학, 약동학 및 산물 대사
4.1.1 재료 및 방법
4.1.1.1 원숭이 실험
원숭이 실험을 유럽의 동물 실험 가이드라인에 따라 수행하였다.
면역화는 Mauritius(CRP Le Vallon)에서 기원된 시노몰러스 원숭이(Macaca fascicularis)를 대상으로 수행하였다. 원숭이는 면역화하기 전에 Sanofi Pasteur의 동물 실험실에서 6주간 격리시켰다.
원숭이의 팔에 백신 0.5 ml을 피하(SC) 경로로 백신 접종하였다(해당 섹션 참조). 케타민(Imalgene, Merial)으로 간단하게 마취시킨 후, 서혜부 및 복재 정맥의 천공에 의해 채혈하였다. 0일 및 28일째에, 혈액 5 ml을 항체 반응 평가를 위해 샘플링하였고, 2일 내지 10일 사이에 혈액 1 ml은 바이러스 혈증 평가를 위해 샘플링하였다. 혈액을 얼음 위에서 모은 다음 혈청이 분리될때까지 얼음 위에 두었다. 혈청 분리를 위해, 혈액을 20분간 4℃에서 원심분리하고, 혈청을 채집하여 Rich Kinney's laboratory에서 테스트할 때까지 -80℃에 보관하였다. 미국으로 이송시 드라이아이스에서 유지시켰다.
4.1.1.2 바이러스 혈증 및 중화 항체 반응(플라그 감소 중화 테스트, PRNT)
모든 분석은 미국의 포트 콜린스 CDC의 R. Kinney 실험실에서 수행하였다. 혈청 샘플을 -80℃로 유지하여 이송시키고, 테스트할 때까지 상기 온도로 저장하였다. 일차 해동시, 샘플은 바이러스 혈증에 대해 테스트하였고, 혈청을 1:5로 희석시켰다. 1:5 혈청 희석물은 중화 항체 테스트하기 전에 56℃에서 30분간 불활화하였다.
4.1.1.2.1 바이러스 혈증
0.125 ml의 혈청을 96웰 플레이트의 첫번째 웰내 희석물 0.125 ml(RPMI medium)에 넣고, 각 희석으로 0.025 ml을 0.225 ml로 이동시켜 10배 연속 희석을 수행하였다. 0.2 ml의 100.3-105.3 연속 희석물을 6웰 플레이트의 Vero 세포에 넣었다(바이러스는 37℃에서 1.5시간동안 흡착시키고, 아가로스가 무첨가된 중성 레드 4 ml을 적층한 다음 중성 레드가 함유된 아가로스 2 ml을 6-7일 후에 적층하여, 플라그의 수를 측정함). 바이러스의 검출 한계는 10 PFU/ml이었다. 대조군으로, 스톡 DEN-16681 PDK-13 (LAV2) 백신을 접종하였다.
4.1.1.2.2 PRNT(플라그 감소 중화 테스트)
중화 항체를 Huang et al.(2000)에 개시된 바에 따라 정량하였다. 간략하게는, 0.2 ml의 열에 의해 불활화한 1:5 혈청 희석물을 96웰 플레이트의 첫번째 웰에 넣고, 각 희석으로 0.1 ml을 희석물(RPMI 배지) 0.1 ml에 이동시켜 2배 연속 희석을 수행하였다. 그 결과 1:10 - 1:320의 혈청 연속 희석물이 제조되었다. 0.1 ml의 DEN 바이러스(60-160 PFU; 모균주 DEN2 16681 바이러스)를 혈청-바이러스 혼합물의 최종 부피 0.2 ml로 각 혈청 희석물이 있는 웰에 첨가하였다. 96웰 플레이트는 4℃에서 철야 배양하였다. 0.1 ml의 혈청-바이러스 혼합물(첨가한 바이러스가 30-80 PFU로 포함됨)을 6웰의 Vero 플레이트에 접종하고(바이러스 혈증 섹션에 기재된 내용 참조), 중성 레드로 염색하여 플라그 수를 측정하였다. 2배, 1배 및 0.5배 테스트 농도로 첨가한 바이러스의 여러가지 백 역가 확인(multiple back titration)으로, 50% (PRNT50) 및 70% (PRNT70) 종말점 항체 역가를 결정하는 기준인, 주입 PFU의 직접적인 실험치를 결정하였다. 네거티브 혈청 결과는 중화 항체 역가가 < 1: 10이어야 한다. 중화 역가 320을 보이는 혈청은 종말점 역가 결정을 위해 1:80 - 1:2560 희석물에서 재분석하였다.
4.1.2 원숭이에서의 9회 계대한 일가 VDV2 후보물질의 평가
VDV2 후보물질의 정제/선정은 실시예 1에 기재된 바에 따라 수행하였다. (표현형 마커 및 서열을 토대로) 선정된 클론을 9회 계대 배양한 후, Sanofi pasteur에서 CRP Le Vallon, Mauritius 기원의 시노몰구스 마카크 수컷(Macaca fascicularis, 평균 체중 3.1 kg)을 대상으로 테스트하였다.
D0에 면역화한 다음, D2 내지 D10 동안 바이러스 혈청을 조사하였고, D0 및 D28에 면역성을 측정하였다. 바이러스 및 백신은 액체 형태로 사용하는 경우 모두 -70℃에서 유지시켰다.
LAV2 : 역가 : 103,93 DICC50 / ml; 동결건조하고, 0.5 ml의 PBS(Ca2 + 및 Mg2+; CaCl2.2H2O 0.133 g/l; MgCl2.6H2O, 0.1g/l 함유)에 재현탁한 다음 모두 투여함.
계대 배양 VDV2 DEN2-TV722(2회 플라그 정제 + 1회 증폭) : 역가 : 105,6 DICC50 /ml; 액체, PBS(Ca2 + 및 Mg2 +; CaCl2.2H2O 0,133 g/l; MgCl2.6H20, 0,1g/l 함유)에 105,3 pfu/ml로 희석하고, 0.5 ml 투여함.
23G1 바늘로 VDV2를 105 DICC50 투여량으로 팔에 피하 주사하였다.
결과는 표 11에 나타낸다. 28일째의 역가 확인은 PRNT70 및/또는 PRNT50을 3세트로 수행하였다.
VDV2와 LAV2 비교시 바이러스 혈증에 대해 명확한 차이가 나타났으며, 3/4 원숭이에서 VDV2의 단기간의 바이러스 혈증은 LAV2 보다 높았으며, 양쪽 타입에 대한 면역성이 현저하였다(VDV2에 대해 다소 낮음). 이러한 VDV2의 바이러스 혈증은 Vero 세포에서 수회 계대 배양한 후 프리-마스터 수준에서는 너무 높은 것으로 여겨질 수 있다. 그러나, 야생형 DEN2(및 그외 타입들 역시) 보다 장기간(6-7일간)동안 바이러스 혈증을 유도하며, 밀도도 높다(최대 5 log pfu)(Monath et al., 2000; Bray et al., 1996).
VDV2의 9회 계대 균주의 면역성
Figure 112014006104976-pat00005
4.1.3 11회 계대 배양한 일가 VDV2 후보물질의 평가
백신의 면역성을 9회 계대 배양 균주를 대상으로 수행하였기에, 2회 더 계대 배양한 후(10회 계대) 일가 계대 배양주를 테스트하기 위한 실험을 또한 설계하였다.
C.R.P. Le Vallon, Ile Maurice 기원의 마카카 파시큘라리스(Macaca fascicularis) 원숭이 수컷을 상기와 같이 사용하였다(24마리의 원숭이, 평균 체중 3.4 kg).
VDV2 의 11회 계대 배양 균주; 배치: 역가 : 8.07 log10 DICC50/ml
위약: Ca2 + 및 Mg2 +이 포함된 PBS
VDV3: Vero 유래 백신 뎅기 혈청형 3 균주, Vero 세포에서 LAV3의 위생 처리에 의해 수득
VDV4: Vero 유래 백신 뎅기 혈청형 4 균주, Vero 세포에서 LAV3의 위생 처리에 의해 수득
백신을 (Ca2 + 및 Mg2 +; CaCl2.2H2O 0.133 g/l; MgCl2.6H2O, 0.1g/l 포함된) PBS에 105.3 DICC50/ml로 희석하고, 23G1 바늘로 팔에 투여량 105 DICC50에 해당되는 0.5 ml을 투여하였다.
바이러스 혈증 및 면역성을 R Kinney에 의해 CDC에서 측정하였다. 그 결과는 표 12에 나타낸다.
VDV2의 11회 계대 배양 균주의 일가 백신은 현저한 면역 반응을 유도하지만 바이러스 혈증은 낮거나 없었다. 이러한 없거나 낮은 VDV2 유도성 바이러스 혈증은 VDV2의 9회 계대 배양 균주가 매우 초기에 바이러스 혈증을 유도하였던 이전 실험 측면에서 고려된다. 9회 계대와 11회 계대 사이의 이러한 진화는 높은 바이러스 혈증을 억제시켰지만, 면역성은 유지시켰다. 따라서, VDV2는 수용가능한 후보 물질이다.
동일한 실험에서, 원숭이 4마리에 동일한 VDV2의 11회 계대 백신이 포함된 4가 제형을 백신 주사하였지만, VDV1 및 VDV2에 대한 바이러스 혈증은 검출되지 않았고, VDV3과 VDV4는 바이러스 혈증을 유도하였다.
다른 2번의 실험에서는, VDV2를 단독으로 또는 다른 혈청형과 조합하여 사용하였다.
첫번째 실험에서(4가 실험; 각 혈청형의 5 log), VDV2 및 VDV1에 대한 바이러스 혈증은 검출되지 않았지만, VDV3 및 VDV4에 대해서는 높은 수준의 바이러스 혈증이 검출되었다.
두번째 실험에서, VDV2의 11회 계대 배양주를 단독으로 또는 VDV1을 포함하는 4가 조합물로 투여하였다. 단독 투여시, VDV2의 11회 계대 배양주는 원숭이 4마리중 한마리에서만 바이러스 혈증을 낮게(peak 40) 유도하였지만, 나머지 3마리는 바이러스 혈증이 나타나지 않았다. 4가 제형 투여시, 심지어 VDV2를 4 log로 투여하고 VDV3 및 VDV4를 2 log로 투여하더라도, VDV2는 바이러스 혈증을 유도하지 않거나, 또는 VDV3 및 VDV4에 비해 매우 낮게 유도하였다. 이 결과는, 바이러스 혈증 측면에서는 VDV2의 안정성이 높다는 것을 나타낸다. 따라서, 일가 VDV2는 원숭이에서 최초로 규정된 성공 기준을 만족시켰다.
VDV2의 11회 계대 배양 균주의 면역성 및 바이러스 혈증
Figure 112014006104976-pat00006
4.2 VDV2 의 독성
4.2.1 원숭이에서의 신경독성 테스트
이 실험의 목적은 Sanofi Pasteur에서 생산된 약독화된 2 뎅기 바이러스 종균의 원숭이(Ph. Eur 2.6.18)에 대한 향신경성 특성이 없음을 입증하기 위한 것이다.
Mauritius 유래 시노몰구스 원숭이 10마리에 VDV2의 9회 계대 배양 균주를 뇌내 경로로 접종하였다(107.10CCID50/mL, 각 뇌 반구의 시상에). 테스트 종료시, 원숭이를 죽이고 포르말린 용액을 주입하였다. 각 원숭이의 뇌에서 조직 샘플을 취하였다(연수, 뇌교, 소뇌, 중뇌, 좌우 파트를 포함한 시상, 대뇌 피질의 좌 및 우). 조직 단편은 8 ㎛의 두께로 잘라 에오신과 갈로시아닌으로 염색하였다.
혈청형 2 프라이머리 바이러스 종균을 주입한 원숭이의 뇌에서는 어떠한 병원성을 보이는 조직병리학적 신호는 관찰되지 않았다.
4.2.2 VDV2 의 1회 피하 투여 후 28일간 관찰하는, 시노몰거스 원숭이에서의 GLP 독성 실험
이 GLP 실험의 목적은 VDV2의 9회 계대 배양 균주와 다른 뎅기 백신 후보물질 간에 상호작용을 평가하기 위한 것이다. 실험의 제1 단계는 다른 백신 후보물질을 투여하기 전에 VDV2의 안전성과 면역성을 평가하기 위한 것이다.
시노몰거스 원숭이(수컷 4마리, 암컷 4마리)에 0일에 VDV2를 인간 1회 투여량(1회 투약 당 약 104 CCID50)으로 피하 투여하였다. 수컷 2마리와 암컷 2마리로 이루어진 대조군 그룹에는 비히클(NaCl 4 ‰)을 제공하였다.
실험 전반에 거쳐 사망율, 임상 증상, 체중 및 음식 소모량을 모니터링하였다. 투여한 그날부터 매일 테스트하기 전에 그리고 투여 후 2일동안 매일 한번씩 체온을 측정하였다. 혈액 샘플을, 테스트 전, 8일 및 27일째에 임상 실험 측정을 위해 취하였다.
임상적인 증상, 체중, 음식 소모량, 피부 반응, 체온, 혈액학, 임상 화학 또는 장기의 무게에는 별 영향이 없었다. 실험하는 동안에 사망한 동물은 없었다.
결론적으로, 시노몰거스 원숭이(Macaca fascicularis)에 VDV2를 테스트 용량으로 피하 투여하였을때, 생전에 임상 관찰 결과 및 임상적인 병리로 평가한 바에 따르면, 원숭이의 건강에 나쁜 영향을 미치지 않았다.
실시예 5: 18 내지 40세의 플라비바이러스에 노출된적 없는 건강한 성인에서 의 일가 VDV2의 안전성
1상 실험의 목적은 플라비바이러스에 노출된적 없는 성인에서 Stamaril®(대조군)와 비교하여 104 CCID50의 바이러스 농도에서 1가 VDV2에 대한 안전성, 바이러스 혈증 및 면역성 프로파일을 확인하기 위한 것이다. 1회 주사한 다음 6개월 및 12개월간 추적하였다. 안전 예방책으로, 순차적 통합(sequential inclusion)을 수행하였다.
이에, 등록 및 백신 접종은 엇갈리게 수행하였다: 1차 코호트(그룹 당 n=4, 총 n=12)에 백신 접종하였다. 최대 28일째까지 수집한 안전성 데이타는, 나머지 개체(그룹 당 n=8, 총 n=16)에 대한 백신 접종 진행을 결정하기 전에 IDMC(Independent Data Monitoring Committee) 및 왕립 애덜레이드 병원의 IDSC(Investigational Drugs Subcommittee)에서 논의하였다. 실험 설계의 개략적인 사항은 도 6에 나타낸다.
백신을 투여한 후, 환자를 다양한 임상 실험 및 테스트로 정기적으로 진찰하였다. 그 결과는 하기 표 13에 나타낸다.
등록된 집단은 플라비바이로스에 노출된 적 없는 사람 [플라비바이러스 질환(예, 황열, 일본 뇌염, 뎅기열)에 대해 백신 접종을 받은 개체; 또는 플라비바이러스 감염 병력이 있는 개체(임상적으로, 혈청학적으로 또는 미생물학적으로 확인됨), 또는 이전에 뎅기 감염 풍토성이 높은 지역에서 (얼마 동안이라도) 거주 또는 여행한 적이 있는 개체, 또는 2주 이상동안 노스 퀸슬랜드에 거주 또는 여행한 적 있는 사람은 제외됨]을 포함하며, 18 내지 40세(즉, 18번째 생일인 날에서 41번째 생일이 되기 전날)의 성인으로 구성된다.
조사한 플로우 차트
진찰 횟수 V01 V02 V03 V04 V05 V06 V07 V08 V09 V10 V11 V12
실험 시간표 # D0 D2 D4 D6 D8 D10 D12 D14 D16 D28 D180 D365
시간 윈도우 +1d +1d +4d +15d +30d
임상 검사 v v v v v v v v v v v v
바이탈 사인(BP, 맥박수) v
구강 온도 v v v v v v v v v v
혈액 샘플링:
-혈청 HBV/HCV/HIV
-생물학적 안전성
-바이러스 혈증
-면역성
-혈청내 사이토카인
-T 세포(세브세트)에 대한 PBMC
-국소 및 전신 현상의 직접 감시




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V: 진찰 - D: 일(day)
# 진찰 시간 간격은 진찰한 날과는 다른 백신 접종 실험한 날로부터 계산된다(예, 임시 배제 기준에 해당되는 경우). V06 및 V07은 적어도 1일 이상의 간격으로 행해져야 한다.
테스트한 제품은 다음과 같다:
조사된 백신은 별개로 제공된 희석제를 사용하여 즉석에서 재구성되는, 바이얼에 담기 동결건조된 제품;
활성 성분: 투여량 0.5 ml 당 각 1가 Vero 뎅기 바이러스 혈청형 2(VDV2) 4 + 0.5 log10 CCID50;
희석제: 백신 재구성을 위한 멸균 NaCl 4‰ 용액.
재구성된 백신, 즉 1가 VDV2의 NaCl 4‰ 용액 0.5 mL은 즉시 사용하거나 사용하기 전까지 +2℃ 내지 +8℃에서 유지시켜야 한다.
백신 투여량 0.5 mL은 삼각근에 피하 투여된다.
대조군 백신인 Stamaril®은 Aventis Pasteur 사에서 생산되는 황열 백신이다. Stamaril®은 동결건조된 형태로, 조류-로이코시스-결핍성, 안정화된 제품으로, 사용하기 바로 전에 희석제를 이용하여 재구성된다. (활성 성분: 약독화된 황열 생바이러스(17D 균주): >1,000 마우스 치사량 50% (LD50)/희석제: 멸균된 NaCl 4‰ 용액).
대조군 백신은 삼각근에 피하 투여된다.
개체는 백신 접종과 관련된 임상적으로 유의한 증후군을 나타내진 않았다. 개체 한명은 일과성 열(<38℃)이 발생하였다. 개체 한명은 국소 반응(경화)을 보였다. 백신 접종과 관려된 심각한 부작용은 관찰되지 않았다.
모든 개체는 뎅기 2에 대한 백신 접종 후 28일 경과시에 항체 반응성을 보였다(역가 1888 - 6393).
참조문헌
Figure 112014006104976-pat00007
Figure 112014006104976-pat00008
Figure 112014006104976-pat00009
<110> Sanofi Pasteur Centers for Disease Control and Prevention <120> Dengue serotype 2 attenuated strain <130> BET 06P0277 <150> US 60/691274 <151> 2005-06-17 <160> 42 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 10723 <212> DNA <213> Dengue virus <220> <221> misc_feature <222> (1)..(10723) <223> VDV2 <220> <221> CDS <222> (97)..(10272) <400> 1 agttgttagt ctacgtggac cgacaaagac agattctttg agggagctaa gctcaatgta 60 gttctaacag ttttttaatt agagagcaga tctctg atg aat aac caa cgg 111 Met Asn Asn Gln Arg 1 5 aaa aag gcg aaa aac acg cct ttc aat atg ctg aaa cgc gag aga aac 159 Lys Lys Ala Lys Asn Thr Pro Phe Asn Met Leu Lys Arg Glu Arg Asn 10 15 20 cgc gtg tcg act gtg caa cag ctg aca aag aga ttc tca ctt gga atg 207 Arg Val Ser Thr Val Gln Gln Leu Thr Lys Arg Phe Ser Leu Gly Met 25 30 35 ctg cag gga cga gga cca tta aaa ctg ttc atg gcc ctg gtg gcg ttc 255 Leu Gln Gly Arg Gly Pro Leu Lys Leu Phe Met Ala Leu Val Ala Phe 40 45 50 ctt cgt ttc cta aca atc cca cca aca gca ggg ata ttg aag aga tgg 303 Leu Arg Phe 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Cys Pro Leu Leu Arg Gln Asn Glu Pro Glu Asp Ile Asp Cys Trp 170 175 180 tgc aac tct acg tcc acg tgg gta act tat ggg acg tgt acc acc atg 687 Cys Asn Ser Thr Ser Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys Thr Thr Met 185 190 195 gga gaa cat aga aga gaa aaa aga tca gtg gca ctc gtt cca cat gtg 735 Gly Glu His Arg Arg Glu Lys Arg Ser Val Ala Leu Val Pro His Val 200 205 210 cga atg gga ctg gag aca cga act gaa aca tgg atg tca tca gaa ggg 783 Arg Met Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser Ser Glu Gly 215 220 225 gcc tgg aaa cat gtc cag aga att gaa act tgg atc ttg aga cat cca 831 Ala Trp Lys His Val Gln Arg Ile Glu Thr Trp Ile Leu Arg His Pro 230 235 240 245 ggc ttc acc atg atg gca gca atc ctg gca tac acc ata gga acg aca 879 Gly Phe Thr Met Met Ala Ala Ile Leu Ala Tyr Thr Ile Gly Thr Thr 250 255 260 cat ttc caa aga gcc ctg att ttc atc tta ctg aca gct gtc act cct 927 His Phe Gln Arg Ala Leu Ile Phe Ile Leu Leu Thr Ala Val Thr Pro 265 270 275 tca atg aca atg cgt tgc ata gga atg tca aat aga gac ttt gtg 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aga tgc aaa aag aac atg 1311 Lys Gly Gly Ile Val Thr Cys Ala Met Phe Arg Cys Lys Lys Asn Met 390 395 400 405 gaa gga aaa gtt gtg caa cca gaa aac ttg gaa tac acc att gtg ata 1359 Glu Gly Lys Val Val Gln Pro Glu Asn Leu Glu Tyr Thr Ile Val Ile 410 415 420 aca cct cac tca ggg gaa gag cat gca gtc gga aat gac aca gga aaa 1407 Thr Pro His Ser Gly Glu Glu His Ala Val Gly Asn Asp Thr Gly Lys 425 430 435 cat ggc aag gaa atc aaa ata aca cca cag agt tcc atc aca gaa gca 1455 His Gly Lys Glu Ile Lys Ile Thr Pro Gln Ser Ser Ile Thr Glu Ala 440 445 450 gaa ttg aca ggt tat ggc act gtc aca atg gag tgc tct cca aga acg 1503 Glu Leu Thr Gly Tyr Gly Thr Val Thr Met Glu Cys Ser Pro Arg Thr 455 460 465 ggc ctc gac ttc aat gag atg gtg ttg ctg cag atg gaa aat aaa gct 1551 Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Gln Met Glu Asn Lys Ala 470 475 480 485 tgg ctg gtg cac agg caa tgg ttc cta gac ctg ccg tta cca tgg ttg 1599 Trp Leu Val His Arg Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu Pro Trp Leu 490 495 500 ccc gga gcg gac aca caa gag tca aat tgg ata cag aag gag aca ttg 1647 Pro Gly Ala Asp Thr Gln Glu Ser Asn Trp Ile Gln Lys Glu Thr Leu 505 510 515 gtc act ttc aaa aat ccc cat gcg aag aaa cag gat gtt gtt gtt tta 1695 Val Thr Phe Lys Asn Pro His Ala Lys Lys Gln Asp Val Val Val Leu 520 525 530 gga tcc caa gaa ggg gcc atg cac aca gca ctt aca ggg gcc aca gaa 1743 Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala Thr Glu 535 540 545 atc caa atg tca tca gga aac tta ctc ttc aca gga cat ctc aag tgc 1791 Ile Gln Met Ser Ser Gly Asn Leu Leu Phe Thr Gly His Leu Lys Cys 550 555 560 565 agg ctg aga atg gac aag cta cag ctc aaa gga atg tca tac tct atg 1839 Arg Leu Arg Met Asp Lys Leu Gln Leu Lys Gly Met Ser Tyr Ser Met 570 575 580 tgc aca gga aag ttt aaa gtt gtg aag gaa ata gca gaa aca caa cat 1887 Cys Thr Gly Lys Phe Lys Val Val Lys Glu Ile Ala Glu Thr Gln His 585 590 595 gga aca ata gtt atc aga gtg caa tat gaa ggg gac ggc tct cca tgc 1935 Gly Thr Ile Val Ile Arg Val Gln Tyr Glu Gly Asp Gly Ser Pro Cys 600 605 610 aag atc cct ttt gag ata atg gat ttg gaa aaa aga cat gtc tta ggt 1983 Lys Ile Pro Phe Glu Ile Met Asp Leu Glu Lys Arg His Val Leu Gly 615 620 625 cgc ctg att aca gtc aac cca att gtg aca gaa aaa gat agc cca gtc 2031 Arg Leu Ile Thr Val Asn Pro Ile Val Thr Glu Lys Asp Ser Pro Val 630 635 640 645 aac ata gaa gca gaa cct cca ttt gga gac agc tac atc atc ata gga 2079 Asn Ile Glu Ala Glu Pro Pro Phe Gly Asp Ser Tyr Ile Ile Ile Gly 650 655 660 gta gag ccg gga caa ctg aag ctc aac tgg ttt aag aaa gga agt tct 2127 Val Glu Pro Gly Gln Leu Lys Leu Asn Trp Phe Lys Lys Gly Ser Ser 665 670 675 atc ggc caa atg ttt gag aca aca atg agg ggg gcg aag aga atg gcc 2175 Ile Gly Gln Met Phe Glu Thr Thr Met Arg Gly Ala Lys Arg Met Ala 680 685 690 att tta ggt gac aca gcc tgg gat ttt gga tcc ttg gga gga gtg ttt 2223 Ile Leu Gly Asp Thr Ala Trp Asp Phe Gly Ser Leu Gly Gly Val Phe 695 700 705 aca tct ata gga aag gct ctc cac caa gtc ttt gga gca atc tat gga 2271 Thr Ser Ile Gly Lys Ala Leu His Gln Val Phe Gly Ala Ile Tyr Gly 710 715 720 725 gct gcc ttc agt ggg gtt tca tgg act atg aaa atc ctc ata gga gtc 2319 Ala Ala Phe Ser Gly Val Ser Trp Thr Met Lys Ile Leu Ile Gly Val 730 735 740 att atc aca tgg ata gga atg aat tca cgc agc acc tca ctg tct gtg 2367 Ile Ile Thr Trp Ile Gly Met Asn Ser Arg Ser Thr Ser Leu Ser Val 745 750 755 aca cta gta ttg gtg gga att gtg aca ctg tat ttg gga gtc atg gtg 2415 Thr Leu Val Leu Val Gly Ile Val Thr Leu Tyr Leu Gly Val Met Val 760 765 770 cag gcc gat agt ggt tgc gtt gtg agc tgg aaa aac aaa gaa ctg aaa 2463 Gln Ala Asp Ser Gly Cys Val Val Ser Trp Lys Asn Lys Glu Leu Lys 775 780 785 tgt ggc agt ggg att ttc atc aca gac aac gtg cac aca tgg aca gaa 2511 Cys Gly Ser Gly Ile Phe Ile Thr Asp Asn Val His Thr Trp Thr Glu 790 795 800 805 caa tac aaa ttc caa cca gaa tcc cct tca aaa cta gct tca gct atc 2559 Gln Tyr Lys Phe Gln Pro Glu Ser Pro Ser Lys Leu Ala Ser Ala Ile 810 815 820 cag aaa gcc cat gaa gag gac att tgt gga atc cgc tca gta aca aga 2607 Gln Lys Ala His Glu Glu Asp Ile Cys Gly Ile Arg Ser Val Thr Arg 825 830 835 ctg gag aat ctg atg tgg aaa caa ata aca cca gaa ttg aat cac att 2655 Leu Glu Asn Leu Met Trp Lys Gln Ile Thr Pro Glu Leu Asn His Ile 840 845 850 cta tca gaa aat gag gtg aag tta act att atg aca gga gac atc aaa 2703 Leu Ser Glu Asn Glu Val Lys Leu Thr Ile Met Thr Gly Asp Ile Lys 855 860 865 gga atc atg cag gca gga aaa cga tct ctg cgg cct cag ccc act gag 2751 Gly Ile Met Gln Ala Gly Lys Arg Ser Leu Arg Pro Gln Pro Thr Glu 870 875 880 885 ctg aag tat tca tgg aaa aca tgg ggc aaa gca aaa atg ctc tct aca 2799 Leu Lys Tyr Ser Trp Lys Thr Trp Gly Lys Ala Lys Met Leu Ser Thr 890 895 900 gag tct cat aac cag acc ttt ctc att gat ggc ccc gaa aca gca gaa 2847 Glu Ser His Asn Gln Thr Phe Leu Ile Asp Gly Pro Glu Thr Ala Glu 905 910 915 tgc ccc aac aca aat aga gct tgg aat tcg ttg gaa gtt gaa gac tat 2895 Cys Pro Asn Thr Asn Arg Ala Trp Asn Ser Leu Glu Val Glu Asp Tyr 920 925 930 ggc ttt gga gta ttc acc acc aat ata tgg cta aaa ttg aaa gaa aaa 2943 Gly Phe Gly Val Phe Thr Thr Asn Ile Trp Leu Lys Leu Lys Glu Lys 935 940 945 cag gat gta ttc tgc gac tca aaa ctc atg tca gcg gcc ata aaa gac 2991 Gln Asp Val Phe Cys Asp Ser Lys Leu Met Ser Ala Ala Ile Lys Asp 950 955 960 965 aac aga gcc gtc cat gcc gat atg ggt tat tgg ata gaa agt gca ctc 3039 Asn Arg Ala Val His Ala Asp Met Gly Tyr Trp Ile Glu Ser Ala Leu 970 975 980 aat gac aca tgg aag ata gag aaa gcc tct ttc att gaa gtt aaa aac 3087 Asn Asp Thr Trp Lys Ile Glu Lys Ala Ser Phe Ile Glu Val Lys Asn 985 990 995 tgc cac tgg cca aaa tca cac acc ctc tgg agc aat gga gtg cta gaa 3135 Cys His Trp Pro Lys Ser His Thr Leu Trp Ser Asn Gly Val Leu Glu 1000 1005 1010 agt gag atg ata att cca aag aat ctc gct gga cca gtg tct caa cac 3183 Ser Glu Met Ile Ile Pro Lys Asn Leu Ala Gly Pro Val Ser Gln His 1015 1020 1025 aac tat aga cca ggc tac cat aca caa ata aca gga cca tgg cat cta 3231 Asn Tyr Arg Pro Gly Tyr His Thr Gln Ile Thr Gly Pro Trp His Leu 1030 1035 1040 1045 ggt aag ctt gag atg gac ttt gat ttc tgt gat gga aca aca gtg gta 3279 Gly Lys Leu Glu Met Asp Phe Asp Phe Cys Asp Gly Thr Thr Val Val 1050 1055 1060 gtg act gag gac tgc gga aat aga gga ccc tct ttg aga aca acc act 3327 Val Thr Glu Asp Cys Gly Asn Arg Gly Pro Ser Leu Arg Thr Thr Thr 1065 1070 1075 gcc tct gga aaa ctc ata aca gaa tgg tgc tgc cga tct tgc aca tta 3375 Ala Ser Gly Lys Leu Ile Thr Glu Trp Cys Cys Arg Ser Cys Thr Leu 1080 1085 1090 cca ccg cta aga tac aga ggt gag gat ggg tgc tgg tac ggg atg gaa 3423 Pro Pro Leu Arg Tyr Arg Gly Glu Asp Gly Cys Trp Tyr Gly Met Glu 1095 1100 1105 atc aga cca ttg aag gag aaa gaa gag aat ttg gtc aac tcc ttg gtc 3471 Ile Arg Pro Leu Lys Glu Lys Glu Glu Asn Leu Val Asn Ser Leu Val 1110 1115 1120 1125 aca gct gga cat ggg cag gtc gac aac ttt tca cta gga gtc ttg gga 3519 Thr Ala Gly His Gly Gln Val Asp Asn Phe Ser Leu Gly Val Leu Gly 1130 1135 1140 atg gca ttg ttc ctg gag gaa atg ctt agg acc cga gta gga acg aaa 3567 Met Ala Leu Phe Leu Glu Glu Met Leu Arg Thr Arg Val Gly Thr Lys 1145 1150 1155 cat gca ata cta cta gtt gca gtt tct ttt gtg aca ttg atc aca ggg 3615 His Ala Ile Leu Leu Val Ala Val Ser Phe Val Thr Leu Ile Thr Gly 1160 1165 1170 aac atg tcc ttt aga gac ctg gga aga gtg atg gtt atg gta ggc gcc 3663 Asn Met Ser Phe Arg Asp Leu Gly Arg Val Met Val Met Val Gly Ala 1175 1180 1185 act atg acg gat gac ata ggt atg ggc gtg act tat ctt gcc cta cta 3711 Thr Met Thr Asp Asp Ile Gly Met Gly Val Thr Tyr Leu Ala Leu Leu 1190 1195 1200 1205 gca gcc ttc aaa gtc aga cca act ttt gca gct gga cta ctc ttg aga 3759 Ala Ala Phe Lys Val Arg Pro Thr Phe Ala Ala Gly Leu Leu Leu Arg 1210 1215 1220 aag ctg acc tcc aag gaa ttg atg atg act act ata gga att gta ctc 3807 Lys Leu Thr Ser Lys Glu Leu Met Met Thr Thr Ile Gly Ile Val Leu 1225 1230 1235 ctc tcc cag agc acc ata cca gag acc att ctt gag ttg act gat gcg 3855 Leu Ser Gln Ser Thr Ile Pro Glu Thr Ile Leu Glu Leu Thr Asp Ala 1240 1245 1250 tta gcc tta ggc atg atg gtc ctc aaa atg gtg aga aat atg gaa aag 3903 Leu Ala Leu Gly Met Met Val Leu Lys Met Val Arg Asn Met Glu Lys 1255 1260 1265 tat caa ttg gca gtg act atc atg gct atc ttg tgc gtc cca aac gca 3951 Tyr Gln Leu Ala Val Thr Ile Met Ala Ile Leu Cys Val Pro Asn Ala 1270 1275 1280 1285 gtg ata tta caa aac gca tgg aaa gtg agt tgc aca ata ttg gca gtg 3999 Val Ile Leu Gln Asn Ala Trp Lys Val Ser Cys Thr Ile Leu Ala Val 1290 1295 1300 gtg tcc gtt tcc cca ctg ttc tta aca tcc tca cag caa aaa aca gat 4047 Val Ser Val Ser Pro Leu Phe Leu Thr Ser Ser Gln Gln Lys Thr Asp 1305 1310 1315 tgg ata cca tta gca ttg acg atc aaa ggt ctc aat cca aca gct att 4095 Trp Ile Pro Leu Ala Leu Thr Ile Lys Gly Leu Asn Pro Thr Ala Ile 1320 1325 1330 ttt cta aca acc ctc tca aga acc agc aag aaa agg agc tgg cca tta 4143 Phe Leu Thr Thr Leu Ser Arg Thr Ser Lys Lys Arg Ser Trp Pro Leu 1335 1340 1345 aat gag gct atc atg gca gtc ggg atg gtg agc att tta gcc agt tct 4191 Asn Glu Ala Ile Met Ala Val Gly Met Val Ser Ile Leu Ala Ser Ser 1350 1355 1360 1365 ctc cta aaa aat gat att ccc atg aca gga cca tta gtg gct gga ggg 4239 Leu Leu Lys Asn Asp Ile Pro Met Thr Gly Pro Leu Val Ala Gly Gly 1370 1375 1380 ctc ctc act gtg tgc tac gtg ctc act gga cga tcg gcc gat ttg gaa 4287 Leu Leu Thr Val Cys Tyr Val Leu Thr Gly Arg Ser Ala Asp Leu Glu 1385 1390 1395 ctg gag aga gca gcc gat gtc aaa tgg gaa gac cag gca gag ata tca 4335 Leu Glu Arg Ala Ala Asp Val Lys Trp Glu Asp Gln Ala Glu Ile Ser 1400 1405 1410 gga agc agt cca atc ctg tca ata aca ata tca gaa gat ggt agc atg 4383 Gly Ser Ser Pro Ile Leu Ser Ile Thr Ile Ser Glu Asp Gly Ser Met 1415 1420 1425 tcg ata aaa aat gaa gag gaa gaa caa aca ctg acc ata ctc att aga 4431 Ser Ile Lys Asn Glu Glu Glu Glu Gln Thr Leu Thr Ile Leu Ile Arg 1430 1435 1440 1445 aca gga ttg ctg gtg atc tca gga ctt ttt cct gta tca ata cca atc 4479 Thr Gly Leu Leu Val Ile Ser Gly Leu Phe Pro Val Ser Ile Pro Ile 1450 1455 1460 acg gca gca gca tgg tac ctg tgg gaa gtg aag aaa caa cgg gcc gga 4527 Thr Ala Ala Ala Trp Tyr Leu Trp Glu Val Lys Lys Gln Arg Ala Gly 1465 1470 1475 gta ttg tgg gat gtt cct tca ccc cca ccc atg gga aag gct gaa ctg 4575 Val Leu Trp Asp Val Pro Ser Pro Pro Pro Met Gly Lys Ala Glu Leu 1480 1485 1490 gaa gat gga gcc tat aga att aag caa aaa ggg att ctt gga tat tcc 4623 Glu Asp Gly Ala Tyr Arg Ile Lys Gln Lys Gly Ile Leu Gly Tyr Ser 1495 1500 1505 cag atc gga gcc gga gtt tac aaa gaa gga aca ttc cat aca atg tgg 4671 Gln Ile Gly Ala Gly Val Tyr Lys Glu Gly Thr Phe His Thr Met Trp 1510 1515 1520 1525 cat gtc aca cgt ggc gct gtt cta atg cat aaa gga aag agg att gaa 4719 His Val Thr Arg Gly Ala Val Leu Met His Lys Gly Lys Arg Ile Glu 1530 1535 1540 cca aca tgg gcg gac gtc aag aaa gac cta ata tca tat gga gga ggc 4767 Pro Thr Trp Ala Asp Val Lys Lys Asp Leu Ile Ser Tyr Gly Gly Gly 1545 1550 1555 tgg aag tta gaa gga gaa tgg aag gaa gga gaa gaa gtc cag gta ttg 4815 Trp Lys Leu Glu Gly Glu Trp Lys Glu Gly Glu Glu Val Gln Val Leu 1560 1565 1570 gca ctg gag cct gga aaa aat cca aga gcc gtc caa acg aaa cct ggt 4863 Ala Leu Glu Pro Gly Lys Asn Pro Arg Ala Val Gln Thr Lys Pro Gly 1575 1580 1585 ctt ttc aaa acc aac gcc gga aca ata ggt gct gta tct ctg gac ttt 4911 Leu Phe Lys Thr Asn Ala Gly Thr Ile Gly Ala Val Ser Leu Asp Phe 1590 1595 1600 1605 tct cct gga acg tca gga tct cca att atc gac aaa aaa gga aaa gtt 4959 Ser Pro Gly Thr Ser Gly Ser Pro Ile Ile Asp Lys Lys Gly Lys Val 1610 1615 1620 gtg ggt ctt tat ggt aat ggt gtt gtt aca agg agt gga gca tat gtg 5007 Val Gly Leu Tyr Gly Asn Gly Val Val Thr Arg Ser Gly Ala Tyr Val 1625 1630 1635 agt gct ata gcc cag act gaa aaa agc att gaa gac aac cca gag atc 5055 Ser Ala Ile Ala Gln Thr Glu Lys Ser Ile Glu Asp Asn Pro Glu Ile 1640 1645 1650 gaa gat cac att ttc cga aag aga aga ctg acc atc atg gac ctc cac 5103 Glu Asp His Ile Phe Arg Lys Arg Arg Leu Thr Ile Met Asp Leu His 1655 1660 1665 cca gga gcg gga aag acg aag aga tac ctt ccg gcc ata gtc aga gaa 5151 Pro Gly Ala Gly Lys Thr Lys Arg Tyr Leu Pro Ala Ile Val Arg Glu 1670 1675 1680 1685 gct ata aaa cgg ggt ttg aga aca tta atc ttg gcc ccc act aga gtt 5199 Ala Ile Lys Arg Gly Leu Arg Thr Leu Ile Leu Ala Pro Thr Arg Val 1690 1695 1700 gtg gca gct gaa atg gag gaa gcc ctt aga gga ctt cca ata aga tac 5247 Val Ala Ala Glu Met Glu Glu Ala Leu Arg Gly Leu Pro Ile Arg Tyr 1705 1710 1715 cag acc cca gcc atc aga gct gag cac acc ggg cgg gag att gtg gac 5295 Gln Thr Pro Ala Ile Arg Ala Glu His Thr Gly Arg Glu Ile Val Asp 1720 1725 1730 cta atg tgt cat gcc aca ttt acc atg agg ctg cta tca cca gtt aga 5343 Leu Met Cys His Ala Thr Phe Thr Met Arg Leu Leu Ser Pro Val Arg 1735 1740 1745 gtg cca aac tac aac ctg att atc atg gac gaa gcc cat ttc aca gac 5391 Val Pro Asn Tyr Asn Leu Ile Ile Met Asp Glu Ala His Phe Thr Asp 1750 1755 1760 1765 cca gca agt ata gca gct aga gga tac atc tca act cga gtg gag atg 5439 Pro Ala Ser Ile Ala Ala Arg Gly Tyr Ile Ser Thr Arg Val Glu Met 1770 1775 1780 ggt gag gca gct ggg att ttt atg aca gcc act ccc ccg gga agc aga 5487 Gly Glu Ala Ala Gly Ile Phe Met Thr Ala Thr Pro Pro Gly Ser Arg 1785 1790 1795 gac cca ttt cct cag agc aat gca cca atc ata gat gaa gaa aga gaa 5535 Asp Pro Phe Pro Gln Ser Asn Ala Pro Ile Ile Asp Glu Glu Arg Glu 1800 1805 1810 atc cct gaa cgc tcg tgg aat tcc gga cat gaa tgg gtc acg gat ttt 5583 Ile Pro Glu Arg Ser Trp Asn Ser Gly His Glu Trp Val Thr Asp Phe 1815 1820 1825 aaa ggg aag act gtt tgg ttc gtt cca agt ata aaa gca gga aat gat 5631 Lys Gly Lys Thr Val Trp Phe Val Pro Ser Ile Lys Ala Gly Asn Asp 1830 1835 1840 1845 ata gca gct tgc ctg agg aaa aat gga aag aaa gtg ata caa ctc agt 5679 Ile Ala Ala Cys Leu Arg Lys Asn Gly Lys Lys Val Ile Gln Leu Ser 1850 1855 1860 agg aag acc ttt gat tct gag tat gtc aag act aga acc aat gat tgg 5727 Arg Lys Thr Phe Asp Ser Glu Tyr Val Lys Thr Arg Thr Asn Asp Trp 1865 1870 1875 gac ttc gtg gtt aca act gac att tca gaa atg ggt gcc aat ttc aag 5775 Asp Phe Val Val Thr Thr Asp Ile Ser Glu Met Gly Ala Asn Phe Lys 1880 1885 1890 gct gag agg gtt ata gac ccc aga cgc tgc atg aaa cca gtc ata cta 5823 Ala Glu Arg Val Ile Asp Pro Arg Arg Cys Met Lys Pro Val Ile Leu 1895 1900 1905 aca gat ggt gaa gag cgg gtg att ctg gca gga cct atg cca gtg acc 5871 Thr Asp Gly Glu Glu Arg Val Ile Leu Ala Gly Pro Met Pro Val Thr 1910 1915 1920 1925 cac tct agt gca gca caa aga aga ggg aga ata gga aga aat cca aaa 5919 His Ser Ser Ala Ala Gln Arg Arg Gly Arg Ile Gly Arg Asn Pro Lys 1930 1935 1940 aat gag aat gac cag tac ata tac atg ggg gaa cct ctg gaa aat gat 5967 Asn Glu Asn Asp Gln Tyr Ile Tyr Met Gly Glu Pro Leu Glu Asn Asp 1945 1950 1955 gaa gac tgt gca cac tgg aaa gaa gct aaa atg ctc cta gat aac atc 6015 Glu Asp Cys Ala His Trp Lys Glu Ala Lys Met Leu Leu Asp Asn Ile 1960 1965 1970 aac acg cca gaa gga atc att cct agc atg ttc gaa cca gag cgt gaa 6063 Asn Thr Pro Glu Gly Ile Ile Pro Ser Met Phe Glu Pro Glu Arg Glu 1975 1980 1985 aag gtg gat gcc att gat ggc gaa tac cgc ttg aga gga gaa gca agg 6111 Lys Val Asp Ala Ile Asp Gly Glu Tyr Arg Leu Arg Gly Glu Ala Arg 1990 1995 2000 2005 aaa acc ttt gta gac tta atg aga aga gga gac cta cca gtc tgg ttg 6159 Lys Thr Phe Val Asp Leu Met Arg Arg Gly Asp Leu Pro Val Trp Leu 2010 2015 2020 gcc tac aga gtg gca gct gaa ggc atc aac tac gca gac aga agg tgg 6207 Ala Tyr Arg Val Ala Ala Glu Gly Ile Asn Tyr Ala Asp Arg Arg Trp 2025 2030 2035 tgt ttt gat gga gtc aag aac aac caa atc cta gaa gaa aac gtg gaa 6255 Cys Phe Asp Gly Val Lys Asn Asn Gln Ile Leu Glu Glu Asn Val Glu 2040 2045 2050 gtt gaa atc tgg aca aaa gaa ggg gaa agg aag aaa ttg aaa ccc aga 6303 Val Glu Ile Trp Thr Lys Glu Gly Glu Arg Lys Lys Leu Lys Pro Arg 2055 2060 2065 tgg ttg gat gct agg atc tat tct gac cca ctg gcg cta aaa gaa ttt 6351 Trp Leu Asp Ala Arg Ile Tyr Ser Asp Pro Leu Ala Leu Lys Glu Phe 2070 2075 2080 2085 aag gaa ttt gca gcc gga aga aag tct ctg acc ctg aac cta atc aca 6399 Lys Glu Phe Ala Ala Gly Arg Lys Ser Leu Thr Leu Asn Leu Ile Thr 2090 2095 2100 gaa atg ggt agg ctc cca acc ttc atg act cag aag gca aga gac gca 6447 Glu Met Gly Arg Leu Pro Thr Phe Met Thr Gln Lys Ala Arg Asp Ala 2105 2110 2115 ctg gac aac tta gca gtg ctg cac acg gct gag gca ggt gga agg gcg 6495 Leu Asp Asn Leu Ala Val Leu His Thr Ala Glu Ala Gly Gly Arg Ala 2120 2125 2130 tac aac cat gct ctc agt gaa ctg ccg gag acc ctg gag aca ttg ctt 6543 Tyr Asn His Ala Leu Ser Glu Leu Pro Glu Thr Leu Glu Thr Leu Leu 2135 2140 2145 tta ctg aca ctt ctg gct aca gtc acg gga ggg atc ttt tta ttc ttg 6591 Leu Leu Thr Leu Leu Ala Thr Val Thr Gly Gly Ile Phe Leu Phe Leu 2150 2155 2160 2165 atg agc gca agg ggc ata ggg aag atg acc ctg gga atg tgc tgc ata 6639 Met Ser Ala Arg Gly Ile Gly Lys Met Thr Leu Gly Met Cys Cys Ile 2170 2175 2180 atc acg gct agc atc ctc cta tgg tac gca caa ata cag cca cac tgg 6687 Ile Thr Ala Ser Ile Leu Leu Trp Tyr Ala Gln Ile Gln Pro His Trp 2185 2190 2195 ata gca gct tca ata ata ctg gag ttt ttt ctc ata gtt ttg ctt att 6735 Ile Ala Ala Ser Ile Ile Leu Glu Phe Phe Leu Ile Val Leu Leu Ile 2200 2205 2210 cca gaa cct gaa aaa cag aga aca ccc caa gac aac caa ctg acc tac 6783 Pro Glu Pro Glu Lys Gln Arg Thr Pro Gln Asp Asn Gln Leu Thr Tyr 2215 2220 2225 gtt gtc ata gcc atc ctc aca gtg gtg gcc gca acc atg gca aac gag 6831 Val Val Ile Ala Ile Leu Thr Val Val Ala Ala Thr Met Ala Asn Glu 2230 2235 2240 2245 atg ggt ttc cta gaa aaa acg aag aaa gat ctc gga ttg gga agc att 6879 Met Gly Phe Leu Glu Lys Thr Lys Lys Asp Leu Gly Leu Gly Ser Ile 2250 2255 2260 gca acc cag caa ccc gag agc aac atc ctg gac ata gat cta cgt cct 6927 Ala Thr Gln Gln Pro Glu Ser Asn Ile Leu Asp Ile Asp Leu Arg Pro 2265 2270 2275 gca tca gca tgg acg ctg tat gcc gtg gcc aca aca ttt gtt aca cca 6975 Ala Ser Ala Trp Thr Leu Tyr Ala Val Ala Thr Thr Phe Val Thr Pro 2280 2285 2290 atg ttg aga cat agc att gaa aat tcc tca gtg aat gtg tcc cta aca 7023 Met Leu Arg His Ser Ile Glu Asn Ser Ser Val Asn Val Ser Leu Thr 2295 2300 2305 gct ata gcc aac caa gcc aca gtg tta atg ggt ctc ggg aaa gga tgg 7071 Ala Ile Ala Asn Gln Ala Thr Val Leu Met Gly Leu Gly Lys Gly Trp 2310 2315 2320 2325 cca ttg tca aag atg gac atc gga gtt ccc ctt ctc gcc att gga tgc 7119 Pro Leu Ser Lys Met Asp Ile Gly Val Pro Leu Leu Ala Ile Gly Cys 2330 2335 2340 tac tca caa gtc aac ccc ata act ctc aca gca gct ctt ttc tta ttg 7167 Tyr Ser Gln Val Asn Pro Ile Thr Leu Thr Ala Ala Leu Phe Leu Leu 2345 2350 2355 gta gca cat tat gcc atc ata ggg cca gga ctc caa gca aaa gca acc 7215 Val Ala His Tyr Ala Ile Ile Gly Pro Gly Leu Gln Ala Lys Ala Thr 2360 2365 2370 aga gaa gct cag aaa aga gca gcg gcg ggc atc atg aaa aac cca act 7263 Arg Glu Ala Gln Lys Arg Ala Ala Ala Gly Ile Met Lys Asn Pro Thr 2375 2380 2385 gtc gat gga ata aca gtg att gac cta gat cca ata cct tat gat cca 7311 Val Asp Gly Ile Thr Val Ile Asp Leu Asp Pro Ile Pro Tyr Asp Pro 2390 2395 2400 2405 aag ttt gaa aag cag ttg gga caa gta atg ctc cta gtc ctc tgc gtg 7359 Lys Phe Glu Lys Gln Leu Gly Gln Val Met Leu Leu Val Leu Cys Val 2410 2415 2420 act caa gta ttg atg atg agg act aca tgg gct ctg tgt gag gct tta 7407 Thr Gln Val Leu Met Met Arg Thr Thr Trp Ala Leu Cys Glu Ala Leu 2425 2430 2435 acc tta gct acc ggg ccc atc tcc aca ttg tgg gaa gga aat cca ggg 7455 Thr Leu Ala Thr Gly Pro Ile Ser Thr Leu Trp Glu Gly Asn Pro Gly 2440 2445 2450 agg ttt tgg aac act acc att gcg gtg tca atg gct aac att ttt aga 7503 Arg Phe Trp Asn Thr Thr Ile Ala Val Ser Met Ala Asn Ile Phe Arg 2455 2460 2465 ggg agt tac ttg gcc gga gct gga ctt ctc ttt tct att atg aag aac 7551 Gly Ser Tyr Leu Ala Gly Ala Gly Leu Leu Phe Ser Ile Met Lys Asn 2470 2475 2480 2485 aca acc aac aca aga agg gga act ggc aac ata gga gag acg ctt gga 7599 Thr Thr Asn Thr Arg Arg Gly Thr Gly Asn Ile Gly Glu Thr Leu Gly 2490 2495 2500 gag aaa tgg aaa agc cga ttg aac gca ttg gga aaa agt gaa ttc cag 7647 Glu Lys Trp Lys Ser Arg Leu Asn Ala Leu Gly Lys Ser Glu Phe Gln 2505 2510 2515 atc tac aag aaa agt gga atc cag gaa gtg gat aga acc tta gca aaa 7695 Ile Tyr Lys Lys Ser Gly Ile Gln Glu Val Asp Arg Thr Leu Ala Lys 2520 2525 2530 gaa ggc att aaa aga gga gaa acg gac cat cac gct gtg tcg cga ggc 7743 Glu Gly Ile Lys Arg Gly Glu Thr Asp His His Ala Val Ser Arg Gly 2535 2540 2545 tca gca aaa ctg aga tgg ttc gtt gag aga aac atg gtc aca cca gaa 7791 Ser Ala Lys Leu Arg Trp Phe Val Glu Arg Asn Met Val Thr Pro Glu 2550 2555 2560 2565 ggg aaa gta gtg gac ctc ggt tgt ggc aga gga ggc tgg tca tac tat 7839 Gly Lys Val Val Asp Leu Gly Cys Gly Arg Gly Gly Trp Ser Tyr Tyr 2570 2575 2580 tgt gga gga cta aag aat gta aga gaa gtc aaa ggc cta aca aaa gga 7887 Cys Gly Gly Leu Lys Asn Val Arg Glu Val Lys Gly Leu Thr Lys Gly 2585 2590 2595 gga cca gga cac gaa gaa ccc atc ccc atg tca aca tat ggg tgg aat 7935 Gly Pro Gly His Glu Glu Pro Ile Pro Met Ser Thr Tyr Gly Trp Asn 2600 2605 2610 cta gtg cgt ctt caa agt gga gtt gac gtt ttc ttc atc ccg cca gaa 7983 Leu Val Arg Leu Gln Ser Gly Val Asp Val Phe Phe Ile Pro Pro Glu 2615 2620 2625 aag tgt gac aca tta ttg tgt gac ata ggg gag tca tca cca aat ccc 8031 Lys Cys Asp Thr Leu Leu Cys Asp Ile Gly Glu Ser Ser Pro Asn Pro 2630 2635 2640 2645 aca gtg gaa gca gga cga aca ctc aga gtc ctt aac tta gta gaa aat 8079 Thr Val Glu Ala Gly Arg Thr Leu Arg Val Leu Asn Leu Val Glu Asn 2650 2655 2660 tgg ttg aac aac aac act caa ttt tgc ata aag gtt ctc aac cca tat 8127 Trp Leu Asn Asn Asn Thr Gln Phe Cys Ile Lys Val Leu Asn Pro Tyr 2665 2670 2675 atg ccc tca gtc ata gaa aaa atg gaa gca cta caa agg aaa tat gga 8175 Met Pro Ser Val Ile Glu Lys Met Glu Ala Leu Gln Arg Lys Tyr Gly 2680 2685 2690 gga gcc tta gtg agg aat cca ctc tca cga aac tcc aca cat gag atg 8223 Gly Ala Leu Val Arg Asn Pro Leu Ser Arg Asn Ser Thr His Glu Met 2695 2700 2705 tac tgg gta tcc aat gct tcc ggg aac ata gtg tca tca gtg aac atg 8271 Tyr Trp Val Ser Asn Ala Ser Gly Asn Ile Val Ser Ser Val Asn Met 2710 2715 2720 2725 att tca agg atg ttg atc aac aga ttt aca atg aga tac aag aaa gcc 8319 Ile Ser Arg Met Leu Ile Asn Arg Phe Thr Met Arg Tyr Lys Lys Ala 2730 2735 2740 act tac gag ccg gat gtt gac ctc gga agc gga acc cgt aac atc ggg 8367 Thr Tyr Glu Pro Asp Val Asp Leu Gly Ser Gly Thr Arg Asn Ile Gly 2745 2750 2755 att gaa agt gag ata cca aac cta gat ata att ggg aaa aga ata gaa 8415 Ile Glu Ser Glu Ile Pro Asn Leu Asp Ile Ile Gly Lys Arg Ile Glu 2760 2765 2770 aaa ata aag caa gag cat gaa aca tca tgg cac tat gac caa gac cac 8463 Lys Ile Lys Gln Glu His Glu Thr Ser Trp His Tyr Asp Gln Asp His 2775 2780 2785 cca tac aaa acg tgg gca tac cat ggt agc tat gaa aca aaa cag act 8511 Pro Tyr Lys Thr Trp Ala Tyr His Gly Ser Tyr Glu Thr Lys Gln Thr 2790 2795 2800 2805 gga tca gca tca tcc atg gtc aac gga gtg gtc agg ctg ctg aca aaa 8559 Gly Ser Ala Ser Ser Met Val Asn Gly Val Val Arg Leu Leu Thr Lys 2810 2815 2820 cct tgg gac gtt gtc ccc atg gtg aca cag atg gca atg aca gac acg 8607 Pro Trp Asp Val Val Pro Met Val Thr Gln Met Ala Met Thr Asp Thr 2825 2830 2835 act cca ttt gga caa cag cgc gtt ttt aaa gag aaa gtg gac acg aga 8655 Thr Pro Phe Gly Gln Gln Arg Val Phe Lys Glu Lys Val Asp Thr Arg 2840 2845 2850 acc caa gaa ccg aaa gaa ggc acg aag aaa cta atg aaa ata aca gca 8703 Thr Gln Glu Pro Lys Glu Gly Thr Lys Lys Leu Met Lys Ile Thr Ala 2855 2860 2865 gag tgg ctt tgg aaa gaa tta ggg aag aaa aag aca ccc agg atg tgc 8751 Glu Trp Leu Trp Lys Glu Leu Gly Lys Lys Lys Thr Pro Arg Met Cys 2870 2875 2880 2885 acc aga gaa gaa ttc aca aga aag gtg aga agc aat gca gcc ttg ggg 8799 Thr Arg Glu Glu Phe Thr Arg Lys Val Arg Ser Asn Ala Ala Leu Gly 2890 2895 2900 gcc ata ttc act gat gag aac aag tgg aag tcg gca cgt gag gct gtt 8847 Ala Ile Phe Thr Asp Glu Asn Lys Trp Lys Ser Ala Arg Glu Ala Val 2905 2910 2915 gaa gat agt agg ttt tgg gag ctg gtt gac aag gaa agg aat ctc cat 8895 Glu Asp Ser Arg Phe Trp Glu Leu Val Asp Lys Glu Arg Asn Leu His 2920 2925 2930 ctt gaa gga aag tgt gaa aca tgt gtg tac aac atg atg gga aaa aga 8943 Leu Glu Gly Lys Cys Glu Thr Cys Val Tyr Asn Met Met Gly Lys Arg 2935 2940 2945 gag aag aag cta ggg gaa ttc ggc aag gca aaa ggc agc aga gcc ata 8991 Glu Lys Lys Leu Gly Glu Phe Gly Lys Ala Lys Gly Ser Arg Ala Ile 2950 2955 2960 2965 tgg tac atg tgg ctt gga gca cgc ttc tta gag ttt gaa gcc cta gga 9039 Trp Tyr Met Trp Leu Gly Ala Arg Phe Leu Glu Phe Glu Ala Leu Gly 2970 2975 2980 ttc tta aat gaa gat cac tgg ttc tcc aga gag aac tcc ctg agt gga 9087 Phe Leu Asn Glu Asp His Trp Phe Ser Arg Glu Asn Ser Leu Ser Gly 2985 2990 2995 gtg gaa gga gaa ggg ctg cac aag cta ggt tac att cta aga gac gtg 9135 Val Glu Gly Glu Gly Leu His Lys Leu Gly Tyr Ile Leu Arg Asp Val 3000 3005 3010 agc aag aaa gag gga gga gca atg tat gcc gat gac acc gca gga tgg 9183 Ser Lys Lys Glu Gly Gly Ala Met Tyr Ala Asp Asp Thr Ala Gly Trp 3015 3020 3025 gat aca aaa atc aca cta gaa gac cta aaa aat gaa gag atg gta aca 9231 Asp Thr Lys Ile Thr Leu Glu Asp Leu Lys Asn Glu Glu Met Val Thr 3030 3035 3040 3045 aac cac atg gaa gga gaa cac aag aaa cta gcc gag gcc att ttc aaa 9279 Asn His Met Glu Gly Glu His Lys Lys Leu Ala Glu Ala Ile Phe Lys 3050 3055 3060 cta acg tac caa aac aag gtg gtg cgt gtg caa aga cca aca cca aga 9327 Leu Thr Tyr Gln Asn Lys Val Val Arg Val Gln Arg Pro Thr Pro Arg 3065 3070 3075 ggc aca gta atg gac atc ata tcg aga aga gac caa aga ggt agt gga 9375 Gly Thr Val Met Asp Ile Ile Ser Arg Arg Asp Gln Arg Gly Ser Gly 3080 3085 3090 caa gtt ggc acc tat gga ctc aat act ttc acc aat atg gaa gcc caa 9423 Gln Val Gly Thr Tyr Gly Leu Asn Thr Phe Thr Asn Met Glu Ala Gln 3095 3100 3105 cta atc aga cag atg gag gga gaa gga gtc ttt aaa agc att cag cac 9471 Leu Ile Arg Gln Met Glu Gly Glu Gly Val Phe Lys Ser Ile Gln His 3110 3115 3120 3125 cta aca atc aca gaa gaa atc gct gtg caa aac tgg tta gca aga gtg 9519 Leu Thr Ile Thr Glu Glu Ile Ala Val Gln Asn Trp Leu Ala Arg Val 3130 3135 3140 ggg cgc gaa agg tta tca aga atg gcc atc agt gga gat gat tgt gtt 9567 Gly Arg Glu Arg Leu Ser Arg Met Ala Ile Ser Gly Asp Asp Cys Val 3145 3150 3155 gtg aaa cct tta gat gac agg ttc gca agc gct tta aca gct cta aat 9615 Val Lys Pro Leu Asp Asp Arg Phe Ala Ser Ala Leu Thr Ala Leu Asn 3160 3165 3170 gac atg gga aag att agg aaa gac ata caa caa tgg gaa cct tca aga 9663 Asp Met Gly Lys Ile Arg Lys Asp Ile Gln Gln Trp Glu Pro Ser Arg 3175 3180 3185 gga tgg aat gat tgg aca caa gtg ccc ttc tgt tca cac cat ttc cat 9711 Gly Trp Asn Asp Trp Thr Gln Val Pro Phe Cys Ser His His Phe His 3190 3195 3200 3205 gag tta atc atg aaa gac ggt cgc gta ctc gtt gtt cca tgt aga aac 9759 Glu Leu Ile Met Lys Asp Gly Arg Val Leu Val Val Pro Cys Arg Asn 3210 3215 3220 caa gat gaa ctg att ggc aga gcc cga atc tcc caa gga gca ggg tgg 9807 Gln Asp Glu Leu Ile Gly Arg Ala Arg Ile Ser Gln Gly Ala Gly Trp 3225 3230 3235 tct ttg cgg gag acg gcc tgt ttg ggg aag tct tac gcc caa atg tgg 9855 Ser Leu Arg Glu Thr Ala Cys Leu Gly Lys Ser Tyr Ala Gln Met Trp 3240 3245 3250 agc ttg atg tac ttc cac aga cgc gac ctc agg ctg gcg gca aat gct 9903 Ser Leu Met Tyr Phe His Arg Arg Asp Leu Arg Leu Ala Ala Asn Ala 3255 3260 3265 att tgc tcg gca gta cca tca cat tgg gtt cca aca agt cga aca acc 9951 Ile Cys Ser Ala Val Pro Ser His Trp Val Pro Thr Ser Arg Thr Thr 3270 3275 3280 3285 tgg tcc ata cat gct aaa cat gaa tgg atg aca acg gaa gac atg ctg 9999 Trp Ser Ile His Ala Lys His Glu Trp Met Thr Thr Glu Asp Met Leu 3290 3295 3300 aca gtc tgg aac agg gtg tgg att caa gaa aac cca tgg atg gaa gac 10047 Thr Val Trp Asn Arg Val Trp Ile Gln Glu Asn Pro Trp Met Glu Asp 3305 3310 3315 aaa act cca gtg gaa aca tgg gag gaa atc cca tac ttg ggg aaa aga 10095 Lys Thr Pro Val Glu Thr Trp Glu Glu Ile Pro Tyr Leu Gly Lys Arg 3320 3325 3330 gaa gac caa tgg tgc ggc tca ttg att ggg tta aca agc agg gcc acc 10143 Glu Asp Gln Trp Cys Gly Ser Leu Ile Gly Leu Thr Ser Arg Ala Thr 3335 3340 3345 tgg gca aag aac atc caa gca gca ata aat caa gtt aga tcc ctt ata 10191 Trp Ala Lys Asn Ile Gln Ala Ala Ile Asn Gln Val Arg Ser Leu Ile 3350 3355 3360 3365 ggc aat gaa gaa tac aca gat tac atg cca tcc atg aaa aga ttc aga 10239 Gly Asn Glu Glu Tyr Thr Asp Tyr Met Pro Ser Met Lys Arg Phe Arg 3370 3375 3380 aga gaa gag gaa gaa gca gga gtt ctg tgg t agaaagcaaa actaacatga 10290 Arg Glu Glu Glu Glu Ala Gly Val Leu Trp 3385 3390 aacaaggcta gaagtcaggt cggattaagc catagtacgg aaaaaactat gctacctgtg 10350 agccccgtcc aaggacgtta aaagaagtca ggccatcata aatgccatag cttgagtaaa 10410 ctatgcagcc tgtagctcca cctgagaagg tgtaaaaaat ccgggaggcc acaaaccatg 10470 gaagctgtac gcatggcgta gtggactagc ggttagggga gacccctccc ttacaaatcg 10530 cagcaacaat gggggcccaa ggcgagatga agctgtagtc tcgctggaag gactagaggt 10590 tagaggagac ccccccgaaa caaaaaacag catattgacg ctgggaaaga ccagagatcc 10650 tgctgtctcc tcagcatcat tccaggcaca gaacgccaga aaatggaatg gtgctgttga 10710 atcaacaggt tct 10723 <210> 2 <211> 3391 <212> PRT <213> Dengue virus <400> 2 Met Asn Asn Gln Arg Lys Lys Ala Lys Asn Thr Pro Phe Asn Met Leu 1 5 10 15 Lys Arg Glu Arg Asn Arg Val Ser Thr Val Gln Gln Leu Thr Lys Arg 20 25 30 Phe Ser Leu Gly Met Leu Gln Gly Arg Gly Pro Leu Lys Leu Phe Met 35 40 45 Ala Leu Val Ala Phe Leu Arg Phe Leu Thr Ile Pro Pro Thr Ala Gly 50 55 60 Ile Leu Lys Arg Trp Gly Thr Ile Lys Lys Ser Lys Ala Ile Asn Val 65 70 75 80 Leu Arg Gly Phe Arg Lys Glu Ile Gly Arg Met Leu Asn Ile Leu Asn 85 90 95 Arg Arg Arg Arg Ser Ala Gly Met Ile Ile Met Leu Ile Pro Thr Val 100 105 110 Met Ala Phe His Leu Thr Thr Arg Asn Gly Glu Pro His Met 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cctacggaat gcgatgcgta ggagtaggaa 960 acagagactt tgtggaagga gtctcaggtg gagcatgggt cgatctggtg ctagaacatg 1020 gaggatgcgt cacaaccatg gcccagggaa aaccaacctt ggattttgaa ctgactaaga 1080 caacagccaa ggaagtggct ctgttaagaa cctattgcat tgaagcctca atatcaaaca 1140 taaccacggc aacaagatgt ccaacgcaag gagagcctta tctaaaagag gaacaagacc 1200 aacagtacat ctgccggaga gatgtggtag acagagggtg gggcaatggc tgtggcttgt 1260 ttggaaaagg aggagttgtg acatgtgcga agttttcatg ttcggggaag ataacaggca 1320 atttggtcca aattgagaac cttgaataca cagtggttgt aacagtccac aatggagaca 1380 cccatgcagt aggaaatgac acatccaatc atggagttac agccacgata actcccaggt 1440 caccatcggt ggaagtcaaa ttgccggact atggagaact aacactcgat tgtgaaccca 1500 ggtctggaat tgactttaat gagatgattc tgatgaaaat gaaaaagaaa acatggcttg 1560 tgcataagca atggtttttg gatctacctc taccatggac agcaggagca gacacatcag 1620 aggttcactg gaattacaaa gagagaatgg tgacatttaa ggttcctcat gccaagagac 1680 aggatgtgac agtgctggga tctcaggaag gagccatgca ttctgccctc gctggagcca 1740 cagaagtgga ctccggtgat ggaaatcaca tgtttgcagg acatctcaag tgcaaagtcc 1800 gtatggagaa attgagaatc aagggaatgt catacacgat gtgttcagga aagttctcaa 1860 ttgacaaaga gatggcagaa acacagcatg ggacaacagt ggtgaaagtc aagtatgaag 1920 gtgctggagc tccgtgtaaa gtccccatag agataagaga tgtgaacaag aaaaaagtgg 1980 ttgggcgtat catctcatcc acccctttgg ctgagaatac caacagtgca accaacatag 2040 agttagaacc cccctttggg gacagctaca tagtgatagg tgttggaaac agtgcattaa 2100 cactccattg gttcaggaaa gggagttcca ttggcaagat gtttgagtcc acatacagag 2160 gtgcaaaacg aatggccatt ctaggtgaaa cagcttggga ttttggttcc gttggtggac 2220 tgttcacatc attgggaaag gctgtgcacc aggtttttgg aagtgtgtat acaaccatgt 2280 ttggaggagt ctcatggatg attagaatcc taattgggtt cctagtgttg tggattggca 2340 cgaactcaag gaacacttca atggctatga cgtgcatagc tgttggagga atcactctgt 2400 ttctgggctt cacagttcaa gcagacatgg gttgtgtggt gtcatggagt gggaaagaat 2460 tgaagtgtgg aagcggaatt tttgtggttg acaacgtgca cacttggaca gaacagtaca 2520 aatttcaacc ggagtcccca gcgagactag cgtctgcaat attgaatgcc cacaaagatg 2580 gggtctgtgg aattagatca accacgaggc tggaaaatgt catgtggaag caaataacca 2640 acgagctaaa ttatgttctc tgggaaggag gacatgacct cactgtagtg gctggggatg 2700 tgaagggggt gttgaccaaa ggcaagagag cactcacacc cccagtgaat gatctgaaat 2760 attcatggaa gacatgggga aaagcaaaaa tcttcacccc agaagcaaga aatagcacat 2820 ttttaataga cggaccagac acctccgaat gccccaatga acgaagagca tggaactttc 2880 ttgaggtgga agactatgga tttggcatgt tcacgaccaa catatggatg aaattccgag 2940 aaggaagttc agaagtgtgt gaccacaggt taatgtcagc ggcaattaaa gatcagaaag 3000 ctgtgcatgc tgacatgggt tattggatag agagctcaaa aaaccagacc tggcagatag 3060 agaaagcatc tcttattgaa gtgaaaacat gtctgtggcc caagacccac acattgtgga 3120 gcaatggagt gctggaaagc cagatgctca ttccaaaatc atatgcgggc cctttttcac 3180 accacaatta ccgccagggc tatgccacgc aaaccgtggg cccatggcac ttaggcaaat 3240 tagagataga ctttggagaa tgccccggaa caacagtcgc aattcaggag gattgtgacc 3300 atagaggccc atctttgagg accaccactg catctggaaa actagtcacg caatggtgct 3360 gccgctcctg cacgatgcct cccttaaggt tcttgggaga agatgggtgc tggtatggga 3420 tggagattag gcccttgagt gaaaaagaag 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ttcttccatc aatagtgaga gaagccttaa 5160 aaaggaggct gcgaaccttg attttggctc ccacgagagt ggtggcggcc gagatggaag 5220 aggccctacg tggactgcca atccgttatc agaccccagc tgtgaaatca gaacacacag 5280 gaagagagat tgtagacctc atgtgtcatg caaccttcac aacaagactt ttgtcatcaa 5340 ccagagttcc aaattacaac ctcatagtga tggatgaagc acatttcacc gatccttcta 5400 gtgtcgcggc tagaggatac atctcgacca gggtggaaat gggagaggca gcagccatct 5460 tcatgaccgc aacccctccc ggagcgacag atccctttcc ccagagcaac agcccaatag 5520 aagacatcga gagggaaatt ccggaaaggt catggaacac agggttcgac tggataacag 5580 actaccaagg gaaaactgtg tggtttgttc ccagcataaa agctggaaat gacattgcaa 5640 attgtttgag aaagtcggga aagaaagtta tccagttgag taggaaaacc tttgatacag 5700 agtatccaaa aacgaaactc acggactggg attttgtggt cactacagac atatctgaaa 5760 tgggggccaa ttttagagct gggagagtga tagaccctag gagatgcctc aagccagtta 5820 tcctaacaga tgggccagag agagtcattt tagcaggtcc tattccagtg actccagcaa 5880 gcgctgctca gagaagaggg cgaataggaa ggaacccagc acaagaagac gaccaatacg 5940 ttttctccgg agacccacta aaaaatgatg aagatcatgc ccactggaca gaagcaaaga 6000 tgctgcttga caatatctac accccagaag ggatcattcc aacattgttt ggtccggaaa 6060 gggaaaaaac ccaagccatt gatggagagt ttcgcctcag aggggaacaa aggaagactt 6120 ttgtggaatt aatgaggaga ggagaccttc cggtgtggct gagctataag gtagcttctg 6180 ctggcatttc ttacaaagat cgggaatggt gcttcacagg ggaaaggaat aaccaaattt 6240 tagaagaaaa catggaggtt gaaatttgga ctagagaggg agaaaagaaa aagctaaggc 6300 caagatggtt agatgcacgt gtatacgctg accccatggc tttgaaggat tttaaggagt 6360 ttgctagtgg aaggaagagc ataactctcg acatcctaac agagattgcc agtttgccaa 6420 cttacctttc ctctagggcc aagctcgccc ttgataacat agtcatgctc cacacaacag 6480 aaagaggagg gagggcctac caacacgccc tgaacgaact cccggagtca ctggaaacac 6540 ttatgcttgt agctttacta ggtgctatga cagcaggtat cttcctgttt ttcatgcaag 6600 ggaaaggaat agggaaattg tcaatgggtt tgataaccat tgcggtggct agtggcttgt 6660 tctgggtagc agaaattcaa ccccagtgga tagcggcctc aatcatacta gagttttttc 6720 tcatggtact gttgataccg gaaccagaaa aacaaaggac cccacaagac aatcaattga 6780 tctacgtcat attgaccatt ctcaccatta ttggtctcat agcagccaac gagatggggc 6840 tgattgaaaa aacaaaaacg gattttgggt tttaccaggt aaaaacagaa accaccatcc 6900 tcgatgtgga cttgagacca gcttcagcat ggacgctcta tgcagtagcc accacawttc 6960 tgactcccat gctgagacac accatagaaa acacgtcggc caacctatct ctagcagcca 7020 ttgccaacca ggcggccgtc ctaatggggc ttggaaaagg atggccgctc cacagaatgg 7080 acctcggtgt gccgctgtta gcaatgggat gctattctca agtgaaccca acaactttga 7140 cagcatcctt agtcatgctt tcagtccatt atgcaataat aggtccagga ttgcaggcaa 7200 aagccacaag agaggcccag aaaaggacag ctgctgggat catgaaaaac cccacggtgg 7260 acgggataac agtaatagat ctagaaccaa tatcctatga cccaaaattt gaaaagcaat 7320 tagggcaggt catgctactc gtcttgtgtg ctggacaact actcttgatg agaacaacat 7380 gggctttctg tgaagtcttg actttggcca caggaccaat cttgaccttg tgggagggca 7440 acccgggaag gttttggaac acgaccatag ccgtatccac cgccaacatt ttcaggggaa 7500 gttacctggc gggagctgga ctggcttttt cactcataaa gaatgyacaa acccctagga 7560 ggggaactgg gaccacagga gagacactgg gagagaagtg gaagagacag ctaaactcat 7620 takacagaaa agagtttgaa gagtataaaa gaagtggaat actagaagtg gacaggactg 7680 aagccaagtc tgccctgaaa gatgggtcta aaatcaagca tgcagtatct agagggtcca 7740 gtaagattag atggattgtt gagagaggga tggtaaagcc aaaagggaaa gttgtagatc 7800 ttggctgtgg gagaggagga tggtcttatt acatggcgac gctcaagaac gtgactgaag 7860 tgaaagggta tacaaaagga ggtccaggac atgaagaacc gattcccatg gctacttatg 7920 gctggaattt ggtcaaactc cattcagggg ttgacgtgtt ctacaaaccc acagagcaag 7980 tggacaccct gctctgtgat attggggagt catcttctaa tccaacaata gaggaaggaa 8040 gaacattaag agttttgaag atggtggagc catggctctc ttcaaaacct gaattctgca 8100 tcaaagtcct taacccctac atgccaacag tcatagaaga gctggagaaa ctgcagagaa 8160 aacatggtgg gaaccttgtc agatgcccgc tgtccaggaa ctccacccat gagatgtatt 8220 gggtgtcagg agcgtcggga aacattgtga gctctgtgaa cacaacatca aagatgttgt 8280 tgaacaggtt cacaacaagg cataggaaac ccacttatga gaaggacgta gatcttgggg 8340 caggaacgag aagtgtctcc actgaaacag aaaaaccaga catgacaatt attgggagaa 8400 ggcttcagcg attgcaagag gagcacaaag aaacctggca ttatgatcag gaaaacccat 8460 acagaacctg ggcgtatcat ggaagctatg aagctccttc gacaggctct gcatcctcca 8520 tggtgaacgg ggtagtaaaa ctgctaacaa aaccttggga tgtggttcca atggtgaccc 8580 agttagccat gacagacaca accccttttg ggcaacaaag agtgttcaaa gagaaggtgg 8640 ataccagaac accacaacca aaacccggta cacgaatggt tatgaccacg acagccaatt 8700 ggctgtgggc cctccttggg aagaagaaaa atcccagact gtgcacaagg gaagagttca 8760 tctcaaaagt tagatcaaac gcagccatag gcgcagtctt tcaggaagaa cagggatgga 8820 catcagccag tgaagctgtg aatgacagcc ggttttggga actggttgac aaagaaaggg 8880 ccctacacca ggaagggaaa tgtgaatcgt gtgtctacaa catgatggga aaacgtgaga 8940 aaaagttagg agagtttggc agagccaagg gaagccgagc aatctggtac atgtggctgg 9000 gagcgcggtt tctggaattt gaagccctgg gttttttgaa tgaagatcac tggtttggca 9060 gagaaaattc atggagtgga gtggaagggg aaggtctgca cagattggga tatatcctgg 9120 aggagataga caagaaggat ggagacctaa tgtatgctga tgacacagca ggctgggaca 9180 caagaatcac tgaggatgac cttcaaaatg aagaactgat cacggaacag atggcccccc 9240 accacaagat cctagccaaa gccattttca aactaaccta tcaaaacaaa gtggtgaaag 9300 tcctcagacc cacaccgaga ggagcggtga tggatatcat atccaggaaa gaccaaagag 9360 gtagtggaca agttggaaca tatggtttga acacattcac caacatggaa gttcaactca 9420 tccgccaaat ggaagctgaa ggagtcatca cacaagatga catgcagaac ccaaaagggt 9480 tgaaagaaag agttgagaaa tggctgaaag agtgtggtgt cgacaggtta aagaggatgg 9540 caatcagtgg agacgattgc gtggtgaagc ccctggatga gaggtttggc acttccctcc 9600 tcttcttgaa cgacatggga aaggtgagga aagacattcc gcagtgggaa ccatctaagg 9660 gatggaaaaa ctggcaagag gttccttttt gctcccacca ctttcacaag atcttcatga 9720 aggatggccg ctcactagtt gttccatgta gaaaccagga tgaactgata gggagagcca 9780 gaatctcgca gggggctgga tggagcttaa gagaaacagc ctgcctgggc aaagcttacg 9840 cccagatgtg gtcgctcatg tacttccaca gaagggatct gcgtttagcc tccatggcca 9900 tatgctcagc agttccaacg gaatggtttc caacaagcag aacaacatgg tcaatccacg 9960 ctcatcatca gtggatgacc actgaagata tgctcaaagt gtggaacaga gtgtggatag 10020 aagacaaccc taatatgact gacaagactc cagtccattc gtgggaagat ataccttacc 10080 tagggaaaag agaggatttg tggtgtggat ccctgattgg actttcttcc agagccacct 10140 gggcgaagaa cattcacacg gccataaccc aggtcagaaa cctgatcgga aaagaggaat 10200 acgtggatta catgccagta atgaaaagat acagcgctcc ttcagagagt gaaggagttc 10260 tgtaattacc aacaacaaac accaaaggct attgaagtca ggccacttgt gccacggctt 10320 gagcaaaccg tgctgcctgt agctccgcca ataatgggag gcgtgaaatc cctagggagg 10380 ccatgcgcca cggaagctgt acgcgtggca tattggacta gcggttagag gagacccctc 10440 ccatcactga caaaacgcag caaaaggggg cccgaagcca ggaggaagct gtactcctgg 10500 tggaaggact agaggttaga ggagaccccc ccaacacaaa aacagcatat tgacgctggg 10560 aaagaccaga gatcctgctg tctctgcaac atcaatccag gcacagagcg aagcaagatg 10620 gattggtgtt gttgatccaa caggttct 10648

Claims (17)

  1. 서열번호 38에서 서열번호 38의 데옥시티미딘 대신 우리딘을 포함하는 RNA 서열을 포함하는 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주(live attenuated dengue-2 virus strain)로서, 서열번호 38을 기준으로 상기 RNA 서열의 적어도 736, 1619, 4723, 5062, 9191, 10063 및 10507번 위치의 뉴클레오티드가 돌연변이되고, 57, 524, 2055, 2579, 4018, 5547, 6599 및 8571번 위치의 뉴클레오티드는 돌연변이되지 않았으며,
    상기 RNA 서열의 736, 1619, 4723, 5062, 9191, 10063 및 10507번 위치에서 일어나는 돌연변이된 뉴클레오티드는 각각 C, A, A, C, A, A 및 G인, 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주.
  2. 제 1항에 있어서, 상기 RNA 서열은 서열번호 38의 서열을 기준으로, 736, 1619, 1638, 2520, 4723, 5062, 9191, 9222, 10063 및 10507번 위치에서 돌연변이를 포함하며, 736, 1619, 1638 , 2520, 4723, 5062, 9191, 9222, 10063 및 10507번 위치에서 일어난 변이된 뉴클레오티드가 각각 C, A, G, A, A, C, A, G, A 및 G 인, 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주.
  3. 제 1항에 있어서, 상기 RNA 서열은 서열번호 38에 의하여 코딩되는 아미노산을 기준으로, 주어진 위치에서 코딩하고 있는 아미노산을 변이시키지 않고 해당 코돈 위치에 하나 이상의 뉴클레오티드 치환을 더 포함하는 것인, 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주.
  4. 제 1항에 있어서, 상기 RNA 서열은 서열번호 1에서 서열번호 1의 데옥시티미딘 대신 우리딘을 포함하는 RNA 서열과 5 돌연변이 이하의 차이를 가지는 것인, 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주.
  5. 제 1항에 있어서, 서열번호 1에서 서열번호 1의 데옥시티미딘 대신 우리딘을 포함하는 RNA 서열을 포함하는 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주.
  6. 제 1항 내지 제 5항 중 어느 한 항에 따른 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주를 약제학적으로 허용가능한 담체 내에 포함하는 면역원성 조성물.
  7. 제 6항에 있어서, 1가(monovalent) 백신 조성물인, 면역원성 조성물.
  8. 제 6항에 있어서, 다가(multivalent) 뎅기 백신 조성물인, 면역원성 조성물.
  9. 제 8항에 있어서, 서열번호 39에서 서열번호 39의 데옥시티미딘 대신 우리딘을 포함하는 RNA를 포함하는 약독화된 뎅기-1 바이러스 생균주를 포함하는 면역원성 조성물.
  10. 제 6항에 있어서, 상기 약독화된 뎅기-2 바이러스 생균주를 10 내지 105 CCID50로 포함하는, 면역원성 조성물.
  11. 서열번호 1의 DNA 서열 또는 서열번호 1에서 서열번호 1의 데옥시티미딘 대신 우리딘을 포함하는 RNA 서열을 포함하는 핵산.
  12. 서열번호 1에 의해 코딩되는 폴리단백질.
  13. 서열번호 38에서, 서열번호 38을 기준으로 뉴클레오티드 서열의 적어도 736, 1619, 4723, 5062, 9191, 10063 및 10507번 위치의 뉴클레오티드가 돌연변이되고, 상기 뉴클레오티드 서열의 57, 524, 2055, 2579, 4018, 5547, 6599 및 8571번 위치의 뉴클레오티드는 돌연변이되지 않은 서열을 가지는 뉴클레오티드 서열로부터 만들어지는 RNA를 포함하는 뎅기-2 바이러스 균주로서,
    상기 뉴클레오티드 서열의 736, 1619, 4723, 5062, 9191, 10063 및 10507번 위치에서 일어나는 돌연변이된 뉴클레오티드는 각각 C, A, A, C, A, A 및 G인, 뎅기-2 바이러스 균주.
  14. 서열번호 38에서, 서열번호 38의 데옥시티미딘 대신 우리딘을 포함하는 RNA서열을 가지는 RNA 분자로서,
    서열번호 38을 기준으로 상기 RNA 서열의 적어도 736, 1619, 4723, 5062, 9191, 10063 및 10507번 위치의 뉴클레오티드가 돌연변이되고, 57, 524, 2055, 2579, 4018, 5547, 6599 및 8571번 위치의 뉴클레오티드는 돌연변이되지 않았으며,
    상기 RNA 서열의 736, 1619, 4723, 5062, 9191, 10063 및 10507번 위치에서 일어나는 돌연변이된 뉴클레오티드는 각각 C, A, A, C, A, A 및 G인, RNA 분자.
  15. 서열번호 1에서, 서열번호 1의 데옥시티미딘 대신 우리딘을 포함하는 RNA 서열을 가지는 RNA 분자.
  16. 삭제
  17. 삭제
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